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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】6704044
(24)【登録日】2020年5月13日
(45)【発行日】2020年6月3日
(54)【発明の名称】水溶性高分子が結合したナノ物質を含む消光剤及びその用途
(51)【国際特許分類】
C12N 15/113 20100101AFI20200525BHJP
C12N 15/11 20060101ALI20200525BHJP
C12N 15/115 20100101ALI20200525BHJP
C12Q 1/6876 20180101ALI20200525BHJP
G01N 33/53 20060101ALI20200525BHJP
G01N 21/64 20060101ALI20200525BHJP
B82Y 5/00 20110101ALI20200525BHJP
【ＦＩ】
C12N15/113 ZZNA
C12N15/11 Z
C12N15/115 Z
C12Q1/6876 Z
G01N33/53 M
G01N33/53 Z
G01N21/64 F
B82Y5/00
【請求項の数】20
【全頁数】20
(21)【出願番号】特願2018-516666(P2018-516666)
(86)(22)【出願日】2016年6月15日
(65)【公表番号】特表2018-533005(P2018-533005A)
(43)【公表日】2018年11月8日
(86)【国際出願番号】KR2016006355
(87)【国際公開番号】WO2017057823
(87)【国際公開日】20170406
【審査請求日】2018年3月30日
(31)【優先権主張番号】10-2015-0139174
(32)【優先日】2015年10月2日
(33)【優先権主張国】KR
(73)【特許権者】
【識別番号】517022072
【氏名又は名称】レモネックス インコーポレイテッド
【氏名又は名称原語表記】ＬＥＭＯＮＥＸ ＩＮＣ．
(74)【代理人】
【識別番号】100137095
【弁理士】
【氏名又は名称】江部 武史
(74)【代理人】
【識別番号】100091627
【弁理士】
【氏名又は名称】朝比 一夫
(72)【発明者】
【氏名】ウォン，チョルヘ
(72)【発明者】
【氏名】ミン，ダル−ヘ
【審査官】
池上 京子
(56)【参考文献】
【文献】
韓国公開特許第１０−２０１４−００１４４４３（ＫＲ，Ａ）
【文献】
米国特許出願公開第２０１４／０１００１２４（ＵＳ，Ａ１）
【文献】
Xiang-Ling Li, et al.，Lab on a Chip，２０１３年，Vol.13，p.3868-3875
【文献】
Li Gao, et al.，Nanoscale，２０１５年，Vol.7，p.10903-10907
【文献】
Jiayan Luo, et al.，J. AM. CHEM. SOC.，２０１０年，vol.132，p.17667-17669
【文献】
Dinggeng He et al.，Chem. Commun.，２０１５年 ８月１０日，vol.51，p.14764-14767
【文献】
Haixin Chang, et al.，Analytical Chemistry，２０１０年，Vol.82, No.6，p.2341-2346
(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）
Ｃ１２Ｑ １／００−３／００
Ｇ０１Ｎ ３３／４８−３３／９８
ＣＡｐｌｕｓ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ／ＷＰＩＤＳ（ＳＴＮ）
ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
グラフェンオキサイドナノコロイド（ＧＯＮ）と、
前記グラフェンオキサイドナノコロイドの表面のカルボキシル基部分に結合した水溶性高分子と、
前記グラフェンオキサイドナノコロイドの前記水溶性高分子が結合していない表面部分に結合する、蛍光物質が結合したプローブと、を含み、
前記水溶性高分子は、キトサン、キトサン塩、デキストラン、ヒアルロン酸、ヒアルロン酸塩、ペクチン、ペクチン塩、アルギン酸塩、アルギン酸、寒天、ガラクトマンナン、ガラクトマンナン塩、キサンタン、キサンタン塩、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つであることを特徴とする標的物質検出用組成物。
前記グラフェンオキサイドナノコロイドの表面のカルボキシル基部分に結合した水溶性高分子と、
前記グラフェンオキサイドナノコロイドの前記水溶性高分子が結合していない表面部分に結合する、蛍光物質が結合したプローブと、を含み、
前記水溶性高分子は、キトサン、キトサン塩、デキストラン、ヒアルロン酸、ヒアルロン酸塩、ペクチン、ペクチン塩、アルギン酸塩、アルギン酸、寒天、ガラクトマンナン、ガラクトマンナン塩、キサンタン、キサンタン塩、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つであることを特徴とする標的物質検出用組成物。
【請求項2】
前記グラフェンオキサイドナノコロイドは、粒子状またはシート状である、請求項１に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項3】
前記グラフェンオキサイドナノコロイドの粒子サイズが０．０１〜１μｍである、請求項２に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項4】
前記結合が、化学的または物理的結合である、請求項１に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項5】
