特許 5754792 大腸癌の予後予測方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】5754792

(24)【登録日】2015年6月5日

(45)【発行日】2015年7月29日

(54)【発明の名称】大腸癌の予後予測方法

(51)【国際特許分類】

   C12Q 1/68 20060101AFI20150709BHJP

【ＦＩ】

   C12Q1/68 A

【請求項の数】1

【全頁数】13

(21)【出願番号】特願2009-220502(P2009-220502)

(22)【出願日】2009年9月25日

(65)【公開番号】特開2011-67130(P2011-67130A)

(43)【公開日】2011年4月7日

【審査請求日】2012年7月3日

(73)【特許権者】

【識別番号】304020177

【氏名又は名称】国立大学法人山口大学

(72)【発明者】

【氏名】日野田 裕治

(72)【発明者】

【氏名】末広 寛

(72)【発明者】

【氏名】上野 耕司

(72)【発明者】

【氏名】岡田 季之

【審査官】 野村 英雄

(56)【参考文献】

【文献】 特開２００８−０１１８６０（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特開２００８−０３５８３６（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特開２００１−１６５９３３（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特開２００３−２５９８７４（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特開２００７−０３７４０９（ＪＰ，Ａ）

【文献】 呼 群、外８名，「Enhancer of zeste homolog2 (EZH2)蛋白発現と非小細胞肺癌の予後との関係」，肺癌，２００８年１０月 ５日，Vol.48, No.5(第49回日本肺癌学総会号)，P.590，P-401欄

【文献】 FLUGE, O. et al.，"Expression of EZH2 and Ki-67 in colorectal cancer and associations with treatment response and prognosis."，BRITISH JOURNAL OF CANCER，２００９年，Vol.101, No.8，P.1282-1289，Epub 2009 Sep 22.

【文献】 VALDES-MORA, F. et al.，"TWIST1 overexpression is associated with nodal invasion and male sex in primary colorectal cancer."，ANNALS OF SURGICAL ONCOLOGY，２００９年 １月，Vol.16, No.1，P.78-87

(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）

Ｃ１２Ｑ １／６８

ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）

ＰｕｂＭｅｄ

ＣｉＮｉｉ

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

大腸癌罹患者の正常大腸粘膜に由来する細胞におけるＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ｔｗｉｓｔ ｈｏｍｏｌｏｇ １（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子及び／またはＥｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｚｅｓｔｅ ｈｏｍｏｌｏｇ ２（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子の発現上昇を検出する、大腸癌の予後予測方法において、ＲＯＣ曲線に基づいて求められるカットオフ値よりも高い遺伝子発現レベルのとき、予後不良の可能性有りと判定することを特徴とする、大腸癌の予後予測方法。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

本発明は、特定の遺伝子の発現に着目した大腸癌の予後予測方法に関し、より詳しくは、被検細胞におけるＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ｔｗｉｓｔ ｈｏｍｏｌｏｇ １（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子（以下「ＴＷＩＳＴ１」という）及び／またはＥｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｚｅｓｔｅ ｈｏｍｏｌｏｇ ２（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子（以下「ＥＺＨ２」という）の発現増大を検出することを特徴とする、大腸癌の予後予測方法に関する。

【背景技術】

【0002】

盲腸、結腸、直腸に発生する癌腫の総称である「大腸癌」は、我が国において現状２番目に罹患者数の多い疾患であり、多くは消化管内面の粘膜上皮細胞の突然変異によって生じることが知られている。粘膜上皮細胞の癌化の主因は細胞増殖を制御するゲノムＤＮＡ上の変異であると考えられており、その他環境因子（リスク因子）、遺伝、ウィルス感染などが癌化に影響する因子として知られている。

【0003】

多くの癌と同様、大腸癌も早期の発見がその治療にとっては何より重要であり、これまでに多くの検査手法が開発されてきた。主な検査手法としては便鮮血検査、血液検査、直腸指診、大腸内視鏡を用いた診断などがあるが、便鮮血検査は早期の癌の検出感度に問題があり、血液検査（血中に含まれる腫瘍マーカー検査）も進行癌でしか陽性にならないという問題があり、直腸指診は指の届く範囲内しか診断できないという問題、大腸内視鏡による診断も視認しにくい早期の癌では検出感度が落ちるという問題、等々、それぞれの検査手法には特に早期の癌における感度において課題があった。

