特許 5963678 病状を治療するためのアンチセンス分子及び方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】5963678

(24)【登録日】2016年7月8日

(45)【発行日】2016年8月3日

(54)【発明の名称】病状を治療するためのアンチセンス分子及び方法

(51)【国際特許分類】

   C12N 15/113 20100101AFI20160721BHJP

   A61P 21/04 20060101ALI20160721BHJP

   A61K 31/7105 20060101ALI20160721BHJP

   A61K 48/00 20060101ALI20160721BHJP

【ＦＩ】

   C12N15/00 GZNA

   A61P21/04

   A61K31/7105

   A61K48/00

【請求項の数】71

【全頁数】65

(21)【出願番号】特願2012-538147(P2012-538147)

(86)(22)【出願日】2010年11月12日

(65)【公表番号】特表2013-510561(P2013-510561A)

(43)【公表日】2013年3月28日

(86)【国際出願番号】AU2010001520

(87)【国際公開番号】WO2011057350

(87)【国際公開日】20110519

【審査請求日】2013年11月12日

(31)【優先権主張番号】2009905549

(32)【優先日】2009年11月12日

(33)【優先権主張国】AU

(73)【特許権者】

【識別番号】512123662

【氏名又は名称】ジ ユニバーシティ オブ ウェスタン オーストラリア

(74)【代理人】

【識別番号】100107515

【弁理士】

【氏名又は名称】廣田 浩一

(74)【代理人】

【識別番号】100107733

【弁理士】

【氏名又は名称】流 良広

(74)【代理人】

【識別番号】100115347

【弁理士】

【氏名又は名称】松田 奈緒子

(72)【発明者】

【氏名】スティーブン・ウィルトン

(72)【発明者】

【氏名】スー・フレッチャー

(72)【発明者】

【氏名】アビー・アダムス

(72)【発明者】

【氏名】ペニー・メロニ

【審査官】 鳥居 敬司

(56)【参考文献】

【文献】 国際公開第２００６／００００５７（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 国際公開第２００９／１０１３９９（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 国際公開第２０１０／０４８５８６（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 国際公開第２００９／０５４７２５（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 国際公開第２００４／０８３４４６（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 国際公開第２００７／１３５１０５（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 中国特許出願公開第２５０７１２５（ＣＮ，Ａ）

【文献】 国際公開第２０１０／１２３３６９（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 Molecular Therapy, 2007, Vol.15, No.7, p.1288-1296

(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）

Ｃ１２Ｎ １５／００−１５／９０

ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）

ＣＡｐｌｕｓ／ＲＥＧＩＳＴＲＹ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ（ＳＴＮ）

ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ／ＤＤＢＪ／ＧｅｎｅＳｅｑ

ＷＰＩＤＳ／ＷＰＩＸ（ＳＴＮ）

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

下記（ｉ）〜（ｘｖｉｉ）からなる群から選択されるアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
（ｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０９＋２５）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３４塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋２５）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｉｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０６＋２５）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｉｖ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−１２＋１９）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｖ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋１９）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２２塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｖｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０９＋１９）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｖｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０９＋１６）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２５塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｖｉｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−１２＋１６）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｉｘ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−１０＋２０）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３０塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０８＋１９）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２７塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０７＋２５）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３２塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−１２＋２２）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３４塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｉｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０９＋２２）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｉｖ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０６＋２２）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｖ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０６＋２８）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３４塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｖｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋２２）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２５塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、及び
（ｘｖｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋２８）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、エキソン４５のスキッピングを誘導するアニーリング部位に特異的に結合し、
前記エキソン４５標的領域が、下記式で表されることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。
Ｈ４５Ａ（ｘ ｙ）・・・（式）
「Ｈ」は、ヒトを示し、「４５」は、標的ジストロフィンエキソン番号４５を表し、「Ａ」は、エキソンの最初のアクセプタースプライス部位を示し、（ｘ ｙ）は、「−」又は「＋」がそれぞれイントロン配列又はエキソン配列を示すアニーリング座標を表す。

【請求項2】

アンチセンスオリゴヌクレオチドが、５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、Ｎ−２置換プリン、Ｎ−６置換プリン、及びＯ−６置換プリンから選択されるヌクレオ塩基修飾又は置換を含む請求項１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項3】

下記（ｉｉ）、（ｖ）、（ｘｖｉ）及び（ｘｖｉｉ）からなる群から選択される請求項１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、
（ｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋２５）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｖ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋１９）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２２塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｖｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋２２）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な２５塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド、
（ｘｖｉｉ）標的領域がアニーリング部位Ｈ４５Ａ（−０３＋２８）である、ヒトジストロフィンプレｍＲＮＡのエキソン４５標的領域と１００％相補的な３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド。

【請求項4】

配列番号１１、５５、６１〜６６、２２８、２３０、２３１、２３７、２３９、２４２、２４３、２４４、及び２４５で表される塩基配列から選択される塩基配列からなる請求項１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項5】

５−置換ピリミジンを含む請求項４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項6】

下記（ｉ）〜（ｘｖｉｉ）からなる群から選択される塩基配列からなるアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
（ｉ） ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：１１）、
（ｉｉ） ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：５５）、
（ｉｉｉ） ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡ（配列番号：６１）、
（ｉｖ） ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡＣＣ（配列番号：６２）、
（ｖ） ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：６３）、
（ｖｉ） ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：６４）、
（ｖｉｉ） ＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：６５）、
（ｖｉｉｉ） ＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡＣＣ（配列番号：６６）、
（ｉｘ） ＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡ（配列番号：２２８）、
（ｘ） ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡ（配列番号：２３０）、
（ｘｉ） ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧ（配列番号：２３１）、
（ｘｉｉ） ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡＣＣ（配列番号：２３７）、
（ｘｉｉｉ） ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：２３９）、
（ｘｉｖ） ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡ（配列番号：２４２）、
（ｘｖ） ＧＣＣＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＡＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡ（配列番号：２４３）、
（ｘｖｉ） ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：２４４）、及び
（ｘｖｉｉ） ＧＣＣＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：２４５）、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含むことを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項7】

３００ｎＭ以下の濃度でエキソンスキッピングを誘導する請求項１から６のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項8】

２５ｎＭ以下の濃度でエキソンスキッピングを誘導する請求項１から６のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項9】

ＲＮａｓｅＨを活性化しない請求項１から８のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項10】

骨格のヌクレオシド間連結が、自然界には存在しないヌクレオシド間連結で置換された請求項１から９のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項11】

自然界には存在しないヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェートである請求項１０に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項12】

修飾ホスフェートが、メチルホスホネート、メチルホスホロチオエート、ホスホロモルホリデート、ホスホロピペラジデート、及びホルホロアミデートからなる群から選択される請求項１１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項13】

ペプチド核酸である請求項１から８のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項14】

アンチセンスオリゴヌクレオチドの活性、細胞内分布、又は細胞内取り込みを高める１以上の部分又はコンジュゲートが化学的に連結された請求項１から１３のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項15】

ポリエチレングリコール鎖が化学的に連結された請求項１４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項16】

請求項１から１５のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩の少なくともいずれかと、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項17】

筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項１から１５のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項１６に記載の組成物。

【請求項18】

筋ジストロフィーが、デュシェンヌ型筋ジストロフィーである請求項１７に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩又は組成物。

【請求項19】

筋ジストロフィーを調節する医薬を製造するための請求項１から１５のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩の使用。

【請求項20】

エキソン４５のスキッピングの誘導に使用するための請求項１から１５のいずれかに記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩の少なくともいずれかを含むことを特徴とする組成物。

【請求項21】

塩基配列：ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：１１）を含む３４塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項22】

塩基配列：ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：５５）を含む２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項23】

塩基配列：ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡ（配列番号：６１）を含む３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項24】

塩基配列：ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡＣＣ（配列番号：６２）を含む３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項25】

塩基配列：ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：６３）を含む２２塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項26】

塩基配列：ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：６４）を含む２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項27】

塩基配列：ＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：６５）を含む２５塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項28】

塩基配列：ＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡＣＣ（配列番号：６６）を含む２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項29】

塩基配列：ＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡ（配列番号：２２８）を含む３０塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項30】

塩基配列：ＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡ（配列番号：２３０）を含む２７塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項31】

塩基配列：ＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧ（配列番号：２３１）を含む３２塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項32】

塩基配列：ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵＡＣＣ（配列番号：２３７）を含む３４塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項33】

塩基配列：ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡＧＡＵ（配列番号：２３９）を含む３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項34】

塩基配列：ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡ（配列番号：２４２）を含む２８塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項35】

塩基配列：ＧＣＣＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＡＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧＵＡＡ（配列番号：２４３）を含む３４塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項36】

塩基配列：ＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：２４４）を含む２５塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項37】

塩基配列：ＧＣＣＧＣＵＧＣＣＣＡＡＵＧＣＣＡＵＣＣＵＧＧＡＧＵＵＣＣＵＧ（配列番号：２４５）を含む３１塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩であって、
前記アンチセンスオリゴヌクレオチドの塩基配列が、５−置換ピリミジン塩基を含み、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドのそれぞれのヌクレオシド間連結が、修飾ホスフェート結合であり、前記アンチセンスオリゴヌクレオチドが、ポリエチレングリコール鎖と化学的に連結されていることを特徴とするアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩。

【請求項38】

請求項２１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項39】

請求項２２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項40】

請求項２３に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項41】

請求項２４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項42】

請求項２５に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項43】

請求項２６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項44】

請求項２７に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項45】

請求項２８に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項46】

請求項２９に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項47】

請求項３０に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項48】

請求項３１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項49】

請求項３２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項50】

請求項３３に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項51】

請求項３４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項52】

請求項３５に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項53】

請求項３６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項54】

請求項３７に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩と、薬学的に許容できる担体とを含むことを特徴とする組成物。

【請求項55】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項３８に記載の組成物。

【請求項56】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項３９に記載の組成物。

【請求項57】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２３に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４０に記載の組成物。

【請求項58】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４１に記載の組成物。

【請求項59】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２５に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、は請求項４２に記載の組成物。

【請求項60】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４３に記載の組成物。

【請求項61】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２７に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４４に記載の組成物。

【請求項62】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２８に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４５に記載の組成物。

【請求項63】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項２９に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４６に記載の組成物。

【請求項64】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３０に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４７に記載の組成物。

【請求項65】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３１に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４８に記載の組成物。

【請求項66】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３２に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項４９に記載の組成物。

【請求項67】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３３に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項５０に記載の組成物。

【請求項68】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３４に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項５１に記載の組成物。

【請求項69】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３５に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項５２に記載の組成物。

【請求項70】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３６に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項５３に記載の組成物。

【請求項71】

デュシェンヌ型筋ジストロフィーの治療方法に使用するための請求項３７に記載のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はその薬学的に許容できる塩、又は請求項５４に記載の組成物。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

本発明は、エキソンスキッピングを促進するのに好適な新規アンチセンス化合物及び組成物に関する。また、新規アンチセンス化合物を用いてエキソンスキッピングを誘導する方法、及び本発明の方法において使用するのに適した治療用組成物も提供する。

【背景技術】

【0002】

背景技術に関する以下の議論は、本発明に関する理解を促進することのみを意図するものである。以下の議論は、言及される資料がいずれも本願の優先日の時点における一般的な知見の一部である又はあったことを承認又は容認するものではない。

【0003】

現在、遺伝子中の疾患を引き起こす突然変異を抑制又は補償する方法の研究に多大な労力が費やされている。様々な異なるレベル（転写、スプライシング、安定性、翻訳）で遺伝子の発現に影響を与える様々な化学作用を用いるアンチセンス技術が開発されている。このような研究の多くは、無数の異なる症状における異常な遺伝子又は疾患に関連する遺伝子を補正又は補償するためのアンチセンス化合物の使用に注力している。

【0004】

アンチセンス分子は、高度に特異的に遺伝子の発現を阻害することができるので、遺伝子発現の調節因子としてのオリゴヌクレオチドに関する多くの研究努力は、癌遺伝子又はウイルス遺伝子等の標的遺伝子の発現の阻害に焦点を当てている。アンチセンスオリゴヌクレオチドは、ＲＮＡ（センス鎖）又はＤＮＡのいずれかを対象とし、これらと三重鎖構造を形成してＲＮＡポリメラーゼＩＩによる転写を阻害する。

