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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2024024371
(43)【公開日】2024-02-22
(54)【発明の名称】コロニー計数装置、制御方法およびプログラム
(51)【国際特許分類】
C12M 1/34 20060101AFI20240215BHJP
【ＦＩ】
C12M1/34 B
【審査請求】未請求
【請求項の数】20
【出願形態】ＯＬ
(21)【出願番号】P 2022127158
(22)【出願日】2022-08-09
(71)【出願人】
【識別番号】000129253
【氏名又は名称】株式会社キーエンス
(74)【代理人】
【識別番号】110003281
【氏名又は名称】弁理士法人大塚国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】松村 晋吾
(72)【発明者】
【氏名】関谷 傑
(72)【発明者】
【氏名】藤 健太
【テーマコード（参考）】
4B029
【Ｆターム（参考）】
4B029AA07
4B029BB02
4B029BB06
4B029CC02
4B029CC07
4B029EA20
4B029FA02
4B029FA10
4B029GA01
4B029GB02
4B029GB10
4B029HA10
(57)【要約】
【課題】コロニーの計数精度を向上させる。
【解決手段】コロニー計数装置は、検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成し、初期状態の検査個体の画像を基準画像として登録し、基準画像に含まれる残渣を特定するとともに、基準画像と、培養後の検査個体の画像である検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、基準画像に含まれる残渣に対応する検査画像における残渣の位置を特定し、残渣の位置に基づいて、残渣をコロニーとしての計数からは除外してコロニーの個数を計数する。
【選択図】図５９
【解決手段】コロニー計数装置は、検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成し、初期状態の検査個体の画像を基準画像として登録し、基準画像に含まれる残渣を特定するとともに、基準画像と、培養後の検査個体の画像である検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、基準画像に含まれる残渣に対応する検査画像における残渣の位置を特定し、残渣の位置に基づいて、残渣をコロニーとしての計数からは除外してコロニーの個数を計数する。
【選択図】図５９
【特許請求の範囲】
【請求項1】
検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成する撮像部と、
前記撮像部により生成された初期状態の検査個体の画像を基準画像として登録する登録部と、
前記登録部により登録された基準画像に含まれる残渣を特定するとともに、当該基準画像と、前記撮像部により生成された培養後の前記検査個体の画像である検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定する残渣特定部と、
前記残渣特定部により特定される残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数する計数部と、
を有するコロニー計数装置。
前記撮像部により生成された初期状態の検査個体の画像を基準画像として登録する登録部と、
前記登録部により登録された基準画像に含まれる残渣を特定するとともに、当該基準画像と、前記撮像部により生成された培養後の前記検査個体の画像である検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定する残渣特定部と、
前記残渣特定部により特定される残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数する計数部と、
を有するコロニー計数装置。
【請求項2】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
前記登録部により基準画像を登録する際に、当該基準画像と、当該基準画像が示す検査個体の識別情報とを関連付けて記憶する記憶部と、
前記登録部により登録された基準画像を読み出すための検査個体の識別情報の入力を受け付ける受付部と、
をさらに有し、
前記残渣特定部は、前記受付部により受け付けられた前記検査個体の識別情報に関連付けられている基準画像に含まれる残渣に対応する検査画像における残渣の位置を特定する、コロニー計数装置。
前記登録部により基準画像を登録する際に、当該基準画像と、当該基準画像が示す検査個体の識別情報とを関連付けて記憶する記憶部と、
前記登録部により登録された基準画像を読み出すための検査個体の識別情報の入力を受け付ける受付部と、
をさらに有し、
前記残渣特定部は、前記受付部により受け付けられた前記検査個体の識別情報に関連付けられている基準画像に含まれる残渣に対応する検査画像における残渣の位置を特定する、コロニー計数装置。
【請求項3】
請求項２に記載のコロニー計数装置であって、
前記撮像部に撮像条件を設定する設定部をさらに有し、
前記登録部は、前記培養前の検査個体を撮像する際に前記撮像部に適用された撮像条件を前記検査個体の識別情報に関連付けて前記記憶部に記憶させるように構成されており、
前記設定部は、前記検査個体の培養後に前記受付部により再び受け付けられた前記検査個体の識別情報に関連付けられている撮像条件を前記記憶部から読み出し、前記撮像部に当該撮像条件を設定するように構成されており、
前記撮像部は、前記設定部により設定された撮像条件にしたがって培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得するように構成されている、を有するコロニー計数装置。
前記撮像部に撮像条件を設定する設定部をさらに有し、
前記登録部は、前記培養前の検査個体を撮像する際に前記撮像部に適用された撮像条件を前記検査個体の識別情報に関連付けて前記記憶部に記憶させるように構成されており、
前記設定部は、前記検査個体の培養後に前記受付部により再び受け付けられた前記検査個体の識別情報に関連付けられている撮像条件を前記記憶部から読み出し、前記撮像部に当該撮像条件を設定するように構成されており、
前記撮像部は、前記設定部により設定された撮像条件にしたがって培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得するように構成されている、を有するコロニー計数装置。
【請求項4】
請求項３に記載のコロニー計数装置であって、
前記検査個体を照明する照明部をさらに有し、
前記設定部は、前記照明部に照明条件を設定するように構成されており、
前記登録部は、前記培養前の検査個体を撮像する際に前記照明部に設定された前記照明条件を前記検査個体の識別情報に関連付けて前記記憶部に記憶させるように構成されており、
前記設定部は、前記検査個体の培養後に前記受付部により再び受け付けられた前記検査個体の識別情報に関連付けられている前記照明条件を前記記憶部から読み出し、前記照明部に当該照明条件を設定するように構成されており、
前記撮像部は、前記設定部により設定された照明条件にしたがって培養後の前記検査個体が照明された状態で、当該検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得するように構成されている、コロニー計数装置。
前記検査個体を照明する照明部をさらに有し、
前記設定部は、前記照明部に照明条件を設定するように構成されており、
前記登録部は、前記培養前の検査個体を撮像する際に前記照明部に設定された前記照明条件を前記検査個体の識別情報に関連付けて前記記憶部に記憶させるように構成されており、
前記設定部は、前記検査個体の培養後に前記受付部により再び受け付けられた前記検査個体の識別情報に関連付けられている前記照明条件を前記記憶部から読み出し、前記照明部に当該照明条件を設定するように構成されており、
前記撮像部は、前記設定部により設定された照明条件にしたがって培養後の前記検査個体が照明された状態で、当該検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得するように構成されている、コロニー計数装置。
【請求項5】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
前記残渣特定部は、前記検査個体を収容する円筒形の透明容器の上面または下面の周縁部に付与されている目印を、前記二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
前記残渣特定部は、前記検査個体を収容する円筒形の透明容器の上面または下面の周縁部に付与されている目印を、前記二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
【請求項6】
請求項５に記載のコロニー計数装置であって、
前記残渣特定部は、線状の前記目印を少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
前記残渣特定部は、線状の前記目印を少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
【請求項7】
請求項５に記載のコロニー計数装置であって、
前記円筒形の透明容器は、円筒形で有底の培地が形成された内側透明容器と、当該内側透明容器の蓋となる円筒形の外側透明容器とを有し、
前記残渣特定部は、前記内側透明容器の底面の周縁部に付与されている目印を、前記二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
前記円筒形の透明容器は、円筒形で有底の培地が形成された内側透明容器と、当該内側透明容器の蓋となる円筒形の外側透明容器とを有し、
前記残渣特定部は、前記内側透明容器の底面の周縁部に付与されている目印を、前記二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
【請求項8】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
前記残渣特定部は、前記検査個体を収容する容器、前記検査個体に付着している残渣、または、前記検査個体の一部を前記二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
前記残渣特定部は、前記検査個体を収容する容器、前記検査個体に付着している残渣、または、前記検査個体の一部を前記二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識する、コロニー計数装置。
【請求項9】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
前記培養前の検査個体から取得された前記基準画像と、前記撮像部により取得される前記培養後の検査個体の動画像と、を重畳して表示する表示部をさらに有する、コロニー計数装置。
前記培養前の検査個体から取得された前記基準画像と、前記撮像部により取得される前記培養後の検査個体の動画像と、を重畳して表示する表示部をさらに有する、コロニー計数装置。
【請求項10】
請求項９に記載のコロニー計数装置であって、
前記検査個体を載置されるステージと、
前記ステージ上に設けられ、前記ステージに載置された前記検査個体に対するユーザによる手動での位置合わせを補助する位置合わせ部材と、
を有し、
前記位置合わせ部材は、前記検査個体を収容する容器に対して少なくとも二点で接触して前記容器を支持するように形成された形状を有する、コロニー計数装置。
前記検査個体を載置されるステージと、
前記ステージ上に設けられ、前記ステージに載置された前記検査個体に対するユーザによる手動での位置合わせを補助する位置合わせ部材と、
を有し、
前記位置合わせ部材は、前記検査個体を収容する容器に対して少なくとも二点で接触して前記容器を支持するように形成された形状を有する、コロニー計数装置。
【請求項11】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を作成し、記憶部に記憶させる表管理部と、
前記表管理部により作成された前記カウント表を表示する表示部と、
前記表示部に表示される前記カウント表に含まれる複数のセルの中から対象セルを特定するセル特定部と、
前記対象セルに対して前記検査個体の識別情報と前記基準画像とを関連付けて登録する登録部と、を有し、
前記計数部は、前記対象セルが特定されると、前記対象セルに関連付けられている前記基準画像を前記記憶部から読み出し、当該基準画像に含まれる残渣を低減して前記検査画像に含まれているコロニーの個数を計数し、前記計数されたコロニーの個数を前記対象セルに入力または関連付けるように構成されている、コロニー計数装置。
複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を作成し、記憶部に記憶させる表管理部と、
前記表管理部により作成された前記カウント表を表示する表示部と、
前記表示部に表示される前記カウント表に含まれる複数のセルの中から対象セルを特定するセル特定部と、
前記対象セルに対して前記検査個体の識別情報と前記基準画像とを関連付けて登録する登録部と、を有し、
前記計数部は、前記対象セルが特定されると、前記対象セルに関連付けられている前記基準画像を前記記憶部から読み出し、当該基準画像に含まれる残渣を低減して前記検査画像に含まれているコロニーの個数を計数し、前記計数されたコロニーの個数を前記対象セルに入力または関連付けるように構成されている、コロニー計数装置。
【請求項12】
請求項１１に記載のコロニー計数装置であって、
前記カウント表は、前記検査個体ごとに第一セルと第二セルとを有し、
前記第一セルは、前記基準画像が取得済みであるかどうかを示し、
前記第二セルは、前記第一セルに関連付けられており、前記コロニーの個数を示し、
前記対象セルは、前記第二セルである、コロニー計数装置。
前記カウント表は、前記検査個体ごとに第一セルと第二セルとを有し、
前記第一セルは、前記基準画像が取得済みであるかどうかを示し、
前記第二セルは、前記第一セルに関連付けられており、前記コロニーの個数を示し、
前記対象セルは、前記第二セルである、コロニー計数装置。
【請求項13】
請求項１２に記載のコロニー計数装置であって、
前記撮像部は、
前記第一セルがクリックされると、前記培養前の検査個体を撮像して前記基準画像を取得し、
前記第二セルがクリックされると、前記第一セルに関連付けられている撮像条件を用いて、前記培養後の検査個体を撮像して前記検査画像を取得する、ように構成されている、コロニー計数装置。
前記撮像部は、
前記第一セルがクリックされると、前記培養前の検査個体を撮像して前記基準画像を取得し、
前記第二セルがクリックされると、前記第一セルに関連付けられている撮像条件を用いて、前記培養後の検査個体を撮像して前記検査画像を取得する、ように構成されている、コロニー計数装置。
【請求項14】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
前記計数部は、前記残渣の影響を軽減する第一モードと、前記残渣の影響を軽減しない第二モードとを有し、
前記コロニー計数装置は、前記第一モードまたは前記第二モードを選択するためのアイコンを表示する表示部を有する、コロニー計数装置。
前記計数部は、前記残渣の影響を軽減する第一モードと、前記残渣の影響を軽減しない第二モードとを有し、
前記コロニー計数装置は、前記第一モードまたは前記第二モードを選択するためのアイコンを表示する表示部を有する、コロニー計数装置。
【請求項15】
請求項２に記載のコロニー計数装置であって、
前記記憶部に記憶されている複数の候補画像から前記基準画像を指定する指定部と、
前記指定部により指定された前記基準画像に関連付けられている培地の種類、希釈倍率、前記検査個体の名称、および、前記検査個体の識別情報のうち少なくとも一つを前記記憶部から読み出して表示部に表示させる表示制御部と、
を有する、コロニー計数装置。
前記記憶部に記憶されている複数の候補画像から前記基準画像を指定する指定部と、
前記指定部により指定された前記基準画像に関連付けられている培地の種類、希釈倍率、前記検査個体の名称、および、前記検査個体の識別情報のうち少なくとも一つを前記記憶部から読み出して表示部に表示させる表示制御部と、
を有する、コロニー計数装置。
【請求項16】
請求項１５に記載のコロニー計数装置であって、
前記検査個体の識別情報は、前記検査個体を収容する容器の識別情報である、コロニー計数装置。
前記検査個体の識別情報は、前記検査個体を収容する容器の識別情報である、コロニー計数装置。
【請求項17】
請求項１に記載のコロニー計数装置であって、
前記残渣特定部は、
前記基準画像における前記残渣の位置を特定し、
前記二以上の共通の特徴箇所に基づき、前記検査画像の位置および回転角度と、前記基準画像の位置および回転角度の相対的なズレを求め、
前記計数部は、
前記残渣の位置と、前記相対的なズレに基づいて、前記検査画像にマスク領域を設定し、
前記マスク領域が設定された前記検査画像から前記コロニーの個数を計数する、
ように構成されている、コロニー計数装置。
前記残渣特定部は、
前記基準画像における前記残渣の位置を特定し、
前記二以上の共通の特徴箇所に基づき、前記検査画像の位置および回転角度と、前記基準画像の位置および回転角度の相対的なズレを求め、
前記計数部は、
前記残渣の位置と、前記相対的なズレに基づいて、前記検査画像にマスク領域を設定し、
前記マスク領域が設定された前記検査画像から前記コロニーの個数を計数する、
ように構成されている、コロニー計数装置。
【請求項18】
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得するとともに、培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得する撮像部と、
前記基準画像におけるコロニーの個数と、前記検査画像におけるコロニーの個数と、を計数し、前記検査画像におけるコロニーの個数から前記基準画像におけるコロニーの個数を減算して、培養後の前記検査個体におけるコロニーの個数を求める計数部と、
を有するコロニー計数装置。
前記基準画像におけるコロニーの個数と、前記検査画像におけるコロニーの個数と、を計数し、前記検査画像におけるコロニーの個数から前記基準画像におけるコロニーの個数を減算して、培養後の前記検査個体におけるコロニーの個数を求める計数部と、
を有するコロニー計数装置。
【請求項19】
コロニー計数装置の制御方法であって、
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得することと、
培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得することと、
前記基準画像に含まれる残渣を特定することと、
前記基準画像と前記検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定することと、前記特定された残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数することと、
を有する、コロニー計数装置の制御方法。
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得することと、
培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得することと、
前記基準画像に含まれる残渣を特定することと、
前記基準画像と前記検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定することと、前記特定された残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数することと、
を有する、コロニー計数装置の制御方法。
【請求項20】
コロニー計数装置を制御するコンピュータにより実行されるプログラムであって、前記コンピュータに、
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得させ、
培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得させ、
前記基準画像に含まれる残渣を特定させ、
前記基準画像と前記検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定させ、
前記特定された残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数させる、
プログラム。
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得させ、
培養後の前記検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得させ、
前記基準画像に含まれる残渣を特定させ、
前記基準画像と前記検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定させ、
前記特定された残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数させる、
プログラム。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、コロニー計数装置、制御方法およびプログラムに関する。
【背景技術】
【0002】
食品を製造する工場ではコロニーカウンタを用いて菌が商品に混入しているかどうかが検査される。検査者は、シャーレ内に培地を形成し、培地に食品サンプルを投入し、所定期間にわたり保温庫等に保管する。その後、検査者は、保温庫からシャーレを取り出して、コロニーカウンタでコロニー（細菌の群体）をカウントする。このようにコロニーカウンタのカウント精度は食品の衛生管理上で重要である。
【0003】
ところで、シャーレにゴミなどの残渣が着すると、残渣をコロニーとして誤ってカウントしてしまうことがある。特許文献１によれば、コロニーの特徴色を予め記憶しておき、特徴色に基づいてコロニーをカウントすることが提案されている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0004】
【特許文献1】特開２０１６－０１５９４４号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0005】
特許文献１の発明は、コロニーの色と残渣の色とが異なる場合には有効であるが、コロニーの色と残渣の色とが同色の場合には残渣をコロニーとしてカウントしてしまう。そこで、本発明は、コロニーの計数精度を向上することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【0006】
本発明は、たとえば、
検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成する撮像部と、
前記撮像部により生成された初期状態の検査個体の画像を基準画像として登録する登録部と、
前記登録部により登録された基準画像に含まれる残渣を特定するとともに、当該基準画像と、前記撮像部により生成された培養後の前記検査個体の画像である検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定する残渣特定部と、
前記残渣特定部により特定される残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数する計数部と、
を有するコロニー計数装置を提供する。
検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成する撮像部と、
前記撮像部により生成された初期状態の検査個体の画像を基準画像として登録する登録部と、
前記登録部により登録された基準画像に含まれる残渣を特定するとともに、当該基準画像と、前記撮像部により生成された培養後の前記検査個体の画像である検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定する残渣特定部と、
前記残渣特定部により特定される残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して前記検査画像に含まれるコロニーの個数を計数する計数部と、
を有するコロニー計数装置を提供する。
【発明の効果】
【0007】
本発明によれば、コロニーの計数に関するユーザの負担が軽減される。
【図面の簡単な説明】
【0008】
【図1】コロニー計数装置を示す図。
【図2】ヘッド装置の構造を説明する図。
【図3】ヘッド装置の電気的な構成を説明する図。
【図4】制御装置の電気的な構成を説明する図。
【図5】ユーザインタフェース（ＵＩ）を説明する図。
【図6】サンプルデータベースからカウント表を作成するＵＩを説明する図。
【図7】サンプル名の入力補助に関するＵＩを説明する図。
【図8】新規にカウント表を作成するＵＩを説明する図。
【図9】表計算ソフトのシートを説明する図。
【図10】過去のカウント表を流用するためのＵＩを説明する図。
【図11】統計処理の設定を容易化するＵＩを説明する図。
【図12】統計処理の設定を容易化するＵＩを説明する図。
【図13】親子関係に関するＵＩを説明する図。
【図14】親子関係に関するＵＩを説明する図。
【図15】列要素を追加するためのＵＩを説明する図。
【図16】検査時のＵＩを説明する図。
【図17】検査条件等を変更するＵＩを説明する図。
【図18】カウントを指示する際のＵＩを説明する図。
【図19】カウント結果をセルに登録する際のＵＩを説明する図。
【図20】対象セルの自動特定を示すＵＩを説明する図。
【図21】カウント結果の単位を切り替えるＵＩを説明する図。
【図22】セルに表示する情報を切り替えるＵＩを説明する図。
【図23】計数条件を再設定するＵＩを説明する図。
【図24】ボタンへの機能の割り当ての遷移を説明する図。
【図25】検査条件等を変更するためのＵＩを説明する図。
【図26】過去に作成されたカウント表を呼び出すＵＩを説明する図。
【図27】検査リストを説明する図。
【図28】ユーザ認証札を説明する図。
【図29】自由列のセルへ情報を登録するＵＩを説明する図。
【図30】自由列のセルへ情報を登録するＵＩを説明する図。
【図31】コード（シンボル）の読み取りＵＩを説明する図。
【図32】シンボルのデコード結果を説明する図。
【図33】レポートを説明する図。
【図34】ＰＣにより実行される処理を示すフローチャート。
【図35】ヘッド装置により実行される処理を示すフローチャート。
【図36】サンプルデータベースの編集を示すフローチャート。
【図37】カウント表の編集を説明するフローチャート。
【図38】カウント表の特定を説明するフローチャート。
【図39】コロニーのカウント方法を説明するフローチャート。
【図40】自由列のセルへ情報を登録する方法を説明するフローチャート。
【図41】シャーレに付与された識別画像を説明する図。
【図42】培養前画像（基準画像）を説明する図。
【図43】培養後画像（基準画像）を説明する図。
【図44】培養後画像（基準画像）を説明する図。
【図45】残渣低減を有効化するＵＩを説明する図。
【図46】残渣低減が関与するセルを説明する図。
【図47】基準画像を取得するためのＵＩを説明する図。
【図48】検査画像を取得するためのＵＩを説明する図。
【図49】検査画像を取得するためのＵＩを説明する図。
【図50】基準画像などを読み出すためのＵＩを説明する図。
【図51】基準画像に関連付けられている検査条件を表示することを説明する図。
【図52】複数の目印を説明する図。
【図53】手動位置合わせを補助するＵＩを説明する図。
【図54】手動位置合わせを補助するＵＩを説明する図。
【図55】カウント結果を表示するＵＩを説明する図。
【図56】カウント結果がセルに入力されたことを説明する図。
【図57】複数の目印の他の例を説明する図。
【図58】第一の残渣低減アルゴリズムを説明する図。
【図59】第二の残渣低減アルゴリズムを説明する図。
【図60】カウント表を用いずに基準画像を取得する方法を示すフローチャートである。
【図61】カウント表を用いずに検査画像を取得してコロニーをカウントする方法を示すフローチャート。
【図62】カウント表を用いて基準画像を取得する方法を示すフローチャートである。
【図63】カウント表を用いて検査画像を取得してコロニーをカウントする方法を示すフローチャート。
【図64】第一のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャート。
【図65】第二のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャート。
【図66】第三のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャート。
【発明を実施するための形態】
【0009】
以下、添付図面を参照して実施形態を詳しく説明する。なお、以下の実施形態は特許請求の範囲に係る発明を限定するものではなく、また実施形態で説明されている特徴の組み合わせの全てが発明に必須のものとは限らない。実施形態で説明されている複数の特徴のうち二つ以上の特徴が任意に組み合わされてもよい。また、同一若しくは同様の構成には同一の参照番号を付し、重複した説明は省略する。
