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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】6082693
(24)【登録日】2017年1月27日
(45)【発行日】2017年2月15日
(54)【発明の名称】喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法及び判定キット
(51)【国際特許分類】
C12Q 1/68 20060101AFI20170206BHJP
C12N 15/09 20060101ALN20170206BHJP
【ＦＩ】
C12Q1/68 AZNA
!C12N15/00 A
【請求項の数】12
【全頁数】75
(21)【出願番号】特願2013-512383(P2013-512383)
(86)(22)【出願日】2012年4月25日
(86)【国際出願番号】JP2012061016
(87)【国際公開番号】WO2012147757
(87)【国際公開日】20121101
【審査請求日】2015年4月16日
(31)【優先権主張番号】特願2011-97651(P2011-97651)
(32)【優先日】2011年4月25日
(33)【優先権主張国】JP
(73)【特許権者】
【識別番号】504013775
【氏名又は名称】学校法人 埼玉医科大学
(74)【代理人】
【識別番号】100107515
【弁理士】
【氏名又は名称】廣田 浩一
(74)【代理人】
【識別番号】100107733
【弁理士】
【氏名又は名称】流 良広
(74)【代理人】
【識別番号】100115347
【弁理士】
【氏名又は名称】松田 奈緒子
(72)【発明者】
【氏名】井上 聡
(72)【発明者】
【氏名】井上 公仁子
(72)【発明者】
【氏名】森 圭介
(72)【発明者】
【氏名】米谷 新
(72)【発明者】
【氏名】神田 将和
(72)【発明者】
【氏名】岡崎 康司
【審査官】
森井 文緒
(56)【参考文献】
【文献】
特開２００９−０２７９７２（ＪＰ，Ａ）
【文献】
国際公開第２００９／０５９３１８（ＷＯ，Ａ１）
【文献】
国際公開第２００９／０５９３１７（ＷＯ，Ａ１）
【文献】
国際公開第２００８／１１０８２４（ＷＯ，Ａ１）
【文献】
森圭介，加齢黄斑変性のリスク遺伝子と個別化医療の可能性，眼科，２００９年，vol.51, no.12，p.1647-1652
【文献】
森圭介ほか，眼内血管新生病の遺伝子解析と抗血管新生治療に対する個別化医療の確立，埼玉医科大学雑誌，２０１０年，vol.37, no.1，p.21-25
【文献】
MORI K., et al.，Coding and noncoding variants in the CFH gene and cigarette smoking influence the risk of age-related macular degeneration in japanese population，Invest. Ophthalmol. Vis. Sci.，２００７年，vol.48, no.11，p.5315-5319
【文献】
MACHIDA S., et al.，Monozygotic twins with polypoidal choroidal vasuculopathy，Clin. Ophthalmol.，２０１０年，vol.4，p.793-800
(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）
Ｃ１２Ｎ １５／００−１５／９０
Ｃ１２Ｑ １／６８
ＰｕｂＭｅｄ
ＣＡｐｌｕｓ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ（ＳＴＮ）
ＷＰＩＤＳ／ＷＰＩＸ（ＳＴＮ）
ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）
ＧｅｎｅＣａｒｄｓ
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する検出工程（Ｉ）と、
前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
【請求項2】
被検体由来のＤＮＡ含有試料において、
ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する請求項１に記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する請求項１に記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
【請求項3】
被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する検出工程（ＩＩ）と、
前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
【請求項4】
被検体由来のＤＮＡ含有試料において、
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣ、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する請求項３に記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣ、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性であると判定する請求項３に記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
【請求項5】
喫煙感受性加齢黄斑変性が、喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性である請求項１から４のいずれかに記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定方法。
【請求項6】
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段を含むことを特徴とする喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
【請求項7】
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段が、前記ｒｓ４０７５５６１を含む、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む請求項６に記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
【請求項8】
ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段の少なくともいずれかを更に含む請求項６から７のいずれかに記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
【請求項9】
ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含むことを特徴とする喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
【請求項10】
ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ９２８７３２６を含む、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む請求項９に記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
【請求項11】
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段の少なくともいずれかを更に含む請求項９から１０のいずれかに記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
【請求項12】
喫煙感受性加齢黄斑変性が、喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性である請求項６から１１のいずれかに記載の喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定キット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、加齢黄斑変性易罹患性判定マーカーに基づく加齢黄斑変性易罹患性判定方法及び加齢黄斑変性易罹患性判定キットに関する。【背景技術】
【0002】
加齢黄斑変性（Ａｇｅ−ｒｅｌａｔｅｄ Ｍａｃｕｌａｒ Ｄｅｇｅｎｅｒａｔｉｏｎ：ＡＭＤ）は、高齢者の眼底において、網膜中心部の黄斑部に組織の変性や血管新生が起こり、視機能障害に至る加齢性眼科疾患であり、我が国を含む先進国において増加傾向にある疾患である。現在、５０歳以上の人口の約０．９％が罹患していると考えられ、数百万人単位の高齢者のＱＯＬ（Ｑｕａｌｉｔｙ ｏｆ Ｌｉｆｅ）が著しく損なわれる疾患として注目されている。しかし、加齢黄斑変性に対する治療としては、視力低下発症後のものが主体であるため、病期進行してからの治療については効果が限られているのが現状である。
【0003】
加齢黄斑変性の発症リスク因子としては、近年、補体系の抑制因子である補体Ｈ因子（ＣＦＨ）（非特許文献１〜３参照）、及びセリンプロテアーゼ遺伝子ＨＴＲＡ１近傍（非特許文献４〜５参照）の遺伝子多型が同定され、加齢黄斑変性が遺伝的背景により強く影響を受ける可能性が示唆されている。しかしながら、これらの遺伝子多型が加齢黄斑変性発症に関与するメカニズムの詳細については不明な点が多く、加齢黄斑変性の診断及び治療の分子標的として必要充分であるか否かについては明らかではない。
【0004】
これに対し、ＣＦＨをコードする遺伝子の多型部位における変異の存在又は非存在を、一塩基多型（ＳＮＰ）を用いて測定する加齢黄斑変性を発症する被検体の性向を決定するための診断方法が開示されている（特許文献１参照）。しかしながら、この方法を用いても加齢黄斑変性疾患易罹患性の判定の確立及び精度が十分ではない点で問題であった。
【0005】
加齢黄斑変性の発症は、前記遺伝的な要因だけでなく、喫煙や食生活等の疾患関連性が指摘されていることから、多数の遺伝子が関連する遺伝的要因と、環境要因との両者が関与する多因子疾患であると考えられる。【0006】
日本人においては、白人種に比べて、特に新生血管を伴う滲出型加齢黄斑変性が多いことが知られている。しかしながら、従来報告された遺伝子多型からだけでは日本人加齢黄斑変性の特徴は説明できず、特に滲出型加齢黄斑変性発症のメカニズムに特異的に関与する遺伝子多型及びそれを用いた判定用マーカーが診断・治療において必要とされている。
【0007】
また、加齢黄斑変性には、遺伝因子の他、環境因子として、喫煙歴が関連することが報告されてきた。しかしながら、加齢黄斑変性において喫煙歴との関連が示された遺伝子多型については、これまでに報告されていない。
【0008】
したがって、著しい視力低下をきたす加齢黄斑変性の発症及び進行、喫煙感受性加齢黄斑変性や喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の易罹患性を高い確率で予測可能であり、加齢黄斑変性の早期予防や、既に発症した患者に対する最適な薬剤治療法の選択に好適に利用可能であり、加齢黄斑変性の罹患の難易を簡便に判定可能な加齢黄斑変性易罹患性判定方法及び加齢黄斑変性易罹患性判定キットの提供が強く望まれているのが現状である。【先行技術文献】
【特許文献】
【0009】
【特許文献1】特表２００８−５２９５３６号公報
【非特許文献】
【0010】
【非特許文献1】Ｋｌｅｉｎ ＲＪ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２００５， ３０８（５７２０）， ３８５−３８９
【非特許文献2】Ｅｄｗａｒｄｓ ＡＯ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２００５， ３０８（５７２０）， ４２１−４２４
【非特許文献3】Ｈａｉｎｅｓ ＪＬ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２００５， ３０８（５７２０）， ４１９−４２１
【非特許文献4】Ｙａｎｇ Ｚ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２００６， ３１４（５８０１）， ９９２−９９３
【非特許文献5】Ｄｅｗａｎ Ａ ｅｔ ａｌ．， Ｓｃｉｅｎｃｅ， ２００６， ３１４（５８０１）， ９８９−９９２
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0011】
本発明は、従来における前記諸問題を解決し、以下の目的を達成することを課題とする。即ち、本発明は、著しい視力低下をきたす加齢黄斑変性の易罹患性を、高い精度及び確率で予測可能であり、加齢黄斑変性の早期予防や、既に発症した患者に対する最適な薬剤治療法の選択に好適に利用可能であり、加齢黄斑変性の罹患の難易を簡便に判定可能な加齢黄斑変性易罹患性判定方法及び加齢黄斑変性易罹患性判定キットを提供することを目的とする。【課題を解決するための手段】
【0012】
前記課題を解決するため、本発明者らは鋭意検討した結果、以下のような知見を得た。即ち、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）受容体ＮＴＲＫ２／ＴｒｋＢ遺伝子の一塩基多型ｒｓ４０７５５６１をマーカーとして用い、前記一塩基多型を検出することで、前記一塩基多型から高い確率及び精度で加齢黄斑変性、喫煙感受性加齢黄斑変性、及び喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であること、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型ｒｓ９２８７３２６をマーカーとして用い、前記一塩基多型を検出することで、前記一塩基多型から高い確率及び精度で加齢黄斑変性、喫煙感受性加齢黄斑変性、及び喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であること、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型をマーカーとして用い、該一塩基多型を検出することで、前記一塩基多型から高い確率及び精度で加齢黄斑変性、喫煙感受性加齢黄斑変性、及び喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であること、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型をマーカーとして用い、該一塩基多型を検出することで、前記一塩基多型から高い確率及び精度で加齢黄斑変性、喫煙感受性加齢黄斑変性、及び喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であること、また、前記各一塩基多型間での組合せ、又は、前記各一塩基多型と、補体Ｈ因子（ＣＦＨ）遺伝子の一塩基多型、ＡＭＤ感受性遺伝子座２（ＡＲＭＳ２）の一塩基多型、及びセリンプロテアーゼ遺伝子ＨＴＲＡ１近傍の一塩基多型の少なくともいずれかの一塩基多型との組合せにより更に高い精度及び確立で判定可能であることを知見し、本発明の完成に至った。【0013】
本発明は、本発明者らによる前記知見に基づくものであり、前記課題を解決するための手段としては、以下の通りである。即ち、＜１＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する検出工程（Ｉ）と、
前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜２＞ 検出工程（Ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する工程である前記＜１＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜３＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、
ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する前記＜１＞から＜２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜４＞ 追加の検出工程（ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜５＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、ｒｓ１９８２８４１、ｒｓ１２００００１１、ｒｓ１０８６８２４６、ｒｓ４４１９８９１、ｒｓ４２４２６３０、ｒｓ４３０５９７９、ｒｓ４６３１５５０、ｒｓ４３９４４７８、ｒｓ４２４２６３２、ｒｓ４１４２９０９、ｒｓ１４９０４０７、ｒｓ１４９０４０５、ｒｓ１４９０４０４、ｒｓ１０１１６７５０、ｒｓ４１４２９１０、ｒｓ７８５３４３３、ｒｓ１２３７８０２１、ｒｓ１４９０４０３、ｒｓ６７８６５４、及びｒｓ４７４８９９から選択される少なくともいずれかである前記＜３＞から＜４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜６＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．７超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、及びｒｓ１９８２８４１から選択される少なくともいずれかである前記＜３＞から＜５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜７＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである前記＜３＞から＜６＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜８＞ 追加の検出工程（ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３＞から＜７＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜９＞ 追加の検出工程（ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３＞から＜８＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜１０＞ 追加の検出工程（ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３＞から＜９＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜１１＞ 追加の検出工程（ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３＞から＜１０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜１２＞ 追加の検出工程（ｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３＞から＜１１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜１３＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する検出工程（ＩＩ）と、
前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜１４＞ 検出工程（ＩＩ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する工程である前記＜１３＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜１５＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣ、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する前記＜１３＞から＜１４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜１６＞ 追加の検出工程（ｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜１５＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜１７＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、ｒｓ１９８２８４１、ｒｓ１２００００１１、ｒｓ１０８６８２４６、ｒｓ４４１９８９１、ｒｓ４２４２６３０、ｒｓ４３０５９７９、ｒｓ４６３１５５０、ｒｓ４３９４４７８、ｒｓ４２４２６３２、ｒｓ４１４２９０９、ｒｓ１４９０４０７、ｒｓ１４９０４０５、ｒｓ１４９０４０４、ｒｓ１０１１６７５０、ｒｓ４１４２９１０、ｒｓ７８５３４３３、ｒｓ１２３７８０２１、ｒｓ１４９０４０３、ｒｓ６７８６５４、及びｒｓ４７４８９９から選択される少なくともいずれかである前記＜１５＞から＜１６＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜１８＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．７超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、及びｒｓ１９８２８４１から選択される少なくともいずれかである前記＜１５＞から＜１７＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜１９＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである前記＜１５＞から＜１８＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜２０＞ 追加の検出工程（ｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜１５＞から＜１９＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜２１＞ 追加の検出工程（ｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜１５＞から＜２０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜２２＞ 追加の検出工程（ｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜１５＞から＜２１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜２３＞ 追加の検出工程（ｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜１５＞から＜２２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜２４＞ 追加の検出工程（ｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜１５＞から＜２３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜２５＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する検出工程（ＩＩＩ）と、
