知財求人 - 知財ポータルサイト「IP Force」
▶ リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッドの特許一覧
特開2025-23307アンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤による眼疾患の治療
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公開特許公報(A)
(11)【公開番号】P2025023307
(43)【公開日】2025-02-14
(54)【発明の名称】アンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤による眼疾患の治療
(51)【国際特許分類】
A61K 45/00 20060101AFI20250206BHJP
A61P 27/02 20060101ALI20250206BHJP
A61P 27/06 20060101ALI20250206BHJP
A61K 31/7088 20060101ALI20250206BHJP
A61K 31/713 20060101ALI20250206BHJP
A61K 31/7105 20060101ALI20250206BHJP
A61K 48/00 20060101ALI20250206BHJP
A61K 38/43 20060101ALI20250206BHJP
C12N 15/113 20100101ALI20250206BHJP
C12N 15/11 20060101ALI20250206BHJP
C12N 15/09 20060101ALI20250206BHJP
C12Q 1/6827 20180101ALI20250206BHJP
C12N 15/12 20060101ALI20250206BHJP
C12Q 1/6844 20180101ALI20250206BHJP
【ＦＩ】
A61K45/00
A61P27/02
A61P27/06
A61K31/7088
A61K31/713
A61K31/7105
A61K48/00
A61K38/43
C12N15/113 Z ZNA
C12N15/11 Z
C12N15/09 110
C12Q1/6827 Z
C12N15/12
C12Q1/6844 Z
C12N15/113 Z
A61K45/00 ZNA
【審査請求】有
【請求項の数】1
【出願形態】ＯＬ
(21)【出願番号】P 2024213170
(22)【出願日】2024-12-06
(62)【分割の表示】P 2021543226の分割
【原出願日】2020-01-21
(31)【優先権主張番号】62/795,665
(32)【優先日】2019-01-23
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】62/880,609
(32)【優先日】2019-07-30
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】62/902,683
(32)【優先日】2019-09-19
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】62/909,573
(32)【優先日】2019-10-02
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(71)【出願人】
【識別番号】597160510
【氏名又は名称】リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド
【氏名又は名称原語表記】ＲＥＧＥＮＥＲＯＮ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ， ＩＮＣ．
(74)【代理人】
【識別番号】100105957
【弁理士】
【氏名又は名称】恩田 誠
(74)【代理人】
【識別番号】100068755
【弁理士】
【氏名又は名称】恩田 博宣
(74)【代理人】
【識別番号】100142907
【弁理士】
【氏名又は名称】本田 淳
(74)【代理人】
【識別番号】100152489
【弁理士】
【氏名又は名称】中村 美樹
(72)【発明者】
【氏名】プラビーン、カビタ
(72)【発明者】
【氏名】シュールマン、クラウディア
(72)【発明者】
【氏名】グルスキ、ローレン
(72)【発明者】
【氏名】ドスタル、ターニャ テスロヴィッチ
(72)【発明者】
【氏名】アベカシス、ゴンサロ
(72)【発明者】
【氏名】バラス、アリス
(72)【発明者】
【氏名】コッポラ、ジョバンニ
(57)【要約】
【課題】本開示は、眼疾患を有する患者を治療する方法、眼疾患を発症するリスクが上昇している対象を同定する方法、ヒトアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）の変異体核酸分子及び変異体ポリペプチドを検出する方法、ならびにＡＮＧＰＴＬ７の変異体核酸分子及び変異体ポリペプチドを提供する。
【解決手段】ＩＯＰが増大している患者を治療する方法は、前記患者にアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤を投与することを含む。
【選択図】図６Ａ
【解決手段】ＩＯＰが増大している患者を治療する方法は、前記患者にアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤を投与することを含む。
【選択図】図６Ａ
【特許請求の範囲】
【請求項1】
ＩＯＰが増大している患者を治療する方法であって、前記患者にアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項2】
緑内障の患者を治療する方法であって、前記患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む、前記方法。
【請求項3】
前記ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡにハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、または短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）を含む、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項4】
前記ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、Ｃａｓタンパク質と、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）とを含む、請求項１または請求項２に記載の方法。
【請求項5】
前記Ｃａｓタンパク質は、Ｃａｓ９またはＣｐｆ１である、請求項４に記載の方法。
【請求項6】
前記ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位、配列番号１に従った４，２８７位、配列番号１に従った４，２４３位、配列番号１に従った４，３２５位、もしくは配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置を包含するかまたはそれに近接する、請求項４または請求項５に記載の方法。
【請求項7】
前記ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位、配列番号１に従った４，２８７位、配列番号１に従った４，２４３位、配列番号１に従った４，３２５位、または配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置の、約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、もしくは５ヌクレオチドから位置する、請求項４～６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項8】
プロトスペーサー隣接モチーフ（ＰＡＭ）配列は、前記ｇＲＮＡ認識配列の約２～６ヌクレオチド下流である、請求項４～７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項9】
前記ｇＲＮＡは、約１７～約２３ヌクレオチドを含む、請求項４～８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項10】
前記ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１３～１３１及び配列番号１４４～１６５のうちのいずれか１つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項４～８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項11】
前記患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することをさらに含む、請求項１～１０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項12】
前記患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型である場合、前記患者はまた、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で投与される、請求項１１に記載の方法。
【請求項13】
前記患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である場合、前記患者はまた、眼疾患を治療または阻害する治療剤を、前記標準投与量と同じかもしくはそれより低い投与量で投与される、請求項１１に記載の方法。
【請求項14】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードする核酸分子である、請求項１１～１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項15】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、またはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする核酸分子である、請求項１１～１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項16】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項１５に記載の方法。
【請求項17】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項１５に記載の方法。
【請求項18】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項１５に記載の方法。
【請求項19】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項１５に記載の方法。
【請求項20】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項１５に記載の方法。
【請求項21】
前記検出ステップはインビトロで行われる、請求項１１～２０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項22】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１６及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１６及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項23】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、１７、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、１７、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項24】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、１８、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、１８、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項25】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、１９、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、１９、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項26】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、２０、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；及び／または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項１１～１５、２０、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項27】
前記検出ステップは、
ａ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号２に従った４，２９１位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号５に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、ならびに
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１６、２１、及び２２のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号２に従った４，２９１位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号５に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、ならびに
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１６、２１、及び２２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項28】
前記検出ステップは、
ａ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号３に従った４，２８７位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号６に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、ならびに
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、１７、２１、及び２３のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号３に従った４，２８７位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号６に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、ならびに
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、１７、２１、及び２３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項29】
前記検出ステップは、
ａ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、１８、２１、及び２４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、１８、２１、及び２４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項30】
前記検出ステップは、
ａ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、１９、２１、及び２５のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、１９、２１、及び２５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項31】
前記検出ステップは、
ａ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、２０、２１、及び２６のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項１１～１５、２０、２１、及び２６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項32】
前記検出ステップは、前記核酸分子全体を配列決定することを含む、請求項２２～３１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項33】
前記検出ステップは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１６、２１、２２、２７、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１６、２１、２２、２７、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項34】
前記検出ステップは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１７、２１、２３、２８、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１７、２１、２３、２８、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項35】
前記検出ステップは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンを含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１８、２１、２４、２９、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンを含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１８、２１、２４、２９、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項36】
前記検出ステップは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンを含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１９、２１、２５、３０、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンを含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１９、２１、２５、３０、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項37】
前記検出ステップは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンを含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、２０、２１、２６、３１、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンを含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、２０、２１、２６、３１、及び３２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項38】
前記試料の前記核酸分子はｍＲＮＡであり、前記ｍＲＮＡは、前記増幅ステップの前にｃＤＮＡに逆転写される、請求項３３～３７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項39】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１６、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１６、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項40】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１７、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１７、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項41】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１８、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１８、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項42】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１９、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、１９、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項43】
前記検出ステップは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、２０、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項１１～１５、２０、及び２１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項44】
眼疾患を治療または阻害する治療剤により、眼疾患に罹患している患者を治療する方法であって、
前記患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、アンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定することを、
前記患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであることと、
前記患者が、前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために、前記生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることとによって行う、決定ステップ、ならびに
前記患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、前記眼疾患を治療または阻害する前記治療剤を標準投与量で前記患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、前記患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び
前記患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、前記眼疾患を治療または阻害する前記治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で前記患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、前記患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、を含み、
ここで、前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、前記患者が、前記眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す、前記方法。
前記患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、アンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定することを、
前記患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであることと、
前記患者が、前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために、前記生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることとによって行う、決定ステップ、ならびに
前記患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、前記眼疾患を治療または阻害する前記治療剤を標準投与量で前記患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、前記患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び
前記患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、前記眼疾患を治療または阻害する前記治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で前記患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、前記患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、を含み、
ここで、前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、前記患者が、前記眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す、前記方法。
【請求項45】
前記患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型であり、前記患者は、前記眼疾患を治療もしくは阻害する前記治療剤を標準投与量で投与されるかまたは投与を継続され、かつ、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与される、請求項４４に記載の方法。
【請求項46】
前記患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であり、前記患者は、前記眼疾患を治療もしくは阻害する前記治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で投与されるかまたは投与を継続され、かつ、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与される、請求項４４に記載の方法。
【請求項47】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードする核酸分子である、請求項４４～４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項48】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする核酸分子である、請求項４４～４６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項49】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項50】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項51】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項52】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項53】
前記ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項54】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４９のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項55】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５０のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項56】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５１のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項57】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５２のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の、ｍＲＮＡ分子から生成される前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項58】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５３のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること；または
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置を含む、前記配列決定すること、
を含み、ここで、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子であり、
前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含んでいれば、その場合は、前記生体試料の前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子である、請求項４４～４８、及び５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項59】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号２に従った４，２９１位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号５に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号８に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４９、及び５４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号２に従った４，２９１位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号５に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号８に従った５２９位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４９、及び５４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項60】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号３に従った４，２８７位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号６に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号９に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５０、及び５５のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号３に従った４，２８７位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号６に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号９に従った５２５位に対応する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５０、及び５５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項61】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５１、及び５６のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５１、及び５６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項62】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５２、及び５７のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５２、及び５７のいずれか一項に記載の方法。
【請求項63】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５３、及び５８のいずれか一項に記載の方法。
ａ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の、前記ヌクレオチド配列の一部分、にハイブリダイズするプライマーと、前記生体試料とを接触させること、
ｂ）前記プライマーを、少なくとも、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接する前記ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の前記位置を通って伸長させること、
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、
を含む、請求項４４～４８、５３、及び５８のいずれか一項に記載の方法。
【請求項64】
前記検出ステップは、前記核酸分子全体を配列決定することを含む、請求項５９～６３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項65】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４９、５４、５９、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４９、５４、５９、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項66】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５０、５５、６０、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体；配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５０、５５、６０、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項67】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５１、５６、６１、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５１、５６、６１、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項68】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５２、５７、６２、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５２、５７、６２、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項69】
前記ジェノタイピングアッセイは、
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５３、５８、６３、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
ａ）前記ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする前記核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む、前記増幅させること、
ｂ）前記増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、
ｃ）前記標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、５３、５８、６３、及び６４のいずれか一項に記載の方法。
【請求項70】
前記試料の前記核酸分子はｍＲＮＡであり、前記ｍＲＮＡは、前記増幅ステップの前にｃＤＮＡに逆転写される、請求項６５～６９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項71】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４９のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４９のいずれか一項に記載の方法。
【請求項72】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５０のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列；または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項73】
前記ジェノタイピングアッセイは、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含むか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含むか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、前記増幅核酸分子の前記核酸配列、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５１のいずれか一項に記載の方法。
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項74】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５２のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項75】
前記ジェノタイピングアッセイは、
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５３のいずれか一項に記載の方法。
前記生体試料の前記核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、前記変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンもしくはその相補体を含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列；または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む前記増幅核酸分子の前記核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること、及び
前記検出可能な標識を検出すること、
を含む、請求項４４～４８、及び５３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項76】
前記核酸分子は、前記ヒト対象から取得された細胞内に存在する、請求項４４～７５のいずれか一項に記載の方法。
【請求項77】
前記ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡにハイブリダイズする、アンチセンス核酸分子、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、または短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）を含む、請求項４４～７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項78】
前記ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、Ｃａｓタンパク質と、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）とを含む、請求項４４～７６のいずれか一項に記載の方法。
【請求項79】
前記Ｃａｓタンパク質は、Ｃａｓ９またはＣｐｆ１である、請求項７８に記載の方法。
【請求項80】
前記ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位、配列番号１に従った４，２８７位、配列番号１に従った４，２４３位、配列番号１に従った４，３２５位、もしくは配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置を包含するかまたはそれに近接する、請求項７８または請求項７９に記載の方法。
【請求項81】
前記ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位、配列番号１に従った４，２８７位、配列番号１に従った４，２４３位、配列番号１に従った４，３２５位、または配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置の、約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、もしくは５ヌクレオチドから位置する、請求項７８～８０のいずれか一項に記載の方法。
【請求項82】
プロトスペーサー隣接モチーフ（ＰＡＭ）配列は、前記ｇＲＮＡ認識配列の約２～６ヌクレオチド下流である、請求項７８～８１のいずれか一項に記載の方法。
【請求項83】
前記ｇＲＮＡは、約１７～約２３ヌクレオチドを含む、請求項７８～８２のいずれか一項に記載の方法。
【請求項84】
前記ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１３～１３１及び配列番号１４４～１６５のうちのいずれか１つに記載のヌクレオチド配列を含む、請求項７８～８３のいずれか一項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
配列表の参照
本出願には、２０２０年１月１８日に作成され、サイズが１１１キロバイトの１８９２３８０１６０２ＳＥＱという名前のテキストファイルとして電子的に提出された配列表が含まれる。配列表は、参照により本明細書に組み込まれる。
本出願には、２０２０年１月１８日に作成され、サイズが１１１キロバイトの１８９２３８０１６０２ＳＥＱという名前のテキストファイルとして電子的に提出された配列表が含まれる。配列表は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0002】
本開示は一般に、アンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤による、眼疾患を有する患者の治療、眼疾患を発症するリスクが上昇している対象を同定する方法、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体核酸分子及び変異体ポリペプチドを検出する方法、ならびにＡＮＧＰＴＬ７の変異体核酸分子及びＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドに関する。
【背景技術】
【0003】
緑内障は、眼の視神経を損傷する障害の一群であり、部分的な視力喪失及び失明をもたらし得る。数種類の緑内障が存在し、原発型である開放隅角緑内障では、眼内の液体が蓄積して、視神経を損傷するレベルにまで眼内部の圧力（眼圧；ＩＯＰ）が増大する。低眼圧または正常眼圧の緑内障では、眼圧が正常な人々において視神経損傷及び側方視野狭窄が生じる。閉塞隅角緑内障では、前眼部の液体が適切に排出できず、急激な眼圧増大を引き起こし得る。先天性緑内障では、小児は生まれつき、液体の正常な排出が遅れるという眼の欠陥がある。緑内障治療としては、薬物療法、レーザー線維柱帯形成術、及び従来手術が挙げられる。これらの治療は残存視力を保存し得るが、緑内障ですでに失われた視力を改善するわけではない。
【0004】
ＡＮＧＰＴＬ７は、成長因子のアンジオポエチンファミリーに構造的に関連する分泌糖タンパク質である。ＡＮＧＰＴＬ７は、Ｃ末端（フィブリノゲン様）及びＮ末端（コイルド）ドメインを含有する。ＡＮＧＰＴＬ７は、角膜の実質層及び線維柱帯の細胞外マトリックスに主に見られる。
【発明の概要】
【0005】
本開示は、ＩＯＰが増大している患者を治療する方法を提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。
本開示は、緑内障の患者を治療する方法も提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。
本開示は、緑内障の患者を治療する方法も提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。
【0006】
いくつかの実施形態では、方法はさらに、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含む。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であるか、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であるか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。
【0007】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列、または生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の、少なくとも一部分を配列決定することを含む。
【0008】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させること、及び検出可能な標識を検出することを含む。
【0009】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって決定するステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。
