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特開2024-119907黄色ブドウ球菌（ＳＴＡＰＨＹＬＯＣＯＣＣＵＳ ＡＵＲＥＵＳ）感染症を治療および予防するための組成物および方法
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2024119907
(43)【公開日】2024-09-03
(54)【発明の名称】黄色ブドウ球菌（ＳＴＡＰＨＹＬＯＣＯＣＣＵＳ ＡＵＲＥＵＳ）感染症を治療および予防するための組成物および方法
(51)【国際特許分類】
A61K 39/395 20060101AFI20240827BHJP
A61P 31/04 20060101ALI20240827BHJP
A61P 43/00 20060101ALI20240827BHJP
A61K 38/14 20060101ALI20240827BHJP
C07K 16/12 20060101ALI20240827BHJP
A61K 38/16 20060101ALI20240827BHJP
【ＦＩ】
A61K39/395 N
A61K39/395 R ZNA
A61P31/04
A61P43/00 121
A61K38/14
C07K16/12
A61K38/16
A61K39/395 R
【審査請求】有
【請求項の数】1
【出願形態】ＯＬ
(21)【出願番号】P 2024092217
(22)【出願日】2024-06-06
(62)【分割の表示】P 2022076737の分割
【原出願日】2015-06-03
(31)【優先権主張番号】62/007,242
(32)【優先日】2014-06-03
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】62/115,665
(32)【優先日】2015-02-13
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】62/041,423
(32)【優先日】2014-08-25
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．ＴＷＥＥＮ
(71)【出願人】
【識別番号】510312617
【氏名又は名称】エックスバイオテク インコーポレイテッド
【氏名又は名称原語表記】ＸＢｉｏｔｅｃｈ Ｉｎｃ．
(74)【代理人】
【識別番号】110001302
【氏名又は名称】弁理士法人北青山インターナショナル
(72)【発明者】
【氏名】シマール，ジョン
(57)【要約】 （修正有）
【課題】対象における黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を治療する、または黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を発現するリスクを減少させるための医薬組成物を提供する。
【解決手段】医薬上許容される担体と、Ｆａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合する精製モノクローナル抗体とを含み、前記モノクローナル抗体が、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌上のＳｐＡにそれらのＦｃ領域を介して結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換することができることを特徴とする、医薬組成物が提供される。
【選択図】なし
【解決手段】医薬上許容される担体と、Ｆａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合する精製モノクローナル抗体とを含み、前記モノクローナル抗体が、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌上のＳｐＡにそれらのＦｃ領域を介して結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換することができることを特徴とする、医薬組成物が提供される。
【選択図】なし
【特許請求の範囲】
【請求項1】
対象における黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を治療する、または黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を発現するリスクを減少させるための医薬組成物であって、前記医薬組成物が、
医薬上許容される担体と、Ｆａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合する精製モノクローナル抗体とを含み、
前記モノクローナル抗体が、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌上のＳｐＡにそれらのＦｃ領域を介して結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換することができることを特徴とする、医薬組成物。
医薬上許容される担体と、Ｆａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合する精製モノクローナル抗体とを含み、
前記モノクローナル抗体が、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌上のＳｐＡにそれらのＦｃ領域を介して結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換することができることを特徴とする、医薬組成物。
【請求項2】
請求項１に記載の医薬組成物において、前記モノクローナル抗体が、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３モノクローナル抗体であることを特徴とする、医薬組成物。
【請求項3】
請求項１に記載の医薬組成物において、前記モノクローナル抗体が、それらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合する少なくとも１ｍｇ／ｍＬのＩｇＧ免疫グロブリンの存在下でＳｐＡ発現性黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌のオプシニゼーションを媒介することができることを特徴とする、医薬組成物。
【請求項4】
請求項１に記載の医薬組成物において、前記黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症が、菌血症であることを特徴とする、医薬組成物。
【請求項5】
請求項１に記載の医薬組成物において、前記黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症が、メチシリン耐性黄色ブドウ球菌によって引き起こされることを特徴とする、医薬組成物。
【請求項6】
請求項１に記載の医薬組成物において、前記モノクローナル抗体が、対象に静脈投与されるものであることを特徴とする、医薬組成物。
【請求項7】
請求項１に記載の医薬組成物において、バンコマイシンが、対象に前記モノクローナル抗体と共に投与されるものであることを特徴とする、医薬組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願の相互参照
本出願は、２０１４年６月３日に出願された米国仮特許出願第６２／００７，２４２号明細書、２０１４年８月２５日に出願された同第６２／０４１，４２３号明細書および２０１５年２月１３日に出願された同第６２／１１５，６６５号明細書からの優先権を主張するものである。
本出願は、２０１４年６月３日に出願された米国仮特許出願第６２／００７，２４２号明細書、２０１４年８月２５日に出願された同第６２／０４１，４２３号明細書および２０１５年２月１３日に出願された同第６２／１１５，６６５号明細書からの優先権を主張するものである。
【0002】
配列表
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に提出されており、参照により全体として本明細書に組み込まれる配列表を含有する。２０１５年５月２８日に作成された上記のＡＳＣＩＩコピーは、５４０７－０２３４＿ＳＬ．ｔｘｔと指名されており、サイズは８３，０３６バイトである。
本出願は、ＡＳＣＩＩフォーマットで電子的に提出されており、参照により全体として本明細書に組み込まれる配列表を含有する。２０１５年５月２８日に作成された上記のＡＳＣＩＩコピーは、５４０７－０２３４＿ＳＬ．ｔｘｔと指名されており、サイズは８３，０３６バイトである。
【0003】
本発明は、概して内科療法、免疫学および微生物学の方法に関する。より詳細には、本発明は、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を治療および予防するための組成物および方法に関する。
【背景技術】
【0004】
黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）（ＳＡ）は、ヒトおよび動物の何れにおいても疾患および死亡の実質的原因である。これらのグラム陽性球菌による感染症は、表在性膿瘍の発生を生じさせることが多い。ＳＡ感染症のその他の症例は、はるかに重篤となることがある。例えば、リンパ管および血液中へのＳＡの侵入は全身性感染症もたらす可能性があり、これは順に、例えば心内膜炎、関節炎、骨髄炎、肺炎、敗血症性ショックおよび死亡さえなどの合併症を引き起こす場合がある。院内ＳＡ感染症は一般的であり、ＳＡが院内外科部位感染症および肺炎の最も頻度の高い原因であり、心血管および血流感染症の２番目に頻度の高い原因である場合は特に解決が困難になる。抗生物質の投与は、これまでＳＡ感染症の標準治療であったが、現在も依然として標準治療である。残念なことに、抗生物質の使用は、ＳＡにおける抗生物質耐性の発生も加速させてきた。明白に、メチシリン耐性ＳＡ（ＭＲＳＡ）は、例えばペニシリンおよびセファロスポリン系のβ－ラクタム系抗生物質に抵抗する能力を進化させてきた。より懸念されることに、近年は、例えばバンコマイシンおよびリネゾリドなどの頼みの綱の抗生物質へのＳＡ耐性が出現してきた。このため、ＳＡ感染症を予防および治療するための新規なアプローチが必要とされる。
【発明の概要】
【0005】
ＳＡタンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合するＦａｂ領域パラトープを有する特定の抗体（Ａｂ）は、抗体（Ａｂ）中和ＳｐＡのＳＡの発現にもかかわらずＳＡ細菌のオプシニゼーション（ｏｐｓｉｎｉｚａｔｉｏｎ）を媒介できることが見いだされた。ＳＡ感染症を治療または予防するための以前のＡｂに基づく戦略は、前臨床および早期臨床試験において前途有望であることを示したが、第ＩＩＩ相試験におけるエンドポイントを満たすことには失敗した。おそらくこれらの結果を説明するのは、以前の戦略がＳｐＡのＡｂ中和特性に取り組まなかったことにある。ＳｐＡは、それらのＦｃ（エフェクター）領域を介してほとんどの免疫グロブリン（Ｉｇ）に結合する、多量に発現する細胞壁関連タンパク質である。ＳｐＡは、サブクラスのＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のヒト抗体にそれらのＦｃ領域を介して約１×１０－９ＭのＫＤで結合し、それにより免疫グロブリン（Ｉｇ）のエフェクター部分を例えば補体などのＦｃ相互作用免疫エフェクターおよびＦｃ受容体（ＦｃＲ）担持食細胞から外向きに方向付けるＦｃ領域アンカーとして作用する。したがって、ＳＡ抗原に対して特異的な大多数のＡｂは、この方法で免疫エフェクターから「隔離」される。さらに、ＳｐＡは、ＳＡの細胞壁上で極めて高度に発現するため（細胞壁の推定７％）、ＳｐＡは、細胞壁を被覆するＩｇのシールド形成を媒介する。このシールドは、細胞壁抗原に対して特異的なＡｂがそれらの標的に結合して細菌のオポノファゴサイトーシス（ｏｐｏｎｏｐｈａｇｏｃｙｔｏｓｉｓ）を媒介するのを立体的に妨害する。Ｉｇシールドの形成は、以前は毒性因子であるとは認識されていなかった。そこでＳｐＡのＦｃ中和能力およびＩｇシールドの形成にもかかわらず、それらのＦｃ領域が依然として免疫エフェクター細胞上のＦｃＲと相互作用する、および／またはＣｌｑに結合することにより補体を活性化することを許容しながらＳｐＡに特異的に結合するＦａｂ領域を有するＳＡ結合Ａｂは、抗ＳＡ Ａｂをベースとするアプローチに比して有意なステップであった。そのようなＡｂの好ましいバージョンは、ＳｐＡに既に結合したＩｇをそれらのＦｃ領域によって置換することができる。
【0006】
上記の例として、本明細書では、ＳｐＡのＦｃ結合特性およびそれらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合したＩｇによる標的エピトープの立体障害にもかかわらず、それらのＦｃ領域が依然として１つの（例えば、免疫細胞上の可溶性の組換えまたは天然）ＦｃＲと相互作用することが可能でありながら、ＳＡ細菌上のＳｐＡの標的エピトープに特異的に結合できるＦａｂ領域を単離または精製抗体（特に、例えばアミノ酸４３５位にアルギニンを有するアロタイプを備えるようなＳｐＡに対して低親和性または非親和性のＦｃ領域を有するヒトＩｇＧ３抗体；Ｓｔａｐｌｅｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎｓ ２，Ａｒｔｉｃｌｅ ｎｕｍｂｅｒ：５９９，２０１１）について記載する。さらに本明細書では、これらの抗体のうちの少なくとも１つと医薬上許容される担体（例えば、非天然型の医薬上許容される担体）とを含有する医薬組成物が提供される。さらに、ＳＡ感染症を有する対象を治療する、または対象においてＳＡ感染症が発現するリスクを減少させる方法において、それを必要とする対象に治療有効量の本明細書に記載した医薬組成物の何れか、または本明細書に記載した抗体もしくは抗原結合フラグメントの何れかを投与するステップを含む方法が提供される。
【0007】
本明細書で使用する名詞の前の用語「１つの（ａ）」または「１つの（ａｎ）」は、１つ以上の特定名詞を表す。例えば、フレーズの「抗体」は、「１つ以上の抗体」を表す。
【0008】
用語「抗体」または「Ａｂ」は、抗原（例えば、配列番号１などのＳｐＡ抗原または配列番号１の抗原フラグメント）に特異的に結合する任意の免疫グロブリン（例えば、ヒト、軟骨魚類もしくはラクダ抗体）またはそれらのコンジュゲートを意味する。極めて広範なＡｂが当業者には公知である。Ａｂの非限定的な例には、モノクローナルＡｂ（例えば、全長Ａｂを含む）、ポリクローナルＡｂ、多重特異性Ａｂ（例えば、二重特異性Ａｂ）、二重可変ドメインＡｂ、一本鎖Ａｂ（例えば、単一ドメインＡｂ、ラクダＡｂおよび軟骨魚類抗体）、キメラ（例えば、ヒト化、例えばヒト化ＩｇＧ３）ＡｂおよびヒトＡｂ（例えば、ヒトＩｇＧ３ Ａｂ）が含まれる。用語の「抗体」には、さらにＡｂコンジュゲート（例えば、安定化タンパク質、標識または治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）にコンジュゲートしたＡｂ）が含まれる。
【0009】
