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▶ センター フォー ヴァイロロジー， ヴァクシノロジー アンド セラピューティクス リミテッドの特許一覧
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2024156641
(43)【公開日】2024-11-06
(54)【発明の名称】リボ核タンパク質ナノ複合体ワクチン及びその使用
(51)【国際特許分類】
A61K 39/12 20060101AFI20241029BHJP
A61K 39/215 20060101ALI20241029BHJP
A61K 39/145 20060101ALI20241029BHJP
A61K 39/29 20060101ALI20241029BHJP
A61P 37/04 20060101ALI20241029BHJP
A61P 31/12 20060101ALI20241029BHJP
A61P 31/16 20060101ALI20241029BHJP
A61P 31/14 20060101ALI20241029BHJP
A61K 47/64 20170101ALI20241029BHJP
C12N 15/50 20060101ALI20241029BHJP
C07K 14/165 20060101ALI20241029BHJP
【ＦＩ】
A61K39/12
A61K39/215
A61K39/145
A61K39/29
A61P37/04
A61P31/12
A61P31/16
A61P31/14
A61K47/64
C12N15/50 ZNA
C07K14/165
【審査請求】未請求
【請求項の数】53
【出願形態】ＯＬ
【外国語出願】
(21)【出願番号】P 2024070290
(22)【出願日】2024-04-24
(31)【優先権主張番号】63/497,895
(32)【優先日】2023-04-24
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(71)【出願人】
【識別番号】524158036
【氏名又は名称】センター フォー ヴァイロロジー， ヴァクシノロジー アンド セラピューティクス リミテッド
(74)【代理人】
【識別番号】100078282
【弁理士】
【氏名又は名称】山本 秀策
(74)【代理人】
【識別番号】100113413
【弁理士】
【氏名又は名称】森下 夏樹
(74)【代理人】
【識別番号】100181674
【弁理士】
【氏名又は名称】飯田 貴敏
(74)【代理人】
【識別番号】100181641
【弁理士】
【氏名又は名称】石川 大輔
(74)【代理人】
【識別番号】230113332
【弁護士】
【氏名又は名称】山本 健策
(72)【発明者】
【氏名】コク キン ハン
(72)【発明者】
【氏名】ラム ジョイ ヤン
(72)【発明者】
【氏名】ユエン クォク ユン
【テーマコード（参考）】
4C076
4C085
4H045
【Ｆターム（参考）】
4C076AA99
4C076BB01
4C076BB21
4C076BB25
4C076CC06
4C076EE41
4C076EE59
4C085AA03
4C085BA55
4C085BA71
4C085BA92
4C085EE01
4C085GG08
4C085GG10
4H045AA11
4H045AA30
4H045BA50
4H045BA54
4H045CA01
4H045CA02
4H045DA86
4H045EA31
(57)【要約】
【課題】アダプタ－抗原ポリペプチドと、ウイルスＲＮＡ足場と、を含む複合体を特異的に含有するワクチン組成物を提供すること。
【解決手段】本発明はさらに、医薬組成物の調製のためのワクチンの使用、ウイルス感染を治療または防止する方法、及びワクチンを含むキットに関する。一態様では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、約５：１を超え、例えば、６：１、７：１、８：１、９：１、または１０：１うちのいずれか以上である。
【選択図】なし
【解決手段】本発明はさらに、医薬組成物の調製のためのワクチンの使用、ウイルス感染を治療または防止する方法、及びワクチンを含むキットに関する。一態様では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、約５：１を超え、例えば、６：１、７：１、８：１、９：１、または１０：１うちのいずれか以上である。
【選択図】なし
【特許請求の範囲】
【請求項1】
ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、前記ナノ複合体が、ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、前記ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、前記ワクチン組成物。
【請求項2】
前記アダプタ－抗原ポリペプチド対前記足場分子のモル比が、約５：１超である、請求項１に記載のワクチン組成物。
【請求項3】
前記ウイルス抗原が、抗原ポリペプチドである、請求項１または２に記載のワクチン組成物。
【請求項4】
前記ウイルス抗原が、免疫原性タンパク質である、請求項１または２に記載のワクチン組成物。
【請求項5】
前記ウイルス抗原が、前記ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している、請求項１～４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項6】
前記ウイルス抗原が、前記ウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している、請求項１～４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項7】
前記ウイルスＲＮＡが、ウイルスゲノムの非翻訳領域を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項8】
前記ウイルスＲＮＡが、前記ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域を含む、請求項７に記載のワクチン組成物。
【請求項9】
前記ウイルスＲＮＡが、約１０～約５００ヌクレオチド長である、請求項１～８のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項10】
前記ウイルスＲＮＡが、約２００～約５００ヌクレオチド長である、請求項９に記載のワクチン組成物。
【請求項11】
前記ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、請求項１～１０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項12】
前記ウイルスＲＮＡが、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む、請求項１１に記載のワクチン組成物。
【請求項13】
前記ウイルスＲＮＡが、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）に由来する、請求項１～１０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項14】
前記ウイルスＲＮＡが、配列番号３０に記載のＩＡＶゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む、請求項１３に記載のワクチン組成物。
【請求項15】
前記ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、請求項１～１４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項16】
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質が、配列番号１２のアミノ酸配列を含む、請求項１５に記載のワクチン組成物。
【請求項17】
前記ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶに由来する、請求項１～１４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項18】
前記ウイルス核タンパク質が、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する、請求項１７に記載のワクチン組成物。
【請求項19】
前記ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１に由来するウイルス核タンパク質が、配列番号１３のアミノ酸配列を含む、請求項１７または１８に記載のワクチン組成物。
【請求項20】
前記ウイルス核タンパク質及び前記ウイルス抗原が、同じウイルスに由来する、請求項１～１９のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項21】
前記ウイルス核タンパク質及び前記ウイルス抗原が、異なるウイルスに由来する、請求項１～１９のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項22】
前記ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項23】
前記ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項２２に記載のワクチン組成物。
【請求項24】
前記ウイルス抗原が、受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）を含む、請求項２３に記載のワクチン組成物。
【請求項25】
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原が、配列番号１４または１５のアミノ酸配列を含む、請求項２３または２４に記載のワクチン組成物。
【請求項26】
前記ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項27】
前記ウイルス抗原が、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項２６に記載のワクチン組成物。
【請求項28】
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＩＡＶまたはインフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）に由来する、請求項２６または２７に記載のワクチン組成物。
【請求項29】
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する、請求項２８に記載のワクチン組成物。
【請求項30】
前記ＩＡＶウイルス抗原が、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項２９に記載のワクチン組成物。
【請求項31】
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａのＩＢＶサブタイプに由来する、請求項２８に記載のワクチン組成物。
【請求項32】
前記ＩＢＶウイルス抗原が、配列番号１９または２０のアミノ酸配列を含む、請求項３１に記載のワクチン組成物。
【請求項33】
前記ウイルス抗原が、呼吸器合胞体ウイルス（「ＲＳＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項34】
前記ウイルス抗原が、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項３３に記載のワクチン組成物。
【請求項35】
前記ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＲＳＶ ＡサブタイプまたはＲＳＶ Ｂサブタイプに由来する、請求項３４に記載のワクチン組成物。
【請求項36】
前記ＲＳＶウイルス抗原が、配列番号２１または２２のアミノ酸配列を含む、請求項３４または３５に記載のワクチン組成物。
【請求項37】
前記ウイルス抗原が、Ｃ型肝炎ウイルス（「ＨＣＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項38】
前記ウイルス抗原が、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、請求項３７に記載のワクチン組成物。
【請求項39】
前記ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＨＣＶ遺伝子型１ａまたはＨＣＶ遺伝子型２ａに由来する、請求項３８に記載のワクチン組成物。
【請求項40】
前記ＨＣＶウイルス抗原が、配列番号２３または２４のアミノ酸配列を含む、請求項３８または３９に記載のワクチン組成物。
【請求項41】
前記アダプタ－抗原ポリペプチドが、配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、請求項１～４０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項42】
前記ワクチン組成物中の前記ナノ複合体が、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する、請求項１～４１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項43】
前記ワクチン組成物中の前記ナノ複合体が、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する、請求項１～４２のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
【請求項44】
個体におけるウイルス感染を防止する方法であって、前記個体に、有効量の請求項１～４３のいずれか１項に記載のワクチン組成物を投与することを含む、前記方法。
【請求項45】
前記ワクチン組成物が、鼻腔内または皮内投与によって投与される、請求項４４に記載の方法。
【請求項46】
前記ワクチン組成物が、初回用量で、続いて１回または２回のブースター用量で投与される、請求項４４または４５に記載の方法。
【請求項47】
前記初回用量及び前記１回または２回のブースター用量が、約７日から約２１日間隔で投与される、請求項４６に記載の方法。
【請求項48】
前記初回用量及び前記１回または２回のブースター用量が、約１４日間隔で投与される、請求項４７に記載の方法。
【請求項49】
前記初回用量及び第１のブースター用量、ならびに前記第１のブースター用量及び第２のブースター用量が、約７～約２１日間隔、任意選択的に約１４日間隔で投与される、請求項４６～４８のいずれか１項に記載の方法。
【請求項50】
前記ワクチン組成物が、同じウイルス種の一部である２つ以上のウイルスサブタイプに対するヘテロサブタイプ保護を提供する、請求項４４～４９のいずれか１項に記載の方法。
【請求項51】
前記方法が、異なるウイルス属からの２つ以上のウイルスによるウイルス感染を防止する、請求項４４～５０のいずれか１項に記載の方法。
【請求項52】
（ｉ）前記２つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉ）前記２つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものである、請求項５１に記載の方法。
（ｉｉ）前記２つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものである、請求項５１に記載の方法。
【請求項53】
前記方法が、３つ以上のウイルス種によるウイルス感染を防止し、
（ｉ）前記３つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、
（ｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、（ａ）同じウイルス種からのものである２つ以上のウイルスサブタイプまたは亜種、及び（ｂ）前記（ａ）のウイルスとは異なるウイルスファミリーからのものである１つ以上のウイルス種を含む、請求項５１または５２に記載の方法。
（ｉ）前記３つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、
（ｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、（ａ）同じウイルス種からのものである２つ以上のウイルスサブタイプまたは亜種、及び（ｂ）前記（ａ）のウイルスとは異なるウイルスファミリーからのものである１つ以上のウイルス種を含む、請求項５１または５２に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願の相互参照
本出願は、２０２３年４月２４日出願の米国仮特許出願第６３／４９７，８９５号の優先権の利益を主張するものであり、その内容全体は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
本出願は、２０２３年４月２４日出願の米国仮特許出願第６３／４９７，８９５号の優先権の利益を主張するものであり、その内容全体は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0002】
電子配列表への参照
電子配列表の内容（２５３３２２０００３４２ｓｅｑｌｉｓｔ．ｘｍｌ、サイズ：７５，６４３バイト、及び作成日：２０２４年４月１９日）は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
電子配列表の内容（２５３３２２０００３４２ｓｅｑｌｉｓｔ．ｘｍｌ、サイズ：７５，６４３バイト、及び作成日：２０２４年４月１９日）は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0003】
本発明は、アダプタ－抗原ポリペプチドと、核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）と、を含む複合体を含む、ワクチン組成物に関する。さらに、本明細書で提供されるのは、ワクチンを含む医薬組成物、ワクチンを使用してウイルス感染を防止または改善する方法、それを作製する方法、及びワクチンを含むキットである。本発明は、アダプタ－抗原ポリペプチドと、ウイルスＲＮＡ足場と、を含む複合体を特異的に含有するワクチン組成物に関する。本発明はさらに、医薬組成物の調製のためのワクチンの使用、ウイルス感染を治療または防止する方法、及びワクチンを含むキットに関する。
【背景技術】
【0004】
ワクチンは、特定の病原体に対するヒトなどの個体内の防御免疫応答を刺激するように作用するので、後にその病原体に感染した場合、免疫系は、感染が体内に広がり、疾患を引き起こすことを迅速に防止することができる。この方式において、ワクチンは、病気を引き起こすことなく自然感染を模倣する。従来、ワクチンは、筋肉内注射によって投与される。しかしながら、この投与方法は、ウイルス感染によって影響を受けた組織または臓器内に見出される局所的な組織常在性の特異的免疫細胞（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、インフルエンザ、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）などの呼吸器ウイルス感染を防止するための常在性肺免疫細胞）をうまくプライミングできない。
【0005】
アジュバントと組み合わせる場合を除いて、組換えタンパク質ワクチンなどのワクチンを、鼻投与（例えば、鼻吸入）を介して投与することが、ヒトにおいて特に有効かつ安全であるとは未だに証明されていない。しかしながら、一般に、外因性アジュバントによって引き起こされる刺激性の炎症性免疫応答を含む有害な副作用に起因して、ミョウバンなどの従来のアジュバントは、ヒト気道内の粘膜ワクチン接種には不適切である。患者において、全身性炎症の自然免疫応答などの副作用を引き起こすことなく、ウイルス標的に対する組織常在性免疫細胞をプライミングするために、関連する組織に投与すること（例えば、鼻腔内、経口、粘膜投与）ができる安全かつ有効なワクチンが必要である。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0006】
一態様では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物が提供される。
【0007】
いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、約５：１を超え、例えば、６：１、７：１、８：１、９：１、または１０：１うちのいずれか以上である。
【0008】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、抗原ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、免疫原性タンパク質である。
【0009】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している。
【0010】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムの非翻訳領域、例えば、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域を含む。
【0011】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約１０～約３００）ヌクレオチド長、例えば、約２００～約５００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００ヌクレオチド長である。
【0012】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む。
【0013】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、配列番号３０に記載のＩＡＶゲノムの遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む。
【0014】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質は、配列番号１２のアミノ酸配列を含む。
【0015】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＩＡＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１に由来するウイルス核タンパク質は、配列番号１３のアミノ酸配列を含む。
【0016】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。
【0017】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。
【0018】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）を含む。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原は、配列番号１４または１５のアミノ酸配列を含む。
【0019】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）またはインフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）に由来する。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＩＡＶウイルス抗原は、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａのＩＢＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＩＢＶウイルス抗原は、配列番号１９または２０のアミノ酸配列を含む。
【0020】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、呼吸器合胞体ウイルス（「ＲＳＶ」）タンパク質、例えば、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片またはバリアントは、ＲＳＶ Ａサブタイプ及びＲＳＶ Ｂサブタイプからなる群から選択されるＲＳＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＲＳＶウイルス抗原は、配列番号２１または２２のアミノ酸配列を含む。
【0021】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、Ｃ型肝炎ウイルス（「ＨＣＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＨＣＶ遺伝子型１ａまたはＨＣＶ遺伝子型２ａのＨＣＶ遺伝子型に由来する。いくつかの実施形態では、ＨＣＶウイルス抗原は、配列番号２３または２４のアミノ酸配列を含む。
【0022】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0023】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。
【0024】
上記のワクチン組成物のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。
【0025】
上記のワクチン組成物のいずれかによるいくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、同じウイルス種からのものである２つ以上のウイルスサブタイプ（例えば、ＩＡＶ、例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、及びＨ７Ｎ９のうちの２つ以上）に対するヘテロサブタイプ保護を提供する。
【0026】
別の態様では、個体（例えば、ヒト）におけるウイルス感染を防止する方法であって、個体に、有効量の上記のワクチン組成物のうちのいずれかを投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、鼻腔内または皮内投与によって投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、初回用量で、続いて１回または２回のブースター用量で投与される。いくつかの実施形態では、初回用量及び１回または２回のブースター用量は、約７日～約２１日間隔で投与される。いくつかの実施形態では、初回用量及び１回または２回のブースター用量は、約１４日間隔で投与される。いくつかの実施形態では、初回用量及び第１のブースター用量、ならびに第１のブースター用量及び第２のブースター用量は、約７～約２１日間隔で、任意選択的に約１４日間隔で投与される。
【0027】
上記の方法のうちのいずれかによるいくつかの実施形態では、本方法は、異なるウイルス属からの２つ以上のウイルスによるウイルス感染を防止する。いくつかの実施形態では、本方法は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＩＡＶによるウイルス感染を防止する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、同じウイルスファミリーの一部である２つ以上のウイルス種に対するヘテロサブタイプ保護を提供し、任意選択的に、２つ以上のウイルス種は、同じウイルス属の一部である。いくつかの実施形態では、ｉ）２つ以上のウイルス種は、同じウイルスファミリーからのものであるか、またはｉｉ）２つ以上のウイルス種は、異なるウイルスファミリーからのものである。いくつかの実施形態では、本方法は、３つ以上のウイルス種によるウイルス感染を防止し、ｉ）３つ以上のウイルス種は、同じウイルスファミリーからのものであるか、ｉｉ）３つ以上のウイルス種は、異なるウイルスファミリーからのものであるか、またはｉｉｉ）３つ以上のウイルス種は、（ａ）同じウイルス種からのものである２つ以上のウイルスサブタイプまたは亜種、及び（ｂ）（ａ）のウイルスとは異なるウイルスファミリーからのものである１つ以上のウイルス種を含む。
【0028】
図面は、本開示のある特定の特徴及び利点を示す。これらの実施形態は、いかなる様式においても、添付の特許請求の範囲を限定することを意図するものではない。
【図面の簡単な説明】
【0029】
【図1A】様々なウイルス抗原に対するナノ複合体ワクチンを示す。図１Ａは、ＮＣ－ＣｏＶ－０１及びＮＣ－ＣｏＶ－０２を含む、コロナウイルス（すなわち、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）を標的とするワクチンを示す。図１Ｂは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０２、ＮＣ－ＩＡＶ－０３、ＮＣ－ＩＢＶ－０１、及びＮＣ－ＩＢＶ－０２を含む、インフルエンザウイルスを標的とするワクチンを示す。図１Ｃは、ＮＣ－ＲＳＶ－０１及びＮＣ－ＲＳＶ－０２を含む、ＲＳＶを標的とするワクチンを示す。図１Ｄは、ＮＣ－ＨＣＶ－０１及びＮＣ－ＨＣＶ－０２を含む、ＨＣＶを標的とするワクチンを示す。ＲＢＤ、受容体結合ドメイン；ＨＡ、ヘマグルチニン；ｍｏｎｏＦ、ＲＳＶ Ｆモノマー；Ｅ２、エンベロープ糖タンパク質Ｅ２；ＮＰ、核タンパク質；ミニｖＲＮＡ、ミニウイルスＲＮＡ。
【図1B】様々なウイルス抗原に対するナノ複合体ワクチンを示す。図１Ａは、ＮＣ－ＣｏＶ－０１及びＮＣ－ＣｏＶ－０２を含む、コロナウイルス（すなわち、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）を標的とするワクチンを示す。図１Ｂは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０２、ＮＣ－ＩＡＶ－０３、ＮＣ－ＩＢＶ－０１、及びＮＣ－ＩＢＶ－０２を含む、インフルエンザウイルスを標的とするワクチンを示す。図１Ｃは、ＮＣ－ＲＳＶ－０１及びＮＣ－ＲＳＶ－０２を含む、ＲＳＶを標的とするワクチンを示す。図１Ｄは、ＮＣ－ＨＣＶ－０１及びＮＣ－ＨＣＶ－０２を含む、ＨＣＶを標的とするワクチンを示す。ＲＢＤ、受容体結合ドメイン；ＨＡ、ヘマグルチニン；ｍｏｎｏＦ、ＲＳＶ Ｆモノマー；Ｅ２、エンベロープ糖タンパク質Ｅ２；ＮＰ、核タンパク質；ミニｖＲＮＡ、ミニウイルスＲＮＡ。
【図1C】様々なウイルス抗原に対するナノ複合体ワクチンを示す。図１Ａは、ＮＣ－ＣｏＶ－０１及びＮＣ－ＣｏＶ－０２を含む、コロナウイルス（すなわち、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）を標的とするワクチンを示す。図１Ｂは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０２、ＮＣ－ＩＡＶ－０３、ＮＣ－ＩＢＶ－０１、及びＮＣ－ＩＢＶ－０２を含む、インフルエンザウイルスを標的とするワクチンを示す。図１Ｃは、ＮＣ－ＲＳＶ－０１及びＮＣ－ＲＳＶ－０２を含む、ＲＳＶを標的とするワクチンを示す。図１Ｄは、ＮＣ－ＨＣＶ－０１及びＮＣ－ＨＣＶ－０２を含む、ＨＣＶを標的とするワクチンを示す。ＲＢＤ、受容体結合ドメイン；ＨＡ、ヘマグルチニン；ｍｏｎｏＦ、ＲＳＶ Ｆモノマー；Ｅ２、エンベロープ糖タンパク質Ｅ２；ＮＰ、核タンパク質；ミニｖＲＮＡ、ミニウイルスＲＮＡ。
【図1D】様々なウイルス抗原に対するナノ複合体ワクチンを示す。図１Ａは、ＮＣ－ＣｏＶ－０１及びＮＣ－ＣｏＶ－０２を含む、コロナウイルス（すなわち、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）を標的とするワクチンを示す。図１Ｂは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０２、ＮＣ－ＩＡＶ－０３、ＮＣ－ＩＢＶ－０１、及びＮＣ－ＩＢＶ－０２を含む、インフルエンザウイルスを標的とするワクチンを示す。図１Ｃは、ＮＣ－ＲＳＶ－０１及びＮＣ－ＲＳＶ－０２を含む、ＲＳＶを標的とするワクチンを示す。図１Ｄは、ＮＣ－ＨＣＶ－０１及びＮＣ－ＨＣＶ－０２を含む、ＨＣＶを標的とするワクチンを示す。ＲＢＤ、受容体結合ドメイン；ＨＡ、ヘマグルチニン；ｍｏｎｏＦ、ＲＳＶ Ｆモノマー；Ｅ２、エンベロープ糖タンパク質Ｅ２；ＮＰ、核タンパク質；ミニｖＲＮＡ、ミニウイルスＲＮＡ。
【図2】例示的なナノ複合体ワクチンにおけるアダプタ－抗原ポリペプチド及びＲＮＡ足場構成要素の概略図を示す。
【図3A】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンのナノ複合体形成の試験からの結果を示す。図３Ａは、アダプタ－抗原構成要素であるヌクレオカプシド（ＮＰ）－ＲＢＤの構造予測を示す。図３Ｂは、試験したＮＰ－ＲＢＤタンパク質のＳＤＳ－ＰＡＧＥ結果を提供する。図３Ｃの左パネルは、Ｒ２６６のＲＮＡ二次構造予測（例示的なＲＮＡ足場）を示し、右パネルは、Ｒ２６６の３Ｄ構造予測を示す。図３Ｄは、Ｒ２６６が尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化されたことを示す。図３Ｅは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、ゲルシフトアッセイによって確認されたことを示す。量を増加させたＮＰ－ＲＢＤとＲ２６６を混合し、尿素－ＰＡＧＥ（上部パネル）及びウエスタンブロット（下部パネル）によって分析した。図３Ｆは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、蛍光偏光性によってさらに確認されたことを示す。簡潔には、濃度を増加させたＮＰ－ＲＢＤ、全長ＮＰ、及びスパイクＲＢＤタンパク質と、ＨＥＸ標識ＲＮＡオリゴを混合し、蛍光偏光性を測定した。特定の緩衝液系中のＫｄを計算した。
【図3B】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンのナノ複合体形成の試験からの結果を示す。図３Ａは、アダプタ－抗原構成要素であるヌクレオカプシド（ＮＰ）－ＲＢＤの構造予測を示す。図３Ｂは、試験したＮＰ－ＲＢＤタンパク質のＳＤＳ－ＰＡＧＥ結果を提供する。図３Ｃの左パネルは、Ｒ２６６のＲＮＡ二次構造予測（例示的なＲＮＡ足場）を示し、右パネルは、Ｒ２６６の３Ｄ構造予測を示す。図３Ｄは、Ｒ２６６が尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化されたことを示す。図３Ｅは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、ゲルシフトアッセイによって確認されたことを示す。量を増加させたＮＰ－ＲＢＤとＲ２６６を混合し、尿素－ＰＡＧＥ（上部パネル）及びウエスタンブロット（下部パネル）によって分析した。図３Ｆは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、蛍光偏光性によってさらに確認されたことを示す。簡潔には、濃度を増加させたＮＰ－ＲＢＤ、全長ＮＰ、及びスパイクＲＢＤタンパク質と、ＨＥＸ標識ＲＮＡオリゴを混合し、蛍光偏光性を測定した。特定の緩衝液系中のＫｄを計算した。
【図3C】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンのナノ複合体形成の試験からの結果を示す。図３Ａは、アダプタ－抗原構成要素であるヌクレオカプシド（ＮＰ）－ＲＢＤの構造予測を示す。図３Ｂは、試験したＮＰ－ＲＢＤタンパク質のＳＤＳ－ＰＡＧＥ結果を提供する。図３Ｃの左パネルは、Ｒ２６６のＲＮＡ二次構造予測（例示的なＲＮＡ足場）を示し、右パネルは、Ｒ２６６の３Ｄ構造予測を示す。図３Ｄは、Ｒ２６６が尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化されたことを示す。図３Ｅは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、ゲルシフトアッセイによって確認されたことを示す。量を増加させたＮＰ－ＲＢＤとＲ２６６を混合し、尿素－ＰＡＧＥ（上部パネル）及びウエスタンブロット（下部パネル）によって分析した。図３Ｆは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、蛍光偏光性によってさらに確認されたことを示す。簡潔には、濃度を増加させたＮＰ－ＲＢＤ、全長ＮＰ、及びスパイクＲＢＤタンパク質と、ＨＥＸ標識ＲＮＡオリゴを混合し、蛍光偏光性を測定した。特定の緩衝液系中のＫｄを計算した。
【図3D】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンのナノ複合体形成の試験からの結果を示す。図３Ａは、アダプタ－抗原構成要素であるヌクレオカプシド（ＮＰ）－ＲＢＤの構造予測を示す。図３Ｂは、試験したＮＰ－ＲＢＤタンパク質のＳＤＳ－ＰＡＧＥ結果を提供する。図３Ｃの左パネルは、Ｒ２６６のＲＮＡ二次構造予測（例示的なＲＮＡ足場）を示し、右パネルは、Ｒ２６６の３Ｄ構造予測を示す。図３Ｄは、Ｒ２６６が尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化されたことを示す。図３Ｅは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、ゲルシフトアッセイによって確認されたことを示す。量を増加させたＮＰ－ＲＢＤとＲ２６６を混合し、尿素－ＰＡＧＥ（上部パネル）及びウエスタンブロット（下部パネル）によって分析した。図３Ｆは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、蛍光偏光性によってさらに確認されたことを示す。簡潔には、濃度を増加させたＮＰ－ＲＢＤ、全長ＮＰ、及びスパイクＲＢＤタンパク質と、ＨＥＸ標識ＲＮＡオリゴを混合し、蛍光偏光性を測定した。特定の緩衝液系中のＫｄを計算した。
【図3E】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンのナノ複合体形成の試験からの結果を示す。図３Ａは、アダプタ－抗原構成要素であるヌクレオカプシド（ＮＰ）－ＲＢＤの構造予測を示す。図３Ｂは、試験したＮＰ－ＲＢＤタンパク質のＳＤＳ－ＰＡＧＥ結果を提供する。図３Ｃの左パネルは、Ｒ２６６のＲＮＡ二次構造予測（例示的なＲＮＡ足場）を示し、右パネルは、Ｒ２６６の３Ｄ構造予測を示す。図３Ｄは、Ｒ２６６が尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化されたことを示す。図３Ｅは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、ゲルシフトアッセイによって確認されたことを示す。量を増加させたＮＰ－ＲＢＤとＲ２６６を混合し、尿素－ＰＡＧＥ（上部パネル）及びウエスタンブロット（下部パネル）によって分析した。図３Ｆは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、蛍光偏光性によってさらに確認されたことを示す。簡潔には、濃度を増加させたＮＰ－ＲＢＤ、全長ＮＰ、及びスパイクＲＢＤタンパク質と、ＨＥＸ標識ＲＮＡオリゴを混合し、蛍光偏光性を測定した。特定の緩衝液系中のＫｄを計算した。
【図3F】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンのナノ複合体形成の試験からの結果を示す。図３Ａは、アダプタ－抗原構成要素であるヌクレオカプシド（ＮＰ）－ＲＢＤの構造予測を示す。図３Ｂは、試験したＮＰ－ＲＢＤタンパク質のＳＤＳ－ＰＡＧＥ結果を提供する。図３Ｃの左パネルは、Ｒ２６６のＲＮＡ二次構造予測（例示的なＲＮＡ足場）を示し、右パネルは、Ｒ２６６の３Ｄ構造予測を示す。図３Ｄは、Ｒ２６６が尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化されたことを示す。図３Ｅは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、ゲルシフトアッセイによって確認されたことを示す。量を増加させたＮＰ－ＲＢＤとＲ２６６を混合し、尿素－ＰＡＧＥ（上部パネル）及びウエスタンブロット（下部パネル）によって分析した。図３Ｆは、アダプタ－抗原とＲ２６６との会合が、蛍光偏光性によってさらに確認されたことを示す。簡潔には、濃度を増加させたＮＰ－ＲＢＤ、全長ＮＰ、及びスパイクＲＢＤタンパク質と、ＨＥＸ標識ＲＮＡオリゴを混合し、蛍光偏光性を測定した。特定の緩衝液系中のＫｄを計算した。
【図4A】ＮＣ－ＣｏＶ－０１がインビボで粘膜免疫を誘発したことを実証する。図４Ａは、動物におけるＮＣ－ＣｏＶ－０１の免疫化を示す概略図を提供する。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、ＮＰ－ＲＢＤ、ＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２０（２０ｎｔウイルスＲＮＡ）対照、またはＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２６６（ＮＣ－ＣｏＶ－０１）の３つの用量で鼻腔内免疫化した。血清及び気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）を採取し、抗原特異的抗体についてＥＬＩＳＡで試験した。図４Ｂは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＡ応答を示す。図４Ｃは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。図４Ｄは、実験の１４日目、２８日目、及び４２日目にわたる血清中の抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。全てのＥＬＩＳＡ結果を、９５％信頼区間による幾何平均力価として提示した。＊：ｐ＜０．０５、＊＊：ｐ＜０．００５、＊＊＊：ｐ＜０．０００５、ｎ．ｓ．：有意でない。
【図4B】ＮＣ－ＣｏＶ－０１がインビボで粘膜免疫を誘発したことを実証する。図４Ａは、動物におけるＮＣ－ＣｏＶ－０１の免疫化を示す概略図を提供する。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、ＮＰ－ＲＢＤ、ＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２０（２０ｎｔウイルスＲＮＡ）対照、またはＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２６６（ＮＣ－ＣｏＶ－０１）の３つの用量で鼻腔内免疫化した。血清及び気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）を採取し、抗原特異的抗体についてＥＬＩＳＡで試験した。図４Ｂは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＡ応答を示す。図４Ｃは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。図４Ｄは、実験の１４日目、２８日目、及び４２日目にわたる血清中の抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。全てのＥＬＩＳＡ結果を、９５％信頼区間による幾何平均力価として提示した。＊：ｐ＜０．０５、＊＊：ｐ＜０．００５、＊＊＊：ｐ＜０．０００５、ｎ．ｓ．：有意でない。
【図4C】ＮＣ－ＣｏＶ－０１がインビボで粘膜免疫を誘発したことを実証する。図４Ａは、動物におけるＮＣ－ＣｏＶ－０１の免疫化を示す概略図を提供する。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、ＮＰ－ＲＢＤ、ＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２０（２０ｎｔウイルスＲＮＡ）対照、またはＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２６６（ＮＣ－ＣｏＶ－０１）の３つの用量で鼻腔内免疫化した。血清及び気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）を採取し、抗原特異的抗体についてＥＬＩＳＡで試験した。図４Ｂは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＡ応答を示す。図４Ｃは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。図４Ｄは、実験の１４日目、２８日目、及び４２日目にわたる血清中の抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。全てのＥＬＩＳＡ結果を、９５％信頼区間による幾何平均力価として提示した。＊：ｐ＜０．０５、＊＊：ｐ＜０．００５、＊＊＊：ｐ＜０．０００５、ｎ．ｓ．：有意でない。
【図4D】ＮＣ－ＣｏＶ－０１がインビボで粘膜免疫を誘発したことを実証する。図４Ａは、動物におけるＮＣ－ＣｏＶ－０１の免疫化を示す概略図を提供する。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、ＮＰ－ＲＢＤ、ＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２０（２０ｎｔウイルスＲＮＡ）対照、またはＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２６６（ＮＣ－ＣｏＶ－０１）の３つの用量で鼻腔内免疫化した。血清及び気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）を採取し、抗原特異的抗体についてＥＬＩＳＡで試験した。図４Ｂは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＡ応答を示す。図４Ｃは、ＢＡＬＦにおける抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。図４Ｄは、実験の１４日目、２８日目、及び４２日目にわたる血清中の抗スパイクＲＢＤ ＩｇＧ応答を示す。全てのＥＬＩＳＡ結果を、９５％信頼区間による幾何平均力価として提示した。＊：ｐ＜０．０５、＊＊：ｐ＜０．００５、＊＊＊：ｐ＜０．０００５、ｎ．ｓ．：有意でない。
【図5A】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5B】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5C】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5D】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5E】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5F】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5G】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5H】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図5I】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンによるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する鼻腔内免疫化後のインビボでの様々な炎症促進性サイトカイン及びケモカインの遺伝子発現結果を示す。図５Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を示す。ＮＰ－ＲＢＤを、Ｒ２０またはＲ２６６のいずれかと混合し、ＢＡＬＢ／ｃマウスに経鼻投与した。投与１６時間後にＢＡＬＦを収集した。ＲＮＡをこれらのＢＡＬＦの細胞ペレットから抽出し、ＲＴ－ｑＰＣＲによって分析した。図５Ｂ～図５Ｉは、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β、図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、及び炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）の誘導を示し、これらの全ては、倍数±Ｓ．Ｄ．として提示した。
【図6A】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染の発生に対してマウスを保護することを示す。図６Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を提供する。図６Ｂ～図６Ｃは、プラークアッセイによって分析した、肺（図６Ｂ）及び鼻甲介（図６Ｃ）ホモジネートにおけるウイルス感染力価レベルを示す。データを、組織のグラム当たりのＰＦＵとして提示した。図６Ｄは、マウス肺の免疫組織学及びＨ＆Ｅ染色を示し、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ヌクレオカプシド陽性染色細胞を矢印によって示す。Ｎ．Ｄ．、検出されず；Ｈ＆Ｅ、ヘマトキシリン及びエオシン。
【図6B】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染の発生に対してマウスを保護することを示す。図６Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を提供する。図６Ｂ～図６Ｃは、プラークアッセイによって分析した、肺（図６Ｂ）及び鼻甲介（図６Ｃ）ホモジネートにおけるウイルス感染力価レベルを示す。データを、組織のグラム当たりのＰＦＵとして提示した。図６Ｄは、マウス肺の免疫組織学及びＨ＆Ｅ染色を示し、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ヌクレオカプシド陽性染色細胞を矢印によって示す。Ｎ．Ｄ．、検出されず；Ｈ＆Ｅ、ヘマトキシリン及びエオシン。
