特許 6874023 伝染性気管支炎ウイルスに対するワクチン

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】6874023

(24)【登録日】2021年4月23日

(45)【発行日】2021年5月19日

(54)【発明の名称】伝染性気管支炎ウイルスに対するワクチン

(51)【国際特許分類】

   A61K 39/215 20060101AFI20210510BHJP

   A61P 31/14 20060101ALI20210510BHJP

   C12N 7/04 20060101ALI20210510BHJP

   C12N 15/10 20060101ALN20210510BHJP

   C12N 15/50 20060101ALN20210510BHJP

【ＦＩ】

   A61K39/215ZNA

   A61P31/14

   C12N7/04

   !C12N15/10 200Z

   !C12N15/50

【請求項の数】20

【全頁数】125

(21)【出願番号】特願2018-565802(P2018-565802)

(86)(22)【出願日】2017年6月13日

(65)【公表番号】特表2019-521987(P2019-521987A)

(43)【公表日】2019年8月8日

(86)【国際出願番号】EP2017064442

(87)【国際公開番号】WO2017216180

(87)【国際公開日】20171221

【審査請求日】2018年12月26日

(31)【優先権主張番号】16174857.9

(32)【優先日】2016年6月16日

(33)【優先権主張国】EP

(73)【特許権者】

【識別番号】505258715

【氏名又は名称】ベーリンガー インゲルハイム フェトメディカ ゲーエムベーハー

【氏名又は名称原語表記】Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ Ｖｅｔｍｅｄｉｃａ ＧｍｂＨ

(74)【代理人】

【識別番号】100094569

【弁理士】

【氏名又は名称】田中 伸一郎

(74)【代理人】

【識別番号】100088694

【弁理士】

【氏名又は名称】弟子丸 健

(74)【代理人】

【識別番号】100103610

【弁理士】

【氏名又は名称】▲吉▼田 和彦

(74)【代理人】

【識別番号】100084663

【弁理士】

【氏名又は名称】箱田 篤

(74)【代理人】

【識別番号】100093300

【弁理士】

【氏名又は名称】浅井 賢治

(74)【代理人】

【識別番号】100119013

【弁理士】

【氏名又は名称】山崎 一夫

(74)【代理人】

【識別番号】100123777

【弁理士】

【氏名又は名称】市川 さつき

(74)【代理人】

【識別番号】100111796

【弁理士】

【氏名又は名称】服部 博信

(72)【発明者】

【氏名】ロッティエル ペトルス ヨゼーヒュス マリー

(72)【発明者】

【氏名】ファン ベールデン ステファヌス ヨハネス

(72)【発明者】

【氏名】フェルハイエ モニク エレーヌ

(72)【発明者】

【氏名】ムント エグベルト ジークフリート

【審査官】 吉田 知美

(56)【参考文献】

【文献】 Vaccine,2007,25(30),p.5558-5562

【文献】 PLoS One,2013,8(6),e67875

【文献】 Adv.Exp.Med.Biol.,2006,581,p.363-368

【文献】 J.Virol.Methods,2009,160(1-2),p.48-56

【文献】 Arch.Virol.,2016-MAY,161(5),p.1209-1216

【文献】 J.Virol.,2008,82(4),p.2013-2024

(58)【調査した分野】（Int.Cl.，ＤＢ名）

Ａ６１Ｋ ３９／００

ＣＡｐｌｕｓ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ／ＷＰＩＤＳ（ＳＴＮ）

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含むワクチンであって、
− ＯＲＦ５ｂ
が不活性化されている、ワクチン。

【請求項2】

− ＯＲＦ５ａ
が不活性化されている、請求項１に記載のワクチン。

【請求項3】

− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ
が不活性化されている、請求項１又は２に記載のワクチン。

【請求項4】

− ＯＲＦ３ａの前記不活性化が、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはこれがＳタンパク質の活性に影響せず、
− ＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはこれがＥタンパク質の活性に影響せず、または
− ＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはこれがＮタンパク質の活性に影響しない、
請求項１から３のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項5】

前記不活性化が、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、請求項１から４のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項6】

ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている、請求項１から５のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項7】

開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、請求項６に記載のワクチン。

【請求項8】

ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂの１〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、もしくは逆位になっている、または、ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂの１〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、もしくは逆位になっている、請求項３から７のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項9】

ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド（ｎｕｃｌｏｅｔｉｄｅ）、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内、またはＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、請求項３から８のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項10】

ＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂの１〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、もしくは逆位になっている、または、ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの１〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、もしくは逆位になっている、請求項１から９のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項11】

ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内、またはＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、請求項１から１０のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項12】

前記ＩＢＶが弱毒化されている、請求項１から１１のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項13】

前記ＩＢＶが組換え体である、請求項１から１２のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項14】

ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、請求項１から１３のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項15】

ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、請求項１から１３のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項16】

ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、請求項１から１３のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項17】

対象を免疫化するための、請求項１から１６のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項18】

対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防するための、請求項１から１６のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項19】

対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減するための、請求項１から１６のいずれか１項に記載のワクチン。

【請求項20】

皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、請求項１７から１９のいずれか１項に記載のワクチン。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

配列表
本願は、連邦規則集第３７巻第１．８２１条〜第１．８２５条に従う配列表を含む。本願に付随する配列表は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。

【背景技術】

【0002】

鳥コロナウイルスである伝染性気管支炎ウイルス（ＩＢＶ）は、コロナウイルス科、ニドウイルス目におけるガンマコロナウイルスのプロトタイプである。伝染性気管支炎ウイルスは、主にニワトリの上気道上皮に感染し、呼吸器疾患を引き起こし、一般に二次細菌性病原体が合併する（Cook et al 2012. Avian Pathol. 41 :239-250）。いくつかのＩＢＶ株は、さらに腎尿細管、卵管および胃腸管の部分に影響し、これらの器官系における病理学的病変および臨床徴候をもたらす。このウイルスは、商用ニワトリおよび自家飼育ニワトリの両方において世界的な存在感を有する。その高い遺伝的多様性に起因して、ＩＢＶは多種多様な遺伝子型、血清型および防御型において識別される。ＩＢＶは現在、家禽産業において最も経済的に重要なウイルス病原体の１つと認識されている。

【0003】

伝染性気管支炎ウイルスは、２７．６ｋｂのプラス鎖１本鎖ＲＮＡゲノムを有するエンベロープウイルスである（Cavanagh 2007. Vet. Res. 38:281-297）。このウイルスゲノムにおける最初の３分の２は大きなコード領域（遺伝子１とも表される）を含み、２つのオープンリーディングフレーム１ａおよび１ｂへと分割されるが、これらは、ＲＮＡ複製、編集、および転写に関わる１５の非構造タンパク質をコードする。このウイルスゲノムにおける最後の３分の１は、以下の構造タンパク質をコードする：スパイクタンパク質（Ｓ、遺伝子２によってコードされる）、エンベロープタンパク質（Ｅ、遺伝子３ｃによってコードされる）、膜タンパク質（Ｍ、遺伝子４によってコードされる）、およびヌクレオカプシドタンパク質（Ｎ、遺伝子６によってコードされる）。タンパク質Ｓ、ＥおよびＭはウイルスエンベロープの部分である一方、タンパク質ＮはウイルスＲＮＡと共にリボヌクレオタンパク質コアを形成する。スパイクタンパク質は二量体または三量体の膜貫通タンパク質であり、これは２つのサブユニットであるＳ１およびＳ２へとタンパク質分解により開裂する。大量にグリコシル化されたＳ１ドメインは、スパイクタンパク質の「頭部」を形成し、受容体結合ドメインを含むが、これは宿主細胞表面上の２，３−結合型シアル酸と相互作用する（Promkuntod et al. 2014. Virology. 448:26-32）。Ｓ２ドメインは、エクトドメインにおける残りの部分（「ストーク」）、膜貫通ドメインおよび細胞質局在エンドドメインを含む。コロナウイルスのスパイクタンパク質は、主に宿主種特異的親和性を決定する（Kuo et al. 2000. J. Virol. 74: 1393-1406）。

【0004】

コロナウイルスの構造遺伝子の間に散らばって、可変な数のグループ特異的アクセサリー遺伝子が局在している（Liu et al 2014. Antiviral Res. 109:97-109）。これらの遺伝子のほとんどが非構造的なものであり、それらの発現は、胚形成したニワトリの卵または細胞培養のいずれにおいても、ウイルス複製のために必須ではない。ＩＢＶゲノムは、アクセサリー遺伝子３および５を含み、これらはそれぞれ、タンパク質３ａおよび３ｂ、ならびに５ａおよび５ｂをコードする（Britton et al 2006; Adv Exp Med Bio1.;581 :363-8）。さらに、遺伝子４および５の間の遺伝子間領域（ＩＲ）には、オープンリーディングフレームが局在している（Bentley et al2013; J.Virol. 87:2128-2136）。
遺伝子３は機能的にトリシストロン性であり、３つのタンパク質、３ａ、３ｂ、および３ｃをコードする。後者は、ＩＢＶにおける構造的Ｅタンパク質である。遺伝子５は機能的にバイシストロン性であり、２つのタンパク質、５ａおよび５ｂをコードする（Britton et al 2006; Adv Exp Med Bio1.;581 :363-8）。ＩＢＶのアクセサリータンパク質３ａおよび３ｂは、近年、インビトロでＩ型インターフェロン応答の遅延した活性化を誘導することが見出され、ＩＦＮによって誘導される細胞性抗ウイルス状態に対するＩＢＶの抵抗性に、タンパク質３ａがさらに関与している（Kint et al2015: J.Virol. 89:1156-1167; Kint et al 2015: J.Virol. doi: NI.01057-15.）。アクセサリータンパク質５ｂは宿主シャットオフに寄与し、これによって、中でもＩ型ＩＦＮの翻訳を阻害する（Ｋｉｎｔ、博士論文 ２０１５年）。

【0005】

Britton et al 2006（Adv Exp Med Bio1.;581 :363-8）は、ＩＢＶの３ａ、３ｂ、５ａ、および５ｂタンパク質の発現を欠失させ、これらの遺伝子産物のいずれも、それ自体の複製には必須でないこと、およびこれらがアクセサリータンパク質と考えることができることを示した。さらに、Bentley et al. 2013（PLOS One. 8(6):e67875）は、ＯＲＦ３ａおよび３ｂのｈＲｌｕｃによる置換、ならびに遺伝子５の、ｈＲｌｕｃのＩＢＶにコドン最適化されたバージョンによる置換を開示している。しかし、遺伝子３ａおよび３ｂまたは遺伝子５の置換が、野生型ＩＢＶとは異なるいずれかの表現型（弱毒化のようなもの）をもたらし得ることは、示されても、示唆されてもいなかった。むしろ、Ｂｅｎｔｌｅｙらは、ＩＢＶゲノム内にマーカー遺伝子を導入することができるかどうかに焦点を当てている。これに関して、Ｂｅｎｔｌｅｙらは、組換えＩＢＶの安定性が、置換されているゲノム領域に依存して変動したことを開示している。

【0006】

今日までに、最も広く使用された弱毒化生ＩＢＶワクチン株は、オランダにおいて１９６０年代に遡って開発されたものであり、これはマサチューセッツ（Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）様ＩＢＶ株の連続継代による（Bijlenga et al 2004; Avian Pathol. 33:550-557）。継代の間、ウイルスは胚形成した卵に馴化するようになり、第３０継代目までに胚の矮化が観察され、より多い継代において胚の死亡が観察された。５１継代後、ウイルスは感染後４８時間（４８ｈｐｉ）以内に胚死を引き起こしたが、第５２継代（Ｈ５２と呼ばれる）はなお、ひな鳥に対して毒性が高すぎた。さらに６８継代後、ウイルス（Ｈ１２０として知られる）は、若いひな鳥において安全に使用するのに十分弱毒化されたが、その一方でなお、防御的免疫応答を誘導している。しかし、１９７０年代における新規なＩＢＶ血清型の出現であって、これについて伝統的なマサチューセッツ様ワクチンが十分保護しなかったものによって、新規な弱毒化生ワクチンの開発、および複数の血清型に対して防御的免疫を潜在的に誘導する他のワクチンタイプに向けた研究が促進された（Cook et al 2012. Avian Pathol. 41 :239-250）。今日において、最も広く使用されているＩＢＶワクチンはなお、胚形成した卵における連続継代によって弱毒化されているが、これは多大な労力を要し、時間がかかるものである。さらに、このタイプの弱毒化はランダムなものであり、その結果はむしろ予測不可能である。

【0007】

したがって、連続継代ではない他の方法が、ＩＢＶワクチンを開発するために必要である。いくつかの研究グループが既に、組換え技術によってＩＢＶゲノムを操作するためのシステムを独立に開発した（Youn, et ai 2005. Virology. 332:206-215; Zhou et al 2013. Vet. Microbiol. 162:53-61）。しかし、これらすべての逆遺伝学システムは、非病原性細胞培養馴化ＩＢＶ株であるボーデット（Ｂｅａｕｄｅｔｔｅ）、または高度に弱毒化されたＩＢＶワクチン株であるＨ１２０に基づくものである。これらのＩＢＶ株は非毒性であり（Bijlenga et al 2004. Avian Pathol. 33:550-557）、防御的免疫は、病原性ＩＢＶ株から毒性因子を導入することによってのみ誘導することができる可能性がある。このアプローチは安全性の懸念を呼び起こし得るものであり、組換えＩＢＶワクチンの登録にはまだ至っていなかった。

【発明の概要】

【0008】

したがって、新規で極めて有効なＩＢＶワクチン、ならびにＩＢＶを弱毒化するための代替的な戦略のそれぞれについて、必要性が存在する。

【0009】

発明の詳細な説明
本発明の態様が記載される前に、本明細書および添付した特許請求の範囲において使用される単数形「１つの（ａ）」、「１つの（ａｎ）」、および「その（ｔｈｅ）」は、文脈が明瞭に逆の指示をしない限り、複数の指示対象を含むことに注意しなければならない。よって、例えば、「抗原」への言及は複数の抗原を含み、「ウイルス」への言及は、１つまたは複数のウイルスおよび当業者に公知のその等価体への言及であり、その他も同様である。他に定義されない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野における当業者によって一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載されたものと同じかまたは均等なあらゆる方法および材料を、本発明の実施および試験において使用することができ、好ましい方法、デバイス、および材料を、次に記載する。本明細書において言及されるすべての刊行物は、それらの刊行物において報告された、本発明に関連して使用され得る細胞系、ベクター、および方法論を記載ならびに開示する目的のために、参照により本明細書に組み込まれる。本明細書における何物も、先行発明によるそのような開示に本発明が先行する資格がないことを自認するものとして解釈されるべきではない。

【0010】

組成物
本発明は、先行技術に内在する課題を解決し、本技術分野の水準における際立った進歩を提供するものである。
概して、本発明は、
− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ、および／または
− ＯＲＦ５ａ、および／または
− ＯＲＦ５ｂ
が不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を提供する。

【0011】

よって、本発明はまた、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている
ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）ＩＢＶを提供する。
よって、本発明は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を提供する。
よって、本発明は、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を提供する。
よって、本発明は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を提供する。

【0012】

さらに、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ、および／または
− ＯＲＦ５ａ、および／または
− ＯＲＦ５ｂ
が不活性化されている免疫原性組成物を提供する。
よって、本発明はまた、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている
免疫原性組成物を提供する。

【0013】

よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。

【0014】

よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ａが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ５ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。

【0015】

よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ５ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。

【0016】

よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ５ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。

【0017】

よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ５ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。

【0018】

よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂおよびＯＲＦ３ａが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ５ａまたはＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ３ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ５ａまたはＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ３ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。
よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物を提供する。例において示されるように、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物は、安全および有効であることが証明された。

【0019】

先行技術のＩＢＶワクチンは、いくつかの不利な点を有する。不活性化されたワクチンは、概して、液性免疫応答のみ（限定された細胞性免疫応答を除く）を与えるものであり、不活性化されたＩＢＶワクチンが使用される場合には、概して追加ワクチン接種が必須である。この理由のため、修飾ＩＢＶ生ワクチン（液性および細胞性免疫応答を誘導する）が、概して好ましい選択となり得る。しかし、これまでに開発された修飾ＩＢＶ生ワクチンは、異なる欠点を有する。ボーデットＩＢＶ株（非病原性細胞培養馴化ＩＢＶ株）は、弱毒化されすぎている。Ｈ５２のような他の株は十分に弱毒化されておらず、ワクチン接種後に気道の損傷を生じ得る。さらに、最も広く使用されている修飾ＩＢＶ生ワクチンは、胚形成した卵における連続継代によって弱毒化されたものであり、これは多大な労力を要し、時間がかかるものである。さらに、このタイプの弱毒化はランダムなものであり、その結果はむしろ予測不可能である。ニワトリにおいて継代されている間に、毒性へと復帰するリスクがある。よって、安全および有効な、新規な組換え修飾ＩＢＶ生ワクチンへの必要性が存在する。

【0020】

さらに、二重突然変異体（ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化；ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの不活性化）がなお過剰弱毒化されていなかったとは予測されていなかったが、それは、多すぎる（ｔｏ ｍａｎｙ）欠失／不活性化が導入された場合、ウイルスは過剰弱毒化されるようになり得、このことは、ワクチン接種された宿主において、防御的免疫応答を導入するための不十分な能力を生じるからである。「過剰弱毒化」とも呼ばれるこの現象は、文献において、典型的にはRennick et al 2015（J Virol. 2015 Feb;89(4):2192-200）において、低い免疫応答を誘導した１つの麻疹ウイルス突然変異体について記載された。別の例がChen et al 2016（Arch Virol. 2016, 161:77-86）によって与えられたが、はブタ繁殖・呼吸障害症候群ウイルスが細胞培養中であまりに頻繁に継代され、ブタにおける低すぎる免疫性によって示された過剰弱毒化をもたらした。Manservigi et al 2010（Open Virol J. 2010; 4: 123-156）は、単純ヘルペスウイルス１のゲノムにおける多すぎる欠失が、その価値を否定する過剰弱毒化を生じ得るという懸念を提起した。したがって、二重突然変異体（ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化；ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの不活性化）が、単一突然変異体（ＯＲＦ３ａの不活性化；ＯＲＦ３ｂの不活性化；ＯＲＦ５ａの不活性化；ＯＲＦ５ｂの不活性化）と比較して、なお防御的免疫応答を誘導することができたことは、驚くべきことだった。さらにより驚くべきことに、４つすべてのＯＲＦ（ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ）における不活性化を有する欠失突然変異体は、過剰弱毒化表現型を示さなかった。

【0021】

用語「免疫原性組成物」は、少なくとも１つの抗原を含む組成物を意味し、これは前記免疫原性組成物が投与された宿主における免疫学的応答を誘発する。そのような免疫学的応答は、本発明の免疫原性組成物に対する細胞性および／または抗体媒介性免疫応答であってよい。好ましくは、免疫原性組成物は免疫応答を誘導し、より好ましくは、ＩＢＶ感染における１つまたは複数臨床徴候に対して防御的免疫を付与する。宿主は「対象」とも記載される。好ましくは、本明細書に記載または言及された宿主または対象のいずれかは、鳥または家禽である。

【0022】

通常、「免疫学的応答」は、本発明の免疫原性組成物に含まれる抗原または抗原（複数）に特異的に向けられた、１つまたは複数の以下の効果：抗体、Ｂ細胞、ヘルパーＴ細胞、サプレッサーＴ細胞、および／または細胞毒性Ｔ細胞および／またはガンマ−デルタＴ細胞の産生または活性化を含むが、これらに限定されない。好ましくは、宿主は、防御的免疫学的応答または治療的応答のいずれかを示し得る。

【0023】

「防御的免疫学的応答」または「防御的免疫」は、感染している宿主によって通常示される臨床徴候の低減もしくは欠如、より速やかな回復時間および／もしくはより低下した感染性の持続期間、または感染している宿主の組織もしくは体液もしくは排出物における低下した病原体力価のいずれかによって実証され得る。
新たな感染に対する抵抗性が強化されおよび／または疾患の臨床的重症度が低減し得るように、宿主が防御的免疫学的応答を示す場合、免疫原性組成物は「ワクチン」と記載される。
用語「ＩＢＶ」は、当業者によく知られている伝染性気管支炎ウイルスを意味する。用語「ＩＢＶ」は、伝染性気管支炎ウイルスにおけるすべての株、遺伝子型、防御型、および血清型を包含する。

【0024】

用語「ＯＲＦ３ａ」および「ＯＲＦ３ｂ」は、ＩＢＶの遺伝子３によってコードされるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）３ａおよび３ｂを意味する。ＩＢＶの遺伝子３は機能的にトリシストロン性であり、３つのタンパク質３ａ、３ｂ、および３ｃをコードする。タンパク質３ｃは、Ｅタンパク質とも表される。ＯＲＦ３ａは、配列番号２９に示されるように、開始コドン（ＡＵＧ）から停止（ｓｔｏｐｐ）コドン（ＵＡＡ）まで１７４ヌクレオチドの長さを有する。しかし、ＯＲＦ３ａにおけるＡＵＧの最初のヌクレオチド（Ａ）は、ＯＲＦＳ（スパイク）の停止コドン（Ａ）における最後のヌクレオチドであり、そのため、ＯＲＦ３ａは、１つのヌクレオチド内でＯＲＦＳと重複している。さらに、ＯＲＦ３ａの停止コドンの最後のヌクレオチド（Ａ）は、ＯＲＦ３ｂのＡＵＧの最初のヌクレオチド（Ａ）であり、そのため、ＯＲＦ３ａは、１つのヌクレオチド内でＯＲＦ３ｂと重複している。ＯＲＦ３ｂは、配列番号３０に示されるように、開始コドン（ＡＵＧ）から停止コドン（ＵＡＡ）まで１９５ヌクレオチドの長さを有する。しかし、ＯＲＦ３ｂは、ＯＲＦ３ｃと２０ヌクレオチド重複している。

【0025】

用語「ＯＲＦ５ａ」および「ＯＲＦ５ｂ」は、ＩＢＶの遺伝子５によってコードされるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）５ａおよび５ｂを意味する。遺伝子５は機能的にバイシストロン性であり、２つのタンパク質５ａおよび５ｂをコードする。ＯＲＦ５ａは、配列番号３１に示されるように、開始コドン（ＡＵＧ）から停止コドン（ＵＧＡ）まで１９８ヌクレオチドの長さを有する。しかし、ＯＲＦ５ａは、ＯＲＦ５ｂと４ヌクレオチド重複している。ＯＲＦ５ｂは、配列番号３２に示されるように、開始コドン（ＡＵＧ）から停止コドン（ＵＡＧ）まで２４９ヌクレオチドの長さを有する。しかし、ＯＲＦ５ｂは、ＯＲＦＮと５８ヌクレオチド重複している。

【0026】

用語「不活性化されている」は、ＯＲＦ３ａ、ＯＲＦ３ｂ、ＯＲＦ５ａ、およびＯＲＦ５ｂ内における突然変異を意味する。用語突然変異は、前記タンパク質をコードするウイルスＲＮＡにおける、前記コードされたタンパク質の変化をもたらす修飾を含む。用語変異は、置換（１つまたは複数のヌクレオチド／塩基対の置換）、欠失（１つ、複数またはすべてのヌクレオチド／塩基対の除去）、および／または挿入（１つまたは複数のヌクレオチド／塩基対の付加）に関するが、これらに限定されない。よって、用語突然変異は、点突然変異（単一ヌクレオチド突然変異）またはより大きな突然変異であって、例えばコード（および／または非コード）ヌクレオチド／塩基対の部分が欠失している（部分的欠失）、もしくはすべてのコード（および／または非コード）ヌクレオチド／塩基対が欠失している（完全欠失）、置換されている、および／または付加的なコード（および／または非コード）ヌクレオチド／塩基対が挿入されているものを含むがこれらに限定されない突然変異を含む。用語突然変異は、コードヌクレオチド／塩基対内における突然変異、制御性ヌクレオチド／塩基対内のような非コードヌクレオチド／塩基対内における突然変異、ならびにコードヌクレオチド／塩基対および非コードヌクレオチド／塩基対の両方内における突然変異を含むことが理解されるべきである。さらに、用語突然変異はまた、コードヌクレオチド／塩基対の一部もしくはすべての逆位、もしくは非コードヌクレオチド／塩基対の一部もしくはすべての逆位、またはこれらの組み合わせのような、ヌクレオチド／塩基対（コードおよび／または非コード）の逆位を含む。さらに、用語突然変異はまた、コードヌクレオチド／塩基対の一部もしくはすべての再配置、もしくは非コードヌクレオチド／塩基対の一部もしくはすべての再配置、またはこれらの組み合わせのような、ヌクレオチド／塩基対（コードおよび／または非コード）の再配置を含む。本明細書で使用される場合、突然変異は単一突然変異または複数突然変異であってよく、したがって、しばしば、用語「突然変異（複数可）」が使用され、単一突然変異および複数突然変異の両方に関連する。前記突然変異は、コード配列における変化に起因して、修飾された発現をするタンパク質を生じ得る。しかし、用語突然変異は当業者によく知られているものであり、当業者は容易に突然変異を生成することができる。

【0027】

好ましくは、ＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化は、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはＥタンパク質（ＯＲＦ３ｃによってコードされる）の活性に影響しない。よって、ＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ発現（３ｂのＲＮＡもしくは３ａおよび３ｂのＲＮＡ、ならびに／または３ｂのタンパク質もしくは３ａのタンパク質および３ｂのタンパク質）および／または前記タンパク質の活性が低減される（または消失する）一方で、ＯＲＦ３ｃの発現および／またはＥタンパク質の活性は影響されない。よって、ＯＲＦ３ｃの発現および／またはＥタンパク質の活性が影響されない限りにおいて、ＯＲＦ３ｃの開始コドン（ＡＵＧ）およびＯＲＦ３ｂの停止コドン（ＵＡＡ）の重複領域内における欠失、トランケーション、置換、挿入、逆位、または再配置が包含されることが理解されるべきである。

【0028】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化は、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはＥタンパク質の活性に影響しない。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはこれがＥタンパク質の活性に影響しないＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0029】

好ましくは、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化は、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはこれは、ＩＢＶにおけるＳタンパク質にのみ（ｓｏｌｅｙ）基づく防御的免疫応答によって示されるＳタンパク質の活性に影響しない。よって、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ発現（３ａのＲＮＡもしくは３ａおよび３ｂのＲＮＡ、ならびに／または３ａのタンパク質もしくは３ａのタンパク質および３ｂのタンパク質）および／または前記タンパク質の活性が低減される（または消失する）一方で、ＯＲＦＳの発現および／またはＳタンパク質の活性は影響されない。好ましくは、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化は、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）と重複しているスパイク（Ｓ）タンパク質の終末コドン（ＵＡＡ）を無傷で残す。このことは、ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡＵＧのＡを不活性化しないことによって、またはＯＲＦＳにおける最後の２つのヌクレオチド（ＵＡ）の３’の最初のヌクレオチドが、終末コドン（ＵＡＡまたはＵＡＧ）を有するようにＡまたはＧであるような方法において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂを不活性化することによって行われてよい。あるいは、ＯＲＦＳの新たな停止コドンが、欠失、トランケーション、置換、挿入、逆位または再配置によって生成されて、ＵＡＡ、ＵＡＧまたはＵＧＡ（停止コドン）の読みを与えてよい。よって、ＯＲＦＳの発現および／または活性が影響されない限りにおいて、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）およびＯＲＦＳの停止（ＵＡＡ）における重複領域内における欠失、置換、挿入、逆位または再配置が包含されることが理解されるべきである。

【0030】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化は、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはＳタンパク質の活性に影響しない。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはこれがＳタンパク質の活性に影響しないＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0031】

好ましくは、ＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの前記不活性化は、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはＮタンパク質（ＯＲＦＮによってコードされる）の活性に影響しない。よって、ＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ発現（５ｂのＲＮＡもしくは５ａおよび５ｂのＲＮＡ、ならびに／または５ｂのタンパク質もしくは５ａのタンパク質および５ｂのタンパク質）および／または前記タンパク質の活性が低減される（または消失する）一方で、ＯＲＦＮの発現および／またはＮタンパク質の活性は影響されない。好ましくは、ＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの不活性化は、Ｎタンパク質の開始コドン（ＡＵＧ）を無傷で残し、そしてしたがってＯＲＦＮもまたそうである。しかし、ＯＲＦＮの発現および／またはＮタンパク質の活性が影響されない限りにおいて、ＯＲＦＮの開始コドン（ＡＵＧ）およびＯＲＦ５ｂの停止（ＵＡＡ）における重複領域内における欠失、トランケーション、置換、挿入、逆位または再配置が包含されることが理解されるべきである。

【0032】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの前記不活性化は、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはＮタンパク質の活性に影響しない。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ｂまたはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはこれがＮタンパク質の活性に影響しないＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0033】

