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特許7168955ポリイソプレノイドの製造方法、ベクター、形質転換植物、空気入りタイヤの製造方法及びゴム製品の製造方法
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】
(24)【登録日】2022-11-01
(45)【発行日】2022-11-10
(54)【発明の名称】ポリイソプレノイドの製造方法、ベクター、形質転換植物、空気入りタイヤの製造方法及びゴム製品の製造方法
(51)【国際特許分類】
C12N 15/54 20060101AFI20221102BHJP
C12P 5/02 20060101ALI20221102BHJP
C12N 15/82 20060101ALI20221102BHJP
A01H 1/00 20060101ALI20221102BHJP
【ＦＩ】
C12N15/54
C12P5/02 ZNA
C12N15/82 122Z
A01H1/00 A
【請求項の数】
17
(21)【出願番号】P 2018166009
(22)【出願日】2018-09-05
(65)【公開番号】P2020036560
(43)【公開日】2020-03-12
【審査請求日】2021-05-06
(73)【特許権者】
【識別番号】000183233
【氏名又は名称】住友ゴム工業株式会社
(73)【特許権者】
【識別番号】504157024
【氏名又は名称】国立大学法人東北大学
(73)【特許権者】
【識別番号】504160781
【氏名又は名称】国立大学法人金沢大学
(74)【代理人】
【識別番号】110000914
【氏名又は名称】弁理士法人ＷｉｓｅＰｌｕｓ
(72)【発明者】
【氏名】山口 晴彦
(72)【発明者】
【氏名】井之上 ゆき乃
(72)【発明者】
【氏名】伏原 和久
(72)【発明者】
【氏名】高橋 征司
(72)【発明者】
【氏名】中山 亨
(72)【発明者】
【氏名】山下 哲
【審査官】西 賢二
(56)【参考文献】
【文献】特開２０１４－２３９６６４（ＪＰ，Ａ）
【文献】特開２０１４－２１２７０６（ＪＰ，Ａ）
【文献】国際公開第２０１８／１１６７２６（ＷＯ，Ａ１）
【文献】国際公開第２０１７／００２８１８（ＷＯ，Ａ１）
【文献】特開２０１６－１５４４５８（ＪＰ，Ａ）
【文献】特開２０１７－０１２０５８（ＪＰ，Ａ）
【文献】特開２０１３－１６２７７６（ＪＰ，Ａ）
【文献】特開２０１６－０５９３１３（ＪＰ，Ａ）
【文献】PNAS，Vol. 106，2009年，pp. 10865-10870
【文献】The Plant Journal，2013年，Vol. 73，pp. 640-652
(58)【調査した分野】(Int.Cl.，ＤＢ名)
Ｃ１２Ｎ １５／００－１５／９０
Ｃ１２Ｐ １／００－４１／００
Ａ０１Ｈ １／００－１７／００
ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）
ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ／ＷＰＩＤＳ（ＳＴＮ）
ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ／ＤＤＢＪ／ＧｅｎｅＳｅｑ
ＵｎｉＰｒｏｔ／ＧｅｎｅＳｅｑ
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させる結合工程を含み、前記結合工程が、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて蛋白質合成を行い、ゴム粒子に、ネリル二リン酸合成酵素を結合させる工程であるポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項2】
前記ポリイソプレノイドが、１００％シス型のポリイソプレノイドである請求項１記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項3】
前記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子が、植物由来である請求項１又は２記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項4】
前記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子が、トマト由来である請求項１～３のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項5】
前記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子が、以下の［１］又は［２］のいずれかに記載のＤＮＡからなる請求項１～４のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法。［１］配列番号７で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［２］配列番号７で表される塩基配列と９０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
【請求項6】
前記ネリル二リン酸合成酵素が、Ｈｅｌｉｘ３部位を、炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位に置換した変異蛋白質である請求項１～５のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項7】
前記無細胞蛋白合成溶液が、胚芽抽出物を含む請求項１～６のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項8】
前記胚芽抽出物が、小麦由来である請求項７記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項9】
前記無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が、５～５０ｇ／Ｌである請求項１～８のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法。
【請求項10】
請求項１～９のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び前記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法。
【請求項11】
請求項１～９のいずれかに記載のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び前記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法。
【請求項12】
乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結されたネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を含むベクターを植物に導入することにより、該植物におけるポリイソプレノイドの生産量を向上させる方法。
【請求項13】
前記乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターが、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）をコードする遺伝子のプロモーター、及び、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）をコードする遺伝子のプロモーターからなる群より選択される少なくとも１種である請求項１２記載のポリイソプレノイドの生産量を向上させる方法。
【請求項14】
乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結されたネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を含むベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び前記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法。
【請求項15】
前記乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターが、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）をコードする遺伝子のプロモーター、及び、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）をコードする遺伝子のプロモーターからなる群より選択される少なくとも１種である請求項１４記載の空気入りタイヤの製造方法。
【請求項16】
乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結されたネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を含むベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、前記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び前記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法。
【請求項17】
前記乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターが、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）をコードする遺伝子のプロモーター、及び、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）をコードする遺伝子のプロモーターからなる群より選択される少なくとも１種である請求項１６記載のゴム製品の製造方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、ポリイソプレノイドの製造方法、ベクター、形質転換植物、空気入りタイヤの製造方法、及びゴム製品の製造方法に関する。
【背景技術】
【0002】
現在、工業用ゴム製品に用いられている天然ゴム（ポリイソプレノイドの１種）は、トウダイグサ科のパラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）や桑科植物のインドゴムノキ（Ｆｉｃｕｓ ｅｌａｓｔｉｃａ）などのゴム産生植物を栽培することで得られるが、このような天然ゴムは、イソプレン単位がシス型に結合したポリイソプレノイドである。ただし、植物内で合成される天然ゴムは、主骨格はシス型で連結されるが、開始末端（ω末端）としてはトランス型のファルネシル二リン酸（Ｅ，Ｅ－ＦＰＰ）が用いられるため、トランス型が一部に入ってしまい、ほぼシス型ではあるが、全てのイソプレン単位がシス型で連結されたものはこれまで存在しなかった。
【0003】
自然界では、ジメチルアリル二リン酸（ＤＭＡＰＰ）とイソペンテニル二リン酸（ＩＰＰ）をシス型に結合する酵素として、ネリル二リン酸合成酵素が知られているが、当該酵素は炭素数１０までしかイソプレノイド鎖を伸長させることができないため、短鎖の１００％シス型のイソプレノイド鎖は合成できるが、高分子量のポリイソプレノイドを合成することはできないものである。
【0004】
一方、イソプレン単位を化学的に結合して得られる合成ゴムであるイソプレンゴムにおいても、重合反応を完全にシス型に制御することは困難であり、重合反応の途中でトランス型の結合が入ってしまう。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0005】
