特許 6496417 実験設計および分析のための方法およびシステム

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】6496417

(24)【登録日】2019年3月15日

(45)【発行日】2019年4月3日

(54)【発明の名称】実験設計および分析のための方法およびシステム

(51)【国際特許分類】

   G01N 21/64 20060101AFI20190325BHJP

   C12M 1/34 20060101ALI20190325BHJP

   C12M 1/00 20060101ALN20190325BHJP

【ＦＩ】

   G01N21/64 Z

   C12M1/34 B

   !C12M1/00 A

【請求項の数】20

【全頁数】24

(21)【出願番号】特願2017-541375(P2017-541375)

(86)(22)【出願日】2016年2月5日

(65)【公表番号】特表2018-506974(P2018-506974A)

(43)【公表日】2018年3月15日

(86)【国際出願番号】US2016016827

(87)【国際公開番号】WO2016127086

(87)【国際公開日】20160811

【審査請求日】2019年2月1日

(31)【優先権主張番号】62/113,006

(32)【優先日】2015年2月6日

(33)【優先権主張国】US

【早期審査対象出願】

(73)【特許権者】

【識別番号】502221282

【氏名又は名称】ライフ テクノロジーズ コーポレーション

(74)【代理人】

【識別番号】100078282

【弁理士】

【氏名又は名称】山本 秀策

(74)【代理人】

【識別番号】100113413

【弁理士】

【氏名又は名称】森下 夏樹

(72)【発明者】

【氏名】リックス， スコット

(72)【発明者】

【氏名】ラウ， リク セン

(72)【発明者】

【氏名】テオ， コック シオン

(72)【発明者】

【氏名】チュー， ゼン ウェイ

(72)【発明者】

【氏名】ロー， リェン セン

(72)【発明者】

【氏名】フォー， ヴァニー

(72)【発明者】

【氏名】ウイ， マイケル

(72)【発明者】

【氏名】フォード， デイビッド

(72)【発明者】

【氏名】ジンマーマン， ショーン

【審査官】 嶋田 行志

(56)【参考文献】

【文献】 特表２００３−５０５６９１（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１３−５３７６３５（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２００４−５３５１９８（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２００８−５３６０９２（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１３−５３３５２３（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２００３−５０８０６４（ＪＰ，Ａ）

【文献】 米国特許出願公開第２００７／０１００５６９（ＵＳ，Ａ１）

【文献】 特表２０１３−５２３１６７（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１４−５３４４９７（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１３−５３０４３４（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１４−５０７０３１（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１４−５２９０８５（ＪＰ，Ａ）

【文献】 特表２０１４−５０１２８９（ＪＰ，Ａ）

【文献】 米国特許出願公開第２０１２／０２３１４５８（ＵＳ，Ａ１）

【文献】 米国特許出願公開第２０１１／００２５７１７（ＵＳ，Ａ１）

【文献】 特表２００５−５０４５４３（ＪＰ，Ａ）

(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）

Ｇ０１Ｎ ２１／００−２１／９５８

Ｇ０１Ｎ ２７／００−２７／９２

Ｇ０１Ｎ ３０／００−３０／９６

Ｇ０１Ｎ ３３／００−３３／９８

Ｇ０１Ｎ ３５／００−３５／１０

Ｇ０１Ｎ ３７／００

Ｇ０１Ｊ １／００− １／６０

Ｇ０１Ｊ ３／００− ３／５２

Ｃ１２Ｍ １／００− １／４２

Ｃ１２Ｍ ３／００− ３／１０

Ｃ１２Ｑ １／００− １／７０

Ｃ１２Ｑ ３／００

Ｇ１６Ｂ ５／００−９９／００

Ｇ１６Ｚ ９９／００

Ｇ０６Ｆ ３／００− ３／１８

Ｇ０６Ｆ ９／００− ９／５４

Ｇ０６Ｆ １７／００−１７／５０

ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するための方法であって、前記方法は、
複数の反応部位から増幅データを受信することであって、各反応部位は、サンプルを含む、ことと、
前記増幅データから複数の増幅曲線を生成することと、
前記複数の増幅曲線の第１の部分を表示画面上に表示することと、
前記増幅曲線の第１の部分と並んで、前記増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを前記表示画面上に表示することと、
前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューからシフトし、前記複数の増幅曲線の第２の部分を含むビューを表示することであって、前記複数の増幅曲線の第２の部分のうちの少なくとも一部は、前記複数の増幅曲線の第１の部分内に含まれない、ことと、
前記複数の増幅曲線の第２の部分と並んで、前記複数の増幅曲線の第２の部分内に含まれた視認可能な増幅曲線に関連する反応部位の表示を前記表示画面上に表示するために、前記リストを動的に調整することであって、前記リストは、スクロール可能であるように構成されている、ことと
を含む、方法。

【請求項2】

ズームインすることによって、前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューまたは前記複数の増幅曲線の第２の部分のビューを調整することをさらに含む、請求項１に記載の方法。

【請求項3】

ズームアウトすることによって、前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューまたは前記複数の増幅曲線の第２の部分のビューを調整することをさらに含む、請求項１に記載の方法。

【請求項4】

前記リストの第１の部分は、前記表示画面上で視認可能である、請求項１に記載の方法。

【請求項5】

前記リストの第２の部分は、前記リストをスクロールダウンした後に視認可能である、請求項４に記載の方法。

【請求項6】

ユーザが反応部位の表示を前記リストから選択した後、前記反応部位内のサンプルについて情報を提供することをさらに含む、請求項１に記載の方法。

【請求項7】

前記表示画面は、タッチスクリーンである、請求項１に記載の方法。

【請求項8】

プロセッサ実行可能命令でコード化された非一時的なコンピュータ可読記憶媒体であって、前記命令は、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するためのものであり、前記命令は、
複数の反応部位から増幅データを受信することであって、各反応部位は、サンプルを含む、ことと、
前記増幅データから複数の増幅曲線を生成することと、
前記複数の増幅曲線の第１の部分を表示画面上に表示することと、
前記増幅曲線の第１の部分と並んで、前記増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを前記表示画面上に表示することと、
前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューからシフトし、前記複数の増幅曲線の第２の部分を含むビューを表示することであって、前記複数の増幅曲線の第２の部分のうちの少なくとも一部は、前記複数の増幅曲線の第１の部分内に含まれない、ことと、
前記複数の増幅曲線の第２の部分と並んで、前記複数の増幅曲線の第２の部分内に含まれた視認可能な増幅曲線に関連する反応部位の表示を前記表示画面上に表示するために、前記リストを動的に調整することであって、前記リストは、スクロール可能であるように構成されている、ことと
を行うための命令を含む、コンピュータ可読記憶媒体。

