特許 5913103 酵母ベースの免疫療法組成物を含む組合せ物及び被験者のスクリーニング方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】5913103

(24)【登録日】2016年4月8日

(45)【発行日】2016年4月27日

(54)【発明の名称】酵母ベースの免疫療法組成物を含む組合せ物及び被験者のスクリーニング方法

(51)【国際特許分類】

   A61K 36/064 20060101AFI20160414BHJP

   C12N 1/16 20060101ALI20160414BHJP

   A61K 45/00 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 37/04 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 31/12 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 31/14 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 31/20 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 35/00 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 31/00 20060101ALI20160414BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20160414BHJP

   A61K 38/00 20060101ALI20160414BHJP

【ＦＩ】

   A61K36/064

   C12N1/16 GZNA

   A61K45/00 101

   A61P37/04

   A61P31/12

   A61P31/14

   A61P31/20

   A61P35/00

   A61P31/00

   A61P43/00 105

   A61K37/02

【請求項の数】14

【全頁数】86

(21)【出願番号】特願2012-529823(P2012-529823)

(86)(22)【出願日】2010年9月14日

(65)【公表番号】特表2013-504623(P2013-504623A)

(43)【公表日】2013年2月7日

(86)【国際出願番号】US2010048699

(87)【国際公開番号】WO2011032119

(87)【国際公開日】20110317

【審査請求日】2013年9月13日

(31)【優先権主張番号】61/242,355

(32)【優先日】2009年9月14日

(33)【優先権主張国】US

(31)【優先権主張番号】61/242,353

(32)【優先日】2009年9月14日

(33)【優先権主張国】US

(31)【優先権主張番号】61/288,568

(32)【優先日】2009年12月21日

(33)【優先権主張国】US

(73)【特許権者】

【識別番号】308032460

【氏名又は名称】ザ リージェンツ オブ ザ ユニバーシティ オブ コロラド，ア ボディー コーポレイト

【氏名又は名称原語表記】ＴＨＥ ＲＥＧＥＮＴＳ ＯＦ ＴＨＥ ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ ＯＦ ＣＯＬＯＲＡＤＯ，ａ ｂｏｄｙ ｃｏｒｐｏｒａｔｅ

(74)【代理人】

【識別番号】100068755

【弁理士】

【氏名又は名称】恩田 博宣

(74)【代理人】

【識別番号】100105957

【弁理士】

【氏名又は名称】恩田 誠

(74)【代理人】

【識別番号】100142907

【弁理士】

【氏名又は名称】本田 淳

(72)【発明者】

【氏名】ベルグラウ、ドナルド

(72)【発明者】

【氏名】タンブリーニ、ベス

【審査官】 佐々木 大輔

(56)【参考文献】

【文献】 特表２００８−５１６６１０（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２００６−５１０７１８（ＪＰ，Ａ）

【文献】 国際公開第２００８／１１５６１０（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 国際公開第２００７／１３０４９３（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 2009.01, Vol.106, No.3, pp.876-881

【文献】 INFECTION AND IMMUNITY, 2009.05, Vol.77, No.5, pp.1774-1781

【文献】 LEIBUNDGUT-LANDMANN SALOME，SYK- AND CARD9-DEPENDENT COUPLING OF INNATE IMMUNITY TO THE INDUCTION OF T HELPER CELLS 以下備考，NATURE IMMUNOLOGY，２００７年 ６月，V8 N6，P630-638，THAT PRODUCE INTERLEUKIN 17

(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）

Ａ６１Ｋ ３６／００−３６／９０６８

Ａ６１Ｋ ３８／００−３８／５８

Ａ６１Ｋ ４１／００−４５／０８

Ａ６１Ｋ ４８／００

ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）

ＣＡｐｌｕｓ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ／ＷＰＩＤＳ（ＳＴＮ）

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

被験者においてＣＤ４＋ ＴＨ１７細胞の産生又は生存を阻害し、ＴＨ１免疫応答を増強する方法に使用するための組成物の組合せ物であって、前記組合せ物は、
ａ）全酵母及び抗原を含む酵母ベースの免疫療法組成物であって、抗原が全酵母により発現されるか、全酵母に結合しているか、又は全酵母と混合されている免疫療法組成物と、
ｂ）ｉ）インターロイキン−６（ＩＬ−６）、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、ＩＬ−１７、及びＩＬ−１のうちから選択されるサイトカイン又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤であって、前記作用剤は抗サイトカイン抗体、その抗原結合部分、ｓｉＲＮＡ、前記サイトカインの可溶性不活型形態及びその受容体のうちから選択される作用剤、及び、
ｉｉ）ＩＬ−２５及びＩＬ−２７のうちから選択される作用剤
のうちから選択される作用剤と
を含む組合せ物。

【請求項2】

疾患がウイルス疾患である、請求項１に記載の組合せ物。

【請求項3】

ウイルス疾患が、Ｃ型肝炎ウイルス感染症又はＢ型肝炎ウイルス感染症である、請求項２に記載の組合せ物。

【請求項4】

疾患が癌である、請求項１に記載の組合せ物。

【請求項5】

作用剤及び酵母ベースの免疫療法の投与が、酵母ベースの免疫療法組成物単独の投与と比較して、ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を増強する、請求項１〜４のいずれか一項に記載の組合せ物。

【請求項6】

被験者に、作用剤の非存在下で酵母ベースの免疫療法組成物を投与した結果、被験者におけるＩＬ−１７の産生量及びＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の存在数の少なくともいずれか一方が、一般的に健康な個体の集団又は群として特定の疾患または症状を有していない集団に由来する同じ供給源から単離されたＣＤ４＋ Ｔ細胞におけるＩＬ−１７の平均産生レベル又はＴＨ１７細胞の平均レベル／数よりも統計学的に有意に（ｐ＞０．０５）多くなる、請求項１〜５のいずれか一項に記載の組合せ物。

【請求項7】

被験者から単離されたＴ細胞が、酵母ベースの免疫療法組成物との接触に応答して増殖しない、請求項１〜６のいずれか一項に記載の組合せ物。

【請求項8】

被験者においてＴＨ１７免疫応答を増強する方法に使用するための組成物の組合せ物であって、前記組合せ物は、
ａ）全酵母及び抗原を含む酵母ベースの免疫療法組成物であって、抗原が全酵母により発現されるか、全酵母に結合しているか、又は全酵母と混合されている免疫療法組成物と、
ｂ）ｉ）ＩＬ−６、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、ＩＬ−１７、及びＩＬ−１のうちから選択される作用剤、及び
ｉｉ）ＩＬ−２５及びＩＬ−２７のうちから選択されるサイトカイン又はそれらの受容体の発現又は活性を阻害する作用剤であって、前記作用剤は抗サイトカイン抗体、その抗原結合部分、ｓｉＲＮＡ、前記サイトカインの可溶性不活型形態及びその受容体のうちから選択される作用剤
のうちから選択される作用剤と
を含む組合せ物。

【請求項9】

真菌感染症又は細胞外病原体感染症に関連する疾患の治療に使用するための、請求項８に記載の組合せ物。

【請求項10】

被験者に、作用剤の非存在下で酵母ベースの免疫療法組成物を投与した結果、被験者におけるＩＬ−１７の産生量及びＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の存在数の少なくともいずれか一方が、一般的に健康な個体の集団又は群として特定の疾患または症状を有していない集団に由来する同じ供給源から単離されたＣＤ４＋ Ｔ細胞におけるＩＬ−１７の平均産生レベル又はＴＨ１７細胞の平均レベル／数よりも統計学的に有意に（ｐ＞０．０５）少なくなる、請求項８又は９に記載の組合せ物。

【請求項11】

作用剤が、酵母ベースの免疫療法組成物の投与と同時に、酵母ベースの免疫療法組成物の投与前に、酵母ベースの免疫療法組成物の投与後に、又は酵母ベースの免疫療法組成物と共に断続的に投与されるか、
酵母ベースの免疫療法組成物が、作用剤の投与を開始する前の特定の期間にわたって１つ又は複数の用量で投与されるか、
作用剤が、被験者の初期免疫応答を調節するのに十分な所定の期間投与され、その後酵母ベースの免疫療法組成物が作用剤の非存在下で投与される期間が続くか、又は
酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母が、作用剤を保持又は発現するように操作されている、請求項１〜１０のいずれか一項に記載の組合せ物。

【請求項12】

全酵母が、熱不活化全酵母である、請求項１〜１１のいずれか一項に記載の組合せ物。

【請求項13】

全酵母が、サッカロマイセス・セレビシエ由来である、請求項１〜１２のいずれか一項に記載の組合せ物。

【請求項14】

酵母ベースの免疫療法の予測される免疫応答性について被験者をスクリーニングする方法であって、酵母ベースの免疫療法は全酵母及び抗原の投与を含み、抗原は全酵母により発現されるか、全酵母に結合しているか、又は全酵母と混合されたものであり、前記方法は、
ａ）被験者に由来するＴ細胞を、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞（ＡＰＣ）とｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることと、
ｂ）ＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞増殖、ＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞によるＩＬ−１７産生、及びＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞によるレチノイド関連オーファン受容体（ＲＯＲ）の発現からなる群から選択されるＴ細胞の表現型を検出することとを含み、
Ｔ細胞がＡＰＣとの接触に応答して増殖できないか、又は一般的に健康な個体の集団又は群として特定の疾患または症状を有していない集団に由来する同じ供給源から単離されたＴ細胞と比較して、そのＴ細胞が正常より多量のＩＬ−１７を産生するか若しくは正常より高いＲＯＲγｔの発現を示す場合、その被験者はＴＨ１７細胞の産生又は生存を阻害する作用剤と共に酵母ベースの免疫療法組成物を投与する候補であると予測される方法。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

政府支援
本発明は、国立癌研究所により授与されたＮＣＩ補助金第ＣＡ１３６１４６号に基づく政府支援でなされたものである。合衆国政府は、本発明について一定の権利を有する。

【0002】

配列表の参照
本出願は、ＥＦＳ−Ｗｅｂによるテキストファイルとして電子的に提出される配列表を含む。「３９２３−２７−ＰＣＴ＿ＳＴ２５」という名のテキストファイルは、サイズが７８ＫＢバイトであり、２０１０年９月１３日に記録された。テキストファイルに含まれている情報は、米国特許法規則１．５２（ｅ）（５）に基づき、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0003】

技術分野
本発明は、一般的に、酵母ベースの免疫療法生成物、並びにそのような生成物により誘発される免疫応答、予防的応答、及び／又は治療的応答を調節する方法、並びに修飾された酵母ベースの免疫療法生成物及び組成物に関する。

【背景技術】

【0004】

２００５年以前は、Ｔ細胞免疫学ドグマの主要な焦点は、２つのＴヘルパー（ＴＨ）細胞サブセットの一般的に認められている役割を指す「ＴＨ１／ＴＨ２パラダイム」と呼ばれるものに向けられていた。ＴＨ細胞は、典型的には表面タンパク質、ＣＤ４を発現し、免疫系の確立及び能力に影響を及ぼすリンパ球である。疾患転帰は、通常、これらのＴ細胞サブセットの一方又は他方へと向かう偏りに関連付けられてきた。その理論的根拠は、抗原が樹状細胞（ＤＣ）等の抗原提示細胞（ＡＰＣ）に導入される様式が、どのＴＨサブセットが優先的に活性化されるかを決定し、したがって免疫系がどのように応答するかに影響を及ぼすという観察に基づいていた。例えば、ウイルス等によるＤＣの直接感染が引き起こす内因性経路では、活性化ＤＣは、インターロイキン１２（ＩＬ−１２）を産生し、それは、ＴＨ１ Ｔ細胞の特異的刺激をもたらした。ＴＨ１活性化は、ＩＬ−２依存性ＣＤ８^＋ Ｔ細胞免疫を駆動するために必要とされるインターロイキン２（ＩＬ−２）の産生をもたらし、次いで感染細胞の直接溶解をもたらした。一方、抗原が食作用による等の外来性経路によりＤＣに提示された場合、ＤＣで産生されたインターロイキン−１０（ＩＬ−１０）は、ＴＨ２活性化、その後のインターロイキン４（ＩＬ−４）の分泌、及びＢ細胞の抗体産生の支援をもたらした。ほとんどの疾患病理は、免疫系に対する内因性又は外来性抗原提示による、免疫応答の細胞性又は体液性のいずれかへの偏りと関連付けられるようになった。抗体が関与していた場合は、ＴＨ２の関与が示唆され、例えば、Ｉ型糖尿病における膵島の細胞媒介性破壊に直接的細胞融解活性が観察された場合、それは、ＴＨ１活性によると仮定された。

【0005】

ＴＨ１／ＴＨ２パラダイムの更なる担い手は、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）であった。Ｔｒｅｇ機能は、一般的に免疫応答の調節及び非活性化に関するものであるが、末梢ではＴＧＦβ及び高ＩＬ−２受容体発現に依存することが見出された（しかし、胸腺では依存しない）。Ｔｒｅｇは、ＴＨ２のようにＩＬ−４を産生し、ＴＨ１細胞の制御におけるＴｒｅｇ機能は、ＩＬ−２をめぐるＴＨ１及びＴｒｅｇ間の競合を伴うと考えられた。

【0006】

ＴＨ１、ＴＨ２、及びＴｒｅｇの排他的な三位一体性は、２００５年、ＩＬ−１２遺伝子をノックアウトすると真菌感染に対する免疫が低下することが研究者により実証された時に変更された。ＩＬ−１２ノックアウトマウスを生成するために使用された分子的根拠に関する注意深い研究により、ＩＬ−１２が、別のサイトカイン、インターロイキン−２３（ＩＬ−２３）とｐ４０共通鎖を共有することが実証された。ＩＬ−２３に特有な非ｐ４０鎖がノックアウトされると、ＴＨ１機能は保持されたが、真菌免疫は阻止され続けた（Ｃｕａら、２００３年；Ｍｕｒｐｈｙら、２００３年）。真菌免疫の原因である主なサイトカインは、インターロイキン−１７（ＩＬ−１７）であり、これは、ＤＣ誘導性ＩＬ−２３により駆動されるＴＨ１７ Ｔ細胞として知られるようになったもの（Ｈａｒｒｉｎｇｔｏｎら、２００５年）により産生されることがすぐに発見された。ＩＬ−１７は、ＴＨ１７細胞の増殖因子でないが（Ｈａｒｒｉｎｇｔｏｎら、２００５年；Ｌａｎｇｒｉｓｈら、２００５年；Ｐａｒｋら、２００５年）、その代り、好中球を動員し、病原体クリアランスをもたらす顆粒球形成を促進する。

【0007】

ＴＧＦβ及びインターロイキン−６（ＩＬ−６）は、ＴＨ１７発生に関連する２つのサイトカインである（Ｂｅｔｔｅｌｉら、２００６年；Ｍａｎｇｅｎら、２００６年；Ｖｅｌｄｈｏｅｎら、２００６年）。ある状況下では、ＴＧＦβは、Ｔｈ１又はＴｈ２の非存在下で最も顕著な（Ｄａｓら、２００９年）ＴＨ１７の増殖因子であり得るが（Ｖｅｌｄｈｏｅｎら、２００６年）、それらの存在下では、Ｔｈ１及びＴｈ２発生を抑制するように機能する場合もある（Ｌｉら、２００７年）。ＴＧＦβは、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の増殖因子でもある（Ｋｏｒｎら、２００９年）。ＴＨ１７及びＴｒｅｇの間で競合して後者が阻害されること（Ｂｅｔｔｅｌｌｉら、２００６年）は、ＴＨ１７が、多発性硬化症（Ｍａｔｕｓｅｖｉｃｉｕｓら、１９９９年；Ｌｏｃｋら、２００２年）、関節リウマチ（Ｍｕｒｐｈｙら、２００３年；Ｋｉｒｋｍａｍら、２００６年）、Ｉ型糖尿病（Ｖｕｋｋａｄａｐｕら、２００５年；Ｂｒａｄｓｈａｗら、２００９年）、乾癬（Ｗｉｌｓｏｎら、２００７年；Ｋｒｕｅｇｅｒら、２００７年）、ブドウ膜炎（Ｌｕｇｅｒら、２００８年）、炎症性腸疾患（Ｆｕｊｉｎｏら、２００３年；Ｄｕｅｒｒら、２００６年）、及びクローン病（Ｓｃｈｍｉｄｔら、２００５年；Ｆｕｓｓら、２００６年）等の自己免疫障害の誘導に関与する機序であるとみなされている。ＴＨ１７関連サイトカイン、ＩＬ−６は、同様にＴｒｅｇ分化を直接的に抑制する（ＤｅＬｕｃａら、２００７年；Ｋｏｒｎら、２００８年）。したがって、ＴＨ１７又はそれらの誘導因子を標的とすることは、自己免疫疾患を治療する有望な手段であることが記述されている（ＤｅＢｅｎｅｄｅｔｔｉ、２００９年；Ｐｅｒｎｉｓ、２００９年）。

【0008】

ＴＨ１、ＴＨ２、ＴＨ１７、及びＴｒｅｇの分子的特徴は、サブセット特異的転写因子、Ｔ−ｂｅｔ、ＧＡＴＡ−３、ＲＯＲ（レチノイン酸オーファン受容体）、及びＦｏｘＰ３によりそれぞれ制御される。ＦｏｘＰ３は、ＩＬ−２転写を阻害し、それによりＩＬ−２の外来性供給源に対する貪欲な食細胞欲がＴｒｅｇに与えられる。ＲＯＲ発現は、抗増殖性であることが報告されている。

【0009】

ＴＨ１７ Ｔ細胞は、クレブシエラ・ニューモニエ（Ｋｌｅｂｓｉｅｌｌａ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、ボルデテラ・パータシス（Ｂｏｒｄａｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、ストレプトコッカス・ニューモニエ（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｎｅｕｍｏｎｉａｅ）、及びカンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ）を含む、特定の細菌性又は真菌性細胞外病原体に応答して誘導される（Ｙｅら、２００１年；非特許文献１；Ｈａｐｐｅｌら、２００５年；Ｈｉｇｇｅｎｓら、２００６年；ＤｅＬｕｃａら、２００７年；Ｌｕら、２００８年；Ｚｈａｎｇら、２００９年）。一般的に、これらの病原体は主として気道、皮膚、及び腸管腔等の露出表面にコロニーを形成する（Ｐｅｃｋ及びＭｅｌｌｉｎｓ、２００９年）。この免疫応答は、微生物成分と、デクチン−１及びＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）を含むＡＰＣ表面の種々のパターン認識受容体（ＰＲＲ）との相互作用により誘発され、ＴＨ１７細胞の活性化及び他の炎症促進性事象をもたらすことが報告されている（例えば、非特許文献２〜４を参照）。デクチン−１及び種々のＴＬＲ経路の活性化は、ＩＬ−２３及びＩＬ−１２経路の相互調節をもたらすことが示されている（例えば、非特許文献５及び６を参照）。ＴＨ１７は、サイトカイン媒介性の好中球動員により、微生物感染を除去する。中でもリステリア・モノサイトゲネス（Ｌｉｓｔｅｒｉａ ｍｏｎｏｃｙｔｏｇｅｎｅｓ）、サルモネラ・エンテリティディス（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｅｎｔｅｒｉｄｉｔｉｓ）、トキソプラズマ・ゴンディ（Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ ｇｏｎｄｉｉ）、クラミジア・トラコマティス（Ｃｌａｍｙｄｉａ ｔｒａｃｈｏｍａｔｉｓ）、及びマイコバクテリウム・ツベルクローシス（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）等の、特定の細胞内病原体に対してＴＨ１７が役割を果たすことに関する根拠も存在する（Ｈａｒｔｙ及びＢｅｖａｎ、１９９５年；Ｄａｌｒｙｍｐｌｅら、１９９５年；Ｃｏｏｐｅｒら、２００２年；Ｋｅｌｌｙら、２００５年；Ｋｈａｄｅｒら、２００５年；Ｓｃｈｕｌｚら、２００８年；Ｚｈａｎｇら、２００８年）。

【0010】

１９９０年代に、酵母ベースの免疫療法組成物が、抗原提示細胞のＭＨＣクラスＩ制限経路及びＭＨＣクラスＩＩ制限経路の両方により免疫応答を誘導するための新規組成物として導入された（特許文献１を参照）。酵母ベースの免疫療法組成物は、最初に外来性抗原として免疫系と接触するが、ＭＨＣクラスＩ制限経路による抗原の交差提示によるＣＤ８＋細胞毒性Ｔ細胞応答と、ＭＨＣクラスＩＩ制限経路による抗原提示によるＣＤ４＋ Ｔ細胞応答の両方の誘導を引き起こすことができる点で独特である（例えば、特許文献１及び２、非特許文献７及び８を参照）。酵母ベースの免疫療法組成物は、パターン認識受容体（ＰＲＲ）を刺激し、接着分子、同時刺激分子、並びにＤＣを含む抗原提示細胞上のＭＨＣクラスＩ及びクラスＩＩ分子を上方制御し、抗原提示細胞による炎症促進性サイトカイン（例えば、ＴＮＦ−α及びＩＬ−１２）の産生を誘導する（例えば、非特許文献７（上記）、非特許文献９を参照）。

【0011】

１つ又は複数の抗原を発現するように操作されていてもよい酵母ベースの免疫療法組成物においては、酵母ベースの免疫療法の免疫系に対する作用機序の複雑性及び治療効力は、完全には特定されていない。様々な個体が酵母ベースの免疫療法組成物による免疫にどのように応答するかをより良好に理解し、それにより免疫療法戦略を操作及び個別化して、個体の所与の疾患又は状態に最も適切な所望の免疫応答をより効果的に誘発することが望ましい。

【先行技術文献】

【特許文献】

【0012】

【特許文献1】米国特許第５，８３０，４６３号明細書

【特許文献2】米国特許第７，０８３，７８７号明細書

【非特許文献】

【0013】

【非特許文献1】Ｈｕａｎｇら、Ｊ．Ｉｎｆｅｃｔ．Ｄｉｓ．１９０巻：６２４〜６３１頁（２００４年）

【非特許文献2】ＬｅｉｂｕｎｄＧｕｔ−Ｌａｎｄｍａｎｎら、Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．８巻（６号）６３０〜６３８頁（２００７年）

【非特許文献3】Ａｃｏｓｔａ−Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ、Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．８巻（６号）：６３９〜６４６頁（２００７年）

【非特許文献4】Ｔａｙｌｏｒら、Ｎａｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ、８巻（１号）：３１〜３８頁（２００７年）

【非特許文献5】Ｇｅｒｏｓａら、Ｊ．ＥＸＰ．Ｍｅｄ．２０５巻（６号）１４４７〜１４６１頁（２００８年）

【非特許文献6】Ｄｅｎｎｅｈｙら、Ｅｕｒ Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ．３９巻（５号）：１３７９〜１３８６頁（２００９年）

【非特許文献7】Ｓｔｕｂｂｓら、Ｎａｔ．Ｍｅｄ．７巻：６２５〜６２９頁（２００１年）

【非特許文献8】Ｌｕら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ６４巻：５０８４〜５０８８頁（２００４年）

【非特許文献9】Ｂｒｏｗｎら、Ｊ Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１９７巻：１１１９〜１１２４頁（２００３年）

【発明の概要】

【0014】

本発明の種々の実施形態が、下記に記述されている。しかしながら、本発明は、この概要に記述されている実施形態に制限されることはなく、以下の説明に記述されている発明も明示的に包含される。

【0015】

本発明の１つの実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物の免疫療法特性を強化する方法に関する。この方法は、被験者に、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＣＤ４＋ ＴＨ１７細胞の産生又は生存を調節する作用剤とを投与するステップを含む。作用剤は、被験者における酵母ベースの免疫療法の免疫療法特性を増強するために、酵母ベースの免疫療法組成物の用量の投与前、投与と同時に、及び／又は投与後に投与される。

【0016】

本発明の別の実施形態は、被験者における酵母ベースの免疫療法組成物の免疫療法特性を増強するための薬剤の調製における組成物の使用に関する。組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物、及び（ｂ）ＣＤ４＋ ＴＨ１７細胞の産生又は生存を調節する作用剤を含む。

【0017】

本明細書に記載の本発明の任意の実施形態の１つの態様では、被験者は、疾患に関連する１つ又は複数の症状に関して、酵母ベースの免疫療法に対する不応答者（ｎｏｎ−ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ）又は部分的応答者（ｐａｒｔｉａｌ ｒｅｓｐｏｎｄｅｒ）である。

【0018】

本発明の更に別の実施形態は、疾患に関連する１つ又は複数の症状に関して酵母ベースの免疫療法に対する不応答者又は部分的応答者である被験者における、酵母ベースの免疫療法の効力を向上させる方法に関する。この方法は、被験者に、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を調節する作用剤を投与して、被験者における酵母ベースの免疫療法の効力を向上させるステップを含み、投与は、酵母ベースの免疫療法組成物の用量の投与前、投与と同時、又は投与後である。

【0019】

上記に記載の本発明の任意の実施形態の１つの態様では、疾患は、ウイルス疾患である。１つの態様では、被験者は、作用剤の非存在下では、酵母ベースの免疫療法の適用に応答して、ウイルスに対する十分な治療的免疫応答を生じさせることができず、治療的応答を達成するのに十分なレベルにウイルス負荷を低減させることができず、及び／又はウイルス感染の少なくとも１つの症状の出現頻度又は重症度を低減させることができない。そのようなウイルス疾患は、限定されないが、肝炎ウイルス感染症（例えば、Ｃ型肝炎ウイルス感染症又はＢ型肝炎ウイルス感染症）を含むことができる。

【0020】

上記に記載の本発明の任意の実施形態の１つの態様では、疾患は癌である。１つの態様では、被験者は、作用剤の非存在下では、酵母ベースの免疫療法に応答して、癌に対する十分な治療的免疫応答を生じさせることができず、全身腫瘍組織量を低減させることができず、腫瘍成長を阻害することができず、及び／又は生存率を向上させることができない。

【0021】

上記に記載の本発明の任意の実施形態の１つの態様では、疾患は細胞内病原体による感染症である。１つの態様では、被験者は、作用剤の非存在下では、酵母ベースの免疫療法の適用に応答して、病原体に対する十分な治療的免疫応答を生じさせることができず、治療的応答を達成するのに十分なレベルまで病原体負荷を低減させることができず、及び／又は病原体感染症の少なくとも１つの症状の出現頻度又は重症度を低減させることができない。

【0022】

本発明の１つの実施形態は、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１媒介性免疫応答を上方制御する方法に関する。この方法は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与するステップと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生又は生存を下方制御する作用剤をその被験者に投与するステップとを含む。

【0023】

本発明の別の実施形態は、癌を治療するか又はその１つ若しくは複数の症状を軽減する方法であって、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与するステップと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生又は生存を下方制御する作用剤をその被験者に投与するステップとを含む方法に関する。

【0024】

本発明の更に別の実施形態は、ウイルス感染症を治療するか又はその１つ若しくは複数の症状を軽減する方法であって、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与するステップと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生又は生存を下方制御する作用剤をその被験者に投与するステップとを含む方法に関する。１つの態様では、ウイルス感染症は、肝炎ウイルス感染症であり、それには、限定されないが、Ｃ型肝炎ウイルス及びＢ型肝炎ウイルスが含まれていてもよい。

【0025】

上記に記載の本発明の実施形態のいずれかにおいて、他の態様を相互に除外しない１つの態様では、被験者は、作用剤の非存在下での酵母ベースの免疫療法組成物の投与の結果として、強力なＴＨ１７応答を生じる。他の態様を相互に除外しない１つの態様では、被験者から単離されたＴ細胞は、酵母ベースの免疫療法組成物との接触に応答して増殖しないか又は増殖が微弱である。他の態様を相互に除外しない１つの態様では、被験者から単離されたＴ細胞は、正常より高いＲＯＲγｔ発現及び／又は正常より高いレベルのＩＬ−１７産生を示す。他の態様を相互に除外しない１つの態様では、被験者は、Ｉ型インターフェロン療法に不応答性であるか又は部分的に応答性である。

【0026】

上述の実施形態のいずれか１つの態様では、方法又は使用は、ＴＨ１細胞の産生若しくは生存を上方制御し、並びに／又はＴｒｅｇの産生及び／若しくは生存を下方制御する作用剤を更に含む。

【0027】

本明細書に記載の実施形態のいずれか１つの態様では、作用剤及び酵母ベースの免疫療法の投与は、酵母ベースの免疫療法組成物単独の投与と比較して、ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を増強する。

【0028】

本明細書に記載の本発明の任意の実施形態の１つの態様では、疾患は、真菌性疾患である。この実施形態の１つの態様では、被験者は、作用剤の非存在下での酵母ベースの免疫療法組成物の投与の結果として、微弱なＴＨ１７応答を生じる。１つの態様では、被験者から単離されたＴ細胞は、酵母ベースの免疫療法組成物との接触に応答して増殖する。１つの態様では、被験者から単離されたＴ細胞は、正常以下のＲＯＲγｔ発現及び／又は正常以下のレベルのＩＬ−１７産生を示す。

【0029】

本明細書に記載の実施形態のいずれか１つの態様では、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存の下方制御、ＴＨ１細胞の産生及び／若しくは生存の上方制御、並びに／又はＴｒｅｇの産生及び／若しくは生存の下方制御が所望される場合、作用剤は、ＩＬ−１、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、又はそれらの受容体の発現若しくは活性を阻害するか、又はＩＬ−２５若しくはＩＬ−２７若しくはそれらのアゴニストである。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−１（ＩＬ−１）又はＩＬ−１の受容体の発現又は活性を下方制御する。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−６（ＩＬ−６）又はＩＬ−６の受容体の発現又は活性を下方制御する。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−１７（ＩＬ−１７）又はＩＬ−１７の受容体の発現又は活性を下方制御する。１つの態様では、作用剤は、ＩＬ−２１又はＩＬ−２１の受容体の発現又は活性を下方制御する。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−２２（ＩＬ−２２）又はＩＬ−２２の受容体の発現又は活性を下方制御する。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−２３（ＩＬ−２３）又はＩＬ−２３の受容体の発現又は活性を下方制御する。１つの態様では、作用剤は、ＩＬ−２５又はＩＬ−２５のアゴニスト又はその受容体である。１つの態様では、作用剤は、ＩＬ−２７又はＩＬ−２７のアゴニスト又はその受容体である。

【0030】

本明細書に記載の実施形態のいずれか１つの態様では、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存の下方制御、ＴＨ１細胞の産生及び／若しくは生存の上方制御、並びに／又はＴｒｅｇの産生及び／若しくは生存の下方制御が所望される場合、作用剤は、以下のものから選択される：Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニスト若しくはそれらの組み合わせ、Ｉ型インターフェロン、ＩＩ型インターフェロン、ＩＩＩ型インターフェロン、ＩＬ−１２、抗ＩＬ−１２Ｒ、抗ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ若しくはそれらのアゴニスト、ＬＡＧ３、ＩＭＰ３２１、可溶性受容体を含むＣ型レクチン受容体、抗炎症剤、免疫調節物質、及び／又は免疫療法ワクチン。

【0031】

本明細書に記載の実施形態のいずれか１つの態様では、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存の下方制御、ＴＨ１細胞の産生及び／若しくは生存の上方制御、並びに／又はＴｒｅｇの産生及び／若しくは生存の下方制御が所望される場合、作用剤は、以下のものから選択される：抗真菌剤、抗生物質、抗炎症剤、免疫調節剤、及び／又はビタミン。

【0032】

本明細書に記載の実施形態のいずれか１つの態様では、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存の上方制御、ＴＨ１細胞の産生及び／又は生存の下方制御又は遅延が所望される場合、作用剤は、ＩＬ−１、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、ＩＬ−２３、若しくはそれらの受容体であるか、又はそれらの発現若しくは活性を誘発若しくは増加させるか、又はＩＬ−２５若しくはＩＬ−２７若しくはそれらの受容体の発現もしくは活性を阻害する。

【0033】

本明細書に記載の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、作用剤は、抗原提示細胞を標的とする。１つの態様では、作用剤は、Ｔ細胞を標的とする。
本明細書に記載の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、作用剤は、以下のものからなる群から選択される：抗体又はその抗原結合部分、ｓｉＲＮＡ、タンパク質又はペプチド、低分子、及びアプタマー。１つの態様では、作用剤は、抗体又はその抗原結合部分である。

【0034】

本明細書に記載の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物の投与と同時に、酵母ベースの免疫療法組成物の投与前に、酵母ベースの免疫療法組成物の投与後に、及び／又は酵母ベースの免疫療法組成物と共に断続的に投与される。

【0035】

本明細書に記載の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物は、作用剤の投与を開始する前のある期間にわたって１つ又は複数の用量で投与される。

【0036】

更に別の態様では、酵母ベースの免疫療法組成物は、作用剤の投与を開始する前のある期間にわたって１つ又は複数の用量で投与される。別の態様では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物の投与を開始する前のある期間にわたって１つ又は複数の用量で投与される。

【0037】

本明細書に記載の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法を受ける被験者の初期免疫応答を調節するのに十分な規定の期間（例えば、所定の若しくは規定の用量数、及び／又は所定の若しくは規定の週数若しくは月数）投与され、その後の期間では、酵母ベースの免疫療法組成物が作用剤の非存在下で投与される。

【0038】

本明細書に記載の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、作用剤を保持又は発現するように操作されている。

【0039】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物の免疫療法特性を増強する方法であって、被験者に酵母ベースの免疫療法組成物を投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母が、遺伝子組換えされており、かつ／又は被験者にＣＤ４＋ ＴＨ１７免疫応答を誘導する酵母の能力を修飾する条件下で産生される方法に関する。更に別の実施形態は、被験者における免疫療法を増強するための酵母ベースの免疫療法組成物の使用であって、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母が、遺伝子組換えされており、かつ／又は被験者にＣＤ４＋ ＴＨ１７免疫応答を誘導する酵母の能力を修飾する条件下で産生される使用に関する。

【0040】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１媒介性免疫応答を増強する方法であって、被験者に酵母ベースの免疫療法組成物を投与するステップを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母が、遺伝子組換えされており、かつ／又は被験者にＴＨ１７免疫応答を誘導する酵母の能力を低減させる条件下で産生される方法に関する。この実施形態の１つの態様では、被験者は癌を有する。１つの態様では、被験者はウイルス感染症を有する。

【0041】

この実施形態の１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のＣ型レクチン受容体（例えば、デクチン）、マンノース受容体、及び／又はＤＣ−ＳＩＧＮ受容体によるシグナル伝達が増加するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生されている。１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のデクチン受容体（例えば、デクチン−１、デクチン−２）、マンノース受容体、及び／又はＤＣ−ＳＩＧＮ受容体によるシグナル伝達が減少するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生されている。１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、酵母の細胞壁表面のβ−グルカンの露出を低減させる又は除去する条件下で産生されている。１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、酵母の細胞壁表面のβ−グルカンの露出を増加させる条件下で産生されている。１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、酵母の細胞壁表面のマンノースの露出を低減させる又は除去する条件下で産生されている。１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、酵母の細胞壁表面のマンノースの露出を増加させる条件下で産生されている。１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物は、ＴＨ１７媒介性免疫応答を誘導する酵母の能力を低減させる条件下で産生されている。別の態様では、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母は、ＴＨ１７媒介性免疫応答を誘導する酵母の能力を増加させる条件下で産生されている。

【0042】

本発明の更に別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法の予測される免疫応答性について被験者をスクリーニングする方法に関する。この方法は、（ａ）被験者に由来するＴ細胞を、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞（ＡＰＣ）とｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させるステップと、（ｂ）ＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞増殖、ＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞によるＩＬ−１７の産生、及びＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞によるレチノイド関連オーファン受容体（ＲＯＲγｔ）の発現からなる群から選択されるＴ細胞の表現型を検出するステップとを含む。そのＴ細胞がＡＰＣとの接触に応答して増殖するか、又はＩＬ−１７の正常産生若しくはＲＯＲγｔの正常発現を示す被験者は、酵母ベースの免疫療法組成物を投与するための良好な候補であると予測される。そのＴ細胞がＡＰＣとの接触に応答して増殖できないか若しくは増殖が不良であるか、又はそのＴ細胞が正常量を超えるＩＬ−１７を産生するか若しくは正常よりも高いＲＯＲγｔの発現を示す被験者は、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を阻害する作用剤と共に酵母ベースの免疫療法組成物を投与するための候補であると予測される。そのＴ細胞が正常量より少ないＩＬ−１７を産生するか又は正常よりも低いＲＯＲγｔの発現を示す被験者は、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を増加させる作用剤と共に酵母ベースの免疫療法組成物を投与するための候補であると予測される。

【0043】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物、及び（ｂ）ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を調節する作用剤を含む組成物に関する。１つの態様では、作用剤は、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を誘発又は下方制御する。１つの態様では、作用剤は、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を上方制御する。そのような作用剤は、上記の他の実施形態及び本明細書の他所に詳細に記述されている。１つの態様では、作用剤は、以下のものからなる群から選択されるサイトカインの発現又は活性を下方制御する：インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及びＩＬ−２３、又はそれらの受容体。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、ＩＬ−２７、又はそれらのアゴニストを含む。１つの態様では、作用剤は、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を誘発又は増強する作用剤を含む。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及びＩＬ−２３、又はそれらのアゴニストを含む。１つの態様では、作用剤は、インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、ＩＬ−２７、又はそれらの受容体の発現又は活性を下方制御する。

【0044】

本発明の更に別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物のいずれか及び／又は本明細書に記載の作用剤のいずれかを含む組成物のいずれかを含むキットに関する。
本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法に対する被験者のＴ細胞の増殖応答を調節する方法に関する。この方法は、被験者に、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を調節する作用剤を投与して、酵母ベースの免疫療法に対する被験者のＴ細胞増殖応答を調節することを含み、投与は、酵母ベースの免疫療法組成物の用量の投与前、投与と同時、又は投与後である。この実施形態に有用な作用剤には、上記又は本明細書の他所に記載されているＴＨ１７免疫応答を調節するための作用剤のいずれかが含まれる。

【0045】

本発明の更に別の実施形態は、ＴＨ１媒介性免疫応答を増強する酵母ベースの免疫療法組成物を生成する方法に関する。この方法は、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母を、酵母ベースの免疫療法組成物が投与される被験者のＴＨ１７媒介性応答を低減させるのに効果的な様式で遺伝子操作することを含む。

【0046】

本発明の更に別の実施形態は、ＴＨ１媒介性免疫応答を増強する、酵母ベースの免疫療法組成物を生成する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物が投与される被験者のＴＨ１７媒介性応答を低減させるのに効果的な条件下で、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母を産生することを含む方法に関する。

【0047】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及びＩＬ−２３、又はそれらの受容体からなる群から選択されるサイトカインの発現又は活性を下方制御する作用剤とを含む組成物に関する。

【0048】

本発明の更に別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、ＩＬ−２７、又はそれらのアゴニストとを含む組成物に関する。

【0049】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７細胞の産生又は生存を誘発又は増強する作用剤とを含む組成物に関する。
本発明の更に別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及びＩＬ−２３、又はそれらのアゴニストからなる群から選択されるサイトカインとを含む組成物に関する。

【0050】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、ＩＬ−２７、又はそれらの受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤とを含む組成物に関する。

【0051】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７細胞を下方制御する作用剤とを含むキットに関する。
本発明の更に別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及び／若しくはＩＬ−２３、並びに／又はそれらの受容体からなる群から選択されるサイトカインの発現又は活性を下方制御する作用剤とを含むキットに関する。

【0052】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、ＩＬ−２７、又はそれらのアゴニストとを含むキットに関する。

【0053】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７細胞の産生又は生存を上方制御する作用剤とを含むキットに関する。
本発明の更に別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及びＩＬ−２３、又はそれらのアゴニストからなる群から選択されるサイトカインとを含むキットに関する。

【0054】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、ＩＬ−２７、又はそれらの受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤とを含むキットに関する。

【0055】

本発明の別の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７細胞を検出するための試薬とを含むキットに関する。
本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物に対する抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定する方法であって、（ａ）非ヒト動物を酵母ベースの免疫療法組成物で免疫し、ＴＨ１７応答が非ヒト動物で阻害又は阻止されるステップと、（ｂ）免疫された非ヒト動物に、等数の標識された標的細胞（標的細胞は抗原を発現又は提示し、その抗原に対して酵母ベースの免疫療法組成物がＴ細胞応答を誘発する）及び標識された非標的細胞（非標的細胞は抗原を発現又は提示しない）の混合物を注射するステップであって、標的細胞が、非標的細胞とは異なるように標識されているステップと、（ｃ）非ヒト動物から、標識された標的細胞及び標識された非標的細胞を含有する細胞集団を収集するステップと、（ｄ）非標的細胞に対する標的細胞の比率の違いを検出することにより、非ヒト動物の抗原特異性ＣＤ８＋ Ｔ細胞を測定し、非標的細胞と比較した標的細胞の低減が、非ヒト動物の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答のレベルを示すステップとを含む方法に関する。１つの態様では、標的細胞は、標的抗原のペプチドをパルスした脾臓細胞である。１つの態様では、（ｃ）の細胞集団は脾臓に由来する。１つの態様では、標的細胞は、標的抗原を発現する腫瘍細胞である。１つの態様では、（ｃ）の細胞集団は肝臓に由来する。１つの態様では、ステップ（ｄ）は、フローサイトメトリーを使用して実施される。