上述のように、自然界でも、化学合成においても、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成することはできず、全てのイソプレン単位がシス型で連結された、１００％シス型のポリイソプレノイドはこれまで存在しなかった。
【0006】
本発明は、前記課題を解決し、生体外で、１００％シス型のポリイソプレノイドの合成を可能にする、ポリイソプレノイドの製造方法を提供することを目的とする。
【0007】
本発明はまた、前記課題を解決し、遺伝子組換え技術により植物体に導入することでポリイソプレノイドの生産量を向上させることができるベクターを提供することを目的とする。また、該ベクターが導入された形質転換植物、並びに、該ベクターを植物に導入することにより、該植物におけるシス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドの生産量を向上させる方法を提供することも目的とする。
【課題を解決するための手段】
【0008】
本発明は、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させる結合工程を含むポリイソプレノイドの製造方法に関する。以降、この発明を本発明の第１の発明とし、第１の本発明とも称する。
【0009】
上記ポリイソプレノイドは、１００％シス型のポリイソプレノイドであることが好ましい。
【0010】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、植物由来であることが好ましい。
【0011】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、トマト由来であることが好ましい。
【0012】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、以下の［１］又は［２］のいずれかに記載のＤＮＡからなることが好ましい。
［１］配列番号７で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［２］配列番号７で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
［１］配列番号７で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［２］配列番号７で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
【0013】
上記ネリル二リン酸合成酵素は、Ｈｅｌｉｘ３部位を、炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位に置換した変異蛋白質であることが好ましい。
【0014】
上記結合工程は、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて蛋白質合成を行い、ゴム粒子に、ネリル二リン酸合成酵素を結合させる工程であることが好ましい。
【0015】
上記無細胞蛋白合成溶液は、胚芽抽出物を含むことが好ましい。
【0016】
上記胚芽抽出物は、小麦由来であることが好ましい。
【0017】
上記無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度は、５～５０ｇ／Ｌであることが好ましい。
【0018】
第１の本発明はまた、上記第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び上記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法に関する。
【0019】
第１の本発明はまた、上記第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法に関する。
【0020】
本発明はまた、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結されたネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を含むベクターに関する。以降、この発明を本発明の第２の発明とし、第２の本発明とも称する。
【0021】
上記乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターは、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）をコードする遺伝子のプロモーター、及び、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）をコードする遺伝子のプロモーターからなる群より選択される少なくとも１種であることが好ましい。
【0022】
第２の本発明はまた、上記いずれかのベクターが導入された形質転換植物に関する。
【0023】
第２の本発明はまた、上記いずれかのベクターを植物に導入することにより、該植物におけるシス型イソプレノイドの生産量を向上させる方法に関する。
【0024】
第２の本発明はまた、上記いずれかのベクターを植物に導入することにより、該植物におけるポリイソプレノイドの生産量を向上させる方法に関する。
【0025】
第２の本発明はまた、上記いずれかのベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び上記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法に関する。
【0026】
第２の本発明はまた、上記いずれかのベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法に関する。
【発明の効果】
【0027】
第１の本発明によれば、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させる結合工程を含むポリイソプレノイドの製造方法であるので、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることで、ゴム粒子中に１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することができ、効率的に反応槽（試験管、プラントなど）内でポリイソプレノイドを生産することが可能となる。
【0028】
第１の本発明の空気入りタイヤの製造方法は、第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び上記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法であるので、ポリイソプレノイド製造時の製造効率が高い手法で得られたポリイソプレノイドから空気入りタイヤを製造するため、植物資源を有効に利用でき、環境に配慮して空気入りタイヤを製造することができる。
【0029】
第１の本発明のゴム製品の製造方法は、第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法であるので、ポリイソプレノイド製造時の製造効率が高い手法で得られたポリイソプレノイドからゴム製品を製造するため、植物資源を有効に利用でき、環境に配慮してゴム製品を製造することができる。
【0030】
第２の本発明のベクターは、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーター、及び、該プロモーターに機能的に連結されたネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を含むベクターである。そして、該ベクターを植物に導入することにより、該ベクターに含まれる、ポリイソプレノイド生合成に関わる蛋白質をコードする遺伝子が乳管特異的に発現し、当該植物におけるシス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドの生産量を向上させることができる。
【0031】
第２の本発明の空気入りタイヤの製造方法は、第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び上記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法であるので、ポリイソプレノイド生産量の向上した形質転換植物から得られるポリイソプレノイドから空気入りタイヤを製造するため、植物資源を有効に利用でき、環境に配慮して空気入りタイヤを製造することができる。
【0032】
第２の本発明のゴム製品の製造方法は、第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法であるので、ポリイソプレノイド生産量の向上した形質転換植物から得られるポリイソプレノイドから空気入りタイヤを製造するため、植物資源を有効に利用でき、環境に配慮してゴム製品を製造することができる。
【図面の簡単な説明】
【0033】
【図1】実施例において透析法を行っている様子を示す概略図である。
【図2】実施例１、２、比較例１において合成された超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布の測定結果を表すグラフである。
【図3】実施例において用いられたネリル二リン酸合成酵素のアミノ酸配列のマルチプルシーケンスアライメントを行った様子を示す概略図である。
【図4】実施例において用いられたネリル二リン酸合成酵素のアミノ酸配列のマルチプルシーケンスアライメントを行った様子を示す概略図である。
【図5】種々の生物由来の炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのマルチプルシーケンスアライメントを行った様子を示す概略図である。
【発明を実施するための形態】
【0034】
本明細書においては、第１の本発明と第２の本発明を合わせて本発明ともいう。まず、第１の本発明について説明し、続いて第２の本発明について説明する。
（第１の本発明）
第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法は、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させる結合工程を含む。
本発明者らは、生体外で、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることで、ゴム粒子中に１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することができることを初めて見出した。ネリル二リン酸合成酵素は、ゴム粒子上に配置され、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成することで、ポリイソプレノイド合成の開始末端（ω末端）を用意し、ゴム粒子によるゴム合成に関与しているものと推測される。より具体的には、ネリル二リン酸合成酵素によって合成されたイソプレン単位がシス型で連結されたネリル二リン酸を開始末端として、ゴム粒子上に存在する、イソプレノイド化合物の鎖長をシス型に延長する反応を触媒するシス型プレニルトランスフェラーゼ等によりポリイソプレノイドが合成されることから、１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドが合成されるものと考えられる。したがって、第１の本発明の製造方法のように、生体外で（例えば、反応槽（試験管、プラントなど）内で）、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることで、ゴム粒子中に１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することができ、効率的に反応槽（試験管、プラントなど）内でポリイソプレノイドを生産することができる。