前記化学的結合がＥＤＣカップリング（coupling）である、請求項４に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項6】
前記物理的結合が水素結合である、請求項４に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項7】
前記プローブが、抗体、核酸、ペプチド、タンパク質、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項１に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項8】
前記核酸は、１０〜５０個の塩基で構成される、請求項７に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項9】
前記核酸は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、非翻訳ＲＮＡ、二重らせんＲＮＡ、二重らせんＤＮＡ、ＤＮＡベースの酵素、ジオキシリボザイム、アプタマー、ＰＮＡ、ＬＮＡ、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項７に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項10】
前記核酸が、配列番号１〜１０からなる群より選択される何れか一つである、請求項７に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項11】
前記蛍光物質が、フルオレセイン、フルオレセインクロロトリアジニル、ローダミングリーン、ローダミンレッド、テトラメチルローダミン、フルオレセインイソチオシアン酸塩（fluorescein isothiocyanate、ＦＩＴＣ）、オレゴングリーン（oregon green）、アレックスフルオロ、カルボキシフルオレスセイン（carboxyfluorescein、ＦＡＭ）、６−カルボキシ−４’，５’−ジクロロ−２’，７’−ジメトキシフルオレスセイン（ＪＯＥ）、カルボキシ−Ｘ−ローダミン（ＲＯＸ）、６−カルボキシ−２’，４，４’，５’，７，７’−ヘキサクロロフルオレスセイン（ＨＥＸ）、テキサスレッド（sulforhodamine 101 acid chloride）、６−カルボキシ−２’，４，７’，７−テトラクロロフルオレスセイン（ＴＥＴ）、テトラメチルローダミン−イソチオシアネート（ＴＲＩＴＣ）、カルボキシテトラメチルローダミン（ＴＡＭＲＡ）、シアニン系染料、シアジカルボシアニン染料、およびその組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項１に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項12】
前記シアニン系染料が、Ｃｙ３、Ｃｙ５、Ｃｙ５．５、Ｃｙ７、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項１１に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項13】
前記標的物質は、疾患患者で検出されるものであり、
前記疾患は、癌、感染性疾患、炎症性疾患又は遺伝子疾患である、請求項１に記載の標的物質検出用組成物。
前記疾患は、癌、感染性疾患、炎症性疾患又は遺伝子疾患である、請求項１に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項14】
前記感染性疾患が、バクテリア、カビ、ウイルス、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つによるものである、請求項１３に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項15】
前記バクテリアが、緑膿菌、黄色ブドウ球菌、連鎖球菌、アシネトバクター・バウマニ菌、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項１４に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項16】
前記ウイルスが、二本鎖ＤＮＡウイルス、一本鎖ＤＮＡウイルス、二本鎖ＲＮＡウイルス、陽性−極性の一本鎖ＲＮＡウイルス、陰性−極性の一本鎖ＲＮＡウイルス、一本鎖ＲＮＡ−レトロウイルス、二本鎖ＤＮＡ−レトロウイルス、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項１４に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項17】
前記ウイルスが、ヒトサイトメガロウイルス、デングウイルス、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つである、請求項１４に記載の標的物質検出用組成物。
【請求項18】
１）請求項１に記載の標的物質検出用組成物および分離された試料を混合するステップと、
２）前記混合物の蛍光を測定するステップと、
３）正常対照群試料の蛍光レベルと比較するステップと、
を含む疾患の診断に必要な情報の提供方法。
２）前記混合物の蛍光を測定するステップと、
３）正常対照群試料の蛍光レベルと比較するステップと、
を含む疾患の診断に必要な情報の提供方法。
【請求項19】
前記疾患が、癌、感染性疾患、炎症性疾患又は遺伝子疾患である、請求項１８に記載の方法。
【請求項20】
請求項１に記載の標的物質検出用組成物を含むキット。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、水溶性高分子が結合したナノ物質を含む消光剤及びその用途に関する。
【背景技術】
【0002】
