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特開2024-138365病理組織標本のモバイルデジタル空間プロファイリングのための方法、装置、システムおよびデバイス。
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2024138365
(43)【公開日】2024-10-08
(54)【発明の名称】病理組織標本のモバイルデジタル空間プロファイリングのための方法、装置、システムおよびデバイス。
(51)【国際特許分類】
G01N 21/17 20060101AFI20241001BHJP
G02B 21/00 20060101ALI20241001BHJP
G02B 21/06 20060101ALI20241001BHJP
G02B 21/30 20060101ALI20241001BHJP
G02B 21/28 20060101ALI20241001BHJP
G01N 21/64 20060101ALI20241001BHJP
C12M 1/34 20060101ALN20241001BHJP
C12M 1/00 20060101ALN20241001BHJP
【ＦＩ】
G01N21/17 A
G02B21/00
G02B21/06
G02B21/30
G02B21/28
G01N21/64 E
C12M1/34 B
C12M1/00 A
【審査請求】有
【請求項の数】1
【出願形態】ＯＬ
(21)【出願番号】P 2024108797
(22)【出願日】2024-07-05
(62)【分割の表示】P 2021535867の分割
【原出願日】2019-12-20
(31)【優先権主張番号】62/783,735
(32)【優先日】2018-12-21
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．ブルートゥース
(71)【出願人】
【識別番号】513322707
【氏名又は名称】ナノストリング テクノロジーズ，インコーポレイティド
(74)【代理人】
【識別番号】100099759
【弁理士】
【氏名又は名称】青木 篤
(74)【代理人】
【識別番号】100123582
【弁理士】
【氏名又は名称】三橋 真二
(74)【代理人】
【識別番号】100117019
【弁理士】
【氏名又は名称】渡辺 陽一
(74)【代理人】
【識別番号】100141977
【弁理士】
【氏名又は名称】中島 勝
(74)【代理人】
【識別番号】100138210
【弁理士】
【氏名又は名称】池田 達則
(72)【発明者】
【氏名】ジョーセフ エム．ビーチェム
(72)【発明者】
【氏名】ドウェイン ダナウェイ
(72)【発明者】
【氏名】チェミョン チュン
(72)【発明者】
【氏名】ピーター シュルツ
(72)【発明者】
【氏名】エリオット ソシン
(72)【発明者】
【氏名】グラント トレメル
(57)【要約】
【課題】固定組織サンプル中の生物種の相対量を定量化するためのデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）法における軽量化。
【解決手段】ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、組織サンプルの前記画像を表示し、前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの関心領域（ＲＯＩ）に関するユーザー入力を受信し、およびフォトマスキング手段を使用して、前記ＲＯＩをＵＶ光で照射するように処理回路を構成することにより、従来のデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システムではなされていなかった軽量化を可能にし、ひいてはコンパクトな形態のＤＳＰシステムの提供を可能にする。
【選択図】図２A
【解決手段】ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、組織サンプルの前記画像を表示し、前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの関心領域（ＲＯＩ）に関するユーザー入力を受信し、およびフォトマスキング手段を使用して、前記ＲＯＩをＵＶ光で照射するように処理回路を構成することにより、従来のデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システムではなされていなかった軽量化を可能にし、ひいてはコンパクトな形態のＤＳＰシステムの提供を可能にする。
【選択図】図２A
【特許請求の範囲】
【請求項1】
デジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システムであって、前記ＤＳＰの少なくとも一つのコンポーネントを収容する（ｃｏｎｔａｉｎ）ためのハウジングまたは他の構造を含み、前記ハウジングまたは他の構造が：
電源；
紫外線（ＵＶ）光源（ＵＶＳ）；
明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）；
組織サンプルを乗せたスライドの少なくとも一部を中に入れる（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成されたスロットを備えるチャンバー；
ユーザーインターフェースおよびカメラセンサーを備えるパーソナルモバイルコンピューティングデバイス（ＰＭＤ）であって、チャンバー内のスライド上の前記組織サンプルを画像化するためにチャンバーに対して配置されるＰＭＤ；
前記ＵＶＳからの紫外光（ＵＶ ｌｉｇｈｔ）および／または前記ＶＬＳからの可視光で前記組織サンプルを選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段；
前記組織サンプル、前記チャンバー、前記フォトマスキング手段、および前記カメラセンサーの少なくとも一つに前記ＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（ｏｐｔｉｃ ｍｅａｎｓ）；および
前記カメラセンサーを介して前記組織サンプルの画像を取得し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの前記画像を表示し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの関心領域（ＲＯＩ）に関するユーザー入力を受信し、および
前記フォトマスキング手段を使用して、前記ＲＯＩをＵＶ光で照射するように構成された処理回路
を含み、
ここで前記ＰＭＤが前記ハウジングおよび／または前記チャンバーに取り外し可能に取り付けられている、ＤＳＰシステム。
電源；
紫外線（ＵＶ）光源（ＵＶＳ）；
明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）；
組織サンプルを乗せたスライドの少なくとも一部を中に入れる（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成されたスロットを備えるチャンバー；
ユーザーインターフェースおよびカメラセンサーを備えるパーソナルモバイルコンピューティングデバイス（ＰＭＤ）であって、チャンバー内のスライド上の前記組織サンプルを画像化するためにチャンバーに対して配置されるＰＭＤ；
前記ＵＶＳからの紫外光（ＵＶ ｌｉｇｈｔ）および／または前記ＶＬＳからの可視光で前記組織サンプルを選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段；
前記組織サンプル、前記チャンバー、前記フォトマスキング手段、および前記カメラセンサーの少なくとも一つに前記ＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（ｏｐｔｉｃ ｍｅａｎｓ）；および
前記カメラセンサーを介して前記組織サンプルの画像を取得し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの前記画像を表示し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの関心領域（ＲＯＩ）に関するユーザー入力を受信し、および
前記フォトマスキング手段を使用して、前記ＲＯＩをＵＶ光で照射するように構成された処理回路
を含み、
ここで前記ＰＭＤが前記ハウジングおよび／または前記チャンバーに取り外し可能に取り付けられている、ＤＳＰシステム。
【請求項2】
前記フォトマスキング手段はバックライトを有するＬＣＤを含み、ここで前記ＶＬＳは前記ＬＣＤバックライトまたは外部ＶＬＳを含む；
前記光学的手段は、集光レンズまたは走査レンズ、ダイクロイックミラーを含む前記ＵＶＳの第一のセット、および対物レンズを含む光学の第二のセットを含む；
前記ダイクロイックミラーは、複数の光源からの光を一つの光学軸に向け直すように構成されている；
前記フォトマスキング手段は、前記ＲＯＩでのみ組織サンプルに到達するようにＵＶまたは可視光の少なくとも一つを構造化するようにプログラム可能な開口部として構成されたＬＣＤを含む；および／または
前記フォトマスキング手段は、デジタルマイクロミラーデバイス（ＤＭＤ）、液晶オンシリコン（ＬＣｏｓ）ディスプレイ、有機発光ダイオード（ＯＬＥＤ）、マイクロ発光ダイオード（μＬＥＤ）アレイ、光ファイバー束、液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）、スキャニングレーザー、および物的障壁の少なくとも一つを含む、
請求項１に記載のシステム。
前記光学的手段は、集光レンズまたは走査レンズ、ダイクロイックミラーを含む前記ＵＶＳの第一のセット、および対物レンズを含む光学の第二のセットを含む；
前記ダイクロイックミラーは、複数の光源からの光を一つの光学軸に向け直すように構成されている；
前記フォトマスキング手段は、前記ＲＯＩでのみ組織サンプルに到達するようにＵＶまたは可視光の少なくとも一つを構造化するようにプログラム可能な開口部として構成されたＬＣＤを含む；および／または
前記フォトマスキング手段は、デジタルマイクロミラーデバイス（ＤＭＤ）、液晶オンシリコン（ＬＣｏｓ）ディスプレイ、有機発光ダイオード（ＯＬＥＤ）、マイクロ発光ダイオード（μＬＥＤ）アレイ、光ファイバー束、液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）、スキャニングレーザー、および物的障壁の少なくとも一つを含む、
請求項１に記載のシステム。
【請求項3】
前記フォトマスキング手段は、ピクセルグリッドを含むＬＣＤを含み、ここで前記ＬＣＤは、前記組織サンプルから所定の距離に配置されている；
前記所定の距離は、前記組織サンプルが前記ピクセルグリッドによって遮られない（ｎｏｔ ｏｂｓｃｕｒｅｄ）ように構成される；
前記所定の距離は、約０．０１～５ｍｍの間、０．５０～２．５ｍｍの間、０．７５～２．２５ｍｍの間、または１～２ｍｍの間であるように選択される；