本発明の一態様において、前記不活性化は、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ３ｂの部分的な欠失ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ３ｂの部分的なトランケーションならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ３ｂの部分的な逆位ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ３ｂの部分的な再配置ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
前記不活性化が、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ３ｂの部分的な欠失ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ３ｂの部分的なトランケーションならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ３ｂの部分的な逆位ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ３ｂの部分的な再配置ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、ＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。
用語「不活性化されている」は、タンパク質（および／またはＲＮＡ）の低減もしくは消失のいずれかである発現および／またはタンパク質の低減した活性を意味する。

【0034】

用語「不活性化されている」は、ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂ（３ａおよび／もしくは３ｂのＲＮＡならびに／または３ａのタンパク質および／もしくは３ｂのタンパク質）ならびに／またはＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂ（５ａおよび／もしくは５ｂのＲＮＡならびに／または５ａのタンパク質および／もしくは５ｂのタンパク質）の、低減した（または消失した）発現を包含する。低減した発現は、低減したＲＮＡ転写に加えて、低減したタンパク質発現の両方を包含することが理解されるべきである。好ましくは、ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂ（３ａおよび／もしくは３ｂのＲＮＡならびに／または３ａのタンパク質および／もしくは３ｂのタンパク質）ならびに／またはＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂ（５ａおよび／もしくは５ｂのＲＮＡならびに／または５ａのタンパク質および／もしくは５ｂのタンパク質）の発現は、本発明のＩＢＶにおいて、野生型ＩＢＶウイルスにおける発現と比較した場合、ＲＮＡおよび／またはタンパク質により５〜１０％、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％、８０〜９０％、９０〜９５％、９５〜９９％またはそれより多く低減している。より好ましくは、ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂ（３ａおよび／もしくは３ｂのＲＮＡならびに／または３ａのタンパク質および／もしくは３ｂのタンパク質）ならびに／またはＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂ（５ａおよび／もしくは５ｂのＲＮＡならびに／または５ａのタンパク質および／もしくは５ｂのタンパク質）の発現は、本発明のＩＢＶにおいて、野生型ＩＢＶウイルスにおける発現と比較した場合、ＲＮＡおよび／またはタンパク質により５０〜１００％、６０〜１００％、７０〜１００％ ８０〜１００％または９０〜１００％低減している。さらにより好ましくは、ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂ（３ａおよび／もしくは３ｂのＲＮＡならびに／または３ａのタンパク質および／もしくは３ｂのタンパク質）ならびに／またはＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂ（５ａおよび／もしくは５ｂのＲＮＡならびに／または５ａのタンパク質および／もしくは５ｂのタンパク質）の発現は、本発明のＩＢＶにおいて、野生型ＩＢＶウイルスにおける発現と比較した場合、ＲＮＡおよび／またはタンパク質により８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％低減している。

【0035】

好ましくは、ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂ（３ａおよび／もしくは３ｂのＲＮＡならびに／または３ａのタンパク質および／もしくは３ｂのタンパク質）ならびに／またはＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂ（５ａおよび／もしくは５ｂのＲＮＡならびに／または５ａのタンパク質および／もしくは５ｂのタンパク質）の発現は、本発明のＩＢＶにおいて、野生型ＩＢＶウイルスにおける発現と比較した場合、ＲＮＡおよび／またはタンパク質により約１〜約１００倍、約５〜約８０倍、約２０〜約８０倍、約１〜約１０倍、または約１〜約５倍、または約４０〜約８０倍、または１、２、３、４、５、７、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５もしくは１００倍低減している。

【0036】

用語「ＲＮＡ」は、あらゆるリボ核酸を意味する。この用語は、一本鎖に加えて二本鎖のＲＮＡを包含する。本発明のＲＮＡは、単離されたＲＮＡ（すなわち、その天然の状態から単離されたもの）および遺伝的に修飾された形態を包含する。さらに、メチル化ＲＮＡのような天然に存在する修飾ＲＮＡまたはビオチン化ＲＮＡのような人為的修飾ＲＮＡを含む、化学的に修飾されたＲＮＡもまた含まれる。用語「ＲＮＡ」はまた、特に４つの生物学的に存在するヌクレオチド／塩基（アデニン、グアニン、シトシンおよびウラシル）以外の塩基から構成されるＲＮＡを含む。本発明のＲＮＡは、これが上記で言及されたタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）をコードすべきであるという点で特徴付けられる。

【0037】

用語「核酸」または「核酸配列」は、ＤＮＡ分子、ＲＮＡ分子、ｃＤＮＡ分子または誘導体を含むポリヌクレオチドを意味する。この用語は、一本鎖に加えて二本鎖のポリヌクレオチドを包含する。本発明の核酸は、単離されたポリヌクレオチド（すなわち、その天然の状態から単離されたもの）および遺伝的に修飾された形態を包含する。さらに、グリコシル化もしくはメチル化ポリヌクレオチドのような天然に存在する修飾ポリヌクレオチドまたはビオチン化ポリヌクレオチドのような人為的修飾ポリヌクレオチドを含む、化学的に修飾されたポリヌクレオチドもまた含まれる。さらに、用語「核酸」および「ポリヌクレオチド」は交換可能であり、あらゆる核酸を意味する。用語「核酸」および「ポリヌクレオチド」は、また、特に５つの生物学的に存在する塩基（アデニン、グアニン、チミン、シトシンおよびウラシル）以外の塩基から構成される核酸を含む。

【0038】

用語「タンパク質」、「アミノ酸」および「ポリペプチド」は、交換可能に使用される。用語「タンパク質」は、天然に存在するアミノ酸に加えてその誘導体から構成されるアミノ酸の配列を意味する。天然に存在するアミノ酸は、本技術分野においてよく知られており、生化学の標準的な教科書に記載されている。アミノ酸配列の中で、アミノ酸はペプチド結合によって結合している。さらに、アミノ酸配列における２つの末端は、カルボキシル末端（Ｃ末端）およびアミノ末端（Ｎ末端）と呼ばれる。用語「タンパク質」は、本質的に精製されたタンパク質、またはさらに他のタンパク質を含むタンパク質調製物を包含する。さらに、この用語はまた、タンパク質断片に関する。さらに、これは化学的に修飾されたタンパク質を含む。そのような修飾は、人為的修飾、またはリン酸化、グリコシル化、ミリスチル化その他のような天然に存在する修飾であってもよい。

【0039】

ＯＲＦ３ａおよび／もしくはＯＲＦ３ｂ（３ａおよび／もしくは３ｂのＲＮＡならびに／または３ａのタンパク質および／もしくは３ｂのタンパク質）ならびに／またはＯＲＦ５ａおよび／もしくはＯＲＦ５ｂ（５ａおよび／もしくは５ｂのＲＮＡならびに／または５ａのタンパク質および／もしくは５ｂのタンパク質）の低減した発現を測定する方法は、当業者によく知られている。そのような方法は、ＲＴ−ＰＣＲ、リアルタイムＲＴ−ＰＣＲ、ノザンブロット、ウェスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡ、免疫蛍光、免疫組織化学、インシチュハイブリダイゼーションを含むが、これらに限定されない。

【0040】

しかし、用語「不活性化されている」はまた、タンパク質（３ａタンパク質および／もしくは３ｂタンパク質ならびに／または５ａタンパク質および／もしくは５ｂタンパク質）の低減した（または消失した）活性を包含する。好ましくは、本発明のＩＢＶにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性は、野生型ＩＢＶウイルスにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性と比較した場合、５〜１０％、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％、８０〜９０％、９０〜９５％、９５〜９９％低減している。より好ましくは、本発明のＩＢＶにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性は、野生型ＩＢＶウイルスにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性と比較した場合、５０〜１００％、６０〜１００％、７０〜１００％ ８０〜１００％または９０〜１００％低減している。さらにより好ましくは、本発明のＩＢＶにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性は、野生型ＩＢＶウイルスにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性と比較した場合、８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％または１００％低減している。

【0041】

好ましくは、本発明のＩＢＶにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性は、野生型ＩＢＶウイルスにおけるタンパク質（３ａタンパク質および／または３ｂタンパク質および／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）の活性と比較した場合、約１〜約１００倍、約５〜約８０倍、約２０〜約８０倍、約１〜約１０倍、または約１〜約５倍、または約４０〜約８０倍、または１、２、３、４、５、７、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５もしくは１００低減している。

【0042】

ＩＢＶのアクセサリータンパク質３ａおよび３ｂは、近年、インビトロでＩ型インターフェロン応答の遅延した活性化を引き起こすことが見出され、ＩＦＮによって誘導される細胞性抗ウイルス状態に対するＩＢＶの抵抗性に、タンパク質３ａがさらに関与している（Kint et al2015: J.Virol. 89:1156-1167; Kint et al 2015: J.Virol. doi: NI.01057-15.）。アクセサリータンパク質５ｂは宿主細胞シャットオフに寄与し、これによって、中でもＩ型ＩＦＮの翻訳を阻害する（Ｋｉｎｔ、博士論文 ２０１５年）。

【0043】

用語「不活性化されている」は、低減されたまたは阻害された細胞性インターフェロン免疫応答を有する組換えＩＢＶを包含する（細胞性インターフェロン免疫応答に完全に干渉することができないＩＢＶ）。好ましくは、この組換えＩＢＶは、インターフェロン発現および／または活性への干渉を低減または阻害した。好ましくは、１つもしくは２つのタイプのインターフェロン（ＩＦＮ）の発現および／または活性が低減または阻害される。本発明の一態様において、組換えＩＢＶは、ＩＦＮ−［アルファ］の発現および／または活性に対する影響を引き起こす。別の態様において、ＩＦＮ−［ベータ］の発現および／または活性が影響される。別の態様において、ＩＦＮ−［ガンマ］の発現および／または活性が影響される。好ましくは、ＩＦＮ−［アルファ］および／またはＩＦＮ−［ベータ］および／またはＩＦＮ−［ガンマ］の発現および／または活性は、例えば同じ条件下における野生型細胞または動物のようなＩＦＮ応答性システムにおける対照（例えばＰＢＳ、またはインターフェロンアンタゴニスト活性のないタンパク質）と比較した場合、インターフェロンアンタゴニスト活性を有するタンパク質、ポリペプチド等により５〜１０％、１０〜２０％、２０〜３０％、３０〜４０％、４０〜５０％、５０〜６０％、６０〜７０％、７０〜８０％、８０〜９０％、またはそれより多く低減している。より好ましくは、ＩＦＮ−［アルファ］および／またはＩＦＮ−［ベータ］および／またはＩＦＮ−［ガンマ］の発現および／または活性は、例えば同じ条件下におけるＩＦＮ応答性システムにおける対照（例えばＰＢＳ、またはインターフェロンアンタゴニスト活性のないタンパク質）と比較した場合、インターフェロンアンタゴニスト活性を有するタンパク質、ポリペプチド等により約１〜約１００倍、約５〜約８０倍、約２０〜約８０倍、約１〜約１０倍、または約１〜約５倍、または約４０〜約８０倍、または１、２、３、４、５、７、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５もしくは１００倍低減している。低減または阻害されたインターフェロン発現および／活性を測定する方法は、当業者によく知られている。
本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａは完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａは完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0044】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａは完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａは完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0045】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａは完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａは完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0046】

用語「完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は、完全または部分的な欠失、完全または部分的な置換、および完全または部分的な逆位を包含する。用語「完全」は、全ＯＲＦが、そのＯＲＦの開始コドンから停止コドンまで影響されることを意味する。好ましくは、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ５ａが完全に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。しかし、用語「部分的」は、全ＯＲＦの一部のみが影響されることを意味する。好ましくは、ＯＲＦ３ａ、ＯＲＦ３ｂ、ＯＲＦ５ａ、ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。より好ましくは、ＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。最も好ましくは、ＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ３ｃ（Ｅタンパク質をコードしている）およびＯＲＦＮ（Ｎタンパク質をコードしている）の発現ならびに／またはＥタンパク質およびＮタンパク質の活性に影響しないために、部分的に欠失している。
本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａは完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂは部分的に欠失している。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａは完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂは部分的に欠失しているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0047】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａは完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ５ｂは部分的に欠失している。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａは完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ５ｂは部分的に欠失しているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。
本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａは完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂは部分的に欠失している。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａは完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂは部分的に欠失しているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0048】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ、および／または
− ＯＲＦ５ａ、および／または
− ＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0049】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｂの開始コドンが不活性化されている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｂの開始コドンが不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0050】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が不活性化されている。よって、ＡＵＧの不活性化は、ＡＵＧ内における１、２、または３個のヌクレオチドの不活性化／突然変異を包含することが理解されなければならない。したがって、開始コドンＡＵＧの不活性化は、Ａの突然変異および／またはＵの突然変異および／またはＧの突然変異を包含する。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0051】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化は、欠失、置換または逆位である。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が、欠失、置換または逆位によって不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0052】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0053】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が不活性化されている。よって、ＡＵＧの不活性化は、ＡＵＧ内における１、２、または３個のヌクレオチドの不活性化／突然変異を包含することが理解されなければならない。したがって、開始コドンＡＵＧの不活性化は、Ａの突然変異および／またはＵの突然変異および／またはＧの突然変異を包含する。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0054】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化は、欠失、置換または逆位である。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が、欠失、置換または逆位によって不活性化されているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0055】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0056】

用語「開始コドンの５’末端からトランケートされている」は、５’末端におけるＯＲＦのトランケーションを意味する。用語「５’末端」は既に、他の箇所に記載された。用語「トランケートされたまたはトランケーション」は、ＯＲＦ内における１つまたは複数のヌクレオチド／塩基の欠失を意味する。よって、ＯＲＦの３’末端の部分は保持される一方、ＯＲＦの５’末端領域の部分は欠失する。しかし、５’末端におけるトランケーションは、対応するタンパク質内における１つまたは複数のアミノ酸の欠失、またはＯＲＦにおけるフレームシフトを生じ得、これは野生型のタンパク質とは異なるコード領域を生じる。しかし、５’末端におけるトランケーションは、開始コドンがトランケートされるために、タンパク質の発現をまったく生じ得ない可能性がある。
本明細書で使用される用語「開始コドンの５’末端」は、前記トランケーションが、ＯＲＦの開始コドンに影響する（を含む）と理解されるべきである。開始コドン（ＡＵＧ）の５’末端はＡであり、その一方（ｗｈｅｒｅａｓｅ）ＡＵＧの３’末端はＧである。しかし、用語「５’」および「３」は当業者によく知られている。

【0057】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂは、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
本発明ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0058】

本明細書で使用される用語「開始コドンのＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている」は、前記トランケーションがＡまたはＵまたはＧで開始し得ると理解されるべきである。トランケーションがＡで開始する場合、そのＡがトランケートされる。しかし、Ａからのトランケーションが２つ以上のヌクレオチドの欠失を含むのであれば、Ｕも同様に欠失する。さらに、Ａからのトランケーションが３つ以上のヌクレオチドの欠失を含むのであれば、Ａ、Ｕ、およびＧが欠失する。しかし、トランケーションがＵで開始するのであれば、そのＵが欠失し、その一方でＡＵＧのＡはなお残る。さらに、トランケーションがＧで開始するのであれば、そのＧが欠失し、一方でＡＵＧのＡおよびＵはなお残る。

【0059】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0060】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0061】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂは、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされており、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされており、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0062】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0063】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0064】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0065】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。

【0066】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0067】

用語「ＯＲＦ３ａの開始コドンの５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は、５’末端からのＯＲＦ３ａのヌクレオチドにおける欠失、置換、または逆位を意味し、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ；配列番号１のヌクレオチド１〜３）が１番である。よって、前記用語は、ヌクレオチド１〜１７３、１〜１７２、１〜１７１、１〜１７０、１〜１６９、その他１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、および１〜１までにおける５’末端からの欠失、置換または逆位を包含する。よって、用語「ＯＲＦ３ａの開始コドンの５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は１７３の変異体を包含し、１７３すべての変異体において、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡが１番と定義される）が欠失しているか、置換されているか、または逆位になっていると理解されるべきである。

【0068】

用語「ＯＲＦ３ｂの開始コドンの５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は、５’末端からのＯＲＦ３ｂのヌクレオチドの欠失、置換、または逆位を意味し、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ；配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が１番である。よって、前記用語は、ヌクレオチド１〜１７５、１〜１７４、１〜１７３、１〜１７２、１〜１７０、その他１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、および１〜１までにおける５’末端からの欠失、置換または逆位を包含する。よって、用語「ＯＲＦ３ｂの開始コドンの５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は１７５の変異体を包含し、１７５すべての変異体において、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡが１番と定義される）が欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。

【0069】

好ましくは、本発明のＩＢＶは、ＯＲＦ３ａの５’末端からの、ヌクレオチド１〜１０、ヌクレオチド１〜２０、ヌクレオチド１〜３０、ヌクレオチド１〜４０、ヌクレオチド１〜５０、ヌクレオチド１〜６０、ヌクレオチド１〜７０、ヌクレオチド１〜８０、ヌクレオチド１〜９０、ヌクレオチド１〜１００、ヌクレオチド１〜１１０、ヌクレオチド１〜１２０、ヌクレオチド１〜１３０、ヌクレオチド１〜１４０、ヌクレオチド１〜１５０、ヌクレオチド１〜１６０、ヌクレオチド１〜１７０、ヌクレオチド１〜１７３の欠失、置換または逆位を含み、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ；配列番号１のヌクレオチド１）が１番であり、そして、好ましくは、本発明のＩＢＶは、ＯＲＦ３ｂの５’末端からの、ヌクレオチド１〜１０、ヌクレオチド１〜２０、ヌクレオチド１〜３０、ヌクレオチド１〜４０、ヌクレオチド１〜５０、ヌクレオチド１〜６０、ヌクレオチド１〜７０、ヌクレオチド１〜８０、ヌクレオチド１〜９０、ヌクレオチド１〜１００、ヌクレオチド１〜１１０、ヌクレオチド１〜１２０、ヌクレオチド１〜１３０、ヌクレオチド１〜１４０、ヌクレオチド１〜１５０、ヌクレオチド１〜１６０、ヌクレオチド１〜１７０、ヌクレオチド１〜１７５の欠失、置換または逆位を含み、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ；配列番号１のヌクレオチド１７４）が１番である。

【0070】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜１７３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜１７２ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜１７１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１７４）から１〜１７５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド１７５）から１〜１７４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド１７６）から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜１７３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜１７２ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜１７１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１７４）から１〜１７５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド１７５）から１〜１７４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド１７６）から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0071】

用語「１〜１７１ヌクレオチド」、「１〜１７２ヌクレオチド」、「１〜１７３ヌクレオチド」、「１〜１７４ヌクレオチド」および「１〜１７５ヌクレオチド」は、上記に示した他の定義に従って理解されなければならない。よって、前記用語は、１７１の変異体、１７２の変異体、１７３の変異体、１７４の変異体または１７５の変異体を包含する。用語「開始コドンのＡから」、「開始コドンのＵから」または「開始コドンのＧから」は、欠失、置換または逆位の開始点を定義する。用語「開始コドンのＡから」は、典型的には、開始コドン（ＡＵＧ）におけるＡから開始する欠失、置換または逆位を定義し、Ａに影響する。
好ましくは、本発明のＩＢＶは、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ）のＡ、ＵまたはＧからの、ヌクレオチド１〜１０、ヌクレオチド１〜２０、ヌクレオチド１〜３０、ヌクレオチド１〜４０、ヌクレオチド１〜５０、ヌクレオチド１〜６０、ヌクレオチド１〜７０、ヌクレオチド１〜８０、ヌクレオチド１〜９０、ヌクレオチド１〜１００、ヌクレオチド１〜１１０、ヌクレオチド１〜１２０、ヌクレオチド１〜１３０、ヌクレオチド１〜１４０、ヌクレオチド１〜１５０、ヌクレオチド１〜１６０、ヌクレオチド１〜１７０の欠失、置換または逆位を含む。

【0072】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0073】

用語「ＯＲＦ５ａの開始コドンの５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は、５’末端からのＯＲＦ５ａのヌクレオチドの欠失、置換、または逆位を意味し、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ；配列番号２のヌクレオチド１〜３）が１番である。よって、前記用語は、ヌクレオチド１〜１９４、１〜１９３、１〜１９２、１〜１９１、１〜１９０、その他１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、および１〜１までにおける５’末端からの欠失、置換または逆位を包含する。よって、用語「ＯＲＦ５ａの開始コドンの５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は１９４の変異体を包含し、１９４すべての変異体において、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡが１番と定義される）が欠失しているか、置換されているか、または逆位になっていると理解されるべきである。

【0074】

用語「ＯＲＦ５ｂの開始コドンの５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は、５’末端からのＯＲＦ５ｂのヌクレオチドの欠失、置換、または逆位を意味し、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が１番である。よって、前記用語は、ヌクレオチド１〜１９１、１〜１９０、１〜１８９、１〜１８８、１〜１８７、その他１〜５、１〜４、１〜３、１〜２、および１〜１までにおける５’末端からの欠失、置換または逆位を包含する。よって、用語「ＯＲＦ５ｂの開始コドンの５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は１９１の変異体を包含し、１９１すべての変異体において、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡが１番と定義される）が欠失しているか、置換されているか、または逆位になっていると理解されるべきである。

【0075】

好ましくは、本発明のＩＢＶは、ＯＲＦ５ａの５’末端からの、ヌクレオチド１〜１０、ヌクレオチド１〜２０、ヌクレオチド１〜３０、ヌクレオチド１〜４０、ヌクレオチド１〜５０、ヌクレオチド１〜６０、ヌクレオチド１〜７０、ヌクレオチド１〜８０、ヌクレオチド１〜９０、ヌクレオチド１〜１００、ヌクレオチド１〜１１０、ヌクレオチド１〜１２０、ヌクレオチド１〜１３０、ヌクレオチド１〜１４０、ヌクレオチド１〜１５０、ヌクレオチド１〜１６０、ヌクレオチド１〜１７０、ヌクレオチド１〜１８０、ヌクレオチド１〜１９０、ヌクレオチド１〜１９４の欠失、置換または逆位を含み、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）が１番であり、そして、好ましくは、本発明のＩＢＶは、ＯＲＦ５ｂの５’末端からの、ヌクレオチド１〜１０、ヌクレオチド１〜２０、ヌクレオチド１〜３０、ヌクレオチド１〜４０、ヌクレオチド１〜５０、ヌクレオチド１〜６０、ヌクレオチド１〜７０、ヌクレオチド１〜８０、ヌクレオチド１〜９０、ヌクレオチド１〜１００、ヌクレオチド１〜１１０、ヌクレオチド１〜１２０、ヌクレオチド１〜１３０、ヌクレオチド１〜１４０、ヌクレオチド１〜１５０、ヌクレオチド１〜１６０、ヌクレオチド１〜１７０、ヌクレオチド１〜１８０、ヌクレオチド１〜１９０、ヌクレオチド１〜１９１の欠失、置換または逆位を含み、５’末端のヌクレオチド（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）が１番である。

【0076】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜１９４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜１９３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜１９２ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜１９１ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜１９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜１８９ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜１９４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜１９３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜１９２ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜１９１ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜１９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜１８９ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0077】

用語「１〜１８９ヌクレオチド」、「１〜１９０ヌクレオチド」、「１〜１９１ヌクレオチド」、「１〜１９２ヌクレオチド」、「１〜１９３ヌクレオチド」、「１〜１９４ヌクレオチド」は、上記に示した他の定義に従って理解されなければならない。前記用語は、１８９の変異体、１９０の変異体、１９１の変異体、１９２の変異体、１９３の変異体または１９４の変異体を包含する。用語「開始コドンのＡから」、「開始コドンのＵから」または「開始コドンのＧから」は、欠失、置換または逆位の開始点を定義する。用語「開始コドンのＡから」は、典型的には、開始コドン（ＡＵＧ）におけるＡから開始する欠失、置換または逆位を定義し、Ａに影響する。

【0078】

好ましくは、本発明のＩＢＶは、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ）のＡ、ＵまたはＧからの、ヌクレオチド１〜１０、ヌクレオチド１〜２０、ヌクレオチド１〜３０、ヌクレオチド１〜４０、ヌクレオチド１〜５０、ヌクレオチド１〜６０、ヌクレオチド１〜７０、ヌクレオチド１〜８０、ヌクレオチド１〜９０、ヌクレオチド１〜１００、ヌクレオチド１〜１１０、ヌクレオチド１〜１２０、ヌクレオチド１〜１３０、ヌクレオチド１〜１４０、ヌクレオチド１〜１５０、ヌクレオチド１〜１６０、ヌクレオチド１〜１７０、ヌクレオチド１〜１８０、ヌクレオチド１〜１８９の欠失、置換または逆位を含む。

【0079】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａにおける５’末端から少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0080】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0081】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0082】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0083】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１７４〜２００ヌクレオチド、もしくは１７４〜３００ヌクレオチド、もしくは１７４〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１７４〜２００ヌクレオチド、もしくは１７４〜３００ヌクレオチド、もしくは１７４〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0084】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１７４〜３４８ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１７３〜３４７ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１７２〜３４６ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１７４〜３４８ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１７３〜３４７ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１７２〜３４６ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0085】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１９５〜２５０ヌクレオチド、もしくは１９５〜３００ヌクレオチド、もしくは１９５〜３５０ヌクレオチド、もしくは１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１９５〜２５０ヌクレオチド、もしくは１９５〜３００ヌクレオチド、もしくは１９５〜３５０ヌクレオチド、もしくは１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0086】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１９５〜３８５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１９４〜３８４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１９３〜３８３ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１９５〜３８５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１９４〜３８４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１９３〜３８３ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0087】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0088】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0089】

概して、用語「ＯＲＦ３ａ／３ｂ／５ａ／５ｂのヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」は、前記ＯＲＦ内におけるすべての場所で生じ得るヌクレオチドの欠失、置換または逆位を意味する。よって、ヌクレオチドの前記欠失、置換または逆位は、前記ＯＲＦの５’末端のみ、前記ＯＲＦの３’末端のみ、もしくは前記ＯＲＦの残りのヌクレオチド（５’末端および３’末端を除く）またはこれらのあらゆる組み合わせ（典型的には前記ＯＲＦの５’末端およびさらなるヌクレオチド、または前記ＯＲＦの３’末端およびさらなるヌクレオチドのようなもの）に影響しうる。よって、典型的には「ＯＲＦ３ａ／３ｂ／５ａ／５ｂにおける少なくとも２５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」という表現は、前記２５ヌクレオチドが前記ＯＲＦ内のあらゆる場所で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっていることができることを意味し、前記ＯＲＦ内のヌクレオチドの欠失、置換または逆位の局在に向けた限定は伴わない。さらに、典型的には「ＯＲＦ３ａにおける１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている」という表現は、前記ヌクレオチドが前記ＯＲＦ内のあらゆる場所で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっていることができることを意味し、前記ＯＲＦ内のヌクレオチドの欠失、置換または逆位の局在に向けた限定は伴わない。さらに、上記に示したように、用語「１〜１７３ヌクレオチド」は、１７３の変異体（１、２、３、４、その他１７１、１７２もしくは１７３ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含すると理解されるべきである。したがって、用語「１〜１７５ヌクレオチド」は、１７５の変異体（１、２、３、４、その他１７３、１７４もしくは１７５ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含し、用語「１〜１９４ヌクレオチド」は、１９４の変異体（１、２、３、４、その他１９２、１９３もしくは１９４ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含し、用語「１〜９０ヌクレオチド」は、９０の変異体（１、２、３、４、その他８８、８９もしくは９０ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含し、用語「１〜１９１ヌクレオチド」は、１９１の変異体（１、２、３、４，その他１８９、１９０もしくは１９１ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含し、用語「１〜３４８ヌクレオチド」は、３４８の変異体（１、２、３、４、その他３４６、３４７もしくは３４８ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含し、そして用語「１〜３８５ヌクレオチド」は、３８５の変異体（１、２、３、４，その他３８３、３８４もしくは３８５ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位）を包含することが理解されるべきである。

【0090】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａにおける１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂにおける１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａにおける１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂにおける１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0091】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａにおける１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂにおける１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａにおける１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂにおける１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0092】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶまたはＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0093】

「ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内」という用語は、本明細書で使用するとき、ヌクレオチドの前記欠失、置換または逆位が、ＯＲＦ３ａの開始コドンに影響を与え得（含み得）、ＯＲＦ３ｃの開始コドンは影響を受けない（除かれる）ものと理解されるべきである。よって、ＯＲＦ３ｃの発現および／またはＥタンパク質の活性は影響を受けない。よって、「ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内」という用語は、ＯＲＦ３ｃの開始コドンが影響を受けない限り、前記ＯＲＦ内のどこにでも生じ得るヌクレオチドの欠失、置換または逆位を指す。よって、ヌクレオチドの前記欠失、置換または逆位は、ＯＲＦ３ａの５’末端のみ、ＯＲＦ３ｂの３’末端のみ（ＯＲＦ３ｃの開始コドンに影響を与えない）もしくは前記ＯＲＦのヌクレオチドの残り（前記５’末端および３’末端を除く）、またはそれらの任意の組み合わせに影響を与え得る。さらに、前記から、「１７６〜３４８ヌクレオチド」という用語は、１７６、１７７、１７８などから３４６、３４７または３４８ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位を包含すると理解されるべきである。