前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含むことを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜２６＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、ｒｓ１９８２８４１、ｒｓ１２００００１１、ｒｓ１０８６８２４６、ｒｓ４４１９８９１、ｒｓ４２４２６３０、ｒｓ４３０５９７９、ｒｓ４６３１５５０、ｒｓ４３９４４７８、ｒｓ４２４２６３２、ｒｓ４１４２９０９、ｒｓ１４９０４０７、ｒｓ１４９０４０５、ｒｓ１４９０４０４、ｒｓ１０１１６７５０、ｒｓ４１４２９１０、ｒｓ７８５３４３３、ｒｓ１２３７８０２１、ｒｓ１４９０４０３、ｒｓ６７８６５４、及びｒｓ４７４８９９から選択される少なくともいずれかである前記＜２５＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜２７＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．７超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、及びｒｓ１９８２８４１から選択される少なくともいずれかである前記＜２５＞から＜２６＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜２８＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣ、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉｉｉ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する前記＜２５＞から＜２７＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜２９＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜３０＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞から＜２９＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜３１＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである前記＜２８＞から＜３０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜３２＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞から＜３１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜３３＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞から＜３２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜３４＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞から＜３３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜３５＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞から＜３４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜３６＞ 追加の検出工程（ｉｉｉ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜２８＞から＜３５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜３７＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する検出工程（ＩＶ）と、
前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する判定工程とを含み、
前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えであることを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜３８＞ 被検体由来のＤＮＡ含有試料において、
ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣ、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧ、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡの少なくともいずれかを検出する処理を含む追加の検出工程（ｉｖ）を更に含み、
判定工程が、更に、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有する場合、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有する場合、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有する場合、及び前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有する場合の少なくともいずれかの場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する前記＜３７＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜３９＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜４０＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞から＜３９＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜４１＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、ｒｓ１９８２８４１、ｒｓ１２００００１１、ｒｓ１０８６８２４６、ｒｓ４４１９８９１、ｒｓ４２４２６３０、ｒｓ４３０５９７９、ｒｓ４６３１５５０、ｒｓ４３９４４７８、ｒｓ４２４２６３２、ｒｓ４１４２９０９、ｒｓ１４９０４０７、ｒｓ１４９０４０５、ｒｓ１４９０４０４、ｒｓ１０１１６７５０、ｒｓ４１４２９１０、ｒｓ７８５３４３３、ｒｓ１２３７８０２１、ｒｓ１４９０４０３、ｒｓ６７８６５４、及びｒｓ４７４８９９から選択される少なくともいずれかである前記＜３８＞から＜４０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜４２＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．７超えである、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、及びｒｓ１９８２８４１から選択される少なくともいずれかである前記＜３８＞から＜４１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜４３＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞から＜４２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜４４＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞から＜４３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜４５＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞から＜４４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜４６＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞から＜４５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜４７＞ 追加の検出工程（ｉｖ）が、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理を含む前記＜３８＞から＜４６＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜４８＞ 加齢黄斑変性が、喫煙感受性加齢黄斑変性である前記＜１＞から＜４７＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜４９＞ 喫煙感受性加齢黄斑変性が、喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性である前記＜４８＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法である。
＜５０＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段を含むことを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜５１＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段が、前記ｒｓ４０７５５６１を含む、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５０＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜５２＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段の少なくともいずれかを更に含む前記＜５０＞から＜５１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜５３＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓｒｓ９２８７３２６を含む、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５２＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜５４＞ ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段が、前記ｒｓ１１２００６３８を含む、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５２＞から＜５３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜５５＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ８００２９２を含む、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５２＞から＜５４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜５６＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１４１０９９６を含む、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５２＞から＜５５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜５７＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１０６１１７０を含む、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５２＞から＜５６＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜５８＞ ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段が、前記ｒｓ１０４９０９２４を含む、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５２＞から＜５７＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜５９＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含むことを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜６０＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ９２８７３２６を含む、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜５９＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜６１＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段の少なくともいずれかを更に含む前記＜５９＞から＜６０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜６２＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段が、前記ｒｓ４０７５５６１を含む、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６１＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜６３＞ ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段が、前記ｒｓ１１２００６３８を含む、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６１＞から＜６２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜６４＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ８００２９２を含む、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６１＞から＜６３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜６５＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１４１０９９６を含む、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６１＞から＜６４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜６６＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１０６１１７０を含む、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６１＞から＜６５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜６７＞ ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段が、前記ｒｓ１０４９０９２４を含む、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６１＞から＜６６＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜６８＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を含むことを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜６９＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段の少なくともいずれかを更に含む前記＜６８＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜７０＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段が、前記ｒｓ４０７５５６１を含む、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜７１＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓｒｓ９２８７３２６を含む、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞から＜７０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜７２＞ ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段が、前記ｒｓ１１２００６３８を含む、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞から＜７１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜７３＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ８００２９２を含む、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞から＜７２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜７４＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１４１０９９６を含む、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞から＜７３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜７５＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１０６１１７０を含む、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞から＜７４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜７６＞ ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段が、前記ｒｓ１０４９０９２４を含む、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜６９＞から＜７５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜７７＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を含み、
前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えであることを特徴とする加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜７８＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段、及びＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段の少なくともいずれかを更に含む前記＜７７＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜７９＞ ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段が、前記ｒｓ４０７５５６１を含む、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
＜８０＞ ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓｒｓ９２８７３２６を含む、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞から＜７９＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
＜８１＞ ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段が、前記ｒｓ１１２００６３８を含む、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞から＜８０＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
＜８２＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ８００２９２を含む、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞から＜８１＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
＜８３＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１４１０９９６を含む、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞から＜８２＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