（第１の本発明）
第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法は、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させる結合工程を含む。
本発明者らは、生体外で、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることで、ゴム粒子中に１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することができることを初めて見出した。ネリル二リン酸合成酵素は、ゴム粒子上に配置され、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成することで、ポリイソプレノイド合成の開始末端（ω末端）を用意し、ゴム粒子によるゴム合成に関与しているものと推測される。より具体的には、ネリル二リン酸合成酵素によって合成されたイソプレン単位がシス型で連結されたネリル二リン酸を開始末端として、ゴム粒子上に存在する、イソプレノイド化合物の鎖長をシス型に延長する反応を触媒するシス型プレニルトランスフェラーゼ等によりポリイソプレノイドが合成されることから、１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドが合成されるものと考えられる。したがって、第１の本発明の製造方法のように、生体外で（例えば、反応槽（試験管、プラントなど）内で）、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることで、ゴム粒子中に１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することができ、効率的に反応槽（試験管、プラントなど）内でポリイソプレノイドを生産することができる。
【0035】
更に、野生型のネリル二リン酸合成酵素は炭素数１０までしかイソプレノイド鎖を伸長させることが出来ず、ポリイソプレノイド合成の開始末端の提供までしかできないが、ネリル二リン酸合成酵素の生成物の鎖長決定に寄与すると考えられるＨｅｌｉｘ３部位を、中鎖以上（炭素数３５以上）のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位の配列に置換することにより、ネリル二リン酸合成酵素自身が１００％シス型のポリイソプレノイドを合成することが可能となることをも本発明者らは初めて見出した。
【0036】
自然界に存在する天然ゴムの開始末端は必ずトランス型のイソプレノイド鎖であり、ゴム粒子に結合しているＣＰＴ（シス型プレニルトランスフェラーゼ）はトランス型のイソプレノイド鎖を開始末端として認識するとされてきた。酵素は厳密な基質特異性を有しており、シス型のネリル二リン酸を開始末端として利用できるかはわからなかった。
また、上述のとおり、ネリル二リン酸合成酵素は、炭素数１０までしかイソプレノイド鎖を伸長させることができず、短鎖のイソプレノイド鎖しか合成できないものであることが知られていた。
このような中で、第１の本発明の製造方法においては、ネリル二リン酸合成酵素をゴム粒子に結合させることにより、ネリル二リン酸合成酵素の生成物をゴム粒子に結合しているＣＰＴが利用することで、１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することが可能となったものであり、この結果は、当業者の予測することのできない驚くべき結果といえる。そして更には、ネリル二リン酸合成酵素に上述のような変異を導入してゴム粒子に結合させることにより、ネリル二リン酸合成酵素自身で１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することが可能となり、この結果も、当業者の予測することのできない驚くべき結果といえる。
また、上述のとおり、ネリル二リン酸合成酵素は、炭素数１０までしかイソプレノイド鎖を伸長させることができず、短鎖のイソプレノイド鎖しか合成できないものであることが知られていた。
このような中で、第１の本発明の製造方法においては、ネリル二リン酸合成酵素をゴム粒子に結合させることにより、ネリル二リン酸合成酵素の生成物をゴム粒子に結合しているＣＰＴが利用することで、１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することが可能となったものであり、この結果は、当業者の予測することのできない驚くべき結果といえる。そして更には、ネリル二リン酸合成酵素に上述のような変異を導入してゴム粒子に結合させることにより、ネリル二リン酸合成酵素自身で１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することが可能となり、この結果も、当業者の予測することのできない驚くべき結果といえる。
【0037】
なお、第１の本発明の製造方法は、上記結合工程を含む限りその他の工程を含んでいてもよく、また、各工程は１回行われてもよいし、複数回繰り返し行われてもよい。
また、第１の本発明において、ゴム粒子に結合するネリル二リン酸合成酵素の量は特に限定されない。
また、第１の本発明において、ゴム粒子に結合するネリル二リン酸合成酵素の量は特に限定されない。
【0038】
本明細書において、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素が結合するとは、ネリル二リン酸合成酵素の全部又は一部がゴム粒子中に取り込まれる又はゴム粒子の膜構造に挿入される、といったことを意味するが、これに限らず、ゴム粒子表面又は内部に局在する等の場合をも意味する。また更には、ゴム粒子に結合している蛋白質とネリル二リン酸合成酵素が複合体を形成し、複合体としてゴム粒子上に存在する場合もゴム粒子に結合しているとの概念範囲に含まれる。
【0039】
上記ゴム粒子の由来は特に限定されず、例えば、パラゴムノキ、ロシアンタンポポ、グアユール、ノゲシなどのゴム産生植物のラテックス由来であればよい。
【0040】
また、上記ゴム粒子の粒子径も特に限定されず、所定の粒子径のものを分取して用いてもよいし、様々な粒子径のものが含まれた状態のものを使用してもよく、所定の粒子径のものを分取して用いる場合であっても、用いられるゴム粒子としては、粒子径の小さいＳｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ（ＳＲＰ）を用いてもよいし、粒子径の大きいＬａｒｇｅ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅｓ（ＬＲＰ）を用いてもよい。
【0041】
上記所定の粒子径のゴム粒子を分取する方法としては、通常行われる方法を採用することができるが、例えば、遠心分離処理、より好ましくは多段階の遠心分離処理、を行う方法などが挙げられる。具体的には、５００～１５００×ｇでの遠心分離処理、１７００～２５００×ｇでの遠心分離処理、７０００～９０００×ｇでの遠心分離処理、１５０００～２５０００×ｇでの遠心分離処理、４００００～６００００×ｇでの遠心分離処理を順に行う方法が挙げられる。なお、各遠心分離処理の処理時間としては、２０分以上が好ましく、３０分以上がより好ましく、４０分以上が更に好ましい。一方、１２０分以下が好ましく、９０分以下がより好ましい。また、各遠心分離処理の処理温度としては、０～１０℃が好ましく、２～８℃がより好ましく、４℃が特に好ましい。
【0042】
上記結合工程においては、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質がゴム粒子に結合される。
【0043】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、その由来は特に制限されず、微生物由来であっても、動物由来であっても、植物由来であってもよいが、植物由来であることが好ましく、Ｓｏｌａｎｕｍ属由来であることがより好ましい。中でも、トマト由来であることが特に好ましい。
【0044】
なお、本明細書において、ネリル二リン酸合成酵素は、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質としてネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素である。上記ネリル二リン酸合成酵素としては、トマト由来のＮＤＰＳなどが挙げられる。
【0045】
ここで、本明細書において、イソプレノイド化合物とは、イソプレン単位（Ｃ５Ｈ８）を有する化合物を意味する。また、シス型イソプレノイドは、イソプレン単位がシス型に結合したイソプレノイド化合物を有する化合物であり例えば、ネリル二リン酸、シス－ファルネシル二リン酸（Ｚ，Ｚ－ファルネシル二リン酸）、ネリルネリル二リン酸、シス型ポリイソプレノイドなどが挙げられる。
【0046】
また、第１の本発明においては、生体外で、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることで、ゴム粒子中にポリイソプレノイドを合成することができるが、上述のように、ネリル二リン酸合成酵素は、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、イソプレン単位がシス型で連結されたネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素であり、ゴム粒子上で、この合成されたネリル二リン酸を開始末端として、イソプレノイド化合物の鎖長をシス型に延長する反応が進行することで、ポリイソプレノイドが合成されるものと推測され、反応に関与する酵素の反応特異性から、１００％シス型のポリイソプレノイドが合成されるものと推測される。したがって、第１の本発明においては、トランス型が含まれず、全てのイソプレン単位がシス型で連結された、１００％シス型のポリイソプレノイドが得られるといえる。すなわち、第１の本発明において製造されるポリイソプレノイドが、１００％シス型のポリイソプレノイドであることもまた、本発明の好適な実施形態の１つである。
【0047】
また、上述のように、第１の本発明においては、トランス型が含まれず、全てのイソプレン単位がシス型で連結された、短鎖ではないポリイソプレノイドを得ることができるものであるが、第１の本発明において製造されるポリイソプレノイドの重量平均分子量（Ｍｗ）としては、１０万以上であることが好ましく、８０万以上であることがより好ましい。また、上限は特に限定されないが、通常２００万程度である。
【0048】
なお、本明細書において、重量平均分子量（Ｍｗ）は、ゲルパーミエーションクロマトグラフ（ＧＰＣ）（東ソー（株）製ＧＰＣ－８０００シリーズ、検出器：示差屈折計、カラム：東ソー（株）製のＴＳＫＧＥＬ ＳＵＰＥＲＭＵＬＴＩＰＯＲＥ ＨＺ－Ｍ）による測定値を基に標準ポリスチレン換算により求めることができる。
【0049】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、ゴムを産生しない植物由来であり、ネリル二リン酸合成酵素は当然、自然状態ではゴム合成に関与していない。にもかかわらず、本発明においては、ネリル二リン酸合成酵素であれば、ゴム粒子に結合させることで、ゴム粒子中に１００％シス型のポリイソプレノイドを含むポリイソプレノイドを合成することができる。
【0050】
本発明において用いるネリル二リン酸合成酵素はゴム粒子との親和性を上げるために、Ｎ末端側に膜貫通領域を持っていることが望ましく、野生型として持っていない場合はネリル二リン酸合成酵素のＮ末端側に人工的に膜貫通領域を融合させても良い。融合させる膜貫通領域のアミノ酸配列は特に限定されないが、自然界で本来ゴム粒子に結合している蛋白質が持つ膜貫通領域のアミノ酸配列であることが望ましい。
【0051】
