特許 6490133 官能化核酸の合成のための方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】6490133

(24)【登録日】2019年3月8日

(45)【発行日】2019年3月27日

(54)【発明の名称】官能化核酸の合成のための方法

(51)【国際特許分類】

   C07H 21/04 20060101AFI20190318BHJP

   A61K 31/7125 20060101ALN20190318BHJP

【ＦＩ】

   C07H21/04 A

   !A61K31/7125

【請求項の数】20

【全頁数】73

(21)【出願番号】特願2017-74528(P2017-74528)

(22)【出願日】2017年4月4日

(62)【分割の表示】特願2014-521681(P2014-521681)の分割

【原出願日】2012年7月13日

(65)【公開番号】特開2017-141272(P2017-141272A)

(43)【公開日】2017年8月17日

【審査請求日】2017年5月2日

(31)【優先権主張番号】61/509,526

(32)【優先日】2011年7月19日

(33)【優先権主張国】US

(73)【特許権者】

【識別番号】516212924

【氏名又は名称】ウェイブ ライフ サイエンシズ リミテッド

【氏名又は名称原語表記】ＷＡＶＥ ＬＩＦＥ ＳＣＩＥＮＣＥＳ ＬＴＤ．

(74)【代理人】

【識別番号】100116850

【弁理士】

【氏名又は名称】廣瀬 隆行

(74)【代理人】

【識別番号】100165847

【弁理士】

【氏名又は名称】関 大祐

(72)【発明者】

【氏名】ヴァーダイン，グレゴリー，エル

(72)【発明者】

【氏名】ミーナ

(72)【発明者】

【氏名】イワノト，ナオキ

(72)【発明者】

【氏名】バトラー，デビッド，チャールズ ドネル

【審査官】 三上 晶子

(56)【参考文献】

【文献】 国際公開第２０１１／００５７６１（ＷＯ，Ａ１）

【文献】 米国特許第０３４８４４７３（ＵＳ，Ａ）

【文献】 特表２００２−５３３０８７（ＪＰ，Ａ）

【文献】 Tetrahedron Letters，１９９５年，Vol.36, No.5，pp.703-706

【文献】 Journal of Medicinal Chemistry，１９６４年，Vol.7, No.5，pp.671-673

【文献】 Applied Spectroscopy，１９６６年，Vol.20, No.2，pp.73-79

【文献】 Chemical & Pharmaceutical Bulletin，１９６４年，Vol.12, No.11，pp.1271-1276

(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）

Ｃ０７Ｈ １／００− ９９／００

Ａ６１Ｋ ３１／３３− ３３／４４

ＣＡｐｌｕｓ／ＲＥＧＩＳＴＲＹ（ＳＴＮ）

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの製造方法であって、
ｉ）構造ＩａのＨ−ホスホネートをシリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）前記シリルオキシホスホネートを構造ＩＩａのチオスルホネート試薬と反応させて、構造ＩＩＩａのオリゴヌクレオチドをもたらすステップと、を含み、
構造Ｉａの前記Ｈ−ホスホネートは、次の構造：

【化1】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、又はカルバメートであり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＩａの前記チオスルホネート試薬は、次の構造：

【化2】

を有し、式中、
Ｘは、アルキル、シクロアルキル、またはヘテロアリールであり、
Ｒは、Ｒ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−アルケニレン−Ｓ−、−アルキレン−Ｓ−、−アルキレン−アリール−アルキレン−Ｓ−、−アルキレン−アリール−ＣＯ−Ｓ−、または−アルキレン−アリール−アルキレン−ＣＯ−Ｓ−から選択され、
Ｒ^２は、−Ｓ−アルキレン−ヘテロシクロ、−Ｓ−アルケニレン−ヘテロシクロ、−Ｓ−アミノアルキル、または−Ｓ−アルキレン−Ｎ（アルキル）_４から選択され、
構造ＩＩＩａの前記オリゴヌクレオチドは、次の構造：

【化3】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、Ｒ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−アルケニレン−Ｓ−、−アルキレン−Ｓ−、−アルキレン−アリール−アルキレン−Ｓ−、−アルキレン−アリール−ＣＯ−Ｓ−、または−アルキレン−アリール−アルキレン−ＣＯ−Ｓ−から選択され、
Ｒ^２は、−Ｓ−アルキレン−ヘテロシクロ、−Ｓ−アルケニレン−ヘテロシクロ、−Ｓ−アミノアルキル、または−Ｓ−アルキレン−Ｎ（アルキル）_４から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、又はカルバメートであり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００である、方法。

【請求項2】

請求項１に記載の方法であって，Ｒ^１は、−アルケニレン−Ｓ−又は−アルキレン−Ｓ−から選択される基である方法。

【請求項3】

請求項１に記載の方法であって，Ｒ^２は、−Ｓ−アルキレン−ヘテロシクロである方法。

【請求項4】

請求項１に記載の方法であって，Ｒ^１は、

【化4】

から選択されるいずれかの基である方法。

【請求項5】

請求項１に記載の方法であって，Ｒ^２は、

【化5】

から選択されるいずれかの基である方法。

【請求項6】

請求項１〜５のいずれかに記載の方法であって，Ｘはアルキルである，方法。

【請求項7】

請求項６に記載の方法であって，Ｘはメチルである，方法。

【請求項8】

請求項１に記載の方法であって，チオスルホネート試薬は

【化6】

（式中，ＭＴＳはＣＨ_３−Ｓ（Ｏ）_２−Ｓ−を示す。）である方法。

【請求項9】

請求項１に記載の方法であって，チオスルホネート試薬は

【化7】

（式中，ＭＴＳはＣＨ_３−Ｓ（Ｏ）_２−Ｓ−を示す。）である方法。

【請求項10】

請求項１に記載の方法であって，チオスルホネート試薬は

【化8】

（式中，ＭＴＳはＣＨ_３−Ｓ（Ｏ）_２−Ｓ−を示す。）である方法。

【請求項11】

構造ＩＩａで示されるチオスルホネート試薬。

【化9】

式中、
Ｘは、アルキル、シクロアルキル、またはヘテロアリールであり、
Ｒは、Ｒ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−アルケニレン−Ｓ−、−アルキレン−Ｓ−、−アルキレン−アリール−アルキレン−Ｓ−、−アルキレン−アリール−ＣＯ−Ｓ−、または−アルキレン−アリール−アルキレン−ＣＯ−Ｓ−から選択され、
Ｒ^２は、−Ｓ−アルキレン−ヘテロシクロ、−Ｓ−アルケニレン−ヘテロシクロ、−Ｓ−アミノアルキル、または−Ｓ−アルキレン−Ｎ（アルキル）_４から選択される。

【請求項12】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，Ｒ^１は、−アルケニレン−Ｓ−又は−アルキレン−Ｓ−から選択される基であるチオスルホネート試薬。

【請求項13】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，Ｒ^２は、−Ｓ−アルキレン−ヘテロシクロであるチオスルホネート試薬。

【請求項14】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，Ｒ^１は、

【化10】

から選択されるいずれかの基であるチオスルホネート試薬。

【請求項15】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，Ｒ^２は、

【化11】

から選択されるいずれかの基であるチオスルホネート試薬。

【請求項16】

請求項１１〜１５のいずれかに記載のチオスルホネート試薬であって，Ｘはアルキルである，チオスルホネート試薬。

【請求項17】

請求項１６に記載のチオスルホネート試薬であって，Ｘはメチルである，チオスルホネート試薬。

【請求項18】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，前記チオスルホネート試薬は

【化12】

（式中，ＭＴＳはＣＨ_３−Ｓ（Ｏ）_２−Ｓ−を示す。）であるチオスルホネート試薬。

【請求項19】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，前記チオスルホネート試薬は

【化13】

（式中，ＭＴＳはＣＨ_３−Ｓ（Ｏ）_２−Ｓ−を示す。）であるチオスルホネート試薬。

【請求項20】

請求項１１に記載のチオスルホネート試薬であって，前記チオスルホネート試薬は

【化14】

（式中，ＭＴＳはＣＨ_３−Ｓ（Ｏ）_２−Ｓ−を示す。）であるチオスルホネート試薬。

【発明の詳細な説明】

【背景技術】

【0001】

本出願は、２０１１年７月１９日に出願された米国仮特許出願第６１／５０９，５２６号に対する優先権を主張し、その全体が、参照により本明細書に組み込まれる。

【0002】

オリゴヌクレオチドは、治療的、予防的、研究的、およびナノ材料用途において有用である。治療法のためのＤＮＡまたはＲＮＡの天然の配列の使用は、細胞外および細胞内ヌクレアーゼに対するそれらの不安定性、低い細胞透過性および分布のために、制限される。さらに、インビトロ研究は、結合親和性、相補的ＲＮＡへの配列特異的結合（Ｃｏｓｓｔｉｃｋ ａｎｄ Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，１９８５、ＬａＰｌａｎｃｈｅ ｅｔ ａｌ．，１９８６、Ｌａｔｉｍｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９８９、Ｈａｃｉａ ｅｔ ａｌ．，１９９４、Ｍｅｓｍａｅｋｅｒ ｅｔ ａｌ．，１９９５）、ヌクレアーゼに対する安定性等のアンチセンスヌクレオチドの特性が、リン原子の構造によって影響を受けることを示している。したがって、多数のインビトロおよびインビボ用途のために、偏在するヌクレアーゼに対する安定性をもたらし、相補的ＲＮＡに対する結合親和性を増加させ、細胞透過性および生体分布を増加させる、修飾オリゴヌクレオチドに対する必要性が存在する。

【発明の概要】

【0003】

新規な官能化核酸および核酸プロドラッグの合成のための方法を、本明細書に記載する。いくつかの実施形態において、核酸は、キラルなリン部分を含む。

【0004】

一実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、
ｉ）構造ＩａのＨ−ホスホネートをシリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）シリルオキシホスホネートを構造ＩＩａのチオスルホネート試薬と反応させて、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、を含み、
構造ＩａのＨ−ホスホネートは、次の構造：

【化1】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＩａのチオスルホネート試薬は、次の構造：

【化2】

を有し、
式中、
Ｘは、アルキル、シクロアルキル、またはヘテロアリールであり、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルは、次の構造：

【化3】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００である、プロセスを提供する。

【0005】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、ＷはＯである、プロセスを提供する。

【0006】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、Ｒ^１は、

【化4】

から選択され、
Ｒ^２は、

【化5】

から選択される、プロセスを提供する。

【0007】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、シリル化試薬は、
１，１，３，３−テトラメチル−１，３−ジフェニルジシラザン、
１，３−ジメチル−１，１，３，３−テトラフェニルジシラザン、
１−（トリメチルシリル）イミダゾール、
Ｎ−トリメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
ビス（ジメチルアミノ）ジメチルシラン、
ブロモトリメチルシラン、
クロロジメチル（ペンタフルオロフェニル）シラン、
クロロトリエチルシラン、
クロロトリイソプロピルシラン、
クロロトリメチルシラン、
ジクロロジメチルシラン、
ヘキサメチルジシラザン、
Ｎ，Ｎ′−ビス（トリメチルシリル）尿素、
Ｎ，Ｎ−ビス（トリメチルシリル）メチルアミン、
Ｎ，Ｎ−ジメチルトリメチルシリルアミン、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）アセトアミド、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）カルバメート、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
トリメチルシリルトリフラート、
トリエチルシリルトリフラート、
トリイソプロピルシリルトリフラート、または
ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルトリフラートから選択される、プロセスを提供する。

【0008】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、トリメチルシリルトリフラート、クロロトリメチルシラン、または１−（トリメチルシリル）イミダゾールから選択される、プロセスを提供する。

【0009】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミドから選択される、プロセスを提供する。

【0010】

別の実施形態は、Ｈ−ホスホネートが、固相に共有結合される、プロセスを提供する。

【0011】

一実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含む、ホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、
ｉ）構造Ｉｂの非立体無作為性リン酸連結を含むＨ−ホスホネートを、シリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）シリルオキシホスホネートを、構造ＩＩｂのチオスルホネート試薬と反応させて、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、を含み、
構造Ｉｂの非立体無作為性リン酸連結を含むＨ−ホスホネートは、次の構造：

【化6】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＩｂのチオスルホネート試薬は、次の構造：

【化7】

を有し、
式中、
Ｘは、アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むキラルホスホロチオトリエステルは、次の構造：

【化8】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００である、プロセスを提供する。

【0012】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、ＷはＯである、プロセスを提供する。

【0013】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、Ｒ^１は、

【化9】

から選択され、
Ｒ^２は、

【化10】

から選択される、プロセスを提供する。

【0014】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、シリル化試薬は、
１，１，３，３−テトラメチル−１，３−ジフェニルジシラザン、
１，３−ジメチル−１，１，３，３−テトラフェニルジシラザン、
１−（トリメチルシリル）イミダゾール、
Ｎ−トリメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
ビス（ジメチルアミノ）ジメチルシラン、
ブロモトリメチルシラン、
クロロジメチル（ペンタフルオロフェニル）シラン、
クロロトリエチルシラン、
クロロトリイソプロピルシラン、
クロロトリメチルシラン、
ジクロロジメチルシラン、
ヘキサメチルジシラザン、
Ｎ，Ｎ′−ビス（トリメチルシリル）尿素、
Ｎ，Ｎ−ビス（トリメチルシリル）メチルアミン、
Ｎ，Ｎ−ジメチルトリメチルシリルアミン、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）アセトアミド、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）カルバメート、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
トリメチルシリルトリフラート、
トリエチルシリルトリフラート、
トリイソプロピルシリルトリフラート、または
ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルトリフラートから選択される、プロセスを提供する。

【0015】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、トリメチルシリルトリフラート、クロロトリメチルシラン、または１−（トリメチルシリル）イミダゾールから選択される、プロセスを提供する。

【0016】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミドから選択される、プロセスを提供する。

【0017】

別の実施形態は、Ｈ−ホスホネートが、固相に共有結合される、プロセスを提供する。

【0018】

一実施形態は、構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、
ｉ）構造ＩｃのＨ−ホスホネートを、シリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）シリルオキシホスホネートを、構造ＩＶｃのビス（チオスルホネート）試薬と反応させて、構造Ｖｃのチオスルホネート基を含むホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、
ｉｉｉ）構造Ｖｃのチオスルホネート基を含むホスホロチオトリエステルを、構造ＶＩｃの求核試薬と反応させて、構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、を含み、
構造ＩｃのＨ−ホスホネートは、次の構造：

【化11】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＶｃのビス（チオスルホネート）試薬は、次の構造：

【化12】

を有し、
式中、
Ｘは、アルキレン、アルケニレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｒ^６は、独立して、アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、
構造ＶＩｃの求核試薬は、次の構造：
Ｒ^７−ＳＨを有し、式中、Ｒ^７は、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロシクロ、アミノアルキル、または（ヘテロシクロ）アルキルから選択され、
構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルは、次の構造：

【化13】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、Ｒ^７−Ｓ−Ｓ−Ｘ−であり、
Ｒ^７は、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロシクロ、アミノアルキル、または（ヘテロシクロ）アルキルであり、
Ｘは、アルキレン、アルケニレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩｃのＨ−ホスホネートのリン酸連結は、ホスホロチオトリエステルが構造Ｖｃのチオスルホネート基を含み、構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルが、任意で、非立体無作為性リン酸連結を含んでもよい、プロセスを提供する。

【0019】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂのホスホロチオトリエステルが、非立体無作為性リン酸連結を含み、構造ＩｃのＨ−ホスホネートが、非立体無作為性リン酸連結を含み、Ｗが、独立して、Ｏ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択される、プロセスを提供する。別の実施形態は、ＷがＯであるプロセスを提供する。

【0020】

別の実施形態は、Ｒ^６がメチルであるプロセスを提供する。

【0021】

別の実施形態は、構造ＩＶｃのビス（チオスルホネート）試薬が、

【化14】

から選択される、プロセスを提供する。

【0022】

別の実施形態は、構造ＶＩｃの求核試薬が、次の構造：

【化15】

を有する、プロセスを提供する。

【0023】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、シリル化試薬が、
１，１，３，３−テトラメチル−１，３−ジフェニルジシラザン、
１，３−ジメチル−１，１，３，３−テトラフェニルジシラザン、
１−（トリメチルシリル）イミダゾール、
Ｎ−トリメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
ビス（ジメチルアミノ）ジメチルシラン、
ブロモトリメチルシラン、
クロロジメチル（ペンタフルオロフェニル）シラン、
クロロトリエチルシラン、
クロロトリイソプロピルシラン、
クロロトリメチルシラン、
ジクロロジメチルシラン、
ヘキサメチルジシラザン、
Ｎ，Ｎ′−ビス（トリメチルシリル）尿素、
Ｎ，Ｎ−ビス（トリメチルシリル）メチルアミン、
Ｎ，Ｎ−ジメチルトリメチルシリルアミン、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）アセトアミド、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）カルバメート、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
トリメチルシリルトリフラート、
トリエチルシリルトリフラート、
トリイソプロピルシリルトリフラート、または
ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルトリフラートから選択される、プロセスを提供する。

【0024】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、トリメチルシリルトリフラート、クロロトリメチルシラン、または１−（トリメチルシリル）イミダゾールから選択される、プロセスを提供する。

【0025】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミドから選択される、プロセスを提供する。

【0026】

別の実施形態は、Ｈ−ホスホネートが固相に共有結合される、プロセスを提供する。
参照による組み込み

【0027】

本明細書に記載される全ての出版物および特許出願は、各個々の出版物または特許出願が、具体的かつ個別に参照によって組み込まれることが示されるのと同程度に、参照により本明細書に組み込まれる。

【図面の簡単な説明】

【0028】

本発明の新規な特徴は、添付の特許請求の範囲に具体的に記載される。本発明の特徴および利点のより良好な理解は、本発明の原理を利用した例示的な実施形態について記載する以下の発明を実施するための形態、および添付の図面を参照することによって得られるであろう。

【0029】

【図1】実施例６に記載されるＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｓの^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを提供する。

【図2】実施例６に記載される、ＢＳＴＦＡを添加した後のＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｓの^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを提供する。

【図3】実施例６に記載される、ＢＳＴＦＡ、ＴＥＡ、およびＭＴＳを添加した後のＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｓの^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを提供する。

【図4】実施例６に記載されるＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｒの^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを提供する。

【図5】実施例６に記載されるＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｒの^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを提供する。

【図6】実施例６に記載される、ＢＳＴＦＡ、ＴＥＡ、およびＭＴＳを添加した後のＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｒの^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを提供する。

【発明を実施するための形態】

【0030】

別段の記述がない限り、本明細書および特許請求の範囲を含む、本願で使用される以下の用語は、以下に提供される定義を有する。本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される際、単数形「１つの（ａ）」、「１つのａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈によりそうでないことが明確に示されない限り、複数の指示対象を含むことに留意されたい。別段の指定がない限り、質量分析、ＮＭＲ，ＨＰＬＣ，タンパク質化学、生化学、組み換えＤＮＡ技術、および薬理学の従来的な方法を利用する。本願において、「または」または「および」の使用は、別段の記述がない限り、「および／または」を意味する。さらに、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに「含む（ｉｎｃｌｕｄｅ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」、および「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」といった他の形態の使用は、限定するものではない。
特定の化学用語

【0031】

別段に示されない限り、「アルキル」、「アミン」、「アリール」等であるがこれらに限定されない、一般的な化学用語の使用は、非置換である。

【0032】

本明細書で使用される際、Ｃ_１−Ｃ_ｘは、Ｃ_１−Ｃ_２、Ｃ_１−Ｃ_３、．．．Ｃ_１−Ｃ_ｘを含む。単なる例として、「Ｃ_１−Ｃ_４」と指定された基は、その部分に１〜４個の炭素原子が存在すること、すなわち、１個の炭素原子、２個の炭素原子、３個の炭素原子、または４個の炭素原子、ならびにＣ_１−Ｃ_２およびＣ_１−Ｃ_３の範囲を含む基を示す。したがって、単なる例として、「Ｃ_１−Ｃ_４アルキル」は、アルキル基中に１〜４個の炭素原子が存在することを示し、すなわち、アルキル基は、メチル、エチル、プロピル、イソプロピル、ｎ−ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、およびｔ−ブチルの中から選択される。本明細書中に現れる場合は常に、「１〜１０」等の数値範囲は、与えられた範囲内の各整数を指し、例えば、「１〜１０個の炭素原子」は、その基が、１個の炭素原子、２個の炭素原子、３個の炭素原子、４個の炭素原子、５個の炭素原子、６個の炭素原子、７個の炭素原子、８個の炭素原子、９個の炭素原子、または１０個の炭素原子を有し得ることを意味する。

【0033】

本明細書に使用される「ヘテロ原子」または「ヘテロ」という用語は、単独または組み合わせで、炭素または水素以外の原子を指す。ヘテロ原子は、独立して、酸素、窒素、硫黄、リン、シリコン、セレン、およびスズの中から選択され得るが、これらの原子に限定されない。２つ以上のヘテロ原子が存在する実施形態において、２つ以上のヘテロ原子は、互いに同じであってもよく、または２つ以上のヘテロ原子のうちのいくつかもしくは全てが、それぞれ、他と異なるものであってもよい。