用語「抗原結合フラグメント」は、抗原に特異的に結合できる少なくとも１つの可変ドメイン（（例えば、哺乳動物（例えば、ヒト，マウス、ラット、ウサギまたはヒツジ）重鎖または軽鎖免疫グロブリン）、ラクダ可変抗原結合ドメイン（ＶＨＨ）または抗原に特異的に結合できる軟骨魚類免疫グロブリン新規抗原受容体（Ｉｇ－ＮＡＲ）ドメイン）を含有する全長Ａｂの何れかの部分を意味する。例えば、本明細書に記載した抗原結合フラグメントは、哺乳動物（例えば、ヒト）における抗体依存性の細胞媒介性細胞毒性（ＡＤＣＣ）および／または補体依存性の細胞毒性（ＣＤＣ）を媒介するために十分であり、および／または治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）にコンジュゲートしているＡｂ Ｆｃ領域の少なくとも一部を含むことができる。Ａｂフラグメントの非限定的な例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆｖフラグメント、ダイアボディ、線状抗体およびＡｂフラグメントから形成された多重特異性Ａｂが含まれる。少なくとも１つのラクダＶＨＨドメインまたは少なくとも１つの軟骨魚類Ｉｇ－ＮＡＲドメインを含有する追加のＡｂフラグメントには、ミニボディ、マイクロ抗体、サブナノ抗体およびナノ抗体ならびに米国特許出願公開第２０１０／００９２４７０号明細書に記載された他の形態のＡｂの何れかが含まれる。抗原結合フラグメントは、例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ３ ＩｇＧ４、ＩｇＤ、ＩｇＡ、ＩｇＥまたはＩｇＭの１つの抗原結合フラグメントであってよい。
【0010】
用語「ヒト抗体」は、ヒトのゲノム内に存在する核酸（例えば、再配列ヒト免疫グロブリン重鎖または軽鎖遺伝子座）によってコードされるＡｂを意味する。一部の実施形態では、ヒトＡｂは、哺乳動物（例えば、ヒト）細胞培養中で生成される。一部の実施形態では、ヒトＡｂは、非ヒト細胞（例えば、チャイニーズハムスター卵巣細胞系またはマウスもしくはハムスター細胞系）中で生成される。一部の実施形態では、ヒトＡｂは、細菌または酵母細胞中で生成される。ヒトＡｂは、コンジュゲート化治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）を含むことができる。ヒトＡｂは、ヒトＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ４、ＩｇＤ、ＩｇＡ、ＩｇＥまたはＩｇＭであってよく、好ましくはヒトＩｇＧ３である。用語「完全ヒト抗体」は、人間の血清中に自然に存在する重鎖および軽鎖可変領域を備えるＡｂを意味する。
【0011】
用語「ヒト化抗体」は、ヒトＡｂの大多数の配列を含有するが、さらに非ヒト（例えば、マウス、ラット、ウサギまたはヤギ）Ｉｇに由来する最小配列も含むＡｂを意味する。非限定的な例では、ヒト化Ａｂは、レシピエントＡｂの超可変領域残基が所望の特異性、親和性および能力を有する非ヒト種Ａｂ（ドナーＡｂ）、例えば、マウス、ウサギまたはヤギＡｂ由来の超可変領域残基と置換されるヒトＡｂ（レシピエントＡｂ）である。一部の実施形態では、ヒトＩｇのＦｖフレームワーク残基は、対応する非ヒト残基によって置換される。一部の実施形態では、ヒト化Ａｂは、レシピエントＡｂまたはドナーＡｂ中では見いだされない残基を含有していてよい。これらの修飾は、Ａｂ性能をさらに精錬するために加えることができる。
【0012】
一部の実施形態では、ヒト化Ａｂは、超可変ループ（相補性決定領域）の全部または実質的に全部が非ヒト免疫グロブリンの超可変ループに対応し、フレームワーク領域の全部または実質的に全部がヒト免疫グロブリン配列のフレームワーク領域である、少なくとも１つ、および典型的には２つの可変ドメインの実質的に全部を含有しているであろう。ヒト化抗体は、さらに、典型的にはヒトＩｇ（例えば、ヒトＩｇＧ３）のＩｇ定常領域（Ｆｃ領域）の少なくとも一部を含有している可能性がある。ヒト化Ａｂは、当技術分野において周知である分子生物学的方法によって生成できる。ヒト化抗体を生成する方法の非限定的な例は、本明細書に記載されている。ヒト化Ａｂは、コンジュゲート化治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）を含むことができる。
【0013】
用語「一本鎖抗体」は、抗原に特異的に結合できる少なくとも１つの可変結合ドメイン（例えば、哺乳動物重鎖もしくは軽鎖Ｉｇ、ラクダ可変抗原結合ドメイン（ＶＨＨ）または軟骨魚類（例えば、サメ）免疫グロブリン新規抗原受容体（Ｉｇ－ＮＡＲ）ドメイン）の可変ドメイン）を含有する単一ポリペプチドである。一本鎖Ａｂの非限定的な例は、本明細書に記載されており、当技術分野において公知である（例えば、米国特許出願公開第２０１０／００９２４７０号明細書に記載された抗体）。単一ドメイン抗体は、コンジュゲート化治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）を含むことができる。
【0014】
Ａｂまたはその抗原結合フラグメントは、特定抗原、例えばＳｐＡ（例えば、配列番号１を含むエピトープまたは配列番号１の抗原結合フラグメント）に「特異的に結合する（ｓｐｅｃｉａｌｌｙ ｂｉｎｄｓ）」または「特異的に結合する（ｂｉｎｄｓ ｓｐｅｃｉａｌｌｙ）」が、Ａｂまたはその抗原結合フラグメントがその抗原に結合する場合は、サンプル中の他の分子にはより少ない程度にのみ認識および結合する（例えば、認識および結合しない）。一部の実施形態では、Ａｂまたはその抗原結合フラグメントは、リン酸緩衝食塩液中で（表面プラズモン共鳴によって決定した）１×１０－１０Ｍ以下（例えば、１×１０－１１Ｍ以下または１×１０－１２Ｍ以下）の親和性（ＫＤ）でエピトープに選択的に結合する。Ａｂまたは抗原結合フラグメントがタンパク質エピトープに特異的に結合する能力は、当技術分野において公知の方法または本明細書に記載した方法の何れかを使用して決定することができる。
【0015】
用語「相補性決定領域」または「ＣＤＲ」は、Ａｂまたはその抗原結合フラグメント中の抗原結合部位の一部（パラトープ）を形成するＩｇ（重鎖または軽鎖Ｉｇ）内の１つの領域を意味する。当技術分野において公知であるように、重鎖Ｉｇは、通常はそれぞれ３つのＣＤＲ：ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含有し、軽鎖Ｉｇは、通常はそれぞれ３つのＣＤＲ：ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含有する。何れかのＡｂまたはその抗原結合フラグメント内では、重鎖Ｉｇ由来の３つのＣＤＲおよび軽鎖Ｉｇ由来の３つのＣＤＲは、Ａｂまたはその抗原結合フラグメント内で一緒に１つの抗原結合部位を形成する。カバット（Ｋａｂａｔ）データベースは、軽鎖Ｉｇまたは重鎖Ｉｇ内に存在するＣＤＲ配列をナンバリングするために当技術分野において使用される１つのシステムである。
【0016】
他に特に規定しない限り、本明細書で使用する全ての技術用語および科学用語は、本発明が属する技術分野の当業者であれば一般に理解される意味と同一の意味を有する。本明細書では本発明において使用するための方法および材料について記載する。当技術分野において公知である他の好適な方法および材料も使用できる。材料、方法および実施例は、例示することのみを意図しており、限定することは意図していない。本明細書で言及した全ての刊行物、特許出願、特許、配列、データベース記入事項および他の参考文献は、参照により全体として組み込まれる。不一致が生じた場合は、用語の定義を含めて本明細書が優先されることになる。
【図面の簡単な説明】
【0017】
【図2】図２は、ビオチン化ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂ（明るい線）またはコントロールのビオチン化抗インターロイキン１αＡｂ（ＭＡＢｐ１）（濃い線）とともにインキュベートされ、次にストレプトアビジン－ＡＰＣとともにインキュベートされた、ＳＡ臨床単離体００Ｘ（上）およびＳＡ菌株ＡＴＣＣ＃２５９２３（下）の蛍光のヒストグラムを示す２つのグラフのセットである。
【図3】図３は、未標識ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂ（明るい線）または未標識ＭＡＢｐ１ Ａｂ（濃い線）とともにインキュベートされ、次にビオチン化組換えＦｃγ受容体１とともにインキュベートされ、さらに次にストレプトアビジン－ＡＰＣとともにインキュベートされた、ＳＡ臨床単離体００Ｘ（上）およびＳＡ菌株ＡＴＣＣ＃２５９２３（下）の蛍光のヒストグラムを示す２つのグラフのセットである。
【図4】図４は、ｐＨ－ロードグリーン標識菌株ＡＴＣＣ＃２５９２３または臨床単離体００Ｘを用いてオプソニン化されたＰＡ８－Ｇ３ Ａｂとともにコインキュベーションされた後の分化ＨＬ６０細胞の（蛍光細胞分類法を使用した）平均蛍光強度のグラフである。ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂの代わりに、コントロールＡｂ ＭＡＢｐ１とともにインキュベートされた類似のサンプルを陰性コントロールとして使用した。
【図5】図５は、ビオチン化ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂまたは陰性コントロールＭＡＢＰ１ Ａｂの添加前の１５分間にわたりヒト血清とともに予備インキュベートされ、次にストレプトアビジンＡＰＣとともにインキュベートされた、臨床単離体００Ｘ（上）またはＡＴＣＣ＃２５９２３（下）の蛍光強度を示している２つのグラフのセットである。
【発明を実施するための形態】
【0018】
本明細書では、ＳＡ感染症を有する対象を治療するため、または対象におけるＳＡ感染症を発現するリスクを減少させるための方法および組成物について記載する。
【0019】
抗体およびそれらの抗原結合フラグメント
本明細書では、ＳｐＡに結合し、ＳＡの抗体（Ａｂ）中和ＳｐＡの発現にもかかわらずＳＡ細菌のオプシニゼーションを媒介することができる、精製または単離（例えば、重量で少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％純粋な）Ａｂ（例えば、好ましくは完全ヒト、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３）について記載する。好ましいそのようなＡｂは、配列番号１のペプチドに、それらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換するために十分な結合親和性で結合する。好ましいＡｂは、それらのＦａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満（例えば、１×１０－１１Ｍ未満、１×１０－１２Ｍ未満、０．５×１０－１２Ｍ未満または１×１０－１３Ｍ未満）のＫＤで、生理的条件（例えば、リン酸緩衝食塩液）下において（例えば、表面プラズモン共鳴または組換えＳｐＡを使用するバイオレイヤー干渉分光法（Ｂｉｏ－Ｌａｙｅｒ Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｍｅｔｒｙ）を使用して決定されるように）ＳｐＡに結合できる。例えば、本明細書で記載したそれらのＦａｂ領域を介してＳｐＡに（例えば、生理的条件下、例えばリン酸緩衝食塩液中で、例えば組換えＳｐＡを使用する表面プラズモン共鳴を使用して測定して）１×１０－１０Ｍ～０．５×１０－１２Ｍ、１×１０－１１Ｍ～０．５×１０－１２Ｍ、１×１０－１１Ｍ～０．２×１０－１２ＭのＫＤで結合するＡｂが好ましい。本明細書に記載したそれらのＡｂまたは抗原結合フラグメントは、好ましくはそれらのＦｃ領域を介してＳＡ細菌の細胞壁内のＳｐＡに結合したヒトＡｂ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換することができる。さらに本明細書では、それらのＦａｂ領域パラトープを介して黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで特異的に結合する精製または単離（例えば、重量で少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％純粋の）ｍＡｂ（例えば、好ましくは完全ヒト、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３）が提供されるが、このときｍＡｂは、それらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合する少なくとも１ｍｇ／ｍＬ（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、１０、２５、５０または１００ｍｇ／ｍＬまたはヒト血清中に通常含有される量）のＩｇＧ免疫グロブリンの存在下で、ＳｐＡ発現性黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌のオプシニゼーションを媒介することができる。
本明細書では、ＳｐＡに結合し、ＳＡの抗体（Ａｂ）中和ＳｐＡの発現にもかかわらずＳＡ細菌のオプシニゼーションを媒介することができる、精製または単離（例えば、重量で少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％純粋な）Ａｂ（例えば、好ましくは完全ヒト、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３）について記載する。好ましいそのようなＡｂは、配列番号１のペプチドに、それらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリン（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換するために十分な結合親和性で結合する。好ましいＡｂは、それらのＦａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満（例えば、１×１０－１１Ｍ未満、１×１０－１２Ｍ未満、０．５×１０－１２Ｍ未満または１×１０－１３Ｍ未満）のＫＤで、生理的条件（例えば、リン酸緩衝食塩液）下において（例えば、表面プラズモン共鳴または組換えＳｐＡを使用するバイオレイヤー干渉分光法（Ｂｉｏ－Ｌａｙｅｒ Ｉｎｔｅｒｆｅｒｏｍｅｔｒｙ）を使用して決定されるように）ＳｐＡに結合できる。例えば、本明細書で記載したそれらのＦａｂ領域を介してＳｐＡに（例えば、生理的条件下、例えばリン酸緩衝食塩液中で、例えば組換えＳｐＡを使用する表面プラズモン共鳴を使用して測定して）１×１０－１０Ｍ～０．５×１０－１２Ｍ、１×１０－１１Ｍ～０．５×１０－１２Ｍ、１×１０－１１Ｍ～０．２×１０－１２ＭのＫＤで結合するＡｂが好ましい。本明細書に記載したそれらのＡｂまたは抗原結合フラグメントは、好ましくはそれらのＦｃ領域を介してＳＡ細菌の細胞壁内のＳｐＡに結合したヒトＡｂ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換することができる。さらに本明細書では、それらのＦａｂ領域パラトープを介して黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで特異的に結合する精製または単離（例えば、重量で少なくとも９０％、９２％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％または９９％純粋の）ｍＡｂ（例えば、好ましくは完全ヒト、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３）が提供されるが、このときｍＡｂは、それらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合する少なくとも１ｍｇ／ｍＬ（例えば、少なくとも１、２、３、４、５、１０、２５、５０または１００ｍｇ／ｍＬまたはヒト血清中に通常含有される量）のＩｇＧ免疫グロブリンの存在下で、ＳｐＡ発現性黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌のオプシニゼーションを媒介することができる。