【0004】

癌診断においては、近年、癌関連遺伝子の発見に伴い、特定の遺伝子のメチル化や発現の増大／減少に着目して癌の診断や予測をするという技術が開発されてきた。例えば、被検細胞の癌の悪性度の進行度をモニターするための表現型及び遺伝子型の不動を検出し少なくとも１種類の治療薬に対する腫瘍細胞の化学療法応答を予測するためのシステム（特許文献１）、乳癌の管内治療で標的となる特定遺伝子のメチル化されたプロモーター（特許文献２）、染色体上のゲノム変化領域（ＲＡＲ）上に位置する癌抑制遺伝子の一種ＣＡＭＴＡ１の発現減少を測定し、大腸癌の診断を行う方法（特許文献３）などがこれまでに開示されているが、いずれの手法も既存の腫瘍マーカー検出による癌診断の精度を凌駕するものではなく、また癌の予後（これは適切な癌治療法の選択につながる）を適切に予測可能なものではなかった。また一口に癌と言っても、その由来により性質が異なることが明らかになっていることから、特に大腸癌の予後を特異的に予測可能な手法の開発が望まれていた。

【先行技術文献】

【特許文献】

【0005】

【特許文献1】特表２００９−５０６７７７号公報

【特許文献2】特表２００４−５２５１５１号公報

【特許文献3】特開２００８−０１１８６０号公報

【発明の概要】

【発明が解決しようとする課題】

【0006】

上記の現状に鑑み、本発明は、大腸癌の予後・進展と高い相関を持つ遺伝子の発現増大を指標とする大腸癌の予後予測方法、及び前記予測方法を実施するためのキットを提供することを目的とする。

【課題を解決するための手段】

【0007】

上記課題の解決のため、本発明者らは、大腸癌の予後を予測可能で、かつ癌組織だけではなく癌周辺組織でも発現の変動があるマーカー遺伝子の探索を進め、その結果、ＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子が大腸癌の予後予測マーカーとして目的に適合した性質を有することを見いだし、本発明を完成させた。

【0008】

すなわち本発明は、大腸癌罹患者の正常大腸粘膜に由来する細胞におけるＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ｔｗｉｓｔ ｈｏｍｏｌｏｇ １（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子及び／またはＥｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｚｅｓｔｅ ｈｏｍｏｌｏｇ ２（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子の発現上昇を検出することを特徴とする、大腸癌の予後予測方法において、ＲＯＣ曲線に基づいて求められるカットオフ値よりも高い遺伝子発現レベルのとき、予後不良の可能性有りと判定することを特徴とする、大腸癌の予後予測方法を提供する。

【発明の効果】

【0013】

本発明の提供する大腸癌の予後予測方法を利用することにより、同一人の正常大腸粘膜と腫瘍におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子の発現を比較し、予後を正確に予測することが可能となる。本発明の提供するこれらのマーカーは、癌患者さんにおいて、癌組織そのものだけでなく正常組織においても予後の予測に利用可能という点が特質であり、これは癌切除後の検査においても予後を予測しうるという点でこれまでのマーカーには無い利点である。また本発明の実施に際しては、常法であるＴａｑｍａｎ法（Ｒｏｃｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ，ＣＨ）にてＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子の発現を正常大腸粘膜と腫瘍組織とを対象にして行うので、簡便、安価で再現性に優れた大腸癌診断を小さな施設でも行うことが可能となる。

【図面の簡単な説明】

【0014】

【図1】大腸癌患者の正常大腸粘膜と大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子の発現量を比較して示す。

【図2】大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子の発現量と生命予後の関係を示す。

【図3】図２の結果より作成したＲＯＣ曲線を示す。

【図4】大腸癌患者の正常大腸粘膜におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子の発現量と生命予後の関係を示す。

【図5】図４の結果より作成したＲＯＣ曲線を示す。

【図6】大腸癌患者の正常大腸粘膜と大腸癌組織におけるＥＺＨ２遺伝子の発現量を比較して示す。

【図7】大腸癌組織におけるＥＺＨ２遺伝子の発現量と生命予後の関係を示す。

【図8】図７の結果より作成したＲＯＣ曲線を示す。

【図9】大腸癌患者の正常大腸粘膜におけるＥＺＨ２遺伝子の発現量と生命予後の関係を示す。

【図10】図９の結果より作成したＲＯＣ曲線を示す。

【図11】大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子の発現とＥＺＨ２遺伝子の発現の相関関係を示す。