＜８４＞ ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段が、前記ｒｓ１０６１１７０を含む、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞から＜８３＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
＜８５＞ ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段が、前記ｒｓ１０４９０９２４を含む、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、各プローブとのセットを含む前記＜７８＞から＜８４＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
＜８６＞ 加齢黄斑変性が、喫煙感受性加齢黄斑変性である前記＜５０＞から＜８５＞のいずれかに記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
＜８７＞ 喫煙感受性加齢黄斑変性が、喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性である前記＜８６＞に記載の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットである。
【発明の効果】
【0014】
本発明によれば、従来における前記諸問題を解決し、前記目的を達成することができ、著しい視力低下をきたす加齢黄斑変性の易罹患性を、高い精度及び確率で予測可能であり、加齢黄斑変性の早期予防や、既に発症した患者に対する最適な薬剤治療法の選択に好適に利用可能であり、加齢黄斑変性の罹患の難易を簡便に判定可能な加齢黄斑変性易罹患性判定方法及び加齢黄斑変性易罹患性判定キットを提供することができる。【図面の簡単な説明】
【0015】
【発明を実施するための形態】
【0016】
（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法は、検出工程と、判定工程と、を少なくとも含み、必要に応じて、更に追加の検出工程などのその他の工程を含む。
本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法の態様としては、前記検出工程が、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する検出工程（Ｉ）である態様（以下、「第１の態様」と称することがある。）、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する検出工程（ＩＩ）である態様（以下、「第２の態様」と称することがある。）、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する検出工程（ＩＩＩ）である態様（以下、「第３の態様」と称することがある。）、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する検出工程（ＩＶ）である態様（以下、「第４の態様」と称することがある。）が挙げられる。
これらの態様の中でも、前記第１の態様、前記第２の態様が好ましく、前記第１の態様がより好ましい。前記好ましい態様であると、加齢黄斑変性易罹患性を高い確率及び精度で判定することができ、前記より好ましい態様であると、喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性、又は喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性を高い確率及び精度で判定することができる。
【0017】
＜検出工程＞前記第１の態様における前記検出工程は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、神経栄養性チロシン受容体キナーゼタイプ２（ＮＴＲＫ２）遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する工程（以下、「検出工程（Ｉ）」と称することがある。）である。
前記第２の態様における前記検出工程は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、低比重リポタンパク質受容体ファミリーであるＬＲＰ１Ｂ（ｌｏｗ−ｄｅｎｓｉｔｙ ｌｉｐｏｐｒｏｔｅｉｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒ−ｒｅｌａｔｅｄ ｐｒｏｔｅｉｎ １ｂ）遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する工程（以下、「検出工程（ＩＩ）」と称することがある。）である。
前記第３の態様における前記検出工程は、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する工程（以下、「検出工程（ＩＩＩ）」と称することがある。）である。
前記第４の態様における前記検出工程は、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する工程（以下、「検出工程（ＩＶ）」と称することがある。）である。
【0018】
−一塩基多型−一塩基多型（ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ：ＳＮＰ）とは、一般的には、遺伝子の塩基配列が１カ所だけ異なる状態及びその部位をいう。また、多型とは、一般的には、母集団中１％以上の頻度で存在する２以上の対立遺伝子（アレル）をいう。本発明において、「ＳＮＰ」は、好ましくは、当業者が自由に利用可能な公開されたデータベースに登録されたＳＮＰであって、そのリファレンス番号から特定できるＳＮＰである。このようなデータベースとしては、例えば、米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）のＳＮＰデータベース、ＩＭＳ−ＪＳＴ（東京大学、科学技術振興財団）のＪＳＮＰ（登録商標）データベースなどが挙げられる。本発明におけるＳＮＰは、上記ＮＣＢＩのＳＮＰデータベースのリファレンス番号であるｄｂＳＮＰ ＩＤにより特定できる。以下、本発明においては、特定のＳＮＰを、このＮＣＢＩのＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤで記載する。
【0019】
［ＮＴＲＫ２遺伝子、及びｒｓ４０７５５６１］−ＮＴＲＫ２遺伝子−
前記ＮＴＲＫ２遺伝子は、脳由来神経栄養因子（ＢＤＮＦ）受容体をコードする遺伝子であり、別名、ＴｒｋＢ遺伝子ともいう。前記ＮＴＲＫ２遺伝子は、図１及び２に示す通り、第９番染色体の長腕ｑ２１．３３領域に位置し、遺伝子向きは染色体方向に順向きである。
【0020】
−ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ４０７５５６１−ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰであるｒｓ４０７５５６１（以下、「ＳＮＰ１」と称することがある）は、前記ＮＴＲＫ２遺伝子の３’側イントロン領域（例えば、ＮＭ＿００１０１８０６５．２などの短型ＮＴＲＫ２遺伝子では３’下流領域）に位置する一塩基多型であり、その存在位置は、ｃｈｒ９：８６７８５５９１−８６７８５５９１である。なお、ｒｓ４０７５５６１は、ＮＣＢＩのＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号である。
なお、ＮＴＲＫ２遺伝子イントロンのｒｓ４０７５５６１は、複数の転写因子（例えば、ＦＯＸＤ１、ＮＲ２Ｅ３、ＲＯＲＡなど）が結合する転写因子結合部位における結合能変化に関与する塩基位置に相当すると予想され、転写調節に関連するＳＮＰである可能性が考えられる。
【0021】
以下に示す配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列は、ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）を含む塩基配列であり、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）の部位である。また、ＳＮＰ１の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ｇ」である。５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴ［Ｇ／Ｔ］ＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１及び配列番号：２）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
前記検出工程（Ｉ）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する工程であることが好ましい。
【0022】
［ＬＲＰ１Ｂ遺伝子、及びｒｓ９２８７３２６］−ＬＲＰ１Ｂ遺伝子−
前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子は、低比重リポタンパク質受容体ファミリーに属するＬＲＰ１Ｂをコードする遺伝子である。前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子は、第２番染色体の長腕ｑ２２．１−２２．２領域に位置し、遺伝子向きは染色体方向に逆向きである。
【0023】
−ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型ｒｓ９２８７３２６−ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰであるｒｓ９２８７３２６（以下、「ＳＮＰ２」と称することがある）は、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の第１イントロン領域に位置する一塩基多型であり、その存在位置は、ｃｈｒ２：１４２３５８６４３−１４２３５８６４３（ヒトゲノムバージョン：ｈｇ１８）である。なお、ｒｓ９２８７３２６は、ＮＣＢＩのＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号である。
なお、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子イントロンのｒｓ９２８７３２６は、複数の転写因子（例えば、ＣＲＥＢ１、ＥＳＲ１、ＰＡＸ２など）が結合する転写因子結合部位における結合能変化に関与する塩基位置に相当すると予想され、転写調節に関連するＳＮＰである可能性が考えられる。
【0024】
以下に示す配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列は、ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）を含む塩基配列であり、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）の部位である。また、ＳＮＰ２の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ｃ」である。５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴ［Ａ／Ｃ］ＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３及び配列番号：４）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
前記検出工程（ＩＩ）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する工程であることが好ましい。
【0025】
［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］−連鎖不平衡−
生物集団において２つの密に連鎖した遺伝子座における特定の対立遺伝子の組み合わせ出現頻度が、それぞれの遺伝子頻度から推定される期待値と異なる場合を連鎖不平衡という。連鎖不平衡が起こるためには、２つの遺伝子座の物理的距離が非常に近いことが必須である。
本発明においては、２つのＳＮＰにおける特定のアレルの組み合わせが、ある集団内で頻度が高く、２つのＳＮＰの挙動が独立ではない関係を、「連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ」という。また、ハプロタイプとは、一倍体染色体上の連続した遺伝子群又は遺伝子領域のことである。同一染色体上で統計学的に見て関連のある、つまり遺伝的に連鎖しているＳＮＰなどの組合せをいう。
【0026】
ここで、「前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ」としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、２つのＳＮＰ間の連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が、０．５を超えていることが好ましく、０．７を超えていることがより好ましい。また、「連鎖不平衡係数（Ｄ’値）」は、同一染色体上に存在する遺伝子座ＡのＳＮＰ及び遺伝子座ＢのＳＮＰについて、２つのＳＮＰの間に関連性がある（連鎖不平衡が存在する）場合、２つのＳＮＰのアレルの組合せにより生じる４つのハプロタイプ頻度が、各アレル頻度の積の値からどれだけずれるかの連鎖不平衡の尺度として定義されている連鎖不平衡係数：Ｄ値を規格化したものであり、Ｄ’値は組み換えの歴史を表す尺度として用いられる。
連鎖不平衡係数：Ｄ値は、下記数式（１）〜（４）より導かれた下記数式（５）により算出される。Ｄ値の範囲は、−０．２５〜０．２５である。
遺伝子座Ａのアレル頻度：ＰＡ Ｐａ
遺伝子座Ｂのアレル頻度：ＰＢ Ｐｂ
各ハプロタイプ頻度：ＰＡＢ、ＰＡｂ、ＰａＢ、Ｐａｂ
Ｄ ＝ ＰＡＢ−ＰＡＰＢ ＰＡＢ ＝ ＰＡＰＢ＋Ｄ 数式（１）
Ｄ ＝ ＰＡＰｂ−ＰＡｂ ＰＡｂ ＝ ＰＡＰｂ−Ｄ 数式（２）
Ｄ ＝ ＰａＰＢ−ＰａＢ ＰａＢ ＝ ＰａＰＢ−Ｄ 数式（３）
Ｄ ＝ Ｐａｂ−ＰａＰｂ Ｐａｂ ＝ ＰａＰｂ＋Ｄ 数式（４）
Ｄ＝ＰＡＢ・Ｐａｂ−ＰＡｂ・ＰａＢ 数式（５）
連鎖不平衡係数（Ｄ’値）は、下記数式（６）及び（７）より導かれた下記数式（８）及び（９）により算出される。Ｄ’値の範囲は、０〜１である。
Ｄｍｉｎ ＝ ｍａｘ （−ＰＡＰＢ， −ＰａＰｂ）
＝ （−１）×ｍｉｎ （ＰＡＰＢ， ＰａＰｂ） 数式（６）
Ｄｍａｘ ＝ ｍｉｎ （ＰＡＰｂ， ＰａＰＢ） 数式（７）
Ｄ’ ＝ ｜Ｄ ／ Ｄｍａｘ｜ （Ｄ＞０の場合） 数式（８）
Ｄ’ ＝ ｜Ｄ ／ Ｄｍｉｎ｜ （Ｄ＜０の場合） 数式（９）
なお、連鎖不平衡係数（Ｄ’値）は、「国際ＨａｐＭａｐ計画（Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔ）」のホームページから入手することができる。例えば、日本人集団の連鎖不平衡（ＬＤ）データ「ＪＰＴ」は、ｈｔｔｐ：／／ｈａｐｍａｐ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌ．ｊａ、ゲノムバージョン：ＮＣＢＩ Ｂ３８ ａｓｓｅｍｂｌｙ， ｄｂＳＮＰ ｂ１２６で入手することができる。
【0027】
前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである、ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、ｒｓ１９８２８４１、ｒｓ１２００００１１、ｒｓ１０８６８２４６、ｒｓ４４１９８９１、ｒｓ４２４２６３０、ｒｓ４３０５９７９、ｒｓ４６３１５５０、ｒｓ４３９４４７８、ｒｓ４２４２６３２、ｒｓ４１４２９０９、ｒｓ１４９０４０７、ｒｓ１４９０４０５、ｒｓ１４９０４０４、ｒｓ１０１１６７５０、ｒｓ４１４２９１０、ｒｓ７８５３４３３、ｒｓ１２３７８０２１、ｒｓ１４９０４０３、ｒｓ６７８６５４、及びｒｓ４７４８９９から選択される少なくともいずれかであることが好ましい。【0028】
また、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．７超えである、ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４５０４７１５、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ４４０１９５０、ｒｓ１１７９５３８６、ｒｓ１７０８８００１、ｒｓ１７０８８０１３、ｒｓ１７０８８０２２、ｒｓ１７０８８０２８、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ４３９４４７９、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ１７４１８２４１、ｒｓ１３８７９２６、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３０、ｒｓ１０７３０４９、ｒｓ１５８６６８１、ｒｓ１１１４０８３１、ｒｓ９７２６０４、ｒｓ１０４３５９４９、ｒｓ１１７９１０１７、ｒｓ９８８６７５９、ｒｓ１７３３４２５０、ｒｓ５８７８６１、ｒｓ１７０８８１０５、ｒｓ１１１４０８３７、ｒｓ１０３８７６３、ｒｓ１１１４０８４０、ｒｓ１７４１９０８１、ｒｓ１７３３４４８０、ｒｓ７０１９９０６、ｒｓ１２３３８７８９、ｒｓ１２５５５０５３、ｒｓ６８４００６、ｒｓ１４９０４０２、ｒｓ７０３２００９、ｒｓ５５５６８５、ｒｓ１２６８３９５４、ｒｓ１２３５０３５０、ｒｓ４７５３３５、ｒｓ５９６２０１、ｒｓ５３４１９６、ｒｓ７８６２６７５、ｒｓ１０３８７６２、ｒｓ２８０８７０８、ｒｓ２７８０９３１、ｒｓ６１４８８６、及びｒｓ１９８２８４１から選択される少なくともいずれかであることがより好ましい。【0029】
また、２つのＳＮＰが連鎖不平衡関係にあることを示す他の指標としては、「ｒ２値」が挙げられる。前記ｒ２値は、変異の成り立ちを表す尺度として捉えられているものである。
前記ｒ２値は、「国際ＨａｐＭａｐ計画（Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔ）」のホームページから入手することができる。例えば、日本人集団の連鎖不平衡（ＬＤ）データ「ＪＰＴ」は、ｈｔｔｐ：／／ｈａｐｍａｐ．ｎｃｂｉ．ｎｌｍ．ｎｉｈ．ｇｏｖ／ｉｎｄｅｘ．ｈｔｍｌ．ｊａ、ゲノムバージョン：ＮＣＢＩ Ｂ３８ ａｓｓｅｍｂｌｙ， ｄｂＳＮＰ ｂ１２６で入手することができる。
【0030】
前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型のｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が０．２超えである一塩基多型としては、例えば、ｒｓ４０７５５６２、ｒｓ４０７５２７４、ｒｓ４４０６４９０、ｒｓ４３５８８７２、ｒｓ１０８６８２４６、ｒｓ１９４８３０８、ｒｓ７０３６０９０、ｒｓ２３７８６７６、ｒｓ１０１２５１４１、ｒｓ１０１１５９０８、ｒｓ３７３９５７０、ｒｓ２２９１５０６、ｒｓ１３８７９２３、ｒｓ１１１４０８３１が挙げられる。
また、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0031】
［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰとしては、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５超えであれば特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記Ｄ’値が０．７を超えていることが好ましい。
また、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰの前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、０．２を超えていることが好ましい。
前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0032】
前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５超えである一塩基多型としては、例えば、ｒｓ６４２９９２７、ｒｓ４６６２５５５、ｒｓ１３４２９４１４、ｒｓ１９９１９９７、ｒｓ１９９１９９８、ｒｓ１３４０８３６５、ｒｓ１２６１１５５８、ｒｓ１２６２１４１４、ｒｓ１０１６５１５４、ｒｓ１１８８４９８４、ｒｓ７６０２６７７、ｒｓ７５９３５９４、ｒｓ２３８１１６７、ｒｓ１３４１８０２７、ｒｓ１５６１０１９、ｒｓ１３０１２２６５、ｒｓ１０４９６９０６、ｒｓ４６６２５５７、ｒｓ１４３５５９８、ｒｓ１０１８３１４２、ｒｓ１０４９６９０７、ｒｓ１５２９８６９、ｒｓ１８９８０１８、ｒｓ１０１９８６５０、ｒｓ９７８９４３０、ｒｓ１６８４７６４０、ｒｓ１３６９５４２、ｒｓ１３０１３３１６、ｒｓ１２４６６１８８、ｒｓ１３０１１２７２、ｒｓ９５６９５８、ｒｓ１０２０５８３６、ｒｓ１２６２３５６３、ｒｓ１３０３１０５６、ｒｓ２１９６３５３、ｒｓ１２４７１２３５、ｒｓ１２４６７０１４、ｒｓ１０１８１８３８、ｒｓ１４３５６１６、ｒｓ１４３５６１２、ｒｓ１６８４７７２９、ｒｓ７４２１７５５、ｒｓ１６８４７７３３、ｒｓ１９７５２４８、ｒｓ１５６１０２２、ｒｓ１３６９５４０、ｒｓ７５６４５０２、ｒｓ１０１９７２７７、ｒｓ１６８５５０９５、ｒｓ１５４１９７４、ｒｓ１４３５６０７、ｒｓ１４３５６０９が挙げられる。【0033】
前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．７超えである、ｒｓ６４２９９２７、ｒｓ４６６２５５５、ｒｓ１３４２９４１４、ｒｓ１９９１９９７、ｒｓ１９９１９９８、ｒｓ１３４０８３６５、ｒｓ１２６１１５５８、ｒｓ１２６２１４１４、ｒｓ１０１６５１５４、ｒｓ１１８８４９８４、ｒｓ７６０２６７７、ｒｓ７５９３５９４、ｒｓ２３８１１６７、ｒｓ１３４１８０２７、ｒｓ１５６１０１９、ｒｓ１３０１２２６５、ｒｓ１０４９６９０６、ｒｓ４６６２５５７、ｒｓ１４３５５９８、ｒｓ１０１８３１４２、ｒｓ１０４９６９０７、ｒｓ１５２９８６９、ｒｓ１８９８０１８、ｒｓ１０１９８６５０、ｒｓ９７８９４３０、ｒｓ１６８４７６４０、ｒｓ１３６９５４２、ｒｓ１３０１３３１６、ｒｓ１２４６６１８８、ｒｓ１３０１１２７２、ｒｓ９５６９５８、ｒｓ１０２０５８３６、ｒｓ１２６２３５６３、ｒｓ１３０３１０５６、ｒｓ２１９６３５３、ｒｓ１２４７１２３５、ｒｓ１２４６７０１４、ｒｓ１０１８１８３８、ｒｓ１４３５６１６、ｒｓ１４３５６１２、ｒｓ１６８４７７２９、ｒｓ７４２１７５５、ｒｓ１６８４７７３３、ｒｓ１９７５２４８、ｒｓ１５６１０２２、ｒｓ１３６９５４０、ｒｓ７５６４５０２、及びｒｓ１０１９７２７７から選択される少なくともいずれかであることが好ましい。【0034】