【図6C】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染の発生に対してマウスを保護することを示す。図６Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を提供する。図６Ｂ～図６Ｃは、プラークアッセイによって分析した、肺（図６Ｂ）及び鼻甲介（図６Ｃ）ホモジネートにおけるウイルス感染力価レベルを示す。データを、組織のグラム当たりのＰＦＵとして提示した。図６Ｄは、マウス肺の免疫組織学及びＨ＆Ｅ染色を示し、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ヌクレオカプシド陽性染色細胞を矢印によって示す。Ｎ．Ｄ．、検出されず；Ｈ＆Ｅ、ヘマトキシリン及びエオシン。
【図6D】ＮＣ－ＣｏＶ－０１ワクチンが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染の発生に対してマウスを保護することを示す。図６Ａは、マウス鼻腔内免疫化モデルの概略図を提供する。図６Ｂ～図６Ｃは、プラークアッセイによって分析した、肺（図６Ｂ）及び鼻甲介（図６Ｃ）ホモジネートにおけるウイルス感染力価レベルを示す。データを、組織のグラム当たりのＰＦＵとして提示した。図６Ｄは、マウス肺の免疫組織学及びＨ＆Ｅ染色を示し、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ヌクレオカプシド陽性染色細胞を矢印によって示す。Ｎ．Ｄ．、検出されず；Ｈ＆Ｅ、ヘマトキシリン及びエオシン。
【図7】ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びインフルエンザＡウイルス抗原に対するＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２／ＦｌｕＡ二価ナノ複合体ワクチンを示す。本明細書に提供される例示的な二価ナノ複合体ワクチンフォーマットでは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２アダプタをインフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）抗原と融合させ、次いでＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ミニｖＲＮＡ足場Ｒ２６６と複合体化させて、二価ナノ複合体（ＢｉＮＣ）ワクチン（ＢｉＮＣ－０１及びＢｉＮＣ－０２）を生成する。代替として、ＩＡＶアダプタをＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗原と融合させ、次いでミニｖＲＮＡ足場（例えば、ＩＡＶミニｖＲＮＡ、Ｒ３２６、またはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ミニｖＲＮＡ、Ｒ２６６）と複合体化させて、ＢｉＮＣワクチン（ＢｉＮＣ－０３、ＢｉＮＣ－０４）を生成する。
【図8A】例示的なＢｉＮＣ－０１ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ１Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図８Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図８Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図８Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。
【図8B】例示的なＢｉＮＣ－０１ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ１Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図８Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図８Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図８Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。
【図8C】例示的なＢｉＮＣ－０１ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ１Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図８Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図８Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図８Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。
【図9A】例示的なＢｉＮＣ－０２ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ５Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図９Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図９Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図９Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。
【図9B】例示的なＢｉＮＣ－０２ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ５Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図９Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図９Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図９Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。
【図9C】例示的なＢｉＮＣ－０２ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ５Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図９Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図９Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図９Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。
【図10】以下のアダプタ－抗原法を使用して構築された２つの例示的なインフルエンザＡ特異的ナノ複合体ワクチンを示す。（１）Ｈ１Ｎ１特異的（ＮＣ－ＩＡＶ－０１）ワクチン、及び（２）Ｈ５Ｎ１特異的（ＮＣ－ＩＡＶ－０２）ワクチン。
【図11A】ウイルス複合体（図１１Ａ）及びインビボワクチン接種実験デザイン（図１１Ｂ）の概略を提供する。図１１Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンのタンパク質構造を示すリボン図を提供する。図１１Ｂは、鼻腔内に投与される２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０１による動物の免疫化を示す概略図を提供する。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図11B】ウイルス複合体（図１１Ａ）及びインビボワクチン接種実験デザイン（図１１Ｂ）の概略を提供する。図１１Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンのタンパク質構造を示すリボン図を提供する。図１１Ｂは、鼻腔内に投与される２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０１による動物の免疫化を示す概略図を提供する。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図12A】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ１Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図１２Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図１２Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図１２Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図12B】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ１Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図１２Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図１２Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図１２Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図12C】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ１Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図１２Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図１２Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図１２Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図13A】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンによるＢＡＬＢ／ｃマウスの鼻腔内ワクチン接種後のマウス免疫系によるＨ１Ｎ１の中和を示す。図１３Ａは、インビボでの血清血球凝集阻害応答を示す。図１３Ｂは、インビボでの血清ＦＲＮＴ５０中和応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図13B】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンによるＢＡＬＢ／ｃマウスの鼻腔内ワクチン接種後のマウス免疫系によるＨ１Ｎ１の中和を示す。図１３Ａは、インビボでの血清血球凝集阻害応答を示す。図１３Ｂは、インビボでの血清ＦＲＮＴ５０中和応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図14A】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンの２回分の用量で鼻腔内ワクチン接種したマウスにおける生のＨ１Ｎ１ウイルスチャレンジの実験デザイン及び付随する結果を示す。図１４Ａは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０１で鼻腔内ワクチン接種し、次いで生Ｈ１Ｎ１ウイルスによってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１４Ｂは、感染後１４日間にわたってマウスの体重をモニタリングした結果を示す。図１４Ｃは、感染後１４日までの感染したマウスの生存曲線を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図14B】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンの２回分の用量で鼻腔内ワクチン接種したマウスにおける生のＨ１Ｎ１ウイルスチャレンジの実験デザイン及び付随する結果を示す。図１４Ａは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０１で鼻腔内ワクチン接種し、次いで生Ｈ１Ｎ１ウイルスによってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１４Ｂは、感染後１４日間にわたってマウスの体重をモニタリングした結果を示す。図１４Ｃは、感染後１４日までの感染したマウスの生存曲線を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図14C】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンの２回分の用量で鼻腔内ワクチン接種したマウスにおける生のＨ１Ｎ１ウイルスチャレンジの実験デザイン及び付随する結果を示す。図１４Ａは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０１で鼻腔内ワクチン接種し、次いで生Ｈ１Ｎ１ウイルスによってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１４Ｂは、感染後１４日間にわたってマウスの体重をモニタリングした結果を示す。図１４Ｃは、感染後１４日までの感染したマウスの生存曲線を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図15A】ＮＣ－ＩＡＶ－０２ウイルス複合体（図１５Ａ）及びインビボワクチン接種実験デザイン（図１５Ｂ）の概略を提供する。図１１Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンのタンパク質構造を示すリボン図を提供する。図１１Ｂは、鼻腔内に投与される２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２による動物の免疫化を示す概略図を提供する。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図15B】ＮＣ－ＩＡＶ－０２ウイルス複合体（図１５Ａ）及びインビボワクチン接種実験デザイン（図１５Ｂ）の概略を提供する。図１１Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンのタンパク質構造を示すリボン図を提供する。図１１Ｂは、鼻腔内に投与される２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２による動物の免疫化を示す概略図を提供する。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図16A】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ５Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図１６Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図１６Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図１６Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図16B】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ５Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図１６Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図１６Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図１６Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図16C】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによる鼻腔内ワクチン接種後に生じた、Ｈ５Ｎ１に特異的であったマウス抗体応答を示す。図１６Ａは、血清ＩｇＧ応答を示す。図１６Ｂは、ＢＡＬＦ ＩｇＧ応答を示す。図１６Ｃは、ＢＡＬＦ ＩｇＡ応答を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図17A】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンの２回分の用量で鼻腔内ワクチン接種したマウスにおける生Ｈ５Ｎ１ウイルスチャレンジの実験デザイン及び付随する結果を示す。図１７Ａは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内ワクチン接種し、次いで生Ｈ５Ｎ１ウイルスによってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１７Ｂは、感染後１４日間にわたってマウスの体重をモニタリングした結果を示す。図１７Ｃは、感染後１４日までの感染したマウスの生存曲線を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図17B】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンの２回分の用量で鼻腔内ワクチン接種したマウスにおける生Ｈ５Ｎ１ウイルスチャレンジの実験デザイン及び付随する結果を示す。図１７Ａは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内ワクチン接種し、次いで生Ｈ５Ｎ１ウイルスによってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１７Ｂは、感染後１４日間にわたってマウスの体重をモニタリングした結果を示す。図１７Ｃは、感染後１４日までの感染したマウスの生存曲線を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図17C】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンの２回分の用量で鼻腔内ワクチン接種したマウスにおける生Ｈ５Ｎ１ウイルスチャレンジの実験デザイン及び付随する結果を示す。図１７Ａは、ＢＡＬＢ／ｃマウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内ワクチン接種し、次いで生Ｈ５Ｎ１ウイルスによってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１７Ｂは、感染後１４日間にわたってマウスの体重をモニタリングした結果を示す。図１７Ｃは、感染後１４日までの感染したマウスの生存曲線を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図18-1】異なるＩＡＶサブタイプに対するＩＡＶアダプタタンパク質の交差反応性を示す。図１８Ａは、マウスが、例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１または例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンのいずれかで鼻腔内免疫化された、実験デザインの概略を提供する。ＢＡＬＦ細胞及び脾臓細胞を、第２の用量の投与の７日後に採取し、異なるサブタイプからの元の免疫原またはＮＰを使用して、ＥＬＩＳｐｏｔによってアッセイした。図１８Ｂ～１８Ｃは、ワクチンと同じ免疫原によって刺激された細胞を使用したＥＬＩＳｐｏｔアッセイの結果を示す（図１８Ｂ：ＮＣ－ＩＡＶ－０１、及び図１８Ｃ：ＮＣ－ＩＡＶ－０２）。図１８Ｄは、異なるインフルエンザＡサブタイプ、すなわち、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、またはＨ７Ｎ９のウイルスヌクレオカプシドによって刺激された細胞を使用したＥＬＩＳｐｏｔアッセイの結果を示し、ワクチンは、ＮＣ－ＩＡＶ－０２であった。ＮＰ、ヌクレオカプシド；Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図18-2】異なるＩＡＶサブタイプに対するＩＡＶアダプタタンパク質の交差反応性を示す。図１８Ａは、マウスが、例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１または例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンのいずれかで鼻腔内免疫化された、実験デザインの概略を提供する。ＢＡＬＦ細胞及び脾臓細胞を、第２の用量の投与の７日後に採取し、異なるサブタイプからの元の免疫原またはＮＰを使用して、ＥＬＩＳｐｏｔによってアッセイした。図１８Ｂ～１８Ｃは、ワクチンと同じ免疫原によって刺激された細胞を使用したＥＬＩＳｐｏｔアッセイの結果を示す（図１８Ｂ：ＮＣ－ＩＡＶ－０１、及び図１８Ｃ：ＮＣ－ＩＡＶ－０２）。図１８Ｄは、異なるインフルエンザＡサブタイプ、すなわち、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、またはＨ７Ｎ９のウイルスヌクレオカプシドによって刺激された細胞を使用したＥＬＩＳｐｏｔアッセイの結果を示し、ワクチンは、ＮＣ－ＩＡＶ－０２であった。ＮＰ、ヌクレオカプシド；Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図19A】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによるワクチン接種から生じた、異なるＩＡＶサブタイプに対する交差保護を示す。図１９Ａは、マウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内免疫化し、次いで２つの異なる生のＩＡＶサブタイプ（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１）によってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１９Ｂ～１９Ｃは、Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｂ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｃ）を示す。図１９Ｄ～１９Ｅは、Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｄ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｅ）を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図19B】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによるワクチン接種から生じた、異なるＩＡＶサブタイプに対する交差保護を示す。図１９Ａは、マウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内免疫化し、次いで２つの異なる生のＩＡＶサブタイプ（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１）によってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１９Ｂ～１９Ｃは、Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｂ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｃ）を示す。図１９Ｄ～１９Ｅは、Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｄ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｅ）を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図19C】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによるワクチン接種から生じた、異なるＩＡＶサブタイプに対する交差保護を示す。図１９Ａは、マウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内免疫化し、次いで２つの異なる生のＩＡＶサブタイプ（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１）によってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１９Ｂ～１９Ｃは、Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｂ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｃ）を示す。図１９Ｄ～１９Ｅは、Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｄ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｅ）を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図19D】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによるワクチン接種から生じた、異なるＩＡＶサブタイプに対する交差保護を示す。図１９Ａは、マウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内免疫化し、次いで２つの異なる生のＩＡＶサブタイプ（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１）によってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１９Ｂ～１９Ｃは、Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｂ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｃ）を示す。図１９Ｄ～１９Ｅは、Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｄ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｅ）を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【図19E】例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによるワクチン接種から生じた、異なるＩＡＶサブタイプに対する交差保護を示す。図１９Ａは、マウスを２回分の用量のＮＣ－ＩＡＶ－０２で鼻腔内免疫化し、次いで２つの異なる生のＩＡＶサブタイプ（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１）によってチャレンジした、実験デザインの概略を提供する。図１９Ｂ～１９Ｃは、Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｂ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｃ）を示す。図１９Ｄ～１９Ｅは、Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１の生ウイルスでチャレンジしたマウスの、１４日にわたる体重の変化（図１９Ｄ）及び１４日までの生存曲線（図１９Ｅ）を示す。Ｒ３２６、ＩＡＶゲノムに由来する例示的なミニｖＲＮＡ足場。
【発明を実施するための形態】
【0030】
本出願は、ウイルス感染などの標的疾患、障害、または感染に対して個体（例えば、ヒト）をワクチン接種するかまたは治療するための新規のワクチン組成物及び方法を提供する。具体的には、本発明者らは、以下の２つの部分：（ｉ）アダプタ－抗原ポリペプチドとしても知られる、標的抗原（例えば、ウイルス抗原）と融合した核タンパク質と、（ｉｉ）ウイルスＲＮＡ、例えば、ミニウイルスＲＮＡ（ミニｖＲＮＡ）を含む核酸足場と、を含む新規のワクチンナノ複合体プラットフォームを設計し、試験した。核タンパク質が核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）に対して高い親和性を有するので、核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）足場は、複数のアダプタ－抗原ポリペプチドの結合が可能である。このワクチンナノ複合体プラットフォームは、従来のワクチンと比較して免疫原性複合体のサイズを増加させるアダプタ－抗原／ＲＮＡナノ複合体の形成と、宿主自然免疫を活性化するためのアジュバントとしての核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）の存在との両方によって顕著に改善される高いワクチン接種効力を実証する。理論に拘束されることなく、このナノ複合体ワクチンプラットフォームの使用は、多くの利点：１）粘膜投与によるワクチン接種の有効性は、安全であり、非常に有効である。２）ナノ複合体ワクチンは、従来のワクチンと比較して、副作用がないか、または低いため（例えば、従来のワクチンよりも低い、軽度もしくは区別できない症状、またはほぼない）、改善された安全性プロファイルを示す。３）タンパク質ワクチンの鼻スプレーは、筋肉内注射よりも比較的侵襲性が低く、粘膜の感染と戦うための粘膜免疫の誘導を潜在的に改善する可能性がある。４）組換えタンパク質ワクチンの鼻スプレーは、感染性物質の取り扱いを伴わないため、感染性物質に関連する安全性の懸念を伴わない。５）アダプタ－抗原子ポリペプチドの構築へのミックスアンドマッチアプローチは、単一のワクチン分子からの効果的な二価ワクチン接種を提供することができる。６）ナノ複合体ワクチンは、複数のウイルスサブタイプに対するヘテロサブタイプ保護を提供することが可能である（例えば、限定されないが、インフルエンザＡウイルスサブタイプＨ５Ｎ１を標的とし、またＩＡＶサブタイプＨ１Ｎ１、Ｎ３Ｎ２、及び／またはＨ７Ｎ９に対して保護するナノ複合体ワクチン）。
【0031】
したがって、一態様では、本出願は、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）核酸（例えば、ウイルスＲＮＡ）を含む足場分子と、ｉｉ）核酸（例えば、ウイルスＲＮＡ）に結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合した標的抗原（例えば、ウイルス抗原）を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物を提供する。
【0032】
別の態様では、個体（例えば、ヒト）における疾患、障害、または感染（例えば、ウイルス感染）を防止または治療する方法であって、個体に有効量のワクチン組成物を投与することを含む、方法が提供される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、鼻腔内または皮内投与によって投与される。
【0033】
本出願で参照される、特許文書、科学記事、及びデータベースを含む全ての出版物は、各個別の出版物が、個別に参照により組み込まれるのと同じ程度に、あらゆる目的のためにそれら全体が参照により組み込まれている。本明細書に記載の定義が、参照により本明細書に組み込まれる特許、出願、公開出願、及び他の出版物に記載の定義と矛盾するかまたは一致しない場合、本明細書に記載の定義が、参照により本明細書に組み込まれる定義よりも優先される。
【0034】
本明細書で使用される節の見出しは、構成目的のみのためであり、記載される主題を限定するものと解釈されるべきではない。
【0035】
Ｉ．定義
ウラシル及びチミンは両方とも、ウラシルの「ｕ」及びチミンの「ｔ」の代わりに、「ｔ」によって表され得ることが当業者によって理解され、リボ核酸の文脈では、別途示されない限り、「ｔ」が、ウラシルを表すために使用されることが理解されるであろう。
ウラシル及びチミンは両方とも、ウラシルの「ｕ」及びチミンの「ｔ」の代わりに、「ｔ」によって表され得ることが当業者によって理解され、リボ核酸の文脈では、別途示されない限り、「ｔ」が、ウラシルを表すために使用されることが理解されるであろう。
【0036】
本明細書で使用される「ゲノムＲＮＡ」という用語は、ＲＮＡウイルスの遺伝性の遺伝子情報を指す。しかしながら、本発明の文脈において、「ゲノム」という用語は、典型的には、ＲＮＡウイルスのゲノム、したがって、リボ核酸配列を有するＲＮＡゲノムも指す。当業者は、ＲＮＡウイルスのゲノムが、プラスミドなどのベクター内のＤＮＡ配列としても提供され得ることを理解するであろう。次いで、ＲＮＡゲノムは、宿主細胞のトランスフェクション後に転写を介して宿主細胞において生成される。したがって、ポジティブセンスＲＮＡウイルスの核酸配列を指す場合、「配列表」セクションの配列は、ＲＮＡ配列（「Ｕ」を「Ｔ」に置き換えている）またはＤＮＡ配列を指し得ることが理解されるであろう。
【0037】
本明細書で使用される「遺伝子」という用語は、機能的産生物として発現されることによって、または遺伝子発現の調節によって生物の（例えば、ＲＮＡウイルス）形質に影響を与える遺伝性ゲノム配列のＤＮＡまたはＲＮＡ遺伝子座を指す。遺伝子及びポリヌクレオチドは、ゲノム配列におけるようなイントロン及びエクソン、または開始コドン（メチオニンコドン）及び翻訳停止コドンを含むオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）などのｃＤＮＡにおけるようなコード配列のみを含み得る。遺伝子及びポリヌクレオチドはまた、転写開始、翻訳、及び転写終結などの、それらの発現を調節する領域を含み得る。したがって、プロモータなどの調節エレメントも含まれる。
【0038】
本明細書で使用される「核酸」、「ヌクレオチド」、及び「ポリヌクレオチド」という用語は、互換的に使用され、５’末端から３’末端に読み取られるデオキシリボヌクレオチド塩基またはリボヌクレオチド塩基の一本鎖または二本鎖ポリマーを指し、二本鎖ＤＮＡ（ｄｓＤＮＡ）、一本鎖ＤＮＡ（ｓｓＤＮＡ）、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ、ネガティブセンス及びポジティブセンス）、二本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、ゲノムＤＮＡ、ｃＤＮＡ、ｃＲＮＡ、組換えＤＮＡ、または組換えＲＮＡ、及びそれらの誘導体、例えば、修飾された骨格を含有するものを含む。
【0039】
本明細書で使用される「リボ核酸」、「ＲＮＡ」、または「ＲＮＡオリゴヌクレオチド」という用語は、核酸塩基、リボース糖、及びリン酸基で構築されるヌクレオチドの配列からなる分子について記載している。ＲＮＡは、通常、一本鎖分子であり、様々な機能を発揮することができる。
【0040】
「上流」及び「下流」という用語は、ＤＮＡまたはＲＮＡにおける相対的な位置を指す。ＤＮＡまたはＲＮＡの各鎖は、デオキシリボースまたはリボース単位の末端炭素位置に関連する５’末端及び３’末端を有する。従来、「上流」は、ポリヌクレオチドの５’末端に向かうことを意味する一方で、「下流」は、ポリヌクレオチドの３’末端に向かうことを意味する。二本鎖ＤＮＡ、例えば、ゲノムＤＮＡの場合、「上流」という用語は、コード鎖の５’末端に向かうことを意味する一方で、「下流」は、コード鎖の３’末端に向かうことを意味する。
【0041】
「コード鎖」または「ポジティブセンス鎖」という用語は、タンパク質をコードするＲＮＡ鎖を指す。
【0042】
「非コード鎖」、「アンチセンス鎖」、または「ネガティブセンス鎖」もしくは「ネガティブ鎖」という用語は、翻訳前にＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼによってポジティブ鎖ＲＮＡへと転写される必要があるＲＮＡ鎖を指す。
【0043】
「コードする（ｅｎｃｏｄｅ）」及び「コードする（ｃｏｄｅ ｆｏｒ）」という用語は、広義には、ポリマー性巨大分子における情報が、第１の分子とは異なる第２の分子の産生を指示するために使用される、任意のプロセスを指す。第２の分子は、第１の分子の化学的性質とは異なる化学構造を有し得る。例えば、「コードする」という用語は、二本鎖ＤＮＡ分子の一方の鎖が、ＤＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼによって新しく合成された相補的な妹鎖をコードするための鋳型として使用される、半保存的ＤＮＡ複製のプロセスについて記載している。さらに、ＤＮＡ分子は、（例えば、ＤＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼの使用によって）ＲＮＡ分子をコードすることができるか、またはＲＮＡ分子（ネガティブ鎖）は、（例えば、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼの使用によって）ＲＮＡ分子（ポジティブ鎖）をコードすることができる。また、ＲＮＡ分子（ポジティブ鎖）は、翻訳のプロセスと同様に、ポリペプチドをコードすることができる。翻訳プロセスについて記載するために使用される場合、「コードする」という用語は、アミノ酸をコードするトリプレットコドンにも及ぶ。ＲＮＡ分子はまた、例えば、ＲＮＡ依存性ＤＮＡポリメラーゼを使用する逆転写のプロセスによって、ＤＮＡ分子をコードすることができる。ポリペプチドをコードするＤＮＡ分子について言及する場合、転写及び翻訳のプロセスについての言及である。
【0044】
本明細書で使用される「発現」という用語は、宿主細胞内の異種核酸配列の転写及び／または翻訳を指す。宿主細胞における目的の遺伝子産生物の発現レベルは、細胞に存在する、対応するｍＲＮＡ（またはポジティブ鎖ＲＮＡ）の量、または選択された配列によってコードされるポリペプチドの量のいずれかに基づいて決定することができる。例えば、選択された配列から転写されたＲＮＡは、ノーザンブロットハイブリダイゼーション、リボヌクレアーゼＲＮＡ保護、細胞ＲＮＡへのインサイチュハイブリダイゼーション、またはｑＰＣＲなどのＰＣＲによって定量化することができる。選択された配列によってコードされるタンパク質は、様々な方法、例えば、ＥＬＩＳＡによって、ウエスタンブロッティングによって、ラジオイムノアッセイによって、免疫沈降によって、タンパク質の生物学的活性についてアッセイすることによって、タンパク質の免疫染色、その後のＦＡＣＳ分析によって、または均質な時間分解蛍光（ＨＴＲＦ）アッセイによって定量化することができる。ｍｉＲＮＡまたはｓｈＲＮＡなどの非コードＲＮＡの発現レベルは、ｑＰＣＲなどのＰＣＲによって定量化することができる。
【0045】
ウイルスの「参照配列」は、任意のヒトによる変異を含まない配列（すなわち、野生型ウイルス配列）であり、その他の全てのバージョンが比較されるウイルス配列である。例えば、参照ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルスは、元々単離された株であり、ＮＩＨ ＧｅｎＢａｎｋ Ｌｏｃｕｓ ＮＣ＿０４５５１２によって、Ｇｌｏｂａｌ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｏｎ Ｓｈａｒｉｎｇ Ａｖｉａｎ Ｉｎｆｌｕｅｎｚａ Ｄａｔａ（ＧＩＳＡＩＤ）によるｈＣｏＶ－１９参照配列として記載される。
【0046】
本明細書で使用される場合、「治療」または「治療すること」は、臨床結果を含む有益なまたは所望の結果を得るためのアプローチである。本出願の目的のため、有益なまたは所望の臨床結果としては、疾患の発症を防止すること、疾患に対する免疫を強化すること、疾患から生じる１つ以上の症状を減少させること、疾患の程度を減弱させること、疾患を安定化すること（例えば、疾患の悪化を防止または遅延させること）、疾患の広がりもしくは伝染を防止もしくは遅延させること、疾患の発生もしくは再発（すなわち、感染または再感染）を防止もしくは遅延させること、疾患の進行を遅延もしくは減速させること、疾患状態を改善すること、疾患を治療するために必要とされる１つ以上の他の医薬品の用量を減少させること、疾患の進行を遅延させること、生活の質を向上させること、及び／または生存期間を延長させること、のうちの１つ以上が挙げられるがこれらに限定されない。また、「治療」によって包含されるのは、疾患の病理学的結果の低減である。本出願の方法は、治療のこれらの態様のうちのいずれか１つ以上を企図する。
【0047】
本明細書で使用される「防止すること」は、疾患にかかりやすいか、または疾患のリスクがあり得るが、未だ疾患に罹患していないか、または疾患を有すると診断されていない対象における、疾患の発生または再発に関する予防を提供することを含む。
【0048】
「ワクチン」という用語は、最も広い意味で使用され、具体的には、特定の感染性疾患に対する能動的な獲得免疫を提供する、任意の生物学的調製物を網羅する。
【0049】
本明細書で使用される場合、「ワクチン接種」という用語は、ウイルスなどの病原体に曝露したか、または曝露し得る個体において、感染を防止するか、予防的に免疫化するか、伝播を防止するか、重症度を低減するか、免疫応答を誘発するか、または感染を治療することを必要とする個体においてそれを行うために、個体に治療有効量のワクチンを投与するように設計された臨床介入を指す。例えば、効果的にワクチン接種された個体は、ワクチン接種されていない個体と比較して、感染によって引き起こされる病気に罹患しないことができるか、または穏やかな病気にのみ罹患する場合がある。
【0050】
本明細書で使用される場合、「ヘテロサブタイプ免疫」は、複数のウイルス種、サブタイプ、または亜種にわたって対象において免疫を誘導する能力を指す。この点で、１つのウイルスサブタイプ（例えば、インフルエンザＡウイルスサブタイプＨ５Ｎ１）を標的とするように設計されたワクチンは、例えば、遺伝的類似性のために、ワクチンによって特異的に標的とされなかった他のウイルスサブタイプ（例えば、ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及び／またはＨ７Ｎ９）に対する交差保護を同時に提供するであろう。ヘテロサブタイプ免疫は、遺伝的に密接に関連する、同じ属の異なる種のいくつかのウイルスにさらに拡大し得る。
【0051】
本明細書で使用される場合、「多価」という用語は、ワクチン組成物と併せて使用される場合、１つのワクチン分子を使用して、２つ、３つ、またはそれ以上の異なるウイルス種に対する免疫を誘導することが可能なワクチン組成物を指す。これには、同じウイルス属もしくはウイルスファミリーからのものである、及び／または異なるウイルスファミリーもしくはウイルス属からのものであるウイルス種が含まれる。例えば、２つ以上のウイルスは、ヘテロサブタイプ免疫を生成する可能性が低いように、遺伝的に異なり得る。
【0052】
本明細書で使用される場合、「有効量」は、対象において、ウイルス感染をワクチン接種するかまたは治療するのに有効な薬剤または薬物の量を指す。「治療有効量」は、化合物または細胞、疾患及びその重症度、ならびに治療される対象の年齢、体重などに応じて変動し得る。
【0053】
「個体」、「対象」及び「患者」という用語は、ヒトを含む哺乳動物を記載するために本明細書で互換的に使用される。いくつかの実施形態では、個体は、ヒトである。いくつかの実施形態では、個体は、非ヒトである。いくつかの実施形態では、個体は、呼吸器感染に罹患している。いくつかの実施形態では、個体は、治療を必要とする。
【0054】
「ポリペプチド」及び「タンパク質」という用語は、アミノ酸残基のポリマーを指すために互換的に使用され、最小長に限定されない。アミノ酸残基のそのようなポリマーは、天然または非天然のアミノ酸残基を含有し得、アミノ酸残基のペプチド、オリゴペプチド、二量体、三量体、及び多量体が挙げられるが、これらに限定されない。全長タンパク質及びその断片の両方が定義に包含される。用語は、ポリペプチドの発現後改変、例えば、グリコシル化、シアリル化、アセチル化、リン酸化なども含む。さらに、本出願の目的のために、「ポリペプチド」は、タンパク質が所望の活性を維持する限り、天然配列への欠失、付加、及び（概して、性質が保存的な）置換などの修飾を含むタンパク質を指す。これらの修飾は、部位特異的変異誘発を通じて意図的であり得るか、またはタンパク質を生成する宿主の変異もしくはＰＣＲ増幅に起因するエラーなどを通じた偶発的なものであり得る。
【0055】
本明細書で使用される場合、「実質的に同様の」または「実質的に同じ」という用語は、２つ以上の数値間で同一性が十分に高い程度を示すので、当業者は、２つ以上の値の間の差が、当該値によって測定される生物学的特徴の文脈内で、生物学的及び／または統計的有意性がほとんどまたは全くないとみなすであろう。いくつかの実施形態では、２つ以上の実質的に同様の値は、約５％、１０％、１５％、２０％、２５％、または５０％のうちのいずれか１つ以下だけ異なる。
【0056】
ポリペプチド「バリアント」は、最大パーセントの配列同一性を達成するために、配列を整列させ、必要に応じてギャップを導入した後に、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有し、かつ天然の配列ポリペプチドと１００％以下の同一性を有する、生物学的に活性なポリペプチドを意味する。そのようなバリアントは、例えば、ポリペプチドのＮ末端またはＣ末端で１つ以上のアミノ酸残基が付加または欠失されるポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、バリアントは、少なくとも約８０％のアミノ酸配列同一性を有する。いくつかの実施形態では、バリアントは、少なくとも約９０％のアミノ酸配列同一性を有する。いくつかの実施形態では、バリアントは、天然配列ポリペプチドと少なくとも約９５％のアミノ酸配列同一性を有する。
【0057】
本明細書で使用される場合、ペプチド、ポリペプチド、または抗体配列に関する「アミノ酸配列同一性パーセント（％）」は、最大パーセントの配列同一性を達成するために、配列を整列させ、必要に応じてギャップを導入した後に、配列同一性の一部として任意の保存的置換を考慮せずに、特定のペプチドまたはポリペプチド配列中のアミノ酸残基と同一である候補配列中のアミノ酸残基のパーセンテージとして定義される。アミノ酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアラインメントは、当該技術分野の範囲内である様々な方式で、例えば、公的に入手可能なコンピュータソフトウェア、例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ－２、ＡＬＩＧＮ、またはＭＥＧＡＬＩＧＮ（商標）（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェアを使用して達成することができる。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大のアラインメントを達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメータを決定することができる。
【0058】
本明細書で使用される場合、核酸、ＤＮＡ、またはＲＮＡ配列に関する「核酸配列同一性パーセント（％）」及び「ホモロジー」は、最大パーセントの配列同一性を達成するために、配列を整列させ、必要に応じてギャップを導入した後に、配列同一性の一部として任意の保存的置換を考慮せずに、特定のＤＮＡまたはＲＮＡ配列中の核酸ヌクレオチドと同一である候補配列中の核酸ヌクレオチドのパーセンテージとして定義される。核酸配列同一性パーセントを決定する目的のためのアラインメントは、当該技術分野の範囲内である様々な方式で、例えば、ＢＬＡＳＴ、ＢＬＡＳＴ－２、ＡＬＩＧＮ、またはＭＥＧＡＬＩＧＮ（商標）（ＤＮＡＳＴＡＲ）ソフトウェアなどの公的に入手可能なコンピュータソフトウェアを使用して達成することができる。当業者は、比較される配列の全長にわたって最大のアラインメントを達成するために必要な任意のアルゴリズムを含む、アラインメントを測定するための適切なパラメータを決定することができる。
【0059】
別途特定されない限り、「アミノ酸配列をコードするヌクレオチド配列」には、互いのバージョンを変性させ、同じアミノ酸配列をコードする全てのヌクレオチド配列が含まれる。タンパク質またはＲＮＡをコードするヌクレオチド配列という語句はまた、タンパク質をコードするヌクレオチド配列がいくつかのバージョンにおいてイントロン（複数可）を含有し得る程度までイントロンを含み得る。
【0060】
「操作可能に連結された」という用語は、調節配列と異種核酸配列との間の機能的連結を指し、異種核酸配列の発現が生じる。例えば、第１の核酸配列が第２の核酸配列との機能的関係に置かれる場合、第１の核酸配列は、第２の核酸配列と操作可能に連結している。例えば、プロモータは、プロモータがコード配列の転写または発現に影響を与える場合、機能的に連結している。一般に、操作可能に連結されたＤＮＡ配列は、連続しており、２つのタンパク質コード領域を結合する必要がある場合は、同じリーディングフレーム内にある。
【0061】
「ベクター」という用語は、宿主細胞内で増殖され得る、クローン化されたポリヌクレオチド（複数可）を含有するように操作され得るポリヌクレオチドを説明するために使用される。ベクターは、以下の要素：複製起点、目的のポリペプチドの発現を調節する１つ以上の調節配列（例えば、プロモータ及び／またはエンハンサなど）、及び／または１つ以上の選択可能なマーカー遺伝子（例えば、抗生物質耐性遺伝子、及び比色アッセイで使用することができる遺伝子、例えば、β－ガラクトシダーゼなど）、のうちの１つ以上を含み得る。「発現ベクター」という用語は、宿主細胞において目的のポリペプチドを発現させるために使用されるベクターを指す。
【0062】