【図12】大腸癌患者の正常大腸粘膜におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子の発現とＥＺＨ２遺伝子の発現の相関関係を示す。

【発明を実施するための形態】

【0015】

以下に本発明を実施するための形態を示す。本発明の第１の態様は、被検細胞におけるＨｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ ｔｗｉｓｔ ｈｏｍｏｌｏｇ １（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子、及び／またはＥｎｈａｎｃｅｒ ｏｆ ｚｅｓｔｅ ｈｏｍｏｌｏｇ ２（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）遺伝子の発現上昇を検出することを特徴とする、大腸癌の予後予測方法を提供する。本発明におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子とは、ショウジョウバエ（Ｄｒｏｓｏｐｈｉｌａ）の形態形成に係る遺伝子ｔｗｉｓｔのヒトホモログであり、これまでの研究でアポトーシスの阻害、化学療法への抵抗性、癌の転移に関与すると指摘されている（Ｍｉｌｌｅｒ ＳＪ ｅｔ ａｌ．２００６．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．）。またＴＷＩＳＴ１遺伝子の突然変異がある種の先天性異状の原因となるとの報告もある（Ｖｉｌｌａｖｉｃｅｎｃｉｏ ＥＨ ｅｔ ａｌ．２００２．Ｇｅｎｅｓｉｓ）。また本発明におけるＥＺＨ２遺伝子とは、ショウジョウバエで発見されたポリコーム（Ｐｏｌｙｃｏｍｂ）遺伝子の一種であり、遺伝子の発現抑制に働く遺伝子ｚｅｓｔｅのヒトホモログである。これまでの研究で、ヒトにおいてはＨｏｘ遺伝子のサイレンシング、Ｘ染色体の不活性化に働き（Ｃａｏ ＆ Ｚａｎｇ Ｍｏｌ．Ｃｅｌｌ ２００４）、またリンパ腫で発現が上昇することなどが報告されている（Ｖｉｓｓｅｒ ｅｔ ａｌ．Ｂｒ．Ｊ．Ｈａｅｍａｔｏｌ．２００１）。しかしながら、ＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子が癌、特に大腸癌の予後予測のマーカーになりうるという知見はこれまでに得られておらず、本発明者らにより初めて明らかにされた点である。

【0016】

本発明の実施における被検細胞とは、その目的が大腸癌の予後予測にあるという点からも、大腸癌の患者さんより採取された大腸由来の細胞が適しており、特に大腸粘膜由来の細胞が、より具体的には大腸粘膜における腫瘍組織と正常組織（腫瘍化していない組織）に由来する細胞が適している。検査の正確性の観点からは腫瘍組織が適しているが、簡便性の観点からは正常組織、例えばバイオプシーで得られた組織や腸洗浄で得られた組織、便に含まれる粘膜組織であっても良いし、また外科的切除検体に由来する細胞でも良い。

