(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2024095326
(43)【公開日】2024-07-10
(54)【発明の名称】試料回収方法
(51)【国際特許分類】
C12N 1/02 20060101AFI20240703BHJP
C12N 15/10 20060101ALI20240703BHJP
【ＦＩ】
C12N1/02
C12N15/10 110Z
【審査請求】未請求
【請求項の数】6
【出願形態】ＯＬ
(21)【出願番号】P 2022212531
(22)【出願日】2022-12-28
(71)【出願人】
【識別番号】000006507
【氏名又は名称】横河電機株式会社
(74)【代理人】
【識別番号】110002147
【氏名又は名称】弁理士法人酒井国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】三森 裕示
(72)【発明者】
【氏名】田口 朋之
【テーマコード（参考）】
4B065
【Ｆターム（参考）】
4B065AA01X
4B065AA57X
4B065AA87X
4B065AA95X
4B065BD15
4B065BD16
4B065CA23
(57)【要約】
【課題】遠心分離によって試料を効率よく回収すること。
【解決手段】菌体回収方法は、所定の色彩を有する着色ビーズＢを菌体培養液Ｓに添加し、遠心分離機３０を用いて着色ビーズＢが添加された菌体培養液Ｓを上清Ｌと沈殿Ｐとに分離し、分離した上清Ｌを除去し、分離した沈殿Ｐを回収する。
【選択図】図１
【解決手段】菌体回収方法は、所定の色彩を有する着色ビーズＢを菌体培養液Ｓに添加し、遠心分離機３０を用いて着色ビーズＢが添加された菌体培養液Ｓを上清Ｌと沈殿Ｐとに分離し、分離した上清Ｌを除去し、分離した沈殿Ｐを回収する。
【選択図】図１
【特許請求の範囲】
【請求項1】
試料を含む試料溶液から前記試料を回収する試料回収方法であって、
所定の色彩を有するビーズを前記試料溶液に添加する添加工程と、
遠心分離機を用いて、前記ビーズが添加された前記試料溶液を上清と沈殿物とに分離する分離工程と、
前記上清を除去し、前記沈殿物を回収する除去工程と、
を含む試料回収方法。
所定の色彩を有するビーズを前記試料溶液に添加する添加工程と、
遠心分離機を用いて、前記ビーズが添加された前記試料溶液を上清と沈殿物とに分離する分離工程と、
前記上清を除去し、前記沈殿物を回収する除去工程と、
を含む試料回収方法。
【請求項2】
前記添加工程は、
回収対象となる前記試料の比重に対して所定の範囲内の比重である前記ビーズを添加する、
請求項１に記載の試料回収方法。
回収対象となる前記試料の比重に対して所定の範囲内の比重である前記ビーズを添加する、
請求項１に記載の試料回収方法。
【請求項3】
前記添加工程は、
回収対象となる前記試料の大きさに対して所定の範囲内の粒径である前記ビーズを添加する、
請求項１に記載の試料回収方法。
回収対象となる前記試料の大きさに対して所定の範囲内の粒径である前記ビーズを添加する、
請求項１に記載の試料回収方法。
【請求項4】
前記ビーズは、ラテックス、ポリ乳酸、シリカ、ポリスチレンまたはポリエチレンである、
請求項１に記載の試料回収方法。
請求項１に記載の試料回収方法。
【請求項5】
前記試料溶液は、菌体培養液である、
請求項１から４のいずれか１項に記載の試料回収方法。
請求項１から４のいずれか１項に記載の試料回収方法。
【請求項6】
前記除去工程によって回収された菌体の細胞から核酸を抽出する抽出工程、
をさらに含む請求項５に記載の試料回収方法。
をさらに含む請求項５に記載の試料回収方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、試料回収方法に関する。
【背景技術】
【0002】
従来、菌体培養液を遠心分離することによって菌体（適宜、「微生物」とも表記）を回収する技術がある。この技術では、菌体培養液を遠心分離することによって培地と菌体ペレットに分離した後、デカンテーションによって培地を取り除くことで菌体を回収する。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0003】
【特許文献1】特開２０１０－０８１８３２号公報
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0004】
しかしながら、従来技術では、遠心分離によって試料を効率よく回収することが難しい。例えば、従来技術では、遠心分離後のデカンテーションは目視で菌体ペレットを確認しながら操作するので、目に見えない少量の菌体を残してデカンテーションすることが困難である。
【0005】
本発明は、上記に鑑みてなされたものであって、遠心分離によって試料を効率よく回収することを目的とする。
【課題を解決するための手段】
【0006】
本発明は、試料を含む試料溶液から前記試料を回収する試料回収方法であって、所定の色彩を有するビーズを前記試料溶液に添加する添加工程と、遠心分離機を用いて、前記ビーズが添加された前記試料溶液を上清と沈殿物とに分離する分離工程と、前記上清を除去し、前記沈殿物を回収する除去工程と、を含む試料回収方法を提供する。
【発明の効果】
【0007】
本発明によれば、遠心分離によって試料を効率よく回収することができるという効果がある。
【図面の簡単な説明】
【0008】
【図1】実施形態に係る菌体回収システムの構成例を示す図である。
【図2】実施形態に係る着色ビーズの具体例を示す図である。
【図3】実施形態に係る実験結果１を説明するための図である。
【図4】実施形態に係る実験結果２－１を説明するための図である。
【図5】実施形態に係る実験結果２－２を説明するための図である。
【図6】実施形態に係る実験結果３を説明するための図である。
【図7】実施形態に係る菌体回収工程の流れの一例を示すフローチャートである。
【発明を実施するための形態】
【0009】
以下に、本発明の一実施形態に係る試料回収方法を、図面を参照して詳細に説明する。なお、本発明は、以下に説明する実施形態により限定されるものではない。
【0010】
〔実施形態〕
以下に、実施形態に係る菌体回収システム１００の構成、各工程の詳細、各工程の流れを順に説明し、最後に実施形態の効果を説明する。
以下に、実施形態に係る菌体回収システム１００の構成、各工程の詳細、各工程の流れを順に説明し、最後に実施形態の効果を説明する。
【0011】
〔１．菌体回収システム１００の構成〕
図１を用いて、実施形態に係る菌体回収システム１００の構成を説明する。図１は、実施形態に係る菌体回収システム１００の構成例を示す図である。以下では、菌体回収システム１００全体の構成例、菌体回収システム１００の各工程、菌体回収システム１００の効果の順に説明する。
図１を用いて、実施形態に係る菌体回収システム１００の構成を説明する。図１は、実施形態に係る菌体回収システム１００の構成例を示す図である。以下では、菌体回収システム１００全体の構成例、菌体回収システム１００の各工程、菌体回収システム１００の効果の順に説明する。
【0012】
（１－１．菌体回収システム１００全体の構成例）
菌体回収システム１００は、菌体培養容器１０、遠心チューブ２０、遠心分離機３０およびピペット４０を有する。以下では、菌体培養容器１０、遠心チューブ２０、遠心分離機３０、ピペット４０の順に説明する。
菌体回収システム１００は、菌体培養容器１０、遠心チューブ２０、遠心分離機３０およびピペット４０を有する。以下では、菌体培養容器１０、遠心チューブ２０、遠心分離機３０、ピペット４０の順に説明する。
【0013】
（１－１－１．菌体培養容器１０）
菌体培養容器１０は、菌体培養液Ｓを収容する容器である。菌体培養液Ｓは、菌体Ｃ等の微生物を培養する溶液である。なお、図１の例では、菌体培養容器１０は、栓の付いた三角フラスコであるが、菌体培養容器１０の形状、材質、容量等は限定されない。
菌体培養容器１０は、菌体培養液Ｓを収容する容器である。菌体培養液Ｓは、菌体Ｃ等の微生物を培養する溶液である。なお、図１の例では、菌体培養容器１０は、栓の付いた三角フラスコであるが、菌体培養容器１０の形状、材質、容量等は限定されない。
【0014】
（１－１－２．遠心チューブ２０）
遠心チューブ２０は、採取された菌体培養液Ｓおよび添加された着色ビーズＢを収容する容器である。なお、遠心チューブ２０の形状、材質、容量等は限定されない。
遠心チューブ２０は、採取された菌体培養液Ｓおよび添加された着色ビーズＢを収容する容器である。なお、遠心チューブ２０の形状、材質、容量等は限定されない。
【0015】
（１－１－３．遠心分離機３０）
遠心分離機３０は、設置された遠心チューブ２０を遠心分離する装置である。なお、遠心分離機３０の種類、遠心加速度等は限定されない。
遠心分離機３０は、設置された遠心チューブ２０を遠心分離する装置である。なお、遠心分離機３０の種類、遠心加速度等は限定されない。
【0016】
（１－１－４．ピペット４０）
ピペット４０は、分離された菌体培養液Ｓの上清を除去する器具である。図１の例では、ピペット４０は、ガラス製の駒込ピペットであるが、ピペット４０の形状、材質、容量等は限定されない。
ピペット４０は、分離された菌体培養液Ｓの上清を除去する器具である。図１の例では、ピペット４０は、ガラス製の駒込ピペットであるが、ピペット４０の形状、材質、容量等は限定されない。
【0017】
（１－１－５．その他）
