特許第6579960号(P6579960)IP Force 特許公報掲載プロジェクト 2022.1.31 β版

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特許6579960代謝疾患に係わる嗅覚受容体遺伝子及びその用途
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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】6579960
(24)【登録日】2019年9月6日
(45)【発行日】2019年9月25日
(54)【発明の名称】代謝疾患に係わる嗅覚受容体遺伝子及びその用途
(51)【国際特許分類】
   C12N 15/00 20060101AFI20190912BHJP
   C12Q 1/02 20060101ALI20190912BHJP
   C12Q 1/6876 20180101ALI20190912BHJP
【FI】
   C12N15/00ZNA
   C12Q1/02
   C12Q1/6876
【請求項の数】2
【全頁数】94
(21)【出願番号】特願2016-1423(P2016-1423)
(22)【出願日】2016年1月7日
(62)【分割の表示】特願2013-543086(P2013-543086)の分割
【原出願日】2011年9月30日
(65)【公開番号】特開2016-104025(P2016-104025A)
(43)【公開日】2016年6月9日
【審査請求日】2016年1月27日
【審判番号】不服2017-17805(P2017-17805/J1)
【審判請求日】2017年12月1日
(31)【優先権主張番号】10-2010-0125349
(32)【優先日】2010年12月9日
(33)【優先権主張国】KR
(73)【特許権者】
【識別番号】507175175
【氏名又は名称】インダストリー−アカデミック コーポレーション ファウンデーション,ヨンセイ ユニバーシティ
(74)【代理人】
【識別番号】100107515
【弁理士】
【氏名又は名称】廣田 浩一
(74)【代理人】
【識別番号】100107733
【弁理士】
【氏名又は名称】流 良広
(74)【代理人】
【識別番号】100115347
【弁理士】
【氏名又は名称】松田 奈緒子
(72)【発明者】
【氏名】パク・テ スン
【合議体】
【審判長】 中島 庸子
【審判官】 長井 啓子
【審判官】 高堀 栄二
(56)【参考文献】
【文献】 特表2006−522586(JP,A)
【文献】 特表2008−517931(JP,A)
【文献】 特開2007−306801(JP,A)
【文献】 国際公開第2009/139459(WO,A1)
【文献】 国際公開第2010/052581(WO,A1)
【文献】 Biotechnol.J.,vol.5(9),pp.950−960(2010)
【文献】 J.Proteome Res.,vol.9(6),pp.2977−2987(2010)
【文献】 J.Nutrigenet.Nutrigenomics,vol.1(6),p.290,FP13(2008)
(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
C12N 15/00 - 15/90
C12Q 1/68
GenBank/EMBL/DDBJ/GeneSeq
JSTPlus/JMEDPlus/JST7580(JDreamIII)
CAPlus/WPIDS/MEDLINE/BIOSIS(STN)
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
嗅覚受容体遺伝子であるOlfr16遺伝子をコードする配列番号:26のヌクレオチド配列に特異的に結合するプライマーをみ、前記配列番号:26のヌクレオチド配列は、肥満疾患患者において高発現することを特徴とする内臓脂肪による肥満診断用の遺伝子増幅キット。
【請求項2】
内臓脂肪による肥満の治療剤候補物質のスクリーニング方法であって、
(a)配列番号:26のヌクレオチド配列を含む細胞に、分析しようとする試料を接触させる工程と、
(b)前記ヌクレオチド配列の発現量を測定する工程であって、前記配列番号:26のヌクレオチド配列の高発現が抑制される場合に、前記試料は、内臓脂肪による肥満の治療剤候補物質と判定される工程と、
を含むことを特徴とする内臓脂肪による肥満の治療剤候補物質のスクリーニング方法。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、代謝疾患に係わる嗅覚受容体遺伝子及びその代謝疾患診断用のキット、及びスクリーニング方法における用途に関する。
【背景技術】
【0002】
国内市場だけではなく、グローバルな製品化が可能な肥満治療剤を商用化するためには、原料の抗肥満効能に対する作用メカニズム及びターゲットタンパク質に関する研究が切実に要求される。現在までに肥満及び代謝疾患に使用されている治療剤ターゲット(作用点)は、既に開発され又は開発中であり、それらは四つの分類に大別される。第1に、食欲調節に係わるターゲットとして、例えば、CBR(カンナビノイド受容体)アンタゴニスト、5−HT2c(選択的5−ヒドロキシトリプタミン受容体サブタイプ2c)アゴニスト、MC4R(メラノコルチン受容体)アゴニスト、MCH(メラニン凝集ホルモン)アンタゴニスト及びNPY(ニューロペプチドY)アンタゴニストなどがある。第2に、代謝率又は新陳代謝の調節に係わるターゲットとして、例えば、β3−AR(β3−アドレナリン受容体)アゴニスト、リパーゼ抑制剤、脂質代謝酵素調節剤(ジアシルグリセロールアシルトラスフェラーゼ、脂肪酸合成酵素、アセチル−CoAカルボキシラーゼ、ステアリル−CoA不飽和化酵素)などがある。第3に、胃腸管系の作用調節に係わるターゲットとして、例えば、GLP−1(グルカゴン様ペプチド−1)受容体アゴニスト、CCK−A(コレシストキニン−A)アゴニスト、グレリンアンタゴニストなどがある。最後に、脂肪酸酸化に係わるターゲットとして、例えば、PPAR(ペルオキシソーム増殖剤活性化受容体)調節剤、CPA(カルボキシペプチダーゼ)抑制剤、PTP(プロテインチロシンホスファターゼ)抑制剤、そしてAMPK(AMP活性化タンパク質キナーゼ)調節剤などがある(非特許文献1)。
【0003】
嗅覚受容体は、嗅覚上皮細胞で主に発現することが知られている。空気中の匂い分子が嗅覚上皮細胞の細胞膜に存在する嗅覚受容体と結合すると、Golf(嗅覚Gタンパク質)を優先的に活性化させて、それからAC(嗅覚関連アデニル酸シクラーゼ)を活性化させる。後者は、嗅覚細胞内でATPからcAMP(サイクリックAMP)の生成を促進させ、カルシウムイオンチャネルを活性化させ、最終的に脳に信号を伝達し、匂い分子を認識する。人間の場合、ほぼ1,200種類の嗅覚受容体アイソフォームが存在することが報告され、これは、人間が持っている遺伝子の約3%を占めている。単一嗅覚受容体が担当する匂い分子は、約2〜3種であり、約100余種の嗅覚受容体の組み合わせによって、人間は1万種程度の匂い(又は匂い分子)を区別することができるようになる。嗅覚受容体は、嗅覚上皮細胞で主に発現することが知られているが、最近の研究によると、嗅覚様化学受容性シグナル伝達(olfactory−like chemosensory signaling)が嗅覚上皮組織以外の他の生体組織でも起こるという報告がある。即ち、嗅覚受容体、嗅覚関連AC及びGolf遺伝子は、嗅覚上皮細胞だけではなく、腎臓組織でも発現して、レンニン分泌及び糸球体ろ過率の調節に関与することが明らかとなった。しかし、嗅覚受容体の肥満関連機能は、まだ明らかとなっていない。
【0004】
本発明者は、マウスの末梢組織(脂肪組織及び筋肉組織)で多様な種類の嗅覚受容体が発現することを最初に見出し、また、これらの嗅覚受容体の発現が食餌性肥満により調節されることを見出した。したがって、天然物に存在する多様な香り成分が脂肪組織、肝臓組織、筋肉組織などの末梢組織の細胞膜に存在する多数の嗅覚受容体と選択的に結合して、後者が、ACを経由して末梢組織における脂肪蓄積、遊離脂肪酸酸化、熱発生、インシュリン抵抗性調節に関与することを見出した。
【0005】
本明細書全体にかけて多数の論文及び特許文献が参照され、その引用が表示されている。このような特許及び文献の公開は、その全体が本明細書に参照として取り込まれ、本発明の属する技術分野の水準及び本発明の内容がより明確に説明される。
【先行技術文献】
【非特許文献】
【0006】
【非特許文献1】Chakrabarti R.Pharmacotherapy of obesity:emerging drugs and targets,Expert Opin.Ther.Targets 13:195(2009)
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0007】
本発明者らは、脂質代謝異常により引き起こされる肥満を始めとした多様な代謝性疾患の新しい遺伝子ターゲットを開発するために鋭意研究した。その結果、末梢組織で多様な種類の嗅覚受容体が発現するだけではなく、これらの嗅覚受容体の発現がが食餌性肥満により調節されることを見出した。したがって、これらの発現が肥満などに対する新しい分子的ターゲットになり得ることを見出し、本発明を完成した。
【0008】
したがって、本発明の目的は、ジェンバンク(GenBank)アクセッション番号NM_146416のヌクレオチド配列(配列番号:25)に特異的に結合するプライマー又はプローブを含む、肥満、脂質代謝異常、脂肪肝及びインシュリン抵抗性症候群からなる群から選択される代謝疾患診断用のキットを提供することにある。
【0009】
本発明の他の目的は、肥満、脂質代謝異常、脂肪肝及びインシュリン抵抗性症候群からなる群から選択される代謝疾患の治療用組成物のスクリーニング方法を提供することにある。
【0010】
本発明の他の目的及び利点は、発明の詳細な説明、請求の範囲及び図面により、さらに明確にされる。
【課題を解決するための手段】
【0011】
本発明の一様態によると、本発明は、以下のジェンバンク(GenBank)アクセッション番号からなる群から選択されるヌクレオチド配列に特異的に結合するプライマー又はプローブを含む、肥満、脂質代謝異常、脂肪肝及びインシュリン抵抗性症候群からなる群から選択される代謝疾患診断用のキットを提供する。
ジェンバンク(GenBank)アクセッション番号NM_146834、NM_207149、NM_001011758、NM_147015、NM_001011721、NM_146588、NM_207142、NM_147013、NM_001011783、NM_207561、NM_001011777、NM_146577、NM_147010、NM_146408、NM_146511、NM_146407、NM_146730、NM_146542、NM_207154、NM_146752、NM_146661、NM_146658、NM_146351、NM_146642、NM_146293、NM_001011753、NM_146817、NM_146649、NM_146532、NM_001011868、NM_001011816、NM_001011535、NM_146823、NM_146458、NM_001001810、NM_146459、NM_146901、NM_146899、NM_146288、NM_146891、NM_146790、NM_146788、NM_146476、NM_146977、NM_146981、NM_146342、NM_146975、NM_146394、NM_146908、NM_207254、NM_146404、NM_146885、NM_146403、NM_146884、NM_146652、NM_146887、NM_146889、NM_001011787、NM_207151、NM_146449、NM_146274、NM_146292、NM_207570、NM_001011870、NM_207703、NM_147071、NM_207571、NM_146308、NM_146541、NM_146283、NM_146911、NM_207573、NM_207574、NM_001011741、NM_146473、NM_147065、NM_146471、NM_146276、NM_146877、NM_146337、NM_146275、NM_146881、NM_181818、NM_146491、NM_146490、NM_001011525、NM_146984、NM_001011853、NM_146806、NM_146687、NM_146683、NM_146697、NM_146747、NM_001011841、NM_146869、NM_001011842、NM_146301、NM_146696、NM_020513、NM_146271、NM_207576、NM_206823、NM_146451、NM_146466、NM_146935、NM_146357、NM_146335、NM_146484、NM_001011808、NM_207550、NM_146429、NM_146405、NM_146606、NM_207553、NM_146688、NM_146489、NM_146824、NM_146280、NM_146457、NM_147036、NM_146281、NM_206903、NM_146878、NM_001011866、NM_001011770、NM_146947、NM_146949、NM_146628、NM_146940、NM_146941、NM_146625、NM_146624、NM_207235、NM_147051、NM_207555、NM_147023、NM_207224、NM_146825、NM_146347、NM_147006、NM_147008、NM_146706、NM_146709、NM_146715、NM_146722、NM_146717、NM_146655、NM_146273、NM_146576、NM_001005488、NM_146426、NM_146370、XM_891283、NM_146775、NM_146734、NM_146733、NM_146737、NM_146307、NM_146952、NM_146518、NM_001011814、NM_001011815、NM_146962、NM_001011782、NM_147101、NM_207621、NM_147103、NM_146359、NM_147109、NM_147115、NM_147111、NM_207556、NM_146731、NM_146955、NM_146841、NM_146812、NM_147119、NM_147072、NM_146329、NM_147077、NM_207144、NM_147056、NM_001011757、XM_993242、NM_147096、NM_147060、NM_147059、NM_147043、NM_146760、NM_001011848、NM_147095、NM_146358、NM_013620、NM_147069、NM_146598、NM_146599、NM_001011749、NM_001011542、NM_019486、NM_147033、NM_146780、NM_146316、NM_146319、NM_001011809、NM_146493、NM_146363、NM_146667、NM_207133、NM_146299、NM_207156、NM_001011829、NM_146422、NM_146864、NM_146863、NM_146547、NM_146266、NM_207008、NM_207620、NM_207559、NM_001011849、NM_146548、NM_001011821、NM_146550、NM_207159、NM_146670、NM_146677、NM_146676、NM_146300、NM_146567、NM_146282、NM_146525、NM_146524、NM_146558、NM_146903、NM_146882、NM_146749、NM_146883、NM_146417、NM_001011739、NM_146336、NM_146801、NM_146872、NM_146811、NM_146810、NM_001011864、NM_146782、NM_146441、NM_146442、NM_001011518、NM_146503、NM_146330、NM_146279、NM_146612、NM_146826、NM_147107、NM_147105、NM_146510、NM_146286、NM_146855、NM_146515、NM_146437、NM_146589、NM_146660、NM_001011833、NM_146640、NM_146531、NM_001011517、NM_146631、NM_146898、NM_146893、NM_001011803、NM_207631、NM_146832、NM_146534、NM_147066、NM_146692、NM_146634、NM_001011850、NM_019475、NM_019476、NM_147002、NM_146992、NM_146870、NM_146621、NM_146537、NM_146859、NM_146724、NM_146723、NM_146755、NM_147113、NM_147114、NM_146964、NM_147080、NM_146665、NM_146378、NM_146324、NM_146557、NM_146419、NM_146482、NM_146478、NM_146861、NM_207673、NM_001011695、NM_146866、NM_001011872、NM_147012、NM_146391、NM_001011735、NM_207135、NM_146843、NM_146594、NM_207632、NM_146348、NM_146645、NM_146641、NM_146294、XM_621554、XM_621555、NM_146895、NM_146778、NM_146789、NM_146970、NM_146983、NM_146341、NM_146794、NM_146377、NM_146985、NM_206816、NM_001005568、NM_146400、XM_888068、NM_146886、NM_146450、NM_146831、NM_146385、NM_147040、NM_001011737、NM_146744、NM_146540、NM_146488、NM_146910、NM_001011790、NM_146467、NM_146468、NM_146470、NM_146651、NM_146809、NM_001011839、NM_146684、NM_146371、NM_207575、NM_146291、NM_207138、NM_020514、NM_146585、NM_008763(配列番号:26)、NM_147068、NM_001011855、NM_146957、NM_146993、NM_146999、NM_146912、NM_010970、NM_010974、NM_001005520、NM_146269、NM_207552、NM_001005780、NM_146829、NM_001011767、NM_146536、NM_146500、NM_146948、NM_146939、NM_146662、XM_619748、NM_147007、NM_001011863、NM_146761、NM_146721、NM_207158、NM_146
