(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2024099539
(43)【公開日】2024-07-25
(54)【発明の名称】NKG2D、CD16、およびC型レクチン様分子-1(CLL-1)に結合するタンパク質
(51)【国際特許分類】
C07K 16/46 20060101AFI20240718BHJP
C07K 16/30 20060101ALN20240718BHJP
C07K 16/28 20060101ALN20240718BHJP
C12N 15/13 20060101ALN20240718BHJP
C12N 15/62 20060101ALN20240718BHJP
C12N 1/15 20060101ALN20240718BHJP
C12N 1/19 20060101ALN20240718BHJP
C12N 1/21 20060101ALN20240718BHJP
C12N 5/09 20100101ALN20240718BHJP
C12N 5/0783 20100101ALN20240718BHJP
C12N 5/10 20060101ALN20240718BHJP
【FI】
C07K16/46 ZNA
C07K16/30
C07K16/28
C12N15/13
C12N15/62 Z
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
C12N5/09
C12N5/0783
C12N5/10
【審査請求】有
【請求項の数】1
【出願形態】OL
【外国語出願】
(21)【出願番号】P 2024060206
(22)【出願日】2024-04-03
(62)【分割の表示】P 2020514936の分割
【原出願日】2018-09-13
(31)【優先権主張番号】62/558,510
(32)【優先日】2017-09-14
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
【公序良俗違反の表示】
(特許庁注:以下のものは登録商標)
1.TWEEN
2.TRITON
(71)【出願人】
【識別番号】519288755
【氏名又は名称】ドラゴンフライ セラピューティクス, インコーポレイテッド
(74)【代理人】
【識別番号】100145403
【弁理士】
【氏名又は名称】山尾 憲人
(74)【代理人】
【識別番号】100122301
【弁理士】
【氏名又は名称】冨田 憲史
(74)【代理人】
【識別番号】100170520
【弁理士】
【氏名又は名称】笹倉 真奈美
(74)【代理人】
【識別番号】100221545
【弁理士】
【氏名又は名称】白江 雄介
(72)【発明者】
【氏名】チャン, グレゴリー ピー.
(72)【発明者】
【氏名】チュン, アン エフ.
(72)【発明者】
【氏名】ヘイニー, ウィリアム
(72)【発明者】
【氏名】ランディ, ブラッドリー エム.
(72)【発明者】
【氏名】プリンツ, ビアンカ
【テーマコード(参考)】
4B065
4H045
【Fターム(参考)】
4B065AA93X
4B065AA94X
4B065AC20
4B065CA44
4H045AA11
4H045AA30
4H045BA41
4H045DA76
4H045EA22
4H045EA28
(57)【要約】 (修正有)
【課題】CLL-1/CLEC12Aに結合する多重特異性結合タンパク質、およびがんの処置における上記タンパク質の使用を提供する。
【解決手段】本発明の一態様は、NKG2Dに結合する第1の抗原結合部位と、CLEC12Aに結合する第2の抗原結合部位と、CD16に結合するに十分な抗体Fcドメイン、その一部分、またはCD16に結合する第3の抗原結合部位とを組み込んだタンパク質を提供する。抗原結合部位は各々、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメインを組み込んでいてもよいか、または抗原結合部位の1つもしくは複数は、VHH抗体もしくはVNAR抗体などの単一ドメイン抗体であってもよい。本発明の別の態様は、患者のがんを処置する方法を提供する。本方法は、それを必要とする患者に、多重特異性結合タンパク質を治療有効量で投与することを含む。
【選択図】なし
【特許請求の範囲】
【請求項1】
(a)NKG2Dに結合する第1の抗原結合部位と
(b)CLL-1/CLEC12Aに結合する第2の抗原結合部位と
(c)CD16に結合するに十分な抗体Fcドメインもしくはその一部分、またはCD16に結合する第3の抗原結合部位と
を含むタンパク質。
【請求項2】
前記第1の抗原結合部位は、ヒト、非ヒト霊長類またはげっ歯動物のNKG2Dに結合する、請求項1に記載のタンパク質。
【請求項3】
前記第1の抗原結合部位は、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項1または2に記載のタンパク質。
【請求項4】
前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインは、同じポリペプチド上に存在する、請求項3に記載のタンパク質。
【請求項5】
前記第2の抗原結合部位は、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項3または4に記載のタンパク質。
【請求項6】
前記第2の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインは、同じポリペプチド上に存在する、請求項5に記載のタンパク質。
【請求項7】
前記第1の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインは、前記第2の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有する、請求項5または6に記載のタンパク質。
【請求項8】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号1、配列番号41、配列番号49、配列番号57、配列番号59、配列番号61、配列番号69、配列番号77、配列番号85、および配列番号93から選択されるアミノ酸配列と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインを含む、先行する請求項のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項9】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号41と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号42と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項10】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号49と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号50と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項11】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号57と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号58と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項12】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号59と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号60と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項13】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号61と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号62と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項14】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号69と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号70と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。前
【請求項15】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号77と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号78と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項16】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号85と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号86と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項17】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号93と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号94と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項18】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号101と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号102と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項19】
前記第1の抗原結合部位は、配列番号103と少なくとも90%同一の重鎖可変ドメインと、配列番号104と少なくとも90%同一の軽鎖可変ドメインとを含む、請求項1~8のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項20】
前記第1の抗原結合部位は、単一ドメイン抗体である、請求項1または2に記載のタンパク質。
【請求項21】
前記単一ドメイン抗体は、VHH断片またはVNAR断片である、請求項20に記載のタンパク質。
【請求項22】
前記第2の抗原結合部位は、重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインを含む、請求項1~2または20~21のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項23】
前記第2の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインおよび前記軽鎖可変ドメインは、同じポリペプチド上に存在する、請求項22に記載のタンパク質。
【請求項24】
前記第2の抗原結合部位は、単一ドメイン抗体である、請求項1~4または8~19のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項25】
前記第2の抗原結合部位は、VHH断片またはVNAR断片である、請求項24に記載のタンパク質。
【請求項26】
前記第2の抗原結合部位は、CLEC12Aに結合し、前記第2の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインは、配列番号115と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含み、前記第2の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインは、配列番号119と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む、請求項1~25のいずれかに記載のタンパク質。
【請求項27】
前記第2の抗原結合部位の前記重鎖可変ドメインは、 配列番号116のアミノ酸配列と同一の重鎖CDR1配列と、
配列番号117のアミノ酸配列と同一の重鎖CDR2配列と、
配列番号118のアミノ酸配列と同一の重鎖CDR3配列と
を含むアミノ酸配列を含む、請求項26に記載のタンパク質。
【請求項28】
前記第2の抗原結合部位の前記軽鎖可変ドメインは、
配列番号120のアミノ酸配列と同一の軽鎖CDR1配列と、
配列番号121のアミノ酸配列と同一の軽鎖CDR2配列と、
配列番号122のアミノ酸配列と同一の軽鎖CDR3配列と、
を含むアミノ酸配列を含む、請求項27に記載のタンパク質。
【請求項29】
前記タンパク質は、CD16に結合するに十分な抗体Fcドメインの一部分を含み、前記抗体Fcドメインは、ヒンジおよびCH2ドメインを含む、請求項1~28のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項30】
前記抗体Fcドメインは、ヒトIgG1抗体のヒンジおよびCH2ドメインを含む、請求項29に記載のタンパク質。
【請求項31】
前記Fcドメインは、ヒトIgG1抗体のアミノ酸234~332と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む、請求項29または30に記載のタンパク質。
【請求項32】
前記Fcドメインは、ヒトIgG1のFcドメインと少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含み、Q347、Y349、L351、S354、E356、E357、K360、Q362、S364、T366、L368、K370、N390、K392、T394、D399、S400、D401、F405、Y407、K409、T411、K439からなる群より選択される1つまたは複数の位置において異なる、請求項29~31のいずれか1項に記載のタンパク質。
【請求項33】
先行する請求項のいずれか1項に記載のタンパク質および薬学的に許容される担体を含む製剤。
【請求項34】
請求項1~32のいずれか1項に記載のタンパク質を発現する1または複数の核酸を含む細胞。
【請求項35】
請求項1~32のいずれか1項に記載のタンパク質に、腫瘍細胞およびナチュラルキラー細胞を曝露する工程を包含する、腫瘍細胞死を直接的におよび/または間接的に増強する方法。
【請求項36】
請求項1~32のいずれか1項に記載のタンパク質または請求項33に記載の製剤を、患者に投与することを包含する、がんを処置する方法。
【請求項37】
前記がんは、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)、リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、および古典的ホジキンリンパ腫からなる群より選択される、請求項36に記載の方法。
【請求項38】
前記AMLは、急性未分化型骨髄芽球性白血病、急性最小分化型骨髄芽球性白血病、急性分化型骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病(APL)、急性骨髄単球性白血病、好酸球増加症を伴う急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤芽球性白血病、急性巨核芽球性白血病(AMKL)、急性好塩基球性白血病、線維症を伴う急性汎骨髄症、および芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(BPDCN)から選択される、請求項37に記載の方法。
【請求項39】
前記AMLは、前記AML白血病幹細胞(LSC)上のCLL-1の発現によって特徴づけられる、請求項37または38に記載の方法。
【請求項40】
前記LSCは、CD34、CD38、CD123、TIM3、CD25、CD32、およびCD96から選択される膜マーカーをさらに発現する、請求項39に記載の方法。
【請求項41】
前記AMLは、微小残存病変(MRD)である、請求項37~40のいずれか1項に記載の方法。
【請求項42】
前記MRDは、FLT3-ITD((Fms様チロシンキナーゼ3)-遺伝子内縦列重複(ITD))、NPM1(ヌクレオホスミン1)、DNMT3A(DNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子DNMT3A)、およびIDH(イソクエン酸デヒドロゲナーゼ1および2(IDH1およびIDH2))から選択される変異の存在または非存在によって特徴づけられる、請求項41に記載の方法。
【請求項43】
前記MDSは、多血球系異形成を伴うMDS(MDS-MLD)、単一血球系異形成を伴うMDS(MDS-SLD)、環状鉄芽球を伴うMDS(MDS-RS)、芽球増加を伴うMDS(MDS-EB)、単独del(5q)を伴うMDS、および分類不能型MDS(MDS-U)から選択される、請求項37に記載の方法。
【請求項44】
前記MDSは、原発性MDSまたは二次性MDSである、請求項37に記載の方法。
【請求項45】
前記ALLは、B細胞急性リンパ芽球性白血病(B-ALL)およびT細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)から選択される、請求項37に記載の方法。
【請求項46】
前記MPNは、真性赤血球増加症、本態性血小板血症(ET)、および骨髄線維症から選択される、請求項37に記載の方法。
【請求項47】
前記非ホジキンリンパ腫は、B細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫から選択される、請求項37に記載の方法。
【請求項48】
前記リンパ腫は、慢性リンパ球性白血病(CLL)、リンパ芽球性リンパ腫(LPL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、バーキットリンパ腫(BL)、原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫(PMBL)、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、形質細胞骨髄腫(PCM)または多発性骨髄腫(MM)、成熟T/NK細胞腫瘍、および組織球腫瘍から選択される、請求項37に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願への相互参照
本出願は、2017年9月14日に出願された米国仮特許出願番号第62/558,510号に基づく利益および優先権を主張する。
【0002】
配列表
本出願は、ASCIIフォーマットで電子提出された配列表を含み、その全体は、参照により本明細書に組み込まれている。前記ASCIIコピーは2018年9月11日に作成され、DFY-041WO_SL.txtという名称であり、89,993バイトのサイズである。
【0003】
発明の分野
本発明は、NKG2D、CD16、および腫瘍関連抗原、C型レクチン様分子-1(CLL-1)に結合する多重特異性結合タンパク質に関する。
【背景技術】
【0004】
背景