図１に示した菌体回収システム１００には、複数の菌体培養容器１０、複数の遠心チューブ２０、複数台の遠心分離機３０または複数のピペット４０が含まれてもよい。また、菌体培養容器１０は、遠心チューブ２０と統合した構成であってもよい。また、以下では、実施形態に係る菌体回収システム１００として、菌体培養容器１０が収容する菌体培養液Ｓから菌体Ｃを回収する例について説明するが、培養されていない菌体Ｃを回収する工程にも適用可能であり、菌体回収システム１００の適用範囲は特に限定されるものではない。
図１に示した菌体回収システム１００には、複数の菌体培養容器１０、複数の遠心チューブ２０、複数台の遠心分離機３０または複数のピペット４０が含まれてもよい。また、菌体培養容器１０は、遠心チューブ２０と統合した構成であってもよい。また、以下では、実施形態に係る菌体回収システム１００として、菌体培養容器１０が収容する菌体培養液Ｓから菌体Ｃを回収する例について説明するが、培養されていない菌体Ｃを回収する工程にも適用可能であり、菌体回収システム１００の適用範囲は特に限定されるものではない。
【0018】
（１－２．菌体回収システム１００の工程）
上記の菌体回収システム１００の工程について説明する。以下では、菌体培養液採取工程、着色ビーズ添加工程、遠心分離工程、上清除去工程の順に説明する。なお、各工程は、異なる順序で実行することもできる。また、各工程のうち、省略される工程があってもよい。
上記の菌体回収システム１００の工程について説明する。以下では、菌体培養液採取工程、着色ビーズ添加工程、遠心分離工程、上清除去工程の順に説明する。なお、各工程は、異なる順序で実行することもできる。また、各工程のうち、省略される工程があってもよい。
【0019】
（１－２－１．菌体培養液採取工程）
第１に、菌体回収システム１００では、図１（１）に示す菌体培養液採取工程を実施する。例えば、菌体培養液採取工程では、菌体Ｃとして、大腸菌（Escherichia coli：E.coli）や黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus：S.aureus）を使用し、ＳＣＤ（Soybean Casein Digest）液体培地において３７℃で一晩培養した菌体培養液Ｓの一部を、滅菌済みのホールピペットを使用して遠心チューブ２０に採取する。
第１に、菌体回収システム１００では、図１（１）に示す菌体培養液採取工程を実施する。例えば、菌体培養液採取工程では、菌体Ｃとして、大腸菌（Escherichia coli：E.coli）や黄色ブドウ球菌（Staphylococcus aureus：S.aureus）を使用し、ＳＣＤ（Soybean Casein Digest）液体培地において３７℃で一晩培養した菌体培養液Ｓの一部を、滅菌済みのホールピペットを使用して遠心チューブ２０に採取する。
【0020】
（１－２－２．着色ビーズ添加工程）
第２に、菌体回収システム１００では、図１（２）に示す着色ビーズ添加工程を実施する。例えば、着色ビーズ添加工程では、着色ビーズＢとして、赤色、粒径１．０μｍ、ポリスチレン製の球状のビーズを使用し、菌体培養液Ｓが採取された遠心チューブ２０に着色ビーズＢの懸濁液を添加する。
第２に、菌体回収システム１００では、図１（２）に示す着色ビーズ添加工程を実施する。例えば、着色ビーズ添加工程では、着色ビーズＢとして、赤色、粒径１．０μｍ、ポリスチレン製の球状のビーズを使用し、菌体培養液Ｓが採取された遠心チューブ２０に着色ビーズＢの懸濁液を添加する。
【0021】
（１－２－３．遠心分離工程）
第３に、菌体回収システム１００では、図１（３）に示す遠心分離工程を実施する。例えば、遠心分離工程では、着色ビーズＢが添加された遠心チューブ２０を遠心分離機３０に設置し、遠心チューブ２０を３０００Ｇ、１０分間回転させ、着色ビーズＢと菌体Ｃが含まれる沈殿（適宜、「沈殿物」とも表記）Ｐと菌体培養液Ｓの培地成分が含まれる上清Ｌとを分離する。
第３に、菌体回収システム１００では、図１（３）に示す遠心分離工程を実施する。例えば、遠心分離工程では、着色ビーズＢが添加された遠心チューブ２０を遠心分離機３０に設置し、遠心チューブ２０を３０００Ｇ、１０分間回転させ、着色ビーズＢと菌体Ｃが含まれる沈殿（適宜、「沈殿物」とも表記）Ｐと菌体培養液Ｓの培地成分が含まれる上清Ｌとを分離する。
【0022】
（１－２－４．上清除去工程）
第４に、菌体回収システム１００では、図１（４）に示す上清除去工程を実施する。例えば、上清除去工程では、滅菌済みの駒込ピペットであるピペット４０を使用して、遠心チューブ２０の上清Ｌを除去し、沈殿Ｐに含まれる菌体Ｃを回収する。
第４に、菌体回収システム１００では、図１（４）に示す上清除去工程を実施する。例えば、上清除去工程では、滅菌済みの駒込ピペットであるピペット４０を使用して、遠心チューブ２０の上清Ｌを除去し、沈殿Ｐに含まれる菌体Ｃを回収する。
【0023】
（１－２－５．その他）
菌体回収システム１００では、回収した菌体Ｃから核酸を抽出する核酸抽出工程をさらに実施することができる。例えば、核酸抽出工程では、沈殿Ｐを収容する遠心チューブ２０に菌体Ｃの細胞の溶解を促進する溶解補助剤を添加し、得られた懸濁液を加熱用容器に移し替え、密閉した加熱用容器を１４０℃、４５秒間加熱することによって、菌体Ｃから核酸を抽出することができる。
菌体回収システム１００では、回収した菌体Ｃから核酸を抽出する核酸抽出工程をさらに実施することができる。例えば、核酸抽出工程では、沈殿Ｐを収容する遠心チューブ２０に菌体Ｃの細胞の溶解を促進する溶解補助剤を添加し、得られた懸濁液を加熱用容器に移し替え、密閉した加熱用容器を１４０℃、４５秒間加熱することによって、菌体Ｃから核酸を抽出することができる。
【0024】
（１－３．菌体回収システム１００の効果）
以下では、参考技術としての菌体回収技術の概要、参考技術の改善点を順に説明した上で、菌体回収システム１００の効果について説明する。
以下では、参考技術としての菌体回収技術の概要、参考技術の改善点を順に説明した上で、菌体回収システム１００の効果について説明する。
【0025】
（１－３－１．参考技術の概要）
参考技術の菌体回収技術では、以下の工程が実施される。第１に、菌体培養液を遠心チューブに採取する。第２に、菌体培養液が採取された遠心チューブを遠心分離機に設置し、遠心分離する。第３に、遠心分離後の菌体培養液についてデカンテーションを実施することによって、培地成分を含む上清を除去する。
参考技術の菌体回収技術では、以下の工程が実施される。第１に、菌体培養液を遠心チューブに採取する。第２に、菌体培養液が採取された遠心チューブを遠心分離機に設置し、遠心分離する。第３に、遠心分離後の菌体培養液についてデカンテーションを実施することによって、培地成分を含む上清を除去する。
【0026】
（１－３－２．参考技術の改善点）
参考技術の菌体回収技術では、以下の改善点がある。第１に、少量の菌体を含む菌体培養液を遠心分離した際に沈殿（ペレット）が確認できないので、分離できているのかを判断できない。第２に、遠心分離後のデカンテーションは目視で菌体ペレットを確認しながら操作するので、目に見えない少量の菌体を回収することが困難である。
参考技術の菌体回収技術では、以下の改善点がある。第１に、少量の菌体を含む菌体培養液を遠心分離した際に沈殿（ペレット）が確認できないので、分離できているのかを判断できない。第２に、遠心分離後のデカンテーションは目視で菌体ペレットを確認しながら操作するので、目に見えない少量の菌体を回収することが困難である。
【0027】
（１－３－３．菌体回収システム１００の概要）
菌体回収システム１００では、所定の色彩を有する着色ビーズＢを、菌体Ｃを含む菌体培養液Ｓに添加し、着色ビーズＢが添加された菌体培養液Ｓを遠心分離機３０によって上清Ｌと沈殿Ｐとに分離し、上清Ｌを除去し、沈殿Ｐを回収する。また、菌体回収システム１００では、回収された菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する。
菌体回収システム１００では、所定の色彩を有する着色ビーズＢを、菌体Ｃを含む菌体培養液Ｓに添加し、着色ビーズＢが添加された菌体培養液Ｓを遠心分離機３０によって上清Ｌと沈殿Ｐとに分離し、上清Ｌを除去し、沈殿Ｐを回収する。また、菌体回収システム１００では、回収された菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する。
【0028】
（１－３－４．菌体回収システム１００の効果）
菌体回収システム１００は、以下のような効果が期待できる。第１に、菌体回収システム１００では、菌体培養液Ｓに着色ビーズＢを添加することによって、目視で沈殿Ｐが確認できないような少量な菌体Ｃにおいても、菌体培養液Ｓに含まれる菌体Ｃを回収することが可能となる。第２に、菌体回収システム１００では、回収後に実施する核酸抽出工程を阻害することなく、菌体培養液Ｓに含まれる菌体Ｃを効率よく回収することが可能となる。
菌体回収システム１００は、以下のような効果が期待できる。第１に、菌体回収システム１００では、菌体培養液Ｓに着色ビーズＢを添加することによって、目視で沈殿Ｐが確認できないような少量な菌体Ｃにおいても、菌体培養液Ｓに含まれる菌体Ｃを回収することが可能となる。第２に、菌体回収システム１００では、回収後に実施する核酸抽出工程を阻害することなく、菌体培養液Ｓに含まれる菌体Ｃを効率よく回収することが可能となる。
【0029】
〔２．菌体回収システム１００の各工程の詳細〕
図１に示した菌体回収システム１００の各工程の詳細について説明する。以下では、実施形態に係る各工程について、菌体培養工程、菌体培養液採取工程、着色ビーズ添加工程、遠心分離工程、上清除去工程、核酸抽出工程の順に説明する。