前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）０．２超えである、ｒｓ６４２９９２７、ｒｓ４６６２５５５、ｒｓ１３４２９４１４、ｒｓ１９９１９９７、ｒｓ１９９１９９８、ｒｓ１３４０８３６５、ｒｓ１２６１１５５８、ｒｓ１２６２１４１４、ｒｓ１０１６５１５４、ｒｓ１１８８４９８４、ｒｓ７６０２６７７、ｒｓ７５９３５９４、ｒｓ２３８１１６７、ｒｓ１３４１８０２７、ｒｓ１５６１０１９、ｒｓ１３０１２２６５、ｒｓ１０４９６９０６、ｒｓ４６６２５５７、ｒｓ１４３５５９８、ｒｓ１０１８３１４２、ｒｓ１０４９６９０７、ｒｓ１５２９８６９、ｒｓ１８９８０１８、ｒｓ１０１９８６５０、ｒｓ９７８９４３０、ｒｓ１６８４７６４０、ｒｓ１３６９５４２、ｒｓ１３０１３３１６、ｒｓ１２４６６１８８、ｒｓ１３０１１２７２、ｒｓ９５６９５８、ｒｓ１０２０５８３６、ｒｓ１２６２３５６３、ｒｓ１３０３１０５６、ｒｓ２１９６３５３、ｒｓ１２４７１２３５、ｒｓ１２４６７０１４、ｒｓ１０１８１８３８、ｒｓ１４３５６１６、ｒｓ１４３５６１２、ｒｓ１６８４７７２９、ｒｓ７４２１７５５、ｒｓ１６８４７７３３、ｒｓ１９７５２４８、ｒｓ１５６１０２２、ｒｓ１３６９５４０、ｒｓ７５６４５０２、ｒｓ１０１９７２７７、ｒｓ１６８５５０９５、ｒｓ１５４１９７４、ｒｓ１４３５６０７、及びｒｓ１４３５６０９から選択される少なくともいずれかであることが好ましい。【0035】
−ＤＮＡ含有試料−前記ＤＮＡ含有試料は、前記第１の態様では被検体由来の前記ＮＴＲＫ２遺伝子領域を、前記第２の態様では被検体由来のＬＲＰ１Ｂ遺伝子領域を、前記第３の態様では前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が含まれる領域を、前記第４の態様では前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が含まれる領域を、少なくとも含み、後述する追加の検出工程を含む場合は、当該追加の検出工程で検出する一塩基多型が含まれる領域を更に含むものである。
前記検出工程において、前記ＤＮＡ含有試料は、予めＤＮＡとして調製されたものであってもよく、被検体から採取してＤＮＡ調製から行ってもよい。
また、前記ＤＮＡ含有試料は、ＤＮＡの代わりにＤＮＡの転写産物であってもよく、これらの混合溶液であってもよい。
【0036】
前記ＤＮＡ含有試料を前記被検体から採取する際に用いる被検体由来の試料としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、細胞、組織、血液、血球成分、唾液、リンパ液、毛髪などが挙げられる。これらは、１種単独で使用してもよく、２種以上を併用してもよい。これらの中でも、前記被検体由来の試料は、血液及びその分画である血球成分が、採取が簡便であるため好ましい。【0037】
前記被検体由来の試料からＤＮＡを抽出する方法としては、特に制限はなく、公知の方法の中から、目的に応じて適宜選択することができる。また、前記ＤＮＡ含有試料は、前記抽出したＤＮＡそのものであってもよく、配列番号：１から配列番号：１４で表される塩基配列の少なくともいずれかを含む領域を予めＰＣＲで増幅して得られた増幅産物であってもよい。
【0038】
＜判定工程＞前記第１の態様における前記判定工程は、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ４０７５５６１の相補鎖がアレルＣを有することと、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有することは同義である。
前記第２の態様における前記判定工程は、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓｒｓ９２８７３２６の相補鎖がアレルＧを有することと、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有することは同義である。
前記第３の態様における前記判定工程は、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。
前記第４の態様における前記判定工程は、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあり、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。
なお、後述する追加の検出工程を行う場合、前記判定工程では、前記各態様におけるアレルの有無と、該追加の検出工程で検出するアレルの有無とを組み合わせることにより、加齢黄斑変性易罹患性の判定を行うことができる。
【0039】
下記の実施例から明らかな通り、ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１が、加齢黄斑変性罹患性と高い相関を示し、ｒｓ４０７５５６１が、「Ｇ」（アレルＧ；その相補鎖においてはアレルＣ）の場合、易罹患性アレル（リスクアレル）であり、「Ｔ」（アレルＴ；その相補鎖においてはアレルＡ）の場合、難罹患性アレルであり、ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合に、高い確率及び精度で加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができ、アレルＧを２つ（即ち、ホモで）有する場合に、更に高い確率及び精度で加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。また、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６が、加齢黄斑変性罹患性と高い相関を示し、ｒｓ９２８７３２６が、「Ｃ」（アレルＣ；その相補鎖においてはアレルＧ）の場合、易罹患性アレル（リスクアレル）であり、「Ａ」（アレルＡ；その相補鎖においてはアレルＴ）の場合、難罹患性アレルであり、ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合に、高い確率及び精度で加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができ、アレルＣを２つ（即ち、ホモで）有する場合に、更に高い確率及び精度で加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。
そして、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあり、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）０．５超えである一塩基多型が、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合も高い確率及び精度で加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。
【0040】
＜追加の検出工程、及び判定工程＞本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法は、下記（１）〜（９）に示す検出処理の少なくともいずれかを含む追加の検出工程と組み合わせることにより、前記検出工程単独の場合よりも、加齢黄斑変性罹患性の難易を更に高い確率で判定することができる。
すなわち、本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法は、追加の検出工程を含むことが好ましく、前記追加の検出工程としては、後述する検出処理（１）〜（９）の少なくともいずれかを含むことが好ましい。
前記追加の検出工程は、前記検出工程と同時に行ってもよいし、別々に行ってもよい。前記別々に行う場合、その順序は、目的に応じて適宜選択することができる。
また、前記追加の検出工程における各検出処理は、同時に行ってもよいし、別々に行ってもよい。前記別々に行う場合、その順序は、目的に応じて適宜選択することができる。
前記追加の検出工程を含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法の前記判定工程は、前記検出工程でリスクアレルが検出された場合に加え、更に前記追加の検出工程でもリスクアレルが検出された場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。
【0041】
−追加の検出工程（ｉ）−前記追加の検出工程（ｉ）は、前記検出工程が「検出工程（Ｉ）」の場合に好適に用いることができる。
前記追加の検出工程（ｉ）は、下記（２）から（９）の少なくともいずれかの検出処理を含む。これらの中でも下記（２）、（５）、（６）、（７）、及び（９）の少なくともいずれかの検出処理であることが好ましく、（５）及び（６）、並びに（５）及び（７）のいずれかの検出処理であることがより好ましい。前記好ましい検出処理であると、更に高い確率で加齢黄斑変性罹患性の難易を判定することができる点で、有利である。
【0042】
−追加の検出工程（ｉｉ）−前記追加の検出工程（ｉｉ）は、前記検出工程が「検出工程（ＩＩ）」の場合に好適に用いることができる。
前記追加の検出工程（ｉｉ）は、下記（１）、及び（３）から（９）の少なくともいずれかの検出処理を含む。これらの中でも下記（１）の検出処理が、更に高い確率で加齢黄斑変性罹患性の難易を判定することができる点で、有利である。
【0043】
−追加の検出工程（ｉｉｉ）−前記追加の検出工程（ｉｉｉ）は、前記検出工程が「検出工程（ＩＩＩ）」の場合に好適に用いることができる。
前記追加の検出工程（ｉｉｉ）は、下記（１）、（２）、及び（４）から（９）の少なくともいずれかの検出処理を含む。
【0044】
−追加の検出工程（ｉｖ）−前記追加の検出工程（ｉｖ）は、前記検出工程が「検出工程（ＩＶ）」の場合に好適に用いることができる。
前記追加の検出工程（ｉｖ）は、下記（１）から（３）、及び（５）から（９）の少なくともいずれかの検出処理を含む。
【0045】
［ＮＴＲＫ２遺伝子、及びｒｓ４０７５５６１］ＮＴＲＫ２遺伝子、及びｒｓ４０７５５６１は、上述した通りである。
【0046】
（１）ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）検出処理（１）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１(ＳＮＰ１）のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する処理である。
前記検出処理（１）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）がアレルＧを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）の相補鎖がアレルＣを有することと、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有することは同義である。
【0047】
前記検出処理（１）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、前記配列番号：１及び前記配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する工程であることが好ましい。【0048】
［ＬＲＰ１Ｂ遺伝子、及びｒｓ９２８７３２６］ＬＲＰ１Ｂ遺伝子、及びｒｓ９２８７３２６は、上述した通りである。
【0049】
（２）ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）検出処理（２）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６(ＳＮＰ２）のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する処理である。
前記検出処理（２）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ９２８７３２６(ＳＮＰ２）がアレルＣを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ９２８７３２６(ＳＮＰ２）の相補鎖がアレルＧを有することと、前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有することは同義である。
【0050】
前記検出処理（２）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、前記配列番号：３及び前記配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理であることが好ましい。【0051】
［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］（３）ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ
検出処理（３）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する処理である。
前記検出処理（３）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。
【0052】
前記検出処理（３）における前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が、０．５を超えていることが好ましく、０．７を超えていることがより好ましい。前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５を超えているＳＮＰとしては、上記＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．７を超えているＳＮＰとしては、上記＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
【0053】
また、前記検出処理（３）における前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒ２値が０．２を超えているＳＮＰとしては、上記＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
また、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0054】
［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］（４）ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ
検出処理（４）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する処理である。
前記検出処理（４）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるアレルを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。
【0055】
前記検出処理（４）における前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が、０．５を超えていることが好ましく、０．７を超えていることがより好ましい。前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５を超えているＳＮＰとしては、上記＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．７を超えているＳＮＰとしては、上記＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
【0056】
また、前記検出処理（４）における前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒ２値が０．２を超えているＳＮＰとしては、上記＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
また、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0057】
［ＨＴＲＡ１遺伝子、及びｒｓ１１２００６３８］セリンプロテアーゼ遺伝子（ＨＴＲＡ１）は、第１０番染色体長腕ｑ２６領域に位置する遺伝子であり、ｒｓ１１２００６３８（以下、「ＳＮＰ３」と称することがある）は、ＨＴＲＡ１遺伝子のプロモータ領域に位置する一塩基多型である。
【0058】
（５）ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型ｒｓ１１２００６３８検出処理（５）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１１２００６３８（ＳＮＰ３）のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する処理である。
前記検出処理（５）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ１１２００６３８（ＳＮＰ３）がアレルＡを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ１１２００６３８（ＳＮＰ３）の相補鎖がアレルＴを有することと、前記ｒｓ１１２００６３８がアレルＡを有することは同義である。
【0059】
以下に示す配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列は、ｒｓ１１２００６３８（ＳＮＰ３）を含む塩基配列であり、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ１１２００６３８（ＳＮＰ３）の部位である。また、ＳＮＰ３の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ａ」（その相補対は「Ｔ」）である。５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣ［Ａ／Ｇ］ＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５及び配列番号：６）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
前記検出処理（５）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理であることが好ましい。
【0060】
［ＣＦＨ遺伝子、並びにｒｓ８００２９２、ｒｓ１４１０９９６及びｒｓ１０６１１７０］補体Ｈ因子（ＣＦＨ）遺伝子は、第１番染色体長腕ｑ３１．３領域に位置する遺伝子であり、以下に示す、３種類の一塩基多型が特に加齢黄斑変性罹患性のマーカーとして知られている。
（ａ）エクソン２の蛋白質６２番目のイソロイシンがバリンへ変異したアミノ酸変異（Ｉ６２Ｖ）を伴うコーディング領域のミスセンスＳＮＰ：ｒｓ８００２９２（以下、「ＳＮＰ４」と称することがある）。
（ｂ）イントロン１４のＳＮＰ：ｒｓ１４１０９９６（以下、「ＳＮＰ５」と称することがある）。
（ｃ）エクソン９の蛋白質４０２番目のチロシンがヒスチジンに変異したアミノ酸変異（Ｙ４０２Ｈ）を伴うコーディング領域のミスセンスＳＮＰ：ｒｓ１０６１１７０（以下、「ＳＮＰ６」と称することがある）。
【0061】
（６）ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ８００２９２検出処理（６）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号ｒｓ８００２９２（ＳＮＰ４）のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する処理である。
前記検出処理（６）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ８００２９２（ＳＮＰ４）がアレルＣを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ８００２９２（ＳＮＰ４）の相補鎖がアレルＧを有することと、前記ｒｓ８００２９２がアレルＣを有することは同義である。
【0062】
以下に示す配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列は、ｒｓ８００２９２（ＳＮＰ４）を含む塩基配列であり、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ８００２９２（ＳＮＰ４）の部位である。また、ＳＮＰ４の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ｃ」であり、配列番号：７で表される塩基配列では、その相補対である「Ｇ」である。５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴ［Ｇ／Ａ］ＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７及び配列番号：８）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
前記検出処理（６）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理であることが好ましい。
【0063】
（７）ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ１４１０９９６検出処理（７）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号ｒｓ１４１０９９６（ＳＮＰ５）のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する処理である。
前記検出処理（７）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ１４１０９９６（ＳＮＰ５）がアレルＣを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ１４１０９９６（ＳＮＰ５）の相補鎖がアレルＧを有することと、前記ｒｓ１４１０９９６がアレルＣを有することは同義である。
【0064】