【0017】

本発明の実施においては、被検細胞におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子の発現を定量化し、内因性コントロール遺伝子（βアクチン等）の発現と比較してその上昇を検出し、大腸癌の予後予測、具体的には「大腸癌罹患者においてＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子の発現が通常よりも高い場合には予後が悪い」という予後予測に供するものである。ここで両遺伝子の発現上昇とは、被検細胞における両遺伝子の発現を定量化・数値化した値が所定のカットオフ値よりも高い値を示したとき、予後不良の可能性ありと判定することを特徴とするものであり、被検細胞の腫瘍組織におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子／ＥＺＨ２遺伝子の発現と、腫瘍化していない正常大腸粘膜細胞におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子／ＥＺＨ２遺伝子の発現との比較において発現上昇の有無を判別したり、特定のパラメーター、例えば年齢、性別、病歴、等々を共有する集団におけるこれらの遺伝子発現量の標準化した値と被検細胞での発現とを比較したりすることで検出されるものである。指標としては相対発現量（Ｒｅｌａｔｉｖｅ ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ）のうち比較Ｃｔ法（ΔΔＣｔ法：基準となるサンプルと比較して、未知サンプルが何サイクル早く、あるいは何サイクル遅くスレショルドラインに達するかに注目して相対定量する方法。検量線を作成しない相対定量法であり、１サイクルの検出の違いで２倍量の差となる、という理論を使用する。検量線作成が不要なので多サンプルを処理できるというメリットを有する）を用いるのが適している。具体的なカットオフ値は、個体差や細胞での差を考慮し、当業者が利用可能な手法の中から適宜選択し決定する事が可能であるが、下記実施例で示す通り検査データについて特異度と検出感度の２軸によるＲＯＣ曲線を作成し、最適なカットオフ値を求める手法は適した例である。実施例でも示すとおり、ＴＷＩＳＴ１遺伝子とＥＺＨ２遺伝子は特に腫瘍組織における発現量が正の相関を示し、検出対照はＴＷＩＳＴ１遺伝子、ＥＺＨ２遺伝子単独でも良いし、両方でも良い。
本発明の実施における遺伝子発現の比較については、臨床検査、細胞生物学分野で用いられている手法のうちから適宜選択可能であり、本発明を限定するものでは無いが、細胞から抽出したｍＲＮＡを逆転写とＰＣＲにより増幅しその発現量を定量的に検出する手法が適しており、より具体的には上述の通り、ＴａｑＭａｎ法やＳＹＢＲ法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｐｒｏｂｅｓ Ｉｎｃ．）が広く用いられており適している。

【0018】

本発明は、その第１から第４の態様を実施するための大腸癌の予後予測キットも包含するものである。キットの構成は、大腸癌罹患者の大腸粘膜から採取した細胞におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子及び／またはＥＺＨ２遺伝子の発現を検出・可視化できるようなものであれば特に限定は無い。
以下に本発明の実施例を示すが、本発明は実施例にのみ限定されるものではない。

【実施例1】

【0019】

（臨床検体）本実施例の材料として、山口大学附属病院において、インフォームドコンセントのもと組織採取と研究利用に書面にて同意が得られた大腸癌の患者さんより、正常大腸粘膜の検体を１７７検体、大腸癌組織の検体を２２２検体を採取し、ＴＷＩＳＴ１遺伝子、ＥＺＨ２遺伝子発現の検証のための材料とした。検体はＤＮＡ／ＲＮＡ抽出まで、凍結保存した。
Ａｌｌ Ｐｒｅｐ ＤＮＡ／ＲＮＡ Ｍｉｎｉ Ｋｉｔ（Ｑｉａｇｅｎ社製）を用いてＤＮＡとｔｏｔａｌ ＲＮＡの抽出を行った。２ｍｌチューブへ製品付属のＲＬＴ ｐｌｕｓバッファーを６００μｌ添加し、βメルカプトエタノール６μｌを添加後、凍結検体を加え、径が５ｍｍのステンレススチールビーズ（Ｑｉａｇｅｎ社製）を１個加え、Ｑｉａｇｅｎ Ｍｉｘｅｒ Ｍｉｌｌ ＭＭ３００（Ｑｉａｇｅｎ社製）を用いて検体の超音波破砕（３０Ｈｚ，１０分間）を行った。破砕した検体をＡｌｌ Ｐｒｅｐ ＤＮＡスピンカラム（Ｑｉａｇｅｎ社製）に移し、１００００ｒｐｍ、３０秒間遠心した。ろ液は後述のＲＮＡ抽出に用いた。遠心後のスピンカラムを室温または４℃において、新しい２ｍｌチューブにセットしてインキュベートした。このスピンカラムは後述のＤＮＡ抽出に用いた。

【0020】

（ＤＮＡ抽出）インキュベートしたＤＮＡスピンカラムに５００μｌのＡＷ１バッファー（製品付属）を添加し、１００００ｒｐｍ、３０秒間遠心して廃液を捨てた後にスピンカラムを２ｍｌのコレクションチューブにセットした。次いで、製品付属のＡＷ２バッファーを５００μｌ添加し、１５３００ｒｐｍ、２分間遠心を行った。これらの操作によりＤＮＡ試料の洗浄を行った。スピンカラムを新しい１．５ｍｌチューブに移し、１００μｌのＥＢバッファー（製品付属）を直接カラムのメンブレンに添加し、室温で１分間インキュベートした後、１００００ｒｐｍ、１分間遠心して、ＤＮＡを溶出した。