【0020】
本明細書に提供した精製または単離Ａｂは、ＳｐＡの細胞外ドメイン中に存在する（例えば、ＸＲ反復領域および１つ以上のＩｇＧ結合ドメイン中に存在する）エピトープに結合する可能性がある。本明細書に提供したＡｂ（またはそれらの抗原結合フラグメント）の何れかによって特異的に認識できる抗原の非限定的例には、配列番号１の６、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０隣接アミノ酸（例えば、配列番号１のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３もしくは１４位から始まるフラグメント）；配列番号８２の６、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０もしくは２１隣接アミノ酸（例えば、配列番号８２のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４もしくは１５位から始まるフラグメント）；配列番号８３の６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５もしくは１６隣接アミノ酸（例えば、配列番号８３のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９もしくは１０位から始まるフラグメント）；配列番号８４の６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０もしくは２１隣接アミノ酸（例えば、配列番号８４のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４もしくは１５位から始まるフラグメント）；配列番号８５の６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０隣接アミノ酸（例えば、配列番号８５のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３もしくは１４位から始まるフラグメント）；または配列番号８６のアミノ酸１～２０、１０～３０、２０～４０、３０～５０、４０～６０、５０～７０、６０～８０、７０～９０、８０～１００、９０～１１０、１００～１２０、１１０～１３０、１２０～１４０、１３０～１５０、１４０～１６０、１５０～１７０、１６０～１８０、１７０～１９０、１８０～２００、１９０～２１０、２００～２２０、２１０～２３０、２２０～２４０、２３０～２５０、２４０～２６０、２５０～２７０、２６０～２８０、２７０～２９０、２８０～３００、２９０～３１０、３００～３２０、３１０～３３０、３２０～３４０、３３０～３５０、３４０～３６０、３５０～３７０、３６０～３８０、３７０～３９０、３８０～４００、３９０～４１０、４００～４２０、４１０～４３０、４２０～４４０または４３０～４５０位からの６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０隣接アミノ酸が含まれる。他の抗原の例には、配列番号８６のアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を有するＳｐＡの類似のフラグメントが含まれる。
【0021】
Ａｂまたはその抗原結合フラグメントが標的タンパク質（例えば、ＳｐＡまたはその一部分）に結合する能力を決定するための方法は、当技術分野において公知の方法を使用して実施することができる。そのような方法の非限定的な例には、標的タンパク質（例えば、ＳｐＡ）に結合することが公知のＡｂを使用する競合結合アッセイ、酵素結合免疫吸着検定法、ＢｉｏＣｏＲＥ（登録商標）、アフィニティカラム、免疫ブロッティングまたはタンパク質アレイテクノロジーが含まれる。一部の実施形態では、Ａｂまたはその抗原結合フラグメントの結合能力は、ＳＡ細菌をＡｂまたはその抗原結合フラグメントと接触させることによって決定される。Ａｂまたはその抗原結合フラグメントがＳＡ細菌の細胞壁内のＳｐＡに結合したヒトＡｂ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換する能力を決定するための典型的な方法については、下記の実施例の項において記載する。Ａｂまたはその抗原結合フラグメントがＳＡ細菌の細胞壁内のＳｐＡに結合したヒトＡｂ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換する能力を決定するための追加の方法は、当技術分野において公知である。
【0022】
Ａｂは、例えばｍＡｂ、多重特異性Ａｂ（例えば、二重特異性Ａｂ）、キメラＡｂ（例えば、ヒト化Ａｂ、例えばヒト化ＩｇＧ Ａｂ）、ヒトＡｂまたは上記の何れかのフラグメントであってよい。例えば、Ａｂは、ヒトまたはヒト化モノクローナルＩｇＧ３ Ａｂであってよい。Ａｂは、さらに一本鎖Ａｂ（例えば、単一ドメインＡｂ）、例えば一本鎖ラクダもしくは軟骨魚類（例えば、サメ）Ａｂまたは少なくとも１つのラクダ可変抗原結合ドメイン（ＶＨＨ）もしくは少なくとも１つの軟骨魚類（例えば、サメ）免疫グロブリン新規抗原受容体（Ｉｇ－ＮＡＲ）ドメインを含有する一本鎖Ａｂ（例えば、米国特許出願公開第２０１０／００９２４７０号明細書に記載されたＡｂ）であってよい。Ａｂは、Ａｂ全分子またはＡｂ多量体であってよい。
【0023】
用語の「Ａｂ」には、さらにＡｂコンジュゲート（例えば、安定化タンパク質、標識または治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れかにコンジュゲートしたＡｂ））が含まれる。例えば、本明細書に提供したＡｂには、哺乳動物（例えば、ヒト）におけるＡｂ依存性の細胞媒介性細胞毒性（ＡＤＣＣ）および／または補体依存性の細胞毒性（ＣＤＣ）を媒介するために十分である、および／または治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）にコンジュゲートしているＦｃドメインまたはＦｃドメインの一部を含むことができる。Ａｂは、例えばヒトまたはヒト化ＩｇＧ１、ＩｇＧ２、ＩｇＧ４、ＩｇＤ、ＩｇＡ、ＩｇＥまたはＩｇＭであってよく、好ましくはヒトまたはヒト化ＩｇＧ３である。
【0024】
本明細書に記載した抗原結合フラグメントは、例えば、哺乳動物（例えば、ヒト）におけるＡｂ依存性の細胞媒介性細胞毒性（ＡＤＣＣ）および／または補体依存性の細胞毒性（ＣＤＣ）を媒介するために十分であり、および／または治療薬（例えば、本明細書に記載した、または当技術分野において公知の治療薬の何れか）にコンジュゲートしているＦｃドメインの少なくとも一部を含むことができる。Ａｂフラグメントの非限定的な例には、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆ（ａｂ’）２、一本鎖Ｆｖ（ｓｃＦｖ）、Ｆｖフラグメント、可変軽鎖または可変重鎖ドメイン何れかを含有するフラグメント、ダイアボディ、線状ＡｂおよびＡｂフラグメントから形成された多重特異性Ａｂが含まれる。少なくとも１つのラクダＶＨＨドメインまたは少なくとも１つの軟骨魚類Ｉｇ－ＮＡＲドメインを含有する追加のＡｂフラグメントには、ミニボディ、マイクロＡｂ、サブナノ－Ａｂおよびナノ－Ａｂならびに米国特許出願公開第２０１０／００９２４７０号明細書に記載された他の形態のＡｂの何れかが含まれる。
【0025】
Ａｂまたはそれらの抗原結合フラグメントは、何れかのタイプ（例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ、ＩｇＥ、ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＡおよびＩｇＹ）、クラス（例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ１（例えば、ＩｇＧ１ａもしくはＩｇＧ１ｂ）、ＩｇＧ２（例えば、ＩｇＧ２ａもしくはＩｇＧ２ｂ）、ＩｇＧ３（例えば、ＩｇＧ３ａもしくはＩｇＧ３ｂ）、ＩｇＧ４（例えば、ＩｇＧ４ａもしくはＩｇＧ４ｂ）、ＩｇＡ１およびＩｇＡ２またはサブクラスであってよいが、生理的条件（例えば、リン酸緩衝食塩液）下で（例えば、組換えＳｐＡを使用する表面プラズモン共鳴を使用して決定されるような）ＳｐＡに対するＦｃ結合親和性が低い（例えば、１×１０－７Ｍ、１×１０－６Ｍ、１×１０－５Ｍ、１×１０－４Ｍまたは１×１０－３Ｍより大きいＫＤを有するか、またはヒトＩｇＧ１のＦｃ領域についてはＳｐＡのＫＤより大きいＫＤを有する）Ａｂまたはその抗原結合フラグメントが好ましい。抗原結合フラグメントは、例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ１（例えば、ＩｇＧ１ａもしくはＩｇＧ１ｂ）、ＩｇＧ２（例えば、ＩｇＧ２ａもしくはＩｇＧ２ｂ）、ＩｇＧ４（例えば、ＩｇＧ４ａもしくはＩｇＧ４ｂ）、ＩｇＤ、ＩｇＡ（例えば、ＩｇＡ１もしくはＩｇＡ２）、ＩｇＥもしくはヒト化ＩｇＭの抗原結合フラグメントであってよく、好ましくはヒトもしくはヒト化ＩｇＧ３（例えば、ＩｇＧ３ａもしくはＩｇＧ３ｂ）のフラグメントである。アミノ酸突然変異は、これらのＩｇＧサブクラスの定常領域内に導入することができる。導入できるアミノ酸突然変異は、例えば、（例えば、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．１０３（１１）：４００５－４０１０，２００６；ＭＡｂ １（６）：５７２－５７９，２００９；米国特許出願公開第２０１０／０１９６３６２号明細書；同第２０１３／０１０８６２３号明細書；同第２０１４／０１７１６２３号明細書；同第２０１４／００９３４９６号明細書；および同第２０１４／００９３９５９号明細書に記載されているように）Ｆｃ受容体への結合を強化する、または（例えば、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７６（９）：６５９１－６６０４，２００１；Ｉｎｔ Ｉｍｍｕｎｏｌ．１８（１２）：１７５９－１７６９，２００６；およびＪ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８１（３３）：２３５１４－２３５２４，２００６に記載されているように）ＦｃＲｎへの結合を強化または減少させるアミノ酸突然変異であってよい。
【0026】
２つのタイプのＨ鎖は、非相同的に関連して二重特異性Ａｂを生成する。ノブイントゥホール（ｋｎｏｂｓ－ｉｎｔｏ－ｈｏｌｅｓ）テクノロジー（例えば、Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２４８（１－２）：７－１５，２００１；およびＪ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８５（２７）：２０８５０－２０８５９，２０１０に記載されている）、静電反発力テクノロジー（例えば、国際公開第０６／１０６９０５号パンフレットに記載されている）、ＳＥＥＤｂｏｄｙテクノロジー（例えば、Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｅｎｇ．Ｄｅｓ．Ｓｅｌ．２３（４）：１９５－２０２，２０１０に記載されている）などは、ＣＨ３ドメインを介して２つのタイプのＨ鎖の異種関連のために使用できる。本明細書に記載した抗体の何れも、修飾または欠損性糖鎖を備える抗体であってよい。改質糖鎖を有する抗体の例には、グリコシル化組換え抗体（例えば、国際公開第９９／５４３４２号パンフレットに記載されているように）、脱フコシル化糖鎖を備える抗体（例えば、国際公開第００／６１７３９号パンフレット、同第０２／３１１４０号パンフレット、同第０６／０６７８４７号パンフレットおよび同第０６／０６７９１３号パンフレットに記載されているように）ならびにバイセクティング（ｂｉｓｅｃｔｉｎｇ）ＧｌｃＮＡｃ（例えば、国際公開第０２／７９２５５号パンフレットに記載されている）が含まれる。糖鎖欠損性ＩｇＧ抗体を生成するための方法の公知の例には、重鎖内のＥＵナンバリング位置２９７位でアスパラギンに突然変異を導入する方法（Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．５０（５）：４９４－５０６，２０１０）および大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）を使用してＩｇＧを製造する方法（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｍｅｔｈｏｄｓ ２６３（１－２）：１３３－１４７，２００２；およびＪ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８５（２７）：２０８５０－２０８５９，２０１０）が含まれる。さらに、ＩｇＧ内のＣ末端リシンの異種性付随欠失およびＩｇＧ２のヒンジ領域内のジスルフィド結合の異種付随誤対合は、（例えば、国際公開第０９／０４１６１３号パンフレットに記載されているように）アミノ酸欠失／置換を導入することによって減少させることができる。本明細書に記載したＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れかには、対応するヒトＡｂ内には存在しない少なくとも１つの（例えば、１つ、２つ、３つ、４つ、５つまたは６つの）アミノ酸（例えば、ＣＤＲ内には存在しない付加、挿入または置換アミノ酸）が含まれる。本明細書に記載したＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れも、さらに少なくとも１つの（対応するヒトＡｂと比較して）欠失したアミノ酸、例えば軽鎖または重鎖のＮ末端またはＣ末端からの欠失、または定常領域（例えば、Ｆｃ領域）からの１つのアミノ酸の欠失を有することができる。
【0027】
ＳｐＡまたはそのフラグメント（例えば、配列番号１の少なくとも７、８、９または１０隣接アミノ酸（例えば、配列番号１のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２または１３位から始まる、または配列番号１の全部）は、ポリクローナルおよびモノクローナルＡｂ調製物のための標準技術を使用してＡｂを生成するための免疫原として使用できる。Ａｂフラグメントは、当技術分野において周知の方法を使用してモノクローナルＡｂから生成することができる。