【0010】
本特許ファイルまたは出願ファイルは、カラーで作成した少なくとも１つの図面を含有する。カラー図面（複数可）付きの本特許または本特許出願公開の写しは請求及び必要手数料の支払いに応じて米国特許庁より提供される。
【図面の簡単な説明】
【0011】
【図1】ＵＫＢ及びＧＨＳの研究のメタアナリシスにおける、レアな（ＮＡＦ＜０．０１）、タンパク質を変化させる変異体（スプライシングに影響を与えることが予測されるものを含む）と、ヨーロッパ系個人のＩＯＰとの関連を示すマンハッタンプロットを示す。重要性閾値：１×１０－５（青線）及び５×１０－８（赤線）。
【図2A】ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ（図２Ａ、２Ｃ、及び２Ｅ）変異体及びＡｒｇ１７７＊（図２Ｂ、図２Ｄ、及び図２Ｆ）変異体と、ヨーロッパ系の個人のＩＯＰ及び緑内障との関連を示す。ＩＯＰとの関連への影響は標準偏差の単位で測定される。関連ｐ値は、年齢、年齢二乗、性別、上位主要構成要素、またＵＫＢの場合はジェノタイピングアレイ及びアセスメントセンター（図２Ａ及び２Ｂ）について補正したＢＯＬＴ－ＬＭＭを使用して算出した。箱ひげ図はＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋの遺伝子型間のゴールドマン式眼圧計に相当する眼圧（ＩＯＰｇ）を表す（図２Ｃ及び２Ｄ）。Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓのヘテロ接合体保有者及びホモ接合体保有者はそれぞれ、非保有者と比較してＩＯＰｇ中央値が０．８ｍｍＨｇ及び４．１ｍｍＨｇ低い（図２Ｃ）。Ａｒｇ１７７＊ヘテロ接合体保有者は、非保有者と比較してＩＯＰｇが１．４ｍｍＨｇ低い（図２Ｄ）。緑内障との関連は、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７＊について４系列にわたり行った。ＧＨＳ ＶＣＲｏｍｅ：ＶＣＲｏｍｅで取り込んだ、Ｇｅｉｓｉｎｇｅｒの約６０，０００例の個人；ＧＨＳ ＩＤＴ：ＩＤＴで取り込んだ、約８５，０００例の個人；ＵＫＢ：ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ；ＭＳＳＭ：Ｍｔ．Ｓｉｎａｉ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｃｈｏｏｌ ＢｉｏＭｅ Ｂｉｏｂａｎｋ；ＭＤＣＳ：Ｍａｌｍｏ Ｄｉｅｔ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｓｔｕｄｙ（図２Ｅ及び２Ｆ）；ＡＡＦ＝オルタナティブアレルの頻度。
【図2B】同上。
【図2C】同上。
【図2D】同上。
【図2E】同上。
【図2F】同上。
【図3】ＡＮＧＰＴＬ７のミスセンス及び予測される機能喪失（ｐＬＯＦ）変異体ならびにヨーロッパ系個人のＩＯＰレベルを示す。プロットは、エクソーム配列データが利用可能なＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ約１５０，０００例の個人における、ＡＮＧＰＴＬ７の１つのｐＬＯＦ変異体及び６つのミスセンス変異体の保有者でのゴールドマン式眼圧計に相当するＩＯＰ（両眼平均）レベルを表しており、それらの変異体は、５つの異なるアルゴリズムにより有害であると予測されているもので、ＩＯＰ測定値のある少なくとも４例の保有者がいる。ｐＬＯＦ ＡＮＧＰＴＬ７変異体及び予測有害ミスセンスＡＮＧＰＴＬ７変異体の全３４の保有者全体のＩＯＰレベル中央値（１５．１１ｍｍＨｇ）は赤線で示され、変異体非保有者のＩＯＰ中央値（１５．５１ｍｍＨｇ）は青線で示されている。赤紫の菱形は、各変異体の保有者におけるＩＯＰ中央値を表す。プロットの下は、各変異体についてのＩＯＰの中央値と四分位範囲、ならびに緑内障の症例保有者数及び対照者数である。
【図4A】種間の眼組織でのＡＮＧＰＴＬ７発現を示し、ＲＮＡ配列決定に基づく発現レベル（１００万あたりの転写産物（ＴＰＭ）で測定）は、ヒト眼では角膜、線維柱帯（ＴＭ）、及び強膜で最も高い。
【図4B】種間の眼組織でのＡＮＧＰＴＬ７発現を示し、ＲＮＡ配列決定に基づく発現レベル（１００万あたりの転写産物（ＴＰＭ）で測定）は、アフリカミドリザルの眼では角膜、線維柱帯（ＴＭ）、及び強膜で最も高い。
【図4C】種間の眼組織でのＡＮＧＰＴＬ７発現を示し、ＲＮＡ配列決定に基づく発現レベル（１００万あたりの転写産物（ＴＰＭ）で測定）は、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊマウスでは角膜、ＴＭ、強膜、視神経、及び脈絡膜／ＲＰＥで最も高い。
【図4D】インサイチュハイブリダイゼーション（ＲＮＡＳｃｏｐｅ）により、ヒトの眼のＴＭ、角膜及び強膜でのＡＮＧＰＴＬ７／Ａｎｇｐｔｌ７（赤）の発現が示される。ＤＡＰＩ染色（青色）で細胞核が対比染色されている。ＲＰＥ：網膜色素上皮；ＳＣ：シュレム管；ＣＭ：毛様体筋；ＡＣ：前房；ＴＭ：線維柱帯。
【図4E】インサイチュハイブリダイゼーション（ＲＮＡＳｃｏｐｅ）により、マウスの眼のＴＭ、角膜及び強膜でのＡＮＧＰＴＬ７／Ａｎｇｐｔｌ７（赤）の発現が示される。ＤＡＰＩ染色（青色）で細胞核が対比染色されている。ＲＰＥ：網膜色素上皮；ＣＢ：毛様体；ＴＭ：線維柱帯；ＲＧＣ：網膜神経節細胞；ＩＮＬ：内顆粒層；ＯＮＬ：外顆粒層。
【図5】定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）で測定した、３つの独立したヒトの眼からの３つのヒト線維柱帯（ｈＴＭ）初代細胞株でのデキサメタゾン（ＤＥＸ）誘導性遺伝子発現変化を示しており、ｈＴＭ細胞をＤＥＸで７２時間処理した後、ｑＰＣＲ分析を行った。ＤＥＸ処理により、ＨＴＭ細胞株３株中２株でＡＮＧＰＴＬ７発現が増加した。Ｃｔｒｌは未処理細胞を表し、ＥｔＯＨはエタノール処理を表す。データは、２つの複製試料全体の平均±標準誤差として示されており、一元配置ＡＮＯＶＡを使用し、＊ｐ＝０．０１、＊＊ｐ＝０．００１、＊＊＊ｐ＝０．０００１である。
【図6A】マウス眼においてｍＡｎｇｐｔｌ７レベルが増大するとＩＯＰが増大することを示す。マウスＡｎｇｐｔｌ７（ｍＡｎｇｐｔｌ７）タンパク質をマウス眼に硝子体内経路で注射し、ＩＯＰを経時的に測定した。初回点眼後、Ａｎｇｐｔｌ７処置した眼では対照眼と比較してＩＯＰが上昇していた。データは、平均±ＳＥＭとして示されている。
【図6B】マウス眼においてｍＡｎｇｐｔｌ７レベルが増大するとＩＯＰが増大することを示す。マウスＡｎｇｐｔｌ７（ｍＡｎｇｐｔｌ７）タンパク質をマウス眼に前房内経路で注射し、ＩＯＰを経時的に測定した。初回点眼後、Ａｎｇｐｔｌ７処置した眼では対照眼と比較してＩＯＰが上昇していた。データは、平均±ＳＥＭとして示されている。
【図7A】２つのコホート間でのアフリカ系個人におけるＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８＊とＩＯＰとの関連を示す。
【図7B】２つのコホート間でのアフリカ系個人におけるＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８＊と緑内障との関連を示す。
【図7C】ＩＯＰに関するＡＮＧＰＴＬ７でのｐＬＯＦ変異体であるヨーロッパ系濃縮Ａｒｇ１７７＊及びアフリカ系濃縮Ｔｒｐ１８８＊のメタアナリシスを示す。Ａｒｇ１７７＊変異体は「ＥＵＲ」という名称のコホートにより表され、ヨーロッパ系個人のみが含まれている。Ｔｒｐ１８８＊変異体は「ＡＦＲ」という名称のコホートにより表され、アフリカ系個人のみが含まれている。
【図7D】緑内障に関するＡＮＧＰＴＬ７でのｐＬＯＦ変異体であるヨーロッパ系濃縮Ａｒｇ１７７＊及びアフリカ系濃縮Ｔｒｐ１８８＊のメタアナリシスを示す。Ａｒｇ１７７＊変異体は「ＥＵＲ」という名称のコホートにより表され、ヨーロッパ系個人のみが含まれている。Ｔｒｐ１８８＊変異体は「ＡＦＲ」という名称のコホートにより表され、アフリカ系個人のみが含まれている。
【図8A】ＨＥＫ２９３全細胞溶解物におけるＡＮＧＰＴＬ７の２つの変異体（Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）の発現を示す。
【図8B】ＨＥＫ２９３全細胞溶解物におけるＡＮＧＰＴＬ７の２つの変異体（Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）の発現を示す。
【図8C】野生型ＡＮＧＰＴＬ７と比較して細胞上清で観察されたＧｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体の激減を示す。
【図8D】野生型ＡＮＧＰＴＬ７と比較して細胞上清で観察されたＧｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体の激減を示す。
【図8E】Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体が上清中に分泌できなかったことを示す。
【図9A】ＨＥＫ２９３トランスフェクションから４８時間目におけるＡＮＧＰＴＬ７の野生型及び変異体型のＲＴ－ＰＣＲ分析を示す。発現値は、ＧＡＰＤＨハウスキーピング遺伝子に対して計算される。
【図9B】ＡＮＧＰＴＬ７野生型、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡＮＧＰＴＬ７ Ａｒｇ１７７＊の細胞内タンパク質レベルを示すウェスタンブロッティングを示す。
【図9C】ＡＮＧＰＴＬ７野生型、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡＮＧＰＴＬ７ Ａｒｇ１７７＊の細胞内タンパク質レベルを示すＥＬＩＳＡアッセイを示す。定量用に、各細胞溶解物を１：１，０００で希釈した。
【図9D】ＡＮＧＰＴＬ７野生型、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡＮＧＰＴＬ７ Ａｒｇ１７７＊の細胞外タンパク質レベルを示すウェスタンブロッティングを示す。分析を、３つの独立した生物学的反復で繰り返した。
【図9E】ＡＮＧＰＴＬ７野生型、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡＮＧＰＴＬ７ Ａｒｇ１７７＊の細胞外タンパク質レベルを示すＥＬＩＳＡアッセイを示す。定量用に、各上清を１：１０，０００で希釈した。ウェスタンブロッティング及びＥＬＩＳＡ分析を、３つの独立した生物学的反復で繰り返した。技術的反復（ｎ＝３）をＲＴ－ＰＣＲ及びＥＬＩＳＡ分析で実施した。
【発明を実施するための形態】
【0012】
本開示の態様に関連する様々な用語が明細書及び特許請求の範囲にわたり使用されている。そのような用語には、別段に示されていない限り、当該技術分野における通常の意味が与えられるものとする。具体的に定義されている他の用語は、本明細書に示されている定義と一致する形で解釈されるものとする。
【0013】
別段に明示的な記述のない限り、本明細書に記載のいずれの方法または態様も、そのステップを特定の順序で行う必要があるものとして解釈されることは何ら意図されていない。したがって、方法クレームが特許請求の範囲または説明において、ステップが特定の順序に限定されるべきことを具体的に記述していない場合、いかなる点においても、順序が推定されることは何ら意図されていない。このことは、ステップもしくは操作フローの手筈に関する論理事項、文法構成もしくは句読法に由来する一般的意味、または本明細書に記載されている態様の数もしくは種類を含め、あらゆる考え得る非明示的な解釈基準についても同様である。
【0014】
本明細書で使用する場合、単数形「ａ」、「ａｎ」、及び「ｔｈｅ」には、文脈で特に明確に指示されない限り、複数の指示対象が含まれる。
本明細書で使用される場合、用語「対象」及び「患者」は同じ意味で使用される。対象には、哺乳類を含め、任意の動物が含まれ得る。哺乳類としては、家畜（例えば、ウマ、ウシ、ブタ等）、コンパニオンアニマル（例えば、イヌ、ネコ等）、実験動物（例えば、マウス、ラット、ウサギ等）、及び非ヒト霊長類が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。
本明細書で使用される場合、用語「対象」及び「患者」は同じ意味で使用される。対象には、哺乳類を含め、任意の動物が含まれ得る。哺乳類としては、家畜（例えば、ウマ、ウシ、ブタ等）、コンパニオンアニマル（例えば、イヌ、ネコ等）、実験動物（例えば、マウス、ラット、ウサギ等）、及び非ヒト霊長類が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。
【0015】
本明細書で使用される場合、「核酸」、「核酸分子」、「核酸配列」、「ポリヌクレオチド」、または「オリゴヌクレオチド」は、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を含むことができ、ＤＮＡ及び／またはＲＮＡを含むことができ、一本鎖、二本鎖もしくは多重鎖であり得る。核酸の一本鎖は、その相補鎖も指す。
【0016】
本明細書で使用される場合、用語「含む」は、特定の実施形態では所望に応じて「なる」または「本質的に～からなる」で置き換えられ得る。
「単離された」核酸分子は、その天然の環境以外、例えば、血液及び動物組織のような環境以外の状態にあるポリヌクレオチドである。好ましい形態では、単離された核酸分子は、他のポリヌクレオチド、特に動物由来の他のポリヌクレオチドを実質的に含まない。核酸分子を高度に精製された形態、すなわち、９５％超の純度、より好ましくは９９％超の純度で提供することが好ましい。この文脈で使用される場合、用語「単離された」とは、同じ核酸分子が、二量体等の代替的物理的形態、または代替としてリン酸化形態もしくは誘導体化形態で存在することを除外するものではない。
「単離された」核酸分子は、その天然の環境以外、例えば、血液及び動物組織のような環境以外の状態にあるポリヌクレオチドである。好ましい形態では、単離された核酸分子は、他のポリヌクレオチド、特に動物由来の他のポリヌクレオチドを実質的に含まない。核酸分子を高度に精製された形態、すなわち、９５％超の純度、より好ましくは９９％超の純度で提供することが好ましい。この文脈で使用される場合、用語「単離された」とは、同じ核酸分子が、二量体等の代替的物理的形態、または代替としてリン酸化形態もしくは誘導体化形態で存在することを除外するものではない。
【0017】
ＡＮＧＰＴＬ７遺伝子の特定の変異体は、ヒト対象でのＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクの減少と関連する。例えば、ヒトＡＮＧＰＴＬ７参照配列（配列番号１を参照のこと）の４，２９１位のシトシンヌクレオチドをチミンに変化させるか、またはヒトＡＮＧＰＴＬ７参照配列（配列番号１を参照のこと）の４，２８７位のグアニンヌクレオチドをチミンに変化させる遺伝子変化は、そのような変化を有するヒトが、ＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクが減少している場合があることを示すことが観察されている。まとめると、本明細書に記載される遺伝子解析は、ＡＮＧＰＴＬ７遺伝子の特定の変異体はＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクの減少と関連することを示している。したがって、ＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクが上昇している、ＡＮＧＰＴＬ７参照型のヒト対象は、かかる眼疾患が予防される、その症状が軽減される、及び／または症状の発症が抑制されるように治療され得る。したがって、本開示は、単離されたＡＮＧＰＴＬ７変異体ゲノム核酸分子、変異体ｍＲＮＡ分子、及び変異体ｃＤＮＡ分子を提供する。さらに、開示は、対象におけるそのような変異体の同定を活用して、そのような対象でＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクを同定もしくは層別化するか、または対象をＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクが上昇していると診断し、リスクのある対象または活動性疾患を有する対象がそれに応じて治療され得るようにする方法を提供する。したがって、本明細書では、ＩＯＰ増大及び緑内障等の眼疾患を発症するリスクの減少と関連することが発見された、ＡＮＧＰＴＬ７機能喪失型変異体核酸分子を提供する。
【0018】
本開示の目的のために、いかなる特定のヒトも、ｉ）ＡＮＧＰＴＬ７参照型、ｉｉ）ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体、及びｉｉｉ）ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体という３つのＡＮＧＰＴＬ７遺伝子型のうちの１つを有すると分類することができる。ＡＮＧＰＴＬ７参照型分類のヒトは、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子のコピーを持たない。ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体分類のヒトは、単一コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する。ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、部分的機能喪失、完全機能喪失、予測される部分的機能喪失、または予測される完全機能喪失を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、任意のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはかかるｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子等）である。部分的機能喪失（または予測される部分的機能喪失）を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有するヒトは、ＡＮＧＰＴＬ７低形質である。ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードする任意の核酸分子であると考えられている。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、またはＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、またはＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、またはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＬｙｓ１９２Ｇｌｎをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体分類のヒトは、２コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する。
【0019】
ＡＮＧＰＴＬ７参照型であると遺伝子型判定または決定されているヒトの対象もしくは患者の場合、そのようなヒトの対象もしくは患者は、ＩＯＰ増大、前緑内障、緑内障、及び角膜可塑性低下等の眼疾患を発症するリスクが上昇している。ＡＮＧＰＴＬ７参照型またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体のいずれかであると遺伝子型判定または決定されているヒトの対象もしくは患者の場合、そのようなヒト対象または患者は、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤により治療することができる。
【0020】
本開示は、緑内障の患者を治療する方法を提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。いくつかの実施形態では、緑内障は、原発開放隅角緑内障、閉塞隅角緑内障、正常眼圧緑内障、先天性緑内障、血管新生緑内障、ステロイド緑内障、または眼外傷に関連する緑内障である。
【0021】
本開示は、ＩＯＰが増大している患者を治療する方法も提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。いくつかの実施形態では、ＩＯＰ増大は、角膜厚に影響されない補正ＩＯＰ（ＩＯＰｃｃ）またはゴールドマン式眼圧計に相当するＩＯＰ（ＩＯＰｇ）である。
【0022】
本開示は、前緑内障の患者を治療する方法も提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。
本開示は、角膜可塑性低下の患者を治療する方法も提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。
本開示は、角膜可塑性低下の患者を治療する方法も提供し、かかる方法は、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与することを含む。
【0023】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、アンチセンス分子を含む。アンチセンス分子の例としては、アンチセンス核酸分子、低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、及び短鎖ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）が挙げられるが、これらに限定されない。そのようなアンチセンス分子は、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡの任意の領域を標的とするよう設計することができる。いくつかの実施形態では、アンチセンスＲＮＡ、ｓｉＲＮＡ、またはｓｈＲＮＡは、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子内の配列にハイブリダイズし、対象の細胞でのＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドの発現を低下させる。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子にハイブリダイズして対象の細胞でのＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドの発現を低下させるアンチセンスＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子にハイブリダイズして対象の細胞でのＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドの発現を低下させるｓｉＲＮＡを含む。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子にハイブリダイズして対象の細胞でのＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドの発現を低下させるｓｈＲＮＡを含む。
【0024】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、認識配列（複数可）に１つ以上のニックまたは二本鎖切断を誘導するヌクレアーゼ物質、またはＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内の認識配列に結合するＤＮＡ結合タンパク質を含む。認識配列は、ＡＮＧＰＴＬ７遺伝子のコード領域内、または遺伝子の発現に影響を与える調節領域内に位置し得る。ＤＮＡ結合タンパク質またはヌクレアーゼ物質の認識配列は、イントロン、エクソン、プロモーター、エンハンサー、調節領域、または任意のタンパク質非コード領域に位置し得る。認識配列は、ＡＮＧＰＴＬ７遺伝子の開始コドンを包含するか、またはそれに近接し得る。例えば、認識配列は、開始コドンの約１０ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、または１，０００ヌクレオチドから位置し得る。別の例として、２つ以上のヌクレアーゼ物質を使用することができ、それぞれが、開始コドンを包含するかまたはそれに近接するヌクレアーゼ認識配列を標的とする。別の例として、２つのヌクレアーゼ物質を使用することができ、１つは開始コドンを包含するかまたはそれに近接するヌクレアーゼ認識配列を標的とし、１つは終止コドンを包含するかまたはそれに近接するヌクレアーゼ認識配列を標的とし、ヌクレアーゼ物質による切断が、２つのヌクレアーゼ認識配列に挟まれたコード領域の欠失をもたらし得る。所望の認識配列にニックまたは二本鎖切断を誘導するいかなるヌクレアーゼ物質も、本明細書に開示される方法及び組成物で使用することができる。所望の認識配列に結合するいかなるＤＮＡ結合タンパク質も、本明細書に開示される方法及び組成物で使用することができる。
【0025】
本明細書での使用に好適なヌクレアーゼ物質及びＤＮＡ結合タンパク質としては、ジンクフィンガータンパク質もしくはジンクフィンガーヌクレアーゼ（ＺＦＮ）対、転写活性化因子様エフェクター（ＴＡＬＥ）タンパク質もしくは転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ（ＴＡＬＥＮ）、またはクラスター化規則的間隔短鎖回文リピート（ＣＲＩＳＰＲ）／ＣＲＩＳＰＲ関連（Ｃａｓ）系が挙げられるが、これらに限定されない。認識配列の長さは異なり得、例えば、ジンクフィンガータンパク質またはＺＦＮ対の場合は約３０～３６ｂｐ（すなわち、各ＺＦＮにつき約１５～１８ｂｐ）の認識配列、ＴＡＬＥタンパク質またはＴＡＬＥＮの場合は約３６ｂｐの認識配列、及びＣＲＩＳＰＲ／ＣａｓガイドＲＮＡの場合は約２０ｂｐの認識配列が挙げられる。
【0026】
いくつかの実施形態では、ＣＲＩＳＰＲ／Ｃａｓ系は、細胞内のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子を修飾するために使用することができる。本明細書に開示される方法及び組成物では、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子の部位特異的切断にＣＲＩＳＰＲ複合体（Ｃａｓタンパク質と複合体化したガイドＲＮＡ（ｇＲＮＡ）を含む）を利用することにより、ＣＲＩＳＰＲ－Ｃａｓ系を用いることができる。
【0027】
Ｃａｓタンパク質は一般に、ｇＲＮＡと相互作用することができる少なくとも１つのＲＮＡ認識ドメインまたはＲＮＡ結合ドメインを含む。Ｃａｓタンパク質はまた、ヌクレアーゼドメイン（例えば、ＤＮａｓｅドメインまたはＲＮａｓｅドメイン等）、ＤＮＡ結合ドメイン、ヘリカーゼドメイン、タンパク質間相互作用ドメイン、二量体化ドメイン、及び他のドメインも含み得る。好適なＣａｓタンパク質としては、例えば、野生型Ｃａｓ９タンパク質及び野生型Ｃｐｆ１タンパク質（例えば、ＦｎＣｐｆ１等）が挙げられる。Ｃａｓタンパク質は、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内に二本鎖切断を作るよう、十分な切断活性を有し得るか、またはＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内に一本鎖切断を作るニッカーゼであり得る。Ｃａｓタンパク質の追加の例としては、Ｃａｓ１、Ｃａｓ１Ｂ、Ｃａｓ２、Ｃａｓ３、Ｃａｓ４、Ｃａｓ５、Ｃａｓ５ｅ（ＣａｓＤ）、Ｃａｓ６、Ｃａｓ６ｅ、Ｃａｓ６ｆ、Ｃａｓ７、Ｃａｓ８ａ１、Ｃａｓ８ａ２、Ｃａｓ８ｂ、Ｃａｓ８ｃ、Ｃａｓ９（Ｃｓｎ１またはＣｓｘ１２）、Ｃａｓ１０、Ｃａｓ１０ｄ、ＣａｓＦ、ＣａｓＧ、ＣａｓＨ、Ｃｓｙ１、Ｃｓｙ２、Ｃｓｙ３、Ｃｓｅ１（ＣａｓＡ）、Ｃｓｅ２（ＣａｓＢ）、Ｃｓｅ３（ＣａｓＥ）、Ｃｓｅ４（ＣａｓＣ）、Ｃｓｃ１、Ｃｓｃ２、Ｃｓａ５、Ｃｓｎ２、Ｃｓｍ２、Ｃｓｍ３、Ｃｓｍ４、Ｃｓｍ５、Ｃｓｍ６、Ｃｍｒ１、Ｃｍｒ３、Ｃｍｒ４、Ｃｍｒ５、Ｃｍｒ６、Ｃｓｂ１、Ｃｓｂ２、Ｃｓｂ３、Ｃｓｘ１７、Ｃｓｘ１４、Ｃｓ×１０、Ｃｓｘ１６、ＣｓａＸ、Ｃｓｘ３、Ｃｓｘ１、Ｃｓｘ１５、Ｃｓｆ１、Ｃｓｆ２、Ｃｓｆ３、Ｃｓｆ４、及びＣｕ１９６６、ならびにそれらの相同体または修飾型が挙げられるが、これらに限定されない。Ｃａｓタンパク質はまた、融合タンパク質として異種ポリペプチドに機能的に連結され得る。例えば、Ｃａｓタンパク質は、切断ドメイン、エピジェネティックな修飾ドメイン、転写活性化ドメイン、または転写抑制ドメインに融合され得る。Ｃａｓタンパク質は、いかなる形態でも提供され得る。例えば、Ｃａｓタンパク質は、ｇＲＮＡと複合体化したＣａｓタンパク質等のタンパク質の形態で提供され得る。別法として、Ｃａｓタンパク質は、ＲＮＡまたはＤＮＡ等、Ｃａｓタンパク質をコードする核酸分子の形態で提供され得る。
【0028】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の標的遺伝子修飾は、Ｃａｓタンパク質と、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の標的ゲノム遺伝子座内の１つ以上のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズする１つ以上のｇＲＮＡとに、細胞を接触させることによって作成することができる。例えば、ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１の領域に位置し得る。いくつかの実施形態では、ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位、配列番号１に従った４，２８７位、配列番号１に従った４，２４３位、配列番号１に従った４，３２５位、もしくは配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置を包含するかまたはそれに近接する。例えば、ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位に対応する位置の約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、または５ヌクレオチドから位置し得る。ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２８７位に対応する位置の約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、または５ヌクレオチドから位置し得る。ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２４３位に対応する位置の約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、または５ヌクレオチドから位置し得る。ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，３２５位に対応する位置の約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、または５ヌクレオチドから位置し得る。ｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置の約１０００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、または５ヌクレオチドから位置し得る。さらに別の例として、ｇＲＮＡ認識配列は、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の開始コドンまたはＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の終止コドンを包含するか、またはそれに近接し得る。例えば、ｇＲＮＡ認識配列は、開始コドンまたは終止コドンの約１０ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、もしくは１，０００ヌクレオチドから位置し得る。
【0029】
ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の標的ゲノム遺伝子座内のｇＲＮＡ認識配列は、Ｃａｓ９ヌクレアーゼが標的とするＤＮＡ配列の直ぐ後に続く２～６塩基対のＤＮＡ配列であるプロトスペーサー隣接モチーフ（ＰＡＭ）配列の近傍に位置する。標準ＰＡＭは５’－ＮＧＧ－３’という配列であり、ここで、「Ｎ」は任意の核酸塩基であり、それに２つのグアニン（「Ｇ」）核酸塩基が続く。ｇＲＮＡは、遺伝子編集のためのゲノムのいかなる場所へもＣａｓ９を導くことができるが、Ｃａｓ９がＰＡＭを認識する箇所以外ではいかなる部位でも編集は起こらない。さらに、５’－ＮＧＡ－３’は、ヒト細胞にとっては非標準の、高効率のＰＡＭであり得る。一般に、ＰＡＭは、ｇＲＮＡが標的とするＤＮＡ配列の下流にある約２～６のヌクレオチドである。ＰＡＭは、ｇＲＮＡ認識配列に隣接し得る。いくつかの実施形態では、ｇＲＮＡ認識配列は、３’末端でＰＡＭと隣接し得る。いくつかの実施形態では、ｇＲＮＡ認識配列は、５’末端でＰＡＭと隣接し得る。例えば、Ｃａｓタンパク質の切断部位は、ＰＡＭ配列の上流または下流の、約１～約１０の塩基対、約２～約５の塩基対、または３つの塩基対であり得る。いくつかの実施形態では（Ｓ．ｐｙｏｇｅｎｅｓ由来Ｃａｓ９または近縁Ｃａｓ９を使用する場合等）、非相補鎖のＰＡＭ配列は５’－ＮＧＧ－３’であり得、ここで、Ｎは、任意のＤＮＡヌクレオチドであり、標的ＤＮＡの非相補鎖のｇＲＮＡ認識配列の３’に隣接する。したがって、相補鎖のＰＡＭ配列は５’－ＣＣＮ－３’となり、ここで、Ｎは、任意のＤＮＡヌクレオチドであり、標的ＤＮＡの相補鎖のｇＲＮＡ認識配列の５’に隣接する。
【0030】
ｇＲＮＡは、Ｃａｓタンパク質に結合して、Ｃａｓタンパク質をＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内の特定の位置へ指向させるＲＮＡ分子である。例示的ｇＲＮＡの１つは、Ｃａｓ酵素を、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子に結合するよう、またはそれを切断するよう導くのに有効なｇＲＮＡであり、かかるｇＲＮＡは、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするＤＮＡ指向性セグメントを含み、かかるｇＲＮＡ認識配列は、配列番号１に従った４，２９１位に対応する位置を包含するかもしくはそれに近接するか、または配列番号１に従った４，２８７位に対応する位置を包含するかもしくはそれに近接するか、または配列番号１に従った４，２４３位に対応する位置を包含するかもしくはそれに近接するか、または配列番号１に従った４，３２５位に対応する位置を包含するかもしくはそれに近接するか、または配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置を包含するかもしくはそれに近接する。例えば、ｇＲＮＡは、配列番号１に従った４，２９１位に対応する位置の約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、または１，０００ヌクレオチドから位置するｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするよう選択され得る。ｇＲＮＡはまた、配列番号１に従った４，２８７位に対応する位置の約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、または１，０００ヌクレオチドから位置するｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするよう選択され得る。ｇＲＮＡはまた、配列番号１に従った４，２４３位に対応する位置の約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、または１，０００ヌクレオチドから位置するｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするよう選択され得る。ｇＲＮＡはまた、配列番号１に従った４，３２５位に対応する位置の約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、または１，０００ヌクレオチドから位置するｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするよう選択され得る。ｇＲＮＡはまた、配列番号１に従った４，３３６位に対応する位置の約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、または１，０００ヌクレオチドから位置するｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするよう選択され得る。他の例示的ｇＲＮＡは、配列番号１の領域に位置する、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするＤＮＡ指向性セグメントを含む。他の例示的ｇＲＮＡは、開始コドンもしくは終止コドンを包含するかまたはそれに近接する、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするＤＮＡ指向性セグメントを含む。例えば、ｇＲＮＡは、開始コドンの約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、もしくは１，０００ヌクレオチドから位置するか、または開始コドンもしくは終止コドンの約５ヌクレオチド、１０ヌクレオチド、１５ヌクレオチド、２０ヌクレオチド、２５ヌクレオチド、３０ヌクレオチド、３５ヌクレオチド、４０ヌクレオチド、４５ヌクレオチド、５０ヌクレオチド、１００ヌクレオチド、２００ヌクレオチド、３００ヌクレオチド、４００ヌクレオチド、５００ヌクレオチド、もしくは１，０００ヌクレオチドから位置するｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズするよう選択され得る。ｇＲＮＡの設計及び合成は、例えば、Ｍａｌｉ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１３，３３９，８２３－８２６、Ｊｉｎｅｋ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１２，３３７，８１６－８２１、Ｈｗａｎｇ
ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０１３，３１，２２７－２２９、Ｊｉａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０１３，３１，２３３－２３９、及びＣｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１３，３３９，８１９－８２３に記載されている。好適なｇＲＮＡは、約１７～約２３ヌクレオチド、約１８～約２２ヌクレオチド、または約１９～約２１ヌクレオチドを含むことができる。いくつかの実施形態では、ｇＲＮＡは、２０ヌクレオチドを含むことができる。
ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０１３，３１，２２７－２２９、Ｊｉａｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．，２０１３，３１，２３３－２３９、及びＣｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１３，３３９，８１９－８２３に記載されている。好適なｇＲＮＡは、約１７～約２３ヌクレオチド、約１８～約２２ヌクレオチド、または約１９～約２１ヌクレオチドを含むことができる。いくつかの実施形態では、ｇＲＮＡは、２０ヌクレオチドを含むことができる。
【0031】
ヒトＡＮＧＰＴＬ７参照型遺伝子の好適なｇＲＮＡ認識配列の例は、配列番号１３～１３１及び１４４～１６５（表１～９を参照のこと）に記載されている。
【0032】
【表1】
【0033】
【表2】
【0034】
【表3】
【0035】
【表4】
【0036】
【表5】
【0037】
【表6】
【0038】
【表7】
【0039】
【表8】
【0040】
【表9】
【0041】
Ｃａｓタンパク質とｇＲＮＡは複合体を形成し、Ｃａｓタンパク質が標的ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子を切断する。Ｃａｓタンパク質は、ｇＲＮＡのＤＮＡ指向性セグメントが結合する標的ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子中に存在する核酸配列の内部または外側の部位で、核酸分子を切断することができる。例えば、ＣＲＩＳＰＲ複合体の形成（ｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズされ、Ｃａｓタンパク質と複合体化されたｇＲＮＡを含む）により、ｇＲＮＡのＤＮＡ指向性セグメントが結合するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子中に存在する核酸配列内またはその近傍（例えば、そこから、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、５０、またはそれ以上の塩基対内等）で、１本鎖もしくは両鎖の切断がもたらされ得る。
【0042】
そのような方法により、例えば、配列番号１の領域が破壊されているか、開始コドンが破壊されているか、終止コドンが破壊されているか、またはコード配列が欠失しているＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子がもたらされ得る。任意選択で、細胞をさらに、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の標的ゲノム遺伝子座内の追加のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズする、１つ以上の追加のｇＲＮＡと接触させることができる。細胞を、１つ以上の追加のｇＲＮＡ（例えば、第２のｇＲＮＡ認識配列にハイブリダイズする第２のｇＲＮＡ等）と接触させることによって、Ｃａｓタンパク質による切断で２つ以上の二本鎖切断または２つ以上の一本鎖切断を作ることができる。
【0043】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、小分子を含む。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、６，１１－ジヒドロ［１］ベンゾチオピラノ［４，３－ｂ］インドール（ＰＤ１４６１７６）、２－ブロモフェノール、２，４－ジブロモフェノール、２－（１－チエニル）エチル－３，４－ジヒドロキシベンジリデンシアノアセタート（ＴＥＤＣ）、４，４’－（２，３－ジメチル－１，４－ブタンジイル）ビス－１，２－ベンゼンジオール（ノルジヒドログアイアレチン酸）、またはシンナミル－３，４－ジヒドロキシ－ａ－シアノシナマート（ＣＤＣ）である。
【0044】
いくつかの実施形態では、方法はさらに、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含む。本開示全体にわたり使用される「ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子」とは、部分的機能喪失、完全機能喪失、予測される部分的機能喪失、または予測される完全機能喪失を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、任意のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子等）である。例えば、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードするあらゆる核酸分子であり得る。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、またはＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、またはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＬｙｓ１９２Ｇｌｎをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。
【0045】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。
【0046】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。
【0047】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。
【0048】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。
【0049】
いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子である。
【0050】
いくつかの実施形態では、患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型である場合、患者はまた、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で投与される。いくつかの実施形態では、患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である場合、患者はまた、眼疾患を治療または阻害する治療剤を、標準投与量と同じかもしくはそれより低い投与量で投与される。
【0051】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって決定するステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、ｉ）眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、ｉ）眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0052】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子であり、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって行う決定ステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0053】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子であり、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって行う決定ステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0054】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子であり、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって行う決定ステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0055】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子であり、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって行う決定ステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0056】
