特許 7593669 コンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キット

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】

(24)【登録日】2024-11-25

(45)【発行日】2024-12-03

(54)【発明の名称】コンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キット

(51)【国際特許分類】

   G01N 33/68 20060101AFI20241126BHJP

   G01N 33/53 20060101ALI20241126BHJP

   G01N 27/62 20210101ALI20241126BHJP

【ＦＩ】

G01N33/68

G01N33/53 V

G01N33/53 D

G01N33/53 Y

G01N27/62 V

【請求項の数】 16

(21)【出願番号】P 2022535227

(86)(22)【出願日】2020-06-26

(65)【公表番号】

(43)【公表日】2023-02-16

(86)【国際出願番号】 KR2020008322

(87)【国際公開番号】W WO2021167177

(87)【国際公開日】2021-08-26

【審査請求日】2022-06-09

(31)【優先権主張番号】10-2020-0019622

(32)【優先日】2020-02-18

(33)【優先権主張国・地域又は機関】KR

(31)【優先権主張番号】10-2020-0056180

(32)【優先日】2020-05-11

(33)【優先権主張国・地域又は機関】KR

【前置審査】

(73)【特許権者】

【識別番号】521533463

【氏名又は名称】イノベイション バイオ カンパニー リミテッド

【氏名又は名称原語表記】ＩｎｎｏＢａｔｉｏｎ Ｂｉｏ Ｃｏ．， Ｌｔｄ．

(74)【代理人】

【識別番号】100125450

【弁理士】

【氏名又は名称】河野 広明

(72)【発明者】

【氏名】ユ、ビョンチョル

(72)【発明者】

【氏名】キム、ギョンヒ

(72)【発明者】

【氏名】パク、ジェグァン

(72)【発明者】

【氏名】ウ、サンミョン

(72)【発明者】

【氏名】イ、ヨンジュ

(72)【発明者】

【氏名】チェ、ボムギュ

【審査官】小澤 理

(56)【参考文献】

【文献】国際公開第２０１６／０４９３８５（ＷＯ，Ａ１）

【文献】国際公開第２０１８／１９０３７９（ＷＯ，Ａ１）

(58)【調査した分野】(Int.Cl.，ＤＢ名)

Ｇ０１Ｎ ３３／４８ － ３３／９８

Ａ６１Ｋ ３８／００ － ４５／０８

Ａ６１Ｋ ４８／００ － ５１／１２

Ｃ１２Ｎ １／００ － ７／０８

Ｃ１２Ｎ １５／００ － １５／９０

Ｇ０１Ｎ ２７／６２

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）を含み、がん細胞に対するＰＤ－１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｅａｔｈ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ－Ｌｉｇａｎｄ １）免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測し、
血液から抽出されることを特徴とし、且つ、
前記補体Ｃ７のタンパク質量は、定量分析を通じて測定することを特徴とする、
コンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項2】

前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＨＲＧ（Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ－Ｒｉｃｈ Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、ＡＺＧＰ１（Ｚｉｎｃ－Ａｌｐｈａ－２－Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、補体Ｃ５（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ５）、ＩＨＫＶ４－１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｋａｐｐａ Ｖａｒｉａｂｌｅ ４－１）、ＭＡＮ１Ａ（Ｍａｎｎｏｓｙｌ－Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ １，２－Ａｌｐｈａ－Ｍａｎｎｏｓｉｄａｓｅ １Ａ）、Ａ２Ｍ（Ａｌｐｈａ－２－Ｍａｃｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ）、ＳＰＰ１（Ｏｓｔｅｏｐｏｎｔｉｎ）およびＨＹＯＵ１（Ｈｙｐｏｘｉａ Ｕｐ－Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーをさらに含むことを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項3】

前記補体Ｃ７のタンパク質量は、タンパク質質量分析、タンパク質チップ分析、免疫測定法、リガンドバインディングアッセイ、ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ（Ｍａｔｒｉｘ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）分析、ＳＥＬＤＩ－ＴＯＦ（Ｓｕｌｆａｃｅ Ｅｎｈａｎｃｅｄ Ｌａｓｅｒ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）分析、放射線免疫分析、放射免疫拡散法、オクタロニー免疫拡散法、ロケット免疫電気泳動、組織免疫染色、補体固定分析法、２次元電気泳動分析、液体クロマトグラフィー－質量分析（Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，ＬＣ－ＭＳ）、ＬＣ－ＭＳ／ＭＳ（Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ／ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）、ウェスタンブロットおよびＥＬＩＳＡ（Ｅｎｚｙｍｅ Ｌｉｎｋｅｄ Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔａｓｓａｙ）からなる群から選択されるいずれか一つの方法で測定されることを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項4】

前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比して前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群における前記補体Ｃ７の量が減少することを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項5】

前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比して前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群における前記補体Ｃ７の量が増加することを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項6】

前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比して前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群における前記補体Ｃ７の量が減少することを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項7】

前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比して前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群における前記補体Ｃ７の量が増加することを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項8】

前記補体Ｃ７のタンパク質量に対するカットオフ値は、１００～１１０μｇ／ｍＬの範囲内であることを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項9】

前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いことを特徴とする
請求項８に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項10】

前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いことを特徴とする
請求項８に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項11】

前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いことを特徴とする
請求項８に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項12】

前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いことを特徴とする
請求項８に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項13】

前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ－Ｌｉｇａｎｄ １）タンパク質をさらに含むことを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項14】

前記がん細胞は、前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤に特異的に反応するがん腫に該当するがん細胞であることを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項15】

前記がん細胞は、肺がん、肝がん、胃がん、胃と胃食道接合部腺がん、皮膚黒色腫、頭頸部がん、骨がん、すい臓がん、皮膚がん、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、大腸がん、結腸がん、乳がん、子宮肉腫、ラッパ管がん腫、子宮内膜がん腫、子宮頸部がん腫、膣がん腫、外陰部がん腫、食道がん、喉頭がん、小腸がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、軟組織の肉腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性または急性白血病、幼年期の固形腫瘍、分化リンパ腫、膀胱がん、腎臓がん、腎細胞がん腫、腎臓骨盤がん腫、原発性中枢神経系リンパ腫、脊髄腫瘍、脳幹部神経膠腫および脳下垂体腺腫からなる群から選択されるいずれか一つのがん腫に該当するがん細胞であることを特徴とする
請求項１に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【請求項16】

前記がん細胞は、肺がんまたは肝がんに該当するがん細胞であることを特徴とする
請求項１５に記載のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

本発明は、コンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットに関し、具体的には、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応予測のためのコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットに関する。

【背景技術】

【0002】

コンパニオン診断（Ｃｏｍｐａｎｉｏｎ Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ）は、患者の特定薬物治療に対する反応性をあらかじめ予測するための診断技法である。がん細胞および正常細胞に対して全部作用して、副作用が大きい従来の大部分の抗がん剤の短所を克服するために、特定の標的タンパク質を選択的に攻撃する標的抗がん剤、抑制されていた人体の免疫体系を活性化させてがん細胞を死滅させる免疫抗がん剤などが開発された。

【0003】

しかしながら、標的抗がん剤は、同じ種類のがんであるとしても、特定の標的タンパク質を有するがん患者にのみ効果を示すので、このような標的タンパク質を有する患者を選別しなければ、治療効率が非常に低い。また、標的抗がん剤は、細胞死滅より細胞成長や増殖阻害に依存するので、長期間にわたって持続的な薬物投与による耐性発生の可能性が高い。したがって、抗がん剤の標的に対する分析を通じて薬物を投与する前に薬物に効果を示す患者群を選別することが必要である。

【0004】

免疫抗がん剤は、免疫体系の特異性（ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ）、記憶能力（ｍｅｍｏｒｙ）、適応力（ａｄａｐｔｉｖｅｎｅｓｓ）を増強させることによって、抗がん効果を示す。すなわち人体の免疫システムを利用して正確にがん細胞のみを攻撃して、副作用が少なく、免疫システムの記憶能力と適応力を利用するので、免疫抗がん剤に効果がある患者は、持続的な抗がん効果を奏することができる。しかしながら、免疫抗がん剤も、同様に、同じ種類のがんであるとしても、特定患者によって抗がん効果の程度が異なるので、免疫抗がん剤を通した患者の治療反応性をあらかじめ予測するためのコンパニオン診断が必要である。