653、NM_001011869、NM_001011810、NM_146732、NM_146736、NM_146738、NM_146914、NM_001011871、NM_146725、NM_146956、NM_146960、NM_010997、NM_146840、NM_146325、NM_147091、NM_147085、NM_147089、NM_147052、NM_001011847、NM_146727、NM_147083、NM_147055、NM_146379、NM_001011755、NM_147044、NM_001011862、NM_146597、NM_147035、NM_146604、NM_146664、NM_001011754、NM_146430、NM_207558、NM_130866、NM_146933、NM_146554、NM_146929、NM_146552、NM_146776、NM_146526、NM_146528、NM_146412、NM_146310、NM_146754、NM_147053、NM_146354、NM_146822、NM_146477、NM_146508、NM_146854、NM_001011827、NM_147108、NM_147106、NM_001011785、NM_146434、NM_146762、NM_207134、NM_146838、NM_146632、NM_001011835、NM_206896、NM_146968、NM_146965、NM_207572、NM_146945、NM_146963、NM_146571、NM_146587、NM_207562、NM_146592、NM_001011825、NM_146836、NM_146402、NM_146362、NM_020515、NM_146635、NM_146990、NM_146646、NM_146997、NM_146485、NM_010980、NM_146951、NM_146623、NM_146338、NM_146305、NM_146830、NM_146774、NM_010998、NM_207143、NM_147094、NM_147076、NM_146315、NM_207146、NM_146758、NM_146596、NM_146479、NM_146785、NM_146456、NM_001011813、NM_146745、NM_207563、NM_207565、NM_146297、NM_147029、NM_146648、NM_146918、NM_207568、NM_146333、NM_146395、NM_146401、NM_146867、NM_146304、NM_146913、NM_207136、NM_130868、NM_147003、NM_019473、NM_146860、NM_146958、NM_001011801、NM_147022、NM_207137、NM_146988、NM_010991、NM_207160、NM_146520、NM_147112、NM_001025386、NM_147050、NM_146494、NM_146671、NM_146610、NM_146921、NM_146573、NM_146572、NM_147019、NM_207566、NM_146917、NM_001005227、NM_146902、NM_146966、NM_146474、NM_146852、NM_146679、NM_207626、NM_146703、NM_146313、NM_146691、NM_146633、NM_147025、NM_147064、NM_010990、NM_146372、NM_147063、NM_146353、NM_146555、NM_146786、NM_146375、NM_146439、NM_146506、NM_146436、NM_001011852、NM_147078、NM_001005485、NM_147030、NM_146637、NM_146907、NM_146916、NM_146469、NM_146701、NM_146636、NM_146796、NM_146265、NM_146322、NM_146759、NM_146617、NM_207230、NM_146502、NM_146711、NM_146311、NM_147079、NM_146959、NM_147074、NM_146392、NM_146682、NM_146674、NM_146424、NM_146787、NM_146746、NM_146507、NM_146611、NM_146615、XM_619781、NM_146629、NM_146630、NM_146974、NM_146447、NM_146448、NM_146699、NM_146693、NM_146995、NM_207175、NM_146619、NM_146718、NM_146583、NM_147070、NM_146284、NM_146605、NM_146845、NM_146349、NM_146464、NM_001005225、NM_146973、NM_146982、NM_146890、NM_207152、NM_146389、NM_146535、NM_207227、NM_147037、NM_146689、NM_146686、NM_146920、NM_001011751、XM_620674、NM_146346、NM_146987、NM_146444、NM_146819、NM_146925、NM_001011858、NM_146954、NM_146314、NM_147061、NM_001011738、NM_207201、NM_146564、NM_146272、NM_207141、NM_146514、NM_146504、NM_146828、NM_146570、NM_146568、NM_207564、NM_146846、NM_147031、NM_146644、NM_207150、NM_146713、NM_207132、NM_030553、NM_146739、NM_147093、NM_147041、NM_013618、NM_146750、NM_146339、NM_001011797、NM_146553、NM_146433、NM_206822、NM_146409、NM_146590、NM_146897、NM_146455、NM_146793、NM_146980、NM_146853、NM_146704、NM_001011840、NM_207554、NM_146416、NM_146708、NM_146413、NM_146926、NM_146498、NM_146497、NM_146743、NM_147084、NM_146814、NM_146492、NM_146668、NM_146551、NM_146423、NM_001011523、NM_146513、NM_147021、NM_146289、NM_146287、NM_146849、NM_146848、NM_146792、NM_146343、NM_147042、NM_008762、NM_001011831、NM_001011791、NM_001011736、NM_146446、NM_146938、NM_146368、NM_146374、NM_146270、NM_010984、NM_146445、NM_001011527、NM_001011846、NM_146306、NM_011002、NM_146453、NM_146579、NM_146365、NM_146591、NM_146323、NM_146695、NM_146443、NM_146495、NM_020291、NM_147046、NM_146522、NM_146868、XM_619779、NM_001011734、NM_146462、NM_207140、NM_146808、NM_207236、NM_146888、NM_146936、NM_001001809、NM_146411、NM_146924、NM_146735、NM_001011867、NM_147110、NM_147120、NM_147049、NM_054090、NM_146930、NM_146904、NM_182714、NM_146896、NM_021368、NM_146327、NM_146702、NM_146770、NM_146950、NM_147004、NM_146364、NM_147081、NM_146481、NM_146768、NM_146638、NM_207567、NM_207240、NM_207664、NM_146923、NM_001011789、NM_147009、NM_147122、NM_146666、NM_054091、NM_146285、NM_146566、NM_146578、NM_146835、NM_001013575、NM_146837、NM_146647、NM_146543、NM_146694、NM_146321、NM_146627、NM_146383、NM_146820、NM_146600、NM_146672、NM_001012266、NM_146561、NM_146440、NM_001011826、NM_147014、NM_147018、NM_146320、NM_146705、NM_146431、NM_146622、NM_146932N、M_14682
7、NM_146569、NM_147001、NM_146384、NM_146944、NM_146656、NM_147088、NM_001011793、BC051435、NM_146613、NM_147011、NM_146847、NM_146366 ,NM_146766、NM_001011775、NM_147000、NM_147005、NM_207622、NM_146934、NM_147032、NM_146278、NM_146527、NM_001011748、NM_146865、NM_146971、NM_146410、NM_146751、NM_207145、NM_146833、NM_146406、NM_146765、NM_207253、NM_146680、NM_001005524、NM_010983、NM_001011861、NM_146922、NM_147104、NM_146813、NM_207249、NM_146663、NM_146862、NM_146905、NM_146418、NM_147028、NM_146303、NM_146295、NM_147098、NM_146803及びNM_146784。
【0012】
本発明者らは、脂質代謝異常で引き起こされる肥満を始めとした多様な代謝性疾患の新しい遺伝子ターゲットを開発するために鋭意研究した。その結果、末梢組織で多様な種類の嗅覚受容体が発現するだけではなく、これらの嗅覚受容体の発現が食餌性肥満により調節されることを観察した。したがって、これらの発現が肥満などに対する新しい分子的ターゲットになり得ることを見出した。
【0013】
本発明によると、嗅覚器官の他にも、脂肪及び筋肉などの末梢組織で多様な種類の嗅覚受容体が発現する。天然物に存在する多様な香り成分が、脂肪組織、肝臓組織、筋肉組織などの末梢組織の細胞膜に存在する多数の嗅覚受容体と選択的に結合し、これらの嗅覚受容体が、ACを経由して末梢組織における脂肪蓄積、遊離脂肪酸酸化、熱発生、インシュリン抵抗性調節に関与する。
【0014】
このような知見に基づいて、本発明者らは、高脂肪食餌マウスの内臓脂肪、皮下脂肪及び筋肉組織で、正常食餌を摂取する対照群に比べて発現が2倍以上変化する嗅覚受容体遺伝子プロファイル(差次的に発現した遺伝子、differentially expressed gene、DEG)を分析した。
【0015】
本明細書で使用される用語‘脂質代謝異常’は、高脂血症を含む概念であって、血液内の脂肪数値増加により現れる高コレステロール血症、高中性脂肪血症、低HDL−コレステロール血症の他にも、リポタンパクの代謝異常などに起因する異常な脂質状態を意味する。
【0016】
本明細書で使用される用語‘脂肪肝’は、肝臓の脂肪代謝障害により脂肪が肝細胞に過度なる量で蓄積された状態をいい、これは、狭心症、心筋梗塞、脳卒中、動脈硬化、脂肪肝及び膵臓炎などの多様な疾病の原因になる。
【0017】
本明細書で使用される用語‘糖尿病’は、ブドウ糖不耐性を招くインシュリンの相対的又は絶対的不足で特徴付けられる慢性疾患を意味する。用語‘糖尿病’は、あらゆる種類の糖尿病を含み、例えば、第1型糖尿病、第2型糖尿病及び遺伝性糖尿病を含む。第1型糖尿病は、インシュリン依存性糖尿病であって、主にβ−細胞の破壊により生じる。第2型糖尿病は、インシュリン非依存性糖尿病であって、食事後、不十分なインシュリン分泌により生じるか、あるいはインシュリン抵抗性により生じる。
【0018】
本明細書で使用される用語‘インシュリン抵抗性’は、血糖を下げるインシュリンの機能が低下し、細胞がブドウ糖を効果的に燃焼できないことを意味する。インシュリン抵抗性が高い場合、人体は過多なインシュリンを生産し、これにより、高血圧や脂質代謝異常のみならず、心臓病、糖尿病を発症する可能性がある。
【0019】
特に、第2型糖尿病では、筋肉と脂肪組織でインシュリンの増加に気付かず、インシュリンの作用が起こらない。
【0020】
本明細書で使用される用語‘インシュリン抵抗性症候群’は、前記インシュリン抵抗性により誘発された疾患を総称する概念であって、インシュリン作用に対する細胞の抵抗性、高インシュリン血症、超低密度リポ蛋白(very low density lipoprotein、VLDL)と中性脂肪の増加、高密度リポ蛋白(high density lipoprotein,HDL)の減少及び高血圧などを特徴とする疾患を意味し、心血管疾患と第2型糖尿病の危険因子と認識されている概念である(Reaven GM.,Role of insulin resistance in human disease,Diabetes,37:1595−607(1988))。また、インシュリン抵抗性は、高血圧、糖尿、喫煙などの危険因子と共に細胞内酸化ストレスを増加させて、シグナル伝達系を変化させて炎症反応を誘発し、アテローム硬化症を進行させることが知られている(Freeman BA et al.,Biology of disease: free radicals and tissue injury,Lab.Invest.47:412−26(1982)、Kawamura M et al.,Pathophysiological concentrations of glucose promote oxidative modification of low density lipoprotein by a superoxide−dependent pathway,J.Clin.Invest.94:771−8(1994))。
【0021】
本明細書で使用される用語‘代謝疾患’は、各種心血管系疾患と第2型糖尿病の危険要因が互いに群集をなす現象を一つの疾患群に概念化させたもので、インシュリン抵抗性及びこれに係わる複雑で多様な代謝異常と臨床的な異常を全て包括して意味する概念である。1988年Reavenは、このような症状の共通の原因が、インシュリン抵抗性であることを主張し、インシュリン抵抗性症候群と命名したが、1998年世界保健機構(WHO)は、インシュリン抵抗性がこれらの症状の全ての要素を全部説明することはできないことから、‘代謝症候群’又は‘代謝疾患’という用語を導入した。
【0022】
本発明の好ましい実施形態によると、本発明のヌクレオチド配列は、ジェンバンク(GenBank)アクセッション番号NM_146693、NM_147025、NM_146610、NM_146366、NM_146648、NM_146640、NM_146632、NM_146416、NM_146997、NM_146770、NM_146819、NM_001011870、NM_008763、NM_146893、NM_147069、NM_146703、NM_147063、NM_146950、NM_146364、NM_146448、NM_146858、NM_146897、NM_146391、NM_146697、NM_147028、NM_001011757、NM_146849、NM_207137、NM_146750及びNM_146339からなる群から選択される。前記遺伝子は、高脂肪食餌マウスと正常食餌対照群との間に、発現量に2倍以上差のある遺伝子のうち、抗肥満効能を示す多様な香り成分により発現が調節される遺伝子である。
【0023】
本発明の好ましい実施形態によると、本発明のキットは、マイクロアレイである。
【0024】
本発明の診断用キットで利用されるプローブ又はプライマーは、本発明のヌクレオチド配列に対して相補的な配列を有する。本明細書で用語‘相補的(complementary)’は、ある特定なハイブリッド形成又はアニーリング条件下で前記本発明のヌクレオチド配列に選択的にハイブリッド形成できる程度の相補性を有することを意味する。したがって、用語‘相補的’は、用語‘完全相補的(perfectly complementary)’とは異なる意味を有し、本発明のプライマー又はプローブは、前記本発明のヌクレオチド配列に選択的にハイブリッド形成できる程度であれば、一つ又はそれ以上のミスマッチ(mismatch)塩基配列を有することができる。本明細書で使用される‘プライマー’は、適した温度で適した緩衝液内で適した条件(即ち、4種の異なるヌクレオチドトリホスフェート及び重合反応酵素の存在下)において鋳型依存的DNA合成の開始点として作用できる一本鎖オリゴヌクレオチドを意味する。プライマーの適した長さは、多様な要素、例えば、温度とプライマーの用途によって変化があるが、典型的に15〜30ヌクレオチドである。短いプライマー分子は、鋳型と十分安定したハイブリッド形成二重鎖を形成するために、一般的により低い温度が必要となる。
【0025】
プライマーの配列は、鋳型の一部配列と完全に相補的な配列を有する必要はなく、鋳型とハイブリッド形成されてプライマー固有の作用ができる範囲内で十分な相補性を有すれば十分である。したがって、本発明におけるプライマーは、鋳型である前記本発明のヌクレオチド配列に完璧に相補的な配列を有する必要はなく、この遺伝子配列にハイブリッド形成されてプライマー作用ができる範囲内で十分な相補性を有すれば十分である。このようなプライマーのデザインは、本発明のヌクレオチド配列を参照して当業者が容易に実施することができ、例えば、プライマーデザイン用プログラム(例えば、PRIMER3プログラム)を利用して実施できる。
【0026】