および／または
前記所定の距離は、組織サンプルの明確な視覚化を提供するように、および／または紫外光の拡散を最小限にするように構成される、
請求項２に記載のシステム。
前記所定の距離は、前記組織サンプルが前記ピクセルグリッドによって遮られない（ｎｏｔ ｏｂｓｃｕｒｅｄ）ように構成される；
前記所定の距離は、約０．０１～５ｍｍの間、０．５０～２．５ｍｍの間、０．７５～２．２５ｍｍの間、または１～２ｍｍの間であるように選択される；
および／または
前記所定の距離は、組織サンプルの明確な視覚化を提供するように、および／または紫外光の拡散を最小限にするように構成される、
請求項２に記載のシステム。
【請求項4】
前記システムは、さらに以下：
前記チャンバーに溶液の流れを提供するように構成されたポンプシステム、
および／または
前記処理回路上で動作し、前記ＰＭＤに、前記カメラセンサーを介して取得されて前記ＰＭＤの前記インターフェースを介して表示される前記画像の少なくとも一つのＲＯＩを選択するためのユーザー入力を受信するように構成されたグラフィカルユーザーインターフェイス（ＧＵＩ）を表示するように構成されたソフトウェアアプリケーション、
を含み、そして
前記フォトマスキング手段は、以下のうちの少なくとも１つを提供するように構成される： 約５０～３００ｎｍの間の照明解像度、約５～１２ｃｍ2の間の視野、および約１～５倍の間の倍率；
前記ハウジング、前記チャンバー、および前記スロットの少なくとも一つは、少なくとも一つの溶液を中に入れる、および／または取り込む（ｒｅｔｒｉｅｖｅ）ように構成されており、
前記ハウジングは、複数の足場、ＰＭＤフレーム、少なくとも一つの対物レンズフレーム、少なくとも一つのスライドフレーム、フォトマスキングフレーム、少なくとも一つの集光フレーム（ｃｏｎｄｅｎｓｅｒ ｆｒａｍｅ）、および少なくとも一つの熱管理手段を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）か、または含み（ｉｎｃｌｕｄｅ）、
前記ハウジングは、それぞれが異なる対物レンズおよび対応する倍率を有する、複数の対物レンズフレームの単一の対物レンズフレームを取り外し可能に収容する（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成され、
および／または
前記システムはさらに、暗視野顕微鏡、明視野顕微鏡、位相差顕微鏡、蛍光顕微鏡、および紫外線表面励起を伴う顕微鏡のうちの少なくとも一つのために構成される、
請求項１に記載のシステム。
前記チャンバーに溶液の流れを提供するように構成されたポンプシステム、
および／または
前記処理回路上で動作し、前記ＰＭＤに、前記カメラセンサーを介して取得されて前記ＰＭＤの前記インターフェースを介して表示される前記画像の少なくとも一つのＲＯＩを選択するためのユーザー入力を受信するように構成されたグラフィカルユーザーインターフェイス（ＧＵＩ）を表示するように構成されたソフトウェアアプリケーション、
を含み、そして
前記フォトマスキング手段は、以下のうちの少なくとも１つを提供するように構成される： 約５０～３００ｎｍの間の照明解像度、約５～１２ｃｍ2の間の視野、および約１～５倍の間の倍率；
前記ハウジング、前記チャンバー、および前記スロットの少なくとも一つは、少なくとも一つの溶液を中に入れる、および／または取り込む（ｒｅｔｒｉｅｖｅ）ように構成されており、
前記ハウジングは、複数の足場、ＰＭＤフレーム、少なくとも一つの対物レンズフレーム、少なくとも一つのスライドフレーム、フォトマスキングフレーム、少なくとも一つの集光フレーム（ｃｏｎｄｅｎｓｅｒ ｆｒａｍｅ）、および少なくとも一つの熱管理手段を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）か、または含み（ｉｎｃｌｕｄｅ）、
前記ハウジングは、それぞれが異なる対物レンズおよび対応する倍率を有する、複数の対物レンズフレームの単一の対物レンズフレームを取り外し可能に収容する（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成され、
および／または
前記システムはさらに、暗視野顕微鏡、明視野顕微鏡、位相差顕微鏡、蛍光顕微鏡、および紫外線表面励起を伴う顕微鏡のうちの少なくとも一つのために構成される、
請求項１に記載のシステム。
【請求項5】
前記ハウジング、前記チャンバー、および前記スロットのうちの少なくとも一つは、前記スライドがそれに対して移動することを可能にするように構成されている、
請求項１に記載のシステム。
請求項１に記載のシステム。
【請求項6】
前記ハウジング、前記チャンバー、および前記スロットは、前記少なくとも一つの溶液を、液体輸送を介して中に入れる、および／または取り込むように構成された、請求項５に記載のシステム。
【請求項7】
液体輸送は、ピペッティングおよび毛細管作用の少なくとも一つを含み、ここで該ピペッティングは手動またはロボット手段を介した自動のいずれかでありうる、請求項６に記載のシステム。
【請求項8】
前記ハウジングは、複数の足場、ＰＭＤフレーム、少なくとも一つの対物レンズフレーム、少なくとも一つのスライドフレーム、フォトマスキングフレーム、少なくとも一つの集光フレーム、および少なくとも一つの熱管理手段を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）か、または含む（ｉｎｃｌｕｄｅ）、請求項１に記載のシステム。
【請求項9】
前記熱管理手段は、ヒートシンク、ヒートポンプ、ファン、液体冷却システム、およびペルチェデバイスの少なくとも一つを含む、請求項８に記載のシステム。
【請求項10】
前記ハウジングは、それぞれが異なる対物レンズおよび対応する倍率を有する、複数の対物レンズフレームの単一の対物レンズフレームを取り外し可能に収容するように構成されている、請求項１に記載のシステム。
【請求項11】
前記各対物レンズフレームは、カメラセンサーから異なる間隔を提供するように構成されている、請求項１０に記載のシステム。
【請求項12】
前記ＰＭＤは、ＰＭＤプロセッサ、ディスプレイ、情報を直接またはネットワークを介して遠隔デバイスに通信するための第一の無線通信手段、およびローカルデバイスと通信するための第二の無線通信手段を含む、請求項１に記載のシステム。
【請求項13】
前記ハウジングおよび前記チャンバーのうちの少なくとも一つの中の温度を測定するように構成された温度センサーをさらに含む、請求項１に記載のシステム。
【請求項14】
前記プロセッサは、
感知された温度に対応する温度センサーからの入力を受信する、および
以下の少なくとも一つ：
前記感知された温度が所定の温度よりも高い場合に、ＵＶＳをオフにする；および
前記感知された温度が所定の温度よりも高い場合に、視覚的および聴覚的警告の少なくとも一つを提供する
ように構成されている、請求項１に記載のシステム。
感知された温度に対応する温度センサーからの入力を受信する、および
以下の少なくとも一つ：
前記感知された温度が所定の温度よりも高い場合に、ＵＶＳをオフにする；および
前記感知された温度が所定の温度よりも高い場合に、視覚的および聴覚的警告の少なくとも一つを提供する
ように構成されている、請求項１に記載のシステム。
【請求項15】
以下をさらに含む、請求項１に記載のシステム：
前記チャンバー内に前記組織サンプル上の液体環境を維持するための密閉手段、および／または
前記組織サンプルの近くに配置され、前記組織サンプルからの溶液のピペッティングを可能にするように構成された手動の流体収集誘導手段。
前記チャンバー内に前記組織サンプル上の液体環境を維持するための密閉手段、および／または
前記組織サンプルの近くに配置され、前記組織サンプルからの溶液のピペッティングを可能にするように構成された手動の流体収集誘導手段。
【請求項16】
前記手動の流体収集誘導手段は、フローセルとして、またはフローセルとともに構成された、および／または前記チャンバー内または前記チャンバーに近接して配置されるよう構成されたマイクロアレイを含む；および／または、前記手動の流体収集誘導手段は、前記密閉手段内または前記密閉手段に近接して配置されたグリッドバリア（ｇｒｉｄ ｂａｒｒｉｅｒ）を含む、請求項１５に記載のシステム。
【請求項17】
デジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）方法であって、
請求項１に記載のシステムを提供する工程を含み、ここで、処理回路は
前記チャンバーのスロット内に入れられる前記スライド上の前記組織サンプルに照明光を提供し、ここで前記組織サンプルは事前に抗体溶液と結合されており、挿入前に緩衝液で覆われており、ここで前記スライドは画像化のためのチャンバーのスロットの中に入れられ、フォトマスキング手段と位置合わせされている；
前記ＰＭＤの前記カメラセンサーで前記組織サンプルを可視光下で画像化し、および前記ＰＭＤの前記ユーザーインターフェースを介して前記画像を表示する；
前記ＧＵＩを介して複数のマーカーの選択を受けとり、ここで前記選択は、長方形の輪郭を形成する；
選択された複数のバイオマーカーに基づいてＲＯＩを限定する；
可視光の照射を停止する；および
前記組織サンプルの前記ＲＯＩ内のオリゴを切断するのに十分な所定の時間、前記組織サンプルの前記ＲＯＩをＵＶ光照射に曝露する
ように構成される、およびここで前記方法は、
切断されたオリゴを含む前記組織サンプルから溶液を収集する工程
をさらに含む、方法。
請求項１に記載のシステムを提供する工程を含み、ここで、処理回路は
前記チャンバーのスロット内に入れられる前記スライド上の前記組織サンプルに照明光を提供し、ここで前記組織サンプルは事前に抗体溶液と結合されており、挿入前に緩衝液で覆われており、ここで前記スライドは画像化のためのチャンバーのスロットの中に入れられ、フォトマスキング手段と位置合わせされている；
前記ＰＭＤの前記カメラセンサーで前記組織サンプルを可視光下で画像化し、および前記ＰＭＤの前記ユーザーインターフェースを介して前記画像を表示する；
前記ＧＵＩを介して複数のマーカーの選択を受けとり、ここで前記選択は、長方形の輪郭を形成する；
選択された複数のバイオマーカーに基づいてＲＯＩを限定する；
可視光の照射を停止する；および
前記組織サンプルの前記ＲＯＩ内のオリゴを切断するのに十分な所定の時間、前記組織サンプルの前記ＲＯＩをＵＶ光照射に曝露する
ように構成される、およびここで前記方法は、
切断されたオリゴを含む前記組織サンプルから溶液を収集する工程
をさらに含む、方法。
【請求項18】
前記フォトマスキング手段をキャリブレーションするために前記スライドの挿入前に前記フォトマスキング手段を画像化する、および／または前記選択されたマーカーによって輪郭が描かれた前記長方形の前記サイズを変更するように、前記処理回路が構成された、請求項１８に記載の方法。
【請求項19】
一つまたは複数のコンピュータプロセッサが請求項１８に記載の方法の一つまたは複数の工程を実行できるようにするための命令を格納した、非一時的なコンピュータ可読媒体。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願