図１に示した菌体回収システム１００の各工程の詳細について説明する。以下では、実施形態に係る各工程について、菌体培養工程、菌体培養液採取工程、着色ビーズ添加工程、遠心分離工程、上清除去工程、核酸抽出工程の順に説明する。
【0030】
（２－１．菌体培養工程）
以下では、菌体回収システム１００の菌体培養液採取工程に先立って実施される、試料である菌体Ｃを培養する菌体培養工程について説明する。
以下では、菌体回収システム１００の菌体培養液採取工程に先立って実施される、試料である菌体Ｃを培養する菌体培養工程について説明する。
【0031】
（２－１－１．菌体培養工程の具体例）
例えば、菌体培養工程では、菌体培養容器１０に収容される菌体培養液Ｓにおいて、菌体Ｃを培養する。培養に使用する器具の一例について説明すると、菌体培養工程では、菌体培養容器１０として滅菌したガラス製の栓付き三角フラスコを使用し、菌体Ｃを培養する。培養する菌体Ｃの一例について説明すると、菌体培養工程では、大腸菌や黄色ブドウ球菌を培養する。培養する条件の一例について説明すると、菌体培養工程では、ＳＣＤ液体培地において菌体Ｃを３７℃で一晩培養する。
例えば、菌体培養工程では、菌体培養容器１０に収容される菌体培養液Ｓにおいて、菌体Ｃを培養する。培養に使用する器具の一例について説明すると、菌体培養工程では、菌体培養容器１０として滅菌したガラス製の栓付き三角フラスコを使用し、菌体Ｃを培養する。培養する菌体Ｃの一例について説明すると、菌体培養工程では、大腸菌や黄色ブドウ球菌を培養する。培養する条件の一例について説明すると、菌体培養工程では、ＳＣＤ液体培地において菌体Ｃを３７℃で一晩培養する。
【0032】
（２－１－２．菌体培養液Ｓの培養方法）
上記の菌体培養工程で使用される菌体培養液Ｓは、核酸を有する試料を培養することにより得られる。試料の培養方法は、特に限定されず、例えば、試料を捕集したフィルターを直接固体培地上に置き、フィルターを介して試料を培養する方法（固相培養）が挙げられる。また、試料の別の培養方法としては、例えば、液体培地または固体培地を水に溶解させた溶液の存在下で試料を培養する方法（液相培養）が挙げられる。また、使用する液体培地や固体培地の種類は、培養する試料の種類や生理的条件によって選択される。
上記の菌体培養工程で使用される菌体培養液Ｓは、核酸を有する試料を培養することにより得られる。試料の培養方法は、特に限定されず、例えば、試料を捕集したフィルターを直接固体培地上に置き、フィルターを介して試料を培養する方法（固相培養）が挙げられる。また、試料の別の培養方法としては、例えば、液体培地または固体培地を水に溶解させた溶液の存在下で試料を培養する方法（液相培養）が挙げられる。また、使用する液体培地や固体培地の種類は、培養する試料の種類や生理的条件によって選択される。
【0033】
（２－１－３．菌体培養液Ｓの試料）
上記の菌体培養工程において、処理対象である試料は、特に限定されない。例えば、処理対象である試料としては、微生物、微生物以外の動物細胞（例えば、昆虫細胞等）、植物細胞、マイコプラズマ、ウィルス等であってもよい。
上記の菌体培養工程において、処理対象である試料は、特に限定されない。例えば、処理対象である試料としては、微生物、微生物以外の動物細胞（例えば、昆虫細胞等）、植物細胞、マイコプラズマ、ウィルス等であってもよい。
【0034】
上記微生物としては、例えば、アシネトバクター（Acinetobacter）種、アクチノミセス（Actinomyces）種、アエロコッカス（Aerococcus）種、アエロモナス（Aeromonas）種、アルカリゲネス（Alcaligenes）種、バチルス（Bacillus）種、バクテリオデス（Bacteriodes）種、ボルデテラ（Bordetella）種、ブランハメラ（Branhamella）種、ブレビバクテリウム（Brevibacterium）種、カンピロバクター（Campylobacter）種、カンジダ（Candida）種、カプノシトファギア（Capnocytophagia）種、クロモバクテリウム（Chromobacterium）種、クロストリジウム（Clostridium）種、コリネバクテリウム（Corynebacterium）種、クリプトコッカス（Cryptococcus）種、デイノコッカス（Deinococcus）種、エンテロコッカス（Enterococcus）種、エリジペロスリックス（Erysipelothrix）種、エシェリシア（Escherichia）種、フラボバクテリウム（Flavobacterium）種、ゲメラ（Gemella）種、ヘモフィルス（Haemophilus）種、クレブシエラ（Klebsiella）種、ラクトバチルス（Lactobacillus）種、ラクトコッカス（Lactococcus）種、レジオネラ（Legionella）種、ロイコノストック（Leuconostoc）種、リステリア（Listeria）種、ミクロコッカス（Micrococcus）種、マイコバクテリウム（Mycobacterium）種、ナイセリア（Neisseria）種、クリプトスポリジウム（Cryptosporidium）種、ノカルディア（Nocardia）種、オエルスコビア（Oerskovia）種、パラコッカス（Paracoccus）種、ペディオコッカス（Pediococcus）種、ペプトストレプトコッカス（Peptostreptococcus）種、プロピオニバクテリウム（Propionibacterium）種、プロテウス（Proteus）種、シュードモナス（Pseudomonas）種、ラーネラ（Rahnella）種、ロドコッカス（Rhodococcus）種、ロドスピリルム（Rhodospirillum）種、スタフィロコッカス（Staphylococcus）種、ストレプトミセス（Streptomyces）種、ストレプトコッカス（Streptococcus）種、ビブリオ（Vibrio）種、およびイェルシニア（Yersinia）種、メチロバクテリウム（Methylobacterium）種、ラルストニア（Ralstonia）種、スフィンゴモナス（Sphingomonas）種からなる群より選ばれる少なくとも１種である。
【0035】
上述した微生物の中には、生育状態によって芽胞や胞子といった形態をとる微生物が存在する。菌体回収システム１００において、処理対象である試料の形態は、特に限定されない。また、菌体回収システム１００において、処理対象である試料は、１種類であってもよく、２種類以上であってもよい。
【0036】
（２－２．菌体培養液採取工程）
以下では、菌体回収システム１００の菌体培養液採取工程の後に実施される、試料溶液である菌体培養液Ｓを採取する菌体培養液採取工程について説明する。
以下では、菌体回収システム１００の菌体培養液採取工程の後に実施される、試料溶液である菌体培養液Ｓを採取する菌体培養液採取工程について説明する。
【0037】
（２－２－１．菌体培養液採取工程の具体例）
例えば、菌体培養液採取工程では、菌体培養容器１０に収容される菌体培養液Ｓの一部を遠心チューブ２０に採取する。採取に使用する器具の一例について説明すると、菌体培養液採取工程では、採取する器具として滅菌したガラス製のホールピペットを使用し、遠心チューブ２０として滅菌したポリプロピレン製の遠沈管を使用し、菌体培養液Ｓを採取する。
例えば、菌体培養液採取工程では、菌体培養容器１０に収容される菌体培養液Ｓの一部を遠心チューブ２０に採取する。採取に使用する器具の一例について説明すると、菌体培養液採取工程では、採取する器具として滅菌したガラス製のホールピペットを使用し、遠心チューブ２０として滅菌したポリプロピレン製の遠沈管を使用し、菌体培養液Ｓを採取する。
【0038】
（２－２－２．遠心チューブ２０）
上記の菌体培養液採取工程において、遠心チューブ２０は、特に限定されない。例えば、遠心チューブ２０は、１５ｍＬ～５０ｍＬ容量の遠沈管の他、マイクロチューブや、耐圧ガラス製の試験管等であってもよい。また、遠心チューブ２０は、遠心分離機３０による高速回転時に２００００Ｇ程度の遠心加速度に対する耐久性があればよい。
上記の菌体培養液採取工程において、遠心チューブ２０は、特に限定されない。例えば、遠心チューブ２０は、１５ｍＬ～５０ｍＬ容量の遠沈管の他、マイクロチューブや、耐圧ガラス製の試験管等であってもよい。また、遠心チューブ２０は、遠心分離機３０による高速回転時に２００００Ｇ程度の遠心加速度に対する耐久性があればよい。
【0039】
（２－３．着色ビーズ添加工程）
以下では、菌体回収システム１００の菌体培養液採取工程の後に実施される、所定の色彩を有するビーズである着色ビーズＢを試料溶液に添加する着色ビーズ添加工程について説明する。
以下では、菌体回収システム１００の菌体培養液採取工程の後に実施される、所定の色彩を有するビーズである着色ビーズＢを試料溶液に添加する着色ビーズ添加工程について説明する。
【0040】
（２－３－１．着色ビーズ添加工程の具体例）
例えば、着色ビーズ添加工程では、赤色、粒径１．０μｍ、ポリスチレン製の着色ビーズＢの懸濁液を、菌体培養液Ｓが採取された遠心チューブ２０に注入することによって、着色ビーズＢを添加する。
例えば、着色ビーズ添加工程では、赤色、粒径１．０μｍ、ポリスチレン製の着色ビーズＢの懸濁液を、菌体培養液Ｓが採取された遠心チューブ２０に注入することによって、着色ビーズＢを添加する。
【0041】
（２－３－２．着色ビーズＢの色彩および形状）
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの色彩および形状は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの色彩は、目視によって視認できる色であればよく、上記の赤色の他、青色、黄色、紫色、白色等であってもよい。また、着色ビーズＢの形状は、一定範囲の粒径の微粒子であればよく、球状の他、楕円体、多面体であってもよいし、粒子の表面に凹凸があってもよいし、粒子を貫通する穴があってもよい。