【0034】

本明細書に使用される「アルキル」という用語は、単独または組み合わせで、１〜約１０個の炭素原子、または１〜６個の炭素原子を有する、直鎖または分枝鎖の飽和炭化水素モノラジカルを指す。例としては、メチル、エチル、ｎ−プロピル、イソプロピル、２−メチル−１−プロピル、２−メチル−２−プロピル、２−メチル−１−ブチル、３−メチル−１−ブチル、２−メチル−３−ブチル、２，２−ジメチル−１−プロピル、２−メチル−１−ペンチル、３−メチル−１−ペンチル、４−メチル−１−ペンチル、２−メチル−２−ペンチル、３−メチル−２−ペンチル、４−メチル−２−ペンチル、２，２−ジメチル−１−ブチル、３，３−ジメチル−１−ブチル、２−エチル−１−ブチル、ｎ−ブチル、イソブチル、ｓｅｃ−ブチル、ｔ−ブチル、ｎ−ペンチル、イソペンチル、ネオペンチル、ｔｅｒｔ−アミルおよびへキシル、ならびにヘプチル、オクチル等のより長いアルキル基が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書中に現れる場合は常に、「Ｃ_１−Ｃ_６アルキル」または「Ｃ_１−６アルキル」等の数値範囲は、アルキル基が、１個の炭素原子、２個の炭素原子、３個の炭素原子、４個の炭素原子、５個の炭素原子、または６個の炭素原子からなり得ることを意味する。一実施形態において、「アルキル」は、置換される。別段に示されない限り、「アルキル」は、非置換である。

【0035】

本明細書に使用される「アルケニル」という用語は、単独または組み合わせで、１つ以上の炭素−炭素二重結合を有し、２〜約１０個の炭素原子または２〜約６個の炭素原子を有する、直鎖または分枝鎖の炭化水素モノラジカルを指す。この基は、二重結合（複数可）に関して、シスまたはトランスのいずれかの配座であり得、両方の異性体を含むと理解されるべきである。例としては、エテニル（−ＣＨ＝ＣＨ_２）、１−プロペニル（−ＣＨ_２ＣＨ＝ＣＨ_２）、イソプロペニル［−Ｃ（ＣＨ_３）＝ＣＨ_２］、ブテニル、１，３−ブタジエニル等が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書中に現れる場合は常に、「Ｃ_２−Ｃ_６アルケニル」または「Ｃ_２−６アルケニル」等の数値範囲は、アルケニル基が、２個の炭素原子、３個の炭素原子、４個の炭素原子、５個の炭素原子、または６個の炭素原子からなり得ることを意味する。一実施形態において、「アルケニル」は、置換される。別段の指定がない限り、「アルケニル」は、非置換である。

【0036】

本明細書に使用される「アルキニル」という用語は、単独または組み合わせで、１つ以上の炭素−炭素三重結合を有し、２〜約１０個の炭素原子または２〜約６個の炭素原子を有する、直鎖または分枝鎖の炭化水素モノラジカルを指す。例としては、エチニル、２−プロピニル、２−ブチニル、１，３−ブタジイニル等が挙げられるが、これらに限定されない。本明細書中に現れる場合は常に、「Ｃ_２−Ｃ_６アルキニル」または「Ｃ_２−６アルキニル」等の数値範囲は、アルキル基が、２個の炭素原子、３個の炭素原子、４個の炭素原子、５個の炭素原子、または６個の炭素原子からなり得ることを意味する。一実施形態において、「アルキニル」は、置換される。別段の指定がない限り、「アルキニル」は、非置換である。

【0037】

本明細書に使用される「ヘテロアルキル」、「ヘテロアルケニル」、および「ヘテロアルキニル」という用語は、単独または組み合わせで、骨格鎖炭素原子（および必要に応じて任意の結合した水素原子）のうちの１つ以上が、それぞれ独立して、ヘテロ原子（すなわち、酸素、窒素、硫黄、シリコン、リン、スズ等、もしくはそれらの組み合わせであるが、これらに限定されない、炭素以外の原子）、または−Ｏ−Ｏ−、−Ｓ−Ｓ−、−Ｏ−Ｓ−、−Ｓ−Ｏ−、＝Ｎ−Ｎ＝、−Ｎ＝Ｎ−、−Ｎ＝Ｎ−ＮＨ−、−Ｐ（Ｏ）_２−、−Ｏ−Ｐ（Ｏ）_２−、−Ｐ（Ｏ）_２−Ｏ−、−Ｓ（Ｏ）−、−Ｓ（Ｏ）_２−、−ＳｎＨ_２−等であるがこれらに限定されないヘテロ原子基で、置き換えられた、それぞれ、上に記載されるアルキル、アルケニル、およびアルキニル構造を指す。

【0038】

本明細書で使用される「ハロアルキル」、「ハロアルケニル」、および「ハロアルキニル」という用語は、単独または組み合わせで、１つ以上の水素原子が、フッ素、塩素、臭素、またはヨウ素原子、またはそれらの組み合わせで置き換えられた、それぞれ、上に定義されるアルキル、アルケニル、およびアルキニル基を指す。いくつかの実施形態では、２つ以上の水素原子は、互いに同じであるハロゲン原子で置き換えられてもよく（例えば、ジフルオロメチル）、他の実施形態では、２つ以上の水素原子は、互いに全てが同じではないハロゲン原子で置き換えられてもよい（例えば、１−クロロ−１−フルオロ−１−ヨードエチル）。ハロアルキル基の非限定的な例は、フルオロメチル、クロロメチル、およびブロモエチルである。ハロアルケニル基の非限定的な例は、ブロモエテニルである。ハロアルキニル基の非限定的な例は、クロロエチニルである。

【0039】

本明細書で使用される「炭素鎖」という用語は、単独または組み合わせで、直鎖、環状、またはそれらの任意の組み合わせである、任意のアルキル、アルケニル、アルキニル、ヘテロアルキル、ヘテロアルケニル、またはヘテロアルキニル基を指す。鎖が、リンカーの一部であり、リンカーが、主骨格の一部として１つ以上の環を含む場合、鎖長を計算する目的で、「鎖」は、所与の環の底部または頂部を構成し、その両方ではない炭素原子のみを含み、環（複数可）の頂部および底部の長さが同じではない場合、より短い距離を、鎖長の判定に使用するものとする。鎖が、骨格の一部としてヘテロ原子を含む場合、それらの原子は、炭素鎖長の一部として計算されない。

【0040】

本明細書で使用される「シクロアルキル」という用語は、単独または組み合わせで、３〜約１５個または３〜約１０個の環炭素原子を含む、飽和炭化水素モノラジカル環を指すが、追加の非環炭素原子を置換基として含んでもよい（例えば、メチルシクロプロピル）。本明細書中に現れる場合は常に、「Ｃ_３−Ｃ_６シクロアルキル」または「Ｃ_３−６シクロアルキル」等の数値範囲は、シクロアルキル基が、３個の炭素原子、４個の炭素原子、５個の炭素原子、または６個の炭素原子からなり得る、すなわち、シクロプロピル、シクロブチル、シクロペンチル、またはシクロヘプチルであることを意味するが、本定義は、数値範囲が指定されない「シクロアルキル」という用語の存在もまた含む。この用語は、縮合、非縮合、架橋、およびスピロラジカルを含む。縮合シクロアルキルは、２〜４個の縮合環を含み得、ここで、結合環はシクロアルキル環であり、他の個々の環は、脂環式、複素環式、芳香族、複素芳香族、またはこれらの任意の組み合わせであり得る。例としては、シクロプロピル、シクロペンチル、シクロへキシル、デカリニル（ｄｅｃａｌｉｎｙｌ）、ならびにビシクロ［２．２．１］ヘプチルおよびアダマンチル環系が挙げられるが、これらに限定されない。例示的な例には、次の部分：

【化16】

等が挙げられるが、これらに限定されない。
一実施形態において、「シクロアルキル」は、置換される。別段の指定がない限り、「シクロアルキル」は、非置換である。

【0041】

本明細書に使用される「非芳香族ヘテロシクリル」および「ヘテロアシクリル」という用語は、単独または組み合わせで、３〜約２０個の環原子を含む、飽和、部分不飽和、または完全不飽和の非芳香族環モノラジカルを指し、環原子のうちの１つ以上は、独立して、酸素、窒素、硫黄、リン、シリコン、セレン、およびスズの中から選択されるが、これらに限定されない、炭素以外の原子である。環に２つ以上のヘテロ原子が存在する実施形態においては、２つ以上のヘテロ原子は、互いに同じであってもよく、または２つ以上のヘテロ原子のうちのいくつかまたは全てが、それぞれ、他のものと異なってもよい。この用語は、縮合、非縮合、架橋、およびスピロラジカルを含む。縮合非芳香族複素環式ラジカルは、２〜４個の縮合環を含み得、ここで、結合環は非芳香族複素環であり、他の個々の環は、脂環式、複素環式、芳香族、複素芳香族、またはこれらの任意の組み合わせであり得る。縮合環系は、単結合または二重結合にわたって、ならびに、炭素−炭素、炭素−ヘテロ原子、またはヘテロ原子−ヘテロ原子の結合にわたって、縮合され得る。この用語はまた、３〜約１２個の骨格環原子を有するラジカル、ならびに、３〜約１０個の骨格環原子を有するものを含む。非芳香族複素環式サブユニットのその親分子への結合は、ヘテロ原子または炭素原子を介してもよい。同様に、追加の置換は、ヘテロ原子または炭素原子を介してもよい。非限定的な例として、イミダゾリジン非芳香族複素環は、親分子に、そのＮ原子（イミダゾリジン−１−イルもしくはイミダゾリジン−３−イル）またはその炭素原子のうちの任意のもの（イミダゾリジン−２−イル、イミダゾリジン−４−イル、もしくはイミダゾリジン−５−イル）のいずれかを介して、結合することができる。ある特定の実施形態において、非芳香族複素環は、例えば、オキソ−およびチオ−含有基等、１つ以上のカルボニルまたはチオカルボニル基を含む。例としては、ピロリジニル、テトラヒドロフラニル、ジヒドロフラニル、テトラヒドロチエニル、テトラヒドロピラニル、ジヒドロピラニル、テトラヒドロチオピラニル、ピペリジノ、モルホリノ、チオモルホリノ、チオキサニル、ピペラジニル、アゼチジニル、オキセタニル、チエタニル、モホピペリジニル、オキセパニル、チエパニル、オキサゼピニル、ジアゼピニル、チアゼピニル、１，２，３，６−テトラヒドロピリジニル、２−ピロリニル、３−ピロリニル、インドリニル、２Ｈ−ピラニル、４Ｈ−ピラニル、ジオキサニル、１，３−ジオキソラニル、ピラゾリニル、ジチアニル、ジチオラニル、ジヒドロピラニル、ジヒドロチエニル、ジヒドロフラニル、ピラゾリジニル、イミダゾリニル、イミダゾリジニル、３−アザビシクロ［３．１．０］ヘキサニル、３−アザビシクロ［４．１．０］ヘプタニル、３Ｈ−インドリル、およびキノリジニルが挙げられるが、これらに限定されない。非芳香族複素環とも称されるヘテロシクロアルキル基の例示的な例には、

【化17】

等が挙げられる。

【0042】

これらの用語はまた、炭水化物の全ての環形態を含み、単糖、二糖、およびオリゴ糖が含まれるが、これらに限定されない。一実施形態において、「非芳香族ヘテロシクリル」または「ヘテロアリシクリル」は、置換される。別段の指定がない限り、「非芳香族ヘテロシクリル」または「ヘテロアリシクリル」は、非置換である。

【0043】

本明細書に使用される「アリール」という用語は、単独または組み合わせで、６〜約２０個の環炭素原子の芳香族炭化水素ラジカルを指し、縮合および非縮合アリール環を含む。縮合アリール環ラジカルは、２〜４個の縮合環を含み、ここで、結合環はアリール環であり、他の個々の環は、脂環式、複素環式、芳香族、複素芳香族、またはこれらの任意の組み合わせであり得る。さらに、アリールという用語には、６〜約１２個の環炭素原子を含む縮合および非縮合環、ならびに６〜約１０個の環炭素原子を含むものが含まれる。単環アリール基の非限定的な例には、フェニルが含まれ、縮合環アリール基には、ナフチル、フェナントレニル、アントラセニル、アズレニルが含まれ、非縮合ビアリール基には、ビフェニルが含まれる。一実施形態において、「アリール」は、置換される。別段の指定がない限り、「アリール」は、非置換である。

【0044】

本明細書に使用される「ヘテロアリール」という用語は、単独または組み合わせで、約５〜約２０個の骨格環原子を含む芳香族モノラジカルを指し、環原子のうちの１つ以上は、独立して、酸素、窒素、硫黄、リン、シリコン、セレン、およびスズの中から選択されるが、これらの原子に限定されないヘテロ原子であり、ただし、前記基の環が、２つの隣接するＯまたはＳ原子を含まないことを条件とする。環に２つ以上のヘテロ原子が存在する実施形態においては、２つ以上のヘテロ原子は、互いに同じであってもよく、または２つ以上のヘテロ原子のうちのいくつかまたは全てが、それぞれ、他のものと異なってもよい。ヘテロアリールという用語は、少なくとも１つのヘテロ原子を有する縮合および非縮合ヘテロアリールラジカルを含む。ヘテロアリールという用語はまた、５〜約１２個の骨格環原子を有する縮合および非縮合ヘテロアリール、ならびに５〜約１０個の骨格環原子を有するものを含む。ヘテロアリール基への結合は、炭素原子またはヘテロ原子を介してもよい。したがって、非限定的な例として、イミダゾール基は、その炭素原子のうちの任意のもの（イミダゾール−２−イル、イミダゾール−４−イル、もしくはイミダゾール−５−イル）、またはその窒素原子（イミダゾール−１−イルもしくはイミダゾール−３−イル）を介して親分子に結合され得る。同様に、ヘテロアリール基は、その炭素原子のうちのいずれかもしくは全て、および／またはそのヘテロ原子のうちのいずれかもしくは全てを介して、さらに置換されてもよい。縮合ヘテロアリールラジカルは、２〜４個の縮合環を含み、ここで、結合環は複素芳香族環であり、他の個々の環は、脂環式、複素環式、芳香族、複素芳香族、またはこれらの任意の組み合わせであり得る。単環ヘテロアリール基の非限定的な例にはピリジルが挙げられ、縮合環ヘテロアリール基には、ベンズイミダゾリル、キノリニル、アクリジニルが挙げられ、非縮合ビヘテロアリール基には、ビピリジニルが挙げられる。ヘテロアリールのさらなる例には、限定されることなく、フラニル、チエニル、オキサゾリル、アクリジニル、フェナジニル、ベンズイミダゾリル、ベンゾフラニル、ベンズオキサゾリル、ベンゾチアゾリル、ベンゾチアジアゾリル、ベンゾチオフェニル、ベンゾキサジアゾリル（ｂｅｎｚｏｘａｄｉａｚｏｌｙｌ）、ベンゾトリアゾリル、イミダゾリル、インドリル、イソオキサゾリル、イソキノリニル、インドリジニル、イソチアゾリル、イソインドリルオキサジアゾリル、インダゾリル、ピリジル、ピリダジル、ピリミジル、ピラジニル、ピロリル、ピラジニル、ピラゾリル、プリニル、フタラジニル、プテリジニル、キノリニル、キナゾリニル、キノキサリニル、トリアゾリル、テトラゾリル、チアゾリル、トリアジニル、チアジアゾリル等、および例えばピリジル−Ｎ−オキシド等、それらのオキシドが挙げられる。ヘテロアリール基の例示的な例には、次の部分：

【化18】

等が挙げられる。
一実施形態において、「ヘテロアリール」は、置換される。別段の指定がない限り、「ヘテロアリール」は、非置換である。

【0045】

本明細書に使用される「ヘテロシクリル」という用語は、単独または組み合わせで、ヘテロアリシクリルおよびヘテロアリール基を集合的に指す。本明細書では、複素環中の炭素原子の数が示される場合（例えば、Ｃ_１−Ｃ_６複素環）は常に、少なくとも１つの非炭素原子（ヘテロ原子）が環に存在しなければならない。「Ｃ_１−Ｃ_６複素環」等の表記は、環の炭素原子の数のみを指し、環内の原子の総数を示すものではない。「４〜６員複素環」等の指定は、環に含まれる原子の総数を指す（すなわち、少なくとも１つの原子が炭素原子であり、少なくとも１つの原子がヘテロ原子であり、残りの２〜４個の原子が、炭素原子またはヘテロ原子のいずれかである、４、５、または６員環）。２つ以上のヘテロ原子を有する複素環については、それらの２つ以上のヘテロ原子は、互いに同じかまたは異なってもよい。非芳香族複素環式基は、環内に３個の原子のみを有する基を含むが、芳香族複素環式基は、環内に少なくとも５個の原子を有する必要がある。複素環への結合（すなわち、親分子への結合またはさらなる置換）は、ヘテロ原子または炭素原子を介してもあってもよい。一実施形態において、「ヘテロシクリル」は、置換される。別段の指定がない限り、「ヘテロシクリル」は、非置換である。

【0046】

本明細書に使用される「ハロゲン」、「ハロ」、または「ハロゲン化物」という用語は、単独または組み合わせで、フルオロ、クロロ、ブロモ、および／またはヨードを指す。

【0047】

化合物、またはそれらの薬学的に許容される塩は、１つ以上の不斉中心を含んでもよく、したがって、エナンチオマー、ジアステレオマー、および（Ｒ）−または（Ｓ）−等、絶対立体化学に関して定義することができる他の立体異性体形態をもたらし得る。本明細書に記載される化合物が、オレフィン二重結合または他の幾何学的不斉中心を含む場合、そうでないことが示されない限り、化合物は、ＺおよびＥ両方の幾何異性体（例えば、シスまたはトランス）を含むことが意図される。同様に、全ての可能性のある異性体、ならびにそれらのラセミ形態および光学的に純粋な形態、ならびに全ての互変異性体形態もまた、含まれることが意図される。

【0048】

「立体異性体」は、同じ結合によって結合された同じ原子で構成されるが、異なる３次元構造を有し、重ね合わせることができない、２つ以上の化合物間の関係を指す。「エナンチオマー」という用語は、重ね合わせることができない互いの鏡像である、２つの立体異性体を指す。本明細書に開示される化合物の種々の立体異性体、およびそれらの混合物は、本開示の範囲内であり、特に、エナンチオマーを含むことが企図される。

【0049】

「互変異性体」は、分子の１つの原子から同じ分子の別の原子へのプロトン移動が可能な化合物を指す。本明細書に提示される化合物は、互変異性体として存在してもよい。互変異性化が可能である溶液中では、互変異性体の化学均衡が存在することになる。互変異性体の正確な比率は、温度、溶媒、およびｐＨを含む、複数の因子に依存する。互変異性平衡のいくつかの例を、以下に示す。

【化19】

【0050】

本明細書に使用される「非立体無作為性リン酸連結（複数可）」という用語は、ホスホジエステル、または他の等比体積連結型であるヌクレオチド間連結中のキラルなリン原子を指す。１つを上回るヌクレオチド間リン酸連結を含む実施形態については、リンにおけるキラリティの掌性は、独立して、各リン原子で選択される。一実施形態において、本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドは、純粋なジアステレオマーである。別の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ジアステレオマー純度が９５％を上回る。別の実施形態において、オリゴヌクレオチドは、ジアステレオマー純度が９０％を上回る。

【0051】

「任意な」または「任意に」とは、続いて記載される事象または状況が、発生してもよく、または発生しなくてもよいこと、ならびに、説明には、事象または状況が発生する場合の例、およびそれが発生しない場合の例が含まれることを意味する。例えば、「任意に置換されたアルキル」とは、アルキルラジカルが、置換されてもされなくてもよいこと、ならびに説明には、置換されたアリールラジカルおよび置換を有さないアリールラジカルの両方が含まれることを意味する。
特定の核酸に関する用語

【0052】

天然核酸は、リン酸骨格を有し、人工核酸は、他の種類の骨格を含み得るが、同じ塩基を含む。

【0053】

本明細書に使用される「ヌクレオチド」という用語は、複素環塩基、糖、および１つ以上のリン酸基からなるポリヌクレオチドのモノマー単位を指す。天然に存在する塩基（グアニン（Ｇ）、アデニン（Ａ）、シトシン（Ｃ）、チミン（Ｔ）、およびウラシル（Ｕ））は、プリンまたはピリミジンの誘導体であるが、天然および非天然の塩基類似体もまた含まれることを理解されたい。天然に存在する糖は、ペントース（５炭糖）デオキシリボース（ＤＮＡを形成する）またはリボース（ＲＮＡを形成する）であるが、天然および非天然の糖類似体もまた含まれることを理解されたい。核酸は、リン酸結合を介して連結されて核酸またはポリヌクレオチドを形成するが、多数の他の連結が当該技術分野で既知である（例えば、限定されないが、ホスホロチオエート、ボラノホスフェート等）。人工核酸は、ＰＮＡ（ペプチド核酸）、ホスホチオネート、および天然核酸のリン酸骨格の他の変異体を含む。

【0054】

「ヌクレオシド」という用語は、核酸塩基または修飾核酸塩基が、糖または修飾糖に共有結合された部分を指す。

【0055】

「糖」という用語は、閉および／または開形態にある単糖を指す。糖には、リボース、デオキシリボース、ペントフラノース、およびヘキソピラノース部分が含まれるが、これらに限定されない。

