特開 2024-39273 解析装置および表示方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公開特許公報(A)

(11)【公開番号】P2024039273

(43)【公開日】2024-03-22

(54)【発明の名称】解析装置および表示方法

(51)【国際特許分類】

   G01N 27/447 20060101AFI20240314BHJP

【ＦＩ】

G01N27/447 325D

G01N27/447 325B

【審査請求】未請求

【請求項の数】10

【出願形態】ＯＬ

(21)【出願番号】P 2022143695

(22)【出願日】2022-09-09

(71)【出願人】

【識別番号】000001993

【氏名又は名称】株式会社島津製作所

(74)【代理人】

【識別番号】110001195

【氏名又は名称】弁理士法人深見特許事務所

(72)【発明者】

【氏名】荻野 康太

(72)【発明者】

【氏名】原田 亨

(57)【要約】

【課題】電気泳動データの解析において、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識する。
【解決手段】サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータを解析する解析装置１であって、メモリ１１と、表示部１３と、プロセッサ１０とを備える。メモリ１１は、データを記憶する。表示部１３は、データに基づいて、ゲルイメージ、エレクトロフェログラム、ゲルイメージに対応する第１サイズガイドＧ１、および、エレクトロフェログラムに対応する第２サイズガイドＧ２を表示する。プロセッサ１０は、ゲルイメージにおいて第１サイズガイドＧ１がサイズに関連する特定値に対応する第１位置にある場合、エレクトロフェログラムにおいて特定値に対応する第２位置に、第２サイズガイドＧ２を表示する。
【選択図】図３

【特許請求の範囲】

【請求項1】

サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータを解析する解析装置であって、
前記データを記憶するメモリと、
前記データに基づいて、ゲルイメージ、エレクトロフェログラム、前記ゲルイメージに対応する第１サイズガイド、および、前記エレクトロフェログラムに対応する第２サイズガイドを表示する表示部と、
プロセッサとを備え、
前記プロセッサは、
前記ゲルイメージにおいて前記第１サイズガイドがサイズに関連する特定値に対応する第１位置にある場合、
前記エレクトロフェログラムにおいて前記特定値に対応する第２位置に、前記第２サイズガイドを表示する、解析装置。

【請求項2】

前記第１サイズガイドは、前記ゲルイメージのサイズに関連する値を示す軸に対応して移動可能であり、
前記第１サイズガイドを前記第１位置へ移動させるユーザの指示を受け付けた場合、
前記プロセッサは、前記第２位置に前記第２サイズガイドを表示する、請求項１に記載の解析装置。

【請求項3】

前記解析装置に対するユーザの指示を入力するための入力部をさらに備え、
前記プロセッサは、前記入力部による、前記第１サイズガイドの移動の指示を受け付ける、請求項２に記載の解析装置。

【請求項4】

前記入力部は、ポインティングデバイスまたはキーボードである、請求項３に記載の解析装置。

【請求項5】

前記特定値は、特定サイズ、特定泳動時間および特定移動時間インデックスの少なくとも１つを含み、
前記特定値に対応する前記第２位置は、前記特定値に対応するサイズに対応する位置、前記特定値に対応する泳動時間に対応する位置、および、前記特定値に対応する移動時間インデックスに対応する位置の少なくとも１つを含む、請求項１～４のいずれか１項に記載の解析装置。

【請求項6】

前記第１サイズガイドは、前記第１位置を示す線分を含み、
前記第２サイズガイドは、前記第２位置を示す線分を含む、請求項１～４のいずれか１項に記載の解析装置。

【請求項7】

前記第１サイズガイドは、前記特定値の数値の表示を含み、
前記第２サイズガイドは、前記第２位置に対応する数値の表示を含む、請求項１～４のいずれか１項に記載の解析装置。

【請求項8】

前記１以上のデータが複数のデータである場合、前記プロセッサは、前記第１位置を示す前記第１サイズガイドを前記複数のデータについて表示する、請求項１～４のいずれか１項に記載の解析装置。

【請求項9】

前記第２サイズガイドは、前記エレクトロフェログラムのサイズに関連する値を示す軸に対応して移動可能であり、
前記第２サイズガイドを、前記エレクトロフェログラムにおいて第３位置へ移動させるユーザの指示を受け付けた場合、
前記プロセッサは、前記第３位置に対応するサイズに関連する値に対応する第４位置に、前記第２サイズガイドを表示する、請求項１～４のいずれか１項に記載の解析装置。

【請求項10】

サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータの表示方法であって、
前記データに基づいて、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムを表示するステップと、
前記ゲルイメージにおいて、サイズに関連する値に対応する値を示す軸に対応して移動可能な第１サイズガイドを、第１位置へ移動させるユーザの指示を受け付けるステップと、
前記第１位置に対応するサイズに関連する特定値を算出するステップと、
前記エレクトロフェログラムにおいて、前記特定値に対応する第２位置を算出するステップと、
前記エレクトロフェログラムにおいて、前記第２位置に第２サイズガイドを表示するステップとを含む、表示方法。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

本発明は、解析装置および表示方法に関し、より特定的には、電気泳動データの解析装置および表示方法に関する。

【背景技術】

【0002】

従来、電気泳動データを解析・表示するソフトウェアでは、検出されたデータを、ゲルイメージ、エレクトロフェログラムおよびピークリストなどの形態で表示する。

【0003】

特開２０２０－２０７２５号公報（特許文献１）には、検出されたデータをエレクトロフェログラムおよびゲルイメージの形態で表示する電気泳動で分離されたサンプルのデータ解析装置の一例が開示されている。

【先行技術文献】

【特許文献】

【0004】

【特許文献1】特開２０２０－２０７２５号公報

【発明の概要】

【発明が解決しようとする課題】

【0005】

ゲルイメージには、電気泳動で分画されたサンプル中の成分に対応するバンドが含まれる。通常、ユーザはこのバンドのサイズに基づいて、どのような成分がサンプルに含まれていたかを解析する。しかし、ゲルイメージ上のバンドは泳動方向に幅があり、当該幅の中のどの位置が、実際の成分のサイズに対応するかを判定することが困難な場合があった。この場合、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを求めることが困難となり得る。