【請求項9】

ズームインすることによって、前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューまたは前記複数の増幅曲線の第２の部分のビューを調整することをさらに含む、請求項８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。

【請求項10】

ズームアウトすることによって、前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューまたは前記複数の増幅曲線の第２の部分のビューを調整することをさらに含む、請求項８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。

【請求項11】

前記リストの第１の部分は、前記表示画面上で視認可能である、請求項８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。

【請求項12】

前記リストの第２の部分は、前記リストをスクロールダウンした後に視認可能である、請求項１１に記載のコンピュータ可読記憶媒体。

【請求項13】

ユーザが反応部位の表示を前記リストから選択した後、前記反応部位内のサンプルについて情報を提供するための命令をさらに含む、請求項８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。

【請求項14】

前記表示画面は、タッチスクリーンである、請求項８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。

【請求項15】

複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するためのシステムであって、前記システムは、
プロセッサと、
前記プロセッサによって実行可能な命令でコード化されたメモリと
を備え、
前記命令は、
複数の反応部位から増幅データを受信することであって、各反応部位は、サンプルを含む、ことと、
前記増幅データから複数の増幅曲線を生成することと、
表示画面上に前記複数の増幅曲線の第１の部分を表示することと、
前記増幅曲線の第１の部分と並んで、前記増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを前記表示画面上に表示することと、
前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューからシフトし、前記複数の増幅曲線の第２の部分を含むビューを表示することであって、前記複数の増幅曲線の第２の部分のうちの少なくとも一部は、前記複数の増幅曲線の第１の部分内に含まれない、ことと、
前記複数の増幅曲線の第２の部分と並んで、前記複数の増幅曲線の第２の部分内に含まれた視認可能な増幅曲線に関連する反応部位の表示を前記表示画面上に表示するために、前記リストを動的に調整することであって、前記リストは、スクロール可能であるように構成されている、ことと
を行うための命令を含む、システム。

【請求項16】

ズームインすることによって、前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューまたは前記複数の増幅曲線の第２の部分のビューを調整することをさらに含む、請求項１５に記載のシステム。

【請求項17】

ズームアウトすることによって、前記複数の増幅曲線の第１の部分のビューまたは前記複数の増幅曲線の第２の部分のビューを調整することをさらに含む、請求項１５に記載のシステム。

【請求項18】

前記リストの第１の部分は、前記表示画面上で視認可能である、請求項１５に記載のシステム。

【請求項19】

前記リストの第２の部分は、前記リストをスクロールダウンした後に視認可能である、請求項１８に記載のシステム。

【請求項20】

ユーザが反応部位の表示を前記リストから選択した後、前記反応部位内のサンプルについて情報を提供するための命令をさらに含む、請求項１５に記載のシステム。

【発明の詳細な説明】

【背景技術】

【0001】

一般に、ユーザは、様々な生物学的データセットを収集し比較することによって生物学的研究を行う。例えば、ユーザは、研究の対象となる遺伝子について、遺伝子型データまたは遺伝子発現データなどの異なる種類の生物学的データを収集するために、様々なｑＰＣＲベースの実験を実行することがある。ユーザが様々な種類の生物学的データを比較したい場合、手動で行われることが多い。また、１回の実験に必要なサンプル数が多くなることがあり、ユーザがデータから価値ある情報を素早く簡単に入手できるように、ユーザが検討し視覚化するための特定のサンプルを分離することは難しい場合が多い。さらに、実験室または施設では、多くの場合、いくつかの生物学的機器が動作している。機器のメンテナンスや校正を追跡することは難しい場合がある。

【発明の概要】

【課題を解決するための手段】

【0002】

１つの例示的な実施形態では、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別する方法が提供される。この方法は、複数の反応部位から増幅データを受信するステップを含み、各反応部位はサンプルを含み、増幅データから複数の増幅曲線が生成される。この方法は、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップとをさらに含む。この方法は、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップとを含む。リストはスクロール可能に構成されている。

【0003】

別の例示的な実施形態では、プロセッサ実行可能命令であって、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するための命令でコード化されたコンピュータ可読記憶媒体が提供される。命令は、複数の反応部位から増幅データを受信するための命令を備え、各反応部位はサンプルを含み、増幅データから複数の増幅曲線が生成される。命令は、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示し、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するための命令をさらに含む。命令は、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整し、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するための命令をさらに含む。リストはスクロール可能に構成されている。