【0005】

特定の遺伝子のダウンレギュレーションにおいて望ましい効果を達成するために、前記オリゴヌクレオチドは、標的ｍＲＮＡの崩壊を促進するか又は前記ｍＲＮＡの翻訳をブロックして、望ましくない標的タンパク質のデノボ合成を有効に防がなければならない。

【0006】

ネイティブタンパク質の生成をアップレギュレートすることを目的とする場合、又はナンセンス突然変異若しくはフレームシフト突然変異等の翻訳の早期終結を誘導する突然変異を補償することを目的とする場合、かかる技術は有用ではない。

【0007】

更に、タンパク質中に存在する突然変異が原因で正常に機能するタンパク質が早期終結する場合、アンチセンス技術を用いて幾つかの機能的なタンパク質生成を修復するための手段が、スプライシングプロセス中の干渉を通して可能であることが示されている（非特許文献１〜３）。これらの場合、不完全な遺伝子転写産物が分解の標的となってはならないので、アンチセンスオリゴヌクレオチドの化学的性質によって標的ｍＲＮＡの崩壊が促進されてはならない。

【0008】

様々な遺伝子疾患において、遺伝子の最終的な発現に対する突然変異の影響は、スプライシングプロセス中に標的とするエキソンをスキッピングするプロセスを通して調節することができる。スプライシングプロセスは、プレｍＲＮＡ中の隣接するエキソン−イントロン接合を近接させる複合体多粒子機構により導かれ、イントロン末端のホスホジエステル結合を切断し、その後、共にスプライシングされるエキソン間を再編成する。この複雑且つ高度に正確なプロセスは、プレｍＲＮＡ中の配列モチーフによって媒介され、前記配列モチーフは、後にスプライシング反応に関与する様々な核スプライシング因子に結合する比較的短い半保存的ＲＮＡセグメントである。プレｍＲＮＡに関与するモチーフをスプライシング機構が読み取る又は認識する方法を変化させることによって、様々にスプライシングされたｍＲＮＡ分子を作製することが可能である。現在、ヒト遺伝子の大部分が、正常な遺伝子発現中にオルタナティブスプライシングされることが認められているが、それを引き起こす機序は同定されていない。アンチセンスオリゴヌクレオチドを用いて、コードされているｍＲＮＡにおけるエラー及び欠失をバイパスしたり、マチュアな遺伝子転写産物から除去したりできることが示されている。

【0009】

自然界では、スプライシングプロセスにおける遺伝子欠損、即ちエキソンスキッピングの程度は、完全には理解されていないが、一般的に非常に低いレベルで生じているという例が多く報告されている（非特許文献４）。しかし、疾患を引き起こす突然変異に関連しているエキソンが幾つかの遺伝子から特異的に欠損している場合、ネイティブなタンパク質と類似の生物学的性質を有するか、又は標的エキソンに関連する突然変異によって引き起こされる疾患を寛解させるのに十分な生物活性を有する短いタンパク質産物が生成される場合があることが認められている（非特許文献５及び６）。

【0010】

このターゲティングされたエキソンスキッピングプロセスは、多くのエキソン及びイントロンが存在するか、エキソンの遺伝子構成に重複性が存在するか、又はタンパク質が１以上の特定のエキソンなしでも機能することが可能である長い遺伝子において特に有用である可能性がある（例えば、７９エキソンからなるジストロフィン遺伝子；恐らく、反復する配列ブロックをコードする幾つかのコラーゲン遺伝子、又はそれぞれ−８０及び３７０超のエキソンからなる巨大なネブリン若しくはタイチン遺伝子）。

【0011】

様々な遺伝子における突然変異によって引き起こされる先端切断に関連する遺伝子疾患を治療するために遺伝子のプロセシングを再指示しようとする試みは、（１）スプライシングプロセスに関与するエレメントと完全に又は部分的に重複しているか；或いは（２）そのエレメントで生じる特定のスプライシング反応を正常に媒介するスプライシング因子の結合及び機能を破壊するためにエレメントに十分近接している位置でプレｍＲＮＡに結合する（例えば、ブロックされるエレメントから３、６、又は９ヌクレオチド以内の位置でプレｍＲＮＡに結合する）アンチセンスオリゴヌクレオチドの使用に焦点を当てている。

【0012】

例えば、突然変異型ジストロフィンのプレｍＲＮＡスプライシングのアンチセンスオリゴヌクレオチドによる調節は、インビトロ及びインビボの両方で報告されている。日本で報告されたジストロフィン突然変異のうちの１種では、５２塩基対の欠失突然変異によって、隣接するイントロンと共にエキソン１９がスプライシングプロセス中に除去される（非特許文献７）。インビトロにおけるミニ遺伝子のスプライシングシステムを用いて、ジストロフィン神戸のエキソン１９における欠失配列のうち５’側の半分に対して相補的な３１塩基の２’−Ｏ−メチルオリゴヌクレオチドが、野生型のプレｍＲＮＡのスプライシングを阻害することが示されている（非特許文献８）。同じヌクレオチドを用いて、ヒトのリンパ芽球様培養細胞におけるネイティブなジストロフィン遺伝子転写産物からエキソンスキッピングが誘導された。

【0013】

非特許文献９には、筋ジストロフィーのモデルであるｍｄｘマウス突然変異体における突然変異型ジストロフィンのエキソン２３の周囲で行われるスプライシングについて分析するためのインビトロコンストラクトについて記載されている。マウスのジストロフィンのエキソン２３内又はそれに隣接する部位をスプライシングすることを標的とする２’修飾オリゴヌクレオチドを用いて、インビトロにおいてこれらコンストラクトを分析するための計画について検討したが、標的部位又は配列は得られなかった。

【0014】

その後、このグループから、２’−Ｏ−メチルオリゴリボヌクレオチドが、ｍｄｘマウスに由来する筋芽細胞におけるジストロフィン欠損を補正することが報告された。マウスのジストロフィンのイントロン２２の３’スプライス部位を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドが突然変異型エキソン及び幾つかの隣接するエキソンのスキッピングを引き起こすことが報告され、新たな内部欠損を有する新規インフレームジストロフィン転写産物が作製された。この突然変異型ジストロフィンは、アンチセンスで処理されたｍｄｘ筋管の１％〜２％で発現した。２’−Ｏ−メトキシエチルホスホジエステル等の他のオリゴヌクレオチド修飾の使用も記載されている（非特許文献１０）。

【0015】

したがって、アンチセンス分子は、デュシェンヌ型筋ジストロフィー（ＤＭＤ）等の遺伝子疾患の治療におけるツールを提供することができる。しかし、アンチセンス分子を用いてエキソンスキッピングを誘導しようとする試みは、必ずしも成功している訳ではない。

【0016】

ジストロフィンプレｍＲＮＡからエキソン１９をスキッピングすることに成功したジストロフィンのエキソン１９に関する研究は、非特許文献１１に記載されている通り、隣接するスプライス部位又はエキソンの定義に関与するエキソン内のモチーフを対象とする様々なアンチセンス分子を用いて達成された。

【0017】

エキソン１９のスキッピングが一見容易であるのとは対照的に、非特許文献１０によるｍｄｘマウスにおけるエキソン２３のスキッピングの最初の報告は、現在、真のアンチセンス活性ではなく、自然に生じる復帰突然変異転写産物又はアーティファクトを報告しただけであると考えられている。更に、エキソン２３を欠く転写産物が一貫して生成される訳ではなく、非特許文献１０は、誘導されたエキソンスキッピングの任意の経時変化、或いはエキソンスキッピングのレベルがアンチセンスオリゴヌクレオチドの量の増加又は減少に対応する用量依存的な効果を示すためのアンチセンスオリゴヌクレオチドの用量設定さえも示していなかった。更に、この成果は、他の研究者によって再現することができなかった。

【0018】

ｍｄｘマウスモデルにおける特異的且つ再現可能なエキソンスキッピングの最初の例は、非特許文献２に報告されている。アンチセンス分子をドナースプライス部位に導くことによって、培養細胞の処理後６時間以内にジストロフィンｍＲＮＡにおいて一貫した効率的なエキソン２３のスキッピングが誘導された。また、非特許文献２は、より長いアンチセンスオリゴヌクレオチドによるマウスのジストロフィンプレｍＲＮＡのアクセプター領域のターゲティングについて記載しており、非特許文献１０に公開されている結果を再現することはできないと述べている。イントロン２２のアクセプタースプライス部位を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドの選択を用いて、エキソン２３のみ又は幾つかの隣接するエキソンを複数除去するエキソンスキッピングを再現可能に検出することはできなかった。

【0019】

イントロン２３のドナースプライス部位を対象とする第１のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、一次培養筋芽細胞において一貫してエキソンスキッピングを誘導したが、この化合物は、高レベルのジストロフィンを発現する不死化細胞培養物においてそれほど効率的ではないことが見出された。しかし、正確なターゲティング及びアンチセンスオリゴヌクレオチド設計を行うことにより、特定のエキソンを除去する効率が大幅に上昇した（非特許文献１２を参照されたい）。

【0020】

したがって、標的ヌクレオチド配列に結合し、スプライシングを調節することができるアンチセンスオリゴヌクレオチドを提供することが必要とされている。スプライシングに重要であると推定されるモチーフにアンチセンスオリゴヌクレオチドを単に導くだけで、治療設定におけるその化合物の有効性が保証される訳ではない。

【0021】

本発明の背景に関する前述の議論は、本発明に関する理解を促進することのみを意図する。この議論は、言及される資料がいずれも本願の優先日の時点における一般的な知見の一部である又はあったことを承認又は容認するものではないことを理解すべきである。

【先行技術文献】

【非特許文献】

【0022】

【非特許文献1】Ｓｉｅｒａｋｏｗｓｋａ Ｈ，ｅｔ ａｌ．，（１９９６）Ｐｒｏｃ Ｎａｔｌ Ａｃａｄ Ｓｃｉ ＵＳＡ ９３，１２８４０−１２８４４

【非特許文献2】Ｗｉｌｔｏｎ ＳＤ，ｅｔ ａｌ．，（１９９９）Ｎｅｕｒｏｍｕｓｃ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ ９，３３０−３３８

【非特許文献3】ｖａｎ Ｄｅｕｔｅｋｏｍ ＪＣ ｅｔ ａｌ．，（２００１）Ｈｕｍａｎ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔ １０，１５４７−１５５４

【非特許文献4】Ｓｈｅｒｒａｔ ＴＧ， ｅｔ ａｌ．，（１９９３）Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ５３，１００７−１０１５

【非特許文献5】Ｌｕ ＱＬ， ｅｔ ａｌ．，（２００３）Ｎａｔｕｒｅ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ９，１００９−１０１４

【非特許文献6】Ａａｒｔｓｍａ−Ｒｕｓ Ａ ｅｔ ａｌ．，（２００４）Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ ７４： ８３−９２

【非特許文献7】Ｍａｔｓｕｏ ｅｔ ａｌ．，（１９９１）Ｊ Ｃｌｉｎ Ｉｎｖｅｓｔ．８７：２１２７−２１３１

【非特許文献8】Ｔａｋｅｓｈｉｍａ ｅｔ ａｌ．（１９９５），Ｊ Ｃｌｉｎ． Ｉｎｖｅｓｔ．９５：５１５−５２０

【非特許文献9】Ｄｕｎｃｋｌｅｙ ｅｔ ａｌ．（１９９７）Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ＆Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，１６，１６６５−１６６８

【非特許文献10】Ｄｕｎｃｋｌｅｙ ｅｔ ａｌ．（１９９８）Ｈｕｍａｎ Ｍｏｌ．Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，５：１０８３−９０

【非特許文献11】Ｅｒｒｉｎｇｔｏｎ ｅｔ ａｌ．（２００３）Ｊ Ｇｅｎ Ｍｅｄ ５：５１８−５２７

【非特許文献12】Ｍａｎｎ ＣＪ ｅｔ ａｌ．，（２００２）Ｊ Ｇｅｎ Ｍｅｄ ４，６４４−６５４

【発明の概要】

【発明が解決しようとする課題】

【0023】

本発明は、プレｍＲＮＡのスプライシングに関与するＲＮＡモチーフに結合するのに好適なアンチセンス分子化合物及び組成物であって、特異的且つ効率的にエキソンスキッピングを誘導可能であるアンチセンス分子化合物及び組成物、並びにその使用方法を提供する。