【0056】

「修飾糖」という用語は、糖と置き換えることができる部分を指す。修飾糖は、糖の空間配置、電子特性、または何らかの他の物理化学特性を模倣する。

【0057】

本明細書に使用される「核酸」および「ポリヌクレオチド」という用語は、リボヌクレオチド（ＲＮＡ）またはデオキシリボヌクレオチド（ＤＮＡ）のいずれかの任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を指す。これらの用語は、分子の一次構造を指し、したがって、二本鎖および一本鎖ＤＮＡ、ならびに二本鎖および一本鎖ＲＮＡが含まれる。これらの用語は、同等物として、メチル化および／またはキャッピングしたポリヌクレオチド等であるがこれらに限定されない、ヌクレオチド類似体および修飾ポリヌクレオチドから形成されたＲＮＡまたはＤＮＡのいずれかの類似体を含む。これらの用語は、ポリまたはオリゴリボヌクレオチド（ＲＮＡ）およびポリまたはオリゴデオキシリボヌクレオチド（ＤＮＡ）；核酸塩基および／または修飾核酸塩基のＮ−グリコシドまたはＣ−グリコシドに由来するＲＮＡまたはＤＮＡ；糖および／または修飾糖に由来する核酸；ならびに、リン酸架橋および／または修飾リン原子架橋に由来する核酸を包含する。これらの用語は、核酸塩基、修飾核酸塩基、糖、修飾糖、リン酸架橋、または修飾リン原子架橋の任意の組み合わせを含む核酸を包含する。例としては、リボース部分を含む核酸、デオキシリボース部分を含む核酸、リボースおよびデオキシリボース両方の部分を含む核酸、リボースおよび修飾リボース部分を含む核酸が挙げられるがこれらに限定されない。接頭辞ポリとは、約１〜約１０，０００ヌクレオチドモノマー単位を含む核酸を指し、接頭辞オリゴとは、約１〜約２００ヌクレオチドモノマー単位を含む核酸を指す。

【0058】

「核酸塩基」という用語は、配列特異的な方式で、１つの核酸鎖を別の相補鎖に結合させる水素結合に関与する核酸の部分を指す。最も一般的な天然に存在する核酸塩基は、アデニン（Ａ）、グアニン（Ｇ）、ウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）、およびチミン（Ｔ）である。

【0059】

「修飾核酸塩基」という用語は、核酸塩基と置き換えることができる部分を指す。修飾核酸塩基は、核酸塩基の空間配置、電子特性、または何らかの他の物理化学特性を模倣し、配列特異的な方式で、１つの核酸鎖を別のものに結合させる水素結合の特性を保持する。修飾核酸塩基は、融解挙動、細胞内酵素による認識、またはオリゴヌクレオチド二本鎖の活性に影響を及ぼすことなく、５つの天然に存在する塩基（ウラシル、チミン、アデニン、シトシン、またはグアニン）の全てと対形成することができる。

【0060】

「キラル試薬」という用語は、キラルまたはエナンチオピュアであり、核酸合成の不斉誘導に使用することができる化合物を指す。

【0061】

「キラルリガンド」または「キラル補助基」という用語は、キラルまたはエナンチオピュアであり、反応の立体化学的結果を制御する部分を指す。

【0062】

縮合反応において、「縮合試薬」という用語は、反応性の低い部位を活性化し、求核試薬による攻撃をより受けやすくする試薬を指す。

【0063】

「ブロッキング基」という用語は、官能基の反応性を一時的に遮蔽する基を指す。官能基は、その後、ブロッキング基の除去によって脱遮蔽することができる。

【0064】

「部分」という用語は、分子の特定のセグメントまたは官能基を指す。化学的部分は、しばしば、分子内に埋め込まれるか、またはそこに付加された化学的実体と認識される。

【0065】

「固体支持体」という用語は、核酸の合成大量生成を可能にし、必要時に再利用することができる任意の支持体を指す。本明細書に使用される際、この用語は、核酸を合成するために実行される反応ステップに利用される媒体に不溶性であり、反応基を含むように誘導体化されるポリマーを指す。

【0066】

「連結部分」という用語は、任意で、末端ヌクレオシドと固体支持体の間、または末端ヌクレオシドと別のヌクレオシド、ヌクレオチド、もしくは核酸との間に配置される、任意の部分を指す。

【0067】

「ＤＮＡ分子」とは、一本鎖形態または二本鎖へリックスのいずれかの状態にあるデオキシリボヌクレオチド（アデニン、グアニン、チミン、もしくはシトシン）のポリマー形態を指す。この用語は、分子の一次および二次構造のみを指し、それをいずれの特定の三次形態にも限定するものではない。したがって、この用語は、とりわけ、直鎖ＤＮＡ分子（例えば、制限フラグメント）、ウイルス、プラスミド、および染色体中に見られる二本鎖ＤＮＡを含む。特定の二本鎖ＤＮＡ分子の構造について論じる際、配列は、ＤＮＡの非転写鎖（すなわち、ｍＲＮＡに相同な配列を有する鎖）に沿って、５’から３’への方向の配列のみを提供する通常の慣例に従って本明細書に記載することができる。

【0068】

本明細書に使用される際、「アンチセンス」核酸分子は、タンパク質をコードする「センス」核酸に相補的である、例えば、二本鎖ｃＤＮＡ分子のコード鎖に相補的、ｍＲＮＡ配列に相補的、または遺伝子のコード配列に相補的である、ヌクレオチド配列を含む。したがって、アンチセンス核酸分子は、センス核酸分子に水素結合することができる。

【0069】

本明細書に使用される際、「相補的ＤＮＡ」または「ｃＤＮＡ」は、ｍＲＮＡの逆転写によって合成された組み換えポリヌクレオチド、およびそこから介在配列（イントロン）が除去されたものを含む。
新規な官能化核酸および核酸プロドラッグの調製のための合成方法

【0070】

新規な官能化核酸および核酸プロドラッグの合成のための方法を本明細書に記載する。いくつかの実施形態において、核酸は、キラルなリン部分を含む。

【0071】

一実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、
ｉ）構造ＩａのＨ−ホスホネートをシリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）シリルオキシホスホネートを構造ＩＩａのチオスルホネート試薬と反応させて、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、を含み、
構造ＩａのＨ−ホスホネートは、次の構造：

【化20】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＩａのチオスルホネート試薬は、次の構造：

【化21】

を有し、
式中、
Ｘは、アルキル、シクロアルキル、またはヘテロアリールであり、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルは、次の構造：

【化22】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００である、プロセスを提供する。

【0072】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、ＷがＯである、プロセスを提供する。

【0073】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、Ｒ^１は、

【化23】

から選択され、
Ｒ^２は、

【化24】

から選択される、プロセスを提供する。

【0074】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、シリル化試薬が、
１，１，３，３−テトラメチル−１，３−ジフェニルジシラザン、
１，３−ジメチル−１，１，３，３−テトラフェニルジシラザン、
１−（トリメチルシリル）イミダゾール、
Ｎ−トリメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
ビス（ジメチルアミノ）ジメチルシラン、
ブロモトリメチルシラン、
クロロジメチル（ペンタフルオロフェニル）シラン、
クロロトリエチルシラン、
クロロトリイソプロピルシラン、
クロロトリメチルシラン、
ジクロロジメチルシラン、
ヘキサメチルジシラザン、
Ｎ，Ｎ′−ビス（トリメチルシリル）尿素、
Ｎ，Ｎ−ビス（トリメチルシリル）メチルアミン、
Ｎ，Ｎ−ジメチルトリメチルシリルアミン、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）アセトアミド、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）カルバメート、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
トリメチルシリルトリフラート、
トリエチルシリルトリフラート、
トリイソプロピルシリルトリフラート、または
ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルトリフラートから選択される、プロセスを提供する。

【0075】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、トリメチルシリルトリフラート、クロロトリメチルシラン、または１−（トリメチルシリル）イミダゾールから選択される、プロセスを提供する。

【0076】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミドから選択される、プロセスを提供する。

【0077】

別の実施形態は、Ｈ−ホスホネートが、固相に共有結合される、プロセスを提供する。

【0078】

一実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、
ｉ）構造Ｉｂの非立体無作為性リン酸連結を含むＨ−ホスホネートを、シリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）シリルオキシホスホネートを、構造ＩＩｂのチオスルホネート試薬と反応させて、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、を含み、
構造Ｉｂの非立体無作為性リン酸連結を含むＨ−ホスホネートは、次の構造：

【化25】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＩｂのチオスルホネート試薬は、次の構造：

【化26】

を有し、
式中、
Ｘは、アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むキラルホスホロチオトリエステルは、次の構造：

【化27】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、アルキル、アルケニル、アルキニル、シクロアルキル、アリール、アラルキル、ヘテロアリール、ヘテロアラルキル、またはＲ^１−Ｒ^２であり、
Ｒ^１は、−Ｓ−アルケニレン−、−Ｓ−アルキレン−、−Ｓ−アルキレン−アリール−アルキレン−、−Ｓ−ＣＯ−アリール−アルキレン−、または−Ｓ−ＣＯ−アルキレン−アリール−アルキレン−から選択され、
Ｒ^２は、ヘテロシクロ−アルキレン−Ｓ−、ヘテロシクロ−アルケニレン−Ｓ−、アミノアルキル−Ｓ−、または（アルキル）_４Ｎ−アルキレン−Ｓ−から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００である、プロセスを提供する。

【0079】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、ＷがＯである、プロセスを提供する。

【0080】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、Ｒ^１は、

【化28】

から選択され、
Ｒ^２は、

【化29】

から選択される、プロセスを提供する。

【0081】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂの非立体無作為性リン酸連結を含むホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、シリル化試薬は、
１，１，３，３−テトラメチル−１，３−ジフェニルジシラザン、
１，３−ジメチル−１，１，３，３−テトラフェニルジシラザン、
１−（トリメチルシリル）イミダゾール、
Ｎ−トリメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
ビス（ジメチルアミノ）ジメチルシラン、
ブロモトリメチルシラン、
クロロジメチル（ペンタフルオロフェニル）シラン、
クロロトリエチルシラン、
クロロトリイソプロピルシラン、
クロロトリメチルシラン、
ジクロロジメチルシラン、
ヘキサメチルジシラザン、
Ｎ，Ｎ′−ビス（トリメチルシリル）尿素、
Ｎ，Ｎ−ビス（トリメチルシリル）メチルアミン、
Ｎ，Ｎ−ジメチルトリメチルシリルアミン、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）アセトアミド、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）カルバメート、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
トリメチルシリルトリフラート、
トリエチルシリルトリフラート、
トリイソプロピルシリルトリフラート、または
ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルトリフラートから選択される、プロセスを提供する。

【0082】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、トリメチルシリルトリフラート、クロロトリメチルシラン、または１−（トリメチルシリル）イミダゾールから選択される、プロセスを提供する。

【0083】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミドから選択される、プロセスを提供する。

【0084】

別の実施形態は、Ｈ−ホスホネートが、固相に共有結合される、プロセスを提供する。

【0085】

一実施形態は、構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、
ｉ）構造ＩｃのＨ−ホスホネートを、シリル化試薬と反応させて、シリルオキシホスホネートをもたらすステップと、
ｉｉ）シリルオキシホスホネートを、構造ＩＶｃのビス（チオスルホネート）試薬と反応させて、構造Ｖｃのチオスルホネート基を含むホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、
ｉｉｉ）構造Ｖｃのチオスルホネート基を含むホスホロチオトリエステルを、構造ＶＩｃの求核試薬と反応させて、構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルをもたらすステップと、を含み、
構造ＩｃのＨ−ホスホネートは、次の構造：

【化30】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、_｀
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩＶｃのビス（チオスルホネート）試薬は、次の構造：

【化31】

を有し、
式中、
Ｘは、アルキレン、アルケニレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
各Ｒ^６は、独立して、アルキル、シクロアルキル、アリール、またはヘテロアリールであり、
構造ＶＩｃの求核試薬は、次の構造：
Ｒ^７−ＳＨを有し、式中、Ｒ^７は、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロシクロ、アミノアルキル、または（ヘテロシクロ）アルキルから選択され、
構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルは、次の構造：

【化32】

を有し、
式中、
Ｗは、独立して、Ｏ、Ｓ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択され、
Ｒは、Ｒ^７−Ｓ−Ｓ−Ｘ−であり、
Ｒ^７は、アルキル、アルケニル、アリール、ヘテロシクロ、アミノアルキル、または（ヘテロシクロ）アルキルであり、
Ｘは、アルキレン、アルケニレン、アリーレン、またはヘテロアリーレンであり、
Ｒ^３は、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）、−ＯＲ^ａ、または−ＳＲ^ｃであり、
Ｙ^１は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、Ｓ、またはＳｅであり、
Ｒ^ａは、ブロッキング基であり、
Ｒ^ｃは、ブロッキング基であり、
各場合のＲ^ｄは、独立して、水素、アルキル、アルケニル、アルキニル、アリール、アシル、置換シリル、カルバメート、−Ｐ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）_２、または−ＨＰ（Ｏ）（Ｒ^ｅ）であり、
各場合のＲ^ｅは、独立して、水素、アルキル、アリール、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^２−、アルケニル−Ｙ^２−、アルキニル−Ｙ^２−、アリール−Ｙ^２−、もしくはヘテロアリール−Ｙ^２−、またはＮａ^＋１、Ｌｉ^＋１、もしくはＫ^＋１であるカチオンであり、
Ｙ^２は、Ｏ、ＮＲ^ｄ、またはＳであり、
各場合のＲ^４は、独立して、水素、−ＯＨ、−ＳＨ、−ＮＲ^ｄＲ^ｄ、−Ｎ_３、ハロゲン、アルキル、アルケニル、アルキニル、アルキル−Ｙ^１−、アルケニル−Ｙ^１−、アルキニル−Ｙ^１−、アリール−Ｙ^１−、ヘテロアリール−Ｙ^１−、−ＯＲ^ｂ、または−ＳＲ^ｃであり、Ｒ^ｂは、ブロッキング基であり、
各場合のＢａは、独立して、ブロックまたは非ブロックのアデニン、シトシン、グアニン、チミン、ウラシル、または修飾核酸塩基であり、
Ｒ^５は、水素、ブロッキング基、固体支持体に結合した連結部分、または核酸に結合した連結部分であり、
ｎは、１〜約２００であり、
構造ＩｃのＨ−ホスホネートのリン酸連結は、ホスホロチオトリエステルが構造Ｖｃのチオスルホネート基を含み、構造ＩＩＩｃのホスホロチオトリエステルが、任意で、非立体無作為性リン酸連結を含んでもよい、プロセスを提供する。

【0086】

別の実施形態は、構造ＩＩＩｂのホスホロチオトリエステルが、非立体無作為性リン酸連結を含み、構造ＩｃのＨ−ホスホネートが、非立体無作為性リン酸連結を含み、Ｗが、独立して、Ｏ、ＮＨ、またはＣＨ_２から選択される、プロセスを提供する。別の実施形態は、ＷがＯであるプロセスを提供する。

【0087】

別の実施形態は、Ｒ^６がメチルであるプロセスを提供する。

【0088】

別の実施形態は、構造ＩＶｃのビス（チオスルホネート）試薬が、

【化33】

から選択される、プロセスを提供する。

【0089】

別の実施形態は、構造ＶＩｃの求核試薬が、次の構造：

【化34】

を有する、プロセスを提供する。

【0090】

別の実施形態は、構造ＩＩＩａのホスホロチオトリエステルの調製のためのプロセスであって、シリル化試薬が、
１，１，３，３−テトラメチル−１，３−ジフェニルジシラザン、
１，３−ジメチル−１，１，３，３−テトラフェニルジシラザン、
１−（トリメチルシリル）イミダゾール、
Ｎ−トリメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
ビス（ジメチルアミノ）ジメチルシラン、
ブロモトリメチルシラン、
クロロジメチル（ペンタフルオロフェニル）シラン、
クロロトリエチルシラン、
クロロトリイソプロピルシラン、
クロロトリメチルシラン、
ジクロロジメチルシラン、
ヘキサメチルジシラザン、
Ｎ，Ｎ′−ビス（トリメチルシリル）尿素、
Ｎ，Ｎ−ビス（トリメチルシリル）メチルアミン、
Ｎ，Ｎ−ジメチルトリメチルシリルアミン、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）アセトアミド、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）カルバメート、
Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
Ｎ−ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリル−Ｎ−メチルトリフルオロアセトアミド、
Ｎ−メチル−Ｎ−トリメチルシリルヘプタフルオロブチルアミド、
トリメチルシリルトリフラート、
トリエチルシリルトリフラート、
トリイソプロピルシリルトリフラート、または
ｔｅｒｔ−ブチルジメチルシリルトリフラートから選択される、プロセスを提供する。

【0091】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミド、トリメチルシリルトリフラート、クロロトリメチルシラン、または１−（トリメチルシリル）イミダゾールから選択される、プロセスを提供する。

【0092】

別の実施形態は、シリル化試薬が、Ｎ，Ｏ−ビス（トリメチルシリル）トリフルオロアセトアミドから選択される、プロセスを提供する。

【0093】

別の実施形態は、Ｈ−ホスホネートが、固相に共有結合される、プロセスを提供する。
修飾オリゴヌクレオチド

【0094】

オリゴヌクレオチドは、プロドラッグ戦略の適用を通じて改善することができる複数の薬学的特性を有する。特に、オリゴヌクレオチドは、ヌクレアーゼによって急速に分解され、細胞質細胞膜を通じた低い細胞内取り込みを示す（Ｐｏｉｊａｒｖｉ−Ｖｉｒｔａ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（２００６），１３（２８）；３４４１−６５、Ｗａｇｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｅｄ．Ｒｅｓ．Ｒｅｖ．（２０００），２０（６）：４１７−５１、Ｐｅｙｒｏｔｔｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｍｉｎｉ Ｒｅｖ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．（２００４），４（４）：３９５−４０８、Ｇｏｓｓｅｌｉｎ ｅｔ ａｌ．，（１９９６），４３（１）：１９６−２０８、Ｂｏｌｏｇｎａ ｅｔ ａｌ．，（２００２），Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ＆Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ１２：３３−４１）。一例では、Ｖｉｖｅｓら（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（１９９９），２７（２０）：４０７１−７６）は、ｔｅｒｔ−ブチルＳＡＴＥプロオリゴヌクレオチドが、親オリゴヌクレオチドと比較して、著しく増加した細胞透過を示したことを見出した。修飾オリゴヌクレオチドまたはプロヌクレオチドの合成のための方法を本明細書に記載する。
本発明の方法に使用される反応条件および試薬。
条件

【0095】

アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子と５′−ＯＨ部分を含むヌクレオシドを反応させて、縮合中間体を形成するステップは、いずれの中間体も単離することなく行うことができる。いくつかの実施形態において、アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子と５′−ＯＨ部分を含むヌクレオシドを反応させて、縮合中間体を形成するステップは、ワンポット反応で行われる。一実施形態において、アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子、縮合試薬、キラル試薬、および遊離求核部分を含む化合物を、異なる時間で反応混合物に追加する。別の実施形態において、アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子、縮合試薬、およびキラル試薬は、同じ反応容器または同じポット中に存在する。別の実施形態において、アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子、縮合試薬、キラル試薬、および遊離求核部分を含む化合物は、同じ反応または同じポット中に存在する。これは、中間体を単離することなく反応を実行することを可能にし、時間のかかるステップを排除し、経済的かつ効率的な合成をもたらす。特定の実施形態において、アキラルＨ−ホスホネート、縮合試薬、キラルアミノアルコール、５′−ＯＨヌクレオシドは、反応中に同時に存在する。さらなる実施形態において、縮合のためのキラル中間体の形成は、インサイチュで形成され、縮合反応より前に単離されない。別の実施形態において、アキラルＨ−ホスホネート部分を含む分子は、キラル中間体を遊離５′−ＯＨ部分を含む化合物と反応させる際に使用したものとは異なる反応容器において、縮合試薬、キラル試薬との反応によって活性化されている。
固体支持体上での合成

【0096】

いくつかの実施形態において、核酸の合成は、溶液中で行われる。他の実施形態において、核酸の合成は、固相上で行われる。固体支持体の反応基は、保護されていなくてもよく、または保護されていてもよい。オリゴヌクレオチド合成中、固体支持体を、複数の合成サイクル中に種々の試薬で処理して、個々のヌクレオチド単位での成長するヌクレオチド鎖の段階的な伸長を達成する。固体支持体に直接連結した鎖の末端のヌクレオシド単位は、本明細書に使用される際、「第１のヌクレオシド」と称される。第１のヌクレオシドは、リンカー部分、すなわち、ジラジカルを介して、固体支持体のポリマーおよびヌクレオシドの両方への共有結合により、固体支持体に結合される。リンカーは、オリゴヌクレオチド鎖を構築するために行われる合成サイクル中、無傷なままであり、鎖構築後に開裂されて、オリゴヌクレオチドが支持体から解放される。