本開示は、眼疾患に罹患している患者を、眼疾患を治療または阻害する治療剤で治療する方法も提供し、かかる方法は、患者が、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定するステップであって、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子から生成されるｃＤＮＡ分子であり、患者からの生体試料を取得するかまたは取得済みであること、及び患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生体試料でジェノタイピングアッセイを実施するかまたは実施済みであることによって行う決定ステップ、ならびに患者がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップ、及び患者がＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体であれば、その場合は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかもしくはそれよりも低い量で患者に投与するかまたは投与を継続し、かつ、患者にＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与するステップを含み、ここで、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有する遺伝子型の存在は、患者が、眼疾患を発症するリスクが低下していることを示す。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0057】
ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、部分的機能喪失、完全機能喪失、予測される部分的機能喪失、または予測される完全機能喪失を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、あらゆるＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子等）であり得る。例えば、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードするあらゆる核酸分子であり得る。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、またはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＬｙｓ１９２Ｇｌｎをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。
【0058】
患者からの生体試料において、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子のうちいずれかの有無を検出すること、及び／または患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するかどうかを決定することは、本明細書に記載される方法のいずれによっても行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法はインビトロで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法はインサイチュで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法はインビボで行うことができる。
【0059】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、生体試料中のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子、またはＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、配列決定された部分は、機能喪失（部分的または完全）を引き起こすかまたは機能喪失（部分的または完全）を引き起こすことが予測される変異（複数可）を含む。例えば、いくつかの実施形態では、検出ステップ（ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｓｔｅｐ）、検出ステップ（ｄｅｔｅｃｔｉｎｇ ｓｔｅｐ）、またはジェノタイピングアッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７
ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0060】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0061】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0062】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0063】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0064】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0065】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0066】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0067】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0068】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0069】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0070】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0071】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0072】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0073】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0074】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0075】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0076】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0077】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0078】
いくつかの実施形態では、決定ステップ、検出ステップ、またはジェノタイピングアッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３９に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0079】
これらの実施形態のいずれにおいても、核酸分子は、ヒト対象から取得された細胞内に存在し得る。
本明細書に記載される実施形態のいずれにおいても、眼疾患は、ＩＯＰ増大、前緑内障、緑内障、または角膜可塑性低下である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、ＩＯＰ増大である。いくつかの実施形態では、ＩＯＰ増大は、ＩＯＰｃｃまたはＩＯＰｇである。いくつかの実施形態では、眼疾患は、前緑内障である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、緑内障である。いくつかの実施形態では、緑内障は、原発開放隅角緑内障、閉塞隅角緑内障、正常眼圧緑内障、先天性緑内障、血管新生緑内障、ステロイド緑内障、または眼外傷に関連する緑内障である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、角膜可塑性低下である。
本明細書に記載される実施形態のいずれにおいても、眼疾患は、ＩＯＰ増大、前緑内障、緑内障、または角膜可塑性低下である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、ＩＯＰ増大である。いくつかの実施形態では、ＩＯＰ増大は、ＩＯＰｃｃまたはＩＯＰｇである。いくつかの実施形態では、眼疾患は、前緑内障である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、緑内障である。いくつかの実施形態では、緑内障は、原発開放隅角緑内障、閉塞隅角緑内障、正常眼圧緑内障、先天性緑内障、血管新生緑内障、ステロイド緑内障、または眼外傷に関連する緑内障である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、角膜可塑性低下である。
【0080】
ＡＮＧＰＴＬ７参照型またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体のいずれかであると遺伝子型判定または決定されているヒト対象もしくは患者の場合、本明細書に記載されるように、そのようなヒト対象または患者はＡＮＧＰＴＬ７阻害剤により治療することができる。
【0081】
眼疾患を治療または阻害する治療剤の例としては、プロスタグランジン、β遮断薬、アルファ－アドレナリン作動薬、炭酸脱水酵素阻害剤、ｒｈｏキナーゼ阻害剤、または縮瞳薬またはコリン作動薬が挙げられるが、これらに限定されない。
【0082】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤はプロスタグランジンである。いくつかの実施形態では、プロスタグランジンは、Ｘａｌａｔａｎ（登録商標）（ラタノプロスト）、Ｔｒａｖａｔａｎ Ｚ（登録商標）（トラボプロスト）、Ｚｉｏｐｔａｎ（登録商標）（タフルプロスト）、Ｌｕｍｉｇａｎ（登録商標）（ビマトプロスト）、またはＶｙｚｕｌｔａ（登録商標）（ラタノプロステンブノド）である。
【0083】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤は、β遮断薬である。いくつかの実施形態では、β遮断薬は、Ｂｅｔｉｍｏｌ（登録商標）、Ｉｓｔａｌｏｌ（登録商標）、またはＴｉｍｏｐｔｉｃ（登録商標）（チモロール）またはＢｅｔｏｐｔｉｃ（登録商標）（ベタキソロール）である。
【0084】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤は、アルファ－アドレナリン作動薬である。いくつかの実施形態では、アルファ－アドレナリン作動薬は、Ｉｏｐｉｄｉｎｅ（登録商標）（アプラクロニジン）またはＡｌｐｈａｇａｎ（登録商標）もしくはＱｏｌｉａｎａ（登録商標）（ブリモニジン）である。
【0085】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤は、炭酸脱水酵素阻害剤である。いくつかの実施形態では、炭酸脱水酵素阻害剤は、Ｔｒｕｓｏｐｔ（登録商標）（ドルゾラミド）またはＡｚｏｐｔ（登録商標）（ブリンゾラミド）である。
【0086】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤は、ｒｈｏキナーゼ阻害剤である。いくつかの実施形態では、ｒｈｏキナーゼ阻害剤は、Ｒｈｏｐｒｅｓｓａ（登録商標）（ネタルスジル）である。
【0087】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤は、縮瞳薬またはコリン作動薬である。いくつかの実施形態では、縮瞳薬またはコリン作動薬は、Ｉｓｏｐｔｏ（登録商標） Ｃａｒｐｉｎｅ（ピロカルピン）である。
【0088】
いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤の用量は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である患者またはヒト対象の場合、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である患者またはヒト対象（標準投与量を受ける場合がある）と比較して、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、もしくは約９０％減量され得る（すなわち、標準投与量よりも低い）。いくつかの実施形態では、眼疾患を治療または阻害する治療剤の用量は、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、もしくは約５０％減量され得る。さらに、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である患者またはヒト対象での眼疾患を治療または阻害する治療剤の用量は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である患者またはヒト対象と比較して少ない頻度で投与することができる。
【0089】
眼疾患を治療もしくは阻害する治療剤及び／またはＡＮＧＰＴＬ７阻害剤の投与は、例えば、１日、２日、３日、５日、１週間、２週間、３週間、１か月、５週間、６週間、７週間、８週間、２か月、または３か月の後に繰り返すことができる。繰り返し投与は、同用量または異なる用量であり得る。投与は、１回、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、またはそれ以上繰り返すことができる。例えば、特定の投与レジメンによれば、患者は、長期間、例えば、６か月、１年、またはそれ以上の期間等の治療を受けることがある。
【0090】
眼疾患を治療もしくは阻害する治療剤及び／またはＡＮＧＰＴＬ７阻害剤の投与は、非経口、静脈内、経口、皮下、動脈内、頭蓋内、髄腔内、腹腔内、局所的、鼻腔内、または筋肉内が含まれるがこれらに限定されない任意の好適な経路で行うことができる。投与用医薬組成物は、望ましくは無菌かつ実質的に等張であり、ＧＭＰ条件下で製造される。医薬組成物は、単位剤形（すなわち、単回投与用の投与量）で提供され得る。医薬組成物は、１つ以上の生理学的及び薬学的に許容される担体、希釈剤、添加剤または助剤を使用して製剤化され得る。製剤は、選択投与経路に応じて異なる。用語「薬学的に許容される」とは、担体、希釈剤、添加剤、または助剤は、製剤の他の成分と適合性があり、その被投与者に実質的に有害ではないことを意味する。
【0091】
本明細書で使用される場合、用語「治療する」、「治療すること」、及び「治療」ならびに「予防する」、「予防すること」、及び「予防」とはそれぞれ、治療的効果及び予防的効果等の所望の生物学的応答を誘発することを指す。いくつかの実施形態では、治療効果は、薬剤または薬剤を含む組成物の投与後の、眼疾患の低下／軽減、眼疾患の重症度の低下／軽減、（例えば、眼疾患の発症の低減または阻害等）、症状及び眼疾患関連作用の低下／軽減、症状及び眼疾患関連作用の発症遅延、眼疾患関連作用の症状の重症度の軽減、急性エピソードの重症度の軽減、症状及び眼疾患関連作用の数の軽減、症状及び眼疾患関連作用の潜時の短縮、症状及び眼疾患関連作用の改善、二次的症状の軽減、二次感染の軽減、眼疾患の再発予防、再発エピソードの回数もしくは頻度の減少、有症状エピソードまでの潜時延長、持続的な進行までの時間の延長、迅速寛解、寛解導入、寛解増強、回復を早める、または代替的治療法の有効性増大もしくはそれに対する抵抗性低下、及び／または罹患宿主動物の生存期間延長のうち、１つ以上を含む。予防効果は、治療プロトコールの投与後の、眼疾患の発症／進行の、完全もしくは部分的な回避／阻害または遅延（例えば、完全もしくは部分的な回避／阻害または遅延等）、及び罹患宿主動物の生存期間延長を含み得る。眼疾患の治療には、いかなる臨床病期もしくは臨床症状であっても眼疾患の任意の形態に罹患しているとすでに診断された患者の治療、眼疾患の症状もしくは徴候の、発症もしくは進行もしくは増悪もしくは悪化の遅延、及び／または眼疾患の重症度の予防及び／または軽減が包含される。
【0092】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１１に従った１７６位に対してＣ末端である任意の位置に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１１に従った１７６位に対してＣ末端である任意の位置に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0093】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0094】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４１または配列番号１０に従った１６１位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４１または配列番号１０に従った１６１位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0095】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４２に従った１８７位に対してＣ末端である任意の位置に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４２に従った１８７位に対してＣ末端である任意の位置に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0096】
いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４３または配列番号１０に従った１９２位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４３または配列番号１０に従った１９２位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0097】
本開示はまた、眼疾患発症のリスクが上昇しているヒト対象を同定する方法も提供し、かかる方法は、対象から取得された生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子等）の有無を決定するかまたは決定済みであることを含み、ここで、ｉ）ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を欠いていれば（すなわち、ヒト対象は、遺伝子型がＡＮＧＰＴＬ７参照型であるとして分類される）、その場合は、ヒト対象は、眼疾患発症のリスクが上昇しており、ｉｉ）ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有していれば（すなわち、ヒト対象は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体であるとして分類される）、その場合は、ヒト対象は、眼疾患発症のリスクが減少している。単一コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有することにより、眼疾患の発症からの保護がヒト対象に付与される。
【0098】
いかなる特定の理論または作用機序にも限定されることを意図するものではないが、単一コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（すなわち、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体）により、眼疾患の発症からの保護がヒト対象に付与されると考えられ、また、２コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有すること（すなわち、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体）により、単一コピーを有するヒト対象と比べて、眼疾患の発症からのさらなる保護がヒト対象に付与され得ると考えられる。したがって、いくつかの実施形態では、単一コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、完全に保護的というわけではないが、その代わり、眼疾患の発症からのヒト対象の部分的または不完全な保護となり得る。いかなる特定の理論にも拘束されることを望むわけではないが、単一コピーのＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を有するヒト対象にまだ存在している、眼疾患の発症に関与する追加の因子または分子があり、そのために、眼疾患の発症からの完全な保護に及ばない場合がある。
【0099】
本開示はまた、眼疾患発症のリスクが上昇しているヒト対象を同定する方法も提供し、かかる方法は、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含み、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、もしくはその相補体であるか、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体であるか、またはｉｉｉ）ｍＲＮＡ分子から生成され、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体であり、ここで、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが上昇しており、ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが減少している。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0100】
本開示はまた、眼疾患発症のリスクが上昇しているヒト対象を同定する方法も提供し、かかる方法は、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含み、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、もしくはその相補体であるか、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体であるか、またはｉｉｉ）ｍＲＮＡ分子から生成され、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体であり、ここで、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが上昇しており、ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが減少している。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0101】
本開示はまた、眼疾患発症のリスクが上昇しているヒト対象を同定する方法も提供し、かかる方法は、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含み、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、もしくはその相補体であるか、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体であるか、またはｉｉｉ）ｍＲＮＡ分子から生成され、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体であり、ここで、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが上昇しており、ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが減少している。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0102】
本開示はまた、眼疾患発症のリスクが上昇しているヒト対象を同定する方法も提供し、かかる方法は、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含み、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、もしくはその相補体であるか、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体であるか、またはｉｉｉ）ｍＲＮＡ分子から生成され、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体であり、ここで、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが上昇しており、ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが減少している。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0103】
本開示はまた、眼疾患発症のリスクが上昇しているヒト対象を同定する方法も提供し、かかる方法は、患者からの生体試料において、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子の有無を検出することを含み、ここで、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子、もしくはその相補体であるか、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体であるか、またはｉｉｉ）ｍＲＮＡ分子から生成され、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体であり、ここで、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが上昇しており、ヒト対象が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のホモ接合体であれば、その場合は、かかるヒト対象は、眼疾患発症のリスクが減少している。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0104】
ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、部分的機能喪失、完全機能喪失、予測される部分的機能喪失、または予測される完全機能喪失を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、あらゆるＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子等）であり得る。例えば、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードするあらゆる核酸分子であり得る。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、またはＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、またはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＬｙｓ１９２Ｇｌｎをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。
【0105】
本明細書に記載される実施形態のいずれにおいても、眼疾患は、ＩＯＰ増大、前緑内障、緑内障、または角膜可塑性低下である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、ＩＯＰ増大である。いくつかの実施形態では、ＩＯＰ増大は、ＩＯＰｃｃまたはＩＯＰｇである。いくつかの実施形態では、眼疾患は、前緑内障である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、緑内障である。いくつかの実施形態では、緑内障は、原発開放隅角緑内障、閉塞隅角緑内障、正常眼圧緑内障、先天性緑内障、血管新生緑内障、ステロイド緑内障、または眼外傷に関連する緑内障である。いくつかの実施形態では、眼疾患は、角膜可塑性低下である。
【0106】
対象から取得された試料において特定の核酸分子の有無を決定するかまたは決定済みであることは、本明細書に記載される方法のいずれによっても行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法はインビトロで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法はインサイチュで行うことができる。いくつかの実施形態では、これらの方法はインビボで行うことができる。
【0107】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0108】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0109】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0110】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0111】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0112】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0113】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0114】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0115】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0116】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、
ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0117】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0118】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0119】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0120】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、
ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0121】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0122】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0123】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0124】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、
ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、を含む。
ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0125】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0126】
いくつかの実施形態では、決定ステップは、、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0127】
これらの実施形態のいずれにおいても、核酸分子は、ヒト対象から取得された細胞内に存在し得る。
いくつかの実施形態では、ヒト対象はさらに、本明細書に記載されるように、眼疾患を治療もしくは阻害する治療剤及び／またはＡＮＧＰＴＬ７阻害剤により治療される。例えば、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であり、そのために、眼疾患発症のリスクが上昇している場合、そのヒト対象は、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与される。いくつかの実施形態では、そのような患者はまた、眼疾患を治療または阻害する治療剤も投与される。いくつかの実施形態では、患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である場合、患者は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかまたはそれよりも低い投与量で投与され、かつ、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も投与される。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
いくつかの実施形態では、ヒト対象はさらに、本明細書に記載されるように、眼疾患を治療もしくは阻害する治療剤及び／またはＡＮＧＰＴＬ７阻害剤により治療される。例えば、ヒト対象がＡＮＧＰＴＬ７参照型であり、そのために、眼疾患発症のリスクが上昇している場合、そのヒト対象は、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤を投与される。いくつかの実施形態では、そのような患者はまた、眼疾患を治療または阻害する治療剤も投与される。いくつかの実施形態では、患者が、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である場合、患者は、眼疾患を治療または阻害する治療剤を標準投与量と同じかまたはそれよりも低い投与量で投与され、かつ、ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も投与される。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７参照型である。いくつかの実施形態では、患者は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のヘテロ接合体である。
【0128】
本開示はまた、対象であるヒトからの生体試料において、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｍＲＮＡ分子、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ｃＤＮＡ分子の存在を検出する方法も提供する。集団内の遺伝子配列及びそのような遺伝子によりコードされるｍＲＮＡ分子は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供されるＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子、及びＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の配列は例示的配列にすぎない。ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子、変異体ｍＲＮＡ分子、及び変異体ｃＤＮＡ分子の他の配列もまた可能である。
【0129】
生体試料は、対象からの任意の細胞、組織、または生体液に由来し得る。試料は、骨髄試料、腫瘍生検、穿刺吸引液、または血液、歯肉溝滲出液、血漿、血清、リンパ、腹水、嚢胞液、もしくは尿等の体液試料等、臨床上関連する任意の組織を含み得る。場合によっては、試料は、口腔スワブを含む。本明細書に開示される方法で使用される試料は、アッセイフォーマット、検出方法の性質、及び試料として使用される組織、細胞、または抽出物に基づいて異なる。生体試料は、採用されるアッセイに応じて異なった処理が行われ得る。例えば、任意のＡＮＧＰＴＬ７の変異体核酸分子を検出する場合、ゲノムＤＮＡの試料を単離するかまたはそれを濃縮するよう設計された予備的処理が採用され得る。多種多様な公知の技術がこのために使用され得る。任意のＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡレベルを検出する場合、生体試料をｍＲＮＡで濃縮するために異なる技術を使用することができる。ｍＲＮＡの存在もしくはレベルまたは特定の変異体ゲノムＤＮＡ遺伝子座の存在を検出するための様々な方法を使用することができる。
【0130】
いくつかの実施形態では、ヒト対象のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を検出する方法は、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子、またはＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子が、機能喪失（部分的または完全）を引き起こすかまたは機能喪失（部分的または完全）を引き起こすことが予測される１つ以上の変異を含むかどうかを決定するため、ヒト対象から取得された生体試料をアッセイすることを含む。例えば、いくつかの実施形態では、ヒト対象のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を検出する方法は、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、対象から取得された生体試料をアッセイすることを含む。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0131】
いくつかの実施形態では、ヒト対象においてＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子等）の有無を検出する方法は、ヒト対象から取得された生体試料でアッセイを実施することを含み、かかるアッセイでは、生体試料の核酸分子が、ｉ）配列番号２（ゲノム核酸分子）に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、ｉｉ）配列番号５（ｍＲＮＡ分子）に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、またはｉｉｉ）配列番号８（ｃＤＮＡ分子）に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、をコードするヌクレオチド配列を含むかどうかが決定される。いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または細胞溶解物を含む。そのような方法はさらに、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子を含む対象からの生体試料を取得すること、ｍＲＮＡの場合は、任意選択でｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させること、及びＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ、またはｃＤＮＡの位置がそれぞれ、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンをコードすることを決定する、生体試料でのアッセイを実施すること、を含むことができる。そのようなアッセイは、例えば、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子のこれらの位置の固有性を決定することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0132】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料中のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子、またはＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、ここで、配列決定された部分は、機能喪失（部分的または完全）を引き起こす１つ以上の変異を含む。例えば、いくつかの実施形態では、アッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0133】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、及びｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、を含む。いくつかの実施形態では、アッセイは、核酸分子全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のみが分析される。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡのみが分析される。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡから取得されたＡＮＧＰＴＬ７
ｃＤＮＡのみが分析される。
ｃＤＮＡのみが分析される。
【0134】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、またはｉｉｉ）配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、及びｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0135】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、及び検出可能な標識を検出すること、を含む。核酸配列中のＳＮＰ等の突然変異を検出するには変化特異的ポリメラーゼ連鎖反応技術を使用することができる。鋳型とのミスマッチが存在するとＤＮＡポリメラーゼは伸長しないため、変化特異的プライマーを使用することができる。
【0136】
いくつかの実施形態では、ヒト対象のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を検出する方法は、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、対象から取得された生体試料をアッセイすることを含む。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0137】
いくつかの実施形態では、ヒト対象においてＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子等）の有無を検出する方法は、ヒト対象から取得された生体試料でアッセイを実施することを含み、かかるアッセイでは、生体試料の核酸分子が、ｉ）配列番号３（ゲノム核酸分子）に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、ｉｉ）配列番号６（ｍＲＮＡ分子）に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、またはｉｉｉ）配列番号９（ｃＤＮＡ分子）に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、をコードするヌクレオチド配列を含むかどうかが決定される。いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または細胞溶解物を含む。そのような方法はさらに、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子を含む対象からの生体試料を取得すること、ｍＲＮＡの場合は、任意選択でｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させること、及びＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ、またはｃＤＮＡの位置がそれぞれ、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンをコードすることを決定する、生体試料でのアッセイを実施すること、を含むことができる。そのようなアッセイは、例えば、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子のこれらの位置の固有性を決定することを含み得る。いくつかの実施形態では、本方法は、インビトロ方法である。
【0138】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料中のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子、またはＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することを含み、ここで、配列決定された部分は、機能喪失（部分的または完全）を引き起こす１つ以上の変異を含む。例えば、いくつかの実施形態では、アッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、を含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0139】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、及びｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むかどうか、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含むかどうかを決定すること、を含む。いくつかの実施形態では、アッセイは、核酸分子全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のみが分析される。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡのみが分析される。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡから取得されたＡＮＧＰＴＬ７
ｃＤＮＡのみが分析される。
ｃＤＮＡのみが分析される。
【0140】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、またはｉｉｉ）配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、及びｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0141】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシルもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、及び検出可能な標識を検出すること、を含む。核酸配列中のＳＮＰ等の突然変異を検出するには変化特異的ポリメラーゼ連鎖反応技術を使用することができる。鋳型とのミスマッチが存在するとＤＮＡポリメラーゼは伸長しないため、変化特異的プライマーを使用することができる。
【0142】
いくつかの実施形態では、ヒト対象のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を検出する方法は、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、対象から取得された生体試料をアッセイすることを含む。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0143】
