特許第6087341号(P6087341)IP Force 特許公報掲載プロジェクト 2022.1.31 β版

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特許6087341セファロスポリンに対する耐性の少なくとも1つの機構を質量分析により検出する方法
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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】6087341
(24)【登録日】2017年2月10日
(45)【発行日】2017年3月1日
(54)【発明の名称】セファロスポリンに対する耐性の少なくとも1つの機構を質量分析により検出する方法
(51)【国際特許分類】
   G01N 27/62 20060101AFI20170220BHJP
【FI】
   G01N27/62 V
【請求項の数】35
【全頁数】366
(21)【出願番号】特願2014-505660(P2014-505660)
(86)(22)【出願日】2012年4月20日
(65)【公表番号】特表2014-512015(P2014-512015A)
(43)【公表日】2014年5月19日
(86)【国際出願番号】EP2012057322
(87)【国際公開番号】WO2012143534
(87)【国際公開日】20121026
【審査請求日】2015年3月10日
(31)【優先権主張番号】61/477,907
(32)【優先日】2011年4月21日
(33)【優先権主張国】US
(73)【特許権者】
【識別番号】502073946
【氏名又は名称】ビオメリュー・インコーポレイテッド
(74)【代理人】
【識別番号】100109726
【弁理士】
【氏名又は名称】園田 吉隆
(74)【代理人】
【識別番号】100101199
【弁理士】
【氏名又は名称】小林 義教
(72)【発明者】
【氏名】シャルティエ, ヤニック
(72)【発明者】
【氏名】シャリエ, ジャン−フィリップ
(72)【発明者】
【氏名】フランチェスキ, クリスティーヌ
(72)【発明者】
【氏名】ザンバルディ, ジル
(72)【発明者】
【氏名】セッチーニ, ティフェン
(72)【発明者】
【氏名】ドゥゴ−シャルメット, エロディ
【審査官】 加々美 一恵
(56)【参考文献】
【文献】 特表2009−540814(JP,A)
【文献】 特開2010−119382(JP,A)
【文献】 国際公開第2011/007884(WO,A1)
【文献】 特表2011−522210(JP,A)
【文献】 米国特許出願公開第2002/0182207(US,A1)
【文献】 特表2013−506124(JP,A)
【文献】 モダンメディア,2012年 4月,第58巻第4号,p113−122
【文献】 Journal of Clinical Microbiology,2011年 2月,Vol.49, No.5,p1961-1964
(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
G01N 27/60−27/70、27/92
G01N 33/48−33/98
C12Q 1/00−3/00
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
試料中に含有される少なくとも1つの微生物について、セファロスポリンに対する耐性の少なくとも1つのマーカーをMRMモードのMS/MS質量分析により検出する方法であって、前記耐性の少なくとも1つのマーカーが、TEM、CMY、CTX−M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA、及びGESからなる群から選択されるタンパク質またはペプチドである、方法。
【請求項2】
耐性マーカーが、前記少なくとも1つの微生物に由来するタンパク質である、請求項1記載の検出方法。
【請求項3】
前記微生物に由来するタンパク質がペプチドに消化される、請求項1及び2に記載の検出方法。
【請求項4】
消化が、酵素により実行される、請求項に記載の検出方法。
【請求項5】
酵素がトリプシンである、請求項に記載の検出方法。
【請求項6】
耐性マーカーが、配列番号166から配列番号218、配列番号220から配列番号230、配列番号232から配列番号241、配列番号243から配列番号252、配列番号254から配列番号257、配列番号259から配列番号261、配列番号1923、配列番号1927および配列番号1928に記載の配列のペプチドから選択されるTEMペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項7】
耐性マーカーが、配列番号166、配列番号167、配列番号168、配列番号169、配列番号170、配列番号171、配列番号172、配列番号173、配列番号174、配列番号180、配列番号181、配列番号186、配列番号187、配列番号188、配列番号189、配列番号190、配列番号191、配列番号192、配列番号193、配列番号194、配列番号195、配列番号196、配列番号197、配列番号198、配列番号199、配列番号200、配列番号201、配列番号202、配列番号203、配列番号212、配列番号213、配列番号214、配列番号215、配列番号216、配列番号217、配列番号219、配列番号220、配列番号223、配列番号224、配列番号225、配列番号226、配列番号227、配列番号228、配列番号229、配列番号230、配列番号241、配列番号242、配列番号243、配列番号250、配列番号251、配列番号252、配列番号253、配列番号254、配列番号255、配列番号259、配列番号260、配列番号261、配列番号1927及び配列番号1928に記載の配列のペプチドから選択されるTEMマーカーである、請求項に記載の検出方法。
【請求項8】
耐性がESBLであり、耐性マーキングペプチドが配列番号168、配列番号169、配列番号179、配列番号181、配列番号186、配列番号199、配列番号200、配列番号205、配列番号206、配列番号208、配列番号212、配列番号213、配列番号214、配列番号215、配列番号216、配列番号217、配列番号222、配列番号225、配列番号226、配列番号227、配列番号230、配列番号234、配列番号236、配列番号237、配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号249、配列番号254、配列番号255、配列番号256、配列番号259、配列番号261、配列番号446、配列番号447、配列番号448、配列番号449、配列番号450、配列番号451、配列番号452、配列番号453、配列番号454、配列番号455、配列番号456、配列番号457、配列番号458、配列番号459、配列番号460、配列番号461、配列番号462、配列番号463、配列番号464、配列番号465、配列番号466、配列番号467、配列番号468、配列番号469、配列番号470、配列番号471、配列番号472、配列番号473、配列番号474、配列番号475、配列番号476、配列番号477、配列番号478、配列番号480、配列番号481、配列番号482、配列番号483、配列番号484、配列番号485、配列番号486、配列番号487、配列番号488、配列番号489、配列番号490、配列番号491、配列番号492、配列番号493、配列番号494、配列番号495、配列番号615、配列番号634、配列番号646、配列番号651、配列番号659、配列番号663、配列番号665、配列番号678、配列番号683、配列番号686、配列番号690、配列番号702、配列番号705、配列番号1045、配列番号1046、配列番号1047、配列番号1051、配列番号1052、配列番号1053、配列番号1054、配列番号1055、配列番号1056、配列番号1057、配列番号1058、配列番号1059、配列番号1060、配列番号1061、配列番号1062、配列番号1063、配列番号1064、配列番号1065、配列番号1069、配列番号1070、配列番号1071、配列番号1072、配列番号1073、配列番号1074、配列番号1075、配列番号1076、配列番号1077、配列番号1085、配列番号1086、配列番号1087、配列番号1088、配列番号1089、配列番号1090、配列番号1091、配列番号1092、配列番号1093、配列番号1094、配列番号1095、配列番号1096、配列番号1097、配列番号1098、配列番号1099、配列番号1100、配列番号1101、配列番号1102、配列番号1103、配列番号1104、配列番号1268、配列番号1270、配列番号1271、配列番号1272、配列番号1277、配列番号1278、配列番号1279、配列番号1280、配列番号1281、配列番号1283、配列番号1288、配列番号1290、配列番号1295、配列番号1297、配列番号1299、配列番号1300、配列番号1301、配列番号1302、配列番号1303、配列番号1304、配列番号1305、配列番号1306、配列番号1307、配列番号1308、配列番号1309、配列番号1310、配列番号1314、配列番号1315、配列番号1316、配列番号1317、配列番号1318、配列番号1319、配列番号1320、配列番号1323、配列番号1332、配列番号1339、配列番号1341、配列番号1342、配列番号1344、配列番号1354、配列番号1355、配列番号1356、配列番号1357、配列番号1358、配列番号1359、配列番号1360、配列番号1365、配列番号1367、配列番号1369、配列番号1373、配列番号1390、配列番号1391、配列番号1393、配列番号1394、配列番号1407、配列番号1413、配列番号1414、配列番号1423、配列番号1425、配列番号1427、配列番号1432、配列番号1433、配列番号1439、配列番号1444、配列番号1446、配列番号1447、配列番号1448、配列番号1450、配列番号1451、配列番号1456、配列番号1457、配列番号1465、配列番号1468、配列番号1472、配列番号1477、配列番号1478、配列番号1480、配列番号1485、配列番号1487、配列番号1490、配列番号1495、配列番号1498、配列番号1499、配列番号1504、配列番号1506、配列番号1508、配列番号1509、配列番号1510、配列番号1513、配列番号1514、配列番号1515、配列番号1521、配列番号1525、配列番号1526、配列番号1533、配列番号1534、配列番号1539、配列番号1540、配列番号1543、配列番号1545、配列番号1548、配列番号1550、配列番号1551、配列番号1552、配列番号1553、配列番号1554、配列番号1555、配列番号1556、配列番号1559、配列番号1567、配列番号1569、配列番号1570、配列番号1571、配列番号1572、配列番号1582、配列番号1589、配列番号1590、配列番号1592、配列番号1595、配列番号1596、配列番号1598、配列番号1600、配列番号1602、配列番号1605、配列番号1609、配列番号1611、配列番号1612、配列番号1613、配列番号1614、配列番号1615、配列番号1616、配列番号1617、配列番号1618、配列番号1620、配列番号1626、配列番号1627、配列番号1632、配列番号1633、配列番号1634、配列番号1635、配列番号1637、配列番号1638、配列番号1639、配列番号1640、配列番号1652、配列番号1653、配列番号1656、配列番号1657、配列番号1660、配列番号1661、配列番号1662、配列番号1664、配列番号1665、配列番号1666、配列番号1670、配列番号1671、配列番号1672、配列番号1678、配列番号1680、配列番号1681、配列番号1695、配列番号1696、配列番号1697、配列番号1703、配列番号1704、配列番号1706、配列番号1707、配列番号1708、配列番号1709、配列番号1712、配列番号1713、配列番号1714、配列番号1720、配列番号1721、配列番号1722、配列番号1725、配列番号1730、配列番号1732、配列番号1733、配列番号1737、配列番号1738、配列番号1740、配列番号1742、配列番号1743、配列番号1748、配列番号1751、配列番号1752、配列番号1753、配列番号1754、配列番号1755、配列番号1758、配列番号1759、配列番号1761、配列番号1762、配列番号1763、配列番号1769、配列番号1771、配列番号1773、配列番号1776、配列番号1777、配列番号1785、配列番号1788、配列番号1792、配列番号1794、配列番号1800、配列番号1806、配列番号1810、配列番号1816、配列番号1818、配列番号1828、配列番号1927、配列番号1928、配列番号2009、配列番号2010、配列番号2011、配列番号2012、配列番号2013、配列番号2015、配列番号2017、配列番号2019、配列番号2021、配列番号2022、配列番号2023、配列番号2024、配列番号2025、配列番号2026、配列番号2027、配列番号2029、配列番号2030、配列番号2032、配列番号2034、配列番号2035、配列番号2036、配列番号2037、配列番号2038、配列番号2039、配列番号2042、配列番号2043、配列番号2044、配列番号2045、配列番号2046、配列番号2047、配列番号2048、配列番号2049、配列番号2050、配列番号2051、配列番号2054、配列番号2055、配列番号2057、配列番号2058、配列番号2059、配列番号2060、配列番号2061、配列番号2062、配列番号2063、配列番号2065、配列番号2066、配列番号2067、配列番号2069、配列番号2070、配列番号2071、配列番号2072、配列番号2073、配列番号2074、配列番号2076、配列番号2077、配列番号2078、配列番号2081、配列番号2082、配列番号2083、配列番号2084、配列番号2085、配列番号2086、配列番号2087、配列番号2088、配列番号2090、配列番号2091、配列番号2092、配列番号2095、配列番号2132、配列番号2134、配列番号2135、配列番号2136、配列番号2137、配列番号2138、配列番号2141、配列番号2142、配列番号2143、配列番号2144、配列番号2145、配列番号2146、配列番号2147、配列番号2148、配列番号2149、配列番号2150、配列番号2151、配列番号2152、配列番号2153、配列番号2154、配列番号2155、配列番号2157、配列番号2158、配列番号2159、配列番号2160、配列番号2161、配列番号2162、配列番号2163、配列番号2164、配列番号2165、配列番号2166、配列番号2167、配列番号2168、配列番号2169、配列番号2170及び配列番号2171に記載の配列から選択される、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項9】
耐性マーカーが、配列番号312から配列番号320、配列番号322から配列番号343、配列番号345から配列番号350、配列番号1929、配列番号1931から配列番号1934、配列番号1936、配列番号1938、配列番号1939、配列番号1940、配列番号1942、配列番号1944、配列番号1945、配列番号1946、配列番号1948、配列番号1949、配列番号1951、配列番号1953から配列番号1962、配列番号1969、配列番号1970、配列番号1971、配列番号1978、配列番号1980、配列番号1981、配列番号1982、配列番号1984から配列番号1999、配列番号2001、配列番号2002、配列番号2003、配列番号2004及び配列番号2007に記載の配列のペプチドから選択されるCMYペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項10】
耐性マーカーが、配列番号312、配列番号313、配列番号314、配列番号315、配列番号316、配列番号317、配列番号318、配列番号320、配列番号322、配列番号323、配列番号325、配列番号326、配列番号327、配列番号328、配列番号330、配列番号331、配列番号332、配列番号333、配列番号334、配列番号335、配列番号336、配列番号339、配列番号340、配列番号350、配列番号337及び配列番号343に記載の配列のペプチドから選択されるCMYペプチドである、請求項に記載の検出方法。
【請求項11】
耐性マーカーが、配列番号446から配列番号478、配列番号480から配列番号495および配列番号2009から配列番号2013、配列番号2015、配列番号2017、配列番号2019、配列番号2021、配列番号2022、配列番号2023、配列番号2024、配列番号2025、配列番号2026、配列番号2027、配列番号2029、配列番号2030、配列番号2032、配列番号2034、配列番号2035、配列番号2036、配列番号2037、配列番号2038、配列番号2039、配列番号2042、配列番号2043、配列番号2044、配列番号2045、配列番号2046、配列番号2047、配列番号2048、配列番号2049、配列番号2050、配列番号2051、配列番号2054、配列番号2055、配列番号2057、配列番号2058、配列番号2059、配列番号2060、配列番号2061、配列番号2062、配列番号2063、配列番号2065、配列番号2066、配列番号2067、配列番号2069、配列番号2070、配列番号2071、配列番号2072、配列番号2073、配列番号2074、配列番号2076、配列番号2077、配列番号2078、配列番号2081、配列番号2082、配列番号2083、配列番号2084、配列番号2085、配列番号2086、配列番号2087、配列番号2088、配列番号2090、配列番号2091及び配列番号2092に記載の配列のペプチドから選択されるCTX−Mペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項12】
耐性マーカーが、配列番号446、配列番号451、配列番号454、配列番号458、配列番号460、配列番号461、配列番号462、配列番号463、配列番号464、配列番号467、配列番号468、配列番号470、配列番号471、配列番号474、配列番号480、配列番号484、配列番号485、配列番号489及び配列番号491に記載の配列のペプチドから選択されるCTX−Mペプチドである、請求項11に記載の方法。
【請求項13】
耐性マーカーが、配列番号614から配列番号711および配列番号2093から配列番号2096の配列のペプチドから選択されるSHVペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項14】
耐性マーカーが、配列番号614、配列番号617、配列番号618、配列番号619、配列番号620、配列番号622、配列番号624、配列番号626、配列番号628、配列番号630、配列番号631、配列番号632、配列番号636、配列番号637、配列番号638、配列番号649、配列番号651、配列番号652、配列番号653、配列番号655、配列番号656、配列番号657、配列番号658、配列番号659、配列番号660、配列番号661、配列番号662、配列番号663、配列番号664、配列番号666、配列番号667、配列番号668、配列番号671、配列番号672、配列番号674、配列番号682、配列番号684、配列番号686、配列番号689、配列番号691、配列番号694、配列番号695、配列番号696、配列番号697、配列番号698、配列番号701、配列番号702、配列番号704、配列番号707及び配列番号708に記載の配列のペプチドから選択されるSHVペプチドである、請求項13に記載の検出方法。
【請求項15】
耐性マーカーが、配列番号719から配列番号733、配列番号2098、配列番号2101、配列番号2102、配列番号2105、配列番号2107、配列番号2108、配列番号2109、配列番号2110、配列番号2112および配列番号2113に記載の配列のペプチドから選択されるFOXペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項16】
耐性マーカーが、配列番号719、配列番号720、配列番号721、配列番号723、配列番号724、配列番号725、配列番号726、配列番号727、配列番号728、配列番号729、配列番号730、配列番号731及び配列番号732に記載の配列のペプチドから選択されるFOXペプチドである、請求項15に記載の方法。
【請求項17】
耐性マーカーが、配列番号740から配列番号787に記載の配列のペプチドから選択されるACCペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項18】
耐性マーカーが、配列番号740、配列番号741、配列番号742、配列番号743、配列番号744、配列番号745、配列番号746、配列番号747、配列番号748、配列番号751、配列番号755、配列番号756、配列番号757、配列番号758、配列番号761、配列番号762、配列番号763、配列番号765、配列番号766、配列番号767、配列番号768、配列番号769、配列番号770、配列番号771、配列番号773、配列番号774、配列番号775、配列番号776、配列番号777、配列番号778、配列番号779、配列番号780、配列番号781、配列番号782、配列番号783、配列番号784、配列番号785、配列番号786及び配列番号787に記載の配列から選択されるACCペプチドである、請求項17に記載の検出方法。
【請求項19】
耐性マーカーが、配列番号741、配列番号744、配列番号745、配列番号756、配列番号758、配列番号761、配列番号765、配列番号767、配列番号769、配列番号771、配列番号773、配列番号775、配列番号776、配列番号778、配列番号779、配列番号781、配列番号783、配列番号784、配列番号786及び配列番号787に記載の配列から選択されるACCペプチドである、請求項17に記載の方法。
【請求項20】
耐性マーカーが、配列番号798、配列番号799、配列番号802、配列番号804から配列番号807、配列番号809から配列番号813、配列番号816から配列番号826及び配列番号828から配列番号841に記載の配列のペプチドから選択されるACTペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項21】
耐性マーカーが、配列番号853から配列番号921に記載の配列のペプチドから選択されるCARBペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項22】
耐性マーカーが、配列番号853、配列番号854、配列番号855、配列番号856、配列番号857、配列番号859、配列番号860、配列番号861、配列番号865、配列番号866、配列番号867、配列番号868、配列番号869、配列番号870、配列番号871、配列番号872、配列番号873、配列番号874、配列番号875、配列番号876、配列番号877、配列番号878、配列番号882、配列番号883、配列番号884、配列番号886、配列番号887、配列番号889、配列番号890、配列番号891、配列番号892、配列番号893、配列番号894、配列番号896、配列番号897、配列番号898、配列番号899、配列番号900、配列番号901、配列番号903、配列番号904、配列番号905、配列番号906、配列番号907、配列番号908、配列番号909、配列番号911、配列番号912、配列番号913、配列番号915、配列番号916、配列番号917、配列番号918、配列番号919、配列番号920及び配列番号921に記載の配列のペプチドから選択されるCARBペプチドである、請求項21に記載の検出方法。
【請求項23】
耐性マーカーが、配列番号928から配列番号935、配列番号937から配列番号942、及び配列番号944から配列番号948に記載の配列のペプチドから選択されるDHAペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項24】
耐性マーカーが、配列番号929、配列番号931、配列番号932、配列番号934、配列番号937、配列番号938、配列番号939、配列番号941、配列番号944、配列番号946、配列番号947及び配列番号948に記載の配列のペプチドから選択されるDHAペプチドである、請求項23に記載の方法。
【請求項25】
耐性マーカーが、配列番号954、配列番号956、配列番号957、配列番号959から配列番号961、配列番号963、配列番号964、配列番号966、配列番号967、及び配列番号969から配列番号981に記載の配列のペプチドから選択されるMIRペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項26】
耐性マーカーが、配列番号979、配列番号980及び配列番号981に記載の配列のペプチドから選択されるMIRペプチドである、請求項25に記載の検出方法。
【請求項27】
耐性マーカーが、配列番号990から配列番号993、配列番号995から配列番号998、配列番号1000から配列番号1012、配列番号1014から配列番号1016、配列番号1018から配列番号1020、配列番号1022から配列番号1029、および配列番号1031から配列番号1037に記載の配列のペプチドから選択されるMOXペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項28】
耐性マーカーが、配列番号992、配列番号1015、配列番号1006、配列番号1023、配列番号1024、配列番号1035、配列番号1036、及び配列番号1037に記載の配列のペプチドから選択されるMOXペプチドである、請求項27に記載の検出方法。
【請求項29】
耐性マーカーが、配列番号1045から配列番号1047、配列番号1051から配列番号1065、および配列番号1069から配列番号1077に記載の配列のペプチドから選択されるPERペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項30】
耐性マーカーが、配列番号1051、配列番号1054、配列番号1055、配列番号1057、配列番号1061、配列番号1069、配列番号1073、配列番号1075、及び配列番号1076に記載の配列のペプチドから選択されるPERペプチドである、請求項29に記載の検出方法。
【請求項31】
耐性マーカーが、配列番号1085から配列番号1104に記載の配列のペプチドから選択されるVEBペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項32】
耐性マーカーが、配列番号1088、配列番号1089、配列番号1093、及び配列番号1103に記載の配列のペプチドから選択されるVEBペプチドである、請求項31に記載の検出方法。
【請求項33】
耐性マーカーが、配列番号1267、配列番号1268、配列番号1270、配列番号1271、配列番号1272、配列番号1273、配列番号1274、配列番号1275、配列番号1276、配列番号1277、配列番号1278、配列番号1279、配列番号1280、配列番号1281、配列番号1283、配列番号1284、配列番号1286、配列番号1288、配列番号1289、配列番号1290、配列番号1291、配列番号1292、配列番号1293、配列番号1294、配列番号1295、配列番号1296、配列番号1297、配列番号1298、配列番号1299、配列番号1300、配列番号1301、配列番号1302、配列番号1303、配列番号1304、配列番号1305、配列番号1306、配列番号1307、配列番号1308、配列番号1309、配列番号1310、配列番号1311、配列番号1312、配列番号1313、配列番号1314、配列番号1315、配列番号1316、配列番号1317、配列番号1318、配列番号1319、配列番号1320、配列番号1321、配列番号1322、配列番号1323、配列番号1324、配列番号1325、配列番号1329、配列番号1330、配列番号1332、配列番号1333、配列番号1334、配列番号1335、配列番号1336、配列番号1338、配列番号1339、配列番号1341、配列番号1342、配列番号1344、配列番号1345、配列番号1346、配列番号1347、配列番号1348、配列番号1349、配列番号1351、配列番号1352、配列番号1353、配列番号1354、配列番号1355、配列番号1356、配列番号1357、配列番号1358、配列番号1359、配列番号1360、配列番号1362、配列番号1364、配列番号1365、配列番号1367、配列番号1369、配列番号1370、配列番号1371、配列番号1372、配列番号1373、配列番号1374、配列番号1376、配列番号1378、配列番号1380、配列番号1381、配列番号1382、配列番号1383、配列番号1384、配列番号1385、配列番号1390、配列番号1391、配列番号1393、配列番号1394、配列番号1395、配列番号1396、配列番号1397、配列番号1398、配列番号1399、配列番号1400、配列番号1401、配列番号1403、配列番号1406、配列番号1407、配列番号1409、配列番号1410、配列番号1411、配列番号1412、配列番号1413、配列番号1414、配列番号1417、配列番号1418、配列番号1422、配列番号1423、配列番号1424、配列番号1425、配列番号1427、配列番号1428、配列番号1430、配列番号1431、配列番号1432、配列番号1433、配列番号1434、配列番号1435、配列番号1436、配列番号1437、配列番号1438、配列番号1439、配列番号1443、配列番号1444、配列番号1445、配列番号1446、配列番号1447、配列番号1448、配列番号1449、配列番号1450、配列番号1451、配列番号1452、配列番号1454、配列番号1456、配列番号1457、配列番号1458、配列番号1459、配列番号1460、配列番号1461、配列番号1464、配列番号1465、配列番号1468、配列番号1472、配列番号1475、配列番号1477、配列番号1478、配列番号1480、配列番号1483、配列番号1484、配列番号1485、配列番号1486、配列番号1487、配列番号1490、配列番号1493、配列番号1494、配列番号1495、配列番号1496、配列番号1498、配列番号1499、配列番号1501、配列番号1502、配列番号1503、配列番号1504、配列番号1505、配列番号1506、配列番号1507、配列番号1508、配列番号1509、配列番号1510、配列番号1511、配列番号1512、配列番号1513、配列番号1514、配列番号1515、配列番号1517、配列番号1518、配列番号1520、配列番号1521、配列番号1524、配列番号1525、配列番号1526、配列番号1527、配列番号1528、配列番号1529、配列番号1531、配列番号1532、配列番号1533、配列番号1534、配列番号1535、配列番号1536、配列番号1537、配列番号1538、配列番号1539、配列番号1540、配列番号1541、配列番号1543、配列番号1544、配列番号1545、配列番号1546、配列番号1547、配列番号1548、配列番号1550、配列番号1551、配列番号1552、配列番号1553、配列番号1554、配列番号1555、配列番号1556、配列番号1557、配列番号1558、配列番号1559、配列番号1561、配列番号1562、配列番号1563、配列番号1564、配列番号1565、配列番号1567、配列番号1568、配列番号1569、配列番号1570、配列番号1571、配列番号1572、配列番号1573、配列番号1576、配列番号1579、配列番号1580、配列番号1582、配列番号1583、配列番号1584、配列番号1585、配列番号1586、配列番号1587、配列番号1588、配列番号1589、配列番号1590、配列番号1591、配列番号1592、配列番号1593、配列番号1594、配列番号1595、配列番号1596、配列番号1598、配列番号1599、配列番号1600、配列番号1602、配列番号1603、配列番号1604、配列番号1605、配列番号1606、配列番号1607、配列番号1608、配列番号1609、配列番号1611、配列番号1612、配列番号1613、配列番号1614、配列番号1615、配列番号1616、配列番号1617、配列番号1618、配列番号1619、配列番号1620、配列番号1623、配列番号1624、配列番号1625、配列番号1626、配列番号1627、配列番号1629、配列番号1632、配列番号1633、配列番号1634、配列番号1635、配列番号1636、配列番号1637、配列番号1638、配列番号1639、配列番号1640、配列番号1641、配列番号1642、配列番号1643、配列番号1644、配列番号1645、配列番号1646、配列番号1647、配列番号1648、配列番号1649、配列番号1650、配列番号1651、配列番号1652、配列番号1653、配列番号1654、配列番号1655、配列番号1656、配列番号1657、配列番号1658、配列番号1659、配列番号1660、配列番号1661、配列番号1662、配列番号1663、配列番号1664、配列番号1665、配列番号1666、配列番号1667、配列番号1668、配列番号1670、配列番号1671、配列番号1672、配列番号1678、配列番号1679、配列番号1680、配列番号1681、配列番号1686、配列番号1688、配列番号1690、配列番号1693、配列番号1694、配列番号1695、配列番号1696、配列番号1697、配列番号1698、配列番号1699、配列番号1700、配列番号1701、配列番号1702、配列番号1703、配列番号1704、配列番号1705、配列番号1706、配列番号1707、配列番号1708、配列番号1709、配列番号1711、配列番号1712、配列番号1713、配列番号1714、配列番号1716、配列番号1719、配列番号1720、配列番号1721、配列番号1722、配列番号1725、配列番号1726、配列番号1728、配列番号1730、配列番号1731、配列番号1732、配列番号1733、配列番号1734、配列番号1735、配列番号1736、配列番号1737、配列番号1738、配列番号1739、配列番号1740、配列番号1741、配列番号1742、配列番号1743、配列番号1744、配列番号1748、配列番号1750、配列番号1751、配列番号1752、配列番号1753、配列番号1754、配列番号1755、配列番号1756、配列番号1758、配列番号1759、配列番号1761、配列番号1762、配列番号1763、配列番号1766、配列番号1767、配列番号1769、配列番号1770、配列番号1771、配列番号1772、配列番号1773、配列番号1776、配列番号1777、配列番号1778、配列番号1780、配列番号1782、配列番号1783、配列番号1784、配列番号1785、配列番号1786、配列番号1788、配列番号1789、配列番号1792、配列番号1794、配列番号1799、配列番号1800、配列番号1802、配列番号1803、配列番号1804、配列番号1806、配列番号1807、配列番号1808、配列番号1810、配列番号1811、配列番号1812、配列番号1816、配列番号1817、配列番号1818、配列番号1820、配列番号1821、配列番号1822、配列番号1825、配列番号1826、配列番号1827、配列番号1828、配列番号1829、配列番号1830、配列番号1831、配列番号1832、配列番号1833、配列番号1834、配列番号2160、配列番号2161、配列番号2162、配列番号2163、配列番号2164、配列番号2165、配列番号2166、配列番号2167、配列番号2168、配列番号2169、配列番号2170及び配列番号2171に記載の配列のペプチドから選択されるOXAペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【請求項34】
耐性マーカーが、配列番号2160、配列番号2162、配列番号2164、配列番号2165、配列番号2166、配列番号2167、配列番号2169、配列番号2170、及び配列番号2171に記載の配列のペプチドから選択されるOXAペプチドである、請求項33に記載の検出方法。
【請求項35】
耐性マーカーが、配列番号2132、配列番号2134から配列番号2138、配列番号2141から配列番号2155、および配列番号2157から配列番号2159に記載の配列のペプチドから選択されるGESペプチドである、請求項1からのいずれか一項に記載の検出方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、微生物学の分野に関する。より正確に述べると、本発明は、質量分析を用いることによる、試料由来の少なくとも1つの微生物のセファロスポリンに対する耐性の少なくとも1つの機構の検出に関する。
【背景技術】
【0002】
パスツールによる微生物の発見以来、微生物は、顕微鏡法および生化学的解析により研究されている。これらの従来の方法は、長時間にわたり面倒であることが多く、代替的解析法が極めて早期から探索されてきた。このため、1975年から、J.AnhaltおよびC.Fenselauにより、質量分析を介する細菌の解析が創始された[1]。
【0003】
この予備的業績の後、微生物の細胞壁に由来する脂肪酸についての研究であって、質量分析と組み合わせたガスクロマトグラフィー(GC−MS)を用いる研究が行われた[2]。この方法は、脂肪酸メチルエステルを表すFAMEという英語の用語の下で普及した。FAMEは、現在のところ、分類研究のための基準方法を構成している。しかし、その使用は、サポニン化、加水分解、および誘導による試料の処理を取り扱う特定の専門的実験室に依然として限定されている。
【0004】
1996年に、M.Claydonらによる業績[3]のほか、T.KrishnamurthyおよびP.Rossによる業績[4]が、MALDI−TOF(マトリックス支援レーザー脱離イオン化飛行時間の英語の頭字語)質量分析器により、異なる細菌種を同定する可能性を裏付けた。解析では、質量スペクトルの収集と、専門的ソフトウェアによる解釈とを組み合わせる。MALDI−TOFは、極めて簡素であり、数分間で実行することができる。しかし、MALDI−TOFが医学的解析の実験室に導入されるようになったのは、ごく最近のことである[5]。その臨床的使用は、現在のところ、細菌種および酵母種の同定に限定されている。MALDI−TOFは、抗微生物剤に対する耐性を同定するのに常法として用いられていはいない。
【0005】
しかし、抗生剤などの抗微生物剤に対する耐性の同定は、最適の患者ケアを確保するのに不可欠の要素である。
【0006】
これらの必要を満たすために、他の質量分析法、特に、タンデム質量分析法が提起されている。例として述べると、β−ラクタマーゼを四重極TOF(Q−TOF)により同定することについてのC.Fenselauらの業績[6]を引用することが可能である。
【0007】
しかし、これらの研究成果は、日常的な臨床使用には適用可能でない。これらの研究成果は、高技能者を要請する研究用測定器により得られた。試料1つ当たり1時間を超えることが多い解析時間は、微生物学的解析実験室の作業負荷には適合しない。
【0008】
より近年になって、S.Hofstadlerら[7]は、PCRによる微生物ゲノムの増幅を、エレクトロスプレーTOF(ESI−TOF)によるPCR産物の検出と組み合わせる方法を提起した。この方法は、現在では完全に自動化されている[8]。しかし、この方法は、分子生物学に固有の欠陥、すなわち、抽出収量、プローブの費用などの欠陥を伴うPCR増幅を要請する。
【発明の概要】
【0009】
この文脈で、本発明の目的は、セファロスポリンに対する耐性の機構を検出する方法であって、先行技術による方法の欠点を克服することを可能とする方法を提起すること、すなわち、特に、分子生物学法と比較して、各々の種に特異的な試薬を伴わない廉価な方法であって、1時間より短い短時間で結果をもたらし、高技能者を必要とすることなく、通常の臨床研究において使用することができる方法を提供することである。
【0010】
この目的のために、本発明は、試料由来の少なくとも1つの微生物の少なくとも1つの抗微生物剤に対する耐性の少なくとも1つの機構を質量分析により検出する新たな方法であって、抗微生物剤がセファロスポリンであり、タンパク質および/またはペプチドが、少なくとも1つのセファロスポリンクラスの抗生剤に対する耐性の前記機構のマーカーとして検出されることを特徴とする方法を提起する。
【0011】
数種の異なる抗微生物剤に対する耐性のマーカーは、同時に検出されうることが有利である。
【0012】
出願番号PCT/FR2010/052181において示される通り、前記微生物の種類および/または毒性のマーカーも、耐性機構マーカーの検出の前に、またはこれと同時に、質量分析により同様に検出することができる。
【発明を実施するための形態】
【0013】
少なくとも1つのセファロスポリンクラスの抗微生物剤に対する耐性のマーカーとは、前記特性に特徴的なタンパク質由来の分子を意味することが理解される。
【0014】
セファロスポリンとは、β−ラクタムファミリーに属する抗生剤である。セファロスポリンは通常、以下の数種のサブクラスに分類される:
・第1群、および第2b群、第2br群、第2be群、第2ber群のβ−ラクタマーゼにより分解される、セファゾリン、セファロチン、セファクロル、セファレキシンなど、第1世代のセファロスポリン;
・第1群、第2be群、第2ber群のβ−ラクタマーゼにより分解される、セファマンドール、セフポドキシム、セフロキシムなど、第2世代のセファロスポリン;
・第1世代のセファロスポリンおよび第2世代のセファロスポリンより安定的であるが、第1群、第2be群、第2ber群のβ−ラクタマーゼにより分解される、セフォタキシム、セフタジジム、セフトリアキソン、セフィキシムなど、第3世代のセファロスポリン;
・第2be群および第2ber群のβ−ラクタマーゼにより分解される、セフェピムおよびセフピロームなど、第4世代のセファロスポリン;
・第2be群および第2ber群のβ−ラクタマーゼにより分解される、セフタロリンおよびセフトビプロールなど、抗MRSA活性を呈示するセファロスポリン;
・第1群のβ−ラクタマーゼにより分解される、セフォキシチン、セフォテタン、セフメタゾールなどのセファマイシン。
【0015】
少なくとも1つの抗微生物剤に対する耐性の決定とは、抗微生物剤により破壊される微生物の感受性を決定することを意味することが理解される。耐性機構に関与するタンパク質は、ファミリーおよび種によって異なることになる。
【0016】
β−ラクタマーゼ、β−ラクタム耐性の細菌酵素についての用語法は、標準化されていない。β−ラクタマーゼ、β−ラクタム耐性の細菌酵素は、それらの一次構造に基づく4つの分子クラス(A〜D)、または標的基質およびそれらの阻害剤に対する耐性に基づく機能群に分類される(概説については、[9]BushおよびJacoby、Antimicrobial Agents and Chemotherapy、2010;54(3):969〜976を参照されたい)。分子的分類のためには、配列決定法を介して、より正確な分類が可能となっている:例えば、183のTEMタンパク質変異体が記載されている(TEM−iと名付けられる;iは、1〜183の間である)。機能的分類のためには、BushおよびJacoby(前出)により、以下の新たな機能的亜群が提起されている:
・第1群の酵素は、分子クラスCに属するセファロスポリナーゼである。ACC、ACT、MIR、MOX、DHA、CMY、およびFOXは、この亜群に属するプラスミド保有酵素である。
・第2群の酵素は、分子クラスAおよびDに属する。この群はそれ自体、亜群:2a、2b、2be、2br、2ber、2c、2ce、2d、2de、2df、2fなどに細分される。CTX−M(2be)、SHV(2b、2be、または2br)、PER(2be)、VEB(2be)、およびTEM(2b、2be、2br、または2ber)は、この群に属する酵素である。
○第2a亜群は、ベンジルペニシリンおよびペニシリン誘導体を加水分解するが、セファロスポリン、カルバペネム、またはモノバクタムは加水分解しないβ−ラクタマーゼに対応する。
○第2b亜群は、第1世代のペニシリンならびにセファロリジンおよびセファロチンなどのセファロスポリンを加水分解し、クラブラン酸、スルホバクタム、またはタゾバクタムにより阻害される広域スペクトルのβ−ラクタマーゼに対応する。変異体であるTEM−1、TEM−2、およびSHV−1は、この亜群に属する。
■第2be亜群は、これらもまたクラブラン酸、スルホバクタム、またはタゾバクタムにより阻害される、広域スペクトルのβ−ラクタマーゼ(ESBL)に対応する。これらの酵素は、第2b亜群の特性に加えて、セフォタキシムまたはセフタジジムなど、少なくとも1つのオキシイミノ系β−ラクタム、およびアズトレオナムなどのモノバクタムを加水分解する。この亜群は、多数のTEMおよびSHVの変異体、PERおよびVEBの変異体のほか、CTX−M、BEL−1、BES−1、SFO−1、TAL−1、およびTAL−2を含有する。
■第2br亜群は、クラブラン酸、スルホバクタム、またはタゾバクタムによる阻害に対して非感受性の、第2b亜群に由来するβ−ラクタマーゼに対応する。この亜群は、酵素であるTEMおよびSHVの変異体を含有する。
■第2ber亜群は、クラブラン酸、スルホバクタム、またはタゾバクタムによる阻害に対して非感受性の、第2be亜群に由来するβ−ラクタマーゼに対応する。この亜群は、TEM変異体を含有する。
○第2ce亜群は、それがカルベニシリンまたはチカルシリンのほか、セフェピムおよびセフピロームを加水分解する能力を特徴とする。CARB−10は、この亜群の一部である。
○第2d亜群は、クロキサシリンまたはオキサシリンを加水分解することが可能なOXAβ−ラクタマーゼを包含する。OXA(またはオキサシリナーゼ)は、それらの一次配列により、クラスDのβ−ラクタマーゼに対応し、セファロスポリン、またはセファロスポリンおよびカルバペネムに対する耐性を付与しうる(Poirelら、2010、Antimicrobio.Agents Chemother.、54:24〜38)。
■第2de亜群は、オキシ−イミノ−β−ラクタムまで及ぶが、カルバペネムまでは及ばない広域スペクトルを有するOXAを包含する。
■第2df亜群は、カルバペネムまで及ぶスペクトルを有するOXAを包含する。
○第2e亜群は、クラブラン酸またはタゾバクタムにより阻害される、広域スペクトルのセファロスポリナーゼに対応する。
○第2f亜群は、SME、KPC、または特定のGESの変異体などのカルバペネマーゼに対応する。最初のGESβ−ラクタマーゼは、1998年に仏領ギアナで単離された(Poirelら、2000、Antimicrobio.Agents Chemother.、43:622〜632)。この酵素(GES−1)は、ESBL耐性(第2be亜群)を付与した。GESβ−ラクタマーゼを保有する細菌からの第2の単離は、2000年に南アフリカで達成された(Poirelら、2001、Antimicrobio.Agents Chemother.、45:2598〜2603)。この酵素(GES−2)は、セファロスポリン、およびイミペネム(第2f亜群)などのカルバペネムに対する耐性を付与した。
・第3群の酵素は、カルバペネムクラスの抗生剤を加水分解することで知られるメタロ−β−ラクタマーゼである。酵素IMP、VIM、CAU、GOB、またはFEZは、この群の一部である。