【0006】

本開示は、このような事情を鑑みてなされたものであり、その目的は、電気泳動データの解析において、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することである。

【課題を解決するための手段】

【0007】

本開示の第１の態様は、サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータを解析する解析装置であって、メモリと、表示部と、プロセッサとを備える。メモリは、データを記憶する。表示部は、データに基づいて、ゲルイメージ、エレクトロフェログラム、ゲルイメージに対応する第１サイズガイド、および、エレクトロフェログラムに対応する第２サイズガイドを表示する。プロセッサは、ゲルイメージにおいて第１サイズガイドがサイズに関連する特定値に対応する第１位置にある場合、エレクトロフェログラムにおいて特定値に対応する第２位置に、第２サイズガイドを表示する。

【0008】

本開示の第２の態様は、サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータの表示方法であって、データに基づいて、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムを表示するステップと、ゲルイメージにおいて、サイズに関連する値に対応する値を示す軸に対応して移動可能な第１サイズガイドを、第１位置へ移動させるユーザの指示を受け付けるステップと、第１位置に対応するサイズに関連する特定値を算出するステップと、エレクトロフェログラムにおいて、特定値に対応する第２位置を算出するステップと、エレクトロフェログラムにおいて、第２位置に第２サイズガイドを表示するステップとを含む。

【発明の効果】

【0009】

本開示による解析装置によれば、電気泳動データの解析において、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。

【図面の簡単な説明】

【0010】

【図1】本実施形態に係る解析システムの全体の構成を示す図である。

【図2】ゲルイメージ上のバンドの幅を説明するための図である。

【図3】実施形態に係る解析画面の一例を示す図である。

【図4】比較例に係る解析画面の一例を示す図である。

【図5】多数のサンプルの解析結果を含む場合の実施形態に係る解析画面の例を示す図である。

【図6】サイズ差が小さい複数の成分を含む場合の実施形態に係る解析画面の例である。

【図7】解析装置の表示処理を示すフローチャートである。

【発明を実施するための形態】

【0011】

以下、本発明の実施形態について、図面を参照しながら詳細に説明する。なお、図中同一または相当部分には同一符号を付してその説明は繰返さない。

【0012】

［１．解析システムの構成］
図１は、解析システムの全体の構成を示す図である。図１に示されているように、解析システム１００は、解析装置１と電気泳動装置２とを含む。

【0013】

電気泳動装置２は、サンプルを特定の支持体（膜、ゲル等）に設置した後、支持体に直流電場をかけることで、サンプルにふくまれる成分をその鎖長に応じて分離するための装置である。一実施例において、電気泳動装置２は、行列状にウェルが形成されたプレート２１に設置された１以上のサンプルを自動的に連続分析する。具体的には、たとえば、ユーザは１以上のサンプルをプレート２１に設置する。電気泳動装置２は、プレート２１から微細な分析流路中にサンプルを導入する。分析流路中には蛍光色素が含まれており、サンプルは分析流路中を泳動する間に蛍光色素で染色される。電気泳動装置２は、分析流路に電圧を印加し、サンプルを成分ごとに分離する。そして、電気泳動装置２は、分析流路に紫外線を照射し、分離された成分から発生する蛍光を検出する。電気泳動装置２は、蛍光の信号強度と、分析流路中の移動距離との関係を示す分離データを取得する。なお、当該移動距離は、一般にサンプルのサイズ（分子量）に相関する。

【0014】

一実施例において、サンプルはデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）を成分として含み、電気泳動装置２は、ＤＮＡをそのサイズである塩基対の数（ｂｐ：base pair）によって分離する。ただし、サンプルの成分は以上の例に限定されず、電気泳動により分離されることが可能であればよく、たとえばリボ核酸（ＲＮＡ）またはタンパク質であってもよい。

【0015】

一実施例において、電気泳動装置２は、４つの分析流路を有し、一度に４つのサンプルの電気泳動が可能である。

【0016】

解析装置１は、電気泳動で得られた１以上の分離データを電気泳動装置２から取得して、データ解析処理を実施する。分離データは、本開示における「データ」の一実施例に対応する。

【0017】

解析装置１は、プロセッサ１０と、メモリ１１と、入力部１２と、表示部１３とを備える。

【0018】

プロセッサ１０は、たとえばＣＰＵ（Central Processing Unit）を含む。プロセッサ１０は、メモリ１１に格納されているプログラムをＲＡＭ等に展開して実行する。

【0019】

メモリ１１は、たとえば、ＲＯＭ（Read Only Memory）、ＲＡＭ（Random Access Memory）、不揮発性メモリを含む。ＲＯＭに格納されるプログラムは、解析装置１の処理手順が記されたプログラムである。不揮発性メモリは、電気泳動装置２から送られてきた分離データをデータファイルとして記憶する。なお、メモリ１１は、不揮発性メモリに代えてまたはこれに加えてハードディスク装置を含んでいても良い。

【0020】

入力部１２は、解析装置１に対するユーザの指示を入力するための部である。たとえば、入力部１２は、キーボードおよびマウス等のポインティングデバイスを含む。

【0021】

表示部１３は、液晶ディスプレイ等を含む。解析装置１は、処理手順が記されたプログラムに従って、表示用データを生成し、表示部１３に表示させる。この制御については、ソフトウェアによる処理に限られず、専用のハードウェア（電子回路）で処理することも可能である。

【0022】

表示部１３は、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムを含む、分離データの解析結果を表示する。ゲルイメージは、複数サンプルの分析結果を俯瞰的に確認できる表示形式である。一方、エレクトロフェログラムは単一サンプルの分析結果を詳細に確認できる表示形式である。

