(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
(a)SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:45、もしくはSEQ ID NO:62に対して少なくとも90%の配列同一性を有する重鎖可変領域;および
(b)SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:17、またはSEQ ID NO:72に対して少なくとも95%の配列同一性を有する軽鎖可変領域 を含む、請求項1記載の抗体。
(a)SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:86、SEQ ID NO:17、もしくはSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域;
(b)SEQ ID NO:15を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:17もしくはSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域;
(c)SEQ ID NO:16を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:17もしくはSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域;
(d)SEQ ID NO:36を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:17もしくはSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域;
(e)SEQ ID NO:37を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:17もしくはSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域;
(f)SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域;
(g)SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域;およびSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域
を含む、請求項2記載の抗体。
PTA-120420としてATCCに寄託されたプラスミドによってコードされる重鎖可変領域、およびPTA-120421としてATCCに寄託されたプラスミドによってコードされる軽鎖可変領域を含み、ヒトRSPO3に特異的に結合する、抗体。
対象における腫瘍成長の阻害、腫瘍細胞の分化の誘導、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度の低下、または癌の処置のための薬剤の製造における、請求項1〜8のいずれか一項記載の抗体の使用。
腫瘍または癌が、結腸直腸腫瘍または結腸直腸癌、卵巣腫瘍または卵巣癌、膵腫瘍または膵癌、肺腫瘍または肺癌、肝腫瘍または肝癌、乳房腫瘍または乳癌、腎腫瘍または腎癌、前立腺腫瘍または前立腺癌、胃腸管腫瘍または胃腸管癌、黒色腫または癌、子宮頸部腫瘍または子宮頸癌、膀胱腫瘍または膀胱癌、神経膠芽腫、および頭頸部腫瘍または頭頸部癌からなる群より選択される、請求項12記載の方法または請求項13記載の使用。
腫瘍成長の阻害、腫瘍細胞の分化の誘導、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度の低下、または癌の処置が、少なくとも一種類のさらなる治療剤の投与を含む、請求項13または14記載の使用。
【発明を実施するための形態】
【0044】
発明の詳細な説明
本発明は、RSPOタンパク質、特にヒトRSPO3に結合する抗体などのポリペプチドを含むがそれに限定されるわけではない新規な剤を提供する。RSPO3結合剤には、β-カテニンシグナル伝達のアンタゴニストが含まれるが、それに限定されるわけではない。RSPO3結合剤には、RSPO3とLGRタンパク質との相互作用の阻害剤が含まれるが、それに限定されるわけではない。関連するポリペプチドおよびポリヌクレオチド、RSPO3結合剤を含む組成物、ならびにRSPO3結合剤を作製する方法も提供される。新規RSPO3結合剤を使用する方法(例えば、腫瘍成長を阻害する方法、癌を処置する方法、血管新生を調節する方法、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度を低下させる方法、β-カテニンシグナル伝達を阻害する方法、ならびに/または処置するための対象を特定するおよび/もしくは選択する方法)がさらに提供される。
【0045】
ヒトRSPO3に特異的に結合するモノクローナル抗体が同定された(モノクローナル抗体131R002および131R003)(実施例3)。抗RSPO3抗体131R002および131R003は、ヒトRSPO3に対して10 nM未満の結合親和性を有する(実施例3)。抗RSPO3抗体131R002および131R003は、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を阻害する(実施例4、
図3)。131R003の親和性成熟変異体は、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を阻害し、親131R003よりも高い親和性を有する(実施例5、
図4)。抗RSPO3抗体は、単剤として、抗RSPO1抗体との併用で、および1種または複数種の化学療法剤との併用で、腫瘍成長を阻害する(実施例6、7、11、12、および14;
図5〜7、10〜12、および14)。ヒト化抗RSPO3抗体h131R006およびh131R007は、抗体131R002よりも強力なβ-カテニン活性の阻害剤である(実施例8、
図8)。抗RSPO3抗体h131R006およびh131R007は、LGR5へのRSPO3の結合を遮断する(実施例9、
図9)。ヒト化抗RSPO3抗体h131R010アイソタイプIgG1は、IgG2アイソタイプ抗体h131R007と同様にβ-カテニン活性を阻害する(実施例13、
図13)。
【0046】
I. 定義
本発明の理解を促すために、いくつかの用語および句を下記で定義する。
【0047】
本明細書において使用される用語「アンタゴニスト」および「アンタゴニストの」は、標的の生物学的活性および/またはシグナル経路(例えば、β-カテニンシグナル伝達)を部分的にまたは完全に遮断する、阻害する、減少させる、または中和する任意の分子を指す。用語「アンタゴニスト」は、タンパク質(例えば、RSPOタンパク質)の活性を部分的にまたは完全に遮断する、阻害する、減少させる、または中和する任意の分子を包含するために本明細書において使用される。好適なアンタゴニスト分子としては、具体的には、アンタゴニスト抗体または抗体断片が挙げられるが、それに限定されるわけではない。
【0048】
本明細書において使用される用語「調節」および「調節する」は、生物学的活性の変化または変更を指す。調節には、活性の刺激または阻害が含まれるが、それに限定されるわけではない。調節は、活性の増加もしくは減少(例えば、RSPOシグナル伝達の減少;β-カテニンシグナル伝達の減少)、結合特性の変化、または、タンパク質、経路、もしくは他の関心対象となる生物学的特質の活性に関連する生物学的、機能的、もしくは免疫学的特性におけるその他の任意の変化であり得る。
【0049】
本明細書において使用される用語「抗体」は、標的(例えば、タンパク質、ポリペプチド、ペプチド、炭水化物、ポリヌクレオチド、脂質、または前述のものの組み合わせ)を免疫グロブリン分子の可変領域内の少なくとも1つの抗原結合部位を介して認識するおよび特異的に結合する免疫グロブリン分子を指す。本明細書において使用されるとき、この用語は、インタクトなポリクローナル抗体、インタクトなモノクローナル抗体、単鎖抗体、抗体断片(例えば、Fab、Fab'、F(ab')2、およびFv断片)、一本鎖Fv(scFv)抗体、多重特異性抗体(例えば二重特異性抗体)、単一特異的(monospecific)抗体、一価抗体、キメラ抗体、ヒト化抗体、ヒト抗体、抗体の抗原結合部位を含む融合タンパク質、および抗原認識部位(すなわち抗原結合部位)を含む他の任意の改変された免疫グロブリン分子を、それらの抗体が所望の生物学的活性を示す限り包含する。抗体は、免疫グロブリンの5つの主要なクラス:それぞれアルファ、デルタ、イプシロン、ガンマ、およびミューと呼ばれるそれらの重鎖定常ドメインの独自性に基づいて、IgA、IgD、IgE、IgG、およびIgMまたはそれらのサブクラス(アイソタイプ)(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgA1、およびIgA2)のいずれかであり得る。異なるクラスの免疫グロブリンは、異なる周知のサブユニット構造および3次元配置を有する。抗体は、裸で存在し得るか、または他の分子(トキシンおよび放射性同位体を含むがそれに限定されるわけではない)にコンジュゲートされ得る。
【0050】
用語「抗体断片」は、インタクトな抗体の一部を指し、インタクトな抗体の抗原性決定可変領域を指す。抗体断片の例としては、Fab、Fab'、F(ab')2、およびFv断片、鎖状抗体、一本鎖抗体、ならびに抗体断片から形成される多重特異性抗体が挙げられるが、それに限定されるわけではない。本明細書において使用される「抗体断片」は、抗原結合部位またはエピトープ結合部位を含む。
【0051】
抗体の「可変領域」という用語は、単独のまたは組み合わせた、抗体軽鎖の可変領域または抗体重鎖の可変領域を指す。重鎖および軽鎖の可変領域の各々は、「超可変領域」としても知られる3つの相補性決定領域(CDRs)によって接続された4つのフレームワーク領域(FR)からなる。各鎖におけるCDRは、フレームワーク領域によって互いに近接して保持され、他の鎖のCDRとともに抗体の抗原結合部位の形成に寄与する。CDRを決定するための手法は少なくとも2つある:(1)異種間の配列多様性に基づくアプローチ(すなわち、Kabat et al., 1991, Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Edition, National Institutes of Health, Bethesda MD.)、および(2)抗原抗体複合体の結晶学的研究に基づくアプローチ(Al-Lazikani et al., 1997, J. Mol. Biol., 273: 927-948)。さらに、これらの2つのアプローチの組み合わせが時折、CDRを決定するために当技術分野において使用される。
【0052】
本明細書において使用される用語「モノクローナル抗体」は、単一の抗原決定基またはエピトープの高度に特異的な認識および結合に関わる均質の抗体集団を指す。これは、様々な異なる抗原決定基に対する異なる抗体の混合物を通常含むポリクローナル抗体と対照的である。用語「モノクローナル抗体」は、インタクトなおよび完全長の両方のモノクローナル抗体、ならびに抗体断片(例えば、Fab、Fab'、F(ab')2、Fv)、一本鎖(scFv)抗体、二重特異性抗体、抗体部分を含む融合タンパク質、および抗原認識部位(抗原結合部位)を含む他の任意の改変された免疫グロブリン分子を包含する。さらに、「モノクローナル抗体」は、任意の数の手法(ハイブリドーマ産生、ファージ選択、組換え発現、およびトランスジェニック動物を含むがそれに限定されるわけではない)によって作製されるそのような抗体を指す。
【0053】
本明細書において使用される用語「ヒト化抗体」は、最小の非ヒト配列を含む、特異的な免疫グロブリン鎖、キメラ免疫グロブリン、またはそれらの断片である、非ヒト(例えば、マウス)抗体の形態を指す。典型的には、ヒト化抗体は、CDRの残基が、所望の特異性、親和性、および/または結合能を有する非ヒト種(例えば、マウス、ラット、ウサギ、またはハムスター)のCDR由来の残基によって置換されたヒト免疫グロブリンである(Jones et al., 1986, Nature, 321: 522-525; Riechmann et al., 1988, Nature, 332: 323-327; Verhoeyen et al., 1988, Science, 239: 1534-1536)。場合によっては、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク領域残基は、所望の特異性、親和性、構造、および/または結合能を有する非ヒト種由来の抗体内の対応する残基で置換される。ヒト化抗体は、抗体の特異性、親和性、構造、および/または結合能を洗練させるおよび最適化するために、Fvフレームワーク領域におけるおよび/または置換された非ヒト残基内におけるさらなる残基の置換によってさらに改変され得る。通常、ヒト化抗体は、非ヒト免疫グロブリンに対応するCDRの少なくとも1つ、および典型的には2つまたは3つを実質的に全て含む一方、フレームワーク領域の全てまたは実質的に全てがヒト免疫グロブリンのコンセンサス配列のものである。ヒト化抗体はまた、免疫グロブリンの定常領域またはドメイン(Fc)の少なくとも一部、典型的にはヒト免疫グロブリンの少なくとも一部を含み得る。ヒト化抗体を作製するために使用される方法の例は、例えば、米国特許第5,225,539号に記載されている。
【0054】
本明細書において使用される用語「ヒト抗体」は、ヒトによって産生される抗体、またはヒトによって産生される抗体に対応するアミノ酸配列を有する抗体を指す。ヒト抗体は、当技術分野において公知の任意の手法を使用して作製され得る。ヒト抗体のこの定義は、非ヒトCDRを含むヒト化抗体を明確に排除する。
【0055】
本明細書において使用される用語「キメラ抗体」は、免疫グロブリン分子のアミノ酸配列が2つ以上の種に由来する抗体を指す。典型的には、軽鎖と重鎖の両方の可変領域が、所望の特異性、親和性、および/または結合能を有する哺乳動物の1つの種(例えば、マウス、ラット、ウサギなど)に由来する抗体の可変領域に対応するが、定常領域は、別の種(通常、ヒト)に由来する抗体における配列に対応する。
【0056】
本明細書において使用される句「親和性成熟抗体」は、変更を有しない親抗体と比べて、抗原に対するその抗体の親和性を改善する1つまたは複数の変更を1つまたは複数のCDRに有する抗体を指す。この定義は、CDR残基に対する変更に関連して作製された非CDR残基における変更も含む。好ましい親和性成熟抗体は、標的抗原に対してナノモルまたはピコモルの親和性を有する。親和性成熟抗体は、当技術分野において公知の手順によって作製される。例えば、Marks et al., 1992, Bio/Technology 10: 779-783は、VHおよびVLドメインのシャフリングによる親和性成熟を記載している。CDRおよび/またはフレームワーク残基のランダム突然変異誘発は、Barbas et al., 1994, PNAS, 91: 3809-3813; Schier et al., 1995, Gene, 169: 147-155; Yelton et al., 1995, J. Immunol. 155: 1994-2004; Jackson et al., 1995, J. Immunol., 154: 3310-9;およびHawkins et al., 1992, J. Mol. Biol., 226: 889-896によって記載されている。部位特異的突然変異誘発もまた親和性成熟抗体を得るために使用され得る。
【0057】
用語「エピトープ」および「抗原決定基」は、本明細書において交換可能に使用され、特定の抗体によって認識されることおよび特異的に結合されることができる抗原の部分を指す。抗原がポリペプチドであるとき、エピトープは、タンパク質の三次フォールディングによって並置される連続したアミノ酸と不連続のアミノ酸の両方から形成され得る。連続したアミノ酸から形成されるエピトープ(直鎖状エピトープとも呼ばれる)は、典型的には、タンパク質が変性されても保持されるのに対し、三次フォールディングによって形成されたエピトープ(立体構造エピトープとも呼ばれる)は、典型的には、タンパク質が変性されると失われる。エピトープは、典型的には、特有の空間的立体構造において、少なくとも3個およびそれ以上、通常、少なくとも5または8〜10個のアミノ酸を含む。
【0058】
用語「ヘテロ多量体分子」または「ヘテロ多量体」または「ヘテロ多量体複合体」または「ヘテロ多量体ポリペプチド」は、本明細書において交換可能に使用されて、少なくとも第1ポリペプチドおよび第2ポリペプチドを含む分子を指し、この場合、該第2ポリペプチドのアミノ酸配列は該第1ポリペプチドと少なくとも1アミノ酸残基だけ異なる。ヘテロ多量体分子は、第1ポリペプチドおよび第2ポリペプチドによって形成される「ヘテロ二量体」を含んでもよく、またはさらなるポリペプチドが存在するより高次の三次構造を形成してもよい。
【0059】
用語「選択的に結合する」または「特異的に結合する」は、結合剤または抗体が、無関係のタンパク質を含む代替の物質と比べて、エピトープ、タンパク質または標的分子に、より頻繁に、より迅速に、より長い時間にわたって、より高い親和性で、または上記のもののいくつかの組み合わせで、反応するかまたは会合することを意味する。ある特定の態様において、「特異的に結合する」は、例えば、抗体が、約0.1mMまたはそれ以下、より通常では約1μM未満のK
Dでタンパク質に結合することを意味する。ある特定の態様において、「特異的に結合する」は、抗体が、ある時には少なくとも約0.1μMもしくはそれ以下、またある時には少なくとも約0.01μMもしくはそれ以下、およびまたある時には少なくとも約1nMまたはそれ以下のK
Dで標的に結合することを意味する。異なる種における相同タンパク質間の配列同一性のおかげで、特異的結合は、2以上の種におけるタンパク質(例えば、ヒトRSPO3およびマウスRSPO3)を認識する抗体を含み得る。同様に、異なるタンパク質のポリペプチド配列のある特定の領域内の相同性のおかげで、特異的結合は、2以上のタンパク質(例えば、ヒトRSPO3およびヒトRSPO1)を認識する抗体(または他のポリペプチドまたは結合剤)を含み得る。ある特定の態様において、第1の標的に特異的に結合する抗体または結合部分は、第2の標的に特異的に結合することもあるし、しないこともあることが理解される。よって、「特異的結合」は、必ずしも排他的結合、すなわち、単一標的への結合を要求しない(が、それを含み得る)。したがって、抗体は、ある特定の態様において、2以上の標的に特異的に結合し得る。ある特定の態様において、複数の標的が、抗体上の同じ抗原結合部位によって結合され得る。例えば、抗体は、ある特定の場合において、2つの同一の抗原結合部位を含むことがあり、その各々が、2つ以上のタンパク質(例えば、RSPO3およびRSPO1)上の同じエピトープに特異的に結合する。ある特定の代替の態様において、抗体は多重特異性であり得、異なる特異性を有する少なくとも2つの抗原結合部位を含む。非限定的な例として、二重特異性抗体は、1つのタンパク質(例えば、ヒトRSPO3)上のエピトープを認識する1つの抗原結合部位を含み、第2のタンパク質(例えば、ヒトRSPO2)上の異なるエピトープを認識する第2の異なる抗原結合部位をさらに含むことがある。通常、結合に対する言及は、特異的結合を意味するが、必ずしもそうではない。
【0060】
用語「ポリペプチド」および「ペプチド」および「タンパク質」は、本明細書において交換可能に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。ポリマーは、直鎖状であっても分枝状であってもよく、修飾されたアミノ酸を含んでもよく、非アミノ酸によって中断されてもよい。それらの用語は、天然にまたは介入によって改変されたアミノ酸ポリマー;例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、アセチル化、リン酸化、または他の任意の操作もしくは修飾(例えば、標識成分とのコンジュゲート)も包含する。例えば、アミノ酸の1つまたは複数のアナログ(例えば、非天然アミノ酸を含む)ならびに当技術分野において公知の他の修飾を含むポリペプチドもこの定義に含められる。本発明のポリペプチドは、抗体に基づくことがあるので、ある特定の態様において、ポリペプチドは、一本鎖または会合した鎖として存在することができることが理解される。
【0061】
用語「ポリヌクレオチド」および「核酸」は、本明細書において交換可能に使用され、任意の長さのヌクレオチドのポリマーを指し、DNAおよびRNAを含む。ヌクレオチドは、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、改変されたヌクレオチドもしくは塩基、および/またはそれらのアナログ、あるいはDNAまたはRNAポリメラーゼによってポリマーに組み込まれ得る任意の基質であり得る。
【0062】
「高ストリンジェンシーの条件」は、(1)洗浄に低イオン強度および高温を使用する条件、例えば、50℃での、15mM NaCl/1.5mMクエン酸ナトリウム/0.1%ドデシル硫酸ナトリウム;(2)ハイブリダイゼーション中に、例えば、ホルムアミドなどの変性剤、例えば、5×SSC(0.75M NaCl、75mMクエン酸ナトリウム)中、0.1%ウシ血清アルブミン/0.1%Ficoll/0.1%ポリビニルピロリドン/50mMリン酸ナトリウム緩衝液pH6.5を含む50%(v/v)ホルムアミドを、42℃で使用する条件;または(3)ハイブリダイゼーション中に、42℃で、5×SSC中50%ホルムアミド、50mMリン酸ナトリウム(pH6.8)、0.1%ピロリン酸ナトリウム、5×デンハート液、超音波処理されたサケ精子DNA(50μg/ml)、0.1%SDS、および10%デキストラン硫酸を、55℃での、EDTAを含む0.1×SSCからなる高ストリンジェンシー洗浄が次に続く42℃での0.2×SSCおよび50%ホルムアミドにおける洗浄とともに使用する条件、によって特定され得る。
【0063】
2つ以上の核酸またはポリペプチドの文脈における用語「同一」またはパーセント「同一性」は、配列同一性の部分としていかなる保存的アミノ酸置換も考慮せずに、対応が最大になるように(必要であれば、ギャップを導入して)比較およびアラインメントされた場合、同じであるか、または、同じであるヌクレオチドもしくはアミノ酸残基を特定のパーセンテージで有する、2つ以上の配列または部分配列を指す。同一性パーセントは、配列比較ソフトウェアもしくはアルゴリズムを使用して、または目視検査によって、測定され得る。アミノ酸配列またはヌクレオチド配列のアラインメントを得るために使用され得る様々なアルゴリズムおよびソフトウェアが、当技術分野において周知である。これらとしては、BLAST、ALIGN、Megalign、BestFit、GCG Wisconsin Package、およびそれらの変化物が挙げられるが、それに限定されるわけではない。いくつかの態様において、本発明の2つの核酸またはポリペプチドは実質的に同一であり、このことは、対応が最大になるように比較およびアラインメントされた場合に、これらが、配列比較アルゴリズムを使用してまたは目視検査によって測定される、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%の、およびいくつかの態様において少なくとも95%、96%、97%、98%、99%のヌクレオチドまたはアミノ酸残基同一性を有することを、意味する。いくつかの態様において、同一性は、少なくとも約10、少なくとも約20、少なくとも約40〜60残基、少なくとも約60〜80残基長またはそれらの間の任意の整数値の配列の領域にわたって存在する。いくつかの態様において、同一性は、60〜80残基より長い領域(例えば、少なくとも約80〜100残基)にわたって存在し、いくつかの態様において、それらの配列は、比較される配列の完全長(例えば、ヌクレオチド配列のコード領域)にわたって実質的に同一である。
【0064】
「保存的アミノ酸置換」は、1つのアミノ酸残基が、類似の側鎖を有する別のアミノ酸残基で置換される置換である。塩基性側鎖(例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、無電荷極性側鎖(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、トレオニン、チロシン、システイン)、非極性側鎖(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、ベータ分枝側鎖(例えば、トレオニン、バリン、イソロイシン)、および芳香族側鎖(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を含む類似の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当技術分野において定義されている。例えば、フェニルアラニンへのチロシンの置換は、保存的置換である。好ましくは、本発明のポリペプチドおよび抗体の配列における保存的置換は、該ポリペプチドまたは抗体が結合する抗原、すなわち、1つまたは複数のRSPOタンパク質への、そのアミノ酸配列を含むポリペプチドまたは抗体の結合を無効にしない。抗原結合を取り消さないヌクレオチドおよびアミノ酸の保存的置換を特定する方法は、当技術分野において周知である。
【0065】
本明細書において使用される用語「ベクター」は、宿主細胞において関心対象の1つまたは複数の遺伝子または配列を送達することができ、かつ通常は発現することができる、コンストラクトのことを意味する。ベクターの例としては、ウイルスベクター、裸のDNAもしくはRNA発現ベクター、プラスミド、コスミド、またはファージベクター、カチオン性縮合剤と会合したDNAもしくはRNA発現ベクター、およびリポソームに被包されたDNAまたはRNA発現ベクターが挙げられるが、それに限定されるわけではない。
【0066】
「単離された」ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、または組成物は、天然には見られない形態の、ポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、または組成物である。単離されたポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、または組成物には、それらがもはや天然に見られる形態ではない程度にまで精製されたものが含まれる。いくつかの態様において、単離されたポリペプチド、抗体、ポリヌクレオチド、ベクター、細胞、または組成物は、実質的に純粋である。
【0067】
本明細書において使用される用語「実質的に純粋」は、少なくとも50%純粋(すなわち、夾雑物を含まない)、少なくとも90%純粋、少なくとも95%純粋、少なくとも98%純粋、または少なくとも99%純粋である材料を指す。
【0068】
本明細書において使用される用語「癌」および「癌性」は、制御されない細胞の成長によって細胞の集団が特徴づけられる、哺乳動物における生理学的状態を指すかまたは説明する。癌の例としては、癌腫、芽腫、肉腫、および血液癌(例えば、リンパ腫および白血病)が挙げられるが、それに限定されるわけではない。
【0069】
本明細書において使用される用語「腫瘍」および「新生物」は、良性(癌性でない)または前癌病変を含む悪性(癌性)のいずれかの、過剰な細胞成長または増殖に起因する、組織の任意の塊を指す。
【0070】
本明細書において使用される用語「転移」は、癌が、起源の部位から身体の他の領域に広がるまたは移行するプロセス(新しい位置での同様の癌性病変の発生を伴う)を指す。「転移」細胞または「転移する」細胞は、隣接する細胞との付着性の接触を失っており、かつ疾患の原発部位から血流またはリンパ液を介して遊走し隣接する身体構造に浸潤する細胞である。
【0071】
用語「癌幹細胞」および「CSC」および「腫瘍幹細胞」および「腫瘍開始細胞」は、本明細書において交換可能に使用され、(1)幅広い増殖能力を有する;2)非対称性の細胞分裂を起こして、1つまたは複数のタイプの分化細胞の子孫を産生することができる(ここで、該分化細胞の増殖または発生の潜在能力は低下している);および(3)自己複製または自己保全のための対称性の細胞分裂を起こすことができる、癌または腫瘍由来の細胞を指す。これらの特性により癌幹細胞は、腫瘍を形成できない大多数の腫瘍細胞と比べて、免疫無防備状態の宿主(例えば、マウス)に累代移植されると腫瘍または癌を形成するまたは確立する能力を与えられる。癌幹細胞は、分化に対して自己複製を無秩序な様式で起こし、変異が生じるにつれて経時的に変化し得る異常な細胞型の腫瘍を形成する。
【0072】
用語「癌細胞」および「腫瘍細胞」は、癌細胞集団の大部分を構成する非腫瘍形成性細胞と、腫瘍形成性幹細胞(癌幹細胞)の両方を含む、癌または腫瘍または前癌病変に由来する細胞の集団全体を指す。本明細書において使用されるとき、用語「癌細胞」または「腫瘍細胞」は、癌幹細胞と腫瘍細胞を区別するために、再生および分化する能力を欠く細胞のことを単独で指すときは用語「非腫瘍形成性」によって修飾される。
【0073】
本明細書において使用される用語「腫瘍形成性」は、他の全ての腫瘍細胞を産生する(分化した腫瘍細胞およびひいては非腫瘍形成性の腫瘍細胞を生じる)自己複製(さらなる腫瘍形成性の癌幹細胞を生じる)および増殖の特性を含む、癌幹細胞の機能的特性を指す。
【0074】
本明細書において使用される用語「腫瘍形成能」は、免疫無防備状態の宿主(例えば、マウス)に累代移植されると、腫瘍由来の細胞のランダムな試料が明白な腫瘍を形成する能力を指す。この定義はまた、免疫無防備状態の宿主(例えば、マウス)への累代移植の際に明白な腫瘍を形成する、濃縮されたおよび/または単離された癌幹細胞集団も含む。
【0075】
用語「対象」は、任意の動物(例えば、哺乳動物)を指し、それは、特定の処置のレシピエントになる予定のヒト、非ヒト霊長類、イヌ、ネコ、げっ歯類などを含むがそれに限定されるわけではない。典型的には、用語「対象」および「患者」は、ヒト対象に対する言及において本明細書において交換可能に使用される。
【0076】
用語「薬学的に許容される」は、連邦政府もしくは州政府の規制当局によって承認されている(もしくは承認可能な)生成物もしくは化合物、またはヒトを含む動物において使用するために米国薬局方または他の一般に認識されている薬局方に列挙されていることを指す。
【0077】
用語「薬学的に許容される賦形剤、担体、または佐剤」または「許容される薬学的担体」は、本開示の少なくとも一種類の結合剤(例えば、抗体)とともに対象に投与することができ、かつこの結合剤の活性を破壊しない賦形剤、担体、または佐剤を指す。この賦形剤、担体、または佐剤は、かつ治療効果を送達するのに十分な用量で結合剤とともに投与された場合には無毒性であるべきである。
【0078】
用語「有効量」または「治療有効量」または「治療効果」は、対象または哺乳動物における疾患または障害を「処置する」のに有効な、結合剤、抗体、ポリペプチド、ポリヌクレオチド、有機小分子、または他の薬物の量を指す。癌の場合、治療有効量の薬物(例えば、抗体)は、治療効果を有し、よって、癌細胞の数を減少させることができる;腫瘍形成能、腫瘍形成頻度もしくは腫瘍形成能力を減少させることができる;癌幹細胞の数もしくは発生頻度を低下させることができる;腫瘍サイズを減少させることができる;癌細胞集団を減少させることができる;末梢器官への癌細胞の浸潤(例えば、軟部組織および骨への癌の伝播を含む)を阻害することおよび/もしくは停止することができる;腫瘍もしくは癌細胞の転移を阻害することおよび/もしくは停止することができる;腫瘍もしくは癌細胞の成長を阻害することおよび/もしくは停止することができる;癌に関連する症状の1つまたは複数をある程度軽減することができる;病的状態および死亡を減少させることができる;生活の質を改善することができる;またはそれらの効果の組み合わせである。その剤、例えば、抗体が、成長を予防する限りおよび/または既存の癌細胞を殺滅する限り、それは、細胞分裂抑制および/または細胞傷害性と呼ぶことができる。
【0079】
用語「処置する(treating)」または「処置」または「処置する(to treat)」または「緩和する(alleviating)」または「緩和する(to alleviate)」は、1)診断された病的な状態または障害を治癒する、減速する、その症状を和らげる、かつ/またはその進行を停止する治療的方法と、2)標的にされている病的な状態または障害の発生を予防するかまたは遅延させる予防的または防止的な方法の両方を指す。したがって、処置の必要がある者には、すでにその障害を有する者;その障害を有する傾向がある者;およびその障害が予防されるべき者が含まれる。いくつかの態様において、患者が以下のうちの1つまたは複数を示す場合、対象は、本発明の方法による「処置」に成功している:癌細胞の数の減少もしくは癌細胞が完全に無くなること;腫瘍サイズの減少;軟部組織および骨への癌細胞の伝播を含む末梢器官への癌細胞浸潤の阻害もしくはそれが無くなること;腫瘍または癌細胞の転移の阻害もしくはそれが無くなること;癌の成長の阻害もしくは癌が成長しなくなること;特定の癌に関連する1つもしくは複数の症状の軽減; 病的状態および死亡の減少;生活の質の改善;腫瘍形成能の低下;癌幹細胞の数もしくは発生頻度の低下;または効果のいくつかの組み合わせ。
【0080】
本開示および特許請求の範囲において使用される際、単数形「1つの」、「ある」および「その」は、文脈が明らかに他のことを示さない限り、複数形を含む。
【0081】
態様が、語「〜を含む」を用いて本明細書において記載される場合は必ず、「〜からなる」および/または「〜から本質的になる」に関して記載される別途類似の態様も提供されることが理解される。態様が、語「〜から本質的になる」を用いて本明細書において記載される場合は必ず、「〜からなる」に関して記載される別途類似の態様も提供されることもまた理解される。
【0082】
本明細書における「Aおよび/またはB」などの句において使用される用語「および/または」は、AとBの両方;AまたはB;A(単独);およびB(単独)を包含することを意図している。同様に、「A、B、および/またはC」などの句において使用される用語「および/または」は、以下の態様の各々を包含することを意図している:A、B、およびC;A、B、またはC;AまたはC;AまたはB;BまたはC:AおよびC;AおよびB;BおよびC;A(単独);B(単独);ならびにC(単独)。
【0083】
II. RSPO結合剤
本発明は、ヒトRSPOタンパク質に特異的に結合する剤を提供する。これらの剤は、本明細書において「RSPO結合剤」と呼ばれる。いくつかの態様において、RSPO結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO結合剤はポリペプチドである。ある特定の態様において、RSPO結合剤はRSPO3に結合する(「RSPO3結合剤」)。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、少なくとも1種の他のヒトRSPOに特異的に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤によって結合される少なくとも1種の他のヒトRSPOは、RSPO1、RSPO2、およびRSPO4からなる群より選択される。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO1、RSPO2、および/またはRSPO4上の共通のエピトープに結合する抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3上の第1エピトープに結合し、かつRSPO1、RSPO2、および/またはRSPO4上の第2の異なるエピトープに結合する二重特異性抗体である。ヒトRSPO1、RSPO2、RSPO3、およびRSPO4に対する完全長アミノ酸(aa)配列は、当技術分野において公知であり、SEQ ID NO:1(RSPO1)、SEQ ID NO:2(RSPO2)、SEQ ID NO:3(RSPO3)、およびSEQ ID NO:4(RSPO4)として本明細書において提供される。
【0084】
ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO結合剤(例えば、抗体または二重特異性抗体)の抗原結合部位は、1、2、3、または4種のRSPOに結合することができる(または結合する)。ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO結合剤(例えば、抗体または二重特異性抗体)の抗原結合部位は、RSPO3、ならびに1、2、または3種の他のRSPOに結合することができる(または結合する)。例えば、ある特定の態様において、RSPO3結合剤の抗原結合部位は、RSPO3、ならびにRSPO1、RSPO2、およびRSPO4からなる群より選択される少なくとも1種の他のRSPOに特異的に結合することができる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3およびRSPO1に特異的に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3およびRSPO2に特異的に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3およびRSPO4に特異的に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3、RSPO1、およびRSPO2に特異的に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3、RSPO1、およびRSPO4に特異的に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3、RSPO2、およびRSPO4に特異的に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、ヒトRSPO3とマウスRSPO3の両方に特異的に結合する。
【0085】
ある特定の態様において、抗原結合剤は、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の範囲内に特異的に結合する抗体である。ある特定の態様において、抗原結合剤は、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜207の範囲内に特異的に結合する抗体である。ある特定の態様において、抗原結合剤は、ヒトRSPO3のアミノ酸35〜135の範囲内に特異的に結合する抗体である。ある特定の態様において、抗原結合剤は、ヒトRSPO3のアミノ酸35〜86の範囲内に特異的に結合する抗体である。ある特定の態様において、抗原結合剤は、ヒトRSPO3のアミノ酸92〜135の範囲内に特異的に結合する抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:5の範囲内に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、RSPO3のフューリン様システインリッチドメインに結合する。いくつかの態様において、前記剤または抗体は、RSPO3のフューリン様システインリッチドメイン内の少なくとも1つのアミノ酸に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、SEQ ID NO:6またはSEQ ID NO:7の配列内に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、SEQ ID NO:6およびSEQ ID NO:7の配列内に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3のトロンボスポンジンドメインに結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、RSPO3のトロンボスポンジンドメイン内の少なくとも1つのアミノ酸に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、SEQ ID NO:8の範囲内に結合する。
【0086】
ある特定の態様において、RSPO結合剤または抗体は、約1μMもしくはそれ以下、約100nMもしくはそれ以下、約40nMもしくはそれ以下、約20nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下の解離定数(K
D)で少なくとも1種のRSPOタンパク質に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約1μMもしくはそれ以下、約100nMもしくはそれ以下、約40nMもしくはそれ以下、約20nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下の解離定数(K
D)でRSPO3に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約20nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約10nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約1nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約0.5nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約0.1nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合する。ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO3結合剤または抗体は、少なくとも1種の他のRSPOに結合する。ある特定の態様において、少なくとも1種の他のRSPOに結合する本明細書において記載されるRSPO3結合剤または抗体は、約100nMもしくはそれ以下、約20nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下のK
Dで少なくとも1種の他のRSPOに結合する。例えば、いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、RSPO1、RSPO2、および/またはRSPO4にも約10nMまたはそれ以下のK
Dで結合する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、約10nMまたはそれ以下のK
DでヒトRSPOとマウスRSPOの両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約1nMまたはそれ以下のK
DでヒトRSPO3とマウスRSPO3の両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約0.1nMまたはそれ以下のK
DでヒトRSPO3とマウスRSPO3の両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3タンパク質に対する結合剤(例えば、抗体)の解離定数は、Biacoreチップ上に固定化されたRSPO3タンパク質の少なくとも一部を含むRSPO3融合タンパク質を使用して測定された解離定数である。いくつかの態様において、RSPO3タンパク質に対する結合剤(例えば、抗体)の解離定数は、Biacoreチップ上の抗ヒトIgG抗体によって捕捉された該結合剤およびRSPO3タンパク質を使用して測定された解離定数である。
【0087】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位および第2標的に特異的に結合する第2抗原結合部位を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約100nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3と第2標的の両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約50nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3と第2標的の両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約20nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3と第2標的の両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約10nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3と第2標的の両方に結合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、約1nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3と第2標的の両方に結合する。いくつかの態様において、抗原結合部位のうちの一方の親和性は、他方の抗原結合部位の親和性よりも低くてよい。例えば、一方の抗原結合部位のK
Dは約1nMであってよく、第2抗原結合部位のK