【0028】
免疫原は、典型的には好適な対象（例えば、ウサギ、ヤギ、マウスまたは他の哺乳動物）を免疫することによってＡｂを調製するために使用される。適切な免疫原調製物は、例えば、組換え発現ポリペプチドまたは化学合成ポリペプチドを含有することができる。この調製物は、さらにアジュバント、例えばフロイントの完全もしくは不完全アジュバントまたは類似の免疫賦活剤を含むことができる。
【0029】
モノクローナルＡｂ分泌ハイブリドーマを調製するための代替法として、ポリペプチドに対して向けられたモノクローナルＡｂは、関心のあるポリペプチドを備える組換えコンビナトリアル免疫グロブリンライブラリ（例えば、Ａｂファージ提示ライブラリ）をスクリーニングすることによって同定および単離することができる。ファージ提示ライブラリを生成およびスクリーニングするためのキットは、市販で入手できる（例えば、ｔｈｅ Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｒｅｃｏｍｂｉｎａｎｔ Ｐｈａｇｅ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｓｙｓｔｅｍ，Ｃａｔａｌｏｇ Ｎｏ．２７－９４００－０１；およびｔｈｅ Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ ＳｕｒｆＺＡＰ＊ Ｐｈａｇｅ Ｄｉｓｐｌａｙ Ｋｉｔ，Ｃａｔａｌｏｇ Ｎｏ．２４０６１２）。さらに、Ａｂ提示ライブラリを生成およびスクリーニングする際に使用するために特に適した方法および試薬の例は、例えば、米国特許第５，２２３，４０９号明細書；国際公開第９２／１８６１９号パンフレット；同第９１／１７２７１号パンフレット；同第９２／２０７９号パンフレット；同第９２／１５６７９号パンフレット；同第９３／０１２８８号パンフレット；同第９２／０１０４７号パンフレット；同第９２／０９６９０号パンフレット；同第９０／０２８０９号パンフレット；Ｆｕｃｈｓ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ９：１３７０－１３７２，１９９１；Ｈａｙ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍ．Ａｎｔｉｂｏｄ．Ｈｙｂｒｉｄｏｍａｓ ３：８１－８５，１９９２；Ｈｕｓｅ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２４６：１２７５－１２８１，１９８９；Ｇｒｉｆｆｉｔｈｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．１２：７２５－７３４，１９９３に見いだすことができる。
【0030】
下記の実施例のセクションでは、ＳｐＡエピトープ（例えば、配列番号１のポリペプチド内に位置する、または規定されるエピトープ）に特異的に結合するヒトＡｂ（例えば、ヒトＩｇＧ３）を単離およびシーケンシングするための追加の方法について記載する。Ａｂおよび抗原結合フラグメントを作成するための追加の一般的方法は、米国特許出願公開第２０１１／００５９０８５号明細書に記載されている。
【0031】
一部の実施形態では、本明細書に提供したＡｂまたは抗原結合フラグメントは、ヒトまたはヒト化Ａｂ（例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３ Ａｂ）である。一部の実施形態では、ヒト化Ａｂは、非ヒトＡｂ（例えば、ラット、マウス、ウサギまたはヤギＡｂ）中に存在する少なくとも１つの相補性決定領域（ＣＤＲ）を含有するように組み換えられているヒトＡｂである。一部の実施形態では、１つのヒト化Ａｂまたはそのフラグメントは、ＳｐＡエピトープ（例えば、配列番号１のポリペプチド内に位置する、または規定されたエピトープ）に特異的に結合するヒトまたは非ヒトＡｂの軽鎖の全３つのＣＤＲを含有することができる。一部の実施形態では、そのヒト化Ａｂまたはそのフラグメントは、ＳｐＡエピトープ（例えば、配列番号１のポリペプチド内に位置する、または規定されたエピトープ）に特異的に結合するヒトまたは非ヒトＡｂの重鎖の全３つのＣＤＲを含有することができる。一部の実施形態では、そのヒト化Ａｂまたはそのフラグメントは、ＳｐＡエピトープ（例えば、配列番号１のポリペプチド内に位置する、または規定されたエピトープ）に特異的に結合するヒト化またはヒトモノクローナルＡｂの重鎖の全３つのＣＤＲおよび軽鎖の全３つのＣＤＲを含有することができる。
【0032】
本発明のＡｂは、さらにＡｂの多量体形を含むことができる。例えば、本発明のＡｂは、単量体免疫グロブリン分子のＡｂ二量体、三量体またはより高次の多量体の形態を取ることができる。完全免疫グロブリン分子またはＦ（ａｂ’）２フラグメントの二量体は四価であるが、ＦａｂフラグメントまたはｓｃＦｖ分子の二量体は二価である。Ａｂ多量体内の個別単量体は同一であってよい、または異なっていてよく、すなわちそれらはヘテロメリックまたはホモメリックＡｂ多量体であってよい。例えば、多量体内の個別Ａｂは、同一または異なる結合特異性を有していてよい。
【0033】
Ａｂの多量体化は、Ａｂの自然凝集を通して、または当技術分野において公知の化学結合または組換え結合技術を通して遂行することができる。例えば、一部のパーセンテージの精製Ａｂ調製物（例えば、精製ＩｇＧ１分子）は、Ａｂホモ二量体および他より高次のＡｂ多量体を含有するタンパク質凝集体を自然に形成する。または、Ａｂホモ二量体は、当技術分野において公知である化学結合技術を通して形成されてよい。Ａｂ多量体を形成するためには、例えば、ＳＭＣＣ（スクシンイミジル４－（マレイミドメチル）シクロヘキサン－１－カルボキシレート）およびＳＡＴＡ（Ｎ－スクシンイミジルＳ－アセチルチオ－アセテート）（例えば、Ｐｉｅｒｃｅ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｉｎｃ．（Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ）から入手可能）を含むがそれらに限定されないヘテロ二官能架橋剤を使用することができる。Ａｂホモ二量体を形成するための典型的なプロトコルは、Ｇｈｅｔｉｅ ｅｔ ａｌ．（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．９４：７５０９－７５１４，１９９７）に明示されている。Ａｂホモ二量体は、ペプシンによる消化を通してＦａｂ’２ホモ二量体に変換させることができる。Ａｂホモ二量体を形成するためのまた別の方法は、Ｚｈａｏ ｅｔ ａｌ．（Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２５：３９６－４０４，２００２）に記載されたオートフィリック（ａｕｔｏｐｈｉｌｉｃ）Ｔ１５ペプチドの使用による。
【0034】
または、Ａｂは、組換えＤＮＡ技術を通して多量体化するために作成できる。ＩｇＭおよびＩｇＡは、成熟Ｊ鎖ポリペプチドとの相互作用を通してＡｂ多量体を自然に形成する。非ＩｇＡまたは非ＩｇＭ分子、例えばＩｇＧ分子は、ＩｇＡまたはＩｇＭのＪ鎖相互作用ドメインを含有し、それにより非ＩｇＡまたは非ＩｇＭ分子上により高次の多量体を形成する能力を付与するように組み換えることができる（例えば、Ｃｈｉｎｔａｌａｃｈａｒｕｖｕ ｅｔ ａｌ．，Ｃｌｉｎ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．１０１：２１－３１，２００１およびＦｒｉｇｅｒｉｏ ｅｔ ａｌ．，Ｐｌａｎｔ Ｐｈｙｓｉｏｌ．１２３：１４８３－１４９４，２０００を参照されたい）。ＩｇＡ二量体は、粘膜で内張りされた器官の内腔に自然に分泌される。この分泌は、上皮細胞上のＪ鎖とポリマーＩｇＡ受容体（ｐｌｇＲ）との相互作用を通して媒介される。Ａｂ（またはＪ鎖相互作用ドメインを含有するために組み換えられたＡｂ）のＩｇＡ形の分泌が望ましくない場合は、ｐＩｇＲと余り相互作用しない変異Ｊ鎖と関連してＡｂ分子を発現させることによって大きく減少させることができる（Ｊｏｈａｎｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．，１６７：５１８５－１９２，２００１）。ＳｃＦｖ二量体は、さらに当技術分野において公知である組換え技術によって形成することができる。ｓｃＦｖ二量体の構築の例は、Ｇｏｅｌ ｅｔ ａｌ．（Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．６０：６９６４－７１，２０００）に明示されている。Ａｂ多量体は、サイズ排除クロマトグラフィを含むがそれには限定されない当技術分野において公知である任意の好適な方法を使用して精製することができる。
【0035】
本明細書に記載したＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れも、安定化分子（例えば、ネコまたは溶液中でＡｂまたはその抗原結合フラグメントの半減期を増加させる分子）にコンジュゲートさせることができる。安定化分子の非限定的な例には、ポリマー（例えば、ポリエチレングリコール）またはタンパク質（例えば、血清アルブミン、例えばネコ血清アルブミン）が含まれる。本明細書に記載したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れも、標識（例えば、蛍光体、放射性同位体または発光性分子）または治療薬（例えば、細胞毒性薬または放射性同位体）にコンジュゲートさせることができる。標識または治療薬をＡｂに付着させるための典型的な方法は、米国特許出願公開第２０１３／０２２４２２８号明細書に記載されている。細胞毒性薬の非限定的な例には、微生物（例えば、グラム陽性菌、例えば黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ））の細胞死を誘導することが公知の作用物質が含まれる。本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れかにコンジュゲートさせることができる細胞毒性薬の非限定的な例には、リネゾリド、エリスロマイシン、ムピロシン、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム、シラスタチン、メロペネム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン（ｃｅｆａｌｏｔｉｎ）、セファロチン（ｃｅｐｈａｌｏｔｈｉｎ）、セファレキシン、セフラコール（ｃｅｆｌａｃｏｒ）、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、セフロキシム、セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン、セフタロリン・フォサミル、セフトビプロール、テイコプラニン、バンコマイシン、テレバンシン（ｔｅｌｅｖａｎｃｉｎ）、クリンダマイシン、リンコマイシン、ダプトマイシン、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリンＧ、ペニシリンＶ、ピペラシリン、ペニシリンＧ、テモシリン、チカルシリン、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンＢ、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、ゲミフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ナリジクス酸、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン、グレパフロキサシン、スパルフロキサシン、テマフロキサシン、マフェニド、スルファセタミド、スルファジアジン、スルファジアジン銀、スルファジメトキシン、スファメチゾール（ｓｕｆａｍｅｔｈｉｚｏｌｅ）、スルファメトキサゾール、スルファニルアミド、スルファサラジン、スルフイソキサゾール、トリメトプリム・スルファメトキサゾール、スルホンアミドクリソイジン、デメクロサイクロン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリンおよびテトラサイクリンが含まれる。
【0036】
例えば、ＳｐＡに特異的に結合する、本明細書に提供したＡｂ（例えば、ヒトまたはヒト化モノクローナルＩｇＧ３）またはその抗原結合フラグメント（例えば、ヒトまたはヒト化モノクローナルＩｇＧ３のフラグメント）には、
（ｉ）それぞれ配列番号２、３および４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号７、８および９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｉｉ）それぞれ配列番号１２、１３および１４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号１７、１８および１９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｉｉｉ）それぞれ配列番号２２、２３および２４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号２７、２８および２９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｉｖ）それぞれ配列番号３２、３３および３４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号３７、３８および３９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｖ）それぞれ配列番号４２、４３および４４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号４７、４８および４９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｖｉ）それぞれ配列番号５２、５３および５４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号５７、５８および５９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｖｉｉ）それぞれ配列番号６２、６３および６４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号６７、６８および６９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；または
（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号７２、７３および７４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号７７、７８および７９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖を含むことができる。