【0056】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物に対する抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定する方法であって、（ａ）非ヒト動物を酵母ベースの免疫療法組成物で免疫し、ＴＨ１７応答が非ヒト動物で阻害又は阻止されるステップと、（ｂ）（ａ）の免疫された非ヒト動物から、ＣＤ８＋ Ｔ細胞を含有する細胞集団を収集するステップと、（ｃ）（ｃ）の集団中のＣＤ８＋ Ｔ細胞の抗原−ＭＨＣ複合体を検出する能力を検出することにより、非ヒト動物の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定するステップとを含む方法に関する。１つの態様では、（ｃ）の細胞集団は、末梢血単核細胞を含有する集団である。１つの態様では、抗原−ＭＨＣ複合体は四量体である。

【0057】

抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定する上述の方法のいずれかにおいて、１つの態様では、非ヒト動物はマウスである。１つの態様では、ＩＬ−１、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及び／又はＩＬ−２３から選択されるサイトカインの発現又は活性は、非ヒト動物で阻止又は阻害される。１つの態様では、非ヒト動物は、ＩＬ−６ホモ接合型ノックアウトマウスである。

【0058】

上記又は本明細書の他所に記載の方法、使用、組成物、又はキットのいずれかにおいて、１つの態様では、酵母ベースの免疫療法組成物は、酵母媒体及び抗原を含み、抗原は、酵母媒体により発現されるか、酵母媒体に結合されているか、又は酵母媒体と混合されている。１つの態様では、抗原は、酵母媒体により発現される。１つの態様では、抗原は、酵母媒体と混合されている。１つの態様では、抗原は、酵母媒体に結合されている。１つの態様では、酵母媒体は、全酵母、酵母スフェロプラスト、酵母サイトプラスト、酵母ゴースト、及び／又は亜細胞酵母膜抽出物若しくはその画分からなる群から選択される。１つの態様では、酵母媒体は、全酵母及び／又は酵母スフェロプラストから選択される。１つの態様では、酵母媒体は、全酵母である。１つの態様では、酵母媒体は、熱不活化全酵母である。１つの態様では、酵母媒体は、サッカロマイセス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）に由来する。１つの態様では、酵母媒体は、サッカロマイセス・セレビシエ（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）に由来する。

【図面の簡単な説明】

【0059】

【図1】酵母ベースの免疫療法生成物による免疫に起因する一次抗原特異的ＣＤ８＋細胞媒介性免疫の発生を示すフローサイトメトリーグラフである（図１Ａ＝ＯＶＡＸ、図１Ｂ＝ＹＶＥＣ＋オボアルブミン、図１Ｃ＝ＹＶＥＣ、図１Ｄ＝未感作）。

【図2】酵母＋オボアルブミン（図２Ａ）、オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（図２Ｂ）、酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０（図２Ｃ）、ならびにｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０（図２Ｄ）で免疫した野生型マウスにおける一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。

【図3】図３Ａ〜３Ｃは、免疫していない（未感作、図３Ａ）；酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（酵母、図３Ｂ）；及びｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（ｐａｍ３ｃｙｓ、図３Ｃ）野生型マウス（ＷＴ）における一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。図３Ｄ〜３Ｆは、免疫していない（未感作、図３Ｄ）；酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（酵母、図３Ｅ）；及びｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（ｐａｍ３ｃｙｓ、図３Ｆ）ＩＬ−１２Ｒβノックアウトマウス（ＩＬ−１２Ｒβ−／−）における一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。図３Ｇ〜３Ｉは、免疫していない（未感作、図３Ｇ）；酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（酵母、図３Ｈ）；及びｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（ｐａｍ３ｃｙｓ、図３Ｉ）ｔｂｅｔノックアウトマウス（ｔｂｅｔ−／−）における一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。

【図4】酵母＋抗ＣＤ４０で免疫した（図４Ａ）、酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（図４Ｂ）、及びｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（図４Ｃ）ＭｙＤ８８ノックアウトマウスにおける一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。

【図5】野生型マウス（ＷＴ、黒色バー）、ＴＬＲシグナル伝達タンパク質ＭｙＤ８８を欠如するマウス（ＭｙＤ８８−／−、白色バー）、又はＣＤ４＋ Ｔ細胞を欠如するマウス（ＭＨＣクラスＩＩ−／−、灰色バー）において発生したＣＤ８＋ Ｔ細胞のパーセントを、ＷＴマウスでｐａｍ３ｃｙｓに応答して発生した抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度（第１列で１００％として表されている）とＹ軸で比較して示す棒グラフである。

【図6】オボアルブミン＋抗ＣＤ４０で免疫した（図６Ａ）、酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（図６Ｂ）、及びｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（図６Ｃ）ＩＬ−６ノックアウトマウスにおける一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。

【図7】未感作マウス（未免疫）により、ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫したマウス（ｐａｍ３ｃｙｓ）により、並びに酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫したマウス（酵母）により生成された、ＩＬ−１７を産生するＣＤ４＋ Ｔ細胞の出現頻度（Ｙ軸）を示す棒グラフである。

【図8】図８Ａ〜８Ｂは、酵母ベースの免疫療法組成物で免疫した後のｔｂｅｔノックアウトマウス及び野生型マウスの脾臓（図８Ａ）及び肺（図８Ｂ）で産生されたインターフェロン−γのパーセントを示す棒グラフである。図８Ｃ〜８Ｄは、酵母ベースの免疫療法組成物で免疫した後のｔｂｅｔノックアウトマウス及び野生型マウスの脾臓（図８Ｃ）及び肺（図８Ｄ）で産生されたインターロイキン−１７（ＩＬ−１７）のパーセントを示す棒グラフである。

【図9】オボアルブミン＋抗ＣＤ４０で免疫した（図９Ａ）、酵母＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（図９Ｂ）、及びｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン及び抗ＣＤ４０で免疫した（図９Ｃ）デクチン−１ノックアウトマウス（デクチン−１ −／−）における一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。

【図10】ＭｙＤ８８ノックアウトマウス（図１０Ａ）、野生型マウス（図１０Ｂ）、及びＩＬ−６ノックアウトマウス（図１０Ｃ）を、酵母、オボアルブミン、及び抗ＣＤ４０で免疫した後の一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生を示すフローサイトメトリーグラフである。

【図11】オボアルブミンに対して抗原特異的である、図３Ａ〜３Ｃの酵母ベースの免疫療法で免疫したマウスに由来する集団におけるＣＤ８ Ｔ細胞の実際のパーセントを示すグラフである。

【図12】酵母ベースの免疫療法による１回目の免疫（一次、白色バー）後の、及び６０日後の同一の第２の免疫（記憶、黒色バー）後の、野生型及びＩＬ−６ノックアウトマウスにおける抗原特異的ＣＤ８ Ｔ細胞の出現頻度を示す棒グラフである。

【図13】酵母ベースの免疫療法組成物で免疫したＩＬ−６ノックアウトマウスの流入領域リンパ節及び非流入領域リンパ節の制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）のパーセントを示す棒グラフである。

【図14】野生型（ＷＴ、黒色バー）及びＩ型インターフェロン受容体ノックアウトマウス（ＩＦＮαＲ−／−、白色バー）において、ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０で免疫したマウス（ｐａｍ３ｃｙｓ、ＷＴのみで示された１００％の対照セット）で、及び酵母＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０で免疫したマウス（酵母）で発生したＣＤ８＋ Ｔ細胞のパーセントを示す棒グラフである。

【発明を実施するための形態】

【0060】

本発明は、一般的に、酵母ベースの免疫療法組成物が免疫系と相互作用する機序の本発明者らの発見、並びに酵母ベースの免疫療法組成物を含有する組成物を生成又は処方するための新規方法を提供するためのこの発見の使用、並びに酵母ベースの免疫療法を使用して免疫応答を特異的に調節し、個体の種々の疾患状態に対する酵母ベースの免疫療法の効力を向上させる方法及び組成物に関する。本発明は、酵母ベースの免疫療法組成物により誘発された免疫応答を測定するための方法及びキット、並びに酵母ベースの免疫療法組成物により誘発された免疫応答について被験者をスクリーニングするための方法も含む。

【0061】

免疫療法の主な目的は、抗原特異的ＣＤ８＋ エフェクターＴ細胞を生成及び増殖させることであった。このプロセスは、ＣＤ８ Ｔ細胞により使用されるクラスＩ ＭＨＣ経路に対するウイルス抗原又は腫瘍抗原の交差提示を増強するＩ型インターフェロンにより促進することができ、Ｉ型インターフェロンは、ウイルス複製の直接阻害等の他の効果を示すインターフェロン応答遺伝子を上方制御する。残念ながら、インターフェロン媒介性療法は一律に成功するものではなく、したがって、Ｉ型インターフェロン非依存性経路を使用することは有用である。

【0062】

本発明は、酵母ベースの免疫療法が、インターフェロン非依存性かつＣＤ４依存性のＣＤ８ Ｔ細胞の生成を引き起こすという根拠を提供し、更に、酵母ベースの免疫応答を、特定の個体において及び特定の疾患又は状態について望まれる免疫応答のタイプを「個別化」又は選択的に修飾するように制御することができることを実証する。より詳しくは、本明細書では、酵母ベースの免疫療法剤の投与が、ＴＨ１７ Ｔ細胞を誘導し、このＴＨ表現型の誘導が、ＩＬ−１２に依存するＴＨ１ ＣＤ４^＋及び抗原特異的ＣＤ８^＋ Ｔ細胞媒介性免疫のＩ型インターフェロン非依存的発生と同時に生じることが実証される。更に本明細書では、酵母ベースの免疫療法剤で繰り返し免疫した後でのＣＤ８^＋ Ｔ細胞の持続性は、Ｔｒｅｇの出現頻度を低減させる酵母ベースの免疫療法剤による対抗手段の発生と関連することが実証される。したがって、酵母によるＴＨ１７誘導は、インターフェロン非依存性かつＣＤ４依存性ＣＤ８^＋ Ｔ細胞応答が生じることを可能にすることにより、及びＣＤ８^＋細胞を別様に制御する制御性Ｔ細胞を妨害することにより、持続的なＣＤ８^＋ Ｔ細胞発生を支援することができる。ＴＨ１７を活性化させずにＴＬＲを使用する他の免疫刺激手法は、Ｔｒｅｇの機能を妨害するこの免疫制御成分を欠如する場合があり、酵母ベースの免疫療法の有益性を例示する。更に、ＴＬＲアゴニスト手法等の、ＴＬＲを使用する他の免疫刺激手法は、Ｉ型インターフェロンに依存する場合があり、Ｉ型インターフェロン非依存性細胞媒介性免疫応答を誘発する酵母ベースの免疫療法の能力は、Ｉ型インターフェロンに応答する能力を欠如するか又は損なわれている個体に対する、免疫応答性の手段の適用を可能にする。

【0063】

まとめると、これらのデータは、酵母ベースの免疫療法により発生する持続的かつ免疫療法的に生産的な細胞媒介性免疫の発生におけるＴＨ１及びＴＨ１７間の複雑な均衡を明らかにし、これらの経路の調節が、所与の個体及び／又は疾患状態の免疫応答を適合させる方法であることを示している。

【0064】

例えば、本発明者らは、本明細書で、酵母ベースの免疫療法が媒介する抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生が、ＴＨ１７ Ｔヘルパー細胞経路を調節することにより強く影響され得ることを実証する。実際、酵母ベースの免疫療法の均衡ポイントは、ＣＤ８＋ Ｔ細胞発生を制御することができるＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の発生と共に停止するという根拠が、本明細書に提供されている。この例では、本発明者らは、ＩＬ−６の枯渇により、免疫応答を、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１７経路性ＣＤ８＋抗原特異的Ｔ細胞応答に向けて駆動するサイトカインが、例えば、総ＣＤ８＋応答のおよそ１〜５％からおよそ２５〜３３％以上に著しく増加する場合があることを示す。酵母ベースの組成物の投与の結果として産生される炎症促進性ＩＬ−６はＴＨ１媒介性応答に負の影響を及ぼす一方で、酵母ベースの免疫療法組成物はＴＨ１媒介性ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の強力な誘導因子であることが知られている、という、はっきりした難問が存在する。しかしながら、本明細書に記載の発見を考慮すると、理論により束縛されないが、本発明者らは、酵母ベースの免疫療法剤が部分的に真菌として作用し、ＴＨ１７経路を誘導し、これが、ＴＨ１炎症ではなくＴＨ１７の初期発生によるＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生に大きな影響を及ぼすと考える。より詳しくは、本発明者らは、酵母ベースの免疫療法がほとんどの個体でＴＨ１７応答をもたらす初期炎症促進効果を示し、ＴＨ１７応答は、炎症が解消するにつれてＣＤ８＋ Ｔ細胞増殖を支援するＴＨ１媒介性応答に移行すると考える。本発明者らは、このＴＨ１７経路を阻止又は阻害する作用剤は、ＩＬ−６を阻害する作用剤を含むがそれに限定されず、初期ＴＨ１７応答をＩＬ−１２依存性ＴＨ１経路に向けて再集中させることにより、又は幾つかの個体により経験される場合があるＴＨ１７経路に対する「過剰傾倒」を低減させることにより、ＣＤ８＋ Ｔ細胞発生を促進するであろうと提唱する。そのような作用剤は、ＣＤ８応答が所望される場合（例えば、癌又はウイルス感染症において）、酵母ベースの免疫療法に対して部分的応答又は不応答を示す被験者に特に有用であるが、そのような作用剤は、ほとんどの個体において酵母ベースの免疫療法により発生するＣＤ８応答を増強すると予想され、したがって、一般的に、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１媒介性免疫応答を増強するために使用することができる。同様に、逆の手法を使用して、より強力なＴＨ１７応答が有益であり得る状況で（例えば、真菌感染症又は細胞外病原体感染症）、より弱いＴＨ１７応答を示す被験者のＴＨ１７応答を増強することができる。

【0065】

理論により束縛されないが、本発明者らは、個体が、様々なＴＨ１７設定ポイントを有しており、「より弱い」又は「より強い」ＴＨ１７産生体のいずれかに大きく分類することができると考える。より弱いＴＨ１７活性は、Ｉ型インターフェロン及びＣＤ４非依存性ＣＤ８ Ｔ細胞応答に対する応答性と相関し、より強いＴＨ１７活性は、最終的かつ優先的なＣＤ４ ＴＨ１媒介性のＣＤ８ Ｔ細胞の発生と相関する。一般的に、より弱いＴＨ１７活性は、ＣＤ４ Ｔ細胞非依存性及びＩ型インターフェロン依存性と一致し、より強いＴＨ１７活性は、ＣＤ４ Ｔ細胞依存性及びＩ型インターフェロン非依存性と一致する。したがって、酵母ベースの免疫療法は、個体のＴＨ１７活性を制御することにより修飾することができる療法を提供し、ある患者集団及び／又はある疾患若しくは状態に特に有用であり得る、Ｉ型インターフェロンに基づく療法に対する免疫応答性の代替的又は追加的経路も提供する。本発明は、１つの方向又は別の方向に免疫応答を「偏らせる」という様式で、酵母ベースの免疫療法に対する免疫応答を「調節」することを対象とすると理解される。言い換えれば、ほとんどの状況では、Ｔｒｅｇ経路に対して、ＴＨ１経路に対して、ＴＨ１７経路を完全に阻止又は過剰活性化することは必ずしも望ましくはなく、むしろ、免疫療法の治療効果を最大限にするためには、治療しようとする疾患は何か、どのタイプの免疫応答がどの時点で最も有益になるか、及び個体が酵母ベースの免疫療法にどのように応答するかに基づいて、応答を調節することが望ましい。

【0066】

酵母ベースの免疫療法に起因するＴＨ１７からＴＨ１の利用に取り組む１つの方法は、ＩＬ−６に大きく依存するＴＨ１７開始を制限することであるため、本発明者らは、ＩＬ−６ノックアウトマウスにおいて酵母ベースの免疫療法技術を試験することを選択した。本発明者らは、酵母ベースの免疫療法組成物を投与すると、このマウスでは、免疫応答が直ちにＴＨ１７から直接ＴＨ１に移行することを発見した。より詳しくは、野生型マウスは、１用量のＴＡＲＭＯＧＥＮ（商標）免疫療法（酵母ベースの免疫療法、Ｇｌｏｂｅｌｍｍｕｎｅ，Ｉｎｃ．社、ルーイビル、コロラド州）を適切に投与した後で、１〜５％の抗原特異的ＣＤ８＋細胞を再現性よく発生させたが、この出現頻度は、ＩＬ−６ノックアウトマウスにおいていつも決まって３０％以上に増加した（例えば、図２Ｃ及び図６Ｂを参照）。したがって、野生型マウスのＩＬ−６は、ＴＨ１からＣＤ８＋ Ｔ細胞への移行を少なくとも遅延させており、理論により束縛されないが、本発明者らは、これがＴＨ１７経路の活性化によるものであったと考える。興味深いことには、ＴＬＲ２経路による（Ｐａｍ３ｃｙｓによる）抗原特異的ＣＤ８^＋ Ｔ細胞の発生は、ＩＬ−６の消失により影響を受けなかった。

【0067】

これらの結果は、酵母ベースの免疫療法の機序が、ＴＨ１ Ｔ細胞に加えて、ＩＬ−６及びＴＨ１７ Ｔ細胞の（したがって、ＩＬ−１７又はＩＬ−２３等の、ＴＨ１７経路におけるサイトカインの）役割を含むことを示した。本発明者らは、本明細書で、野生型及びＴ−ｂｅｔノックアウトマウス（つまり、ＴＨ１依存性転写因子、Ｔ−ｂｅｔが欠失しているマウス）を使用した並列実験により、酵母ベースの免疫療法の適用後にＴＨ１７及びＴＨ１ Ｔ細胞が両方とも誘発されることを更に実証した。酵母ベースの免疫療法により、ＴＨ１及びＴＨ１７ Ｔ細胞が両方とも誘導されたが、ＴＬＲ２アゴニストによっては誘導されなかった。したがって、全酵母ベースの免疫療法は、ＴＨ１７により影響を受け／制御され、次いでＩＬ−６依存性プロセスにより誘導されるＴＨ１依存性プロセスにより、ＣＤ８ Ｔ細胞を発生させることができる。

【0068】

興味深いことには、酵母依存性ＣＤ８ Ｔ細胞応答は、ＴＨ１依存性ＣＤ４ Ｔ細胞集団が除去されると、バックグラウンドレベルに低下したが（実施例２を参照）、ＣＤ４ Ｔ細胞集団（つまり、ＴＨ１、ＴＨ１７等）が全て除去されると、酵母ベースの免疫療法は、野生型マウスにおける対応するＣＤ８応答と比べて向上したＣＤ８応答を誘導した。まとめると、これらの結果は、ＣＤ４ Ｔ細胞が、ＴＬＲ特異的刺激に対する免疫応答とは異なる様式で、酵母に対するＣＤ８応答を制御することを示す。ＣＤ４ Ｔ細胞が欠けている環境で生じることに留意されたいが、酵母は、ＣＤ４非依存性ＴＬＲアゴニストｐａｍ３ｃｙｓで観察された応答と同等のＣＤ４非依存性ＣＤ８ Ｔ細胞応答を誘発することができ、酵母は、更に別のＣＤ４サブセット、ＴＨ１７により影響を受けるＴＨ１ ＣＤ４依存性／ＩＬ−１２依存性ＣＤ８ Ｔ細胞応答も誘発することができ、酵母免疫に対する応答の誘導及び制御の両方における、酵母により発生するＣＤ４ Ｔ細胞の役割が確認される。

【0069】

本発明者らは、樹状細胞上のＣ−タイプレクチン受容体であるデクチン−１の結合は、酵母ベースの免疫療法剤がＩＬ−６産生及びＴＨ１７応答を誘導するための唯一の機序ではないことも示す。理論により束縛されないが、本発明者らは、デクチン−２受容体、マンノース受容体、ＤＣ−ＳＩＧＮ受容体、及び／又は他のＣ−タイプレクチン受容体が含まれ得るがこれらに限定されないデクチン−１受容体以外の受容体の結合の結果としてＩＬ−６が産生され得ると考える。

【0070】

本発明者らは、酵母ベースの免疫療法に起因するＴＨ１７ Ｔ細胞の誘導が、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）出現頻度の低減と関連することも実証した（実施例５を参照）。ＴＨ１７誘導は、Ｔｒｅｇと負に関連しており、ＴＨ１７細胞は、ＴＨ１細胞と同軸上にあるだけでなく、ＴｒｅｇをＴＨ１７表現型に変換可能であることも証拠付けられている。実際、自己免疫は、制限性ＴＧＦβを競合し、Ｔｒｅｇ発生経路を欠乏させるＩＬ−６駆動性ＴＨ１７の持続性と関連すると考えられる。酵母ベースの免疫療法がＴｒｅｇを低減させるという観察の１つの説明は、ＩＬ−６が、ＴＨ１７誘導性の環境では、ＩＬ−６媒介性のＦｏｘＰ３機能の妨害により制御性Ｔ細胞発生を直接標的とするということであるが、本発明者らは、理論により束縛されないが、本明細書に示されているデータにより、他の説明が支持されると考える。例えば、ＩＬ−６ノックアウトマウスにおける酵母ベースの免疫療法による著しく増強された抗原特異的ＣＤ８^＋ Ｔ細胞応答の生成は、ＴＨ１７ Ｔ細胞誘導の欠乏の結果であり、以前は協調したＴＨ１−ＴＨ１７免疫応答であったものをＴＨ１に高度に偏ったものへと偏らせる可能性がある。本明細書に提供されているデータにより、別の代替的説明が支持される。ＴＨ１７は、Ｔｒｅｇのように、生存をＴＧＦβに依存しており、Ｔ細胞がＴＧＦβの存在下でＴＨ１７になるか又はＴｒｅｇになるかの違いは、ＩＬ−６の存在、及びＴＧＦβに対するＴＨ１７の感受性の増加である。つまり、ＴＨ１７はＴｒｅｇほどＴＧＦβを必要としない。ＴＨ１７ Ｔ細胞は、必要とするＴＧＦβの量が少ないため、この必須増殖因子をめぐるＴｒｅｇとの競合に「勝利する」。ＩＬ−２１依存性経路等のＩＬ−６非依存性経路によりＴＨ１７を産生させることもできる可能性がある。この経路に関する独立した根拠は、本明細書に記載の反復免疫研究に由来する。ＩＬ−６の非存在が、最終的に、制御されていないＴｒｅｇの誘導に有利であると仮定すると、抗原特異的ＣＤ８^＋Ｔ細胞応答は、免疫の出現頻度と共に低下するであろうと予想される。しかしながら、実施例に示されているように、酵母ベースの免疫療法の適用は、ＩＬ−６ノックアウトマウスのバックグラウンドでさえ、時間の経過と共に持続する免疫応答をもたらす。したがって、酵母ベースの免疫療法剤は、個体におけるＴｒｅｇの持続性を調節する機会を更に提供する。

【0071】

本明細書に記載の発見に基づき、本発明は、酵母ベースの免疫療法が、抗真菌免疫療法、抗ウイルス免疫療法、及び抗腫瘍免疫療法を含むがそれらに限定されない様々なタイプの免疫療法の価値を有し相互に排他的でない少なくとも６つの作用様式を有することを企図する。第１に、酵母ベースの免疫療法組成物は、直接的に腫瘍を溶解する抗原特異的ＣＤ８^＋陽性Ｔ細胞を発生させる。これらのＣＤ８^＋ Ｔ細胞は、上で言及した６つの作用様式のうちの２つである少なくとも２つの様式で発生させることができる：１）抗原特異的ＣＤ８^＋ Ｔ細胞の直接的活性化をもたらす、外因的に貪食された酵母の交差提示；及び２）ＣＤ８^＋ Ｔ細胞の機能保持に不可欠なＩＬ−２等のサイトカインを産生するＩＬ−１２依存性Ｉ型インターフェロン非依存的機序によるＴＨ１細胞の発生。第３の作用様式は、ＩＬ−２１を産生する細胞の酵母ベースの発生である。ＩＬ−２１は、ＣＤ８ Ｔ細胞の生存を増強するように機能することができ、したがってより長期的な免疫応答を促進する。酵母ベースの免疫療法の第４の作用様式は、酵母免疫療法により誘導される炎症が軽減され、酵母を貪食していない動員好中球が死滅し、次いでそれら自体が貪食されると共に、ＴＨ１の発生が有利な条件に変換するＴＨ１７細胞の発生である。これらの最初の４つの機序は全て、ＴＨ１７からＴＨ１への免疫応答の偏りの恩恵を受けており、それは下記により詳細に記述されている。第５に、ＴＨ１７ Ｔ細胞は、好中球の動員による直接的殺腫瘍活性又は間接的殺腫瘍活性のいずれかでＩＬ−１７を産生し、したがって、ＴＨ１７応答及びＴＨ１応答の両方が、癌に有益である。この作用様式は、これらの経路のより定方向の一時的な調節が、抗癌効力を向上させることができることを示す。第６に、ＴＨ１７は、ＴＧＦβに関してＴｒｅｇと競合し、したがって免疫抑制的Ｔｒｅｇ活性を調節する（つまり、Ｔｒｅｇ活性を低減させる）。これは、酵母ベースの免疫療法により誘導されるＴＨ１７応答に対する別の有益性であり、それを活用して、被験者における免疫療法の効力を増強することができる。したがって、酵母ベースの免疫療法は、免疫療法を用いて感染症又は疾患に取り組む多経路手法を提供し、この経路を更に修飾して、所望の治療手法及び治療しようとする個体に基づき、１つの方向又は別の方向に応答を偏らせることができる。

【0072】

したがって、本発明は、標的、及び疾患兆候、並びに酵母ベースの免疫療法組成物の投与後に、一方のＴＨ細胞経路又は他方の経路によってより活発に応答する個体の一般的な傾向に応じて、酵母ベースの免疫療法を使用して免疫応答を調節するための方法を提供する。ＴＨ１経路は、抗原特異的細胞媒介性免疫の発生と顕著に関連しており、ＴＨ１７経路は、抗真菌特性、抗腫瘍特性、及びＴｒｅｇの中和の発生と関連する。ＩＬ−６及びＩ型インターフェロンの役割、並びにＣＤ４０の結合（又は樹状細胞の活性化）も、このプロセスにおいて重要である。酵母ベースの免疫療法により媒介されるＴＨ１及びＴＨ１７応答の発生におけるこれらの免疫調節剤間の相互作用を理解することにより、本発明者らは、これらの経路を調節して、特定の治療転帰をより正確に計画し、したがって酵母ベースの免疫療法基盤の能力を強化することができるということを提示する。加えて、個体をスクリーニングして、酵母ベースの免疫療法を使用した治療が（例えば、治療しようとする疾患、所望の免疫応答のタイプ、及びＴＨ１７応答に向かって又は離れるように偏る免疫応答を開始する個体の傾向に応じて）どの程度最良であるかを決定することもでき、それにしたがってそのような免疫療法を個別化することができる。手短に言うと、酵母ベースの免疫療法は、２つのＣＤ４経路を活性化する単一生成物を使用した治療的免疫調節の機序を表しており、本明細書に記載の発見を考慮すると、今やこの知識を活用して免疫応答を更に調節することができる。

【0073】

酵母ベースの免疫療法剤（例えば、ＴＡＲＭＯＧＥＮ（商標）製品）が、レチノイド関連オーファン受容体（ＲＯＲ）の発現、特にＴＨ１７ Ｔ細胞によるＲＯＲγｔの発現を含むＴＨ１７表現型を誘発することが、本発明者らにより本明細書で実証されていることを考慮すると、理論により束縛されないが、本発明者らは、およそ２５％の患者が、初回抗原刺激の後でさえｉｎ ｖｉｔｒｏで酵母ベースの免疫療法剤に対するＴ細胞増殖応答を開始することができないという観察の１つの説明は、ＴＨ１７サブセットの持続性を反映している可能性があり、これらの患者が、抗増殖性ＴＨ１７応答に対する「過剰傾倒」を示すことを示唆していると考える。持続的なＴＨ１７応答は、そのような患者において、ＣＤ８^＋ Ｔ細胞応答を含むＴＨ１応答及び抗原特異的免疫への効果的な「変換」又は開始を防止又は阻害することができる。これらの個体の幾つかでは、この欠損は、ＴＨ１７表現型への偏りの結果としてのＩ型インターフェロン依存性Ｔ細胞応答を発生させる能力の欠損であってもよく、それら個体の場合、酵母ベースの免疫療法は、そのような個体が効果的なＣＤ８応答を開始するための利点及び手段であり得ると予想される。そのような個体のうち他の個体では、より強いＴＨ１７応答への偏りは、実際に酵母ベースの免疫療法に対する効果的なＣＤ８＋応答を生み出すそれらの能力を損なう場合があり（つまり、応答がＴＨ１７応答へと非常に偏っているため、ＴＨ１応答に戻る変換が制限されている）、そのような患者は、本明細書に記載のような、酵母誘導性ＴＨ１７応答を下方制御又は調節するための追加的治療手法を必要とする場合がある。注記したように、酵母ベースの免疫療法により誘発される多経路応答は、治療上有益であると考えられるため、ＴＨ１７応答を全て阻止又は遮断することは一般的に望ましくない。或いは、持続的なＴＨ１７応答は、そのような患者の免疫応答の臨床効力を実際に増強する場合があるか、又はＴＨ１応答とは異なるが、少なくともある条件下では臨床的に効果的でもある免疫応答を単に表している場合がある。実際、ＴＨ１７及びＴＨ１応答を同時に発生させることに価値があるはずであり、ＴＨ１７は、Ｔｒｅｇを標的とすることにより最終的にＴＨ１応答を向上させ、及び長期的記憶ＣＤ８^＋応答を促進するＩＬ−２１等のサイトカインを産生することができる。加えて、真菌性疾患の場合には、ＴＨ１７優勢免疫応答が好ましい可能性があり、追加的な長期的ＣＤ８＋記憶応答が望ましい。いずれの場合でも、酵母ベースの免疫療法組成物の効力を向上又は増強するために、どのタイプの免疫応答が所与の標的又は疾患により効果的であるはずであるかに応じて、一方又は他方のタイプの応答に向けて個体の免疫応答を効果的に調節するために本発明を使用することができる。実際、本発明は、両タイプの免疫応答が有益な役割を果たすことができる疾患状態に対して、抑制された一時的な様式でＴＨ１７応答を提供しその後ＴＨ１応答を提供するように免疫応答を調節する機会を提供する。

【0074】

ＧＩ−４０００−０１として知られている酵母ベースの免疫療法（ＴＡＲＭＯＧＥＮ（商標）療法、Ｇｌｏｂｅｌｍｍｕｎｅ，Ｉｎｃ．社、ルーイビル、コロラド州）の、結腸直腸癌及び膵癌被験者における第１相非盲検用量漸増安全性治験には、５人の長期生存者があった。５人の長期生存者は皆、Ｔ細胞増殖により測定したところ、酵母ベースの免疫療法に対するｉｎ ｖｉｔｒｏでの応答者であった。例えばそれは、ＴＨ１７応答からＴＨ１応答へと効果的に変換させるそのような患者の能力と一致する。いずれにせよ、理論により束縛されないが、本発明者らは、そのような免疫療法に対するｉｎ ｖｉｔｒｏでの増殖性応答が、誰がどのような疾患状態でそのような療法から最も利益を受け得るかに関する有用な決定要因であり、かつ／又は酵母ベースの免疫療法から最大の利益を得るために追加的治療が必要又は推奨される可能性のある患者を識別するために使用されることができると考える。

【0075】

ＴＨ１７細胞及びＩＬ−１７が抗腫瘍活性と関連することを考慮すると、酵母ベースの免疫療法は、そのような組成物の真菌としてＴＨ１７を誘導する能力により、本質的に殺腫瘍性であると予想される。ＴＨ１７媒介性の殺腫瘍機序は、現在一般的には理解されていないが、１つの可能性は、ＩＬ−１７が直接的殺腫瘍活性を有するということである。ＩＬ−１７は、好中球を動員することにより又はＴｒｅｇ発生を妨害することにより、間接的に抗腫瘍活性を示す可能性もある。いずれにしても、これらの機序は、酵母ベースの免疫療法により提示される抗原に依存せずに生じると考えることができる。しかしながら、以前に言及されているように、酵母ベースの免疫療法により誘導される炎症は、軽減されると、ＴＨ１７からＴＨ１へと均衡を揺動させ、したがってＣＤ８＋ Ｔ細胞の活性化を引き起こすであろう。したがって、癌等の特定の疾患状態は、ＴＨ１７媒介性の抗腫瘍活性及びＴｒｅｇ機能不全の両方、並びに抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生から利益を得ることができる。

【0076】

したがって、本発明の組成物及び方法は、様々な疾患状態及び個体に様々な様式で応用することができる。例えば、癌を有する被験者では、１つの態様では、個体は、酵母ベースの免疫療法剤のＴＨ１７誘導活性、及び酵母により誘導される最終的なＴＨ１媒介性免疫応答から利益を受けることができる。したがって、１つの態様では、酵母ベースの免疫療法剤は、更なる修飾をせずに初期に投与されるか、又はその代わりに酵母ベースの免疫療法剤が投与され、その後の時点で、ＴＨ１７媒介性の抗腫瘍効果が誘導された後、ＴＨ１応答は、ＴＨ１７応答からＴＨ１応答への移行を増強する作用剤の投与により上方制御される（例えば、ＴＨ１７を下方制御する及び／又はＴＨ１を上方制御する作用剤）。或いは、ＴＨ１及びＣＤ８＋免疫応答の抗腫瘍効果は、腫瘍消失又は制御の重要な部分であると考えられているため、本発明の幾つかの態様では、酵母ベースの免疫療法剤は、ＴＨ１７を下方制御及び／又はＴＨ１を上方制御する作用剤と同時に投与され、これにより、そのような作用剤が存在しない場合よりも迅速に又はより確実にＴＨ１応答への移行が増強される。加えて、所与の疾患（下記で定義）で酵母ベースの免疫療法に対して一般的に不応答性であるか又は部分的にしか応答しない個体では、酵母ベースの免疫療法の開始同時に又は開始後に、ＴＨ１７応答を調節する及び／又はＴＨ１応答を調節する作用剤を投与することにより、そのような個体、特に、少なくともある疾患又は状態でＴＨ１７経路に「過剰傾倒」する素因があるか、又は恐らくは「より弱い」ＴＨ１７応答者である個体に、酵母ベースの免疫療法を用いてより有益な免疫応答を発生させることができる。酵母は、例えば、ＴＨ１７応答又はＴＨ１応答の修飾という目的を達成するように遺伝子操作及び／又は製造することもできる。

【0077】

実際、本発明は、ＴＨ１７応答を下方制御する及び／又はＴＨ１応答を上方制御する作用剤を、例えば、ＴＨ１７応答からＴＨ１応答への移行が可能でないか若しくは正常母集団ほど可能でない個体に、又はインターフェロン非依存性免疫応答の開始が可能でないか若しくは正常集団ほど可能でない個体に投与することにより、その個体、特に癌又はウイルス感染症若しくは疾患を罹患している個体に、酵母ベースの免疫療法の有用性を実現することができるという点で、（所与の疾患又は症状に関して）酵母ベースの免疫療法に対して不応答者であるか又は部分的な応答者である個体に一般的に有用である。本発明は、より効果的であると予想される様式で特定の個人及び／又は特定の疾患状態を治療するために、酵母ベースの免疫療法の「個別化」を可能にする。同様に、個体、特に正常より弱いＴＨ１７応答を示すか又は真菌感染に対する免疫療法に対して「不応答者」若しくは「部分的応答者」である個体に、ＴＨ１７応答を上方制御する作用剤を投与することにより、その個体による真菌感染症に対する免疫応答を増強させることができ、被験者の真菌感染症状の低減が支援される。

【0078】

本発明によると、酵母ベースの療法に対する「不応答者」は、酵母ベースの免疫療法を使用して治療しようとする特定の疾患又は症状に関して定義され、免疫療法が標的とするその疾患の少なくとも１つの症状を低減又は軽減するのに十分に効果的である酵母ベースの免疫療法に対して免疫応答を発生させない被験者を指す。「部分的不応答者」は、所与の疾患又は状態において部分的な治療結果をもたらす酵母ベースの免疫療法に対して幾らかの応答を示すことができるが、その応答は、最適には及ばないか、又はより良好な治療的応答を獲得するために改善する余地がある。同様に、「不応答者」は、酵母ベースの免疫療法に対する応答（例えば、強力なＴＨ１７応答）を示すことができるが、例えばウイルス感染症又は癌に対して有効なＴＨ１媒介性ＣＤ８＋応答を発生させることができない。そのような個体は、インターフェロン依存性免疫応答を発生させることができない等の他の欠損を有する場合もあり、したがって、多くのタイプの感染症又は疾患に対処する自身の免疫系の能力が制限される。言い換えれば、ほとんどの被験者が、酵母ベースの免疫療法組成物による免疫に対して免疫応答を発生させると予想されるが、被験者に誘発される免疫応答のタイプは、本明細書に記載のように様々であり得、被験者に誘発される特定の応答は、免疫療法により標的とされる疾患又は状態の症状を低減若しくは軽減するのに効果的である場合もあり、又は効果的でない場合もある。本発明は、ＴＨ１７細胞集団が、酵母ベースの免疫療法の状況で様々な疾患に対する個体の応答性を制御することを提唱する。例えば、上で言及したように、被験者は、酵母ベースの免疫療法組成物による免疫に対して強力なＴＨ１７免疫応答を示し得るが、そのような応答を効果的なＴＨ１応答に容易に変換することができない場合がある。したがって、そのような被験者は、真菌性疾患の酵母ベースの免疫療法に関して「応答者」であり得るが、効力を示すためにはＴＨ１媒介性ＣＤ８＋応答を必要とすると考えられる肝炎等のウイルス疾患に対する酵母ベースの免疫療法に関しては、不応答者又は部分的不応答者である場合がある。したがって、用語「応答者」又は「不応答者」は、任意の免疫応答が、酵母ベースの免疫療法の適用に応答して被験者に誘発されるか否かよりもむしろ、治療しようとする疾患に関して使用される。

【0079】

したがって、個体を特徴付ける別の様式は、個体が免疫療法に応答して生じさせるＴＨ１７免疫応答に関する。ある個体は「より強力な」ＴＨ１７応答者であってもよく、そのような個体は、集団の大多数と比較して又は正常な若しくは予想通りのＴＨ１７応答を示す個人（例えば、所与の疾患又は状態を有する被験者の場合、これは、正常な又は健康な対照個人であってもよい）と比較して、酵母ベースの免疫療法に対して活発な又はより強力なＴＨ１７型応答を生じさせることを意味する。典型的には、ＴＨ１７応答は、被験者から単離されたＣＤ４＋ Ｔ細胞により産生されたＩＬ−１７の量をｉｎ ｖｉｔｒｏで測定することにより、又は被験者から単離されたＩＬ−１７産生ＣＤ４＋ Ｔ細胞（ＴＨ１７細胞）のレベル／数を、その被験者の同じ供給源（例えば、末梢血、肺、脾臓、リンパ節等）に由来する全ＣＤ４＋ Ｔ細胞のレベル／数と比べて測定することにより決定される。幾つかの場合には、レチノイド関連オーファン受容体（ＲＯＲ）及び特にＲＯＲγｔ、ＴＨ１７細胞マーカーの発現のレベルが、被験者のＴＨ１７細胞レベルの指標として、被験者から単離されたＣＤ４＋ Ｔ細胞の集団で評価される。単離された細胞は、酵母ベースの免疫療法組成物との接触前及び接触後に評価することができ、酵母ベースの免疫療法との接触は、典型的にはｉｎ ｖｉｔｒｏで生じ（しかし、状況によっては、ｉｎ ｖｉｖｏで生じてもよい）、並びに／又は多数の陽性対照及び陰性対照（例えば、ＴＬＲアゴニスト、サイトカイン、緩衝液単独、酵母ベースの免疫療法に対する明確な免疫応答を示す個体若しくは他の個体の集団に由来する試料等）と比較して評価することができる。Ｔ細胞増殖アッセイ、サイトカインアッセイ、及び他のバイオマーカーアッセイは、当技術分野で周知である。増殖は、典型的には、被験者からＴ細胞を取得し、それらを、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞に曝露し、放射性同位元素又は比色検出法を使用すること等によりＴ細胞の増殖を測定することによって、ｉｎ ｖｉｔｒｏで測定される。サイトカインアッセイには、限定されないが、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、免疫組織化学的分析、免疫ブロッティング、蛍光活性化細胞分類（ＦＡＣＳ）、及びフローサイトメトリーが含まれる。ｍＲＮＡ発現レベルは、ＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）、ｉｎ ｓｉｔｕ ＰＣＲ、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、及びノーザンブロットを含むがこれらに限定されない当技術分野で公知の様々なアッセイを使用して検出することができる。強力なＴＨ１７応答者は、酵母ベースの免疫療法に応答して、一般的に健康な又は「正常な」個体の集団（つまり、群として、特定の疾患や症状を有していない）に由来する同じ供給源（例えば、末梢血）から単離された平均レベルのＩＬ−１７産生又はＣＤ４＋ Ｔ細胞における平均レベル／数のＴＨ１７細胞よりも、統計的に有意に（ｐ＞０．０５）多いＩＬ−１７を産生するか、及び／又は統計的に有意に（ｐ＞０．０５）多いＩＬ−１７産生ＣＤ４＋ Ｔ細胞（ＴＨ１７細胞）を有する。ＩＬ−１７レベルは、当技術分野で公知の種々のｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイにより測定することができ、ＩＬ−１７タンパク質又はｍＲＮＡの量を評価することにより測定することができる。同様に、ＲＯＲγｔレベルは、この転写因子を測定するための当技術分野で公知の技術を使用して測定することができる。

