【文献】
Erdelmeier I. et al.,Green Chem.,2012年,Vol. 14,pp.2256-2265
(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
工程(d)において、ジメチルホルムアミド(DMF)およびN−ブロモスクシンイミド(NBS)を使用して5−ブロモへルシニンラクトンを形成する、請求項1に記載の方法。
【実施例】
【0111】
1.一般手順
すべての溶媒は適切な技法によって乾燥させ、使用前に新たに蒸留した。市販の試薬はすべてSigma−AldrichおよびMerckから購入し、さらに精製することなく使用した。
【0112】
別途明記しない限り、反応はオーブン乾燥したガラス容器中で窒素の不活性雰囲気下で行い、Merckシリカゲル60−F
254シート(0.2mm層)で予めコーティングしたプレート上で行った薄層クロマトグラフィー(TLC)によりモニタリングし、生成物を254nmのUV光下で、またはニンヒドリンのエタノール溶液(2%v/v)をプレートに噴霧し、続いて加熱することによって可視化した。
【0113】
カラムクロマトグラフィーは、Merck Kieselgelシリカゲル60(0.040〜0.063mm)を使用して行い、適切な溶媒混合物で溶離した。すべての化合物を真空下で乾燥してから収率を測定した。
【0114】
核磁気共鳴スペクトル(
1Hおよび
13C)を、Varian Mercury 300MHz(
13Cでは75MHz)、Varian Unity 400MHz(
13Cでは101MHz)、Bruker unity 400MHz(
13Cでは101MHz)、またはBruker unity 600MHz(
13Cでは151MHz)で記録し、別途明記しない限り、溶媒としてCDCl
3、DMSO−d
6およびD
2O中で実施した。化学シフトは、内部標準として使用したテトラメチルシラン(TMS、δ=0.00ppm)に対してppm単位で得られる。必要に応じて、帰属をCOSY、APTおよびHSQC分析によって確認した。カップリング定数(J)はヘルツ(Hz)単位で報告される。スピン多重度は、記号s(一重線)、d(二重線)、dd(二重線の二重線)、t(三重線)、m(多重線)、q(四重線)およびbr(幅広)で示される。
【0115】
旋光度は、Perking Elmer 141旋光計を使用して20℃で得た。濃度cはg/100mlを意味する。
【0116】
融点はReichert−Jung Thermovarホットプレート顕微鏡を使用して測定し、補正していない。赤外線スペクトルは、4000cm
−1から450cm
−1までPerkin−Elmer FT−IR分光計(cm
−1単位)で記録した。
【0117】
質量スペクトルは、JEOL GC MATE II磁気セクター質量分析計で記録し、基準ピークを得た、University of Cape Town。
【0118】
LCMS分析は、UHPLC Agilent 1290 Infinity Series(ドイツ)、すなわちAgilentジェット流イオン化源(正イオン化モード)(ESI
+)およびカラム(Eclipse+C
18 RRHD 1.8μm 2.1×50、Agilent、ドイツ)を備えた正確な質量分析計Agilent 6530 Qradrupole Time Of Flight(QTOF)で行った。
【0119】
酵素反応物をNuaireインキュベーター(DH Autoflow CO
2 Air−jarcketed Incubator)中でインキュベートさせ、Eppendhorf遠心分離機(Model 5810R、ドイツ)で遠心分離した、Tygerberg Stellenbosch University、ケープタウン、南アフリカ。
【0120】
2.エルゴチオネイン基質とスルホンの合成
【0121】
【化36】
【0122】
スキーム5:スルホキシド(II)とスルホン(III)の合成
【0123】
N−ベンジル−L−ヒスチジン(12)
【0124】
【化37】
【0125】
Nα−Boc−N(im)−ベンジル−L−ヒスチジン11(Sigma−Aldrich)(750mg、2.17mmol)をジクロロメタン(10mL)に懸濁させ、続いて氷浴で冷却しながらトリフルオロ酢酸(1mL)を加えた。得られた均質溶液を、完全に脱保護されたことが薄層クロマトグラフィーで示されるまで室温で撹拌させた。溶媒を除去し、Et