がんは、この疾患を処置するための文献に報告されている十分な研究努力および科学進歩にもかかわらず、重大な健康問題であり続けている。最も頻繁に診断されるがんの中には、前立腺がん、乳がん、肺がんおよび結腸直腸がんが含まれる。前立腺がんは、男性におけるがんの最も一般的な形態である。乳がんは依然として女性における主要な死因である。血液および骨髄のがんはまた、頻繁に診断されるがんのタイプであり、多発性骨髄腫、白血病、およびリンパ腫が挙げられる。これらのがんに対する現在の処置選択肢は、すべての患者に効果的というわけではなく、および/または実質的な有害副作用を有する可能性がある。他のタイプのがんもまた、既存の治療選択肢を使用して処置することは依然として難題である。
【0005】
がん免疫療法は、それらが非常に特異的であり、患者自身の免疫系を使用してがん細胞の破壊を促進することができるので望ましい。二重特異性T細胞エンゲージャーなどの融合タンパク質は、腫瘍細胞の破壊を促進するために腫瘍細胞およびT細胞に結合する、文献に記載されているがん免疫療法である。ある特定の腫瘍関連抗原およびある特定の免疫細胞に結合する抗体は文献に記載されている。例えば、WO2016/134371およびWO2015/095412を参照されたい。
【0006】
ナチュラルキラー(NK)細胞は、先天性免疫系の構成要素であり、循環リンパ球の約15%を構成する。NK細胞は実質的にすべての組織に浸潤し、最初は、事前感作を必要とせずに腫瘍細胞を効果的に殺傷するそれらの能力によって特徴付けられた。活性化されたNK細胞は、細胞傷害性T細胞と同様の手段によって、すなわち、パーフォリンおよびグランザイムを含有する細胞傷害性顆粒を介して、ならびに死受容体経路を介して、標的細胞を殺傷する。活性化されたNK細胞はまた、標的組織への他の白血球の動員を促進するIFN-ガンマおよびケモカインなどの炎症性サイトカインを分泌する。
【0007】
NK細胞は、それらの表面における様々な活性化受容体および阻害受容体を介してシグナルに応答する。例えば、NK細胞が健康な自己細胞に遭遇すると、それらの活性は、キラー細胞免疫グロブリン様受容体(KIR)の活性化によって阻害される。あるいはNK細胞が外来細胞またはがん細胞に遭遇すると、それらは、それらの活性化受容体(例えば、NKG2D、NCR、DNAM1)を介して活性化される。NK細胞はまた、それらの表面におけるCD16受容体を介していくつかの免疫グロブリンの定常領域によって活性化される。活性化に対するNK細胞の全体的な感受性は、刺激シグナルおよび阻害シグナルの合計に依存する。
C型レクチンドメインファミリー12メンバーA遺伝子は、C型レクチン/C型レクチン様ドメイン(CTL/CTLD)スーパーファミリーのメンバーをコードする。このファミリーのメンバーは、共通するタンパク質折りたたみを共に有し、多様な機能(例えば、細胞接着、細胞間シグナル伝達、糖タンパク質ターンオーバー、ならびに炎症および免疫応答における役割)を有する。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、顆粒球および単球機能の負の調節因子である。MICLまたはCLEC12Aとしても公知のヒトC型レクチン様分子-1(CLL-1)は、II型膜貫通糖タンパク質であり、免疫調節に関与するC型レクチン様レセプターの大きなファミリーのメンバーである。CLL-1/CLEC12Aは、急性骨髄性白血病患者のうちの90%超において、白血病幹細胞上で過剰発現されるが、正常な造血細胞上では過剰発現されない。本発明は、CLL-1/CLEC12Aに結合する多重特異性結合タンパク質、およびがんの処置における上記タンパク質の使用を提供する。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0008】
【特許文献1】国際公開第2016/134371号
【特許文献2】国際公開第2015/095412号
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0009】
要旨
本発明は、腫瘍関連抗原CLEC12Aに、ならびにナチュラルキラー細胞上のNKG2DレセプターおよびCD16レセプターに結合する多重特異性結合タンパク質を提供する。かかるタンパク質は、2種類以上のNK活性化受容体と会合することができ、天然リガンドのNKG2Dへの結合を遮断し得る。ある特定の実施形態では、タンパク質は、ヒトにおいてNK細胞を刺激し得、げっ歯動物およびカニクイザルなどの他の種においてNK細胞を刺激し得る。本発明の様々な態様および実施形態を以下にさらに詳細に記載する。
【0010】
したがって、本発明の一態様は、NKG2Dに結合する第1の抗原結合部位と、CLEC12Aに結合する第2の抗原結合部位と、CD16に結合するに十分な抗体Fcドメイン、その一部分、またはCD16に結合する第3の抗原結合部位とを組み込んだタンパク質を提供する。抗原結合部位は各々、抗体重鎖可変ドメインおよび抗体軽鎖可変ドメイン(例えば、抗体のように配列されるか、またはscFvを形成するために一緒に融合される)を組み込んでいてもよいか、または抗原結合部位の1つもしくは複数は、ラクダ科抗体などのVHH抗体もしくは軟骨魚類に見出されるものなどのVNAR抗体などの単一ドメイン抗体であってもよい。
【0011】
NKG2Dに結合する第1の抗原結合部位は、一部の実施形態では、例えば配列番号1と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一のアミノ酸配列を有すること、ならびに/または、配列番号1のCDR1配列(配列番号105)、CDR2配列(配列番号106)、およびCDR3配列(配列番号107)と同一のアミノ酸配列を組み込むことにより、配列番号1に関連する重鎖可変ドメインを組み込んでいてもよい。配列番号1に関する重鎖可変ドメインは、種々の軽鎖可変ドメインと結びついてNKG2D結合部位を形成することができる。例えば、配列番号1に関する重鎖可変ドメインを組み込む第1の抗原結合部位はさらに、配列番号2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、および40に関する配列のうちのいずれか1つから選択される軽鎖可変ドメインを組み込み得る。例えば、第1の抗原結合部位は、配列番号1と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一なアミノ酸配列を有する重鎖可変ドメイン、ならびに配列番号2、4、6、8、10、12、14、16、18、20、22、24、26、28、30、32、34、36、38、および40から選択される配列のうちのいずれか1つと少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一なアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインを組み込む。
【0012】
代替的に、第1の抗原結合部位は、配列番号41に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号42に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号41と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または列番号41のCDR1配列(配列番号43)、CDR2配列(配列番号44)、およびCDR3配列(配列番号45)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号42と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号42のCDR1配列(配列番号46)、CDR2配列(配列番号47)、およびCDR3配列(配列番号48)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0013】
他の実施形態では、第1の抗原結合部位は、配列番号49に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号50に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号49と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号49のCDR1配列(配列番号51)、CDR2配列(配列番号52)、およびCDR3配列(配列番号53)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号50と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号50のCDR1配列(配列番号54)、CDR2配列(配列番号55)、およびCDR3配列(配列番号56)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0014】
代替的に、第1の抗原結合部位は、例えば、それぞれ、配列番号57と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一である、および配列番号58と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であるアミノ酸配列を有することによって、配列番号57に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号58に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。
【0015】
別の実施形態において、第1の抗原結合部位は、配列番号59に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号60に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号59と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号59のCDR1配列(配列番号109)、CDR2配列(配列番号110)、およびCDR3配列(配列番号111)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号60と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号60のCDR1配列(配列番号112)、CDR2配列(配列番号113)、およびCDR3配列(配列番号114)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0016】
NKG2Dに結合する第1の抗原結合部位は、一部の実施形態では、配列番号61に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号62に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号61と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号61のCDR1配列(配列番号63)、CDR2配列(配列番号64)、およびCDR3配列(配列番号65)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号62と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号62のCDR1配列(配列番号66)、CDR2配列(配列番号67)、およびCDR3配列(配列番号68)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0017】
一部の実施形態では、第1の抗原結合部位は、配列番号69に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号70に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号69と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号69のCDR1配列(配列番号71)、CDR2配列(配列番号72)、およびCDR3配列(配列番号73)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号70と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号70のCDR1配列(配列番号74)、CDR2配列(配列番号75)、およびCDR3配列(配列番号76)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0018】
一部の実施形態では、第1の抗原結合部位は、配列番号77に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号78に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号77と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号77のCDR1配列(配列番号79)、CDR2配列(配列番号80)、およびCDR3配列(配列番号81)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号78と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号78のCDR1配列(配列番号82)、CDR2配列(配列番号83)、およびCDR3配列(配列番号84)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0019】
一部の実施形態では、第1の抗原結合部位は、配列番号85に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号86に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号85と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号85のCDR1配列(配列番号87)、CDR2配列(配列番号88)、およびCDR3配列(配列番号89)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号86と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号86のCDR1配列(配列番号90)、CDR2配列(配列番号91)、およびCDR3配列(配列番号92)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0020】
一部の実施形態では、第1の抗原結合部位は、配列番号93に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号94に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第1の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号93と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号93のCDR1配列(配列番号95)、CDR2配列(配列番号96)、およびCDR3配列(配列番号97)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号94と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号94のCDR1配列(配列番号98)、CDR2配列(配列番号99)、およびCDR3配列(配列番号100)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0021】
一部の実施形態では、第1の抗原結合部位は、例えば、それぞれ、配列番号101と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一である、および配列番号102と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であるアミノ酸配列を有することによって、配列番号101に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号102に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。
【0022】
一部の実施形態では、第1の抗原結合部位は、例えば、それぞれ、配列番号103と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一である、および配列番号104と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であるアミノ酸配列を有することによって、配列番号103に関連する重鎖可変ドメインと、配列番号104に関連する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。
【0023】
一部の実施形態では、第2の抗原結合部位は、CLEC12Aに結合し、配列番号115に関する重鎖可変ドメインと、配列番号119に関する軽鎖可変ドメインとを組み込んでいてもよい。例えば、第2の抗原結合部位の重鎖可変ドメインは、配列番号115と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号115のCDR1配列(配列番号116)、CDR2配列(配列番号117)、およびCDR3配列(配列番号118)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。同様に、第2の抗原結合部位の軽鎖可変ドメインは、配列番号119と少なくとも90%(例えば、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、または100%)同一であってよく、かつ/または配列番号119のCDR1配列(配列番号120)、CDR2配列(配列番号121)、およびCDR3配列(配列番号122)と同一のアミノ酸配列を組み込んでいてもよい。
【0024】
一部の実施形態では、第2の抗原結合部位は、第1の抗原結合部位に存在する軽鎖可変ドメインのアミノ酸配列と同一のアミノ酸配列を有する軽鎖可変ドメインを組み込んでいる。
【0025】
一部の実施形態では、本タンパク質は、CD16に結合するに十分な抗体Fcドメインの一部分を組み込んでおり、ここで抗体Fcドメインは、ヒンジおよびCH2ドメイン、および/またはヒトIgG抗体のアミノ酸配列234~332と少なくとも90%同一のアミノ酸配列を含む。
【0026】
これらのタンパク質のうちの1つを含有する製剤、これらのタンパク質を発現する1つまたは複数の核酸を含有する細胞、およびこれらのタンパク質を使用して腫瘍細胞死を増強する方法も提供される。
【0027】
本発明の別の態様は、患者のがんを処置する方法を提供する。本方法は、それを必要とする患者に、本明細書に記載の多重特異性結合タンパク質を治療有効量で投与することを含む。多重特異性結合タンパク質を使用して処置するための例示的ながんとしては、例えば、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)、リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、および古典的ホジキンリンパ腫が挙げられる。