いくつかの実施形態では、ヒト対象においてＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子等）の有無を検出する方法は、ヒト対象から取得された生体試料でアッセイを実施することを含み、かかるアッセイでは、生体試料の核酸分子が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、をコードするヌクレオチド配列を含むかどうかが決定される。いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または細胞溶解物を含む。そのような方法はさらに、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子を含む対象からの生体試料を取得すること、ｍＲＮＡの場合は、任意選択でｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させること、及びＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ、またはｃＤＮＡの位置がそれぞれ、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンをコードすることを決定する、生体試料でのアッセイを実施すること、を含むことができる。そのようなアッセイは、例えば、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子のこれらの位置の固有性を決定することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0144】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0145】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0146】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0147】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0148】
いくつかの実施形態では、ヒト対象のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を検出する方法は、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、対象から取得された生体試料をアッセイすることを含む。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0149】
いくつかの実施形態では、ヒト対象においてＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子等）の有無を検出する方法は、ヒト対象から取得された生体試料でアッセイを実施することを含み、かかるアッセイでは、生体試料の核酸分子が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、をコードするヌクレオチド配列を含むかどうかが決定される。いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または細胞溶解物を含む。そのような方法はさらに、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子を含む対象からの生体試料を取得すること、ｍＲＮＡの場合は、任意選択でｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させること、及びＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ、またはｃＤＮＡの位置がそれぞれ、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンをコードすることを決定する、生体試料でのアッセイを実施すること、を含むことができる。そのようなアッセイは、例えば、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子のこれらの位置の固有性を決定することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0150】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0151】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0152】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0153】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0154】
いくつかの実施形態では、ヒト対象のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子を検出する方法は、生体試料のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体、またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体、を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、対象から取得された生体試料をアッセイすることを含む。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0155】
いくつかの実施形態では、ヒト対象においてＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子等）の有無を検出する方法は、ヒト対象から取得された生体試料でアッセイを実施することを含み、かかるアッセイでは、生体試料の核酸分子が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、をコードするヌクレオチド配列を含むかどうかが決定される。いくつかの実施形態では、生体試料は、細胞または細胞溶解物を含む。そのような方法はさらに、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７のゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子を含む対象からの生体試料を取得すること、ｍＲＮＡの場合は、任意選択でｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させること、及びＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ、またはｃＤＮＡの位置がそれぞれ、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンをコードすることを決定する、生体試料でのアッセイを実施すること、を含むことができる。そのようなアッセイは、例えば、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子のこれらの位置の固有性を決定することを含み得る。いくつかの実施形態では、方法はインビトロ法である。
【0156】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、ｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定すること、及び／またはｉｉｉ）生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分を配列決定することであって、配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、配列決定することを含む。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の配列決定された部分が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のゲノム核酸分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｍＲＮＡ分子である。生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の配列決定された部分が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む場合には、その生体試料のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体のｃＤＮＡ分子である。
【0157】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の一部分、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置に近接するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の一部分にハイブリダイズするプライマーと、生体試料とを接触させること、ｂ）プライマーを、少なくとも、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の位置、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応するＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の位置を通って伸長させること、ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうか、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むかどうかを決定すること、を含む。
【0158】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子の少なくとも一部分を増幅させることであって、かかる部分が、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む、増幅させること、ｂ）増幅核酸分子を検出可能な標識で標識すること、ｃ）標識核酸分子と、変化特異的プローブを含む支持体とを接触させることであって、変化特異的プローブが、ｉ）配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、ｉｉ）配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列、及び／またはｉｉｉ）配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子の核酸配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびにｄ）検出可能な標識を検出すること、を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子はｍＲＮＡであり、決定ステップはさらに、増幅ステップの前にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることを含む。
【0159】
いくつかの実施形態では、アッセイは、生体試料の核酸分子と、検出可能な標識を含む変化特異的プローブとを接触させることであって、変化特異的プローブが、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列、及び／または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンもしくはその相補体を含む増幅核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること、ならびに検出可能な標識を検出すること、を含む。
【0160】
いくつかの実施形態では、試料の核酸分子はｍＲＮＡであり、ｍＲＮＡは、増幅ステップの前にｃＤＮＡに逆転写される。いくつかの実施形態では、核酸分子は、ヒト対象から取得された細胞内に存在する。
【0161】
ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、部分的機能喪失、完全機能喪失、予測される部分的機能喪失、または予測される完全機能喪失を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする、あらゆるＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子等）であり得る。例えば、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ、Ａｒｇ３４０Ｈｉｓ、Ａｒｇ２２０Ｈｉｓ、Ａｓｎ３０２Ｌｙｓ、またはＡｒｇ２２０Ｃｙｓをコードするあらゆる核酸分子であり得る。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ、またはＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ、またはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＬｙｓ１９２Ｇｌｎをコードする。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７のＰｈｅ１６１Ｉｌｅをコードする。
【0162】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ストリンジェントな条件下でＡＮＧＰＴＬ７変異体ゲノム配列、変異体ｍＲＮＡ配列、または変異体ｃＤＮＡ配列に特異的にハイブリダイズし、対応するＡＮＧＰＴＬ７参照配列にはハイブリダイズしない、変化特異的プライマーもしくは変化特異的プローブ等のプライマーまたはプローブと生体試料を接触させること、及びハイブリダイゼーションが生じたかどうかを決定することを含む。
【0163】
いくつかの実施形態では、アッセイは、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－Ｓｅｑ）を含む。いくつかの実施形態では、アッセイは、逆転写ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ＰＣＲ）等による、ｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写させることも含む。
【0164】
いくつかの実施形態では、方法は、標的ヌクレオチド配列に結合するのに十分なヌクレオチド長のプローブ及びプライマーを利用し、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子、変異体ｍＲＮＡ分子、もしくは変異体ｃＤＮＡ分子を含むポリヌクレオチドを特異的に検出及び／または同定する。ハイブリダイゼーションの条件または反応条件は、この結果を達成するために操作者が決定することができる。このヌクレオチド長は、本明細書で記載または例示される任意のアッセイを含めた選択検出方法での使用に十分な、いかなる長さであってもよい。そのようなプローブ及びプライマーは、高いストリンジェンシーのハイブリダイゼーション条件下で標的ヌクレオチド配列に特異的にハイブリダイズすることができる。プローブ及びプライマーは、標的ヌクレオチド配列内の連続したヌクレオチドの完全なヌクレオチド配列同一性を有し得るが、プローブは、標的ヌクレオチド配列とは異なり、かつ、標的ヌクレオチド配列を特異的に検出及び／または同定する能力を保持しているものを従来の方法で設計することができる。したがって、プローブ及びプライマーは、標的核酸分子のヌクレオチド配列に対する約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％、もしくは１００％の配列同一性または相補性を共有することができる。
【0165】
いくつかの実施形態では、生体試料内の、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）またはその相補体が、配列番号２（ゲノム核酸分子）に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、または配列番号５（ｍＲＮＡ分子）に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号８（ｃＤＮＡ分子）に従った５２９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するため、生体試料は増幅方法に供され得、その際、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、または配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン、または配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとが含まれるプライマー対を使用して、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む位置でのＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成されるようにする。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対とを足して合わせた長さから、ＤＮＡ増幅プロトコールにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲に及び得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から、増幅反応の限界まで、または約２００００ヌクレオチド塩基対までに及び得る。任意選択で、プライマー対は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む位置と、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む位置のそれぞれの側での少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、もしくはそれ以上のヌクレオチドとが含まれる領域に隣接する。
【0166】
いくつかの実施形態では、生体試料内の、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）またはその相補体が、配列番号３（ゲノム核酸分子）に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、または配列番号６（ｍＲＮＡ分子）に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号９（ｃＤＮＡ分子）に従った５２５位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するため、生体試料は増幅方法に供され得、その際、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、または配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン、または配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとが含まれるプライマー対を使用して、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む位置でのＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成されるようにする。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対とを足して合わせた長さから、ＤＮＡ増幅プロトコールにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲に及び得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から、増幅反応の限界まで、または約２００００ヌクレオチド塩基対までに及び得る。任意選択で、プライマー対は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む位置と、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む位置のそれぞれの側での少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、もしくはそれ以上のヌクレオチドとが含まれる領域に隣接する。
【0167】
いくつかの実施形態では、生体試料内の、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）またはその相補体が、配列番号１３２（ゲノム核酸分子）に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３５（ｍＲＮＡ分子）に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３８（ｃＤＮＡ分子）に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンを含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するため、生体試料は増幅方法に供され得、その際、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとが含まれるプライマー対を使用して、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成されるようにする。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対とを足して合わせた長さから、ＤＮＡ増幅プロトコールにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲に及び得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から、増幅反応の限界まで、または約２００００ヌクレオチド塩基対までに及び得る。任意選択で、プライマー対は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む位置と、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む位置のそれぞれの側での少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、もしくはそれ以上のヌクレオチドとが含まれる領域に隣接する。
【0168】
いくつかの実施形態では、生体試料内の、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）またはその相補体が、配列番号１３３（ゲノム核酸分子）に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３６（ｍＲＮＡ分子）に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３９（ｃＤＮＡ分子）に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンを含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するため、生体試料は増幅方法に供され得、その際、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとが含まれるプライマー対を使用して、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成されるようにする。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対とを足して合わせた長さから、ＤＮＡ増幅プロトコールにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲に及び得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から、増幅反応の限界まで、または約２００００ヌクレオチド塩基対までに及び得る。任意選択で、プライマー対は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む位置と、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む位置のそれぞれの側での少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、もしくはそれ以上のヌクレオチドとが含まれる領域に隣接する。
【0169】
いくつかの実施形態では、生体試料内の、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）またはその相補体が、配列番号１３４（ゲノム核酸分子）に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１３７（ｍＲＮＡ分子）に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１４０（ｃＤＮＡ分子）に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンを含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するため、生体試料は増幅方法に供され得、その際、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとが含まれるプライマー対を使用して、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成されるようにする。いくつかの実施形態では、アンプリコンの長さは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対とを足して合わせた長さから、ＤＮＡ増幅プロトコールにより生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの範囲に及び得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から、増幅反応の限界まで、または約２００００ヌクレオチド塩基対までに及び得る。任意選択で、プライマー対は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むか、または配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む位置と、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含むか、または配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含むか、または配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む位置のそれぞれの側での少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、もしくはそれ以上のヌクレオチドとが含まれる領域に隣接する。
【0170】
ＰＣＲプライマー対は、例えば、Ｖｅｃｔｏｒ ＮＴＩバージョン１０（Ｉｎｆｏｒｍａｘ Ｉｎｃ．，Ｂｅｔｈｅｓｄａ Ｍｄ．）のＰＣＲプライマー分析ツール、ＰｒｉｍｅｒＳｅｌｅｃｔ（ＤＮＡＳＴＡＲ Ｉｎｃ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．）、及びＰｒｉｍｅｒ３（バージョン０．４．０（著作権）、１９９１、Ｗｈｉｔｅｈｅａｄ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｆｏｒ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，Ｍａｓｓ．）のような、その目的のために意図されたコンピュータプログラムを使用した、既知配列に由来し得る。さらに、配列を、視覚的に走査して、既知のガイドラインを使用して手作業でプライマーを同定することができる。
【0171】
多種多様な技術が当該技術分野で利用可能であり、例えば、核酸配列決定、核酸ハイブリダイゼーション、及び核酸増幅が含まれる。例示的な核酸配列決定技術の例としては、鎖ターミネーター（サンガー）シーケンシング及びダイ・ターミネーターシーケンシングが挙げられるが、これらに限定されない。
【0172】
他の方法は、精製ＤＮＡ、増幅ＤＮＡ、及び固定細胞調製物に対して誘導される、標識したプライマーまたはプローブ（蛍光インサイチュハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ））を使用することを含む、シーケンシング以外の核酸ハイブリダイゼーション法を伴う。いくつかの方法では、標的核酸分子は、検出の前かまたはそれと同時に増幅され得る。例示的な核酸増幅技術の例としては、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）、及び核酸配列に基づく増幅（ＮＡＳＢＡ）が挙げられるが、これらに限定されない。他の方法としては、リガーゼ連鎖反応、鎖置換増幅、及び好熱ＳＤＡ（ｔＳＤＡ）が挙げられるが、これらに限定されない。
【0173】
ハイブリダイゼーション技術では、プローブまたはプライマーがその標的に特異的にハイブリダイズするようストリンジェントな条件を用いることができる。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的配列に対し、他の非標的配列に対するよりも検出できるほど高い程度で、例えば、バックグラウンドに対して少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、またはそれ以上の、バックグラウンドに対して１０倍超が含まれる程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列に対し、他のヌクレオチド配列に対するよりも少なくとも２倍の検出できるほど高い程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列に対し、他のヌクレオチド配列に対するよりも少なくとも３倍の検出できるほど高い程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列に対し、他のヌクレオチド配列に対するよりも少なくとも４倍の検出できるほど高い程度でハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下でのポリヌクレオチドのプライマーまたはプローブは、その標的ヌクレオチド配列に対し、他のヌクレオチド配列に対するよりも、バックグラウンドに対して１０倍超の検出できるほど高い程度でハイブリダイズする。ストリンジェントな条件は配列依存的であり、状況が異なれば条件は異なってくる。
【0174】
ＤＮＡハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件、例えば、約４５℃での６×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）、その後、５０℃での２×ＳＳＣ洗浄が知られており、またＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９），６．３．１－６．３．６に見出すことができる。典型的に、ハイブリダイゼーション及び検出のためのストリンジェントな条件は、塩濃度が、ｐＨ７．０～８．３で約１．５Ｍ Ｎａ＋イオン未満、典型的には約０．０１～１．０Ｍ Ｎａ＋イオン濃度（または他の塩）であり、温度が、短鎖プローブ（例えば、１０～５０ヌクレオチド等）の場合は少なくとも約３０℃、長鎖プローブ（例えば、５０ヌクレオチド超等）の場合は少なくとも約６０℃であるものである。ストリンジェントな条件はまた、ホルムアミド等の不安定化剤の添加によっても達成され得る。任意選択で、洗浄バッファーは、約０．１％～約１％のＳＤＳを含み得る。ハイブリダイゼーションの持続時間は一般に、約２４時間未満、通常は約４～約１２時間である。洗浄時間の持続時間は、少なくとも平衡に達するのに十分長い時間である。
【0175】
本開示はまた、対象におけるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドが、そのポリペプチドに機能喪失（部分的または完全）を持たせるようにする１つ以上の変異を含有するかどうかを決定するために、ヒト対象から取得された試料でアッセイを実施することを含む、ヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ポリペプチドの存在を検出する方法も提供する。例えば、いくつかの実施形態では、方法は、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７ Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体ポリペプチド等のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ポリペプチドの存在を検出し、試料中のＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドが、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止するかどうかを決定するために、ヒト対象から取得された試料でアッセイを実施することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１１に従った１７６位に対してＣ末端である任意の位置に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む（そのようなポリペプチドは参照であり、そのような位置が存在しないことは、そのポリペプチドが、少なくとも１７６位にて終止しており、予測される機能喪失型変異体ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドであることを示す）。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止するポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0176】
本開示はまた、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号２等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号５等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号８等）にハイブリダイズする単離された核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置が含まれるか、または配列番号５もしくは配列番号８に従った５２９位に対応する位置が含まれる、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子の部分にハイブリダイズする。
【0177】
いくつかの実施形態では、方法は、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体ポリペプチド等のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ポリペプチドの存在を検出し、試料中のＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドが、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むかどうかを決定するために、ヒト対象から取得された試料でアッセイを実施することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0178】
本開示はまた、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号３等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号６等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号９等）にハイブリダイズする単離された核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置が含まれるか、または配列番号６もしくは配列番号９に従った５２５位に対応する位置が含まれる、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子の部分にハイブリダイズする。
【0179】
いくつかの実施形態では、方法は、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｐｈｅ１６１Ｉｌｅ変異体ポリペプチド等のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ポリペプチドの存在を検出し、試料中のＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドが、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むかどうかを決定するために、ヒト対象から取得された試料でアッセイを実施することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0180】
本開示はまた、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３２等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３５等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１３８等）にハイブリダイズする単離された核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置が含まれるか、または配列番号１３５もしくは配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置が含まれる、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子の部分にハイブリダイズする。
【0181】
いくつかの実施形態では、方法は、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｔｒｐ１８８Ｓｔｏｐ変異体ポリペプチド等のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ポリペプチドの存在を検出し、試料中のＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドが、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止するかどうかを決定するために、ヒト対象から取得された試料でアッセイを実施することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４２に従った１８７位に対してＣ末端である任意の位置に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む（そのようなポリペプチドは参照であり、そのような位置が存在しないことは、そのポリペプチドが、少なくとも１８７位にて終止しており、予測される機能喪失型変異体ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドであることを示す）。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止するポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0182】
本開示はまた、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３３等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３６等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１３９等）にハイブリダイズする単離された核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置が含まれるか、または配列番号１３６もしくは配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置が含まれる、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子の部分にハイブリダイズする。
【0183】
いくつかの実施形態では、方法は、例えば、ＡＮＧＰＴＬ７ Ｌｙｓ１９２Ｇｌｎ変異体ポリペプチド等のヒトＡＮＧＰＴＬ７の予測される機能喪失型変異体ポリペプチドの存在を検出し、試料中のＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドが、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むかどうかを決定するために、ヒト対象から取得された試料でアッセイを実施することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置を含むポリペプチドの少なくとも一部分を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、ポリペプチド全体を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、検出ステップは、配列番号１０または配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置を含むポリペプチドの存在を検出するための免疫測定法を含む。
【0184】
本開示はまた、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３４等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３７等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１４０等）にハイブリダイズする単離された核酸分子も提供する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置が含まれるか、または配列番号１３７もしくは配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置が含まれる、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子の部分にハイブリダイズする。
【0185】
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１１、少なくとも約１２、少なくとも約１３、少なくとも約１４、少なくとも約１５、少なくとも約１６、少なくとも約１７、少なくとも約１８、少なくとも約１９、少なくとも約２０、少なくとも約２１、少なくとも約２２、少なくとも約２３、少なくとも約２４、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約５５、少なくとも約６０、少なくとも約６５、少なくとも約７０、少なくとも約７５、少なくとも約８０、少なくとも約８５、少なくとも約９０、少なくとも約９５、少なくとも約１００、少なくとも約２００、少なくとも約３００、少なくとも約４００、少なくとも約５００、少なくとも約６００、少なくとも約７００、少なくとも約８００、少なくとも約９００、少なくとも約１０００、少なくとも約２０００、少なくとも約３０００、少なくとも約４０００、もしくは少なくとも約５０００ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１１、少なくとも約１２、少なくとも約１３、少なくとも約１４、少なくとも約１５、少なくとも約１６、少なくとも約１７、少なくとも約１８、少なくとも約１９、少なくとも約２０、少なくとも約２１、少なくとも約２２、少なくとも約２３、少なくとも約２４、もしくは少なくとも約２５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。好ましい実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約１８ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約１５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１０～約３５、約１０～約３０、約１０～約２５、約１２～約３０、約１２～約２８、約１２～約２４、約１５～約３０、約１５～約２５、約１８～約３０、約１８～約２５、約１８～約２４、もしくは約１８～約２２のヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。好ましい実施形態では、単離された核酸分子は、約１８～約３０ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約１５ヌクレオチド～少なくとも約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【0186】
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号２等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号５等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号８等）にハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、及びｓｉＲＮＡが限定されることなく含まれ、それらは、本明細書に記載される方法のいずれにおいても使用することができる。
【0187】
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号２等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号５等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号８等）と少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一な核酸分子の、少なくとも約１５連続するヌクレオチドにハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチド、もしくは約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【0188】