【0097】

固相核酸合成のための固体支持体には、例えば、米国特許第４，６５９，７７４号、同第５，１４１，８１３号、同第４，４５８，０６６号、Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ米国特許第４，４１５，７３２号、同第４，４５８，０６６号、同第４，５００，７０７号、同第４，６６８，７７７号、同第４，９７３，６７９号、および同第５，１３２，４１８号、Ａｎｄｒｕｓら米国特許第５，０４７，５２４号、同第５，２６２，５３０号、ならびにＫｏｓｔｅｒ米国特許第４，７２５，６７７号（Ｒｅ３４，０６９として再発行）に記載される支持体が挙げられる。いくつかの実施形態において、固相は、有機ポリマー支持体である。他の実施形態において、固相は、無機ポリマー支持体である。いくつかの実施形態において、有機ポリマー支持体は、ポリスチレン、アミノメチルポリスチレン、ポリエチレングリコール−ポリスチレングラフトコポリマー、ポリアクリルアミド、ポリメタクリレート、ポリビニルアルコール、高度架橋ポリマー（ＨＣＰ）、もしくは他の合成ポリマー、セルロースおよびデンプン等の炭水化物、もしくは他のポリマー炭水化物、あるいは他の有機ポリマーおよび任意のコポリマー、複合材料または上述の無機もしくは有機材料の組み合わせである。他の実施形態において、無機ポリマー支持体は、シリカ、アルミナ、シリカゲル支持体である制御多孔質ガラス（ＣＰＧ）、またはアミノプロピルＣＰＧである。他の有用な固体支持体としては、フルオラス固体支持体（例えば、ＷＯ／２００５／０７０８５９号を参照されたい）、長鎖アルキルアミン（ＬＣＡＡ）制御多孔質ガラス（ＣＰＧ）固体支持体（例えば、Ｓ．Ｐ．Ａｄａｍｓ，Ｋ．Ｓ．Ｋａｖｋａ，Ｅ．Ｊ．Ｗｙｋｅｓ，Ｓ．Ｂ．Ｈｏｌｄｅｒ ａｎｄ Ｇ．Ｒ．Ｇａｌｌｕｐｐｉ，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，１９８３，１０５，６６１−６６３、Ｇ．Ｒ．Ｇｏｕｇｈ，Ｍ．Ｊ．Ｂｒｕｄｅｎ ａｎｄ Ｐ．Ｔ．Ｇｉｌｈａｍ，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９８１，２２，４１７７−４１８０を参照されたい）が挙げられる。膜支持体およびポリマー膜（例えば、Ｉｎｎｏｖａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｐｅｒｓｐｅｃｔｉｖｅｓ ｉｎ Ｓｏｌｉｄ Ｐｈａｓｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｐｅｐｔｉｄｅｓ，Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ａｎｄ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ，ｃｈ ２１ ｐｐ１５７−１６２，１９９４，Ｅｄ．Ｒｏｇｅｒ Ｅｐｔｏｎおよび米国特許第４，９２３，９０１号を参照されたい）もまた、核酸の合成に有用である。いったん形成されると、膜は、核酸合成で使用するために化学的に官能化することができる。官能基を膜に結合させることに加えて、膜に結合したリンカーまたはスペーサー基の使用が、膜と合成された鎖との間の立体障害を最小限に抑えるために用いられてもよい。

【0098】

他の好適な固体支持体には、固相方法での使用に好適であることが当該技術分野で一般的に知られているものが挙げられ、例えば、ＰｒｉｍｅｒＴＭ ２００支持体として販売されるガラス、制御多孔質ガラス（ＣＰＧ）、オキサリル−制御多孔質ガラス（例えば、Ａｌｕｌ，ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９１，１９，１５２７を参照されたい）、ＴｅｎｔａＧｅｌ Ｓｕｐｐｏｒｔ−アミノポリエチレングリコール誘導体化支持体（例えば、Ｗｒｉｇｈｔ，ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９３，３４，３３７３）、Ｐｏｒｏｓ−ポリスチレン／ジビニルベンゼンのコポリマーが挙げられる。

【0099】

表面活性化ポリマーは、複数の固体支持体媒体上での天然および修飾された核酸およびタンパク質の合成における使用が例証されている。固体支持体材料は、好適に多孔性が均一な任意のポリマーであり得、十分なアミン含量を有し、完全性を失うことなく任意の付随操作を受けるのに十分に柔軟性がある。好適な選択される材料の例としては、ナイロン、ポリプロピレン、ポリエステル、ポリテトラフルオロエチレン、ポリスチレン、ポリカーボネート、およびニトロセルロースが挙げられる。他の材料は、研究者の設計に応じて、固体支持体として機能し得る。いくつかの設計を考慮すると、例えば、被覆金属、特に金または白金を選択することができる（例えば、米国公開第２００１００５５７６１号を参照されたい）。オリゴヌクレオチド合成の一実施形態において、例えば、ヌクレオシドは、ヒドロキシルまたはアミノ残基で官能化された固体支持体に固定される。あるいは、固体支持体を、トリメトキシトリチル基（ＴＭＴ）等、酸に不安定なトリアルコキシトリチル基をもたらすように誘導体化する。理論に束縛されるものではないが、トリアルコキシトリチル保護基の存在が、ＤＮＡ合成装置で広く使用される条件下での初期脱トリチル化を可能にすることが予想される。アンモニア水を有する溶液中でのオリゴヌクレオチド材料のより速い放出のために、ジグリコエートリンカーが、任意で支持体上に導入される。
連結部分

【0100】

連結部分またはリンカーは、任意で、遊離求核部分を含む化合物に固体支持体を結合させるために使用される。固相合成技術において、固体支持体を初期ヌクレオシド分子の官能基（例えば、ヒドロキシル基）に結合させるように機能する短分子等、好適なリンカーが、既知である。いくつかの実施形態において、連結部分は、スクシンアミド酸リンカー、またはコハク酸塩リンカー（−ＣＯ−ＣＨ_２−ＣＨ_２−ＣＯ−）、またはオキサリルリンカー（−ＣＯ−ＣＯ−）である。他の実施形態において、連結部分およびヌクレオシドは、エステル結合を通じて一緒に結合される。他の実施形態において、連結部分およびヌクレオシドは、アミド結合を通じて一緒に結合される。さらなる実施形態において、連結部分は、ヌクレオシドを別のヌクレオチドまたは核酸に結合させる。好適なリンカーは、例えば、Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ Ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｕｅｓ Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅｋｓｔｅｉｎ，Ｆ．Ｅｄ．，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ，Ｎ．Ｙ．，１９９１，Ｃｈａｐｔｅｒ１に記載されている。

【0101】

リンカー部分は、遊離求核部分を含む化合物を、別のヌクレオシド、ヌクレオチド、または核酸に結合させるために使用される。いくつかの実施形態において、連結部分は、ホスホジエステル連結である。他の実施形態において、連結部分は、Ｈ−ホスホネート部分である。なおも他の実施形態において、連結部分は、Ｘ−ホスホネート部分である。
合成のための溶媒

【0102】

核酸の合成は、非プロトン性有機溶媒中で実行される。いくつかの実施形態において、溶媒は、アセトニトリル、ピリジン、またはＮＭＰである。いくつかの実施形態において、溶媒は、アセトン、アセトニトリル、ＮＭＰ、酢酸エチル、ＴＨＦ、ジオキサン、ＤＭＦ、ＤＭＳＯ、ＤＣＭ、クロロホルム、ピリジン、２，６−ルチジン、ＨＭＰＡ、ＨＭＰＴ、ＤＭＡ、グリム、ジグリム、スルホン、メチルｔｅｒｔ−ブチルエーテル、またはこれらの組み合わせである。いくつかの実施形態において、溶媒は、極性の非プロトン性有機溶媒である。いくつかの実施形態において、溶媒は、無水である。
ブロッキング基を除去するための酸性化条件

【0103】

ブロッキング基を除去するための酸性化は、ブレンステッド酸またはルイス酸によって達成される。いくつかの実施形態において、酸性化は、Ｒ^１ブロッキング基を除去するために用いられる。有用なブレンステッド酸は、カルボン酸、アルキルスルホン酸、アリールスルホン酸、リン酸およびその誘導体、ホスホン酸およびその誘導体、アルキルホスホン酸およびそれらの誘導体、アリールホスホン酸およびそれらの誘導体、ホスフィン酸、ジアルキルホスフィン酸、ならびにジアリールホスフィン酸であり、これらは、有機溶媒または水（８０％酢酸の場合）中−０．６（トリフルオロ酢酸）〜４．７６（酢酸）のｐＫａ（水中２５℃）を有する。酸性化ステップで使用される酸の濃度（１〜８０％）は、酸の酸性度に依存する。強酸条件は、プリニルまたはピリミジニル塩基をリボース環から開裂する、脱プリン化／脱ピリミジン化をもたらすことになるため、酸の強度の検討も考慮に入れる必要がある。

【化35】

【0104】

いくつかの実施形態において、酸性化は、有機溶媒中でルイス酸によって達成される。有用なルイス酸は、ＺｎＸ_２であり、式中、Ｘは、Ｃｌ、Ｂｒ、I、またはＣＦ_３ＳＯ_３である。

【0105】

いくつかの実施形態において、酸性化は、縮合中間体からプリン部分を除去することなく、縮合中間体を式４の化合物に変換させるのに有効なある量のブレンステッド酸またはルイス酸を添加することを含む。

【0106】

酸性化ステップに有用な酸にはまた、有機溶媒中１０％リン酸、有機溶媒中１０％塩酸、有機溶媒中１％トリフルオロ酢酸、有機溶媒中３％ジクロロ酢酸、または水中８０％酢酸が挙げられるが、これらに限定されない。プロセスで使用される任意のブレントステッド酸またはルイス酸の濃度は、酸の濃度が、糖部分からの核酸塩基の開裂を引き起こす濃度を超えないように選択される。

【0107】

いくつかの実施形態において、酸性化は、有機溶媒中１％トリフルオロ酢酸を添加することを含む。いくつかの実施形態において、酸性化は、有機溶媒中約０．１％〜約８％トリフルオロ酢酸を添加することを含む。他の実施形態において、酸性化は、有機溶媒中３％ジクロロ酢酸を添加することを含む。他の実施形態において、酸性化は、有機溶媒中約０．１％〜約１０％ジクロロ酢酸を添加することを含む。さらに他の実施形態において、酸性化は、有機溶媒中３％トリクロロ酢酸を添加することを含む。なおも他の実施形態において、酸性化は、有機溶媒中約０．１％〜約１０％トリクロロ酢酸を添加することを含む。いくつかの実施形態において、酸性化は、水中８０％酢酸を添加することを含む。いくつかの実施形態において、酸性化は、水中約５０％〜約９０％、または約５０％〜約８０％、約５０％〜約７０％、約５０％〜約６０％、約７０％〜約９０％酢酸を添加することを含む。いくつかの実施形態において、酸性化は、酸性溶媒へのカチオンスカベンジャーのさらなる添加を含む。特定の実施形態において、カチオンスカベンジャーは、トリエチルシランまたはトリイソプロピルシランであり得る。いくつかの実施形態において、Ｒ^１は、縮合中間体を酸性化するステップの前に脱ブロックされる。いくつかの実施形態において、Ｒ^１は、有機溶媒中１％トリフルオロ酢酸を添加することを含む、酸性化によって脱ブロックされる。いくつかの実施形態において、Ｒ^１は、有機溶媒中３％ジクロロ酢酸を添加することを含む、酸性化によって脱ブロックされる。いくつかの実施形態において、Ｒ^１は、有機溶媒中３％トリクロロ酢酸を添加することを含む、酸性化によって脱ブロックされる。
ブロッキング部分または基の除去

【0108】

核酸塩基または糖部分に位置するヒドロキシルまたはアミノ部分等の官能基は、合成中にブロッキング（保護）基（部分）で定期的にブロックされ、続いて脱ブロックされる。一般的に、ブロッキング基は、分子の化学官能性を特定の反応条件に対して不活性にし、後に、分子の残りに実質的に損害を与えることなく、分子内のこのような官能性から除去することができる（例えば、Ｇｒｅｅｎ ａｎｄ Ｗｕｔｓ，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，２^ｎｄ Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，１９９１を参照されたい）。例えば、アミノ基は、フタルイミド、９−フルドレニルメトキシカルボニル（ＦＭＯＣ）、トリフェニルメチルスルフェニル、ｔ−ＢＯＣ、４，４’−ジメトキシトリチル（ＤＭＴｒ）、４−メトキシトリチル（ＭＭＴｒ）、９−フェニルキサンチン−９−イル（Ｐｉｘｙｌ）、トリチル（Ｔｒ）、または９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンチン−９−イル（ＭＯＸ）等の窒素ブロッキング基でブロッキングすることができる。カルボキシル基は、アセチル基として保護することができる。ヒドロキシ基は、テトラヒドロピラニル（ＴＨＰ）、ｔ−ブチルジメチルシリル（ＴＢＤＭＳ）、１−［（２−クロロ−４−メチル）フェニル］−４−メトキシピペリジン−４−イル（Ｃｔｍｐ）、１−（２−フルオロフェニル）−４−メトキシピペリジン−４−イル（Ｆｐｍｐ）、１−（２−クロロエトキシ）エチル、３−メトキシ−１，５−ジカルボメトキシペンタン−３−イル（ＭＤＰ）、ビス（２−アセトキシエトキシ）メチル（ＡＣＥ）、トリイソプロピルシリルオキシメチル（ＴＯＭ）、１−（２−シアノエトキシ）エチル（ＣＥＥ）、２−シアノエトキシメチル（ＣＥＭ）、［４−（Ｎ−ジクロロアセチル−Ｎ−メチルアミノ）ベンジルオキシ］メチル、２−シアノエチル（ＣＮ）、ピバロイルオキシメチル（ＰｉｖＯＭ）、レブニルオキシメチル（ＡＬＥ）等として保護することができる。他の代表的なヒドロキシルブロッキング基が説明されている（例えば、Ｂｅａｕｃａｇｅ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９２，４６，２２２３を参照されたい）。いくつかの実施形態において、ヒドロキシルブロッキング基は、トリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、トリメトキシトリチル、９−フェニルキサンチン−９−イル（Ｐｉｘｙｌ）、および９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンチン−９−イル（ＭＯＸ）等、酸に不安定な基である。化学官能基はまた、それらを前駆体形態で含めることによってブロックすることができる。したがって、アジド基は容易にアミンに変換されるため、アジド基は、アミンのブロック形態と見なすことができる。核酸合成に利用されるさらなる代表的な保護基が既知である（例えば、Ａｇｒａｗａｌ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｆｏｒ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ，Ｅｄｓ．，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，Ｎｅｗ Ｊｅｒｓｅｙ，１９９４，Ｖｏｌ．２６，ｐｐ．１−７２を参照されたい）。

【0109】

核酸からブロッキング基を除去するための種々の方法が既知であり、使用されている。いくつかの実施形態においては、全てのブロッキング基が除去される。他の実施形態において、ブロッキング基は部分的に除去される。さらに他の実施形態において、反応条件は、ある特定の部分のブロッキング基を除去するように調整することができる。Ｒ^２がブロッキング基である、ある特定の実施形態において、Ｒ^２でのブロッキング基の除去は、Ｒ^１でのブロッキング基の除去と無関係である。Ｒ^１およびＲ^２におけるブロッキング基は、合成ステップ中無傷なままであり、鎖構築後に集合的に除去される。いくつかの実施形態において、Ｒ^２ブロッキング基は、固体支持体からの核酸の開裂および核酸塩基ブロッキング基の除去と同時に除去される。特定の実施形態において、Ｒ^１におけるブロッキング基は除去されるが、一方で、Ｒ^２におけるブロッキング基および核酸塩基は無傷なままとどまる。Ｒ^１におけるブロッキング基は、第１級アミン、第２級アミン、またはそれらの混合物等、有機塩基により固体支持体上で開裂可能である。Ｒ^１位置の脱ブロッキングは、一般的に、前脱保護と称される。

【0110】

ある実施形態において、核酸塩基ブロッキング基は、存在する場合、それぞれの核酸を構築した後、酸性試薬で開裂可能である。別の実施形態において、核酸塩基ブロッキング基のうちの１つ以上は、酸性でも塩基性でもない条件下で開裂可能であり、例えば、フッ化物塩またはフッ化水素酸複合体で開裂可能である。さらに別の実施形態において、核酸塩基ブロッキング基のうちの１つ以上は、それぞれの核酸を構築した後に塩基または塩基性溶媒の存在下で開裂可能であり、核酸塩基ブロッキング基は、アミンでの前脱保護ステップの条件に対して安定である。

【0111】

いくつかの実施形態において、核酸塩基のブロッキング基は必要ない。他の実施形態において、核酸塩基のブロッキング基が必要である。さらに他の実施形態において、ある特定の核酸塩基は、ブロッキング基を必要とするが、一方で他の核酸塩基はブロッキング基を必要としない。核酸塩基がブロックされる実施形態では、ブロッキング基は、初めにブロッキング基を除去するのに適した条件下で、完全にかまたは部分的にのいずれかで除去される。例えば、Ｒ^１は、ＯＲ^ａを示し得、ここで、Ｒ^ａはアシルであり、Ｂａは、イソブチリル、アセチル、または４−（ｔｅｒｔ−ブチルフェノキシ）アセチルを含むがこれらに限定されないアシル基でブロックされたグアニンを示す。Ｒ^１およびＢａにおけるアシル基は、同じ脱ブロッキングステップ中に除去されるか、または部分的に除去されることになる。
オリゴヌクレオシドホスホロチオエート連結の立体化学

【0112】

オリゴヌクレオシドホスホロチオエートは、治療的可能性を示している（Ｓｔｅｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ（１９９３），２６１：１００４−１２、Ａｇｒａｗａｌ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｓｅｎｃｅ Ｒｅｓ．ａｎｄ Ｄｅｖ．（１９９２），２：２６１−６６、Ｂａｙｅｖｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓ．ａｎｄ Ｄｅｖ．（１９９３），３：３８３−３９０）。ホスホロチオエートの立体化学を考慮することなく調製されたオリゴヌクレオシドホスホロチオエートは、２^ｎジアステレオマーの混合物として存在し、このｎは、ヌクレオチド間ホスホロチオエート連結の数である。これらのジアステレオマーホスホロチオエートの化学的および生物学的特性は、はっきりと区別することができる。例えば、Ｗａｄａら（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ Ｓｅｒｉｅｓ Ｎｏ．５１ ｐ．１１９−１２０；ｄｏｉ：１０．１０９３／ｎａｓｓ／ｎｒｍ０６０）は、立体定義された（Ｒｐ）−（Ｕｐｓ）_９Ｕ／（Ａｐ）_９Ａ二本鎖が、天然の（Ｕｐ）_９Ｕ／（Ａｐ）_９Ａのものよりも高いＴｍ値を示し、立体定義された（Ｓｐ）−（Ｕｐｓ）_９Ｕが二本鎖を形成しなかったことを見出した。別の例において、Ｔａｎｇらによる研究（Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ（１９９５），１４：９８５−９９０）では、立体的に純粋なＲｐ−オリゴデオキシリボヌクレオシドホスホロチオエートが、定義されていないリンキラリティを有する親オリゴデオキシリボヌクレオシドホスホロチオエートよりも、ヒト血清に内在性であるヌクレアーゼに対してより低い安定性を有することがわかった。
核酸塩基および修飾核酸塩基

【0113】

本明細書に記載の化合物および方法で利用される核酸塩基Ｂａは、天然の核酸塩基または天然の核酸塩基に由来する修飾された核酸塩基である。例としては、それぞれのアミノ基がアシル保護基によって保護された、ウラシル、チミン、アデニン、シトシン、およびグアニン、２−フルオロウラシル、２−フルオロシトシン、５−ブロモウラシル、５−ヨードウラシル、２，６−ジアミノプリン、アザシトシン、プソイドシトシンおよびプソイドウラシルを含むピリミジン類似体、ならびに８−置換プリン、キサンチン、ヒポキサンチン（後者の２つは、天然の分解生成物である）等の他の修飾核酸塩基が挙げられるが、これらに限定されない。Ｃｈｉｕ ａｎｄ Ｒａｎａ，ＲＮＡ，２００３，９，１０３４−１０４８、Ｌｉｍｂａｃｈ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９４，２２，２１８３−２１９６、およびＲｅｖａｎｋａｒ ａｎｄ Ｒａｏ，Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ Ｎａｔｕｒａｌ Ｐｒｏｄｕｃｔｓ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，ｖｏｌ．７，３１３に開示される修飾核酸塩基もまた、本明細書に記載の化合物および方法のＢａ部分として企図される。

【0114】

次の一般式によって表される化合物もまた、修飾核酸塩基として企図される。

【化36】

【0115】

上述の式中、Ｒ^８は、１〜１５個の炭素原子を有する、直鎖または分枝鎖アルキル、アリール、アラルキル、またはアリールオキシルアルキル基であり、例示のみの目的で、メチル、イソプロピル、フェニル、ベンジル、またはフェノキシメチル基が挙げられ、Ｒ^９およびＲ^１０のそれぞれは、１〜４個の炭素原子を有する直鎖または分枝鎖アルキル基を表す。

【0116】

修飾核酸塩基はまた、１つ以上のベンゼン環が付加されている、伸長寸法の核酸塩基を含む。Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈカタログ（ｗｗｗ．ｇｌｅｎｒｅｓｅａｒｃｈ．ｃｏｍ）、Ｋｒｕｅｇｅｒ ＡＴ ｅｔ ａｌ，Ａｃｃ．Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．，２００７，４０，１４１−１５０、Ｋｏｏｌ，ＥＴ，Ａｃｃ．Ｃｈｅｍ．Ｒｅｓ．，２００２，３５，９３６−９４３、Ｂｅｎｎｅｒ Ｓ．Ａ．，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｒｅｖ．Ｇｅｎｅｔ．，２００５，６，５５３−５４３、Ｒｏｍｅｓｂｅｒｇ，Ｆ．Ｅ．，ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．，２００３，７，７２３−７３３、Ｈｉｒａｏ，Ｉ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．，２００６，１０，６２２−６２７に記載される核酸塩基の置き換えは、本明細書に記載される核酸の合成に有用であるとして企図される。これらの伸長寸法の核酸塩基のいくつかの例を、以下に示す。

【化37】

【0117】

本明細書において、修飾核酸塩基はまた、核酸塩基とは見なされないが、コリンまたはポルフィリンに由来する環等であるがこれらに限定されない他の部分である、構造を包含する。ポルフィリン由来塩基の置き換えは、Ｍｏｒａｌｅｓ−Ｒｏｊａｓ，Ｈ ａｎｄ Ｋｏｏｌ，ＥＴ，Ｏｒｇ．Ｌｅｔｔ．，２００２，４，４３７７−４３８０に記載されている。塩基の置き換えとして使用することができるポルフィリン由来環の一例を、以下に示す。