Dは約10nMであってよい。いくつかの態様において、2つの抗原結合部位間の親和性の違いは、約2倍もしくはそれ以上、約3倍もしくはそれ以上、約5倍もしくはそれ以上、約8倍もしくはそれ以上、約10倍もしくはそれ以上、約15倍もしくはそれ以上、約20倍もしくはそれ以上、約30倍もしくはそれ以上、約50倍もしくはそれ以上、または約100倍もしくはそれ以上であってよい。2つの抗原結合部位の親和性の調節は、二重特異性抗体の生物学的活性に影響を及ぼし得る。例えば、RSPO3または第2標的に対する抗原結合部位の親和性を低下させることは、望ましい効果、例えば、結合剤の低下した毒性および/または増加した治療指数を有し得る。
【0088】
非限定的な例として、二重特異性抗体は、(a)約0.1nM〜約10nMのK
DでヒトRSPO3に結合する第1抗原結合部位、および(b)約0.1nM〜約20nM、約0.5nM〜約20nM、または約1.0nM〜約10nMのK
Dで第2標的(例えば、ヒトRSPO2)に特異的に結合する第2抗原結合部位を含み得る。
【0089】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、約1μMもしくはそれ以下、約100nMもしくはそれ以下、約40nMもしくはそれ以下、約20nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下の最大半量有効濃度(EC
50)で少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、約1μMもしくはそれ以下、約100nMもしくはそれ以下、約40nMもしくはそれ以下、約20nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMまたはそれ以下の最大半量有効濃度(EC
50)でヒトRSPO3に結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、約40nMもしくはそれ以下、約20nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下のEC
50でヒトRSPO1、RSPO2、および/またはRSPO4にも結合する。
【0090】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体である。いくつかの態様において、抗体は、組換え抗体である。いくつかの態様において、抗体は、モノクローナル抗体である。いくつかの態様において、抗体は、キメラ抗体である。いくつかの態様において、抗体は、ヒト化抗体である。いくつかの態様において、抗体は、ヒト抗体である。いくつかの態様において、抗体は、IgA、IgD、IgE、IgG、またはIgM抗体である。ある特定の態様において、抗体は、IgG1抗体である。ある特定の態様において、抗体は、IgG2抗体である。ある特定の態様において、抗体は、抗原結合部位を含む抗体断片である。いくつかの態様において、抗体は、二重特異性抗体または多重特異性抗体である。いくつかの態様において、抗体は、一価抗体である。いくつかの態様において、抗体は、単一特異的抗体である。いくつかの態様において、抗体は、二価抗体である。いくつかの態様において、抗体は、細胞傷害性部分にコンジュゲートされている。いくつかの態様において、抗体は、単離されている。いくつかの態様において、抗体は、実質的に純粋である。
【0091】
本発明のRSPO3結合剤(例えば、抗体)は、当技術分野において公知の任意の方法によって特異的結合についてアッセイすることができる。使用できるイムノアッセイとしては、Biacore解析、FACS解析、免疫蛍光法、免疫細胞化学、ウエスタンブロット解析、ラジオイムノアッセイ、ELISA、「サンドイッチ」イムノアッセイ、免疫沈降アッセイ、沈降反応、ゲル拡散沈降反応、免疫拡散アッセイ、凝集アッセイ、補体結合アッセイ、イムノラジオメトリックアッセイ、蛍光イムノアッセイ、およびプロテインAイムノアッセイなどの手法を使用する競合および非競合アッセイシステムが挙げられるが、それに限定されるわけではない。そのようなアッセイは、当技術分野において慣用かつ周知である(例えば、Ausubel et al., Editors, 1994-present, Current Protocols in Molecular Biology, John Wiley & Sons, Inc., New York, NYを参照のこと)。
【0092】
例えば、ヒトRSPO3への抗体の特異的結合は、ELISAを使用して測定され得る。ELISAアッセイは、抗原を調製する工程、96ウェルマイクロタイタープレートのウェルを抗原でコーティングする工程、検出可能な化合物(例えば、酵素基質(例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼまたはアルカリホスファターゼ))にコンジュゲートされたRSPO3結合抗体または他のRSPO3結合剤をそのウェルに加える工程、ある時間にわたってインキュベートする工程、およびその抗原に結合した抗体の存在を検出する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合抗体または結合剤は、検出可能な化合物にコンジュゲートされないが、その代わりに、RSPO3結合剤または抗体(例えば、抗Fc抗体)を認識しかつ検出可能な化合物にコンジュゲートされた第2のコンジュゲートされた抗体がウェルに加えられる。いくつかの態様において、ウェルを抗原でコーティングする代わりに、RSPO3結合剤または抗体をウェルにコーティングすることができ、コーティングされたウェルに抗原を加えた後に、検出可能な化合物にコンジュゲートされた第2の抗体を加えることができる。当業者は、検出されるシグナルを増大するために改変され得るパラメータならびに当技術分野において公知のELISAの他のバリエーションに関して精通しているだろう。
【0093】
別の例では、ヒトRSPO3への抗体の特異的結合は、FACSを使用して測定され得る。FACSスクリーニングアッセイは、融合タンパク質(例えば、RSPO3-FcまたはRSPO3-CD4TM)として抗原を発現するcDNAコンストラクトを作製する工程、該コンストラクトを細胞にトランスフェクトする工程、該抗原を細胞の表面上に発現させる工程、トランスフェクトされた細胞とRSPO3結合剤を混合する工程、およびある時間にわたってインキュベートする工程を含み得る。RSPO3結合剤によって結合された細胞は、検出可能な化合物にコンジュゲートされた二次抗体(例えば、PEコンジュゲート抗Fc抗体)およびフローサイトメーターを使用することによって識別され得る。当業者は、検出されるシグナルを最適化するために改変され得るパラメータ、ならびにスクリーニング(例えば、遮断抗体についてのスクリーニング)を増強し得るFACSの他のバリエーションに関して精通しているだろう。
【0094】
抗原(例えば、RSPO3)への抗体または他の結合剤の結合親和性および抗体と抗原との相互作用の解離速度は、競合結合アッセイによって測定することができる。競合結合アッセイの一例は、増加量の非標識抗原の存在下において標識抗原(例えば、
3Hまたは
125I)またはその断片もしくは変異体と関心対象の抗体とをインキュベートした後、標識抗原に結合した抗体を検出する工程を含む、ラジオイムノアッセイである。抗原に対する抗体の親和性および結合の解離速度は、スキャッチャードプロット解析によってそのデータから測定することができる。いくつかの態様において、抗原(例えば、RSPO3)に結合する抗体または剤の結合速度および解離速度を測定するために、Biacore動態解析が使用される。いくつかの態様において、Biacore動態解析は、その表面上に抗原(例えば、RSPO3)が固定化されたチップへの抗体の結合およびそのチップからの解離を解析することを含む。いくつかの態様において、Biacore動態解析は、その表面上に抗体(例えば、抗RSPO3抗体)が固定化されたチップへの抗原(例えば、RSPO3)の結合およびそのチップからの解離を解析することを含む。
【0095】
ある特定の態様において、本発明は、ヒトRSPO3に特異的に結合するRSPO3結合剤(例えば、抗体)を提供し、ここで、該RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体131R002、抗体131R003、またはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの1、2、3、4、5、および/または6つを含む(表1を参照のこと)。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、131R002、131R003、もしくはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの1つもしくは複数;131R002、131R003、もしくはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの2つもしくはそれ以上;131R002、131R003、もしくはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの3つもしくはそれ以上;131R002、131R003、もしくはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの4つもしくはそれ以上;131R002、131R003、もしくはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、もしくはh131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの5つもしくはそれ以上;または131R002、131R003、もしくはそのヒト化変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R008、h131R010、もしくはh131R011を含む)のCDRの6つ全てを含む。
【0096】
【表1】
[この文献は図面を表示できません]
【0097】
ある特定の態様において、本発明は、ヒトRSPO3に特異的に結合するRSPO3結合剤(例えば、抗体)を提供し、ここで、該RSPO3結合剤は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤はさらに、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、AAS(SEQ ID NO:13)を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、およびTYFANNFD(SEQ ID NO:80)を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、ならびに
(b)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3を含む。
【0098】
ある特定の態様において、本発明は、ヒトRSPO3に特異的に結合するRSPO3結合剤(例えば、抗体または二重特異性抗体)を提供し、ここで、該RSPO3結合剤は、
(a)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、または1、2、3、もしくは4つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(b)
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を含む重鎖CDR2、または1、2、3、もしくは4つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(c)
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3、または1、2、3、もしくは4つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(d)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR1、または1、2、3、もしくは4つのアミノ酸置換を含むその変異体;
(e)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR2、または1、2、3、もしくは4つのアミノ酸置換を含むその変異体;および
(f)
[この文献は図面を表示できません]
を含む軽鎖CDR3、または1、2、3、もしくは4つのアミノ酸置換を含むその変異体を含む。ある特定の態様において、アミノ酸置換は保存的置換である。いくつかの態様において、置換は、生殖細胞系列ヒト化工程の一部として作製される。
【0099】
ある特定の態様において、本発明は、RSPO3に特異的に結合するRSPO3結合剤(例えば、抗体)を提供し、ここで、該RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、もしくはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する重鎖可変領域、および/またはSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86に対して少なくとも80%の配列同一性を有する軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:16に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:36に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:37に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する重鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:17に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:72に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:86に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、もしくはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約95%の配列同一性を有する重鎖可変領域、および/またはSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86に対して少なくとも約95%の配列同一性を有する軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、もしくはSEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域、および/またはSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、またはSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、またはSEQ ID NO:86から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、またはSEQ ID NO:86からなる軽鎖可変領域を含む。
【0100】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17からなる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17からなる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17からなる軽鎖可変領域を含む。
【0101】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72からなる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72からなる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:72からなる軽鎖可変領域を含む。
【0102】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62から本質的になる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86から本質的になる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86からなる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86からなる軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62からなる重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:86からなる軽鎖可変領域を含む。
【0103】
ある特定の態様において、本発明は、RSPO3に特異的に結合するRSPO3結合剤(例えば、抗体)を提供し、ここで、該RSPO3結合剤は、(a)SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69に対して少なくとも約90%の配列同一性を有する重鎖;および/または(b)SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88に対して少なくとも90%の配列同一性を有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、(a)SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69に対して少なくとも約95%の配列同一性を有する重鎖;および/または(b)SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88に対して少なくとも95%の配列同一性を有する軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:27を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:28を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:39を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:42を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69から本質的になる重鎖;およびSEQ ID NO:29から本質的になる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:29からなる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:88からなる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:27を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:28を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:39を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:42を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、および/またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69から本質的になる重鎖;およびSEQ ID NO:74から本質的になる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:74からなる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69から本質的になる重鎖;およびSEQ ID NO:88から本質的になる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:88からなる軽鎖を含む。
【0104】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:29から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:29から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:29から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:29から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48からなる重鎖、およびSEQ ID NO:29からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49からなる重鎖、およびSEQ ID NO:29からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64からなる重鎖、およびSEQ ID NO:29からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:29からなる軽鎖を含む。
【0105】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:74から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:74から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:74から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:74から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48からなる重鎖、およびSEQ ID NO:74からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49からなる重鎖、およびSEQ ID NO:74からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64からなる重鎖、およびSEQ ID NO:74からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:74からなる軽鎖を含む。
【0106】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48を含む重鎖、およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49を含む重鎖、およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64を含む重鎖、およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69を含む重鎖、およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:88から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:88から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:88から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69から本質的になる重鎖、およびSEQ ID NO:88から本質的になる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:48からなる重鎖、およびSEQ ID NO:88からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:49からなる重鎖、およびSEQ ID NO:88からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:64からなる重鎖、およびSEQ ID NO:88からなる軽鎖を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:69からなる重鎖、およびSEQ ID NO:88からなる軽鎖を含む。
【0107】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R002抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R002抗体の重鎖および軽鎖(リーダー配列を含むまたは含まない)を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は131R002抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R002抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のキメラ型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R002抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のヒト化型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R002抗体の重鎖CDRおよび/または軽鎖CDRを、該抗体のヒト化型で含む。いくつかの態様において、131R002のヒト化バージョンはIgG1抗体である。いくつかの態様において、131R002のヒト化バージョンはIgG2抗体である。
【0108】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R002を含むか、抗体131R002から本質的になるか、または抗体131R002からなる。
【0109】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R003抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は131R003抗体の重鎖可変領域を含み、ここで、131R003由来の該重鎖可変領域は親和性成熟されている。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は131R003抗体の重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域は、親131R003抗体と比べて少なくとも1つの改変または変更されたCDRを含む。いくつかの態様において、RSPO結合剤は131R003抗体の重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域は、親131R003抗体と比べて改変されたCDR1を含む。いくつかの態様において、RSPO結合剤は131R003抗体の重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域は、親131R003抗体と比べて改変されたCDR2を含む。いくつかの態様において、RSPO結合剤は131R003抗体の重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域は、親131R003抗体と比べて改変されたCDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO結合剤は131R003抗体の重鎖可変領域を含み、ここで、該重鎖可変領域は、親131R003抗体と比べて改変されたCDR1およびCDR3を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R003抗体の重鎖および軽鎖(リーダー配列を含むまたは含まない)を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は131R003抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、親131R003抗体と比べて異なる重鎖CDR1を含む131R003抗体の変異体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、親131R003抗体と比べて異なる重鎖CDR3を含む131R003抗体の変異体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、親131R003抗体と比べて異なる重鎖CDR1および異なる重鎖CDR3を含む131R003抗体の変異体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R003抗体または131R003の変異体のいずれかの重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のキメラ型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R003抗体または131R003の変異体のいずれかの重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のヒト化型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R003抗体または131R003の変異体のいずれかの重鎖CDRおよび/または軽鎖CDRを、該抗体のヒト化型で含む。いくつかの態様において、131R003または131R003変異体のヒト化バージョンはIgG1抗体である。いくつかの態様において、131R003または131R003変異体のヒト化バージョンはIgG2抗体である。
【0110】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003を含むか、抗体131R003から本質的になるか、または抗体131R003からなる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体を含むか、抗体131R003の変異体から本質的になるか、または抗体131R003の変異体からなる。
【0111】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R006B抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R006B抗体の重鎖および軽鎖(リーダー配列を含むまたは含まない)を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は131R006B抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R006B抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のキメラ型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R006B抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のヒト化型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R006B抗体の重鎖CDRおよび/または軽鎖CDRを、該抗体のヒト化型で含む。いくつかの態様において、131R006Bのヒト化バージョンはIgG1抗体である。いくつかの態様において、131R006Bのヒト化バージョンはIgG2抗体である。
【0112】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R006Bを含むか、抗体131R006Bから本質的になるか、または抗体131R006Bからなる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R006Bの変異体を含むか、抗体131R006Bの変異体から本質的になるか、または抗体131R006Bの変異体からなる。
【0113】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R005/131R007抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R005/131R007体の重鎖および軽鎖(リーダー配列を含むまたは含まない)を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は131R005/131R007抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R005/131R007抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のキメラ型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R005/131R007抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のヒト化型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、131R005/131R007抗体の重鎖CDRおよび/または軽鎖CDRを、該抗体のヒト化型で含む。いくつかの態様において、131R005/131R007のヒト化バージョンはIgG1抗体である。いくつかの態様において、131R005/131R007のヒト化バージョンはIgG2抗体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は131R008である。
【0114】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R005/131R007を含むか、抗体131R005/131R007から本質的になるか、または抗体131R005/131R007からなる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R005/131R007の変異体を含むか、抗体131R005/131R007の変異体から本質的になるか、または抗体131R005/131R007の変異体からなる。
【0115】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R008を含むか、抗体131R008から本質的になるか、または抗体131R008からなる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R008の変異体を含むか、抗体131R008の変異体から本質的になるか、または抗体131R008の変異体からなる。
【0116】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、h131R010またはh131R011抗体の重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、h131R010またはh131R011抗体の重鎖および軽鎖(リーダー配列を含むまたは含まない)を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤はh131R010抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤はh131R011抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、h131R010またはh131R011抗体の重鎖可変領域および/または軽鎖可変領域を、該抗体のキメラ型で含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、h131R010またはh131R011抗体の重鎖CDRおよび/または軽鎖CDRを含む。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体はh131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体はh131R011である。
【0117】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、American Type Culture Collection(ATCC)に寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる重鎖可変領域を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる軽鎖可変領域を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる重鎖可変領域、およびATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる軽鎖可変領域を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる重鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる軽鎖を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる重鎖、およびATCCに寄託されPTA-
と命名されたプラスミドによってコードされる軽鎖を含む。
【0118】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R010を含むか、抗体h131R010から本質的になるか、または抗体h131R010からなる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R010の変異体を含むか、抗体h131R010の変異体から本質的になるか、または抗体h131R010の変異体からなる。
【0119】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R011を含むか、抗体h131R011から本質的になるか、または抗体h131R011からなる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R011の変異体を含むか、抗体h131R011の変異体から本質的になるか、または抗体h131R011の変異体からなる。
【0120】
ある特定の態様において、本発明は、二重特異性抗体であるRSPO3結合剤を提供する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位、および第2標的に結合する第2抗原結合部位を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
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を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位および第2抗原結合部位を含む二重特異性抗体であり、ここで、該第1抗原結合部位は、
(a)
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含み、ここで、該第1抗原結合部位と該第2抗原結合部位は共通の(すなわち、同一の)軽鎖を含む。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む第1抗原結合部位を含む。
【0121】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約80%の配列同一性を有する第1重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する第1重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、またはSEQ ID NO:86に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有する軽鎖可変領域を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44を含む第1重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45を含む第1重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62を含む第1重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:17を含む第1軽鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:72を含む第1軽鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:86を含む第1軽鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。
【0122】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62を含む第1重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:60またはSEQ ID NO:61を含む第1重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:44を含む第1重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:60またはSEQ ID NO:61を含む第1重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:45を含む第1重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:60またはSEQ ID NO:61を含む第1重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:62を含む第1重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:60またはSEQ ID NO:61を含む第1重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。
【0123】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3および第2標的に特異的に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3および第2のヒトRSPOに特異的に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3と、RSPO1、RSPO2、およびRSPO4からなる群より選択される第2のヒトRSPOとに特異的に結合する二重特異性抗体である。ヒトRSPOに対する抗体の非限定的な例は、例えば、国際特許公開第WO 2013/012747号に記載されている。
【0124】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3およびヒトRSPO1に特異的に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、a)ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位、およびb)ヒトRSPO1に特異的に結合する第2抗原結合部位を含み、ここで、該第1抗原結合部位は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3を含み;かつここで、該第1抗原結合部位と該第2抗原結合部位の両方が共通の軽鎖を含む。
【0125】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3およびヒトRSPO2に特異的に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、a)ヒトRSPO3に特異的に結合する第1抗原結合部位、およびb)ヒトRSPO2に特異的に結合する第2抗原結合部位を含み、ここで、該第1抗原結合部位は、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR1、
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR2、および
[この文献は図面を表示できません]
を含む重鎖CDR3を含み;かつここで、該第1抗原結合部位と該第2抗原結合部位の両方が共通の軽鎖を含む。