【0094】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化は、ＯＲＦ３ｃの発現に影響を与えず、および／またはＥタンパク質の活性に影響を与えない。よって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの発現（３ａおよび３ｂ ＲＮＡならびに／または３ａタンパク質および３ｂタンパク質）および／またはタンパク質の活性は低減し（または排除され）、一方、ＯＲＦ３ｃ発現は影響を受け、および／またはＥタンパク質の活性は影響を受けないＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0095】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0096】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドは、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。よって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの不活性化は、ＯＲＦ３ｃの発現に影響を与えず、および／またはＥタンパク質の活性に影響を与えない。よって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ発現（３ａおよび３ｂ ＲＮＡならびに／または３ａタンパク質および３ｂタンパク質）および／またはタンパク質の活性は低減され（または排除され）、一方、ＯＲＦ３ｃの発現および／またはＥタンパク質の活性は影響を受けない。

【0097】

本発明の１つの態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドは、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドの発明は、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0098】

「ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内」という用語は、本明細書で使用するとき、ヌクレオチドの前記欠失、置換または逆位が、ＯＲＦ５ａの開始コドンに影響を与え得（含み得）、一方、ＯＲＦＮの開始コドンは影響を受けない（除かれる）ものと理解されるべきである。よって、ＯＲＦＮの発現および／またはＮタンパク質の活性は影響を受けない。よって、「ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内」という用語は、ＯＲＦＮの開始コドンが影響を受けない限り、ＯＲＦ内のどこにでも生じ得るヌクレオチドの欠失、置換または逆位を指す。よって、ヌクレオチドの前記欠失、置換または逆位は、ＯＲＦ５ａの５’末端のみ、ＯＲＦ５ｂの３’末端のみ（ＯＲＦＮの開始コドンに影響を与えない）もしくは前記ＯＲＦのヌクレオチドの残りまたはそれらのいずれかの組み合わせに影響を与え得る。さらに、前記から、「１９５〜３８５ヌクレオチド」という用語は、１９５、１９６、１９７などから３８３、３８４または３８５ヌクレオチドまでの欠失、置換または逆位を包含するものと理解されるべきである。

【0099】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５のヌクレオチドは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている免疫原性組成物を提供する。よって、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの不活性化は、ＯＲＦＮの発現および／またはＮタンパク質の活性に影響を与えない。よって、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ発現（５ａおよび５ｂ ＲＮＡならびに／または５ａタンパク質および／または５ｂタンパク質）およびタンパク質の発現は低減し（または排除され）、一方、ＯＲＦＮの発現および／またはＮタンパク質の活性は影響を受けないＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0100】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドは、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびｂＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0101】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ｂ、ならびにＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドは、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0102】

本発明の一態様において、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までのＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂは、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までのＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂは、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0103】

本発明の一態様において、配列番号１に示されるＲＮＡ配列は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
配列番号１に示されるＲＮＡ配列は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0104】

本発明の一態様において、配列番号１に示されるＲＮＡ配列と少なくとも７０％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
配列番号１に示されるＲＮＡ配列と少なくとも７０％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0105】

本発明の一態様において、配列番号１に示されるＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％または少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
配列番号１に示されるＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％または少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0106】

用語「同一性」または「配列同一性」は、当該技術分野において公知であり、２つ以上のポリペプチド配列または２つ以上のポリヌクレオチド配列、すなわち参照配列と、参照配列と比較するための所与の配列の間の関係を指す。配列同一性は、所与の配列を参照配列と、それらの配列を最適に整列させ、このような配列の鎖間の一致によって決定される最高度の配列類似性を達成した後に比較することによって決定される。このような整列に際して、配列同一性は、位置ごとを基準に確認される。例えば、特定の位置でヌクレオチドまたはアミノ酸残基が同一である場合、配列はその位置で「同一」である。次に、このような位置同一の総数を参照配列中のヌクレオチドまたは残基の総数で割ることによって、配列同一性％が与えられる。配列同一性は、公知の方法によって容易に計算され得、限定されないが、それらの教示が参照により本明細書に組み込まれる、Computational Molecular Biology、Lesk, A. N.、編集、Oxford University Press、New York（１９８８年）、Biocomputing: Informatics and Genome Projects、Smith, D.W.、編集、Academic Press、New York（１９９３年）；Computer Analysis of Sequence Data、Part I、Griffin, A.M.、およびGriffin, H. G.、編集、Humana Press、New Jersey（１９９４年）；Sequence Analysis in Molecular Biology、von Heinge, G.、Academic Press（１９８７年)；Sequence Analysis Primer、Gribskov, M.およびDevereux, J.、編集、M. Stockton Press、New York（１９９１年）；Carillo, H.、およびLipman, D.,、SIAM J. Applied Math.、４８巻：１０７３頁（１９８８年）に記載されている方法が挙げられる。配列同一性を決定する好ましい方法は、試験される配列間で最大の一致をもたらすように設計される。配列同一性を決定する方法は、所与の配列間の配列同一性を決定する、公衆に利用可能なコンピュータプログラムで集大成されている。このようなプログラムの例には、限定されないが、ＧＣＧプログラムパッケージ（Devereux, J.ら、Nucleic Acids Research、１２巻（１号）：３８７頁、１９８４年）、BLASTP、BLASTNおよびFASTA（Altschul, S. F.ら、J. Molec. Biol.、２１５巻：４０３〜４１０頁、１９９０年）が含まれる。ＢＬＡＳＴＸプログラムは、ＮＣＢＩおよび他の供給源（それらの教示が参照により本明細書に組み込まれる、BLAST Manual、Altschul, S.ら、NCVI NLM NIH Bethesda, MD 20894、Altschul, S. F.ら、J. Molec. Biol.、２１５巻：４０３〜４１０頁（１９９０年））から公衆に利用可能である。

【0107】

これらのプログラムは、所与の配列と参照配列の間で最高レベルの配列同一性を生じさせるために、デフォルトギャップ重みを用いて最適に配列を整列させる。参照ヌクレオチド配列に対して少なくとも例えば８５％、好ましくは９０％、さらに好ましくは９５％の「配列同一性」を有するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドを例にすると、所与のポリヌクレオチドのヌクレオチド配列は、所与のポリヌクレオチド配列が、参照ヌクレオチド配列の１００ヌクレオチドごとに１５まで、好ましくは１０まで、さらに好ましくは５までの点突然変異を含み得ることを除いて、参照配列と同一であることが意図される。換言すれば、参照ヌクレオチド配列と比べて少なくとも例えば８５％、好ましくは９０％、さらに好ましくは９５％の同一性を有するポリヌクレオチドにおいて、参照配列のヌクレオチドの１５％まで、好ましくは１０％まで、さらに好ましくは５％までが欠失もしくは別のヌクレオチドで置換され得、または参照配列中の総ヌクレオチドの１５％まで、好ましくは１０％まで、さらに好ましくは５％までの数のヌクレオチドが参照配列に挿入され得る。参照配列のこれらの突然変異は、参照配列の５’もしくは３’末端の位置またはそれら末端の位置の間の任意の位置に存在するか、参照配列のヌクレオチドの間に個々に分散されるか、または参照配列内の１つまたは複数の連続するグループに存在し得る。同様に、参照アミノ酸配列に対して少なくとも例えば８５％、好ましくは９０％、さらに好ましくは９５％の「配列同一性」を有する所与のアミノ酸配列を有するポリペプチドでは、所与のポリペプチドのアミノ酸配列は、所与のポリペプチド配列が参照アミノ酸配列の１００アミノ酸毎に１５まで、好ましくは１０まで、さらに好ましくは５までのアミノ酸変化を含み得ることを除いて、参照配列と同一であることが意図される。換言すれば、参照配列と少なくとも８５％、好ましくは９０％、さらに好ましくは９５％の配列同一性を有する所与のポリペプチド配列を得るために、参照配列のアミノ酸残基の１５％まで、好ましくは１０％まで、さらに好ましくは５％までが欠失もしくは別のアミノ酸で置換され得るか、または参照配列中のアミノ酸残基の総数の１５％まで、好ましくは１０％まで、さらに好ましくは５％までの数のアミノ酸残基が参照配列に挿入され得る。参照配列のこれらの変化は、参照アミノ酸配列のアミノもしくはカルボキシ末端の位置またはそれら末端の位置の間の任意の位置に存在するか、参照配列の残基の間に個々に分散されるか、または参照配列内の１つまたは複数の連続するグループに存在し得る。好ましくは、同一ではない残基の位置は、保存的アミノ酸置換によって相違する。しかしながら、保存的置換は、配列同一性を決定するときには一致として含まれない。

【0108】

「同一性」、「配列同一性」および「同一性パーセント」という用語は、本明細書において同義的に用いられる。本発明の目的で、ここでは、２つのアミノ酸配列または２つの核酸配列の同一性パーセントを決定するために、最適な比較を目的として配列を整列させることが規定されている（例えば、第２のアミノまたは核酸配列との最適なアラインメントのために第１のアミノ酸または核酸の配列の中にギャップを導入することができる）。次に、対応するアミノ酸またはヌクレオチド位置にあるアミノ酸またはヌクレオチド残基が比較される。第１の配列内の１つの位置が第２の配列内の対応する位置と同じアミノ酸またはヌクレオチド残基によって占有されている場合、分子はその位置において同一である。２つの配列間の同一性パーセントは、配列が共有する同一の位置の数の関数である（すなわち、同一性％＝同一位置の数／合計位置数（すなわち重複する位置）×１００）。好ましくは、２つの配列は同じ長さである。
配列比較は、比較される２つの配列の全長にわたってか、または２つの配列の断片全体にわたって実施されてもよい。典型的には、この比較は比較される２つの配列の全長にわたって実施される。しかしながら、配列同一性は、例えば、２０、５０、１００個またはそれより多い隣接しているアミノ酸残基の一領域にわたって実施され得る。

【0109】

当業者であれば、２つの配列間の相同性を決定するために異なるコンピュータプログラムを利用することができるということを認識する。例えば、２つの配列間の配列の比較および同一性パーセントの決定は、数学的アルゴリズムを用いて達成することができる。好ましい実施形態においては、２つのアミノ酸または核酸配列の間の同一性パーセントは、Ｂｌｏｓｕｍ６２マトリックスまたはＰＡＭ２５０マトリックスのいずれか、ならびに１６、１４、１２、１０、８、６または４というギャップ重みおよび１、２、３、４、５または６という長さ重みを用いて、（http://www.accelrys.com/products/gcg/で入手可能な）Ａｃｃｅｌｒｙｓ ＧＣＧソフトウェアパッケージ内のＧＡＰプログラム内に取込まれたNeedlemanおよびWunsch（J. Mol. Biol.（４８巻）：４４４〜４５３頁（１９７０年））アルゴリズムを用いて決定される。当業者は、これらの異なるバラメータのすべてが、わずかに異なる結果を生み出すが、２つの配列の全体的同一性パーセンテージが、異なるアルゴリズムを使用した場合に著しく変わらない、ということを認識する。

【0110】

さらに、本発明のタンパク質配列またはヌクレオチド配列は、例えば、他のファミリーメンバーまたは関連する配列を同定するために、公開データベースに対する検索を実行するための「クエリー配列」として使用することができる。このような検索は、Altschulら（１９９０年）J. Mol. Biol.、２１５巻：４０３〜１０頁のＢＬＡＳＴＮおよびＢＬＡＳＴＰプログラム（バージョン２．０）を用いて実行することができる。本発明のタンパク質分子と相同なアミノ酸配列を得るために、ＢＬＡＳＴＰプログラム、スコア＝５０、ワード長＝３を用いて、ＢＬＡＳＴタンパク質検索を実行することができる。比較を目的としてギャップ付きアラインメントを得るために、ギャップ付きＢＬＡＳＴをAltschulら（１９９７年）Nucleic Acids Res.、２５巻（１７号）：３３８９〜３４０２頁に記載されているように利用することができる。ＢＬＡＳＴおよびギャップ付きＢＬＡＳＴＰプログラムを利用する場合、それぞれのプログラム（例えば、ＢＬＡＳＴＰおよびＢＬＡＳＴＮ）のデフォルトパラメータを使用することができる。国立生物工学情報センター（National Center for Biotechnology Information）のホームページhttp://www.ncbi.nlm.nih.gov/を参照されたい。

【0111】

本発明の一態様において、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までのＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂは、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までのＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂは、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0112】

本発明の一態様において、配列番号２に示されるＲＮＡ配列は、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
配列番号２に示されるＲＮＡ配列は、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0113】

本発明の一態様において、配列番号２に示されるＲＮＡ配列と少なくとも７０％の同一性を有するＲＮＡは、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
配列番号２に示されるＲＮＡ配列と少なくとも７０％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0114】

本発明の一態様において、配列番号２に示されるＲＮＡ配列と、少なくとも１つと少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内において欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている。よって、本発明は、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、またはＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されており、
配列番号２に示されるＲＮＡ配列と、少なくとも１つと少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、または少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列は、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内において欠失しているか、置換されているか、または逆位になっているＩＢＶまたはＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。
本発明の一態様において、Ｅタンパク質は、遺伝子型ＱＸ、ボーデット、Ｈ１２０もしくはＨ５２のアミノ酸配列を有するか、または上記した遺伝子型のうちの少なくとも１つと、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有する。

【0115】

本発明の一態様において、Ｅタンパク質は、ＫＭ５８６８１８（ＱＸ）、ＡＪ３１１３１７（ボーデット）、ＦＪ８０７６５２（Ｈ１２０）もしくは配列番号３８（Ｈ５２）に示されるアミノ酸配列を有するか、または上記した配列のうちの少なくとも１つと、少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％または少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有する。
本発明の一態様において、ＩＢＶは弱毒化される。

【0116】

用語「弱毒化された」とは、野生型分離物と比較して毒性が低減した病原体を指す。本発明において、弱毒化ＩＢＶは、毒性が低減してＩＢＶ感染の臨床徴候を引き起こさないが、標的動物において免疫反応を誘導することができるものであるが、これは、臨床徴候が、弱毒化されていないＩＢＶに感染し、弱毒化されたウイルスを受けていない動物の「対照群」と比較して、弱毒化ＩＢＶに感染させた動物の発症率または重症度において低減することも意味し得る。これに関連して、用語「低減／低減した」とは、上記で定義される弱毒化されていないＩＢＶに感染させた対照群と比較して、少なくとも１０％、好ましくは２５％、さらにより好ましくは５０％、なおより好ましくは６０％、さらにより好ましくは７０％、なおより好ましくは８０％、なおより好ましくは９０％、さらにより好ましくは９５％、および最も好ましくは１００％の低減を意味する。よって、弱毒化ＩＢＶ株は、修飾された生きたＩＢＶを含む免疫原性組成物への組み込みに適しているものである。

【0117】

よって、本発明は、弱毒化ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）、または弱毒化ＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。
よって、本発明は、弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。
よって、本発明は、弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。
よって、本発明は、弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている弱毒化ＩＢＶまたは弱毒化ＩＢＶを含む免疫原性組成物を提供する。

【0118】

不活性化ウイルス
本発明の一態様において、本発明のＩＢＶは不活性化されており、その結果、全体的に不活性化ウイルスが生じる。よって、本発明はまた、不活性化ＩＢＶを含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ、および／または
− ＯＲＦ５ａ、および／または
− ＯＲＦ５ｂ
は不活性化されている免疫原性組成物を指す。
本発明の別の態様において、本発明のＩＢＶは不活性化されており、その結果、全体的に不活性化ウイルスが生じる。よって、本発明はまた、以下：
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている不活性化ＩＢＶ、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている不活性化ＩＢＶ、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている不活性化ＩＢＶ
を含む免疫原性組成物を指す。

【0119】

任意の通常的な不活性化方法を本発明の目的のために用いることができる。よって、不活性化は、当業者に公知である化学的および／または物理的処理によって実施できる。好ましい不活性化方法には、環化されて二元性エチレンイミン（ＢＥＩ）を形成している２−ブロモエチレンアミンヒドロブロミド（ＢＥＡ）の溶液の添加を含む環化二元性エチレンイミン（ＢＥＩ）の添加が含まれる。さらに好ましい化学的不活性化剤は、限定されないが、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１００、デオキシコール酸ナトリウム、セチルトリメチルアンモニウムブロミド、β−プロピオラクトン、チメロサール、フェノールおよびホルムアルデヒド（ホルマリン）を含む。しかしながら、不活性化はまた、中和ステップを含み得る。好ましい中和剤には、限定されないが、チオ硫酸ナトリウム、重亜硫酸ナトリウムなどが含まれる。

【0120】

好ましいホルマリン不活性化条件は、約０．０２％（ｖ／ｖ）〜２．０％（ｖ／ｖ）、より好ましくは約０．１％（ｖ／ｖ）〜１．０％％（ｖ／ｖ）、さらに好ましくは約０．１５％（ｖ／ｖ）〜０．８％（ｖ／ｖ）、さらに好ましくは約０．１６％（ｖ／ｖ）〜０．６％（ｖ／ｖ）、最も好ましくは約０．２％（ｖ／ｖ）〜０．４％（ｖ／ｖ）のホルマリン濃度を含む。インキュベーション時間は、ＩＢＶの耐性に依存する。一般的に、不活性化プロセスは、適切な培養系でＩＢＶの増殖が検出できなくなるまで実施される。
好ましくは、本発明の不活性化ＩＢＶは、好ましくは本明細書において上述される濃度を使用して、ホルマリン不活性化される。

【0121】

本発明の不活性化ＩＢＶは、公知の技術、例えばNature、１９７４年、２５２巻、２５２〜２５４頁またはJournal of Immunology、１９７８年、１２０巻、１１０９〜１３頁に記載されているものを用いてリポソームに取り込まれ得る。本発明の別の実施では、本発明の不活性化ＩＢＶは、適切な生物学的化合物、例えば、多糖、ペプチド、タンパク質など、またはそれらの組み合わせにコンジュゲートされ得る。
本発明の一態様において、ＩＢＶは遺伝的に操作されている。
用語「遺伝的に操作された」とは、「逆遺伝学」アプローチを用いて突然変異させたＩＢＶを指す。好ましくは、本発明によるＩＢＶは、遺伝的に操作されている。逆遺伝学技術は、合成組換えウイルスＲＮＡの調製を伴う。しかしながら、「逆遺伝学」技術は、当業者に周知である。
本発明の一態様において、ＩＢＶは、組換えＩＢＶである。

【0122】

用語「組換え」とは、本明細書で使用するとき、対応するＲＮＡゲノム（またはＲＮＡ配列もしくははタンパク質）に、天然に存在しない任意の修飾を有するＲＮＡゲノム（またはＲＮＡ配列もしくはタンパク質）を指す。例えば、ＲＮＡゲノム（またはＲＮＡ配列もしくはタンパク質）は、例えば、ヒト介入により、人為的に導入された挿入、欠失、逆位、再配置または点突然変異を含有する場合、「組換え」とみなされる。よって、ＲＮＡゲノム配列（またはＲＮＡ配列もしくはタンパク質）は、性質上、関連している配列（ＲＮＡ配列またはタンパク質のアミノ酸配列）のすべてまたは一部に関連していない。用語「組換え」とは、ウイルスに関して使用する場合、ウイルスゲノムの人為的操作によって産生されるウイルスを意味する。用語「組換えウイルス」は、遺伝子学的に修飾されたウイルスを包含する。

【0123】

ＩＢＶ株
ＩＢＶ株は、血清型および遺伝子型によって分類することができる。血清型分類は中和抗体によるウイルスの処理を伴い、一方、遺伝子型分類はＳ１（スパイク）タンパク質の配列を調べることを伴う。しかしながら、様々なＩＢＶ株が当業者に周知である。伝染性気管支炎ウイルスは、１９３０年代に米国で最初に発見された。同定された最初のＩＢＶ血清型はマサチューセッツであったが、米国では、元々同定されたマサチューセッツ型に加えて、アーカンソーおよびデラウェアなどのいくつかの血清型が同定されている。
ＩＢＶ株ボーデットはマサチューセッツ型であり、ニワトリ胚において少なくとも１５０継代後に誘導された。ＩＢＶ株ボーデットは、元々ＢｅａｕｄｅｔｔｅおよびＨｕｄｓｏｎ（J. Am. Vet. Med. A.、９０巻、５１〜６０頁、１９３７年）によって分離され、ニワトリ胚において数百回継代された。これは、一般的に「ニワトリ胚に適応した」または「卵に適応した」株である。ボーデット以外の他のマサチューセッツ型ＩＢＶ株は、Ｈ１２０、Ｈ５２、およびＭ４１である。
ＩＢ ＱＸは、元々中国で分離されたＩＢＶの毒性分離株として報告されている。しかしながら、このウイルスは、ヨーロッパに広がっており、オランダを中心とした西ヨーロッパにおいて同定されているが、ドイツ、フランス、ベルギー、デンマーク、英国では同定されていない。ＱＸ血清型は、アジアおよびアフリカのいくつかの国々（countires）で報告されている。
別のＩＢＶ株は、一般的に７９３Ｂとも呼ばれる４／９１遺伝子型である。

【0124】

イタリアでは１９９０年代後半に「イタリエン−０２」または「イタリア−０２」と呼ばれる株が分離されている。これらの分離株の１つの配列分析は、２００２年に公開された（ＮＣＢＩ−ＢＬＡＳＴ、番号ＡＪ４５７１３７）。しかしながら、研究は、このイタリア−０２株がヨーロッパに広がり、ＩＢＶ変種４／９１は別として、英国、スペイン、フランス、オランダにおいて最も優勢な遺伝子型の１つとなっていることを示している。
さらに、Ｄ２７４、Ｂ１６４８／Ｄ８８８０、Ｄ１４６６、Ｖ１３９７およびＡｒｋａｎｓａｓ株は、同様にヨーロッパで同定されている。

【0125】

本発明の一態様において、ＩＢＶは、アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３）、グレー、ホルテ（Holte）、アイオワ（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６ Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアＷｏｌｇ／９８）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ １７、Ｖａｒｉａｎｔ ２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）からなる株のリストから選択される遺伝子型を有する。
本発明の一態様において、ＩＢＶは、ＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型である。

【0126】

本発明の一態様において、ＱＸ遺伝子型は、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／ＣＫ／ＳＰ／１７０／ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６からなるリストから選択される。
本発明の一態様において、マサチューセッツ遺伝子型は、Ｈ１２０、Ｈ５２、Ｓｐａｉｎ／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、Ｓｐａｉｎ／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３からなるリストから選択される。

【0127】

本発明の一態様において、４／９１遺伝子型は、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、 ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、Ｓｐａｉｎ／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１からなるリストから選択される。
本発明の一態様において、Ｑ１遺伝子型は、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ−２９５−１０からなるリストから選択される。

【0128】

本発明の一態様において、イタリア０２遺伝子型は、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、Ｓｐａｉｎ／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８からなるリストから選択される。
本発明の一態様において、ＩＢＶは、マサチューセッツ遺伝子型Ｈ５２株のものである。
本発明の一態様において、Ｈ５２は、Ｈ５２Ｕである。
本発明の一態様において、Ｈ５２は、ＥＵ８１７４９７で示されるヌクレオチド配列、またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有する。

【0129】

本発明の一態様において、Ｈ５２株は、ＡＦ３５２３１５で示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するスパイク（Ｓ１）タンパク質を有する。
本発明の一態様において、Ｈ５２株は、ＡＹ０４４１８５もしくはＡＦ３５２３１０で示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するヌクレオカプシド（Ｎ）タンパク質を有する。
本発明の一態様において、Ｈ５２株は、ＡＦ３１７２１０で示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するエンベロープ（Ｅ）タンパク質を有する。
本発明の一態様において、Ｈ５２株は、ＡＦ２８６１８５で示されるアミノ酸配列、またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有する膜糖タンパク質（Ｍ）タンパク質を有する。

【0130】

任意のＩＢＶ株を得ることは、当業者の一般的な知識の範囲内である。ＩＢＶ株は、市販品として購入することができ、科学研究所から入手することができ、またはゲノムは、ＩＢＶ株が配列決定され、配列が公表され、したがって利用可能であるため、相補的ＤＮＡとして合成することができる。さらに、ＩＢＶ株は、野外から分離することができる。ＩＢＶ株を分離する方法およびＩＢＶ株を特徴付ける方法は、当業者に周知である。Valter Leonardo de Quadros、２０１１年（Dissertation, Das Infektiose Bronchitis Virus（IBV）：Molekularbiologische Untersuchungen zur Diagnostik und zum Vorkommen sowie zur Pathogenitat des Genotyps IBV QX in spezifisch pathogenfreien (SPF) Broilern, Freie Universitat Berlin）、Worthingtonら、２００９年（Avian Pathology、３７巻（３号）、２４７〜２５７頁）、Liuら、２００９年（Virus Genes、３８巻：５６〜６５頁）、Dolzら、２００６年（Avian Pathology、３５巻（２号）：７７〜８５頁）、Farsangら、２００２年（Avian Pathology、３１巻：２２９〜２３６頁）、Fengら、２０１４年（Virus Genes、４９巻：２９２〜３０３頁）には、様々なＩＢＶ株を分離し、分化させる方法が記載されている。

【0131】

典型的には、任意のＩＢＶ株を得ることは、当業者の一般的な知識の範囲内である。典型的なＮｏｂｉｌｉｓ ＩＢ Ｈ５２（ＭＳＤ Ａｎｉｍａｌ Ｈｅａｌｔｈ）、ＡｖｉＰｒｏ ＩＢ Ｈ５２（Ｌｏｈｍａｎｎ Ａｎｉｍａｌ Ｈｅａｌｔｈ ＧｍｂＨ ＆ Ｃｏ．ＫＧ）、Ｂｒｏｎｃｈｏｖａｃ（Ｃｅｖａ）および同様のものなどのＩＢＶ Ｈ５２株を市販品として購入することができる。さらに、McDonaldら、１９８０年（Avain Pathology、９巻：２４５〜２５９頁）は、Ｃｅｎｔｒａｌ Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ＲｏｔｔｅｒｄａｍによりＩＢＶ Ｈ５２を得ることができることを開示し、Kusters（J. gen Virol、６８巻：３４３〜３５２頁）は、オランダにあるＰｏｕｌｔｒｙ Ｈｅａｌｔｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ Ｄｏｒｎ（現在、Deventer Instituteである；ＩＢＶ Ｈ５２は、Ｄｅｖｅｎｔｅｒで得ることができる）によりＩＢＶ Ｈ５２を得ることができることを開示し、およびChenら、２００７年（Avian Pathology、３６巻（４号）：２６９〜２７４頁）は、Ｃｈｉｎａ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｏｆ Ｖｅｔｅｒｉｎａｒｙ Ｄｒｕｇ ＣｏｎｔｒｏｌによりＩＢＶ Ｈ５２を得ることができることを開示する。さらに、ＩＢＶ Ｈ５２は、何十年もの間、ワクチン株として使用されており（Bijlengaら、２００４年、Avian Pathology、３３巻（６号）：５５０〜５５７頁）、よって、野外で見出され、そこから分離することができる。ＩＢＶ Ｈ５２株を分離する方法、およびＩＢＶ Ｈ５２株を特徴付ける方法は、当業者に周知である。典型的には、ＩＢＶ Ｈ５２株は、Zwaagstraら、１９９２年（J. Clin. Microbiol.、３０巻（１号）：７９〜８４頁）、Ｈａｎｄｂｅｒｇら、１９９９年（Avian Pathology、２８巻：３２７〜３３５頁）、またはCallisonら、２００６年（Journal of Virological Methods、１３８巻：６０〜６５頁）に記載されているように特徴付けることができる。例えば、Ｚｗａａｇｓｔｒａら１９９２およびＨａｎｄｂｅｒｇら１９９９は、ＲＴ−ＰＣＲおよび配列決定のためのマサチューセッツ特異的プライマー（例えば、それぞれＳタンパク質およびＮタンパク質用）および比較のための参照配列を開示する。