2O(15mL)で粉砕し、乾燥して、生成物12を白色結晶(700mg、定量的)として得た。Mp: 230-233 °C, (Lit. 240 °C)
1;
1H NMR (400 MHz, DMSO) δ 9.01 (s, 1H, H-2'), 7.50 (s, 1H, H-5'), 7.39 (m, 5H, フェニル), 5.37 (s, 2H, H-1''), 4.22 (t, J = 7.0 Hz, 1H, H-2), 3.22 (dd, J = 15.6, 7.0 Hz, 1H, H-3a), 3.14 (dd, J = 15.6, 7.0 Hz, 1H, H-3b);
13C NMR (101 MHz, DMSO) δ 170.1 (C-1), 136.3 (C-2''), 135.8 (C-2'), 130.0 (C-4'), 129.4 (C-5'' C-6''), 129.0 (C-7''), 128.6 (C-3''C-4''), 120.6 (C-5'), 51.7 (C-1''), 51.6 (C-2), 26.3 (C-3)(
図4および
図5)。
【0126】
(S)−3−(1−ベンジル−1H−イミダゾール−4−イル)−2−(ジメチルアミノ)プロパン酸(13)
【0127】
【化38】
【0128】
CH
3CN(20mL)に12(1.31g、5.34mmol)を懸濁させ、続いてホルムアルデヒド(1.2mL、15.5mmol、37%)を加えた。得られた均質溶液にNaBH(OAc)
3(3.2g、15.5mmol)を加え、溶液を室温で24時間撹拌させた。望ましくない塩をセライトを通してろ過し、溶媒を蒸発させ、乾固して粗ジメチル生成物13を黄色油状物(1.80g、定量的)として得た。液液抽出法でこの生成物を単離しようとしたが、分子の双性イオン性の性質のために成功しなかった。しかしながら、この生成物は十分に純粋であり、それ以上精製することなく次の工程で使用した(
図21)。
【0129】
(2S)−N,N,N−2−トリメチルエタンアミニウム−3−(1−ベンジル−1H−イミダゾール−4−イル)プロパン酸(14)
【0130】
【化39】
【0131】
乾燥テトラヒドロフラン(10mL)中に粗ジメチル生成物13(870mg、3.16mmol)を溶解し、続いてMeI(0.41mL、942mg、6.64mmol)を加えた。得られた溶液を室温で暗所で1〜2日間撹拌させた。溶媒を除去して、生成物14を黄色油状物(822mg、93%)として得た。無水エタノール中での結晶化により、生成物14を白色固体として得た。Mp: 156 °C (dec),
1H NMR (400 MHz, D
2O) δ 8.65 (d, J = 1.6 Hz, 1H, H-2'), 7.39 - 7.29 (m, 5H, Ph), 7.28 - 7.24 (m, 1H, H-5'), 5.27 (s, 2H, H-1'), 4.26 (dd, J = 9.7, 4.7 Hz, 1H, H-2), 3.47 - 3.36 (m, 2H, H-3), 2.88 (s, 9H, H-1''H-2''H-3'');
13C NMR (101 MHz, D
2O) δ 169.0 (C-1), 134.9 (C-2'), 134.7 (C-2''), 133.5 (C-4'), 129.3 (C-3'' C-4''), 128.4 (C-5'' C-6''), 127.5 (C-7''), 121.0 (C-5'), 81.8 (C-2), 65.4 (C-1''), 52.7 (C-1'''C-2'''C-3'''), 21.8 (C-3); LRMS (EI
+) m/z C
16H
21N
3O
2について計算 287.2 [M-1]
+ 実測値287.1 ([M]
+, 1 %), C
14H
17N
3+について計算 227.1 [M-CO
2および-CH
3]
+ 実測値227.1 ([M-CO
2および-CH
3]
+, 100 %)(
図6および
図7)。
【0132】
イミダゾール環の選択的かつ穏やかな臭素化
【0133】
【化40】
【0134】
スキーム6:イミダゾール環の選択的かつ穏やかな臭素化
【0135】
臭素化条件を非常に選択的であるように最適化した。2つの臭素化中間体が、逆相C18クロマトグラフィーによって単離するのに十分安定であることが見出されている。モノ臭素化中間体である5−ブロモヘルシニン(A)(