【0017】
本発明の方法を使用して、細菌におけるセファロスポリンに対する耐性の機構を検出することができる。したがって、例えば、本発明の方法によりセファロスポリンに対する耐性の機構を探索することが可能な細菌としては、以下について非網羅的に言及することができる:
・第1群および第2群のタンパク質およびペプチドを耐性マーカーとして用いる腸内細菌(Enterobacteriaceae)科;
・非発酵型細菌(緑膿菌(Pseudomonas aeruginosa)、アシネトバクター・バウマンニー(Acinetobacter baumannii))など。
【0018】
カルバペネムに対して耐性であることが知られる株はまた、セファロスポリンおよびペニシリンに対しても耐性であることにもさらに注意すべきである。したがって、カルバペネムに対する耐性の機構を検出する方法はまた、セファロスポリンおよびペニシリンに対する耐性の機構を検出することも可能とする。
【0019】
本発明の方法を使用しうる試料は、標的の微生物を含有しやすい任意の試料である。試料は、動物、植物、またはヒトである生物由来でありうる。この場合、試料は、体液検体(例えば、全血液、血清、血漿、尿、脳脊髄液、生物学的分泌物)、組織検体、または単離細胞に対応しうる。この検体は、β−ラクタムに対する細菌の耐性の機構のマーカーが被験試料中で入手可能な限りでそれ自体として用いる場合もあり、解析の前に、当業者に知られた方法に従う富化、抽出、濃縮、精製、培養による調製を経る場合もある。
【0020】
試料は、産業由来の場合もあり、非網羅的なリストにより述べれば、大気検体、水検体、地表検体、部品もしくは工業製品、または食品の場合もある。食品試料の中では、乳製品(ヨーグルト、チーズ)、肉、魚、鶏卵、果物、野菜、水、飲料(ミルク、果汁、ソーダなど)の試料について非網羅的な言及を行うことができる。これらの食品試料はまた、ソースまたは調理済み食品にも由来しうる。最後に、食品試料は、動物の餌などの動物飼料にも由来しうる。
【0021】
質量分析による検出の上流では、解析される試料を、この試料中に存在する全タンパクからペプチドを作製するために前処理して、例えば、タンパク質分解酵素(プロテアーゼ)による消化を介して、または化学的試薬の作用を介して、これらのタンパク質をペプチドにフラグメント化することが好ましい。実際、タンパク質の切断は、物理化学的処理により実行することもでき、生物学的処理により実行することもでき、2つの処理の組合せにより実行することもできる。使用可能な処理の中では、特に、Hを伴うヒドロキシルラジカルによる処理について言及することができる。ヒドロキシルラジカルによる処理は、タンパク質のペプチド結合のうちのいずれかにおいてランダムに生じる、ペプチド結合の切離しを結果としてもたらす。ヒドロキシルラジカルの濃度は、実行される切断の数を決定し、したがって、得られるペプチドフラグメントの長さを決定する。また、例えば、とりわけ、メチオニル残基のカルボキシル基においてペプチド結合を分断する臭化シアン(CNBr)処理など、他の化学的処理も用いることができる。また、トリフルオロ酢酸中でタンパク質溶液を1000℃まで加熱することにより、アスパルチル残基において部分的な酸切断を実施することも可能である。
【0022】
にもかかわらず、タンパク質の構造のうちのより多くを保存し、制御が容易であるために、酵素的消化によるタンパク質の処理が、物理化学的処理よりも好ましい。「酵素的消化」とは、適切な反応条件下における、単一であるかまたは組み合わせた1または複数の酵素の作用を意味することが理解される。プロテアーゼと称する、タンパク質分解を実行する酵素は、タンパク質を、特定の場所で切り離す。各プロテアーゼは一般に、その中で常に同じ切離しを施すアミノ酸の配列を認識する。あるプロテアーゼが単一のアミノ酸またはその間で切断を実施する2つのアミノ酸の配列を認識するのに対し、他のプロテアーゼは、長い配列のみを認識する。これらのプロテアーゼは、エンドプロテアーゼの場合もあり、エキソプロテアーゼの場合もある。WO2005/098071において記載される通り、既知のプロテアーゼの中では、以下について言及することができる:
・Arg残基およびLys残基のカルボキシル基においてペプチド結合を分断するトリプシン、リシンの−CO基のペプチド結合を切断するエンドシリン、芳香族残基(Phe、Tyr、およびTrp)のカルボキシル基においてペプチド結合を加水分解するキモトリプシン、芳香族残基(Phe、Tyr、およびTrp)のNH基において切離しをもたらすペプシン、Glu残基のカルボキシル基においてペプチド結合を切断する、黄色ブドウ球菌(Staphylococcus aureus)のV8株に由来するV8プロテアーゼなどの特異的酵素;
・疎水性アミノ酸(Xaa−The、Xaa−Ile、Xaa−Phe)のNH基のペプチド結合を加水分解する、細菌であるバチルス・テルモプロテオリティクス(Bacillus thermoproteolyticus)に由来するテルモリシン、制御された反応条件(酵素濃度および反応の持続時間)下で、ほとんど全ての結合を加水分解し、タンパク質をオリゴペプチドに転換しうる細菌プロテアーゼであるスブチリシンおよびプロナーゼなどの非特異的酵素。
【0023】
数種のプロテアーゼを、それらの作用方式が適合性である場合は同時に用いることもでき、逐次的に用いることもできる。本発明の枠組み内で、試料の消化は、プロテアーゼ酵素、例えば、トリプシンの作用を介して実行することが好ましい。
【0024】
化学的試薬またはプロテアーゼを用いるペプチドの生成は、溶液中の簡素な反応を介して得ることができる。ペプチドの生成はまた、電子レンジにより実行することもでき[10]圧力下で実行することもでき[11]、またはさらには超音波デバイスによって実行することもできる[12]。これら直前の3つの場合には、プロトコールがはるかに迅速となろう。
【0025】
このようにして得られたペプチドの中で、タンパク質に特異的なペプチドを、タンパク質分解性ペプチドと称する。質量分析によりアッセイされるのは、これらのペプチドである。
【0026】
本発明によれば、セファロスポリンに対する細菌の耐性の機構のマーカーは、セファロスポリンに対する耐性の機構が探索される細菌に由来するタンパク質である。特に、前記タンパク質は、酵素によりペプチドに消化されることが好ましく、トリプシンにより消化されることがより好ましい。
【0027】
同様にまた、セファロスポリンに対する細菌の耐性の機構を特徴づけるタンパク質マーカーを含有する試料も、精製を目的として前処理することができる。この精製のための前処理は、上記のペプチド生成ステップの前または後で使用することができる。
【0028】
試料精製のための前処理は、当業者に広く知られており、特に、遠心分離法、濾過法、電気泳動法、またはクロマトグラフィー法を使用することができる。これらの分離法を単独で、または互いに組み合わせて用いて、多次元分離を得ることができる。例えば、多次元クロマトグラフィーは、T.Fortinら[13]、またはH.Keshishianら[14]により記載される通り、イオン交換クロマトグラフィーによる分離を、逆相クロマトグラフィーによる分離と組み合わせることにより用いることができる。これらの公刊物では、クロマトグラフィー媒体を、カラムまたはカートリッジ内に入れることが可能とされている(固相抽出)。
【0029】
タンパク質分解性ペプチドの電気泳動による画分、またはクロマトグラフィーによる画分(または一次元クロマトグラフィーもしくは多次元クロマトグラフィーにおける保持時間)は、各ペプチドに特徴的であり、したがって、これらの技法を使用することにより、タンパク質分解性ペプチドまたはアッセイされるペプチドを選択することが可能となる。このような作製したペプチドの画分化は、後続の質量分析によるアッセイの特異性を増大させることを可能とする。
【0030】
ペプチドを画分化するための電気泳動法またはクロマトグラフィー法に対する代替法は、とりわけ、N−糖ペプチドの精製にある([15]および特許出願第WO2008/066629号)。しかし、このような精製が定量化することを可能とするのは、N−グリコシル化による翻訳後修飾を経たペプチドに限られる。とはいえ、全てのタンパク質がグリコシル化されるわけではなく、したがって、その使用は限定される。
【0031】
当業者には、本発明の方法において使用される質量分析が、異なる種類の分子を解析および検出するための強力なツールとして広く知られている。一般に、イオン化することが可能な任意の種類の分子は、質量分析器を一助として、その分子量により検出することができる。検出される分子がタンパク質由来であるかまたは代謝由来であるかの性質により、特定の質量分析法がより適切となりうる。にもかかわらず、検出のためにいかなる質量分析法を用いるのであれ、この質量分析法は、標的分子を、いわゆる分子イオンにイオン化するステップを包含し、本発明の場合には、特徴づけマーカーをイオン化するステップと、得られた分子イオンをそれらの質量により分離するステップとを包含する。
【0032】
したがって、全ての質量分析器は、以下を含む:
・解析される試料中に存在するマーカーをイオン化する、すなわち、正または負の電荷をこれらのマーカーに付与することを意図するイオン化源;
・イオン化されたマーカーまたは分子イオンを、それらの質量対電荷比(m/z)により分離することを意図する質量分析計;
・分子イオンにより直接的に、または、以下で詳述される通り、分子イオンから作製したイオンによりもたらされるシグナルを測定することを意図する検出器。
【0033】
質量分析を使用するのに必要なイオン化ステップは、当業者に知られた任意の方法を介して実行することができる。イオン化源は、アッセイされる分子を、気体のイオン化状態に転換することを可能とする。イオン化源は、陽イオンについて研究するための陽イオンモードで用いることもでき、陰イオンについて研究するための陰イオンモードで用いることもできる。数種のイオン源が存在し、探索される結果および解析される分子に応じてこれらが用いられることになる。特に、以下について言及することができる:
・電子イオン化(EI)、化学イオン化(CI)、および脱離化学イオン化(DCI)
・高速原子衝撃(FAB)、準安定原子衝撃(MAB)、またはイオン衝撃(SIMS、LSIMS)
・誘導結合プラズマ(ICP)
・大気圧化学イオン化(APCI)および大気圧光イオン化(APPI)
・電子噴霧化またはエレクトロスプレー(ESI)
・マトリックス支援レーザー脱離/イオン化(MALDI)、表面活性化レーザー脱離/イオン化(SELDI)、またはシリコン上の脱離/イオン化(DIOS)
・準安定分子種との相互作用によるイオン化/脱離(DART)。
【0034】
特に、イオン化は、以下の通りに使用することができる:標的分子を含有する試料を、イオン化源であって、分子を気体状態でイオン化させ、したがって、初期分子に対応する分子イオンに転換するイオン化源に導入する。エレクトロスプレーイオン化(ESI)源は、分子を、液体状態から気体状態に移行させることにより、イオン化することを可能とする。したがって、得られる分子イオンは、陽イオンモードでは、1つ、2つの、もしくはさらには3つの、またはこれを超えるさらなるプロトンを伴って、液体状態中に存在する分子に対応し、したがって、1つ、2つの、もしくはさらには3つの、またはこれを超える電荷を保有する。例えば、標的分子がタンパク質である場合、標的タンパク質の画分化の後で得られるタンパク質分解性ペプチドの、陽イオンモードで機能するエレクトロスプレーイオン源を介するイオン化により、1つ、2つの、もしくはさらには3つの、またはこれを超えるさらなるプロトンを伴い、したがって、1つ、2つの、もしくはさらには3つの、またはこれを超える電荷を担い、液体状態から気体状態に移行することを可能とする、気体状態のポリペプチドイオンがもたらされる[16]。この種のイオン源は、標的分子または得られたタンパク質分解性ペプチドが逆相液体クロマトグラフィーによりあらかじめ分離されている場合に特によく適する。にもかかわらず、この試料中に存在する分子のイオン化収量は、存在する異なる種の濃度および性質に応じて変化しうる。この現象により、当業者によく知られたマトリックス効果がもたらされる。
【0035】
MALDI用のイオン化源は、固体状態の試料に由来する分子のイオン化を可能とすることになる。
【0036】
イオン化されたマーカーをそれらの質量対電荷比(m/z)により分離するステップを実行する質量分析計は、当業者に知られた任意の質量分析計である。低分解度の分析計、四重極(quadripoleまたはquadrupole)(Q)分析計、3Dイオントラップ(IT)分析計、または、イオントラップとも称するリニアイオントラップ(LIT)分析計、および分析物の正確な質量を測定することを可能とする高分解度の分析計であって、特に、電気セクターに連結された磁気セクターを用いる分析計、飛行時間(TOF)分析計、フーリエ変換イオンサイクロトロン共鳴(FT−ICR)分析計であるOrbitrapについて言及することができる。
【0037】
それらのm/z比に応じた分子イオンの分離は、1回だけ(単回の質量分析、またはMS)使用することもでき、数回にわたる逐次的なMSによる分離を実行することもできる。2回にわたる逐次的なMSによる分離を実行する場合、この解析をMS/MSまたはMSと称する。3回にわたる逐次的なMSによる分離を実行する場合、この解析をMS/MS/MSまたはMSと称し、より一般的に、n回にわたる逐次的なMSによる分離を実行する場合、この解析をMSと称する。
【0038】
数回の逐次的な分離を使用する技法の中では、単一の標的分子を検出もしくはアッセイする場合のSRM(選択的反応モニタリング)モード、または数種の標的分子を検出もしくはアッセイする場合のMRM(多重反応モニタリング)モードが、MS分離で特に用いられる。同様に、MRMモードも、MS/MS/MS分離で特に用いられる。これを、標的化質量分析と称する。
【0039】
単一のMSモードで検出する場合、検出される標的分子と相関するのは、得られる分子イオンの質量対電荷比である。
【0040】
MS/MSモードで検出する場合、MSアッセイと比較して、本質的に以下の2つのステップ:
・分子イオンをフラグメント化するステップであって、前駆体イオンと称するイオンをもたらし、次いで、第1世代のフラグメントイオンと称するイオンをもたらすステップと、
・第1世代のフラグメントイオンと称するイオンを、それらの比(m/z)により分離するステップ(比(m/z)は、前駆体イオンの比(m/z)に対応する)と
が付加される。
【0041】
したがって、検出される標的分子と相関するのは、このようにして得られる第1世代のフラグメントイオンの質量対電荷比である。第1世代のフラグメントイオンとは、フラグメント化のステップの後で前駆体イオンから派生するイオンであり、その質量対電荷比であるm/zは、前駆体イオンのm/zと異なることが理解される。
【0042】
(m/z)と(m/z)との対をトランジションと称し、検出される特徴的なイオンを表す。
【0043】
当業者は、標準的な方法に従い、標的分子と相関することが検出される特徴的なイオンの選択を行う。それらの選択は、再現性および信頼性の点で、可能な限り最も高感度で、特異的で、頑健なアッセイをもたらすと有利であろう。タンパク質分解性ペプチドによる(m/z)、および第1世代のフラグメントによる(m/z)を選択するために開発された方法では、選択が反応の強度に本質的に基づく。さらなる詳細については、V.Fusaroら[17]を参照することが可能である。当業者は、Applied BiosystemsまたはMRMaidによるMIDASソフトウェアおよびMRM Pilotソフトウェア[18]など、市販のソフトウェアを用いて、全ての可能なトランジション対の予測を可能としうる。当業者はまた、研究者集団により記載されているペプチドのMRMトランジションの全てをまとめるように、F Desiereら[19]により構築された、PeptideAtlasと称するデータベースも用いることができる。このデータベースであるPeptideAtlasは、インターネット上において無償で入手できる。タンパク質以外の分子にはまた、例えば、Applied Biosystems社(United States of America)によるCliquidソフトウェアを介してアクセス可能なデータベースなどのデータベースを用いることも可能である。
【0044】
タンパク質分解性ペプチドによる(m/z)および(m/z)を選択するための代替法は、他の作業中に得られるMS/MSによるフラグメント化スペクトルを用いることである。この作業は、例えば、プロテオーム解析によるバイオマーカーの発見および同定の段階でありうる。この手法は、使用者会議においてThermo Scientificにより提起された[18]。この手法は、SIEVE(Thermo Scientific)ソフトウェアによる試験を介して同定されるペプチドから、候補トランジションのリストを作成することを可能とする。イオンによる(m/z)および(m/z)の選択についての特定の基準は、J.Meadら[18]により詳述されているが、これを以下に詳述する:
・リシンまたはアルギニンにプロリンが後続するのでない限り、内部切断部位、すなわち、内部リシンまたは内部アルギニンを伴うペプチドは、回避しなければならない;
・アスパラギンまたはグルタミンを伴うペプチドは、脱アミノ化しうるために、回避しなければならない;
・N末端においてグルタミンまたはグルタミン酸を伴うペプチドは、自発的に環化しうるために、回避しなければならない;
・メチオニンを伴うペプチドは、酸化しうるために、回避しなければならない;
・システインを伴うペプチドは、チオール官能基の潜在的な変性ステップ、還元ステップ、および保護ステップにおいて再現不可能な形で修飾されうるために、回避しなければならない;
・プロリンを伴うペプチドは一般に、MS/MSにおいて極めて強い単一のピークを伴う強度の大きなフラグメントを作製するために、好適であると考えることができる。しかし、極めて強い単一のフラグメントは、複雑な混合物中におけるトランジションの識別の検証を可能としない。実のところ、数種の特徴的なフラグメントの同時的な存在だけが、探索される前駆体イオンが実際に検出されたことの検証を可能とする;
・プロリンがC末端に隣接する(n−1位にある)かまたはC末端から2番目にある(n−2位にある)ペプチドは、この場合、第1世代のペプチドフラグメントのサイズが、十分に特異的であるためには余りに小さすぎると一般に考えられるために、回避すべきである;
・特異性を促進するために、前駆体を超える質量を有するフラグメントの選択に優先性を与えるべきである。この目的のためには、二価に帯電した前駆体イオンを選択し、前駆体を超える質量を有する、強度の最も強い第1世代のイオンフラグメント、すなわち、一価に帯電した第1世代のフラグメントイオンを選択することが必要である。
【0045】
選択された前駆体イオンのフラグメント化は、イオンを分離することもまた可能な三連四重極モデル[20]、イオントラップモデル[21]、または飛行時間(TOF)モデル[22]などのフラグメント化セル内で実行される。1回または複数回のフラグメント化は慣例上、電場内のアルゴンもしくは窒素など、不活性ガスとの衝突により、強い光源を用いる光励起もしくは光解離により、例えば、飛行時間チューブ内で電位差を印加することを介する、電子もしくはラジカル種との衝突により、または他の任意の活性化モードにより実行されることになる。電場の特徴は、フラグメント化の強度および性質を決定する。したがって、例えば、四重極内、不活性ガスの存在下で印加される電場により、イオンにもたらされる衝突エネルギーが決定される。この衝突エネルギーは、アッセイされるトランジションの感度を増大させるように、当業者により最適化されるであろう。例として述べると、Applied Biosystems社(Foster City、United States of America)によるAB SCIEX QTRAP(登録商標)5500質量分析器のq2では、衝突エネルギーを5〜180eVの間で変化させることが可能である。同様に、衝突ステップの持続時間、および、例えば、イオントラップ内の励起エネルギーも、最高感度のアッセイをもたらすように、当業者により最適化されるであろう。例として述べると、Applied Biosystems社によるAB SCIEX QTRAP(登録商標)5500質量分析器のQ3では、励起時間と称するこの持続時間を0.010〜50ミリ秒の間で変化させ、励起エネルギーを0〜1(任意単位)の間で変化させることが可能である。
【0046】
最後に、選択された特徴的なイオンの検出を、特に、検出器および処理システムを介する従来の方式で行う。検出器は、イオンを回収し、その強度が回収されたイオンの量に依存する電気シグナルを発生させる。次いで、得られたシグナルを、コンピュータで処理しうるように増幅する。コンピュータのデータ処理アセンブリーにより、質量スペクトル検出器により受け取られた情報を変換することが可能となる。
【0047】
SRMモード、またはさらにはMRMモードの原理は、とりわけ、前駆体イオンを選択し、それをフラグメント化し、次いで、とりわけ、そのフラグメントイオンのうちの1つを選択することである。このような適用のために、三連四重極、またはハイブリッドの三連四重極/イオントラップデバイスが一般に用いられる。
【0048】
標的タンパク質をアッセイまたは検出することを視野に入れてMSモードにおいて用いられる三連四重極デバイス(Q1q2Q3)の場合、第1の四重極(Q1)は、早期の消化ステップにおいてアッセイされ、得られるタンパク質に特徴的なタンパク質分解性ペプチドに対応する分子イオンを、それらの質量対電荷比(m/z)に応じてフィルタリングすることを可能とする。探索されるタンパク質分解性ペプチドの質量対電荷比であって、(m/z)と称する比を有するペプチドだけが第2の四重極(q2)に伝送され、後続のフラグメント化のための前駆体イオンとして作用する。分析計q2は、質量対電荷比が(m/z)であるペプチドを、第1世代のフラグメントイオンにフラグメント化しうる。フラグメント化は一般に、q2における、前駆体ペプチドの、窒素またはアルゴンなどの不活性ガスとの衝突を介して得られる。第1世代のフラグメントイオンは、第1世代のフラグメントイオンを、(m/z)と称する特定の質量対電荷比に応じてフィルタリングする第3の四重極(Q3)に伝送される。探索されるタンパク質分解性ペプチドに特徴的なフラグメントの質量対電荷比である(m/z)を有する第1世代のフラグメントイオンだけが、検出器に伝送されて、検出されるか、またはさらには定量化される。
【0049】
この操作モードは、一方で前駆体イオンの選択に関して、他方で第1世代のフラグメントイオンの選択に関して、二重の選択性を呈示する。したがって、定量化には、SRMモードまたはMRMモードの質量分析が有利である。
【0050】
本発明による方法において使用される質量分析がタンデム質量分析(MS、MS、MS、またはMS)である場合、数個の質量分析計を、互いに連結することができる。例えば、第1の分析計がイオンを分離し、衝突セルがイオンをフラグメント化することを可能とし、第2の分析計がフラグメントイオンを分離する。イオントラップまたはFT−ICRなど、特定の分析計が、数個の分析計を一体に構成し、イオンをフラグメント化し、フラグメントを直接的に解析することを可能とする。
【0051】
本発明の好ましい実施形態によれば、本発明の方法は、以下の特徴のうちの1または複数を含む:
・少なくとも1つの抗微生物剤に対する潜在的な耐性の特性のために使用される質量分析が、MS/MS質量分析であって、検出されるかまたは定量化される分子に特異的なフラグメントを作製し、したがって、アッセイ法に大きな特異性をもたらす利点を有するMS/MS質量分析である特徴;
・MS/MS質量分析が、MRMであって、質量分析器において、数十ミリ秒にわたる解析サイクル時間であり、多数の異なる分子を、マルチプレックス様式で、高感度に検出または定量化することを可能とする解析サイクル時間を用いる利点を有するMRMである特徴;
・適切な場合、種類の特性および毒性因子の決定を、少なくとも1つの抗微生物剤に対する耐性のマーカーを決定する質量分析装置と同じ質量分析装置において、好ましくは同時に実行する特徴であって、解析時間を短縮し、測定器の費用を節減し、また、結果の処理および作成も容易とする利点を有する特徴。
【0052】
抗生剤に対する耐性を決定することに加えて、試験対象の試料中に存在する1または複数の微生物を同定することが必要である。
【0053】
微生物を同定する方法は、例えば、Murray P.R.ら、Manual of Clinical Microbiology、2007、9版により、とりわけ、細菌および酵母についてはI巻、III節、15および16章により、ウイルスについては、II巻、VI節、82章により、原虫についてはII巻、X節、135章により記載される通り、当業者に広く知られている。従来の同定法の例として、例えば、VITEK2(bioMerieux)同定カードを用いることによる生物学的プロファイルの決定、またはさらには特定の遺伝子の存在についての研究、およびそれらの配列についての研究に基づく同定基準を伴う分子生物学法を用いることによる生物学的プロファイルの決定について言及することができる。
【0054】
同定は、同定が行われる試料から直接的に実行することもでき、試料中に含有される微生物を、Murray P.R.ら、Manual of Clinical Microbiology、2007、9版、I巻、III節、14章により、特に、細菌についてはI巻、IV節、21章により、ウイルスについては、II巻、VI節、81章により、酵母についてはII巻、VIII節、117章、原虫についてはII巻、X節、134章により記載される通り、探索される微生物種に照らして調整した最適の培養培地および培養条件により、当業者によく知られた方法を用いて培養することもできる。
【0055】
したがって、一般に、生化学的方法を用いて検体中の細菌を同定する場合、例えば、寒天上に播種した後に、純粋な培養物中の細菌を得ることがまず必要である。特定の場合には、分子生物学(PCR)を、解析される試料に直接的に適用することができる。
【0056】
微生物を培養する代わりに、活性表面を介して試料中の微生物を直接的に捕捉することにより濃縮することもできる。このような方法は、Fe/TiO活性化表面を伴う磁気ビーズを一助として異なる細菌種を捕捉したW.−J.Chenら[11]により記載された。また、レクチンによる捕捉[23]、または抗体による捕捉[24]、またはバンコマイシンによる捕捉[25]など、他の手段を介する捕捉も可能である。捕捉により、微生物を濃縮し、したがって、培養ステップを縮小、またはさらには除外することが可能となる。これにより、大幅な時間の節減が結果としてもたらされる。
【0057】
同定はまた、既に記載されている技法に従う質量分析、好ましくはMSにより、MS/MSにより、またはさらには、本発明の一実施形態を構成する、MSにMS/MSを後続させた質量分析によっても実行することができる。この場合にもまた、試料を、あらかじめ、寒天上における播種など、培養ステップにかけることができる。
【0058】
MSによる同定法の使用は、数分間で実行することができ、要請される質量分析器が、単一の分析計である、すなわち、MS/MSにおいて用いられるタンデム質量分析器ほど複雑な測定器ではない点で有利である。
【0059】
また、MSにMS/MSを後続させた質量分析による同定法の使用も有利である。これは、MSにより観察されたイオンの識別を点検することを可能とし、これにより、解析の特異性が増大する。
【0060】
MRM型のMS/MSによる同定法の使用は、従来のMSにMS/MSを後続させた手法より高感度でより簡素である利点を有する。この方法は、MSスペクトルの収集とMS/MSスペクトルの収集との間で情報を処理する高性能ソフトウェアも、MSスペクトル、次いで、MS/MSスペクトルを接合するためのマシンパラメータ環境の変化も要請しない。
【0061】
MSによる同定法は、S.Vaidyanathanら[26]またはR.Everleyら[27]により記載される通り、クロマトグラフィーによる分離の後で、生試料に対して、エレクトロスプレーイオン源と共に使用することができる。したがって、異なるm/z範囲により、微生物を同定することが可能となる。S.Vaidyanathanらは200〜2000Thの間の範囲を用い、R.Everleyらは、620〜2450Thの間の範囲を用いた。また、質量スペクトルをデコンボリュートして、それらの荷電状態とは独立にタンパク質の質量に到達することもできる。したがって、R.Everleyらは、約5,000〜50,000Daの間の質量を用いた。代替的に、MSによる同定法はまた、Claydonら[3]ならびにT.KrishnamurthyおよびP.Ross[4]により記載されている通り、MALDI−TOFを一助としても使用することができる。解析では、質量スペクトルの収集と、専門的ソフトウェアによる解釈とを組み合わせる。MALDI−TOFは、極めて簡素であり、数分間で実行することができる。この同定法は、現在のところ、医学的解析実験室においてますます普及しつつある[28]。
【0062】
試料中に存在するそれらのタンパク質を介する、MS/MSを後続させたMSによる細菌の同定は、多数の研究チームにより広く適用されている。例として述べると、サルモネラ・エンテリカ(Salmonella enterica)のペプチドームについて研究した、Manes,N.ら[29]の近年の業績、またはトリプシンによるタンパク質の消化後における細菌のプロテオームについて研究したR.Nandakumarら[30]もしくはL.Hernychovaら[31]の業績について言及することができる。従来の手法は、i)MSスペクトルを収集すること、ii)強いシグナルを伴うMSスペクトルにおいて観察される各前駆体イオンを逐次的に選択すること、iii)各前駆体イオンを逐次的にフラグメント化し、そのMS/MSスペクトルを収集すること、iv)Mascot(Matrix Science、London、United Kingdom)、またはSEQUEST(Thermo Scientific、Waltham、United States of America)などのソフトウェアを介して、SWISS−PROTまたはNCBIなどのタンパク質データベースに問い合わせて、観察されたMS/MSスペクトルにマッチする確率が高いペプチドを同定することにある。種に特徴的なタンパク質またはペプチドが同定される場合は、この方法により、微生物の同定がもたらされうる。
【0063】
質量分析の使用の利点のうちの1つは、質量分析が、特に、分子、本発明の場合は、β−ラクタムに対する細菌の耐性の機構のマーカーを定量化するのに有用である点にある。この目的のために、検出される電流の強度であって、標的分子の量と比例する強度を用いる。このようにして測定される電流の強度は、存在する標的分子の量を決定することを可能とする定量的な測定値であって、その国際単位系(SI)であるモル/m単位もしくはkg/m単位における表現により、またはこれらの単位の倍数もしくは約数により、またはその倍数もしくは約数を含めた通常のSI単位の誘導単位により特徴づけられる測定値として働きうる。非限定的な例として、ng/mlまたはフェムトモル/lなどの単位は、定量的な測定値を特徴づける単位である。
【0064】
にもかかわらず、測定されたピーク面積であって、検出されるイオンにより誘導される電流の強度に対応するピーク面積を、アッセイされる標的分子の量と相関させることが可能であるためには較正が必要である。この目的で、本発明の枠組み内では、質量分析において慣例上用いられる較正を使用することができる。MRMアッセイは慣例上、外部基準物質を一助として較正されるか、または好ましくはT.Fortinら[13]により記載される内部基準物質などの内部基準物質を一助として較正される。標的分子が、対象のタンパク質のアッセイを可能とするタンパク質分解性ペプチドである場合は、測定されたシグナルを、アッセイされる量が既知である基準シグナルと比べて較正することにより、定量的な測定値と標的のタンパク質分解性ペプチドの量との間の相関を得、その後、定量的な測定値と対象のタンパク質の量との間の相関を得る。較正は、例えば、以下で詳述されるAQUA法、QconCAT法、またはPSAQ法に従い、例えば、基準のタンパク質分解性ペプチドを異なる濃度で逐次的に注入すること(外部較正)により、または好ましくは内部基準物質としての重ペプチドを用いる内部較正により得られる検量線を用いて実行することができる。「重ペプチド」とは、タンパク質分解性ペプチドに対応するが、1もしくは複数の炭素12(12C)原子が、炭素13(13C)により置きかえられ、かつ/または1もしくは複数の窒素14(14N)原子が窒素15(15N)により置きかえられたペプチドを意味することが理解される。
【0065】
内部基準物質としての重ペプチド(AQUA)の使用はまた、米国特許出願第2004/0229283号においても提起された。その原理は、通常の天然同位体より重い同位体を含有するアミノ酸を伴うタンパク質分解性ペプチドを人工的に合成することである。このようなアミノ酸は、例えば、炭素12(12C)原子の一部を、炭素13(13C)で置きかえることにより、または窒素14(14N)原子の一部を、窒素15(15N)で置きかえることにより得られる。このようにして合成された人工ペプチド(AQUA)は、天然ペプチドと厳密に同じ(質量が大きいことを除き)物理化学的特性を有する。AQUAペプチドは一般に、質量分析によるアッセイの上流の、例えば、対象の試料中のタンパク質の切断を伴う処理と、処理ステップの後で得られたペプチドの画分化との間で、所与の濃度で試料に添加される。したがって、AQUAペプチドは、ペプチドの画分化において、アッセイされる天然ペプチドと共に共精製される。したがって、2つのペプチドは、アッセイのために質量分析器に同時に注入される。次いで、2つのペプチドは、イオン源内で同じイオン化を受ける。天然ペプチドのピーク面積と、その濃度が既知であるAQUAペプチドのピーク面積との比較により、天然ペプチドの濃度を計算し、したがって、アッセイされるタンパク質の濃度に遡及することが可能となる。AQUA法の変法は、QconCATという名称の下に、J.−M.Prattら[32]により提起された。この変化形はまた、特許出願第WO2006/128492号においても記載されている。この変化形は、多様なAQUAペプチドを濃縮することと、人工ポリペプチドを組換え重タンパク質の形態で作製することとにある。組換えタンパク質は、重同位体を含むアミノ酸により合成する。この方式により、数種のタンパク質に対する同時的なアッセイを較正するための基準物質を低廉な費用で得ることが可能である。QconCAT基準物質は、タンパク質の切断を伴う処理の上流で、タンパク質を画分化するステップ、タンパク質を変性させるステップ、タンパク質を還元するステップ、およびこれらが存在する場合はタンパク質のチオール官能基を保護するステップの前に初発から添加される。したがって、QconCAT基準物質は、天然タンパク質と同じ、タンパク質の切断を伴う処理サイクルであって、タンパク質の切断を伴う処理ステップからの収量を考慮することを可能とする処理サイクルを経る。実際、特に、天然タンパク質の消化による処理は、完全でない場合がある。この場合、AQUA基準物質を用いれば、天然タンパク質の量を過小評価することになろう。したがって、完全なアッセイのためには、タンパク質の切断を伴う処理からの収量を考慮することが重要でありうる。しかし、V.Brunら[33]は、QconCAT基準物質が、場合によって、QconCATタンパク質とは異なる三次元的立体構成に疑いなく起因して、特に、天然タンパク質の消化による処理収量を正確に再現しない可能性があることを示した。
【0066】
そこで、V.Brunら[33]は、PSAQと称し、特許出願第WO2008/145763号において記載される方法の使用を提起した。この場合には、内部基準物質が、天然タンパク質と同じ配列を有するが、重アミノ酸により合成された組換えタンパク質である。この合成は、重アミノ酸によりex vivoで実行される。この基準物質は、天然ペプチドと厳密に同じ(質量が大きいことを除き)物理化学的特性を有する。この基準物質は、タンパク質の画分化ステップが存在する場合、その前に初発から添加される。したがって、この基準物質は、タンパク質の画分化ステップにおいて天然タンパク質と共に共精製される。この基準物質は、天然タンパク質と同じ処理収量であって、特に、消化による同じ処理収量を呈示する。ペプチドの画分化ステップを実行する場合はまた、切断の後で得られる重ペプチドも、天然ペプチドと共に共精製される。したがって、2つのペプチドが質量分析器に同時に注入されて、定量的にアッセイされる。次いで、2つのペプチドは、イオン源内で同じイオン化を受ける。天然ペプチドのピーク面積と、PSAQ法における基準ペプチドのピーク面積との比較により、アッセイ法のステップの全てを考慮しながら、アッセイされるタンパク質の濃度を計算することが可能となる。
【0067】
本発明の枠組み内で、質量分析アッセイにおいて用いられ、特に、MRMアッセイまたはMSアッセイにおいて用いられるこれらの技法の全て、すなわち、AQUA法、QconCAT法、もしくはPSAQ法、または他の任意の較正法を使用して、較正を実行することができる。
【0068】
本発明による検出方法において用いられる質量分析は、MS/MSであることが好ましい。質量分析は、MRMであることがより好ましい。
【0069】
耐性マーカーとしての少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする本発明の方法は、セファロスポリンに対する耐性を検出することを可能とする。前記耐性マーカーペプチドは、タンパク質であるTEM、CMY、CTX−M、SHV、FOX、ACC、ACT、CARB、DHA、MIR、MOX、PER、VEB、OXA、またはGESに属することが好ましい。
【0070】
特に、TEMタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、TEMタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号1〜配列番号165および配列番号1836〜配列番号1843に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号1:
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配列番号2:
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配列番号3:
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配列番号4:
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配列番号5:
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配列番号6:
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配列番号7:
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配列番号8:
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配列番号9:
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配列番号10:
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配列番号11:
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配列番号12:
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配列番号13:
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配列番号14:
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配列番号15:
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配列番号16:
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配列番号17:
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配列番号18:
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配列番号19:
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配列番号20:
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配列番号21:
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配列番号22:
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配列番号23:
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配列番号24:
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配列番号25:
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配列番号26:
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配列番号27:
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配列番号28:
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配列番号29:
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配列番号30:
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配列番号31:
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配列番号32:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMVSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号33:
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配列番号34:
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配列番号35:
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配列番号36:
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配列番号37:
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配列番号38:
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配列番号39:
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配列番号40:
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配列番号41:
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配列番号42:
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配列番号43:
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配列番号44:
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配列番号45:
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配列番号46:
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配列番号47:
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配列番号48:
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配列番号49:
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配列番号50:
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配列番号51:
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配列番号52:
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配列番号53:
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配列番号54:
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配列番号55:
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配列番号56:
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配列番号57:
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配列番号58:
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配列番号59:
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配列番号60:
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配列番号61:
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配列番号62:
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配列番号63:
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配列番号64:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDELNRQIAEIGASLIKHW
配列番号65:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASQQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号66:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号67:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号68:
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配列番号69:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSSGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号70:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号71:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMGDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号72:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSSGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号73:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMVSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRREPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGASLIKHW
配列番号74:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSGGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号75:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAVTMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGASLIKHW
配列番号76:
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配列番号77:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMVSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDEQNRQIAEIGASLIKHW
配列番号78:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRCEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDEQNRQIAEIGASLIKHW
配列番号79:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGASLIKHW
配列番号80:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号81:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号82:
MSIKHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLHCWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号83:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTDELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号84:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMGDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号85:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTGGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号86:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDCWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号87:
MSIKHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号88:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号89:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号90:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGAKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号91:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLGRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号92:
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配列番号93:
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配列番号94:
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配列番号95:
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配列番号96:
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配列番号97:
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配列番号98:
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配列番号99:
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配列番号100:
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配列番号101:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号102:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGADERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号103:
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配列番号104:
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配列番号105:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号106:
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配列番号107:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号108:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号109:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号110:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号111:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGKRGSSGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号112:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDEQNRQIAEIGASLIKHW
配列番号113:
MSIKHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号114:
MSIKHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号115:
MSIQHFRVALIPFLAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSREPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGASLIKHW
配列番号116:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERETTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号117:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDNVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号118:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGEHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号119:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号120:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKPAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号121:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号122:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAVPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号123:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号124:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号125:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号126:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGGQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号127:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGRRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号128:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPIDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号129:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIEMDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号130:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVEDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号131:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGANERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号132:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDCWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号133:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDCWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号134:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLMRSALPAGWFIADKSGAGERGSHGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号135:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLPDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSHGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号136:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSVLPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号137:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATKLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号138:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGVRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号139:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPDTLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号140:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMVSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGGSLIKHW
配列番号141:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMVSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGASLIKHW
配列番号142:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号143:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号144:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNIGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号145:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQSDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号146:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERDRQIAEIGASLIKHW
配列番号147:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMISTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号148:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMVSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号149:
MSIKHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号150:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPKTLVKVKDAENQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEKRFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQSDVVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPVAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号151:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDEQNRQIAEIGASLIKLW
配列番号152:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQVGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQTAEIGASLIKHW
配列番号153:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号154:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVGELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号155:
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配列番号156:
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配列番号157:
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配列番号158:
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配列番号159:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRIDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号160:
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配列番号161:
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配列番号162:
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配列番号163:
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配列番号164:
MSIKHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVKYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDSWEPELNEAIPNDERDTTTPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGTGKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号165:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGSTSGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGSQELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDEADTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGARERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1836:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1837:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMLSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1838:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDKLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1839:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1840:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1841:
MSIQHFRVALIPFFAAFCFPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGASKRGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYMTGGQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1842:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDHWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSRGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
配列番号1843:
MSIQHFRVALIPFFAAFCLPVFAHPETLVKVKDAEDQLGARVGYIELDLNSGKILESFRPEERFPMMSTFKVLLCGAVLSRVDAGQEQLGRRIHYSQNDLVEYSPVTEKHLTDGMTVRELCSAAITMSDNTAANLLLTTIGGPKELTAFLHNMGDHVTRLDRWEPELNEAIPNDERDTTMPAAMATTLRKLLTGELLTLASRQQLIDWMEADKVAGPLLRSALPAGWFIADKSGAGERGSSGIIAALGPDGKPSRIVVIYTTGSQATMDERNRQIAEIGASLIKHW
【0071】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号166〜配列番号261および配列番号1923〜配列番号1928の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0072】
臨床的対象欄内の、2b、2br、2be、および2berの項目は、対応するペプチドにより検出することが可能となる、TEMβ−ラクタマーゼの機能的亜群に対応する。したがって、2beペプチドの検出は、ペニシリン、セファロリジンおよびセファロチンなどの第1世代のセファロスポリン、ならびにセフォタキシム、セフタジジムなどのオキシイミノ系β−ラクタムのクラス、またはアズトレオナムなどのモノバクタムに由来する少なくとも1つの抗生剤を加水分解することが可能な広域スペクトルを伴うβ−ラクタマーゼ(ESBL)の存在を示す。
【0073】
TEMという項目は、第2b亜群、第2br亜群、および第2be亜群、または第2ber亜群のうちの少なくとも2つの間で共通なペプチドを示す。対応するペプチドは、TEMβ−ラクタマーゼの存在、ならびに少なくともペニシリンおよび第1世代のセファロスポリンに対する耐性の機構の存在を示す。
【0074】
TEMタンパク質により誘導される、ESBL(広域スペクトルのβ−ラクタマーゼ)によるセファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、配列番号168、配列番号169、配列番号179、配列番号181、配列番号186、配列番号199、配列番号200、配列番号205、配列番号206、配列番号208、配列番号212、配列番号213、配列番号214、配列番号215、配列番号216、配列番号217、配列番号222、配列番号225、配列番号226、配列番号227、配列番号230、配列番号234、配列番号236、配列番号237、配列番号238、配列番号239、配列番号240、配列番号249、配列番号254、配列番号255、配列番号256、配列番号259、配列番号261、配列番号1927、配列番号1928の配列から選択される、少なくとも1つの耐性マーキング2beペプチドの検出を特徴とする。
【0075】
CMYタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、CMYタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号262〜配列番号311および配列番号1844〜配列番号1870に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号262:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGASVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSVFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAQLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLAFVKANIGGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILAQLAG
配列番号263:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGAGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAPLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANIGGVDDKALQQAISLTHQGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIEARIKAAHAILAQLAG
配列番号264:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGAGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAPLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANIGGVDDKALQQAISLTHQGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVSLEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIEARIKAAHAILAQLAG
配列番号265:
MMKKSLCCALLLTASFSTFASAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAIIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKAALLRFYQNWQPQWAPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSNVTDMARWVQVNMDASRVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号266:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVAFAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号267:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGNGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号268:
MKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDNKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号269:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGELAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGKLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号270:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAYWRILEKLQ
配列番号271:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAGAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号272:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号273:
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配列番号274:
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配列番号275:
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配列番号276:
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配列番号277:
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配列番号278:
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配列番号279:
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配列番号280:
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配列番号281:
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配列番号282:
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配列番号283:
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配列番号284:
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配列番号285:
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配列番号286:
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配列番号287:
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配列番号288:
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配列番号289:
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配列番号290:
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配列番号291:
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配列番号292:
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配列番号293:
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配列番号294:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGASVSEQTLFDIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSVFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAQLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLAFVKANIGGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVSLEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILAQLAG
配列番号295:
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配列番号296:
MMKKSLCCALLLTASFSTFASAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKTYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQDISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKTALLHFYQNWQPQWAPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQSEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSNVTDMARWVQVNMDASRVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号297:
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配列番号298:
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配列番号299:
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配列番号300:
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配列番号301:
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配列番号302:
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配列番号303:
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配列番号304:
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配列番号305:
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配列番号306:
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配列番号307:
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配列番号308:
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配列番号309:
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配列番号310:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYSNSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号311:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLNAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKNYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1844:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGAGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAPLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANIGGVDDKALQQAISLTHQGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIEARIKAAHAILAQLAG
配列番号1845:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGAGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAPLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANIGGVDDKALQQAISLTHQGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVSLEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIEARIKAAHAILAQLAG
配列番号1846:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVAFAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1847:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGNGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1848:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAYWRILEKLQ
配列番号1849:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGELAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDNKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1850:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1851:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVAPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1852:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVLYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYLPELTGKQWQGISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKAALLRFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVTPGQLDAEAYGVKSNVTDMARWIQVNMDASRVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPTVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1853:
MMKKSICCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAIIYEGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWRGISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKAALLRFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQSEQKNYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIELAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPARVEAAWRILEKLQ
配列番号1854:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKTDSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1855:
MMKKSLCCALLLTASLSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAIAVIYQGKPYYFTWGKADITNNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGISLLHLATYTAGGLPLQIPDDVTDKAALLRFYQNWQPQWAPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKAVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQVNMDASRVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1856:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYCVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1857:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFIGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1858:
MMNRYAAALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1859:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFSALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1860:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGASVSEQTLFDIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSVFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAQLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLAFVKANIGGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILAQLAG
配列番号1861:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGASVSEQTLFDIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSVFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAQLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLAFVKANIGGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVSLEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILAQLAG
配列番号1862:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1863:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGAGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAPLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANIGGVDDKALQQAISLTHQGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPNEARIKAAHAILAQLAG
配列番号1864:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1865:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYSNSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKNYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1866:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGELAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYAWGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1867:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKNYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1868:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYANSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEINPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1869:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLQIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYSNSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
配列番号1870:
MMKKSLCCALLLTASFSTFAAAKTEQQIADIVNRTITPLMQEQAIPGMAVAVIYQGKPYYFTWGKADIANNHPVTQQTLFELGSVSKTFNGVLGGDAIARGEIKLSDPVTKYWPELTGKQWQGIRLLHLATYTAGGLPLKIPDDVRDKAALLHFYQNWQPQWTPGAKRLYSNSSIGLFGALAVKPSGMSYEEAMTRRVLQPLKLAHTWITVPQNEQKDYARGYREGKPVHVSPGQLDAEAYGVKSSVIDMARWVQANMDASHVQEKTLQQGIALAQSRYWRIGDMYQGLGWEMLNWPLKADSIINGSDSKVALAALPAVEVNPPAPAVKASWVHKTGSTVGFGSYVAFVPEKNLGIVMLANKSYPNPVRVEAAWRILEKLQ
【0076】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号312〜配列番号350、配列番号734、配列番号735および配列番号1929〜配列番号2007の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0077】
CTX−Mタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、CTX−Mタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号351〜配列番号445および配列番号1871〜配列番号1908に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号351:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQTNSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWGVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPANHAPLVLVTYFTQPEQKAESRRDVLAAAAKIVTHGF
配列番号352:
MMRHRVKRMMLMTTACISLLLGSAPLYAQANDVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNAQTLYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKKVLSQKVEIKSSDLINYNPITEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARAIGDNTFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLRNLTLGSALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIQAGLPTSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPEGRAPLILVTYFTQPEQKAESRRDVLAAAAKIVTDGY
配列番号353:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTAGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号354:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTVDVQQKLAELEQQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTDGL
配列番号355:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号356:
MVTKRMQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTKDNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFAREIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号357:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAGLERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSPAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRHVLAS
配列番号358:
MVKKSLRQFTLMATAAVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPSLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDILASAAKIVTDGL
配列番号359:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTAGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号360:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号361:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTESTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号362:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAKGL
配列番号363:
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配列番号364:
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配列番号365:
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配列番号366:
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配列番号367:
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配列番号368:
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配列番号369:
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配列番号407:
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配列番号409:
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配列番号410:
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配列番号411:
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配列番号412:
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配列番号413:
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配列番号414:
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配列番号415:
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配列番号416:
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配列番号417:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSCGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTDGL
配列番号418:
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配列番号419:
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配列番号420:
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配列番号421:
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配列番号422:
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配列番号423:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAVAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号424:
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配列番号425:
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配列番号426:
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配列番号428:
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配列番号431:
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配列番号432:
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配列番号433:
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配列番号434:
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配列番号435:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQANSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAESRRDFLAAAAKIVTHGF
配列番号436:
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配列番号437:
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配列番号438:
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配列番号439:
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配列番号440:
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配列番号441:
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配列番号443:
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配列番号444:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQTNSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWGVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAESRRDVLAAAAKIVTHGF
配列番号445:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQTNSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAALLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIQAGLPKSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAESRRDVLAAAAKIVTHGF
配列番号1871:
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配列番号1877:
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配列番号1880:
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配列番号1881:
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配列番号1882:
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配列番号1883:
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配列番号1884:
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配列番号1885:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAVAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1886:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKAMAVAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTDGL
配列番号1887:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTESTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAERRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1888:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTQNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1889:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELIAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTDGL
配列番号1890:
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配列番号1891:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAVAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQREQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1892:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAENRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1893:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDRTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRHDVLASAARIIAEG
配列番号1894:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAVAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTNGL
配列番号1895:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEEHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGNL
配列番号1896:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGQGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1897:
VKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDRTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVT
配列番号1898:
VKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRAEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVT
配列番号1899:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1900:
MVTKRVQRMMFAAAACIPLLLGSAPLYAQTSAVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNTQVLYRGDERFPMCSTSKVMAAAAVLKRSETQKQLLNQPVEIKPADLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAQLGGPGGVTAFARAIGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPRAMAQTLRQLTLGHALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIRAGLPTSWTVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPQGRAPLVLVTYFTQPQQNAESRRDVLASAARIIAEGL
配列番号1901:
VKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSRILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTK
配列番号1902:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQANSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAERRRDILAAAAKIVTHGF
配列番号1903:
MRHRVKRMMLMTTACISLLLGSAPLYAQANDVQQKLAALEKSSGGRLGVALIDTADNAQTLYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSETQKNVLSQKVEIKSSDLINYNPIAEKHVNGTMTLAELSAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARAIGDDTFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLRHLTLGSALGETQRAQLVTWLKGNTTGAASIQAGLPTSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPEGRAPLILVTYFTQPEQKAENRRDVLAAAAKIVTDGY
配列番号1904:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAVAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVDGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLISHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTNGL
配列番号1905:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQANSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAESRRDILAAAAKIVTHGF
配列番号1906:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTDGL
配列番号1907:
MMTQSIRRSMLTVMATLPLLFSSATLHAQANSVQQQLEALEKSSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKQSESDKHLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMTLAELGAAALQYSDNTAMNKLIAHLGGPDKVTAFARSLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTTPLAMAQTLKNLTLGKALAETQRAQLVTWLKGNTTGSASIRAGLPKSWVVGDKTGSGDYGTTNDIAVIWPENHAPLVLVTYFTQPEQKAESRRDFLAAAAKIVTHGF
配列番号1908:
MVKKSLRQFTLMATATVTLLLGSVPLYAQTADVQQKLAELERQSGGRLGVALINTADNSQILYRADERFAMCSTSKVMAAAAVLKKSESEPNLLNQRVEIKKSDLVNYNPIAEKHVNGTMSLAELSAAALQYSDNVAMNKLIAHVGGPASVTAFARQLGDETFRLDRTEPTLNTAIPGDPRDTTSPRAMAQTLRNLTLGKALGDSQRAQLVTWMKGNTTGAASIQAGLPASWVVGDKTGSGGYGTTNDIAVIWPKDRAPLILVTYFTQPQPKAESRRDVLASAAKIVTNGL
【0078】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号446〜配列番号495および配列番号2008〜配列番号2092の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0079】
臨床的対象欄内の2beの項目は、CTX−Mペプチドの全てが、ペニシリン、セファロリジンおよびセファロチンなどの第1世代のセファロスポリン、ならびにセフォタキシム、セフタジジムなどのオキシイミノ系β−ラクタムのクラス、またはアズトレオナムなどのモノバクタムに由来する少なくとも1つの抗生剤を加水分解することが可能な広域スペクトルを伴うβ−ラクタマーゼ(ESBL)の存在を示すことを示す。
【0080】
CTX−Mタンパク質により誘導される、ESBL(広域スペクトルのβ−ラクタマーゼ)によるセファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、配列番号446〜配列番号478、配列番号480〜配列番号495および配列番号2008〜配列番号2092の配列から選択される、少なくとも1つの耐性マーキング2beペプチドの検出を特徴とする。
【0081】
SHVタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、SHVタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号496〜配列番号613および配列番号1909〜配列番号1919に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号496:
KRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号497:
LRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSASSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号498:
MRFIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号499:
MRFIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNNAERMVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号500:
MRFIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASKRGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号501:
MRIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPVGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADRTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号502:
MRYARLCIISLLATLPLVVHASPQPLEQIKQSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITVSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号503:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号504:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPVGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADRTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号505:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGSVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIDDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASKRGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号506:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGSVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAAKRGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号507:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGSVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号508:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGSVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号509:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGSVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASKRGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号510:
MRYFRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGSVGMIEMDLASGRTLTAWRADGRFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号511:
MRYIRLCIISLLAALPLAVHASPQPLEQIKQSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMISTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLAIVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号512:
MRYIRLCIISLLAALPLAVHASPQPLEQIKQSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVEDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号513:
MRYIRLCIISLLAALPLAVHASPQPLEQIKQSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITVSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQHIAGIGAALIEHWQR
配列番号514:
MRYIRLCIISLLAALPLAVHASPQPLEQIKQSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITVSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号515:
MRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLDQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGASKRGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号516:
MRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWHADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号517:
MRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWHADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGKRGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAKRNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号518:
MRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMISTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTVGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号519:
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配列番号520:
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配列番号521:
MRYIRLCIISLLATLPLAVHASPQPLEQIKLSESQLSGRVGMIEMDLASGRTLTAWRADERFPMMSTFKVVLCGAVLARVDAGDEQLERKIHYRQQDLVDYSPVSEKHLADGMTIGELCAAAITMSDNSAANLLLATVGGPAGLTAFLRQIGDNVTRLDRWETELNEALPGDARDTTTPASMAATLRKLLTSQRLSARSQRQLLQWMVDDRVAGPLIRSVLPAGWFIADKTGAGERGARGIVALLGPNNKAERIVVIYLRDTPASMAERNQQIAGIGAALIEHWQR
配列番号522:
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配列番号523:
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配列番号524:
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配列番号525:
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配列番号526:
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配列番号527:
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配列番号528:
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配列番号529:
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配列番号530:
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配列番号531:
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配列番号532:
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配列番号533:
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配列番号575:
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配列番号576:
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配列番号577:
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配列番号578:
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配列番号579:
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配列番号580:
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配列番号581:
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配列番号582:
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配列番号583:
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配列番号584:
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配列番号585:
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配列番号586:
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配列番号590:
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配列番号591:
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配列番号1909:
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配列番号1911:
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配列番号1913:
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配列番号1914:
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配列番号1915:
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配列番号1917:
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配列番号1918:
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配列番号1919:
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【0082】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号614〜配列番号711および配列番号2093〜配列番号2096の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0083】
臨床的対象欄内の2b、2br、2be、および2berの項目は、対応するペプチドにより検出することが可能となる、SHVβ−ラクタマーゼの機能的亜群に対応する。したがって、2beペプチドの検出は、ペニシリン、セファロリジンおよびセファロチンなどの第1世代のセファロスポリン、ならびにセフォタキシム、セフタジジムなどのオキシイミノ系β−ラクタムのクラス、またはアズトレオナムなどのモノバクタムに由来する少なくとも1つの抗生剤を加水分解することが可能な広域スペクトルを伴うβ−ラクタマーゼ(ESBL)の存在を示すことになる。
【0084】
SHVという項目は、第2b亜群、第2br亜群、および第2be亜群、または第2ber亜群のうちの少なくとも2つの間で共通なペプチドを示す。対応するペプチドは、SHVβ−ラクタマーゼの存在、ならびに少なくともペニシリンおよび第1世代のセファロスポリンに対する耐性の機構の存在を示す。
【0085】
SHVタンパク質により誘導される、ESBL(広域スペクトルのβ−ラクタマーゼ)によるセファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、
配列番号616、配列番号617、配列番号627、配列番号629、配列番号634、配列番号647、配列番号648、配列番号653、配列番号654、配列番号656、配列番号660、配列番号661、配列番号662、配列番号663、配列番号664、配列番号665、配列番号670、配列番号673、配列番号674、配列番号675、配列番号678、配列番号682、配列番号684、配列番号685、配列番号686、配列番号687、配列番号688、配列番号697、配列番号702、配列番号703、配列番号704、配列番号707、配列番号708、配列番号709、配列番号711、配列番号2095
の配列から選択される少なくとも1つの耐性マーキング2beペプチドの検出を特徴とする。
【0086】
FOXタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、FOXタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号712〜配列番号718および配列番号1920〜配列番号1922に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号712:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTAAVDGIIQPMLKAYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSQHAPWLKGSALDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDEVDSNDKMRTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMVNYAYGYSKEDKPVRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFAEANMGYQGDAAVKSAIALTHTGFYSVGDMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNAPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号713:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTAAVDGIIQPMLKAYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSQHAPWLKGSALDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDEVDSNDKMRTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMVNYAYGYSKEDKPVRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFAEANMGYQGDAAVKSAIALTHTGFYSVGDMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNAPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号14:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYARGEAPLTAAVDGIIQPMLKEYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSQHAPWLKGSAFDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDEVDSNDKMRTYYRHWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAIANYAYGYSKEDKPVRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFTEANMGYQGDAALKTRIALTHTGFYSVGDMTQGLGWESYAYPLTEQALLAGNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号715:
MQQRRALALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTAAVDGIIQPMLKEYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSHHAPWLKGSAFDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDEVDSNDKMQTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEKLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMANYAYGYSKEDKPIRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFVEANMGYQGDAALKSAIALTHTGFYSVGDMTQGLGWESYAYPVTEQALLAGNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号716:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTATVDGIIQPMLKEYRIPGIAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFVLDDKVSQHAPWLKGSALDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDKVDSNDKMQTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMANYAYGYSKEDKPIRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFAEANMGYQGDALVKSAIALTHTGFYSVGEMTQGLGWESYDYPVTEQVLLAGNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号717:
MQQRRALALLMLGSLLLAPCTYASGEAPLTATVDGIIQPMLKAYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSQHAPWLKGSAFDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDEVDSNDKMQTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMANYAYGYSKEDKPIRATPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFVEANMGYQGDAALKSAIALTHTGFHSVGEMTQGLGWESYDYPVTEQVLLAGNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号718:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYARGEAPLTAAVDGIIQPMLKEYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSQHAPWLKGSAFDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDEVDSNDKMRTYYRHWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAIANYAYGYSKEDKPVRATPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFTEANMGYQGDAALKSAIALTHTGFYSVGDMTQGLGWESYAYPLTEQALLAGNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号1920:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTATVDGIIQPMLKEYRIPGIAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFVLDDKVSQHAPWLKGSALDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDKVDSNDKMQTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMANYAYGYSKEDKPIRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFAEANMGYQGDALVKSAIALTHTGFYSVGEMTQGLGWESYDYPVTEQVLLAGNSPAVSLQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号1921:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTVTVDGIIQPMLKAYRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFELDDKVSQHAPWLKGSAFDGVTMAELATYSAGGLPLQFPEEVDSNDKMRTYYRSWSPVYPAGTHRQYANTSIGLFGYLAANSLGQSFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMANYAYGYSKEEKPIRVTPGMLAAEAYGIKTGSADLLKFAEANMGYQGDAAVKSAIALTHTGFYSVGDMTQGLGWESYDYPVTEQVLLADNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