【0005】

特定薬物治療に効果を示す患者群を選別するために、コンパニオン診断用バイオマーカーが用いられるが、ここで、コンパニオン診断用バイオマーカーとは、患者の特定薬物治療に対する反応性をあらかじめ予測するための指標であり、タンパク質、ＤＮＡ，ＲＮＡ、代謝物質などを含んでもよい。すなわち、特定疾患やがんの場合、正常または病的な状態を区分できたり、治療反応を予測でき、客観的に測定できる標識子を意味する。

【0006】

一方、製薬会社の新薬開発費用の削減と標的抗がん剤に対する需要の増加に伴い、コンパニオン診断の世界市場は、２０１３～２０１９年間に毎年１８％ずつ成長して、２０１９年にその規模が約５８億ドルに達すると推定されている。

【0007】

例えば、多国籍製薬会社の一つであるＲｏｃｈｅは、最初の乳がん標的抗がん剤である「Ｈｅｒｃｅｐｔｉｎ」とこれに対するコンパニオン診断キットである「Ｈｅｒｃｅｐｔｅｓｔ」を開発したＧｅｎｅｎｔｅｃｈを買収して、コンパニオン診断基盤の抗がん剤治療を始めることになった。

【0008】

コンパニオン診断キットは、ＤＡＫＯ、ＨｅｒｃｅｐＴｅｓｔのような免疫組織化学検査を通じて特定タンパク質の過発現を確認する方法、Ｖｅｎｔａｎａ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｙｓｔｅｍｓ、ＩＮＦＯＲＭ ＨＥＲ－２／ＮＥＵのような特定遺伝子の遺伝子増幅をＤＮＡ ｐｒｏｂｅを利用したＦＩＳＨまたはＣＩＳＨ検査を通じて確認する方法、そして、Ｒｏｃｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ、ｃｏｂａｓ ＥＧＦＲ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｔｅｓｔのようなｑ－ＰＣＲなど遺伝学的技法を利用してバイオマーカー遺伝子の突然変異の有無を検査して確認する方法などがある。

【0009】

一方、免疫抗がん剤には、受動免疫治療と能動免疫治療とに区分できるが、受動免疫治療には、免疫チェックポイント阻害剤（ｉｍｍｕｎｅ ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）、免疫細胞治療剤（ｉｍｍｕｎｅ ｃｅｌｌ ｔｈｅｒａｐｙ）、治療用抗体（ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ａｎｔｉｂｏｄｙ）などがある。免疫チェックポイント阻害剤は、Ｔ細胞阻害に関与する免疫チェックポイントタンパク質（ｉｍｍｕｎｅ ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ ｐｒｏｔｅｉｎ）の活性化を遮断してＴ細胞を活性化させてがん細胞を攻撃する薬剤であり、ＣＴＬＡ－４、ＰＤ－１、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤などがある。

【0010】

ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤は、２世代免疫抗がん剤であり、メルク社が開発したペムブロリズマブ（Ｐｅｍｂｒｏｌｉｚｕｍａｂ、キイトルーダ（ＫＥＹＴＲＵＤＡ登録商標））と小野薬品工業とＢＭＳ社が開発したニボルマブ（Ｎｉｖｏｌｕｍａｂ、オプジーボ（ＯＰＤＩＶＯ登録商標））が２０１４年に米ＦＤＡで承認され、ジェネンテック／ロシュ社が開発したＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤であるアテゾリズマブ（Ａｔｅｚｏｌｉｚｕｍａｂ、 テセントリク（Ｔｅｃｅｎｔｒｉｑ登録商標））が２０１６年に米ＦＤＡで承認された。

【0011】

ＰＤ－１を媒介とするリンパ球陰性調節（ＰＤ－１とＰＤ－Ｌ１およびＰＤ－Ｌ２リガンド間の相互作用）を遮断するヒト型抗ＰＤ－１モノクローナル抗体またはヒト型抗ＰＤ－Ｌ１モノクローナル抗体で免疫力を増強させて、がん細胞を異物として認識してこれを除去する作用機序を有している。

【0012】

ペムブロリズマブは、悪性黒色腫（Ｍａｌｉｇｎａｎｔ Ｍｅｌａｎｏｍａ）、非小細胞性肺がん（Ｎｏｎ－Ｓｍａｌｌ Ｃｅｌｌ Ｌｕｎｇ Ｃａｎｃｅｒ）、頭頸部扁平上皮細胞がん（Ｈｅａｄ Ａｎｄ Ｎｅｃｋ Ｓｑｕａｍｏｕｓ Ｃｅｌｌ Ｃａｎｃｅｒ）、古典的ホジキンリンパ腫（Ｈｏｄｇｋｉｎ Ｌｙｍｐｈｏｍａ）、尿路上皮がん（Ｕｒｏｔｈｅｌｉａｌ Ｃａｒｃｉｎｏｍａ）、ミスマッチ修復欠損（Ｄｅｆｉｃｉｅｎｔ Ｍｉｓｍａｔｃｈ Ｒｅｐａｉｒ，ｄＭＭＲ）または高頻度マイクロサテライト不安定性（Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ Ｉｎｓｔａｂｉｌｉｔｙ－Ｈｉｇｈ，ＭＳＩ－Ｈｉｇｈ）を示すすべての固形がん、そして、胃と胃食道接合部腺がん（Ａｄｅｎｏｃａｒｃｉｎｏｍａ）の治療においてＦＤＡ承認を受け、ニボルマブは、多様な進行性がんに対する臨床研究において臨床的な利得を示して、最近、黒色腫、非小細胞肺がん、腎臓がんなどにおいて薬剤として承認を受けて広く使用されている。

【0013】

また、ペムブロリズマブが特定患者に免疫抗がん剤として抗がん効果を効率的に示すか否かを判断するために使用されるコンパニオン診断検査法で胃と胃食道接合部腺がん組織を採取して分析する「ＰＤ－Ｌ１ ＩＨＣ ２２Ｃ３ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔ」がある。ＰＤ－Ｌ１ ＩＨＣ ２２Ｃ３ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔは、免疫組織化学染色（Ｉｍｍｕｎｏｈｉｓｔｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，ＩＨＣ）方法の一つであり、ＤＡＫＯ社のＰＤ－Ｌ１ ＩＨＣ ２２Ｃ３ ｐｈａｒｍＤｘ製品を使用して生検がん細胞のＰＤ－Ｌ１発現率を観察して、ペムブロリズマブの治療に適した患者群を選別するのに使用する検査法である。同様に、ニボルマブに関するコンパニオン診断検査法として「ＶＥＮＴＡＮＡ ＰＤ－Ｌ１（ＳＰ２６３）Ａｓｓａｙ検査」、「ＰＤ－Ｌ１ ＩＨＣ ２８－８ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔ」などがある。

【0014】

ただし、このような従来のコンパニオン診断検査は、患者の腫瘍の一部組織（４０５μｍ）を引き剥がして、ＰＤ－Ｌ１発現を測定するが、患者の組織サンプリングによってＰＤ－Ｌ１発現程度が異なり、分析結果を得るのに３週以上の時間がかかるだけでなく、免疫抗がん剤に効果を示す患者群を選別する正確性が多少落ちるという問題点が存在する。

【0015】

これによって、本発明者らは、このようなコンパニオン診断検査の技術的限界を克服するために、組織における測定だけでなく、血液上のプロテオーム解析を通じてＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応予測のためのコンパニオン診断バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断キットを開発した。

【発明の概要】

【発明が解決しようとする課題】

【0016】

上述したような問題点を解決するために、本発明は、がん患者の組織を通したコンパニオン診断だけでなく、がん患者の血液内プロテオーム解析を通じてＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応予測のためのコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットを提供することを目的とする。

【0017】

また、本発明は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群とその効果を示さない非反応患者群を選別する正確度が高いＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応予測のためのコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットを提供することを他の目的とする。

【0018】

また、本発明は、より正確にＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に適した患者群を判別できるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットを提供することをさらに他の目的とする。