【0126】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗RSPO3抗体131R003由来の重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗RSPO3抗体131R003の変異体由来の重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗RSPO3抗体131R006B由来の重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗RSPO3抗体h131R005/131R007由来の重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗RSPO3抗体h131R010またはh131R011由来の重鎖可変領域を含む二重特異性抗体である。
【0127】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、それぞれがヘテロ多量体の形成を促進するように改変されている第1 CH3ドメインおよび第2 CH3ドメインを含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、第1 CH3ドメインおよび第2 CH3ドメインは、ノブ・イントゥ・ホール(knobs-into-holes)法を用いて改変される。いくつかの態様において、第1 CH3ドメインおよび第2 CH3ドメインは、変更された静電相互作用をもたらすアミノ酸の変化を含む。いくつかの態様において、第1 CH3ドメインおよび第2 CH3ドメインは、変更された疎水性/親水性相互作用をもたらすアミノ酸の変化を含む。
【0128】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、(a)IgG1(SEQ ID NO:56)の253位および292位に相当するアミノ酸がグルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられた第1ヒトIgG1定常領域、ならびにIgG1(SEQ ID NO:56)の240位および282位に相当するアミノ酸がリジンに置き換えられた第2ヒトIgG1定常領域;(b)IgG2(SEQ ID NO:57)の249位および288位に相当するアミノ酸がグルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられた第1ヒトIgG2定常領域、ならびにIgG2(SEQ ID NO:57)の236位および278位に相当するアミノ酸がリジンに置き換えられた第2ヒトIgG2定常領域;(c)IgG3(SEQ ID NO:58)の300位および339位に相当するアミノ酸がグルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられた第1ヒトIgG3定常領域、ならびにIgG3(SEQ ID NO:58)の287位および329位に相当するアミノ酸がリジンに置き換えられた第2ヒトIgG3定常領域;ならびに(d)IgG4(SEQ ID NO:59)の250位および289位に相当するアミノ酸がグルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられた第1ヒトIgG4定常領域、ならびにIgG4(SEQ ID NO:59)の237位および279位に相当するアミノ酸がリジンに置き換えられた第2 IgG4定常領域からなる群より選択される重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。
【0129】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、IgG1(SEQ ID NO:56)の253位および292位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG1定常領域(ここで、IgG1(SEQ ID NO:56)の253位および292位に相当する位置における該アミノ酸は、グルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられている)、ならびにIgG1(SEQ ID NO:56)の240位および282位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG1定常領域(ここで、IgG1(SEQ ID NO:56)の240位および282位に相当する位置における該アミノ酸は、リジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、IgG2(SEQ ID NO:57)の249位および288位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG2定常領域(ここで、IgG2(SEQ ID NO:57)の249位および288位に相当する位置における該アミノ酸は、グルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられている)、ならびにIgG2(SEQ ID NO:57)の236位および278位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG2定常領域(ここで、IgG2(SEQ ID NO:57)の236位および278位に相当する位置における該アミノ酸は、リジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、IgG3(SEQ ID NO:58)の300位および339位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG3定常領域(ここで、IgG3(SEQ ID NO:58)の300位および339位に相当する位置における該アミノ酸は、グルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられている)、ならびにIgG3(SEQ ID NO:58)の287位および329位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG3定常領域(ここで、IgG3(SEQ ID NO:58)の287位および329位に相当する位置における該アミノ酸は、リジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、IgG4(SEQ ID NO:59)の250位および289位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG4定常領域(ここで、IgG4(SEQ ID NO:59)の250位および289位に相当する位置における該アミノ酸は、グルタミン酸またはアスパラギン酸に置き換えられている)、ならびにIgG4(SEQ ID NO:59)の237位および279位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG4定常領域(ここで、IgG4(SEQ ID NO:59)の237位および279位に相当する位置における該アミノ酸は、リジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。
【0130】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、IgG1(SEQ ID NO:56)の253位および292位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG1定常領域(ここで、該アミノ酸はグルタミン酸に置き換えられている)、ならびにIgG1(SEQ ID NO:56)の240位および282位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG1定常領域(ここで、該アミノ酸はリジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、IgG1(SEQ ID NO:56)の253位および292位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG1定常領域(ここで、該アミノ酸はアスパラギン酸に置き換えられている)、ならびにIgG1(SEQ ID NO:56)の240位および282位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG1定常領域(ここで、該アミノ酸はリジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。
【0131】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、IgG2(SEQ ID NO:57)の249位および288位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG2定常領域(ここで、該アミノ酸はグルタミン酸に置き換えられている)、ならびにIgG2(SEQ ID NO:57)の236位および278位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG2定常領域(ここで、該アミノ酸はリジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、IgG2(SEQ ID NO:57)の249位および288位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第1ヒトIgG2定常領域(ここで、該アミノ酸はアスパラギン酸に置き換えられている)、ならびにIgG2(SEQ ID NO:57)の236位および278位に相当する位置においてアミノ酸置換を有する第2ヒトIgG2定常領域(ここで、該アミノ酸はリジンに置き換えられている)を含む二重特異性抗体である。
【0132】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:60の重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、SEQ ID NO:61の重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:60の第1重鎖定常領域およびSEQ ID NO:61の第2重鎖定常領域を含む二重特異性抗体である。
【0133】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約50nMもしくはそれ以下、約25nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下のK
DでRSPO3に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約50nMもしくはそれ以下、約25nMもしくはそれ以下、約10nMもしくはそれ以下、約1nMもしくはそれ以下、または約0.1nMもしくはそれ以下のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約50nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合し、かつ約50nMまたはそれ以下のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約25nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合し、かつ約25nMまたはそれ以下のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約10nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合し、かつ約10nMまたはそれ以下のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合する二重特異性抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、約1nMまたはそれ以下のK
DでRSPO3に結合し、かつ約1nMまたはそれ以下のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合する二重特異性抗体である。
【0134】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、第2抗原結合部位の結合親和性よりも弱い結合親和性を有する1つの抗原結合部位を含む二重特異性抗体である。例えば、いくつかの態様において、二重特異性抗体は、約0.1nM〜1nMの範囲のK
DでRSOP3に結合してよく、かつ約1nM〜10nMの範囲のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合してよい。または、二重特異性抗体は、約1nM〜10nMの範囲のK
DでRSOP3に結合してよく、かつ約0.1nM〜1nMの範囲のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合してよい。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、約0.1nM〜1nMの範囲のK
DでRSOP3に結合してよく、かつ約1nM〜10nMの範囲のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合してよい。または、二重特異性抗体は、約1nM〜10nMの範囲のK
DでRSOP3に結合してよく、かつ約0.1nM〜1nMの範囲のK
Dで第2標的(例えば、RSPO2)に結合してよい。いくつかの態様において、2つの抗原結合部位間の親和性の違いは、約2倍もしくはそれ以上、約3倍もしくはそれ以上、約5倍もしくはそれ以上、約8倍もしくはそれ以上、約10倍もしくはそれ以上、約15倍もしくはそれ以上、約30倍もしくはそれ以上、約50倍もしくはそれ以上、または約100倍もしくはそれ以上であってよい。いくつかの態様において、RSPO3に対する抗原結合部位の少なくとも1つのCDR中の少なくとも1つのアミノ酸残基は、RSPO3結合部位の親和性が変更されるように、異なるアミノ酸で置換される。いくつかの態様において、RSPO3結合部位の親和性は上昇する。いくつかの態様において、RSPO3結合部位の親和性は低下する。いくつかの態様において、第2標的(例えば、RSPO2)に対する抗原結合部位の少なくとも1つのCDR中の少なくとも1つのアミノ酸残基は、第2抗原結合部位の親和性が変更されるように、異なるアミノ酸で置換される。いくつかの態様において、第2抗原結合部位の親和性は上昇する。いくつかの態様において、第2抗原結合部位の親和性は低下する。いくつかの態様において、RSPO3結合部位と第2抗原結合部位の両方の親和性が変更される。
【0135】
本発明は、ヒトRSPOタンパク質に特異的に結合する抗体を含むがそれに限定されるわけではないポリペプチドを提供する。いくつかの態様において、該ポリペプチドはヒトRSPO3に結合する。いくつかの態様において、該ポリペプチドは、ヒトRSPO3と、RSPO1、RSPO2、およびRSPO4からなる群より選択される少なくとも1種のさらなるヒトRSPOに結合する。
【0136】
ある特定の態様において、ポリペプチドは、抗体131R002、131R003、または131R003の変異体(h131R005/131R007、h131R006A、h131R006B、h131R010、およびh131R011を含む)のCDRの1、2、3、4、5、および/または6つを含む(本明細書における表1を参照のこと)。いくつかの態様において、ポリペプチドは、CDR1つあたり最大4個(すなわち、0、1、2、3、または4個)のアミノ酸置換を有するCDRを含む。ある特定の態様において、重鎖CDRは重鎖可変領域内に含まれる。ある特定の態様において、軽鎖CDRは軽鎖可変領域内に含まれる。
【0137】
いくつかの態様において、本発明は、ヒトRSPO3に特異的に結合するポリペプチドを提供し、ここで、該ポリペプチドは、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、もしくはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約80%の配列同一性を有するアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86に対して少なくとも約80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、またはSEQ ID NO:86に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、もしくはSEQ ID NO:62に対して少なくとも約95%の配列同一性を有するアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、もしくはSEQ ID NO:86に対して少なくとも約95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:15を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:16を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:36を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:37を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:44を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:45を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:62を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:17を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:15を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:16を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:36を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:37を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:44を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:45を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:62を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:72を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:44を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:86を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:45を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:86を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:62を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:86を含むアミノ酸配列を含む。
【0138】
いくつかの態様において、本発明は、ヒトRSPO3に特異的に結合するポリペプチドを提供し、ここで、該ポリペプチドは、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:63、もしくはSEQ ID NO:68に対して少なくとも約80%の配列同一性を有するアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:23、SEQ ID NO:73、もしくはSEQ ID NO:87に対して少なくとも約80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:63、またはSEQ ID NO:68に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:73、またはSEQ ID NO:87に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:63、もしくはSEQ ID NO:68に対して少なくとも約95%の配列同一性を有するアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:23、SEQ ID NO:73、もしくはSEQ ID NO:87に対して少なくとも約95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:63、もしくはSEQ ID NO:68を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:23、SEQ ID NO:73、もしくはSEQ ID NO:87を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:63、もしくはSEQ ID NO:68、および/またはSEQ ID NO:23、SEQ ID NO:73、もしくはSEQ ID NO:87から本質的になる。
【0139】
ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88から本質的になるアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69から本質的になるアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88から本質的になるアミノ酸配列を含む。
【0140】
いくつかの態様において、本発明は、ヒトRSPO3に特異的に結合するポリペプチドを提供し、ここで、該ポリペプチドは、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69に対して少なくとも約80%の配列同一性を有するアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88に対して少なくとも約80%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、またはSEQ ID NO:88に対して少なくとも約85%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、または少なくとも約99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69に対して少なくとも約95%の配列同一性を有するアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88に対して少なくとも約95%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、もしくはSEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、もしくはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:29を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27および/またはSEQ ID NO:29から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:28および/またはSEQ ID NO:29から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48および/またはSEQ ID NO:29から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49および/またはSEQ ID NO:29から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64および/またはSEQ ID NO:29から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69および/またはSEQ ID NO:29から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:74を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:27および/またはSEQ ID NO:74から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:28および/またはSEQ ID NO:74から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48および/またはSEQ ID NO:74から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49および/またはSEQ ID NO:74から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64および/またはSEQ ID NO:74から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69および/またはSEQ ID NO:74から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69を含むアミノ酸配列、および/またはSEQ ID NO:88を含むアミノ酸配列を含む。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:48および/またはSEQ ID NO:88から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:49および/またはSEQ ID NO:88から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:64および/またはSEQ ID NO:88から本質的になる。ある特定の態様において、ポリペプチドは、SEQ ID NO:69および/またはSEQ ID NO:88から本質的になる。
【0141】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:87、およびSEQ ID NO:88からなる群より選択される配列を含むポリペプチドを含む。
【0142】
抗体を含む多くのタンパク質は、様々な位置へのそのタンパク質の輸送を指示するシグナル配列を含む。シグナル配列(シグナルペプチドまたはリーダー配列とも呼ばれる)は、新生ポリペプチドのN末端に存在する。それらは、ポリペプチドを小胞体に標的化し、それらのタンパク質は、それらの目的地、例えば、細胞小器官の内腔、内膜、細胞の外膜、または分泌によって細胞の外側に局在化される。ほとんどのシグナル配列は、タンパク質が小胞体に輸送された後、シグナルペプチダーゼによってそのタンパク質から切断される。ポリペプチドからのシグナル配列の切断は、通常、アミノ酸配列の特定の部位で生じ、シグナル配列内のアミノ酸残基に依存する。通常、特定の1つの切断部位が存在するが、2つ以上の切断部位が、シグナルペプチダーゼによって認識および/または使用されることがあり、ポリペプチドの不均質なN末端が生じる。例えば、シグナル配列内の異なる切断部位の使用によって、異なるN末端のアミノ酸を有して発現されるポリペプチドが生じ得る。したがって、いくつかの態様において、本明細書において記載されるポリペプチドは、異なるN末端を有するポリペプチドの混合物を含み得る。いくつかの態様において、N末端は、1、2、3、4、または5アミノ酸だけ長さが異なる。いくつかの態様において、ポリペプチドは実質的に均一であり、すなわち、それらのポリペプチドは同じN末端を有する。いくつかの態様において、ポリペプチドのシグナル配列は、「天然の」または「親の」シグナル配列と比べて、1つまたは複数の(例えば、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10個などの)アミノ酸置換および/または欠失を含む。いくつかの態様において、ポリペプチドのシグナル配列は、1つの切断部位を主要にさせるアミノ酸置換および/または欠失を含むことによって、1つのN末端を有する実質的に均一なポリペプチドが得られる。いくつかの態様において、ポリペプチドのシグナル配列は、該ポリペプチドの発現レベル、例えば、増加した発現または減少した発現に影響する。
【0143】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、またはSEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域、およびSEQ ID NO:17、SEQ ID NO:72、またはSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:17を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:17を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:17を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:72を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:44を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:45を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:62を含む重鎖可変領域およびSEQ ID NO:86を含む軽鎖可変領域を含む抗体と競合する。
【0144】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:64、またはSEQ ID NO:69を含む重鎖、およびSEQ ID NO:29、SEQ ID NO:74、またはSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:48を含む重鎖およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:49を含む重鎖およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:64を含む重鎖およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:69を含む重鎖およびSEQ ID NO:29を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:48を含む重鎖およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:49を含む重鎖およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:64を含む重鎖およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:69を含む重鎖およびSEQ ID NO:74を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:48を含む重鎖およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:49を含む重鎖およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:64を含む重鎖およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む抗体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、RSPO3への特異的結合について、SEQ ID NO:69を含む重鎖およびSEQ ID NO:88を含む軽鎖を含む抗体と競合する。
【0145】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体131R002または抗体131R003と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体131R003の変異体と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体131R003のヒト化バージョンと競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体h131R005/131R007と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体h131R008と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bと競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体h131R010と競合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒトRSPO3への特異的結合について、抗体h131R011と競合する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤または抗体は、インビトロ競合結合アッセイにおいて、RSPO3への特異的結合について競合する。いくつかの態様において、RSPO3はヒトRSPO3である。いくつかの態様において、RSPO3はマウスRSPO3である。
【0146】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、本発明の抗体と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体131R002または抗体131R003と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体131R003の変異体と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体131R003のヒト化バージョンと同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bと同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体h131R005/131R007と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体h131R008と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体h131R010と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、抗体h131R011と同じRSPO3上のエピトープまたは本質的に同じエピトープに結合する。
【0147】
別の態様において、RSPO3結合剤は、本発明の抗体によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R002または抗体131R003によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。別の態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003のヒト化バージョンによって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bによって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R008によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R010によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R011によって結合されるRSPO3上のエピトープと重複するRSPO3上のエピトープに結合する抗体である。
【0148】
ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO結合剤(例えば、抗体)は、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質に結合し、RSPO活性を調節する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、RSPOアンタゴニストであり、RSPO活性を低下させる。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、RSPOアンタゴニストであり、β-カテニン活性を低下させる。
【0149】
ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO3結合剤(例えば、抗体)は、ヒトRSPO3に結合し、RSPO3活性を調節する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3アンタゴニストであり、RSPO3活性を低下させる。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3アンタゴニストであり、β-カテニン活性を低下させる。
【0150】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質のアンタゴニストである。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、少なくとも1種のRSPOのアンタゴニストであり、RSPO活性を阻害する。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、RSPO活性を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または約100%阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、1、2、3、または4種のRSPOタンパク質の活性を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、ヒトRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の活性を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤はRSPO3活性を阻害する。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。ある特定の態様において、ヒトRSPO3活性を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0151】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質のアンタゴニストである。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、RSPOシグナル伝達を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または約100%阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、1、2、3、または4種のRSPOタンパク質によるシグナル伝達を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、ヒトRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4のシグナル伝達を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤はヒトRSOP3シグナル伝達を阻害する。ある特定の態様において、RSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。ある特定の態様において、RSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。ある特定の態様において、ヒトRSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。ある特定の態様において、ヒトRSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。ある特定の態様において、ヒトRSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。ある特定の態様において、ヒトRSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。ある特定の態様において、ヒトRSOP3シグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0152】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、β-カテニンシグナル伝達のアンタゴニストである。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、β-カテニンシグナル伝達を少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または約100%阻害する。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO結合剤は、RSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤はβ-カテニンシグナル伝達を阻害する。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0153】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、受容体への少なくとも1種のRSPOタンパク質の結合を阻害する。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、該受容体の1つまたは複数へのヒトRSPOタンパク質の結合を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、少なくとも1種のLGRタンパク質へのRSPOタンパク質の結合を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、LGR4、LGR5、および/またはLGR6へのRSPOタンパク質の結合を阻害する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、LGR4へのRSPO3の結合を阻害する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、LGR5へのRSPO3の結合を阻害する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、LGR6へのRSPO3の結合を阻害する。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのRSPO結合剤の結合の阻害は、少なくとも約10%、少なくとも約25%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または少なくとも約95%である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質への少なくとも1種のRSPOの結合を阻害するRSPO結合剤はさらに、β-カテニンシグナル伝達を阻害する。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0154】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、受容体への少なくとも1種のRSPOの結合を遮断する。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、該受容体の1つまたは複数へのヒトRSPOタンパク質の結合を遮断する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、少なくとも1種のLGRタンパク質へのRSPOの結合を遮断する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、LGR4、LGR5、および/またはLGR6への少なくとも1種のRSPOタンパク質の結合を遮断する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、LGR4へのRSPO3の結合を遮断する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、LGR5へのRSPO3の結合を遮断する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、LGR6へのRSPO3の結合を遮断する。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのRSPO結合剤の結合の遮断は、少なくとも約10%、少なくとも約25%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または少なくとも約95%である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質への少なくとも1種のRSPOタンパク質の結合を遮断するRSPO結合剤はさらに、β-カテニンシグナル伝達を阻害する。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。ある特定の態様において、少なくとも1種のLGRタンパク質へのヒトRSPO3の結合を遮断するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0155】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、β-カテニンシグナル伝達を阻害する。β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO結合剤は、ある特定の態様において、β-カテニンシグナル経路における1つまたは複数の受容体によるシグナル伝達を阻害することがあるが、必ずしも全ての受容体によるシグナル伝達を阻害するわけではないことが理解される。ある特定の代替の態様において、全てのヒト受容体によるβ-カテニンシグナル伝達が阻害され得る。ある特定の態様において、LGR4、LGR5、およびLGR6からなる群より選択される1つまたは複数の受容体によるβ-カテニンシグナル伝達が阻害される。ある特定の態様において、RSPO結合剤によるβ-カテニンシグナル伝達の阻害は、少なくとも約10%、少なくとも約25%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または少なくとも約95%のβ-カテニンシグナル伝達のレベルの低下である。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。いくつかの態様において、β-カテニンシグナル伝達を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0156】