【0024】

標的の選択は、エキソンスキッピングの効率、延いては後に行われる可能性のある治療法への応用において重要な役割を果たす。スプライシングに関与すると推定されるプレｍＲＮＡの標的領域に対するアンチセンス分子を単に設計するだけでは、効率的且つ特異的なエキソンスキッピングを誘導するという保証は得られない。スプライシング干渉に関して最も明らか又は容易に定義される標的は、ドナー及びアクセプタースプライス部位であるが、例えばエキソンスプライシングエンハンサーエレメント、サイレンシングエレメント、及びブランチポイント等のそれほど明確に定義又は保存されていないモチーフも存在する。アクセプター及びドナースプライス部位は、それぞれ約１６塩基及び約８塩基のコンセンサス配列を有する（エキソン認識、イントロン除去、及びスプライシングプロセスに関与するモチーフ及びドメインの概略については図１を参照されたい）。

【課題を解決するための手段】

【0025】

第１の態様によれば、本発明は、選択された標的に結合してエキソンスキッピングを誘導可能であるアンチセンス分子を提供する。

【0026】

例えば、ジストロフィン遺伝子転写産物においてエキソン５、１２、１７、２１、２２、２４、４３〜４７、４９、５０、５４〜６４、６６、６７、７０、及び７２のエキソンスキッピングを誘導するためには、表１Ａに列記される群からアンチセンス分子を選択することが好ましい。

【0027】

更なる例では、本発明の２以上のアンチセンスオリゴヌクレオチドを共に組み合わせて、エキソン３、４、８、１０、２６、３６、４８、６０、６６、及び６８においてより効率的にエキソンスキッピングを誘導することが可能である。アンチセンスオリゴヌクレオチドの組み合わせ、即ち「カクテル」は、エキソンに導かれて、効率的にエキソンスキッピングを誘導する。

【0028】

第２の態様によれば、本発明は、遺伝子障害の予防的処置又は治療的処置に役立つように選択されるか又は前記処置に適するアンチセンス分子であって、患者に送達するのに好適な形態の少なくとも１つのアンチセンス分子を含むアンチセンス分子を提供する。

【0029】

第３の態様によれば、本発明は、特定のタンパク質をコードする遺伝子に突然変異が存在し、前記突然変異の作用をエキソンスキッピングにより取り消すことができる遺伝子疾患に罹患している患者を治療する方法であって、（ａ）本明細書に記載される方法に従ってアンチセンス分子を選択する工程と、（ｂ）かかる治療を必要としている患者に前記分子を投与する工程とを含む方法を提供する。

【0030】

また、本発明は、遺伝子疾患を治療する医薬を製造するための本発明の精製及び単離アンチセンスオリゴヌクレオチドの使用を提供する。

【0031】

更に、本発明は、デュシェンヌ型筋ジストロフィーに特徴的な症状を治療する方法であって、患者の特定の遺伝子病変に関連する適切に設計された治療に有効な量の本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドを、治療を必要としている患者に投与することを含む方法を提供する。更に、本発明は、患者を予防的に処置して、デュシェンヌ型筋ジストロフィーを予防するか又は少なくとも最小化する方法であって、治療に有効な量のアンチセンスオリゴヌクレオチド又はこれら生物学的な分子のうちの１以上を含む医薬組成物を患者に投与する工程を含む方法を提供する。

【0032】

また、本発明は、遺伝子疾患を治療するためのキットであって、好適な容器に包装されている本発明のアンチセンスオリゴヌクレオチドと、その使用説明書とを少なくとも含むキットを提供する。

【0033】

本発明の他の態様及び利点は、以下の記載を吟味することにより当業者に明らかになるであろう。以下の図を参照して説明を進める。

【図面の簡単な説明】

【0034】

【図1】図１は、エキソン認識、イントロン除去、及びスプライシングプロセスに関与するモチーフ及びドメインの概略図である。

【図2】図２は、疾患を引き起こす突然変異をバイパスするためにエキソンスキッピングを誘導するアンチセンスオリゴヌクレオチドの概念図である（縮尺は正確でない）。斜線付きボックスは、ｍＲＮＡの残りがタンパク質に翻訳されるのを妨げる突然変異を有するエキソンを表す。黒いバーは、マチュアなｍＲＮＡにそのエキソンが含まれるのを妨げるアンチセンスオリゴヌクレオチドを表す。

【図3】図３は、正常なヒト筋肉培養細胞において１０ｎＭのトランスフェクション濃度で強力且つ一貫してエキソンスキッピングを誘導するエキソン３を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図4】図４は、正常なヒト筋肉培養細胞において２５ｎＭのトランスフェクション濃度で強力且つ一貫してエキソンスキッピングを誘導するエキソン４を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図5】図５は、エキソンスプライシングエンハンサーエレメントであると推定されるエキソン５の内部ドメインを対象とするアンチセンス分子［Ｈ５Ａ（＋３５＋６５）］を用いる強力且つ効率的なヒトのエキソン５のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。この好ましい化合物は、ヒト筋肉培養細胞における２５ｎＭのトランスフェクション濃度で一貫してエキソンスキッピングを誘導する。

【図6】図６は、正常なヒト筋肉培養細胞において１０ｎＭのトランスフェクション濃度でエキソン８及びエキソン８／９の両方に対して強力且つ一貫してエキソンスキッピングを誘導する、エキソン８を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図7】図７は、エキソン１０及び周囲のエキソンのスキッピングを誘導する様々なカクテル及び単一のアンチセンス分子を示すゲル電気泳動像である。［Ｈ１０Ａ（−０５＋１６）］及び［Ｈ１０Ａ（＋９８＋１１９）］の組み合わせ又は［Ｈ１０Ａ（−０５＋１６）］及び［Ｈ１０Ａ（＋１３０＋１４９）］の組み合わせは、エキソン１０及びエキソン９〜１２のスキッピングを誘導するが、［Ｈ１０Ａ（−０５＋１６）］単独ではエキソン９〜１４のスキッピングを誘導する。

【図8】図８は、エキソン１４を対象とするアンチセンス分子Ｈ１４Ａ（＋３１＋６１）を用いるエキソン１４のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図9】図９は、エキソン１７を対象とするアンチセンス分子Ｈ１７Ａ（＋１０＋３５）を用いるエキソン１７のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図10】図１０は、エキソン２６を対象とするアンチセンス分子の２つのカクテルを示すゲル電気泳動像である。［Ｈ２６Ａ（−０７＋１９）］及び［Ｈ２６Ａ（＋２４＋５０）］のダブルカクテルは、エキソン２６のスキッピングを良好に誘導し、前記カクテルに更にアンチセンス分子を添加してもスキッピング効率は影響を受けない。

【図11】図１１は、正常なヒト筋肉培養細胞において２５ｎＭのトランスフェクション濃度で強力且つ一貫してエキソンスキッピングを誘導する、エキソン３６を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図12】図１２は、アンチセンス分子Ｈ４３Ａ（＋９２＋１１７）を用いて正常なヒト筋肉培養細胞における２５ｎＭのトランスフェクション濃度で強力且つ一貫してエキソン４３のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図13】図１３は、アンチセンス分子Ｈ４４Ａ（＋６５＋９０）を用いる用量依存的なエキソン５５のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図14】図１４は、アンチセンス分子Ｈ４５Ａ（−０９＋２５）を用いる強力且つ一貫したエキソン４５のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図15】図１５は、アンチセンス分子Ｈ４６Ａ（＋８１＋１０９）を用いる強力且つ一貫したエキソン４６のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図16】図１６は、アンチセンス分子Ｈ４７Ａ（＋０１＋２９）を用いる強力且つ一貫したエキソン４７のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図17】図１７は、強力且つ一貫してエキソンスキッピングを誘導するエキソン４７を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図18】図１８は、アンチセンス分子Ｈ４９Ａ（＋４５＋７０）を用いる強力且つ一貫したエキソン４９のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図19】図１９は、アンチセンス分子Ｈ５０Ａ（＋４８＋７４）を用いる強力且つ一貫したエキソン５０のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図20】図２０は、アンチセンス分子Ｈ５１Ａ（＋６６＋９５）を用いる強力且つ一貫したエキソン５１のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図21】図２１は、アンチセンス分子Ｈ５４Ａ（＋６７＋９７）を用いる強力且つ一貫したエキソン５４のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図22】図２２は、用量依存的にエキソン５５のスキッピングを誘導するアンチセンス分子Ｈ５５Ａ（−１０＋２０）を示すゲル電気泳動像である。

【図23】図２３は、アンチセンス分子Ｈ５６Ａ（＋９２＋１２１）を用いる強力且つ一貫したエキソン５６のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図24】図２４は、用量依存的にエキソン５７のスキッピングを誘導するアンチセンス分子Ｈ５７Ａ（−１０＋２０）を示すゲル電気泳動像である。

【図25】図２５は、エキソン５９を対象とするアンチセンス分子Ｈ５９Ａ（＋９６＋１２０）を用いるエキソン５９及びエキソン５８／５９のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図26】図２６は、エキソン６０のエキソンスキッピングを誘導する２つの異なるカクテルを示すゲル電気泳動像である。

【図27】図２７は、アンチセンス分子Ｈ６３Ａ（＋２０＋４９）を用いるエキソン６３のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図28】図２８は、アンチセンス分子Ｈ６４Ａ（＋３４＋６２）を用いるエキソン６４のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図29】図２９は、用量依存的にエキソンスキッピングを誘導するエキソン６６を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図30】図３０は、アンチセンス分子Ｈ６７Ａ（＋１７＋４７）を用いるエキソン６７のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図31】図３１は、用量依存的にエキソンのスキッピングを誘導するエキソン６８を対象とするアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図32】図３２は、２５ｎＭのトランスフェクション濃度で強力且つ一貫してエキソン６９／７０のエキソンスキッピングを誘導するアンチセンス分子の「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図33】図３３は、様々なレベルのエキソン５０のスキッピングを誘導するアンチセンス分子の様々な「カクテル」を示すゲル電気泳動像である。

【図34】図３４は、エキソン５０／５１の効率的なスキッピングを誘導する３つのアンチセンス分子のカクテルを示すゲル電気泳動像である。

【図35】図３５は、様々な効率のエキソンスキッピングを示す濃度測定結果のグラフである。試験したアンチセンス分子は、エキソン３［Ｈ３Ａ（＋３０＋６０）及びＨ３Ａ（＋６１＋８５）］；エキソン４［Ｈ４Ｄ（＋１４−１１）及びＨ４Ａ（＋１１＋４０）］；エキソン１４［Ｈ１４Ａ（＋３２＋６１）］；エキソン１７［Ｈ１７Ａ（＋１０＋３５）］；エキソン２６［Ｈ２６Ａ（−０７＋１９）、Ｈ２６Ａ（＋２４＋５０）及びＨ２６Ａ（＋６８＋９２）］；エキソン３６［Ｈ３６Ａ（−１６＋０９）及びＨ３６Ａ（＋２２＋５１）］であった。

【図36】図３６は、様々な効率のエキソンスキッピングを示す濃度測定結果のグラフである。試験したアンチセンス分子は、エキソン４６［Ｈ４６Ａ（＋８１＋１０９）］；エキソン４７［Ｈ４７Ａ（＋０１＋２９）］；エキソン４８［Ｈ４８Ａ（＋０１＋２８）及びＨ４８Ａ（＋４０＋６７）］；エキソン４９［Ｈ４９Ａ（＋４５＋７０）］であった。

【図37】図３７は、アンチセンス分子Ｈ１１Ａ（＋５０＋７９）を用いるエキソン１１のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図38】図３８は、アンチセンス分子Ｈ１２Ａ（＋３０＋５７）を用いるエキソン１２のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図39】図３９は、アンチセンス分子Ｈ４４Ａ（＋５９＋８５）を用いるエキソン４４のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図40】図４０は、アンチセンス分子Ｈ４５Ａ（−０３＋２５）を用いるエキソン４５のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図41】図４１は、アンチセンス分子Ｈ５１Ａ（＋７１＋１００）を用いるエキソン５１のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図42】図４２は、アンチセンス分子Ｈ５２Ａ（＋０９＋３８）を用いるエキソン５２のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図43】図４３は、アンチセンス分子Ｈ５３Ａ（＋３３＋６５）を用いるエキソン５３のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図44】図４４は、アンチセンス分子Ｈ４６Ａ（＋９３＋１２２）を用いるエキソン４６のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図45】図４５は、アンチセンス分子Ｈ７３Ａ（＋０２＋２６）を用いるエキソン７３のスキッピングを示すゲル電気泳動像である。