【0010】
［コロニー計数装置］
図１はコロニー計数装置１を示している。なお、コロニー計数装置１は、ヘッド装置１ａと、後述される制御装置（パーソナルコンピュータ（ＰＣ））１ｂとを含む。ヘッド装置１ａとＰＣ１ｂとは、たとえば、ユニバーサルシリアルバス（ＵＳＢ）ケーブルで有線接続されてもよいし、無線により接続されてもよい。
図１はコロニー計数装置１を示している。なお、コロニー計数装置１は、ヘッド装置１ａと、後述される制御装置（パーソナルコンピュータ（ＰＣ））１ｂとを含む。ヘッド装置１ａとＰＣ１ｂとは、たとえば、ユニバーサルシリアルバス（ＵＳＢ）ケーブルで有線接続されてもよいし、無線により接続されてもよい。
【0011】
ヘッド装置１ａは、上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４を有している。ヘッド装置１ａの内部には、カメラおよび照明装置が設けられている。支持ユニット３は、上部ユニット２と下部ユニット４との間に存在し、上部ユニット２を支持している。下部ユニット４の頂面にはステージ５が設けられている。ステージ５は、シャーレ１５が載置される透過窓６と、透過窓６の中央にシャーレ１５を位置決めするための位置決め部材７とが設けられている。下部ユニット４の正面には、操作部８とフロントカメラ１０が設けられている。操作部８は、ユーザが指示を入力するための複数のスイッチ（例：第一ハードウエアボタン８ａ、第二ハードウエアボタン８ｂ、第三ハードウエアボタン８ｃ）などを含む。フロントカメラ１０は、オプションであり、たとえば、二次元シンボル（バーコード）などを読み取る。フロントカメラ１０は、ヘッド装置１の筐体の前面に設けられた凹部４ａに、配置されている。下部ユニット４の側面には電源スイッチ９が設けられている。
【0012】
図２はヘッド装置１ａの断面図である。上部ユニット２の下面付近には、落射照明を行うためのリング照明装置１２が配置されている。落射照明とは、検査個体で反射した光を受光することで検査個体を観察するための照明手法である。リング照明装置１２の上方にはメインカメラ１１と光学系１６とが配置されている。透過窓６の下方にもリング照明装置１３が配置されている。リング照明装置１３のさらに下方には、同軸照明（全射照明）を行う同軸照明装置１４が配置されている。同軸照明（全射照明）は、透過照明とも呼ばれ、検査個体を透過してきた光を受光することで検査個体を観察する手法で利用される。リング照明装置１２は、リング状に並べられた複数の発光素子１２ａと、複数の発光素子１２ａから出力される光を拡散する拡散板１２ｂとを有している。同時に点灯する発光素子１２ａを選択することで、照明方向が自在に変更可能となっている。これは、それぞれ異なる方向から照明された検査個体（食品サンプル）を撮像して取得された複数の検査画像を合成する際に役立つであろう。リング照明装置１３は、リング状に並べられた複数の発光素子１３ａと、反射板１３ｂと、拡散板１３ｃとを有している。反射板１３ｂは、複数の発光素子１３ａから出力された光を拡散板１３ｃに向けて反射する。拡散板１３ｃは、反射板１３ｂからの光を均一に拡散する。複数の発光素子１３ａのうち同時に点灯する発光素子１３ａを選択することで、照明方向が自在に変更される。同軸照明装置１４は、同心円状またはアレイ状に並べられた複数の発光素子１４ａを有する。このように複数のタイプの照明装置を設け、食品サンプルと培地との組み合わせごとに適切な照明装置を選択することで、コロニーの個数を正確にカウントすることが可能となろう。
【0013】
図３はヘッド装置１ａの電気的構成を示している。ＭＣＵ２０は、記憶装置２５に記憶されている制御プログラム２７を実行し、制御プログラム２７にしたがってヘッド装置１ａを制御するプロセッサである。なお、ＭＣＵはマイクロコントローラユニットの略称である。ＭＣＵ２０は撮像制御部２１を介してメインカメラ１１およびフロントカメラ１０を制御し、様々な画像データを取得する。撮像制御部２１は、たとえば、メインカメラ１１の露光時間などを制御する。ＭＣＵ２０は、照明制御部２２を介してリング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４を点灯させたり、消灯させたりする。照明制御部２２は、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４に供給される駆動電力を制御する。ＭＣＵ２０は、操作受付部２３を介して操作部８から入力されるユーザ入力を受け付ける。操作受付部２３は、操作部８のスイッチ部の状態を示す信号を生成する入力回路などを含む。通信回路２４は、通信ケーブル２６を介して、図４に示されるＰＣ１ｂと通信する回路である。通信回路２４は、無線通信回路およびＬＡＮインタフェース回路を含んでもよい。ＬＡＮはローカルエリアネットワークの略称である。通信ケーブル２６は、たとえば、ＵＳＢケーブルであってもよい。記憶装置２５は、たとえば、制御プログラム２７を記憶するリードオンリメモリ（ＲＯＭ）と、ワークエリアとして利用されるランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）とを含む。記憶装置２５は、たとえば、ＰＣ１ｂにより設定された検査条件２８と、メインカメラ１１により取得された検査画像２９などを記憶してもよい。検査条件２８は、たとえば、照明条件や撮像条件、カウント条件などを含みうる。検査画像２９は、培地およびサンプルを含むシャーレ１５の画像である。
【0014】
図４は、ヘッド装置１ａを制御するＰＣ１ｂを示す。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたプログラムを実行し、プログラムにしたがってＰＣ１ｂおよびヘッド装置１ａを制御するプロセッサである。ＭＣＵ３０は、入出力回路３１に接続されたキーボード３２およびポインティングデバイス３３からユーザの指示を受け付ける。ＭＣＵ３０は、入出力回路３１に接続されたプリンタ３８を制御し、表などを紙に印刷する。ＭＣＵ３０は、グラフィクスボードなどの表示制御部３６を介して、表示装置３７に様々な情報を表示する。通信回路３４は、通信ケーブル２６を介して、ヘッド装置１ａと通信する回路である。通信回路３４は、無線通信回路およびＬＡＮインタフェース回路を含んでもよい。記憶装置３５は、たとえば、プログラムを記憶するリードオンリメモリ（ＲＯＭ）と、ワークエリアとして利用されるランダムアクセスメモリ（ＲＡＭ）とを含む。さらに、記憶装置３５は、ハードディスクドライブ（ＨＤＤ）およびソリッドステートドライブ（ＳＳＤ）を含んでもよい。記憶装置３５は、アプリケーションプログラム３９、検査条件２８、検査画像２９、サンプルＤＢ４０およびカウント表５５などを記憶してもよい。ＤＢはデータベースの略称である。アプリケーションプログラム３９は、たとえば、サンプルＤＢ４０およびカウント表５５の作成・編集、ヘッド装置１の制御などを担当する。検査条件２８は、アプリケーションプログラム３９にしたがって、ＭＣＵ３０により設定される。検査画像２９はヘッド装置１から受信される。サンプルＤＢ４０は、カウント表５５を作成する際に参照されるデータベースである。カウント表５５は、複数のセルがアレイ状に配置された表であり、行要素と列要素とを含む。
【0015】
ＰＣ１ｂは、通信回路３４は、スマートフォンやタブレット端末などの端末装置１ｃと無線通信を実行してもよい。端末装置１ｃは、カウント表５５を表示したり、カウント表５５から作成された検査リストを表示したりしてもよい。検査リストは、シャーレ番号、サンプル名、菌種、培地、希釈倍率、培養時間などを含み、ユーザが検査個体をシャーレ１５に準備する際に参照される。
【0016】
［検査手順］
一般的な検査手順は以下のとおりである。
（１）ユーザは、手書きで検査リストを作成する。検査リストは、複数の行を含み、各行は、シャーレ番号、菌種、希釈倍率、カウント数、コメント（サンプル品名など）を書き込み可能となっている。なお、ここでシャーレ番号とは、培地の種類や希釈倍率などの培養条件を特定するために予め所定のルールで割り当てられた識別情報である。
（２）ユーザは、検査リストにしたがってシャーレのふたに番号を書き込むか、または、シャーレに予め書き込まれた番号を検査リストに書き込む。
（３）ユーザは、検査リストに書き込まれている希釈倍率にしたがって培地を作成する。検査リストに希釈倍率が書き込まれていなければ、ユーザは、実際の希釈倍率を検査リストに書き込む。
（４）ユーザは、各シャーレの培地にサンプルを投入（混釈）する。ユーザは、検査リストのコメント欄にサンプル名を書き込む。
（５）ユーザは、培養器にシャーレを投入する。
（６）所定時間が経過すると、ユーザは、培養器からシャーレを取り出して、コロニーの個数をカウントする。たとえば、ユーザは、シャーレの底面側からコロニーを透かし見ながら、コロニーの位置に油性ペンでカウント済みのマークを付与して行く。コロニーの個数は検査リストに書き込まれる。なお、ユーザは、目視で菌種を確かめながら、菌種ごとのコロニーの個数をカウントしてもよい。この場合、ユーザは、各シャーレについて菌種ごとのコロニーの個数を検査リストに書き込む。
（７）ユーザは、ＰＣを起動し、検査リストに書き込まれている数値および文字を読み取りながら、表計算ソフトウエアに、入力する。表計算ソフトウエアのマクロ機能などを使用して、コロニーの個数が集計される。
一般的な検査手順は以下のとおりである。
（１）ユーザは、手書きで検査リストを作成する。検査リストは、複数の行を含み、各行は、シャーレ番号、菌種、希釈倍率、カウント数、コメント（サンプル品名など）を書き込み可能となっている。なお、ここでシャーレ番号とは、培地の種類や希釈倍率などの培養条件を特定するために予め所定のルールで割り当てられた識別情報である。
（２）ユーザは、検査リストにしたがってシャーレのふたに番号を書き込むか、または、シャーレに予め書き込まれた番号を検査リストに書き込む。
（３）ユーザは、検査リストに書き込まれている希釈倍率にしたがって培地を作成する。検査リストに希釈倍率が書き込まれていなければ、ユーザは、実際の希釈倍率を検査リストに書き込む。
（４）ユーザは、各シャーレの培地にサンプルを投入（混釈）する。ユーザは、検査リストのコメント欄にサンプル名を書き込む。
（５）ユーザは、培養器にシャーレを投入する。
（６）所定時間が経過すると、ユーザは、培養器からシャーレを取り出して、コロニーの個数をカウントする。たとえば、ユーザは、シャーレの底面側からコロニーを透かし見ながら、コロニーの位置に油性ペンでカウント済みのマークを付与して行く。コロニーの個数は検査リストに書き込まれる。なお、ユーザは、目視で菌種を確かめながら、菌種ごとのコロニーの個数をカウントしてもよい。この場合、ユーザは、各シャーレについて菌種ごとのコロニーの個数を検査リストに書き込む。
（７）ユーザは、ＰＣを起動し、検査リストに書き込まれている数値および文字を読み取りながら、表計算ソフトウエアに、入力する。表計算ソフトウエアのマクロ機能などを使用して、コロニーの個数が集計される。
【0017】
このように、従来の検査手順では、手書きで検査リストが作成されており、これはユーザにとって非常に面倒な作業であった。また、検査リストに書き込まれた数値等を表計算ソフトウエアのシートに転記する際に誤入力があると、集計結果も誤ってしまう可能性があった。仮に、コロニーの個数をコロニーカウンタによって自動的に取得できたとしても、依然として、従来手法では、検査リストの作成と、コロニー個数の検査リストへの書き込みと、検査リストから表計算ソフトウエアのシートへの転記は、いずれも手書きであり、誤記入および誤入力の可能性があった。
【0018】
そこで、本実施例では、ＰＣ１ｂにより電子的な検査リストを作成し、電子的な検査リストにしたがってコロニーを計数し、当該計数結果を電子的な検査リストに直接入力し、入力された個数を集計することが提案される。これにより、コロニーの計数結果についての事後処理に関するユーザの負担が軽減されるだろう。また、ユーザによる手書き、または、手入力が減少するため、誤入力も減少し、検査精度も向上するであろう。
【0019】
［検査リスト（カウント表）の作成］
図５は、ＰＣ１ｂの表示装置３７に表示されるカウントアプリケーションプログラムのＵＩ５０を示している。カウントアプリケーションプログラムは記憶装置３５に記憶されており、ＭＣＵ３０により実行される。ＵＩ５０は、カウントアプリケーションプログラムが有している複数の機能を切り替えるためのボタン、リンクまたはタブなどを有している。
図５は、ＰＣ１ｂの表示装置３７に表示されるカウントアプリケーションプログラムのＵＩ５０を示している。カウントアプリケーションプログラムは記憶装置３５に記憶されており、ＭＣＵ３０により実行される。ＵＩ５０は、カウントアプリケーションプログラムが有している複数の機能を切り替えるためのボタン、リンクまたはタブなどを有している。
【0020】
ＵＩ５０は、表作成領域５１と、ＤＢ表示領域６１とを有している。ＤＢはデータベースの略称である。表作成領域５１は、少なくともカウント表５５を表示する。タイトル表示部５２は、カウント表５５に付与されたタイトル（名称）の入力をキーボード３２から受け付けて表示する。ボタン５３は各セルのカウントの実施／非実施を切り替えるボタンである。ボタン５４は、カウント表５５に列を追加することを指示するボタンである。平均化設定部５６は、カウント結果の平均化を実行するかどうかを指示するためのチェックボックスと、平均化の対象となるカウント値の数（＝カウントの反復回数）の選択部と、を有する。
【0021】
ＤＢ表示領域６１は、予め登録されたカウント項目のひな型の一覧（例：サンプルＤＢ４０）を表示する。ここで、カウント項目とは、カウント表５５における一行に相当する。カウント項目は、通常、検査対象物の名称（サンプル名）により区別される。名称表示部６２は、予め登録されているひな型の名称（サンプル名）を表示する。インジケータ６３は、サンプル名に対して関連付けられている分類タグを視覚的に表示するオブジェクトである。分類タグとは、ユーザによって定義された分類（例：主食、総菜、デザート）を示すタグである。たとえば、インジケータ６３は、色の違いによって分類タグの違いを表現してもよい。インジケータ６３は、インジケータ６３の形状の違いによって分類タグの違いを表現してもよい。ボタン６７は、あるサンプル名に対して親子関係にある１つ以上のサブ項目を展開して表示するためのボタンである。親子関係とは、あるサンプルと、そのサンプルを構成する複数の具材との関係をいう。たとえば、サンドイッチを親とすると、サンドイッチを構成する具材（例：ハム、レタス、玉子）は子となる。ボタン６４は、対応するひな型をカウント表５５に追加することを指示するボタンである。このように予めサンプルＤＢ４０を用意しておくことで、ユーザは、カウント表５５を容易に作成できるようになる。
【0022】
図５に示された事例では、ユーザがサンドイッチに関連付けられたボタン６４を押すと、ＭＣＵ３０は、カウント表５５に一行を追加し、追加された行のＩＤ表示セルにＩＤとして"１"を表示し、追加された行においてサンプル名を表示するセルに「サンドイッチ」を表示する。ＩＤは識別情報の略称である。すなわち、ＩＤやサンプル名は行単位で設定されるものであり、「行に対する設定」である。さらに、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に登録されているサンドイッチの検査条件を記憶装置３５から読み出し、カウント表５５に新規の列を追加し、新規の列に、読み出した検査条件を表示する。この例では、検査条件は、菌種（例：一般生菌／大腸菌）、培地の希釈倍率、サンプルの培養時間などを含んでいる。各列は、たとえば、菌種のセル、希釈倍率のセル、培養時間のセルおよびカウント値のセルを含む。すなわち、菌種や希釈倍率、培養時間は列単位で設定されるものであり、「列に対する設定」である。この例では、まだ、検査の実行前であり、カウント値が入手されていないため、カウント値のセルには何も入力されていない。サンドイッチについての一つ目の検査項目は、一般生菌について希釈倍率として１００倍の培地を使用し、培養時間として４８時間が適用されることである。サンドイッチについての二つ目の検査項目は、一般生菌について希釈倍率として１０００倍の培地を使用し、培養時間として４８時間が適用されることである。このように、ＭＣＵ３０は、検査項目の個数に応じて列を追加する。
【0023】
図６は、ユーザがキムチに関連付けられたボタン６４を押すと、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に登録されているキムチの検査条件を記憶装置３５から読み出し、読み出された検査条件に対応する行と列をカウント表５５に追加する。
【0024】
この例で、キムチは、二つの検査項目を有している。キムチについての一つ目の検査項目は、一般生菌について希釈倍率として１００倍の培地を使用し、培養時間として４８時間が適用されることである。これは、サンドイッチについての一つ目の検査項目と共通している。そのため、ＭＣＵ３０は、キムチのひな型に含まれている一つ目の検査項目を破棄し、新規の列として追加しない。キムチについての二つ目の検査項目は、大腸菌について希釈倍率として１００倍の培地を使用し、培養時間として２４時間が適用されることである。ＭＣＵ３０は、これを新規の列としてカウント表５５に追加する。
【0025】
なお、サンドイッチについては大腸菌に関する検査は実行されない。そのためカウント値のセルには「非検査」を示す文字または画像が表示されてもよい。同様に、キムチについては一般生菌について希釈倍率として１０００倍の培地を使用する検査は実行されない。そのため、カウント値のセルには「非検査」を示す文字または画像が表示されてもよい。
【0026】
なお、カウントの実施・非実施はカウント反転ボタン５３の操作により実行することもできる。サンドイッチについて、大腸菌に対応するセルを選択した状態で、カウント反転ボタン５３が操作されると、ＭＣＵ３０は、「非検査」を示す文字または画像を表示するか、カウント結果を入力するために空欄とするのかを切り替えることができてもよい。
【0027】
図５および図６が示すように検索ボックス６５やタグ検索絞り込みボタン６６が追加されてもよい。サンプルＤＢ４０に登録されているひな型の個数が多くなると、ＤＢ表示領域６１は、一度にすべてのひな型を表示することができなくなる。そこで、ＭＣＵ３０は、検索ボックス６５に入力された文字に基づき記憶装置３５から検索してひな型を抽出し、ＤＢ表示領域６１に検索結果を表示してもよい。また、タグ検索絞り込みボタン６６が押されると、ＭＣＵ３０は、指定した分類タグでフィルタされたサンプル品だけを表示してもよい。たとえば、複数のサンプル品に対して同じ分類タグが付与されていてもよい。この場合、選択された分類タグが付与されている複数のサンプル品をカウント表５５へ追加する。
【0028】
図７は、新規の行を追加する別の手順を示している。ユーザは、新規の行におけるサンプル名表示セルをポインタ５７で選択し、キーボード３２を通じてサンプル名を先頭の文字から順番に入力して行く。ＭＣＵ３０は、入力された一以上の文字でサンプルＤＢ４０を検索し、入力候補となるサンプル名を候補表示部５８に表示する。この例では、サンプル名表示セルに「ミックス」が入力されたため、ＭＣＵ３０は「ミックス」をサンプル名として含むひな型を検索し、「ミックスジュース」を発見し、候補表示部５８に「ミックスジュース」を表示する。ここで、ユーザが、ポインタ５７によって候補表示部５８に表示された「ミックスジュース」を選択すると、ＭＣＵ３０は、ミックスジュースの検査条件を記憶装置３５から読み出し、読み出された検査条件に応じて列を追加する。これにより、ミックスジュースのセルに検索条件が関連付けられることになる。
【0029】
図８は、新規にカウント表を作成する場合のＵＩ５０を示している。たとえば、ＭＣＵ３０は、アプリケーションプログラム３９と並行して表計算ソフトウエアを起動することができる。
【0030】
図９は、表計算ソフトウエアのシート７０を示している。ＭＣＵ３０は、表計算ソフトウエアにおいて選択されたシート７０またはセル群について、ＵＩ５０へのコピーペーストの指示を受け付ける。これにより、ＭＣＵ３０は、図６に示されたカウント表５５を作成してもよい。
【0031】
図１０は、すでにカウント値が入力されたカウント表８２を呼び出して新規のカウント表５５を作成する手順を説明する図である。ＭＣＵ３０は、検索ボックス６５に入力されたファイル名に対応するファイルを記憶装置３５から読み出し、そのファイルの属性を属性表示部８０に表示してもよい。ＭＣＵ３０は、表作成領域５１に、読み出されたカウント表８２を表示する。図１０が示すように、カウント値のセルにはカウント値が入力済みである。ＭＣＵ３０は、新規作成ボタン８１が押されたことを検知すると、読み出されたカウント表８２を構成しているカウント値のセルに入力されているカウント値をすべて削除し、新規のカウント表５５を作成する。図１１は、すでにカウント値が入力されたカウント表８２から作成された新規のカウント表５５を示している。カウント値を削除する代わりに、カウント値が０にリセットされてもよい。
【0032】
なお、ＭＣＵ３０は、複数のカウント表８２をマージして一つのカウント表５５を作成してもよい。この場合、ＭＣＵ３０は、複数のカウント表８２を分析し、重複する行と列を削除し、新規のカウント表５５を作成する。
【0033】
図１２は、平均化を含むカウント表５５の作成方法を説明するための図である。この例では、平均化がまだ適用されていないため、一つのサンプル名について一つの行が設けられている。この状態で平均化設定部５６がチェックされ、反復回数として「２」が選択されると、ＭＣＵ３０は、図１１に示されたＵＩ５０を表示する。図１１が示すように、反復回数が「２」であることから、ＭＣＵ３０は、各サンプル名に関連付けられたカウント値の入力行を三つの行に分割するとともに、反復回数を示す列を追加する。この例では、三つの行のうち、一つ目の行は１回目の検査で取得されたカウント値が入力されるセルを有する。二つ目の行は２回目の検査で取得されたカウント値が入力されるセルを有する。三つ目の行は１回目の検査で取得されたカウント値と、２回目の検査で取得されたカウント値との平均値が入力されるセルを有する。このように、ＭＣＵ３０は、反復回数に応じて、カウント値が入力されるセルと平均値が入力されるセルとをカウント表５５に追加してもよい。
【0034】
図１３は、複数のサンプル間の親子関係の一例を示す。この例では、サンドイッチのインジケータ６３が押されると、ＭＣＵ３０は、サンドイッチと親子関係を有する具材である「ハム」と「レタス」を選択可能にＤＢ表示領域６１に表示する。この状態で、「ハム」または「レタス」のボタン６４が押されると、ＭＣＵ３０は、「ハム」または「レタス」の検査項目を記憶装置３５から読み出し、カウント表５５に追加する。図１４は、「ハム」および「レタス」の各検査項目が記憶装置３５から読み出されて、カウント表５５に追加されたことを示す。親子関係を有するサンドイッチ、ハムおよびレタスが一括して登録されてもよい。たとえば、サンドイッチに関連付けられたボタン６４が押されると、サンドイッチ、ハムおよびレタスがテーブル表５５に一括して登録されてもよい。
【0035】
図１５は、列を追加するためのダイアログ９０を示している。ＵＩ５０に設けられたボタン５４が押されると、ＭＣＵ３０は、ダイアログ９０を表示装置３７に表示する。項目名設定部９１は、列の項目名である菌種の名称の入力を受け付ける。列タイプ設定部９２は、列のタイプがカウント列であるか、または、自由列であるかの設定を受け付ける。カウント列とは、カウント値が入力されるセルを含む列である。自由列とは、備考やコメントなど、ユーザが自由にテキスト、画像、その他の情報を入力可能な列である。希釈倍率設定部９３は、希釈倍率の入力を受け付ける。培養時間設定部９４は、培養時間の入力を受け付ける。アルゴリズム設定部９５は、検査画像に適用される画像処理の設定を受け付ける。残渣除去とは、シャーレ１５などに付着した残渣（例：ゴミ、汚れ、手書き）を画像処理によって低減するモードである。迅速モードとは、迅速な結果の確認を重視したモードであり、[0]従来よりも短い培養時間で培養されたシャーレ１５を高感度で検査するモードである。培地タイプ設定部９６は、培地の種類（例：一般生菌（白）、一般生菌（黒））などの選択を受け付ける。なお、一覧ボタン９６ａが押されると、ＭＣＵ３０は、記憶装置３５から培地タイプの候補を読み出してリストを作成して表示装置３７に表示してもよい。カウント設定部９７は、メインカメラ１１の撮影条件（例：露光時間）、照明の種類（例：明るさ、照明装置）、表示処理の種類、画像処理の種類などの設定を受け付ける。すなわち、ダイアログ９０で受け付けられた菌種、希釈倍率、培養時間、アルゴリズム設定、培地タイプ、またはカウント設定は、デフォルトの設定として列ごとに設定される。
【0036】
［カウント処理］
図１６は、ＰＣ１ｂからヘッド装置１ａを制御してカウント処理を実行中にＰＣ１ｂの表示装置３７に表示されるＵＩ１００を示している。カウント表領域１０１は、ＵＩ５０を通じて編集されたカウント表５５を表示する領域である。結果領域１０２は、ヘッド装置１ａのメインカメラ１１により取得された検査画像１０３を表示する領域である。なお、検査画像１０３は、動画像であってもよいし、静止画像であってもよい。一般に、メインカメラ１１の露光時間の調整、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４の明るさ、点灯すべき発光素子の選択、画像処理の選択などを実行する際は、ＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により動画像を取得して、結果領域１０２に表示する。一方で、カウント処理を実行する際には、ＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により静止画像を取得して、結果領域１０２に表示する。
図１６は、ＰＣ１ｂからヘッド装置１ａを制御してカウント処理を実行中にＰＣ１ｂの表示装置３７に表示されるＵＩ１００を示している。カウント表領域１０１は、ＵＩ５０を通じて編集されたカウント表５５を表示する領域である。結果領域１０２は、ヘッド装置１ａのメインカメラ１１により取得された検査画像１０３を表示する領域である。なお、検査画像１０３は、動画像であってもよいし、静止画像であってもよい。一般に、メインカメラ１１の露光時間の調整、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４の明るさ、点灯すべき発光素子の選択、画像処理の選択などを実行する際は、ＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により動画像を取得して、結果領域１０２に表示する。一方で、カウント処理を実行する際には、ＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により静止画像を取得して、結果領域１０２に表示する。
【0037】
チェックボックス１０６は、カウント値領域１０４にカウント結果を表示するかどうかを選択するためのコントロールオブジェクトである。第一ソフトウエアボタン１０５ａは、第一ハードウエアボタン８ａと同一の機能を有するボタンである。第二ソフトウエアボタン１０５ｂは、第二ハードウエアボタン８ｂと同一の機能を有するボタンである。この例では、第一ソフトウエアボタン１０５ａには撮影の指示（撮影ボタン）が割り当てられている。第二ソフトウエアボタン１０５ｂには登録の指示（登録ボタン）が割り当てられている。図１５においては、第二ソフトウエアボタン１０５ｂが破線で示されているが、これは操作不可能であることを意味する。
【0038】
ユーザは、カウント表領域１０１に表示されたカウント表に含まれる複数のセルのうち、ステージ５にセットしたシャーレ１５に対応するセルをポインタ５７によりクリックして選択する。図１６に示すように、どのセルがユーザにより選択されたかが分かるように、ポインタ５７により選択されたセルは、強調して表示されてもよい。各セルには、予め検査条件（コロニーを二値化する際の感度、照明装置の種類、明るさなど）が関連付けられて記憶装置３５に保存されている。ＭＣＵ３０は、選択されたセルに関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出して、ヘッド装置１ａに送信する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は受信された検査条件にしたがってメインカメラ１１、リング照明装置１２、１３、および同軸照明装置１４を制御し、画像を取得して、ＰＣ１ｂへ送信する。なお、別のセルが選択されると、ＭＣＵ３０は、選択されたセルに関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出して、ヘッド装置１ａに送信する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は受信された検査条件にしたがってメインカメラ１１、リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４を制御し、画像を取得して、ＰＣ１ｂへ送信する。このように、ユーザは、セルを選択することで、検査条件を変更することができる。
【0039】