【課題を解決するための手段】

【0019】

上記のような目的を達成するために、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）を含み、がん細胞に対するＰＤ－１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｅａｔｈ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ－Ｌｉｇａｎｄ １）免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測することを特徴とする。

【0020】

ここで、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＨＲＧ（Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ－Ｒｉｃｈ Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、ＡＺＧＰ１（Ｚｉｎｃ－Ａｌｐｈａ－２－Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、補体Ｃ５（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ５）、ＩＨＫＶ４－１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｋａｐｐａ Ｖａｒｉａｂｌｅ ４－１）、ＭＡＮ１Ａ（Ｍａｎｎｏｓｙｌ－Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ １，２－Ａｌｐｈａ－Ｍａｎｎｏｓｉｄａｓｅ １Ａ）、Ａ２Ｍ（Ａｌｐｈａ－２－Ｍａｃｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ）、ＳＰＰ１（Ｏｓｔｅｏｐｏｎｔｉｎ）およびＨＹＯＵ１（Ｈｙｐｏｘｉａ Ｕｐ－Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーをさらに含んでもよい。

【0021】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量は、定量分析を通じて測定できる。

【0022】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量は、タンパク質質量分析、タンパク質チップ分析、免疫測定法、リガンドバインディングアッセイ、ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ（Ｍａｔｒｉｘ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）分析、ＳＥＬＤＩ－ＴＯＦ（Ｓｕｌｆａｃｅ Ｅｎｈａｎｃｅｄ Ｌａｓｅｒ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）分析、放射線免疫分析、放射免疫拡散法、オクタロニー免疫拡散法、ロケット免疫電気泳動、組織免疫染色、補体固定分析法、２次元電気泳動分析、液体クロマトグラフィー－質量分析（Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，ＬＣ－ＭＳ）、ＬＣ－ＭＳ／ＭＳ（Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ／ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）、ウェスタンブロットおよびＥＬＩＳＡ（Ｅｎｚｙｍｅ Ｌｉｎｋｅｄ Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔａｓｓａｙ）からなる群から選択されるいずれか一つの方法で測定できる。

【0023】

ここで、前記補体Ｃ７は、前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比して前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の量が減少することができる。

【0024】

ここで、前記補体Ｃ７は、前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比して前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の量が増加することができる。

【0025】

ここで、前記補体Ｃ７は、前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比して前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の量が減少することができる。

【0026】

ここで、前記補体Ｃ７は、前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比して前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の量が増加することができる。

【0027】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量に対するカットオフ値は、１００～１１０μｇ／ｍＬの範囲内でありうる。

【0028】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いものでありうる。

【0029】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いものでありうる。

【0030】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いものでありうる。

【0031】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いものでありうる。

【0032】

ここで、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、血液、血清、血漿および組織からなる群から選択されるいずれか一つから抽出されたものでありうる。

【0033】

ここで、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、血液から抽出されたものでありうる。

【0034】

ここで、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、組織から抽出されたものでありうる。

【0035】

ここで、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ－Ｌｉｇａｎｄ １）タンパク質をさらに含んでもよい。

【0036】

ここで、前記がん細胞は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤に特異的に反応するがん腫に該当するがん細胞でありうる。

【0037】

ここで、前記がん細胞は、肺がん、肝がん、胃がん、胃と胃食道接合部腺がん、皮膚黒色腫、頭頸部がん、骨がん、すい臓がん、皮膚がん、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、大腸がん、結腸がん、乳がん、子宮肉腫、ラッパ管がん腫、子宮内膜がん腫、子宮頸部がん腫、膣がん腫、外陰部がん腫、食道がん、喉頭がん、小腸がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、軟組織の肉腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性または急性白血病、幼年期の固形腫瘍、分化リンパ腫、膀胱がん、腎臓がん、腎細胞がん腫、腎臓骨盤がん腫、原発性中枢神経系リンパ腫、脊髄腫瘍、脳幹部神経膠腫および脳下垂体腺腫からなる群から選択されるいずれか一つのがん腫に該当するがん細胞でありうる。

【0038】

ここで、前記がん細胞は、肺がんまたは肝がんに該当するがん細胞でありうる。

【0039】

ここで、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤と同時にまたは順次に併用投与されるものでありうる。

【0040】

一方、本発明によるコンパニオン診断用キットは、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を含んでもよい。

【発明の効果】

【0041】

上述したような本発明のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットは、がん患者の組織を通したコンパニオン診断だけでなく、がん患者の血液内プロテオーム解析を通じてＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応を予測できる効果がある。

【0042】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と効果を示さない非反応患者群とを選別する正確度が高いという長所がある。

【0043】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットは、より正確にＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に適合した患者群を判別できる効果がある。

【図面の簡単な説明】

【0044】

図１ａ～図１ｉは、順に補体Ｃ７、ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＧＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２Ｍ、ＳＰＰ１およびＨＹＯＵ１のコンパニオン診断用バイオマーカー９種に対して、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測したコンパニオン診断結果をグラフで示す図である。
図２ａは、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通した肺がん患者１０人に対するコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。
図２ｂは、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通した肺がん患者１１人に対するコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。
図２ｃは、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通した肺がん患者全体２１人に対するコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。
図３は、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物においてバイオマーカーＩＧＫＶ４－１をさらに含む場合のコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。

【発明を実施するための最良の形態】

【0045】

本発明のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）を含み、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測することを特徴とする。

【発明を実施するための形態】

【0046】

本出願において使用する用語は、単に特定の例示を説明するために使用されるものである。これによって、例えば、単数の表現は、文脈上明白に単数でなければならない限り、複数の表現を含む。なお、本出願において使用される「含む」または「具備する」などの用語は、明細書上に記載された特徴、段階、機能、構成要素またはこれらを組み合わせたものが存在することを明確に指すために使用されるものであり、他の特徴や段階、機能、構成要素またはこれらを組み合わせたものの存在を予備的に排除するために使用されるものではないことに留意しなければならない。

【0047】

一方、特に別途に定義しない限り、本明細書において使用されるすべての用語は、本発明の属する技術分野における通常の知識を有する者によって一般的に理解されるものと同じ意味を有するものと見なすべきである。したがって、本明細書において明確に定義しない限り、特定用語が過度に理想的または形式的な意味と解すべきものではない。

【0048】

本明細書において「コンパニオン診断（Ｃｏｍｐａｎｉｏｎ Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ）」とは、患者の特定薬物治療に対する反応性をあらかじめ予測するための診断技法を意味する。

【0049】

本明細書において「コンパニオン診断用バイオマーカー」とは、患者の特定薬物治療に対する反応性をあらかじめ予測するための指標であり、タンパク質、ＤＮＡ、ＲＮＡ、代謝物質などを含んでもよい。すなわち、特定疾患やがんの場合、正常または病的な状態を区分できたり、治療反応を予測でき、客観的に測定できる標識子を意味する。

【0050】

本明細書において「免疫チェックポイント阻害剤」とは、免疫関門阻害剤（Ｉｍｍｕｎｅ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）と同義語であり、Ｔ細胞阻害に関与する免疫チェックポイントタンパク質（Ｉｍｍｕｎｅ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｐｒｏｔｅｉｎ）の活性化を遮断してＴ細胞を活性化させてがん細胞を攻撃する薬剤であり、本明細書上では、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤について開示し、前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤または、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤は、ペムブロリズマブ、ニボルマブまたはアテゾリズマブでありうるが、これらに限定されるものではない。

【0051】

＜コンパニオン診断用バイオマーカー組成物＞
本発明者は、上で述べた課題を解決するために研究した結果、下記のような発明を考案するに至った。本明細書は、補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）を含み、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測することを特徴とする、コンパニオン診断用バイオマーカー組成物を開示する。