【0080】

ある個体は、「より弱い」ＴＨ１７応答者であってもよく、これは集団の大多数と比較して、免疫療法に対して中程度又はより弱いＴＨ１７型応答を生じさせることを意味する。個体は、広範なＴＨ１７応答に遭遇することになると予想され、したがって、酵母ベースの免疫療法に対する免疫応答を修飾する能力は、個別化療法に有益であろう。「弱い」ＴＨ１７応答は、上述のように測定することができ、一般的に健康な又は「正常な」個体の集団（つまり、群として、特定の疾患や症状を有していない）に由来する同じ供給源（例えば、末梢血）から単離された平均レベルのＩＬ−１７産生又はＣＤ４＋ Ｔ細胞における平均レベルのＴＨ１７細胞よりも、統計的に有意に（ｐ＞０．０５）少ないＩＬ−１７を産生するか、及び／又は統計的に有意に（ｐ＞０．０５）少ないＩＬ−１７産生ＣＤ４＋ Ｔ細胞（ＴＨ１７細胞）を有するであろうと予測される。

【0081】

ウイルス感染症又はウイルス疾患（例えば、ウイルス関連疾患）を有する個体において、特にインターフェロン駆動性の療法に抵抗性である個体では、ＴＨ１及びＣＤ８＋免疫応答の有益性を達成することが一般的に望ましく、したがってこのタイプの感染症又は疾患では（他の細胞内病原体に適用可能であると予想される）、酵母ベースの免疫療法剤は、ＴＨ１７からＴＨ１応答への移行を増強する作用剤（例えば、ＴＨ１７を下方制御する及び／若しくはＴＨ１を上方制御する作用剤）と同時に若しくは連続的に投与されるか、又はその代わりに、酵母は、ＴＨ１媒介性免疫応答を誘導する酵母の能力を増強するような遺伝子操作若しくは製造プロセスにより修飾される。

【0082】

細胞外病原体及び幾つかの細胞内病原体に関連する真菌感染症又は疾患を有する個体では、感染症又は疾患を制御するためにＴＨ１７免疫応答の有益性を達成することが一般的に望ましく、したがってこれらの実施形態では、酵母ベースの免疫療法剤は、ＴＨ１７応答を増強する作用剤と同時に若しくは連続的に投与されるか、又はその代わりに、酵母は、ＴＨ１７媒介性免疫応答を増強する酵母の能力を増加させるような遺伝子操作若しくは製造プロセスにより修飾される。しかしながら、真菌性疾患においてでさえ、長期的なＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を最終的に生じさせることに対して及び炎症促進性応答の減少を可能にすることに対して有益性があり、したがって、この実施形態では、ＴＨ１応答の形成を完全に阻止することは望ましくない。１つの態様では、免疫応答をＴＨ１媒介性応答に進行させることが望ましい場合、作用剤を療法プロトコールから除外若しくは中止することができ、ＴＨ１誘導性作用剤を投与することができ、及び／又は酵母がＴＨ１７応答を増強するように遺伝子組換え若しくは製造されていた場合、そのような様式で処理されていない酵母を追加免疫に使用することができる。他の実施形態では、ＴＨ１７応答が真菌性疾患を治療するために増強されるべきである程度は、酵母ベースの免疫療法を施された際にＴＨ１７応答を開始する個体の能力に部分的に依存するであろう。個体が、一般集団よりも弱いＴＨ１７応答を示す場合、ＴＨ１７増強剤の使用は、特に有用であり得る。

【0083】

本発明の方法
本発明は、酵母ベースの免疫療法を使用して免疫応答を調節する様々な方法を含む。本発明の１つの実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与し、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生及び／又は生存を調節する少なくとも１つの作用剤をその被験者に投与することにより、酵母ベースの免疫療法組成物の免疫療法特性を増強する方法に関する。本発明の１つの態様では、被験者は、疾患に関連する１つ又は複数の症状に関して、酵母ベースの免疫療法に対する不応答者又は部分的応答者である。実際、本明細書に記載のような、修飾された酵母ベースの免疫療法から最も利益を受ける可能性が高いのは、これらの被験者である。

【0084】

本発明の１つの実施形態は、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１媒介性免疫応答を増強する方法に関する。この方法は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与するステップと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋細胞の産生及び／又は生存を下方制御する少なくとも１つの作用剤をその被験者に投与するステップとを含む。本発明の別の実施形態は、癌を治療するか又はその１つ若しくは複数の症状を軽減する方法であって、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生及び／又は生存を下方制御する少なくとも１つの作用剤をその被験者に投与することとを含む方法に関する。本発明の更に別の実施形態は、ウイルス感染症を治療するか又はその１つ若しくは複数の症状を軽減する方法であって、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生及び／又は生存を下方制御する少なくとも１つの作用剤をその被験者に投与することとを含む方法に関する。この実施形態の１つの態様では、ウイルス感染は、Ｂ型肝炎ウイルス及びＣ型肝炎ウイルスを含むがこれらに限定されない肝炎ウイルス感染症である。本明細書の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物単独の投与と比較して、酵母ベースの免疫療法に対するＣＤ８^＋ Ｔ細胞応答を増強する方法に関する。この方法は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与するステップと、（ｂ）ＴＨ１７ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の産生及び／又は生存を下方制御する少なくとも１つの作用剤をその被験者に投与するステップとを含む。本発明のこれらの実施形態で使用するのに好適な作用剤は、下記で詳細に記述される。

【0085】

本発明によると、ＴＨ１７ Ｔ細胞は、インターロイキン−１７（ＩＬ−１７）並びにＩＬ−２１及びＩＬ−２２を産生するＴヘルパーＣＤ４＋ Ｔ細胞のサブセットであると定義される。ＴＨ１７ Ｔ細胞は、他の既知ＴヘルパーサブセットＴｈ１、Ｔｈ２、及びＴｒｅｇ Ｔ細胞とは異なるとみなされている。ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存は、形質転換増殖因子ベータ（ＴＧＦβ）、インターロイキン−１β（ＩＬ−１β）、インターロイキン６（ＩＬ−６）、インターロイキン２１（ＩＬ−２１）、インターロイキン−２２（ＩＬ−２２）、及びインターロイキン２３（ＩＬ−２３）を含むがこれらに限定されない種々のサイトカイン／増殖因子と関連する。加えて、ＴＨ１７の分化に関与する転写因子は、レチノイン酸受容体関連オーファン受容体アルファ（ＲＯＲα）及びＲＯＲγｔ、並びにＳＴＡＴ３である。ＴＨ１７は、ＴＧＦβ、ＩＬ−６、及び恐らくはＩＬ−１βの存在下で活性化及び分化すると考えられているが、ＩＬ−２１は、ＴＨ１７細胞のＩＬ−６非依存性活性化因子であり得る。ＲＯＲ−γｔの活性化は、ＩＬ−２３に対する受容体の発現も引き起こし、ＩＬ−２３は、分化のために、より詳しくはＴＨ１７細胞（つまり、ＴＨ１７系統に既に傾倒しているＴ細胞）の増殖及び生存のために必要であると考えられている。ＩＬ−１７は、ＴＨ１７により産生され、好中球の動員、活性化、及び遊走に関与する。ＩＬ−１７は、Ｔ細胞初回抗原刺激を増強し、炎症促進性分子の産生を刺激する炎症促進性サイトカインでもある。インターフェロン−γ（ＩＦＮ−γ）は、ＴＨ１７分化の負の制御因子である。ＴＨ１７細胞は、ＩＬ−１７Ｆ、ＩＬ−２１、及びＩＬ−２２も産生する。

【0086】

本発明の別の実施形態は、真菌感染、他の感染性疾患、及び幾つかの実施形態では癌を含むがこれらに限定されない、ＴＨ１７媒介性免疫応答から利益を受ける疾患又は状態を治療する方法に関する。そのような方法は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することと、（ｂ）ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を上方制御する少なくとも１つの作用剤をその被験者に投与することとを含む。本発明のこれらの実施形態で使用するのに好適な作用剤は、下記で詳細に記述される。

【0087】

本発明は、ＴＨ１７ Ｔ細胞の産生及び／又は生存を調節することができる作用剤の使用を含む。本発明によると、用語「調節する」は、「制御する」と同義に使用することができ、一般的に特定の活性を上方制御又は下方制御することを指す。本明細書で使用される場合、用語「上方制御する」は、特定の活性に関して、一般的に以下のいずれかを記述するために使用することができる：誘発する、開始する、増加させる、増大させる、助長する、向上する、増強する、増幅する、促進する、又は提供する。同様に、用語「下方制御する」は、特定の活性に関して、一般的に以下のいずれかを記述するために使用することができる：低下させる、低減させる、阻害する、軽減する、減少させる、緩和する、阻止する、又は防止する。したがって例としては、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を調節するのに有用な作用剤には、幾つかの実施形態では、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存を下方制御するあらゆる作用剤が含まれていてもよく、他の実施形態では、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存を上方制御するあらゆる作用剤が含まれていてもよい。同様に、例としては、ＴＨ１応答を調節するのに有用な作用剤には、幾つかの実施形態では、ＴＨ１応答を下方制御するあらゆる作用剤が含まれていてもよく、他の実施形態では、ＴＨ１応答を上方制御するあらゆる作用剤が含まれていてもよく、又はＴｒｅｇ及び／若しくはＴＨ１７応答を調節することによりＴＨ１応答を調節するあらゆる作用剤が含まれていてもよい。本発明の種々の実施形態に有用な作用剤は、以下で詳細に記述される。

【0088】

本発明の種々の方法は、本発明の組成物を投与することにより疾患又は状態を治療する。本明細書で使用される場合、語句「疾患を治療する」又はその任意の変化形（例えば、「疾患が治療される」等）は、一般的に、疾患を予防すること、疾患の少なくとも１つの症状を予防すること、疾患の発症を遅延させること、疾患の１つ又は複数の症状を低減させること、疾患の出現を低減させること、及び／又は疾患の重症度を低減させることを指すことができる。例えば、癌に関して、本発明の方法は、以下の１つ又は複数をもたらすことができる：腫瘍増殖の予防、疾患発症の遅延、全身腫瘍組織量及び／若しくは腫瘍量の低減、腫瘍増殖の低減、生存の増加、器官機能の改善、並びに／又は個体の全体的な健康の改善。感染症及び他の疾患に関して、本発明の方法は、以下の１つ又は複数もたらすことができる：疾患若しくは状態の予防、感染の予防、感染により引き起こされる疾患若しくは状態の発症の遅延、生存の増加、病原体負荷の低減（例えば、ウイルス力価の低減）、個体における感染に起因する少なくとも１つの症状の低減、感染若しくは疾患に起因する器官若しくは生理学的系の損傷の低減、器官若しくは系の機能の改善、及び／又は個体の全体的な健康の改善。

【0089】

本発明の更に別の実施形態は、疾患に関連する１つ又は複数の症状に関して、酵母ベースの免疫療法に対する不応答者又は部分的応答者である被験者における、酵母ベースの免疫療法の効力を向上させる方法に関する。この方法は、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を調節する少なくとも１つの作用剤を被験者に投与することを含む。投与のステップは、酵母ベースの免疫療法組成物の用量の投与前に、投与と同時に、又は投与後に実施することができ、被験者における酵母ベースの免疫療法の効力を向上させる。１つの態様では、疾患は、ウイルス疾患である。１つの態様では、疾患は、癌である。１つの態様では、作用剤は、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を下方制御する。この実施形態の別の態様では、疾患は、真菌性疾患である。別の態様では、作用剤は、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を上方制御する。本発明のこれらの実施形態で使用するのに好適な作用剤は、以下で詳細に記述される。

【0090】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法に対する被験者のＴ細胞増殖応答を調節する方法であって、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を調節する作用剤を被験者に投与して、酵母ベースの免疫療法に対する被験者のＴ細胞増殖応答を調節することを含み、投与が、酵母ベースの免疫療法組成物の用量の投与前、投与と同時に、又は投与後である方法に関する。１つの態様では、この方法は、被験者のＴ細胞増殖応答を開始又は増加させる。別の態様では、この方法は、被験者のＴ細胞増殖応答を減少させる。本発明のこれらの実施形態で使用するのに好適な作用剤は、以下で詳細に記述される。

【0091】

理論により束縛されないが、本発明者らは、酵母ベースの免疫療法に応答した被験者のＴ細胞増殖は、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１応答を開始する被験者の能力を示し、Ｔ細胞増殖は、ＴＨ１ Ｔ細胞の存在を示し、その一方で酵母ベースの免疫療法に応答した増殖がより低いこと又は増殖が欠如することは、ＴＨ１７応答性への被験者の傾倒又は恐らくは過剰傾倒を示し、幾つかの場合では、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１応答を開始する能力の低下を示すと考える。増殖は、典型的には、被験者からＴ細胞を取得し、それらを、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞に曝露し、放射性同位元素又は比色検出法を使用すること等によりＴ細胞の増殖を測定することにより、ｉｎ ｖｉｔｒｏで測定される。Ｔ細胞増殖アッセイは、当技術分野で周知である。酵母ベースの免疫療法に応答した増殖は、被験者が酵母ベースの免疫療法に応答することになるか否かを必ずしも示さず、むしろ被験者が酵母ベースの免疫療法に対してどのタイプの免疫応答を示すかを示すと考えられる（例えば、それは、被験者がＴＨ１７応答性の尺度上のどこに位置するかに関する情報を提供し、したがって、治療しようとする疾患若しくは状態、及び／又は被験者に誘発することが望まれている免疫応答のタイプに応じて、酵母ベースの免疫療法の効力の向上のために追加的な作用剤が必要であるか否かを示す）。

【0092】

本発明の更に別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物の免疫療法特性を強化する方法に関する。そのような方法は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与するステップと、（ｂ）その被験者に第２の免疫療法組成物を投与し、第２の免疫療法組成物が、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存を上方制御し、並びに／又はＴＨ１細胞の産生及び／若しくは生存を上方制御し、並びに／又はＴｒｅｇの産生及び／若しくは生存を下方制御するステップとを含む。本発明のこの実施形態は、免疫療法組成物及び化合物を含む種々の治療用組成物及び化合物が、本明細書に記載の酵母ベースの免疫療法組成物の天然免疫調節効果を模倣、補完、増強、追加、又は相乗効果を示し得ることを企図する。この実施形態では、この方法は、特に免疫系活性化及び／又は免疫機能に関して、類似の又は補完的な特性を有する別の組成物と組み合わせることにより、酵母ベースの免疫療法剤投与の天然効果を増強する。

【0093】

本発明の上述の実施形態のいずれかにおいて、１つの態様では、作用剤は、抗原提示細胞を標的としてもよく、又はＴ細胞を標的としてもよい。
本発明の他の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により誘発される免疫応答のタイプを変更又は調節するために、遺伝子操作又は製造／生産方法等によって、酵母ベースの免疫療法組成物に使用される酵母を操作することにより、細胞媒介性免疫応答を調節するか又は酵母ベースの免疫療法に対する免疫応答を調節する方法を含む。酵母を遺伝子組換えする方法を含む、本発明に有用な酵母媒体を生成する種々の方法は、以下に記載されており、それらはいずれも、本明細書に記載の結果を達成するために使用することができる。１つの態様では、そのような方法は、ＴＨ１免疫応答の上方制御及び／又はＴＨ１７免疫応答の下方制御に関する。１つの態様では、そのような方法は、ＴＨ１７免疫応答の上方制御及びＴＨ１免疫応答の下方制御に関する。別の態様では、ＴＨ１７免疫応答及びＴＨ１免疫応答は両方とも上方制御される。

【0094】

例えば、これらの実施形態では、酵母は、本明細書に記載のように、ＴＨ１７応答及び／又はＴＨ１応答を調節するのに有用な作用剤を発現するように遺伝子組換えされていてもよい。１つの態様では、そのような作用剤は、酵母ベースの免疫療法剤を生成するために使用される酵母媒体により（又は別の酵母媒体により）分泌されてもよい。１つの態様では、そのような作用剤は、酵母表面に発現されてもよい。１つの態様では、酵母細胞壁は、抗原提示細胞上の細胞表面分子と相互作用し、したがって抗原提示細胞が活性化されるか、及び／又は抗原提示細胞により発生する先天性免疫応答のタイプを調節する様式を調節する作用剤を発現するように、遺伝子操作により修飾されていてもよい。別の態様では、酵母ベースの治療剤を生成するために使用される酵母媒体（又は別の酵母媒体）は、ｓｉＲＮＡ等の作用剤を保持及び送達するように遺伝子組換えされている。１つの態様では、酵母は、酵母細胞壁の組成及び／又は流動性を修飾し、それによって酵母により活性化された抗原提示細胞により発生する先天性免疫応答のタイプに影響を及ぼす細胞壁成分（例えば、ポリサッカライド、糖タンパク質等）を露出させるか、覆い隠すか、除去するか、又は変更する条件下で増殖させてもよい。

【0095】

１つの実施形態では、本発明は、ＴＨ１媒介性免疫応答を上方制御する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を生成するのに使用される酵母が、遺伝子組み換えされているか、並びに／又は被験者にＴＨ１７免疫応答を誘導する酵母の能力を下方制御する条件下で及び／若しくは被験者にＴＨ１免疫応答を誘導する酵母の能力を上方制御する条件下で産生される方法を含む。そのような方法は、例えば被験者が癌又はウイルス感染を有する場合に有用であってもよい。

【0096】

１つの実施形態では、本発明は、ＴＨ１媒介性免疫応答を下方制御するか又はＴＨ１７免疫応答を上方制御する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、遺伝子組換えされているか、又は被験者のＴＨ１７免疫応答を誘導する酵母の能力を上方制御する条件下で及び／若しくは被験者のＴＨ１免疫応答を誘導する酵母の能力を低下させる条件下で産生される方法を含む。そのような方法は、例えば被験者が真菌感染症、又は幾つかの場合では癌を有する場合に、有用であってもよい。

【0097】

別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のデクチン受容体によるシグナル伝達が増加するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生される方法に関する。

【0098】

或いは、別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のデクチン受容体によるシグナル伝達が減少するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生される方法に関する。

【0099】

本発明のこれらの２つの実施形態では、デクチン受容体は、デクチン−１受容体又はデクチン−２受容体を含むことができる。１つの実施形態では、デクチン−１受容体によるシグナル伝達が低減される。別の実施形態では、デクチン−１受容体及びデクチン−２受容体の両方によるシグナル伝達が低減される。

【0100】

別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のマンノース受容体によるシグナル伝達が増加するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生される方法に関する。

【0101】

或いは、別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のマンノース受容体によるシグナル伝達が減少するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生される方法に関する。

【0102】

別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のＤＣ−ＳＩＧＮ受容体によるシグナル伝達が増加するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生される方法に関する。

【0103】

或いは、別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞のＤＣ−ＳＩＧＮ受容体によるシグナル伝達が減少するように酵母細胞壁を修飾する条件下で産生される方法に関する。

【0104】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母の細胞壁表面のβ−グルカンの露出を低減させる又は除去する条件下で産生される方法に関する。

【0105】

或いは、本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母の細胞壁表面のβ−グルカンの露出を増加させる条件下で産生される方法に関する。

【0106】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母の細胞壁表面のマンノース又はその誘導体の露出を低減させる又は除去する条件下で産生される方法に関する。

【0107】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、酵母の細胞壁表面のマンノース又はその誘導体の露出を低減させる又は除去する条件下で産生される方法に関する。

【0108】

本発明の更に別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、ＴＨ１７媒介性免疫応答を誘導する酵母の能力を下方制御する条件下で産生される（例えば、増殖又は製造される）方法に関する。

【0109】

或いは、本発明は、酵母ベースの免疫療法組成物により生じる免疫応答を調節する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を被験者に投与することを含み、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母が、ＴＨ１７媒介性免疫応答を誘導する酵母の能力を上方制御する条件下で産生される方法も含む。

【0110】

本発明は、ＴＨ１媒介性免疫応答を増強する酵母ベースの免疫療法組成物を産生する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物が投与される被験者でＴＨ１７媒介性応答を下方制御するのに効果的なように、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母を遺伝子操作することを含む方法も含む。酵母を遺伝子組換えするための種々の方法は、当技術分野で公知であり、本明細書に記載されている。例えば、本明細書に記載の１つ又は複数の作用剤の酵母による発現（例えば、組換え発現）をもたらす方法が企図される。

【0111】

本発明の別の実施形態は、ＴＨ１媒介性免疫応答を増強する酵母ベースの免疫療法組成物を産生する方法であって、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母を、酵母ベースの免疫療法組成物が投与される被験者でＴＨ１７媒介性応答を下方制御するのに効果的な条件下で増殖又は製造（産生）することを含む方法を含む。例えば、中性ｐＨで酵母を増殖すること等により、酵母細胞壁の外表面の流動性及び／又は組成を修飾するように酵母を増殖する方法は、本発明のこの実施形態により包含される。

【0112】

本発明の方法に有用な作用剤
種々の作用剤が、本発明の方法で使用するために本明細書で企図される。作用剤は、単一の組成物として、酵母ベースの免疫療法剤と共に若しくは同時に投与される別々の組成物として、又は酵母ベースの免疫療法剤の前に、後で、若しくは交互に、若しくは他の特別なスケジュールで投与される組成物として、本発明の方法で使用される酵母ベースの免疫療法剤と組み合わされる。そのような作用剤には、本明細書に記載のように酵母ベースの免疫療法組成物と共に投与することができ、所望の調節効果を示すことができるあらゆる（化学的又は生物学的）部分（ｍｏｉｅｔｙ）が含まれる。例えば、作用剤には以下のものが含まれ得るがこれらに限定されない：タンパク質、ペプチド、抗体若しくはその抗原結合部分、低分子（例えば、薬物若しくは化学化合物）；ポリヌクレオチド若しくは核酸結合剤（例えば、プローブ、ｓｉＲＮＡ、アンチセンス分子、リボザイム）、可溶性リガンド若しくはその受容体の生物学的アゴニスト若しくはアンタゴニスト、細胞表面分子／受容体の生物学的アゴニスト若しくはアンタゴニスト；脂質若しくはその誘導体、ポリサッカライド及びその誘導体、又はアプタマー、並びにそのような作用剤の相同体若しくは誘導体、及びそのような作用剤の組み合わせ。１つの実施形態では、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母は、作用剤を保持又は発現するように操作されている。作用剤には、ＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存を調節する作用剤、並びに／又はＴＨ１細胞の産生及び／若しくは生存を調節する作用剤、並びに／又はＴｒｅｇの産生及び／若しくは生存を調節する作用剤が含まれるがこれらに限定されない。例えば、そのような作用剤には、下記でより詳細に記載されている作用剤のいずれかが含まれるがこれらに限定されない：限定ではないが、サイトカイン、ケモカイン、抗体及びその抗原結合性断片（抗サイトカイン抗体、抗サイトカイン受容体抗体、抗ケモカイン抗体を含むがこれらに限定されない）、受容体、リガンド、ポリサッカライド、免疫調節物質、抗炎症剤、炎症促進剤、ビタミン、核酸結合剤、融合タンパク質、そのような作用剤のいずれかの相同体若しくは誘導体、又は他のワクチン若しくは免疫療法化合物、作用剤若しくは組成物、並びに他の生物学的応答調節剤。

【0113】

本発明の１つの態様では、酵母ベースの免疫療法剤と併用する本発明の方法に有用な作用剤は、ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を下方制御することが可能である。ＴＨ１７細胞の産生又は生存を下方制御するのに有用な１つのタイプの作用剤には、ＴＨ１７ Ｔ細胞の発生、活性化、分化、及び／若しくは生存と関連するサイトカイン又はその受容体の発現並びに／又は活性を下方制御する作用剤が含まれるがこれらに限定されない。そのようなサイトカインには、ＩＬ−１（ＩＬ−１βを含む）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及び／又はＩＬ−２３が含まれるがこれらに限定されない。ＴＨ１７細胞の産生又は生存を下方制御するのに有用な別のタイプの作用剤には、ＩＬ−２５又はＩＬ−２７等の、ＴＨ１７細胞の発生、活性化、分化、及び／若しくは生存の阻害と関連するサイトカイン又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を下方制御するのに有用な他の好適な作用剤には、免疫調節物質、抗真菌剤、抗生物質、抗炎症剤、及び限定ではないがビタミンＡ又はビタミンＤを含むビタミンを含む低分子が含まれるがこれらに限定されない。

【0114】

本発明の別の態様では、本発明の方法に有用な作用剤は、ＴＨ１の発生、活性化、分化、及び／又は生存を上方制御することが可能である。そのような作用剤には、Ｉ型インターフェロン（例えば、ＩＦＮ−α）、ＩＩ型インターフェロン（例えば、ＩＦＮ−γ）、ＩＬ−１２、抗炎症剤、ＣＤ４０Ｌ、抗ＣＤ４０、リンパ球活性化遺伝子３（ＬＡＧ３）タンパク質、及び／又はＩＭＰ３２１（可溶性形態のＬＡＧ３に由来するＴ細胞免疫刺激因子）が含まれ得るがこれらに限定されない。これらの作用剤は、単独で使用してもよく、又はＴＨ１７産生若しくは生存を上方制御若しくは下方制御する作用剤等の、本明細書に記載の他の作用剤と組み合わせて使用してもよく、幾つかの実施形態では、そのような作用剤は、同一であってもよい。

【0115】

本発明の別の態様では、本発明の方法に有用な作用剤は、ＴＨ１７の産生及び／又は生存を上方制御することが可能である。ＴＨ１７細胞の産生又は生存を上方制御するのに有用な１つのタイプの作用剤には、ＴＨ１７ Ｔ細胞の発生、活性化、分化、及び／若しくは生存と関連するサイトカイン又はその受容体の発現並びに／又は活性を上方制御する（増加させることに加えて、開始又は維持することが含まれていてもよい）作用剤が含まれ、そのようなサイトカインには、ＩＬ−１、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及び／又はＩＬ−２３が含まれるがこれらに限定されない。ＴＨ１７細胞の産生又は生存を上方制御するのに有用な別のタイプの作用剤には、ＩＬ−２５又はＩＬ−２７を含むがそれらに限定されないもの等の、ＴＨ１７細胞の発生、活性化、分化、及び／又は生存の阻害と関連するサイトカイン又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれる。ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を上方制御するための他の好適な作用剤には、真菌生成物及び炎症促進剤が含まれるがこれらに限定されない。

【0116】

本発明の別の態様では、本発明の方法に有用な作用剤は、ＴＨ１の発生、活性化、分化、及び／又は生存を下方制御することが可能である。そのような作用剤には、Ｉ型インターフェロン（例えば、ＩＦＮ−α）、ＩＩ型インターフェロン（例えば、ＩＦＮ−γ）、又はＩＬ−１２の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ得るがこれらに限定されない。これらの作用剤は、単独で使用してもよく、又はＴＨ１７の産生若しくは生存を上方制御若しくは下方制御する作用剤等の、本明細書に記載の他の作用剤と組み合わせて使用してもよく、幾つかの実施形態では、そのような作用剤は、同一であってもよい。

【0117】

本発明の別の態様では、本発明の方法に有用な作用剤は、酵母ベースの免疫療法剤のＴＨ１７、ＴＨ１、及びＴｒｅｇ調節能力のいずれか１つ又は複数に関して、酵母ベースの免疫療法剤の１つ又は複数の天然免疫調節効果について、模倣、補完、増強、追加、相乗効果を示すことができるか、又は幾つかの態様では、阻害若しくは阻止することができるあらゆる作用剤である。そのような作用剤には、（ａ）抗原の交差提示を誘導することにより及び／若しくはＣＤ８^＋ Ｔ細胞の発生及び／若しくは活性化を支援するサイトカインを誘導することによりＣＤ８^＋ Ｔ細胞を発生させる作用剤、（ｂ）ＩＬ−１７を産生するＴＨ１７細胞の産生及び／若しくは生存を支援若しくは増強する作用剤、（ｃ）ＴＨ１の産生及び生存を支援若しくは増強する作用剤、並びに／又は（ｄ）Ｔｒｅｇ活性を阻害する作用剤、又はそれらの組み合わせが含まれる。

【0118】

そのような作用剤には、サイトカイン（ＴＨ１７及び／又はＴＨ１免疫応答の調節に使用するための、本明細書で以前に記載のもの等）、ケモカイン、ホルモン、脂質誘導体、ペプチド、タンパク質、ポリサッカライド、低分子薬、抗体及びその抗原結合性断片（抗サイトカイン抗体、抗サイトカイン受容体抗体、抗ケモカイン抗体を含むがこれらに限定されない）、ビタミン、ポリヌクレオチド、核酸結合部分、アプタマー、及び増殖調節因子が含まれ得るがこれらに限定されない。そのような作用剤には、限定ではないが、ＴＨ１７応答、ＴＨ１応答、及び／又はＴｒｅｇ応答を調節する作用剤が含まれる。幾つかの好適な作用剤には、以下のものが含まれるがこれらに限定されない：ＩＬ−１又はＩＬ−１若しくはＩＬ−１Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−１又は他のＩＬ−１アンタゴニスト；ＩＬ−６又はＩＬ−６若しくはＩＬ−６Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−６又は他のＩＬ−６アンタゴニスト；ＩＬ−１２又はＩＬ−１２若しくはＩＬ−１２Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−１２又は他のＩＬ−１２アンタゴニスト；ＩＬ−１７又はＩＬ−１７若しくはＩＬ−１７Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−１７又は他のＩＬ−１７アンタゴニスト；ＩＬ−２１又はＩＬ−２１若しくはＩＬ−２１Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−２１又は他のＩＬ−２１アンタゴニスト；ＩＬ−２２又はＩＬ−２２若しくはＩＬ−２２Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−２２又は他のＩＬ−２２アンタゴニスト；ＩＬ−２３又はＩＬ−２３若しくはＩＬ−２３Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−２３又は他のＩＬ−２３アンタゴニスト；ＩＬ−２５又はＩＬ−２５若しくはＩＬ−２５Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−２５又は他のＩＬ−２５アンタゴニスト；ＩＬ−２７又はＩＬ−２７若しくはＩＬ−２７Ｒのアゴニスト、抗ＩＬ−２７又は他のＩＬ−２７アンタゴニスト；Ｉ型インターフェロン（ＩＦＮ−αを含む）又はＩ型インターフェロン若しくはその受容体のアゴニスト若しくはアンタゴニスト；ＩＩ型インターフェロン（ＩＦＮ−γを含む）又はＩＩ型インターフェロン若しくはその受容体のアゴニスト若しくはアンタゴニスト；抗ＣＤ４０、ＣＤ４０Ｌ、リンパ球活性化遺伝子３（ＬＡＧ３）タンパク質及び／又はＩＭＰ３２１（可溶性形態のＬＡＧ３に由来するＴ細胞免疫刺激因子）、抗ＣＴＬＡ−４抗体（例えば、アネルギー性Ｔ細胞を放出する）；Ｔ細胞同時刺激物質（例えば、抗ＣＤ１３７、抗ＣＤ２８、抗ＣＤ４０）；アレムツズマブ（例えば、ＣａｍＰａｔｈ（登録商標））、デニロイキンジフチトクス（例えば、ＯＮＴＡＫ（商標））；抗ＣＤ４；抗ＣＤ２５；抗ＰＤ−１、抗ＰＤ−Ｌ１、抗ＰＤ−Ｌ２；ＦＯＸＰ３を阻止する（例えば、活性／死滅ＣＤ４＋／ＣＤ２５＋ Ｔ制御細胞を抑制する）作用剤；Ｆｌｔ３リガンド、イミキモド（Ａｌｄａｒａ（登録商標））、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）；果粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）、サルグラモスチム（Ｌｅｕｋｉｎｅ（商標））；限定ではないがプロラクチン及び成長ホルモンを含むホルモン；ＴＬＲ−２アゴニスト、ＴＬＲ−４アゴニスト、ＴＬＲ−７アゴニスト、及びＴＬＲ−９アゴニストを含むがこれらに限定されないＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニスト；ＴＬＲ−２アンタゴニスト、ＴＬＲ−４アンタゴニスト、ＴＬＲ−７アンタゴニスト、及びＴＬＲ−９アンタゴニストを含むがこれらに限定されないＴＬＲアンタゴニスト；ＣＯＸ−２阻害剤（例えば、セレコキシブ、ＮＳＡＩＤＳ）、グルココルチコイド、スタチン、及びサリドマイド、及びサリドマイドの構造的及び機能的な類似体であるＩＭｉＤ（商標）を含むがこれらに限定されないそれらの類似体（例えば、ＲＥＶＬＩＭＩＤ（登録商標）（レナリドマイド）、ＡＣＴＩＭＩＤ（登録商標）（ポマリドマイド））を含む抗炎症剤及び免疫調節物質；真菌若しくは細菌成分又は任意の炎症促進性サイトカイン若しくはケモカイン等の炎症促進剤；ウイルスに基づくワクチン、細菌に基づくワクチン、又は抗体に基づくワクチンを含むがこれらに限定されない免疫療法ワクチン；並びに任意の他の免疫調節物質、免疫強化物質、抗炎症剤、炎症促進剤、並びに抗原提示細胞の若しくはＴＨ１７、ＴＨ１、及び／若しくはＴｒｅｇ細胞の数を調節するか、活性化状態を調節するか、及び／又は生存を調節する任意の作用剤。そのような作用剤のあらゆる組み合わせが本発明により企図されており、酵母ベースの免疫療法剤と併用される、又はあるプロトコールで（例えば、同時に、連続的に、又は他の形式で）酵母ベースの免疫療法剤と共に投与されるそのような作用剤はいずれも、本発明により包含される組成物である。そのような作用剤は、当技術分野で周知である。これらの作用剤は、単独で使用してもよく、又はＴＨ１７若しくはＴＨ１産生若しくは生存を上方制御若しくは下方制御する作用剤等の、本明細書に記載の他の作用剤と組み合わせて使用してもよく、幾つかの実施形態では、そのような作用剤は、同一であってもよい。

【0119】

本発明は、以下の指定された組合せのいずれかを明示的に含むがこれらに限定されない：酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−１又はＩＬ−１若しくはＩＬ−１Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−１又は他のＩＬ−１アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−６又はＩＬ−６若しくはＩＬ−６Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−６又は他のＩＬ−６アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−１２又はＩＬ−１２若しくはＩＬ−１２Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−１２又は他のＩＬ−１２アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−１７又はＩＬ−１７若しくはＩＬ−１７Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−１７又は他のＩＬ−１７アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−２１又はＩＬ−２１若しくはＩＬ−２１Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−２１又は他のＩＬ−２１アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−２２又はＩＬ−２２若しくはＩＬ−２２Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−２２又は他のＩＬ−２２アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−２３又はＩＬ−２３若しくはＩＬ−２３Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＩＬ−２３又は他のＩＬ−２３アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−２５又はＩＬ−２５若しくはＩＬ−２５Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗−ＩＬ−２５又は他のＩＬ−２５アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＬ−２７又はＩＬ−２７若しくはＩＬ−２７Ｒのアゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び抗−ＩＬ−２７又は他のＩＬ−２７アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩ型インターフェロン（ＩＦＮ−αを含む）又はＩ型インターフェロン若しくはその受容体のアゴニスト若しくはアンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＩ型インターフェロン（ＩＦＮ−γを含む）又はＩＩ型インターフェロン若しくはその受容体のアゴニスト若しくはアンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びＩＩＩ型インターフェロン（ＩＦＮ−λ１、ＩＦＮ−λ２、ＩＦＮ−λ３を含む）又はＩＩＩ型インターフェロン若しくはその受容体のアゴニスト若しくはアンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法及び抗ＣＤ４０；酵母ベースの免疫療法剤及びＣＤ４０Ｌ；酵母ベースの免疫療法剤及びＬＡＧ３又はＩＭＰ３２１；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＣＴＬＡ−４；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＣＤ１３７；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＣＤ２８；酵母ベースの免疫療法剤及びアレムツズマブ（例えば、ＣａｍＰａｔｈ（登録商標））；酵母ベースの免疫療法剤及びデニロイキンジフチトクス（例えば、ＯＮＴＡＫ（商標））；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＣＤ４；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＣＤ２５；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＰＤ−１；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＰＤ−Ｌ１；酵母ベースの免疫療法剤及び抗ＰＤ−Ｌ２；酵母ベースの免疫療法剤、及びＦＯＸＰ３を阻止する１つ又は複数の作用剤；酵母ベースの免疫療法剤及びＦｌｔ３リガンド；酵母ベースの免疫療法剤及びビタミンＡ；酵母ベースの免疫療法剤及びビタミンＤ；酵母ベースの免疫療法剤及びイミキモド（Ａｌｄａｒａ（登録商標））；酵母ベースの免疫療法剤及び顆粒球マクロファージコロニー刺激因子（ＧＭ−ＣＳＦ）；酵母ベースの免疫療法剤及び顆粒球コロニー刺激因子（Ｇ−ＣＳＦ）；酵母ベースの免疫療法剤及びサルグラモスチム（Ｌｅｕｋｉｎｅ（商標））；酵母ベースの免疫療法剤及びプロラクチン；酵母ベースの免疫療法剤及び成長ホルモン；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−２アゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−４アゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−７アゴニスト；並びに酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−９アゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−２アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−４アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−７アンタゴニスト；並びに酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＴＬＲ−９アンタゴニスト；酵母ベースの免疫療法剤及びセレコキシブ；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のＮＳＡＩＤ；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のグルココルチコイド；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のスタチン；酵母ベースの免疫療法剤及びサリドマイド；酵母ベースの免疫療法剤及びＲＥＶＬＩＭＩＤ（登録商標）（レナリドマイド）；酵母ベースの免疫療法剤及びＡＣＴＩＭＩＤ（登録商標）（ポマリドマイド）；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数の真菌成分；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数の細菌成分；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数のウイルスに基づくワクチン；酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数の細菌に基づくワクチン；或いは酵母ベースの免疫療法剤及び１つ又は複数の抗体に基づくワクチン。

【0120】

本発明の１つの実施形態では、組成物は、生物学的応答修飾物質化合物、又はそのような調節物質を産生する能力（つまり、そのような調節物質をコードする核酸分子を有する酵母媒体を形質移入することによる）を含むことができ、１つの態様では、そのような生物学的応答修飾物質は、ＴＨ１７、ＴＨ１、及び／又はＴｒｅｇ免疫応答を調節するための本発明に有用な作用剤と同一であってもよい。例えば、酵母媒体は、少なくとも１つの抗原及び少なくとも１つの生物学的応答修飾物質化合物で形質移入若しくは負荷することができるか、又は本発明の組成物は、少なくとも１つの生物学的応答修飾物質と共に投与することができる。生物学的応答修飾物質には、免疫応答を調節することができ、免疫調節化合物と呼ばれる場合があるアジュバント及び他の化合物、並びに酵母ベースの免疫療法剤等の、別の化合物又は作用剤の生物活性を修飾する化合物が含まれ、そのような生物活性は免疫系効果に限定されない。特定の免疫調節化合物は、防御的免疫応答を刺激することができる一方で、他の免疫調節化合物は、有害免疫応答を抑制することができ、免疫調節剤が、所与の酵母ベースの免疫療法剤との組み合わせで有用であるか否かは、治療又は予防しようとする疾患状態又は状態に、及び／又は治療しようとする個体に、少なくとも部分的に依存する場合がある。特定の生物学的応答修飾物質は、細胞媒介性免疫反応を優先的に増強する一方で、他の生物学的応答修飾物質は、体液性免疫応答を優先的に増強する（つまり、体液性免疫と比較して、細胞媒介性のレベルが増加した免疫応答を刺激することができ、又はその逆もできる）。特定の生物学的応答修飾物質は、ＴＨ１７、ＴＨ１、及び／又はＴｒｅｇに対する酵母ベースの免疫療法剤の効果等に関して、酵母ベースの免疫療法剤の生物学的特性と共通の１つ又は複数の特性を有するか、又は酵母ベースの免疫療法剤の生物学的特性を増強又は補完する。免疫応答の刺激又は抑制を測定する技術、並びに細胞媒介性免疫反応と体液性免疫応答を区別する技術は、多くが当業者に知られている。

【0121】

インターロイキン−１７（ＩＬ−１７、ＩＬ−１７Ａとも呼ばれる）及び関連ファミリーメンバー、ＩＬ−１７Ｆは、ＴＨ１７としても知られているＴＨサブセットにより、並びにナチュラルキラー（ＮＫ）細胞、ナチュラルキラーＴ（ＮＫＴ）細胞、γδＴ細胞、好中球、及び好酸球により産生される。ＩＬ−１７ファミリーサイトカインは、細胞外病原体及び幾つかの細胞内病原体に対する免疫応答に関連する炎症促進性サイトカインであり、マトリックス破壊を誘導し、Ｔ細胞初回抗原刺激を増強し、炎症促進性分子の産生を刺激し、ＴＮＦ−α、ＩＬ−１β、ＩＬ−６、ＧＭ−ＣＳＦ、及びＧ−ＣＳＦを含むサイトカイン、並びに種々のケモカインを発現する細胞を誘導する。ＩＬ−１７及びＩＬ−１７Ｆは、好中球の動員、活性化、及び遊走にも関与する。