【図46A】図４６Ａは、アンチセンス分子の配列を示す。

【図46B】図４６Ｂは、アンチセンス分子の配列を示す。

【発明を実施するための形態】

【0035】

配列表の簡単な説明

【表1】

【表2】

【0036】

総論
当業者は、本明細書に記載される発明において、具体的に記載されている発明以外の変形例及び変更例も可能であることを理解するであろう。本発明は、全てのかかる変形例及び変更例を含むことを理解されたい。また、本発明は、個々に又は集合的に明細書中に言及又は指示される工程、特徴、組成物、及び化合物の全て、並びに前記工程又は特徴のうちの任意の及び全ての組み合わせ又は任意の２以上を含む。

【0037】

本発明は、本明細書に記載される特定の実施形態によって範囲を限定されるものではなく、前記実施形態は、例証する目的のみを意図するものである。機能的に等価な生成物、組成物、及び方法は、明らかに本明細書に記載される本発明の範囲内である。

【0038】

本明細書に含まれるヌクレオチド及びアミノ酸の配列情報を含む配列特定番号（配列番号）は、記載の最後にまとめて記載する。これらは、プログラムＰａｔｅｎｔＩｎバージョン３．０を用いて作成したものである。各ヌクレオチド又はアミノ酸配列は、数字見出し＜２１０＞とその後の配列特定子（例えば、＜２１０＞１、＜２１０＞２等）によって配列表中で識別される。各ヌクレオチド又はアミノ酸配列の長さ、配列の種類、及び起源生物は、それぞれ、数字見出し＜２１１＞、＜２１２＞、及び＜２１３＞に提供される情報によって示される。明細書中で言及されるヌクレオチド及びアミノ酸の配列は、数字見出し＜４００＞とその後の配列特定子（例えば、＜４００＞１、＜４００＞２等）によって提供される情報によって定義される。

【0039】

様々なアンチセンス分子を識別するために、アンチセンス分子の命名システムが提案され、公開されている（Ｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，（２００２）Ｊ Ｇｅｎ Ｍｅｄ ４，６４４−６５４を参照されたい）。この命名法は、全て同じ標的領域を対象とする幾つかの僅かに異なるアンチセンス分子を試験したときに特に関連し、以下のように示される：
Ｈ＃Ａ／Ｄ（ｘ：ｙ）
最初の文字は、種を表す（例えば、Ｈ：ヒト、Ｍ：マウス、Ｃ：イヌ）。
「＃」は、標的ジストロフィンエキソン番号を表す。
「Ａ／Ｄ」は、それぞれ、エキソンの最初と最後のアクセプタースプライス部位又はドナースプライス部位を示す。
（ｘ ｙ）は、「−」又は「＋」がそれぞれイントロン配列又はエキソン配列を示すアニーリング座標を表す。一例として、Ａ（−６＋１８）は、標的エキソンの前のイントロンの最後の６塩基と、標的エキソンの最初の１８塩基を示す。最も近接するスプライス部位は、アクセプターであるので、これら座標の前に「Ａ」と記載する。ドナースプライス部位におけるアニーリング座標は、アンチセンス分子のアニーリング部位に対応する最後の２つのエキソン塩基と最初の１８個のイントロン塩基を表すＤ（＋２−１８）と記載することができる。Ａ（＋６５＋８５）によって表される全体がエキソンであるアニーリング座標は、即ち、そのエキソンの最初から６５番目のヌクレオチドと８５番目のヌクレオチドとの間の部位である。

【0040】

本明細書に引用される全ての刊行物（特許、特許出願、論文、研究室マニュアル、書籍、又は他の文書を含む）の全開示は、参照することによって本明細書に援用される。参照文献のいずれかが先行技術を構成したり、本発明が関連する分野における研究の一般的な知見の一部であったりすることを認めるものではない。

【0041】

本明細書で使用するとき、「由来」及び「由来する」という用語は、特定の対象（ｉｎｔｅｇｅｒ）が、特定の起源から必ずしも直接得られないとしても、前記起源から得ることが可能であることを示すものとする。

【0042】

本明細書全体を通して、文脈上他の意味を必要としない限り、用語「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」又はその変形（「ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ」又は「ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ」等）は、指定の対象又は対象群を含むことを意味するが、任意の他の対象又は対象群を除くものではないと理解されるであろう。

【0043】

本明細書で用いられる選択された用語の他の定義は、本発明の詳細な記載中に見出すことができ、明細書全体に適用される。別段の定義がなされない限り、本明細書で用いられる全ての他の科学用語及び技術用語は、本発明が属する分野の当業者が一般的に理解する意味と同じ意味を有する。

【0044】

好ましい実施形態の説明
アンチセンス分子が、プレｍＲＮＡ配列内のエキソンにおけるスプライシングに関与しているヌクレオチド配列を標的としている場合、エキソンの正常なスプライシングが阻害されて、スプライシング機構がマチュアなｍＲＮＡからマチュアなエキソン全体をバイパスしてしまうことがある。エキソンスキッピングを誘導するアンチセンスオリゴヌクレオチドの概念を図２に示す。

【0045】

多くの遺伝子において、エキソン全体が欠損すると、重要な機能ドメインの喪失又はリーディングフレームの崩壊が生じ、非機能的タンパク質が生成される。しかし、一部のタンパク質では、リーディングフレームが崩壊することなしに、且つタンパク質の生物活性を著しく変化させることなしに、タンパク質内から１以上のエキソンを欠損させることによってタンパク質を短くすることが可能である。一般的に、かかるタンパク質は、構造的役割を有するか、末端に機能ドメインを有するか、又は構造的役割を有し且つ末端に機能ドメインを有する。本発明は、特定のジストロフィンプレｍＲＮＡに結合し、その遺伝子のプロセシングを再指示することができるアンチセンス分子について記載する。

【0046】

アンチセンス分子に基づく治療法の好ましい目的は、できる限り低濃度のアンチセンス分子によって最大のエキソンスキッピングを得ることにある。一般に、アンチセンス分子は、強くロバストなエキソンスキッピングを引き起こす場合もあり；弱く散在するエキソンスキッピングを引き起こす場合もあり；エキソンスキッピングを全く引き起こさない場合もある。低治療用量で強く、ロバストで、且つ一貫したエキソンスキッピングをもたらすことのできるアンチセンス分子（の単体又は組み合わせ）を開発することが好ましい。

【0047】

アンチセンス分子
本発明は第１の態様によれば、選択された標的に結合してエキソンスキッピングを誘導可能であるアンチセンス分子が提供される。ジストロフィン遺伝子転写産物のエキソンにおいてエキソンスキッピングを誘導するためには、表１Ａに示す化合物の群からアンチセンス分子を選択することが好ましい。

【0048】

また、選択された標的に結合してエキソンスキッピングを誘導可能である２以上のアンチセンスオリゴヌクレオチドの組み合わせ、即ち「カクテル」が提供される。ジストロフィン遺伝子転写産物のエキソンにおいてエキソンスキッピングを誘導するためには、表１Ｂに示す化合物の群から「カクテル」に含まれるアンチセンス分子を選択することが好ましい。

【0049】

アンチセンス分子がコンセンサススプライス部位を完全に網羅するように設計しても、必ずしも標的エキソンのスキッピングが生じる訳ではない。更に、本発明らは、アンチセンスオリゴヌクレオチド自体のサイズ、即ち長さが、常にアンチセンス分子を設計する際の主な要因である訳ではないことを見出した。エキソン１９等の一部の標的では、１２塩基の短いアンチセンスオリゴヌクレオチドがエキソンスキッピングを誘導可能であったにもかかわらず、より長い（２０塩基〜３１塩基）オリゴヌクレオチドはそれ程効率的ではなかった。マウスのジストロフィンエキソン２３等の幾つかの他の標的では、１７残基長しかないアンチセンスオリゴヌクレオチドが、２５ヌクレオチドの別の重複する化合物よりも効率的にスキッピングを誘導することができた。しかし、本発明では、一般的に、より長いアンチセンス分子の方がより短い分子よりもエキソンスキッピングをより効率的に誘導する場合が多いことを見出した。したがって、本発明のアンチセンス分子は、長さ２４核酸〜３０核酸、好ましくは約２８ヌクレオチドであることが好ましい。例えば、２０塩基のアンチセンスオリゴヌクレオチド（Ｈ１６Ａ（−０７＋１３））は、エキソン１６のエキソンスキッピングの誘導について効果がないが、前記２０塩基のオリゴヌクレオチドを完全に含む３１塩基のオリゴヌクレオチド（Ｈ１６Ａ（−０６＋２５））は、スキッピングの誘導について有効であることが既に見出されている（Ｈａｒｄｉｎｇ ｅｔ ａｌ（２００７）Ｍｏｌ Ｔｈｅｒ １５：１５７−１６６）。

【0050】

また、本発明者らは、スプライシングを再指示するためにアンチセンス分子によってブロック又はマスクされ得る任意の標準的なモチーフなど存在しないであろうことを見出した。マウスジストロフィンのエキソン２３等の幾つかのエキソンでは、そのエキソンのスキッピングを再指示するための標的に最もなりやすいのはドナースプライス部位であった。ドナースプライス部位の重複領域にアニーリングする一連のエキソン２３特異的アンチセンス分子の設計及び試験から、エキソンスキッピングの誘導効率には大きなばらつきがあることが示されたことに留意すべきである。Ｍａｎｎら（２００２年）に報告されている通り、ナンセンス突然変異のバイパス効率は、アンチセンス分子のアニーリングに依存して大きく変動していた（“Ｉｍｐｒｏｖｅｄ ａｎｔｉｓｅｎｓｅ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｉｎｄｕｃｅｄ ｅｘｏｎ ｓｋｉｐｐｉｎｇ ｉｎ ｔｈｅ ｍｄｘ ｍｏｕｓｅ ｍｏｄｅｌ ｏｆ ｍｕｓｃｕｌａｒ ｄｙｓｔｒｏｐｈｙ”．Ｊ Ｇｅｎ Ｍｅｄ ４：６４４−６５４）。エキソン２３又は幾つかの内部ドメインのアクセプター部位を標的とする任意の一貫したエキソン２３のスキッピング誘導は見出されていない。

【0051】

除去の標的となる他のエキソンでは、ドナースプライス部位のマスキングは、エキソンスキッピングを全く誘導しなかった。しかし、アクセプタースプライス部位（以下に論じられるヒトのエキソン８）にアンチセンス分子を導くことにより、強力且つ持続性であるエキソンスキッピングが誘導された。ヒトエキソン８の除去は、エキソン９の同時除去と密接に関連していることに留意すべきである。エキソン８のアンチセンスオリゴヌクレオチドとエキソン９の対応する領域とは配列相同性が低いので、交差反応の問題であるとは考えられない。むしろ、これら２つのエキソンのスプライシングは、一般的に関連している。これが唯一の例ではなく、同様の作用がイヌ細胞でも観察されており、この場合もエキソン８を除去するためにターゲティングするとエキソン９もスキッピングされる。また、マウスのジストロフィンプレｍＲＮＡにおいてエキソン２３を除去するためにターゲティングすると、エキソン２２も除去されることが多い。この作用は、用量依存的に生じ、また、２つの隣接するエキソンが密接に協働してプロセシングされていることを示す。

【0052】

他の標的とされるエキソンでは、ドナー又はアクセプタースプライス部位を対象とするアンチセンス分子は、エキソンスキッピングを誘導しなかったか又は僅かしか誘導しなかったが、一方、アンチセンス分子のエキソン内領域（即ち、ヒトのジストロフィンエキソン４内のエキソンスプライシングエンハンサーエレメント）へのアニーリングは、エキソンスキッピングの誘導において最も効率的であった。幾つかのエキソン、例えばマウス及びヒトのエキソン１９は、様々なモチーフを標的とするアンチセンス分子によって容易にスキッピングされる。即ち、ターゲティングされたエキソンスキッピングは、アンチセンスオリゴヌクレオチドを用いてドナー及びアクセプタースプライス部位、又はエキソンスプライシングエンハンサーエレメントをマスクした後に誘導される。

