【実施例】
【0047】
2次元液体クロマトグラフィー−質量分析(2D-LC MALDI TOF-MS)による認知機能障害疾患診断マーカーペプチドの探索
【0048】
(1)血清試料
以下、括弧の前は略称である。
AD(アルツハイマー病)40例、MCI(軽度認知障害)35例、DLB(レビー小体型認知症)13例、FTD(前頭側頭型認知症)7例、およびNDC(精神疾患に罹患していない被験者)21例からなる。
【0049】
(2)方法
血清25μlの各々に475μlの0.1%トリフルオロ酢酸(TFA)を加え、100℃で15分間煮沸した。その後、分子量1万以下のペプチドを回収するためにミリポア社YM-10を用いて限外ろ過を行った。次に以下のように、2D-LC MALDI TOF-MS法による分析を行った。すなわち、限外ろ過で回収されたサンプルを2次元HPLC(1次元目SCX陽イオン交換ならびに2次元目C18逆相カラム)を用いて1サンプルあたり合計382に分画した。SCX陽イオン交換カラムでは2つの画分に分画した、すなわちSCX 1は素通り画分、SCX 2は塩濃度100%で溶出した画分である。SCXで分画された2つの画分はそれぞれC18逆相カラムクロマトグラフィーにより191の画分に分画した。1画分は6秒で溶出し、保持時間(Retention Time)は溶出済み画分数−1に6秒を乗じて求められた。すべてのサンプルはオンラインで接続されたスポッティングロボット(AccuSpot, SHIMADZU)を用いてMALDI TOF/TOF型質量分析計(ultraflex TOF/TOF, BRUKER DALTONICS)用のMALDIターゲットプレート(MTP AnchorChip(TM) 600/384 plate(BRUKER DALTONICS))上のウエルにマトリックス溶液(α-シアノ-ヒドロキシケイ皮酸, α-CHCA)と混合しながらスポットし共結晶化した。ultraflex TOF/TOFに装着後した後、レーザーを照射しリフレクトロンモードで質量ならびにその質量におけるピーク面積(以下に述べる正規化プロセスを含む)を自動測定した。ピーク面積はマトリックス溶液に予め加えられた各ウエル当り250fmoleのbradykinin 1-7で正規化し、Area値とした。すなわち、サンプルの特定の質量におけるピーク面積をbradykinin 1-7から得られるピーク面積で割った値をArea値とした。このArea値はサンプル血清25μlに対応する。群間で血清中の存在量に差のあるペプチドの検出(差異解析)は、我々が開発した多群間統計解析ソフトウェアであるParnassum(TM)(MCBI)を用いて行った。存在量に差の認められたペプチドは、そのままultraflex TOF/TOFでMS/MSにてアミノ酸配列を決定し、その起源であるインタクトタンパク質またはペプチドを同定した。
【0050】
(3)結果
以下に、個々の被験者の血清を2D-LC MALDI TOF-MSに供して得られたデータについてParnassumソフトウェアで差異解析を行った結果を示す。
図1は1次元目のSCX陽イオン交換カラムで2つの画分に分画したもののうち、最初に分画される画分(SCX 1)を2次元目にC18逆相カラムで191の画分に分画した画分をMALDI TOF-MSで測定したスペクトルについて、横軸は単位荷電当たりの質量(m/z)を、縦軸は2次元目の逆相カラムクロマトグラフィーの保持時間で表した図である。図中の点はそれぞれ個々の被験者に由来するTOF-MSのピークであり、点が集合している部分は誤差範囲内で同一m/zかつ同一保持時間の1個のペプチドに由来するピークと規定し、これをクラスターとして示している。
図1の(A)で示された長方形内の点の集合はMarker Aのクラスターである。
【0051】
図2はMarker Aの差異解析の結果を示す。Marker Aは後に
図4に示すように、Complement C3由来ペプチドCO3である。
図2は認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)間の比較である。Area値は、NDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であった。
【0052】
図2の結果から、Marker Aがバイオマーカーとしてどの程度に有用であるかを評価するために受信者操作特性曲線(receiver operating characteristic curve, ROC曲線)による分析を行った。
図3のA)、B)はそれぞれAD対NDC、MCI対NDCの比較におけるROC曲線である。ROC曲線の下部の面積値(AUC of ROC)(以下、AUC値という)が1に近いほどバイオマーカーとしての有用性が高くなる。感度(sensitivity)と特異度(specificity)の代表的な値は
図3のA)、B)においてy軸上の100%の点からROC曲線に直線を引いたとき、その距離が最小となるROC曲線上の点の座標(図中のopen square)の値である。この点を与えるcutoff値が異なる群の間の分別に有用な閾値となり、そのときの感度と特異度(すなわち上述の代表的な値)がAUC値とともにバイオマーカーの有用性の指標となる。
図3のA)では、AD対NDCにおいて代表的な値としての感度(sensitivity)が73.0%、特異度(specificity)が100%、AUC値が0.88であり、B)ではMCI対NDCにおいて代表的な値としての感度(sensitivity)が70.6%、特異度(specificity)が89.5%、AUC値が0.83であった。
【0053】
以上の結果から、Marker AはAD患者およびMCI患者を精神疾患に罹患していない被験者(NDC)と区別するのに有用であることが分かった。とくに、MCIはADの前段階であることから、ADに移行する可能性がある被験者を早期に診断、検出するマーカーとしてMarker Aはきわめて有用と考えられる。
【0054】
図4はMarker Aについて、ultraflex TOF/TOF型質量分析計でMS/MS解析した結果を示す。y-ion、b-ion、a-ionを示すシグナルが十分に現れており、アミノ酸配列が容易に決定できた。この結果についてMascotによる検索を行い、その起源であるタンパク質またはペプチド(以下、インタクトタンパク質またはペプチドという)がComplement C3と同定され、検出されたペプチドがこのたんぱく質に由来するアミノ酸配列APVIHQEMIGGLRNであることが明らかとなった。検出されたペプチドについてはUniProtのEntry NameであるCO3をペプチド名の略称として用いる。以下、CO3以外のペプチドについても同様とする。
【0055】
Marker Aを含め、群間で血清中の存在量に差のあるペプチドをultraflex TOF/TOFにてMS/MSを行い、アミノ酸配列を決定するとともに、インタクトタンパク質またはペプチドを同定した。結果を以下に示す。Marker A以外のペプチドについてもy-ionおよびb-ionを示すシグナルが十分に現れており、アミノ酸配列が容易に決定できた。以下のアミノ酸配列は2つの配列のセットを1組として示しているが、そのうちの1番目の配列はインタクトタンパク質のアミノ酸配列であり、2番目の配列は検出されたペプチドの配列である。1番目の配列の下線部が検出されたペプチドの配列に対応している。配列中の(0001)から始まるアミノ酸配列はN末端側であることを表わす。
【0056】
〔1〕 Complement C3由来ペプチド CO3
配列番号2のCO3はParnassum(TM)を用いたクラスタリングにより、
図1のクラスターを形成していた。
図2に示すように、Area値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号2のCO3は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(
図3のA)、B)、表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 SPMYSIITPN ILRLESEETM VLEAHDAQGD VPVTVTVHDF PGKKLVLSSE
0051 KTVLTPATNH MGNVTFTIPA NREFKSEKGR NKFVTVQATF GTQVVEKVVL
0101 VSLQSGYLFI QTDKTIYTPG STVLYRIFTV NHKLLPVGRT VMVNIENPEG
0151 IPVKQDSLSS QNQLGVLPLS WDIPELVNMG QWKIRAYYEN SPQQVFSTEF
0201 EVKEYVLPSF EVIVEPTEKF YYIYNEKGLE VTITARFLYG KKVEGTAFVI
0251 FGIQDGEQRI SLPESLKRIP IEDGSGEVVL SRKVLLDGVQ NPRAEDLVGK
0301 SLYVSATVIL HSGSDMVQAE RSGIPIVTSP YQIHFTKTPK YFKPGMPFDL
0351 MVFVTNPDGS PAYRVPVAVQ GEDTVQSLTQ GDGVAKLSIN THPSQKPLSI
0401 TVRTKKQELS EAEQATRTMQ ALPYSTVGNS NNYLHLSVLR TELRPGETLN
0451 VNFLLRMDRA HEAKIRYYTY LIMNKGRLLK AGRQVREPGQ DLVVLPLSIT
0501 TDFIPSFRLV AYYTLIGASG QREVVADSVW VDVKDSCVGS LVVKSGQSED
0551 RQPVPGQQMT LKIEGDHGAR VVLVAVDKGV FVLNKKNKLT QSKIWDVVEK
0601 ADIGCTPGSG KDYAGVFSDA GLTFTSSSGQ QTAQRAELQC PQPAARRRRS
0651 VQLTEKRMDK VGKYPKELRK CCEDGMRENP MRFSCQRRTR FISLGEACKK
0701 VFLDCCNYIT ELRRQHARAS HLGLARSNLD EDIIAEENIV SRSEFPESWL
0751 WNVEDLKEPP KNGISTKLMN IFLKDSITTW EILAVSMSDK KGICVADPFE
0801 VTVMQDFFID LRLPYSVVRN EQVEIRAVLY NYRQNQELKV RVELLHNPAF