「細胞」という用語は、初代対象細胞及びその子孫を含む。「宿主細胞」は、ベクターまたは単離ポリヌクレオチドのレシピエントとなり得るか、またはこれである細胞を指す。宿主細胞は、原核細胞または真核細胞であってよい。例示的な真核細胞としては、霊長類または非霊長類動物細胞などの哺乳動物細胞；酵母などの真菌細胞；植物細胞；及び昆虫細胞が挙げられる。非限定的な例示的な哺乳動物細胞としては、ＮＳＯ細胞、ＰＥＲ．Ｃ６（登録商標）細胞（Ｃｒｕｃｅｌｌ）、ならびに２９３及びＣＨＯ細胞、ならびにそれぞれ２９３－６Ｅ細胞及びＤＧ４４細胞などのそれらの誘導体が挙げられるが、これらに限定されない。
【0063】
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される」または「薬理学的に適合する」とは、生物学的ではないかまたは望ましくない材料を意味し、例えば、材料は、任意の顕著な望ましくない生物学的影響を引き起こすことなく、またはそれを含有する組成物の他の構成要素のうちのいずれかと有害な様式で相互作用することなく、患者に投与される医薬組成物に組み込むことができる。薬学的に許容される担体または賦形剤は、好ましくは、毒性試験及び製造試験の必要基準を満たしており、及び／または米国食品医薬品局によって作成されたＩｎａｃｔｉｖｅ Ｉｎｇｒｅｄｉｅｎｔ Ｇｕｉｄｅに収載されている。
【0064】
本明細書に記載の本発明の実施形態は、「からなる」及び／または「から本質的になる」実施形態を含むことが理解される。
【0065】
本明細書における、「約」の値またはパラメータへの言及は、その値またはパラメータ自体に対する変動を含む（及び説明する）。例えば、「約Ｘ」を指す記載は、「Ｘ」の記載を含む。
【0066】
本明細書で使用される「約Ｘ～Ｙ」という用語は、「約Ｘ～約Ｙ」と同じ意味を有する。
【0067】
本明細書で使用される場合、「ｎｏｔ」の値またはパラメータへの言及は、一般的に、値またはパラメータ「以外」を意味し、それについて記載している。例えば、Ｘ型のがんを治療するために本方法を使用しないとは、Ｘ型以外の種類のがんを治療するために本方法を使用することを意味する。
【0068】
本明細書及び添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」は、文脈が明示的に別途示さない限り、複数の指示対象を含む。
【0069】
ＩＩ．ナノ複合体ワクチン組成物
本明細書で提供されるのは、１つ以上のナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ｉ）核酸を含む足場分子と、ｉｉ）核酸に結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合した標的抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物である。足場分子は、ＲＮＡ分子またはＤＮＡ分子を含み得る。いくつかの実施形態では、足場分子は、ウイルスＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ウイルス抗原である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。
本明細書で提供されるのは、１つ以上のナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ｉ）核酸を含む足場分子と、ｉｉ）核酸に結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合した標的抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物である。足場分子は、ＲＮＡ分子またはＤＮＡ分子を含み得る。いくつかの実施形態では、足場分子は、ウイルスＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ウイルス抗原である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。
【0070】
いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）のモル比は、少なくとも約５：１である。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、約６：１～約１０：１、約８：１～約１２：１、または約６：１～約８：１のうちのいずれかなどの、約６：１～約１２：１である。例えば、いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、約５：１、６：１、７：１、８：１、９：１、１０：１、１１：１、または１２：１のうちのいずれか、またはこれらの比のうちのいずれかの間の範囲である。
【0071】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＲＢＤペプチドを含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原は、配列番号１４もしくは１５のアミノ酸配列、または配列番号１４もしくは１５に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルス抗原は、例えば、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含むインフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）を含む。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルス抗原は、インフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）抗原、例えば、配列番号１９もしくは２０のアミノ酸配列、または配列番号１９もしくは２０のアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含むＩＢＶウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＲＳＶタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＲＳＶウイルス抗原は、配列番号２１もしくは２２のアミノ酸配列、または配列番号２１もしくは２２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＨＣＶタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＨＣＶウイルス抗原は、配列番号２３もしくは２４のアミノ酸配列、または配列番号２３もしくは２４に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。
【0072】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１２のアミノ酸配列、または配列番号１２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、例えば、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。
【0073】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶ（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、またはＨ７Ｎ９）に由来する、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１３のアミノ酸配列、または配列番号１３に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。
【0074】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルスＲＮＡが、ウイルスゲノムの非翻訳領域（例えば、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域）を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のゲノムのウイルス遺伝子の非翻訳領域（例えば、５’非翻訳領域または３’非翻訳領域）を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（例えば、配列番号２５に記載されるような）のゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルスＲＮＡが、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＩＡＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶのゲノムの非翻訳領域（例えば、５’非翻訳領域または３’非翻訳領域）を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶのゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む（例えば、配列番号３０に記載されるような）。したがって、いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルスＲＮＡが、配列番号３０に記載のＩＡＶゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００、または約２００～約３００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。
【0075】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来し、ウイルスＲＮＡが、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２遺伝子またはＩＡＶ遺伝子の５’または３’ＵＴＲなど）を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来し、ウイルスＲＮＡが、（ａ）ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２参照配列：配列番号２５）のゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、ヌクレオチド１～２６６）または（ｂ）ＩＡＶ（ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９参照配列：配列番号３０）のゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、ヌクレオチド１～３２６）を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１２のアミノ酸配列、または配列番号１２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、例えば、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＲＢＤペプチドを含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＲＳＶタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＨＣＶタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。
【0076】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶ（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、またはＨ７Ｎ９）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２遺伝子またはＩＡＶ遺伝子の５’または３’ＵＴＲなど）を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶに由来し、ウイルスＲＮＡが、ａ）ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２参照配列：配列番号２５）のゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、ヌクレオチド１～２６６）または（ｂ）ＩＡＶ（ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９参照配列：配列番号３０）のゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、ヌクレオチド１～３２６）を含む、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１３のアミノ酸配列、または配列番号１３に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、例えば、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＲＢＤペプチドを含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＲＳＶタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＨＣＶタンパク質またはその断片もしくはバリアント、例えば、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。
【0077】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（例えば、配列番号１２を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号２５のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６）を含み、ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、ＲＢＤペプチドを含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原は、配列番号１４もしくは１５のアミノ酸配列、または配列番号１４もしくは１５に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス株、例えば、異なるウイルス亜種、バリアント、サブバリアント、またはサブタイプ（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２バリアント、例えば、Ｂ．１．１．７、Ｂ．１．３５１、Ｂ．１．５２６、Ｂ１．５２６．１、Ｂ１．６１７、Ｂ．１．６１７．１、Ｂ．１．６１７．２、Ｂ１．６１７．３、Ｐ．２、Ｐ．１、もしくはＢ．１．１．２８．１、Ａ．２３．１、ＣＡＬ．２０Ｃ、Ｂ．１．４２７、Ｂ．１．４２９、Ｂ．１．５２５、ＢＡ．２、ＢＡ．５、ＢＡ．２．７５．２、ＢＱ．１、ＢＱ．１．１、ＸＢＢ、及び／またはＰ．１．３５１）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルス株に由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号１または２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約３００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。
【0078】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（例えば、配列番号１２を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号２５のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６）を含み、ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＩＡＶまたはＩＢＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含むＩＡＶ抗体である。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号２６または２７のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１９もしくは２０のアミノ酸配列、または配列番号１９もしくは２０に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含むＩＢＶ抗原である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、及び／またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株（例えば、ウイルスサブタイプまたはウイルス亜種）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約３００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。
【0079】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（例えば、配列番号１２を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号２５のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６）を含み、ウイルス抗原が、ＲＳＶウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ＲＳＶウイルス抗原は、配列番号２１もしくは２２のアミノ酸配列、または配列番号２１もしくは２２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、及び／またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株（例えば、ウイルスサブタイプまたはウイルス亜種）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号８または９のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。
【0080】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（例えば、配列番号１２を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号２５のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６）を含み、ウイルス抗原が、ＨＣＶウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ＨＣＶウイルス抗原は、配列番号２３もしくは２４のアミノ酸配列、または配列番号２３もしくは２４に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、及び／またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株（例えば、ウイルスサブタイプまたはウイルス亜種）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号１０または１１のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。
【0081】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶ（例えば、配列番号１３を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＩＡＶゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号３０のＩＡＶゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６）を含み、ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアント）であり、ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、ＲＢＤペプチドを含む、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原は、配列番号１４もしくは１５のアミノ酸配列、または配列番号１４もしくは１５に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合される。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、及び／またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株（例えば、ウイルスサブタイプまたはウイルス亜種）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号２８または２９のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。
【0082】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶ（例えば、配列番号１３を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＩＡＶゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号３０のＩＡＶゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６）を含み、ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＩＡＶまたはＩＢＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むＩＡＶ抗体、または配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号３～５からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１９もしくは２０のアミノ酸配列を含むＩＢＶ抗原、または配列番号１９もしくは２０に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号６または７のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及びウイルス抗原は、同じウイルス株に由来する（例えば、ウイルス亜種またはウイルスサブタイプ）。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス抗原は、同じウイルス株に由来し、ウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。
【0083】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶに由来し（例えば、配列番号１３を含む）、ウイルスＲＮＡが、ＩＡＶゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号３０のＩＡＶゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６）を含み、ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアント）であり、ウイルス抗原が、ＲＳＶウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ＲＳＶウイルス抗原は、配列番号２１もしくは２２のアミノ酸配列、または配列番号２１もしくは２２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、及び／またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株（例えば、ウイルスサブタイプまたはウイルス亜種）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。
【0084】
いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ナノ複合体が、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含み、ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶ（例えば、配列番号１３を含む）に由来し、ウイルスＲＮＡが、ＩＡＶゲノムの遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、配列番号３０のＩＡＶゲノム配列のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６）を含み、ウイルス抗原が、ＨＣＶウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアント（例えば、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアント）である、ワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、ＨＣＶウイルス抗原は、配列番号２３もしくは２４のアミノ酸配列、または配列番号２３もしくは２４に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ、ウイルス核タンパク質、及び／またはウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスファミリー、属、種、及び／またはサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルスに由来し、ウイルス抗原は、異なるウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、異なるウイルス株（例えば、ウイルスサブタイプまたはウイルス亜種）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡ及びウイルス核タンパク質は、同じウイルス株に由来する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１（例えば、約６：１～約１２：１）である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約２００～約５００）ヌクレオチド長である。
【0085】
アダプタ－抗原ポリペプチド
いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、核酸（例えば、ＲＮＡまたはＤＮＡ）に結合することが可能である核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）に融合した標的抗原を含む。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ウイルス抗原である。いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、ウイルスＲＮＡ、例えば、ミニウイルスＲＮＡである。いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、非ウイルスＲＮＡである。いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、宿主ＲＮＡである。いくつかの実施形態では、標的抗原は、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）のＮ末端に融合している。いくつかの実施形態では、標的抗原は、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、標的抗原と核タンパク質とを接続するリンカー（例えば、ペプチドリンカー）が存在する。アダプタ－抗原ポリペプチド構成要素間に所望の間隔及び／またはアダプタ－抗原ポリペプチドの柔軟性を付与することができる任意のリンカーが、本明細書で使用され得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、ＧＳのアミノ酸配列を含む。
いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、核酸（例えば、ＲＮＡまたはＤＮＡ）に結合することが可能である核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）に融合した標的抗原を含む。いくつかの実施形態では、標的抗原は、ウイルス抗原である。いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、ウイルスＲＮＡ、例えば、ミニウイルスＲＮＡである。いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、非ウイルスＲＮＡである。いくつかの実施形態では、ＲＮＡは、宿主ＲＮＡである。いくつかの実施形態では、標的抗原は、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）のＮ末端に融合している。いくつかの実施形態では、標的抗原は、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、標的抗原と核タンパク質とを接続するリンカー（例えば、ペプチドリンカー）が存在する。アダプタ－抗原ポリペプチド構成要素間に所望の間隔及び／またはアダプタ－抗原ポリペプチドの柔軟性を付与することができる任意のリンカーが、本明細書で使用され得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、ＧＳのアミノ酸配列を含む。
【0086】
核タンパク質
いくつかの実施形態では、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）は、核酸、例えば、一本鎖または二本鎖のＤＮＡまたはＲＮＡに結合することが可能なドメイン及び／またはサブドメインを含む。いくつかの実施形態では、核タンパク質は、ＲＮＡ結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＲＮＡ、例えば、ウイルスＲＮＡ（例えば、ミニウイルスＲＮＡ）、非ウイルスＲＮＡ（例えば、宿主ＲＮＡ）に結合することが可能である。いくつかの実施形態では、核酸（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、足場分子として作用する。
いくつかの実施形態では、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）は、核酸、例えば、一本鎖または二本鎖のＤＮＡまたはＲＮＡに結合することが可能なドメイン及び／またはサブドメインを含む。いくつかの実施形態では、核タンパク質は、ＲＮＡ結合ドメインを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＲＮＡ、例えば、ウイルスＲＮＡ（例えば、ミニウイルスＲＮＡ）、非ウイルスＲＮＡ（例えば、宿主ＲＮＡ）に結合することが可能である。いくつかの実施形態では、核酸（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、足場分子として作用する。
【0087】
いくつかの実施形態では、核タンパク質、例えば、ウイルス核タンパク質は、ウイルスＲＮＡと天然に会合している。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドの複数のコピー（例えば、アダプタ－抗原ポリペプチドの２、３、４、５、６、７、９、１０、２０、３０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、またはそれ以上のコピー）は、単一のウイルスＲＮＡ足場に結合している。
【0088】
いくつかの実施形態では、ＲＮＡ足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、アジュバントとしても作用するので、付着したアダプタ－抗原ポリペプチドがウイルスＲＮＡを包み込み、それによって、従来のワクチンの粘膜投与の際に従来の外因性アジュバントによって引き起こされる炎症などの刺激性応答を防止するようにアジュバントをマスクする。いくつかの実施形態では、付着したアダプタ－抗原ポリペプチドは、個体（例えば、ヒト個体）へのワクチン組成物の粘膜投与の際の炎症性サイトカインの産生（例えば、過剰産生）を含む、自然免疫応答（例えば、過剰自然免疫応答）の誘導を防止する。したがって、いくつかの実施形態では、本明細書で提供されるワクチン組成物は、個体（例えば、ヒト個体）への粘膜投与の際に、当該技術分野で現在知られているような従来のアジュバントを含むワクチンよりも、誘導される副作用がより少ない（または全くない）。
【0089】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）によって直接食作用を受ける。いくつかの実施形態では、ＲＮＡ足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、ワクチン組成物の食作用の際にＡＰＣを活性化する。いくつかの実施形態では、付着したアダプタ－抗原ポリペプチドは、ＡＰＣ食作用の前に自然免疫応答の誘導を防止する。
【0090】
いくつかの実施形態では、核タンパク質は、本明細書に記載の任意の例示的なウイルスを含む、既知のまたは発見されるようになる任意のウイルスなどのウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質は、ウイルスタンパク質、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ＲＢＤの一部分を含む（またはそれから本質的になるか、またはそれからなる）。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、核タンパク質（例えば、ウイルス核タンパク質）は、ＩＡＶ（例えば、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９、例えば、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９／ＺＪ）に由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質は、ＩＡＶウイルスタンパク質の一部を含む（またはそれから本質的になるか、またはそれからなる）。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１３のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、標的抗原ペプチド、例えば、以下に記載の標的抗原ペプチドのうちのいずれかなどのウイルス抗原ペプチドに融合している。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び標的抗原は、同じソース、例えば、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び標的抗原は、異なるソース、例えば、異なるウイルス、例えば、ウイルスの異なるサブタイプ、ウイルスの異なる種、または異なるウイルスファミリーに由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び足場分子（例えば、核酸、例えば、ウイルスＲＮＡ）は、同じソース、例えば、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び足場分子（例えば、核酸、例えば、ウイルスＲＮＡ）は、異なるソース、例えば、異なるウイルス、例えば、ウイルスの異なるサブタイプ、ウイルスの異なる種、または異なるウイルスファミリーに由来する。
【0091】
標的抗原
いくつかの実施形態では、標的抗原は、ウイルス抗原である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、抗原ポリペプチド（例えば、免疫原性ポリペプチド）である。本開示のウイルス抗原は、当該技術分野で既知の、または発見されるようになる任意のウイルス抗原を含み得る。ウイルス抗原は、野生型タンパク質、または変異体もしくはバリアント形態（例えば、増加または減少した免疫原性活性を有する）であり得る。
いくつかの実施形態では、標的抗原は、ウイルス抗原である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、抗原ポリペプチド（例えば、免疫原性ポリペプチド）である。本開示のウイルス抗原は、当該技術分野で既知の、または発見されるようになる任意のウイルス抗原を含み得る。ウイルス抗原は、野生型タンパク質、または変異体もしくはバリアント形態（例えば、増加または減少した免疫原性活性を有する）であり得る。
【0092】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルスゲノムによってコードされるペプチドである。ウイルス抗原ペプチドは、約１０～約５００のアミノ酸（ａａ）、例えば約１００～約３００ａａ、約２００～約５００ａａ、約１０～約３００ａａ、約１００～約２００ａａ、約１０～約１００ａａ、約２００～約４５０ａａ、約３００～約５００ａａ、または約１０～約８０ａａの長さを有し得る。例えば、ウイルス抗原ペプチドは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１２０、１４０、１６０、１８０、２００、２２０、２４０、２６０、２８０、３００、３５０、４００、４５０、もしくは５００のアミノ酸のうちのいずれかの長さ、またはそれらのａａ長のうちのいずれかの間の範囲を有し得る。保護抗体応答を誘導する主なウイルス抗原は、脂質エンベロープを含有するウイルスの表面糖タンパク質、または二十面体ウイルスの表面上に存在するタンパク質である。ＩｇＡ抗体は、ＩｇＧ抗体と同じウイルスタンパク質を認識する。例えば、ポリクローナルＩｇＧ抗体のようなポリクローナルＩｇＡ抗体は、インフルエンザウイルスのヘマグルチニン（例えば、Ｃｌｅｍｅｎｔｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１９８６，２４（１）：１５７－１６０及びＭｕｒｐｈｙ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｆｅｃｔ Ｉｍｍｕｎ．１９８２，３６（３）：１１０８－１１０８を参照されたい）、呼吸器合胞体ウイルスのｇｐ７０（融合）及びｇｐ９０（付着糖タンパク質）（例えば、Ｍｕｒｐｈｙ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１９８６，２３（６）：１００９－１０１４を参照されたい）、Ｅｐｓｔｅｉｎ－Ｂａｒｒウイルスのｇｐ３４０（例えば、Ｙａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｉｎｔ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ １９９１，４８（１）：４５－５０を参照されたい）、ポリオウイルスのウイルスタンパク質（ＶＰ）１、ＶＰ２、及びＶＰ３（例えば、Ｚｈａｏｒｉ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ．１９８９，１５９（６）：１０１８－１０２４を参照されたい）、ならびにロタウイルスのＶＰ４またはＶＰ７（例えば、Ｃｏｎｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ．１９９１，６５（５）：２５６２－２５７１、Ｒｉｃｈａｒｄｓｏｎ ａｎｄ Ｂｉｓｈｏｐ，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．１９９０，２８（９）：１８９１－１８９７、及びＳｈａｗ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｖｉｒｏｌ．１９９１，６５（６）：３０５２－３０５９を参照されたい）を認識する。
【0093】
以下に記載のウイルスタンパク質に由来する例示的な標的抗原としては、ビリオン表面タンパク質または膜タンパク質、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイク（Ｓ；受容体結合ドメインを含む）タンパク質、インフルエンザヘマグルチニン（ＨＡ）タンパク質、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）融合（Ｆ）タンパク質、またはＣ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）エンベロープ糖タンパク質Ｅ２が挙げられる。例えば、ウイルスエンベロープ、ウイルス膜、または関連タンパク質を含む標的抗原は、宿主細胞へのウイルス進入を防止するための有益な標的であり得る。ポリメラーゼまたはウイルス核酸を含む標的抗原は、ウイルスの複製を防止するために有益であり得る。本明細書に記載のワクチン組成物は、本明細書に記載されるウイルス抗原のうちのいずれかなどの目的の抗原を標的とするように設計することができる。例示的な標的ウイルスに由来するウイルス抗原は、例示的な標的ウイルスによってコードされる任意のタンパク質を含み得るので、タンパク質が個体（例えば、ヒト個体）内で免疫学的応答を誘導することができる。
【0094】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス表面糖タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。ウイルス抗原ペプチドは、約１０～約５００のアミノ酸（ａａ）、例えば約１００～約３００ａａ、約２００～約５００ａａ、約１０～約３００ａａ、約１００～約２００ａａ、約１０～約１００ａａ、約２００～約４５０ａａ、約３００～約５００ａａ、または約１０～約８０ａａの長さを有し得る。例えば、ウイルス抗原ペプチドは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１２０、１４０、１６０、１８０、２００、２２０、２４０、２６０、２８０、３００、３５０、４００、４５０、もしくは５００のアミノ酸のうちのいずれかの長さ、またはそれらのａａ長のうちのいずれかの間の範囲を有し得る。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む（またはそれから本質的になるか、またはそれからなる）。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、ウイルスの異なるサブタイプ、ウイルスの異なる種、または異なるウイルスファミリーに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原及びウイルスＲＮＡは、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原及びウイルスＲＮＡは、異なるウイルス、例えば、ウイルスの異なるサブタイプ、ウイルスの異なる種、または異なるウイルスファミリーに由来する。
【0095】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）ペプチドを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１４もしくは１５のアミノ酸配列、または配列番号１４もしくは１５に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。
【0096】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントであり、例えば、ＩＡＶまたはＩＢＶに由来するものである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザ（例えば、ＩＡＶまたはＩＢＶ）ＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＩＡＶウイルス抗原は、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａのＩＢＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＩＢＶウイルス抗原は、配列番号１９もしくは２０のアミノ酸配列、または配列番号１９もしくは２０に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。
【0097】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）タンパク質またはその断片もしくはバリアントであり、例えば、ＲＳＶ ＡサブタイプまたはＲＳＶ Ｂサブタイプに由来するものである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＲＳＶ（例えば、サブタイプＡまたはサブタイプＢ）Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号２１もしくは２２のアミノ酸配列、または配列番号２１もしくは２２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。
【0098】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）タンパク質またはその断片もしくはバリアントであり、例えば、ＨＣＶ遺伝子型１ａまたはＨＣＶ遺伝子型２ａに由来するものである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＨＣＶ（例えば、遺伝子型１ａまたは２ａ）Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号２３もしくは２４のアミノ酸配列、または配列番号２３もしくは２４に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。
【0099】
例示的なウイルス
ナノ複合体を含むワクチン組成物は、任意のウイルス、例えば、任意の配列決定されたウイルスを標的とする（例えば、免疫応答を誘導する、または免疫を構築する）ように設計され得る。標的化されたウイルスは、ＤＮＡウイルスまたはＲＮＡウイルスであり得る。例えば、本明細書に記載のワクチン組成物は、Ａ型インフルエンザウイルス（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ７Ｎ９）、Ｂ型インフルエンザウイルス、Ｃ型インフルエンザウイルス、Ｄ型インフルエンザウイルス、エボラウイルス、マールブルグウイルス、黄熱ウイルス、ウエストナイルウイルス、デングウイルス、ジカウイルス、Ｂ型ヘパシウイルス、Ｃ型ヘパシウイルス、Ａ型ペギウイルス、Ｂ型ペギウイルス、Ｃ型ペギウイルス、Ａ型ペスチウイルス、Ｃ型ペスチウイルス、アルファコロナウイルス２２９Ｅ（ＨＣｏＶ－２２９Ｅ）、ニューヘブンコロナウイルスＮＬ６３（ＨＣｏＶ－ＮＬ６３）、ベータコロナウイルスＯＣ４３（ＨＣｏＶ－ＯＣ４３）、コロナウイルスＨＫＵ１（ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１）、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ）、中東呼吸器症候群コロナウイルス（ＭＥＲＳ－ＣｏＶ）、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）、痘そうウイルス（天然痘ウイルス）、ワクシニアウイルス、牛痘ウイルス、サル痘ウイルス、ｏｒｆウイルス、偽牛痘、牛丘疹性口内炎ウイルス、タナポックスウイルス、ヤバ猿腫瘍ウイルス、伝染性軟属腫ウイルス（ＭＣＶ）、チクングニア熱、ノロウイルス、エンテロウイルス、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、フニンウイルス、ラッサ熱ウイルス、ニパウイルス、またはヘンドラウイルスなどの、同定されているかまたは同定されていない属、種、サブタイプ、株、及びそれらの再集合体を含む、Ｏｒｔｈｏｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅ、Ｆｉｌｏｖｉｒｉｄａｅ、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ、Ｃｏｒｏｎａｖｉｒｉｄａｅ、またはＰｏｘｖｉｒｉｄａｅファミリーのうちのいずれか１つ、またはそれらの任意の組み合わせから選択されるウイルスを標的とするように設計され得る。例として、ウイルス株、バリアント、亜種、または関連する種を含む４つのウイルス（すなわち、サルベコウイルス（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス）、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、及びＣ型肝炎ウイルス）が本明細書に記載される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のナノ複合体は、本明細書に記載のウイルスのうちのいずれかを標的とする。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／またはウイルスＲＮＡもしくはＤＮＡは、本明細書に記載のウイルスのうちのいずれかに由来する。