【0132】

さらに、用語「ＩＢＶ」は、分離され、特徴付けられているＩＢＶの多数の血清型を包含することを意味し、（限定されないが）以下のものを含む：Ｂ／Ｄ２７４／８４；Ｂ／ＵＫ １６７／８４；Ｂ／ＵＫ１４２／８６；Ｅ Ｄ３Ｓ９６／８４；Ｅ／ＵＫ １２３／８２；ブラジル／ＢＲｌ／ＵＳＰ−７３／０９；７９３Ｂ／４−９１／９１；ＦＲ／ＣＲ８８１２１ ８８；中国／Ｑ１／９８；Ｃｈｋａ／ＬＤＬ９７１ ９７ ａａｚ０９２０２；ＣＡＶ／ＣＡＶ９４３７／９５；ＣＡＶ／ＣＡＶ１ ８６／９５；ＣＡＶ／ＣＡＶ５６ｂ ９１；ＰＡ／Ｗｏｌｇｅｍｎｔｈ／９８；ＰＡ／ｉ ７１／９９；Ｃ／５５７／０３ ＳＩ；ＪＡＡ／０４ ＳＩワクチン；ＨＮ９９ ＳＩ；Ｎ１／６２／ＳＩ；ＧＡＧＳ ＳＩ ＧＵ３０１９２５；Ａｒｋ／ＡｒｋＤＰＩ ８１ ＳＩ；Ａｒｋ／Ａｒｋ９９／７３；ＣＡＬ９９／ＣＡＬ９９／９９ ＳＩ；ＣＡＬ９９／ＮＥ１５１７２／９５ ＳＩ；Ｈｏｌｔｅ／Ｈｏｌｔｅ／５４；ＪＭＫ／ＪＭＫ／６４；Ｇｒａｙ／Ｇｒａｙ／６０；ｌｏｗａ／ｌｏｗａ６０９／５６；Ｃａ １７３７／０４ ＳＩ；ＤＭＡ／５６４２／０６ ＳＩ；ＧＡ０７／ＧＡ０７／０７ Ｓｉ；ＱＸ／ＱＸＩＢＶ／９９；Ｍａｓｓ／Ｈ５２／ＳＩ；Ｍａｓｓ／Ｈｉ ２０／ＳＩ；Ｍａｓｓ／Ｍａｓｓ４１／４ｌ ＳＩ；Ｃｏｆｌｎ／Ｃｏｒｍ４６／５１ ＳＩワクチン：ＦＬ／ＦＬ ｉ ８２８８／７１；ＤＥ ＤＥ０７２／９２ ＳＩワクチン；ＧＡ９８／Ｑ４７０／９８ ＳＩ；およびＤｕｔｃｈ／Ｄ １４６６／８１。
典型的な参照株およびそれらのスパイク遺伝子配列のヌクレオチド配列データベース受託番号のさらなる例は、Ｍ４１（マサチューセッツ血清型；Ｘ０４７２２）、ＮＵＤ２７４／７８（Ｄ２７４血清型；Ｘ１５８３２）、米国／アーカンソー９９（Ａｒｋ ９９血清型；Ｌ１０３８４）、ベルギー／Ｂ１６４８（Ｂ１６４８血清型；Ｘ８７２３８）、米国（ＤＥ）／０７２／９２（ＤＥ０７２血清型；Ｕ７７２９８）、ＵＳ（ＧＡ）／０４７０／９８（ジョージア９８血清型；ＡＦ２７４４３７）、Ｕｔ１４／９１（７９３Ｂ１血清型；ＡＦ０９３７９４）、ＵＳＡ／コネチカット（コネチカット血清型；Ｌ１８９９０）およびＮＬ／Ｄ１４６６（Ｄ１４６６血清型；Ｍ２１９７１）である。

【0133】

本発明の一態様において、免疫原性組成物はワクチンである。用語「ワクチン」は、本明細書の他の箇所において既に記載されている。しかしながら、宿主が、新規感染に対する耐性が増強され、および／または疾患の臨床的重症度が低減するような防御免疫反応を示す場合、免疫原性組成物は「ワクチン」として記載される。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、薬学的に許容される担体を含む。
「薬学的に許容される担体」という用語は、任意のおよびすべての溶媒、分散媒、コーティング剤、安定化剤、希釈剤、防腐剤、抗菌剤および抗真菌剤、等張剤、吸着遅延剤、アジュバント、免疫刺激剤、ならびのそれらの組み合わせを含む。

【0134】

「希釈剤」は、水、生理食塩水、デキストロース、エタノール、グリセロールなどを含むことができる。等張剤は、とりわけ、塩化ナトリウム、デキストロース、マンニトール、ソルビトール、およびラクトースを含むことができる。安定化剤は、とりわけ、アルブミンおよびエチレンジアミン四酢酸のアルカリ塩を含むことができる。
本発明の一態様において、薬学的に許容される担体は、リン酸緩衝生理食塩水である。
好ましくは、免疫原性組成物は、ショ糖ゼラチン安定化剤をさらに含む。
本発明の一態様において、薬学的に許容される担体は、キトサンである。

【0135】

キトサンは、甲殻類（例えば、エビ、カニ）、昆虫、および他の無脊椎動物のキチンからの天然に脱アセチル化された多糖である。最近、Rauwら、２００９年（Vet Immunol Immunop、１３４巻：２４９〜２５８頁）は、キトサンが、生きたニューカッスル病ワクチンの細胞性免疫反応を増強し、その保護効果を促進することを実証した。さらに、Wangら（２０１２年）（Arch Virol（２０１１年）１５７巻：１４５１〜１４６１頁）は、生きた弱毒化インフルエンザワクチンに使用するためのアジュバントとしてのキトサンの可能性を示す結果を示している。
好ましくは、免疫原性組成物は、１つまたは複数の他の免疫調節剤、例えば、インターロイキン、インターフェロン、または他のサイトカインをさらに含むことができる。本発明との関連において有用なアジュバントおよび添加剤の量および濃度は、当業者によって容易に決定することができる。

【0136】

一部の態様において、本発明の免疫原性組成物は、アジュバントを含む。本明細書で使用される「アジュバント」は、水酸化アルミニウムおよびリン酸アルミニウム、サポニン、例えばQuil A、QS-21（Cambridge Biotech Inc.、ケンブリッジ、マサチューセッツ州）、GPI-0100（Galenica Pharmaceuticals、Inc.、バーミンガム、AL）、油中水型エマルジョン、水中油型エマルジョン、水中油中水型エマルジョンを含むことができる。エマルジョンは、特に、軽質流動パラフィン油（European Pharmacopeaタイプ）；イソプレノイド油、例えば、スクアランまたはスクアレン；アルケン、特にイソブテンまたはデセンのオリゴマー化から生じる油；酸のエステルまたは線状アルキル基を含有するアルコールのエステル、より具体的には、植物油、オレイン酸エチル、ジ−（カプリル酸塩／カプリン酸）プロピレングリコール、トリ−（カプリル酸塩／カプリン酸）グリセリル、またはジオレイン酸プロピレングリコール；分岐脂肪酸のエステルまたはアルコールのエステル、特にイソステアリン酸エステルに基づくことができる。油は、エマルジョンを形成するために乳化剤と組み合わせて使用される。乳化剤は、好ましくは非イオン性界面活性剤、特にソルビタンのエステル、マンニドのエステル（例えばオレイン酸無水マンニトール）、グリコールのエステル、ポリグリセロールのエステル、プロピレングリコールのエステル、および場合によりエトキシル化されるオレイン酸、イソステアリン酸、リシノレイン酸またはヒドロキシステアリン酸のエステル、およびポリオキシプロピレン−ポリオキシンエチレンコポリマーブロック、特にプルロニック製品、とりわけＬ１２１である。Hunterら、「The Theory and Practical Application of Adjuvants」（編集Stewart-Tull、D．E．S．）、JohnWileyおよびSons、NY、５１〜９４頁（１９９５年、）およびToddら、Vaccine 、１５巻：５６４〜５７０頁（１９９７年）を参照されたい。典型的なアジュバントは、M. PowellおよびM. Newmanによって編集された「Vaccine Design, The Subunit and Adjuvant Approach」（Plenum Press、１９９５年）の１４７頁に記載されているＳＰＴエマルジョン、および同書籍の１８３頁に記載されているエマルジョンＭＦ５９である。

【0137】

アジュバントのさらなる例は、アクリル酸またはメタクリル酸のポリマー、および無水マレイン酸とアルケニル誘導体とのコポリマーから選ばれる化合物である。有利なアジュバント化合物は、特に糖またはポリアルコールのポリアルケニルエーテルで架橋されているアクリル酸またはメタクリル酸のポリマーである。これらの化合物は、用語カルボマー（Phameuropa、８巻、２号、１９９６年６月）により公知である。当業者はまた、少なくとも３個のヒドロキシル基、好ましくは８個以下のヒドロキシル基を有するポリヒドロキシル化された化合物で架橋されたこのようなアクリル系ポリマーを記載している米国特許第２，９０９，４６２号を参照することができ、少なくとも３個のヒドロキシル基は、少なくとも２個の炭素原子を有する不飽和脂肪族基によって置換される。好ましいラジカルは、２〜４個の炭素原子を含有するラジカルであり、例えば、ビニル、アリルおよび他のエチレン性不飽和基が挙げられる。不飽和基は、それ自体、メチルなどの他の置換基を含有し得る。Ｃａｒｂｏｐｏｌ（ＢＦ Ｇｏｏｄｒｉｃｈ、オハイオ州、米国）という名称で販売されている製品が特に適切である。それらは、アリルスクロースまたはアリルペンタエリスリトールと架橋される。その中で、Ｃａｒｂｏｐｏｌ ９７４Ｐ、９３４Ｐおよび９７１Ｐが言及され得る。Ｃａｒｂｏｐｏｌ ９７１Ｐの使用が最も好ましい。無水マレイン酸とアルケニル誘導体のコポリマーの中には、無水マレイン酸とエチレンのコポリマーであるコポリマーＥＭＡ（Ｍｏｎｓａｎｔｏ）がある。水へのこれらのポリマーの溶解は、免疫原性、免疫学的またはワクチン組成物自体が取り込まれるアジュバント溶液を与えるために、好ましくは生理学的ｐＨに、中和される酸性溶液をもたらす。

【0138】

さらに適切なアジュバントには、限定されないが、多数ある中で、ＲＩＢＩアジュバントシステム（Ｒｉｂｉ Ｉｎｃ．）、ブロックコポリマー（ＣｙｔＲｘ、アトランタ、ＧＡ）、ＳＡＦ−Ｍ（Ｃｈｉｒｏｎ、エメリービル、ＣＡ）、モノホスホリル脂質Ａ、アブリジン脂質−アミンアジュバント、大腸菌由来の熱不安定性エンテロトキシン（組換えまたはその他）、コレラ毒素、ＩＭＳ １３１４もしくはムラミルジペプチド、あるいは天然もしくは組換えサイトカインまたはそれらの類似体、あるいは内在性サイトカイン放出の刺激剤が含まれる。

【0139】

アジュバントは、用量あたり約１００μｇ〜約１０ｍｇの量で、好ましくは用量あたり約１００μｇ〜約１０ｍｇの量で、より好ましくは用量あたり約５００μｇ〜約５ｍｇの量で、なおより好ましくは用量あたり約７５０μｇ〜約２．５ｍｇの量で、最も好ましくは用量あたり約１ｍｇの量で添加され得ることが期待される。あるいは、アジュバントは、最終生成物の体積比で、約０．０１〜５０％の濃度で、好ましくは約２％〜３０％の濃度で、より好ましくは約５％〜２５％の濃度で、さらにより好ましくは約７％〜２２％の濃度で、最も好ましくは１０％〜２０％の濃度で存在し得る。

【0140】

本発明の一態様において、免疫原性組成物は、必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である。「処置および／または予防」、「臨床徴候」および「必要とする」という用語は、他の箇所において定義されている。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、相同的なチャレンジから保護する。「保護」および「予防」および「予防する」という用語は、本出願において同義的に使用される。しかしながら、これらの用語は、他の箇所において定義されている。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、Ｍ４１によるチャレンジから保護する。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、単回投与のために製剤化される。
単回投薬の体積は、本明細書の他の箇所において定義されている。
さらに、このような単回用量のこのような免疫原性組成物の投与後に、１用量の本発明の免疫原性組成物は有効であることが示されている。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、ＩＢＶの用量あたり１〜１０ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ５０／ｍｌを含む。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、ＩＢＶの用量あたり２〜５ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ５０／ｍｌを含む。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、ＩＢＶの用量あたり２〜４ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ５０／ｍｌを含む。

【0141】

キット
組成物は、必要に応じて、活性成分を含有する１つまたは複数の単位投与形態を含有し得るパックまたはディスペンサーデバイス中に提供され得る。パックは、例えば、ブリスターパックなどの金属またはプラスチックホイルを含み得る。パックまたはディスペンサーデバイスは、投与するための、好ましくは対象、特に家禽に投与するための指示書を添付され得る。このような容器（単数または複数）に、医薬品または生物学的製剤の製造、使用または販売を規制する政府機関によって規定された形式の通知が関連付けることができる。この通知は、人ヒト投与用の製造、使用または販売の機関による承認が反映される。
したがって、本発明は、本明細書に記載されているＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキットを提供する。
本発明の一態様において、キットは、鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む。
本発明の一態様において、キットは、家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む。
本発明の一態様において、キットは、ＩＢ（伝染性気管支炎）の処置および／または予防のための指示書をさらに含む。

【0142】

処置方法
さらに、本発明は、対象を免疫化する方法であって、そのような対象に本明細書に記載されている免疫原性組成物を投与することを含む方法を提供する。
「免疫化する」という用語は、免疫化される対象に免疫原性組成物を投与することによる能動免疫化に関し、それにより、このような免疫原性組成物に含まれる抗原に対する免疫学的反応を引き起こす。
好ましくは、免疫化は、一群における特定のＩＢＶ感染の発症率の緩和、または特定のＩＢＶ感染によって引き起こされるかもしくは関連付けられる臨床徴候の重症度の低減をもたらす。
さらに、本明細書で提供される免疫原性組成物による、必要性のある対象の免疫化は、ＩＢＶ感染による対象の感染の予防をもたらす。さらにより好ましくは、免疫化は、ＩＢＶ感染に対して有効であり、持続的な免疫学的反応をもたらす。前記期間は、１ヶ月を超え、好ましくは２ヶ月を超え、好ましくは３ヶ月を超え、より好ましくは４ヶ月を超え、より好ましくは５ヶ月を超え、より好ましくは６ヶ月を超えて続くことが理解される。免疫化は、免疫化されたすべての対象において有効でない場合があることを理解するべきである。しかしながら、その用語は、一群の対象のかなりの部分が効果的に免疫化されることを要求する。

【0143】

好ましくは、通常、すなわち免疫化せずに、ＩＢＶ感染によって通常引き起こされるかまたはＩＢＶ感染に関連付けられる臨床徴候を発症する一群の対象が想定される。一群の対象が効果的に免疫化されているかどうかは、当業者にさらなる煩雑さを伴うことなく決定することができる。好ましくは、免疫化は、少なくとも３３％、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも９０％、なおより好ましくは少なくとも９５％、最も好ましくは少なくとも１００％の所与の群の対象における臨床徴候が、本発明の前に利用可能であった免疫原性組成物で免疫化されていないかまたは免疫化されたが、後に特定のＩＢＶに感染した対象と比較して、少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２０％、なおより好ましくは少なくとも３０％、さらにより好ましくは少なくとも４０％、なおより好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、なおより好ましくは少なくとも７０％、なおより好ましくは少なくとも８０％、なおより好ましくは少なくとも９０％、なおより好ましくは少なくとも９５％、最も好ましくは１００％まで発症率または重症度において減少される場合、有効である。
さらに、本発明は、必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に本明細書に記載されている免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法を提供する。

【0144】

「処置および／または予防」という用語は、一群における特定のＩＢＶ感染の発症率の減少、または特定のＩＢＶ感染によって引き起こされるかもしくは関連付けられる臨床徴候の重症度の低減を指す。したがって、「処置および／または予防」という用語はまた、特定のＩＢＶに感染するようになった一群における対象数の減少（＝特定のＩＢＶ感染の発症率の減少）、あるいは、通常、ＩＢＶ感染と関連付けられるかもしくはＩＢＶ感染によって引き起こされる臨床徴候の重症度の減少、あるいは特定のＩＢＶによる感染後のウイルス排出の低減、または対象が本明細書において提供される免疫原性組成物を受けていない対象群と比較して、このような有効量の免疫原性組成物を受けている対象群において、特定のＩＢＶによる感染後の産卵鶏における産卵減少の予防もしくは低減を指す。

【0145】

「処置および／または予防」は、一般的に、本発明の有効量の免疫原性組成物を、必要性のある対象もしくは一群の対象に投与すること、またはこのような処置／予防から利益を得ることができることを伴う。用語「処置」とは、対象または一群の少なくとも一部の対象がＩＢＶに既に感染している場合、有効量の免疫原性組成物の投与を指し、そのような対象は、そのようなＩＢＶ感染によって引き起こされるかまたはそれに関連付けられた一部の臨床徴候をすでに示している。用語「予防」とは、ＩＢＶによるこのような対象のいずれもの感染前の対象、または少なくとも、このような対象もしくは対象群における対象のいずれもがこのようなＩＢＶによって引き起こされるかまたはこのようなＩＢＶによる感染に関連付けられるいずれもの臨床徴候を示さない対象の投与を指す。「予防（prophylaxis）」および「予防（prevention）」という用語は、本出願において同義的に使用される。

【0146】

本明細書で使用される「有効量」という用語は、限定されないが、対象において免疫反応を誘発するかまたは誘発することができる抗原の量を意味する。このような有効量は、一群における特定のＩＢＶ感染の発症率を減少することができ、または特定のＩＢＶ感染の臨床徴候の重症度を低減させることができる。
好ましくは、臨床徴候は、本発明の前に利用可能であった免疫原性組成物で処置されていないかまたは処置されたが、後に特定のＩＢＶに感染した対象と比較して、少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２０％、なおより好ましくは少なくとも３０％、さらにより好ましくは少なくとも４０％、なおより好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、なおより好ましくは少なくとも７０％、なおより好ましくは少なくとも８０％、なおより好ましくは少なくとも９０％、なおより好ましくは少なくとも９５％、最も好ましくは１００％まで発症率または重症度において減少される。

【0147】

用語「臨床徴候」は、本明細書で使用するとき、ＩＢＶからの対象の感染の徴候を指す。感染の臨床徴候は、選択される病原体に依存する。このような臨床徴候の例には、限定されないが、呼吸困難、腎炎、唾液腺炎、異常な産卵、羽毛の波打ち、うつ病、成長率の低下および食欲の低下が含まれる。呼吸窮迫の徴候は、気管におけるガス抜き、咳、くしゃみ、気管支収縮、鼻および眼球排出、気管病変および線毛運動障害を含む呼吸器徴候を包含する。腎炎の徴候は、腎臓病変および水様性下痢を包含する。異常な産卵の徴候は、産卵減少、より小さいサイズの卵、下殻、内部卵の質の低下、卵黄の薄い卵および卵管内の線毛運動障害を包含する。しかしながら、臨床徴候はまた、限定されないが、生きている動物から直接観察可能な臨床徴候を含む。生きた動物から直接観察される臨床徴候の例には、鼻および眼球排出、咳、喘ぎ、くしゃみ、気管支収縮、羽毛の波打ち、結膜炎、体重減少、成長率の低下、食欲の低下、脱水、水様性下痢、跛行、嗜眠、衰弱および発育不全などが含まれる。

【0148】

好ましくは、本発明の前に利用可能であった免疫原性組成物で処置されていないかまたは処置されたが、後に特定のＩＢＶに感染した対象と比較して、処置された対象における発症率または重症度が減少した臨床徴候は、線毛運動障害の低減、水泡音の低減、産卵減少の低減、腎臓病変の低減、水様性下痢の低減、体重減少の低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはそれらの組み合わせを指す。
用語「必要とする」または「必要性のある」とは、本明細書で使用するとき、投与／処置が、本発明による免疫原性組成物を受ける対象の健康もしくは臨床徴候、または健康における任意の他の陽性な薬効の増強または改善と関連付けられる。

【0149】

用語「低減する」または「低減した」または「低減」または「より低い」は、本出願において同義的に使用される。用語「低減」とは、臨床徴候が、処置されていない（免疫化されていない）が、後に特定のＩＢＶに感染した対象と比較して、少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２０％、なおより好ましくは少なくとも３０％、さらにより好ましくは少なくとも４０％、なおより好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、なおより好ましくは少なくとも７０％、なおより好ましくは少なくとも８０％、なおより好ましくは少なくとも９０％、なおより好ましくは少なくとも９５％、最も好ましくは１００％まで減少されることを意味する。
さらに、本発明は、必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に本明細書に記載されている免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法を提供する。
例に示されるように、本明細書において提供される免疫原性組成物は、線毛運動障害の低減を効果的であることが証明されている。
用語「線毛運動障害」は、気管内の線毛の運動の低減を指す。したがって、線毛運動障害は、線毛の運動のために気管内輪の内層を調べることによって決定され得る。気管内の線毛の運動を決定する方法は、当業者の一般的な知識の範囲である。
好ましくは、線毛の運動は、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、ＩＢＷによるチャレンジまたは感染の１０日後から、より好ましくはＩＢＷによるチャレンジまたは感染の５日後から、より好ましくはＩＢＷによるチャレンジまたは感染の４日後から、より好ましくはＩＢＷによるチャレンジまたは感染の３日後から、最も好ましくはＩＢＷによるチャレンジまたはＩＢＶ感染の１日または２日後から低下しない。

【0150】

用語「線毛運動障害の低下」とは、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、少なくとも１０％、より好ましくは少なくとも２０％、なおより好ましくは少なくとも３０％、さらにより好ましくは少なくとも４０％、なおより好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、なおより好ましくは少なくとも７０％、なおより好ましくは少なくとも８０％、なおより好ましくは少なくとも９０％、なおより好ましくは少なくとも９５％、最も好ましくは１００％まで低減することを意味する。線毛運動障害の低減を測定する方法は、当業者の一般的な知識の範囲内である。
本発明の一態様において、前記対象は鳥である。
用語「鳥」は、当業者に周知である。用語「鳥」は、家禽を含むすべてのトリを包含する。
本発明の一態様において、前記対象は家禽である。
用語「家禽」は、当業者に周知である。用語「家禽」は、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、キジ、ギニアフォウル、ガチョウ、およびアヒルを包含する。さらに、用語「ニワトリ」には、若鶏、産卵鶏、および繁殖家として再交雑される生殖用のストックが含まれる。
本発明の一態様において、前記対象は、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は１回投与される。
単回投薬は１回のみ投与されることが理解される。例に示されるように、本明細書において提供される免疫原性組成物は、単回投薬を必要性のある対象に投与した後に有効であることが証明されている。
家禽ああたりの投薬量は、ワクチン接種の経路および家禽の年齢に依存する。

【0151】

典型的には、点眼ワクチンは、任意の年齢で１用量あたり１〜１００μｌの体積で投与される。好ましくは、点眼用の単回投薬ワクチンは、約５μｌ〜５０μｌの全体積、より好ましくは約２０μｌ〜５０μｌの全体積を有し、単一の２０μｌ、２５μｌ、３０μｌ、３５μｌ、４０μｌ、４５μｌまたは５０μｌの用量が好ましい。最も好ましくは、点眼用の単回投与ワクチンは、約３０μｌ〜５０μｌの全体積を有し、単一の３０μｌ、３５μｌ、４０μｌ、４５μｌまたは５０μｌの用量が好ましい。

【0152】

スプレーワクチンは、１日齢の家禽については、２５〜１０００μｌの体積で用量を含有し得る。好ましくは、スプレーワクチン用の単回用量は、約５０μｌ〜５０００μｌ、より好ましくは約７５μｌ〜２０００μｌ、より好ましくは約１００μｌ〜１０００μｌ、さらにより好ましくは約２００μｌ〜９００μｌ、さらにより好ましくは約３００μｌ〜８００μｌ、さらにより好ましくは約４００μ〜７００μｌの全体積を有し、単一の４００μｌ、４２５μｌ、４５０μｌ、４７５μｌ、５００μｌ、５２５μｌ、５５０μｌ、５７５μｌ、６００μｌ、６２５μｌ、６５０μｌ、６７５μｌまたは７００μｌの用量が好ましい。最も好ましくは、単回用量は、４００μｌ、４５０μｌ、５００μｌ、５５０μｌ、６００μｌ、６５０μｌまたは７００μｌの全体積を有する。

【0153】

卵内ワクチン接種用のワクチンは、５０〜１００μｌ、好ましくは５０μｌの体積の用量を含有し得る。好ましくは、卵内ワクチン用の単回用量は、約１０μｌ〜２５０μｌ、より好ましくは約１５μｌ〜２００μｌ、さらにより好ましくは約２０μｌ〜１５０μｌ、さらにより好ましくは約３０μｌ〜１００μｌ、さらにより好ましくは約３０μｌ〜７５μｌの全体積を有し、単一の３０μｌ、３５μｌ、４０μｌ、４５μｌ、５０μｌ、５５μｌ、６０μｌ、６５μｌ、７０μｌまたは７５μｌ用量が好ましい。最も好ましくは、単回用量は、４０μｌ、４５μｌ、５０μｌ、５５μｌまたは６０μｌの全体積を有する。
筋肉内または皮下ワクチン接種用のワクチンまたは飲用水ワクチンの１用量は、３０μｌ〜１０００μｌの体積の用量を含有し得る。好ましくは、単回用量は、約３０μｌ〜１０００μｌ、より好ましくは約５０μｌ〜５００μｌ、より好ましくは約７５μｌ〜２５０μｌ、さらにより好ましくは約１００μｌ〜２００μｌの全体積を有し、単一の１００μｌ、１１０μｌ、１２０μｌ、１２５μｌ、１３０μｌ、１３５μｌ、１４０μｌ、１４５μｌ、１５０μｌ、１６０μｌ、１７０μｌ、１７５μｌ、１８０μｌ、１９０μｌ、１５５μｌ、または２００μｌ用量の最も好ましい。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、２回以上の用量で投与される。
しかしながら、免疫原性組成物は、２回以上の用量で投与することができ、第１用量は第２（追加免疫）用量の投与前に投与される。

【0154】

２回の投薬レジメンの好ましい態様において、免疫原性組成物の第１用量と第２用量の両方は、同量で投与される。好ましくは、各用量は、上記の好ましい量である。第１および第２の投薬レジメンに加えて、別の実施形態は、さらに続く投薬を含む。例えば、第３、第４または第５の用量をこれらの態様で投与することができる。好ましくは、続く第３、第４および第５の投薬レジメンは、第１用量と同量で投与され、投薬間の時間枠は、上記の第１および第２の投薬間の時期と一致する。

【0155】

好ましくは、ワクチンの１回目の投与は、以下に記載の方法により、最初の３週齢以内、より好ましくは１週齢以内、最も好ましくは１日齢で実施される。２回目の投与は、最初の２０週齢以内、好ましくは１６〜１８週齢以内、より好ましくは６〜１２週齢以内に実施することができる。典型的には、初回（１回目）のワクチン接種は１〜１０日齢で実施され、２回目のワクチン接種（追加免疫）は６〜１２週齢もしくは１６〜１８週齢で生ワクチンまたは不活化ワクチンを用いて実施される。より好ましくは、初回（１回目）のワクチン接種は１日齢で実施され、２回目のワクチン接種（追加免疫）は６〜１２週齢もしくは１６〜１８週齢で生ワクチンまたは不活化ワクチンを用いて実施される。
卵内ワクチン接種が使用される場合、好ましくは、胚が１５〜１９日齢、好ましくは１７、１８または１９日齢、最も好ましくは１８日齢であるときに、１回目の投与が実施される。２回目の投与は、最初の３週齢以内、好ましくは最初の１０日齢以内に実施することができる。
本発明の一態様において、前記免疫原性組成物は、皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される。

【0156】

免疫原性組成物は、好ましくは、局所的または全身的に投与される。適切な投与経路は、鼻内、静脈内、皮内、経皮、筋肉内、腹腔内、皮下、ならびに吸入、卵内、噴霧、飲用水または点眼によるものなどの経口または非経口投与である。しかしながら、化合物の性質および作用様式に依存して、免疫原性組成物は、同様に他の経路によって投与され得る。例えば、このような他の経路には、皮内、静脈内、血管内、動脈内、腹腔内、髄腔内、気管内、皮内、心臓内、間唇内、肺葉内、髄内、肺内、直腸内、および膣内が含まれる。しかしながら、最も好ましくは、免疫原性組成物は、皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される。
生ＩＢＶワクチンは、好ましくは、点眼、鼻腔内、筋肉内または皮下により個々に投与される。
より好ましくは、飲用水およびエアロゾルスプレーワクチン接種を含む大量塗布方法が使用される。また、以下にさらに記載されるように、胚ワクチン（いわゆる卵内ワクチン）としてのワクチンの使用が好ましい。
例えば、若鶏は、１日齢または１〜３週齢で、特に、高レベルのＭＤＡを有する若鶏に対してワクチン接種され得る。飼育ストックまたは繁殖用ストックは、初期には、１〜１０日齢でワクチン接種され、７〜１２週齢または１６〜１８週齢でワクチンにより追加免疫され得る。
卵内投与