【0004】

さらに別の例示的な実施形態では、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するためのシステムが提供される。このシステムは、プロセッサとメモリとを含む。メモリには、プロセッサによって実行可能な命令がコード化されている。この命令は、複数の反応部位から増幅データを受信するための命令を含み、各反応部位はサンプルを含み、増幅データから複数の増幅曲線が生成される。命令は、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示し、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するための命令をさらに含む。命令は、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整し、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するための命令をさらに含む。リストはスクロール可能に構成されている。
本願明細書は、例えば、以下の項目も提供する。
（項目１）
複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別する方法であって、前記方法は、
複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、
前記増幅データから前記複数の増幅曲線を生成するステップと、
複数の増幅曲線の第１の部分を表示画面上に表示するステップと、
前記増幅曲線の第１の部分と共に、前記増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを前記表示画面上に表示するステップと、
複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、
前記増幅曲線の第２の部分と共に、前記増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を前記表示画面上に表示するために、前記リストを動的に調整するステップであって、前記リストがスクロール可能である、ステップとを備える方法。
（項目２）
前記ビューを調整するステップが、前記複数の増幅曲線にズームインするステップである、項目１に記載の方法。
（項目３）
前記ビューを調整するステップが、前記複数の増幅曲線からズームアウトするステップである、項目１に記載の方法。
（項目４）
前記リストの第１の部分が前記表示画面上で視認可能である、項目１に記載の方法。
（項目５）
前記リストの第２の部分は、前記リストをスクロールダウンした後に視認可能である、項目４に記載の方法。
（項目６）
ユーザが前記反応部位の表示を前記リストから選択した後、前記反応部位のサンプルについて情報を提供するステップをさらに備える、項目１に記載の方法。
（項目７）
前記表示画面がタッチスクリーンである、項目１に記載の方法。
（項目８）
プロセッサ実行可能命令でコード化されたコンピュータ可読記憶媒体であって、前記命令は、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するための命令であって、前記命令は、
複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、
前記増幅データから前記複数の増幅曲線を生成するステップと、
複数の増幅曲線の第１の部分を表示画面上に表示するステップと、
前記増幅曲線の第１の部分と共に、前記増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを前記表示画面上に表示するステップと、
複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、
前記増幅曲線の第２の部分と共に、前記増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を前記表示画面上に表示するために、前記リストを動的に調整するステップであって、前記リストがスクロール可能である、ステップとを備える方法。
（項目９）
前記ビューを調整するステップが、前記複数の増幅曲線にズームインするステップである、項目８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１０）
前記ビューを調整するステップが、前記複数の増幅曲線からズームアウトするステップである、項目８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１１）
前記リストの第１の部分が前記表示画面上で視認可能である、項目８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２）
前記リストの第２の部分は、前記リストをスクロールダウンした後に視認可能である、項目１１に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１３）
ユーザが前記反応部位の表示を前記リストから選択した後、前記反応部位のサンプルについて情報を提供するステップのための命令をさらに備える、項目８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１４）
前記表示画面はタッチスクリーンである、項目８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１５）
複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するためのシステムであって、前記システムは、
プロセッサと、
前記プロセッサによって実行可能な命令をコード化されたメモリとを備え、前記命令は、
複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、
前記増幅データから前記複数の増幅曲線を生成するステップと、
表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、
前記増幅曲線の第１の部分にと共に、前記増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを前記表示画面上に表示するステップと、
複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、
前記増幅曲線の第２の部分と共に、前記増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を前記表示画面上に表示するために、前記リストを動的に調整するステップであって、前記リストがスクロール可能に構成されている、ステップのための命令を備える、システム。
（項目１６）
前記ビューを調整するステップは、前記複数の増幅曲線にズームインするステップである、項目１５に記載のシステム。
（項目１７）
前記ビューを調整するステップは、前記複数の増幅曲線からズームアウトするステップである、項目１５に記載のシステム。
（項目１８）
前記リストの第１の部分が前記表示画面上で視認可能である、項目１５に記載のシステム。
（項目１９）
前記リストの第２の部分は、前記リストをスクロールダウンした後に視認可能である、項目１８に記載のシステム。
（項目２０）
ユーザが前記反応部位の表示を前記リストから選択した後、前記反応部位のサンプルについて情報を提供するステップのための命令をさらに備える、項目１５に記載のシステム。

【図面の簡単な説明】

【0005】

【図1】本明細書に記載の様々な実施形態による増幅曲線を表示するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図2】本明細書に記載の様々な実施形態による増幅曲線の選択を見るためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図3】本明細書に記載の様々な実施形態による増幅曲線を識別するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図4】本明細書に記載の様々な実施形態による増幅曲線を識別するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図5】本明細書に記載の様々な実施形態によるタグまたはコメントを入力するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図6】本明細書に記載の様々な実施形態によるサーマルサイクリングプロトコルを表示および編集するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図7】本明細書に記載の様々な実施形態によるサーマルサイクリングプロトコルを表示および編集するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図8】本明細書に記載の様々な実施形態による複数の機器の状態を表示するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図9】本明細書に記載の様々な実施形態による機器に関する情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図10】本明細書に記載の様々な実施形態による機器に関する統計情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図11】本明細書に記載の様々な実施形態による機器に関する統計情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。

【図12】本明細書に記載の様々な実施形態が実装され得るコンピューティングシステムを示す図である。

【図13】本明細書に記載の様々な実施形態による例示的な分散ネットワークシステムを示す。

【図14】本発明の実施形態が実装され得るＰＣＲ機器１４００を示すブロック図である。

【図15】本明細書に記載の実施形態による画像化に使用され得る例示的な光学システム１５００を示す。

【発明を実施するための形態】

【0006】

（発明の詳細な説明）
本発明のより完全な理解を提供するために、以下の説明では、特定の構成、パラメータ、実施例などのような多くの特定の詳細を述べる。しかしながら、このような説明は、本発明の範囲を限定するものではなく、例示的な実施形態のより良い説明を提供することを意図するものであることを認識すべきである。

【0007】

研究者は、対象となる遺伝子を研究するために、生物学的器具を用いて様々な実験を行う。本発明は、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ−ＰＣＲ）機器に関して説明される。特に、本発明の実施形態は、ウェルプレートの光学画像化を利用するＲＴ−ＰＣＲ機器について実装される。このような機器は、分析目的のために、複数のサンプル、スポット、または反応部位からの信号を同時に測定することができる。

【0008】

測定された信号は、複数の反応部位から取得された蛍光データを含み、反応部位内のサンプルが増幅されるにつれて、反応部位内の核酸の量を経時的に検出する。各反応部位の蛍光データをプロットして、増幅曲線を生成する。蛍光データはあらゆる反応部位から測定されるため、生成される増幅曲線は数百、場合によっては数千ある。想像できるように、サンプルに関する単一の増幅曲線および関連情報を見ることは困難である。本明細書に記載の様々な実施形態によれば、方法およびシステムにより、ユーザは、対象となる特定の増幅曲線を容易に選択し、その増幅曲線に関連する情報を見ることが可能になるため、ユーザは、リアルタイム増幅曲線から有用な情報を迅速に得ることができるか、または後でさらに分析するために曲線に印を付けることができる。

【0009】

図１を参照すると、増幅曲線プロット１０２内に複数の増幅曲線１０４を表示するグラフィカルユーザインターフェース１００が示されている。増幅曲線プロット１０２内に見える複数の増幅曲線１０４の部分について、増幅曲線に関連する各ウェルの詳細は、ウェル詳細ボタン１０６を起動することによって見ることができる。さらに、ズームボタン１０８を起動することにより増幅曲線プロット１０２をズームまたはズーム解除することによって、複数の増幅曲線の異なる部分を見ることができる。

【0010】

図２に示す別の実施形態では、選択された増幅曲線２０４を見るためのグラフィカルユーザインターフェース２００の例が示されている。この例では、増幅曲線プロット２０２は増幅曲線２０４の一部を表示している。増幅曲線プロット２０２のビューは、矢印２０６を起動することによってシフトしてもよい。さらに、ズームボタン３０８を起動することによって増幅曲線プロット２０２のビューにズームインしてもよく、ズーム解除ボタン２１０を使用してズームアウトしてもよい。増幅曲線プロット２０２のビューを変更することによって、表示される増幅曲線の部分が動的に変化してもよい。ウェルスクロールバー２１６には、視認可能な増幅曲線に関するさらなる情報が表示される。例えば、増幅曲線２０４のウェル位置は、ウェルスクロールバー２１６に色で示される。増幅曲線プロット２０２内に見える増幅曲線の数が、ウェルスクロールバー２１６内の利用可能な空間の量を超える場合、ユーザは、上下にスクロールして他の増幅曲線ｓに関する情報を見ることができる。特定の増幅曲線についてより多くの情報が求められる場合、ユーザは、ウェルスクロールバー２１６内の関連するウェル位置情報を選択して、ウェル内に装填されたサンプルの種類などのさらなる詳細を見ることができる。このようにして、個々の増幅曲線をより容易に選択することができ、選択された増幅曲線に関連する情報を迅速かつ容易に識別することができる。