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、かかる変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、かかる部分は、配列番号２に従った４，２９１位もしくはその相補体に対応するか、配列番号５に従った５２９位もしくはその相補体に対応するか、または配列番号８に従った５２９位もしくはその相補体に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号５に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号８に従った５２９位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
【0189】
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号３等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号６等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号９等）にハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、及びｓｉＲＮＡが限定されることなく含まれ、それらは、本明細書に記載される方法のいずれにおいても使用することができる。
【0190】
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号３等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号６等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号９等）と少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一な核酸分子の、少なくとも約１５連続するヌクレオチドにハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチド、もしくは約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【0191】
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、かかる変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、かかる部分は、配列番号３に従った４，２８７位もしくはその相補体に対応するか、配列番号６に従った５２５位もしくはその相補体に対応するか、または配列番号９に従った５２５位もしくはその相補体に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号６に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号９に従った５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
【0192】
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３２等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３５等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１３８等）にハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、及びｓｉＲＮＡが限定されることなく含まれ、それらは、本明細書に記載される方法のいずれにおいても使用することができる。
【0193】
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３２等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３５等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１３８等）と少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一な核酸分子の、少なくとも約１５連続するヌクレオチドにハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチド、もしくは約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【0194】
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、かかる変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、かかる部分は、配列番号１３２に従った４，２４３位もしくはその相補体に対応するか、配列番号１３５に従った４８１位もしくはその相補体に対応するか、または配列番号１３８に従った４８１位もしくはその相補体に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号配１３５に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
【0195】
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３３等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３６等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１３９等）にハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、及びｓｉＲＮＡが限定されることなく含まれ、それらは、本明細書に記載される方法のいずれにおいても使用することができる。
【0196】
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３３等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３６等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１３９等）と少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一な核酸分子の、少なくとも約１５連続するヌクレオチドにハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチド、もしくは約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【0197】
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、かかる変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、かかる部分は、配列番号１３３に従った４，３２５位もしくはその相補体に対応するか、配列番号１３６に従った５６３位もしくはその相補体に対応するか、または配列番号１３９に従った５６３位もしくはその相補体に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
【0198】
いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３４等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３７等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１４０等）にハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書に記載または例示されているようなプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用することができ、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、及びｓｉＲＮＡが限定されることなく含まれ、それらは、本明細書に記載される方法のいずれにおいても使用することができる。
【0199】
いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（配列番号１３４等）、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（配列番号１３７等）、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（配列番号１４０等）と少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一な核酸分子の、少なくとも約１５連続するヌクレオチドにハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチド、もしくは約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約３５ヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。
【0200】
いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、かかる変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列の一部分に相補的なヌクレオチド配列を含み、かかる部分は、配列番号１３４に従った４，３３６位もしくはその相補体に対応するか、配列番号１３７に従った５７４位もしくはその相補体に対応するか、または配列番号１４０に従った５７４位もしくはその相補体に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置、もしくはその相補体を含む、ヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含む。
【0201】
いくつかの実施形態では、変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーは、ＤＮＡを含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーは、ＲＮＡを含む。
【0202】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるプローブ及びプライマー（変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーを含む）は、本明細書に開示される核酸分子のいずれか、またはその相補体に特異的にハイブリダイズするヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、プローブ及びプライマーは、ストリンジェントな条件下、本明細書に開示される核酸分子のいずれかに特異的にハイブリダイズする。
【0203】
いくつかの実施形態では、変化特異的プライマーを含め、プライマーは、第二世代シーケンシングまたはハイスループットシーケンシングで使用することができる。場合によっては、変化特異的プライマーを含め、プライマーは、修飾することができる。特に、プライマーは、例えば、マッシブパラレルシグネチャーシーケンシング（ＭＰＳＳ）、ポロニーシーケンシング、及び４５４パイロシーケンシングの異なるステップにて使用される様々な修飾を含むことができる。修飾プライマーは、工程のいくつかのステップにおいて使用することができ、クローニングステップでのビオチン化プライマーならびにビーズ搭載ステップ及び検出ステップにて使用される蛍光標識プライマーが含まれる。ポロニーシーケンシングは一般に、ＤＮＡ鋳型の各分子が約１３５ｂｐの長さであるペアエンドタグライブラリーを使用して実施される。ビオチン化プライマーは、ビーズ搭載ステップ及びエマルジョンＰＣＲにおいて使用される。蛍光標識した縮重ノナマーオリゴヌクレオチドは、検出ステップにて使用される。アダプターは、ストレプトアビジンでコートしたビーズ上へのＤＮＡライブラリーの固定用に５’－ビオチンタグを含有し得る。
【0204】
本明細書に記載されるプローブ及びプライマーは、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（例えば、配列番号２に従う等）内のＣ４，２９１Ｔ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（例えば、配列番号５に従う等）内のＣ５２９Ｕ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（例えば、配列番号８に従う等）内のＣ５２９Ｔ変異を検出するために使用することができる。例えば、プライマーは、Ｃ４，２９１Ｔ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子またはその断片を増幅させるために使用することができる。プライマーはまた、Ｃ５２９Ｕ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。プライマーはまた、Ｃ５２９Ｔ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。
【0205】
本明細書に記載されるプローブ及びプライマーは、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（例えば、配列番号３に従う等）内のＧ４，２８７Ｔ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（例えば、配列番号６に従う等）内のＧ５２５Ｕ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（例えば、配列番号９に従う等）内のＧ５２５Ｔ変異を検出するために使用することができる。例えば、プライマーは、Ｇ４，２８７Ｔ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子またはその断片を増幅させるために使用することができる。プライマーはまた、Ｇ５２５Ｕ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。プライマーはまた、Ｇ５２５Ｔ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。
【0206】
本明細書に記載されるプローブ及びプライマーは、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（例えば、配列番号１３２に従う等）内のＴ４，２４３Ａ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（例えば、配列番号１３５に従う等）内のＵ４８１Ａ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（例えば、配列番号１３８に従う等）内のＴ４８１Ａ変異を検出するために使用することができる。例えば、プライマーは、Ｔ４，２４３Ａ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子またはその断片を増幅させるために使用することができる。プライマーはまた、Ｕ４８１Ａ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。プライマーはまた、Ｔ４８１Ａ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。
【0207】
本明細書に記載されるプローブ及びプライマーは、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（例えば、配列番号１３３に従う等）内のＧ４，３２５Ａ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（例えば、配列番号１３６に従う等）内のＧ５６３Ａ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（例えば、配列番号１３９に従う等）内のＧ５６３Ａ変異を検出するために使用することができる。例えば、プライマーは、Ｇ４，３２５Ａ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子またはその断片を増幅させるために使用することができる。プライマーはまた、Ｇ５６３Ａ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。プライマーはまた、Ｇ５６３Ａ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。
【0208】
本明細書に記載されるプローブ及びプライマーは、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子（例えば、配列番号１３４に従う等）内のＡ４，３３６Ｃ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子（例えば、配列番号１３７に従う等）内のＡ５７４Ｃ変異、またはＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子（例えば、配列番号１４０に従う等）内のＡ５７４Ｃ変異を検出するために使用することができる。例えば、プライマーは、Ａ４，３３６Ｃ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子またはその断片を増幅させるために使用することができる。プライマーはまた、Ａ５７４Ｃ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。プライマーはまた、Ａ５７４Ｃ変異を含むＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡまたはその断片を増幅させるために使用することもできる。
【0209】
本開示はまた、上記プライマーのいずれかを含むプライマーの対も提供する。プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号２と比較した）４，２９１位に対応する位置にて（チミンではなく）シトシンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号２と比較した）４，２９１位に対応する位置にて（シトシンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号２の４，２９１位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端であり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号５と比較した）５２９位に対応する位置にて（ウラシルではなく）シトシンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号５と比較した）５２９位に対応する位置にて（シトシンではなく）ウラシルにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号５の５２９位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端であり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号８と比較した）５２９位に対応する位置にて（チミンではなく）シトシンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号８と比較した）５２９位に対応する位置にて（シトシンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号８の５２９位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端であり得る。
【0210】
いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む部分にて、配列番号２を含むＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む部分にて、配列番号５を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む部分にて、配列番号８を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【0211】
プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号３と比較した）４，２８７位に対応する位置にて（チミンではなく）グアニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号３と比較した）４，２８７位に対応する位置にて（グアニンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号３の４，２８７位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端であり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号６と比較した）５２５位に対応する位置にて（ウラシルではなく）グアニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号６と比較した）５２５位に対応する位置にて（グアニンではなく）ウラシルにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号６の５２５位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端であり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号９と比較した）５２５位に対応する位置にて（チミンではなく）グアニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号９と比較した）５２５位に対応する位置にて（グアニンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号９の５２５位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端であり得る。
【0212】
いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む部分にて、配列番号３を含むＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む部分にて、配列番号６を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む部分にて、配列番号９を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【0213】
プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号１３２と比較した）４，２４３位に対応する位置にて（アデニンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号１３２と比較した）４，２４３位に対応する位置にて（チミンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７
ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３５と比較した）４８１位に対応する位置にて（アデニンではなく）ウラシルにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３５と比較した）４８１位に対応する位置にて（ウラシルではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号１３８と比較した）４８１位に対応する位置にて（アデニンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３８と比較した）４８１位に対応する位置にて（チミンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。
ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３５と比較した）４８１位に対応する位置にて（アデニンではなく）ウラシルにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３５と比較した）４８１位に対応する位置にて（ウラシルではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号１３８と比較した）４８１位に対応する位置にて（アデニンではなく）チミンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３８と比較した）４８１位に対応する位置にて（チミンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。
【0214】
いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む部分にて、配列番号１３２を含むＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む部分にて、配列番号１３５を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む部分にて、配列番号１３８を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【0215】
プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号１３３と比較した）４，３２５位に対応する位置にて（アデニンではなく）グアニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号１３３と比較した）４，３２５位に対応する位置にて（グアニンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３６と比較した）５６３位に対応する位置にて（アデニンではなく）グアニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３６と比較した）５６３位に対応する位置にて（グアニンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号１３９と比較した）５６３位に対応する位置にて（アデニンではなく）グアニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号１３９と比較した）５６３位に対応する位置にて（グアニンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。
【0216】
いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む部分にて、配列番号１３３を含むＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む部分にて、配列番号１３６を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む部分にて、配列番号１３９を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【0217】
プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子において（配列番号１及び配列番号１３４と比較した）４，３３６位に対応する位置にて（シトシンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子において（配列番号１及び配列番号１３４と比較した）４，３３６位に対応する位置にて（アデニンではなく）シトシンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３７と比較した）５７４位に対応する位置にて（シトシンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子において（配列番号４及び配列番号１３７と比較した）５７４位に対応する位置にて（アデニンではなく）シトシンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。さらに、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号１４０と比較した）５７４位に対応する位置にて（シトシンではなく）アデニンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。逆に、プライマーの３’末端のうちの１つが、特定のＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子において（配列番号７及び配列番号１４０と比較した）５７４位に対応する位置にて（アデニンではなく）シトシンにハイブリダイズする場合には、増幅断片の存在は、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子の存在を示すと考えられる。いくつかの実施形態では、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。
【0218】
いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む部分にて、配列番号１３４を含むＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子の部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む部分にて、配列番号１３７を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子の一部分にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズする、ヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、プローブまたはプライマーは、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む部分にて、配列番号１４０を含むＡＮＧＰＴＬ７ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズするか、またはこの核酸分子の相補体にハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【0219】
開示との関連において「特異的にハイブリダイズする」とは、プローブまたはプライマー（例えば、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー等）は、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子、及び／またはＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子をコードする核酸配列にはハイブリダイズしないことを意味する。
【0220】
いくつかの実施形態では、プローブ（例えば、変化特異的プローブ等）は標識を含む。いくつかの実施形態では、標識は、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである。
本開示はまた、本明細書に開示されるプローブのうちのいずれか１つ以上が結合している基質を含む支持体も提供する。固体支持体は、固体状態の基質であるか、または本明細書に開示されるプローブのいずれか等の分子が会合することのできる支持体である。固体支持体の形態はアレイである。固体支持体の別の形態はアレイ検出器である。アレイ検出器は、複数の異なるプローブが、アレイ、格子、または他の組織化されたパターンで結合されている固体支持体である。固体状態の基質の形態は、標準的な９６ウェル型等のマイクロタイターディッシュである。いくつかの実施形態では、通常、ウェルあたり１アレイが含有されているマルチウェルスライドガラスを使用することができる。
本開示はまた、本明細書に開示されるプローブのうちのいずれか１つ以上が結合している基質を含む支持体も提供する。固体支持体は、固体状態の基質であるか、または本明細書に開示されるプローブのいずれか等の分子が会合することのできる支持体である。固体支持体の形態はアレイである。固体支持体の別の形態はアレイ検出器である。アレイ検出器は、複数の異なるプローブが、アレイ、格子、または他の組織化されたパターンで結合されている固体支持体である。固体状態の基質の形態は、標準的な９６ウェル型等のマイクロタイターディッシュである。いくつかの実施形態では、通常、ウェルあたり１アレイが含有されているマルチウェルスライドガラスを使用することができる。
【0221】
本開示はまた、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）もしくはその相補体のいずれかと、本明細書に記載される変化特異的プライマーもしくは変化特異的プローブのいずれかとを含むかまたはそれらからなる分子複合体も提供する。いくつかの実施形態では、分子複合体中のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）またはその相補体は、一本鎖である。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子は、本明細書に記載されるゲノム核酸分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子は、本明細書に記載されるｍＲＮＡ分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、ＡＮＧＰＴＬ７核酸分子は、本明細書に記載されるｃＤＮＡ分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、分子複合体は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）もしくはその相補体のいずれかと、本明細書に記載される変化特異的プライマーのいずれかとを含むかまたはそれらからなる。いくつかの実施形態では、分子複合体は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）もしくはその相補体のいずれかと、本明細書に記載される変化特異的プローブのいずれかとを含むかまたはそれらからなる。いくつかの実施形態では、分子複合体は、標識を含む変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーを含む。いくつかの実施形態では、標識は、蛍光標識、放射標識、またはビオチンである。いくつかの実施形態では、分子複合体はさらに、非ヒトのポリメラーゼを含む。
【0222】
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子も提供し、かかるポリペプチドは、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置またはその相補体にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１１に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１１に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１１に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１１に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１１に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１１に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。
【0223】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１１を含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１１からなるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0224】
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子も提供し、かかるポリペプチドは、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンまたはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１２に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１２に対する配列同一性が少なくとも約９０％であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１２に対する配列同一性が少なくとも約９２％であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１２に対する配列同一性が少なくとも約９４％であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１２に対する配列同一性が少なくとも約９６％であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１２に対する配列同一性が少なくとも約９８％であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0225】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１２を含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１２からなるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0226】
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子も提供し、かかるポリペプチドは、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンまたはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４１に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４１に対する配列同一性が少なくとも約９０％であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４１に対する配列同一性が少なくとも約９２％であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４１に対する配列同一性が少なくとも約９４％であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４１に対する配列同一性が少なくとも約９６％であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４１に対する配列同一性が少なくとも約９８％であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0227】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１４１を含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１４１からなるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0228】
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子も提供し、かかるポリペプチドは、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置またはその相補体にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４２に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４２に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４２に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４２に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４２に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４２に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるアミノ酸配列を有するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードし、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。
【0229】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１４２を含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１４２からなるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0230】
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む単離された核酸分子も提供し、かかるポリペプチドは、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置におけるグルタミンまたはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４３に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４３に対する配列同一性が少なくとも約９０％であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４３に対する配列同一性が少なくとも約９２％であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４３に対する配列同一性が少なくとも約９４％であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４３に対する配列同一性が少なくとも約９６％であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４３に対する配列同一性が少なくとも約９８％であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むアミノ酸配列を有する、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0231】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１４３を含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、核酸分子は、配列番号１４３からなるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする。
【0232】
ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号１に記載されている。配列番号１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の４，２９１位はシトシンである。配列番号１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の４，２８７位はグアニンである。配列番号１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の４，２４３位はチミンである。配列番号１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の４，３２５位はグアニンである。配列番号１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ゲノム核酸分子の４，３３６位はアデニンである。
【0233】
ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子が存在し、（配列番号１に記載の参照ゲノム配列に関して）４，２９１位におけるシトシンがチミンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号２に記載されている。
【0234】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ゲノム核酸分子が存在し、（配列番号１に記載の参照ゲノム配列に関して）４，２８７位におけるグアニンがチミンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号３に記載されている。
【0235】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ゲノム核酸分子が存在し、（配列番号１に記載の参照ゲノム配列に関して）４，２４３位におけるチミンがアデニンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３２に記載されている。
【0236】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ゲノム核酸分子が存在し、（配列番号１に記載の参照ゲノム配列に関して）４，３２５位におけるグアニンがアデニンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３３に記載されている。
【0237】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ゲノム核酸分子が存在し、（配列番号１に記載の参照ゲノム配列に関して）４，３３６位におけるアデニンがシトシンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３４に記載されている。
【0238】
本開示は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子を提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン（Ｃ４，２９１Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン（Ｃ４，２９１Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置におけるチミン（Ｃ４，２９１Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置にＴＧＡコドンを含む。