特定の核酸（ＤＮＡ又はＲＮＡ）またはタンパク質を検出する方法は、科学研究の分野で重要な技術である。特定の核酸またはタンパク質を検出できるようになったことにより、研究者は、どの遺伝的、生物学的標識が人の健康状態を示す指標になるのかを判定できるようになった。このような核酸とタンパク質を検出する方法を用いると、試料に存在する病原体の遺伝子の変形、または特定の遺伝子の発現などを発見することができる。
【0003】
一方、酸化グラフェンのように２次元の格子内に満たされた平面構造を有する有機または無機の高分子及びその誘導体は、電子伝達が可能である。この電子伝達は、これらの結晶及び格子構造のような物理的な特定に起因する。特に、蛍光共鳴エネルギー伝達（fluorescence resonance energy transfer、ＦＲＥＴ）現象により、有機蛍光染料の蛍光シグナルを消光することができる。
【0004】
これにより、酸化グラフェンのような物質の物理的特性を用いて、蛍光染料が結合した核酸高分子の蛍光シグナルの変化を観察することができ、これを通じて、核酸及びタンパク質などのバイオ物質を検出できるようになっている（韓国特許第１０−１４９６６７１号公報）。また、このような物質を用いて、蛍光分析に基づいて酵素活性を検出する方法が開発されている（韓国特許第１０−１５５４１７３号公報）。最近、このような物質を用いる技術は、試料に存在する病原体の遺伝子やタンパク質などを観察できる点で、病気及び疾患の初期研究において重要なものになっている。
【0005】
しかしながら、このように酸化グラフェンを用いる検出方法は、簡単であるものの、試料中に含まれる標的物質の量に大きな影響を受けることがあり、また検出に用いられる核酸高分子のサイズ分布が均一でなくて誤差の範囲が広い。さらに、体外診断のための生体外の環境では前記高分子が不安定であるため、再現性が低下する欠点がある。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0006】
本発明の目的は、水溶性高分子が結合したナノ物質を含む消光剤、並びに該消光剤及び蛍光物質が結合したプローブを含む組成物を提供することである。また、本発明の他の目的は、前記組成物を用いて疾患の診断に必要な情報を提供する方法を提供することである。
【課題を解決するための手段】
【0007】
前記目的を達成するために、本発明は、水溶性高分子が結合したナノ物質を含む消光剤を提供する。
【0008】
また、本発明は、前記消光剤及び蛍光物質が結合したプローブを含む組成物を提供する。
【0009】
さらに、本発明は、前記組成物および分離された試料を混合して混合物を準備するステップと、前記混合物の蛍光レベルを測定するステップと、正常対照群試料の蛍光レベルと比較するステップとを含む疾患の診断に必要な情報の提供方法を提供する。
【0010】
また、本発明は、前記消光剤及び蛍光物質が結合したプローブを含むキットを提供する。
【発明の効果】
【0011】
本発明の水溶性高分子が結合したナノ物質を含む消光剤は、蛍光物質が結合したプローブからの蛍光を効果的に消光する。また、水溶性高分子が結合したナノ物質と蛍光物質が結合したプローブが安定的に結合する。それだけでなく、標的物質の存在時、プローブは標的物質に結合し、水溶性高分子が結合したナノ物質から容易に離脱できるので、効率よく標的物質を検出することができる。これにより、前記消光剤及び蛍光物質が結合したプローブを含む組成物は、低濃度で存在する標的物質も検出することができる。従って、バイオ物質の検出または疾患の診断に必要な情報を提供するための組成物又はキットとして有用に用いることができる。
【図面の簡単な説明】
【0012】
【図6】図６は、ポリエチレングリコールによって表面改質されたＮＧＯ（ＰＥＧ−ＮＧＯ）（ａ）、若しくはＰＥＧ及びポリエチレンイミン（ＰＥＩ）によって表面改質されたＧＯＮ（ＰＥＧ−ＰＥＩ−ＧＯＮ）（ｂ）をＡＦＭで撮影した写真である。
【発明を実施するための形態】
【0013】
以下、本発明を詳細に説明する。
【0014】
本発明の一局面では、水溶性高分子が結合したナノ物質を含む消光剤を提供する。
【0015】
本明細書で使用される用語の「水溶性高分子」とは、水に溶けるか、或いは水中で微細な粒子に分散し得る樹脂または高分子を意味する。前記水溶性高分子は、天然高分子、半合成高分子、または合成高分子であってもよい。本発明で使用できる水溶性高分子は、１〜２０ｋＤａ、５〜１５ｋＤａ、または８〜１２ｋＤａの分子量を有することができる。一実施形態では、前記水溶性高分子は１０ｋＤａのものであってもよい。
【0016】
前記水溶性高分子は、キトサン及びその誘導体、キトサン塩、デキストラン及びその誘導体、ヒアルロン酸及びその誘導体、ヒアルロン酸塩、ペクチン及びその誘導体、ペクチン塩、アルギン酸塩及びその誘導体、アルギン酸、寒天、ガラクトマンナン及びその誘導体、ガラクトマンナン塩、キサンタン及びその誘導体、キサンタン塩、β−シクロデキストリン及びその誘導体、β−シクロデキストリン塩、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）、ポリエチレンイミン（ＰＥＩ）、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。一実施形態では、前記水溶性高分子は、デキストラン、ポリエチレングリコール、ポリエチレンイミン、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。
【0017】
本明細書で使用される用語の「ナノ物質」とは、ナノサイズを有する物質を意味する。これは、サイズが小さくて細胞膜を容易に通過することができる。前記ナノ物質は、シート状または粒子状のものであってもよい。前記シートは、単層または複数層で構成されていてもよい。また、シートの形状は、平面または曲面を含むことができ、様々な形状であってもよい。一実施形態では、前記ナノ物質は、２次元単層シート状のナノ物質であってもよい。また、粒子の形状は、球状、楕円状、棒状および多角形状などの様々な形状であってもよい。