図8)は非常に高収率(90%)で単離されたが、2,−5ジブロモヘルシニン中間体(B)(
図9)は10%の低い収率で単離された。
【0136】
ヘルシニルシステインチオエーテル(15)(ワンポット合成)
【0137】
【化41】
【0138】
ジメチルホルムアミド(8mL)に14(700mg、2.43mmol)を溶解し、続いてN−ブロモスクシンイミド(1.8g、6.08mmol)を加えた。得られた溶液を、出発材料が完全に消失するまで室温で撹拌させたところ(薄層クロマトグラフィーによるモニタリング)、溶液は赤橙色になった。これは、良好に臭素化されたことを示している。
【0139】
良好な臭素化の後、システインHCl。H
2O(1.07g、6.08mmol)を一度に加え、得られた溶液を室温で24時間撹拌させた。逆相クロマトグラフィーC18により、酢酸塩形態の黄色の吸湿性固体(695mg、90%)として単離された生成物15を得た。
1H NMR (400 MHz, D
2O) δ 7.41 (m, 1H), 4.54 (dd, J = 7.7, 4.4 Hz, 1H, H-2''), 4.42 (t, J = 5.0 Hz, 1H, H-2), 3.50 (dd, J = 15.2, 4.4 Hz, 1H, H-3a''), 3.36 (dd, J = 15.2, 7.7 Hz, 1H, H-3b''), 3.19 (m, 2H, H-3), 2.80 (s, 9H, H-1''H-2''H-3''), 2.75 (s, 3H,アセテート);
13C NMR (101 MHz, D
2O) δ 170.3 (C-1''), 170.0 (C-1), 129.4 (C-2'), 128.9 (C-4'), 120.9 (C-5'), 61.0 (C-2), 54.4 (C-2''), 51.7 (C-1'''C-2'''C-3'''), 36.3 (C-3''), 23.9 (C-3); HRMS (ESI
+): m/z 317.1284 [M]
+. C
12H
21N
4O
4S
+についての計算値は317.1277 [M]
+であった(
図10)。
【0140】
ヘルシニルシステインスルホキシド(II)およびスルホン(III)の合成
S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルホキシドまたは(2S)−N,N,N−2−トリメチルアンモニウム−3−[2−((2R)−2−アミノ−2−ヒドロキシカルボニル)エチルスルフィニル)−1H−イミダゾール−4−イル]プロパン酸(II)
26
【0141】
【化42】
【0142】
H
2O
2(30%、224mg、6.58mmol、2.4当量)の溶液に15(870mg、2.74mmol)およびパラトルエンスルホン酸(15mg、0.08mmol)を加えた。得られた反応混合物を室温で24時間撹拌させた。最後に、H
2O(10mL)の添加により反応を停止させ、高真空下で蒸発させて粗生成物を得、これをC18逆相により精製して、生成物IIを黄色固体(640mg、70%)として得た。
1H NMR (300 MHz, D
2O) δ 8.01 (s, 1H, H-5'), 4.49 (dd, J = 8.6, 3.3 Hz, 1H, H-2''), 3.90 (dd, J = 16.1, 9.3 Hz, 1H, H-2), 3.65 (dd, J = 15.0, 3.3 Hz, 2H, H-1''), 3.52 (dd, J = 9.3, 4.9 Hz, 1H, H-3a), 3.44 (dd, J = 9.3, 4.9 Hz, 1H, H-3b), 2.86 (s, 9H, NMe
3), 2.79 (s, 3H,アセテート);
13C NMR (101 MHz, D
2O) δ 171.8 (C-3''), 170.1 (C-1), 156.6 (C-2'), 129.5 (C-4'), 125.5 (C-5'), 72.5 (C-2), 49.5 (NMe
3), 49.1 (C-1''), 43.5 (C-2''), 20.8 (C-3); HRMS (ESI
+): m/z 334.1306 [MH]
+. C
12H
22N
4O
5S
2+についての計算値は334.1321 [MH]
+であった(
図11)。
【0143】