以下に示す配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列は、ｒｓ１４１０９９６（ＳＮＰ５）を含む塩基配列であり、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ１４１０９９６（ＳＮＰ５）の部位である。また、ＳＮＰ５の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ｃ」であり、配列番号：９で表される塩基配列では、その相補対である「Ｇ」である。５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧ［Ｇ／Ａ］ＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９及び配列番号：１０）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
前記検出処理（７）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理であることが好ましい。
【0065】
（８）ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ１０６１１７０検出処理（８）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号ｒｓ１０６１１７０（ＳＮＰ６）のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する処理である。
前記検出処理（８）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ１０６１１７０（ＳＮＰ６）がアレルＣを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ１０６１１７０（ＳＮＰ６）の相補鎖がアレルＧを有することと、前記ｒｓ１０６１１７０がアレルＣを有することは同義である。
【0066】
以下に示す配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列は、ｒｓ１０６１１７０（ＳＮＰ６）を含む塩基配列であり、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ１０６１１７０（ＳＮＰ６）の部位である。また、ＳＮＰ６の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ｃ」であり、配列番号：１１で表される塩基配列では、その相補対である「Ｇ」である。５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴ［Ｇ／Ａ］ＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１及び配列番号：１２）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
前記検出処理（８）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理であることが好ましい。
【0067】
［ＡＲＭＳ２遺伝子、及びｒｓ１０４９０９２４］ＡＭＤ感受性遺伝子座２（ＡＲＭＳ２）は、第１０番染色体長腕ｑ２６領域に位置する遺伝子であり、ｒｓ１０４９０９２４（以下、「ＳＮＰ７」と称することがある）は、蛋白質６９番目のアラニンがセリンに変異したアミノ酸変異（Ａ６９Ｓ）を伴うコーディング領域のミスセンス一塩基多型である。
【0068】
（９）ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ１０４９０９２４検出処理（９）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ１０４９０９２４（ＳＮＰ７）のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する処理である。
前記検出処理（９）を更に含む本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法においては、前記判定工程が、前記検出工程におけるＳＮＰがリスクアレルを有する場合に加え、更に前記ｒｓ１０４９０９２４（ＳＮＰ７）がアレルＴを有する場合に加齢黄斑変性易罹患性であると判定する工程である。なお、前記ｒｓ１０４９０９２４（ＳＮＰ７）の相補鎖がアレルＡを有することと、前記ｒｓ１０４９０９２４がアレルＴを有することは同義である。
【0069】
以下に示す配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列は、ｒｓ１０４９０９２４（ＳＮＰ７）を含む塩基配列であり、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列中、下線部を付した箇所がｒｓ１０４９０９２４（ＳＮＰ７）の部位である。また、ＳＮＰ７の易罹患性アレル（リスクアレル）は、「Ｔ」（その相補対は「Ａ」）である。５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴ［Ｔ／Ｇ］ＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３及び配列番号：１４）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
前記検出処理（９）は、被検体由来のＤＮＡ含有試料において、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する処理であることが好ましい。
【0070】
前記ＳＮＰを解析する方法としては、特に制限はなく、公知の方法の中から、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、Ｍｏｒｉ Ｋ ｅｔ ａｌ．， Ｉｎｖｅｓｔ Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ Ｖｉｓ Ｓｃｉ， ２００７， ４８（１１）， ５３１５−５３１９に記載の方法や、特表２００８−５２９５３６号公報に記載の方法などが挙げられる。また、前記一塩基多型の検出方法としては、特に制限はなく、目的に応じて公知の方法を適宜選択することができ、例えば、ポリメラーゼ連鎖反応法（ＰＣＲ法）、塩基配列解析、ＤＮＡマイクロアレイ、インベーダアッセイ、ＰＣＲ−ＲＥＴＩＮＡ法（ＰＣＲ−ｒｅａｌ−ｔｉｍｅ ｉｎｖａｄｅｒ ａｓｓａｙ；特開２００８−２６３９７４号公報参照）、ＰＣＲ−制限酵素断片多型法（ＰＣＲ−ＲＦＬＰ法）などが挙げられる。
【0071】
また、米国における唾液を用いた遺伝子解析キット（２３ａｎｄＭｅ社）においては、糖尿病や関節リウマチ、各種悪性疾患、パーキンソン病などのリスク判定とともに、ＡＭＤに関する３遺伝子（補体系ＣＦＨ、Ｃ２遺伝子、ＡＲＭＳ２遺伝子）のジェノタイピングを行い、ＡＭＤ発症リスク情報を顧客に提供している。国内においては、京都大学などにおいて、外来診療におけるＳｍａｒｔＡｍｐ法を用いたＡＲＭＳ２遺伝子多型検出キットを臨床研究として用いており、迅速遺伝子型判定を実施している。本発明の加齢黄斑変性易罹患性判定方法は、このようなキットと組み合わせて用いることにより、より高い確率及び精度で加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能とするものである。【0072】
−喫煙感受性の加齢黄斑変性、及び喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性−本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定方法は、喫煙感受性の加齢黄斑変性、及び喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性の易罹患性の判定方法として好適に用いることができる。
即ち、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）がアレルＧを有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）がアレルＣを有する場合に喫煙感受性の加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。ここで、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合に、高い確率及び精度で喫煙感受性の加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができ、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを２つ（即ち、ホモで）有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを２つ（即ち、ホモで）有する場合に、更に高い確率及び精度で喫煙感受性の加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。
さらに、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを有する場合に喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。ここで、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合に、高い確率及び精度で喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができ、前記ｒｓ４０７５５６１がアレルＧを２つ（即ち、ホモで）有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６がアレルＣを２つ（即ち、ホモで）有する場合に、更に高い確率及び精度で喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性易罹患性であると判定することができる。
【0073】
これまでに、加齢黄斑変性には、遺伝因子の他、環境因子として、喫煙歴が関連することが報告されてきた。しかしながら、加齢黄斑変性において喫煙歴との関連が示された遺伝子多型については、これまでに報告されておらず、よって、ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１、及びＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６が、加齢黄斑変性において喫煙歴との関連が初めて示された遺伝子多型である。また、日本人においては、白人種に比べて、特に新生血管を伴う滲出型加齢黄斑変性が多いことが知られているが、従来報告された遺伝子多型からだけでは日本人加齢黄斑変性の特徴は説明できるものではなかった。本発明において、新たにＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１、及びＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６が、喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性に関与することが示され、よって、喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性罹患性の難易を判定する判定用マーカーとして利用できることが示された。
ここで、「滲出型加齢黄斑変性」とは、血管新生を伴う、広義の滲出型の加齢黄斑変性を指し、ここには、狭義の滲出型加齢黄斑変性と、ポリープ状脈絡膜血管症（ＰＣＶ）が含まれる。
【0074】
また、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型、又は前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型は、ｒｓ４０７５５６１、又は前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるため、ｒｓ４０７５５６１、又は前記ｒｓ９２８７３２６と同様に、喫煙感受性の加齢黄斑変性及び／又は喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性についての易罹患性の判定に好適に用いることができる。すなわち、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣと連鎖不平衡関係にある易罹患性アレル（リスクアレル）を少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合、又は前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型が、ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧと連鎖不平衡関係にある易罹患性アレル（リスクアレル）を少なくとも１つ（即ち、ヘテロ又はホモで）有する場合に、高い確率及び精度で喫煙感受性の加齢黄斑変性及び／又は喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性であると判定することができ、また、該易罹患性アレルを２つ（即ち、ホモで）有する場合に、更に高い確率及び精度で喫煙感受性の加齢黄斑変性及び／又は喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性であると判定することができる。
【0075】
＜用途＞前記加齢黄斑変性易罹患性判定方法は、後述する本発明の加齢黄斑変性易罹患性判定用キットに好適に利用可能である。
本発明の加齢黄斑変性易罹患性判定方法によれば、加齢黄斑変性の発症及び進行、喫煙感受性加齢黄斑変性や喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性を予測可能であり、これにより発症の危険度が高い人に関しては、より頻回に眼科検査を受けることにより加齢黄斑変性の早期予防が可能となり、加齢黄斑変性を既に発症した患者に対しては、最適な薬剤治療法の選択が可能となる。
【0076】
（加齢黄斑変性易罹患性の判定キット）本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットの態様としては、前記ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段を少なくとも含む態様（以下、「第１の態様」と称することがある。）、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型である米国バイオテクノロジー情報センター（ＮＣＢＩ）ＳＮＰデータベースのｄｂＳＮＰ ＩＤ番号：ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を少なくとも含む態様（以下、「第２の態様」と称することがある。）、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を少なくとも含む態様（以下、「第３の態様」と称することがある。）、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を少なくとも含む態様（以下、「第４の態様」と称することがある。）が挙げられる。
これらの態様の中でも、前記第１の態様、前記第２の態様が好ましく、前記第１の態様がより好ましい。前記好ましい態様であると、加齢黄斑変性易罹患性を高い確率及び精度で判定することができ、前記より好ましい態様であると、喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性、又は喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性を高い確率及び精度で判定することができる。
これらのキットは、被検体由来のＤＮＡ含有試料を用い、ＰＣＲ法などで簡便に加齢黄斑変性の罹患の難易を判定することができるものである。
【0077】
［ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ４０７５５６１（第１の態様）］前記第１の態様の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、少なくとも、前記ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段を含み、更に必要に応じて、追加の検出セット、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0078】
前記ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ４０７５５６１を含む、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：１及び配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
【0079】
［ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型ｒｓ９２８７３２６（第２の態様）］前記第２の態様の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、少なくとも、前記ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含み、更に必要に応じて、追加の検出セット、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0080】
前記ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ９２８７３２６を含む、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：３及び配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
【0081】
［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ（第３の態様）］前記第３の態様の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、少なくとも、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を含み、更に必要に応じて、追加の検出セット、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0082】
前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が、０．５を超えていることが好ましく、０．７を超えていることがより好ましい。
前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．７を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
【0083】
また、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒ２値が０．２を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
また、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0084】
［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ（第４の態様）］前記第４の態様の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、少なくとも、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を含み、更に必要に応じて、追加の検出セット、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0085】
前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５超えであれば特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記Ｄ’値が、０．７を超えていることが好ましい。
前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが挙げられる。前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．７を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
【0086】
また、前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒ２値が０．２を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
また、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0087】
前記ＰＣＲ法は、前記被検体由来のＤＮＡ含有試料（ＤＮＡ試料）に標識を有するプローブを結合させ、該ＤＮＡ試料を増幅させ、前記標識のシグナルの有無により前記一塩基多型のアレルを検出する方法である。前記ＰＣＲにおいて、例えば、前記第１の態様では、前記配列番号：１で表される塩基配列に対するプローブの標識と、前記配列番号：２で表される塩基配列に対するプローブの標識とで異なる標識を用いることで、これらのＰＣＲ増幅量を区別して検出することができ、他の態様でも同様にして検出することができる。
【0088】
前記加齢黄斑変性易罹患性判定用キットの使用方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、本発明の前記加齢黄斑変性易罹患性判定方法を用いることが好ましい。【0089】
−プライマー及びプライマー対−前記ＰＣＲに用いるプライマー及びプライマー対としては、前記被検体由来のＤＮＡ含有試料を鋳型ＤＮＡとして、検出対象とするＳＮＰを含むゲノム領域を増幅させるものであれば、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。そのようなプライマー及びプライマー対としては、鋳型ＤＮＡ乃至その相補鎖の一部と全ての配列が一致していてもよく、鋳型ＤＮＡ乃至その相補鎖の一部の配列に対し、１若しくは数個の塩基が欠失、置換、挿入された塩基配列からなるものであってもよい。
前記プライマーの塩基数としても、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、１５塩基〜３０塩基が好ましく、１７塩基〜２５塩基がより好ましく、１８塩基〜２２塩基が特に好ましい。また、ある程度長いゲノム領域において、複数のプローブを用いたマルチＰＣＲを行う場合は、プライマー対は、同等の温度で鋳型ＤＮＡにアニーリング可能なように設計されることが好ましい。
【0090】