【0021】

（ＲＮＡ抽出）
上述のＲＮＡを含むろ液に、７０％エタノールを４００μｌ添加し、ピペットでよく混和した後、ＲＮｅａｓｙスピンカラムに６００μｌをアプライし、１１０００ｒｐｍ、２０秒間遠心した。廃液を捨て、残りのろ液を同じカラムにアプライし、１１０００ｒｐｍ、２０秒間遠心した。７００μｌのＲＷ１バッファー（製品付属）をカラムに添加し、１５分間インキュベート後、１１０００ｒｐｍ、２０秒間遠心して液を捨てた。スピンカラムを２ｍｌコレクションチューブに移し、５００μｌのＲＰＥバッファー（製品付属）を加えて１１０００ｒｐｍ、２０秒間遠心し、ろ液を捨てた。更に５００μｌのＲＰＥバッファーを加えて１１０００ｒｐｍ、２０秒間遠心し、ろ液を捨てた。これらの操作によりＲＮＡ試料の洗浄を行った。カラムを新しい１．５ｍｌチューブに移し、５０μｌのＲＮａｓｅフリー水を直接カラムのメンブレンに添加し、１１０００ｒｐｍ、１分間遠心して全ＲＮＡ（ｔｏｔａｌ ＲＮＡ）を溶出した。

【0022】

（ｃＤＮＡの合成）上記で抽出したｔｏｔａｌＲＮＡを鋳型に、Ｈｉｇｈ Ｃａｐａｃｉｔｙ ｃＤＮＡ Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ Ｋｉｔ ｗｉｔｈ ＲＮａｓｅ Ｉｎｈｉｂｉｔｏｒ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）を用いて逆転写を行い、ｃＤＮＡを合成した。チューブに２μｌの１０×ＲＴバッファー（製品付属）、０．８μｌの２５×ｄＮＴＰ ｍｉｘ（１００ｍＭ）、２μｌの１０×ＲＴ Ｒａｎｄｏｍ Ｐｒｉｍｅｒｓ（製品付属）、１μｌのＲＮａｓｅ阻害剤、１μｌのＭｕｌｔｉｓｃｒｉｂｅ Ｒｅｖｅｒｓｅ Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔａｓｅ、２μｇのｔｏｔａｌ ＲＮＡを加え、ヌクレアーゼフリー水を加えて全量を２０μｌとした。２５℃−１０分間、３７℃−２時間、８５℃−５秒間のプログラムで逆転写反応を行った。試薬類はキット添付のものを使用した。

【0023】

（定量的ＰＣＲ）上記で合成したｃＤＮＡを鋳型とし、ＴＷＩＳＴ１遺伝子とＥＺＨ２遺伝子の発現を比較するためにＴａｑＭａｎ法（Ｒｏｃｈｅ）による定量的ＰＣＲを行った。プライマー及びプローブはＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製の以下のものを用いた。
内因性コントロール：βアクチン（製品番号：４３２６３１５Ｅ）
ターゲット遺伝子：ＴＷＩＳＴ１（製品番号：Ｈｓ０１６７５８１８＿ｓ１）、及びＥＺＨ２（Ｈｓ００５４４８３０＿ｍ１）
１０ｎｇのｃＤＮＡ、１×ＴａｑＭａｎ Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（製品付属）、１×ＴａｑＭａｎ Ｐｒｏｂｅ Ｍｉｘ（９００ｎＭ ｅａｃｈ ｐｒｉｍｅｒ、２５０ｎＭ ＦＡＭ ｄｙｅ−ｌａｂｅｌｅｄ ＴａｑＭａｎ ＭＧＢ ｐｒｏｂｅ）に滅菌水を加え、全量を２０μｌとした。ＡＢＩ Ｐｒｉｓｍ ７９００ＨＴ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｓｙｓｔｅｍ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｗａｒｒｉｎｇｔｏｎ，ＵＫ）を使用して定量ＰＣＲを行った。温度条件は、（１）５０℃−２分、９５℃−１０分の後、（２）９５℃−１５秒、６０℃−３０秒にて４０サイクル行った。全ての反応は二重測定にて行い、またｍＲＮＡの発現レベルは検体番号５２８を標準サンプル（発現量＝１）とし、２^{−ΔΔＣＴ}法（ΔΔＣｔ法，Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）にて解析し相対発現量を求めた。上述の通り、本法においては基準となるサンプル（標準サンプル）と比較して、未知サンプルにおける値を測定するため、標準サンプルは任意の検体で良いが、発現量が極端に高くも低くもない検体からＮｏ．５２８を選択した。