本出願は、２０１９年１２月２１日に出願された米国仮特許出願第６２／７８３，７３５号の利益および優先権を主張し、その開示全体は参照により本明細書に組み込まれる。
本出願は、２０１９年１２月２１日に出願された米国仮特許出願第６２／７８３，７３５号の利益および優先権を主張し、その開示全体は参照により本明細書に組み込まれる。
【0002】
開示の分野
本開示の実施形態は、病理組織標本の生化学的特性解析のためのモバイルデジタル空間プロファイリングに関する。
本開示の実施形態は、病理組織標本の生化学的特性解析のためのモバイルデジタル空間プロファイリングに関する。
【背景技術】
【0003】
生物学的研究および臨床病理学において、組織における生体分子の空間的配置の情報は、病状および病因を決定するために重要である。しかしながら、現在の方法は「ｌｏｗ－ｐｌｅｘ」、つまり非定量的、破壊的、または空間情報の欠如のいずれかである。このニーズを満たすために、固定組織サンプル中の生物種の相対量を定量化するためのデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）法が開発されてきた。このような方法は、ＤＮＡ、ＲＮＡ、およびタンパク質を対象とし、「ｈｉｇｈ－ｐｌｅｘ」、つまり、ＤＮＡベースの蛍光バーコードの使用により、病状および／または病因を決定するための適切な（またはそれ以上の）量の情報の収集である。各バーコードは、分子認識部分に結合したオリゴヌクレオチドに結合しており、紫外光を使用して切断し、溶液中で回収することができる。次に、バーコードを使用して、サンプル内の分子の相対量を決定する。この方法には多くの利点があるが、市場には軽量の代替手段の余地が残されている。
【発明の概要】
【0004】
一部の実施形態の概要
本開示の実施形態は、小型化したサイズのデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システム、ならびに関連する装置、デバイス、および方法を対象とする。上記のすべては、組織の一つまたは複数の関心領域（ＲＯＩ）をイメージングし、紫外光を使用して一つまたは複数のＲＯＩ内の抗体からオリゴ（すなわち、オリゴマー）を切断し（「光切断」）、後でハイブリダイズして（たとえば、Ｎａｎｏｓｔｒｉｎｇ（登録商標）ｎＣｏｕｎｔｅｒ技術を使用して）計数することができる光切断されたオリゴを収集するように構成することができる。一部の実施形態では、そのような機能はまた、モバイル、さらに（一部の実施形態では）コンパクトな形態で提供することができる。
本開示の実施形態は、小型化したサイズのデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システム、ならびに関連する装置、デバイス、および方法を対象とする。上記のすべては、組織の一つまたは複数の関心領域（ＲＯＩ）をイメージングし、紫外光を使用して一つまたは複数のＲＯＩ内の抗体からオリゴ（すなわち、オリゴマー）を切断し（「光切断」）、後でハイブリダイズして（たとえば、Ｎａｎｏｓｔｒｉｎｇ（登録商標）ｎＣｏｕｎｔｅｒ技術を使用して）計数することができる光切断されたオリゴを収集するように構成することができる。一部の実施形態では、そのような機能はまた、モバイル、さらに（一部の実施形態では）コンパクトな形態で提供することができる。
【0005】
したがって、一部の実施形態では、そのようなコンパクトなモバイルＤＳＰシステムは、たとえば電源、プロセッサ、紫外光源（ＵＶ ｓｏｕｒｃｅ；ＵＶＳ）、明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）（例：ＬＥＤ、ＬＥＤアレイ、蛍光電球（fluorescence bulb）、白熱電球、アーク灯、メタルハライドランプ等）、紫外光源からの紫外光（ＵＶ ｌｉｇｈｔ）および／または可視光源からの可視光で組織サンプルを選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段、組織のための液体環境で構成された、組織を乗せたスライド（ｔｈｅ ｓｌｉｄｅ ｈａｖｉｎｇ ｔｈｅ ｔｉｓｓｕｅ ｔｈｅｒｅｏｎ）の少なくとも一部を中に入れる（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成されたチャンバー、および組織、スライド、チャンバー、フォトマスキング手段、およびパーソナルモバイルコンピューティングデバイス（ＰＭＤ）に動作可能にリンクされたカメラセンサーの少なくとも一つに前記ＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（ｏｐｔｉｃ ｍｅａｎｓ）（一部の実施形態では、チャンバーの外部に備えることができる）を含んでもよい。ＰＭＤは、電話、タブレット、ラップトップ、およびデスクトップを含んでもよい。動作可能にリンクされたカメラセンサーは、ＰＭＤの内部もしくは内蔵、またはＰＭＤの外部であってもよい。カメラセンサーが組織をイメージングできるように、ハウジングおよびチャンバーの少なくとも一つは、ＰＭＤへの取り外し可能な取り付けのために構成されている。
【0006】
そのような実施形態は、以下の特徴、構造、機能、工程、および／または説明（一部の実施形態では、その複数、さらなる実施形態では、すべて）のうちの少なくとも一つまたは複数をさらに含んでもよく、さらにさらなる実施形態をもたらす：
－フォトマスキング手段は、任意選択でバックライトを有するＬＣＤを含んでもよい；
－ＶＬＳはＬＣＤバックライトまたは個別の外部可視光源を含んでもよい；
－光学的手段は、集光レンズまたは走査レンズ、ダイクロイックミラーの少なくとも一つ、複数、またはすべてを含んでもよいＵＶＳの第一のセット、および対物レンズを含んでもよい光学の第二のセットを含んでもよい；
〇ダイクロイックミラーは、複数の光源からの光を一つの光学軸に向け直すように構成されていてもよい；
－フォトマスキング手段は、関心領域（ＲＯＩ）でのみ組織に到達するようにＵＶおよび可視光の少なくとも一つを構造化するようにプログラム可能な開口部として構成されたＬＣＤを含んでもよい；
－チャンバーは、スライドを中に入れるように構成されたスロットを含んでもよい；
－フォトマスクは、デジタルマイクロミラーデバイス（ＤＭＤ）、液晶オンシリコン（ＬＣｏｓ）ディスプレイ、有機発光ダイオード（ＯＬＥＤ）、マイクロ発光ダイオード（μＬＥＤ）アレイ、光ファイバー束、液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）、スキャニングレーザー、および物的障壁の少なくとも一つを含んでもよい；
－フォトマスキング手段は、ピクセルグリッドを含むＬＣＤを含んでもよく、ここでＬＣＤは、組織から所定の距離に配置されており、ここで：
〇所定の距離は、組織がピクセルグリッドによって遮られない（ｎｏｔ ｏｂｓｃｕｒｅｄ）ように構成されていてもよい；
〇所定の距離は、約０．０１～５ｍｍの間であってもよい；
〇所定の距離は、約０．５０～２．５ｍｍの間であってもよい；
〇所定の距離は、約０．７５～２．２５ｍｍの間であってもよい；または
〇所定の距離は、約１～２ｍｍの間であってもよい；および／または
〇所定の距離は、少なくとも組織の明確な視覚化（ｃｌｅａｒ ｖｉｓｕａｌｉｚｅ）を提供するように、または紫外光の拡散を最小限にするように構成されていてもよい；
－フォトマスキング手段は、以下のうちの少なくとも１つを提供するように構成されていてもよい： 約５０～３００ｎｍの間の照明解像度、約１～１２．５ｃｍ2または５～１２．５ｃｍ2の間の視野、および／または約１～５倍または１～３倍の間の倍率；
－ハウジング、チャンバー、およびスロットのうちの少なくとも一つは、スライドがそれに対して移動することを可能にするように構成されており、ここで：
〇スライドの相対的な動きは、組織イメージングのためであってもよい；
－ハウジング、チャンバー、およびスロットの少なくとも一つは、少なくとも一つの溶液を中に入れる、および／または取り込む（ｒｅｔｒｉｅｖｅ）ように構成されており、ここで少なくとも一つの溶液は、液体輸送を介して中に入れる、および／または取り込むことができ、ここで液体輸送は、ピペッティングおよび毛細管作用の少なくとも一つを含んでもよく、ピペッティングは手動またはロボット手段を介した自動のいずれかであってもよい；
－ハウジングは、複数の足場、ＰＭＤフレーム、少なくとも一つの対物レンズフレーム、少なくとも一つのスライドフレーム、フォトマスキングフレーム、少なくとも一つの集光フレーム（ｃｏｎｄｅｎｓｅｒ ｆｒａｍｅ）、および少なくとも一つの熱管理手段のうちの、少なくとも一つ、一部の実施形態では複数、および一部の実施形態ではすべてを含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）か、または含んで（ｉｎｃｌｕｄｅ）いてもよい；
－熱管理手段は、ヒートシンク、ヒートポンプ、ファン、液体冷却システム、およびペルチェデバイスの少なくとも一つを含んでもよい；
－ハウジングは、それぞれが異なる対物レンズおよび対応する倍率を有する、複数の対物レンズフレームの単一の対物レンズフレームを取り外し可能に収容するように構成されていてもよく、ここで：
〇各対物レンズフレームは、カメラセンサーから異なる間隔を提供するように構成されていてもよい；および／または
〇少なくとも熱管理手段は、複数のヒートシンククリップを含んでいてもよい；
－ＰＭＤをさらに含んでいてもよい；
〇ＰＭＤは、ＰＭＤプロセッサ、ディスプレイ、スライド上に配置された組織をイメージングするためのカメラセンサー、および情報を直接またはネットワークを介して遠隔デバイスに通信するための第一の無線通信手段、および任意選択でローカルデバイスと通信するための第二の無線通信手段のうちの、少なくとも一つ、一部の実施形態ではその複数、および一部の実施形態ではすべてを含んでもよい；および／または
〇第二の無線通信手段は、ブルートゥース、Ｗｉ－ｆｉ、または赤外線の少なくとも一つを含んでもよい；
－プロセッサ上で動作するよう構成されていてもよく、モバイルデバイスに、組織スライドのカメラセンサーを介して取得されてＰＭＤのディスプレイに表示される組織像の関心領域（ＲＯＩ）を選択するためのユーザー入力を受信するように構成されていてもよいグラフィカルユーザーインターフェイス（ＧＵＩ）を表示するように構成されていてもよいソフトウェアアプリケーション；
－システムは、さらに、暗視野顕微鏡、明視野顕微鏡、位相差顕微鏡、蛍光顕微鏡、および紫外線表面励起を伴う顕微鏡のうちの少なくとも一つのために構成されていてもよい；
－スライドに溶液の流れを提供するように構成されたポンプシステム、ここで溶液は緩衝液および／または組織染色剤であってもよい；
－ハウジングおよびチャンバーのうちの少なくとも一つの中の温度を測定するように構成されていてもよい温度センサー；
－プロセッサは、
〇感知された温度に対応する温度センサーからの入力を受信する、および／または