【0023】

［２．従来の解析システムとの比較］
電気泳動分離の分離データを解析するソフトウェアにおいては、サンプルを分離した結果が、ゲルイメージ、エレクトロフェログラムおよびピークリストなどの形態で表示される。特許文献１には、検出されたデータをエレクトロフェログラムおよびゲルイメージの形態で表示するデータ解析装置の一例が示されている。

【0024】

ゲルイメージには、サンプル中の各成分に対応するバンドが含まれる。ユーザは、このバンドのサイズに基づいて、サイズに対応する成分がサンプルに含まれていたことを認識できる。しかし、ゲルイメージのバンドには泳動方向に幅があるため、当該幅の中のどの位置が、実際の成分のサイズに対応するのかを特定することは困難な場合があった。

【0025】

図２は、ゲルイメージ上のバンドの一例を示す図である。たとえば矢印で示したバンドには幅があるので、バンドに対応する成分のサイズを正確に推定することは困難である。すなわち、ゲルイメージだけでは、バンドに対応する成分のサイズを判定することが困難である場合があった。

【0026】

そこで、本実施に係る解析システムにおいては、ゲルイメージにおいて所定のサイズに対応する位置を示す第１サイズガイドと、エレクトロフェログラムにおいて所定のサイズに対応する位置を示す第２サイズガイドとが示される。そして、第１サイズガイドと第２サイズガイドの位置は連動するように構成される。これにより、第２サイズガイドがエレクトロフェログラム中のピークの頂点に位置するように、ユーザが第１サイズガイドを移動させたときの、第１サイズガイドの位置に基づいて、バンドに対応する成分のサイズを容易に推定することが可能になる。なお、以降の説明において、第１サイズガイドおよび第２サイズガイドを、「サイズガイド」と総称する。

【0027】

［３．実施形態に係る解析画面］
（３－１．解析画面の概要）
次に、分離データを解析するための解析画面である図３を説明する。

【0028】

図３は、実施形態に係る解析装置１の解析画面の一例を示す図である。なお、本明細書において、「実施形態に係る解析装置１の解析画面」は、「実施形態に係る解析画面」とも称する。解析画面は、たとえば表示部１３に表示され、ゲルイメージウィンドウＷ１、エレクトロフェログラムウィンドウＷ２およびプレートイメージウィンドウＷ３を含む。解析画面は、他の解析に関する表示を含んでもよい。たとえば、解析画面は、ピークに対応するサイズ、移動時間インデックス、ピークの信号強度から算出された濃度等の値を含む、ピークテーブルを含んでも良い。

【0029】

プレートイメージウィンドウＷ３は、図１のプレート２１に形成されている行列状のウェルの配置に対応する画像であるプレートイメージを表示する。一実施例において、プレート２１は、Ａ～Ｈ行、Ｘ１～Ｘ３，１～１２列のウェルを含む。プレートイメージにおいては、サンプルが設置されたウェルが、サンプルが設置されていないウェルとは異なる視覚的表現を有するように示されている。なお、図４以降では、プレートイメージウィンドウＷ３の表記を省略する。

【0030】

ゲルイメージウィンドウＷ１は、各サンプルのゲルイメージを表示する。ゲルイメージウィンドウＷ１においては、各ゲルイメージに対応するサンプルの分析順が（１）～（８）として示され、ウェルの位置がその下に示される。図３の例では、プレート２１のＡ行Ｘ１列のウェルＸ１Ａに設置された解析コントロールとして使用されるサンプル（以下、「コントロール」と称する）について、４つの分析流路を使用して分析が実行される。よって、分析順（１）～（４）には同じウェルＸ１Ａが示されている。その後、分析順（５）以降で、ウェルＡ１～Ａ４に設置された、解析対象となる未知サンプルが順に１回ずつ分析されている。本明細書において、コントロールおよび未知サンプルを、「サンプル」と総称する。

【0031】

ゲルイメージは、電気泳動装置２で得られた分離データに基づいて作成される、サンプルの分離データを簡易な表現で表した画像である。一実施例において、ゲルイメージの縦軸は、サイズ（ｂｐ）である。ただし、ゲルイメージの縦軸は、サイズに関連する値であればよく、泳動時間または移動時間インデックスであってもよい。ゲルイメージの縦軸の単位は、たとえば、入力部１２を用いて、解析画面に表示される図示しない所定のボタンを操作することで変更することができる。「移動時間インデックス」は、分析流路における移動時間のインデックスであり、サイズを算出するために用いられる。ゲルイメージにおける濃淡は、信号強度（ｍＶ）に相関する。よって、ゲルイメージにおける縞（一般に「バンド」と称される）の各々は、試料に含まれる成分を示している。

【0032】

エレクトロフェログラムウィンドウＷ２は、各サンプルのエレクトロフェログラムを表示する。図３の例では、エレクトロフェログラムウィンドウＷ２には、Ａ行１列のウェルＡ１に設置された未知サンプルのエレクトロフェログラムが表示されている。

【0033】

エレクトロフェログラムは、電気泳動装置２で得られた分離データに基づいて作成される。一実施例において、エレクトロフェログラムの横軸は、サイズ（ｂｐ）である。ただし、エレクトロフェログラムの横軸は、サイズに関連する値であればよく、図３のグラフの横軸に括弧書きで示したように、泳動時間または移動時間インデックスであってもよい。エレクトロフェログラムの横軸の単位は、ゲルイメージの縦軸の単位と同じでも、異なっても良い。エレクトロフェログラムの横軸の単位は、たとえば、入力部１２を用いて、解析画面に表示される図示しない所定のボタンを操作することで変更することができる。エレクトロフェログラムの縦軸は信号強度（ｍＶ）である。

【0034】

エレクトロフェログラムには、試料に含まれる成分に対応するピークが示される。当該ピークは、たとえば、解析装置１により、信号強度の時間あたりの変化が所定の閾値以上であることを指標として検出される。エレクトロフェログラムで示されたピークは、ゲルイメージにおけるバンドに対応している。