【0053】

また、どのアンチセンス分子のカクテルがエキソンスキッピングを誘導するかを予測することはできない。例えば、単独では所定のエキソンのスキッピング誘導について非常に優れている２つのアンチセンス分子を組み合わせても、カクテルとして組み合わせたときエキソンのスキッピングを引き起こすとは限らない。例えば、Ｈ５０Ａ（＋０２＋３０）及びＨ５０Ａ（＋６６＋９５）は、それぞれ単独ではエキソン５０及び５１のスキッピングを良好に誘導する。しかし、カクテルとして組み合わせると、前記２つのエキソンのスキッピングを僅かに誘導することしかできない。同様に、Ｈ５０Ａ（＋０２＋３０）とＨ５１Ａ（＋６６＋９０）との組み合わせ、又はＨ５０Ａ（＋０２＋３０）とＨ５１Ａ（＋６１＋９０）との組み合わせは、個々のアンチセンス分子が有効であったにもかかわらず、エキソン５０及び５１のスキッピングを効率的に引き起こさなかった。しかし、第３のアンチセンス分子（単独ではスキッピングを引き起こさない［Ｈ５１Ｄ（＋１６−０７）］）を導入して、３つの要素のカクテル（［Ｈ５０Ａ（＋０２＋３０）］、Ｈ５１Ａ（＋６６＋９０）、及び［Ｈ５１Ｄ（＋１６−０７）］）を作製すると、エキソン５０及び５１を１ｎＭまでスキッピングすることができた。

【0054】

或いは、単独では効果がない又は非常に低い効果しかない２つ又は３つのアンチセンス分子を組み合わせたとき、優れたスキッピングが生じる場合もある。例えば、Ｈ２６Ａ（−０７＋１９）［配列番号３９］、Ｈ２６Ａ（＋２４＋５０）［配列番号４０］、及びＨ２６Ａ（＋６８＋９２）［配列番号４１］は、個別にはエキソン２６のスキッピングを非効率的にしか生じさせず、また複数のエキソンスキッピング（２６〜２９又は２７〜３０）を誘導する。しかし、３つのエキソンをカクテルとして組み合わせると、エキソン２６が非常に効率的にスキッピングする。

【0055】

上記例及び議論から、ある組み合わせが機能するかどうかを正確に予測する方法が存在しないことは明らかである。

【0056】

アンチセンス分子は、「用量依存的に」又は「非用量依存的に」エキソンのスキッピングを引き起こす場合がある。用量依存的とは、より多い量のアンチセンス分子がより良好にエキソンをスキッピングすることを意味し、一方、非用量依存的アンチセンス分子は、非常に低用量でさえもスキッピングを誘導することができる。例えば、図１５から、Ｈ４６Ａ（＋８１＋１０９）［配列番号１２］は、存在するアンチセンス分子の量（６００ｎＭ〜２５ｎＭ）にかかわらずエキソン４６を等しく良好にスキッピングすることが分かる。対照的に、Ｈ５７Ａ（−１０＋２０）［配列番号２０］（図２４）は、１００ｎＭでエキソン５７のスキッピングを強く誘導するが、５０ｎＭでは、スキッピングの程度が低下し、２５ｎＭでは更に大きく低下する。

【0057】

非用量依存的にスキッピングを誘導するアンチセンス分子を選択することが好ましい。その理由は、非常に低濃度でこれら分子を投与しても治療効果を得ることができるためである。しかし、用量依存的にスキッピングを誘導するアンチセンス分子、特に、低濃度で良好又は優れたスキッピングを誘導する分子を好ましい分子として選択することも許容可能である。本発明のアンチセンス分子は、５００ｎＭ未満、好ましくは２００ｎＭ未満、より好ましくは１００ｎＭ、５０ｎＭ、又は更には２５ｎＭもの低濃度で良好又は優れたエキソンスキッピングを誘導できることが好ましい。本発明のオリゴヌクレオチド分子は、１００ｎＭの濃度にて３０％超のレベルでスキッピングを誘導することが最も好ましい。

【0058】

エキソンスキッピングの調節において用いるのに好適なアンチセンスオリゴヌクレオチドを同定及び選択するために、機能を調節すべき核酸配列を先ず同定しなければならない。これは、例えば、発現が特定の障害又は疾患状態に関連している遺伝子（又はその遺伝子から転写されるｍＲＮＡ）であってもよく、又は感染因子に由来する核酸分子であってもよい。本発明の状況において、好ましい標的部位は、ｍＲＮＡのスプライシングに関与する部位（即ち、スプライスドナー部位、スプライスアクセプター部位、又はエキソンスプライシングエンハンサーエレメント）である。スプライスブランチポイント及びエキソン認識配列又はスプライスエンハンサーエレメントも、ｍＲＮＡのスプライシングを調節するための標的部位になり得る。

【0059】

好ましくは、本発明は、効率的且つ一貫したエキソンスキッピングを誘導するためにジストロフィンプレｍＲＮＡにおける選択された標的に結合可能なアンチセンス分子を提供することを目的とする。デュシェンヌ型筋ジストロフィーは、ジストロフィンの機能的遺伝子産物の合成を妨げる突然変異から生じる。これらデュシェンヌ型筋ジストロフィー遺伝子の欠陥は、一般的に、リーディングフレームを崩壊させる欠失、重複、微小欠失、又は挿入等のナンセンス突然変異又はゲノムの再構成である。ヒトのジストロフィン遺伝子は、大きく複雑な遺伝子であるので（７９個のエキソンが共にスプライシングされて、約１１，０００塩基のオープンリーディングフレームを含むマチュアなｍＲＮＡを生成する）、これら突然変異が生じる可能性のある位置が多数存在する。結果として、ジストロフィン遺伝子における様々な疾患を引き起こす突然変異の多くを扱う包括的なアンチセンスオリゴヌクレオチドに基づく療法では、多くのエキソンがスプライシングプロセス中の除去の標的となり得ることが必要とされる。

【0060】

本発明の状況において、好ましい標的部位は、ｍＲＮＡのスプライシングに関与する部位（即ち、スプライスドナー部位、スプライスアクセプター部位、又はエキソンスプライシングエンハンサーエレメント）である。スプライスブランチポイント及びエキソン認識配列又はスプライスエンハンサーエレメントも、ｍＲＮＡのスプライシングを調節するための標的部位となり得る。

【0061】

各分子における十分な数の対応位置が、互いに水素結合可能なヌクレオチドによって占有されている場合、オリゴヌクレオチドとＤＮＡ又はＲＮＡとは互いに相補的である。したがって、「特異的にハイブリダイズ可能」及び「相補的」という用語は、オリゴヌクレオチドとＤＮＡ又はＲＮＡの標的との間で安定且つ特異的な結合が生じるように、十分な程度に相補的である、又は正確に対合することを示すために用いられる用語である。アンチセンス分子の配列は、特異的にハイブリダイズ可能な標的配列と１００％相補的である必要はないということが、当技術分野では理解される。アンチセンス分子は、標的ＤＮＡ又はＲＮＡに対する化合物の結合が前記標的ＤＮＡ又はＲＮＡの正常な機能に干渉して有用性を喪失させ、且つ特異的に結合することが望ましい条件下で、即ち、インビボアッセイ又は治療的処置の場合は生理学的条件下で、インビトロアッセイの場合はアッセイが実施される条件下で、非標的配列に対するアンチセンス化合物の非特異的結合を妨げるのに十分な程度の相補性が存在する場合、特異的にハイブリダイズ可能である。

【0062】

上記方法を用いて、その生物学的機能に影響を与えることなしに短くすることができるタンパク質内から任意のエキソンを欠損させることができるアンチセンス分子を選択することができるが、前記エキソンの欠損によって、短くなった転写ｍＲＮＡにおけるリーディングフレームシフトが生じてはならない。したがって、３つのエキソンの直鎖配列において、第１のエキソンの最後にコドンにおける３つのヌクレオチドのうちの２つがコードされており、次のエキソンが欠損した場合、直鎖配列における第３のエキソンは、前記コドンのヌクレオチドトリプレットを完成させることができる１つのヌクレオチドで始まらなければならない。第３のエキソンが前記１つのヌクレオチドで始まらない場合、先端切断型又は非機能的なタンパク質の生成を導くリーディングフレームシフトが生じる。

【0063】

構造タンパク質におけるエキソンの最後におけるコドンの再構成は、常にコドンの最後で崩壊する訳ではないことが理解される。結果として、ｍＲＮＡのインフレームリーディングを保証するために、プレｍＲＮＡから１超のエキソンを欠損させる必要がある場合もある。かかる状況では、複数のアンチセンスオリゴヌクレオチドは、欠損させるエキソンにおけるスプライシングの誘導に関与する様々な領域を各々が対象とする本発明の方法によって選択される必要があるだろう。

【0064】

アンチセンス分子の長さは、プレｍＲＮＡ分子内の意図する箇所に選択的に結合可能である限り変動してもよい。かかる配列の長さは、本明細書に記載される選択手順に従って決定することができる。一般的に、アンチセンス分子は、長さ約１０ヌクレオチド〜長さ約５０ヌクレオチドである。しかし、この範囲内の任意の長さのヌクレオチドを前記方法で用いてもよいことが理解される。アンチセンス分子の長さは、１７ヌクレオチド〜３０ヌクレオチドの長さであることが好ましい。驚くべきことに、より長いアンチセンス分子が、エキソンスキッピングの誘導についてより効率的であることが多いことが見出されている。したがって、アンチセンス分子は、２４ヌクレオチド〜３０ヌクレオチドの長さであることが最も好ましい。

【0065】

ジストロフィン遺伝子内でどのエキソンを接続可能であるのかを判定するために、エキソン境界マップを参照すべきである。あるエキソンと別のエキソンとの接続は、接続されるエキソンの５’境界に存在するのと同数を３’境界に有するエキソンに基づく。したがって、エキソン７が欠損した場合、エキソン６は、リーディングフレームを維持するためにエキソン１２又は１８と接続しなければならない。したがって、前者の場合はエキソン７〜１１について、後者の場合はエキソン７〜１７についてスプライシングを再指示するアンチセンスオリゴヌクレオチドを選択する必要がある。エキソン７の欠損の前後でリーディングフレームを回復させるための別の若干簡単なアプローチは、２つの隣接するエキソンを除去することである。エキソン６及び８のスキッピングの誘導は、エキソン５から９にスプライシングしてインフレーム転写産物を生じさせなければならない。しかし実際には、プレｍＲＮＡから除去するためにエキソン８をターゲティングすると、エキソン９も同時に除去されるので、得られる転写産物ではエキソン５とエキソン１０とが接合している。エキソン９を含んでいても含んでいなくてもリーディングフレームは変化しない。

【0066】

試験されるアンチセンス分子が同定されれば、前記アンチセンス分子は、当技術分野において標準的な技術に従って調製される。アンチセンス分子を生成するための最も一般的な方法は、ヒドロキシリボースの２’位のメチル化及びホスホロチオエート骨格の導入である。これによって、表面的にはＲＮＡに類似しているが、ヌクレアーゼ分解に対する耐性が遥かに高い分子が生成される。

【0067】

アンチセンス分子と二重鎖を形成している間にプレｍＲＮＡが分解されるのを防ぐために、前記方法で用いられるアンチセンス分子は、内因性ＲＮａｓｅＨによる切断を最小化する又は避けるのに適応している場合がある。細胞内環境に存在するか又はＲＮａｓｅＨを含有する粗抽出物と接触している非メチル化ＲＮＡオリゴヌクレオチドの存在が、プレｍＲＮＡ：アンチセンスオリゴヌクレオチド二重鎖の分解を導くので、この性質は非常に好ましい。かかる分解をバイパスできるか又は誘導しない任意の形態の修飾アンチセンス分子を本方法で用いることができる。このヌクレアーゼ耐性は、部分不飽和脂肪族炭化水素鎖と、カルボン酸基、エステル基、及びアルコール基を含む１以上の極性基又は荷電基とを含むように本発明のアンチセンス分子を修飾することによって達成することができる。

【0068】

ＲＮＡと二重鎖を形成するとき、細胞内ＲＮａｓｅＨによって切断されないアンチセンス分子の例は、２’−Ｏ−メチル誘導体である。２’−Ｏ−メチル−オリゴリボヌクレオチドは、細胞内環境及び動物組織で非常に安定であり、ＲＮＡとの二重鎖は、リボ又はデオキシリボ対応物よりも高いＴｍ値を有する。或いは、本発明のヌクレアーゼ耐性アンチセンス分子は、フッ化されている最後の３’末端のヌクレオチドのうちの少なくとも１つを有してもよい。或いは、本発明のヌクレアーゼ耐性アンチセンス分子は、最後の３’末端のヌクレオチド塩基のうちの少なくとも２つの間を連結するホスホロチオエート結合を有し、好ましくは、最後の４つの３’末端のヌクレオチド塩基間を連結するホスホロチオエート結合を有する。