0851 CSLATTKRRH QQTVTIPPKS SLSVPYVIVP LKTGLQEVEV KAAVYHHFIS
0901 DGVRKSLKVV PEGIRMNKTV AVRTLDPERL GREGVQKEDI PPADLSDQVP
0951 DTESETRILL QGTPVAQMTE DAVDAERLKH LIVTPSGCGE QNMIGMTPTV
1001 IAVHYLDETE QWEKFGLEKR QGALELIKKG YTQQLAFRQP SSAFAAFVKR
1051 APSTWLTAYV VKVFSLAVNL IAIDSQVLCG AVKWLILEKQ KPDGVFQED
A
1101
PVIHQEMIGG LRNNNEKDMA LTAFVLISLQ EAKDICEEQV NSLPGSITKA
1151 GDFLEANYMN LQRSYTVAIA GYALAQMGRL KGPLLNKFLT TAKDKNRWED
1201 PGKQLYNVEA TSYALLALLQ LKDFDFVPPV VRWLNEQRYY GGGYGSTQAT
1251 FMVFQALAQY QKDAPDHQEL NLDVSLQLPS RSSKITHRIH WESASLLRSE
1301 ETKENEGFTV TAEGKGQGTL SVVTMYHAKA KDQLTCNKFD LKVTIKPAPE
1351 TEKRPQDAKN TMILEICTRY RGDQDATMSI LDISMMTGFA PDTDDLKQLA
1401 NGVDRYISKY ELDKAFSDRN TLIIYLDKVS HSEDDCLAFK VHQYFNVELI
1451 QPGAVKVYAY YNLEESCTRF YHPEKEDGKL NKLCRDELCR CAEENCFIQK
1501 SDDKVTLEER LDKACEPGVD YVYKTRLVKV QLSNDFDEYI MAIEQTIKSG
1551 SDEVQVGQQR TFISPIKCRE ALKLEEKKHY LMWGLSSDFW GEKPNLSYII
1601 GKDTWVEHWP EEDECQDEEN QKQCQDLGAF TESMVVFGCP N(配列番号1)
【0057】
Complement C3由来ペプチド CO3
APVIHQEMIG GLRN(配列番号2)
【0058】
〔2〕 Transcription factor AP-2 gamma由来ペプチド AP2C
配列番号4のAP2CのArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図5)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号4のAP2Cは有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 MLWKITDNVK YEEDCEDRHD GSSNGNPRVP HLSSAGQHLY SPAPPLSHTG
0051 VAEYQPPPYF PPPYQQLAYS QSADPYSHLG EAYAAAINPL HQPAPTGSQQ
0101 QAW
PGRQSQE GAGLPSHHGR PAGLLPHLSG LEAGAVSARR DAYRRSDLLL
0151 PHAHALDAAG LAENLGLHDM PHQMDEVQNV DDQHLLLHDQ TVIRKGPISM
0201 TKNPLNLPCQ KELVGAVMNP TEVFCSVPGR LSLLSSTSKY KVTVAEVQRR
0251 LSPPECLNAS LLGGVLRRAK SKNGGRSLRE KLDKIGLNLP AGRRKAAHVT
0301 LLTSLVEGEA VHLARDFAYV CEAEFPSKPV AEYLTRPHLG GRNEMAARKN
0351 MLLAAQQLCK EFTELLSQDR TPHGTSRLAP VLETNIQNCL SHFSLITHGF
0401 GSQAICAAVS ALQNYIKEAL IVIDKSYMNP GDQSPADSNK TLEKMEKHRK(配列番号3)
【0059】
Transcription factor AP-2 gamma由来ペプチド AP2C
PGRQSQEGAG LPSHHG(配列番号4)
【0060】
〔3〕 Synapsin-3由来ペプチド SYN3
配列番号6のSYN3のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図6)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号6のSYN3は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 MNFLRRRLSD SSFMANLPNG YMTDLQRPDS STSSPASPAM ERRHPQPLAA
0051 SFSSPGSSLF SSLSSAMKQA PQATSGLMEP PGPSTPIVQR PRILLVIDDA
0101 HTDWSKYFHG KKVNGEIEIR VEQAEFSELN LAAYVTGGCM VDMQVVRNGT
0151 KVVSRSFKPD FILVRQHAYS MALGEDYRSL VIGLQYGGLP AVNSLYSVYN
0201 FCSKPWVFSQ LIKIFHSLGP EKFPLVEQTF FPNHKPMVTA PHFPVVVKLG
0251 HAHAGMGKIK VENQLDFQDI TSVVAMAKTY ATTEAFIDSK YDIRIQKIGS
0301 NYKAYMRTSI SGNWKANTGS AMLEQVAMTE RYRLWVDSCS
EMFGGLDICA
0351
VKAVHSKDGR DYIIEVMDSS MPLIGEHVEE DRQLMADLVV SKMSQLPMPG
0401 GTAPSPLRPW APQIKSAKSP GQAQLGPQLG QPQPRPPPQG GPRQAQSPQP
0451 QRSGSPSQQR LSPQGQQPLS PQSGSPQQQR SPGSPQLSRA SSGSSPNQAS
0501 KPGATLASQP RPPVQGRSTS QQGEESKKPA PPHPHLNKSQ SLTNSLSTSD
0551 TSQRGTPSED EAKAETIRNL RKSFASLFSD(配列番号5)
【0061】
Synapsin-3由来ペプチド SYN3
EMFGGLDICA VKAVHSK(配列番号6)
【0062】
〔4〕 Oxytocin receptor由来ペプチド OXYR
配列番号8のOXYRのArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図7)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号8のOXYRは有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 MEGALAANWS AEAANAS
AAP PGAEGNRTAG PPRRNEALAR VEVAVLCLIL
0051 LLALSGNACV LLALRTTRQK HSRLFFFMKH LSIADLVVAV FQVLPQLLWD
0101 ITFRFYGPDL LCRLVKYLQV VGMFASTYLL LLMSLDRCLA ICQPLRSLRR
0151 RTDRLAVLAT WLGCLVASAP QVHIFSLREV ADGVFDCWAV FIQPWGPKAY
0201 ITWITLAVYI VPVIVLAACY GLISFKIWQN LRLKTAAAAA AEAPEGAAAG
0251 DGGRVALARV SSVKLISKAK IRTVKMTFII VLAFIVCWTP FFFVQMWSVW
0301 DANAPKEASA FIIVMLLASL NSCCNPWIYM LFTGHLFHEL VQRFLCCSAS
0351 YLKGRRLGET SASKKSNSSS FVLSHRSSSQ RSCSQPSTA(配列番号7)
【0063】
Oxytocin receptor由来ペプチド OXYR
AAPPGAEGNR T(配列番号8)
【0064】
〔5〕 Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5-like protein由来ペプチド ITH5L
配列番号10のITH5LのArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図8)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号10のITH5Lは有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPPVPASSST KLLMTSYSMR STVVSRYAHT LVTSVLFNPH AEAHEAIFDL
0051 DLPHLAFISN FTMTINNKVY IAEVKEKHQA KKIYEEAHQQ GKTAAHVGIR
0101 DRESEKFRIS TSLAAGTEVT FSLAYEELLQ RHQGQYQLVV SLRPGQLVKR
0151 LSIEVTVSER TGISYVHIPP LRTGRLRTNA HASEVDSPPS TRIERGETCV
0201 RITYCPTLQD QSSISGSGIM ADFLVQYDVV MEDIIGDVQI YDDYFIHYFA
0251 PRGLPPMEKN VVFVIDVSSS MFGTKMEQTK TAMNVILSDL QANDYFNIIS
0301 FSDTVNVWKA GGSIQATIQN VHSAKDYLHC MEADGWTDVN SALLAAASVL
0351 NHSNQEPGRG PSVGRIPLII FLTDGEPTAG VTTPSVILSN VRQALGH
RVS
0401
LFSLAFGDDA DFTLLRRLSL ENRGIARRIY EDTDAALQLK GLYEEISMPL
0451 LADVRLNYLG GLVGASPWAV FPNYFGGSEL VVAGQVQPGK QELGIHLAAR
0501 GPKDQLLVAH HSEGATNNSQ KAFGCPGEPA PNVAHFIRRL WAYVTIGELL
0551 DAHFQARDTT TRHLLAAKVL NLSLEYNFVT PLTSLVMVQP KQASEETRRQ