図１７は、設定タブまたは設定ボタンをポインタ５７にクリックすることで表示される検査条件の確認画面１１０を示す。これにより、ユーザは、各セルごとの検査条件を確認することができる。なお、セルをポインタ５７により右クリックすることで、確認画面１１０が表示されてもよい。確認画面１１０に表示される情報としては、たとえば、サンプル名、培地の種類、希釈倍率、培養時間、シャーレ番号、コメント、撮影設定（落射照明のオンオフ、照明装置の種類、落射照明の明るさ、透過照明の明るさ、画像処理（ハイダイナミックレンジ"ＨＤＲ"のオンオフ、リング除去のオンオフなどのカウント設定）などである。図１７において、「上リング」とはリング照明装置１２の略称である。「下リング」とはリング照明装置１３の略称である。「全射」とは同軸照明装置１４の略称である。ここで、ＭＣＵ３０は、菌種、希釈倍率、培養時間、アルゴリズム設定、培地タイプ、または撮影設定（カウント設定）について、図１５に示すダイアログ９０上で、列単位で、デフォルト値を設定するが、図１７の確認画面１１０上で、各セルに対して個別に設定してもよい。
【0040】
なお、セルに対してダブルクリックなどの特定の入力を受け付けることで、当該セルに対応する設定を一覧表示した確認画面１１０がＵＩ１００上に重畳して表示されてもよい。また、ポインタ５７によりセルが選択されると、ＭＣＵ３０は、当該セルに対応する設定をＵＩ１００上に表示するようにしてもよい。
【0041】
図１８は、撮影ボタンである第一ソフトウエアボタン１０５ａまたは第一ハードウエアボタン８ａが押されると、ＭＣＵ３０が表示装置３７に表示するＵＩ１００を示している。結果領域１０２には、シャーレ１５の画像１０３（静止画像）が表示される。ＭＣＵ３０は、第一ソフトウエアボタン１０５ａを撮影ボタンからカウントを指示するボタン（カウントボタン）に割り当てる。
【0042】
図１９は、カウントボタンである第一ソフトウエアボタン１０５ａまたは第一ハードウエアボタン８ａが押されると、ＭＣＵ３０が表示装置３７に表示するＵＩ１００を示している。カウントボタンが押されると、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにコロニーのカウントを指示する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０はカウント指示にしたがってコロニーをカウントし、カウント値をＰＣ１ｂへ送信する。なお、カウント処理はＭＣＵ３０により実行されてもよい。ＭＣＵ３０は、カウント値をカウント値領域１０４に表示する。この際には、ＭＣＵ３０は、カウント値をＣＦＵ／ｍＬ（単位体積（ミリリットル）あたりのコロニーの個数）に変換してカウント値領域１０４に表示してもよい。たとえば、カウント値領域１０４をポインタ５７でクリックするごとに、ＭＣＵ３０は、カウント値のみ、ＣＦＵ／ｍＬのみ、カウント値＋ＣＦＵ／ｍＬと順番に表示を切り替えてもよい。なお、ＣＦＵはコロニー形成単位の略称である。また、カウント値が取得されると、ＭＣＵ３０は、第一ソフトウエアボタン１０５ａをカウントボタンから撮影ボタンに割り当て直す。さらに、ＭＣＵ３０は、登録ボタンに割り当てられている第二ソフトウエアボタン１０５ｂおよび第二ハードウエアボタン８ｂを操作不可能状態から操作可能状態に変更する。
【0043】
図２０は、登録ボタンが押された状態を示している。ＭＣＵ３０は、現在選択中のセルに対してカウント値を書き込み、次のセルを選択中（注目セル）に変更してもよい。この例では、１行目のセルから２行目のセルに注目セル（アクティブセル）が変更されている。このように、ＭＣＵ３０が自動的に次のセルを選択することで、ユーザの負担が軽減される。なお、ＭＣＵ３０は、登録ボタンに割り当てられている第二ソフトウエアボタン１０５ｂおよび第二ハードウエアボタン８ｂを操作可能状態から操作不可能状態に戻す。
【0044】
【0045】
図２１が示すように、ユーザが変更メニュー１０９において「ＣＦＵ／ｍＬ」を選択すると、ＭＣＵ３０は、セルの表示対象を「カウント数」から「ＣＦＵ／ｍＬ」に変更する。これにより、ユーザは容易にセルの表示対象を切り替えることができる。
【0046】
図２２が示すように、ユーザが変更メニュー１０９において「コメント」を選択すると、ＭＣＵ３０は、セルの表示対象を「コメント」に変更する。これにより、ユーザは容易にセルの表示対象をコメントに切り替えることができる。また、このＵＩ１００においても、ユーザは、図２２に示すように「コンタミ発生」などのコメントを直接入力できる。ここで、コメントとは、カウント表の一行に含まれる備考などである。
【0047】
図２３は、カウント値が入力済みであるセルをダブルクリックされると、ＭＣＵ３０が表示装置３７に表示するＵＩ１００を示している。設定画面１２０は、ダブルクリックにより選択されたセルに関連付けられている検査条件のうちコロニーの検出アルゴリズムに関するパラメータを調整するためのコントロールオブジェクトを含む。スライドバー１２１は、たとえば、小粒子を画像処理により除去するための閾値を設定するためのコントロールオブジェクトである。スライドバー１２２は、コロニーの検出感度を調整するためのコントロールオブジェクトである。
【0048】
ＭＣＵ３０は、結果領域１０２に表示された画像１０３において、コロニーとして検出された部分にサークルなどのマークを重畳表示してもよい。スライドバー１２１、１２２の調整に応じて、ＭＣＵ３０がアルゴリズムを変更するため、コロニーを示すマークの位置と個数も変化する。これにより、ユーザは、適切な調整量を見出しやすくなるであろう。
【0049】
［ボタンの割り当て］
図２４は、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）と、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）に割り当てられる機能の一例を示している。
図２４は、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）と、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）に割り当てられる機能の一例を示している。
【0050】
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。
【0051】
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。
【0052】
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作可能）が割り当てられる。なお、撮影ボタンは、撮りなおしボタンと呼ばれてもよい。
【0053】
カウント表の状態が「カウント表が表示されている」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。
【0054】
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。
【0055】
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が動画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）にはカウントボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作不可能）が割り当てられる。
【0056】
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値未入力であれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には登録ボタン（操作可能）が割り当てられる。
【0057】
カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態であり、画像１０３が静止画像であり、かつ、アクティブセルの状態がカウント値入力済みであれば、第一ハードウエアボタン８ａ（第一ソフトウエアボタン１０５ａ）には撮影ボタンが割り当てられ、第二ハードウエアボタン８ｂ（第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）には再登録ボタン（操作可能）が割り当てられる。
【0058】
図１７や図２３が示すように、カウント表の状態が「カウント表が表示されていない」状態では、カウント表に代えて、検査条件を変更可能なＵＩが表示されている。したがって、検査条件が変更されると、カウント値も変化するため、ユーザには、変化後のカウント値をアクティブセルに書き込む（再登録）するかどうかをＭＣＵ３０が問い合わせることになる。
【0059】
「カウント表が表示されていない」状態は、カウント結果が入力されたカウント表が表示され、かつ、カウント結果を再編集可能な状態であってもよい。図２５は、再編集のための編集タブ１２４が設けられたＵＩ１００を示している。図２４に表示された「カウント表が表示されていない」状態は、カウント結果が入力されたカウント表が表示され、かつ、編集タブ１２４がクリックされた状態であってもよい。図２５において検査条件タブ１２３は、図１７に示された検査条件の確認画面１１０を表示するためのタブである。上述されたように、確認画面１１０において照明やメインカメラ１１の設定が変更可能となっている。
【0060】
このように結果領域１０２に動画像が表示されているときにカウントボタンが押されると、動画像が静止画像に変更され、カウント結果が表示され、登録ボタンが操作可能となる。静止画像が表示されているときに登録ボタンが押されると、カウント結果がアクティブセルに書き込まれ、結果領域１０２は動画像を表示する状態に戻る。一度登録されたカウント結果が変更され、再登録ボタンが押されると、変更されたカウント結果がカウント表に上書きされ、結果領域１０２は動画像を表示する状態に戻る。結果領域１０２が静止画像を表示しているときに、撮影ボタン（撮りなおしボタン）が押されると、結果領域１０２は動画像を表示する状態に戻る。
【0061】
［カウント表の特定方法］
ユーザは、シャーレ１５で菌を培養したり、コロニーをカウントしたりする際にカウント表を見ることになる。ここで、カウント表を作成された日と、カウント表を目視して準備作業およびカウント作業を実行する日と、が異なっている場合がある。この場合、ユーザは、所望のカウント表を記憶装置３５から読み出して表示装置３７に表示させる必要がある。
ユーザは、シャーレ１５で菌を培養したり、コロニーをカウントしたりする際にカウント表を見ることになる。ここで、カウント表を作成された日と、カウント表を目視して準備作業およびカウント作業を実行する日と、が異なっている場合がある。この場合、ユーザは、所望のカウント表を記憶装置３５から読み出して表示装置３７に表示させる必要がある。
【0062】
図２６は、カウント表などのファイルを呼び出すファイルＵＩ２００を示している。ボタン２１０は、呼び出す対象としてカウント表を指定するためのボタンである。ファイルリスト２１１は、記憶装置３５に記憶されたファイルを一覧２１２として表示する領域である。ボタン２１０が押されると、ＭＣＵ３０は、複数のファイルのうちカウント表に特有の拡張子を有するファイルのみをファイルリスト２１１に表示する。一覧２１２は、ＩＤ（通し番号）、タイトル、最終更新日、カウントが済んでいるかどうか、その他の情報を含む。
【0063】
検索ボックス２１３は、一覧２１２に含まれる複数のファイルからさらに所望のファイルを検索するためのキーワードを入力されるボックスである。ボタン２１４は、カウント表を紙に印刷することで作成された検査リストに付与されている識別画像を読み取るためにフロントカメラ１０を起動することを指示するためのボタンである。開くボタン２１５は、一覧２１２から選択されたカウント表を開くことを指示するボタンである。
【0064】
図２７は、検査リスト２２０を示している。ＭＣＵ３０は検査リスト２２０をプリンタ３８から出力してもよいし、端末装置１ｃの表示装置に出力してもよい。検査リスト２２０は、対応するカウント表５５から作成されたリストである。カウント表５５における情報の並ぶ順序と検査リスト２２０における情報の並ぶ順序とは異なっていてもよいし、一致していてもよい。検査リスト２２０は、表示装置３７に表示されるカウント表５５と同じであってもよい。また、検査リスト２２０にはカウント結果を記入する必要が無いため、カウント結果を記入するためのセルが省略されていてもよい。さらに、ユーザが検査リスト２２０を培養サンプルの準備に用いる場合、培養時間は必ずしも必要ではない。そのため、培養時間のセルが省略されていてもよい。検査リスト２２０は、各カウント表を識別するための識別情報として一次元シンボルや二次元シンボルなどの識別画像２２１を付与されていてもよい。識別画像２２１は、ユーザの識別情報を含んでいてもよい。
【0065】
図２６に示されたボタン２１４が押されると、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにフロントカメラ１０の起動を指示する。ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は、フロントカメラ１０を起動し、識別画像２２１の読み取りを試行する。識別画像２２１は単にシンボルと呼ばれてもよい。この際にユーザは、フロントカメラ１０に識別画像２２１を読み取らせるよう、検査リスト２２０の位置をフロントカメラ１０に対して合わせる。ＭＣＵ２０は、識別画像２２１の読取に成功すると、識別画像２２１から識別情報を復号（デコード）して、ＰＣ１ｂへ送信する。ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａから受信された識別情報に関連付けられているカウント表を記憶装置３５から読み出す。
【0066】
図２８は、ユーザが身に着けるユーザ認証札２３０を示している。データインテグリティ規制のために、ヘッド装置１ａを使用するユーザに種々の制限が課されることがある。たとえば、米国のＦＤＡ（食品医薬品局）の規則である２１ ＣＦＲ Ｐａｒｔ１１によれば、ユーザは、物理的および論理的に管理されることが求められている。たとえば、ヘッド装置１ａおよびＰＣ１ｂについてもユーザごとに使用可能な機能を制限するために、ユーザ認証札２３０が利用されてもよい。ユーザは、フロントカメラ１０によりユーザ認証札２３０の識別画像２２１を読み取らせることで、ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０がユーザ認証を実行してもよい。つまり、識別画像２２１は、ユーザ名とパスワードなどのアカウント情報を示すシンボルを含んでいてもよい。ただし、ユーザ名とパスワードは暗号化された上で、識別画像２２１となっている。
【0067】
ユーザごとの機能制限としては、次のようなものが考えられる。一例として、ユーザは、管理者、リーダー、および作業者に分かれている。管理者は、ユーザを追加したり、各ユーザの権限を設定したりすることができる。リーダーは、カウント表を作成でき、カウントを実行でき、カウント結果を保存でき、カウント結果を編集でき、カウント結果を出力（印刷、送信）できる。作業者は、カウントを実行でき、カウント結果を保存できる。ＭＣＵ２０およびＭＣＵ３０は、識別画像２２１から特定されたユーザの権限に応じて、そのユーザが実行できる機能を制限してもよい。
【0068】
ここで、フロントカメラ１０により識別画像２２１が読み取られているが、メインカメラ１１により識別画像２２１が読み取られてもよい。
【0069】
図４１が示すように、フロントカメラ１０およびメインカメラ１１は、シャーレ１５に貼付されたシール２７０に印刷されているシャーレ番号や識別画像２２１を撮像して読み取ってもよい。識別画像２２１には、カウント表５５の識別情報、サンプル名、カウント結果が格納されるセルを示す固有の識別情報などが符号化されていてもよい。つまり、識別画像２２１を読み取ることで、ＭＣＵ３０は、カウント表５５、サンプル名、シャーレ１５、検査条件を特定することができる。さらに、ＭＣＵ３０は、特定された検査条件をヘッド装置１ａに送信し、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０は受信された検査条件にしたがってメインカメラ１１、リング照明装置１２、１３、および同軸照明装置１４を制御し、画像を取得できる。
【0070】
［フロントカメラの他の応用例］
（１）セルへのテキスト入力
図２９はボタン５４を押すことで備考として利用される新規の列が追加されたカウント表５５を示している。新規の列は、自由列として定義されており、文字や数字だけでなく、画像などを保持することができる。
（１）セルへのテキスト入力
図２９はボタン５４を押すことで備考として利用される新規の列が追加されたカウント表５５を示している。新規の列は、自由列として定義されており、文字や数字だけでなく、画像などを保持することができる。
【0071】
図３０は、自由列のセルをポインタ５７で右クリックされると表示される編集画面２４０を示している。この例では、セルに対するテキスト「商品番号：」が入力済みであり、それに続くテキストを入力するためのダイアログ２４１が表示されている。ダイアログ２４１は、編集画面２４０のテキストボックス内をポインタ５７で右クリックすることで表示される。ダイアログ２４１は、フロントカメラ１０を利用することで商品等からコードを読み取り、読取結果をセルに入力するための複数の選択肢を含む。この例では、選択肢として、フロントカメラ１０によるコードの読み取りが含まれる。たとえば、「コード読み取り（一次元シンボル）」がポインタ５７により選択され、読み取りボタン２４２が押されると、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａに対して一次元シンボルの読み取りを指示する。
【0072】
図３１は、読み取りボタン２４２が押されると、表示装置３７に表示される読取画面２５０を示している。チェックボックス２５１は、ＭＣＵ２０がコードの認識に成功したときにＭＣＵ３０が読取画面２５０を自動的に閉じることを指示するためのチェックボックスである。画像領域２５２は、フロントカメラ１０により取得された動画像または静止画像を表示する。読取結果領域２５３は、一次元シンボルや二次元シンボルから復号されたテキストを表示する領域である。
【0073】
ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０はフロントカメラ１０を起動し、一次元コードを読み取らせ、一次元コードからテキストを復号し、復号されたテキストをＰＣ１ｂへ送信する。ユーザは読取結果領域２５３に表示されたテキストを確認し、ＯＫボタン２５４またはキャンセルボタン２５５を押す。ＯＫボタン２５４が押されると、ＭＣＵ３０は、読取画面２５０を閉じて編集画面２４０に戻り、ヘッド装置１ａから受信されたテキストをセルに挿入する。キャンセルボタン２５５が押されると、ヘッド装置１ａから受信されたテキストを破棄し、読取画面２５０を閉じて、編集画面２４０に戻る。
【0074】
【0075】
（２）セルへの画像入力
図３３は、カウント表の一部、またはカウント表から作成されたカウントレポート２６０の一例を示している。カウント表５５に含まれる自由列のセルには画像データを関連付けることができる。ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのメインカメラ１１を制御してシャーレ１５の画像（シャーレ画像）を取得し、取得したシャーレ画像をセルに関連付ける。あるいは、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御してシャーレ１５の画像（シャーレ画像）を取得し、取得したシャーレ画像をセルに関連付けてもよい。同様に、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御して商品の外観画像を取得し、取得した外観画像をセルに関連付けてもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御して商品に付与されているバーコードを読み取って復号させ、復号された商品番号等をセルに入力してもよい。ＭＣＵ３０は、プリンタ３８を制御し、カウントレポート２６０を紙に印刷してもよい。
図３３は、カウント表の一部、またはカウント表から作成されたカウントレポート２６０の一例を示している。カウント表５５に含まれる自由列のセルには画像データを関連付けることができる。ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのメインカメラ１１を制御してシャーレ１５の画像（シャーレ画像）を取得し、取得したシャーレ画像をセルに関連付ける。あるいは、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御してシャーレ１５の画像（シャーレ画像）を取得し、取得したシャーレ画像をセルに関連付けてもよい。同様に、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御して商品の外観画像を取得し、取得した外観画像をセルに関連付けてもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を制御して商品に付与されているバーコードを読み取って復号させ、復号された商品番号等をセルに入力してもよい。ＭＣＵ３０は、プリンタ３８を制御し、カウントレポート２６０を紙に印刷してもよい。
【0076】
ここでは、フロントカメラ１０により様々な画像が取得されているが、メインカメラ１１により様々な画像が取得されて、セルに関連付けられてもよい。
【0077】
［フローチャート］
（１）ＰＣ１ｂの主な処理
図３４は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行される一連の処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
（１）ＰＣ１ｂの主な処理
図３４は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行される一連の処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
【0078】
【0079】
Ｓ２でＭＣＵ３０はカウント表を記憶装置３５に保存する。
【0080】
Ｓ３でＭＣＵ３０はカウント表を特定する。カウント表の特定は、フロントカメラ１０と検査リスト２２０またはユーザ認証札２３０を用いて実行されたり、図２６に示されたファイルＵＩ２００を使用して実行されたりしてもよい。
【0081】
Ｓ４でＭＣＵ３０は特定されたカウント表を記憶装置３５から読み出す。これにより、図１６に示されたＵＩ１００が表示装置３７に表示される。
【0082】
Ｓ５でＭＣＵ３０はカウント値を書き込まれるセルを特定する。最初は、カウント表において最も上に位置する行のセルが選択されてもよいし、ポインタ５７によりクリックされたセルが選択されてもよい。
【0083】
Ｓ６でＭＣＵ３０はアクティブセルに関連付けられている検査条件を特定する。たとえば、ＭＣＵ３０は、カウント表の作成の際に各セルに対し関連付けられた検査条件を記憶装置３５から読み出す。
【0084】
Ｓ７でＭＣＵ３０は、アクティブセルに関連付けられている検査条件をヘッド装置１ａに設定する。上述されたように、メインカメラ１１の感度、点灯すべき照明装置、明るさ、点灯すべき発光素子の数（照射方向）、画像処理（ＨＤＲ、リング除去）、カウントアルゴリズム（閾値などのパラメータ）などをヘッド装置１ａに送信する。
【0085】
Ｓ８でＭＣＵ３０は検査条件が変更されたかどうかを判定する。上述されたように、セルに関連付けられた検査条件は検査中においても随時変更可能である。よって、検査条件が変更されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ７に戻り、変更後の検査条件をヘッド装置１ａに送信する。検査条件が変更されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ９に進む。
【0086】
Ｓ９でＭＣＵ３０は、ユーザにより撮影指示が入力されたかどうかを判定する。ユーザは、ヘッド装置１ａの第一ハードウエアボタン８ａまたはＵＩ１００の第一ソフトウエアボタン１０５ａを押すことで撮影を指示することができる。撮影指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０はＳ９からＳ８に戻る。撮影指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ９からＳ１０に進む。
【0087】
Ｓ１０でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａに対して撮像指示を送信する。
【0088】
Ｓ１１でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａからメインカメラ１１により取得されたシャーレ画像１０３の画像（検査画像）を取得し、ＵＩ１００の結果領域１０２に検査画像を表示する。
【0089】
Ｓ１２でＭＣＵ３０は、カウント指示が入力されたかどうかを判定する。ユーザは、カウントボタンとして割当たられたヘッド装置１ａの第一ハードウエアボタン８ａまたはＵＩ１００の第一ソフトウエアボタン１０５ａを押すことで、カウント指示を入力できる。カウント指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ１２からＳ８に戻る。カウント指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ１２からＳ１３に進む。
【0090】
Ｓ１３でＭＣＵ３０は、カウント指示をヘッド装置１ａへ送信する。なお、カウント処理がＰＣ１ｂにより実行される場合、ＭＣＵ３０がＭＣＵ２０の代わりにカウント処理を実行する。
【0091】
Ｓ１４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａからカウント結果を受信し、カウント結果をカウント値領域１０４に表示する。なお、Ｓ１４でＭＣＵ３０がカウント処理を実行する場合、ＭＣＵ３０はカウント処理を実行することで得られたカウント結果をカウント値領域１０４に表示する。
【0092】
Ｓ１５で、ＭＣＵ３０は、画像処理、カウントアルゴリズム等の検査条件が変更されたかどうかを判定する。検査条件が変更されると、Ｓ１３に戻る。検査条件が変更されていなければ、ＭＣＵ３０はＳ１６に進む。なお、Ｓ８の検査条件の変更は画像の再取得が必要になるような検査条件の変更が想定されている。Ｓ１５の検査条件の変更は取得された画像に対する画像処理の変更をもたらすが、画像の再取得は不要なものが想定されている。
【0093】
Ｓ１６でＭＣＵ３０は、ユーザにより登録指示が入力されたかどうかを判定する。ユーザは、登録ボタンとして割当たられたヘッド装置１ａの第二ハードウエアボタン８ｂまたはＵＩ１００の第二ソフトウエアボタン１０５ｂを押すことで、登録指示を入力できる。登録指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ１６からＳ８に戻り、撮りなおしを実行したり、検査条件を変更したりする。登録指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ１６からＳ１７に進む。
【0094】
Ｓ１７でＭＣＵ３０は、カウント結果をアクティブセルに登録する。
【0095】
Ｓ１８でＭＣＵ３０は、カウントがすべて終了したかどうかを判定する。たとえば、カウント表に存在するすべてのセルにカウント結果が入力されていれば、ＭＣＵ３０は、カウント終了と判定する。まだ、未入力のセルが存在している場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ１８からＳ５に進み、アクティブセルを次のセルに変更する（セルの特定）。
【0096】
（２）ヘッド装置１ａの主な処理
図３５は、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０が制御プログラムにしたがって実行する一連の処理を示す。
図３５は、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０が制御プログラムにしたがって実行する一連の処理を示す。
【0097】
Ｓ２１でＭＣＵ２０は、フロントカメラ１０に対する撮影の指示を受信したかどうかを判定する。上述されたように検査リスト２２０の識別画像２２１を読み取る場合、フロントカメラ１０に対する撮影の指示（コードを読み取り指示）がＰＣ１ｂからヘッド装置１ａへ入力される。フロントカメラ１０に対する撮影の指示が入力されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２１からＳ２３に進む。フロントカメラ１０に対する撮影の指示が入力されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２１からＳ２２に進む。
【0098】
Ｓ２２でＭＣＵ２０は、フロントカメラ１０を起動して画像（フロントカメラ画像）を取得し、フロントカメラ画像またはシンボルのデコード結果をＰＣ１ｂへ送信する。
【0099】
Ｓ２３でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから検査条件を受信し、記憶装置２５に保存する。
【0100】
Ｓ２４でＭＣＵ２０は、検査条件を各部に設定する。検査条件のうち感度は撮像制御部２１に設定される。点灯すべき照明装置、明るさ、照明方向などは照明制御部２２に設定される。
【0101】
Ｓ２５でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから検査条件の変更指示が受信されたかどうかを判定する。変更指示は、新しい検査条件とともに受信される。検査条件の変更指示が受信されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２４に戻り、新しい検査条件を設定する。変更指示が受信されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２５からＳ２６に進む。