配列番号1922:
MQQRRAFALLTLGSLLLAPCTYASGEAPLTATVDGIIQPMLKEYRIPGIAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGQRVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAAVKGGFVLDDKVSQHAPWLKGSALDGVTMAELATYSAGGLPLQFPDKVDSNDKMQTYYRSWSPVYPAGTHRQYSNPSIGLFGHLAANSLGQPFEQLMSQTLLPKLGLHHTYIQVPESAMANYAYGYSKEDKPIRVTPGVLAAEAYGIKTGSADLLKFAEANMGYQGDALVKSAIALTHTGFYSVGEMTQGLGWESYDYPVTEQVLLAGNSPAVSFQANPVTRFAVPKAMGEQRLYNKTGSTGGFGAYVAFVPARGIAIVMLANRNYPIEARVKAAHAILSQLAE
【0087】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号719〜配列番号733および配列番号2097〜配列番号2113の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0088】
ACCタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、ACCタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号736〜配列番号739に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号736:
MRKKMQNTLKLLSVITCLAATAQGAMAANIDESKIKDTVDGLIQPLMQKNNIPGMSVAVTIRGRNYIYNYGLAAKQPQQPVTENTLFEVGSLSKTFAAILASYAQASGKLSLEQSVSHYVPELRGSSFDHVSVLNVGTHTSGLQLFMPEDIKNTTQLMTYLKAWKPADAAGTHRVYSNIGTGLLGMIAAKSLGVSYEDAIEQTILPLLGMNQTYLKVPADQMENYAWGYNKKDEPVHVNMEILGNEAYGIKTTSSDLLRYVQANMGQLKLDGNAKIQHALTATHTGYFKSGEITQDLMWEQLPYPVSLPNLLTGNDMAMTKSVATPIVPPLPPQENVWINKTGSTNGFGAYIAFVPAKKMGIVMLANKNYSIDQRVTVAYKILSSLEVNK
配列番号737:
MRKKMQNTLKMLSVITCLALTAQGAMASEMDQAKIKDTVDSLIQPLMQKNNIPGMSVAVTLNGKNYIYNYGLASKQPQQPVTDNTLFEVGSLSKTFAATLASYAQVSGKLSLDKSISHYVPELRGSSFDHISVLNAGTHTTGLALFMPEEVKNTDQLMAYLKAWKPADPAGTHRVYSNIGTGLLGMIAAQSMGMTYEDAIEKTLLPKLGMTHTYLNVPADQAENYAWGYNKKNEPIHVNMEVLGNEAYGIRTNASDLIRYVQANMGQLKLDGNSTLQKALTDTHIGYFKSGKITQDLMWEQLPYPVSLPDLLTGNDMAMTKSVATPIVPPLPPQENVWINKTGSTNGFGAYIAFVPAKKMGIVMLANKNYSIDQRVT
配列番号738:
MQNTLKLLSVITCLAATVQGALAANIDESKIKDTVDDLIQPLMQKNNIPGMSVAVTVNGKNYIYNYGLAAKQPQQPVTENTLFEVGSLSKTFAATLASYAQVSGKLSLDQSVSHYVPELRGSSFDHVSVLNVGTHTSGLQLFMPEDIKNTTQLMAYLKAWKPADAAGTHRVYSNIGTGLLGMIAAKSLGVSYEDAIEKTLLPQLGMHHSYLKVPADQMENYAWGYNKKDEPVHGNMEILGNEAYGIKTTSSDLLRYVQANMGQLKLDANAKMQQALTATHTGYFKSGEITQDLMWEQLPYPVSLPNLLTGNDMAMTKSVATPIVPPLPPQENVWINKTGSTNGFGAYIAFVPAKKMGIVMLANKNYSIDQRVTVAYKILSSLEGNK
配列番号739:
MQNTLKLLSVITCLAATVQGALAANIDESKIKDTVDDLIQPLMQKNNIPGMSVAVTVNGKNYIYNYGLAAKQPQQPVTENTLFEVGSLSKTFAATLASYAQVSGKLSLDQSVSHYVPELRGSSFDHVSVLNVGTHTSGLQLFMPEDIKNTTQLMAYLKAWKPADAAGTHRVYSNIGTGLLGMIAAKSLGVSYEDAIEKTLLPQLGMHHSYLKVPADQMENYAWGYNKKDEPVHVNMEILGNEAYGIKTTSSDLLRYVQANMGQLKLDANAKMQQALTATHTGYFKSGEITQDLMWEQLPYPVSLPNLLTGNDMAMTKSVATPIVPPLPPQENVWINKTGSTNGFGAYIAFVPAKKMGIVMLANKNYSIDQRVTVAYKILSSLEGNK
【0089】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号740〜配列番号787の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0090】
ACTタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、ACTタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号788〜配列番号794に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号788:
MMMTKSLCCALLLSTSCSVLATPMSEKQLAEVVERTVTPLMKAQAIPGMAVAVIYEGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLGDPVTKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVKDNASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAITTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVQDMASWVMVNMKPDSLQDNSLRKGLTLAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVEGSDNKVALAPLPAREVNPPAPPVNASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILSAL
配列番号789:
MMMTKSLCCALLLSTSCSVLATPMSEKQLAEVVERTVTPLMKAQAIPGMAVAVIYEGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLGDPVTKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDNASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAITTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAIHVSPGMLDAEAYGVKTNVQDMASWVMVNMKPDSLQDNSLRKGLTLAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVEGSDNKVALAPLPAREVNPPAPPVNASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILSAL
配列番号790:
MMTKSLCCALLLSTSCSVLAAPMSEKQLAEVVERTVTPLMKAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLGDPVTKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVADNASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANTSIGLFGALAVKPSGMSYEQAITTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVQDMASWVMVNMKPDSLQDNSLRQGIALAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVEGSDNKVALAPLPAREVNPPAPPVNASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILSAL
配列番号791:
MMTKSLCCALLLSTSCSVLAAPMSEKQLAEVVERTVTPLMKAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLGDPVTKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDNASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAITTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVKDMANWVMVNMKPDSLQDSSLKEGITLAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVEGSDNKVALAPLPAREVNPPAPPVNASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILDALQ
配列番号792:
MMRKSLCCALLLGISCSALATPVSEKQLAEVVANTVTPLMKAQSVPGMAVAVIYQGKPHYYTFGKADIAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLDDPVTRYWPQLTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDNASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMPYEQAMTTRVLKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAVRVSPGMLDAQAYGVKTNVQDMANWVMANMAPENVADASLKQGIALAQSRYWRIGSMYQGLGWEMLNWPVEANTVVEGSDSKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQIGIVMLANTSYPNPARVEAAYHILEALQ
配列番号793:
MMKKSLCCALLLGISCSALAAPVSEKQLAEVVANTVTPLMKAQSIPGMAVAVIYQGKPHYYTFGKADIAASKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLDDPVTRYWPQLTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDNAALLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMPFEQAMTTRVLKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAVRVSPGMLDAQAYGMKTNVQDMANWVMANMAPENVADASLKQGISLAQSRYWRIGSMYQGLGWEMLNWPVEANTVIEGSDSKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQIGIVMLANKSYPNPARVEAAYPILDALQ
配列番号794:
MMMTKSLCCALLLSTSCSVLATPMSEKQLAEVVERTVTPLMKAQAIPGMAVAVIYEGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEISLGDPVTKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDNASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAITTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYRDGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVQDMASWVMVNMKPDSLQDNSLRKGLTLAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVEGSDNKVALAPLPAREVNPPAPPVNASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILSAL
【0091】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号795〜配列番号841の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0092】
CARBタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、CARBタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号842〜配列番号852に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号842:
MLLYKMCDNQNYGVTYMKFLLAFSLLIPSVVFASSSKFQQVEQDVKAIEVSLSARIGVSVLDTQNGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGKVNPNSTVEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNTAANIILSAVGGPKGVTDFLRQIGDKETRLDRIEPDLNEGKLGDLRDTTTPKAIASTLNKFLFGSALSEMNQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPAGWNIADRSGAGGFGARSITAVVWSEHQAPIIVSIYLAQTQASMAERNDAIVKIGHSIFDVYTSQSR
配列番号843:
MLLYKMCDNQNYGVTYMKFLLAFSLLIPSVVFASSSKFQQVEQDVKAIEVSLSARIGVSVLDTQNGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGKVNPNSTVEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNTAANIILSAVGGPKGVTDFLRQIGDKETRLDRIEPDLNEGKLGDLRDTTTPKAIASTLNKLLFGSALSEMNQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPAGWNIADRSGAGGFGARSITAVVWSEHQAPIIVSIYLAQTQASMAERNDAIVKIGHSIFDVYTSQSR
配列番号844:
MKLLLVFSLLIPSMVFANSSKFQQVEQDAKVIEASLSAHIGISVLDTQTGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGEINPKSTIEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNAAANIILNALGGPESVTDFLRQIGDKETRLDRIEPELNEGKLGDLRDTTTPNAIVNTLNELLFGSTLSQDGQKKLEYWMVNNQVTGNLLRSVLPEGWNIADRSGAGGFGARSITAVVWSEAQSPIIVSIYLAQTEASIADRNDAIVKIGRSIFEVYSSQSR
配列番号845:
MKFLLAFSLLIPSVVFASSSKFQQVEQDVKAIEVSLSARIGVSVLDTQNGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGKVNPNSTVEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNTAANIILSAVGGPKGVTDFLRQIGDKETRLDRIEPDLNEGKLGDLRDTTTPKAIASTLNQLLFGSTLSEASQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPVKWSIADRSGAGGFGARSITAIVWSEEKKTIIVSIYLAQTEASMAERNDAIVKIGRSIFEVYTSQSR
配列番号846:
MNVRKHKASFFSVVITFLCLTLSLNANATDSVLEAVTNAETELGARIGLAVHDLETGKRWEHKSNERFPLSSTFKTLACANVLQRVDLGKERIDRVVRFSESNLVTYSPVTEKHVGKKGMSLAELCQATLSTSDNSAANFILQAIGGPKALTKFLRSIGDDTTRLDRWETELNEAVPGDKRDTTTPIAMVTTLEKLLIDETLSIKSRQQLESWLKGNEVGDALFRKGVPSDWIVADRTGAGGYGSRAITAVMWPPNRKPIVAALYITETDASFEERNAVIAKIGEQIAKTVLMENSRN
配列番号847:
MKFLLAFSLLIPSVVFASSSKFQQVEQDVKAIEVSLSARIGVSVLDTQNGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGKVNSNSTVEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNTAANIILSAVGGPKGVTDFLRQIGDKETRLDRIEPDLNEGKLGDLRDTTTPKAIASTLNKFLFGSALSEMNQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPAGWNIADRSGAGGFGARSITAVVWSEHQAPIIVSIYLAQTQASMAERNDAIVKIGHSIFDVYTSQSR
配列番号848:
MKFLLAFSLLIPSVVFASSSKFQQVEQDVKAIEVSLSARIGVSVLDTQNGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGKVNPNSTVEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNTAANIILSAVGGPKGVTDFLRQIGDKETRLDRIEPDLNEGKLGDLRDTTTPKAIASTLNKFLFGSALSEMNQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPAGWNIADRSGAGGFGARSITAVVWSEHQAPIIVSIYLAQTQASMEERNDAIVKIGHSIFDVYTSQSR
配列番号849:
MKSLLVFALLMPSVVFASSSKFQSVEQEIKGIESSLSARIGVAILDTQNGESWDYNGDQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEHGKVNLNSTVEIKKADLVTYSPVLEKQVGKPITLSDACLATMTTSDNTAANIVINAVGDPKSITDFLRQIGDKETRLDRVEPELNEGKLGDLRDTTTPNAITSTLNQLLFGSTLSEASQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPVKWSIADRSGAGGFGARSITAIVWSEEKKPIIVSIYLAQTEASMAERNDAIVKIGRSIFEVYTSQSR
配列番号850:
MDVRKHKASFFSVVITFLCLTLSLNANATDSVLEAVTNAETELGARIGLAVHDLETGKRWEHKSNERFPLSSTFKTLACANVLQRVDLGKERIDRVVRFSESNLVTYSPVTEKHVGKKGMSLAELCQATLSTSDNSAANFILQAIGGPKALTKFLRSIGDDTTRLDRWETELNEAVPGDKRDTTTPIAMVTTLEKLLIDETLSIKSRQQLESWLKGNEVGDALFRKGVPSDWIVADRTGAGGYGSRAITAVMWPPNRKPIVAALYITETDASFEERNAVIAKIGEQIAKTILMENSRN
配列番号851:
MKSLLVFALLMPSVVFASSSKFQSVEQEIKGIESSLSARIGVAILDTQNGESWDYNGDQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEHGKVNLNSTVEVKKADLVTYSPVLEKQVGKPITLSDACFATMTTSDNTAANIVINAVGDPKSITDFLRQIGDKETRLDRVEPELNEGKLGDLRDTTTPNAITSTLNQLLFGSTLSEASQKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPVTWSIADRSGAGGFGARSITAIVWSEEKKPIIVSIYLAQTEASMAERNDAIVKIGRSIFEVYTSQSR
配列番号852:
MKFLLVFSLLIPSVVFASSSKFRQVEQDVKAIEVSLSARIGVSVLDTQNGEYWDYNGNQRFPLTSTFKTIACAKLLYDAEQGKVNPNSTVEIKKADLVTYSPVIEKQVGQAITLDDACFATMTTSDNTAANIILSAVGGSKGVTDFLRQIGDKETRLDRIEPDLNEGKLGDLRDTTTPKAIASTLNKFLFGSALSEMNKKKLESWMVNNQVTGNLLRSVLPAGWNIADRSGAGGFGARSITAVVWSEHQAPIIVSIYLAQTQASMAERNDAIVKIGRSIFDVYTSQSR
【0093】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号853〜配列番号921の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0094】
DHAタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、DHAタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号922〜配列番号927に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号922:
MKKSLSATLISALLAFSAPGFSAADNVAAVVDSTIKPLMAQQDIPGMAVAVSVKGKPYYFNYGFADVQAKQPVTENTLFELGSVSKTFTGVLGAVSVAKKEMMLNDPAEKYQPELALPQWKGITLLDLATYTTGGLPLQVPDAVKNRAELLHFYQQWQPSRKPGDMRLYANSSIGLFGALTANAAGMPYEQLLTARILAPLGLSHTFITVPESAQSQYAYGYKNKKPVRVSPGQLDAESYGVKSASKDMLRWAEMNMEPSRAGNADLEMAMYLAQTRYYKTAAINQGLGWEMYDWPQQKDMIINGVTNEVALQPHPVTDNQVQPYNRASWVHKTGATTGFGAYVAFIPEKQVAIVILANKNYPNTERVKAAQAILSALE
配列番号923:
MKKSLSATLISALLAFSAPGFSAADNVAAVVDSTIKPLMAQQDIPGMAVAVSVKGKPYYFNYGFADIQAKQPVTENTLFELGSVSKTFTGVLGAVSVAKKEMALNDPAAKYQPELALPQWKGITLLDLATYTAGGLPLQVPDAVKSRADLLNFYQQWQPSRKPGDMRLYANSSIGLFGALTANAAGMPYEQLLTARILAPLGLSHTFITVPDSAQSQYAYGYKNKKPVRVSPGQLDAESYGVKSASKDMLRWAEMNIEPSRAGNADLEMAMYLAQTRYYKTAAINQGLGWEMYDWPQQKDMIINGVTNEVALQPHPVTDNQVQPYNRASWVHKTGATTGFGAYVAFIPEKQVAIVILANKNYPNTERVKAAQAILSALE
配列番号924:
MKKSLSATLISALLAFSAPGFSAADNVAAVVDSTIKPLMAQQDIPGMAVAVSVKGKPYYFNYGFADIQAKQPVTENTLFELGSVSKTFTGVLGAVSVAKKEMALNDPAAKYQPELALPQWKGITLLDLATYTAGGLPLQVPDAVKSRADLLNFYQQWQPSRKPGDMRLYANSSIGLFGALTANAAGMPYEQLLTARILAPLGLSHTFITVPESAQSQYAYGYKNKKPVRVSPGQLDAESYGVKSASKDMLRWAEMNMEPSRAGNADLEMAMYLAQTRYYKTAAINQGLGWEMYDWPQQKDMIINGVTNEVALQPHPVTDNQVQPYNRASWVHKTGATTGSGAYVAFIPEKQVAIVILANKNYPNTERVKAAQAILSALE
配列番号925:
MKKSLSATLISALLAFSAPGFSAADNVAAVVDSTIKPLMAQQDIPGMAVAVSVKGKPYYFNYGFADIQAKQPVTENTLFELGSVSKTFTGVLGAVSVAKKEMALNDPAAKYQPELALPQWKGITLLDLATYTAGGLPLQVPDAVKSRADLLNFYQQWQPSRKPGDMRLYANSSIGLFGALTANAAGMPYEQLLTARILAPLGLSHTFITVPESAQSQYAYGYKNKKPVRVSPGQLDAESYGVKSTSKDMLRWAEMNMEPSRAGNADLEMAMYLAQTRYYKTAAINQGLGWEMYDWPQQKDMIINGVTNEVALQPHPVTDNQVQPYNRASWVHKTGATTGFGAYVAFIPEKQVAIVILANKNYPNTERVKAAQAILSALE
配列番号926:
MKKSLSATLISALLAFSAPGFSAADNVAAVVDSTIKPLMAQQDIPGMAVAVSVKGRPYYFNYGFADVQAKQPVTENTLFELGSVSKTFTGVLGAVSVAKKEMALNDPAAKYQPELALPQWKGITLLDLATYTAGGLPLQVPDAVKSRADLLHFYQQWQPSRKPGDMRLYANSSIGLFGALTANAAGMPYEQLLTARILAPLGLSHTFITVPESAQSQYAYGYKNKKPVRVSPGQLDAESYGVKSASKDMLRWAEMNMEPSRAGNADLEMAMYLAQTRYYKTAAINQGLGWEMYDWPQQKDMIINGVTNEVALQPHPVTDNQVQPYNRASWVHKTGATTGFGAYVAFIPEKQVAIVILANKNYPNTERVKAAQAILSALE
配列番号927:
MKKSLSATLISALLAFSAPGFSAADNVAAVVDSTIKPLMAQQDIPGMAVAVSVKGKPYYFNYGFADIQAKQPVTENTLFELGSVSKTFTGVLGAVSVAKKEMALNDPAAKYQPELALPQWKGITLLDLATYTAGGLPLQVPDAVKSRADLLNFYQQWQPSRKPGDMRLYANSSIGLFGALTANAAGMPYEQLLTARILAPLGLSHTFITVPESAQSQYAYGYKNKKPVRVSPGQLDAESYGVKSASKDMLRWAEMNMEPSRAGNADLEMAMYLAQTRYYKTAAINQGLGWEMYDWPQQKDMIINGVTNEVALQPHPVTDNQVQPYNRASWVHKTGATTGFGAYVAFIPEKQVAIVILANKNYPNTERVKAAQAILSALE
【0095】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号928〜配列番号948の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0096】
MIRタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、MIRタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号949〜配列番号953に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号949:
MMTKSLSCALLLSVASSAFAAPMSEKQLAEVVERTVTPLMNAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEIALGDPVAKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDTASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAMTTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHFAWGYREGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVKDMASWLIANMKPDSLQAPSLKQGIALAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVGGSDNKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILDALQ
配列番号950:
MMTKSLSCALLLSVASAAFAAPMSETQLAEVVERTVTPLMNAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEIALGDPVAKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDTASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAMTTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYREGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVKDMASWVIANMKPDSLQAPSLKQGIALAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVGGSDNKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYHILDALQ
配列番号951:
MMTKSLSCALLLSVASAAFAAPMSEKQLAEVVERTVTPLMNAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEIALGDPVAKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDTASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAMTTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYREGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVKDMASWLIANMKPDSLHAPSLKQGIALAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVGGSDNKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILDALQ
配列番号952:
MMTKSLSCALLLSVASAAFAAPMFEKQLAEVVERTVTPLMNAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEIALGDPVAKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDTASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAMTTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYREGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVKDMASWLIANMKPDSLHAPSLKQGIALAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVGGSDNKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILDALQ
配列番号953:
MMTKSLSCALLLSVASSAFAAPMSEKQLAEVVERTVTPLMNAQAIPGMAVAVIYQGQPHYFTFGKADVAANKPVTPQTLFELGSISKTFTGVLGGDAIARGEIALGDPVAKYWPELTGKQWQGIRMLDLATYTAGGLPLQVPDEVTDTASLLRFYQNWQPQWKPGTTRLYANASIGLFGALAVKPSGMSYEQAMTTRVFKPLKLDHTWINVPKAEEAHYAWGYREGKAVHVSPGMLDAEAYGVKTNVKDMASWLIANMKPDSLQAPSLKQGIALAQSRYWRVGAMYQGLGWEMLNWPVDAKTVVGGSDNKVALAPLPVAEVNPPAPPVKASWVHKTGSTGGFGSYVAFIPEKQLGIVMLANKSYPNPARVEAAYRILDALQ
【0097】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号954〜配列番号981の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0098】
MOXタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、MOXタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号982〜配列番号988に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号982:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGETSPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVADRERAVGVSEQTLFEIGSVSKPLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSLEKMQAYYRQWTPAYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAQLMEQTLLPGLGLHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVSPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANISGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWERYAYPVSEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQMLFNKTGSTSGFGAYVAFVPAKGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILTQLAR
配列番号983:
MQQRQSILWGALATLMWAGLAHAGDTSAVDPLRPVVDASIRPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVADRERAVGVSEQTLFEIGSVSKPLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSLEKMQAYYRQWTPAYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSMKQPFAQLMEQTLLPGLGLHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVSPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANISGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVSEQTLLAGNSAEVILEANPTAAPRESGNLMLFNKTGSTSGFGAYVAFVPAKGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILTQLAR
配列番号984:
MQQRQSILWGALATLMWAGLAHAGDKAATDPLRPVVDASIRPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVADRERAVGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVQGGFELDDKASLFAPWLKGSAFDNITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSLEKMQAYYRQWTPAYSRGSHRQYANPSIGLFGYLAASSMKQPFDRLMEQTMLPGLGLYHTYLNVPEQPMGHYAYGYWKEDKPFRVTPAMLAEEPYGIKTSSADLLRFVKANISGVDNAAMQQAIDLTHQGQYAVGEMTQGLGWERYPYPVSEQTLLAGNSPAMIYNANPAAPAPAAAGHPVLFKKTGSTNGFGAYVAFVPAKGIGVVMLANRNYPNEGTLKAGHAILTQLAR
配列番号985:
MQQRQSILWGVLPTLMWAGLAHAGDRAATDPLRPVVDASIRPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVADRERAVGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVQGSFELDDKASLFAPWLKGSVFDNITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSLEKMQAYYRQWTPAYSPGSHRQYANPSIGLFGYLAASSMKQPFDRLMEQTILPGLGLYHTYLNVPEQAMGHYAYGYSKEDKPIRVTPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANISGVDNAAMQQAIDLTHQGQYAVGEMTQGLGWERYAYPVSEQTLLAGNSAAMIYNANPAAPAPAARGHPVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPAKGIGIVMLANRNSPIEGTLKAGHAILTQLAR
配列番号986:
MQQRQSILWGALATLMWAGLVHAGDKAATDPLRPVVDASIRPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVADRERAVGVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVQGSFELDDKASLFAPWLKGSVFDNITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSLEKMQAYYRQWTPAYSPGSHRQYANPSIGLFGYLAASSMKQPFDRLMEQTMLPGLGLYHTYLTVPEQAMGHYAYGYSKEDKPIRVTPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANIGGVDNAAMQQAIDLTHQGQYAVGEMTQGLGWERYAYPVSEQTLLAGNSPAMIYNAIPAVPAPAAAGHPVLFNKTGSTNGFGAYVAFVPAKGIGIVMLANRNSPIEARIKAAHAILTQLAR
配列番号987:
MQQRQSILWGAVATLMWAGLAHAGEASPVDPLRPVVDASIQPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVANRESGASVSEQTLFEIGSVSKTLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSVFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSSEKMRAYYRQWAPVYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSLKQPFAQLMEQTLLPGLGMHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVNPGMLADEAYGIKTSSADLLAFVKANIGGVDDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVTEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQVLFNKTGSSNGFGAYVAFVPARGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILAQLAG
配列番号988:
MQQRQSILWGALATLMWAGLAHAGETSPVDPLRPVVDASIRPLLKEHRIPGMAVAVLKDGKAHYFNYGVADRERAVGVSEQTLFEIGSVSKPLTATLGAYAVVKGAMQLDDKASRHAPWLKGSAFDSITMGELATYSAGGLPLQFPEEVDSLEKMQAYYRQWTPAYSPGSHRQYSNPSIGLFGHLAASSMKQPFAQLMEQTLLPGLGLHHTYVNVPKQAMASYAYGYSKEDKPIRVSPGMLADEAYGIKTSSADLLRFVKANISGVHDKALQQAISLTHKGHYSVGGMTQGLGWESYAYPVSEQTLLAGNSAKVILEANPTAAPRESGSQMLFNKTGSTSGFGAYVAFVPAKGIGIVMLANRNYPIPARVKAAHAILTQLAR
【0099】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号989〜配列番号1037の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0100】
PERタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、PERタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号1038〜配列番号1044に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号1038:
MNVIIKAVVTASTLLMVSFSSFETSAQSPLLKEQIESIVIGKKATVGVAVWGPDDLEPLLINPFEKFPMQSVFKLHLAMLVLHQVDQGKLDLNQTVIVNRAKVLQNTWAPIMKAYQGDEFSVPVQQLLQYSVSLSDNVACDLLFELVGGPAALHDYIQSMGIKETAVVANEAQMHADDQVQYQNWTSMKGAAEILKKFEQKTQLSETSQALLWKWMVETTTGPERLKGLLPAGTVVAHKTGTSGIKAGKTAATNDLGIILLPDGRPLLVAVFVKDSAESSRTNEAIIAQVAQTAYQFELKKLSALSPN
配列番号1039:
MNVIIKAVVTASTLLMVSFSSFETSAQSPLLKEQIESIVIGKKATVGVAVWGPDDLEPLLINPFEKFPMQSVFKLHLAMLVLHQVDQGKLDLNQTVIVNRAKVLQNTWAPIMKAYQGDEFSVPVQQLLQYSVSHTDNVACDLLFELVGGPAALHDYIQSMGIKETAVVANEAQMHADDQVQYQNWTSMKGAAEILKKFEQKTQLSETSQALLWKWMVETTTGPERLKGLLPAGTVVAHKTGTSGIKAGKTAATNDLGIILLPDGRPLLVAVFVKDSAESSRTNEAIIAQVAQTAYQFELKKLSALSPN
配列番号1040:
MNVIIKAVVTASTLLMVSFSSFETSAQSPLLKGQIESIVIGKKATVGVAVWGPDDLEPLLINPFEKFPMQSVFKLHLAMLVLHQVDQGKLDLNQTVIVNRAKVLQNTWAPIMKAYQGDEFSVPVQQLLQYSVSHSDNVACDLLFELVGGPAALHDYIQSMGIKETAVVANEAQMHADDQVQYQNWTSMKGAAEILKKFEQKTQLSETSQALLWKWMVETTTGPERLKGLLPAGTVVAHKTGTSGIKAGKTAATNDLGIILLPDGRPLLVAVFVKDSAESSRTNEAIIAQVAQTAYQFELKKLSALSPN
配列番号1041:
MNVIAKGVFTTTALLMLSLSSWVVSAQSPLLKEQIETIVTGKKATVGVAVWGPDDLEPLLVNPFEKFPMQSVFKMHLAMLVLHQVDQGKLDLNKTVAVNRAAVLQNTWSPMMKDHQGDEFTVTVQQLLQYSVSHSDNVACDLLFELVGGPAALHAYIQSLGIKETEVVANEAQMHADDQVQYKNWTSMKAAAQLLRKFEQKKQLSETSQALLWKWMVETTTGPQRLKGLLPAGTVVAHKTGTSGVRAGKTAATNDIGVIMLPDGRPLLVAVFVKDSAESARTNEAIIAQVAQAAYQFELKKLSAVSPD