【0052】

体内免疫機能は、抗原認知と同時に、このような同時刺激（Ｃｏ－Ｓｔｉｍｕｌａｔｏｒｙ）シグナルおよび同時阻害（Ｃｏ－Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒｙ）シグナルの調節を通じて全体的なＴ細胞機能を調節する。したがって、免疫細胞は、がん細胞で起こる突然変異などの変化によって発現する腫瘍特異抗原を感知し、がん細胞を除去する。しかしながら、がん細胞は、免疫攻撃を回避するために、腫瘍微小環境を変化させて免疫機能を阻害したり、Ｔ細胞免疫寛容（Ｉｍｍｕｎｅｔｏｌｅｒａｎｃｅ）または免疫編集（Ｉｍｍｕｎｏ－Ｅｄｉｔｉｎｇ）などを通じて免疫回避（Ｉｍｍｕｎｅ Ｅｓｃａｐｅ）をしようとする。このような回避戦略の一つとして免疫チェックポイントの機能を変化させてＴ細胞の機能を阻害するが、すなわち免疫関門は、がん細胞の破壊を妨害するタンパク質であり、がんは、阻害免疫チェックポイントを活性化させてＴ細胞の攻撃を回避する。

【0053】

このようなＴ細胞の免疫反応は、加速機（Ａｃｃｅｌｅｒａｔｏｒ）の役割をする同時刺激受容体、制動機の役割をする同時阻害受容体、およびそれぞれの受容体と結合するリガンド（Ｌｉｇａｎｄ）の相互作用が視空間的に非常に精巧に作動する。一方、Ｔ細胞のＰＤ－１は、がん細胞のＰＤ－Ｌ１／ＰＤ－Ｌ２を通じて末梢組織でＴ細胞機能を調節する。すなわち、がん細胞のＰＤ－Ｌ１とＴ細胞のＰＤ－１が結合すると、Ｔ細胞が機能を喪失し、死滅することになる。免疫チェックポイント阻害剤は、サイトカイン治療剤、抗がんワクチンなどのような従来の免疫治療剤とは異なって、がん細胞とＴ細胞の結合部位に結合して免疫回避シグナルを遮断することによって、免疫学的シナプスが形成されず、これによって、免疫回避の妨害を受けないＴ細胞ががん細胞を破壊する機序を有している。すなわち、ＰＤ－１抗体またはＰＤ－Ｌ１抗体がＰＤ－Ｌ１とＰＤ－１の結合部位の間にあらかじめ結合すると、免疫回避シグナルが遮断され、免疫回避シグナルを受けなかったＴ細胞は、がん細胞を死滅する。

【0054】

本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）を含み、前記Ｃ７は、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断用バイオマーカーとして用いられ得る。

【0055】

本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれた補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）は、バイオマーカーとして人体の抗原－抗体免疫反応を調節する役割をし、細胞膜傷害複合体（Ｍｅｍｂｒａｎｅ Ａｔｔａｃｋ Ｃｏｍｐｌｅｘ，ＭＡＣ）を形成して病原体を溶解させる。遺伝子オントロジー（Ｇｅｎｅ ｏｎｔｏｌｏｇｙ）分類によれば、免疫反応および溶解に関与するタンパク質であり、該遺伝子情報は、ＧｅｎｅＢａｎｋ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．，Ｕｎｉｐｒｏｔなどから探すことができる。しかしながら、前記補体Ｃ７のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）の反応性予測に関する直接的な関連性はどこにも開示されていない。

【0056】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、前記補体Ｃ７のタンパク質量を測定する製剤をさらに含んでもよい。

【0057】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＨＲＧ（Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ－Ｒｉｃｈ Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、ＡＺＧＰ１（Ｚｉｎｃ－Ａｌｐｈａ－２－Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、補体Ｃ５（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ５）、ＩＨＫＶ４－１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｋａｐｐａ Ｖａｒｉａｂｌｅ ４－１）、ＭＡＮ１Ａ（Ｍａｎｎｏｓｙｌ－Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ １，２－Ａｌｐｈａ－Ｍａｎｎｏｓｉｄａｓｅ １Ａ）、Ａ２Ｍ（Ａｌｐｈａ－２－Ｍａｃｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ）、ＳＰＰ１（Ｏｓｔｅｏｐｏｎｔｉｎ）およびＨＹＯＵ１（Ｈｙｐｏｘｉａ Ｕｐ－Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーをさらに含んでもよい。

【0058】

本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれたＨＲＧ（Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ－Ｒｉｃｈ Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、ＡＺＧＰ１（Ｚｉｎｃ－Ａｌｐｈａ－２－Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、補体Ｃ５（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ５）、ＩＨＫＶ４－１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｋａｐｐａ Ｖａｒｉａｂｌｅ ４－１）、ＭＡＮ１Ａ（Ｍａｎｎｏｓｙｌ－Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ １，２－Ａｌｐｈａ－Ｍａｎｎｏｓｉｄａｓｅ １Ａ）、Ａ２Ｍ（Ａｌｐｈａ－２－Ｍａｃｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ）、ＳＰＰ１（Ｏｓｔｅｏｐｏｎｔｉｎ）およびＨＹＯＵ１（Ｈｙｐｏｘｉａ Ｕｐ－Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）は、バイオマーカーとして人体の抗原－抗体免疫反応を調節する役割をし、遺伝子オントロジー（Ｇｅｎｅ ｏｎｔｏｌｏｇｙ）分類によれば、免疫反応および溶解に関与するタンパク質であり、該遺伝子情報は、ＧｅｎｅＢａｎｋ Ａｃｃｅｓｓｉｏｎ Ｎｏ．，Ｕｎｉｐｒｏｔなどから探すことができる。しかしながら、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１，ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性予測に関する直接的な関連性は、どこにも開示されていない。

【0059】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量を測定する製剤をさらに含んでもよい。

【0060】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記補体Ｃ７のタンパク質量は、定量分析を通じて測定できる。また、前記補体Ｃ７のタンパク質量は、プロテオーム解析法を通じて定性分析、定量分析または定性分析と定量分析を共に行うこともできる。

【0061】

同様に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量は、定量分析を通じて測定できる。また、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量は、プロテオーム解析法を通じて定性分析、定量分析および定性分析と定量分析を共に行うこともできる。

【0062】

本明細書において「タンパク質量」とは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤に特異的に反応するがん腫に該当するがん患者にＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を処理して、前記がん患者の血液内タンパク質の存在の有無と測定程度を確認する過程を意味する。前記タンパク質またはペプチド断片に特異的に結合する抗体、相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子（Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ）またはアプタマー（Ａｐｔａｍｅｒ）を利用してタンパク質の量を確認できるだけでなく、当該タンパク質またはペプチド断片に特異的な親和力（Ａｆｆｉｎｉｔｙ）を有するすべての検出手段を含んでもよい。より好ましくは、抗体、相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子（Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ）またはアプタマー（Ａｐｔａｍｅｒ）を利用せずにタンパク質量自体を測定できる。

【0063】

本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において、前記タンパク質量測定または比較分析方法としては、タンパク質質量分析、タンパク質チップ分析、免疫測定法、リガンドバインディングアッセイ、ＭＡＬＤＩ－ＴＯＦ（Ｍａｔｒｉｘ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）分析、ＳＥＬＤＩ－ＴＯＦ（Ｓｕｌｆａｃｅ Ｅｎｈａｎｃｅｄ Ｌａｓｅｒ Ｄｅｓｏｒｐｔｉｏｎ／Ｉｏｎｉｚａｔｉｏｎ Ｔｉｍｅ ｏｆ Ｆｌｉｇｈｔ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）分析、放射線免疫分析、放射免疫拡散法、オクタロニー免疫拡散法、ロケット免疫電気泳動、組織免疫染色、補体固定分析法、２次元電気泳動分析、液体クロマトグラフィー－質量分析（Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ，ＬＣ－ＭＳ）、ＬＣ－ＭＳ／ＭＳ（Ｌｉｑｕｉｄ Ｃｈｒｏｍａｔｏｇｒａｐｈｙ－Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ／ Ｍａｓｓ Ｓｐｅｃｔｒｏｍｅｔｒｙ）、ウェスタンブロットおよびＥＬＩＳＡ（Ｅｎｚｙｍｅ Ｌｉｎｋｅｄ Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔａｓｓａｙ）からなる群から選択されるいずれか一つの方法で測定または比較分析することが好ましいが、これらに限定されるものではない。