本明細書で使用された用語‘プローブ’は、天然の又は修飾されたモノマー又は連鎖(linkages)の線形オリゴマーを意味し、デオキシリボヌクレオチド及びリボヌクレオチドを含み、ターゲットヌクレオチド配列に特異的にハイブリッド形成でき、天然に存在するか或いは人為的に合成されたものである。本発明のプローブは、好ましくは一本鎖であり、オリゴデオキシリボヌクレオチドである。本発明のプローブは、天然(naturally occurring)dNMP(即ち、dAMP、dGM、dCMP及びdTMP)、ヌクレオチド類似体又は誘導体を含むことができる。また、本発明のプローブは、リボヌクレオチドも含むことができる。例えば、発明のプローブは、骨格修飾されたヌクレオチド〔例えば、ペプチド核酸(PNA)(M.Egholm et al.,Nature,365:566−568(1993))、ホスホロチオエートDNA、ホスホロジチオエートDNA、ホスホロアミデートDNA(phosphoramidate DNA)、アミド結合DNA、MMI結合DNA、2’−O−メチルRNA、アルファ−DNA及びメチルホスホン酸DNA〕、糖修飾されたヌクレオチド(例えば、2’−O−メチルRNA、2’−フルオロRNA、2’−アミノRNA、2’−O−アルキルDNA、2’−O−アリルDNA、2’−O−アルキニルDNA、ヘキソースDNA、ピラノシルRNA及びアンヒドロヘキシトールDNA)、及び塩基修飾を有するヌクレオチド〔例えば、C−5置換されたピリミジン(置換基は、フルオロ基、ブロモ基、クロロ基、ヨード基、メチル基、エチル基、ビニル基、ホルミル基、エチニル基、プロピニル基、アルキニル基、チアゾリル基、イミダゾリル基、ピリジル基を含む)、C−7置換基を有する7−デアザプリン(置換基は、フルオロ基、ブロモ基、クロロ基、ヨード基、メチル基、エチル基、ビニル基、ホルミル基、アルキニル基、アルケニル基、チアゾリル基、イミダゾリル基、ピリジル基を含む)、イノシン及びジアミノプリン〕を含むことができる。
【0027】
本発明のマイクロアレイにおいて、前記プローブは、ハイブリッド形成可能なアレイ要素(hybridizable array element)として利用されて、基体(substrate)上に固定化される。
【0028】
好ましい基体は、適した堅固性又は半堅固性の支持体であって、例えば、膜、フィルター、チップ、スライド、ウェハー、ファイバー、磁性又は非磁性ビーズ、ゲル、管、プレート、高分子、極微粒子及び毛細管を含む。上記のハイブリッド形成可能なアレイ要素は、上記の基体上に配列されて固定化される。このような固定化は、化学的結合方法又はUVのような共有結合方法により実施される。例えば、前記ハイブリッド形成可能なアレイ要素は、エポキシ化合物又はアルデヒド基を含むように修飾されたグラス表面に結合できて、また、ポリリジンコーティング表面でUVにより結合できる。また、前記ハイブリッド形成アレイ要素は、リンカー(例えば、エチレングリコールオリゴマー及びジアミン)を介して基体に結合できる。
【0029】
一方、本発明のマイクロアレイに適用される試料DNAは、標識でき、マイクロアレイ上のアレイ要素とハイブリッド形成される。ハイブリッド形成条件は、多様である。ハイブリッド形成程度の検出及び分析は、標識物質によって多様である。
【0030】
本発明の代謝疾患診断用のキットは、ハイブリッド形成に基づいて実施できる。この場合、前記本発明のヌクレオチド配列に対して相補的な配列を有するプローブが利用される。前記ヌクレオチド配列にハイブリッド形成されるプローブを利用してハイブリッド形成に基づく分析により、代謝疾患の危険度を判断することができる。プローブの標識は、ハイブリッド形成の有無を検出するシグナルを提供することができ、これは、オリゴヌクレオチドに連結できる。適した標識は、蛍光団(例えば、フルオレセイン、フィコエリトリン、ロダミン、リサミン、Cy3及びCy5(ファルマシア))、発色団、化学発光団、磁気粒子、放射能同位元素(P32及びS35)、マス標識、電子密集粒子、酵素(例えば、アルカリホスファターゼ又はホースラディッシュペルオキシダーゼ)、助因子、酵素に対する基質、重金属(例えば、金);及び抗体、ストレプトアビジン、ビオチン、ジゴキシゲニンとキレーティング基のような特定結合パートナーを有するハプテンを含むが、これらに限定されるものではない。標識は、当業界で通常的に実施される多様な方法、例えば、ニックトランスレーション(nick translation)方法、無作為プライミング方法(Multiprime DNA labelling systems booklet,”Amersham”(1989))及びキネーション方法(Maxam&Gilbert,Methods in Enzymology,65:499(1986))を通じて実施できる。標識は、蛍光、放射能、発色測定、重量測定、X線回折又は吸収、磁気、酵素的活性、マス分析、結合親和度、高頻度ハイブリッド形成、ナノクリスタルにより検出できるシグナルを提供する。
【0031】
分析対象になる核酸試料は、多様な生体試料(biosamples)から得たmRNAを利用して製造できる。前記生体試料は、好ましくは脂肪又は筋肉組織細胞である。プローブの代わりに、分析対象となるcDNAを標識してハイブリッド形成反応に基づく分析を実施することもできる。
【0032】
プローブを利用する場合、プローブをcDNA分子とハイブリッド形成させる。本発明において、適したハイブリッド形成条件は、最適化手順によって一連の過程で決定できる。
【0033】
このような手順は、研究室で使用のためのプロトコールを樹立するために、当業者によって一連の過程で実施される。例えば、温度、成分の濃度、ハイブリッド形成及び洗浄時間、緩衝液成分及びこれらのpH及びイオン強度などの条件は、プローブの長さ及びGC量及びターゲットヌクレオチド配列などの多様な因子に依存する。ハイブリッド形成のための詳細な条件は、Joseph Sambrook,et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.(2001);及びM.L.M.Anderson,Nucleic Acid Hybridization,Springer−Verlag New York Inc.N.Y.(1999)で確認できる。例えば、前記厳格条件において、高厳格条件は、0.5M NaHPO、7%SDS(ドデシル硫酸ナトリウム)、1 mM EDTAで65℃条件でハイブリッド形成して、0.1×SSC(standard saline citrate)/0.1%SDSで68℃条件で洗浄することを意味する。又は、高厳格条件は、6×SSC/0.05%ピロリン酸ナトリウムで48℃条件で洗浄することを意味する。低厳格条件は、例えば、0.2×SSC/0.1%SDSで42℃条件で洗浄することを意味する。
【0034】
ハイブリッド形成反応に次いで、ハイブリッド形成の発生を示すハイブリッド形成シグナルを検出する。ハイブリッド形成シグナルは、例えば、プローブに結合された標識の種類によって多様な方法で実施できる。例えば、プローブが酵素により標識された場合、この酵素の基質をハイブリッド形成結果物と反応させて、ハイブリッド形成の発生の有無を確認することができる。利用できる酵素/基質の組合せは、ペルオキシダーゼ(例えば、ホースラディッシュペルオキシダーゼ)と、クロロナフトール、アミノエチルカルバゾール、ジミノベンジジン、D−ルシフェリン、ルシゲニン(ビス−N−メチルアクリジニウムニトレート)、レゾルフィンベンジルエーテル、ルミノール、アンプレックスレッド試薬(10−アセチル−3,7−ジヒドロキシフェノキサジン)、HYR(p−フェニレンジアミン−HCl及びピロカテコール)、TMB(テトラメチルベンジジン)、ABTS(2,2’−アジン−ジ[3−エチルベンズチアゾリンスルホネート])、o−フェニレンジアミン(OPD)及びナフトール/ピロニン;アルカリホスファターゼとブロモクロロインドールイルホスフェート(BCIP)、ニトロブルーテトラゾリウム(NBT)、ナフトール−AS−B1−ホスフェート及びECF基質との組合せ;グルコースオキシダーゼと、t−NBT(ニトロブルーテトラゾリウム)及びm−PMS(フェナジンメトスルファート)との組合せなどである。プローブが金粒子で標識された場合は、硝酸銀を利用してシルバー染色方法で検出することができる。したがって、本発明の肥満などの代謝性疾患の危険度を予測する方法をハイブリッド形成に基づいて実施する場合は、具体的に(i)本発明のヌクレオチド配列に対して相補的な配列を有するプローブを核酸試料にハイブリッド形成させる工程と、(ii)前記ハイブリッド形成の発生の有無を検出する工程とを含む。ハイブリッド形成過程によるハイブリッド形成シグナルの強度を分析することにより、肥満などの代謝疾患の危険度を判断することができる。即ち、試料から、本発明によって代謝疾患患者で高発現することが明らかにされた嗅覚受容体遺伝子配列に対するハイブリッド形成シグナルが正常試料(正常細胞)より強く出る場合は、肥満を始めとした代謝疾患の危険度が高いと判断する。加えて、試料から、本発明によって代謝疾患患者で低発現することが明らかにされた嗅覚受容体遺伝子配列に対するハイブリッド形成シグナルが正常試料(正常細胞)より弱く出る場合は、肥満を始めとした代謝疾患の危険度が高いと判断する。
【0035】
本発明の好ましい実施形態によると、本発明のキットは、遺伝子増幅キットである。
【0036】
本明細書に記載された用語‘増幅’は、核酸分子を増幅する反応を意味する。多様な増幅反応が当業界に報告されており、これは、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)(米国特許第4,683,195号、第4,683,202号及び第4,800,159号)、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(RT−PCR)(Sambrookら,Molecular Cloning.A Laboratory Manual,3rd ed.Cold Spring Harbor Press(2001))、Miller,H.I.(WO 89/06700)及びDavey,C.ら(EP329,822)の方法、リガーゼ連鎖反応(ligase chain reaction;LCR)、Gap−LCR(WO90/01069)、復旧連鎖反応(repair chain reaction;EP439,182)、転写介在増幅(transcription−mediated amplification;TMA)(WO 88/10315)、自家持続塩基配列複製(self sustained sequence replication)(WO90/06995)、ターゲットポリヌクレオチド塩基配列の選択的増幅(米国特許第6,410,276号)、コンセンサス配列プライミングポリメラーゼ連鎖反応(consensus sequence primed polymerase chain reaction;CPPCR)(米国特許第4,437,975号)、任意的プライミングポリメラーゼ連鎖反応(arbitrarily primed polymerase chain reaction;AP−PCR)(米国特許第5,413,909号及び5,861,245号)、核酸塩基配列ベース増幅(nucleic acid sequence based amplification;NASBA)(米国特許第5,130,238号、第5,409,818号、第5,554,517号及び第6,063,603号)、鎖置換増幅(strand displacement amplification)(21、22)及び環−仲裁恒温性増幅(loop−mediated isothermal amplification;LAMP)(23)を含むが、これらに限定されない。使用可能な他の増幅方法は、米国特許第5,242,794、第5,494,810号、第4,988,617号及び米国特許第09/854,317号に記述されている。PCRは、最もよく知られた核酸増幅方法であって、そのバリエーションと応用がたくさん開発されている。例えば、PCRの特異性又は敏感性を増進させるために伝統的なPCR過程を変形し、タッチダウンPCR、ホットスタートPCR、ネステッドPCR及びブースターPCRが開発された。また、リアルタイムPCR、ディファレンシャルディスプレイPCR(DD−PCR)、cDNA末端の迅速増幅(rapid amplification of cDNA ends:RACE)、マルチプレックスPCR、インバースポリメラーゼ連鎖反応(inverse polymerase chain reaction:IPCR)、ベクトレット(vectorette)PCR及びTAIL−PCR(thermal asymmetric interlaced PCR)が特定な応用のために開発された。PCRに対する詳しい内容は、McPherson,M.J.,及びMoller,S.G.PCR.BIOS Scientific Publishers、Springer−Verlag New York Berlin Heidelberg,N.Y.(2000)に記載されており、その教示事項は、本明細書に参照として取り込まれる。本発明の診断用キットをプライマーを利用して実施する場合は、遺伝子増幅反応を実施して本発明のヌクレオチド配列の発現程度を調べる。本発明は、前記ヌクレオチド配列の発現程度を分析するものであるため、分析対象の試料で本発明のヌクレオチド配列のmRNA量を調べて、前記ヌクレオチド配列の発現程度を決定する。したがって、本発明は、原則的に試料内のmRNAを鋳型として、mRNA又はcDNAに結合するプライマーを利用して遺伝子増幅反応を行う。mRNAを得るために、試料から全RNAを分離する。全RNAを分離することは、当業界に公知された通常の方法によって実施できる(参照:Sambrook,J.et al.,Molecular Cloning.A Laboratory Manual,3rd ed.Cold Spring Harbor Press(2001);Tesniere,C.et al.,Plant Mol.Biol.Rep.,9:242(1991);Ausubel,F.M.et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Willey&Sons(1987);及びChomczynski,P.et al.,Anal.Biochem.162:156(1987))。例えば、Trizolを利用して容易に細胞内の全RNAを分離することができる。次いで、分離されたmRNAからcDNAを合成して、このcDNAを増幅する。本発明の全RNAは、人間の試料から分離されるものであるため、mRNAの末端にはポリーAテールを有しており、このような配列特性を利用したオリゴdTプライマー及び逆転写酵素を利用してcDNAを容易に合成することができる(参照:PNAS USA,85:8998(1988);Libert F,et al.Science,244:569(1989);及びSambrook,J.et al.,Molecular Cloning.A Laboratory Manual,3rd ed.Cold Spring Harbor Press(2001))。次いで、遺伝子増幅反応を通じて、合成されたcDNAを増幅する。
【0037】
本発明に利用されるプライマーは、鋳型の一部位にハイブリッド形成又はアニーリングされて、二本鎖構造を形成する。このような二本鎖構造を形成するのに適した核酸ハイブリッド形成の条件は、Joseph Sambrookら、Molecular Cloning、A Laboratory Manual、Cold Spring Harbor Laboratory Press、Cold Spring Harbor、N.Y.(2001)及びHaymes、B.D.ら、Nucleic Acid Hybridization、A Practical Approach、IRL Press、Washington、D.C.(1985)に開示されている。
【0038】
多様なDNAポリメラーゼが本発明の増幅に利用できて、これは、E.coli DNAポリメラーゼIの‘Klenow’断片、熱安定性DNAポリメラーゼ及びバクテリオファージT7 DNAポリメラーゼを含む。好ましくは、ポリメラーゼは、多様なバクテリア種から得られる熱安定性DNAポリメラーゼであり、Thermus aquaticus(Taq)、Thermus thermophilus(Tth)、Thermus filiformis、Thermis flavus、Thermococcus literalis及びPyrococcus furiosus(Pfu)を含む。
【0039】
重合反応を実施する場合、反応容器に、このような反応に必要な構成成分の過剰量を提供することが好ましい。増幅反応に必要な成分の過剰量は、増幅反応が各成分の濃度によって実質的に制限されない程度の量を意味する。Mg2+のような助因子、dATP、dCTP、dGTP及びdTTPを、所望の増幅程度が達成できる程度に反応混合物に供給する必要がある。増幅反応に利用される全ての酵素は、同一な反応条件下で活性状態であり得る。実際に、緩衝液は、全ての酵素が最適の反応条件に近接するようにする。したがって、本発明の増幅過程は、反応物の添加のような条件の変化無しに、単一反応物で実施できる。
【0040】
本発明においてアニーリングは、ターゲットヌクレオチド配列とプライマー間での特異的結合を可能にする厳格条件下で実施される。アニーリングのための厳格条件は、配列依存的であり、周囲環境的変数によって多様である。
【0041】
このように増幅された本発明のヌクレオチド配列のcDNAを適した方法で分析し、前記ヌクレオチド配列の発現程度を調べる。例えば、上述の増幅反応結果物をゲル電気泳動して、その結果形成されるバンドを観察及び分析することにより、本発明のヌクレオチド配列の発現程度を調べる。このような増幅反応を通じて、生体試料(biosamples)から、本発明によって代謝疾患患者で高発現することが明らかとなった嗅覚受容体遺伝子配列の発現が正常試料(正常細胞)より高く出るか、代謝疾患患者で低発現することが明らかとなった嗅覚受容体遺伝子配列の発現が正常試料より弱く出る場合は、肥満を始めとした代謝疾患の危険度が高いと判断する。
【0042】
したがって、本発明の代謝疾患マーカーの検出方法をcDNAを利用する増幅反応に基づいて実施する場合は、具体的に(i)本発明のヌクレオチド配列にアニーリングするプライマーを利用して増幅反応を実施する工程と、(ii)前記増幅反応の産物を分析して前記ヌクレオチド配列の発現程度を決定する工程とを含む。
【0043】