【0024】

（結果）図１に、大腸癌罹患者の正常大腸粘膜と大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子の発現量の比較を示した。グラフ縦軸は相対発現量（対数値）を、横軸は正常大腸粘膜と大腸癌組織とをそれぞれ表し、グラフ中の白丸（○）は各々の発現量を示している。正常大腸粘膜におけるＴＷＩＳＴ１発現量の中央値は０．７１０（グラフ中の横棒）であったのに対し、大腸癌組織では１．８３５と正常大腸粘膜の２．５倍以上の値を示し、有意に高値であった（Ｐ＜０．０００１、Ｍａｎｎ−Ｗｈｉｔｎｅｙ Ｕ ｔｅｓｔ、以下同じ）。

【0025】

図２に、大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１の発現量と生命予後との関係を示す。グラフ縦軸は相対発現量（対数値）を、横軸は生存群（Ｎ＝９４）と死亡群（Ｎ＝２７）をそれぞれ示し、グラフ中の白丸（○）は各々の発現量を示している。大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１の発現量の中央値は、生存群で０．６２７と正常大腸粘膜と変わらないレベルであったのに対し、死亡群では４．２５１と６．５倍以上という高い発現量を示し、統計的にも有意に高値であった（Ｐ＜０．０００１）。図２の結果を基に作成したＲＯＣ曲線（Ｒｅｃｅｉｖｅｒ ｏｐｅｒａｔｉｎｇ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃ ｃｕｒｖｅ）を図３に示す。ＲＯＣ曲線の作成法は常法に従い、特異度、感度ともに最も良い値をカットオフ値とした。グラフ縦軸は検出感度を、横軸は１００．０％−特異度を示している。解析の結果より、ＴＷＩＳＴ１遺伝子発現のカットオフ値を１．２８９とした時に最適である事が示され、このときの予後予測の感度は７４％、特異度は６４％であった。下記表１に、カットオフ値１．２８９を適用したときのデータを示した。

【0026】

【表1】

＊感度＝74% (20/27), 特異度=64% (60/94), 陽性的中率=37% (20/54), 陰性的中率=90% (60/67)
P = 0.0008, Odd比5.042（95%信頼区間 1.934-13.146 Fisherテストによる）

【0027】

図４に、大腸癌患者の正常大腸粘膜におけるＴＷＩＳＴ１発現量を生存群と死亡群で比較した結果を示す。グラフ縦軸はＴＷＩＳＴ１発現量（相対値）を、横軸は生存群（Ｎ＝８５）と死亡群（Ｎ＝２５）をそれぞれ示し、グラフ中白丸（○）が各々のデータである。正常大腸粘膜におけるＴＷＩＳＴ１の発現に着目すると、生存群では中央値が０．２４４と低い値であったのに対し、死亡群では同値が３．２８３であり、生存群の１３倍以上と非常に高い値を示しまた統計的に有意な差であった（Ｐ＝０．００１０）。図４の結果を基に作成したＲＯＣ曲線を、図５に示す。ＲＯＣ曲線の作成法は常法に従った。グラフ縦軸は検出感度を、横軸は１００．０％−特異度を示している。解析の結果より、ＴＷＩＳＴ１遺伝子発現のカットオフ値を１．２８６とした時に最適である事が示され、このときの予後予測の感度は７２％、特異度は７４％であった。下記表２に、カットオフ値１．２８６を適用したときのデータを示した。

【0028】

【表2】

＊感度=72% (18/25), 特異度=74% (64/87), 陽性的中率=44% (18/41), 陰性的中率=90% (64/71)
P = 0.0001, Odd比7.155（95%信頼区間 2.646-19.350 Fisherテストによる）

【0029】

図６に、大腸癌患者の正常大腸粘膜と大腸癌組織におけるＥＺＨ２遺伝子の発現量（相対値）比較を示す。グラフ縦軸はＥＺＨ２発現量の相対値（対数値）を、横軸は正常大腸粘膜（Ｎ＝１１８）と大腸癌組織（Ｎ＝１３７）をそれぞれ示している。ＥＺＨ２遺伝子の発現量の中央値は、正常大腸粘膜では０．５０５であったのに対し、大腸癌組織では０．７６９（グラフ横棒）であり、大腸癌組織で有意に高値であった（Ｐ＝０．０００１）。