配列番号1042:
MNVIIKAVVTASTLLMVSFSSFETSAQSPLLKEQIESIVIGKKATVGVAVWGPDDLEPLLINPFEKFPMQSVFKLHLAMLVLHQVDQGKLDLNQTVIVNRAKVLQNTWAPIMKAYQGDQFSVPVQQLLQYSVSHSDNVACDLLFELVGGPAALHDYIQSMGIKETAVVANEAQMHADDQVQYQNWTSMKGAAEILKKFEQKTQLSETSQALLWKWMVETTTGPERLKGLLPAGTVVAHKTGTSGVRAGKTAATNDLGIILLPDGRPLLVAVFVKDSAESSRTNEAIIAQVAQAAYQFELKKLSALSPN
配列番号1043:
MNVITKCVFTASALLMLGLSSFVVSAQSPLLKEQIETIVTGKKATVGVAVWGPDDLEPLLLNPFEKFPMQSVFKLHLAMLVLHQVDQGKLDLNQSVTVNRAAVLQNTWSPMMKDHQGDEFTVAVQQLLQYSVSHSDNVACDLLFELVGGPQALHAYIQSLGVKEAAVVANEAQMHADDQVQYQNWTSMKAAAQVLQKFEQKKQLSETSQALLWKWMVETTTGPQRLKGLLPAGTIVAHKTGTSGVRAGKTAATNDAGVIMLPDGRPLLVAVFVKDSAESERTNEAIIAQVAQAAYQFELKKLSAVSPD
配列番号1044:
MNVIIKAVVTASTLLMVSFSSFETSAQSPLLKEQIESIVIGKKATVGVAVWGPDDLEPLLINPFEKFPMQSVFKLHLAMLVLHQVDQGKLDLNQTVIVNRAKVLQNTWAPIMKAYQGDEFSVPVQQLLQYSVSHSDNVACDLLFELVGGPAALHDYIQSMGIKETAVVANEAQMHADDQVQYQNWTSMKGAAEILKKFEQKTQLSETSQALLWKWMVETTTGPERLKGLLPAGTVVAHKTGTSGIKAGKTAATNDLGIILLPDGRPLLVAVFVKDSAESSRTNEAIIAQVAQTAYQFELKKLSALSPN
【0101】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号1045〜配列番号1077の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0102】
PERタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、ESBL耐性を示す。配列番号1045〜配列番号1065および配列番号1069〜配列番号1077を一助として検出することが好ましい。
【0103】
VEBタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、VEBタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号1078〜配列番号1084に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号1078:
MKIVKRILLVLLSLFFTIVYSNAQTDNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTLKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKTWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGIAAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
配列番号1079:
MKIVKRILLVLLSLFFTIVYSNAQADNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTLKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKTWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGIAAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
配列番号1080:
MKIVKRILLVLLSLFFTVVYSNAQTDNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTFKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKTWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGIAAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
配列番号1081:
MKIVKRILLVLLSLFFTIVYSNAQADNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTLKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKMWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGIAAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
配列番号1082:
MKIVKRILLVLLSLFFTVEYSNAQTDNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTLKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKMWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGIAAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
配列番号1083:
MKIVKRILLVLLSLFFTVVYSNAQADNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTLKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKMWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGIAAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
配列番号1084:
MKIVKRILLVLLSLFFTVEYSNAQTDNLTLKIENVLKAKNARIGVAIFNSNEKDTLKINNDFHFPMQSVMKFPIALAVLSEIDKGNLSFEQKIEITPQDLLPKTWSPIKEEFPNGTTLTIEQILNYTVSESDNIGCDILLKLIGGTDSVQKFLNANHFTDISIKANEEQMHKDWNTQYQNWATPTAMNKLLIDTYNNKNQLLSKKSYDFIWKIMRETTTGSNRLKGQLPKNTIVAHKTGTSGINNGITAATNDVGVITLPNGQLIFISVFVAESKETSEINEKIISDIAKITWNYYLNK
【0104】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号1085〜配列番号1104の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0105】
VEBタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、ESBL耐性を示す。
【0106】
OXAタンパク質の発現により誘導される、セファロスポリンまたはカルバペネムに対する耐性の機構の検出は、OXAタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号1105〜配列番号1266に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号1105:
MSRLLLSGLLATGLLCAVPASAASGCFLYADGNGQTLSSEGDCSSQLPPASTFKIPLALMGYDSGFLVNEEHPALPYKPSYDGWLPAWRETTTPRRWETYSVVWFSQQITEWLGMERFQQYVDRFDYGNRDLSGNPGKHDGLTQAWLSSSLAISPEEQARFLGKMVSGKLPVSAQTLQYTANILKVSEVEGWQIHGKTGMGYPKKLDGSLNRDQQIGWFVGWASKPGKQLIFVHTVVQKPGKQFASIKAKEEVLAALPAQLKKL
配列番号1106:
IACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEDQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1107:
MKKILLLHMLVFVSATLPISSVASDEVETLKCTIIADAITGNTLYETGECARRVSPCSSFKLPLAIMGFDSGILQSPKSPTWELKPEYNPSPRDRTYKQVYPALWQSDSVVWFSQQLTSRLGVDRFTEYVKKFEYGNQDVSGDSGKHNGLTQSWLMSSLTISPKEQIQFLLRFVAHKLPVSEAAYDMAYATIPQYQAAEGWAVHGKSGSGWLRDNNGKINESRPQGWFVGWAEKNGRQVVFARLEIGKEKSDIPGGSKAREDILVELPVLMGNK
配列番号1108:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNAGPSTSNGDYWIEGSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1109:
MQRSLSMSGKRHFIFAVSFVISTVCLTFSPANAAQKLSCTLVIDEASGDLLHREGSCDKAFAPMSTFKLPLAIMGYDADILLDATTPRWDYKPEFNGYKSQQKPTDPTIWLKDSIVWYSQELTRRLGESRFSDYVQRFDYGNKDVSGDPGKHNGLTHAWLASSLKISPEEQVRFLRRFLRGELPVSEDALEMTKAVVPHFEAGDWDVQGKTGTGSLSDAKGGKAPIGWFIGWATRDDRRVVFARLTVGARKGEQPAGPAARDEFLNTLPALSENF
配列番号1110:
MKTFAAYVIIACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1111:
IACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQITREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEDQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1112:
IACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPASTFKIPSAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1113:
MIIRFLALLFSAVVLVSLGHAQEKTHESSNWGKYFSDFNAKGTIVVVDERTNGNSTSVYNESRAQQRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFHVFRWDGAKRSFAGHNQDQNLRSAMRNSTVWVYQLFAKEIGENKARSYLEKLNYGNADPSTKSGDYWIDGNLAISANEQISILKKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAKRDWILRAKTGWDGQMGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRMEDLHKREAIARAILQSVNALPPN
配列番号1114:
MAIRIFAILFSTFVFGTFAHAQEGMRERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQTDRVILVFDQVRSEKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAARDEFQVFRWDGIKRSFAAHNQDQDLRSAMRNSTVWIYELFAKEIGEDKARRYLKQIDYGNADPSTSNGDYWIDGNLAIAAQEQIAFLRKLYHNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRIGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1115:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPSAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1116:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEDQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1117:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFGLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1118:
MKNTIHINFAIFLIIANIIYSSASASTDISTVASPLFEGTEGCFLLYDASTNAEIAQFNKAKCATQMAPDSTFKIALSLMAFDAEIIDQKTIFKWDKTPKGMEIWNSNHTPKTWMQFSVVWVSQEITQKIGLNKIKNYLKDFDYGNQDFSGDKERNNGLTEAWLESSLKISPEEQIQFLRKIINHNLPVKNSAIENTIENMYLQDLDNSTKLYGKTGAGFTANRTLQNGWFEGFIISKSGHKYVFVSALTGNLGSNLTSSIKAKKNAITILNTLNL
配列番号1119:
ANIIYSSASASTDISTVASPLFEGTEGCFLLYDVSTNAEIAQFNKAKCATQMAPDSTFKIALSLMAFDAEIIDQKTIFKWDKTPKGMEIWNSNHTPKTWMQFSVVWVSQEITQKIGLNKIKNYLKDFDYGNQDFSGDKERNNGLTEAWLESSLKISPEEQIQFLRKIINHNLPVKNSAIENTIENMYLQDLENSTKLYGKTGAGFTANRTLQNGWFEGFIISKSGHKYVFVSALTGNLGSNLTSSIKAKKNAITIL
配列番号1120:
IFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNAYPSTSNGDYWIEGSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAIL
配列番号1121:
MIIRFLALLFSAVVLVSLGHAQDKTHESSNWGKYFSDFNAKGTIVVVDERTNGNSTSVYNESRAQQRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFHVFRWDGAKRSFAGHNQDQNLRSAMRNSTVWVYQLFAKEIGENKARSYLEKLNYGNADPSTKSGDYWIDGNLAISANEQISILKKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAKRDWILRAKTGWDGQMGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRMEDLHKREAIARAILQSVNALPPN
配列番号1122:
MKKFILPIFSISILVSLSACSSIKTKSEDNFHISSQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNLSTYGNALARANKEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRTYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQELARRTGLELMQKEVKRVNFGNTNIGTQVDNFWLVGPLKITPVQEVNFADDLAHNRLPFKLETQEEVEKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMGVTPQVGWLTGWVEQANGKKIPFSLNLEMKEGMSGSIRNEITYKLLENLGII
配列番号1123:
MKKFILPIFSISILVSLSACSSIKTKSEDNFHISSQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNLSTYGNALARANKEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRTYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQELARRTGLELMQKEVKRVNFGNTNIGTQVDNFWLVGPLKITPVQEVNFADDLAHNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMGVTPQVGWLTGWVEQANGKKIPFSLNLEMKEGMTGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1124:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKADINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALKMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1125:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNADPSTSNGDYCIEGSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAIL
配列番号1126:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1127:
MAIRFLTILLSTFFLTSFVHAQEHVLERSDWKKFFSDLRAEGAIVISDERQAEHALLVFGQERAAKRYSPASTFKLPHTLFALDADAVRDEFQVFRWDGVKRSFAGHNQDQDLRSAMRNSAVWVYELFAKEIGKDKARHYLKQIDYGNADPSTIKGDYWIDGNLEISAHEQISFLRKLYRNQLPFQVEHQRLVKDLMITEAGRNWILRAKTGWEGRFGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRTDDLFKREAIARAILRSIDALPPN
配列番号1128:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNADPSTSNGDYWIEGSIAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1129:
MKKFILPIFSISILVSLSACSSIKTKSEDNFHISSQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNLSTYGNALARANKEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRTYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQELARRTGLELMQKEVKRVNFGNTNIGTQVDNFWLVGPLKITPVQEVNFADDLAHNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMGVTPQVGWLTGWVEQANGKKIPFSLNLEMKEGMSGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1130:
MAIRFLTILLSTFFLTSFVHAQEHVLERSDWKKFFSDLRAEGAIVISDERQAEHALLVFGQERAAKRYSPASTFKLPHTLFALDADAVRDEFQVFRWDGVKRSFAGHNQDQDLRSAMRNSAVWVYELFAKEIGEDKARRYLKQIDYGNADPSTIKGDYWIDGNLEISAHEQISFLRKLYRNQLPFQVEHQRLVKDLMITEAGRNWILRAKTGWEGRFGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRTDDLFKREAIARAILRSIDALPPN
配列番号1131:
MAIRFFTILLSTFFLTSFVYAQEHVVIRSDWKKFFSDLQAEGAIVIADERQAKHTLSVFDQERAAKRYSPASTFKIPHTLFALDADAVRDEFQVFRWDGVNRSFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKDIGEDKARRYLKQIDYGNVDPSTIKGDYWIDGNLKISAHEQILFLRKLYRNQLPFKVEHQRLVKDLMITEAGRSWILRAKTGWEGRFGWWVGWIEWPTGPVFFALNIDTPNRTDDLFKREAIARAILRSIDALPPN
配列番号1132:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVERIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1133:
MAIQIFAILFSTFVLATFAHAQDGTLERSDWGKFFSDFQAKGTIVVADERQADHAILVFDQARSMKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVKRSFAGHNKDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDGKARRYLKQIGYGNADPSTSHGDYWIEGSLAISAQEQIAFLRKLYQNDLPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGSMGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIARAILLSIEALPPNPAVHSDAAR
配列番号1134:
MKNTIHINFAIFLIIANIIYSSASASTDISTVASQLFEGTEGCFLLYDASTNAEIAQFNKAKCAAQMAPDSTFKIALSLMAFDAEIIDQKTIFKWDKIPKGMEIWNSNHTPKTWMQFSVVWVSQEITQKIGLNKIKNYLKDFDYGNQDFSGDKERNNGLTEAWLESSLKISPEEQIQFLRKIINHNLPVRNSAIENTIDNMYLQDLENSTKLYGKTGAGFTANRTLQNGWFEGFIISKSGHKYVFVSALTGSLGSNLTSSIKAKKNAITILNTLNL
配列番号1135:
MLLFMFSIISFGNENQFMKEIFERKGLNGTFVVYDLKNDKIDYYNLDRANERFYPASSFKIFNTLIGLENGIVKNVDEMFYYYDGSKVFLDSWAKDSNLRYAIKVSQVPAYKKLARELGKERMQEGLNKLNYGNKEIGSEIDKFWLEGPLKISAMEQVKLLNLLSQSKLPFKLENQEQVKDITILEKKDDFILHGKTGWATDNIVVPIGWFVGWIETSDNIYSFAINLDISDSKFLPKREEIVREYFKNINVIK
配列番号1136:
MRVLALSAVFLVASIIGMPAVAKEWQENKSWNAHFTEHKSQGVVVLWNENKQQGFTNNLKRANQAFLPASTFKIPNSLIALDLGVVKDEHQVFKWDGQTRDIATWNRDHNLITAMKYSVVPVYQEFARQIGEARMSKMLHAFDYGNEDISGNVDSFWLDGGIRISATEQISFLRKLYHNKLHVSERSQRIVKQAMLTEANGDYIIRAKTGYSTRIEPKIGWWVGWVELDDNVWFFAMNMDMPTSDGLGLRQAITKEVLKQEKIIP
配列番号1137:
MLSRYSKTLAFAVVACTLAISTATAHAELVVRNDLKRVFDDAGVSGTFVLMDITADRTYVVDPARAARSIHPASTFKIPNSLIAFDTGAVRDDQEVLPYGGKPQPYEQWEHDMALPEAIRLSAVPIYQEVARRVGFERMQAYVDAFDYGNRQLGSAIDQFWLRGPLEISAFEEARFTSRMALKQLPVKPRTWDMVQRMLLIEQQGDAALYAKTGVATEYQPEIGWWAGWVERAGHVYAFALNIDMPREGDMAKRIPLGKQLMRALEVWPAP
配列番号1138:
MRPLLFSALLLLSGHTQASEWNDSQAVDKLFGAAGVKGTFVLYDVQRQRYVGHDRERAETRFVPASTYKVANSLIGLSTGAVRSADEVLPYGGKPQRFKAWEHDMSLRDAIKASNVPVYQELARRIGLERMRANVSRLGYGNAEIGQVVDNFWLVGPLKISAMEQTRFLLRLAQGELPFPAPVQSTVRAMTLLESGPGWELHGKTGWCFDCTPELGWWVGWVKRNERLYGFALNIDMPGGEADIGKRVELGKASLKALGILP
配列番号1139:
MNKGLHRKRLSKRLLLPMLLCLLAQQTQAVAAEQTKVSDVCSEVTAEGWQEVRRWDKLFESAGVKGSLLLWDQKRSLGLSNNLSRAAEGFIPASTFKLPSSLIALETGAVRDETSRFSWDGKVREIAVWNRDQSFRTAMKYSVVPVYQQLAREIGPKVMAAMVRQLEYGNQDIGGQADSFWLDGQLRITAFQQVDFLRQLHDNKLPVSERSQRIVKQMMLTEASTDYIIRAKTGYGVRRTPAIGWWVGWLELDDNTVYFAVNLDLASASQLPLRQQLVKQVLKQEQLLP
配列番号1140:
MNTIISRRWRAGLWRRLVGAVVLPATLAATPAAYAADVPKAALGRITERADWGKLFAAEGVKGTIVVLDARTQTYQAYDAARAEKRMSPASTYKIFNSLLALDSGALDNERAIIPWDGKPRRIKNWNAAMDLRTAFRVSCLPCYQVVSHKIGRRYAQAKLNEVGYGNRTIGGAPDAYWVDDSLQISAREQVDFVQRLARGTLPFSARSQDIVRQMSIVEATPDYVLHGKTGWFVDKKPDIGWWVGWIERDGNITSVAINIDMLSEADAPKRARIVKAVLKDLKLI
配列番号1141:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTFWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQIFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGAEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1142:
MRVLALSAVLVVASIVGMPAMANEWQEKPSWNTHFSEHKAQGVIVLWNENKQQGFTNNLKRANQAFLPASTFKIPNSLIALDLGVVKDEHQVFKWDGQTRDIAAWNRDHDLITAMKYSVVPVYQEFARQIGQARMSKMLHAFDYGNEDISGNLDSFWLDGGIRISATEQVAFLRKLYHNKLHVSERSQRIVKQAMLTEANSDYIIRAKTGYSTRIEPQIGWWVGWVELDDNVWFFAMNMDMPTADGLGLRQAITKEVLKQEKIIP
配列番号1143:
MKKITLFLLFLNLVFGQDKILNNWFKEYNTSGTFVFYDGKTWASNDFSRAMETFSPASTFKIFNALIALDSGVIKTKKEIFYHYRGEKVFLSSWAQDMNLSSAIKYSNVLAFKEVARRIGIKTMQEYLNKLHYGNAKISKIDTFWLDNSLKISAKEQAILLFRLSQNSLPFSQEAMNSVKEMIYLKNMENLELFGKTGFNDGQKIAWIVGFVYLKDENKYKAFALNLDIDKFEDLYKREKILEKYLDELVKKVKNDG
配列番号1144:
MSKKNFILIFIFVILISCKNTEKISNETTLIDNIFTNSNAEGTLVIYNLNDDKYIIHNKERAEQRFYPASTFKIYNSLIGLNEKAVKDVDEVFYKLMAKSFLESWAKDSNLRYAIKNSQVPAYKELARRIGIKKMKENIEKLDFGNKSIGDSVDTFWLEGPLEISAMEQVKLLTKLAQNELQYPIEIQKAISDITITRANLHITLHGKTGLADSKNMTTEPIGWFVGWLEENDNIYVFALNIDNINSDDLAKRINIVKESLKALNLLK
配列番号1145:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALKMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1146:
MNIQALLLITSAIFISACSPYIVTANPNYSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRIGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGISSSVRKEITYRGLEQLGIL
配列番号1147:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKGEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1148:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1149:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1150:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQEVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1151:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIHQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGEKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1152:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDKKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWNGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQHEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1153:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKTTTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1154:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTAVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGTPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1155:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLPRRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1156:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEKLGIL
配列番号1157:
MNIKTLLLITSTIFISACSPYIVTANPNHSTSKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASIEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEIFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSLKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1158:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAISVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLAGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1159:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASALPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1160:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIHQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGEKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGSVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1161:
MNIKTLLLITSTIFISACSPYIVTANPNHSTSKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASIEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEIFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSLKAQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1162:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDKKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1163:
MNIKTLLLITSAIFISACSHYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFTYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1164:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1165:
MNIKALLLITSTIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALISLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1166:
MNIQALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPHGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1167:
MNIKALFLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1168:
MKLLKILSLVCLSISIGACAEHSMSRAKTSTIPQVNNSIIDQNVQALFNEISADAVFVTYDGQNIKKYGTHLDRAKTAYIPASTFKIANALIGLENHKATSTEIFKWDGKPRFFKAWDKDFTLGEAMQASTVPVYQELARRIGPSLMQSELQRIGYGNMQMGTEVDQFWLKGPLTITPIQEVKFVYDLAQGQLPFKPEVQQQVKEMLYVERRGENRLYAKSGWGMAVDPQVGWYVGFVEKADGQVVAFALNMQMKAGDDIALRKQLSLDVLDKLGVFHYL
配列番号1169:
MNIKALLLITSTIFISACSPYIVTANPNHSTSKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEIFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSLKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1170:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEVHTTGVLVIRQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEMNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1171:
MKLLKILSLVCLSISIGACAEHSMSRAKTSTIPQVNNSIIDQNVQALFNEISGDAVFVTYDGQNIKKYGTHLDRAKTAYIPASTFKIANALIGLENHKATSTEIFKWDGKPRFFKAWDKDFTLGEAMQASTVPVYQELARRIGPSLMQSELQRIGYGNMQIGTEVDQFWLKGPLTITPIQEVKFVYDLAQGQLPFKPEVQQQVKEMLYVERRGENRLYAKSGWGMAVDPQVGWYVGFVEKADGQVVAFALNMQMKAGDDIALRKQLSLDVLDKLGVFHYL
配列番号1172:
MKKFILPIFSISILVSLSACSSIKTKSEDNFHISSQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNLSTYGNALARANKEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRTYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQELARRTGLELMQKEVKRVNFGNTNIGTQVDNFWLVGPLKITPVQEVNFADDLAHNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMDVTPQVGWLTGWVEQANGKKIPFSLNLEMKEGMSGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1173:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNADPSTSNGDYWIESSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1174:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1175:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAILVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1176:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDKKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWNGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1177:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIHQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGEKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1178:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTTNPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNTDIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1179:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIQVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1180:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIHQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGEKRLFPEWEKNMTLGDAMKASALPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1181:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEMNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1182:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIHQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGEKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFPLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1183:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGGDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1184:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAILVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1185:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1186:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKTTTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1187:
MSKKNFILIFIFVILISCKNTEKISNETTLIDNIFTNSNAEGTLVIYNLNDDKYIIHNKERAEQRFYPASTFKIYNSLIGLNEKAVKDVDEVFYKYNGEKVFLESWAKDSNLRYAIKNSQVPAYKELARRIGLKKMKENIEKLDFGNKSIGDSVDTFWLEGPLEISAMEQVKLLTKLAQNELPYPIEIQKAVSDITILEQTYNYTLHGKTGLADSKNMTTEPIGWFVGWLEENDNIYVFALNIDNINSDDLAKRINIVKESLKALNLLK
配列番号1188:
MSKKNFILIFIFVILTSCKNTEKISNETTLIDNIFTNSNAEGTLVIYNLNDDKYIIHNKERAEQRFYPASTFKIYNSLIGLNEKAVKDVDEVFYKYNGEKVFLESWAKDSNLRYAIKNSQVPAYKELARRIGLKKMKENIEKLDFGNKSIGDSVDTFWLEGPLEISAMEQIKLLTKLAQNELPYPIEIQKAVSDITILEQTYNYTLHGKTGLADSKNMTTEPIGWFVGWLEENDNIYVFALNIDNINSDDLAKRINIVKESLKALNLLK
配列番号1189:
LLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSL
配列番号1190:
LLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTEWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSL
配列番号1191:
MTVRRLSCALGAALSLSALGGGPVQAAVLCTVVADAADGRILFQQGTQQACAERYTPASTFKLAIALMGADAGILQGPHEPVWNYQPAYPDWGGDAWRQPTDPARWIKYSVVWYSQLTAKALGQDRFQRYTSAFGYGNADVSGEPGKHNGTDGAWIISSLRISPLEQLAFLRKLVNRQLPVKAAAYELAENLFEAGQADGWRLYGKTGTGSPGSNGVYTAANAYGWFVGWARKDGRQLVYARLLQDERATRPNAGLRARDELVRDWPAMAGAWRP
配列番号1192:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNVLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQEVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1193:
MKTFAAYVIIACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPASTFKIPSAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEDQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1194:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1195:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTTNPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNTDIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1196:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAVPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNQQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1197:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEVHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEMTYKSLEQLGIL
配列番号1198:
MNKYFTCYVVASLFFSGCTVQHNLINETQSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTTWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVERIDFGNAEIGQQVDNFWLIGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEENNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1199:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1200:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFLLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1201:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGDADPSTSNGDYWIEGSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1202:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDKKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKASTTEVFKWNGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVKSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1203:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKHVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1204:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKHVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1205:
MKKFILPILSISTLLSVSACSSIQTKFEDTFHTSNQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKKGKNISTYGNNLTRAHTEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTTEIFKWDGKKRSYPMWEKDMTLGDAMALSAVPVYQELARRTGLDLMQKEVKRVGFGNMNIGTQVDNFWLVGPLKITPIQEVNFADDFANNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEFNGSKIYAKSGWGMDVTPQVGWLTGWVEKSNGEKVAFSLNIEMKQGMPGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1206:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQEVQDEVQSILFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1207:
MKKFILPIFSISILVSLSACSSIKTKSEDNFHISSQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNLSTYGNALARANKEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRTYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQELARRTGLELMQKEVKRVNFGNTNIGTQVDNFWLVGPLKITPVQEVNFADDLAHNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMGVTSQVGWLTGWVEQANGKKIPFSLNLEMKEGMSGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1208:
MRVLALSAVFLVASIIGMPAVAKEWQENKSWNAHFTEHKSQGVVVLWNENKQQGFTNNLKRANQAFLPASTFKIPNSLIALDLGVVKDEHQVFKWDGQTRDIATWNRDHNLITAMKYSVVPVYQEFARQIGEARMSKMLHAFDYGNEDISGNVDSFWLDGGIRISATEQISFLRKLYHNKLHVSERSQRIVKQAMLTEANGDYIIRAKTGYSARIEPKIGWWVGWVELDDNVWFFAMNMDMPTSDGLGLRQAITKEVLKQEKIIP
配列番号1209:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAVPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGLDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1210:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAVPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGLDVNLQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1211:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEKLGIL
配列番号1212:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIRNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1213:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDSKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1214:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDGVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1215:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDSKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAILVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1216:
MKLLKILSLVCLSISIGACAEHSMSRAKTSTIPQVNNSIIDQNVQALFNEISADAVFVTYDGQNIKKYGTHLDRAKTAYIPASTFKIANALIGLENHKATSTEIFKWDGKPRFLKAWDKDFTLGEAMQASTVPVYQELARRIGPSLMQSELQRIGYGNMQIGTEVDQFWLKGPLTITPIQEVKFVYDLAQGQLPFKPEVQQQVKEMLYVERRGENRLYAKSGWGMAVDPQVGWYVGFVEKADGQVVAFALNMQMKAGDDIALRKQLSLDVLDKLGVFHYL
配列番号1217:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDVKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1218:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGALVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1219:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELMMKSLKQLNII
配列番号1220:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLAGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1221:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDERNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1222:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEKSNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1223:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASTRNELLMKSLKQLNII
配列番号1224:
MKKFILPIFSISILLSLSACSSIQTKFEDTFHISNQKHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNISSYGNNLVRAHTEYVPASTFKMLNALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRSYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQDLARRIGLNLMQKEVKRVGFGNMNIGTQVDNFWLIGPLKITPIQEVNFADDLANNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMDVSPQVGWLTGWVEKSNGEKVSFSLNIEMKQGMSGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1225:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIAVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1226:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAIKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1227:
MKILIFLPLLSCLGLTACSLPVSSLPSQSISTQAIASLFDQAQSSGVLVIQRDQQVQVYGNDLNRANTEYVPASTFKMLNALIGLQHGKATTNEIFKWDGKKRSFTAWEKDMTLGQAMQASAVPVYQELARRIGLELMQQEVQRIQFGNQQIGQQVDNFWLVGPLKVTPKQEVQFVSALAREQLAFDPQVQQQVKAMLFLQERKAYRLYVKSGWGMDVEPQVGWLTGWVETPQAEIVAFSLNMQMQNGIDPAIRLEILQQALAELGLYPKAEG
配列番号1228:
MHKHMSKLFIAFLAFLLSVPAAAEDQTLAELFAQQGIDGTIVISSLHNGKTFIHNDPRAKQRFSTASTFKILNTLISLEEKAISGKDDVLKWDGHIYDFPDWNRDQTLESAFKVSCVWCYQALARQVGAEKYRNYLRKSVYGELREPFEETTFWLDGSLQISAIEQVNFLKKVHLRTLPFSASSYETLRQIMLIEQTPAFTLRAKTGWATRVKPQVGWYVGHVETPTDVWFFATNIEVRDEKDLPLRQKLTRKALQAKGIIE
配列番号1229:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGTDKFWLEDQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1230:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAILVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGLDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1231:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIQVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1232:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAMPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1233:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEVHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1234:
MRVLALSAVFLVASIIGMPAVAKEWQENKSWNAHFTEHKSQGVVVLWNENKQQGFTNNLKRANQAFLPASTFKIPNSLIALDLGVVKDEHQVFKWDGQTRDIATWNRDHNLITAMKYSVVPVYQEFARQIGEARMSKMLHAFDYGNEDISGNVDSFWLDGGIRISATEQISFLRKLYHNKLHVSERSQRIVKQAMLTEANGDYIIRAKTGYDTKIGWWVGWVELDDNVWFFAMNMDMPTSDGLGLRQAITKEVLKQEKIIP
配列番号1235:
MSKKNFILIFIFVILISCKNTEKTSNETTLIDNIFTNSNAEGTLVIYNLNDDKYIIHNKERAEQRFYPASTFKIYNSLIGLNEKAVKDVDEVFYKYNGEKVFLESWAKDSNLRYAIKNSQVPAYKELARRIGLEKMKENIEKLDFGNKNIGDSVDTFWLEGPLEISAMEQVKLLTKLAQNELPYPIEIQKAVSDITILEQTDNYTLHGKTGLADSENMTTEPIGWLVGWLEENNNIYVFALNIDNINSDDLAKRINIVKESLKALNLLK
配列番号1236:
MNIKALFLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1237:
MNIKALFLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPSSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKMYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1238:
MNIKALFLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEIAYKSLEQLGIL
配列番号1239:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNADPSTSNGDCWIEGSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1240:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEVHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWVVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1241:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEVHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEYHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1242:
MAIRFLTILLSTFFLTSFVHAQEHVVVRSDWKKFFSDLQAEGAIVIADERQAEHALLVFGQERAAKRYSPASTFKLPHTLFALDAGAVRDEFQVFRWDGVKRSFAGHNQDQDLRSAMRNSAVWVYELFAKEIGEDNARRYLKQIDYGNADPSTIKGNYWIDGNLEISAHEQISFLRKLYRNQLPFQVEHQRLVKYLMITEAGRNWILRAKTGWEGRFGWWIGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRTDDLFKREAIARAILRSIDALPPN
配列番号1243:
MRVLALSAVFLVASIIGMPAVAKEWQENKSWNAHFTEHKSQGVVVLWNENKQQGFTNNLKRANQAFLPASTFKIPNSLIALDLGVVKDEHQVFKWDGQTRDIAAWNRDHDLITAMKYSVVPVYQEFARQIGEARMSKMLHAFDYGNEDISGNVDSFWLDGGIRISATQQIAFLRKLYHNKLHVSERSQRIVKQAMLTEANGDYIIRAKTGYSTRIEPKIGWWVGWVELDDNVWFFAMNMDMPTSDGLGLRQAITKEVLKQEKIIP
配列番号1244:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKSQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1245:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDVKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAISVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1246:
MAIRIFAILFSIFSLATFAHAQEGTLERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQADRAMLVFDPVRSKKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAVRDEFQIFRWDGVNRGFAGHNQDQDLRSAMRNSTVWVYELFAKEIGDDKARRYLKKIDYGNADPSTSNGDYWIEGSLAISAQEQIAFLRKLYRNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGSVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1247:
MKTIAAYLVLVFYASTALSESISENLAWNKEFSSESVHGVFVLCKSSSNSCTTNNAARASTAYIPASTFKIPNALIGLETGAIKDERQVFKWDGKPRAMKQWEKDLKLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEIRMQKYLNLFSYGNANIGGGIDKFWLEGQLRISAFNQVKFLESLYLNNLPASKANQLIVKEAIVTEATPEYIVHSKTGYSGVGTESSPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNESKLPSRKSISTKIMASEGIIIGG
配列番号1248:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTFWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKLACATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQIFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGAEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1249:
MAIRIFAILFSTFVFGTFAHAQEGMRERSDWRKFFSEFQAKGTIVVADERQTDRVILVFDQVRSEKRYSPASTFKIPHTLFALDAGAARDEFQVFRWDGIKRSFAAHNQDQDLRSAMRNSTVWIYELFAKEIGEDKARRYLKQIDYGNADPSTSNGDYWIDGNLAIAAQEQIAFLRKLYHNELPFRVEHQRLVKDLMIVEAGRNWILRAKTGWEGRMGWWVGWVEWPTGPVFFALNIDTPNRMDDLFKREAIVRAILRSIEALPPNPAVNSDAAR
配列番号1250:
MKTFAAYVIIACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGSQNISGGIDKFWLEDQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1251:
MNKYFTCYVVASLFLSGCTVQHNLINETPSQIVQGHNQVIHQYFDEKNTSGVLVIQTDKKINLYGNALSRANTEYVPASTFKMLNALIGLENQKTDINEIFKWKGEKRSFTAWEKDMTLGEAMKLSAVPVYQELARRIGLDLMQKEVKRIGFGNAEIGQQVDNFWLVGPLKVTPIQEVEFVSQLAHTQLPFSEKVQANVKNMLLLEESNGYKIFGKTGWAMDIKPQVGWLTGWVEQPDGKIVAFALNMEMRSEMPASIRNELLMKSLKQLNII
配列番号1252:
MKKLSVLLWLTLFYCGTIWAQSTCFLVQENQTVLKHEGKDCNKRFAPESTFKIALSLMGFDSGILKDTLNPEWPYKKEYELYLNVWKYPHNPRTWIRDSCVWYSQVLTQQLGMTRFKNYVDAFHYGNQDISGDKGQNNGLTHSWLSSSLAISPSEQIQFLQKIVNKKLSVNPKAFTMTKDILYIQELAGGWKLYGKTGNGRQLTKDKSQKLSLQHGWFIGWIEKDGRVITFTKHIADSKKHVTFASFRAKNETLNQLFYLINELEK
配列番号1253:
MNIKTLLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEVHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSPKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1254:
MKFRHALSSAFVLLGCIAASAHAKTICTAIADAGTGKLLVQDGDCGRRASPASTFKIAISLMGYDAGFLRNEHDPVLPYRDSYIAWGGEAWKQPTDPTRWLKYSVVWYSQQVAHHLGAQRFAQYAKAFGYGNADVSGDPGQNNGLDRAWIGSSLQISPLEQLEFLGKMLNRKLPVSPTAVDMTERIVESTTLADGTVVHGKTGVSYPLLADGTRDWARGSGWFVGWIVRGNQTLVFARLTQDERKQPVSAGIRTREAFLRDLPRLLAAR
配列番号1255:
MKFRHALSSAFVLLGCIAASAHAKTICTAIADAGTGKLLVQDGDCGRRASPASTFKIAISLMGYDAGFLRNEHDPVLPYRDSYIAWGGEAWKQPTDPTRWLKYPVVWYSQQVAHHLGAQRFAQYAKAFGYGNADVSGDPGQNNGLDRAWIGSSLQISPLEQLEFLGKMLNRKLPVSPTAVDMTERIVESTTLADGTVVHGKTGVSYPLLADGTRDWARGSGWFVGWIVRGKQTLVFARLTQDERKQPVSAGIRTREAFLRDLPRLLAAR
配列番号1256:
MRGKHTVILGAALSALFAGAAGAQMLECTLVADAASGQELYRKGACDKAFAPMSTFKVPLAVMGYDAGILVDAHNPRWDYKPEFNGYKFQQKTTDPTIWEKDSIVWYSQQLTRKMGQKRFAAYVAGFGYGNGDISGEPGKSNGLTHSWLGSSLKISPEGQVRFVRDLLSAKLPASKDAQQMTVSILPHFAAGDWAVQGKTGTGSFIDARGAKAPLGWFIGWATHEERRVVFARMTAGGKKGEQPAGPAARDAFLKALPDLAKRF
配列番号1257:
MKFRHALSSAFVLLGCIAASAHAKTICTAIADAGTGKLLVQDGDCGRRASPASTFKIAISLMGYDAGFLRNEHDPVLPYRDSYIAWGGEAWKQPTDPTRWLKYSVVWYSQQVAHHLGAQRFAQYAKAFGYGNADVSGDPGQNNGLDRAWIGSSLQISPLEQLEFLGKMLDRKLPVSPTAVDMTERIVESTTLADGTVVHGKTGVSYPLLADGTRDWARGSGWFVGWIVRGKQTLVFARLTQDERKQPVSAGIRTREAFLRDLPRLLAAR
配列番号1258:
MKFRHALSSAFVLLGCIAASAHAKTICTAIADAGTGKLLVQDGDCGRRASPASTFKIAISLMGYDAGFLRNEHDPVLPYRDSYIAWGGEAWKQPTDPTRWLKYSVVWYSQQVAHHLGAQRFAQYAKAFGYGNADVSGDPGQNNGLDRAWIGSSLQISPLEQLEFLGKMLNRKLPVSPTAVDMTERIVESTTLADGTVVHGKTGVSYPLLADGTRDWARGSGWFVGWIVRGKQTLVFARLTQDERKQPVSAGIRTREAFLRDLPRLLAAR
配列番号1259:
MKTFAAYVIIACLSSTALAGSITENTSWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNDLARASKEYLPVSTFKIPSAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLTLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLYLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKETEVYFFAFNMDIDNESKLPLRKSIPTKIMESEGIIGG
配列番号1260:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGKKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1261:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVSANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKNMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVNPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1262:
MKTFAAYVITACLSSTALASSITENTFWNKEFSAEAVNGVFVLCKSSSKSCATNNLARASKEYLPASTFKIPNAIIGLETGVIKNEHQVFKWDGKPRAMKQWERDLSLRGAIQVSAVPVFQQIAREVGEVRMQKYLKKFSYGNQNISGGIDKFWLEGQLRISAVNQVEFLESLFLNKLSASKENQLIVKEALVTEAAPEYLVHSKTGFSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNENKLPLRKSIPTKIMASEGIIGG
配列番号1263:
MKTIAAYLVLVFFAGTALSESISENLAWNKEFSSESVHGVFVLCKSSSNSCTTNNATRASTAYIPASTFKIPNALIGLETGAIKDARQVFKWDGKPRAMKQWEKDLTLRGAIQVSAVPVFQQIARDIGKKRMQKYLNLFSYGNANIGGGIDKFWLEGQLRISAVNQVKFLESLYLNNLPASKANQLIVKEAIVTEATPEYIVHSKTGYSGVGTESNPGVAWWVGWVEKGTEVYFFAFNMDIDNESKLPSRKSIPTKIMASEGIIIGG
配列番号1264:
MKKFILPIFSISILVSLSACSSIKTKSEDNFHISSQQHEKAIKSYFDEAQTQGVIIIKEGKNLSTYGNALARANKEYVPASTFKMLIALIGLENHKATTNEIFKWDGKKRTYPMWEKDMTLGEAMALSAVPVYQELARRTGLELMQKEVKRVNFGNTNIGTQVDNFWLVGPLKITPVQEVNFADDLAHNRLPFKLETQEEVKKMLLIKEVNGSKIYAKSGWGMGVTPQVGWLTGWVEQANGKKIPFSLNLEMKEGMSGSIRNEITYKSLENLGII
配列番号1265:
MNIKALLLITSAIFISACSPYIVTANPNHSASKSDDKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIHQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWNGQKRLFPEWEKDMTLGDAMKASAIPVYQDLARRIGLELMSNEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQVGWLTGWVVQPQGNIVAFSLNLEMKKGIPSSVRKEITYKSLEQLGIL
配列番号1266:
MNIKALLLITSAISISACSPYIVTANPNHSASKSDEKAEKIKNLFNEAHTTGVLVIQQGQTQQSYGNDLARASTEYVPASTFKMLNALIGLEHHKATTTEVFKWDGQKRLFPEWEKDMTLGDAIKASAIPVYQDLARRIGLELMSKEVKRVGYGNADIGTQVDNFWLVGPLKITPQQEAQFAYKLANKTLPFSQKVQDEVQSMLFIEEKNGNKIYAKSGWGWDVDPQV
【0107】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号1267〜配列番号1835および配列番号2160〜配列番号2171の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0108】
臨床的対象欄内の2d、2de、2dfの項目は、対応するペプチドにより検出することが可能となる、OXAβ−ラクタマーゼの機能的亜群に対応する。したがって、2dfペプチドの検出は、カルバペネムを加水分解することが可能なカルバペネマーゼであるβ−ラクタマーゼの存在を示すことになる。
【0109】
2deという項目は、ペニシリン、セファロリジンおよびセファロチンなどの第1世代のセファロスポリン、ならびにセフォタキシム、セフタジジムなどのオキシイミノ系β−ラクタムのクラス、またはアズトレオナムなどのモノバクタムに由来する少なくとも1つの抗生剤を加水分解することが可能な広域スペクトルを伴うβ−ラクタマーゼ(ESBL)の存在を示すことになる。
【0110】
OXAという項目は、第2d亜群、第2de亜群、および第2df亜群のうちの少なくとも2つの間で共通なペプチドを示す。対応するペプチドは、OXAβ−ラクタマーゼの存在、ならびに少なくともペニシリンおよび第1世代のセファロスポリンに対する耐性の機構の存在を示す。
【0111】
OXAタンパク質により誘導される、ESBL(広域スペクトルのβ−ラクタマーゼ)によるセファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、
配列番号1277、1297、1323、1344、1368、1369、1373、1375、1392、1421、1423、1427、1429、1439、1444、1446、1450、1451、1457、1465、1468、1490、1491、1495、1498、1534、1543、1545、1575、1589、1597、1598、1600、1602、1657、1713、1721、1724、1740、1742、1787、1824、1268、1269、1270、1271、1272、1278、1279、1280、1281、1283、1285、1288、1290、1295、1299、1300、1301、1302、1303、1304、1305、1306、1307、1308、1309、1310、1314、1315、1316、1317、1318、1319、1320、1332、1337、1339、1340、1341、1342、1350、1354、1355、1356、1357、1358、1359、1360、1365、1366、1367、1386、1389、1390、1391、1393、1394、1402、1404、1405、1407、1408、1413、1414、1419、1420、1425、1432、1433、1440、1447、1448、1456、1471、1472、1477、1478、1480、1485、1487、1488、1499、1504、1506、1508、1509、1510、1513、1514、1515、1516、1521、1522、1525、1526、1530、1533、1539、1540、1548、1550、1551、1552、1553、1554、1555、1556、1559、1567、1569、1570、1571、1572、1574、1577、1582、1590、1592、1595、1596、1605、1609、1610、1611、1612、1613、1614、1615、1616、1617、1618、1620、1626、1627、1628、1632、1633、1634、1635、1637、1638、1639、1640、1652、1653、1656、1660、1661、1662、1664、1665、1666、1669、1670、1671、1672、1673、1677、1
678、1680、1681、1685、1687、1695、1696、1697、1703、1704、1706、1707、1708、1709、1712、1714、1715、1717、1720、1722、1725、1727、1729、1730、1732、1733、1737、1738、1743、1746、1748、1751、1752、1753、1754、1755、1758、1759、1760、1761、1762、1763、1764、1765、1769、1771、1773、1775、1776、1777、1781、1785、1788、1790、1791、1792、1793、1794、1795、1796、1797、1798、1800、1805、1806、1809、1810、1815、1816、1818、1828、2160、2161、2162、2163、2164、2165、2166、2167、2168、2169、2170、2171
の配列から選択される、少なくとも1つの耐性マーキング2deペプチドの検出を特徴とする。
【0112】
GESタンパク質の発現により誘導される、カルバペネムまたはセファロスポリンに対する耐性の機構の検出は、GESタンパク質ならびにその異なる配列変異体である配列番号2114〜配列番号2130に属する少なくとも1つのペプチドの検出を特徴とする。
配列番号2114:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2115:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVKWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2116:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQLAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2117:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMNDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2118:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMSDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2119:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVKWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMSDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2120:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGSRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2121:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGARNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2122:
MRFIHALLLAGTAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRTAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLCDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2123:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVKWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMNDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2124:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKESEMSDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2125:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMSDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGARNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2126:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAEIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMSDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2127:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVKWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGARNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2128:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRTAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVKWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2129:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRTAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVKWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMSDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGTCANGGRNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
配列番号2130:
MRFIHALLLAGIAHSAYASEKLTFKTDLEKLEREKAAQIGVAIVDPQGEIVAGHRMAQRFAMCSTFKFPLAALVFERIDSGTERGDRKLSYGPDMIVEWSPATERFLASGHMTVLEAAQAAVQLSDNGATNLLLREIGGPAAMTQYFRKIGDSVSRLDRKEPEMGDNTPGDLRDTTTPIAMARTVAKVLYGGALTSTSTHTIERWLIGNQTGDATLRAGFPKDWVVGEKTGACANGARNDIGFFKAQERDYAVAVYTTAPKLSAVERDELVASVGQVITQLILSTDK
【0113】
前記ペプチドは、以下で規定される配列番号2131〜配列番号2159の配列のペプチドから選択することが好ましい。
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【0114】
臨床的対象欄内のESBLおよびcarbaの項目は、対応するペプチドにより検出することが可能となる、GESβ−ラクタマーゼ活性に対応する。したがって、carbaペプチドの検出は、カルバペネム、ペニシリン、セファロリジンおよびセファロチンなどの第1世代のセファロスポリン、ならびにセフォタキシム、セフタジジムなどのオキシイミノ系β−ラクタムのクラス、またはアズトレオナムなどのモノバクタムに由来する少なくとも1つの抗生剤を加水分解することが可能なカルバペネマーゼであるβ−ラクタマーゼの存在を示すことになる。
【0115】
carbaと称するペプチドが検出されない場合、ESBLと称するペプチドの検出は、ペニシリン、セファロリジンおよびセファロチンなどの第1世代のセファロスポリン、ならびにセフォタキシム、セフタジジムなどのオキシイミノ系β−ラクタムのクラス、またはアズトレオナムなどのモノバクタムに由来する少なくとも1つの抗生剤を加水分解することが可能な広域スペクトルを伴うβ−ラクタマーゼ(ESBL)の存在を示すことになる。
【0116】
したがって、GESタンパク質により誘導される、広域スペクトルを伴うセファロスポリナーゼの耐性の機構の検出は、配列番号2131〜配列番号2159の配列から選択される、少なくとも1つの耐性マーキングESBLペプチドの検出を特徴とする。
【0117】
特定のペプチド配列は、数種の耐性機構に共通でありうる。したがって、以下の配列は同一である:
配列番号834および配列番号978
配列番号833および配列番号977
配列番号832および配列番号976
配列番号831および配列番号975
配列番号826および配列番号974
配列番号825および配列番号973
配列番号824および配列番号972
配列番号823および配列番号971
配列番号822および配列番号970
配列番号817および配列番号969
配列番号813および配列番号967
配列番号802および配列番号964
配列番号798および配列番号963
配列番号666および配列番号895
配列番号350および配列番号1035
配列番号349および配列番号1031
配列番号347および配列番号1030
配列番号346および配列番号1029
配列番号345および配列番号1028
配列番号343および配列番号1037および配列番号725
配列番号342および配列番号1026
配列番号341および配列番号1025
配列番号340および配列番号1024
配列番号339および配列番号1023
配列番号338および配列番号1020
配列番号337および配列番号1036および配列番号719
配列番号337および配列番号1036
配列番号336および配列番号841および配列番号981
配列番号323および配列番号840および配列番号980
配列番号315および配列番号839および配列番号948および配列番号979
配列番号240および配列番号679
配列番号184および配列番号626
配列番号182および配列番号625
配列番号1034および配列番号1999
配列番号1032および配列番号1988
配列番号1027および配列番号1970
配列番号1022および配列番号1952
配列番号1021および配列番号1937
配列番号1019および配列番号1933
配列番号809および配列番号966
配列番号1033および配列番号1989
【0118】
全ての場合において、上記の配列は、セファロスポリンに対する耐性の機構の発現を示す。
【0119】
本発明の方法およびその利点は、前記方法の実装の数個の非限定的な例を提示する本明細書の記載の残りから明らかとなろう。
【実施例1】
【0120】
生化学的プロファイルによる、試料に由来する微生物の同定
1.培養培地における試料の培養
最適の培養培地および最適の培養条件は、微生物の種により異なる。初期設定では、試料を、以下の異なる培地上に播種する:
○好気性雰囲気または嫌気性雰囲気中、35℃で18〜24時間にわたる、ヒツジ血液によるColumbia寒天(bioMerieux ref.43041)培地;
○37℃で18〜24時間にわたる、TSA寒天(bioMerieux ref.43011)培地。
【0121】
2.微生物の同定
同定は、以下の通りに実行する:
1.単離されたコロニーを選択する
2.無菌条件を維持する一方で、3.0mLの水性滅菌生理食塩液(0.45〜0.50%のNaCl、pH4.5〜7.0)を、透明なプラスチック製(ポリスチレン製)の試験管に移す