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの色彩および形状は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの色彩は、目視によって視認できる色であればよく、上記の赤色の他、青色、黄色、紫色、白色等であってもよい。また、着色ビーズＢの形状は、一定範囲の粒径の微粒子であればよく、球状の他、楕円体、多面体であってもよいし、粒子の表面に凹凸があってもよいし、粒子を貫通する穴があってもよい。
【0042】
（２－３－３．着色ビーズＢの材質）
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの材質は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの材質は、核酸抽出工程や核酸増幅工程において抽出や増幅を阻害する影響（例：阻害物質の放出）がなければよく、上記のポリスチレンの他、ラテックス、ポリ乳酸、シリカ、ポリエチレン等であってもよい。また、着色ビーズＢに付着している色素も同様に、核酸抽出工程や核酸増幅工程において抽出や増幅を阻害する影響がなければよい。
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの材質は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの材質は、核酸抽出工程や核酸増幅工程において抽出や増幅を阻害する影響（例：阻害物質の放出）がなければよく、上記のポリスチレンの他、ラテックス、ポリ乳酸、シリカ、ポリエチレン等であってもよい。また、着色ビーズＢに付着している色素も同様に、核酸抽出工程や核酸増幅工程において抽出や増幅を阻害する影響がなければよい。
【0043】
（２－３－４．着色ビーズＢの比重）
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの比重は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの比重は、回収対象となる試料である菌体Ｃの比重に対して所定の範囲内の比重１．１～１．４ｇ／ｍＬ程度であればよい。すなわち、着色ビーズＢの比重は、回収対象となる菌体Ｃと同程度の比重であればよい。
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの比重は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの比重は、回収対象となる試料である菌体Ｃの比重に対して所定の範囲内の比重１．１～１．４ｇ／ｍＬ程度であればよい。すなわち、着色ビーズＢの比重は、回収対象となる菌体Ｃと同程度の比重であればよい。
【0044】
（２－３－５．着色ビーズＢの粒径）
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの粒径は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの粒径は、回収対象となる試料である菌体Ｃの大きさ（例：桿菌２μｍ）に対して所定の範囲内の粒径１．０～３２μｍ程度であればよい。すなわち、着色ビーズＢの粒径は、回収対象となる菌体Ｃと同程度の大きさであればよい。
上記の着色ビーズ添加工程において、着色ビーズＢの粒径は、特に限定されない。例えば、着色ビーズＢの粒径は、回収対象となる試料である菌体Ｃの大きさ（例：桿菌２μｍ）に対して所定の範囲内の粒径１．０～３２μｍ程度であればよい。すなわち、着色ビーズＢの粒径は、回収対象となる菌体Ｃと同程度の大きさであればよい。
【0045】
【0046】
（２－３－６－１．着色ビーズ「Ａ」）
図２の着色ビーズ「Ａ」は、製品名「micromer-blue」、メーカ「micromod社」、品番「60-02-203」、材質「ラテックス」、色「青」、粒径「２μｍ」の着色ビーズＢ－Ａである。
図２の着色ビーズ「Ａ」は、製品名「micromer-blue」、メーカ「micromod社」、品番「60-02-203」、材質「ラテックス」、色「青」、粒径「２μｍ」の着色ビーズＢ－Ａである。
【0047】
（２－３－６－２．着色ビーズ「Ｂ」）
図２の着色ビーズ「Ｂ」は、製品名「PLA-color particles」、メーカ「micromod社」、品番「54-00-203」、材質「着色ポリ乳酸粒子」、色「青」、粒径「２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｂである。
図２の着色ビーズ「Ｂ」は、製品名「PLA-color particles」、メーカ「micromod社」、品番「54-00-203」、材質「着色ポリ乳酸粒子」、色「青」、粒径「２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｂである。
【0048】
（２－３－６－３．着色ビーズ「Ｃ」）
図２の着色ビーズ「Ｃ」は、製品名「sicastar」、メーカ「micromod社」、品番「74-01-303」、材質「シリカ」、色「赤」、粒径「３μｍ」の着色ビーズＢ－Ｃである。
図２の着色ビーズ「Ｃ」は、製品名「sicastar」、メーカ「micromod社」、品番「74-01-303」、材質「シリカ」、色「赤」、粒径「３μｍ」の着色ビーズＢ－Ｃである。
【0049】
（２－３－６－４．着色ビーズ「Ｄ」）
図２の着色ビーズ「Ｄ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「白」、粒径「１．０６μｍ」の着色ビーズＢ－Ｄである。
図２の着色ビーズ「Ｄ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「白」、粒径「１．０６μｍ」の着色ビーズＢ－Ｄである。
【0050】
（２－３－６－５．着色ビーズ「Ｅ」）
図２の着色ビーズ「Ｅ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「赤」、粒径「１．０μｍ」の着色ビーズＢ－Ｅである。
図２の着色ビーズ「Ｅ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「赤」、粒径「１．０μｍ」の着色ビーズＢ－Ｅである。
【0051】
（２－３－６－６．着色ビーズ「Ｆ」）
図２の着色ビーズ「Ｆ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「青」、粒径「１．０μｍ」の着色ビーズＢ－Ｆである。
図２の着色ビーズ「Ｆ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「青」、粒径「１．０μｍ」の着色ビーズＢ－Ｆである。
【0052】
（２－３－６－７．着色ビーズ「Ｇ」）
図２の着色ビーズ「Ｇ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「黄」、粒径「１．０μｍ」の着色ビーズＢ－Ｇである。
図２の着色ビーズ「Ｇ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「黄」、粒径「１．０μｍ」の着色ビーズＢ－Ｇである。
【0053】
（２－３－６－８．着色ビーズ「Ｈ」）
図２の着色ビーズ「Ｈ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「紫」、粒径「０．９７μｍ」の着色ビーズＢ－Ｈである。
図２の着色ビーズ「Ｈ」は、製品名「Polybead Dyed Microsphere」、メーカ「Polysciences社」、品番「16906-1」、材質「ポリスチレン」、色「紫」、粒径「０．９７μｍ」の着色ビーズＢ－Ｈである。
【0054】
（２－３－６－９．着色ビーズ「Ｉ」）
図２の着色ビーズ「Ｉ」は、製品名「Fluorescent Red Polyethylene Microspheres」、メーカ「Cospheric社」、品番「UVPMS-BR-1.090」、材質「ポリエチレン」、色「赤」、粒径「２７－３２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｉである。
図２の着色ビーズ「Ｉ」は、製品名「Fluorescent Red Polyethylene Microspheres」、メーカ「Cospheric社」、品番「UVPMS-BR-1.090」、材質「ポリエチレン」、色「赤」、粒径「２７－３２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｉである。
【0055】
（２－３－６－１０．着色ビーズ「Ｊ」）
図２の着色ビーズ「Ｊ」は、製品名「Fluorescent Red Polyethylene Microspheres」、メーカ「Cospheric社」、品番「UVPMS-BB-1.12」、材質「ポリエチレン」、色「青」、粒径「２７－３２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｊである。
図２の着色ビーズ「Ｊ」は、製品名「Fluorescent Red Polyethylene Microspheres」、メーカ「Cospheric社」、品番「UVPMS-BB-1.12」、材質「ポリエチレン」、色「青」、粒径「２７－３２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｊである。