【0011】

加えて、様々な実施形態によれば、コメントボタン２１２およびタグボタン２１４をユーザに提供して、ユーザは特定の増幅曲線に対してコメントまたはタグを追加することを選択することができる。例えば、ユーザは、増幅曲線が異常な特徴を有していることに気づき、その増幅曲線に関連したコメントをして後日の参照用に保存したい場合がある。コメントボタン２１２およびタグボタン２１４は、タグおよび／またはコメントを入力するためにユーザによって選択されてもよい。

【0012】

矢印２０６、ズームインボタン２０８、ズームアウトボタン２１０、およびウェルスクロールバー２１６は、タッチコントロールによって起動してもよい。様々な実施形態では、ユーザは、増幅曲線プロット２０２上でピンチトゥーズームのタッチスクリーンジェスチャを行って、増幅曲線プロット２０２の可視領域をズームインおよびズームアウトすることもできる。また、上方にフリックしてウェルスクロールバー２１６を上に動かす、または下方にフリックしてウェルスクロールバー２１６を下に動かすなどのタッチスクリーンジェスチャによって、ウェルスクロールバー２１６を制御してもよい。

【0013】

図３は、本明細書に記載の様々な実施形態による増幅曲線を識別するためのグラフィカルユーザインターフェース３００の別の例を示す。この例では、増幅曲線プロット３０２は、増幅曲線３０４の一部を表示している。増幅曲線プロット３０２のビューは、矢印３０６を起動にすることによってシフトしてもよい。さらに、ズームボタン３０８を起動することによって増幅曲線プロット３０２のビューにズームインしてもよく、またはズームアウトボタン３１０を用いてズームアウトしてもよい。増幅曲線プロット３０２のビューを変更することによって、表示される増幅曲線の部分が動的に変化してもよい。ウェルスクロールバー３１６には、視認可能な増幅曲線に関するさらなる情報が表示される。例えば、増幅曲線３０４のウェル位置は、ウェルスクロールバー３１６に色で示される。増幅曲線プロット３０２内に見える増幅曲線の数が、ウェルスクロールバー３１６内の利用可能な空間の量を超える場合、ユーザは、上下にスクロールして他の増幅曲線ｓに関する情報を見ることができる。特定の増幅曲線についてより多くの情報が求められる場合、ユーザは、ウェルスクロールバー３１６内の関連するウェル位置情報を選択して、ウェル内に装填されたサンプルの種類などのさらなる詳細を見ることができる。この例では、ウェルスクロールバー３１６からＡ２７が選択されている。Ａ２７に関連する他の情報は、ウェルスクロールバー３１６に隣接して表示される。さらに、Ａ２７に関連する増幅曲線は、ユーザがウェルＡ２７に対する全ての関連情報を容易に識別することができるように、増幅曲線プロット３０２内で強調されてもよい。このようにして、個々の増幅曲線をより容易に選択することができ、選択された増幅曲線に関連する情報を迅速かつ容易に識別することができる。

【0014】

加えて、様々な実施形態によれば、コメントボタン３１２およびタグボタン３１４をユーザに提供して、ユーザは特定の増幅曲線に対してコメントまたはタグを追加することを選択することができる。例えば、ユーザは、増幅曲線が異常な特徴を有していることに気づき、その増幅曲線に関連したコメントをして後日の参照用に保存したい場合がある。コメントボタン３１２およびタグボタン３１４は、タグおよび／またはコメントを入力するためにユーザによって選択されてもよい。

【0015】

矢印３０６、ズームボタン３０８、ズームアウトボタン３１０、およびウェルスクロールバー３１６は、タッチコントロールによって起動してもよい。様々な実施形態では、ユーザは、増幅曲線プロット３０２上でピンチトゥーズームのタッチスクリーンジェスチャを行って、増幅曲線プロット３０２の可視領域をズームおよびズームアウトすることもできる。また、上方にフリックしてウェルスクロールバー３１６を上に動かす、または下方にフリックしてウェルスクロールバー３１６を下に動かすなどのタッチスクリーンジェスチャによって、ウェルスクロールバー３１６を制御してもよい。

【0016】

図４は、本明細書に記載の様々な実施形態による増幅曲線を識別するためのグラフィカルユーザインターフェース４００の別の例を示す。この例では、選択された増幅曲線が増幅プロット４０２内で強調表示されている。ウェルスクロールバー４１８は、複数の増幅曲線４０４の一部のウェル位置を表示する。ユーザは、特定のウェル（この場合はＡ２７）を選択し、Ａ２７に関連するサンプル名、ターゲット名、ウェルＩＤ、および色素を見ることができる。Ａ２７に関連する増幅曲線は緑色で示されている。関連する増幅曲線を識別するための色に加えて、システムはまた、他の曲線が目立たなくなって増幅曲線４０６を強調するように、Ａ２７に関連する増幅曲線４０６を強調して表示する。

【0017】

図５は、本明細書に記載の様々な実施形態によるタグまたはコメントを入力するためのグラフィカルユーザインターフェース５００の一例を示す。図４を再び参照すると、コメントボタン４１４およびタグボタン４１６により、ユーザは、選択された増幅曲線に対してコメントまたはタグを入力することを選択することができる。ユーザがコメントボタン４１４またはタグボタン４１６を選択すると、キーボードがユーザに表示される。ユーザは、キーボードを使用して入力フィールドボックス５０２にコメントまたはタグを入力することができる。キーボードをタッチスクリーン上に表示して、ユーザが表示された画像と直接対話できるようにしてもよい。

【0018】

図６は、本明細書に記載の様々な実施形態によるサーマルサイクリングプロトコルを表示および編集するためのグラフィカルユーザインターフェースの一例を示す。ユーザは、グラフィカルユーザインターフェース６００を使用してサーマルサイクリングプロトコルをセットアップすることができる。ユーザは、機器で実行が開始される前にプロトコルを調整することができる。ユーザは、実行が開始された後にプロトコルを調整することもできる。ユーザがサーマルサイクリングプロトコルを修正／調整したい場合、ユーザは、編集したいサーマルサイクリングプロトコル６０２のグラフィック表示の部分を選択し、次に編集ボタン６１０を選択することができる。次に、ユーザは、例えばサイクルの特定の部分の温度または長さを調整することができる。この機能によりユーザは実験全体の実行を停止することなく、即座に変更を行うことができる。