0601 TSTSAGPDTI MPSSSSRHGL GVSTAQPALV PKVISPKSRP VKPKFYLSST
0651 TTASTKKMLS SKELEPLGES PHTLSMPTYP KAKIPAQQDS GTLAQPTLRT
0701 KPTILVPSNS GTLLPLKPGS LSHQNPDILP TNSRTQVPPV KPGIPASPKA
0751 DTVKCVTPLH SKPGAPSHPQ LGALTSQAPK GLPQSRPGVS TLQVPKYPLH
0801 TRPRVPAPKT RNNMPHLGPG ILLSKTPKIL LSLKPSAPPH QISTSISLSK
0851 PETPNPHMPQ TPLPPRPDRP RPPLPESLST FPNTISSSTG PSSTTTTSVL
0901 GEPLPMPFTP TLPPGRFWHQ YDLLPGPQRT RQVLGPSRPG VPTMSLLNSS
0951 RPTPEGSPPN LPILLPSSIL PEAISLLLLP EELELLSESM VESKFVESLN
1001 PPAFYTFLTP DEDGSPNWDG NSEEILGGAG GSMESQGSSV GLAKGTLPSI
1051 FTFSSSVDGD PHFVIQIPHS EEKICFTLNG HPGDLLQLIE DPKAGLHVSG
1101 KLLGAPPRPG HKDQTRTYFQ IITVTTDKPR AYTITISRSS ISLRGEGTLR
1151 LSWDQPALLK RPQLELYVAA AARLTLRLGP YLEFLVLRHR YRHPSTLQLP
1201 HLGFYVANGS GLSPSARGLI GQFQHADIRL VTGPMGPCLR RHHGPDVPVI
1251 LGKRLLKDSP RLLPRWASCW LVKRSHVELL LGHPYLSYVL(配列番号9)
【0065】
Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H5-like protein由来ペプチド ITH5L
RVSLFSLAFG DDAD(配列番号10)
【0066】
〔6〕 E3 ubiquitin-protein ligase HERC2由来ペプチド HERC2
配列番号12のHERC2のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図9)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号12のHERC2は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 MPSESFCLAA QARLDSKWLK TDIQLAFTRD GLCGLWNEMV KDGEIVYTGT
0051 ESTQNGELPP RKDDSVEPSG TKKEDLNDKE KKDEEETPAP IYRAKSILDS
0101 WVWGKQPDVN ELKECLSVLV KEQQALAVQS ATTTLSALRL KQRLVILERY
0151 FIALNRTVFQ ENVKVKWKSS GISLPPVDKK SSRPAGKGVE GLARVGSRAA
0201 LSFAFAFLRR AWRSGEDADL CSELLQESLD ALRALPEASL FDESTVSSVW
0251 LEVVERATRF LRSVVTGDVH GTPATKGPGS IPLQDQHLAL AILLELAVQR
0301 GTLSQMLSAI LLLLQLWDSG AQETDNERSA QGTSAPLLPL LQRFQSIICR
0351 KDAPHSEGDM HLLSGPLSPN ESFLRYLTLP QDNELAIDLR QTAVVVMAHL
0401 DRLATPCMPP LCSSPTSHKG SLQEVIGWGL IGWKYYANVI GPIQCEGLAN
0451 LGVTQIACAE KRFLILSRNG RVYTQAYNSD TLAPQLVQGL ASRNIVKIAA
0501 HSDGHHYLAL AATGEVYSWG CGDGGRLGHG DTVPLEEPKV ISAFSGKQAG
0551 KHVVHIACGS TYSAAITAEG ELYTWGRGNY GRLGHGSSED EAIPMLVAGL
0601 KGLKVIDVAC GSGDAQTLAV TENGQVWSWG DGDYGKLGRG GSDGCKTPKL
0651 IEKLQDLDVV KVRCGSQFSI ALTKDGQVYS WGKGDNQRLG HGTEEHVRYP
0701 KLLEGLQGKK VIDVAAGSTH CLALTEDSEV HSWGSNDQCQ HFDTLRVTKP
0751 EPAALPGLDT KHIVGIACGP AQSFAWSSCS EWSIGLRVPF VVDICSMTFE
0801 QLDLLLRQVS EGMDGSADWP PPQEKECVAV ATLNLLRLQL HAAISHQVDP
0851 EFLGLGLGSI LLNSLKQTVV TLASSAGVLS TVQSAAQAVL QSGWSVLLPT
0901 AEERARALSA LLPCAVSGNE VNISPGRRFM IDLLVGSLMA DGGLESALHA
0951 AITAEIQDIE AKKEAQKEKE IDEQEANAST FHRSRTPLDK DLINTGICES
1001 SGKQCLPLVQ LIQQLLRNIA SQTVARLKDV ARRISSCLDF EQHSRERSAS
1051 LDLLLRFQRL LISKLYPGES IGQTSDISSP ELMGVGSLLK KYTALLCTHI
1101 GDILPVAASI ASTSWRHFAE VAYIVEGDFT GVLLPELVVS IVLLLSKNAG
1151 LMQEAGAVPL LGGLLEHLDR FNHLAPGKER DDHEELAWPG IMESFFTGQN
1201 CRNNEEVTLI RKADLENHNK DGGFWTVIDG KVYDIKDFQT QSLTGNSILA
1251 QFAGEDPVVA LEAALQFEDT RESMHAFCVG QYLEPDQEIV TIPDLGSLSS
1301 PLIDTERNLG LLLGLHASYL AMSTPLSPVE IECAKWLQSS IFSGGLQTSQ
1351 IHYSYNEEKD EDHCSSPGGT PASKSRLCSH RRALGDHSQA FLQAIADNNI
1401 QDHNVKDFLC QIERYCRQCH LTTPIMFPPE HPVEEVGRLL LCCLLKHEDL
1451 GHVALSLVHA GALGIEQVKH RTLPKSVVDV CRVVYQAKCS LIKTHQEQGR
1501 SYKEVCAPVI ERLRFLFNEL RPAVCNDLSI MSKFKLLSSL PRWRRIAQKI
1551 IRERRKKRVP KKPESTDDEE KIGNEESDLE EACILPHSPI NVDKRPIAIK
1601 SPKDKWQPLL STVTGVHKYK WLKQNVQGLY PQSPLLSTIA EFALKEEPVD
1651 VEKMRKCLLK QLERAEVRLE GIDTILKLAS KNFLLPSVQY AMFCGWQRLI
1701 PEGIDIGEPL TDCLKDVDLI PPFNRMLLEV TFGKLYAWAV QNIRNVLMDA
1751 SAKFKELGIQ PVPLQTITNE NPSGPSLGTI PQARFLLVML SMLTLQHGAN
1801 NLDLLLNSGM LALTQTALRL IGPSCDNVEE DMNASAQGAS ATVLEETRKE
1851 TAPVQLPVSG PELAAMMKIG TRVMRGVDWK WGDQDGPPPG LGRVIGELGE
1901 DGWIRVQWDT GSTNSYRMGK EGKYDL
KLAE LPAAAQPSAE DSDTEDDSEA
1951 EQTERNIHPT AMMFTSTINL LQTLCLSAGV HAEIMQSEAT KTLCGLLRML
2001 VESGTTDKTS SPNRLVYREQ HRSWCTLGFV RSIALTPQVC GALSSPQWIT
2051 LLMKVVEGHA PFTATSLQRQ ILAVHLLQAV LPSWDKTERA RDMKCLVEKL
2101 FDFLGSLLTT CSSDVPLLRE STLRRRRVRP QASLTATHSS TLAEEVVALL
2151 RTLHSLTQWN GLINKYINSQ LRSITHSFVG RPSEGAQLED YFPDSENPEV
2201 GGLMAVLAVI GGIDGRLRLG GQVMHDEFGE GTVTRITPKG KITVQFSDMR
2251 TCRVCPLNQL KPLPAVAFNV NNLPFTEPML SVWAQLVNLA GSKLEKHKIK
2301 KSTKQAFAGQ VDLDLLRCQQ LKLYILKAGR ALLSHQDKLR QILSQPAVQE
2351 TGTVHTDDGA VVSPDLGDMS PEGPQPPMIL LQQLLASATQ PSPVKAIFDK
2401 QELEAAALAV CQCLAVESTH PSSPGFEDCS SSEATTPVAV QHIRPARVKR
2451 RKQSPVPALP IVVQLMEMGF SRRNIEFALK SLTGASGNAS SLPGVEALVG
2501 WLLDHSDIQV TELSDADTVS DEYSDEEVVE DVDDAAYSMS TGAVVTESQT
2551 YKKRADFLSN DDYAVYVREN IQVGMMVRCC RAYEEVCEGD VGKVIKLDRD
2601 GLHDLNVQCD WQQKGGTYWV RYIHVELIGY PPPSSSSHIK IGDKVRVKAS
2651 VTTPKYKWGS VTHQSVGVVK AFSANGKDII VDFPQQSHWT GLLSEMELVP
2701 SIHPGVTCDG CQMFPINGSR FKCRNCDDFD FCETCFKTKK HNTRHTFGRI
2751 NEPGQSAVFC GRSGKQLKRC HSSQPGMLLD SWSRMVKSLN VSSSVNQASR
2801 LIDGSEPCWQ SSGSQGKHWI RLEIFPDVLV HRLKMIVDPA DSSYMPSLVV