【0018】
前記ナノ物質の粒子サイズは、約１０〜５００ｎｍ、約１０〜２００ｎｍ、約１０〜１５０ｎｍ、約１０〜１００ｎｍ、約１０〜５０ｎｍ、約２０〜２００ｎｍ、約２０〜１５０ｎｍ、約２０〜１００ｎｍ、約２０〜５０ｎｍ、約３０〜２００ｎｍ、約３０〜１５０ｎｍ、約３０〜１００ｎｍ、約３０〜５０ｎｍ、約５０〜２００ｎｍ、約５０〜１５０ｎｍ、約５０〜 １００ｎｍ、約５０〜８０ｎｍ、約６０〜２００ｎｍ、約６０〜１００ｎｍ、約６０〜８０ｎｍ、約８０〜２００ｎｍ、約８０〜１５０ｎｍ、約８０〜１００ｎｍ、約９０〜２００ｎｍ 、約９０〜１５０ｎｍまたは約９０〜１００ｎｍであってもよいが、これらに限定されない。本発明の一実施形態では、前記ナノ物質は、５０〜８０ｎｍ、９０〜２００ｎｍ、９０〜１５０ｎｍまたは８０〜１００ｎｍのものであってもよい。ここで、前記粒子の大きさは、動的光散乱（Dynamic Light Scattering）を用いた測定で得られた実験値、または原子力顕微鏡（ＡＦＭ）や走査透過顕微鏡（ＴＥＭ）の画像から示される大きさを平均して計算した値であり、ナノ物質を球形または円形のものと仮定して得られる値を意味する。
【0019】
前記ナノ物質は、炭素ナノ物質または二酸化マンガンで製造することができる。ここで、前記炭素ナノ物質は、ナノグラフェンオキサイド（ＮＧＯ）及びその誘導体、還元された酸化グラフェン及びその誘導体、グラフェンオキサイドナノコロイド（ＧＯＮ）、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。一実施形態では、前記ナノ物質は、ナノグラフェンオキサイド、グラフェンオキサイドナノコロイド、又は二酸化マンガンであってもよい。
【0020】
本明細書で使用される用語の「消光剤」は、光または波長を吸収して蛍光を発する物質の蛍光エネルギーを吸収する物質を意味する。消光効果は、蛍光を発する物質とナノ物質との相互作用により起こる。蛍光物質とナノ物質が１０ｎｍ程度又はそれ以下の近距離に位置するときに主に発生する。このとき、蛍光物質は、エネルギードナー（energy donor）としての役割を果たし、ナノ物質は、エネルギーアクセプター（energy acceptor）としての役割を果たす。
【0021】
前記消光剤は、水溶性高分子によってナノ物質の表面が改質されたものであってもよい。このとき、前記水溶性高分子およびナノ物質が化学的または物理的に結合したものであってもよい。前記化学的結合としては、アミド結合、エステル結合、エーテル結合などが可能であるが、これらに限定されない。また、化学的結合は、架橋剤により行うことができる。一実施形態では、水溶性高分子とナノ物質は、ＥＤＣカップリング（coupling）により結合することができる。また、前記物理的な結合は、静電気的な引力、水素結合、ファンデルワールス結合であってもよいが、これらに限定されない。また、このように水溶性高分子によって表面改質されたナノ物質は、分散能力および安定性が向上するとともに、生体親和性が向上し得る。
【0022】
また、本発明の他の局面では、本発明は、前記消光剤及び蛍光物質が結合したプローブを含む組成物を提供する。
【0023】
本明細書で使用される用語の「プローブ」とは、標的物質に特異的に結合できる物質を意味する。前記プローブは、抗体、核酸、ペプチド、タンパク質、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つであってもよい。他にも、目的とする標的物質と高い親和性を有する物質として知られている物質であれば、いずれも用いることができる。一実施形態では、前記抗体は、標的タンパク質のエピトープと特異的に結合して標的物質を検出することができる。また、前記核酸が標的物質の核酸の配列と相補的な配列を有する場合には、前記核酸は、標的塩基配列に結合して標的物質を検出することができる。また、前記ペプチドは、細胞の表面に発現されている受容体またはリガンドなどに特異的に結合して標的物質を検出することができる。
【0024】
前記核酸は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｍｉＲＮＡ、非翻訳ＲＮＡ、二重らせんＲＮＡ、二重らせんＤＮＡ、ＤＮＡベースの酵素、ジオキシリボザイム、アプタマー、ペプチド核酸（Peptide Nucleic acid、ＰＮＡ）、ロックド核酸（Locked nucleic Acid、ＬＮＡ）、およびそれらの組み合わせからなる群より選択される何れか一つであってもよい。
【0025】
このとき、前記核酸は、１０〜５０個、１０〜３０個、１２〜２８個、１５〜２５個、１８〜２２個の塩基で構成できるが、標的核酸配列と相補的に結合できれば、塩基の数はこれらに限定されない。一実施形態では、前記核酸は、１５〜２２個の塩基で構成されていてもよい。本発明の一実施形態では、前記核酸は、配列番号１〜２０からなる群より選択される何れか一つであってもよい。
【0026】
本発明に係るプローブには、蛍光物質が結合している。前記蛍光物質は、水溶性高分子が結合したナノ物質によって蛍光エネルギーが吸収されて消光された状態で存在していて、前記プローブが標的物質と特異的に結合してナノ物質から遊離すると、蛍光を示すことになる。前記蛍光物質は、プローブの一方の末端または中間に結合することができる。プローブが核酸である場合は、蛍光物質は、核酸の５’または３’の位置または核酸の内部に位置することができる。プローブがペプチドである場合は、蛍光物質は、ペプチドのＮ末端、Ｃ末端または内部に結合することができる。蛍光物質は、プローブに直接結合するか、または架橋剤を介して結合することができる。
【0027】