ある特定の態様において、RSPO結合剤(例えば、抗体)は、β-カテニンの活性化を阻害する。β-カテニンの活性化を阻害するRSPO結合剤は、ある特定の態様において、1つまたは複数の受容体によるβ-カテニンの活性化を阻害することがあるが、必ずしも全ての受容体によるβ-カテニンの活性化を阻害するわけではないことが理解される。ある特定の代替の態様において、全てのヒト受容体によるβ-カテニンの活性化が阻害され得る。ある特定の態様において、LGR4、LGR5、およびLGR6からなる群より選択される1つまたは複数の受容体によるβ-カテニンの活性化が阻害される。ある特定の態様において、RSPO結合剤によるβ-カテニンの活性化の阻害は、少なくとも約10%、少なくとも約25%、少なくとも約50%、少なくとも約75%、少なくとも約90%、または少なくとも約95%のβ-カテニンの活性化のレベルの低下である。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体である。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体131R002、抗体131R003、または131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R008である。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R010である。いくつかの態様において、β-カテニンの活性化を阻害するRSPO3結合剤は、抗体h131R011である。
【0157】
RSPO結合剤(または候補RSPO結合剤)がβ-カテニンシグナル伝達を阻害するかを判定するためのインビボおよびインビトロアッセイは、当技術分野において公知である。例えば、ホタルルシフェラーゼレポーター遺伝子の上流に多コピーのTCF結合ドメインを含むTCF/Lucレポーターベクターを利用する細胞ベースのルシフェラーゼレポーターアッセイが、インビトロにおいてβ-カテニンシグナル伝達のレベルを測定するために使用され得る(Gazit et al., 1999, Oncogene, 18; 5959-66; TOPflash, Millipore, Billerica MA)。RSPO結合剤の存在下におけるRSPOタンパク質またはRSPO馴化培地有りまたは無しでの1つまたは複数のWnt(例えば、トランスフェクトされた細胞によって発現されるかまたはWnt馴化培地によって提供されるWnt)の存在下におけるβ-カテニンシグナル伝達のレベルが、RSPO結合剤が存在しない場合のシグナル伝達のレベルと比較される。β-カテニンシグナル伝達に対するRSPO結合剤(または候補剤)の効果は、TCF/Lucレポーターアッセイに加えて、β-カテニンによって制御される遺伝子(例えば、c-myc(He et al., 1998, Science, 281: 1509-12)、サイクリンD1(Tetsu et al., 1999, Nature, 398: 422-6)、および/またはフィブロネクチン(Gradl et al. 1999, Mol. Cell Biol., 19: 5576-87))の発現レベルに対するその剤の効果を測定することによって、インビトロまたはインビボにおいて測定され得る。ある特定の態様において、β-カテニンシグナル伝達に対するRSPO結合剤の効果は、Dishevelled-1、Dishevelled-2、Dishevelled-3、LRP5、LRP6、および/またはβ-カテニンのリン酸化状態に対するその剤の効果を測定することによっても評価され得る。
【0158】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、以下の効果のうちの1つまたは複数を有する:腫瘍細胞の増殖を阻害すること、腫瘍成長を阻害すること、腫瘍の腫瘍形成能を低下させること、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度を低下させることによって腫瘍の腫瘍形成能を低下させること、腫瘍成長を阻害すること、腫瘍細胞の細胞死を誘発すること、腫瘍内の細胞の分化を誘導すること、腫瘍形成性細胞が非腫瘍形成性状態に分化すること、腫瘍細胞における分化マーカーの発現を誘導すること、腫瘍細胞の転移を予防すること、腫瘍細胞の生存を減少させること、または血管新生を調節すること。
【0159】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、腫瘍成長を阻害することができる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、インビボにおいて(例えば、異種移植片マウスモデル、および/または癌を有するヒトにおいて)腫瘍成長を阻害することができる。ある特定の態様において、腫瘍成長は、無処置の腫瘍と比較して、少なくとも約2倍、約3倍、約5倍、約10倍、約50倍、約100倍、または約1000倍阻害される。
【0160】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、腫瘍の腫瘍形成能を減少させることができる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、動物モデル(例えば、マウス異種移植片モデル)において癌幹細胞を含む腫瘍の腫瘍形成能を減少させることができる。ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、腫瘍中の癌幹細胞の数または発生頻度を低下させることによって、腫瘍の腫瘍形成能を減少させることができる。ある特定の態様において、腫瘍内の癌幹細胞の数または発生頻度は、少なくとも約2倍、約3倍、約5倍、約10倍、約50倍、約100倍、または約1000倍減少する。ある特定の態様において、癌幹細胞の数または発生頻度の減少は、動物モデルを使用した限界希釈アッセイによって測定される。腫瘍内の癌幹細胞の数または発生頻度の低下を測定するための限界希釈アッセイの使用に関するさらなる例および指針は、例えば、国際公開番号WO2008/042236、米国特許出願公開第2008/0064049号、および米国特許出願公開第2008/0178305号に見られる。
【0161】
ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO3結合剤は、マウス、カニクイザル、またはヒトにおいて、少なくとも約2時間、少なくとも約5時間、少なくとも約10時間、少なくとも約24時間、少なくとも約3日間、少なくとも約1週間、または少なくとも約2週間の循環半減期を有する。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、マウス、カニクイザル、またはヒトにおいて、少なくとも約2時間、少なくとも約5時間、少なくとも約10時間、少なくとも約24時間、少なくとも約3日間、少なくとも約1週間、または少なくとも約2週間の循環半減期を有するIgG(例えば、IgG1またはIgG2)抗体である。ポリペプチドおよび抗体などの剤の半減期を延長する(または短縮する)方法は、当技術分野において公知である。例えば、IgG抗体の循環半減期を延長する公知の方法には、pH6.0における新生児Fc受容体(FcRn)への抗体のpH依存性結合を増加させる変異をFc領域に導入することが含まれる(例えば、米国特許出願公開第2005/0276799号、同第2007/0148164号、および同第2007/0122403号を参照のこと)。Fc領域を欠く抗体断片の循環半減期を延長する公知の方法には、PEG化などのような手法が含まれる。
【0162】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ポリクローナル抗体である。ポリクローナル抗体は、任意の公知の方法によって調製することができる。いくつかの態様において、ポリクローナル抗体は、複数回の皮下または腹腔内注射を使用して動物(例えば、ウサギ、ラット、マウス、ヤギ、ロバ)を関心対象の抗原(例えば、精製されたペプチド断片、完全長組換えタンパク質、または融合タンパク質)で免疫することによって産生される。その抗原は、任意で担体(例えば、キーホールリンペットヘモシアニン(KLH)または血清アルブミン)にコンジュゲートされ得る。その抗原(担体タンパク質有りまたは無し)は、滅菌食塩水に希釈され、安定したエマルジョンを形成するために、通常、アジュバント(例えば、フロイント完全または不完全アジュバント)と混合される。十分な時間が経過した後、免疫された動物から、通常は血液または腹水からポリクローナル抗体が回収される。ポリクローナル抗体は、当技術分野における標準的な方法(アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、および透析を含むがそれに限定されるわけではない)に従って血清または腹水から精製することができる。
【0163】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、モノクローナル抗体である。モノクローナル抗体は、当業者に公知のハイブリドーマ法を使用して調製することができる(例えば、Kohler and Milstein, 1975, Nature, 256: 495-497を参照のこと)。いくつかの態様において、ハイブリドーマ法を使用するとき、マウス、ハムスター、または他の適切な宿主動物を、上に記載されたように免疫することにより、リンパ球からの、免疫抗原に特異的に結合する抗体の産生を誘発する。いくつかの態様において、リンパ球は、インビトロにおいて免疫することができる。いくつかの態様において、免疫抗原は、ヒトタンパク質またはその一部であり得る。いくつかの態様において、免疫抗原は、マウスタンパク質またはその一部であり得る。
【0164】
免疫した後、リンパ球を単離し、例えば、ポリエチレングリコールを使用して、好適なミエローマ細胞株と融合させる。ハイブリドーマ細胞は、当技術分野において公知の専用の培地を使用して選択され、融合していないリンパ球およびミエローマ細胞は、この選択工程を生き残ることはない。選択された抗原に特異的なモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマは、種々の方法(免疫沈降、免疫ブロット法、およびインビトロ結合アッセイ(例えば、フローサイトメトリー、FACS、ELISA、およびラジオイムノアッセイ)を含むがそれに限定されるわけではない)によって識別され得る。そのハイブリドーマは、標準的な方法を使用するインビトロ培養において(J.W. Goding, 1996, Monoclonal Antibodies: Principles and Practice, 3
rd Edition, Academic Press, San Diego, CA)または動物の腹水腫瘍としてインビボにおいて、増殖され得る。そのモノクローナル抗体は、当技術分野における標準的な方法(アフィニティークロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、ゲル電気泳動、および透析を含むがそれに限定されるわけではない)に従って培養培地または腹水から精製することができる。
【0165】
ある特定の態様において、モノクローナル抗体は、当業者に公知であるような組換えDNA法を使用して作製することができる。モノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチドは、該抗体の重鎖および軽鎖をコードする遺伝子を特異的に増幅するオリゴヌクレオチドプライマーを使用するRT-PCRなどによって、成熟B細胞またはハイブリドーマ細胞から単離され、それらの配列は、標準の手法を使用して決定される。次いで、重鎖および軽鎖をコードする単離されたポリヌクレオチドは、別途免疫グロブリンタンパク質を産生しない宿主細胞(例えば、大腸菌(E. coli)、サルCOS細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、またはミエローマ細胞)にトランスフェクトされたときモノクローナル抗体を生成する好適な発現ベクターにクローニングされる。
【0166】
ある特定の他の態様において、組換えモノクローナル抗体またはその断片は、所望の種の可変領域またはCDRを発現するファージディスプレイライブラリーから単離することができる(例えば、McCafferty et al., 1990, Nature, 348: 552-554; Clackson et al., 1991, Nature, 352: 624-628;およびMarks et al., 1991, J. Mol. Biol., 222: 581-597を参照のこと)。
【0167】
モノクローナル抗体をコードするポリヌクレオチドは、例えば、代替の抗体を作製する組換えDNA技術を使用することによって、改変することができる。いくつかの態様において、例えばマウスモノクローナル抗体の、軽鎖および重鎖の定常ドメインを、例えばヒト抗体の該領域の代わりに用いてキメラ抗体を作製することができ、または、非免疫グロブリンポリペプチドの代わりに用いて融合抗体を作製することができる。いくつかの態様において、モノクローナル抗体の所望の抗体断片を作製するために、定常領域は、切断されるかまたは除去される。モノクローナル抗体の特異性、親和性などを最適化するために、可変領域の部位特異的または高密度突然変異誘発を使用することができる。
【0168】
いくつかの態様において、ヒトRSPO3に対するモノクローナル抗体は、ヒト化抗体である。典型的には、ヒト化抗体は、当業者に公知の方法を使用して、CDRの残基が所望の特異性、親和性、および/または結合能を有する非ヒト種(例えば、マウス、ラット、ウサギ、ハムスターなど)のCDRの残基によって置換されたヒト免疫グロブリンである。いくつかの態様において、ヒト免疫グロブリンのFvフレームワーク領域残基は、所望の特異性、親和性、および/または結合能を有する非ヒト種由来の抗体内の対応する残基で置換されている。いくつかの態様において、ヒト化抗体は、Fvフレームワーク領域および/または置換された非ヒト残基内におけるさらなる残基の置換によってさらに改変することができ、それにより、抗体の特異性、親和性、および/または性能が洗練されるおよび最適化される。通常、ヒト化抗体は、非ヒト免疫グロブリンに対応するCDRの全てまたは実質的に全てを含む少なくとも1つ、および典型的には2つまたは3つの可変ドメイン領域の実質的に全てを含む一方、フレームワーク領域の全てまたは実質的に全ては、ヒト免疫グロブリンコンセンサス配列のものである。いくつかの態様において、ヒト化抗体は、典型的にはヒト免疫グロブリンの、免疫グロブリン定常領域またはドメイン(Fc)の少なくとも一部も含み得る。ある特定の態様において、そのようなヒト化抗体は、ヒト対象に投与されると抗原性およびHAMA(ヒト抗マウス抗体)反応を減少させ得るので、治療的に使用される。当業者は、公知の手法に従って、免疫原性が低下した機能的なヒト化抗体を得ることができるだろう(例えば、米国特許第5,225,539号;同第5,585,089号;同第5,693,761号;および同第5,693,762号を参照のこと)。
【0169】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、ヒト抗体である。ヒト抗体は、当技術分野において公知の様々な手法を使用して直接調製することができる。いくつかの態様において、ヒト抗体は、インビトロにおいて免疫された不死化ヒトBリンパ球から、または免疫された個体から単離されたリンパ球から生成され得る。いずれの場合も、標的抗原に対する抗体を産生する細胞が作製および単離され得る(例えば、Cole et al., 1985, Monoclonal Antibodies and Cancer Therapy, Alan R. Liss, p. 77; Boemer et al., 1991, J. Immunol., 147: 86-95;ならびに米国特許第5,750,373号;同第5,567,610号および同第5,229,275号を参照のこと)。いくつかの態様において、ヒト抗体は、ファージライブラリーから選択することができ、ここで該ファージライブラリーは、ヒト抗体を発現する(Vaughan et al, 1996, Nature Biotechnology, 14: 309-314; Sheets et al., 1998, PNAS, 95: 6157-6162; Hoogenboom and Winter, 1991, J. Mol. Biol., 227: 381; Marks et al., 1991, J. Mol. Biol., 222: 581)。あるいは、ファージディスプレイ技術を使用することにより、インビトロにおいて、免疫されていないドナー由来の免疫グロブリン可変ドメイン遺伝子レパートリーからヒト抗体および抗体断片を生成することができる。抗体ファージライブラリーの作製および使用についての手法は、米国特許第5,969,108号;同第6,172,197号;同第5,885,793号;同第6,521,404号;同第6,544,731号;同第6,555,313号;同第6,582,915号;同第6,593,081号;同第6,300,064号;同第6,653,068号;同第6,706,484号;および同第7,264,963号;ならびにRothe et al., 2008, J. Mol. Bio., 376: 1182-1200にも記載されている。抗体が同定されると、チェインシャフリング(Marks et al., 1992, Bio/Technology, 10: 779-783)および部位特異的突然変異誘発を含むがそれに限定されるわけではない当技術分野において公知の親和性成熟ストラテジーが、高親和性ヒト抗体を作製するために使用され得る。
【0170】
いくつかの態様において、ヒト抗体は、ヒト免疫グロブリン遺伝子座を含むトランスジェニックマウスにおいて産生され得る。免疫されると、これらのマウスは、内因性の免疫グロブリンを産生せずに、ヒト抗体の完全なレパートリーを産生することができる。このアプローチは、米国特許第5,545,807号;同第5,545,806号;同第5,569,825号;同第5,625,126号;同第5,633,425号;および同第5,661,016号に記載されている。
【0171】
本発明は、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質を特異的に認識する二重特異性抗体も包含する。二重特異性抗体は、少なくとも2つの異なる抗原またはエピトープを特異的に認識し、それらに結合することができる。異なるエピトープは、同じ分子内(例えば、ヒトRSPO3上の2つのエピトープ)であるか、または異なる分子上(例えば、RSPO3上の1つのエピトープおよびRSPO2上の1つのエピトープ)のいずれかであってよい。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、個別の抗体、または2つ以上の抗体の組み合わせと比べて増強された効力を有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、個別の抗体、または2つ以上の抗体の組み合わせと比べて低下した毒性を有する。いずれの結合剤(例えば、抗体)も特有の薬物動態(PK)(例えば、循環半減期)を有し得ることが当業者には公知である。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの活性結合剤のPKを同調させる能力を有し、ここで、該2つの個別の結合剤は異なるPKプロファイルを有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの結合剤(例えば、抗体)の作用を共通の領域(例えば、腫瘍および/または腫瘍微小環境)に集中させる能力を有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの結合剤(例えば、抗体)の作用を共通の標的(例えば、腫瘍または腫瘍細胞)へ集中させる能力を有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの結合剤(例えば、抗体)の作用を2つ以上の生物学的経路または機能へ標的化する能力を有する。
【0172】
ある種の態様において、二重特異性抗体は、RSPO3および第2標的に特異的に結合する。ある種の態様において、二重特異性抗体は、RSPO3および第2のヒトRSPO(例えば、RSPO1、RSPO2、またはRSPO4)に特異的に結合する。ある種の態様において、二重特異性抗体は、RSPO3およびRSPO2に特異的に結合する。いくつかの態様において、二重特異性抗体はモノクローナル抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体はヒト化抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体はヒト抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体はIgG1抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体はIgG2抗体である。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、低下した毒性および/または副作用を有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの個別の抗体の混合物または単剤としての抗体と比べて低下した毒性および/または副作用を有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、増加した治療指数を有する。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの個別の抗体の混合物または単剤としての抗体と比べて増加した治療指数を有する。
【0173】
いくつかの態様において、抗体は、細胞防御機構を、第1抗原標的を発現および/または産生している細胞に集中させるために、第1抗原標的(例えば、RSPO3)ならびに第2抗原標的(例えば、白血球上のエフェクター分子(例えば、CD2、CD3、CD28、CTLA-4、CD80、もしくはCD86)またはFc受容体(例えば、CD64、CD32、もしくはCD16))を特異的に認識し、それらに結合することができる。いくつかの態様において、抗体は、細胞傷害剤を、特定の標的抗原を発現する細胞に向けるために使用することができる。これらの抗体は、抗原に結合するアーム、および細胞傷害剤または放射性核種キレート剤(例えば、EOTUBE、DPTA、DOTA、またはTETA)に結合するアームを有する。
【0174】
二重特異性抗体を作製するための手法は、当業者に公知である。例えば、Millstein et al., 1983, Nature, 305:537-539; Brennan et al., 1985, Science, 229:81; Suresh et al., 1986, Methods in Enzymol., 121:120; Traunecker et al., 1991, EMBO J., 10:3655-3659; Shalaby et al., 1992, J. Exp. Med., 175:217-225; Kostelny et al., 1992, J. Immunol., 148:1547-1553; Gruber et al., 1994, J. Immunol., 152:5368;米国特許第5,731,168号;国際公開第WO 2009/089004号;および米国特許出願公開第2011/0123532号を参照のこと。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、2つの重鎖間の界面の一部であるアミノ酸の改変を有する重鎖定常領域を含む。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、「ノブ・イントゥ・ホール」戦略を用いて作製することができる(例えば、米国特許第5,731,168号; Ridgway et. al., 1996, Prot. Engin., 9:617-621を参照のこと)。場合によっては、「ノブ」および「ホール」という専門用語は、「突起」および「空洞」という用語に置き換えられる。いくつかの態様において、二重特異性抗体は、重鎖間でジスルフィド結合を形成することができない変異体ヒンジ領域を含み得る(例えば、WO 2006/028936を参照のこと)。いくつかの態様において、改変は、変更された静電相互作用をもたらすアミノ酸の変化を含み得る。いくつかの態様において、改変は、変更された疎水性/親水性相互作用をもたらすアミノ酸の変化を含み得る。
【0175】
二重特異性抗体は、抗原結合部位を含む、インタクトな抗体または抗体断片であり得る。2より高い結合価を有する抗体もまた企図される。例えば、三重特異性抗体が調製され得る(Tutt et al., 1991, J. Immunol., 147: 60)。したがって、ある特定の態様において、RSPO3に対する抗体は、多重特異性である。
【0176】
ある特定の態様において、本明細書において記載される抗体(または他のポリペプチド)は、単一特異的であり得る。ある特定の態様において、抗体が含む1つまたは複数の抗原結合部位の各々は、RSPOタンパク質上の相同エピトープに結合することができる(または結合する)。ある特定の態様において、本明細書において記載される単一特異的抗体の抗原結合部位は、例えば、RSPO3およびRSPO2に結合することができる(または結合する)(すなわち、同じエピトープが、RSPO3とRSPO2の両方のタンパク質上に見られる)。
【0177】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体断片である。抗体断片は、インタクトな抗体とは異なる機能または能力を有することがある;例えば、抗体断片は、高い腫瘍透過性を有し得る。抗体断片を作製するための様々な手法が知られており、それらは、インタクトな抗体のタンパク分解性消化を含むがそれに限定されるわけではない。いくつかの態様において、抗体断片は、抗体分子のペプシン消化によって生成されるF(ab')2断片を含む。いくつかの態様において、抗体断片は、F(ab')2断片のジスルフィド架橋を還元することによって生成されるFab断片を含む。他の態様において、抗体断片は、パパインおよび還元剤による抗体分子の処理によって生成されるFab断片を含む。ある特定の態様において、抗体断片は、組換え的に生成される。いくつかの態様において、抗体断片は、Fvまたは一本鎖Fv(scFv)断片を含む。Fab、Fv、およびscFv抗体断片は、大量のこれらの断片の生成が可能な大腸菌または他の宿主細胞において発現され得るおよびそれらから分泌され得る。いくつかの態様において、抗体断片は、本明細書において論じられるような抗体ファージライブラリーから単離される。例えば、RSPOタンパク質、またはその誘導体、断片、アナログ、もしくはホモログに対して所望の特異性を有するモノクローナルFab断片の迅速かつ効率的な識別を可能にするFab発現ライブラリーを構築するための方法を使用することができる(Huse et al, 1989, Science, 246: 1275-1281)。いくつかの態様において、抗体断片は、鎖状抗体断片である。ある特定の態様において、抗体断片は、単一特異的または二重特異的である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、scFvである。1つまたは複数のヒトRSPOに特異的な一本鎖抗体を作製するための様々な手法を使用することができる(例えば、米国特許第4,946,778号を参照のこと)。
【0178】
特に抗体断片の場合において、血清半減期を変更(例えば、延長または短縮)するために抗体を改変することがさらに望ましいことがある。これは、例えば、抗体断片内の適切な領域の変異によってサルベージ受容体結合エピトープを該抗体断片に組み込むことによって、またはそのエピトープをペプチドタグに組み込み、次いでそれを抗体断片のいずれかの末端または中央に(例えば、DNAまたはペプチド合成によって)融合することによって、達成することができる。
【0179】
ヘテロコンジュゲート抗体もまた、本発明の範囲内である。ヘテロコンジュゲート抗体は、2つの共有結合的に接続された抗体から構成される。そのような抗体は、例えば、望まれない細胞に免疫細胞を標的化するために提案されている(例えば、米国特許第4,676,980号を参照)。架橋剤が関与する方法を含む合成タンパク質化学における公知の方法を使用してインビトロにおいてヘテロコンジュゲート抗体が調製され得ることもまた企図される。例えば、ジスルフィド交換反応を使用して、またはチオエーテル結合を形成することによって、免疫毒素を構築することができる。この目的にとって好適な試薬の例としては、イミノチオレートおよびメチル-4-メルカプトブチルイミデートが挙げられる。
【0180】
本発明の目的のために、改変された抗体は、標的(すなわち、ヒトRSPO3)と該抗体の会合を提供する任意のタイプの可変領域を含み得ることが理解されるべきである。この点において、該可変領域は、所望の抗原に対する体液性応答を惹起するおよび免疫グロブリンを産生するように誘導され得る任意のタイプの哺乳動物を含み得るか、またはそれらに由来し得る。よって、改変された抗体の可変領域は、例えば、ヒト、マウス、非ヒト霊長類(例えば、カニクイザル、マカクなど)、またはウサギ起源であり得る。いくつかの態様において、改変された免疫グロブリンの可変領域と定常領域の両方が、ヒトである。他の態様において、適合性の抗体の可変領域(通常、非ヒト起源に由来する)は、該分子の結合特性を改善するようにまたは該分子の免疫原性を低下させるように操作され得るかまたは特異的に調整され得る。この点において、本発明において有用な可変領域は、ヒト化され得るか、または移入されるアミノ酸配列を含めることによって別途変更され得る。
【0181】
ある特定の態様において、重鎖と軽鎖の両方における可変ドメインは、1つまたは複数のCDRの少なくとも部分的な置換によって、ならびに必要であれば、部分的なフレームワーク領域の置換ならびに配列の改変および/または変更によって、変更される。CDRは、フレームワーク領域の起源である抗体と同じクラスまたはサブクラスの抗体に由来してもよいが、それらのCDRは、異なるクラスの抗体および多くの場合異なる種の抗体に由来してもよいことも認識される。1つの可変ドメインから別の可変ドメインに抗原結合能を移行させるために、全てのCDRをドナー可変領域由来の全てのCDRで置換する必要がない場合がある。むしろ、抗原結合部位の活性の維持に必要とされる残基を移行させることだけでよい。
【0182】
可変領域に対する変更にもかかわらず、本発明の改変された抗体が、所望の生化学的特徴(例えば、天然のまたは変更されていない定常領域を含むほぼ同じ免疫原性の抗体と比べて増大した腫瘍局在性または増大した血清半減期)を提供するように定常領域ドメインの1つまたは複数の少なくとも一部分が欠失しているかまたはさもなくば変更されている抗体(例えば、完全長抗体またはその免疫反応性断片)を含むことを、当業者は認識するであろう。いくつかの態様において、改変された抗体の定常領域は、ヒト定常領域を含むと考えられる。本発明に適合する定常領域に対する改変は、1つまたは複数のドメインにおける1つまたは複数のアミノ酸の付加、欠失、または置換を含む。本明細書において開示される改変された抗体は、3つの重鎖定常ドメイン(CH1、CH2、またはCH3)の1つもしくは複数および/または軽鎖定常ドメイン(CL)に対する変更または改変を含み得る。いくつかの態様において、改変された抗体の定常領域から、1つまたは複数のドメインを部分的にまたは全体的に欠失させる。いくつかの態様において、改変された抗体は、CH2ドメインの全体が除去された、ドメイン欠失コンストラクトまたは変異体を含む(ΔCH2コンストラクト)。いくつかの態様において、省略された定常領域ドメインは、存在しない定常領域ドメインによって通常付与される分子可撓性のいくらかを提供する短いアミノ酸スペーサー(例えば、10アミノ酸残基)によって置換される。
【0183】
いくつかの態様において、改変された抗体は、CH3ドメインを抗体のヒンジ領域に直接融合するように操作される。他の態様において、ペプチドスペーサーは、ヒンジ領域と改変されたCH2および/またはCH3ドメインとの間に挿入される。例えば、CH2ドメインが欠失しており、残りのCH3ドメイン(改変されているまたは改変されていない)が5〜20アミノ酸スペーサーによってヒンジ領域に接続されている、コンストラクトが発現され得る。そのようなスペーサーは、定常ドメインの調節エレメントが自由かつ到達可能なままであることまたはヒンジ領域が可撓性のままであることを保証するために付加され得る。しかしながら、アミノ酸スペーサーが、場合によっては免疫原性であると証明されることがあることおよびそのコンストラクトに対して望まれない免疫応答を誘発することがあることに注意すべきである。したがって、ある特定の態様において、コンストラクトに付加される任意のスペーサーは、改変された抗体の所望の生物学的品質が維持されるように比較的非免疫原性である。
【0184】
いくつかの態様において、改変された抗体は、定常ドメインの部分的な欠失またはいくつかのもしくは単一のアミノ酸の置換だけを有し得る。例えば、CH2ドメインの選択された領域における単一アミノ酸の変異は、Fc結合を実質的に低下させるため、ならびにそれによって癌細胞の局在性および/または腫瘍透過性を高めるために十分であり得る。同様に、調節される特定のエフェクター機能(例えば、補体C1q結合)を制御する1つまたは複数の定常領域ドメインの一部を単に欠失させることが、望ましい場合がある。定常領域のそのような部分的な欠失は、対象の定常領域ドメインに関連する他の望ましい機能を無傷のまま維持しながら、抗体の選択された特徴(血清半減期)を改善し得る。さらに、上で暗示されたように、開示される抗体の定常領域は、得られるコンストラクトのプロファイルを向上させる1つまたは複数のアミノ酸の変異または置換によって改変され得る。この点において、改変された抗体の配置および免疫原性プロファイルを実質的に維持しつつ、保存された結合部位によって提供される活性(例えば、Fc結合)を混乱させることが可能であり得る。ある特定の態様において、改変された抗体は、望ましい特徴(例えば、エフェクター機能を減少または増加させること)を向上させるため、またはより多くの細胞毒もしくは炭水化物付着部位を提供するために、定常領域への1つまたは複数のアミノ酸の付加を含む。
【0185】
定常領域がいくつかのエフェクター機能を媒介することは、当技術分野において公知である。例えば、IgGまたはIgM抗体(抗原に結合したもの)のFc領域への補体のC1成分の結合は、補体系を活性化する。補体の活性化は、細胞病原体のオプソニン化および溶解において重要である。補体の活性化は、炎症反応も刺激し、自己免疫性過敏症にも関与し得る。さらに、抗体のFc領域は、Fc受容体(FcR)を発現する細胞に結合することができる。種々のクラスの抗体に特異的ないくつかのFc受容体(IgG(ガンマ受容体)、IgE(イプシロン受容体)、IgA(アルファ受容体)およびIgM(ミュー受容体)を含む)が存在する。細胞表面上のFc受容体への抗体の結合は、抗体でコーティングされた粒子の貪食および破壊、免疫複合体のクリアランス、抗体でコーティングされた標的細胞のキラー細胞による溶解(抗体依存性細胞傷害またはADCCと呼ばれる)、炎症性メディエーターの放出、胎盤通過、ならびに免疫グロブリン産生の制御を含むいくつかの重要かつ多様な生物学的応答を引き起こす。
【0186】
ある特定の態様において、改変された抗体は、変更されたエフェクター機能(それはその後、投与された抗体の生物学的プロファイルに影響する)を提供する。例えば、いくつかの態様において、定常領域ドメインの欠失または不活性化(点変異または他の手段による)は、改変された循環抗体のFc受容体結合を減少させることがあり、それにより、癌細胞の局在性および/または腫瘍透過性が増加することがある。他の態様において、定常領域の改変は、抗体の血清半減期を延長する。他の態様において、定常領域の改変は、抗体の血清半減期を短縮する。いくつかの態様において、定常領域は、ジスルフィド結合またはオリゴ糖部分を除去するように改変される。本発明に係る定常領域に対する改変は、周知の生化学的手法または分子操作法を使用して容易に行われ得る。
【0187】
ある特定の態様において、抗体であるRSPO3結合剤は、1つまたは複数のエフェクター機能を有しない。例えば、いくつかの態様において、抗体は、ADCC活性を有さず、かつ/または補体依存性細胞傷害(CDC)活性を有しない。ある特定の態様において、抗体は、Fc受容体および/または補体因子に結合しない。ある特定の態様において、抗体は、エフェクター機能を有しない。
【0188】
本発明はさらに、本明細書において示されるキメラ抗体、ヒト化抗体、およびヒト抗体、またはそれらの抗体断片と実質的に相同である変異体および等価物を包含する。これらは、例えば、保存的置換の変異、すなわち、類似のアミノ酸による1つまたは複数のアミノ酸の置換を含み得る。例えば、保存的置換は、あるアミノ酸を、同一の一般的なクラスにおける別のアミノ酸により置換すること、例えば、1つの酸性アミノ酸を別の酸性アミノ酸で、1つの塩基性アミノ酸を別の塩基性アミノ酸で、または、1つの中性アミノ酸を別の中性アミノ酸で置換することを指す。保存的アミノ酸置換が意図するものは、当技術分野において周知であり、本明細書において記載される。
【0189】
したがって、本発明は、RSPO3に結合する抗体(RSPO3と第2標的(例えば、ヒトRSPO)の両方に特異的に結合する二重特異性抗体を含む)を作製するための方法を提供する。いくつかの態様において、RSPO3に結合する抗体を作製するための方法は、ハイブリドーマ法を使用する工程を含む。いくつかの態様において、ヒトRSPO3に結合する抗体を作製するための方法が提供される。いくつかの態様において、該方法は、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272を使用する工程を含む。いくつかの態様において、該方法は、SEQ ID NO:3のアミノ酸22〜272を使用する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3に結合する抗体を作製する方法は、ヒトファージライブラリーをスクリーニングする工程を含む。本発明はさらに、RSPO3に結合する抗体を識別する方法を提供する。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3またはその一部への結合についてのFACSによるスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3および第2のRSPOまたはそれらの一部への結合についてのFACSによるスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3およびRSPO2の両方またはそれらの一部への結合についてのFACSによるスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3への結合についてのELISAを使用したスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3および第2のRSPOへの結合についてのELISAを使用したスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3およびRSPO2の両方への結合についてのELISAを使用したスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、ヒトLGRタンパク質へのRSPO3の結合の遮断についてのFACSによるスクリーニングによって識別される。いくつかの態様において、抗体は、β-カテニンシグナル伝達の阻害または遮断についてのスクリーニングによって識別される。
【0190】
いくつかの態様において、ヒトRSPO3タンパク質に対する抗体を作製する方法は、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272を含むポリペプチドで哺乳動物を免疫する工程を含む。いくつかの態様において、ヒトRSPO3タンパク質に対する抗体を作製する方法は、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部を含むポリペプチドで哺乳動物を免疫する工程を含む。いくつかの態様において、該方法は、該哺乳動物から抗体または抗体産生細胞を単離する工程をさらに含む。いくつかの態様において、RSPO3タンパク質に結合するモノクローナル抗体を作製する方法は、(a)ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部を含むポリペプチドで哺乳動物を免疫する工程;(b)免疫された哺乳動物から抗体産生細胞を単離する工程;(c)該抗体産生細胞をミエローマ細胞株の細胞と融合してハイブリドーマ細胞を形成する工程を含む。いくつかの態様において、該方法はさらに、(d)RSPO3タンパク質に結合する抗体を発現しているハイブリドーマ細胞を選択する工程を含む。いくつかの態様において、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部は、SEQ ID NO:5〜8からなる群より選択される。いくつかの態様において、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部は、SEQ ID NO:5である。いくつかの態様において、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部は、SEQ ID NO:6またはSEQ ID NO:7である。いくつかの態様において、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部は、SEQ ID NO:6およびSEQ ID NO:7である。ある特定の態様において、哺乳動物は、マウスである。いくつかの態様において、抗体は、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部を含むポリペプチドを使用して選択される。ある特定の態様において、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部を含む、選択するために使用されるポリペプチドは、SEQ ID NO:5〜8からなる群より選択される。いくつかの態様において、抗体は、RSPO3および少なくとも1種の他のRSPOタンパク質に結合する。ある特定の態様において、少なくとも1種の他のRSPOタンパク質は、RSPO1、RSPO2、およびRSPO4からなる群より選択される。ある特定の態様において、抗体は、RSPO3およびRSPO1に結合する。ある特定の態様において、抗体は、RSPO3およびRSPO2に結合する。ある特定の態様において、抗体は、RSPO3およびRSPO4に結合する。ある特定の態様において、抗体は、RSPO3、RSPO1、およびRSPO2に結合する。ある特定の態様において、抗体は、RSPO3、RSPO1、およびRSPO4に結合する。ある特定の態様において、抗体は、RSPO3、RSPO2、およびRSPO4に結合する。いくつかの態様において、抗体は、ヒトRSPO3とマウスRSPO3の両方に結合する。