〇以下の少なくとも一つ： 感知された温度が所定の温度よりも高い場合に、ＵＶＳをオフにする；および／または感知された温度が所定の量よりも高い場合に、視覚的および聴覚的警告の少なくとも一つを提供する
ように構成されていてもよい；
－組織上の液体環境を維持するために構成されてもよい密閉手段；および
－以下のような流体収集誘導手段：
〇組織（ｉｓｓｕｅ）の近くに配置されていてもよい、
〇組織からの溶液のピペッティングを可能にするように構成されていてもよい、および
〇グリッドバリアを含んでいてもよく、ここでグリッドバリアは密閉手段内または密閉手段に近接して構成されていてもよく、またはフローセルとして、またはフローセルとともに構成されていてもよく、および／またはグリッドバリアはチャンバー内またはチャンバーに近接して配置されていてもよい。
－フォトマスキング手段は、任意選択でバックライトを有するＬＣＤを含んでもよい；
－ＶＬＳはＬＣＤバックライトまたは個別の外部可視光源を含んでもよい；
－光学的手段は、集光レンズまたは走査レンズ、ダイクロイックミラーの少なくとも一つ、複数、またはすべてを含んでもよいＵＶＳの第一のセット、および対物レンズを含んでもよい光学の第二のセットを含んでもよい；
〇ダイクロイックミラーは、複数の光源からの光を一つの光学軸に向け直すように構成されていてもよい；
－フォトマスキング手段は、関心領域（ＲＯＩ）でのみ組織に到達するようにＵＶおよび可視光の少なくとも一つを構造化するようにプログラム可能な開口部として構成されたＬＣＤを含んでもよい；
－チャンバーは、スライドを中に入れるように構成されたスロットを含んでもよい；
－フォトマスクは、デジタルマイクロミラーデバイス（ＤＭＤ）、液晶オンシリコン（ＬＣｏｓ）ディスプレイ、有機発光ダイオード（ＯＬＥＤ）、マイクロ発光ダイオード（μＬＥＤ）アレイ、光ファイバー束、液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）、スキャニングレーザー、および物的障壁の少なくとも一つを含んでもよい；
－フォトマスキング手段は、ピクセルグリッドを含むＬＣＤを含んでもよく、ここでＬＣＤは、組織から所定の距離に配置されており、ここで：
〇所定の距離は、組織がピクセルグリッドによって遮られない（ｎｏｔ ｏｂｓｃｕｒｅｄ）ように構成されていてもよい；
〇所定の距離は、約０．０１～５ｍｍの間であってもよい；
〇所定の距離は、約０．５０～２．５ｍｍの間であってもよい；
〇所定の距離は、約０．７５～２．２５ｍｍの間であってもよい；または
〇所定の距離は、約１～２ｍｍの間であってもよい；および／または
〇所定の距離は、少なくとも組織の明確な視覚化（ｃｌｅａｒ ｖｉｓｕａｌｉｚｅ）を提供するように、または紫外光の拡散を最小限にするように構成されていてもよい；
－フォトマスキング手段は、以下のうちの少なくとも１つを提供するように構成されていてもよい： 約５０～３００ｎｍの間の照明解像度、約１～１２．５ｃｍ2または５～１２．５ｃｍ2の間の視野、および／または約１～５倍または１～３倍の間の倍率；
－ハウジング、チャンバー、およびスロットのうちの少なくとも一つは、スライドがそれに対して移動することを可能にするように構成されており、ここで：
〇スライドの相対的な動きは、組織イメージングのためであってもよい；
－ハウジング、チャンバー、およびスロットの少なくとも一つは、少なくとも一つの溶液を中に入れる、および／または取り込む（ｒｅｔｒｉｅｖｅ）ように構成されており、ここで少なくとも一つの溶液は、液体輸送を介して中に入れる、および／または取り込むことができ、ここで液体輸送は、ピペッティングおよび毛細管作用の少なくとも一つを含んでもよく、ピペッティングは手動またはロボット手段を介した自動のいずれかであってもよい；
－ハウジングは、複数の足場、ＰＭＤフレーム、少なくとも一つの対物レンズフレーム、少なくとも一つのスライドフレーム、フォトマスキングフレーム、少なくとも一つの集光フレーム（ｃｏｎｄｅｎｓｅｒ ｆｒａｍｅ）、および少なくとも一つの熱管理手段のうちの、少なくとも一つ、一部の実施形態では複数、および一部の実施形態ではすべてを含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）か、または含んで（ｉｎｃｌｕｄｅ）いてもよい；
－熱管理手段は、ヒートシンク、ヒートポンプ、ファン、液体冷却システム、およびペルチェデバイスの少なくとも一つを含んでもよい；
－ハウジングは、それぞれが異なる対物レンズおよび対応する倍率を有する、複数の対物レンズフレームの単一の対物レンズフレームを取り外し可能に収容するように構成されていてもよく、ここで：
〇各対物レンズフレームは、カメラセンサーから異なる間隔を提供するように構成されていてもよい；および／または
〇少なくとも熱管理手段は、複数のヒートシンククリップを含んでいてもよい；
－ＰＭＤをさらに含んでいてもよい；
〇ＰＭＤは、ＰＭＤプロセッサ、ディスプレイ、スライド上に配置された組織をイメージングするためのカメラセンサー、および情報を直接またはネットワークを介して遠隔デバイスに通信するための第一の無線通信手段、および任意選択でローカルデバイスと通信するための第二の無線通信手段のうちの、少なくとも一つ、一部の実施形態ではその複数、および一部の実施形態ではすべてを含んでもよい；および／または
〇第二の無線通信手段は、ブルートゥース、Ｗｉ－ｆｉ、または赤外線の少なくとも一つを含んでもよい；
－プロセッサ上で動作するよう構成されていてもよく、モバイルデバイスに、組織スライドのカメラセンサーを介して取得されてＰＭＤのディスプレイに表示される組織像の関心領域（ＲＯＩ）を選択するためのユーザー入力を受信するように構成されていてもよいグラフィカルユーザーインターフェイス（ＧＵＩ）を表示するように構成されていてもよいソフトウェアアプリケーション；
－システムは、さらに、暗視野顕微鏡、明視野顕微鏡、位相差顕微鏡、蛍光顕微鏡、および紫外線表面励起を伴う顕微鏡のうちの少なくとも一つのために構成されていてもよい；
－スライドに溶液の流れを提供するように構成されたポンプシステム、ここで溶液は緩衝液および／または組織染色剤であってもよい；
－ハウジングおよびチャンバーのうちの少なくとも一つの中の温度を測定するように構成されていてもよい温度センサー；
－プロセッサは、
〇感知された温度に対応する温度センサーからの入力を受信する、および／または
〇以下の少なくとも一つ： 感知された温度が所定の温度よりも高い場合に、ＵＶＳをオフにする；および／または感知された温度が所定の量よりも高い場合に、視覚的および聴覚的警告の少なくとも一つを提供する
ように構成されていてもよい；
－組織上の液体環境を維持するために構成されてもよい密閉手段；および
－以下のような流体収集誘導手段：
〇組織（ｉｓｓｕｅ）の近くに配置されていてもよい、
〇組織からの溶液のピペッティングを可能にするように構成されていてもよい、および
〇グリッドバリアを含んでいてもよく、ここでグリッドバリアは密閉手段内または密閉手段に近接して構成されていてもよく、またはフローセルとして、またはフローセルとともに構成されていてもよく、および／またはグリッドバリアはチャンバー内またはチャンバーに近接して配置されていてもよい。
【0007】
一部の実施形態では、手動流体収集誘導手段は、マイクロアレイをフローセルとして、またはフローセルとともに構成することができ、および／またはマイクロアレイをチャンバー内またはチャンバーに近接して配置することができるマイクロアレイを含んでもよい。
【0008】
一部の実施形態では、デジタル空間プロファイリングシステムは、プロセッサ、ディスプレイ、スライド上に配置された組織をイメージングするためのカメラセンサー、および直接またはネットワークを介して遠隔デバイスに情報を通信するための通信手段、プロセッサ上で動作し、モバイルデバイスに、組織スライドのカメラセンサーを介して取得されてディスプレイに表示される組織像の関心領域（ＲＯＩ）を選択するためのユーザー入力を受信するように構成されたグラフィカルユーザーインターフェイス（ＧＵＩ）を表示するように構成されたソフトウェアアプリケーション、および以下の少なくとも一つ、一部の実施形態ではその複数、および一部の実施形態ではすべてを含むＤＳＰシステムの少なくとも一つのコンポーネントを収容するためのハウジングまたは他の構造： 紫外光源（ＵＶＳ）、明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）、紫外光源からの紫外光または可視光源からの可視光で組織を選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段、スライドを中に入れるように構成されたスロット、および組織を乗せたスライドの少なくとも一部をスロットを介して中に入れるように構成されたチャンバーのうちの少なくとも一つ、一部の実施形態では複数、および一部の実施形態ではすべてを備える、および含む。チャンバーは、組織のための水性の環境で構成されていてもよい。システムはまた、組織、チャンバー、フォトマスキング手段、およびカメラセンサーの少なくとも一つに前記ＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（ｏｐｔｉｃ ｍｅａｎｓ）を含んでいてもよい。ハウジング、スロット、および／またはチャンバーは、カメラセンサーが組織をイメージングできるように、ＰＭＤへの取り外し可能な取り付けのために構成されていてもよく、通信手段は無線通信手段であってもよい。
【0009】
一部の実施形態では、デジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）法は、以下のうちの少なくとも一つ、一部の実施形態ではその複数、および一部の実施形態ではすべてを備える、および含む： 任意選択でそのような開示されたシステム、装置、およびデバイスに記載のシステム、装置、および／またはデバイスを提供する工程、パーソナルモバイルデバイス（ＰＭＤ）上でソフトウェアアプリケーションを開始する工程、イメージングのためにチャンバーの中に入れ、フォトマスクと位置合わせされるように、組織は事前に抗体溶液と結合しており、挿入前に緩衝液で覆われている組織サンプルを乗せたスライドを挿入する工程、組織に光の照射を提供する工程、ＰＭＤのカメラセンサーで組織サンプルをイメージングし、ＰＭＤディスプレイを介して画像を表示する工程、ＧＵＩを介して表示されるフォトマスクの複数のマーカーを選択し、そのような選択は、長方形の輪郭を形成する工程、ＲＯＩをＧＵＩを介して選択する工程、ＰＭＤをＤＳＰシステムに無線で接続する工程、光の照射を停止する工程、組織内のオリゴを切断するのに十分な所定の時間、組織をＵＶ照射（ＵＶ ｉｌｌｕｍｉｎａｔｉｏｎ）に曝露する工程、および切断されたオリゴを含む組織から溶液を収集する工程。
【0010】
そのような実施形態は、以下の特徴、構造、機能、工程、および／または説明（一部の実施形態では、その複数、さらなる実施形態では、すべて）のうちの少なくとも一つまたは複数を追加で含んでもよく、さらにさらなる実施形態をもたらす：