【0028】
ある特定の実施形態では、処置するがんは、急性未分化型骨髄芽球性白血病、急性最小分化型骨髄芽球性白血病(acute myeloblastic leukemia with minimal maturation)、急性分化型骨髄芽球性白血病(acute myeloblastic leukemia with maturation
)、急性前骨髄球性白血病(APL)、急性骨髄単球性白血病、好酸球増加症を伴う急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤芽球性白血病、急性巨核芽球性白血病(AMKL)、急性好塩基球性白血病、線維症を伴う急性汎骨髄症、および芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(BPDCN)から選択されるAMLである。
【0029】
本発明のある特定の実施形態では、がんは、多血球系異形成を伴うMDS(MDS-MLD)、単一血球系異形成を伴うMDS(MDS-SLD)、環状鉄芽球を伴うMDS(MDS-RS)、芽球増加を伴うMDS(MDS-EB)、単独del(5q)を伴うMDS、および分類不能型MDS(MDS-U)から選択されるMDSである。
【0030】
本発明のある特定の実施形態では、処置するALLは、B細胞急性リンパ芽球性白血病(B-ALL)およびT細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)から選択される。本発明の実施形態では、処置するMPNは、真性赤血球増加症(polycythaemia vera)、
本態性血小板血症(ET)、および骨髄線維症から選択される。本発明のある特定の実施形態では、処置する非ホジキンリンパ腫は、B細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫から選択される。本発明のある特定の実施形態では、処置するリンパ腫は、慢性リンパ球性白血病(CLL)、リンパ芽球性リンパ腫(LPL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、バーキットリンパ腫(BL)、原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫(PMBL)、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、形質細胞骨髄腫(PCM)または多発性骨髄腫(MM)、成熟T/NK細胞腫瘍、および組織球腫瘍から選択される。
【図面の簡単な説明】
【0031】
【
図1】
図1は、ヘテロ二量体の多重特異性抗体(三重特異性結合タンパク質(TriNKET))の図である。各アームは、NKG2D結合ドメインまたは腫瘍関連抗原結合ドメインのいずれかを表し得る。一部の実施形態では、NKG2D結合ドメインおよび腫瘍関連抗原結合ドメインは、共通の軽鎖を共に有し得る。
【0032】
【
図2】
図2は、ヘテロ二量体の多重特異性抗体の図である。NKG2D結合ドメインまたは腫瘍関連抗原結合ドメインのいずれかは、scFvフォーマット(右アーム)をとることができる。
【0033】
【
図3】
図3は、ELISAアッセイにおけるヒト組換えNKG2Dに対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の結合親和性を示す線グラフである。
【0034】
【
図4】
図4は、ELISAアッセイにおけるカニクイザル組換えNKG2Dに対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の結合親和性を示す線グラフである。
【0035】
【
図5】
図5は、ELISAアッセイにおけるマウス組換えNKG2Dに対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の結合親和性を示す線グラフである。
【0036】
【
図6】
図6は、フローサイトメトリーによる、ヒトNKG2Dを発現するEL4細胞に対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の結合を示す棒グラフであり、バックグラウンドに対する平均蛍光強度(MFI)の倍率(FOB)を示している。
【0037】
【
図7】
図7は、フローサイトメトリーによる、マウスNKG2Dを発現するEL4細胞に対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の結合を示す棒グラフであり、バックグラウンドに対する平均蛍光強度(MFI)の倍率(FOB)を示している。
【0038】
【
図8】
図8は、天然リガンドULBP-6と競合することによる、組換えヒトNKG2D-Fcに対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の特異的結合親和性を示す線グラフである。
【0039】
【
図9】
図9は、天然リガンドMICAと競合することによる、組換えヒトNKG2D-Fcに対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の特異的結合親和性を示す線グラフである。
【0040】
【
図10】
図10は、天然リガンドRae-1デルタと競合することによる、組換えマウスNKG2D-Fcに対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の特異的結合親和性を示す線グラフである。
【0041】
【
図11】
図11は、ヒトNKG2D-CD3ゼータ融合タンパク質を発現するTNF-α陽性細胞のパーセンテージを定量することにより、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)によるヒトNKG2Dの活性化を示す棒グラフである。
【0042】
【
図12】
図12は、マウスNKG2D-CD3ゼータ融合タンパク質を発現するTNF-α陽性細胞のパーセンテージを定量することにより、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)によるマウスNKG2Dの活性化を示す棒グラフである。
【0043】
【
図13】
図13は、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)によるヒトNK細胞の活性化を示す棒グラフである。
【0044】
【
図14】
図14は、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)によるヒトNK細胞の活性化を示す棒グラフである。
【0045】
【
図15】
図15は、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)によるマウスNK細胞の活性化を示す棒グラフである。
【0046】
【
図16】
図16は、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)によるマウスNK細胞の活性化を示す棒グラフである。
【0047】
【
図17】
図17は、腫瘍細胞に対するNKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の細胞傷害作用を示す棒グラフである。
【0048】
【
図18】
図18は、示差走査型蛍光定量法によって測定された、NKG2D結合ドメイン(クローンとして列記されている)の融解温度を示す棒グラフである。
【0049】
【
図19】
図19A~19Cは、CD16およびNKG2D結合を使用したNK細胞の相乗的活性化の棒グラフである。
図19AはCD107aのレベルを示し、
図19BはIFNγのレベルを示し、
図19CはCD107aおよびIFNγのレベルを示す。グラフは平均(n=2)±SDを示している。データは、5名の異なる健康なドナーを使用した、5つの独立した実験を代表するものである。
【0050】
【
図20】
図20は、IgG様形状を維持する三機能性の二重特異性抗体であるTriomab形態における三重特異性結合タンパク質(TriNKET)の図である。このキメラは、2つの親抗体に由来する2つの半抗体からなり、各半抗体が1本の軽鎖および1本の重鎖を有する。Triomab形態は、ラット抗体の1/2およびマウス抗体の1/2を含有するヘテロ二量体構築物であり得る。
【0051】
【
図21】
図21は、ノブ・イントゥ・ホール(KIH:knobs-into-holes)技術を含むKiH共通軽鎖形態におけるTriNKETの図である。KiHは、標的1および2に結合する2つのFab断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcを含有するヘテロ二量体である。KiHフォーマットにおけるTriNKETは、2つの異なる重鎖と、両方の重鎖と対合する共通の軽鎖とを含有する、標的1および標的2に結合する2つのFab断片を有するヘテロ二量体構築物であり得る。
【0052】
【
図22】
図22は、自然起源の可動性リンカーを介して2つのモノクローナル抗体の標的結合ドメインを組み合わせ、四価のIgG様分子をもたらす、二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD-Ig(商標))形態におけるTriNKETの図である。DVD-Ig(商標)とは、抗原2を標的とする可変ドメインが、抗原1を標的とするFab断片の可変ドメインのN末端に融合しているホモ二量体構築物である。DVD-Ig(商標)形態は通常のFcを含有する。
【0053】
【
図23】
図23は、Fcに融合した標的1および標的2に結合する2つのFab断片を含有するヘテロ二量体構築物である、直交性Fab界面(オルト-Fab)形態におけるTriNKETの図である。軽鎖(LC)-重鎖(HC)の対合は、直交界面によって確実になっている。ヘテロ二量体化は、Fcにおける変異によって確実になっている。
【0054】
【
図24】
図24は、2in1 IgフォーマットにおけるTriNKETの図である。
【0055】
【
図25】
図25は、Fcに融合した標的1および標的2に結合する2つの異なるFab断片を含有するヘテロ二量体構築物である、ES形態におけるTriNKETの図である。ヘテロ二量体化は、Fcにおける静電的ステアリング変異によって確実になっている。
【0056】
【
図26】
図26は、Fab断片アーム交換形態におけるTriNKET、すなわち、重鎖および結合した軽鎖(半分子)を別の分子の重鎖-軽鎖対とスワップすることによりFabアームを交換した結果、二重特異性抗体となった抗体の図である。Fabアーム交換形態(cFAE)は、標的1および2に結合する2つのFab断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcを含有するヘテロ二量体である。
【0057】
【
図27】
図27は、標的1および2に結合する2つのFab断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcを含有するヘテロ二量体である、SEED Body形態におけるTriNKETの図である。
【0058】
【
図28】
図28は、2つの異なるHCのヘテロ二量体化を誘導するためにロイシンジッパーを使用する、LuZ-Y形態におけるTriNKETの図である。LuZ-Y形態は、Fcに融合した標的1および2に結合する2つの異なるscFabを含有するヘテロ二量体である。ヘテロ二量体化は、FcのC末端に融合したロイシンジッパーモチーフによって確実になっている。
【0059】
【
図29】
図29は、Cov-X-Body形態におけるTriNKETの図である。
【0060】
【
図30】
図30Aおよび30Bは、ヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcに融合した2つの異なるFab断片を有するヘテロ二量体構築物である、κλ-Body形態におけるTriNKETの図である。抗原1を標的とする一方のFab断片はカッパLCを含有し、抗原2を標的とする第2のFab断片はラムダLCを含有する。
図30Aは、κλ-Bodyの一形態の例示的な図であり、
図30Bは、別のκλ-Bodyの例示的な図である。
【0061】
【
図31】
図31は、標的1に結合するFab断片と、標的2に結合するscFabとを含み、その両方がFcドメインに融合したOasc-Fabヘテロ二量体構築物である。ヘテロ二量体化は、Fcドメインにおける変異によって確実になっている。
【0062】
【
図32】
図32は、抗原1および2に結合する2つの異なるFab断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcを含有するヘテロ二量体構築物である、DuetMabである。Fab断片1および2は、軽鎖および重鎖の正確な対合を確実にする特異な(differential)S-S架橋を含有する。
【0063】
【
図33】
図33は、標的1および2に結合する2つの異なるFab断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcを有するヘテロ二量体構築物である、CrossmAbである。CLドメインおよびCH1ドメインと、VHドメインおよびVLドメインとが切り換わっており、例えば、CH1は、VLと一列をなして融合しており、一方、CLは、VHと一列をなして融合している。
【0064】
【
図34】
図34は、抗原2に結合するFab断片が、抗原1に結合するFab断片のHCのN末端に融合しているホモ二量体構築物である、Fit-Igである。この構築物は、野生型Fcを含有する。
【0065】
【
図35】
図35は、CLEC12Aを発現するヒトAML細胞株SKM-1への、CLEC12A標的化TriNKET(例えば、A49-TriNKET-CLEC12A)および抗CLEC12Aモノクローナル抗体の結合を示す線グラフである。
【0066】
【
図36】
図36は、CLEC12Aを発現するヒトAML細胞株U937への、CLEC12A標的化TriNKET(例えば、A49-TriNKET-CLEC12A)および抗CLEC12Aモノクローナル抗体の結合を示す線グラフである。
【0067】
【
図37】
図37は、ヒトNKG2Dを発現するEL4細胞への、CLEC12A標的化TriNKET(例えば、A49-TriNKET-CLEC12A)および抗CLEC12Aモノクローナル抗体の結合を示す線グラフである。
【0068】
【
図38】
図38は、HL60細胞でのCLEC12A標的化TriNKET(例えば、A49-TriNKET-CLEC12A)、抗CLEC12A抗体、および抗CD33抗体リンツズマブの内部移行を示す線グラフである。
【0069】
【
図39】
図39は、SKM-1細胞でのCLEC12A標的化TriNKET(例えば、A49-TriNKET-CLEC12A)、抗CLEC12A抗体、および抗CD33抗体リンツズマブの内部移行を示す線グラフである。
【0070】
【
図40】
図40は、U937細胞でのCLEC12A標的化TriNKET(例えば、A49-TriNKET-CLEC12A)、抗CLEC12A抗体、および抗CD33抗体リンツズマブの内部移行を示す線グラフである。
【0071】
【
図41】
図41は、CLEC12A標的化TriNKETが、初代ヒトNK細胞によるHL60標的細胞殺滅を媒介することを示す線グラフである。対照抗体は、抗CLEC12Aモノクローナル抗体および非特異性TriNKET(例えば、CLEC12Aを標的としないTriNKET)である。
【0072】
【
図42】
図42は、CLEC12A標的化TriNKETが初代ヒトNK細胞によるMv4-11標的細胞殺滅を媒介することを示す線グラフである。対照抗体は、抗CLEC12Aモノクローナル抗体および非特異性TriNKET (例えば、CLEC12Aを標的としないTriNKET)である。
【発明を実施するための形態】
【0073】
詳細な説明
本発明は、がん細胞上のCLEC12A、ならびにナチュラルキラー細胞上のNKG2D受容体およびCD16受容体に結合して、ナチュラルキラー細胞を活性化する多重特異性結合タンパク質、かかる多重特異性結合タンパク質を含む医薬組成物、ならびにがんの処置などの目的のためのかかる多重特異性タンパク質および医薬組成物を使用する治療方法を提供する。本発明の様々な態様を複数のセクションに分けて以下に記述する。しかしながら、1つの特定のセクションに記載される本発明の態様は、いずれかの特定のセクションに限定されるものではない。
【0074】
本発明の理解を容易にするために、いくつかの用語および句を以下に定義する。
【0075】
本明細書で使用される場合、「1つの(a)」および「1つの(an)」という用語は、「1つまたは複数」を意味し、文脈が不適切でない限り、複数を含む。
【0076】
本明細書で使用される場合、「抗原結合部位」という用語は、抗原結合に関与する免疫グロブリン分子の一部分を指す。ヒト抗体において、抗原結合部位は、重(「H」)鎖および軽(「L」)鎖のN末端可変(「V」)領域のアミノ酸残基によって形成される。重鎖および軽鎖のV領域内の3つの高度に分岐したストレッチは、「フレームワーク領域」または「FR」として公知である、より保存された隣接するストレッチの間に介在している「超可変領域」と称される。したがって、「FR」という用語は、免疫グロブリンにおける超可変領域の間におよびそれに隣接して天然に見出されるアミノ酸配列を指す。ヒト抗体分子において、軽鎖の3つの超可変領域および重鎖の3つの超可変領域は、抗原結合表面を形成するように三次元空間において互いに対して配置される。抗原結合表面は、結合した抗原の三次元表面と相補的であり、重鎖および軽鎖の各々の3つの超可変領域は、「相補性決定領域」または「CDR」と称される。ラクダおよび軟骨魚類などのある特定の動物において、抗原結合部位は、「単一ドメイン抗体」を提供する単一抗体鎖によって形成される。抗原結合部位は、インタクトな抗体中、抗原結合表面を保持する抗体の抗原結合断片中、またはscFvなどの組換えポリペプチド中に存在し、ペプチドリンカーを使用して単一ポリペプチドにおいて重鎖可変ドメインを軽鎖可変ドメインに連結することができる。
【0077】
本明細書で使用される場合、「腫瘍関連抗原」という用語は、がんに関連するタンパク質、糖タンパク質、ガングリオシド、炭水化物、脂質を含むがこれらに限定されない、任意の抗原を意味する。このような抗原は、悪性細胞において、または腫瘍関連血管、細胞外マトリックス、間葉系間質、もしくは免疫浸潤物におけるような腫瘍微小環境中で発現され得る。
【0078】
本明細書で使用される場合、「対象」および「患者」という用語は、本明細書に記載の方法および組成物によって処置される生物を指す。かかる生物には、好ましくは、限定されないが、哺乳動物(例えば、ネズミ、サル、ウマ、ウシ、ブタ、イヌ、ネコなど)が含まれ、より好ましくはヒトが含まれる。
【0079】
本明細書中で使用される場合、「有効量」という用語は、有益なまたは所望の結果をもたらすのに十分な化合物(例えば、本発明の化合物)の量を指す。有効量は、1回または複数回の投与、適用または投薬量で投与されてもよく、特定の製剤または投与経路に限定されることを意図しない。本明細書中で使用される場合、「処置する」という用語は、何らかの効果、例えば、状態、疾患、障害などの好転をもたらす、減少、低減、モジュレート、改善もしくは除去、またはそれらの症状の改善を含む。
【0080】
本明細書で使用される場合、「医薬組成物」という用語は、組成物を、in vivoまたはex vivoでの診断的使用または治療的使用に特に適切にする、活性剤と、不活性または活性な担体との組合せを指す。