2851 VSGGNSLNNL IELKTININP SDTTVPLLND CTEYHRYIEI AIKQCRSSGI
2901 DCKIHGLILL GRIRAEEEDL AAVPFLASDN EEEEDEKGNS GSLIRKKAAG
2951 LESAATIRTK VFVWGLNDKD QLGGLKGSKI KVPSFSETLS ALNVVQVAGG
3001 SKSLFAVTVE GKVYACGEAT NGRLGLGISS GTVPIPRQIT ALSSYVVKKV
3051 AVHSGGRHAT ALTVDGKVFS WGEGDDGKLG HFSRMNCDKP RLIEALKTKR
3101 IRDIACGSSH SAALTSSGEL YTWGLGEYGR LGHGDNTTQL KPKMVKVLLG
3151 HRVIQVACGS RDAQTLALTD EGLVFSWGDG DFGKLGRGGS EGCNIPQNIE
3201 RLNGQGVCQI ECGAQFSLAL TKSGVVWTWG KGDYFRLGHG SDVHVRKPQV
3251 VEGLRGKKIV HVAVGALHCL AVTDSGQVYA WGDNDHGQQG NGTTTVNRKP
3301 TLVQGLEGQK ITRVACGSSH SVAWTTVDVA TPSVHEPVLF QTARDPLGAS
3351 YLGVPSDADS SAASNKISGA SNSKPNRPSL AKILLSLDGN LAKQQALSHI
3401 LTALQIMYAR DAVVGALMPA AMIAPVECPS FSSAAPSDAS AMASPMNGEE
3451 CMLAVDIEDR LSPNPWQEKR EIVSSEDAVT PSAVTPSAPS ASARPFIPVT
3501 DDLGAASIIA ETMTKTKEDV ESQNKAAGPE PQALDEFTSL LIADDTRVVV
3551 DLLKLSVCSR AGDRGRDVLS AVLSGMGTAY PQVADMLLEL CVTELEDVAT
3601 DSQSGRLSSQ PVVVESSHPY TDDTSTSGTV KIPGAEGLRV EFDRQCSTER
3651 RHDPLTVMDG VNRIVSVRSG REWSDWSSEL RIPGDELKWK FISDGSVNGW
3701 GWRFTVYPIM PAAGPKELLS DRCVLSCPSM DLVTCLLDFR LNLASNRSIV
3751 PRLAASLAAC AQLSALAASH RMWALQRLRK LLTTEFGQSI NINRLLGEND
3801 GETRALSFTG SALAALVKGL PEALQRQFEY EDPIVRGGKQ LLHSPFFKVL
3851 VALACDLELD TLPCCAETHK WAWFRRYCMA SRVAVALDKR TPLPRLFLDE
3901 VAKKIRELMA DSENMDVLHE SHDIFKREQD EQLVQWMNRR PDDWTLSAGG
3951 SGTIYGWGHN HRGQLGGIEG AKVKVPTPCE ALATLRPVQL IGGEQTLFAV
4001 TADGKLYATG YGAGGRLGIG GTESVSTPTL LESIQHVFIK KVAVNSGGKH
4051 CLALSSEGEV YSWGEAEDGK LGHGNRSPCD RPRVIESLRG IEVVDVAAGG
4101 AHSACVTAAG DLYTWGKGRY GRLGHSDSED QLKPKLVEAL QGHRVVDIAC
4151 GSGDAQTLCL TDDDTVWSWG DGDYGKLGRG GSDGCKVPMK IDSLTGLGVV
4201 KVECGSQFSV ALTKSGAVYT WGKGDYHRLG HGSDDHVRRP RQVQGLQGKK
4251 VIAIATGSLH CVCCTEDGEV YTWGDNDEGQ LGDGTTNAIQ RPRLVAALQG
4301 KKVNRVACGS AHTLAWSTSK PASAGKLPAQ VPMEYNHLQE IPIIALRNRL
4351 LLLHHLSELF CPCIPMFDLE GSLDETGLGP SVGFDTLRGI LISQGKEAAF
4401 RKVVQATMVR DRQHGPVVEL NRIQVKRSRS KGGLAGPDGT KSVFGQMCAK
4451 MSSFGPDSLL LPHRVWKVKF VGESVDDCGG GYSESIAEIC EELQNGLTPL
4501 LIVTPNGRDE SGANRDCYLL SPAARAPVHS SMFRFLGVLL GIAIRTGSPL
4551 SLNLAEPVWK QLAGMSLTIA DLSEVDKDFI PGLMYIRDNE ATSEEFEAMS
4601 LPFTVPSASG QDIQLSSKHT HITLDNRAEY VRLAINYRLH EFDEQVAAVR
4651 EGMARVVPVP LLSLFTGYEL ETMVCGSPDI PLHLLKSVAT YKGIEPSASL
4701 IQWFWEVMES FSNTERSLFL RFVWGRTRLP RTIADFRGRD FVIQVLDKYN
4751 PPDHFLPESY TCFFLLKLPR YSCKQVLEEK LKYAIHFCKS IDTDDYARIA
4801 LTGEPAADDS SDDSDNEDVD SFASDSTQDY LTGH(配列番号11)
【0067】
E3 ubiquitin-protein ligase HERC2由来ペプチド HERC2
KLAELPAAAQ PSAEDSD(配列番号12)
【0068】
〔7〕 Prothrombin由来ペプチド THRB
配列番号14のTHRBのArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図10)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号14のTHRBは有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 ANTFLEEVRK GNLERECVEE TCSYEEAFEA LESSTATDVF WAKYTACETA
0051 RTPRDKLAAC LEGNCAEGLG TNYRGHVNIT RSGIECQLWR SRYPHKPEIN
0101 STTHPGADLQ ENFCRNPDSS TTGPWCYTTD PTVRRQECSI PVCGQDQVTV
0151 AMTPRSEGSS VNLSPPLEQC VPDRGQQYQG RLAVTTHGLP CLAWASAQAK
0201 ALSKHQDFNS AVQLVENFCR NPDGDEEGVW CYVAGKPGDF GYCDLNYCEE
0251 AVEEETGDGL DEDSDRAIEG R
TATSEYQTF FNPRTFGSGE ADCGLRPLFE
0301 KKSLEDKTER ELLESYIDGR IVEGSDAEIG MSPWQVMLFR KSPQELLCGA
0351 SLISDRWVLT AAHCLLYPPW DKNFTENDLL VRIGKHSRTR YERNIEKISM
0401 LEKIYIHPRY NWRENLDRDI ALMKLKKPVA FSDYIHPVCL PDRETAASLL
0451 QAGYKGRVTG WGNLKETWTA NVGKGQPSVL QVVNLPIVER PVCKDSTRIR
0501 ITDNMFCAGY KPDEGKRGDA CEGDSGGPFV MKSPFNNRWY QMGIVSWGEG
0551 CDRDGKYGFY THVFRLKKWI QKVIDQFGE(配列番号13)
【0069】
Prothrombin由来ペプチド THRB
TATSEYQTFF NPRTFGSGEA D(配列番号14)
【0070】
〔8〕 Transthyretin由来ペプチド TTHY
配列番号16のTTHYのArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図11)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号16のTTHYは有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPTGTGESKC PLMVKVLD
AV RGSPAINVAV HVFRKAADDT WEPFASGKTS
0051 ESGELHGLTT EEEFVEGIYK VEIDTKSYWK ALGISPFHEH AEVVFTANDS
0101 GPRRYTIAAL LSPYSYSTTA VVTNPKE(配列番号15)
【0071】
Transthyretin由来ペプチド TTHY
AVRGSPAINV AVHVFRKAAD(配列番号16)
【0072】
〔9〕 Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16由来ペプチド TNR16
配列番号18のTNR16のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図12)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号18のTNR16は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 KEACPTGLYT HSGECCKACN LGEGVAQPCG ANQTVCEPCL DSVTFSDVVS
0051 ATEPCKPCTE CVGLQSMSAP CVEADDAVCR CAYGYYQDET TGRCEACRVC
0101 EAGSGLVFSC QDKQNTVCEE CPDGTYSDEA NHVDPCLPCT VCEDTERQLR
0151 ECTRWADAEC EEIPGRWITR STPPEGSDST APSTQEPEAP PEQDLIASTV
0201 AGVVTTVMGS SQPVVTRGTT DNLIPVYCSI LAAVVVGLVA YIAFKRWNSC
0251 KQNKQGANSR PVNQTPPPEG EKLHSDSGIS VDSQSLHDQQ PHT
QTASGQA
0301
LKGDGGLYSS LPPAKREEVE KLLNGSAGDT WRHLAGELGY QPEHIDSFTH