－フォトマスクをキャリブレーションするためにスライドを挿入する前にフォトマスクをイメージングする工程、および
－選択されたマーカーによって輪郭が描かれた長方形のサイズを変更する工程であって、ここで変更されたサイズは、複数の指定されたサイズのうちの一つに対応していてもよい、工程。
－フォトマスクをキャリブレーションするためにスライドを挿入する前にフォトマスクをイメージングする工程、および
－選択されたマーカーによって輪郭が描かれた長方形のサイズを変更する工程であって、ここで変更されたサイズは、複数の指定されたサイズのうちの一つに対応していてもよい、工程。
【0011】
一部の実施形態では、一つまたは複数のコンピュータプロセッサが本開示に提示される方法実施形態のいずれかの一つまたは複数の工程を実行できるようにするための命令を格納した、非一時的なコンピュータ可読媒体を提供する。
【0012】
一部の実施形態では、直接またはネットワークを介して遠隔デバイスに情報を通信するための第一の無線通信手段は、電気通信インフラストラクチャを介したＲＯＩの遠隔選択、および／または健康評価または健康相談等のヘルスケアサービスの配信を可能にする。
【0013】
本開示のこれらおよび他の実施形態は、簡単な説明が以下に提供される図面を参照することでさらに明確になり、以下の開示の少なくとも一部の実施形態の追加の詳細が示される。
【図面の簡単な説明】
【0014】
【図1A】本開示の少なくとも一部の実施形態による、コンパクトなモバイルデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システムによって実行されるいくつかの工程の概要の概略図を示す。
【図1B-1】本開示の一部の実施形態による、ＤＳＰシステムを使用して、一つまたは複数の関心領域（ＲＯＩ）をイメージングするためのプロセスの概略図を示す。
【図1B-2】本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムの概略図を示す。
【図1C】一部の実施形態による、ＤＳＰシステムの設計留意点の表である。
【図1D】本開示の一部の実施形態による、ＤＳＰシステムのいくつかの構成要素の斜視図である。
【図2A】本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムの少なくとも一部の概略図である。
【図2B】本開示の一部の実施形態による、ＤＳＰシステムの一部を表すＬＤＣマスキングコンポーネントの概略図である。
【図2C-1】本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムの少なくとも一部の概略図である。
【図2C-2】本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムの少なくとも一部の概略図である。
【図2C-3】本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムの少なくとも一部の概略図であり、システムのＵＶ ＬＥＤコンポーネントの使用を示している。
【図2D】本開示の一部の実施形態による、ＤＳＰシステムのＵＶ ＬＥＤコンポーネントによるＵＶ照明の減衰を示す。
【図3B】本開示の一部の実施形態による、異なる顕微鏡モダリティを達成するための例示的な表示パターンを示す。
【図4C】本開示の一部の実施形態による、ＤＳＰシステムの概略図である；スキャニングレーザーの構造と動作を説明する。
【図4D】本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムのキャリブレーションスキームを示す。
【図5F】本開示の一部の実施形態による例示的なＤＳＰシステムハウジング構造を示す。
【図6】本開示の一部の実施形態による、ＤＳＰシステムの熱管理のための例示的な回路を示す。
【発明を実施するための形態】
【0015】
開示された実施形態の少なくとも一部のための詳細な説明
本開示の一部の実施形態では、コンパクトで移動可能なデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システム（ならびに関連する装置、デバイス、および方法）が提供され、一つまたは複数の関心領域（ＲＯＩ）をイメージングし、紫外光を使用して各ＲＯＩ内の抗体からオリゴを切断し（「光切断」）、（後でハイブリダイズして、たとえば、Ｎａｎｏｓｔｒｉｎｇ（登録商標）ｎＣｏｕｎｔｅｒ技術を使用して計数する）ことができる光切断されたオリゴを収集するように構成されている。本開示の一部のそのような実施形態は、図１Ｃのチャートに示されるように、ＤＳＰシステムの考慮事項をさらに設計することである。
本開示の一部の実施形態では、コンパクトで移動可能なデジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システム（ならびに関連する装置、デバイス、および方法）が提供され、一つまたは複数の関心領域（ＲＯＩ）をイメージングし、紫外光を使用して各ＲＯＩ内の抗体からオリゴを切断し（「光切断」）、（後でハイブリダイズして、たとえば、Ｎａｎｏｓｔｒｉｎｇ（登録商標）ｎＣｏｕｎｔｅｒ技術を使用して計数する）ことができる光切断されたオリゴを収集するように構成されている。本開示の一部のそのような実施形態は、図１Ｃのチャートに示されるように、ＤＳＰシステムの考慮事項をさらに設計することである。
【0016】
本開示の少なくとも一部の実施形態によって実行される工程の高レベルの外観図が、図１Ａ（図１Ｂ－１に概説されるプロセスの一部である）に示されている。具体的には、組織をＤＳＰシステムでイメージングして蛍光標識抗体１０１を見出し、ＲＯＩを決定し、ＵＶで照射し、キャピラリー手段１０３を介してＤＮＡタグを収集し、次に、収集したＤＮＡをプレート内のバーコードにハイブリダイズさせ、特定のＲＯＩ １０５へのインデックスカウントを行う（ｉｎｄｅｘ ｃｏｕｎｔｓ ｔｏ ｔｈｅ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＲＯＩｓ １０５）。
【0017】
より具体的には、一部の実施形態によれば、図１Ｂ－１に示されるように、プロセスは、オリゴ結合抗体を有する組織１０２を乗せたスライドを染色することによって開始し、次いで、スライドは、ＤＳＰシステムで（一部の実施形態によって）イメージングされ、一つまたは複数のＲＯＩ １０４が選択される。一つまたは複数のＲＯＩは次に、一つまたは複数のＲＯＩ内の抗体からオリゴヌクレオチド（「オリゴ」）を切断するように、紫外光１０６に曝露される。そこから、切断されたオリゴは、たとえば、マイクロキャピラリーデバイスを介して、スライドから吸引される１０８。次に、収集されたオリゴをアッセイ１１０（たとえば、９６ウェルプレート）に入れることができる。このプロセスは、選択されたＲＯＩごとに繰り返される１１２。オリゴがアッセイに分注された後、オリゴはバーコードにハイブリダイズされ、次に定量化システム（たとえば、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇｎＣｏｕｎｔｅｒ（登録商標）プラットフォームシステム）を介して定量化される１１４。
【0018】
図１Ｂ－２は、一部の実施形態によるＤＳＰシステムの例示的なブロック図を示している。示されるように、プロセッサ（たとえば、「ラズベリーパイ（Ｒａｓｐｂｅｒｒｙ Ｐｉ）」、「アルドゥイーノウノ（Ａｒｄｕｉｎｏ Ｕｎｏ）」等）１２０は、カメラ１２２、ＵＶ偏光子を備えたＬＣＤ１２４（たとえば、）、ＵＶ ＬＥＤ １２４ａおよび／またはＵＶ ＬＥＤダイバー（ｄｉｖｅｒ）１２４ｂ、および明視野イメージングに使用される可視ＬＥＤアレイ１２６（たとえば、）と通信（たとえばデジタル通信）している。供給される電力は、ＡＣまたはＤＣのいずれかであってもよく、これは、たとえば、フォトマスキング手段、紫外光源および可視光源、ならびに提供されうる任意のプロセッサおよび通信手段に電力を供給するために、たとえば、システムに電力を供給するための適切な量の電力（たとえば、２５ワット以下）を供給する。したがって、構成要素（たとえば、プロセッサ、ＵＶ ＬＥＤ、ＵＶ ＬＥＤドライバー、可視ＬＥＤアレイ等）は、典型的な標準ＡＣ電源１２８（たとえば、壁コンセントまたは専用電源）、および／またはＤＣ電源（たとえば、１２Ｖ電源１３０）から電力を受け取るように構成することができる。プロセッサは、プロセッサ上で動作可能なコンピュータ命令を含むか、またはそれらにアクセスして、プロセッサにそのようなコンポーネントの一つまたは複数を制御させることができ、モバイルデバイス１３２または他の遠隔コンピューティングデバイス／システム（たとえば、デスクトップ、ラップトップ、サーバー）との間で取得または必要とされる情報を通信するための命令（および必要に応じて、関連するハードウェア、たとえば、ｗｉｆｉ、ブルートゥース、セルラー、有線）も含むことができる。遠隔デバイスは、病理医１３４によってアクセス可能であり、（一部の実施形態による）システムによって実行される結果および／または指示されたプロセスをレビューすることができる。図１Ｂ－２はまた、一部の実施形態（たとえば、電力、制御、インターフェース、および入力／出力）に従って示されている異なるプロセスに関する凡例１３６を含む。この場合も、プロセッサは、調整可能な開口サイズおよび位置を備えたフォトマスクの作成を可能にするグラフィックスサポート、ならびにたとえば黒または暗い色の背景上の４つの白い点４８０または角４８２、白または明るい背景上のシアンの長方形４８４、または黒または暗い背景上の単一ピクセル照明４８６を含む、図４Ｄに示すようなキャリブレーショングリッド（たとえば、パーソナルモバイルデバイスアプリケーション用）を提供するように構成することができる。一部の実施形態では、起動時に、プロセッサは、キャリブレーショングリッドがＬＣＤ上に表示され、座標がＤＳＰ内のプロセッサに送信されるのを待つように構成することができる（たとえば、ブルートゥースを介したペアリング）。受信すると、適切なフォトマスクがＬＣＤに表示され、ユーザーが選択したＲＯＩが強調表示され、バックライトがオフになり、紫外光源が所定の時間、たとえば３分、１分、または３０秒等温になる。
【0019】
したがって、その例が図１Ｄに示されている一部の実施形態では、デジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システム１４０は、ハウジング、および電源、プロセッサ、紫外光源（ＵＶＳ）、たとえば、ＵＶ ＬＥＤ、明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）（たとえば、ＬＣＤバックライト）、紫外光源からの紫外光および／または可視光源からの可視光で組織サンプルを選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段（たとえば、ＬＣＤ）、ならびにたとえばスロット（図示していない）を介して組織を乗せたスライド（ｔｈｅ ｓｌｉｄｅ ｈａｖｉｎｇ ｔｈｅ ｔｉｓｓｕｅ ｔｈｅｒｅｏｎ）の少なくとも一部を中に入れるように構成されたＤＳＰシステム内のチャンバー（たとえば、ハウジング内のチャンバー）（図示していない）のうちの少なくとも一つ、いくつかの実施形態では、複数の、およびさらなる実施形態では、すべてを備え、および含む。