S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルホンまたは(2S)−N,N,N−2−トリメチルアンモニウム−3−[2−((2R)−2−アミノ−2−ヒドロキシカルボニル)エチルスルホニル)−1H−イミダゾール−4−イル]プロパン酸(III)
27
【0144】
【化43】
【0145】
H
2O
2(30%、416mg、12.24mmol、4.8当量)とホウ酸(5mg、0.08mmol)との溶液に15(810mg、2.55mmol)を加え、反応混合物を室温で24時間撹拌させた。最後に、H
2O(10mL)の添加により反応を停止させ、高真空下で蒸発させて粗生成物を得、これをC18逆相により精製して、生成物IIIを黄色固体(545mg、61%)として得た。
1H NMR (300 MHz, D
2O) δ 8.01 (s, 1H, H-5'), 4.52 (dd, J = 8.3, 3.1 Hz, 1H, H-2''), 3.89 (dd, J = 16.1, 9.3 Hz, 1H, H-2), 3.65 (dd, J = 15.0, 2.8 Hz, 2H, H-1''), 3.59 - 3.43 (m, 2H. H-3), 2.85 (s, 9H, NMe
3), 2.79 (s, 3H,アセテート);
13C NMR (101 MHz, D
2O) δ 171.7 (C-3''), 170.0 (C-1), 159.8 (C-2'), 156.6 (C-4'), 132.9 (C-5'), 64.3 (C-2), 56.7 (C-1''), 49.4 (NMe
3), 49.1 (C-2''), 34.7 (C-3); HRMS (ESI
+): m/z 349.1177 [M]
+. C
12H
21N
4O
6S
+についての計算値は349.1192 [M]
+であった(
図12)。
【0146】
3.Mycobacterium smegmatisからの総タンパク質の抽出および精製
Mc
2155(M.smegmatis)の増殖条件
M.smeg培養液(800ml)を指数期まで増殖させた後、乾燥させて乾燥菌体10gを得た。得られたM.smeg細胞のペレットを、その後、必要になるまで−80℃で保存した。
【0147】
総タンパク質の抽出
M.smeg細胞を4℃で35分間超音波処理し(25台のパルサー)、続いてリン酸カリウム緩衝液(60ml;pH7)を加えた。この溶液を4℃で10分間撹拌させ、その後3000rpmで20分間遠心分離した。上清を回収し、測定し、次いで適切な量の硫酸アンモニウムを4℃で一晩撹拌しながら徐々に加えて60〜70%飽和させた。
28
【0148】
総タンパク質が沈殿した後、懸濁液を4℃で3000rpmで20分間遠心分離し、−20℃で保存した。
【0149】
総タンパク質の精製
ピリドキサールリン酸(10ml;20μM)、リン酸カリウム緩衝液(8ml;50mM;pH7)および(2ml;1mM EDTA)を含有する緩衝液混合物(20ml;pH7)に、複合総タンパク質アンモニウム塩沈殿物を再懸濁させた。
【0150】
タンパク質検量線
総タンパク質濃度を決定するために、タンパク質DcアッセイおよびBradfordアッセイを使用した。Bradfordの検量線は、この場合にはタンパク質Dcよりも正確であることが判明した(
図13)。
【0151】
計算されたM.Smeg総タンパク質濃度は10.33μg/μlであることが判明した。
【0152】
4.HPLC−ESI/MS(QTOF)分析
材料および方法
分析は、UHPLC Agilent 1290 Infinity Series(ドイツ)、すなわちAgilentジェット流イオン化源(正イオン化モード)(ESI
+)およびカラム(Polaris 3 C
18 Ether 100×2mm、粒子サイズ3μm、Agilent、ドイツ)を備えた正確な質量分析計Agilent 6530 Qradrupole Time Of Flight(QTOF)で行った。
【0153】
15μLの濃縮試料をLCMSに注入した。分析物の分離を、0.1%ギ酸ミリQ水(溶媒A)溶液、および90%のアセトニトリル、0.1%のギ酸、10%のミリQ水(溶媒B)の混合物を移動相として、イソクラティック流速0.3mL/分で試みた。
【0154】
システムは、Mass Hunterワークステーションソフトウェア(QualitativeおよびQuantitativeバージョンB.05.00;Build 5.0.519.0、Agilent 2011、ドイツ)のソフトウェアパッケージで制御した。