0351 EACPVRALLA SWATQDSATL DALLAALRRI QRADLVESLC SESTATSPV(配列番号17)
【0073】
Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16由来ペプチド TNR16
QTASGQALKG DGGLYS(配列番号18)
【0074】
〔10〕 Complement C4-A由来ペプチド CO4-1
配列番号20のCO4-1のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図13)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号20のCO4-1は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
Complement C4-Aタンパク質は生合成後、プロセシングによりComplement C4 beta chain、Complement C4-A alpha chain、Complement C4 gamma chainに分かれる。配列番号19は、これらのすべてを含むインタクトタンパク質Complement C4-Aのアミノ酸配列である。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 KPRLLLFSPS VVHLGVPLSV GVQLQDVPRG QVVKGSVFLR NPSRNNVPCS
0051 PKVDFTLSSE RDFALLSLQV PLKDAKSCGL HQLLRGPEVQ LVAHSPWLKD
0101 SLSRTTNIQG INLLFSSRRG HLFLQTDQPI YNPGQRVRYR VFALDQKMRP
0151 STDTITVMVE NSHGLRVRKK EVYMPSSIFQ DDFVIPDISE PGTWKISARF
0201 SDGLESNSST QFEVKKYVLP NFEVKITPGK PYILTVPGHL DEMQLDIQAR
0251 YIYGKPVQGV AYVRFGLLDE DGKKTFFRGL ESQTKLVNGQ SHISLSKAEF
0301 QDALEKLNMG ITDLQGLRLY VAAAIIESPG GEMEEAELTS WYFVSSPFSL
0351 DLSKTKRHLV PGAPFLLQAL VREMSGSPAS GIPVKVSATV SSPGSVPEVQ
0401 DIQQNTDGSG QVSIPIIIPQ TISELQLSVS AGSPHPAIAR LTVAAPPSGG
0451 PGFLSIERPD SRPPRVGDTL NLNLRAVGSG ATFSHYYYMI LSRGQIVFMN
0501 REPKRTLTSV SVFVDHHLAP SFYFVAFYYH GDHPVANSLR VDVQAGACEG
0551 KLELSVDGAK QYRNGESVKL HLETDSLALV ALGALDTALY AAGSKSHKPL
0601 NMGKVFEAMN SYDLGCGPGG GDSALQVFQA AGLAFSDGDQ WTLSRKRLSC
0651 PKEKTTRKKR NVNFQKAINE KLGQYASPTA KRCCQDGVTR LPMMRSCEQR
0701 AARVQQPDCR EPFLSCCQFA ESLRKKSRDK GQAGLQRALE ILQEEDLIDE
0751 DDIPVRSFFP ENWLWRVETV DRFQILTLWL PDSLTTWEIH GLSLSKTKGL
0801 CVATPVQLRV FREFHLHLRL PMSVRRFEQL ELRPVLYNYL DKNLTVSVHV
0851 SPVEGLCLAG GGGLAQQVLV PAGSARPVAF SVVPTAAAAV SLKVVARGSF
0901 EFPVGDAVSK VLQIEKEGAI HREELVYELN PLDHRGRTLE IPGNSDPNMI
0951 PDGDFNSYVR VTASDPLDTL GSEGALSPGG VASLLRLPRG CGEQTMIYLA
1001 PTLAASRYLD KTEQWSTLPP ETKDHAVDLI QKGYMRIQQF RKADGSYAAW
1051 LSRDSSTWLT AFVLKVLSLA QEQVGGSPEK LQETSNWLLS QQQADGSFQD
1101 PCPVLDRSMQ GGLVGNDETV ALTAFVTIAL HHGLAVFQDE GAEPLKQRVE
1151 ASISKANSFL GEKASAGLLG AHAAAITAYA LSLTKAPVDL LGVAHNNLMA
1201 MAQETGDNLY WGSVTGSQSN AVSPTPAPRN PSDPMPQAPA LWIETTAYAL
1251 LHLLLHEGKA EMADQASAWL TRQGSFQGGF RSTQDTVIAL DALSAYWIAS
1301 HTTEERGLNV TLSSTGR
NGF KSHALQLNNR QIRGLEEELQ FSLGSKINVK
1351 VGGNSKGTLK VLRTYNVLDM KNTTCQDLQI EVTVKGHVEY TMEANEDYED
1401 YEYDELPAKD DPDAPLQPVT PLQLFEGRRN RRRREAPKVV EEQESRVHYT
1451 VCIWRNGKVG LSGMAIADVT LLSGFHALRA DLEKLTSLSD RYVSHFETEG
1501 PHVLLYFDSV PTSRECVGFE AVQEVPVGLV QPASATLYDY YNPERRCSVF
1551 YGAPSKSRLL ATLCSAEVCQ CAEGKCPRQR RALERGLQDE DGYRMKFACY
1601 YPRVEYGFQV KVLREDSRAA FRLFETKITQ VLHFTKDVKA AANQMRNFLV
1651 RASCRLRLEP GKEYLIMGLD GATYDLEGHP QYLLDSNSWI EEMPSERLCR
1701 STRQRAACAQ LNDFLQEYGT QGCQV(配列番号19)
【0075】
Complement C4由来ペプチド CO4-1
NGFKSHALQL NNRQIR(配列番号20)
【0076】
〔11〕 Complement C4-B由来ペプチド CO4-1
配列番号20のペプチドCO4-1はMS/MSおよび、MASCOTデータベース検索の結果から、Complement C4-A(配列番号19)およびComplement C4-Bのタンパク質に共通するトポロジカル領域部分に存在するアミノ酸配列である。
Complement C4-Bタンパク質は生合成後、プロセシングによりComplement C4 beta chain、Complement C4-B alpha chain、Complement C4 gamma chainに分かれる。配列番号21は、これらのすべてを含むインタクトタンパク質Complement C4-Bのアミノ酸配列である。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 KPRLLLFSPS VVHLGVPLSV GVQLQDVPRG QVVKGSVFLR NPSRNNVPCS
0051 PKVDFTLSSE RDFALLSLQV PLKDAKSCGL HQLLRGPEVQ LVAHSPWLKD
0101 SLSRTTNIQG INLLFSSRRG HLFLQTDQPI YNPGQRVRYR VFALDQKMRP
0151 STDTITVMVE NSHGLRVRKK EVYMPSSIFQ DDFVIPDISE PGTWKISARF
0201 SDGLESNSST QFEVKKYVLP NFEVKITPGK PYILTVPGHL DEMQLDIQAR
0251 YIYGKPVQGV AYVRFGLLDE DGKKTFFRGL ESQTKLVNGQ SHISLSKAEF
0301 QDALEKLNMG ITDLQGLRLY VAAAIIESPG GEMEEAELTS WYFVSSPFSL
0351 DLSKTKRHLV PGAPFLLQAL VREMSGSPAS GIPVKVSATV SSPGSVPEVQ
0401 DIQQNTDGSG QVSIPIIIPQ TISELQLSVS AGSPHPAIAR LTVAAPPSGG
0451 PGFLSIERPD SRPPRVGDTL NLNLRAVGSG ATFSHYYYMI LSRGQIVFMN
0501 REPKRTLTSV SVFVDHHLAP SFYFVAFYYH GDHPVANSLR VDVQAGACEG
0551 KLELSVDGAK QYRNGESVKL HLETDSLALV ALGALDTALY AAGSKSHKPL
0601 NMGKVFEAMN SYDLGCGPGG GDSALQVFQA AGLAFSDGDQ WTLSRKRLSC
0651 PKEKTTRKKR NVNFQKAINE KLGQYASPTA KRCCQDGVTR LPMMRSCEQR
0701 AARVQQPDCR EPFLSCCQFA ESLRKKSRDK GQAGLQRALE ILQEEDLIDE
0751 DDIPVRSFFP ENWLWRVETV DRFQILTLWL PDSLTTWEIH GLSLSKTKGL
0801 CVATPVQLRV FREFHLHLRL PMSVRRFEQL ELRPVLYNYL DKNLTVSVHV
0851 SPVEGLCLAG GGGLAQQVLV PAGSARPVAF SVVPTAAAAV SLKVVARGSF
0901 EFPVGDAVSK VLQIEKEGAI HREELVYELN PLDHRGRTLE IPGNSDPNMI
0951 PDGDFNSYVR VTASDPLDTL GSEGALSPGG VASLLRLPRG CGEQTMIYLA
1001 PTLAASRYLD KTEQWSTLPP ETKDHAVDLI QKGYMRIQQF RKADGSYAAW
1051 LSRDSSTWLT AFVLKVLSLA QEQVGGSPEK LQETSNWLLS QQQADGSFQD
1101 LSPVIHRSMQ GGLVGNDETV ALTAFVTIAL HHGLAVFQDE GAEPLKQRVE
1151 ASISKANSFL GEKASAGLLG AHAAAITAYA LSLTKAPVDL LGVAHNNLMA