【0122】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−１７又はＩＬ−１７及びＩＬ−１７Ｒアンタゴニストを含むその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−１７又はＩＬ−１７及びＩＬ−１７Ｒアゴニストを含むその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−１７及びＩＬ−１７受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−１７アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−１７Ａ及びＩＬ−１７Ｆの核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号２及び配列番号３（ヒトＩＬ−１７Ａ）、並びにそれぞれ配列番号４及び配列番号５（ヒトＩＬ−１７Ｆ）により表されている。加えて、ＩＬ−１７Ａに対する抗体、例えば抗ヒトＩＬ−１７Ａ（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，Ｉｎｃ．社製）が産生されており、抗体及び可溶性受容体を含むＩＬ−１７Ａ及びＩＬ−１７Ｆの種々のアンタゴニストが記述されている（例えば、国際公開第２００９／１３６２８６号、国際公開第２００７／０３８７０３号、国際公開第２００７／１４７０１９号、国際公開第２００９／０８２６２４号、国際公開第２００８／１３４６５９号、又は国際公開第２００８／１１８９３０号を参照）。ＩＬ−１７Ｆにも結合するＩＬ−１７の同系受容体は、ＩＬ−１７ＲＡである（Ｍｏｓｅｌｅｙら、２００３年、Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ｇｒｏｗｔｈ Ｆａｃｔｏｒ Ｒｅｖ．１４巻：１５５〜７４頁）。

【0123】

インターロイキン−６（ＩＬ−６）は、炎症促進性サイトカインであり、先天性免疫系のパターン認識受容体（ＰＲＲ）に結合する、病原体関連分子パターン（ＰＡＭＰ）と呼ばれる特定微生物分子に応答して、先天性免疫系の細胞（例えば、マクロファージ、樹状細胞、単球、マスト細胞、Ｂ細胞）により分泌される。ＩＬ−６は、ＩＬ−６Ｒαリガンド結合鎖及びシグナル伝達ｇｐ１３０成分で構成されるその受容体に結合し、受容体複合体は、種々の転写因子、ヤヌスキナーゼ及びＳＴＡＴにより信号伝達カスケードを開始させる。（例えば、Ｈｅｉｎｒｉｃｈら、（２００３年）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．３７４巻：１〜２０頁；又はＨｅｉｎｒｉｃｈら、（１９９８年）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．３３４巻：２９７〜３１４頁を参照）。

【0124】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−６やＩＬ−６Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−６又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−６やＩＬ−６Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−６又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−６及びＩＬ−６受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−６アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−６の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号６及び配列番号７により表されている。加えて、ＩＬ−６及びその受容体に対する抗体が産生されており、例えばＯＰＲ−００３、完全ヒト抗インターロイキン−６（Ｖａｃｃｉｎｅｘ社製）；ヒト化抗ヒトＩＬ−６受容体（ＩＬ−６Ｒ）抗体、ＭＲＡ（Ｍｉｈａｒａら、２００１年、Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌ．９８巻（３号）；３１９〜３２６頁）；抗ヒトＩＬ−６（ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，Ｉｎｃ．社製）；ＣＮＴＯ３２８（ｃＣＬＢ８）、ＩＬ−６に対するヒトマウスキメラＭＡｂ（Ｚａｋｉら、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃａｎｃｅｒ、１１１巻（４号）：５９２〜５９５頁、２００４年）；国際公開第２００９／１４０３４８号；国際公開第２００８／０１９０６１号である。ＩＬ−６のアゴニスト及びアンタゴニストも記述されている（例えば、国際公開第２００９／０９５４８９号、国際公開第２００９／０６０２８２号、国際公開第２００８／０７１６８５号を参照）。

【0125】

ＩＬ−２１は、ＴＨ１７細胞を含む活性化Ｔ細胞及びＮＫＴ細胞により産生される炎症促進性サイトカインであり、ナチュラルキラー（ＮＫ）細胞及び細胞毒性Ｔ細胞の活性を制御することができ、並びに活性化Ｂ細胞の増殖及びアイソタイプクラス切替の役割を果たす。例えば、Ｂｒａｎｄｔら、（２００７年）Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ｇｒｏｗｔｈ Ｆａｃｔｏｒ Ｒｅｖ．１８巻（３−４号）：２２３〜３２頁、又はＬｅｏｎａｒｄ及びＳｐｏｌｓｋｉ Ｒ．２００５年、Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．５巻：６８８〜９８頁、又はＫｏｒｎら、Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏ．、２００９年、２７巻：４８５〜５１７頁を参照されたい。ＩＬ−２１は、ＴＧＦβと共に、ＩＬ−６及びＴＧＦβの組み合わせの代替経路としてＴＨ１７細胞の分化を誘導することが示されており、したがってＩＬ−６が制限されている場合に、正のフィードバックをＴＨ１７分化にもたらし、並びにＴＨ１７前駆体の維持及び増幅を支援することができる。ＩＬ−２１は、ＲＯＲγｔの発現も誘導する。ＩＬ−２１受容体は、Ｉ型サイトカイン受容体であり、ＩＬ−２及びＩＬ−１５受容体と共通のガンマ鎖を共有する。

【0126】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−２１やＩＬ−２１Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−２１又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−２１やＩＬ−２１Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−２１又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−２１及びＩＬ−２１受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−２１アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−２１の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号８及び配列番号９により表されている。加えて、完全ヒト抗ＩＬ−２１モノクローナル抗体（ＩＬ−２１ ｍＡｂ）（例えば、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，Ｉｎｃ．社製の抗ヒトＩＬ−２１；国際公開第２００７／１１１７１４号；国際公開第２００９／０４７３６０号を参照）を含む、ＩＬ−２１に対する抗体が産生されており、ＩＬ−２１及びＩＬ−２１受容体のアンタゴニストが記述されている（例えば、国際公開第２００７／１１４８６１号；国際公開第２００９／１４３５２６号；国際公開第２００９／１３２８２１号；国際公開第２００９／１０００３５号；国際公開第２００８／０７４８６３号；国際公開第２００８／０４９９２０号を参照）。

【0127】

ＩＬ−２２は、最終分化したＴＨ１７細胞により分泌される炎症促進性サイトカインであり、上皮細胞増殖及び抗微生物タンパク質産生の誘導を含む、宿主防御の役割を果たす。ＩＬ−２２は、インターフェロン受容体関連タンパク質ＣＲＦ２〜４及びＩＬ２２Ｒによりシグナルを伝達する。例えば、Ｘｉｅら、（２０００年）Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、２７５巻、３１３３５〜３１３３９頁を参照されたい。

【0128】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−２２やＩＬ−２２Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−２２又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−２２やＩＬ−２２Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−２２又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−２２及びＩＬ−２２受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−２２アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−２２の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号１０及び配列番号１１により表されている。加えて、ＩＬ−２２に対する抗体が産生されており（例えば、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，Ｉｎｃ．社製の抗ヒトＩＬ−２２、又は国際公開第２００７／０９８１７０号を参照）、ＩＬ−２２及びＩＬ−２２受容体のアンタゴニストが記述されている（例えば、国際公開第２００７／１２６４３９号を参照）。

【0129】

ＩＬ−２３は、ｐ４０サブユニット（ＩＬ−１２と共有）及びｐ１９サブユニット（ＩＬ−２３アルファサブユニット）で構成されるヘテロ二量体サイトカインである。ＩＬ−２３は、マトリックスメタロプロテアーゼＭＭＰ９の上方制御を促進し、血管新生を増加させ、ＣＤ８＋ Ｔ細胞浸潤を低減し、ＴＨ１７細胞の完全で持続的な分化に必要である。ＩＬ−２３は、ＴＨ１７細胞の安定化及び生存に寄与することができ、炎症促進性サイトカイン発現を促進することもできる。ＩＬ−２３は、ＩＬ１２のベータ１サブユニット（ＩＬ１２ＲＢ１）及びＩＬ２３特異的サブユニット、ＩＬ２３Ｒにより形成されるＩＬ２３受容体に結合する。例えば、Ｌａｎｇｏｗｓｋｉら、（２００６年）Ｎａｔｕｒｅ ４４２巻（７１０１）：４６１〜５頁；Ｋｉｋｌｙら、（２００６年）Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８巻（６号）：６７０〜５頁；Ｏｐｐｍａｎｎら、（２０００年）Ｉｍｍｕｎｉｔｙ １３巻（５号）：７１５〜２５頁を参照されたい。

【0130】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−２３やＩＬ−２３Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−２３又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−２３やＩＬ−２３Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−２３又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−２３及びＩＬ−２３受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−２３アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−２３ ｐ１９及びｐ４０サブユニットの核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号１２及び配列番号１３（ｐ１９）、並びにそれぞれ配列番号１４及び配列番号１５（ｐ４０サブユニット）により表されている。抗体を含む、ＩＬ−２３及びＩＬ−２３受容体のアゴニスト及びアンタゴニストが記述されている（例えば、ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ，Ｉｎｃ．社製の抗ヒトＩＬ−２３；国際公開第２００９／１０００３５号；国際公開第２００７／１４７０１９号；国際公開第２００９／０８２６２４号；国際公開第２００８／１３４６５９号を参照）。

【0131】

ＩＬ−２５は、サイトカインのＩＬ−１７ファミリー（ＩＬ−１７Ｅとしても知られている）に属するサイトカインであり、ＴＨ２関連サイトカインを誘導し、慢性炎症を制限する。ＩＬ−２５は、ＴＨ１７細胞機能を阻害する。例えば、Ｋｌｅｉｎｓｃｈｅｋら、Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ ２００７年；２０４巻：１６１〜１７０頁；Ｏｗｙａｎｇら、Ｊ Ｅｘｐ Ｍｅｄ ２００６年；２０３巻：８４３〜８４９頁を参照されたい。

【0132】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−２５やＩＬ−２５Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−２５又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−２５やＩＬ−２５Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−２５又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−２５及びＩＬ−２５受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−２５アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−２５の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらの転写変異体のヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号１６及び配列番号１７により表されている。加えて、ＩＬ−２５に対する抗体が記述されており、それらには抗体が含まれる（例えば、国際公開第２００８／１２９２６３号を参照）。

【0133】

ＩＬ−２７は、ＩＬ−１２ファミリーのメンバーであり、先天性免疫系の細胞により産生されるサイトカインである。ＩＬ−２７は、ＴＨ１応答を増強することが示されており、抗炎症特性を有する。ＩＬ−２７は、ＴＨ１応答を増強するその能力に依存せずにＴＨ１７応答を阻害することが可能であることが示されている（例えば、Ｂａｔｔｅｎら、２００６年、Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．７巻：９２９〜３６頁；Ｓｔｕｍｈｏｆｅｒら、２００６年、Ｎａｔ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．７巻：９３７〜４５頁を参照）。

【0134】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−２７やＩＬ−２７Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−２７又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−２７やＩＬ−２７Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−２７又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−２７及びＩＬ−２７受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−２７アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−２７の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号１８及び配列番号１９により表されている。ＩＬ−２７及びＩＬ−２７受容体のアゴニスト及びアンタゴニストが記述されており、それらには抗体が含まれる（例えば、国際公開第２００８／０７００９７号；国際公開第２００８／０２５０３２号；国際公開第２００８／０２５０３３号を参照）。

【0135】

ＩＬ−１βは、感染に対する免疫防御に関与する炎症促進性サイトカインである。ＩＬ−１βは、マクロファージ、単球、及び樹状細胞により産生される。例えば、Ｄｉｎａｒｅｌｌｏ（１９９４年）Ｆａｓｅｂ Ｊ．８巻（１５号）：１３１４〜２５頁を参照されたい。

【0136】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−１βやＩＬ−１βＲのアンタゴニスト等の、ＩＬ−１β又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−１βやＩＬ−１βＲのアゴニスト等の、ＩＬ−１β又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−１β及びＩＬ−１β受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−１βアゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−１βの核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、それらのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号２０及び配列番号２１により表されている。ＩＬ−１β及びＩＬ−１β受容体のアゴニスト及びアンタゴニストが記述されており、それらには抗体が含まれる（例えば、国際公開第２００７／０５０６０７号を参照）。

【0137】

ＩＬ−１２は、ＴＨ１細胞の分化の役割を果たし、ＤＣを含む活性化ＡＰＣにより産生されるサイトカインである。ＩＬ−１２は、ｐ３５及びｐ４０と表記される２つのサブユニットで形成される。ｐ４０は、ｐ１９と組み合わせるとサイトカインＩＬ−２３を形成するサブユニットでもある（上記を参照）。

【0138】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＩＬ−１２やＩＬ−１２Ｒのアンタゴニスト等の、ＩＬ−１２又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＩＬ−１２やＩＬ−１２Ｒのアゴニスト等の、ＩＬ−１２又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＩＬ−１２及びＩＬ−１２受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＩＬ−１２アゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＩＬ−１２の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、そのｐ３５サブユニットのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号２２及び配列番号２３により表されている（ｐ４０サブユニットの核酸及びアミノ酸配列は、上述されており、本明細書では配列番号１４及び配列番号１５により表されている）。ＩＬ−１２及びＩＬ−１２受容体のアゴニスト及びアンタゴニストが記述されており、それらには抗体が含まれる（例えば、国際公開第２００８／０７９３５９号；国際公開第２００６／１２４６６２号；国際公開第２００５／０８６８３５号を参照）。

【0139】

ＴＧＦβは、多種多様な細胞の増殖、細胞分化、及び他の機能を制御する、少なくとも３つのアイソフォームが存在するサイトカインである。ＴＧＦβは、ＴＨ１７及びＴｒｅｇ細胞の両方の活性化及び分化を指図する。ＴＨ１７活性化及び分化に関して、ＴＧＦβは、ＩＬ−６及び代替的にはＩＬ−２１及び恐らくは他のサイトカインと協同して指図する。ＴＧＦ−βは、未感作ＣＤ４＋ Ｔ細胞におけるＩＬ−１７の初期誘導及びＩＬ−２３Ｒの誘導の両方に必要であり、ＴＨ１７の成熟化を更に促進する。

【0140】

本発明の方法に有用な作用剤には、幾つかの態様では、ＴＧＦβやＴＧＦβＲのアンタゴニスト等の、ＴＧＦβ又はその受容体の発現又は活性を下方制御する作用剤が含まれ、他の態様では、ＴＧＦβやＴＧＦβＲのアゴニスト等の、ＴＧＦβ又はその受容体の発現又は活性を上方制御する作用剤が含まれる。そのような作用剤は、ＴＧＦβ及びＴＧＦβ受容体の構造及び機能に関する知識を踏まえて、産生及び／又は選択することができ、様々なＴＧＦβアゴニスト及びアンタゴニストが、当技術分野で知られている。ＴＧＦβ（アイソフォーム１）の核酸配列及びアミノ酸配列は、当技術分野で公知であり、そのヒト配列は、本明細書では、それぞれ配列番号２４及び配列番号２５により表されている。ＴＧＦβ及びＴＧＦβ受容体のアゴニスト及びアンタゴニストが記述されており、それらには抗体が含まれる（例えば、国際公開第２００５／１１３８１１号を参照）。

【0141】

本明細書で使用される場合、用語「インターフェロン」は、典型的には、免疫系の細胞により及び幅広く多様な細胞により産生されるサイトカインを指す。インターフェロンは、宿主細胞内のウイルス複製を阻害し、ナチュラルキラー細胞及びマクロファージを活性化し、リンパ球に対する抗原提示を増加させ、ウイルス感染に対する宿主細胞の耐性を誘導することにより、免疫応答を支援する。Ｉ型インターフェロンには、限定ではないが、インターフェロン−αが含まれる。ＩＩ型インターフェロンには、限定ではないが、インターフェロン−γが含まれる。本発明の方法の幾つかに有用なインターフェロンには、インターフェロン−α２を含む、インターフェロン−α等の任意のＩ型インターフェロン、インターフェロン−γを含む任意のＩＩ型インターフェロン、又はインターフェロン−λ１、インターフェロン−λ２、若しくはインターフェロン−λ３を含む任意のＩＩＩ型インターフェロンが含まれ、１つの態様では、任意のインターフェロンのより長期持続型が企図されており、それらには、ペグ化インターフェロン、インターフェロン融合タンパク質（アルブミンに融合されたインターフェロン）、及びインターフェロンを含む放出制御製剤（例えば、ミクロスフェア中のインターフェロン又はポリアミノ酸ナノ粒子を有するインターフェロン）が含まれるが、それらに限定されない。

【0142】

上記で考察したように、本発明に有用な作用剤には、本明細書に記載のように酵母ベースの免疫療法組成物と共に投与することができ、ＴＨ細胞に対して所望の調節効果を示すあらゆる（化学的又は生物学的）部分が含まれていてもよい。例えば、作用剤には、タンパク質、ペプチド、抗体若しくはその抗原結合部分、低分子（例えば、薬物又は化学化合物）；ｓｉＲＮＡ、アンチセンス分子、リボザイム、サイトカイン若しくはその受容体の生物学的アゴニスト若しくはアンタゴニスト、又はアプタマーが含まれるがこれらに限定されない。１つの実施形態では、酵母ベースの免疫療法組成物を産生するのに使用される酵母は、作用剤を保持又は発現するように操作されている。作用剤には、所与のタンパク質若しくはペプチド又はそのドメインのアゴニスト及びアンタゴニストが含まれていてもよい。本明細書で使用される場合、「アゴニスト」は、限定ではないが、低分子、タンパク質、ペプチド、抗体、核酸結合剤等を含む、受容体又はリガンドに結合し応答を生じさせる又は引き起こす任意の化合物又は作用剤であり、それらには、受容体に結合する天然物質又はリガンドの作用を模倣する作用剤が含まれていてもよい。「アンタゴニスト」は、限定ではないが、低分子、タンパク質、ペプチド、抗体、核酸結合剤等を含む、アゴニストの作用を阻止又は阻害又は低減させる任意の化合物又は作用剤である。

【0143】

本発明による作用剤として有用なタンパク質及びペプチドには、所望の機能、例えばＴＨ１７、ＴＨ１、及び／又はＴｒｅｇの産生及び／又は生存の上方制御又は下方制御を示す任意のタンパク質又はペプチドが含まれていてもよい。例えば、有用なタンパク質又はペプチドには、サイトカイン及びサイトカイン受容体、その部分、又はそのアゴニスト若しくはアンタゴニスト、抗体若しくはその部分、又は阻止ペプチドが含まれ得るがこれらに限定されない。タンパク質及びペプチドには、可溶性不活型サイトカイン及び／又はそれらの受容体が含まれていてもよい。

【0144】

抗体は、免疫グロブリンドメインを含むことを特徴とし、したがってタンパク質の免疫グロブリンスーパーファミリーのメンバーである。本発明に有用な抗体には、ポリクローナル及びモノクローナル抗体、二価及び一価抗体、二重特異的又は多重特異的抗体、そのような抗体を含有する血清、様々な程度に精製された抗体、並びに全抗体の任意の機能的等価物が含まれる。抗体には、ヒト化抗体、キメラ抗体、及び完全ヒト抗体、又はそれらの機能的な部分又は等価物が含まれていてもよい。単離された抗体には、そのような抗体又は様々な程度に精製された抗体を含有する血清が含まれていてもよい。本発明の全抗体は、ポリクローナルであってもよく又はモノクローナルであってもよい。或いは、１つ又は複数の抗体ドメインが切断され又は欠失している抗原結合断片（抗原結合部分）等の全抗体の機能的等価物（例えば、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、又はＦ（ａｂ）２断片）、並びに単鎖抗体又は複数のエピトープに結合することができる抗体（例えば、二重特異的抗体）又は複数の異なる抗原に結合することができる抗体（例えば、二重特異的又は多重特異的抗体）を含む遺伝子操作された抗体又はその抗原結合断片も、本発明で使用することができる。

【0145】

本発明の遺伝子操作された抗体には、抗体可変領域及び／又は定常領域をコードするＤＮＡの操作及び再発現を含む標準的組換えＤＮＡ技術により産生されたものが含まれる。特定の例には、抗体のＶＨ及び／又はＶＬドメインがその抗体の残りとは異なる供給源に由来するキメラ抗体、並びに少なくとも１つのＣＤＲ配列及び任意に少なくとも１つの可変領域フレームワークアミノ酸が１つの供給源に由来し、可変領域及び定常領域（該当する場合）の残りの部分が、異なる供給源に由来するＣＤＲ移植抗体（及びその抗原結合断片）が含まれる。キメラ及びＣＤＲ移植抗体の構築は、例えば、欧州特許出願公開第０１９４２７６号、欧州特許出願公開第０２３９４００号、欧州特許出願公開第０４５１２１６号、及び欧州特許出願公開第０４６０６１７号に記載されている。

【0146】

ヒト化抗体は、当技術分野で公知の様々な方法を使用して産生することができ、それらには、キメラ抗体（例えば、ヒト−マウス）を生成し、その後選択的に突然変異を誘発させてより完全なヒト配列にすることを含む、完全ヒト化又は部分的ヒト（キメラ）抗体を生成するための組換えＤＮＡ技術の使用（例えば、Ｎｏｒｄｅｒｈａｕｇら、１９９７年、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２０４巻（１号）：７７〜８７頁）；ヒト抗体スキャフォールドへのヒトＣＤＲ領域の挿入（例えば、Ｋａｓｈｍｉｒｉら、２００５年、Ｍｅｔｈｏｄｓ ３６巻（１号）：２５〜３４頁；又はＨｏｕら、２００８年、Ｊ Ｂｉｏｃｈｅｍ １４４巻（１号）：１１５〜２０頁）；又はファージディスプレイ法が含まれるが、それらに限定されない。ヒト抗体は、例えば、標的タンパク質又はペプチドでヒトを免疫することにより、又は特定の疾患若しくは感染症を有し、抗体を発生させる患者から血清を収集することにより産生することもでき、それらには、ヒトにより産生される血清に由来するモノクローナル抗体が含まれる（例えば、Ｓｔａｃｙら、２００３年、Ｊ Ｉｍｍｕｎｏｌ Ｍｅｔｈｏｄｓ ２８３巻（１−２号）：２４７〜５９頁）。

【0147】

一般的に、抗体の産生では、例えば、ウサギ、ヒツジ、ハムスター、モルモット、マウス、ラット、又はニワトリ等であるがこれらに限定されない好適な実験動物を、それに対する抗体が所望である抗原に曝露する。典型的には、動物は、動物に注射される有効量の抗原で免疫される。抗原の有効量とは、動物による抗体産生を誘導するために必要とされる量を指す。その後、所定の期間にわたって動物の免疫系を応答させる。免疫系が抗原に対する抗体を産生していることが判明するまで、免疫プロセスを繰り返すことができる。抗原に特異的なポリクローナル抗体を得るために、所望の抗体を含有する動物から血清を採取する（又は、ニワトリの場合には、抗体は卵から収集してもよい）。そのような血清は、試薬として有用である。ポリクローナル抗体は、例えば、硫酸アンモニウムで血清を処理することにより、血清（又は卵）から更に精製ことができる。

【0148】

モノクローナル抗体は、Ｋｏｈｌｅｒ及びＭｉｌｓｔｅｉｎ（Ｎａｔｕｒｅ、２５６巻：４９５〜４９７頁、１９７５年）の方法に従って産生してもよい。例えば、免疫された動物の脾臓（又は任意の好適な組織）からＢリンパ球を回収し、その後ミエローマ細胞と融合させて、好適な培養培地中で連続的に増殖可能なハイブリドーマ細胞の集団を得る。所望の抗体を産生するハイブリドーマを、ハイブリドーマにより産生される抗体が所望の抗原に結合する能力を試験することにより選択する。

【0149】

本発明は、所与のサイトカイン若しくはその受容体、又はＴＨ１７細胞を調節することができる他のタンパク質若しくは分子に特異的に結合し、所与のサイトカイン若しくはその受容体、又はＴＨ１７細胞を調節することができる他のタンパク質若しくは分子を必要に応じて活性化又は阻害するかのいずれかをするように設計されている、結合パートナーと呼ばれることがある非抗体ポリペプチドにも拡張される。所定のリガンド特異性を有するそのようなポリペプチドの設計の例は、Ｂｅｓｔｅら（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．９６巻：１８９８〜１９０３頁、１９９９年）に記載されており、この文献は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0150】

アンチセンスＲＮＡ及びＤＮＡ分子は、サイトカインをコードするＲＮＡ又はＤＮＡ等の、阻害しようとする部分の核酸配列に基づく。化学的にポリヌクレオチドを合成するための技術は、固相ホスホラミダイト化学合成等が、当技術分野で周知である。或いは、ＲＮＡ分子は、アンチセンスＲＮＡ分子をコードするＤＮＡ配列のｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏ転写により生成することができる。そのようなＤＮＡ配列は、Ｔ７又はＳＰ６ポリメラーゼプロモーター等の好適なＲＮＡポリメラーゼプロモーターが組み込まれている、幅広く多様なベクターに組み込まれていてもよい。使用されるプロモーターに応じてアンチセンスＲＮＡを構成的に又は誘導可能に合成するアンチセンスｃＤＮＡ構築体を、宿主細胞に安定的に導入することができる。

【0151】

アプタマーは、高い親和性及び特異性で所定の特定の標的分子に結合するそれらの能力により、無作為化コンビナトリアル核酸ライブラリーから選択される短鎖の合成核酸である（通常はＲＮＡであるが、ＤＮＡの場合もある）。またアプタマーは、他のタンパク質相互作用を妨害するように設計されている、両端がタンパク質スキャフォールドに結合された可変ペプチドループで構成されるペプチドであってもよい。アプタマーは、明確な三次元構造をとることが仮定されており、構造がごくわずかに異なる化合物を区別することが可能である。

【0152】

ＲＮＡ干渉（ＲＮＡｉ）は、「ＲＮＡ干渉」（ＲＮＡｉ）と名付けられた、遺伝子サイレンシングにより遺伝子を不活化するための手法である。例えば、Ｆｉｒｅら、Ｎａｔｕｒｅ ３９１巻：８０６〜８１１頁（１９９８年）及び米国特許第６，５０６，５５９号を参照されたい。ＲＮＡ干渉は、ＲＮＡポリヌクレオチドが、内因性細胞プロセスにより作用して、その配列がＲＮＡの配列に対応する遺伝子の発現を特異的に抑制する際に生じる事象を指す。標的遺伝子のサイレンシングは、宿主動物による、二本鎖（ｄｓ）ＲＮＡによるｍＲＮＡの分解の際に、時にはＲＮＡａｓｅ ＩＩＩエンドヌクレアーゼ消化によるｍＲＮＡの分解の際に生じる。消化により、長さ（又はサイズ）が約２１〜２３個のヌクレオチド（又は塩基）の分子がもたらされるが、分子の大きさは、３０塩基ほどの大型であってもよい。これらの短鎖ＲＮＡ種（低分子干渉ＲＮＡ又はｓｉＲＮＡ）は、恐らくは、低分子ｄｓＲＮＡが塩基対合相互作用により相補的ｍＲＮＡを認識するのを支援する、ＲＮＡ誘導性サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）と呼ばれるＲＮＡｉヌクレアーゼ複合体により、対応するＲＮＡメッセージ及び転写物の分解を媒介する。その基質とのｓｉＲＮＡ相互作用後に、ｍＲＮＡは、恐らくはＲＩＳＣに存在する酵素による、分解の標的とされる。このタイプの機序は、ウイルス感染、トランスポゾンジャンプ、及び類似の現象を阻害するという点で生物に有用であり、内因的遺伝子の発現を制御するのに有用である。ＲＮＡｉ活性は、これまで、他の生物の中でも植物、昆虫、線虫、及び脊椎動物で明らかになっている。一般的な背景情報については、例えば、Ｓｃｈｕｔｚら、Ｖｉｒｏｌｏｇｙ ３４４巻（１号）：１５１〜７頁（２００６年）；Ｌｅｏｎａｒｄら、Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒ．１３巻（６号）：５３２〜４０頁（２００６年）；Ｃｏｌｂｅｒｅ−Ｇａｒａｐｉｎら、Ｍｉｃｒｏｂｅｓ Ｉｎｆｅｃｔ．７巻（４号）：７６７〜７５頁（２００５年）；Ｗａｌｌ、Ｔｈｅｒｉｏｇｅｎｏｌｏｇｙ ５７巻（１号）：１８９〜２０１頁（２００２年）；Ｅｌ−Ｂａｓｈｉｒら、Ｎａｔｕｒｅ ４１１巻：４９４〜４９８頁（２００１年）；Ｆｉｒｅ，Ａ．ら、Ｓｃｉｅｎｃｅ ３９１巻：８０６〜８１１頁（１９９８年）；Ｇｉｔｌｉｎら、Ｎａｔｕｒｅ ４１８巻：４３０〜４３４頁（２００２年）；Ｇｉｔｌｉｎら、Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７９巻：１０２７〜１０３５頁（２００５年）；Ｋａｈａｎａら、Ｊ．Ｇｅｎ．Ｖｉｒｏｌ．８５巻、３２１３〜３２１７頁（２００４年）；Ｋｒｏｎｋｅら、Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７８巻：３４３６〜３４４６頁（２００４年）；Ｌｅｏｎａｒｄら、Ｊ．Ｖｉｒｏｌ．７９巻：１６４５〜１６５４頁（２００５年）；及びＹｏｋｏｔａら、ＥＭＢＯ Ｒｅｐ．４巻：６０２〜６０８頁（２００３年）を参照されたい。例としては、酵母媒体又は酵母ベースの免疫療法剤は、そのような細胞が酵母を貪食し、それにより、酵母媒体又は酵母ベースの免疫療法剤による抗原提示細胞の活性化に関連する免疫応答を調節する際に、抗原提示細胞におけるサイトカインの発現を阻害することになるｓｉＲＮＡを保持するように操作されてもよい。

【0153】

リボザイムは、生物学的触媒作用を行うことができる（例えば、共有結合を破壊又は形成することにより）ＲＮＡ断片である。より詳しくは、リボザイムは、標的ＲＮＡ部分に結合することにより機能し、特異的な切断部位でホスホジエステル骨格を切断することにより標的ＲＮＡ部分を不活化するアンチセンスＲＮＡ分子である。そのような核酸に基づく作用剤は、宿主細胞又は組織に導入し、種々のタンパク質の発現及び／又は機能を阻害するために使用することができる。

【0154】

本発明は、種々の受容体の立体構造的アンタゴニスト若しくは活性化因子、又はサイトカインの模倣体若しくは修飾型、又は生物学的タンパク質若しくは受容体と相互作用することが可能な他の分子等の低分子化合物（例えば、薬物発見及び／又は開発の産物）も含む。そのような作用剤は、例えば、分子多様性戦略（大型の化学的に多様な分子ライブラリーの迅速な構築を可能にする関連戦略の組み合わせ）から、天然化合物若しくは合成化合物のライブラリーから、特に化学的若しくはコンビナトリアルライブラリー（つまり、配列若しくはサイズが異なるが、同一の構成要素を有する化合物のライブラリー）から、又は合理的薬物設計により得ることができる。例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＭａｕｌｉｋら、１９９７年、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ：Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ ａｎｄ Ｓｔｒａｔｅｇｉｅｓ、Ｗｉｌｅｙ−Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．社を参照されたい。

【0155】

所与のタンパク質（例えば、サイトカイン又は受容体）の「発現」は、遺伝子の転写及び／又は遺伝子によりコードされたタンパク質の翻訳を指す。所与のタンパク質の「活性」は、一般的に生物活性を指し、それは、本明細書では、ｉｎ ｖｉｖｏで（つまり、天然の生理学的環境中で）又はｉｎ ｖｉｔｒｏで（つまり、実験室条件下で）測定又は観察される、細胞又は生物の代謝又は他のプロセスに効果を示すあらゆる検出可能な活性と定義される。

【0156】

酵母ベースの免疫療法組成物
本発明は、少なくとも１つの「酵母ベースの免疫療法剤組成物」（この語句は、「酵母ベースの免疫療法生成物」、「酵母ベースの組成物」、「酵母ベースの免疫療法剤」、又は「酵母ベースのワクチン」と同義に使用される場合がある）の使用を含む。本明細書で使用される場合、語句「酵母ベースの免疫療法組成物」は、酵母媒体成分を含み、被験者において少なくとも１つの治療的有益性を達成するのに十分な免疫応答を誘発する組成物を指す。より詳しくは、酵母ベースの免疫療法組成物は、酵母媒体成分を含み、限定ではないがＴ細胞媒介性細胞性免疫反応を含む細胞性免疫反応等の免疫応答を誘発又は誘導することができる組成物である。１つの態様では、本発明に有用な免疫療法組成物は、ＣＤ８＋及び／又はＣＤ４＋ Ｔ細胞媒介性免疫応答を誘導することが可能であり、１つの態様では、ＣＤ８＋及びＣＤ４＋ Ｔ細胞媒介性免疫応答を誘導することが可能である。任意に、酵母ベースの免疫療法組成物は、体液性免疫応答を誘発することが可能である。本発明に有用な酵母ベースの免疫療法組成物は、例えば、個体の疾患若しくは状態、又は疾患若しくは状態に起因する症状が治療されるように、個体に免疫応答を誘発することができる。

【0157】

本発明の酵母ベースの免疫療法組成物は、「予防的」又は「治療的」のいずれであってもよい。予防的に提供された場合、本発明の免疫療法組成物は、疾患又は状態の任意の症状に先立って提供される。免疫療法組成物の予防的な投与は、任意のその後の疾患を予防するか、又は軽減するか、又は発症までの時間を遅延させるのに役立つ。治療的に提供される場合、免疫療法組成物は、疾患の症状の発症時に又は発症後に提供される。用語「疾患」は、動物の正常健康状態からのあらゆる逸脱を指し、疾患症状が存在する際の状態、並びに逸脱（例えば、腫瘍増殖、感染等）は生じているが、症状がまだ現れていない状態を含む。

【0158】

典型的には、酵母ベースの免疫療法組成物は、酵母媒体、及び酵母媒体により発現された、酵母媒体に結合された、又は酵母媒体と混合された少なくとも１つの抗原又はその免疫原性ドメインを含む。幾つかの実施形態では、抗原又はその免疫原性ドメインは、融合タンパク質として提供される。本発明の１つの態様では、融合タンパク質は、２つ以上の抗原を含むことができる。１つの態様では、融合タンパク質は、１つ若しくは複数の抗原の２つ以上の免疫原性ドメイン、又は１つ若しくは複数の抗原の２つ以上のエピトープを含むことができる。ＴＡＲＭＯＧＥＮ（商標）は、本発明に有用な酵母ベースの免疫療法組成物の１つの非限定的な例である。ＴＡＲＭＯＧＥＮ（商標）（ＴＡＲｇｅｔｅｄ ＭＯｌｅｃｕｌａｒ ｉｍｍｕｎｏＧＥＮ、ＧｌｏｂｅＩｍｍｕｎｅ，Ｉｎｃ．社製、ルーイビル、コロラド州）は、一般的に１つ又は複数の異種抗原を、細胞外に（その表面に）、細胞内に（内部的に若しくはサイトゾル的に）、又は細胞外及び細胞内の両方に発現する酵母媒体を指す。Ｔａｒｍｏｇｅｎは、当技術分野で一般的に記述されている。例えば、米国特許第５，８３０，４６３号を参照されたい。

【0159】

酵母ベースの免疫療法組成物、及びその製作方法、及びその一般的な使用方法は、例えば、米国特許第５，８３０，４６３号、米国特許第７，０８３，７８７号、米国特許第７，４６５，４５４号、米国特許公開第２００７−０２２４２０８号、米国特許公開第２００８−０００３２３９号、及びＳｔｕｂｂｓら、Ｎａｔ．Ｍｅｄ．７巻：６２５〜６２９頁（２００１年）、Ｌｕら、Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ６４巻：５０８４〜５０８８頁（２００４年）、及びＢｅｒｎｓｔｅｉｎら、Ｖａｃｃｉｎｅ ２００８年１月２４日；２６巻（４号）：５０９〜２１頁に詳細に記載されており、それらの各々は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。これらの酵母ベースの免疫療法生成物は、細胞性及び体液性免疫応答を含む免疫応答を誘発することが示されている。酵母ベースの免疫療法生成物は、様々な動物種において、様々な抗原を発現する標的細胞をｉｎ ｖｉｖｏで死滅させることが可能であり、抗原特異的ＣＤ４＋及びＣＤ８＋媒介性免疫応答により死滅させる。更なる研究により、酵母は貪欲に貪食され、その後酵母関連タンパク質を非常に効率的な様式でＣＤ４＋及びＣＤ８＋ Ｔ細胞に提示する樹状細胞を直接的に活性化することが示されている。例えば、Ｓｔｕｂｂｓら、Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄ．５巻：６２５〜６２９頁（２００１年）及び米国特許第７，０８３，７８７号を参照されたい。

【0160】

本発明で使用される酵母ベースの免疫療法組成物のいずれかでは、酵母媒体に関連する以下の態様が、本発明に含まれる。本発明によると、酵母媒体は、本発明の治療用組成物中の１つ若しくは複数の抗原、その免疫原性ドメイン、若しくはそのエピトープと共に使用することができる任意の酵母細胞（例えば、全細胞又は無傷細胞）又はその誘導体（以下を参照）であるか、又は１つの態様では、酵母媒体は、単独で若しくはアジュバントとして使用することができる。１つの態様では、酵母は、更に、本明細書に記載のようにＴＨ１７及び／又はＴＨ１免疫応答を調節するのに有用な１つ又は複数の作用剤と共に使用される。したがって、酵母媒体には、生菌無傷酵母微生物（つまり、細胞壁を含むその成分を全て有する酵母細胞）、死滅（死）若しくは不活化無傷酵母微生物、又は酵母スフェロプラスト（つまり、細胞壁を欠如する酵母細胞）、酵母サイトプラスト（つまり、細胞壁及び核を欠如する酵母細胞）、酵母ゴースト（つまり、細胞壁、核、及び細胞質を欠如する酵母細胞）、亜細胞酵母膜抽出物若しくはその画分（酵母膜粒子及び以前は細胞内酵母粒子とも呼ばれる）、任意の他の酵母粒子、若しくは酵母細胞壁調製物を含むそれらの誘導体が含まれるがこれらに限定されない。

【0161】

酵母スフェロプラストは、典型的には、酵母細胞壁の酵素消化により生成される。そのような方法は、例えば、Ｆｒａｎｚｕｓｏｆｆら、１９９１年、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１９４巻、６６２〜６７４頁に記載されており、この文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0162】

酵母サイトプラストは、典型的には、酵母細胞の除核により生成される。そのような方法は、例えば、Ｃｏｏｎ、１９７８年、Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．Ｍｏｎｏｇｒ．４８巻、４５〜５５頁に記載されており、この文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0163】

酵母ゴーストは、典型的には、透過処理された又は溶解された細胞を再閉鎖することにより生成され、その細胞の細胞小器官の少なくとも幾つかを含有していてもよいが、そうでなくてもよい。そのような方法は、例えば、Ｆｒａｎｚｕｓｏｆｆら、１９８３年、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５８巻、３６０８〜３６１４頁、及びＢｕｓｓｅｙら、１９７９年、Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ ５５３巻、１８５〜１９６頁に記載されており、これらの文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0164】

酵母膜粒子（亜細胞酵母膜抽出物又はその画分）は、天然の核又は細胞質を欠如する酵母膜を指す。粒子は、天然酵母膜のサイズから、超音波処理又は当業者に公知の他の膜破壊法により生成され、その後再閉鎖される微粒子のサイズまでの範囲のサイズを含む、任意のサイズであってもよい。亜細胞酵母膜抽出物を生成する方法は、例えば、Ｆｒａｎｚｕｓｏｆｆら、１９９１年、Ｍｅｔｈ．Ｅｎｚｙｍｏｌ．１９４巻、６６２〜６７４頁に記述されている。抗原又は他のタンパク質が、酵母膜粒子、抗原、又は他の目的タンパク質を調製する前に、酵母により組換え的に発現された場合、酵母膜部分を含有する酵母膜粒子の画分を使用してもよい。抗原又は他の目的タンパク質は、膜の内部に保持されていてもよく、膜の表面に保持されていてもよく、又はその組み合わせで保持されてもよい（つまり、タンパク質は、膜の内部及び外側の両方にあってもよく、並びに／又は酵母膜粒子の膜を貫通していてもよい）。１つの実施形態では、酵母膜粒子は、少なくとも１つの所望の抗原若しくは他の目的タンパク質（例えば、本明細書に記載のようにＴＨ１７及び／又はＴＨ１免疫応答を調節するための作用剤）を膜表面に含むか、又は膜内部に少なくとも部分的に埋込まれている、無傷の、破壊された、若しくは破壊後に再閉鎖された酵母膜であってもよい組換え酵母膜粒子である。

【0165】

酵母細胞壁調製物の一例は、抗原をその表面に保持するか、又は抗原が少なくとも部分的に細胞壁内に埋込まれている単離された酵母細胞壁であり、その結果、酵母細胞壁調製物は、動物に投与されると、疾患標的に対して所望の免疫応答を刺激する。或いは又は加えて、酵母細胞壁は、本明細書に記載のようにＴＨ１７及び／又はＴＨ１免疫応答を調節するのに有用な作用剤を保持していてもよい。

【0166】

任意の酵母菌株を使用して、本発明の酵母媒体を生成することができる。酵母は、３つのクラス：子嚢菌、担子菌、及び不完全菌類の１つに属する単細胞微生物である。免疫調節物質として使用するための酵母のタイプを選択する場合に考慮すべき１つの点は、酵母の病原性である。１つの実施形態では、酵母は、サッカロマイセス・セレビシエ等の非病原性菌株である。非病原性酵母菌株を選択することにより、酵母媒体が投与される個体に対するいかなる有害効果も最小限に抑えられる。しかしながら、当業者に公知の任意の手段により酵母の病原性を無効にすることができる場合は、病原性酵母を使用してもよい（例えば、突然変異株）。本発明の１つの態様によると、非病原性酵母菌株が使用される。