【0064】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記補体Ｃ７のタンパク質量を測定する製剤は、前記補体Ｃ７のタンパク質に特異的に結合する抗体、相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子およびアプタマーからなる群から選択されるいずれか一つ以上を含んでもよい。前記抗体は、抗原性部位に対して標識される特異的なタンパク質分子を意味するが、本発明の目的上、前記抗体は、前記補体Ｃ７のタンパク質に対して特異的に結合する抗体を言い、ポリクローナル抗体、モノクローナル抗体および組換え抗体を全部含む。前記抗体を生成することは、当業界において広く公知となった技術を利用して容易に製造することができる。また、前記抗体は、２個の全長の軽鎖および２個の全長の重鎖を有する完全な形態だけでなく、前記抗体分子の機能的な断片を含む。前記抗体分子の機能的な断片とは、少なくとも抗原結合機能を保有している断片を意味し、Ｆａｂ，Ｆ（ａｂ’）、Ｆ（ａｂ’）２およびＦｖなどがある。

【0065】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量を測定する製剤は、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質に特異的に結合する抗体、相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子およびアプタマーからなる群から選択されるいずれか一つ以上を含んでもよい。

【0066】

本明細書において「アプタマー（Ａｐｔａｍｅｒ）」とは、単一、二重らせんのＤＮＡ、ＲＮＡ形態で特定ターゲットタンパク質との３次元結合を通じてタンパク質の相互作用を阻害する生高分子物質であり、多様な標的分子に結合する特徴を有する。通常、アプタマーは、規定された２次および３次構造、例えばステム－ループ構造に折りたたまれる１５～５０塩基長さの小さい核酸でありうる。アプタマーは、１０^－６、１０^－８、１０^－１０、または１０^－１２より少ないｋｄで標的高発現タンパク質または低発現タンパク質と結合することが好ましい。前記アプタマーは、非常に高度な特異性を有する高発現タンパク質または低発現タンパク質と結合することができ、前記アプタマーは、多数のリボヌクレオチド単位、デオキシリボヌクレオチド単位、または２つの類型のヌクレオチド残基の混合物からなり得る。また、前記アプタマーは、一つ以上の変形された塩基、糖またはホスフェート主鎖単位をさらに含んでもよい。

【0067】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれた補体Ｃ７は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の量が減少することを特徴とする。

【0068】

反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれた補体Ｃ７は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の量が増加することを特徴とする。

【0069】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれた補体Ｃ７は、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の量が減少することを特徴とする。

【0070】

反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれた補体Ｃ７は、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の量が増加することを特徴とする。

【0071】

本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において、前記補体Ｃ７のタンパク質量に対するカットオフ値は、９０～１２０μｇ／ｍＬの範囲内であることが好ましく、より具体的に、１００～１１０μｇ／ｍＬの範囲内であることがより好ましいが、これらに限定されるものではない。前記カットオフ値は、測定するがん患者の数によってコンパニオン診断検査を行う実行者が任意に設定することができる。前記補体Ｃ７のタンパク質量に対するカットオフ値は、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を判断する基準になる値であり、より具体的に、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と効果を示さない非反応患者群とに分類する基準となる値を意味する。

【0072】

ここで、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いものでありうる。すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断を実施した結果、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いことを意味する。この場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群に分類することができる。

【0073】

反対に、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いものでありうる。すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断を実施した結果、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性は高いことを意味する。この場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群に分類することができる。

【0074】

前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いものでありうる。すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん細胞に対するＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断を実施した結果、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いことを意味する。この場合、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群に分類することができる。

【0075】

反対に、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いものでありうる。すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん細胞に対するＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断を実施した結果、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いことを意味する。この場合、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群に分類することができる。これと関連して具体的な内容は、下記｛実施例および評価｝で詳細に説明する。

【0076】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれたＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の量が減少することを特徴とする。

【0077】

反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれたＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の量が増加することを特徴とする。

【0078】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量に対するカットオフ値は、５０～１５０ ｕｇ／ｍＬの範囲内であることが好ましいが、これに限定されるものではない。前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量に対するカットオフ値は、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を判断する基準となる値であり、より具体的に、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と効果を示さない非反応患者群とに分類する基準となる値を意味する。

【0079】

ここで、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いものでありうる。すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断を実施した結果、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が低いことを意味する。この場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群に分類することができる。

【0080】

反対に、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いものでありうる。すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断を実施した結果、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーのタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記がん細胞に対する前記ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が高いことを意味する。この場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤および／またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群に分類することができる。

【0081】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、血液、血清、血漿および組織からなる群から選択されるいずれか一つから抽出されることを特徴とする。また、本発明の一効果として、本発明は、従来の組織を通したコンパニオン診断だけでなく、血液内プロテオーム解析を通じてＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測できるという点が、本発明の一特徴といえる。

【0082】

すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、血液から抽出されたことが好ましいが、これに限定されるものではない。より具体的に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、がん患者の血液を対象にプロテオーム解析を通じてコンパニオン診断を行うことによって、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応を予測できる効果がある。

【0083】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、上述したように、組織から抽出されたものでありうるが、この場合、前記補体Ｃ７のタンパク質発現レベルは、定量分析を通じて測定できる。一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記補体Ｃ７は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の発現レベルが減少することを特徴とする。

【0084】

反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記補体Ｃ７は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の発現レベルが増加することを特徴とする。

【0085】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記補体Ｃ７は、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の発現レベルが減少することを特徴とする。
反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記補体Ｃ７は、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の発現レベルが増加することを特徴とする。

【0086】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の発現レベルが減少することを特徴とする。

【0087】

反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の発現レベルが増加することを特徴とする。

【0088】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーは、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群と対比してＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群においてタンパク質の発現レベルが減少することを特徴とする。

【0089】

反対に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーは、ＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と対比してＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群においてタンパク質の発現レベルが増加することを特徴とする。

【0090】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を組織から抽出する場合、前記コンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ－Ｌｉｇａｎｄ １）タンパク質をさらに含んでもよい。これによって、前記ＰＤ－Ｌ１タンパク質の発現レベルの測定と共に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてがん患者のＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応を予測することができる。
一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記がん細胞は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤に特異的に反応するがん腫に該当するがん細胞であることを特徴とする。すなわち、本発明は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通じて抗がん治療が可能な対象がん腫であれば、いずれでも関係なくコンパニオン診断を行うことができる。

【0091】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記がん細胞は、肺がん、肝がん、胃がん、胃と胃食道接合部腺がん、皮膚黒色腫、頭頸部がん、骨がん、すい臓がん、皮膚がん、子宮がん、卵巣がん、直腸がん、大腸がん、結腸がん、乳がん、子宮肉腫、ラッパ管がん腫、子宮内膜がん腫、子宮頸部がん腫、膣がん腫、外陰部がん腫、食道がん、喉頭がん、小腸がん、甲状腺がん、副甲状腺がん、軟組織の肉腫、尿道がん、陰茎がん、前立腺がん、慢性または急性白血病、幼年期の固形腫瘍、分化リンパ腫、膀胱がん、腎臓がん、腎細胞がん腫、腎臓骨盤がん腫、原発性中枢神経系リンパ腫、脊髄腫瘍、脳幹部神経膠腫および脳下垂体腺腫からなる群から選択されるいずれか一つのがん腫に該当するがん細胞であることを特徴とする。

【0092】

より具体的に、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において前記がん細胞は、肺がんまたは肝がんに該当するがん細胞であることが好ましいが、これに限定されるものではない。

【0093】

一方、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤と同時にまたは順次に併用投与されることを特徴とする。

【0094】

＜コンパニオン診断用キット＞
一方、本明細書は、補体Ｃ７（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ７）を含み、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤（ＰＤ－Ｌ１ Ｃｈｅｃｋｐｏｉｎｔ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ）のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測することを特徴とするコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を含む、コンパニオン診断用キットをさらに開示する。本発明によるコンパニオン診断用キットにおいて、コンパニオン診断用バイオマーカー組成物に関する事項は、上述した＜コンパニオン診断用バイオマーカー組成物＞を準用する。
本発明によるコンパニオン診断用キットは、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を含んでもよい。