前記蛍光物質は、フルオレセイン、フルオレセインクロロトリアジニル、ローダミングリーン、ローダミンレッド、テトラメチルローダミン、フルオレセインイソチオシアン酸塩（fluorescein isothiocyanate、ＦＩＴＣ）、オレゴングリーン（oregon green）、アレックスフルオロ、カルボキシフルオレスセイン（carboxyfluorescein、ＦＡＭ）、６−カルボキシ−４’，５’−ジクロロ−２’，７’−ジメトキシフルオレスセイン（ＪＯＥ）、カルボキシ−Ｘ−ローダミン（ＲＯＸ）、６−カルボキシ−２’，４，４’，５’，７，７’−ヘキサクロロフルオレスセイン（ＨＥＸ）、テキサスレッド（sulforhodamine 101 acid chloride）、６−カルボキシ−２’，４，７’，７−テトラクロロフルオレスセイン（ＴＥＴ）、テトラメチルローダミン−イソチオシアネート（ＴＲＩＴＣ）、カルボキシテトラメチルローダミン（ＴＡＭＲＡ）、シアニン系染料、シアジカルボシアニン染料、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。前記シアニン系染料は、Ｃｙ３、Ｃｙ５、Ｃｙ５．５、Ｃｙ７、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。
【0028】
前記消光剤は、１つ以上の標的を検知することができる。１つ以上の標的を検知するために、ナノ物質は、異なる二種類以上のプローブを含むことができる。このとき、各々のプローブは、異なる蛍光物質を含むことができる。このとき、各々のプローブは、異なる標的物質と結合することにより、互いに異なる標的物質を検出することができる。
【0029】
また、前記組成物は、バイオ物質の検出または疾患の診断に必要な情報を提供するのに用いることができる。前記疾患は、癌、感染性疾患、炎症性疾患または遺伝子疾患であってもよい。一実施形態では、前記疾患は癌または感染性疾患であってもよい。
【0030】
前記癌は、乳癌、肺癌、肝臓癌、膵臓癌、胃癌、大腸癌、骨癌、皮膚癌、脳癌、肉腫癌、眼癌、骨髄癌、血液癌、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。一方、前記感染性疾患は、バクテリア、カビ、ウイルス、寄生虫、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。ここで、前記バクテリアは、腸内細菌または腸球菌であってもよい。前記バクテリアの例としては、緑膿菌、黄色ブドウ球菌およびアシネトバクター・バウマニ菌などがある。本発明の一実施形態では、前記バクテリアは緑膿菌または黄色ブドウ球菌であってもよい。
【0031】
前記ウイルスは、二本鎖ＤＮＡウイルス、一本鎖ＤＮＡウイルス、二本鎖ＲＮＡウイルス、陽性−極性の一本鎖ＲＮＡウイルス、陰性−極性の一本鎖ＲＮＡウイルス、一本鎖ＲＮＡ−レトロウイルス、および二本鎖ＤＮＡ−レトロウイルスなどを含むことができる。本発明の一実施形態では、前記ウイルスは、サイトメガロウイルス、デングウイルス、およびそれらの組み合わせからなる群より選択することができる。
【0032】
本発明の他の側面では、前記消光剤と蛍光物質が結合したプローブを含む組成物および分離された試料を混合するステップと、前記混合物の蛍光を測定するステップと、正常対照群試料の蛍光レベルと比較するステップとを含む疾患の診断に必要な情報の提供方法を提供する。
【0033】
前記組成物に含まれる消光剤及び蛍光物質が結合したプローブは、前述した通りである。また、前記試料は、診断対象から分離・排出された試料であり、細胞、細胞培養液、組織、唾液、小便、大便、精液、血液、血漿または血清であってもよい。また、正常対照群試料は、疾患を持たない健常者から分離・排出された試料を意味する。
【0034】
本発明に係る方法は、核酸またはタンパク質などのバイオ物質の検出、或いは前述したような疾患の診断に用いることができる。このとき、前記蛍光は、ナノ物質によって消光された蛍光物質が標的物質と特異的に接触または結合することで遊離して発光することを測定することにより分かる。前記蛍光レベルの測定には、流動細胞分析（flow−cytometry）、流動細胞分離（fluorescence activated cell sorting、ＦＡＣＳ）、または蛍光シグナルや画像を分析する方法を用いることができる。
【0035】
また、本発明の他の局面では、本発明は、前記消光剤及び蛍光物質が結合したプローブを含むキットを提供する。前記組成物に含まれる消光剤及び蛍光物質が結合したプローブは、前述の通りである。前記キットは、核酸またはタンパク質などのバイオ物質の検出、或いは前述したような疾患の診断に用いることができる。
【0036】
以下、本発明を下記の実施例により詳細に説明する。但し、下記の実施例は、本発明を例示するためのものであり、本発明を制限するものではない。
【0037】
Ｉ．２次元ナノ物質の製造実施例１．グラフェンオキサイドナノコロイド（ＧＯＮ）の製造
４ｇのＫ２Ｓ２Ｏ８及び４ｇのＰ４Ｏ１０を５０ｍｌのＨ２ＳＯ４に添加し、攪拌して溶解した。ここに、２ｇのグラファイトナノファイバー（graphite nanofiber）を添加し、９０℃で１６時間加熱した。加熱された混合物を常温に冷やし、２５０ｍｌの蒸留水を添加した後、これを紙フィルター（Ｗｈａｔｍａｎ、ＧＥ Ｈｅａｌｔｈｃａｒｅ、米国）で精製した。精製した混合物を蒸留水で２回以上洗浄し、空気中で乾燥した。
【0038】
１．５ｇの前記乾燥された粉末状のグラファイトナノファイバーを２５０ｍｌのＨ２ＳＯ４に添加し、ここに１０ｇのＫＭｎＯ４を少しずつ添加しながら攪拌して反応させた。このとき、反応温度は１０℃が超えないようにした。反応物を３５℃の蒸留水で湯煎で６時間攪拌しながら更に反応させた。反応が終了した後、１，０００ｍｌの蒸留水を添加し、この時の温度は５５℃以下に維持した。ここに５０ｍｌのＨ２Ｏ２を添加して反応させ、混合物を１０，０００ｒｐｍの条件で３０分間遠心分離してペレットを得た。得られたペレットは、３．４％（ｗ／ｗ）のＨＣｌ及びアセトンで遠心分離機を用いてそれぞれ３回以上洗浄した。
【0039】