【0167】

本発明に使用することができる酵母菌株の属には、サッカロマイセス属、カンジダ属（Ｃａｎｄｉｄａ）（病原性であり得る）、クリプトコックス属（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、ハンゼヌラ属（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ）、クリベロマイセス属（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）、ピキア属（Ｐｉｃｈｉａ）、ロドトルラ属（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ）、シゾサッカロミセス属（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）、及びヤロウイア属（Ｙａｒｒｏｗｉａ）が含まれるがこれらに限定されない。１つの態様では、酵母の属は、サッカロマイセス属、カンジダ属、ハンゼヌラ属、ピキア属、又はシゾサッカロミセス属から選択され、１つの態様では、サッカロマイセス属が使用される。本発明に使用することができる酵母菌株の種には、サッカロマイセス・セレビシエ、サッカロマイセス・カールスベルゲンシス（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｃａｒｌｓｂｅｒｇｅｎｓｉｓ）、カンジダ・アルビカンス（Ｃａｎｄｉｄａ ａｌｂｉｃａｎｓ）、カンジダ・ケフィール（Ｃａｎｄｉｄａ ｋｅｆｙｒ）、カンジダ・トロピカリス（Ｃａｎｄｉｄａ ｔｒｏｐｉｃａｌｉｓ）、クリプトコックス・ローレンティ（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｕｒｅｎｔｉｉ）、クリプトコックス・ネオフォルマンス（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｎｅｏｆｏｒｍａｎｓ）、ハンゼヌラ・アノマラ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ ａｎｏｍａｌａ）、ハンゼヌラ・ポリモルファ（Ｈａｎｓｅｎｕｌａ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈａ）、クリベロマイセス・フラジリス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ）、クリベロマイセス・ラクティス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｌａｃｔｉｓ）、クリベロマイセス・マルキシアヌスバール亜種ラクティス（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ ｍａｒｘｉａｎｕｓ ｖａｒ．ｌａｃｔｉｓ）、ピキア・パストリス（Ｐｉｃｈｉａ ｐａｓｔｏｒｉｓ）、ロドトルラ・ルブラ（Ｒｈｏｄｏｔｏｒｕｌａ ｒｕｂｒａ）、シゾサッカロミセス・ポンベ（Ｓｃｈｉｚｏｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｐｏｍｂｅ）、及びヤロウイア・リポリティカ（Ｙａｒｒｏｗｉａ ｌｉｐｏｌｙｔｉｃａ）が含まれるがこれらに限定されない。多数のこれらの種は、前述の種内に含まれることが意図されている様々な亜種、タイプ、サブタイプ等を含むことが理解されるべきである。１つの態様では、本発明に使用される酵母種には、Ｓ．セレビシエ、Ｃ．アルビカンス、Ｈ．ポリモルファ、Ｐ．パストリス、及びＳ．ポンベが含まれる。Ｓ．セレビシエは、操作するのが比較的容易であり、食品添加物として使用するための「安全食品認定」又は「ＧＲＡＳ」（ＧＲＡＳ、ＦＤＡ規則案６２ＦＲ１８９３８、１９９７年４月１７日）であるため、有用である。本発明の１つの実施形態は、Ｓ．セレビシエｃｉｒ°菌株等の、プラスミドを特に高いコピー数に複製することが可能な酵母菌株である。Ｓ．セレビシエ菌株は、１つ又は複数の標的抗原及び／又は抗原融合タンパク質及び／又は他のタンパク質の高レベル発現を可能にする発現ベクターを支持することが可能な１つの菌株である。加えて、任意の突然変異体酵母菌株を本発明に使用することができ、それらには、Ｎ結合グリコシル化を伸長する酵素における突然変異等の、発現される標的抗原又は他のタンパク質の翻訳後修飾の低減を示すものが含まれる。

【0168】

１つの実施形態では、本発明の酵母媒体を、樹状細胞又はマクロファージ等の、酵母媒体及び抗原／作用剤が送達されようとしている細胞タイプと融合させることが可能であり、それにより、その細胞タイプに対する、酵母媒体の、多くの実施形態では、抗原又は他の作用剤の特に効率的な送達が達成される。本明細書で使用される場合、酵母媒体と標的細胞タイプとの融合は、酵母細胞膜又はその粒子が、標的細胞タイプ（例えば、樹状細胞又はマクロファージ）の膜と融合し、シンシチウム形成を導く能力を指す。本明細書で使用される場合、シンシチウムは、細胞の融合により生成される多核塊原形質である。多数のウイルス表面タンパク質（ＨＩＶ等の免疫不全症ウイルス、インフルエンザウイルス、ポリオウイルス、及びアデノウイルスの表面タンパク質を含む）及び他の融合物質（卵子と精子との融合に関与するもの等）は、２つの膜間（つまり、ウイルス膜と哺乳動物細胞膜との間、又は哺乳動物細胞膜間）の融合を達成することができることが示されている。例えば、その表面にＨＩＶ ｇｐ１２０／ｇｐ４１異種抗原を産生する酵母媒体は、ＣＤ４＋ Ｔ−リンパ球と融合することが可能である。しかしながら、酵母媒体への標的化部分の組込みは、幾つかの状況下では望ましい場合があるが、必ずしも必要ではないことに留意されたい。これは、抗原を細胞外に発現する酵母媒体の場合には、本発明の酵母媒体の更なる利点であり得る。一般的に、本発明に有用な酵母媒体は、樹状細胞（並びにマクロファージ等の他の細胞）によって容易に取り込まれる。

【0169】

上記で考察したように、本発明の幾つかの実施形態では、酵母媒体及び／又は酵母ベースの免疫療法組成物は、ＴＨ１７及び／又はＴＨ１免疫応答を調節するのに有用な作用剤を含み、そのような作用剤は、本明細書の他所に記載されている。本発明のほとんどの実施形態では、酵母ベースの免疫療法組成物は、少なくとも１つの抗原、その免疫原性ドメイン、又はそのエピトープを含む。本発明での使用に企図される抗原には、それに対する免疫応答を誘発することが望まれている任意の抗原が含まれる。１つの態様では、酵母が保持するか（例えば、発現する、負荷されている、結合されている等）又は抗原もしくはその免疫原性ドメインと混合されている酵母ベースの免疫療法組成物はまた、本発明によるＴＨ１７及び／又はＴＨ１応答の調節に有用な作用剤を保持していてもよく、又は作用剤と混合されていてもよい。或いは又は加えて、本発明によるＴＨ１及び／又はＴＨ１応答の調節に有用な作用剤を保持する酵母媒体は、酵母ベースの免疫療法剤と共に混合されていてもよく、又は酵母ベースの免疫療法剤と同時に、連続的に、若しくは交互様式で投与されてもよい。酵母ベースの組成物の種々の組み合わせ及び順列を、本発明に従って構築及び使用することができる。

【0170】

本発明によると、用語「抗原」の本明細書での一般的使用は以下のものを指す：天然に生じてもよく又は合成的に導出されてもよいタンパク質（ペプチド、部分的タンパク質、全長タンパク質）の任意の部分、細胞組成物（全細胞、細胞溶解産物、若しくは破壊された細胞）、微生物若しくは細胞（全微生物、溶解産物、又は破壊された細胞）、又は炭水化物、又は他の分子若しくはその部分。抗原は、幾つかの実施形態では、免疫系のエレメント（例えば、Ｔ細胞、抗体）が遭遇するのと同じか又は類似の抗原に対する抗原特異的免疫応答（例えば、体液性免疫応答及び／又は細胞媒介性免疫応答）を誘発することができる。用語「癌抗原」は、本明細書では、用語「腫瘍特異的抗原」、「腫瘍関連抗原」、「癌関連標的」、又は「腫瘍関連標的」と同義に使用することができる。

【0171】

抗原は、単一のエピトープほどの小ささであってもよく、又はより大型であってもよく、複数のエピトープを含んでいてもよい。そのため、抗原のサイズは、約５〜１２個アミノ酸（例えば、小型ペプチド）ほどの小ささであってもよく、多量体及び融合タンパク質、キメラタンパク質、又はアゴニストタンパク質若しくはペプチドを含む、タンパク質のドメイン、部分的タンパク質（ペプチド又はポリペプチド）、全長タンパク質のように大型であってもよい。加えて、抗原には、炭水化物が含まれていてもよい。

【0172】

免疫応答の刺激を参照する場合、用語「免疫原」は、用語「抗原」のサブセットであり、したがって、幾つかの場合、用語「抗原」と同義に使用することができる。免疫原は、本明細書で使用される場合、体液性及び／又は細胞媒介性免疫応答を誘発する抗原（つまり、免疫原）を指し、したがって適切な状況で免疫原を個体に投与することにより（例えば、酵母ベースの免疫療法組成物の一部として）、個体の免疫系が遭遇するのと同じか又は類似の抗原に対する抗原特異的免疫応答が誘発又は誘導される。

【0173】

所与の抗原の「免疫原性ドメイン」は、動物に投与した際に免疫原として作用する少なくとも１つのエピトープを含有する抗原（例えば、ペプチド断片若しくはサブユニット、又は抗体エピトープ、又は他の立体構造エピトープ）の任意の部分、断片、又はエピトープであってもよい。例えば、単一のタンパク質は、複数の異なる免疫原性ドメインを含有することができる。免疫原性ドメインは、体液性免疫応答等の場合には、タンパク質内の線形的な配列である必要はない。

【0174】

エピトープは、本明細書では、免疫応答を誘発するのに十分な、所与の抗原内の単一の免疫原性部位と定義される。当業者であれば、Ｔ細胞エピトープは、Ｂ細胞エピトープとはサイズ及び組成が異なり、ＭＨＣクラスＩ経路により提示されるエピトープは、ＭＨＣクラスＩＩ経路により提示されるエピトープとは異なることを認識するであろう。エピトープは、線形的な配列であってもよく、又は立体構造エピトープ（保存された結合領域）であってもよい。

【0175】

本発明での使用に企図される抗原には、それに対する免疫応答を誘発することが望まれている任意の抗原、特に、そのような抗原に対する治療的免疫応答が個体に有益であると考えられる任意の抗原が含まれる。例えば、抗原には、ウイルス抗原、真菌抗原、細菌抗原、蠕虫抗原、寄生虫抗原、外寄生生物抗原、原生動物抗原、又は任意の他の感染因子に由来する抗原を含むがこれらに限定されない病原体に関連する任意の抗原が含まれていてもよい。また抗原には、病原性供給源に由来するか又は細胞性供給源に由来するかに関わらず、特定の疾患又は状態に関連する任意の抗原が含まれていてもよく、それらには、限定ではないが以下のものが含まれる：癌抗原、自己免疫疾患に関連する抗原（例えば、糖尿病抗原）、アレルギー抗原（アレルゲン）、１つ又は複数の突然変異アミノ酸を内包する哺乳動物細胞分子、哺乳動物細胞により通常は出生前又は新生児期に発現されるタンパク質、その発現が疫学的物質（例えば、ウイルス）の挿入により誘導されるタンパク質、及びその発現が遺伝子転座により誘導されるタンパク質、及びその発現が調節配列の突然変異により誘導されるタンパク質。これらの抗原は、天然抗原であってもよく、又は幾つかの様式（例えば、配列変化又は融合タンパク質の産生）で修飾された遺伝子操作抗原であってもよい。幾つかの実施形態では（つまり、抗原が、酵母媒体により組換え核酸分子から発現される場合）、抗原は、細胞全体又は微生物ではなく、タンパク質又はその任意のエピトープ若しくは免疫原性ドメイン、融合タンパク質、又はキメラタンパク質であってもよい。

【0176】

本発明の酵母ベースの免疫療法組成物に有用な他の抗原には、例えばアレルゲン、自己免疫抗原、炎症性物質、ＧＶＨＤ、ある種の癌に関与する抗原、敗血症ショック抗原、及び移植拒絶に関与する抗原により引き起こされるもの等の、望ましくないか又は有害な免疫応答の抑制に関連する場合のある抗原が含まれる。

【0177】

本発明の１つの態様では、本発明の１つ又は複数の免疫療法組成物に有用な抗原には、任意の癌又は腫瘍関連抗原が含まれる。１つの態様では、抗原には、新生物発生前の又は過形成性の状態に関連する抗原が含まれる。抗原は、癌に関連している場合もあり、又は癌の原因である場合もある。そのような抗原は、腫瘍特異的抗原、腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）、又は組織特異的抗原、それらのエピトープ、及びそれらのエピトープアゴニストであってもよい。癌抗原には、任意の腫瘍又は癌に由来する抗原が含まれるがこれらに限定されず、腫瘍又は癌には、以下のものが含まれるがこれらに限定されない：メラノーマ、扁平上皮癌、乳癌、頭頸部癌、甲状腺癌、軟部組織肉腫、骨肉腫、精巣癌、前立腺癌、卵巣癌、膀胱癌、皮膚癌、脳癌、血管肉腫、血管肉腫、肥満細胞腫瘍、白血病、リンパ腫、原発性肝癌、肺癌、膵臓癌、消化官癌（結腸直腸癌を含む）、腎細胞癌、造血器新形成、及びそれらの転移癌。

【0178】

好適な癌抗原には、以下のもの等の癌胎児抗原（ＣＥＡ）及びそのエピトープが含まれるがこれらに限定されない：ＣＡＰ−１、ＣＡＰ−１−６Ｄ（ＧｅｎＢａｎｋ受入番号Ｍ２９５４０）、ＭＡＲＴ−１（Ｋａｗａｋａｍｉら、Ｊ．Ｅｘｐ．Ｍｅｄ．１８０巻：３４７〜３５２頁、１９９４年）、ＭＡＧＥ−１（米国特許第５，７５０，３９５号）、ＭＡＧＥ−３、ＧＡＧＥ（米国特許第５，６４８，２２６号）、ＧＰ−１００（Ｋａｗａｋａｍｉら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔ’ｌ Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ９１巻：６４５８〜６４６２頁、１９９２年）、ＭＵＣ−１、ＭＵＣ−２、点突然変異Ｒａｓ腫瘍性タンパク質、正常及び点突然変異ｐ５３腫瘍性タンパク質（Ｈｏｌｌｓｔｅｉｎら、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２２巻：３５５１〜３５５５頁、１９９４年）、ＰＳＭＡ（Ｉｓｒａｅｌｉら Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．５３巻：２２７〜２３０頁、１９９３年）、チロシナーゼ（Ｋｗｏｎら、ＰＮＡＳ ８４巻：７４７３〜７４７７頁、１９８７年）、ＴＲＰ−１（ｇｐ７５）（Ｃｏｈｅｎら Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｒｅｓ．１８巻：２８０７〜２８０８頁、１９９０年；米国特許第５，８４０，８３９号）、ＮＹ−ＥＳＯ−１（Ｃｈｅｎら ＰＡＳ ９４巻：１９１４〜１９１８頁、１９９７年）、ＴＲＰ−２（Ｊａｃｋｓｏｎら ＥＭＢＯＪ、１１巻：５２７〜５３５頁、１９９２年）、ＴＡＧ７２、ＫＳＡ、ＣＡ−１２５、ＰＳＡ、ＨＥＲ−２／ｎｅｕ／ｃ−ｅｒｂ／Ｂ２（米国特許第５，５５０，２１４号）、ＥＧＦＲ、ｈＴＥＲＴ、ｐ７３、Ｂ−ＲＡＦ、大腸ポリポーシス（ＡＰＣ）、Ｍｙｃ、フォンヒッペル−リンダウタンパク質（ＶＨＬ）、Ｒｂ−１、Ｒｂ−２、アンドロゲン受容体（ＡＲ）、Ｓｍａｄ４、ＭＤＲ１、Ｆｌｔ−３、ＢＲＣＡ−１、ＢＲＣＡ−２、Ｂｃｒ−Ａｂｌ、ｐａｘ３−ｆｋｈｒ、ｅｗｓ−ｆｌｉ−ｌ、ブラキュリ、ＨＥＲＶ−Ｈ、ＨＥＲＶ−Ｋ、ＴＷＩＳＴ、メソテリン、ＮＧＥＰ、そのような抗原及び組織特異的抗原の修飾、そのような抗原のスプライスバリアント、及び／又はそのような抗原のエピトープアゴニスト。他の癌抗原は、当技術分野で公知である。他の癌抗原も、米国特許第４，５１４，５０６号に開示されている方法等の、当技術分野で公知の方法により特定、単離、及びクローニングしてもよい。また、癌抗原には、１つ又は複数の増殖因子、及び各々のスプライスバリアントが含まれていてもよい。

【0179】

本発明の１つの態様では、本発明の１つ又は複数の免疫療法組成物に有用な抗原には、病原体、又は病原体により引き起こされるか若しくは病原体と関連する疾患若しくは状態に関連する任意の抗原が含まれる。そのような抗原には、ウイルス抗原、真菌抗原、細菌抗原、蠕虫抗原、寄生虫抗原、外寄生生物抗原、原生動物抗原、又は任意の他の感染因子に由来する抗原を含むがこれらに限定されない病原体に関連する任意の抗原が含まれる。

【0180】

１つの態様では、抗原はウイルス由来であり、ウイルスには、以下のものが含まれるがこれらに限定されない：アデノウイルス、アレナウイルス、ブンヤウイルス、コロナウイルス、コクサッキーウイルス、サイトメガロウイルス、エプスタイン−バーウイルス、フラビウイルス、ヘパドナウイルス、肝炎ウイルス、ヘルペスウイルス、インフルエンザウイルス、レンチウイルス、はしかウイルス、おたふくかぜウイルス、ミクソウイルス、オルトミクソウイルス、パピローマウイルス、パポバウイルス、パラインフルエンザウイルス、パラミクソウイルス、パルボウイルス、ピコルナウイルス、ポックスウイルス、狂犬病ウイルス、呼吸系発疹ウイルス、レオウイルス、ラブドウィルス、風疹ウイルス、トガウイルス、及び水痘ウイルス。他のウイルスには、ヒトＴ細胞リンパ球向性ウイルス（ＨＴＬＶ−Ｉ及びＨＴＬＶ−ＩＩ等のＨＴＬＶ）、ウシ白血病ウイルス（ＢＬＶＳ）、及びネコ白血病ウイルス（ＦＬＶ）等のＴ−リンパ球向性ウイルスが含まれる。レンチウイルスには、ヒト（ＨＩＶ−１又はＨＩＶ−２を含むＨＩＶ）、サル（ＳＩＶ）、ネコ（ＦＩＶ）、及びイヌ（ＣＩＶ）免疫不全症ウイルスが含まれるがこれらに限定されない。１つの実施形態では、ウイルス抗原には、非腫瘍ウイルスに由来するものが含まれる。

【0181】

別の態様では、抗原は、以下のものから選択される属に由来する感染因子に由来する：アスペルギルス属（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ）、ボルデテラ属、ブルギア属（Ｂｒｕｇｉａ）、カンジダ属、クラミジア属、コクシジウム属（Ｃｏｃｃｉｄｉａ）、クリプトコックス属、ディロフィラリア属（Ｄｉｒｏｆｉｌａｒｉａ）、エシェリヒア属（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、フランキセラ属（Ｆｒａｎｃｉｓｅｌｌａ）、淋菌属（Ｇｏｎｏｃｏｃｃｕｓ）、ヒストプラスマ属（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ）、リーシュマニア属（Ｌｅｉｓｈｍａｎｉａ）、ミコバクテリウム属（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、マイコプラズマ属（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａ）、パラメシウム属（Ｐａｒａｍｅｃｉｕｍ）、百日咳属（Ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、プラスモジウム属（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ）、肺炎球菌属（Ｐｎｅｕｍｏｃｏｃｃｕｓ）、ニューモシスティス属（Ｐｎｅｕｍｏｃｙｓｔｉｓ）、リケッチア属（Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａ）、サルモネラ属（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ）、シゲラ属（Ｓｈｉｇｅｌｌａ）、スタフィロコッカス属（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス属（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、トキソプラズマ属（Ｔｏｘｏｐｌａｓｍａ）、ビブリオコレラエ属（Ｖｉｂｒｉｏｃｈｏｌｅｒａｅ）、及びエルジニア属（Ｙｅｒｓｉｎｉａ）。１つの態様では、感染因子は、熱帯熱マラリア原虫（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ ｆａｌｃｉｐａｒｕｍ）又は三日熱マラリア原虫（Ｐｌａｓｍｏｄｉｕｍ ｖｉｖａｘ）から選択される。

【0182】

１つの態様では、抗原は、以下のものから選択される科に由来するバクテリアに由来する：腸内菌科（Ｅｎｔｅｒｏｂａｃｔｅｒｉａｃｅａｅ）、ミクロコッカス科（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃａｃｅａｅ）、ビブリオ科（Ｖｉｂｒｉｏｎａｃｅａｅ）、パスツレラ科（Ｐａｓｔｅｕｒｅｌｌａｃｅａｅ）、マイコプラズマ科（Ｍｙｃｏｐｌａｓｍａｔａｃｅａｅ）、及びリケッチア科（Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａｃｅａｅ）。１つの態様では、バクテリアは、以下のものから選択される属である：シュードモナス属、ボルデテラ属、ミコバクテリウム属、ビブリオ属、バチルス属、サルモネラ属、フランキセラ属、スタフィロコッカス属、ストレプトコッカス属、エシェリヒア属、エンテロコッカス属、パスツレラ属、及びエルジニア属。１つの態様では、バクテリアは、以下のものから選択される種に由来する：シュードモナス・エルギノーサ、シュードモナス・マレイ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｍａｌｌｅｉ）、シュードモナス・シュードマレイ（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｐｓｅｕｄｏｍａｌｌｅｉ）、ボルデテラ・パータシス（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｐｅｒｔｕｓｓｉｓ）、マイコバクテリウム・ツベルクローシス（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ）、マイコバクテリウム・レプレ（Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｅｐｒａｅ）、フランシセラ・ツラレンシス（Ｆｒａｎｃｉｓｅｌｌａ ｔｕｌａｒｅｎｓｉｓ）、ビブリオ・コレラエ（Ｖｉｂｒｉｏ ｃｈｏｌｅｒａｅ）、バチルス・アントラシス（バチルス・アントラシス）、サルモネラ・エンテリカ（Ｓａｌｍｏｎｅｌｌａ ｅｎｔｅｒｉｃ）、エルシニア・ペスチス（Ｙｅｒｓｉｎｉａ ｐｅｓｔｉｓ）、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）、及びボルデテラ・ブロンキセプチカ（Ｂｏｒｄｅｔｅｌｌａ ｂｒｏｎｃｈｉｓｅｐｔｉｃａ）。

【0183】

１つの態様では、抗原は真菌に由来し、そのような真菌には、以下のものに由来する真菌であるがこれらに限定されない：サッカロマイセス種（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．）、アスペルギルス種（Ａｓｐｅｒｇｉｌｌｕｓ ｓｐｐ．）、クリプトコックス種（Ｃｒｙｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓｐｐ．）、コクシジオイデス種（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ ｓｐｐ．）、ニューロスポラ種（Ｎｅｕｒｏｓｐｏｒａ ｓｐｐ．）、ヒストプラスマ種（Ｈｉｓｔｏｐｌａｓｍａ ｓｐｐ．）、又はブラストミセス種（Ｂｌａｓｔｏｍｙｃｅｓ ｓｐｐ．）。１つの態様では、真菌は、以下のものから選択される種に由来する：アスペルギルス・フミガーツス、Ａ．フラバス、黒色コウジ菌（Ａ．ｎｉｇｅｒ）、Ａ．テレウス（Ａ．ｔｅｒｒｅｕｓ）、Ａ．ニデュランス（Ａ．ｎｉｄｕｌａｎｓ）、コクシジオイデス・イミチス（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ ｉｍｍｉｔｉｓ）、コクシジオイデス・ポサダシ（Ｃｏｃｃｉｄｉｏｉｄｅｓ ｐｏｓａｄａｓｉｉ）、又はクリプトコックス・ネオフォルマンス。例えば、侵襲性疾患を引き起こすアスペルギルス属の最も一般的な種には、Ａ．フミガーツス（Ａ．ｆｕｍｉｇａｔｕｓ）、Ａ．フラバス、黒色コウジ菌、Ａ．テレウス、及びＡ．ニデュランスが含まれ、例えば、免疫抑制又はＴ細胞若しくは食細胞障害を有する患者に見出される場合がある。Ａ．フミガーツスは、喘息、アスペルギローム、及び侵襲性アスペルギルス症に関与する。コクシジオイデス症は、サンホアキン渓谷熱としても知られており、コクシジオイデス・イミチスにより引き起こされる真菌性疾患であり、急性呼吸器感染症、及び慢性肺性疾患、又は髄膜、硬骨、及び関節への転移に結び付く場合がある。例えば、非免疫抑制被験者、又はＨＩＶに感染している被験者等の免疫抑制被験者のクリプトコックス症関連状態も、本発明の方法により標的とされる。

【0184】

幾つかの実施形態では、抗原は、融合タンパク質である。本発明の１つの態様では、融合タンパク質は、２つ以上の抗原を含むことができる。１つの態様では、融合タンパク質は、１つ又は複数の抗原の２つ以上の免疫原性ドメイン、又は２つ以上のエピトープを含むことができる。そのような抗原を含有する免疫療法組成物は、広範囲の患者に抗原特異的免疫を提供することができる。例えば、本発明に有用な多ドメイン融合タンパク質は、複数のドメインを有していてもよく、各ドメインは、特定のタンパク質に由来するペプチドで構成されており、ペプチドは、タンパク質の両側に隣接し、タンパク質に見出される突然変異アミノ酸を含む少なくとも４つのアミノ酸残基で構成されており、突然変異は、特定の疾患又は状態に関連する。

【0185】

１つの実施形態では、本発明に有用な酵母ベースの免疫療法組成物の成分が使用されている融合タンパク質は、酵母における異種抗原の発現に特に有用な構築体を使用して産生される。典型的には、所望の抗原性タンパク質又はペプチドは、それらのアミノ末端が以下のものに融合されている：（ａ）酵母媒体での融合タンパク質の発現を安定させるか、又は発現された融合タンパク質の翻訳後修飾を防止する特定の合成ペプチド（そのようなペプチドは、例えば、２００４年８月１２日に公開された米国特許公開第２００４−０１５６８５８号に詳細に記述されており、この文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）；（ｂ）いずれかの融合パートナーが、酵母におけるタンパク質発現の安定性の著しい増強及び／又は酵母細胞によるタンパク質の翻訳後修飾の防止を提供する、内因性酵母タンパク質の少なくとも一部（そのようなタンパク質も、例えば、米国特許公開第２００４−０１５６８５８号に詳細に記述されている）；及び／又は（ｃ）融合タンパク質を酵母表面に発現させる酵母タンパク質の少なくとも一部（例えば、本明細書により詳細に記述されているＡｇａタンパク質）。加えて、本発明は、特にタンパク質の選択及び特定に使用するための、抗原をコードする構築体のＣ末端に融合されているペプチドの使用を含む。そのようなペプチドには、ペプチドタグ（例えば、６×Ｈｉｓ）又は任意の他の短鎖エピトープタグ等の、任意の合成又は天然ペプチドが含まれるがこれらに限定されない。本発明による抗原のＣ末端に結合されたペプチドは、上記で考察したＮ末端ペプチドを付加して又は付加せずに使用することができる。

【0186】

１つの実施形態では、融合タンパク質に有用な合成ペプチドは、抗原のＮ末端に結合され、ペプチドは、抗原に対して異種性である少なくとも２つのアミノ酸残基で構成されており、ペプチドは、酵母媒体における融合タンパク質の発現を安定化させるか又は発現された融合タンパク質の翻訳後修飾を防止する。合成ペプチド及び抗原のＮ末端部分は一緒になって、以下の要件を満たす融合タンパク質を形成する：（１）融合タンパク質の１位のアミノ酸残基が、メチオニンであること（つまり、合成ペプチドの最初のアミノ酸がメチオニンである）；（２）融合タンパク質の２位のアミノ酸残基が、グリシン又はプロリンではないこと（つまり、合成ペプチドの２番目のアミノ酸が、グリシン又はプロリンではない）；（３）融合タンパク質の２〜６位のアミノ酸残基がいずれも、メチオニンではないこと（つまり、合成ペプチドが６個のアミノ酸より短い場合、合成ペプチドの一部であるか又はタンパク質の一部であるかに関わらず、２〜６位のアミノ酸が、メチオニンを含んでいない）；及び（４）融合タンパク質の２〜６位のアミノ酸がいずれも、リジン又はアルギニンではないこと（つまり合成ペプチドが５個のアミノ酸より短い場合、合成ペプチドの一部であるか又はタンパク質の一部であるかに関わらず、２〜６位のアミノ酸が、リジン又はアルギニンを含んでいない）。合成ペプチドは、２個のアミノ酸程度の短さでもよいが、１つの態様では、少なくとも２〜６個のアミノ酸であり（３、４、及び５個アミノ酸を含む）、６個のアミノ酸より長くてもよく、整数で、最大約２００個のアミノ酸、最大３００個のアミノ酸、最大４００個のアミノ酸、５００個以上のアミノ酸である。

【0187】

１つの実施形態では、融合タンパク質は、Ｍ−Ｘ２−Ｘ３−Ｘ４−Ｘ５−Ｘ６のアミノ酸配列を含み、Ｍはメチオニンであり、Ｘ２は、グリシン、プロリン、リジン、又はアルギニン以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ３は、メチオニン、リジン、又はアルギニン以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ４は、メチオニン、リジン、又はアルギニン以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ５は、メチオニン、リジン、又はアルギニン以外の任意のアミノ酸であり、Ｘ６は、メチオニン、リジン、又はアルギニン以外の任意のアミノ酸である。１つの実施形態では、Ｘ６残基は、プロリンである。酵母細胞における抗原発現の安定性を増強する、及び／又は酵母におけるタンパク質の翻訳後修飾を防止する例示的な合成配列には、配列Ｍ−Ａ−Ｄ−Ｅ−Ａ−Ｐ（配列番号ｌ）が含まれる。発現産物の安定性の増強に加えて、この融合パートナーは、構築体のワクチン接種抗原に対する免疫応答に負の影響を与えないと考えられる。加えて、合成融合ペプチドは、抗体等の選択用の物質により認識され得るエピトープを提供するように設計することができる。

【0188】

本発明の１つの態様では、酵母媒体は、抗原又はＴＨ１７免疫応答及び／若しくはＴＨ１免疫応答の調節に有用な作用剤が、部分的に若しくは全体的に酵母媒体の表面で発現されるか又は発現されたタンパク質産物の送達又はトランスロケーションにより酵母媒体の表面に提供される（細胞外発現）ように操作される。本発明のこの態様を達成する１つの方法は、酵母媒体の表面に１つ又は複数のタンパク質を配置するためにスペーサーアームを使用することである。例えば、スペーサーアームを使用して、抗原又は他の目的タンパク質と、抗原又は他の目的タンパク質を酵母細胞壁へと標的化するタンパク質との融合タンパク質を生成することができる。例えば、他のタンパク質を標的化するために使用することができる１つのそのようなタンパク質は、抗原又は他のタンパク質が酵母表面に配置されるように、抗原又は他のタンパク質の酵母細胞壁への標的化を可能にする酵母タンパク質（例えば、細胞壁タンパク質２（ｃｗｐ２）、Ａｇａ２、Ｐｉｒ４、又はＦｌｏ１タンパク質）である。酵母タンパク質以外のタンパク質をスペーサーアームに使用してもよいが、いずれのスペーサーアームタンパク質の場合でも、免疫原応答を、スペーサーアームタンパク質ではなく標的抗原に対してに向けさせることが最も望ましい。したがって、他のタンパク質がスペーサーアームとして使用される場合、使用されるスペーサーアームタンパク質は、スペーサーアームタンパク質自体に対して、標的抗原の免疫応答が圧倒されるほど大きな免疫応答を発生させるべきでない。当業者は、標的抗原に対する免疫応答に比べて、スペーサーアームタンパク質に対する免疫応答が少なくなることを目指すべきである。スペーサーアームは、必要に応じて、抗原を酵母から容易に除去又は切り離すことを可能にする切断部位（例えば、プロテアーゼ切断部位）を有するように構築することができる。免疫応答の大きさを決定する任意の公知の方法（例えば、抗体産生、細胞溶解アッセイ等）を使用することができ、それらは当業者に容易に知られている。

【0189】

標的抗原又は他のタンパク質を酵母表面に露出するように配置する別の方法は、グリコシルホスファチジルイノシトール（ＧＰＩ）等のシグナル配列を使用して酵母細胞壁に標的を係留することである。或いは、配置は、抗原が細胞壁に結合するタンパク質（例えば、ｃｗｐ）に結合するように、小胞体（ＥＲ）へのトランスロケーションにより抗原又は他の目的タンパク質を分泌経路に標的化するシグナル配列を追加することにより達成することができる。

【0190】

１つの態様では、スペーサーアームタンパク質は、酵母タンパク質である。酵母タンパク質は、約２〜約８００個のアミノ酸の酵母タンパク質で構成されていてもよい。１つの実施形態では、酵母タンパク質は、約１０〜７００個のアミノ酸である。別の実施形態では、酵母タンパク質は、約４０〜６００個のアミノ酸である。本発明の他の実施形態は、少なくとも２５０個のアミノ酸、少なくとも３００個のアミノ酸、少なくとも３５０個のアミノ酸、少なくとも４００個のアミノ酸、少なくとも４５０個のアミノ酸、少なくとも５００個のアミノ酸、少なくとも５５０個のアミノ酸、少なくとも６００個のアミノ酸、又は少なくとも６５０個のアミノ酸である酵母タンパク質を含む。１つの実施形態では、酵母タンパク質は、長さが約４５０個のアミノ酸である。

【0191】

酵母タンパク質を使用することにより、酵母媒体における融合タンパク質発現が安定し、発現された融合タンパク質の翻訳後修飾が防止され、及び／又は酵母の特定の区画に融合タンパク質を標的化する（例えば、酵母細胞表面に発現させる）ことができる。酵母分泌経路に送達する場合、使用する例示的な酵母タンパク質には、以下のものが含まれるがこれらに限定されない：Ａｇａ（Ａｇａ１及び／又はＡｇａ２を含むがこれらに限定されない）；ＳＵＣ２（酵母インベルターゼ）；アルファ因子シグナルリーダー配列；ＣＰＹ；細胞壁への局在化及び保持用のＣｗｐ２ｐ；娘細胞形成の初期段階中の酵母細胞芽における局在化用のＢＵＤ遺伝子；Ｆｌｏ１ｐ；Ｐｉｒ２ｐ；及びＰｉｒ４ｐ。

【0192】

他の配列を使用して、タンパク質を、酵母媒体の他の部分、例えばサイトゾル又はミトコンドリアに標的化、保持、及び／又は安定化させることができる。上記の実施形態のいずれかに使用することができる好適な酵母タンパク質の例には、以下のものが含まれるがこれらに限定されない：ＳＥＣ７；それらの抑制可能なグルコース発現及びサイトゾル局在化のためのホスホエノールピルビン酸カルボキシキナーゼＰＣＫ１、ホスホグリセロキナーゼＰＧＫ、及びトリオースリン酸イソメラーゼＴＰＩ遺伝子産物；細胞が熱処理に曝されるとその発現が誘導され、そのタンパク質はより熱安定性であるヒートショックタンパク質ＳＳＡ１、ＳＳＡ３、ＳＳＡ４、ＳＳＣ１；ミトコンドリアへの移入のためのミトコンドリアタンパク質ＣＹＣ１；ＡＣＴ１。

【0193】

酵母媒体を生成し、酵母媒体を発現させ、目的の抗原及び／若しくは他のタンパク質及び／若しくは作用剤と混合し、並びに／又は目的の抗原及び／若しくは他のタンパク質及び／若しくは作用剤と関連させて、酵母ベースの免疫療法組成物を生成する方法が、本発明により企図される。

【0194】

本発明によると、用語「酵母媒体−抗原複合体」又は「酵母−抗原複合体」は、酵母媒体と抗原との任意の結合を指すために一般的に使用され、そのような組成物が、上述のように免疫応答を誘発するために使用される場合、「酵母ベースの免疫療法組成物」と同義に使用することができる。そのような結合には、酵母（組換え酵母）による抗原の発現、酵母への抗原の導入、酵母に対する抗原の物理的結合、及び緩衝液又は他の溶液又は製剤等の中で酵母及び抗原を一緒に混合することが含まれる。これらのタイプの複合体は、下記で詳細に記述される。

【0195】

１つの実施形態では、酵母媒体を調製するために使用される酵母細胞は、酵母細胞によりタンパク質が発現されるように、タンパク質（例えば、抗原又は作用剤）をコードする異種性核酸分子で形質移入される。そのような酵母は、本明細書では、組換え酵母又は組換え酵母媒体とも呼ばれる。その後、酵母細胞を無傷細胞として樹状細胞に負荷してもよく、又は酵母細胞を死滅させてもよく、又は酵母細胞を、酵母スフェロプラスト、サイトプラスト、ゴースト、若しくは亜細胞粒子の形成等により誘導体化してもよく、誘導体は、これらの誘導体化のいずれかの後で樹状細胞に負荷される。酵母スフェロプラストは、抗原又は他のタンパク質を発現する組換えスフェロプラストを生成するために、組換え核酸分子で直接的に形質移入することもできる（例えば、スフェロプラストは、全酵母から生成され、その後形質移入される）。

【0196】

１つの態様では、酵母媒体を調製するために使用される酵母細胞又は酵母スフェロプラストは、抗原又は他のタンパク質が、酵母細胞又は酵母スフェロプラストにより組換え的に発現されるように、抗原又は他のタンパク質をコードする組換え核酸分子で形質移入される。この態様では、抗原又は他のタンパク質を組換え的に発現する酵母細胞又は酵母スフェロプラストは、酵母サイトプラスト、酵母ゴースト、又は酵母膜粒子、又は酵母細胞壁粒子、又はそれらの画分を含む酵母媒体を生成するために使用される。

【0197】

一般的に、酵母媒体及び抗原、又は本発明によるＴＨ１７応答及び／若しくはＴＨ１応答を調節する作用剤を含む他の作用剤は、本明細書に記載の任意の技術により結合させることができる。１つの態様では、酵母媒体には、抗原及び／又は作用剤が細胞内に負荷されていた。別の態様では、抗原及び／又は作用剤は、共有結合又は非共有結合で酵母媒体に結合されていた。更に別の態様では、酵母媒体並びに抗原及び／又は作用剤は、混合することにより結合された。別の態様及び１つの実施形態では、抗原及び／又は作用剤は、酵母媒体により、又は酵母媒体が由来した酵母細胞若しくは酵母スフェロプラストにより、組換え的に発現される。

【0198】

本発明の酵母媒体により産生される抗原及び／又は他のタンパク質の数は、酵母媒体により合理的に産生することができ、約２つから約６つの異種抗原及び又は他のタンパク質を含む、典型的には少なくとも１つから少なくとも約６つ以上の範囲の抗原及び／又は他のタンパク質の任意の数である。

【0199】

本発明の酵母媒体における抗原又は他のタンパク質の発現は、当業者に公知の技術を使用して達成される。手短に言えば、少なくとも１つの所望の抗原又は他のタンパク質をコードする核酸分子は、宿主酵母細胞に形質転換される際に、核酸分子の構成的な発現又は制御された発現のいずれかの達成を可能にするため、核酸分子が転写制御配列に作用可能に結合されるように発現ベクターに挿入される。１つ又は複数の抗原及び／又は他のタンパク質をコードする核酸分子は、１つ又は複数の発現ベクターにおいて１つ又は複数の発現制御配列に作用可能に結合されていてもよい。特に重要な発現制御配列は、プロモーター及び上流活性化配列等の、転写開始を制御する配列である。本発明では、任意の好適な酵母プロモーターを使用することができ、様々なそのようなプロモーターが、当業者に公知である。サッカロマイセス・セレビシエでの発現用プロモーターには、これらに限定されないが、以下の酵母タンパク質：アルコールデヒドロゲナーゼＩ（ＡＤＨ１）又はＩＩ（ＡＤＨ２）、ＣＵＰ１、ホスホグリセリン酸キナーゼ（ＰＧＫ）、トリオースリン酸イソメラーゼ（ＴＰＩ）、翻訳伸長因子Ｆ−１アルファ（ＴＥＦ２）、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ；トリオースリン酸デヒドロゲナーゼの場合、ＴＤＨ３とも呼ばれる）、ガラクトキナーゼ（ＧＡＬ１）、ガラクトース−１−リン酸ウリジル−トランスフェラーゼ（ＧＡＬ７）、ＵＤＰ−ガラクトースエピメラーゼ（ＧＡＬ１０）、チトクロムｃ１（ＣＹＣ１）、Ｓｅｃ７タンパク質（ＳＥＣ７）、及び酸性ホスファターゼ（ＰＨＯ５）をコードする遺伝子のプロモーターが含まれ、ＡＤＨ２／ＧＡＰＤＨ及びＣＹＣ１／ＧＡＬ１０プロモーター等のハイブリッドプロモーターが含まれ、細胞中のグルコース濃度が低い場合に（例えば、約０．１〜約０．２パーセント）誘導されるＡＤＨ２／ＧＡＰＤＨプロモーター、並びにＣＵＰ１プロモーター及びＴＥＦ２プロモーターが含まれる。同様に、エンハンサーとも呼ばれる多数の上流活性化配列（ＵＡＳ）が知られている。サッカロマイセス・セレビシエでの発現用上流活性化配列には、これらに限定されないが、以下のタンパク質：ＰＣＫ１、ＴＰＩ、ＴＤＨ３、ＣＹＣ１、ＡＤＨ１、ＡＤＨ２、ＳＵＣ２、ＧＡＬ１、ＧＡＬ７、及びＧＡＬ１０をコードする遺伝子のＵＡＳ、並びにＧＡＬ４遺伝子産物により活性化される他のＵＡＳが含まれ、１つの態様では、ＡＤＨ２ ＵＡＳが使用される。ＡＤＨ２ ＵＡＳは、ＡＤＲ１遺伝子産物により活性化されるため、異種遺伝子がＡＤＨ２ ＵＡＳに作用可能に結合されている場合、ＡＤＲ１遺伝子を過剰発現することが好ましい場合がある。サッカロマイセス・セレビシエでの発現用の転写終結配列には、α−因子、ＧＡＰＤＨ、及びＣＹＣ１遺伝子の終結配列が含まれる。