【0239】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0240】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号２に従った４，２８９～４，２９１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0241】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン（Ｇ４，２８７Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン（Ｇ４，２８７Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン（Ｇ４，２８７Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置にＣＡＴコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン（Ｇ４，２８７Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン（Ｇ４，２８７Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置におけるチミン（Ｇ４，２８７Ｔ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置にＣＡＴコドンを含む。
【0242】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0243】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号３に従った４，２８５～４，２８７位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0244】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号３からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン（Ｔ４，２４３Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン（Ｔ４，２４３Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン（Ｔ４，２４３Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置にＡＴＣコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン（Ｔ４，２４３Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン（Ｔ４，２４３Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニン（Ｔ４，２４３Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置にＡＴＣコドンを含む。
【0245】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0246】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３２に従った４，２４３～４，２４５位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0247】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３２からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン（Ｇ４，３２５Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン（Ｇ４，３２５Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン（Ｇ４，３２５Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置にＴＡＧコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン（Ｇ４，３２５Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン（Ｇ４，３２５Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニン（Ｇ４，３２５Ａ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置にＴＡＧコドンを含む。
【0248】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0249】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３３に従った４，３２４～４，３２６位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0250】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３３からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン（Ａ４，３３６Ｃ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン（Ａ４，３３６Ｃ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン（Ａ４，３３６Ｃ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置にＣＡＧコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたゲノム核酸分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン（Ａ４，３３６Ｃ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン（Ａ４，３３６Ｃ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置におけるシトシン（Ａ４，３３６Ｃ）、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置にＣＡＧコドンを含む。
【0251】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0252】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３４に従った４，３３６～４，３３８位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0253】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号１３４からなる。
ゲノム核酸分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ゲノム核酸分子は、ヒト、または非ヒト哺乳類、げっ歯類、マウス、もしくはラット等の別の生物からのオルソログであり得る。集団内の遺伝子配列は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供される例は、例示的配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
ゲノム核酸分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ゲノム核酸分子は、ヒト、または非ヒト哺乳類、げっ歯類、マウス、もしくはラット等の別の生物からのオルソログであり得る。集団内の遺伝子配列は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供される例は、例示的配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
【0254】
いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、ゲノムＤＮＡ配列全体よりも少ない配列を含む。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２、配列番号３、配列番号１３２、配列番号１３３、及び／または配列番号１３４のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約１５、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約９０、少なくとも約１００、少なくとも約２００、少なくとも約３００、少なくとも約４００、少なくとも約５００、少なくとも約６００、少なくとも約７００、少なくとも約８００、少なくとも約９００、少なくとも約１０００、少なくとも約２０００、少なくとも約３０００、少なくとも約４０００、もしくは少なくとも約５０００連続するヌクレオチドを含むかまたはそれらからなる。いくつかの実施形態では、単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２、配列番号３、配列番号１３２、配列番号１３３、及び／または配列番号１３４のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約１０００～少なくとも約２０００連続するヌクレオチドを含むかまたはそれらからなる。いくつかの実施形態では、これらの単離されたゲノム核酸分子は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含むか、または配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置におけるアデニンを含むか、または配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置におけるアデニンを含むか、または配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む。
【0255】
ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号４に記載されている。配列番号４に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の５２９位は、シトシンである。配列番号４に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の５２５位は、グアニンである。配列番号４に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の４８１位は、ウラシルである。配列番号４に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の５６３位は、グアニンである。配列番号４に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｍＲＮＡ分子の５７４位は、アデニンである。
【0256】
ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子が存在し、（配列番号４に記載の参照ｍＲＮＡ配列に関して）５２９位におけるシトシンがウラシルに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号５に記載されている。
【0257】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｍＲＮＡ分子が存在し、（配列番号４に記載の参照ｍＲＮＡ配列に関して）５２５位におけるグアニンがウラシルに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号６に記載されている。
【0258】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｍＲＮＡ分子が存在し、（配列番号４に記載の参照ｍＲＮＡ配列に関して）４８１位におけるウラシルがアデニンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３５に記載されている。
【0259】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｍＲＮＡ分子が存在し、（配列番号４に記載の参照ｍＲＮＡ配列に関して）５６３位におけるグアニンがアデニンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３６に記載されている。
【0260】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｍＲＮＡ分子が存在し、（配列番号４に記載の参照ｍＲＮＡ配列に関して）５７４位におけるアデニンがシトシンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３７に記載されている。
【0261】
本開示は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子を提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置にＵＧＡコドンを含む。
【0262】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0263】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＵＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＵＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＵＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＵＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＵＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号５に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＵＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0264】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置にＣＡＵコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置にＣＡＵコドンを含む。
【0265】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２５位に対応する位置におけるウラシル、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0266】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＵコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＵコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＵコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＵコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＵコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号６に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＵコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0267】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号６からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置にＡＵＣコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置にＡＵＣコドンを含む。
【0268】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0269】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＵＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＵＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＵＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＵＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＵＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３５に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＵＣコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0270】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３５からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置にＵＡＧコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置にＵＡＧコドンを含む。
【0271】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0272】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＵＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＵＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＵＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＵＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＵＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３６に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＵＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0273】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３６からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置にＣＡＧコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｍＲＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置にＣＡＧコドンを含む。
【0274】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0275】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３７に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0276】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号１３７からなる。
ｍＲＮＡ分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ｍＲＮＡ分子は、ヒト、または非ヒト哺乳類、げっ歯類、マウス、もしくはラット等の別の生物からのオルソログであり得る。集団内でのｍＲＮＡ配列は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供される例は、例示的配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
ｍＲＮＡ分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ｍＲＮＡ分子は、ヒト、または非ヒト哺乳類、げっ歯類、マウス、もしくはラット等の別の生物からのオルソログであり得る。集団内でのｍＲＮＡ配列は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供される例は、例示的配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
【0277】
いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、ｍＲＮＡ配列全体よりも少ない配列を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５、配列番号６、配列番号１３５、配列番号１３６、及び／または配列番号１３７のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１２、少なくとも約１５、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約９０、少なくとも約１００、少なくとも約２００、少なくとも約３００、少なくとも約４００、もしくは少なくとも約５００連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５、配列番号６、配列番号１３５、配列番号１３６、及び／または配列番号１３７のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約４００から少なくとも約５００連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、これらの単離されたｍＲＮＡ分子は、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含むか、または配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含むか、または配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む。
【0278】
ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号７に記載されている。配列番号７に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の５２９位は、シトシンである。配列番号７に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の５２５位は、グアニンである。配列番号７に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の４８１位は、チミンである。配列番号７に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の５６３位は、グアニンである。配列番号７に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ｃＤＮＡ分子の５７４位は、アデニンである。
【0279】
ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子が存在し、（配列番号７に記載の参照ｃＤＮＡ配列に関して）５２９位におけるシトシンがチミンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号８に記載されている。
【0280】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｃＤＮＡ分子が存在し、（配列番号７に記載の参照ｃＤＮＡ配列に関して）５２５位におけるグアニンがチミンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号９に記載されている。
【0281】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｃＤＮＡ分子が存在し、（配列番号７に記載の参照ｃＤＮＡ配列に関して）４８１位におけるチミンがアデニンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３８に記載されている。
【0282】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｃＤＮＡ分子が存在し、（配列番号７に記載の参照ｃＤＮＡ配列に関して）５６３位におけるグアニンがアデニンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３９に記載されている。
【0283】
ＡＮＧＰＴＬ７の別の変異体ｃＤＮＡ分子が存在し、（配列番号７に記載の参照ｃＤＮＡ配列に関して）５７４位におけるアデニンがシトシンに置き換えられる。このＡＮＧＰＴＬ７の変異体ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１４０に記載されている。
【0284】
本開示は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子を提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置にＴＧＡコドンを含む。
【0285】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0286】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号８に従った５２９～５３１位に対応する位置におけるＴＧＡコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0287】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置にＣＡＴコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置にＣＡＴコドンを含む。
【0288】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２５位に対応する位置におけるチミン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0289】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号９に従った５２３～５２５位に対応する位置におけるＣＡＴコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0290】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置にＡＴＣコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置にＡＴＣコドンを含む。
【0291】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0292】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３８に従った４８１～４８３位に対応する位置におけるＡＴＣコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0293】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置にＴＡＧコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置にＴＡＧコドンを含む。
【0294】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置におけるアデニン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0295】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１３９に従った５６２～５６４位に対応する位置におけるＴＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0296】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９からなる。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置にＣＡＧコドンを含む。
本開示はまた、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなる単離されたｃＤＮＡ分子も提供し、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列からなり、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、またはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、かかるヌクレオチド配列は、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置にＣＡＧコドンを含む。
【0297】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置におけるシトシン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0298】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、もしくは少なくとも約９９％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９０％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９２％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９４％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９６％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に対する配列同一性が少なくとも約９８％であるヌクレオチド配列を含むかまたはそれからなり、配列番号１４０に従った５７４～５７６位に対応する位置におけるＣＡＧコドン、もしくはその相補体を含む。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0299】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０からなる。
ｃＤＮＡ分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ｃＤＮＡ分子は、ヒト、または非ヒト哺乳類、げっ歯類、マウス、もしくはラット等の別の生物からのオルソログであり得る。集団内でのｃＤＮＡ配列は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供される例は、例示的配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
ｃＤＮＡ分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ｃＤＮＡ分子は、ヒト、または非ヒト哺乳類、げっ歯類、マウス、もしくはラット等の別の生物からのオルソログであり得る。集団内でのｃＤＮＡ配列は、一塩基多型等の多型のために異なり得ると理解される。本明細書で提供される例は、例示的配列にすぎない。他の配列もまた可能である。
【0300】
いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、ｃＤＮＡ配列全体よりも少ない配列を含む。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８、配列番号９、配列番号１３８、配列番号１３９、及び／または配列番号１３９のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１２、少なくとも約１５、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約９０、少なくとも約１００、少なくとも約２００、少なくとも約３００、少なくとも約４００、もしくは少なくとも約５００連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８、配列番号９、配列番号１３８、配列番号１３９、及び／または配列番号１３９のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約４００から少なくとも約５００連続するヌクレオチドを含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、これらの単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む。いくつかの実施形態では、これらの単離されたｃＤＮＡ分子は、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む。
【0301】
本開示はまた、本明細書に開示される単離された、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子のいずれかの断片も提供する。いくつかの実施形態では、断片は、本明細書に開示される核酸分子のいずれかの、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１１、少なくとも約１２、少なくとも約１３、少なくとも約１４、少なくとも約１５、少なくとも約１６、少なくとも約１７、少なくとも約１８、少なくとも約１９、少なくとも約２０、少なくとも約２１、少なくとも約２２、少なくとも約２３、少なくとも約２４、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約５５、少なくとも約６０、少なくとも約６５、少なくとも約７０、少なくとも約７５、少なくとも約８０、少なくとも約８５、少なくとも約９０、少なくとも約９５、もしくは少なくとも約１００連続する残基、もしくはその任意の相補体を含むかまたはそれからなる。これに関して、より長い断片が短いものよりも好ましい。
【0302】
いくつかの実施形態では、断片は、本明細書に開示される核酸分子のいずれかの、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、もしくは少なくとも約３５連続する残基、もしくはその任意の相補体を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、断片は、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分、または配列番号５もしくは配列番号８に従った５２９位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、断片は、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分、または配列番号６もしくは配列番号９に従った５２５位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、断片は、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分、または配列番号１３５もしくは配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、断片は、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分、または配列番号１３６もしくは配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、断片は、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分、または配列番号１３７もしくは配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置が含まれる核酸分子の部分を含むかまたはそれからなる。そのような断片は、例えば、本明細書に記載もしくは例示される、プローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用され得、これには、各々が本明細書の他の箇所で詳述されているプライマー、プローブ、アンチセンスＲＮＡ、ｓｈＲＮＡ、及びｓｉＲＮＡが限定されることなく含まれる。
【0303】
本明細書ではまた、開示されている核酸分子と相互作用することができる機能性ポリヌクレオチドも提供する。機能性ポリヌクレオチドは、標的分子と結合するかまたは特定の反応を触媒する等、特定の機能を有する核酸分子である。機能性ポリヌクレオチドの例としては、アンチセンス分子、アプタマー、リボザイム、三本鎖形成分子、及び外部ガイド配列が挙げられるが、これらに限定されない。機能性ポリヌクレオチドは、標的分子の持つ特定の活性の、エフェクター、阻害剤、調節因子、及び刺激物質として作用することができるか、または機能性ポリヌクレオチドは、他のいかなる分子とも独立して、デノボ活性を持つことができる。
【0304】
本明細書に開示される単離された核酸分子は、ＲＮＡ、ＤＮＡ、またはＲＮＡとＤＮＡの両方を含むことができる。単離された核酸分子はまた、ベクター内、または異種標識等、異種核酸配列と連結または融合され得る。例えば、本明細書に開示される単離された核酸分子は、ベクター内部にあるか、または単離された核酸分子と異種核酸配列とを含む外因性ドナー配列であり得る。単離された核酸分子はまた、蛍光標識等の異種標識と連結または融合され得る。
【0305】
標識は、直接検出可能である（例えば、フルオロフォア等）か、または間接的に検出可能である（例えば、ハプテン、酵素、またはフルオロフォアクエンチャー等）。そのような標識は、分光学的、光化学、生化学的、免疫化学的、または化学的な手段によって検出可能であり得る。そのような標識としては、例えば、放射能標識体、色素（ｐｉｇｍｅｎｔ）、色素（ｄｙｅ）、色素原、スピン標識、及び蛍光標識が挙げられる。標識は、例えば、化学発光物質、金属含有物質、または酵素でもあり得、酵素の場合、酵素依存性の二次的シグナル発生が生じる。用語「標識」はまた、複合体化分子に選択的に結合することができ、その複合体化分子が、後で基質と共に加えた際に検出可能なシグナルを発生させるために使用されるようにする「タグ」またはハプテンを指し得る。例えば、ビオチンは、タグとして、西洋ワサビペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）のアビジン複合体またはストレプトアビジン複合体と共に使用して、このタグに結合させ、ＨＲＰの存在を検出するために、発色基質（例えば、テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ等））または蛍光発光性基質を使用して調べることができる。精製を容易にするためにタグとして使用できる例示的標識としては、ｍｙｃ、ＨＡ、ＦＬＡＧまたは３ＸＦＬＡＧ、６ＸＨｉｓもしくはポリヒスチジン、グルタチオンＳ－転移酵素（ＧＳＴ）、マルトース結合タンパク質、エピトープタグ、または免疫グロブリンのＦｃ部分が挙げられるが、これらに限定されない。多くの標識としては、例えば、粒子、フルオロフォア、ハプテン、酵素ならびに酵素の発色基質、蛍光発光性基質及び化学発光基質ならびに他の標識が含まれる。
【0306】
開示されている核酸分子は、例えば、ヌクレオチド類似体または代用ヌクレオチド等のヌクレオチドまたは非天然もしくは修飾されたヌクレオチドを含むことができる。そのようなヌクレオチドには、修飾された塩基、糖、もしくはリン酸基を含有するか、またはその構造に非天然部分が組み込まれたヌクレオチドが含まれる。非天然ヌクレオチドの例としては、ジデオキシヌクレオチド、ビオチン化ヌクレオチド、アミノ化ヌクレオチド、脱アミノ化ヌクレオチド、アルキル化ヌクレオチド、ベンジル化ヌクレオチド、及びフルオロフォア標識化ヌクレオチドが挙げられるが、これらに限定されない。
【0307】
本明細書に開示する核酸分子は、１つ以上のヌクレオチド類似体または置換を含むこともできる。ヌクレオチド類似体は、塩基部分、糖部分、またはリン酸塩部分のいずれかに対する修飾を含有するヌクレオチドである。塩基部分に対する修飾としては、Ａ、Ｃ、Ｇ、及びＴ／Ｕ、ならびに様々なプリン塩基またはピリミジン塩基、例えば、プソイドウリジン、ウラシル－５－イル、ヒポキサンチン－９－イル（Ｉ）、及び２－アミノアデニン－９－イル等の、天然及び合成による修飾が挙げられるが、これらに限定されない。修飾塩基としては、５－メチルシトシン（５－ｍｅ－Ｃ）、５－ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２－アミノアデニン；アデニン及びグアニンの６－メチル及び他のアルキル誘導体；アデニン及びグアニンの２－プロピル及び他のアルキル誘導体；２－チオウラシル、２－チオチミン及び２－チオシトシン；５－ハロウラシル及び５－ハロシトシン；５－プロピニルウラシル及び５－プロピニルシトシン；６－アゾウラシル、６－アゾシトシン及び６－アゾチミン；５－ウラシル（プソイドウラシル）、４－チオウラシル；８－ハロ、８－アミノ、８－チオール、８－チオアルキル、８－ヒドロキシル及び他の８－置換のアデニン及びグアニン；５－ハロ（例えば、５－ブロモ等）、５－トリフルオロメチル及び他の５－置換のウラシル及びシトシン；７－メチルグアニン、７－メチルアデニン、８－アザグアニン、８－アザアデニン、７－デアザグアニン、７－デアザアデニン、３－デアザグアニン、及び３－デアザアデニンが挙げられるが、これらに限定されない。
【0308】
ヌクレオチド類似体にはまた、糖部分の修飾も含まれ得る。糖部分に対する修飾としては、リボース及びデオキシリボースの天然修飾ならびに合成修飾が挙げられるが、これらに限定されない。糖修飾としては、２’位における、ＯＨ；Ｆ；Ｏ－、Ｓ－、もしくはＮ－アルキル；Ｏ－、Ｓ－、もしくはＮ－アルケニル；Ｏ－、Ｓ－もしくはＮ－アルキニル；またはＯ－アルキル－Ｏ－アルキルという修飾であって、アルキル、アルケニル、及びアルキニルが、置換または非置換の、Ｃ１～１０アルキルもしくはＣ２～１０アルケニル、及びＣ２～１０アルキニルであり得る修飾が挙げられるが、これらに限定されない。例示的２’糖修飾としてはまた、ｎ及びｍが１～約１０である、－Ｏ［（ＣＨ２）ｎＯ］ｍＣＨ３、－Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＣＨ３、－Ｏ（ＣＨ２）ｎＮＨ２、－Ｏ（ＣＨ２）ｎＣＨ３、－Ｏ（ＣＨ２）ｎ－ＯＮＨ２、及び－Ｏ（ＣＨ２）ｎＯＮ［（ＣＨ２）ｎＣＨ３）］２も挙げられるが、これらに限定されない。２’位における他の修飾としては、Ｃ１～１０アルキル、置換された低級のアルキル、アルカリール、アラルキル、Ｏ－アルカリールもしくはＯ－アラルキル、ＳＨ、ＳＣＨ３、ＯＣＮ、Ｃｌ、Ｂｒ、ＣＮ、ＣＦ３、ＯＣＦ３、ＳＯＣＨ３、ＳＯ２ＣＨ３、ＯＮＯ２、ＮＯ２、Ｎ３、ＮＨ２、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換シリル、ＲＮＡ切断基、レポーター基、インターカレーター、オリゴヌクレオチドの薬物動態学的特性を改善するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改善するための基、及び同様の特性を有する他の置換基が挙げられるが、これらに限定されない。同様の修飾はまた、糖の他の位置、特に、３’末端ヌクレオチド上または２’－５’で結合したオリゴヌクレオチド内の糖の３’位、及び５’末端ヌクレオチドの５’位でも行われ得る。修飾糖には、ＣＨ２及びＳ等、環の架橋酸素での修飾を含有するものも含まれ得る。ヌクレオチド糖類似体はまた、ペントフラノシル糖に代わるシクロブチル部分等の糖模倣物を有し得る。
【0309】
ヌクレオチド類似体はまた、リン酸塩部分でも修飾され得る。修飾リン酸塩部分としては、２つのヌクレオチド間の結合が、ホスホロチオアート、キラルホスホロチオアート、ホスホロジチオアート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチル及び他のアルキルホスホナート（３’－アルキレンホスホナート及びキラルホスホナートを含む）、ホスフィナート、ホスホロアミダート（３’－アミノホスホロアミダート及びアミノアルキルホスホロアミダートを含む）、チオノホスホロアミダート、チオノアルキルホスホロアミダート、チオノアルキルホスホトリエステル、及びボラノホスファートを含有するよう修飾され得るものが挙げられるが、これらに限定されない。２つのヌクレオチド間のこれらのリン酸塩または修飾リン酸塩の結合は、３’－５’の結合または２’－５’の結合であり得、結合は、３’－５’が５’－３’に、または２’－５’が５’－２’にというように、逆の極性を含有し得る。様々な塩、混合塩、及び遊離酸形態も含まれ得る。代用ヌクレオチドとしては、ペプチド核酸（ＰＮＡ）も挙げられる。
【0310】
本開示はまた、本明細書に開示される核酸分子のうちのいずれか１つ以上を含むベクターも提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、本明細書に開示される核酸分子のうちのいずれか１つ以上及び異種核酸を含む。ベクターは、核酸分子を輸送することができるウイルスベクターまたは非ウイルスベクターであり得る。いくつかの実施形態では、ベクターは、プラスミドまたはコスミドである（例えば、中に追加のＤＮＡセグメントを連結することができる環状二本鎖ＤＮＡ等）。いくつかの実施形態では、ベクターはウイルスベクターであり、追加のＤＮＡセグメントは、ウイルスゲノム内に連結され得る。発現ベクターとしては、プラスミド、コスミド、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、植物ウイルス（カリフラワーモザイクウィルス及びタバコモザイクウイルス等）、酵母人工染色体（ＹＡＣ）、エプスタイン－バー（ＥＢＶ）由来エピソーム、及び当該技術分野で公知の他の発現ベクターが挙げられるが、これらに限定されない。
【0311】
哺乳類宿主細胞発現に所望される制御配列には、例えば、レトロウイルスＬＴＲ、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）（例えば、ＣＭＶプロモーター／エンハンサー等）、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）（例えば、ＳＶ４０プロモーター／エンハンサー等）、アデノウイルス、（例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター（ＡｄＭＬＰ等））、ポリオーマに由来するプロモーター及び／またはエンハンサー等、哺乳類細胞での高レベルのポリペプチド発現を導くウイルス要素、ならびに天然免疫グロブリン及びアクチンプロモーター等の強い哺乳類プロモーターが含まれ得る。細菌細胞または真菌細胞（例えば、酵母細胞等）でポリペプチドを発現させる方法も周知である。プロモーターは、例えば、構成的活性型プロモーター、条件付きプロモーター、誘導性プロモーター、時間的に制限されたプロモーター（例えば、発生が調節されたプロモーター等）、または空間的に制限されたプロモーター（例えば、細胞特異的または組織特異的なプロモーター等）であり得る。