【0081】
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」という用語は、リン酸緩衝生理食塩水溶液、水、エマルション(例えば、油/水または水/油エマルションなど)、および種々の種類の湿潤剤などの標準的な医薬担体のいずれかを指す。組成物はまた、安定剤および保存剤を含んでもよい。担体、安定剤およびアジュバントの例に関しては、例えば、Martin、Remington’s Pharmaceutical Sciences、第15版、Mack Publ.Co.、Easton、PA[1975年]を参照されたい。
【0082】
本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される塩」という用語は、対象に投与すると、本発明の化合物またはその活性代謝産物もしくは残留物を提供することができる、本発明の化合物の任意の薬学的に許容される塩(例えば、酸または塩基)を指す。当業者に公知であるように、本発明の化合物の「塩」は、無機または有機の酸および塩基から誘導され得る。例示的な酸には、限定されないが、塩酸、臭化水素酸、硫酸、硝酸、過塩素酸、フマル酸、マレイン酸、リン酸、グリコール酸、乳酸、サリチル酸、コハク酸、トルエン-p-スルホン酸、酒石酸、酢酸、クエン酸、メタンスルホン酸、エタンスルホン酸、ギ酸、安息香酸、マロン酸、ナフタレン-2-スルホン酸、ベンゼンスルホン酸などが含まれる。シュウ酸などの他の酸は、それら自体では薬学的に許容されないが、本発明の化合物およびそれらの薬学的に許容される酸付加塩を得る際の中間体として有用な塩の調製に利用され得る。
【0083】
例示的な塩基には、限定されないが、アルカリ金属(例えば、ナトリウム)水酸化物、アルカリ土類金属(例えば、マグネシウム)水酸化物、アンモニアおよび式NW4
+(式中、WはC1~4アルキルである)の化合物などが含まれる。
【0084】
例示的な塩には、限定されないが、酢酸塩、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスパラギン酸塩、安息香酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、重硫酸塩、酪酸塩、クエン酸塩、ショウノウ酸塩、ショウノウスルホン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、フマル酸塩、フルコヘプタン酸塩、グリセロリン酸、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、塩酸塩、臭化水素酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシエタンスルホン酸塩、乳酸塩、マレイン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、シュウ酸塩、パルモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、フェニルプロピオン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、コハク酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、トシル酸塩、ウンデカン酸塩などが含まれる。塩の他の例には、Na+、NH4
+およびNW4
+(式中、WはC1~4アルキル基である)などの適切なカチオンと配合された本発明の化合物のアニオンが含まれる。
【0085】
治療的使用のために、本発明の化合物の塩は、薬学的に許容されると意図される。しかしながら、薬学的に許容されない酸および塩基の塩も、例えば、薬学的に許容される化合物の調製または精製において使用することができる。
【0086】
組成物が特定の成分を有する、含む(including)、もしくは含む(comprising)と記載されているか、またはプロセスおよび方法が特定のステップを有する、含む(including)、もしくは含む(comprising)と記載されている説明全体にわたって、さらに、列挙された成分から本質的になる、またはそれからなる本発明の組成物が存在すること、ならびに列挙されたプロセスステップから本質的になる、またはそれからなる本発明によるプロセスおよび方法が存在することが意図される。
【0087】
一般的事項として、パーセンテージを特定する組成物は、特に明記しない限り、重量による。さらに、変数が定義を伴わない場合、変数の以前の定義が優先する。
【0088】
I.タンパク質
本発明は、ナチュラルキラー細胞におけるNKG2D受容体およびCD16受容体、ならびに腫瘍関連抗原CLEC12Aに結合する多重特異性結合タンパク質を提供する。多重特異性結合タンパク質は、本明細書に記載の医薬組成物および治療方法において有用である。ナチュラルキラー細胞のNKG2D受容体およびCD16受容体に多重特異性結合タンパク質が結合すると、腫瘍関連抗原CLEC12Aを発現する腫瘍細胞の破壊に向けてのナチュラルキラー細胞の活性が増強される。腫瘍関連抗原発現細胞に多重特異性結合タンパク質が結合すると、がん細胞をナチュラルキラー細胞に近接させるため、ナチュラルキラー細胞によるがん細胞の直接的および間接的な破壊が容易になる。一部の例示的な多重特異性結合タンパク質のさらなる記載を、以下に提供する。
【0089】
多重特異性結合タンパク質の第1の構成要素は、NK細胞、γδT細胞およびCD8+αβT細胞を含み得るがこれらに限定されない、NKG2D受容体発現細胞に結合する。多重特異性結合タンパク質は、NKG2Dに結合すると、ULBP6(UL16結合タンパク質6)およびMICA(主要組織適合遺伝子複合体クラスI鎖関連A)などの天然リガンドがNKG2Dに結合することおよびNKG2D受容体を活性化することを遮断し得る。
【0090】
多重特異性結合タンパク質の第2の構成要素は、腫瘍関連抗原CLEC12Aに結合する。腫瘍関連抗原発現細胞は、例えば、急性骨髄性白血病およびT細胞白血病などの白血病において見出され得る。
【0091】
多重特異性結合タンパク質の第3の構成要素は、ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、好中球、好酸球、マスト細胞、および濾胞性樹状細胞を含む白血球の表面にあるFc受容体であるCD16を発現する細胞に結合する。
【0092】
本明細書に記載の多重特異性結合タンパク質は、様々なフォーマットをとることができる。例えば、1つのフォーマットは、第1の免疫グロブリン重鎖、第1の免疫グロブリン軽鎖、第2の免疫グロブリン重鎖、および第2の免疫グロブリン軽鎖を含む、ヘテロ二量体の多重特異性抗体(
図1)である。第1の免疫グロブリン重鎖は、第1のFc(ヒンジ-CH2-CH3)ドメインと、第1の重鎖可変ドメインと、必要に応じて第1のCH1重鎖ドメインとを含む。第1の免疫グロブリン軽鎖は、第1の軽鎖可変ドメインおよび第1の軽鎖定常ドメインを含む。第1の免疫グロブリン軽鎖は、第1の免疫グロブリン重鎖と一緒に、NKG2Dに結合する抗原結合部位を形成する。第2の免疫グロブリン重鎖は、第2のFc(ヒンジ-CH2-CH3)ドメインと、第2の重鎖可変ドメインと、必要に応じて第2のCH1重鎖ドメインとを含む。第2の免疫グロブリン軽鎖は、第2の軽鎖可変ドメインおよび第2の軽鎖定常ドメインを含む。第2の免疫グロブリン軽鎖は、第2の免疫グロブリン重鎖と一緒に、腫瘍関連抗原CLEC12Aに結合する抗原結合部位を形成する。第1のFcドメインおよび第2のFcドメインは一緒にCD16に結合することができる(
図1)。一部の実施形態では、第1の免疫グロブリン軽鎖は、第2の免疫グロブリン軽鎖と同一である。
【0093】
別の例示的フォーマットは、第1の免疫グロブリン重鎖、第2の免疫グロブリン重鎖および免疫グロブリン軽鎖を含む、ヘテロ二量体の多重特異性抗体(
図2)に関する。第1の免疫グロブリン重鎖は、対合し、NKG2Dに結合する、または腫瘍関連抗原CLEC12Aに結合する重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインから構成された一本鎖可変断片(scFv)に、リンカーまたは抗体ヒンジのいずれかを介して融合している、第1のFc(ヒンジ-CH2-CH3)ドメインを含む。第2の免疫グロブリン重鎖は、第2のFc(ヒンジ-CH2-CH3)ドメインと、第2の重鎖可変ドメインと、必要に応じてCH1重鎖ドメインとを含む。この免疫グロブリン軽鎖は、軽鎖可変ドメインおよび軽鎖定常ドメインを含む。第2の免疫グロブリン重鎖は、免疫グロブリン軽鎖と対合し、NKG2Dに結合する、またはCLEC12Aに結合する。第1のFcドメインおよび第2のFcドメインは一緒にCD16に結合することができる(
図2)。
【0094】
1つまたは複数のさらなる結合モチーフが、必要に応じてリンカー配列を介して、定常領域CH3ドメインのC末端に融合され得る。ある特定の実施形態では、抗原結合モチーフは、四価もしくは三価の分子を形成する、一本鎖もしくはジスルフィド安定化可変領域(scFv)である。
【0095】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、IgG様形状を維持する三機能性の二重特異性抗体である、Triomab形態である。このキメラは、2つの親抗体に由来する2つの半抗体からなり、各半抗体が1本の軽鎖および1本の重鎖を有する。
【0096】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、ノブ・イントゥ・ホール(KIH)技術を用いるKiH共通軽鎖(LC)形態である。KIHは、ヘテロ二量体化を促進するために、CH3ドメインを工学操作して各重鎖に「ノブ」または「ホール」のいずれかを作出することを伴う。「ノブ・イントゥ・ホール(KiH)」Fc技術の背後にある概念は、小さな残基を嵩高の残基で置換することにより、1つのCH3ドメイン(CH3A)に「ノブ」(例えば、EU付番でT366WCH3A)を導入することであった。この「ノブ」に適応するように、他方のCH3ドメイン(CH3B)において、ノブに最も近い隣接残基をより小さな残基に置き換えること(例えば、T366S/L368A/Y407VCH3B)により、相補的な「ホール」表面が作出された。「ホール」変異は、構造情報に基づくファージライブラリスクリーニング(Atwell S、Ridgway
JB、Wells JA、Carter P.、Stable heterodimers from remodeling the domain interface of a homodimer using a phage display library、J Mol Biol(1997年)270巻(1号):26~35頁)によって最適化された。KiH Fc変異体のX線結晶構造(Elliott JM、Ultsch M、Lee J、Tong R、Takeda K、Spiess Cら、Antiparallel conformation of knob and hole
aglycosylated half-antibody homodimers is mediated by a CH2-CH3 hydrophobic interaction. J Mol Biol(2014年)426巻(9号):1947~57頁、Mimoto F、Kadono S、Katada H、Igawa T、Kamikawa T、Hattori K. Crystal structure of a novel asymmetrically engineered Fc variant with improved affinity for FcγRs. Mol Immunol(2014年)58巻(1号):132~8頁)は、CH3ドメイン間のコア界面では、立体的相補性によって推進される疎水性相互作用がヘテロ二量体化に熱力学的に有利に働くが、ノブ-ノブおよびホール-ホールの界面は、それぞれ立体障害および好ましい相互作用の妨害が原因でホモ二量体化に有利に働かないことを示した。
【0097】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、自然起源の可動性リンカーを介して2つのモノクローナル抗体の標的結合ドメインを組み合わせ、四価のIgG様分子をもたらす、二重可変ドメイン免疫グロブリン(DVD-Ig(商標))形態におけるものである。
【0098】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、直交性Fab界面(オルト-Fab)形態におけるものである。オルト-Fab IgGアプローチ(Lewis SM、Wu X、Pustilnik A、Sereno A、Huang F、Rick HLら、Generation of bispecific IgG antibodies by structure-based design of an orthogonal Fab interface. Nat. Biotechnol.(2014年)32巻(2号):191~8頁)では、構造に基づく領域デザインにより、一方のFab断片のみにおいてLCおよびHCVH-CH1の界面に相補的変異が導入され、他方のFab断片にはいかなる変更もなされない。
【0099】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、2in1 Igフォーマットにおけるものである。一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、Fcに融合した標的1および標的2に結合する2つの異なるFab断片を含有するヘテロ二量体構築物である、ES形態におけるものである。ヘテロ二量体化は、Fcにおける静電的ステアリング変異によって確実になっている。
【0100】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、ヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcに融合した2つの異なるFab断片を有するヘテロ二量体構築物である、κλ-Body形態におけるものである。抗原1を標的とするFab断片1はカッパLCを含有し、一方、抗原2を標的とする第2のFab断片はラムダLCを含有する。
図30Aは、κλ-Bodyの一形態の例示的な図であり、
図30Bは、別のκλ-Bodyの例示的な図である。
【0101】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、Fabアーム交換形態(重鎖および結合した軽鎖(半分子)を別の分子の重鎖-軽鎖対とスワップすることによりFabアームを交換した結果、二重特異性抗体となった抗体)である。
【0102】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、SEED Body形態におけるものである。SEED(strand-exchange engineered domain)プラットフォームは、天然抗体の治療用途を広げる可能性がある非対称かつ二重特異性抗体様の分子を生成するためにデザインされた。このタンパク質工学操作プラットフォームは、保存されたCH3ドメインにおける免疫グロブリンの構造的に関連した配列の交換に基づく。SEEDデザインは、AGおよびGA SEED CH3ドメインのホモ二量体化を回避しつつ、AG/GAヘテロ二量体の効果的な生成を可能にする(Muda M.ら、Protein Eng. Des. Sel.(2011年、24巻(5号):447~54頁))。
【0103】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、2つの異なるHCのヘテロ二量体化を誘導するためにロイシンジッパーを使用する、LuZ-Y形態におけるものである(Wranik, BJ.ら、J. Biol. Chem.(2012年)、287巻:43331~9頁)。
【0104】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、Cov-X-Body形態におけるものである。二重特異性CovX-Bodyでは、分枝状のアゼチジノンリンカーを使用して2つの異なるペプチドをひとつに結合させ、温和な条件下にてスキャフォールド抗体に部位特異的様式で融合させる。機能的活性に関与するのはファルマコフォアだが、抗体スキャフォールドは長い半減期およびIg様の分布をもたらす。最適化された、または独特の二重特異性抗体を生成するために、ファルマコフォアは化学的に最適化するか、または他のファルマコフォアに置き換えることができる(Doppalapudi VRら、PNAS(2010年)、107巻(52号);22611~22616頁)。
【0105】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、Fcに融合した、標的1に結合するFab断片と、標的2に結合するscFabとを含む、Oasc-Fabヘテロ二量体形態におけるものである。ヘテロ二量体化は、Fcにおける変異によって確実になっている。
【0106】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、抗原1および2に結合する2つの異なるFab断片、ならびにヘテロ二量体化変異によって安定化されたFcを含有するヘテロ二量体構築物である、DuetMab形態におけるものである。Fab断片1および2は、LCおよびHCの正確な対合を確実にする特異なS-S架橋を含有する。
【0107】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、ヘテロ二量体化によって安定化されたFcに融合した、標的1および2に結合する2つの異なるFab断片を有するヘテロ二量体構築物である、CrossmAb形態におけるものである。CLドメインおよびCH1ドメインと、VHドメインおよびVLドメインとが切り換わっており、例えば、CH1は、VLと一列をなして融合しており、CLは、VHと一列をなして融合している。
【0108】
一部の実施形態では、多重特異性結合タンパク質は、抗原2に結合するFab断片が、抗原1に結合するFab断片のHCのN末端に融合しているホモ二量体構築物である、Fit-Ig形態におけるものである。この構築物は、野生型Fcを含有する。
【0109】
表1は、組み合わせてNKG2Dと結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのペプチド配列を記載している。NKG2D結合ドメインは、NKG2Dに対するそれらの結合親和性において変動し得、にも拘わらず、それらは全て、ヒトNKG2DおよびNK細胞を活性化する。
【表1-1】
【表1-2】
【表1-3】
【表1-4】
【表1-5】
【表1-6】
【表1-7】
【表1-8】
【0110】
代替的に、US9,273,136において説明されているように、配列番号101によって表される重鎖可変ドメインを、配列番号102によって表される軽鎖可変ドメインと対合させて、NKG2Dに結合することができる抗原結合部位を形成してもよい。
配列番号101
【化1】
配列番号102
【化2】
【0111】
代替的に、US7,879,985において説明されているように、配列番号103によって表される重鎖可変ドメインを、配列番号104によって表される軽鎖可変ドメインと対合させて、NKG2Dに結合することができる抗原結合部位を形成してもよい。
配列番号103
【化3】
配列番号104
【化4】
【0112】
表2は、組み合わせて、CLL-1/CLEC12Aに結合することができる重鎖可変ドメインおよび軽鎖可変ドメインのペプチド配列を記載する。