【0035】

（３－２．サイズガイド）
本実施形態に係る解析画面には、ゲルイメージに対応する第１サイズガイドＧ１、および、エレクトロフェログラムに対応する第２サイズガイドＧ２が表示される。

【0036】

第１サイズガイドＧ１は、ゲルイメージ上の所定のサイズに対応する位置を示すための表示である。第１サイズガイドＧ１は、ゲルイメージのサイズ軸（縦軸）に対応して移動可能である。一実施例において、第１サイズガイドＧ１は、特定サイズに対応する第１位置を示す線分を含む。第１位置はたとえばゲルイメージ上の任意の位置であるが、後述するように、第１サイズガイドＧ１の位置を調整することによりバンドのサイズを判定できる。当該線分は、好ましくは、縦軸に垂直に、すなわち、バンドと平行に表示される。第１サイズガイドＧ１により、ユーザはゲルイメージ上の第１位置を容易に認識できる。

【0037】

複数のデータに基づいたゲルイメージが表示される場合、第１サイズガイドＧ１は、第１位置を示すサイズガイドを複数のデータについて表示する。図３においては、第１サイズガイドＧ１は、複数のサンプルのゲルイメージにオーバーラップする１つの線分として表示されている。これにより、共通の第１サイズガイドＧ１と複数のゲルイメージの各々のバンドとの位置関係を一度に認識することができる。より特定的には、複数のゲルイメージの各々が、第１サイズガイドＧ１が示すサイズと同じサイズのバンドを含むかを同時に認識できる。さらに特定的には、所定のゲルイメージにおいて解析対象となるバンドと、同一のサイズのバンドを含むゲルイメージが容易に認識できる。この場合、後述するように、所定の解析対象となるバンドに対応する成分のサイズを認識した場合、当該同一のサイズのバンドに対応する成分のサイズも同時に明らかになる。また、後述するように、多数のサンプルを同時に比較検討することも容易になる。

【0038】

第２サイズガイドＧ２は、エレクトロフェログラム上の所定のサイズに対応する位置を示すための表示である。一実施例において、第２サイズガイドＧ２は、特定サイズに対応する第２位置を示す線分を含む。当該線分は、好ましくは、サイズ軸（横軸）に垂直に表示される。これにより、ユーザはエレクトロフェログラム上の第２位置を容易に認識できる。

【0039】

ゲルイメージにおける第１サイズガイドＧ１の位置、および、エレクトロフェログラムにおける第２サイズガイドＧ２の位置は対応している。より具体的には、ゲルイメージにおいて第１サイズガイドＧ１がサイズに関連する特定値に対応する第１位置にある場合、エレクトロフェログラムにおいて当該特定値に対応する第２位置に、第２サイズガイドＧ２が表示される。本実施例において当該特定値はたとえば特定サイズである。ただし、特定値は、サイズに関連する特定の値であればよく、特定泳動時間または特定移動時間インデックスであってもよい。本実施例において、特定値に対応する第２位置は、特定値に対応するサイズに対応する位置である。ただし、特定値に対応する第２位置は、特定値に対応する泳動時間に対応する位置、または、特定値に対応する移動時間インデックスに対応であってもよい。これにより、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムの各々において、サイズ、泳動時間および移動時間インデックスのうち、いずれの単位を用いた軸が使用されている場合においても、共通の特定値に対応する位置に、サイズガイドを表示することができる。

【0040】

より具体的には、たとえば、ユーザは入力部１２を用いて、ゲルイメージにおける第１位置へ第１サイズガイドＧ１を移動する指示を入力する。ユーザは、たとえば、ポインティングデバイスまたはキーボードを用いて、第１位置を選択することにより、第１位置への移動の指示を入力する。ユーザは、たとえば、カーソルを第１位値に移動させる、または、第１位置をクリックすることにより、第１位置を選択する。ユーザは、第１サイズガイドＧ１をドラッグしたり、キーボードの矢印ボタン等を押したりして、第１サイズガイドＧ１を第１位置へ移動させても良い。また、ユーザは、第１サイズガイドＧ１の位置を移動するための解析画面中の専用のアイコン（図示せず）を、ポインティングデバイスまたはキーボードを用いて操作することにより、第１サイズガイドＧ１を第１位置へ移動させても良い。これにより、ユーザは汎用性のある入力部１２を用いて、容易に第１サイズガイドＧ１の移動の指示を入力することができる。

【0041】

解析装置１のプロセッサ１０は、第１位置への移動の指示を受け付けた場合、第１位置に対応する特定サイズを算出し、特定サイズに対応するエレクトロフェログラム中の第２位置を示す第２サイズガイドＧ２を表示部に表示する。これにより、ユーザはエレクトロフェログラム中の所望する位置に第２サイズガイドＧ２が位置するように、第１サイズガイドＧ１を移動させることができる。

【0042】

第１サイズガイドＧ１の表記は図３の例に限定されない。以下に、第１サイズガイドＧ１の表記の例について説明する。

【0043】

第１サイズガイドＧ１は、たとえば、一部のサンプルのゲルイメージにのみオーバーラップされるように表示されても良い。当該一部のサンプルは、たとえば、ユーザによって選択されたサンプルである。

【0044】

また、第１サイズガイドＧ１を構成する線分は１つでなく、複数であってもよい。たとえば、第１サイズガイドＧ１は、各ゲルイメージにオーバーラップする部分にのみ表示され、各ゲルイメージの間隙には表示されなくても良い。逆に当該間隙のみに表示されてもよい。

【0045】

また、第１サイズガイドＧ１の表示形式は線分でなくてもよく、たとえば、各ゲルイメージの特定サイズに対応する第１位置を指す矢印として、各ゲルイメージの間隙に表示されてもよい。

【0046】

一実施例において、第１サイズガイドＧ１は、特定サイズの数値Ｖ１の表示を含む。図３の例では、第１サイズガイドＧ１に対応して、特定サイズの数値Ｖ１が表示されている。これにより、ユーザは第１サイズガイドＧ１に対応する特定サイズの数値Ｖ１を容易に認識することができる。特定サイズの数値Ｖ１の表示場所は、望ましくは図３の例のように第１サイズガイドＧ１に隣接する場所であるが、特に限定されず、ユーザが数値Ｖ１が第１サイズガイドＧ１に対応していることが認識できる場所であれば良い。