【0312】
核酸分子内のヌクレオチド配列またはポリペプチド内のアミノ酸配列の特定ストレッチ同士の同一性パーセント（または相補性パーセント）は、ＢＬＡＳＴプログラム（塩基局所アラインメント検索ツール）及びＰｏｗｅｒＢＬＡＳＴプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９９０，２１５，４０３－４１０、Ｚｈａｎｇ ａｎｄ Ｍａｄｄｅｎ，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ．，１９９７，７，６４９－６５６）を使用するか、またはＳｍｉｔｈ ａｎｄ Ｗａｔｅｒｍａｎのアルゴリズム（Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．，１９８１，２，４８２－４８９）を使用するＧＡＰプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｖｅｒｓｉｏｎ ８ ｆｏｒ Ｕｎｉｘ，Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐａｒｋ，Ｍａｄｉｓｏｎ Ｗｉｓ．）をデフォルト設定で使用することによって日常的に決定することができる。本明細書では、配列同一性パーセントについて言及する場合、配列同一性はパーセンテージの低いものより高いものが好ましい。
【0313】
本開示はまた、本明細書に開示される単離された核酸分子、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子のうちのいずれか１つ以上を含む組成物も提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、医薬組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、担体及び／または添加剤を含む。担体の例としては、ポリ乳酸（ＰＬＡ）ミクロスフェア、Ｄ，Ｌ－乳酸・グリコール酸共重合体（ＰＬＧＡ）ミクロスフェア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、脂質コクリエート（ｃｏｃｈｌｅａｔｅ）、及び脂質微小管が挙げられるが、これらに限定されない。担体は、ＰＢＳ、ＨＢＳＳ等のような緩衝塩溶液を含み得る。
【0314】
ＡＮＧＰＴＬ７の参照ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１０に記載されている。配列番号１０に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の参照ポリペプチドは、長さが３４６アミノ酸である。配列番号１０に関して、１７５位はグルタミンである。配列番号１０に関して、１７７位はアルギニンである。配列番号１０に関して、１６１位はフェニルアラニンである。配列番号１０に関して、１８８位はトリプトファンである。配列番号１０に関して、１９２位はリジンである。
【0315】
ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドが存在し（ｐ．Ａｒｇ１７７ＳｔｏｐまたはＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）、そのアミノ酸配列は配列番号１１に記載されている。配列番号１１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドは、長さが１７６アミノ酸である。配列番号１１に関して、１７７位は、１７６位での切断のため存在しない。
【0316】
別のＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドが存在し（Ｇｌｎ１７５ＨｉｓまたはＱ１７５Ｈ）、そのアミノ酸配列は配列番号１２に記載されている。配列番号１２に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドは、長さが３４６アミノ酸である。配列番号１２に関して、１７５位はヒスチジンである。
【0317】
別のＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドが存在し（Ｐｈｅ１６１ＩｌｅまたはＦ１６１Ｉ）、そのアミノ酸配列は配列番号１４１に記載されている。配列番号１４１に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドは、長さが３４６アミノ酸である。配列番号１４１に関して、１６１位はイソロイシンである。
【0318】
別のＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドが存在し（ｐ．Ｔｒｐ１８８ＳｔｏｐまたはＴｒｐ１８８Ｓｔｏｐ）、そのアミノ酸配列は配列番号１４２に記載されている。配列番号１４２に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドは、長さが１８７アミノ酸である。配列番号１４２に関して、１８７位はアスパラギン酸である。この変異体は、参照型のｍＲＮＡ分子またはｃＤＮＡ分子（ｍＲＮＡ及びｃＤＮＡの参照配列についてはそれぞれ、配列番号４及び配列番号７を参照のこと）の５６３位における、グアニンのアデニンによる置き換えの結果である。
【0319】
別のＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドが存在し（Ｌｙｓ１９２ＧｌｎまたはＫ１９２Ｑ）、そのアミノ酸配列は配列番号１４３に記載されている。配列番号１４３に関して、ＡＮＧＰＴＬ７の変異体ポリペプチドは、長さが３４６アミノ酸である。配列番号１４３に関して、１９２位はグルタミンである。
【0320】
本開示は、配列番号１１と少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％同一なアミノ酸配列を有し、かつ、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１１と少なくとも約９０％同一であり、かつ、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１１と少なくとも約９２％同一であり、かつ、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１１と少なくとも約９４％同一であり、かつ、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１１と少なくとも約９６％同一であり、かつ、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１１と少なくとも約９８％同一であり、かつ、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。
【0321】
いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１１を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１１からなる。
【0322】
本開示はまた、配列番号１２と少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％同一なアミノ酸配列を有し、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも約９０％同一であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも約９２％同一であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも約９４％同一であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも約９６％同一であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１２と少なくとも約９８％同一であり、かつ、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む、アミノ酸配列を有する。
【0323】
いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１２を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１２からなる。
【0324】
本開示はまた、配列番号１４１と少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％同一なアミノ酸配列を有し、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４１と少なくとも約９０％同一であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４１と少なくとも約９２％同一であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４１と少なくとも約９４％同一であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４１と少なくとも約９６％同一であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４１と少なくとも約９８％同一であり、かつ、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む、アミノ酸配列を有する。
【0325】
いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１４１を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１４１からなる。
【0326】
本開示はまた、配列番号１４２と少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％同一なアミノ酸配列を有し、かつ、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４２と少なくとも約９０％同一であり、かつ、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４２と少なくとも約９２％同一であり、かつ、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４２と少なくとも約９４％同一であり、かつ、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４２と少なくとも約９６％同一であり、かつ、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４２と少なくとも約９８％同一であり、かつ、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する、アミノ酸配列を有する。
【0327】
いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１４２を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１４２からなる。
【0328】
本開示はまた、配列番号１４３と少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、または少なくとも約９９％同一なアミノ酸配列を有し、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドも提供する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４３と少なくとも約９０％同一であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４３と少なくとも約９２％同一であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４３と少なくとも約９４％同一であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４３と少なくとも約９６％同一であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む、アミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドは、配列番号１４３と少なくとも約９８％同一であり、かつ、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む、アミノ酸配列を有する。
【0329】
いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１４３を含む。いくつかの実施形態では、単離されたヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号１４３からなる。
【0330】
いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４１、配列番号１４２、及び／または配列番号１４３のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約１５、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約９０、少なくとも約１００、少なくとも約１５０、少なくとも約２００、少なくとも約２５０、少なくとも約３００、少なくとも約３５０、少なくとも約４００、少なくとも約４５０、少なくとも約５００、少なくとも約５５０、もしくは少なくとも約６００連続するアミノ酸を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む。
【0331】
いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４１、配列番号１４２、及び／または配列番号１４３のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１５、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約９０、少なくとも約１００、少なくとも約１５０、少なくとも約２００、少なくとも約２５０、少なくとも約３００、少なくとも約３５０、少なくとも約４００、少なくとも約４５０、少なくとも約５００、少なくとも約５５０、もしくは少なくとも約６００連続するアミノ酸と、少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一なアミノ酸配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む。
【0332】
いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１１、配列番号１２、配列番号１４１、配列番号１４２、及び／または配列番号１４３のうちのいずれか１つ以上の、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１５、少なくとも約２０、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約９０、少なくとも約１００、少なくとも約１５０、少なくとも約２００、少なくとも約２５０、少なくとも約３００、少なくとも約３５０、少なくとも約４００、少なくとも約４５０、少なくとも約５００、少なくとも約５５０、もしくは少なくとも約６００連続するアミノ酸と、少なくとも約９０％、少なくとも約９１％、少なくとも約９２％、少なくとも約９３％、少なくとも約９４％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、もしくは１００％同一なアミノ酸配列を含むかまたはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含む。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止する。いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含む。
【0333】
本明細書に開示される単離されたポリペプチドは、天然に存在するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドのアミノ酸配列を含むことができ、また天然には存在しない配列を含むこともできる。いくつかの実施形態では、天然に存在する配列は、保存的アミノ酸置換のために、天然には存在しない配列とは異なり得る。例えば、配列は、保存的アミノ酸置換を除いて同一であり得る。
【0334】
いくつかの実施形態では、単離されたポリペプチドは、非天然または修飾された、アミノ酸またはペプチド類似体を含む。例えば、天然に存在するアミノ酸よりも多数の、Ｄ－アミノ酸または異なる官能性置換基を有するアミノ酸がある。
【0335】
本開示はまた、本明細書に開示されるポリペプチドのいずれかをコードする核酸分子も提供する。これには、特定のポリペプチド配列に関連する、あらゆる縮重配列が含まれる（すなわち、１つの特定のポリペプチド配列をコードする配列を有するあらゆる核酸、ならびに開示されている変異体型及びそのタンパク質配列の誘導体をコードする、縮重核酸も含めたあらゆる核酸）。したがって、それぞれの特定の核酸配列がもれなく本明細書で記載されない場合があるが、事実上、個別かつすべての配列が、開示されているポリペプチド配列を介して本明細書に開示され、かつ、記載される。
【0336】
本開示はまた、核酸分子のいずれか１つ以上及び／または本明細書に開示するポリペプチドのいずれか１つ以上を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、担体を含む。担体の例としては、ポリ乳酸（ＰＬＡ）ミクロスフェア、Ｄ，Ｌ－乳酸・グリコール酸共重合体（ＰＬＧＡ）ミクロスフェア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、脂質コクリエート、及び脂質微小管が挙げられるが、これらに限定されない。
【0337】
本開示はまた、本明細書に開示されるＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドまたはその断片のいずれかを生成する方法も提供する。そのようなＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドまたはその断片は、任意の好適な方法により生成することができる。
【0338】
本開示はまた、本明細書に開示される核酸分子のうちのいずれか１つ以上及び／またはポリペプチドのうちのいずれか１つ以上を含む細胞も提供する。細胞は、インビトロ、エキソビボ、またはインビボであり得る。核酸分子は、それらが発現され、コードされたタンパク質が生成されるよう、プロモーター及び他の制御配列に連結させることができる。
【0339】
いくつかの実施形態では、細胞は、例えば、げっ歯類ＥＳ細胞、マウスＥＳ細胞、またはラットＥＳ細胞等の胚性幹（ＥＳ）細胞のような全能性細胞または多能性細胞である。いくつかの実施形態では、細胞は、初代体細胞であるか、または初代体細胞ではない細胞である。細胞は、どの供給源からのものでも可能である。例えば、細胞は、真核細胞、動物細胞、植物細胞、または真菌（例えば、酵母等）細胞であり得る。そのような細胞は、魚類細胞もしくは鳥類細胞であり得、またはそのような細胞は、ヒト細胞、非ヒト哺乳類細胞、げっ歯類細胞、マウス細胞もしくはラット細胞等の哺乳類細胞でもあり得る。哺乳類としては、ヒト、非ヒト霊長類、サル、類人猿、ネコ、イヌ、ウマ、雄ウシ、シカ、バイソン、ヒツジ、げっ歯類（例えば、マウス、ラット、ハムスター、モルモット等）、家畜（例えば、雌ウシ、去勢雄ウシ等のようなウシ種；ヒツジ、ヤギ等のようなヒツジ種；及びブタ及び雄ブタ等のようなブタ種）が挙げられるが、これらに限定されない。用語「非ヒト動物」では、ヒトは除外される。
【0340】
添付の配列表に記載されているヌクレオチド及びアミノ酸配列は、ヌクレオチド塩基では標準的な文字の略号を、またアミノ酸では３文字表記を使用して示されている。ヌクレオチド配列は、配列の５’末端から始まり３’末端へ向けて（すなわち、各ラインで左から右へ）進行するという標準的な慣例に従っている。各ヌクレオチド配列の１本の鎖のみが示されているが、表示されている鎖へのいかなる言及によってもその相補鎖が含まれると理解される。アミノ酸配列は、配列のアミノ末端から始まりカルボキシ末端へ向けて（すなわち、各ラインの左から右へ）進行するという標準的な慣例に従っている。
【0341】
本明細書で使用される場合、語句「に対応する」またはその文法的変異形は、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列または位置の番号付けとの関連において使用される場合、かかる特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列が、ある参照配列（例えば、配列番号１、配列番号４、または配列番号７等）と比較される際の、指定の参照配列の番号付けを指す。言い換えれば、特定のポリマーの残基（例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸等）の番号または残基（例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸等）の位置は、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列の内部における残基の実際の数字的位置ではなく、参照配列に関して指定される。例えば、特定のヌクレオチド配列は、２配列間の残基の一致を最適化するためにギャップを導入することにより、参照配列に対して整列させることができる。これらの場合、ギャップが存在しても、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列における残基の番号付けは、整列させてある参照配列に関して行われる。
【0342】
例えば、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む核酸分子は、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列を配列番号２の配列に対して整列させた場合に、ＡＮＧＰＴＬ７の配列が、配列番号２の４，２９１位に対応する位置にチミン残基を有することを意味する。同じことは、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含むｍＲＮＡ分子、及びヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含むｃＤＮＡ分子にも当てはまる。言い換えれば、これらの語句は、ＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードする核酸分子であって、ゲノム核酸分子が、配列番号２の４，２９１位におけるチミン残基と相同なチミン残基を含むヌクレオチド配列を有するもの（またはｍＲＮＡ分子が、配列番号５の５２９位におけるウラシル残基と相同なウラシル残基を含むヌクレオチド配列を有するもの、またはｃＤＮＡ分子が、配列番号８の５２９位におけるチミン残基と相同なチミン残基を含むヌクレオチド配列を有するもの）を指す。本明細書では、そのような配列は、ゲノム核酸分子に言及して「Ｃ４，２９１Ｔ変化のあるＡＮＧＰＴＬ７配列」または「Ｃ４，２９１Ｔ変異のあるＡＮＧＰＴＬ７配列」（またはｍＲＮＡ分子に言及して「Ｃ５２９Ｕ変化のあるＡＮＧＰＴＬ７配列」もしくは「Ｃ５２９Ｕ変異のあるＡＮＧＰＴＬ７配列」、及びｃＤＮＡ分子に言及して「Ｃ５２９Ｔ変化のあるＡＮＧＰＴＬ７配列」もしくは「Ｃ５２９Ｔ変異のあるＡＮＧＰＴＬ７配列」）とも呼ばれる。
【0343】
本明細書に記載される、配列番号２に従った４，２９１位に対応する、ＡＮＧＰＴＬ７ゲノム核酸分子内での位置は、特定のＡＮＧＰＴＬ７核酸分子のヌクレオチド配列と、配列番号２のヌクレオチド配列との間で配列アラインメントを実施することによって同定することができる。例えば、配列番号２における４，２９１位に対応する、ヌクレオチドの位置を同定するための配列アラインメントを実施するのに使用することができる様々な計算アルゴリズムが存在する。例えば、ＮＣＢＩ ＢＬＡＳＴアルゴリズム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９７，２５，３３８９－３４０２）またはＣＬＵＳＴＡＬＷソフトウェア（Ｓｉｅｖｅｒｓ ａｎｄ Ｈｉｇｇｉｎｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２０１４，１０７９，１０５－１１６）を使用することによって配列のアラインメントを実施してよい。しかしながら、配列は、手作業で整列させることもできる。
【0344】
本開示はまた、ヒト対象における眼疾患の治療での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0345】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0346】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患の治療での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0347】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２に従った４，２９１位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号５に従った５２９位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号８に従った５２９位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１１に従った１７６位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0348】
本開示はまた、ヒト対象における眼疾患の治療での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0349】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0350】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患の治療での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0351】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３に従った４，２８７位に対応する位置にチミンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号６に従った５２５位に対応する位置にウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号９に従った５２５位に対応する位置にチミンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１２に従った１７５位に対応する位置にヒスチジンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0352】
本開示はまた、ヒト対象における眼疾患の治療での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0353】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0354】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患の治療での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0355】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３２に従った４，２４３位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３５に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３８に従った４８１位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４１に従った１６１位に対応する位置にイソロイシンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0356】
本開示はまた、ヒト対象における眼疾患の治療での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0357】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0358】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患の治療での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0359】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３３に従った４，３２５位に対応する位置にアデニンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３６に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３９に従った５６３位に対応する位置にアデニンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４２に従った１８７位に対応する位置にて終止するＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0360】
本開示はまた、ヒト対象における眼疾患の治療での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0361】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のための、眼疾患を治療または阻害する治療剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。眼疾患を治療または阻害する治療剤は、本明細書に記載される眼疾患を治療または阻害する治療剤のいずれでもあり得る。
【0362】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患の治療での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0363】
本開示はまた、ヒト対象の眼疾患を治療するための医薬品の調製での使用のためのＡＮＧＰＴＬ７阻害剤も提供し、ここで、ヒト対象は、ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３４に従った４，３３６位に対応する位置にシトシンを含む、ゲノム核酸分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３７に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｍＲＮＡ分子、もしくはその相補体；ヒトＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１４０に従った５７４位に対応する位置にシトシンを含む、ｃＤＮＡ分子、もしくはその相補体；または配列番号１４３に従った１９２位に対応する位置にグルタミンを含むＡＮＧＰＴＬ７ポリペプチドを有する。ＡＮＧＰＴＬ７阻害剤は、本明細書に記載されるＡＮＧＰＴＬ７阻害剤のいずれでもあり得る。
【0364】
上記または以下で引用されている特許文献、ウェブサイト、他の刊行物、受託番号等はいずれも、個々の項目各々が、あらゆる目的のためにその全体が参照により組み込まれることが具体的かつ個別に示されているかの如く同程度に、そのように参照により組み込まれる。ある配列の別バージョンが異なる時期の受託番号と関連している場合は、本出願の有効出願日における受託番号と関連するバージョンが意図される。有効出願日とは、該当する場合、実際の出願日または受託番号に言及している優先権主張出願の出願日のうちいずれか早い方を意味する。同様に、刊行物、ウェブサイト等の別バージョンが異なる時期に公開されている場合、別段に示されていない限り、出願の有効出願日の直近に公開されているバージョンが意図される。本開示のいかなる特徴、ステップ、要素、実施形態、または態様も、別段に具体的に示されていない限り、他の任意の特徴、ステップ、要素、実施形態、または態様と組み合わせて使用することができる。本開示を、明確化及び理解を目的として、例示及び例としてある程度詳述してきたが、特定の変更及び改変が添付の特許請求の範囲内で実施され得ることは明らかであろう。
【0365】
以下の実施例は、実施形態をより詳細に説明するために提供される。これらは、特許請求する実施形態を例示することを意図しており、限定することを意図していない。以下の実施例は、本明細書に記載される化合物、組成物、物品、装置及び／または方法がどのように為され、評価されるかについての開示及び説明を当業者提供するものであり、単に例示的であることが意図され、いかなる特許請求の範囲も限定することは意図されない。数字（例えば、量、温度等）に関し、正確さを保証するべく努められているが、ある程度の誤差及び偏差が考慮され得る。別段に示されていない限り、部は、重量部であり、温度は、℃または雰囲気温度であり、圧力は、大気圧または大気圧近傍である。
【実施例0366】
実施例１：エクソームシーケンシング解析
ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ（ＵＫＢ）の５０Ｋのエクソームのデータセットと併せたＲｅｇｅｎｅｒｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｅｎｔｅｒにおけるエクソームシーケンシングと解析により、推定機能喪失型変異体であるｐ．Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐが、ＩＯＰ低下と大きく関連することが特定された（表１０）。表１１は、ＡＮＧＰＴＬ７内の全ｐＬＯＦ（アレル頻度≦１％）の集合であるＭ１マスクと、ＩＯＰとの関連を示す。この結果は、表１０に示される単一変異体ｐＬＯＦの関連を支持しており、２９例中２７例のキャリアが表１０に示すｐ．Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体を有している。
ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ（ＵＫＢ）の５０Ｋのエクソームのデータセットと併せたＲｅｇｅｎｅｒｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｅｎｔｅｒにおけるエクソームシーケンシングと解析により、推定機能喪失型変異体であるｐ．Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐが、ＩＯＰ低下と大きく関連することが特定された（表１０）。表１１は、ＡＮＧＰＴＬ７内の全ｐＬＯＦ（アレル頻度≦１％）の集合であるＭ１マスクと、ＩＯＰとの関連を示す。この結果は、表１０に示される単一変異体ｐＬＯＦの関連を支持しており、２９例中２７例のキャリアが表１０に示すｐ．Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体を有している。
【0367】
【表10】
【0368】
【表11】
【0369】
Ｇｅｉｓｉｎｇｅｒ Ｈｅａｌｔｈ Ｓｙｓｔｅｍの６０ｋ（ＧＨＳ６０ｋ）、ＧＨＳ３０ｋ及び／またはＵＫＢと併せたＲｅｇｅｎｅｒｏｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｅｎｔｅｒにおける追加のエクソームシーケンシングと解析を行い、その結果を表１２～１７に示す。
【0370】
ＧＨＳ６０ｋ、ＧＨＳ３０ｋ及びＵＫＢの補完後データセット、ならびに３つのコホートのメタアナリシスにおける、ＡＮＧＰＴＬ７でのミスセンス（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ）変異体と緑内障との関連を表１２に示す。ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓの影響の方向（ＩＯＰ低下）は、表１０及び表１１で示されるｐＬＯＦ ｐ．Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体の影響の方向と同じであり、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ変化がＡＮＧＰＴＬ７の機能を低下させるよう作用することを示唆している。
【0371】
【表12】
【0372】
ＧＨＳ６０ｋ、ＧＨＳ３０ｋ及びＵＫＢの補完後データセット、ならびに３つのコホートのメタアナリシスにおける、ミスセンス（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ）変異体とＩＯＰｇとの関連を表１３に示す。
【0373】
【表13】
【0374】
ＧＨＳ６０ｋ、ＧＨＳ３０ｋ及びＵＫＢのエクソームデータセット、ならびに３つのコホートのメタアナリシスにおける、ミスセンス（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ）変異体とＩＯＰｇとの関連を表１４に示す。
【0375】
【表14】
【0376】
ＧＨＳ６０ｋ、ＧＨＳ３０ｋ及びＵＫＢのエクソームデータセット、ならびに３つのコホートのメタアナリシスにおける、ミスセンス（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ）変異体と緑内障との関連を表１５に示す。
【0377】
【表15】
【0378】
ｂｕｒｄｅｎテストにおける、ＡＮＧＰＴＬ７でのＭ１．１（ｐＬＯＦ変異体≦１％ ＡＡＦ）マスクとＩＯＰｇとの関連を表１６に示す。
【0379】
【表16】
【0380】
ＵＫＢのエクソームと遺伝子型決定済／補完後データセットにおける、ミスセンス（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ）変異体とＩＯＰｃｃとの関連を表１７に示す。
【0381】
【表17】
【0382】
実施例２：遺伝学的及び機能的研究からＡＮＧＰＴＬ７が緑内障の治療標的として特定される
試験デザイン及び参加者
５つのコホートからのデータを使用して関連試験を行った。コホートには以下が含まれた。１）ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ（ＵＫＢ）は、４年にわたり４０～６９歳の５００，０００人超が登録され、生活習慣、環境、病歴、物理的測定及びＤＮＡ試料に関する広範なデータが収集された、大規模な前向き研究である。ＵＫＢコホート全体で実施されたゲノムワイド関連解析では、ＩＯＰを測定したヨーロッパ系９２，６７２例及びアフリカ系４，１７９例の参加者をＩＯＰ解析に含めた。緑内障関連解析では、ヨーロッパ系の症例８，６３９例と対照４５３，７４６例、ならびにアフリカ系の症例３７１例と対照９，３６１例を含めた。配列決定されている約１５０，０００例のＵＫＢ参加者で実施されたエクソームワイド関連解析では、ヨーロッパ系４７，０９６例及びアフリカ系１，７４３例の個人をＩＯＰ解析に含めた。２）ＭｙＣｏｄｅ Ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ Ｈｅａｌｔｈ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｏｆ Ｇｅｉｓｉｎｇｅｒからの計約１４５，０００例の配列決定済み個人からなるＤｉｓｃｏｖＥＨＲ研究の集団（ＧＨＳ）では、その中のＩＯＰ測定値のある緑内障とは診断されなかった個人２９，３９５例、緑内障の症例８，１５４例と対照１１６，５５７例を含めた。３）スウェーデンをベースとしたＭａｌｍｏ ｄｉｅｔ ａｎｄ ｃａｎｃｅｒ ｓｔｕｄｙ（ＭＤＣＳ）には、食事ががんに及ぼす影響を研究するために募集された約２９，０００例の参加者が含まれる。ＭＤＣＳからの緑内障の症例１，７０８例と対照２６，２２２例を含めた。４）Ｍｏｕｎｔ Ｓｉｎａｉ’ｓ ＢｉｏＭｅ Ｐｅｒｓｏｎａｌｉｚｅｄ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ（ＭＳＳＭ）コホートは、広範囲にわたる生物医学的形質を特徴とする、祖先の異なる約３１，０００例の参加者からなる、電子カルテ（ＥＨＲ）で結ばれた臨床ケアコホートである。ヨーロッパ系の症例４２４例と対照８，７７４例、及びアフリカ系の症例１，３４９例と対照１１，２５８例が緑内障解析に使用された。５）Ｐｒｉｍａｒｙ Ｏｐｅｎ Ａｎｇｌｅ Ａｆｒｉｃａｎ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｇｌａｕｃｏｍａ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ（ＰＯＡＡＧＧ）研究は、ペンシルバニアのＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ＰｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａのＳｃｈｅｉｅ Ｅｙｅ
Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ及びその提携研究施設から募集された３５歳以上の自己申告によるアフリカ系の個人からなる５年間の集団ベースプロジェクトである。ＰＯＡＡＧＧでのＩＯＰ関連解析では、ＩＯＰを測定し、かつＰＯＡＧの診断をされていない個人３，０９７例を含め、また、ＰＯＡＧ症例２，４７４例と対照４，０９２例を緑内障関連解析に含めた。
試験デザイン及び参加者
５つのコホートからのデータを使用して関連試験を行った。コホートには以下が含まれた。１）ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ（ＵＫＢ）は、４年にわたり４０～６９歳の５００，０００人超が登録され、生活習慣、環境、病歴、物理的測定及びＤＮＡ試料に関する広範なデータが収集された、大規模な前向き研究である。ＵＫＢコホート全体で実施されたゲノムワイド関連解析では、ＩＯＰを測定したヨーロッパ系９２，６７２例及びアフリカ系４，１７９例の参加者をＩＯＰ解析に含めた。緑内障関連解析では、ヨーロッパ系の症例８，６３９例と対照４５３，７４６例、ならびにアフリカ系の症例３７１例と対照９，３６１例を含めた。配列決定されている約１５０，０００例のＵＫＢ参加者で実施されたエクソームワイド関連解析では、ヨーロッパ系４７，０９６例及びアフリカ系１，７４３例の個人をＩＯＰ解析に含めた。２）ＭｙＣｏｄｅ Ｃｏｍｍｕｎｉｔｙ Ｈｅａｌｔｈ Ｉｎｉｔｉａｔｉｖｅ ｏｆ Ｇｅｉｓｉｎｇｅｒからの計約１４５，０００例の配列決定済み個人からなるＤｉｓｃｏｖＥＨＲ研究の集団（ＧＨＳ）では、その中のＩＯＰ測定値のある緑内障とは診断されなかった個人２９，３９５例、緑内障の症例８，１５４例と対照１１６，５５７例を含めた。３）スウェーデンをベースとしたＭａｌｍｏ ｄｉｅｔ ａｎｄ ｃａｎｃｅｒ ｓｔｕｄｙ（ＭＤＣＳ）には、食事ががんに及ぼす影響を研究するために募集された約２９，０００例の参加者が含まれる。ＭＤＣＳからの緑内障の症例１，７０８例と対照２６，２２２例を含めた。４）Ｍｏｕｎｔ Ｓｉｎａｉ’ｓ ＢｉｏＭｅ Ｐｅｒｓｏｎａｌｉｚｅｄ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ（ＭＳＳＭ）コホートは、広範囲にわたる生物医学的形質を特徴とする、祖先の異なる約３１，０００例の参加者からなる、電子カルテ（ＥＨＲ）で結ばれた臨床ケアコホートである。ヨーロッパ系の症例４２４例と対照８，７７４例、及びアフリカ系の症例１，３４９例と対照１１，２５８例が緑内障解析に使用された。５）Ｐｒｉｍａｒｙ Ｏｐｅｎ Ａｎｇｌｅ Ａｆｒｉｃａｎ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｇｌａｕｃｏｍａ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ（ＰＯＡＡＧＧ）研究は、ペンシルバニアのＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ ＰｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａのＳｃｈｅｉｅ Ｅｙｅ
Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ及びその提携研究施設から募集された３５歳以上の自己申告によるアフリカ系の個人からなる５年間の集団ベースプロジェクトである。ＰＯＡＡＧＧでのＩＯＰ関連解析では、ＩＯＰを測定し、かつＰＯＡＧの診断をされていない個人３，０９７例を含め、また、ＰＯＡＧ症例２，４７４例と対照４，０９２例を緑内障関連解析に含めた。
【0383】
表現型の定義
Ｏｃｕｌａｒ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ Ａｎａｌｙｚｅｒ（ＯＲＡ，Ｒｅｉｃｈｅｒｔ Ｃｏｒｐ．，Ｂｕｆｆａｌｏ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）を使用して、各眼でＵＫＢのＩＯＰを測定した。この試験前の４週間に眼の手術を受けているかまたは眼の感染症があると参加者から報告があった場合は、それらの参加者は試験から除外した。ＯＲＡは、ゴールドマン式眼圧計に相当するＩＯＰ（ＩＯＰｇ）と角膜厚に影響されない補正ＩＯＰ（ＩＯＰｃｃ）の２種類のＩＯＰを算出する。ＩＯＰｇは、ゴールドマン圧平眼圧計により測定されるＩＯＰに最も近い値を出すもので、ＩＯＰ測定のゴールドスタンダードとされており、一方、ＩＯＰｃｃでは、角膜の生体力学特性の影響を除くよう補正されたＩＯＰ測定値が得られる。この研究では、他のコホートにおいてＩＯＰｇの測定値がＩＯＰ測定値に最も匹敵していたことからＩＯＰｇに焦点をあてており、本明細書ではＩＯＰｇはＩＯＰと呼ばれる。ＩＯＰの関連解析では、以下の個人を除外した：１）緑内障の診断を有する（Ｎ＝１，９３２）、２）ＩＯＰ測定値が、平均からの標準偏差５を超えている、及び３）両眼に１０ｍｍＨｇ超の差がある。両眼の平均ＩＯＰ値を、それぞれの個人について作成した。両眼のＩＯＰ測定値が得られない場合は片目のみのＩＯＰを使用した。ＵＫＢの場合同様、ＧＨＳ（ＥＨＲでの直近のＩＯＰ測定値を使用した）及びＰＯＡＡＧＧの左右の眼の平均ＩＯＰを解析し、上記で概説された除外及び基準と同じものを適用した。