最終的に得られた茶色の上澄み液に含まれているアセトンを真空中で除去し、ここに蒸留水を入れて最終濃度が１ｍｇ／ｍｌになるようにし、ボルテックスして十分に分散した。前記から得られたものを１０，０００Ｄａの透析膜（dialysis membrane）を用いて精製および中性化し、最終的に得られた産物を凍結乾燥してパウダー状のＧＯＮを得た。得られたＧＯＮを原子力顕微鏡（ＡＦＭ）で観察した結果を図２に示す。図２に示すように、１００ｎｍ以下のサイズ及び２ｎｍ以下の厚さを有するＧＯＮを得た。
【0040】
実施例２．二酸化マンガン（ＭｎＯ２）の製造３２ｍｌのドデシル硫酸ナトリウム（sodium dodecyl sulfate、ＳＤＳ）、及び１．６ｍｌのＨ２ＳＯ４溶液に蒸留水を添加し、最終の体積を３００ｍｌにした。これを９５℃で１５分間加熱し、３．２ｍｌのＫＭｎＯ４溶液を迅速に添加した。その後、６０分間加熱を継続し、濃い茶色の溶液である二酸化マンガンシートを得た。
【0041】
得られた二酸化マンガンシートに３次蒸留水及びアルコールを１：１の体積比で添加し、１２，０００ｒｐｍで遠心分離して、ペレットを得た。同じ条件でさらに遠心分離を２回繰り返して得られた産物を３次蒸留水に分散し、最終の産物を得た。得られたＭｎＯ２を走査透過顕微鏡（Transmittance Electron Microscopy、ＴＥＭ）および原子力顕微鏡（atomic force microscopy、ＡＦＭ）で観察した結果を図３に示す。図３ｂに示すように、２００ｎｍ以下のサイズ及び２ｎｍ以下の厚さを有するＭｎＯ２を得た。
【0042】
実施例３．ナノグラフェンオキサイド（ＮＧＯ）の製造０．５ｇのＮａ２ＮＯ３を２３ｍｌのＨ２ＳＯ４に添加し、これを攪拌して溶解させた。ここに、０．５ｇのグラファイトナノファイバーを添加した後、３ｇのＫＭｎＯ４を少しずつ添加しながら攪拌して反応させた。このとき、反応温度は１０℃が超えないようにした。反応物を３５℃の蒸留水で湯煎で１時間攪拌しながら更に反応させ、その後、さらに９０℃で３０分間反応した。反応が終了した後、１ｍｌの蒸留水を添加し、この時の温度は５５℃以下に維持した。前記反応物に３ｍｌのＨ２Ｏ２を添加して反応させ、これを常温に冷やした後、２５０ｍｌの蒸留水を添加した。これを紙フィルターでろ過した後、ろ過物を蒸留水で２回以上洗浄し、空気中で乾燥した。
【0043】
酸化グラフェン（ＧＯ）を製造するために、１０ｍｇ／ｍｌ濃度の酸化グラフェン溶液に５０ｍｌの９Ｍ ＮａＯＨを添加した後、９０分間チップ超音波分解（tip−sonication）を行った。これを３，８００Ｄａの透析膜を用いて精製及び中性化し、最終的に得られた産物を凍結乾燥してパウダー状のＮＧＯを得た。得られたＮＧＯをＡＦＭで観察した結果を図４に示す。図４に示すように、２００ｎｍ以下のサイズ及び１．５ｎｍ以下の厚さを有するＮＧＯを得た。
【0044】
ＩＩ．高分子で表面改質された２次元ナノ物質の製造実施例４．デキストランによって表面改質されたグラフェンオキサイドナノコロイド（ＤＲｅＧＯＮ）の製造
前記実施例１で得られたグラフェンオキサイドナノコロイドの表面をデキストランを用いて改質した。具体的には、５０ｍｇのグラフェンオキサイドナノコロイドを５０ｍｌの蒸留水に分散し、０．１％（ｗ／ｗ）のデキストラン水溶液を添加した。前記混合物を３０分間超音波処理した後、２５μｌのアンモニア水溶液を添加し、９５℃で３時間攪拌して反応させた。前記反応物を蒸留水で洗浄した後、１０，０００ｒｐｍの条件で３０分間遠心分離して分離し、凍結乾燥して、最終の産物であるＤＲｅＧＯＮを得た。
【0045】
得られたＤＲｅＧＯＮを用いてラマン分析を行った。具体的には、シリコンウエハにＤＲｅＧＯＮを入れて、ラマン機器（ＬａｂＲＡＭ ＨＲ ＵＶ／ｖｉｓ／ＮＩＲ）に前記シリコンウエハを取り付けた後、５１４ｎｍ波長のＣＷレーザを照射してスペクトルを分析した。
【0046】
前記から得られたＤＲｅＧＯＮをＡＦＭで観察した結果を図５ａに、ラマンスペクトルで分析した結果を図５ｂに示す。図５ａに示すように、１００ｎｍ以下のサイズ及び７ｎｍ以下の厚さを有するＤＲｅＧＯＮを得た。一方、図５ｂに示すように、１３７０ｃｍ−１及び１６００ｃｍ−１の領域でＤ及びＧのピークが観察され、ＩＤ／ＩＧの値は０．８５であった。
【0047】
実施例５．ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）によって表面改質されたＮＧＯの製造前記実施例３で得られたＮＧＯの表面をＰＥＧを用いて改質した。具体的には、５ｍｇのＮＧＯと同量のポリエチレングリコール（１０ｋＤａ）とを混ぜて水槽−超音波分解（bath−sonication）を行った。ここに、５ｍｇのＥＤＣ（1-ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl)carbodiimide）を添加し、さらに５分間水槽−超音波分解を行った。前記混合物を６時間攪拌した後、１０，０００Ｄａの透析膜を用いて精製および中性化し、最終的に得られた産物を凍結乾燥してパウダー状の、ポリエチレングリコールによって表面改質されたＮＧＯ（ＰＥＧ−ＮＧＯ）を得た。
【0049】
実施例６．ポリエチレングリコール及びポリエチレンイミン（ＰＥＩ）によって表面改質されたＧＯＮの製造前記実施例１で得られたＧＯＮの表面をＰＥＧおよびＰＥＩを用いて改質した。具体的には、２ｍｇ／ｍｌ濃度のＧＯＮ溶液１０ｍｌに２０ｍｇのＰＥＧ（１０ｋＤａ）を添加し、５分間水槽−超音波分解を行った。ここに２０ｍｇのＥＤＣを添加し、さらに５分間水槽−超音波分解を行った。前記反応物に１０ｍｇのＰＥＩを添加してから５分間、ＥＤＣを添加してから５分間、前記のように水槽−超音波分解を行った後、これを常温で６時間攪拌して反応が均一になるようにした。その後、前記混合物を１２，０００Ｄａの透析膜を用いて精製および中性化し、最終的に得られた産物を凍結乾燥し、パウダー状の、ＰＥＧ及びＰＥＩによって表面改質されたＧＯＮ（ＰＧＥ−ＰＥＩ−ＧＯＮ）を得た。