【0200】

メチロトローフ（ｍｅｔｈｙｌｔｒｏｐｈｉｃ）酵母中で遺伝子を発現するための転写制御配列には、アルコールオキシダーゼ及びギ酸デヒドロゲナーゼをコードする遺伝子の転写制御領域が含まれる。

【0201】

本発明による酵母細胞への核酸分子の形質移入は、核酸分子が細胞に導入される任意の方法により達成することができ、それらの方法には、拡散、能動輸送、超音波処理浴、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、リポフェクション、吸着、及びプロトプラスト融合が含まれるがこれらに限定されない。形質移入された核酸分子は、当業者に公知の技術を使用して、酵母染色体に組み込まれてもよく、又は染色体外ベクターで維持されてもよい。そのような核酸分子を保持する酵母媒体の例は、本明細書で詳細に開示されている。上記で考察したように、酵母サイトプラスト、酵母ゴースト、及び酵母膜粒子又は細胞壁調製物は、無傷酵母微生物又は酵母スフェロプラストを所望の核酸分子で形質移入し、その中で抗原を産生させ、その後当業者に公知の技術を使用して微生物又はスフェロプラストを更に操作し、所望の抗原又は他のタンパク質を含有するサイトプラスト、ゴースト、又は亜細胞酵母膜抽出物若しくはその画分を生成することにより、組換え的に生成することもできる。

【0202】

組換え酵母媒体の産生並びに酵母媒体による抗原及び／又は他のタンパク質（例えば、本明細書に記載の作用剤）の発現に効果的な条件には、酵母菌株を培養することができる効果的な培地が含まれる。効果的な培地は、典型的には、同化可能な炭水化物、窒素、及びリン酸供給源、並びに適切な塩、無機物、金属、並びにビタミンや増殖因子等の他の栄養素を含む水性培地である。培地は、複雑な栄養素を含んでいてもよく、又は限定最小培地であってもよい。本発明の酵母菌株は、バイオリアクター、エルレンマイヤーフラスコ、試験管、マイクロタイター皿、及びペトリ皿を含むがこれらに限定されない様々な容器中で培養することができる。培養は、酵母菌株に適切な温度、ｐＨ、及び酸素含有量で実施される。そのような培養条件は、十分に当業者の専門知識内にある（例えば、Ｇｕｔｈｒｉｅら（編）、１９９１年、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、１９４巻、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ、サンディエゴを参照）。

【0203】

本発明の幾つかの態様では、酵母は、中性ｐＨ条件下で、特に少なくとも５．５のｐＨレベルに維持された培地中で増殖され、すなわち増殖培地のｐＨを、ｐＨ５．５未満に低下させない。他の態様では、酵母は、約５．５に維持されたｐＨレベルで増殖される。他の態様では、酵母は約５．６、５．７、５．８、又は５．９に維持されたｐＨレベルで増殖される。別の態様では、酵母は、約６に維持されたｐＨレベルで増殖される。別の態様では、酵母は、約６．５に維持されたｐＨレベルで増殖される。他の態様では、酵母は約６、６．１、６．２、６．３、６．４、６．５、６．６、６．７、６．８、６．９又は７．０に維持されたｐＨレベルで増殖される。他の態様では、酵母は、約７、７．１、７．２、７．３、７．４、７．５、７．６、７．７、７．８、７．９、又は８．０に維持されたｐＨレベルで増殖される。ｐＨレベルは、酵母の培養に重要である。当業者であれば、培養プロセスには、酵母培養の開始だけでなく培養の維持も同様に含まれることを認識するであろう。酵母培養は、時間の経過と共に酸性になる（つまり、ｐＨが低下する）ことが知られているため、培養プロセス中は、注意してｐＨレベルをモニタリングしなければならない。培地のｐＨレベルが６未満に低下した酵母細胞培養は、培地のｐＨを、培養プロセス中のある時点で少なくとも５．５に上昇させれば、依然として本発明の範囲内に企図される。そのため、少なくともｐＨ５．５以上の培地で酵母を増殖させる時間が長ければ長いほど、結果は、望ましい特徴を有する酵母を得るという点でより良好になるであろう。

【0204】

本明細書で使用される場合、用語「中性ｐＨ」の一般的な使用は、約ｐＨ５．５〜約ｐＨ８、１つの態様では約ｐＨ６〜約８のｐＨ範囲を指す。当業者であれば、ｐＨ計で測定する場合、軽微な変動（例えば、１０分の１又は１００分の１）が生じる場合があることを理解するであろう。そのため、酵母細胞を増殖させるために中性ｐＨを使用するということは、酵母細胞が、培養中の時間のうちほとんどは中性ｐＨで増殖されることを意味する。酵母を培養する際に中性ｐＨを使用することにより、免疫修飾用の媒体として酵母を使用するための望ましい特徴である幾つかの生物学的効果が促進される。１つの態様では、中性ｐＨでの酵母培養は、細胞生成時間に対する負の効果（例えば、倍加時間の減速）が一切ない酵母の良好な増殖を可能にする。酵母は、細胞壁の柔軟性を失わずに、高密度になるまで増殖を継続することができる。別の態様では、中性ｐＨの使用により、あらゆる回収密度で、柔軟な細胞壁を有する酵母及び／又は細胞壁消化酵素（例えば、グルカナーゼ）に感受性である酵母の産生が可能になる。この形質が望ましいのは、柔軟な細胞壁を有する酵母が、酵母の宿主である細胞でのサイトカイン（例えば、インターフェロン−γ（ＩＦＮ−γ））の分泌を促進すること等により、通常ではない免疫応答を誘導することができるためである。加えて、細胞壁に配置された抗原に対するより大きな接近可能性が、そのような培養法により付与される。別の態様では、幾つかの抗原の場合、中性ｐＨの使用は、ジチオトレイトール（ＤＴＴ）で処理することにより、ジスルフィドで結合された抗原を放出することを可能にし、それは、そのような抗原発現酵母がより低いｐＨ（例えば、ｐＨ５）の培地で培養される場合では可能でない。最後に、別の態様では、中性ｐＨ法を使用して培養された酵母は、ＩＦＮ−γ、インターロイキン１２（ＩＬ−１２）、及びＩＬ−２を含むがこれらに限定されない少なくともＴＨ１型のサイトカインの産生の増加を誘発し、炎症促進性サイトカイン（例えば、ＩＬ−６）等の、他のサイトカインの産生の増加も誘発することができる。

【0205】

１つの実施形態では、酵母グリコシル化の量の制御を使用して、酵母による抗原の、特に表面での発現を制御する。酵母グリコシル化の量は、糖部分はかさ高い傾向があるため、表面に発現された抗原の免疫原性及び抗原性に影響を及ぼす場合がある。そのため、酵母表面における糖部分の存在、及び標的抗原周囲の三次元空間に対するその影響は、本発明による酵母の調節において考慮されるべきである。任意の方法を使用して、酵母のグリコシル化の量を低減させることができる（又は必要に応じて、それを増加させることができる）。例えば、低グリコシル化を有するように選択された酵母突然変異株（例えば、ｍｎｎ１、ｏｃｈ１、及びｍｎｎ９突然変異体）を使用してもよく、又は標的抗原に対するグリコシル化受容体配列を突然変異により除去してもよい。或いは、短縮されたグリコシル化パターンを示す酵母（例えば、ピキア）を使用してもよい。また、グリコシル化を低減又は変更する方法を使用して酵母を処理してもよい。

【0206】

本発明の１つの実施形態では、酵母媒体中で抗原又は他のタンパク質を組換え的に発現する代わりに、酵母媒体には、抗原として作用するか及び／又は本発明による免疫調節剤若しくは生物学的応答修飾物質として有用であるタンパク質若しくはペプチド又は炭水化物若しくは他の分子が細胞内に負荷される。その後、抗原及び／又は他のタンパク質を細胞内に含有する酵母媒体を、患者に投与してもよく、又は樹状細胞等の担体に負荷してもよい。ペプチド及びタンパク質は、拡散、能動輸送、リポソーム融合、エレクトロポレーション、食作用、凍結融解サイクル、及び超音波処理浴等による、当業者に公知の技術により本発明の酵母媒体に直接挿入することができる。ペプチド、タンパク質、炭水化物、又は他の分子を直接負荷することができる酵母媒体には、無傷酵母、並びにスフェロプラスト、ゴースト、又はサイトプラストが含まれ、それらには、産生後に抗原及び他の作用剤が負荷されてもよい。或いは、無傷酵母に抗原及び／又は作用剤を負荷し、その後そこからスフェロプラスト、ゴースト、サイトプラスト、又は細胞内粒子を調製してもよい。この実施形態では、任意の数の抗原及び／又は他の作用剤、少なくとも１、２、３、４、又は任意の整数から最大数百又は数千までの数の抗原及び／又は他の作用剤を酵母媒体に負荷することができ、数は、例えば、微生物の負荷量により、哺乳動物腫瘍細胞又はその部分の負荷量により提供されるであろう。

【0207】

本発明の別の実施形態では、抗原及び／又は他の作用剤は、酵母媒体に物理的に結合されている。抗原及び／又は他の作用剤の酵母媒体に対する物理的な結合は、抗原及び／若しくは他の作用剤を酵母媒体の外側表面に化学的に架橋すること、又は抗体若しくは他の結合パートナーを使用すること等により抗原及び／若しくは他の作用剤を酵母媒体の外側表面に生物学的に結合させることを含むがこれらに限定されない共有結合及び非共有結合法を含む、当技術分野で好適な任意の方法により達成することができる。化学的架橋は、例えば、グルタルアルデヒド結合、光親和性標識、カルボジイミドによる処理、ジスルフィド結合を結合可能な薬品による処理、及び当技術分野で標準的な他の架橋化学物質による処理を含む方法により達成することができる。或いは、酵母膜の脂質二分子膜の電荷又は細胞壁の組成を変更する化学物質を、酵母媒体と接触させ、その結果、酵母の外側表面が、特定の電荷特徴を有する抗原及び／又は他の作用剤と融合又は結合する可能性をより高める。また、抗体、結合ペプチド、可溶性受容体、及び他のリガンド等の標的化作用剤は、融合タンパク質として抗原に組み込まれていてもよく、又はそうでなければ、抗原の酵母媒体への結合のためにその抗原と結合されていてもよい。

【0208】

抗原又は他のタンパク質が、酵母表面に発現されるか又は酵母表面に物理的に結合されている場合、１つの態様では、スペーサーアームを注意深く選択して、抗原又は他のタンパク質の表面における発現又は含有量を最適化することができる。スペーサーアームのサイズは、抗原又は他のタンパク質が、結合のために酵母表面に露出される程度に影響を及ぼす場合がある。したがって、当業者であれば、どの抗原又は他のタンパク質が使用されているかに応じて、酵母表面の抗原又は他のタンパク質に適切な離間をもたらすスペーサーアームを選択するであろう。１つの実施形態では、スペーサーアームは、少なくとも４５０個のアミノ酸の酵母タンパク質である。スペーサーアームは、上記で詳細に考察されている。

【0209】

抗原の表面発現を最適化するために考慮すべき別の点は、抗原及びスペーサーアームの組み合わせが、単量体、又は二量体、又は三量体、又は更に多くの互いに結合された単位として発現されるべきであるか否かということである。このような単量体、二量体、三量体等を使用することにより、抗原の適切な離間又は折り畳みが可能になり、全てではなくとも抗原のある部分が、より免疫原性になるような様式で酵母媒体の表面に提示される。

【0210】

更に別の実施形態では、酵母媒体及び抗原又は他のタンパク質は、緩衝液又は他の好適な製剤（例えば、混合物）中で、酵母媒体及び抗原又は他のタンパク質を一緒に穏やかに混合することによる等の、より受動的な、非特異的な、又は非共有結合的な機序により互いに結合される。

【0211】

本発明の１つの実施形態では、酵母媒体及び抗原又は他のタンパク質は両方とも、樹状細胞又はマクロファージ等の担体に細胞内で負荷され、本発明の治療用組成物又はワクチンを形成する。或いは、抗原又は他のタンパク質を、酵母媒体の非存在下で樹状細胞に負荷することができる。

【0212】

１つの実施形態では、無傷酵母（異種抗原又は他のタンパク質を発現する又は発現しない）は、酵母細胞壁調製物、酵母膜粒子、又は酵母断片（つまり、無傷ではない）を生成するように破砕又は処理することができ、幾つかの実施形態では、酵母断片は、免疫応答を増強するための抗原（例えば、ＤＮＡワクチン、タンパク質サブユニットワクチン、死滅又は不活化された病原体）を含む他の組成物と共に提供又は投与することができる。例えば、酵素処理、化学処理、又は物理的力（例えば、機械的剪断若しくは超音波処理）を使用して、アジュバントとして使用される部分へと酵母を解体することができる。

【0213】

本発明の１つの実施形態では、本発明に有用な酵母媒体には、死滅又は不活化された酵母媒体が含まれる。酵母の死滅又は不活性化は、当技術分野で公知の様々な好適な方法のいずれかで達成することができる。例えば、酵母の熱不活性化は、酵母を不活化する標準的な方法であり、当業者であれば、必要に応じて、当技術分野で公知の標準的方法により、標的抗原の構造変化をモニタリングすることができる。或いは、化学的方法、電気的方法、放射性方法、又はＵＶ法等の、酵母を不活化する他の方法を使用することができる。例えば、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、１９４巻、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ（１９９０年）等の、標準的な酵母培養の教科書に開示されている方法を参照されたい。使用される不活性化戦略はいずれも、標的抗原の二次構造、三次構造、又は四次構造を考慮に入れ、その免疫原性を最適化するように構造を保存するべきである。

【0214】

酵母媒体は、被験者に直接投与される調製物を含む本発明の酵母ベースの免疫療法組成物若しくは生成物に製剤化してもよく、又は当業者に公知の多数の技術を使用して、まず樹状細胞等の担体に負荷してもよい。例えば、酵母媒体は、凍結乾燥により乾燥することができる。酵母媒体を含む製剤は、製パン又は醸造作業に使用される酵母について実施されているように、酵母を固塊又は錠剤に詰めることにより調製することができる。加えて、酵母媒体は、宿主又は宿主細胞により許容される等張性緩衝液等の、薬学的に許容される賦形剤と混合されていてもよい。そのような賦形剤の例には、水、生理食塩水、リンゲル液、デキストロース溶液、ハンクス溶液、及び他の生理学的にバランスのとれた塩水溶液が含まれる。固定油、胡麻油、オレイン酸エチル、又はトリグリセリド等の非水性賦形剤も使用することができる。他の有用な製剤には、ナトリウムカルボキシメチルセルロース、ソルビトール、グリセロール、又はデキストラン等の粘性促進剤を含有する懸濁剤が含まれる。また、賦形剤は、等張性及び化学的安定性を増強する物質等の少量の添加剤を含有していてもよい。緩衝液の例には、リン酸緩衝液、重炭酸緩衝液、及びＴｒｉｓ緩衝液が含まれ、保存剤の例には、チメロサール、ｍ−又はｏ−クレゾール、ホルマリン、及びベンジルアルコールが含まれる。標準的製剤は、液体注射剤又は、注射用の懸濁剤又は液剤として好適な液体に処理することができる固形物のいずれであってもよい。したがって、非液体製剤では、賦形剤は、例えば、デキストロース、ヒト血清アルブミン、及び／又は保存剤を含んでいてもよく、投与前に滅菌水又は生理食塩水をそれに添加することができる。

【0215】

本発明の１つの実施形態では、組成物は、生物学的応答修飾物質化合物、又はそのような修飾物質を生成する能力（つまり、そのような修飾物質をコードする核酸分子で酵母媒体を形質移入することにより）を含むことができ、１つの態様では、そのような生物学的応答修飾物質は、ＴＨ１７、ＴＨ１、及び／又はＴｒｅｇ免疫応答を調節するための本発明に有用な作用剤と同一であってもよい。生物学的応答修飾物質は、上述されている。

【0216】

本発明の組成物は、感染性疾患又は癌を含む特定の疾患又は状態から被験者を防御するのに有用な任意の他の化合物、又はそのような感染症の任意の症状を治療又は軽減する任意の化合物を更に含んでいてもよい。

【0217】

したがって、また本発明は、本発明の方法に有用な様々な組成物を含み、それらの種々の態様は、詳細に上述されている。１つの実施形態では、組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を下方制御する作用剤とを含む。別の実施形態では、組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及び／若しくはＩＬ−２３、又はそれらの受容体からなる群から選択されるサイトカインの発現又は活性を下方制御する作用剤とを含む。別の実施形態では、組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）若しくはインターロイキン−２７（ＩＬ−２７）又はそれらのアゴニストとを含む。別の実施形態では、組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７細胞の産生及び／又は生存を上方制御する作用剤とを含む。別の実施形態では、組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−１（ＩＬ−１）、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、及び／若しくはＩＬ−２３、又はそれらのアゴニストからなる群から選択されるサイトカインとを含む。更に別の実施形態では、組成物は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）インターロイキン−２５（ＩＬ−２５）、インターロイキン−２７（ＩＬ−２７）、又はそれらの受容体の発現若しくは活性を下方制御する作用剤とを含む。

【0218】

別の実施形態では、上述のいずれかの組成物を含む、酵母ベースの免疫療法組成物を含む組成物は、ＴＨ１の産生及び／又は生存を上方制御する作用剤を含んでいてもよい。別の実施形態では、上述のいずれかの組成物を含む、酵母ベースの免疫療法組成物を含む組成物は、ＴＨ１の産生及び／又は生存を下方制御する作用剤を含んでいてもよい。

【0219】

別の実施形態では、上述のいずれかの組成物を含む、酵母ベースの免疫療法組成物を含む組成物は、Ｔｒｅｇの産生及び／又は生存を下方制御する作用剤を含んでいてもよい。
本発明の他の実施形態は、（ａ）酵母ベースの免疫療法組成物と、（ｂ）ＴＨ１７応答、ＴＨ１応答、及び／又はＴｒｅｇ応答を、本発明の方法と一致する様式で調節するのに有用な作用剤の任意の組み合わせとを含む組成物を含む。

【0220】

本発明は、本明細書に記載の組成物のいずれか、又は本明細書に記載の組成物の個々の成分のいずれかを含むキットも含む。１つの実施形態では、本発明のキットは、酵母ベースの免疫療法組成物、並びにＴＨ１７細胞、ＴＨ１細胞、及び／又はＴｒｅｇを検出するための１つ又は複数の試薬を含む。そのような試薬には、Ｔ細胞増殖、サイトカイン発現若しくは産生、並びに／又はＴＨ１７細胞、ＴＨ１、及び／若しくはＴｒｅｇに結合する転写因子若しくは受容体の発現を検出するための試薬が含まれ得るがこれらに限定されない。試薬は、遊離形態で存在していてもよく、又はプラスチック皿、マイクロアレイプレート、試験管、及び試験棒等の支持体に固定化されてもよい。キットは、試薬を検出するのに及び／又は陽性若しくは陰性対照を標識するのに好適な試薬、洗浄溶液、及び希釈緩衝液等も含むことができる。キットは、キットを使用するための及び結果を解釈するための１組の書面による説明書も含むことができる。１つの実施形態では、キットは、ハイスループットアッセイ用に考案されている。キットは、本発明のあらゆる臨床法、研究法、又は診断法のために調製及び使用することができる。

【0221】

本発明の組成物の投与方法又は使用方法
本発明は、本発明の組成物を被験者に送達（投与、免疫）することを含む。投与プロセスは、ｅｘ ｖｉｖｏ又はｉｎ ｖｉｖｏで実施することができるが、典型的にはｉｎ ｖｉｖｏで実施される。ｅｘ ｖｉｖｏ投与とは、酵母媒体、抗原、及び任意の他の作用剤又は組成物が、細胞に負荷されるような条件下で、患者から取り出された細胞（樹状細胞）の集団に本発明の組成物を投与し、その細胞を患者に戻す等、患者の外部で調節ステップの一部を実施することを指す。本発明の治療用組成物は、患者に戻してもよく、又は任意の好適な投与方法により患者に投与してもよい。

【0222】

組成物の投与は、全身性、粘膜性、及び／又は標的部位の位置に近位（例えば、腫瘍付近）であってもよい。好適な投与経路は、当業者にとっては、予防若しくは治療しようとする状態のタイプ、使用される抗原、及び／又は標的細胞集団若しくは組織に応じて明白であろう。種々の許容される投与方法には、以下の投与方法が含まれるがこれらに限定されない：静脈内投与、腹腔内投与、筋内投与、結節内投与、冠内投与、動脈内投与（例えば、頚動脈への）、皮下投与、経皮的送達、気管内投与、皮下投与、関節内投与、脳室内投与、吸入（例えば、エアロゾル）、頭蓋内、脊髄内、眼内、耳内、鼻腔内、経口、経肺投与、カテーテル含浸、及び組織への直接注入。１つの態様では、投与経路には、以下のものが含まれる：静脈内、腹腔内、皮下、皮内、結節内、筋肉内、経皮、吸入、鼻腔内、経口、眼内、関節内、頭蓋内、及び脊髄内。非経口送達には、以下のものが含まれる：皮内、筋肉内、腹腔内、胸膜腔内、肺内、静脈内、皮下、心房カテーテル、及び静脈カテーテル経路。耳内送達には、点耳剤が含まれていてもよく、鼻腔内送達には、点鼻剤又は鼻腔内注射が含まれていてもよく、眼内送達には目薬が含まれていてもよい。エアロゾル（吸入）送達は、当技術分野で標準的な方法を使用して実施することもできる（例えば、Ｓｔｒｉｂｌｉｎｇら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １８９巻：１１２７７〜１１２８１頁、１９９２年を参照、この文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）。粘膜免疫を調節する他の投与経路は、ウイルス感染症の治療に有用である。そのような経路には、以下のものが含まれる：気管支内、皮内、筋肉内、鼻腔内、他の吸入的、直腸的、皮下的、局所的、経皮的、膣的、尿道的経路。１つの態様では、本発明の免疫療法組成物は、皮下投与される。

【0223】

本発明の酵母ベースの免疫療法組成物に関して、好適な単一用量は、一般的には、好適な期間にわたって１回又は複数回を投与される場合、患者体内の所与の細胞タイプ、組織、又は領域に、酵母媒体及び抗原（含まれている場合）を、抗原特異的免疫応答を誘発するのに有効な量で効果的に提供することが可能な用量である。例えば、１つの実施形態では、本発明の酵母媒体の単一用量は、組成物が投与されている生物の体重１キログラム当たり約１×１０^５〜約５×１０^７個の酵母細胞当量である。１つの態様では、本発明の酵母媒体の単一用量は、１用量当たり（つまり、１つの生物当たり）約０．１Ｙ．Ｕ．（１×１０^６個の細胞）〜約１００Ｙ．Ｕ．（１×１０^９個の細胞）であり、０．１×１０^６個細胞の増加間隔での任意の中間用量（つまり、１．１×１０^６、１．２×１０^６、１．３×１０^６．．．）が含まれる。１つの実施形態では、用量には、１Ｙ．Ｕ．〜４０Ｙ．Ｕ．の用量が含まれ、１つの態様では、１０Ｙ．Ｕ〜４０Ｙ．Ｕ．の用量が含まれる。１つの実施形態では、用量は、個体の異なる部位にであるが、同じ投与期間中に投与される。例えば、４０Ｙ．Ｕ．用量は、１投与期間中に個体の４つの異なる部位に１０Ｙ．Ｕ．用量を注射することにより投与されてもよい。

【0224】

例えば、抗原に対する免疫応答が減退した場合、又は免疫応答を提供するか若しくは特定の抗原に対する記憶応答を誘導するために必要な場合、治療用組成物の「ブースター」又は「追加免疫」が投与される。ブースターは、最初の投与後の約１、２、３、４、５、６、７、又は８週間から、１か月、２か月、３か月、１年、数年の間隔をおいて投与される。１つの実施形態では、投与スケジュールは、生物の体重１ｋｇ当たり約１×１０^５〜約５×１０^７個の酵母細胞当量の組成物が、数週間から数か月間、数年間の期間にわたって、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、又は１０回以上投与されるスケジュールである。

【0225】

本発明で投与するためのＴＨ１７細胞、ＴＨ１細胞、及び／又はＴｒｅｇを制御する作用剤は、投与しようとする特定の作用剤タイプ毎に、当業者により直ちに知られるか又は決定される用量及びプロトコールにより投与することができる。本発明に有用な作用剤に関して、１つの態様では、タンパク質又は抗体は、被験者の体重の１ｋｇ当たり約５０Ｕ〜約１５，０００Ｕの量で投与される。別の実施形態では、タンパク質又は抗体は、患者の体重の１ｋｇ当たり約０．０１μｇ〜約１０ｍｇ、より好ましくは患者の体重１ｋｇ当たり約０．１μｇ〜約１００μｇの量で投与される。送達される化合物が核酸分子である場合、適切な単一用量は、送達された核酸１μｇにつき、総組織タンパク質１ｍｇ当たり少なくとも約１ｐｇの発現タンパク質をもたらす。低分子は、所与の低分子について指定される好ましい用量に従って送達され、当業者であれば決定することができる。

【0226】

本明細書の１つの態様では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物と同時に投与される。本明細書の１つの態様では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物と連続的に投与される。別の実施形態では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物が投与される前に投与される。別の実施形態では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物が投与された後に投与される。１つの実施形態では、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物との交互投与で、又は酵母ベースの組成物が、作用剤の１回又は複数回の連続投与間で又は連続投与と共に所定の間隔をおいて、又はその逆で投与されるプロトコールで投与される。１つの実施形態では、酵母ベースの免疫療法組成物は、作用剤の投与を開始する前のある期間にわたって１回又は複数回投与される。言い換えれば、酵母ベースの免疫療法組成物は、ある期間単独療法として投与され、その後作用剤投与が、新たな用量の酵母ベースの免疫療法と同時に、又は酵母ベースの免疫療法と交互する様式のいずれかで追加される。或いは、作用剤は、酵母ベースの免疫療法組成物の投与を始める前に、ある期間にわたって投与されてもよい。１つの態様では、酵母は、作用剤を発現又は保持するように操作されているか、又は異なる酵母が、作用剤を発現又は保持するように操作又は生成される。

【0227】

組成物の投与に関して本明細書で使用される場合、用語「同時に」は、組成物（例えば、酵母ベースの免疫療法組成物、及びＴＨ１７細胞を調節する作用剤）の各々、特にそのような組成物の初回投与を、本質的に同時に、又は同じ投与期間内に、又は免疫療法組成物による免疫系の初回抗原刺激の初期効果が生じる期間内（例えば、１〜２日以下以内）に投与することを意味する。簡単に言えば、同時投与は、組成物の全てを厳密に同時に投与する必要はなく、むしろ、組成物全ての投与は、免疫系を初回刺激し、同時に作用剤の効果を達成するために、患者の１投与予定内で実施されるべきである（例えば、１つの組成物が、最初に投与され、その直後又はその直近で第２の組成物が投与される等でもよい）。組成物が同じ部位に投与される場合等の幾つかの状況では、組成物は、混合物で提供されてもよいが、同じ部位に投与される場合でさえ、同一投与期間中の各組成物の連続投与が使用されてもよい。１つの態様では、組成物は、同一の１〜２日以内に投与され、別の態様では、同じ日に投与され、別の態様では、同一の１２時間以内に投与され、別の態様では、同一の８時間以内に投与され、別の態様では、同一の４時間以内に投与され、別の態様では、同一の１、２、又は３時間以内に投与され、別の態様では、同一の１、２、３、４、６、７、８、９、又は１０分以内に投与される。

【0228】

本発明の１つの実施形態では、酵母ベースの免疫療法組成物及び作用剤は、同時に投与されるが、患者の異なる身体部位に投与される。例えば、１つの組成物又は作用剤を、個体の身体の１つ又は複数の部位に投与し、他の組成物又は作用剤を、個体の身体の１つ又は複数の異なる部位、例えば身体の異なる側、又は異なる流入領域リンパ節付近に投与してもよい。別の実施形態では、免疫療法組成物及び作用剤は、患者の同じ部位又は実質的に隣接した部位に同時に投与される。実質的に隣接した部位は、最初の組成物又は作用剤が投与される注射部位と厳密に同じではないが、最初の注射部位と非常に近接（隣接）している部位である。１つの実施形態では、免疫療法組成物及び作用剤は、混合物で投与される。幾つかの実施形態は、投与手法の組み合わせを含んでいてもよい。

【0229】

本発明の方法では、組成物及び治療用組成物は、任意の脊椎動物を含む動物に、特に、限定ではないが、霊長類、げっ歯動物、家畜、及び家庭ペットを含む脊椎動物綱、哺乳綱の任意のメンバーに投与することができる。家畜には、消費されるか又は有用な産物を生成する哺乳動物（例えば、羊毛生産用のヒツジ）が含まれる。防御する哺乳動物には、ヒト、イヌ、ネコ、マウス、ラット、ヤギ、ヒツジ、ウシ、ウマ、及びブタが含まれる。

【0230】

「個体」は、限定ではないがヒトを含む哺乳動物等の脊椎動物である。哺乳動物には、家畜、スポーツ動物、ペット、霊長類、マウス、及びラットが含まれるがこれらに限定されない。用語「個体」は、用語「動物」、「被験者」、又は「患者」と同義に使用することができる。

【0231】

本発明のスクリーニング法、研究法、及び診断法
また、本発明は、酵母ベースの免疫療法剤組成物により誘発される二重ＴＨ１／ＴＨ１７免疫応答の発見と関連する種々のスクリーニング法及び研究法又は診断法を含む。１つの実施形態では、本発明は、被験者をスクリーニングして、酵母ベースの免疫療法に対するＴＨ１媒介性免疫応答性を予測する方法を含む。この方法は、（ａ）被験者に由来するＴ細胞を、酵母ベースの免疫療法組成物と接触した抗原提示細胞（ＡＰＣ）とｉｎ ｖｉｔｒｏで接触させることと、（ｂ）ＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞増殖、ＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞によるＩＬ−１７の産生、及びＡＰＣとの接触に応答したＴ細胞による転写因子、レチノイド関連オーファン受容体（ＲＯＲ）の発現からなる群から選択されるＴ細胞の表現型を検出することとを含む。そのＴ細胞がＡＰＣとの接触に応答して増殖するか、又はＩＬ−１７の正常産生若しくはＲＯＲの正常発現を示す被験者は、ＴＨ１媒介性応答が望ましい、酵母ベースの免疫療法組成物を投与するための良好な候補であると予測される。そのＴ細胞がＡＰＣとの接触に応答して増殖できないか若しくは増殖が不良であるか、又はそのＴ細胞が正常量を超えるＩＬ−１７を産生するか若しくは正常よりも高いＲＯＲの発現を示す被験者は、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を阻害する作用剤と共に、酵母ベースの免疫療法組成物を投与するための候補であると予測される。そのＴ細胞が正常量より少ないＩＬ−１７を産生するか又は正常よりも低いＲＯＲ発現を示す被験者は、ＴＨ１７細胞の産生又は生存を増加させる作用剤と共に、酵母ベースの免疫療法組成物を投与するための候補であると予測される。ＴＨ１７細胞の産生、発現、又は生存を増加又は減少させる（上方制御又は下方制御する）作用剤は、本明細書に記述されている。

【0232】

この実施形態によると、Ｔ細胞の試料は、典型的には懸濁状態で被験者から取得され、それは、本発明の方法で評価するのに好適な数のＴ細胞のコレクションがもたらされる任意の好適な方法により、組織若しくは器官から（例えば、生検により）又は体液（末梢血単核細胞）から収集される。

【0233】

Ｔ細胞増殖アッセイは、当技術分野で周知であり、本明細書で既に一般的に記載されている。ＲＯＲγｔ等のサイトカイン及び他のタンパク質の発現の検出は、核酸又はタンパク質の検出により実施することができる。核酸配列は、遺伝子配列又は発現を測定又は検出する任意の好適な方法又は技術により検出することができる。そのような方法には、ＰＣＲ、逆転写ＰＣＲ（ＲＴ−ＰＣＲ）、ｉｎ ｓｉｔｕ ＰＣＲ、ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション、サザンブロッティング、ノーザンブロッティング、配列解析、マイクロアレイ解析、レポーター遺伝子の検出、又は他のＤＮＡ／ＲＮＡハイブリダイゼーションプラットフォームが含まれるがこれらに限定されない。タンパク質は、例えば、以下のもの等の形式で抗体を使用して検出することができる：ウエスタンブロッティング、免疫ブロッティング、酵素結合免疫吸着測定法（ＥＬＩＳＡ）、ラジオイムノアッセイ（ＲＩＡ）、免疫沈降、表面プラズモン共鳴、化学ルミネセンス、蛍光偏光、リン光、免疫組織化学法、マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間型（ＭＡＬＤＩ−ＴＯＦ）質量分析、マイクロサイトメトリー、マイクロアレイ、顕微鏡法、蛍光活性化細胞分類（ＦＡＣＳ）、及びフローサイトメトリー。

【0234】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物に対する抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定する方法を含む。この方法は、（ａ）非ヒト動物を酵母ベースの免疫療法組成物で免疫し、ＴＨ１７応答が非ヒト動物で阻害又は阻止されることと、（ｂ）（ａ）の免疫された非ヒト動物に、等数の標識標的細胞及び標識非標的細胞の混合物を注射し、標的細胞が、酵母ベースの免疫療法組成物がそれに対してＴ細胞応答を誘発する抗原を発現又は提示し、非標的細胞は、抗原を発現又は提示せず、標的細胞が、非標的細胞とは異なるように標識されていることと、（ｃ）標識標的細胞及び標識非標的細胞を含有する（ｂ）の非ヒト動物に由来する細胞の集団を収集することと、（ｄ）非標的細胞に対する標的細胞の比率の違いを検出することにより、非ヒト動物の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞を測定し、非標的細胞と比較した標的細胞の低減が、非ヒト動物の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答のレベルを示すこととを含む方法を含む。本発明のこの実施形態の１つの態様では、標的細胞は、標的抗原のペプチドをパルスした脾臓細胞である。１つの態様では、（ｃ）の細胞の集団は、脾臓に由来する。１つの態様では、標的細胞は、標的抗原を発現する腫瘍細胞である。１つの態様では、（ｃ）の細胞の集団は、肝臓に由来する。１つの態様では、ステップ（ｄ）は、フローサイトメトリーを使用して実施される。

【0235】

本発明の別の実施形態は、酵母ベースの免疫療法組成物に対する抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定する方法に関する。この方法は、（ａ）非ヒト動物を酵母ベースの免疫療法組成物で免疫し、ＴＨ１７応答が非ヒト動物で阻害又は阻止されることと、（ｂ）（ａ）の非ヒト動物から、ＣＤ８＋ Ｔ細胞を含有する細胞の集団を収集することと、（ｃ）抗原−ＭＨＣ複合体を検出する（ｃ）の集団中のＣＤ８＋ Ｔ細胞の能力を検出することにより、非ヒト動物での抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定することとを含む。１つの態様では、（ｃ）の細胞の集団は、末梢血単核細胞を含有する集団である。１つの態様では、抗原−ＭＨＣ複合体は、四量体である。

【0236】

ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を測定するための上述の方法のいずれかにおいて、非ヒト動物は、任意の好適な非ヒト動物であってよく、１つの態様では、マウス等のげっ歯動物である。１つの態様では、ＩＬ−１、ＩＬ−６、ＩＬ−１７、ＩＬ−２１、ＩＬ−２２、又はＩＬ−２３から選択されるサイトカインの発現又は活性は、非ヒト動物で阻止又は阻害される。１つの態様では、非ヒト動物は、ＩＬ−６ホモ接合型ノックアウトマウスである。

【0237】

任意の上述の方法における細胞、細胞溶解産物、核酸分子、又はタンパク質が、混合すること等により、別の試薬又は化合物に曝露又は接触する条件は、任意の好適な培養又はアッセイ条件である。

【0238】

本発明に有用な一般的な技術
本発明の実施には、別様の指定がない限り、分子生物学（組換え技術を含む）、微生物学、細胞生物学、生化学、核酸化学、及び免疫学の従来の技術が使用されることになり、それらは、当業者に周知である。そのような技術は、以下の文献等で十分に説明されている：Ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ、１９４巻、Ｇｕｔｈｒｉｅら編、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９０年）；Ｂｉｏｌｏｇｙ ａｎｄ ａｃｔｉｖｉｔｉｅｓ ｏｆ ｙｅａｓｔｓ、Ｓｋｉｎｎｅｒら編、Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ（１９８０年）；Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ ｙｅａｓｔ ｇｅｎｅｔｉｃｓ：ａ ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｃｏｕｒｓｅ ｍａｎｕａｌ、Ｒｏｓｅら、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９０年）；Ｔｈｅ Ｙｅａｓｔ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ：Ｃｅｌｌ Ｃｙｃｌｅ ａｎｄ Ｃｅｌｌ Ｂｉｏｌｏｇｙ、Ｐｒｉｎｇｌｅら編、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９７年）；Ｔｈｅ Ｙｅａｓｔ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ：Ｇｅｎｅ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ、Ｊｏｎｅｓら編、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９３年）；Ｔｈｅ Ｙｅａｓｔ Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ：Ｇｅｎｏｍｅ Ｄｙｎａｍｉｃｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，ａｎｄ Ｅｎｅｒｇｅｔｉｃｓ、Ｂｒｏａｃｈら編、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ（１９９２年）；Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第２版（Ｓａｍｂｒｏｏｋら、１９８９年）及びＭｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、第３版（Ｓａｍｂｒｏｏｋ及びＲｕｓｓｅｌ、２００１年）、（本明細書では合わせて「Ｓａｍｂｒｏｏｋ」と呼ぶ）；Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌら編、１９８７年、２００１年までの追補を含む）；ＰＣＲ：Ｔｈｅ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ、（Ｍｕｌｌｉｓら編、１９９４年）；Ｈａｒｌｏｗ及びＬａｎｅ（１９８８年）Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ，Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ；Ｈａｒｌｏｗ及びＬａｎｅ（１９９９年）Ｕｓｉｎｇ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ、Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ、ＮＹ（本明細書では合わせて「Ｈａｒｌｏｗ及びＬａｎｅ」と呼ぶ）、Ｂｅａｕｃａｇｅら編、Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、 Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｉｎｃ．、Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ、２０００年）；Ｃａｓａｒｅｔｔ ａｎｄ Ｄｏｕｌｌ’ｓ Ｔｏｘｉｃｏｌｏｇｙ Ｔｈｅ Ｂａｓｉｃ Ｓｃｉｅｎｃｅ ｏｆ Ｐｏｉｓｏｎｓ，Ｃ．Ｋｌａａｓｓｅｎ編、第６版（２００１年）、及びＶａｃｃｉｎｅｓ，Ｓ．Ｐｌｏｔｋｉｎ及びＷ．Ｏｒｅｎｓｔｅｉｎ編、第３版（１９９９年）。

【0239】

一般的な定義
「細胞媒介性」免疫応答（本明細書のあらゆる箇所で、用語「細胞性」免疫応答と同義に使用することができる）は、一般的に、Ｔリンパ球（細胞傷害性リンパ球（ＣＴＬ）を含む）、樹状細胞、マクロファージ、及びナチュラルキラー細胞を含む免疫細胞の抗原に対する応答、並びにそれら細胞の活性化及び増殖、ＣＴＬエフェクター機能、適応免疫反応及び先天性免疫応答に関与する他の細胞の機能に影響を及ぼすサイトカイン産生、並びに記憶Ｔ細胞発生を含むがこれらに限定されないそのような応答に関連するプロセスの全てに対する応答を指す。

【0240】

「ワクチン接種」又は「免疫」は、抗原を単独で又はアジュバントと共に投与した結果としての、抗原又はその免疫原性部分に対する免疫応答の誘発（誘導）を指す。ワクチン接種は、防御又は治療効果をもたらし、抗原（又は抗原の供給源）に対するその後の接触が、動物の疾患又は状態を低減又は予防する抗原（又は供給源）に対する免疫応答を誘発する。ワクチン接種の概念は、当技術分野で周知である。免疫療法組成物（ワクチン）の投与により誘発される免疫応答は、組成物を投与しない場合と比較して、免疫応答（例えば、細胞媒介性応答、体液性応答、サイトカイン産生）のいずれかの側面の任意の検出可能な変化であり得る。

【0241】

本発明によると、「異種性アミノ酸」は、指定のアミノ酸配列と隣接することが天然では見出されないか（つまり、自然界、ｉｎ ｖｉｖｏに見出されない）、指定のアミノ酸配列の機能と関連しないか、又は所与のアミノ酸配列が由来する生物の標準的コドン使用頻度を使用して、天然配列のそのようなヌクレオチドが翻訳された場合に、それが遺伝子に生じる指定のアミノ酸配列をコードする天然核酸配列を隣接するヌクレオチドによりコードされないであろうと考えられるアミノ酸の配列である。したがって、抗原に対して異種性である少なくとも２つのアミノ酸残基は、抗原に隣接することが天然では見出されない２つの任意のアミノ酸残基である。

【0242】

本発明によると、異種性融合タンパク質を含む、本発明の酵母媒体に関して「異種性」のタンパク質又は「異種性」の抗原への言及は、タンパク質又は抗原は、酵母により天然で発現されるタンパク質又は抗原ではないが、融合タンパク質は、酵母により天然で発現される酵母配列若しくはタンパク質又はその部分（例えば、本明細書に記載のＡｇａタンパク質）を含んでいてもよいことを意味する。例えば、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質及び酵母Ａｇａタンパク質の融合タンパク質は、そのような融合タンパク質が、酵母により天然では発現されないため、本発明の酵母媒体に関して異種性タンパク質であるとみなされる。