【0113】
【0114】
腫瘍関連抗原CLL1に結合できる抗原結合部位は、配列番号123によって定義されるアミノ酸配列への結合についてスクリーニングすることによって同定することができる。
【化5】
【0115】
Fcドメイン内で、CD16結合はヒンジ領域およびCH2ドメインによって媒介される。例えば、ヒトIgG1内で、CD16との相互作用は主に、アミノ酸残基Asp265~Glu269、Asn297~Thr299、Ala327~Ile332、Leu234~Ser239、およびCH2ドメインにおける炭水化物残基N-アセチル-D-グルコサミンに焦点が当てられている(Sondermannら、Nature、406巻(6793号):267~273頁を参照されたい)。既知のドメインに基づいて、変異は、ファージディスプレイライブラリもしくは酵母表面ディスプレイcDNAライブラリを使用することなどによって、CD16に対する結合親和性を増強もしくは低減させるように選択され得るか、または相互作用の既知の三次元構造に基づいてデザインされ得る。
【0116】
ヘテロ二量体抗体重鎖の構築は、同じ細胞内で2つの異なる抗体重鎖配列を発現させることによって達成することができ、これにより、各抗体重鎖のホモ二量体の構築およびヘテロ二量体の構築をもたらすことができる。ヘテロ二量体の選択的構築の促進は、US13/494870、US16/028850、US11/533709、US12/875015、US13/289934、US14/773418、US12/811207、US13/866756、US14/647480および、US14/830336に示されているように、各抗体重鎖定常領域のCH3ドメイン内に異なる変異を組み込むことによって達成することができる。例えば、変異は、ヒトIgG1に基づき、これらの2つの鎖が互いに選択的にヘテロ二量体化することを可能にする第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチド内にアミノ酸置換の異なる対を組み込んでいるCH3ドメイン内で作製され得る。以下に例示したアミノ酸置換の位置は、Kabatにおけるように、すべてEUインデックスに従って番号付けしている。
【0117】
1つの状況では、第1のポリペプチドにおけるアミノ酸置換は、元のアミノ酸を、アルギニン(R)、フェニルアラニン(F)、チロシン(Y)またはトリプトファン(W)から選択される、より大きなアミノ酸で置換し、第2のポリペプチドにおける少なくとも1つのアミノ酸置換は、元のアミノ酸を、より大きなアミノ酸置換(突出)が、より小さなアミノ酸置換(空洞)の表面に適合するように、アラニン(A)、セリン(S)、トレオニン(T)、またはバリン(V)から選択される、より小さなアミノ酸で置換する。例えば、一方のポリペプチドはT366W置換を組み込むことができ、他方のポリペプチドは、T366S、L368A、およびY407Vを含む3つの置換を組み込むことができる。
【0118】
本発明の抗体重鎖可変ドメインは、必要に応じて、CH1ドメインを有するまたは有さないヒンジ、CH2およびCH3ドメインを含むIgG定常領域などの、抗体定常領域と少なくとも90%同一であるアミノ酸配列と連結され得る。一部の実施形態では、定常領域のアミノ酸配列は、ヒトIgG1定常領域、IgG2定常領域、IgG3定常領域、またはIgG4定常領域などの、ヒト抗体定常領域と少なくとも90%同一である。一部の他の実施形態では、定常領域のアミノ酸配列は、ウサギ、イヌ、ネコ、マウス、またはウマなどの別の哺乳動物由来の抗体定常領域と少なくとも90%同一である。1つまたは複数の変異が、ヒトIgG1定常領域と比較して、例えば、Q347、Y349、L351、S354、E356、E357、K360、Q362、S364、T366、L368、K370、N390、K392、T394、D399、S400、D401、F405、Y407、K409、T411および/またはK439において定常領域に組み込まれ得る。例示的な置換には、例えば、Q347E、Q347R、Y349S、Y349K、Y349T、Y349D、Y349E、Y349C、T350V、L351K、L351D、L351Y、S354C、E356K、E357Q、E357L、E357W、K360E、K360W、Q362E、S364K、S364E、S364H、S364D、T366V、T366I、T366L、T366M、T366K、T366W、T366S、L368E、L368A、L368D、K370S、N390D、N390E、K392L、K392M、K392V、K392F、K392D、K392E、T394F、T394W、D399R、D399K、D399V、S400K、S400R、D401K、F405A、F405T、Y407A、Y407I、Y407V、K409F、K409W、K409D、T411D、T411E、K439D、およびK439Eが含まれる。
【0119】
ある特定の実施形態では、ヒトIgG1定常領域のCH1に組み込まれ得る変異は、アミノ酸V125、F126、P127、T135、T139、A140、F170、P171、および/またはV173であり得る。ある特定の実施形態では、ヒトIgG1定常領域のCκに組み込まれ得る変異は、アミノ酸E123、F116、S176、V163、S174、および/またはT164であり得る。
【0120】
代替的に、アミノ酸置換は以下の表3にされる置換のセットから選択され得る。
【表3】
【0121】
代替的に、アミノ酸置換は、以下の表4に示される置換のセットから選択され得る。
【表4-1】
【表4-2】
【0122】
代替的に、アミノ酸置換は以下の表5に示される置換のセットから選択され得る。
【表5】
【0123】
代替的に、各ポリペプチド鎖における少なくとも1つのアミノ酸置換は、表6から選択され得る。
【表6】
【0124】
代替的に、以下の表7における置換のセットから少なくとも1つのアミノ酸置換を選択してもよく、ここで第1のポリペプチド欄に示される位置(複数可)は、任意の公知の負に帯電したアミノ酸によって置き換えられ、第2のポリペプチド欄に示される位置(複数可)は、任意の公知の正に帯電したアミノ酸によって置き換えられる。
【表7】
【0125】
代替的に、以下の表8におけるセットから少なくとも1つのアミノ酸置換を選択してもよく、ここで第1のポリペプチド欄に示される位置(複数可)は、任意の公知の正に帯電したアミノ酸によって置き換えられ、第2のポリペプチド欄に示される位置(複数可)は、任意の公知の負に帯電したアミノ酸によって置き換えられる。
【表8】
【0126】
代替的に、アミノ酸置換は、以下の表9におけるセットから選択してもよい。
【表9】
【0127】
代替的にまたは付加的に、ヘテロ多量体タンパク質の構造安定性は、第1または第2のポリペプチド鎖のいずれかにS354Cを導入し、反対のポリペプチド鎖にY349Cを導入することによって増加させることができ、これにより、2つのポリペプチドの界面内で人工ジスルフィド架橋が形成する。
【0128】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366位においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366、L368およびY407からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0129】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366、L368およびY407からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366位においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0130】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、E357、K360、Q362、S364、L368、K370、T394、D401、F405、およびT411からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349、E357、S364、L368、K370、T394、D401、F405およびT411からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0131】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349、E357、S364、L368、K370、T394、D401、F405およびT411からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、E357、K360、Q362、S364、L368、K370、T394、D401、F405、およびT411からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0132】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、L351、D399、S400およびY407からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366、N390、K392、K409およびT411からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0133】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366、N390、K392、K409およびT411からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、L351、D399、S400およびY407からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0134】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Q347、Y349、K360、およびK409からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Q347、E357、D399およびF405からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0135】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Q347、E357、D399およびF405からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349、K360、Q347およびK409からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0136】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、K370、K392、K409およびK439からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、D356、E357およびD399からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0137】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、D356、E357およびD399からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、K370、K392、K409およびK439からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0138】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、L351、E356、T366およびD399からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349、L351、L368、K392およびK409からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0139】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349、L351、L368、K392およびK409からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、L351、E356、T366およびD399からなる群より選択される1またはこれより多くの位置においてIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0140】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、S354C置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349C置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0141】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、Y349C置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、S354C置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0142】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、K360EおよびK409W置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、O347R、D399VおよびF405T置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0143】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、O347R、D399VおよびF405T置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、K360EおよびK409W置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0144】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366W置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366S、T368A、およびY407V置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0145】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366S、T368A、およびY407V置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T366W置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0146】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T350V、L351Y、F405A、およびY407V置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T350V、T366L、K392L、およびT394W置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0147】
一部の実施形態では、抗体定常領域の一方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T350V、T366L、K392L、およびT394W置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なり、ここで抗体定常領域の他方のポリペプチド鎖のアミノ酸配列は、T350V、L351Y、F405A、およびY407V置換だけIgG1定常領域のアミノ酸配列とは異なる。
【0148】
上記の多重特異性タンパク質は、当業者に周知の組換えDNA技術を使用して作製され得る。例えば、第1の免疫グロブリン重鎖をコードする第1の核酸配列を第1の発現ベクターにクローニングすることができ、第2の免疫グロブリン重鎖をコードする第2の核酸配列を第2の発現ベクターにクローニングすることができ、免疫グロブリン軽鎖をコードする第3の核酸配列を第3の発現ベクターにクローニングすることができ、第1、第2および第3の発現ベクターを一緒に宿主細胞に安定にトランスフェクトして多量体タンパク質を産生することができる。
【0149】
多重特異性タンパク質の最も高い収率を達成するために、第1、第2および第3の発現ベクターの異なる比率を調べて宿主細胞へのトランスフェクションのための最適比率を決定することができる。トランスフェクション後、限界希釈、ELISA、FACS、顕微鏡法、またはClonepixなどの当技術分野において公知の方法を使用して、細胞バンク生成のために単一クローンを単離することができる。
【0150】
クローンは、バイオリアクタスケールアップに適した条件下で培養することができ、多重特異性タンパク質の発現を維持することができる。多重特異性タンパク質は、遠心分離、深層濾過、細胞溶解、均質化、凍結融解、親和性精製、ゲル濾過、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性相互作用交換クロマトグラフィー、およびミックスモードクロマトグラフィーを含む、当技術分野において公知の方法を使用して単離され、精製され得る。
【0151】
II.多重特異性タンパク質の特徴
本明細書に記載の多重特異性タンパク質は、NKG2D結合部位と、CD16結合部位と、腫瘍関連抗原CLEC12Aとを含む。一部の実施形態では、多重特異性タンパク質は、NK細胞などのNKG2Dおよび/またはCD16を発現する細胞に、ならびに腫瘍関連抗原CLEC12Aを発現する腫瘍細胞に同時に結合する。多重特異性タンパク質がNK細胞に結合すると、腫瘍細胞の破壊に向けてのNK細胞の活性が増強され得る。
【0152】
一部の実施形態では、多重特異性タンパク質は、腫瘍関連抗原CLEC12Aに、対応するモノクローナル抗体(例えば、米国特許出願公開番号2104/0120096 A1に記載されるモノクローナル抗体4331)))に類似の親和性で結合する。一部の実施形態では、多重特異性タンパク質は、対応するモノクローナル抗体と比較して、腫瘍関連抗原CLEC12Aを発現する腫瘍細胞を死滅させることにおいてより有効である。
【0153】
ある特定の実施形態では、NKG2D結合部位および腫瘍関連抗原CLEC12Aの結合部位を含む本明細書に記載の多重特異性タンパク質は、CLEC12Aを発現する細胞と共培養すると、初代ヒトNK細胞を活性化する。NK細胞活性化は、CD107a脱顆粒およびIFN-γサイトカイン産生の増加によって示される。さらに、対応するCLEC12Aに対するモノクローナル抗体と比較して、多重特異性タンパク質は、CLEC12Aを発現する細胞の存在下において、ヒトNK細胞の優れた活性化を示し得る。
【0154】
ある特定の実施形態では、NKG2D結合部位およびCLEC12Aの結合部位を含む本明細書に記載の多重特異性タンパク質は、CLEC12Aを発現する細胞と共培養して、休止ヒトNK細胞およびIL-2活性化ヒトNK細胞の活性を増強する。