1201 MAQETGDNLY WGSVTGSQSN AVSPTPAPRN PSDPMPQAPA LWIETTAYAL
1251 LHLLLHEGKA EMADQASAWL TRQGSFQGGF RSTQDTVIAL DALSAYWIAS
1301 HTTEERGLNV TLSSTGR
NGF KSHALQLNNR QIRGLEEELQ FSLGSKINVK
1351 VGGNSKGTLK VLRTYNVLDM KNTTCQDLQI EVTVKGHVEY TMEANEDYED
1401 YEYDELPAKD DPDAPLQPVT PLQLFEGRRN RRRREAPKVV EEQESRVHYT
1451 VCIWRNGKVG LSGMAIADVT LLSGFHALRA DLEKLTSLSD RYVSHFETEG
1501 PHVLLYFDSV PTSRECVGFE AVQEVPVGLV QPASATLYDY YNPERRCSVF
1551 YGAPSKSRLL ATLCSAEVCQ CAEGKCPRQR RALERGLQDE DGYRMKFACY
1601 YPRVEYGFQV KVLREDSRAA FRLFETKITQ VLHFTKDVKA AANQMRNFLV
1651 RASCRLRLEP GKEYLIMGLD GATYDLEGHP QYLLDSNSWI EEMPSERLCR
1701 STRQRAACAQ LNDFLQEYGT QGCQV(配列番号21)
【0077】
念のため、CO4-1の配列を以下に示す。
Complement C4由来ペプチド CO4-1
NGFKSHALQL NNRQIR(配列番号20)
【0078】
〔12〕 Complement C4-A由来ペプチド CO4-2
配列番号22のCO4-2のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図14)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号22のCO4-2は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
Complement C4-Aタンパク質は生合成後、プロセシングによりComplement C4 beta chain、Complement C4-A alpha chain、Complement C4 gamma chainに分かれる。配列番号19は、これらのすべてを含むインタクトタンパク質Complement C4-Aのアミノ酸配列である。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 KPRLLLFSPS VVHLGVPLSV GVQLQDVPRG QVVKGSVFLR NPSRNNVPCS
0051 PKVDFTLSSE RDFALLSLQV PLKDAKSCGL HQLLRGPEVQ LVAHSPWLKD
0101 SLSRTTNIQG INLLFSSRRG HLFLQTDQPI YNPGQRVRYR VFALDQKMRP
0151 STDTITVMVE NSHGLRVRKK EVYMPSSIFQ DDFVIPDISE PGTWKISARF
0201 SDGLESNSST QFEVKKYVLP NFEVKITPGK PYILTVPGHL DEMQLDIQAR
0251 YIYGKPVQGV AYVRFGLLDE DGKKTFFRGL ESQTKLVNGQ SHISLSKAEF
0301 QDALEKLNMG ITDLQGLRLY VAAAIIESPG GEMEEAELTS WYFVSSPFSL
0351 DLSKTKRHLV PGAPFLLQAL VREMSGSPAS GIPVKVSATV SSPGSVPEVQ
0401 DIQQNTDGSG QVSIPIIIPQ TISELQLSVS AGSPHPAIAR LTVAAPPSGG
0451 PGFLSIERPD SRPPRVGDTL NLNLRAVGSG ATFSHYYYMI LSRGQIVFMN
0501 REPKRTLTSV SVFVDHHLAP SFYFVAFYYH GDHPVANSLR VDVQAGACEG
0551 KLELSVDGAK QYRNGESVKL HLETDSLALV ALGALDTALY AAGSKSHKPL
0601 NMGKVFEAMN SYDLGCGPGG GDSALQVFQA AGLAFSDGDQ WTLSRKRLSC
0651 PKEKTTRKKR NVNFQKAINE KLGQYASPTA KRCCQDGVTR LPMMRSCEQR
0701 AARVQQPDCR EPFLSCCQFA ESLRKKSRDK GQAGLQRALE ILQEEDLIDE
0751 DDIPVRSFFP ENWLWRVETV DRFQILTLWL PDSLTTWEIH GLSLSKTKGL
0801 CVATPVQLRV FREFHLHLRL PMSVRRFEQL ELRPVLYNYL DKNLTVSVHV
0851 SPVEGLCLAG GGGLAQQVLV PAGSARPVAF SVVPTAAAAV SLKVVARGSF
0901 EFPVGDAVSK VLQIEKEGAI HREELVYELN PLDHRGRTLE IPGNSDPNMI
0951 PDGDFNSYVR VTASDPLDTL GSEGALSPGG VASLLRLPRG CGEQTMIYLA
1001 PTLAASRYLD KTEQWSTLPP ETKDHAVDLI QKGYMRIQQF RKADGSYAAW
1051 LSRDSSTWLT AFVLKVLSLA QEQVGGSPEK LQETSNWLLS QQQADGSFQD
1101 PCPVLDRSMQ GGLVGNDETV ALTAFVTIAL HHGLAVFQDE GAEPLKQRVE
1151 ASISKANSFL GEKASAGLLG AHAAAITAYA LSLTKAPVDL LGVAHNNLMA
1201 MAQETGDNLY WGSVTGSQSN AVSPTPAPRN PSDPMPQAPA LWIETTAYAL
1251 LHLLLHEGKA EMADQASAWL TRQGSFQGGF RSTQDTVIAL DALSAYWIAS
1301 HTTEERGLNV TLSSTGRNGF KSHALQLNNR QIRGLEEELQ FSLGSKINVK
1351 VGGNSKGTLK VLRTYNVLDM KNTTCQDLQI EVTVKGHVEY TMEANEDYED
1401 YEYDELPAKD DPD
APLQPVT PLQLFEGRRN RRRREAPKVV EEQESRVHYT
1451 VCIWRNGKVG LSGMAIADVT LLSGFHALRA DLEKLTSLSD RYVSHFETEG
1501 PHVLLYFDSV PTSRECVGFE AVQEVPVGLV QPASATLYDY YNPERRCSVF
1551 YGAPSKSRLL ATLCSAEVCQ CAEGKCPRQR RALERGLQDE DGYRMKFACY
1601 YPRVEYGFQV KVLREDSRAA FRLFETKITQ VLHFTKDVKA AANQMRNFLV
1651 RASCRLRLEP GKEYLIMGLD GATYDLEGHP QYLLDSNSWI EEMPSERLCR
1701 STRQRAACAQ LNDFLQEYGT QGCQV(配列番号19)
【0079】
Complement C4由来ペプチド CO4-2
APLQPVTPLQ LFEGRRN(配列番号22)
【0080】
〔13〕 Complement C4-B由来ペプチド CO4-2
配列番号22のペプチドCO4-2はMS/MSおよび、MASCOTデータベース検索の結果から、Complement C4-A(配列番号19)およびComplement C4-Bのタンパク質に共通するトポロジカル領域部分に存在するアミノ酸配列である。
Complement C4-Bタンパク質は生合成後、プロセシングによりComplement C4 beta chain、Complement C4-B alpha chain、Complement C4 gamma chainに分かれる。配列番号21は、これらのすべてを含むインタクトタンパク質Complement C4-Bのアミノ酸配列である。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 KPRLLLFSPS VVHLGVPLSV GVQLQDVPRG QVVKGSVFLR NPSRNNVPCS
0051 PKVDFTLSSE RDFALLSLQV PLKDAKSCGL HQLLRGPEVQ LVAHSPWLKD
0101 SLSRTTNIQG INLLFSSRRG HLFLQTDQPI YNPGQRVRYR VFALDQKMRP
0151 STDTITVMVE NSHGLRVRKK EVYMPSSIFQ DDFVIPDISE PGTWKISARF
0201 SDGLESNSST QFEVKKYVLP NFEVKITPGK PYILTVPGHL DEMQLDIQAR
0251 YIYGKPVQGV AYVRFGLLDE DGKKTFFRGL ESQTKLVNGQ SHISLSKAEF
0301 QDALEKLNMG ITDLQGLRLY VAAAIIESPG GEMEEAELTS WYFVSSPFSL
0351 DLSKTKRHLV PGAPFLLQAL VREMSGSPAS GIPVKVSATV SSPGSVPEVQ
0401 DIQQNTDGSG QVSIPIIIPQ TISELQLSVS AGSPHPAIAR LTVAAPPSGG
0451 PGFLSIERPD SRPPRVGDTL NLNLRAVGSG ATFSHYYYMI LSRGQIVFMN
0501 REPKRTLTSV SVFVDHHLAP SFYFVAFYYH GDHPVANSLR VDVQAGACEG
0551 KLELSVDGAK QYRNGESVKL HLETDSLALV ALGALDTALY AAGSKSHKPL
0601 NMGKVFEAMN SYDLGCGPGG GDSALQVFQA AGLAFSDGDQ WTLSRKRLSC
0651 PKEKTTRKKR NVNFQKAINE KLGQYASPTA KRCCQDGVTR LPMMRSCEQR
0701 AARVQQPDCR EPFLSCCQFA ESLRKKSRDK GQAGLQRALE ILQEEDLIDE