ナノ複合体を含むワクチン組成物は、任意のウイルス、例えば、任意の配列決定されたウイルスを標的とする（例えば、免疫応答を誘導する、または免疫を構築する）ように設計され得る。標的化されたウイルスは、ＤＮＡウイルスまたはＲＮＡウイルスであり得る。例えば、本明細書に記載のワクチン組成物は、Ａ型インフルエンザウイルス（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ７Ｎ９）、Ｂ型インフルエンザウイルス、Ｃ型インフルエンザウイルス、Ｄ型インフルエンザウイルス、エボラウイルス、マールブルグウイルス、黄熱ウイルス、ウエストナイルウイルス、デングウイルス、ジカウイルス、Ｂ型ヘパシウイルス、Ｃ型ヘパシウイルス、Ａ型ペギウイルス、Ｂ型ペギウイルス、Ｃ型ペギウイルス、Ａ型ペスチウイルス、Ｃ型ペスチウイルス、アルファコロナウイルス２２９Ｅ（ＨＣｏＶ－２２９Ｅ）、ニューヘブンコロナウイルスＮＬ６３（ＨＣｏＶ－ＮＬ６３）、ベータコロナウイルスＯＣ４３（ＨＣｏＶ－ＯＣ４３）、コロナウイルスＨＫＵ１（ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１）、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ）、中東呼吸器症候群コロナウイルス（ＭＥＲＳ－ＣｏＶ）、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）、痘そうウイルス（天然痘ウイルス）、ワクシニアウイルス、牛痘ウイルス、サル痘ウイルス、ｏｒｆウイルス、偽牛痘、牛丘疹性口内炎ウイルス、タナポックスウイルス、ヤバ猿腫瘍ウイルス、伝染性軟属腫ウイルス（ＭＣＶ）、チクングニア熱、ノロウイルス、エンテロウイルス、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、フニンウイルス、ラッサ熱ウイルス、ニパウイルス、またはヘンドラウイルスなどの、同定されているかまたは同定されていない属、種、サブタイプ、株、及びそれらの再集合体を含む、Ｏｒｔｈｏｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅ、Ｆｉｌｏｖｉｒｉｄａｅ、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ、Ｃｏｒｏｎａｖｉｒｉｄａｅ、またはＰｏｘｖｉｒｉｄａｅファミリーのうちのいずれか１つ、またはそれらの任意の組み合わせから選択されるウイルスを標的とするように設計され得る。例として、ウイルス株、バリアント、亜種、または関連する種を含む４つのウイルス（すなわち、サルベコウイルス（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス）、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、及びＣ型肝炎ウイルス）が本明細書に記載される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のナノ複合体は、本明細書に記載のウイルスのうちのいずれかを標的とする。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／またはウイルスＲＮＡもしくはＤＮＡは、本明細書に記載のウイルスのうちのいずれかに由来する。
【0100】
ｉ．サルベコウイルス
サルベコウイルスは、ウイルスのＣｏｒｏｎａｖｉｒｉｄａｅファミリー内のベータコロナウイルス属の亜属である。サルベコウイルスの例としては、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ／ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＧＸ－Ｐ５Ｌ、Ｂａｔ ＣｏＶ ＢｔＫＹ７２、Ｂａｔ ＣｏＶ ＢＭ４８－３１、１６ＢＯ１３３、ＪＴＭＣ１５、Ｂａｔ ＳＡＲＳ ＣｏＶ Ｒｆ１、ＢｔＣｏＶ ＨＫＵ３、ＬＹＲａ１１、Ｂａｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ／Ｒｐ３、Ｂａｔ ＳＬ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３１Ｃ、Ｂａｔ ＳＬ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３４Ｃ、ＳＨＣ０１４－ＣｏＶ、ＷＩＶ１、ＷＩＶ１６、Ｃｉｖｅｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、（Ｂａｔ）Ｒｃ－ｏ３１９、Ｂａｔ ＳＬ－ＺＸＣ２１、Ｂａｔ ＳＬ－ＺＣ４５、Ｐａｎｇｏｌｉｎ ＳＡＲＳｒ－ＣｏＶ－ＧＸ、Ｐａｎｇｏｌｉｎ ＳＡＲＳｒ－ＣｏＶ－ＧＤ、Ｒｓ７３２７、Ｒｓ４２３１、Ｒｓ４０８４、Ｒｆ４０９２、ＪＬ２０１２、２７３－２００５、ＨｅＢ２０１３、ＨｕＢ２０１３、Ｒｓ４２４７、Ｌｏｎｇｑｕａｎ－１４０、ＨＫＵ３－１、ＧＸ２０１３、Ｓｈａａｎｘｉ２０１１、２７９－２００５、Ａｓ６５２６、Ｙｕｎｎａｎ２０１１、Ｒｓ４２３７、Ｒｓ４０８１、Ｂａｔ ＲｓｈＳＴＴ１８２、Ｂａｔ ＲｓｈＳＴＴ２００、（Ｂａｔ）ＲａｃＣＳ２０３、（Ｂａｔ）ＲｍＹＮ０２、（Ｂａｔ）ＲｐＹＮ０６、ＹＮ２０１３、（Ｂａｔ）ＲａＴＧ１３、（Ｂａｔ）ＢＡＮＡＬ－５２、及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２と組み合わさった懸念されるバリアント（ＶＯＣ）（例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Ｎａｔｕｒｅ（２０２２）６０３：９１３－９１８を参照されたい）が挙げられるが、これらに限定されない。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２バリアントは、以下の実証の際に「懸念されるバリアント」（ＶＯＣ）であると定義される：（ｉ）伝播性の増加もしくは疫学における他の有害な変化、（ｉｉ）毒性の増加もしくは臨床的疾患症状における変化、（ｉｉｉ）自然感染に由来する免疫からの脱出、及び／または（ｉｖ）公衆衛生、もしくはワクチン接種、現在の臨床使用における治療などの臨床的対抗措置、影響が基準によって容易に緩和されない場合の試験、ならびに検査室品質及び規制措置などの有効性の減少。サルベコウイルスは、一般に、アンジオテンシン変換酵素２（ＡＣＥ２）受容体に結合することによって宿主細胞に進入する、エンベロープ化されたポジティブセンスの一本鎖ＲＮＡウイルスであると理解されている。例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２は、前立腺、精巣、卵巣、子宮、乳房、肺、口腔、心臓、鼻腔、回腸、腸、結腸、胃、甲状腺、肝臓、胆嚢、膵臓、腎臓、膀胱、角膜、神経、胎盤などの様々な組織に見出すことができる上皮細胞によって発現される、ＡＣＥ２とＴＭＰＲＳＳ２の両方に結合する。受容体発現レベルは、高血圧、ＣＯＰＤ、喘息、心血管疾患、糖尿病、クローン病（ＣＤ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）などが挙げられるが、これらに限定されない、様々な炎症性疾患状態で増加する。結果として、これらもしくは同様の疾患のうちのいずれか、または免疫不全疾患を有する個体は、サルベコウイルス感染及びその合併症のリスクが増加する。
サルベコウイルスは、ウイルスのＣｏｒｏｎａｖｉｒｉｄａｅファミリー内のベータコロナウイルス属の亜属である。サルベコウイルスの例としては、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ／ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＧＸ－Ｐ５Ｌ、Ｂａｔ ＣｏＶ ＢｔＫＹ７２、Ｂａｔ ＣｏＶ ＢＭ４８－３１、１６ＢＯ１３３、ＪＴＭＣ１５、Ｂａｔ ＳＡＲＳ ＣｏＶ Ｒｆ１、ＢｔＣｏＶ ＨＫＵ３、ＬＹＲａ１１、Ｂａｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ／Ｒｐ３、Ｂａｔ ＳＬ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３１Ｃ、Ｂａｔ ＳＬ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３４Ｃ、ＳＨＣ０１４－ＣｏＶ、ＷＩＶ１、ＷＩＶ１６、Ｃｉｖｅｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、（Ｂａｔ）Ｒｃ－ｏ３１９、Ｂａｔ ＳＬ－ＺＸＣ２１、Ｂａｔ ＳＬ－ＺＣ４５、Ｐａｎｇｏｌｉｎ ＳＡＲＳｒ－ＣｏＶ－ＧＸ、Ｐａｎｇｏｌｉｎ ＳＡＲＳｒ－ＣｏＶ－ＧＤ、Ｒｓ７３２７、Ｒｓ４２３１、Ｒｓ４０８４、Ｒｆ４０９２、ＪＬ２０１２、２７３－２００５、ＨｅＢ２０１３、ＨｕＢ２０１３、Ｒｓ４２４７、Ｌｏｎｇｑｕａｎ－１４０、ＨＫＵ３－１、ＧＸ２０１３、Ｓｈａａｎｘｉ２０１１、２７９－２００５、Ａｓ６５２６、Ｙｕｎｎａｎ２０１１、Ｒｓ４２３７、Ｒｓ４０８１、Ｂａｔ ＲｓｈＳＴＴ１８２、Ｂａｔ ＲｓｈＳＴＴ２００、（Ｂａｔ）ＲａｃＣＳ２０３、（Ｂａｔ）ＲｍＹＮ０２、（Ｂａｔ）ＲｐＹＮ０６、ＹＮ２０１３、（Ｂａｔ）ＲａＴＧ１３、（Ｂａｔ）ＢＡＮＡＬ－５２、及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２と組み合わさった懸念されるバリアント（ＶＯＣ）（例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Ｎａｔｕｒｅ（２０２２）６０３：９１３－９１８を参照されたい）が挙げられるが、これらに限定されない。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２バリアントは、以下の実証の際に「懸念されるバリアント」（ＶＯＣ）であると定義される：（ｉ）伝播性の増加もしくは疫学における他の有害な変化、（ｉｉ）毒性の増加もしくは臨床的疾患症状における変化、（ｉｉｉ）自然感染に由来する免疫からの脱出、及び／または（ｉｖ）公衆衛生、もしくはワクチン接種、現在の臨床使用における治療などの臨床的対抗措置、影響が基準によって容易に緩和されない場合の試験、ならびに検査室品質及び規制措置などの有効性の減少。サルベコウイルスは、一般に、アンジオテンシン変換酵素２（ＡＣＥ２）受容体に結合することによって宿主細胞に進入する、エンベロープ化されたポジティブセンスの一本鎖ＲＮＡウイルスであると理解されている。例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２は、前立腺、精巣、卵巣、子宮、乳房、肺、口腔、心臓、鼻腔、回腸、腸、結腸、胃、甲状腺、肝臓、胆嚢、膵臓、腎臓、膀胱、角膜、神経、胎盤などの様々な組織に見出すことができる上皮細胞によって発現される、ＡＣＥ２とＴＭＰＲＳＳ２の両方に結合する。受容体発現レベルは、高血圧、ＣＯＰＤ、喘息、心血管疾患、糖尿病、クローン病（ＣＤ）、炎症性腸疾患（ＩＢＤ）などが挙げられるが、これらに限定されない、様々な炎症性疾患状態で増加する。結果として、これらもしくは同様の疾患のうちのいずれか、または免疫不全疾患を有する個体は、サルベコウイルス感染及びその合併症のリスクが増加する。
【0101】
いくつかの実施形態では、サルベコウイルスは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ、ＲａＴＧ１３、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＧＸ－Ｐ５Ｌ、及びＳＡＲＳ－ＣｏＶと組み合わさったＶＯＣからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、サルベコウイルスは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２である。
【0102】
バリアントは、さらに、目的のバリアント、懸念されるバリアント、または重大な結果のバリアントと称され得る。いくつかの実施形態では、サルベコウイルスは、Ｂ．１．１．７バリアント、Ｂ．１．３５１バリアント、Ｂ．１．５２６バリアント、Ｂ１．５２６．１バリアント、Ｂ．１．１．５２９バリアント、Ｂ１．６１７バリアント、Ｂ．１．６１７．１バリアント、Ｂ．１．６１７．２バリアント、Ｂ１．６１７．３バリアント、Ｐ．２バリアント、Ｐ．１（Ｂ．１．１．２８．１としても知られる）バリアント、Ａ．２３．１バリアント、ＣＡＬ．２０Ｃバリアント、Ｂ．１．４２７バリアント、Ｂ．１．４２９バリアント、Ｂ．１．５２５バリアント、ＢＡ．２、ＢＡ．５バリアント、ＢＡ．２．７５．２バリアント、ＢＱ．１バリアント、ＢＱ．１．１バリアント、ＸＢＢバリアント、及びＰ．１．３５１バリアントからなる群から選択されるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２バリアントである。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルスは、ＢＡ．２、ＢＡ．５、ＢＡ．２．７５．２、ＢＱ．１、ＢＱ．１．１、またはＸＢＢのうちのいずれか１つが挙げられるが、これらに限定されないバリアントスパイク遺伝子を含む。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の他のバリアントは、当該技術分野で既知である。例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、Ｇｏｍｅｚ ｅｔ ａｌ．，Ｖａｃｃｉｎｅｓ ９（３）： ２４３，２０２１及びＴａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ８２：ｅ２７－ｅ２８，２０２１を参照されたい。
【0103】
「ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム」は、ＮＩＨ ＧｅｎＢａｎｋ Ｌｏｃｕｓ ＮＣ＿０４５５１２によって記載される２９，９０３ヌクレオチド長配列、またはＧｌｏｂａｌ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｏｎ Ｓｈａｒｉｎｇ Ａｖｉａｎ Ｉｎｆｌｕｅｎｚａ Ｄａｔａ（ＧＩＳＡＩＤ）によって記載されるｈＣｏＶ－１９参照配列（配列番号２５）を指す。コード領域を有するＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのＤＮＡ配列は、受託番号ＮＣ＿０４５５１２．２としてＮＣＢＩウェブサイトから入手可能である。ウイルスゲノムは、ウイルスタンパク質をコードすることができるオープンリーディングフレーム（ＯＲＦ）として知られるサブユニットを含む。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム内のこれらのサブユニットとしては、ＯＲＦ１ａｂ、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ、ヘリカーゼ、遺伝子Ｓ、ｎｓｐ３、ｎｓｐ４Ｂ、ｎｓｐ９、ＯＲＦ３ａ、遺伝子Ｅ、遺伝子Ｍ／ＯＲＦ５、ＯＲＦ６、ＯＲＦ７ａ、ＯＲＦ７ｂ、ＯＲＦ８、遺伝子Ｎ／ＯＲＦ９、及びＯＲＦ１０を挙げることができる。
【0104】
ＯＲＦ１ａｂは、以下の表１に示されるように、本明細書に記載の他のＯＲＦによってコードされる複数のタンパク質を包含する大きなポリタンパク質をコードする。ＮＣＢＩ受託番号ＹＰ＿００９７２５２９９．１を有するｎｓｐ３は、膜貫通ドメイン１（ＴＭ１）を含むタンパク質をコードする。ｎｓｐ３タンパク質は、Ｎ末端酸性（Ａｃ）、予測されるホスホエステラーゼ、パパイン様プロテアーゼ、Ｙドメイン、膜貫通ドメイン１（ＴＭ１）、及びアデノシン二リン酸リボース１”ホスファターゼ（ＡＤＲＰ）を含む、追加の保存ドメインを有する。ＮＣＢＩ受託番号ＹＰ＿００９７２５３００を有するｎｓｐ４ｂは、膜貫通ドメイン２（ＴＭ２）を含むタンパク質をコードする。ＮＣＢＩ受託番号ＹＰ＿００９７２５３０５．１を有するｎｓｐ９は、ｓｓＲＮＡ結合タンパク質をコードする。遺伝子Ｅ、Ｍ、Ｓ、及びＮは、それぞれ、エンベロープ、膜、スパイク、及びヌクレオカプシドタンパク質をコードする。ウイルスエンベロープタンパク質は、ウイルスアセンブリ、出芽、及びエンベロープ形成に関与する膜タンパク質である。ウイルス膜タンパク質は、ウイルスを宿主細胞に付着させ、ウイルス進入のためにウイルス膜と宿主細胞膜との間の融合を促進する。ウイルススパイクタンパク質は、宿主細胞上の特定の受容体に結合して、宿主細胞へのウイルス進入及び宿主細胞感染の開始に従事する。ウイルスヌクレオカプシドタンパク質は、ウイルスＲＮＡに結合し、ウイルスＲＮＡを封入する。一緒になって、これらの４つのタンパク質は、サルベコウイルス、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に見られる不可欠な構造タンパク質を構成する。
【表1】
【0105】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＲＢＤペプチドを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスバリアント、または異なるウイルス科、属、種、もしくは亜種に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するＲＮＡ結合ドメインを含むＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１２のアミノ酸配列、または配列番号１２に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約１０～約３００）ヌクレオチド長である。例えば、いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、もしくは５００ヌクレオチド長のうちのいずれか、またはそれらのヌクレオチド長のうちのいずれかの間の範囲である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～５０、約３０～６０、約４０～７０、約５０～８０、約６０～９０歳、約７０～１００、約１０～１００、約８０～１１０、約９０～１２０、約１００～１３０、約１１０～１４０、約１２０～１５０、約１３０～１６０、約１４０～１７０、約１５０～１８０、約１６０～１９０、約１７０～２００、約１８０～２１０、約１９０～２２０、約２００～２３０、約２１０～２４０、約２２０～２５０、約２３０～２６０、約２４０～２７０、約２５０～２８０、約２６０～２９０、約２７０～３００、約２８０～３１０、約２９０～３２０、約３００～３３０、約３１０～３４０、約３２０～３５０、約３３０～３６０、約３４０～３７０、約３５０～３８０、約３６０～３９０、約３７０～４００、約３８０～４１０、約３９０～４２０、約４００～４３０、約４１０～４４０、約４２０～４５０、約４３０～４６０、約４４０～４７０、約４５０～４８０、約４６０～４９０、または約４７０～５００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約２００～約５００（例えば、約２００～約３００）ヌクレオチド長である。例えば、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム（例えば、配列番号２５）またはその修飾されたゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む。
【0106】
ｉｉ．インフルエンザ
より一般的には流感と呼ばれるインフルエンザは、健康な小児及び成人でさえ、軽度～重度の症状、及び死亡を含む生命を脅かす合併症を引き起こし得る伝染性ウイルス感染である。インフルエンザウイルスは、ウイルスのＯｒｔｈｏｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅファミリーのメンバーである。インフルエンザウイルスの例としては、アルファインフルエンザウイルス属（Ａ型インフルエンザウイルス、またはＩＡＶ）、ベータインフルエンザウイルス属（Ｂ型インフルエンザウイルス、またはＩＢＶ）、ガンマインフルエンザウイルス属（Ｃ型インフルエンザウイルス、またはＩＣＶ）、及びデルタインフルエンザウイルス属（Ｄ型インフルエンザウイルス、またはＩＤＶ）が挙げられる。４つの種の各々は、独自の属の唯一のメンバーである。ＩＡＶ及びＩＢＶは、ヒトにおいて循環し、季節性流行を引き起こし、ＩＣＶは、主に小児において、軽度の感染を引き起こす。ＩＤＶは、ヒトに感染する場合があるが、病気を引き起こすことは知られていない。
より一般的には流感と呼ばれるインフルエンザは、健康な小児及び成人でさえ、軽度～重度の症状、及び死亡を含む生命を脅かす合併症を引き起こし得る伝染性ウイルス感染である。インフルエンザウイルスは、ウイルスのＯｒｔｈｏｍｙｘｏｖｉｒｉｄａｅファミリーのメンバーである。インフルエンザウイルスの例としては、アルファインフルエンザウイルス属（Ａ型インフルエンザウイルス、またはＩＡＶ）、ベータインフルエンザウイルス属（Ｂ型インフルエンザウイルス、またはＩＢＶ）、ガンマインフルエンザウイルス属（Ｃ型インフルエンザウイルス、またはＩＣＶ）、及びデルタインフルエンザウイルス属（Ｄ型インフルエンザウイルス、またはＩＤＶ）が挙げられる。４つの種の各々は、独自の属の唯一のメンバーである。ＩＡＶ及びＩＢＶは、ヒトにおいて循環し、季節性流行を引き起こし、ＩＣＶは、主に小児において、軽度の感染を引き起こす。ＩＤＶは、ヒトに感染する場合があるが、病気を引き起こすことは知られていない。
【0107】
Ａ型インフルエンザウイルスは、流感のパンデミックを引き起こすことが知られている唯一のインフルエンザウイルスである。ＩＡＶは、ウイルスの表面上の２つのタンパク質：ヘマグルチニン（Ｈ）及びノイラミニダーゼ（Ｎ）に基づいてサブタイプに分割される。１８の異なるヘマグルチニンサブタイプ及び１１の異なるノイラミニダーゼサブタイプ（それぞれ、Ｈ１～Ｈ１８、及びＮ１～Ｎ１１）が存在する。１３０超のＩＡＶサブタイプの組み合わせが、主に野鳥から自然おいて同定されているが、ウイルス再集合の傾向を考慮すると、より多くのＩＡＶサブタイプの組み合わせが潜在的に存在し、それによって、インフルエンザウイルスは、例えば、２つのインフルエンザウイルスが同時に宿主に感染し、遺伝子情報を交換すると、遺伝子セグメントを交換する。例えば、ごく最近、Ｈ１７Ｎ１０及びＨ１８Ｎ１１ ＩＡＶが中南米のフルーツコウモリで同定され、以前同定されていなかった株が、未だ決定されていない病原体保有動物において既に循環している可能性が非常に高いことが実証されている。ヒトにおいて日常的に循環するＩＡＶの現在のサブタイプとしては、Ｈ１Ｎ１及びＨ３Ｎ２が挙げられ、監視されているか、またはヒトにおいて懸念の原因となるさらなる例としては、Ｈ１Ｎ１、Ｈ１Ｎ２、Ｈ２Ｎ２、Ｈ２Ｎ３、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ７Ｎ７、及びＨ７Ｎ９が挙げられるが、これらに限定されない。ＩＡＶサブタイプは、異なる遺伝子分岐群及び亜分岐群（例えば、Ｈ１Ｎ１：分岐群６Ｂ．１、亜分岐群６Ｂ１．Ａ；またはＨ３Ｎ２：分岐群３Ｃ．２ａもしくは３Ｃ．３ａ、亜分岐群３Ｃ．２ａ１、３Ｃ．２ａ２、３Ｃ．２ａ３、または３Ｃ．２ａ４）にさらに分解することができる。いくつかの実施形態では、ＩＡＶは、Ｈ１Ｎ１／ｐｄｍ０９、Ｈ５Ｎ１／１１９４、Ｈ３Ｎ２／４８０１、Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１、及びＨ７Ｎ９／ＺＪからなる群から選択される。
【0108】
Ｂ型インフルエンザウイルスは、２つの別個の系統：Ｙａｍａｇａｔａ及びＶｉｃｔｏｒｉａに分離することができる。ＩＢＶは、４～５年ごとに最も顕著なインフルエンザの循環株である。さらに、ＩＢＶ感染は、例えば、ＨＩＶ患者において、ＩＡＶと比較して、入院のリスクが高く、ＩＢＶは、ＩＡＶ株と比較して、顕著に高い死亡率を実証している。ＩＢＶは、ＩＡＶと比較して、限定的な抗原ドリフト、ならびに病原体保有動物の欠如を示している（例えば、Ｓｈａｒｍａ ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒ Ｒｅｓｐｉｒ Ｊ．２０１９，５４（２）：１９０１３２５を参照されたい）。ＩＢＶサブタイプは、異なる遺伝子分岐群及び亜分岐群、例えば、Ｂ／Ｙａｍａｇａｔａ（例えば、分岐群Ｙ１、Ｙ２、Ｙ３）、Ｂ／Ｖｉｃｔｏｒｉａ（例えば、亜分岐群Ｖ１Ａ．１、Ｖ１Ａ．２、Ｖ１Ａ．３）にさらに分解することができる。Ｃ型インフルエンザウイルス感染は、一般に、軽度の病気を引き起こし、ヒトの流行を引き起こすとは考えられていない。Ｄ型インフルエンザウイルス（すなわち、トゴトウイルス）は、最初に牛に影響を及ぼして、他の動物に波及するが、ヒトへの感染または病気を引き起こすことは知られていない。例えば、Ｔｙｐｅｓ ｏｆ Ｉｎｆｌｕｅｎｚａ Ｖｉｒｕｓｅｓと題されたＣＤＣウェブサイト（ｗｗｗ．ｃｄｃ．ｇｏｖ／ｆｌｕ／ａｂｏｕｔ／ｖｉｒｕｓｅｓ／ｔｙｐｅｓ）を参照されたい。
【0109】
インフルエンザウイルスは、ネガティブセンスの一本鎖セグメント化ＲＮＡゲノムを有する。ＩＡＶ及びＩＢＶは、１０個の主なタンパク質をコードする８つのゲノムセグメント：ＰＢ１ポリメラーゼ、ＰＢ２ポリメラーゼ、ＰＡポリメラーゼ、ヘマグルチニン（ＨＡ）、核タンパク質（ＮＰ）、ノイラミニダーゼ（ＮＡ）、マトリックス１（Ｍ１）、マトリックス２（Ｍ２）、非構造１（ＮＳ１）、及び非構造２（ＮＳ２）タンパク質を有する。ＩＣＶ及びＩＤＶは、９つの主なタンパク質をコードする７つのゲノムセグメントを有し、ＨＡ及びＮＡタンパク質の代わりに、ＩＣＶ及びＩＤＶゲノムが、ＨＡ及びＮＡの機能を統合するヘマグルチニン－エステラーゼ融合（ＨＥＦ）タンパク質をコードする。３つのセグメントは、ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ（ＲｄＲｐ）複合体の３つのサブユニット：ＰＢ１、５’キャップを認識する転写酵素ＰＢ２、及びエンドヌクレアーゼであるＰＡ（ＩＣＶ及びＩＤＶのＰ３）をコードする。マトリックスタンパク質（Ｍ１）及び膜タンパク質（Ｍ２）は、非構造タンパク質（ＮＳ１）及び核輸出タンパク質（ＮＥＰ）と同様に、セグメントを共有する。ＩＡＶ及びＩＢＶでは、ヘマグルチニン（ＨＡ）及びノイラミニダーゼ（ＮＡ）は、各々１つのセグメント上でコードされる一方で、ＩＣＶ及びＩＤＶは、１つのセグメント上でヘマグルチニン－エステラーゼ融合（ＨＥＦ）タンパク質をコードする。最後のゲノムセグメントは、ウイルス核タンパク質（ＮＰ）をコードする。インフルエンザウイルスはまた、代替的なオープンリーディングフレームを介して発現することができ、宿主の防御抑制、毒性、及び病原性において重要である、ＰＢ１－Ｆ２及びＰＡ－Ｘなどのいくつかの付属タンパク質をコードする。
【0110】
ビリオンは、各セグメントの別々のリボ核タンパク質（ＲＮＰ）複合体内で核タンパク質に結合したゲノムからなり、これらは、脂質二重層膜（すなわち、ウイルスエンベロープ）によって囲まれている。全てのサブユニットが組み込まれたＲｄＲｐのコピーは、各ＲＮＰに結合している。エンベロープは、ＲＮＰを包囲する内部のマトリックスタンパク質、Ｍ１及びＭ２によって構造的に強化され、エンベロープは、エンベロープの外面から外向きに延在するＨＡ及びＮＡ（またはＩＣＶもしくはＩＤＶの場合はＨＥＦ）タンパク質を含有する。Ｍ２タンパク質は、ウイルスの剥離中のビリオン内部の酸性化、及びＨＡ合成中の細胞のゴルジ体内のｐＨの制御を含む、ウイルスの出入りに必要とされるウイルスエンベロープを通るプロトンイオンチャネルを形成する。例えば、Ｗｅｂｓｔｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｒｅｖ．１９９２，５６（１）：１５２－１７９及びＷｉｌｌｅ ａｎｄ Ｈｏｌｍｅｓ，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂ Ｐｅｒｓｐｅｃｔ Ｍｅｄ．２０２０，１０（７）：ａ０３８４８９を参照されたい。
【0111】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザタンパク質またはその断片もしくはバリアントであり、例えば、ＩＡＶまたはＩＢＶに由来するものである。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａのＩＢＶサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＩＡＶまたはＩＢＶ ＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッドペプチド、ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッドペプチド、ＩＡＶ Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡヘッドペプチド、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９／ＡＨ１ ＨＡヘッドペプチド、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９／ＺＪ ＨＡヘッドペプチド、ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡヘッド、及びＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡヘッドペプチドからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ＩＡＶウイルス抗原は、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ＩＢＶウイルス抗原は、配列番号１９または２０のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号３～７，２６、及び２７からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号３～７，２６、及び２７からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＩＡＶ（例えば、ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１３のアミノ酸配列、または配列番号１３に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスバリアント、または異なるウイルス科、属、種、もしくは亜種に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、インフルエンザ（例えば、ＩＡＶ、例えば、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９、例えば、Ｈ７Ｎ９／ＺＪ）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００（例えば、約１０～約４００）ヌクレオチド長である。例えば、いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、または４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれか、またはそれらのヌクレオチド長のうちのいずれかの間の範囲である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～５０、約３０～６０、約４０～７０、約５０～８０、約６０～９０歳、約７０～１００、約１０～１００、約８０～１１０、約９０～１２０、約１００～１３０、約１１０～１４０、約１２０～１５０、約１３０～１６０、約１４０～１７０、約１５０～１８０、約１６０～１９０、約１７０～２００、約１８０～２１０、約１９０～２２０、約２００～２３０、約２１０～２４０、約２２０～２５０、約２３０～２６０、約２４０～２７０、約２５０～２８０、約２６０～２９０、約２７０～３００、約２８０～３１０、約２９０～３２０、約３００～３３０、約３１０～３４０、約３２０～３５０、約３３０～３６０、約３４０～３７０、約３５０～３８０、約３６０～３９０、約３７０～４００、約３８０～４１０、約３９０～４２０、約４００～４３０、約４１０～４４０、約４２０～４５０、約４３０～４６０、約４４０～４７０、約４５０～４８０、約４６０～４９０、または約４７０～５００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約２００～約５００ヌクレオチド長である。例えば、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、インフルエンザＡゲノム（例えば、Ｈ７Ｎ９、例えば、Ｈ７Ｎ９／ＺＪ、例えば、配列番号３０に記載されるような）またはその修飾されたゲノムのウイルス遺伝子（例えば、ＰＢ２遺伝子）のヌクレオチド１～３２６を含む。
【0112】
ｉｉｉ．呼吸器合胞体ウイルス
呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）は、Ｐｎｅｕｍｏｖｉｒｉｄａｅファミリー及びモノネガウイルス目内のオルトニューモウイルス属に属する。この属のメンバーとしては、ヒトＲＳＶ、ウシＲＳＶ、及びマウス肺炎ウイルスが挙げられる。ＲＳＶ－Ｇ配列における抗原ドリフト及び重複によって大きく決定されるヒトＲＳＶ（Ａ及びＢ）の２つの主な抗原サブタイプが存在するが、ＲＳＶ－Ｆ配列内を含むゲノム全体の配列発散を伴う。
呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）は、Ｐｎｅｕｍｏｖｉｒｉｄａｅファミリー及びモノネガウイルス目内のオルトニューモウイルス属に属する。この属のメンバーとしては、ヒトＲＳＶ、ウシＲＳＶ、及びマウス肺炎ウイルスが挙げられる。ＲＳＶ－Ｇ配列における抗原ドリフト及び重複によって大きく決定されるヒトＲＳＶ（Ａ及びＢ）の２つの主な抗原サブタイプが存在するが、ＲＳＶ－Ｆ配列内を含むゲノム全体の配列発散を伴う。
【0113】
小児集団（例えば、５歳以下の小児、特に６か月齢以下の乳児）に対する病理学的負荷に加えて、ＲＳＶは、高齢者において重要な病原体としてますます認識されている。ＲＳＶ感染は、６５歳以上の入院率の増加をもたらし、インフルエンザで見られる割合に近いこの集団の死亡率の増加をもたらす。
【0114】
呼吸器合胞体ウイルスは、１１個のタンパク質をコードする１０個の遺伝子を含有する、およそ１５，０００個のヌクレオチドのネガティブセンスの一本鎖非セグメント化ＲＮＡゲノムを有するエンベロープ化されたウイルスであり、これらの遺伝子は、順に、非構造１（Ｎｓ１）、非構造２（Ｎｓ２）、核タンパク質（Ｎ）、リンタンパク質（Ｐ）、マトリックス（Ｍ）、小疎水性タンパク質（ＳＨ）、糖タンパク質（Ｇ）、融合（Ｆ）、Ｍ２－１補因子、Ｍ２－２補因子、及びＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ（Ｌ）である。ビリオンエンベロープに埋め込まれた付着糖タンパク質（Ｇ）及び融合糖タンパク質（Ｆ）は、それぞれ、ウイルス付着及び進入を媒介する。
【0115】
ＲＳＶ Ｇは、インビボで病原性を増強し、宿主細胞への付着を促進するが、感染に絶対的に必要ではない。ＲＳＶ Ｇタンパク質は、２つの形態：約２９８個のアミノ酸を含有する完全長膜結合形態（挿入なし）、及び第２のＡＵＧコドン（Ｍｅｔ４８）での内部開始を通じて翻訳される分泌形態（ｓＧ）で産生される。完全長Ｇタンパク質は、ＩＩ型膜タンパク質であり、Ｎ末端細胞質ドメイン（アミノ酸（ａａ）１～３６）、膜貫通ドメイン（ａａ３７～６７）、及びエクトドメイン（ａａ６８～２９８）を含有する。エクトドメインは、保存された中央ドメイン（ＣＣＤ）及びヘパリン結合ドメイン（ＨＢＤ）に隣接する２つの超可変ムチン様ドメインからなる。２つのムチン様ドメインは、３０～４０個のＯ結合グリカン及び３～５つのＮ結合グリカンを含有し、ＲＳＶの抗原性と関連付けられる。ＣＣＤは、ＲＳＶ中和抗体の保護標的であり、ＲＳＶ感染の重要なステップであるヒトケモカイン受容体ＣＸ３ＣＲ１と相互作用するＣＸ３Ｃモチーフを構成する３つのアミノ酸を含有する。ヘパラン硫酸及び他のグリコサミノグリカン（ＧＡＧ）を含むＨＢＤは、ＲＳＶの潜在的な付着受容体への結合を促進する。Ｚｈａｏ ｅｔ ａｌ．，Ｆｒｏｎｔ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２０２２，１３：９６６２３５を参照されたい。
【0116】
ＲＳＶ Ｆは、ウイルス進入に対して、克服できないエネルギー障壁を課すプロセスである、ウイルス膜と宿主細胞膜との融合を媒介するクラスＩ融合タンパク質である。最初に、Ｆタンパク質は、膜貫通ドメインによってウイルス膜に固定される準安定状態の前融合コンフォメーションで存在する。この構造では、疎水性融合ペプチドは、タンパク質の中央空洞内に埋められている。未知の事象によって、前融合Ｆは劇的なコンフォメーション変化を受け、融合ペプチドに隣接する５つの別個の構造要素が単一のアルファヘリックスへと再度折り畳まれ、融合ペプチドの宿主細胞膜への挿入が生じる。プレヘアピン中間体と呼ばれるこの状態では、２つのヘプタッドリピート（ＨＲＡ及びＨＲＢ）がＦ分子の対向する端部に位置する。これらのヘプタッドリピートの、安定な６ヘリックス束への崩壊は、２つの脂質二重層の融合に連結している、エネルギー的に好ましいコンフォメーション変化である。Ｆと結合している抗体は、融合プロセスを中断することができ、それによって、ウイルス進入を防止し、ＲＳＶ関連疾患の重症度を低減する。最近、Ｆの前融合コンフォメーションを特異的に認識する抗体が、一般に、後融合Ｆにも結合する抗体よりも強力に中和されることが、確立されている。Ｇｉｌｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ Ｃｏｍｍｕｎ．２０１９，１０（１）：２１０５を参照されたい。
【0117】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、呼吸器合胞体（ＲＳＶ）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＲＳＶ ＡサブタイプまたはＲＳＶ Ｂサブタイプに由来する。いくつかの実施形態では、ＲＳＶウイルス抗原は、配列番号２１または２２のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスバリアント、または異なるウイルス科、属、種、もしくは亜種に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＲＳＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＲＳＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００ヌクレオチド長である。例えば、いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、もしくは５００ヌクレオチド長のうちのいずれか、またはそれらのヌクレオチド長のうちのいずれかの間の範囲である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは約１０～５０であり、約３０～６０、約４０～７０、約５０～８０、約６０～９０歳、約７０～１００、約８０～１１０、約９０～１２０、約１０～１００、約１００～１３０、約１１０～１４０、約１２０～１５０、約１３０～１６０、約１４０～１７０、約１５０～１８０、約１６０－１９０、約１７０～２００、約１８０～２１０、約１９０～２２０、約２００～２３０、約２１０～２４０、約２２０～２５０、約２３０～２６０、約２４０～２７０、約２５０～２８０、約２６０～２９０、約２７０～３００、約２８０～３１０、約２９０～３２０、約３００～３３０、約３１０～３４０、約３２０～３５０、約３３０～３６０、約３４０～３７０、約３５０～３８０、約３６０～３９０、約３７０～４００、約３８０～４１０、約３９０～４２０、約４００～４３０、約４１０～４４０、約４２０～４５０、約４３０～４６０、約４４０～４７０、約４５０～４８０、約４６０～４９０、または約４７０～５００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００ヌクレオチド長である。例えば、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれかである。
【0118】
ｉｖ．肝炎：Ｃ型肝炎ウイルス
Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ、ヘパシウイルス）は、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ内のヘパシウイルス属に属する。ＨＣＶは、少なくとも７つの遺伝子型（すなわち、ｇｔ１～７）及び多数のサブタイプを含む。Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）は、およそ９６００ヌクレオチド長の小さな、エンベロープ化された、ポジティブ一本鎖ＲＮＡウイルスである。ＨＣＶは、単一のポリタンパク質をコードし、細胞及びウイルスプロテアーゼによって処理されて１０個のポリペプチドを生成する。ＨＣＶゲノムはまた、重複する＋１リーディングフレームを含有し、追加のタンパク質（すなわち、代替的なリーディングフレームからのＦタンパク質）の合成をもたらし得る。単一のポリタンパク質から切断された１０個のポリペプチドは、コアタンパク質及び２つのエンベロープタンパク質（コア、Ｅ１、Ｅ２）を含む３つの構造タンパク質、ならびに切断、アセンブリ、転写、及び追加の機能に関与する７つの非構造（ＮＳ）タンパク質ＮＳ１、ＮＳ３、ＮＳ４Ａ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５Ａ、及びＮＳ５Ｂを含む。ＨＣＶの構造タンパク質及び非構造タンパク質は、多機能性である。
Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ、ヘパシウイルス）は、Ｆｌａｖｉｖｉｒｉｄａｅ内のヘパシウイルス属に属する。ＨＣＶは、少なくとも７つの遺伝子型（すなわち、ｇｔ１～７）及び多数のサブタイプを含む。Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）は、およそ９６００ヌクレオチド長の小さな、エンベロープ化された、ポジティブ一本鎖ＲＮＡウイルスである。ＨＣＶは、単一のポリタンパク質をコードし、細胞及びウイルスプロテアーゼによって処理されて１０個のポリペプチドを生成する。ＨＣＶゲノムはまた、重複する＋１リーディングフレームを含有し、追加のタンパク質（すなわち、代替的なリーディングフレームからのＦタンパク質）の合成をもたらし得る。単一のポリタンパク質から切断された１０個のポリペプチドは、コアタンパク質及び２つのエンベロープタンパク質（コア、Ｅ１、Ｅ２）を含む３つの構造タンパク質、ならびに切断、アセンブリ、転写、及び追加の機能に関与する７つの非構造（ＮＳ）タンパク質ＮＳ１、ＮＳ３、ＮＳ４Ａ、ＮＳ４Ｂ、ＮＳ５Ａ、及びＮＳ５Ｂを含む。ＨＣＶの構造タンパク質及び非構造タンパク質は、多機能性である。
【0119】
コアタンパク質は、ヌクレオカプシドを形成する。コアタンパク質の成熟形態は、二量体アルファヘリカルタンパク質であり、膜タンパク質及びＲＮＡ結合タンパク質として挙動する。ビリオン膜上のウイルススパイクは、Ｅ１及びＥ２糖タンパク質のヘテロ二量体によって形成される。これらのＥ１及びＥ２タンパク質は、ＨＣＶウイルスが宿主細胞に進入するために不可欠であり、感染性ウイルス粒子のアセンブリに参与する。Ｄｕｂｕｉｓｓｏｎ，Ｗｏｒｌｄ Ｊ Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ．２００７，１３（１７）：２４０６－２４１５を参照されたい。
【表2】
【0120】
いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、Ｃ型肝炎（ＨＣＶ）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントは、ＨＣＶ遺伝子型１ａまたはＨＣＶ遺伝子型２ａに由来する。いくつかの実施形態では、ＨＣＶウイルス抗原は、配列番号２３または２４のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスバリアント、または異なるウイルス科、属、種、もしくは亜種に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＨＣＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＨＣＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００ヌクレオチド長である。例えば、いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、もしくは５００ヌクレオチド長のうちのいずれか、またはそれらのヌクレオチド長のうちのいずれかの間の範囲である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～５０、約３０～６０、約４０～７０、約５０～８０、約６０～９０歳、約７０～１００、約１０～１００、約８０～１１０、約９０～１２０、約１００～１３０、約１１０～１４０、約１２０～１５０、約１３０～１６０、約１４０～１７０、約１５０～１８０、約１６０～１９０、約１７０～２００、約１８０～２１０、約１９０～２２０、約２００～２３０、約２１０～２４０、約２２０～２５０、約２３０～２６０、約２４０～２７０、約２５０～２８０、約２６０～２９０、約２７０～３００、約２８０～３１０、約２９０～３２０、約３００～３３０、約３１０～３４０、約３２０～３５０、約３３０～３６０、約３４０～３７０、約３５０～３８０、約３６０～３９０、約３７０～４００、約３８０～４１０、約３９０～４２０、約４００～４３０、約４１０～４４０、約４２０～４５０、約４３０～４６０、約４４０～４７０、約４５０～４８０、約４６０～４９０、または約４７０～５００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約２００～約３００ヌクレオチド長である。例えば、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００以上のヌクレオチド長のうちのいずれかである。
【0121】
核タンパク質－抗原融合ペプチド
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のウイルス核タンパク質と本明細書に記載の標的抗原ペプチドとは、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介して付着、例えば、融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質とウイルス抗原ペプチドとは融合して、アダプタ－抗原ポリペプチドを作製する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び標的抗原は、同じソース、例えば、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び標的抗原は、異なるソース、例えば、異なるウイルス、例えば、ウイルスの異なるサブタイプ、ウイルスの異なる種もしくは属、または異なるウイルスファミリーに由来する。
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のウイルス核タンパク質と本明細書に記載の標的抗原ペプチドとは、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介して付着、例えば、融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質とウイルス抗原ペプチドとは融合して、アダプタ－抗原ポリペプチドを作製する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び標的抗原は、同じソース、例えば、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、核タンパク質及び標的抗原は、異なるソース、例えば、異なるウイルス、例えば、ウイルスの異なるサブタイプ、ウイルスの異なる種もしくは属、または異なるウイルスファミリーに由来する。
【0122】
いくつかの実施形態では、核タンパク質、例えば、ウイルス核タンパク質は、標的抗原ペプチド、例えば、ウイルス標的抗原に融合し、ウイルスＲＮＡと自然に会合し、それによって、大きな免疫原性複合体を形成する。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原の複数のコピーが、ウイルスＲＮＡ足場に付着している。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡはまた、アジュバントとして作用するので、付着したアダプタ－抗原ペプチドは、ウイルスＲＮＡを包み込み、それによって、個体（例えば、ヒト個体）へのワクチン組成物の粘膜投与の際に、炎症性サイトカインの産生を含む自然免疫応答を防止するようにアジュバントをマスクする。
【0123】
いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ウイルスＲＮＡに結合することが可能であるウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含む（例えば、ＲＮＡ結合ドメインを含む）。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、インフルエンザ由来の抗原（例えば、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＩＣＶ、またはＩＤＶ、例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ７Ｎ９、Ｙａｍａｇａｔａ、またはＶｉｃｔｏｒｉａ）と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、インフルエンザ由来の抗原（例えば、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＩＣＶ、またはＩＤＶ、例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ７Ｎ９、Ｙａｍａｇａｔａ、またはＶｉｃｔｏｒｉａ）と融合したＩＡＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、Ｈ１Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶ由来の抗原と融合したＩＡＶ Ｈ５Ｎ１に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＢＶ由来の抗原、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａと融合したＩＡＶ由来の核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＨＣＶ由来の抗原と融合したＨＣＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＲＳＶ由来の抗原と融合したＲＳＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルス表面糖タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＩＡＶ（例えば、ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１）に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１２もしくは１３のアミノ酸配列、または配列番号１２もしくは１３に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。
【0124】
いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ウイルスＲＮＡまたはＤＮＡに結合することが可能である第２のウイルスに由来するウイルス核タンパク質に融合した第１のウイルスに由来するウイルス抗原を含む（またはそれから本質的になる、またはそれからなる）。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、第１のウイルス、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、またはＨＣＶに由来するウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、第１のウイルスに由来するウイルス表面糖タンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質（または足場分子、例えば、ウイルスＲＮＡもしくはＤＮＡに結合可能な断片もしくはバリアント）は、第２のウイルス、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、またはＨＣＶに由来する。第１のウイルス及び第２のウイルスは、同じであっても異なっていてもよい。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、インフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）由来の抗原と融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２由来の抗原と融合したＩＡＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＢＶ由来の抗原と融合したＩＡＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＨＣＶ由来の抗原と融合したＩＡＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＲＳＶ由来の抗原と融合したＩＡＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２由来の抗原と融合したＩＢＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＡＶ由来の抗原と融合したＩＢＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＨＣＶ由来抗原と融合したＩＢＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＲＳＶ由来の抗原と融合したＩＢＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２由来の抗原と融合したＨＣＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＡＶ由来の抗原と融合したＨＣＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＢＶ由来の抗原と融合したＨＣＶ由来の核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＲＳＶ由来の抗原と融合したＨＣＶ由来の核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２由来の抗原と融合したＲＳＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＡＶ由来の抗原と融合したＲＳＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＩＢＶ由来の抗原と融合したＲＳＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、ＨＣＶ由来の抗原と融合したＲＳＶに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号１２もしくは１３のアミノ酸配列、または配列番号１２もしくは１３に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号１２または１３のアミノ酸配列を含むウイルス核タンパク質と、配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むウイルス抗原と、を含み、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来しない。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、配列番号６～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号６～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列に対して少なくとも約８０％（例えば、少なくとも約８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれか）の配列同一性を有するそのバリアントを含む。
【0125】
足場分子
いくつかの実施形態では、足場分子は、核酸を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、ＤＮＡまたはＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、ＤＮＡ分子を含む（またはそれからなる、またはそれから本質的になる）。いくつかの実施形態では、ＤＮＡは、一本鎖ＤＮＡ（ｓｓＤＮＡ）分子である。いくつかの実施形態では、ＤＮＡは、二本鎖ＤＮＡ（ｄｓＤＮＡ）分子である。いくつかの実施形態では、足場分子は、ｓｓＲＮＡなどのＲＮＡ分子を含む（またはそれからなる、またはそれから本質的になる）。いくつかの実施形態では、足場分子は、ウイルスＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、ミニウイルスＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、非ウイルスＲＮＡ分子（例えば、宿主ＲＮＡ）を含む。足場分子がウイルスＲＮＡまたはＤＮＡを含む場合、それは、野生型または変異型のいずれかであり得る（例えば、挿入（複数可）、欠失（複数可）、及び／または置換（複数可）を含有する）。
いくつかの実施形態では、足場分子は、核酸を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、ＤＮＡまたはＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、ＤＮＡ分子を含む（またはそれからなる、またはそれから本質的になる）。いくつかの実施形態では、ＤＮＡは、一本鎖ＤＮＡ（ｓｓＤＮＡ）分子である。いくつかの実施形態では、ＤＮＡは、二本鎖ＤＮＡ（ｄｓＤＮＡ）分子である。いくつかの実施形態では、足場分子は、ｓｓＲＮＡなどのＲＮＡ分子を含む（またはそれからなる、またはそれから本質的になる）。いくつかの実施形態では、足場分子は、ウイルスＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、ミニウイルスＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、非ウイルスＲＮＡ分子（例えば、宿主ＲＮＡ）を含む。足場分子がウイルスＲＮＡまたはＤＮＡを含む場合、それは、野生型または変異型のいずれかであり得る（例えば、挿入（複数可）、欠失（複数可）、及び／または置換（複数可）を含有する）。
【0126】
足場ＲＮＡ（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、転写に由来する小さなＲＮＡ、大きなウイルスゲノムに由来する長く複雑なＲＮＡ、または複製中に誘導される長いゲノムＲＮＡであり得る。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡはまた、内部アジュバントとして機能する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、アジュバントとして、個体内で、すなわち、個体（例えば、ヒト個体）に投与されると、自然免疫を活性化する。いくつかの実施形態では、個体（例えば、ヒト個体）内の自然免疫を活性化するアジュバント活性は、トール様受容体及び／またはＲＩＧ－Ｉ様受容体によって媒介される。
【0127】
いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルス核タンパク質、例えば、融合したアダプタ－抗原タンパク質と自然に会合し、それによって、大きな免疫原性複合体、またはナノ複合体を形成する。いくつかの実施形態では、ＲＮＡ足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、アダプタ－抗原の複数のコピーの結合を可能にするための足場として作用する。このナノ複合体内で、抗原ペプチドは、当該技術分野で既知の任意のウイルス抗原を含む、本開示に記載の抗原ペプチドのうちのいずれかを含み得る。いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物は、多価である。
【0128】
いくつかの実施形態では、足場分子は、ＲＮＡ分子を含む（またはそれからなる、またはそれから本質的になる）。いくつかの実施形態では、足場分子は、ミニウイルスＲＮＡ分子を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡはまた、内部アジュバントとして機能する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、５’非翻訳領域は、ゲノム複製のために高度に構造化された足場へと折り畳まれる。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の３’非翻訳領域を含む。
【0129】
いくつかの実施形態では、足場分子は、約１０～約２０００ヌクレオチド（ｎｔ）長、例えば、約１０～約３００ｎｔ、約２００～約３００ｎｔ、約１０～約２００ｎｔ、約２００～約５００ｎｔ、約５００～約１０００ｎｔ、約１０～約５００ｎｔ、約１００～約１０００ｎｔ、約１０００～約２０００ｎｔ、または約１００～約５００ｎｔの長さのうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、足場分子は、少なくとも約２００ヌクレオチド長、例えば、約２００～５００ヌクレオチド長、または約２００～約３００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、足場分子は、アダプタ－抗原ポリペプチドに結合するための足場として機能することができる任意のＤＮＡまたはＲＮＡ分子などのＤＮＡまたはＲＮＡを含む。足場分子は、哺乳動物、鳥類、昆虫、細菌、ウイルス、酵母、または植物を含むが、これらに限定されない任意の生物に由来し得る。いくつかの実施形態では、足場分子は、ウイルスＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、宿主ＲＮＡ（例えば、ヒトＲＮＡなどの哺乳動物ＲＮＡ）などの非ウイルスＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、足場分子は、タンパク質またはその断片もしくはバリアントをコードする。いくつかの実施形態では、足場分子は、タンパク質またはその断片もしくはバリアントをコードしない。いくつかの実施形態では、足場分子は、標的抗原に対する宿主の免疫応答を増強するためのアジュバントとして機能する。いくつかの実施形態では、足場分子は、約１０～約５００ｎｔ、または約２００～約５００ｎｔの長さである。例えば、いくつかの実施形態では、足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、もしくは５００ヌクレオチド長のうちのいずれか、またはそれらのヌクレオチド長のうちのいずれかの間の範囲である。いくつかの実施形態では、足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、約１０～５０、約３０～６０、約４０～７０、約５０～８０、約６０～９０、約７０～１００、約８０～１１０、約９０～１２０、約１０～１００、約１００～１３０、約１１０～１４０、約１２０～１５０、約１３０～１６０、約１４０～１７０、約１５０～１８０、約１６０～１９０、約１７０～２００、約１８０～２１０、約１９０～２２０、約２００～２３０、約２１０～２４０、約２２０～２５０、約２３０～２６０、約２４０～２７０、約２５０～２８０、約２６０～２９０、約２７０～３００、約２８０～３１０、約２９０～３２０、約３００～３３０、約３１０～３４０、約３２０～３５０、約３３０～３６０、約３４０～３７０、約３５０～３８０、約３６０～３９０、約３７０～４００、約３８０～４１０、約３９０～４２０、約４００～４３０、約４１０～４４０、約４２０～４５０、約４３０～４６０、約４４０～４７０、約４５０～４８０、約４６０～４９０、または約４７０～５００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、少なくとも約２００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、約２００～約５００ヌクレオチド長である。例えば、足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、少なくとも約２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれかである。
【0130】
いくつかの実施形態では、足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、ウイルスゲノムの非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノム（例えば、配列番号２５）のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶゲノム（例えば、配列番号３０）のウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む。
【0131】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約５０ｎｍ～約２００ｎｍの平均粒径を有する。例えば、いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約５０ｎｍ、６０ｎｍ、７０ｎｍ、８０ｎｍ、９０ｎｍ、１００ｎｍ、１１０ｎｍ、１２０ｎｍ、１３０ｎｍ、１４０ｎｍ、または１５０ｎｍのうちのいずれかの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約５０ｎｍ～８０ｎｍ、約６０ｎｍ～９０ｎｍ、約７０ｎｍ～１００ｎｍ、約８０ｎｍ～１１０ｎｍ、約９０ｎｍ～１２０ｎｍ、約１００ｎｍ～１３０ｎｍ、約１１０ｎｍ～１４０ｎｍ、約１２０ｎｍ～１５０ｎｍ、約１３０ｎｍ～１６０ｎｍ、約１４０ｎｍ～１７０ｎｍ、約１５０ｎｍ～１８０ｎｍ、約１６０ｎｍ～１９０ｎｍ、または約１７０ｎｍ～２００ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体の粒径（例えば、平均粒径）は、ＳＤＳ－ＰＡＧＥ、ネイティブ－ＰＡＧＥ、高速サイズ排除クロマトグラフィー（ＨＰ－ＳＥＣ）、沈降速度分析超遠心分離（ＳＶ－ＡＵＣ）、動的光散乱（ＤＬＳ）、流動場分離法、ナノ粒子追跡分析（ＮＴＡ）、共鳴質量測定（ＲＭＭ）、光遮蔽法、フローイメージング顕微鏡法、目視検査などのうちのいずれかによって測定することができる。いくつかの実施形態では、ＨＰ－ＳＥＣまたは流動場分離法は、ＵＶ／ＶＩＳ吸光度、静的光散乱、蛍光、または屈折率などの連続的なオンライン検出器と組み合わせられ得る。
【0132】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約０ｍＶ～約－５０ｍＶのゼータ電位を有する。例えば、いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約０ｍＶ、約－１０ｍＶ、約－２０ｍＶ、約－３０ｍＶ、約－４０ｍＶ、または約－５０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約０ｍＶ～約－１０ｍＶ、約－５ｍＶ～約－１５ｍＶ、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶ、約－１５ｍＶ～約－２５ｍＶ、約－２０ｍＶ～約－３０ｍＶ、約－２５ｍＶ～約－３５ｍＶ、約－３０ｍＶ～約－４０ｍＶ、約－３５ｍＶ～約－４５ｍＶ、または約－４０ｍＶ～約－５０ｍＶのゼータ電位を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。
【0133】
したがって、いくつかの実施形態では、ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、ｉ）ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、ｉｉ）ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合した配列番号１４～２４及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含むウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含むナノ複合体を含むワクチン組成物が提供される。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子のモル比は、少なくとも約５：１、例えば、約６：１～約１２：１、約６：１～約１０：１、約８：１～約１２：１、または約６：１～約８：１である。例えば、いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチド対足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）のモル比は、約５：１、６：１、７：１、８：１、９：１、１０：１、１１：１、または１２：１のうちのいずれか、またはこれらの比のうちのいずれかの間の範囲である。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、ウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである。いくつかの実施形態では、ウイルス抗原は、任意選択的なリンカー（例えば、ＧＳリンカー）を介してウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、同じウイルスに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質及びウイルス抗原は、異なるウイルス、例えば、異なるウイルスバリアント、または異なるウイルス科、属、種、もしくは亜種に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２またはＩＡＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質は、配列番号１２または１３のアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、アダプタ－抗原ポリペプチドは、配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムの非翻訳領域を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域（例えば、ウイルス遺伝子の５’または３’ＵＴＲ）を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域（例えば、ウイルス遺伝子の５’ＵＴＲ）を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０～約５００ヌクレオチド長である。例えば、いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約１０、２０、３０、４０、５０、６０、７０、８０、９０、１００、１１０、１２０、１３０、１４０、１５０、１６０、１７０、１８０、１９０、２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約２０～５０、約３０～６０、約４０～７０、約５０～８０、約６０～９０、約７０～１００、約８０～１１０、約９０～１２０、約１００～１３０、約１１０～１４０、約１２０～１５０、約１３０～１６０、約１４０～１７０、約１５０～１８０、約１６０～１９０、約１７０～２００、約１８０～２１０、約１９０～２２０、約２００～２３０、約２１０～２４０、約２２０～２５０、約２３０～２６０、約２４０～２７０、約２５０～２８０、約２６０～２９０、約２７０～３００、約２８０～３１０、約２９０～３２０、約３００～３３０、約３１０～３４０、約３２０～３５０、約３３０～３６０、約３４０～３７０、約３５０～３８０、約３６０～３９０、約３７０～４００、約３８０～４１０、約３９０～４２０、約４００～４３０、約４１０～４４０、約４２０～４５０、約４３０～４６０、約４４０～４７０、約４５０～４８０、約４６０～４９０、または約４７０～５００ヌクレオチド長である。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、約２００～約５００ヌクレオチド長である。例えば、ウイルスＲＮＡは、少なくとも約２００、２１０、２２０、２３０、２４０、２５０、２６０、２７０、２８０、２９０、３００、３１０、３２０、３３０、３４０、３５０、３６０、３７０、３８０、３９０、４００、４１０、４２０、４３０、４４０、４５０、４６０、４７０、４８０、４９０、または５００ヌクレオチド長のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶに由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスＲＮＡは、ＩＡＶ Ｈ７Ｎ９ゲノム（例えば、配列番号３０に記載されるような）またはその修飾されたゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、均一なサイズを有する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物中のナノ複合体は、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する。
【0134】
ＩＩＩ．ナノ複合体ワクチンの産生のための宿主細胞
また、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載のワクチン組成物のアダプタ－抗原ポリペプチド及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素を産生するための宿主細胞である。
また、本明細書で提供されるのは、本明細書に記載のワクチン組成物のアダプタ－抗原ポリペプチド及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素を産生するための宿主細胞である。
【0135】
好適な宿主細胞としては、哺乳動物細胞などの高等真核細胞を挙げることができるが、これらに限定されない。好適な高等真核細胞としては、無脊椎動物細胞及び昆虫細胞、ならびに脊椎動物細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
【0136】
宿主細胞は、ＤＥＡＥ－デキストラン媒介性送達、リン酸カルシウム沈殿法、カチオン性脂質媒介性送達、リポソーム媒介性トランスフェクション、エレクトロポレーション、レンチウイルス形質導入、マイクロプロジェクタイルガン、受容体媒介性遺伝子送達、ポリリジン、ヒストン、キトサン、及びペプチドによって媒介される送達が挙げられるが、これらに限定されない、当該技術分野で既知の任意の好適な方法を使用して、ゲノム編集の標準的な方法の一部としてトランスフェクトすることができる。目的のベクターの発現のための細胞のトランスフェクション及び形質転換のための標準的な方法は、当該技術分野で周知である。
【0137】
任意の好適な宿主細胞が、本明細書で使用され得る。宿主細胞としては、ＢＨＫ２１細胞、ＶｅｒｏＥ６細胞、Ｌ９２９細胞、ＣＨＯ細胞、ＢＨＫ細胞、ＭＤＣＫ細胞、Ｃ３Ｈ １０Ｔ１／２細胞、ＦＬＹ細胞、Ｐｓｉ－２細胞、ＢＯＳＣ２３細胞、ＰＡ３１７細胞、ＷＥＨＩ細胞、ＣＯＳ細胞、ＢＳＣ１細胞、ＢＳＣ４０細胞、ＢＭＴ１０細胞、ＶＥＲＯ細胞、Ｗ１３８細胞、ＭＲＣ５細胞、Ａ５４９細胞、ＨＴ１０８０細胞、２９３細胞、２９３Ｔ細胞、Ｂ－５０細胞、３Ｔ３細胞、ＮＩＨ３Ｔ３細胞、ＨｅｐＧ２細胞、Ｓａｏｓ－２細胞、Ｈｕｈ７細胞、ＨｅＬａ細胞、Ｗ１６３細胞、２１１細胞、ＮＳ０細胞、ＰｅｒＣ６細胞、Ｓｐ２／０細胞、ＢＨＫ細胞、Ｃ１２７細胞、２１１Ａ細胞、及びこれらの細胞のうちのいずれかに由来する任意の宿主細胞を挙げることができるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、好適な宿主細胞は、本明細書に記載のワクチン組成物の構成要素（例えば、配列番号１～１１、及び２６～２９のうちのいずれか１つ以上及び／またはＲＮＡ足場分子、例えば、配列番号２５または３０のうちのいずれか）を発現するように遺伝子操作されている。
【0138】
ＩＩＩ．調製の方法
本明細書に記載のワクチン組成物は、当該技術分野の既知の核酸発現、タンパク質産生、及びインサイチュ合成方法のうちのいずれかによって調製することができる。アダプタ－抗原ポリペプチドは、上記の任意の宿主細胞を含む宿主細胞内で、発現及び産生され得る。次いで、アダプタ－抗原ポリペプチドは、宿主細胞または培養培地から（例えば、宿主細胞からアダプタ－抗原ポリペプチドが分泌される際に）採取され得る。核酸足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、宿主細胞内で発現され得るか、インビトロで転写され得るか、またはインビトロで完全に合成され得る。例えば、ＲＮＡ足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、ＳＰ６もしくはＴ７ポリメラーゼを使用してインビトロで転写され得るか、化学的に合成され得るか、または宿主細胞内で産生され得る（例えば、ベクターなどのＤＮＡテンプレートから転写され得る）。
本明細書に記載のワクチン組成物は、当該技術分野の既知の核酸発現、タンパク質産生、及びインサイチュ合成方法のうちのいずれかによって調製することができる。アダプタ－抗原ポリペプチドは、上記の任意の宿主細胞を含む宿主細胞内で、発現及び産生され得る。次いで、アダプタ－抗原ポリペプチドは、宿主細胞または培養培地から（例えば、宿主細胞からアダプタ－抗原ポリペプチドが分泌される際に）採取され得る。核酸足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、宿主細胞内で発現され得るか、インビトロで転写され得るか、またはインビトロで完全に合成され得る。例えば、ＲＮＡ足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）は、ＳＰ６もしくはＴ７ポリメラーゼを使用してインビトロで転写され得るか、化学的に合成され得るか、または宿主細胞内で産生され得る（例えば、ベクターなどのＤＮＡテンプレートから転写され得る）。
【0139】
いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素をコードする核酸（複数可）は、ベクター、例えば、発現ベクター、ウイルスベクター、またはクローニングベクターに挿入される。したがって、本明細書に記載されるウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素のいずれかをコードするベクターも提供される。ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素の発現のために、ベクターは、宿主細胞内でウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素をコードする核酸の発現を可能にするように宿主細胞に導入され得る。発現ベクターは、発現を制御するための様々な要素を含有することができ、限定されないが、プロモータ配列、転写開始配列、エンハンサ配列、選択可能マーカー、及びシグナル配列が含まれる。これらの要素は、当業者によって適切に選択され得る。例えば、プロモータ配列は、ベクターにおける核酸の転写を促進するために選択され得る。好適なプロモータ配列には、限定されないが、Ｔ７プロモータ、Ｔ３プロモータ、ＳＰ６プロモータ、ベータアクチンプロモータが含まれる。ＥＦ１ａプロモータ、ＣＭＶプロモータ、及びＳＶ４０プロモータ。エンハンサ配列は、核酸の転写を増強するために選択され得る。選択可能マーカーは、ベクターが挿入された宿主細胞を、挿入されていないものから選択することを可能にし得、例えば、選択可能マーカーは、抗生物質耐性を付与する遺伝子であり得る。シグナル配列は、発現されたウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素が、宿主細胞の外側に輸送されることを可能にするように選択され得る。
【0140】
好適なベクターとしては、一本鎖、二本鎖、または部分的に二本鎖である核酸分子；１つ以上の遊離端を含み、遊離端（例えば、環状）を含まない核酸分子；ＤＮＡ、ＲＮＡ、またはその両方を含む核酸分子；及び当該技術分野において既知の他の多様なポリヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。１つのタイプのベクターは、「プラスミド」であり、これは、標準的な分子クローニング技術などによって、追加のＤＮＡセグメントを挿入することができる環状二本鎖ＤＮＡループを指す。ある特定のベクターは、ベクターが導入された宿主細胞内で自律的に複製することが可能である（例えば、細菌の複製起点を有する細菌ベクター、及びエピソーム性の哺乳動物ベクター）。他のベクター（例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター）は、宿主細胞への導入の際に宿主細胞のゲノムに組み込まれ、それにより宿主ゲノムとともに複製される。さらに、ある特定のベクターは、ベクターが動作可能なように連結されたコードヌクレオチド配列の転写または発現を誘導することが可能である。このようなベクターは、本明細書では「発現ベクター」と呼ばれる。
【0141】
いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素をコードする発現ベクターは、ウイルスベクター、細菌ベクター、及び哺乳類細胞ベクターからなる群から選択される。ウイルスベクター技術は、当該技術分野において周知であり、例えば、Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．（２０１２）、及びＡｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．（１９９９）、ならびに他のウイルス学及び分子生物学マニュアルに記載される。ベクターとして有用であるウイルスには、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ関連ウイルス（ＡＡＶ）、ヘルペスウイルス、及びレンチウイルスが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、マウス幹細胞ウイルス（ＭＳＣＶ）ベクターは、所望の核酸を発現させるために使用される。ＭＳＣＶベクターは、細胞内で所望の核酸を効率的に発現することが実証されている。ウイルスベクターの他の例は、モロニーマウス白血病ウイルス（ＭｏＭｕＬＶ）及びヒト免疫不全ウイルス（ＨＩＶ）に基づくものである。いくつかの実施形態では、好適なベクターは、少なくとも１つの生物において機能的な複製起点、プロモータ配列、便利な制限エンドヌクレアーゼ部位、及び１つ以上の選択可能マーカーを含有する。（例えば、ＷＯ０１／９６５８４、ＷＯ０１／２９０５８、及び米国特許第６，３２６，１９３号を参照されたい。）いくつかの実施形態では、ベクターは、組換えアデノ随伴ウイルス（ｒＡＡＶ）ベクターである。いくつかの実施形態では、ｒＡＡＶベクターは、ＡＡＶ血清型に由来するベクターであり、ＡＡＶ ＩＴＲは、ＡＡＶ１、ＡＡＶ２、ＡＡＶ３、ＡＡＶ４、ＡＡＶ５、ＡＡＶ６、ＡＡＶ７、ＡＡＶ８、ＡＡＶｒｈ８、ＡＡＶｒｈ８Ｒ、ＡＡＶ９、ＡＡＶ１０、ＡＡＶｒｈ１０、ＡＡＶ１１、ＡＡＶ１２、ＡＡＶ２Ｒ４７１Ａ、ＡＡＶ ＤＪ、ヤギＡＡＶ、ウシＡＡＶ、またはマウスＡＡＶキャプシド血清型などであることを含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ベクターは、ｒＡＡＶ粒子にカプセル化されている。いくつかの実施形態では、ベクターは、レンチウイルスベクターである。
【0142】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のワクチン組成物を作製する方法は、宿主細胞を、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素をコードする核酸またはベクターでトランスフェクトすることをさらに含む。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素をコードする核酸（複数可）またはベクター（複数可）は、当該宿主細胞に同時にトランスフェクトされる。いくつかの実施形態では、ウイルス核タンパク質、ウイルス抗原、及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素をコードする核酸（複数可）またはベクター（複数可）は、当該宿主細胞に逐次的にトランスフェクトされる。本明細書に記載の核酸、またはベクター（例えば、ウイルスベクター）は、遺伝子治療の目的のために、宿主細胞または個体（例えば、ヒト）に直接送達することができる。核酸の非ウイルス送達の方法には、リポフェクション、ヌクレオフェクション、マイクロインジェクション、バイオリスティック、ビロソーム、リポソーム、免疫リポソーム、ポリカチオンまたは脂質：核酸複合体、エレクトロポレーション、ナノ粒子、エクソソーム、マイクロベシクル、または遺伝子銃、裸のＤＮＡ、及び人工ビリオンが含まれる。核酸の送達のためのＲＮＡまたはＤＮＡウイルスベースのシステムの使用は、ウイルスを特定の細胞に標的化し、ウイルスペイロードを細胞核に輸送することにおいて高い効率を有する。
【0143】
本明細書に記載のワクチン組成物のアダプタ－抗原ポリペプチド（またはそれをコードする核酸）または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素は、ＤＥＡＥ－デキストラン媒介性送達、リン酸カルシウム沈殿法、カチオン性脂質媒介性送達、リポソーム媒介性トランスフェクション、エレクトロポレーション、レンチウイルス形質導入、マイクロプロジェクタイルガン、受容体媒介性遺伝子送達、ポリリジン、ヒストン、キトサン、及びペプチドによって媒介される送達が挙げられるが、これらに限定されない、当該技術分野で既知の任意の好適な方法を使用して、宿主細胞に導入することができる。細胞のトランスフェクション及び形質転換のための標準的な方法は、当該技術分野で周知である。
【0144】
いくつかの実施形態では、本出願は、本明細書に記載のワクチン組成物のアダプタ－抗原ポリペプチド（またはアダプタもしくは抗原の単一の構成要素）及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素を作製する方法であって、アダプタ－抗原ポリペプチド（またはアダプタもしくは抗原の単一構成要素）及び／または核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素を含む単離された宿主細胞を、構成要素の発現に好適な条件下で培養することと、発現された構成要素を、当該宿主細胞から（例えば、細胞培養物から）得ることと、を含む、方法を提供する。発現のための好適な条件は、好適な培地、培養培地中の宿主細胞の好適な密度、必要な栄養素の存在、補助因子の存在、好適な温度及び湿度、ならびに微生物汚染物質の不在を挙げることができるが、これらに限定されない。当業者は、発現を目的として適宜好適な条件を選択することができる。
【0145】
アダプタ－抗原ポリペプチド（またはアダプタもしくは抗原の単一構成要素）を宿主細胞から採取し、核酸足場（例えば、ウイルスＲＮＡ）を宿主細胞から合成（例えば、インビトロ転写）または採取した後、次いで、これらの分子を組み合わせて、本明細書に記載のナノ複合体を形成することができる。アダプタ－抗原ポリペプチドは、本明細書に記載の核酸足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）に自然に結合し、複数のアダプタ－抗原ポリペプチドが、本明細書に記載の同じ核酸足場分子に結合することができる。次いで、合成されたナノ複合体を単離し、本明細書に記載の標準的な方法（例えば、精製）によって調製して、個体（例えば、ヒト）に投与する。
【0146】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のワクチン組成物を作製する方法は、アダプタ、抗原、及び／または核酸足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素を精製及び／または富化することをさらに含む。例えば、ウイルスＲＮＡは、フェノール－クロロホルム－イソプロパノール方法によって精製され得る。本明細書では、当該技術分野で既知の任意のタンパク質精製方法（例えば、イオン交換、濾過、親和性精製、混合モード精製）が、タンパク質構成要素精製に使用され得る。いくつかの実施形態では、アダプタ、抗原、及び／または核酸足場分子の純度は、少なくとも約９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、または１００％のうちのいずれかなどの、少なくとも約９０％である。
【0147】
いくつかの実施形態では、精製されたアダプタ、抗原、及び核酸足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素は、緩衝液中で混合され、好適な条件（例えば、タンパク質／核酸結合に好適な温度）下で一定期間の間（例えば、少なくとも約５分間）インキュベートされて、本明細書に記載のナノ複合体が形成される。いくつかの実施形態では、精製されたアダプタ及び抗原は、緩衝液中で混合され、好適な条件（例えば、タンパク質／タンパク質結合に好適な温度）下で一定期間の間（例えば、少なくとも約５分）インキュベートされて、本明細書に記載のアダプタ－抗原ポリペプチドが形成され、次いで、アダプタ－抗原ポリペプチド及び核酸足場分子（例えば、ウイルスＲＮＡ）構成要素は、緩衝液中で混合され、好適な条件（例えば、タンパク質／核酸結合に好適な温度）下で一定期間の間（例えば、少なくとも約５分間）インキュベートされて、本明細書に記載のナノ複合体が形成される。
【0148】
ＩＶ．医薬組成物、単位投薬量、製品、及びキット
本出願によってさらに提供されるのは、本明細書に記載のナノ複合体を含むワクチン組成物のうちのいずれか１つと、任意選択的に、薬学的に許容される担体と、を含む、医薬組成物である。
本出願によってさらに提供されるのは、本明細書に記載のナノ複合体を含むワクチン組成物のうちのいずれか１つと、任意選択的に、薬学的に許容される担体と、を含む、医薬組成物である。
【0149】
医薬組成物は、本明細書に記載される様々な投与方法、例えば、全身投与または局所投与を含む方法に好適であってよい。本明細書に記載のワクチン組成物（またはその医薬組成物）のうちのいずれかの例示的な投与経路としては、これらに限定されないが、経口、静脈内、腔内、腫瘍内、動脈内、筋肉内、皮下、非経口、経粘膜、経皮、眼、局所、腹腔内、頭蓋内、胸膜内、及び上皮経路が挙げられるか、またはウイルス感染した細胞を収容することが知られているリンパ腺、体内空間、臓器、もしくは組織に送達される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、粘膜投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、鼻スプレーによる投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、点鼻による投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、筋肉内または皮内投与などによって、非経口投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、単回用量として投与される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、複数回用量として投与される。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、任意の年齢である。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、６５歳以上、例えば、６５、７０、７５、８０、８５、８６、８７、８８、８９、９０歳以上のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、１８歳以下、例えば、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２歳以下のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、１歳以下の幼児（例えば、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２、１か月以下のうちのいずれかである）。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、健康である。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、心臓、肺、脳、または免疫系の機能を低減させる医学的状態、既往症、または状態を有する。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、免疫不全状態である。
【0150】
鼻ワクチンとしてのマイクロ及びナノ担体に基づく送達系は、体液性、細胞性、及び粘膜免疫を誘導する。ワクチン接種の鼻経路はまた、いくつかの遠隔の粘膜部位（例えば、口腔、直腸、膣、及び肺）で免疫を提供することができる。鼻ワクチン送達は、局所免疫を誘導することによって、粘膜部位での病原体進入をブロックし、他の投与経路へのバイオアベイラビリティの増加を示し、粘膜吸収を介した血液循環系への迅速な取り込みを実証し、他の投与経路、例えば、非経口経路よりも良好な患者コンプライアンスを奨励する（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Ｒａｍｖｉｋａｓ ｅｔ ａｌ．（２０１６）Ｍｉｃｒｏ ａｎｄ Ｎａｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｉｎ Ｖａｃｃｉｎｅ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ２０１７：２７９－３０１を参照されたい）。鼻ワクチン送達製剤としては、微粒子、ナノ粒子、及びリポソームの形態を挙げることができるが、これらに限定されない。
【0151】
いくつかの場合では、主題の方法は、それを必要とする個体に、有効量のナノ複合体を含むワクチン組成物（またはその医薬組成物）を投与することに関与する。いくつかの実施形態では、主題のワクチンの「有効量」は、個体に１回以上の用量で、単剤療法で、または併用療法で投与される場合、ワクチンによる投与の不在下での個体と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％、ウイルス感染もしくは伝播を防止するか、または個体におけるウイルス感染の症状を低減するのに有効である量である。
【0152】
本明細書で使用される「担体」は、用いられる投薬量及び濃度で曝露される細胞または個体に対して無毒である、薬学的に許容される担体、賦形剤、または安定剤を含む。多くの場合、生理学的に許容される担体は、ｐＨ緩衝水溶液である。許容される担体、賦形剤、または安定剤は、核酸構築物（すなわち、ＲＮＡ及び／またはＤＮＡ）と適合性であり、当該担体、賦形剤、または安定剤を含む溶液は、ＲＮａｓｅ及び／またはＤＮａｓｅ活性の１つ以上の阻害剤をさらに含み得る。許容される担体、賦形剤、または安定剤は、用いられる投薬量及び濃度でレシピエントに対して非毒性であり、これらとしては、緩衝液、例えば、リン酸塩、クエン酸塩、及び他の有機酸など、アスコルビン酸及びメチオニンを含む抗酸化剤、防腐剤（オクタデシルジメチルベンジルアンモニウムクロライド、塩化ヘキサメトニウム、塩化ベンザルコニウム、塩化ベンゼトニウム、フェノール、ブチルもしくはベンジルアルコール、アルキルパラベン、例えば、メチルもしくはプロピルパラベンなど、カテコール、レゾルシノール、シクロヘキサノール、３－ペンタノール、及びｍ－クレゾールなど）、低分子量（約１０残基未満の）ポリペプチド、タンパク質、例えば、血清アルブミン、ゼラチン、もしくは免疫グロブリンなど、親水性ポリマー、例えば、ポリビニルピロリドンなど、アミノ酸、例えば、グリシン、グルタミン、アスパラギン、ヒスチジン、アルギニン、もしくはリジンなど、グルコース、マンノース、もしくはデキストリンを含む単糖類、二糖類、及び他の炭水化物、キレート剤、例えば、ＥＤＴＡなど、糖、例えば、スクロース、マンニトール、トレハロースもしくはソルビトールなど、塩形成対イオン、例えば、ナトリウムなど、金属複合体（例えば、Ｚｎ－タンパク質複合体）、及び／または非イオン性界面活性剤、例えば、ＴＷＥＥＮ（登録商標）、ＰＬＵＲＯＮＩＣＳ（登録商標）もしくはポリエチレングリコール（ＰＥＧ）などが挙げられる。
【0153】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、約４．５～約９．０の範囲のｐＨ、例えば、約５．０～約８．０、約６．５～約７．５、または約６．５～約７．０のいずれか１つのｐＨ範囲を含むｐＨを有するように製剤化される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、約４．５～約６．５の範囲のｐＨを有するように製剤化される。いくつかの実施形態では、医薬組成物はまた、好適な等張性改変剤の添加によって、血液と等張であるようにすることができる。
【0154】
インビボ投与に使用される医薬組成物は、一般に、滅菌の、実質的に等張な状態で製剤化され、米国食品医薬品局の全てのＧｏｏｄ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｐｒａｃｔｉｃｅ（ＧＭＰ）規制を完全に遵守している。滅菌性は、滅菌濾過膜に通して濾過することによって容易に達成される。いくつかの実施形態では、組成物は、病原体を含まない。非経口投与では、医薬組成物は、液体溶液の形態、例えば、生理学的に適合する緩衝液の形態、例えば、ハンク溶液またはリンガー溶液であってもよい。加えて、医薬組成物は、固体形態であってもよく、使用の直前に、例えば、水中に再溶解または懸濁され得る。凍結乾燥組成物も含まれる。
【0155】
吸入を介した投与に好適なエアロゾル製剤も、作製することができる。エアロゾル製剤は、ジクロロジフルオロメタン、プロパン、窒素などの加圧された許容可能な推進剤に入れることができる。
【0156】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、静脈内、腹腔内、皮下、筋肉内、または硝子体内注射に適した医薬組成物として、通常の手順に従って製剤化される。いくつかの実施形態では、主題の送達系は、鼻腔または肺への送達のためのデバイスを備える。例えば、本明細書に記載の組成物は、ネブライザ、吸入器デバイスなどによる送達用に製剤化することができる。