【0019】

加えて、ユーザは、実験６０４の開始時間６０６、終了時間６０８、および残り時間を見ることができる。ＧＵＩ６００は、ＧＵＩ６００と直接対話するユーザによって起動することができるタッチスクリーン上に表示されてもよい。

【0020】

図７は、本明細書に記載の様々な実施形態によるサーマルサイクリングプロトコルを表示および編集するためのグラフィカルユーザインターフェースの別の例を示す。この例では、ユーザは、追加ボタン７０４または削除ボタン７０６を起動することによって、サーマルサイクリングプロトコル７０２のグラフィック表現を追加または削除することができる。

【0021】

実験室環境において、実験室を使用している研究者は複数の機器を使用することが多い。その状態、および機器の定期的な保守および校正のスケジュールを監視することは難しい場合がある。本明細書で説明される様々な実施形態によれば、ＧＵＩ８００をユーザに表示して、例えば実験室で使用される機器のネットワーク内の各機器の状態を示してもよい。図８を参照すると、本明細書に記載の様々な実施形態による複数の機器の状態８０２を表示するためのグラフィカルユーザインターフェース８００が示されている。ＧＵＩ８００を見ているユーザは、同じネットワーク内の機器を見ることができ、使用可能または使用中など機器の状態、および較正状態など他の情報を容易に見ることができる。個々の機器についてのより詳細な情報も見ることができる。

【0022】

図９は、本明細書に記載の様々な実施形態による機器に関する情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェース９００の一例を示す。ＧＵＩ９００は、個々の機器の概要ページ９０２を示す。較正状態の表９０４では様々な較正状態および有効期限が見られる。ユーザはまた、イベント履歴タブ９０６、較正履歴タブ９０８、および統計タブ９１０を見るように選択することもできる。概要ページ９０２において、ユーザは機器の較正状態を見ることができる。

【0023】

図１０は、本明細書に記載の様々な実施形態による機器に関する統計情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェース１０００の一例を示す。統計ページ１０１０は、この機器が使用されたこの特定の機器の実行の種類を示す。統計ページ１０１０はまた、この実験の使用時間数を示す。

【0024】

図１１は、本明細書に記載の様々な実施形態による機器に関する統計情報を表示するためのグラフィカルユーザインターフェース１１００の別の例を示す。この例では、円グラフ１１０４がユーザによる機器の使用量を図示している。円グラフ１１０４は、この機器がユーザ１によって最も頻繁に使用されたことを示している。
コンピュータ実装システム

【0025】

当業者は、様々な実施形態の動作が、ハードウェア、ソフトウェア、ファームウェア、またはそれらの組み合わせを適切に使用して実装され得ることを認識するであろう。例えば、いくつかのプロセスは、ソフトウェア、ファームウェア、またはハードワイヤードロジックの制御下で、プロセッサまたは他のデジタル回路を使用して行うことができる。（ここで、「ロジック」という用語は、固定されたハードウェア、プログラマブルロジック、および／またはそれらの適切な組み合わせを指し、当業者であれば列挙された機能を認識し実行することができる。）ソフトウェアおよびファームウェアは、非一時的なコンピュータ可読媒体に格納することができる。いくつかの他のプロセスは、当業者に周知のように、アナログ回路を使用して実装することができる。
加えて、本発明の実施形態では、メモリまたは他のストレージ、ならびに通信コンポーネントを利用することができる。

【0026】

図１２は、様々な実施形態による、処理機能を実行するために利用され得るコンピュータシステム１２００を示すブロック図である。実験を行うための機器は、例示的なコンピューティングシステム１２００に接続されてもよい。コンピューティングシステム１２００は、プロセッサ１２０４などの１つまたは複数のプロセッサを含むことができる。プロセッサ１２０４は、例えば、マイクロプロセッサ、コントローラ、または他の制御ロジックなどの汎用または特殊処理エンジンを使用して実装することができる。この例では、プロセッサ１２０４は、バス１２０２または他の通信媒体に接続されている。

【0027】

さらに、図１２のコンピューティングシステム１２００は、ラックマウント型コンピュータ、メインフレーム、スーパーコンピュータ、サーバ、クライアント、デスクトップコンピュータ、ラップトップコンピュータ、タブレットコンピュータ、手持ち式コンピューティング装置（例えば、ＰＤＡ、携帯電話、スマートフォン、パームトップなど）、クラスタグリッド、ネットブック、組み込みシステム、または与えられたアプリケーションまたは環境に対して望ましいかまたは適切であり得る任意の他の種類の特殊または汎用コンピューティング装置のようないくつかの形式のいずれにおいて組み入れられてもよい。加えて、コンピューティングシステム１２００は、クライアント／サーバ環境および１つまたは複数のデータベースサーバ、またはＬＩＳ／ＬＩＭＳインフラストラクチャとの統合を含む、従来のネットワークシステムを含むことができる。ローカルエリアネットワーク（ＬＡＮ）またはワイドエリアネットワーク（ＷＡＮ）を含み、無線および／または有線コンポーネントを含む、多くの従来のネットワークシステムが当技術分野で知られている。加えて、クライアント／サーバ環境、データベースサーバ、およびネットワークは、当該技術分野において十分に文書化されている。
本明細書で説明される様々な実施形態によれば、コンピューティングシステム１２００は、分散ネットワーク内の１つまたは複数のサーバに接続するように構成されてもよい。コンピューティングシステム１２００は、分散ネットワークから情報または更新を受信することができる。コンピューティングシステム１２００は、分散ネットワークに接続する他のクライアントがアクセスし得る分散ネットワーク内に格納される情報も送信することができる。

【0028】

コンピューティングシステム１２００は、情報を通信するためのバス１２０２または他の通信機構、およびバス１２０２に結合されて情報を処理するプロセッサ１２０４を含んでいてもよい。

【0029】

コンピューティングシステム１２００はまた、メモリ１２０６を含むことができ、メモリ１２０６は、プロセッサ１２０４によって実行される命令を記憶するためにバス１２０２に結合された、ランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）または他の動的メモリであり得る。メモリ１２０６はまた、プロセッサ１２０４によって実行される命令の実行中に一時変数または他の中間情報を記憶するために使用されてもよい。コンピューティングシステム１２００は、プロセッサ１２０４のための静的情報および命令を記憶するためにバス１２０２に結合された、読み出し専用メモリ（ＲＯＭ）１２０８または他の静的記憶装置をさらに含む。