【0102】
Ｓ２６でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから撮像指示が受信されたかどうかを判定する。撮像指示が入力されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２６からＳ２５に戻る。撮像指示が入力されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２６からＳ２７に進む。
【0103】
Ｓ２７でＭＣＵ２０は、メインカメラ１１を起動して検査画像を取得し、検査画像をＰＣ１ｂへ送信する。
【0104】
Ｓ２８でＭＣＵ２０は、ヘッド装置１ａからカウント指示が入力されたかどうかを判定する。カウント指示が入力されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ２８からＳ２５に戻る。カウント指示が入力されると、ＭＣＵ２０は、Ｓ２８からＳ２９に進む。
【0105】
Ｓ２９でＭＣＵ２０は、検査条件にしたがってコロニーのカウントを実行する。
【0106】
Ｓ３０でＭＣＵ２０は、カウント結果をＰＣ１ｂへ送信する。
【0107】
Ｓ３１でＭＣＵ２０は、カウント終了指示を受信したかどうかを判定する。カウント終了指示が受信されると、ＭＣＵ２０は、カウントを終了する。カウント終了指示が受信されていなければ、ＭＣＵ２０は、Ｓ３１からＳ２３に戻り、次のセルについての検査条件を受信する。
【0108】
（３）サンプルデータベースの登録
カウント表は複数の行および列を有し、さらに各セルには検査条件が関連付けられている。カウント表や検査リストは、日ごとに作り替えられることがある。ただし、同一のサンプルについて毎日検査が実行されることもある。したがって、検査頻度の多いサンプルについては、サンプルＤＢ４０に予め登録しておくことで、カウント表の作成処理の負担が軽減される。そこで、サンプル表を作成したときに、ユーザは、各サンプルに対応する行要素をサンプルＤＢ４０に登録してもよい。
カウント表は複数の行および列を有し、さらに各セルには検査条件が関連付けられている。カウント表や検査リストは、日ごとに作り替えられることがある。ただし、同一のサンプルについて毎日検査が実行されることもある。したがって、検査頻度の多いサンプルについては、サンプルＤＢ４０に予め登録しておくことで、カウント表の作成処理の負担が軽減される。そこで、サンプル表を作成したときに、ユーザは、各サンプルに対応する行要素をサンプルＤＢ４０に登録してもよい。
【0109】
図３６は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるサンプルＤＢ４０の編集処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたアプリケーションプログラム３９にしたがって以下の処理を実行する。
【0110】
Ｓ４１でＭＣＵ３０は、カウント表に含まれる複数の行要素のうちサンプルＤＢ４０に登録したい行要素の選択を受け付ける。たとえば、ＭＣＵ３０は、サンプル表に含まれる行要素のうちいずれかの行要素に対するポインタ５７によるクリックを受け付けてもよい。
【0111】
Ｓ４２でＭＣＵ３０は、選択された行要素の追加指示を受け付ける。たとえば、行要素が選択された状態でポインタ５７により右クリックが実行されると、追加指示が入力されてもよい。
【0112】
Ｓ４３でＭＣＵ３０は、追加指示された行要素のサンプル名を取得し、同一のサンプル名がすでにサンプルＤＢ４０に登録済みであるかどうかを判定する（重複判定）。追加指示された行要素が既に存在しなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ４３からＳ４５に進む。追加指示された行要素がサンプルＤＢ４０に存在すれば、ＭＣＵ３０は、Ｓ４３からＳ４４に進む。
【0113】
Ｓ４４でＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に行要素を上書きするかどうかをユーザに問い合わせる。キャンセル指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、行要素の追加をキャンセルする。上書き指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ４４からＳ４５に進む。
【0114】
Ｓ４５でＭＣＵ３０は、追加対象の行要素を構成している項目名（例：サンプル名、菌種、培地タイプ、希釈倍率）を取得する。
【0115】
Ｓ４６でＭＣＵ３０は、行要素のセルに関連付けられている検査条件を記憶装置３５から取得する。
【0116】
Ｓ４７でＭＣＵ３０は、項目名と検査条件をサンプルＤＢ４０に登録する。
【0117】
Ｓ４８でＭＣＵ３０は、ＵＩ５０におけるサンプルＤＢ４０の表示を更新する。
【0118】
（４）カウント表の編集
図３７は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるカウント表の編集処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
図３７は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるカウント表の編集処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
【0119】
Ｓ５１でＭＣＵ３０は、カウント表において新しく行要素を追加される位置（セルまたは行）を特定する。たとえば、ＭＣＵ３０は、カウント表においてサンプル名が入力済みである最終行の次の行を選択する。なお、ある行と別の行との間に新たな行が選択されてもよい。たとえば、カウント表においてサンプル名が入力済みである行が選択され、ポインタ５７による右クリックが実行されると、選択された行の次に空行が追加される。
【0120】
Ｓ５２でＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されたかどうかを判定する。たとえば、ＵＩ５０のボタン６４が押されると、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されたと認識する。サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ５３に進む。サンプルＤＢ４０から行の追加が指示されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ６１に進む。
【0121】
Ｓ５３でＭＣＵ３０は、追加指示された行の項目名をサンプルＤＢ４０から取得する。
【0122】
Ｓ５４でＭＣＵ３０は、追加指示された行の検査条件をサンプルＤＢ４０から取得する。
【0123】
Ｓ５５でＭＣＵ３０は、取得された項目名と検査条件とをカウント表に貼り付ける。つまり、ＭＣＵ３０は新規の行要素をカウント表に追加する。なお、ＭＣＵ３０は、サンプルＤＢ４０に保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれているか否かを判定してもよい。さらに、ユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれていないと判定された場合、ＭＣＵ３０は、ユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれていない列要素のセルを含むか否かを判定してもよい。ユーザにより指定された行要素が新規のカウント表に含まれていない列要素のセルを含むと判定された場合、ＭＣＵ３０は、当該列要素を新規のカウント表に追加する。つまり、すでにカウント表に存在する他のサンプル名を付与された行要素にも列要素が追加されることになる。
【0124】
Ｓ５６でＭＣＵ３０は、編集完了かどうかを判定する。ユーザにより編集完了が指示されると、ＭＣＵ３０は、カウント表を記憶装置３５に保存する。ユーザにより編集完了が指示されなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ５６からＳ５１に戻る。
【0125】
サンプルＤＢ４０を利用せずに新規に行が追加される場合、Ｓ６１でＭＣＵ３０は、キーボード３２やポインティングデバイス３３を通じた項目名の入力を受け付ける。
【0126】
Ｓ６２でＭＣＵ３０は、キーボード３２やポインティングデバイス３３を通じた検査条件の入力を受け付ける。
【0127】
Ｓ６３でＭＣＵ３０は、取得された項目名と検査条件とをカウント表に書き込む。その後、ＭＣＵ３０は、Ｓ５６に進む。
【0128】
（５）カウント表の特定
図３８は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるカウント表の特定処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
図３８は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行されるカウント表の特定処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
【0129】
Ｓ７１でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０の起動指示が入力されたどうかを判定する。たとえば、図２６に示されたファイルＵＩ２００のボタン２１４がクリックされると、ＭＣＵ３０は、起動指示が入力されたと判定し、Ｓ７２に進む。
【0130】
Ｓ７２でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０の起動指示をヘッド装置１ａへ送信する。
【0131】
Ｓ７３でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにおいて識別画像２２１の読取が成功するのを待つ。
【0132】
Ｓ７４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａにおいて識別画像２２１からデコードされた識別情報を取得する。
【0133】
Ｓ７５でＭＣＵ３０は、記憶装置３５において、識別情報に対応するカウント表を検索する。
【0134】
Ｓ７６でＭＣＵ３０は、識別情報に対応するカウント表が発見されたかどうかを判定する。カウント表が存在しない場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ７１に戻る。カウント表が存在した場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ７７に進む。
【0135】
Ｓ７７でＭＣＵ３０は、カウント表を記憶装置３５から読み出し、ＵＩ１００にセットする。
【0136】
Ｓ７１で起動指示が入力されていなければ、ＭＣＵ３０は、Ｓ７８に進む。Ｓ７８でＭＣＵ３０は、カウント表の検索画面を表示装置３７に表示する。Ｓ７９でＭＣＵ３０は、カウント表の選択を受け付ける。たとえば、図２６に示されたファイルＵＩ２００においていずれかカウント表が選択されてもよい。その後、ＭＣＵ３０は、Ｓ７７に進む。
【0137】
（６）コロニーのカウント
図３９は、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０が制御プログラムにしがって実行するコロニーのカウント処理を示す。ただし、画像処理やカウント処理は、ＭＣＵ３０により実行されてもよい。
図３９は、ヘッド装置１ａのＭＣＵ２０が制御プログラムにしがって実行するコロニーのカウント処理を示す。ただし、画像処理やカウント処理は、ＭＣＵ３０により実行されてもよい。
【0138】
Ｓ８１でＭＣＵ２０は、ＰＣ１ｂから受信された検査条件からカウントアルゴリズムを取得する。具体的には、カウントアルゴリズムにおいて使用される画像処理や閾値パラメータ（例：二値化閾値）が取得される。
【0139】
Ｓ８２でＭＣＵ２０は、メインカメラ１１により取得された検査画像にカウントアルゴリズムを適用する。たとえば、ＨＤＲやリング除去などの画像処理が検査画像に適用される。
【0140】
Ｓ８３でＭＣＵ２０は、検査条件（閾値パラメータ）にしたがって検査画像に含まれるコロニーをカウントする。
【0141】
（７）自由列（例：備考セル）への情報の登録
図４０は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行される備考セル等の自由列への情報登録処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
図４０は、ＰＣ１ｂのＭＣＵ３０により実行される備考セル等の自由列への情報登録処理を示すフローチャートである。ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に記憶されたカウントアプリケーションプログラムにしたがって以下の処理を実行する。
【0142】
Ｓ９１でＭＣＵ３０は、備考セルの選択を受け付ける。ここでは一例として備考セルが挙げられているが、他の自由列のセルであってもよい。ＭＣＵ３０は、ポインタ５７により選択された備考セルをアクティブセルに設定する。
【0143】
Ｓ９２でＭＣＵ３０は、備考セルの属性を特定する。各セルには、属性（例：カウント値、文字列、画像）が予め付与されていてもよい。ＭＣＵ３０は、各セルの属性を記憶装置３５から読み出する。
【0144】
Ｓ９３でＭＣＵ３０は、フロントカメラの起動が指示されたかどうかを判定する。フロントカメラ１０の起動が指示されなければ、ＭＣＵ３０は、キーボード３２等から入力されたテキストを備考セルに入力する。一方、起動指示が入力されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ９４に進む。
【0145】
Ｓ９４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１ａのフロントカメラ１０を起動する。
【0146】
Ｓ９５でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０により画像を取得する。
【0147】
Ｓ９６でＭＣＵ３０は、特定された属性が画像かどうかを判定する。属性が画像である場合、ＭＣＵ３０は、Ｓ９７に進む。
【0148】
Ｓ９７でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０により取得された画像（例：商品の外観画像）を備考セルに関連付ける。
【0149】
Ｓ９６で、特定された属性が画像でないと判定されると、ＭＣＵ３０は、Ｓ９８に進む。
【0150】
Ｓ９８でＭＣＵ３０は、フロントカメラ１０により取得された画像のデコード結果をヘッド装置１ａから取得する。
【0151】
Ｓ９９でＭＣＵ３０は、取得された情報（デコード結果（例：商品のシリアル番号など））を備考セルに書き込む。
【0152】
＜残渣の除去＞
図４２は、菌類を培養する前にメインカメラ１１により取得された事前画像を示している。図４２が示すように、シャーレ１５は、内皿１５ａと外皿１５ｂとを有している。内皿１５ａの外径は、外皿１５ｂの内径よりも小さく、外皿１５ｂは内皿１５ａを覆う蓋として機能する。目印１５ｃは、位置合わせのための目印であり、ユーザが内皿１５ａの底または底の裏面にペンにより記入する目印である。目印１５ｃは、刻印などであってもよい。残渣１５ｄは、ほこりや塵、汚れ、ペンにより描かれて消し忘れた文字などの異物である。残渣１５ｄは、検査対象である食品の一部であってもよい。
図４２は、菌類を培養する前にメインカメラ１１により取得された事前画像を示している。図４２が示すように、シャーレ１５は、内皿１５ａと外皿１５ｂとを有している。内皿１５ａの外径は、外皿１５ｂの内径よりも小さく、外皿１５ｂは内皿１５ａを覆う蓋として機能する。目印１５ｃは、位置合わせのための目印であり、ユーザが内皿１５ａの底または底の裏面にペンにより記入する目印である。目印１５ｃは、刻印などであってもよい。残渣１５ｄは、ほこりや塵、汚れ、ペンにより描かれて消し忘れた文字などの異物である。残渣１５ｄは、検査対象である食品の一部であってもよい。
【0153】
図４３は、菌類を培養した後にメインカメラ１１により取得された事後画像を示している。コロニー１５ｅの輝度と残渣１５ｄの輝度とが近い場合、二値化処理された事後画像において、コロニー１５ｅと残渣１５ｄとは区別不可能である。そのため、残渣１５ｄは、コロニーとしてカウントされてしまうことがある。そこで、本実施例は、事前画像（基準画像）と、事後画像（検査画像）とを取得し、事前画像に基づいて検査画像における残渣１５ｄの影響を低減することで、コロニーの個数の計数精度を向上させる。
【0154】
図４４は、別の事後画像を示している。菌類を培養するには、２４時間や４８時間などかなりの時間を要する。本実施例では、シャーレ１５は、事前画像を取得された後に、ステージ５から降ろされて、保温庫等に保管される。培養終了時刻が過ぎると、ユーザは、保温庫からシャーレ１５を取り出して、ステージ５に載置し、メインカメラ１１により事後画像を取得する。このとき、事前画像を取得したときのシャーレ１５の位置および回転角度と、事後画像を取得したときのシャーレ１５の位置および回転角度と、は必ずしも一致しない。たとえば、目印１５を用いてステージ５にシャーレ１５を位置合わせしたとしても、事前画像におけるシャーレ１５の位置および回転角度と、事後画像におけるシャーレ１５の位置および回転角度と、を完全に合わせることは困難である。このような相対的なズレが発生すると、事前画像を用いて、事後画像における残渣１５ｄの影響を十分に低減することも困難となる。そこで、本実施例は、このような相対的なズレの影響も低減する。
【0155】
上述されたように、メインカメラ１１の撮像条件や照明装置の照明条件などを含む検査条件は、コロニーの計数に影響を与える。仮に、事前画像を取得するときの検査条件と、事後画像を取得するときの検査条件とが異なれば、残渣１５ｄの影響を十分に低減することも困難となりうる。したがって、事前画像を取得するときの検査条件と、事後画像を取得するときの検査条件とを一致させるための手段があれば、有利であろう。
【0156】
ところで、食品検査では、非常に多くのシャーレ１５が利用されるため、どの事前画像がどの事後画像に対応するかを把握することが重要である。図４１が示すように、シャーレ１５の側面に識別情報（例：シャーレ番号）を付与すれば、少なくとも複数のシャーレ１５をユーザは区別できる。しかし、メインカメラ１１により取得される事前画像および事後画像には、シャーレ１５の側面に付与されたシャーレ番号が含まれない。シャーレ１５の蓋または底にシャーレ番号をペンで記入すると、事前画像および事後画像にシャーレ番号が含まれることになるが、これは残渣１５ｄとなって、計数精度を低下させる。したがって、シャーレ１５、事前画像および事後画像の関係を正しく保持することが重要となる。たとえば、事前画像からシャーレ番号を確認できたり、事後画像からシャーレ番号を確認できたりすれば、ユーザにとって便利であろう。
【0157】
［ユーザインタフェース］
以下では事前画像を基準画像と呼び、事後画像を検査画像と呼ぶことにする。
以下では事前画像を基準画像と呼び、事後画像を検査画像と呼ぶことにする。
【0158】
図４５は、残渣低減処理に対応したＵＩ５０を示している。ＵＩ５０は、残渣低減処理のオン／オフ（有効／無効）を設定する設定部として機能するチェックボックス５９を有している。チェックボックス５９は、ポインタ５７によってクリックされるたびに、オンまたはオフとなる。カウントセル２９０はカウント結果が入力されるセルである。
【0159】
図４６は、残渣低減処理がオフからオンに切り替えられたときのＵＩ５０を示している。ＭＣＵ３０は、チェックボックス５９がオンになったことを検知すると、カウント表５５においてカウントセル２９０を第一セル２９１と第二セル２９２とに分割する。なお、チェックボックス５９がオンからオフに切り替えられると、図４６に示されているＵＩ５０は、図４５に示されているＵＩ５０に戻り、第一セル２９１と第二セル２９２は一つのカウントセル２９０に戻る（統合される）。
【0160】
第一セル２９１を含む列要素には培養時間として"０ｈ"が示されている。"０ｈ"は培養前であることを示唆する表記にすぎない。第一セル２９１は、基準画像の取得が済んでいるかどうかを示すチェックボックス２９３またはアイコンが含まれていてもよい。
【0161】
第二セル２９２を含む列要素には培養時間として"４８ｈ"が示されている。これは、元のカウントセル２９０に関連付けられている培養時間と共通である。
【0162】
図４７は基準画像を取得するためのＵＩ３００を示している。すでに説明された部分には同一の参照符号が付与されている。ＵＩ３００は、第一セル２９１をポインタ５７によりダブルクリックすることで表示装置３７に表示されてもよいし、カウント表５５とは異なるユーザインタフェースから呼び出されてもよい。ＭＣＵ３０は、ＵＩ３００を通じて第一セル２９１に設定された検査条件を記憶装置３５に保存する。さらに、ＭＣＵ３０は、ヘッド装置１に起動指示を送信し、メインカメラ１１により取得された動画像を結果領域１０２に表示する。ユーザは、表示装置３７に表示された動画像を見ながら、菌類の培養前のシャーレ１５を位置合わせ部材７に対して位置合わせする。ＭＣＵ３０は、画像処理によってシャーレ１５の中心を画像（基準画像）の中心に対して位置合わせしてもよい。この場合であっても、シャーレ１５を位置合わせ部材７に対して、できる限り正確に、手動で位置合わせしておくことで、画像処理による位置合わせ精度が向上する。
【0163】
位置合わせ部材７は、シャーレ１５と対応する形状を有する。これにより、ユーザは位置合わせ部材７に沿わせてシャーレ１５を配置することで位置合わせができる。なお、検査個体の培養容器としてウェルプレートやフィルム型の培地を用いる場合がある。それぞれの培養容器の形状に対応した位置合わせ部材７を用意しておくことで、ウェルプレートやフィルム型の培地を用いた場合であっても容易に位置合わせを行うことができる。
【0164】
ＵＩ３００で設定された検査条件は、たとえば、培地の種類、サンプル名、希釈倍率、培養時間、シャーレ番号、コメント、撮影設定（露光時間などのカメラ設定と、照明装置の選択、明るさ、画像処理）などを含む。
【0165】
ＭＣＵ３０は、撮影ボタンに割り当てられた第一ソフトウエアボタン１０５ａ（第一ハードウエアボタン８ａ）が操作されたことを検知すると、ヘッド装置１に撮影設定を送信し、メインカメラ１１にシャーレ１５を撮像させ、基準画像（静止画）を取得する。ユーザは、結果領域１０２に表示された基準画像を確認し、登録ボタン１０５ｂを押すか、再撮影のために撮影ボタン１０５ｂを押す。後者の場合、ユーザは、ＵＩ３００を操作して検査条件（主に撮影設定）を変更することができる。
【0166】
ＭＣＵ３０は、登録ボタン１０５ｂが押されたことを検知すると、基準画像を記憶装置３５に保存する。ここで、ＭＣＵ３０は、基準画像のヘッダに含まれる、基準画像であることを示すフラグ（基準フラグ）を"１"に設定してもよい。また、ＭＣＵ３０は、基準画像に対してシャーレ番号などの識別情報を関連付けたり、第一セル２９１を関連付けたりして記憶装置３５に保存してもよい。
【0167】
図４８は、第二セル２９２がポインタ５７によりダブルクリックされたときに表示装置３７に表示されるＵＩ１００を示す。ここでは、ステージ５に対してシャーレ１５がまだ載置されていない。ＭＣＵ３０は、第二セル２９２が指定されると、第二セル２９２に関連付けられている第一セル２９１にさらに紐づけられている検査条件を記憶装置３５から読み出し、検査条件をヘッド装置１に設定する。図４８においては、すでに基準画像が取得ずみであるため、チェックボックス２９３にはチェックマークが表示されている。
【0168】
図４９は、ステージ５にシャーレ１５が載置されたことを示している。ここで、位置合わせ部材７が省略されている。ユーザは、結果領域１０２に表示された動画像を見ながら、シャーレ１５の位置を調整する。ここで、シャーレ１５の位置の調整を容易にするためにガイド画像（例：基準画像）が動画像に対して重畳して表示されてもよい。ＭＣＵ３０は、第二セル２９２に関連付けられている第一セル２９１に紐づけられている基準画像を記憶装置３５から読み出してもよい。あるいは、ＭＣＵ３０は、次のようなＵＩを使用してユーザに基準画像を選択させてもよい。
【0169】
図５０は、基準画像または残渣の低減対象となる検査画像を指定するためのＵＩ３１０を示している。チェックボックス３１１は、呼出対象が基準画像であることを示す。チェックボックス３１２は、呼出対象が検査画像であることを示す。ＭＣＵ３０は、チェックボックス３１１がチェックされると、記憶装置３５に保存されている複数の画像のうち基準フラグが"１"にセットされている画像を基準画像として抽出し、リストを作成する。
【0170】
メニュー３１３がポインタ５７によりクリックされると、ＭＣＵ３０は、メニュー３１３にリストを表示する。この例では、各基準画像にシャーレ番号が付与されている。ユーザがポインタ５７により一つの基準画像をメニュー３１３から選択すると、ＭＣＵ３０は、選択された基準画像に関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出す。
【0171】
図５１は、一つの基準画像が指定されたときのＵＩ３１０を示している。ＭＣＵ３０は、ユーザにより選択された基準画像に関連付けられている検査条件を条件表示部３１５に表示する。これにより、ユーザは、自分の意図通りの基準画像を選択できたかどうかを確認することができるだろう。
【0172】
チェックボックス３１２がチェックされると、ＭＣＵ３０は、記憶装置３５に保存されている複数の画像のうち基準フラグが"１"にセットされている画像を基準画像として抽出し、リストを作成する。
【0173】
メニュー３１３がポインタ５７によりクリックされると、ＭＣＵ３０は、メニュー３１３にリストを表示する。検査画像にはシャーレ番号が付与されていてもよい。ユーザがポインタ５７により一つの基準画像をメニュー３１３から選択すると、ＭＣＵ３０は、選択された基準画像に関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出し、ＵＩ３１０に表示する。
【0174】
図５２は、シャーレ１５の内皿１５ａに付与された少なくとも二つの目印１５ｃ、１５ｆを示している。目印１５ｃ、１５ｆは、手動によるシャーレ１５の位置合わせに利用されるが、後述される残渣低減処理においても利用される。
【0175】
図５３は、検査画像を撮影してコロニーをカウントするためのＵＩ１００において、動画像である検査画像１０３ａに対して基準画像１０３ｂを重畳して表示することを示している。基準画像１０３ｂは、位置合わせのガイド画像として機能する。ＭＣＵ３０は、たとえば、基準画像１０３ｂの輝度を低減したり、基準画像１０３ｂからシャーレ１５の輪郭を抽出し、輪郭を目立つ色（例：赤、オレンジ、緑、青、紫）で着色したりして、検査画像１０３ａに重畳してもよい。ユーザは、基準画像１０３ｂの位置と回転角度に対して検査画像１０３ａの位置と回転角度とが一致するように、手動でシャーレ１５の位置を調整する。その際に、ユーザは、目印１５ｃ、１５ｆを参考にすることで、精度よく位置合わせを実行できるようになろう。
【0176】
図５４は、シャーレ１５の位置合わせが終了した状態である。基準画像１０３ｂの位置と回転角度に対して検査画像１０３ａの位置と回転角度とはできる限り一致することが望ましいが、これらは完全に一致している必要はない。ただし、位置合わせが正確であれば、より正確に残渣が低減されて、コロニーのカウント精度も向上する。
【0177】
ＭＣＵ３０は、カウントボタンに割り当てられた第一ソフトウエアボタン１０５ａ（第一ハードウエアボタン８ａ）が押されたことを検知すると、検査条件をヘッド装置１に設定するとともに、撮像指示を送信する。これにより、検査画像が取得され、検査画像が記憶装置３５に保存される。ＭＣＵ３０は、さらに、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａ（静止画）とを用いて検査画像１０３ａに含まれる残渣を低減し、コロニーをカウントする。
【0178】
図５５は、カウント結果が取得されたことを示すＵＩ１００を示す。上述されたように第一ソフトウエアボタン１０５ａ（第一ハードウエアボタン８ａ）には、撮りなおしのための撮影ボタンが割り当てられ、第二ソフトウエアボタン１０５ｂ（第二ハードウエアボタン８ｂ）には登録ボタンが割り当てられる。ＭＣＵ３０は、登録ボタンが押されたことを検知すると、カウント結果をカウント表５５の第二セル２９２に入力する。
【0179】
図５６は、カウント結果が第二セル２９２に入力されたことを示す。ユーザが、ポインタ５７により次のセルを選択すると、ＭＣＵ３０は、次のセルについて上記の手順を繰り返す。
【0180】
［位置合わせの目印］
図５２では、内皿１５ａに付与された少なくとも二つの目印１５ｃ、１５ｆが示されている。目印１５ｃ、１５ｆは、ペンにより描かれたり、刻印されたりしてもよいが、他のタイプの目印が採用されてもよい。
図５２では、内皿１５ａに付与された少なくとも二つの目印１５ｃ、１５ｆが示されている。目印１５ｃ、１５ｆは、ペンにより描かれたり、刻印されたりしてもよいが、他のタイプの目印が採用されてもよい。
【0181】