【0157】

前記で概説したように、本発明はまた、卵内経路を介して安全に投与することができ、同時に防御免疫反応を誘導することができるＩＢＶワクチンを提供する。卵内投与は当業者に周知であり、当業者はさらなる煩雑さを伴うことなしに卵内投与を行うことができる。ワクチンの卵内投与は、卵に含有されている間にトリ胚へのワクチンの投与を伴う（卵内ワクチン接種についての概説については、Ricksら、Advances in Vet. Med.、４９５〜５１５頁、１９９９年を参照されたい）。ワクチンは、当該技術分野（Sharma；Am. J. Vet. Res.、４５巻、１６１９〜１６２３頁、１９８４年）において報告されているように、卵の任意の適切な区画（例えば、尿膜腔液、卵黄嚢、羊膜、気胞または胚）に投与され得る。好ましくは、ワクチンは、卵殻膜（気胞膜）および漿尿膜の下に投与される。
好ましくは、ワクチンは、孵化の後期中に、一般的に、孵化期間の最後の４分の１の間、好ましくは孵化の３〜４日前に胚の卵に注入される。好ましくは、投与は、胚が１５〜１９日齢、好ましくは１７、１８または１９日齢、最も好ましくは１８日齢である場合に実施される。続いて、ワクチン接種された孵化卵は、孵化のためにインキュベーターに移される。卵内投与のプロセスは、従来技術に記載されているようなロボット注入プロセスを用いて自動化することができる。

【0158】

後期胚は、検査されるほとんどのワクチンウイルスの感染に対して非常に感受性が高いため、通常、家禽の孵化後ワクチン接種のための従来のワクチンは、卵内ワクチン接種には使用することができない。しかしながら、国際特許出願公開第０１／６４２４４号は、ＩＢＶワクチンが、それが非常に低用量で適用されるという条件で、卵内投与に使用することができることを開示する。さらに、Wakenellら、１９８６年（Am. J. Vet. Res.、４７巻、９３３〜９３８頁）は、組織培養においてＩＢワクチンウイルスを継代することにより、ウイルスを胚に対して非病原性にすることを開示する。
本発明の一態様において、前記免疫原性組成物は、点眼を介して投与される。

【0159】

典型的には、孵化後投与用の生ワクチンは、単位用量あたり１０¹〜１０⁸のＥＩＤ₅₀（５０％卵感染用量）の濃度、好ましくは単位用量あたり１０²〜１０⁵のＥＩＤ₅₀の濃度、より好ましくは単位用量あたり１０²〜１０⁴のＥＩＤ₅₀の濃度、さらにより好ましくは単位用量あたり１０²〜１０³のＥＩＤ₅₀の濃度で弱毒化ＩＢＶを含む。
卵内投与用の生ワクチンは、典型的には、５０〜１００μｌ、好ましくは５０μｌの体積で、１０²〜１０⁷のＥＩＤ₅₀／胚、好ましくは１０²〜１０³のＥＩＤ₅₀／胚の減弱化ＩＢＶの量を含む。

【0160】

好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、用量あたり約１〜約１０ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ（卵感染用量）₅₀／ｍｌの量で、好ましくは用量あたり約２〜約８ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌの量で、好ましくは用量あたり約２〜約７ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌの量で、より好ましくは用量あたり約２〜約６ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ５０／ｍｌの量で、さらにより好ましくは用量あたり約２〜約５ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌの量で、さらにより好ましくは用量あたり約２〜約３ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌの量で、本発明のＩＢＶを含む。より好ましくは、本発明の免疫原性組成物は、用量あたり約１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、５．５、６、６．５、７、７．５またはｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌの量で本発明のＩＢＶを含む。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、１〜１０ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌのＩＢＶを含む。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、２〜５ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌのＩＢＶを含む。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、２〜４ｌｏｇ₁₀のＥＩＤ₅₀／ｍｌのＩＢＶを含む。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、最初の１週間齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または最初の１日齢以内に対象に投与される。

【0161】

好ましくは、免疫化される対象は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０または２１日齢である。より好ましくは、免疫化される前記対象は、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４日齢である。最も好ましくは、免疫化される前記対象は、１、２、３、４、５、６または７日齢である。
しかしながら、数日齢である対象者のワクチン接種後、家禽の免疫系がＩＢＶ感染に対する免疫を増強するためには数日を要することを理解しなければならない。したがって、好ましくは、対象は、最初の２４時間齢以内に免疫化される。
本発明の一態様において、免疫原性組成物は、１日齢以内に対象に投与される。例に示されるように、本明細書において提供される免疫原性組成物は、１日齢の家禽に投与した場合、安全であり、有効であることが証明されている。

【0162】

本発明の一態様において、前記方法は、同種の免疫化されていない対照群と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、水泡音の予防もしくは低減、産卵減少の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水様性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはそれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータの改善をもたらす。
「処置および／または予防」という用語は、他の箇所において定義されており、ここでは、「予防（prophylaxis）」および「予防する」または「予防（prevention）」という用語は、本出願において同義的に使用される。さらに、「排出する」という用語もまた、他の箇所において定義されている。

【0163】

「低減する」、「低減した」、「低減」または「より低い」という用語は、有効性パラメータ（線毛運動障害、水泡音、産卵減少、腎臓病変、水様性下痢、体重減少、ウイルス負荷、ウイルス排出）が、同種の免疫化されていない対照群と比較して、少なくとも１０％、好ましくは少なくとも２０％、より好ましくは少なくとも３０％、なおより好ましくは少なくとも４０％、なおより好ましくは少なくとも５０％、なおより好ましくは少なくとも６０％、なおより好ましくは少なくとも７０％、なおより好ましくは少なくとも８０％、なおより好ましくは少なくとも９０％、なおより好ましくは少なくとも９５％、最も好ましくは１００％低減することを意味する。有効性パラメータの改善を測定する方法は、当業者の一般的な知識の範囲内である。

【0164】

用語「ウイルス負荷」は当業者に周知である。ウイルス負荷という用語は、本明細書中のウイルス力価という用語と同義である。ウイルス負荷またはウイルス力価は、活動性ウイルス感染の重症度の尺度であり、当業者に公知の方法によって決定することができる。この決定は、ウイルスタンパク質への抗体結合およびさらなる検出によるか、または、代替的に、ＲＴ−ＰＣＲなどの増幅方法によるウイルスＲＮＡの検出による、ウイルスタンパク質の検出に基づくことができる。核酸増幅法による血漿中のビリオン関連ウイルスＲＮＡのモニタリングは、レトロウイルス疾患の状態および進行を評価し、予防的および治療的介入の有効性を評価するために広く使用されるパラメータである。典型的に、ウイルス負荷またはウイルス力価は、血漿１ｍｌあたりのＲＮＡのコピー数などの、関与する体液中のウイルスの生存量を推定することによって計算することができる。
用語「線毛運動障害」は、当業者に周知である。気管の表面は、線毛と呼ばれる多数の運動性の毛様構造で裏打ちされた特殊な上皮細胞で覆われている。用語「線毛運動障害」は、線毛の減少もしくは喪失、および／または線毛運動の喪失もしくは部分喪失を包含する。線毛運動障害は、当業者にさらなる煩雑さを伴うことなく決定することができる。
用語「水泡音」は、当業者には周知である。しかしながら、用語「水泡音」は、気管水泡音を包含し、気管支から発する音を指す。水泡音は、当業者にさらなる煩雑さを伴うことなく決定することができる。
用語「産卵減少」は、当業者に周知である。用語「産卵減少」は、産卵の減少を包含する。
本発明の一態様において、処置または予防は、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または減少をもたらす。
本発明の一態様において、処置または予防は、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または軽減をもたらす。
本発明の一態様において、処置または予防は、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵減少の予防または低減をもたらす
本発明はさらに、治療的に使用するための、本明細書に記載されているＩＢＶまたは免疫原性組成物を提供する。
本発明はさらに、免疫原またはワクチンとしての使用のための、本明細書に記載されているＩＢＶまたは免疫原性組成物を提供する。
本発明はさらに、医薬としての使用のための、本明細書に記載されているＩＢＶまたは免疫原性組成物を提供する。
本発明はさらに、医薬の製造のための、本明細書に記載されているＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用を提供する。
本発明はさらに、対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、本明細書に記載されているＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用を提供する。

【0165】

さらに、ＯＲＦ３ａの単一の不活性化またはＯＲＦ３ｂの単一の不活性化またはＯＲＦ５ａの単一の不活性化またはＯＲＦ５ｂの単一の不活性化は、同様にＩＢＶの弱毒化をもたらすことを理解しなければならない。したがって、ＯＲＦ３ａの単一の不活性化またはＯＲＦ３ｂの単一の不活性化またはＯＲＦ５ａの単一の不活性化またはＯＲＦ５ｂの単一の不活性化を有するＩＢＶは、免疫原性組成物を調製するために使用することができる。さらに、このような免疫原性組成物は、本明細書に記載されるような効果（ＩＢＶチャレンジ感染に対する防御など）を有する。

【0166】

さらに、このような単一の不活性化（ＯＲＦ３ａまたはＯＲＦ３ｂまたはＯＲＦ５ａまたはＯＲＦ５ｂ）を生じさせる場合、終止コドンを含む配列が、ＯＲＦの下流に挿入されて、前記ＯＲＦの翻訳の停止を確実にすることができると理解しなければならない。これは、２つのＯＲＦが重複し、一方のＯＲＦの不活性化が他方のＯＲＦの終止コドンを不活性化する場合に必要となり得る。

【0167】

実施形態
以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ。

【0168】

２．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、または
− ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物。
３．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはＥタンパク質の活性に影響しない、条項１のＩＢＶまたは条項２の免疫原性組成物。
４．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはＳタンパク質の活性に影響しない、条項１〜３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはＮタンパク質の活性に影響しない、条項１〜４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0169】

６．前記不活性化が、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ３ｂの部分的な欠失ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ３ｂの部分的なトランケーションならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ３ｂの部分的な逆位ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ３ｂの部分的な再配置ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、条項１〜５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７．ＯＲＦ３ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８．ＯＲＦ５が完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0170】

９．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０．ＯＲＦ３ａが完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂが部分的に欠失している、条項１〜９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１．ＯＲＦ５ａが完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失している、条項１〜１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａが完全もしくは部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが部分的に欠失している、条項１〜１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１３．ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜１２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0171】

１４．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が不活性化されている、条項１〜１３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項１３または条項１４のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６．ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が不活性化されている、条項１〜１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項１６または条項１７のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0172】

１９．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２１．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている、条項１〜２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２２．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0173】

２３．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされており、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている、条項１〜２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0174】

２４．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0175】

２５．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0176】

２６．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0177】

２７．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２８．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0178】

２９．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜１７３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜１７２ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜１７１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１７４）から１〜１７５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド１７５）から１〜１７４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド１７６）から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３０．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0179】

３１．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜１９４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜１９３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜１９２ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜１９１ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜１９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜１８９ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0180】

３２．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0181】

３３．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３４．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0182】

３５．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３６．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１７４〜２００ヌクレオチド、もしくは１７４〜３００ヌクレオチド、もしくは１７４〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0183】

３７．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１７４〜３４８ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１７３〜３４７ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１７２〜３４６ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３８．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１９５〜２５０ヌクレオチド、もしくは１９５〜３００ヌクレオチド、もしくは１９５〜３５０、もしくは１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0184】

３９．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１９５〜３８５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１９４〜３８４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１９３〜３８３ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0185】

４０．ＯＲＦ３ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0186】

４１．ＯＲＦ５ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0187】

４２．ＯＲＦ３ａの１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４３．ＯＲＦ５ａの１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４４．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４５．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0188】

４６．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0189】

４７．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４８．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４９．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0190】

５０．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５１．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0191】

５２．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５３．配列番号１に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0192】

５４．配列番号１に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５５．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５６．配列番号２に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0193】

５７．配列番号２に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５８．前記ＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜５７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５９．前記ＩＢＶが遺伝的に操作されている、条項１〜５８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６０．前記ＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜５９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0194】

６１．前記ＩＢＶが、アーカンソー（Ａｒｋａｎｓａｓ）（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット（Ｃｏｎｎｅｃｔｉｃｕｔ）、デラウェア（Ｄｅｌａｗａｒｅ）（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄｕｔｃｈ）（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ（Ｆｌｏｒｉｄａ）、ジョージア（Ｇｅｏｒｇｉａ）（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３など）、グレイ（Ｇｒａｙ）、ホルテ（Ｈｏｌｔｅ）、アイオワ（Ｉｏｗａ）（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（Ｉｔａｌｙ）（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（Ｍａｉｎｅ）（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍａｓｓａｃｈｕｓｅｔｔｓ）（Ｍ４１、ボーデット（Ｂｅａｕｄｅｔｔｅ）、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０など）、ペンシルベニア（Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａ）（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ（Ｗｏｌｇ）／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント（Ｖａｒｉａｎｔ）２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１〜６０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６２．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１〜６１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0195】

６３．前記ＱＸ遺伝子型が、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／１７０／０９、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６を含むリストから選択される、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６４．前記マサチューセッツ遺伝子型が、Ｈ１２０、Ｈ５２、スペイン（Ｓｐａｉｎ）／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、スペイン／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３を含むリストから選択される、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0196】

６５．前記４／９１遺伝子型が、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、スペイン／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１を含むリストから選択される、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６６．前記Ｑ１遺伝子型が、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ（Ｃｈｉｌｅ）−２９５−１０を含むリストから選択される、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0197】

６７．前記イタリア０２遺伝子型が、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、スペイン／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８を含むリストから選択される、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６８．前記ＩＢＶがマサチューセッツ遺伝子型株Ｈ５２のものである、条項１〜６２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６９．ワクチンである、条項２〜６８のいずれか１項の免疫原性組成物。
７０．薬学的に許容される担体を含む、条項２〜６９のいずれか１項の免疫原性組成物。
７１．前記薬学的に許容される担体がリン酸緩衝生理食塩水である、条項７０の免疫原性組成物。
７２．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である、条項２〜７１のいずれか１項の免疫原性組成物。
７３．同種チャレンジから保護する、条項２〜７２のいずれか１項の免疫原性組成物。
７４．Ｍ４１によるチャレンジから保護する、条項２〜７３のいずれか１項の免疫原性組成物。
７５．単回投与のために製剤化される、条項２〜７４のいずれか１項の免疫原性組成物。
７６．皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項２〜７５のいずれか１項の免疫原性組成物。
７７．１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜７６のいずれか１項の免疫原性組成物。
７８．２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜７７のいずれか１項の免疫原性組成物。
７９．２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜７８のいずれか１項の免疫原性組成物。
８０．条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキット。
８１．鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項８０に記載のキット。
８２．家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項８１に記載のキット。
８３．ＩＢの処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項８２に記載のキット。
８４．対象を免疫化する方法であって、そのような対象に条項２〜７９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む方法。

【0198】

８５．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に条項２〜７９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
８６．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に条項２〜７９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
８７．対象を免疫化する方法における使用のための、条項２〜７９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0199】

８８．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法における使用のための、条項２〜７９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0200】

８９．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群における対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法における使用のための、条項２〜７９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。
９０．前記対象が鳥である、条項８４〜８９のいずれか１項の方法または使用。
９１．前記対象が家禽である、条項８４〜９０のいずれか１項の方法または使用。
９２．前記対象が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される、条項８４〜９１のいずれか１項の方法または使用。
９３．前記免疫原性組成物を１回投与する、条項８４〜９２のいずれか１項の方法または使用。
９４．前記免疫原性組成物を２回以上の用量で投与する、条項８４〜９２のいずれか１項の方法または使用。
９５．前記免疫原性組成物を、皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項８４〜９４のいずれか１項の方法または使用。
９６．前記免疫原性組成物を、点眼を介して投与する、条項８４〜９５のいずれか１項の方法または使用。
９７．前記免疫原性組成物が、１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項８４〜９６のいずれか１項の方法または使用。
９８．前記免疫原性組成物が、２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項８４〜９７のいずれか１項の方法または使用。
９９．前記免疫原性組成物が、２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項８４〜９８のいずれか１項の方法または使用。
１００．前記免疫原性組成物を、対象に、第１週齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または第１日齢以内に投与する、条項８４〜９９のいずれか１項の方法または使用。
１０１．前記免疫原性組成物を、対象に、第１日齢以内に投与する、条項８４〜１００のいずれか１項の方法または使用。

【0201】

１０２．前記方法が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、ラッセル音の予防もしくは低減、産卵低下の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはこれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータにおける改善を生じる、条項８４〜１０１のいずれか１項の方法または使用。
１０３．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または低減を生じる、条項８４〜１０２のいずれか１項の方法または使用。
１０４．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または低減を生じる、条項８４〜１０３のいずれか１項の方法または使用。
１０５．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵低下の予防または低減を生じる、条項８４〜１０４のいずれか１項の方法または使用。
１０６．治療的使用のための、条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０７．免疫原またはワクチンとしての使用のための、条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０８．医薬としての使用のための、条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０９．医薬の製造のための、条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。
１１０．対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。

【0202】

さらに、以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．ＩＢＶを増殖し、遺伝的に修飾する方法であって、
ａ）ＩＢＶのウイルスＲＮＡを細胞にトランスフェクトするステップ、
ｂ）ステップａ）からの細胞に第１の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡを共トランスフェクトするステップであって、前記第１の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡが、異なるコロナウイルスの表面タンパク質をコードするものであるステップ、
ｃ）前記部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡの前記異なるコロナウイルスにおける前記表面タンパク質について陽性であるキメラ感染性ＩＢＶクローンを選択するステップ、
ｄ）第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡを、ステップｃ）におけるキメラ感染性ＩＢＶクローンについて陽性である細胞系にトランスフェクトするステップであって、前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡがＩＢＶの表面タンパク質をコードし、前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡが、さらなる修飾を保有するものであるステップ、
ｅ）ステップｄ）からの前記細胞を、胚形成した鳥の卵に接種するステップ、
ｆ）ステップｅ）における前記胚形成した鳥の卵から、遺伝的に修飾されたＩＢＶを選択するステップであって、前記遺伝的に修飾されたＩＢＶがＩＢＶの前記表面タンパク質を有し、前記遺伝的に修飾されたＩＢＶが、前記さらなる修飾を保有するものであるステップ
を含む、方法。
２．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１の方法。

【0203】

３．前記ＩＢＶが、アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８など）、グレイ、ホルテ、アイオワアイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０正しい？など）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１または２の方法。
４．トランスフェクトすることがマイクロインジェクションである、条項１〜３のいずれか１項の方法。
５．トランスフェクトすることがエレクトロポレーションである、条項１〜３のいずれか１項方法。
６．条項１のステップａ）におけるトランスフェクションおよび条項１のステップｂ）における共トランスフェクションが同時に行われる、条項１〜５のいずれか１項の方法。
７．前記細胞が、哺乳動物、鳥、または脊椎動物起源を有する、条項１〜６のいずれか１項の方法。

【0204】

８．前記細胞が、ＢＨＫ（ベビーハムスター腎臓）−２１、Ｖｅｒｏ（アフリカミドリザル腎臓上皮細胞）、Ｃｏｓ−７（アフリカミドリザルＣｅｒｃｏｐｉｔｈｅｃｕｓ ａｅｔｈｉｏｐｓ線維芽細胞様腎細胞）、ＣＫ（ニワトリ腎臓）、ＣＥＦ（ニワトリ胚線維芽細胞）、ニワトリ胚肝細胞（ＣＥＬＣ）、ニワトリ胚皮膚細胞（ＣＥＤ）、Ｖｅｒｏ細胞、および２９３Ｔ細胞からなる群から選択される、条項１〜７のいずれか１項の方法。

【0205】

９．前記細胞が第２のタイプの細胞と共に共培養され、前記第２のタイプの細胞が、その種特異性が前記異なるコロナウイルスからのものであるよりも同種に由来するものである、条項１〜８のいずれか１項の方法。
１０．共培養のための前記第２のタイプの細胞が、マウス、ネコ、ブタ、ヒト、またはシチメンチョウに由来する細胞である、条項９の方法。

【0206】

１１．共培養のための前記第２のタイプの細胞が、マウスＬＲ７、マウスＬ２Ｒ、マウスＬ２、マウスｍＴＡＬ（マウス髄の太い上行脚）、ネコＦＣＷＦ（Ｆｅｌｉｓ ｃａｔｕｓ全胎児）、ＳＴ（ブタ精巣）またはＬＬＣ−ＰＫ（ブタ腎臓上皮細胞）である、条項９または１０の方法。
１２．共培養のための前記第２のタイプの細胞が、マウスＬＲ７である、条項９または１０の方法。
１３．条項１のステップｂ）における共トランスフェクションステップが、さらに、コロナウイルスヌクレオカプシドタンパク質（Ｎタンパク質）をコードするＲＮＡの共トランスフェクションを含む、条項１〜１２のいずれか１項の方法。

【0207】

１４．コロナウイルスＮ遺伝子をコードする前記ＲＮＡが、ＩＢＶのＮタンパク質、ＭＨＶのＮタンパク質、ＦＩＰＶのＮタンパク質またはＳＤＣＶのＮタンパク質をコードするＲＮＡである、条項１３の方法。
１５．前記表面タンパク質が受容体結合タンパク質またはその一部である、条項１〜１４のいずれか１項の方法。
１６．前記表面タンパク質がスパイクタンパク質またはその一部である、条項１〜１５のいずれか１項の方法。
１７．前記表面タンパク質が、前記スパイクタンパク質またはその一部のエクトドメインである、条項１〜１６のいずれか１項の方法。
１８．条項１のステップｂ）における異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＭＨＶ、ＦＩＰＶ、ＰＥＤＶ、もしくはＳＤＣＶの表面タンパク質またはその一部である、条項１〜１７のいずれか１項の方法。
１９．条項１のステップｂ）における異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＭＨＶ、ＦＩＰＶ、ＰＥＤＶ、もしくはＳＤＣＶの受容体結合タンパク質またはその一部である、条項１〜１７のいずれか１項の方法。
２０．条項１のステップｂ）における異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＭＨＶ、ＦＩＰＶ、ＰＥＤＶ、もしくはＳＤＣＶのスパイクタンパク質またはその一部である、条項１〜１９のいずれか１項の方法。
２１．条項１のステップｂ）における異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＭＨＶ、ＦＩＰＶ、ＰＥＤＶ、もしくはＳＤＣＶのスパイクタンパク質またはその一部のエクトドメインである、条項１〜１９のいずれか１項の方法。
２２．異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＩＢＶ以外のコロナウイルスからのものである、条項１〜２１のいずれか１項の方法。
２３．異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＭＨＶのスパイクタンパク質またはその一部である、条項１〜２２のいずれか１項の方法。
２４．異なるコロナウイルスの前記表面タンパク質が、ＭＨＶのスパイクタンパク質またはその一部のエクトドメインである、条項１〜２３のいずれか１項の方法。
２５．前記キメラ感染性ＩＢＶクローンが、ＭＨＶ、ＦＩＰＶ、ＰＥＤＶ、もしくはＳＤＣＶのスパイクタンパク質またはその一部を含む、条項１〜２４のいずれか１項の方法。

【0208】

２６．前記キメラ感染性ＩＢＶクローンが、ＭＨＶ、ＦＩＰＶ、ＰＥＤＶ、もしくはＳＤＣＶのスパイクタンパク質またはその一部のエクトドメインを含む、条項１〜２５のいずれか１項の方法。
２７．前記キメラ感染性ＩＢＶクローンが、ＭＨＶのスパイクタンパク質またはその一部を含む、条項１〜２６のいずれか１項の方法。
２８．前記キメラ感染性ＩＢＶクローンが、ＭＨＶのスパイクタンパク質またはその一部のエクトドメインを含む、条項１〜２７のいずれか１項の方法。
２９．前記胚形成した鳥の卵が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからのものである、条項１〜２８のいずれか１項の方法。
３０．前記胚形成した鳥の卵がニワトリの卵である、条項１〜２９のいずれか１項の方法。

【0209】

３１．感染性ＩＢＶクローンを選択することが、ＲＴ−ＰＣＲ、リアルタイムＲＴ−ＰＣＲ、ノザンブロット、ウェスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡアッセイ、免疫蛍光、免疫組織化学、インシチュハイブリダイゼーションからなる群から選択される方法を含む、条項１〜３０のいずれか１項の方法。
３２．前記部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡが組換えウイルスＲＮＡである、条項１〜３１のいずれか１項の方法。
３３．前記部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡが合成ウイルスＲＮＡである、条項１〜３２のいずれか１項の方法。
３４．条項１における前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡが、ＩＢＶのスパイクタンパク質またはその一部をコードする、条項１〜３３のいずれか１項の方法。
３５．条項１における前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡが、ＩＢＶのスパイクタンパク質またはその一部のエクトドメインをコードする、条項１〜３４のいずれか１項の方法。

【0210】

３６．前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡにおける前記修飾が、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列の完全な欠失、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列の部分的な欠失、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列のトランケーション、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列の逆位、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列の再配置、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列内における核酸の挿入、遺伝子、ＯＲＦ、プロモーターまたはいずれかの非コード配列内における核酸の置換からなる群から選択される、条項１〜３５のいずれか１項の方法。

【0211】

３７．前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡにおける前記修飾が、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ３ｂの部分的な欠失ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な欠失およびＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ３ｂの部分的な欠失ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよびＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ３ｂの部分的な逆位ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な逆位およびＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ３ｂの部分的な再配置ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な再配置およびＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内ならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、条項１〜３６のいずれか１項の方法。

【0212】

３８．前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡにおける前記修飾が、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な欠失、置換もしくは逆位およびＯＲＦ３ｂの部分的な欠失、置換もしくは逆位ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な欠失、置換もしくは逆位およびＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、置換もしくは逆位である、条項１〜３６のいずれか１項の方法。
３９．前記第２の部分的ＩＢＶウイルスＲＮＡにおける前記修飾が、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂならびに／またはＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂのトランケーションである、条項１〜３６のいずれか１項の方法。

【0213】

４０．前記胚形成した鶏の卵から遺伝的に修飾されたＩＢＶを選択することが、ＲＴ−ＰＣＲ、リアルタイムＲＴ−ＰＣＲ、ノザンブロット、ウェスタンブロット、ラジオイムノアッセイ、ＥＬＩＳＡアッセイ、免疫蛍光 免疫組織化学、インシチュハイブリダイゼーション、終点希釈からなる群から選択される方法を含む、条項１〜３９のいずれか１項の方法。
４１．前記遺伝的に修飾されたＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜４０のいずれか１項の方法。
４２．前記遺伝的に修飾されたＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜４１のいずれか１項の方法。
４３．胚形成したニワトリの卵において前記遺伝的に修飾されたコロナウイルスを選択することが、限界希釈によって行われる、条項１〜４２のいずれか１項の方法。
４４．条項１〜４３のいずれか１項に記載の方法を含む、弱毒化ＩＢＶワクチンを調製する方法。
４５．前記弱毒化ＩＢＶを薬学的に許容される担体と共に混合することを含む、条項４４の方法。
４６．条項１〜４３のいずれか１項に記載のＩＢＶを含む細胞。
４７．条項１〜４３のいずれか１項に記載のＩＢＶを含む、胚形成した鳥の卵。
４８．条項１〜４２のいずれか１項に記載のＩＢＶを含む、胚形成したニワトリの卵。
４９．条項１〜４２のいずれか１項に記載の方法によって得られた弱毒化ＩＢＶ。

【0214】

さらに、ＯＲＦ３ａの不活性化に関する以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．ＯＲＦ３ａが不活性化されている、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）。
２．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ａが不活性化されている、免疫原性組成物。
３．ＯＲＦ３ａの前記不活性化が、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはＳタンパク質の活性に影響しない、条項１または２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４．ＯＲＦ３ａの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｂの発現に影響しないおよび／または３ｂタンパク質の活性に影響しない、条項１〜３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５．前記不活性化が、ＯＲＦ３ａの完全または部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全または部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａの完全または部分的な逆位、ＯＲＦ３ａの完全または部分的な再配置、ＯＲＦ３ａ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａ内における核酸の置換である、条項１〜４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６．ＯＲＦ３ａが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７．ＯＲＦ３ａが部分的に欠失している、条項１〜６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８．ＯＲＦ３ａの開始コドンが不活性化されている、条項１〜７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）が不活性化されている、条項１〜８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項８または条項９のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0215】

１１．ＯＲＦ３ａが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２．ＯＲＦ３ａが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0216】

１３．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0217】

１４．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜１７３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜１７２ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜１７１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0218】

１７．ＯＲＦ３ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８．ＯＲＦ３ａの１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１９．ＯＲＦ３ａが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド１７３まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０．配列番号３３に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0219】

２１．配列番号３３に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２２．前記ＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２３．前記ＩＢＶが遺伝的に操作されている、条項１〜２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４．前記ＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜２３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0220】

２５．前記ＩＢＶが、アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３など）、グレイ、ホルテ、アイオワ（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０など）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１〜２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２６．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１〜２５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0221】

２７．前記ＱＸ遺伝子型が、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／１７０／０９、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２８．前記マサチューセッツ遺伝子型が、Ｈ１２０、Ｈ５２、スペイン／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、スペイン／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0222】