【0047】

第１サイズガイドＧ１の位置に対応するゲルイメージの縦軸の数値が表示されている場合、ユーザは当該縦軸の数値に基づいて、第１サイズガイドＧ１の対応する特定サイズを判定することも可能である。

【0048】

このように、第１サイズガイドＧ１の表記方法は、特に限定されず、ゲルイメージの特定サイズに対応する第１位置を、ユーザに認識させることが可能であれば良い。

【0049】

一実施例において、第１サイズガイドＧ１は、サイズガイド表示ボタン３２を選択することにより、解析画面に表示される。しかし、第１サイズガイドＧ１は、解析画面において常に表示されても良い。

【0050】

第２サイズガイドＧ２の表記は、第１サイズガイドＧ１と同様に、図３の例に限定されない。

【0051】

一実施例において、第２サイズガイドＧ２は、第２位置に対応する数値Ｖ２の表示を含む。図３の例では、第２サイズガイドＧ２に対応して、特定サイズの数値Ｖ２が表示されている。これにより、ユーザは第２サイズガイドＧ２に対応する特定サイズの数値Ｖ２を必要に応じて容易に参照することができる。

【0052】

また、上記では、ユーザが第１サイズガイドＧ１を操作することにより第２サイズガイドＧ２が連動して動く構成を説明したが、ユーザが第２サイズガイドＧ２を操作することにより第１サイズガイドＧ１が連動して動く構成に変えてもよい。具体的には、第２サイズガイドＧ２は、エレクトロフェログラムのサイズ軸に対応して移動可能に構成される。第２サイズガイドＧ２を、エレクトロフェログラムにおいて第３位置へ移動させるユーザの指示を受け付けた場合、プロセッサは、第３位置に対応するサイズに対応する第４位置に、第２サイズガイドＧ２を表示する。これにより、ユーザは、第１サイズガイドＧ１の位置が解析を所望するバンドにオーバーラップするように第２サイズガイドＧ２を所定のピークに移動させたのち、第２サイズガイドＧ２を当該ピークの頂点に移動させることができる。その結果、解析を所望するバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。

【0053】

また、第１サイズガイドＧ１および第２サイズガイドＧ２の両方がユーザによる操作を受け付けることが可能な構成としても良い。当該構成の場合、操作を受け付けたサイズガイドに、操作を受け付けなかった方のサイズガイドが連動して動く。これにより、ユーザは適宜第１サイズガイドＧ１および第２サイズガイドＧ２を移動させることにより、解析を所望するバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。

【0054】

（３－３．バンドに対応する成分のサイズの推定）
解析装置１を用いれば、ユーザは、解析対象である特定バンドに対応する成分のサイズを、特定バンドに対応する特定ピークを用いて判定することができる。より特定的には、ユーザは第２サイズガイドＧ２を特定ピークの頂点に対応するように、第１サイズガイドＧ１を移動させることにより、特定バンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。

【0055】

ここで、「特定バンド」とはたとえば、ユーザが当該バンドのサイズに基づいて、バンドに対応する成分が何かを判定したいと考えるバンドである。「特定ピーク」は、ゲルイメージ上の特定バンドに対応する、エレクトロフェログラム上のピークである。

【0056】

特定ピークの頂点は、たとえば特定ピークの極大値を示す点であり、もしくは、目視において特定ピークの極大値を示すと推定される点である。第２サイズガイドＧ２の位置（第２位置）は、たとえば、当該特定ピークの頂点を通過し、横軸に垂直な直線上の位置である。換言すれば、第２位置は、特定ピークの頂点に対応する特定サイズを示す位置である。

【0057】

特定バンドに対応する成分のサイズは、特定ピークの頂点が対応する特定サイズに対応すると考えられる。そのため、第２サイズガイドＧ２の位置がエレクトロフェログラム上の特定ピークの頂点に対応するように第１サイズガイドＧ１の位置（第１位置）を調整すると、第１サイズガイドＧ１の位置は、ゲルイメージの特定バンド上の特定サイズに対応する位置となる。よって、ユーザは、第１サイズガイドＧ１を参照して、特定バンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。

【0058】

上記のように、実施形態に係る解析装置１においては、ゲルイメージ上の第１サイズガイドＧ１に連動して、エレクトロフェログラム上に第２サイズガイドＧ２を表示する。これにより、ゲルイメージ上の第１サイズガイドＧ１、および、エレクトロフェログラム上の第２サイズガイドＧ２の対応を、容易に確認できる。また、エレクトロフェログラムのピーク形状を確認しながら、サイズガイドの位置を動かせるので、より正確にサイズガイドの位置を調整できる。さらに、第２サイズガイドＧ２をピークの頂点に位置するように、第１サイズガイドＧ１を移動させることにより、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することが可能である。よって、ユーザの解析効率が向上する。

【0059】

［４．比較例に係る解析画面］
次に、比較例として、エレクトロフェログラム上に第２サイズガイドＧ２が表示されない解析画面を説明する。

【0060】

図４は、比較例に係る解析装置の解析画面の一例を示す図である。なお、本明細書において、「比較例に係る解析装置の解析画面」は、「比較例に係る解析画面」とも称する。図４ではゲルイメージに第１サイズガイドＧ１Ａが表示されているが、エレクトロフェログラムには第２サイズガイドが表示されない。よって、ユーザはバンドの対応する成分のサイズを判定するために、バンドを観察して、中央と思われる位置に第１サイズガイドＧ１Ａを移動した。この場合、第１サイズガイドＧ１Ａの対応するサイズは２７６ｂｐであった。しかし、エレクトロフェログラムにおいて、２７６ｂｐの位置を確認すると、ピークの頂点からずれている（点線５ 参照）。すなわち、比較例に係る解析画面においては、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを正しく判別できない場合がある。以上の比較例からも、実施形態に係る解析画面のように、エレクトロフェログラムに第２サイズガイドＧ２を表示することは、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを知るために有用であるといえる。