【0030】

図７に、大腸癌患者の大腸癌組織におけるＥＺＨ２遺伝子の発現量を生存群と死亡群で比較した結果を示す。グラフ縦軸はＥＺＨ２発現量（相対値）を、横軸は生存群（Ｎ＝９５）と死亡群（Ｎ＝２７）をそれぞれ示し、グラフ中白丸（○）が各々のデータである。また生存群の中央値は０．６１７であったのに対し、死亡群では１．９５７（グラフ横棒）と３倍も高く、死亡群において有意に高値であった（Ｐ＝０．００３２）。また図７の結果を基に作成したＲＯＣ曲線を、図８に示す。ＲＯＣ曲線の作成法は常法に従った。グラフ縦軸は検出感度を、横軸は１００．０％−特異度を示している。解析の結果より、ＥＺＨ２遺伝子発現のカットオフ値を１．０６７とした時に最適である事が示され、このときの予後予測の感度は６３％、特異度は７０％であった。下記表３に、カットオフ値１．０６７を適用したときのデータを示した。

【0031】

【表3】

＊感度=63% (17/27), 特異度=70% (66/96), 陽性的中率=37% (17/46), 陰性的中率=87% (66/76)
P = 0.0032, Odd比3.869（95%信頼区間 1.581-9.469 Fisherテストによる）

【0032】

図９に、大腸癌患者の正常大腸粘膜におけるＥＺＨ２遺伝子の発現量を生存群と死亡群で比較した結果を示す。グラフ縦軸はＥＺＨ２発現量（相対値）を、横軸は生存群（Ｎ＝８０）と死亡群（Ｎ＝２３）をそれぞれ示し、グラフ中白丸（○）が各々のデータである。正常大腸粘膜におけるＥＺＨ２の発現に着目すると、生存群では中央値が０．４３８と低い値であったのに対し、死亡群では同値が０．６８０であり、統計的に有意な差であった（Ｐ＝０．００３２）。図９の結果を基に作成したＲＯＣ曲線を、図１０に示す。ＲＯＣ曲線の作成法は常法に従った。グラフ縦軸は検出感度を、横軸は１００．０％−特異度を示している。解析の結果より、ＥＺＨ２遺伝子発現のカットオフ値を０．５７４７とした時に最適である事が示され、このときの予後予測の感度は７４％、特異度は６６％であった。下記表４に、カットオフ値０．５７４７を適用したときのデータを示した。

【0033】

【表4】

＊感度=74% (17/23), 特異度=66% (53/80), 陽性的中率=39% (17/44), 陰性的中率=90% (53/59)
P = 0.0008, Odd比5.562（95%信頼区間 1.966-15.735 Fisherテストによる）

【0034】

上記の結果より、大腸癌組織におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子とＥＺＨ２遺伝子の発現量の関係を統計解析した結果を図１１に示す。統計解析はＳｐｅａｒｍａｎ検定を用い、グラフ横軸はＴＷＩＳＴ１の相対発現量を、縦軸はＥＺＨ２遺伝子の相対発現量をそれぞれ示し、白丸（○）が生存群、黒丸（●）が死亡群を示し、丸一つが各々のサンプルを表している。検定の結果、ｒ値は０．７４５６、Ｐ＜０．０００１と有意な正の相関関係が見られた。

【0035】

一方、大腸癌患者の正常大腸粘膜におけるＴＷＩＳＴ１遺伝子とＥＺＨ２遺伝子の発現量の関係を統計解析した結果を図１２に示す。統計解析はＳｐｅａｒｍａｎ検定を用い、グラフ横軸はＴＷＩＳＴ１の相対発現量を、縦軸はＥＺＨ２遺伝子の相対発現量をそれぞれ示し、白丸（○）が生存群、黒丸（●）が死亡群を示し、丸一つが各々のサンプルを表している。検定の結果、ｒ値は０．５３５７、Ｐ＜０．０００１と有意な正の相関関係が見られた。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【図9】

【図10】

【図11】

【図12】