２９．前記４／９１遺伝子型が、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、スペイン／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３０．前記Ｑ１遺伝子型が、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ−２９５−１０を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0223】

３１．前記イタリア０２遺伝子型が、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、スペイン／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３２．前記ＩＢＶがマサチューセッツ遺伝子型株Ｈ５２のものである、条項１〜２６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３３．ワクチンである、条項２〜３２のいずれか１項の免疫原性組成物。
３４．薬学的に許容される担体を含む、条項２〜３３のいずれか１項の免疫原性組成物。
３５．前記薬学的に許容される担体がリン酸緩衝生理食塩水である、条項３４の免疫原性組成物。
３６．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である、条項２〜３５のいずれか１項の免疫原性組成物。
３７．同種チャレンジから保護する、条項２〜３６のいずれか１項の免疫原性組成物。
３８．Ｍ４１によるチャレンジから保護する、条項２〜３７のいずれか１項の免疫原性組成物。
３９．単回投与のために製剤化される、条項２〜３８のいずれか１項の免疫原性組成物。
４０．皮下、筋肉内、経口的、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される、条項２〜３９のいずれか１項の免疫原性組成物。
４１．１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４０のいずれか１項の免疫原性組成物。
４２．２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４１のいずれか１項の免疫原性組成物。
４３．２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４２のいずれか１項の免疫原性組成物。
４４．条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキット。
４５．鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４４に記載のキット。
４６．家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４５に記載のキット。
４７．ＩＢの処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４６に記載のキット。
４８．対象を免疫化する方法であって、そのような対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む方法。

【0224】

４９．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５０．必要性のある対象において、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５１．対象を免疫化する方法における使用のための免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物。

【0225】

５２．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法における使用のための免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物。

【0226】

５３．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法における使用のための免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物。
５４．前記対象が鳥である、条項４８〜５３のいずれか１項の方法または使用。
５５．前記対象が家禽である、条項４８〜５４のいずれか１項の方法または使用。
５６．前記対象が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される、条項４８〜５５のいずれか１項の方法または使用。
５７．前記免疫原性組成物を１回投与する、条項４８〜５６のいずれか１項の方法または使用。
５８．前記免疫原性組成物を２回以上の用量で投与する、条項４８〜５６のいずれか１項の方法または使用。
５９．前記免疫原性組成物を、皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項４８〜５８のいずれか１項の方法または使用。
６０．前記免疫原性組成物を、点眼を介して投与する、条項４８〜５９のいずれか１項の方法または使用。
６１．前記免疫原性組成物が、１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６０のいずれか１項の方法または使用。
６２．前記免疫原性組成物が、２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６１のいずれか１項の方法または使用。
６３．前記免疫原性組成物が、２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６２のいずれか１項の方法または使用。
６４．前記免疫原性組成物を、対象に、第１週齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または第１日齢以内に投与する、条項４８〜６３のいずれか１項の方法または使用。
６５．前記免疫原性組成物を、対象に、第１日齢以内に投与する、条項４８〜６４のいずれか１項の方法または使用。

【0227】

６６．前記方法が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、ラッセル音の予防もしくは低減、産卵低下の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはこれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータにおける改善を生じる、条項４８〜６５のいずれか１項の方法または使用。
６７．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または低減を生じる、条項４８〜６６のいずれか１項の方法または使用。
６８．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または低減を生じる、条項４８〜６７のいずれか１項の方法または使用。
６９．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵低下の予防または低減を生じる、条項４８〜６８のいずれか１項の方法または使用。
７０．治療的使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７１．免疫原またはワクチンとしての使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７２．医薬としての使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７３．医薬の製造のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。
７４．対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。

【0228】

さらに、ＯＲＦ３ｂの不活性化に関する以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．ＯＲＦ３ｂが不活性化されている、ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）。
２．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ３ｂが不活性化されている免疫原性組成物。
３．ＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ａの発現に影響しないおよび／または３ａタンパク質の活性に影響しない、条項１または２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４．ＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはＥタンパク質の活性に影響しない、条項１〜３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５．前記不活性化が、ＯＲＦ３ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ｂ内における核酸の置換である、条項１〜４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６．ＯＲＦ３ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７．ＯＲＦ３ｂが部分的に欠失している、条項１〜６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８．ＯＲＦ３ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が不活性化されている、条項１〜８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項８または条項９のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１．ＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２．ＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0229】

１３．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0230】

１４．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0231】

１６．ＯＲＦ３ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１７４）から１〜１７５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド１７５）から１〜１７４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド１７６）から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0232】

１７．ＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８．ＯＲＦ３ｂにおける１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１９．ＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０．配列番号３４に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0233】

２１．配列番号３４に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２２．前記ＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２３．前記ＩＢＶが遺伝的に操作されている、条項１〜２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４．前記ＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜２３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0234】

２５．前記ＩＢＶが、アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３など）、グレイ、ホルテ、アイオワ（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０など）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１〜２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２６．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１〜２５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0235】

２７．前記ＱＸ遺伝子型が、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／１７０／０９、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２８．前記マサチューセッツ遺伝子型が、Ｈ１２０、Ｈ５２、スペイン／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、スペイン／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0236】

２９．前記４／９１遺伝子型が、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、スペイン／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３０．前記Ｑ１遺伝子型が、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ−２９５−１０を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0237】

３１．前記イタリア０２遺伝子型が、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、スペイン／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３２．前記ＩＢＶがマサチューセッツ遺伝子型株Ｈ５２のものである、条項１〜２６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３３．ワクチンである、条項２〜３２のいずれか１項の免疫原性組成物。
３４．薬学的に許容される担体を含む、条項２〜３３のいずれか１項の免疫原性組成物。
３５．前記薬学的に許容される担体がリン酸緩衝生理食塩水である、条項３４の免疫原性組成物。
３６．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である、条項２〜３５のいずれか１項の免疫原性組成物。
３７．同種チャレンジから保護する、条項２〜３６のいずれか１項の免疫原性組成物。
３８．Ｍ４１によるチャレンジから保護する、条項２〜３７のいずれか１項の免疫原性組成物。
３９．単回投与のために製剤化される、条項２〜３８のいずれか１項の免疫原性組成物。
４０．皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される、条項２〜３９のいずれか１項の免疫原性組成物。
４１．１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４０のいずれか１項の免疫原性組成物。
４２．２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４１のいずれか１項の免疫原性組成物。
４３．２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４２のいずれか１項の免疫原性組成物。
４４．条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキット。
４５．鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４４に記載のキット。
４６．家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４５に記載のキット。
４７．ＩＢの処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４６に記載のキット。
４８．対象を免疫化する方法であって、そのような対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む方法。

【0238】

４９．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５０．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５１．対象を免疫化する方法における使用のための、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0239】

５２．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法における使用のための、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0240】

５３．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法における使用のための、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。
５４．前記対象が鳥である、条項４８〜５３のいずれか１項の方法または使用。
５５．前記対象が家禽である、条項４８〜５４のいずれか１項の方法または使用。
５６．前記対象が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される、条項４８〜５５のいずれか１項の方法または使用。
５７．前記免疫原性組成物を１回投与する、条項４８〜５６のいずれか１項の方法または使用。
５８．前記免疫原性組成物を２回以上の用量で投与する、条項４８〜５６のいずれか１項の方法または使用。
５９．前記免疫原性組成物を、皮下に、筋肉内に、経口的に、卵内に、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項４８〜５８のいずれか１項の方法または使用。
６０．前記免疫原性組成物を、点眼を介して投与する、条項４８〜５９のいずれか１項の方法または使用。
６１．前記免疫原性組成物が、１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６０のいずれか１項の方法。
６２．前記免疫原性組成物が、２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６１のいずれか１項の方法。
６３．前記免疫原性組成物が、２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６２のいずれか１項の方法。
６４．前記免疫原性組成物が、対象に、第１週齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または第１日齢以内に投与される、条項４８〜６３のいずれか１項の方法または使用。
６５．前記免疫原性組成物が、対象に、第１日齢以内に投与される、条項４８〜６４のいずれか１項の方法または使用。

【0241】

６６．前記方法が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、ラッセル音の予防もしくは低減、産卵低下の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはこれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータにおける改善を生じる、条項４８〜６５のいずれか１項の方法または使用。
６７．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または低減を生じる、条項４８〜６６のいずれか１項の方法または使用。
６８．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または低減を生じる、条項４８〜６７のいずれか１項の方法または使用。
６９．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵低下の予防または低減を生じる、条項４８〜６８のいずれか１項の方法または使用。
７０．治療的使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７１．免疫原またはワクチンとしての使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７２．医薬としての使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７３．医薬の製造のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。
７４．対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。

【0242】

さらに、ＯＲＦ５ａの不活性化に関する以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．ＯＲＦ５ａが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）。
２．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ａが不活性化されている免疫原性組成物。
３．ＯＲＦ５ａの前記不活性化が、ＯＲＦ５ｂの発現に影響しないおよび／または５ｂタンパク質の活性に影響しない、条項１または２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４．前記不活性化が、ＯＲＦ５ａの完全または部分的な欠失、ＯＲＦ５ａの完全または部分的なトランケーション、ＯＲＦ５ａの完全または部分的な逆位、ＯＲＦ５ａの完全または部分的な再配置、ＯＲＦ５ａ内における核酸の挿入、ＯＲＦ５ａ内における核酸の置換である、条項１〜３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５．ＯＲＦ５ａが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６．ＯＲＦ５ａが部分的に欠失している、条項１〜５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７．ＯＲＦ５ａの開始コドンが不活性化されている、条項１〜６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）が不活性化されている、条項１〜７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項７または条項８のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失である、条項７〜９条項８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１．ＯＲＦ５ａが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２．ＯＲＦ５ａが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0243】

１３．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0244】

１４．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0245】

１６．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜１９４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜１９３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜１９２ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0246】

１７．ＯＲＦ５ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８．ＯＲＦ５ａにおける１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１９．ＯＲＦ５ａが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド１９４まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０．配列番号３５に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0247】

２１．配列番号３５に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２２．前記ＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２３．前記ＩＢＶが遺伝的に操作されている、条項１〜２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４．前記ＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜２３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0248】

２５．アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３など）、グレイ、ホルテ、アイオワ（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０など）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１〜２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２６．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１〜２５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0249】

２７．前記ＱＸ遺伝子型が、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／１７０／０９、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２８．前記マサチューセッツ遺伝子型が、Ｈ１２０、Ｈ５２、スペイン／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、スペイン／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0250】

２９．前記４／９１遺伝子型が、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、スペイン／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３０．前記Ｑ１遺伝子型が、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ−２９５−１０を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0251】

３１．前記イタリア０２遺伝子型が、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、スペイン／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８を含むリストから選択される、条項２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３２．前記ＩＢＶがマサチューセッツ遺伝子型株Ｈ５２のものである、条項１〜２６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３３．ワクチンである、条項２〜３２のいずれか１項の免疫原性組成物。
３４．薬学的に許容される担体を含む、条項２〜３３のいずれか１項の免疫原性組成物。
３５．前記薬学的に許容される担体がリン酸緩衝生理食塩水である、条項３４の免疫原性組成物。
３６．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である、条項２〜３５のいずれか１項の免疫原性組成物。
３７．同種チャレンジから保護する、条項２〜３６のいずれか１項の免疫原性組成物。
３８．Ｍ４１によるチャレンジから保護する、条項２〜３７のいずれか１項の免疫原性組成物。
３９．単回投与のために製剤化される、条項２〜３８のいずれか１項の免疫原性組成物。
４０．皮下、筋肉内、経口的、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される、条項２〜３９のいずれか１項の免疫原性組成物。
４１．１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４０のいずれか１項の免疫原性組成物。
４２．２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４１のいずれか１項の免疫原性組成物。
４３．２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４２のいずれか１項の免疫原性組成物。
４４．条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキット。
４５．鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４４に記載のキット。
４６．家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４５に記載のキット。
４７．ＩＢの処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項４６に記載のキット。
４８．対象を免疫化する方法であって、そのような対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む方法。

【0252】

４９．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５０．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５１．対象を免疫化する方法における使用のための、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0253】

５２．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法における使用のための、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0254】

５３．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法における使用のための、条項２〜４３のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。
５４．前記対象が鳥である、条項４８〜５３のいずれか１項の方法または使用。
５５．前記対象が家禽である、条項４８〜５４のいずれか１項の方法または使用。
５６．前記対象が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される、条項４８〜５５のいずれか１項の方法または使用。
５７．前記免疫原性組成物を１回投与する、条項４８〜５６のいずれか１項の方法または使用。
５８．前記免疫原性組成物を２回以上の用量で投与する、条項４８〜５６のいずれか１項の方法または使用。
５９．前記免疫原性組成物を、皮下、筋肉内、経口的、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項４８〜５８のいずれか１項の方法または使用。
６０．前記免疫原性組成物を、点眼を介して投与される、条項４８〜５９のいずれか１項の方法または使用。
６１．前記免疫原性組成物が、１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６０のいずれか１項の方法または使用。
６２．前記免疫原性組成物が、２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６１のいずれか１項の方法または使用。
６３．前記免疫原性組成物が、２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項４８〜６２のいずれか１項の方法または使用。
６４．前記免疫原性組成物を、対象に、第１週齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または第１日齢以内に投与する、条項４８〜６３のいずれか１項の方法または使用。
６５．前記免疫原性組成物を、対象に、第１日齢以内に投与する、条項４８〜６４のいずれか１項の方法または使用。

【0255】

６６．前記方法が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、ラッセル音の予防もしくは低減、産卵低下の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはこれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータにおける改善を生じる、条項４８〜６５のいずれか１項の方法または使用。
６７．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または低減を生じる、条項４８〜６６のいずれか１項の方法または使用。
６８．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または低減を生じる、条項４８〜６７のいずれか１項の方法または使用。
６９．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵低下の予防または低減を生じる、条項４８〜６８のいずれか１項の方法または使用。
７０．治療的使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７１．免疫原またはワクチンとしての使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７２．医薬としての使用のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７３．医薬の製造のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。
７４．対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。

【0256】

さらに、ＯＲＦ５ｂの不活性化に関する以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．ＯＲＦ５ｂが不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）。
２．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、ＯＲＦ５ｂが不活性化されている免疫原性組成物。
３．ＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはＮタンパク質の活性に影響しない、条項１または２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４．ＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ５ａの発現に影響しないおよび／または５ａタンパク質の活性に影響しない、条項１〜３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５．前記不活性化が、ＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、条項１〜４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６．ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７．ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失している、条項１〜６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８．ＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が不活性化されている、条項１〜８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項８または条項９のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１．ＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２．ＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0257】

１３．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも９０ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、が欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0258】

１４．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも９０ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７．ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜８９ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜８８ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0259】

１８．ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜１９１ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜１９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜１８９ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0260】

１９．ＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも９０ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０．ＯＲＦ５ｂの１〜９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２１．ＯＲＦ５ｂの１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0261】

２２．ＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド２８４まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２３．配列番号３６に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているかまたは逆位になっている、条項１〜２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0262】

２４．配列番号３６に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２５．ＴＲＳ（転写制御配列）がＯＲＦＮの５’に挿入されている、条項１〜２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２６．前記ＴＲＳが、配列ＣＵＵＡＡＣＡＡを有する、条項２５のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２７．前記ＴＲＳ（転写制御配列）が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはＮタンパク質の活性に影響しないために挿入される、条項２５または２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２８．停止コドンを含む配列が、ＯＲＦＮにおけるＴＲＳの５’に挿入されている、条項１〜２７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２９．停止コドンを含む前記配列が、配列番号３７に記載された配列を有する、条項２８のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３０．前記ＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜２９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３１．前記ＩＢＶが遺伝的に操作されている、条項１〜３０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３２．前記ＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜３１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0263】

３３．前記ＩＢＶが、アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３など）、グレイ、ホルテ、アイオワ（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０など）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１〜３２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３４．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１〜３３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0264】

３５．前記ＱＸ遺伝子型が、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／１７０／０９、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６を含むリストから選択される、条項３４のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３６．前記マサチューセッツ遺伝子型が、Ｈ１２０、Ｈ５２、スペイン／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、スペイン／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３を含むリストから選択される、条項３４のＩＢＶまたは免疫原性組成物：。

【0265】

３７．前記４／９１遺伝子型が、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、スペイン／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１を含むリストから選択される、条項３４のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３８．前記Ｑ１遺伝子型が、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ−２９５−１０を含むリストから選択される、条項３４のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0266】

３９．前記イタリア０２遺伝子型が、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、スペイン／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８を含むリストから選択される、条項３４のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４０．前記ＩＢＶがマサチューセッツ遺伝子型株Ｈ５２のものである、条項１〜３９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４１．ワクチンである、条項２〜４０のいずれか１項の免疫原性組成物。
４２．薬学的に許容される担体を含む、条項２〜４１のいずれか１項の免疫原性組成物。
４３．前記薬学的に許容される担体がリン酸緩衝生理食塩水である、条項４２の免疫原性組成物。
４４．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である、条項２〜４３のいずれか１項の免疫原性組成物。
４５．同種チャレンジから保護する、条項２〜４４のいずれか１項の免疫原性組成物。
４６．Ｍ４１によるチャレンジから保護する、条項２〜４５のいずれか１項の免疫原性組成物。
４７．単回投与のために製剤化される、条項２〜４６のいずれか１項の免疫原性組成物。
４８．皮下、筋肉内、経口的、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される、条項２〜４７のいずれか１項の免疫原性組成物。
４９．１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４８のいずれか１項の免疫原性組成物。
５０．２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜４９のいずれか１項の免疫原性組成物。
５１．２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜５０のいずれか１項の免疫原性組成物。
５２．条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキット。
５３．鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項５２に記載のキット。
５４．家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項５３に記載のキット。
５５．ＩＢの処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項５４に記載のキット。
５６．対象を免疫化する方法であって、そのような対象に条項２〜５１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む方法。
５７．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に条項２〜５１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５８．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に条項２〜５１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
５９．対象を免疫化する方法における使用のための、条項２〜５１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0267】

６０．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法における使用のための、条項２〜５１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0268】

６１．必要性のある対象において、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法における使用のための、条項２〜５１のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。
６２．前記対象が鳥である、条項５６〜６１のいずれか１項の方法または使用。
６３．前記対象が家禽である、条項５６〜６２のいずれか１項の方法または使用。
６４．前記対象が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される、条項５６〜６３のいずれか１項の方法または使用。
６５．前記免疫原性組成物を１回投与する、条項５６〜６４のいずれか１項の方法または使用。
６６．前記免疫原性組成物を２回以上の用量で投与する、条項５６〜６５のいずれか１項の方法または使用。
６７．前記免疫原性組成物を、皮下、筋肉内、経口的、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項５６〜６６のいずれか１項の方法または使用。
６８．前記免疫原性組成物を、点眼を介して投与する、条項５６〜６７のいずれか１項の方法または使用。
６９．前記免疫原性組成物が、１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項５６〜６８のいずれか１項の方法または使用。
７０．前記免疫原性組成物が、２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項５６〜６９のいずれか１項の方法または使用。
７１．前記免疫原性組成物が、２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項５６〜７０のいずれか１項の方法または使用。
７２．前記免疫原性組成物を、対象に、第１週齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または第１日齢以内に投与する、条項５６〜７１のいずれか１項の方法または使用。
７３．前記免疫原性組成物を、対象に、第１日齢以内に投与する、条項５６〜７２のいずれか１項の方法または使用。

【0269】

７４．前記方法が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、ラッセル音の予防もしくは低減、産卵低下の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはこれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータにおける改善を生じる、条項５６〜７３のいずれか１項の方法または使用。
７５．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または低減を生じる、条項５６〜７４のいずれか１項の方法または使用。
７６．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または低減を生じる、条項５６〜７５のいずれか１項の方法または使用。
７７．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵低下の予防または低減を生じる、条項５６〜７６のいずれか１項の方法または使用。
７８．治療的使用のための、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７９．免疫原またはワクチンとしての使用のための、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８０．医薬としての使用のための、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８１．医薬の製造のための、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。
８２．対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。

【0270】

以下の条項もまた、本明細書に記載される。
１．− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ、および／または
− ＯＲＦ５ａ、および／または
− ＯＲＦ５ｂ
が不活性化されているＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）。

【0271】

２．ＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物であって、
− ＯＲＦ３ａ、および／または
− ＯＲＦ３ｂ、および／または
− ＯＲＦ５ａ、および／または
− ＯＲＦ５ｂ
が不活性化されている免疫原性組成物。
３．ＯＲＦ３ａの前記不活性化が、ＯＲＦＳ(ＯＲＦ Ｓ)の発現に影響しないおよび／またはこれがＳタンパク質の活性に影響しない、条項１または２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４．ＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはこれがＥタンパク質の活性に影響しない、条項１〜３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５．ＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮ(ＯＲＦ Ｎ)の発現に影響しないおよび／またはこれがＮタンパク質の活性に影響しない、条項１〜４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0272】

６．前記不活性化が、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な欠失および／もしくはＯＲＦ３ｂの部分的な欠失ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な欠失および／もしくはＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよび／もしくはＯＲＦ３ｂの部分的なトランケーションならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的なトランケーションおよび／もしくはＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な逆位および／もしくはＯＲＦ３ｂの部分的な逆位ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な逆位および／もしくはＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａの完全もしくは部分的な再配置および／もしくはＯＲＦ３ｂの部分的な再配置ならびに／またはＯＲＦ５ａの完全もしくは部分的な再配置および／もしくはＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、条項１〜５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0273】

７．前記不活性化が、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的な欠失、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的なトランケーション、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的な逆位、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの部分的な再配置、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内における核酸の挿入、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内における核酸の置換である、条項１〜６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂおよび／またはＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９．開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項８のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０．ＯＲＦ３ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項８のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１．ＯＲＦ３ａが完全または部分的に欠失している、条項１〜１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）が不活性化されている、条項１〜１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１３．開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項１２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１４．開始コドンの前記不活性化が欠失である、条項１２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５．ＯＲＦ３ａの前記不活性化が、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはこれがＳタンパク質の活性に影響しない、条項１〜１４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６．ＯＲＦ３ａが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７．ＯＲＦ３ａが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0274】

１８．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0275】

１９．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0276】

２１．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜１７３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜１７２ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜１７１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0277】

２２．ＯＲＦ３ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２３．ＯＲＦ３ａの１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４．ＯＲＦ３ａが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド１７３まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２５．配列番号３３に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0278】

２６．配列番号３３に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２７．ＯＲＦ３ｂが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜２６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２８．ＯＲＦ３ｂが完全または部分的に欠失している、条項１〜２７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２９．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が不活性化されている、条項１〜２８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３０．開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項２９のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３１．開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項２９のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３２．ＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはこれがＥタンパク質の活性に影響しない、条項１〜３１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３３．ＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされている、条項１〜３２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３４．ＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜３３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0279】

３５．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0280】

３６．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
３７．ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0281】

３８．ＯＲＦ３ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１７４）から１〜１７５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド１７５）から１〜１７４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド１７６）から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0282】

３９．ＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４０．ＯＲＦ３ｂにおける１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜３９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４１．ＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４２．配列番号３４に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0283】

４３．配列番号３４に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４４．ＯＲＦ５ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４５．ＯＲＦ５ａが完全または部分的に欠失している、条項１〜４４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４６．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）が不活性化されている、条項１〜４５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４７．開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項４６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４８．開始コドンの前記不活性化が欠失である、条項４６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
４９．ＯＲＦ５ａが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端からトランケートされている、条項１〜４８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５０．ＯＲＦ５ａが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜４９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0284】

５１．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0285】

５２．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５３．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0286】

５４．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜１９４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜１９３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜１９２ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0287】

５５．ＯＲＦ５ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５６．ＯＲＦ５ａにおける１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５７．ＯＲＦ５ａが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド１９４まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
５８．配列番号３５に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0288】

５９．配列番号３５に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６０．ＯＲＦ５ｂが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜５９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６１．ＯＲＦ５ｂが完全または部分的に欠失している、条項１〜６０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６２．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が不活性化されている、条項１〜６１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６３．開始コドンの前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６４．開始コドンの前記不活性化が欠失である、条項６２のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６５．ＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはこれがＮタンパク質の活性に影響しない、条項１〜６４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６６．ＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている、条項１〜６５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
６７．ＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜６６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0289】

６８．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも９０ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜６７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0290】

６９．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも９０ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜６８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７０．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜６９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７１．ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0291】

７２．ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜８９ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜８８ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７３．ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜１９１ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜１９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜１８９ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0292】

７４．ＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも９０ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７５．ＯＲＦ５ｂにおける１〜９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７６．ＯＲＦ５ｂにおける１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0293】

７７．ＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド２８４まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
７８．配列番号３６に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0294】

７９．配列番号３６に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜７８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８０．ＴＲＳ（転写制御配列）がＯＲＦＮの５’に挿入されている、条項１〜７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８１．前記ＴＲＳが、配列ＣＵＵＡＡＣＡＡを有する、条項８０のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８２．前記ＴＲＳ（転写制御配列）が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはＮタンパク質の活性に影響しないために挿入される、条項８０または８１のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８３．停止コドンを含む配列が、ＯＲＦＮにおけるＴＲＳの５’に挿入されている、条項１〜８２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８４．停止コドンを含む前記配列が、配列番号３７に記載された配列を有する、条項８３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0295】

８５．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0296】

８６．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0297】

８７．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８８．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
８９．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜３４８ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0298】

９０．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜３４８ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜３４７ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜３４６ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜８９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９１．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜３８５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0299】

９２．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜３８５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜３８４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜３８３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0300】

９３．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0301】

９４．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0302】

９５．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0303】

９６．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９７．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0304】

９８．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜３４８ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜３４７ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜３４６ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
９９．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0305】

１００．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜３８５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜３８４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜３８３ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜９９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0306】

１０１．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１００のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0307】

１０２．ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０３．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの１〜３４８ヌクレオチドが、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０４．ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの１〜３８５ヌクレオチドが、欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0308】

１０５．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの１〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０６．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの１〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0309】

１０７．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0310】

１０８．ＯＲＦ３ａおよび／またはＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１０９．ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの１〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１０．ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの１〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１０９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0311】

１１１．ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１１０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0312】

１１２．ＯＲＦ５ａおよび／またはＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１１１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１３．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦ３ｃの発現に影響しないおよび／またはこれがＥタンパク質の活性に影響しない、条項１〜１１２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１４．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＳの発現に影響しないおよび／またはこれがＳタンパク質の活性に影響しない、条項１〜１１３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１５．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの前記不活性化が、ＯＲＦＮの発現に影響しないおよび／またはこれがＮタンパク質の活性に影響しない、条項１〜１１４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１６．ＯＲＦ３ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているかまたは逆位になっており、ＯＲＦ３ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１１５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１７．ＯＲＦ５ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているかまたは逆位になっており、ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１１６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0313】

１１８．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａが完全もしくは部分的に欠失しているか、置換されているかまたは逆位になっており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが部分的に欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１１７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１１９．ＯＲＦ３ａが完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂが部分的に欠失している、条項１〜１１８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２０．ＯＲＦ５ａが完全または部分的に欠失しており、ＯＲＦ５ｂが部分的に欠失している、条項１〜１１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２１．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａが完全もしくは部分的に欠失しており、ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが部分的に欠失している、条項１〜１２０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２２．ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜１２１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２３．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）が不活性化されている、条項１〜１２２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２４．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項１２２または条項１２３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２５．ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦ５ｂの開始コドンが不活性化されている、条項１〜１２４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２６．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）が不活性化されている、条項１〜１２５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１２７．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ）の前記不活性化が欠失、置換または逆位である、条項１２５または条項１２６のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0314】

１２８．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１２７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0315】

１２９．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１２８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１３０．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１２９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１３１．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、Ｕ、またはＧからトランケートされている、条項１〜１３０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0316】

１３２．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ）（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端からトランケートされており、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）およびＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端からトランケートされている、条項１〜１３１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0317】

１３３．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0318】

１３４．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１３５．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0319】

１３６．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0320】

１３７．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１７４〜１７６）の５’末端から１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0321】

１３８．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１〜１７３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１〜１７２ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１〜１７１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１７４）から１〜１７５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド１７５）から１〜１７４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド１７６）から１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１３９．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１９５〜１９７）の５’末端から１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0322】

１４０．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１〜１９４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１〜１９３ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１〜１９２ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１９５）から１〜１９１ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド１９６）から１〜１９０ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド１９７）から１〜１８９ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１３９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１４１．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0323】

１４２．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）のＡ、ＵまたはＧから少なくとも１７４ヌクレオチド、少なくとも１７５ヌクレオチド、少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０、ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0324】

１４３．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0325】

１４４．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）のＡ、Ｕ、またはＧから少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも１９６ヌクレオチド、少なくとも１９７ヌクレオチド、少なくとも２００、ヌクレオチド、少なくとも２１０ヌクレオチド、少なくとも２２０ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３２５ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１４５．ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１７４〜２００ヌクレオチド、または１７４〜３００ヌクレオチド、または１７４〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0326】