【0157】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、鼻腔内投与などの粘膜投与に適した医薬組成物として、通常の手順に従って製剤化される。鼻腔内投与は、鼻粉末、点鼻、鼻エアロゾル、鼻ゲルなどを介して達成することができる。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、静脈内、腹腔内、皮下、筋肉内、または硝子体内注射に適した医薬組成物として、通常の手順に従って製剤化される。典型的には、注射用組成物は、滅菌等張水性緩衝液中の溶液である。必要に応じて、組成物はまた、可溶化剤及び注射部位の痛みを和らげるためにリグノカインなどの局所麻酔薬も含んでよい。一般に、成分は別個に、または単位剤形中で互いに混合させるかのいずれかで、例えば、活性剤の量を示すアンプルまたはサシェなどの密封された密閉容器中の乾燥凍結乾燥粉末または無水濃縮物として供給される。組成物が投与される場合、組成物は、必要に応じて再構成され得る。
【0158】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、ヒトへの投与に好適である。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、齧歯類（例えば、マウス、ラット）、非ヒト霊長類（例えば、カニクイザル）、サル、ネコ、イヌ、ウマ、ウシ、ブタ、ヒツジ、ヤギ、哺乳動物実験動物、哺乳動物農場動物、哺乳動物スポーツ動物、及び哺乳動物ペットへの投与に好適である。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、単回使用密封バイアルなどの単回使用バイアルに収容される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、多回使用バイアルに収容される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、容器内にバルクで収容される。いくつかの実施形態では、医薬組成物は凍結保存される。
【0159】
「単位剤形」という用語は、個体への単一投与量として好適な物理的に個別の単位を指し、各単位が、好適な医薬担体、希釈剤、または賦形剤と関連して、所望の治療効果をもたらすように算出された所定量の活性物質を含有する。これらの単位剤形は、単一または複数の単位投薬量で好適な包装内に保存され得、さらに滅菌及び密封されてもよい。
【0160】
本出願は、本明細書に記載される組成物（医薬組成物など）を好適な包装内に含む製品をさらに提供する。本明細書に記載の組成物（医薬組成物など）に好適な包装は、当該技術分野で既知であり、例えば、バイアル（例えば、密封バイアル）、鼻スプレーまたは点鼻ボトル、容器、アンプル、ボトル、瓶、柔軟性包装（例えば、密封されたマイラーまたはビニール袋）などが挙げられる。これらの製品は、さらに滅菌及び／または密封されてよい。
【0161】
本出願は、本明細書に記載される組成物（医薬組成物など）を含むキットも提供し、本明細書に記載される使用などの、組成物を使用する方法に関する説明書（複数可）をさらに含んでよい。本明細書に記載のキットは、他の緩衝液、希釈剤、フィルタ、スプレーボトル、ネブライザ、吸入器デバイス、針、シリンジ、及び本明細書に記載の任意の方法を実施するための説明書を含む添付文書を含む、商業及び使用者の観点から望ましい他の材料をさらに含み得る。
【0162】
Ｖ．ワクチン接種する方法
本出願の一態様は、個体（ヒトなど）におけるウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス）を防止（例えば、ワクチン接種）または治療する方法であって、個体に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物またはその医薬組成物のうちのいずれかを投与することを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、鼻腔内または皮内投与によって投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、初回用量、続いて１回以上（例えば、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、またはそれ以上）のブースター用量で投与される。いくつかの実施形態では、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を防止（例えば、ワクチン接種）するか、または治療するための方法は、個体において、異なるウイルスファミリーからの１つ以上の追加のウイルス種（例えば、多価免疫を提供する）及び／またはウイルスの１つ以上のウイルス株もしくはサブタイプ（例えば、ヘテロサブタイプ免疫を提供する）からの感染をさらに防止するか、または治療する。いくつかの実施形態では、本方法は、２つ以上のウイルス種（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、及びＨＣＶのうちの２つ以上）に対する多価免疫を誘導する。いくつかの実施形態では、本方法は、２つ以上のウイルスサブタイプ（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９から選択される２つ以上のＩＡＶサブタイプ；ＩＢＶサブタイプＹａｍａｇａｔａ及びＶｉｃｔｏｒｉａ；２つ以上のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２株；２つ以上のＨＣＶ遺伝子型もしくはサブタイプ；または２つ以上のＲＳＶ株）に対するヘテロサブタイプ免疫を誘導する。いくつかの実施形態では、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を防止（例えば、ワクチン接種）するか、または治療するための方法は、当該ウイルス感染に対する個体の免疫を強化することをさらに含む。いくつかの実施形態では、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を防止（例えば、ワクチン接種）するか、または治療するための方法は、当該ウイルス感染のバリアント（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２のバリアント株、ＩＡＶのサブタイプもしくはバリアント、ＩＢＶのサブタイプもしくはバリアント、ＲＳＶのサブタイプもしくはバリアント、及び／またはＨＣＶのサブタイプもしくはバリアント）によって、感染に罹患するリスクを低減することをさらに含む。
本出願の一態様は、個体（ヒトなど）におけるウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、呼吸器合胞体ウイルス）を防止（例えば、ワクチン接種）または治療する方法であって、個体に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物またはその医薬組成物のうちのいずれかを投与することを含む、方法を提供する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、鼻腔内または皮内投与によって投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、初回用量、続いて１回以上（例えば、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、またはそれ以上）のブースター用量で投与される。いくつかの実施形態では、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を防止（例えば、ワクチン接種）するか、または治療するための方法は、個体において、異なるウイルスファミリーからの１つ以上の追加のウイルス種（例えば、多価免疫を提供する）及び／またはウイルスの１つ以上のウイルス株もしくはサブタイプ（例えば、ヘテロサブタイプ免疫を提供する）からの感染をさらに防止するか、または治療する。いくつかの実施形態では、本方法は、２つ以上のウイルス種（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、及びＨＣＶのうちの２つ以上）に対する多価免疫を誘導する。いくつかの実施形態では、本方法は、２つ以上のウイルスサブタイプ（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９から選択される２つ以上のＩＡＶサブタイプ；ＩＢＶサブタイプＹａｍａｇａｔａ及びＶｉｃｔｏｒｉａ；２つ以上のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２株；２つ以上のＨＣＶ遺伝子型もしくはサブタイプ；または２つ以上のＲＳＶ株）に対するヘテロサブタイプ免疫を誘導する。いくつかの実施形態では、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を防止（例えば、ワクチン接種）するか、または治療するための方法は、当該ウイルス感染に対する個体の免疫を強化することをさらに含む。いくつかの実施形態では、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を防止（例えば、ワクチン接種）するか、または治療するための方法は、当該ウイルス感染のバリアント（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２のバリアント株、ＩＡＶのサブタイプもしくはバリアント、ＩＢＶのサブタイプもしくはバリアント、ＲＳＶのサブタイプもしくはバリアント、及び／またはＨＣＶのサブタイプもしくはバリアント）によって、感染に罹患するリスクを低減することをさらに含む。
【0163】
いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種する方法は、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に対して個体を予防的に免疫する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種する方法は、個体がウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に罹患することを防止する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体をワクチン接種する方法は、ワクチン接種された個体からワクチン接種されていない個体へのウイルス伝播を防止する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種するか、または治療する方法は、個体におけるウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）の重症度を低減する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種する方法は、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に対する個体における免疫を強化する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種する方法は、個体がウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に罹患するリスクを低減する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種するか、または治療する方法は、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）を有する個体を治療する方法をさらに含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種するか、または治療方法は、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に対する個体における免疫応答を誘発する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体にワクチン接種するか、または治療方法は、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に対する個体のＴ細胞応答を増強する方法を含む。いくつかの実施形態では、個体において免疫応答を誘発する、例えば、Ｔ細胞応答を増強する方法は、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス、インフルエンザウイルス、肝炎ウイルス、または呼吸器合胞体ウイルスからの感染）に対してＣＤ４＋Ｔ細胞を活性化する方法をさらに含む。いくつかの実施形態では、個体をワクチン接種するか、または治療する方法は、本明細書に記載のナノ複合体を含むワクチン組成物を投与することを含み、ワクチンが、同じファミリー内の異なるウイルス種、または異なるファミリーに対する多価保護を提供する。いくつかの実施形態では、個体をワクチン接種するか、または治療する方法は、本明細書に記載のナノ複合体を含むワクチン組成物を投与することを含み、ワクチンが、同じファミリー内の異なるウイルス種に対するか、または異なるウイルス株、サブタイプ、もしくは亜種に対する、ヘテロサブタイプの保護をさらに提供する。いくつかの実施形態では、個体は、哺乳動物、例えば、ヒト、ウシ、ウマ、ネコ、イヌ、齧歯類、または霊長類である。いくつかの実施形態では、個体は、ヒトである。いくつかの実施形態では、個体は、ウイルス感染に罹患するリスクがあるか、またはウイルス感染に罹患している。いくつかの実施形態では、個体は、ウイルス感染の罹患の際に死亡のリスクが高い。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、任意の年齢である。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、６５歳以上、例えば、６５、７０、７５、８０、８５、８６、８７、８８、８９、９０歳以上のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、１８歳以下、例えば、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２歳以下のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、６か月齢以下、例えば、６、５、４、３、２、１か月齢、または新生児のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、健康である。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、心臓、肺、脳、または免疫系の機能を低減させる医学的状態、既往症、または状態を有する。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、免疫不全状態である。いくつかの実施形態では、個体は、獲得免疫系不全及び／または自然免疫系不全を有する。いくつかの実施形態では、個体は、弱い免疫系を有する。いくつかの実施形態では、個体は、弱い獲得免疫系及び／または弱い自然免疫系を有する。いくつかの実施形態では、個体は、１コース以上の免疫抑制剤を投与される。いくつかの実施形態では、個体は、１コース以上の免疫抑制剤を投与されたことがある。
【0164】
ウイルス感染の症状は、ウイルス、及び個体における感染した組織または臓器に基づいて異なって提示され得る。多くの場合、いくつかの症状、例えば、疲労感、倦怠感、頭痛、またはより重篤な症例では、敗血症、臓器不全、炎症性サイトカインレベル上昇、及び場合によっては死亡が重複する。さらなる例は、以下に提供される。
【0165】
いくつかの実施形態では、サルベコウイルス感染、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染の症状としては、発熱、咳、喉の痛み、鼻詰まり、倦怠感、頭痛、筋肉痛、息切れ、軽度の肺炎、重度の肺炎、急性肺炎、敗血症、敗血症性ショック、またはそれらの任意の組み合わせのうちのいずれか１つが挙げられる。感染の徴候としては、精神状態の変化、呼吸困難または多呼吸、低酸素飽和度、尿量の低減、速い心拍数、弱い脈拍、冷たい四肢もしくは低血圧、皮膚斑点、または凝固障害、血小板減少症、アシドーシス、高乳酸塩症、または高ビリルビン血症の検査による証拠が挙げられる。いくつかの実施形態では、サルベコウイルス感染、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染は、感染した個体における炎症性サイトカインのレベルを顕著に上昇させる。いくつかの実施形態では、炎症性サイトカインのレベルの上昇、すなわちサイトカインストームは、過剰な、制御されていない全身性炎症を引き起こす。場合によっては、サルベコウイルスに感染した個体において、制御されていない全身性炎症は、肺炎、呼吸不全、ショック、臓器不全、二次細菌性肺炎、及び潜在的な死亡をもたらす。
【0166】
いくつかの実施形態では、インフルエンザ感染、例えば、Ｈ３Ｎ２の症状としては、発熱、悪寒、咳、喉の痛み、鼻詰まり、倦怠感、頭痛、筋肉痛、嘔吐、下痢、息切れ、軽度の肺炎、重度の肺炎、急性肺炎、またはそれらの任意の組み合わせのうちのいずれか１つが挙げられる。インフルエンザウイルスに感染した個体における重度のインフルエンザ感染の徴候としては、肺炎、心筋炎、脳炎、筋炎、横紋筋溶解症、多臓器不全、極度の炎症応答、敗血症、二次細菌性肺炎、及び潜在的な死亡が挙げられる。
【0167】
いくつかの実施形態では、肝炎ウイルス、例えば、Ｃ型肝炎ウイルス（ＨＣＶ）の症状としては、黄疸、疲労感、うつ、腹痛、腹水、粘土色もしくは青白い便、色の濃い尿、発熱、かゆみ、食欲不振、吐き気、嘔吐、肝硬変、肝臓癌、またはそれらの任意の組み合わせのうちのいずれか１つが挙げられる。場合によっては、肝炎ウイルスを有する個体は、症状がないかまたは軽度の症状を提示する。場合によっては、肝炎ウイルスを有する個体は、肝炎誘導性肝硬変または肝臓癌を発症した後に症状を発症する。
【0168】
いくつかの実施形態では、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）の症状としては、鼻詰まり、食欲減退、脱水、咳、くしゃみ、発熱、息切れもしくは喘鳴、呼吸困難、過敏性、活動低下、倦怠感、疲労感、疼痛、またはそれらの任意の組み合わせのうちのいずれか１つが挙げられる。呼吸器合胞体ウイルスに感染した個体におけるより重篤な場合では、ＲＳＶ症状としては、気管支炎及び／または肺炎、ならびに潜在的な死亡をさらに挙げることができる。リスクが最も高い個体としては、高齢者（例えば、６５歳以上）及び６か月齢未満の乳児が挙げられる。
【0169】
いくつかの実施形態では、個体におけるウイルス感染の重症度は、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つによるワクチン接種または治療の後に低減され、例えば、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つによるワクチン接種または治療を受けなかった個体における同じウイルス感染の重症度と比較して、少なくとも約２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、またはそれ以上低減される。いくつかの実施形態では、個体における免疫応答は、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つによるワクチン接種または治療の後に誘発される。いくつかの実施形態では、誘発された免疫応答は、個体におけるＴ細胞活性化などのＴ細胞応答を含む。いくつかの実施形態では、個体におけるＴ細胞応答の増強は、ＣＤ４＋Ｔ細胞を活性化する方法をさらに含む。いくつかの実施形態では、個体におけるウイルス感染の進行は、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つによるワクチン接種または治療によって遅延される。いくつかの実施形態では、個体におけるウイルス感染によって引き起こされる死亡は、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つによるワクチン接種または治療によって防止される。いくつかの実施形態では、ウイルス感染するか、または既に感染している、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つでワクチン接種されたかまたは治療された個体は、ワクチン接種されていない個体にウイルス感染を伝播することを防止する。
【0170】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つによるワクチン接種または治療は、２つ以上（ｍｏｒｅ ｔｈａｎ ｏｎｅ）のウイルスサブバリアントまたはサブタイプに対する、例えば、２つ以上（ｔｗｏ ｏｒ ｍｏｒｅ）のウイルスサブバリアントまたはサブタイプに対するヘテロサブタイプ免疫を誘導し得る。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ＩＡＶであり、２つ以上のサブバリアントまたはサブタイプは、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ＩＢＶであり、２つ以上のサブバリアントまたはサブタイプは、Ｙａｍａｇａｔａ及びＶｉｃｔｏｒｉａである。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２であり、２つ以上のサブバリアントまたはサブタイプは、Ｂ．１．１．７バリアント、Ｂ．１．３５１バリアント、Ｂ．１．５２６バリアント、Ｂ１．５２６．１バリアント、Ｂ１．６１７バリアント、Ｂ．１．６１７．１バリアント、Ｂ．１．６１７．２バリアント、Ｂ１．６１７．３バリアント、Ｐ．２バリアント、Ｐ．１（Ｂ．１．１．２８．１としても知られる）バリアント、Ａ．２３．１バリアント、ＣＡＬ．２０Ｃバリアント、Ｂ．１．４２７バリアント、Ｂ．１．４２９バリアント、Ｂ．１．５２５バリアント、ＢＡ．２、ＢＡ．５バリアント、ＢＡ．２．７５．２バリアント、ＢＱ．１バリアント、ＢＱ．１．１バリアント、ＸＢＢバリアント、及びＰ．１．３５１バリアントからなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ＨＣＶであり、２つ以上のサブバリアントまたはサブタイプは、ＨＣＶ遺伝子型１～７のうちのいずれか、例えば、限定されないが、ＨＣＶ遺伝子型１ａ、１ｂ、１ｃ、２ａ、２ｂ、２ｃ、２ｄ、２ｅ、２ｆ、２ｇ、２ｈ、２ｉ、２ｊ、２ｋ、３ａ、３ｂ、３ｃ、３ｄ、３ｅ、３ｆ、３ｇ、３ｈ、３ｉ、３ｊ、３ｋ、４ａ、４ｂ、４ｃ、４ｄ、５ａ、６ａ、６ｂ、６ｃ、６ｄ、６ｅ、６ｆ、６ｇ、６ｈ、６ｉ、６ｊ、６ｋ、及び７ａのうちのいずれか１つ以上に由来する。いくつかの実施形態では、ウイルスは、ＲＳＶであり、２つ以上のサブバリアントまたはサブタイプは、ＲＳＶ Ａ及びＲＳＶ Ｂである。
【0171】
本明細書に記載の治療の効力は、例えば、ウイルス量を測定すること（例えば、ウイルスＤＮＡの検出を介して）、個体の生存期間、生活の質、ウイルスタンパク質発現及び／または活性、コロナウイルスに対する血清学的抗体の検出、呼吸機能の評価、及び／またはコンピュータ断層撮影（ＣＴ）イメージングによって評価することができる。
【0172】
ワクチン組成物の有効性は、例えば、血清もしくは他の体液（限定されないが、気管支肺胞洗浄液など）中のウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、インフルエンザ、肝炎、または呼吸器合胞体ウイルスなど）のうちの１つ以上のタンパク質に対する中和抗体のレベルによって、またはウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、インフルエンザ、肝炎、または呼吸器合胞体ウイルスなど）のうちの１つ以上の株に対する血清もしくは他の体液の中和活性によって評価することができる。
【0173】
いくつかの実施形態では、本方法は、個体に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つを投与することを含み、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルス抗原に対する（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクＲＢＤに対する）血清中の中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、バリアント標的ウイルス抗原に対する血清中の中和抗体レベルの増加を示す。本明細書に記載の方法のうちのいずれか１つによるいくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、約１０％、２０％、５０％、７５％、１００％、２倍、５倍、１０倍、２５倍、５０倍、１００倍、５００倍、または１０００倍以上のうちのいずれか１つだけ、中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、中和抗体レベルは、ワクチン組成物の投与の約１、７、１４、２１、３０、４５、６０、９０、１２０、１８０、２４０、３６０、４８０、または７２０日後のうちのいずれか１つに決定される。いくつかの実施形態では、本方法は、個体に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つを投与することを含み、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上の標的ウイルス抗原（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクＲＢＤ及びＩＡＶタンパク質）に対する血清中の中和抗体レベルの増加、例えば、少なくとも約２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、またはそれ以上のうちのいずれかの増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上の標的ウイルス抗原に対する血清中の中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物の投与は、同じウイルスの２つ以上のウイルスサブタイプ（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９から選択される２つ以上のＩＡＶサブタイプ）に由来する２つ以上の標的ウイルス抗原に対する、対象におけるヘテロサブタイプ保護を誘導する。
【0174】
いくつかの実施形態では、本方法は、個体の粘膜に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つを投与することを含み、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルスに対する粘膜免疫の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上の標的ウイルスに対する粘膜免疫の増加、例えば、少なくとも約２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、１００％、または１．５倍、２倍、２．５倍、３倍、３．５倍、４倍、４．５倍、５倍、１０倍、１５倍、２０倍、２５倍、３０倍、３５倍、４０倍、４５倍、５０倍、またはそれ以上のうちのいずれか増加を示す。いくつかの実施形態では、２つ以上の標的ウイルスは、同じ属の一部、任意選択的に同じファミリーの一部である。いくつかの実施形態では、２つ以上の標的ウイルスは、異なるファミリーの一部である。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、３つ以上の標的ウイルスに対する（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ１Ｎ５、Ｈ２Ｎ３、及びＨ７Ｎ９から選択されるＩＡＶの３つ以上のサブタイプに対する）粘膜免疫の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与後に、肺常在性記憶Ｂ細胞の誘導を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与後に、濾胞性ヘルパーＴ細胞の誘導を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルスに対する（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＲＳＶ、またはインフルエンザに対する）気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）液中の中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上の標的ウイルスに対する（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＩＡＶに対する）気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）液中の中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、３つ以上の標的ウイルスに対する（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ１Ｎ５、Ｈ２Ｎ３、及びＨ７Ｎ９から選択されるＩＡＶの３つ以上のサブタイプに対する）気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）液中の中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、中和抗体は、ＩｇＡを含む。本明細書に記載の方法のうちのいずれか１つによるいくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、約１０％、２０％、５０％、７５％、１００％、２倍、５倍、１０倍、２５倍、５０倍、１００倍、５００倍、または１０００倍以上のうちのいずれか１つだけ、中和抗体レベルの増加を示す。いくつかの実施形態では、中和抗体レベルは、ワクチン組成物の投与の約１、７、１４、２１、３０、４５、６０、９０、１２０、１８０、２４０、３６０、４８０、または７２０日後のうちのいずれか１つに決定される。
【0175】
いくつかの実施形態では、本方法は、個体に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つを投与することを含み、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルスに対する（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、インフルエンザ、ＲＳＶ、またはＨＣＶに対する）血清中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上の標的ウイルス（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、及び／またはＨＣＶのうちの２つ以上）に対する血清中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、３つ以上の標的ウイルスに対する（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ１Ｎ５、Ｈ２Ｎ３、及びＨ７Ｎ９から選択されるＩＡＶの３つ以上のサブタイプに対する）血清中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルスのバリアントに対する血清中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、中和活性は、ウイルス株に対するフォーカス減少法による中和アッセイによって、定量的に決定される。本明細書に記載の方法のうちのいずれか１つによるいくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、約１０％、２０％、５０％、７５％、１００％、２倍、５倍、１０倍、２５倍、５０倍、１００倍、５００倍、または１０００倍以上のうちのいずれか１つだけ、中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、中和活性は、ワクチン組成物の投与の約１、７、１４、２１、３０、４５、６０、９０、１２０、１８０、２４０、３６０、４８０、または７２０日後のうちのいずれか１つに決定される。
【0176】
いくつかの実施形態では、本方法は、個体の粘膜に、有効量の本明細書に記載のワクチン組成物のうちのいずれか１つを投与することを含み、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルスに対する粘膜免疫の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、標的ウイルスに対する（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＲＳＶ、またはインフルエンザに対する）気管支肺胞洗浄液（ＢＡＬ）中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上の標的ウイルスに対する血清中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、２つ以上のウイルスサブタイプに対する粘膜免疫の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、２つ以上の標的ウイルスに対して（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＩＡＶの両方に対して）、気管支肺胞洗浄液（ＢＡＬ）中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、個体は、２つ以上のウイルスサブタイプに対する（例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９から選択される２つ以上のＩＡＶサブタイプに対する）気管支肺胞洗浄液（ＢＡＬ）中の中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、中和活性は、真正な生ウイルスに対するフォーカス減少法による中和アッセイによって、定量的に決定される。本明細書に記載の方法のうちのいずれか１つによるいくつかの実施形態では、個体は、ワクチン組成物の投与前と比較して、約１０％、２０％、５０％、７５％、１００％、２倍、５倍、１０倍、２５倍、５０倍、１００倍、５００倍、または１０００倍以上のうちのいずれか１つだけ、中和活性の増加を示す。いくつかの実施形態では、中和活性は、ワクチン組成物の投与の約１、７、１４、２１、３０、４５、６０、９０、１２０、１８０、２４０、３６０、４８０、または７２０日後のうちのいずれか１つに決定される。
【0177】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物（医薬組成物など）は、１回投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物（医薬組成物など）は、例えば、約２週間～約１年の間隔で２回以上投与される。複数回用量のワクチン組成物を含む方法について、例示的な投薬頻度には、週ごと、休憩なしで週ごと、３週のうち２週の週ごと、４週のうち３週の週ごと、２週ごと、３週ごと、月ごと、６か月ごと、年ごとなどが含まれ得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、約２週ごとに１回、３週ごとに１回、４週ごとに１回、６週ごとに１回、または８週ごとに１回投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物（医薬組成物など）は、約２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、１か月、２か月、３か月、４か月、５か月、６か月、７か月、８か月、９か月、１０か月、１１か月、１２か月、１３か月、１４か月、１５か月、１６か月、または１年ごとの間隔のうちのいずれかで投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物（医薬組成物など）は、２回投与され、次の用量は、初回用量の１４日後に投与される。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物（医薬組成物など）は、３回投与され、次の用量は、それぞれ、前の用量の１４日後に投与される。
【0178】
いくつかの実施形態では、方法は、以前ワクチン接種されたことがある個体（ヒトなど）をワクチン接種するかまたは治療するために使用される。本明細書に提供されるワクチン接種または治療の方法のうちのいずれかは、以前ワクチン接種されたことがない個体（ヒトなど）をワクチン接種するかまたは治療するために使用され得る。いくつかの実施形態では、方法は、個体（ヒトなど）を予防的に免疫化するために使用される。いくつかの実施形態では、方法は、ワクチン接種された個体（ヒトなど）からワクチン接種されていない個体へのウイルス伝播を防止するために使用される。いくつかの実施形態では、方法は、個体（ヒトなど）におけるウイルス感染を治療するために使用される。いくつかの実施形態では、方法は、感染した個体（ヒトなど）における感染及び関連付けられる症状をさらに改善または低減する。いくつかの実施形態では、方法は、個体（ヒトなど）における免疫応答（Ｂ細胞、またはＣＤ４＋Ｔ細胞及び／またはＣＤ８＋Ｔ細胞を含むＴ細胞などのリンパ球；ならびに限定されないが、単球、マクロファージ、好中球、顆粒球、マスト細胞、樹状細胞、及び／または好酸球を含む骨髄細胞の活性化など）を誘発するために使用される。いくつかの実施形態では、方法は、予防ワクチンとして使用される。いくつかの実施形態では、本方法は、２つ以上の異なるウイルス種に対する（すなわち、異なるファミリー及び／または異なる属からのウイルス種、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、及び／またはＨＣＶのうちの２つ以上に対する）予防及び／または治療として使用される。いくつかの実施形態では、本方法は、２つ以上の異なるウイルス亜種に対する（すなわち、同じウイルス種または属の異なる株または亜種、例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９から選択される２つ以上のＩＡＶサブタイプに対する）予防及び／または治療として使用される。いくつかの実施形態では、本方法は、３つ以上の異なるウイルス亜種に対する（すなわち、同じウイルス種または属の異なる株または亜種、例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９から選択される２つ以上のＩＡＶサブタイプに対する）予防及び／または治療として使用される。いくつかの実施形態では、方法は、個体（ヒトなど）におけるＴ細胞応答を増強するために使用される。いくつかの実施形態では、方法は、ウイルス感染及びその関連する症状を改善するか、または低減するための第１選択療法または第２選択療法として使用される。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、任意の年齢である。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、６５歳以上、例えば、６５、７０、７５、８０、８５、８６、８７、８８、８９、９０歳以上のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、１８歳以下、例えば、１８、１７、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４、３、２歳以下のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、６か月齢以下、例えば、６、５、４、３、２、１か月齢、または新生児のうちのいずれかである。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、健康である。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、心臓、肺、脳、または免疫系の機能を低減させる医学的状態、既往症、または状態を有する。いくつかの実施形態では、個体（ヒトなど）は、免疫不全状態である。
【0179】
本明細書に記載の方法またはワクチン組成物は、多様なウイルスに対するワクチン接種、及び／または多様なウイルスに関連付けられる疾患の治療に好適である。投与経路、投与される投薬量、及びウイルス感染が防止、改善、低減、治療、または治癒される程度は、標的ウイルス及び標的抗原に依存する。例えば、ウイルスエンベロープ、ウイルス膜、または関連タンパク質を含む標的抗原は、宿主細胞へのウイルス進入を防止するための有益な標的であり得る。ポリメラーゼまたはウイルス核酸を含む標的抗原は、ウイルスの複製を防止するために有益であり得る。本明細書に記載のワクチン組成物は、本明細書に記載のウイルス抗原のうちのいずれかなどの目的の抗原を標的とするように設計され得、本明細書に記載のワクチン組成物を投与する方法は、その改善された安全性プロファイルに起因して、標的ウイルス及び／または標的抗原に基づいて、現在の従来のワクチンと比較して、必要に応じて安全に改変され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のワクチン組成物は、２つ以上のウイルスファミリー、属、または種、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、及びＨＣＶのうちの２つ以上を標的とするように設計され得、本明細書に記載のワクチン組成物を投与する方法は、現在の従来のワクチンと比較して、その改善された安全性プロファイルにより、標的ウイルス及び／または標的抗原に基づいて、必要に応じて安全に修飾され得る。
【0180】
例えば、いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、サルベコウイルス（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）に対してワクチン接種するか、または治療し、標的抗原は、サルベコウイルスファミリーのうちのいずれかのウイルスに由来する抗原性または免疫原性ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ／ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ、ＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＧＸ－Ｐ５Ｌ、Ｂａｔ ＣｏＶ ＢｔＫＹ７２、Ｂａｔ ＣｏＶ ＢＭ４８－３１、１６ＢＯ１３３、ＪＴＭＣ１５、Ｂａｔ ＳＡＲＳ ＣｏＶ Ｒｆ１、ＢｔＣｏＶ ＨＫＵ３、ＬＹＲａ１１、Ｂａｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ／Ｒｐ３、Ｂａｔ ＳＬ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３１Ｃ、Ｂａｔ ＳＬ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３４Ｃ、ＳＨＣ０１４－ＣｏＶ、ＷＩＶ１、ＷＩＶ１６、Ｃｉｖｅｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、（Ｂａｔ）Ｒｃ－ｏ３１９、Ｂａｔ ＳＬ－ＺＸＣ２１、Ｂａｔ ＳＬ－ＺＣ４５、Ｐａｎｇｏｌｉｎ ＳＡＲＳｒ－ＣｏＶ－ＧＸ、Ｐａｎｇｏｌｉｎ ＳＡＲＳｒ－ＣｏＶ－ＧＤ、Ｒｓ７３２７、Ｒｓ４２３１、Ｒｓ４０８４、Ｒｆ４０９２、ＪＬ２０１２、２７３－２００５、ＨｅＢ２０１３、ＨｕＢ２０１３、Ｒｓ４２４７、Ｌｏｎｇｑｕａｎ－１４０、ＨＫＵ３－１、ＧＸ２０１３、Ｓｈａａｎｘｉ２０１１、２７９－２００５、Ａｓ６５２６、Ｙｕｎｎａｎ２０１１、Ｒｓ４２３７、Ｒｓ４０８１、Ｂａｔ ＲｓｈＳＴＴ１８２、Ｂａｔ ＲｓｈＳＴＴ２００、（Ｂａｔ）ＲａｃＣＳ２０３、（Ｂａｔ）ＲｍＹＮ０２、（Ｂａｔ）ＲｐＹＮ０６、ＹＮ２０１３、（Ｂａｔ）ＲａＴＧ１３、（Ｂａｔ）ＢＡＮＡＬ－５２、及び懸念されるバリアント（ＶＯＣ）と組み合わさったＳＡＲＳ－ＣｏＶ（例えば、参照によりその全体が本明細書に組み込まれるＮａｔｕｒｅ（２０２２）６０３：９１３－９１８を参照されたい）を含む、全てのサルベコウイルスに適用可能である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、上記のコロナウイルスのいずれかを含む、コロナウイルスファミリーの複数のウイルスに対するヘテロサブタイプ保護を誘導する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、コロナウイルス、及び別のファミリー、属、または種（例えば、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＲＳＶ、またはＨＣＶ）からのウイルスに対してワクチン接種するか、または治療する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、サルベコウイルス及びインフルエンザウイルス（例えば、ＩＡＶまたはＩＢＶ）に対してワクチン接種するか、または治療する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、サルベコウイルス及び肝炎ウイルスに対してワクチン接種するか、または治療する。いくつかの実施形態では、ワクチンは、サルベコウイルス及び呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ、例えば、ＲＳＶ－ＡまたはＲＳＶ－Ｂ）に対してワクチン接種するか、または治療する。
【0181】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、インフルエンザウイルス（例えば、ＩＡＶまたはＩＢＶ）に対してワクチン接種するか、または治療し、標的抗原は、インフルエンザファミリーの任意のウイルスに由来する抗原性または免疫原性ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法またはワクチン組成物は、任意のインフルエンザウイルス、例えば、インフルエンザＡウイルス、インフルエンザＢウイルス、インフルエンザＣウイルス、またはインフルエンザＤウイルス（すなわち、トゴトウイルス）のうちのいずれかに対するワクチン接種に好適である。例えば、本明細書に記載の方法は、Ｈ１Ｎ１、Ｈ１Ｎ２、Ｈ２Ｎ２、Ｈ２Ｎ３、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ７Ｎ７、Ｈ７Ｎ９、Ｂ／Ｙａｍａｇａｔａ（例えば、分岐群Ｙ１、Ｙ２、Ｙ３）、Ｂ／Ｖｉｃｔｏｒｉａ（例えば、亜分岐群Ｖ１Ａ．１、Ｖ１Ａ．２、Ｖ１Ａ．３）、及びそれらのバリアントのうちのいずれかを含むが、これらに限定されない、全てのインフルエンザウイルスに適用可能である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、２つ以上のインフルエンザ株、例えば、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）、インフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）、インフルエンザＣウイルス（ＩＣＶ）、またはインフルエンザＤウイルス（ＩＤＶ）のうちのいずれかの２つ以上に対してワクチン接種するか、または治療する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、ＩＡＶの２つ以上のサブ株、例えば、Ｈ１Ｎ１、Ｈ１Ｎ２、Ｈ２Ｎ２、Ｈ２Ｎ３、Ｈ３Ｎ２、Ｈ５Ｎ１、Ｈ７Ｎ７、及び／またはＨ７Ｎ９のうちのいずれかの２つ以上に対してワクチン接種するか、または治療する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、ＩＢＶの２つ以上のサブ株、例えば、Ｙａｍａｇａｔａ及びＶｉｃｔｏｒｉａ、またはそれらのサブ株、例えば、ＹａｍａｇａｔａサブクレードＹ１、Ｙ２、及び／またはＹ３のうちの２つ以上、またはＶｉｃｔｏｒｉａサブクレードＶ１Ａ．１、Ｖ１Ａ．２、及び／またはＶ１Ａ．３のうちの２つ以上に対してワクチン接種するか、または治療する。
【0182】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、肝炎ウイルス（例えば、ＨＣＶ）に対してワクチン接種するか、または治療し、標的抗原は、任意の肝炎ウイルスに由来する抗原性または免疫原性ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法またはワクチン組成物は、任意の肝炎ウイルス、例えば、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、Ｅ型肝炎ウイルス、またはそれらの任意の組み合わせのうちのいずれかに対するワクチン接種に好適である。例えば、本明細書に記載の方法は、ＨＣＶ遺伝子型１ａ、ＨＣＶ遺伝子型１ｂ、ＨＣＶ遺伝子型２ａ、ＨＣＶ遺伝子型２ｂ、ＨＣＶ遺伝子型２ｃ、ＨＣＶ遺伝子型３ａ、またはＨＣＶ遺伝子型３ｂを含む、全てのＣ型肝炎ウイルスに適用可能である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、肝炎ウイルスの任意の２つ以上の種、例えば、Ａ型肝炎ウイルス、Ｂ型肝炎ウイルス、Ｃ型肝炎ウイルス、Ｄ型肝炎ウイルス、Ｅ型肝炎ウイルス、またはそれらの任意の組み合わせのうちのいずれかに対するワクチン接種に好適である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、任意の２つ以上のＣ型肝炎株、例えば、ＨＣＶ遺伝子型１ａ、ＨＣＶ遺伝子型１ｂ、ＨＣＶ遺伝子型２ａ、ＨＣＶ遺伝子型２ｂ、ＨＣＶ遺伝子型２ｃ、ＨＣＶ遺伝子型３ａ、及び／またはＨＣＶ遺伝子型３ｂに対するヘテロサブタイプ保護を提供する。