前記プライマー配列を設計する方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、Ｐｒｉｍｅｒ Ｅｘｐｒｅｓｓ ｖｅｒ ３．０ソフトウェア（アプライドバイオシステムズ社製）、遺伝子相同性探索プログラムＢＬＡＳＴなどを用いて設計する方法などが挙げられる。前記プライマーの入手方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、合成する方法、市販品を用いる方法などが挙げられる。
【0091】
−プローブ−前記プローブとしては、例えば、前記第１の態様では、ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１の各アレルを検出するものであり、具体的には、前記配列番号：１で表される塩基配列のｒｓ４０７５５６１部位を含む領域に相補的な配列を有するプローブと、前記配列番号：２で表される塩基配列のｒｓ４０７５５６１部位を含む領域に相補的な配列を有するプローブとの組合せである。また、他の態様でも同様に、検出対象に合わせた組合せとすることができる。
【0092】
前記プローブの蛍光標識としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、ＦＡＭ、ＶＩＣ、Ｃｙ３、Ｃｙ５、ＦＩＴＣ、Ｔｅｘａｓ Ｒｅｄなどが挙げられる。また、前記プローブは、蛍光標識の代わりに放射性標識を有するものであってもよいが、安全性の点で蛍光標識が好ましい。【0093】
前記プローブを入手する方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、合成する方法、市販品を用いる方法などが挙げられる。前記市販品を用いる場合、例えば、ＴａｑＭａｎ ＭＧＢプローブ（Ｃｏｐｙ Ｎｕｍｂｅｒ Ａｓｓａｙｓ：アプライドバイオシステムズ社製）などを用いることができる。
【0094】
−アレルの検出−前記各態様におけるＳＮＰの各アレルを検出する方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、ＰＣＲ法、塩基配列解析、ＤＮＡマイクロアレイ、インベーダアッセイ、ＰＣＲ−ＲＥＴＩＮＡ法、ＰＣＲ−ＲＦＬＰ法などが挙げられる。これらは、１種単独で使用してもよく、２種以上を併用してもよい。
これらの中でも、リアルタイムＰＣＲ法が簡便に測定できる点で好ましい。
【0095】
前記リアルタイムＰＣＲ法は、前記プローブの蛍光強度を経時的にモニターすることで前記アレルの有無を検出することができるが、該モニターする方法としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、インターカレーター法、ＴａｑＭａｎ法、サイクリングプローブ法（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｅａｃｏｎ法）などが挙げられる。これらの中でも、ＴａｑＭａｎ法やサイクリングプローブ法が、標的配列に特異的なプローブを使用することにより極めて高い検出特異性を得ることができる点、また複数のプローブを用いたマルチカラー解析を行うことができる点で好ましい。【0096】
前記ＴａｑＭａｎ法で用いられるプローブは、その両端を蛍光物質と消光物質とで修飾され、標的核酸の増幅領域にハイブリダイズし得るオリゴヌクレオチドであり、アニーリング時に前記標的核酸にハイブリダイズするが消光物質の存在により蛍光を発せず、伸長反応時にＤＮＡポリメラーゼのエキソヌクレアーゼ活性により分解されて蛍光物質が遊離することにより蛍光を発する。したがって、蛍光強度を測定することにより増幅産物の生成量をモニタリングすることができ、それによって元の鋳型ＤＮＡの有無を推定することができる。【0097】
前記加齢黄斑変性易罹患性の判定キットにおいて、前記プライマー及び前記プローブは、乾燥した状態であってもよく、溶液の状態であってもよい。前記プライマー及び前記プローブが溶液の状態である場合、該溶液としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができ、例えば、水、エタノールなどが挙げられる。前記プライマー及び前記プローブは、使用時に適宜前記溶液により所望の濃度に調製して用いることができる。前記プライマー及びプローブの濃度としては、特に制限はなく、反応条件などに応じて適宜選択することができる。
【0098】
＜＜追加の検出手段＞＞本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、下記（１）〜（９）に示す追加の検出手段の少なくともいずれかと組み合わせることにより、前記検出手段単独の場合よりも、加齢黄斑変性罹患性の難易を更に高い確率で判定することができる。
すなわち、本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、後述する追加の検出手段（１）〜（９）の少なくともいずれかを更に含むことが好ましい。
前記第１の態様では、前記追加の検出手段として、下記（２）から（９）の少なくともいずれかの検出手段を含むことが好ましい。これらの中でも下記（２）、（５）、（６）、（７）、及び（９）の少なくともいずれかの追加の検出手段であることが好ましく、（５）及び（６）、並びに（５）及び（７）のいずれかの追加の検出手段であることがより好ましい。前記好ましい追加の検出手段であると、更に高い確率で加齢黄斑変性罹患性の難易を判定することができる点で、有利である。
前記第２の態様では、前記追加の検出手段として、下記（１）、及び（３）から（９）の少なくともいずれかの検出手段を含むことが好ましい。これらの中でも下記（１）の追加の検出手段が、更に高い確率で加齢黄斑変性罹患性の難易を判定することができる点で、有利である。
前記第３の態様では、前記追加の検出手段として、下記（１）、（２）、及び（４）から（９）の少なくともいずれかの検出手段を含むことが好ましい。
前記第４の態様では、前記追加の検出手段として、下記（１）から（３）、及び（５）から（９）の少なくともいずれかの検出手段を含むことが好ましい。
【0099】
（１）ＮＴＲＫ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ４０７５５６１追加の検出手段（１）は、前記ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0100】
前記追加の検出手段（１）における前記ｒｓ４０７５５６１のアレルＧ又はその相補鎖におけるアレルＣを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）を含む、前記配列番号：１及び前記配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、前記配列番号：１及び前記配列番号：２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。【0101】
（２）ＬＲＰ１Ｂ遺伝子の一塩基多型ｒｓ９２８７３２６追加の検出手段（２）は、前記ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0102】
前記追加の検出手段（２）における前記ｒｓ９２８７３２６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）を含む、前記配列番号：３及び前記配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、前記配列番号：３及び前記配列番号：４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。【0103】
（３）ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ追加の検出手段（３）は、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0104】
前記追加の検出手段（３）における前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。前記追加の検出手段（３）における前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が、０．５を超えていることが好ましく、０．７を超えていることがより好ましい。
前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。前記ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．７を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
【0105】
また、前記追加の検出手段（３）における前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ４０７５５６１に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒ２値が０．２を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
また、前記ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0106】
（４）ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ追加の検出手段（４）は、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0107】
前記追加の検出手段（４）における前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型を検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができる。前記追加の検出手段（４）における前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が、０．５を超えていることが好ましく、０．７を超えていることがより好ましい。
前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．５を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。前記ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（Ｄ’値）が０．７を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
【0108】
また、前記追加の検出手段（４）における前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、ｒｓ９２８７３２６に対する連鎖不平衡係数（ｒ２値）が、０．２を超えていることが好ましい。前記ｒ２値が０．２を超えているＳＮＰとしては、上記（加齢黄斑変性易罹患性の判定方法）の＜検出工程＞の［ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ］に記載したものと同様のものが好ましい。
また、前記ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡関係にある一塩基多型としては、前記連鎖不平衡係数「Ｄ’値」及び「ｒ２値」のいずれもが前記好ましい値を満たしていることが好ましい。
【0109】
（５）ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型ｒｓ１１２００６３８追加の検出手段（５）は、前記ＨＴＲＡ１遺伝子近傍の一塩基多型ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段を含み、を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0110】
前記追加の検出手段（５）における前記ｒｓ１１２００６３８のアレルＡ又はその相補鎖におけるアレルＴを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ１１２００６３８（ＳＮＰ３）を含む、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：５及び配列番号：６で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
【0111】
（６）ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ８００２９２追加の検出手段（６）は、前記ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0112】
前記追加の検出手段（６）における前記ｒｓ８００２９２のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ８００２９２（ＳＮＰ４）を含む、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：７及び配列番号：８で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
【0113】
（７）ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ１４１０９９６追加の検出手段（７）は、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0114】
前記追加の検出手段（７）における前記ｒｓ１４１０９９６のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ１４１０９９６（ＳＮＰ５）を含む、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：９及び配列番号：１０で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
【0115】
（８）ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ１０６１１７０追加の検出手段（８）は、ＣＦＨ遺伝子の一塩基多型ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0116】
前記追加の検出手段（８）における前記ｒｓ１０６１１７０のアレルＣ又はその相補鎖におけるアレルＧを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ１０６１１７０（ＳＮＰ６）を含む、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：１１及び配列番号：１２で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＧＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１１）
５’−ＧＧＣＡＡＣＧＴＣＴＡＴＡＧＡＴＴＴＡＣＣＣＴＧＴＡＣＡＡＡＣＴＴＴＣＴＴＣＣＡＴＡＡＴＴＴＴＧＡＴＴＡＴＡＴＣＣＡＴＴＴＴＣＣＡＡＡＴＡＡＧＧＡＡＡＡＴＡＡＣＡＴＴＴＴＣＣＴＡＡ−３’（配列番号：１２）
【0117】
（９）ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ１０４９０９２４追加の検出手段（９）は、ＡＲＭＳ２遺伝子の一塩基多型ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段を含み、更に必要に応じて、酵素、ＰＣＲ用バッファー、容器、使用説明書などのその他の要素を含む。
【0118】
前記追加の検出手段（９）における前記ｒｓ１０４９０９２４のアレルＴ又はその相補鎖におけるアレルＡを検出する手段としては、特に制限はなく、目的に応じて適宜選択することができるが、前記ｒｓ１０４９０９２４（ＳＮＰ７）を含む、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する共通プライマー対と、配列番号：１３及び配列番号：１４で表される塩基配列又はそれらの相補塩基配列を検出する各プローブとのセットを含むことが好ましい。５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
【0119】
前記追加の検出手段（１）〜（９）におけるプライマー、プローブなどについては、各検出手段の標的配列などの事項を除いて、本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットにおいて説明した前記プライマー、前記プローブなどと同様のものを適宜選択することができる。【0120】
−喫煙感受性の加齢黄斑変性、及び喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性−本発明の加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、喫煙感受性の加齢黄斑変性、及び喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性の易罹患性の判定キットとして好適に用いることができる。
【0121】
＜用途＞前記加齢黄斑変性易罹患性判定キットは、加齢黄斑変性の発症及び進行、喫煙感受性加齢黄斑変性や喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の易罹患性を予測するための診断キットとして好適に利用可能である。
これにより、発症の危険度が高い人に関してはより頻回に眼科検査を受けることにより加齢黄斑変性の早期予防が可能となり、また、加齢黄斑変性を既に発症した患者に対しては、最適な薬剤治療法の選択が可能となる。
【実施例】
【0122】
以下に本発明の実施例を挙げて本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例に何ら限定されるものではない。【0123】
（実施例１：ＳＮＰ１による加齢黄斑変性易罹患性の判定）＜ＤＮＡ採取工程＞
埼玉医科大学倫理委員会の承認の下、埼玉医科大学病院眼科で受診した加齢黄斑変性罹患者（以下、「ＡＭＤ罹患群」又は「罹患群」と称することがある。）男女２４７名と、眼底疾患を有さない非罹患者（以下、「対照群」と称することがある。）男女１２３名の合計３７０名より、血液を採取し、ＤＮＡサンプルをＷｉｚａｒｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ（プロメガ社製）を用いて精製した。
【0124】
＜検出工程＞一塩基多型（以下、「ＳＮＰ」と称することがある。）の解析には、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ法（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社）を用い、使用機器、キット及び試薬として、下記のものを用いた。
【0125】
−使用機器−（１）ＳｔｅｐＯｎｅＰｌｕｓ（登録商標）リアルタイムＰＣＲシステム（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）、又は（２）ＧｅｎｅＡｍｐ（登録商標）ＰＣＲ Ｓｙｓｔｅｍ ９７００（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）で前記ＤＮＡサンプルをＰＣＲ増幅の上、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ７０００リアルタイムＰＣＲシステム（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）により解析を行った。
−−ＰＣＲ条件−−
サイクル１ ：９５℃、１０分間
サイクル２〜４１：９５℃、５秒間の後、６０℃、１分間
−キット−
ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）
−試薬−
ＴａｑＭａｎ（登録商標）Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）
【0126】
＜＜ＮＴＲＫ２ ＳＮＰ（ＳＮＰ１）及びその標的配列＞＞本実施例１では、ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰであるｒｓ４０７５５６１を検出対象のＳＮＰとした。前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１（以下、「ＳＮＰ１」と称することがある。）及びその標的配列（以下、「標的配列１」と称することがある。）は、以下の通りである。
なお、ＮＴＲＫ２ ＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１用検出キットとして、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）のＡｓｓａｙ ＩＤ：Ｃ＿＿２７９９６８７９＿２０を用いた。
【0127】
−ＳＮＰ１−ＮＴＲＫ２遺伝子のイントロンに位置するＳＮＰ：ｒｓ４０７５５６１
−標的配列１−
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴ［Ｇ／Ｔ］ＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１及び配列番号：２）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＧＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：１）
５’−ＣＡＡＡＡＴＡＧＧＡＧＴＡＡＡＴＧＣＡＴＡＡＡＣＴＴＧＧＧＡＡＡＣＧＡＡＡＧＴＣＡＧＧＧＴＡＧＧＴＧＣ−３’（配列番号：２）
【0128】
なお、前記ＮＴＲＫ２ ＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１用検出キットでは、ＳＮＰ塩基部位にある［Ｇ／Ｔ］のどちらかと結合（ハイブリダイズ）するよう、アレル１（Ｇ）又はアレル２（Ｔ）の２種類ＴａｑＭａｎプローブが設定されている（［Ｇ／Ｔ］を含む約１５塩基対程度の長さのプローブであり、配列詳細は非公開）。また、ＰＣＲプライマー（配列詳細は非公開）は、上記ＳＮＰ１の標的配列１の５’末端から約２０塩基の配列がフォワードプライマーとして、３’末端から約２０塩基の配列に対する相補的配列がリバースプライマーとして、一対のＰＣＲプライマーが設定される。【0129】
前記ＳＮＰのアレル検出メカニズムは、以下の通りである。アレル１用ＴａｑＭａｎプローブの５’末端にはレポーターのＶＩＣ蛍光色素が、アレル２用ＴａｑＭａｎプローブの５’末端にはＦＡＭ蛍光色素が結合している。また、両プローブの３’末端にレポーター色素からの蛍光を吸収する消光物質（Ｑｕｅｎｃｈｅｒ）が結合しており、ＰＣＲが伸長するまではレポーター色素からの蛍光は検出されない。ＰＣＲ反応が進行するに従い、ＴａｑＭａｎプローブが分解され、Ｑｕｅｎｃｈｅｒから遊離したレポーター色素の蛍光が検出できる。【0130】