【0243】

本発明によると、語句「選択的に結合する」とは、本発明の抗体、抗原結合断片、又は結合パートナーが、指定のタンパク質と優先的に結合する能力を指す。より詳しくは、語句「選択的に結合する」とは、別のタンパク質（例えば、抗体、その断片、又は抗原の結合パートナー）に対する１つのタンパク質の特異的結合を指し、結合レベルは、任意の標準的アッセイ（例えば、イムノアッセイ）により測定すると、アッセイのバックグラウンド対照より統計的に有意に高い。例えば、イムノアッセイを実施する場合、典型的には、対照には、抗体又は抗原結合断片のみを含有する（つまり、抗原の非存在下の）反応ウェル／チューブが含まれ、抗原の非存在下における抗体又はその抗原結合断片による反応性（例えば、ウェルに対する非特異的結合）の量は、バックグラウンドであるとみなされる。結合は、酵素免疫法（例えば、ＥＬＩＳＡ、免疫ブロッティングアッセイ等）を含む当技術分野で標準的な様々な方法を使用して測定することができる。

【0244】

本発明におけるタンパク質又はポリペプチドへの言及は、全長タンパク質、融合タンパク質、又はそのようなタンパク質の任意の断片、ドメイン、立体構造エピトープ、若しくは相同体を含む。より詳しくは、本発明によると、単離されたタンパク質は、その天然環境（つまり、人工的操作を受けていない）から取り出されたタンパク質（ポリペプチド又はペプチドを含む）であり、例えば、精製されたタンパク質、部分的に精製されたタンパク質、組換え的に産生されたタンパク質、及び合成的に生成されたタンパク質を含むことができる。したがって、「単離された」は、タンパク質が精製された程度を反映しない。本発明の１つの態様では、本発明の単離されたタンパク質は、組換え的に産生される。本発明によると、用語「修飾」及び「突然変異」は、特にタンパク質又はその部分のアミノ酸配列の修飾／突然変異に関して、同義に使用することができる。

【0245】

本明細書で使用される場合、用語「相同体」は、天然タンパク質又はペプチド（つまり「原型」又は「野生型」タンパク質）に対する軽微な修飾により、天然タンパク質又はペプチドと異なるが、天然形態の基本的タンパク質構造及び側鎖構造を維持するタンパク質又はペプチドを指すために使用される。そのような変化には、以下のものが含まれるがこれらに限定されない：１つ又は少数のアミノ酸側鎖の変化；欠失（例えば、タンパク質又はペプチドの切断型）、挿入、及び／又は置換を含む１つ又は少数のアミノ酸変化；１つ又は少数の原子の立体化学の変化；及び／又はメチル化、グリコシル化、リン酸化、アセチル化、ミリストイル化、プレニル化、パルミタート化（ｐａｌｍｉｔａｔｉｏｎ）、アミド化、及び／又はグリコシルホスファチジルイノシトールの付加を含むがこれらに限定されない軽微な誘導体化。相同体は、天然タンパク質又はペプチドと比較して、増強された、低下した、又は実質的に同様のいずれの特性を有していてもよい。相同体は、タンパク質のアゴニスト又はタンパク質のアンタゴニストを含むことができる。相同体は、単離された天然タンパク質の直接修飾、直接的タンパク質合成、又は例えば古典的技術若しくは組換えＤＮＡ技術を使用してタンパク質をコードする核酸配列を修飾し、ランダム突然変異誘発若しくは標的突然変異誘発を達成することを含むがこれらに限定されないタンパク質を産生するための当技術分野で公知の技術を使用して産生することができる。

【0246】

所与のタンパク質の相同体は、基準タンパク質のアミノ酸配列と少なくとも約４５％、又は少なくとも約５０％、又は少なくとも約５５％、又は少なくとも約６０％、又は少なくとも約６５％、又は少なくとも約７０％、又は少なくとも約７５％、又は少なくとも約８０％、又は少なくとも約８５％、又は少なくとも約９０％、又は少なくとも約９５％同一、又は少なくとも約９５％同一、又は少なくとも約９６％同一、又は少なくとも約９７％同一、又は少なくとも約９８％同一、又は少なくとも約９９％同一（又は整数の増加間隔で４５％〜９９％の任意の同一性パーセント）のアミノ酸配列を含むか、これから本質的になるか、又はこれからなる。１つの実施形態では、相同体は、基準タンパク質の天然アミノ酸配列と１００％未満の同一性、約９９％未満の同一性、約９８％未満の同一性、約９７％未満の同一性、約９６％未満の同一性、約９５％未満の同一性等であり、１％の増加間隔で約７０％未満の同一性であるアミノ酸配列を含むか、これから本質的になるか、又はこれからなる。

【0247】

本明細書で使用される場合、別様の指示がない限り、同一性パーセント（％）への言及は、以下のものを使用して実施される相同性の評価を指す：（１）アミノ酸探索の場合はｂｌａｓｔｐを使用し、核酸探索の場合はｂｌａｓｔｎを使用した、標準的初期設定パラメーターを用いたＢＬＡＳＴ２．０ Ｂａｓｉｃ ＢＬＡＳＴ相同性探索、この探索では、クエリー配列は、初期設定では低複雑度領域がフィルタリングされる（Ａｌｔｓｃｈｕｌ，Ｓ．Ｆ．、Ｍａｄｄｅｎ，Ｔ．Ｌ．、Ｓｃｈａａｆｆｅｒ，Ａ．Ａ．、Ｚｈａｎｇ，Ｊ．、Ｚｈａｎｇ，Ｚ．、Ｍｉｌｌｅｒ，Ｗ．、及びＬｉｐｍａｎ，Ｄ．Ｊ．（１９９７年）「Ｇａｐｐｅｄ ＢＬＡＳＴ ａｎｄ ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ：ａ ｎｅｗ ｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｐｒｏｔｅｉｎ ｄａｔａｂａｓｅ ｓｅａｒｃｈ ｐｒｏｇｒａｍｓ．」Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２５巻：３３８９〜３４０２頁に記載されており、この文献は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる）；（２）ＢＬＡＳＴ２アラインメント（下記に記載のパラメーターを使用）；（３）及び／又は標準的初期設定パラメーターを用いたＰＳＩ−ＢＬＡＳＴ（位置特異的反復ＢＬＡＳＴ）。ＢＬＡＳＴ２．０ Ｂａｓｉｃ ＢＬＡＳＴとＢＬＡＳＴ２とで標準的パラメーターが多少異なるため、２つの特定の配列が、ＢＬＡＳＴ２プログラムを使用して有意な相同性を有すると認識される場合がある一方で、その配列の１つをクエリー配列として使用したＢＬＡＳＴ２．０ Ｂａｓｉｃ ＢＬＡＳＴで実施した探索は、第２の配列を最高一致として特定しない場合があることに留意されたい。加えて、ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴは、自動化された使い易いバージョンの「プロファイル」探索を提供し、この探索は、配列相同体を探索するための高感度法である。このプログラムは、まずギャップを考慮したＢＬＡＳＴデータベース探索を実施する。ＰＳＩ−ＢＬＡＳＴプログラムは、結果として返ってきた任意の有意なアラインメントからの情報を使用して位置特異的スコアマトリックスを構築し、それにより次回のデータベース探索クエリー配列が置換される。このようにして、これらのプログラムのいずれか１つを使用することにより、同一性パーセントを決定することができることが理解されるはずである。

【0248】

２つの特定の配列は、Ｔａｔｕｓｏｖａ及びＭａｄｄｅｎ、（１９９９年）、「Ｂｌａｓｔ ２ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ−ａ ｎｅｗ ｔｏｏｌ ｆｏｒ ｃｏｍｐａｒｉｎｇ ｐｒｏｔｅｉｎ ａｎｄ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ」、ＦＥＭＳ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｌｅｔｔ．１７４巻：２４７〜２５０頁（引用によりその全体が本明細書に組み込まれる）に記載のように、ＢＬＡＳＴ２配列を使用して、互いにアラインすることができる。ＢＬＡＳＴ２配列アラインメントは、ＢＬＡＳＴ２．０アルゴリズムを使用してｂｌａｓｔｐ又はｂｌａｓｔｎで実施し、２配列間のギャップを考慮したＢＬＡＳＴ探索（ＢＬＡＳＴ２．０）を行い、その結果生じる配列にギャップ（欠失及び挿入）の導入が許容される。本明細書では、明瞭性のために、ＢＬＡＳＴ２配列アラインメントは、以下のような標準的初期設定パラメーターを使用して実施される。

【0249】

ｂｌａｓｔｎの場合、０ ＢＬＯＳＵＭ６２マトリックスを使用する：
一致報酬＝１
不一致ペナルティ＝−２
空白ギャップ（５）及び伸長ギャップ（２）ペナルティ
ギャップｘ＿ｄｒｏｐｏｆｆ（５０）期待値（１０）ワードサイズ（１１）フィルター（オン）
ｂｌａｓｔｐの場合、０ ＢＬＯＳＵＭ６２マトリックスを使用する：
空白ギャップ（１１）及び伸長ギャップ（１）ペナルティ
ギャップｘ＿ｄｒｏｐｏｆｆ（５０）期待値（１０）ワードサイズ（３）フィルター（オン）
単離された核酸分子は、その天然環境（つまり、人工的な操作を受けていない）から取り出された核酸分子であり、その天然環境は、核酸分子が天然で見出されるゲノム又は染色体である。したがって、「単離された」は、核酸分子が精製された程度を必ずしも反映しないが、核酸分子が天然で見出されるゲノム全体又は染色体全体を、その分子が含んでいないことを示す。単離された核酸分子は、遺伝子を含むことができる。遺伝子を含んでいる単離された核酸分子は、そのような遺伝子を含んでいる染色体の断片ではなく、むしろ遺伝子に関連するコード領域及び調節領域を含むが、同じ染色体上に天然で見出される更なる遺伝子を含んでいない。また、単離された核酸分子は、天然では指定の核酸配列を通常は隣接しない更なる核酸（つまり異種性配列）により隣接された（つまり、配列の５’及び／又は３’末端で）、指定の核酸配列を含んでいてもよい。単離された核酸分子は、ＤＮＡ、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ）、又はＤＮＡ若しくはＲＮＡのいずれかの誘導体（例えば、ｃＤＮＡ）を含んでいてもよい。語句「核酸分子」は、主に物理的な核酸分子を指し、語句「核酸配列」は、主に核酸分子のヌクレオチドの配列を指すが、この２つの語句は、タンパク質又はタンパク質のドメインをコードすることが可能な、特に核酸分子又は核酸配列に関して同義に使用することができる。

【0250】

組換え核酸分子は、形質移入される細胞での核酸分子の発現を効果的に制御することが可能な任意の転写制御配列の少なくとも１つに作用可能に結合された、本明細書に記載の任意の１つ又は複数のタンパク質をコードする任意の核酸配列の少なくとも１つを含むことができる分子である。語句「核酸分子」は、主に物理的な核酸分子を指し、語句「核酸配列」は、主に核酸分子のヌクレオチドの配列を指すが、この２つの語句は、タンパク質をコードすることが可能な、特に核酸分子又は核酸配列に関して同義に使用することができる。加えて、語句「組換え分子」は、主に転写制御配列に作用可能に結合された核酸分子を指すが、動物に投与される語句「核酸分子」と同義に使用することができる。

【0251】

組換え核酸分子は、組換えベクターを含み、組換えベクターは、任意の核酸配列、典型的には異種性配列であり、本発明の融合タンパク質をコードする単離された核酸分子に作用可能に結合されており、融合タンパク質の有効な組換え体産生が可能であり、本発明により核酸分子を宿主細胞に送達することが可能である。そのようなベクターは、ベクターに挿入される単離された核酸分子に隣接することが天然では見出されない核酸配列を含有することができる。ベクターは、ＲＮＡ又はＤＮＡのいずれでもよく、原核生物又は真核生物のいずれでもよく、本発明の１つの態様では、ウイルス又はプラスミドである。組換えベクターは、クローニング、配列決定、及び／又は核酸分子の別様な操作に使用することができ、そのような分子の送達に使用することができる（例えば、ＤＮＡワクチン又はウイルスベクターに基づくワクチンでのように）。組換えベクターは、核酸分子の発現に使用してもよく、発現ベクターと呼ばれる場合もある。幾つかの組換えベクターは、形質移入された宿主細胞で発現することが可能である。

【0252】

本発明の組換え分子では、核酸分子は、転写制御配列、翻訳制御配列、複製開始点、及び宿主細胞と適合性をもち、本発明の核酸分子の発現を制御する他の制御配列等の制御配列を含有する発現ベクターに作用可能に結合されている。特に、本発明の組換え分子には、１つ又は複数の発現制御配列に作用可能に結合されている核酸分子が含まれる。語句「作用可能に結合された」は、宿主細胞に形質移入（つまり、形質転換、変換導入、又は形質移入）された際にその分子が発現されるような様式で、核酸分子を発現制御配列に結合させることを指す。

【0253】

本発明によると、用語「形質移入」は、外来性核酸分子（つまり、組換え核酸分子）を細胞に挿入することができる任意の方法を指すために使用される。用語「形質転換」は、そのような用語が、藻類、細菌、及び酵母等の微生物細胞への核酸分子導入を指すために使用される場合、用語「形質移入」と同義に使用することができる。微生物系では、用語「形質転換」は、微生物による外来性核酸の獲得による遺伝的変化を記述するために使用され、用語「形質移入」と本質的に同義である。したがって、形質移入技術には、形質転換、細胞の化学処理、粒子衝突、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション、リポフェクション、吸着、感染、及びプロトプラスト融合が含まれるがこれらに限定されない。

【0254】

以下の実験結果は、例示のために提供されており、本発明の範囲を限定することは意図されていない。
実施例
実施例１
以下の例は、全酵母ベースの免疫療法免疫による、抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞媒介性一次免疫の発生を実証する。

【0255】

オボアルブミン発現するように操作された酵母によるマウスの免疫が、オボアルブミン発現腫瘍の細胞媒介性破壊の発生に結び付くことは以前に示されている（Ｓｔｕｂｂｓら、Ｎａｔ．Ｍｅｄ．７巻：６２５〜６２９頁（２００１年））。ｉｎ ｖｉｖｏでの効率的な腫瘍破壊は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞を必要とし、少なくとも２回の免疫後に発生した。

【0256】

強化された免疫手順を使用して、本発明者らは、検出可能な抗原特異的ＣＤ８^＋細胞媒介性一次免疫反応を発生させることができるか否かを決定した。抗原特異的一次免疫応答は、抗原特異的Ｔ細胞の出現頻度が向上された場合にその検知がより簡単になるであろうという前提に基づく最初の手法は、免疫優勢オボアルブミンペプチド、ＳＩＩＮＦＥＫＬ（配列番号２６）に特異的な単一のＴ細胞受容体を保持するＣＤ８^＋ Ｔ細胞がＴ細胞レパートリーで優勢である、ＯＴ−１トランスジェニックマウスに由来するＴ細胞の養子移入である。オボアルブミンを組換え発現するように操作された全サッカロマイセス・セレビシエ酵母（ＯＶＡＸと呼ぶ）による１回の免疫は、ＣＦＳＥ染色の希釈により明確にしたところ、養子移入されたＯＴ−１ ＣＤ８^＋ Ｔ細胞の活性化及び増殖をもたらした（図１Ａ）。同様の結果が、可溶性オボアルブミン（ｏｖａ）と、ＣＵＰ１プロモータープラスミドのみで形質転換されたサッカロマイセス・セレビシエ酵母（ＹＶＥＣ）との混合物で観察された（ＹＶＥＣ＋ｏｖａ；図１Ｂ）。オボアルブミン特異的Ｔ細胞活性化は、ＹＶＥＣ酵母のみ（図１Ｃ）又は未感作養子レシピエント（図１Ｄ）では観察されなかった。これらの結果は、酵母が可溶性抗原の交差提示をｉｎ ｖｉｔｒｏで誘導することができると結論付けた従来の研究（Ｓｔｕｂｂｓら、２００１年、上記；Ｈａｌｌｅｒら、２００７年、Ｖａｃｃｉｎｅ ２５巻：１４５２〜１４６３頁）を裏付けたが、本実験は、ｉｎ ｖｉｖｏ手法を使用して交差提示を実証した。

【0257】

ＣＤ４０シグナル伝達は、サイトカイン産生、ＭＨＣクラスＩＩ及びＣＤ８０／８６等の同時刺激分子の誘導、並びに交差提示の促進により樹状細胞を成熟させ、これらの全てが、より効率的なＴ細胞活性化及び分化を提供するとみなされている。

【0258】

単回の免疫（つまり、一次応答）で内因性の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞を発生させることができるように酵母ベースの免疫手法の感受性を最適化及び増加させるために、本発明者らは、可溶性抗原、この場合はオボアルブミンが共に加えられた酵母と、樹状細胞（ＤＣ）活性化抗原ＣＤ４０（αＣＤ４０又はａＣＤ４０）に対する抗体との混合物を使用した。手短に言えば、Ｃ５７Ｂ１／６野生型（ＷＴ）マウスを、図２Ａ〜２Ｄに示されているように、ＹＶＥＣ、可溶性オボアルブミン、及び／又は抗ＣＤ４０（抗原提示細胞上のＣＤ４０分子を標的とする抗体）の種々の組み合わせを用いて、静脈内に１回免疫した。７日後に、末梢血リンパ球を血液試料から単離した。末梢血細胞を、活性化Ｔ細胞で発現されたＣＤ４４マーカー（Ｙ軸）及びオボアルブミン抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞（Ｘ軸）について染色した。フローサイトメトリーのヒストグラムは、生産的な免疫応答を示すＴ細胞活性化マーカー及び抗原特異的マーカーが両方とも染色される、試料中の細胞の相対数を示す。両マーカーが染色される細胞は、ヒストグラムの右上四分部に示される。

【0259】

上記の図１Ａ〜１Ｄに示されている結果と比較して、抗ＣＤ４０抗体が実験に含まれていた場合、より活発な一次応答が観察された（図２Ａ〜２Ｄを参照）。抗ＣＤ４０抗体は、抗原提示細胞上のＣＤ４０と結合する手段として使用されたが、それは、これにより、より効率的な抗原提示が提供されると考えられているためである（Ａｈｏｎｅｎら、２００９年）。抗ＣＤ４０抗体をオボアルブミン及び酵母と組み合わせたこの免疫手法（酵母＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０）は、オボアルブミン＋酵母のみ（酵母＋ｏｖａ；図２Ａ）又はオボアルブミン＋抗ＣＤ４０のみ（ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図２Ｂ）と比較して、実証可能な四量体陽性内因性ＯＶＡ抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞を、野生型（ＷＴ）動物にもたらした（図２Ｃ）。内因性一次抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生により、一次免疫応答シグナルを修飾するためにＯＴ−１トランスジェニックＴ細胞養子移入をする必要性がなくなった。酵母＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０抗体は、約５％の抗原特異的ＣＤ８の出現頻度をもたらしたが（図２Ｃ）、オボアルブミン及び抗ＣＤ４０と組み合わせたＴＬＲ２アゴニスト、ｐａｍ３ｃｙｓによる免疫（図２Ｄ）は、酵母免疫と比較して、抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞のおよそ３倍の増加（５．８対１５．８）をもたらした（図２Ｃ）。

【0260】

実施例２
以下の例は、全酵母ベースの免疫による抗原特異的ＣＤ８＋細胞媒介性一次免疫のＴＬＲ依存的発生が、ＩＬ−１２及びＣＤ４＋ ＴＨ１ Ｔ細胞により明らかに影響されることを示す。

【0261】

この一連の実験では、ＴＨ１ Ｔ細胞の酵母ベースの発生と抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の酵母ベースの発生との間にどのように関係性があるのか、及び特定のタイプの免疫応答の阻害により細胞媒介性免疫応答を調節することができるか否かを研究した。

【0262】

本発明者らは、最初に、酵母関連病原体分子パターンの認識能力を欠損したマウス；Ｔｈ１特異的転写因子、Ｔｂｅｔを欠損したマウス；及びＴＨ１関連サイトカイン、ＩＬ−１２を認識することができないマウスで発生した全酵母ベースの免疫応答に注目した。酵母は、抗原提示細胞上のＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）に結合し、酵母に結合した可能性が最も高いＴＬＲは、ＴＬＲ２及び４であると考えられ、それらは両方ともＭｙｄ８８シグナル伝達依存性である。Ｔｂｅｔは、Ｔｈ１特異的転写因子であり、Ｔｂｅｔをコードする遺伝子を欠如するマウスは、Ｔｈ１型のＣＤ４＋ Ｔ細胞を産生しない。ＩＬ−１２は、ＤＣ上のＴＬＲと結合することにより開始されるＴＨ１誘導と関連するサイトカインである（Ｐａｓａｒｅ及びＭｅｄｚｈｉｔｏｖ、２００３年）。

【0263】

手短に言えば、様々な群のマウス（下述）を、図３〜５に示されているように、ＹＶＥＣ（空ベクターを含有する酵母、「酵母」と表記される）、可溶性オボアルブミン（ｏｖａ）、ｐａｍ３ｃｙｓとして知られているＴＬＲ２アゴニスト、及び／又は抗ＣＤ４０（ａＣＤ４０；抗原提示細胞上のＣＤ４０分子を標的とする抗体）の種々の組み合わせを用いて、静脈内に１回免疫した。幾つかの実験には、免疫されなかった未感作動物が含まれていた（「未感作」と表記される）。７日後に、末梢血リンパ球を血液試料から単離し、末梢血細胞を、上記の実施例１の実験に記載されているように、活性化Ｔ細胞上に発現されたＣＤ４４マーカー（図３及び４、Ｙ軸）、並びにオボアルブミン抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞（図３及び４、Ｘ軸）について染色した。

【0264】

図３Ａ〜３Ｉは、酵母ベースの免疫療法剤により発生されるＣＤ８＋応答におけるＴＨ１活性化の必要性評価する実験の結果を示す。ＩＬ−１２Ｒβ−／−マウスは、ＩＬ−１２受容体サブユニットを欠如しており、したがってＩＬ−１２に誘導される生物学的機能の欠損がもたらされている。Ｔｂｅｔ−／−マウスは、ＴＨ１細胞の産生に関連する主要な転写因子、Ｔｂｅｔを欠如しており、したがってＴＨ１ ＣＤ４＋ Ｔ細胞を欠損している。野生型マウス（ＷＴ；図３Ａ〜３Ｃ）、ＩＬ−１２Ｒβ−／−マウス（図３Ｄ〜３Ｆ）、及びｔｂｅｔ−／−マウス（図３Ｇ〜３Ｉ）を、（１）無（「未感作」と表記される；図３Ａ、３Ｄ、３Ｇ）、（２）ＹＶＥＣ＋可溶性オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（「酵母」と表記される；図３Ｂ、３Ｅ、３Ｈ）、又は（３）ｐａｍ３ｃｙｓ＋可溶性オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（「ｐａｍ３ｃｙｓ」と表記される；図３Ｃ、３Ｆ、３Ｉ）で免疫した。

【0265】

図３Ａ〜３Ｉの各パネルの右上四分部には、産生された抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞のパーセントが示されており、例えば、ＷＴマウスを使用した場合、酵母ベースの免疫（図３Ｂ）は、ｐａｍ３ｃｙｓ免疫と比較して（図３Ｃ）、およそ４０％のＣＤ８ Ｔ細胞の出現頻度を発生させた（それぞれ、７．５％対１８．７％）。

【0266】

ＴＨ１ ＣＤ４＋ Ｔ細胞を発生させることができないマウス（ｔｂｅｔ−／−マウス）（Ｓｚａｂｏら、２０００年）では、酵母が発生させた応答は、本質的にバックグラウンドにまで低減された（図３Ｈ）。同様の結果が、ＩＬ−１２受容体を欠如するマウスでＩＬ−１２依存性ＴＨ１応答を除去することにより得られた（図３Ｅ）。ＩＬ−１２受容性の妨害及びＴＨ１ ＣＤ４＋ Ｔ細胞の除去はいずれも、ｐａｍ３ｃｙｓ応答に対して、いかなる有意な効果も示さなかった（図３Ｆ及び３Ｉ）。これらのデータは、ｐａｍ３ｃｙｓ及び酵母が、幾つかの重要な点で異なることを示した。第１に、ＣＤ４＋ ＴＨ１サブセット、又はこの応答を駆動する樹状細胞（ＤＣ）に由来する主要なサイトカイン（ＩＬ−１２）をノックアウトすることにより、酵母で免疫された動物では、ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生が、バックグラウンドまで又はその付近まで低下したが、ｐａｍ３ｃｙｓのＣＤ８＋ Ｔ細胞発生には明白な効果を示さなかった。このように、酵母ベースの免疫は、ＴＨ１ ＣＤ４依存性応答及びＩＬ−１２依存性応答を発生させたが、ｐａｍ３ｃｙｓ応答は、ＴＨ１ ＣＤ４依存性でもＩＬ−１２依存性でもなかった。第２に、実験は正常（野生型）マウスで実施されていることに留意すると、ｐａｍ３ｃｙｓ応答はより強く、図３Ａ〜３Ｃに示されるように、強度が酵母と比較しておよそ２．５倍であると考えられる。

【0267】

ｐａｍ３ｃｙｓ免疫療法と比べて、酵母ベースの免疫療法に応答したＣＤ８＋ Ｔ細胞の活性化に必要であるシグナルは何かを決定するために、図４Ａ〜４Ｃ及び図５には、これらの治療手法により発生するＣＤ８＋応答におけるＴＬＲシグナル伝達及びＭＨＣクラスＩＩシグナル伝達の必要性を評価する実験の結果が示されている。ＭｙＤ８８−／−マウスは、ＴＬＲ３を除くＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）が全て機能不全にされているＣ５７Ｂ１／６マウスである（つまり、ＴＬＲ３を除くＴＬＲは全て、生産的なシグナル伝達のためにＭｙＤ８８を必要とする）。クラスＩＩ ＭＨＣノックアウトマウス（ＭＨＣクラスＩＩ −／−）は、ＭＨＣクラスＩＩ分子が陰性のマウスであり、マウスは全てのタイプのＣＤ４＋ Ｔ細胞を欠いている。

【0268】

第１の実験では、ＭｙＤ８８−／−マウスを、以下のもので免疫した：（１）ＹＶＥＣ＋抗ＣＤ４０（酵母＋ａＣＤ４０；図４Ａ）、（２）ＹＶＥＣ＋可溶性オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（酵母＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図４Ｂ）、又は（３）ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（ｐａｍ３ｃｙｓ＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図４Ｃ）。これらの結果は、ＴＬＲ３を除くＴＬＲを全て機能不全にすることにより、酵母で免疫されたマウス及びｐａｍ３ｃｙｓで免疫されたマウスの両方で、消失ではないにしても免疫応答の著しい低下がもたらされることを示し、両応答が機能的なＴＬＲシグナル伝達に依存することが示される。２Ａ〜２Ｄを図４Ａ〜４Ｃと比較すると、酵母＋ｏｖａ＋抗ＣＤ４０に対する応答は、５．８％から１．４％になり、ｐａｍ３ｃｙｓ＋ｏｖａ＋抗ＣＤ４０による応答は、１５．８％から０．７８％になった。

【0269】

図５に示されている第２の実験では、ＴＬＲシグナル伝達タンパク質ＭｙＤ８８を欠如するマウス（ＭｙＤ８８−／−）で発生したＣＤ８＋ Ｔ細胞のパーセントを、Ｙ軸上で、ｐａｍ３ｃｙｓに応答してＷＴマウスに発生した抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度（最初の列で１００％として表されている）と比較する。野生型（ＷＴ；黒色バー）又は、ＭｙＤ８８−／−マウス（白色バー）を、以下のもので免疫した：（１）ＹＶＥＣ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（オボアルブミン、酵母、ａＣＤ４０）又は（２）ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（オボアルブミン、ｐａｍ３ｃｙｓ、ａＣＤ４０）。この実験では、ＷＴマウスの酵母ベースの免疫に対する応答が、ｐａｍ３ｃｙｓについて観察された免疫（以前の図でも示されているような）の４０％であったことを観察することができる。図４のように、ＴＬＲ２及びＴＬＲ３を除く他の全てのＴＬＲシグナル伝達に不可欠であるＭｙＤ８８受容体が存在しないと、酵母及びｐａｍ３ｃｙｓに対する応答は両方とも本質的に消失することも観察することができる（図５、レーン２及び５をレーン１と比較）（^＊ ｐ＜０．０５、^＊＊＊ ｐ＜０．０００１）。まとめると、図４及び５の実験は、ＭｙＤ８８が作用しなかった場合、応答がバックグラウンドレベル付近まで低下したため、ＭｙＤ８８依存性ＴＬＲ（ＴＬＲ３を除く）は、酵母ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答及びｐａｍ３ｃｙｓ ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の両方に必要であったことを実証している（図５、レーン２及び５）。

【0270】

また、本発明者らは、クラスＩＩ ＭＨＣノックアウトマウス（つまり、全てのタイプのＣＤ４＋ Ｔ細胞を欠くマウス）で実験を実施することにより、ＣＤ４ Ｔ細胞サブセットを全て除去することが与える、酵母ベースの免疫による抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生に対する影響を研究した。結果は、図５に示されている（灰色バー、４番目の列）。図５では、酵母ベースのＣＤ８＋ Ｔ細胞応答は、ＴＨ１ ＣＤ４＋ Ｔ細胞のみを欠如するＭｙＤ８８−／−動物では、ｐａｍ３ｃｙｓ処置と比較してバックグラウンドレベルに低減されたが（白色バー）、クラスＩＩ ＭＨＣ−／−動物では、ＣＤ４＋ Ｔ細胞サブセットが全て欠失していても、酵母に対するＣＤ８＋ Ｔ細胞応答は発生し、実際、ｐａｍ３ｃｙｓ処置により誘発された応答とほとんど同じであった（図５、１列目を４列目と比較）ことが示されている。ＣＤ４＋ Ｔ細胞の除去は、ＷＴマウスと比較して、ｐａｍ３ｃｙｓで処置したクラスＩＩ ＭＨＣ−／−マウスに対して影響を及ぼさなかった（データ非表示）。

【0271】

言い換えれば、野生型マウスでのｐａｍ３ｃｙｓ応答は、酵母ベースの免疫により発生した免疫よりもおよそ２．５倍高かったが（図３Ｂ及び３Ｃを参照）、ＣＤ４＋ Ｔ細胞を全て欠損している動物では、酵母応答及びｐａｍ３ｃｙｓ応答は同等であった。まとめると、これらの結果は、ＣＤ４＋ Ｔ細胞が、ｐａｍ３ｃｙｓ ＴＬＲ特異的刺激に対する免疫応答とは異なる様式で、酵母に対するＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を制御することを示す。実験がＣＤ４ Ｔ細胞を欠く動物で実施されていることに留意すると、酵母は、ＣＤ４非依存性ＴＬＲアゴニストｐａｍ３ｃｙｓで観察される応答と同等のＣＤ４非依存性ＣＤ８ Ｔ細胞応答を刺激することが可能であり、ｐａｍ３ｃｙｓ処置とは異なり、酵母は、更に別のＣＤ４サブセットにより影響を受けるＴＨ１ ＣＤ４依存性／ＩＬ−１２依存性ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答も刺激することができ、酵母により発生したＣＤ４ Ｔ細胞は、酵母ベースの免疫療法に対する応答の誘導及び制御の両方の役割を果たすことが確認される。

【0272】

実施例３
以下の例は、全酵母ベースの免疫による抗原特異的ＣＤ８＋細胞媒介性一次免疫のＴＬＲ依存的発生が、ＩＬ−６により明らかに影響されることを示す。

【0273】

この一連の実験では、酵母ベースのＴＨ１ Ｔ細胞及び抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生と、ＴＨ１７ Ｔ細胞等の他のＴ細胞の発生との間に、あるとすればどのように関係性があるのか、及び更に、特定のタイプの免疫応答の阻害により細胞媒介性免疫応答を調節することができるか否かを研究した。実験には、炎症促進性のＴＨ１７関連サイトカイン、ＩＬ−６を産生する能力が欠損しているマウスを使用した。ＴＨ１７産生は、酵母由来のベータグルカンに結合するデクチン−１等の受容体の結合により促進され、ＩＬ−６産生に結び付く（Ｋｏｒｎら、２００８年；Ｄｅｎｎｅｈｅｙら、２００９年）。

【0274】

実施例２では、ＣＤ４＋ ＴＨ１細胞は、ＣＤ４＋ Ｔ細胞集団が無傷の場合、酵母ベースの免疫療法に対するＣＤ４依存性ＣＤ８＋応答の誘導因子であることが実証されているため、次に、本発明者らは、どのＣＤ４サブセットが、酵母免疫療法に対する応答の制御に関与したかを決定しようと試みた。

【0275】

酵母ベースの免疫療法により誘発された対照ＣＤ４集団は、図６Ａ〜６Ｃに示されているようにＩＬ−６依存性である。この実験では、酵母ベースの免疫療法により発生した免疫応答におけるＩＬ−６の必要性を評価した。ＩＬ−６ −／−マウスは、ＩＬ−６を産生する能力を有していないＣ５７Ｂ１／６マウスである（ＩＬ−６ノックアウトマウス）。ＩＬ−６ −／−マウスを、以下のもので免疫した：（１）オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図６Ａ）、（２）ＹＶＥＣ＋可溶性オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（酵母＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図６Ｂ）、又は（３）ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（ｐａｍ３ｃｙｓ＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図６Ｃ）。７日後に、末梢血リンパ球を血液試料から単離し、末梢血細胞を、上記の実施例１の実験に記載されているように、活性化Ｔ細胞上に発現されたＣＤ４４マーカー（Ｙ軸）及びオボアルブミン抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞（Ｘ軸）について染色した。

【0276】

ｐａｍ３ｓｙｓ＋ｏｖａ＋抗ＣＤ４０によるＩＬ−６欠損動物の免疫は、ＷＴ対照と比較して明らかな効果を示さなかったが（１８．２％対１５．８％、図６Ｃを図２Ｄと比較）、ＩＬ−６欠損環境での酵母＋ｏｖａ＋抗ＣＤ４０による免疫は、応答を、例えば、酵母、抗原、及び抗ＣＤ４０の同じ組み合わせによるＷＴマウスの免疫と比較して６倍に劇的に向上させた（３３．１％対５．８２％、図６Ｂを図２Ｃと比較）。他の実験では（データ非表示）、抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度は、ＷＴマウスと比較して、ＩＬ−６ −／−マウスでは２５倍以上も増強された。実際、ＩＬ−６の除去は、ＣＤ４ Ｔ細胞は無傷のままであるが、酵母ベースの免疫療法に対する応答でのＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度を、実際に、ｐａｍ３ｃｙｓ処置の場合に観察された最大値の２倍の値に再現性よく増加させる（図６Ｂ及び６Ｃ）。したがって、ＩＬ−６依存性ＣＤ４＋ Ｔ細胞集団は、酵母ベースの免疫療法に対するＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の制御に関与するが、ｐａｍ３ｃｙｓに基づく免疫療法に対しては関与せず、ＩＬ−６依存性制御の除去は、酵母ベースの免疫に対するＣＤ８＋応答の劇的な上昇をもたらした。

【0277】

図７に関して、その後、本発明者らは、酵母ベースの免疫療法応答を制御したＩＬ−６依存性ＣＤ４＋ Ｔ細胞集団が、ＩＬ−１７産生により明確にされるようなＣＤ４＋ ＴＨ１７ Ｔ細胞集団であったことを示した。この実験では、野生型（ＷＴ）マウスを、上述のように酵母（ＹＶＥＣ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０）又はｐａｍ３ｃｙｓ（ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０）で免疫し、ＩＬ−１７を産生するＣＤ４＋ Ｔ細胞の出現頻度（フローサイトメトリーにより発色された細胞内サイトカイン染色により明確にされるような）について、末梢血を７日後に検査した。Ｙ軸の、ｐａｍ３ｃｙｓ処置から発生したＩＬ−１７産生ＣＤ４＋ Ｔ細胞のパーセントは、５％未満であり、未感作マウスで観察された応答よりも有意には大きくはないが（１番目の列対３番目の列）、酵母ベースの免疫療法で処置された動物におけるＴＨ１７のパーセントは、１５％と高い場合がある（ＴＨ１細胞が除去されている場合に、最も著しい。データ非表示）。

【0278】

ＩＬ−６が存在しないことにより、酵母ベースの免疫による抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の発生は増強されたが、ｐａｍ３ｃｙｓ免疫では増強されなかったという、上記に示されているデータを考慮して、酵母ベースの免疫後のＴＨ１７ Ｔ細胞の出現頻度を分析した。この手法は、フローサイトメトリーを使用して、ＣＤ４＋ Ｔ細胞の細胞内ＩＬ−１７産生を調査するためのものであった。手短に言えば、Ｔ細胞を、脾臓及び肺から単離し、ＰＭＡで５時間パルスしてサイトカインを発生させた直後に、サイトカイン産生を検査した。至適条件下での全酵母ベースの免疫の後でさえ、この手法を野生型マウスに使用してＩＬ−１７産生を測定することにより、ＴＨ１７を再現性よく検出するのは難しかった。ＴＨ１７シグナルは、ＴＨ１７シグナルを増強する手段としてＴＨ１７誘導性サイトカインを使用する長期間のｉｎ ｖｉｔｒｏ刺激ステップを使用して、他の系で以前に検出されている。しかしながら、そのような方法の交絡影響の可能性を回避するために、本発明者らは、その代わりに、この重要なＴＨ１転写因子を欠如するためＴＨ１ Ｔ細胞が欠損しているＴ−ｂｅｔノックアウトマウスでＴＨ１７を検査することを選択した（例えば、Ｋｏｃｈら、２００９年を参照）。

【0279】

図８Ａ（脾臓）及び８Ｂ（肺）に関して、インターフェロン−γ−産生ＣＤ４＋ Ｔ細胞（ＩＦＮｇパーセント）は、酵母ベースの（酵母）免疫（図８Ａ及び８Ｂ（ｔｂｅｔ−／−の列を参照））又はｐａｍ３ｃｙｓ免疫（データ非表示）後のＴ−ｂｅｔノックアウトでは観察されなかったが、それらは、ＷＴマウスでの全酵母ベースの免疫後の出現頻度が直ちに増強された（図８Ａ及び８Ｂ、（ＷＴ、酵母））。

【0280】

酵母で免疫されたＴ−ｂｅｔノックアウトマウスでは、操作されていない動物のＴＨ１７細胞をｅｘ ｖｉｖｏで直接検出することができ、それらの出現頻度は、酵母による免疫の関数として、脾臓（図８Ｃ）及び肺（図８Ｄ）中で増加した。Ｔ−ｂｅｔノックアウトマウスを、ｐａｍ３ｃｙｓで免疫した場合、ＩＬ−１７産生ＣＤ４ Ｔ細胞のこのような増加は、観察されなかった（データ非表示）。したがって、酵母ベースの免疫には、インターフェロン−γ−産生ＣＤ４ Ｔ細胞及びＩＬ−１７産生ＣＤ４ Ｔ細胞の両方の増加と関連する。

【0281】

これらの結果は、ＩＬ−１７産生ＣＤ４ Ｔ細胞の出現頻度が、ＴＨ１ Ｔ細胞発生が欠損しているＴ−ｂｅｔノックアウトマウスでの全酵母ベースの免疫後に増加することを示す。これは、ＴＨ１７ ＣＤ４ Ｔ細胞が、酵母の提示後に発生することを実証する。加えて、これらの結果は、酵母が、ＴＨ１表現型を有するＣＤ４ Ｔ細胞も誘導することができることを実証する。ＴＨ１７は、Ｔ−ｂｅｔノックアウト、ＴＨ１欠損環境で増加し、ＴＨ１は、ＩＬ−６欠損環境で増加するという実証は、ＴＨ１及びＴＨ１７は両方とも、全酵母ベースの免疫により誘導され、免疫系又は免疫プロセスを操作することにより、免疫応答を調節することができることを示す。

【0282】

したがって、酵母ベースの免疫療法は、ＴＨ１７細胞により影響を受け／制御され、次いでＩＬ−６依存性プロセスにより誘導されるＴＨ１依存性プロセスによりＣＤ８＋ Ｔ細胞を発生させることができる。ｐａｍ３ｃｙｓ等のＴＬＲ（ＭｙＤ８８依存性）アゴニストと酵母との１つの重要な違いは、酵母は、酵母表面にグルカン及びマンナンが存在するため、デクチン受容体及びマンノース受容体等の、樹状細胞上にある複数のＣ型レクチン受容体と結合する可能性が高いということである（ＬｅｉｂｕｎｄＧｕｔ−Ｌａｎｄｍａｎｎら、２００７年；Ｎｅｔｅａら、２００８年；Ｒｏｂｉｎｓｏｎら、２００９年；Ｆｅｒｗｅｒｄａら、２００９年；Ｇｌｏｃｋｅｒら、２００９年；Ｇｅｉｔｊｅｎｂｅｅｋ及びＧｒｉｎｇｈｕｉｓ、２００９年）。Ｃ型レクチン受容体による誘導は、ＩＬ−６産生、ＩＬ−１２依存性のＴＨ１産生経路の妨害、及び別のＣＤ４集団、ＴＨ１７の発生に結び付く（Ｄｅｎｎｅｈｙ及びＢｒｏｗｎ、２００９年）。ｐａｍ３ｃｙｓは、本質的に排他的にＴＬＲアゴニストであり（つまり、実質的にＣ型レクチン受容体を活性化しない）（Ｃｈｅｎら、２００９年）、ＴＨ１、ＩＬ−１２、又はＩＬ−６による妨害効果は観察されず、したがって、発生したｐａｍ３ｃｙｓ特異的応答は、本質的にＩＬ−１２非依存性及びＣＤ４非依存性であると考えられる。