【0056】
（２－３－６－１１．着色ビーズ「Ｋ」）
図２の着色ビーズ「Ｋ」は、製品名「Fluorescent Red Polyethylene Microspheres」、メーカ「Cospheric社」、品番「UVPMS-BV-1.00」、材質「ポリエチレン」、色「紫」、粒径「２７－３２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｋである。
図２の着色ビーズ「Ｋ」は、製品名「Fluorescent Red Polyethylene Microspheres」、メーカ「Cospheric社」、品番「UVPMS-BV-1.00」、材質「ポリエチレン」、色「紫」、粒径「２７－３２μｍ」の着色ビーズＢ－Ｋである。
【0057】
（２－３－６－１２．着色ビーズ「Ｌ」）
図２の着色ビーズ「Ｌ」は、製品名「Polybead Polystyrene Red Dyed Microsphere 6.00μm」、メーカ「Polysciences社」、品番「15714-5」、材質「ポリスチレン」、色「赤」、粒径「６μｍ」の着色ビーズＢ－Ｌである。
図２の着色ビーズ「Ｌ」は、製品名「Polybead Polystyrene Red Dyed Microsphere 6.00μm」、メーカ「Polysciences社」、品番「15714-5」、材質「ポリスチレン」、色「赤」、粒径「６μｍ」の着色ビーズＢ－Ｌである。
【0058】
（２－４．遠心分離工程）
以下では、菌体回収システム１００の着色ビーズ添加工程の後に実施される、所定の色彩を有するビーズである着色ビーズＢが添加された試料溶液を遠心分離機３０によって上清Ｌと沈殿Ｐとに分離する遠心分離工程について説明する。
以下では、菌体回収システム１００の着色ビーズ添加工程の後に実施される、所定の色彩を有するビーズである着色ビーズＢが添加された試料溶液を遠心分離機３０によって上清Ｌと沈殿Ｐとに分離する遠心分離工程について説明する。
【0059】
（２－４－１．遠心分離工程の具体例）
例えば、遠心分離工程では、菌体培養液Ｓ、および赤色、粒径１．０μｍ、ポリスチレン製の着色ビーズＢの懸濁液を収容した１５ｍＬ容量の遠心チューブ２０を遠心分離機３０に設置し、３０００Ｇ、１０分間の条件で遠心分離する。
例えば、遠心分離工程では、菌体培養液Ｓ、および赤色、粒径１．０μｍ、ポリスチレン製の着色ビーズＢの懸濁液を収容した１５ｍＬ容量の遠心チューブ２０を遠心分離機３０に設置し、３０００Ｇ、１０分間の条件で遠心分離する。
【0060】
（２－４－２．遠心分離機３０）
上記の遠心分離工程において、遠心分離機３０の種類は、特に限定されない。例えば、遠心分離機３０が対応する遠心チューブ２０は、１５ｍＬ～５０ｍＬ容量の遠沈管を設置可能な装置の他、マイクロチューブや、耐圧ガラス製の試験管等を設置可能な装置であってもよい。また、遠心分離機３０の遠心加速度は、最大遠心加速度として２００００Ｇ程度あればよいが、特に限定されない。また、遠心分離機３０のローターは、アングルローターであっても、スイングローターであってもよい。
上記の遠心分離工程において、遠心分離機３０の種類は、特に限定されない。例えば、遠心分離機３０が対応する遠心チューブ２０は、１５ｍＬ～５０ｍＬ容量の遠沈管を設置可能な装置の他、マイクロチューブや、耐圧ガラス製の試験管等を設置可能な装置であってもよい。また、遠心分離機３０の遠心加速度は、最大遠心加速度として２００００Ｇ程度あればよいが、特に限定されない。また、遠心分離機３０のローターは、アングルローターであっても、スイングローターであってもよい。
【0061】
（２－５．上清除去工程）
以下では、菌体回収システム１００の遠心分離工程の後に実施される、上清Ｌを除去し、沈殿Ｐを回収する上清除去工程について説明する。
以下では、菌体回収システム１００の遠心分離工程の後に実施される、上清Ｌを除去し、沈殿Ｐを回収する上清除去工程について説明する。
【0062】
（２－５－１．上清除去工程の具体例）
例えば、上清除去工程では、ピペット４０として滅菌済みの駒込ピペットを使用して、遠心チューブ２０の培地成分が含まれる上清Ｌを除去する。
例えば、上清除去工程では、ピペット４０として滅菌済みの駒込ピペットを使用して、遠心チューブ２０の培地成分が含まれる上清Ｌを除去する。
【0063】
（２－５－２．ピペット４０）
上記の上清除去工程において、ピペット４０の種類は、特に限定されない。例えば、ピペット４０は、駒込ピペットの他、スポイト、ホールピペット、メスピペット、マイクロピペット、キャピラリー等であってもよい。
上記の上清除去工程において、ピペット４０の種類は、特に限定されない。例えば、ピペット４０は、駒込ピペットの他、スポイト、ホールピペット、メスピペット、マイクロピペット、キャピラリー等であってもよい。
【0064】
（２－６．核酸抽出工程）
以下では、菌体回収システム１００の上清除去工程の後に実施される、回収された試料である菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する核酸抽出工程について説明する。
以下では、菌体回収システム１００の上清除去工程の後に実施される、回収された試料である菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する核酸抽出工程について説明する。
【0065】
（２－６－１．核酸抽出工程の具体例）
例えば、核酸抽出工程では、試料である菌体Ｃに細胞の溶解を促進する溶解補助剤を添加して混合液を調製し、調製した混合液を加熱に耐久性のある核酸抽出用チューブに移し替え、核酸抽出用チューブの蓋を閉めることによって密閉し、混合液が収容された核酸抽出用チューブをヒートブロック等の加熱装置を用いて１４０℃、４５秒間加熱することによって、菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する。
例えば、核酸抽出工程では、試料である菌体Ｃに細胞の溶解を促進する溶解補助剤を添加して混合液を調製し、調製した混合液を加熱に耐久性のある核酸抽出用チューブに移し替え、核酸抽出用チューブの蓋を閉めることによって密閉し、混合液が収容された核酸抽出用チューブをヒートブロック等の加熱装置を用いて１４０℃、４５秒間加熱することによって、菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する。
【0066】
（２－６－２．溶解補助剤の種類）
菌体回収システム１００の核酸抽出工程では、水のみでも上記効果を発揮するが、試料から核酸をより効率的に抽出する目的で、水以外に、界面活性剤、アルカリ、酸、酸化還元剤およびタンパク質変性剤からなる群から選ばれる少なくとも１種の溶解補助剤を含むことが好ましい。溶解補助剤は、試料の膜構造を溶解させる能力を有する。溶解補助剤が試料の膜構造に作用することで、試料を破壊しやすくなり、試料から核酸をより効率的に抽出することができる。以下では、溶解補助剤の種類について説明する。
菌体回収システム１００の核酸抽出工程では、水のみでも上記効果を発揮するが、試料から核酸をより効率的に抽出する目的で、水以外に、界面活性剤、アルカリ、酸、酸化還元剤およびタンパク質変性剤からなる群から選ばれる少なくとも１種の溶解補助剤を含むことが好ましい。溶解補助剤は、試料の膜構造を溶解させる能力を有する。溶解補助剤が試料の膜構造に作用することで、試料を破壊しやすくなり、試料から核酸をより効率的に抽出することができる。以下では、溶解補助剤の種類について説明する。
【0067】
（２－６－２－１．界面活性剤）
溶解補助剤として使用する界面活性剤は、例えばイオン性であってもよく、非イオン性であってもよい。非イオン性の界面活性剤としては、例えばオクチルフェノールエトキシレート（Ｃ１４Ｈ２２Ｏ（Ｃ２Ｈ４Ｏ）ｎ）等が挙げられる。菌体回収システム１００の核酸抽出工程では、市販品のオクチルフェノールエトキシレートを用いることができ、例えばＳＩＧＭＡ社製のＴｒｉｔｏｎＸ－１００（Ｃ１４Ｈ２２Ｏ（Ｃ２Ｈ４Ｏ）ｎ，ｎ＝１００）等が挙げられる。
溶解補助剤として使用する界面活性剤は、例えばイオン性であってもよく、非イオン性であってもよい。非イオン性の界面活性剤としては、例えばオクチルフェノールエトキシレート（Ｃ１４Ｈ２２Ｏ（Ｃ２Ｈ４Ｏ）ｎ）等が挙げられる。菌体回収システム１００の核酸抽出工程では、市販品のオクチルフェノールエトキシレートを用いることができ、例えばＳＩＧＭＡ社製のＴｒｉｔｏｎＸ－１００（Ｃ１４Ｈ２２Ｏ（Ｃ２Ｈ４Ｏ）ｎ，ｎ＝１００）等が挙げられる。
【0068】
また、イオン性の界面活性剤は、陰イオン性であってもよく、陽イオン性であってもよく、両イオン性であってもよい。陰イオン性の界面活性剤としては、例えばドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ：Sodium Dodecyl Sulfate）等が挙げられる。陽イオン性の界面活性剤としては、例えば臭化セチルトリメチルアンモニウム（ＣＴＡＢ：Cetyltrimethylammonium Bromide）等が挙げられる。両イオン性の界面活性剤としては、例えばベタイン等が挙げられる。ここで、「ベタイン」とは、正電荷と負電荷とを同一分子内の隣り合わない位置に持ち、正電荷をもつ原子には解離しうる水素原子が結合しておらず、分子全体としては電荷を持たない化合物の総称のことである。ベタインの代表例としては、トリメチルグリシンが挙げられる。
【0069】
（２－６－２－２．アルカリ）