3.攪拌棒または滅菌スワブを一助として、十分な数の同一のコロニーを、ステップ2で調製された生理食塩液の試験管に移し、細菌懸濁液を、較正されたVITEK(登録商標)のDENSICHEKにより、0.50〜0.63マクファーランドの間に調整する
4.細菌懸濁液の試験管およびVITEK(登録商標)同定カードを、VITEK(登録商標)カートリッジに取り付ける
5.カートリッジをVITEK(登録商標)測定器に装填する
6.充填、密封、インキュベーション、および読取りの操作は自動である
7.生化学的プロファイルを収集する
8.既知の株の生化学的プロファイルと比較することにより、VITEK(登録商標)システムでの同定を実行する。
【実施例2】
【0122】
微生物富化による一次尿試料の調製:
以下のプロトコールを16ステップ(富化された試料を、後で実施例4以降に従い処理する場合、ステップ5〜12は任意選択であり、省略しても構わない)で実行する:
1.5mLの夾雑物を含む尿を、2000gで30秒間遠心分離するステップ
2.上清を回収するステップ
3.15000gで5分間遠心分離するステップ
4.上清を廃棄するステップ
5.再懸濁させることにより、3mLの蒸留水でペレットを洗浄するステップ
6.15000gで5分間遠心分離するステップ
7.上清を廃棄するステップ
8.1/10に希釈するために、ペレットを溶媒(1メタノール容量に対して8アセトン容量)の存在下に置くステップ
9.−20℃で1時間静置するステップ
10.15000gで5分間遠心分離するステップ
11.上清を廃棄するステップ
12.1/10に希釈するために、ペレットを溶媒(1メタノール容量に対して8アセトン容量)の存在下に置くステップ
13.−20℃で1時間静置するステップ
14.15000gで5分間遠心分離するステップ
15.上清を廃棄するステップ
16.ペレットは、微生物が富化された試料を構成している。
【実施例3】
【0123】
MALDI−TOFによる、試料に由来する微生物の同定
同定は、以下の通りに実行する:
1.MALDI−TOF質量分析のために、1μlのエーゼを一助として、実施例1に従い得られた微生物コロニーの一部、または実施例2に従い富化された試料を移し、プレート上で均一に沈着させる
2.沈着物を1μlのマトリックスで覆う。用いられるマトリックスは、有機溶媒(50%のアセトニトリルおよび2.5%のトリフルオロ酢酸)中のHCCA(α−シアノ−4−ヒドロキシ桂皮酸)の飽和溶液である
3.周囲温度で乾燥させる
4.プレートを質量分析器に導入する
5.質量スペクトルを収集する
6.得られたスペクトルを、知識ベースに含有されるスペクトルと比較する
7.得られたピークを、知識ベース内のピークと比較することにより、微生物を同定する。
【実施例4】
【0124】
ESI−TOFによる、試料に由来する微生物の同定
同定は、以下の通りに実行する:
1.実施例1に従い得られた微生物コロニー、または実施例2に従い富化された試料をサンプリングし、100μlの脱塩水中に懸濁させる。
2.3000gで5分間遠心分離する。
3.上清を廃棄する。
4.100μlの脱塩水中に再懸濁させる。
5.3000gで5分間遠心分離する。
6.上清を廃棄する。
7.100μlのアセトニトリル、脱塩水、およびギ酸による混合物(50/50/0.1%)中に再懸濁させる。
8.細孔径が0.45μmのフィルターで濾過する。
9.単一のMSモードによる質量分析器に注入する。
10.質量スペクトルを収集する。
11.得られたスペクトルを、知識ベースに含有されるスペクトルと比較する。
12.基準スペクトルを参照することにより、微生物を同定する。
【実施例5】
【0125】
微生物からの消化されたタンパク質の取得
以下のプロトコールは、慣例上17ステップで実行される:
1.実施例1に従い得られた微生物コロニー、または実施例2に従い富化された試料をサンプリングし、10〜100μlの6M塩酸グアニジン溶液、50mMトリス−HCl、pH=8.0中に懸濁させるステップ。
2.ジチオトレイトール(DTT)を添加して、5mMの最終濃度を達成するステップ。
3.水浴中95℃で20分間還元するステップ。
4.試験管を周囲温度まで冷却するステップ。
5.ヨードアセトアミドを添加して、12.5mMの最終濃度を得るステップ。
6.周囲温度、暗所内で40分間アルキル化させるステップ。
7.50mMのNHHCO溶液、pH=8.0で6倍に希釈して、塩酸グアニジンの最終濃度1Mを得るステップ。
8.1μgのトリプシンを添加するステップ。
9.37℃で6時間〜一晩の間消化するステップ。
10.pHが4を下回るまでギ酸を添加して、反応を停止させるステップ。
11.試料容量を、水/0.5%(v/v)のギ酸で1mLまで補充するステップ。
12.Waters Oasis HLBカラムを、1mLのメタノール、次いで、1mLのHO/0.1%(v/v)のギ酸で平衡化するステップ。
13.重力により流下する試料を沈着させるステップ。
14.1mLのHO/0.1%(v/v)のギ酸で洗浄するステップ。
15.80%のメタノールと20%の水/0.1%(v/v)のギ酸との混合物1mLで溶出させるステップ。
16.約100μlの容量を得るために、溶出物を、SpeedVac(登録商標)SPD2010蒸留器(Thermo Electron Corporation、Waltham、Massachusetts、United States of America)で、2時間にわたり蒸発させるステップ。
17.次いで、十分量(QSF)である250μlの水/0.5%(v/v)のギ酸溶液中に溶出物を採取するステップ。
【実施例6】
【0126】
TEMβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam10〜Sam61は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表1に示す。
表1:
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【0127】
試料Sam10〜Sam61は、TEM耐性機構を含むことが可能な種(腸内細菌科の種)に対応する。次いで、以下の方法を実行して、このような機構について探索する。
【0128】
各試料を実施例5に従い処理し、次いで、容量50μlの消化されたタンパク質を注入し、以下の条件に従い解析する:
●Dionex Corporation(Sunnyvale、United States of America)によるDionex Ultimate 3000クロマトグラフィーチャネル。
●Waters BEH130 C18カラム、内径2.1mm、長さ100mm、粒子サイズ3.5μm(Waters、Saint−Quentin En Yvelines、France)。
●溶媒A:HO+0.1%のギ酸。
●溶媒B:ACN+0.1%のギ酸。
HPLCの勾配は、以下の表2で規定される:
表2:
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●クロマトグラフィーカラムから流下する溶出物を、Applied Biosystems(Foster City、United States of America)によるQTRAP(登録商標)5500質量分析器のイオン化源に直接的に注入する。
●微生物タンパク質の消化に由来するペプチドを、MRMモードの質量分析器により解析する。表3に示されるペプチドだけが検出される。この目的のために、表3に示されるペプチドの(1または複数の)フラグメントを検出する。表3にはまた、前駆体の荷電状態、および酸化したメチオニンの可能な存在も示される。
表3:
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【0129】
表3において言及されるトランジションは、表4に示されるパラメータを用いることにより検出する。前駆体ペプチドの保持時間およびトランジション、すなわち、Q1による(m/z)1比およびQ3による(m/z)2比のほか、前駆体イオンをフラグメント化するのに用いられる衝突エネルギーを表4に示す。また、それを上回ればトランジションが検出されると考えられる閾値も表4に示す。
表4:
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【0130】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:40.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):80.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):10.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):35V
・全サイクル時間:1.2秒間
・検出範囲:90秒間
【0131】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、表4で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、表5で「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが、表4で記載される陽性の閾値より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、表5で「0」に分類する。
表5:
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【0132】
試料Sam10は、TEMに特徴的なペプチドを提示しない。試料Sam10中に存在する細菌は、セファロスポリンおよびペニシリンに対して感受性でありうる。
【0133】
試料Sam11〜Sam61は、TEMに特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam11〜Sam61中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【0134】
表現型2bに特異的なペプチドは観察されず、ペニシリンだけに対して耐性であるものとして同定される被験試料は見られない。
【0135】
試料Sam35、Sam49、およびSam50は、表現型2brに特異的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam35、Sam49、およびSam50は、クラブラン酸型およびタゾバクタム型の阻害剤と随伴するペニシリンに対して耐性である。
【0136】
表現型2berに特異的なペプチドは観察されず、この表現型だけに属するものとして同定される被験試料は見られない。
【0137】
試料Sam12〜Sam21、Sam23〜Sam27、Sam29、Sam32、Sam33、Sam44、Sam46、Sam52、Sam55、およびSam57〜Sam61は、表現型2beまたは表現型2berに特異的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam12〜Sam21、Sam23〜Sam27、Sam29、Sam32、Sam33、Sam44、Sam46、Sam52、Sam55、およびSam57〜Sam61は、ペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対して耐性である。
【実施例7】
【0138】
CMYβ−ラクタムに対する耐性の同定:
CMY耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0139】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表6によるペプチドを検出することにより解析する。
表6:
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【0140】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例8】
【0141】
CTX−Mβ−ラクタムに対する耐性の同定:
CTX−M耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0142】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表7によるペプチドを検出することにより解析する。
表7:
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【0143】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例9】
【0144】
SHVβ−ラクタムに対する耐性の同定:
SHV耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0145】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表8によるペプチドを検出することにより解析する。
表8:
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【0146】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例10】
【0147】
FOXβ−ラクタムに対する耐性の同定:
FOX耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0148】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表9によるペプチドを検出することにより解析する。
表9:
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【0149】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例11】
【0150】
TEMβ−ラクタムまたはCTX−Mβ−ラクタムに対する耐性の同定:
TEM耐性機構またはCTX−M耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0151】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表10によるペプチドを検出することにより解析する。
表10:
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【0152】
臨床的対象欄内の、TEM、2b、2br、2be、および2berの項目は、表4における意味と同じ意味に対応する。
【0153】
表10において言及されるトランジションは、表11に示されるパラメータを用いることにより検出する。
表11:
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【0154】
同じペプチドの少なくとも2つのトランジションの面積が、表11で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考える。同じペプチドの2つを超えるトランジションが、表11で記載される陽性の閾値より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考える。
【0155】
TEM耐性機構に対応する少なくとも1つのペプチドが検出される場合、試料は、TEMタンパク質を発現させる細菌を含有する。これらの細菌は、ペニシリンに対して耐性である。
【0156】
TEM耐性機構の臨床的対象である2bに対応する少なくとも1つのペプチドが検出される場合、試料は、TEMタンパク質の表現型2bを発現させる細菌を含有する。これらの細菌は、ペニシリンだけに対して耐性である。
【0157】
TEM耐性機構の臨床的対象である2brに対応する少なくとも1つのペプチドが検出される場合、試料は、TEMタンパク質の表現型2brを発現させる細菌を含有する。これらの細菌は、クラブラン酸型およびタゾバクタム型の阻害剤と随伴するペニシリンに対して耐性である。
【0158】
CTX−M耐性機構またはTEM耐性機構の臨床的対象である2beに対応する少なくとも1つのペプチドが検出される場合、試料は、CTX−Mタンパク質、またはTEMタンパク質の表現型2beを発現させる細菌を含有する。これらの細菌は、ペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対して耐性である。
【0159】
TEM耐性機構の臨床的対象である2berに対応する少なくとも1つのペプチドが検出される場合、試料は、TEMタンパク質の表現型2berを発現させる細菌を含有する。これらの細菌は、ペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対して耐性であり、クラブラン酸、スルホバクタム、またはタゾバクタムによる阻害に対して非感受性である。
【実施例12】
【0160】
PERβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam74〜Sam78は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表12に示す。
表12:
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【0161】
試料Sam74〜Sam78は、PER耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表13によるペプチドを検出することにより解析する。
表13:
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【0162】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:40.00psi
・加熱ガス:40.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):10.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1秒間
・検出範囲:240秒間
【0163】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表13で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表14で「1」に分類する。トランジションの面積が、表13で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表14で「0」に分類する。
【0164】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表14:
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【0165】
試料Sam74〜Sam78は、PERに特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam74〜Sam78中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例13】
【0166】
VEBβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam79〜Sam82は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表15に示す。
表15:
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【0167】
試料Sam79〜Sam82は、VEB耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表16によるペプチドを検出することにより解析する。
表16:
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【0168】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:40.00psi
・加熱ガス:40.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):10.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1.2秒間
・検出範囲:240秒間
【0169】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表16で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表17で「1」に分類する。トランジションの面積が、表16で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表17で「0」に分類する。
【0170】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表17:
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【0171】
試料Sam79〜Sam82は、VEBに特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam79〜Sam82中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例14】
【0172】
MOXβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam83は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定される。種の同定は、表18に示す。
表18:
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【0173】
試料Sam83は、MOX耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表19によるペプチドを検出することにより解析する。
表19:
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【0174】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:40.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:40.00psi
・加熱ガス:40.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):10.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1秒間
・検出範囲:240秒間
【0175】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表19で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表20で「1」に分類する。トランジションの面積が、表19で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表20で「0」に分類する。
【0176】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表20:
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【0177】
試料Sam83は、MOXに特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam83中に存在する細菌は、この試料にペニシリンおよび第4世代のセファロスポリンを例外としたセファロスポリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例15】
【0178】
ACCβ−ラクタムに対する耐性の同定:
ACC耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0179】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表21によるペプチドを検出することにより解析する。
表21:
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【0180】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例16】
【0181】
ACTβ−ラクタムに対する耐性の同定:
ACT耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0182】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表22によるペプチドを検出することにより解析する。
表22:
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【0183】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例17】
【0184】
CMYβ−ラクタムに対する耐性の同定:
CMY耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0185】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表23によるペプチドを検出することにより解析する。
表23:
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【0186】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例18】
【0187】
CTX−Mβ−ラクタムに対する耐性の同定:
CTX−M耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0188】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表24によるペプチドを検出することにより解析する。
表24:
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【0189】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例19】
【0190】
DHAβ−ラクタムに対する耐性の同定:
DHA耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0191】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表25によるペプチドを検出することにより解析する。
表25:
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【0192】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例20】
【0193】
FOXβ−ラクタムに対する耐性の同定:
FOX耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0194】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表26によるペプチドを検出することにより解析する。
表26:
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【0195】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例21】
【0196】
MIRβ−ラクタムに対する耐性の同定:
MIR耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0197】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表27によるペプチドを検出することにより解析する。
表27:
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【0198】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例22】
【0199】
SHVβ−ラクタムに対する耐性の同定:
SHV耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0200】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表28によるペプチドを検出することにより解析する。
表28:
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【0201】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例23】
【0202】
CARBβ−ラクタムに対する耐性の同定:
CARB耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0203】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表29によるペプチドを検出することにより解析する。
表29:
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【0204】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例24】
【0205】
OXAβ−ラクタムに対する耐性の同定:
OXA耐性機構を含むことが可能な種に対応する試料は、以下の方法を使用することにより検出することができる。
【0206】
各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表30によるペプチドを検出することにより解析する。
表30:
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【0207】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。同じペプチドの3つのトランジションの面積が、2500より大きいかまたはこれに等しい場合、このペプチドの検出を陽性と考え、「1」に分類する。少なくとも1つのトランジションが2500より小さい面積を含む場合、対応するペプチドを非検出と考え、「0」に分類する。
【実施例25】
【0208】
ACCβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam96〜Sam101は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表31に示す。
表31:
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【0209】
試料Sam96〜Sam101は、ACC耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表32によるペプチドを検出することにより解析する。
表32:
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【0210】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:なし
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:50.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):6.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1.32秒間
【0211】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表32で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表33で「1」に分類する。トランジションの面積が、表32で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表33で「0」に分類する。
【0212】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表33:
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【0213】
試料Sam96〜Sam101は、ACCタンパク質に特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam96〜Sam101中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリンおよび第4世代のセファロスポリンを例外としたセファロスポリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例26】
【0214】
CMYβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam102〜Sam108は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表34に示す。
表34:
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【0215】
試料Sam102〜Sam108は、CMY耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表35によるペプチドを検出することにより解析する。
表35:
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【0216】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:50.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):6.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:0.04秒間
・検出範囲:120秒間
【0217】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表35で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表36で「1」に分類する。トランジションの面積が、表35で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表36で「0」に分類する。
【0218】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表36:
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【0219】
試料Sam102〜Sam108は、CMYタンパク質に特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam102〜Sam108中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリンおよび第4世代のセファロスポリンを例外としたセファロスポリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例27】
【0220】
CTX−Mβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam109〜Sam118は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表37に示す。
表37:
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【0221】
試料Sam109〜Sam118は、CTX−M耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表38によるペプチドを検出することにより解析する。
表38:
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【0222】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:50.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):6.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:0.04秒間
・検出範囲:120秒間
【0223】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表38で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表39で「1」に分類する。トランジションの面積が、表38で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表39で「0」に分類する。
【0224】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表39:
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【0225】
試料Sam109〜Sam118は、CTX−Mタンパク質に特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam109〜Sam118中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例28】
【0226】
DHAβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam119〜Sam124は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表40に示す。
表40:
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【0227】
試料Sam119〜Sam124は、DHA耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表41によるペプチドを検出することにより解析する。
表41:
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【0228】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:なし
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:50.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):6.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1.17秒間
【0229】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表41で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表42で「1」に分類する。トランジションの面積が、表41で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表42で「0」に分類する。
【0230】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表42:
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【0231】
試料Sam119〜Sam124は、DHAタンパク質に特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam119〜Sam124中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリン、および第4世代のセファロスポリンを例外としたセファロスポリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例29】
【0232】
FOXβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam125〜Sam130は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表43に示す。
表43:
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【0233】
試料Sam125〜Sam130は、FOX耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表44によるペプチドを検出することにより解析する。
表44:
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【0234】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:なし
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:50.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):6.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1.38秒間
【0235】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表44で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表45で「1」に分類する。トランジションの面積が、表44で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表45で「0」に分類する。
【0236】
所与のペプチドについて、少なくとも2つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表45:
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【0237】
試料Sam125〜Sam130は、FOXタンパク質に特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam125〜Sam130中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリン、および第4世代のセファロスポリンを例外としたセファロスポリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【実施例30】
【0238】
SHVβ−ラクタムに対する耐性の同定:
試料Sam131〜Sam144は、実施例1、3、または4で記載される方法のうちの1つに従い同定する。種の同定は、表46に示す。
表46:
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【0239】
試料Sam131〜Sam144は、SHV耐性機構を含むことが可能な種に対応する。各々の試料を実施例5に従い処理し、次いで、実施例6に従い、表3によるペプチドの代わりに表47によるペプチドを検出することにより解析する。
表47:
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【0240】
用いられる他のマシンパラメータは、以下の通りである:
・走査の種類:MRM
・MRMの設計:あり
・極性:正
・イオン化源:Turbo V(商標)(Applied BioSystems)
・Q1の設定:単位導出によるフィルタリング
・Q3の設定:単位導出によるフィルタリング
・走査間の休止:5.00ミリ秒
・走査速度:10Da/秒
・カーテンガス:50.00psi
・コーン電圧:5500.00V
・イオン源の温度:500.00℃
・噴霧化ガス:50.00psi
・加熱ガス:50.00psi
・解離を誘導する衝突ガス:9.00psi
・ダイナミックフィリング:活性化
・デクラスタリング電位(DP):100.00V
・Q0前のエントリー電位(EP):6.00V
・衝突セルイグジット電位(CXP):15V
・全サイクル時間:1秒間
・検出範囲:120秒間
【0241】
トランジションの各々および研究される微生物の各々について得られる面積を測定した。トランジションの面積が、表47で記載される陽性の閾値より大きいかまたはこれに等しい場合、このトランジションの検出を陽性と考え、表48で「1」に分類する。トランジションの面積が、表47で記載される陽性の閾値より小さい場合、このトランジションを非検出と考え、表48で「0」に分類する。
【0242】
所与のペプチドについて、少なくとも3つのトランジションが「1」に分類される場合、このペプチドは、検出されつつあると考えられる。
表48:
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【0243】
試料Sam131〜Sam144は、SHVタンパク質に特徴的な少なくとも1つのペプチドを含む。したがって、試料Sam131〜Sam144中に存在する細菌は、これらの試料にペニシリンに対する耐性を付与するβ−ラクタマーゼを発現させる。
【0244】
試料Sam142は、表現型2beに特異的なペプチドを含む。したがって、試料Sam142は、ペニシリン、セファロスポリン、およびモノバクタムに対して耐性である。
【0245】
表現型2bおよび2brに特異的なペプチドは観察されず、これらの表現型だけに属するものとして同定される被験試料は見られない。
【0246】
実施例6〜30で記載した検出方法は、多数のペプチドをアッセイし、同時に、1または複数のβ−ラクタマーゼにより誘導される1または複数の耐性機構の存在を検出することを可能とするのに特に有利である。
【0247】
さらに、検出は1時間より短い短時間で実行される。実際、3〜34分後の間の勾配の一部だけが解析に有用である。さらに、アッセイされるペプチドの保持時間は、全て34分間未満である。
【0248】
加えて、実施例6〜30で記載した検出方法は、遺伝子の発現産物を検出するものであり、遺伝子自体を検出するものではないために、分子生物学法より有利である。この遺伝子が発現しないか、または有効な耐性をもたらすには発現が弱すぎる場合、耐性の検出は、いかなる臨床的意味も持ちえない。耐性機構に特徴的なタンパク質を特徴づけるペプチドの検出は、この欠点を有さない。
【0249】
驚くべきことに、上記の実施例は、分子生物学法が用いられる場合に通常である増幅法を使用することなく、質量分析により、試料中に含有される微生物の、少なくとも1つの抗微生物剤に対する耐性の機構の存在の特異的な検出に必要な感度を達成しうることを示す。
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【配列表】
[この文献には参照ファイルがあります.J-PlatPatにて入手可能です(IP Forceでは現在のところ参照ファイルは掲載していません)]