図５７は、他のタイプの目印１５ｇを示している。目印１５ｇは、残渣そのものである。シャーレ１５の内皿１５ａまたは外皿１５ｂには様々な残渣が存在しうる。とりわけ、内皿１５ａまたは外皿１５ｂに固着した残渣は目印１５ｇとして適しているだろう。培地に存在する残渣も目印１５ｇとして利用可能であるが、この場合、コロニーの形成によって目印１５ｇが移動してしまう可能性があることを許容しなければならない。
【0182】
ＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂを二値化し、最も大きな塊を目印１５ｃとして選択してもよいし、基準画像１０３ｂからユーザによりポインタ５７により指定された残渣を目印１５ｃとして選択してもよい。
【0183】
［残渣低減アルゴリズム］
（１）第一のアルゴリズム
図５８は、残渣低減アルゴリズムの一例を示している。ＭＣＵ３０は、同一の識別情報（例：シャーレ番号）に関連付けられている基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとを共通の特徴箇所である目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇに基づき、画像処理による位置合わせを実行する。たとえば、基準画像１０３ｂにおける目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇと、検査画像１０３ａにおける目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇとに基づき、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ｂとの間の位置と回転角度のズレ量を求める。基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとのうちの一方をズレ量で補正することで、基準画像１０３ｂの位置と回転角度と検査画像１０３ａの位置と回転角度とが一致する。
（１）第一のアルゴリズム
図５８は、残渣低減アルゴリズムの一例を示している。ＭＣＵ３０は、同一の識別情報（例：シャーレ番号）に関連付けられている基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとを共通の特徴箇所である目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇに基づき、画像処理による位置合わせを実行する。たとえば、基準画像１０３ｂにおける目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇと、検査画像１０３ａにおける目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇとに基づき、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ｂとの間の位置と回転角度のズレ量を求める。基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとのうちの一方をズレ量で補正することで、基準画像１０３ｂの位置と回転角度と検査画像１０３ａの位置と回転角度とが一致する。
【0184】
その後、ＭＣＵ３０は、二値化された検査画像１０３ａから二値化された基準画像１０３ｂを減算することで、カウント用の検査画像１０３ｃを作成し、カウント用の検査画像１０３ｃに含まれるコロニー１５ｅの個数をカウントする。ここで、二値化された検査画像１０３ａから二値化された基準画像１０３ｂを減算することにより、基準画像１０３ｂに含まれる残渣の影響を低減して検査画像１０３ａに含まれるコロニー１５ｅの個数をカウントできる。すなわち、検査画像１０３ａに、培養により増加したコロニー１５ｅと、培養開始時点で存在していた残渣とが存在する場合であったとしても、培養により増加したコロニー１５ｅの個数を選択的にカウントできる。
【0185】
【0186】
ＭＣＵ３０は、二値化された基準画像１０３ｂから残渣１５ｄの座標を特定し、残渣１５ｄの座標をズレ量で補正する。これにより、検査画像１０３ａにおける残渣１５ｄの位置が特定される。ＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａにおいて特定された残渣１５ｄに対してマスク１５ｈを設定する。ＭＣＵ３０は、マスク１５ｈを設定された画素をコロニーのカウントから除外する。基準画像１０３ｂから特定された残渣１５ｄの位置に対してマスク１５ｈを設定することにより、基準画像１０３ｂに含まれる残渣の影響を低減して検査画像１０３ａに含まれるコロニー１５ｅの個数をカウントできる。
【0187】
図５９においてマスク１５ｈは矩形で示されているが、二値化された基準画像１０３ｂから特定された残渣１５ｄの輪郭がマスク１５ｈの形状として採用されてもよい。または、マスク１５ｈは、残渣１５ｄの輪郭よりも大きくてもよい。この場合、残渣１５ｄの輪郭とマスク１５ｈの形状とは相似となる。
【0188】
（３）第三のアルゴリズム
第三のアルゴリズムは最もシンプルである。ＭＣＵ３０は、二値化された基準画像１０３ｂからコロニーをカウントして、コロニーの個数ｍを求める。ＭＣＵ３０は、二値化された検査画像１０３ａからコロニーをカウントして、コロニーの個数ｎを求める。ＭＣＵ３０は、個数ｎから個数ｍを減算し、最終的なコロニーの個数ｎ－ｍを求める。
第三のアルゴリズムは最もシンプルである。ＭＣＵ３０は、二値化された基準画像１０３ｂからコロニーをカウントして、コロニーの個数ｍを求める。ＭＣＵ３０は、二値化された検査画像１０３ａからコロニーをカウントして、コロニーの個数ｎを求める。ＭＣＵ３０は、個数ｎから個数ｍを減算し、最終的なコロニーの個数ｎ－ｍを求める。
【0189】
第三のアルゴリズムは、画像処理による位置合わせすら不要となろう。短時間でカウントすることが要求される場合は、第三のアルゴリズムが適しているだろう。
【0190】
【0191】
Ｓ１０１でＭＣＵ３０は、基準フラグを設定する。ここでは、基準フラグを"１"に設定する。基準フラグが"０"であることは、その画像が基準画像でないことを示す。
【0192】
Ｓ１０２でＭＣＵ３０は、キーボード３２またはフロントカメラ１０を通じてユーザにより入力されるシャーレ番号を受け付ける。上述されたようにシャーレ番号は識別画像２２１からデコードされてもよい。
【0193】
Ｓ１０３でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１に撮像コマンドを送信し、ヘッド装置１に培養前のシャーレ１５を撮影させ、基準画像１０３ｂを取得する。
【0194】
Ｓ１０４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１から受信した基準画像１０３ｂを記憶装置３５に記憶する。ここで、ＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂのヘッダに基準フラグとシャーレ番号を保存してもよい。ＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂを取得する際に使用された検査条件を基準画像１０３ｂに関連付けて記憶装置３５に記憶してもよい。
【0195】
図６１は、カウント表５５を用いずに検査画像１０３ａを取得してコロニーをカウントする方法を示すフローチャートである。
【0196】
Ｓ１１１でＭＣＵ３０は、検査フラグを設定する。ここでは、検査フラグに"１"がセットされる。検査フラグが"０"であることは、その画像が検査画像でないことを示す。
【0197】
Ｓ１１２でＭＣＵ３０は、キーボード３２またはフロントカメラ１０を通じてユーザにより入力されるシャーレ番号を受け付ける。上述されたようにシャーレ番号は識別画像２２１からデコードされてもよい。
【0198】
Ｓ１１３でＭＣＵ３０は、シャーレ番号に基づき基準画像１０３ｂと検査条件を記憶装置３５から読み出す。上述されたように、シャーレ番号、基準画像１０３ｂおよび対応する検査条件は、相互に関連付けて記憶装置３５に記憶されている。
【0199】
Ｓ１１４でＭＣＵ３０は、検査条件をヘッド装置１に設定する。
【0200】
Ｓ１１５でＭＣＵ３０は、メインカメラ１１により取得される動画に対して基準画像１０３ｂを重畳して表示する。これによりユーザにとっては、手動によるシャーレ１５の位置合わせが容易となろう。
【0201】
Ｓ１１６でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１に撮像コマンドを送信し、メインカメラ１１に培養後のシャーレ１５を撮影させ、静止画である検査画像１０３ａを取得する。なお、ＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａとして、Ｓ１１３で読み出された検査条件に基づいて位置合わせ用の検査画像を取得し、ユーザによる検査条件の調整を受け付けた後にカウント用の検査画像を取得してもよい。
【0202】
Ｓ１１７でＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとに基づきコロニーをカウントする。検査画像１０３ａとして、位置合わせ用の検査画像と、カウント用の検査画像を取得する場合、ＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂと位置合わせ用の検査画像とに基づいて、シャーレ１５の位置合わせを行い、基準画像１０３ｂとカウント用の検査画像とに基づいて、コロニーをカウントする。カウント処理は、ＭＣＵ２０により実行されてもよいし、ＭＣＵ３０により実行されてもよい。
【0203】
（２）カウント表を利用するケース
図６２は、カウント表５５を用いて基準画像１０３ｂを取得する方法を示すフローチャートである。
図６２は、カウント表５５を用いて基準画像１０３ｂを取得する方法を示すフローチャートである。
【0204】
Ｓ１２１でＭＣＵ３０は、ユーザにより指定されたカウント表５５を表示装置３７に表示する。カウント表５５は、たとえば、キーボード３２、ポインティングデバイス３３、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１を通じて指定される。
【0205】
Ｓ１２２でＭＣＵ３０は、基準セルである第一セル２９１の指定を受け付ける。第一セル２９１は、たとえば、ポインティングデバイス３３により操作されるポインタ５７により指定される。
【0206】
Ｓ１２３でＭＣＵ３０は、基準セルである第一セル２９１に関連付けられている検査条件を記憶装置３５から読み出してヘッド装置１に設定する。
【0207】
Ｓ１２４でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１に撮像コマンドを送信し、ヘッド装置１に培養前のシャーレ１５を撮影させ、基準画像１０３ｂを取得する。
【0208】
Ｓ１２５でＭＣＵ３０は、ヘッド装置１から受信した基準画像１０３ｂを、基準セルである第一セル２９１に関連付けて記憶装置３５に記憶する。カウント表５５において、第一セル２９１は、検査個体の識別情報（例：サンプル名）に関連付けられている。つまり、基準画像１０３ｂも検査個体の識別情報（例：サンプル名）に関連付けられる。
【0209】
図６３は、カウント表５５を用いて検査画像１０３ａを取得してコロニーをカウントする方法を示すフローチャートである。
【0210】
Ｓ１３１でＭＣＵ３０は、ユーザにより指定されたカウント表５５を表示装置３７に表示する。カウント表５５は、たとえば、キーボード３２、ポインティングデバイス３３、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１を通じて指定される。
【0211】
Ｓ１３２でＭＣＵ３０は、カウント表５５における対象セル（第二セル２９２）の指定を受け付ける。対象セルである第二セル２９２は、たとえば、ポインティングデバイス３３により操作されるポインタ５７により指定される。
【0212】
Ｓ１３３でＭＣＵ３０は、対象セルである第二セル２９２に関連付けられている基準セル（第一セル２９１）の検査条件を記憶装置３５から読み出す。
【0213】
その後、ＭＣＵ３０は、Ｓ１１４からＳ１１７を実行する。
【0214】
Ｓ１３８でＭＣＵ３０は、対象セルである第二セル２９２にカウント結果を入力する。
【0215】
（３）カウント処理（Ｓ１１７の詳細）
図６４は、第一のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャートである。カウント処理はＭＣＵ３０またはＭＣＵ２０のどちらで実行されてもよいが、ここでは、説明の便宜上、ＭＣＵ３０において実行されるものとして、説明される。
図６４は、第一のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャートである。カウント処理はＭＣＵ３０またはＭＣＵ２０のどちらで実行されてもよいが、ここでは、説明の便宜上、ＭＣＵ３０において実行されるものとして、説明される。
【0216】
Ｓ１４１でＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから共通の特徴箇所を特定する。上述されたように、ＭＣＵ３０は、複数の目印１５ｃ、１５ｆ、１５ｇの中から少なくとも２つの目印を基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとからそれぞれ抽出する。
【0217】
Ｓ１４２でＭＣＵ３０は、共通の特徴箇所に基づき位置のズレ量と回転角度のズレ量を求める。つまり、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとの間のズレ量が求められる。
【0218】
Ｓ１４３でＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂにおける残渣を特定し、特定された残渣の座標を求める。
【0219】
Ｓ１４４でＭＣＵ３０は、ずれ量に基づき残渣の座標を補正する。これにより、基準画像１０３ｂにおいて特定された残渣の位置と大きさが、検査画像１０３ａにおける残渣の位置と大きさとに変換されることになる。
【0220】
Ｓ１４５でＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａから残渣を除去する。残渣は、複数の画素から形成されている。したがって、検査画像１０３ａにおいて、残渣を構成している複数の画素の輝度値がコロニーとしてカウントされない値に変更される。検査画像１０３ａが二値化されている場合、コロニーを示す画素は１であり、コロニーではない画素は０である。よって、検査画像１０３ａにおいて、残渣を構成している複数の画素の輝度値が０に置換される。
【0221】
Ｓ１４６でＭＣＵ３０は、残渣を低減された検査画像１０３ａにおいてコロニーをカウントする。
【0222】
図６５は、第二のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャートである。カウント処理はＭＣＵ３０またはＭＣＵ２０のどちらで実行されてもよいが、ここでは、説明の便宜上、ＭＣＵ３０において実行されるものとして、説明される。なお、図６５では、図６４のＳ１４５、Ｓ１４６がＳ１５５、Ｓ１５６に置換されるため、Ｓ１５５とＳ１５６が中心に説明される。
【0223】
Ｓ１５５でＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａにおいて残渣をマスクする。たとえば、ＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａにおいて、残渣を構成している複数の画素をマスクする。あるいは、ＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａにおいて、残渣を構成している複数の画素を囲むようにマスクを設定する。
【0224】
Ｓ１５６でＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａにおいてマスクされた画素を除外して、コロニーをカウントする。
【0225】
図６６は、第三のカウントアルゴリズムにしたがったカウント方法を示すフローチャートである。カウント処理はＭＣＵ３０またはＭＣＵ２０のどちらで実行されてもよいが、ここでは、説明の便宜上、ＭＣＵ３０において実行されるものとして、説明される。
【0226】
Ｓ１６１でＭＣＵ３０は、基準画像１０３ｂを二値化し、二値化された基準画像１０３ｂについてコロニーの個数ｍをカウントする。
【0227】
Ｓ１６２でＭＣＵ３０は、検査画像１０３ａを二値化し、二値化された検査画像１０３ａについてコロニーの個数ｎをカウントする。
【0228】
Ｓ１６３でＭＣＵ３０は、個数ｎから個数ｍを減算し、カウント結果（個数ｎ－ｍ）を求める。
【0229】
＜まとめ＞
［観点Ａ１］
記憶装置３５は、複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶する記憶部の一例である。ＭＣＵ３０および表示制御部３６は、記憶部に記憶されているカウント表を表示装置３７に表示する表示制御部の一例である。ＭＣＵ３０およびポインティングデバイス３３などは、表示制御部により表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定するセル特定部の一例である。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、ユーザの操作にしたがった計数指示を生成する計数指示部の一例である。ＭＣＵ３０およびメインカメラ１１は、計数指示部で生成された計数指示に基づいて検査個体の画像である検査画像を取得する取得部の一例である。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数する計数部の一例である。図１９や図２０などが例示するように、ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、計数部により計数されたコロニーの数を対象セルに反映する表管理部として機能する。これにより、コロニーの計数結果についての事後処理に関するユーザの負担が軽減される。
［観点Ａ１］
記憶装置３５は、複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶する記憶部の一例である。ＭＣＵ３０および表示制御部３６は、記憶部に記憶されているカウント表を表示装置３７に表示する表示制御部の一例である。ＭＣＵ３０およびポインティングデバイス３３などは、表示制御部により表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定するセル特定部の一例である。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、ユーザの操作にしたがった計数指示を生成する計数指示部の一例である。ＭＣＵ３０およびメインカメラ１１は、計数指示部で生成された計数指示に基づいて検査個体の画像である検査画像を取得する取得部の一例である。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数する計数部の一例である。図１９や図２０などが例示するように、ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、計数部により計数されたコロニーの数を対象セルに反映する表管理部として機能する。これにより、コロニーの計数結果についての事後処理に関するユーザの負担が軽減される。
【0230】
［観点Ａ２］
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、ユーザ操作に応じて検査個体の識別情報を格納する識別情報セルと、識別情報セルと関連付けられ、検査個体についてのコロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルと、を含むカウント表を作成し、記憶部に当該カウント表を記憶させてもよい。つまり、図５や図１６などが示すように、カウント表５５、８２は、検査個体の識別情報（例：サンプル名）を格納する識別情報セルと、識別情報セルと関連付けられ、検査個体についてのコロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルと、を含んでもよい。これにより、ユーザは、カウント表を手書きで作成する手間を省くことができるであろう。
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、ユーザ操作に応じて検査個体の識別情報を格納する識別情報セルと、識別情報セルと関連付けられ、検査個体についてのコロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルと、を含むカウント表を作成し、記憶部に当該カウント表を記憶させてもよい。つまり、図５や図１６などが示すように、カウント表５５、８２は、検査個体の識別情報（例：サンプル名）を格納する識別情報セルと、識別情報セルと関連付けられ、検査個体についてのコロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルと、を含んでもよい。これにより、ユーザは、カウント表を手書きで作成する手間を省くことができるであろう。
【0231】
［観点Ａ３］
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、コロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルに対して検査条件を関連付けてもよい。これにより、カウント結果が格納されるセルに対して検査条件を関連付けておくことで、コロニーに関する検査を事項する際に検査条件を容易に設定することが可能となる。
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、コロニーの数のカウント結果を格納するカウント結果セルに対して検査条件を関連付けてもよい。これにより、カウント結果が格納されるセルに対して検査条件を関連付けておくことで、コロニーに関する検査を事項する際に検査条件を容易に設定することが可能となる。
【0232】
［観点Ａ４］
取得部は、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、照明部により照明された検査個体を撮像する撮像部（例：メインカメラ１１）と、を有してもよい。検査条件は、照明部の照明条件（例：照明の種類、明るさ）を含んでもよい。大腸菌、一般生菌などの菌の種別や培地の種別（例：シート型の培地、液体型の培地、選択型の培地）に応じて適切な照明条件は異なる。よって、検査条件として照明条件を含めることで、各セルに適した照明条件が設定可能となる。さらに、検査条件は、撮像部の撮像条件（例：露光時間）を含んでもよい。培地の色やコロニーの色によって適切な撮像条件は異なりうる。検査条件が撮像条件を含むことで、各セルごとに適切な撮像条件が設定可能となろう。
取得部は、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、照明部により照明された検査個体を撮像する撮像部（例：メインカメラ１１）と、を有してもよい。検査条件は、照明部の照明条件（例：照明の種類、明るさ）を含んでもよい。大腸菌、一般生菌などの菌の種別や培地の種別（例：シート型の培地、液体型の培地、選択型の培地）に応じて適切な照明条件は異なる。よって、検査条件として照明条件を含めることで、各セルに適した照明条件が設定可能となる。さらに、検査条件は、撮像部の撮像条件（例：露光時間）を含んでもよい。培地の色やコロニーの色によって適切な撮像条件は異なりうる。検査条件が撮像条件を含むことで、各セルごとに適切な撮像条件が設定可能となろう。
【0233】
［観点Ａ５］
照明部は、検査個体を落射照明する第一照明モード（例：リング照明装置１２を点灯するモード）と、撮像部に対して対向する方向から検査個体を透過照明する第二照明モード（例：同軸照明装置１４を点灯するモード）とのいずれかにしたがって動作してもよい。検査条件は、第一照明モードまたは第二照明モードの選択を含む。検査条件が照明モードの指定を含むことで、各セルごとに適切な照明モードを選択することが可能となろう。
照明部は、検査個体を落射照明する第一照明モード（例：リング照明装置１２を点灯するモード）と、撮像部に対して対向する方向から検査個体を透過照明する第二照明モード（例：同軸照明装置１４を点灯するモード）とのいずれかにしたがって動作してもよい。検査条件は、第一照明モードまたは第二照明モードの選択を含む。検査条件が照明モードの指定を含むことで、各セルごとに適切な照明モードを選択することが可能となろう。
【0234】
［観点Ａ６］
検査条件は、計数部に適用される計数条件を含んでもよい。ここで、計数条件は、コロニーを検出するための閾値、および、コロニーを検出する際の基準となる色の少なくとも一方を含みうる。たとえば、計数条件は、コロニーとそれ以外とを区別するための閾値（例：検出感度を左右する二値化閾値）、および、コロニーを計数する際の基準となる色（例：前景色、背景色）を含んでもよい。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、検査画像を二値化してコロニーの個数をカウントしてもよい。よって、二値化閾値はコロニーの検出感度を左右する。二値化閾値を適切に設定することで、コロニーの誤検出が減少する。また、コロニーの色と培地の色とを適切に設定することが出来れば、コロニーの誤検出が減少する。各セルごとに計数条件を設定することで、各セルごとにコロニーの誤検出が減少するであろう。また、計数条件に応じて計数アルゴリズムを適切に調整することが可能となろう。
検査条件は、計数部に適用される計数条件を含んでもよい。ここで、計数条件は、コロニーを検出するための閾値、および、コロニーを検出する際の基準となる色の少なくとも一方を含みうる。たとえば、計数条件は、コロニーとそれ以外とを区別するための閾値（例：検出感度を左右する二値化閾値）、および、コロニーを計数する際の基準となる色（例：前景色、背景色）を含んでもよい。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、検査画像を二値化してコロニーの個数をカウントしてもよい。よって、二値化閾値はコロニーの検出感度を左右する。二値化閾値を適切に設定することで、コロニーの誤検出が減少する。また、コロニーの色と培地の色とを適切に設定することが出来れば、コロニーの誤検出が減少する。各セルごとに計数条件を設定することで、各セルごとにコロニーの誤検出が減少するであろう。また、計数条件に応じて計数アルゴリズムを適切に調整することが可能となろう。
【0235】
［観点Ａ７］
計数部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０）は、ユーザにより計数指示が入力されると、対象セルに関連付けられている検査条件にしたがった照明コマンドを照明部に出力してもよい。照明部は、照明コマンドにしたがって検査個体を照明する。撮像部は、照明コマンドにしたがって照明部により照明された検査個体を撮像して検査画像を生成する。計数部は、照明コマンドが反映された検査画像に基づきコロニーの数を計数する。これにより、各セルごとに設定された検査条件が反映された検査画像についてコロニー数を計数することが可能となる。
計数部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０）は、ユーザにより計数指示が入力されると、対象セルに関連付けられている検査条件にしたがった照明コマンドを照明部に出力してもよい。照明部は、照明コマンドにしたがって検査個体を照明する。撮像部は、照明コマンドにしたがって照明部により照明された検査個体を撮像して検査画像を生成する。計数部は、照明コマンドが反映された検査画像に基づきコロニーの数を計数する。これにより、各セルごとに設定された検査条件が反映された検査画像についてコロニー数を計数することが可能となる。
【0236】
［観点Ａ８］
計数部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０）は、特定部により対象セルが第一セルから第二セルに変更されると、取得部に適用される検査条件を、第一セルに関連付けられている第一検査条件から、第二セルに関連付けられている第二検査条件に変更する。このように、対象セルが変更されるとそれに連動して検査条件を変更することが可能となる。各セルごとに、つまり、検査個体ごとに適切な検査条件はことなることがある。予めセルごとに適切な検査条件が設定されていれば、ユーザはセルを選択するだけで適切な検査条件を選択することが可能となろう。
計数部（例：ＭＣＵ２０、ＭＣＵ３０）は、特定部により対象セルが第一セルから第二セルに変更されると、取得部に適用される検査条件を、第一セルに関連付けられている第一検査条件から、第二セルに関連付けられている第二検査条件に変更する。このように、対象セルが変更されるとそれに連動して検査条件を変更することが可能となる。各セルごとに、つまり、検査個体ごとに適切な検査条件はことなることがある。予めセルごとに適切な検査条件が設定されていれば、ユーザはセルを選択するだけで適切な検査条件を選択することが可能となろう。
【0237】
［観点Ａ９］