溶解補助剤として使用するアルカリとしては、例えば水酸化ナトリウム（ＮａＯＨ）、または水酸化カリウム（ＫＯＨ）等が挙げられる。
溶解補助剤として使用するアルカリとしては、例えば水酸化ナトリウム（ＮａＯＨ）、または水酸化カリウム（ＫＯＨ）等が挙げられる。
【0070】
（２－６－２－３．酸）
溶解補助剤として使用する酸としては、例えば塩酸（ＨＣｌ）、または硫酸（Ｈ２ＳＯ４）等が挙げられる。
溶解補助剤として使用する酸としては、例えば塩酸（ＨＣｌ）、または硫酸（Ｈ２ＳＯ４）等が挙げられる。
【0071】
（２－６－２－４．酸化還元剤）
溶解補助剤として使用する酸化還元剤としては、例えば過酸化水素水、β－メルカプトエタノール、ジチオトレイトール等が挙げられる。
溶解補助剤として使用する酸化還元剤としては、例えば過酸化水素水、β－メルカプトエタノール、ジチオトレイトール等が挙げられる。
【0072】
（２－６－２－５．タンパク質変性剤）
溶解補助剤として使用するタンパク質変性剤としては、例えばグアニジン塩酸塩、尿素等が挙げられる。
溶解補助剤として使用するタンパク質変性剤としては、例えばグアニジン塩酸塩、尿素等が挙げられる。
【0073】
（２－６－２－６．その他）
溶解補助剤の成分として、キレート剤を使用してもよい。溶解補助剤として使用するキレート剤としては、例えばエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ：Ethylenediaminetetraacetic Acid）等が挙げられる。
溶解補助剤の成分として、キレート剤を使用してもよい。溶解補助剤として使用するキレート剤としては、例えばエチレンジアミン四酢酸（ＥＤＴＡ：Ethylenediaminetetraacetic Acid）等が挙げられる。
【0074】
また、上述した溶解補助剤の中でも、菌体回収システム１００の溶解補助剤は、界面活性剤を含むことが好ましく、ＳＤＳと、オクチルフェノールエトキシレートとのいずれか一方または両方を含むことがより好ましい。
【0075】
例えば、菌体回収システム１００の核酸抽出工程で抽出した核酸を高感度で検出したい場合にはＳＤＳを用いるとよい。これに対し、菌体回収システム１００の核酸抽出工程で抽出した核酸を、ＳＤＳによって阻害される酵素反応に用いる場合には、試料の膜構造に対してＳＤＳよりも温和に作用するオクチルフェノールエトキシレートを用いるとよい。
【0076】
菌体回収システム１００の溶解補助剤は、必要に応じて緩衝剤を含んでもよい。緩衝剤としては、例えばトリスヒドロキシメチルアミノメタン塩酸塩（Ｔｒｉｓ－ＨＣｌ）等が挙げられる。
【0077】
（２－６－３．核酸の種類）
上記の核酸抽出工程において、抽出される核酸の種類は、特に限定されない。例えば、抽出される核酸としては、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ：Deoxyribonucleic Acid）であるゲノムＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ等や、リボ核酸（ＲＮＡ：Ribonucleic Acid）であるメッセンジャーＲＮＡ、トランスファーＲＮＡ、リボソームＲＮＡ等であってもよい。
上記の核酸抽出工程において、抽出される核酸の種類は、特に限定されない。例えば、抽出される核酸としては、デオキシリボ核酸（ＤＮＡ：Deoxyribonucleic Acid）であるゲノムＤＮＡ、プラスミドＤＮＡ等や、リボ核酸（ＲＮＡ：Ribonucleic Acid）であるメッセンジャーＲＮＡ、トランスファーＲＮＡ、リボソームＲＮＡ等であってもよい。
【0078】
【0079】
（３－１．実験結果１）
図３を用いて、菌体回収システム１００による着色ビーズＢの挙動を確認する実験結果１について説明する。図３は、実施形態に係る実験結果１を説明するための図である。以下では、実験手順を示しつつ、遠心分離前の着色ビーズＢの状態、遠心分離後の着色ビーズＢの状態、実験結果１の考察の順に説明する。
図３を用いて、菌体回収システム１００による着色ビーズＢの挙動を確認する実験結果１について説明する。図３は、実施形態に係る実験結果１を説明するための図である。以下では、実験手順を示しつつ、遠心分離前の着色ビーズＢの状態、遠心分離後の着色ビーズＢの状態、実験結果１の考察の順に説明する。
【0080】
（３－１－１．遠心分離前の着色ビーズＢの状態）
図３（１）は、図２に示した着色ビーズ「Ｅ」（赤色）である着色ビーズＢ－Ｅの懸濁液１０μＬを、１０ｍＬの脱イオン水（ＤＩＷ：Deionized Water）が入った１５ｍＬの遠心チューブ２０に添加した状態を示す。図３（１）では、着色ビーズＢ－Ｅの色彩に由来する赤色の懸濁液が観察される。
図３（１）は、図２に示した着色ビーズ「Ｅ」（赤色）である着色ビーズＢ－Ｅの懸濁液１０μＬを、１０ｍＬの脱イオン水（ＤＩＷ：Deionized Water）が入った１５ｍＬの遠心チューブ２０に添加した状態を示す。図３（１）では、着色ビーズＢ－Ｅの色彩に由来する赤色の懸濁液が観察される。
【0081】
（３－１－２．遠心分離後の着色ビーズＢの状態）
図３（２）は、図２に示した着色ビーズ「Ｅ」（赤色）である着色ビーズＢ－Ｅの懸濁液を、遠心分離機３０によって３０００Ｇ、１０分間の条件で遠心分離した状態を示す。図３（２）では、着色ビーズＢ－Ｅの色彩に由来する濃い赤色の沈殿Ｐが観察される。
図３（２）は、図２に示した着色ビーズ「Ｅ」（赤色）である着色ビーズＢ－Ｅの懸濁液を、遠心分離機３０によって３０００Ｇ、１０分間の条件で遠心分離した状態を示す。図３（２）では、着色ビーズＢ－Ｅの色彩に由来する濃い赤色の沈殿Ｐが観察される。
【0082】
（３－１－３．実験結果１の考察）
図３（１）および（２）の実験結果１より、菌体回収システム１００では、遠心分離前の赤色の懸濁液が遠心分離後に濃い赤色の沈殿Ｐとして観察されるので、着色ビーズＢが沈殿Ｐを形成することが確認できる。
図３（１）および（２）の実験結果１より、菌体回収システム１００では、遠心分離前の赤色の懸濁液が遠心分離後に濃い赤色の沈殿Ｐとして観察されるので、着色ビーズＢが沈殿Ｐを形成することが確認できる。
【0083】
（３－２．実験結果２）
図４および図５を用いて、菌体回収システム１００による菌体Ｃの回収量を確認する実験結果２（２－１、２－２）について説明する。以下では、着色ビーズＢを添加した遠心チューブ２０等の状態、着色ビーズＢを使用した核酸抽出効率、実験結果２の考察の順に説明する。
図４および図５を用いて、菌体回収システム１００による菌体Ｃの回収量を確認する実験結果２（２－１、２－２）について説明する。以下では、着色ビーズＢを添加した遠心チューブ２０等の状態、着色ビーズＢを使用した核酸抽出効率、実験結果２の考察の順に説明する。
【0084】
（３－２－１．遠心チューブ２０等の状態）
図４を用いて、着色ビーズＢを添加した遠心チューブ２０等の状態について説明する。図４は、実施形態に係る実験結果２－１を説明するための図である。以下では、実験手順を示しつつ、懸濁液の状態、沈殿Ｐの状態、希釈液の状態について説明する。
図４を用いて、着色ビーズＢを添加した遠心チューブ２０等の状態について説明する。図４は、実施形態に係る実験結果２－１を説明するための図である。以下では、実験手順を示しつつ、懸濁液の状態、沈殿Ｐの状態、希釈液の状態について説明する。
【0085】
（３－２－１－１．懸濁液の状態）
以下のように、懸濁液の調製を実施する。第１に、ＳＣＤ培地で３７℃、一晩培養した大腸菌（E.coli）および黄色ブドウ球菌（S.aureus）から菌体懸濁液（約１０６細胞数／ｍＬ）を調製する。第２に、調製した菌体懸濁液１ｍＬに着色ビーズＢ－Ｅ（着色ビーズ「Ｅ」：赤色）、着色ビーズＢ－Ｆ（着色ビーズ「Ｆ」：青色）および着色ビーズＢ－Ｌ（着色ビーズ「Ｌ」：赤色）の懸濁液５μＬをそれぞれ添加する。第３に、着色ビーズＢを添加しない対照試料「ＮＣ」を準備する。このとき、調製した各懸濁液（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）は、図４（１）のように観察される。
以下のように、懸濁液の調製を実施する。第１に、ＳＣＤ培地で３７℃、一晩培養した大腸菌（E.coli）および黄色ブドウ球菌（S.aureus）から菌体懸濁液（約１０６細胞数／ｍＬ）を調製する。第２に、調製した菌体懸濁液１ｍＬに着色ビーズＢ－Ｅ（着色ビーズ「Ｅ」：赤色）、着色ビーズＢ－Ｆ（着色ビーズ「Ｆ」：青色）および着色ビーズＢ－Ｌ（着色ビーズ「Ｌ」：赤色）の懸濁液５μＬをそれぞれ添加する。第３に、着色ビーズＢを添加しない対照試料「ＮＣ」を準備する。このとき、調製した各懸濁液（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）は、図４（１）のように観察される。
【0086】
図４（１）では、着色ビーズＢ－Ｅの懸濁液が赤色（図４（１）「Ｅ」参照）、着色ビーズＢ－Ｆの懸濁液が青色（図４（１）「Ｆ」参照）、着色ビーズＢ－Ｌの懸濁液が赤色（図４（１）「Ｌ」参照）、対照試料が無色（図４（１）「ＮＣ」参照）として観察される。
【0087】
（３－２－１－２．沈殿Ｐの状態）
以下のように、沈殿Ｐの回収を実施する。第１に、調製した各懸濁液（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）を、１３０００Ｇ、１０分間遠心分離して沈殿Ｐを沈降させ、上清９８０μＬを除去する。このとき、沈降した各沈殿Ｐ（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）は、図４（２）のように観察される。