【0095】

本発明によるコンパニオン診断用キットは、ＥＬＩＳＡ（Ｅｎｚｙｍｅ Ｌｉｎｋｅｄ Ｉｍｍｕｎｏｓｏｒｂｅｎｔａｓｓａｙ）キット、タンパク質チップキット、ラピッド（Ｒａｐｉｄ）キットおよびＭＲＭ（Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｒｅａｃｔｉｏｎ Ｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇ）キットからなる群から選択されるいずれか一つのキットであることが好ましいが、これらに限定されるものではない。この際、ＥＬＩＳＡキット、タンパク質チップキット、ラピッド（Ｒａｐｉｄ）キットおよびＭＲＭ（Ｍｕｌｔｉｐｌｅ Ｒｅａｃｔｉｏｎ Ｍｏｎｉｔｏｒｉｎｇ）キットからなる群から選択されるいずれか一つのキットは、公知の方法によって行われるキットでありうる。

【0096】

また、本発明によるコンパニオン診断用キットは、分析方法に適した一種類またはそれ以上の他の構成成分組成物、溶液または装置をさらに含んでもよい。

【0097】

本発明によるコンパニオン診断用キットは、ＥＬＩＳＡを行うために必要な必須要素を含むことを特徴とする診断キットでありうる。前記ＥＬＩＳＡキットは、前記タンパク質またはペプチド断片に特異的に結合する抗体、相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子（Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ）またはアプタマー（Ａｐｔａｍｅｒ）を含んでもよい。前記抗体は、各補体のタンパク質に対する特異性および親和性が高く、他のタンパク質に対する交差反応性が殆どない抗体であり、モノクローナル抗体、ポリクローナル抗体または組換え抗体でありうる。また、ＥＬＩＳＡキットは、前記タンパク質またはペプチド断片に特異的に結合する相互作用タンパク質、リガンド、ナノ粒子（Ｎａｎｏｐａｒｔｉｃｌｅｓ）、アプタマー（Ａｐｔａｍｅｒ）または対照群タンパク質に特異的な抗体を含んでもよい。その他、前記ＥＬＩＳＡキットは、結合した抗体を検出できる試薬、例えば、標識された２次抗体、発色団（Ｃｈｒｏｍｏｐｈｏｒｅｓ）、酵素（例：抗体とコンジュゲート（Ｃｏｎｊｕｇａｔｅ）なる酵素）およびその基質または前記抗体と結合できる他の物質などを含んでもよい。

【0098】

以下、添付の図面および実施例を参照して本明細書が請求するところについてより詳しく説明する。ただし、本明細書において提示している図面～実施例などは、通常の技術者によって多様な方式で変形されて色々な形態を有することができるところ、本明細書の記載事項は、本発明を特定の開示形態に限定されるものではなく、本発明の思想および技術範囲に含まれるすべての均等物ないし代替物を含んでいるみのと見なすべきである。また、添付の図面は、本発明を通常の技術者に、より正確に理解できるように助けるために提示されるものであり、実際より誇張されたり縮小されて図示されることができる。

【0099】

｛実施例および評価｝
実施例１．補体Ｃ７を含むコンパニオン診断用バイオマーカー９種の選定
データマイニング（Ｄａｔａ Ｍｉｎｉｎｇ）を通じて本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物に含まれるバイオマーカー候補９種を選別し、前記選別されたバイオマーカー候補９種に対する有効性検証（Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ Ｓｔａｇｅ）を行った。

【0100】

すでに肺がん患者のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が判別された血液サンプル１０種（以下、「Ｔｒａｉｎｉｎｇ Ｓｅｔ」という）を準備した。ここで、前記血液サンプル１０種は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群（Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ）の血液サンプル８種とＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）の血液サンプル２種であった。また、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群（Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ）の血液サンプル８種は、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）の血液サンプル５種と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）の血液サンプル３種とに分類した。

【0101】

すでに肺がん患者のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が判別された血液サンプル１０種に関する具体的な情報は、下記表１の通りである。ただし、下記表１で、ＰＤは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群を意味し、ＰＲは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群を意味し、ＳＤは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群を意味する。また、下記表１で、Ｍは、男性（Ｍａｌｅ）を示し、Ｆは、女性（Ｆｅｍａｌｅ）を示す。

【0102】

【表1】

【0103】

すでに肺がん患者のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が判別された血液サンプル１０種に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するために、前記血液サンプル１０種から血漿をそれぞれ抽出した後、前処理過程を経て、ＴＭＴ１０同重化合物（ＴＭＴ１０ Ｉｓｏｂａｒｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ）を利用して前記血漿１０種に対してタンパク質分析（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ）を行って、前記選別されたバイオマーカー候補９種に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。ただし、ここで、前記タンパク質分析は、定量分析を通じて前記バイオマーカー候補９種に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。

【0104】

この際、前記バイオマーカー候補９種別に測定されるタンパク質量のカットオフ値をそれぞれ１００μｇ／ｍＬに設定して、前記バイオマーカー候補９種のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記バイオマーカー候補９種のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記バイオマーカー候補９種のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実施例１」という）した。

【0105】

評価１．補体Ｃ７を含むコンパニオン診断用バイオマーカー組成物の有効性評価
図１ａ～図１ｉは、順に補体Ｃ７、ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＧＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２Ｍ、ＳＰＰ１およびＨＹＯＵ１のコンパニオン診断用バイオマーカー９種に対して、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測したコンパニオン診断結果をグラフで示す図である。

【0106】

より具体的に、図１ａは、バイオマーカーＣ７、図１ｂは、バイオマーカーＨＲＧ、図１ｃは、バイオマーカーＡＺＧＰ１、図１ｄは、バイオマーカーＣ５、図１ｅは、バイオマーカーＩＧＫＶ４－１、図１ｆは、バイオマーカーＭＡＮ１Ａ、図１ｇは、バイオマーカーＡ２Ｍ、図１ｈは、バイオマーカーＳＰＰ１、図１ｉは、バイオマーカーＨＹＯＵ１に対してがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測したコンパニオン診断結果をグラフで示す図である。

【0107】

図１を参照すると、血液サンプル１０種に対するタンパク質分析結果、数日が経過しても、バイオマーカーのタンパク質の測定量が一定であり、前記バイオマーカーのタンパク質量がカットオフ値以上の場合および前記バイオマーカーのタンパク質量がカットオフ値未満の場合に、一定の傾向性を示すバイオマーカーＣ７のコンパニオン診断結果が最も優れていることを確認できる。これによって、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物としてバイオマーカーＣ７を特定し、残りのバイオマーカーであるＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１は、Ｃ７と共に組み合わせて併用する場合に、本発明によるバイオマーカー組成物として優れたコンパニオン診断結果を示すものと推定することができる。

【0108】

実施例２．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通したコンパニオン診断検査
前記実施例１の結果によって肺がん患者の血液サンプル１１種（以下、「 Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ Ｓｅｔ」という）を準備して、前記血液サンプル１１種から血漿をそれぞれ抽出した後、前処理過程を経て、ＴＭＴ１０同重化合物（ＴＭＴ１０ Ｉｓｏｂａｒｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ）を利用して前記血漿１１種に対してタンパク質分析（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ）を行って、前記補体Ｃ７に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。ただし、ここで、前記タンパク質分析は、定量分析を通じて前記補体Ｃ７に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。

【0109】

肺がん患者の血液サンプル１１種に対する具体的な情報は、下記表２の通りである。ただし、下記表２で、ＰＤは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群を意味し、ＰＲは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群を意味し、ＳＤは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群を意味する。また、下記表２で、Ｍは、男性（Ｍａｌｅ）を示し、Ｆは、女性（Ｆｅｍａｌｅ）を示す。

【0110】

【表2】

【0111】

この際、前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１００μｇ／ｍＬに設定し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤通じた抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実施例２」という）した。

【0112】

評価２．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通したコンパニオン診断検査結果分析および評価
図２ａは、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通した肺がん患者１０人に対するコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。図２ｂは、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通した肺がん患者１１人に対するコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。図２ｃは、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通した肺がん患者合計２１人に対するコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。