サンプルＤＢ４０は、カウント表５５，８２の作成を補助するためのデータベースである。ＭＣＵ３０は、データベースにデータを登録する登録部として機能してもよい。カウント表５５、８２は、識別情報セルとカウント結果セルとをそれぞれ含む複数の行要素を有してもよい。登録部（ＭＣＵ３０）は、カウント結果がカウント結果セルに入力されたカウント表８２に含まれる行要素をデータベースに登録するように構成されてもよい。ここで、行要素は、セルと当該セルに関連付けられた検査条件とを含む。表管理部（ＭＣＵ３０）は、データベースに保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素に基づき新規のカウント表を作成してもよい。たとえば、ユーザにより指定された行要素を構成するセルと当該セルに関連付けられている検査条件とが新規のカウント表へコピーされる。また、セルに格納されていたカウント結果は、サンプルＤＢ４０に登録される際に削除されてもよい。このように、予めカウント表の行要素として採用可能な行要素をデータベース化しておくことで、ユーザは、新規のカウント表を容易に作成することができる。
サンプルＤＢ４０は、カウント表５５，８２の作成を補助するためのデータベースである。ＭＣＵ３０は、データベースにデータを登録する登録部として機能してもよい。カウント表５５、８２は、識別情報セルとカウント結果セルとをそれぞれ含む複数の行要素を有してもよい。登録部（ＭＣＵ３０）は、カウント結果がカウント結果セルに入力されたカウント表８２に含まれる行要素をデータベースに登録するように構成されてもよい。ここで、行要素は、セルと当該セルに関連付けられた検査条件とを含む。表管理部（ＭＣＵ３０）は、データベースに保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素に基づき新規のカウント表を作成してもよい。たとえば、ユーザにより指定された行要素を構成するセルと当該セルに関連付けられている検査条件とが新規のカウント表へコピーされる。また、セルに格納されていたカウント結果は、サンプルＤＢ４０に登録される際に削除されてもよい。このように、予めカウント表の行要素として採用可能な行要素をデータベース化しておくことで、ユーザは、新規のカウント表を容易に作成することができる。
【0238】
［観点Ａ１０］
カウント表５５、８２は、複数の列要素を有してもよい。複数の列要素は、それぞれ組み合わせに関連付けられていてもよい。ここで、組み合わせとは、検査個体の培養条件（例：希釈倍率、培養時間）と菌種（例：一般生菌、大腸菌）との組み合わせである。各列要素は、培養条件と菌種との組み合わせが異なっている。たとえば、第一列要素と第二列要素とでは、培養条件と菌種とのうち少なくとも一方が異なっている。これにより、ある検査個体について、様々な培養条件と様々な菌種とから構成される複数の組み合わせそれぞれ対応するセルを一行にまとめることも可能となろう。
カウント表５５、８２は、複数の列要素を有してもよい。複数の列要素は、それぞれ組み合わせに関連付けられていてもよい。ここで、組み合わせとは、検査個体の培養条件（例：希釈倍率、培養時間）と菌種（例：一般生菌、大腸菌）との組み合わせである。各列要素は、培養条件と菌種との組み合わせが異なっている。たとえば、第一列要素と第二列要素とでは、培養条件と菌種とのうち少なくとも一方が異なっている。これにより、ある検査個体について、様々な培養条件と様々な菌種とから構成される複数の組み合わせそれぞれ対応するセルを一行にまとめることも可能となろう。
【0239】
［観点Ａ１１］
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、データベースに保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素（指定行要素）が、新規のカウント表に含まれているか否かを判定してもよい。指定行要素がカウント表に含まれていないと判定された場合、ＭＣＵ３０は、指定行要素が、カウント表に含まれていない新規の列要素のセルを含むか否かを判定してもよい。指定行要素が新規の列要素のセルを含むと判定された場合、ＭＣＵ３０は、当該新規の列要素を新規のカウント表に追加する。一方、指定行要素がカウント表にすでに含まれているか、または、指定行要素が新規の列要素のセルを含まない場合、当該列要素はカウント表に追加されない。これにより、テーブル表における行要素の重複と列要素の重複が抑制され、テーブル表のコンパクト化が実現されよう。
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、データベースに保持されている複数の行要素のうちユーザにより指定された行要素（指定行要素）が、新規のカウント表に含まれているか否かを判定してもよい。指定行要素がカウント表に含まれていないと判定された場合、ＭＣＵ３０は、指定行要素が、カウント表に含まれていない新規の列要素のセルを含むか否かを判定してもよい。指定行要素が新規の列要素のセルを含むと判定された場合、ＭＣＵ３０は、当該新規の列要素を新規のカウント表に追加する。一方、指定行要素がカウント表にすでに含まれているか、または、指定行要素が新規の列要素のセルを含まない場合、当該列要素はカウント表に追加されない。これにより、テーブル表における行要素の重複と列要素の重複が抑制され、テーブル表のコンパクト化が実現されよう。
【0240】
［観点Ａ１２、１３］
データベースは、親子関係を定義された複数の行要素を含んでもよい。親子関係は、完成品を親とし、当該完成品を構成する具材を子とする関係であってもよい。商品全体（完成品）の培養結果におけるコロニーのカウントと、商品を構成する個別の具材の培養結果におけるコロニーのカウントとが必要なケースがある。よって、親子関係をあらかじめ定義しておくことで、カウント表を作成する際のユーザ工数が削減される。たとえば、ある完成品（例：サンドイッチ）が選択されたときに、その具材（例：ハム、レタス）が選択可能に提示されてもよい。
データベースは、親子関係を定義された複数の行要素を含んでもよい。親子関係は、完成品を親とし、当該完成品を構成する具材を子とする関係であってもよい。商品全体（完成品）の培養結果におけるコロニーのカウントと、商品を構成する個別の具材の培養結果におけるコロニーのカウントとが必要なケースがある。よって、親子関係をあらかじめ定義しておくことで、カウント表を作成する際のユーザ工数が削減される。たとえば、ある完成品（例：サンドイッチ）が選択されたときに、その具材（例：ハム、レタス）が選択可能に提示されてもよい。
【0241】
［観点Ａ１４］
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、親子関係を定義された複数の行要素を一括して新規のカウント表に追加してもよい。これにより、カウント表を作成する際のユーザの負担がさらに軽減されるであろう。
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、親子関係を定義された複数の行要素を一括して新規のカウント表に追加してもよい。これにより、カウント表を作成する際のユーザの負担がさらに軽減されるであろう。
【0242】
［観点Ａ１５］
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、統計処理の適用が指示されると、同一の検査個体をそれぞれ培養するｎ個の培養器の各カウント結果を格納するｎ個の行要素と、当該ｎ個の行要素の統計処理結果を格納する少なくとも１個の行要素と、を含むようにカウント表を作成してもよい。図１１によれば、ｎ＝２の事例が説明されている。ｎは３以上であってもよい。これにより、平均化等の統計処理を実行するカウント表の作成が容易になろう。
表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、統計処理の適用が指示されると、同一の検査個体をそれぞれ培養するｎ個の培養器の各カウント結果を格納するｎ個の行要素と、当該ｎ個の行要素の統計処理結果を格納する少なくとも１個の行要素と、を含むようにカウント表を作成してもよい。図１１によれば、ｎ＝２の事例が説明されている。ｎは３以上であってもよい。これにより、平均化等の統計処理を実行するカウント表の作成が容易になろう。
【0243】
［観点Ａ１６］
図１６などが例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、表示装置３７に、検査画像とカウント表とを並べて（同時並行的に）表示させてもよい。セル特定部（例：ＭＣＵ３０）は、表示装置３７に検査画像とともに表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、ユーザの選択にしたがって対象セルを特定してもよい。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数部により計数されたコロニーの数が対象セルに反映されたカウント表を、検査画像とともに表示装置に表示させてもよい。これにより、カウント結果を格納されるセルが容易に選択可能となろう。
図１６などが例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、表示装置３７に、検査画像とカウント表とを並べて（同時並行的に）表示させてもよい。セル特定部（例：ＭＣＵ３０）は、表示装置３７に検査画像とともに表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、ユーザの選択にしたがって対象セルを特定してもよい。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数部により計数されたコロニーの数が対象セルに反映されたカウント表を、検査画像とともに表示装置に表示させてもよい。これにより、カウント結果を格納されるセルが容易に選択可能となろう。
【0244】
［観点Ａ１７］
図２５が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、対象セルに関連付けられる検査条件に含まれる照明条件を設定するための第一コントロールオブジェクト（例：タブ１２３）と、当該検査条件に含まれる計数条件を設定するための第二コントロールオブジェクト（例：タブ１２４）と、を表示装置３７に表示してもよい。これにより、セルに関連付けられている検査条件を容易に変更することが可能となろう。さらに、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第一コントロールオブジェクト（例：タブ１２３）に対するユーザ操作を検知すると、照明条件を設定するための設定画面（例：確認画面１１０）を表示装置に表示してもよい。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第二コントロールオブジェクト（例：タブ１２４）に対するユーザ操作を検知すると、計数条件を設定するための設定画面（例：設定画面１２０）を表示装置に表示してもよい。
図２５が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、対象セルに関連付けられる検査条件に含まれる照明条件を設定するための第一コントロールオブジェクト（例：タブ１２３）と、当該検査条件に含まれる計数条件を設定するための第二コントロールオブジェクト（例：タブ１２４）と、を表示装置３７に表示してもよい。これにより、セルに関連付けられている検査条件を容易に変更することが可能となろう。さらに、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第一コントロールオブジェクト（例：タブ１２３）に対するユーザ操作を検知すると、照明条件を設定するための設定画面（例：確認画面１１０）を表示装置に表示してもよい。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第二コントロールオブジェクト（例：タブ１２４）に対するユーザ操作を検知すると、計数条件を設定するための設定画面（例：設定画面１２０）を表示装置に表示してもよい。
【0245】
［観点Ａ１８］
表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数部に計数を指示するための第三コントロールオブジェクト（例：第一ソフトウエアボタン１０５ａ）と、カウント結果を対象セルに登録することを指示するための第四コントロールオブジェクト（例：第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）と、を表示装置３７に表示してもよい。これによりユーザは容易にカウントの指示とカウント結果の登録とを指示することが可能となろう。
表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数部に計数を指示するための第三コントロールオブジェクト（例：第一ソフトウエアボタン１０５ａ）と、カウント結果を対象セルに登録することを指示するための第四コントロールオブジェクト（例：第二ソフトウエアボタン１０５ｂ）と、を表示装置３７に表示してもよい。これによりユーザは容易にカウントの指示とカウント結果の登録とを指示することが可能となろう。
【0246】
［観点Ａ１９］
表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第三コントロールオブジェクトに対するユーザ操作を検知すると、当該第三コントロールオブジェクトを、計数を指示するためのコントロールオブジェクト（例：カウントボタン）から、取得部に検査画像の取得を指示するためのコントロールオブジェクト（例：撮影ボタン、撮りなおしボタン）に割り当ててもよい。つまり、ＭＣＵ３０は、第三コントロールオブジェクトを操作することで発行されるコマンドを、計数を指示するためのコマンドから、検査画像の取得を指示するためのコマンドに変更してもよい。これにより、操作可能なボタンの数が削減され、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。
表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第三コントロールオブジェクトに対するユーザ操作を検知すると、当該第三コントロールオブジェクトを、計数を指示するためのコントロールオブジェクト（例：カウントボタン）から、取得部に検査画像の取得を指示するためのコントロールオブジェクト（例：撮影ボタン、撮りなおしボタン）に割り当ててもよい。つまり、ＭＣＵ３０は、第三コントロールオブジェクトを操作することで発行されるコマンドを、計数を指示するためのコマンドから、検査画像の取得を指示するためのコマンドに変更してもよい。これにより、操作可能なボタンの数が削減され、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。
【0247】
［観点Ａ２０］
図１８が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第三コントロールオブジェクトが計数を指示するためのコントロールオブジェクト（例：カウントボタン）に割り当てられているときは、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）を表示してもよい。図１９が例示すように、計数を指示するためのコントロールオブジェクトに割り当てられている第三コントロールオブジェクトが操作されると、計数結果が取得される。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数結果が取得されると、第三コントロールオブジェクトが取得部に検査画像の取得を指示するためのコントロールオブジェクト（例：撮影ボタン）に割り当てられ、かつ、ユーザ操作を受け付けるように第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）を変更してもよい。つまり、第三コントロールオブジェクトに対して計数を指示するためのコマンドが割り当てられているときは、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクトが表示されてもよい。さらに、計数を指示するためのコマンドが割り当てられている第三コントロールオブジェクトが操作されて、カウント結果が取得されると、第三コントロールオブジェクトに対して、取得部に検査画像の取得を指示するためのコマンドが割り当てられ、かつ、ユーザ操作を受け付けるように、第四コントロールオブジェクトの表示が変更されてもよい。これにより、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。
図１８が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第三コントロールオブジェクトが計数を指示するためのコントロールオブジェクト（例：カウントボタン）に割り当てられているときは、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）を表示してもよい。図１９が例示すように、計数を指示するためのコントロールオブジェクトに割り当てられている第三コントロールオブジェクトが操作されると、計数結果が取得される。表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、計数結果が取得されると、第三コントロールオブジェクトが取得部に検査画像の取得を指示するためのコントロールオブジェクト（例：撮影ボタン）に割り当てられ、かつ、ユーザ操作を受け付けるように第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）を変更してもよい。つまり、第三コントロールオブジェクトに対して計数を指示するためのコマンドが割り当てられているときは、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクトが表示されてもよい。さらに、計数を指示するためのコマンドが割り当てられている第三コントロールオブジェクトが操作されて、カウント結果が取得されると、第三コントロールオブジェクトに対して、取得部に検査画像の取得を指示するためのコマンドが割り当てられ、かつ、ユーザ操作を受け付けるように、第四コントロールオブジェクトの表示が変更されてもよい。これにより、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。
【0248】
［観点Ａ２１］
図１９，図２０などが例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）が操作されると、カウント結果を対象セルに登録し、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクトを再び変更してもよい。ここで、セル特定部は、対象セルを次のセルに変更する。図２０および図１８が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、取得部に検査画像の取得を指示するためのコマンドが割り当てられた第三コントロールオブジェクト（例：撮影ボタン）が操作されると、取得部に検査画像を取得させ、計数を指示するためのコマンドが第三コントロールオブジェクト（例：カウントボタン）に割り当てられてもよい。これにより、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。
図１９，図２０などが例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、第四コントロールオブジェクト（例：登録ボタン）が操作されると、カウント結果を対象セルに登録し、ユーザ操作を受け付けないように第四コントロールオブジェクトを再び変更してもよい。ここで、セル特定部は、対象セルを次のセルに変更する。図２０および図１８が例示するように、表示制御部（例：ＭＣＵ３０）は、取得部に検査画像の取得を指示するためのコマンドが割り当てられた第三コントロールオブジェクト（例：撮影ボタン）が操作されると、取得部に検査画像を取得させ、計数を指示するためのコマンドが第三コントロールオブジェクト（例：カウントボタン）に割り当てられてもよい。これにより、ユーザは、今、何を操作すべきかを容易に判断できるであろう。
【0249】
［観点Ａ２２］
ヘッド装置１は、たとえば、コロニー計数装置の筐体に設けられた第一ハードウエアボタンおよび第二ハードウエアボタンをさらに有してもよい。第一ハードウエアボタンと第三コントロールオブジェクトには同一の機能が割り当てられ、第二ハードウエアボタンと第四コントロールオブジェクトには同一の機能が割り当てられてもよい。これにより、ハードウエアボタンとソフトウエアボタンとを連携させることが可能となろう。ユーザが、ヘッド装置１にセットされたシャーレ１５に注視している場合、ヘッド装置１のハードウエアボタンにより指示を入力することが可能となる。つまり、ユーザは、ＰＣ１ｂの表示装置３７に視線を移し、かつ、ポインティングデバイス３３を操作することなく、簡単に指示を入力できるようになろう。その一方で、ユーザが、ＰＣ１ｂに表示された検査画像に注視している場合、ハードウエアボタンに視線を移し、それを押すことは、作業効率を低下させるだろう。よって、この場合、表示装置３７にソフトウエアボタンを表示することで、ユーザは簡単かつ正確にボタンを操作できるようになろう。
ヘッド装置１は、たとえば、コロニー計数装置の筐体に設けられた第一ハードウエアボタンおよび第二ハードウエアボタンをさらに有してもよい。第一ハードウエアボタンと第三コントロールオブジェクトには同一の機能が割り当てられ、第二ハードウエアボタンと第四コントロールオブジェクトには同一の機能が割り当てられてもよい。これにより、ハードウエアボタンとソフトウエアボタンとを連携させることが可能となろう。ユーザが、ヘッド装置１にセットされたシャーレ１５に注視している場合、ヘッド装置１のハードウエアボタンにより指示を入力することが可能となる。つまり、ユーザは、ＰＣ１ｂの表示装置３７に視線を移し、かつ、ポインティングデバイス３３を操作することなく、簡単に指示を入力できるようになろう。その一方で、ユーザが、ＰＣ１ｂに表示された検査画像に注視している場合、ハードウエアボタンに視線を移し、それを押すことは、作業効率を低下させるだろう。よって、この場合、表示装置３７にソフトウエアボタンを表示することで、ユーザは簡単かつ正確にボタンを操作できるようになろう。
【0250】
［観点Ａ２３］
アプリケーションプログラム３９は、コロニー計数装置を制御する制御装置において実行されるプログラムの一例である。アプリケーションプログラム３９は、ＰＣ１ｂに、
複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶部に記憶させ、
記憶部に記憶されているカウント表を表示装置に表示させ、
表示装置に表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定させ、
検査個体の画像である検査画像を取得させ、
ユーザにより入力される計数指示にしたがって、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーの数を取得させ、
コロニーの数を対象セルに反映させる。
アプリケーションプログラム３９は、コロニー計数装置を制御する制御装置において実行されるプログラムの一例である。アプリケーションプログラム３９は、ＰＣ１ｂに、
複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶部に記憶させ、
記憶部に記憶されているカウント表を表示装置に表示させ、
表示装置に表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定させ、
検査個体の画像である検査画像を取得させ、
ユーザにより入力される計数指示にしたがって、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーの数を取得させ、
コロニーの数を対象セルに反映させる。
【0251】
［観点Ａ２４］
上記の実施例によれば、コロニー計数装置１を制御する制御方法が提供される。当該制御方法は、
複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶部に記憶させることと、
記憶部に記憶されているカウント表を表示装置に表示することと、
表示装置に表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定することと、
検査個体の画像である検査画像を取得することと、
ユーザにより入力される計数指示にしたがって、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数することと、
計数されたコロニーの数を対象セルに反映させることと、
を有する。
上記の実施例によれば、コロニー計数装置１を制御する制御方法が提供される。当該制御方法は、
複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表を記憶部に記憶させることと、
記憶部に記憶されているカウント表を表示装置に表示することと、
表示装置に表示されるカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定することと、
検査個体の画像である検査画像を取得することと、
ユーザにより入力される計数指示にしたがって、取得部で取得された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数することと、
計数されたコロニーの数を対象セルに反映させることと、
を有する。
【0252】
［観点Ｂ１］
記憶装置３５は、検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶する記憶部として機能する。ＭＣＵ３０およびＭＣＵ２０は、識別情報を符号化した識別画像（例：一次元シンボル、二次元シンボル）から当該識別情報を取得する識別情報取得部として機能する。ＭＣＵ３０は、取得部により取得された識別情報に関連付けられているカウント表を記憶部から読み出す表管理部として機能する。さらに、ＭＣＵ３０は、表管理部で読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定するセル特定部として機能する。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、ユーザの操作にしたがった計数指示を生成する計数指示部として機能する。メインカメラ１１は、計数指示部で生成された計数指示に基づいて検査個体の画像である検査画像を生成する第一撮像部として機能する。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、前記第一撮像部で生成された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数する計数部として機能する。表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、セル特定部で特定された対象セルに、計数部により計数されたコロニーの数を反映するように構成されている。このように、識別画像から、カウント結果を入力されることになるカウント表が特定されて表示されるため、コロニーの計数に関するユーザの負担が軽減される。
記憶装置３５は、検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶する記憶部として機能する。ＭＣＵ３０およびＭＣＵ２０は、識別情報を符号化した識別画像（例：一次元シンボル、二次元シンボル）から当該識別情報を取得する識別情報取得部として機能する。ＭＣＵ３０は、取得部により取得された識別情報に関連付けられているカウント表を記憶部から読み出す表管理部として機能する。さらに、ＭＣＵ３０は、表管理部で読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定するセル特定部として機能する。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、ユーザの操作にしたがった計数指示を生成する計数指示部として機能する。メインカメラ１１は、計数指示部で生成された計数指示に基づいて検査個体の画像である検査画像を生成する第一撮像部として機能する。ＭＣＵ２０またはＭＣＵ３０は、前記第一撮像部で生成された検査画像に基づき検査個体に含まれるコロニーを計数する計数部として機能する。表管理部（例：ＭＣＵ３０）は、セル特定部で特定された対象セルに、計数部により計数されたコロニーの数を反映するように構成されている。このように、識別画像から、カウント結果を入力されることになるカウント表が特定されて表示されるため、コロニーの計数に関するユーザの負担が軽減される。
【0253】
［観点Ｂ２］
識別情報取得部は、第一撮像部（例：メインカメラ１１）により撮像された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。このように、検査個体を撮像する撮像部を、識別画像を撮像する撮像部として兼用してもよい。
識別情報取得部は、第一撮像部（例：メインカメラ１１）により撮像された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。このように、検査個体を撮像する撮像部を、識別画像を撮像する撮像部として兼用してもよい。
【0254】
［観点Ｂ３］
識別情報取得部は第二撮像部を有してもよい。フロントカメラ１０は、識別画像を撮像する第二撮像部の一例である。識別情報取得部（例：ＭＣＵ２０，３０）は、第二撮像部により撮像された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。