（ｉ）それぞれ配列番号２、３および４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号７、８および９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｉｉ）それぞれ配列番号１２、１３および１４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号１７、１８および１９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｉｉｉ）それぞれ配列番号２２、２３および２４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号２７、２８および２９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｉｖ）それぞれ配列番号３２、３３および３４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号３７、３８および３９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｖ）それぞれ配列番号４２、４３および４４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号４７、４８および４９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｖｉ）それぞれ配列番号５２、５３および５４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号５７、５８および５９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；
（ｖｉｉ）それぞれ配列番号６２、６３および６４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号６７、６８および６９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖；または
（ｖｉｉｉ）それぞれ配列番号７２、７３および７４のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む重鎖、ならびに／またはそれぞれ配列番号７７、７８および７９のＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３を含む軽鎖を含むことができる。
【0037】
一部の例では、本明細書に提供したＡｂの何れかは、配列番号６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号１１を含む軽鎖；配列番号１６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号２１を含む軽鎖；配列番号２６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号３１を含む軽鎖；配列番号３６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号４１を含む軽鎖；配列番号４６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号５１を含む軽鎖；配列番号５６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号６１を含む軽鎖；配列番号６６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号７１を含む軽鎖；または配列番号７６を含むＡｂ重鎖および／または配列番号８１を含む軽鎖を有する。
【0038】
本明細書に提供した追加の例では、Ａｂ（例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３）または抗原結合フラグメント（例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３の抗原結合フラグメント）は、１×１０－１０Ｍ未満（例えば、１×１０－１１Ｍ未満または１×１０－１２Ｍ未満）のＫＤでＳｐＡに結合できる、および／またはＳｐＡに結合したヒトＡｂ（例えば、ＩｇＧ１、ＩｇＧおよびＩｇＧ４のうちの１つ以上）を置換することができ、このときその抗原または抗原結合フラグメントは、６つのＣＤＲのセットであって、
（ｉ）配列番号２、３、４、７、８および９；
（ｉｉ）配列番号１２、１３、１４、１７、１８および１９；
（ｉｉｉ）配列番号２２、２３、２４、２７、２８および２９；
（ｉｖ）配列番号３２、３３、３４、３７、３８および３９；
（ｖ）配列番号４２、４３、４４、４７、４８および４９；
（ｖｉ）配列番号５２、５３、５４、５７、５８および５９；
（ｖｉｉ）配列番号６２、６３、６４、６７、６８および６９；または
（ｖｉｉｉ）配列番号７２、７３、７４、７７、７８および７９
からなる群から選択される６つのＣＤＲのセット（セット全体）内に１個、２個、３個、４個、５個または６個以下の全アミノ酸置換（例えば、保存アミノ酸置換）を有する、６つＣＤＲのセットを有する。
（ｉ）配列番号２、３、４、７、８および９；
（ｉｉ）配列番号１２、１３、１４、１７、１８および１９；
（ｉｉｉ）配列番号２２、２３、２４、２７、２８および２９；
（ｉｖ）配列番号３２、３３、３４、３７、３８および３９；
（ｖ）配列番号４２、４３、４４、４７、４８および４９；
（ｖｉ）配列番号５２、５３、５４、５７、５８および５９；
（ｖｉｉ）配列番号６２、６３、６４、６７、６８および６９；または
（ｖｉｉｉ）配列番号７２、７３、７４、７７、７８および７９
からなる群から選択される６つのＣＤＲのセット（セット全体）内に１個、２個、３個、４個、５個または６個以下の全アミノ酸置換（例えば、保存アミノ酸置換）を有する、６つＣＤＲのセットを有する。
【0039】
例えば、本明細書に提供したＡｂ（例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３）または抗原結合フラグメント（例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３の抗原結合フラグメント）は、６つのＣＤＲのセットであって、配列番号２、３、４、７、８および９の６つのＣＤＲのセット（セット全体）内に１個、２個、３個または４個以下の全アミノ酸置換を有する、６つのＣＤＲのセットを含むことができる。例えば、本明細書に提供したＡｂ（例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ３）またはその抗原結合フラグメント（例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ３の抗原結合フラグメント）は、
（ｉ）配列番号２、３、４、７、８および９の６つのＣＤＲのセット；
（ｉｉ）配列番号１２、１３、１４、１７、１８および１９の６つのＣＤＲのセット；
（ｉｉｉ）配列番号２２、２３、２４、２７、２８および２９の６つのＣＤＲのセット；
（ｉｖ）配列番号３２、３３、３４、３７、３８および３９の６つのＣＤＲのセット；
（ｖ）配列番号４２、４３、４４、４７、４８および４９の６つのＣＤＲのセット；
（ｖｉ）配列番号５２、５３、５４、５７、５８および５９の６つのＣＤＲのセット；
（ｖｉｉ）配列番号６２、６３、６４、６７、６８および６９の６つのＣＤＲのセット；または
（ｖｉｉｉ）配列番号７２、７３、７４、７７、７８および７９の６つのＣＤＲのセット
を含むか、またはそれらからなる可能性がある。
（ｉ）配列番号２、３、４、７、８および９の６つのＣＤＲのセット；
（ｉｉ）配列番号１２、１３、１４、１７、１８および１９の６つのＣＤＲのセット；
（ｉｉｉ）配列番号２２、２３、２４、２７、２８および２９の６つのＣＤＲのセット；
（ｉｖ）配列番号３２、３３、３４、３７、３８および３９の６つのＣＤＲのセット；
（ｖ）配列番号４２、４３、４４、４７、４８および４９の６つのＣＤＲのセット；
（ｖｉ）配列番号５２、５３、５４、５７、５８および５９の６つのＣＤＲのセット；
（ｖｉｉ）配列番号６２、６３、６４、６７、６８および６９の６つのＣＤＲのセット；または
（ｖｉｉｉ）配列番号７２、７３、７４、７７、７８および７９の６つのＣＤＲのセット
を含むか、またはそれらからなる可能性がある。
【0040】
追加の例では、ＳｐＡに特異的に結合する本明細書に提供したＡｂ（例えば、ヒトもしくはヒト化モノクローナルＩｇＧ３）または抗原結合フラグメント（例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ３の抗原結合フラグメント）には、（ｉ）配列番号５を含むか、または配列番号５からなる可変ドメイン；（ｉｉ）配列番号１０を含むか、または配列番号１０からなる可変ドメイン；（ｉｉｉ）配列番号１５を含むか、または配列番号１５からなる可変ドメイン；（ｉｖ）配列番号２０を含むか、または配列番号２０からなる可変ドメイン；（ｖ）配列番号２５を含むか、または配列番号２５からなる可変ドメイン；（ｖｉ）配列番号３０を含むか、または配列番号３０からなる可変ドメイン；（ｖｉｉ）配列番号３５を含むか、または配列番号３５からなる可変ドメイン；（ｖｉｉｉ）配列番号４０を含むか、または配列番号４０からなる可変ドメイン；（ｉｘ）配列番号４５を含むか、または配列番号４５からなる可変ドメイン；（ｘ）配列番号５０を含むか、または配列番号５０からなる可変ドメイン；（ｘｉ）配列番号５５を含むか、または配列番号５５からなる可変ドメイン；（ｘｉｉ）配列番号６０を含むか、または配列番号６０からなる可変ドメイン；（ｘｉｉｉ）配列番号６５を含むか、または配列番号６５からなる可変ドメイン；（ｘｉｖ）配列番号７０を含むか、または配列番号７０からなる可変ドメイン；（ｘｖ）配列番号７５を含むか、または配列番号７５からなる可変ドメイン；または（ｘｖｉ）配列番号８０を含むか、または配列番号８０からなる可変ドメインからなる群から選択される可変ドメインが含まれる。例えば、Ａｂ（例えば、ヒトまたはヒト化モノクローナルＩｇＧ３）または抗原結合フラグメント（例えば、ヒトまたはヒト化ＩｇＧ３の抗原結合フラグメント）は、（ｉ）配列番号５を含むか、または配列番号５からなる可変ドメインおよび／または配列番号１０を含むか、または配列番号１０からなる可変ドメイン；（ｉｉ）配列番号１５を含むか、または配列番号１５からなる可変ドメインおよび／または配列番号２０を含むか、または配列番号２０からなる可変ドメイン；（ｉｉｉ）配列番号２５を含むか、または配列番号２５からなる可変ドメインおよび／または配列番号３０を含むか、または配列番号３０からなる可変ドメイン；（ｉｖ）配列番号３５を含むか、または配列番号３５からなる可変ドメインおよび／または配列番号４０を含むか、または配列番号４０からなる可変ドメイン；（ｖ）配列番号４５を含むか、または配列番号４５からなる可変ドメインおよび／または配列番号５０を含むか、または配列番号５０からなる可変ドメイン；（ｖｉ）配列番号５５を含むか、または配列番号５５からなる可変ドメインおよび／または配列番号６０を含むか、または配列番号６０からなる可変ドメイン；（ｖｉｉ）配列番号６５を含むか、または配列番号６５からなる可変ドメインおよび／または配列番号７０を含むか、または配列番号７０からなる可変ドメイン；または配列番号７５を含むか、または配列番号７５からなる可変ドメインおよび／または配列番号８０を含むか、または配列番号８０からなる可変ドメインを含むことができる。
【0041】
本明細書に記載したＡｂ（例えば、ヒトもしくはヒト化モノクローナルＩｇＧ３）または抗原結合フラグメント（例えば、ヒトもしくはヒト化ＩｇＧ３の抗原結合フラグメント）の何れかの一部の実施形態は、以下の：ＭＲＳＡの菌株中のＳｐＡに特異的に結合する；配列番号１によって規定されたエピトープに特異的に結合する；ＳｐＡに１×１０－１０Ｍ未満（例えば、１×１０－１１Ｍ未満または１×１０－１２未満）のＫＤで結合する；および黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌（例えば、ＭＲＳＡ菌）の細胞壁内のＳｐＡに結合したヒトＡｂを置換する能力のうちの１つ以上（例えば、１つ、２つ、３つまたは４つ）を有する。
【0042】
医薬組成物
本明細書では、少なくとも１つの医薬上許容される担体（例えば、非天然の医薬上許容される担体）および少なくとも１つ（例えば、２つ、３つまたは４つ）の本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れかを含有する医薬組成物が提供される。医薬上許容される担体の非限定的な例には、滅菌水、生理的食塩水、安定剤、賦形剤、酸化防止剤（例えば、アスコルビン酸）、バッファー（例えば、リン酸塩、クエン酸塩、ヒスチジンおよび他の有機酸）、防腐剤、界面活性剤（例えば、ＰＥＧおよびＴｗｅｅｎ）、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡまたはＥＧＴＡ）ならびに結合剤が含まれる。医薬上許容される担体の追加の例には、さらにまた低分子量ポリペプチド、タンパク質（例えば、血清アルブミンおよびゼラチン）、アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、グルタミン酸、アスパラギン酸、メチオニン、アルギニンおよびリシン）、糖および炭水化物（例えば、多糖類および単糖類）ならびに糖アルコール（例えば、マンニトールおよびソルビトール）も含まれる。注射用水溶液を調製する場合は、グルコースおよび他のアジュバント、例えばＤ－ソルビトール、Ｄ－マンノース、Ｄ－マンニトールおよび塩化ナトリウムを含む生理的食塩水および等張性溶液を、および必要であれば、適切な可溶化剤、例えばアルコール（例えば、エタノール）、ポリアルコール（例えば、プロピレングリコールおよびＰＥＧ）、および非イオン性界面活性剤（例えば、ポリソルベート８０、ポリソルベート２０、ポロキサマー１８８およびＨＣＯ－５０）と組み合わせて使用することができる。調製物中にヒアルロニダーゼを混合することによって、より多量の流体量を皮下投与することができる（例えば、Ｅｘｐｅｒｔ．Ｏｐｉｎ．Ｄｒｕｇ．Ｄｅｌｉｖ．４（４）：４２７－４４０，２００７を参照されたい）。