【化38】

【0118】

他の修飾核酸塩基はまた、以下に示されるもの等の塩基の置き換えを含む。

【化39】

【0119】

蛍光性である修飾核酸塩基もまた企図される。これらの塩基置換の非限定的な例には、以下に示されるように、フェナントレン、ピレン、スチルベン、イソキサンチン、イソザントプテリン、テルフェニル、テルチオフェン、ベンゾテルチオフェン、クマリン、ルマジン、テザースチルベン（ｔｅｔｈｅｒｅｄ ｓｔｉｌｌｂｅｎｅ）、ベンゾ−ウラシル、およびナフト−ウラシルが挙げられる。

【化40】

【0120】

修飾核酸塩基は、非置換であり得るか、またはヘテロ原子、アルキル基、もしくは蛍光部分、ビオチンもしくはアビジン部分、または他のタンパク質もしくはペプチドに結合された連結部分等、さらなる置換を含み得る。修飾核酸塩基はまた、最も古典的な意味では核酸塩基ではないが、核酸塩基と同様に機能する、ある特定の「普遍的塩基（ｕｎｉｖｅｒｓａｌ ｂａｓｅ）」を含む。このような普遍的塩基の１つの代表的な例は、３−ニトロピロールである。

【0121】

他のヌクレオシドもまた、本明細書に開示されるプロセスで使用することができ、修飾核酸塩基、または修飾糖に共有結合された核酸塩基を組み込むヌクレオシドが挙げられる。修飾核酸塩基を組み込むヌクレオシドのいくつかの例には、４−アセチルシチジン；５−（カルボキシヒドロキシルメチル）ウリジン；２′−Ｏ−メチルシチジン；５−カルボキシメチルアミノメチル−２−チオウリジン；５−カルボキシメチルアミノメチルウリジン；ジヒドロウリジン；２′−Ｏ−メチルプソイドウリジン；β，Ｄ−ガラクトシルキューオシン；２′−Ｏ−メチルグアノシン；Ｎ^６−イソペンテニルアデノシン；１−メチルアデノシン；１−メチルプソイドウリジン；１−メチルグアノシン；ｌ−メチルイノシン；２，２−ジメチルグアノシン；２−メチルアデノシン；２−メチルグアノシン；Ｎ^７−メチルグアノシン；３−メチル−シチジン；５−メチルシチジン；Ｎ^６−メチルアデノシン；７−メチルグアノシン；５−メチルアミノエチルウリジン；５−メトキシアミノメチル−２−チオウリジン；β，Ｄ−マンノシルキューオシン；５−メトキシカルボニルメチルウリジン；５−メトキシウリジン；２−メチルチオ−Ｎ^６−イソペンテニルアデノシン；Ｎ−（（９−β，Ｄ−リボフラノシル−２−メチルチオプリン−６−イル）カルバモイル）スレオニン；Ｎ−（（９−β，Ｄ−リボフラノシルプリン−６−イル）−Ｎ−メチルカルバモイル）スレオニン；ウリジン−５−オキシ酢酸メチルエステル；ウリジン−５−オキシ酢酸（ｖ）；プソイドウリジン；キューオシン；２−チオシチジン；５−メチル−２−チオウリジン；２−チオウリジン；４−チオウリジン；５−メチルウリジン；２′−Ｏ−メチル−５−メチルウリジン；および２′−Ｏ−メチルウリジンが挙げられる。

【0122】

いくつかの実施形態において、ヌクレオシドは、６′位に（Ｒ）または（Ｓ）−キラリティのいずれかを有する６′−修飾二環式ヌクレオシド類似体を含み、米国特許第７，３９９，８４５号に記載される類似体を含む。他の実施形態において、ヌクレオシドは、５′位に（Ｒ）または（Ｓ）−キラリティのいずれかを有する５′修飾二環式ヌクレオシド類似体を含み、米国特許出願公開第２００７０２８７８３１号に記載される類似体を含む。

【0123】

いくつかの実施形態において、核酸塩基または修飾核酸塩基は、抗体、抗体フラグメント、ビオチン、アビジン、ストレプトアビジン、受容体リガンド、またはキレート部分等の生体分子結合部分を含む。他の実施形態において、Ｂａは、５−ブロモウラシル、５−ヨードウラシル、または２，６−ジアミノプリンである。さらに他の実施形態において、Ｂａは、蛍光性または生体分子結合部分での置換によって修飾される。いくつかの実施形態において、Ｂａ上の置換基は、蛍光性部分である。他の実施形態において、Ｂａ上の置換基は、ビオチンまたはアビジンである。
ヌクレオチド／ヌクレオシドの修飾糖

【0124】

最も一般的な天然のヌクレオチドは、核酸塩基であるアデノシン（Ａ）、シトシン（Ｃ）、グアニン（Ｇ）、およびチミン（Ｔ）またはウラシル（Ｕ）に連結されたリボース糖である。ヌクレオチド中のリン酸基または修飾リン原子部分を、糖または修飾糖の種々の位置に連結させることができる、修飾ヌクレオチドもまた企図される。非限定的な例として、リン酸基または修飾リン原子部分は、糖または修飾糖の２′、３′、４′、または５′ヒドロキシル部分に連結させることができる。上述の修飾核酸塩基を組み込むヌクレオチドもまた、本明細書に開示されるプロセスで使用することができる。いくつかの実施形態において、保護されていない−ＯＨ部分を含むヌクレオチドまたは修飾ヌクレオチドを、本明細書に開示されるプロセスで使用する。

【0125】

スキーム１〜４ｂに記載のリボース部分に加えて、他の修飾糖もまた、本明細書に開示される核酸に組み込むことができる。いくつかの実施形態において、修飾糖は、２′位に、次のうちの１つを含む１つ以上の置換基を含む：Ｆ；ＣＦ_３、ＣＮ、Ｎ_３、ＮＯ、ＮＯ_２、Ｏ−、Ｓ−、もしくはＮ−アルキル；Ｏ−、Ｓ−、もしくはＮ−アルケニル；Ｏ−、Ｓ−、もしくはＮ−アルキニル；またはＯ−アルキル−Ｏ−アルキル、Ｏ−アルキル−Ｎ−アルキル、もしくはＮ−アルキル−Ｏ−アルキル（ここで、アルキル、アルケニル、およびアルキニルは、置換または非置換Ｃ_１−Ｃ_１０アルキル、またはＣ_２−Ｃ_１０アルケニル、およびアルキニルであり得る）。置換基の例には、Ｏ（ＣＨ_２）_ｎＯＣＨ_３、およびＯ（ＣＨ_２）_ｎＮＨ_２（式中、ｎは１〜約１０である）、ＭＯＥ、ＤＭＡＯＥ、ＤＭＡＥＯＥが挙げられるが、これら限定されない。ＷＯ２００１／０８８１９８号、およびＭａｒｔｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ，１９９５，７８，４８６−５０４に記載される修飾糖もまた、企図される。いくつかの実施形態において、修飾糖は、置換シリル基、ＲＮＡ開裂基、レポーター基、蛍光標識、挿入分子、核酸の薬物動態特性を改善するための基、または核酸の薬理学特性を改善するための基、および類似の特性を有する他の置換基を含む。修飾は、３′−末端ヌクレオチド上の糖の３′位または５′−末端ヌクレオチドの５′位を含む、糖または修飾糖の２′、３′、４′、５′、または６′位に行われ得る。

【0126】

修飾糖はまた、ペントフラノシル糖の代わりに、シクロブチルまたはシクロペンチル部分等の糖模倣体を含む。このような修飾糖構造の調製を教示する代表的な米国特許には、米国特許第４，９８１，９５７号、同第５，１１８，８００号、同第５，３１９，０８０号、および同第５，３５９，０４４号が挙げられるが、これらに限定されない。企図されるいくつかの修飾糖には、

【化41】

が挙げられる。

【0127】

修飾糖の他の非限定的な例としては、グリセロールが挙げられ、これは、グリセロール核酸（ＧＮＡ）類似体を形成する。ＧＮＡ類似体の一例は、以下に示され、Ｚｈａｎｇ，Ｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００８，１３０，５８４６−５８４７、Ｚｈａｎｇ Ｌ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００５，１２７，４１７４−４１７５、およびＴｓａｉ ＣＨ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ，２００７，１４５９８−１４６０３に記載されている：

【化42】

式中、Ｘは、本明細書に定義される通りである。ＧＮＡ由来の類似体の別の例である、ホルミルグリセロールの混合アセタールアミナールに基づく柔軟性のある核酸（ＦＮＡ）は、Ｊｏｙｃｅ ＧＦ ｅｔ ａｌ．，ＰＮＡＳ，１９８７，８４，４３９８−４４０２およびＨｅｕｂｅｒｇｅｒ ＢＤ ａｎｄ Ｓｗｉｔｚｅｒ Ｃ，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００８，１３０，４１２−４１３に記載されており、以下に示される。

【化43】

【0128】

修飾糖の他の非限定的な例には、ヘキソピラノシル（６’から４’）、ペントピラノシル（４’から’２’）、ペントピラノシル（４’から３’）、またはテトロフラノシル（ｔｅｔｒｏｆｕｒａｎｏｓｙｌ）（３’から２’）糖が挙げられる。

【0129】

企図されるヘキソピラノシル（６’から４’）糖には、

【化44】

が挙げられる。

【0130】

企図されるペントピラノシル（４’から２’）糖には、

【化45】

が挙げられる。

【0131】

企図されるペントピラノシル（４’から３’）糖には、

【化46】

が挙げられる。

【0132】

企図されるテトロフラノシル（３’から２’）糖には、

【化47】

が挙げられる。

【0133】

企図される他の修飾糖には、

【化48】

が挙げられる。

【0134】

以下に図示される糖模倣体が、さらに企図され、式中、Ｘは、Ｓ、Ｓｅ、ＣＨ_２、Ｎ−Ｍｅ、Ｎ−Ｅｔ、またはＮ−ｉＰｒから選択される。

【化49】

【0135】

修飾糖および糖模倣体は、Ａ．Ｅｓｃｈｅｎｍｏｓｅｒ，Ｓｃｉｅｎｃｅ（１９９９），２８４：２１１８、Ｍ． Ｂｏｈｒｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ（１９９２），７５：１４１６−１４７７、Ｍ．Ｅｇｌｉ ｅｔ ａｌ，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．（２００６），１２８（３３）：１０８４７−５６、Ａ．Ｅｓｃｈｅｎｍｏｓｅｒ ｉｎ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ：Ｇｎｏｓｉｓ ｔｏ Ｐｒｏｇｎｏｓｉｓ，Ｃ．Ｃｈａｔｇｉｌｉａｌｏｇｌｕ ａｎｄ Ｖ．Ｓｎｉｅｋｕｓ，Ｅｄ．，（Ｋｌｕｗｅｒ Ａｃａｄｅｍｉｃ，Ｎｅｔｈｅｒｌａｎｄｓ，１９９６），ｐ．２９３、Ｋ．−Ｕ．Ｓｃｈｏｎｉｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｓｃｉｅｎｃｅ（２０００），２９０：１３４７−１３５１、Ａ．Ｅｓｃｈｅｎｍｏｓｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ（１９９２），７５：２１８、Ｊ．Ｈｕｎｚｉｋｅｒ ｅｔ ａｌ，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ（１９９３），７６：２５９、Ｇ．Ｏｔｔｉｎｇ ｅｔ ａｌ，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ（１９９３），７６：２７０１、Ｋ．Ｇｒｏｅｂｋｅ ｅｔ ａｌ，Ｈｅｌｖ．Ｃｈｉｍ．Ａｃｔａ（１９９８），８１：３７５、およびＡ．Ｅｓｃｈｅｎｍｏｓｅｒ，Ｓｃｉｅｎｃｅ（１９９９），２８４：２１１８を含むがこれらに限定されない、当該技術分野で既知の方法によって、調製することができる。
ブロッキング基

【0136】

記載される反応において、ある特定の実施形態では、反応性官能基、例えば、ヒドロキシ、アミノ、チオール、またはカルボキシ基が最終生成物中に所望される場合、反応への望まれない関与を避けるために、これらを保護することが必要である。保護基は、一部または全ての反応性部分をブロックし、保護基が除去されるまで、このような基が化学反応に関与することを防止するために使用される。一実施形態において、各保護基は、異なる手段で除去可能である。完全に異なる反応条件下で開裂される保護基は、異なる除去の要件を満たす。いくつかの実施形態において、保護基は、酸、塩基、および／または水素化分解によって除去される。トリチル、ジメトキシトリチル、アセタール、およびｔ−ブチルジメチルシリル等の基は、酸に不安定であり、ある特定の実施形態において、水素化分解によって除去可能なＣｂｚ基および／または塩基に不安定なＦｍｏｃ基で保護されたアミノ基の存在下で、カルボキシおよびヒドロキシ反応性部分を保護するために使用される。他の実施形態において、カルボン酸およびヒドロキシ反応性部分は、ｔ−ブチルカルバメート等の酸に不安定な基で、または酸および塩基の両方に安定であるが、加水分解で除去可能なカルバメートでブロックされたアミンの存在下で、メチル、エチル、およびアセチル等であるがこれらに限定されない、塩基に不安定な基でブロックされる。

【0137】

別の実施形態において、ヒドロキシ反応性部分は、ベンジル基等の加水分解で除去可能な保護基でブロックされるが、一方で、酸との水素結合が可能なアミン基は、Ｆｍｏｃ等の塩基に不安定な基でブロックされる。別の実施形態において、カルボン酸反応性部分は、単純エステル化合物への変換によって保護されるか、またはそれらは、さらに別の実施形態では、２，４−ジメトキシベンジル等の酸化的に除去可能な保護基でブロックされるが、一方で、共存するアミノ基は、フッ化物に不安定なシリルまたはカルバメートブロッキング基でブロックされる。

【0138】

アリルブロッキング基は、酸および塩基保護基の存在下で有用であり、これは、前者が安定であり、後で金属またはπ酸触媒によって除去することができるためである。例えば、アリルブロックヒドロキシ基は、酸に不安定なｔ−ブチルカルバメートまたは塩基に不安定なアセテートアミン保護基の存在下で、Ｐｄ（０）に触媒される反応で脱保護することができる。保護基のさらに別の形態は、化合物または中間体が結合される樹脂である。残基が樹脂に結合している限り、官能基はブロックされ、反応することができない。樹脂から放出されると、官能基は反応できるようになる。

【0139】

典型的には、本明細書に記載される化合物の合成に有用なブロッキング／保護基は、例示のみを目的として、

【化50】

である。

【0140】

合成中にヌクレオチドを保護するのに有用な代表的な保護基には、塩基に不安定な保護基および酸に不安定な保護基が含まれる。塩基に不安定な保護基は、複素環式核酸塩基の環外アミノ基を保護するために使用される。この種類の保護は、概して、アシル化によって達成される。この目的で、３つの一般的に使用されるアシル化基は、塩化ベンゾイル、フェノキシ酢酸無水物、および塩化イソブチリルである。これらの保護基は、核酸合成時に使用される反応条件に安定であり、合成終了時の塩基処理中におおよそ等しい速度で開裂される。

【0141】

いくつかの実施形態において、５′−保護基は、トリチル、モノメトキシトリチル、ジメトキシトリチル、トリメトキシトリチル、２−クロロトリチル、ＤＡＴＥ、ＴＢＴｒ、９−フェニルキサンチン−９−イル（Ｐｉｘｙｌ）、または９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンチン−９−イル（ＭＯＸ）である。

【0142】

いくつかの実施形態において、チオール部分は、本明細書に記載される化合物に組み込まれ、保護される。いくつかの実施形態において、保護基には、ｐｉｘｙｌ、トリチル、ベンジル、ｐ−メトキシベンジル（ＰＭＢ）、またはｔｅｒｔ−ブチル（ｔ−Ｂｕ）が挙げられるが、これらに限定されない。

【0143】

他の保護基、加えて、保護基の生成およびそれらの除去に適用可能な技術の詳細な説明は、Ｇｒｅｅｎｅ ａｎｄ Ｗｕｔｓ，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，３^ｒｄ Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ，１９９９、およびＫｏｃｉｅｎｓｋｉ，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ，Ｔｈｉｅｍｅ Ｖｅｒｌａｇ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ，１９９４に記載され、これらは、このような開示のために参照により本明細書に組み込まれる。

【0144】

以下に提供される実施例は、本発明の化合物およびこのような化合物の調製の方法を、さらに図示および例証する。本発明の範囲は、決して、以下の実施例および調製物の範囲に制限されるものではないことを理解されたい。
実施例
実施例１−メタンチオスルホネート試薬の合成

【化51】

【0145】

化合物２：ＤＣＭ（５０ｍｌ）中の（Ｚ）−ブト−２−エン−１，４−ジオール（０．９３ｍｌ、１１．３ｍｍｏｌ）およびトリエチルアミン（３．３ｍｌ、２４ｍｍｏｌ）の溶液を、ＤＣＭ（５０ｍｌ）中のメタンスルホニルクロリド（１．９ｍｌ、２４ｍｍｏｌ）の撹拌氷冷溶液に、滴下方式で添加した。室温で０．５時間撹拌した後、混合物を、氷上に注いで抽出した。有機層を収集し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、２．６６ｇ、９６％の化合物２まで濃縮し、これは、ＮＭＲによって、次の反応ステップで直接使用するために十分に純粋であると判断した。

【0146】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５．９４（ｄｄｄ，Ｊ＝５．４，４．１，１．３Ｈｚ，２Ｈ），４．８３（ｄｄ，Ｊ＝４．１，１．３Ｈｚ，４Ｈ），３．０４（ｓ，６Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ１２８．３４，６４．３８，３８．２７；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：２６２．０４、実測値：２６２．０５。Ｒ_ｆ＝０．３（１：１ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0147】

化合物３：ＭｅＯＨ（２０ｍｌ）中のメタンスルホノチオエートナトリウム（１．５１ｇ、１１．３ｍｍｏｌ）の溶液を、室温で、未希釈（Ｚ）−ブト−２−エン−１，４−ジイルジメタンスフホネート（１．２５ｇ、５．１２ｍｍｏｌ）で処理した。５分後に、沈殿の発生が観察された。３６時間後、混合物を、水とＤＣＭとに分割した。有機層を分離し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、濃縮して、無色の油を得た。カラムクロマトグラフィー（ＩＳＣＯ）により、淡い無色の油として純粋な生成物を得た。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として純粋な化合物３（０．８９ｇ、６３％）を得た。

【0148】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５．８４（ｄｄｄ，Ｊ＝６．６，５．１，１．５Ｈｚ，２Ｈ），３．９２（ｄｄ，Ｊ＝５．１，１．５ＨＺ，４Ｈ），３．３３（ｓ，６Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ１２８．１，５１．４７，３３．１３；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：２９４．００、実測値：２９４．０４。Ｒ_ｆ＝０．４（１：１ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0149】

化合物４：アルゴン雰囲気下で、モルホリン（１０ｇ、１１５ｍｍｏｌ）を、丸底フラスコにおいてエチレンスルフィド（１５ｇ、２５０ｍｍｏｌ）に添加した。反応物を、７時間撹拌し、シリカゲルカラムに直接充填した。カラムをまずＤＣＭで洗浄し、次いで、２％ＭｅＯＨ／ＤＣＭを使用して、無色の油として化合物４（１５．３ｇ、９１％）を得た。

【0150】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ３．６７−３．５９（ｍ，４Ｈ），２．６３−２．５２（ｍ，２Ｈ），２．５１−２．４５（ｍ，２Ｈ），２．４４−２．３４（ｍ，４Ｈ）；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）＋＝１４８．０７、実測値：１４８．１。

【0151】

化合物５：２−モルホリノエタンチオール（０．２１ｇ、１．４４ｍｍｏｌ）のＤＣＭ溶液（１ｍｌ）を、室温で、ＤＣＭ（１０ｍｌ）中の撹拌溶液の化合物３（０．４０ｇ、１．４４ｍｍｏｌ）に、シリンジを介して滴下添加した。添加の直後に、ＴＬＣを検査し、生成物およびある量の二量体の急速な形成が明らかとなった。０．５時間後、混合物を、水の添加によって分割した。抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として化合物５（０．２９ｇ、５８％）を得た。

【0152】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５．７８（ｍ，２Ｈ），３．９２（ｄ，Ｊ＝７．３Ｈｚ，２Ｈ），３．７０（ｔ，Ｊ＝４．７Ｈｚ，４Ｈ），３．４６（ｄ，Ｊ＝５．５Ｈｚ，２Ｈ），３．３１（ｓ，３Ｈ），２．８４（ｄｄ，Ｊ＝７．８，６．７Ｈｚ，２Ｈ），２．６６（ｄｄ，Ｊ＝７．８，６．７，２Ｈ），２．４８（ｔ，Ｊ＝４．６Ｈｚ，４Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ１３０．３５，１２６．２７，６６．９７，５８．２０，５３．６７，５１．５２，３６．２２，３５．１６，３３．６７；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：３４４．０５、実測値：３４４．０６。Ｒ_ｆ＝０．３（ＥｔＯＡｃ）。

【0153】

化合物５ｂ：化合物４ｂ（３９５ｍｇ、１．０８５ｍｍｏｌ）のＤＣＭ溶液（１ｍＬ）を、室温で、撹拌ＤＣＭ（１５ｍｌ）溶液の化合物３（３００ｍｇ、１．０８５ｍｍｏｌ）に、シリンジを介して滴下添加した。１時間後、結果として得られた溶液を、水の添加によって分割した。抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として化合物５ｂを得た（０．３５ｇ、５８％）。^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５．８３−５．７０（ｍ，２Ｈ），５．３５−５．２１（ｄｔ，Ｊ＝２６．０，９．３Ｈｚ，２Ｈ），５．１６−５．０７（ｍ，１Ｈ），４．５９−４．５４（ｄ，Ｊ＝９．５Ｈｚ，１Ｈ），４．２９−４．２３（ｍ，１Ｈ），４．２３−４．１８（ｍ，１Ｈ），３．９９−３．８８（ｄｄ，Ｊ＝６．７，１．２Ｈｚ，２Ｈ），３．８０−３．７２（ｄｄｄ，Ｊ＝１０．１，４．６，２．６Ｈｚ，１Ｈ），３．６４−３．５６（ｍ，１Ｈ），３．５０−３．４３（ｍ，１Ｈ），３．３１（ｓ，３Ｈ），２．０９（ｓ，３Ｈ），２．０３（ｓ，６Ｈ），２．００（ｓ，３Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７０．６８，１７０．３０，１６９．５１，１６９．３０，１２９．４３，１２７．１４，８７．７３，７６．４９，７３．８９，６９．１６，６７．９９，６１．９９，５１．６４，３５．８９，３３．５８，２０．９５，２０．８０，２０．７４，２０．７１；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４^＋）：５７８．０７、実測値：５７７．９６。Ｒ_ｆ＝０．５（１：１ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0154】