【0069】

ＲＮａｓｅＨを活性化しないアンチセンス分子は、公知の技術に従って作製することができる（例えば、米国特許第５，１４９，７９７号明細書を参照されたい）。かかるアンチセンス分子は、デオキシリボヌクレオチド配列であってもよくリボヌクレオチド配列であってもよく、単に、オリゴヌクレオチドを含有する二重鎖分子に対するＲＮａｓｅＨの結合を立体障害するか又は防ぐ任意の構造的修飾をその配列の１つのメンバーとして含み、前記構造的修飾は、二重鎖の形成を実質的に妨げたり乱したりしない。二重鎖の形成に関与しているオリゴヌクレオチドの部分は、前記オリゴヌクレオチドに対するＲＮａｓｅＨの結合に関与している部分とは実質的に異なるので、ＲＮａｓｅＨを活性化させない多くのアンチセンス分子が利用可能である。例えば、かかるアンチセンス分子は、ヌクレオチド間を架橋するホスフェート残基のうちの少なくとも１つ又は全てが、メチルホスホネート、メチルホスホロチオエート、ホスホロモルホリデート、ホスホロピペラジデート、及びホルホロアミデート等の修飾ホスフェートであるオリゴヌクレオチドであってよい。例えば、ヌクレオチド間を架橋するホスフェート残基が一つ置きに上記の通り修飾されてもよい。別の非限定的な例では、かかるアンチセンス分子は、ヌクレオチドのうちの少なくとも１つ又は全てが２’低級アルキル部分（例えば、Ｃ_１−Ｃ_４、直鎖又は分枝、飽和又は不飽和アルキル、例えば、メチル、エチル、エテニル、プロピル、１−プロペニル、２−プロペニル、及びイソプロピル）を含有する。例えば、ヌクレオチドが一つ置きに上記の通り修飾されてもよい。

【0070】

アンチセンスオリゴヌクレオチドは、アンチセンス分子の好ましい形態であるが、本発明は、以下に記載するもの等のオリゴヌクレオチド擬似物質が挙げられるがこれらに限定されない他のオリゴマーアンチセンス分子を含む。

【0071】

本発明において有用である好ましいアンチセンス化合物の具体例としては、修飾骨格又は自然界には存在しないヌクレオシド間連結を含有するオリゴヌクレオチドが挙げられる。本明細書に定義する通り、修飾骨格を有するオリゴヌクレオチドとしては、骨格中にリン原子を保持しているもの及び骨格中にリン原子を有しないものが挙げられる。本明細書の目的のために、また時に当技術分野において参照される通り、ヌクレオシド間骨格にリン原子を有しない修飾ヌクレオチドも、オリゴヌクレオシドであるとみなすことができる。

【0072】

他の好ましいオリゴヌクレオチド擬似物質では、ヌクレオチド単位の糖及びヌクレオシド間連結、即ち骨格が、新規の基で置換されている。基本単位は、適切な核酸標的化合物とのハイブリダイズが維持されている。１つのかかるオリゴマー化合物である、優れたハイブリダイゼーション性を有することが示されているオリゴヌクレオチド擬似物質は、ペプチド核酸（ＰＮＡ）と称される。ＰＮＡ化合物では、オリゴヌクレオチドの糖骨格が、アミド含有骨格、特にアミノエチルグリシン骨格で置換されている。ヌクレオ塩基は保持され、骨格のアミド部分のアザ窒素原子に直接又は間接的に結合する。

【0073】

また、修飾オリゴヌクレオチドは、１以上の置換糖部分を含有してもよい。また、オリゴヌクレオチドは、ヌクレオ塩基（当技術分野においては単に「塩基」と称することが多い）修飾又は置換を含んでいてもよい。特定のヌクレオ塩基は、本発明のオリゴマー化合物の結合親和性を高めるのに特に有用である。これらとしては、５−置換ピリミジン、６−アザピリミジン、並びに例えば、２−アミノプロピルアデニン、５−プロピニルウラシル、及び５−プロピニルシトシンを含むＮ−２、Ｎ−６、及びＯ−６置換プリンが挙げられる。５−メチルシトシン置換は、核酸の二重鎖安定性を０．６℃〜１．２℃上昇させることが示されており、本発明において好ましい塩基置換であり、更には２’−Ｏ−メトキシエチル糖修飾と組み合わせたときに特に好ましい塩基置換である。

【0074】

本発明のオリゴヌクレオチドの別の修飾は、オリゴヌクレオチドの活性、細胞内分布、又は細胞内取り込みを高める１以上の部分又はコンジュゲートをオリゴヌクレオチドに化学的に連結させることを含む。かかる部分としては、コレステロール部分、コール酸、チオエーテル、例えば、ヘキシル−Ｓ−トリチルチオール、チオコレステロール、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオール又はウンデシル残基、リン脂質、例えば、ジ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロール又はトリエチルアンモニウム１，２−ジ−Ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３−Ｈ−ホスホネート、ポリアミン又はポリエチレングリコール鎖、或いはアダマンタン酢酸、パルミチル部分、或いはオクタデシルアミン又はヘキシルアミノ−カルボニル−オキシコレステロール部分等の脂質部分が挙げられるが、これらに限定されない。

【0075】

必ずしも所定の化合物における全ての位置が均一に修飾される必要はなく、実際に、前述の修飾のうちの１超を単一化合物に、又は更にはオリゴヌクレオチド内の単一ヌクレオシドに組み込んでもよい。また、本発明は、キメラ化合物であるアンチセンス化合物を含む。「キメラ」アンチセンス化合物、即ち「キメラ」は、本発明の状況において、２以上の化学的に異なる領域を含有し、その各々が少なくとも１つのモノマー単位、即ちオリゴヌクレオチド化合物の場合ヌクレオチドで構成されるアンチセンス分子、特にオリゴヌクレオチドである。これらオリゴヌクレオチドは、一般的に、ヌクレアーゼ分解に対する耐性を高め、細胞への取り込みを増加させるためにオリゴヌクレオチドが修飾される少なくとも１つの領域と、標的核酸に対する結合親和性を高めるための更なる領域とを含有する。

【0076】

アンチセンス分子の製造方法
本発明に従って用いられるアンチセンス分子は、固相合成の周知技術を通して簡便に且つルーチンに製造することができる。かかる合成を行うための設備は、例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ（Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，Ｃａｌｉｆ．）を含む幾つかの供給元によって販売されている。修飾固体支持体においてオリゴヌクレオチドを合成するための１つの方法は、米国特許第４，４５８，０６６号明細書に記載されている。

【0077】

これに加えて又はこれに代えて、かかる合成のために当技術分野において公知である任意の他の手段を使用してもよい。ホスホロチオエート及びアルキル化誘導体等のオリゴヌクレオチドを調製するために類似の技術を用いることが周知である。１つのかかる自動化実施形態では、ジエチル−ホスホラミダイトが出発物質として用いられ、Ｂｅａｕｃａｇｅ，ｅｔ ａｌ．，（１９８１）Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔｅｒｓ，２２：１８５９−１８６２に記載の通り合成することができる。

【0078】

本発明のアンチセンス分子は、インビトロで合成され、生物学的起源のアンチセンス組成物、又はアンチセンス分子のインビボ合成を導くよう設計された遺伝子ベクターコンストラクトを含まない。また、取り込み、分布、及び／又は吸収を補助するために、例えば、リポソーム、受容体が標的とする分子、経口用、直腸用、局所用、又は他の製剤として、本発明の分子を他の分子、分子構造、又は化合物の混合物と共に混合、カプセル化、コンジュゲート化、又は結合物としてもよい。

【0079】

治療剤
また、本発明は、遺伝子疾患を治療する目的のために利用することができる予防剤又は治療剤として用いてもよい。

【0080】

したがって、１つの実施形態では、本発明は、薬学的に許容できる担体、希釈剤、又は賦形剤と混合されている、治療に有効な量でジストロフィンプレｍＲＮＡにおける選択された標的に結合して本明細書に記載の効率的且つ一貫したエキソンスキッピングを誘導するアンチセンス分子を提供する。

【0081】

語句「薬学的に許容できる」とは、患者に投与したとき、生理学的に忍容性であり、且つ一般的に急性胃蠕動等のアレルギー性反応又は類似の有害な反応を生じさせない分子実体及び組成物を指す。用語「担体」は、化合物と共に投与される希釈剤、アジュバント、賦形剤、又はビヒクルを指す。かかる医薬担体は、ラッカセイ油、ダイズ油、鉱油、ゴマ油等の石油、動物、植物、又は合成起源の油を含む油及び水等の不活性液体であってよい。水又は生理食塩水、並びに水性デキストロース及びグリセロール水溶液は、担体として、特に注射液として使用されることが好ましい。好適な医薬担体は、Ｍａｒｔｉｎ，Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄ．，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ，（１９９０）に記載されている。

【0082】

本発明のより具体的な形態では、薬学的に許容できる希釈剤、保存剤、可溶化剤、乳化剤、アジュバント、及び／又は担体と共に治療に有効な量のアンチセンス分子を含む医薬組成物を提供する。かかる組成物は、様々なバッファ内容物（例えば、Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ、酢酸塩、リン酸塩）、ｐＨ及びイオン強度の希釈剤、洗剤及び可溶化剤（例えば、Ｔｗｅｅｎ８０、ポリソルベート８０）、酸化防止剤（例えば、アスコルビン酸、メタ重亜硫酸ナトリウム）、保存剤（例えば、チメロサール、ベンジルアルコール）、及びバルク物質（例えば、ラクトース、マンニトール）等の添加剤を含む。これら物質は、ポリ酢酸、ポリグリコール酸等のポリマー化合物の粒子状調製物、又はリポソームに配合してもよい。ヒアルロン酸を用いてもよい。かかる組成物は、本タンパク質及び誘導体の物理的状態、安定性、インビボにおける放出速度、及びインビボにおけるクリアランス速度に影響を与える場合がある。例えば、参照することによって本明細書に援用されるＭａｒｔｉｎ，Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ，１８ｔｈ Ｅｄ．（１９９０，Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，ＰＡ １８０４２）ｐａｇｅｓ １４３５−１７１２を参照されたい。組成物は、液体形態で調製してもよく、凍結乾燥形態等の乾燥粉末であってもよい。

【0083】

本発明に従って提供される医薬組成物は、当技術分野において公知の任意の出願によって投与することができると認識される。投与するための医薬組成物は、注入、経口、肺、又は鼻経路によって投与されることが好ましい。アンチセンス分子は、静脈内、動脈内、腹腔内、筋肉内、又は皮下投与経路によって送達されることがより好ましい。

【0084】

アンチセンス分子に基づく療法
また、遺伝子疾患を調節する医薬を製造するための本発明のアンチセンス分子の使用も本発明により扱われる。

【0085】

治療に有用な量のアンチセンス分子の送達は、既に公開されている方法によって行うことができる。例えば、アンチセンス分子の細胞内送達は、アンチセンス分子と有効な量のブロックコポリマーとの混合物を含む組成物を介して行うことができる。この方法の例は、米国特許出願公開第２００４／０２４８８３３号明細書に記載されている。

【0086】

アンチセンス分子を核に送達する他の方法は、Ｍａｎｎ ＣＪ ｅｔ ａｌ．，（２００１）［“Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ−ｉｎｄｕｃｅｄ ｅｘｏｎ ｓｋｉｐｐｉｎｇ ａｎｄ ｔｈｅ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ ｄｙｓｔｒｏｐｈｉｎ ｉｎ ｔｈｅ ｍｄｘ ｍｏｕｓｅ”．Ｐｒｏｃ．，Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉｅｎｃｅ，９８（１）４２−４７］及びＧｅｂｓｋｉ ｅｔ ａｌ．，（２００３）．Ｈｕｍａｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ，１２（１５）：１８０１−１８１１に記載されている。

【0087】

ネイキッドＤＮＡ又は液体担体と複合体化されているＤＮＡのいずれかとして発現ベクターを用いて細胞内に核酸分子を導入する方法は、米国特許第６，８０６，０８４号明細書に記載されている。

【0088】

コロイド分散系においてアンチセンス分子を送達することが望ましい場合がある。コロイド分散系としては、巨大分子複合体、ナノカプセル、ミクロスフィア、ビーズ、及び水中油型エマルション、ミセル、混合ミセルを含む液体に基づく系、及びリポソーム又はリポソーム製剤が挙げられる。