【0183】
いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）に対してワクチン接種するか、または治療し、標的抗原は、任意のＲＳＶ株、バリアント、または亜種に由来する抗原性または免疫原性ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法またはワクチン組成物は、任意の呼吸器合胞体ウイルス、例えば、１６種のＲＳＶ－Ａまたは２２種のＲＳＶ－Ｂサブタイプ（例えば、ＧＡ１、ＧＡ２、ＧＡ５、ＧＡ７、ＢＡなど）のうちのいずれかに対するワクチン接種に好適である。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、呼吸器合胞体ウイルスの任意の２つ以上の株、バリアント、または亜種、例えば、１６種のＲＳＶ－Ａまたは２２種のＲＳＶ－Ｂサブタイプ（例えば、ＧＡ１、ＧＡ２、ＧＡ５、ＧＡ７、ＢＡなど）から選択される任意の２つ以上の株、バリアント、または亜種に対してワクチン接種する。いくつかの実施形態では、ワクチン組成物は、呼吸器合胞体ウイルスの任意の２つ以上の株、バリアント、または亜種、例えば、１６種のＲＳＶ－Ａまたは２２種のＲＳＶ－Ｂサブタイプ（例えば、ＧＡ１、ＧＡ２、ＧＡ５、ＧＡ７、ＢＡなど）から選択される任意の２つ以上の株、バリアント、または亜種に対するヘテロサブタイプ保護を提供する。
【0184】
いくつかの実施形態では、第１のウイルス及び第２のウイルスのワクチン接種または治療に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、第１のウイルスに由来する標的抗原性または免疫原性ポリペプチド（すなわち、ウイルス抗原）、及び第２のウイルスに由来する核タンパク質を含む。いくつかの実施形態では、第１のウイルス及び第２のウイルスは、各々独立して、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ＩＡＶ、ＩＢＶ、ＨＣＶ、及びＲＳＶ、またはその株、バリアント、もしくは亜種からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＩＡＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質及びＩＡＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＩＢＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質及びＩＢＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＲＳＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質及びＲＳＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＨＣＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質及びＨＣＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＡＶ及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＡＶに由来するウイルス核タンパク質及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＡＶ及びＩＢＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＡＶに由来するウイルス核タンパク質及びＩＢＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＡＶ及びＨＣＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＡＶに由来するウイルス核タンパク質及びＨＣＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＡＶ及びＲＳＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＡＶに由来するウイルス核タンパク質及びＲＳＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＢＶ及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＢＶに由来するウイルス核タンパク質及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＢＶ及びＩＡＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＢＶに由来するウイルス核タンパク質及びＩＡＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＢＶ及びＨＣＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＢＶに由来するウイルス核タンパク質及びＨＣＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＩＢＶ及びＲＳＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＩＢＶに由来するウイルス核タンパク質及びＲＳＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＨＣＶ及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＨＣＶに由来するウイルス核タンパク質及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＨＣＶ及びＩＡＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＨＣＶに由来するウイルス核タンパク質及びＩＡＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＨＣＶ及びＩＢＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＨＣＶに由来するウイルス核タンパク質及びＩＢＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＨＣＶ及びＲＳＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＨＣＶに由来するウイルス核タンパク質及びＲＳＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＲＳＶ及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＲＳＶに由来するウイルス核タンパク質及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＲＳＶ及びＩＡＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＲＳＶに由来するウイルス核タンパク質及びＩＡＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＲＳＶ及びＩＢＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＲＳＶに由来するウイルス核タンパク質及びＩＢＶに由来するウイルス抗原を含む。いくつかの実施形態では、ＲＳＶ及びＨＣＶに対するワクチン接種に使用するためのワクチン組成物が提供され、ワクチン組成物は、ＲＳＶに由来するウイルス核タンパク質及びＨＣＶに由来するウイルス抗原を含む。
【0185】
本明細書に記載の方法は、ワクチン接種、ウイルス伝播防止、または疾患を低減するための治療として使用され得、治療が、第１の療法、第２の療法、第３の療法として、またはアジュバント設定もしくはネオアジュバント設定で、コルチコステロイド、抗炎症シグナル伝達調節物質、β２－アドレナリン受容体アゴニスト気管支拡張剤、抗コリン作動薬、粘液溶解剤、抗ウイルス剤、抗線維化剤、高張性生理食塩水、抗体、ワクチン、及びそれらの混合物などからなる群から選択される治療剤などの、当該技術分野で既知の他の種類の抗ウイルス療法との併用療法として作用し得る。例えば、抗ウイルス剤は、レムデシビル、ロピナビル／リトナビル、ＩＦＮ－α、ロピナビル、リトナビル、ペンシクロビル、ガリデシビル、ジスルフィラム、ダルナビル、コビシスタット、ＡＳＣ０９Ｆ、ジスルフィラム、ナファモスタット、グリフィスシン、アリスポリビル、クロロキン、ニタゾキサニド、バロキサビルマルボキシル、オセルタミビル、ザナミビル、ペラミビル、アマンタジン、リマンタジン、ファビピラビル、ラニナミビル、リバリン、ウミフェノビル、及びそれらの任意の組み合わせからなる群からさらに選択することができる。一態様では、個体をウイルスに対してワクチン接種する方法であって、個体にナノ複合体を含むワクチン組成物を投与することを含む、方法が提供される。
【0186】
個体（ヒトなど）に投与されるワクチン組成物（またはその医薬組成物）の投与レジメンは、特定のワクチン組成物、投与の方法、及び治療されるウイルス感染の特定の種類及び段階によって変動し得る。いくつかの実施形態では、ワクチンの有効量は、毒性効果（すなわち、臨床的に許容される毒性レベルを超える効果）を誘導するレベルを下回るか、または組成物が個体に投与される場合に潜在的な副作用が制御もしくは許容され得るレベルにある。
【実施例0187】
以下の実施例は、例示の目的のためにのみ含まれ、本開示の範囲を限定することを意図するものではない。
【0188】
実施例１：様々な標的ウイルス感染に対するナノ複合体ワクチンの生成
ナノ複合体ワクチンは、ｉ）アダプタ－抗原としても知られるウイルス抗原と融合した核タンパク質と、ｉｉ）ミニウイルスＲＮＡ（ミニｖＲＮＡ）との２つの部分で構成される。ミニｖＲＮＡは、アダプタ－抗原の複数のコピーの付着を可能にするための足場として作用する。核タンパク質は、ｖＲＮＡに対して高い親和性を有し、ナノ複合体ワクチンにおけるアダプタとして機能する。ワクチンの効力は、免疫原性複合体のサイズを増加させる、複合体の形成、及び自然免疫を活性化する、ＲＮＡアジュバントの存在の両方によって顕著に改善される。したがって、対応する抗原をアダプタタンパク質に融合させることによるナノ複合体技術は、任意のワクチンに適用することができ、ワクチン開発のための汎用的な選択肢となる。
ナノ複合体ワクチンは、ｉ）アダプタ－抗原としても知られるウイルス抗原と融合した核タンパク質と、ｉｉ）ミニウイルスＲＮＡ（ミニｖＲＮＡ）との２つの部分で構成される。ミニｖＲＮＡは、アダプタ－抗原の複数のコピーの付着を可能にするための足場として作用する。核タンパク質は、ｖＲＮＡに対して高い親和性を有し、ナノ複合体ワクチンにおけるアダプタとして機能する。ワクチンの効力は、免疫原性複合体のサイズを増加させる、複合体の形成、及び自然免疫を活性化する、ＲＮＡアジュバントの存在の両方によって顕著に改善される。したがって、対応する抗原をアダプタタンパク質に融合させることによるナノ複合体技術は、任意のワクチンに適用することができ、ワクチン開発のための汎用的な選択肢となる。
【0189】
図１Ａ～１Ｄ、図２、及び図１０に示されるように、合計１１個の例示的なナノ複合体ワクチンを、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２コロナウイルス、インフルエンザウイルス、呼吸器合胞体ウイルス、及びＣ型肝炎ウイルスによって引き起こされる感染に対してワクチン接種するように設計した。各種類のナノ複合体ワクチンは、それぞれの病原体の様々な株またはサブタイプに由来する抗原を含有していた。
【0190】
さらに、アダプタタンパク質及びウイルス抗原が異なるウイルスに由来する二価のナノ複合体ワクチンを生成することができる。例示的な二価ナノ複合体ワクチン（ＢｉＮＣ）を図７に提供する（ＢｉＮＣ－０１～ＢｉＮＣ－０４）。ＢｉＮＣ－０１及びＢｉＮＣ－０２は、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）抗原と融合し、次いで、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域のヌクレオチド位置１～２６６）と複合体化したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２アダプタを含む。ＢｉＮＣ－０３及びＢｉＮＣ－０４は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗原と融合し、次いで、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場またはＩＡＶ Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場（ＩＡＶゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域のヌクレオチド位置１～３２６）のいずれかと複合体化したＩＡＶアダプタを含む。
【0191】
実施例２：ナノ複合体ワクチンは、標的ウイルス感染に対して保護する
例示的なＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ナノ複合体ワクチン
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染を標的とする例示的なナノ複合体ワクチンを、ＮＣ－ＣｏＶ－０１と呼んだ。アダプタ－抗原構成要素は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクＲＢＤ（抗原）に融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２核タンパク質（アダプタ）を含み、ミニウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムの５’非翻訳領域（ヌクレオチド位置１～２６６、すなわち、「Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場」）に由来した。
例示的なＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ナノ複合体ワクチン
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染を標的とする例示的なナノ複合体ワクチンを、ＮＣ－ＣｏＶ－０１と呼んだ。アダプタ－抗原構成要素は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクＲＢＤ（抗原）に融合したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２核タンパク質（アダプタ）を含み、ミニウイルスＲＮＡは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムの５’非翻訳領域（ヌクレオチド位置１～２６６、すなわち、「Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場」）に由来した。
【0192】
図３Ａは、アダプタ－抗原の予測される構造を示し、その品質及び発現を、クマシーブルー染色によって確認した（図３Ｂ）。図３Ｃに示されるように、ミニｖＲＮＡ、Ｒ２６６の二次及び三次構造を予測した（それぞれ、左パネル及び右パネル）。５’非翻訳領域は、ゲノム複製のために高度に構造化された足場へと折り畳まれた。インビトロで転写されたＲ２６６を、尿素－ＰＡＧＥを使用して視覚化した（図３Ｄ）。加えて、ＮＣ－ＣｏＶ－０１のナノ複合体は、ゲルシフトアッセイ及び蛍光偏光性アッセイによって確認し、これらの両方は、ミニｖＲＮＡ足場とのアダプタ－抗原の複合体形成を実証した（図３Ｅ及び３Ｆ）。
【0193】
ＮＣ－ＣｏＶ－０１は、マウスインビボアッセイによって実証されるように、粘膜性及び全身性免疫を誘発した。様々な外因性アジュバントによって引き起こされる刺激性応答に起因して、ミョウバンなどの従来のアジュバントは、ヒト気道における粘膜ワクチン接種での使用には不適切であった。しかしながら、ナノ複合体ワクチン、例えば、ＮＣ－ＣｏＶ－１は、免疫刺激するミニｖＲＮＡ（この場合、Ｒ２６６）をアダプタ－抗原融合ペプチドの複数のコピーで包むことによって、この副作用を防止するように設計した。したがって、ナノ複合体は、抗原提示細胞（ＡＰＣ）によって食作用を受けることが予想され、ナノ複合体内のＲ２６６は、次いで、ＡＰＣを直接活性化するであろう。
【0194】
マウス鼻腔内免疫化モデル（図４Ａ）を介して示されるように、肺気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）中のＩｇＡ及びＩｇＧの両方の誘導は、強い粘膜免疫応答を実証した（図４Ｂ及び図４Ｃ）が、血清試料中のスパイクＲＢＤ特異的ＩｇＧの強力な誘導は、堅牢な全身性獲得免疫応答を示した（図４Ｄ）。ミニＲＮＡ（２０ヌクレオチド長であったＲ２０）を陰性対照として含めて、複合体形成及びサイズの重要性を評価した。アダプタ－抗原及びＲ２０の混合物で免疫化したマウスは、抗体応答を誘発したが、Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＣｏＶ－０１ナノ複合体ワクチンと比較すると、少ない。
【0195】
さらに、自然免疫応答の活性化は、主にトール様受容体及び／またはＲＩＧ－Ｉ様受容体によって媒介されるウイルスＲＮＡの感知を通じて生じる。ウイルスＲＮＡは、転写に由来する小さなＲＮＡ、大きなウイルスゲノムに由来する長く複雑なＲＮＡ、または複製中に誘導される長いゲノムＲＮＡであり得る。鼻腔内免疫化マウスモデル（図５Ａ）を使用して示されるように、ＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２０及びＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２６６の両方のワクチン接種は、インターフェロン－β（ＩＦＮ－β）産生（図５Ｂ）、インターフェロン刺激遺伝子（ＩＦＩＴＭ３、図５Ｃ；及びＲＩＧ－Ｉ、図５Ｄ）、ケモカイン（ＣＸＣＬ１０、図５Ｆ；及びＣＣＬ５、図５Ｇ）、ならびに炎症促進性サイトカイン（ＩＬ－６、図５Ｅ；ＩＬ－１β、図５Ｈ；及びＴＮＦα、図５Ｉ）を活性化した。ＲＮＡ足場を含まないＮＰ－ＲＢＤを、対照として機能させた。
【0196】
ＮＣ－ＣｏＶ－０１ナノ複合体ワクチン効力を、マウス鼻腔内感染モデルで評価した（図６Ａ）。ＢＡＬＢ／ｃマウスの群を、３用量のＮＰ－ＲＢＤ＋Ｒ２６６（ＮＣ－ＣｏＶ－０１）で模擬免疫化または鼻腔内免疫化した。第３の用量を投与した７日後に、鼻腔内接種を介して、マウスをＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ベータ（Ｂ．１．３５１）ウイルスに致死的に感染させた。感染後２日目に、肺及び鼻甲介を採取した。肺（図６Ｂ）及び鼻甲介（図６Ｃ）におけるウイルス力価の不在によって証明されるように、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス感染に罹患することからマウスを完全に保護したことが見出された。加えて、核タンパク質染色の不在は、ワクチン接種されたマウスの肺におけるウイルス複製の不在を示した（図６Ｄ）。
【0197】
例示的なＡ型インフルエンザウイルスナノ複合体ワクチン
インフルエンザＡ感染を標的とする２つの例示的なナノ複合体ワクチンは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１（Ｈ１Ｎ１を標的とする）及びＮＣ－ＩＡＶ－０２（Ｈ５Ｎ１を標的とする）と呼ばれた。例示的な構造については、図１０を参照されたい。ＮＣ－ＩＡＶ－０１では、アダプタ－抗原構成要素は、ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ヘマグルチニン（ＨＡ）タンパク質（抗原）に融合したＩＡＶ Ｈ５Ｎ１／１１９４核タンパク質（アダプタ）を含み、ミニウイルスＲＮＡは、ＩＡＶゲノムの５’非翻訳領域（ヌクレオチド位置１～３２６、すなわち、「Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場」）に由来した。ＮＣ－ＩＡＶ－０２では、アダプタ－抗原構成要素は、ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１／１１９４ヘマグルチニン（ＨＡ）タンパク質（抗原）に融合したＩＡＶ Ｈ５Ｎ１／１１９４核タンパク質（アダプタ）を含み、ミニウイルスＲＮＡは、Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場であった。
インフルエンザＡ感染を標的とする２つの例示的なナノ複合体ワクチンは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１（Ｈ１Ｎ１を標的とする）及びＮＣ－ＩＡＶ－０２（Ｈ５Ｎ１を標的とする）と呼ばれた。例示的な構造については、図１０を参照されたい。ＮＣ－ＩＡＶ－０１では、アダプタ－抗原構成要素は、ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ヘマグルチニン（ＨＡ）タンパク質（抗原）に融合したＩＡＶ Ｈ５Ｎ１／１１９４核タンパク質（アダプタ）を含み、ミニウイルスＲＮＡは、ＩＡＶゲノムの５’非翻訳領域（ヌクレオチド位置１～３２６、すなわち、「Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場」）に由来した。ＮＣ－ＩＡＶ－０２では、アダプタ－抗原構成要素は、ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１／１１９４ヘマグルチニン（ＨＡ）タンパク質（抗原）に融合したＩＡＶ Ｈ５Ｎ１／１１９４核タンパク質（アダプタ）を含み、ミニウイルスＲＮＡは、Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場であった。
【0198】
Ｈ１Ｎ１標的ナノ複合体ワクチン
図１１Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１の一部であるＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質の予測されるリボン構造を示す。図１１Ｂは、以下の２回分の用量によるＢＡＬＢ／ｃマウスの免疫化プロトコルを概略する概略図を提供し、（ｉ）ＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質単独（ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ、陰性対照）、または（ｉｉ）Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０１；各々は、１４日間隔で２回鼻腔内に投与される（ｎ＝１群当たり３匹のマウス）。
図１１Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０１の一部であるＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質の予測されるリボン構造を示す。図１１Ｂは、以下の２回分の用量によるＢＡＬＢ／ｃマウスの免疫化プロトコルを概略する概略図を提供し、（ｉ）ＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質単独（ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ、陰性対照）、または（ｉｉ）Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０１；各々は、１４日間隔で２回鼻腔内に投与される（ｎ＝１群当たり３匹のマウス）。
【0199】
ＮＣ－ＩＡＶ－０１は、マウスインビボアッセイによって実証されるように、粘膜性及び全身性免疫を誘発した。マウス鼻腔内免疫化モデル（図１１Ｂ）を介して示されるように、肺気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）中のＩｇＡ及びＩｇＧの両方の誘導は、強い粘膜免疫応答を実証し（図１２Ｂ及び図１２Ｃ）、血清試料中のＨ１Ｎ１ ＨＡ特異的ＩｇＧの強力な誘導は、堅牢な全身性獲得免疫応答を示した（図１２Ａ）。ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独で免疫化したマウスは、抗体応答を誘発したが、この応答は、Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンによって引き起こされる抗体応答よりも著しく低かった。さらに、ワクチン接種後のＨ１Ｎ１－ＨＡ中和抗体の力価は、ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独と比較して、Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含む鼻腔内ＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンを投与したマウスの血清において著しく高く（図１３Ａ）、Ｈ１Ｎ１ ＨＡ阻害の増加を示している。生Ｈ１Ｎ１の免疫中和を、フォーカス減少法による中和試験（Ｆｏｃｕｓ Ｒｅｄｕｃｔｉｏｎ Ｎｅｕｔｒａｌｉｚａｔｉｏｎ Ｔｅｓｔ）によって評価し、ワクチン接種されたマウスから採取された血清試料を生ウイルスと混合した。図１３Ｂに示すように、ＦＲＮＴ５０力価は、入力ウイルス（すなわち、Ｈ１Ｎ１）の５０％を中和する血清の逆数希釈を表す。図１３Ｂに示されるように、Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含む鼻腔内ＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチンを投与されたマウスから採取された血清は、鼻腔内ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独を投与されたマウスから採取された血清と比較して、著しく高い中和を示し、血清中のより高いレベルの機能的ＨＡ中和抗体を示した。
【0200】
ＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチン効力を、マウス鼻腔内感染モデルにおいて評価した（図１４Ａ）。ＢＡＬＢ／ｃマウス群を、（ｉ）ＰＢＳ、（ｉｉ）ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独、または（ｉｉｉ）ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ ＋ Ｒ３２６（Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０１ナノ複合体ワクチン）の２回分の用量（１４日間隔）で鼻腔内免疫化した。第２の用量が投与された後の１４日目に、マウスを次いで、鼻腔内接種を介してインフルエンザＡウイルスサブタイプＨ１Ｎ１／ｐｄｍ０９に感染させた。体重を感染後１４日間追跡し、ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ＋Ｒ３２６で免疫化したマウスは、経時的に体重の変化を示さなかったが、ＰＢＳまたはＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独を投与されたマウスは、同様に徐々に体重が減少した（図１４Ｂ）。さらに、ＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ＋Ｒ３２６で免疫化したマウスは、ＰＢＳまたはＮＰ－Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独を投与されたマウスと比較して、より高い生存率を示した（図１４Ｃ）。
【0201】
Ｈ５Ｎ１標的ナノ複合体ワクチン
図１５Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０２の一部であるＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質の予測されるリボン構造を示す。図１５Ｂは、以下の２回分の用量によるＢＡＬＢ／ｃマウスの免疫化プロトコルを概略する概略図を提供し、（ｉ）ＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質単独（ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ、陰性対照）、または（ｉｉ）Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０２；各々は、１４日間隔で２回鼻腔内に投与される（ｎ＝１群当たり３匹のマウス）。
図１５Ａは、ＮＣ－ＩＡＶ－０２の一部であるＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質の予測されるリボン構造を示す。図１５Ｂは、以下の２回分の用量によるＢＡＬＢ／ｃマウスの免疫化プロトコルを概略する概略図を提供し、（ｉ）ＩＡＶアダプタ－抗原タンパク質単独（ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ、陰性対照）、または（ｉｉ）Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０２；各々は、１４日間隔で２回鼻腔内に投与される（ｎ＝１群当たり３匹のマウス）。
【0202】
ＮＣ－ＩＡＶ－０２は、マウスインビボアッセイによって実証されるように、粘膜性及び全身性免疫を誘発した。マウス鼻腔内免疫化モデル（図１５Ｂ）を介して示されるように、肺気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）中のＩｇＡ及びＩｇＧの両方の誘導は、強い粘膜免疫応答を実証した（図１６Ｂ及び図１６Ｃ）が、血清試料中のＨ５Ｎ１ ＨＡ特異的ＩｇＧの強力な誘導は、堅牢な全身性獲得免疫応答を示した（図１６Ａ）。ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ単独で免疫化したマウスは、抗体応答を誘発したが、この応答は、Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンによって引き起こされる抗体応答よりも著しく低かった。
【0203】
さらに、ＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチン効力を、マウス鼻腔内感染モデルにおいて評価した（図１７Ａ）。ＢＡＬＢ／ｃマウス群を、（ｉ）ＰＢＳ、（ｉｉ）ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ単独、または（ｉｉｉ）ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ ＋ Ｒ３２６（Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場を含むＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチン）の２回分の用量（１４日間隔）で鼻腔内免疫化した。第２の用量が投与された後の１４日目に、マウスを次いで、鼻腔内接種を介してインフルエンザＡウイルスサブタイプＨ５Ｎ１／１１９４に感染させた。体重を感染後１４日間追跡し、ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ＋Ｒ３２６で免疫化したマウスは、経時的に体重の変化を示さなかったが、ＰＢＳまたはＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ単独で投与されたマウスは、同様に徐々に体重が減少した（図１７Ｂ）。さらに、ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ＋Ｒ３２６で免疫化したマウスは、ＰＢＳまたはＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ単独を投与されたマウスと比較して、より高い生存率を示した（図１７Ｃ）。
【0204】
総合すると、これらのデータは、本明細書で提供されるナノ複合体ワクチンが、インビボでの様々なウイルスの感染に対する保護に有効であるだけでなく、安全でもあることを実証する。
実施例３：インフルエンザウイルスＡ（ＩＡＶ）ナノ複合体ワクチンは、異なるＩＡＶサブタイプ免疫原に交差反応する
実施例３：インフルエンザウイルスＡ（ＩＡＶ）ナノ複合体ワクチンは、異なるＩＡＶサブタイプ免疫原に交差反応する
【0205】
ＢＡＬＢ／ｃマウスを、例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０１もしくは例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチン、または陰性対照としてのＰＢＳのいずれかで２回分の用量（１４日間隔）で鼻腔内免疫化した。ＢＡＬＦ細胞及び脾臓細胞を、第２のワクチン用量の投与の７日後に採取し、刺激のために異なるＩＡＶサブタイプ（すなわち、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｎ３Ｎ２、またはＨ７Ｎ９）からの元の免疫原またはヌクレオカプシドタンパク質を使用して、ＥＬＩＳｐｏｔによってアッセイした。試験ワークフローについては、図１８Ａを参照されたい。同じ免疫原（それぞれＨ１Ｎ１またはＨ５Ｎ１）で刺激すると、ＮＣ－ＩＡＶ－０１（図１８Ｂ）及びＮＣ－ＩＡＶ－０２（図１８Ｃ）の両方は、ＢＡＬＦ及び脾臓において強い免疫応答を誘導した。驚くべきことに、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｎ３Ｎ２、またはＨ７Ｎ９ヌクレオカプシドタンパク質で刺激すると、例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンは、試験された各サブタイプに対する免疫応答を刺激することが可能であった（図１８Ｄ）。
【0206】
次に、図１９Ａに示されるように、ワクチン接種後の異なるＩＡＶサブタイプに対して交差保護するＮＣ－ＩＡＶ－０２の能力を試験した。ＢＡＬＢ／ｃマウスを、例示的なＮＣ－ＩＡＶ－０２ナノ複合体ワクチンまたは陰性対照としてのＰＢＳで２回分の用量（１４日間隔）で鼻腔内免疫化した。第２の用量が投与された後の１４日目に、マウスを次いで、鼻腔内接種を介してＩＡＶサブタイプＨ１Ｎ１／ＰＲ８またはＩＡＶサブタイプＨ７Ｎ９／ＡＨ１で感染させた。体重を感染後１４日間追跡し、ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ＋Ｒ３２６で免疫化したマウスは、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、著しく体重減少が少ない（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８接種：図１９Ｂ、及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１接種：図１９Ｄ）。さらに、ＮＰ－Ｈ５Ｎ１－ＨＡ＋Ｒ３２６で免疫化したマウスは、ＰＢＳを投与されたマウスと比較して、より高い生存率を示した（Ｈ１Ｎ１／ＰＲ８接種：図１９Ｃ、及びＨ７Ｎ９／ＡＨ１接種：図１９Ｅ）。
【0207】
したがって、これらのデータは、ＩＡＶナノ複合体ワクチン、例えば、ＮＣ－ＩＡＶ－０２が、ＩＡＶウイルス感染、ＩＡＶの他のサブタイプに対してさえからもマウスを保護することができることを実証し、本明細書に記載のナノ複合体ワクチンが、ヘテロサブタイプウイルスに対して効果的に保護することが可能であることを示す。
【0208】
実施例４：二価ナノ複合体ワクチンは、標的ウイルス感染に対して保護する
上記の実施例１に記載されるように、アダプタタンパク質及びウイルス抗原が異なるウイルスに由来する二価ナノ複合体ワクチンを生成することができる。例示的な二価ナノ複合体ワクチン（ＢｉＮＣ）を図７に提供する（ＢｉＮＣ－０１～ＢｉＮＣ－０４）。ＢｉＮＣ－０１及びＢｉＮＣ－０２は、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）抗原と融合し、次いで、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場と複合体化したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２アダプタを含む。ＢｉＮＣ－０３及びＢｉＮＣ－０４は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗原と融合し、次いで、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場またはＩＡＶ Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場のいずれかと複合体化するＩＡＶアダプタを含む。
上記の実施例１に記載されるように、アダプタタンパク質及びウイルス抗原が異なるウイルスに由来する二価ナノ複合体ワクチンを生成することができる。例示的な二価ナノ複合体ワクチン（ＢｉＮＣ）を図７に提供する（ＢｉＮＣ－０１～ＢｉＮＣ－０４）。ＢｉＮＣ－０１及びＢｉＮＣ－０２は、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）抗原と融合し、次いで、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場と複合体化したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２アダプタを含む。ＢｉＮＣ－０３及びＢｉＮＣ－０４は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗原と融合し、次いで、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場またはＩＡＶ Ｒ３２６ミニｖＲＮＡ足場のいずれかと複合体化するＩＡＶアダプタを含む。
【0209】
ＢｉＮＣ－０１は、マウスインビボアッセイによって実証されるように、Ｈ１Ｎ１に対する粘膜性及び全身性免疫を誘発した。２回分の用量の（１４日間隔）免疫化による上述のマウス鼻腔内免疫化モデルに続いて（例えば、ＮＣ－ＣｏＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、またはＮＣ－ＩＡＶ－０２によるワクチン接種のため）、肺気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）中のＩｇＡ及びＩｇＧの両方の誘導は、強い粘膜免疫応答を示し（図８Ｂ及び８Ｃ）、血清試料中のＨ１Ｎ１ ＨＡ特異的ＩｇＧの強力な誘導は、堅牢な全身性適応免疫応答を示した（図８Ａ）。ＣｏＶ－ＮＰ／Ｈ１Ｎ１－ＨＡ単独で免疫化したマウスは、抗体応答を誘発したが、この応答は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場を含むＢｉＮＣ－０１ナノ複合体ワクチンによって引き起こされる抗体応答よりも著しく低かった。
【0210】
ＢｉＮＣ－０２は、マウスインビボアッセイによって実証されるように、Ｈ５Ｎ１に対する粘膜性及び全身性免疫を誘発した。２回分の用量の（１４日間隔）免疫化による上述のマウス鼻腔内免疫化モデルに続いて（例えば、ＮＣ－ＣｏＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、またはＮＣ－ＩＡＶ－０２によるワクチン接種のため）、肺気管支肺胞液（ＢＡＬＦ）中のＩｇＡ及びＩｇＧの両方の誘導は、強い粘膜免疫応答を示し（図９Ｂ及び９Ｃ）、血清試料中のＨ５Ｎ１ ＨＡ特異的ＩｇＧの強力な誘導は、堅牢な全身性適応免疫応答を示した（図９Ａ）。ＣｏＶ－ＮＰ／Ｈ５Ｎ１－ＨＡ単独で免疫化したマウスは、抗体応答を誘発したが、この応答は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｒ２６６ミニｖＲＮＡ足場を含むＢｉＮＣ－０２ナノ複合体ワクチンによって引き起こされる抗体応答よりも著しく低かった。
【0211】
総合すると、これらのデータは、ナノ複合体ワクチン、例えば、ＮＣ－ＣｏＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０１、ＮＣ－ＩＡＶ－０２、ＢｉＮＣ－０１、及びＢｉＮＣ－０２が、複数のウイルスサブタイプに対するヘテロサブタイプ保護を提供すること、ならびに複数のウイルスファミリー（すなわち、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＩＡＶ）に対する多価保護を提供することを含む、堅牢な免疫応答を促進することによって、ウイルス感染（例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染、インフルエンザＡ感染）を完全に保護したことを実証する。さらに、ナノ複合体ワクチンは、インビボでの使用について安全であることが実証された。
【0212】
配列表
配列番号１（ＮＣ－ＣｏＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ＋ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤ祖先株；祖先株スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４３４５７１））
配列番号２（ＮＣ－ＣｏＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤオミクロンＢＡ．５；オミクロンＢＡ．５スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１３７７７６５８－ｈＣｏＶ－１９／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／ＨＫＵ－２２０７１２－００５／２０２２））
配列番号３（ＮＣ－ＩＡＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
配列番号４（ＮＣ－ＩＡＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッド；Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡの参照配列（ＥＦ５４１４０２．１－Ａ／Ｖｉｅｔｎａｍ／１１９４／２００４））
配列番号５（ＮＣ－ＩＡＶ－０３：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ ＋ ＩＡＶ Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡヘッド；Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ６７５７９７－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４８０１／２０１４））
配列番号６（ＮＣ－ＩＢＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ５２９３４５－Ｂ／ＰＨＵＫＥＴ／３０７３／２０１３））
配列番号７（ＮＣ－ＩＢＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ１８４５７９３－Ｂ／Ａｕｓｔｒｉａ／１３５９４１７／２０２１））
配列番号８（ＮＣ－ＲＳＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＲＳＶサブタイプＡ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＡ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４１２８６６－ｈＲＳＶ／Ａ／Ｅｎｇｌａｎｄ／３９７／２０１７））
配列番号９（ＮＣ－ＲＳＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＲＳＶ サブタイプＢ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＢ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１６５３９９９－ｈＲＳＶ／Ｂ／Ａｕｓｔｒａｌｉａ／ＶＩＣ－ＲＣＨ０５６／２０１９））
配列番号１０（ＮＣ－ＨＣＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＨＣＶ遺伝子型１ａ Ｅ２；遺伝子型１ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿０３８８８２．１；単離株Ｈ７７））
配列番号１１（ＮＣ－ＨＣＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＨＣＶ遺伝子型２ａ Ｅ２；遺伝子型２ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿００９８２３．１；単離株ＨＣ－Ｊ６））
配列番号１２（ＳＡＲＳ２ウイルス核タンパク質アミノ酸配列）
ＳＤＮＧＰＱＮＱＲＮＡＰＲＩＴＦＧＧＰＳＤＳＴＧＳＮＱＮＧＥＲＳＧＡＲＳＫＱＲＲＰＱＧＬＰＮＮＴＡＳＷＦＴＡＬＴＱＨＧＫＥＤＬＫＦＰＲＧＱＧＶＰＩＮＴＮＳＳＰＤＤＱＩＧＹＹＲＲＡＴＲＲＩＲＧＧＤＧＫＭＫＤＬＳＰＲＷＹＦＹＹＬＧＴＧＰＥＡＧＬＰＹＧＡＮＫＤＧＩＩＷＶＡＴＥＧＡＬＮＴＰＫＤＨＩＧＴＲＮＰＡＮＮＡＡＩＶＬＱＬＰＱＧＴＴＬＰＫＧＦＹＡＥＧＳＲＧＧＳＱＡＳＳＲＳＳＳＲＳＲＮＳＳＲＮＳＴＰＧＳＳＲＧＴＳＰＡＲＭＡＧＮＧＧＤＡＡＬＡＬＬＬＬＤＲＬＮＱＬＥＳＫＭＳＧＫＧＱＱＱＱＧＱＴＶＴＫＫＳＡＡＥＡＳＫＫＰＲＱＫＲＴＡＴＫＡＹＮＶＴＱＡＦＧＲＲＧＰＥＱＴＱＧＮＦＧＤＱＥＬＩＲＱＧＴＤＹＫＨＷＰＱＩＡＱＦＡＰＳＡＳＡＦＦＧＭＳＲＩＧＭＥＶＴＰＳＧＴＷＬＴＹＴＧＡＩＫＬＤＤＫＤＰＮＦＫＤＱＶＩＬＬＮＫＨＩＤＡＹＫＴＦＰＰＴＥＰＫＫＤＫＫＫＫＡＤＥＴＱＡＬＰＱＲＱＫＫＱＱＴＶＴＬＬＰＡＡＤＬＤＤＦＳＫＱＬＱＱＳＭＳＳＡＤＳＴＱＡ
配列番号１３（ＩＡＶウイルス核タンパク質アミノ酸配列）
ＡＡＡＧＴＡＡＳＹＥＱＭＥＴＧＧＥＲＱＮＡＴＥＩＲＡＳＶＧＲＭＶＳＧＩＧＲＦＹＩＱＭＣＴＥＬＫＬＳＤＹＥＧＲＬＩＱＮＳＩＴＩＥＲＭＶＬＳＡＦＤＥＲＲＮＲＹＬＥＥＨＰＳＡＧＫＤＰＫＫＴＧＧＰＩＹＲＲＲＤＧＫＷＶＲＥＬＩＬＹＤＫＥＥＩＲＲＩＷＲＱＡＮＮＧＥＤＡＴＡＧＬＴＨＬＭＩＷＨＳＮＬＮＤＡＴＹＱＲＴＲＡＬＶＲＴＧＭＤＰＲＭＣＳＬＭＱＧＳＴＬＰＲＲＳＧＡＡＧＡＡＶＫＧＶＧＴＭＶＭＥＬＩＲＭＩＫＲＧＩＮＤＲＮＦＷＲＧＥＮＧＲＲＴＲＩＡＹＥＲＭＣＮＩＬＫＧＫＦＱＴＡＡＱＲＡＭＭＤＱＶＲＥＳＲＮＰＧＮＡＥＩＥＤＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲＧＳＶＡＨＫＳＣＬＰＡＣＶＹＧＬＡＶＡＳＧＹＤＦＥＲＥＧＹＳＬＶＧＩＤＰＦＲＬＬＱＮＳＱＶＦＳＬＩＲＰＮＥＮＰＡＨＫＳＱＬＶＷＭＡＣＨＳＡＡＦＥＤＬＲＶＳＳＦＩＲＧＴＲＶＶＰＲＧＱＬＳＴＲＧＶＱＩＡＳＮＥＮＭＥＡＭＤＳＮＴＬＥＬＲＳＲＹＷＡＩＲＴＲＳＧＧＮＴＮＱＱＲＡＳＡＧＱＩＳＶＱＰＴＦＳＶＱＲＮＬＰＦＥＲＡＴＩＭＡＡＦＴＧＮＴＥＧＲＴＳＤＭＲＴＥＩＩＲＭＭＥＳＡＲＰＥＤＶＳＦＱＧＲＧＶＦＥＬＳＤＥＫＡＴＮＰＩＶＰＳＦＤＭＮＮＥＧＳＹＦＦＧＤＮＡＥＥＹＤＳ
配列番号１４（ＮＣ－ＣｏＶ－０１及びＢｉＮＣ－０３抗原アミノ酸配列：ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤ祖先株；祖先株スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４３４５７１））
ＦＴＶＥＫＧＩＹＱＴＳＮＦＲＶＱＰＴＥＳＩＶＲＦＰＮＩＴＮＬＣＰＦＧＥＶＦＮＡＴＲＦＡＳＶＹＡＷＮＲＫＲＩＳＮＣＶＡＤＹＳＶＬＹＮＳＡＳＦＳＴＦＫＣＹＧＶＳＰＴＫＬＮＤＬＣＦＴＮＶＹＡＤＳＦＶＩＲＧＤＥＶＲＱＩＡＰＧＱＴＧＫＩＡＤＹＮＹＫＬＰＤＤＦＴＧＣＶＩＡＷＮＳＮＮＬＤＳＫＶＧＧＮＹＮＹＬＹＲＬＦＲＫＳＮＬＫＰＦＥＲＤＩＳＴＥＩＹＱＡＧＳＴＰＣＮＧＶＥＧＦＮＣＹＦＰＬＱＳＹＧＦＱＰＴＮＧＶＧＹＱＰＹＲＶＶＶＬＳＦＥＬＬＨＡＰＡＴＶＣＧＰＫＫＳＴＮＬＶＫＮＫＣＶＮＦＮＦ
配列番号１５（ＮＣ－ＣｏＶ－０２及びＢｉＮＣ－０４抗原アミノ酸配列：ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤオミクロンＢＡ．５；オミクロンＢＡ．５スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１３７７７６５８－ｈＣｏＶ－１９／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／ＨＫＵ－２２０７１２－００５／２０２２））
ＦＴＶＥＫＧＩＹＱＴＳＮＦＲＶＱＰＴＥＳＩＶＲＦＰＮＩＴＮＬＣＰＦＤＥＶＦＮＡＴＲＦＡＳＶＹＡＷＮＲＫＲＩＳＮＣＶＡＤＹＳＶＬＹＮＦＡＰＦＦＡＦＫＣＹＧＶＳＰＴＫＬＮＤＬＣＦＴＮＶＹＡＤＳＦＶＩＲＧＮＥＶＳＱＩＡＰＧＱＴＧＮＩＡＤＹＮＹＫＬＰＤＤＦＴＧＣＶＩＡＷＮＳＮＫＬＤＳＫＶＧＧＮＹＮＹＲＹＲＬＦＲＫＳＮＬＫＰＦＥＲＤＩＳＴＥＩＹＱＡＧＮＫＰＣＮＧＶＡＧＶＮＣＹＦＰＬＲＳＹＧＦＲＰＴＹＧＶＧＨＱＰＹＲＶＶＶＬＳＦＥＬＬＨＡＰＡＴＶＣＧＰＫＫＳＴＮＬＶＫＮＫＣＶＮＦ
配列番号１６（ＮＣ－ＩＡＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
ＬＣＫＬＲＧＶＡＰＬＨＬＧＫＣＮＩＡＧＷＩＬＧＮＰＥＣＥＳＬＳＴＡＳＳＷＳＹＩＶＥＴＳＳＳＤＮＧＴＣＹＰＧＤＦＩＤＹＥＥＬＲＥＱＬＳＳＶＳＳＦＥＲＦＥＩＦＰＫＴＳＳＷＰＮＨＤＳＮＫＧＶＴＡＡＣＰＨＡＧＡＫＳＦＹＫＮＬＩＷＬＶＫＫＥＮＳＹＰＫＬＳＫＳＹＩＮＤＫＧＫＥＶＬＶＬＷＧＩＨＨＰＳＴＳＡＤＱＱＳＬＹＱＮＡＤＡＹＶＦＶＧＳＳＲＹＳＫＫＦＫＰＥＩＡＩＲＰＫＶＲＧＱＥＧＲＭＮＹＹＷＴＬＶＥＰＧＤＫＩＴＦＥＡＴＧＮＬＶＶＰＲＹＡＦＡＭＥＲＮＡＧＳＧＩＩＩＳＤＴＰＶＨＤＣＮ