【0061】

また、上記の比較例と違い、第２サイズガイドは表示されるが、第１サイズガイドと連動しない場合も、所定のバンドに対応するサイズを求めることは困難である。この場合、たとえば、ユーザが目視により解析を所望するバンドに対応するピークを見いだし、当該ピークに第２サイズガイドを移動した後、第２サイズガイドの対応する横軸の値を確認する、という作業が必要となる。電気泳動解析の分離データにおいては、通常複数のバンドが含まれるので、所定のバンドに対応するピークをエレクトロフェログラムから見いだすことはユーザに負荷を与えることとなる。また、電気泳動解析は複数のサンプルにそれぞれ対応する複数の分離データを同時に解析することが一般的である。この場合、解析画面においては複数のゲルイメージおよび複数のエレクトロフェログラムが表示されるため、解析画面に表示されるバンドおよびピークの数はさらに増加する。よって、ユーザが目視によって、所定のバンドに対応するピークをエレクトロフェログラムから見いだすことは、さらに困難になる。

【0062】

より具体的には、ユーザはたとえば、ゲルイメージにおいて解析対象となるバンドが上から何番目のバンドであるかを数えた後、エレクトロフェログラムのピークを左から数えることによって、対応するバンドを探索する。このような作業はユーザにとって煩雑であり、特に、バンド数が多い場合、あるいは、複数のピークが近接する場合などには、バンドの数あるいはピークの数を数え間違ったり、混同したりする可能性もある。

【0063】

一方で、本実施形態に係る解析画面においては、第１サイズガイドＧ１および第２サイズガイドＧ２を用いて、解析対象となるバンドと対応するピークの認識が容易である。また、第１サイズガイドＧ１および第２サイズガイドＧ２を用いて、解析対象となるバンドに対応するピークの頂点に対応するサイズを認識することも容易である。当該ピークの頂点に対応するサイズは、バンドに対応する成分のサイズに対応する。このことより、実施形態に係る解析画面においては、比較例に係る解析画面に比べ、所定のバンドに対応する成分のサイズを認識することが容易である。また、実施形態に係る解析画面においては、比較例に係る解析画面に比べ、ピークの数え間違いによるピークの取り違え等のヒューマンエラーが起こる可能性も低減される。よって、ユーザの解析効率および解析精度が向上する。特に、解析画面に含まれるサンプルまたはバンドの数が多いほど解析画面の煩雑度が増すので、第１サイズガイドＧ１および第２サイズガイドＧ２を用いたバンドに対応する成分のサイズの判定は、効果を発揮する。

【0064】

［５．多数のデータを含む場合の実施形態に係る解析画面］
次に、解析装置１によって、多数のサンプルまたはバンドを含むデータを解析する例を説明する。

【0065】

電気泳動解析の解析画面においては、しばしば多数の分離データが一度に表示され、一度に解析される。たとえば解析装置１においては、８行×１５列＝１２０個のサンプルを一度に解析することが可能である。これにより、最大１２０サンプルの分離データを一度に表示することが可能である。

【0066】

しかし、サンプル数および／またはサンプル当たりのバンドの数が多いほど、ゲルイメージとエレクトロフェログラムとを見比べて、バンドとピークとの対応を確認することが煩雑となり、ユーザに負荷を与えるおそれが大きくなる。場合によっては、解析結果を誤認する可能性も大きくなる。

【0067】

図５は、多数のサンプルの分離データを含む、本実施形態に係る解析画面の例を示す図である。図５の解析画面は、１つのコントロールおよび多数の未知サンプルについてのゲルイメージを含む解析画面である。

【0068】

図５は、サンプル辺りのバンド数が多いゲルイメージの一例として、菌のゲノム中に分布するＩＳ（Ｉｎｓｅｃｔｉｏｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ）についてのゲルイメージを示している。当該多数の分離データを含む解析画面においても、所定の１つのバンドに対応するピークに第２サイズガイドＧ２の位置を合わせることにより、第１サイズガイドＧ１を参照して、当該バンドに対応する成分のサイズを容易に求めることができる。さらに、サイズガイドは、複数のサンプルのバンドを同時に確認する上でも有用である。

【0069】

たとえば、図５では、エレクトロフェログラムにおけるウェルＸ１Ａに対応するコントロールの約４９５ｂｐのピークの頂点に対応する位置に第２サイズガイドＧ２が位置するように、第１サイズガイドＧ１が調整されている。

【0070】

これにより、ゲルイメージの第１サイズガイドＧ１を参照すると、どのサンプルのどのバンドが、コントロールと同じ約４９５ｂｐのバンドであるかを容易に判定することができる。より具体的には、ユーザは第１サイズガイドＧ１がオーバーラップしているバンド、および、当該バンドを含むサンプルを容易に認識できる。これにより、コントロールと同じ約４９５ｂｐの成分に対応するバンド、および、コントロールと同じ約４９５ｂｐの成分を含むサンプルが容易に認識できる。以上より、サンプルあたりのバンド数が多いゲルイメージにおいて、約４９５ｂｐのバンドが存在するか否かを見間違える（誤判定する）可能性を低減できる。当該誤判定を抑止する効果は、サンプル数が多くなればなるほど大きくなる。

【0071】

以上のように、解析装置１を用いれば、サンプル数および／またはサンプル当たりのバンドの数が多い場合において、所定の１つのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができるだけでなく、多数のサンプルおよび／またはバンドについて、同時に比較検討することが可能になる。これにより、多数のサンプルおよび／またはバンドを含む解析データの解析において、ユーザの解析効率がさらに向上する。