【0051】
ＩＩＩ．高分子で表面改質された２次元ナノ物質の検出用組成物の形成の確認実験例１．高分子で表面改質された２次元ナノ物質の検出用組成物の形成の確認
実験例１−１．ＤＲｅＧＯＮの検出用組成物の形成の確認−（１）
前記実施例４で製造したＤＲｅＧＯＮを標的物質検出用組成物として用いることができるかを確認するために、次のような実験を行った。具体的には、標的物質を検知するためのＰＮＡ（peptide nucleic acid）プローブは、５’−末端にＣｙ５が標識され、Ｃｙ５及びプローブ配列の間に１つの酸素に２つの炭素が結合した形態の単位体の２つをリンカーとして含むようにＰａｎａｇｅｎｅ社（韓国）に依頼して製作した。前記１μＭのＰＮＡプローブを２０μｌのヌクレアーゼ−フリーウォーター（nuclease−free water）に添加し、これを８０℃で約３分間加熱しながら完全に溶解した。溶解されたＰＮＡプローブ２０μｌを前記実施例４で製造したＤＲｅＧＯＮと混合し、常温で３０分間反応させた。反応４、８、１２又は２４時間の後、Ｅｘ／Ｅｍ＝６４７／６７０ｎｍで蛍光リーダーにより蛍光シグナルを測定した。このとき、対照群としては、ＰＮＡプローブのみを使用した。
【0052】
その結果、ＰＮＡプローブ自体の蛍光シグナルを１００％としたとき、高分子で表面改質された２次元ナノ物質と反応させる場合、蛍光シグナルが５％未満に減少しており、前記物質が検出用組成物を形成することを確認した。
【0053】
実験例１−２．ＤＲｅＧＯＮの検出用組成物の形成の確認−（２）前記実施例４で製造したＤＲｅＧＯＮを標的物質検出用組成物として用いることができるかを確認するために、前記実験例１−１と同様の条件及び方法により実験を行った。このとき、ＰＮＡプローブとしては、下記表２に示すＰＮＡ−ＵＳ５−２またはＰＮＡ−ＤＥＮＶを用いた。１０ｐｍｏｌのＰＮＡプローブをそれぞれ０、０．２、０．４、０．６、０．８、１．０、１．２、１．４又は１．６μｇのＤＲｅＧＯＮと混合した。その結果、測定した蛍光シグナルの値を図７に示す。図７に示すように、添加されたＰＮＡプローブの濃度に依存して蛍光シグナルが減少しており、前記物質が検出用組成物を形成することを確認した。
【0054】
実験例１−３．ＰＥＧ−ＮＧＯの検出用組成物の形成の確認前記実施例５で製造したＰＥＧ−ＮＧＯを標的物質検出用組成物として用いることができるかを確認するために、前記実験例１−１と同様の条件及び方法により実験を行った。このとき、１０ｐｍｏｌのＰＮＡプローブを０、０．１、０．２、０．５又は１．０μｇのＰＥＧ−ＮＧＯと混合した。前記ＰＮＡプローブとしては、表１に示すＰＮＡ−ＳａまたはＰＮＡ−ＰａにＣｙ５蛍光染料が結合したものを用いた。その結果、測定した蛍光シグナルの値を図８に示す。図８に示すように、添加されたＰＮＡプローブの濃度に依存して蛍光シグナルが減少しており、前記物質が検出用組成物を形成することを確認した。
【0055】
実験例１−４．ＰＥＧ−ＰＥＩ−ＧＯＮの検出用組成物の形成の確認前記実施例６で製造したＰＥＧ−ＰＥＩ−ＧＯＮを標的物質検出用組成物として用いることができるかを確認するために、前記実験例１−１と同様の条件及び方法により実験を行った。このとき、１０ｐｍｏｌのＰＮＡプローブを０、０．１、０．２、０．５又は１．０μｇのＰＥＧ−ＰＥＩ−ＮＧＯと混合した。前記ＰＮＡプローブとしては、下記表１に示すＰＮＡ−ＴＳにＦＩＴＣ蛍光染料が結合したものを用いた。その結果、測定した蛍光シグナルの値を図９に示す。図９に示すように、添加されたＰＮＡプローブの濃度に依存して蛍光シグナルが減少しており、前記物質が検出用組成物を形成することを確認した。
【0056】
実験例２．ＤＲｅＧＯＮ粒子の安定性の確認前記実施例４で製造したＤＲｅＧＯＮ粒子の安定性を確認するために、次のような実験を行った。具体的には、０．１ｍｇ／ｍｌ濃度のＤＲｅＧＯＮ溶液を血清が含まれているＰＢＳ溶液によく懸濁して、０、４、８、１２又は２４時間常温に置いて、各時間ごとの吸光度を測定した。対照群としては、実施例１で製造されたグラフェンオキサイドナノコロイド（ＧＯＮ）を用いた。その結果、図１０に示すように、ＤＲｅＧＯＮ（ｂ）は、ＧＯＮ（ａ）よりも長時間、生理活性環境で安定した吸光スペクトルを示しており、このような安定した分散能は、２４時間以上持続した。
【0057】
ＩＶ．高分子によって表面改質された２次元ナノ物質の標的物質の検出能の確認実験例３．癌細胞特異的核酸塩基配列の検出能の確認
実験例３−１．ＤＲｅＧＯＮの検出能の確認
前記実施例４で製造したＤＲｅＧＯＮの検出限界を測定するために、次のように実験を行った。まず、実験例１−１と同様の条件及び方法によりプローブのＰＮＡ２１及びＤＲｅＧＯＮを混合して反応させた。反応３０分後、反応物に癌細胞特異的配列を含む標的物質であるｍｉＲ−２１を０、０．００１、０．０１、０．１、１、１０、１００又は１０００ｎＭの濃度になるように添加し、常温で２時間反応させた。これをＥｘ／Ｅｍ＝６４７／６７０ｎｍで蛍光リーダーにより蛍光シグナルを測定した。実験に用いられたＰＮＡプローブ及び標的物質の配列を、それぞれ表１及び２に示す。
【0058】
【表1】
【0059】
【表2】
【0060】
標的物質を添加する前後の蛍光の変化を下記の数式１に代入して導出した結果を図１１に示す。このとき、対照群としては、実施例１で製造したＧＯＮを用いた。
【0061】
【数1】
【0062】
図１１に示すように、ＧＯＮは２３０ｐＭ濃度までの標的物質を検出したが、ＤＲｅＧＯＮは１０ｐＭの濃度までの標的物質を検出した。このことから、本発明の高分子で表面改質された２次元ナノ物質は、試料中に低濃度で存在する標的核酸も検出できることを確認した。
【0063】