【0089】

リポソームは、インビトロ及びインビボで送達小胞として有用である人工膜小胞である。これら製剤は、正味のカチオン電荷特性、アニオン電荷特性、又は中性電荷特性を有してもよく、インビトロ、インビボ、及びエキソビボにおける送達方法に有用な特性である。０．２ＰＨＩ．ｍ〜４．０ＰＨＩ．ｍのサイズの大単ラメラ小胞（ＬＵＶ）は、巨大分子を含有する水性バッファをかなりの割合封入することができる。ＲＮＡ及びＤＮＡは、水性の内部に封入されてもよく、生物学的活性型で細胞に送達されてもよい（Ｆｒａｌｅｙ，ｅｔ ａｌ．，Ｔｒｅｎｄｓ Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．，６：７７，１９８１）。

【0090】

リポソームを有効な遺伝子輸送ビヒクルにするために、以下の特徴を有していなければならない：（１）高効率で対象アンチセンス分子を封入するが、前記アンチセンス分子の生物活性を低下させない；（２）非標的細胞に比べて、標的細胞に対して優先的且つ実質的に結合する；（３）高効率で標的細胞の細胞質に小胞の水性内容物を送達する；及び（４）遺伝情報を正確且つ有効に発現させる（Ｍａｎｎｉｎｏ，ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ，６：６８２，１９８８）。

【0091】

リポソームの組成物は、通常、リン脂質の組み合わせ、特に相転移温度の高いリン脂質の組み合わせであり、通常、ステロイド類、特にコレステロールと併用される。他のリン脂質又は他の脂質を使用してもよい。リポソームの物性は、ｐＨ、イオン強度、及び二価カチオンの存在に依存する。

【0092】

或いは、アンチセンスコンストラクトは、他の薬学的に許容できる担体又は希釈剤と組み合わせて、医薬組成物を生成してもよい。好適な担体及び希釈剤としては、等張生理食塩水、例えば、リン酸緩衝生理食塩水が挙げられる。組成物は、非経口、筋肉内、静脈内、皮下、眼内、経口、又は経皮投与用に製剤化してもよい。

【0093】

記載されている投与経路は、指針として示すことのみを意図し、その理由は、当業者であれば、最適な投与経路、並びに任意の特定の動物及び症状に関する任意の投薬量を容易に決定できるためである。

【0094】

本発明のアンチセンス分子は、ヒトを含む動物に投与されたとき、（直接又は間接的に）生物学的に活性である代謝産物又はその残基を提供することができる任意の薬学的に許容できる塩、エステル、かかるエステルの塩、又は任意の他の化合物を含む。したがって、例えば、本発明の化合物のプロドラッグ及び薬学的に許容できる塩、かかるプロドラッグの薬学的に許容できる塩、及び他の生物学的等価物も開示に含まれる。

【0095】

「薬学的に許容できる塩」という用語は、本発明の化合物の生理学的且つ薬学的に許容できる塩；即ち、本化合物の望ましい生物活性を保持し、且つ本化合物に望ましくない毒性作用を付与しない塩を指す。

【0096】

オリゴヌクレオチドの場合、薬学的に許容できる塩の好ましい例としては、（ａ）ナトリウム、カリウム、アンモニウム、マグネシウム、カルシウム、ポリアミン（例えばスペルミン及びスペルミジン等）等のカチオンと共に形成される塩；（ｂ）例えば、塩酸、臭化水素酸、硫酸、リン酸、硝酸等の無機酸と共に形成される酸付加塩；（ｃ）例えば、酢酸、シュウ酸、酒石酸、コハク酸、マレイン酸、フマル酸、グルコン酸、クエン酸、リンゴ酸、アスコルビン酸、安息香酸、タンニン酸、パルミチン酸、アルギン酸、ポリグルタミン酸、ナフタレンスルホン酸、メタンスルホン酸、ｐ−トルエンスルホン酸、ナフタレンジスルホン酸、ポリガラクツロン酸等の有機酸と共に形成される塩；並びに（ｄ）塩素、臭素、及びヨウ素等の元素アニオンから形成される塩が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の医薬組成物は、局所治療が望ましいか又は全身治療が望ましいか、及び治療される領域に依存して多数の方法で投与することができる。投与は、局所投与（眼及び直腸送達を含む粘膜への投与等）、例えば、粉末又はエアロゾルの吸入又は吹送による肺投与（例えばネブライザによる、気管内、鼻内、表皮、及び経皮）、経口投与又は非経口投与であってよい。非経口投与としては、静脈内、動脈内、皮下、腹腔内、又は筋肉内への注射又は注入；或いは頭蓋内、例えば、髄腔内又は心室内投与が挙げられる。少なくとも１つの２’−Ｏ−メトキシエチル修飾を有するオリゴヌクレオチドが、経口投与に特に有用であると考えられる。

【0097】

本発明の医薬製剤は、簡便な単位剤形で提示されてもよく、医薬業界で周知の慣用技術に従って調製することができる。かかる技術は、医薬担体又は賦形剤と活性成分とを関連付ける工程を含む。一般的に、製剤は、活性成分と、液体担体、微粉化固体担体、又はこれら両方とを均質且つ緊密に関連付け、次いで、必要に応じて製品を成形することによって調製される。

【0098】

本発明のキット
また、本発明は、遺伝子疾患を有する患者を治療するためのキットであって、好適な容器に包装されている少なくとも１つのアンチセンス分子と、その使用説明書とを含むキットを提供する。

【0099】

好ましい実施形態では、キットは、表１Ａに示される少なくとも１つのアンチセンス分子、又は表１Ｂに示されるアンチセンス分子のカクテルを含む。また、キットは、バッファ、安定剤等の非必須試薬を含んでいてもよい。

【0100】

キットの内容物は、凍結乾燥されていてもよく、キットは、凍結乾燥されている成分を再構成するための好適な溶媒を更に含んでいてもよい。キットの個々の成分は、別々の容器に包装され、かかる容器と共に、医薬品又は生物学的製品の製造、使用、又は販売を規制する政府機関によって定められている形態の通知であって、ヒトへの投与についての製造、使用、又は販売を規制する機関による認可を反映している通知を添付してもよい。

【0101】

キットの成分が１以上の液体溶液で提供されるとき、前記液体溶液は、水溶液、例えば無菌水溶液であってよい。インビボで使用する場合、発現コンストラクトを薬学的に許容できる注射用組成物に製剤化してもよい。この場合、容器手段は、単体で吸入器、注射器、ピペット、点眼器、又は他の同様の装置であってよく、これらから、肺等の動物の罹患領域に製剤を適用したり、動物に注射したり、更にはキットの他の成分に適用し、それと混合したりすることができる。

【0102】

また、キットの成分は、乾燥形態又は凍結乾燥形態で提供されてもよい。試薬又は成分が乾燥形態として提供されるとき、一般的に、好適な溶媒の添加によって再構成が行われる。また、溶媒は、別の容器手段で提供されてもよいことが想到される。容器の数又は種類にかかわらず、本発明のキットは、動物の体内に最終的な複雑な組成物を注射／投与又は配置するのを補助するための機器を含むか、又はこれらと共に包装されてもよい。かかる機器は、吸入器、注射器、ピペット、ピンセット、計量スプーン、点眼器、又は任意の医学的に認められている送達ビヒクルであってもよい。

【0103】

当業者は、上記方法の適用が、多くの他の疾患の治療において使用するのに好適なアンチセンス分子を同定するための幅広い用途を有することを認識すべきである。

【実施例】

【0104】

以下の実施例は、上記本発明を用いる手順を更に詳細に記載するものであり、本発明の様々な態様を実施するために考えられる最良の実施形態について記載するものである。これら実施例は、如何なる方法でも本発明の真の範囲を限定するものではなく、例証目的のために提示されるものであることを理解されたい。本明細書に引用する参照文献は、参照することによって明示的に本明細書に援用される。

【0105】

以下の実施例に明確には記載されていない分子のクローニング方法、免疫学的方法、及びタンパク質化学的方法は、文献に報告されており、当業者に公知である。当技術分野における従来の分子生物学、微生物学、及び組換えＤＮＡ技術について記載している一般的な教科書としては、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（１９８９）；Ｇｌｏｖｅｒ ｅｄ．，ＤＮＡ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｖｏｌｕｍｅｓ Ｉ ａｎｄ ＩＩ，ＭＲＬ Ｐｒｅｓｓ，Ｌｔｄ．，Ｏｘｆｏｒｄ，Ｕ．Ｋ．（１９８５）；及びＡｕｓｕｂｅｌ，Ｆ．，Ｂｒｅｎｔ，Ｒ．，Ｋｉｎｇｓｔｏｎ，Ｒ．Ｅ．，Ｍｏｏｒｅ，Ｄ．Ｄ．，Ｓｅｉｄｍａｎ，Ｊ．Ｇ．，Ｓｍｉｔｈ，Ｊ．Ａ．，Ｓｔｒｕｈｌ，Ｋ．Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ．Ｇｒｅｅｎｅ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ａｓｓｏｃｉａｔｅｓ／Ｗｉｌｅｙ Ｉｎｔｅｒｓｃｉｅｎｃｅｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ（２００２）が挙げられる。

【0106】

ヒト筋肉細胞において誘導されたエキソンスキッピングの判定
全てのエキソンに適用することができる一貫した傾向は存在しないと考えられるので、アンチセンス分子の設計における合理的なアプローチを開発するという本発明者らの試みは完全には成功しなかった。したがって、最も有効であり、したがって、最も治療に役立つアンチセンス分子化合物の同定が、経験的な研究の結果であった。

【0107】

これら経験的な研究は、スプライシングプロセスに関与している可能性のあるモチーフを同定するためにコンピュータプログラムを使用することを含んでいた。また、他のコンピュータプログラムを用いて、広範囲に及ぶ二次構造を有していない可能性があり、したがって、アンチセンス分子のアニーリング部位になる可能性があるプレｍＲＮＡの領域を同定した。これらアプローチのいずれも、信頼性が高く且つ効率的にエキソンスキッピングを誘導するためのアンチセンスオリゴヌクレオチドの設計において完全に信頼できるとは証明されなかった。

【0108】

先ず、スプライシングに関与する公知の又は予測されるモチーフ又は領域に基づいて、試験のためにヒトジストロフィンプレｍＲＮＡにおけるアニーリング部位を選択した。調査中の標的配列に対して相補的であるように２ＯＭｅアンチセンスオリゴヌクレオチドを設計し、Ｅｘｐｅｄｉｔｅ８９０９核酸合成機で合成した。合成が完了したら、オリゴヌクレオチドを支持カラムから切断し、水酸化アンモニウムで脱保護した後、脱塩した。オリゴヌクレオチド合成の品質は、合成ログで検出するとき、合成中の各脱保護工程におけるトリチルシグナルの強度によってモニターした。アンチセンスオリゴヌクレオチドの濃度は、希釈したアリコートの吸光度を２６０ｎｍで測定することによって推定した。

【0109】

次いで、特定の量のアンチセンス分子を、下記の通りインビトロアッセイにおいてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【0110】

簡潔に述べると、正常な筋芽細胞の一次培養物を、インフォームドコンセント後に得たヒトの筋肉生検から調製した。標準的な培養技術を用いて細胞を増殖させ、筋管に分化させた。次いで、カチオン性リポプレックス、アンチセンス分子の混合物、又はカチオン性リポソーム調製物として細胞にオリゴヌクレオチドを送達することにより、アンチセンスオリゴヌクレオチドで前記細胞をトランスフェクトした。

【0111】

次いで、細胞を更に２４時間増殖させた後、全ＲＮＡを抽出し、分子分析を開始した。逆転写酵素増幅（ＲＴ−ＰＣＲ）を行って、ジストロフィンプレｍＲＮＡの標的となる領域又はエキソンの再構成の誘導について試験した。

【0112】

例えば、エキソン１９のスキッピングを誘導するためのアンチセンス分子の試験においては、ＲＴ−ＰＣＲ試験によって幾つかのエキソンを走査して、任意の隣接するエキソンの存在を検出した。例えば、エキソン１９のスキッピングを誘導するとき、エキソン１７から２１に亘って増幅するプライマーを用いてＲＴ−ＰＣＲを実施した。また、この領域における更に大きな生成物（即ち、エキソン１３〜２６）を増幅させて、より短い誘導及びスキッピングされた転写産物についての最小限の増幅バイアスしか存在しないことを保証した。より短い生成物又はエキソンスキッピングされた生成物は、より効率的に増幅される傾向があり、正常且つ誘導された転写産物の推定値にバイアスをかける可能性がある。