１４６．ＯＲＦ３ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号１のヌクレオチド１）から１７４〜３４８ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号１のヌクレオチド２）から１７３〜３４７ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号１のヌクレオチド３）から１７２〜３４６ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１４７．ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から１９５〜２５０ヌクレオチド、または１９５〜３００ヌクレオチド、または１９５〜３５０、または１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0327】

１４８．ＯＲＦ５ａの開始コドンのＡ（ＡＵＧのＡ、配列番号２のヌクレオチド１）から１９５〜３８５ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＵ（ＡＵＧのＵ、配列番号２のヌクレオチド２）から１９４〜３８４ヌクレオチド、もしくは開始コドンのＧ（ＡＵＧのＧ、配列番号２のヌクレオチド３）から１９３〜３８３ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0328】

１４９．ＯＲＦ３ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0329】

１５０．ＯＲＦ５ａの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの少なくとも１ヌクレオチド、少なくとも２ヌクレオチド、少なくとも３ヌクレオチド、少なくとも４ヌクレオチド、少なくとも５ヌクレオチド、少なくとも１０ヌクレオチド、少なくとも１５ヌクレオチド、少なくとも２０ヌクレオチド、少なくとも２５ヌクレオチド、少なくとも５０ヌクレオチド、少なくとも７５ヌクレオチド、少なくとも１００ヌクレオチド、少なくとも１２５ヌクレオチド、少なくとも１５０ヌクレオチド、少なくとも１７０ヌクレオチド、少なくとも１９０ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１４９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0330】

１５１．ＯＲＦ３ａの１〜１７３ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ３ｂの１〜１７５ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５２．ＯＲＦ５ａの１〜１９４ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっており、ＯＲＦ５ｂの１〜１９１ヌクレオチドが欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５３．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５４．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの１７６〜３４８ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0331】

１５５．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドンおよびＯＲＦ３ｃの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0332】

１５６．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂの少なくとも１７６ヌクレオチド、少なくとも１８０ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３４０ヌクレオチドが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５７．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１５８．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの１９５〜３８５ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範の間で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0333】

１５９．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドンおよびＯＲＦＮの開始コドンの５’末端内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６０．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂの少なくとも１９５ヌクレオチド、少なくとも２００ヌクレオチド、少なくとも２２５ヌクレオチド、少なくとも２５０ヌクレオチド、少なくとも３００ヌクレオチド、少なくとも３５０ヌクレオチド、少なくとも３８０ヌクレオチドが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５までの範囲内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１５９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0334】

１６１．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが、ＯＲＦ３ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号１のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号１のヌクレオチド３４８まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６２．配列番号１に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６３．配列番号１に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0335】

１６４．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが、ＯＲＦ５ａの開始コドン（ＡＵＧ、配列番号２のヌクレオチド１〜３）の５’末端から配列番号２のヌクレオチド３８５まで欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６５．配列番号２に記載されたＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0336】

１６６．配列番号２に記載されたＲＮＡ配列と少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％もしくは少なくとも９９％の同一性を有するＲＮＡ配列が、ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂ内で欠失しているか、置換されているか、または逆位になっている、条項１〜１６５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0337】

１６７．Ｅタンパク質が、遺伝子型ＱＸ、ボーデット、Ｈ１２０もしくはＨ５２のアミノ酸配列、または上述した遺伝子型の少なくとも１つと少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するものである、条項１〜１６６のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６８．Ｅタンパク質が、ＫＭ５８６８１８（ＱＸ）、ＡＪ３１１３１７（ボーデット）、ＦＪ８０７６５２（Ｈ１２０）もしくは配列番号３８（Ｈ５２）で示されるアミノ酸配列、または上述した配列の少なくとも１つと少なくとも７０％、少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するものである、条項１〜１６７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１６９．前記ＩＢＶが弱毒化されている、条項１〜１６８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７０．前記ＩＢＶが遺伝的に操作されている、条項１〜１６９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７１．前記ＩＢＶが組換えＩＢＶである、条項１〜１７０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0338】

１７２．前記ＩＢＶが、アーカンソー（アーカンソー９９など）、カリフォルニア（カリフォルニア１７３４／０４、カリフォルニア９９など）、コネチカット、デラウェア（デラウェア９８など）、オランダ（Ｄ２０７、Ｄ２１２、Ｄ２７４、Ｄ３１２８、Ｄ３８９６、Ｄ８８８０、Ｄ１４６６など）、フロリダ、ジョージア（ジョージアＧＡ−Ｏ８、ＧＡ−１２、ＧＡ−１３など）、グレイ、ホルテ、アイオワ（アイオワ９７およびアイオワ６９など）、イタリア（イタリア０２など）、ＪＭＫ、メイン（メイン２０９など）、マサチューセッツ（Ｍ４１、ボーデット、２４６Ｇ、Ｄ５８０、Ｈ５２、Ｈ１２０など）、ペンシルベニア（ペンシルベニア１２２０／９８、ペンシルベニアウォルグ／９８など）、Ｑｕ、（Ｑｕ−ｍｖなど）、ＱＸ（ＧＢ３４１／９６など）、Ｑ１、ＳＥ１７、バリアント２（ＩＳ／１４９４／０６など）および４／９１（７９３Ｂ）を含む株のリストから選択される遺伝子型を有する、条項１〜１７１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７３．前記ＩＢＶがＱＸ、マサチューセッツ、４／９１、Ｑ１またはイタリア０２遺伝子型のものである、条項１〜１７２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0339】

１７４．前記ＱＸ遺伝子型が、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｔ−０５、ＦＲ−Ｌ１４５０Ｌ−０５、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｔ−０４、ＮＬ−Ｌ１４４９Ｋ−０４、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／１７０／０９、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／７９／０８、ＩＢＶ／Ｃｋ／ＳＰ／２４８／０９、ＨＢＮ、ＩＢＶＱＸ、ＬＸ４、ＢＪＱ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＧＤ／０３、ＧＢ３４１／９６を含むリストから選択される、条項１７３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７５．前記マサチューセッツ遺伝子型が、Ｈ１２０、Ｈ５２、スペイン／９８／３０８、ＩＢＭＡ５−１、ＳＤ／９７／０１、ボーデット、スペイン／９６／３３４、Ｍ４１−Ｍ２１８８３を含むリストから選択される、条項１７３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0340】

１７６．前記４／９１遺伝子型が、スペイン／９８／３２８、スペイン／９２／３５、ＩＲ−３６５４−ＶＭ、ＦＲ−ＣＲ８８０６１−８８、ＦＲ−８５１３１−８５、ＵＫ−１２３３−９５、ＵＫ／３／９１、スペイン／００／３３６、ＵＫ／７／９１、４／９１−病原性、４／９１弱毒化、ＩＢ４−９１を含むリストから選択される、条項１７３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７７．前記Ｑ１遺伝子型が、ＣＫ／ＣＨ／ＬＤＬ／９８Ｉ、ＣＫ／ＣＨ／ＬＳＤ／０８−１０、Ｊ２、Ｑ１、ＡＲ０８ＥＲ２２、ＡＲ０８ＢＡ２１、チリ−２９５−１０を含むリストから選択される、条項１７３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0341】

１７８．前記イタリア０２遺伝子型が、スペイン／９９／３１６、イタリア−０２、ＵＫ−Ｌ６３３−０４、Ｉｔ−４９７−０２、スペイン／０５／８６６、スペイン／０４／２２１、スペイン／００／３３７、スペイン／１５５／０９、スペイン／０３／０８を含むリストから選択される、条項１７３のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１７９．前記ＩＢＶがマサチューセッツ遺伝子型株Ｈ５２のものである、条項１〜１７８のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８０．Ｈ５２遺伝子型がＨ５２Ｕである、条項１〜１７９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８１．Ｈ５２が、ＥＵ８１７４９７で示されるヌクレオチド配列またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するものである、条項１〜１８０のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0342】

１８２．Ｈ５２株が、ＡＦ３５２３１５で示されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するスパイク（Ｓ１）タンパク質を有するものである、条項１〜１８１のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８３．Ｈ５２株が、ＡＹ０４４１８５もしくはＡＦ３５２３１０で示されるアミノ酸配列または上述した配列の少なくとも１つと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するヌクレオカプシド（Ｎ）タンパク質を有するものである、条項１〜１８２のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８４．Ｈ５２株が、ＡＦ３１７２１０で示されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有するエンベロープ（Ｅ）タンパク質を有するものである、条項１〜１８３のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８５．Ｈ５２株が、ＡＦ２８６１８５で示されるアミノ酸配列またはそれと少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％もしくは少なくとも９９．５％の配列同一性を有する配列を有する膜糖タンパク質（Ｍ）タンパク質を有するものである、条項１〜１８４のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８６．前記ＩＢＶが、Ｎ１／８８、Ｑ３／８８、Ｖ１８／９１またはＶ６／９２ではない、条項１〜１８５のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１８７．ワクチンである、条項２〜１８６のいずれか１項の免疫原性組成物。
１８８．薬学的に許容される担体を含む、条項２〜１８７のいずれか１項の免疫原性組成物。
１８９．前記薬学的に許容される担体が、リン酸緩衝生理食塩水である、条項１８８の免疫原性組成物。

【0343】

１９０．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候の処置および／または予防において有効である、条項２〜１８９のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９１．同種チャレンジから保護する、条項２〜１９０のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９２．Ｍ４１によるチャレンジから保護する、条項２〜１９１のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９３．単回投与のために製剤化される、条項２〜１９２のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９４．皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与される、条項２〜１９３のいずれか１項の免疫原性組成物。

【0344】

１９５．１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜１９４のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９６．２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜１９５のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９７．２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２〜１９６のいずれか１項の免疫原性組成物。
１９８．ＯＲＦ３ａが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
１９９．ＯＲＦ３ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２００．ＯＲＦ５ａが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０１．ＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０２．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０３．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ａが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０４．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。

【0345】

２０５．ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０６．ＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０７．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０８．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２０９．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２１０．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂおよびＯＲＦ３ａが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２１１．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２１２．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜１９７のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２１３．ＯＲＦ３ａが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。
２１４．ＯＲＦ３ｂが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。
２１５．ＯＲＦ５ａが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。
２１６．ＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。
２１７．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。
２１８．ＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。

【0346】

２１９．ＯＲＦ３ａおよびＯＲＦ３ｂおよびＯＲＦ５ａおよびＯＲＦ５ｂが不活性化されている、条項１〜２１２のいずれか１項のＩＢＶ（伝染性気管支炎ウイルス）を含む免疫原性組成物。
２２０．条項１〜２１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物を含むキット。
２２１．鳥の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項２２０に記載のキット。
２２２．家禽の疾患の処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項２２１に記載のキット。
２２３．ＩＢの処置および／または予防のための指示書をさらに含む、条項２２２に記載のキット。
２２４．対象を免疫化する方法であって、そのような対象に条項２〜２１９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物を投与することを含む方法。

【0347】

２２５．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法であって、前記対象に条項２〜２１９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
２２６．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法であって、前記対象に条項２〜２１９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含む方法。
２２７．対象を免疫化する方法における使用のための、条項２〜２１９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0348】

２２８．必要性のある対象において、ＩＢＶによって引き起こされる臨床徴候を処置または予防する方法における使用のための、条項２〜２１９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。

【0349】

２２９．必要性のある対象において、同種の免疫化されていない対照群の対象と比較して、線毛運動障害を低減する方法における使用のための、条項２〜２１９のいずれか１項に記載の免疫原性組成物であって、前記方法が、前記対象に前記免疫原性組成物の治療有効量を投与することを含むものである免疫原性組成物。
２３０．前記対象が鳥である、条項２２４〜２２９のいずれか１項の方法または使用。
２３１．前記対象が家禽である、条項２２４〜２３０のいずれか１項の方法または使用。
２３２．前記対象が、ニワトリ、シチメンチョウ、ウズラ、またはキジからなるリストから選択される、条項２２４〜２３１のいずれか１項の方法または使用。
２３３．前記免疫原性組成物を１回投与する、条項２２４〜２３２のいずれか１項の方法または使用。
２３４．前記免疫原性組成物を２回以上の用量で投与する、条項２２４〜２３２のいずれか１項の方法または使用。
２３５．前記免疫原性組成物を、皮下、筋肉内、経口、卵内、噴霧を介して、飲用水を介して、または点眼によって投与する、条項２２４〜２３４のいずれか１項の方法または使用。
２３６．前記免疫原性組成物を、点眼を介して投与する、条項２２４〜２３５のいずれか１項の方法または使用。
２３７．前記免疫原性組成物が、１〜１０ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２２４〜２３６のいずれか１項の方法または使用。
２３８．前記免疫原性組成物が、２〜５ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２２４〜２３７のいずれか１項の方法または使用。
２３９．前記免疫原性組成物が、２〜４ｌｏｇ₁₀ ＥＩＤ₅₀の前記ＩＢＶを含む、条項２２４〜２３８のいずれか１項の方法または使用。
２４０．前記免疫原性組成物を、対象に、第１週齢以内、最初の３日齢以内、最初の２日齢以内、または第１日齢以内に投与する、条項２２４〜２３９のいずれか１項の方法または使用。
２４１．前記免疫原性組成物を、対象に、第１日齢以内に投与する、条項２２４〜２４０のいずれか１項の方法または使用。

【0350】

２４２．前記方法が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防もしくは低減、ラッセル音の予防もしくは低減、産卵低下の予防もしくは低減、腎臓病変の予防もしくは低減、水性下痢の予防もしくは低減、体重減少の予防もしくは低減、より低いウイルス負荷、低減したウイルス排出またはこれらの組み合わせからなる群から選択される有効性パラメータにおける改善を生じる、条項２２４〜２４１のいずれか１項の方法または使用。
２４３．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、線毛運動障害の予防または低減を生じる、条項２２４〜２４２のいずれか１項の方法または使用。
２４４．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、腎臓病変の予防または低減を生じる、条項２２４〜２４３のいずれか１項の方法または使用。
２４５．前記処置または予防が、同種の非処置対照群の対象と比較して、産卵低下の予防または低減を生じる、条項２２４〜２４４のいずれか１項の方法または使用。
２４６．治療的使用のための、条項１〜２１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４７．免疫原またはワクチンとしての使用のための、条項１〜２１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４８．医薬としての使用のための、条項１〜２１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物。
２４９．医薬の製造のための、条項１〜２１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。
２５０．対象におけるＩＢＶ感染の処置および／または予防のための、条項１〜２１９のいずれか１項のＩＢＶまたは免疫原性組成物の使用。

【実施例】

【0351】

以下の例は、本発明の特定の実施形態を例示するために以下に記載される。これらの例は単なる例示であり、本発明の範囲または基本原理を限定するものではないことが理解される。

【0352】

（例１）
プラスミドの構築
ＩＢＶドナープラスミドの構築
ＩＢＶ−Ｈ５２株（Ｂｏｅｈｒｉｎｇｅｒ Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ，Ｉｎｇｅｌｈｅｉｍ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用した。ドナープラスミドの設計は、主に、Kuoら、２０００年（J. Virol. ７４巻：１３９３〜１４０６頁）に従った。ドナープラスミドｐ−ＩＢＶは、５つのサブプラスミド：ｐ−ＩＢＶ−５、ｐ−ＩＢＶ−１ｂ、ｐ−ＩＢＶ−Ｓ、ｐ−ＩＢＶ−ＳＩＲおよびｐ−ＩＢＶ−３Ｔの続くライゲーションから構築された（表１）。

【表1】

プラスミドＩＢＶ−５は、ほぼ全長の５’−非翻訳領域（ＵＴＲ）を含む。プラスミドＩＢＶ−１ｂは、ｐｏｌ １ｂ遺伝子の最後の７５４ｎｔを含み、スパイク遺伝子との５０ｎｔの重複、およびスパイクタンパク質シグナル配列をコードするヌクレオチド配列を含むスパイク遺伝子の最初の６６ｎｔを含む。プラスミドＩＢＶ−Ｓは、長さは３２１１ｎｔである、スパイク遺伝子のほぼ全長のエクトドメインを含有する。プラスミドＩＢＶ−ＳＩＲは、スパイク遺伝子（膜貫通およびエンドドメイン）の最後の２１２ｎｔ、アクセサリー遺伝子３、エンベロープ遺伝子、膜遺伝子および遺伝子間領域（ＩＲ）の半分を含む。プラスミドＩＢＶ−３Ｔは、ＩＲの後半、アクセサリー遺伝子５、ヌクレオカプシド遺伝子、３’−ＵＴＲおよび１００ｎｔのポリＡ配列を含むＩＢＶゲノムの３’末端領域を含む。

【0353】

すべてのプラスミド接合部は、サイレントに導入されたｐ−ＩＢＶ−１ｂおよびｐ−ＩＢＶ−Ｓを接続するＸｈｏＩ部位を除いて、天然に存在する制限酵素切断部位（ＲＥＳ）である。ＲＥＳは、ドナープラスミドに含まれるウイルスゲノムの他の部分からこれらのＲＥＳをサイレントに除去することによって固有のものとなった（表２）。

【0354】

【表2】

さらに、準固有なＲＥＳは、アクセサリー遺伝子３および５の上流および下流の２００ｎｔ以内のサイレント突然変異によって導入され、それらの操作を可能にした。最後に、固有のＲＥＳ ＭｓｓＩおよびＰａｃＩをポリＡ配列の後に含め、単一の制限酵素切断によるプラスミドの線状化を可能にした。すべてのプラスミドは、ＧｅｎＳｃｒｉｐｔ（Ｐｉｓｃａｔａｗａｙ，ＮＪ，ＵＳＡ）によって生成され、ポリリンカーを除去した標準クローニングプラスミドであるプラスミドｐＵＣ５７−シンプルに提供した。

【0355】

すべてのゲノム断片は、表１において特定される制限酵素を用いてｐ−ＩＢＶ−５内に段階的にライゲートされ、続いてＨＢ１０１コンピテント細胞を用いて形質転換された。最終プラスミドは、ここではｐ−ＩＢＶと呼ばれるｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲ−３Ｔからなっていた。プラスミドの組成は、ＰＣＲ、制限酵素消化およびインサートの配列決定（Ｍａｃｒｏｇｅｎ、ソウル、韓国）によって各ステップで確認された。

【0356】

ｍＩＢＶドナープラスミドの構築
Vennemaら、１９９６年（EMBO J.、１５巻：２０２０〜２０２８年）由来のＭＨＶスパイクコード遺伝子のエクトドメインは、ＸｈｏＩオーバーハングを有するプライマー（表３）を用いたＰＣＲによってｐＴＵＧ／ｐＴＵＭＳから増幅され、ｐ−ＭＨＶ−ＳをもたらすｐＪｅｔ１．２内にライゲートされた。Ｑ５ ＳＤＭキット（Ｎｅｗ Ｅｎｇｌａｎｄ Ｂｉｏｌａｂｓ、イプスウィッチ、米国）を用いた部位特異的突然変異誘発（ＳＤＭ）を使用して、続くクローニングステップを干渉するＥｃｏＲＩおよびＸｈｏＩ ＲＥＳをサイレントに除去した（表３）。

【0357】

【表3】

ＭＨＶスパイクのエクトドメインをｐ−ＩＢＶ−５−１ｂにライゲートし、その後、ＩＢＶ断片ＳＩＲおよび３Ｔによるクローニングステップが続き、ここではｐ−ｍＩＢＶと呼ばれるｐ−ＩＢＢ−５−１ｂ−ｍｈｖＳ−ＳＩＲ−３Ｔがもたらされる。

【0358】

３ａｂおよび５ａｂをコードする遺伝子の二重および四重欠失を有するデルタプラスミドの構築
アクセサリー遺伝子３および５を欠失した。デルタ３ａｂ断片（Δ３ａｂ）のインシリコ設計は、スパイク遺伝子の終止コドンと３ａ遺伝子のＡＴＧコドンの間の１ｎｔ重複が、スパイクの終止コドンとエンベロープ遺伝子のＡＴＧコドンの間の重複によって置換されるようなものであった。よって、３ｂ遺伝子の３’末端とエンベロープ遺伝子の間のここでの非コーディング２０ｎｔ重複は存在したままであった。遺伝子３ａで開始するサブゲノムＲＮＡを形成するためにスパイク遺伝子の３’末端に位置するＴＲＳ（転写制御配列）は機能的なままであるが、ここではエンベロープ遺伝子で開始すると予想される。デルタ５ａｂ断片（Δ５ａｂ）の設計は、５ａ遺伝子のＡＴＧコドンがここではヌクレオカプシド遺伝子のＡＴＧコドンであるようなものであった。よって、５ｂ遺伝子の３’末端とヌクレオカプシド遺伝子の間の非コーディング５８ｎｔ重複が存在したままであった。ヌクレオカプシド遺伝子を含むサブゲノムＲＮＡを形成するために５ｂ遺伝子の３’末端に位置するＴＲＳは、遺伝子５ｂとともに除去された；しかし、ＩＲの３’末端にあるＴＲＳは機能的なままであることが予想され、ヌクレオカプシド遺伝子で開始するサブゲノムＲＮＡを形成するために使用される。

【0359】

上記のように設計された欠失を有するアクセサリー遺伝子３および５（Δ３ａｂおよびΔ５ａｂ）を取り囲む準固有なＲＥＳからのＤＮＡ断片を生成し、ＧｅｎｓｃｒｉｐｔによってｐＵＣ５７−シンプルにライゲートした。Ｄｅｌｔａ３ａｂをＮｈｅＩ−ＰｍｌＩ二重消化後にｐａｂＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲにライゲートして３ａｂ遺伝子を除去し、続いて３Ｔ領域を除去して、ここではｐ−ＩＢＶ−Δ３ａｂと呼ばれるｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲΔ３ａｂ−３Ｔを形成した。Ｄｅｌｔａ５ａｂをＡｆｅＩ−ＮｈｅＩ二重消化後にｐａｂＶ−３Ｔにライゲートして、５ａｂ遺伝子を除去した。続いて、断片３ＴΔ５ａｂをｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲまたはｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲΔ３ａｂの後にライゲートして、それぞれ、ここではｐ−ＩＢＶ−Δ５ａｂおよびｐ−ＩＢＶ−Δ３ａｂ５ａｂと呼ばれる、ｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲ−３ＴΔ５ａｂおよびｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲΔ３ａｂ−３ＴΔ５ａｂを形成した。

【0360】

Ｎ転写プラスミドの構築
ヌクレオカプシド遺伝子およびＩＢＶ Ｈ５２株の３’−ＵＴＲ配列を含むＲＮＡ転写プラスミドは、プライマーＩＢＶ−Ｈ５２．Ｎ．ＡＴＧ．ＦＷおよびＩＢＶ−Ｍ４１．＃２．ＩＲ．ＲＶ（表３）を用いて、それぞれの領域をＲＴ−ＰＣＲ増幅することにより作製された。アンプリコンをｐＪｅｔ１．２にライゲートし、ｐ−ＩＢＶ−Ｎを得、これを配列決定により確認した。

【0361】

（例２）
弱毒化ＩＢＶの生成
インビトロ転写
キャップされたランオフドナー転写物は、ｍＭｅｓｓａｇｅ ｍＭａｃｈｉｎｅ Ｔ７キット（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ ＳｃｉｅｎｔｉｆｉｃによるＡｍｂｉｏｎ）を用いてｐ−ＩＢＶ、ｐ−ｍＩＢＶおよびｐ−ＩＢＶ−Ｎから合成された。簡単には、ｐ−ｍＩＢＶをＰａｃＩ線状化し、ｐ−ＩＢＶおよびｐ−ＩＢＶ−ＮをＭｓｓＩ線状化した。線状化プラスミドＤＮＡをエタノール沈殿させた。転写反応は、それぞれｐ−（ｍ）ＩＢＶおよびｐ−ＩＢＶ−Ｎに対して１０μｌの反応あたりそれぞれ１．５μｇおよび０．５μｇの線状化ＤＮＡを用いて、製造者の指示に従って調製された。３７℃で１時間インキュベーションした後、ＲＮＡの生成は、ゲル電気泳動を用いて、１μｌの反応容積を分析することにより試験された。計２時間のインキュベーション後、反応管を氷上に移すことによって反応を停止させた。

【0362】

標的化ＲＮＡ組換えおよびｍＩＢＶの救出
ＩＢＶスパイク遺伝子は、Kuoら、２０００年（J. Virol.、７４巻：１３９３〜１４０６頁）に本質的に記載されているように、ｐ−ｍＩＢＶ生成ドナーＲＮＡとレシピエントウイルス（ＩＢＶ）ＲＮＡの間の標的化ＲＮＡ組換えにより、ＩＢＶゲノム中のキメラＭＨＶ−ＩＢＶスパイク遺伝子によって置換された。ほとんどのＩＢＶの感染は連続細胞株では不可能であるため、ＩＢＶウイルスＲＮＡは、代わりに、細胞培養に適合したＩＢＶ株ボーデットの複製を支持することが公知である細胞株であるＢＨＫ−２１細胞にトランスフェクトされた。２０μｌのＩＢＶ−Ｈ５２ウイルスＲＮＡは、１０μｌのｐ−ｍＩＢＶとｐ−ＩＢＶ−Ｎの転写反応混合物とともに、Ｇｅｎｅ Ｐｕｌｓｅｒ電気穿孔（Ｂｉｏ−Ｒａｄ）で８５０Ｖおよび２５μＦの２つのパルスを用いた電気穿孔によってＢＨＫ−２１細胞内にトランスフェクトされた。トランスフェクトされたＢＨＫ−２１細胞をＬＲ７細胞の単層上に播種し、３７℃でインキュベートした。
トランスフェクションの２日後に、ＬＲ７単層中のシンシチウムが観察された場合、上清を採取し、ウイルスをＬＲ７細胞上で２ラウンドのプラーク精製によって精製した。候補組換え体のゲノムの最後の１／３の特徴付けは、表４において特定されたプライマーセットを用いて、ＲＴ−ＰＣＲおよびサンガー配列決定によって行われた。マウス化ＩＢＶ（ｍ）ＩＢＶ株＃１Ｂ３−ＩＩＡからのストックを増殖させ、ＬＲ７細胞上で滴定した。

【0363】

標的化ＲＮＡ組換えおよび組換えｍＩＢＶの救出
組換えＩＢＶ（ｒＩＢＶ−ｗｔ）は、ＩＢＶスパイクエクトドメインを、ｐ−ＩＢＶ生成ドナーＲＮＡとレシピエントウイルスｍＩＢＶの間の標的化ＲＮＡ組換えによって、ｍＩＢＶゲノムに戻して導入することによりを生成された。ＬＲ７細胞は、ＭＯＩ（感染多重度）が０．４のｍＩＢＶで４時間感染された。ｐ−ＩＢＶからのキャップされたランオフ転写物は、８５０Ｖおよび５０μＦの２つのパルスを用いてｍＩＢＶ感染ＬＲ７細胞にトランスフェクトされた。電気穿孔されたＬＲ７細胞は、加温したＤＭＥＭ中で２ｍｌに希釈され、１０⁰から１０^-3の１０倍の希釈液が調製された。２００μｌのＬＲ７細胞懸濁液は、１０日齢の孵化ＳＰＦ鶏卵（希釈あたり５個の卵）に尿膜腔内注射された。卵を毎日２回、光にあてて、胚の死亡についてスコア化された。死亡によりまたは７日後、卵を４℃に移し、１６〜２４時間後、ＡＦをＲＴ−ｑＰＣＲについて無作為に収集し、各卵の漿尿膜（ＣＡＭ）をＩＨＣのために１０％ホルマリンで固定した。ＲＴ−ｑＰＣＲおよびＩＨＣによってウイルスが検出された、電気穿孔されたＬＲ７細胞の最高希釈液を接種した卵からのＡＦは、８日齢のＥＣＥにおいて２回のエンドポイント希釈ラウンドに供した。候補組換え体の遺伝的特徴付けは、表４において特定されたプライマーセットを用いて、ＲＴ−ＰＣＲおよびサンガー配列決定により行われた。