本明細書では、少なくとも１つの医薬上許容される担体（例えば、非天然の医薬上許容される担体）および少なくとも１つ（例えば、２つ、３つまたは４つ）の本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れかを含有する医薬組成物が提供される。医薬上許容される担体の非限定的な例には、滅菌水、生理的食塩水、安定剤、賦形剤、酸化防止剤（例えば、アスコルビン酸）、バッファー（例えば、リン酸塩、クエン酸塩、ヒスチジンおよび他の有機酸）、防腐剤、界面活性剤（例えば、ＰＥＧおよびＴｗｅｅｎ）、キレート剤（例えば、ＥＤＴＡまたはＥＧＴＡ）ならびに結合剤が含まれる。医薬上許容される担体の追加の例には、さらにまた低分子量ポリペプチド、タンパク質（例えば、血清アルブミンおよびゼラチン）、アミノ酸（例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、グルタミン酸、アスパラギン酸、メチオニン、アルギニンおよびリシン）、糖および炭水化物（例えば、多糖類および単糖類）ならびに糖アルコール（例えば、マンニトールおよびソルビトール）も含まれる。注射用水溶液を調製する場合は、グルコースおよび他のアジュバント、例えばＤ－ソルビトール、Ｄ－マンノース、Ｄ－マンニトールおよび塩化ナトリウムを含む生理的食塩水および等張性溶液を、および必要であれば、適切な可溶化剤、例えばアルコール（例えば、エタノール）、ポリアルコール（例えば、プロピレングリコールおよびＰＥＧ）、および非イオン性界面活性剤（例えば、ポリソルベート８０、ポリソルベート２０、ポロキサマー１８８およびＨＣＯ－５０）と組み合わせて使用することができる。調製物中にヒアルロニダーゼを混合することによって、より多量の流体量を皮下投与することができる（例えば、Ｅｘｐｅｒｔ．Ｏｐｉｎ．Ｄｒｕｇ．Ｄｅｌｉｖ．４（４）：４２７－４４０，２００７を参照されたい）。
【0043】
本明細書に提供したＡｂおよび抗原結合フラグメントは、例えば、（例えば、ヒドロキシメチルセルロース、ゼラチンおよびポリ（メチルメタクリレート）から作成された）マイクロカプセル内に封入できる、またはコロイド状薬物送達系（例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルジョン、ナノ粒子およびナノカプセル）の成分として組み込むことができる（例えば、“Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅ １６ｔｈ ｅｄｉｔｉｏｎ”，Ｏｓｌｏ Ｅｄ．（１９８０）を参照されたい）。制御放出型医薬製剤としての医薬組成物を調製するための方法も周知であり、そのような方法は本発明のＡｂおよび抗原結合フラグメントに適用することができる（例えば、Ｌａｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｂｉｏｍｅｄ．Ｍａｔｅｒ．Ｒｅｓ．１５：２６７－２７７，１９８１；Ｌａｎｇｅｒ，Ｃｈｅｍｔｅｃｈ．１２：９８－１０５，１９８２，；米国特許第３，７７３，９１９号明細書；欧州特許第５８，４８１号明細書；Ｓｉｄｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ ２２：５４７－５５６，１９８３；および欧州特許第１３３，９８８号明細書を参照されたい）。
【0044】
本明細書に提供した医薬組成物は、静脈内、動脈内、皮内、皮下、筋肉内、腹腔内または経口投与のために調製することができる。
【0045】
本発明の医薬組成物の用量は、剤形、投与方法、患者の年齢および体重、患者の症状、ＳＡ感染症の重症度またはＳＡ感染症のリスクのレベルを考察することにより適切に決定することができる。一般に、成人のための１日量は、例えば、１回または数回に分けて０．１ｍｇ～１０，０００ｍｇであってよい。用量は、例えば、０．２～１０，０００ｍｇ／日（例えば、１～１０ｇ／日、２～８ｇ／日、１～５ｇ／日、０．５～２．５ｇ／日、０．５～５００ｍｇ／日、１～３００ｍｇ／日、３～１００ｍｇ／日または５～５０ｍｇ／日）であってよい。これらの用量は、患者の体重および年齢ならびに投与方法に依存して変動してよい。しかし、好適な用量の選択は、明確に当業者の認識範囲内に含まれる。同様に、投与期間は、治療の進展に依存して適切に決定することができる。
【0046】
本明細書に提供した医薬組成物の何れも、１つ以上の追加の抗菌剤を含むことができる。そのような抗菌剤の非限定的な例には、リネゾリド、エリスロマイシン、ムピロシン、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム、シラスタチン、メロペネム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン（ｃｅｆａｌｏｔｉｎ）、セファロチン（ｃｅｆａｌｏｔｈｉｎ）、セファレキシン、セフラコール、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、セフロキシム、セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン、セフタロリン・フォサミル、セフトビプロール、テイコプラニン、バンコマイシン、テレバンシン、クリンダマイシン、リンコマイシン、ダプトマイシン、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリンＧ、ペニシリンＶ、ピペラシリン、ペニシリンＧ、テモシリン、チカルシリン、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンＢ、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、ゲミフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ナリジクス酸、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン、グレパフロキサシン、スパルフロキサシン、テマフロキサシン、マフェニド、スルファセタミド、スルファジアジン、スルファジアジン銀、スルファジメトキシン、スファメチゾール、スルファメトキサゾール、スルファニルアミド、スルファサラジン、スルフイソキサゾール、トリメトプリム・スルファメトキサゾール、スルホンアミドクリソイジン、デメクロサイクロン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリンおよびテトラサイクリンが含まれる。
【0047】
黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）感染症を有する対象を治療する、または対象における黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）感染症が発現するリスクを減少させる方法
さらに、ＳＡ感染症（ＭＲＳＡ感染症、ＳＡ菌血症、ＳＡ皮膚感染症、ＳＡ乳腺炎、ＳＡ蜂巣炎もしくは毛包炎、またはＳＡ関連性創感染症、膿瘍、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、敗血症性ショック、食中毒、毒性ショック症候群）を有する対象を治療する方法において、それを必要とする対象（例えば、人間または他の哺乳動物、例えばウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ヤギ、ウサギ、ブタまたは鳥類）に治療有効量の本明細書に提供した医薬組成物の何れかの少なくとも１つまたは本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも１つを投与するステップを含む方法が提供される。一部の例では、対象は、ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を有すると診断または同定されている。一部の実施形態は、さらに（投与するステップの前に）ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡまたはＶＲＳＡ感染症）を有する対象を診断、同定もしくは選択する、または対象がＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡまたはＶＲＳＡ感染症）を有すると診断、同定または選択するステップを含むことができる。一部の例では、ＳＡ感染症は、院内感染症である。一部の例では、対象は、以前に抗菌治療を用いて治療されており、以前の治療は不成功であった。
さらに、ＳＡ感染症（ＭＲＳＡ感染症、ＳＡ菌血症、ＳＡ皮膚感染症、ＳＡ乳腺炎、ＳＡ蜂巣炎もしくは毛包炎、またはＳＡ関連性創感染症、膿瘍、骨髄炎、心内膜炎、肺炎、敗血症性ショック、食中毒、毒性ショック症候群）を有する対象を治療する方法において、それを必要とする対象（例えば、人間または他の哺乳動物、例えばウシ、ヒツジ、イヌ、ネコ、ウマ、ヤギ、ウサギ、ブタまたは鳥類）に治療有効量の本明細書に提供した医薬組成物の何れかの少なくとも１つまたは本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも１つを投与するステップを含む方法が提供される。一部の例では、対象は、ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を有すると診断または同定されている。一部の実施形態は、さらに（投与するステップの前に）ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡまたはＶＲＳＡ感染症）を有する対象を診断、同定もしくは選択する、または対象がＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡまたはＶＲＳＡ感染症）を有すると診断、同定または選択するステップを含むことができる。一部の例では、ＳＡ感染症は、院内感染症である。一部の例では、対象は、以前に抗菌治療を用いて治療されており、以前の治療は不成功であった。
【0048】
さらに、対象がＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を発現するリスクを減少させる方法において、その対象に有効量の本明細書に提供した医薬組成物の何れかの少なくとも１つまたは本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも１つを投与するステップを含む方法が提供される。一部の実施形態では、ＳＡ感染症は、院内感染症である。一部の実施形態は、投与するステップの前に、さらに対象がＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を発現する増加したリスクを有すると選択または同定するステップを含む。例えば、対象は、医療従事者（例えば、医師、看護師、検査室技師または医師の助手）（例えば、ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を有する対象と物理的に接触する医療従事者）である可能性がある。これらの方法における対象は、さらにＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を有する少なくとも１人の他の対象を含む（受け入れている）入院治療（ｈｏｓｐｉｔａｌ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）または入院治療（ｉｎｐａｔｉｅｎｔ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）（例えば、ナーシングホーム）に受け入れられた対象であってよい。対象は、入院患者、例えば集中治療室内の患者、免疫不全患者および外科手技を受けている、または外科手技を今後受けるであろう患者であってよい。
【0049】
本明細書に提供した方法の何れにおいても、対象は男性または女性であってよい。例えば、対象は、乳児、幼児、青少年、ティーンエージャーまたは成人（例えば、少なくとも１８歳、少なくとも２０歳、少なくとも２５歳、少なくとも３０歳、少なくとも３５歳、少なくとも４０歳、少なくとも４５歳、少なくとも５０歳、少なくとも５５歳、少なくとも６０歳、少なくとも６５歳、少なくとも７０歳、少なくとも７５歳、少なくとも８０歳、少なくとも８５歳、少なくとも９０歳、少なくとも９５歳または少なくとも１００歳）であってよい。一部の例では、対象は、機能が抑制または低下した免疫系（例えば、体液性または細胞性免疫系）を有する。
【0050】
一部の例では、本明細書に提供した少なくとも１つの医薬組成物または本明細書に提供した少なくとも１つのＡｂまたは抗原結合フラグメントは、静脈内、動脈内、皮内、皮下、筋肉内、腹腔内または経口投与される。例えば、ＳＡ感染症を発現するリスクを減少させる方法では、対象には、本明細書に提供した医薬組成物の少なくとも１つまたは本明細書に提供したＡｂまたはその抗原結合フラグメントの少なくとも１つが、ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）が同定された、診断された、ＳＡ感染症（例えば、ＭＲＳＡ感染症）を有する、または有することが疑われる対象と物理的に接触する前に、または接触した直後に投与される。
【0051】
本明細書に記載した方法の何れかでは、対象には、少なくとも１（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９または１０）回量の本明細書に提供した医薬組成物の少なくとも１つまたは本明細書に提供したＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも１（例えば、２、３、４、５、６、７、８、９または１０）回量が投与される。対象には、２回量以上の本明細書に提供した医薬組成物の何れかまたはＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも２回量を毎月少なくとも１回（例えば、毎月少なくとも２回、毎月少なくとも３回、毎月少なくとも４回、少なくとも週１回、少なくとも週２回、少なくとも週３回、少なくとも週４回、少なくとも週５回、少なくとも１日１回、少なくとも１日２回または少なくとも１日３回）の頻度で投与することができる。
【0052】
一部の実施形態は、さらに対象に本明細書に記載したＡｂおよび１種以上の追加の抗菌剤を共投与するステップを含んでいる。そのような抗菌剤の非限定的な例には、リネゾリド、エリスロマイシン、ムピロシン、エルタペネム、ドリペネム、イミペネム、シラスタチン、メロペネム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン（ｃｅｆａｌｏｔｉｎ）、セファロチン（ｃｅｆａｌｏｔｈｉｎ）、セファレキシン、セフラコール、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、セフロキシム、セフィキシム、セフジニル、セフジトレン、セフォペラゾン、セフォタキシム、セフポドキシム、セフタジジム、セフチブテン、セフチゾキシム、セフトリアキソン、セフタロリン・フォサミル、セフトビプロール、テイコプラニン、バンコマイシン、テレバンシン、クリンダマイシン、リンコマイシン、ダプトマイシン、アモキシシリン、アンピシリン、アズロシリン、カルベニシリン、クロキサシリン、ジクロキサシリン、フルクロキサシリン、メズロシリン、メチシリン、ナフシリン、オキサシリン、ペニシリンＧ、ペニシリンＶ、ピペラシリン、ペニシリンＧ、テモシリン、チカルシリン、バシトラシン、コリスチン、ポリミキシンＢ、シプロフロキサシン、エノキサシン、ガチフロキサシン、ゲミフロキサシン、レボフロキサシン、ロメフロキサシン、モキシフロキサシン、ナリジクス酸、ノルフロキサシン、オフロキサシン、トロバフロキサシン、グレパフロキサシン、スパルフロキサシン、テマフロキサシン、マフェニド、スルファセタミド、スルファジアジン、スルファジアジン銀、スルファジメトキシン、スファメチゾール、スルファメトキサゾール、スルファニルアミド、スルファサラジン、スルフイソキサゾール、トリメトプリム・スルファメトキサゾール、スルホンアミドクリソイジン、デメクロサイクロン、ドキシサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリンおよびテトラサイクリンが含まれる。本明細書に提供した医薬組成物の何れかに含めることのできる治療薬の追加の例は、米国特許出願公開第２０１１／００５９０８５号明細書に記載された１つ以上のＡｂである。