【0020】
図２Ａは、本開示の一部の実施形態によるＤＳＰシステムの少なくとも一部の概略図である。示されるように、システム２００は、対物レンズ２０２、ＬＣＤ２０６、ダイクロイックミラー２０８、ＬＤＣバックライト２１０、ＵＶ ＬＥＤ２１０、および集光レンズ２１２を含む。組織サンプル２０５を含むガラススライド２０４は、イメージングおよび光、ＵＶ、またはその他への曝露のために配置されたシステムの一部に配置される。図示の例では、スライドは、ＬＣＤフォトマスキング手段に隣接してまたはその近くに配置されている。イメージャー、すなわち、カメラ２１６を含むモバイルデバイスは、スライド上の組織をイメージングするようにシステム内に配置される。図２Ｃ－１は、図２Ａに類似しているが、一部の実施形態による、システムの他のコンポーネントの間に特定のコンポーネントが配置される距離の例を含む。したがって、一部の実施形態では、フォトマスキング手段は、好ましくは、組織から所定の距離に配置され、その距離は、組織がピクセルグリッドによって遮られないように構成することができる。所定の距離は、約０．０１～５ｍｍの間、約０．５０～２．５ｍｍの間、約０．７５～２．２５ｍｍの間、または約１～２ｍｍの間であってもよい。さらに、所定の距離は、組織の明確な視覚化を提供するように、および紫外光の拡散を最小限にするように構成することができる。一部の実施形態では、フォトマスキング手段は、たとえば約５０～３００ｎｍの間の照明解像度、約１～５ｃｍ2の間の視野、および／または約１～３倍の間の倍率を提供するように構成されている。
【0021】
図２Ｂは、電圧「オン」２２１および電圧「オフ」２２３を伴う、ＬＣＤフォトマスク／機能２１９の分解図の概略図を示す。したがって、一部の実施形態では、ＬＣＤ２１９は、偏光フィルター２２０、透明電極２２２、液晶２２４、第二の透明電極２２６、第二の偏光フィルター２２８、およびスクリーン２３０を含む。電圧がオンのとき２２１、スクリーンは暗く、最初に受信した非偏光（可視光および／または紫外光）がＬＣＤを通過するのを遮断される。電圧がオフの場合２２３、受信した非偏光はスクリーンを通過することができる。したがって、ＬＣＤの構造、および一つまたは複数のピクセルの「ＯＮ－ＯＦＦ」を介してフォトマスクとして機能し、光を通過および遮断する方法を示す。
【0022】
図２Ａと同様に、図２Ｃ－２、および２Ｃ－３は、一部の実施形態による、ＤＳＰシステムの動作を示し、ＬＤＣ２０６および付随する偏光フィルター２２０、２２８が、ＬＣＤマスキングの作用により、一つまたは複数の選択されたＲＯＩのみをＵＶに曝露することをどのように可能にするかを示す。図２Ｃ－２では、組織のいずれか（ＲＯＩまたはその他）を紫外光に曝露する前のシステムが示されている。これにより、組織を白色ＬＥＤライトで照射することができる（したがって、ユーザーは一つまたは複数のＲＯＩを選択できる）。および図２Ｃ－３は、ＬＣＤマスクの作用による紫外光への選択されたＲＯＩの曝露を示している。具体的には、ＬＤＣ２０６は、組織サンプルのＲＯＩを除くすべてへのＵＶの通過を遮断することができることが分かる。一部の実施形態では、白色ＬＥＤ光を拡散するために拡散器２３２を含めることができることは注目に値する。一部の実施形態では、たとえば（一部の実施形態では）たとえばフォトマスキング手段を使用して、紫外光を減衰させることができる（たとえば、図２Ｄを参照）。
【0023】
一部の実施形態によれば、スライドは、ボックスの上部または側面が（たとえば、ヒンジを介して）開くように、「ボックス」構成を介して、ＤＳＰシステムのチャンバー（および／またはハウジング）に中に入れることができる。スライドは、チャンバー（またはチャンバーを含むハウジング、光学系、および／またはＵＶ／光源）に対して移動可能であってもよく、ここで、チャンバーは、組織のための液体環境で構成され、当技術分野で知られている任意の密閉手段；たとえば、ガスケットによって（スライドを示す図２Ｅ－１～図２Ｅ－５参照）、液体の漏れから遮断することができる（図２Ｅ－１、および一緒に使用することができるガスケット構成；図２Ｅ－２および２Ｅ－３）。そのようなスライドおよびガスケット構成は、たとえば、スライド上の磁気手段２４０Ａ、およびガスケット２３９（ハウジングおよび／またはフレーム内）上の２４０Ｂを利用することができ、ここで、たとえば、磁気的手段は、スライドとガスケットとの間の嵌合取り付けのために、スライドおよびガスケット／ハウジング／フレームの一方および／または他方上で永久的かつ電磁的であってもよい。スライドおよびガスケット構成は、図２Ｅ－３に示されるように、グリッドバリア２４２（一部の実施形態ではガイドとも呼ばれる）等の誘導手段を含んでもよく、スライドおよびガスケット構成の中またはそれらに近接して構成することができ、切断されたオリゴのガイド付きピペッティングを手動または機械／ロボットで可能にする。図２Ｅ－４および２Ｅ－５は、毛細管作用（ならびに流体の分配）によって流体を収集するように構成された毛細管２４３のグリッド２４２の使用を示している。示されるように、グリッドは、システムのコンポーネント、たとえば、ガスケット２３９内に適合するように構成することができる。示されるように、グリッド２４３およびチューブ２４３は、ガスケット２３９に挿入することができる。
【0024】
システムは、パーソナルモバイルコンピューティングデバイス（ＰＭＤ）に動作可能にリンクされた組織、チャンバー、フォトマスキング手段、およびカメラセンサー（たとえば、「電話のカメラ（ｐｈｏｎｅ ｃａｍｅｒａ）」）の少なくとも一つにＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（たとえば、対物レンズを含むレンズ等）も含んでもよい。カメラセンサーが組織をイメージングできるように、ハウジングおよびチャンバーの少なくとも一つは、ＰＭＤへの取り外し可能な取り付けのために構成されている。図３Ａは、一部の実施形態によるシステムの高レベルの外観図を示している（図２Ａと同様）。図３Ｂは、明視野３０２、暗視野３０４、位相勾配３０６Ａ、３０６Ｂ、３Ｄ ３０８、および超解像３１０を含む、一部の実施形態によるＤＳＰシステムの様々な顕微鏡モダリティを実現するために表示することができる様々なパターンを示している。
【0025】
光学的手段は、一部の実施形態では、紫外光源およびＶＬＳ（ただし、一部の実施形態では、そのような構造はまた、光学的手段とは別個であると見なすこともできる）、以下のうち一つまたは複数を含んでもよい： 集光レンズ、走査レンズ、ダイクロイックミラー、フォトマスク手段（以下、および本明細書の他の場所を参照）、対物レンズ、カメラ（たとえば、カメラ付きパーソナルモバイルデバイス等）。光学的手段は、一部の実施形態では、紫外光源からの紫外光、ＶＬＳからの可視光、またはＬＣＤバックライトからの可視光または白色光で組織サンプルを照射するように構成される。ダイクロイックミラーは、複数の光源（たとえば、２つの光源）から光学軸（一部の実施形態では、単一の光学軸）への光の方向転換を可能にするように構成されているため、ユーザーが決定した場所でのみサンプルに到達する。
【0026】
上記の一部の実施形態によれば、フォトマスキング手段は、以下のうちの少なくとも一つを含んでもよい： ＬＣＤ（たとえば図２Ａに示すように、バックライトを含んでもよい）、関心領域（ＲＯＩ）でのみ組織に到達するようにＵＶおよび可視光または白色光の少なくとも一つを構造化するようにプログラム可能な開口部として構成されたＬＣＤ、デジタルマイクロミラーデバイス（ＤＭＤ）、液晶オンシリコン（ＬＣｏＳ）ディスプレイ、有機発光ダイオード（ＯＬＥＤ）、マイクロ発光ダイオード（μＬＥＤ）アレイ、光ファイバー束、液晶ディスプレイ（ＬＣＤ）、スキャニングレーザー、および物的障壁（ｐｈｙｓｉｃａｌ ｂａｒｒｉｅｒ）。
【0027】
図４Ａおよび４Ｂは、一部の実施形態によるＤＳＰシステムに対応し、図２Ａおよび２Ｂのものと同様であるが、デジタルマイクロミラーデバイス（ＤＭＤ／液晶オンシリコン（ＬＣｏＳ））、反射マスク構造および操作を示し、フォトマスキング手段の形態に対応する。ＤＭＤは、典型的には、その表面上に、フォトマスキングに使用される「ピクセル」に対応するアレイ（たとえば、長方形）に配置された多数（たとえば、数十万）の顕微鏡ミラー（ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｉｃ ｍｉｒｒｏｒ）を有するチップである。ミラーは、オンまたはオフの状態に個別に回転させることができる（たとえば、±１０～１２°）。オン状態では、光源からの光がレンズに反射され（ピクセルが明るく見えるようになる）、オフ状態では、光が他の場所（たとえばヒートシンク）に向けられ、ピクセルが暗く見えるようになる。したがって、示されるように、組織４０５を備えた組織スライド４０３をシステム内に配置し、ここでレンズ４０７およびダイクロイックミラー４０７を介して白色光４１０で照射することができる。ＤＭＤ／ＬＣｏＳ４２０は、マスキングを実行して、紫外光４１４をスライド４０３上の組織サンプル４０５ａ内の特定のＲＯＩ ４０３ｂに向ける。図４Ｂ－１および４Ｂ－２は、ＤＭＤ／ＬＣｏＳコンポーネント（たとえば、独立して移動可能なマイクロミラー４５０、副鏡４５２およびシリコンチップ４５４）の機能を示す。
【0028】
一部の実施形態によるＤＳＰシステムに対応する図４Ｃは、図４Ａおよび４Ｂのものと同様であるが、さらに別の形態のフォトマスキング手段に対応する走査型レーザーシステム４３８を利用する。走査型レーザーは、典型的には、ＸＹ検流計ミラー４４４等の可動ミラーを含み、たとえば走査レンズ４４０を介して（そして次にダイクロイックミラー４０８、カメラ４１６、レンズ４０２、スライド４０３、組織４０５ａ、一方ＬＥＤ４１０、およびレンズ４０７の他の記載されるコンポーネントを介して）レーザー４４２からのレーザービームを少なくとも二次元に向けることができる。走査は、ラスター走査またはベクトル操作の形式で行うことができる。走査するとき、走査型レーザーは、フォトマスキングに使用される「ピクセル」に対応する、照射される組織のその部分にのみ向けられる。
【0029】