【0072】

［６．サイズ差が小さい複数の成分を含む場合の実施形態に係る解析画面］
次に、解析装置１によって、サイズ差が小さい複数の成分を含むサンプルを解析する例を説明する。

【0073】

図６は、サイズ差が小さい複数の成分を含むサンプルを含む場合の実施形態に係る解析画面の例である。図６のゲルイメージにおいて矢印で示す、あたかも１つのバンドに見える領域（約５７３２ｂｐ）の解析を行なう場合を考える。この場合、図６において当該領域を観察するだけで、実際に当該領域に含まれるピークの数、および、当該ピークのサイズを認識することは困難である。すなわち、当該領域に対応する成分の種類および数を判定することは困難である。

【0074】

しかし、第１サイズガイドＧ１を当該領域に対応する位置に移動させ、エレクトロフェログラム中の第２サイズガイドＧ２を参照することにより、第２サイズガイドＧ２付近の４８６９ｂｐ、５７０８ｂｐ、７５４６ｂｐの３つのピークが当該領域に含まれていたことが分かる。すなわち、４８６９ｂｐ、５７０８ｂｐ、７５４６ｂｐのサイズをそれぞれ有する３つの成分に対応するバンドが当該領域に含まれていたことがわかる。なお、図６中では、図６における当該領域および当該領域を示す矢印の視認性を保つために、第１サイズガイドＧ１は当該領域および当該領域を示す矢印とオーバーラップしないように表記している。しかし、実際の解析画面においては第１サイズガイドＧ１は当該領域とオーバーラップさせて表示してよいことは言うまでもない。

【0075】

以上のように、サイズ差が小さい複数の成分を含むサンプルを含む場合、ゲルイメージにおいては、各成分に対応する複数のバンドが狭いサイズ領域内にオーバーラップおよび／または密接して存在する。この場合、当該複数のバンドは、あたかも１つのバンドのように見えるときもある。このような場合も、エレクトロフェログラム中の第２サイズガイドＧ２を参照すれば、当該複数のバンドに対応する成分のサイズまたは数を判定することが容易である。

【0076】

［７．解析装置の表示処理］
図７は、解析装置の表示処理を示すフローチャートである。図７に示すステップは、解析装置１のプロセッサ１０によって実行される。なお、図中において、「Ｓ」は「ＳＴＥＰ」の略称として用いられる。

【0077】

図７を参照して、Ｓ１において、プロセッサ１０は、電気泳動分離により得られたデータに基づいて、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムを含む解析画面を表示部１３に表示する。

【0078】

Ｓ２において、プロセッサ１０は、ゲルイメージにおいて、サイズ軸に対応して移動可能な第１サイズガイドＧ１を、第１位置へ移動させるユーザの指示を受け付ける。

【0079】

Ｓ２の一実施例において、プロセッサ１０は、当該ユーザの指示は、入力部１２を用いて入力される。また、解析画面に複数のデータの解析結果が含まれる場合、プロセッサ１０は、第１位置を示すサイズガイドを複数のデータについて表示する。

【0080】

Ｓ３において、プロセッサ１０は、第１位置に対応する特定サイズを算出する。

【0081】

Ｓ４において、プロセッサ１０は、エレクトロフェログラムにおいて、特定サイズに対応する第２位置を算出する。

【0082】

Ｓ５において、プロセッサ１０は、エレクトロフェログラムにおいて、第２位置に第２サイズガイドＧ２を表示して、処理を終了する。

【0083】

図７の処理によれば、プロセッサ１０は、ゲルイメージにおいて第１サイズガイドＧ１が特定サイズに対応する第１位置にある場合、エレクトロフェログラムにおいて特定サイズに対応する第２位置に、第２サイズガイドＧ２を表示する。これにより、ユーザは、第１サイズガイドＧ１および第２サイズガイドＧ２に基づいて、ゲルイメージ上のバンドの位置と、エレクトロフェログラムのピークの位置との関係を容易に認識できる。特に、第１サイズガイドＧ１を解析対象のバンド上に移動させることにより、対応するピークの位置を容易に認識できる。また、第２サイズガイドＧ２をピークの頂点に位置するように第１サイズガイドＧ１の位置を調整することにより、バンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。これにより、ユーザの解析に係る時間を低減することができる。

【0084】

［態様］
上述した複数の例示的な実施形態は、以下の態様の具体例であることが当業者により理解される。

【0085】

（第１項）一態様に係る解析装置は、サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータを解析する解析装置であって、メモリと、表示部と、プロセッサとを備える。メモリは、データを記憶する。表示部は、データに基づいて、ゲルイメージ、エレクトロフェログラム、ゲルイメージに対応する第１サイズガイド、および、エレクトロフェログラムに対応する第２サイズガイドを表示する。プロセッサは、ゲルイメージにおいて第１サイズガイドがサイズに関連する特定値に対応する第１位置にある場合、エレクトロフェログラムにおいて特定値に対応する第２位置に、第２サイズガイドを表示する。

【0086】

第１項に記載の解析装置によれば、ゲルイメージ上の第１サイズガイドに連動して、エレクトロフェログラム上に第２サイズガイドを表示する。これにより、ゲルイメージ上の第１サイズガイド、および、エレクトロフェログラム上の第２サイズガイドの対応を、容易に確認できる。また、エレクトロフェログラムのピーク形状を確認しながら、サイズガイドの位置を動かせるので、より正確にサイズガイドを調整できる。さらに、第２サイズガイドをピークの頂点に位置するように、第１サイズガイドを移動させることにより、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することが可能である。よって、ユーザの解析効率が向上する。

【0087】

（第２項）第１項に記載の解析装置において、第１サイズガイドは、ゲルイメージのサイズに関連する値を示す軸に対応して移動可能である。第１サイズガイドを第１位置へ移動させるユーザの指示を受け付けた場合、プロセッサは、第２位置に第２サイズガイドを表示する。

【0088】

第２項に記載の解析装置によれば、ユーザはエレクトロフェログラム中の所望する位置に第２サイズガイドが位置するように、第１サイズガイドを移動させることができる。当該所望する位置は、たとえば、解析を所望する特定バンドに対応する特定ピークの頂点に対応する位置である。