【0053】
キット
本明細書では、さらに本明細書に提供したＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも１つ（例えば、２つ、３つ、４つまたは５つ）を含有するキットが提供される。一部の例では、キットは、配列番号１を含むか、または配列番号１からなる組換えＳｐＡまたはペプチドまたは配列番号１の抗原フラグメント（例えば、配列番号１の少なくとも７個の（例えば、配列番号１のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２または１３位から始まる）隣接アミノ酸））を含有することができる。一部の例では、少なくとも１つのＡｂまたは抗原結合フラグメントは、１つの固体基質（例えば、ウエル、チップ、フィルム、ビーズまたはクロマトグラフィ樹脂）に付着させられている。そのようなキットは、商業包装および／またはＡｂおよびそれらの使用方法についての印刷された情報を含むことができる。
本明細書では、さらに本明細書に提供したＡｂまたは抗原結合フラグメントの何れかの少なくとも１つ（例えば、２つ、３つ、４つまたは５つ）を含有するキットが提供される。一部の例では、キットは、配列番号１を含むか、または配列番号１からなる組換えＳｐＡまたはペプチドまたは配列番号１の抗原フラグメント（例えば、配列番号１の少なくとも７個の（例えば、配列番号１のアミノ酸１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２または１３位から始まる）隣接アミノ酸））を含有することができる。一部の例では、少なくとも１つのＡｂまたは抗原結合フラグメントは、１つの固体基質（例えば、ウエル、チップ、フィルム、ビーズまたはクロマトグラフィ樹脂）に付着させられている。そのようなキットは、商業包装および／またはＡｂおよびそれらの使用方法についての印刷された情報を含むことができる。
【実施例0054】
実施例１．ＳｐＡに特異的に結合してそれらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換するヒトＡｂの生成
ＳｐＡエピトープに結合するヒトＩｇＧ３ Ａｂを下記に記載するように生成した。ＳｐＡ内のＩｇＧ結合配列およびＸｒ反復配列にわたる５つの合成ペプチドを使用して３１１人の健常成人志願者の血液中の抗ペプチドＡｂをスクリーニングした。スクリーニングのために使用したＳｐＡ由来の５つの合成ペプチドは、配列番号８２、８３、８４、８５および１（各々、ペプチド１、２、３、４および５）と指定した配列を有していた。健常対象の約４％は、酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）を使用して決定したバックグラウンドに比して、１０倍を超えるレベルの抗ペプチドＡｂ（抗ＳｐＡ）を有していた（以下では、「陽性ドナー」と呼ぶ）。これらの陽性ドナー由来の血漿を入手し、これを使用して米国特許出願公開第２０１３／００１８１７３号明細書に記載された方法を使用してＳｐＡのＩｇＧ結合配列およびＸｒ反復配列にわたるペプチドに特異的に結合する完全ヒトＡｂを単離した。要約すると、抗原アフィニティクロマトグラフィを使用して関心のあるＡｂを単離し、さらに質量分析法を使用してｄｅ ｎｏｖｏシーケンシングした。同時に、ヒトアイソタイピングキットを使用してＡｂをアイソタイピングした。
ＳｐＡエピトープに結合するヒトＩｇＧ３ Ａｂを下記に記載するように生成した。ＳｐＡ内のＩｇＧ結合配列およびＸｒ反復配列にわたる５つの合成ペプチドを使用して３１１人の健常成人志願者の血液中の抗ペプチドＡｂをスクリーニングした。スクリーニングのために使用したＳｐＡ由来の５つの合成ペプチドは、配列番号８２、８３、８４、８５および１（各々、ペプチド１、２、３、４および５）と指定した配列を有していた。健常対象の約４％は、酵素結合免疫吸着検定法（ＥＬＩＳＡ）を使用して決定したバックグラウンドに比して、１０倍を超えるレベルの抗ペプチドＡｂ（抗ＳｐＡ）を有していた（以下では、「陽性ドナー」と呼ぶ）。これらの陽性ドナー由来の血漿を入手し、これを使用して米国特許出願公開第２０１３／００１８１７３号明細書に記載された方法を使用してＳｐＡのＩｇＧ結合配列およびＸｒ反復配列にわたるペプチドに特異的に結合する完全ヒトＡｂを単離した。要約すると、抗原アフィニティクロマトグラフィを使用して関心のあるＡｂを単離し、さらに質量分析法を使用してｄｅ ｎｏｖｏシーケンシングした。同時に、ヒトアイソタイピングキットを使用してＡｂをアイソタイピングした。
【0055】
単離Ａｂの１つはＶＨ３サブファミリー内にあり、ＩｇＧ２重鎖およびＶＫｌ軽鎖を有すると同定された。Ｂ細胞はＳＴＥＭＣＥＬＬ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．から入手したキットを使用してドナー血液から単離した。それらのＲＮＡは、Ｔｒｉｚｏｌ抽出プロトコルを使用して抽出し、ｃＤＮＡは、ＳｕｐｅｒＳｃｒｉｐｔ ＩＩＩを使用して生成した。リーダー特異的プライマーを使用してＡｂの対応する重鎖および軽鎖を増幅させ、「定方向」ＳｃＦｖライブラリを生成した。ライブラリは、７ラウンドにわたり野生型ＳｐＡ抗原に対してパンニングされた。クローンは野生型ＳｐＡを備える直接およびサンドイッチＥＬＩＳＡを使用してスクリーニングした。選択されたクローンをシーケンシングし、重鎖および軽鎖はＩｇＧ３定常（Ｆｃ）領域（Ｆａｂ領域内のＳｐＡ認識部位が欠如する領域）を備えるベクター内にクローニングした。ベクターをＣＨＯ細胞系内にトランスフェクトし、高産生性クローンを選別した。精製Ａｂを高ＳｐＡ活性について試験した。クローンを大規模生産のために拡大し、産生したＡｂを精製してその後の分析のために使用した。そのような８つのＡｂの例を以下に記載する。
ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂ
配列番号５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号２、３および４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号６の重鎖。
配列番号１０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号７、８および９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号１１の軽鎖。
ＰＡ４－Ｇ３ Ａｂ
配列番号１５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号１２、１３および１４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号１６の重鎖。
配列番号２０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号１７、１８および１９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号２１の軽鎖。
ＰＡ７．２－Ｇ３ Ａｂ
配列番号２５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号２２、２３および２４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号２６の重鎖。
配列番号３０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号２７、２８および２９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号３１の軽鎖。
ＰＡ１５－Ｇ３ Ａｂ
配列番号３５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号３２、３３および３４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号３６の重鎖。
配列番号４０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号３７、３８および３９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号４１の軽鎖。
ＰＡ２１－Ｇ３ Ａｂ
配列番号４５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号４２、４３および４４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号４６の重鎖。
配列番号５０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号４７、４８および４９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号５１の軽鎖。
ＰＡ２７－Ｇ３ Ａｂ
配列番号５５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号５２、５３および５４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号５６の重鎖。
配列番号６０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号５７、５８および５９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号６１の軽鎖。
ＰＡ３２－Ｇ３ Ａｂ
配列番号６５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号６２、６３および６４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号６６の重鎖。
配列番号７０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号６７、６８および６９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号７１の軽鎖。
ＰＡ３７－Ｇ３ Ａｂ
配列番号７５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号７２、７３および７４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号７６の重鎖。
配列番号８０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号７７、７８および７９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号８１の軽鎖。
ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂ
配列番号５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号２、３および４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号６の重鎖。
配列番号１０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号７、８および９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号１１の軽鎖。
ＰＡ４－Ｇ３ Ａｂ
配列番号１５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号１２、１３および１４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号１６の重鎖。
配列番号２０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号１７、１８および１９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号２１の軽鎖。
ＰＡ７．２－Ｇ３ Ａｂ
配列番号２５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号２２、２３および２４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号２６の重鎖。
配列番号３０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号２７、２８および２９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号３１の軽鎖。
ＰＡ１５－Ｇ３ Ａｂ
配列番号３５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号３２、３３および３４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号３６の重鎖。
配列番号４０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号３７、３８および３９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号４１の軽鎖。
ＰＡ２１－Ｇ３ Ａｂ
配列番号４５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号４２、４３および４４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号４６の重鎖。
配列番号５０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号４７、４８および４９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号５１の軽鎖。
ＰＡ２７－Ｇ３ Ａｂ
配列番号５５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号５２、５３および５４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号５６の重鎖。
配列番号６０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号５７、５８および５９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号６１の軽鎖。
ＰＡ３２－Ｇ３ Ａｂ