以下のように、沈殿Ｐの回収を実施する。第１に、調製した各懸濁液（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）を、１３０００Ｇ、１０分間遠心分離して沈殿Ｐを沈降させ、上清９８０μＬを除去する。このとき、沈降した各沈殿Ｐ（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）は、図４（２）のように観察される。
【0088】
図４（２）では、着色ビーズＢ－Ｅの沈殿Ｐが濃い赤色（図４（２）「Ｅ」参照）、着色ビーズＢ－Ｆの沈殿Ｐが濃い青色（図４（２）「Ｆ」参照）、着色ビーズＢ－Ｌの沈殿Ｐが濃い赤色（図４（２）「Ｌ」参照）、対照試料の沈殿Ｐが無色（図４（２）「ＮＣ」参照）として観察される。
【0089】
（３－２－１－３．希釈液の状態）
以下のように、希釈液の調製を実施する。第１に、回収した沈殿Ｐに溶解補助剤２０μＬを添加して混合液を調製する。第２に、調製した混合液を核酸抽出用チューブに移し替えて、密閉して１４０℃、４５秒間加熱する高温高圧処理を実施する。第３に、高温高圧処理後の混合液を脱イオン水で１／２５倍に希釈して希釈液を調製する。第４に、調製した希釈液を遠心分離する。このとき、調製した各希釈液（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）は、図４（３）のように観察される。
以下のように、希釈液の調製を実施する。第１に、回収した沈殿Ｐに溶解補助剤２０μＬを添加して混合液を調製する。第２に、調製した混合液を核酸抽出用チューブに移し替えて、密閉して１４０℃、４５秒間加熱する高温高圧処理を実施する。第３に、高温高圧処理後の混合液を脱イオン水で１／２５倍に希釈して希釈液を調製する。第４に、調製した希釈液を遠心分離する。このとき、調製した各希釈液（着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）は、図４（３）のように観察される。
【0090】
図４（３）では、着色ビーズＢ－Ｅの濃い赤色沈殿および薄い赤色溶液（図４（３）「Ｅ」参照）、着色ビーズＢ－Ｆの濃い青色沈殿および薄い青色溶液（図４（３）「Ｆ」参照）、着色ビーズＢ－Ｌの濃い赤色沈殿および薄い赤色溶液（図４（３）「Ｌ」参照）、対照試料の無色溶液（図４（３）「ＮＣ」参照）が観察される。
【0091】
（３－２－２．核酸抽出効率）
図５を用いて、着色ビーズＢを使用した核酸抽出効率について説明する。図５は、実施形態に係る実験結果２－２を説明するための図である。以下では、実験手順を示しつつ、大腸菌、黄色ブドウ球菌の順に説明する。
図５を用いて、着色ビーズＢを使用した核酸抽出効率について説明する。図５は、実施形態に係る実験結果２－２を説明するための図である。以下では、実験手順を示しつつ、大腸菌、黄色ブドウ球菌の順に説明する。
【0092】
（３－２－２－１．大腸菌の核酸抽出効率）
以下のように、大腸菌の核酸抽出効率を算出する。第１に、大腸菌の菌体Ｃについて、上述した懸濁液の調製、沈殿Ｐの回収、希釈液の調製の順に操作を実施し、遠心分離後の希釈液を分取する。第２に、分取した大腸菌の希釈液に対して、タカラバイオ社「Bacteria-tuf gene Quntitative PCR」のプロトコルにしたがって、ｑＰＣＲ（quantitative Polymerase Chain Reaction）を実施し、抽出核酸量を定量する。第３に、着色ビーズＢを添加していない大腸菌の抽出核酸量を１００％として、核酸抽出効率を算出する。
以下のように、大腸菌の核酸抽出効率を算出する。第１に、大腸菌の菌体Ｃについて、上述した懸濁液の調製、沈殿Ｐの回収、希釈液の調製の順に操作を実施し、遠心分離後の希釈液を分取する。第２に、分取した大腸菌の希釈液に対して、タカラバイオ社「Bacteria-tuf gene Quntitative PCR」のプロトコルにしたがって、ｑＰＣＲ（quantitative Polymerase Chain Reaction）を実施し、抽出核酸量を定量する。第３に、着色ビーズＢを添加していない大腸菌の抽出核酸量を１００％として、核酸抽出効率を算出する。
【0093】
図５の「E.Coli」の棒グラフが示すように、着色ビーズＢ－Ｅ（図５「Ｅ」左参照）を添加した場合では１２０％強の抽出効率、着色ビーズＢ－Ｆ（図５「Ｆ」左参照）を添加した場合では１００％程度の抽出効率、着色ビーズＢ－Ｌ（図５「Ｌ」左参照）を添加した場合では１００％程度の抽出効率で、回収した大腸菌の沈殿Ｐから十分量の核酸を抽出することができる。
【0094】
（３－２－２－２．黄色ブドウ球菌の核酸抽出効率）
以下のように、黄色ブドウ球菌の核酸抽出効率を算出する。第１に、黄色ブドウ球菌の菌体Ｃについて、上述した懸濁液の調製、沈殿Ｐの回収、希釈液の調製の順に操作を実施し、遠心分離後の希釈液を分取する。第２に、分取した黄色ブドウ球菌の希釈液に対して、タカラバイオ社「Bacteria-tuf gene Quntitative PCR」のプロトコルにしたがって、ｑＰＣＲを実施し、抽出核酸量を定量する。第３に、着色ビーズＢを添加していない黄色ブドウ球菌の抽出核酸量を１００％として、核酸抽出効率を算出する。
以下のように、黄色ブドウ球菌の核酸抽出効率を算出する。第１に、黄色ブドウ球菌の菌体Ｃについて、上述した懸濁液の調製、沈殿Ｐの回収、希釈液の調製の順に操作を実施し、遠心分離後の希釈液を分取する。第２に、分取した黄色ブドウ球菌の希釈液に対して、タカラバイオ社「Bacteria-tuf gene Quntitative PCR」のプロトコルにしたがって、ｑＰＣＲを実施し、抽出核酸量を定量する。第３に、着色ビーズＢを添加していない黄色ブドウ球菌の抽出核酸量を１００％として、核酸抽出効率を算出する。
【0095】
図５の「S.aureus」の棒グラフが示すように、着色ビーズＢ－Ｅ（図５「Ｅ」右参照）を添加した場合では８０％弱の抽出効率、着色ビーズＢ－Ｆ（図５「Ｆ」右参照）を添加した場合では８０％弱の抽出効率、着色ビーズＢ－Ｌ（図５「Ｌ」右参照）を添加した場合では８０％程度の抽出効率で、回収した黄色ブドウ球菌の沈殿Ｐから十分量の核酸を抽出することができる。
【0096】
（３－２－２－３．実験結果２の考察）
図４および図５の実験結果２より、菌体回収システム１００では、大腸菌および黄色ブドウ球菌に対して、着色ビーズＢを用いた遠心分離において菌体Ｃを効率よく回収することが確認できる。また、着色ビーズＢの色素成分の一部が核酸を抽出した希釈液に溶出するものの、核酸抽出効率に影響を与えないことが確認できる。
図４および図５の実験結果２より、菌体回収システム１００では、大腸菌および黄色ブドウ球菌に対して、着色ビーズＢを用いた遠心分離において菌体Ｃを効率よく回収することが確認できる。また、着色ビーズＢの色素成分の一部が核酸を抽出した希釈液に溶出するものの、核酸抽出効率に影響を与えないことが確認できる。
【0097】
（３－３．実験結果３）
図６を用いて、菌体回収システム１００による回収した菌体Ｃを高温高圧処理時のＰＣＲ（Polymerase Chain Reaction）阻害物質の溶出を確認する実験結果３について説明する。図６は、実施形態に係る実験結果３を説明するための図である。以下では、ＰＣＲ阻害物質の評価、実験結果３の考察の順に説明する。
図６を用いて、菌体回収システム１００による回収した菌体Ｃを高温高圧処理時のＰＣＲ（Polymerase Chain Reaction）阻害物質の溶出を確認する実験結果３について説明する。図６は、実施形態に係る実験結果３を説明するための図である。以下では、ＰＣＲ阻害物質の評価、実験結果３の考察の順に説明する。
【0098】
（３－３－１．ＰＣＲ阻害物質の評価）
図６に示す棒グラフは、調製した各懸濁液（着色ビーズ「Ａ」、着色ビーズ「Ｂ」、着色ビーズ「Ｃ」、着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｉ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）それぞれについて、溶解補助剤を添加した溶液「Ｌ－ｓｏｌ．」、脱イオン水「ＤＩＷ」、溶解補助剤かつ着色ビーズＢを添加した溶液「Ｌ－ｓｏｌ．＋Ｂｅａｄｓ」ごとの、上述した高温高圧処理した後の希釈液中のＰＣＲ阻害物質の濃度ｎｍｏｌ／Ｌを示す。
図６に示す棒グラフは、調製した各懸濁液（着色ビーズ「Ａ」、着色ビーズ「Ｂ」、着色ビーズ「Ｃ」、着色ビーズ「Ｅ」、着色ビーズ「Ｆ」、着色ビーズ「Ｉ」、着色ビーズ「Ｌ」、対照試料「ＮＣ」）それぞれについて、溶解補助剤を添加した溶液「Ｌ－ｓｏｌ．」、脱イオン水「ＤＩＷ」、溶解補助剤かつ着色ビーズＢを添加した溶液「Ｌ－ｓｏｌ．＋Ｂｅａｄｓ」ごとの、上述した高温高圧処理した後の希釈液中のＰＣＲ阻害物質の濃度ｎｍｏｌ／Ｌを示す。
【0099】
図６の各棒グラフが示すように、着色ビーズＢ－Ａ（図６「Ａ」参照）では各希釈液について３００～３３０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、着色ビーズＢ－Ｂ（図６「Ｂ」参照）では各希釈液について３３０～３５０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、着色ビーズＢ－Ｃ（図６「Ｃ」参照）では各希釈液について３００～３７０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、着色ビーズＢ－Ｅ（図６「Ｅ」参照）では各希釈液について３００～３６０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、着色ビーズＢ－Ｆ（図６「Ｆ」参照）では各希釈液について３００ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、着色ビーズＢ－Ｉ（図５「Ｉ」参照）では各希釈液について３００～３４０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、着色ビーズＢ－Ｌ（図６「Ｌ」参照）では各希釈液について３００～３７０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度、対照試料（図６「ＮＣ」参照）では各希釈液について２５０～３４０ｎｍｏｌ／Ｌ程度の濃度で、ＰＣＲ阻害物質が溶出したことが確認できる。