【0155】
ある特定の実施形態では、CLEC12Aに結合する対応するモノクローナル抗体と比較して、多重特異性タンパク質は、CLEC12Aを発現する腫瘍細胞を標的とすることにおいて利点を提供する。本明細書に記載の多重特異性結合タンパク質は、腫瘍成長を低減し、がん細胞を死滅させることにおいてより有効であり得る。例えば、TriNKETs A49-TriNKET-CLEC12A(クローンADI-27749のNKG2D結合ドメインおよびCLEC12A結合ドメイン)は、抗CLEC12Aモノクローナル抗体と比較して、有効性の増強およびCLEC12A発現標的細胞の最大の溶解を有する。
【0156】
III.治療用途
本発明は、本明細書に記載の多重特異性結合タンパク質および/または本明細書に記載の医薬組成物を使用してがんを処置するための方法を提供する。その方法は、治療有効量の本明細書に記載の多重特異性結合タンパク質を、それを必要とする患者に投与することによって、CLEC12Aを発現する種々のがんを処置するために使用され得る。
【0157】
治療方法は、処置するがんに応じて特徴づけられ得る。例えば、ある特定の実施形態では、がんは、急性骨髄性白血病、多発性骨髄腫、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、胸腺腫、腺様嚢胞癌、消化器がん、腎がん、乳がん、膠芽腫、肺がん、卵巣がん、脳がん、前立腺がん、膵臓がん、または黒色腫である。
【0158】
ある特定の他の実施形態では、がんは、固形腫瘍である。ある特定の他の実施形態では、がんは、結腸がん、膀胱がん、子宮頚がん、子宮体がん、食道がん、白血病、肝臓がん、直腸がん、胃がん、精巣がん、または子宮がんである。なお他の実施形態では、がんは、血管化腫瘍、扁平上皮癌、腺癌、小細胞癌、黒色腫、神経膠腫、神経芽腫、肉腫(例えば、血管肉腫または軟骨肉腫)、喉頭がん、耳下腺がん、胆道がん、甲状腺がん、末端黒子型黒色腫、日光角化症、急性リンパ球性白血病、急性骨髄性白血病、腺様嚢胞癌、腺腫、腺肉腫、腺扁平上皮癌、肛門管がん、肛門がん、肛門直腸がん、星細胞系腫瘍、バルトリン腺癌、基底細胞癌、胆管がん(biliary cancer)、骨がん、骨髄がん、気管支がん
、気管支腺癌、カルチノイド、胆管癌(cholangiocarcinoma)、軟骨肉腫(chondosarcoma)、脈絡叢乳頭腫(choriod plexus papilloma)/癌、慢性リンパ球性白血病、慢性
骨髄性白血病、明細胞癌、結合組織がん、嚢胞腺腫、消化器系がん、十二指腸がん、内分泌系がん、内胚葉洞腫瘍、子宮内膜過形成、子宮内膜間質肉腫、類内膜腺癌、内皮細胞がん、上衣がん、上皮細胞がん、ユーイング肉腫、眼および眼窩のがん、女性性器がん、限局性結節性過形成、胆嚢がん、胃前庭部がん、胃底部がん、ガストリノーマ、神経膠芽腫、グルカゴノーマ、心臓がん、血管芽腫(hemangiblastoma)、血管内皮腫、血管腫、肝
腺腫、肝腺腫症、肝胆道がん、肝細胞癌、ホジキン病、回腸がん、インスリノーマ、上皮内新生物(intaepithelial neoplasia)、上皮間扁平上皮新生物(interepithelial squamous cell neoplasia)、肝内胆管がん、浸潤性扁平上皮癌、空腸がん、関節がん、
カポジ肉腫、骨盤がん、大細胞癌、大腸がん、平滑筋肉腫、悪性黒子由来黒色腫、リンパ腫、男性生殖器がん、悪性黒色腫瘍、悪性中皮腫、髄芽腫、髄上皮腫、髄膜がん、中皮がん、転移性癌、口腔がん(mouth cancer)、粘表皮癌、多発性骨髄腫、筋肉がん、鼻道
がん(nasal tract cancer)、神経系がん、神経上皮腺癌 結節性黒色腫、非上皮性皮膚がん、非ホジキンリンパ腫、燕麦細胞癌、乏突起神経膠がん(oligodendroglial cancer)、口腔がん(oral cavity cancer)、骨肉腫、漿液性乳頭腺癌、陰茎がん、咽頭がん、下垂体腫瘍、形質細胞腫、偽肉腫、肺芽腫、直腸がん、腎細胞癌、呼吸器系がん、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、肉腫、漿液性癌、副鼻腔がん、皮膚がん、小細胞癌、小腸がん、平滑筋がん、軟部組織がん、ソマトスタチン分泌腫瘍、脊椎がん、扁平上皮癌、横紋筋がん、中皮下がん、表在拡大型黒色腫、T細胞白血病、舌がん、未分化癌、尿管がん、尿道がん、膀胱がん、泌尿器系がん、子宮頸部がん、子宮体がん、ぶどう膜黒色腫、膣がん、疣状癌、ビポーマ、外陰部がん、高分化癌、またはウィルムス腫瘍である。
【0159】
ある特定の他の実施形態では、がんは、B細胞リンパ腫またはT細胞リンパ腫などの非ホジキンリンパ腫である。ある特定の実施形態では、非ホジキンリンパ腫は、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫、原発性縦隔B細胞リンパ腫、濾胞性リンパ腫、小リンパ球性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、辺縁帯B細胞リンパ腫、節外性辺縁帯B細胞リンパ腫、節性辺縁帯B細胞リンパ腫、脾辺縁帯B細胞リンパ腫、バーキットリンパ腫、リンパ形質細胞性リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、または原発性中枢神経系(CNS)リンパ腫などのB細胞リンパ腫である。ある特定の他の実施形態では、非ホジキンリンパ腫は、前駆Tリンパ芽球性リンパ腫、末梢T細胞リンパ腫、皮膚T細胞リンパ腫、血管免疫芽球性T細胞リンパ腫、節外性ナチュラルキラー/T細胞リンパ腫、腸症型T細胞リンパ腫、皮下脂肪織炎様T細胞リンパ腫、未分化大細胞リンパ腫、または末梢T細胞リンパ腫などのT細胞リンパ腫である。
【0160】
処置するがんは、がん細胞の表面で発現される特定の抗原の存在に従って特徴づけられ得る。ある特定の実施形態では、がん細胞は、CLEC12Aに加えて、以下のうちの1または複数を発現し得る: CD2、CD19、CD20、CD30、CD38、CD40、CD52、CD70、EGFR/ERBB1、IGF1R、HER3/ERBB3、HER4/ERBB4、MUC1、TROP2、cMET、SLAMF7、PSCA、MICA、MICB、TRAILR1、TRAILR2、MAGE-A3、B7.1、B7.2、CTLA4、およびPD1。
【0161】
本発明の実施形態では、処置するがんは、急性骨髄性白血病(AML)、骨髄異形成症候群(MDS)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、骨髄増殖性腫瘍(MPN)、リンパ腫、非ホジキンリンパ腫、および古典的ホジキンリンパ腫から選択される。
【0162】
本発明の一部の実施形態では、処置するがんは、急性未分化型骨髄芽球性白血病、急性最小分化型骨髄芽球性白血病、急性分化型骨髄芽球性白血病、急性前骨髄球性白血病(APL)、急性骨髄単球性白血病、好酸球増加症を伴う急性骨髄単球性白血病、急性単球性白血病、急性赤芽球性白血病、急性巨核芽球性白血病(AMKL)、急性好塩基球性白血病、線維症を伴う急性汎骨髄症、および芽球性形質細胞様樹状細胞腫瘍(BPDCN)から選択されるAMLである。本発明の一部の実施形態では、AMLは、AMLの白血病幹細胞(LSC)でのCLL-1の発現によって特徴づけられる。本発明の一部の実施形態では、AML対象におけるLSCは、CD34、CD38、CD123、TIM3、CD25、CD32、およびCD96から選択される膜マーカーをさらに発現する。本発明の一部の実施形態では、AMLは、微小残存病変(MRD)として特徴づけられる。本発明の一部の実施形態では、AMLのMRDは、FLT3-ITD((Fms様チロシンキナーゼ3)-遺伝子内縦列重複(ITD))、NPM1(ヌクレオホスミン1)、DNMT3A(DNAメチルトランスフェラーゼ遺伝子DNMT3A)、およびIDH(イソクエン酸デヒドロゲナーゼ1および2(IDH1およびIDH2))から選択される変異の存在または非存在によって特徴づけられる。
【0163】
本発明のある特定の実施形態では、がんは、多血球系異形成を伴うMDS(MDS-MLD)、単一血球系異形成を伴うMDS(MDS-SLD)、環状鉄芽球を伴うMDS(MDS-RS)、芽球増加を伴うMDS(MDS-EB)、単独del(5q)を伴うMDS、および分類不能型MDS(MDS-U)から選択されるMDSである。
【0164】
本発明のある特定の実施形態では、処置するALLは、B細胞急性リンパ芽球性白血病(B-ALL)およびT細胞急性リンパ芽球性白血病(T-ALL)から選択される。本発明のある特定の実施形態では、処置するMPNは、真性赤血球増加症、本態性血小板血症(ET)、および骨髄線維症から選択される。本発明のある特定の実施形態では、処置する非ホジキンリンパ腫は、B細胞リンパ腫およびT細胞リンパ腫から選択される。本発明のある特定の実施形態では、処置するリンパ腫は、慢性リンパ球性白血病(CLL)、リンパ芽球性リンパ腫(LPL)、びまん性大細胞型B細胞リンパ腫(DLBCL)、バーキットリンパ腫(BL)、原発性縦隔大細胞型B細胞リンパ腫(PMBL)、濾胞性リンパ腫、マントル細胞リンパ腫、ヘアリー細胞白血病、形質細胞骨髄腫(PCM)または多発性骨髄腫(MM)、成熟T/NK細胞腫瘍、および組織球腫瘍から選択される。
【0165】
IV.併用療法
本発明の別の態様は併用療法を提供する。本明細書に記載の多重特異性結合タンパク質は、がんを処置するためのさらなる治療剤と組み合わせて使用され得る。
【0166】
がんを処置する際の併用療法の一部として使用され得る例示的な治療剤には、例えば、放射線、マイトマイシン、トレチノイン、リボムスチン、ゲムシタビン、ビンクリスチン、エトポシド、クラドリビン、ミトブロニトール、メトトレキサート、ドキソルビシン、カルボコン、ペントスタチン、ニトラクリン、ジノスタチン、セトロレリクス、レトロゾール、ラルチトレキセド、ダウノルビシン、ファドロゾール、フォテムスチン、チマルファシン、ソブゾキサン、ネダプラチン、シタラビン、ビカルタミド、ビノレルビン、ベスナリノン、アミノグルテチミド、アムサクリン、プログルミド、酢酸エリプチニウム、ケタンセリン、ドキシフルリジン、エトレチナート、イソトレチノイン、ストレプトゾシン、ニムスチン、ビンデシン、フルタミド、ドロゲニル、ブトシン、カルモフール、ラゾキサン、シゾフィラン、カルボプラチン、ミトラクトール、テガフール、イホスファミド、プレドニムスチン、ピシバニール、レバミゾール、テニポシド、インプロスルファン、エノシタビン、リスリド、オキシメトロン、タモキシフェン、プロゲステロン、メピチオスタン、エピチオスタノール、ホルメスタン、インターフェロン-アルファ、インターフェロン-2アルファ、インターフェロン-ベータ、インターフェロン-ガンマ(IFN-γ)、コロニー刺激因子-1、コロニー刺激因子-2、デニロイキンジフチトクス、インターロイキン-2、黄体形成ホルモン放出因子、ならびにその同種受容体に対して特異な結合(differential binding)、および増加したまたは減少した血清半減期を示し得る上
述の薬剤の変形型が含まれる。
【0167】
がんを処置する際の併用療法の一部として使用され得る薬剤のさらなるクラスは免疫チェックポイント阻害剤である。例示的な免疫チェックポイント阻害剤には、(i)細胞傷害性Tリンパ球関連抗原4(CTLA4)、(ii)プログラム細胞死タンパク質1(PD1)、(iii)PDL1、(iv)LAG3、(v)B7-H3、(vi)B7-H4、および(vii)TIM3のうちの1つまたは複数を阻害する薬剤が含まれる。CTLA4阻害剤であるイピリムマブは、黒色腫を処置するために米国食品医薬品局によって承認されている。
【0168】
がんを処置する際に併用療法の一部として使用され得るさらに他の薬剤は、非チェックポイント標的を標的とするモノクローナル抗体薬剤(例えば、ハーセプチン)および非細胞傷害剤(例えば、チロシンキナーゼ阻害剤)である。
【0169】
抗がん剤のさらに他のカテゴリーには、例えば、(i)ALK阻害剤、ATR阻害剤、A2Aアンタゴニスト、塩基除去修復阻害剤、Bcr-Ablチロシンキナーゼ阻害剤、ブルトン型チロシンキナーゼ阻害剤、CDC7阻害剤、CHK1阻害剤、サイクリン依存性キナーゼ阻害剤、DNA-PK阻害剤、DNA-PKおよびmTORの両方の阻害剤、DNMT1阻害剤、DNMT1阻害剤+2-クロロ-デオキシアデノシン、HDAC阻害剤、ヘッジホッグシグナル伝達経路阻害剤、IDO阻害剤、JAK阻害剤、mTOR阻害剤、MEK阻害剤、MELK阻害剤、MTH1阻害剤、PARP阻害剤、ホスホイノシチド3-キナーゼ阻害剤、PARP1およびDHODHの両方の阻害剤、プロテアソーム阻害剤、トポイソメラーゼ-II阻害剤、チロシンキナーゼ阻害剤、VEGFR阻害剤、ならびにWEE1阻害剤から選択される阻害剤;(ii)OX40、CD137、CD40、GITR、CD27、HVEM、TNFRSF25、またはICOSのアゴニスト;ならびに(iii)IL-12、IL-15、GM-CSF、およびG-CSFから選択されるサイトカインが含まれる。
【0170】
本発明のタンパク質はまた、原発病巣の外科的除去の補助として使用され得る。
【0171】
多重特異性結合タンパク質およびさらなる治療剤の量ならびに投与の相対的タイミングは、所望の併用療法効果を達成するために選択され得る。例えば、このような投与を必要とする患者に併用療法を投与する場合、組み合わせる治療剤、または治療剤を含む1つもしくは複数の医薬組成物は、例えば、連続的に、併せて、一緒に、同時になどの任意の順序で投与され得る。さらに、例えば、多重特異性結合タンパク質は、さらなる治療剤がその予防効果または治療効果を発揮する時間の間投与されてもよく、またはその逆であってもよい。
【0172】
V.医薬組成物
本開示はまた、治療有効量の本明細書に記載のタンパク質を含有する医薬組成物を特徴とする。組成物は、種々の薬物送達系で使用されるように製剤化することができる。適切な製剤を作るために、1種または複数の生理学的に許容される賦形剤または担体を組成物に含めることもできる。本開示で使用される好適な製剤は、Remington’s Pharmaceutical Sciences、Mack Publishing Company、Philadelphia、Pa.、第17版、1985年に見出される。薬物送達のための方法に関する簡潔な概説については、例えば、Langer(Science、249巻:1527~1533頁、1990年)を参照されたい。
【0173】
医薬組成物は、CLEC12A結合部位を含有する治療有効量の多重特異性結合タンパク質を含み得る。
【0174】
本開示の静脈内薬物送達製剤は、バッグ、ペン、または注射器に含有されてもよい。ある特定の実施形態では、バッグはチューブおよび/または針を含むチャネルに接続されてもよい。ある特定の実施形態では、製剤は凍結乾燥製剤または液体製剤であってもよい。ある特定の実施形態では、製剤はフリーズドライ(凍結乾燥)されてもよく、約12~60個のバイアルに含有されてもよい。ある特定の実施形態では、製剤はフリーズドライされてもよく、45mgのフリーズドライされた製剤が1個のバイアルに含有されてもよい。ある特定の実施形態では、約40mg~約100mgのフリーズドライされた製剤が1個のバイアルに含有されてもよい。ある特定の実施形態では、12、27、または45個のバイアルからのフリーズドライされた製剤は、静脈内薬物製剤中に治療用量のタンパク質を得るために組み合わされてもよい。ある特定の実施形態では、製剤は液体製剤であってもよく、約250mg/バイアル~約1000mg/バイアルとして保存されてもよい。ある特定の実施形態では、製剤は液体製剤であってもよく、約600mg/バイアルとして保存されてもよい。ある特定の実施形態では、製剤は液体製剤であってもよく、約250mg/バイアルとして保存されてもよい。
【0175】
タンパク質は、製剤を形成する緩衝溶液中に治療有効量のタンパク質を含む液体水性医薬製剤中に存在することができる。
【0176】
これらの組成物は従来の滅菌技術によって滅菌されてもよく、または濾過滅菌されてもよい。得られた水溶液はそのままで使用するためにパッケージ化されてもよく、または凍結乾燥されてもよく、凍結乾燥された調製物は投与前に滅菌水性担体と組み合わされる。調製物のpHは、典型的に、3から11の間、より好ましくは5から9の間または6から8の間、最も好ましくは7から8の間、例えば7~7.5である。得られた固形の組成物は複数の単回用量単位でパッケージ化されてもよく、各々は一定量の上述の1つまたは複数の薬剤を含有する。固形の組成物はまた、柔軟な量のための容器にパッケージ化されてもよい。
【0177】
ある特定の実施形態では、本開示は、マンニトール、クエン酸一水和物、クエン酸ナトリウム、リン酸二ナトリウム二水和物、リン酸二水素ナトリウム二水和物、塩化ナトリウム、ポリソルベート80、水、および酸化ナトリウムと組み合わせて本開示のタンパク質を含む、延長された貯蔵寿命を有する製剤を提供する。
【0178】
ある特定の実施形態では、pH緩衝溶液中に本開示のタンパク質を含む水性製剤が調製される。本発明の緩衝液は、約4~約8、例えば、約4.5~約6.0、もしくは約4.8~約5.5の範囲のpHを有してもよく、または約5.0~約5.2のpHを有してもよい。上記に列挙したpHの中間の範囲も、本開示の一部であることが意図される。例えば、上限および/または下限として上記に列挙した値のいずれかの組合せを使用する値の範囲が含まれることが意図される。pHをこの範囲内に制御する緩衝液の例には、酢酸塩(例えば、酢酸ナトリウム)、コハク酸塩(コハク酸ナトリウムなど)、グルコン酸塩、ヒスチジン、クエン酸塩および他の有機酸緩衝液が含まれる。
【0179】
ある特定の実施形態では、製剤は、pHを約4~約8の範囲に維持するためにクエン酸塩およびリン酸塩を含有する緩衝系を含む。ある特定の実施形態では、pHの範囲は、約4.5~約6.0、または約pH4.8~約5.5、または約5.0~約5.2のpH範囲であってもよい。ある特定の実施形態では、緩衝系には、クエン酸一水和物、クエン酸ナトリウム、リン酸二ナトリウム二水和物、および/またはリン酸二水素ナトリウム二水和物が含まれる。ある特定の実施形態では、緩衝系は、約1.3mg/mlのクエン酸(例えば、1.305mg/ml)、約0.3mg/mlのクエン酸ナトリウム(例えば、0.305mg/ml)、約1.5mg/mlのリン酸二ナトリウム二水和物(例えば、1.53mg/ml)、約0.9mg/mlのリン酸二水素ナトリウム二水和物(例えば、0.86)、および約6.2mg/mlの塩化ナトリウム(例えば、6.165mg/ml)を含む。ある特定の実施形態では、緩衝系は、1~1.5mg/mlのクエン酸、0.25~0.5mg/mlのクエン酸ナトリウム、1.25~1.75mg/mlのリン酸二ナトリウム二水和物、0.7~1.1mg/mlのリン酸二水素ナトリウム二水和物、および6.0~6.4mg/mlの塩化ナトリウムを含む。ある特定の実施形態では、製剤のpHは水酸化ナトリウムを用いて調整される。
【0180】
トニシファイヤー(tonicifier)として作用し、抗体を安定化させることができるポリオールも、製剤に含めることができる。ポリオールは、製剤の所望の等張性に関して変化し得る量で製剤に添加される。ある特定の実施形態では、水性製剤は等張性であってもよい。添加されるポリオールの量も、ポリオールの分子量に関して変化し得る。例えば、二糖(トレハロースなど)と比較して、少量の単糖(例えば、マンニトール)が添加されてもよい。ある特定の実施形態では、等張化剤として製剤に使用され得るポリオールはマンニトールである。ある特定の実施形態では、マンニトール濃度は約5~約20mg/mlであってもよい。ある特定の実施形態では、マンニトールの濃度は約7.5~15mg/mlであってもよい。ある特定の実施形態では、マンニトールの濃度は約10~14mg/mlであってもよい。ある特定の実施形態では、マンニトールの濃度は約12mg/mlであってもよい。ある特定の実施形態では、ポリオールソルビトールを製剤に含めることができる。