化合物６：ＤＣＭ（５０ｍｌ）中の（Ｚ）−ブト−２−エン−１，４−ジオール（０．９３ｍｌ、１１．３ｍｍｏｌ）およびトリエチルアミン（１．６ｍｌ、１１．５ｍｍｏｌ）の氷冷溶液に、２分間にわたって、シリンジを介して塩化ピバロイル（１．４ｍｌ、１１．４ｍｍｏｌ）で滴下処理を行った。１時間後、ＴＬＣは、良好な反応を示した。

【0155】

結果として得られた混合物を、水の添加によって分割した。抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。この粗製化合物は、ＴＬＣ（Ｒｆ＝０．６、１：１ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）によって、出発ジオールを全く含まないことが判明し、これを粗製のまま使用してメシレートを調製した。粗製材料を、トリエチルアミン（１．７ｍｌ、１２ｍｍｏｌ）を含有するＤＣＭ（５０ｍｌ）中に取り込み、氷浴で冷却した。メタンスルホニルクロリド（０．９８ｍｌ、１２．６６ｍｍｏｌ）を、２分間にわたりシリンジを介して滴下添加した。添加直後のＴＬＣは、出発材料の完全な消耗を示した。結果として得られた混合物を、水の添加によって分割した。抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として、１．４８ｇ、５２％の純粋な化合物６を得た。

【0156】

１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ３）δ５．８９-５．７５（ｍ，２Ｈ），４．８９-４．８４（ｄ，Ｊ＝５．７Ｈｚ，２Ｈ），４．６８-４．６３（ｄ，Ｊ＝５．９Ｈｚ，２Ｈ），３．０３（ｓ，３Ｈ），１．１９（ｓ，９Ｈ）；１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ３）δ１７８．２８，１３０．６１，１２６．１１，６５．０８，５９．６５，３８．８４，３８．２１，２７．２５；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ４）：２６８．１２、実測値：２６８．２０、Ｒｆ＝０．３（２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0157】

化合物７：メタンスルホノチオエートナトリウム（０．６３ｇ、４．７０ｍｍｏｌ）および（Ｚ）−４−（メチルスルホニルオキシ）ブト−２−エニルピバレート（１．００ｇ、４．００ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（１０ｍｌ）溶液を、白色沈殿物の形成（１０分後）を伴いながら、室温で１８時間撹拌した。結果として得られた混合物を、水およびＤＣＭの添加によって分割した。ＤＣＭに抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として、０．８３ｇ、７８％の化合物７を得た。

【0158】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５．８２−５．７３（ｍ，２Ｈ），４．７３−４．６６（ｍ，２Ｈ），３．９５−３．８７（ｍ，２Ｈ），３．３２（ｓ，３Ｈ），１．１９（ｓ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７８．３５，１２９．３７，１２７．３２，５９．５０，５１．４４，３８．８４，３３．６１，２７．２８；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：２８４．１０、実測値：２８４．１９、Ｒ_ｆ＝０．４（２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0159】

化合物９：塩化ピバロイル（０．６０ｇ、５．０ｍｍｏｌ）を、ＤＣＭ（２０ｍｌ）中のＳ−２−ヒドロキシエチルメタンスルホノチオエート（０．６５ｇ、４．１６ｍｍｏｌ）の撹拌溶液に、滴下方式で添加した。室温で２時間後、結果として得られた白色沈殿物を有する混合物を、水で分割した。有機層を分離し、乾燥させ（Ｎｓ_２ＳＯ_４）、濾過し、油に濃縮した。カラムによって、無色の油として化合物９を得た（０．４５ｇ、４５％）。^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ４．３９−４．３４（ｔ，Ｊ＝６．３Ｈｚ，２Ｈ），３．４４−３．３９（ｔ，Ｊ＝６．３Ｈｚ，２Ｈ），３．３６（ｓ，３Ｈ），１．２０（ｓ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ６２．１０，５１．１１，３８．９６，３５．１９，２７．２４；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：１５８．０８、実測値：１５８．０４。Ｒ_ｆ＝０．３（２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0160】

化合物１１：塩化ピバロイル（４．９６ｍｌ、４０．３ｍｍｏｌ）を、２−（ヒドロキシメチル）フェノール（５ｇ、４０．３ｍｍｏｌ）およびトリエチルアミン（５．６１ｍｌ、４０．３ｍｍｏｌ）の氷冷ＤＣＭ溶液（５０ｍｌ）に、シリンジを介して滴下添加した。粗製ピバル酸エステルの氷冷溶液を、トリエチルアミン（６．７４ｍｌ、４８．４ｍｍｏｌ）および５０ｍｌのＤＣＭで処理した。次いで、メタンスルホニルクロリド（３．４３ｍｌ、４４．３ｍｍｏｌ）を、シリンジを介してゆっくりと添加し（５分間）、結果として得られた混合物を、室温まで温めた。混合物を、氷上に注ぎ、有機層を分離し、次いで飽和ＮａＨＣＯ３（水溶液）で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、１０．５ｇの粗製淡黄色油に濃縮した。

【0161】

カラム（ＩＳＣＯ）により、５．４５ｇ、４７％の純粋な１１を得た。

【0162】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ７．５３-７．４６（ｄｄ，７．７，１．８Ｈｚ，１Ｈ），７．４６-７．４０（ｄｔ，７．７，１．８Ｈｚ，１Ｈ），７．３２-７．２４（ｔ，７．７Ｈｚ，１Ｈ），７．１３-７．０６（ｄ，７．７Ｈｚ，１Ｈ），５．２１（ｓ，２Ｈ），２．７９（ｓ，３Ｈ），１．４０（ｓ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７７．０５，１５０．０６，１３１．１８，１３１．０７，１２６．３５，１２５．９４，１２３．２１，６６．８８，３９．４８，３８．８２，２７．３０，２７．２６。ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：３０４．１２、実測値：３０３．９９。Ｒ_ｆ＝０．４（２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0163】

化合物１２：メタンスルホノチオエートナトリウム（０．８２５ｇ、６．１５ｍｍｏｌ）のＭｅＯＨ（２０ｍｌ）溶液を、室温で２−（（メチルスルホニルオキシ）メチル）フェニルピバレート（１．７６ｇ、６．１５ｍｍｏｌ）で処理し、１８時間撹拌したままにした。混合物を、水とＤＣＭとに分割した。有機層を分離し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、濃縮して、無色の油を得た。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として、０．７５４ｇ、４１％の純粋な化合物１２を得た。

【0164】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ７．４８-７．４４（ｄｄ，Ｊ＝７．７，１．７Ｈｚ，１Ｈ），７．３９-７．３４（ｔｄ，Ｊ＝７．８，１．７Ｈｚ，１Ｈ），７．２５-７．２０（ｔｄ，Ｊ＝７．６，１．２Ｈｚ，１Ｈ），７．１０-７．０６（ｄｄ，Ｊ＝８．２，１．２Ｈｚ，１Ｈ），４．２９（ｓ，２Ｈ），２．９０（ｓ，３Ｈ），１．３９（ｓ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７６．６９，１４９．５９，１３１．１７，１２９．８５，１２７．４１，１２６．１８，１２３．４０，５１．４３，３９．４７，３６．０１，２７．３０；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：３２０．１０、実測値：３２０．０９。Ｒ_ｆ＝０．４（２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0165】

化合物１４：クロロメチルピバレート（０．４７８ｍｌ、３．３２ｍｍｏｌ）を、室温で、アセトン（７ｍｌ）中のヨウ化ナトリウム（０．０５０ｇ、０．３３ｍｍｏｌ）およびメタンスルホノチオエートナトリウム（０．４４５ｇ、３．３２ｍｍｏｌ）の撹拌混合物に添加した。２４時間後、ＴＬＣは、生成物への良好な変換を示した。溶媒を除去し、残渣を水とＤＣＭとに分割した。有機層を分離し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、濃縮して、無色の油を得た。カラムクロマトグラフィーにより、薄いピンク色の固体として、０．４１ｇ、５５％の純粋な１４を得た。

【0166】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５．６７（ｓ，２Ｈ），３．３９（ｓ，３Ｈ），１．２４（ｓ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７７．３５，６７．８４，５２．２０，３８．９３，２７．０５。Ｒ_ｆ＝０．５（２０％ＥｔＯＡｃ／ヘキサン）。

【0167】

化合物１６：１５およびＮａＭＴＳから、前述のように調製した：米国特許第３，４８４，４７３号。
^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ４．８６（ｓ，２Ｈ），３．４５（ｓ，６Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５２．１５，４１．５０。

【0168】

化合物１８：１７およびＮａＭＴＳから、前述のように調製した：Ｃｈｅｍ．Ｐｈａｒｍ．Ｂｕｌｌ．Ｖｏｌ．１２（１１）ｐ．１２７１，１９６４。
^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ３．５５（ｓ，４Ｈ），３．４０（ｓ，６Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ５０．６７，３５．９６。

【0169】

化合物１９：２−モルホリノエタンチオール（０．１７ｇ、１．２ｍｍｏｌ）のＤＣＭ溶液（１ｍｌ）を、室温で、ＤＣＭ（１０ｍｌ）中の化合物１８（３００ｍｇ、１．２ｍｍｏｌ）の撹拌溶液に、シリンジを介して滴下添加した。添加した直後に、ＴＬＣを検査し、生成物およびいくらかの二量体の急速な形成が明らかとなった。０．５時間後、混合物を、ＮａＨＣＯ_３の添加によって分割した。抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、無色の油として純粋な１９（０．２０ｇ、５３％）を得た。^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ３．７３−３．６７（ｔ，Ｊ＝４．７Ｈｚ，４Ｈ），３．５１−３．４６（ｍ，２Ｈ），３．３５（ｓ，３Ｈ），３．０７−３．０１（ｍ，２Ｈ），２．８８−２．８３（ｍ，２Ｈ），２．６９−２．６３（ｍ，２Ｈ），２．５２−２．４３（ｔ，Ｊ＝４．６Ｈｚ，４Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ６６．９６，５７．９１，５３．５８，５０．７９，３７．６６，３６．１０，３５．５２；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：３１８．０３、実測値：３１８．０４。Ｒ_ｆ＝０．３（ＥｔＯＡｃ）。

【0170】

化合物２１：化合物２０を、化合物１１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１に変換させる。

【0171】

化合物２２：化合物２１を、化合物１２について記載したものに類似の手順によって、化合物２２に変換させる。

【0172】

化合物２３：化合物２３を、文献の方法（Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎａｌ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，５０（２３），５５６８−５５７０；２００７）に従って調製する。

【0173】

化合物２４：化合物２３（１ｍｍｏｌ）の氷冷ピリジン溶液（１０ｍｌ）を、連続的に、滴下方式で塩化アセチル（１ｍｍｏｌ）で処理し、続いて５分後にＭｓＣｌ（１．１ｍｍｏｌ）で処理する。溶液を室温に温め、次いで溶媒を除去する。残渣をＥｔＯＡｃ中に溶解し、水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。カラムクロマトグラフィーによる精製によって、純粋な化合物２４を得る。

【0174】

化合物２５：化合物２４を、化合物１２について記載したものに類似の手順によって、化合物２５に変換させる。

【0175】

化合物２７：化合物２６を、化合物１４について記載したものに類似の手順によって、化合物２７に変換させる。

【0176】

化合物２９：化合物２８を、化合物１４について記載したものに類似の手順によって、化合物２９に変換させる。

【0177】

化合物３０：化合物３０を、文献の方法（Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，４２（２），６０１−７；１９８６．）に従って調製する。

【0178】

化合物３１：化合物３１を、特許の手順（米国特許第２００９０１８１４４４号）に従って、化合物３０から調製する。

【0179】

化合物３３：化合物３３を、特許の手順（米国特許第２００９０１８１４４４号）に従って、化合物３２から調製する。

【0180】

化合物３６：化合物３４（１ｍｍｏｌ）の氷冷ＤＣＭ（２０ｍｌ）溶液を、ＮＥｔ_３（１ｍｍｏｌ）で処理し、続いてＴＭＳ−Ｃｌ（１．１ｍｍｏｌ）の滴下添加を行う。１時間後、この溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。粗製ＴＭＳ保護材料をＴＨＦ（１０ｍｌ）中に再溶解し、そこにＰＰｈ_３（１．２ｍｍｏｌ）、化合物３５（１．２ｍｍｏｌ）、次いでＤＥＡＤ（１．２ｍｍｏｌ、滴下）を連続して添加する。室温で１８時間撹拌した後、溶媒を真空下で除去し、残渣をＤＣＭ中に再溶解し、その溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。カラムクロマトグラフィーによる精製によって、純粋な化合物３６を得る。

【0181】

化合物３７：化合物３６（０．５ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（１０ｍｌ）溶液を、ＴＢＡＦ（ＴＨＦ １Ｍ溶液中１ｍｍｏｌ）で処理し、ＴＬＣによって監視する。
ＴＭＳ開裂が完了した後、溶媒を真空下で除去し、残渣をＤＣＭ中に再溶解し、その溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。
粗製アルコールをピリジン（５ｍｌ）中に再溶解し、ＴｓＣｌ（０．５５ｍｍｏｌ）を添加する。室温で１８時間後、溶媒を除去し、残渣をＤＣＭ中に再溶解し、その溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。カラムクロマトグラフィーによる精製によって、純粋な化合物３７を得る。

【0182】

化合物３８：化合物３７を、化合物１２について記載したものに類似の手順によって、化合物３８に変換させる。

【0183】

化合物４０：化合物３９（１ｍｍｏｌ）の氷冷ＤＣＭ（２０ｍｌ）溶液を、ＮＥｔ_３（１ｍｍｏｌ）で処理し、続いてＴＭＳ−Ｃｌ（１．１ｍｍｏｌ）の滴下添加を行う。１時間後、この溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。粗製ＴＭＳ保護材料をＴＨＦ（１０ｍｌ）中に再溶解し、そこにＰＰｈ_３（１．２ｍｍｏｌ）、カリウムｐ−トルエンチオスルホネート（ＫＴＴＳ、１．２ｍｍｏｌ）、無水ＺｎＣｌ_２（１ｍｍｏｌ）、次いでＤＥＡＤ（１．２ｍｍｏｌ、滴下）を連続して添加する。室温で１８時間撹拌した後、溶媒を真空下で除去し、残渣をＤＣＭ中に再溶解し、その溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。カラムクロマトグラフィーによる精製によって、純粋な化合物４０を得る。

【0184】

化合物４１：化合物４０（０．５ｍｍｏｌ）のＴＨＦ（１０ｍｌ）溶液を、ＴＢＡＦ（ＴＨＦ １Ｍ溶液中１ｍｍｏｌ）で処理し、ＴＬＣによって監視する。ＴＭＳ開裂が完了した後、溶媒を真空下で除去し、残渣をＤＣＭ中に再溶解し、その溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。粗製アルコールをＴＨＦ（１０ｍｌ）中に再溶解し、そこにＰＰｈ_３（１．２ｍｍｏｌ）、化合物３５（１．２ｍｍｏｌ）、次いでＤＥＡＤ（１．２ｍｍｏｌ、滴下）を連続して添加する。室温で１８時間撹拌した後、溶媒を真空下で除去し、残渣をＤＣＭ中に再溶解し、その溶液を水で洗浄し、乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮する。カラムクロマトグラフィーによる精製によって、純粋な化合物４０を得る。

【0185】

化合物４２：化合物４１を、化合物１４について記載したものに類似の手順によって、化合物４２に変換させる。
実施例２−溶液相にホスホロチオトリエステルをもたらすためのＨ−ホスホネートのチオアルキル化

【化52】

【0186】

化合物１００：Ｄｉ−ＤＭＴｒ Ｈ−ホスホネートＴＴ二量体（１００）の合成手順は、既に説明され記載されている（Ｆｒｏｅｈｌｅｒ，Ｂｒｉａｎ Ｃ．；Ｎｇ，Ｐｅｔｅｒ Ｇ．；Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ，Ｍａｒｋ Ｄ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（１９８６），１４（１３），５３９９−５４０７、Ｇａｒｅｇｇ，Ｐｅｒ Ｊ．；Ｌｉｎｄｈ，Ｉｎｇｖａｒ；Ｒｅｇｂｅｒｇ，Ｔｏｒ；Ｓｔａｗｉｎｓｋｉ，Ｊａｃｅｋ；Ｓｔｒｏｅｍｂｅｒｇ，Ｒｏｇｅｒ；Ｈｅｎｒｉｃｈｓｏｎ，Ｃｈｒｉｓｔｉｎａ Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔｅｒｓ（１９８６），２７（３４），４０５１−４０５４）。

【0187】

化合物１０１：ジアステレオマー（２００ｍｇ、０．１７６ｍｍｏｌ）の混合物である化合物１００を、ＡＣＮ（６ｍｌ）中に溶解し、次いで、トリメチルシリル２，２，２−トリフルオロ−Ｎ−（トリメチルシリル）アセトイミデート（２２７ｍｇ、０．８８２ｍｍｏｌ）を添加した。次いで、ＡＣＮ（２ｍｌ）中の（Ｚ）−Ｓ−４−（（２−モルホリノエチル）ジスルファニル）ブト−２−エニルメタンスルホノチオエート（１２１ｍｇ、０．３５３ｍｍｏｌ）の溶液を、ＴＬＣおよびＨＰＬＣ／ＭＳによって監視しながら、３つのおおよそ等しい分量で１時間にわたり添加した。３時間後、結果として得られた溶液を、水の添加によって分割した。抽出した後、有機層を分離し、次いで乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、真空で濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、白色の発泡体として、２２５ｍｇ、９１％の化合物１０１を得た。

【0188】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．７２（ｄ，ｂｒ，１Ｈ），９．２７，（ｄ，ｂｒ，１Ｈ），７．５３（ｄｄ，Ｊ＝２５．０，１Ｈｚ，１Ｈ），７．４２，（ｔ，Ｊ＝７．０Ｈｚ，２Ｈ），７．３７−７．１６（ｍ，１７Ｈ），６．８３（ｍ，８Ｈ），６．４３−６．２８（ｍ，２Ｈ），５．６３−５．４２（ｍ，２Ｈ），５．２１（ｑ，Ｊ＝７．１Ｈｚ，１Ｈ），４．２７（ｍ，ｂｒ，１Ｈ），３．９４（ｍ，ｂｒ，２Ｈ），３．７７（ｍ，１２Ｈ），３．７４−３．６０（ｍ，６Ｈ），３．５１−３．２２（ｍ，５Ｈ），２．８２−２．７６（ｍ，２Ｈ），２．６８−２．６０（ｍ，２Ｈ），２．５９−２．４６（ｍ，５Ｈ），２．４４−２．３３（ｍ，２Ｈ），２．０３−１．８８（ｍ，１Ｈ），１．８４（ｍ，３Ｈ），１．７５−１．６６（ｍ，１Ｈ），１．４８−１．３２（ｄｄ，Ｊ＝１１．８，１．２Ｈｚ，３Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１６４．１０，１６４．０７，１６４．００，１６３．９４，１５９．１４，１５９．１０，１５０．８０，１５０．７８，１５０．７５，１５０．６３，１４５．０９，１４４．３０，１４４．２７，１３６．３１，１３６．２７，１３６．２２，１３６．１８，１３５．９５，１３５．８２，１３５．４３，１３５．３５，１３５．３３，１３５．２４，１３５．２２，１３０．５２，１３０．４３，１３０．４０，１２９．４９，１２９．３０，１２８．５４，１２８．４３，１２８．３９，１２７．６４，１２７．５７，１１３．７８，１１３．７６，１１３．７３，１１３．６７，１１２．０５，１１１．５６，８７．７７，８７．６６，８７．５８，８５．７７，８５．５９，８４．６３，８４．５１，７４．４２，７４．３３，６７．０２，６６．９５，６３．６３，６３．４９，５８．２７，５８．２３，５５．６０，５５．５８，５３．６９，５３．６２，３９．４８，３９．２６，３９．１８，３５．８８，３５．６１，３５．４３，３５．３６，２８．１８，１２．８３，１２．７９，１２．０２，１１．９５．；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２９．２５，２９．１２；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１３９８．４６、実測値：１３９８．６４。Ｒ_ｆ＝０．４（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0189】

化合物２０１：化合物１０１（０．１５０ｇ、０．１０７ｍｍｏｌ）を、３％ＴＣＡ／ＤＣＭ（１０ｍｌ）とともに１０分間にわたり撹拌した。ＴＬＣおよびＨＰＬＣ／ＭＳは、反応が完了したことを示した。１０ｍｌのＭｅＯＨを添加し、２分間撹拌を継続した。溶媒を蒸発させ、残渣をカラムクロマトグラフィーによって精製して、白色の固体として化合物２０１（８５ｍｇ、１００％）を得た。