実験例３−２．ＰＥＧ−ＮＧＯの検出能の確認前記実験例３−１と同様の条件及び方法によりＰＥＧ−ＮＧＯの癌細胞特異的核酸塩基配列の検出能を確認した。このとき、ＤＲｅＧＯＮの代わりに実施例５で製造したＰＥＧ−ＮＧＯを１０ｐｍｏｌの濃度で用い、プローブとしてのＰＮＡ２１及びＰＮＡ２３３と、標的物質としてのｍｉＲ−２１及びｍｉＲ−２３３を０、０．００２、０．０２、０．２、２、２０、２００又は２，０００ｎＭの濃度で用いた。また、標的物質を添加し、４時間反応させながら、２０分間隔で蛍光の変化を測定して図１２に示す。図１２に示すように、標的物質の濃度が増加しながら蛍光シグナルが強くなっており、プローブの濃度および種類に応じて異なるレベルで蛍光が回復した。
【0064】
実験例３−３．ＰＥＧ−ＰＥＩ−ＧＯＮの検出能の確認前記実験例３−１と同様の条件及び方法によりＰＥＧ−ＰＥＩ−ＮＧＯの癌細胞特異的核酸塩基配列の検出能を確認した。このとき、ＤＲｅＧＯＮの代わりに実施例６で製造したＰＥＧ−ＰＥＩ−ＮＧＯを１０ｐｍｏｌの濃度で用い、プローブとしてのＰＮＡ−ＴＳと、標的物質としてのｍｉＲ−ＴＳを１００、２００、３００又は５００ｎＭの濃度で用いた。また、標的物質を添加して４時間反応させながら、２０分間隔で蛍光の変化を測定して図１３に示す。図１３に示すように、標的物質の濃度が増加しながら蛍光シグナルが強くなっており、プローブの濃度及び種類に応じて異なるレベルで蛍光が回復した。
【0065】
実験例３−４．癌細胞株でのＤＲｅＧＯＮの検出能の確認様々な種類の癌細胞株を用いてＤＲｅＧＯＮの癌細胞特異的核酸塩基配列の検出能を確認した。まず、ＭＣＦ−７、ＨｅＬａ、ＳＷ６２０細胞株は、ＤＭＥＭ又はＲＰＭＩ培地を用いて培養して準備した。一方、実験例１−１と同様の条件及び方法によりプローブのＰＮＡ４８４又はＰＮＡ３１をＤＲｅＧＯＮと混合して反応させた。準備された細胞をウェル当り１×１０５個の細胞になるように１２ウェルプレートに分注し、２４時間後、ＤＲｅＧＯＮ、及びＰＮＡ４８４又はＰＮＡ３１の反応物を８０ｐｍｏｌの濃度になるように細胞に添加した。
【0066】
１４時間後、蛍光顕微鏡を用いて観察された細胞の蛍光シグナルを撮影して図１５に示す。このとき、対照群として細胞にプローブを添加せずに撮影した写真を図１４に示す。図１５に示すように、ＤＲｅＧＯＮによって標的物質が検知されたことを、蛍光物質が結合したプローブの蛍光シグナルから分かった。
【0067】
実験例３−５．血球細胞でのＤＲｅＧＯＮの検出能の確認血球細胞中に存在する特定の塩基配列に対するＤＲｅＧＯＮの検出能を確認するために、次のような実験を行った。具体的には、健康な人の血液１０ｍｌから公知の方法で血球細胞を収集し、それをＲＰＭＩ培地を用いて培養した。培養した細胞を固定し、ここに３．０μｇのＤＲｅＧＯＮとＣｙ５蛍光が結合した２００ｎＭのＰＮＡプローブを添加した。このとき、ＰＮＡプローブとしては、ＰＮＡ２１、ＰＮＡ２２３、Ｌｅｔ−７ａ又はこれらの混合物（scrambled）を用いた。対照群として、何れの処理もしていない細胞群を用いた。
【0068】
４時間後、流動細胞分析器を用いて、血球細胞において回復された蛍光の強度を図１６に示す。図１６に示すように、ＰＮＡプローブによって血球細胞で発現されている標的塩基配列が検出されることを確認した。
【0069】
実験例４．ＰＥＧ−ＮＧＯのバクテリア特異的核酸塩基配列の検出能の確認前記実験例３−１と同様の条件及び方法によりＰＥＧ−ＮＧＯの緑膿菌または黄色ブドウ球菌特異的核酸塩基配列の検出能を確認した。このとき、ＤＲｅＧＯＮの代わりに実施例５で製造した０．２μｇのＰＥＧ−ＮＧＯ、及び１０ｐｍｏｌのＰＮＡ−Ｐａ又はＰＮＡ−Ｓａを添加した。ここに、標的物質として、０、１０、２０、４０、７０又は１００ｎＭの濃度の緑膿菌または黄色ブドウ球菌ＡＳ−ＤＮＡを添加した。その結果、測定された蛍光の変化を図１７に示す。図１７に示すように、添加された緑膿菌または黄色ブドウ球菌ＡＳ−ＤＮＡの濃度に依存して蛍光の強度が増加した。
【0070】
実験例５．ＤＲｅＧＯＮのウイルス特異的核酸塩基配列の検出能の確認前記実験例３−１と同様の条件及び方法によりＤＲｅＧＯＮのヒトサイトメガロウイルス（ＨＣＭＶ）又はデングウイルス（ＤＥＮＶ）特異的核酸塩基配列の検出能を確認した。このとき、０．５μｇのＤＲｅＧＯＮ、及び２０ｐｍｏｌのＰＮＡ−ＵＳ５−２又はＰＮＡ−ＤＥＮＶを添加した。ここに、標的物質として、２０ｐｍｏｌのｍｉＲ−ＵＳ５−２又はｍｉＲ−ＤＥＮＶを添加した。その結果、反応時間ごとに測定した蛍光の変化を図１８に示す。図１８に示すように、反応時間に依存して、添加されたＨＣＭＶ又はＤＥＮＶ特異的核酸塩基配列に対する蛍光の強度が増加した。
【0071】
結論として、前記結果から分かるように、本発明の組成物は、マイクロアレイまたはＲＴ−ＰＣＲとは異なり、容易に標的配列を検出できるだけでなく、その濃度を間接的に確認するのに用いることができる。
【0072】
配列表フリーテキスト配列番号１：tcaacatcag tctgataagc ta
配列番号２：agctatgcca gcatcttgcc t
配列番号３：atttgacaaa ctgac
配列番号４：ggaggggact gagcctg
配列番号５：aactatacaa cctactacct ca
配列番号６：ctgccccaaa atgcct
配列番号７：gcggcatggc tggatc
配列番号８：acagagtttt acgatc
配列番号９：agacatcgtc acacctatca ta
配列番号１０：gcgtttcagc atattga
配列番号１１：uagcuuauca gacugauguu ga
配列番号１２：aggcaagaug cuggcauagc u
配列番号１３：gucaguuugu caaau
配列番号１４：caggcucagu ccccucc
配列番号１５：ugagguagua gguuguauag uu
配列番号１６：aggcauuuug gggcag
配列番号１７：gauccagcca ugccgc
配列番号１８：gaucguaaaa cucugu
配列番号１９：uaugauaggu gugacgaugu cu
配列番号２０：ucaauaugcu gaaacgc