あるいは、本発明において用いるネリル二リン酸合成酵素はゴム粒子との親和性を上げるために、野生型として末端にシグナル配列を持っている場合は、ネリル二リン酸合成酵素のシグナル配列を除いて用いるのが好ましいが、付加されたものを用いてもよい。
【0052】
上記シグナル配列は、生体内において、リボソームで生合成された蛋白質が各オルガネラ等へ輸送、局在化されるために用いられる、蛋白質中に存在する配列であり、蛋白質が輸送、局在化されるオルガネラごとに異なる配列となっている。
例えば、配列番号２で示されるトマト由来のＮＤＰＳであれば、配列番号２における２位から４４位までのアミノ酸配列がシグナル配列に相当する。
例えば、配列番号２で示されるトマト由来のＮＤＰＳであれば、配列番号２における２位から４４位までのアミノ酸配列がシグナル配列に相当する。
【0053】
上記ネリル二リン酸合成酵素としては、シグナル配列を除いたものを用いることが好ましく、そのようなネリル二リン酸合成酵素の具体例としては、下記［１］が挙げられる。
［１］配列番号８で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
［１］配列番号８で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
【0054】
また、蛋白質は、元のアミノ酸配列において、１若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、又は付加を含む場合であっても本来持つ機能を有する場合があることが知られている。従って、上記ネリル二リン酸合成酵素の具体例としては、下記［２］も挙げられる。
［２］配列番号８で表されるアミノ酸配列において、１若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び／又は付加を含む配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
［２］配列番号８で表されるアミノ酸配列において、１若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び／又は付加を含む配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
【0055】
なお、上記ネリル二リン酸合成酵素としての機能を維持するためには、配列番号８で表されるアミノ酸配列において、好ましくは１若しくは複数個のアミノ酸、より好ましくは１～５２個のアミノ酸、更に好ましくは１～３９個のアミノ酸、更により好ましくは１～２６個のアミノ酸、更に好ましくは１～１８個のアミノ酸、特に好ましくは１～１３個のアミノ酸、最も好ましくは１～６個のアミノ酸、より最も好ましくは１～３個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び／又は付加を含むアミノ酸配列であることが好ましい。
【0056】
アミノ酸置換の例としては、保存的置換が好ましく、具体的には以下のカッコ内のグループ内での置換が挙げられる。例えば、（グリシン、アラニン）（バリン、イソロイシン、ロイシン）（アスパラギン酸、グルタミン酸）（アスパラギン、グルタミン）（セリン、トレオニン）（リジン、アルギニン）（フェニルアラニン、チロシン）である。
【0057】
また、蛋白質は、元のアミノ酸配列と配列同一性の高いアミノ酸配列を有する蛋白質も同様の機能を有する場合があることが知られている。従って、上記ネリル二リン酸合成酵素の具体例としては、下記［３］も挙げられる。
［３］配列番号８で表されるアミノ酸配列と８０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
［３］配列番号８で表されるアミノ酸配列と８０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
【0058】
なお、上記ネリル二リン酸合成酵素としての機能を維持するためには、配列番号８で表されるアミノ酸配列との配列同一性は、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９３％以上、より更に好ましくは９５％以上、特に好ましくは９８％以上、最も好ましくは９９％以上である。
【0059】
本明細書において、アミノ酸配列や塩基配列の配列同一性は、Ｋａｒｌｉｎ ａｎｄ ＡｌｔｓｃｈｕｌによるアルゴリズムＢＬＡＳＴ［Ｐｒｏ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． ＵＳＡ， ９０， ５８７３（１９９３）］やＦＡＳＴＡ［Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｅｎｚｙｍｏｌ．， １８３， ６３ （１９９０）］を用いて決定することができる。
【0060】
上記酵素活性を有する蛋白質であることを確認する方法としては、例えば、従来公知の方法を用いることができ、例えば、大腸菌などを用いて、目的の蛋白質をコードする遺伝子を導入した形質転換体により、目的蛋白質を発現させ、目的蛋白質の機能の有無をそれぞれの活性測定法により、活性測定等を行う方法が挙げられる。
【0061】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、ネリル二リン酸合成酵素をコードし、発現させてネリル二リン酸合成酵素を産出できるものであれば特に制限されないが、上述したとおり、上記ネリル二リン酸合成酵素としてはシグナル配列を除いたものを用いることが好ましく、そのようなネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子としては、具体的には、下記［１］又は［２］が挙げられる。
［１］配列番号７で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［２］配列番号７で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
［１］配列番号７で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［２］配列番号７で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、ネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
【0062】
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、特定の塩基配列を有するＤＮＡまたは該ＤＮＡの一部にＤＮＡがハイブリダイズする工程である。したがって、該特定の塩基配列を有するＤＮＡまたは該ＤＮＡの一部の塩基配列は、ノーザンまたはサザンブロット解析のプローブとして有用であるか、またはＰＣＲ（Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ）解析のオリゴヌクレオチドプライマーとして使用できる長さのＤＮＡであってもよい。プローブとして用いるＤＮＡとしては、少なくとも１００塩基以上、好ましくは２００塩基以上、より好ましくは５００塩基以上のＤＮＡをあげることができるが、少なくとも１０塩基以上、好ましくは１５塩基以上のＤＮＡであってもよい。
【0063】
ＤＮＡのハイブリダイゼーション実験の方法はよく知られており、例えばモレキュラー・クローニング第２版、第３版（２００１年）、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｆｏｒ Ｇｅｎｅｒａｌ ａｎｄ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂａｃｔｅｒｉｏｌｏｇｙ， ＡＳＭ Ｐｒｅｓｓ（１９９４）、Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ｍｅｔｈｏｄｓ ｍａｎｕａｌ， Ａｃａｄｅｍｉｃ ｐｒｅｓｓ（Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ）に記載の他、多数の他の標準的な教科書に従ってハイブリダイゼーションの条件を決定し、実験を行うことができる。
【0064】
上記のストリンジェントな条件とは、例えばＤＮＡを固定化したフィルターとプローブＤＮＡとを５０％ホルムアミド、５×ＳＳＣ（７５０ｍＭの塩化ナトリウム、７５ｍＭのクエン酸ナトリウム）、５０ｍＭのリン酸ナトリウム（ｐＨ７．６）、５×デンハルト溶液、１０％の硫酸デキストラン、および２０μｇ／ｌの変性させたサケ精子ＤＮＡを含む溶液中で４２℃で一晩、インキュベートした後、例えば約６５℃の０．２×ＳＳＣ溶液中で該フィルターを洗浄する条件をあげることができるが、より低いストリンジェント条件を用いることもできる。ストリンジェントな条件の変更は、ホルムアミドの濃度調整（ホルムアミドの濃度を下げるほど低ストリンジェントになる）、塩濃度および温度条件の変更により可能である。低ストリンジェント条件としては、例えば６×ＳＳＣＥ（２０×ＳＳＣＥは、３ｍｏｌ／ｌの塩化ナトリウム、０．２ｍｏｌ／ｌのリン酸二水素ナトリウム、０．０２ｍｏｌ／ｌのＥＤＴＡ、ｐＨ７．４）、０．５％のＳＤＳ、３０％のホルムアミド、１００μｇ／ｌの変性させたサケ精子ＤＮＡを含む溶液中で、３７℃で一晩インキュベートした後、５０℃の１×ＳＳＣ、０．１％ＳＤＳ溶液を用いて洗浄する条件をあげることができる。また、さらに低いストリンジェントな条件としては、上記した低ストリンジェント条件において、高塩濃度（例えば５×ＳＳＣ）の溶液を用いてハイブリダイゼーションを行った後、洗浄する条件をあげることができる。
【0065】
上記した様々な条件は、ハイブリダイゼーション実験のバックグラウンドを抑えるために用いるブロッキング試薬を添加、または変更することにより設定することもできる。上記したブロッキング試薬の添加は、条件を適合させるために、ハイブリダイゼーション条件の変更を伴ってもよい。
【0066】
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なＤＮＡとしては、例えばＢＬＡＳＴおよびＦＡＳＴＡ等のプログラムを用いて、上記パラメータに基づいて計算したときに、配列番号７で表される塩基配列と少なくとも８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、更に好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列同一性を有する塩基配列からなるＤＮＡをあげることができる。
【0067】
上記したＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡが、所定の酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡであることを確認する方法としては、従来公知の方法を用いることができ、例えば、大腸菌などを用いて、目的の蛋白質をコードする遺伝子を導入した形質転換体により、目的蛋白質を発現させ、目的蛋白質の機能の有無をそれぞれの活性測定法により、活性測定等を行う方法が挙げられる。
【0068】
また、上記蛋白質のアミノ酸配列及び塩基配列を同定する方法は、従来公知の方法を用いることができ、例えば、生育する植物から、Ｔｏｔａｌ ＲＮＡを抽出し、必要に応じてｍＲＮＡを精製し、逆転写反応によりｃＤＮＡを合成する。次に目的蛋白質に相当する既知の蛋白質のアミノ酸配列をもとに、縮重プライマーを設計し、ＲＴ－ＰＣＲを行い、部分的にＤＮＡ断片の増幅を行い、部分的に配列を同定する。次いで、ＲＡＣＥ法などを行い、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定する。ＲＡＣＥ法（Ｒａｐｉｄ Ａｍｐｌｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｃＤＮＡ Ｅｎｄｓ法）とは、ｃＤＮＡの塩基配列が部分的に把握されているときに、その既知領域の塩基配列情報を基にＰＣＲを行って、ｃＤＮＡ末端までの未知領域をクローニングする方法で、ｃＤＮＡライブラリーの作製を経ずに、ＰＣＲ法によって全長のｃＤＮＡをクローニングすることができる方法である。