本発明のキットは、上記の成分の外にも、他の成分を追加的に含むことができる。例えば、本発明のキットがPCR増幅過程に適用される場合は、本発明のキットは選択的に、PCR増幅に必要な試薬、例えば、緩衝液、DNAポリメラーゼ(例えば、Thermus aquaticus(Taq)、Thermus thermophilus(Tth)、Thermus filiformis、Thermis flavus、Thermococcus literalis又はPyrococcus furiosus(Pfu)から収得した熱安定性DNAポリメラーゼ)、DNAポリメラーゼ助因子及びdNTPsを含むことができる。本発明のキットは、上記の試薬成分を含む多数の別途パッケージング又はコンパートメントとして製作できる。
【0044】
本発明の好ましい実施形態によると、以下のジェンバンクアクセッション番号からなる群から選択されるヌクレオチド配列は、代謝疾患患者において高発現する:
ジェンバンクアクセッション番号NM_146834、NM_001011758、NM_001011721、NM_146588、NM_207142、NM_147013、NM_001011783、NM_207561、NM_001011777、NM_146577、NM_146407、NM_146730、NM_146542、NM_207154、NM_146752、NM_146661、NM_146642、NM_146293、NM_001011753、NM_146817、NM_146649、NM_001011816、NM_146823、NM_001001810、NM_146459、NM_146901、NM_146899、NM_146288、NM_146790、NM_146476、NM_146977、NM_146981、NM_146342、NM_146975、NM_146394、NM_146908、NM_207254、NM_146885、NM_146403、NM_146884、NM_146889、NM_001011787、NM_207151、NM_146274、NM_146292、NM_001011870、NM_207703、NM_147071、NM_146541、NM_146283、NM_146911、NM_207573、NM_001011741、NM_146473、NM_147065、NM_146276、NM_146877、NM_146275、NM_146881、NM_181818、NM_146491、NM_001011525、NM_146984、NM_001011853、NM_146806、NM_146687、NM_146697、NM_001011841、NM_146869、NM_146696、NM_207576、NM_206823、NM_146451、NM_146466、NM_146935、NM_146357、NM_001011808、NM_207550、NM_146429、NM_146606、NM_146824、NM_146457、NM_146281、NM_206903、NM_146878、NM_001011770、NM_146947、NM_146949、NM_146628、NM_146940、NM_146941、NM_146625、NM_146624、NM_147051、NM_207555、NM_146825、NM_147006、NM_146706、NM_146709、NM_146715、NM_146722、NM_001005488、XM_891283、NM_146775、NM_146952、NM_001011814、NM_001011815、NM_146962、NM_001011782、NM_147101、NM_207621、NM_147103、NM_147115、NM_147111、NM_146955、NM_146841、NM_146812、NM_147077、NM_207144、NM_147056、NM_001011757、NM_147096、NM_147060、NM_147059、NM_001011848、NM_146358、NM_013620、NM_146599、NM_001011749、NM_001011542、NM_147033、NM_146316、NM_001011809、NM_146493、NM_146363、NM_207133、NM_146299、NM_207156、NM_001011829、NM_146422、NM_146863、NM_207008、NM_207620、NM_207559、NM_001011849、NM_001011821、NM_207159、NM_146677、NM_146676、NM_146282、NM_146524、NM_146558、NM_146903、NM_146749、NM_146883、NM_146417、NM_146801、NM_146872、NM_146782、NM_146441、NM_146442、NM_146503、NM_146330、NM_146279、NM_146826、NM_147107、NM_147105、NM_146855、NM_146515、NM_146437、NM_001011695、NM_146866、NM_001011872、NM_146391、NM_001011735、NM_207135、NM_146348、NM_146645、XM_621554、NM_146778、NM_146789、NM_146983、NM_206816、NM_146400、NM_146450、NM_146831、NM_001011737、NM_146744、NM_146540、NM_146488、NM_146910、NM_146467、NM_146468、NM_146470、NM_146651、NM_146684、NM_146371、NM_207575、NM_008763、NM_147068、NM_001011855、NM_146957、NM_146912、NM_010970、NM_010974、NM_001005520、NM_207552、NM_001005780、NM_001011767、NM_146536、NM_146500、NM_146948、NM_146662、XM_619748、NM_147007、NM_001011863、NM_146761、NM_207158、NM_146653、NM_001011869、NM_001011810、NM_146732、NM_146736、NM_146914、NM_001011871、NM_146956、NM_146840、NM_146325、NM_147091、NM_147085、NM_147089、NM_147052、NM_001011847、NM_147083、NM_001011755、NM_146597、NM_147035、NM_146604、NM_001011754、NM_207558、NM_130866、NM_146933、NM_146929、NM_146552、NM_146526、NM_146528、NM_001011827、NM_147108、NM_147106、NM_001011785、NM_146571、NM_146587、NM_146402、NM_020515、NM_146635、NM_146646、NM_146485、NM_146623、NM_146338、NM_146305、NM_146774、NM_010998、NM_147094、NM_147076、NM_146315、NM_146758、NM_146479、NM_146785、NM_146456、NM_146573、NM_146572、NM_147019、NM_207566、NM_001005227、NM_146902、NM_146474、NM_146852、NM_146679、NM_207626、NM_146703、NM_146691、NM_146633、NM_147025、NM_147064、NM_146372、NM_147063、NM_146353、NM_146555、NM_146375、NM_146439、NM_146506、NM_146436、XM_619781、NM_146629、NM_146974、NM_146447、NM_146448、NM_146699、NM_146693、NM_146995、NM_207175、NM_146619、NM_146564、NM_146570、NM_146568、NM_207564、NM_146846、NM_147031、NM_146644、NM_207150、NM_207132、NM_030553、NM_146739、NM_147093、NM_013618、NM_146750、NM_146339、NM_146553、NM_146433、NM_147084、NM_147021、NM_146287、NM_146849、NM_146848、NM_146792、NM_146343、NM_147042、NM_008762、NM_001011831、NM_146938、NM_146374、NM_146270、NM_010984、NM_146445、NM_001011527、NM_001011846、NM_146306、NM_011002、NM_146453、NM_001011734、NM_146462、NM_207140、NM_146808、NM_207236、NM_146888、NM_146936、NM_001001809、NM_146411、NM_146924、NM_146735、NM_001011867、NM_147110、NM_147120、NM_147049、NM_054090、NM_146930、NM_146904、NM_182714、NM_146638、NM_207567、NM_207240、NM_207664、NM_146923、NM_001011789、NM_147009、NM_147122、NM_146666、NM_054091、NM_146285、NM_146566、NM_147014、NM_147018、NM_146320、NM_146705、NM_146431、NM_146622、NM_146932N、M_146827、NM_147011、NM_146847、NM_146366 ,NM_146766、NM_001011775、NM_147000、NM_147005、NM_207622、NM_146934、NM_147032、NM_146278、NM_146527、NM_001011748、NM_146865、NM_146833、NM_146406、NM_146765、NM_207253、NM_146680、NM_001005524、NM_010983、NM_001011861、NM_146922、NM_147104、NM_146813、NM_207249、NM_146663、NM_146862、NM_146905及びNM_146418。
【0045】
そして、以下のジェンバンクアクセッション番号からなる群から選択されるヌクレオチド配列は、代謝疾患患者において低発現する:
ジェンバンクアクセッション番号NM_146589、NM_146660、NM_001011833、NM_146640、NM_146531、NM_001011517、NM_146631、NM_146898、NM_146893、NM_001011803、NM_207631、NM_146832、NM_146534、NM_147066、NM_146692、NM_146634、NM_001011850、NM_019475、NM_019476、NM_147002、NM_146992、NM_146870、NM_146621、NM_146537、NM_146859、NM_146724、NM_146723、NM_146755、NM_147113、NM_147114、NM_146964、NM_147080、NM_146665、NM_146378、NM_146324、NM_146557、NM_146419、NM_146482、NM_146478、NM_146861、NM_146412、NM_146310、NM_146754、NM_147053、NM_146354、NM_146822、NM_146477、NM_146508、NM_146854、NM_146762、NM_207134、NM_146838、NM_146632、NM_001011835、NM_206896、NM_146968、NM_146965、NM_207572、NM_146945、NM_146963、NM_207565、NM_146297、NM_147029、NM_146648、NM_146294、NM_146918、NM_207568、NM_146333、NM_146395、NM_001005568、NM_146401、NM_146867、NM_146304、NM_146913、NM_207136、NM_130868、NM_147003、NM_146585、NM_019473、NM_146860、NM_146958、NM_001011801、NM_146405、NM_146269、NM_146688、NM_147022、NM_207137、NM_146721、NM_146988、NM_146734、NM_010991、NM_207160、NM_146520、NM_147112、NM_146727、NM_001025386、NM_147050、NM_146494、NM_146671、NM_146300、NM_146525、NM_146610、NM_001011852、NM_207563、NM_147078、NM_001005485、NM_207632、NM_147030、NM_146637、NM_146907、NM_146404、NM_146916、NM_146469、NM_146471、NM_146337、NM_146701、NM_146636、NM_146796、NM_146265、NM_146322、NM_146335、NM_146759、NM_146280、NM_146617、NM_207230、NM_146502、NM_207235、NM_146711、NM_146733、NM_146311、NM_147079、NM_146959、NM_147074、NM_146392、NM_146664、NM_146682、NM_146674、NM_146424、NM_146787、NM_146746、NM_146507、NM_146611、NM_146615、NM_207149、NM_146408、NM_146845、NM_001011825、NM_146349、NM_146658、NM_146836、NM_001011868、NM_146464、NM_001005225、NM_146458、NM_146973、NM_146788、NM_146966、NM_146982、NM_146890、NM_146652、NM_146362、NM_207570、NM_207152、NM_146389、NM_147040、NM_207571、NM_146535、NM_207227、NM_001011790、NM_207574、NM_147037、NM_146689、NM_146686、NM_207553、NM_146920、NM_001011751、NM_001011866、NM_010980、XM_620674、NM_147023、NM_146347、NM_146346、NM_146987、NM_146444、NM_146819、NM_146925、NM_146737、NM_001011858、NM_146725、NM_146954、NM_010997、NM_146731、NM_146314、NM_146841、NM_207146、NM_146760、NM_147061、NM_146319、NM_146667、NM_146430、NM_001011738、NM_146864、NM_207201、NM_146776、NM_146564、NM_146882、NM_001011739、NM_146811、NM_146272、NM_001011518、NM_207141、NM_146514、NM_146504、NM_146828、NM_146286、NM_206822、NM_147012、NM_146409、NM_146590、NM_146897、NM_146630、NM_146970、NM_146455、NM_146341、NM_146377、NM_146985、NM_146793、NM_146980、XM_888068、NM_146853、NM_146704、NM_146313、NM_001011840、NM_146301、NM_207138、NM_020513、NM_207554、NM_146829、NM_146416、NM_146951、NM_146708、NM_146273、NM_146413、NM_146370、NM_146926、NM_010990、NM_146498、NM_146497、NM_146743、NM_146359、NM_207143、NM_147084、NM_146329、NM_147055、NM_146814、NM_019486、NM_146780、NM_146492、NM_146668、NM_146551、NM_146554、NM_146423、NM_001011523、NM_001011813、NM_146513、NM_146612、NM_146510、NM_146434、NM_146579、NM_207562、NM_146592、NM_146365、NM_146591、NM_146323、NM_146695、NM_020514、NM_146997、NM_146443、NM_146576、NM_146426、NM_146495、NM_020291、NM_147046、NM_147069、NM_146547、NM_146548、NM_146567、NM_146522、NM_146868、NM_146745、NM_146917、NM_146896、NM_146794、NM_021368、NM_146327、NM_146308、NM_146490、NM_001011839、NM_146683、NM_146702、NM_146990、NM_146770、NM_147036、NM_146950、NM_147004、NM_146364、NM_147109、NM_207556、NM_147081、NM_147072、NM_146481、NM_146921、NM_207673、NM_146578、NM_146835、NM_001013575、NM_146837、NM_146647、NM_001011535、NM_146895、NM_146891、NM_146886、NM_146449、NM_146713、NM_146385、NM_146543、NM_146809、NM_146694、NM_146271、NM_146321、NM_001011736、NM_146627、NM_146368、NM_146718、NM_146383、NM_146738、NM_147041、NM_146820、NM_146600、NM_001011797、NM_146550、NM_146670、NM_146672、NM_001012266、NM_146561、NM_146336、NM_146810、NM_146440、NM_001011826、NM_146569、NM_147015、NM_147010、XM_619779、NM_146511、NM_146594、NM_146289、NM_146351、NM_146641、NM_146532、NM_146887、NM_146291、NM_147001、NM_146993、NM_146999、NM_001011791、NM_146484、NM_146384、NM_146489、NM_146944、NM_146717、NM_146830、NM_146655、NM_146656、NM_146307、NM_146960、NM_147088、NM_001011793、NM_146598、NM_001011862BC051435、NM_146613、NM_146971、NM_146410、NM_146747、NM_146446、NM_146751、NM_147043、NM_146596、NM_207145、NM_146843、NM_146768、NM_147028、XM_621555、NM_146303、NM_001011842、NM_146939、NM_207224、NM_147008、NM_146295、NM_146518、NM_147098、NM_147119、NM_146379、XM_993242、NM_147095、NM_147044、NM_146266、NM_146803、NM_146786、NM_146784及びNM_001011864。