一部の実施形態による、ＤＳＰのハウジング／フレーム構造は、たとえば、以下のうちの一つまたは複数を含む、複数のコンポーネントを含んでもよい： 足場、ＰＭＤフレーム、対物レンズフレーム、スライドフレーム、フォトマスキングフレーム、集光フレーム（ｃｏｎｄｅｎｓｅｒ ｆｒａｍｅ）、および、一部の実施形態では、少なくとも一つの熱管理手段。図５Ａ～Ｅは、ＤＳＰの様々な足場およびフレームを示している（たとえば、ハウジングを形成するか、一緒にハウジングであってもよい）： 図５Ａ－１、５Ａ－２ －集光レンズを収納するための集光フレーム； 図５Ｂ－１および５Ｂ－２ －フォトマスキング手段（たとえばＬＣＤ）を保持するためのＬＣＤ、ダイクロイック、バックライトフレーム； 図５Ｂ－３ －ＬＣＤおよびレンズ（たとえばダイクロイック）を保持するためのハウジング／フレーム； 図５Ｂ－４ －コントローラーおよびレンズ（たとえばダイクロイック）を備えたＬＣＤを保持するためのハウジング／フレーム； 図５Ｃ －ハウジング／チャンバーに対してＰＭＤを保持するためのＰＭＤおよび／または対物フレーム； 図５Ｄ －様々な用途の足場（たとえば、ハウジング／チャンバーの支持物）；および 図５Ｅ －スロットを介してチャンバーが収容するスライドを保持するためのスライドフレーム。ハウジングは、それぞれが異なる対物レンズおよび対応する倍率を有する、複数の対物レンズフレームの単一の対物レンズフレームを取り外し可能に収容するように構成されていてもよい。各対物レンズフレームは、カメラセンサーとは異なる間隔を提供するように構成でき、別のフレームと簡単に交換できる。フレーム、サポート、足場等のそのような例。図５Ｆは、様々なフレームおよび足場を使用して構築されたＤＳＰシステムの斜視図である。
【0030】
ヒートシンク、ヒートポンプ、ファン、液体冷却システム、およびペルチェデバイスのうちの少なくとも１つを含むことができるＤＳＰシステムの一部の実施形態には、熱管理手段を含めることができる。図６は、一部の実施形態による、ＤＳＰの熱管理のための例示的な回路を示しており、これは、アナログ－デジタル変換（たとえば、Ａｒｄｕｉｎｏ ＡＤＣ）を介してプロセッサに動作可能に接続することができる。熱管理手段はまた、複数のヒートシンククリップを含んでもよい。
【0031】
一部の実施形態では、ソフトウェアアプリケーション（たとえば、モバイルアプリケーション）が含まれ、プロセッサ上で動作し、ＰＭＤに、組織スライドのカメラセンサーを介して取得されてＰＭＤのディスプレイに表示される組織像の関心領域（ＲＯＩ）を選択するためのユーザー入力を受信するように構成されていてもよいグラフィカルユーザーインターフェイス（ＧＵＩ）を表示するように構成されていてもよい。図７Ａ～Ｂは、一部の実施形態によるＧＵＩのスクリーンショットの例を示している。一部の実施形態では、モバイルアプリケーションは、たとえば、ＬＣＤの機能的キャリブレーションを提供するように構成される。たとえば、ＬＣＤに表示される照明の複数（たとえば、正方形／長方形の４つのコーナー）のピクセルをユーザーが選択して（たとえば、ＧＵＩを使用して）、４つのコーナー内の位置としてＲＯＩを確立できる（ｘおよびｙの比率）； たとえば、図７Ａ～Ｂの左側の画像を参照（たとえば、ＬＣＤのキャリブレーションスキームについては図４Ｄも参照）。アプリケーションは、画像上の場所の記録を含む、選択したＲＯＩを表示することもできる。また、ＲＯＩを変更したり、間違いがあった場合にすぐに再選択したり、サイズを拡大または縮小したりすることもできる。
【0032】
図７Ｃは、一部の実施形態による例示的なソフトウェアアプリケーションのスクリーンショットの例を示している。図の左上から始まり、左から右、次に下、左から右に進むと、モバイルアプリケーションのＧＵＩにより、（タッチスクリーンを介して）「開始」ボタンを押し、関心領域を選択することにより、組織をイメージングするプロセスが可能になる（組織を乗せたスライドをチャンバーに入れた後）。その後、組織がイメージングされ、そのようなものは、画像キャプチャ中に組織サンプルに可視光を提供するようにＶＬＳを制御することを含む。その後、画像は、たとえば、ＬＣＤ上の少なくとも一つ（および好ましくは複数）のマーカー（すなわち、フォトマスキング手段）を使用してキャリブレーションされる。
【0033】
次に、たとえば、ユーザーがタッチスクリーンを介してＲＯＩを選択し、アプリケーションを操作するＰＭＤがＤＳＰ（たとえばブルートゥース）にペアリング／接続される。その後、ＲＯＩの座標がＤＳＰに送信され、ＵＶ照射が開始され、光切断可能なリンカーを介して抗体に結合したオリゴが切断される。
【0034】
図７Ｄ－１～７Ｄ－７は、一部の実施形態によるＧＵＩ／ソフトウェアアプリケーションのスクリーンショットの例に対応する：
－図７Ｄ－１： ＧＵＩのスタートのスクリーンショット；
－図７Ｄ－２： コーナー選択の確認のスクリーンショット；
－図７Ｄ－３： ＲＯＩの確認のスクリーンショット；
－図７Ｄ－４： 新しい座標の選択および座標の送信のスクリーンショット；
－図７Ｄ－５： 選択したＲＯＩの照射の開始のスクリーンショット；
－図７Ｄ－６： 正しいＲＯＩ位置の確認および／または（実施形態に応じて）のスクリーンショット；
－図７Ｄ－７： ＲＯＩイメージングの完了および次のＲＯＩへの継続のスクリーンショット。
－図７Ｄ－１： ＧＵＩのスタートのスクリーンショット；
－図７Ｄ－２： コーナー選択の確認のスクリーンショット；
－図７Ｄ－３： ＲＯＩの確認のスクリーンショット；
－図７Ｄ－４： 新しい座標の選択および座標の送信のスクリーンショット；
－図７Ｄ－５： 選択したＲＯＩの照射の開始のスクリーンショット；
－図７Ｄ－６： 正しいＲＯＩ位置の確認および／または（実施形態に応じて）のスクリーンショット；
－図７Ｄ－７： ＲＯＩイメージングの完了および次のＲＯＩへの継続のスクリーンショット。
【0035】
一部の実施形態では、構造および関連する構造は、スライド上の組織との間で流体を伝達するために提供される。たとえば、図８Ａに示すように、切断されたオリゴは吸引され、これは、手動で、または機械／ロボットを介して、ピペッティングを介して行うことができる。これは、組織サンプル／スライド（および／またはチャンバーの一部として、たとえば、その少なくとも一部として）の上に設けられた開口部／穴を介して、または、たとえば、フローセルを介して行うことができる。誘導手段は、スライド上の組織から流体を伝達するための毛細管手段を含む、スライドおよびガスケット構成内またはそれに近接して構成することができる（たとえば、図２Ｅ－４、２Ｅ－５を参照）。図９Ａ～Ｃは、そのような開口部、他の構造、構成、および／またはそれに関連する関連データの例示的なパターンを示している。そのような流体関連の構造および／または機能はまた、スライドへのおよび／またはスライドからの溶液の流れ（たとえば、緩衝液の供給）を提供するように構成されたポンプシステムを含んでもよい。切断されたオリゴは、図８に示すように、グリッドバリア等の誘導手段を介してピペッティングすることにより、手動または機械／ロボットで吸引することができる。誘導手段は、図２Ｅ－３に示すように、スライドおよびガスケット構成内またはその近くに構成することができる。
【0036】
図１０Ａ～１０Ｆ－４は、本開示の一部の実施形態による、スライドおよび／またはアッセイ（たとえば、９６ウェルプレート）への／からの流体輸送の例を示している。たとえば、図１０Ａは、スライド（たとえば）から流体（たとえば、オリゴ）を回収するためのピペットガイド１００５を示している。ガイドの斜視図を図１０Ｂに、ならびに上面図を図１０Ｃに示している。ポイント１０１０は、ピペットを正確な位置に誘導するための、ＲＯＩの上の対応するアレイ穴を照らすＬＣＤ「開口部」からのバックライトを示している。たとえば、図１０Ｅ－１～１０Ｅ－３は、サンプルを白色光／可視光に曝露して決定されたＲＯＩを視覚化すること（図１０Ｅ－１）、ガイドを挿入すること、およびＲＯＩの一を特定すること（図１０Ｅ－２）、および次にピペットを挿入してサンプルを取り出すことを含む、サンプルを収集するための例示的な手段を示している。これはＲＯＩごとに繰り返される。
【0037】
図１０Ｆ－１は、サンプル１０３０上のガイド１０２０を備えたマイクロキャピラリーアレイ（たとえば、９６ウェルフォーマット）１０１０を示す。図１０Ｆ－２は、サンプルの上でマイクロキャピラリーアレイを使用できる開口部／穴の数を示している。図１０Ｆ－３は、一つまたは複数の毛細管の上部での気密キャップ（たとえば）１０４０の使用を示しており、これは、熱によって除去できる薄いパラフィルム層、光分解性材料のプラグ、および／またはマイクロ流体バルブであってもよい。図１０Ｆ－４は、一つまたは複数の毛細管の底部でのプラグ１０５０の使用を示し、これは、一部の実施形態において、毛細管作用を比較的短い時間（たとえば、数秒以下）だけ遅らせるために使用することができ、これは、ＵＶ照射中に液体／サンプルの吸引が発生しないが、その後すぐに開始できるように機能することが可能である。そのようなプラグは、可溶性材料（たとえば、塩、糖）の層、および光分解性層（たとえば、ＵＶ分解性）のうちの少なくとも一つを含んでもよい。
【0038】
様々な本発明の実施形態が本明細書に記載および図示されているが、当業者は、開示された機能を実行し、および／または結果および／または本明細書に記載の一つまたは複数の利点を得るための他の様々な手段、機能、工程、および／または構造（ソフトウェアコードを含む）を容易に想像するであろう。そのような変形および／または改変のそれぞれは、本明細書に記載の本発明の実施形態の範囲内であると見なされる。より一般的には、当業者は、本明細書に記載のすべてのパラメータおよび構成が例示を意図するものであり、実際のパラメータおよび構成が、本発明の教示が使用される特定の用途に依存することを容易に理解するであろう。当業者は、本明細書に記載の特定の本発明の実施形態と多くの同等物を認識し、または日常的な実験のみを使用して確認することができるであろう。したがって、前述の実施形態は例としてのみ提示され、本開示およびその同等物によってサポートされる任意の特許請求の範囲内で、本発明の実施形態は、具体的に記載およびクレームされる以外の方法で実施することができることが理解されるべきである。本開示の発明の実施形態は、本明細書に記載の個々の特徴、システム、装置、デバイス、工程、コード、機能、および／または方法のそれぞれを対象としている。さらに、２つ以上のそのような特徴、システム、装置、デバイス、工程、コード、機能、および／または方法の任意の組み合わせ（そのような特徴、システム、装置、デバイス、工程、コード、機能、および／または方法が相互に矛盾しない）が、本開示の本発明の範囲に含まれる。さらなる実施形態は、一つまたは複数の特徴／機能／工程を具体的に欠くことにより、先行技術に対して特許を受けることができる（すなわち、そのような実施形態を対象とする請求項は、そのような請求項を先行技術から区別するための一つまたは複数の負の制限を含んでもよい）。
【0039】
本開示の上記の実施形態は、多くの方法のいずれかで実施することができる。たとえば、一部の実施形態は、ハードウェア、ソフトウェア、またはそれらの組み合わせを使用して（たとえば、記載されているように）実装されうる。一実施形態のいずれかの態様が少なくとも部分的にソフトウェアに実装される場合、ソフトウェアコードは、単一のコンピュータで提供されるか複数のコンピュータに分散されるかにかかわらず、任意の好適なプロセッサまたはプロセッサの集合、サーバー等で実行することができる。
【0040】