【0113】

増幅反応産物のサイズは、アガロースゲルにおいて推定し、適切なサイズ標準と比較した。これら産物のアイデンティティの最終的な確認は、直接ＤＮＡの配列を決定して、正確な又は予測されるエキソン接合が維持されていることを確認することにより実施した。

【0114】

１つのアンチセンス分子で効率的にエキソンスキッピングが誘導されたら、次の重複するアンチセンス分子を合成し、次いで、上記の通りのアッセイにおいて評価することができる。約３００ｎＭ以下のトランスフェクション濃度で強力且つ持続的なエキソンスキッピングを誘導する分子を効率的なアンチセンス分子と定義した。本発明のオリゴヌクレオチド分子は、１００ｎＭの濃度にて３０％超のレベルでスキッピングを誘導できることが最も好ましい。

【0115】

濃度測定方法
どのアンチセンス分子が望ましい効率を達成するかを判定するために、エキソンスキッピング手順の結果の濃度測定分析を実施した。増幅産物を２％アガロースゲルで分画し、エチジウムブロマイドで染色し、Ｃｈｅｍｉ−Ｓｍａｒｔ ３０００ゲルドキュメンテーションシステム（Ｖｉｌｂｅｒ Ｌｏｕｒｍａｔ，Ｍａｒｎｅ Ｌａ Ｖａｌｌｅｅ）によって画像を取得した。次いで、製造業者の説明書に従ってゲルドキュメンテーションシステム（Ｂｉｏ−Ｐｒｏｆｉｌ，Ｂｉｏ−１Ｄバージョン１１．９，Ｖｉｌｂｅｒ Ｌｏｕｒｍａｔ，Ｍａｒｎｅ Ｌａ Ｖａｌｌｅｅ）を用いてバンドを分析した。

【0116】

以下のアンチセンス分子について濃度測定を実施した。

【表3】

【0117】

エキソン１７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いて、ヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【0118】

以下の表２から、同部位（エキソン１７のアクセプタースプライス部位）を対象とするアンチセンス分子の効果は、２つのアンチセンス分子の結合箇所が重複しているにもかかわらず、非常に異なる場合があることが分かる。イントロン１６の最後の７塩基及びエキソン１７の最初の２３塩基にアニーリングするＨ１７Ａ（−０７＋２３）［配列番号３］は、２５ｎＭの濃度で細胞に送達されたときエキソン１７のスキッピングを誘導する。対照的に、イントロンの最後の１２塩基及びエキソン１７の最初の１８塩基にアニーリングし、したがって、Ｈ１７Ａ（−０７＋２３）の結合箇所と重複するアンチセンス分子Ｈ１７Ａ（−１２＋１８）は、エキソンスキッピングを全く誘導することができなかった。更に、イントロン１６の最後の７塩基及びエキソン１７の最初の１６塩基にアニーリングするＨ１７Ａ（−０７＋１６）は、２００ｎＭでエキソン１７及びエキソン１８の両方をスキッピングした。エキソン１７のエキソン内スプライシングエンハンサーエレメントモチーフにおいて結合するアンチセンス分子Ｈ１７Ａ（＋６１＋８６）［配列番号４］も、良好にスキッピングを誘導することができた。アンチセンス分子がエキソンスキッピングを誘導する能力は、結合箇所から単純に予測することはできず、厳密な試験を通して判定しなければならないことが分かる。

【表4】

【0119】

このデータは、一部の特定のアンチセンス分子は効率的にエキソンスキッピングを誘導するが、近傍又は重複する領域を標的とする別のアンチセンス分子は、誘導効率が遥かに低い場合があることを示す。力価測定研究は、ある分子は２０ｎＭ〜２５ｎＭで標的とするエキソンスキッピングを誘導することができるが、効率の低いアンチセンス分子は、３００ｎＭ以上の濃度でしかエキソンスキッピングを誘導することができなかったことを示す。したがって、スプライシングプロセスに関与しているモチーフに対するアンチセンス分子のターゲティングは、化合物の全体的な有効性において重要な役割を果たしていることが示された。

【0120】

有効性とは、標的エキソンの一貫したスキッピングを誘導する能力を示す。しかし、時に、標的エキソンのスキッピングは、隣接するエキソンに一貫して関連している。即ち、幾つかのエキソンのスプライシングが緊密に連携していることが見出された。例えば、エキソンのドナー部位を対象とするアンチセンス分子を用いて筋ジストロフィーのマウスモデルにおけるエキソン２３を標的とした場合、エキソン２２及び２３が欠損しているジストロフィンが検出されることが多い。別の例として、ヒトジストロフィン遺伝子のエキソン８を対象とするアンチセンス分子を用いる場合、多くの誘導された転写産物は、エキソン８及び９の両方が欠損している。

【0121】

エキソン２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表5】

【0122】

エキソン３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【0123】

アンチセンス分子Ｈ３Ａ（＋３０＋６０）［配列番号３１］及びＨ３Ａ（＋６１＋８５）［配列番号３２］を各々単独で用いてもエキソン３のスキッピングを誘導するが、組み合わせると、２つの分子はスキッピングの誘導について更により有効であり（図３）、また、３００ｎＭ及び６００ｎＭでエキソン４及び５のスキッピングを誘導することができる。この結果は、各アンチセンス分子を単独で使用した結果からは分からない、即ち推測できない。上記更なる生成物では、ＲＴ−ＰＣＲから持ち越した外側のプライマーによる増幅からエキソン３が欠損している転写産物が生じ、ヘテロ二重鎖が形成される。

【表6】

【0124】

エキソン４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図４は、Ｈ４Ａ（＋１１＋４０）［配列番号３３］及びＨ４Ｄ（＋１４−１１）［配列番号３４］のカクテルを用いるエキソン４のスキッピングを示す。

【表7】

【0125】

エキソン５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。Ｈ５Ｄ（＋２６−０５）は、エキソン５の低レベルのスキッピングでさえも誘導することができなかったので、好ましくないアンチセンス分子とみなされる。しかし、エキソンスキッピングエンハンサーエレメントを標的とする可能性があるＨ５Ａ（＋３５＋６５）［配列番号１］は、図５に示す標的エキソンのスキッピングの誘導について非常に効率的であることが見出されており、エキソン５のスキッピングを誘導するのに好ましい化合物であるとみなされる。

【表8】

【0126】

エキソン６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表9】

【0127】

エキソン７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表10】

【0128】

エキソン８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図６を参照されたい。

【表11】

【0129】

エキソン９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表12】

【0130】

エキソン１０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。エキソン１０及び周囲のエキソンのスキッピングを誘導する単一アンチセンスオリゴヌクレオチド分子及びカクテルの例については図７を参照されたい。単一アンチセンスオリゴヌクレオチド分子Ｈ１０Ａ（−０５＋１６）［配列番号３７］は、エキソン９〜１４のスキッピングを誘導することができ、一方、Ｈ１０Ａ（＋９８＋１１９）［配列番号３８］との組み合わせは、エキソン１０単独及びエキソン９〜１２のスキッピング（一部はエキソン１０〜１２のスキッピング）を誘導することができた。Ｈ１０Ａ（−０５＋１６）とＨ１０Ａ（＋１３０＋１４９）との組み合わせは、エキソン１０及びエキソン９〜１２のスキッピングを誘導することができた。

【表13】

【0131】

エキソン１１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図３７を参照されたい。

【表14】

【0132】

エキソン１２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図３８を参照されたい。

【表15】

【0133】

エキソン１３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表16】

【0134】

エキソン１４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図８を参照されたい。

【表17】

【0135】

エキソン１６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表18】

【0136】

エキソン１７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表19】

【0137】

エキソン１８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図９を参照されたい。

【表20】

【0138】

エキソン１９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン１９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表21】

【0139】

エキソン２０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン２０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表22】

【0140】

エキソン２３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン２３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。エキソン２３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。Ｈ２３（＋６９＋９８）−ＳＮＰは、既に文書化されている一塩基多型（ＳＮＰ）を含有する。

【表23】

【0141】

エキソン２４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン２４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表24】

【0142】

エキソン２５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン２５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。オリゴヌクレオチドＨ２５Ａ（＋９５＋１１９）−ＤｕｐＡは、患者特異的アンチセンス分子である。

【表25】

【0143】

エキソン２６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン２６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１０を参照されたい。

【表26】

【0144】

エキソン３１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表27】

【0145】

エキソン３２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表28】

【0146】

エキソン３４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表29】

【0147】

エキソン３５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表30】

【0148】

エキソン３６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１１を参照されたい。

【表31】

【0149】

エキソン３８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表32】

【0150】

エキソン３９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン３９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表33】

【0151】

エキソン４１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表34】

【0152】

エキソン４２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表35】

【0153】

エキソン４３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１２を参照されたい。

【表36】

【0154】

エキソン４４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１３及び３９を参照されたい。

【表37】

【0155】

エキソン４５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１４及び４０を参照されたい。

【表38】

【0156】

エキソン４６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１５及び４４を参照されたい。

【表39】

【0157】

エキソン４４〜４６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４４〜４６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表40】

【0158】

エキソン４７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１６を参照されたい。

【表41】

【0159】

エキソン４８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１７を参照されたい。

【表42】

【0160】

エキソン４９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン４９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１８を参照されたい。

【表43】

【0161】

エキソン５０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図１９及び３３を参照されたい。

【表44】

【0162】

エキソン５１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２０及び４１を参照されたい。

【表45】

【0163】

エキソン５２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図４２を参照されたい。

【表46】

【0164】

エキソン５３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図４３を参照されたい。

【表47】

【0165】

エキソン５４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２１を参照されたい。

【表48】

【0166】

エキソン５５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２２を参照されたい。

【表49】

【0167】

エキソン５６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２３を参照されたい。

【表50】

【0168】

エキソン５７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２４を参照されたい。

【表51】

【0169】

エキソン５９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン５９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２５を参照されたい。

【表52】

【0170】

エキソン６０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２６を参照されたい。

【表53】

【0171】

エキソン６１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表54】

【0172】

エキソン６２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表55】

【0173】

エキソン６３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２７を参照されたい。

【表56】

【0174】

エキソン６４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２８を参照されたい。

【表57】

【0175】

エキソン６５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６５を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表58】

【0176】

エキソン６６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図２９を参照されたい。

【表59】

【0177】

エキソン６７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６７を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図３０を参照されたい。

【表60】

【0178】

エキソン６８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６８を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。図３１を参照されたい。

【表61】

【0179】

エキソン６９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン６９を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。エキソン６９及び７０の両方を除去するためのＨ６９Ａ（＋３２＋６０）及びＨ７０Ａ（−０６＋１８）のカクテルを示す図３２を参照されたい。

【表62】

【0180】

エキソン７０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７０を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表63】

【0181】

エキソン７１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７１を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表64】

【0182】

エキソン７２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７２を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表65】

【0183】

エキソン７３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７３を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表66】

【0184】

エキソン７４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７４を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表67】

【0185】

エキソン７６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
エキソン７６を対象とするアンチセンスオリゴヌクレオチドを調製し、上記方法と同様の方法を用いてヒト筋肉細胞においてエキソンスキッピングを誘導する能力について試験した。

【表68】

【0186】

本発明の様々な実施形態を実施する上記形態の変形例は、開示されている発明に関連する上記教示に基づいて当業者に明らかになるであろう。本発明の上記実施形態は、単なる例示であり、如何なる方法でも限定するものと解釈すべきではない。

【図2】

【図46B】

【図1】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【図9】

【図10】

【図11】

【図12】

【図13】

【図14】

【図15】

【図16】

【図17】

【図18】

【図19】

【図20】

【図21】

【図22】

【図23】

【図24】

【図25】

【図26】

【図27】

【図28】

【図29】

【図30】

【図31】

【図32】

【図33】

【図34】

【図35】

【図36】

【図37】

【図38】

【図39】

【図40】

【図41】

【図42】

【図43】

【図44】

【図45】

【図46A】

【配列表】

[この文献には参照ファイルがあります.J-PlatPatにて入手可能です(IP Forceでは現在のところ参照ファイルは掲載していません)]