【0113】

より具体的に、図２ａは、前記実施例１のトレーニングセット（Ｔｒａｉｎｉｎｇ Ｓｅｔ）においてバイオマーカーＣ７を通したコンパニオン診断検査結果を示す図であり、図２ｂは、前記実施例２のバリデーションセット（Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ Ｓｅｔ）において補体Ｃ７を通したコンパニオン診断検査結果を示す図であり、図２ｃは、前記実施例１のＴｒａｉｎｉｎｇ ＳｅｔにおいてバイオマーカーＣ７を通したコンパニオン診断検査結果と前記実施例２のＶａｌｉｄａｔｉｏｎ Ｓｅｔにおいて補体Ｃ７を通したコンパニオン診断検査結果を合わせた最終結果を示す図である。

【0114】

図２を参照すると、前記実施例２の肺がん患者の血液サンプル１１種に対しても本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通したコンパニオン診断検査結果、前記補体Ｃ７のタンパク質量によりカットオフ値を基準としてＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）およびＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）に正確に分類できることを確認できる。

【0115】

すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、補体Ｃ７を含むことによって、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断に優れた効果があるといえる。

【0116】

実施例３．バイオマーカーＩＧＫＶ４－１をさらに含む本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通したコンパニオン診断検査
実施例１のすでに肺がん患者のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が判別された血液サンプル１０種（以下、「Ｔｒａｉｎｉｎｇ Ｓｅｔ」という）を準備した。前記血液サンプル１０種に対する情報は、実施例１において上述した通りである。すでに肺がん患者のがん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性が判別された血液サンプル１０種に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するために、前記血液サンプル１０種から血漿をそれぞれ抽出した後、前処理過程を経て、ＴＭＴ１０同重化合物（ＴＭＴ１０ Ｉｓｏｂａｒｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ）を利用して前記血漿１０種に対してタンパク質分析（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ）を行って、バイオマーカーである補体Ｃ７とＩＧＫＶ４－１（Ｉｍｍｕｎｏｇｌｏｂｕｌｉｎ Ｋａｐｐａ Ｖａｒｉａｂｌｅ ４－１）のタンパク質量をそれぞれ測定した。ただし、ここで、前記タンパク質分析は、定量分析を通じて前記バイオマーカー補体Ｃ７とＩＧＫＶ４－１に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。

【0117】

この際、それぞれの血漿１０種で測定された補体Ｃ７のタンパク質量を測定されたＩＧＫＶ４－１のタンパク質量で割って、相対的な比率をそれぞれ求めた。前記相対的な比率によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）およびＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）に分類（以下、「実施例３」という）した。

【0118】

評価３．バイオマーカーＩＧＫＶ４－１をさらに含む本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通したコンパニオン診断検査分析および評価
図３は、本発明の一実施例によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物においてバイオマーカーＩＧＫＶ４－１をさらに含む場合のコンパニオン診断検査結果をグラフで示す図である。

【0119】

図３を参照すると、前記実施例３の肺がん患者の血液サンプル１０種に対しても本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通したコンパニオン診断検査結果、前記補体Ｃ７のタンパク質量をＩＧＫＶ４－１のタンパク質量で割って、相対的な比率によって一定の基準値によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）およびＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）に正確に分類できることを確認できる。すなわち、実施例３による結果は、実施例１の前記表１に記載された血液サンプル１０種に対する情報と一致するものである。

【0120】

すなわち、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物は、補体Ｃ７を含むことによって、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断に優れた効果があるだけでなく、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物にバイオマーカーＩＧＫＶ４－１をさらに含む場合にも、がん細胞に対するＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤またはＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤の反応性を予測するコンパニオン診断にさらに優れた効果があることを確認できる。

【0121】

このような結果は、前記補体Ｃ７にバイオマーカーＩＧＫＶ４－１をさらに含む場合だけでなく、前記補体Ｃ７にＨＲＧ（Ｈｉｓｔｉｄｉｎｅ－Ｒｉｃｈ Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、ＡＺＧＰ１（Ｚｉｎｃ－Ａｌｐｈａ－２－Ｇｌｙｃｏｐｒｏｔｅｉｎ）、補体Ｃ５（Ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔ Ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ Ｃ５）、ＭＡＮ１Ａ（Ｍａｎｎｏｓｙｌ－Ｏｌｉｇｏｓａｃｃｈａｒｉｄｅ １，２－Ａｌｐｈａ－Ｍａｎｎｏｓｉｄａｓｅ １Ａ）、Ａ２Ｍ（Ａｌｐｈａ－２－Ｍａｃｒｏｇｌｏｂｕｌｉｎ）、ＳＰＰ１（Ｏｓｔｅｏｐｏｎｔｉｎ）およびＨＹＯＵ１（Ｈｙｐｏｘｉａ Ｕｐ－Ｒｅｇｕｌａｔｅｄ Ｐｒｏｔｅｉｎ １）からなる群から選択されるいずれか一つ以上のバイオマーカーをさらに含む場合にも、前記実施例３のような優れたコンパニオン診断結果を示すものと推定することができる。これは、ＨＲＧ、ＡＺＧＰ１、補体Ｃ５、ＩＨＫＶ４－１、ＭＡＮ１Ａ、Ａ２ＭおよびＨＹＯＵ１は、バイオマーカーとして人体の抗原－抗体免疫反応を調節する役割をし、遺伝子オントロジー（Ｇｅｎｅ ｏｎｔｏｌｏｇｙ）分類によれば、免疫反応および溶解に関与するタンパク質という共通点から類推することができる。

【0122】

実験例１．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において補体Ｃ７のタンパク質測定量に対するカットオフ値が１００μｇ／ｍＬである場合（ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔと比較）
肺がん患者の血液サンプル２７種を準備して、前記血液サンプル２７種から血漿をそれぞれ抽出した後、前処理過程を経て、ＴＭＴ１０同重化合物（ＴＭＴ１０ Ｉｓｏｂａｒｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ）を利用して前記血漿２７種に対してタンパク質分析（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ）を行って、前記補体Ｃ７に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。ただし、ここで、前記タンパク質分析は、定量分析を通じて前記補体Ｃ７に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。

【0123】

この際、前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１００μｇ／ｍＬに設定して、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実験例１」という）した。

【0124】

実験例２．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において補体Ｃ７のタンパク質測定量に対するカットオフ値が１０５μｇ／ｍＬである場合（ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔと比較）
前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１０５μｇ／ｍＬに設定した点を除いては、前記実験例１と同じ方法で実験して、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）に分類（以下、「実験例２」という）した。

【0125】

実験例３．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において補体Ｃ７のタンパク質測定量に対するカットオフ値が１１０μｇ／ｍＬである場合（ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔと比較）
前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１１０μｇ／ｍＬに設定した点を除いては、前記実験例１と同じ方法で実験して、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実験例３」という）した。

【0126】

比較実験例１．「ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔ」を通したコンパニオン診断検査
ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔ（以下、「ｐｈａｒｍＤｘ」という）は、ペムブロリズマブが特定患者に免疫抗がん剤として抗がん効果を効率的に示すか否かを判断するために使用されるコンパニオン診断検査法である。
前記実験例１の肺がん患者の組織サンプル２７種を準備して、ダコ（ＤＡＫＯ）社のＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ製品を使用して生検組織サンプル内がん細胞を免疫組織化学染色法を利用してＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｅａｔｈ Ｐｒｏｔｅｉｎ １ Ｌｉｇａｎｄ）タンパク質を定性検査して、前記がん細胞内ＰＤ－Ｌ１タンパク質の発現率を観察した。ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔ後、染色されたスライドを光学顕微鏡を通じて観察して、腫瘍細胞の部分または全体細胞膜染色を示す有効腫瘍細胞の百分率である腫瘍比率スコア（Ｔｕｍｏｒ Ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎ Ｓｃｏｒｅ，ＴＰＳ）を計算して、ＴＰＳ≧５０％の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）に分類し、ＴＰＳ １～４９％の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）に分類し、ＴＰＳ＜１％の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類（以下、「比較実験例１」という）した。

【0127】

評価４．実験例１～３と比較実験例１による結果分析および評価
以下は、上述した実験例１～３と比較実験例１によるコンパニオン診断検査結果を比較および評価したものである。