【0030】

コンピューティングシステム１２００はまた、記憶装置１２１０を含むことができ、磁気ディスク、光ディスク、またはソリッドステートドライブ（ＳＳＤ）などが提供され、バス１２０２に結合されて情報および命令を記憶する。記憶装置１２１０は、メディアドライブおよびリムーバブルストレージインターフェースを含んでいてもよい。メディアドライブは、ハードディスクドライブ、フロッピー（登録商標）ディスクドライブ、磁気テープドライブ、光ディスクドライブ、ＣＤまたはＤＶＤドライブ（ＲまたはＲＷ）、フラッシュドライブ、またはその他のリムーバブルメディアまたは固定メディアドライブなどの固定またはリムーバブル記憶媒体をサポートするためのドライブまたは他の機構を含んでいてもよい。これらの例が示すように、記憶媒体は、特定のコンピュータソフトウェア、命令、またはデータを記憶したコンピュータ可読記憶媒体を含んでいてもよい。

【0031】

代替となる実施形態では、記憶装置１２１０は、コンピュータプログラムまたは他の命令またはデータをコンピューティングシステム１２００にロードすることを可能にする、他の同様の手段を含んでいてもよい。このような手段には、例えば、プログラムカートリッジおよびカートリッジインターフェースのようなリムーバブルストレージユニットおよびインターフェース、リムーバブルメモリ（例えば、フラッシュメモリまたは他のリムーバブルメモリモジュール）およびメモリスロット、ならびにソフトウェアおよびデータを記憶装置１２１０からコンピューティングシステム１２００に転送することを可能にする他のリムーバブルストレージユニットおよびインターフェースが含まれてもよい。

【0032】

コンピューティングシステム１２００はまた、通信インターフェース１２１８を含むことができる。
通信インターフェース１２１８を使用して、ソフトウェアおよびデータをコンピューティングシステム１２００と外部装置との間で転送することができる。通信インターフェース１２１８の例には、モデム、ネットワークインターフェース（イーサネット（登録商標）または他のＮＩＣカードなど）、通信ポート（例えば、ＵＳＢポート、ＲＳ−２３２Ｃシリアルポートなど）、ＰＣＭＣＩＡスロットおよびカード、Ｂｌｕｅｔｏｏｔｈ（登録商標）などを含むことができる。通信インターフェース１２１８を介して転送されるソフトウェアおよびデータは、通信インターフェース１２１８によって受信可能な電子、電磁気、光学または他の信号であり得る信号形態である。これらの信号は、無線媒体、ワイヤまたはケーブル、光ファイバ、または他の通信媒体などのチャネルを介して、通信インターフェース１２１８によって送信および受信されてもよい。チャネルのいくつかの例は、電話回線、携帯電話リンク、ＲＦリンク、ネットワークインターフェース、ローカルまたはワイドエリアネットワーク、および他の通信チャネルを含む。

【0033】

コンピューティングシステム１２００は、バス１２０２を介して、コンピュータユーザに情報を表示するための陰極線管（ＣＲＴ）または液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）などのディスプレイ１２１２に結合されてもよい。英数字および他のキーを含む入力装置１２１４は、例えば情報およびコマンド選択をプロセッサ１２０４に通信するためにバス１２０２に結合される。入力装置はまた、タッチスクリーン入力機能が構成されたＬＣＤディスプレイなどのディスプレイであってもよい。別の種類のユーザ入力装置は、方向情報およびコマンド選択をプロセッサ１２０４に通信し、ディスプレイ１２１２上のカーソル移動を制御するためのマウス、トラックボール、またはカーソル方向キーなどのカーソル制御部１２１６である。この入力装置は、典型的には、装置が平面内の位置を指定することを可能にする第１の軸（例えばｘ）および第２の軸（例えばｙ）の２つの軸の２つの自由度を有する。コンピューティングシステム１２００は、データ処理を提供し、このようなデータの信頼水準を提供する。本発明の実施形態の特定の実装と一致して、データ処理および信頼値は、プロセッサ１２０４がメモリ１２０６に含まれる１つまたは複数の命令の１つまたは複数のシーケンスを実行することに応じて、コンピューティングシステム１２００によって提供される。このような命令は、記憶装置１２１０のような別のコンピュータ可読媒体からメモリ１２０６に読み込まれてもよい。メモリ１２０６に含まれる一連の命令を実行することにより、プロセッサ１２０４は、本明細書に記載のプロセス状態を実行する。あるいは、ソフトウェア命令の代わりに、またはソフトウェア命令と組み合わせてハードワイヤード回路を使用して、本発明の実施形態を実装してもよい。したがって、本発明の実施形態の実装は、ハードウェア回路およびソフトウェアの特定の組み合わせに限定されない。

【0034】

本明細書で使用する「コンピュータ可読媒体」および「コンピュータプログラム製品」という用語は、一般に、実行のために１つまたは複数のシーケンスまたは１つまたは複数の命令をプロセッサ１２０４に提供することに関与する、任意の媒体を指す。このような命令は、一般に「コンピュータプログラムコード」（コンピュータプログラムまたは他のグルーピングの形態でグループ化されることがある）と呼ばれ、実行されると、コンピューティングシステム１２００が本発明の実施形態の特徴または機能を実行することを可能にする。これらおよび他の形態の非一時的なコンピュータ可読媒体は、非揮発性媒体、揮発性媒体、および伝送媒体を含むが、これに限定されない多くの形態を取ることがある。不揮発性媒体は、例えば、記憶装置１２１０のようなソリッドステートディスク、光学ディスクまたは磁気ディスクを含む。揮発性媒体は、メモリ１２０６のような動的メモリを含む。伝送媒体は、バス１２０２を備えるワイヤを含む同軸ケーブル、銅線、および光ファイバを含む。

【0035】

コンピュータ可読媒体の一般的な形態は、例えば、フロッピー（登録商標）ディスク、フレキシブルディスク、ハードディスク、磁気テープ、または任意の他の磁気媒体、ＣＤ−ＲＯＭ、任意の他の光学媒体、パンチカード、紙テープ、孔パターンを有する任意の他の物理媒体、ＲＡＭ、ＰＲＯＭ、およびＥＰＲＯＭ、フラッシュＥＰＲＯＭ、任意の他のメモリチップまたはカートリッジ、後述する搬送波、またはコンピュータが読み取ることができる任意の他の媒体を含む。