【0190】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ７．７８（ｄｄ，Ｊ＝７．２，１．３Ｈｚ，１Ｈ），７．５３（ｄ，Ｊ＝１．３Ｈｚ，１Ｈ），６．３３−６．２７（ｍ，２Ｈ），５．８３−５．７０（ｍ，２Ｈ），５．２５−５．１９（ｍ，１Ｈ），４．４７−４．３０（ｍ，３Ｈ），４．２７−４．２２（ｍ，１Ｈ），４．１１−４．０５（ｍ，１Ｈ），３．８９−３．８２（ｔ，Ｊ＝４．８Ｈｚ，４Ｈ），３．８５（ｍ，２Ｈ），３．７６−３．７０（ｄｄｄ，Ｊ＝１５．５，７．２，１．７Ｈｚ，２Ｈ），３．５２（ｄｄ，Ｊ＝７．３，３．７Ｈｚ，２Ｈ），３．２８−３．１９（ｂｒ，２Ｈ），３．１６−３．０５（ｂｒ，４Ｈ），３．０５−２．９８（ｄｄｄ，Ｊ＝９．８，５．５，２．０Ｈｚ，２Ｈ），２．６２−２．５２（ｔｄｄ，Ｊ＝１１．５，５．７，１．９Ｈｚ，１Ｈ），２．４７−２．３６（ｍ，１Ｈ），２．３３−２．２８（ｍ，２Ｈ），１．９２−１．８７（ｍ，６Ｈ）；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ３０．２２，３０．１９；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：７９４．２０、実測値：７９４．１８。Ｒ_ｆ＝０．３（１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0191】

化合物１０２：化合物１００（４００ｍｇ、０．３５２ｍｍｏｌ）を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０２に変換させた（４１７ｍｇ、９０％）。

【0192】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．１７（ｄ，Ｊ＝６．０Ｈｚ，１Ｈ），９．１３−９．００（ｄ，Ｊ＝２５．７Ｈｚ，１Ｈ），７．５８−７．４９（ｄｄ，Ｊ＝２６．３，１．５Ｈｚ，１Ｈ），７．４５−７．４０（ｄｄｄ，Ｊ＝８．０，５．２，１．３Ｈｚ，２Ｈ），７．４０−７．１８（ｍ，１７Ｈ），６．８７−６．８１（ｍ，８Ｈ），６．４４−６．３０（ｍ，２Ｈ），５．６５−５．５３（ｍ，１Ｈ），５．５３−５．４４（ｍ，１Ｈ），５．２６−５．１６（５重線，Ｊ＝６．４Ｈｚ，１Ｈ），４．６１−４．５４（ｍ，２Ｈ），４．３０−４．２４（ｍ，１Ｈ），４．１９−４．１３（ｍ，１Ｈ），３．９７−３．８８（ｍ，２Ｈ），３．８０−３．７２（ｍ，１２Ｈ），３．６９−３．５７（ｍ，１Ｈ），３．５４−３．３０（ｍ，５Ｈ），２．６１−２．４９（ｄｔ，Ｊ＝１４．４，５．４Ｈｚ，１Ｈ），２．４４−２．３２（ｍ，１Ｈ），２．０２−１．９１（ｄｔ，Ｊ＝１２．５，５．４Ｈｚ，１Ｈ），１．８５−１．８０（ｄｄ，Ｊ＝５．０，１．３Ｈｚ，３Ｈ），１．７６−１．６３（ｍ，１Ｈ），１．４３−１．３６（ｄｄ，Ｊ＝１０．２，１．２Ｈｚ，３Ｈ），１．１９−１．１４（ｄ，Ｊ＝２．０Ｈｚ，８Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７８．２２，１７８．１７，１６３．８２，１６３．８０，１６３．７５，１５８．９２，１５８．８８，１５０．５２，１５０．４３，１４４．９０，１４４．８８，１４４．１０，１４４．０５，１３６．１１，１３６．０８，１３６．０５，１３６．０１，１３５．５９，１３５．２８，１３５．１６，１３５．０３，１３５．０１，１３０．３０，１３０．２３，１３０．１９，１３０．１６，１２８．６９，１２８．６４，１２８．５９，１２８．３９，１２８．３４，１２８．２３，１２８．２１，１２８．１７，１２７．４２，１２７．３４，１１３．５４，１１３．４５，１１１．８５，１１１．８２，１１１．４１，１１１．３６，８７．５９，８７．４３，８７．３７，８５．４７，８５．３３，８４．４３，８４．２９，８４．０８，８４．００，８３．９２，７４．２４，６７．３６，６３．３８，６３．２６，５９．４２，５５．３７，３９．２２，３８．７７，２７．９４，２７．２４，１２．５７，１１．８０，１１．７４；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２９．２３，２８．９７；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１３３８．５１、実測値：１３３８．８４。Ｒ_ｆ＝０．５（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0193】

化合物２０２：化合物１０２（２００ｍｇ、０．１５１ｍｍｏｌ）を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０２に変換させた（１０５ｍｇ、９７％）。

【0194】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ７．８１−７．７５（ｄｄ，Ｊ＝８．２，１．３Ｈｚ，１Ｈ），７．５７−７．５１（ｄｄ，Ｊ＝８．２，１．３Ｈｚ，１Ｈ），６．３３−６．２３（ｍ，２Ｈ），５．８５−５．７５（ｍ，１Ｈ），５．７５−５．６６（ｍ，１Ｈ），５．２６−５．１９（ｍ，１Ｈ），４．７２−４．６６（ｍ，２Ｈ），４．４７−４．３０（ｍ，３Ｈ），４．２７−４．２０（ｍ，１Ｈ），４．１１−４．０４（ｍ，１Ｈ），３．８３−３．７６（ｍ，２Ｈ），３．７４−３．６４（ｍ，２Ｈ），２．６２−２．５１（ｍ，１Ｈ），２．４５−２．３５（ｔｄ，Ｊ＝８．７，６．５Ｈｚ，１Ｈ），２．３２−２．２４（ｍ，２Ｈ），１．９３−１．８２（ｍ，６Ｈ），１．２０−１．１５（ｄ，Ｊ＝２．１Ｈｚ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１２６ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ１７９．６５，１６６．２８，１５２．３０，１５２．２８，１５２．２２，１３７．９０，１３７．８１，１３７．７９，１３０．０７，１３０．０４，１２９．２６，１２９．２４，１１１．９３，１１１．８８，１１１．８７，８７．２６，８７．２２，８６．９６，８６．９０，８６．７６，８６．５４，８６．１２，８６．０７，８５．９８，８５．９２，８５．８８，８５．８２，８０．５４，８０．４９，８０．４６，８０．４１，７１．８４，７１．６７，６８．７１，６８．６６，６８．４５，６８．４０，６２．５８，６２．５０，６０．７２，４０．５１，４０．４４，３９．７０，３９．５２，３９．４８，２８．６７，２８．６４，２８．６１，２７．５３，１２．６４，１２．４８；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２９．２３，２８．９７；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：７１７．２２、実測値：７１７．２３。Ｒ_ｆ＝０．５（１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0195】

化合物１０３：化合物１００（４００ｍｇ、０．３５２ｍｍｏｌ）を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０３に変換させた（３７９ｍｇ、８３％）。

【0196】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．４８（ｓ，１Ｈ），９．４１−９．２９（ｍ，１Ｈ），７．６０−７．４８（ｄｄ，Ｊ＝９．０，１．０Ｈｚ，１Ｈ），７．４６−７．４０（ｄｔ，Ｊ＝６．９，１．２Ｈｚ，２Ｈ），７．３９−７．１７（ｍ，１７Ｈ），６．８９−６．７９（ｍ，８Ｈ），６．４４−６．３１（ｍ，２Ｈ），５．２７−５．２０（ｔ，Ｊ＝６．５Ｈｚ，１Ｈ），４．３０−４．２４（ｔ，Ｊ＝６．１Ｈｚ，１Ｈ），４．１９−４．１５（ｍ，２Ｈ），４．１３−４．０７（ｔ，Ｊ＝７．１Ｈｚ，１Ｈ），３．９９−３．９０（ｍ，２Ｈ），３．７９−３．７４（ｍ，１２Ｈ），３．７０−３．５８（ｍ，１Ｈ），３．５１−３．４３（ｔｄ，Ｊ＝８．８，７．２，２．３Ｈｚ，１Ｈ），３．４０−３．３２（ｍ，１Ｈ），３．０２−２．８５（ｍ，２Ｈ），２．６１−２．４９（ｄｔ，Ｊ＝１８．５，７．０Ｈｚ，１Ｈ），２．４７−２．３３（ｍ，１Ｈ），１．９８−１．９０（ｄｔ，Ｊ＝１０．２，５．０Ｈｚ，１Ｈ），１．８５−１．８１（ｍ，３Ｈ），１．７４−１．６２（ｔｄ，Ｊ＝１４．２，７．１Ｈｚ，１Ｈ），１．４２−１．３６（ｍ，３Ｈ），１．１９−１．１３（ｄ，Ｊ＝４．９Ｈｚ，９Ｈ）；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２９．３６，２９．１８；^１３Ｃ ＮＭＲ（１２６ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７７．９７，１７７．８９，１６３．９４，１６３．９１，１６３．９０，１６３．８６，１５８．９１，１５８．８７，１５０．６３，１５０．５４，１５０．５３，１５０．５０，１４４．８８，１４４．８５，１４４．１０，１４４．０４，１３６．０９，１３５．９９，１３５．５２，１３５．５０，１３５．２４，１３５．１６，１３５．１２，１３５．０４，１３５．００，１３０．３１，１３０．２９，１３０．２０，１３０．１６，１３０．１３，１２８．３４，１２８．２０，１２８．１８，１２８．１４，１２７．３９，１２７．３１，１２４．８９，１１３．５５，１１３．５２，１１３．４３，１１１．８４，１１１．３８，８７．５８，８７．４２，８７．３６，８５．３０，８４．９８，８４．９５，８４．４０，８４．３３，８４．２７，８３．９８，８３．９１，８３．８４，７９．３１，７９．２７，７８．８８，７８．８４，７４．１６，７４．０８，６７．５６，６７．５０，６７．４６，６７．４１，６３．３３，６３．２４，６２．７９，６２．７５，５５．３４，３９．２１，３９．１６，３９．０４，３９．００，３８．８５，３８．８２，２９．９５，２９．９２，２９．６６，２９．６３，２７．１７，１２．５３，１１．８０，１１．７２；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１３１２．６９、実測値：１３１２．４９。Ｒ_ｆ＝０．４（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0197】

化合物２０３：化合物１０３（２００ｍｇ、０．１５４ｍｍｏｌ）を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０３に変換させた（１０３ｍｇ、９８％）。

【0198】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ７．８０−７．７６（ｄｄ，Ｊ＝８．２，１．２Ｈｚ，１Ｈ），７．５５−７．５１（ｄｄ，７．１，１．２Ｈｚ，１Ｈ），６．３２−６．２４（ｍ，２Ｈ），５．２６−５．１９（ｍ，１Ｈ），４．４６−４．２０（ｍ，６Ｈ），４．１０−４．０５（ｍ，１Ｈ），３．８２−３．７８（ｄｄ，Ｊ＝６．５，３．２Ｈｚ，２Ｈ），３．２２−３．１４（ｄｄｄ，Ｊ＝１６．６，７．０，５．８Ｈｚ，２Ｈ），２．６１−２．５１（ｔｄｄ，Ｊ＝１３．０，５．９，２．１Ｈｚ，１Ｈ），２．４６−２．３７（ｄｄｄ，Ｊ＝１４．３，８．３，６．０Ｈｚ，１Ｈ），２．３１−２．２６（ｔ，Ｊ＝５．８Ｈｚ，２Ｈ），１．９１−１．８６（ｄｔ，Ｊ＝１１．０，１．２Ｈｚ，６Ｈ），１．２１−１．１７（ｍ，９Ｈ）；^３１ＰＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ３０．１５；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ１７９．４５，１７９．４２，１６６．２９，１５２．３１，１５２．２９，１５２．２３，１３７．８２，１３７．８０，１３７．７８，１１１．９１，１１１．８８，８７．２１，８７．１７，８６．９４，８６．８７，８６．６３，８６．５２，８６．１１，８６．０６，８５．９２，８５．８４，８５．７７，８０．６７，８０．６０，８０．４９，８０．４３，７１．７９，７１．６４，６８．８０，６８．７４，６８．５８，６８．５２，６４．１１，６４．０７，６４．０２，６２．５４，６２．４４，４０．４８，４０．４３，３９．８１，３９．７１，３９．６８，３９．５２，３９．４７，３０．７４，３０．７２，３０．６８，２７．５２，１２．６５，１２．５０；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：６９１．２１、実測値：６９１．０９。Ｒ_ｆ＝０．５（１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0199】

化合物１０４：化合物１００（４００ｍｇ、０．３５２ｍｍｏｌ）を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０４に変換させた（４５１ｍｇ、９４％）。

【0200】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．１７−９．０１（ｍ，２Ｈ），７．５１−７．４６（ｄｄ，Ｊ＝７．８，１．５Ｈｚ，１Ｈ），７．４５−７．３８（ｍ，２Ｈ），７．３７−７．０９（ｍ，１９Ｈ），７．０１−６．９０（ｍ，２Ｈ），６．８７−６．７８（ｍ，８Ｈ），６．３９−６．２７（ｍ，２Ｈ），５．１５−５．０１（ｍ，１Ｈ），４．２０−４．１３（ｍ，１Ｈ），３．９６−３．９０（ｍ，１Ｈ），３．９０−３．８３（ｍ，２Ｈ），３．８０−３．６８（ｍ，１４Ｈ），３．５２−３．２０（ｍ，３Ｈ），２．４５−２．１６（ｍ，２Ｈ），２．０１−１．８８（ｄｄｄ，Ｊ＝２３．３，１３．６，５．６Ｈｚ，１Ｈ），１．８５−１．７９（ｄｄ，Ｊ＝９．３，１．２Ｈｚ，３Ｈ），１．６９−１．５３（ｍ，１Ｈ），１．４０−１．３１（ｍ，１２Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７６．４６，１７６．３７，１６３．８４，１６３．７８，１５８．９０，１５８．８７，１５０．５２，１５０．５０，１５０．４３，１４９．３８，１４９．２８，１４４．９５，１４４．８８，１４４．１６，１４４．１０，１３６．１３，１３６．１１，１３６．０９，１３６．０３，１３５．５７，１３５．４９，１３５．３７，１３５．２６，１３５．２１，１３５．０８，１３５．０４，１３０．８３，１３０．７４，１３０．２９，１３０．２１，１３０．１６，１２９．５１，１２９．４９，１２９．４０，１２９．３６，１２９．３５，１２９．３１，１２８．３８，１２８．３５，１２８．２７，１２８．２３，１２８．１９，１２８．１４，１２７．３９，１２７．３３，１２６．０５，１２５．９４，１２２．９４，１２２．８６，１１３．５３，１１３．４２，１１１．７７，１１１．７３，１１１．３９，１１１．２８，８７．５５，８７．５２，８７．３７，８７．３２，８５．３３，８４．９５，８４．９０，８４．２９，８４．２０，８４．００，８３．９２，８３．８７，８３．７９，７９．０５，７９．００，７４．２９，７４．２４，６７．３１，６７．２４，６７．１７，６７．１１，６３．３７，５５．３７，５５．３５，３９．３７，３９．３２，３９．１５，３９．１０，３８．６４，３０．５１，３０．４１，３０．３６，２７．２８，２７．２４，１２．５９，１２．５１，１１．７５，１１．６７；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２９．１２，２８．４９；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋ＮＨ_４）：１３７４．５１、実測値：１３７４．７４。Ｒ_ｆ＝０．４（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0201】

化合物２０４：化合物１０４（２００ｍｇ、０．１４７ｍｍｏｌ）を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０４に変換させた（９８ｍｇ、８８％）。

【0202】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ７．７７−７．７３（ｍ，１Ｈ），７．５１−７．４３（ｍ，２Ｈ），７．３８−７．３１（ｍ，１Ｈ），７．２５−７．１９（ｄｄｄ，Ｊ＝９．２，５．４，１．６Ｈｚ，１Ｈ），７．０８−７．０２（ｄｄｄ，Ｊ＝８．０，３．８，１．３Ｈｚ，１Ｈ），６．２８−６．１７（ｍ，２Ｈ），５．１０−５．０１（ｍ，１Ｈ），４．３０−４．１６（ｍ，３Ｈ），４．１１−４．０３（ｍ，３Ｈ），４．０３−３．９７（ｄ，Ｊ＝５．３Ｈｚ，２Ｈ），３．７４−３．６３（ｍ，２Ｈ），２．４８−２．１１（ｍ，５Ｈ），１．９０−１．８２（ｍ，６Ｈ），１．４３−１．３６（ｄ，Ｊ＝３．４Ｈｚ，９Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ１７８．０５，１６６．２６，１５２．２５，１５２．１９，１５０．７８，１３７．８０，１３７．７６，１３２．１３，１３２．０９，１３０．６１，１３０．５６，１２７．２４，１２４．１０，１１１．９２，１１１．８４，１１１．７９，８７．１４，８７．０９，８６．８０，８６．７１，８６．５０，８５．９８，８５．９５，８５．９２，８５．８７，８５．８３，８５．７５，８０．５５，８０．４８，８０．３２，８０．２７，７１．９７，７１．７３，６８．６７，６８．６１，６８．３５，６８．２９，６２．５１，６２．４２，４０．４１，４０．３６，４０．３２，３９．６６，３９．６４，３９．３５，３９．２９，３１．０８，３１．０４，２７．６１，１２．６８，１２．６５，１２．４９；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ２９．５４，２９．２９；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：７５３．２２、実測値：７５３．１２。Ｒ_ｆ＝０．５（１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0203】

化合物１０５：化合物１００（２００ｍｇ、０．１７６ｍｍｏｌ）を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０５に変換させた（１５８ｍｇ、７０％）。

【0204】

^１Ｈ ＮＭＲ（４００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ７．４６−７．３９（ｍ，２Ｈ）７．３８−７．１６（ｍ，１８Ｈ），６．９０−６．７７（ｍ，８Ｈ），６．４３−６．２７（ｍ，１Ｈ），５．３９−５．１８（ｍ，２Ｈ），４．３１−４．２３（ｄｄ，Ｊ＝１２．０，６．２Ｈｚ，１Ｈ），４．２０−４．１２（ｍ，１Ｈ），３．９８−３．８６（ｍ，１Ｈ），３．８２−３．７０（ｍ，１２Ｈ），３．６９−３．５２（ｍ，１Ｈ），３．５０−３．４３（ｔｄ，Ｊ＝９．９，８．９，２．７Ｈｚ，１Ｈ），３．４１−３．２９（ｄｄｄ，Ｊ＝１７．２，１０．８，２．５Ｈｚ，１Ｈ），２．５９−２．４９（ｍ，１Ｈ），２．４４−２．３０（ｍ，１Ｈ），２．０３−１．９３（ｍ，１Ｈ），１．８６−１．７９（ｄ，Ｊ＝２．９Ｈｚ，３Ｈ），１．７５−１．６７（ｍ，４Ｈ），１．４３−１．３６（ｄ，３Ｈ），１．１６−１．０８（ｄ，Ｊ＝９．３Ｈｚ，９Ｈ）；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２８．１４，２７．８１（２つのジアステレオマー）。ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１２８１．４、実測値：１２８１．１（Ｍ＋Ｈ）^＋および１２９８．６（Ｍ＋ＮＨ_４）^＋

【0205】

化合物２０５：化合物１０５（１３７ｍｇ、０．１０７ｍｍｏｌ）を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０５に変換させた（６６ｍｇ、９１％）。^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ７．８３−７．７６（ｍ，１Ｈ），７．５６−７．５０（ｍ，１Ｈ），６．３４−６．２２（ｍ，２Ｈ），５．５１−５．４３（ｍ，Ｈ），５．２８−５．２０（ｑｔ，Ｊ＝７．８，１．８Ｈｚ，１Ｈ），４．４７−４．３１（ｍ，３Ｈ），４．２９−４．２１（ｍ，１Ｈ），４．１０−４．０５（ｍ，１Ｈ），３．８７−３．７３（ｄｄ，Ｊ＝７．６，３．１Ｈｚ，２Ｈ），２．６２−２．５０（ｔｄｄ，Ｊ＝１６．９，５．７，１．９Ｈｚ，１Ｈ），２．４５−２．３６（ｍ，１Ｈ），２．３２−２．２５（ｄｄｄ，Ｊ＝６．９，５．４，１．５Ｈｚ，３Ｈ），１．９２−１．８４（ｍ，６Ｈ），１．２２−１．１８（ｄ，Ｊ＝５．３Ｈｚ，９Ｈ）；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ２８．７１，２８．４２（２つのジアステレオマー）。ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：６７７．２、実測値：６７７．２（Ｍ＋Ｈ）^＋、６９４．２（Ｍ＋ＮＨ_４）^＋