【0046】
本明細書で使用される用語‘高発現’は、調査対象の試料(例えば、肥満患者の脂肪組織細胞)において対象となるヌクレオチド配列の発現程度が正常試料(例えば、正常細胞)と比較して有意に高い場合(好ましくは、2倍以上)を意味する。本明細書で使用される用語‘低発現’は、調査対象の試料において対象となるヌクレオチド配列の発現程度が正常試料と比較して有意に低い場合(好ましくは、2倍以上)を意味する。本発明の代謝疾患診断用のキットは、本発明者らによって開発された新規なターゲットヌクレオチド配列の高発現又は低発現を分析することにより、代謝疾患の危険度を予測することができる。
【0047】
本発明の好ましい実施形態によると、本発明の脂質代謝異常は、高脂血症である。
【0048】
本明細書で使用される用語‘高脂血症’は、中性脂肪とコレステロールなどの脂肪代謝が円滑ではないために、血液中の脂肪量が多いことにより誘発される疾患である。より具体的に、高脂血症とは、血液内の中性脂肪、LDLコレステロール、リン脂質及び遊離脂肪酸などの脂質成分が増加した状態により特徴付けられ、発生頻度の高い高コレステロール血症又は高中性脂肪血症を含む。
【0049】
本発明の好ましい実施形態によると、本発明のインシュリン抵抗性症候群は、インシュリン抵抗性による肥満、高血圧、動脈硬化、高脂血症、高インシュリン血症、非アルコール性脂肪肝及び第2型糖尿病からなる群から選択される一つ又はそれ以上の疾患を含む。
【0050】
本発明の他の様態によると、本発明は、下記工程(a)及び(b)を含む、肥満、脂質代謝異常、脂肪肝及びインシュリン抵抗性症候群からなる群から選択される代謝疾患治療用組成物のスクリーニング方法を提供する。
【0051】
(a)以下のジェンバンクアクセッション番号からなる群から選択されるヌクレオチド配列を含む細胞に、分析しようとする試料を接触させる工程:
ジェンバンクアクセッション番号NM_146834、NM_207149、NM_001011758、NM_147015、NM_001011721、NM_146588、NM_207142、NM_147013、NM_001011783、NM_207561、NM_001011777、NM_146577、NM_147010、NM_146408、NM_146511、NM_146407、NM_146730、NM_146542、NM_207154、NM_146752、NM_146661、NM_146658、NM_146351、NM_146642、NM_146293、NM_001011753、NM_146817、NM_146649、NM_146532、NM_001011868、NM_001011816、NM_001011535、NM_146823、NM_146458、NM_001001810、NM_146459、NM_146901、NM_146899、NM_146288、NM_146891、NM_146790、NM_146788、NM_146476、NM_146977、NM_146981、NM_146342、NM_146975、NM_146394、NM_146908、NM_207254、NM_146404、NM_146885、NM_146403、NM_146884、NM_146652、NM_146887、NM_146889、NM_001011787、NM_207151、NM_146449、NM_146274、NM_146292、NM_207570、NM_001011870、NM_207703、NM_147071、NM_207571、NM_146308、NM_146541、NM_146283、NM_146911、NM_207573、NM_207574、NM_001011741、NM_146473、NM_147065、NM_146471、NM_146276、NM_146877、NM_146337、NM_146275、NM_146881、NM_181818、NM_146491、NM_146490、NM_001011525、NM_146984、NM_001011853、NM_146806、NM_146687、NM_146683、NM_146697、NM_146747、NM_001011841、NM_146869、NM_001011842、NM_146301、NM_146696、NM_020513、NM_146271、NM_207576、NM_206823、NM_146451、NM_146466、NM_146935、NM_146357、NM_146335、NM_146484、NM_001011808、NM_207550、NM_146429、NM_146405、NM_146606、NM_207553、NM_146688、NM_146489、NM_146824、NM_146280、NM_146457、NM_147036、NM_146281、NM_206903、NM_146878、NM_001011866、NM_001011770、NM_146947、NM_146949、NM_146628、NM_146940、NM_146941、NM_146625、NM_146624、NM_207235、NM_147051、NM_207555、NM_147023、NM_207224、NM_146825、NM_146347、NM_147006、NM_147008、NM_146706、NM_146709、NM_146715、NM_146722、NM_146717、NM_146655、NM_146273、NM_146576、NM_001005488、NM_146426、NM_146370、XM_891283、NM_146775、NM_146734、NM_146733、NM_146737、NM_146307、NM_146952、NM_146518、NM_001011814、NM_001011815、NM_146962、NM_001011782、NM_147101、NM_207621、NM_147103、NM_146359、NM_147109、NM_147115、NM_147111、NM_207556、NM_146731、NM_146955、NM_146841、NM_146812、NM_147119、NM_147072、NM_146329、NM_147077、NM_207144、NM_147056、NM_001011757、XM_993242、NM_147096、NM_147060、NM_147059、NM_147043、NM_146760、NM_001011848、NM_147095、NM_146358、NM_013620、NM_147069、NM_146598、NM_146599、NM_001011749、NM_001011542、NM_019486、NM_147033、NM_146780、NM_146316、NM_146319、NM_001011809、NM_146493、NM_146363、NM_146667、NM_207133、NM_146299、NM_207156、NM_001011829、NM_146422、NM_146864、NM_146863、NM_146547、NM_146266、NM_207008、NM_207620、NM_207559、NM_001011849、NM_146548、NM_001011821、NM_146550、NM_207159、NM_146670、NM_146677、NM_146676、NM_146300、NM_146567、NM_146282、NM_146525、NM_146524、NM_146558、NM_146903、NM_146882、NM_146749、NM_146883、NM_146417、NM_001011739、NM_146336、NM_146801、NM_146872、NM_146811、NM_146810、NM_001011864、NM_146782、NM_146441、NM_146442、NM_001011518、NM_146503、NM_146330、NM_146279、NM_146612、NM_146826、NM_147107、NM_147105、NM_146510、NM_146286、NM_146855、NM_146515、NM_146437、NM_146589、NM_146660、NM_001011833、NM_146640、NM_146531、NM_001011517、NM_146631、NM_146898、NM_146893、NM_001011803、NM_207631、NM_146832、NM_146534、NM_147066、NM_146692、NM_146634、NM_001011850、NM_019475、NM_019476、NM_147002、NM_146992、NM_146870、NM_146621、NM_146537、NM_146859、NM_146724、NM_146723、NM_146755、NM_147113、NM_147114、NM_146964、NM_147080、NM_146665、NM_146378、NM_146324、NM_146557、NM_146419、NM_146482、NM_146478、NM_146861、NM_207673、NM_001011695、NM_146866、NM_001011872、NM_147012、NM_146391、NM_001011735、NM_207135、NM_146843、NM_146594、NM_207632、NM_146348、NM_146645、NM_146641、NM_146294、XM_621554、XM_621555、NM_146895、NM_146778、NM_146789、NM_146970、NM_146983、NM_146341、NM_146794、NM_146377、NM_146985、NM_206816、NM_001005568、NM_146400、XM_888068、NM_146886、NM_146450、NM_146831、NM_146385、NM_147040、NM_001011737、NM_146744、NM_146540、NM_146488、NM_146910、NM_001011790、NM_146467、NM_146468、NM_146470、NM_146651、NM_146809、NM_001011839、NM_146684、NM_146371、NM_207575、NM_146291、NM_207138、NM_020514、NM_146585、NM_008763、NM_147068、NM_001011855、NM_146957、NM_146993、NM_146999、NM_146912、NM_010970、NM_010974、NM_001005520、NM_146269、NM_207552、NM_001005780、NM_146829、NM_001011767、NM_146536、NM_146500、NM_146948、NM_146939、NM_146662、XM_619748、NM_147007、NM_001011863、NM_146761、NM_146721、NM_207158、NM_146653、NM_001011869、NM_001011810、NM_146732、NM_146736、NM_146738、NM_146914、NM_001011871、NM_146725、NM_146956、NM_146960、NM_010997、NM_146840、NM_146325、NM_147091、NM_147085、NM_147089、NM_147052、NM_001011847、NM_146727、NM_147083、NM_147055、NM_146379、NM_001011755、NM_147044、NM_001011862、NM_146597、NM_147035、NM_146604、NM_146664、NM_001011754、NM_146430、NM_207558、NM_130866、NM_146933、NM_146554、NM_146929、NM_146552、NM_146776、NM_146526、NM_146528、NM_146412、NM_146310、NM_146754、NM_147053、NM_146354、NM_146822、NM_146477、NM_146508、NM_146854、NM_001011827、NM_147108、
NM_147106、NM_001011785、NM_146434、NM_146762、NM_207134、NM_146838、NM_146632、NM_001011835、NM_206896、NM_146968、NM_146965、NM_207572、NM_146945、NM_146963、NM_146571、NM_146587、NM_207562、NM_146592、NM_001011825、NM_146836、NM_146402、NM_146362、NM_020515、NM_146635、NM_146990、NM_146646、NM_146997、NM_146485、NM_010980、NM_146951、NM_146623、NM_146338、NM_146305、NM_146830、NM_146774、NM_010998、NM_207143、NM_147094、NM_147076、NM_146315、NM_207146、NM_146758、NM_146596、NM_146479、NM_146785、NM_146456、NM_001011813、NM_146745、NM_207563、NM_207565、NM_146297、NM_147029、NM_146648、NM_146918、NM_207568、NM_146333、NM_146395、NM_146401、NM_146867、NM_146304、NM_146913、NM_207136、NM_130868、NM_147003、NM_019473、NM_146860、NM_146958、NM_001011801、NM_147022、NM_207137、NM_146988、NM_010991、NM_207160、NM_146520、NM_147112、NM_001025386、NM_147050、NM_146494、NM_146671、NM_146610、NM_146921、NM_146573、NM_146572、NM_147019、NM_207566、NM_146917、NM_001005227、NM_146902、NM_146966、NM_146474、NM_146852、NM_146679、NM_207626、NM_146703、NM_146313、NM_146691、NM_146633、NM_147025、NM_147064、NM_010990、NM_146372、NM_147063、NM_146353、NM_146555、NM_146786、NM_146375、NM_146439、NM_146506、NM_146436、NM_001011852、NM_147078、NM_001005485、NM_147030、NM_146637、NM_146907、NM_146916、NM_146469、NM_146701、NM_146636、NM_146796、NM_146265、NM_146322、NM_146759、NM_146617、NM_207230、NM_146502、NM_146711、NM_146311、NM_147079、NM_146959、NM_147074、NM_146392、NM_146682、NM_146674、NM_146424、NM_146787、NM_146746、NM_146507、NM_146611、NM_146615、XM_619781、NM_146629、NM_146630、NM_146974、NM_146447、NM_146448、NM_146699、NM_146693、NM_146995、NM_207175、NM_146619、NM_146718、NM_146583、NM_147070、NM_146284、NM_146605、NM_146845、NM_146349、NM_146464、NM_001005225、NM_146973、NM_146982、NM_146890、NM_207152、NM_146389、NM_146535、NM_207227、NM_147037、NM_146689、NM_146686、NM_146920、NM_001011751、XM_620674、NM_146346、NM_146987、NM_146444、NM_146819、NM_146925、NM_001011858、NM_146954、NM_146314、NM_147061、NM_001011738、NM_207201、NM_146564、NM_146272、NM_207141、NM_146514、NM_146504、NM_146828、NM_146570、NM_146568、NM_207564、NM_146846、NM_147031、NM_146644、NM_207150、NM_146713、NM_207132、NM_030553、NM_146739、NM_147093、NM_147041、NM_013618、NM_146750、NM_146339、NM_001011797、NM_146553、NM_146433、NM_206822、NM_146409、NM_146590、NM_146897、NM_146455、NM_146793、NM_146980、NM_146853、NM_146704、NM_001011840、NM_207554、NM_146416、NM_146708、NM_146413、NM_146926、NM_146498、NM_146497、NM_146743、NM_147084、NM_146814、NM_146492、NM_146668、NM_146551、NM_146423、NM_001011523、NM_146513、NM_147021、NM_146289、NM_146287、NM_146849、NM_146848、NM_146792、NM_146343、NM_147042、NM_008762、NM_001011831、NM_001011791、NM_001011736、NM_146446、NM_146938、NM_146368、NM_146374、NM_146270、NM_010984、NM_146445、NM_001011527、NM_001011846、NM_146306、NM_011002、NM_146453、NM_146579、NM_146365、NM_146591、NM_146323、NM_146695、NM_146443、NM_146495、NM_020291、NM_147046、NM_146522、NM_146868、XM_619779、NM_001011734、NM_146462、NM_207140、NM_146808、NM_207236、NM_146888、NM_146936、NM_001001809、NM_146411、NM_146924、NM_146735、NM_001011867、NM_147110、NM_147120、NM_147049、NM_054090、NM_146930、NM_146904、NM_182714、NM_146896、NM_021368、NM_146327、NM_146702、NM_146770、NM_146950、NM_147004、NM_146364、NM_147081、NM_146481、NM_146768、NM_146638、NM_207567、NM_207240、NM_207664、NM_146923、NM_001011789、NM_147009、NM_147122、NM_146666、NM_054091、NM_146285、NM_146566、NM_146578、NM_146835、NM_001013575、NM_146837、NM_146647、NM_146543、NM_146694、NM_146321、NM_146627、NM_146383、NM_146820、NM_146600、NM_146672、NM_001012266、NM_146561、NM_146440、NM_001011826、NM_147014、NM_147018、NM_146320、NM_146705、NM_146431、NM_146622、NM_146932N、M_146827、NM_146569 ,NM_147001 ,NM_146384 ,NM_146944、NM_146656、NM_147088、NM_001011793、BC051435、NM_146613、NM_147011、NM_146847、NM_146366 ,NM_146766、NM_001011775、NM_147000、NM_147005、NM_207622、NM_146934、NM_147032、NM_146278、NM_146527、NM_001011748、NM_146865、NM_146971、NM_146410、NM_146751、NM_207145、NM_146833、NM_146406、NM_146765、NM_207253、NM_146680、NM_001005524、NM_010983、NM_001011861、NM_146922、NM_147104、NM_146813、NM_207249、NM_146663、NM_146862、NM_146905、NM_146418、NM_147028、NM_146303、NM_146295、NM_147098、NM_146803及びNM_146784。
【0052】
(b)前記ヌクレオチド配列の発現量を測定する工程であって、下記(i)のジェンバンクアクセッション番号からなる群から選択されるヌクレオチド配列の高発現が抑制されるか、下記(ii)のジェンバンクアクセッション番号からなる群から選択されるヌクレオチド配列の低発現が抑制される場合は、前記試料は、肥満治療用組成物と判定される工程:
【0053】
(i)ジェンバンクアクセッション番号NM_146834、NM_001011758、NM_001011721、NM_146588、NM_207142、NM_147013、NM_001011783、NM_207561、NM_001011777、NM_146577、NM_146407、NM_146730、NM_146542、NM_207154、NM_146752、NM_146661、NM_146642、NM_146293、NM_001011753、NM_146817、NM_146649、NM_001011816、NM_146823、NM_001001810、NM_146459、NM_146901、NM_146899、NM_146288、NM_146790、NM_146476、NM_146977、NM_146981、NM_146342、NM_146975、NM_146394、NM_146908、NM_207254、NM_146885、NM_146403、NM_146884、NM_146889、NM_001011787、NM_207151、NM_146274、NM_146292、NM_001011870、NM_207703、NM_147071、NM_146541、NM_146283、NM_146911、NM_207573、NM_001011741、NM_146473、NM_147065、NM_146276、NM_146877、NM_146275、NM_146881、NM_181818、NM_146491、NM_001011525、NM_146984、NM_001011853、NM_146806、NM_146687、NM_146697、NM_001011841、NM_146869、NM_146696、NM_207576、NM_206823、NM_146451、NM_146466、NM_146935、NM_146357、NM_001011808、NM_207550、NM_146429、NM_146606、NM_146824、NM_146457、NM_146281、NM_206903、NM_146878、NM_001011770、NM_146947、NM_146949、NM_146628、NM_146940、NM_146941、NM_146625、NM_146624、NM_147051、NM_207555、NM_146825、NM_147006、NM_146706、NM_146709、NM_146715、NM_146722、NM_001005488、XM_891283、NM_146775、NM_146952、NM_001011814、NM_001011815、NM_146962、NM_001011782、NM_147101、NM_207621、NM_147103、NM_147115、NM_147111、NM_146955、NM_146841、NM_146812、NM_147077、NM_207144、NM_147056、NM_001011757、NM_147096、NM_147060、NM_147059、NM_001011848、NM_146358、NM_013620、NM_146599、NM_001011749、NM_001011542、NM_147033、NM_146316、NM_001011809、NM_146493、NM_146363、NM_207133、NM_146299、NM_207156、NM_001011829、NM_146422、NM_146863、NM_207008、NM_207620、NM_207559、NM_001011849、NM_001011821、NM_207159、NM_146677、NM_146676、NM_146282、NM_146524、NM_146558、NM_146903、NM_146749、NM_146883、NM_146417、NM_146801、NM_146872、NM_146782、NM_146441、NM_146442、NM_146503、NM_146330、NM_146279、NM_146826、NM_147107、NM_147105、NM_146855、NM_146515、NM_146437、NM_001011695、NM_146866、NM_001011872、NM_146391、NM_001011735、NM_207135、NM_146348、NM_146645、XM_621554、NM_146778、NM_146789、NM_146983、NM_206816、NM_146400、NM_146450、NM_146831、NM_001011737、NM_146744、NM_146540、NM_146488、NM_146910、NM_146467、NM_146468、NM_146470、NM_146651、NM_146684、NM_146371、NM_207575、NM_008763、NM_147068、NM_001011855、NM_146957、NM_146912、NM_010970、NM_010974、NM_001005520、NM_207552、NM_001005780、NM_001011767、NM_146536、NM_146500、NM_146948、NM_146662、XM_619748、NM_147007、NM_001011863、NM_146761、NM_207158、NM_146653、NM_001011869、NM_001011810、NM_146732、NM_146736、NM_146914、NM_001011871、NM_146956、NM_146840、NM_146325、NM_147091、NM_147085、NM_147089、NM_147052、NM_001011847、NM_147083、NM_001011755、NM_146597、NM_147035、NM_146604、NM_001011754、NM_207558、NM_130866、NM_146933、NM_146929、NM_146552、NM_146526、NM_146528、NM_001011827、NM_147108、NM_147106、NM_001011785、NM_146571、NM_146587、NM_146402、NM_020515、NM_146635、NM_146646、NM_146485、NM_146623、NM_146338、NM_146305、NM_146774、NM_010998、NM_147094、NM_147076、NM_146315、NM_146758、NM_146479、NM_146785、NM_146456、NM_146573、NM_146572、NM_147019、NM_207566、NM_001005227、NM_146902、NM_146474、NM_146852、NM_146679、NM_207626、NM_146703、NM_146691、NM_146633、NM_147025、NM_147064、NM_146372、NM_147063、NM_146353、NM_146555、NM_146375、NM_146439、NM_146506、NM_146436、XM_619781、NM_146629、NM_146974、NM_146447、NM_146448、NM_146699、NM_146693、NM_146995、NM_207175、NM_146619、NM_146564、NM_146570、NM_146568、NM_207564、NM_146846、NM_147031、NM_146644、NM_207150、NM_207132、NM_030553、NM_146739、NM_147093、NM_013618、NM_146750、NM_146339、NM_146553、NM_146433、NM_147084、NM_147021、NM_146287、NM_146849、NM_146848、NM_146792、NM_146343、NM_147042、NM_008762、NM_001011831、NM_146938、NM_146374、NM_146270、NM_010984、NM_146445、NM_001011527、NM_001011846、NM_146306、NM_011002、NM_146453、NM_001011734、NM_146462、NM_207140、NM_146808、NM_207236、NM_146888、NM_146936、NM_001001809、NM_146411、NM_146924、NM_146735、NM_001011867、NM_147110、NM_147120、NM_147049、NM_054090、NM_146930、NM_146904、NM_182714、NM_146638、NM_207567、NM_207240、NM_207664、NM_146923、NM_001011789、NM_147009、NM_147122、NM_146666、NM_054091、NM_146285、NM_146566、NM_147014、NM_147018、NM_146320、NM_146705、NM_146431、NM_146622、NM_146932N、M_146827、NM_147011、NM_146847、NM_146366 ,NM_146766、NM_001011775、NM_147000、NM_147005、NM_207622、NM_146934、NM_147032、NM_146278、NM_146527、NM_001011748、NM_146865、NM_146833、NM_146406、NM_146765、NM_207253、NM_146680、NM_001005524、NM_010983、NM_001011861、NM_146922、NM_147104、NM_146813、NM_207249、NM_146663、NM_146862、NM_146905及びNM_146418。
【0054】
(ii)ジェンバンクアクセッション番号NM_146589、NM_146660、NM_001011833、NM_146640、NM_146531、NM_001011517、NM_146631、NM_146898、NM_146893、NM_001011803、NM_207631、NM_146832、NM_146534、NM_147066、NM_146692、NM_146634、NM_001011850、NM_019475、NM_019476、NM_147002、NM_146992、NM_146870、NM_146621、NM_146537、NM_146859、NM_146724、NM_146723、NM_146755、NM_147113、NM_147114、NM_146964、NM_147080、NM_146665、NM_146378、NM_146324、NM_146557、NM_146419、NM_146482、NM_146478、NM_146861、NM_146412、NM_146310、NM_146754、NM_147053、NM_146354、NM_146822、NM_146477、NM_146508、NM_146854、NM_146762、NM_207134、NM_146838、NM_146632、NM_001011835、NM_206896、NM_146968、NM_146965、NM_207572、NM_146945、NM_146963、NM_207565、NM_146297、NM_147029、NM_146648、NM_146294、NM_146918、NM_207568、NM_146333、NM_146395、NM_001005568、NM_146401、NM_146867、NM_146304、NM_146913、NM_207136、NM_130868、NM_147003、NM_146585、NM_019473、NM_146860、NM_146958、NM_001011801、NM_146405、NM_146269、NM_146688、NM_147022、NM_207137、NM_146721、NM_146988、NM_146734、NM_010991、NM_207160、NM_146520、NM_147112、NM_146727、NM_001025386、NM_147050、NM_146494、NM_146671、NM_146300、NM_146525、NM_146610、NM_001011852、NM_207563、NM_147078、NM_001005485、NM_207632、NM_147030、NM_146637、NM_146907、NM_146404、NM_146916、NM_146469、NM_146471、NM_146337、NM_146701、NM_146636、NM_146796、NM_146265、NM_146322、NM_146335、NM_146759、NM_146280、NM_146617、NM_207230、NM_146502、NM_207235、NM_146711、NM_146733、NM_146311、NM_147079、NM_146959、NM_147074、NM_146392、NM_146664、NM_146682、NM_146674、NM_146424、NM_146787、NM_146746、NM_146507、NM_146611、NM_146615、NM_207149、NM_146408、NM_146845、NM_001011825、NM_146349、NM_146658、NM_146836、NM_001011868、NM_146464、NM_001005225、NM_146458、NM_146973、NM_146788、NM_146966、NM_146982、NM_146890、NM_146652、NM_146362、NM_207570、NM_207152、NM_146389、NM_147040、NM_207571、NM_146535、NM_207227、NM_001011790、NM_207574、NM_147037、NM_146689、NM_146686、NM_207553、NM_146920、NM_001011751、NM_001011866、NM_010980、XM_620674、NM_147023、NM_146347、NM_146346、NM_146987、NM_146444、NM_146819、NM_146925、NM_146737、NM_001011858、NM_146725、NM_146954、NM_010997、NM_146731、NM_146314、NM_146841、NM_207146、NM_146760、NM_147061、NM_146319、NM_146667、NM_146430、NM_001011738、NM_146864、NM_207201、NM_146776、NM_146564、NM_146882、NM_001011739、NM_146811、NM_146272、NM_001011518、NM_207141、NM_146514、NM_146504、NM_146828、NM_146286、NM_206822、NM_147012、NM_146409、NM_146590、NM_146897、NM_146630、NM_146970、NM_146455、NM_146341、NM_146377、NM_146985、NM_146793、NM_146980、XM_888068、NM_146853、NM_146704、NM_146313、NM_001011840、NM_146301、NM_207138、NM_020513、NM_207554