0751 DDIPVRSFFP ENWLWRVETV DRFQILTLWL PDSLTTWEIH GLSLSKTKGL
0801 CVATPVQLRV FREFHLHLRL PMSVRRFEQL ELRPVLYNYL DKNLTVSVHV
0851 SPVEGLCLAG GGGLAQQVLV PAGSARPVAF SVVPTAAAAV SLKVVARGSF
0901 EFPVGDAVSK VLQIEKEGAI HREELVYELN PLDHRGRTLE IPGNSDPNMI
0951 PDGDFNSYVR VTASDPLDTL GSEGALSPGG VASLLRLPRG CGEQTMIYLA
1001 PTLAASRYLD KTEQWSTLPP ETKDHAVDLI QKGYMRIQQF RKADGSYAAW
1051 LSRDSSTWLT AFVLKVLSLA QEQVGGSPEK LQETSNWLLS QQQADGSFQD
1101 LSPVIHRSMQ GGLVGNDETV ALTAFVTIAL HHGLAVFQDE GAEPLKQRVE
1151 ASISKANSFL GEKASAGLLG AHAAAITAYA LSLTKAPVDL LGVAHNNLMA
1201 MAQETGDNLY WGSVTGSQSN AVSPTPAPRN PSDPMPQAPA LWIETTAYAL
1251 LHLLLHEGKA EMADQASAWL TRQGSFQGGF RSTQDTVIAL DALSAYWIAS
1301 HTTEERGLNV TLSSTGRNGF KSHALQLNNR QIRGLEEELQ FSLGSKINVK
1351 VGGNSKGTLK VLRTYNVLDM KNTTCQDLQI EVTVKGHVEY TMEANEDYED
1401 YEYDELPAKD DPD
APLQPVT PLQLFEGRRN RRRREAPKVV EEQESRVHYT
1451 VCIWRNGKVG LSGMAIADVT LLSGFHALRA DLEKLTSLSD RYVSHFETEG
1501 PHVLLYFDSV PTSRECVGFE AVQEVPVGLV QPASATLYDY YNPERRCSVF
1551 YGAPSKSRLL ATLCSAEVCQ CAEGKCPRQR RALERGLQDE DGYRMKFACY
1601 YPRVEYGFQV KVLREDSRAA FRLFETKITQ VLHFTKDVKA AANQMRNFLV
1651 RASCRLRLEP GKEYLIMGLD GATYDLEGHP QYLLDSNSWI EEMPSERLCR
1701 STRQRAACAQ LNDFLQEYGT QGCQV(配列番号21)
【0081】
念のため、CO4-2の配列を以下に示す。
Complement C4由来ペプチド CO4-2
APLQPVTPLQ LFEGRRN(配列番号22)
【0082】
〔14〕 Fibrinogen alpha chain (isoform 1)由来ペプチド FIBA-1
配列番号24のFIBA-1のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図15)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号24のFIBA-1は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPRVVERHQS ACKDSDWPFC SDEDWNYKCP SGCRMKGLID EVNQDFTNRI
0051 NKLKNSLFEY QKNNKDSHSL TTNIMEILRG DFSSANNRDN TYNRVSEDLR
0101 SRIEVLKRKV IEKVQHIQLL QKNVRAQLVD MKRLEVDIDI KIRSCRGSCS
0151 RALAREVDLK DYEDQQKQLE QVIAKDLLPS RDRQHLPLIK MKPVPDLVPG
0201 NFKSQLQKVP PEWKALTDMP QMRMELERPG GNEITRGGST SYGTGSETES
0251 PRNPSSAGSW NSGSSGPGST GNRNPGSSGT GGTATWKPGS SGPGSTGSWN
0301 SGSSGTGSTG NQNPGSPRPG STGTWNPGSS ERGSAGHWTS ESSVSGSTGQ
0351 WHSESGSFRP DSPGSGNARP NNPDWGTFEE VSGNVSPGTR REYHTEKLVT
0401 SKGDKELRTG KEKVTSGSTT TTRRSCSKTV TKTVIGPDGH KEVTKEVVTS
0451 EDGSDCPEAM DLGTLSGIGT LDGFRHRHPD EAAFFDTAST GKTFPGFFSP
0501 MLGEFVSETE SRGSESGIFT NTKESSSHHP GIAEFPSRGK
SSSYSKQFTS
0551
STSYNRGDST FESKSYKMAD EAGSEADHEG THSTKRGHAK SRPVRDCDDV
0601 LQTHPSGTQS GIFNIKLPGS SKIFSVYCDQ ETSLGGWLLI QQRMDGSLNF
0651 NRTWQDYKRG FGSLNDEGEG EFWLGNDYLH LLTQRGSVLR VELEDWAGNE
0701 AYAEYHFRVG SEAEGYALQV SSYEGTAGDA LIEGSVEEGA EYTSHNNMQF
0751 STFDRDADQW EENCAEVYGG GWWYNNCQAA NLNGIYYPGG SYDPRNNSPY
0801 EIENGVVWVS FRGADYSLRA VRMKIRPLVT Q(配列番号23)
【0083】
Fibrinogen alpha chain由来ペプチド FIBA-1
SSSYSKQFTS STSYNRGDST FES(配列番号24)
【0084】
〔15〕 Fibrinogen alpha chain (isoform 2)由来ペプチド FIBA-1
配列番号24のペプチドFIBA-1はMS/MSおよび、MASCOTデータベース検索の結果から、Fibrinogen alpha chain (isoform 1)(配列番号23)および、Fibrinogen alpha chain (isoform 2)のタンパク質に共通するトポロジカル領域部分に存在するアミノ酸配列である。以下に配列番号25として、Fibrinogen alpha chain (isoform 2)インタクトタンパク質のアミノ酸配列を示す。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPRVVERHQS ACKDSDWPFC SDEDWNYKCP SGCRMKGLID EVNQDFTNRI
0051 NKLKNSLFEY QKNNKDSHSL TTNIMEILRG DFSSANNRDN TYNRVSEDLR
0101 SRIEVLKRKV IEKVQHIQLL QKNVRAQLVD MKRLEVDIDI KIRSCRGSCS
0151 RALAREVDLK DYEDQQKQLE QVIAKDLLPS RDRQHLPLIK MKPVPDLVPG
0201 NFKSQLQKVP PEWKALTDMP QMRMELERPG GNEITRGGST SYGTGSETES
0251 PRNPSSAGSW NSGSSGPGST GNRNPGSSGT GGTATWKPGS SGPGSTGSWN
0301 SGSSGTGSTG NQNPGSPRPG STGTWNPGSS ERGSAGHWTS ESSVSGSTGQ
0351 WHSESGSFRP DSPGSGNARP NNPDWGTFEE VSGNVSPGTR REYHTEKLVT
0401 SKGDKELRTG KEKVTSGSTT TTRRSCSKTV TKTVIGPDGH KEVTKEVVTS
0451 EDGSDCPEAM DLGTLSGIGT LDGFRHRHPD EAAFFDTAST GKTFPGFFSP
0501 MLGEFVSETE SRGSESGIFT NTKESSSHHP GIAEFPSRGK
SSSYSKQFTS
0551
STSYNRGDST FESKSYKMAD EAGSEADHEG THSTKRGHAK SRPVRGIHTS
0601 PLGKPSLSP(配列番号25)
【0085】
念のため、FIBA-1の配列を以下に示す。
Fibrinogen alpha chain由来ペプチド FIBA-1
SSSYSKQFTS STSYNRGDST FES(配列番号24)
【0086】
〔16〕 Fibrinogen alpha chain (isoform 1)由来ペプチド FIBA-2
配列番号26のFIBA-2のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図16)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号26のFIBA-2は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPRVVERHQS ACKDSDWPFC SDEDWNYKCP SGCRMKGLID EVNQDFTNRI
0051 NKLKNSLFEY QKNNKDSHSL TTNIMEILRG DFSSANNRDN TYNRVSEDLR
0101 SRIEVLKRKV IEKVQHIQLL QKNVRAQLVD MKRLEVDIDI KIRSCRGSCS
0151 RALAREVDLK DYEDQQKQLE QVIAKDLLPS RDRQHLPLIK MKPVPDLVPG
0201 NFKSQLQKVP PEWKALTDMP QMRMELERPG GNEITRGGST SYGTGSETES
0251 PRNPSSAGSW NSGSSGPGST GNRNPGSSGT GGTATWKPGS SGPGSTGSWN
0301 SGSSGTGSTG NQNPGSPRPG STGTWNPGSS ERGSAGHWTS ESSVSGSTGQ
0351 WHSESGSFRP DSPGSGNARP NNPDWGTFEE VSGNVSPGTR REYHTEKLVT
0401 SKGDKELRTG KEKVTSGSTT TTRRSCSKTV TKTVIGPDGH KEVTKEVVTS
0451 EDGSDCPEAM DLGTLSGIGT LDGFRHRHPD EAAFFDTAST GKTFPGFFSP