なお、縮重プライマーは、上記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、上記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したｃＤＮＡを鋳型にしてＲＴ－ＰＣＲを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
なお、縮重プライマーは、上記目的蛋白質と共通性の高い配列部位を有する植物由来の配列から作製することが好ましい。
また、上記蛋白質をコードする塩基配列が既知の場合には、その知られている塩基配列から開始コドンを含むプライマー及び終止コドンを含むプライマーを設計し、合成したｃＤＮＡを鋳型にしてＲＴ－ＰＣＲを行うことで全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定することができる。
【0069】
上記ネリル二リン酸合成酵素としては、Ｈｅｌｉｘ３部位を、炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位に置換した変異蛋白質であることが好ましい。
【0070】
上記ネリル二リン酸合成酵素のＨｅｌｉｘ３部位とは、ネリル二リン酸合成酵素の生成物の鎖長決定に寄与すると考えられている部位であり、例えば、配列番号２で示されるトマト由来のＮＤＰＳのアミノ酸配列では、１４７位から１６３位までのアミノ酸配列に相当する。
【0071】
上記ネリル二リン酸合成酵素を、上述のような変異蛋白質とすることによって、ネリル二リン酸合成酵素の生成物の鎖長決定に寄与すると考えられるＨｅｌｉｘ３部位が、中鎖以上（炭素数３５以上）のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位の配列に置換され、ネリル二リン酸合成酵素自身が１００％シス型のポリイソプレノイドを合成することが可能となる。
【0072】
上記ネリル二リン酸合成酵素のＨｅｌｉｘ３部位、及び、上記ネリル二リン酸合成酵素のＨｅｌｉｘ３部位と置換される、炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位は、結晶構造が既知であるマイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）とのマルチアライメントアミノ酸比較により、当該マイクロコッカス属菌由来のＵＰＳのＨｅｌｉｘ３部位（配列番号１５で表されるマイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）における９０位から１１０位のアミノ酸配列〔ＫＬＰＧＤＦＬＮＴＦＬＰＥＬＩＥＫＮＶＫＶ〕）に対応する部位として定義することができ、これにより、当業者であれば、上記ネリル二リン酸合成酵素のアミノ酸配列、及び、上記炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのアミノ酸配列から当該定義によりＨｅｌｉｘ３部位を一義的に決定することが可能である。
【0073】
上記ネリル二リン酸合成酵素のＨｅｌｉｘ３部位は、炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのＨｅｌｉｘ３部位のアミノ酸配列、又は、該アミノ酸配列と８０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列と置換されることが好ましい。上記配列同一性としては、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９５％以上、特に好ましくは９８％以上、最も好ましくは９９％以上である。
【0074】
ここで、上記炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼ（ＣＰＴ）としては、例えば、パラゴムノキ由来のＣＰＴ（ＨＲＴ１、ＨＲＴ２、ＣＰＴ３～５）、シロイヌナズナ由来のＡｔＣＰＴ１～９、レタス由来のＣＰＴ１～３、Ｔａｒａｘａｃｕｍ ｂｒｅｖｉｃｏｒｎｉｃｕｌａｔｕｍ由来のＣＰＴ１～３、大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）、マイクロコッカス属菌由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）、酵母由来のＳＲＴ１、タバコ由来のＤＤＰＳ、マウス由来のＤＤＰＳ、ヒト由来のＨＤＳなどが挙げられる。
【0075】
より具体的には、上記ネリル二リン酸合成酵素のＨｅｌｉｘ３部位が、配列番号１３で表されるシロイヌナズナ由来のＣＰＴ４（ＡｔＣＰＴ４）における１４７位から１６７位のＨｅｌｉｘ３部位のアミノ酸配列（ＳＬＦＥＲＳＬＫＴＥＦＱＮＬＡＫＮＮＶＲＩ）で置換される形態が本発明の好適な実施形態の１つである。
【0076】
その他、上記炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼ（ＣＰＴ）のＨｅｌｉｘ３部位の具体例としては、配列番号１４で表される大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）における８６位から１０６位のアミノ酸配列（ＥＬＦＶＷＡＬＤＳＥＶＫＳＬＨＲＨＮＶＲＬ）、配列番号１６で表される酵母由来のＳＲＴ１における１３６位から１６１位のアミノ酸配列（ＮＬＦＴＶＫＬＤＥＦＡＫＲＡＫＤＹＫＤＰＬＹＧＳＫＩ）、配列番号１７で表されるヒト由来のＨＤＳにおける９５位から１１８位のアミノ酸配列（ＤＬＡＲＱＫＦＳＲＬＭＥＥＫＥＫＬＱＫＨＧＶＣＩ）などが挙げられる。
【0077】
ここで、種々の生物由来の炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのマルチプルシーケンスアライメントを行った様子を示す概略図を図５に示す。これにより、マイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）のＨｅｌｉｘ３部位（配列番号１５で表されるマイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）における９０位から１１０位のアミノ酸配列）は、大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）においては、配列番号１４で表される大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）における８６位から１０６位のアミノ酸配列に対応し、酵母由来のＳＲＴ１においては、配列番号１６で表される酵母由来のＳＲＴ１における１３６位から１６１位のアミノ酸配列に対応し、ヒト由来のＨＤＳにおいては、配列番号１７で表されるヒト由来のＨＤＳにおける９５位から１１８位のアミノ酸配列に対応することが当業者であれば理解可能である。図５中、Ｈｅｌｉｘ３部位を囲んでいる。
なお、上記マルチプルシーケンスアライメントは、後述の実施例の方法により実施できる。
なお、上記マルチプルシーケンスアライメントは、後述の実施例の方法により実施できる。
【0078】
上記変異蛋白質の具体例としては、下記［４］が挙げられる。
［４］配列番号１２で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
［４］配列番号１２で表されるアミノ酸配列からなる蛋白質
【0079】
また、蛋白質は、元のアミノ酸配列において、１若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、又は付加を含む場合であっても同様の機能を有する場合があることが知られている。従って、上記変異蛋白質の具体例としては、下記［５］も挙げられる。
［５］配列番号１２で表されるアミノ酸配列において、１若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び／又は付加を含む配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
［５］配列番号１２で表されるアミノ酸配列において、１若しくは複数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び／又は付加を含む配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
【0080】
なお、上記機能を維持するためには、配列番号１２で表されるアミノ酸配列において、好ましくは１若しくは複数個のアミノ酸、より好ましくは１～５３個のアミノ酸、更に好ましくは１～４０個のアミノ酸、更により好ましくは１～２７個のアミノ酸、特に好ましくは１～１４個のアミノ酸、最も好ましくは１～６個のアミノ酸、より最も好ましくは１～３個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、及び／又は付加を含むアミノ酸配列であることが好ましい。
【0081】
アミノ酸置換の例としては、保存的置換が好ましく、具体的には以下のカッコ内のグループ内での置換が挙げられる。例えば、（グリシン、アラニン）（バリン、イソロイシン、ロイシン）（アスパラギン酸、グルタミン酸）（アスパラギン、グルタミン）（セリン、トレオニン）（リジン、アルギニン）（フェニルアラニン、チロシン）である。
【0082】
また、蛋白質は、元のアミノ酸配列と配列同一性の高いアミノ酸配列を有する蛋白質も同様の機能を有する場合があることが知られている。従って、上記変異蛋白質の具体例としては、下記［６］も挙げられる。
［６］配列番号１２で表されるアミノ酸配列と８０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
［６］配列番号１２で表されるアミノ酸配列と８０％以上の配列同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質
【0083】
なお、上記機能を維持するためには、配列番号１２で表されるアミノ酸配列との配列同一性は、好ましくは８５％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９５％以上、特に好ましくは９８％以上、最も好ましくは９９％以上である。
【0084】
上記酵素活性を有する蛋白質であることを確認する方法としては、上述したのと同様の方法が挙げられる。
【0085】
上記変異蛋白質をコードする遺伝子としては、具体的には、下記［３］又は［４］が挙げられる。
［３］配列番号１１で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［４］配列番号１１で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
［３］配列番号１１で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［４］配列番号１１で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつイソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、１００％シス型のポリイソプレノイドを合成する反応を触媒する酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡ
【0086】
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、上述したのと同様である。また、上記ストリンジェントな条件についても、上述したのと同様である。
【0087】