、NM_146829、NM_146416、NM_146951、NM_146708、NM_146273、NM_146413、NM_146370、NM_146926、NM_010990、NM_146498、NM_146497、NM_146743、NM_146359、NM_207143、NM_147084、NM_146329、NM_147055、NM_146814、NM_019486、NM_146780、NM_146492、NM_146668、NM_146551、NM_146554、NM_146423、NM_001011523、NM_001011813、NM_146513、NM_146612、NM_146510、NM_146434、NM_146579、NM_207562、NM_146592、NM_146365、NM_146591、NM_146323、NM_146695、NM_020514、NM_146997、NM_146443、NM_146576、NM_146426、NM_146495、NM_020291、NM_147046、NM_147069、NM_146547、NM_146548、NM_146567、NM_146522、NM_146868、NM_146745、NM_146917、NM_146896、NM_146794、NM_021368、NM_146327、NM_146308、NM_146490、NM_001011839、NM_146683、NM_146702、NM_146990、NM_146770、NM_147036、NM_146950、NM_147004、NM_146364、NM_147109、NM_207556、NM_147081、NM_147072、NM_146481、NM_146921、NM_207673、NM_146578、NM_146835、NM_001013575、NM_146837、NM_146647、NM_001011535、NM_146895、NM_146891、NM_146886、NM_146449、NM_146713、NM_146385、NM_146543、NM_146809、NM_146694、NM_146271、NM_146321、NM_001011736、NM_146627、NM_146368、NM_146718、NM_146383、NM_146738、NM_147041、NM_146820、NM_146600、NM_001011797、NM_146550、NM_146670、NM_146672、NM_001012266、NM_146561、NM_146336、NM_146810、NM_146440、NM_001011826、NM_146569、NM_147015、NM_147010、XM_619779、NM_146511、NM_146594、NM_146289、NM_146351、NM_146641、NM_146532、NM_146887、NM_146291、NM_147001、NM_146993、NM_146999、NM_001011791、NM_146484、NM_146384、NM_146489、NM_146944、NM_146717、NM_146830、NM_146655、NM_146656、NM_146307、NM_146960、NM_147088、NM_001011793、NM_146598、NM_001011862BC051435、NM_146613、NM_146971、NM_146410、NM_146747、NM_146446、NM_146751、NM_147043、NM_146596、NM_207145、NM_146843、NM_146768、NM_147028、XM_621555、NM_146303、NM_001011842、NM_146939、NM_207224、NM_147008、NM_146295、NM_146518、NM_147098、NM_147119、NM_146379、XM_993242、NM_147095、NM_147044、NM_146266、NM_146803、NM_146786、NM_146784及びNM_001011864。
【0055】
本発明の方法によると、まず本発明の代謝疾患ターゲットである嗅覚受容体遺伝子ヌクレオチド配列を含む細胞に、分析しようとする試料を接触させる。好ましくは、前記ヌクレオチド配列を含む細胞は、脂肪又は筋肉組織の細胞である。本発明のスクリーニング方法を言及しながら使用される用語‘試料’は、本発明のヌクレオチド配列の発現量に影響を及ぼすかどうか検査するためにスクリーニングで試験される物質を意味する。前記試料は、化学物質、ヌクレオチド、アンチセンス−RNA、siRNA(small interference RNA)及び天然物抽出物を含むが、これらに限定されるものではない。次いで、試料の処理された細胞で前記ヌクレオチド配列の発現量を測定する。発現量の測定は、前記記載した通りであり、測定結果、前記ヌクレオチド配列のうち、本発明によって代謝疾患患者で高発現することが明らかとなった嗅覚受容体遺伝子配列の高発現が抑制されるか、又は代謝疾患患者で低発現することが明らかとなった嗅覚受容体遺伝子配列の低発現が抑制される場合は、前記試料は、代謝疾患治療用組成物と判定できる。
【発明の効果】
【0056】
本発明の特徴及び利点を要約すると、以下の通りである:
(a)本発明は、肥満、脂質代謝異常、脂肪肝及びインシュリン抵抗性症候群からなる群から選択される代謝疾患診断用のキット及びこれらの疾患に対する治療用組成物のスクリーニング方法を提供する。
(b)本発明は、肥満などの代謝疾患に対する多量の新しい遺伝子ターゲットを提示することにより、より信頼度の高い肥満などの遺伝子診断及びこれに基づいた治療剤候補物質のスクリーニングに有用に利用できる。
【図面の簡単な説明】
【0057】
図1図1は、高脂肪食餌をしたマウスの体重増加、食餌摂取及び食餌効率比率(food efficiency ratio)を示す図である。それぞれの値は、平均±標準誤差値である(n=10、**p<0.01、***p<0.001)。
図2図2は、高脂肪食餌をしたマウスの内臓脂肪組織重量を示す図である。それぞれの値は、平均±標準誤差値である(n=10、p<0.05)。
図3図3は、嗅覚受容体により媒介される脂肪酸酸化、熱発生、脂肪蓄積、インシュリン抵抗性関連信号伝達体系を示す図である。AC(アデニル酸シクラーゼ);AMPK(AMP活性化タンパク質キナーゼ);AKT(v−aktマウス胸腺腫ウイルス癌遺伝子);CPT1(カルニチンパルミトイル基転移酵素1);CREB(cAMP応答配列結合タンパク質);D2(II型チロキシン脱ヨード酵素);Epac(Rapグアニンヌクレオチド交換因子3);ERK(細胞外シグナル制御キナーゼ);GRB2(増殖因子受容体結合タンパク質2);HSL(ホルモン感受性リパーゼ);IR(インスリン受容体);IRS(インスリン受容体基質);LKB(STK11、セリンスレオニンキナーゼ11);MAPK(マイトジェン活性化プロテインキナーゼ);Olfr(嗅覚受容体);PDK(ピルビン酸脱水素酵素キナーゼ、アイソザイム1);PKA(プロテインキナーゼA);PGC−1(PPARγコアクチベーター1);RAR(レチノイン酸受容体);RAF(RAF癌原遺伝子セリンスレオニンプロテインキナーゼ);ROCK(Rho結合キナーゼ);RXR(レチノイン酸受容体);T3(トリヨードチロニン);mTORC1(哺乳類ラパマイシン標的タンパク質複合体1、mammalian target of rapamycin complex 1);TR(甲状腺ホルモン受容体);TSC2(結節性硬化症複合体2);UCP(脱共役タンパク質)
【発明を実施するための形態】
【0058】
以下、実施例を通じて本発明をさらに詳細に説明するが、これら実施例は、本発明をより具体的に説明するためのものであって、本発明の範囲がこれら実施例に限定されないことは、本発明の属する技術分野で通常の知識を有する者にとっては自明なことであろう。
【実施例】
【0059】
実施例1:マウスの内臓脂肪組織、皮下脂肪組織、及び筋肉組織における、食餌性肥満誘導期間に基づいて発現が変化する嗅覚受容体の発現変化プロファイル
1)食餌性肥満動物モデルの飼育
5週齢のC57BL/6Nマウス計80匹を高脂肪食餌(high−fat diet、HFD、脂肪エネルギー20%)又は正常食餌(normal diet、ND)で飼育しながら、2週目、4週目、8週目及び12週目にそれぞれ20匹ずつ(正常食餌10匹;高脂肪食餌10匹)のマウスを解剖して、試料を採取した。正常食餌(ND)は、AIN−76げっ歯類食餌組成(American Institute of Nutrition、Report of the American Institute of Nutrition ad hoc committee on standards for nutritional studies.J.Nutr.107:1340−1348(1977))に準じて調製した。実験食餌の組成は、表1に提示した。
【0060】
【表1】
【0061】
食餌は、毎日午前10時〜11時の間に水と共に供給して、食餌摂取量は毎日、そして体重は毎週測定した。飼料摂取による急速な体重変化を防ぐために飼料容器を除去して、2時間後に体重を測定した。実験動物を12時間以上断食させた後、ジエチルエーテルで麻酔した状態で血液、肝臓、部位別内臓脂肪組織(副睾丸脂肪、腎臓周辺脂肪、腸間膜脂肪及び後腹腔脂肪)、皮下脂肪組織及び筋肉組織を採取して、0.1Mリン酸緩衝液(pH7.4)で洗浄した後、重量を測定した。腹部大動脈から採血した血液は、1,000×gで15分間遠心分離し、血漿を分離した。
【0062】
2)体重及び内臓脂肪量の変化
高脂肪食餌摂取による肥満誘導期間(2週間、4週間、8週間及び12週間)別に測定された食餌摂取量、体重増加量及び食餌効率結果は、図1に示した通りである。実験食餌を2週間、4週間、8週間及び12週間摂取させた結果、HFD群の累積体重増加量は、それぞれ24.6±0.2g/2週間、28.2±0.8g/4週間、36.1±0.5g/8週間、41.5±0.6g/12週間であった。これらの値は、ND群(21.2±0.1g/2週間、23.6±0.3g/4週間、29.7±0.4g/8週間、34.3±0.3g/12週間)に比べ、それぞれ14%(p<0.001)、16%(p<0.01)、18%(p<0.001)及び17%(p<0.001)有意に増加した。
【0063】
高脂肪食餌による内臓脂肪組織量の増加を肥満誘導期間(2週間、4週間、8週間及び12週間)別に測定した結果を図2に示した。副睾丸、腸間膜、後腹腔及び腎臓周辺の脂肪量を全部足した総内臓脂肪量は、肥満誘導期間(2週間、4週間、8週間及び12週間)別に、HFD群がND群に比べて151%(2週間)、133%(4週間)、83%(8週間)及び33.6%(12週間)有意に増加した(p<0.05)。
【0064】
3)RNA分離及び確認
一定量の内臓及び皮下脂肪又は筋肉組織をTrizol溶液に入れて、ホモジナイザーを利用してホモジナイズし、12,000×g、4℃で10分間遠心分離した。上層液を新しいチューブに移した後、脂肪層を除去した。下層液を新しいチューブに移した後、クロロホルム200μLを添加してボルテックスした。この過程を2回繰り返した後、上層液を新しいチューブに移した後、イソプロパノールと上層液を1:1比率で添加した。10回逆にして振り、室温で10分間放置した後、13,000×g、4℃で10分間遠心分離して上層液を除去した。沈殿物に70%エタノール1mLを添加した後、12,000×g、4℃で10分間遠心分離した。エタノールを除去した後、RNA沈殿物の入ったチューブを室温で5分間乾燥させて、DEPCで処理された蒸留水を使用してRNA沈殿物を溶解させた。UV/VIS分光光度計(ベックマンコールター、DU730)を利用して、260nm、280nm波長でRNA濃度を測定し、アガロースゲル電気泳動を実施して、抽出されたRNA試料の完全性を確認した。
【0065】
4)オリゴDNAマイクロアレイ分析
内臓、皮下脂肪及び筋肉組織RNAを使用したオリゴDNAマイクロアレイ分析は、(株)ジェノチェックに依頼して行った。RNA試料は、各群別に10匹ずつ貯蔵して使用し、オリゴDNAマイクロアレイ分析は、三回反復実験をして再現性を確認した。本実験で使用したNimbleGen Mouse Whole Oligo 12−plex chipは、Mouse Genome Build 8をデータベースにして、マウス遺伝子42,576個を三回繰り返して合成、製作した。NimbleGen mouse Whole Oligo 12−plex chipには、対照群遺伝子を除いて総137,090個のスポットが16μm×16μmの大きさで17.4mm×13mmの大きさに合成されており、42,576個のオリゴには、137,145個の機能の知られた遺伝子と、まだ機能が明かされていない転写物及びEST配列などが5,431個含まれている。全RNA10μg〜50μgにオリゴ−dTプライマー、逆転者酵素、dNTP、Cy3−dUTP及びCy5−dUTPなどを加えて、キット製作会社の指示にしたがって逆転写させた。この反応物をカートリッジを利用して精製した後、乾燥させてハイブリッド形成緩衝液(30μL)に溶解させた。ハイブリッド形成カセット(Hybridization cassette)にマイクロアレイを入れて、95℃〜100℃で5分間加熱した後、Cy3及びCy5で標識されたRNAをそれぞれ混合し、45℃で18時間ハイブリッド形成させた。スライドを室温の1×SSC、0.1%SDS溶液で5分間2回洗浄し、0.1×SSCで5分間洗浄した後、乾燥して分析した。
【0066】
5)内臓脂肪、皮下脂肪組織及び筋肉組織で発現する嗅覚受容体の種類
本研究でマイクロアレイ分析に使用されたNimbleGen Mouse Whole Oligo 12−plex chipには、総1,113種の嗅覚受容体遺伝子が含まれており、本研究でマウスの内臓脂肪、皮下脂肪組織及び筋肉組織でこの1,113種の嗅覚受容体が全部発現することを最初に確認した。よって、今まで嗅覚上皮組織に存在することが知られてきた嗅覚受容体が末梢組織でも発現することが見出された。
【0067】
6)食餌性肥満が誘導されることにより発現が変化した嗅覚受容体プロファイル
A.食餌性肥満により発現が2倍以上変化した嗅覚受容体遺伝子数の確認
マイクロアレイ分析結果、内臓脂肪組織において高脂肪食餌により2倍以上増加又は減少した遺伝子の数は、3,812個(2週間)、3,296個(4週間)、2,098個(8週間)、1,917個(12週間)であり、そのうち、2倍以上増加又は減少した嗅覚受容体遺伝子の数は、472個(2週間)、604個(4週間)、366個(8週間)、549個(12週間)であった。
【0068】
皮下脂肪組織において高脂肪食餌により2倍以上増加又は減少した遺伝子の数は、1896個(2週間)、2235個(4週間)、1649個(8週間)、1316個(12週間)であり、そのうち、2倍以上増加又は減少した嗅覚受容体遺伝子の数は、129個(2週間)、133個(4週間)、128個(8週間)、124個(12週間)であった。
【0069】
筋肉脂肪組織において高脂肪食餌により2倍以上増加又は減少した遺伝子の数は、885個(2週間)、1163個(4週間)、830個(8週間)、1115個(12週間)であり、そのうち、2倍以上増加又は減少した嗅覚受容体遺伝子の数は、79個(2週間)、96個(4週間)、72個(8週間)及び94個(12週間)であった(表2)。
【0070】
【表2】
【0071】
B.DEG分析法を利用して、食餌性肥満により発現が調節される嗅覚受容体遺伝子プロファイル究明
2週間、4週間、8週間及び12週間高脂肪食餌を摂取させたマウスの内臓脂肪、皮下脂肪組織及び筋肉組織において、正常食餌を摂取する対照群に比べて発現が2倍以上調節される嗅覚受容体遺伝子プロファイル(differentially expressed gene、DEG)を表3〜14に示した。
【0072】
【表3-1】
【0073】
【表3-2】
【0074】
【表3-3】
【0075】
【表3-4】
【0076】
【表3-5】
【0077】
【表3-6】
【0078】
【表3-7】
【0079】
【表4-1】
【0080】
【表4-2】
【0081】
【表4-3】
【0082】
【表4-4】
【0083】
【表4-5】
【0084】
【表4-6】
【0085】
【表4-7】
【0086】
【表5-1】
【0087】
【表5-2】
【0088】
【表5-3】
【0089】
【表5-4】
【0090】
【表5-5】
【0091】
【表6-1】
【0092】
【表6-2】
【0093】
【表6-3】
【0094】
【表6-4】
【0095】
【表6-5】
【0096】
【表7-1】
【0097】
【表7-2】
【0098】
【表7-3】
【0099】
【表7-4】
【0100】
【表8-1】
【0101】
【表8-2】
【0102】
【表8-3】
【0103】
【表8-4】
【0104】
【表9-1】
【0105】
【表9-2】
【0106】
【表9-3】
【0107】
【表9-4】
【0108】
【表10-1】
【0109】
【表10-2】
【0110】
【表10-3】
【0111】
【表10-4】
【0112】
【表11-1】
【0113】
【表11-2】
【0114】
【表12-1】
【0115】
【表12-2】
【0116】
【表12-3】
【0117】
【表13-1】
【0118】
【表13-2】
【0119】
【表14-1】
【0120】
【表14-2】
【0121】
【表14-3】
【0122】
C.MNI分析法による食餌性肥満に反応する嗅覚受容体プロファイルの確認
現在までマイクロアレイデータを分析する方法として、特定条件により発現が変化された遺伝子を明かすDEG(differentially expressed gene)分析法が主に利用されてきたが、DEG分析法は、特定条件により発現が変化された数千個の遺伝子に対するプロファイルを確立することはできるが、ターゲット遺伝子(作用点)を明かすことができないという限界点を有している。したがって、これを補完するための分析方法として、最近MNI(mode−of−action by network identification)分析法が新しく開発されて(Bernardo et al.,Chemogenomic profiling on a genome−wide scale using reverse−engineered gene networks,Nature Biotechnology 23:377,2005)、これを利用して様々な疾病及び薬物に対するターゲット遺伝子を明らかにする研究が報告されている。
【0123】
したがって、本研究でも内臓脂肪、皮下脂肪組織及び筋肉組織において、それぞれ食餌性肥満に反応する遺伝子発現プロファイルを、MNI法を利用して分析した。その結果、特定薬物によりMNI遺伝子ネットワークアルゴリズム上で外れる程度を基準として薬物ターゲットのランキングを評価した。前記薬物ターゲット順位が上位200位内に入る遺伝子リストと、これらの上位遺伝子のDEG値とを表15及び表16に示した。
