特開2020-22521(P2020-22521A)IP Force 特許公報掲載プロジェクト 2015.5.11 β版

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特開2020-22521特定のTagSNPが選択されたDNAマイクロアレイ
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  • 特開2020022521-特定のTagSNPが選択されたDNAマイクロアレイ 図000005
  • 特開2020022521-特定のTagSNPが選択されたDNAマイクロアレイ 図000006
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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】特開2020-22521(P2020-22521A)
(43)【公開日】2020年2月13日
(54)【発明の名称】特定のTagSNPが選択されたDNAマイクロアレイ
(51)【国際特許分類】
   C12N 15/09 20060101AFI20200121BHJP
   C12Q 1/6876 20180101ALI20200121BHJP
【FI】
   C12N15/09 200
   C12Q1/6876 Z
【審査請求】有
【請求項の数】2
【出願形態】OL
【全頁数】6314
(21)【出願番号】特願2019-213239(P2019-213239)
(22)【出願日】2019年11月26日
(62)【分割の表示】特願2018-191312(P2018-191312)の分割
【原出願日】2014年11月1日
(31)【優先権主張番号】特願2014-126910(P2014-126910)
(32)【優先日】2014年6月20日
(33)【優先権主張国】JP
(71)【出願人】
【識別番号】504157024
【氏名又は名称】国立大学法人東北大学
(74)【代理人】
【識別番号】100103160
【弁理士】
【氏名又は名称】志村 光春
(72)【発明者】
【氏名】長崎 正朗
(72)【発明者】
【氏名】小島 要
(72)【発明者】
【氏名】成相 直樹
(72)【発明者】
【氏名】三森 隆広
(72)【発明者】
【氏名】河合 洋介
【テーマコード(参考)】
4B063
【Fターム(参考)】
4B063QA08
4B063QQ42
4B063QQ52
4B063QR55
4B063QS34
(57)【要約】
【課題】SNPのインピュテーションを行うに際して、DNAマイクロアレイ等において、インピュテーションを行うための手段として用いる核酸プローブに含まれるTagSNPを、より適切に選択する手段を見出すことを課題とする。
【解決手段】複数個人の遺伝子型が特定されたSNP群の情報が含まれるヒトゲノム情報を用いて、ヒトゲノムのSNP情報をインピュテーションするための手段として用いるTagSNPに対応する核酸プローブ群を構成するために、当該TagSNPを選択する方法において、TagSNP候補とこれらのTargetSNPとの間の相互情報量の和をTagSNP選択の指標とすることにより、上記課題を解決することを見出した。さらに、この原理に基づくコンピュータシステムと、コンピュータプログラム、さらにはこれらの手段により選択されたTagSNPに対応する核酸プローブ群を搭載するDNAマイクロアレイと、その生産方法を提供する。
【選択図】 図1
【特許請求の範囲】
【請求項1】
下記の300,000個のSNPからなるtagSNP群から選ばれる297,000個以上に対応する核酸プローブ群が含まれて搭載されていることを特徴とする、DNAマイクロアレイ。
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