配列番号６５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号６２、６３および６４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号６６の重鎖。
配列番号７０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号６７、６８および６９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号７１の軽鎖。
ＰＡ３７－Ｇ３ Ａｂ
配列番号７５の重鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号７２、７３および７４の重鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号７６の重鎖。
配列番号８０の軽鎖可変ドメイン。
それぞれ配列番号７７、７８および７９の軽鎖ＣＤＲ１、２および３。
配列番号８１の軽鎖。
【0056】
ＰＡ８－Ｇ３ ＡｂがＳＡの細胞壁上のＳｐＡに結合できるかどうかを決定するために実験セットを実施した。これらの実験では、ＳＡは、ＡＴＣＣ＃２５９２３を染色する、または臨床分離体００Ｘは、（ｉ）ＳＡ表面上に結合したビオチン－ＰＡ－Ｇ３の量を蛍光定量するためにビオチン化ＰＡ８－Ｇ３、次にストレプトアビジン－ＡＰＣ（図２）とともに、または（ｉｉ）貪食作用をもたらすであろうＳＡ表面に結合したＰＡ８－Ｇ３の量を蛍光定量するために精製未標識ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂ、その後にビオチン化組換えＦｃγ受容体１、および次にストレプトアビジン－ＡＰＣ（図３）の何れかとともにインキュベートした。抗インターロイキン－１ａ Ａｂ（ＭＡＢｐ１）をこれらの実験における陰性コントロールとして使用した。図２に記載のデータは、ＰＡ８－Ｇ３がＳＡの細胞壁内のＳｐＡに結合することを示しており、図３に記載のデータは、結合ＰＡ８－Ｇ３ ＡｂがＦｃＲと相互作用するために利用可能なそのＦｃ領域を有することを示しており、これはＡｂが（ＳｐＡに結合しており、ＦｃＲに係合することができず、細菌のオプシノファゴサイトーシス（ｏｐｓｉｎｏｐｈａｇｏｃｙｔｏｓｉｓ）を媒介できないＦｃ領域を有するのとは対照的に）ヒト対象におけるＳＡのオプシノファゴサイトーシス（ｏｐｓｉｎｏｐｈａｇｏｃｙｔｏｓｉｓ）を媒介できることを示唆している。
【0057】
ＳＡの表面へのＰＡ８－Ｇ３ Ａｂへの結合が食細胞上のＦｃγ受容体によって認識されるかどうかを試験するためにまた別の実験セットを実施した。これらの実験では、ｐＨ－ロードグリーン標識黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）（臨床単離体００ＸまたはＡＴＣＣ＃２５９２３）の２種の異なる菌株を未標識ＰＡ８－Ｇ３ ＡｂまたはコントロールＡｂ（ＭＡＢｐ１）の何れかとともにインキュベートし、次に分化ＨＬ－６０細胞とともにインキュベートした。結果として生じたＨＬ－６０細胞の蛍光は、蛍光支援細胞選別法（ＦＡＣＳ）を使用して決定した。データは、ＰＡ８－Ｇ３が両方のＳＡ菌株の細胞壁に結合し、ＨＬ－６０細胞の表面上のＦｃγ受容体を通して貪食作用を媒介することを示している（図４）。ＰＡ８－Ｇ３に結合した黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）の分化ＨＬ－６０細胞による良好な結果が得られる貪食作用は、蛍光顕微鏡実験からも明白であった。
【0058】
表面プラズモン共鳴を使用してＰＡ８－Ｇ３のＳｐＡへの結合キネティクスを決定した。これらの実験では、ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂは、抗ヒト捕捉センサーおよび商業的野生型ＳｐＡを使用して固定化した。これらのデータは、ＰＡ８－Ｇ３が５．３８ｐＭのＫＤを有することを示している。この親和性は、ヒト血清ＩｇＧ１、ＩｇＧ２およびＩｇＧ４のＳｐＡへのナノモル親和性のおよそ１，０００倍高い。
【0059】
ＰＡ８－Ｇ３ ＡｂがＳｐＡへの結合についてそれらのＦｃ受容体を通してＳｐＡに結合したヒトＩｇＧと上首尾で競合できるかどうかを決定するために、追加の実験セットを実施した。これらの実験では、２種の異なる黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）菌株をヒト血清（それらのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合する高濃度のＩｇを含有する）とともに１５分間インキュベートし、その後にビオチン化ＰＡ８－Ｇ３ Ａｂまたはビオチン化ＭＡＢｐ１－ＩｇＧ３ Ａｂ（アイソタイプを適応させた陰性コントロール）とともにインキュベートし、次にストレプトアビジン－ＡＰＣを用いて処理し、次にフローサイトメトリーによって蛍光を決定した。データは、ＰＡ８－Ｇ３ ＡｂがそれらのＦｃ領域によってＳｐＡに結合したヒトＩｇＧ Ａｂを有するＳｐＡに結合できたことを示している（図５）。
【0060】
また別の実験セットでは、ＰＡ８－Ｇ３抗体は、ＳｐＡ被覆ビーズ上のＭＡＢｐ１－ＩｇＧ１（そのＦｃ領域を介してＳｐＡに結合する）結合と競合することが証明された。ＳｐＡビーズとＰＡ８－Ｇ３とのプレインキュベーションは、後に加えられたＭＡＢｐ１－ＩｇＧ１結合を８０．３％減少させた。これとは逆に、ＭＡＢｐ１－ＩｇＧ１とともにプレインキュベートしたＳｐＡビーズを用いると、後に加えられたＰＡ８－Ｇ３は１５分間以内にＳｐＡビーズ表面の３０％超に結合したが、他方後に加えられたＭＡＢｐ１－ＩｇＧ３（ＭＡＢｐ１のＦａｂおよびヒトＩｇＧ３ Ｆｃを有するアイソタイプを適応させた陰性コントロール）は、ＭＡＢｐ１－ＩｇＧ１とともにプレインキュベートされたＳｐＡビーズに有意には結合しなかった。
【0061】
追加の抗ＳｐＡ Ａｂが分化ＨＬ－６０細胞によりＳＡの貪食作用を促進する能力を試験するために、追加の実験セットを実施した。これらの実験では、分化ＨＬ－６０細胞をｐＨ－ロードグリーン標識黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）および次のＡｂ：ＰＡ７．２－Ｇ３、ＰＡ４－Ｇ３、ＰＡ８－Ｇ３、ＰＡ１５－Ｇ３、ＰＡ２１－Ｇ３、ＰＡ２７－Ｇ３、ＰＡ３２－Ｇ３、ＰＡ３７－Ｇ３またはＭＡＢｐ１のうちの１つとコインキュベートした。ＭＡＢｐ１は、これらの実験において陰性コントロールとして使用した。データは、試験した抗ＳｐＡ Ａｂの全部が分化ＨＬ－６０細胞による黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）のオプシニゼーションおよび貪食作用を促進できたことを証明している（図６）。
【0062】
７つの追加の抗ＳｐＡ ＡｂのＫＤを決定するために、追加のバイオレイヤー干渉分光法（ＦｏｒｔｅＢｉｏ Ｏｃｔｅｔ Ｒｅｄ ９６機器）実験を実施した（２０ｎＭ抗原を使用して実施した）。結果として生じたデータは、ＰＡ７．２－Ｇ３が１×１０－１２Ｍ未満のＫＤを有し、ＰＡ４－Ｇ３が５．３８×１０－１２ＭのＫＤを有し、ＰＡ１５－Ｇ３が１×１０－１２Ｍ未満のＫＤを有し、ＰＡ２１－Ｇ３が１×１０－１２Ｍ未満のＫＤを有し、ＰＡ２７－Ｇ３が１×１０－１２Ｍ未満のＫＤを有し、ＰＡ３２－Ｇ３が１×１０－１２Ｍ未満のＫＤを有し、およびＰＡ３７－Ｇ３が１×１０－１２Ｍ未満のＫＤを有することを示した。
【0063】
これらをまとめると、データは、本明細書に提供したＡｂが極めて高親和性でＳＡの細胞壁内のＳｐＡに結合して免疫細胞による貪食作用を促進することができること、およびそれらのＦｃ領域によりＳｐＡに結合したヒトＩｇＧの存在下においても同様に実施できることを証明している。
【0064】
マウス菌血症／敗血症モデルにおけるモノクローナル抗体ＰＡ８のＩｎ Ｖｉｖｏ生存試験。黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）菌血症からのマウスの生存率は、予防用量のＰＡ８（実施例１において記載したＰＡ８－Ｇ３と称したモノクローナル抗体）を使用して試験した。
【0065】
雌性Ｂａｌｂ／Ｃマウス（６～８週齢）は、Ｃｈａｒｌｅｓ Ｒｉｖｅｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ，ＮＩＨ，Ｍａｒｙｌａｎｄから購入した。到着後、マウスを試験し、吸収性敷きわらを備えるケージ中にグループ収容（１０匹／ケージ）した。全マウスは、実験動物の管理と使用に関するＮＩＨガイドライン（ＮＩＨ Ｇｕｉｄｅ ｆｏｒ ｔｈｅ Ｃａｒｅ ａｎｄ Ｕｓｅ ｏｆ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ａｎｉｍａｌｓ）に見いだされる必要な飼育基準下に置いた。
【0066】
ＰＡ８の保護効果は、２×１０７個のＣＦＵのＭＲＳＡ菌株ＮＲ－４６２２３の静脈内注射（ｉ．ｖ．）によって誘導されたＳＡ敗血症モデルにおいて調査した。マウスは、第０日および第３日各々にＭＲＳＡ感染症の３時間前に特定用量（５ｍｇまたは１０ｍｇ）または５ｍｇの２回量でＰＡ８を用いて静脈内処置した。コントロールマウスは、調製用バッファー単独を用いて処置した。マウスは、残っているマウス全部を犠死させた時点から１０日間（１日２回）追跡した。
【0067】
ＰＡ８／調製用バッファー（０．１ｍＬ）の静脈内投与の３時間後、マウスには黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）菌株ＮＲ－４６２２３（０．１ｍＬ中の２×１０７個のＣＦＵ）の単回静脈内（ＩＶ）注射によりチャレンジ投与した。１組のマウスに第０日および３日各々に５ｍｇの２回量を与えた。処置群間の相対生残期間において有意差が検出された。図７Ａ～Ｄを参照すると、ｍＡｂ ＰＡ８の５ｍｇ（Ａ）または１０ｍｇ（Ｂ）の単回投与、または第０日および３日での５ｍｇの２回量の受動的投与（静脈内）は、（メチシリン耐性黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）菌株ＮＲ－４６２２３の２×１０７個のコロニー形成単位の静脈内注射によって誘導した）黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）敗血症を備えるＢＡＬＢ／ｃマウスの生残率を用量依存性方法（１群当たり１０匹のマウス）で調製用バッファー処置より有意に高く強化する。セクション（Ｄ）は、１枚のグラフにおいて全部の相違する処置を使用した生残率を示している。調製用バッファー（１／１０）を摂取したマウスの１０％（１／１０）が黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）ＮＲ－４６２２３による細菌チャレンジ投与を生残したことに比較して、５ｍｇのＭａｂ ＰＡ８（ｐ＝０．０１６）を摂取したマウスの５０％（５／１０）が生残し、各々５ｍｇの２回量を摂取した６０％（ｐ＝０．０９）および、１０ｍｇのｍＡｂ ＰＡ８（ｐ＝０．００３）を摂取した７０％（７／１０）が生存した。動物実験データの統計的分析は、マンテル・コックス（Ｍａｎｔｅｌ－Ｃｏｘ）（ログランク）検定を用いるカプラン・マイヤー生存分析を使用して実施した。これらの結果は、明らかに、ＰＡ８が黄色ブドウ球菌（Ｓ．ａｕｒｅｕｓ）ＭＲＳＡ菌株による致死性感染症に対して有意なレベルの防護を提供することを示している。
【0068】
実施例３．チャールス・リバー（Ｃｈａｒｌｅｓ Ｒｉｖｅｒ）研究所からの雌性Ｂａｌｂ／Ｃマウス（１群当たり１０匹）に腹腔内経路を介して０．５ｍｇのバンコマイシンを異なる準最適量のＰＡ８－Ｇ３（静脈内経路による０ｍｇ、２．５ｍｇおよび５ｍｇ）とともにＭＲＳＡ（３×１０７個のＣＦＵ（ｉ．ｖ．）でＮＲ ４６２２３）による感染の２時間前に注射した。マウスを１４日間観察した。図８Ａ～Ｃを参照すると、第１４日にＰＢＳ処置マウスの１０％のみが生残したが、バンコマイシン処置マウスの３０％が生残した。しかし、２．５ｍｇのＰＡ８－Ｇ３がバンコマイシン処置と一緒に注射された場合は、６０％の動物が生残し（ｐ＝０．０２７）、５ｍｇのＰＡ８－Ｇ３がバンコマイシンとともに注射された場合は、６０％の動物が生残し、それらの死亡したマウスは低用量群よりも長期間生存した（ｐ＝０．０１６）。このデータは、低有効量のＰＡ８－Ｇ３は、準最適用量のバンコマイシンを用いて共処置した場合に、ＳＡ媒介性菌血症から動物を救済できることを示している。動物実験データの統計的分析は、マンテル・コックス（Ｍａｎｔｅｌ－Ｃｏｘ）（ログランク）検定を用いるカプラン・マイヤー生存分析を使用して実施した。
【0069】
その他の実施形態
本発明をその詳細な説明と併せて記載してきたが、上記の説明は具体的に説明するためのものであり、添付の特許請求の範囲によって規定される本発明の範囲を限定することは意図していない。他の態様、利点および修飾形態は、以下の特許請求の範囲に含まれる。
本発明をその詳細な説明と併せて記載してきたが、上記の説明は具体的に説明するためのものであり、添付の特許請求の範囲によって規定される本発明の範囲を限定することは意図していない。他の態様、利点および修飾形態は、以下の特許請求の範囲に含まれる。
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【配列表】
【手続補正書】
【提出日】2024-06-07
【手続補正1】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項1】
対象における黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を治療する、または黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）感染症を発現するリスクを減少させるための医薬組成物であって、前記医薬組成物が、
医薬上許容される担体と、Ｆａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合する精製モノクローナル抗体とを含み、
前記モノクローナル抗体が、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌上のＳｐＡにそれらのＦｃ領域を介して結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換することができることを特徴とする、医薬組成物。
医薬上許容される担体と、Ｆａｂ領域パラトープを介して１×１０－１０Ｍ未満のＫＤで黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）タンパク質Ａ（ＳｐＡ）に特異的に結合する精製モノクローナル抗体とを含み、
前記モノクローナル抗体が、黄色ブドウ球菌（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ａｕｒｅｕｓ）細菌上のＳｐＡにそれらのＦｃ領域を介して結合したヒトＩｇＧ免疫グロブリンを置換することができることを特徴とする、医薬組成物。
【手続補正書】
【提出日】2024-07-18
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】変更
【補正の内容】
【配列表】