【0206】

化合物１０６：化合物１００（４０５ｍｇ、０．３５７ｍｍｏｌ）を、化合物１９を使用して、化合物１０１について記載されたものに類似の手順に従って、化合物１０６に変換させた（０．３５ｇ、７１％）。^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．９７−９．４２（ｍ，２Ｈ），７．５８−７．４７（ｍ，１Ｈ），７．４６−７．３９（ｍ，２Ｈ），７．３９−７．１３（ｍ，１７Ｈ），６．８７−６．７８（ｍ，８Ｈ），６．４４−６．２９（ｄｔｄ，Ｊ＝２０．４，９．２，４．７Ｈｚ，２Ｈ），５．２７−５．１６（ｄｔ，Ｊ＝１４．７，７．３Ｈｚ，１Ｈ），４．３０−４．２２（ｍ，１Ｈ），４．２２−４．１２（ｍ，１Ｈ），４．０２−３．９０（ｑ，Ｊ＝３．８，３．４Ｈｚ，２Ｈ），３．８０−３．７３（ｍ，１２Ｈ），３．７２−３．６５（ｍ，５Ｈ），３．５１−３．４３（ｍ，１Ｈ），３．４０−３．３１（ｍ，１Ｈ），３．１４−２．９３（ｍ，２Ｈ），２．８５−２．７２（ｍ，４Ｈ），２．６７−２．５９（ｍ，２Ｈ），２．５７−２．３４（ｍ，６Ｈ），１．９７−１．８７（ｔｄ，Ｊ＝１３．７，１３．１，５．７Ｈｚ，１Ｈ），１．８４（ｓ，３Ｈ），１．７３−１．６１（ｔｄ，Ｊ＝１４．１，６．８Ｈｚ，１Ｈ），１．４２−１．３７（ｄ，Ｊ＝６．７Ｈｚ，３Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１６３．９７，１６３．９４，１６３．９１，１５８．８８，１５８．８４，１５０．６４，１５０．６０，１５０．５２，１４４．８６，１４４．８３，１４４．０９，１４４．０４，１３６．０６，１３６．０４，１３５．９５，１３５．９３，１３５．５４，１３５．１９，１３５．０９，１３５．０３，１３４．９９，１３０．２８，１３０．１７，１３０．１３，１２８．２９，１２８．１７，１２８．１４，１２７．３８，１２７．３１，１１３．５１，１１３．４２，１１１．８２，１１１．７９，１１１．４４，１１１．３８，８７．５３，８７．３８，８７．３３，８５．２９，８５．２６，８４．８９，８４．８５，８４．４１，８４．３６，８４．２９，８４．２５，８３．８８，８３．８５，８３．８０，８３．７６，７９．２８，７９．２３，７８．７２，７８．６７，７４．０４，６７．５３，６７．４６，６７．３７，６７．２９，６６．７７，６３．３３，６３．２１，５７．８４，５５．３４，５３．４１，５３．３４，３９．２３，３９．０９，３９．０１，３８．９２，３８．５５，３８．５１，３８．４６，３８．４２，３５．６４，３５．５９，３０．３５，３０．３０，３０．２６，１２．６０，１１．７９，１１．７４；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２９．３０，２９．１４；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１３７２．４４、実測値：１３７２．７９。Ｒ_ｆ＝０．４（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0207】

化合物２０６：化合物１０６（２００ｍｇ、０．１４６ｍｍｏｌ）を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０６に変換させた（１１０ｍｇ、９８％）。^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ７．８３−７．７５（ｄｄ，Ｊ＝７．６，１．４Ｈｚ，１Ｈ），７．５６−７．４８（ｄ，Ｊ＝１．６Ｈｚ，１Ｈ），６．３５−６．２３（ｍ，２Ｈ），５．２７−５．２０（ｍ，１Ｈ），４．４８−４．３１（ｍ，３Ｈ），４．２８−４．２１（ｄｄ，Ｊ＝９．７，２．１Ｈｚ，１Ｈ），４．１１−４．０４（ｔ，Ｊ＝４．０Ｈｚ，１Ｈ），３．９７−３．８４（ｂｒ，４Ｈ），３．８３−３．７７（ｄｄ，Ｊ＝６．０，３．２Ｈｚ，２Ｈ），３．４３−３．３６（ｍ，２Ｈ），３．２９−３．１８（ｍ，６Ｈ），３．１１−３．００（ｍ，４Ｈ），２．６２−２．５１（ｔｄｄ，Ｊ＝１１．７，５．７，１．７Ｈｚ，１Ｈ），２．４７−２．３８（ｄｄｄ，Ｊ＝１４．３，８．４，６．０Ｈｚ，１Ｈ），２．３８−２．２５（ｑ，Ｊ＝５．３，４．８Ｈｚ，２Ｈ），１．９１（ｓ，３Ｈ），１．８８（ｓ，３Ｈ）；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ３０．１９，３０．１２；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤ_３ＯＤ）δ１６６．２８，１６６．２４，１６６．２３，１５２．３２，１５２．２７，１５２．２４，１３８．０５，１３８．００，１３７．７７，１３７．７５，１１２．０８，１１２．０３，１１１．９７，１１１．９４，８７．２８，８７．２４，８７．０１，８６．９６，８６．６２，８６．５１，８６．１０，８６．０６，８５．７６，８５．６８，７１．７３，７１．５１，６８．９１，６８．５８，６８．５１，６５．４４，６２．６０，６２．５０，５７．５０，５３．５０，４０．２５，４０．１６，３９．６４，３９．５７，３９．２０，３９．１６，３９．０６，３２．５６，３２．５５，３１．０４，３１．００，１２．７３，１２．６９，１２．５２；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：７６８．１８、実測値：７６８．１４。Ｒ_ｆ＝０．３（１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0208】

化合物１０７：化合物５の代わりに化合物２２を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０７に変換させる。

【0209】

化合物２０７：化合物１０７を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０７に変換させる。

【0210】

化合物１０８：化合物５の代わりに化合物２５を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０８に変換させる。

【0211】

化合物２０８：化合物１０８を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０８に変換させる。

【0212】

化合物１０９：化合物５の代わりに化合物２７を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１０９に変換させる。

【0213】

化合物２０９：化合物１０９を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２０９に変換させる。

【0214】

化合物１１０：化合物５の代わりに化合物２９を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１１０に変換させる。

【0215】

化合物２１０：化合物１１０を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１０に変換させる。

【0216】

化合物１１１：化合物５の代わりに化合物３１を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１１１に変換させる。

【0217】

化合物２１１：化合物１１１を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１１に変換させる。

【0218】

化合物１１２：化合物５の代わりに化合物３３を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１１２に変換させる。

【0219】

化合物２１２：化合物１１２を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１２に変換させる。

【0220】

化合物１１３：化合物５の代わりに化合物３８を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１１３に変換させる。

【0221】

化合物２１３：化合物１１３を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１３に変換させる。

【0222】

化合物１１４：化合物５の代わりに化合物４１を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１１４に変換させる。

【0223】

化合物２１４：化合物１１４を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１４に変換させる。

【0224】

化合物１１５：化合物５の代わりに化合物４３を使用して、化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１１５に変換させる。

【0225】

化合物２１５：化合物１１５を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２１５に変換させる。
実施例３−ビス（メタンチオスルホネート）試薬を使用した、ホスホロチオトリエステルの代替的合成

【化53】

【0226】

化合物１５０：化合物１００（３００ｍｇ、０．２６４ｍｍｏｌ）を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１５０に変換させた（１７０ｍｇ、５０％）。

【0227】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．３４−９．３０（ｓ，１Ｈ），９．２８−９．１７（ｄ，Ｊ＝３０．６Ｈｚ，１Ｈ），７．５７−７．４７（ｍ，１Ｈ），７．４７−７．４０（ｍ，２Ｈ），７．３８−７．１８（ｍ，１７Ｈ），７．１８−７．０７（ｄ，Ｊ＝１．４Ｈｚ，１Ｈ），６．８８−６．７７（ｄｄ，Ｊ＝９．０，１．５Ｈｚ，８Ｈ），６．４４−６．３４（ｄｄｄ，Ｊ＝１５．６，８．９，５．４Ｈｚ，１Ｈ），６．３２−６．２１（ｄｄｄ，Ｊ＝１８．９，８．５，５．９Ｈｚ，１Ｈ），５．２７−５．１９（ｑ，Ｊ＝５．９Ｈｚ，１Ｈ），４．４６−４．３３（ｍ，２Ｈ），４．３１−４．１６（ｍ，２Ｈ），４．０３−３．９１（ｍ，２Ｈ），３．８１−３．６７（ｍ，１２Ｈ），３．５４−３．４６（ｍ，１Ｈ），３．４２−３．３４（ｍ，１Ｈ），３．３４−３．２５（ｄ，Ｊ＝２０．２Ｈｚ，３Ｈ），２．６４−２．５３（ｔｄ，Ｊ＝１３．４，５．４Ｈｚ，１Ｈ），２．４７−２．３４（ｄｑ，Ｊ＝１９．９，６．５，５．９Ｈｚ，１Ｈ），１．９９−１．９１（ｍ，１Ｈ），１．８５−１．８０（ｔ，Ｊ＝１．５Ｈｚ，３Ｈ），１．７８−１．６５（ｔｔ，Ｊ＝１４．１，７．５Ｈｚ，１Ｈ），１．４４−１．３７（ｄｄ，Ｊ＝７．３，１．２Ｈｚ，３Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１７１．２７，１６３．８３，１６３．８０，１５８．９５，１５８．９３，１５８．９０，１５０．６４，１５０．５３，１５０．４６，１５０．３８，１４４．９１，１４４．８８，１４４．０９，１４４．０２，１３６．００，１３５．９８，１３５．９４，１３５．８１，１３５．１１，１３５．０４，１３４．９８，１３４．９７，１３０．３４，１３０．２７，１３０．２０，１２８．３０，１２８．２３，１２８．２０，１２７．４６，１２７．３６，１１３．５９，１１３．５６，１１３．４８，１１１．９５，１１１．３８，８７．６０，８７．４７，８７．４３，８６．０３，８５．８３，８４．４４，８４．３４，８３．８１，７９．８２，７９．５８，７３．９９，７３．９１，６７．８５，６７．７８，６３．３１，６３．２０，５５．３９，５１．７７，５１．７０，３９．１６，３８．９９，３８．９０，３７．２１，３７．１６，３７．１２，３７．０５，１２．６３，１２．５７，１１．８５，１１．８０；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２６．１５，２５．６０；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１３０８．３７、実測値：１３０８．７０。Ｒ_ｆ＝０．５（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0228】

化合物１５１：化合物１５０（１５０ｍｇ、０．１１６ｍｍｏｌ）のＤＣＭ（５ｍｌ）溶液を、室温で、ＴＬＣで監視しながら、２−モルホリノエタンチオール（１７ｍｇ、０．１１６ｍｍｏｌ）で処理した。０．５時間後、混合物を、ＮａＨＣＯ_３で洗浄し、ＤＣＭ中に５回抽出した。有機抽出物を乾燥させ（ＭｇＳＯ_４）、濾過し、濃縮した。カラムクロマトグラフィーにより、無色の固体発泡体として化合物１５１を得た（８１ｍｇ、５１％）。

【0229】

^１Ｈ ＮＭＲ（３９９ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ９．６８−９．５４（ｍ，１Ｈ），９．４４（ｓ，１Ｈ），７．５９−７．４８（ｍ，１Ｈ），７．４７−７．４０（ｍ，２Ｈ），７．４０−７．１３（ｍ，１７Ｈ），６．９０−６．７６（ｄｄｄ，Ｊ＝９．３，４．４，２．７Ｈｚ，８Ｈ），６．４５−６．２７（ｍ，２Ｈ），５．３２−５．２２（ｄｄ，Ｊ＝８．５，５．７Ｈｚ，１Ｈ），４．３４−４．２５（ｍ，１Ｈ），４．２３−４．１４（ｍ，１Ｈ），４．０７−３．８９（ｍ，２Ｈ），３．７９−３．７４（ｍ，１２Ｈ），３．７４−３．６５（ｍ，６Ｈ），３．５１−３．３３（ｍ，２Ｈ），２．９０−２．７９（ｄｄ，Ｊ＝１４．２，７．６Ｈｚ，２Ｈ），２．７３−２．５５（ｍ，３Ｈ），２．５５−２．３４（ｍ，６Ｈ），２．０２−１．９１（ｍ，１Ｈ），１．８７−１．８１（ｄｄ，Ｊ＝４．９，１．２Ｈｚ，３Ｈ），１．７７−１．６６（ｄｄｄ，Ｊ＝１４．２，８．７，６．４Ｈｚ，１Ｈ），１．４１−１．３５（ｄｄ，Ｊ＝６．６，１．２Ｈｚ，３Ｈ）；^１３Ｃ ＮＭＲ（１００ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ１６３．９７，１６３．９３，１６３．８８，１５８．９０，１５８．８６，１５８．７１，１５０．６４，１５０．５９，１５０．５３，１５０．５０，１４４．９２，１４４．８８，１４４．１３，１４４．０８，１３６．１１，１３６．０７，１３６．０３，１３６．００，１３５．７３，１３５．６０，１３５．２２，１３５．１４，１３５．０８，１３５．０４，１３５．０２，１３０．３２，１３０．３０，１３０．２３，１３０．１８，１２８．３３，１２８．１９，１２８．１７，１２７．３９，１２７．３３，１１３．５６，１１３．５２，１１３．４５，１１１．８５，１１１．８２，１１１．３８，１１１．２９，８７．５６，８７．４１，８７．３８，８５．７１，８５．３５，８４．９１，８４．３８，８４．２７，８４．２２，８４．０５，８３．９７，８３．８５，８３．７８，７９．３６，７９．１１，７９．０５，７４．２５，７４．０７，６７．３９，６６．８８，６６．７９，６３．２７，５７．８０，５５．３６，５３．５５，５３．５１，５３．４０，４３．０６，４０．７２，４０．５４，３９．２５，３９．１６，３９．０１，３５．９１，１２．６４，１２．６０，１１．７８，１１．７４；^３１Ｐ ＮＭＲ（１６２ＭＨｚ，ＣＤＣｌ_３）δ２７．７６，２７．４６；ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：１３５８．４３、実測値：１３５８．７４。Ｒ_ｆ＝０．４（５％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0230】

化合物２５１：化合物１５１（７５ｍｇ、０．０５５ｍｍｏｌ）を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２５１に変換させた（１０ｍｇ、２４％）。ＭＳ（ＥＳＩ＋ｖｅ）：計算値（Ｍ＋Ｈ）：７５４．１７、実測値：７５４．１９。Ｒ_ｆ＝０．３（１０％ＭｅＯＨ／ＤＣＭ）。

【0231】

化合物１５２：化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１５２に変換させる。

【化54】

【0232】

化合物１５３：化合物４の代わりに１−チオ−β−Ｄ−グルコース四酢酸を使用して、化合物１５２を、化合物１５１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１５３に変換させる。

【0233】

化合物２５３：化合物１５３を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２５３に変換させる。

【0234】

化合物１５４：化合物１００を、化合物１０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１５４に変換させる。

【0235】

化合物１５５：化合物１５４を、化合物１５１について記載されたものに類似の手順によって、化合物１５５に変換させる。

【0236】

化合物２５５：化合物１５５を、化合物２０１について記載されたものに類似の手順によって、化合物２５５に変換させる。
実施例４−Ｈ−固相でホスホロチオトリエステルをもたらすためのホスホネートのチオアルキル化

【0237】

化合物３００：（Ｒｐ）−ＣＡＧＴ−Ｈ−ホスホネート−オキサリルリンカー−ＣＰＧの合成を、報告されている方法（Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｓｏｃｉｅｔｙ ２００８，１３０，１６０３１−１６０３７、Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ Ｃｈｅｍｉｅ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｅｄｉｔｉｏｎ ２００９，４８，４９６−４９９）に従って、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ ３９４ ＤＮＡ／ＲＮＡシンセサイザー上で行った。

【0238】

化合物３０１：（Ｓｐ）−ＣＡＧＴ−ホスホロチオエート（Ｒ＝Ｈ）：（Ｒｐ）−ＣＡＧＴ−Ｈ−ホスホネート−オキサリルリンカー−ＣＰＧを、０．２Ｍ Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬／ＣＨ_３ＣＮ−ＢＳＡ（９：１、ｖ／ｖ）によって処理し、室温で１時間撹拌し、次いで、ＣＳ_２およびアセトニトリルで連続的に洗浄し、減圧下で乾燥させた。結果のＣＰＧを、２ｍｌの２８％ＮＨ_３水溶液で処理し、室温で１８時間撹拌した。減圧下でＮＨ_３を除去した後、結果として得られた生成物を、ＬＣ／ＭＳおよびＨＰＬＣによって分析した。

【0239】

化合物３０２：（Ｓｐ）−ＣＡＧＴ−Ｓ−メチルホスホロチオトリエステル（Ｒ＝Ｍｅ）：ＢＳＴＦＡ（５０μＬ、１８８μｍｏｌ）およびアセトニトリル（５００μＬ）を、（Ｒｐ）−ＣＡＧＴ−Ｈ−ホスホネート−オキサリルリンカー−ＣＰＧ（１４．７ｍｇ、１μｍｏｌ）に添加し、次いで、混合物を、室温で２０分間振盪させた。Ｓ−メチルメタンスルホノチオエート（２０μＬ、２１２μｍｏｌ）およびＮＥｔ_３（５０μＬ）を添加し、室温で１時間振盪を継続した。ＣＰＧを、ＣＨ_３ＣＮで洗浄し、次いで、真空で乾燥させた。乾燥ＣＨ_３ＣＮ（２ｍｌ）中の２０％ＰｒＮＨ_２を、ＣＰＧに添加し、混合物を、室温で１６時間撹拌した。溶媒を減圧下で除去し、ＣＨ_３ＣＮを混合物に添加した。ＣＰＧを濾過によって除去し、濾液を減圧下で濃縮した。ＣＨ_３ＣＮ／ＤＭＳＯ／０．５Ｍ ＡＡ緩衝液（１：１：１、ｖ／ｖ／ｖ）を添加し、混合物を室温で１６時間撹拌し、次いで、ＬＣ／ＭＳおよびＨＰＬＣによって分析した。

【0240】

化合物３０３：化合物３０３を、支持体上で化合物３００の硫黄化によって調製し、続いて開裂させる。ＡＣＮ（４５０μＬ）、ＢＳＴＦＡ（５０μＬ）、および化合物１２（２０ｍｇ）を、化合物３００（１μｍｏｌ）に添加し、それを１８時間振盪させる。ＣＰＧを、濾過によって収集し、乾燥ＣＨ_３ＣＮ（２ｍｌ）中の２０％ＰｒＮＨ_２中に再懸濁させ、室温で１６時間振盪させた。溶媒を減圧下で除去し、残渣をＲＰＨＰＬＣによって精製して、純粋な化合物３０３を得る。
実施例５−溶液相でホスホロチオトリエステルをもたらすためのＨ−ホスホネートのチオアルキル化

【化55】

【0241】

化合物３０５：化合物３００（０．５μｍｏｌ）を、ＡＣＮ（１２５μＬ）中に取り込み、続いてＢＳＴＦＡ（６２μＬ）を添加し、混合物を２０分間振盪させた。ＰｒＮＨ_２（１２５μＬ）を添加し、バイアルを１８時間回転させた。濾過して１ｍｌのＡＣＮで洗浄した後、溶媒を真空で除去し、残渣をトルエンで３回共蒸発させて、粗製化合物３０４を得た。残渣をピリジン（３７５μＬ）中に再溶解し、Ａｒ下で撹拌させながら、ＢＳＴＦＡ（１６μｌ、６０．０μｍｏｌ）、続いて化合物９（７．２ｍｇ、３０．０μｍｏｌ）で処理した。室温で２時間後、溶媒を除去し、残渣を１時間ＭｅＯＨ（０．１２５ｍｌ）で処理し、次いでＡＡ（０．５Ｍ、０．１２５ｍｌ）を添加し、混合物を室温で２時間撹拌した。生成物をＲＰＨＰＬＣによって精製し、化合物３０５を得た。

【0242】

化合物３０３：化合物９の代わりに化合物１２を用いて、化合物３０３を、化合物３０５について記載されたものに類似の手順によって調製した。

【0243】

化合物３０６：化合物１４の代わりに化合物１２を用いて、化合物３０６を、化合物３０５について記載されたものに類似の手順によって調製した。

【0244】

化合物３０７：化合物２９の代わりに化合物１２を用いて、化合物３０７を、化合物３０５について記載されたものに類似の手順によって調製した。

【0245】

化合物３０８：化合物３１の代わりに化合物１２を用いて、化合物３０８を、化合物３０５について記載されたものに類似の手順によって調製した。

【0246】

化合物３０９：化合物３８の代わりに化合物１２を用いて、化合物３０９を、化合物３０５について記載されたものに類似の手順によって調製した。
実施例６−Ｈ−ホスホネートの立体選択的チオアルキル化

【0247】

目的：ホスホロチオトリエステルを生成するためのＨ−ホスホネートとＭＴＳ試薬の反応が立体特異的であることを実証する。^３１Ｐ ＮＭＲを使用して、反応の経過中の変化を追跡した。

【化56】

【0248】

実験手順：ＮＭＲ管に、０．８ｍｌのＣＤ_３ＣＮ中の化合物１００Ｓ ５′−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジン−３′−イル３′−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジン−５′−イルＨ−ホスホネート（２０ｍｇ、１８μｍｏｌ）を添加し、^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを記録した。ＢＳＴＦＡ（１７μＬ、１７６μｍｏｌ）を、同じＮＭＲ管に添加し、５分後に^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを再度記録した。トリエチルアミン（４９μＬ、３５２μｍｏｌ）およびＳ−メチルメタンチオスルホネート（２２μＬ、８８μｍｏｌ）を、同じＮＭＲ管に添加し、^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルを即座に記録した。

【0249】

同じ手順を、Ｒｐ異性体（化合物１００Ｒ）に対して繰り返した。出発材料、中間体、および生成物に対して記録された^３１Ｐ ＮＭＲスペクトルは、リン原子の立体化学が、反応の間保持されることを示す。

【0250】

本発明の好ましい実施形態が、本明細書に示され、記載されているが、このような実施形態は、例示のみの目的で提供されることが、当業者には明らかであろう。今後、当業者は、本発明から逸脱することなく、多数の変化形、変更、および置換が思いつくであろう。本明細書に記載される本発明の実施形態の種々の代替物が、本発明の実施に利用され得ることを理解されたい。以下の特許請求の範囲が本発明の範囲を定義し、これらの特許請求およびそれらの均等物の範囲内にある方法および構造がその適用範囲となることが意図される。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】