【0036】

様々な形態のコンピュータ可読媒体が、実行のために１つまたは複数の命令の１つまたは複数のシーケンスをプロセッサ１２０４に搬送することに関与してもよい。例えば、命令は、最初にリモートコンピュータの磁気ディスク上で実行されてもよい。リモートコンピュータは、命令をその動的メモリにロードし、モデムを使用して電話回線を介して命令を送信することができる。コンピューティングシステム１２００にローカルなモデムは、電話回線上のデータを受信し、赤外線送信機を使用してデータを赤外線信号に変換することができる。
バス１２０２に結合された赤外線検出器は、赤外線信号で運ばれたデータを受信し、バス１２０２上にデータを置くことができる。バス１２０２は、データをメモリ１２０６に運び、そこからプロセッサ１２０４が命令を取り出して実行する。メモリ１２０６によって受信された命令は、プロセッサ１２０４による実行の前または後のいずれかに、オプションで記憶装置１２１０に記憶されてもよい。

【0037】

上記の説明は、明確にするために異なる機能ユニットおよびプロセッサを参照して本発明の実施形態を説明したことが理解されよう。
しかしながら、異なる機能ユニット、プロセッサまたはドメイン間の機能の任意の適切な分布が、本発明を損なうことなく使用され得ることは明らかであろう。例えば、別々のプロセッサまたはコントローラによって実行されるように示された機能は、同じプロセッサまたはコントローラによって実行されてもよい。したがって、特定の機能ユニットへの言及は、厳密な論理的または物理的構造または組織を示すのではなく、記載された機能性を提供するための適切な手段の参照としてのみ理解されるべきである。
分散型システム

【0038】

典型的なインターネットネットワーク構成１３００のいくつかの要素が、図１３に示されており、おそらく遠隔のローカルオフィスにあるいくつかのクライアントマシン１３０２が、それ自体がインターネットサービスプロバイダ（ＩＳＰ）接続１３１０を介してインターネット１３０８に接続されている、ゲートウェイ／ハブ／トンネルサーバ／など１３１０に接続されて示されている。ＩＳＰ接続１３１４を介してインターネット１３０８に同様に接続されている他の可能なクライアント１３１２も示されており、これらのユニットは、おそらく中央実験室またはオフィスに、例えば、ゲートウェイ／トンネルサーバ１３１８へのＩＳＰ接続１３１６を介して通信しており、サーバ１３１８は１３２０を様々なエンタープライズアプリケーションサーバ１３２２に接続し、サーバ１３２２は別のハブ／ルータ１３２６を介して様々なローカルクライアント１３３０に接続することができる。これらのサーバ１３２２はいずれも、以下によりよく説明するように、本発明に記載されている潜在的なコンテンツ管理および配信設計ソリューションの分析のための開発サーバとして機能することができる。
ＰＣＲ機器

【0039】

上記のように、様々な実施形態に従って利用され得る機器は、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）機器であるが、これに限定されない。図１４は、本発明の実施形態が実装され得るＰＣＲ機器１４００を示すブロック図である。ＰＣＲ機器１４００は、基板（図示せず）に収容された複数のサンプル１４１２上に配置された、加熱カバー１４１０を含んでいてもよい。様々な実施形態において、基板は、複数のサンプル領域を有するガラスまたはプラスチックのスライドであってもよく、サンプル領域は、サンプル領域と加熱カバー１４１０との間にカバーを有する。基板のいくつかの例には、標準的なマイクロタイター９６ウェル、３８４ウェルプレート、またはマイクロカードなどのマルチウェルプレート、あるいはガラスまたはプラスチックのスライドなどの実質的に平面の支持体を含んでもよいが、これらに限定されない。基材の様々な実施形態における反応部位は、基材の表面上に形成された規則的または不規則な配列でパターン化された、くぼみ、へこみ、隆起、およびそれらの組み合わせを含み得る。ＰＣＲ機器の様々な実施形態は、サンプルブロック１４１４、加熱および冷却要素１４１６、熱交換器１４１８、制御システム１４２０、およびユーザインターフェース１４２２を含む。本発明による熱ブロックアセンブリの様々な実施形態は、図１４のＰＣＲ機器１４００の構成要素１４１４〜１４１８を備える。

【0040】

リアルタイムＰＣＲ機器１４００は、光学システム１４２４を有する。図１４において、光学システム１４２４は、電磁エネルギーを放射する照明源（図示せず）、基板内のサンプル１４１２から電磁エネルギーを受信するための光学センサ、検出器、またはイメージャ（図示せず）、およびそれぞれのＤＮＡサンプルからの電磁エネルギーをイメージャに導くために使用される光学１４４０を有してもよい。図１４のＰＣＲ機器１４００および図１４のリアルタイムＰＣＲ機器１４００の実施形態では、制御システム１４２０を使用して、検出システム、加熱カバー、および熱ブロックアセンブリの機能を制御してもよい。制御システム１４２０は、図１４のＰＣＲ機器１４００のユーザインターフェース１４２２および図１４のリアルタイムＰＣＲ機器１４００を介して、エンドユーザがアクセス可能であってもよい。また、コンピュータシステム１４００は、図１４に示すように、図１４のＰＣＲ機器１４００の機能ならびにユーザインターフェース機能を制御するように機能してもよい。加えて、図４のコンピュータシステム４００は、データ処理、表示および報告準備機能を提供してもよい。このような機器制御機能は全てＰＣＲ機器に局所的に専用であってもよいし、以下でより詳細に述べるように、図４のコンピュータシステム４００が制御、分析、および報告機能の一部または全ての遠隔制御を提供してもよい。
画像化のための光学システム

【0041】

［図１５］本明細書に記載の実施形態による画像化に使用され得る例示的な光学システム１５００を示す。光学システム１５００は、例示的な光学システムであり、当業者は、他の光学システムを使用して関心対象の画像を取り込むことができることを認識されたい。様々な実施形態によれば、関心対象は、例えば、本明細書に記載の較正プレートのようなサンプルホルダであってもよい。例えば、カメラ１５０４に含まれる光学センサ１５０２は、関心対象１５１０を画像化してもよい。光センサ１５０２はＣＣＤセンサであってもよく、カメラ１５０４はＣＣＤカメラであってもよい。さらに、光学センサは、カメラレンズ１５０６を含む。

【0042】

関心対象に応じて、様々な実施形態による関心対象１５１０を画像化するために、発光フィルタ１５０８を選択することができる。他の実施形態では、関心対象１５０１から放出された蛍光発光を画像化するように発光フィルタ１５０８を変更してもよい。