配列番号１７（ＢｉＮＣ－０１抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
ＫＬＣＫＬＲＧＶＡＰＬＨＬＧＫＦＮＩＡＧＷＩＬＧＮＰＥＣＥＳＬＳＴＡＳＳＷＳＹＩＶＥＴＳＳＳＤＮＧＴＣＹＰＧＤＦＩＤＹＥＥＬＲＥＱＬＳＳＶＳＳＦＥＲＦＥＩＦＰＫＴＳＳＷＰＮＨＤＳＮＫＧＶＴＡＡＣＰＨＡＧＡＲＳＦＹＫＮＬＩＷＬＶＫＫＥＮＳＹＰＫＬＳＫＳＹＩＮＤＫＧＫＥＶＨＶＬＷＧＩＨＨＰＳＴＳＡＤＱＱＳＬＹＱＮＡＤＡＹＶＦＶＧＳＳＲＹＳＫＫＦＫＰＥＩＡＩＲＰＫＶＲＧＱＥＧＲＭＮＹＹＷＴＬＶＥＰＧＤＲＩＴＦＥＡＴＧＮＬＶＶＰＲＹＡＦＡＭＥＲＮＡＧＳＧＩＩＩＳＤＴＰＶＨＤＣＮＴ
配列番号１８（ＮＣ－ＩＡＶ－０２及びＢｉＮＣ－０２抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッド；Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡの参照配列（ＥＦ５４１４０２．１－Ａ／Ｖｉｅｔｎａｍ／１１９４／２００４））
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配列番号１９（ＮＣ－ＩＢＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ５２９３４５－Ｂ／ＰＨＵＫＥＴ／３０７３／２０１３））
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配列番号２０（ＮＣ－ＩＢＶ－０２抗原アミノ酸配列：ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ１８４５７９３－Ｂ／Ａｕｓｔｒｉａ／１３５９４１７／２０２１））
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配列番号２１（ＮＣ－ＲＳＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＲＳＶサブタイプＡ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＡ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４１２８６６－ｈＲＳＶ／Ａ／Ｅｎｇｌａｎｄ／３９７／２０１７））
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配列番号２２（ＮＣ－ＲＳＶ－０２抗原アミノ酸配列：ＲＳＶサブタイプＢ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＢ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１６５３９９９－ｈＲＳＶ／Ｂ／Ａｕｓｔｒａｌｉａ／ＶＩＣ－ＲＣＨ０５６／２０１９））
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配列番号２３（ＮＣ－ＨＣＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＨＣＶ遺伝子型１ａ Ｅ２；遺伝子型１ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿０３８８８２．１；単離株Ｈ７７））
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配列番号２４（ＮＣ－ＨＣＶ－０２抗原アミノ酸配列：ＨＣＶ遺伝子型２ａ Ｅ２；遺伝子型２ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿００９８２３．１；単離株ＨＣ－Ｊ６））
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配列番号２５（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ＤＮＡ配列、参照配列）
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配列番号２６（ＢｉＮＣ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ ＋ ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
配列番号２７（ＢｉＮＣ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ ＋ ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッド；Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡの参照配列（ＥＦ５４１４０２．１－Ａ／Ｖｉｅｔｎａｍ／１１９４／２００４））
配列番号２８（ＢｉＮＣ－０３：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ ＋ ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤ祖先株；祖先株スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４３４５７１））
配列番号２９（ＢｉＮＣ－０４：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ ＋ ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤオミクロンＢＡ．５；オミクロンＢＡ．５スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１３７７７６５８－ｈＣｏＶ－１９／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／ＨＫＵ－２２０７１２－００５／２０２２））
配列番号３０（Ｈ７Ｎ９／ＺＪ，ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１４８７４４）
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配列番号３１（ＮＣ－ＩＡＶ－０３抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡヘッド；Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ６７５７９７－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４８０１／２０１４））
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本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、前記ナノ複合体が、ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、前記ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、前記ワクチン組成物。
（項目２）
前記アダプタ－抗原ポリペプチド対前記足場分子のモル比が、約５：１超である、項目１に記載のワクチン組成物。
（項目３）
前記ウイルス抗原が、抗原ポリペプチドである、項目１または２に記載のワクチン組成物。
（項目４）
前記ウイルス抗原が、免疫原性タンパク質である、項目１または２に記載のワクチン組成物。
（項目５）
前記ウイルス抗原が、前記ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している、項目１～４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目６）
前記ウイルス抗原が、前記ウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している、項目１～４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目７）
前記ウイルスＲＮＡが、ウイルスゲノムの非翻訳領域を含む、項目１～６のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目８）
前記ウイルスＲＮＡが、前記ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域を含む、項目７に記載のワクチン組成物。
（項目９）
前記ウイルスＲＮＡが、約１０～約５００ヌクレオチド長である、項目１～８のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１０）
前記ウイルスＲＮＡが、約２００～約５００ヌクレオチド長である、項目９に記載のワクチン組成物。
（項目１１）
前記ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、項目１～１０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１２）
前記ウイルスＲＮＡが、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む、項目１１に記載のワクチン組成物。
（項目１３）
前記ウイルスＲＮＡが、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）に由来する、項目１～１０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１４）
前記ウイルスＲＮＡが、配列番号３０に記載のＩＡＶゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む、項目１３に記載のワクチン組成物。
（項目１５）
前記ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、項目１～１４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１６）
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質が、配列番号１２のアミノ酸配列を含む、項目１５に記載のワクチン組成物。
（項目１７）
前記ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶに由来する、項目１～１４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１８）
前記ウイルス核タンパク質が、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する、項目１７に記載のワクチン組成物。
（項目１９）
前記ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１に由来するウイルス核タンパク質が、配列番号１３のアミノ酸配列を含む、項目１７または１８に記載のワクチン組成物。
（項目２０）
前記ウイルス核タンパク質及び前記ウイルス抗原が、同じウイルスに由来する、項目１～１９のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２１）
前記ウイルス核タンパク質及び前記ウイルス抗原が、異なるウイルスに由来する、項目１～１９のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２２）
前記ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２３）
前記ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目２２に記載のワクチン組成物。
（項目２４）
前記ウイルス抗原が、受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）を含む、項目２３に記載のワクチン組成物。
（項目２５）
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原が、配列番号１４または１５のアミノ酸配列を含む、項目２３または２４に記載のワクチン組成物。
（項目２６）
前記ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２７）
前記ウイルス抗原が、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目２６に記載のワクチン組成物。
（項目２８）
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＩＡＶまたはインフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）に由来する、項目２６または２７に記載のワクチン組成物。
（項目２９）
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する、項目２８に記載のワクチン組成物。
（項目３０）
前記ＩＡＶウイルス抗原が、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、項目２９に記載のワクチン組成物。
（項目３１）
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａのＩＢＶサブタイプに由来する、項目２８に記載のワクチン組成物。
（項目３２）
前記ＩＢＶウイルス抗原が、配列番号１９または２０のアミノ酸配列を含む、項目３１に記載のワクチン組成物。
（項目３３）
前記ウイルス抗原が、呼吸器合胞体ウイルス（「ＲＳＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目３４）
前記ウイルス抗原が、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目３３に記載のワクチン組成物。
（項目３５）
前記ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＲＳＶ ＡサブタイプまたはＲＳＶ Ｂサブタイプに由来する、項目３４に記載のワクチン組成物。
（項目３６）
前記ＲＳＶウイルス抗原が、配列番号２１または２２のアミノ酸配列を含む、項目３４または３５に記載のワクチン組成物。
（項目３７）
前記ウイルス抗原が、Ｃ型肝炎ウイルス（「ＨＣＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目３８）
前記ウイルス抗原が、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目３７に記載のワクチン組成物。
（項目３９）
前記ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＨＣＶ遺伝子型１ａまたはＨＣＶ遺伝子型２ａに由来する、項目３８に記載のワクチン組成物。
（項目４０）
前記ＨＣＶウイルス抗原が、配列番号２３または２４のアミノ酸配列を含む、項目３８または３９に記載のワクチン組成物。
（項目４１）
前記アダプタ－抗原ポリペプチドが、配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、項目１～４０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目４２）
前記ワクチン組成物中の前記ナノ複合体が、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する、項目１～４１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目４３）
前記ワクチン組成物中の前記ナノ複合体が、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する、項目１～４２のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目４４）
個体におけるウイルス感染を防止する方法であって、前記個体に、有効量の項目１～４３のいずれか１項に記載のワクチン組成物を投与することを含む、前記方法。
（項目４５）
前記ワクチン組成物が、鼻腔内または皮内投与によって投与される、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記ワクチン組成物が、初回用量で、続いて１回または２回のブースター用量で投与される、項目４４または４５に記載の方法。
（項目４７）
前記初回用量及び前記１回または２回のブースター用量が、約７日から約２１日間隔で投与される、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記初回用量及び前記１回または２回のブースター用量が、約１４日間隔で投与される、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記初回用量及び第１のブースター用量、ならびに前記第１のブースター用量及び第２のブースター用量が、約７～約２１日間隔、任意選択的に約１４日間隔で投与される、項目４６～４８のいずれか１項に記載の方法。
（項目５０）
前記ワクチン組成物が、同じウイルス種の一部である２つ以上のウイルスサブタイプに対するヘテロサブタイプ保護を提供する、項目４４～４９のいずれか１項に記載の方法。
（項目５１）
前記方法が、異なるウイルス属からの２つ以上のウイルスによるウイルス感染を防止する、項目４４～５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目５２）
（ｉ）前記２つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉ）前記２つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものである、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
前記方法が、３つ以上のウイルス種によるウイルス感染を防止し、
（ｉ）前記３つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、
（ｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、（ａ）同じウイルス種からのものである２つ以上のウイルスサブタイプまたは亜種、及び（ｂ）前記（ａ）のウイルスとは異なるウイルスファミリーからのものである１つ以上のウイルス種を含む、項目５１または５２に記載の方法。
配列番号１（ＮＣ－ＣｏＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ＋ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤ祖先株；祖先株スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４３４５７１））
【化1】
配列番号２（ＮＣ－ＣｏＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤオミクロンＢＡ．５；オミクロンＢＡ．５スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１３７７７６５８－ｈＣｏＶ－１９／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／ＨＫＵ－２２０７１２－００５／２０２２））
【化2】
配列番号３（ＮＣ－ＩＡＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
【化3】
配列番号４（ＮＣ－ＩＡＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッド；Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡの参照配列（ＥＦ５４１４０２．１－Ａ／Ｖｉｅｔｎａｍ／１１９４／２００４））
【化4】
配列番号５（ＮＣ－ＩＡＶ－０３：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ ＋ ＩＡＶ Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡヘッド；Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ６７５７９７－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４８０１／２０１４））
【化5】
配列番号６（ＮＣ－ＩＢＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ５２９３４５－Ｂ／ＰＨＵＫＥＴ／３０７３／２０１３））
【化6】
配列番号７（ＮＣ－ＩＢＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ－ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ１８４５７９３－Ｂ／Ａｕｓｔｒｉａ／１３５９４１７／２０２１））
【化7】
配列番号８（ＮＣ－ＲＳＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＲＳＶサブタイプＡ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＡ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４１２８６６－ｈＲＳＶ／Ａ／Ｅｎｇｌａｎｄ／３９７／２０１７））
【化8】
配列番号９（ＮＣ－ＲＳＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＲＳＶ サブタイプＢ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＢ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１６５３９９９－ｈＲＳＶ／Ｂ／Ａｕｓｔｒａｌｉａ／ＶＩＣ－ＲＣＨ０５６／２０１９））
【化9】
配列番号１０（ＮＣ－ＨＣＶ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＨＣＶ遺伝子型１ａ Ｅ２；遺伝子型１ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿０３８８８２．１；単離株Ｈ７７））
【化10】
配列番号１１（ＮＣ－ＨＣＶ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ－ＨＣＶ遺伝子型２ａ Ｅ２；遺伝子型２ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿００９８２３．１；単離株ＨＣ－Ｊ６））
【化11】
配列番号１２（ＳＡＲＳ２ウイルス核タンパク質アミノ酸配列）
ＳＤＮＧＰＱＮＱＲＮＡＰＲＩＴＦＧＧＰＳＤＳＴＧＳＮＱＮＧＥＲＳＧＡＲＳＫＱＲＲＰＱＧＬＰＮＮＴＡＳＷＦＴＡＬＴＱＨＧＫＥＤＬＫＦＰＲＧＱＧＶＰＩＮＴＮＳＳＰＤＤＱＩＧＹＹＲＲＡＴＲＲＩＲＧＧＤＧＫＭＫＤＬＳＰＲＷＹＦＹＹＬＧＴＧＰＥＡＧＬＰＹＧＡＮＫＤＧＩＩＷＶＡＴＥＧＡＬＮＴＰＫＤＨＩＧＴＲＮＰＡＮＮＡＡＩＶＬＱＬＰＱＧＴＴＬＰＫＧＦＹＡＥＧＳＲＧＧＳＱＡＳＳＲＳＳＳＲＳＲＮＳＳＲＮＳＴＰＧＳＳＲＧＴＳＰＡＲＭＡＧＮＧＧＤＡＡＬＡＬＬＬＬＤＲＬＮＱＬＥＳＫＭＳＧＫＧＱＱＱＱＧＱＴＶＴＫＫＳＡＡＥＡＳＫＫＰＲＱＫＲＴＡＴＫＡＹＮＶＴＱＡＦＧＲＲＧＰＥＱＴＱＧＮＦＧＤＱＥＬＩＲＱＧＴＤＹＫＨＷＰＱＩＡＱＦＡＰＳＡＳＡＦＦＧＭＳＲＩＧＭＥＶＴＰＳＧＴＷＬＴＹＴＧＡＩＫＬＤＤＫＤＰＮＦＫＤＱＶＩＬＬＮＫＨＩＤＡＹＫＴＦＰＰＴＥＰＫＫＤＫＫＫＫＡＤＥＴＱＡＬＰＱＲＱＫＫＱＱＴＶＴＬＬＰＡＡＤＬＤＤＦＳＫＱＬＱＱＳＭＳＳＡＤＳＴＱＡ
配列番号１３（ＩＡＶウイルス核タンパク質アミノ酸配列）
ＡＡＡＧＴＡＡＳＹＥＱＭＥＴＧＧＥＲＱＮＡＴＥＩＲＡＳＶＧＲＭＶＳＧＩＧＲＦＹＩＱＭＣＴＥＬＫＬＳＤＹＥＧＲＬＩＱＮＳＩＴＩＥＲＭＶＬＳＡＦＤＥＲＲＮＲＹＬＥＥＨＰＳＡＧＫＤＰＫＫＴＧＧＰＩＹＲＲＲＤＧＫＷＶＲＥＬＩＬＹＤＫＥＥＩＲＲＩＷＲＱＡＮＮＧＥＤＡＴＡＧＬＴＨＬＭＩＷＨＳＮＬＮＤＡＴＹＱＲＴＲＡＬＶＲＴＧＭＤＰＲＭＣＳＬＭＱＧＳＴＬＰＲＲＳＧＡＡＧＡＡＶＫＧＶＧＴＭＶＭＥＬＩＲＭＩＫＲＧＩＮＤＲＮＦＷＲＧＥＮＧＲＲＴＲＩＡＹＥＲＭＣＮＩＬＫＧＫＦＱＴＡＡＱＲＡＭＭＤＱＶＲＥＳＲＮＰＧＮＡＥＩＥＤＬＩＦＬＡＲＳＡＬＩＬＲＧＳＶＡＨＫＳＣＬＰＡＣＶＹＧＬＡＶＡＳＧＹＤＦＥＲＥＧＹＳＬＶＧＩＤＰＦＲＬＬＱＮＳＱＶＦＳＬＩＲＰＮＥＮＰＡＨＫＳＱＬＶＷＭＡＣＨＳＡＡＦＥＤＬＲＶＳＳＦＩＲＧＴＲＶＶＰＲＧＱＬＳＴＲＧＶＱＩＡＳＮＥＮＭＥＡＭＤＳＮＴＬＥＬＲＳＲＹＷＡＩＲＴＲＳＧＧＮＴＮＱＱＲＡＳＡＧＱＩＳＶＱＰＴＦＳＶＱＲＮＬＰＦＥＲＡＴＩＭＡＡＦＴＧＮＴＥＧＲＴＳＤＭＲＴＥＩＩＲＭＭＥＳＡＲＰＥＤＶＳＦＱＧＲＧＶＦＥＬＳＤＥＫＡＴＮＰＩＶＰＳＦＤＭＮＮＥＧＳＹＦＦＧＤＮＡＥＥＹＤＳ
配列番号１４（ＮＣ－ＣｏＶ－０１及びＢｉＮＣ－０３抗原アミノ酸配列：ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤ祖先株；祖先株スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４３４５７１））
ＦＴＶＥＫＧＩＹＱＴＳＮＦＲＶＱＰＴＥＳＩＶＲＦＰＮＩＴＮＬＣＰＦＧＥＶＦＮＡＴＲＦＡＳＶＹＡＷＮＲＫＲＩＳＮＣＶＡＤＹＳＶＬＹＮＳＡＳＦＳＴＦＫＣＹＧＶＳＰＴＫＬＮＤＬＣＦＴＮＶＹＡＤＳＦＶＩＲＧＤＥＶＲＱＩＡＰＧＱＴＧＫＩＡＤＹＮＹＫＬＰＤＤＦＴＧＣＶＩＡＷＮＳＮＮＬＤＳＫＶＧＧＮＹＮＹＬＹＲＬＦＲＫＳＮＬＫＰＦＥＲＤＩＳＴＥＩＹＱＡＧＳＴＰＣＮＧＶＥＧＦＮＣＹＦＰＬＱＳＹＧＦＱＰＴＮＧＶＧＹＱＰＹＲＶＶＶＬＳＦＥＬＬＨＡＰＡＴＶＣＧＰＫＫＳＴＮＬＶＫＮＫＣＶＮＦＮＦ
配列番号１５（ＮＣ－ＣｏＶ－０２及びＢｉＮＣ－０４抗原アミノ酸配列：ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤオミクロンＢＡ．５；オミクロンＢＡ．５スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１３７７７６５８－ｈＣｏＶ－１９／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／ＨＫＵ－２２０７１２－００５／２０２２））
ＦＴＶＥＫＧＩＹＱＴＳＮＦＲＶＱＰＴＥＳＩＶＲＦＰＮＩＴＮＬＣＰＦＤＥＶＦＮＡＴＲＦＡＳＶＹＡＷＮＲＫＲＩＳＮＣＶＡＤＹＳＶＬＹＮＦＡＰＦＦＡＦＫＣＹＧＶＳＰＴＫＬＮＤＬＣＦＴＮＶＹＡＤＳＦＶＩＲＧＮＥＶＳＱＩＡＰＧＱＴＧＮＩＡＤＹＮＹＫＬＰＤＤＦＴＧＣＶＩＡＷＮＳＮＫＬＤＳＫＶＧＧＮＹＮＹＲＹＲＬＦＲＫＳＮＬＫＰＦＥＲＤＩＳＴＥＩＹＱＡＧＮＫＰＣＮＧＶＡＧＶＮＣＹＦＰＬＲＳＹＧＦＲＰＴＹＧＶＧＨＱＰＹＲＶＶＶＬＳＦＥＬＬＨＡＰＡＴＶＣＧＰＫＫＳＴＮＬＶＫＮＫＣＶＮＦ
配列番号１６（ＮＣ－ＩＡＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
ＬＣＫＬＲＧＶＡＰＬＨＬＧＫＣＮＩＡＧＷＩＬＧＮＰＥＣＥＳＬＳＴＡＳＳＷＳＹＩＶＥＴＳＳＳＤＮＧＴＣＹＰＧＤＦＩＤＹＥＥＬＲＥＱＬＳＳＶＳＳＦＥＲＦＥＩＦＰＫＴＳＳＷＰＮＨＤＳＮＫＧＶＴＡＡＣＰＨＡＧＡＫＳＦＹＫＮＬＩＷＬＶＫＫＥＮＳＹＰＫＬＳＫＳＹＩＮＤＫＧＫＥＶＬＶＬＷＧＩＨＨＰＳＴＳＡＤＱＱＳＬＹＱＮＡＤＡＹＶＦＶＧＳＳＲＹＳＫＫＦＫＰＥＩＡＩＲＰＫＶＲＧＱＥＧＲＭＮＹＹＷＴＬＶＥＰＧＤＫＩＴＦＥＡＴＧＮＬＶＶＰＲＹＡＦＡＭＥＲＮＡＧＳＧＩＩＩＳＤＴＰＶＨＤＣＮ
配列番号１７（ＢｉＮＣ－０１抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
ＫＬＣＫＬＲＧＶＡＰＬＨＬＧＫＦＮＩＡＧＷＩＬＧＮＰＥＣＥＳＬＳＴＡＳＳＷＳＹＩＶＥＴＳＳＳＤＮＧＴＣＹＰＧＤＦＩＤＹＥＥＬＲＥＱＬＳＳＶＳＳＦＥＲＦＥＩＦＰＫＴＳＳＷＰＮＨＤＳＮＫＧＶＴＡＡＣＰＨＡＧＡＲＳＦＹＫＮＬＩＷＬＶＫＫＥＮＳＹＰＫＬＳＫＳＹＩＮＤＫＧＫＥＶＨＶＬＷＧＩＨＨＰＳＴＳＡＤＱＱＳＬＹＱＮＡＤＡＹＶＦＶＧＳＳＲＹＳＫＫＦＫＰＥＩＡＩＲＰＫＶＲＧＱＥＧＲＭＮＹＹＷＴＬＶＥＰＧＤＲＩＴＦＥＡＴＧＮＬＶＶＰＲＹＡＦＡＭＥＲＮＡＧＳＧＩＩＩＳＤＴＰＶＨＤＣＮＴ
配列番号１８（ＮＣ－ＩＡＶ－０２及びＢｉＮＣ－０２抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッド；Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡの参照配列（ＥＦ５４１４０２．１－Ａ／Ｖｉｅｔｎａｍ／１１９４／２００４））
ＫＬＣＤＬＤＧＶＫＰＬＩＬＲＤＣＳＶＡＧＷＬＬＧＮＰＭＣＤＥＦＩＮＶＰＥＷＳＹＩＶＥＫＡＮＰＶＮＤＬＣＹＰＧＤＦＮＤＹＥＥＬＫＨＬＬＳＲＩＮＨＦＥＫＩＱＩＩＰＫＳＳＷＳＳＨＥＡＳＬＧＶＳＳＡＣＰＹＱＧＫＳＳＦＦＲＮＶＶＷＬＩＫＫＮＳＴＹＰＴＩＫＲＳＹＮＮＴＮＱＥＤＬＬＶＬＷＧＩＨＨＰＮＤＡＡＥＱＴＫＬＹＱＮＰＴＴＹＩＳＶＧＴＳＴＬＮＱＲＬＶＰＲＩＡＴＲＳＫＶＮＧＱＳＧＲＭＥＦＦＷＴＩＬＫＰＮＤＡＩＮＦＥＳＮＧＮＦＩＡＰＥＹＡＹＫＩＶＫＫＧＤＳＴＩＭＫＳＥＬＥＹＧＮＣＮＴ
配列番号１９（ＮＣ－ＩＢＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｙａｍａｇａｔａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ５２９３４５－Ｂ／ＰＨＵＫＥＴ／３０７３／２０１３））
ＦＡＮＬＫＧＴＲＴＲＧＫＬＣＰＤＣＬＮＣＴＤＬＤＶＡＬＧＲＰＭＣＶＧＴＴＰＳＡＫＡＳＩＬＨＥＶＲＰＶＴＳＧＣＦＰＩＭＨＤＲＴＫＩＲＱＬＰＮＬＬＲＧＹＥＫＩＲＬＳＴＱＮＶＩＤＡＥＫＡＰＧＧＰＹＲＬＧＴＳＧＳＣＰＮＡＴＳＫＩＧＦＦＡＴＭＡＷＡＶＰＫＤＮＹＫＮＡＴＮＰＬＴＶＥＶＰＹＩＣＴＥＧＥＤＱＩＴＶＷＧＦＨＳＤＮＫＴＱＭＫＳＬＹＧＤＳＮＰＱＫＦＴＳＳＡＮＧＶＴＴＨＹＶＳＱＩＧＤＦＰＤＱＴＥＤＧＧＬＰＱＳＧＲＩＶＶＤＹＭＭＱＫＰＧＫＴＧＴＩＶＹＱＲＧＶＬＬＰＱＫＶＷＣＡＳＧＲＳＫＶＩＫＧＳＬＰＬＩＧＥＡＤＣＬ
配列番号２０（ＮＣ－ＩＢＶ－０２抗原アミノ酸配列：ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡヘッド；ＩＢＶ Ｖｉｃｔｏｒｉａ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ１８４５７９３－Ｂ／Ａｕｓｔｒｉａ／１３５９４１７／２０２１））
ＦＡＮＬＫＧＴＥＴＲＧＫＬＣＰＫＣＬＮＣＴＤＬＤＶＡＬＧＲＰＫＣＴＧＫＩＰＳＡＲＶＳＩＬＨＥＶＲＰＶＴＳＧＣＦＰＩＭＨＤＲＴＫＩＲＱＬＰＮＬＬＲＧＹＥＨＶＲＬＳＴＨＮＶＩＮＴＥＤＡＰＧＧＰＹＥＩＧＴＳＧＳＣＬＮＩＴＮＧＫＧＦＦＡＴＭＡＷＡＶＰＫＮＫＴＡＴＮＰＬＴＩＥＶＰＹＩＣＴＥＥＥＤＱＩＴＶＷＧＦＨＳＤＤＥＴＱＭＡＲＬＹＧＤＳＫＰＱＫＦＴＳＳＡＮＧＶＴＴＨＹＶＳＱＩＧＧＦＰＮＱＴＥＤＧＧＬＰＱＳＧＲＩＶＶＤＹＭＶＱＫＳＧＫＴＧＴＩＴＹＱＲＧＩＬＬＰＱＫＶＷＣＡＳＧＫＳＫＶＩＫＧＳＬＰＬＩＧＥＡＤＣＬ
配列番号２１（ＮＣ－ＲＳＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＲＳＶサブタイプＡ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＡ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４１２８６６－ｈＲＳＶ／Ａ／Ｅｎｇｌａｎｄ／３９７／２０１７））
ＱＮＩＴＥＥＦＹＱＳＴＣＳＡＶＳＫＧＹＬＳＡＬＲＴＧＷＹＴＳＶＩＴＩＥＬＳＮＩＫＥＮＫＣＮＧＴＤＡＫＶＫＬＩＫＱＥＬＤＫＹＫＮＡＶＴＥＬＱＬＬＭＱＳＴＰＡＡＮＳＲＡＲＱＱＱＱＲＦＬＧＦＬＬＧＶＧＳＡＩＡＳＧＩＡＶＳＫＶＬＨＬＥＧＥＶＮＫＩＫＳＡＬＬＳＴＮＫＡＶＶＳＬＳＮＧＶＳＶＬＴＳＫＶＬＤＬＫＮＹＩＤＫＱＬＬＰＩＶＮＫＱＳＣＳＩＳＮＩＥＴＶＩＥＦＱＱＫＮＮＲＬＬＥＩＴＲＥＦＳＶＮＡＧＶＴＴＰＶＳＴＹＭＬＴＮＳＥＬＬＳＬＩＮＤＭＰＩＴＮＤＱＫＫＬＭＳＳＮＶＱＩＶＲＱＱＳＹＳＩＭＳＩＩＫＥＥＶＬＡＹＶＶＱＬＰＬＹＧＶＩＤＴＰＣＷＫＬＨＴＳＰＬＣＴＴＮＴＫＥＧＳＮＩＣＬＴＲＴＤＲＧＷＹＣＤＮＡＧＳＶＳＦＦＰＱＡＥＴＣＫＶＱＳＮＲＶＦＣＤＴＭＮＳＬＴＬＰＳＥＶＮＬＣＮＩＤＩＦＮＰＫＹＤＣＫＩＭＴＳＫＴＤＶＳＳＳＶＩＴＳＬＧＡＩＶＳＣＹＧＫＴＫＣＴＡＳＮＫＮＲＧＩＩＫＴＦＳＮＧＣＤＹＶＳＮＫＧＶＤＴＶＳＶＧＮＴＬＹＹＶＮＫＱＥＧＫＳＬＹＶＫＧＥＰＩＩＮＦＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＫＳＤＥＬＬＨＮＶＮＡＧＫＳＴＴＮ
配列番号２２（ＮＣ－ＲＳＶ－０２抗原アミノ酸配列：ＲＳＶサブタイプＢ Ｆ；ＲＳＶサブタイプＢ Ｆの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１６５３９９９－ｈＲＳＶ／Ｂ／Ａｕｓｔｒａｌｉａ／ＶＩＣ－ＲＣＨ０５６／２０１９））
ＱＮＩＴＥＥＦＹＱＳＴＣＳＡＶＳＲＧＹＬＳＡＬＲＴＧＷＹＴＳＶＩＴＩＥＬＳＮＩＫＥＴＫＣＮＧＴＤＴＫＶＫＬＩＫＱＥＬＤＫＹＫＮＡＶＴＥＬＱＬＬＭＱＮＴＰＡＶＮＮＲＡＲＱＱＱＱＲＦＬＧＦＬＬＧＶＧＳＡＩＡＳＧＩＡＶＳＫＶＬＨＬＥＧＥＶＮＫＩＫＮＡＬＱＬＴＮＫＡＶＶＳＬＳＮＧＶＳＶＬＴＳＲＶＬＤＬＫＮＹＩＮＮＱＬＬＰＭＶＮＲＱＳＣＲＩＳＮＩＥＴＶＩＥＦＱＱＫＮＳＲＬＬＥＩＴＲＥＦＳＶＮＡＧＶＴＴＰＬＳＴＹＭＬＴＮＳＥＬＬＳＬＩＮＤＭＰＩＴＮＤＱＫＫＬＭＳＳＮＶＱＩＶＲＱＱＳＹＳＩＭＳＩＩＫＥＥＶＬＡＹＶＶＱＬＰＩＹＧＶＩＤＴＰＣＷＫＬＨＴＳＰＬＣＴＴＮＩＫＥＧＳＮＩＣＬＴＲＴＤＲＧＷＹＣＤＮＡＧＳＶＳＦＦＰＱＡＤＴＣＫＶＱＳＮＲＶＦＣＤＴＭＮＳＬＴＬＰＳＥＶＳＬＣＮＴＤＩＦＮＳＫＹＤＣＫＩＭＴＳＫＴＤＩＳＳＳＶＩＴＳＬＧＡＩＶＳＣＹＧＫＴＫＣＴＡＳＮＫＮＲＧＩＩＫＴＦＳＮＧＣＤＹＶＳＮＫＧＶＤＴＶＳＶＧＮＴＬＹＹＶＮＫＬＥＧＫＮＬＹＶＫＧＥＰＩＩＮＹＹＤＰＬＶＦＰＳＤＥＦＤＡＳＩＳＱＶＮＥＫＩＮＱＳＬＡＦＩＲＲＳＤＥＬＬＨＮＶＮＴＧＫＳＴＴＮ
配列番号２３（ＮＣ－ＨＣＶ－０１抗原アミノ酸配列：ＨＣＶ遺伝子型１ａ Ｅ２；遺伝子型１ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿０３８８８２．１；単離株Ｈ７７））
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配列番号２４（ＮＣ－ＨＣＶ－０２抗原アミノ酸配列：ＨＣＶ遺伝子型２ａ Ｅ２；遺伝子型２ａ Ｅ２の参照配列（ＮＣ＿００９８２３．１；単離株ＨＣ－Ｊ６））
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配列番号２５（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ＤＮＡ配列、参照配列）
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配列番号２６（ＢｉＮＣ－０１：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ ＋ ＩＡＶ Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡヘッド；Ｈ１Ｎ１ ｐｄｍ０９ ＨＡの参照配列（ＧＵ９３１８０２．１－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４１５７４２Ｍｄ／２００９））
【化12】
配列番号２７（ＢｉＮＣ－０２：アダプタ＋抗原：ＳＡＲＳ２ ＮＰ ＋ ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡヘッド；Ｈ５Ｎ１ １１９４ ＨＡの参照配列（ＥＦ５４１４０２．１－Ａ／Ｖｉｅｔｎａｍ／１１９４／２００４））
【化13】
配列番号２８（ＢｉＮＣ－０３：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ ＋ ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤ祖先株；祖先株スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿４３４５７１））
【化14】
配列番号２９（ＢｉＮＣ－０４：アダプタ＋抗原：ＩＡＶ ＮＰ ＋ ＳＡＲＳ２スパイクＲＢＤオミクロンＢＡ．５；オミクロンＢＡ．５スパイクの参照配列（ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１３７７７６５８－ｈＣｏＶ－１９／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／ＨＫＵ－２２０７１２－００５／２０２２））
【化15】
配列番号３０（Ｈ７Ｎ９／ＺＪ，ＥＰＩ＿ＩＳＬ＿１４８７４４）
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配列番号３１（ＮＣ－ＩＡＶ－０３抗原アミノ酸配列：ＩＡＶ Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡヘッド；Ｈ３Ｎ２ ４８０１ ＨＡの参照配列（ＥＰＩ６７５７９７－Ａ／Ｈｏｎｇ Ｋｏｎｇ／４８０１／２０１４））
ＩＤＡＬＬＧＤＰＱＣＤＧＦＱＮＫＫＷＤＬＦＶＥＲＳＫＡＹＳＮＣＹＰＹＤＶＰＤＹＡＳＬＲＳＬＶＡＳＳＧＴＬＥＦＮＮＥＳＦＮＷＴＧＶＴＱＮＧＴＳＳＡＣＩＲＲＳＳＳＳＦＦＳＲＬＮＷＬＴＨＬＮＹＫＹＰＡＬＮＶＴＭＰＮＮＥＱＦＤＫＬＹＩＷＧＶＨＨＰＧＴＤＫＤＱＩＦＬＹＡＱＳＳＧＲＩＴＶＳＴＫＲＳＱＱＡＶＩＰＮＩＧＳＲＰＲＩＲＤＩＰＳＲＩＳＩＹＷＴＩＶＫＰＧＤＩＬＬＩＮＳＴＧＮＬＩＡＰＲＧＹＦＫＩＲＳＧＫＳＳＩＭＲＳＤＡＰＩＧＫＣＫＳＥＣＩＴＰＮＧＳＩＰＮＤＫＰＦ
本発明の実施形態において、例えば以下の項目が提供される。
（項目１）
ナノ複合体を含むワクチン組成物であって、前記ナノ複合体が、ウイルスＲＮＡを含む足場分子と、前記ウイルスＲＮＡに結合することが可能なウイルス核タンパク質に融合したウイルス抗原を含むアダプタ－抗原ポリペプチドと、を含む、前記ワクチン組成物。
（項目２）
前記アダプタ－抗原ポリペプチド対前記足場分子のモル比が、約５：１超である、項目１に記載のワクチン組成物。
（項目３）
前記ウイルス抗原が、抗原ポリペプチドである、項目１または２に記載のワクチン組成物。
（項目４）
前記ウイルス抗原が、免疫原性タンパク質である、項目１または２に記載のワクチン組成物。
（項目５）
前記ウイルス抗原が、前記ウイルス核タンパク質のＣ末端に融合している、項目１～４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目６）
前記ウイルス抗原が、前記ウイルス核タンパク質のＮ末端に融合している、項目１～４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目７）
前記ウイルスＲＮＡが、ウイルスゲノムの非翻訳領域を含む、項目１～６のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目８）
前記ウイルスＲＮＡが、前記ウイルスゲノムのウイルス遺伝子の５’非翻訳領域または３’非翻訳領域を含む、項目７に記載のワクチン組成物。
（項目９）
前記ウイルスＲＮＡが、約１０～約５００ヌクレオチド長である、項目１～８のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１０）
前記ウイルスＲＮＡが、約２００～約５００ヌクレオチド長である、項目９に記載のワクチン組成物。
（項目１１）
前記ウイルスＲＮＡが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、項目１～１０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１２）
前記ウイルスＲＮＡが、配列番号２５に記載のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～２６６を含む、項目１１に記載のワクチン組成物。
（項目１３）
前記ウイルスＲＮＡが、インフルエンザＡウイルス（ＩＡＶ）に由来する、項目１～１０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１４）
前記ウイルスＲＮＡが、配列番号３０に記載のＩＡＶゲノムのウイルス遺伝子のヌクレオチド１～３２６を含む、項目１３に記載のワクチン組成物。
（項目１５）
前記ウイルス核タンパク質が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来する、項目１～１４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１６）
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に由来するウイルス核タンパク質が、配列番号１２のアミノ酸配列を含む、項目１５に記載のワクチン組成物。
（項目１７）
前記ウイルス核タンパク質が、ＩＡＶに由来する、項目１～１４のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目１８）
前記ウイルス核タンパク質が、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する、項目１７に記載のワクチン組成物。
（項目１９）
前記ＩＡＶ Ｈ５Ｎ１に由来するウイルス核タンパク質が、配列番号１３のアミノ酸配列を含む、項目１７または１８に記載のワクチン組成物。
（項目２０）
前記ウイルス核タンパク質及び前記ウイルス抗原が、同じウイルスに由来する、項目１～１９のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２１）
前記ウイルス核タンパク質及び前記ウイルス抗原が、異なるウイルスに由来する、項目１～１９のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２２）
前記ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２３）
前記ウイルス抗原が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目２２に記載のワクチン組成物。
（項目２４）
前記ウイルス抗原が、受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）を含む、項目２３に記載のワクチン組成物。
（項目２５）
前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス抗原が、配列番号１４または１５のアミノ酸配列を含む、項目２３または２４に記載のワクチン組成物。
（項目２６）
前記ウイルス抗原が、インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目２７）
前記ウイルス抗原が、インフルエンザＨＡタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目２６に記載のワクチン組成物。
（項目２８）
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＩＡＶまたはインフルエンザＢウイルス（ＩＢＶ）に由来する、項目２６または２７に記載のワクチン組成物。
（項目２９）
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、Ｈ１Ｎ１、Ｈ５Ｎ１、Ｈ３Ｎ２、及びＨ７Ｎ９からなる群から選択されるＩＡＶサブタイプに由来する、項目２８に記載のワクチン組成物。
（項目３０）
前記ＩＡＶウイルス抗原が、配列番号１６～１８及び３１からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、項目２９に記載のワクチン組成物。
（項目３１）
前記インフルエンザウイルスタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＹａｍａｇａｔａまたはＶｉｃｔｏｒｉａのＩＢＶサブタイプに由来する、項目２８に記載のワクチン組成物。
（項目３２）
前記ＩＢＶウイルス抗原が、配列番号１９または２０のアミノ酸配列を含む、項目３１に記載のワクチン組成物。
（項目３３）
前記ウイルス抗原が、呼吸器合胞体ウイルス（「ＲＳＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目３４）
前記ウイルス抗原が、ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目３３に記載のワクチン組成物。
（項目３５）
前記ＲＳＶ Ｆタンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＲＳＶ ＡサブタイプまたはＲＳＶ Ｂサブタイプに由来する、項目３４に記載のワクチン組成物。
（項目３６）
前記ＲＳＶウイルス抗原が、配列番号２１または２２のアミノ酸配列を含む、項目３４または３５に記載のワクチン組成物。
（項目３７）
前記ウイルス抗原が、Ｃ型肝炎ウイルス（「ＨＣＶ」）タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目１～２１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目３８）
前記ウイルス抗原が、ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントである、項目３７に記載のワクチン組成物。
（項目３９）
前記ＨＣＶ Ｅ２タンパク質またはその断片もしくはバリアントが、ＨＣＶ遺伝子型１ａまたはＨＣＶ遺伝子型２ａに由来する、項目３８に記載のワクチン組成物。
（項目４０）
前記ＨＣＶウイルス抗原が、配列番号２３または２４のアミノ酸配列を含む、項目３８または３９に記載のワクチン組成物。
（項目４１）
前記アダプタ－抗原ポリペプチドが、配列番号１～１１及び２６～２９からなる群から選択されるアミノ酸配列を含む、項目１～４０のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目４２）
前記ワクチン組成物中の前記ナノ複合体が、約１００ｎｍ～約１３０ｎｍの平均粒径を有する、項目１～４１のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目４３）
前記ワクチン組成物中の前記ナノ複合体が、約－１０ｍＶ～約－２０ｍＶのゼータ電位を有する、項目１～４２のいずれか１項に記載のワクチン組成物。
（項目４４）
個体におけるウイルス感染を防止する方法であって、前記個体に、有効量の項目１～４３のいずれか１項に記載のワクチン組成物を投与することを含む、前記方法。
（項目４５）
前記ワクチン組成物が、鼻腔内または皮内投与によって投与される、項目４４に記載の方法。
（項目４６）
前記ワクチン組成物が、初回用量で、続いて１回または２回のブースター用量で投与される、項目４４または４５に記載の方法。
（項目４７）
前記初回用量及び前記１回または２回のブースター用量が、約７日から約２１日間隔で投与される、項目４６に記載の方法。
（項目４８）
前記初回用量及び前記１回または２回のブースター用量が、約１４日間隔で投与される、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
前記初回用量及び第１のブースター用量、ならびに前記第１のブースター用量及び第２のブースター用量が、約７～約２１日間隔、任意選択的に約１４日間隔で投与される、項目４６～４８のいずれか１項に記載の方法。
（項目５０）
前記ワクチン組成物が、同じウイルス種の一部である２つ以上のウイルスサブタイプに対するヘテロサブタイプ保護を提供する、項目４４～４９のいずれか１項に記載の方法。
（項目５１）
前記方法が、異なるウイルス属からの２つ以上のウイルスによるウイルス感染を防止する、項目４４～５０のいずれか１項に記載の方法。
（項目５２）
（ｉ）前記２つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉ）前記２つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものである、項目５１に記載の方法。
（項目５３）
前記方法が、３つ以上のウイルス種によるウイルス感染を防止し、
（ｉ）前記３つ以上のウイルス種が、同じウイルスファミリーからのものであるか、
（ｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、異なるウイルスファミリーからのものであるか、または
（ｉｉｉ）前記３つ以上のウイルス種が、（ａ）同じウイルス種からのものである２つ以上のウイルスサブタイプまたは亜種、及び（ｂ）前記（ａ）のウイルスとは異なるウイルスファミリーからのものである１つ以上のウイルス種を含む、項目５１または５２に記載の方法。
【図1A】
【図1B】
【図1C】
【図1D】
【図2】
【図3A】
【図3B】
【図3C】
【図3D】
【図3E】
【図3F】
【図4A】
【図4B】
【図4C】
【図4D】
【図5A】
【図5B】
【図5C】
【図5D】
【図5E】
【図5F】
【図5G】
【図5H】
【図5I】
【図6A】
【図6B】
【図6C】
【図6D】
【図7】
【図8A】
【図8B】
【図8C】
【図9A】
【図9B】
【図9C】
【図10】
【図11A】
【図11B】
【図12A】
【図12B】
【図12C】
【図13A】
【図13B】
【図14A】
【図14B】
【図14C】
【図15A】
【図15B】
【図16A】
【図16B】
【図16C】
【図17A】
【図17B】
【図17C】
【図18-1】
【図18-2】
【図19A】
【図19B】
【図19C】
【図19D】
【図19E】
【配列表】
【外国語明細書】