Ｏｃｕｌａｒ Ｒｅｓｐｏｎｓｅ Ａｎａｌｙｚｅｒ（ＯＲＡ，Ｒｅｉｃｈｅｒｔ Ｃｏｒｐ．，Ｂｕｆｆａｌｏ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）を使用して、各眼でＵＫＢのＩＯＰを測定した。この試験前の４週間に眼の手術を受けているかまたは眼の感染症があると参加者から報告があった場合は、それらの参加者は試験から除外した。ＯＲＡは、ゴールドマン式眼圧計に相当するＩＯＰ（ＩＯＰｇ）と角膜厚に影響されない補正ＩＯＰ（ＩＯＰｃｃ）の２種類のＩＯＰを算出する。ＩＯＰｇは、ゴールドマン圧平眼圧計により測定されるＩＯＰに最も近い値を出すもので、ＩＯＰ測定のゴールドスタンダードとされており、一方、ＩＯＰｃｃでは、角膜の生体力学特性の影響を除くよう補正されたＩＯＰ測定値が得られる。この研究では、他のコホートにおいてＩＯＰｇの測定値がＩＯＰ測定値に最も匹敵していたことからＩＯＰｇに焦点をあてており、本明細書ではＩＯＰｇはＩＯＰと呼ばれる。ＩＯＰの関連解析では、以下の個人を除外した：１）緑内障の診断を有する（Ｎ＝１，９３２）、２）ＩＯＰ測定値が、平均からの標準偏差５を超えている、及び３）両眼に１０ｍｍＨｇ超の差がある。両眼の平均ＩＯＰ値を、それぞれの個人について作成した。両眼のＩＯＰ測定値が得られない場合は片目のみのＩＯＰを使用した。ＵＫＢの場合同様、ＧＨＳ（ＥＨＲでの直近のＩＯＰ測定値を使用した）及びＰＯＡＡＧＧの左右の眼の平均ＩＯＰを解析し、上記で概説された除外及び基準と同じものを適用した。
【0384】
ＵＫＢでの症例のＩＣＤに基づく緑内障の定義は、Ｈｅａｌｔｈ Ｅｐｉｓｏｄｅ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃｓ（ＨＥＳ）の入院患者の記録でＩＣＤ１０－Ｈ４０の一次診断が１回または二次診断が２回以上であることを要件とした。ＧＨＳ、ＭＤＣＳ及びＭＳＳＭでのＩＣＤに基づく緑内障の症例の定義は、ＥＨＲにおいてＩＣＤ１０－Ｈ４０の診断を入院患者として受けているかまたは外来患者として２回以上受けていることを要件とした。ＩＣＤに基づく除外者は、Ｈ４０～Ｈ４２のコード範囲で一次診断を１回以上または二次診断を２回以上受けていた。ＩＣＤに基づく緑内障対照者は、症例とならないか、または除外されない個人と定義された。
【0385】
ＵＫＢでは、症例の定義においてＩＣＤに基づく緑内障と自己申告によるものを併せており、その場合、個人が、タッチスクリーンの質問票にある眼の問題もしくは障害の一覧から「緑内障」を特定したか、または口頭面接で緑内障に罹患したことがあると述べているか、またはＩＣＤ１０ Ｈ４０緑内障の症例であった場合に、その個人を症例と見なした。ＵＫＢにおける緑内障の健常対照者は、タッチスクリーンまたは口頭面接で緑内障であるという申告をしていない個人と定義され、上記のようにＩＣＤに基づく緑内障の対照者と定義された（Ｖａｎ Ｈｏｕｔ，２０１９，ＢｉｏＲｘｉｖ． ｈｔｔｐｓ“／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／５７２３４７”）。
【0386】
ＰＯＡＡＧＧにおいて緑内障の症例を定義するために使用された基準の詳細な説明は、他の箇所で記載されている（Ｃｈａｒｌｓｏｎ，Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌｏｇｙ，２０１５，１２２，７１１－２０）。手短に言えば、ＰＯＡＧの症例は、虹彩角膜角の開放を有すると定義され、片眼または両眼の特徴的な緑内障性視神経所見、特徴的な視野欠損、及び緑内障を二次的に引き起こすすべての原因は除外された。ＰＯＡＡＧＧの対照者は、強度の近視（－８．００ジオプトリーを超える）もしくは老視（＋８．００ジオプトリー）、ＰＯＡＧの家族歴、視野の異常、２１ｍｍＨｇ超のＩＯＰ、神経網膜縁の菲薄化、陥凹、切痕または神経線維層欠損がなく、視神経が非対称であるかまたは両眼のカップ対ディスク比が０．２より大きい、３５歳以上の対象と定義された。ＰＯＡＡＧＧの追加の対照者は、ＩＣＤ９による緑内障の診断のない個人として、Ｐｅｎｎ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ Ｂｉｏｂａｎｋから特定された。
【0387】
試料の調製、シーケンシング及びジェノタイピング
ＵＫＢ、ＧＨＳ、ＭＤＣＳ、ＭＳＳＭ、及びＰＯＡＡＧＧの試料の調製及び全エクソームのシーケンシングを記載のように実施した（Ｄｅｗｅｙ，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１６，３５４，６３１９、及びＶａｎ Ｈｏｕｔ，２０１９，ＢｉｏＲｘｉｖ．ｈｔｔｐｓ“／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／５７２３４７”）。ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ参加者のＤＮＡ抽出とジェノタイピングについての詳細は、Ｂｙｃｒｏｆｔ（Ｂｙｃｒｏｆｔ，Ｎａｔｕｒｅ，２０１９，５６２，２０３－２０９）に記載されている。
ＵＫＢ、ＧＨＳ、ＭＤＣＳ、ＭＳＳＭ、及びＰＯＡＡＧＧの試料の調製及び全エクソームのシーケンシングを記載のように実施した（Ｄｅｗｅｙ，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２０１６，３５４，６３１９、及びＶａｎ Ｈｏｕｔ，２０１９，ＢｉｏＲｘｉｖ．ｈｔｔｐｓ“／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／５７２３４７”）。ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ参加者のＤＮＡ抽出とジェノタイピングについての詳細は、Ｂｙｃｒｏｆｔ（Ｂｙｃｒｏｆｔ，Ｎａｔｕｒｅ，２０１９，５６２，２０３－２０９）に記載されている。
【0388】
統計解析
統計解析には、ｂｕｒｄｅｎテストの記載、レアバリアント解析、及びメタアナリシス法が含まれた。
統計解析には、ｂｕｒｄｅｎテストの記載、レアバリアント解析、及びメタアナリシス法が含まれた。
【0389】
ヒト線維柱帯（ＴＭ）細胞培養及びデキサメタゾン治療
Ｄｕｋｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＮＣのＳｔａｍｅｒ研究室からヒトＴＭ細胞を入手し、以前に開発された方法を使用して特徴付けを行った。ヒトＴＭ細胞を培養し、１０％ウシ胎児血清（ＦＢＳ；Ａｔｌａｓ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ，Ｆｏｒｔ Ｃｏｌｌｉｎｓ，ＣＯ，ＵＳＡ）、ペニシリン（１００単位／ｍＬ）、ストレプトマイシン（０．１ｍｇ／ｍＬ）、及びＬ－グルタミン（０．２９２ｍｇ／ｍＬ）（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ，ＵＳＡ）を添加したダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ－Ｇｉｂｃｏ Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ，ＵＳＡ）に維持した。ヒトＴＭ細胞を６ウェルプレートでコンフルエントな状態になるまで培養し、その後、ビヒクル対照（０．１％エタノール）またはデキサメタゾン（ＤＥＸ、１００ｎＭ）でさらに７２時間処理した。
Ｄｕｋｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，ＮＣのＳｔａｍｅｒ研究室からヒトＴＭ細胞を入手し、以前に開発された方法を使用して特徴付けを行った。ヒトＴＭ細胞を培養し、１０％ウシ胎児血清（ＦＢＳ；Ａｔｌａｓ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌｓ，Ｆｏｒｔ Ｃｏｌｌｉｎｓ，ＣＯ，ＵＳＡ）、ペニシリン（１００単位／ｍＬ）、ストレプトマイシン（０．１ｍｇ／ｍＬ）、及びＬ－グルタミン（０．２９２ｍｇ／ｍＬ）（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｒｏｃｋｆｏｒｄ，ＩＬ，ＵＳＡ）を添加したダルベッコ改変イーグル培地（ＤＭＥＭ）（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ－Ｇｉｂｃｏ Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ，ＵＳＡ）に維持した。ヒトＴＭ細胞を６ウェルプレートでコンフルエントな状態になるまで培養し、その後、ビヒクル対照（０．１％エタノール）またはデキサメタゾン（ＤＥＸ、１００ｎＭ）でさらに７２時間処理した。
【0390】
ＩＯＰ測定
イソフルラン麻酔下にあるＩＯＰを前述のように測定した。ＩＯＰ測定では、マウスを麻酔してから、ＴｏｎｏＬａｂ ｒｅｂｏｕｎｄ眼圧計（Ｃｏｌｏｎｉａｌ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｕｐｐｌｙ，Ｆｒａｎｃｏｎｉａ，ＮＨ）を使用して両眼でＩＯＰを測定した。両眼のＩＯＰ測定は３～５分で終了した。各眼のＩＯＰを測定してから、Ａｎｇｐｔｌ７注射を開始し、以降、６日間毎日注射した。
イソフルラン麻酔下にあるＩＯＰを前述のように測定した。ＩＯＰ測定では、マウスを麻酔してから、ＴｏｎｏＬａｂ ｒｅｂｏｕｎｄ眼圧計（Ｃｏｌｏｎｉａｌ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｓｕｐｐｌｙ，Ｆｒａｎｃｏｎｉａ，ＮＨ）を使用して両眼でＩＯＰを測定した。両眼のＩＯＰ測定は３～５分で終了した。各眼のＩＯＰを測定してから、Ａｎｇｐｔｌ７注射を開始し、以降、６日間毎日注射した。
【0391】
ＡＮＧＰＴＬ７タンパク質の硝子体内注射
ガラス製マイクロシリンジ付き３３ゲージ針（容量５μＬ；Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｃｏｍｐａｎｙ）を使用した。眼の眼球を突出させ、赤道部強膜を介して針を挿入し、約４５度の角度で硝子体腔内へ挿入し、その際、水晶体または網膜の後部に触れないよう注意した。ＡＮＧＰＴＬ７タンパク質（カタログ番号４９６０－ＡＮ－０２５；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）またはＰＢＳ（１μＬ）を１分間かけて硝子体内に注射した。その後、（混合を促進するため）針をさらに４５秒間留置し、それから素早く引き抜いた。注射は１回のみ０日目に投与した。
ガラス製マイクロシリンジ付き３３ゲージ針（容量５μＬ；Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｃｏｍｐａｎｙ）を使用した。眼の眼球を突出させ、赤道部強膜を介して針を挿入し、約４５度の角度で硝子体腔内へ挿入し、その際、水晶体または網膜の後部に触れないよう注意した。ＡＮＧＰＴＬ７タンパク質（カタログ番号４９６０－ＡＮ－０２５；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）またはＰＢＳ（１μＬ）を１分間かけて硝子体内に注射した。その後、（混合を促進するため）針をさらに４５秒間留置し、それから素早く引き抜いた。注射は１回のみ０日目に投与した。
【0392】
ＡＮＧＰＴＬ７タンパク質の前房内注射
ガラス製マイクロシリンジ付き３３ゲージ針（容量５μＬ；Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｃｏｍｐａｎｙ）を使用した。注射前及び注射中、マウスを酸素（０．８Ｌ／分）含有イソフルラン（２．５％）で麻酔した。点眼麻酔では、両眼に１～２滴の０．５％プロパラカインＨＣｌ（Ａｋｏｒｎ，Ｉｎｃ．）を投与した。各眼の眼球を突出させ、角膜縁領域の真上の角膜を介して、角膜と平行になる角度で前房内へ針を挿入し、その際、虹彩、水晶体前嚢上皮、または角膜内皮に触れないよう注意した。最高で１μＬのＡＮＧＰＴＬ７タンパク質（カタログ番号４９６０－ＡＮ－０２５；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）またはＰＢＳを（３０秒間かけて）ゆっくりと注射した。その後、針を引き抜いた。手技は各動物の両眼で実施された。注射は１回のみ０日目に投与した。
ガラス製マイクロシリンジ付き３３ゲージ針（容量５μＬ；Ｈａｍｉｌｔｏｎ Ｃｏｍｐａｎｙ）を使用した。注射前及び注射中、マウスを酸素（０．８Ｌ／分）含有イソフルラン（２．５％）で麻酔した。点眼麻酔では、両眼に１～２滴の０．５％プロパラカインＨＣｌ（Ａｋｏｒｎ，Ｉｎｃ．）を投与した。各眼の眼球を突出させ、角膜縁領域の真上の角膜を介して、角膜と平行になる角度で前房内へ針を挿入し、その際、虹彩、水晶体前嚢上皮、または角膜内皮に触れないよう注意した。最高で１μＬのＡＮＧＰＴＬ７タンパク質（カタログ番号４９６０－ＡＮ－０２５；Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）またはＰＢＳを（３０秒間かけて）ゆっくりと注射した。その後、針を引き抜いた。手技は各動物の両眼で実施された。注射は１回のみ０日目に投与した。
【0393】
ＲＮＡＳｃｏｐｅを使用するインサイチュハイブリダイゼーション
ヒトドナーの眼におけるＴＭ単一細胞集団特異的遺伝子発現の発現パターンは、ＲＮＡＳｃｏｐｅ（登録商標）を製造者の仕様（Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ）に従って使用し、インサイチュハイブリダイゼーションによって決定された。簡単に言えば、１０％ＮＢＦ固定のパラフィン包埋ヒトドナーの眼杯を５～１０μｍの切片に切り、ＳＵＰＥＲＦＲＯＳＴ（登録商標）Ｐｌｕｓスライドガラスに封入した。ＲＮＡＳｃｏｐｅでは、スライドをスライドウォーマーで６０℃にて１時間ベイキングし、脱パラフィンを２０分間行った。次いで、組織切片を、前処理１－室温で１０分間のＲＮＡＳｃｏｐｅ過酸化水素処理、その後、前処理２－Ｏｓｔｅｒ Ｓｔｅａｍｅｒ（ＩＨＣ Ｗｏｒｌｄ， ＬＬＣ， Ｍｏｄｅｌ ５７０９）での標的賦活化処理で９０℃にて２０分間の煮沸、及び３０分間の前処理３－ＨｙｂＥＺオーブンで４０℃でのＲＮＡＳｃｏｐｅ ｐｒｏｔｅａｓｅ ｐｌｕｓ処理に供した。その後、組織切片を、ＤＮａｓｅ Ｉと共に４０℃で１０分間インキュベートし、ゲノムＤＮＡに結合するプローブからの潜在的バックグラウンドを除去した。その後、組織切片を水で５回洗浄し、ＲＮＡＳｃｏｐｅプローブと４０℃で２時間ハイブリダイズさせ、製造者のアッセイプロトコールの残りの工程を、Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ１からＡｍｐｌｉｆｉｅｄ６まで実施した。スライドを、ＲＮＡＳｃｏｐｅ洗浄バッファーで２回（それぞれ室温で２分間）洗浄した。シグナルは、Ｒｅｄ使用溶液（Ｒｅｄ Ｂ対Ｒｅｄ Ａの比は１：６０）と共に光の当たらない状態で室温にて１０分間インキュベーションし、その後、スライドを水で数回洗浄して顕微鏡下で観察して検出した。いくつかの実験では、蛍光シグナルを視覚化し、広視野Ｎｉｋｏｎ Ｅｃｌｉｐｓｅ Ｔｉ－Ｅ顕微鏡を使用して撮像した。
ヒトドナーの眼におけるＴＭ単一細胞集団特異的遺伝子発現の発現パターンは、ＲＮＡＳｃｏｐｅ（登録商標）を製造者の仕様（Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ）に従って使用し、インサイチュハイブリダイゼーションによって決定された。簡単に言えば、１０％ＮＢＦ固定のパラフィン包埋ヒトドナーの眼杯を５～１０μｍの切片に切り、ＳＵＰＥＲＦＲＯＳＴ（登録商標）Ｐｌｕｓスライドガラスに封入した。ＲＮＡＳｃｏｐｅでは、スライドをスライドウォーマーで６０℃にて１時間ベイキングし、脱パラフィンを２０分間行った。次いで、組織切片を、前処理１－室温で１０分間のＲＮＡＳｃｏｐｅ過酸化水素処理、その後、前処理２－Ｏｓｔｅｒ Ｓｔｅａｍｅｒ（ＩＨＣ Ｗｏｒｌｄ， ＬＬＣ， Ｍｏｄｅｌ ５７０９）での標的賦活化処理で９０℃にて２０分間の煮沸、及び３０分間の前処理３－ＨｙｂＥＺオーブンで４０℃でのＲＮＡＳｃｏｐｅ ｐｒｏｔｅａｓｅ ｐｌｕｓ処理に供した。その後、組織切片を、ＤＮａｓｅ Ｉと共に４０℃で１０分間インキュベートし、ゲノムＤＮＡに結合するプローブからの潜在的バックグラウンドを除去した。その後、組織切片を水で５回洗浄し、ＲＮＡＳｃｏｐｅプローブと４０℃で２時間ハイブリダイズさせ、製造者のアッセイプロトコールの残りの工程を、Ａｍｐｌｉｆｉｅｄ１からＡｍｐｌｉｆｉｅｄ６まで実施した。スライドを、ＲＮＡＳｃｏｐｅ洗浄バッファーで２回（それぞれ室温で２分間）洗浄した。シグナルは、Ｒｅｄ使用溶液（Ｒｅｄ Ｂ対Ｒｅｄ Ａの比は１：６０）と共に光の当たらない状態で室温にて１０分間インキュベーションし、その後、スライドを水で数回洗浄して顕微鏡下で観察して検出した。いくつかの実験では、蛍光シグナルを視覚化し、広視野Ｎｉｋｏｎ Ｅｃｌｉｐｓｅ Ｔｉ－Ｅ顕微鏡を使用して撮像した。
【0394】
細胞培養。
ＨＥＫ２９３細胞株を、１０％ＦＢＳ及び１％ペニシリン－ストレプトマイシン－グルタミン（ＢＲＡＮＤ）を添加したＤＭＥＭ培地（４．５ｇ／ＬのＤ－グルコース、（＋）Ｌ－グルタミン、（－）リン酸ナトリウム、（－）ピルビン酸ナトリウム）で、５％ＣＯ２下、加湿雰囲気で３７℃にて培養した。
ＨＥＫ２９３細胞株を、１０％ＦＢＳ及び１％ペニシリン－ストレプトマイシン－グルタミン（ＢＲＡＮＤ）を添加したＤＭＥＭ培地（４．５ｇ／ＬのＤ－グルコース、（＋）Ｌ－グルタミン、（－）リン酸ナトリウム、（－）ピルビン酸ナトリウム）で、５％ＣＯ２下、加湿雰囲気で３７℃にて培養した。
【0395】
トランスフェクション．
トランスフェクション前日、１０％ＦＢＳを添加したＯｐｔｉＭＥＭにＨＥＫ２９３細胞を播種した。２４時間後、細胞にＦｕＧＥＮＥ ６、及び以下のタンパク質：ＡＮＧＰＴＬ７野生型、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ、及びＡｒｇ１７７＊をコードする１０ｕｇのｐｃＤＮＡ３．１（＋）をトランスフェクトした。２４時間後、培地を２％ＦＢＳ ＯｐｔｉＭＥＭで交換した。翌日、細胞を、タンパク質分析及びＲＮＡ分析用に、それぞれ、プロテアーゼとホスファターゼの阻害剤（ＢＲＡＮＤ）またはＴＲＩｚｏｌ試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を添加したＲＩＰＡバッファーに回収した。上清をＥｐｐｅｎｄｏｒｆチューブに移し、下流のタンパク質分析用に直ちにフラッシュ凍結した。
トランスフェクション前日、１０％ＦＢＳを添加したＯｐｔｉＭＥＭにＨＥＫ２９３細胞を播種した。２４時間後、細胞にＦｕＧＥＮＥ ６、及び以下のタンパク質：ＡＮＧＰＴＬ７野生型、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ、及びＡｒｇ１７７＊をコードする１０ｕｇのｐｃＤＮＡ３．１（＋）をトランスフェクトした。２４時間後、培地を２％ＦＢＳ ＯｐｔｉＭＥＭで交換した。翌日、細胞を、タンパク質分析及びＲＮＡ分析用に、それぞれ、プロテアーゼとホスファターゼの阻害剤（ＢＲＡＮＤ）またはＴＲＩｚｏｌ試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を添加したＲＩＰＡバッファーに回収した。上清をＥｐｐｅｎｄｏｒｆチューブに移し、下流のタンパク質分析用に直ちにフラッシュ凍結した。
【0396】
ＲＮＡ抽出及びＴａｑｍａｎ解析。
ＴＲＩｚｏｌ試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）及びＲＮｅａｓｙキット（Ｑｉａｇｅｎ）を製造者の指示書に従って使用してトータルＲＮＡを抽出し、ＲＮａｓｅ不含ＤＮａｓｅ
Ｉ（Ｐｒｏｍｅｇａ）で処理した。Ｓｕｐｅｒｓｃｒｉｐｔ ＶＩＬＯ ｃＤＮＡ合成キット（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用してｃＤＮＡを合成した。ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ ６ Ｆｌｅｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）のＴａｑＭａｎ Ｆａｓｔ
Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）ならびにＡＮＧＰＴＬ７（Ｈｓ００２２１７２７－Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍ）及びＧＡＰＤＨ（Ｈｓ０２７８６６２４＿ｇ１－Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍ）の市販のプライマー及びプローブを使用してＴａｑｍａｎ解析を実施した。
ＴＲＩｚｏｌ試薬（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）及びＲＮｅａｓｙキット（Ｑｉａｇｅｎ）を製造者の指示書に従って使用してトータルＲＮＡを抽出し、ＲＮａｓｅ不含ＤＮａｓｅ
Ｉ（Ｐｒｏｍｅｇａ）で処理した。Ｓｕｐｅｒｓｃｒｉｐｔ ＶＩＬＯ ｃＤＮＡ合成キット（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ）を使用してｃＤＮＡを合成した。ＱｕａｎｔＳｔｕｄｉｏ ６ Ｆｌｅｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）のＴａｑＭａｎ Ｆａｓｔ
Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｍａｓｔｅｒ Ｍｉｘ（Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）ならびにＡＮＧＰＴＬ７（Ｈｓ００２２１７２７－Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍ）及びＧＡＰＤＨ（Ｈｓ０２７８６６２４＿ｇ１－Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍ）の市販のプライマー及びプローブを使用してＴａｑｍａｎ解析を実施した。
【0397】
ウェスタンブロット。
ウエスタンブロット法は、標準的手順を使用して、１：１，０００希釈のＡＮＧＰＴＬ７に対するウサギポリクローナル抗体（１０３９６－１－ＡＰ ＰｒｏｔｅｉｎＴｅｃｈ）を使用して実施された。
ウエスタンブロット法は、標準的手順を使用して、１：１，０００希釈のＡＮＧＰＴＬ７に対するウサギポリクローナル抗体（１０３９６－１－ＡＰ ＰｒｏｔｅｉｎＴｅｃｈ）を使用して実施された。
【0398】
ＥＬＩＳＡアッセイ。
ＡＮＧＰＴＬ７は、製造者の指示書に従ってＥＬＩＳＡで定量した（ＬＳ－Ｆ５０４２５ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）。細胞溶解物を１：１，０００に希釈した。上清を１：１０，０００に希釈した。ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ Ｍ４マイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ）で４５０ｎｍにてＥＬＩＳＡプレートを読み取った。
ＡＮＧＰＴＬ７は、製造者の指示書に従ってＥＬＩＳＡで定量した（ＬＳ－Ｆ５０４２５ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）。細胞溶解物を１：１，０００に希釈した。上清を１：１０，０００に希釈した。ＳｐｅｃｔｒａＭａｘ Ｍ４マイクロプレートリーダー（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｄｅｖｉｃｅｓ）で４５０ｎｍにてＥＬＩＳＡプレートを読み取った。
【0399】
結果
ＡＮＧＰＴＬ７のコーディング変異体はＩＯＰ及び緑内障と関連する
レアコーディング変異体のＩＯＰに対する影響を、緑内障の診断のある症例を除外した後、２つの大規模コホートであるＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ（ＵＫＢ）及びＧｅｉｓｉｎｇｅｒ ＤｉｓｃｏｖＥＨＲ（ＧＨＳ）（図１）で１２０，１４５例のヨーロッパ系個人について検討した。ＩＯＰとの関連について、マイナーアレル頻度（ＭＡＦ）が１％未満であるタンパク質を変化させる変異体（スプライスバリアントを含む）１，３６８，６４１例を調べた。２つのレアコーディング変異体がＩＯＰ低下と大きく関連しており（ｐ値＜５Ｅ－０８）（図１）、それらは、低ＩＯＰと関連するｓｏｎ ｏｆ ｓｅｖｅｎｌｅｓｓ２（ＳＯＳ２）でのミスセンス変異体（ｐ．Ｐｒｏ１９１Ａｒｇ；ＭＡＦ＝約１．０％）（ベータアレル＝－０．１１標準偏差（ＳＤ）；ｐ値＝３．３９Ｅ－０８）、及び、やはり低ＩＯＰと関連するアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）でのミスセンス変異体（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ、ＭＡＦ＝約０．７％）（ベータアレル＝－０．２１ＳＤ、ｐ値＝３．２Ｅ－１９、図２Ａ）であった。
ＡＮＧＰＴＬ７のコーディング変異体はＩＯＰ及び緑内障と関連する
レアコーディング変異体のＩＯＰに対する影響を、緑内障の診断のある症例を除外した後、２つの大規模コホートであるＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ（ＵＫＢ）及びＧｅｉｓｉｎｇｅｒ ＤｉｓｃｏｖＥＨＲ（ＧＨＳ）（図１）で１２０，１４５例のヨーロッパ系個人について検討した。ＩＯＰとの関連について、マイナーアレル頻度（ＭＡＦ）が１％未満であるタンパク質を変化させる変異体（スプライスバリアントを含む）１，３６８，６４１例を調べた。２つのレアコーディング変異体がＩＯＰ低下と大きく関連しており（ｐ値＜５Ｅ－０８）（図１）、それらは、低ＩＯＰと関連するｓｏｎ ｏｆ ｓｅｖｅｎｌｅｓｓ２（ＳＯＳ２）でのミスセンス変異体（ｐ．Ｐｒｏ１９１Ａｒｇ；ＭＡＦ＝約１．０％）（ベータアレル＝－０．１１標準偏差（ＳＤ）；ｐ値＝３．３９Ｅ－０８）、及び、やはり低ＩＯＰと関連するアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）でのミスセンス変異体（ｐ．Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ、ＭＡＦ＝約０．７％）（ベータアレル＝－０．２１ＳＤ、ｐ値＝３．２Ｅ－１９、図２Ａ）であった。
【0400】
ＡＮＧＰＴＬ７での、レアな、予測される機能喪失（ｐＬＯＦ）型変異体（Ａｒｇ１７７＊、ＡＡＦ＝約０．０３％）と、低ＩＯＰ（ベータアレル＝－０．３１ＳＤ、ｐ値＝４．０Ｅ－０３、図２Ｂ）との閾値下の関連もまた認められた。ＡＮＧＰＴＬ７におけるＧｌｎ１７５Ｈｉｓのヘテロ接合体及びホモ接合体の保有者はそれぞれ、ＩＯＰの中央値が５．１％（０．８ｍｍＨｇ）及び２６．５％（４．１ｍｍＨｇ）低下しており（図２Ｃ）、Ａｒｇ１７７＊変異体は、ヘテロ接合体保有者で９％（１．４ｍｍＨｇ）のＩＯＰ中央値の減少をもたらした（図２Ｄ）。ＩＯＰの低下の生物学的重要性を理解するため、ＵＫＢ、ＧＨＳ及びＭｏｕｎｔ Ｓｉｎａｉ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ（ＭＳＳＭ、ｎ＝３１，２０３）とＭａｌｍｏ（ＭＤＣＳ、ｎ＝２９，４８３）で収集された２つの追加系列における、ＡＮＧＰＴＬ７変異体の緑内障リスクに対する影響を調べた。これらのコホート全体のメタアナリシスでは、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ保有者における緑内障リスクの顕著な低下（オッズ比（ＯＲアレル）＝０．７４、ｐ値＝１．９Ｅ－０５、図２Ｅ）、及びレアなＡｒｇ１７７＊変異体の保有者における、閾値下ではあるが一貫したリスクの低下（ＯＲアレル＝０．７９、ｐ値＝３．６Ｅ－０１、図２Ｆ）が示された。以上をまとめると、ミスセンス変異体及びＡＮＧＰＴＬ７でのｐＬＯＦ変異体と、低ＩＯＰ及び緑内障リスクの低下との関連は、ＡＮＧＰＴＬ７の機能の喪失または低下がＩＯＰ低下、及び緑内障からの保護をもたらすという仮説を支持している。
【0401】
ＡＮＧＰＴＬ７でのごくレア変異体が、集合体として、ＩＯＰに対し影響を及ぼすかどうかを評価するため、Ｇｅｎｅ ｂｕｒｄｅｎテストを実施した。Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７＊を除く、５つのアルゴリズムによって有害であると予測された３０のｐＬＯＦとミスセンス変異体のセットと、ＩＯＰとの関連を調べた。ｂｕｒｄｅｎテストでは、低ＩＯＰとの閾値下の関連が示され（ベータ＝－０．３１、ｐ値＝８．４０Ｅ－０３）、ＡＮＧＰＴＬ７における追加の変異体がＩＯＰを低下させて緑内障からの保護をもたらし得ることを示唆している。しかしながら、現在の試料サイズでは、これらの関連は統計的有意性には届かない。図３は、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ、Ａｒｇ１７７＊の保有者、及び少なくとも４例の他のごくレアな変異体の保有者におけるＩＯＰの分布を示す。
【0402】
アフリカ系個人におけるＡＮＧＰＴＬ７変異体
ＵＫＢ、ＭＳＳＭ、及びＰｒｉｍａｒｙ Ｏｐｅｎ Ａｎｇｌｅ Ａｆｒｉｃａｎ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｇｌａｕｃｏｍａ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ（ＰＯＡＡＧＧ）研究におけるアフリカ系個人でのＩＯＰ（及び緑内障）とＡＮＧＰＴＬ７変異体との関連もまた分析した。ＡＮＧＰＴＬ７でのｐＬＯＦ変異体（Ｔｒｐ１８８＊）が同定され、ヨーロッパ系個人（ＭＡＦ＝約０．００１３％）と比較してアフリカ系個人（ＭＡＦ＝約０．２７％）においてより高頻度に見られ、２つのコホート全体のメタアナリシスでは、ＩＯＰの低下（ベータアレル＝－０．１３、ｐ値＝５．３Ｅ－０１；図７Ａ）、及び緑内障に対するリスクの低下（ＯＲアレル＝０．７１、ｐ値＝９．９Ｅ－０２；図７Ｂ）の傾向がある。ｐＬＯＦ変異体のＡｒｇ１７７＊とＴｒｐ１８８＊の両方を含めたメタアナリシスでは、緑内障との関連についてのｐ値が１．９Ｅ－０１（Ａｒｇ１７７＊単独）及び９．８Ｅ－０２（Ｔｒｐ１８８＊単独）から６．９Ｅ－０２（図７Ｄ）に減少した。同様の結果がＩＯＰに関して得られた（図７Ｃ）。
ＵＫＢ、ＭＳＳＭ、及びＰｒｉｍａｒｙ Ｏｐｅｎ Ａｎｇｌｅ Ａｆｒｉｃａｎ Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｇｌａｕｃｏｍａ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ（ＰＯＡＡＧＧ）研究におけるアフリカ系個人でのＩＯＰ（及び緑内障）とＡＮＧＰＴＬ７変異体との関連もまた分析した。ＡＮＧＰＴＬ７でのｐＬＯＦ変異体（Ｔｒｐ１８８＊）が同定され、ヨーロッパ系個人（ＭＡＦ＝約０．００１３％）と比較してアフリカ系個人（ＭＡＦ＝約０．２７％）においてより高頻度に見られ、２つのコホート全体のメタアナリシスでは、ＩＯＰの低下（ベータアレル＝－０．１３、ｐ値＝５．３Ｅ－０１；図７Ａ）、及び緑内障に対するリスクの低下（ＯＲアレル＝０．７１、ｐ値＝９．９Ｅ－０２；図７Ｂ）の傾向がある。ｐＬＯＦ変異体のＡｒｇ１７７＊とＴｒｐ１８８＊の両方を含めたメタアナリシスでは、緑内障との関連についてのｐ値が１．９Ｅ－０１（Ａｒｇ１７７＊単独）及び９．８Ｅ－０２（Ｔｒｐ１８８＊単独）から６．９Ｅ－０２（図７Ｄ）に減少した。同様の結果がＩＯＰに関して得られた（図７Ｃ）。
【0403】
種間の眼組織でのＡＮＧＰＴＬ７発現
異なる種を通した眼組織でのＡＮＧＰＴＬ７の発現を同定するため、眼の様々な部分からのトランスクリプトームプロファイルを作成した。ＡＮＧＰＴＬ７高発現が、ヒト及びアフリカミドリザルの眼の角膜、線維柱帯（ＴＭ）、及び強膜で観察された（図４Ａ及び４Ｂ）。Ａｎｇｐｔｌ７高発現はまた、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊマウスの眼の角膜、ＴＭ、強膜、視神経、及び脈絡膜／ＲＰＥでも観察された（図４Ｃ）。ヒトＡＮＧＰＴＬ７及びマウスＡｎｇｐｔｌ７用ＲＮＡＳｃｏｐｅプローブを使用したヒトドナー及びマウス眼でのインサイチュハイブリダイゼーションでは、ＴＭ、角膜間質、及び強膜でのＡＮＧＰＴＬ７／Ａｎｇｐｔｌ７の発現が示された（図４Ｄ及び図４Ｅ）。
異なる種を通した眼組織でのＡＮＧＰＴＬ７の発現を同定するため、眼の様々な部分からのトランスクリプトームプロファイルを作成した。ＡＮＧＰＴＬ７高発現が、ヒト及びアフリカミドリザルの眼の角膜、線維柱帯（ＴＭ）、及び強膜で観察された（図４Ａ及び４Ｂ）。Ａｎｇｐｔｌ７高発現はまた、Ｃ５７ＢＬ／６Ｊマウスの眼の角膜、ＴＭ、強膜、視神経、及び脈絡膜／ＲＰＥでも観察された（図４Ｃ）。ヒトＡＮＧＰＴＬ７及びマウスＡｎｇｐｔｌ７用ＲＮＡＳｃｏｐｅプローブを使用したヒトドナー及びマウス眼でのインサイチュハイブリダイゼーションでは、ＴＭ、角膜間質、及び強膜でのＡＮＧＰＴＬ７／Ａｎｇｐｔｌ７の発現が示された（図４Ｄ及び図４Ｅ）。
【0404】
デキサメタゾン処理時のヒトＴＭ細胞で遺伝子発現が変化する
デキサメタゾン（ＤＥＸ）処理は、ＡＮＧＰＴＬ７上方制御を含め、ＴＭにおいて多くの生化学変化を遺伝子発現レベルで引き起こすことが知られている。これまでのこれらの所見をさらに特徴付けするため、ビヒクル（０．１％エタノール）またはＤＥＸ（１００ｎＭ）で７２時間処理した３つの独立したヒト眼からの３つのヒトＴＭ初代細胞株で、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）を実施した。ｑＰＣＲ分析により、３つのうち２つでＡＮＧＰＴＬ７発現の発現増加が明らかになり（図５）、ＡＮＧＴＰＬ７のＤＥＸ誘導性上方制御におけるある程度の変動性を示唆しており、一般集団においてステロイド治療に反応して観察された変動性と一致している。
デキサメタゾン（ＤＥＸ）処理は、ＡＮＧＰＴＬ７上方制御を含め、ＴＭにおいて多くの生化学変化を遺伝子発現レベルで引き起こすことが知られている。これまでのこれらの所見をさらに特徴付けするため、ビヒクル（０．１％エタノール）またはＤＥＸ（１００ｎＭ）で７２時間処理した３つの独立したヒト眼からの３つのヒトＴＭ初代細胞株で、定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）を実施した。ｑＰＣＲ分析により、３つのうち２つでＡＮＧＰＴＬ７発現の発現増加が明らかになり（図５）、ＡＮＧＴＰＬ７のＤＥＸ誘導性上方制御におけるある程度の変動性を示唆しており、一般集団においてステロイド治療に反応して観察された変動性と一致している。
【0405】
Ａｎｇｐｔｌ７はマウス眼でＩＯＰを増大させる
以前の研究では、ＴＭ細胞でのＡＮＧＰＴＬ７過剰発現は細胞外マトリックスの沈着と再構成の変化をもたらすこと（Ｃｏｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ ｔｏ Ｃｅｌｌｓ： Ｄｅｖｏｔｅｄ ｔｏ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ＆ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ，２０１１，１６，２４３－２５９、及びＫｕｃｈｔｅｙ，Ｉｎｖｅｓｔ．Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ． ＆ Ｖｉｓｕａｌ Ｓｃｉ．，２００８，４９，３４３８－４８）、及び緑内障患者の房水でＡＮＧＰＴＬ７が増大していること（Ｋｕｃｈｔｅｙ，Ｉｎｖｅｓｔ．Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ． ＆ Ｖｉｓｕａｌ Ｓｃｉ．，２００８，４９，３４３８－４８）が示されたが、ＩＯＰ制御におけるＡＮＧＰＴＬ７の役割は明らかではない。ＩＯＰ制御におけるＡＮＧＰＴＬ７の役割を検討するため、ＡＮＧＰＴＬ７タンパク質をマウスに硝子体内及び前房内経路で注射し、ＩＯＰを経時的に測定した。マウスでのＡＮＧＰＴＬ７タンパク質の硝子体内注射では、ＩＯＰの初期降下がもたらされ、その後、４日目からＩＯＰが４～５ｍｍＨｇ（ベースラインと比較して２２～２５％）上昇し始め、実験終了の７日目まで持続した（図６Ａ）。同様に、マウスでのＡＮＧＰＴＬ７タンパク質の前房内注射では、ＩＯＰの初期降下及びその後の上昇（２～５ｍｍＨｇ）がもたらされ、３日目から始まり実験終了の７日目まで続いた（図６Ｂ）。ビヒクル注射マウスは、いずれの投与経路でもＩＯＰ増大を示さなかった。
以前の研究では、ＴＭ細胞でのＡＮＧＰＴＬ７過剰発現は細胞外マトリックスの沈着と再構成の変化をもたらすこと（Ｃｏｍｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｇｅｎｅｓ ｔｏ Ｃｅｌｌｓ： Ｄｅｖｏｔｅｄ ｔｏ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ＆ Ｃｅｌｌｕｌａｒ Ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ，２０１１，１６，２４３－２５９、及びＫｕｃｈｔｅｙ，Ｉｎｖｅｓｔ．Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ． ＆ Ｖｉｓｕａｌ Ｓｃｉ．，２００８，４９，３４３８－４８）、及び緑内障患者の房水でＡＮＧＰＴＬ７が増大していること（Ｋｕｃｈｔｅｙ，Ｉｎｖｅｓｔ．Ｏｐｈｔｈａｌｍｏｌ． ＆ Ｖｉｓｕａｌ Ｓｃｉ．，２００８，４９，３４３８－４８）が示されたが、ＩＯＰ制御におけるＡＮＧＰＴＬ７の役割は明らかではない。ＩＯＰ制御におけるＡＮＧＰＴＬ７の役割を検討するため、ＡＮＧＰＴＬ７タンパク質をマウスに硝子体内及び前房内経路で注射し、ＩＯＰを経時的に測定した。マウスでのＡＮＧＰＴＬ７タンパク質の硝子体内注射では、ＩＯＰの初期降下がもたらされ、その後、４日目からＩＯＰが４～５ｍｍＨｇ（ベースラインと比較して２２～２５％）上昇し始め、実験終了の７日目まで持続した（図６Ａ）。同様に、マウスでのＡＮＧＰＴＬ７タンパク質の前房内注射では、ＩＯＰの初期降下及びその後の上昇（２～５ｍｍＨｇ）がもたらされ、３日目から始まり実験終了の７日目まで続いた（図６Ｂ）。ビヒクル注射マウスは、いずれの投与経路でもＩＯＰ増大を示さなかった。
【0406】
ＨＥＫ２９３全細胞溶解物におけるＡＮＧＰＴＬ７のＧｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの外因性発現
ＨＥＫ２９３全細胞溶解物におけるＡＮＧＰＴＬ７の２つの変異体（Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）の発現を示すため、試験を実施した（図８Ａ及び図８Ｂ）。野生型ＡＮＧＰＴＬ７と比較して、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体の激減が細胞上清で観察された（図８Ｃ及び図８Ｄ）。さらに、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体が上清中に分泌され得るのかどうかを決定するため、試験を実施した（図８Ｅ）。ＨＥＫ２９３でのＡＮＧＰＴＬ７の野生型及びＧｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体の外因性発現では、比較可能な細胞内タンパク質レベルが示されたが、野生型ＡＮＧＰＴＬ７と比較して分泌Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓの激減が示された。ＨＥＫ２９３細胞でのＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの発現では、細胞内タンパク質レベル低下が示された。Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体が分泌されることはできなかった。
ＨＥＫ２９３全細胞溶解物におけるＡＮＧＰＴＬ７の２つの変異体（Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）の発現を示すため、試験を実施した（図８Ａ及び図８Ｂ）。野生型ＡＮＧＰＴＬ７と比較して、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体の激減が細胞上清で観察された（図８Ｃ及び図８Ｄ）。さらに、Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体が上清中に分泌され得るのかどうかを決定するため、試験を実施した（図８Ｅ）。ＨＥＫ２９３でのＡＮＧＰＴＬ７の野生型及びＧｌｎ１７５Ｈｉｓ変異体の外因性発現では、比較可能な細胞内タンパク質レベルが示されたが、野生型ＡＮＧＰＴＬ７と比較して分泌Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓの激減が示された。ＨＥＫ２９３細胞でのＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの発現では、細胞内タンパク質レベル低下が示された。Ａｒｇ１７７Ｓｔｏｐ変異体が分泌されることはできなかった。
【0407】
ＨＥＫ２９３細胞株でのＡＮＧＰＴＬ７ Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡＮＧＰＴＬ７ Ａｒｇ１７７＊の発現解析
ＨＥＫ２９３Ｔ細胞において、遺伝子関連解析で同定されたＡＮＧＰＴＬ７の２つの変異体（Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）の発現及び分泌を評価するため、インビトロ実験を実施した。「野生型」（非突然変異体）ＡＮＧＰＴＬ７コード領域、またはＧｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの突然変異体型をもたらす変異のいずれか保持するプラスミドをＨＥＫ２９３Ｔに導入した。野生型、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７ＳｔｏｐのＡＮＧＰＴＬ７それぞれのｍＲＮＡのレベルを測定したところ、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７ＳｔｏｐのｍＲＮＡが野生型の場合と比較して減少していることが観察された（図９Ａ）。全細胞溶解物（図９Ｂ）及び細胞上清（図９Ｄ）を抗ＡＮＧＰＴＬ７ポリクローナル抗体でプローブし、野生型ＡＮＧＰＴＬ７及び２つの突然変異体タンパク質のレベルを決定した。ＥＬＩＳＡアッセイを実施し、全細胞溶解物（図９Ｃ）及び上清（図９Ｅ）における各タンパク質のレベルを定量化した。結果は、全細胞溶解物では野生型、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐのタンパク質のレベルに顕著な差はないが（図９Ｂ及び９Ｃ）、細胞の上清では、野生型タンパク質と比較した場合にＧｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの量の激減があることを示している（図９Ｄ及び９Ｅ）。これらのデータは、このインビトロ系ではＧｌｎ１７５Ｈｉｓ突然変異及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ突然変異がＡＮＧＰＴＬ７を十分に分泌させなくしていることを示唆しており、ＡＮＧＰＴＬ７の機能の喪失または低下が眼圧低下、及び緑内障からの保護をもたらすという遺伝子的仮説と一致している。
ＨＥＫ２９３Ｔ細胞において、遺伝子関連解析で同定されたＡＮＧＰＴＬ７の２つの変異体（Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ）の発現及び分泌を評価するため、インビトロ実験を実施した。「野生型」（非突然変異体）ＡＮＧＰＴＬ７コード領域、またはＧｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの突然変異体型をもたらす変異のいずれか保持するプラスミドをＨＥＫ２９３Ｔに導入した。野生型、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７ＳｔｏｐのＡＮＧＰＴＬ７それぞれのｍＲＮＡのレベルを測定したところ、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７ＳｔｏｐのｍＲＮＡが野生型の場合と比較して減少していることが観察された（図９Ａ）。全細胞溶解物（図９Ｂ）及び細胞上清（図９Ｄ）を抗ＡＮＧＰＴＬ７ポリクローナル抗体でプローブし、野生型ＡＮＧＰＴＬ７及び２つの突然変異体タンパク質のレベルを決定した。ＥＬＩＳＡアッセイを実施し、全細胞溶解物（図９Ｃ）及び上清（図９Ｅ）における各タンパク質のレベルを定量化した。結果は、全細胞溶解物では野生型、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐのタンパク質のレベルに顕著な差はないが（図９Ｂ及び９Ｃ）、細胞の上清では、野生型タンパク質と比較した場合にＧｌｎ１７５Ｈｉｓ及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐの量の激減があることを示している（図９Ｄ及び９Ｅ）。これらのデータは、このインビトロ系ではＧｌｎ１７５Ｈｉｓ突然変異及びＡｒｇ１７７Ｓｔｏｐ突然変異がＡＮＧＰＴＬ７を十分に分泌させなくしていることを示唆しており、ＡＮＧＰＴＬ７の機能の喪失または低下が眼圧低下、及び緑内障からの保護をもたらすという遺伝子的仮説と一致している。
【0408】
本研究では、緑内障治療のための可能性の高い戦略としてのＡＮＧＰＴＬ７阻害を強調する遺伝学的及び機能的証拠が実証される。ヨーロッパ人での遺伝子関連解析により、ＡＮＧＰＴＬ７でのレアミスセンス変異体であるＧｌｎ１７５Ｈｉｓ（ｒｓ２８９９１００９）は、ＩＯＰの低下及び緑内障のリスクの低下と関連することが特定された。ＡＮＧＰＴＬ７でのｐＬＯＦ変異体であるＡｒｇ１７７＊（ｒｓ１４３４３５０７２）もまた、やはりＩＯＰの低下と関連することが特定され、Ｇｌｎ１７５Ｈｉｓ保有者は、ＡＮＧＰＴＬ７活性の喪失または低下を介して緑内障から保護されていることが示唆される。この仮説と一致して、ＡＮＧＰＴＬ７でのいくつかのごくレアな変異体は、集合体として、ＩＯＰ低下と関連しており、ＡＮＧＰＴＬ７の追加のｐＬＯＦ変異体であるＴｒｐ１８８＊がアフリカ系個人で豊富であり、これらの人々でもまた、緑内障から保護される傾向にあることが示された。以上をまとめると、遺伝子データは、ＡＮＧＰＴＬ７の下方制御と緑内障からの保護の間の因果関係を強く示している。マウス、ヒト及びアフリカミドリザル全体の眼組織でのＲＮＡシーケンシング及びインサイチュハイブリダイゼーションのデータでは、角膜及び線維柱帯で最も強いＡＮＧＰＴＬ７発現が示された。
【0409】
本明細書に記載されている改変に加え、記載されている主題のさまざまな改変は、前述の記載から当業者には明らかとなるであろう。そのような改変もまた、添付の特許請求の範囲内に入ることが意図される。本出願で引用される各参照（学術論文、米国特許及び非米国特許、特許出願公開、国際特許出願公開、遺伝子バンク受託番号等が含まれるが、これらに限定されない）は、その全体が、あらゆる目的のために参照により本明細書に組み込まれる。
【図1】
【図2A】
【図2B】
【図2C】
【図2D】
【図2E】
【図2F】
【図3】
【図4A】
【図4B】
【図4C】
【図4D】
【図4E】
【図5】
【図6A】
【図6B】
【図7A】
【図7B】
【図7C】
【図7D】
【図8A】
【図8B】
【図8C】
【図8D】
【図8E】
【図9A】
【図9B】
【図9C】
【図9D】
【図9E】
【配列表】
【手続補正書】
【提出日】2024-12-26
【手続補正1】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項1】
ＩＯＰが増大している患者を治療する方法であって、前記患者にアンジオポエチン様７（ＡＮＧＰＴＬ７）阻害剤を投与することを含む、前記方法。
【手続補正2】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】