0501 MLGEFVSETE SRGSESGIFT NTKESSSHHP GIAEFPSRGK
SSSYSKQFTS
0551
STSYNRGDST FESKSYKMAD EAGSEADHEG THSTKRGHAK SRPVRDCDDV
0601 LQTHPSGTQS GIFNIKLPGS SKIFSVYCDQ ETSLGGWLLI QQRMDGSLNF
0651 NRTWQDYKRG FGSLNDEGEG EFWLGNDYLH LLTQRGSVLR VELEDWAGNE
0701 AYAEYHFRVG SEAEGYALQV SSYEGTAGDA LIEGSVEEGA EYTSHNNMQF
0751 STFDRDADQW EENCAEVYGG GWWYNNCQAA NLNGIYYPGG SYDPRNNSPY
0801 EIENGVVWVS FRGADYSLRA VRMKIRPLVT Q(配列番号23)
【0087】
Fibrinogen alpha chain由来ペプチド FIBA-2
SSSYSKQFTS STSYNRGDST FESKS(配列番号26)
【0088】
〔17〕 Fibrinogen alpha chain (isoform 2)由来ペプチド FIBA-2
配列番号26のペプチドFIBA-2はMS/MSおよび、MASCOTデータベース検索の結果から、Fibrinogen alpha chain (isoform 1)(配列番号23)および、Fibrinogen alpha chain (isoform 2)のタンパク質に共通するトポロジカル領域部分に存在するアミノ酸配列である。以下に配列番号25として、Fibrinogen alpha chain (isoform 2)インタクトタンパク質のアミノ酸配列を示す。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPRVVERHQS ACKDSDWPFC SDEDWNYKCP SGCRMKGLID EVNQDFTNRI
0051 NKLKNSLFEY QKNNKDSHSL TTNIMEILRG DFSSANNRDN TYNRVSEDLR
0101 SRIEVLKRKV IEKVQHIQLL QKNVRAQLVD MKRLEVDIDI KIRSCRGSCS
0151 RALAREVDLK DYEDQQKQLE QVIAKDLLPS RDRQHLPLIK MKPVPDLVPG
0201 NFKSQLQKVP PEWKALTDMP QMRMELERPG GNEITRGGST SYGTGSETES
0251 PRNPSSAGSW NSGSSGPGST GNRNPGSSGT GGTATWKPGS SGPGSTGSWN
0301 SGSSGTGSTG NQNPGSPRPG STGTWNPGSS ERGSAGHWTS ESSVSGSTGQ
0351 WHSESGSFRP DSPGSGNARP NNPDWGTFEE VSGNVSPGTR REYHTEKLVT
0401 SKGDKELRTG KEKVTSGSTT TTRRSCSKTV TKTVIGPDGH KEVTKEVVTS
0451 EDGSDCPEAM DLGTLSGIGT LDGFRHRHPD EAAFFDTAST GKTFPGFFSP
0501 MLGEFVSETE SRGSESGIFT NTKESSSHHP GIAEFPSRGK
SSSYSKQFTS
0551
STSYNRGDST FESKSYKMAD EAGSEADHEG THSTKRGHAK SRPVRGIHTS
0601 PLGKPSLSP(配列番号25)
【0089】
念のため、FIBA-2の配列を以下に示す。
Fibrinogen alpha chain由来ペプチド FIBA-2
SSSYSKQFTS STSYNRGDST FESKS(配列番号26)
【0090】
〔18〕 Fibrinogen alpha chain (isoform 1)由来ペプチド FIBA-3
配列番号27のFIBA-3のArea値はNDCと比較して認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)のほうがt−検定の結果、統計的に有意に(p<0.05)高値であり(
図17)、認知機能障害疾患(AD、MCI、DLB、FTD)患者と精神疾患に罹患していない被験者(NDC)とを区別する上で配列番号27のFIBA-3は有用であることが分かった。受信者操作特性曲線による分析によれば、ADおよびMCI患者と精神疾患に罹患していない被験者とを区別するのに有用であることが明らかである(表1)。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPRVVERHQS ACKDSDWPFC SDEDWNYKCP SGCRMKGLID EVNQDFTNRI
0051 NKLKNSLFEY QKNNKDSHSL TTNIMEILRG DFSSANNRDN TYNRVSEDLR
0101 SRIEVLKRKV IEKVQHIQLL QKNVRAQLVD MKRLEVDIDI KIRSCRGSCS
0151 RALAREVDLK DYEDQQKQLE QVIAKDLLPS RDRQHLPLIK MKPVPDLVPG
0201 NFKSQLQKVP PEWKALTDMP QMRMELERPG GNEITRGGST SYGTGSETES
0251 PRNPSSAGSW NSGSSGPGST GNRNPGSSGT GGTATWKPGS SGPGSTGSWN
0301 SGSSGTGSTG NQNPGSPRPG STGTWNPGSS ERGSAGHWTS ESSVSGSTGQ
0351 WHSESGSFRP DSPGSGNARP NNPDWGTFEE VSGNVSPGTR REYHTEKLVT
0401 SKGDKELRTG KEKVTSGSTT TTRRSCSKTV TKTVIGPDGH KEVTKEVVTS
0451 EDGSDCPEAM DLGTLSGIGT LDGFRHRHPD EAAFFDTAST GKTFPGFFSP
0501 MLGEFVSETE SRGSESGIFT NTKESSSHHP GIAEFPSRGK
SSSYSKQFTS
0551
STSYNRGDST FESKSYKMAD EAGSEADHEG THSTKRGHAK SRPVRDCDDV
0601 LQTHPSGTQS GIFNIKLPGS SKIFSVYCDQ ETSLGGWLLI QQRMDGSLNF
0651 NRTWQDYKRG FGSLNDEGEG EFWLGNDYLH LLTQRGSVLR VELEDWAGNE
0701 AYAEYHFRVG SEAEGYALQV SSYEGTAGDA LIEGSVEEGA EYTSHNNMQF
0751 STFDRDADQW EENCAEVYGG GWWYNNCQAA NLNGIYYPGG SYDPRNNSPY
0801 EIENGVVWVS FRGADYSLRA VRMKIRPLVT Q(配列番号23)
【0091】
Fibrinogen alpha chain由来ペプチド FIBA-3
SSSYSKQFTS STSYNRGDST FESKSY(配列番号27)
【0092】
〔19〕 Fibrinogen alpha chain (isoform 2)由来ペプチド FIBA-3
配列番号26のペプチドFIBA-3はMS/MSおよび、MASCOTデータベース検索の結果から、Fibrinogen alpha chain (isoform 1)(配列番号23)および、Fibrinogen alpha chain (isoform 2)のタンパク質に共通するトポロジカル領域部分に存在するアミノ酸配列である。以下に配列番号25として、Fibrinogen alpha chain (isoform 2)インタクトタンパク質のアミノ酸配列を示す。
インタクトタンパク質/ペプチド
0001 GPRVVERHQS ACKDSDWPFC SDEDWNYKCP SGCRMKGLID EVNQDFTNRI
0051 NKLKNSLFEY QKNNKDSHSL TTNIMEILRG DFSSANNRDN TYNRVSEDLR
0101 SRIEVLKRKV IEKVQHIQLL QKNVRAQLVD MKRLEVDIDI KIRSCRGSCS
0151 RALAREVDLK DYEDQQKQLE QVIAKDLLPS RDRQHLPLIK MKPVPDLVPG
0201 NFKSQLQKVP PEWKALTDMP QMRMELERPG GNEITRGGST SYGTGSETES
0251 PRNPSSAGSW NSGSSGPGST GNRNPGSSGT GGTATWKPGS SGPGSTGSWN
0301 SGSSGTGSTG NQNPGSPRPG STGTWNPGSS ERGSAGHWTS ESSVSGSTGQ
0351 WHSESGSFRP DSPGSGNARP NNPDWGTFEE VSGNVSPGTR REYHTEKLVT
0401 SKGDKELRTG KEKVTSGSTT TTRRSCSKTV TKTVIGPDGH KEVTKEVVTS
0451 EDGSDCPEAM DLGTLSGIGT LDGFRHRHPD EAAFFDTAST GKTFPGFFSP
0501 MLGEFVSETE SRGSESGIFT NTKESSSHHP GIAEFPSRGK
SSSYSKQFTS
0551
STSYNRGDST FESKSYKMAD EAGSEADHEG THSTKRGHAK SRPVRGIHTS
0601 PLGKPSLSP(配列番号25)
【0093】
念のため、FIBA-3の配列を以下に示す。
Fibrinogen alpha chain由来ペプチド FIBA-3
SSSYSKQFTS STSYNRGDST FESKSY(配列番号27)
【0094】
【表1】
【0095】
表1には各マーカーペプチドの認知機能障害疾患の検出における受信者操作特性曲線による分析で得たAUC値が示されている。
【0096】
これらのマーカーペプチドをそれぞれ単独、あるいは組み合わせで用いて、液体クロマトグラフィーおよび/または他の適当な分離手段を用いて、あるいは用いないで直接、血清中あるいは血漿中の存在量を質量分析または免疫学的あるいは酵素学的方法などの他の方法によって測定することにより、AD、MCI、DLB、FTDのような認知機能障害疾患を診断上、健常人を含む非精神疾患被験者と区別することが可能である。