【0283】

実施例４
以下の例は、全酵母ベースの免疫による抗原特異的ＣＤ８＋細胞媒介性一次免疫のＴＬＲ依存的発生が、デクチン−１受容体のみによって明らかに影響されるのではないことを示す。

【0284】

図９Ａ〜９Ｃは、酵母ベースの免疫療法剤により発生した免疫応答における、デクチン−１受容体によるシグナル伝達の必要性を評価する実験の結果を示す。デクチン１ −／−マウスは、β−グルカンの骨髄受容体であるデクチン−１を欠如する。酵母ベースの免疫療法剤組成物は、２及び４等のＴＬＲに結合するだけでなく、ＡＰＣ上のデクチン−１受容体に結合する糖残基（例えば、β−グルカン）も発現する。文献には、デクチン１結合が、ＩＬ−６産生に結び付く１つの経路であることが報告されている。デクチン−１ノックアウトマウスでは、デクチン−１受容体を使用せずにＴＬＲを生産的に使用することができる。デクチン−１ −／−マウスを、以下のもので免疫した：（１）オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図９Ａ）、（２）ＹＶＥＣ＋可溶性オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（酵母＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図９Ｂ）、又は（３）ｐａｍ３ｃｙｓ＋オボアルブミン＋抗ＣＤ４０（ｐａｍ３ｃｙｓ＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０；図９Ｃ）。７日後に、末梢血リンパ球を血液試料から単離し、末梢血細胞を、上記の実施例１の実験に記載されているように、活性化Ｔ細胞上に発現されたＣＤ４４マーカー（Ｙ軸）並びにオボアルブミン抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞（Ｘ軸）について染色した。結果は、酵母＋ｏｖａ＋ａＣＤ４０（３．６７％対５．８２％、図９Ｂを図２Ｃと比較）又はｐａｍ３ｃｙｓ＋ｏｖａ＋抗ＣＤ４０（１５．９％対１５．８％、図９Ｃを図２Ｄと比較）の応答に対する、デクチン−１受容性の明らかに実証可能な効果を示さなかった。

【0285】

デクチン−１受容体が、ＩＬ−６の誘導に結び付く重要な食細胞受容体であると考えられていることを考慮すると、この受容体をノックアウトすることにより、ＴＨ１７応答が減少され、それにより、免疫されたマウスにおける一次ＣＤ８＋応答が増加するであろうと予測することができる。しかしながら、図９Ａ〜９Ｃを参照すると、デクチン−１ノックアウトマウスによる抗原特異的ＣＤ８応答は、酵母で免疫されたマウス及びｐａｍ３ｃｙｓで免疫されたマウスの両方において、ＷＴマウスで観察された応答と同等であると考えられた。デクチン−１ノックアウトマウスは、ＷＴマウスで観察された出現頻度と同等なＴｒｅｇ出現頻度の低減も示し（データ非表示）、実証可能なＴＨ１７細胞が、酵母ベースの免疫療法による免疫の結果として、これらのマウスに誘導されたことを示唆する。理論により束縛されないが、本発明者らは、このデータの最も単純な解釈は、デクチン−１受容体に加えて他の受容体の結合の結果としてＩＬ−６が産生される場合があるということであると考える。酵母は、細胞表面にマンナンを大量に発現するため、１つの可能性の高い供給源は、ＩＬ−６産生、デクチン−２、又はＤＣ−ＳＩＧＮとも結合するマンナン受容体である。

【0286】

実施例５
以下の例では、酵母ベースの免疫療法により誘導されるＣＤ４＋ Ｔ細胞応答を調節することにより、ＣＤ８＋抗原特異的Ｔ細胞応答を調節することができることを示す更なる実験が記述されている。

【0287】

この更なる例示的な実験では、ＭｙＤ８８−／−マウス（図１０Ａ）、野生型（ＷＴ）マウス（図１０Ｂ）、及びＩＬ−６ −／−マウス（図１ＯＣ）を、オボアルブミンを発現するように遺伝子組換えされた（組換え技術により）サッカロマイセス・セレビシエ全酵母（ＯＶＡＸ）を用いて静脈内で１回免疫した。マウスを、ＯＶＡＸ、及び抗原提示細胞上のＣＤ４０分子を標的とする抗体（抗ＣＤ４０）で免疫した。７日後に、末梢血リンパ球を血液試料から単離した。末梢血細胞を、活性化Ｔ細胞上に発現されたＣＤ４４マーカー（図１０Ａ〜１０Ｃ、Ｙ軸）及びオボアルブミン抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞（図１０Ａ〜１０Ｃ、Ｘ軸）について染色した。

【0288】

実施例２及び３に示されている結果を裏付けるように、このデータでは、ＭｙＤ８８ −／−マウス（左）は、ＭｙＤ８８経路を使用してＴＬＲ（ＴＬＲ３以外は全て）を介してシグナル伝達する能力を欠如するため、抗原特異的Ｔ細胞を発生させる能力を欠如することが示されている。また、このデータにより、ＩＬ−６を産生する能力の欠失は、実施例４に示されているように、ＷＴと比較してオボアルブミン特異的ＣＤ８ Ｔ細胞の数を劇的に向上させることが確認される。これらのデータにより、酵母ベースの免疫療法に対する抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞応答の発生は、ＩＬ−６及びＴＬＲ結合、又はそれらの阻害により影響を受ける場合があり、これは、オボアルブミンが、酵母により組換え的に産生されるか（この例）又は酵母と混合されるか（実施例２〜４）に関わらず生じることが確認される。

【0289】

図１１には、抗原特異的マーカーを評価する前にＣＤ８ Ｔ細胞をゲート制御することにより、図１０Ａ〜１０Ｃに示されているオボアルブミンに抗原特異的な酵母ベースの免疫療法（酵母／ｏｖａ／ａＣＤ４０）で免疫されたマウスに由来する集団におけるＣＤ８ Ｔ細胞の実際のパーセントが定量化されている。オボアルブミン及び抗ＣＤ４０と組み合わせたｐａｍ３ｃｙｓを用いて免疫したマウスを使用して生成された同様のデータも、酵母ベースの免疫との比較のために示されている（Ｐａｍ３ｃｙｓ／ｏｖａ／ａＣＤ４０）。このデータは、ｐａｍ３ｃｙｓ免疫療法ではなく酵母ベースの免疫療法による抗原特異的Ｔ細胞の発生が、ＩＬ−６の除去により向上することを示す。ｐａｍ３ｃｙｓ系でのＣＤ８ Ｔ細胞応答の向上の欠如は、この作用剤が、ＩＬ−６により影響を受けないという事実を反映する。したがって、酵母及びｐａｍ３ｃｙｓは両方ともＴＬＲと結合することができるため、酵母ベースの免疫療法に対するＩＬ−６による影響は、ＴＬＲによっては生じない可能性が高い。

【0290】

図１２では、１回の免疫（一次）だけでなく、６０日後に同一の第２の免疫（記憶）をした後の、抗原特異的ＣＤ８ Ｔ細胞の出現頻度が検討されている。これらを、抗原特異的Ｔ細胞の数がほぼ検出不能なレベルに戻った中間時点（前追加免疫）と比較する。

【0291】

データは、第２の免疫後のＩＬ−６欠損マウスにおける抗原特異的Ｔ細胞の出現頻度が向上し続けることを示し、ＩＬ−６の除去が、この時間枠内では、酵母系免疫療法組成物の投与の結果としての長期免疫発生を妨害しないと考えられることを示す。

【0292】

抗原特異的ＣＤ８＋ 細胞１００個中１個〜１００個中５個の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度が、野生型マウスで適切に施された１用量の酵母系免疫療法後に再現性よく発生した（例えば、図２Ａ〜２Ｃを参照）。適切に施された１用量の酵母ベースの免疫療法後の抗原特異的ＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度は、ＩＬ−６ノックアウトマウスでは、約３個中１個〜約４個中１個に増加し、ＴＨ１７発生を含むＩＬ−６に関連する経路の阻害を使用して、ＴＨ１媒介性ＣＤ８＋免疫応答を増強することができることが実証された。

【0293】

実施例６
以下の例は、酵母ベースの免疫と制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）の低減との間の相関性を実証する。

【0294】

ＴＨ１７は、より低濃度のＴＧＦβに応答するＴＨ１７の能力によりＴｒｅｇとの競合に勝つことができ、これは、ＦｏｘＰ３シグナル結合解離によりＴｒｅｇを中和するＩＬ−６によって更に促進される場合があると、当技術分野では一般的に考えられている。したがって、本発明者らは、酵母ベースの免疫療法の状況でＴＨ１７出現頻度とＴｒｅｇ出現頻度との間になんらかの相関性が存在したか否か、及びもしに存在する場合は、この相関性が、ＩＬ−６の存在又は非存在により影響を受けたか否かを検討した。

【0295】

基線ＣＤ４ Ｔｒｅｇ出現頻度を測定し、全酵母ベースの免疫後のＩＬ−６ノックアウトマウス及びＷＴマウスにおける出現頻度と比較した。この手法には、市販の抗体で検出することができるＴｒｅｇ転写因子、ＦｏｘＰ３を発現するＣＤ４＋ Ｔ細胞のフローサイトメトリー分析が関与した。

【0296】

免疫後、データ（図１３）は、酵母ベースの免疫療法による免疫の関数として、Ｔｒｅｇレベルの負相関性を示す。ＩＬ−６ノックアウトマウスは、Ｋｏｒｎら、２００７年により以前に報告されているように、ＷＴマウスと比較してＴｒｅｇの出現頻度の増加を示した。しかしながら、本明細書でのデータは、Ｔｒｅｇ出現頻度が、酵母ベースの免疫療法剤で免疫されたＩＬ−６ノックアウト動物の流入領域リンパ節で減少したことを示す（図１３）。野生型マウスでは、Ｔｒｅｇ産生は、末梢血で測定した場合でさえ、酵母ベースの免疫療法の結果として妨害された（データ非表示）。ＷＴマウスにおけるこのようなＴｒｅｇ増殖の欠如は、ＩＬ−１７産生Ｔ細胞の増加と相関した（データ非表示）。Ｔｒｅｇの増殖は、マウスをｐａｍ３ｃｙｓで免疫した場合には生じた。Ｔ細胞のｐａｍ３ｃｙｓ活性化は、ＩＬ−６枯渇により影響を受けないため、これらのデータは、ＩＬ−６媒介性のＴＨ１７誘導が、制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）を発生させる動物の能力に不利な影響を及ぼすという解釈を支持する。したがって、酵母ベースのＴＨ１７の誘導は、そうでなければ通常は持続性ＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞活性化及び増殖を破壊する制御性Ｔ細胞に負の影響を及ぼす手段を提供する。

【0297】

上記の例をまとめると、これらのデータは、酵母がＩＬ−１７産生ＴＨ１７ Ｔ細胞を誘導し、これは制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ）発生の減少に関連することを示す。理論により束縛されないが、本発明者らは、ＴＨ１７及びＴＨ１は両方とも共通してＴＧＦβにより駆動されるため、ＴＨ１７ Ｔ細胞は、より少量のＴＧＦβしか必要とせず、そのため、この必須発育因子をめぐるＴｒｅｇとの競合に「勝利する」と考える。したがって、ＩＬ−６は、Ｔｒｅｇを標的とするのに必要ではない可能性がある。これは、ＩＬ−６ノックアウトが、ＩＬ−６が存在しない場合でさえＴｒｅｇの出現頻度を低減させたＩＬ−６ノックアウトからもたらされたデータにより支持される。このシナリオでは、ここでも理論により束縛されないが、ＩＬ−６が存在しない場合又はＩＬ−６が制限されている場合、ＩＬ−２１依存性の代替経路も、酵母ベースの免疫療法の結果としてＴＨ１７を誘導することができる可能性がある。ＩＬ−６の非存在が、最終的に、抑制されないＴｒｅｇの誘導に有利であると仮定すれば、抗原特異的ＣＤ８＋応答は、免疫の出現頻度と共に低下すると予想することができる。しかしながら、この理論と矛盾し、酵母ベースの免疫が複数の経路によりＴＨ１７を誘導するという概念を支持して、実施例５に記載の反復免疫に関する研究では、酵母ベースの免疫は、ＩＬ−６ノックアウトマウスにおいてでさえ、時間と共に持続性の免疫応答をもたらす。

【0298】

ＩＬ−６を欠く環境下でさえ、全酵母ベースの一次免疫後にＴｒｅｇ発生とＴＨ１７発生との間に逆相関が観察され（実施例３及び６を参照）、ＴＨ１応答の下方制御にＴｒｅｇが役割を果たすことを考慮して、酵母ベースの免疫療法又はｐａｍ２ｃｙｓ免疫療法による反復免疫の長期的結果を検討する。

【0299】

全酵母ベースの免疫はＣＤ８集団を誘導し、ＣＤ８集団は、第２の（図１２を参照）免疫の際に増殖及び持続し、第３の免疫の際に増殖及び持続を継続すると予想される。ＩＬ−１７産生ＣＤ４ Ｔ細胞は、各々の酵母ベースの免疫療法免疫後に増殖すると予想される。Ｔｒｅｇ出現頻度は、ＴＨ１７出現頻度と逆関連すると予想される。ＴＨ１７関連の酵母ベースの免疫後に観察されるＴｒｅｇの出現頻度と、反復免疫後の抗原特異的ＣＤ８発生の出現頻度との間に逆相関が存在するであろうということも予想される。

【0300】

ＴＨ１７は、他のＴ細胞サブセット発生に影響を及ぼす潜在的に自己継続的環境であると考えられる環境で増殖する。しかしながら、ＴＨ１７発生を支援する炎症促進性環境は、クラスＩ経路に対する抗原の交差提示及びその後のＣＤ８ Ｔ細胞発生を増強するＩ型インターフェロンの産生等の、抗炎症対抗手段にもシグナルを伝達する。実際、ＣＤ２８による同時刺激は、ＴＨ１７細胞の障害及びＴｈ１経路の促進を両方とも行うインターフェロン−γ及びＩＬ−２産生を増大させることができる。加えて、好中球のＩＬ−１７媒介性動員は、病原体を取り除き、ＴＨ１７の駆動に重要なＩＬ−６産生を低減させることができる。

【0301】

したがって、理論により束縛されないが、本発明者らは、特定の個体及び特定の疾患状態では、酵母ベースの免疫療法により誘導される応答等の、ＴＨ１７応答及びＴＨ１応答を同時に発生させる点に価値があり、ＴＨ１７は、Ｔｒｅｇを標的とすることにより最終的にＴＨ１応答を向上させることができ、並びに持続的な記憶ＣＤ８応答を促進するＩＬ−２１等のサイトカインを産生することができると考える。或いは、本発明者らが、酵母により標的とされるＴＨ１７／ＴＨ１経路を調節することによって、ＴＨ１７、ＴＨ１、Ｔｒｅｇ、及び／又はＣＤ８＋抗原特異的Ｔ細胞応答を上方制御又は下方制御することができることを示しているため、本明細書に記載の教示に基づき、酵母ベースの免疫療法により発生する応答を調節することによって「個別化された」手法又は「疾患に特異的な」手法が可能である。要約すると、酵母ベースの免疫療法の手法は、特定の個体又は特定の感染症又は他の疾患状態をより良好に治療するために個別化することができる複雑な相互作用に関して非常に多くの機会を提供する。

【0302】

実施例７
以下の例は、酵母ベースの免疫応答のＣＤ４依存性（ＴＨ１、ＴＨ１７）とインターフェロン非依存性との関係性を実証する。

【0303】

Ｉ型インターフェロンは、ＣＤ４依存性経路を阻害することができることが知られている（Ｇｕｏら、２００８年；Ｍｏｓｃｈｅｎら、２００８年；Ａｌｅｘａｎｄｅｒら、２０１０年；Ａｒｉｓｔｉｍｕｎｏら、２０１０年；Ａｘｔｅｌｌら、２０１０年）。したがって、本発明者らは、酵母誘導性のＣＤ４依存性経路が、インターフェロン非依存的様式で機能することができるか否かの決定を試みた。

【0304】

Ｉ型インターフェロン受容体の発現を欠損するように操作されたマウス（ＩＦＮαＲ−／−）を、実施例２に記載のように免疫し、図５に示されている実験に記載のようにｐａｍ３ｃｙｓで免疫したマウスと比較した。図１４に示されているデータは、ｐａｍ３ｃｙｓによりＷＴマウスで発生した四量体陽性細胞を１００％としたパーセントで表されている。結果は、酵母をｐａｍ３ｃｙｓと比較すると（１列目対２列目）、ＣＤ８ Ｔ細胞の発生が再現性よく低減されることを示し、Ｉ型インターフェロンに対する受容性を欠如するマウスでは結果に変化はなかった（３列目）。したがって、その点で、酵母ベースの免疫療法によりＩ型インターフェロン受容体ノックアウトマウスにＣＤ８ Ｔ細胞を発生させることは、発生するＣＤ８ Ｔ細胞の出現頻度に著しい影響を及ぼさない。これらの結果は、酵母ベースの免疫療法が、Ｉ型ＩＦＮ処置に依存せずにＣＤ ８応答を引き起こすことができ、これは、ＣＤ４ Ｔ細胞の存在下で及びＣＤ４ Ｔ細胞依存的に生じることを示す。したがって、酵母ベースの免疫療法は、明らかに、ＣＤ４依存性で、Ｉ型インターフェロン非依存性のプロセスである。酵母ベースの免疫療法に起因するＣＤ４非依存性経路を立証する根拠は、実施例２（図５）において提供されたが、「野生型ヒト」対象者が、遺伝学的に異種性であることに留意すると、野生型（ＣＤ４−「正常」）環境下で１つの経路が著しい様式で優勢であるか否かは明らかではない。

【0305】

実施例８
この例では、ＴＨ１７の直接的抗腫瘍活性、並びにＩＬ−６及び抗ＣＤ４０の寄与を評価する。

【0306】

ＴＨ１７細胞及びＩＬ−１７は、ごく最近抗腫瘍活性と関連付けられた。ＩＬ−１７は、直接的抗殺腫瘍活性を示す場合があり、ＩＬ−１７は、抗殺腫瘍性好中球を動員する。したがって、本発明者らは、酵母ベースの免疫療法剤が、ＴＨ１７を誘導する真菌としてのそれらの能力により、本質的に抗殺腫瘍性であり得ると考える。ＴＨ１７は、Ｔｒｅｇ発生を妨害することにより、間接的に抗腫瘍活性を示す可能性もある。これらの抗腫瘍特性は、抗ＣＤ４０抗体との同時処置で増強されると考えられる。抗ＣＤ４０抗体処置それ自体が、実質的な抗殺腫瘍効果を生じさせるとは報告されていないが、ＣＤ４０結合は、例えば、ＩＬ−１５の外来性供給源の存在下では又はＴＬＲアゴニストと組み合わせると抗殺腫瘍性である。

【0307】

抗ＣＤ４０抗体と組み合わせた酵母ベースの免疫療法免疫は、特異的及び非特異的抗腫瘍性ｉｎ ｖｉｖｏ ＣＴＬ活性を発生させる。本発明者らは、酵母ベースの組成物が、非特異的サイトカイン及びケモカイン関連抗殺腫瘍特性を有するＴＨ１７、並びにＣＤ８活性化及び増殖による特異的殺腫瘍能力を有するＴＨ１を誘導すると考える。ＣＤ４０結合の必要性は明らかではないが、ＡＰＣ活性の集中に影響する可能性が高い。以下の実験では、酵母ベースの免疫療法により誘導されたＣＴＬ活性を測定し、殺腫瘍特異性がＩＬ−６又は抗ＣＤ４０の存在によりどのような影響を受けるかを評価する。

【0308】

抗原特異的ｉｎ ｖｉｖｏ ＣＴＬ実験を、ＹＶＥＣ（空ベクター酵母）で免疫した動物及びＯＶＡＸで免疫した動物を用いて実施した。ＹＶＥＣで免疫した動物を、オボアルブミンを用いて及びオボアルブミンを用いずに免疫する。抗ＣＤ４０抗体の寄与も、この試薬を用いて及びこの試薬を用いずに免疫を実施することにより評価する。ＷＴ及びＩＬ−６ＫＯ免疫マウスを比較する。手短に言えば、免疫したマウスを評価して、マウスが、抗原（この場合は、オボアルブミン）を発現する標的腫瘍細胞に対する抗原特異的ＣＤ８＋ ＣＴＬ応答を発生するか否かを決定する。

【0309】

実施例９
以下の例には、ＴＨ１媒介性及び／又はＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を増強するための他の免疫調節剤の使用が記述されている。

【0310】

動物（ＷＴ及びＩＬ−６ノックアウトマウス）を、オボアルブミン又はＯＶＡＸと組み合わせた酵母等の酵母ベースの免疫療法剤で、抗ＣＤ４０を用いて又は用いずに、並びにＴＨ１７応答を下方制御する免疫調節物質、Ｔｒｅｇを下方制御する免疫調節物質、及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する免疫調節物質を用いて及び用いずに免疫する。免疫調節物質の投与は、野生型動物においてＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答を増強することになり、ＩＬ−６ＫＯ動物においてＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答を増強することもできることが予想される。

【0311】

実施例１０
以下の例には、ＴＨ１７免疫応答を下方制御する方法及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する方法を使用して産生された酵母の使用が記述されている。

【0312】

動物（ＷＴ及びＩＬ−６ノックアウトマウス）を、オボアルブミン又はＯＶＡＸと組み合わせた酵母等の酵母ベースの免疫療法剤で、抗ＣＤ４０を用いて又は用いずに免疫し、酵母は、そのような条件を用いずに産生された酵母と比較して、ＴＨ１７応答を下方制御する条件下で及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する条件下で産生されている。ＴＨ１免疫応答を増強する条件下で産生された酵母の投与は、野生型動物においてＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答を増強することになり、ＩＬ−６ＫＯ動物においてＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答を増強することもできることが予想される。

【0313】

実施例１１
以下の例には、癌を有する被験者においてＴＨ１媒介性及び／又はＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を増強するための免疫調節剤の使用が記述されている。

【0314】

癌を有する被験者を、１つ若しくは複数の癌抗原（例えば、被験者の癌により発現される癌抗原）及び／又はその免疫原性ドメインを発現する酵母等の、酵母ベースの免疫療法剤、並びにＴＨ１７応答を下方制御する作用剤、Ｔｒｅｇを下方制御する作用剤、及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する作用剤で免疫する。被験者は、化学療法、放射線、及び／又は腫瘍の外科的摘出等の癌の治療に有用な１つ又は複数の治療的処置を受けることもできる。酵母ベースの免疫療法剤は、作用剤及び／又は治療的処置と共に断続的に投与することができ、治療的処置及び／又は作用剤の投薬計画の前に又は後で投与することもできる。

【0315】

そのような作用剤は、以下のもののいずれか１つ又は複数から選択することができるがこれらに限定されない：抗ＩＬ−１又はＩＬ−１アンタゴニスト、抗ＩＬ−６又はＩＬ−６アンタゴニスト、抗ＩＬ−１７又はＩＬ−１７アンタゴニスト、抗ＩＬ−２１又はＩＬ−２１アンタゴニスト、抗ＩＬ−２２又はＩＬ−２２アンタゴニスト、抗ＩＬ−２３又はＩＬ−２３アンタゴニスト、ＩＬ−２５又はそのアゴニスト、ＩＬ−２７又はそのアゴニスト、ＦＯＸＰ３を阻止する作用剤、ＴＬＲ−２アゴニスト、ＴＬＲ−４アゴニスト、ＴＬＲ−７アゴニスト、及びＴＬＲ−９アゴニストを含むが、それらに限定されないＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニスト；抗炎症剤、免疫調節剤、及び／又は別の免疫療法ワクチン。

【0316】

酵母ベースの免疫療法剤及び作用剤の組み合わせを投与することにより、被験者のＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答が増強されることになり、それにより癌の１つ又は複数の症状が軽減され、例えば、腫瘍増殖が低減され、全身腫瘍組織量が低減され、及び／又は被験者の生存率が向上すると予想される。

【0317】

実施例１２
以下の例には、肝炎等のウイルス関連疾患を有する被験者においてＴＨ１媒介性及び／又はＣＤ８＋ Ｔ細胞応答を増強するための免疫調節剤の使用が記述されている。

【0318】

肝炎を有する被験者を、１つ若しくは複数の肝炎ウイルス抗原及び／又はその免疫原性ドメインを発現する酵母等の、酵母ベースの免疫療法剤、並びにＴＨ１７応答を下方制御する作用剤、Ｔｒｅｇを下方制御する作用剤、及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する作用剤で免疫する。被験者は、インターフェロン療法及び／又は抗ウイルス療法等の、肝炎の治療に有用な１つ又は複数の治療的処置を受けることもできる。酵母ベースの免疫療法剤は、作用剤及び／又は治療的処置と共に断続的に投与することができ、治療的処置及び／又は作用剤の投薬計画の前に又は後で投与することもできる。

【0319】

そのような作用剤は、以下のもののいずれか１つ又は複数から選択することができるがこれらに限定されない：抗ＩＬ−１又はＩＬ−１アンタゴニスト、抗ＩＬ−６又はＩＬ−６アンタゴニスト、抗ＩＬ−１７又はＩＬ−１７アンタゴニスト、抗ＩＬ−２１又はＩＬ−２１アンタゴニスト、抗ＩＬ−２２又はＩＬ−２２アンタゴニスト、抗ＩＬ−２３又はＩＬ−２３アンタゴニスト、ＩＬ−２５又はそのアゴニスト、ＩＬ−２７又はそのアゴニスト、ＦＯＸＰ３を阻止する作用剤、ＴＬＲ−２アゴニスト、ＴＬＲ−４アゴニスト、ＴＬＲ−７アゴニスト、及びＴＬＲ−９アゴニストを含むが、それらに限定されないＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニスト；抗炎症剤、免疫調節剤、及び／又は別の免疫療法ワクチン。

【0320】

酵母ベースの免疫療法剤及び作用剤の組み合わせを投与することにより、被験者のＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答が増強されることになり、それにより肝炎の１つ又は複数の症状が軽減される、例えば、ウイルス負荷量が低減される、及び／又は被験者の肝臓機能が改善されると予想される。

【0321】

実施例１３
以下の例には、ＴＨ１７免疫応答を下方制御する方法及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する方法を使用して産生された酵母の使用が記述されている。

【0322】

癌を有する被験者を、１つ若しくは複数の癌抗原（例えば、被験者の癌により発現される癌抗原）及び／又はその免疫原性ドメインを発現する酵母等の、酵母ベースの免疫療法剤で免疫する。酵母は、そのような条件を用いずに産生された酵母と比較して、ＴＨ１７応答を下方制御する条件下で及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する条件下で産生されている。被験者は、化学療法、放射線、及び／又は腫瘍の外科的摘出等の癌の治療に有用な１つ又は複数の治療的処置を受けることもできる。酵母ベースの免疫療法剤は、作用剤及び／又は治療的処置と共に断続的に投与することができ、治療的処置及び／又は作用剤の投薬計画の前に又は後で投与することもできる。

【0323】

修飾された酵母ベースの免疫療法剤を投与することにより、被験者のＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答が増強されることになり、それにより癌の１つ又は複数の症状が軽減され、例えば、腫瘍増殖が低減され、全身腫瘍組織量が低減され、及び／又は被験者の生存が増加されると予想される。

【0324】

実施例１４
以下の例には、肝炎等のウイルス関連疾患を有する被験者のＴＨ１７免疫応答を下方制御する方法及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する方法を使用して産生された酵母の使用が記述されている。

【0325】

肝炎の被験者を、１つ若しくは複数の肝炎ウイルス抗原及び／又はその免疫原性ドメインを発現する酵母等の、酵母ベースの免疫療法剤で免疫する。酵母は、そのような条件を用いずに産生された酵母と比較して、ＴＨ１７応答を下方制御する条件下で及び／又はＴＨ１免疫応答を上方制御する条件下で産生されている。被験者は、インターフェロン療法及び／又は抗ウイルス療法等の、肝炎の治療に有用な１つ又は複数の治療的処置を受けることもできる。酵母ベースの免疫療法剤は、作用剤及び／又は治療的処置と共に断続的に投与することができ、治療的処置及び／又は作用剤の投薬計画の前に又は後で投与することもできる。

【0326】

修飾された酵母ベースの免疫療法剤の組み合わせを投与することにより、被験者のＴＨ１及びＣＤ８ Ｔ細胞応答が増強されることになり、それにより肝炎の１つ又は複数の症状が軽減され、例えば、ウイルス負荷量が低減され、及び／又は被験者の肝臓機能が改善されると予想される。

【0327】

実施例１５
以下の例には、真菌性疾患を有する被験者のＴＨ１７ Ｔ細胞応答を増強するための免疫調節剤の使用が記述されている。

【0328】

アスペルギルス感染により引き起こされる疾患、コクシジオイデス・イミチスにより引き起こされる真菌性疾患、又はクリプトコックス関連状態等の真菌性疾患を有する被験者を、１つ又は複数の真菌抗原及び／又はその免疫原性ドメインを発現する酵母等の、酵母ベースの免疫療法剤、並びにＴＨ１７応答を上方制御する作用剤で免疫する。被験者は、真菌性疾患の治療に有用な１つ又は複数の治療的処置を受けることもできる。酵母ベースの免疫療法剤は、作用剤及び／又は治療的処置と共に断続的に投与することができ、治療的処置及び又は作用剤の投薬計画の前に又は後で投与することもできる。

【0329】

そのような作用剤は、以下のもののいずれか１つ又は複数から選択することができるがこれらに限定されない：ＩＬ−１又はそのアゴニスト、ＩＬ−６又はそのアゴニスト、ＩＬ−１７又はそのアゴニスト、ＩＬ−２１又はそのアゴニスト、ＩＬ−２２又はそのアゴニスト、ＩＬ−２３又はそのアゴニスト、抗ＩＬ−２５又はＩＬ−２５アンタゴニスト、抗ＩＬ−２７又はＩＬ−２７アンタゴニスト、Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アンタゴニスト、炎症促進性作用剤、又は更なる酵母を含んでいてもよい細菌性若しくは真菌性成分。

【0330】

疾患の１つ若しくは複数の症状の緩和により初期抗真菌免疫応答が観察された後、又は作用剤と共に約１〜５用量の酵母ベースの免疫療法をした後は、ＴＨ１型応答が個体に生じることを可能にするために、作用剤を更なる療法から除外する。

【0331】

酵母ベースの免疫療法剤及び作用剤の組み合わせを投与することにより、被験者のＴＨ１７ Ｔ細胞応答が増強されることになり、それにより真菌性疾患の１つ又は複数の症状が軽減される、例えば、真菌負荷量が低減され、及び／又は被験者の生存が増加されると予想される。

【0332】

実施例１６
以下の例は、酵母ベースの免疫療法に応答した末梢血リンパ球の増殖の測定を実証する。

【0333】

この例では、第Ｉ相変異型ｒａｓ癌臨床試験（Ｇｌｏｂｅｌｍｍｕｎｅ， Ｉｎｃ．社）の１人のヒト被験者のデータが示される。この実験では、被験者の末梢血リンパ球（ＰＢＬ）が、種々の刺激に応答して増殖する能力を評価した。手短に言えば、ＰＨＡ、カンジダ抽出物、及び２つの異なる濃度の酵母ベースの免疫療法組成物（「４０１６」と表記されている、組換え変異型ｒａｓ抗原を発現する熱死滅化サッカロマイセス・セレビシエ）に対する増殖について、酵母ベースの免疫療法組成物又はカンジダ抽出物の場合は培養開始の５日後、ＰＨＡの場合は３日後にチミジン取り込みを測定することにより、ＰＢＬを評価した。ほとんどの個体に由来するＰＢＬは、ＰＨＡに及びカンジダ酵母抽出物にも応答するであろうということが予想される。これらのデータは、この患者に由来するＰＢＬが、ｉｎ ｖｉｔｒｏでは酵母ベースの免疫療法剤に対して増殖しないが、ＰＨＡ及びカンジダ抽出物と接触すると強力に増殖することを明らかに示す。

【0334】

【表1】

次の例（表２）では、被験者が酵母ベースの免疫療法組成物（４０１６）で免疫された（ｉｎ ｖｉｖｏ）１週間後に、同じ被験者に由来するＰＢＬで実験を繰り返した。酵母ベースの免疫療法に対する患者の応答が、免疫の結果として発生したことは明らかである。

【0335】

【表2】

酵母ベースの免疫療法による免疫後に応答者となる、表１に詳述されている「不応答者」表現型は、種々の臨床試験で試験された被験者のおよそ２５％で観察される（データ非表示）。集団の５０％に相当する第２の表現型は、そのＰＢＬが免疫前にｉｎ ｖｉｔｒｏで酵母ベースの免疫療法組成物に応答し、免疫後に依然として応答者である被験者であることを特徴とする。被験者の最後の２５％は、免疫前に酵母ベースの免疫療法組成物に対してｉｎ ｖｉｔｒｏで増殖し、彼らのＴ細胞が、組成物による免疫後でさえ酵母ベースの免疫療法組成物に応答してｉｎ ｖｉｔｒｏで増殖を継続することができない不応答者である。「不応答者」という語は、酵母ベースの免疫療法剤との接触に応答したＰＢＬのｉｎ ｖｉｔｒｏでの増殖という状況で使用されるが、被験者が、治療剤としての酵母ベースの免疫療法に対して「不応答」であるということを必ずしも示すものではないことに留意されたい。実際、理論により束縛されないが、本発明者らは、これらの「非増殖体」は、実際には超ＴＨ１７応答者（強力な、高度な、又は非常に高度なＴＨ１７応答を生じる個体）である可能性が高く、ＴＨ１７微小環境が、真に不応答性ではなく、実際には抗増殖性の場合があると考える。言い換えれば、これらの個体では、ｉｎ ｖｉｔｒｏ（及びｉｎ ｖｉｖｏでも）で酵母ベースの組成物と接触することにより、ＴＨ１７細胞が活性化される可能性が最も高いが、ＴＨ１細胞は活性化されず（又はＴＨ１経路を犠牲にしてＴＨ１７経路に過剰傾倒する）、その一方で増殖アッセイでは、本来増殖性であることが知られているＴＨ１型ＣＤ４＋応答が測定される。ＴＨ１媒介性ＣＤ８免疫応答が有益であると考えられる場合（例えば、ウイルス、腫瘍、及び／又は細胞内病原体若しくは他の病原体に対する治療的免疫応答を誘発するという状況で）、そのような被験者は、ＴＨ１７応答を阻害する作用剤と共に酵母ベースの免疫療法を施す、特に良好な候補であり得る。

【0336】

実施例１７
以下の例は、酵母ベースの免疫療法の予測される免疫応答について被験者をスクリーニングする方法を実証する。

【0337】

末梢血単核細胞試料及び血清を、スクリーニングしようとする個体から収集する。血清試料を評価して、ＩＬ−１２と比べたＩＬ−１７及び／又はＩＬ−２３のレベルを決定するが、ＩＬ−１７及びＩＬ−２３は、ＴＨ１７サイトカインであるとみなされており、ＩＬ−１２は、ＴＨ１サイトカインであるとみなされている。凝固血から収集し、使用まで−８０℃で保管された血清を、ＩＬ−１２、ＩＬ−２３、及びＩＬ−１７の検出最低限界が、それぞれ１５．０、６．８、及び１５．０ｐｇ／ｍｌであるＨｕｍａｎ Ｑｕａｎｔｉｋｉｎｅ Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ社製のキット等の市販ＥＬＩＳＡキットで試験することになる。被験者を評価して、被験者のＴＨ１７及びＴＨ１レベルが、正常集団で予想されるレベルと異なるか否か、及び被験者が、高（より強い）若しくは低（弱い）ＩＬ−１７産生体又は「正常」ＩＬ−１７産生体に大まかに分類することができるか否かを決定することになる。被験者が、ＩＬ−１２をほとんど又は全く産生せず、刺激に応答してほぼ排他的なＴＨ１７応答を示すと考えられる別のカテゴリーである「非常に高い」ＩＬ−１７産生体を設定してもよい。血清プロファイルが、ＩＬ−１７又はＩＬ−１２について高い／強い対低い／弱いという明確な分類をもたらさない場合、ＩＬ−２３値が、分析を決定すると予想される。ＩＬ−２３は、ＩＬ−１２と重鎖を共有し、ＤＣにより産生され、ＴＨ１７持続性と相関する（Ｋｏｒｎら、２００９年により概説されている）。

【0338】

酵母ベースの免疫療法に応答して最も高い（強い）ＩＬ−１７活性を示す被験者は、ＩＦＮ非依存性ＣＤ４及びＩＬ−１２依存性経路に向かって偏っている免疫応答を示すであろうと予想される。反対に、より低い（弱い）又はよりバランスが保たれたＴＨ１７活性を示す被験者は、それほど優勢ではないＴＨ１７／ＴＨ１応答を示し、ＩＦＮ依存性ＣＤ４及びＩＬ−１２非依存性経路に向かってより偏っているであろう。

【0339】

別の実験では、採取された血液から収集した末梢血単核細胞を、フローサイトメトリー細胞内サイトカイン染色により、ＩＦＮ−γ又はＩＬ−１７の産生体であるＣＤ３＋ ＣＤ４＋細胞の相対的パーセント及びＣＤ３＋ ＣＤ８＋細胞の相対的パーセントについて表現型決定し、各細胞は、Ｃｈｅｎら、２０１０年に記載のようにイオノマイシンで短くパルスした後での細胞内染色により明確にされる。ＣＤ８ ＩＦＮ−γ ＥＬＩＳｐｏｔも実施する。ＩＬ−１７又はＩＬ−１２関連Ｔ細胞サイトカインＩＦＮ−γを産生するＴ細胞の出現頻度及び表現型を、ＩＦＮ−γ産生ＣＤ８＋ Ｔ細胞の出現頻度と同じように評価する。ＩＬ−１７及びＴＨ１７細胞と、ＩＬ−１２及びＩＦＮ−γ産生ＣＤ４ Ｔ細胞との間に相関性が発生する。

【0340】

ＴＨ１７及びＴｒｅｇは逆相関することが予想されるため、別の実験では、Ｔｒｅｇ細胞の出現頻度を、酵母ベースの免疫の関数として評価する。患者に由来する細胞を、ＴｒｅｇのマーカーとしてのＣＤ２５＋ ＦｏｘＰ３＋ ＣＤ４＋ Ｔ細胞について表現型決定する。

【0341】

別の実験では、患者末梢血リンパ球を、免疫の結果として酵母に応答してｉｎ ｖｉｔｒｏで増殖するそれらの能力について評価する。被験者は、実施例１６に記載のように少なくとも３つの集団に分類されるであろうと予測される：（１）以前に酵母ベースの免疫療法を受けたか否かに関わらず、そのリンパ球が、酵母に対してｉｎ ｖｉｔｒｏで常に増殖するもの、（２）アッセイ前に酵母ベースの免疫療法を受けた結果としてのみ、酵母に応答して増殖するもの、及び（３）処置したにも関わらず、酵母に対してｉｎ ｖｉｔｒｏで全く増殖しないもの。理論により束縛されないが、ＴＨ１７転写因子ＲＯＲγｔは、ＴＨ１７関連抗増殖促進性シグナル伝達をもたらす場合があるため、後者の集団は、ＴＨ１７超応答性集団（高い／強い、及び／又は非常に高い／非常に強いＴＨ１７応答者）を含むであろうと予測される。

【0342】

これらのアッセイでは、末梢血単核細胞（ＰＢＬ又はＰＢＭＣを表記されている）を末梢血から単離し、１ＰＢＬ当たり１０：１又は１：１酵母の比率の熱死滅化酵母と共に、１ウェル当たり３００，０００及び１５０，０００個の細胞（平均で約３０％のＣＤ３＋ Ｔ細胞を含有する）で培養する。２つの陽性対照には、カンジダ酵母抽出物、及びＴ細胞マイトジェン、フィトヘマグルチニン（ＰＨＡ）が含まれていてもよく、ほとんどの個体のＰＢＬは、それらに応答するはずである（実施例１６の表を参照）。

【0343】

上記の実施例１６のように、予防又は治療しようとする疾患、その疾患に最も効果的であると予測される免疫応答のタイプ、及び個体が、他の介入なしで酵母ベースの免疫療法に応答して生じさせると予想される免疫応答のタイプを考慮すると、個体のＴＨ１７型応答性のレベル及びＴＨ１型応答性のレベル（又はこの２つの応答の比率）を確立することにより、酵母ベースの免疫療法を使用してどの程度最も良好に個体を治療することができるかを決定することができる。したがって、治療プロトコールを改良して、最も有利であり、有益であり、及び／又は治療的である応答が、特定の個体及び特定の疾患又は状態に対して誘発され、酵母ベースの免疫療法の結果の向上を保証することができる。

【0344】

本発明の種々の実施形態が詳細に記述されているが、当業者であれば、それら実施形態の改変及び応用を企図するであろうということは明白である。しかしながら、そのような改変及び応用は、添付の特許請求の範囲に示されている本発明の範囲内であることが明示的に理解されるべきである。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【図9】

【図10】

【図11】

【図12】

【図13】

【図14】

【配列表】

[この文献には参照ファイルがあります.J-PlatPatにて入手可能です(IP Forceでは現在のところ参照ファイルは掲載していません)]