＜ＳＮＰ１によるＡＭＤ易罹患性の判定＞前記ＡＭＤ罹患群及び対照群における、前記ＳＮＰ１のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表１に示す。その結果、Ｐ値：０．００７１２８、９５％信頼区間：１．１３８〜２．４３６、オッズ比：１．６６７であった。
また、ＡＭＤ罹患群及び対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＧＧ対ＧＴ＋ＴＴの２群間での比較を行った。結果を表２−１及び表２−２に示す。その結果、Ｐ値：０．０１１４、９５％信頼区間：１．１３１〜２．８９２、オッズ比：１．８０８であった。
【0131】
【表1】
【0132】
【表2-1】
【0133】
【表2-2】
【0134】
以上より、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１が、ＡＭＤ罹患性と高い相関を示し、リスクアレルＧを１つでも有する場合に、有意にＡＭＤ易罹患性が高いことが明らかとなり、更に、劣性遺伝モデル解析において、すなわち、リスクアレルＧをホモで有する場合に、リスクアレルＧをホモで有さない場合に対して、ＡＭＤ易罹患性のオッズ比がアレル頻度解析におけるオッズ比よりも、更に高くなることが明らかとなった。したがって、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１から高い確率及び精度で加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であることが示された。【0135】
（実施例２：ＳＮＰ１による喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定）実施例１におけるＡＭＤ罹患群及び対照群の中から、喫煙歴がある対象（ＡＭＤ罹患群男女１７８名及び対照群男女４８名の合計２２６名）について、実施例１と同様にＡＭＤ易罹患性を判定した。
【0136】
＜ＳＮＰ１による喫煙感受性ＡＭＤ易罹患性の判定＞前記喫煙歴ありのＡＭＤ罹患群及び対照群における、前記ＳＮＰ１のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表３に示す。その結果、Ｐ値：０．００７２９６、９５％信頼区間：１．１７５〜３．４７０、オッズ比：２．０３１であった。
また、喫煙歴ありのＡＭＤ罹患群及び対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＧＧ対ＧＴ＋ＴＴの２群間での比較を行った。結果を表４−１及び表４−２に示す。その結果、Ｐ値：０．００３８４７、９５％信頼区間：１．３０８〜５．３４１、オッズ比：２．６３１であった。
【0137】
【表3】
【0138】
【表4-1】
【0139】
【表4-2】
【0140】
以上より、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１が、喫煙感受性のＡＭＤ罹患性と高い相関を示し、リスクアレルＧを１つでも有する場合に、喫煙感受性のＡＭＤ易罹患性のオッズ比がＡＭＤ全体における易罹患性のオッズ比よりも高くなることが明らかとなり、更に、劣性遺伝モデル解析において、すなわち、リスクアレルＧをホモで有する場合に、リスクアレルＧをホモで有さない場合に対して、喫煙感受性のＡＭＤ易罹患性のオッズ比がＡＭＤ全体における易罹患性のオッズ比よりも、有意に高くなることが明らかとなった。したがって、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１から高い確率及び精度で喫煙感受性加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であることが示された。また、後述する「ＳＮＰ２による喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定」の結果と比較して、前記ＳＮＰ１では、Ｐ値が深く（値が小さく）、喫煙感受性加齢黄斑変性の易罹患性のマーカーとして好適であることが示された。
【0141】
（実施例３：ＳＮＰ１による喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性易罹患性の判定）＜ＳＮＰ１による喫煙感受性滲出型ＡＭＤ易罹患性の判定＞
実施例1におけるＡＭＤ罹患群及び対象群の中から、以下の各対象を抽出し、実施例１と同様にＡＭＤ易罹患性を判定した。
（１） 喫煙歴ありの滲出型ＡＭＤ罹患群（男女１５７名）及び喫煙歴ありの対照群（男女４８名）における、前記ＳＮＰ１のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表５に示す。その結果、Ｐ値：０．００３５、９５％信頼区間：１．２７〜３．８８、オッズ比：２．２３であった。
また、喫煙歴ありの滲出型ＡＭＤ罹患群及び喫煙歴ありの対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＧＧ対ＧＴ＋ＴＴの２群間での比較を行った。結果を表６−１及び表６−２に示す。その結果、Ｐ値：０．００３０、９５％信頼区間：１．３９〜５．８５、オッズ比：２．８４であった。
【0142】
【表5】
【0143】
【表6-1】
【0144】
【表6-2】
【0145】
（２） また、喫煙歴５年を境界としたアレルＧの滲出型ＡＭＤ罹患リスクについて、喫煙歴５年以上の滲出型ＡＭＤ罹患群（男女１５３名）及び喫煙歴５年以上の対照群（男女４６名）における、前記ＳＮＰ１のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表７に示す。その結果、Ｐ値：０．００１６、９５％信頼区間：１．３５〜４．２５、オッズ比：２．４１であった。また、喫煙歴５年以上の滲出型ＡＭＤ罹患群及び喫煙歴５年以上の対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＧＧ対ＧＴ＋ＴＴの２群間での比較を行った。結果を表８−１及び表８−２に示す。その結果、Ｐ値：０．００１４、９５％信頼区間：１．４６〜６．３５、オッズ比：３．０３であった。
【0146】
【表7】
【0147】
【表8-1】
【0148】
【表8-2】
【0149】
以上より、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１が、喫煙感受性の滲出型ＡＭＤ罹患性と高い相関を示し、劣性遺伝モデル解析において、すなわち、リスクアレルＧをホモで有する場合に、リスクアレルＧをホモで有さない場合に対して、喫煙感受性の滲出型ＡＭＤ易罹患性のオッズ比がアレル頻度解析におけるオッズ比よりも、更に高くなることが明らかとなった。また、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１は、喫煙歴５年を境界とした滲出型ＡＭＤ易罹患性のほうが、喫煙歴ありを基準にした滲出型ＡＭＤ易罹患性よりも、更に高い相関性を示した。したがって、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１から高い確率及び精度で喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であることが示された。また、後述する「ＳＮＰ２による喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性易罹患性の判定」の結果と比較して、前記ＳＮＰ１では、Ｐ値が深く（値が小さく）、喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の易罹患性のマーカーとして好適であることが示された。
【0150】
（実施例４：ＳＮＰの組合せによる加齢黄斑変性易罹患性の判定−Ｉ）＜ＤＮＡ採取工程＞
実施例１と同様に、埼玉医科大学倫理委員会の承認の下、埼玉医科大学病院眼科で受診したＡＭＤ罹患群の男女２４７名と、対照群の男女１２３名の合計３７０名より、血液を採取し、ＤＮＡサンプルをＷｉｚａｒｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ（プロメガ社製）を用いて精製した。
【0151】
＜検出工程及び追加の検出工程＞検出対象のＳＮＰを、ＳＮＰ１に加えて、以下に示すＳＮＰ３〜５としたこと以外は、実施例１の検出工程と同様にして、検出工程及び追加の検出工程を行った。
【0152】
＜＜ＳＮＰ３〜５及びそれらの標的配列＞＞Ｍｏｒｉ Ｋ ｅｔ ａｌ．， Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌｏｇｙ， ２０１０， １１７（５）， ９２８−９３８に記載の方法により、ＡＭＤ罹患性との相関が明らかになっているＨＴＲＡ１遺伝子のＳＮＰ ｒｓ１１２００６３８（以下、「ＳＮＰ３」と称することがある）、及びＣＦＨ遺伝子の２種類のＳＮＰ ｒｓ８００２９２及びｒｓ１４１０９９６（以下、「ＳＮＰ４」及び「ＳＮＰ５」と称することがある）について、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）を用いて遺伝子型を決定した。
【0153】
前記ＨＴＲＡ１遺伝子のＳＮＰ、及び前記ＣＦＨ遺伝子の２種類のＳＮＰ並びにそれらの標的配列は、以下のＳＮＰ３〜ＳＮＰ５並びに標的配列３〜５にそれぞれ示す通りである。なお、ＳＮＰ３は、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社にてカスタム製造した（Ａｓｓａｙ ＩＤ：ＲＳ１１２００６３８−ＲＳＮＰＭ１）を用いて遺伝子型を決定した。また、ＳＮＰ４及びＳＮＰ５は、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）のＡｓｓａｙ ＩＤ：Ｃ＿＿＿２５３０３８２＿１０及びＡｓｓａｙ ＩＤ：Ｃ＿＿＿２５３０２９４＿１０をそれぞれ用いて遺伝子型を決定した。
【0154】
−ＳＮＰ３−ＨＴＲＡ１遺伝子のプロモータ領域に位置するＳＮＰ：ｒｓ１１２００６３８
−標的配列３−
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣ［Ａ／Ｇ］ＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５及び配列番号：６）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：５）
５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧＣＣＡＧＣＴＣＣＧＣＧＧＡＣＧＣＴＧＣＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡＧＡＧＧＣＣＣＣＧＣＧＧＴＣＡＧＧＧＴＣＣＣＧＣＧ−３’（配列番号：６）
−ＰＣＲプライマー−
ＳＮＰ３−Ｆｗ（フォワードプライマー）：５’−ＧＧＣＧＣＧＧＧＣＴＴＴＣＴＧ−３’（配列番号：１５）
ＳＮＰ３−Ｒｖ（リバースプライマー）：５’−ＣＧＣＧＧＧＡＣＣＣＴＧＡＣＣ−３’（配列番号：１６）
−プローブ−
ＳＮＰ３−Ｐ１（アレル１（Ｇ）用プローブ）：５’−ＣＴＴＣＧＴＣＣＧＧＣＣＧＣＡ−３’（配列番号：１７）
ＳＮＰ３−Ｐ２（アレル２（Ａ）用プローブ）：５’−ＣＴＴＣＧＴＣＣＡＧＣＣＧＣＡ−３’（配列番号：１８）
【0155】
−ＳＮＰ４−ＣＦＨ遺伝子のエクソン２に位置し、ＣＦＨ蛋白質６２番目のイソロイシンがバリンへ変異したアミノ酸変異（Ｉ６２Ｖ）を伴うコーディング領域のミスセンスＳＮＰ：ｒｓ８００２９２
−標的配列４−
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴ［Ｇ／Ａ］ＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７及び配列番号：８）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＧＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：７）
５’−ＣＣＣＴＧＧＡＴＡＴＡＧＡＴＣＴＣＴＴＧＧＡＡＡＴＡＴＡＡＴＡＡＴＧＧＴＡＴＧＣＡＧＧＡＡＧＧＧＡＧＡ−３’（配列番号：８）
【0156】
−ＳＮＰ５−ＣＦＨ遺伝子のイントロン１４に位置するＳＮＰ：ｒｓ１４１０９９６
−標的配列５−
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧ［Ｇ／Ａ］ＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９及び配列番号：１０）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＧＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：９）
５’−ＴＣＴＡＣＡＴＣＡＧＴＧＧＴＡＴＡＧＣＴＧＡＧＴＧＡＣＡＴＧＡＧＧＴＡＧＴＣＡＧＧＧＡＣＴＧＡＧＴＣＡ−３’（配列番号：１０）
【0157】
＜ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３〜５の少なくともいずれかとの組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定＞ＳＮＰ１、ＳＮＰ３、ＳＮＰ４、及びＳＮＰ５のリスクアレル、遺伝子型及び劣性遺伝モデルは、表９に示す通りである。また、ＡＭＤ罹患群及び対照群の全人数におけるＳＮＰ１、ＳＮＰ３、ＳＮＰ４、及びＳＮＰ５の遺伝子型の人数分布、及びこの結果から作成した劣性遺伝モデルによる分割表を表１０に示す。
以下、（１）ＳＮＰ１単独、（２）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３との組合せ、（３）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ４との組合せ、（４）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ５との組合せ、（５）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３と、ＳＮＰ４との組合せ、並びに（６）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３と、ＳＮＰ５との組合せについてＡＭＤ易罹患性を解析した結果を示す。
【0158】
【表9】
【0159】
【表10】
【0160】
（１）ＳＮＰ１によるＡＭＤ易罹患性の判定ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２との４グループ間でＦｉｓｈｅｒ正確検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。結果を表１１に示す。その結果、Ｐ値：０．０１１４、９５％信頼区間：１．１３１〜２．８９２、オッズ比：１．８０８であった。
【0161】
【表11】
【0162】
（２）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ３の劣性遺伝１及び２との８グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表１２に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表１２において、ＳＮＰ１劣性遺伝１かつＳＮＰ３劣性遺伝１の群）を１とする。
【0163】
【表12】
【0164】
表１２の結果から、ＳＮＰ１及びＳＮＰ３の２つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ１単独の場合に比べ、オッズ比が上昇することから、ＡＭＤ罹患性と相関することが判明しているＨＴＲＡ１のＳＮＰとＳＮＰ１とを組み合わせることにより、ＳＮＰ１単独よりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0165】
（３）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ４との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ４の劣性遺伝１及び２との８グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表１３に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表１３において、ＳＮＰ１劣性遺伝１かつＳＮＰ４劣性遺伝１の群）を１とする。
【0166】
【表13】
【0167】
表１３の結果から、ＳＮＰ１及びＳＮＰ４の２つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ１単独の場合に比べ、オッズ比が上昇することから、ＡＭＤ罹患性と相関することが判明しているＣＦＨ遺伝子のＳＮＰとＳＮＰ１とを組み合わせることにより、ＳＮＰ１単独よりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0168】
（４）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ５との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ５の劣性遺伝１及び２との８グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表１４に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表１４において、ＳＮＰ１劣性遺伝１かつＳＮＰ５劣性遺伝１の群）を１とする。
【0169】
【表14】
【0170】
表１４の結果から、ＳＮＰ１及びＳＮＰ５の２つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ１単独の場合に比べ、オッズ比が上昇することから、ＡＭＤ罹患性と相関することが判明しているＣＦＨ遺伝子のＳＮＰとＳＮＰ１とを組み合わせることにより、ＳＮＰ１単独よりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0171】
（５）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３と、ＳＮＰ４との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ３の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ４の劣性遺伝１及び２との１６グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表１５に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表１５において、ＳＮＰ１劣性遺伝１かつＳＮＰ３劣性遺伝１かつＳＮＰ４劣性遺伝１の群）を１とする。
【0172】
【表15】
【0173】
表１５の結果から、ＳＮＰ１、ＳＮＰ３、及びＳＮＰ４の３つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ１単独又は２つのＳＮＰの組合せの場合に比べ、オッズ比が上昇することから、ＡＭＤ罹患性と相関することが判明しているＨＴＲＡ１遺伝子のＳＮＰ及びＣＦＨ遺伝子のＳＮＰとＳＮＰ１とを組み合わせることにより、ＳＮＰ１単独又は２つのＳＮＰの組合せよりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0174】
（６）ＳＮＰ１と、ＳＮＰ３と、ＳＮＰ５との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ３の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ５の劣性遺伝１及び２との１６グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表１６に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表１６において、ＳＮＰ１劣性遺伝１かつＳＮＰ３劣性遺伝１かつＳＮＰ５劣性遺伝１の群）を１とする。
【0175】
【表16】
【0176】
表１６の結果から、ＳＮＰ１、ＳＮＰ３、及びＳＮＰ５の３つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ１単独又は２つのＳＮＰの組合せの場合に比べ、オッズ比が上昇することから、ＡＭＤ罹患性と相関することが判明しているＨＴＲＡ１遺伝子のＳＮＰ及びＣＦＨ遺伝子のＳＮＰとＳＮＰ１とを組み合わせることにより、ＳＮＰ１単独又は２つのＳＮＰの組合せよりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0177】
（実施例５：ＳＮＰの組合せによる加齢黄斑変性易罹患性の判定−ＩＩ）＜ＤＮＡ採取工程＞
実施例１と同様に、埼玉医科大学倫理委員会の承認の下、埼玉医科大学病院眼科で受診したＡＭＤ罹患群の男女２３３名と、対照群の男女１２３名の合計３７０名より、血液を採取し、ＤＮＡサンプルをＷｉｚａｒｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ（プロメガ社製）を用いて精製した。
【0178】
＜検出工程及び追加の検出工程＞検出対象のＳＮＰを、ＳＮＰ１に加えて、以下に示すＳＮＰ７としたこと以外は、実施例１の検出工程と同様にして、検出工程及び追加の検出工程を行った。
【0179】
＜＜ＳＮＰ７及びその標的配列＞＞Ｍｏｒｉ Ｋ ｅｔ ａｌ．， Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌｏｇｙ， ２０１０， １１７（５）， ９２８−９３８に記載の方法により、ＡＭＤ罹患性との相関が明らかになっているＡＲＭＳ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ１０４９０９２４（以下、「ＳＮＰ７」と称することがある）について、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）を用いて遺伝子型を決定した。
【0180】
前記ＡＲＭＳ遺伝子のＳＮＰ並びにその標的配列は、以下のＳＮＰ７並びに標的配列７にそれぞれ示す通りである。なお、ＳＮＰ７は、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）のＡｓｓａｙ ＩＤ：Ｃ＿＿２９９３４９７３＿２０を用いて遺伝子型を決定した。
【0181】
−ＳＮＰ７−ＡＲＭＳ２遺伝子の蛋白質６９番目のアラニンがセリンへ変異したアミノ酸変異（Ａ６９Ｓ）を伴うコーディング領域のミスセンスＳＮＰ：ｒｓ１０４９０９２４