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なＤＮＡとしては、例えばＢＬＡＳＴおよびＦＡＳＴＡ等のプログラムを用いて、上記パラメータに基づいて計算したときに、配列番号１１で表される塩基配列と少なくとも８０％以上、好ましくは９０％以上、より好ましくは９５％以上、更に好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上の配列同一性を有する塩基配列からなるＤＮＡをあげることができる。
【0088】
上記したＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡが、所定の酵素活性を有する蛋白質をコードするＤＮＡであることを確認する方法としては、上述したのと同様の方法が挙げられる。
【0089】
なお、上記蛋白質のアミノ酸配列及び塩基配列を同定する方法は、上述したのと同様である。
【0090】
なお、上記結合工程においては、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質がゴム粒子に結合される限り、更にその他の蛋白質が結合されてもよい。
【0091】
上記その他の蛋白質の由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
【0092】
上記その他の蛋白質としては、何ら制限されずいかなる蛋白質であってもよいが、ゴム粒子のゴム合成能力の観点からは、ゴム産生植物体内でもともとゴム粒子上に存在する蛋白質であることが好ましい。なお、ゴム粒子上に存在する蛋白質は、大きくゴム粒子の膜表面に結合する蛋白質であってもよいし、ゴム粒子の膜に挿入されるように結合する蛋白質であってもよいし、上記膜に結合している蛋白質と複合体を形成して膜表面上に存在することになる蛋白質であってもよい。
【0093】
上記ゴム産生植物体内でもともとゴム粒子上に存在する蛋白質としては、例えば、シス型プレニルトランスフェラーゼ（ＣＰＴ）、Ｎｏｇｏ－Ｂ ｒｅｃｅｐｔｏｒ（ＮｇＢＲ）、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）、Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）、β－１，３－グルカナーゼ、Ｈｅｖｅｉｎなどが挙げられる。
【0094】
上記結合工程は、生体外で、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させることができればその手段は特に制限されず、例えば、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて蛋白質合成を行い、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させる方法などが挙げられる。
【0095】
上記結合工程としては、中でも、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて蛋白質合成を行い、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素を結合させる工程であることが好ましい。
すなわち、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて（より具体的には、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを混合して）蛋白質合成を行うことで、ネリル二リン酸合成酵素の結合したゴム粒子を得ることが好ましい。
なお、リポソームはリン脂質、グリセロ糖脂質、コレステロール等から構成される脂質二重膜として人工的に製造されるため、製造されたリポソームの表面には蛋白質は結合していないのに対して、ゴム産生植物のラテックスから採取されるゴム粒子も脂質膜で覆われた粒子であるが、その膜は天然由来の膜であるため、その表面には植物体内で合成された蛋白質が既に結合している。このことから、蛋白質が結合していないリポソームなどに比べて、既に蛋白質が結合しており、蛋白質で覆われた状態にあるゴム粒子に更に蛋白質を結合させるのは困難であることが予想される。また、ゴム粒子に既に結合している蛋白質が無細胞蛋白合成を阻害することも懸念される。以上のような点から、ゴム粒子共存下での無細胞蛋白合成は実現が困難であると考えられてきた。このような状況下、本発明者らは、これまでに試みられていなかった、ネリル二リン酸合成酵素の無細胞蛋白合成をゴム粒子の共存下で行ったところ、ネリル二リン酸合成酵素の結合したゴム粒子を製造することができることを見出した。
すなわち、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて（より具体的には、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを混合して）蛋白質合成を行うことで、ネリル二リン酸合成酵素の結合したゴム粒子を得ることが好ましい。
なお、リポソームはリン脂質、グリセロ糖脂質、コレステロール等から構成される脂質二重膜として人工的に製造されるため、製造されたリポソームの表面には蛋白質は結合していないのに対して、ゴム産生植物のラテックスから採取されるゴム粒子も脂質膜で覆われた粒子であるが、その膜は天然由来の膜であるため、その表面には植物体内で合成された蛋白質が既に結合している。このことから、蛋白質が結合していないリポソームなどに比べて、既に蛋白質が結合しており、蛋白質で覆われた状態にあるゴム粒子に更に蛋白質を結合させるのは困難であることが予想される。また、ゴム粒子に既に結合している蛋白質が無細胞蛋白合成を阻害することも懸念される。以上のような点から、ゴム粒子共存下での無細胞蛋白合成は実現が困難であると考えられてきた。このような状況下、本発明者らは、これまでに試みられていなかった、ネリル二リン酸合成酵素の無細胞蛋白合成をゴム粒子の共存下で行ったところ、ネリル二リン酸合成酵素の結合したゴム粒子を製造することができることを見出した。
【0096】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて行われる蛋白質合成は、いわゆる、無細胞蛋白合成法を用いたネリル二リン酸合成酵素の合成であり、生物学的機能を担持した（ｎａｔｉｖｅ状態の）ネリル二リン酸合成酵素を合成でき、当該無細胞蛋白合成法をゴム粒子の共存下で行うことにより、合成されるネリル二リン酸合成酵素をｎａｔｉｖｅ状態でゴム粒子に結合することが可能となる。
【0097】
ここで、上記無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子との共存下、蛋白質合成を行うことで、ゴム粒子にネリル二リン酸合成酵素が結合するとは、当該蛋白質合成により合成されたネリル二リン酸合成酵素の各蛋白質の全部又は一部がゴム粒子中に取り込まれる又はゴム粒子の膜構造に挿入される、といったことを意味するが、これに限らず、ゴム粒子表面又は内部に局在する等の場合をも意味する。また更には、上述のようにゴム粒子に結合している蛋白質と複合体を形成し、複合体としてゴム粒子上に存在する場合もゴム粒子に結合しているとの概念範囲に含まれる。
【0098】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡはそれぞれ、翻訳されてネリル二リン酸合成酵素を合成しうる翻訳鋳型である。
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡの由来は特に制限されず、微生物由来であっても、動物由来であっても、植物由来であってもよいが、植物由来であることが好ましく、Ｓｏｌａｎｕｍ属由来であることがより好ましい。中でも、トマト由来であることが特に好ましい。
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡの由来は特に制限されず、微生物由来であっても、動物由来であっても、植物由来であってもよいが、植物由来であることが好ましく、Ｓｏｌａｎｕｍ属由来であることがより好ましい。中でも、トマト由来であることが特に好ましい。
【0099】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡはそれぞれ、翻訳されてネリル二リン酸合成酵素を合成しうる翻訳鋳型であればその調製方法は特に制限されないが、例えば、植物の葉からホットフェノール法などによりＴｏｔａｌ ＲＮＡを抽出し、得られたＴｏｔａｌ ＲＮＡからｃＤＮＡを合成し、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子の塩基配列情報を元に作製したプライマーを用いてネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子のＤＮＡ断片を取得して、該ＤＮＡ断片を元に通常行われるインビトロでの転写反応を行うことにより調製することができる。
【0100】
上記無細胞蛋白合成溶液は、上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む限り、その他の蛋白質をコードするｍＲＮＡを含んでいてもよい。
上記その他の蛋白質をコードするｍＲＮＡとしては、翻訳されてその他の蛋白質を発現することができるものを用いることができる。なお、その他の蛋白質としては、上述したものと同様のものを挙げることができる。
上記その他の蛋白質をコードするｍＲＮＡとしては、翻訳されてその他の蛋白質を発現することができるものを用いることができる。なお、その他の蛋白質としては、上述したものと同様のものを挙げることができる。
【0101】
第１の本発明における結合工程においては、ゴム粒子の共存下でネリル二リン酸合成酵素の無細胞蛋白合成が行われることが好ましいが、当該無細胞蛋白合成は、上記無細胞蛋白合成溶液を用いて、従来と同様の方法で行うことができる。用いられる無細胞蛋白合成系としては、通常用いられる無細胞蛋白質合成手段を採用することができる。例えば、Ｒａｐｉｄ Ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ Ｓｙｓｔｅｍ ＲＴＳ５００（Ｒｏｓｈｅ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ社製）やＰｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９７：５５９－５６４（２０００）、特開２０００－２３６８９６号公報、特開２００２－１２５６９３号公報、特開２００２－２０４６８９号公報に従って調製された小麦胚芽抽出液及びその無細胞蛋白質合成系（特開２００２－２０４６８９号公報、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，９９：１４６５２－１４６５７（２００２））を使用することができる。中でも、胚芽抽出物を用いる系が好ましい。すなわち、上記無細胞蛋白合成溶液が、胚芽抽出物を含むこともまた、第１の本発明の好適な実施形態の１つである。
【0102】
上記胚芽抽出物の由来は特に限定されないが、翻訳効率の観点からは、植物の蛋白質を無細胞蛋白合成法で合成する場合には植物由来の胚芽抽出物を用いることが好ましい。特に好ましくは小麦由来の胚芽抽出物を用いることである。すなわち、上記胚芽抽出物が小麦由来であることもまた、第１の本発明の好適な実施形態の１つである。
【0103】
上記胚芽抽出物の調製方法としては特に制限されず、通常の胚芽抽出物調製方法を採用することができるが、例えば、特開２００５－２１８３５７号公報に記載された方法を採用すればよい。
【0104】
上記無細胞蛋白合成溶液は、更にサイクリックヌクレオシド一リン酸誘導体又はその塩（以降、単に「活性増強物質」とも称する。）を含むことが好ましい。該活性増強物質を含有することにより、蛋白質合成活性を更に増強させることができる。
【0105】