【0191】
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法によって作製される抗体は、RSPOアンタゴニスト、特にRSPO3アンタゴニストである。いくつかの態様において、本明細書において記載される方法によって作製される抗体は、β-カテニンシグナル伝達を阻害する。
【0192】
いくつかの態様において、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質に対する抗体を作製する方法は、単一の抗原結合部位を含む膜結合型ヘテロ二量体分子を使用して抗体を識別する工程を含む。いくつかの非限定的な態様において、抗体は、国際公開WO2011/100566に記載されている方法およびポリペプチドを使用して識別される。
【0193】
いくつかの態様において、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質に対する抗体を作製する方法は、抗体発現ライブラリーをヒトRSPOタンパク質に結合する抗体についてスクリーニングする工程を含む。いくつかの態様において、抗体発現ライブラリーは、ファージライブラリーである。いくつかの態様において、スクリーニングは、パニングを含む。いくつかの態様において、抗体発現ライブラリーは、ファージライブラリーである。いくつかの態様において、抗体発現ライブラリーは、哺乳動物細胞ライブラリーである。いくつかの態様において、抗体発現ライブラリーは、ヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部を使用してスクリーニングされる。いくつかの態様において、第1のスクリーニングにおいて識別された抗体は、再度、異なるRSPOタンパク質を使用してスクリーニングされ、それにより、RSPO3および第2のRSPOタンパク質に結合する抗体が識別される。ある特定の態様において、スクリーニングのために使用されるポリペプチドは、SEQ ID NO:5〜8からなる群より選択されるヒトRSPO3のアミノ酸22〜272の少なくとも一部を含む。いくつかの態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、RSPO3および少なくとも1種の他のRSPOタンパク質に結合する。ある特定の態様において、少なくとも1種の他のRSPOタンパク質は、RSPO1、RSPO2およびRSPO4からなる群より選択される。ある特定の態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、RSPO3およびRSPO1に結合する。ある特定の態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、RSPO3およびRSPO2に結合する。ある特定の態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、RSPO3およびRSPO4に結合する。いくつかの態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、ヒトRSPO3とマウスRSPO3の両方に結合する。いくつかの態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、RSPO3アンタゴニストである。いくつかの態様において、スクリーニングにおいて識別される抗体は、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を阻害する。
【0194】
ある特定の態様において、本明細書において記載される抗体は、単離されている。ある特定の態様において、本明細書において記載される抗体は、実質的に純粋である。
【0195】
本発明のいくつかの態様において、RSPO3結合剤は、ポリペプチドである。そのポリペプチドは、RSPO3に結合する抗体またはその断片を含む、組換えポリペプチド、天然ポリペプチド、または合成ポリペプチドであり得る。本発明のいくつかのアミノ酸配列が、そのタンパク質の構造または機能に有意に影響せずに変更され得ることが当技術分野において認識されるであろう。したがって、本発明はさらに、ヒトRSPO3に対する抗体またはその断片の実質的な活性を示すかまたはそれらの領域を含む、ポリペプチドのバリエーションを包含する。いくつかの態様において、RSPO結合ポリペプチドのアミノ酸配列のバリエーションは、欠失、挿入、逆位、反復、および/または他のタイプの置換を含む。
【0196】
ある特定の態様において、本明細書において記載されるポリペプチドが単離される。ある特定の態様において、本明細書において記載されるポリペプチドは、実質的に純粋である。
【0197】
前記ポリペプチド、そのアナログおよび変異体は、通常はそのポリペプチドの一部でないさらなる化学部分を含むようにさらに改変され得る。誘導体化された部分は、そのポリペプチドの溶解性、生物学的半減期、および/または吸収を改善またはそうでなければ調節し得る。該部分はまた、そのポリペプチドおよび変異体の望ましくない副作用を減少させ得るかまたは排除し得る。化学部分についての概要は、Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 22
st Edition, 2012, Pharmaceutical Press, Londonに見られる。
【0198】
本明細書において記載されるポリペプチドは、当技術分野において公知の任意の好適な方法によって作製することができる。そのような方法は、直接的なタンパク質合成法から、ポリペプチド配列をコードするDNA配列の構築およびそれらの配列の好適な宿主内での発現にまで及ぶ。いくつかの態様において、DNA配列は、関心対象の野生型タンパク質をコードするDNA配列を単離することまたは合成することによって組換え技術を使用して構築される。任意で、該配列は、その機能的アナログを提供する部位特異的突然変異誘発によって変異誘発され得る。例えば、Zoeller et al., 1984, PNAS, 81: 5662-5066および米国特許第4,588,585号を参照のこと。
【0199】
いくつかの態様において、関心対象のポリペプチドをコードするDNA配列は、オリゴヌクレオチド合成装置を使用する化学合成によって構築され得る。オリゴヌクレオチドは、所望のポリペプチドのアミノ酸配列に基づき、関心対象の組換えポリペプチドを産生する宿主細胞において好まれるコドンを選択して、設計することができる。単離された関心対象のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列を合成するために、標準的な方法を適用することができる。例えば、完全なアミノ酸配列を使用して、逆翻訳された遺伝子を構築することができる。さらに、特定の単離されたポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むDNAオリゴマーを合成することができる。例えば、所望のポリペプチドの一部をコードするいくつかの小さなオリゴヌクレオチドを合成し、次いで、ライゲートすることができる。その個々のオリゴヌクレオチドは、典型的には、相補的アセンブリのために5'または3'オーバーハングを含む。
【0200】
関心対象の特定のポリペプチドをコードするポリヌクレオチド配列が(合成、部位特異的突然変異誘発、または別の方法によって)組み立てられたら、発現ベクターに挿入され得、所望の宿主内でのタンパク質の発現に適した発現調節配列に機能的に連結され得る。ヌクレオチド配列決定、制限酵素マッピング、および/または好適な宿主内での生物学的に活性なポリペプチドの発現によって、適切なアセンブリを確認することができる。当技術分野において周知であるように、宿主内におけるトランスフェクト遺伝子の高発現レベルを得るために、該遺伝子は、選択された発現宿主において機能的である転写および翻訳の発現調節配列に機能的に連結されなければならない。
【0201】
ある特定の態様において、ヒトRSPO3に対する抗体またはその断片をコードするDNAを増幅するおよび発現させるために組換え発現ベクターが使用される。例えば、組換え発現ベクターは、哺乳動物、微生物、ウイルス、または昆虫の遺伝子に由来する好適な転写および/または翻訳の調節エレメントに機能的に連結された、RSPO結合剤、例えば抗RSPO抗体、またはその断片のポリペプチド鎖をコードする合成DNA断片またはcDNA由来DNA断片を有する複製可能なDNAコンストラクトであり得る。転写単位は一般に、(1)遺伝子発現において制御の役割を有する遺伝的エレメント、例えば、転写プロモーターまたはエンハンサー、(2)mRNAに転写され、タンパク質に翻訳される構造配列またはコード配列、ならびに(3)適切な転写開始配列および翻訳開始配列ならびに転写終結配列および翻訳終結配列のアセンブリを含む。調節エレメントは、転写を制御するオペレーター配列を含み得る。宿主において複製する能力(通常、複製起点によって付与される)および形質転換体の認識を促す選択遺伝子がさらに組み込まれ得る。DNA領域は、それらが互いに機能的に関係しているとき、「機能的に連結される」。例えば、シグナルペプチド(分泌リーダー)に対するDNAは、それがポリペプチドの分泌に関与する前駆体として発現される場合、該ポリペプチドに対するDNAに機能的に連結される;プロモーターは、それがコード配列の転写を制御する場合、該コード配列に機能的に連結される;またはリボソーム結合部位は、それが翻訳を可能にするように配置される場合、コード配列に機能的に連結される。いくつかの態様において、酵母発現系における使用が意図された構造エレメントには、翻訳されたタンパク質の宿主細胞による細胞外分泌を可能にするリーダー配列が含まれる。他の態様において、組換えタンパク質が、リーダー配列または輸送配列なしで発現される状況では、該組換えタンパク質は、N末端のメチオニン残基を含み得る。最終生成物を提供するために、任意でこの残基を、後に、発現された組換えタンパク質から切断することができる。
【0202】
発現調節配列および発現ベクターの選択は、宿主の選択に依存する。多種多様の発現宿主/ベクターの組み合わせを使用することができる。真核生物宿主にとって有用な発現ベクターとしては、例えば、SV40、ウシパピローマウイルス、アデノウイルス、およびサイトメガロウイルス由来の発現調節配列を含むベクターが挙げられる。細菌宿主にとって有用な発現ベクターとしては、公知の細菌プラスミド(例えば、pCRl、pBR322、pMB9、およびそれらの誘導体を含む大腸菌由来のプラスミド)、およびより広範な宿主範囲のプラスミド(例えば、M13および他の繊維状一本鎖DNAファージ)が挙げられる。
【0203】
本発明のRSPO結合剤(例えば、ポリペプチドまたは抗体)は、1つまたは複数のベクターから発現させることができる。例えば、いくつかの態様において、1つの重鎖ポリペプチドは1つのベクターにより発現され、第2の重鎖ポリペプチドは第2のベクターにより発現され、かつ軽鎖ポリペプチドは第3のベクターにより発現される。いくつかの態様において、第1の重鎖ポリペプチドおよび軽鎖ポリペプチドは、1つのベクターにより発現され、かつ第2の重鎖ポリペプチドは第2のベクターにより発現される。いくつかの態様において、2つの重鎖ポリペプチドは1つのベクターにより発現され、かつ軽鎖ポリペプチドは第2のベクターにより発現される。いくつかの態様において、3つのポリペプチドは1つのベクターから発現される。したがって、いくつかの態様において、第1の重鎖ポリペプチド、第2の重鎖ポリペプチド、および軽鎖ポリペプチドは、単一のベクターにより発現される。
【0204】
RSPO3結合ポリペプチドまたは抗体(または抗原として使用するためのRSPOタンパク質)の発現にとって好適な宿主細胞としては、適切なプロモーターの支配下の原核生物、酵母細胞、昆虫細胞、または高等真核細胞が挙げられる。原核生物には、グラム陰性生物またはグラム陽性生物、例えば、大腸菌またはバチルス属(Bacillus)が含まれる。高等真核細胞には、下記に記載されるような哺乳動物起源の樹立細胞株が含まれる。無細胞翻訳系も使用され得る。細菌、真菌、酵母、および哺乳動物の細胞宿主とともに使用するのに適切なクローニングベクターおよび発現ベクターは、Pouwels et al., 1985, Cloning Vectors: A Laboratory Manual, Elsevier, New York, NYに記載されている。抗体作製を含むタンパク質の作製方法に関するさらなる情報は、例えば、米国特許出願公開第2008/0187954号、米国特許第6,413,746号、同第6,660,501号;および国際特許公開第WO 04/009823号に見られる。
【0205】
様々な哺乳動物培養系が、組換えポリペプチドを発現させるために使用され得る。哺乳動物細胞における組換えタンパク質の発現は、これらのタンパク質が一般に、正しく折り畳まれ、適切に修飾され、かつ生物学的に機能的であるので、望ましい場合がある。好適な哺乳動物宿主細胞株の例としては、COS-7(サル腎臓由来)、L-929(マウス線維芽細胞由来)、C127(マウス乳房腫瘍由来)、3T3(マウス線維芽細胞由来)、CHO(チャイニーズハムスター卵巣由来)、HeLa(ヒト子宮頸癌由来)、BHK(ハムスター腎臓線維芽細胞由来)、HEK-293(ヒト胎児腎由来)細胞株、およびそれらの変異体が挙げられるが、それに限定されるわけではない。哺乳動物発現ベクターは、転写されないエレメント(例えば、複製起点、発現される遺伝子に連結された好適なプロモーターおよびエンハンサー、ならびに他の転写されない5'または3'フランキング配列)、ならびに翻訳されない5'または3'配列(例えば、必要なリボソーム結合部位、ポリアデニル化部位、スプライスドナーおよびアクセプター部位、ならびに転写終結配列)を含み得る。
【0206】
昆虫細胞培養系(例えば、バキュロウイルス)における組換えタンパク質の発現も、正しく折り畳まれ、かつ生物学的に機能的なタンパク質を産生するための頑強な方法を提供する。昆虫細胞において異種タンパク質を産生するためのバキュロウイルス系は、当業者に周知である(例えば、Luckow and Summers, 1988, Bio/Technology, 6:47を参照のこと)。
【0207】
したがって、本発明は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤を含む細胞を提供する。いくつかの態様において、該細胞は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤を産生する。ある特定の態様において、該細胞は抗体を産生する。いくつかの態様において、該細胞は、ヒトRSPO3に結合する抗体を産生する。ある特定の態様において、該細胞は抗体131R002を産生する。ある特定の態様において、該細胞は抗体131R003を産生する。ある特定の態様において、該細胞は、抗体131R003の変異体を産生する。ある特定の態様において、該細胞は、抗体131R002、抗体131R003、または抗体131R003の変異体のヒト化バージョンを産生する。いくつかの態様において、該細胞は、抗体131R002、抗体131R003、または抗体131R003の変異体のキメラバージョンを産生する。いくつかの態様において、該細胞は抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bを産生する。いくつかの態様において、該細胞は抗体h131R005/131R007を産生する。いくつかの態様において、該細胞は抗体h131R008を産生する。いくつかの態様において、該細胞は抗体h131R010を産生する。いくつかの態様において、該細胞は抗体h131R011を産生する。いくつかの態様において、該細胞は、RSPO3に結合する二重特異性抗体を産生する。いくつかの態様において、該細胞は、RSPO3およびRSPO2に結合する二重特異性抗体を産生する。いくつかの態様において、該細胞はハイブリドーマ細胞である。いくつかの態様において、該細胞は哺乳動物細胞である。いくつかの態様において、該細胞は原核細胞である。いくつかの態様において、該細胞は真核細胞である。
【0208】
形質転換された宿主によって産生されるタンパク質は、任意の好適な方法に従って精製され得る。標準的な方法としては、クロマトグラフィー(例えば、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、およびサイジングカラムクロマトグラフィー)、遠心分離、溶解度差(differential solubility)、またはタンパク質精製のための他の任意の標準的な手法が挙げられる。親和性タグ(例えば、ヘキサ-ヒスチジン、マルトース結合ドメイン、インフルエンザコート配列、およびグルタチオン-S-トランスフェラーゼ)が、適切なアフィニティーカラムの通過による容易な精製を可能にするためにタンパク質に付着され得る。免疫グロブリンを精製するために使用されるアフィニティークロマトグラフィーとしては、プロテインAクロマトグラフィー、プロテインGクロマトグラフィー、およびプロテインLクロマトグラフィーが挙げられ得る。単離されたタンパク質は、タンパク質分解、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)、質量分析(MS)、核磁気共鳴(NMR)、等電点電気泳動(IEF)、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、およびX線結晶構造解析のような手法を使用して物理的に特徴付けることができる。単離されたタンパク質の純度は、当業者に公知の手法(SDS-PAGE、SEC、キャピラリーゲル電気泳動、IEF、およびキャピラリー等電点電気泳動(cIEF)を含むがそれに限定されるわけではない)を使用して測定することができる。
【0209】
いくつかの態様において、組換えタンパク質を培養培地に分泌する発現系からの上清は、まず、市販のタンパク質濃縮フィルター、例えば、AmiconまたはMillipore Pellicon限外濾過ユニットを使用して濃縮され得る。濃縮段階の後、その濃縮物は、好適な精製マトリックスに適用され得る。いくつかの態様において、陰イオン交換樹脂、例えば、ペンダントジエチルアミノエチル(DEAE)基を有するマトリックスまたは基材を使用することができる。そのマトリックスは、アクリルアミド、アガロース、デキストラン、セルロース、またはタンパク質精製において通常使用される他のタイプであり得る。いくつかの態様において、陽イオン交換段階を使用することができる。好適な陽イオン交換体としては、スルホプロピル基またはカルボキシメチル基を含む様々な不溶性マトリックスが挙げられる。いくつかの態様において、セラミックヒドロキシアパタイト(CHT)を含むがそれに限定されるわけではないヒドロキシアパタイト媒体を使用することができる。ある特定の態様において、疎水性RP-HPLC媒体、例えば、ペンダントメチル基または他の脂肪族基を有するシリカゲルを使用する1つまたは複数の逆相HPLC段階が、組換えタンパク質(例えば、RSPO3結合剤)をさらに精製するために使用することができる。様々な組み合わせでの前述の精製段階の一部または全部が、均一な組換えタンパク質を提供するために使用することができる。
【0210】
いくつかの態様において、二重特異性抗体などのヘテロ二量体タンパク質は、本明細書において記載される方法のいずれかに従って精製される。いくつかの態様において、抗RSPO二重特異性抗体は、少なくとも1つのクロマトグラフィー段階を用いて単離および/または精製される。いくつかの態様において、少なくとも1つのクロマトグラフィー段階は、アフィニティークロマトグラフィーを含む。いくつかの態様において、少なくとも1つのクロマトグラフィー段階は、陰イオン交換クロマトグラフィーをさらに含む。いくつかの態様において、単離および/または精製された抗体産物は、少なくとも90%のヘテロ二量体抗体を含む。いくつかの態様において、単離および/または精製された抗体産物は、少なくとも95%、96%、97%、98%、または99%のヘテロ二量体抗体を含む。いくつかの態様において、単離および/または精製された抗体産物は、約100%のヘテロ二量体抗体を含む。
【0211】
いくつかの態様において、細菌培養物中に生成される組換えタンパク質は、例えば、細胞ペレットからの最初の抽出に続く、1回または複数回の濃縮、塩析、水溶性イオン交換、またはサイズ排除クロマトグラフィー工程によって、単離することができる。最後の精製工程のためにHPLCを使用することができる。組換えタンパク質の発現において使用される微生物細胞は、凍結融解の繰り返し、超音波処理、機械的破壊、または細胞溶解剤の使用を含む任意の好都合な方法によって破壊することができる。
【0212】
抗体および他のタンパク質を精製するための当技術分野において公知の方法としては、例えば、米国特許出願公開第2008/0312425号、同第2008/0177048号、および同第2009/0187005号に記載されている方法も挙げられる。
【0213】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、抗体ではないポリペプチドである。タンパク質標的に高親和性で結合する非抗体ポリペプチドを識別するためおよび作製するための種々の方法は、当技術分野において公知である。例えば、Skerra, 2007, Curr. Opin. Biotechnol, 18: 295-304; Hosse et al., 2006, Protein Science, 15: 14-27; Gill et al., 2006, Curr. Opin. Biotechnol, 17: 653-658; Nygren, 2008, FEBS J., 275: 2668-76;およびSkerra, 2008, FEBS J., 275: 2677-83を参照のこと。ある特定の態様では、RSPO3結合ポリペプチドを作製するためおよび/または識別するためにファージまたは哺乳動物ディスプレイ技術が使用され得る。ある特定の態様において、ポリペプチドは、プロテインA、プロテインG、リポカリン、フィブロネクチンドメイン、アンキリンコンセンサスリピートドメイン、およびチオレドキシンからなる群より選択されるタイプのタンパク質骨格を含む。
【0214】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤または抗体は、いくつかのコンジュゲート形態(すなわち、免疫コンジュゲートまたは放射性コンジュゲート)または非コンジュゲート形態のいずれか1つとして使用することができる。ある特定の態様において、補体依存性細胞傷害性および抗体依存性細胞毒性を含む対象の天然の防御機構を利用して悪性細胞または癌細胞を排除するために、抗体を、非コンジュゲート形態で使用することができる。
【0215】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体またはポリペプチド)は、細胞傷害剤にコンジュゲートされる。いくつかの態様において、細胞傷害剤は、メトトレキサート、アドリアマイシン(adriamicin)、ドキソルビシン、メルファラン、マイトマイシンC、クロラムブシル、ダウノルビシン、または他の挿入剤を含むがそれに限定されるわけではない化学療法剤である。いくつかの態様において、細胞傷害剤は、細菌、真菌、植物、もしくは動物起源の酵素的に活性なトキシン、またはそれらの断片(ジフテリアA鎖、ジフテリア毒素の活性な非結合性断片、外毒素A鎖、リシンA鎖、アブリンA鎖、モデクシンA鎖、アルファ-サルシン、シナアブラギリ(Aleurites fordii)タンパク質、ジアンシン(dianthin)タンパク質、ヨウシュヤマゴボウ(Phytolaca americana)タンパク質(PAPI、PAPII、およびPAP-S)、ツルレイシ(Momordica charantia)阻害剤、クルシン、クロチン、サボンソウ(Sapaonaria officinalis)阻害剤、ゲロニン、マイトゲリン(mitogellin)、レストリクトシン、フェノマイシン(phenomycin)、エノマイシン(enomycin)、およびトリコテシン(tricothecenes)を含むがそれに限定されるわけではない)である。いくつかの態様において、細胞傷害剤は、放射性コンジュゲートまたは放射性コンジュゲート抗体を生成する、放射性同位体である。放射性コンジュゲート抗体を作製するために種々の放射性核種(
90Y、
125I、
131I、
123I、
111In、
131In、
105Rh、
153Sm、
67Cu、
67Ga、
166Ho、
177Lu、
186Re、
188Re、および
212Biを含むがそれに限定されるわけではない)が利用可能である。抗体と、1つまたは複数の小分子トキシン(例えば、カリケアマイシン、メイタンシノイド、トリコテシン(trichothene)、およびCC1065)およびトキシン活性を有するこれらのトキシンの誘導体とのコンジュゲートも使用され得る。抗体と細胞傷害剤とのコンジュゲートは、種々の二機能性タンパク質カップリング剤(例えば、N-スクシンイミジル-3-(2-ピリジルジチオール(pyridyidithiol))プロピオネート(SPDP)、イミノチオラン(IT)、イミドエステルの二機能性誘導体(例えば、ジメチルアジプイミデートHCl)、活性エステル(例えば、ジスクシンイミジルスベレート)、アルデヒド類(例えば、グルタルアルデヒド(glutareldehyde))、ビス-アジド化合物(例えば、ビス(p-アジドベンゾイル)ヘキサンジアミン)、ビス-ジアゾニウム誘導体(例えば、ビス-(p-ジアゾニウムベンゾイル)-エチレンジアミン)、ジイソシアネート(例えば、トルエン2,6-ジイソシアナート)、およびビス活性フッ素化合物(例えば、1,5-ジフルオロ-2,4-ジニトロベンゼン))を使用して作製され得る。
【0216】
III. ポリヌクレオチド
ある特定の態様において、本発明は、RSPO3に特異的に結合するポリペプチド(またはポリペプチドの断片)をコードするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドを包含する。用語「ポリペプチドをコードするポリヌクレオチド」は、ポリペプチドのコード配列だけを含むポリヌクレオチド、ならびにさらなるコード配列および/または非コード配列を含むポリヌクレオチドを包含する。例えば、いくつかの態様において、本発明は、ヒトRSPO3に対する抗体をコードするか、またはそのような抗体の断片(例えば、抗原結合部位を含む断片)をコードするポリヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドを提供する。本発明のポリヌクレオチドは、RNAの形態またはDNAの形態であり得る。DNAには、cDNA、ゲノムDNA、および合成DNAが含まれ;二本鎖または一本鎖であり得、一本鎖は、コーディング鎖または非コーディング(アンチセンス)鎖であり得る。
【0217】
ある特定の態様において、ポリヌクレオチドは、SEQ ID NO:15、SEQ ID NO:16、SEQ ID NO:17、SEQ ID NO:21、SEQ ID NO:22、SEQ ID NO:23、SEQ ID NO:27、SEQ ID NO:28、SEQ ID NO:29、SEQ ID NO:36、SEQ ID NO:37、SEQ ID NO:38、SEQ ID NO:39、SEQ ID NO:41、SEQ ID NO:42、SEQ ID NO:44、SEQ ID NO:45、SEQ ID NO:46、SEQ ID NO:47、SEQ ID NO:48、SEQ ID NO:49、SEQ ID NO:62、SEQ ID NO:63、SEQ ID NO:64、SEQ ID NO:68、SEQ ID NO:69、SEQ ID NO:72、SEQ ID NO:73、SEQ ID NO:74、SEQ ID NO:86、SEQ ID NO:87、およびSEQ ID NO:88からなる群より選択されるアミノ酸配列を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、ポリヌクレオチドは、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:94、およびSEQ ID NO:95からなる群より選択されるポリヌクレオチド配列を含む。
【0218】
いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:18を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:19を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:20を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:24を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:25を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:30を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:31を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:40を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:43を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:50を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:51を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:52を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:53を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:54を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:55を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:65を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:66を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:67を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:70を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:71を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:75を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:84を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:85を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:89を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:90を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:91を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:92を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:93を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:94を含むポリヌクレオチドを含む。いくつかの態様において、プラスミドは、SEQ ID NO:95を含むポリヌクレオチドを含む。
【0219】
ある特定の態様において、ポリヌクレオチドは、SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:94、およびSEQ ID NO:95からなる群より選択される配列を含むポリヌクレオチドと少なくとも約80%同一、少なくとも約85%同一、少なくとも約90%同一、少なくとも約95%同一、およびいくつかの態様において、少なくとも約96%、97%、98%、または99%同一であるヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含む。SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:990、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:94、またはSEQ ID NO:95にハイブリダイズするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドも提供される。SEQ ID NO:18、SEQ ID NO:19、SEQ ID NO:20、SEQ ID NO:24、SEQ ID NO:25、SEQ ID NO:26、SEQ ID NO:30、SEQ ID NO:31、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:32、SEQ ID NO:40、SEQ ID NO:43、SEQ ID NO:50、SEQ ID NO:51、SEQ ID NO:52、SEQ ID NO:53、SEQ ID NO:54、SEQ ID NO:55、SEQ ID NO:65、SEQ ID NO:66、SEQ ID NO:67、SEQ ID NO:70、SEQ ID NO:71、SEQ ID NO:75、SEQ ID NO:76、SEQ ID NO:77、SEQ ID NO:84、SEQ ID NO:85、SEQ ID NO:89、SEQ ID NO:90、SEQ ID NO:91、SEQ ID NO:92、SEQ ID NO:93、SEQ ID NO:94、またはSEQ ID NO:95の相補体にハイブリダイズするポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドも提供される。ある特定の態様において、ハイブリダイゼーションは、高ストリンジェンシーの条件下である。
【0220】
いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:18およびSEQ ID NO:20を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:19およびSEQ ID NO:20を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:50およびSEQ ID NO:20を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:51およびSEQ ID NO:20を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:65およびSEQ ID NO:20を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:18およびSEQ ID NO:75を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:19およびSEQ ID NO:75を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:50およびSEQ ID NO:75を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:51およびSEQ ID NO:75を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:65およびSEQ ID NO:75を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:95およびSEQ ID NO:89を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:92およびSEQ ID NO:89を含むポリヌクレオチドによってコードされる。
【0221】
いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:24およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:25およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:43およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:52およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:53およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:70およびSEQ ID NO:26を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:24およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:25およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:40およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:43およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:52およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:53およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:70およびSEQ ID NO:76を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:84およびSEQ ID NO:90を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:93およびSEQ ID NO:90を含むポリヌクレオチドによってコードされる。
【0222】
いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:30およびSEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:31およびSEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:54およびSEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:55およびSEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:71およびSEQ ID NO:32を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:30およびSEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:31およびSEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:54およびSEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:55およびSEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:71およびSEQ ID NO:77を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:85およびSEQ ID NO:91を含むポリヌクレオチドによってコードされる。いくつかの態様において、抗体は、SEQ ID NO:94およびSEQ ID NO:91を含むポリヌクレオチドによってコードされる。
【0223】
ある特定の態様において、ポリヌクレオチドは、例えば、宿主細胞由来のポリペプチドの発現および分泌を助けるポリヌクレオチド(例えば、該細胞由来のポリペプチドの輸送を制御するための分泌配列として機能するリーダー配列)に同じ読み枠で融合された成熟ポリペプチドのコード配列を含む。リーダー配列を有するポリペプチドは、プレタンパク質であり、リーダー配列が宿主細胞によって切断されることにより、成熟型のポリペプチドが形成され得る。ポリヌクレオチドは、成熟タンパク質+さらなる5'アミノ酸残基であるプロタンパク質もコードし得る。プロ配列を有する成熟タンパク質は、プロタンパク質であり、そのタンパク質の不活性型である。プロ配列が切断されたら、活性な成熟タンパク質が残る。
【0224】
ある特定の態様において、ポリヌクレオチドは、例えばコードされたポリペプチドの精製を可能にするマーカー配列に同じ読み枠で融合された成熟ポリペプチドのコード配列を含む。例えば、マーカー配列は、細菌宿主の場合、該マーカーに融合された成熟ポリペプチドの精製を提供するpQE-9ベクターによって供給されるヘキサ-ヒスチジンタグであり得るか、またはマーカー配列は、哺乳動物宿主(例えば、COS-7細胞)が使用されるとき、インフルエンザ赤血球凝集素タンパク質に由来する赤血球凝集素(HA)タグであり得る。いくつかの態様において、マーカー配列は、他の親和性タグとともに使用することができる配列
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のペプチドであるFLAGタグである。
【0225】
本発明はさらに、例えば、断片、アナログ、および/または誘導体をコードする、本明細書の上に記載されたポリヌクレオチドの変異体に関する。
【0226】
ある特定の態様において、本発明は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤(例えば、抗体)またはその断片を含むポリペプチドをコードするポリヌクレオチドと少なくとも約80%同一、少なくとも約85%同一、少なくとも約90%同一、少なくとも約95%同一、およびいくつかの態様において、少なくとも約96%、97%、98%、または99%同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを含むポリヌクレオチドを提供する。
【0227】
本明細書において使用されるとき、参照ヌクレオチド配列と少なくとも、例えば95%「同一」のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドという句は、該ポリヌクレオチド配列が参照ヌクレオチド配列の各100ヌクレオチドあたり最大5個の点変異を含み得ることを除いて、該ポリヌクレオチドのヌクレオチド配列が参照配列と同一であることを意味することを意図されている。換言すれば、参照ヌクレオチド配列と少なくとも95%同一のヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを得るために、参照配列中の最大5%のヌクレオチドを、欠失させるかもしくは別のヌクレオチドで置換することができ、または参照配列中の全ヌクレオチドの最大5%までのいくつかのヌクレオチドを、参照配列に挿入することができる。参照配列のこれらの変異は、参照ヌクレオチド配列の5'もしくは3'末端部分または該末端部分の間の任意の箇所にあってよく、参照配列内のヌクレオチド内で個別にまたは参照配列内の1つもしくは複数の連続した群として散在していてもよい。
【0228】
ポリヌクレオチド変異体は、コード領域、非コード領域、またはその両方に変更を含み得る。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、サイレントな置換、付加、または欠失をもたらすが、コードされるポリペプチドの特性または活性を変更しない変更を含む。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、ポリペプチドのアミノ酸配列に変化を生じないサイレント置換(遺伝暗号の縮重に起因する)を含む。いくつかの態様において、ヌクレオチド変異体は、転写レベルで発現の差(例えば、増加したまたは減少した発現)をもたらすヌクレオチド配列を含む。ポリヌクレオチド変異体は、種々の理由のために、例えば、特定の宿主に対してコドン発現を最適化する(すなわち、ヒトmRNAにおけるコドンを大腸菌などの細菌宿主によって好ましいコドンに変更する)ために、生成され得る。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、配列の非コード領域またはコード領域中に少なくとも1つのサイレント変異を含む。