【0100】
（３－３－２．実験結果３の考察）
図６の実験結果３より、菌体回収システム１００では、着色ビーズＢを用いた遠心分離において回収した菌体Ｃから核酸を抽出する際に、核酸抽出量に影響を与える着色ビーズＢ由来のＰＣＲ阻害物質（例：色素成分、高分子化合物成分）が溶出されないことが確認できる。
図６の実験結果３より、菌体回収システム１００では、着色ビーズＢを用いた遠心分離において回収した菌体Ｃから核酸を抽出する際に、核酸抽出量に影響を与える着色ビーズＢ由来のＰＣＲ阻害物質（例：色素成分、高分子化合物成分）が溶出されないことが確認できる。
【0101】
〔４．菌体回収システム１００の処理の流れ〕
図７を用いて、実施形態に係る菌体回収システム１００の工程の流れについて説明する。図７は、実施形態に係る菌体回収工程の流れの一例を示すフローチャートである。なお、下記のステップＳ１０１～Ｓ１０４の工程は、異なる順序で実行することもできる。また、下記のステップＳ１０１～Ｓ１０４の工程のうち、省略される工程があってもよい。
図７を用いて、実施形態に係る菌体回収システム１００の工程の流れについて説明する。図７は、実施形態に係る菌体回収工程の流れの一例を示すフローチャートである。なお、下記のステップＳ１０１～Ｓ１０４の工程は、異なる順序で実行することもできる。また、下記のステップＳ１０１～Ｓ１０４の工程のうち、省略される工程があってもよい。
【0102】
第１に、菌体回収システム１００では、菌体培養液採取工程を実施する（ステップＳ１０１）。第２に、菌体回収システム１００では、着色ビーズ添加工程を実施する（ステップＳ１０２）。第３に、菌体回収システム１００では、遠心分離工程を実施する（ステップＳ１０３）。第４に、菌体回収システム１００では、上清除去工程を実施し（ステップＳ１０４）、菌体回収工程を終了する。
【0103】
〔５．実施形態の効果〕
最後に、実施形態の効果について説明する。以下では、実施形態に係る工程に対応する効果１～６について説明する。
最後に、実施形態の効果について説明する。以下では、実施形態に係る工程に対応する効果１～６について説明する。
【0104】
（５－１．効果１）
第１に、上述した実施形態に係る工程では、所定の色彩を有する着色ビーズＢを菌体培養液Ｓに添加し、遠心分離機３０を用いて着色ビーズＢが添加された菌体培養液Ｓを上清Ｌと沈殿Ｐとに分離し、上清Ｌを除去し、沈殿Ｐを回収する。このため、実施形態に係る工程では、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
第１に、上述した実施形態に係る工程では、所定の色彩を有する着色ビーズＢを菌体培養液Ｓに添加し、遠心分離機３０を用いて着色ビーズＢが添加された菌体培養液Ｓを上清Ｌと沈殿Ｐとに分離し、上清Ｌを除去し、沈殿Ｐを回収する。このため、実施形態に係る工程では、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
【0105】
（５－２．効果２）
第２に、上述した実施形態に係る工程では、回収対象となる菌体Ｃの比重に対して所定の範囲内の比重である着色ビーズＢを添加する。このため、実施形態に係る工程では、菌体Ｃと同程度の比重の着色ビーズＢを使用することによって、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
第２に、上述した実施形態に係る工程では、回収対象となる菌体Ｃの比重に対して所定の範囲内の比重である着色ビーズＢを添加する。このため、実施形態に係る工程では、菌体Ｃと同程度の比重の着色ビーズＢを使用することによって、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
【0106】
（５－３．効果３）
第３に、上述した実施形態に係る工程では、回収対象となる菌体Ｃの大きさに対して所定の範囲内の粒径である着色ビーズＢを添加する。このため、実施形態に係る工程では、菌体Ｃと同程度の大きさの着色ビーズＢを使用することによって、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
第３に、上述した実施形態に係る工程では、回収対象となる菌体Ｃの大きさに対して所定の範囲内の粒径である着色ビーズＢを添加する。このため、実施形態に係る工程では、菌体Ｃと同程度の大きさの着色ビーズＢを使用することによって、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
【0107】
（５－４．効果４）
第４に、上述した実施形態に係る工程では、着色ビーズＢは、ラテックス、ポリ乳酸、シリカ、ポリスチレンまたはポリエチレンである。このため、実施形態に係る工程では、広く流通している着色ビーズＢを使用することによって、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
第４に、上述した実施形態に係る工程では、着色ビーズＢは、ラテックス、ポリ乳酸、シリカ、ポリスチレンまたはポリエチレンである。このため、実施形態に係る工程では、広く流通している着色ビーズＢを使用することによって、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収することができる。
【0108】
（５－５．効果５）
第５に、上述した実施形態に係る工程では、試料溶液は、菌体培養液Ｓである。このため、実施形態に係る工程では、遠心分離によって、さまざまな分析対象となる試料の中でも特に菌体Ｃを効率よく回収することができる。
第５に、上述した実施形態に係る工程では、試料溶液は、菌体培養液Ｓである。このため、実施形態に係る工程では、遠心分離によって、さまざまな分析対象となる試料の中でも特に菌体Ｃを効率よく回収することができる。
【0109】
（５－６．効果６）
第６に、上述した実施形態に係る工程では、回収した菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する。このため、実施形態に係る工程では、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収し、さらに効率的に核酸を抽出することができる。
第６に、上述した実施形態に係る工程では、回収した菌体Ｃの細胞から核酸を抽出する。このため、実施形態に係る工程では、遠心分離によって菌体Ｃを効率よく回収し、さらに効率的に核酸を抽出することができる。
【0110】
〔システム〕
上記文書中や図面中で示した処理手順、制御手順、具体的名称、各種のデータやパラメータを含む情報については、特記する場合を除いて任意に変更することができる。
上記文書中や図面中で示した処理手順、制御手順、具体的名称、各種のデータやパラメータを含む情報については、特記する場合を除いて任意に変更することができる。
【0111】
また、図示した各装置の各構成要素は機能概念的なものであり、必ずしも物理的に図示の如く構成されていることを要しない。すなわち、各装置の分散や統合の具体的形態は図示のものに限られない。つまり、その全部または一部を、各種の負荷や使用状況などに応じて、任意の単位で機能的または物理的に分散・統合して構成することができる。
【0112】
〔その他〕
開示される技術特徴の組合せのいくつかの例を以下に記載する。
開示される技術特徴の組合せのいくつかの例を以下に記載する。
【0113】
（１）試料を含む試料溶液から前記試料を回収する試料回収方法であって、所定の色彩を有するビーズを前記試料溶液に添加する添加工程と、遠心分離機を用いて、前記ビーズが添加された前記試料溶液を上清と沈殿物とに分離する分離工程と、前記上清を除去し、前記沈殿物を回収する除去工程と、を含む試料回収方法。
【0114】
（２）前記添加工程は、回収対象となる前記試料の比重に対して所定の範囲内の比重である前記ビーズを添加する、（１）に記載の試料回収方法。
【0115】
（３）前記添加工程は、回収対象となる前記試料の大きさに対して所定の範囲内の粒径である前記ビーズを添加する、（１）または（２）に記載の試料回収方法。
【0116】
（４）前記ビーズは、ラテックス、ポリ乳酸、シリカ、ポリスチレンまたはポリエチレンである、（１）～（３）のいずれか１つに記載の試料回収方法。
【0117】
（５） 前記試料溶液は、菌体培養液である、（１）～（４）のいずれか１つに記載の試料回収方法。
【0118】
（６）前記除去工程によって回収された菌体の細胞から核酸を抽出する抽出工程、をさらに含む（１）～（５）のいずれか１つに記載の試料回収方法。
【符号の説明】
【0119】
１０ 菌体培養容器
２０ 遠心チューブ
３０ 遠心分離機
４０ ピペット
１００ 菌体回収システム
２０ 遠心チューブ
３０ 遠心分離機
４０ ピペット
１００ 菌体回収システム
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【図6】
【図7】