上記サイクリックヌクレオシド一リン酸誘導体又はその塩としては、無細胞蛋白合成活性を増強しうるものであれば特に制限されず、例えば、アデノシン－３’，５’サイクリック一リン酸及びその塩、アデノシン－３’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｓｐアイソマー）及びその塩、アデノシン－３’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｒｐアイソマー）及びその塩、グアノシン－３’，５’サイクリック一リン酸及びその塩、グアノシン－３’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｓｐアイソマー）及びその塩、グアノシン－３’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｒｐアイソマー）及びその塩、８－ブロモアデノシン－３’，５’－サイクリック一リン酸（ブロモｃＡＭＰ）及びその塩、８－（４－クロロフェニルチオ）アデノシン－３’，５’－サイクリック一リン酸（クロロフェニルチオｃＡＭＰ）及びその塩、５，６－ジクロロ－１－β－Ｄ－リボフラノシルべンジミダゾルアデノシン－３’，５’－サイクリック一リン酸（ジクロロリボフラノシルべンジミダゾルｃＡＭＰ）及びその塩、アデノシン－２’，５’サイクリック一リン酸及びその塩、アデノシン－２’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｓｐアイソマー）及びその塩、アデノシン－２’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｒｐアイソマー）及びその塩、グアノシン－２’，５’サイクリック一リン酸及びその塩、グアノシン－２’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｓｐアイソマー）及びその塩、グアノシン－２’，５’サイクリックチオ一リン酸（Ｒｐアイソマー）及びその塩等が挙げられる。
【0106】
上記サイクリックヌクレオシド一リン酸誘導体との塩を形成する塩基としては、生化学的に許容しうるもので、当該誘導体と塩を形成するものであれば特に制限されないが、中でも好ましいものとしては、例えば、ナトリウム、カリウム等のアルカリ金属原子、トリスヒドロキシアミノメタン等の有機塩基が挙げられる。
【0107】
上記活性増強物質としては、中でも、アデノシン－３’，５’サイクリック一リン酸、アデノシン－３’，５’サイクリック一リン酸ナトリウムが特に好ましい。また、これら活性増強物質は、単独で用いてもよいし、２種類以上を組み合わせて用いてもよい。
【0108】
上記活性増強物質は、あらかじめ上記無細胞蛋白合成溶液に加えておいてもよいが、当該溶液中で不安定である場合には、無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて蛋白質合成反応を行う際に加えるのが好ましい。
【0109】
上記活性増強物質の添加量としては、上記無細胞蛋白合成溶液による蛋白質合成反応が活性化（増加）しうる濃度であれば特に制限されない。具体的には、反応系中の最終濃度として、通常０．１ミリモル／リットル以上であればよい。濃度の下限は、好ましくは０．２ミリモル／リットル、より好ましくは０．４ミリモル／リットル、特に好ましくは０．８ミリモル／リットルである。他方、濃度の上限は、好ましくは２４ミリモル／リットル、より好ましくは６．４ミリモル／リットル、特に好ましくは３．２ミリモル／リットルである。
【0110】
上記活性増強物質を上記無細胞蛋白合成溶液に加える際の無細胞蛋白合成溶液の温度としては特に限定されないが、０～３０℃が好ましく、１０～２６℃がより好ましい。
【0111】
上記無細胞蛋白合成溶液は、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡ（翻訳鋳型）に加え、蛋白質合成に必須の成分であるＡＴＰ、ＧＴＰ、クレアチンリン酸、クレアチンキナーゼ、Ｌ型アミノ酸、カリウムイオン及びマグネシウムイオン等を含有し、更には必要に応じて活性増強物質を含むものであり、このような無細胞蛋白合成溶液を用いることにより無細胞蛋白合成反応系とすることができる。
なお、上記特開２００５－２１８３５７号公報に記載された方法で調製された胚芽抽出物には蛋白質合成反応に必要とされる量のｔＲＮＡが含まれているため、当該方法により調製された胚芽抽出物を無細胞蛋白合成溶液に用いる場合には、別途調製したｔＲＮＡを追加することは必須要件ではない。すなわち、無細胞蛋白合成溶液には、必要に応じてｔＲＮＡを追加すればよい。
なお、上記特開２００５－２１８３５７号公報に記載された方法で調製された胚芽抽出物には蛋白質合成反応に必要とされる量のｔＲＮＡが含まれているため、当該方法により調製された胚芽抽出物を無細胞蛋白合成溶液に用いる場合には、別途調製したｔＲＮＡを追加することは必須要件ではない。すなわち、無細胞蛋白合成溶液には、必要に応じてｔＲＮＡを追加すればよい。
【0112】
第１の本発明における結合工程は、ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを含む無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とを共存させて蛋白質合成を行うことが好ましいものであるが、具体的には蛋白質の合成前又は合成後の適当な時期に、好ましくは蛋白質合成前に、上記無細胞蛋白合成溶液にゴム粒子を加えることにより行うことができる。
また、無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度は、５～５０ｇ／Ｌであることが好ましい。すなわち、無細胞蛋白合成溶液１Ｌに対してゴム粒子を５～５０ｇ共存させることが好ましい。無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が５ｇ／Ｌ未満であると、合成されたネリル二リン酸合成酵素が結合したゴム粒子を回収するために、超遠心分離等による分離処理を行った際に、ゴム層が形成されず、合成されたネリル二リン酸合成酵素が結合したゴム粒子を回収することが困難になる場合がある。一方、無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が５０ｇ／Ｌを超えると、ゴム粒子同士が凝集し、合成されたネリル二リン酸合成酵素がうまくゴム粒子に結合できなくなるおそれがある。上記ゴム粒子の濃度としてより好ましくは１０～４０ｇ／Ｌ、更に好ましくは１５～３５ｇ／Ｌ、特に好ましくは１５～３０ｇ／Ｌである。
また、無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度は、５～５０ｇ／Ｌであることが好ましい。すなわち、無細胞蛋白合成溶液１Ｌに対してゴム粒子を５～５０ｇ共存させることが好ましい。無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が５ｇ／Ｌ未満であると、合成されたネリル二リン酸合成酵素が結合したゴム粒子を回収するために、超遠心分離等による分離処理を行った際に、ゴム層が形成されず、合成されたネリル二リン酸合成酵素が結合したゴム粒子を回収することが困難になる場合がある。一方、無細胞蛋白合成溶液と共存させるゴム粒子の濃度が５０ｇ／Ｌを超えると、ゴム粒子同士が凝集し、合成されたネリル二リン酸合成酵素がうまくゴム粒子に結合できなくなるおそれがある。上記ゴム粒子の濃度としてより好ましくは１０～４０ｇ／Ｌ、更に好ましくは１５～３５ｇ／Ｌ、特に好ましくは１５～３０ｇ／Ｌである。
【0113】
また、上記無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子との共存下での蛋白質合成は、その反応の進展に伴い、適宜ゴム粒子を追加していってもよい。ゴム粒子を上記無細胞蛋白合成溶液に加えてから例えば３～４８時間（好ましくは３～３０時間、より好ましくは３～２４時間）など無細胞蛋白合成系が活性な間、上記無細胞蛋白合成溶液とゴム粒子とが共存するようにしておくことが好ましい。
【0114】
上記ゴム粒子は、第１の本発明における結合工程に用いる前に（より好ましくは前記無細胞蛋白合成溶液と共存させる前に）前処理等の特段の処理を行う必要はない。ただし、ゴム粒子上に存在する蛋白質のうち、第１の本発明の方法により結合させたいネリル二リン酸合成酵素の割合を高めるために、予め界面活性剤によりゴム粒子からある程度蛋白質を除去してもよい。その際、除去後のゴム粒子のゴム合成活性が除去前の５０％以上残っていることが好ましい。このように、第１の本発明において用いられるゴム粒子が、第１の本発明における結合工程に用いる前に（より好ましくは前記無細胞蛋白合成溶液と共存させる前に）、界面活性剤で洗浄されたものであることもまた、第１の本発明の好適な実施形態の１つである。
【0115】
上記界面活性剤としては特に限定されず、非イオン性界面活性剤、両性界面活性剤などが挙げられる。これらの中でも、膜上の蛋白質の変性作用が小さい点で、非イオン性界面活性剤、両性界面活性剤が好適に用いられ、両性界面活性剤が特に好適に用いられる。すなわち、上記界面活性剤が、両性界面活性剤であることもまた、第１の本発明の好適な実施形態の１つである。
これら界面活性剤は、単独で用いてもよいし、２種以上を併用してもよい。
これら界面活性剤は、単独で用いてもよいし、２種以上を併用してもよい。
【0116】
上記非イオン性界面活性剤としては、例えば、ポリオキシアルキレンエーテル系、ポリオキシアルキレンエステル系、多価アルコール脂肪酸エステル系、糖脂肪酸エステル系、アルキルポリグリコシド系、ポリオキシアルキレンポリグルコシド系の非イオン性界面活性剤や、ポリオキシアルキレンアルキルアミン、アルキルアルカノールアミド等が挙げられる。
これらの中でも、ポリオキシアルキレンエーテル系の非イオン性界面活性剤、多価アルコール脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤が好ましい。
これらの中でも、ポリオキシアルキレンエーテル系の非イオン性界面活性剤、多価アルコール脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤が好ましい。
【0117】
上記ポリオキシアルキレンエーテル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、ポリオキシアルキレンアルキルエーテル、ポリオキシアルキレンアルキルフェニルエーテル、ポリオキシアルキレンポリオールアルキルエーテル、ポリオキシアルキレンモノ、ジ、又はトリスチリルフェニルエーテル等が挙げられる。これらの中でも、ポリオキシアルキレンアルキルフェニルエーテルが好適に使用される。なお、前記ポリオールとしては、炭素数２～１２の多価アルコールが好ましく、例えば、エチレングリコール、プロピレングリコール、グリセリン、ソルビトール、グルコース、スクロース、ペンタエリトリトール、ソルビタン等が挙げられる。
【0118】
上記ポリオキシアルキレンエステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、ポリオキシアルキレン脂肪酸エステル、ポリオキシアルキレンアルキルロジン酸エステル等が挙げられる。
上記多価アルコール脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、炭素数２～１２の多価アルコールの脂肪酸エステル又はポリオキシアルキレン多価アルコールの脂肪酸エステル等が挙げられる。より具体的には、例えば、ソルビトール脂肪酸エステル、ソルビタン脂肪酸エステル、グリセリン脂肪酸エステル、ポリグリセリン脂肪酸エステル、ペンタエリトリトール脂肪酸エステル等が挙げられる。また、これらのポリアルキレンオキサイド付加物（例えば、ポリオキシアルキレンソルビタン脂肪酸エステル、ポリオキシアルキレングリセリン脂肪酸エステル等）も使用可能である。これらの中でも、ソルビタン脂肪酸エステルが好適に使用される。