【0181】
洗剤または界面活性剤もまた、製剤に添加してもよい。例示的な洗剤としては、ポリソルベート(例えば、ポリソルベート20、80など)またはポロクサマー(例えば、ポロクサマー188)などの非イオン性洗剤が挙げられる。添加される洗剤の量は、製剤化された抗体の凝集を低減させ、かつ/または製剤中の微粒子の形成を最低限に抑え、かつ/または吸着を低減させるようなものである。ある特定の実施形態では、製剤は、ポリソルベートである界面活性剤を含み得る。ある特定の実施形態では、製剤は、洗剤のポリソルベート80またはTween 80を含有し得る。Tween 80は、ポリオキシエチレン(20)ソルビタンモノオレエートを表すために使用される用語である(Fiedler、Lexikon der Hifsstoffe、Editio Cantor Verlag Aulendorf、第4版、1996年を参照されたい)。ある特定の実施形態では、製剤は、約0.1mg/mLから約10mg/mLの間のポリソルベート80、または約0.5mg/mLから約5mg/mLの間を含有し得る。ある特定の実施形態では、約0.1%のポリソルベート80が製剤に添加され得る。
【0182】
実施形態では、本開示のタンパク質産物は、液体製剤として製剤化される。液体製剤は、ゴム栓で閉じ、アルミニウムクリンプシールクロージャで密封した、USP/Ph EurいずれかのタイプI 50Rバイアルにおいて、10mg/mLの濃度で提供され得る。栓は、USPおよびPh Eurに準拠したエラストマーで作られていてもよい。ある特定の実施形態では、60mLの採取容量を可能にするために、バイアルに61.2mLのタンパク質産物溶液が充填され得る。ある特定の実施形態では、液体製剤は、0.9%の生理食塩水で希釈され得る。
【0183】
ある特定の実施形態では、本開示の液体製剤は、安定化レベルで糖と組み合わせた10mg/mL濃度溶液として調製され得る。ある特定の実施形態では、液体製剤は水性担体中に調製され得る。ある特定の実施形態では、安定化剤は、静脈内投与に望ましくないまたは不適切な粘度をもたらし得る量以下の量で添加され得る。ある特定の実施形態では、糖は、二糖、例えば、スクロースであり得る。ある特定の実施形態では、液体製剤はまた、緩衝剤、界面活性剤、および保存剤のうちの1つまたは複数を含み得る。
【0184】
ある特定の実施形態では、液体製剤のpHは薬学的に許容される酸および/または塩基の添加によって設定され得る。ある特定の実施形態では、薬学的に許容される酸は塩酸であり得る。ある特定の実施形態では、塩基は水酸化ナトリウムであり得る。
【0185】
凝集に加えて、脱アミドは、発酵、採取/細胞清澄化、精製、薬物物質/薬物製品貯蔵の間および試料分析の間に発生し得るペプチドおよびタンパク質の一般的な産物のバリアントである。脱アミドは、加水分解を受け得るスクシンイミド中間体を形成するタンパク質からのNH3の喪失である。スクシンイミド中間体は、親ペプチドの17ダルトンの質量減少をもたらす。その後の加水分解は、18ダルトンの質量増加をもたらす。スクシンイミド中間体の単離は、水性条件下での不安定性に起因して困難である。したがって、脱アミドは、典型的に1ダルトンの質量増加として検出可能である。アスパラギンの脱アミドは、アスパラギン酸またはイソアスパラギン酸のいずれかを生じる。脱アミドの速度に影響を及ぼすパラメータには、pH、温度、溶媒誘電率、イオン強度、一次配列、局所ポリペプチド立体配座および三次構造が含まれる。ペプチド鎖におけるAsnに隣接するアミノ酸残基は、脱アミド化速度に影響を及ぼす。タンパク質配列におけるAsnに続くGlyおよびSerは、脱アミドに対してより高い感受性を生じる。
【0186】
ある特定の実施形態では、本開示の液体製剤は、タンパク質産物の脱アミノを阻止するためのpHおよび湿度の条件下で保存され得る。
【0187】
本明細書における目的の水性担体は、薬学的に許容され(ヒトへの投与に安全かつ無毒であり)、液体製剤の調製に有用であるものである。例示的な担体には、注射用滅菌水(SWFI)、注射用静菌水(BWFI)、pH緩衝溶液(例えば、リン酸緩衝生理食塩水)、滅菌生理食塩水、リンガー液またはデキストロース溶液が含まれる。
【0188】
保存剤は必要に応じて、細菌作用を低減させるために本明細書における製剤に添加することができる。保存剤の添加は、例えば、多数回使用(複数回投与)製剤の製造を容易にすることができる。
【0189】
静脈内(IV)製剤は、患者が、移植後に入院しており、IV経路を介してすべての薬物を受けている場合などの特定の場合に好ましい投与経路であり得る。ある特定の実施形態では、液体製剤は、投与前に0.9%の塩化ナトリウム溶液により希釈される。ある特定の実施形態では、注射のための希釈された薬物製品は等張であり、静脈内注入による投与に適している。
【0190】
ある特定の実施形態では、塩または緩衝成分は10mM~200mMの量で添加することができる。塩および/または緩衝液は薬学的に許容され、「塩基形成」金属またはアミンを用いて種々の公知の酸(無機および有機)から誘導される。ある特定の実施形態では、緩衝液はリン酸緩衝液であり得る。ある特定の実施形態では、緩衝液は、グリシネート、炭酸、クエン酸緩衝液であってもよく、これらの場合、ナトリウム、カリウムまたはアンモニウムイオンが対イオンとして機能し得る。
【0191】
保存剤は必要に応じて、細菌作用を低減させるために本明細書における製剤に添加することができる。保存剤の添加は、例えば、多数回使用(複数回投与)製剤の製造を容易にすることができる。
【0192】
本明細書における目的の水性担体は、薬学的に許容され(ヒトへの投与に安全かつ無毒であり)、液体製剤の調製に有用であるものである。例示的な担体には、注射用滅菌水(SWFI)、注射用静菌水(BWFI)、pH緩衝溶液(例えば、リン酸緩衝生理食塩水)、滅菌生理食塩水、リンガー液またはデキストロース溶液が含まれる。
【0193】
本開示のタンパク質は、タンパク質およびリオプロテクタントを含む凍結乾燥製剤として存在することもできる。リオプロテクタントは糖、例えば二糖であり得る。ある特定の実施形態では、リオプロテクタント(lycoprotectant)は、スクロースまたはマルトースであり得る。凍結乾燥製剤は、緩衝剤、界面活性剤、増量剤、および/または保存剤のうちの1つまたは複数を含んでもよい。
【0194】
凍結乾燥された薬物製品の安定化に有用なスクロースまたはマルトースの量は、少なくとも1:2のタンパク質対スクロースまたはマルトースの重量比であり得る。ある特定の実施形態では、タンパク質対スクロースまたはマルトースの重量比は1:2~1:5であり得る。
【0195】
ある特定の実施形態では、凍結乾燥前の製剤のpHは、薬学的に許容される酸および/または塩基の添加によって設定され得る。ある特定の実施形態では、薬学的に許容される酸は塩酸であり得る。ある特定の実施形態では、薬学的に許容される塩基は水酸化ナトリウムであり得る。
【0196】
凍結乾燥前に、本開示のタンパク質を含有する溶液のpHは6から8の間に調整され得る。ある特定の実施形態では、凍結乾燥した薬物製品についてのpH範囲は7~8であり得る。
【0197】
ある特定の実施形態では、塩または緩衝成分は10mM~200mMの量で添加することができる。塩および/または緩衝液は薬学的に許容され、「塩基形成」金属またはアミンを用いて種々の公知の酸(無機および有機)から誘導される。ある特定の実施形態では、緩衝液はリン酸緩衝液であり得る。ある特定の実施形態では、緩衝液は、グリシネート、炭酸、クエン酸緩衝液であってもよく、これらの場合、ナトリウム、カリウムまたはアンモニウムイオンが対イオンとして機能し得る。
【0198】
ある特定の実施形態では、「増量剤」を添加することができる。「増量剤」は、凍結乾燥混合物に質量を付加し、凍結乾燥ケーキの物理的構造に寄与する(例えば、開放気孔構造を維持する本質的に均一な凍結乾燥ケーキの製造を容易にする)化合物である。例示的な増量剤には、マンニトール、グリシン、ポリエチレングリコールおよびソルビトールが含まれる。本発明の凍結乾燥製剤はこのような増量剤を含有し得る。
【0199】
保存剤は必要に応じて、細菌作用を低減させるために本明細書における製剤に添加することができる。保存剤の添加は、例えば、多数回使用(複数回投与)製剤の製造を容易にすることができる。
【0200】
ある特定の実施形態では、凍結乾燥薬物製品は水性担体で構成され得る。本明細書における目的の水性担体は、薬学的に許容され(例えば、ヒトへの投与に安全かつ無毒であり)、凍結乾燥後、液体製剤の調製に有用であるものである。例示的な希釈剤には、注射用滅菌水(SWFI)、注射用静菌水(BWFI)、pH緩衝溶液(例えば、リン酸緩衝生理食塩水)、滅菌生理食塩水、リンガー液またはデキストロース溶液が含まれる。
【0201】
ある特定の実施形態では、本開示の凍結乾燥薬物製品は、注射用滅菌水、USP(SWFI)または0.9%の塩化ナトリウム注射液、USPのいずれかで再構成される。再構成の間、凍結乾燥粉末は溶液に溶解する。
【0202】
ある特定の実施形態では、本開示の凍結乾燥タンパク質製品は、約4.5mLの注射用水に構成され、0.9%の生理食塩水溶液(塩化ナトリウム溶液)により希釈される。
【0203】
本発明の医薬組成物中の活性成分の実際の投薬量レベルは、患者に毒性を生じず、特定の患者、組成物、および投与様式に対して所望の治療応答を達成するのに有効である活性成分の量を得るように変化し得る。
【0204】
特定の用量は、各患者に対して均一な用量、例えば、50~5000mgのタンパク質であってもよい。代替的に、患者の用量は、患者のおおよその体重または表面積に合わせられ得る。適切な投薬量を決定する際の他の要因には、処置または予防される疾患または状態、疾患の重症度、投与経路、ならびに患者の年齢、性別および医学的状態が含まれ得る。処置のための適切な投薬量を決定するために必要な計算のさらなる改良は、特に、本明細書に開示される投薬量情報およびアッセイを考慮して当業者によって慣用的になされる。投薬量はまた、適切な用量応答データと併せて使用される投薬量を決定するための公知のアッセイの使用によって決定することができる。個々の患者の投薬量は、疾患の進行がモニターされるにつれて調節されてもよい。患者における標的化可能な構築物または複合物の血中レベルは、有効濃度に達するか、または有効濃度を維持するように投薬量が調節される必要があるかどうかを調べるために測定され得る。どの標的化可能な構築物および/または複合物、ならびにそれらの投薬量が、所与の個体に対して効果的である可能性が高いかを決定するために薬理ゲノム学が使用され得る(Schmitzら、Clinica Chimica Acta 308巻:43~53頁、2001年;Steimerら、Clinica Chimica Acta 308巻:33~41頁、2001年)。
【0205】
一般に、体重に基づく投薬量は、約0.01μg~約100mg/kg体重、例えば、約0.01μg~約100mg/kg体重、約0.01μg~約50mg/kg体重、約0.01μg~約10mg/kg体重、約0.01μg~約1mg/kg体重、約0.01μg~約100μg/kg体重、約0.01μg~約50μg/kg体重、約0.01μg~約10μg/kg体重、約0.01μg~約1μg/kg体重、約0.01μg~約0.1μg/kg体重、約0.1μg~約100mg/kg体重、約0.1μg~約50mg/kg体重、約0.1μg~約10mg/kg体重、約0.1μg~約1mg/kg体重、約0.1μg~約100μg/kg体重、約0.1μg~約10μg/kg体重、約0.1μg~約1μg/kg体重、約1μg~約100mg/kg体重、約1μg~約50mg/kg体重、約1μg~約10mg/kg体重、約1μg~約1mg/kg体重、約1μg~約100μg/kg体重、約1μg~約50μg/kg体重、約1μg~約10μg/kg体重、約10μg~約100mg/kg体重、約10μg~約50mg/kg体重、約10μg~約10mg/kg体重、約10μg~約1mg/kg体重、約10μg~約100μg/kg体重、約10μg~約50μg/kg体重、約50μg~約100mg/kg体重、約50μg~約50mg/kg体重、約50μg~約10mg/kg体重、約50μg~約1mg/kg体重、約50μg~約100μg/kg体重、約100μg~約100mg/kg体重、約100μg~約50mg/kg体重、約100μg~約10mg/kg体重、約100μg~約1mg/kg体重、約1mg~約100mg/kg体重、約1mg~約50mg/kg体重、約1mg~約10mg/kg体重、約10mg~約100mg/kg体重、約10mg~約50mg/kg体重、約50mg~約100mg/kg体重である。
【0206】
用量は、1日に1回もしくは複数回、1週間に1回もしくは複数回、1ヶ月に1回もしくは複数回または1年に1回もしくは複数回、またはさらに2~20年に1回与えられ得る。当業者は、体液または組織中の標的化可能な構築物または複合体の測定された滞留時間および濃度に基づいて投薬のための反復率を容易に推定することができる。本発明の投与は、静脈内、動脈内、腹腔内、筋肉内、皮下、胸膜内、髄腔内、腔内であってもよく、カテーテルを介する潅流によってでもよく、または直接的な病巣内注射によってでもよい。これは、1日に1回または複数回、1週間に1回または複数回、1ヶ月に1回または複数回、および1年に1回または複数回、投与され得る。
【0207】
上記の説明は本発明の複数の態様および実施形態を記載している。本出願は特に、態様および実施形態のすべての組合せおよび置換を意図する。
【実施例0208】
ここで概して記載されている本発明は、以下の実施例を参照することによってより容易に理解され、これらの実施例は本発明のある特定の態様および実施形態の例示の目的のためにのみ含まれ、本発明を限定することを意図していない。
【0209】
(実施例1)
NKG2D結合ドメインはNKG2Dに結合する
NKG2D結合ドメインは精製した組換えNKG2Dに結合する
ヒト、マウスまたはカニクイザルNKG2D細胞外ドメインの核酸配列を、ヒトIgG1 Fcドメインをコードする核酸配列と融合させ、発現させる哺乳動物細胞に導入した。精製後、NKG2D-Fc融合タンパク質をマイクロプレートのウェルに吸着させた。非特異的結合を防ぐためにウシ血清アルブミンでウェルを阻止した後、NKG2D結合ドメインを滴定し、NKG2D-Fc融合タンパク質を予め吸着させたウェルに添加した。一次抗体結合を、西洋ワサビペルオキシダーゼとコンジュゲートし、Fc交差反応を回避するためにヒトカッパ軽鎖を特異的に認識する二次抗体を使用して検出した。西洋ワサビペルオキシダーゼに対する基質である3,3’,5,5’-テトラメチルベンジジン(TMB)をウェルに添加して結合シグナルを可視化し、その吸光度を450nMにて測定し、540nMにて補正した。NKG2D結合ドメインクローン、アイソタイプ対照または陽性対照(配列番号101~104、またはeBioscienceにて入手可能な抗マウスNKG2DクローンMI-6およびCX-5から選択した重鎖および軽鎖可変ドメインを含む)を各ウェルに添加した。
【0210】
アイソタイプ対照は組換えNKG2D-Fcタンパク質に対してわずかな結合を示したが、陽性対照が組換え抗原に対して最も強く結合した。クローン毎に親和性は異なったが、すべてのクローンによって産生されたNKG2D結合ドメインが、ヒト、マウス、およびカニクイザルの組換えNKG2D-Fcタンパク質のすべてで結合を示した。概して、各抗NKG2Dクローンは、ヒト(
図3)およびカニクイザル(
図4)の組換えNKG2D-Fcに同様の親和性で結合したが、マウス(
図5)の組換えNKG2D-Fcに対する親和性は比較的低かった。
【0211】
NKG2D結合ドメインはNKG2Dを発現する細胞に結合する
EL4マウスリンパ腫細胞株を、ヒトまたはマウスのNKG2D-CD3ゼータシグナル伝達ドメインキメラ抗原受容体を発現するように工学操作した。NKG2D結合クローン、アイソタイプ対照または陽性対照を100nM濃度にて使用して、EL4細胞において発現した細胞外NKG2Dを染色した。フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトIgG二次抗体を使用して抗体結合を検出した。細胞をフローサイトメトリーによって分析し、親EL4細胞と比較したNKG2D発現細胞の平均蛍光強度(MFI)を使用してバックグラウンドに対する倍率(FOB)を計算した。
【0212】
すべてのクローンによって産生されたNKG2D結合ドメインが、ヒトおよびマウスのNKG2Dを発現するEL4細胞に結合した。陽性対照抗体(配列番号101~104、またはeBioscienceにて入手可能な抗マウスNKG2DクローンMI-6およびCX-5から選択される重鎖および軽鎖可変ドメインを含む)が最も良好なFOB結合シグナルをもたらした。各クローンのNKG2D結合親和性は、ヒトNKG2Dを発現する細胞(
図6)とマウスNKG2Dを発現する細胞(
図7)との間で同様であった。
【0213】
(実施例2)
NKG2D結合ドメインはNKG2Dへの天然リガンドの結合を阻止する
ULBP-6との競合
組換えヒトNKG2D-Fcタンパク質をマイクロプレートのウェルに吸着させ、非特異的結合を低減させるためにウシ血清アルブミンでウェルをブロッキングした。飽和濃度のULBP-6-His-ビオチンをウェルに添加し、続いてNKG2D結合ドメインクローンを添加した。2時間のインキュベーション後、ウェルを洗浄し、NKG2D-Fcでコーティングされたウェルに結合したままであったULBP-6-His-ビオチンを、西洋ワサビペルオキシダーゼとコンジュゲートしたストレプトアビジンおよびTMB基質によって検出した。吸光度を450nMにて測定し、540nMにて補正した。バックグラウンドを差し引いた後、NKG2D-Fcタンパク質へのNKG2D結合ドメインの特異的結合を、ウェル中のNKG2D-Fcタンパク質への結合を遮断されたULBP-6-His-ビオチンのパーセンテージから計算した。陽性対照抗体(配列番号101~104から選択される重鎖および軽鎖可変ドメインを含む)および種々のNKG2D結合ドメインは、NKG2DへのULBP-6の結合を遮断したが、アイソタイプ対照はULBP-6との競合をほとんど示さなかった(
図8)。
ULBP-6配列は、配列番号108により表される。
【化6】
【0214】
MICAとの競合
組換えヒトMICA-Fcタンパク質をマイクロプレートのウェルに吸着させ、非特異的結合を低減させるためにウシ血清アルブミンでウェルを阻止した。NKG2D-Fc-ビオチンをウェルに添加し、続いてNKG2D結合ドメインを添加した。インキュベーションおよび洗浄後、MICA-Fcでコーティングされたウェルに結合したままであったNKG2D-Fc-ビオチンを、ストレプトアビジン-HRPおよびTMB基質を使用して検出した。吸光度を450nMにて測定し、540nMにて補正した。バックグラウンドを差し引いた後、NKG2D-Fcタンパク質へのNKG2D結合ドメインの特異的結合を、MICA-Fcでコーティングされたウェルへの結合を阻止されたNKG2D-Fc-ビオチンのパーセンテージから計算した。陽性対照抗体(配列番号101~104から選択される重鎖および軽鎖可変ドメインを含む)および種々のNKG2D結合ドメインはNKG2DへのMICA結合を阻止したが、アイソタイプ対照はMICAとの競合をほとんど示さなかった(
図9)。
【0215】
Rae-1デルタとの競合