【0124】
内臓脂肪組織において、高脂肪食餌摂取に反応する遺伝子のうち、MNI順位が200位内に入る嗅覚受容体数は、10個(2週間)、7個(4週間)、11個(8週間)及び10個(12週間)であって、皮下脂肪組織において、高脂肪食餌摂取に反応する遺伝子のうち、上位200位内に入る嗅覚受容体数は、8個(2週間)、9個(4週間)、11個(8週間)、8個(12週間)であった。また、筋肉組織において、高脂肪食餌摂取に反応する遺伝子のうち、上位200位内に入る嗅覚受容体数は、12個(2週間)、11個(4週間)、15個(8週間)、12個(12週間)であった。さらに、これらMNI順位の高い嗅覚受容体遺伝子は、ほとんどがDEGにおける発現の変化倍率も高いことが分かった(表15及び16)。
【0125】
【表15】
【0126】
【表16】
【0127】
実施例2:抗肥満効能を示す多様な種類の匂い成分により発現が変化する嗅覚受容体のプロファイル
1)実験食餌の製造及び実験動物の飼育
本実験で使用した肥満誘導食餌は、高脂肪対照食餌(HFD:脂肪エネルギー40%、17gラード+3%トウモロコシ油/食餌100g)であった。匂い成分が補充された食餌は、多様な種類の抗肥満効能を示す匂い成分[インドール−3−カルビノール、オレウロペイン、セドリルアセテート、α−セドレン、ピペリン]を、匂い成分の種類に応じて0.02〜0.05%の濃度で含有させたこと以外は、HFDと組成が同一であった。インドール−3−カルビノール、オレウロペイン、セドリルアセテート、α−セドレン、ピペリンは、シグマ−アルドリッチから購入した。
【0128】
本実験で使用された匂い成分は、多様な種類の食用植物に存在するフィトケミカルであって、国内外で食品添加物(着料添加物)として利用されてきた物質であり、本研究者により体重及び内臓脂肪の低下効果、高脂血症改善効能、及び非アルコール性脂肪肝改善効能、そして第2型糖尿(インシュリン抵抗性)改善効能などが観察された。
【0129】
3)内臓脂肪及び肝臓組織を対象としたオリゴDNAマイクロアレイ分析
A.RNA分離及び確認
一定量の内臓脂肪又は肝臓組織をTrizol溶液に入れて、ホモジナイザーを利用してホモジナイズし、12,000×g、4℃で10分間遠心分離した。上層液を新しいチューブに移した後、脂肪層を除去した。下層液を新しいチューブに移した後、クロロホルム200μLを添加してボルテックスした。この過程を2回繰り返した後、上層液を新しいチューブに移し、イソプロパノールと上層液を1:1比率で添加した。10回逆にして振り、室温で10分間放置した後、13,000×g、4℃で10分間遠心分離し、上層液を除去した。ペレットに70%エタノール1mLを添加した後、12,000×g、4℃で10分間遠心分離した。エタノールを除去した後、RNA沈殿物の入ったチューブを室温で5分間乾燥させて、DEPCで処理された蒸留水を使用してRNAペレットを溶解させた。UV/VIS分光光度計(ベックマンコールター、DU730)を利用して、260nm、280nm波長でRNA濃度を測定し、アガロースゲル電気泳動を実施して、抽出したRNA試料の完全性を確認した。
【0130】
B.オリゴDNAマイクロアレイ分析
内臓脂肪及び肝臓組織のRNAを使用したオリゴDNAマイクロアレイ分析は、(株)ジェノチェックに依頼して行った。RNA試料は、各群別に10匹ずつ貯蔵して使用し、オリゴDNAマイクロアレイ分析は、三回反復実験をして再現性を確認した。本実験で使用されたNimbleGen Mouse Whole Oligo 12−plex chipは、Mouse Genome Build 8をデータベースにして、マウス遺伝子42,576個を三回繰り返して合成、製作した。NimbleGen mouse Whole Oligo 12−plex chipには、対照群遺伝子を除いて総137,090個のスポットが16μm×16μmの大きさで17.4mm×13mmの大きさに合成されており、42,576個のオリゴには、137,145個の機能の知られた公知遺伝子と、まだ機能の明かされていない転写体及びEST配列などが5,431個含まれている。全RNA10μg〜50μgにオリゴ−dTプライマー、逆転者酵素、dNTP、Cy3−dUTP及びCy5−dUTPなどを加えて、キット製作社の指示にしたがって逆転写させた。この反応物をカートリッジを利用して精製した後、speed−vecで乾燥させて、再びハイブリッド形成緩衝液(30μL)に溶解させた。ハイブリッド形成カセット(Hybridization cassette)にマイクロアレイを入れて、95℃〜100℃で5分間加熱した後、Cy3及びCy5で標識されたRNAをそれぞれ混合し、45℃で18時間ハイブリッド形成させた。スライドを室温の1×SSC、0.1%SDS溶液で5分間2回洗浄し、0.1×SSCで5分間洗浄した後、乾燥して分析した。
【0131】
C.抗肥満効能を示す匂い成分により発現が変化する嗅覚受容体のプロファイル
高脂肪食餌に多様な種類の匂い成分を補充した食餌を10週間摂取させて、体重及び内臓脂肪低下効果があらわれたマウスを対象に、内臓脂肪及び肝臓組織でオリゴDNAマイクロアレイ分析を実施した。匂い成分の摂取により組織別に2倍以上発現が調節された嗅覚受容体プロファイルを、表5に示した。結果的に抗肥満効能を示す多様な種類の匂い成分は、末梢組織で多数の嗅覚受容体発現を調節することが確認された。
【0132】
高脂肪食餌を摂取するマウスを対象に、インドール−3−カルビノールを10週間補充摂取させた結果、内臓脂肪及び肝臓組織でolfactory receptor 909、1462、380、1153、116、290及び178の発現は2倍以上増加し、olfactory receptor 972、1093、1165,259、1337、466、1329、16、1045、196、1216及び686の発現は、2倍以上減少した。
【0133】
高脂肪食餌を摂取するマウスを対象に、オレウロペインを10週間補充摂取させた結果、内臓脂肪及び肝臓組織でolfactory receptor 1104、971、1447、290、520、1046、1317、275、38、1204及び1214の発現は2倍以上増加し、olfactory receptor 907、341、495及び1136の発現は、2倍以上減少した。
【0134】
高脂肪食餌を摂取するマウスを対象に、セドリルアセテートを10週間補充摂取させた結果、内臓脂肪及び肝臓組織でolfactory receptor 1104、1123、290、1058、1442、380、1125、663、878,275、38及び305の発現は2倍以上増加し、olfactory receptor 1157、618、1136、417、1165、341及び77の発現は、2倍以上減少した。
【0135】
高脂肪食餌を摂取するマウスを対象に、ピペリンを10週間補充摂取させた結果、内臓脂肪でolfactory receptor 878、38及び520の発現は2倍以上増加し、olfactory receptor 1462及び77の発現は、2倍以上減少した。
【0136】
高脂肪食餌を摂取するマウスを対象に、α−セドレンを10週間補充摂取させた結果、肝臓組織でolfactory receptor 878、38及び1222の発現は2倍以上増加し、olfactory receptor 1045の発現は、2倍以上減少した。
【0137】
このように、抗肥満効能を示す多様な種類の匂い成分が末梢組織で多数の嗅覚受容体発現を調節する一方、ある特定の嗅覚受容体は、様々な匂い成分により共通的に発現が増加又は減少したことを観察した。即ち、olfactory receptor 878と38の発現は、ピペリン、セドリルアセテート、α−セドレン、オレウロペインにより共通的に肝臓で発現が増加し、olfactory receptor 275は、オレウロペインとセドリルアセテートにより共通的に肝臓で発現が増加した。一方、olfactory receptor 77は、ピペリンとセドリルアセテートにより、そして、olfactory receptor 1045は、インドール−3−カルビノールとα−セドレン摂取により共通的に肝臓で発現が減少した(表17)。一方、内臓脂肪組織では、olfactory receptor 380がインドール−3−カルビノールとセドリルアセテートにより発現が共通的に増加して、olfactory receptor 290と1104は、オレウロペインとセドリルアセテートにより共通的に発現が増加した。olfactory receptor 341は、オレウロペインとセドリルアセテートにより、そしてolfactory receptor 1165は、インドール−3−カルビノールとセドリルアセテートにより共通的に内臓脂肪組織で発現が2倍以上減少した(表18)。
【0138】
脂肪細胞、筋肉細胞、肝細胞膜などに存在する嗅覚受容体は、遺伝子発現の調節がない状況でも、抗肥満効能を示す匂い成分と結合すると、ACに信号を伝達して脂肪蓄積を抑制し、脂肪酸酸化及び熱発生を促進させて、インシュリン抵抗性を改善する効果を示すことができる。したがって、これら匂い成分の摂取により末梢組織で嗅覚受容体遺伝子発現が調節されることは、嗅覚受容体がこれら抗肥満匂い成分の直接的な新しいターゲットになり得る必要条件ではないが、十分条件である。
【0139】
【表17-1】
【0140】
【表17-2】
【0141】
【表17-3】
【0142】
【表18】
【0143】
実施例3:抗肥満効能のある匂い成分摂取による肥満及び代謝疾患関連遺伝子の発現変化
1)Trizol法を利用したRNA分離及びRT−PCR方法
内臓脂肪又は肝臓組織0.1g当りTrizol溶液1mLを添加して組織を粉砕した後、4℃、12,000×gで10分間遠心分離した。上層液を新しいチューブに移した後、クロロホルム200μLを添加して、ボルテックスした。この過程を2回繰り返した後、上層液を新しいチューブに移した後、イソプロパノールと上層液を1:1比率で添加した。10回強く振り、室温で10分間放置した後、12,000×g、4℃で10分間遠心分離した。そして、上層液を除去して、残りの沈殿物に70%エタノール1mLを加えた後、7,500×g、4℃で5分間遠心分離した。エタノールを除去した後、RNA沈殿物を入れたチューブを室温で5分間乾燥して、無核酸分解酵素水(nuclease free water)を使用して、RNAペレットを溶解させた。UV/VIS分光光度計(ベックマンコールター、DU730)を利用して260nm及び280nm波長で抽出されたRNA試料の濃度を測定して、アガロースゲル電気泳動を行い、RNA試料の完全性を確認した。
【0144】
内臓脂肪又は肝臓組織から抽出されたRNA試料を対象に、オリゴdTプライマーとSuperscript逆転写酵素(GIBCO BRL、Gaithersburg、MD、USA)を利用して逆転写を行うことによりcDNAを合成した。逆転写を通じて得たcDNAを鋳型として、増幅しようとする遺伝子cDNAの5’と3’両側配列(flanking sequence)をプライマーとして使用してPCRを行った。この際使用されたプライマー配列は、表19に示した通りである。増幅されたPCR産物1μLを1%アガロースゲルに電気泳動してDNAバンドを確認した。
【0145】
【表19】
【0146】
2)タンパク質抽出及びウェスタンプロッティング
乳鉢に一定量の内臓脂肪又は肝臓組織を液体窒素及び溶解緩衝液と共に均質化させた後、組織液を新しいチューブに移してボルテックスした。13,000rpm、4℃で20分間遠心分離した後、中間層を取って、Bradford法によりタンパク質を定量した。50μgのタンパク質量をSDSポリアクリルアミドゲルに電気泳動した後、PVDFハイパーフィルムに電気ブロッティングした。タンパク質に対する該当抗体を使用して反応させて、ECLで検出してフィトケミカル成分のインシュリン抵抗性、脂肪細胞分化、脂質代謝又はエネルギー消費関連作用メカニズムをタンパク質レベルで精査した。
【0147】
3)匂い成分による肥満及び代謝疾患関連遺伝子の発現、及びタンパク質リン酸化の変化
ミトコンドリアの機能障害は、老化、心臓病、胃腸障害、内分泌障害、神経障害と関連がある。ミトコンドリアにおける酸化過程の損傷は、肝臓組織のグルコース生産を増加させ、高血糖症を誘発し、脂肪肝を招くことが知られている。ミトコンドリアは、電子伝達系を利用してミトコンドリア内膜と外膜間のプロトン濃度勾配を形成し、これを駆動力としてF0F1−ATPaseを通じてATPを形成するようになる。しかし、F0F1−ATPaseが正常的に作動しない場合、UCP(脱共役タンパク質)を通じてプロトン濃度勾配を解消して、この過程で熱が発生するようになる。最近、このようなエネルギー消散メカニズムを通じて、脂肪組織でUCPが酸化還元均衡を維持して熱発生を促進する。食餌性肥満が誘導されたマウスの場合、正常対照群に比べ、UCP1とUCP3遺伝子発現が内臓脂肪組織で両方とも有意に減少することが知られている。
【0148】
脂肪組織の生成は、脂肪前駆細胞が増殖及び分化過程を経て成熟した脂肪細胞に変化する過程であり、細胞の形態学的変化及び遺伝子発現様相の変化などを伴う。即ち、この過程で脂質が蓄積されて、aP2(脂肪酸結合タンパク質2)、LPL(リポタンパク質リパーゼ)、そしてFAS(脂肪酸合成酵素)のような脂肪組織に特異的な遺伝子が発現するが、このような遺伝子の発現調節には、PPARγ(ペルオキシソーム増殖剤活性化受容体gamma)、C/EBP(CCAATエンハンサー結合タンパク質)、SREBP−1c(ステロール調節エレメント結合タンパク質−1c)と呼ばれる3種の転写因子が中枢的な役割を担当している。したがって、食餌性肥満が誘導されると、内臓脂肪組織及び肝臓組織において、これら脂肪生成転写因子とターゲット遺伝子の発現が有意に増加することが知られている。さらに、肥満が進行されると、内臓脂肪組織でレプチンだけではなく、TNFα及びIL−6などの炎症促進サイトカインの分泌が増加しつつ、代謝性炎症(metaflammation)が進行する。
【0149】
非アルコール性脂肪肝疾患(non−alcoholic fatty liver disease、以下、NAFLD)は、飲酒と関係なく、肝臓内に中性脂肪が蓄積される疾患を意味し、これには、単純脂肪肝(simple steatosis)と非アルコール性脂肪肝炎(non−alcoholic steatohepatitis、NASH)が含まれる。単純脂肪肝は、臨床的に予後の良好な陽性疾患と思われているが、脂肪肝と共に炎症あるいは繊維化を伴うNASHは、進行性肝臓疾患であって、肝硬変又は肝臓癌を誘発する前駆疾患であることが認知されている。肥満とインシュリン抵抗性は、代表的な非アルコール性脂肪肝疾患の危険因子である。非アルコール性脂肪肝の発病原因は、二つのメカニズムで説明できる。その一つは、遊離脂肪酸の増加が肝細胞内脂肪酸酸化を抑制することにより、脂肪酸が肝細胞内に蓄積されて発病するものであり、二つ目は、炎症及び繊維症進行に係わる全ての体内作用メカニズムにより発生することが知られている。即ち、脂肪酸の増加は、CYP2E1(チトクロムペルオキシダーゼ2E1)の発現を増加させて、活性酸素種を生成して、肝細胞膜の脂質過酸化を誘導し、酸化ストレスの増加は、TNF−αを増加させて、肝細胞のアポトーシスを誘導し、肝臓損傷を進行させる。
【0150】
本発明でRT−PCRを利用して内臓脂肪及び肝臓組織の遺伝子発現を分析した結果、抗肥満効能を示す前記匂い成分を摂取させたマウスの場合、高脂肪食餌を摂取させた対照群に比べ、内臓脂肪組織で核転写因子(C/EBPαとPPARγ2)及びそのターゲット遺伝子(aP2、FAS)の発現が減少した。また、匂い成分の補充摂取は、内臓脂肪組織において、代謝性炎症反応を招くTNFα及びIL−6遺伝子発現を減少させる一方、脂肪酸酸化に関与するCPT1発現、そして熱発生に関与するUCP1とUCP3遺伝子の発現及びこれらターゲット遺伝子の発現を調節するSIRT1及びPGC1αの発現を増加させる効果があることが観察された(表8)。したがって、抗肥満効能を示す匂い成分の補充摂取は、内臓脂肪組織において、脂肪生成に中枢的役割をする核転写因子及びそのターゲット遺伝子発現を減少させて、熱発生及び脂肪酸酸化を促進させ、体重を低下させて、肥満により誘導された慢性的炎症活性化を著しく改善することにより、代謝疾患を総体的に改善する効果があることが分かる。
【0151】
また、本発明でRT−PCRを利用して肝臓組織の遺伝子発現を分析した結果、抗肥満効能を示す前記匂い成分を摂取させたマウスの場合、高脂肪食餌を摂取させた対照群に比べ、脂肪合成に関与する核転写因子(C/EBPαとPPARγ2)及びそのターゲット遺伝子(aP2、FAS)及び単純脂肪肝が脂肪肝炎に進行する過程に中枢的な役割をするTNFα及びIL−6遺伝子発現が減少して、脂肪酸酸化を促進させるCPT1発現は、有意に増加した(表20)。したがって、体重低下効能を有する匂い成分の補充摂取は、肝臓組織において脂質生成に関与する核転写因子及びそのターゲット遺伝子発現を減少させて脂肪酸酸化を促進することにより、脂肪肝生成を予防して肝臓組織において炎症活性化を著しく改善し、非アルコール性脂肪肝炎を改善する効果があることが分かる。
【0152】
【表20】
【0153】
上述した多様な肥満及び代謝疾患関連遺伝子は、結局のところ上流で嗅覚受容体/ACにより媒介されることが分かる(図3)。これを証明するために、内臓脂肪組織において嗅覚受容体により媒介されるHSL(ホルモン感受性リパーゼ)、CREB(cAMP応答配列結合タンパク質)、そしてAKT(v−aktマウス胸腺腫ウイルス癌遺伝子)タンパク質リン酸化をウェスタンブロット分析により評価した結果、匂い成分(インドール−3−カルビノール、オレウロペイン、セドリルアセテート、ピペリン)を補充摂取させたマウスにおいて、高脂肪食餌対照群に比べ、上記3種のタンパク質のリン酸化が全て有意に増加したことが観察された(表21)。したがって、ACは、肥満に係わる脂肪生成、遊離脂肪酸酸化、熱生成及びインシュリン抵抗性に係わるGLUT4転座を調節する上流分子であり、信号が同時に嗅覚受容体により伝達されるため、嗅覚受容体は、肥満及び代謝疾患治療剤の新規なターゲットであることが分かる。
【0154】
【表21】
【0155】
以上、本発明の望ましい実施形態を詳細に記述したが、当業界の通常の知識を有する者にとっては、このような具体的な記述はただ望ましい実施形態に過ぎなく、これに本発明の範囲が限定されないことは明らかである。従って、本発明の実質的な範囲は、添付の請求項とその等価物により定義されると言える。
図1
図2
図3
【配列表】
[この文献には参照ファイルがあります.J-PlatPatにて入手可能です(IP Forceでは現在のところ参照ファイルは掲載していません)]