【0043】

光学システム１５００は、反射された光源１５１２を使用して関心対象１５１０を画像化してもよい。光源１５１２からの光は、ビームスプリッタ１５２０によって関心対象１５１０に反射される前に、非球面１５１４、集束器／発散器１５１６、および励起フィルタ１５１８を介してフィルタリングされてもよい。光学システム１５００はまた、視野レンズ１５２２を含んでいてもよい。関心対象に応じて、様々な実施形態に従って関心対象１５１０を画像化するために、励起フィルタ１５１８を選択または変更することができる。

【0044】

実施例１では、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別する方法が提供される。この方法は、複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、増幅データから複数の増幅曲線を生成するステップと、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップと、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップであって、リストがスクロール可能に構成されている、ステップとを備える。

【0045】

実施例２では、プロセッサ実行可能命令でコード化されたコンピュータ可読記憶媒体が提供され、命令は複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するための命令である。命令は、複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、増幅データから複数の増幅曲線を生成するステップと、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップと、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップであって、リストがスクロール可能に構成されている、ステップのための命令を備える。

【0046】

実施例３では、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するためのシステムが提供される。このシステムは、プロセッサと、プロセッサによって実行可能な命令がコード化されたメモリとを備え、命令は、複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、増幅データから複数の増幅曲線を生成するステップと、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップと、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップであって、リストがスクロール可能に構成されている、ステップのための命令を備える。

【0047】

実施例４では、実施例１、実施例２、実施例３または先の実施例のいずれかが提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線にズームインするステップである。

【0048】

実施例５では、実施例１、実施例２、実施例３または先の実施例のいずれかが提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線からズームアウトするステップである。

【0049】

実施例６では、実施例１、実施例２、実施例３または先の実施例のいずれかが提供され、リストの第１の部分は、表示画面上で視認可能である。

【0050】

実施例７では、実施例１、実施例２、実施例３または先の実施例のいずれかが提供され、リストの第２の部分は、リストをスクロールダウンした後に視認可能である。

【0051】

実施例８では、実施例１、実施例２、実施例３または先の実施例のいずれかが提供され、ユーザが反応部位の表示をリストから選択した後、反応部位のサンプルについて情報を提供するステップをさらに備える。

【0052】

実施例４では、実施例１、実施例２、実施例３または先の実施例のいずれかが提供され、表示画面はタッチスクリーンである。

【0053】

実施例５では、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別する方法が提供され、複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、増幅データから複数の増幅曲線を生成するステップと、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップと、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップであって、リストがスクロール可能に構成されている、ステップとを備える。

【0054】

実施例６では、実施例５が提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線にズームインするステップである。

【0055】

実施例７では、実施例５が提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線からズームアウトするステップである。

【0056】

実施例８では、実施例５が提供され、リストの第１の部分は表示画面上で視認可能である。

【0057】

実施例９では、実施例５および実施例８が提供され、リストの第２の部分は、リストをスクロールダウンした後に視認可能である。

【0058】

実施例１０では、実施例５が提供され、ユーザが反応部位の表示をリストから選択した後、反応部位のサンプルについて情報を提供するステップをさらに備える。

【0059】

実施例１１では、実施例５が提供され、表示画面はタッチスクリーンである。

【0060】

実施例１２では、プロセッサ実行可能命令でコード化されたコンピュータ可読記憶媒体であって、命令は複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するための命令である、コンピュータ可読記憶媒体が提供される。命令は、複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、増幅データから複数の増幅曲線を生成するステップと、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップと、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップであって、リストがスクロール可能に構成されている、ステップのための命令を備える。

【0061】

実施例１３では、実施例１２が提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線にズームインするステップである。

【0062】

実施例１４では、実施例１２が提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線からズームアウトするステップである。

【0063】

実施例１５では、実施例１２が提供され、リストの第１の部分は表示画面上で視認可能である。

【0064】

実施例１６では、実施例１５が提供され、リストの第２の部分は、リストをスクロールダウンした後に視認可能である。

【0065】

実施例１７では、実施例１２が提供され、ユーザが反応部位の表示をリストから選択した後、反応部位のサンプルについて情報を提供するステップのための命令をさらに備える。

【0066】

実施例１８では、実施例１２が提供され、表示画面はタッチスクリーンである。

【0067】

実施例１９では、複数の増幅曲線からある増幅曲線に関連する反応部位を識別するためのシステムが提供され、プロセッサと、プロセッサによって実行可能な命令をコード化されたメモリとを備え、命令は、複数の反応部位から増幅データを受信するステップであって、各反応部位がサンプルを含む、ステップと、増幅データから複数の増幅曲線を生成するステップと、表示画面上に複数の増幅曲線の第１の部分を表示するステップと、増幅曲線の第１の部分と共に、増幅曲線の第１の部分に関連する反応部位の表示のリストを表示画面上に表示するステップと、複数の増幅曲線の第２の部分を表示するためにビューを調整するステップと、増幅曲線の第２の部分と共に、増幅曲線の第２の部分に関連する反応部位の表示を表示画面上に表示するために、リストを動的に調整するステップであって、リストがスクロール可能に構成されている、ステップのための命令を備える。

【0068】

実施例２０では、実施例１９が提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線にズームインするステップである。

【0069】

実施例２１では、実施例１９が提供され、ビューを調整するステップは、複数の増幅曲線からズームアウトするステップである。

【0070】

実施例２２では、実施例１９が提供され、リストの第１の部分は表示画面上で視認可能である。

【0071】

実施例２３では、実施例２２が提供され、リストの第２の部分は、リストをスクロールダウンした後に視認可能である。

【0072】

実施例２４では、実施例１９が提供され、ユーザが反応部位の表示をリストから選択した後、反応部位のサンプルについて情報を提供するステップのための命令をさらに備える。

【0073】

本発明の様々な実装の以下の説明は、例示および説明のために提示されたものである。網羅的ではなく、本発明を開示された正確な形態に限定するものではない。変更および変形は、上記発明に照らして可能であり、または本発明の実施から得ることができる。加えて、説明された実装はソフトウェアを含むが、本発明はハードウェアとソフトウェアの組み合わせとして、またはハードウェア単独で実装されてもよい。本発明は、オブジェクト指向プログラミングシステムおよび非オブジェクト指向プログラミングシステムの両方で実装され得る。

【0074】

様々な実施形態を特定の例示的な実施形態、実施形態、およびアプリケーションに関して説明してきたが、当業者には本教示から逸脱することなく様々な修正および変更を行うことができることが明らかであろう。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【図9】

【図10】

【図11】

【図12】

【図13】

【図14】

【図15】