組換えマウスRae-1デルタ-Fc(R&D Systemsから購入した)をマイクロプレートのウェルに吸着させ、非特異的結合を低減させるためにウェルをウシ血清アルブミンで阻止した。マウスNKG2D-Fc-ビオチンをウェルに添加し、続いてNKG2D結合ドメインを添加した。インキュベーションおよび洗浄後、Rae-1デルタ-Fcでコーティングされたウェルに結合したままであったNKG2D-Fc-ビオチンを、ストレプトアビジン-HRPおよびTMB基質を使用して検出した。吸光度を450nMにて測定し、540nMにて補正した。バックグラウンドを差し引いた後、NKG2D-Fcタンパク質へのNKG2D結合ドメインの特異的結合を、Rae-1デルタ-Fcでコーティングされたウェルへの結合を阻止されたNKG2D-Fc-ビオチンのパーセンテージから計算した。陽性対照抗体(配列番号101~104、またはeBioscienceにて入手可能な抗マウスNKG2DクローンMI-6およびCX-5から選択される重鎖および軽鎖可変ドメインを含む)および種々のNKG2D-結合ドメインクローンはマウスNKG2DへのRae-1デルタ結合を阻止したが、アイソタイプ対照抗体はRae-1デルタとの競合をほとんど示さなかった(
図10)。
【0216】
(実施例3)
NKG2D結合ドメインクローンはNKG2Dを活性化させる
CD3ゼータシグナル伝達ドメインをコードする核酸配列に、ヒトおよびマウスNKG2Dの核酸配列を融合させて、キメラ抗原受容体(CAR)構築物を得た。次に、ギブソンアセンブリを使用してNKG2D-CAR構築物をレトロウイルスベクターにクローニングし、レトロウイルス産生のためにexpi293細胞にトランスフェクトした。8μg/mLのポリブレンと共にNKG2D-CARを含有するウイルスにEL4細胞を感染させた。感染の24時間後、EL4細胞中のNKG2D-CARの発現レベルをフローサイトメトリーによって分析し、細胞表面で高レベルのNKG2D-CARを発現するクローンを選択した。
【0217】
NKG2D結合ドメインがNKG2Dを活性化させるかどうかを判定するために、それらをマイクロプレートのウェルに吸着させ、抗体断片でコーティングされたウェルにおいてNKG2D-CAR EL4細胞をブレフェルジン-Aおよびモネンシンの存在下で4時間にわたって培養した。NKG2D活性化の指標である細胞内TNF-α産生をフローサイトメトリーによってアッセイした。陽性対照で処置した細胞に対してTNF-α陽性細胞のパーセンテージを正規化した。すべてのNKG2D結合ドメインがヒトNKG2D(
図11)およびマウスNKG2D(
図12)の両方を活性化させた。
【0218】
(実施例4)
NKG2D結合ドメインはNK細胞を活性化させる
初代ヒトNK細胞
密度勾配遠心分離を使用し、ヒト末梢血バフィコートから末梢血単核細胞(PBMC)を単離した。磁気ビーズを用いたネガティブセレクションを使用してPBMCからNK細胞(CD3
-CD56
+)を単離した。単離されたNK細胞の純度は典型的には>95%であった。次に、単離されたNK細胞を、100ng/mLのIL-2を含有する培地中で24~48時間にわたって培養した後、それらを、NKG2D結合ドメインを吸着させたマイクロプレートのウェルに移し、フルオロフォアコンジュゲート抗CD107a抗体、ブレフェルジン-A、およびモネンシンを含有する培地中で培養した。培養後、CD3、CD56、およびIFN-γに対するフルオロフォアコンジュゲート抗体を使用したフローサイトメトリーによってNK細胞をアッセイした。CD3
-CD56
+細胞におけるCD107aおよびIFN-γの染色を分析して、NK細胞の活性化を評価した。CD107a/IFN-γ二重陽性細胞の増加は、1つの受容体ではなく2つの活性化受容体の会合による、より良好なNK細胞の活性化を示す。NKG2D結合ドメインおよび陽性対照(例えば、配列番号101または配列番号103によって表される重鎖可変ドメイン、および配列番号102または配列番号104によって表される軽鎖可変ドメイン)は、アイソタイプ対照よりも高いパーセンテージのNK細胞がCD107a
+およびIFN-γ
+になることを示した(
図13および
図14は、NK細胞の調製のために異なるドナーのPBMCをそれぞれ使用した、2つの独立した実験のデータを表す)。
【0219】
初代マウスNK細胞
C57Bl/6マウスから脾臓を得、70μmのセルストレイナーを通して押しつぶして、単一細胞懸濁液を得た。細胞をペレット化し、ACK溶解緩衝液(Thermo Fisher Scientificから購入した、#A1049201;155mM塩化アンモニウム、10mM炭酸水素カリウム、0.01mM EDTA)に再懸濁して赤血球を除去した。残存する細胞を100ng/mLのhIL-2と共に72時間にわたって培養し、その後採取し、NK細胞単離のために用意した。次に、磁気ビーズを用いたネガティブディプリーション技術を使用し、典型的には>90%の純度で脾臓細胞からNK細胞(CD3
-NK1.1
+)を単離した。精製されたNK細胞を、100ng/mLのmIL-15を含有する培地中で48時間にわたって培養した後、NKG2D結合ドメインを吸着させたマイクロプレートのウェルに移し、フルオロフォアコンジュゲート抗CD107a抗体、ブレフェルジン-A、およびモネンシンを含有する培地中で培養した。NKG2D結合ドメインでコーティングされたウェルにおいて培養した後、CD3、NK1.1、およびIFN-γに対するフルオロフォアコンジュゲート抗体を使用したフローサイトメトリーによってNK細胞をアッセイした。CD3
-NK1.1
+細胞におけるCD107aおよびIFN-γの染色を分析して、NK細胞の活性化を評価した。CD107a/IFN-γ二重陽性細胞の増加は、1つの受容体ではなく2つの活性化受容体の会合による、より良好なNK細胞の活性化を示す。NKG2D結合ドメインおよび陽性対照(eBioscienceから入手可能な抗マウスNKG2DクローンMI-6およびCX-5から選択される)は、アイソタイプ対照よりも高いパーセンテージのNK細胞がCD107a
+およびIFN-γ
+になることを示した(
図15および
図16は、NK細胞の調製のために異なるマウスをそれぞれ使用した、2つの独立した実験のデータを表す)。
【0220】
(実施例5)
NKG2D結合ドメインは標的腫瘍細胞の細胞傷害性を可能にする
ヒトおよびマウス初代NK細胞活性化アッセイは、NKG2D結合ドメインとのインキュベーション後、NK細胞において細胞傷害性マーカーの増加を実証した。これが腫瘍細胞溶解の増加につながるかどうかに対処するために、各NKG2D結合ドメインが単一特異的抗体に発達する細胞ベースのアッセイを利用した。Fc領域を1つの標的化アームとして使用し、一方、Fab断片領域(NKG2D結合ドメイン)はNK細胞を活性化するための別の標的化アームとして働いた。ヒト起源であり、高レベルのFc受容体を発現するTHP-1細胞を腫瘍標的として使用し、Perkin Elmer DELFIA細胞傷害性キットを使用した。THP-1細胞をBATDA試薬で標識し、105/mLにて培養培地に再懸濁した。次に、標識したTHP-1細胞をNKG2D抗体と組み合わせ、マイクロタイタープレートのウェル中で37℃にて3時間、マウスNK細胞を単離した。インキュベーション後、20μlの培養上清を取り出し、200μlのユーロピウム溶液と混合し、暗所で15分間振盪しながらインキュベートした。時間分解蛍光モジュール(励起337nm、発光620nm)を備えたPheraStarプレートリーダーによって蛍光を経時的に測定し、キットの指示に従って特異的溶解を計算した。
【0221】
Fcにコンジュゲートした、陽性対照のULBP-6(NKG2Dに対する天然リガンド)は、マウスNK細胞によるTHP-1標的細胞の特異的溶解の増加を示した。NKG2D抗体も、THP-1標的細胞の特異的溶解を増加させたが、アイソタイプ対照抗体は特異的溶解の低減を示した。点線は、抗体を添加していないマウスNK細胞によるTHP-1細胞の特異的溶解を示す(
図17)。
【0222】
(実施例6)
NKG2D抗体は高い熱安定性を示す
NKG2D結合ドメインの融解温度を、示差走査型蛍光定量法を使用してアッセイした。外挿した見かけの融解温度は典型的なIgG1抗体と比較して高い(
図18)。
【0223】
(実施例7)
NKG2DおよびCD16の架橋によるヒトNK細胞の相乗的活性化
初代ヒトNK細胞活性化アッセイ
密度勾配遠心分離を使用し、ヒト末梢血バフィコートから末梢血単核細胞(PBMC)を単離した。ネガティブ磁気ビーズ(StemCell #17955)を使用してPBMCからNK細胞を精製した。NK細胞は、フローサイトメトリーによって決定して>90%のCD3-CD56+であった。次に、細胞を、活性化アッセイに使用する前に100ng/mLのhIL-2(Peprotech #200-02)を含有する培地中で48時間増やした。抗体を、100μlの滅菌PBS中で2μg/ml(抗CD16、Biolegend #302013)および5μg/mL(抗NKG2D、R&D #MAB139)の濃度にて4℃で一晩、96ウェル平底プレート上にコーティングし、続いてウェルを十分に洗浄して過剰の抗体を除去した。脱顆粒の評価のために、IL-2活性化NK細胞を、100ng/mLのヒトIL-2(hIL2)および1μg/mLのAPCコンジュゲート抗CD107a mAb(Biolegend #328619)を補充した培養培地に5×105個の細胞/mLにて再懸濁した。次に、1×105個の細胞/ウェルを、抗体をコーティングしたプレート上に添加した。タンパク質輸送阻害剤であるブレフェルジンA(BFA、Biolegend #420601)およびモネンシン(Biolegend #420701)を、それぞれ1:1000および1:270の最終希釈度にて添加した。蒔いた細胞を、37℃にて4時間にわたって5%CO2においてインキュベートした。IFN-γの細胞内染色のために、NK細胞を、抗CD3(Biolegend #300452)および抗CD56 mAb(Biolegend #318328)で標識し、続いて固定し、透過処理し、抗IFN-γ mAb(Biolegend #506507)で標識した。NK細胞を、生CD56+CD3-細胞においてゲーティングした後、フローサイトメトリーによってCD107aおよびIFN-γの発現について分析した。
【0224】
受容体の組合せの相対的効力を調査するため、プレート結合刺激により、NKG2DまたはCD16の架橋および両受容体の共架橋を行った。
図19(
図19A~19C)に示したように、CD16およびNKG2Dの組み合わせた刺激は、CD107a(脱顆粒)レベル(
図19A)および/またはIFN-γ産生レベル(
図19B)の大きな上昇をもたらした。点線は、各受容体の個々の刺激の相加効果を表す。
【0225】
抗CD16、抗NKG2Dまたは両方のモノクローナル抗体の組合せを用いた4時間のプレート結合刺激の後、IL-2活性化NK細胞のCD107aレベルおよび細胞内IFN-γ産生を分析した。グラフは平均(n=2)±SDを示している。
図19AはCD107aのレベルを示し、
図19BはIFNγのレベルを示し、
図19CはCD107aおよびIFN-γ産生のレベルを示す。
図19A~19Cに示したデータは、5名の異なる健康なドナーを使用した、5つの独立した実験を代表するものである。
【0226】
(実施例8)
標的細胞の三重特異性結合タンパク質(TriNKET)媒介性の細胞傷害性の増強
ヒトNKG2Dを発現した細胞へのTriNKET結合の評価:
【0227】
ヒトNKG2Dで形質導入したEL4細胞を、ヒトNKG2Dを発現する細胞へのA49-TriNKET-CLEC12A(クローンADI-27749のNKG2D結合ドメインおよびUS2014/0120096に記載されるモノクローナル抗体4331(第21頁を参照のこと)のCLEC12A結合ドメイン)の結合を試験するために使用した。TriNKETを、最高濃度に希釈し、次いで、段階希釈した。mAbまたはTriNKETの希釈物を使用して細胞を染色し、フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトIgG二次抗体を使用して、TriNKETまたはmAbの結合を検出した。フローサイトメトリーによって細胞を分析し、結合MFIを、二次抗体対照に対して正規化して、バックグラウンド値に対する倍率を得た。
【0228】
図35および
図36は、CLEC12Aを発現するヒトAML細胞株へのCLEC12A標的化TriNKETの結合を示す。抗CLEC12Aモノクローナル抗体およびTriNKETは、SKM-1細胞(
図35)およびU937細胞(
図36)の両方への類似の結合を示した。
【0229】
ヒトがん抗原を発現した細胞へのTriNKETまたはmAb結合の評価:
CLEC12Aを発現するヒトがん細胞株を使用して、CLEC12Aを標的とするTriNKETの腫瘍抗原結合を評価した。ヒトAML細胞株U937およびSKM-1を使用して、CLEC12Aを発現する細胞へのTriNKETの結合を評価した。TriNKETまたはmAbを希釈し、それぞれの細胞と共にインキュベートした。フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトIgG二次抗体を使用して、TriNKETの結合を検出した。フローサイトメトリーによって細胞を分析し、CLEC12Aを発現する細胞への結合MFIを、二次抗体対照に対して正規化して、バックグラウンド値に対する倍率を得た。
【0230】
図37は、EL4細胞の表面において発現されるヒトNKG2DへのCLEC12A-TriNKETの結合を示す。細胞表面において発現されるNKG2Dへの結合は弱かったが、抗CLEC12Aモノクローナル抗体と比較して検出可能であった。
【0231】
TriNKETまたはmAb内部移行の評価:
HL60、SKM-1、およびU937ヒトAML細胞株を、細胞表面において発現されるCLEC12Aに結合したTrINKETの内部移行を評価するために使用した。TriNKETまたはmAbを20μg/mLに希釈し、希釈物を使用して、細胞を染色した。CLEC12Aサンプルの表面染色を分けた後に、そのサンプルの2/3を37℃で一晩静置して、内部移行を促進し、他方のそのサンプルの1/3に結合した抗体を、フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトIgG二次抗体を使用して検出した。二次抗体で染色した後に細胞を固定し、翌日に分析するために、4℃で一晩貯蔵した。37℃で2時間および20時間後、サンプルをインキュベーターから取り出し、細胞の表面に結合した抗体を、フルオロフォアコンジュゲート抗ヒトIgG二次抗体を使用して検出した。サンプルを固定し、全サンプルを同日に分析した。抗体またはTriNKETの内部移行を、以下のように計算した: %内部移行=(1-(サンプルMFI 24時間/ベースラインMFI)) × 100%。
【0232】
図38、39、および40は、それぞれ、HL60細胞(
図38)、SKM-1細胞(
図39)、およびU937細胞(
図40)とのインキュベーション後の、CLEC12Aを標的とするTriNKETの内部移行を示す。抗CD33抗体リンツズマブを、内部移行のための陽性対照として使用した。なぜならCD33は、HL60細胞株(
図38)、SKM-1細胞株(
図39)、およびU937細胞株(
図40)によって発現されるからである。リンツズマブは、全ての細胞株において高レベルの内部移行を示し、これは時間と共に増大した。試験した全3種の細胞株において、抗CLEC12A mAbおよびTrINKETは、2時間および20時間のインキュベーション後に、類似のレベルの内部移行を示した。
【0233】
初代ヒトNK細胞の細胞傷害性アッセイ:
密度勾配遠心分離を使用し、ヒト末梢血バフィコートからPBMCを単離した。単離したPBMCを洗浄し、NK細胞単離のために用意した。磁気ビーズを用いたネガティブ選択技術を使用してNK細胞を単離したところ、単離したNK細胞の純度は、典型的には>90% CD3-CD56+であった。単離したNK細胞を、一晩休止させた。休止NK細胞を、翌日の細胞傷害性アッセイにおいて使用した。
【0234】
図41および42は、初代ヒトNK細胞によるCLEC12A陽性ヒトAML細胞株の殺滅を示す。休止したヒトNK細胞は、5:1 エフェクター対標的比において、HL60細胞(
図41)およびMv4-11細胞(
図42)に対してほとんど活性を示さなかった。用量応答性様式で、CLEC12A標的化TriNKETは、HL60細胞(
図41)およびMv4-11細胞(
図42)の両方の効率的殺滅を示した。CLEC12Aに対するモノクローナル抗体は、HL60(
図41)およびMv4-11(
図42)に対してごく弱い活性を示した。その一方で、非標的化TrINKETは活性を示さなかった。CLEC12A-TriNNKETは、Mv4-11細胞(
図42)と比較して、より高レベルのCLEC12Aを発現するHL60細胞(
図41)に対してより良好な有効性を示した。
【0235】
DELFIA細胞傷害性アッセイ
目的の標的を発現するヒトがん細胞株を培養物から採取し、HBSで洗浄し、BATDA試薬(Perkin Elmer、AD0116)で標識するために、106細胞/mLにて成長培地に再懸濁した。標的細胞を標識するために製造業者の指示に従った。標識後、細胞をHBSで3回洗浄し、培養培地に0.5×105 細胞/mLにて再懸濁した。バックグラウンドウェルを調製するために、標識した細胞のアリコートをとっておき、その細胞を培地からスピンアウトした。その培地100μlを、三連でウェルへと注意深く添加して、ペレット化した細胞が乱れるのを回避した。BATDA標識細胞100μlを、96ウェルプレートの各ウェルに添加した。ウェルを、標的細胞からの自発的放出のために保全し、1% Triton-Xの添加による標的細胞の溶解のために調製した。目的の腫瘍標的に対するモノクローナル抗体またはTriNKETを、培養培地で希釈し、希釈したmAbまたはTriNKET50μlを、各ウェルに添加した。休止NK細胞を培養物から採取し、洗浄し、望ましいエフェクター対標的細胞比に応じて、培養培地中1.0×105~2.0×106細胞/mLで再懸濁した。NK細胞50μlを、そのプレートの各ウェルに添加して、合計200μl培養容積にした。そのプレートを、アッセイを展開する前に、37℃、5% CO2で2~3時間にわたってインキュベートした。
【0236】
2~3時間の培養の後、そのプレートをインキュベーターから取り出し、細胞を、200×gで5分間遠心分離することによってペレット化した。培養上清20μlを、製造業者から提供されたきれいなマイクロプレートへと移し、室温のユーロピウム溶液(Perkin Elmer C135-100)200μlを、各ウェルに添加した。そのプレートを遮光し、プレート振盪機上で250rpmにおいて15分間インキュベートした。プレートを、Victor 3またはSpectraMax(登録商標) i3X機器(Molecular Devices)を使用して読み取った。% 特異的溶解を、以下のように計算した: % 特異的溶解=((実験的放出-自発的放出)/(最大放出-自発的放出))×100。
【0237】
参照による組み込み
本明細書で参照される特許文献および科学論文の各々の開示全体は、すべての目的のために参照により組み込まれる。
【0238】
等価物
本発明は、その精神または本質的な特徴から逸脱せずに他の特定の形態で実現されてもよい。したがって、前述の実施形態は、本明細書で記載している本発明を限定するのではなく、すべての点で例示的であると見なされるべきである。したがって、本発明の範囲は、前述の記載によってではなく、添付の特許請求の範囲によって示され、特許請求の範囲の等価の意味および範囲内に入るすべての変更はその中に包含されることが意図される。