この点に関して、本明細書に開示される様々な実施形態は、少なくとも部分的に、一つまたは複数のコンピュータまたは他のプロセッサ上で実行されると、上記の技術の様々な実施形態を実施する方法を実行する一つまたは複数のプログラムでコードされたコンピュータ可読記憶媒体（または複数のコンピュータ可読記憶媒体）（たとえば、コンピュータメモリ、一つまたは複数のフロッピーディスク、コンパクトディスク、光ディスク、磁気テープ、フラッシュメモリー、フィールドプログラマブルゲートアレイまたは他の半導体デバイスの回路構成、または他の有形のコンピュータ記憶媒体または非一時的媒体）として少なくとも部分的に具体化されうる。コンピュータ可読媒体（単数または複数）は、その上に格納された一つまたは複数のプログラムを一つまたは複数の異なるコンピュータまたは他のプロセッサにロードして、上記のように本技術の様々な態様を実装できるように、移送可能であってもよい。
【0041】
用語「プログラム」、「ソフトウェア」、「コード」、または「ソフトウェアコード」は、本明細書では、一般的な意味で使用され、上記で説明した本技術の様々な態様を実装するためにコンピュータまたは他のプロセッサをプログラムするために使用することができる任意のタイプのコンピュータコードまたはコンピュータ実行可能命令のセットを指す。さらに、この実施形態の一態様によれば、実行されたときに本技術の方法を実行する一つまたは複数のコンピュータプログラムは、単一のコンピュータまたはプロセッサ上に存在する必要はないが、ネットワーク上および／またはネットワーク上で（ｏｎ ａｎｄ／ｏｒ ｏｖｅｒ ａ ｎｅｔｗｏｒｋ）本技術の様々な態様を実装するために、多数の異なるコンピュータまたはプロセッサ間でモジュール方式で分散されうることを理解されたい。
【0042】
コンピュータ実行可能命令は、一つまたは複数のコンピュータまたは他のデバイスによって実行される、プログラムモジュールまたはコンテナ等の多くの形態であってもよい。一般に、プログラムモジュールは、特定のタスクを実行したり、特定の抽象データ型を実装したりするルーチン、プログラム、オブジェクト、コンポーネント、データ構造等を含む。典型的には、プログラムモジュールの機能は、様々な実施形態において所望されるように組み合わされ、または分散することができる。
【0043】
本出願内で提示される、特許、特許出願、記事、ウェブページ、本等を含むがこれらに限定されない刊行物または他の文書へのすべての参照は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。さらに、本明細書で定義および使用されるすべての定義は、辞書の定義、参照により組み込まれる文書内の定義、および／または定義された用語の通常の意味を制御するように理解されるべきである。
【0044】
本明細書および特許請求の範囲で使用される「および／または」という句は、そのように結合された要素、すなわち、場合によっては結合的に存在し、他の場合には分離的に存在する要素の「いずれかまたは両方」を意味すると理解されるべきである。「および／または」で列挙された複数の要素は、同じ方法で解釈する必要がある。つまり、そのように結合された要素の「一つまたは複数」である。「および／または」節によって具体的に識別される要素以外の他の要素が、具体的に識別される要素に関連するかどうかにかかわらず、任意選択で存在しうる。したがって、非限定的な例として、「Ａおよび／またはＢ」への言及は、「含む」等の制限のない言語と組み合わせて使用される場合、一つの実施形態では、Ａのみ（任意選択で、 Ｂ以外の要素を含む）；別の実施形態では、Ｂのみ（任意選択でＡ以外の要素を含む）；さらに別の実施形態では、ＡおよびＢの両方（任意選択で他の要素を含む）；等を指してもよい。
【0045】
本明細書および特許請求の範囲で使用される場合、「または」は、上記で定義された「および／または」と同じ意味を有すると理解されるべきである。たとえば、リスト内の項目を区切る場合、「または」または「および／または」は包括的であると解釈されるものとする。すなわち、要素の数またはリストの少なくとも一つを含むが、複数も含み、任意選択で追加の列挙されていない項目も含むと解される。「ただ一つ」または「正確に一つ」等、または特許請求の範囲で使用される場合は「からなる」等、反対に明確に示される用語のみが、多数の要素または要素のリストのうちの正確に一つの要素を含むことを指す。一般に、本明細書で使用される用語「または」は、「どちらか」、「一方」、「ただ一つ」、または「正確に一つ」等の排他的な用語が先行する場合にのみ、排他的代替（すなわち、一方または他方、しかし両方ではない）を示すものとして解釈される。「本質的にからなる」は、特許請求の範囲で使用する場合、特許法の分野で使用される通常の意味を有するものとする。
【0046】
本明細書および特許請求の範囲で使用される場合、一つまたは複数の要素の列挙に関連する「少なくとも一つ」という句は、要素の列挙の中の任意の一つまたは複数の要素から選択される少なくとも一つの要素を意味すると理解されるべきであるが、必ずしも要素の列挙の中の具体的に列挙されているすべての要素の少なくとも一つを含む必要はなく要素の列挙内の要素の任意の組み合わせを除外するものではない。この定義はまた、「少なくとも一つ」という句が言及する要素の列挙内で具体的に識別される要素以外の要素が、具体的に特定された要素に関連するかどうかにかかわらず、任意選択で存在することを可能にする。したがって、非限定的な例として、「ＡおよびＢの少なくとも一つ」（または、同等に、「ＡまたはＢの少なくとも一つ」、または同等に「Ａおよび／またはＢの少なくとも一つ」）は、一つの実施形態では、少なくとも一つ、任意選択で２つ以上のＡを含み、Ｂが存在しない（および任意選択でＢ以外の要素を含む）；別の実施形態では、Ｂのみ（任意選択でＡ以外の要素を含む）；さらに別の実施形態では、ＡおよびＢの両方（任意選択で他の要素を含む）；等を指してもよい。
【0047】
特許請求の範囲、ならびに上記の明細書において、「含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」、「含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」、「運ぶ」、「有する」、「含む（ｃｏｎｔａｉｎｉｎｇ）」、「関与する」、「保持する」、「構成される（ｃｏｍｐｏｓｅｄ ｏｆ）」等のすべての移行句は、制限がない、すなわち含むがこれに限定されないことを意味すると理解するべきである。米国特許庁の特許審査便覧のセクション２１１１．０３に記載されているように、移行句「からなる」および「本質的にからなる」のみが、それぞれクローズドまたはセミクローズドな移行句であるものとする。
【図1A】
【図1B-1】
【図1B-2】
【図1C】
【図1D】
【図2A】
【図2B】
【図2C-1】
【図2C-2】
【図2C-3】
【図2D】
【図2E-1】
【図2E-2】
【図2E-3】
【図2E-4】
【図2E-5】
【図3A】
【図3B】
【図4A-4B】
【図4C】
【図4D】
【図5A-1】
【図5B-1】
【図5B-2】
【図5B-3】
【図5B-4】
【図5C】
【図5D】
【図5E】
【図5F】
【図6】
【図7A】
【図7B】
【図7C】
【図7D-1】
【図7D-2】
【図7D-3】
【図8】
【図9A】
【図9B】
【図9C】
【図10-1】
【図10-2】
【図10-3】
【図10-4】
【手続補正書】
【提出日】2024-07-16
【手続補正1】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項1】
デジタル空間プロファイリング（ＤＳＰ）システムであって、前記ＤＳＰの少なくとも一つのコンポーネントを収容する（ｃｏｎｔａｉｎ）ためのハウジングまたは他の構造を含み、前記ハウジングまたは他の構造が：
電源；
紫外線（ＵＶ）光源（ＵＶＳ）；
明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）；
組織サンプルを乗せたスライドの少なくとも一部を中に入れる（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成されたスロットを備えるチャンバー；
ユーザーインターフェースおよびカメラセンサーを備えるパーソナルモバイルコンピューティングデバイス（ＰＭＤ）であって、チャンバー内のスライド上の前記組織サンプルを画像化するためにチャンバーに対して配置されるＰＭＤ；
前記ＵＶＳからの紫外光（ＵＶ ｌｉｇｈｔ）および／または前記ＶＬＳからの可視光で前記組織サンプルを選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段；
前記組織サンプル、前記チャンバー、前記フォトマスキング手段、および前記カメラセンサーの少なくとも一つに前記ＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（ｏｐｔｉｃ ｍｅａｎｓ）；および
前記カメラセンサーを介して前記組織サンプルの画像を取得し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの前記画像を表示し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの関心領域（ＲＯＩ）に関するユーザー入力を受信し、および
前記フォトマスキング手段を使用して、前記ＲＯＩをＵＶ光で照射するように構成された処理回路
を含み、
ここで前記ＰＭＤが前記ハウジングおよび／または前記チャンバーに取り外し可能に取り付けられている、ＤＳＰシステム。
電源；
紫外線（ＵＶ）光源（ＵＶＳ）；
明視野イメージングのための可視光源（ＶＬＳ）；
組織サンプルを乗せたスライドの少なくとも一部を中に入れる（ｒｅｃｅｉｖｅ）ように構成されたスロットを備えるチャンバー；
ユーザーインターフェースおよびカメラセンサーを備えるパーソナルモバイルコンピューティングデバイス（ＰＭＤ）であって、チャンバー内のスライド上の前記組織サンプルを画像化するためにチャンバーに対して配置されるＰＭＤ；
前記ＵＶＳからの紫外光（ＵＶ ｌｉｇｈｔ）および／または前記ＶＬＳからの可視光で前記組織サンプルを選択的に照射するように構成されたフォトマスキング手段；
前記組織サンプル、前記チャンバー、前記フォトマスキング手段、および前記カメラセンサーの少なくとも一つに前記ＵＶＳおよび／またはＶＬＳの少なくとも一つを向けおよび／または集束するように構成された光学的手段（ｏｐｔｉｃ ｍｅａｎｓ）；および
前記カメラセンサーを介して前記組織サンプルの画像を取得し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの前記画像を表示し、
前記ＰＭＤのユーザーインターフェースを介して、前記組織サンプルの関心領域（ＲＯＩ）に関するユーザー入力を受信し、および
前記フォトマスキング手段を使用して、前記ＲＯＩをＵＶ光で照射するように構成された処理回路
を含み、
ここで前記ＰＭＤが前記ハウジングおよび／または前記チャンバーに取り外し可能に取り付けられている、ＤＳＰシステム。