【0128】

下記表３は、前記実験例１～３と比較実験例１によるコンパニオン診断検査結果を示すものである。下記表３で、「結果」は、該当実験結果、該当患者群（ＰＲ、ＰＲ＋ＳＤ、ＰＤ）に分類された患者の数を意味し、「実際」は、該当実験の有無と関係なく、実際該当患者群（ＰＲ、ＰＲ＋ＳＤ、ＰＤ）に分類された患者の数を意味する。すなわち、「結果／実際」は、実際該当患者群に分類された患者の数に対して該当実験結果として該当患者群に分類された患者の数の比率を意味する。

【0129】

【表3】

【0130】

前記表３を参照すると、ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔに該当する比較実験例１の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とを判別する正確度が、実験例１～３に比べて相対的にさらに低いことを確認できる。

【0131】

一方、実験例１～３の場合、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてコンパニオン診断検査結果、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）を判別する正確度が、比較実験例１に比べて相対的に多少低い傾向があるが、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）とＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とを判別する正確度が、比較実験例１に比べて顕著に高い点を確認できる。

【0132】

したがって、実験例１～３の場合、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じて、コンパニオン診断検査結果が、ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔに該当する比較実験例１よりさらに正確度が優れたコンパニオン診断検査であることを確認できる。
実験例４．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において補体Ｃ７のタンパク質測定量に対するカットオフ値が１００μｇ／ｍＬである場合（ＳＰ２６３と比較）

【0133】

肺がん患者の血液サンプル３６種を準備して、前記血液サンプル３６種から血漿をそれぞれ抽出した後、前処理過程を経て、ＴＭＴ１０同重化合物（ＴＭＴ１０ Ｉｓｏｂａｒｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ）を利用して前記血漿３６種に対してタンパク質分析（Ｐｒｏｔｅｏｍｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ）を行って、前記補体Ｃ７に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。ただし、ここで、前記タンパク質分析は、定量分析を通じて前記補体Ｃ７に対するタンパク質量をそれぞれ測定した。

【0134】

この際、前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１００μｇ／ｍＬに設定して、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実験例４」という）した。
実験例５．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において補体Ｃ７のタンパク質測定量に対するカットオフ値が１０５μｇ／ｍＬである場合（ＳＰ２６３と比較）

【0135】

前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１０５μｇ／ｍＬに設定した点を除いては、前記実験例４と同じ方法で実験して、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実験例５」という）した。

【0136】

実験例６．本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物において補体Ｃ７のタンパク質測定量に対するカットオフ値が１１０μｇ／ｍＬである場合（ＳＰ２６３と比較）
前記補体Ｃ７が測定されるタンパク質量のカットオフ値を１１０μｇ／ｍＬに設定した点を除いては、前記実験例４と同じ方法で実験して、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値以上の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類し、前記補体Ｃ７のタンパク質量が前記カットオフ値未満の場合、前記補体Ｃ７のタンパク質測定量によってＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とに分類（以下、「実験例６」という）した。

【0137】

比較実験例２．「ＶＥＮＴＡＮＡ ＰＤ－Ｌ１（ＳＰ２６３）Ａｓｓａｙ」を通したコンパニオン診断検査
ＶＥＮＴＡＮＡ ＰＤ－Ｌ１（ＳＰ２６３）Ａｓｓａｙ（以下、「ＳＰ２６３」という）は、ニボルマブが特定患者に免疫抗がん剤として抗がん効果を効率的に示すか否かを判断するために使用されるコンパニオン診断検査法である。

【0138】

前記実験例１の肺がん患者の組織サンプル３６種を準備して、ベンタナ（ＶＥＮＴＡＮＡ）社のＶＥＮＴＡＮＡ ＰＤ－Ｌ１（ＳＰ２６３）Ａｓｓａｙ製品を使用して生検組織サンプル内がん細胞を免疫組織化学染色法を利用してＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｅａｔｈ Ｐｒｏｔｅｉｎ １ Ｌｉｇａｎｄ）タンパク質を定性検査して、前記がん細胞内ＰＤ－Ｌ１タンパク質の発現率を観察した。ＰＤ－Ｌ１ ｐｈａｒｍＤｘ ｔｅｓｔ後、染色されたスライドを光学顕微鏡を通じて観察して、腫瘍細胞の部分または全体細胞膜染色を示す有効腫瘍細胞の百分率である腫瘍比率スコア（Ｔｕｍｏｒ Ｐｒｏｐｏｒｔｉｏｎ Ｓｃｏｒｅ，ＴＰＳ）を計算して、ＴＰＳ≧１０％の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）に分類し、ＴＰＳ １～９％の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）に分類し、ＴＰＳ＜１％の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）に分類（以下、「比較実験例２」という）した。

【0139】

評価５．実験例４～６と比較実験例２による結果分析および評価
以下は、上述した実験例４～６と比較実験例２によるコンパニオン診断検査結果を比較および評価したものである。

【0140】

下記表４は、前記実験例４～６と比較実験例２によるコンパニオン診断検査結果を示すものである。下記表４で、「結果」は、該当実験結果、該当患者群（ＰＲ、ＰＲ＋ＳＤ、ＰＤ）に分類された患者の数を意味し、「実際」は、該当実験の有無と関係なく、実際該当患者群（ＰＲ、ＰＲ＋ＳＤ、ＰＤ）に分類された患者の数を意味する。すなわち、「結果／実際」は、実際該当患者群に分類された患者の数に対して該当実験結果として該当患者群に分類された患者の数の比率を意味する。

【0141】

【表4】

【0142】

前記表４を参照すると、ＶＥＮＴＡＮＡ ＰＤ－Ｌ１（ＳＰ２６３）Ａｓｓａｙに該当する比較実験例２の場合、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）と、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）とを判別する正確度が、実験例４～６に比べて相対的にさらに低いことを確認できる。それだけでなく、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）を判別する正確度が、また、実験例４～６に比べて相対的に低いことを確認できる。

【0143】

反対に、実験例４～６の場合、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じてコンパニオン診断検査結果、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に高い効果を示す反応患者群（Ｐａｒｔｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ，ＰＲ）、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に低い効果を示す反応患者群（Ｓｔａｂｌｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＳＤ）およびＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示さない非反応患者群（Ｎｏｎ－Ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ；Ｐｒｏｇｒｅｓｓｉｖｅ Ｄｉｓｅａｓｅ，ＰＤ）を判別する正確度が、比較実験例２に比べて相対的にさらに高いことを確認できる。

【0144】

したがって、実験例４～６の場合、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物を通じて、コンパニオン診断検査結果が、ＶＥＮＴＡＮＡ ＰＤ－Ｌ１（ＳＰ２６３）Ａｓｓａｙに該当する比較実験例２よりさらに正確度が優れたコンパニオン診断検査であることを確認できる。

【0145】

上述したような本発明のコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットは、がん患者の組織を通したコンパニオン診断だけでなく、がん患者の血液内プロテオーム解析を通じてＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤の治療反応を予測できる効果がある。

【0146】

また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットは、ＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に効果を示す反応患者群と効果を示さない非反応患者群とを選別する正確度が高いという長所がある。
また、本発明によるコンパニオン診断用バイオマーカー組成物およびこれを含むコンパニオン診断用キットは、より正確にＰＤ－１免疫チェックポイント阻害剤およびＰＤ－Ｌ１免疫チェックポイント阻害剤のうちいずれか一つ以上の免疫チェックポイント阻害剤を通した抗がん治療に適合した患者群を判別できる効果がある。

【0147】

以上の説明は、本発明の技術思想を例示的に説明したものに過ぎないものであり、本発明の属する技術分野における通常の知識を有する者なら、本発明の本質的な特性から外れない範囲で多様な修正および変形が可能だろう。

【0148】

したがって、本発明に開示された実施例は、本発明の技術思想を限定するためのものでなく、説明するためのものであり、このような実施例によって本発明の技術思想の範囲が限定されるものではない。本発明の保護範囲は、下記の請求範囲によって解すべきであり、それと同等な範囲内にあるすべての技術思想は、本発明の権利範囲に含まれると解すべきである。

【図1a】

【図1b】

【図1c】

【図1d】

【図1e】

【図1f】

【図1g】

【図1h】

【図1i】

【図2a】

【図2b】

【図2c】

【図3】