識別情報取得部は第二撮像部を有してもよい。フロントカメラ１０は、識別画像を撮像する第二撮像部の一例である。識別情報取得部（例：ＭＣＵ２０，３０）は、第二撮像部により撮像された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。
【0255】
［観点Ｂ４］
第二撮像部（例：フロントカメラ１０）は、検査個体の外観、包装体（例：包装袋、商品パッケージ）により包装された検査個体の外観、および、当該包装体に印刷された情報のうちの少なくとも一つである付加画像を撮像するように構成されていてもよい。記憶部（例：記憶装置３５）は、対象セルに対して、付加画像と、当該付加画像から取得される付加情報とのうちの少なくとも一方を関連付けて記憶してもよい。上述されたように、カウント表は、カウント結果が入力されるセルと、画像等を格納可能なセル（例：備考セル、自由列のセル）を有してもよい。この場合、後者のセルには、付加画像（例：商品外観）や付加情報（例：商品コード）が格納されるか、関連付けられてもよい。ユーザは、対象セルに関連付けられて記憶されている付加情報または付加画像を参照することで、どの検査個体についてのカウント結果であるかを、容易に把握できるようになろう。
第二撮像部（例：フロントカメラ１０）は、検査個体の外観、包装体（例：包装袋、商品パッケージ）により包装された検査個体の外観、および、当該包装体に印刷された情報のうちの少なくとも一つである付加画像を撮像するように構成されていてもよい。記憶部（例：記憶装置３５）は、対象セルに対して、付加画像と、当該付加画像から取得される付加情報とのうちの少なくとも一方を関連付けて記憶してもよい。上述されたように、カウント表は、カウント結果が入力されるセルと、画像等を格納可能なセル（例：備考セル、自由列のセル）を有してもよい。この場合、後者のセルには、付加画像（例：商品外観）や付加情報（例：商品コード）が格納されるか、関連付けられてもよい。ユーザは、対象セルに関連付けられて記憶されている付加情報または付加画像を参照することで、どの検査個体についてのカウント結果であるかを、容易に把握できるようになろう。
【0256】
［観点Ｂ５］
カウント表は、付加画像と付加情報とのうちの少なくとも一方を保持する付加セル（例：備考セル、自由列のセル）を含んでもよい。ユーザは、付加セルに保持されている付加情報または付加画像を参照することで、どの検査個体についてのカウント結果であるかを、容易に把握できるようになろう。
カウント表は、付加画像と付加情報とのうちの少なくとも一方を保持する付加セル（例：備考セル、自由列のセル）を含んでもよい。ユーザは、付加セルに保持されている付加情報または付加画像を参照することで、どの検査個体についてのカウント結果であるかを、容易に把握できるようになろう。
【0257】
［観点Ｂ６］
図２９や図４０が示すように、ＭＣＵ３０およびポインタ５７は、カウント表に存在する複数の付加セルから一つの付加セルを選択する選択部として機能してもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、選択部により選択された一つの付加セルに、付加画像と付加情報とのうちの少なくとも一方を登録する付加情報登録部として機能してもよい。これにより、ユーザは、カウント表において希望するセルに対して付加画像や付加情報を登録することができる。
図２９や図４０が示すように、ＭＣＵ３０およびポインタ５７は、カウント表に存在する複数の付加セルから一つの付加セルを選択する選択部として機能してもよい。さらに、ＭＣＵ３０は、選択部により選択された一つの付加セルに、付加画像と付加情報とのうちの少なくとも一方を登録する付加情報登録部として機能してもよい。これにより、ユーザは、カウント表において希望するセルに対して付加画像や付加情報を登録することができる。
【0258】
［観点Ｂ７］
ＭＣＵ３０は、対象セルに関連付けられている検査個体の識別情報（例：サンプル名、シャーレ番号）を入手する入手部として機能してもよい。記憶部は、ユーザにより入力される計数指示により第一撮像部により撮像された検査個体の検査画像を検査個体の識別情報と関連付けて記憶するように構成されていてもよい。従来、検査画像と検査個体との関係を正しく記録することは多くの工数が必要であった。たとえば、デジタルカメラで検査画像を取得することが考えられるが、この場合、検査画像と検査個体の識別情報とを人手による紐づけすること必要となるだろう。また、人手による紐づけは、ヒューマンエラーの原因となる。本実施例では、ＭＣＵ３０が対象セルを特定し、かつ、対象セルに関連付けられている検査個体の識別情報に対して検査個体の検査画像を関連付ける。よって、従来によりユーザに必要とされる項数が削減され、かつ、検査個体の検査画像と検査個体の識別情報との関係を正しく記録することが可能となる。
ＭＣＵ３０は、対象セルに関連付けられている検査個体の識別情報（例：サンプル名、シャーレ番号）を入手する入手部として機能してもよい。記憶部は、ユーザにより入力される計数指示により第一撮像部により撮像された検査個体の検査画像を検査個体の識別情報と関連付けて記憶するように構成されていてもよい。従来、検査画像と検査個体との関係を正しく記録することは多くの工数が必要であった。たとえば、デジタルカメラで検査画像を取得することが考えられるが、この場合、検査画像と検査個体の識別情報とを人手による紐づけすること必要となるだろう。また、人手による紐づけは、ヒューマンエラーの原因となる。本実施例では、ＭＣＵ３０が対象セルを特定し、かつ、対象セルに関連付けられている検査個体の識別情報に対して検査個体の検査画像を関連付ける。よって、従来によりユーザに必要とされる項数が削減され、かつ、検査個体の検査画像と検査個体の識別情報との関係を正しく記録することが可能となる。
【0259】
［観点Ｂ８］
図３３が例示するように、ＭＣＵ３０は、検査個体の識別情報と、計数部により計数されたコロニーの数と、検査個体の検査画像と、を含むレポートを生成するレポート生成部として機能してもよい。これにより、ユーザは、どのサンプルの計測結果であるかを直感的に把握できるようになろう。
図３３が例示するように、ＭＣＵ３０は、検査個体の識別情報と、計数部により計数されたコロニーの数と、検査個体の検査画像と、を含むレポートを生成するレポート生成部として機能してもよい。これにより、ユーザは、どのサンプルの計測結果であるかを直感的に把握できるようになろう。
【0260】
［観点Ｂ９］
カウント表においてコロニーの数を入力されるセルには固有のセル識別情報が付与されていてもよい。図４１が示すように、ＭＣＵ３０は、固有のセル識別情報を符号化した識別画像２２１をプリンタ３８によりシール２７０（粘着面を有する樹脂または紙）に印刷してもよい。ユーザは、シャーレ１５の側面にシール２７０を貼り付ける。なお、シャーレ番号は、固有のセル識別情報として利用されてもよい。識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、セル識別情報を取得するように構成されていてもよい。セル特定部（例：ＭＣＵ３０）は、識別情報取得部により取得されたセル識別情報に基づき対象セルを特定してもよい。これにより、ユーザが対象セルを指定する手間が省けるようになる。さらに、検査個体に対応した対象セルが正確に特定されるようになろう。
カウント表においてコロニーの数を入力されるセルには固有のセル識別情報が付与されていてもよい。図４１が示すように、ＭＣＵ３０は、固有のセル識別情報を符号化した識別画像２２１をプリンタ３８によりシール２７０（粘着面を有する樹脂または紙）に印刷してもよい。ユーザは、シャーレ１５の側面にシール２７０を貼り付ける。なお、シャーレ番号は、固有のセル識別情報として利用されてもよい。識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、セル識別情報を取得するように構成されていてもよい。セル特定部（例：ＭＣＵ３０）は、識別情報取得部により取得されたセル識別情報に基づき対象セルを特定してもよい。これにより、ユーザが対象セルを指定する手間が省けるようになる。さらに、検査個体に対応した対象セルが正確に特定されるようになろう。
【0261】
［観点Ｂ１０］
図２８が示すように、識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０）は、第一撮像部または第二撮像部によりユーザ認証情報を取得してもよい。これにより、ユーザ認証用の専用のカメラやコードリーダーを省略できるようになろう。
図２８が示すように、識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０）は、第一撮像部または第二撮像部によりユーザ認証情報を取得してもよい。これにより、ユーザ認証用の専用のカメラやコードリーダーを省略できるようになろう。
【0262】
［観点Ｂ１１］
図２７が例示するように、識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、印刷媒体（例：検査リスト２２０）に印刷された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。
図２７が例示するように、識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、印刷媒体（例：検査リスト２２０）に印刷された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。
【0263】
［観点Ｂ１２］
ＭＣＵ３０は、カウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報とを含む検査リストのデータを作成するデータ作成部として機能してもよい。
ＭＣＵ３０は、カウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報とを含む検査リストのデータを作成するデータ作成部として機能してもよい。
【0264】
［観点Ｂ１３］
識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、端末装置１ｃに表示された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。これにより、紙媒体を削減することが可能となる。
識別情報取得部（例：ＭＣＵ３０、フロントカメラ１０またはメインカメラ１１）は、端末装置１ｃに表示された識別画像から識別情報を取得するように構成されていてもよい。これにより、紙媒体を削減することが可能となる。
【0265】
［観点Ｂ１４］
通信回路３４は、端末装置１ｃと通信し、端末装置１ｃに識別画像を送信する通信部の一例である。
通信回路３４は、端末装置１ｃと通信し、端末装置１ｃに識別画像を送信する通信部の一例である。
【0266】
［観点Ｂ１５］
ＭＣＵ３０は、ユーザ操作に応じてカウント表を作成し、記憶部に当該カウント表を記憶させる作成部として機能してもよい。
ＭＣＵ３０は、ユーザ操作に応じてカウント表を作成し、記憶部に当該カウント表を記憶させる作成部として機能してもよい。
【0267】
［観点Ｂ１６］
作成部（例：ＭＣＵ３０）は、コロニーの数のカウント結果を格納するセルに対して検査条件を関連付けてもよい。第一撮像部は、検査条件（例：露光時間、照明の種類、明るさ）にしたがって検査個体を撮像するように構成されていてもよい。
作成部（例：ＭＣＵ３０）は、コロニーの数のカウント結果を格納するセルに対して検査条件を関連付けてもよい。第一撮像部は、検査条件（例：露光時間、照明の種類、明るさ）にしたがって検査個体を撮像するように構成されていてもよい。
【0268】
［観点Ｂ１７］
コロニー計数装置１は、第一撮像部を有する筐体（例：上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４）をさらに有してもよい。
コロニー計数装置１は、第一撮像部を有する筐体（例：上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４）をさらに有してもよい。
【0269】
筐体は、検査個体を収容したシャーレ１５を保持するステージ５と、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、ユーザにより入力される計数指示を受け付ける受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）と、を有してもよい。
【0270】
［観点Ｂ１８］
コロニー計数装置１は、第一撮像部および第二撮像部を有する筐体（例：上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４）をさらに有してもよい。筐体は、検査個体を収容したシャーレ１５を保持するステージ５と、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、ユーザにより入力される計数指示を受け付ける受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）とを有してもよい。さらに、筐体は、凹部４ａを有してもよい。第二撮像部（例：フロントカメラ１０）は、凹部に配置されていてもよい。受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）は、ステージと凹部との間にある操作部（操作部８）に配置されていてもよい。これにより、簡単に、計数指示を入力することが可能となる。
コロニー計数装置１は、第一撮像部および第二撮像部を有する筐体（例：上部ユニット２、支持ユニット３および下部ユニット４）をさらに有してもよい。筐体は、検査個体を収容したシャーレ１５を保持するステージ５と、検査個体を照明する照明部（例：リング照明装置１２、１３、同軸照明装置１４）と、ユーザにより入力される計数指示を受け付ける受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）とを有してもよい。さらに、筐体は、凹部４ａを有してもよい。第二撮像部（例：フロントカメラ１０）は、凹部に配置されていてもよい。受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）は、ステージと凹部との間にある操作部（操作部８）に配置されていてもよい。これにより、簡単に、計数指示を入力することが可能となる。
【0271】
［観点Ｂ１９］
コロニー計数装置１が第一状態にあるときに受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）が撮像指示を受け付けると、第一撮像部が撮像を実行してもよい。コロニー計数装置１が第一状態と異なる第二状態にあるときに受付部が撮像指示を受け付けると、第二撮像部が撮像を実行してもよい。これにより、単一の受付部に対する同一の操作であるにも拘らず、異なる撮像部に撮像を指示することが可能となる。第一状態とは、たとえば、カウント表がすでに特定された状態である。第二状態とは、たとえば、カウント表がまだ特定されていない状態である。
コロニー計数装置１が第一状態にあるときに受付部（例：第一ハードウエアボタン８ａ）が撮像指示を受け付けると、第一撮像部が撮像を実行してもよい。コロニー計数装置１が第一状態と異なる第二状態にあるときに受付部が撮像指示を受け付けると、第二撮像部が撮像を実行してもよい。これにより、単一の受付部に対する同一の操作であるにも拘らず、異なる撮像部に撮像を指示することが可能となる。第一状態とは、たとえば、カウント表がすでに特定された状態である。第二状態とは、たとえば、カウント表がまだ特定されていない状態である。
【0272】
［観点Ｂ２０］
コロニー計数装置を制御するプロセッサにおいて実行されるプログラムであって、プロセッサに、
検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶部に記憶させ、
前記識別情報を符号化した識別画像から当該識別情報を取得させ、
前記取得された前記識別情報に関連付けられている前記カウント表を前記記憶部から読み出させ、
前記読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定させ、
ユーザの操作にしたがった計数指示を生成させ、
前記生成された計数指示に基づき前記検査個体の画像である検査画像を生成させ、
前記生成された検査画像に基づき前記検査個体に含まれるコロニーを計数させ、
前記特定された対象セルに、前記計数されたコロニーの数を反映させる。
コロニー計数装置を制御するプロセッサにおいて実行されるプログラムであって、プロセッサに、
検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶部に記憶させ、
前記識別情報を符号化した識別画像から当該識別情報を取得させ、
前記取得された前記識別情報に関連付けられている前記カウント表を前記記憶部から読み出させ、
前記読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定させ、
ユーザの操作にしたがった計数指示を生成させ、
前記生成された計数指示に基づき前記検査個体の画像である検査画像を生成させ、
前記生成された検査画像に基づき前記検査個体に含まれるコロニーを計数させ、
前記特定された対象セルに、前記計数されたコロニーの数を反映させる。
【0273】
［観点Ｂ２３］
コロニー計数装置を制御するプロセッサにおいて実行される制御方法であって、
検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶部に記憶することと、
識別情報を符号化した識別画像から当該識別情報を取得することと、
前記取得された前記識別情報に関連付けられている前記カウント表を前記記憶部から読み出すことと、
前記読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定することと、
ユーザの操作にしたがった計数指示を生成することと、
前記生成された計数指示に基づき、前記検査個体の画像である検査画像を生成することと、
前記生成された検査画像に基づき前記検査個体に含まれるコロニーを計数することと、
前記特定された対象セルに、前記計数されたコロニーの数を反映することと、
を有する。
コロニー計数装置を制御するプロセッサにおいて実行される制御方法であって、
検査個体についてのコロニーのカウント結果が入力されるセルを含むカウント表と、当該カウント表に関連付けられた識別情報と、を記憶部に記憶することと、
識別情報を符号化した識別画像から当該識別情報を取得することと、
前記取得された前記識別情報に関連付けられている前記カウント表を前記記憶部から読み出すことと、
前記読み出されたカウント表に含まれる複数のセルの中から、カウント結果が入力される対象セルを特定することと、
ユーザの操作にしたがった計数指示を生成することと、
前記生成された計数指示に基づき、前記検査個体の画像である検査画像を生成することと、
前記生成された検査画像に基づき前記検査個体に含まれるコロニーを計数することと、
前記特定された対象セルに、前記計数されたコロニーの数を反映することと、
を有する。
【0274】
［観点Ｃ１］
メインカメラ１１は、検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成する撮像部として機能する。ＭＣＵ２０，３０は、撮像部により生成された初期状態の検査個体の画像を基準画像１０３ｂとして登録する登録部として機能する。ＭＣＵ２０，３０は、登録部により登録された基準画像１０３ｂに含まれる残渣を特定するとともに、基準画像１０３ｂと、撮像部により生成された培養後の検査個体の画像である検査画像１０３ａとにおける二以上の共通の特徴箇所（例：目印１５ｃ、１５ｇ、１５ｆ）の各々のズレに基づいて、基準画像１０３ｂに含まれる残渣に対応する検査画像１０３ａにおける残渣の位置を特定する残渣特定部として機能する。ＭＣＵ２０，３０は、残渣特定部により特定される残渣の位置に基づいて、残渣をコロニーとしての計数からは除外して検査画像１０３ａに含まれるコロニーの個数を計数する計数部として機能する。これにより、コロニーの計数精度が向上する。
メインカメラ１１は、検査個体を撮像して当該検査個体の画像を生成する撮像部として機能する。ＭＣＵ２０，３０は、撮像部により生成された初期状態の検査個体の画像を基準画像１０３ｂとして登録する登録部として機能する。ＭＣＵ２０，３０は、登録部により登録された基準画像１０３ｂに含まれる残渣を特定するとともに、基準画像１０３ｂと、撮像部により生成された培養後の検査個体の画像である検査画像１０３ａとにおける二以上の共通の特徴箇所（例：目印１５ｃ、１５ｇ、１５ｆ）の各々のズレに基づいて、基準画像１０３ｂに含まれる残渣に対応する検査画像１０３ａにおける残渣の位置を特定する残渣特定部として機能する。ＭＣＵ２０，３０は、残渣特定部により特定される残渣の位置に基づいて、残渣をコロニーとしての計数からは除外して検査画像１０３ａに含まれるコロニーの個数を計数する計数部として機能する。これにより、コロニーの計数精度が向上する。
【0275】
なお、表示装置３７は、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとのうち少なくとも一方を表示する表示部として機能する。ＭＣＵ２０、３０は、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所（例：目印１５ｃ、１５ｇ、１５ｆ）を特定する特徴箇所特定部の一例である。ＭＣＵ２０、３０は、二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせし、基準画像１０３ｂに含まれず、かつ、検査画像１０３ａに含まれているコロニーの個数を計数する計数部として機能する。つまり、ＭＣＵ２０、３０は、基準画像と検査画像とから二以上の共通の特徴箇所を特定し、特定された二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像の位置および回転角度と検査画像の位置および回転角度とを位置合わせし、当該位置合わせ後の検査画像と、基準画像に含まれる残渣の位置と、に基づいて、検査画像に含まれる残渣とコロニーとのうち少なくとも一つの残渣を除外して当該コロニーの個数を計数する計数部として機能してもよい。
【0276】
［観点Ｃ２］
記憶装置３５は、登録部により基準画像１０３ｂを登録する際に、基準画像１０３ｂと、基準画像１０３ｂが示す検査個体の識別情報とを関連付けて記憶する記憶部として機能する。ＭＣＵ３０、キーボード３２、ポインティングデバイス３３、メインカメラ１１およびフロントカメラ１０は、登録部により登録された基準画像１０３ｂを読み出すための検査個体の識別情報の入力を受け付ける受付部として機能する。残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、受付部により受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている基準画像１０３ｂに含まれる残渣に対応する検査画像１０３ａにおける残渣の位置を特定してもよい。このように、検査個体の識別情報を用いることで、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとを簡単に関連付けることができる。つまり、検査個体の識別情報を用いることで、基準画像１０３ｂの撮影と検査画像１０３ａの撮影とを簡単に関連付けることができる。
記憶装置３５は、登録部により基準画像１０３ｂを登録する際に、基準画像１０３ｂと、基準画像１０３ｂが示す検査個体の識別情報とを関連付けて記憶する記憶部として機能する。ＭＣＵ３０、キーボード３２、ポインティングデバイス３３、メインカメラ１１およびフロントカメラ１０は、登録部により登録された基準画像１０３ｂを読み出すための検査個体の識別情報の入力を受け付ける受付部として機能する。残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、受付部により受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている基準画像１０３ｂに含まれる残渣に対応する検査画像１０３ａにおける残渣の位置を特定してもよい。このように、検査個体の識別情報を用いることで、基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとを簡単に関連付けることができる。つまり、検査個体の識別情報を用いることで、基準画像１０３ｂの撮影と検査画像１０３ａの撮影とを簡単に関連付けることができる。
【0277】
なお、ＭＣＵ３０、キーボード３２、ポインティングデバイス３３、メインカメラ１１およびフロントカメラ１０は、検査個体の識別情報（例：シャーレ番号）の入力を受け付ける受付部の一例である。シャーレ番号は一例にすぎず、数値以外の文字や記号を含む識別情報が採用されてもよい。記憶装置３５は、受付部により受け付けされた検査個体の識別情報に関連付けて基準画像１０３ｂを記憶する記憶部として機能する。ＭＣＵ３０は、受付部により受け付けされた検査個体の識別情報と基準画像とを関連付けて記憶部に登録する登録部として機能する。Ｓ１１２やＳ１３２が例示するように、受付部は、計数部がコロニーの個数の計数を開始する前に、検査個体の識別情報の入力を再び受け付けるように構成されていてもよい。Ｓ１１７が例示するように、計数部は、受付部により受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている基準画像１０３ｂを読み出し、当該基準画像１０３ｂと、撮像部により取得された検査画像１０３ａとを用いて、基準画像１０３ｂに含まれず、かつ、検査画像１０３ａに含まれているコロニーの個数を計数するように構成されていてもよい。つまり、計数部は、基準画像と検査画像とを用いて、検査画像に含まれる少なくとも一つの残渣を除外してコロニーの個数を計数するように構成されていてもよい。
【0278】
［観点Ｃ３］
ＭＣＵ３０およびＵＩ３００は、撮像部に撮像条件を設定する設定部の一例である。記憶部（例：記憶装置３５）は、培養前の検査個体を撮像する際に撮像部に適用された撮像条件を検査個体の識別情報に関連付けて記憶するように構成されている。登録部（例：ＭＣＵ３０）は、培養前の検査個体を撮像する際に撮像部に適用された撮像条件を検査個体の識別情報に関連付けて記憶部に記憶させるように構成されている。設定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体の培養後に受付部により再び受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている撮像条件（例：露光時間）を記憶部から読み出し、撮像部に当該撮像条件を設定するように構成されていてもよい。つまり、撮像部は、設定部により設定された撮像条件にしたがって培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得する。これにより、検査個体の識別情報を介して、基準画像１０３ｂの撮影と検査画像１０３ａの撮影とを簡単に関連付けることができる。同一条件で撮影が実行されるため、残渣の影響が精度よく低減されるであろう。
ＭＣＵ３０およびＵＩ３００は、撮像部に撮像条件を設定する設定部の一例である。記憶部（例：記憶装置３５）は、培養前の検査個体を撮像する際に撮像部に適用された撮像条件を検査個体の識別情報に関連付けて記憶するように構成されている。登録部（例：ＭＣＵ３０）は、培養前の検査個体を撮像する際に撮像部に適用された撮像条件を検査個体の識別情報に関連付けて記憶部に記憶させるように構成されている。設定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体の培養後に受付部により再び受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている撮像条件（例：露光時間）を記憶部から読み出し、撮像部に当該撮像条件を設定するように構成されていてもよい。つまり、撮像部は、設定部により設定された撮像条件にしたがって培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得する。これにより、検査個体の識別情報を介して、基準画像１０３ｂの撮影と検査画像１０３ａの撮影とを簡単に関連付けることができる。同一条件で撮影が実行されるため、残渣の影響が精度よく低減されるであろう。
【0279】
［観点Ｃ４］
リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４は、検査個体を照明する照明部の一例である。設定部（例：ＭＣＵ３０、ＵＩ３００）は、照明部に照明条件を設定するように構成されている。記憶部（例：記憶装置３５）は、培養前の検査個体を撮像する際に照明部に設定された照明条件（例：照明の種類、明るさ）を検査個体の識別情報に関連付けて記憶するように構成されていてもよい。つまり、登録部（例：ＭＣＵ３０）は、培養前の検査個体を撮像する際に照明部に設定された照明条件を検査個体の識別情報に関連付けて記憶部に登録する。設定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体の培養後に受付部により再び受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている照明条件を記憶部から読み出し、照明部に当該照明条件を設定するように構成されていてもよい。撮像部は、設定部により設定された照明条件にしたがって培養後の検査個体が照明された状態で、検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得する。これにより、同一照明条件で撮影が実行されるため、残渣の影響が精度よく低減されるであろう。