【0364】

【表4】

【0365】

ＩＢＶ、ｍＩＢＶおよびＭＨＶに対する免疫蛍光二重染色
ｍＩＢＶのキメラ性についての生物学的特徴付けは、ＩＢＶおよびＭＨＶに対する免疫蛍光二重染色によって行われた。ＢＨＫ−２１およびＬＲ７細胞をカバーグラス上で増殖させ、それぞれ１．０のＭＯＩでＩＢＶボーデット、ならびにＭＨＶ Ａ５９およびｍＩＢＶ＃１Ｂ３−ＩＩＡを接種した。第１ラウンドの感染中に、細胞は、ＰＢＳ ４％パラホルムアルデヒド（Ａｕｒｉｏｎ、ワーゲニンゲン、オランダ）を用いて、２０分間、室温で、それぞれＩＢＶ、ＭＨＶおよびｍＩＢＶについて８、５ １／４および１０ｈｐｉで固定された。細胞は、０．１％Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ−１００を含有するＰＢＳを用いて透過処理され、正常なヤギ血清（ＮＧＳ）とともにインキュベートされ、ＮＧＳにおける２つの一次抗体１：４００に希釈されたＮＧＳ：ウサギ抗ＭＨＶポリ血清ｋ１３４［Rottierら、１９８１年、Ｊ. Virol.、３８巻：２０〜２６頁］および１：４００に希釈されたニワトリ抗ＩＢＶ−Ｈ１２０血清、または１：２００に希釈されたマウスＭＡｂ Ｃｈ／ＩＢＶ ２６．１［Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ］の組み合わせとともに４５〜６０分間インキュベートされた。ニワトリ抗ＩＢＶ−Ｈ１２０血清は、ＩＢＶ株Ｈ１２０を用いてＳＰＦチキンを反復免疫した後に得られた。細胞は、ＰＢＳ ０．０５％Ｔｗｅｅｎ−２０で３回洗浄され、ＮＧＳにおいて１：２００に希釈された２つの蛍光色素標識された二次抗体：Ａｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８ヤギ抗チキンＩｇＹおよびＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８ヤギ抗ウサギＩｇＧ、またはＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ４８８ヤギ抗マウスＩｇＧおよびＡｌｅｘａ Ｆｌｕｏｒ ５６８ヤギ抗ウサギＩｇＧ［Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃの一部としてのＩｎｖｉｔｒｏｇｅｎ］。細胞を３回洗浄し、核をＰＢＳ中の３００ｎＭ ＤＡＰＩで暗所において５〜１０分間染色した。細胞をｍｉｌｌｉＱで１回洗浄し、Ｆｌｕｏｒｓａｖｅ（Ｍｅｒｃｋ Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ、Ｂｉｌｌｅｒｉｃａ、ＭＡ、ＵＳＡによるＣａｌｂｉｏｃｈｅｍ）でマウントした。スライドは、Ｌｅｉｃａ ＤＦＣ４２５ＣカラーＣＣＤおよびＬｅｉｃａ ＬＡＳ−ＡＦソフトウェア（Ｌｅｉｃａ Ｍｉｃｒｏｓｙｓｔｅｍｓ、ウェッツラー、ドイツ）を備えたフィルターＩ３、ＡおよびＮ２．１を有するＯｌｙｍｐｕｓ ＢＸ６０顕微鏡を用いて観察された。

【0366】

組換えＩＢＶ変異体の卵内増殖曲線
８日齢のＥＣＥは、１０³のＥＬＤ₅₀のＩＢＶ−Ｈ５２、組換えＩＢＶ野生型（ｒＩＢＶ−ｗｔ、このウイルスのアミノ酸配列はＩＢＶ Ｈ５２のアミノ酸配列と同一であるが、ゲノム配列中のいわゆるサイレント突然変異によりヌクレオチド配列が異なる）、ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂまたはｒＩＢＶ−Δ３ａｂ５ａｂを接種された。卵を１日２回、光にあて、インキュベーションの０、１２、２４、３６、４８、６０および７２時間後、ウイルス株あたり５つの所定の卵は４℃に１６〜２４時間移され、ＡＦは無菌的に採取されて、−８０℃で保存された。ウイルス株あたり１つまたは複数の胚が、所定の回収時間点より１２時間以上前に死亡した場合、その時間点をさらなる分析から除外した。尿膜腔液試料は、ＣａおよびＭｇを含まないＰＢＳで１０倍に希釈され、核酸は、ＱＩＡａｍｐ ＤＮＡ Ｂｌｏｏｄ Ｍｉｎｉキット（Ｑｉａｇｅｎ）で抽出され、Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｓｔａｒｌｅｔピペットロボット（Ｒｅｎｏ、ネバダ、米国）を用いてキャリアＲＮＡを添加した。抽出された核酸は、Callisonら、２００６年（J. Virol. Methods.、１３８巻：６０〜６５頁）から適応させたプロトコルを用いて、ＩＢＶ ＲＮＡの量についてＲＴ−ｑＰＣＲにより分析された。簡単には、同じプライマーおよびプローブが適用され、サーモプロファイルは、ＡＢＩ ＴａｑＭａｎ Ｆａｓｔ Ｖｉｒｕｓ １−ステップマスターミックス（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ ＳｃｉｅｎｔｉｆｉｃによるＡｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）およびＲｏｃｈｅ ４８０ ＬｉｇｈｔＣｙｃｌｅｒの使用に適合された。すべての核酸試料を流し、参照として１０倍希釈系列のＩＢＶ−Ｈ５２を用いて３連で分析した。

【0367】

（例３）
ワクチンおよびチャレンジウイルスの調製：
動物実験について、野生型ＩＢＶ−Ｈ５２、ｒＩＢＶ−ｗｔ、ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂおよびｒＩＢＶ−Δ３ａｂ５ａｂの５種のＩＢＶを試験した。すべてのウイルスは、８日齢の孵化ＳＰＦ卵（ＧＤ、デーフェンテル、オランダ）において増殖された。尿膜腔（allonatoic）液を採取し、分注し、さらに使用するまで−８０℃で保存した。ウイルス力価は、滅菌リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）で１０倍希釈したウイルスを用いて測定された。各希釈用の５個の卵は、８日齢の孵化ＳＰＦ卵の尿膜腔に１００μｌで接種され、卵を密封し、３７℃でインキュベートした。接種後の最初２４時間以内に死亡した胚は、非特異的なものとみなされた。卵は、接種後の７日目まで毎日、光にあてられた。死亡した胚、およびＩＢＶに特異的な徴候を示した胚（胚の萎縮および矮小化、下降胚、赤色胚または出血性胚の集合、およびおそらくは腎臓における白色尿酸性沈着）は陽性とみなされた。卵の感染線量５０％（ＥＩＤ₅₀）は、ＲｅｅｄおよびＭｕｅｎｃｈ［Reed, L.J.およびH. Muench（１９３８年）、A simple method of estimating fifty percent endpoints.、Am J Epidemiol、２７巻：４９３〜４９７頁］の方法に従って算出された。ワクチン接種のために、ウイルスを滅菌ＰＢＳ中で希釈して、１０³のＥＩＤ₅₀／０．１ｍｌの力価を得た。マサチューセッツ血清型のチャレンジウイルスＭ４１（ＧＤ Ｄｅｖｅｎｔｅｒ、デーフェンテル、オランダから入手）は、１１日齢の孵化ＳＰＦ卵（ＶＡＬＯ ＢｉｏＭｅｄｉａ ＧｍｂＨ、オスターホルツ−シャルムベック、ドイツ）において増殖された。尿膜腔液を接種から２４時間後に採取し、分注し、さらなる使用まで−８０℃で保存した。１１日の孵化ＳＰＦ卵を使用したことを除いて、ウイルス力価を上記のように決定した。チャレンジ感染のために、ＩＢＶ株Ｍ４１を滅菌ＰＢＳ中で希釈して、１０³のＥＩＤ₅₀／０．１ｍｌの標的力価を得た。

【0368】

（例４）
Δ３ａｂ、Δ５ａｂ、Δ３ａｂ５ａｂに関するワクチン有効性データ１
材料および方法：この研究のために使用されたニワトリは、ＳＰＦ卵（ＧＤ、デーフェンテル、オランダ）から孵化された。ニワトリを７つのグループに分けた。グループ１〜６には１５羽のニワトリが含まれ、一方、１０羽のニワトリはグループ７に割り付けられた。年齢の１日齢目に、ニワトリは、ＨＥＰＡで濾過された供給空気および排気を有し、湿度（４０〜７０％）および温度（２０〜２１℃）に調節されたアイソレーターに移された。動物は、動物福祉勧告のための地方および国の要件に従った居住状態に維持された。照明計画を調整し、１日あたり１２時間暗く、１２時間明るくした。飼料および水は自由に与えた。アイソレーターに移した後、グループ１〜５のニワトリは、年齢の１日目に、点眼経路（０．０５ｍｌ／目）を介して０．１ｍｌの希釈ワクチン（１０³のＥＩＤ₅₀／０．１ｍｌ）をワクチン接種された。希釈係数は、ウイルス滴定後に得られた力価に基づいて決定された。グループ１のニワトリは、ＩＢＶ−Ｈ５２でワクチン接種され、一方、グループ２〜４のニワトリは、ｒＩＢＶ−ｗｔ（グループ２）、ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ（グループ３）、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ（グループ４）、ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ５ａｂ（グループ５）でワクチン接種された。グループ６のニワトリはワクチン接種されず、チャレンジ対照として役割を果たした。グループ７のニワトリは、厳密な陰性対照（ＳＮＣ）として役割を果たし、ワクチン接種およびチャレンジを受けなかった。ワクチン接種後の７日目に、グループ１〜６のそれぞれ５羽のニワトリを取り出し、安楽死させ、各ニワトリから気管を採取した。グループ１〜６のニワトリは、上記されるように点眼経路により、１０³のＥＩＤ₅₀／０．１ｍＬのチャレンジウイルスＭ４１を用いて、ワクチン接種後の２１日目にチャレンジされた。チャレンジ後の７日目に、すべてのニワトリを安楽死させ、気管を取り出した。ワクチン接種後の７日目およびチャレンジ感染後の７日目に採取された気管を１０個の横断切片に切断した。気管を上部分の３つの横断部分、中央部分の４つの横断部分、および下部分の３つの横断部分にスライスした。切片を予め温めたＰＢＳですすぎ、線毛活動について低倍率顕微鏡法により、サンプリングして２時間以内に調べた。所与の気管切片について、線毛活動は、内部の輪の少なくとも５０％が激しい線毛運動を示す場合、正常とみなされる。ニワトリは、ワクチン接種後の７日目にワクチン接種に使用されたウイルスの影響を受けないかまたはチャレンジウイルスの影響を受けず、よって、１０個のうち９個以上の輪が正常な線毛活動を示す場合、チャレンジ感染後の７日目にチャレンジから保護されたとみなされる。

【0369】

結果：各グループのニワトリは、ワクチン接種後およびチャレンジ感染後の臨床徴候について観察された。ワクチン接種後、いずれのニワトリもワクチン接種に関連する疾患の徴候を示さなかった。グループ３の１羽のトリが、ワクチン接種後の２日目に死亡した。実施した剖検では、卵黄嚢感染が示された。チャレンジ感染後、ワクチン接種されたグループ１〜５およびＳＮＣのグループ７では臨床徴候は観察されなかった。グループ１（ＩＢＶ−Ｈ５２）から１羽のトリを取り出し、チャレンジ感染後の１日目に安楽死させたことに言及する必要がある。しかしながら、このトリは、チャレンジ感染の３日前であるワクチン接種後の１８日目に既にうつ状態にあった。剖検では、軽度の消化管の観察、および過負荷の作物が消化管障害であることを示した。対照的に、チャレンジされ、ワクチン接種を受けていないグループからの４羽のトリは、チャレンジ感染の２〜３日後に伝染性気管支炎に典型的な呼吸器の徴候を示した。

【0370】

各ウイルスの病原性は、絨毛スコアの分析によって評価された。内側リングの５０％以上が激しい線毛運動を示し、スコアが２である場合に、線毛活動は、所与の気管切開部の影響を受けないものとして定義される。スコアは０〜４のスケールであり、０は、絨毛の１００％が運動している。１のスコアは、気管絨毛の約７５％が運動を示すことを意味する。線毛運動の５０％、２５％、および２５％未満は、スコアがそれぞれ２、３、および４となる。最高の気管病変スコアは４０であり、これは４のスコアを有する１０個の気管切片の合計である。トリあたりの各スコアの合計を平均し、その差異を分析した。様々なグループの平均気管病変スコアを表５に列挙する。この研究の結果は、３つの組換えＩＢＶ試験項目（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）のそれぞれを安全に投与することができることを示した。これは、１回用量の欠失突然変異体（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）の投与後の７日目における平均線毛率スコアが、７日の平均気管病変スコアより有意に低い（ｐ＜０．０５）１日齢のＳＰＦ層ニワトリに投与した場合、組換え親ウイルス（ｒＩＢＶ−ｗｔ）の投与後の７日目の平均気管病変スコアよりも有意に低い（ｐ＜０．０５）であったためである。欠失突然変異体（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）をＩＢＶ−Ｈ５２と比較した場合、同様の効果が観察された。さらに、ウイルスゲノムに欠損を含有する３つの試験項目のうちの１つを投与した後に、試験項目に起因する原因からＩＢの顕著な臨床徴候を示し、および死亡したトリはいなかった。まとめると、３種の組換えＩＢＶ試験項目（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂおよびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）はすべて、上記の欠失突然変異体ＩＢＶに欠失を含有しない対照（ｒＩＢＶ−ｗｔまたはＩＢＶ−Ｈ５２）としてより安全であった。

【0371】

【表5】

【0372】

さらに、ゲノム中の欠失を含有する組換えＩＢＶ（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）が、毒性ＩＢＶ株Ｍ４１を用いたチャレンジ感染からの防御を誘導できるかどうかを分析した。標的化されたチャレンジ用量は、点眼法により各眼内に５０μｌで、１００μｌの希釈ウイルス中に適用された１０³のＥＩＤ₅₀／ニワトリであった。チャレンジウイルスの逆滴定は、チャレンジ用量が１０^3.78のＥＩＤ₅₀／１００μｌであり、計画されたようにほぼ１０倍高いことを示した。

【0373】

【表6】

【0374】

試験は、すべてのチャレンジされた対照ニワトリが４０の平均スコアで示されるように線毛活動の極度の喪失を示したため、Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｐｈａｒｍａｃｏｐｏｅａ ＥＰ ０４４２によるすべての妥当性基準を満たした。さらに、ワクチン接種とチャレンジの間の観察期間中、１０パーセント以下のワクチン接種したニワトリまたは対照ニワトリは、試験したワクチンに起因しない原因から異常な臨床徴候を示したかまたは死亡した。この研究の結果は、ワクチン接種されたトリのいずれも臨床徴候を示さなかったかまたはＩＢＶ株Ｍ４１によるチャレンジ後に死亡しなかったため、ウイルスゲノムにおいて欠失を含有する試験された３つの組換えＩＢＶ（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）の有効性を示した。

【0375】

試験項目ｒＩＢＶ−Δ３ａｂについて、９羽のうち６羽（６７％）は、ＥＰ ０４４２に記載されるように、有効性に関するチャレンジ後の試験に応じた（１０個の気管輪のうち９個が正常な絨毛活性を示す）。試験項目ｒＩＢＶ−Δ５ａｂについて１０羽のうち１０羽（１００％）、および試験項目ｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂについて１０羽のうち３羽（３０％）がチャレンジ感染から保護された。興味深いことに、野生型ウイルスＩＢＶ−Ｈ５２によるワクチン接種後、９羽のトリのうち４羽（４４％）が保護されたが、一方、１０羽のうち７羽（７０％）はｒＩＢＶ−ｗｔによるワクチン接種後、チャレンジ感染から保護された。予期しない低保護率は、ＩＢＶ−Ｈ５２でさえも９０％以上の保護を誘導できなかったため、使用したチャレンジウイルスのかなり高い力価によって引き起こされ得る。まとめると、３つすべての組換えＩＢＶ試験項目（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）は、対照（ｒＩＢＶ−ｗｔまたはＩＢＶ−Ｈ５２）としてより安全に投与することができるが、しかしながら、すべての突然変異体は、対照と少なくとも同程度に有効である。

【0376】

（例５）
Δ３ａｂ、Δ５ａｂ、Δ３ａｂ５ａｂに関するワクチン有効性データ２
材料および方法：実験結果を検証するために、上記の実験（例１〜４）を最初から繰り返し、第２の独立したデータセットを得た。構築物は、既に上記された方法に従って２度目に生成された。ワクチン接種およびチャレンジ実験は、同じ遺伝子欠失（Δ３ａｂ、Δ５ａｂ、Δ３ａｂ５ａｂ）および対照として非修飾ウイルス（ＩＢＶ−Ｈ５２、ｒＩＢＶ−ＷＴ）を含有するウイルスを用いて行われた。実験は、例４の下に記載されるように設計された。明確にするために、グループ１のニワトリにＩＢＶ−Ｈ５２をワクチン接種し、一方、グループ２〜５のニワトリにｒＩＢＶ−ｗｔ（グループ２）、ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ（グループ３）、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ（グループ４）、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂ５ａｂ（グループ５）をワクチン接種した。グループ６のニワトリはワクチン接種およびチャレンジを受けず、チャレンジ対照として役割を果たした。グループ７のニワトリは厳密な陰性対照（ＳＮＣ）として役割を果たし、ワクチン接種およびチャレンジを受けなかった。ニワトリに１日齢で１０³のＥＩＤ₅₀／ニワトリをワクチン接種し、ワクチン接種後２１日目に毒性ＩＢＶ株Ｍ４１で１０³のＥＩＤ₅₀／ニワトリをチャレンジした。両方のウイルス接種は、点眼で行われた。ウイルスの安全性を分析するために、気管の線毛活動は、グループ１〜５の５羽のニワトリ、およびグループ７（ＳＮＣ）の５羽のニワトリにおけるワクチン接種後の７日目に例４の下に記載されるように調査された。チャレンジ感染後の気管損傷からウイルスを保護する能力を調査するために、残りのニワトリの気管をチャレンジ感染後の７日目にそれらの線毛活動について分析した。気管の線毛活動は、例４の下に記載されるように調査された。実験（experimenst）の過程で、すべてのニワトリを臨床徴候について毎日観察された。

【0377】

結果：ワクチン投与に関連した臨床観察は、いずれのグループにおいても、ワクチン接種後およびチャレンジ感染後のいずれにも報告されなかった。気管病変スコアは、１つの例外を除いて、例４に記載されたように調査された。ワクチン接種後の７日目に、ＳＮＣの５羽のトリは、動物福祉上の理由により、気管線毛における病変のスコアリングの陰性対照として使用された。要するに、気管の最高スコアは４０であり、これは気管線毛の可能性のある最も高い損傷を示す。表７には、ワクチン接種後の７日目のグループ１あたり５羽のトリの平均病変スコアが示されている。３つの組換えＩＢＶ試験項目（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）はすべて、平均病変スコア（表７）によって示されるように、対照（ｒＩＢＶ−ｗｔまたはＩＢＶ−Ｈ５２）としてより安全に投与することができる。よって、上記の結果は検証された。３つの組換えＩＢＶ試験項目（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂおよびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）は、ＩＢＶ−Ｈ５２およびｒＩＢＶ−ｗｔと比較した場合、より安全であった。

【0378】

【表7】

【0379】

さらに、ゲノム欠失を含有する組換えＩＢＶ（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂ、およびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）が、毒性ＩＢＶ株Ｍ４１を用いたチャレンジ感染からの防御を誘導できるかどうかを試験した。標的化されたチャレンジ用量は、点眼法により各眼内に５０μｌで、１００μｌの希釈ウイルス中に適用された１０³のＥＩＤ₅₀／ニワトリであった。チャレンジウイルスの逆滴定は、チャレンジ用量が１０^3.36のＥＩＤ₅₀／１００μｌであり、予想された範囲であることを示した。

【0380】

チャレンジ感染は、チャレンジ感染後の７日目に３９の平均スコア（表８）で示されるように、チャレンジされた非ワクチン接種対照ニワトリ（グループ６）のすべてが線毛活動の極度の喪失を示したため有効であった。さらに、ワクチン接種とチャレンジの間の観察期間中に、ワクチン適用に起因する臨床徴候は、ニワトリにおいて観察されなかった。
まとめると、３つの組換えＩＢＶ試験項目（ｒＩＢＶ−Δ３ａｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａｂおよびｒＩＢＶ−Δ３ａｂΔ５ａｂ）はすべて、対照（ｒＩＢＶ−ｗｔまたはＩＢＶ−Ｈ５２）としてのワクチンとして適用した後、より安全であるが、しかしながら、すべての突然変異体は、少なくとも対照と同じくらい効果的である。

【表8】

【0381】

（例６）
１つの欠失突然変異体Δ３ａ、Δ３ｂ、Δ５ａ、Δ５ｂの生成および試験
材料と方法：
遺伝子３ａ、３ｂ、５ａ、または５ｂのいずれかにおいて単一欠失を有するプラスミドの構築。単一のタンパク質３ａ、３ｂ、５ａ、または５ｂがＩＢＶの毒性に影響を及ぼすかどうかを分析するために、タンパク質の発現を単一欠失突然変異体によって不活性化した。この目的のために、３ａ、３ｂ、５ａ、または５ｂのいずれかの欠失を含有するｃＤＮＡ断片を合成的に生成し、Ｇｅｎｓｃｒｉｐｔ（ｐＵＣ５７−Δ３ａ；ｐＵＣ５７−Δ３ｂ、ｐＵＣ５７−Δ５ａ、ｐＵＣ５７−Δ５ｂ）によるｐＵＣ５７−シンプル内にライゲートした。プラスミドｐＵＣ５７−Δ３ａを制限酵素ＮｈｅＩおよびＰｍｌＩで切断し、適切なＩＢＶ特異的ｃＤＮＡ配列をＮｈｅＩ／ＰｍｌＩで切断したプラスミドｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲ（表１も参照）にライゲートして、ｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲ−Δ３ａを得た。次のステップにおいて、プラスミドｐ−ＩＢＶ−３Ｔ（表１も参照）をＥｃｏＲＩで切断し、ｃＤＮＡ断片をＥｃｏＲＩで切断したｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲ−Δ３ａにライゲートして、ここではｐ−ＩＢＶ−Δ３ａと呼ばれるｐ−ＩＢＶ−５−ｌｂ−Ｓ−ＳＩＲ−Δ３ａを得た。プラスミドｐＵＣ５７−Δ３ｂの断片を使用したことを除いて、同じ戦略をｐ−ＩＢＶ−Δ３ｂの生成のために用いた。５ａまたは５ｂのいずれかの欠失を含有するプラスミドを生成するために、異なるクローニング手法を選んだ。この目的のために、プラスミドｐＵＣ５７−Δ５ａを２つの制限酵素（ＡｆｅＩ、ＮｈｅＩ）で切断し、溶出されたｃＤＮＡ断片を適切に切断されたｐ−ＩＢＶ−３Ｔにライゲートして、ｐ−ＩＢＶ−Δ５ａ−３Ｔを得た。プラスミドｐ−ＩＢＶ−Δ５ａ−３ＴをＥｃｏＲＩで切断し、溶出されたｃＤＮＡ断片をＥｃｏＲＩで切断したｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲにライゲートして、ここではｐ−ＩＢＶ−Δ５ａと呼ばれる標的プラスミドｐ−ＩＢＶ−５−１ｂ−Ｓ−ＳＩＲΔ５ａ−３Ｔを得た。プラスミドｐＵＣ５７−Δ５ｂを使用したことを除いて、同じ戦略をｐ−ＩＢＶ−Δ５ｂの生成のために用いた。

【0382】

アクセサリータンパク質３ａ、３ｂ、５ａおよび５ｂにおける単一欠失を有する組換えＩＢＶの生成。３ａ、３ｂ、５ａ、または５ｂのいずれかのコード領域において欠失を含有するＩＢＶを上記のように生成した。要するに、線状プラスミドｐ−ＩＢＶ−Ｎ、およびプラスミドｐ−ＩＢＶ−Δ３ａ、ｐ−ＩＢＶ−３ｂ、ｐ−ＩＢＶ−５ａまたはｐ−ＩＢＶ−５ｂのいずれかのランオフ転写物は、例２に記載されているように生成された。組換えＩＢＶの生成は、例２に記載されているように、ｍＩＢＶに感染され、続いて４つの組み合わせのｃＲＮＡ（ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Ｎ、ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Δ３ａ；ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Ｎ、ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Δ３ｂ；ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Ｎ、ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Δ５ａ；ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Ｎ、ｃＲＮＡ−ＩＢＶ−Δ５ｂ）によってトランスフェクトされたＬＲ７細胞を用いて行われた。その後、組換えウイルス（ｒＩＢＶ−Δ３ａ、ｒＩＢＶ−Δ３ｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａ、ｒＩＢＶ−Δ５ｂ）は、例２に記載されるように救出され、例３に記載されるように増殖させた。最終ウイルスストックのＥＩＤ₅₀におけるウイルス力価は、ＲｅｅｄおよびＭｕｅｎｃｈ［Reed, L.J.およびH. Muench（１９３８年）、A simple method of estimating fifty percent endpoints. Am J Epidemiol、２７巻：４９３〜４９７頁］を用いて、希釈あたり５個の卵を使用して、８日齢の胚発生ＳＰＦ卵においてを決定された。

【0383】

動物実験：動物実験を例４に記載されるように行った。グループあたり１５羽のＳＰＦニワトリは、点眼経路を介して、１００μｌのＩＢＶ−Ｈ５２（グループ１）、ｒＩＢＶ−ｗｔ（グループ２）、ｒＩＢＶ−Δ３ａ（グループ３）、ｒＩＢＶ−Δ３ｂ（グループ４）、ｒＩＢＶ−Δ５ａ（グループ５）、またはｒＩＢＶ−Δ５ｂ（グループ６）のいずれかにおける１０³のＥＩＤ₅₀／ニワトリでワクチン接種された。グループ７およびグループ８の１０羽のニワトリはワクチン接種されなかった。グループ８のニワトリは、ワクチン接種およびチャレンジもされていない厳密な陰性対照（ＳＮＣ）として役割を果たした。すべてのトリは、グループ間でウイルス伝染を防ぐため、アイソレーターに維持された。ワクチン接種後の７日目に、グループ１〜６の５羽のトリおよびグループ８の５羽のトリは、例４に記載されているように、気管の線毛活動を評価するために除かれた。チャレンジ感染は、ワクチン接種後の２１日目のグループ１〜７のニワトリを用いて、１００μｌの毒性ＩＢＶ株Ｍ４１における１０³のＥＩＤ₅₀／ニワトリを使用して行われ、一方、グループ群のニワトリはチャレンジされないままであった。すべてのグループの残りのニワトリを安楽死させ、気管は、チャレンジ感染後の７日目に例４に記載されているように線毛活動の分析のために除去された。

【0384】

表９には、ワクチン接種後の７日目の線毛活動の気管スコアの平均値が示されている。統計的分析は、実験グループ３〜６（ｒＩＢＶ−Δ３ａ、ｒＩＢＶ−Δ３ｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａ、ｒＩＢＶ−Δ５）の病変スコアが、グループ２（ｒＩＢＶ−ｗｔ）のスコアと統計的に異なり低かった（ｐ＜０．０５）ことを示した。同様の効果は、欠失突然変異体（ｒＩＢＶ−Δ３ａ、ｒＩＢＶ−Δ３ｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａ、ｒＩＢＶ−Δ５）をＩＢＶ−Ｈ５２と比較した場合に観察された。

【表9】

チャレンジ感染は、チャレンジ感染後の７日目に３６の平均スコア（表１０）で示されるように、チャレンジされた対照ニワトリ（グループ７）が線毛活動の極度の喪失を示したため有効であった。

【0385】

対照のＩＢＶ（ＩＢＶ−Ｈ５２、ＲＩＢＶ−ＷＴ）または欠失突然変異体（ｒＩＢＶ−Δ３ａ、ｒＩＢＶ−Δ３ｂ、ｒＩＢＶ−Δ５ａ、およびｒＩＢＶ−Δ５ｂ）のいずれかでワクチン接種された、ワクチン接種ニワトリは、線毛活動の平均病変スコアが、ワクチン接種されていないがチャレンジされたニワトリ（グループ７）の病変スコアよりも有意に低かったため、チャレンジ感染から保護された。まとめると、遺伝子３ａ、３ｂ、５ａ、または５ｂのいずれかに欠失を含有するＩＢＶは、若いニワトリにおいて弱毒化されるが、マサチューセッツ血清型（ここではＭ４１株）の毒性ＩＢＶでチャレンジされた場合、それらの親（ＩＢＶ−Ｈ５２）および組換え親株（ｒＩＢＶ−ＷＴ）に匹敵する有意な保護を誘導することができる。

【0386】

【表10】

【0387】

本明細書に開示され特許請求される組成物および方法はすべて、本開示に照らして過度の実験なしに作製されおよび実施することができる。本発明の組成物および方法は、好ましい実施形態の観点から記載されているが、当業者には、本発明の概念、精神および範囲から逸脱することなく、本明細書に記載されている組成物および方法に、ならびにステップまたはステップの順序において、変形を適用し得ることは明らかである。より具体的には、化学的におよび生理学的に関連する特定の薬剤が、本明細書に記載されている薬剤と置き換え得、一方、同じまたは類似した結果が達成されることは明らかである。当業者に明らかなこのような類似した置換および修正はすべて、続く特許請求の範囲によって定義される本発明の精神、範囲および概念の範囲内であるとみなされる。

【配列表】

[この文献には参照ファイルがあります.J-PlatPatにて入手可能です(IP Forceでは現在のところ参照ファイルは掲載していません)]