【0089】

（第３項）第２項に記載の解析装置において、解析装置に対するユーザの指示を入力するための入力部をさらに備える。プロセッサは、入力部による、第１サイズガイドの移動の指示を受け付ける。

【0090】

第３項に記載の解析装置によれば、これにより、ユーザは入力部を用いて、容易に第１サイズガイドの移動の指示を入力することができる。

【0091】

（第４項）第３項に記載の解析装置において、入力部は、ポインティングデバイスまたはキーボードである。

【0092】

第４項に記載の解析装置によれば、これにより、ユーザは汎用性のある入力機器であるポインティングデバイスまたはキーボードを用いて、容易に第１サイズガイドの移動の指示を入力することができる。

【0093】

（第５項）第１～４のいずれか１項に記載の解析装置において、特定値は、特定サイズ、特定泳動時間および特定移動時間インデックスの少なくとも１つを含む。特定値に対応する第２位置は、特定値に対応するサイズに対応する位置、特定値に対応する泳動時間に対応する位置、および、特定値に対応する移動時間インデックスに対応する位置の少なくとも１つを含む。

【0094】

第５項に記載の解析装置によれば、これにより、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムの各々において、サイズ、泳動時間および移動時間インデックスのうち、いずれの単位を用いた軸が使用されている場合においても、共通の特定値に対応する位置に、サイズガイドを表示することができる。

【0095】

（第６項）第１～５のいずれか１項に記載の解析装置において、第１サイズガイドは、第１位置を示す線分を含む。第２サイズガイドは、第２位置を示す線分を含む。

【0096】

第６項に記載の解析装置によれば、ユーザはゲルイメージ上の第１位置、および、エレクトロフェログラム上の第２位置を容易に認識できる。

【0097】

（第７項）第１～６のいずれか１項に記載の解析装置において、第１サイズガイドは、特定値の数値の表示を含む。第２サイズガイドは、第２位置に対応する数値の表示を含む。

【0098】

第７項に記載の解析装置によれば、ユーザは第１サイズガイドに対応する特定値の数値、および、第２サイズガイドの第２位置に対応する数値を容易に認識することができる。

【0099】

（第８項）第１～７のいずれか１項に記載の解析装置において、１以上のデータが複数のデータである場合、プロセッサは、第１位置を示す第１サイズガイドを複数のデータについて表示する。

【0100】

第８項に記載の解析装置によれば、共通の第１サイズガイドと複数のゲルイメージの各々のバンドとの位置関係を一度に認識することができる。より特定的には、複数のゲルイメージの各々が、第１サイズガイドが示すサイズと同じサイズのバンドを含むかを同時に認識できる。さらに特定的には、所定のゲルイメージにおいて解析対象となるバンドと、同一のサイズのバンドを含むゲルイメージが容易に認識できる。この場合、後述するように、所定の解析対象となるバンドに対応する成分のサイズを認識した場合、当該同一のサイズのバンドに対応する成分のサイズも同時に明らかになる。また、後述するように、複数のサンプルを同時に比較検討することも容易になる。

【0101】

（第９項）第１～８のいずれか１項に記載の解析装置において、第２サイズガイドは、エレクトロフェログラムのサイズに関連する値を示す軸に対応して移動可能である。第２サイズガイドを、エレクトロフェログラムにおいて第３位置へ移動させるユーザの指示を受け付けた場合、プロセッサは、第３位置に対応するサイズに関連する値に対応する第４位置に、第２サイズガイドを表示する。

【0102】

第９項に記載の解析装置によれば、これにより、ユーザは、第１サイズガイドの位置が解析を所望するバンドにオーバーラップするように第２サイズガイドを所定のピークに移動させたのち、第２サイズガイドを当該ピークの頂点に移動させることができる。その結果、解析を所望するバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することができる。

【0103】

（第１０項）一態様に係る表示方法は、サンプルについて電気泳動分離により得られた１以上のデータの表示方法であって、データに基づいて、ゲルイメージおよびエレクトロフェログラムを表示するステップと、ゲルイメージにおいて、サイズに関連する値に対応する値を示す軸に対応して移動可能な第１サイズガイドを、第１位置へ移動させるユーザの指示を受け付けるステップと、第１位置に対応するサイズに関連する特定値を算出するステップと、エレクトロフェログラムにおいて、特定値に対応する第２位置を算出するステップと、エレクトロフェログラムにおいて、第２位置に第２サイズガイドを表示するステップとを含む。

【0104】

第１０項に記載の表示方法によれば、ゲルイメージ上の第１サイズガイドに連動して、エレクトロフェログラム上に第２サイズガイドを表示する。これにより、ゲルイメージ上の第１サイズガイド、および、エレクトロフェログラム上の第２サイズガイドの対応を、容易に確認できる。また、エレクトロフェログラムのピーク形状を確認しながら、サイズガイドの位置を動かせるので、より正確にサイズガイドを調整できる。さらに、第２サイズガイドがピークの頂点に位置するように、第１サイズガイドを移動させることにより、ゲルイメージのバンドに対応する成分のサイズを容易に認識することが可能である。よって、ユーザの解析効率が向上する。

【0105】

今回開示された実施の形態はすべての点で例示であって制限的なものではないと考えられるべきである。本発明の範囲は、上記した説明ではなく、特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲と均等の意味および範囲内でのすべての変更が含まれることが意図される。

【符号の説明】

【0106】

１ 解析装置、２ 電気泳動装置、１０ プロセッサ、１１ メモリ、１２ 入力部、１３ 表示部、２１ プレート、３２ サイズガイド表示ボタン、１００ 解析システム、Ａ１，Ａ４，Ｘ１Ａ ウェル、Ｇ１，Ｇ１Ａ 第１サイズガイド、Ｇ２ 第２サイズガイド、Ｖ１，Ｖ２ 数値、Ｗ１ ゲルイメージウィンドウ、Ｗ２ エレクトロフェログラムウィンドウ、Ｗ３ プレートイメージウィンドウ。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】