【0229】
いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、コードされるポリペプチドの発現(または発現レベル)を調節または変更するように産生される。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、コードされるポリペプチドの発現を増加させるように産生される。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、コードされるポリペプチドの発現を減少させるように産生される。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、親のポリヌクレオチド配列と比べて増加したコードポリペプチドの発現を有する。いくつかの態様において、ポリヌクレオチド変異体は、親のポリヌクレオチド配列と比べて減少したコードポリペプチドの発現を有する。
【0230】
いくつかの態様において、少なくとも1つのポリヌクレオチド変異体は、ヘテロ多量体分子の産生を増加させるように(コードされるポリペプチドのアミノ酸配列を変化させることなく)産生される。いくつかの態様において、少なくとも1つのポリヌクレオチド変異体は、二重特異性抗体の産生を増加させるように(コードされるポリペプチドのアミノ酸配列を変化させることなく)産生される。
【0231】
ある特定の態様において、ポリヌクレオチドは単離されている。ある特定の態様において、ポリヌクレオチドは実質的に純粋である。
【0232】
本明細書において記載されるポリヌクレオチドを含むベクターも提供される。本明細書において記載されるポリヌクレオチドを含む細胞も提供される。いくつかの態様において、発現ベクターはポリヌクレオチド分子を含む。いくつかの態様において、宿主細胞は、ポリヌクレオチド分子を含む発現ベクターを含む。いくつかの態様において、宿主細胞はポリヌクレオチド分子を含む。
【0233】
IV. 使用方法および薬学的組成物
本発明のRSPO3結合剤(ポリペプチドおよび抗体を含む)は、癌の処置などの治療的な処置方法を含むがそれに限定されるわけではない種々の応用法において有用である。ある特定の態様において、それらの剤は、β-カテニンシグナル伝達を阻害するため、腫瘍成長を阻害するため、血管新生を調節するため、血管新生を阻害するため、分化を誘導するため、腫瘍体積を減少させるため、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度を低下させるため、および/または腫瘍の腫瘍形成能を低下させるために有用である。それらの使用方法は、インビトロ、エクスビボ、またはインビボにおける方法であり得る。ある特定の態様において、RSPO3結合剤またはポリペプチドまたは抗体は、ヒトRSPO3のアンタゴニストである。
【0234】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、β-カテニンの活性化、増加したβ-カテニンシグナル伝達、および/または異常なβ-カテニンシグナル伝達に関連する疾患の処置において使用される。ある特定の態様において、該疾患は、β-カテニンシグナル伝達に依存する疾患である。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、増加した血管新生を特徴とする障害の処置において使用される。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、増加したレベルの幹細胞および/または前駆細胞を特徴とする障害の処置において使用される。いくつかの態様において、前記方法は、RSPO3結合剤(例えば、抗体)の治療有効量を対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、対象はヒトである。
【0235】
本発明は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤または抗体を使用して腫瘍の成長を阻害するための方法を提供する。ある特定の態様において、腫瘍の成長を阻害する方法は、インビトロにおいて細胞をRSPO3結合剤(例えば、抗体)と接触させる工程を含む。例えば、不死化細胞株または癌細胞株を、抗RSPO3抗体または腫瘍成長を阻害する他の剤が加えられた培地中で培養する。いくつかの態様において、腫瘍細胞は、患者試料(例えば、組織生検材料、胸水、または血液試料)から単離され、RSPO3結合剤が加えられた培地中で培養されることにより、腫瘍成長が阻害される。
【0236】
いくつかの態様において、腫瘍の成長を阻害する方法は、インビボにおいて腫瘍または腫瘍細胞をRSPO3結合剤(例えば、抗体)と接触させる工程を含む。ある特定の態様において、腫瘍または腫瘍細胞をRSPO3結合剤と接触させる工程は、動物モデルにおいて行われる。例えば、RSPO3結合剤は、異種移植片を有する免疫無防備状態マウス(例えば、NOD/SCIDマウス)に投与され得る。いくつかの態様において、癌細胞または癌幹細胞を患者試料(例えば、組織生検材料、胸水、または血液試料)から単離して免疫無防備状態マウスに注射し、次いで該マウスにRSPO3結合剤を投与して、腫瘍細胞の成長を阻害する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤が動物に投与される。いくつかの態様において、腫瘍成長を予防するために、腫瘍形成性細胞を動物に導入するのと同時またはそのすぐ後に、RSPO3結合剤を投与する(「予防モデル」)。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、腫瘍が特定のサイズに成長した後に治療剤として投与される(「治療モデル」)。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗RSPO3抗体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R002である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R003である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0237】
ある特定の態様において、腫瘍の成長を阻害する方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含み、ここで、該RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含む。該方法のいくつかの態様において、RSPO3結合剤はさらに、
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。
【0238】
ある特定の態様において、腫瘍の成長を阻害する方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含む。ある特定の態様において、対象はヒトである。ある特定の態様において、対象は、腫瘍を有するか、または腫瘍を除去されたことがある。いくつかの態様において、対象は、上昇した発現レベルの少なくとも1種のRSPOタンパク質(例えば、RSPO1、RSPO2、RSPO3、またはRSPO4)を有する腫瘍を有する。いくつかの態様において、対象は、高発現レベルの少なくとも1種のRSPOタンパク質(例えば、RSPO1、RSPO2、RSPO3、またはRSPO4)を有する腫瘍を有する。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R003である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R008である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R010である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R011である。
【0239】
ある特定の態様において、腫瘍は、β-カテニンシグナル伝達が活性である腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、β-カテニンシグナル伝達が異常である腫瘍である。ある特定の態様において、腫瘍は、APC癌抑制遺伝子における不活性化変異(例えば、短縮型変異)を含む。ある特定の態様において、腫瘍は、APC癌抑制遺伝子における不活性化変異を含まない。いくつかの態様において、腫瘍は野生型APC遺伝子を含む。いくつかの態様において、腫瘍は、β-カテニン遺伝子における活性化変異を含まない。ある特定の態様において、対象が処置されている癌はそのような腫瘍を含む。
【0240】
いくつかの態様において、腫瘍はRSPO遺伝子融合を含む。いくつかの態様において、腫瘍はRSPO2遺伝子融合を含む。いくつかの態様において、腫瘍はRSPO3遺伝子融合を含む。
【0241】
ある特定の態様において、腫瘍はRSPO3を発現しており、それに対してRSPO3結合剤または抗体が結合する。ある特定の態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO1を有するか、またはRSPO1を過剰発現している。ある特定の態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO2を有するか、またはRSPO2を過剰発現している。ある特定の態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO3を有するか、またはRSPO3を過剰発現している。「〜の上昇した発現レベルを腫瘍が有する」という句は、タンパク質の発現レベルまたは核酸の発現レベルを指し得る。通常、タンパク質または遺伝子「の上昇した発現レベルを腫瘍が有する」という句(または類似の句)は、参照試料における同じタンパク質もしくは同じ遺伝子の発現レベル、または予め測定された発現レベルと比べた、腫瘍におけるタンパク質または遺伝子の発現レベルを指す。いくつかの態様において、参照試料は、同じ組織タイプの正常組織である。いくつかの態様において、参照試料は、ある群の組織タイプの正常組織である。いくつかの態様において、参照試料は、同じ組織タイプの腫瘍または腫瘍の群である。いくつかの態様において、参照試料は、異なる組織タイプの腫瘍または腫瘍の群である。したがっていくつかの態様において、腫瘍におけるタンパク質または遺伝子の発現レベルは、ある群の組織タイプ内の該タンパク質または該遺伝子の平均発現レベルと比べて「上昇した」または「高い」。いくつかの態様において、腫瘍におけるタンパク質または遺伝子の発現レベルは、同じ組織タイプまたは異なる組織タイプの他の腫瘍における該タンパク質または該遺伝子の発現レベルと比べて「上昇した」または「高い」。いくつかの態様において、腫瘍は、同じ組織タイプの正常組織において発現されるRSPOレベルと比べて「上昇した」または「高い」レベルのRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4を発現している。いくつかの態様において、腫瘍は、予め測定されたレベルと比べて「上昇した」または「高い」レベルのRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4を発現している。
【0242】
さらに、本発明は、対象における腫瘍の成長を阻害する方法を提供し、該方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含む。ある特定の態様において、腫瘍は癌幹細胞を含む。ある特定の態様において、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度は、RSPO3結合剤の投与によって低下する。本発明は、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度を低下させる方法も提供し、該方法は、腫瘍をRSPO3結合剤(例えば、抗RSPO3抗体)の有効量と接触させる工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗RSPO3抗体)の治療有効量を対象に投与する工程を含む、対象における腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度を低下させる方法が提供される。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗RSPO3抗体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R002である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R003である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0243】
いくつかの態様において、腫瘍は固形腫瘍である。ある特定の態様において、腫瘍は、結腸直腸腫瘍、膵腫瘍、肺腫瘍、卵巣腫瘍、肝腫瘍、乳房腫瘍、腎腫瘍、前立腺腫瘍、胃腸管腫瘍、黒色腫、子宮頸部腫瘍、膀胱腫瘍、神経膠芽腫、および頭頸部腫瘍からなる群より選択される腫瘍である。本明細書において使用されるとき、「肺癌」には、小細胞肺癌および非小細胞肺癌(NSCLC)が含まれるが、それに限定されるわけではない。ある特定の態様において、腫瘍は結腸直腸腫瘍である。ある特定の態様において、腫瘍は卵巣腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は肺腫瘍である。ある特定の態様において、腫瘍は膵腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、APC遺伝子における不活性化変異を含む結腸直腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、APC遺伝子における不活性化変異を含まない結腸直腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、RSPO遺伝子融合を含む結腸直腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、RSPO2遺伝子融合を含む結腸直腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、RSPO3遺伝子融合を含む結腸直腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO1を有する卵巣腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO2を有する膵腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO2を有する結腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO2を有する肺腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO3を有する肺腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO3を有する卵巣腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO3を有する乳房腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、上昇した発現レベルのRSPO3を有する結腸直腸腫瘍である。
【0244】
本発明はさらに、癌を処置するための方法を提供し、該方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含む。ある特定の態様において、該癌は、参照試料内の同じRSPOタンパク質の発現レベルと比べて上昇したレベルの少なくとも1種のRSPOタンパク質を発現している細胞を特徴とする。本明細書において使用されるとき、「参照試料」には、正常組織、同じ組織タイプの非癌性組織、同じ組織タイプの腫瘍組織、および異なる組織タイプの腫瘍組織が含まれるが、それに限定されるわけではない。ある特定の態様において、前記癌は、同じRSPOタンパク質の予め測定されたレベルと比べて上昇したレベルの少なくとも1種のRSPOタンパク質を発現している細胞を特徴とする。いくつかの態様において、少なくとも1種のRSPOの発現レベルを測定する工程は、処置前に行われる。いくつかの態様において、少なくとも1種のRSPOの発現レベルを測定する工程は、免疫組織化学的検査による。したがって、ある特定の態様において、前記癌は、正常組織における同じRSPOタンパク質の発現レベルと比べて上昇したレベルの少なくとも1種のRSPOタンパク質を発現している細胞を特徴とする。ある特定の態様において、該癌は、RSPO1を過剰発現している細胞を特徴とする。ある特定の態様において、該癌は、RSPO2を過剰発現している細胞を特徴とする。ある特定の態様において、該癌は、RSPO3を過剰発現している細胞を特徴とする。ある特定の態様において、該癌は、RSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4からなる群より選択される少なくとも1種のRSPOタンパク質を過剰発現している。ある特定の態様において、該癌は、β-カテニンを発現している細胞を特徴とし、ここで、RSPO3結合剤(例えば、抗体)が、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達および/または活性化を干渉する。
【0245】
いくつかの態様において、RSPO結合剤は、RSPO3に結合し、かつ癌の成長を阻害するかまたは減少させる。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、RSPO3に結合し、RSPO3/LGRの相互作用を干渉し、かつ癌の成長を阻害するかまたは減少させる。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、RSPO3に結合し、β-カテニン活性化を阻害し、かつ癌の成長を阻害するかまたは減少させる。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、RSPO3に結合し、かつ癌における癌幹細胞の発生頻度を低下させる。いくつかの態様において、RSPO結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO結合剤は抗RSPO3抗体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R002である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R003である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO抗体は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0246】
本発明は、癌を処置するための方法を提供し、該方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象(例えば、処置を必要とする対象)に投与する工程を含む。ある特定の態様において、癌を処置する方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含み、ここで、該RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3を含む。該方法のいくつかの態様において、RSPO3結合剤はさらに、
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、
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を含む重鎖CDR1、
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を含む重鎖CDR2、および
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を含む重鎖CDR3、ならびに/または
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を含む軽鎖CDR1、
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を含む軽鎖CDR2、および
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を含む軽鎖CDR3を含む。ある特定の態様において、対象はヒトである。ある特定の態様において、対象は癌性腫瘍を有する。ある特定の態様において、対象は腫瘍を除去されたことがある。いくつかの態様において、癌を処置する方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含み、ここで、該対象は、参照試料または予め測定されたレベルと比べて上昇した発現の少なくとも1種のRSPOタンパク質を有する腫瘍を有する。いくつかの態様において、対象は、上昇した発現のRSPO3を有する肺腫瘍を有し、抗RSPO3抗体を投与される。
【0247】
本発明は、癌を処置する方法おいて使用するためのRSPO3結合剤も提供し、ここで、該RSPO3結合剤は、本明細書において記載される抗体である。本発明は、癌の処置のための薬剤を製造するための、本明細書に記載されるRSPO3結合剤(例えば、抗体)の使用も提供する。
【0248】
ある特定の態様において、癌は、結腸直腸癌、膵癌、肺癌、卵巣癌、肝癌、乳癌、腎癌、前立腺癌、胃腸管癌、黒色腫、子宮頸癌、膀胱癌、神経膠芽腫、および頭頸部癌からなる群より選択される癌である。ある特定の態様において、癌は膵癌である。ある特定の態様において、癌は卵巣癌である。ある特定の態様において、癌は結腸直腸癌である。ある特定の態様において、癌は乳癌である。ある特定の態様において、癌は前立腺癌である。ある特定の態様において、癌は肺癌である。
【0249】
さらに、本発明は、対象における腫瘍の腫瘍形成能を低下させる方法を提供し、該方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含む。ある特定の態様において、腫瘍は癌幹細胞を含む。いくつかの態様において、腫瘍の腫瘍形成能は、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度を低下させることによって低下する。いくつかの態様において、前記方法は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤を使用する工程を含む。ある特定の態様において、腫瘍内の癌幹細胞の発生頻度は、RSPO3結合剤の投与によって低下する。
【0250】
ある特定の態様において、前記方法は、腫瘍または癌における少なくとも1種のRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現レベルを測定する段階をさらに含む。いくつかの態様において、腫瘍または癌におけるRSPOの発現レベルを測定する段階は、RSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルを測定する工程を含む。いくつかの態様において、腫瘍または癌におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルは、参照試料におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルと比較される。いくつかの態様において、腫瘍または癌におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルは、正常組織におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルと比較される。いくつかの態様において、腫瘍または癌におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルは、RSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の予め測定された発現レベルと比較される。いくつかの態様において、腫瘍または癌におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルは、正常組織におけるRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の予め測定された発現レベルと比較される。いくつかの態様において、腫瘍は、高発現レベルのRSPO1を有する。いくつかの態様において、腫瘍は、高発現レベルのRSPO3を有する。通常、RSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現レベルは、同じ組織タイプの正常組織におけるRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現レベルと比較される。しかしながら、いくつかの態様において、RSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現レベルは、ある群の組織タイプ内のRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の平均発現レベルと比較される。いくつかの態様において、腫瘍におけるRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現レベルは、同じ組織タイプまたは異なる組織タイプの他の腫瘍におけるRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現レベルと比較される。
【0251】
いくつかの態様において、RSPO発現のレベルを測定する工程は、処置前に行われる。いくつかの態様において、腫瘍または癌が、参照試料(例えば、正常組織)における同じRSPOの発現レベル、または予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPOを有する場合、対象は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤または抗体を投与される。例えば、いくつかの態様において、腫瘍または癌が、正常組織または対照組織におけるRSPO3の発現レベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3(すなわち、タンパク質または核酸)を有する場合、対象は、RSPO3結合剤(例えば、抗RSPO3抗体)を投与される。
【0252】
ある特定の態様において、前記方法は、腫瘍または癌がAPC遺伝子における不活性化変異を有しているかを判定する段階をさらに含む。いくつかの態様において、該方法は、腫瘍または癌がβ-カテニン遺伝子における活性化変異を有しているかを判定する段階さらに含む。いくつかの態様において、該方法は、腫瘍または癌がRSPO遺伝子融合を有しているかを判定する段階さらに含む。
【0253】
さらに、本発明は、血管新生を調節する方法を提供し、該方法は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、血管新生を調節する工程は、血管新生を阻害する工程を含む。いくつかの態様において、前記方法は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤を使用する工程を含む。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3に結合し、かつ血管新生を阻害するかまたは減少させる。ある特定の態様において、血管新生の阻害および/または減少は、腫瘍または癌の成長を阻害するかまたは減少させる。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3に結合し、かつ異常な血管新生を促進する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、RSPO3に結合し、かつ非生産的な血管新生を促進する。ある特定の態様において、異常な血管新生または非生産的な血管新生は、腫瘍または癌の成長を阻害するかまたは減少させる。
【0254】
さらに、本発明は、RSPO結合剤で処置するためのヒト対象を特定する方法を提供し、該方法は、対象が、正常組織における、参照試料における同じRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)の発現と比べて、またはRSPOタンパク質の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤で処置するためのヒト対象を特定する方法は、対象が、参照試料、またはRSPO3の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤で処置するためのヒト対象を特定する方法は、対象から腫瘍試料を採取する工程、および該腫瘍が、参照試料、またはRSPO3の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、腫瘍が、上昇した発現レベルのRSPO3を有する場合、対象は、RSPO3に特異的に結合する抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、処置のために選択された場合、対象は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤または抗体を投与される。いくつかの態様において、腫瘍が、上昇した発現レベルの2種以上のRSPO(すなわち、タンパク質または核酸)を有する場合、対象は、発現レベルが最も高いRSPOに結合するRSPO結合剤を投与される。ある特定の態様において、対象は腫瘍を除去されたことがある。例えば、いくつかの態様において、腫瘍内のRSPO1、RSPO2、RSPO3、および/またはRSPO4の発現レベルが測定され、該腫瘍が、正常組織におけるRSPO3のレベルと比べて上昇したレベルのRSPO3発現を有する場合、対象は、RSPO3に特異的に結合する抗体による処置のために選択される。処置のために選択された場合、対象は、本明細書において記載される抗RSPO3抗体を投与される。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003のヒト化型である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体のヒト化型である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R008である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R010である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R011である。
【0255】
本発明は、RSPO結合剤で処置するためのヒト対象を選択する方法を提供し、該方法は、対象が、正常組織における同じRSPOの発現と比べて、または予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルの少なくとも1種のRSPO(すなわち、タンパク質または遺伝子)を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍が、上昇した発現レベルの少なくとも1種のRSPOを有する場合、対象は、上昇した発現レベルを有するRSPOに特異的に結合する抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、処置のために選択された場合、対象は、本明細書において記載されるRSPO結合剤または抗体を投与される。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象が、参照試料、またはRSPO3の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象から腫瘍試料を採取する工程、および該腫瘍が、参照試料、またはRSPO3の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象が、参照試料、またはRSPO3の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍が、上昇した発現レベルのRSPO3を有する場合、対象は、該抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象から腫瘍試料を採取する工程、および該腫瘍が、参照試料、またはRSPO3の予め測定されたレベルと比べて上昇した発現レベルのRSPO3を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍が、上昇した発現レベルのRSPO3を有する場合、対象は、該抗体による処置のために選択される。ある特定の態様において、対象は腫瘍を除去されたことがある。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗RSPO3抗体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R002である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R003である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたはh131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0256】
本発明は、ヒト対象における癌を処置する方法も提供し、該方法は、(a)上昇したレベルのRSPOを有する癌を有する対象に少なくとも部分的に基づいて、処置するための対象を選択する工程、および(b)本明細書において記載されるRSPO3結合剤の治療有効量を該対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたはh131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0257】
細胞、腫瘍、または癌におけるRSPO発現のレベルを測定するための方法は、当業者に公知である。核酸発現の場合、これらの方法としては、PCRベースのアッセイ、マイクロアレイ解析、およびヌクレオチド配列決定(例えば、NextGen配列決定法)が挙げられるが、それに限定されるわけではない。タンパク質発現の場合、これらの方法としては、ウエスタンブロット解析、タンパク質アレイ、ELISA、免疫組織化学(IHC)アッセイ、およびFACSが挙げられるが、それに限定されるわけではない。
【0258】
本発明は、RSPO3結合剤で処置するためのヒト対象を特定する方法を提供し、該方法は、対象から腫瘍試料を採取する工程、および該腫瘍がRSPO遺伝子融合を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤で処置するためのヒト対象を特定する方法は、対象が、RSPO遺伝子融合を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍がRSPO遺伝子融合を有する場合、対象は、該抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、RSPO3結合剤で処置するためのヒト対象を特定する方法は、(a)対象から腫瘍試料を採取する工程、および(b)該腫瘍がRSPO遺伝子融合を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍がRSPO遺伝子融合を有する場合、対象は、該抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象が、RSPO遺伝子融合を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含む。
【0259】
本発明は、RSPO結合剤で処置するためのヒト対象を選択する方法も提供し、該方法は、対象が、RSPO遺伝子融合を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍がRSPO遺伝子融合を有する場合、対象は、RSPOタンパク質に特異的に結合する抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象が、RSPO遺伝子融合を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象から腫瘍試料を採取する工程、および該腫瘍がRSPO遺伝子融合を有しているかを判定する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象が、RSPO遺伝子融合を有する腫瘍を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍がRSPO遺伝子融合を有する場合、対象は、該抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、RSPO3に特異的に結合する抗体で処置するためのヒト対象を選択する方法は、対象から腫瘍試料を採取する工程、および該腫瘍がRSPO遺伝子融合を有しているかを判定する工程を含み、腫瘍がRSPO遺伝子融合を有する場合、対象は、該抗体による処置のために選択される。いくつかの態様において、RSPO遺伝子融合はRSPO2遺伝子融合である。いくつかの態様において、RSPO遺伝子融合はRSPO3遺伝子融合である。いくつかの態様において、処置のために選択された場合、対象は、本明細書において記載されるRSPO結合剤または抗体を投与される。ある特定の態様において、対象は腫瘍を除去されたことがある。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗RSPO3抗体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R002である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体131R003である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたはh131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0260】
本発明は、ヒト対象における癌を処置する方法も提供し、該方法は、(a)RSPO遺伝子融合を有する癌を有する対象に少なくとも部分的に基づいて、処置するための対象を選択する工程、および(b)本明細書において記載されるRSPO3結合剤の治療有効量を該対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は、抗体h131R006Aまたはh131R006Bである。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R008である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R010である。いくつかの態様において、抗RSPO3抗体は抗体h131R011である。
【0261】
腫瘍がRSPO遺伝子融合を有しているかを判定するための方法は、当業者に公知である。このような方法には、PCRベースのアッセイ、マイクロアレイ解析、およびヌクレオチド配列決定(例えば、NextGen配列決定法、全ゲノム配列決定法(WGS))が挙げられ得るが、それに限定されるわけではない。
【0262】
腫瘍または癌が上昇したレベルのRSPO発現を有しているか、またはRSPO遺伝子融合を有しているかを判定するための方法は、種々の試料を使用し得る。いくつかの態様において、試料は、腫瘍または癌を有する対象から採取される。いくつかの態様において、試料は新鮮な腫瘍/癌試料である。いくつかの態様において、試料は凍結された腫瘍/癌試料である。いくつかの態様において、試料はホルマリン固定パラフィン包埋試料である。いくつかの態様において、試料を処理して、細胞可溶化物にする。いくつかの態様において、試料を処理して、DNAまたはRNAにする。
【0263】
対象における疾患または障害を処置する方法がさらに提供され、ここで、該疾患または障害は、異常な(例えば、上昇したレベル)β-カテニンシグナル伝達に関連する。対象における疾患または障害を処置する方法がさらに提供され、ここで、該疾患または障害は、増加したレベルの幹細胞および/または前駆細胞を特徴とする。いくつかの態様において、それらの処置方法は、RSPO結合剤、ポリペプチド、または抗体の治療有効量を対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R008である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R010である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R011である。
【0264】
本発明は、細胞におけるβ-カテニンシグナル伝達を阻害する方法も提供し、該方法は、細胞をRSPO結合剤の有効量と接触させる工程を含む。ある特定の態様において、細胞は腫瘍細胞である。ある特定の態様において、前記方法はインビボにおける方法であり、ここで、細胞をRSPO3結合剤と接触させる段階は、RSPO3結合剤の治療有効量を対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、該方法は、インビトロまたはエクスビボにおける方法である。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、β-カテニンシグナル伝達を阻害する。いくつかの態様において、RSPO結合剤は、β-カテニンの活性化を阻害する。ある特定の態様において、RSPO結合剤は、RSPO/LGR相互作用を干渉する。ある特定の態様において、LGRは、LGR4、LGR5、および/またはLGR6である。ある特定の態様において、LGRはLGR4である。ある特定の態様において、LGRはLGR5である。ある特定の態様において、LGRはLGR6である。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R008である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R010である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R011である。
【0265】
腫瘍細胞を含むがそれに限定されるわけではない細胞の分化を誘導するための、本明細書において記載されるRSPO結合剤、ポリペプチド、または抗体の使用も提供される。いくつかの態様において、細胞の分化を誘導する方法は、細胞を、本明細書において記載されるRSPO結合剤(例えば、抗RSPO抗体)の有効量と接触させる工程を含む。ある特定の態様において、対象における腫瘍内の細胞の分化を誘導する方法は、RSPO結合剤、ポリペプチド、または抗体の治療有効量を対象に投与する工程を含む。いくつかの態様において、腫瘍細胞上に分化マーカーを誘導するための方法は、RSPO結合剤、ポリペプチド、または抗体の治療有効量を投与する工程を含む。いくつかの態様において、腫瘍は固形腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は、結腸直腸腫瘍、膵腫瘍、肺腫瘍、卵巣腫瘍、肝腫瘍、乳房腫瘍、腎腫瘍、前立腺腫瘍、胃腸管腫瘍、黒色腫、子宮頸部腫瘍、膀胱腫瘍、神経膠芽腫、および頭頸部腫瘍からなる群より選択される。ある特定の態様において、腫瘍は卵巣腫瘍である。ある特定の他の態様において、腫瘍は結腸腫瘍である。いくつかの態様において、腫瘍は肺腫瘍である。ある特定の態様において、前記方法は、インビボにおける方法である。ある特定の態様において、該方法は、インビトロにおける方法である。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R008である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R010である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R011である。
【0266】