−標的配列７−
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴ［Ｔ／Ｇ］ＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３及び配列番号：１４）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＴＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１３）
５’−ＴＴＴＡＴＣＡＣＡＣＴＣＣＡＴＧＡＴＣＣＣＡＧＣＴＧＣＴＡＡＡＡＴＣＣＡＣＡＣＴＧＡＧＣＴＣＴＧＣＴＴ−３’（配列番号：１４）
【0182】
＜ＳＮＰ１と、ＳＮＰ７との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定＞ＳＮＰ１、及びＳＮＰ７のリスクアレル、遺伝子型、及び劣性遺伝モデルは、表１７に示す通りである。また、ＡＭＤ罹患群及び対照群の全人数におけるＳＮＰ１、及びＳＮＰ７の遺伝子型の人数分布、及びこの結果から作成した劣性遺伝モデルによる分割表を表１８に示す。
【0183】
【表17】
【0184】
【表18】
【0185】
＜＜ＳＮＰ１によるＡＭＤ易罹患性の判定＞＞ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２との４グループ間でＦｉｓｈｅｒ正確検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。結果を表１９に示す。その結果、Ｐ値：０．０１１２、９５％信頼区間：１．１１６〜２．８８３、オッズ比：１．７９３であった。
【0186】
【表19】
【0187】
＜＜ＳＮＰ１と、ＳＮＰ７との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定＞＞ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ７の劣性遺伝１及び２との８グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表２０に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表２０において、ＳＮＰ１劣性遺伝１かつＳＮＰ７劣性遺伝１の群）を１とする。
【0188】
【表20】
【0189】
表２０の結果から、ＳＮＰ１及びＳＮＰ７の２つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ１単独の場合に比べ、オッズ比が上昇することから、両者を組み合わせることにより、ＳＮＰ１単独よりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0190】
（実施例６：ＳＮＰ１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ）ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１（ＳＮＰ１）と連鎖不平衡（Ｌｉｎｋａｇｅ ｄｉｓｅｑｕｉｌｉｂｒｉｕｍ：ＬＤ）の関係にあるＳＮＰについて以下の通り解析を行った。
ＮＴＲＫ２の遺伝子は、図１及び２に示す通り、第９番染色体長腕ｑ２１．３３領域に位置し、遺伝子向きは染色体方向に順向きであり、ＳＮＰ１は遺伝子座の終わりに近い位置である３’側のイントロンに存在する（図２中、下向き矢印の位置）。なお、ＳＮＰ１のｄｂＳＮＰ ＩＤは、ｒｓ４０７５５６１であり、その存在位置は、ｃｈｒ９：８６７８５５９１−８６７８５５９１である。
【0191】
図２におけるＮＴＲＫ２遺伝子座の３’側領域を拡大し、ＳＮＰ１を含む東アジア人（日本人＋漢族中国人）集団における連鎖不平衡ブロック（ＬＤブロック：図２中、下向き逆三角形で示す領域；このＬＤブロックの位置：ｃｈｒ９：８６７６３１６６−８６８４４８７７、このＬＤブロックの長さ：８１，７１２ｂｐ）を模式的に示した図について、このＬＤブロックに含まれる既知の一塩基多型のｄｂＳＮＰ ＩＤと共に、図３に示す。日本人集団におけるこのＬＤブロック内のｒｓ４０７５５６１と強い連鎖不平衡関係にあるＳＮＰについて、表２１−１〜表２１−３に示す。
なお、基となるヒトゲノム情報は、ＵＣＳＣ ｇｅｎｏｍｅ ｂｒｏｗｓｅｒより、バージョンＮＣＢＩ３６／ｈｇ１８として取得した。また、東アジア人又は日本人遺伝情報及び連鎖不平衡係数の情報は、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔから取得されたものを用いた。
【0192】
また、表２１−１〜表２１−３中、Ｄ’値は、連鎖不平衡係数であり、０と１の間の値を取る。連鎖不平衡が無い場合は、Ｄ’＝０を示し、Ｄ’値が高いＳＮＰ（Ｄ’＞０．５が好ましく、Ｄ’＞０．７がより好ましい）は、ＳＮＰ１とより連鎖不平衡関係にあることを示す。また、表２１−１〜表２１−３中、ｒ２も、連鎖不平衡係数であり、０と１の間の値を取る。連鎖不平衡が無い場合は、ｒ２＝０を示し、ｒ２値が高いＳＮＰ（ｒ２＞０．２が好ましい）は、ＳＮＰ１とより連鎖不平衡関係にあることを示す。
連鎖不平衡関係にあるＳＮＰは、そのＳＮＰを解析することにより、ＳＮＰ１と同様又はＳＮＰ１と相関したＡＭＤ罹患の難易を判定でき、よって、ＡＭＤ罹患の難易を判定するマーカーとして利用できる。
【0193】
【表21-1】
【0194】
【表21-2】
【0195】
【表21-3】
【0196】
（実施例７：ＳＮＰ１と、ｒｓ１０８６８２３６との連鎖不平衡解析）これまでに、アムステルダム大学の研究チームによるゲノムワイド関連解析（ＧＷＡＳ）により、喫煙習慣に関連性のあるＳＮＰとして、ＮＴＲＫ２遺伝子のイントロンに存在するｒｓ１０８６８２３６が報告されている（Ｖｉｎｋ ｅｔ ａｌ．，Ａｍ Ｊ Ｈｕｍ Ｇｅｎｅｔ．（２００９）８４，３６７−３７９）。
詳細には、このＳＮＰ ｒｓ１０８６８２３６について、今現在の喫煙習慣との関連性を解析した結果、Ｐ＝９．６４×１０−５、オッズ比＝０．７５であった。したがって、ＮＴＲＫ２遺伝子のイントロンＳＮＰの１つが喫煙癖と相関することがＶｉｎｋらによって示されている。
【0197】
前記ｒｓ１０８６８２３６について、実施例６と同様に、ＳＮＰ１に対するｒｓ１０８６８２３６の連鎖不平衡係数情報を表２２に示す。Ｄ’値は０．１０４、ｒ２値は０．０１０であり、ｒｓ１０８６８２３６は、ＳＮＰ１と若干弱い連鎖不平衡関係にあることが明らかとなった。【0198】
【表22】
【0199】
（実施例８：ＳＮＰ２による加齢黄斑変性易罹患性の判定）＜ＤＮＡ採取工程＞
実施例１と同様に、埼玉医科大学倫理委員会の承認の下、埼玉医科大学病院眼科で受診した加齢黄斑変性罹患者（以下、「ＡＭＤ罹患群」又は「罹患群」と称することがある。）男女２４７名と、眼底疾患を有さない非罹患者（以下、「対照群」と称することがある。）男女１２３名の合計３７０名より、血液を採取し、ＤＮＡサンプルをＷｉｚａｒｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ（プロメガ社製）を用いて精製した。
【0200】
＜検出工程＞一塩基多型（以下、「ＳＮＰ」と称することがある。）の解析には、実施例１と同様に、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ法（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社）を用い、使用機器（ＰＣＲ条件を含む）、キット及び試薬も実施例１と同様のものを用いた。
【0201】
＜＜ＬＲＰ１Ｂ ＳＮＰ（ＳＮＰ２）及びその標的配列＞＞本実施例８では、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰであるｒｓ９２８７３２６を検出対象のＳＮＰとした。前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６（以下、「ＳＮＰ２」と称することがある。）及びその標的配列（以下、「標的配列２」と称することがある。）は、以下の通りである。
なお、ＬＲＰ１Ｂ ＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６用検出キットとして、ＴａｑＭａｎ（登録商標）ＳＮＰ Ｇｅｎｏｔｙｐｉｎｇ Ａｓｓａｙｓ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ社製）のＡｓｓａｙ ＩＤ：Ｃ＿＿９０６７８９４＿１０を用いた。
【0202】
−ＳＮＰ２−ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のイントロンに位置するＳＮＰ：ｒｓ９２８７３２６
−標的配列２−
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴ［Ａ／Ｃ］ＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３及び配列番号：４）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＡＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：３）
５’−ＡＧＡＴＡＡＡＧＣＡＡＡＣＴＡＴＣＴＴＴＧＡＧＧＴＣＡＣＡＣＴＡＡＣＣＣＧＧＴＧＡＡＴＡＧＧＡＡＡＴＣ−３’（配列番号：４）
【0203】
なお、前記ＬＲＰ１Ｂ ＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６用検出キットでは、ＳＮＰ塩基部位にある［Ａ／Ｃ］のどちらかと結合（ハイブリダイズ）するよう、アレル１（Ａ）又はアレル２（Ｃ）の２種類ＴａｑＭａｎプローブが設定されている（［Ａ／Ｃ］を含む約１５塩基対程度の長さのプローブであり、配列詳細は非公開）。また、ＰＣＲプライマー（配列詳細は非公開）は、上記ＳＮＰ２の標的配列２の５’末端から約２０塩基の配列がフォワードプライマーとして、３’末端から約２０塩基の配列に対する相補的配列がリバースプライマーとして、一対のＰＣＲプライマーが設定される。【0204】
前記ＳＮＰのアレル検出メカニズムは、前記実施例１と同様である。【0205】
＜ＳＮＰ２によるＡＭＤ易罹患性の判定＞前記ＡＭＤ罹患群及び対照群における、前記ＳＮＰ２のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表２３に示す。その結果、Ｐ値：０．００３３４８、９５％信頼区間：１．１６２〜２．２５３、オッズ比：１．６１５であった。
また、ＡＭＤ罹患群及び対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＡＣ＋ＣＣ対ＡＡの２群間での比較を行った（優性遺伝モデル）。結果を表２４−１及び表２４−２に示す。その結果、Ｐ値：０．０１０５、９５％信頼区間：１．１３８〜２．９３２、オッズ比：１．８２７であった。
【0206】
【表23】
【0207】
【表24-1】
【0208】
【表24-2】
【0209】
以上より、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６が、ＡＭＤ罹患性と高い相関を示し、リスクアレルＣを１つでも有する場合に、有意にＡＭＤ易罹患性が高いことが明らかとなり、更に、優性遺伝モデル解析において、すなわち、リスクアレルＣを１つでも有する場合に、非リスクアレルＡをホモで有する場合に対して、ＡＭＤ易罹患性のオッズ比がアレル頻度解析におけるオッズ比よりも、更に高くなることが明らかとなった。したがって、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６から高い確率及び精度で加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であることが示された。【0210】
（実施例９：ＳＮＰ２による喫煙感受性加齢黄斑変性易罹患性の判定）実施例８におけるＡＭＤ罹患群及び対照群の中から、喫煙歴がある対象（ＡＭＤ罹患群男女１７８名及び対照群男女４８名の合計２２６名）について、実施例８と同様にＡＭＤ易罹患性を判定した。
【0211】
＜ＳＮＰ２による喫煙感受性ＡＭＤ易罹患性の判定＞前記喫煙歴ありのＡＭＤ罹患群及び対照群における、前記ＳＮＰ２のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表２５に示す。その結果、Ｐ値：０．０３５７、９５％信頼区間：１．０２９〜２．８２４、オッズ比：１．６９０であった。
また、喫煙歴ありのＡＭＤ罹患群及び対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＡＣ＋ＣＣ対ＡＡの２群間での比較を行った。結果を表２６−１及び表２６−２に示す。その結果、Ｐ値：０．０３７４、９５％信頼区間：１．００６〜４．１３５、オッズ比：２．０４３であった。
【0212】
【表25】
【0213】
【表26-1】
【0214】
【表26-2】
【0215】
以上より、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６が、喫煙感受性のＡＭＤ罹患性と高い相関を示し、リスクアレルＣを１つでも有する場合に、喫煙感受性のＡＭＤ易罹患性のオッズ比がＡＭＤ全体における易罹患性のオッズ比よりも高くなることが明らかとなり、更に、優性遺伝モデル解析において、すなわち、リスクアレルＣを１つでも有する場合に、非リスクアレルＡをホモで有する場合に対して、喫煙感受性のＡＭＤ易罹患性のオッズ比がＡＭＤ全体における易罹患性のオッズ比よりも、有意に高くなることが明らかとなった。したがって、前記ＮＴＲＫ２遺伝子のＳＮＰ ｒｓ４０７５５６１から高い確率及び精度で喫煙感受性加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であることが示された。【0216】
（実施例１０：ＳＮＰ２による喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性易罹患性の判定）＜ＳＮＰ２による喫煙感受性滲出型ＡＭＤ易罹患性の判定＞
実施例８におけるＡＭＤ罹患群及び対象群の中から、以下の各対象を抽出し、実施例８と同様にＡＭＤ易罹患性を判定した。
（１） 喫煙歴ありの滲出型ＡＭＤ罹患群（男女１５７名）及び喫煙歴ありの対照群（男女４８名）における、前記ＳＮＰ２のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表２７に示す。その結果、Ｐ値：０．０２５、９５％信頼区間：１．０６〜４．２５、オッズ比：２．９４であった。
また、喫煙歴ありの滲出型ＡＭＤ罹患群及び喫煙歴ありの対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＡＣ＋ＣＣ対ＡＡの２群間での比較を行った。結果を表２８−１及び表２８−２に示す。その結果、Ｐ値：０．０３３２、９５％信頼区間：１．０５１〜４．４４６、オッズ比：２．１６４であった。
【0217】
【表27】
【0218】
【表28-1】
【0219】
【表28-2】
【0220】
（２） また、喫煙歴５年を境界としたアレルＣの滲出型ＡＭＤ罹患リスクについて、喫煙歴５年以上の滲出型ＡＭＤ罹患群（男女１５３名）及び喫煙歴５年以上の対照群（男女４６名）における、前記ＳＮＰ２のアレル頻度を解析し、Ｆｉｓｈｅｒ正確検定により有意差検定を行った。結果を表２９に示す。その結果、Ｐ値：０．０１１０、９５％信頼区間：１．１３８〜３．３１５、オッズ比：１．９２３であった。また、喫煙歴５年以上の滲出型ＡＭＤ罹患群及び喫煙歴５年以上の対照群における、遺伝子型の罹患リスクを検討するため、ＡＣ＋ＣＣ対ＡＡの２群間での比較を行った。結果を表３０−１及び表３０−２に示す。その結果、Ｐ値：０．０２０、９５％信頼区間：１．０８７〜４．７０６、オッズ比：２．２６１であった。
【0221】
【表29】
【0222】
【表30-1】
【0223】
【表30-2】
【0224】
以上より、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６が、喫煙感受性の滲出型ＡＭＤ罹患性と高い相関を示し、優性遺伝モデル解析において、すなわち、リスクアレルＣを１つでも有する場合に、非リスクアレルＡをホモで有する場合に対して、喫煙感受性の滲出型ＡＭＤ易罹患性のオッズ比がアレル頻度解析におけるオッズ比よりも、更に高くなることが明らかとなった。また、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６は、喫煙歴５年を境界とした滲出型ＡＭＤ易罹患性のほうが、喫煙歴ありを基準にした滲出型ＡＭＤ易罹患性よりも、更に高い相関性を示した。したがって、前記ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６から高い確率及び精度で喫煙感受性の滲出型加齢黄斑変性の罹患の難易を判定可能であることが示された。【0225】
（実施例１１：ＳＮＰの組合せによる加齢黄斑変性易罹患性の判定−ＩＩＩ）＜ＤＮＡ採取工程＞
実施例８と同様に、埼玉医科大学倫理委員会の承認の下、埼玉医科大学病院眼科で受診したＡＭＤ罹患群の男女２４７名と、対照群の男女１２３名の合計３７０名より、血液を採取し、ＤＮＡサンプルをＷｉｚａｒｄ Ｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡ Ｐｕｒｉｆｉｃａｔｉｏｎ Ｋｉｔ（プロメガ社製）を用いて精製した。
【0226】
＜検出工程及び追加の検出工程＞検出対象のＳＮＰを、ＳＮＰ２に加えて、ＳＮＰ１としたこと以外は、実施例８の検出工程と同様にして、検出工程及び追加の検出工程を行った。
なお、ＳＮＰ１及びその標的配列、並びに遺伝子型の決定は、実施例１と同様に行った。
【0227】
＜ＳＮＰ２と、ＳＮＰ１との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定＞ＳＮＰ２、及びＳＮＰ１のリスクアレル、遺伝子型、及び劣性遺伝モデルは、表３１に示す通りである。また、ＡＭＤ罹患群及び対照群の全人数におけるＳＮＰ２、及びＳＮＰ１の遺伝子型の人数分布、及びこの結果から作成した劣性遺伝モデルによる分割表を表３２に示す。
以下、ＳＮＰ２と、ＳＮＰ１との組合せについてＡＭＤ易罹患性を解析した結果を示す。
【0228】
【表31】
【0229】
【表32】
【0230】
＜＜ＳＮＰ２によるＡＭＤ易罹患性の判定＞＞ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ２の劣性遺伝１及び２との４グループ間でＦｉｓｈｅｒ正確検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。結果を表３３に示す。その結果、Ｐ値：０．０４０６、９５％信頼区間：１．０１７〜４．０４７、オッズ比：１．９７３であった。
【0231】
【表33】
【0232】
＜＜ＳＮＰ２と、ＳＮＰ１との組合せによるＡＭＤ易罹患性の判定＞＞ＡＭＤ罹患群及び対照群と、ＳＮＰ２の劣性遺伝１及び２と、ＳＮＰ１の劣性遺伝１及び２との８グループ間でカイ二乗検定による加齢黄斑変性の罹患の難易の相関解析を行った。また、オッズ比及びＰ値による有意差検定を行った。結果を表３４に示す。なお、オッズ比は、最もリスクが低い群（表３４において、ＳＮＰ２劣性遺伝１かつＳＮＰ１劣性遺伝１の群）を１とする。
【0233】
【表34】
【0234】
表３４の結果から、ＳＮＰ２及びＳＮＰ１の２つのＳＮＰがリスクホモである場合には、ＳＮＰ２単独の場合に比べ、オッズ比が上昇することから、ＳＮＰ２と、ＳＮＰ１とを組み合わせることにより、ＳＮＰ２単独よりもＡＭＤ罹患の難易を更に高い確率で判定できることがわかった。【0235】
（実施例１２：ＳＮＰ２と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ）ＬＲＰ１Ｂ遺伝子のＳＮＰ ｒｓ９２８７３２６（ＳＮＰ２）と連鎖不平衡（ＬＤ）の関係にあるＳＮＰについて、検討した。
上記の通り、ＬＲＰ１Ｂ遺伝子は、第２番染色体の長腕ｑ２２．１−２２．２領域に位置し、遺伝子向きは染色体方向に逆向きであり、ＳＮＰ２は第１イントロン領域に位置する。なお、ＳＮＰ２のｄｂＳＮＰ ＩＤは、ｒｓｒｓ９２８７３２６であり、その存在位置は、ｃｈｒ２：１４２３５８６４３−１４２３５８６４３である。
【0236】
対象を日本人集団とし、ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰを探索した結果を表３５−１及び表３５−２に示す。なお、基となるヒトゲノム情報は、ＵＣＳＣ ｇｅｎｏｍｅ ｂｒｏｗｓｅｒより、バージョンＮＣＢＩ３６／ｈｇ１８として取得した。また、日本人遺伝情報及び連鎖不平衡係数の情報は、Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ ＨａｐＭａｐ Ｐｒｏｊｅｃｔから取得されたものを用いた。
【0237】
また、表３５−１及び表３５−２中、Ｄ’値は、連鎖不平衡係数であり、０と１の間の値を取る。連鎖不平衡が無い場合は、Ｄ’＝０を示し、Ｄ’値が高いＳＮＰ（Ｄ’＞０．５であり、Ｄ’＞０．７が好ましい）は、ＳＮＰ２とより連鎖不平衡関係にあることを示す。また、表３５−１及び表３５−２中、ｒ２も、連鎖不平衡係数であり、０と１の間の値を取る。連鎖不平衡が無い場合は、ｒ２＝０を示し、ｒ２値が高いＳＮＰ（ｒ２＞０．２が好ましい）は、ＳＮＰ２とより連鎖不平衡関係にあることを示す。
連鎖不平衡関係にあるＳＮＰは、そのＳＮＰを解析することにより、ＳＮＰ２と同様又はＳＮＰ２と相関したＡＭＤ罹患の難易を判定でき、よって、ＡＭＤ罹患の難易を判定するマーカーとして利用できる。
【0238】
【表35-1】
【0239】
【表35-2】
【産業上の利用可能性】
【0240】
本発明で示したＳＮＰであるｒｓ４０７５５６１、ｒｓ９２８７３２６、前記ｒｓ４０７５５６１と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰ、及び前記ｒｓ９２８７３２６と連鎖不平衡関係にあるＳＮＰは、著しい視力低下をきたす加齢黄斑変性の発症及び進行を予測可能であるため、加齢黄斑変性判定用のマーカーとして用いることができ、ＤＮＡアレイ、塩基配列解析、ＰＣＲ法又はＰＣＲ法によらない迅速ＤＮＡ増幅法（インベーダーアッセイ）などに好適に利用可能である。また、本発明の加齢黄斑変性易罹患の性判定方法及び加齢黄斑変性易罹患性の判定キットは、加齢黄斑変性の発症及び進行、喫煙感受性加齢黄斑変性や喫煙感受性滲出型加齢黄斑変性の易罹患性を、予測可能であり、これにより発症の危険度が高い人に関しては、より頻回に眼科検査を受けることにより加齢黄斑変性の早期予防が可能となり、加齢黄斑変性を既に発症した患者に対しては、最適な薬剤治療法の選択に好適に利用可能である。これにより、高齢者の視機能の維持とＱＯＬ向上、ひいては高齢者の医療費の削減も期待され、社会全体にも利益還元が期待される。
【配列表】
[この文献には参照ファイルがあります.J-PlatPatにて入手可能です(IP Forceでは現在のところ参照ファイルは掲載していません)]