【0155】
実験用LCMS
すべての代謝産物中に存在する第四級アンモニウム基の極性および電荷のために、UHPLC(Eclipse+C18 RRHD 1.8μm、2.1×50)カラム上でESHが良好に保持されないことが観察された(保持時間=0.8分)。これ以降の分析はすべて、セクションS3.1に記載されているように、改善されたカラムを使用して行った(保持時間=1.5分)(
図14〜
図16)。
【0156】
Mycobacteria smegmatisにおけるエルゴチオネインのin vitroで再構築した生合成
12
実験を三連で行い、数回(4回以上)繰り返したところ、これらの結果は再現可能であることが判明した。
【0157】
ESHの検量線
ESHの定量のための検量線を作成するために、8つの異なる濃度(0.78、1.56、3.125、6.25、12.5、25、50、100ng/ml)のESHを三連調製し、ESHについて0.78ng/mlの定量限界(LOQ)を得た。これは、L−Z Wangらが見出したものと同様であった。
15 ESHの検出限界(LOD)は9pg/mLであった。ESHの保持時間は1.5分であった。良好な対称ピークが、ESH標準試料および分析された反応試料の両方で得られた(
図17〜
図19)。
【0158】
M.smegmatisの粗酵素調製物を用いた基質のエルゴチオネインへの生体内変換
20mMのTris HCl(pH=7.4)、20mMのNaCl、0.2MmのFeSO
4・7H
2O、0.5mMのメルカプトエタノール、83μlの粗酵素、および50mMの(1)S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルフィド(15)、(2)S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルホキシド(II)、(3)S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルホン(III)または(4)対照(粗酵素のみ基質なし)のいずれかを含む100μlの反応物(1〜4)3セット。粗酵素反応物を37℃で1日間インキュベートした。混合物を90℃で2分間加熱することによって反応を停止させ、続いて凍結乾燥し、その後LC緩衝液中で再構築してからLC/MSによる分析を行った(
図20)。
【0159】
PLPによって触媒されるC−S結合の非酵素的切断
20mMのTris HCl(pH=7.4)、ならびに50mMの(1)S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルフィド(15)およびPLP、(2)S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルホキシド(II)およびPLP、または(3)S−(β−アミノ−β−カルボキシエチル)エルゴチオネインスルホン(III)およびPLPのいずれかを含む100μlの反応物(1〜3)3セット。非酵素反応物を37℃で1日間インキュベートし、続いて凍結乾燥し、その後LC緩衝液中で再構築してからLC/MSによる分析を行った(
図2および
図3)。
【0160】
5.同位体標識
ヘルシニン−d
3(7)は、市販のL−ヒスチジンから出発する2段階反応で合成した(スキーム2)。第1段階は、ホルムアルデヒド水溶液およびトリアセトキシ水素化ホウ素ナトリウムを使用してN,N−ジメチルヒスチジン(6)を得る還元的アミノ化を含んだ。第2段階は、塩基性条件下でd
3ヨウ化メチルを使用して粗N,N−ジメチルヒスチジン(6)を四級化してヘルシニン−d
3(7)を得ることを含んだ。
【0161】
ESH−d
3(10)は、メルカプトヒスチジン(8)に由来するS−tert−ブチル保護2−メルカプト−ヒスチジン(9)から出発して連続した2つの反応工程で合成した。
21 d
3ヨウ化メチルを用いた選択的N−メチル化、続いて2−メルカプトプロピオン酸(tert−ブチルスカベンジャー)のHCl溶液を用いたS−tert−ブチル脱保護を行うことによりESH−d
3(10)を得た。
【0162】
【化44】
【0163】
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