本発明はさらに、腫瘍形成性細胞を非腫瘍形成性細胞に分化させる方法を提供し、該方法は、腫瘍形成性細胞をRSPO結合剤と接触させる工程を含む。いくつかの態様において、該方法は、腫瘍形成性細胞を含む腫瘍を有するかまたはそのような腫瘍を除去されたことがある対象にRSPO結合剤を投与する工程を含む。ある特定の態様において、腫瘍形成性細胞は卵巣腫瘍細胞である。ある特定の態様において、腫瘍形成性細胞は結腸腫瘍細胞である。いくつかの態様において、腫瘍形成性細胞は肺腫瘍細胞である。いくつかの態様において、RSPO結合剤はRSPO3結合剤である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R002である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体131R003である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R002のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体131R003の変異体のヒト化バージョンである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、抗体h131R006Aまたは抗体h131R006Bである。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R005/131R007である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R008である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R010である。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は抗体h131R011である。
【0267】
ある特定の態様において、本明細書において記載されるRSPO3結合剤で処置される疾患は、癌ではない。例えば、該疾患は、代謝障害(例えば、肥満症または糖尿病(例えば、II型糖尿病))であり得る(Jin T., 2008, Diabetologia, 51: 1771-80)。あるいは、該疾患は、骨障害(例えば、骨粗鬆症、変形性関節症、または関節リウマチ)であり得る(Corr M., 2008, Nat. Clin. Pract. Rheumatol., 4: 550-6; Day et al., 2008, Bone Joint Surg. Am., 90 Suppl 1: 19-24)。該疾患は、多発性嚢胞腎などの腎臓障害でもあり得る(Harris et al., 2009, Ann. Rev. Med. , 60: 321-337; Schmidt-Ott et al., 2008, Kidney Int., 74: 1004-8; Benzing et al., 2007, J. Am. Soc. Nephrol , 18: 1389-98)。あるいは、黄斑変性症および家族性滲出性硝子体網膜症を含むがそれに限定されるわけではない眼障害が処置され得る(Lad et al., 2009, Stem Cells Dev., 18: 7-16)。心筋梗塞、アテローム性動脈硬化症、および心臓弁障害を含む心血管障害も処置され得る(Al-Aly Z., 2008, Transl. Res., 151: 233-9; Kobayashi et al., 2009, Nat. Cell Biol., 11: 46-55; van Gijn et al., 2002, Cardiovasc. Res., 55: 16-24; Christman et al., 2008, Am. J. Physiol. Heart Circ. Physiol, 294:H2864-70)。いくつかの態様において、該疾患は、肺障害(例えば、特発性肺動脈高血圧症または肺線維症)である(Laumanns et al., 2008, Am. J. Respir. Cell Mol. Biol., 2009, 40: 683-691; Konigshoff et al., 2008, PLoS ONE, 3:e2142)。いくつかの態様において、RSPO3結合剤で処置される疾患は、肝疾患(例えば、肝硬変または肝線維症)である(Cheng et al., 2008, Am. J. Physiol. Gastrointest. Liver Physiol, 294:G39-49)。
【0268】
本発明はさらに、本明細書において記載されるRSPO3結合剤を含む薬学的組成物を提供する。ある特定の態様において、薬学的組成物は、薬学的に許容されるビヒクルをさらに含む。いくつかの態様において、これらの薬学的組成物は、対象(例えば、ヒト患者)における腫瘍成長の阻害および癌の処置における使用法が見出されている。
【0269】
ある特定の態様において、本発明の精製された抗体または剤を薬学的に許容されるビヒクル(例えば、担体または賦形剤)と混合することによって、貯蔵および使用のための製剤が調製される。好適な薬学的に許容されるビヒクルとしては、無毒性緩衝液(例えば、リン酸、クエン酸、および他の有機酸);塩(例えば、塩化ナトリウム);アスコルビン酸およびメチオニンを含む酸化防止剤;保存剤(例えば、塩化オクタデシルジメチルベンジルアンモニウム、塩化ヘキサメトニウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、フェノール、ブチルアルコールまたはベンジルアルコール、アルキルパラベン(例えば、メチルパラベンまたはプロピルパラベン)、カテコール、レソルシノール、シクロヘキサノール、3-ペンタノール、およびm-クレゾール);低分子量ポリペプチド(例えば、約10アミノ酸残基未満);タンパク質(例えば、血清アルブミン、ゼラチン、または免疫グロブリン);親水性ポリマー(例えば、ポリビニルピロリドン);アミノ酸(例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、またはリジン);炭水化物(例えば、単糖類、二糖類、グルコース、マンノース、またはデキストリン);キレート剤(例えば、EDTA);糖(例えば、スクロース、マンニトール、トレハロース、またはソルビトール);塩形成対イオン(例えば、ナトリウム);金属錯体(例えば、Zn-タンパク質複合体);および非イオン性界面活性剤(例えば、TWEENまたはポリエチレングリコール(PEG))が挙げられるが、それに限定されるわけではない。(Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 22st Edition, 2012, Pharmaceutical Press, London.)。
【0270】
本発明の薬学的組成物は、局所性または全身性の処置のために任意の数の方法で投与することができる。投与は、表皮パッチもしくは経皮パッチ、軟膏、ローション、クリーム、ゲル、滴剤、坐剤、スプレー、液体、および粉末による局所的投与;粉末もしくはエアロゾルの吸入もしくは吹送(噴霧器によるもの、気管内、および鼻腔内を含む)による肺投与;経口投与;または静脈内、動脈内、腫瘍内、皮下、腹腔内、筋肉内(例えば、注射または注入)、もしくは頭蓋内(例えば、硬膜下腔内または脳室内)を含む非経口投与であり得る。
【0271】
治療的製剤は、単位剤形で存在し得る。そのような製剤としては、錠剤、丸剤、カプセル剤、散剤、顆粒剤、水もしくは非水媒体における溶液もしくは懸濁液、または坐剤が挙げられる。錠剤などの固体組成物において、主要な活性成分は、薬学的担体と混合される。従来の錠剤化成分としては、コーンスターチ、ラクトース、スクロース、ソルビトール、タルク、ステアリン酸、ステアリン酸マグネシウム、リン酸二カルシウム、またはゴムおよび希釈剤(例えば、水)が挙げられる。これらは、本発明の化合物またはその薬学的に許容される無毒性の塩の均一な混合物を含む固体の前製剤化組成物を形成するために使用することができる。次いで、その固体の前製剤化組成物は、上に記載されたタイプの単位剤形に細分される。製剤または組成物の錠剤、丸剤などは、コーティングされるかまたは別途調合されることにより、長時間作用の利点をもたらす剤形を提供し得る。例えば、該錠剤または丸剤は、外側成分によって覆われた内側組成物を含み得る。さらに、崩壊に耐えるよう働き、かつ内側成分がインタクトなまま胃を通過することまたは内側成分の放出を遅延させることを可能にする腸溶層によって、該2つの成分を分離することができる。種々の材料を、そのような腸溶層または腸溶コーティングのために使用することができ、そのような材料としては、いくつかのポリマー酸、ならびにポリマー酸とシェラック、セチルアルコール、および酢酸セルロースのような材料との混合物が挙げられる。
【0272】
本明細書において記載されるRSPO3結合剤または抗体はまた、マイクロカプセルに封入され得る。そのようなマイクロカプセルは、コロイド薬物送達系(例えば、リポソーム、アルブミンミクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子、およびナノカプセル)またはRemington: The Science and Practice of Pharmacy, 22st Edition, 2012, Pharmaceutical Press, Londonに記載されているようなマクロエマルジョンにおいて、例えば、コアセルベーション法もしくは界面重合法によって調製される(例えば、それぞれヒドロキシメチルセルロースマイクロカプセルまたはゼラチンマイクロカプセルおよびポリ-(メチルメタクリレート)マイクロカプセル)。
【0273】
ある特定の態様において、薬学的製剤には、リポソームと複合体化された本発明のRSPO3結合剤(例えば、抗体)が含まれる。リポソームを生成する方法は、当業者に公知である。例えば、いくつかのリポソームは、ホスファチジルコリン、コレステロール、およびPEG誘導体化ホスファチジルエタノールアミン(PEG-PE)を含む脂質組成物を用いた逆相蒸発によって生成され得る。リポソームを、規定のポアサイズのフィルターを通過して押し出すことにより、所望の直径を有するリポソームを得ることができる。
【0274】
ある特定の態様において、徐放調製物が生成され得る。徐放調製物の好適な例としては、RSPO3結合剤(例えば、抗体)を含む固体疎水性ポリマーの半透性マトリックスが挙げられ、ここで、該マトリックスは、造形品(例えば、フィルムまたはマイクロカプセル)の形態である。徐放マトリックスの例としては、ポリエステル、ヒドロゲル(例えば、ポリ(2-ヒドロキシエチル-メタアクリレート)またはポリ(ビニルアルコール))、ポリラクチド、L-グルタミン酸および7エチル-L-グルタメートの共重合体、非分解性のエチレン-酢酸ビニル、分解性の乳酸-グリコール酸共重合体(例えば、LUPRON DEPOT(商標)(乳酸-グリコール酸共重合体および酢酸ロイプロリドから構成される注射可能なミクロスフェア))、イソ酪酸酢酸スクロース、ならびにポリ-D-(-)-3-ヒドロキシ酪酸が挙げられる。
【0275】
ある特定の態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)の投与に加えて、前記方法または処置は、少なくとも一種類のさらなる治療剤の投与をさらに包含する。さらなる治療剤は、RSPO3結合剤の投与の前、投与と同時、および/または投与の後に投与することができる。RSPO3結合剤およびさらなる治療剤を含む薬学的組成物も提供される。いくつかの態様において、少なくとも一種類のさらなる治療剤は、1つ、2つ、3つ、またはそれ以上のさらなる治療剤を含む。
【0276】
2つまたはそれ以上の治療剤との併用療法は、必須ではないものの、異なる作用機序によって働く剤を使用することが多い。異なる作用機序を有する剤を使用する併用療法は、相加効果または相乗効果をもたらし得る。併用療法は、単独療法で使用されるよりも各剤の用量を少なくすることにより、有毒な副作用を減少させ得、かつ/またはその剤の治療指数を上昇させ得る。併用療法は、抵抗性の癌細胞が発生する可能性を低下させ得る。いくつかの態様において、併用療法は、非腫瘍形成性細胞に作用する(例えば、阻害するまたは殺滅する)治療剤および腫瘍形成性CSCに作用する(例えば、阻害するまたは殺滅する)治療剤を含む。
【0277】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤と少なくとも一種類のさらなる治療剤との併用により、相加的または相乗的な結果がもたらされる。いくつかの態様において、併用療法は、RSPO3結合剤の治療指数の上昇をもたらす。いくつかの態様において、併用療法は、追加の剤の治療指数の上昇をもたらす。いくつかの態様において、併用療法は、RSPO3結合剤の毒性および/または副作用の低下をもたらす。いくつかの態様において、併用療法は、追加の剤の毒性および/または副作用の低下をもたらす。
【0278】
有用なクラスの治療剤としては、例えば、抗チューブリン剤、アウリスタチン、DNA副溝結合剤、DNA複製阻害剤、アルキル化剤(例えば、白金錯体、例えば、シスプラチン、モノ(白金)、ビス(白金)、および三核白金錯体、ならびにカルボプラチン)、アントラサイクリン、抗生物質、抗葉酸剤、代謝拮抗物質、化学療法増感剤、デュオカルマイシン、エトポシド、フッ素化ピリミジン、イオノフォア、レキシトロプシン、ニトロソ尿素、プラチノール(platinols)、プリン代謝拮抗物質、ピューロマイシン、放射線増感剤、ステロイド、タキサン、トポイソメラーゼ阻害剤、ビンカアルカロイドなどが挙げられる。ある特定の態様において、第2の治療剤は、アルキル化剤、代謝拮抗物質、有糸分裂阻害剤、トポイソメラーゼ阻害剤、または血管新生阻害剤である。いくつかの態様において、第2の治療剤は、カルボプラチンまたはシスプラチンなどの白金錯体である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、タキサンと併用される白金錯体である。
【0279】
RSPO3結合剤と併用して投与され得る治療剤には、化学療法剤が含まれる。したがって、いくつかの態様において、前記方法または処置は、化学療法剤または複数の異なる化学療法剤の混合物と併用される本発明のRSPO3結合剤または抗体の投与を含む。RSPO3結合剤(例えば、抗体)による処置は、化学療法薬の投与の前、投与と同時、または投与の後に行われ得る。併用投与は、単一の薬学的製剤としての同時投与もしくは別個の製剤を使用した同時投与、またはいずれかの順序であるが一般に全ての活性な剤がそれらの生物学的活性を同時に発揮できるような時間内の連続投与を含み得る。そのような化学療法剤に対する調製法および投薬スケジュールは、製造者の指示書に従ってまたは当業者によって経験的に決定されるように、使用され得る。そのような化学療法に対する調製法および投薬スケジュールは、The Chemotherapy Source Book, 4
th Edition, 2008, M. C. Perry, Editor, Lippincott, Williams & Wilkins, Philadelphia, PAにも記載されている。
【0280】
本発明において有用な化学療法剤としては、アルキル化剤(例えば、チオテパおよびシクロスホスファミド(CYTOXAN));スルホン酸アルキル類(例えば、ブスルファン、インプロスルファン、およびピポスルファン;アジリジン(例えば、ベンゾドパ(benzodopa)、カルボコン、メツレドパ(meturedopa)、およびウレドパ);エチレンイミンおよびメチルアメラミン(methylamelamines)(アルトレタミン(altretamine)、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミド(triethylenethiophosphaoramide)、およびトリメチロールメラミン(trimethylolomelamime)を含む);ナイトロジェンマスタード(例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、コロホスファミド(cholophosphamide)、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、塩酸メクロレタミンオキシド、メルファラン、ノベンビキン(novembichin)、フェネステリン、プレドニムスチン、トロフォスファミド(trofosfamide)、ウラシルマスタード);ニトロソ尿素(nitrosureas)(例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、ラニムスチン);抗生物質(例えば、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オースラマイシン(authramycin)、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カリケアマイシン、カラビシン(carabicin)、カルミノマイシン(caminomycin)、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン(potfiromycin)、ピューロマイシン、クエラマイシン(quelamycin)、ロドルビシン(rodorubicin)、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメクス、ジノスタチン、ゾルビシン);代謝拮抗物質(例えば、メトトレキサートおよび5-フルオロウラシル(5-FU));葉酸アナログ(例えば、デノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサート);プリンアナログ(例えば、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン);ピリミジンアナログ(例えば、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シトシンアラビノシド、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン、5-FU);アンドロゲン(例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン);抗副腎剤(anti-adrenals)(例えば、アミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタン);葉酸補給剤(例えば、フォリン酸);アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド(aldophosphamide glycoside);アミノレブリン酸;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトラキセート(edatraxate);デホファミン(defofamine);デメコルチン;ジアジコン;エフロルニチン(elformithine);酢酸エリプチニウム;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダミン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモール;ニトラクリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ポドフィリン酸;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK;ラゾキサン;シゾフィラン(sizofuran);スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジクォン;2,2',2"-トリクロロトリエチルアミン;ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン(gacytosine);アラビノシド(Ara-C);タキソイド、例えば、パクリタキセル(TAXOL)およびドセタキセル(TAXOTERE);クロラムブシル;ゲムシタビン;6-チオグアニン;メルカプトプリン;白金アナログ(例えば、シスプラチンおよびカルボプラチン);ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP-16);イホスファミド;マイトマイシンC;ミトキサントロン;ビンクリスチン;ビノレルビン;ナベルビン;ノバントロン;テニポシド;ダウノマイシン;アミノプテリン;イバンドロネート;CPT11;トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000;ジフルオロメチルオルニチン(DMFO);レチノイン酸;エスペラミシン;カペシタビン(XELODA);および上記のもののいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体が挙げられるが、それに限定されるわけではない。化学療法剤には、腫瘍に対するホルモンの作用を制御するようにまたは阻害するように作用する抗ホルモン剤(例えば、抗エストロゲン(例えば、タモキシフェン、ラロキシフェン、アロマターゼ阻害4(5)-イミダゾール、4-ヒドロキシタモキシフェン、トリオキシフェン、ケオキシフェン、LY117018、オナプリストン、およびトレミフェン(FARESTON)を含む);および抗アンドロゲン(例えば、フルタミド、ニルタミド、ビカルタミド、ロイプロリド、およびゴセレリン));ならびに上記のもののいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体も含まれる。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、シスプラチンである。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、カルボプラチンである。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、パクリタキセル(タキソール)である。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R006A、131R006B、131R005/131R007、または131R008をシスプラチンと併用して投与する工程を含む。
【0281】
ある特定の態様において、化学療法剤は、トポイソメラーゼ阻害剤である。トポイソメラーゼ阻害剤は、トポイソメラーゼ酵素(例えば、トポイソメラーゼIまたはII)の作用を干渉する化学療法剤である。トポイソメラーゼ阻害剤としては、ドキソルビシンHCl、クエン酸ダウノルビシン、ミトキサントロンHCl、アクチノマイシンD、エトポシド、トポテカンHCl、テニポシド(VM-26)、およびイリノテカン、ならびにこれらのいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体が挙げられるが、それに限定されるわけではない。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、イリノテカンである。したがって、いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤をトポイソメラーゼ阻害剤と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をイリノテカンと併用して投与する工程を含む。
【0282】
ある特定の態様において、化学療法剤は、代謝拮抗物質である。代謝拮抗物質は、正常な生化学反応に必要な代謝産物と類似しているものの細胞の1つまたは複数の正常な機能(例えば、細胞分裂)を干渉するのに十分な程度に異なっている構造を有する、化学物質である。代謝拮抗物質としては、ゲムシタビン、フルオロウラシル、カペシタビン、メトトレキサートナトリウム、ラリトレキセド(ralitrexed)、ペメトレキセド(pemetrexed)、テガフール、シトシンアラビノシド、チオグアニン、5-アザシチジン、6-メルカプトプリン、アザチオプリン、6-チオグアニン、ペントスタチン、リン酸フルダラビン、およびクラドリビン、ならびにこれらのいずれかの薬学的に許容される塩、酸、または誘導体が挙げられるが、それに限定されるわけではない。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、ゲムシタビンである。したがって、いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤を代謝拮抗物質と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をゲムシタビンと併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をペメトレキセドと併用して投与する工程を含む。
【0283】
ある特定の態様において、化学療法剤は、チューブリンに結合する剤を含むがそれに限定されるわけではない抗有糸分裂剤である。いくつかの態様において、該剤は、タキサンである。ある特定の態様において、該剤は、パクリタキセルもしくはドセタキセル、またはパクリタキセルもしくはドセタキセルの薬学的に許容される塩、酸、もしくは誘導体である。ある特定の態様において、該剤は、パクリタキセル(TAXOL)、ドセタキセル(TAXOTERE)、アルブミン結合型パクリタキセル(nab-パクリタキセル;ABRAXANE)、DHA-パクリタキセル、またはPG-パクリタキセルである。ある特定の代替の態様において、抗有糸分裂剤は、ビンカアルカロイド(例えば、ビンクリスチン、ビンブラスチン(binblastine)、ビノレルビン、またはビンデシン)、またはその薬学的に許容される塩、酸、もしくは誘導体を含む。いくつかの態様において、抗有糸分裂剤は、キネシンEg5の阻害剤または有糸分裂キナーゼ(例えば、Aurora AまたはPlkl)の阻害剤である。ある特定の態様において、RSPO結合剤と併用して投与される化学療法剤が、有糸分裂阻害剤である場合、処置される癌または腫瘍は、乳癌または乳房腫瘍である。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をパクリタキセルと併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をnab-パクリタキセル(ABRAXANE)と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をゲムシタビンおよびnab-パクリタキセル(ABRAXANE)と併用して投与する工程を含む。
【0284】
いくつかの態様において、さらなる治療剤は、小分子などの剤を含む。例えば、処置は、本発明のRSPO3結合剤(例えば、抗体)と、さらなる腫瘍関連抗原に対する阻害剤として作用する小分子(EGFR、ErbB2、HER2、および/またはVEGFを含むがそれに限定されるわけではない)との併用投与を含み得る。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、癌幹細胞経路を阻害する小分子である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、Notch経路の阻害剤である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、Wnt経路の阻害剤である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、BMP経路の阻害剤である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、β-カテニンシグナル伝達を阻害する分子である。
【0285】
いくつかの態様において、さらなる治療剤は、抗体などの生物学的分子を含む。例えば、処置は、本発明のRSPO3結合剤(例えば、抗体)と、さらなる腫瘍関連抗原に対する他の抗体(EGFR、ErbB2、HER2、および/またはVEGFに結合する抗体を含むがそれに限定されるわけではない)との併用投与を含み得る。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、第2のRSPO、例えば、RSPO1、RSPO2、および/またはRSPO4に結合する抗体である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、抗RSPO2抗体である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、抗RSPO1抗体である。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、抗癌幹細胞マーカーに特異的な抗体である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、Notch経路の構成要素に結合する抗体である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、Wnt経路の構成要素に結合する抗体である。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、癌幹細胞経路を阻害する抗体である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、Notch経路の阻害剤である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、Wnt経路の阻害剤である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、BMP経路の阻害剤である。いくつかの態様において、さらなる治療剤は、β-カテニンシグナル伝達を阻害する抗体である。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、血管新生阻害剤である抗体(例えば、抗VEGFまたはVEGF受容体抗体)である。ある特定の態様において、さらなる治療剤は、ベバシズマブ(AVASTIN)、トラスツズマブ(HERCEPTIN)、パニツムマブ(VECTIBIX)、またはセツキシマブ(ERBITUX)である。
【0286】
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法は、RSPO3結合剤の治療有効量をWnt経路阻害剤と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、Wnt経路阻害剤は、frizzled(FZD)タンパク質結合剤「FZD結合剤」である。FZD結合剤の非限定的な例は、米国特許第7,982,013号(その全体が参照により本明細書に組み入れられる)に見られる。FZD結合剤としては、抗FZD抗体が挙げられ得るが、それに限定されるわけではない。いくつかの態様において、方法は、RSPO結合剤を抗FZD抗体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO結合剤を抗FZD抗体18R5と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、Wnt経路阻害剤は、Wntタンパク質結合剤である「Wnt結合剤」である。Wnt結合剤の非限定的な例は、米国特許第7,723,477号および同第7,947,277号;ならびに国際公報WO2011/088127およびWO2011/088123(それらの全体が参照により本明細書に組み入れられる)に見られる。Wnt結合剤としては、抗Wnt抗体およびFZD-Fc可溶性受容体が挙げられ得るが、それに限定されるわけではない。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤をFZD-Fc可溶性受容体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤をFZD8-Fc可溶性受容体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤を抗FZD抗体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011を抗FZD抗体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011を抗FZD抗体18R5と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をFZD-Fc可溶性受容体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をFZD8-Fc可溶性受容体と併用して投与する工程を含む。
【0287】
いくつかの態様において、本明細書において記載される方法は、RSPO結合剤の治療有効量を2つ以上のさらなる治療剤と併用して投与する工程を含む。したがって、いくつかの態様において、方法は、RSPO結合剤を化学療法剤およびWnt経路阻害剤と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤を化学療法剤およびWnt経路阻害剤と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤を化学療法剤および抗FZD抗体18R5と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤を化学療法剤およびFZD8-Fc可溶性受容体と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、RSPO3結合剤をゲムシタビンおよびWnt経路阻害剤と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をゲムシタビンおよび抗FZD抗体18R5と併用して投与する工程を含む。いくつかの態様において、方法は、抗RSPO3抗体131R002、131R003、131R003の変異体、131R003のヒト化バージョン、h131R006A、h131R006B、h131R005/131R007、h131R008、h131R010、またはh131R011をゲムシタビンおよびFZD8-Fc可溶性受容体と併用して投与する工程を含む。
【0288】
さらに、本明細書において記載されるRSPO3結合剤による処置は、他の生物学的分子(例えば、1つまたは複数のサイトカイン(例えば、リンフォカイン、インターロイキン、腫瘍壊死因子、および/または成長因子))との併用処置を含み得るか、または腫瘍、癌細胞の外科的除去、もしくは処置している医師によって必要と見なされる他の任意の治療を伴い得る。
【0289】
ある特定の態様において、前記処置は、放射線治療と併用される本発明のRSPO3結合剤(例えば、抗体)の投与を含む。RSPO3結合剤による処置は、放射線治療の投与の前、投与と同時、または投与の後に行われ得る。そのような放射線治療に対する投薬スケジュールは、熟練の医師によって決定され得る。
【0290】
併用投与は、単一の薬学的製剤としてもしくは別個の製剤を使用した、同時投与、または、いずれかの順序であるが通常は全ての活性な剤がそれらの生物学的活性を同時に発揮できるような期間内の、連続投与を含み得る。
【0291】
RSPO3結合剤と少なくとも一種類のさらなる治療剤との組み合わせが任意の順序でまたは同時に投与され得ることが認識されるであろう。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、以前に第2の治療剤による処置を受けたことがある患者に投与される。ある特定の他の態様において、RSPO3結合剤および第2の治療剤は、実質的に同時にまたは同時に投与される。例えば、対象は、第2の治療剤(例えば、化学療法)による処置の経過を経ながら、RSPO3結合剤(例えば、抗体)を投与され得る。ある特定の態様において、RSPO3結合剤は、第2の治療剤による処置の1年以内に投与される。ある特定の代替の態様において、RSPO3結合剤は、第2の治療剤による任意の処置の10、8、6、4、または2ヶ月以内に投与される。ある特定の他の態様において、RSPO3結合剤は、第2の治療剤による任意の処置の4、3、2、または1週間以内に投与される。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、第2の治療剤による任意の処置の5、4、3、2、または1日以内に投与される。2つの(またはそれ以上の)剤または処置がおよそ数時間以内または数分以内に(すなわち、実質的に同時に)対象に投与され得ることがさらに認識されるであろう。
【0292】
疾患を処置するために、本発明のRSPO3結合剤(例えば、抗体)の適切な投与量は、処置される疾患のタイプ、該疾患の重症度および経過、該疾患の応答性、RSPO3結合剤または抗体が治療目的で投与されるのかまたは予防目的で投与されるのか、以前の治療、患者の病歴などに依存し、全てが処置している医師の裁量による。RSPO3結合剤または抗体は、1回もしくは数日間から数ヶ月間続く一連の処置にわたって、または治癒するまでもしくは該疾患状態の減衰が達成されるまで(例えば、腫瘍サイズの減少)投与され得る。最適な投薬スケジュールは、患者の体内の薬物蓄積の測定値から計算することができ、個別の抗体または剤の相対的な効力に応じて変動する。投与する医師は、最適な投与量、投与方法、および反復数を容易に決定することができる。ある特定の態様において、投与量は、0.01μg〜100mg/kg体重、0.1μg〜100mg/kg体重、1μg〜100mg/kg体重、1mg〜100mg/kg体重、1mg〜80mg/kg体重、10mg〜100mg/kg体重、10mg〜75mg/kg体重、または10mg〜50mg/kg体重である。ある特定の態様において、前記抗体または他のRSPO3結合剤の投与量は、約0.1mg〜約20mg/kg体重である。ある特定の態様において、1日に、1週間に、1ヶ月に、または1年に1回またはそれ以上、投与が行われ得る。ある特定の態様において、前記抗体または他のRSPO3結合剤は、1週間に1回、2週間に1回、または3週間に1回、投与される。
【0293】
いくつかの態様において、RSPO3結合剤(例えば、抗体)は、初回の、より高い「負荷」用量で投与された後、1回または複数回の、より低い用量で投与され得る。いくつかの態様において、投与の頻度も変化し得る。いくつかの態様において、投与レジメンは、初回用量の投与の後の、1週間に1回、2週間に1回、3週間に1回、または1ヶ月に1回の追加用量(すなわち「維持」用量)の投与を含み得る。例えば、投与レジメンは、初回負荷用量の投与の後の、毎週の維持用量(例えば、初回用量の2分の1)の投与を含み得る。または投与レジメンは、初回負荷用量の投与の後の、1週間おきの維持用量(例えば、初回用量の2分の1)の投与を含み得る。または投与レジメンは、3週間にわたる3回の初回用量の投与の後の、1週間おきの維持用量(例えば、同じ量)の投与を含み得る。
【0294】
当業者に公知であるように、いずれの治療剤の投与も、副作用および/または毒性をもたらすことがある。場合によっては、その副作用および/または毒性は、治療的に有効な用量での特定の剤の投与を不可能にするほど重篤である。場合によっては、薬物治療を中断しなければならず、他の剤が試され得る。しかしながら、同じ治療クラスの多くの剤は類似の副作用および/または毒性を示すことが多く、このことは、患者が治療を中止しなければならないか、または可能であったとしても、その治療剤に関連する不快な副作用に悩まされなければならないことを意味する。
【0295】
したがって、本発明は、対象における癌を処置する方法を提供し、該方法は、RSPO3結合剤、化学療法剤などの投与に関連する副作用および/または毒性を減少させ得る1つまたは複数の剤を投与するために間欠投与ストラテジーを使用する工程を含む。いくつかの態様において、ヒト対象における癌を処置する方法は、該対象に、治療的に有効な用量のRSPO3結合剤を治療的に有効な用量の化学療法剤と併用して投与する工程を含み、ここで、それらの剤の一方または両方が、間欠投与ストラテジーに従って投与される。いくつかの態様において、間欠投与ストラテジーは、初回用量のRSPO3結合剤を対象に投与すること、およびその後の用量のRSPO3結合剤を2週間に約1回投与することを包含する。いくつかの態様において、間欠投与ストラテジーは、初回用量のRSPO3結合剤を対象に投与すること、およびその後の用量のRSPO3結合剤を3週間に約1回投与することを包含する。いくつかの態様において、間欠投与ストラテジーは、初回用量のRSPO3結合剤を対象に投与すること、およびその後の用量のRSPO3結合剤を4週間に約1回投与することを包含する。いくつかの態様において、RSPO3結合剤は、間欠投与ストラテジーを使用して投与され、化学療法剤は、毎週投与される。
【0296】
V. RSPO結合剤を備えるキット
本発明は、本明細書において記載されるRSPO3結合剤(例えば、抗体)を備え、かつ本明細書において記載される方法を行うために使用することができるキットを提供する。ある特定の態様において、キットは、1つまたは複数の容器の中に入った、少なくとも1種のヒトRSPOタンパク質に対する少なくとも1つの精製抗体を備える。いくつかの態様において、該キットは、検出アッセイを行うのに必要および/または十分な構成要素の全て(対照、アッセイを行うための指示書、ならびに解析および結果の提示に必要な任意のソフトウェアの全てを含む)を備える。当業者は、本発明の開示されるRSPO3結合剤が、当技術分野において周知の確立されたキット形式の1つに容易に組み込まれ得ることを容易に認識するであろう。
【0297】
RSPO3結合剤(例えば、抗RSPO3抗体)ならびに少なくとも一種類のさらなる治療剤を備えるキットがさらに提供される。ある特定の態様において、第2の(またはそれ以上の)治療剤は、化学療法剤である。ある特定の態様において、第2の(またはそれ以上の)治療剤は、Wnt経路阻害剤である。ある特定の態様において、第2の(またはそれ以上の)治療剤は、血管新生阻害剤である。
【0298】
本開示の態様は、本開示のある特定の抗体の調製法および本開示の抗体を使用するための方法を詳細に説明している以下の非限定的な例を参照することによりさらに定義され得る。材料と方法の両方に対する多くの改変が本開示の範囲から逸脱することなく行われ得ることは当業者には明らかであろう。
【実施例】
【0299】
実施例1
ヒト腫瘍内でのRSPOおよびLGRの発現
多数のヒト患者の正常組織、良性腫瘍、および悪性腫瘍試料由来のmRNAをマイクロアレイ解析(Genelogic BioExpress Datasuite)によって解析した。このデータは、腎臓、子宮内膜、および卵巣を含むいくつかの腫瘍タイプにおいて正常組織と比べて悪性組織において上昇した発現レベルのRSPO1を明らかにした。RSPO1は、卵巣癌において頻繁に過剰発現されることが注目された(
図1A)。さらに、このデータは、卵巣、膵臓、および肺を含むいくつかの腫瘍タイプにおいて正常組織と比べて悪性組織における上昇した発現レベルのRSPO3を示唆した(
図1C)。さらに、LGR5およびLGR6が、正常組織と比べて、悪性の乳房腫瘍、結腸腫瘍、肺腫瘍、および卵巣腫瘍において過剰発現されるが、LGR4は、肺腫瘍において過剰発現されることが見出された。LGR5およびLGR6の過剰発現は、他の乳房腫瘍のサブタイプと比べてトリプルネガティブ(ER
negPR
negHER2
neg)乳房腫瘍に限定されると見られた。
【0300】
RNAを、マウス異種移植片において成長された一連のヒト腫瘍から単離した。標識cRNAを生成するための確立されたAffymetrixプロトコルを使用して、RNA試料を調製し、処理した。処理されたRNAを、製造者の技術マニュアルに概説されているようにAffymetrix HG-U133plus2.0マイクロアレイ(Affymetrix, Santa Clara, CA)にハイブリダイズした。ハイブリダイゼーションの後、マイクロアレイを洗浄し、走査し、解析した。走査されたアレイのバックグラウンドの補正およびシグナル強度のノーマライゼーションを、GCRMAアルゴリズム(Bioconductor, www.bioconductor.org)を使用して行った。
【0301】
特定のヒトRSPOおよびヒトLGRを評価した(RSPO1(241450_at)、RSPO2(1554012_at)、RSPO3(228186_s_at)、RSPO4(237423_at)、LGR4(218326_s_at)、LGR5(210393_at)、およびLGR6(227819_at))。マイクロアレイ解析は、LGR4およびLGR6がほとんど全ての腫瘍において広く発現されているのに対して、多くの腫瘍は、特定のRSPOファミリーメンバーだけおよびLGR5を大いに過剰発現すると見出された(表2)が、これらの発現レベルは、正常組織における発現レベルと比較されなかったことを示した。一般に、単一のRSPOファミリーメンバーだけが所与の腫瘍において高度に発現されることから、RSPOファミリー内に機能的な重複性が存在し得ることが示唆される。
【0302】
【表2】
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【0303】
実施例2
LGR5へのRSPOタンパク質の結合
標準的な組換えDNA法を使用して、N末端のFLAGタグおよびCD4の膜貫通ドメインおよびC末端GFPタンパク質タグにヒトLGR5のアミノ酸22〜564をライゲートすることによって、細胞表面LGR5タンパク質を作製した(FLAG-LGR5-CD4TM-GFP)。標準的な組換えDNA法を使用して、RSPO-Fcコンストラクトを作製した。詳細には、完全長ヒトRSPO1、RSPO2、RSPO3、およびRSPO4を、ヒトFc領域にインフレームでライゲートし、バキュロウイルスを使用して組換えRSPO-Fcタンパク質を昆虫細胞内で発現させた。プロテインAクロマトグラフィーを使用して、その融合タンパク質を昆虫培地から精製した。
【0304】