リング照明装置１２、１３および同軸照明装置１４は、検査個体を照明する照明部の一例である。設定部（例：ＭＣＵ３０、ＵＩ３００）は、照明部に照明条件を設定するように構成されている。記憶部（例：記憶装置３５）は、培養前の検査個体を撮像する際に照明部に設定された照明条件（例：照明の種類、明るさ）を検査個体の識別情報に関連付けて記憶するように構成されていてもよい。つまり、登録部（例：ＭＣＵ３０）は、培養前の検査個体を撮像する際に照明部に設定された照明条件を検査個体の識別情報に関連付けて記憶部に登録する。設定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体の培養後に受付部により再び受け付けられた検査個体の識別情報に関連付けられている照明条件を記憶部から読み出し、照明部に当該照明条件を設定するように構成されていてもよい。撮像部は、設定部により設定された照明条件にしたがって培養後の検査個体が照明された状態で、検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得する。これにより、同一照明条件で撮影が実行されるため、残渣の影響が精度よく低減されるであろう。
【0280】
［観点Ｃ５］
図５２などが例示するように、二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所は、検査個体を収容する容器に付与されている目印であってもよい。つまり、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体を収容する円筒形の透明容器の上面または下面の周縁部に付与されている目印を、二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。これにより、二つの画像が精度よく位置合わせされよう。その結果、残渣の影響が精度よく低減されるであろう。なお、二つの目印１５ｃ、１５ｆがシャーレ１５の直径上に存在すると、残渣の影響を低減することに失敗することがある。この場合は、目印１５ｃ、１５ｆを結ぶ直線とは重ならない位置に第三の目印が存在すればよい。
図５２などが例示するように、二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所は、検査個体を収容する容器に付与されている目印であってもよい。つまり、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体を収容する円筒形の透明容器の上面または下面の周縁部に付与されている目印を、二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。これにより、二つの画像が精度よく位置合わせされよう。その結果、残渣の影響が精度よく低減されるであろう。なお、二つの目印１５ｃ、１５ｆがシャーレ１５の直径上に存在すると、残渣の影響を低減することに失敗することがある。この場合は、目印１５ｃ、１５ｆを結ぶ直線とは重ならない位置に第三の目印が存在すればよい。
【0281】
［観点Ｃ６］
図５２などが例示するように、目印は、容器（例：内皿１５ａ）にペンで描かれた目印、容器に彫刻された目印、または、容器に貼付された目印であってもよい。また、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、線状の目印を少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。
図５２などが例示するように、目印は、容器（例：内皿１５ａ）にペンで描かれた目印、容器に彫刻された目印、または、容器に貼付された目印であってもよい。また、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、線状の目印を少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。
【0282】
［観点Ｃ７］
容器（例：シャーレ１５）は、内側容器（例：内皿１５ａ）と、内側容器の蓋となる外側容器（例：外皿１５ｂ）とを有してもよい。
この場合、目印は、内側容器に設けられる。計数部（例：ＭＣＵ３０）は、内側容器に設けられた二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像に含まれる内側容器の位置および回転角度と検査画像に含まれる内側容器の位置および回転角度とを位置合わせする。また、円筒形の透明容器は、円筒形で有底の培地が形成された内側透明容器と、当該内側透明容器の蓋となる円筒形の外側透明容器とを有してもよい。この場合、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、内側透明容器の底面の周縁部に付与されている目印を、二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。
容器（例：シャーレ１５）は、内側容器（例：内皿１５ａ）と、内側容器の蓋となる外側容器（例：外皿１５ｂ）とを有してもよい。
この場合、目印は、内側容器に設けられる。計数部（例：ＭＣＵ３０）は、内側容器に設けられた二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像に含まれる内側容器の位置および回転角度と検査画像に含まれる内側容器の位置および回転角度とを位置合わせする。また、円筒形の透明容器は、円筒形で有底の培地が形成された内側透明容器と、当該内側透明容器の蓋となる円筒形の外側透明容器とを有してもよい。この場合、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、内側透明容器の底面の周縁部に付与されている目印を、二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。
【0283】
一般に、内側容器に外側容器を容易に被せるには、内側容器の外径よりも外側容器の内径が大きくなければならない。つまり、内側容器と外側容器との間にはクリアランスが必要となる。しかし、クリアランスが大きくなると、基準画像１０３ｂの撮影時と検査画像１０３ａの撮影時とで、内側容器に対する外側容器の位置がずれてしまい、シャーレ１５を正確に位置決めすることが困難となりやすい。そのため、また、残渣は一般に内側容器に付着するが、シャーレ１５を保温庫に対して出し入れする際に外側容器が回転してしまうことがある。この場合、外側容器に設けられた目印では、残渣の低減が精度よく実行できないことがある。内側容器の目印は、内側容器の残渣に対して位置変化しない。よって、内側容器の目印は、残渣を精度よく低減することに寄与するであろう。
【0284】
［観点Ｃ８］
二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所は、検査個体を収容する容器、検査個体に付着している残渣、または、検査個体の一部であってもよい。つまり、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体を収容する容器、検査個体に付着している残渣、または、検査個体の一部を二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。これにより、容器に目印を付与する手間が省けることになる。
二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所は、検査個体を収容する容器、検査個体に付着している残渣、または、検査個体の一部であってもよい。つまり、残渣特定部（例：ＭＣＵ３０）は、検査個体を収容する容器、検査個体に付着している残渣、または、検査個体の一部を二以上の共通の特徴箇所のうちの少なくとも一つの特徴箇所として認識してもよい。これにより、容器に目印を付与する手間が省けることになる。
【0285】
［観点Ｃ９］
図５３が例示するように、表示部（例：表示装置３７）は、培養前の検査個体から取得された基準画像１０３ｂと、撮像部により取得される培養後の検査個体の動画像と、を重畳して表示するように構成されていてもよい。これにより、ユーザは、検査画像１０３ａを撮影する際に、手動でシャーレ１５を位置合わせしやすくなるであろう。これにより、残渣の低減精度が向上するであろう。
図５３が例示するように、表示部（例：表示装置３７）は、培養前の検査個体から取得された基準画像１０３ｂと、撮像部により取得される培養後の検査個体の動画像と、を重畳して表示するように構成されていてもよい。これにより、ユーザは、検査画像１０３ａを撮影する際に、手動でシャーレ１５を位置合わせしやすくなるであろう。これにより、残渣の低減精度が向上するであろう。
【0286】
［観点Ｃ１０］
撮像部（例：メインカメラ１１）は、ユーザが培養後の検査個体を手動で位置合わせした後に、当該培養後の検査個体から検査画像１０３ａを取得してもよい。計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、基準画像１０３ｂと、ユーザが培養後の検査個体を手動で位置合わせした後に撮像部により取得された検査画像１０３ａと、から二以上の共通の特徴箇所を特定する特徴箇所特定部を有してもよい。計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせし、検査画像１０３ａに含まれる少なくとも一つの残渣を除外してコロニーの個数を計数するように構成されていてもよい。このように、手動により位置合わせと画像処理による位置合わせとを活用することで、残渣の低減精度がさらに向上するであろう。
撮像部（例：メインカメラ１１）は、ユーザが培養後の検査個体を手動で位置合わせした後に、当該培養後の検査個体から検査画像１０３ａを取得してもよい。計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、基準画像１０３ｂと、ユーザが培養後の検査個体を手動で位置合わせした後に撮像部により取得された検査画像１０３ａと、から二以上の共通の特徴箇所を特定する特徴箇所特定部を有してもよい。計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせし、検査画像１０３ａに含まれる少なくとも一つの残渣を除外してコロニーの個数を計数するように構成されていてもよい。このように、手動により位置合わせと画像処理による位置合わせとを活用することで、残渣の低減精度がさらに向上するであろう。
【0287】
［観点Ｃ１１］
ステージ５は、検査個体を載置されるステージの一例である。位置合わせ部材７は、ステージ上に設けられ、ステージに載置された検査個体に対するユーザによる手動での位置合わせを補助する位置合わせ部材の一例である。位置合わせ部材は、検査個体を収容する容器に対して少なくとも二点で接触して容器を支持するように形成された形状を有してもよい。たとえば、位置合わせ部材の接触面の水平断面形状と、容器の非接触面の水平断面形状とが相似であってもよい。あるいは、水平断面形状が円形のシャーレを二点で接触して支持するよう、位置合わせ部材は、ステージの上方から見下ろしたときに、略八の字の形状をしていてもよい。また、複数のウェルを有するウェルプレートは水平断面形状が矩形である。したがって、位置合わせ部材が少なくとも二点で接触してウェルプレートを支持できるよう、位置合わせ部材は、水平断面形状がＬ字形状を有していてもよい。これにより、手動により位置合わせの精度が向上するであろう。
ステージ５は、検査個体を載置されるステージの一例である。位置合わせ部材７は、ステージ上に設けられ、ステージに載置された検査個体に対するユーザによる手動での位置合わせを補助する位置合わせ部材の一例である。位置合わせ部材は、検査個体を収容する容器に対して少なくとも二点で接触して容器を支持するように形成された形状を有してもよい。たとえば、位置合わせ部材の接触面の水平断面形状と、容器の非接触面の水平断面形状とが相似であってもよい。あるいは、水平断面形状が円形のシャーレを二点で接触して支持するよう、位置合わせ部材は、ステージの上方から見下ろしたときに、略八の字の形状をしていてもよい。また、複数のウェルを有するウェルプレートは水平断面形状が矩形である。したがって、位置合わせ部材が少なくとも二点で接触してウェルプレートを支持できるよう、位置合わせ部材は、水平断面形状がＬ字形状を有していてもよい。これにより、手動により位置合わせの精度が向上するであろう。
【0288】
［観点Ｃ１２］
ＭＣＵ３０は、複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表５５を作成し、記憶部に記憶させる表管理部（作成部）として機能してもよい。表示装置３７は、表管理部により作成された前記カウント表を表示する表示部として機能する。ＭＣＵ３０およびポインタ５７は、表示部に表示されるカウント表５５に含まれる複数のセルの中から対象セルを特定するセル特定部として機能してもよい。ＭＣＵ３０は、対象セルに対して検査個体の識別情報（例：シャーレ番号）と基準画像１０３ｂとを関連付けて登録する登録部として機能してもよい。計数部（例：ＭＣＵ３０）は、対象セルが特定されると、対象セルに関連付けられている基準画像１０３ｂを記憶部から読み出し、基準画像に含まれる残渣を低減して検査画像に含まれているコロニーの個数を計数し、計数されたコロニーの個数を対象セルに入力または関連付けてもよい。これにより、ユーザは、対象セルを特定することで、検査画像１０３ａに対応する基準画像１０３ｂを読み出すことが可能となる。計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、コロニーの個数を対象セルに入力または関連付けるように構成されていてもよい。これにより、カウント結果を正しくセルに入力することが可能となろう。
ＭＣＵ３０は、複数の検査個体の各々のカウント結果が入力されるセルを含むカウント表５５を作成し、記憶部に記憶させる表管理部（作成部）として機能してもよい。表示装置３７は、表管理部により作成された前記カウント表を表示する表示部として機能する。ＭＣＵ３０およびポインタ５７は、表示部に表示されるカウント表５５に含まれる複数のセルの中から対象セルを特定するセル特定部として機能してもよい。ＭＣＵ３０は、対象セルに対して検査個体の識別情報（例：シャーレ番号）と基準画像１０３ｂとを関連付けて登録する登録部として機能してもよい。計数部（例：ＭＣＵ３０）は、対象セルが特定されると、対象セルに関連付けられている基準画像１０３ｂを記憶部から読み出し、基準画像に含まれる残渣を低減して検査画像に含まれているコロニーの個数を計数し、計数されたコロニーの個数を対象セルに入力または関連付けてもよい。これにより、ユーザは、対象セルを特定することで、検査画像１０３ａに対応する基準画像１０３ｂを読み出すことが可能となる。計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、コロニーの個数を対象セルに入力または関連付けるように構成されていてもよい。これにより、カウント結果を正しくセルに入力することが可能となろう。
【0289】
［観点Ｃ１３］
カウント表５５は、検査個体ごとに第一セル２９１と第二セル２９２とを有してもよい。この場合、第一セル２９１は、基準画像１０３ｂが取得済みであるかどうかを示す。第二セル２９２は、第一セルに関連付けられており、コロニーの個数を示す。ここで、対象セルは、第二セルである。このように、カウント結果を入力される対象セルと、基準画像１０３ｂに関連付けられているセルとが、さらに、紐づけられていてもよい。
カウント表５５は、検査個体ごとに第一セル２９１と第二セル２９２とを有してもよい。この場合、第一セル２９１は、基準画像１０３ｂが取得済みであるかどうかを示す。第二セル２９２は、第一セルに関連付けられており、コロニーの個数を示す。ここで、対象セルは、第二セルである。このように、カウント結果を入力される対象セルと、基準画像１０３ｂに関連付けられているセルとが、さらに、紐づけられていてもよい。
【0290】
［観点Ｃ１４］
撮像部（例：メインカメラ１１）は、第一セルがクリックされると、培養前の検査個体を撮像して基準画像１０３ｂを取得してもよい。さらに、撮像部（例：メインカメラ１１）は、第二セルがクリックされると、培養後の検査個体を撮像して検査画像１０３ａを取得してもよい。このように、セルがクリックされることが撮影のトリガとされてもよい。なお、セルがクリックされることには、セルがクリックされた後に撮影ボタンが操作されることが、含まれてもよい。
撮像部（例：メインカメラ１１）は、第一セルがクリックされると、培養前の検査個体を撮像して基準画像１０３ｂを取得してもよい。さらに、撮像部（例：メインカメラ１１）は、第二セルがクリックされると、培養後の検査個体を撮像して検査画像１０３ａを取得してもよい。このように、セルがクリックされることが撮影のトリガとされてもよい。なお、セルがクリックされることには、セルがクリックされた後に撮影ボタンが操作されることが、含まれてもよい。
【0291】
撮像部（例：メインカメラ１１）は、第一セルがクリックされると、培養前の検査個体を撮像して基準画像１０３ｂを取得してもよい。撮像部（例：メインカメラ１１）は、第二セルがクリックされると、第一セルに関連付けられている撮像条件を用いて、培養後の検査個体を撮像して検査画像１０３ａを取得してもよい。このように、検査画像１０３ａ用の撮像条件は、第二セル２９２を介して第一セル２９１に関連付けられていてもよい。これにより、基準画像１０３ｂの撮像条件と検査画像１０３ａの撮像条件が一致するため、残渣の低減精度が向上するであろう。また、ユーザが基準画像１０３ｂの撮像条件と検査画像１０３ａの撮像条件とを個別に設定する手間が省けるであろう。
【0292】
［観点Ｃ１５］
計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、残渣の影響を軽減する第一モードと、残渣の影響を軽減しない第二モードとを有してもよい。表示部（例：表示装置３７）は、第一モードまたは第二モードを選択するためのアイコンを表示してもよい。このように、残渣低減処理のオン／オフがアイコンを通じて選択されてもよい。
計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、残渣の影響を軽減する第一モードと、残渣の影響を軽減しない第二モードとを有してもよい。表示部（例：表示装置３７）は、第一モードまたは第二モードを選択するためのアイコンを表示してもよい。このように、残渣低減処理のオン／オフがアイコンを通じて選択されてもよい。
【0293】
［観点Ｃ１６］
図５０が例示するように、ＭＣＵ３０およびＵＩ３１０は、記憶部に記憶されている複数の候補画像から基準画像１０３ｂを指定する指定部として機能してもよい。図５１が例示するように、ＭＣＵ３０は、指定部により指定された基準画像１０３ｂに関連付けられている培地の種類、希釈倍率、検査個体の名称、および、検査個体の識別情報のうち少なくとも一つを記憶部から読み出して表示部に表示させる表示制御部として機能してもよい。
図５０が例示するように、ＭＣＵ３０およびＵＩ３１０は、記憶部に記憶されている複数の候補画像から基準画像１０３ｂを指定する指定部として機能してもよい。図５１が例示するように、ＭＣＵ３０は、指定部により指定された基準画像１０３ｂに関連付けられている培地の種類、希釈倍率、検査個体の名称、および、検査個体の識別情報のうち少なくとも一つを記憶部から読み出して表示部に表示させる表示制御部として機能してもよい。
【0294】
［観点Ｃ１７］
検査個体の識別情報は、検査個体を収容する容器の識別情報（例：シャーレ番号）であってもよい。ユーザにとってなじみ深い情報が使用されれば、ユーザにとって使いやすいコロニー計数装置１が実現されるであろう。
検査個体の識別情報は、検査個体を収容する容器の識別情報（例：シャーレ番号）であってもよい。ユーザにとってなじみ深い情報が使用されれば、ユーザにとって使いやすいコロニー計数装置１が実現されるであろう。
【0295】
［観点Ｃ１８］
計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、基準画像１０３ｂにおける残渣の位置を特定し、二以上の共通の特徴箇所に基づき、検査画像１０３ａの位置および回転角度と、基準画像１０３ｂの位置および回転角度の相対的なズレを求め、残渣の位置と、相対的なズレに基づいて、検査画像にマスク領域を設定し、マスク領域が設定された検査画像１０３ａからコロニーの個数を計数してもよい。
計数部（例：ＭＣＵ２０、３０）は、基準画像１０３ｂにおける残渣の位置を特定し、二以上の共通の特徴箇所に基づき、検査画像１０３ａの位置および回転角度と、基準画像１０３ｂの位置および回転角度の相対的なズレを求め、残渣の位置と、相対的なズレに基づいて、検査画像にマスク領域を設定し、マスク領域が設定された検査画像１０３ａからコロニーの個数を計数してもよい。
【0296】
［観点Ｃ１９］
メインカメラ１１は、培養前の検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像１０３ｂを取得するとともに、培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像１０３ａを取得する撮像部として機能する。ＭＣＵ２０、３０は、基準画像１０３ｂにおけるコロニーの個数と、検査画像１０３ａにおけるコロニーの個数と、を計数し、検査画像１０３ａにおけるコロニーの個数から基準画像１０３ｂにおけるコロニーの個数を減算して、培養後の検査個体におけるコロニーの個数を求める計数部として機能してもよい。このような比較的な演算負荷の小さなアルゴリズムが採用されてもよい。なお、ＭＣＵ３０は、ユーザ指示に応じて複数のアルゴリズムを切り替えてもよい。これにより、ユーザは、よりカウント結果のすぐれたアルゴリズムを採用できるようになろう。
メインカメラ１１は、培養前の検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像１０３ｂを取得するとともに、培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像１０３ａを取得する撮像部として機能する。ＭＣＵ２０、３０は、基準画像１０３ｂにおけるコロニーの個数と、検査画像１０３ａにおけるコロニーの個数と、を計数し、検査画像１０３ａにおけるコロニーの個数から基準画像１０３ｂにおけるコロニーの個数を減算して、培養後の検査個体におけるコロニーの個数を求める計数部として機能してもよい。このような比較的な演算負荷の小さなアルゴリズムが採用されてもよい。なお、ＭＣＵ３０は、ユーザ指示に応じて複数のアルゴリズムを切り替えてもよい。これにより、ユーザは、よりカウント結果のすぐれたアルゴリズムを採用できるようになろう。
【0297】
［観点Ｃ２０］
コロニー計数装置の制御方法は、
培養前の検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像１０３ｂを取得することと、
培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像１０３ａを取得することと、
基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所を特定することと、
基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所を特定し、当該特定された二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせし、当該位置合わせ後の検査画像１０３ａと、基準画像１０３ｂに含まれる残渣の位置と、に基づいて、検査画像１０３ａに含まれる残渣とコロニーとのうち少なくとも一つの残渣を除外して当該コロニーの個数を計数することと、を有してもよい。
コロニー計数装置の制御方法は、
培養前の検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像１０３ｂを取得することと、
培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像１０３ａを取得することと、
基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所を特定することと、
基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所を特定し、当該特定された二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせし、当該位置合わせ後の検査画像１０３ａと、基準画像１０３ｂに含まれる残渣の位置と、に基づいて、検査画像１０３ａに含まれる残渣とコロニーとのうち少なくとも一つの残渣を除外して当該コロニーの個数を計数することと、を有してもよい。
【0298】
あるいは、コロニー計数装置の制御方法は、
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得することと、
培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得することと、
基準画像に含まれる残渣を特定することと、
基準画像と検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定することと、特定された残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して検査画像に含まれるコロニーの個数を計数することと、
を有してもよい。
検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像を取得することと、
培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像を取得することと、
基準画像に含まれる残渣を特定することと、
基準画像と検査画像とにおける二以上の共通の特徴箇所の各々のズレに基づいて、当該基準画像に含まれる残渣に対応する当該検査画像における残渣の位置を特定することと、特定された残渣の位置に基づいて、当該残渣をコロニーとしての計数からは除外して検査画像に含まれるコロニーの個数を計数することと、
を有してもよい。
【0299】
［観点Ｃ２１］
アプリケーションプログラム３９と制御プログラム２７とは、コロニー計数装置を制御するコンピュータにより実行されるプログラムの一例である。プログラムは、コンピュータ（例：ＭＣＵ２０、３０）に、
培養前の検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像１０３ｂを取得させ、
培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像１０３ａを取得させ、
基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所を特定させ、当該特定された二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせさせ、当該位置合わせ後の検査画像１０３ａと、基準画像１０３ｂに含まれる残渣の位置と、に基づいて、検査画像１０３ａに含まれる残渣とコロニーとのうち少なくとも一つの残渣を除外して当該コロニーの個数を計数させてもよい。
アプリケーションプログラム３９と制御プログラム２７とは、コロニー計数装置を制御するコンピュータにより実行されるプログラムの一例である。プログラムは、コンピュータ（例：ＭＣＵ２０、３０）に、
培養前の検査個体を撮像して当該検査個体の残渣の影響を低減するための基準画像１０３ｂを取得させ、
培養後の検査個体を撮像してコロニーをカウントするための検査画像１０３ａを取得させ、
基準画像１０３ｂと検査画像１０３ａとから二以上の共通の特徴箇所を特定させ、当該特定された二以上の共通の特徴箇所に基づき基準画像１０３ｂの位置および回転角度と検査画像１０３ａの位置および回転角度とを位置合わせさせ、当該位置合わせ後の検査画像１０３ａと、基準画像１０３ｂに含まれる残渣の位置と、に基づいて、検査画像１０３ａに含まれる残渣とコロニーとのうち少なくとも一つの残渣を除外して当該コロニーの個数を計数させてもよい。
【0300】
あるいは、コロニー計数装置を制御するコンピュータにより実行されるプログラムは、当該コンピュータに、観点Ｃ２０の制御方法を実行させてもよい。
【0301】
発明は上記の実施形態に制限されるものではなく、発明の要旨の範囲内で、種々の変形・変更が可能である。
【符号の説明】
【0302】
１：コロニー計数装置、３５：記憶装置、３０：ＭＣＵ
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】
【図8】
【図9】
【図10】
【図11】
【図12】
【図13】
【図14】
【図15】
【図16】
【図17】
【図18】
【図19】
【図20】
【図21】
【図22】
【図23】
【図24】
【図25】
【図26】
【図27】
【図28】
【図29】
【図30】
【図31】
【図32】
【図33】
【図34】
【図35】
【図36】
【図37】
【図38】
【図39】
【図40】
【図41】
【図42】
【図43】
【図44】
【図45】
【図46】
【図47】
【図48】
【図49】
【図50】
【図51】
【図52】
【図53】
【図54】
【図55】
【図56】
【図57】
【図58】
【図59】
【図60】
【図61】
【図62】
【図63】
【図64】
【図65】
【図66】