HEK-293細胞をFLAG-LGR5-CD4TM-GFPコンストラクトで一過性にトランスフェクトした。48時間後、トランスフェクトされた細胞を、2%FBSおよびヘパリンを含む氷冷PBSに懸濁し、10μg/mlのRSPO1-Fc、RSPO2-Fc、RSPO3-FC、RSPO4-Fc、またはFZD8-Fc融合タンパク質の存在下において氷上で15分間インキュベートした。100μlのPEコンジュゲート抗ヒトFc二次抗体との第2のインキュベーションを行うことにより、Fc融合タンパク質に結合された細胞を検出した。細胞を、正の対照として抗FLAG抗体(Sigma-Aldrich, St. Louis, MO)と、および負の対照として抗PE抗体とインキュベートした。細胞をFACSCalibur装置(BD Biosciences, San Jose, CA)において解析し、FlowJoソフトウェアを使用してデータを処理した。
【0305】
図2に示されるように、RSPO1、RSPO2、RSPO3、およびRSPO4は全て、HEK-293細胞の表面上に発現されたLGR5に結合したが、負の対照であるFZD8は、LGR5に結合しなかった。
【0306】
RSPOタンパク質とLGR5との結合親和性を表面プラズモン共鳴によって解析した。標準的な組換えDNA法を使用して、可溶性LGR5-Fcコンストラクトを作製した。詳細には、ヒトLGR5のアミノ酸1〜564をヒトFcにインフレームでライゲートし、その組換えLGR5-Fc融合タンパク質を、バキュロウイルスを使用して昆虫細胞内で発現させた。プロテインAクロマトグラフィーを使用して、その昆虫培地からLGR5-Fc融合タンパク質を精製した。LGR5シグナル配列の切断によって、LGR5のアミノ酸22〜564を含む成熟LGR5-Fc融合タンパク質が得られる。組換えRSPO1-Fc、RSPO2-Fc、RSPO3-Fc、およびRSPO4-Fc融合タンパク質を、標準的なアミンベースの化学反応(NHS/EDC)を用いてCM5チップ上に固定化した。可溶性LGR5-Fcの2倍希釈物をそのチップ表面の上に注入した(100nM〜0.78nM)。動態学的データを、Biacore Life Sciences(GE Healthcare)製のBiacore2000システムを使用して経時的に収集し、連立の全体近似式(simultaneous global fit equation)を用いてそのデータを当てはめることにより、各RSPOタンパク質に対する親和性定数(K
D値)を得た(表3)。
【0307】
【表3】
[この文献は図面を表示できません]
【0308】
ヒトRSPO1、RSPO2、RSPO3、およびRSPO4は全て、LGR5に結合したことから、RSPOタンパク質がLGRタンパク質に対するリガンドであり得ることが証明された。
【0309】
実施例3
抗RSPO3抗体の識別
哺乳動物細胞抗体ライブラリーをスクリーニングし、2種類の抗RSPO3抗体、131R002および131R003が同定された。配列データは、その後、抗体131R002および131R003が同じ軽鎖配列を有するが、異なる重鎖配列を有することを証明した。
【0310】
抗体131R002および131R003のK
Dを、Biacore LifeSciences(GE Healthcare)製のBiacore2000システムを使用して測定した。組換えヒトRSPO3タンパク質をビオチン化し、400〜700ruのコーティング密度を有するストレプトアビジンコーティングチップ(GE Healthcare)上に捕捉した。前記抗体を、100nMから0.78nMまでHBS-P(0.01M HEPES pH7.4、0.15M NaCl、0.005% v/v Surfactant P20)で2倍段階希釈し、チップ表面上に注入した。動態学的データを経時的に収集し、連立の全体近似式(simultaneous global fit equation)を用いて当てはめることにより、各抗体に対する親和性定数(K
D値)を得た。
【0311】
抗体131R002は、ヒトRSPO3に対して8.2nMの親和性定数(K
D)を有し、抗体131R003は、ヒトRSPO3に対して7.3nMのK
Dを有した。
【0312】
実施例4
抗RSPO3抗体によるβ-カテニンシグナル伝達の阻害についてのインビトロ試験
HEK-293細胞を、6xTCF-ルシフェラーゼレポーターベクター(TOPflash, Millipore, Billerica, MA)でトランスフェクトした。24〜48時間後、トランスフェクトされたHEK-293細胞を、抗RSPO3抗体131R002および131R003の存在下において、WNT3a(5ng/ml)とヒトRSPO3(10ng/ml, R&D BioSystems, Minneapolis, MN)との組み合わせとともにインキュベートした。抗体131R002および131R003は、20μg/ml〜0.02μg/mlの4倍段階希釈で該細胞に加えた。対照として、細胞を、WNT3aとRSPO3との組み合わせ、WNT3aのみ、RSPO3のみとともに、または添加無しでインキュベートした。該細胞を16時間インキュベートし、Steady-Glo(登録商標)Luciferase Assay Systemを製造者の指示書(Promega, Madison, WI)に従って使用して、ルシフェラーゼ活性を測定した。
【0313】
図3に示されるように、抗RSPO3抗体131R002および131R003の各々は、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を用量依存的様式で減少させた。これらの結果は、抗体131R002および131R003が、RSPO3の特異的阻害剤であり、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を減少させ、かつ/または遮断することができることを証明した。
【0314】
実施例5
RSPO3抗体の親和性成熟およびヒト化
抗RSPO3抗体131R003を親和性成熟させ、いくつかの変異体が同定された。1つの131R003変異体は、親131R003抗体と比べて変更された重鎖CDR1(SEQ ID NO:34)を有した。第2の変異体は、親131R003抗体と比べて変更された重鎖CDR3(SEQ ID NO:35)を有した。親131R003抗体と比べて変更された重鎖CDR1およびCDR3の両方を含むさらなる変異体を作製した。
【0315】
HEK-293細胞を、6xTCF-ルシフェラーゼレポーターベクター(TOPflash, Millipore, Billerica, MA)でトランスフェクトした。24〜48時間後、トランスフェクトされたHEK-293細胞を、抗RSPO3抗体131R003、131R003 CDR1変異体、および131R003 CDR3変異体の存在下において、WNT3aとヒトRSPO3との組み合わせとともにインキュベートした。131R003、131R003 CDR1変異体、および131R003 CDR3変異体は、20μg/ml〜0.006μg/mlの5倍段階希釈で該細胞に加えた。対照として、細胞を、WNT3aとRSPO3との組み合わせ、WNT3aのみ、RSPO3のみ、対照抗体とともに、または添加無しでインキュベートした。該細胞を16時間インキュベートし、Steady-Glo(登録商標)Luciferase Assay Systemを製造者の指示書(Promega, Madison, WI)に従って使用して、ルシフェラーゼ活性を測定した。
【0316】
図4に示されるように、抗RSPO3抗体131R003 CDR1変異体および131R003 CDR3変異体の各々は、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を、用量依存的様式で、かつ親131R003よりも低い濃度で減少させた。これらの結果は、131R003変異体が親131R003の特徴を保持していること、すなわち、それらがRSPO3の特異的阻害剤であり、RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を減少させ、かつ/または遮断することができることを証明した。さらに、これらの結果は、131R003変異体が親131R003よりも優れた活性を有することを証明した。
【0317】
標準的な手法を使用して、131R003変異体のヒト化型を作製した。ヒト化抗体h131R005、h131R007、h131R008、h131R010、h131R011は、親131R003抗体と比べて変更された重鎖CDR3を含む。ヒト化h131R006Bは、親131R003抗体と比べて変更された重鎖CDR3を含む。抗体h131R005/131R007、h131R010、およびh131R011は、抗体h131R006Bと比べて、フレームワーク領域3においていくつかのアミノ酸置換を含む。抗体h131R005/131R007、h131R006、およびh131R011は、IgG2抗体である。抗体h131R008およびh131R010は、IgG1抗体である。抗体h131R005/131R007、h131R010、およびh131R011は、同じ重鎖可変領域を含む。抗体h131R010およびh131R011は、同じ軽鎖可変領域を含み、これはh131R005/131R007の軽鎖可変領域とは異なる。
【0318】
131R010抗体の重鎖をコードするプラスミドを、ブダペスト条約の規定に基づき、2013年6月18日にAmerican Type Culture Collection (ATCC), 10801 University Boulevard, Manassas, VA, USAに寄託し、ATCC寄託指定番号PTA-
が割り当てられた。131R010抗体の軽鎖をコードするプラスミドを、ブダペスト条約の規定に基づき、2013年6月18日にATCC, 10801 University Boulevard, Manassas, VA, USAに寄託し、ATCC寄託指定番号PTA-
が割り当てられた。
【0319】
実施例6
抗RSPO抗体によるインビボにおける卵巣腫瘍成長の阻害
分離されたOMP-OV38卵巣腫瘍細胞(1×10
5細胞)を、6〜8週齢のNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が150mm
3という平均体積に達するまで、39日間成長させた。そのマウスを無作為化し(1群あたりn=8)、抗RSPO1抗体89M5と抗RSPO3抗体131R003との組み合わせ、抗RSPO1抗体89M5と抗RSPO3抗体131R003とタキソールとの組み合わせ、単剤としてのタキソール、または対照抗体で処置した。抗体は20mg/kgで1週間に1回投与し、タキソールは15mg/mlで1週間に1回投与した。抗体およびタキソールの投与は、腹腔内への注射によって行われた。腫瘍成長をモニターし、記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。データは、平均値±S.E M.として表される。
【0320】
図5に示されるように、抗RSPO1抗体と抗RSPO3抗体との組み合わせは、OMP-OV38卵巣腫瘍成長を阻害した。驚いたことに、抗RSPO1抗体89M5と抗RSPO3抗体131R002とタキソールとの組み合わせは、タキソール単独または抗体の組み合わせ単独よりも有意に高いレベルまで腫瘍成長を阻害した。
【0321】
分離されたOMP-OV38卵巣腫瘍細胞(1×10
5細胞)を、6〜8週齢のNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が140mm
3という平均体積に達するまで、35日間成長させた。そのマウスを無作為化し(1群あたりn=10)、抗RSPO3抗体131R002、抗RSPO1抗体89M5、タキソール、89M5とタキソールとの組み合わせ、131R002とタキソールとの組み合わせ、89M5と131R002との組み合わせ、89M5と131R002とタキソールとの組み合わせ、または対照抗体で処置した。抗体は20mg/kgで1週間に1回投与し、タキソールは46日目までは15mg/mlで1週間に1回投与し、その後は7.5mg/kgで投与した。抗体およびタキソールの投与は、腹腔内への注射によって行われた。腫瘍成長をモニターし、記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。データは、平均値±S.E M.として表される。
【0322】
図6に示されるように、抗RSPO1抗体89M5と抗RSPO3抗体131R002との組み合わせは、対照抗体と比べてOMP-OV38卵巣腫瘍成長を阻害した。抗RSPO1抗体89M5とタキソールとの組み合わせまたは抗RSPO3抗体131R002とタキソールとの組み合わせは、タキソール単独と比べて効果を有さなかった。しかしながら、驚いたことに、抗RSPO1 89M5と抗RSPO3抗体131R002とタキソールとの組み合わせは、タキソール単独よりも高い活性を示した。
【0323】
実施例7
抗RSPO3抗体によるインビボにおける肺腫瘍成長の阻害
OMP-LU45非小細胞肺腫瘍において、CD201
+細胞がCD201
-細胞よりも腫瘍形成性が高いことが観察されている。さらに、RSPO3は、CD201
+細胞集団において高度に発現されると見出された。分離され選別されたOMP-LU45 CD44
+ CD201
+肺腫瘍細胞(5×10
4細胞)を、6〜8週齢のNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が140mm
3という平均体積に達するまで、38日間成長させた。そのマウスを無作為化し(1群あたりn=10)、抗RSPO3抗体131R002または対照抗体で処置した。抗体は25mg/kgで1週間に1回投与し、抗体の投与は、腹腔内への注射によって行われた。腫瘍成長をモニターし、記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。データは、平均値±S.E M.として表される。
【0324】
第2の肺腫瘍を用いた研究において、分離されたOMP-LU25肺腫瘍細胞(5×10
4細胞)を、6〜8週齢のNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が110mm
3という平均体積に達するまで、48日間成長させた。そのマウスを無作為化し(1群あたりn=9)、抗RSPO3抗体131R002または対照抗体で処置した。抗体は25mg/kgで1週間に1回投与し、抗体の投与は、腹腔内への注射によって行われた。腫瘍成長をモニターし、記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。データは、平均値±S.E M.として表される。
【0325】
図7Aおよび7Bに示されるように、抗RSPO抗体131R002は、対照抗体と比べて肺腫瘍OMP-LU45およびOMP-LU25の両方の成長を阻害した。
【0326】
実施例8
抗RSPO3抗体によるβ-カテニン活性の阻害
HEK-293細胞を、6xTCF-ルシフェラーゼレポーターベクター(TOPflash, Millipore, Billerica, MA)でトランスフェクトした。24〜48時間後、トランスフェクトされたHEK-293細胞を、抗RSPO3抗体131R002、131R006B、または131R007の存在下において、WNT3a馴化培地(5ng/ml)とヒトRSPO3(10ng/ml, R&D BioSystems)との組み合わせとともにインキュベートした。抗体131R002、131R006、または131R007は、20μg/ml〜0.0064μg/mlの5倍段階希釈で該細胞に加えた。対照として、細胞を、WNT3a馴化培地単独、WNT3a馴化培地とヒトRSPO3との組み合わせとともに、または細胞への添加無しでインキュベートした。該細胞を16時間インキュベートし、Steady-Glo(登録商標)Luciferase Assay Systemを製造者の指示書(Promega, Madison, WI)に従って使用して、ルシフェラーゼ活性を測定した。
【0327】
図8に示されるように、3種全ての抗RSPO3抗体が、WNT3a/RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を用量依存的様式で減少させた。ヒト化抗体131R006Bおよび131R007は、β-カテニン活性を阻害する能力が抗体131R002よりも高いと見られた。これらの結果は、ヒト化抗体131R006Bおよび131R007が、131R002よりも強力なRSPO3の阻害剤であり、WNT3a/RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を減少させ、かつ/または遮断することができることを証明した。
【0328】
実施例9
LGR5へのRSPO3の結合の阻害
HEK-293T細胞を、ヒトLGR5の細胞外ドメインをコードするcDNA発現ベクター(FLAG-LGR5-CD4TM-GFP)でトランスフェクトした。トランスフェクトされた細胞を、抗RSPO3抗体131R006Bまたは131R007の存在下において、組換えRSPO3-ビオチン融合タンパク質とともにインキュベートした。対照として、細胞を抗体無しでインキュベートした。細胞をPBSで洗浄し、LGR5を発現しているトランスフェクトされた細胞に対するRSPO3の結合を、PE-コンジュゲートストレプトアビジンの添加およびフローサイトメトリーによる解析により測定した。
【0329】
図9に示されるように、抗RSPO3抗体131R006Bまたは131R007は、LGR5を発現している細胞に対するRSPO3の結合を遮断するのに非常に効果的であった。
【0330】
実施例10
RSPO3抗体の結合親和性
RSPO3抗体131R002、131R003、131R003 CDR3変異体、h131R007、h131R008、およびh131R011のK
Dを、Biacore LifeSciences(GE Healthcare)製のBiacore2000システムを使用して測定した。使用した方法は、実施例3に記載されたものとは異なった。ヤギ抗ヒトIgG抗体を、標準的なアミンベースの化学反応(NHS/EDC)を用いてカルボキシメチル-デキストラン(CM5)SPRチップに結合させ、エタノールアミンでブロッキングした。抗体(精製抗体または培養上清)をHBS-P-BSA(0.01M HEPES pH7.4、0.15M NaCl、0.005% v/v Polysorbate 20、100ug/ml BSA)で10μg/mlの濃度に希釈し、抗ヒトIgGを介してチップ上に捕捉した。ヒトRSPO3(R&D Systems)を、300nMから37.5nMまでHBS-P-BSAで2倍段階希釈し、捕捉された抗RSPO3抗体上に連続して注入した。各濃度において、RSPO3の会合および解離を測定した。各抗原の注入後、5μlの100 mM H
3PO
4を注入することにより、抗原-抗体複合体を除去し、その後の注入を実施した。動態学的データを経時的に収集し、連立の全体近似式を用いて当てはめることにより、各抗体に対する親和性定数(K
D値)を得た(表4)。
【0331】
【表4】
[この文献は図面を表示できません]
【0332】
さらなる実験において、抗体h131R008は、ヒトRSPO3に対して448pMほどの低いK
D、ヒトRSPO1またはRSPO2に対して検出不可能な結合、およびヒトRSPO4に対して弱い結合を有することが示された。抗体h131R008は、マウスRSPO3に対して248pMというK
D、マウスRSPO1またはRSPO2に対して検出不可能な結合、およびマウスRSPO4に対して弱い結合を有することが示された。
【0333】
実施例11
抗RSPO3抗体によるインビボにおける肺腫瘍成長の阻害
マイクロアレイデータにおける高レベルのRPSO3発現に基づいて、試験のために非小細胞肺癌(NSCLC)細胞株NCI-H2030を選択した。NCI-H2030細胞(1×10
6)をNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が100mm
3という平均体積に達するまで、およそ60日間成長させた。腫瘍を有するマウスを4群に無作為化した(1群あたりn=7〜9)。腫瘍を有するマウスを、抗RSPO3抗体131R002、カルボプラチン、抗RSPO3抗体131R002とカルボプラチンとの組み合わせ、または対照抗体で処置した。抗体は、25mg/kgで1週間に1回投与した。カルボプラチンは、50mg/kgで1週間に1回投与した。腫瘍成長をモニターし、処置後の記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。
【0334】
図10に示されるように、カルボプラチンと併用した抗RSPO3抗体による処置は、カルボプラチン単独または抗体単独よりも良好にNCI-H2030腫瘍成長を阻害した。
【0335】
OMP-LU102は患者由来の非小細胞肺癌(NSCLC)異種移植片であり、マイクロアレイデータにおける高レベルのRPSO3発現に基づいて、試験のためにこれを選択した。OMP-LU102肺腫瘍細胞(1×10
5)をNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が90mm
3という平均体積に達するまで、22日間成長させた。腫瘍を有するマウスを4群に無作為化した(1群あたりn=10)。腫瘍を有するマウスを、抗RSPO3抗体131R002、カルボプラチン、抗RSPO3抗体131R002とカルボプラチンとの組み合わせ、または対照抗体で処置した。抗体は、25mg/kgで1週間に1回投与した。カルボプラチンは、50mg/kgで1週間に1回投与した。腫瘍成長をモニターし、処置後の記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。
【0336】
図11Aに示されるように、抗RSPO3抗体による処置は、単剤としてOMP-LU102肺腫瘍成長を阻害したが、カルボプラチンと併用した場合にはるかにより高い効果を有した。
【0337】
処置後に、4つの実験群の各々に由来する腫瘍からRNAを調製した。マイクロアレイ解析により、遺伝子発現を特徴付けた。遺伝子セット濃縮解析は、抗RSPO3抗体処置(単剤として、またはカルボプラチンと併用して)が、
図11Bに示されるように、正常幹細胞または癌幹細胞に特有の様々な遺伝子セットの発現を阻害することを示した。カルボプラチン単独による処置は、遺伝子発現に対するこの効果を持たなかった。
【0338】
実施例12
抗RSPO3抗体によるインビボにおける膵腫瘍成長の阻害
OMP-PN35は患者由来の膵管腺癌(PDAC)異種移植片であり、マイクロアレイデータにおける高レベルのRPSO3発現に基づいて、試験のためにこれを選択した。OMP-PN35(1×10
5)腫瘍細胞をNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が90mm
3という平均体積に達するまで、30日間成長させた。腫瘍を有するマウスを4群に無作為化した(1群あたりn=10)。腫瘍を有するマウスを、抗RSPO3抗体131R002、ゲムシタビン+nab-パクリタキセル(ABRAXANE)、抗RSPO3抗体とゲムシタビンとnab-パクリタキセル(ABRAXANE)との組み合わせで処置した。抗体は、25mg/kgで1週間に1回投与した。ゲムシタビンは20mg/kgで1週間に1回投与し、nab-パクリタキセル(ABRAXANE)は30mg/kgで1週間に1回投与した。腫瘍成長をモニターし、処置後の記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。
【0339】
図12Aでは、4つ全ての処置群からの結果を示し、
図12Bでは、併用処置のみを拡大スケールで示す。
図12Aおよび
図12Bは、ゲムシタビンおよびnab-パクリタキセル(ABRAXANE)と併用した抗RSPO3抗体が、ゲムシタビンおよびnab-パクリタキセル(ABRAXANE)単独よりも良好にOMP-PN35膵腫瘍成長を阻害したことを示す。
【0340】
実施例13
抗RSPO3抗体によるβ-カテニン活性の阻害
HEK-293細胞を、6xTCF-ルシフェラーゼレポーターベクター(TOPflash, Millipore, Billerica, MA)でトランスフェクトした。24〜48時間後、トランスフェクトされたHEK-293細胞を、抗RSPO3抗体h131R007またはh131R010の存在下において、WNT3a馴化培地(5ng/ml)とヒトRSPO3(2ng/ml, R&D BioSystems)との組み合わせとともにインキュベートした。抗体h131R007またはh131R010は、20μg/ml〜0.0064μg/mlの5倍段階希釈で該細胞に加えた。対照として、細胞を、WNT3a馴化培地単独、WNT3a馴化培地とヒトRSPO3との組み合わせとともに、または細胞への添加無しでインキュベートした。該細胞を16時間インキュベートし、Steady-Glo(登録商標)Luciferase Assay Systemを製造者の指示書(Promega, Madison, WI)に従って使用して、ルシフェラーゼ活性を測定した。
【0341】
図13に示されるように、抗体h131R010は、WNT3a/RSPO3によって誘導されるβ-カテニンシグナル伝達を、用量依存的様式で、かつh131R007と同程度まで減少させた。h131R010がβ-カテニンシグナル伝達をh131R007と同程度まで阻害したことから、抗RSPO3抗体の活性がIgG1アイソタイプへの変換によって影響を受けなかったことが明らかである。
【0342】
実施例14
抗RSPO3抗体によるインビボにおける肺腫瘍成長の阻害
OMP-LU25は患者由来の非小細胞肺癌(NSCLC)異種移植片であり、マイクロアレイデータにおける高レベルのRPSO3発現に基づいて、試験のためにこれを選択した。OMP-LU25腫瘍細胞(5×10
4)をNOD/SCIDマウスに注射した。腫瘍が120mm
3という平均体積に達するまで、33日間成長させた。腫瘍を有するマウスを4群に無作為化した(1群あたりn=9)。腫瘍を有するマウスを、対照抗体、抗RSPO3抗体131R008、パクリタキセル、または抗RSPO3抗体131R008とパクリタキセルとの組み合わせのいずれかで処置した。抗体は、20mg/kgで毎週投与した。パクリタキセルは、15mg/kgで毎週投与した。腫瘍成長をモニターし、処置後の記載の時点において電子ノギスを用いて腫瘍体積を測定した。
【0343】
図14に示されるように、抗RSPO3抗体131R008は、単剤としておよび化学療法と併用してOMP-LU25腫瘍成長を阻害した。さらに、抗RSPO3抗体131R008とパクリタキセルとの組み合わせは、腫瘍退縮をもたらした。
【0344】
本明細書において記載される例および態様は、単に例示目的であること、およびそれに照らした様々な改変または変更が当業者に提案され、それは本願の精神および権限の範囲内に包含されることが理解される。
【0345】
本明細書に引用された全ての刊行物、特許、特許出願、インターネットサイト、およびアクセッション番号/データベース配列(ポリヌクレオチド配列とポリペプチド配列の両方を含む)が、各個別の刊行物、特許、特許出願、インターネットサイト、またはアクセッション番号/データベース配列が、参照により明確かつ個別に組み入れられるとそのように示されたかのように同程度に全ての目的のためにそれらの全体が参照により本明細書に組み入れられる。
【0346】
本明細書に開示の配列は以下のとおりである。
シグナル配列を有するヒトRSPO1タンパク質配列(SEQ ID NO:1)
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シグナル配列を有するヒトRSPO2タンパク質配列(SEQ ID NO:2)
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シグナル配列を有するヒトRSPO3タンパク質配列(SEQ ID NO:3)
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シグナル配列を有するヒトRSPO4タンパク質配列(SEQ ID NO:4)
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予測シグナル配列を有しないヒトRSPO3タンパク質配列(SEQ ID NO:5)
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ヒトRSPO3フューリン様ドメイン1(SEQ ID NO:6)
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ヒトRSPO3フューリン様ドメイン2(SEQ ID NO:7)
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ヒトRSPO3トロンボスポンジンドメイン(SEQ ID NO:8)
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131R002/131R003重鎖CDR1(SEQ ID NO:9)
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131R002/131R003重鎖CDR2(SEQ ID NO:10)
IYPSNGDS
131R002/131R003重鎖CDR3(SEQ ID NO:11)
ATYFANYFDY
131R002/131R003軽鎖CDR1(SEQ ID NO:12)
QSVDYDGDSYM
131R002/131R003軽鎖CDR2(SEQ ID NO:13)
AAS
131R002/131R003軽鎖CDR3(SEQ ID NO:14)
QQSNEDPLT
131R002重鎖可変領域(SEQ ID NO:15)
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131R003重鎖可変領域(SEQ ID NO:16)
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131R002/131R003軽鎖可変領域(SEQ ID NO:17)
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131R002重鎖可変領域ヌクレオチド配列(SEQ ID NO:18)
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131R003重鎖可変領域ヌクレオチド配列(SEQ ID NO:19)
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131R002/131R003軽鎖可変領域ヌクレオチド配列(SEQ ID NO:20)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有する131R002重鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:21)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有する131R003重鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:22)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有する131R002/131R003軽鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:23)
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予測シグナル配列を有する131R002重鎖ヌクレオチド配列(SEQ ID NO:24)
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予測シグナル配列を有する131R003重鎖ヌクレオチド配列(SEQ ID NO:25)
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予測シグナル配列を有する131R002/131R003軽鎖ヌクレオチド配列(SEQ ID NO:26)
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予測シグナル配列を有しない131R002重鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:27)
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予測シグナル配列を有しない131R003重鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:28)
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予測シグナル配列を有しない131R002/131R003軽鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:29)
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予測シグナル配列を有しない131R002重鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:30)
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予測シグナル配列を有しない131R003重鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:31)
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予測シグナル配列を有しない131R002/131R003軽鎖アミノ酸配列(SEQ ID NO:32)
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FLAGタグ(SEQ ID NO:33)
DYKDDDDK
131R003重鎖CDR1変異体(SEQ ID NO:34)
KASGYTFTSYTF
131R003重鎖CDR3変異体(SEQ ID NO:35)
ATYFANNFDY
131R003重鎖可変領域‐変異体1(SEQ ID NO:36)
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131R003重鎖可変領域‐変異体2(SEQ ID NO:37)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有する131R003重鎖‐変異体1(SEQ ID NO:38)
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予測シグナル配列を有しない131R003重鎖‐変異体1(SEQ ID NO:39)
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予測シグナル配列を有する131R003重鎖‐変異体1核酸(SEQ ID NO:40)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有する131R003重鎖‐変異体2(SEQ ID NO:41)
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予測シグナル配列を有しない131R003重鎖‐変異体2(SEQ ID NO:42)
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予測シグナル配列を有する131R003重鎖‐変異体2核酸(SEQ ID NO:43)
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ヒト化131R003抗体
ヒト化131R005/131R007/131R008/131R010/131R011重鎖可変領域(SEQ ID NO:44)
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ヒト化131R006A重鎖可変領域(SEQ ID NO:45)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有するヒト化131R005/131R007/131R011重鎖(IgG2)(SEQ ID NO:46)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有するヒト化131R006A重鎖(SEQ ID NO:47)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R005/131R007/131R011重鎖(IgG2)(SEQ ID NO:48)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R006A重鎖(SEQ ID NO:49)
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ヒト化131R005/131R007重鎖可変領域核酸(SEQ ID NO:50)
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ヒト化131R006A重鎖可変領域核酸(SEQ ID NO:51)
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予測シグナル配列を有するヒト化131R005/131R007重鎖核酸(SEQ ID NO:52)
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予測シグナル配列を有するヒト化131R006A重鎖核酸(SEQ ID NO:53)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R005/131R007重鎖核酸(SEQ ID NO:54)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R006A重鎖核酸(SEQ ID NO:55)
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ヒトIgG1重鎖定常領域(SEQ ID NO:56)
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ヒトIgG2重鎖定常領域(SEQ ID NO:57)
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ヒトIgG3重鎖定常領域(SEQ ID NO:58)
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ヒトIgG4重鎖定常領域(SEQ ID NO:59)
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ヒトIgG2重鎖定常領域(13A鎖変異体)(SEQ ID NO:60)
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ヒトIgG2重鎖定常領域(13B鎖変異体)(SEQ ID NO:61)
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ヒト化131R006B重鎖可変領域(SEQ ID NO:62)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有するヒト化131R006B重鎖(SEQ ID NO:63)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R006B重鎖(SEQ ID NO:64)
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ヒト化131R006B重鎖可変領域核酸(SEQ ID NO:65)
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配列シグナルを有するヒト化131R006B重鎖核酸(SEQ ID NO:66)
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予測配列シグナルを有しないヒト化131R006B重鎖核酸(SEQ ID NO:67)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有するヒト化131R008/131R010重鎖(IgG1)(SEQ ID NO:68)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R008/131R010重鎖(IgG1)(SEQ ID NO:69)
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シグナル配列を有するヒト化131R008重鎖(IgG1)核酸(SEQ ID NO:70)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R008重鎖(IgG1)核酸(SEQ ID NO:71)
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ヒト化131R005/131R007/131R008軽鎖可変領域(SEQ ID NO:72)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有するヒト化131R005/131R007/131R008軽鎖(SEQ ID NO:73)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有しないヒト化131R005/131R007/131R008軽鎖(SEQ ID NO:74)
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ヒト化131R005/131R007/131R008軽鎖可変領域核酸(SEQ ID NO:75)
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シグナル配列を有するヒト化131R005/131R007/131R008軽鎖核酸(SEQ ID NO:76)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R005/131R007/131R008軽鎖核酸(SEQ ID NO:77)
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変異体重鎖CDR1(SEQ ID NO:78)
DYSIH
変異体重鎖CDR2(SEQ ID NO:79)
YIYPSNGDSGYNQKFK
変異体重鎖CDR3(SEQ ID NO:80)
TYFANNFD
変異体軽鎖CDR1(SEQ ID NO:81)
KASQSVDYDGDSYMN
変異体軽鎖CDR2(SEQ ID NO:82)
AASNLES
変異体軽鎖CDR3(SEQ ID NO:83)
QQSNEDPLTF
シグナル配列を有するヒト化131R010重鎖(IgG1)核酸(SEQ ID NO:84)
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シグナル配列を有しないヒト化131R010重鎖(IgG1)核酸(SEQ ID NO:85)
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ヒト化131R010/131R011軽鎖可変領域(SEQ ID NO:86)
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下線が引かれた予測シグナル配列を有するヒト化131R010/131R011軽鎖(SEQ ID NO:87)
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予測シグナル配列を有しないヒト化131R010/131R011軽鎖(SEQ ID NO:88)
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ヒト化131R010/131R011軽鎖可変領域核酸(SEQ ID NO:89)
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シグナル配列を有するヒト化131R010/131R011軽鎖核酸(SEQ ID NO:90)
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シグナル配列を有しないヒト化131R010/131R011軽鎖核酸(SEQ ID NO:91)
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ヒト化131R011重鎖可変領域核酸(SEQ ID NO:92)
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シグナル配列を有するヒト化131R011重鎖(IgG2)核酸(SEQ ID NO:93)
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シグナル配列を有しないヒト化131R011重鎖(IgG2)核酸(SEQ ID NO:94)
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ヒト化131R010重鎖可変領域(SEQ ID NO:95)
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