上記糖脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、ショ糖、グルコース、マルトース、フルクトース、多糖類の脂肪酸エステル等が挙げられ、これらのポリアルキレンオキサイド付加物も使用可能である。
上記アルキルポリグリコシド系の非イオン性界面活性剤としては、グリコシドとしてグルコース、マルトース、フルクトース、ショ糖などが挙げられ、例えば、アルキルグルコシド、アルキルポリグルコシド、ポリオキシアルキレンアルキルグルコシド、ポリオキシアルキレンアルキルポリグルコシドなどが挙げられ、これらの脂肪酸エステル類も挙げられる。また、これらすべてのポリアルキレンオキサイド付加物も使用可能である。
上記多価アルコール脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、炭素数２～１２の多価アルコールの脂肪酸エステル又はポリオキシアルキレン多価アルコールの脂肪酸エステル等が挙げられる。より具体的には、例えば、ソルビトール脂肪酸エステル、ソルビタン脂肪酸エステル、グリセリン脂肪酸エステル、ポリグリセリン脂肪酸エステル、ペンタエリトリトール脂肪酸エステル等が挙げられる。また、これらのポリアルキレンオキサイド付加物（例えば、ポリオキシアルキレンソルビタン脂肪酸エステル、ポリオキシアルキレングリセリン脂肪酸エステル等）も使用可能である。これらの中でも、ソルビタン脂肪酸エステルが好適に使用される。
上記糖脂肪酸エステル系の非イオン性界面活性剤としては、例えば、ショ糖、グルコース、マルトース、フルクトース、多糖類の脂肪酸エステル等が挙げられ、これらのポリアルキレンオキサイド付加物も使用可能である。
上記アルキルポリグリコシド系の非イオン性界面活性剤としては、グリコシドとしてグルコース、マルトース、フルクトース、ショ糖などが挙げられ、例えば、アルキルグルコシド、アルキルポリグルコシド、ポリオキシアルキレンアルキルグルコシド、ポリオキシアルキレンアルキルポリグルコシドなどが挙げられ、これらの脂肪酸エステル類も挙げられる。また、これらすべてのポリアルキレンオキサイド付加物も使用可能である。
【0119】
これら非イオン性界面活性剤におけるアルキル基としては、例えば、炭素数４～３０の直鎖又は分岐した飽和若しくは不飽和のアルキル基が挙げられる。また、ポリオキシアルキレン基としては、炭素数２～４のアルキレン基を有するものが挙げられ、例えば、酸化エチレンの付加モル数が１～５０モル程度のものが挙げられる。また、前記脂肪酸としては、例えば、炭素数４～３０の直鎖又は分岐した飽和若しくは不飽和の脂肪酸が挙げられる。
【0120】
上記非イオン性界面活性剤としては、中でも、ゴム粒子の膜を安定化させた状態で、かつ蛋白質の変性作用が小さい状態で、適度に膜結合蛋白質を除去できるという理由から、ポリオキシエチレンエチレン（１０）オクチルフェニルエーテル（Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００）、ソルビタンモノラウレート（Ｓｐａｎ ２０）が特に好ましい。
【0121】
上記両性界面活性剤としては、例えば、四級アンモニウム塩基／スルホン酸基（－ＳＯ３Ｈ）タイプ、四級アンモニウム塩基／リン酸酸基タイプ（水に可溶）、四級アンモニウム塩基／リン酸酸基タイプ（水に不溶）、四級アンモニウム塩基／カルボキシル基タイプなどの両性イオン界面活性剤が挙げられる。なお、前記の酸基は塩であってもよい。
特に、前記の両性イオン界面活性剤が一分子中に＋と－の両電荷を有することが好ましく、前記の酸基の酸解離定数（ｐＫａ）が、５以下であることが好ましく、４以下であることがより好ましく、３以下であることが更に好ましい。
特に、前記の両性イオン界面活性剤が一分子中に＋と－の両電荷を有することが好ましく、前記の酸基の酸解離定数（ｐＫａ）が、５以下であることが好ましく、４以下であることがより好ましく、３以下であることが更に好ましい。
【0122】
上記両性界面活性剤としては、具体的には、３－[（３－コラミドプロピル）ジメチルアミノ]－２－ヒドロキシ－１－プロパンスルホン酸（ＣＨＡＰＳＯ）、３－[（３－コラミドプロピル）ジメチルアミノ]－プロパンスルホン酸（ＣＨＡＰＳ）、Ｎ，Ｎ－ビス（３－Ｄ－グルコナミドプロピル）－コラミド、ｎ－オクタデシル－Ｎ，Ｎ’－ジメチル－３－アミノ－１－プロパンスルホン酸、ｎ－デシル－Ｎ，Ｎ’－ジメチル－３－アミノ－１－プロパンスルホン酸、ｎ－ドデシル－Ｎ，Ｎ’－ジメチル－３－アミノ－１－プロパンスルホン酸、ｎ－テトラデシル－Ｎ，Ｎ’－ジメチル－３－アミノ－１－プロパンスルホン酸｛Ｚｗｉｔｔｅｒｇｅｎｔ（商標）－３－１４｝、ｎ－ヘキサデシル－Ｎ，Ｎ’－ジメチル－３－アミノ－１－プロパンスルホン酸、ｎ－オクタデシル－Ｎ，Ｎ’－ジメチル－３－アミノ－１－プロパンスルホン酸等のアンモニウムスルホベタイン類、ｎ－オクチルホスホコリン、ｎ－ノニルホスホコリン、ｎ－デシルホスホコリン、ｎ－ドデシルホスホコリン、ｎ－テトラデシルホスホコリン、ｎ－ヘキサデシルホスホコリン等のホスホコリン類、ジラウロイルホスファチジルコリン、ジミリストイルホスファチジルコリン、ジパルミトイルホスファチジルコリン、ジステアロイルホスファチジルコリン、ジオレオイルホスファチジルコリン、ジリノレオイルホスファチジルコリン等のホスファチジルコリン類が挙げられる。これらの中でも、ゴム粒子の膜を安定化させた状態で適度に蛋白質を除去できるという理由から、３－[（３－コラミドプロピル）ジメチルアミノ]－プロパンスルホン酸（ＣＨＡＰＳ）が特に好ましい。
【0123】
上記界面活性剤の処理濃度は、使用する界面活性剤の臨界ミセル濃度（ＣＭＣ）の３倍以内であることが好ましい。臨界ミセル濃度の３倍を超える濃度の界面活性剤で処理するとゴム粒子の膜安定性が低下するおそれがある。より好ましくは２．５倍以内であり、更に好ましくは２．０倍以内である。また下限としては、０．０５倍以上であることが好ましく、０．１倍以上であることがより好ましく、０．３倍以上であることが更に好ましい。
【0124】
上記無細胞蛋白合成における蛋白質合成のための反応システムまたは装置としては、バッチ（回分）法（Ｐｒａｔｔ，Ｊ．Ｍ．ｅｔ ａｌ．，Ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ａｎｄ Ｔｒａｎｌａｔｉｏｎ，Ｈａｍｅｓ，１７９－２０９，Ｂ．Ｄ．＆Ｈｉｇｇｉｎｓ，Ｓ．Ｊ．，ｅｄｓ，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ，Ｏｘｆｏｒｄ（１９８４））や、アミノ酸、エネルギー源等を連続的に反応系に供給する連続式無細胞蛋白質合成システム（Ｓｐｉｒｉｎ，Ａ．Ｓ．ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，２４２，１１６２－１１６４（１９８８））、透析法（木川等、第２１回日本分子生物学会、ＷＩＤ６）、重層法（ＰＲＯＴＥＩＯＳＴＭ Ｗｈｅａｔ ｇｅｒｍ ｃｅｌｌ－ｆｒｅｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｃｏｒｅ ｋｉｔ取扱説明書：ＴＯＹＯＢＯ社製）等が挙げられる。その他、蛋白質合成反応系に、鋳型のＲＮＡ、アミノ酸、エネルギー源等を必要時に供給し、合成物や分解物を必要時に排出する方法等も用いることができる。
【0125】
中でも、重層法は操作が簡便であるという利点はあるものの反応溶液中でゴム粒子が分散してしまい、合成されるネリル二リン酸合成酵素をゴム粒子に効率よく結合させることが困難であるのに対して、透析法では、合成されるネリル二リン酸合成酵素の原料となるアミノ酸は透析膜を透過できるがゴム粒子は透過しないため、ゴム粒子の分散を防ぐことができ、効率的にゴム粒子に合成されるネリル二リン酸合成酵素を結合させることができることから、透析法が好ましい。
【0126】
なお、上記透析法とは、上記無細胞蛋白合成における蛋白質合成の合成反応液を透析内液とし、透析外液と物質移動が可能な透析膜によって隔離される装置を用いて、蛋白質合成を行う方法である。具体的には、例えば、翻訳鋳型を除いた上記合成反応液を必要に応じて適当時間プレインキュベートした後、翻訳鋳型を添加して、適当な透析容器に入れ反応内液とする。透析容器としては、底部に透析膜が付加されている容器（第一化学社製の透析カップ１２，０００等）や、透析用チューブ（三光純薬社製の１２，０００等）が挙げられる。透析膜は、１０，０００ダルトン以上の分子量限界を有するものが用いられるが、１２，０００ダルトン程度の分子量限界を有するものが好ましい。
【0127】
上記透析外液としては、アミノ酸を含む緩衝液が用いられる。透析外液は反応速度が低下した時点で、新鮮なものと交換することにより透析効率を上昇させることができる。反応温度及び時間は用いる蛋白質合成系において適宜選択されるが、例えば、小麦由来の胚芽抽出物を用いた系においては、通常１０～４０℃、好ましくは１８～３０℃、より好ましくは２０～２６℃で、１０分～４８時間（好ましくは１０分～３０時間、より好ましくは１０分～２４時間）行うことができる。
【0128】
また、上記無細胞蛋白合成溶液に含まれるネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡは、分解されやすいことから、上記蛋白質合成反応中に適宜当該ｍＲＮＡを追加することで、蛋白質の合成をより効率的に行うことができる。すなわち、上記蛋白質合成反応中に、上記ネリル二リン酸合成酵素をコードするｍＲＮＡを更に加えることもまた、第１の本発明の好適な実施形態の１つである。
なお、上記ｍＲＮＡの添加時間、添加回数、添加量等は特に制限されず、適宜設定することができる。
なお、上記ｍＲＮＡの添加時間、添加回数、添加量等は特に制限されず、適宜設定することができる。
【0129】
第１の本発明の製造方法においては、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させる結合工程を行った後、必要に応じてゴム粒子を回収する工程を行ってもよい。
【0130】
上記ゴム粒子回収工程は、ゴム粒子を回収することができればその手法は特に制限されず、ゴム粒子を回収する通常行われる方法により行うことができる。具体的には、例えば、遠心分離により行う方法などが挙げられる。当該遠心分離によりゴム粒子を回収する場合、その遠心力や、遠心分離処理時間、遠心分離処理温度はゴム粒子を回収できるよう適宜設定することができるが、例えば、遠心分離処理の遠心力としては、１５０００×ｇ以上が好ましく、２００００×ｇ以上がより好ましく、２５０００×ｇ以上が更に好ましい。一方、遠心力は大きくしすぎてもそれに見合うだけの分離効果が望めないことから、遠心力の上限としては、５００００×ｇ以下が好ましく、４５０００×ｇ以下がより好ましい。遠心分離処理時間としては、２０分以上が好ましく、３０分以上がより好ましく、４０分以上が更に好ましい。一方、遠心分離処理時間を長くしすぎてもそれに見合うだけの分離効果が望めないことから、遠心分離処理時間の上限としては、１２０分以下が好ましく、９０分以下がより好ましい。
また、遠心分離処理温度としては、ゴム粒子に結合したネリル二リン酸合成酵素のタンパク活性を維持するという観点から、０～１０℃が好ましく、２～８℃がより好ましく、４℃が特に好ましい。
また、遠心分離処理温度としては、ゴム粒子に結合したネリル二リン酸合成酵素のタンパク活性を維持するという観点から、０～１０℃が好ましく、２～８℃がより好ましく、４℃が特に好ましい。
【0131】
例えば、上記無細胞蛋白合成を行った場合には、上記遠心分離処理を行うと、ゴム粒子が上層に、無細胞蛋白合成溶液が下層に分離される。その後、下層の無細胞蛋白合成溶液を除去することで、ネリル二リン酸合成酵素を結合させたゴム粒子を回収することができる。回収したゴム粒子はｐＨが中性の適当な緩衝液に再懸濁することで保存することができる。
【0132】
なお、上記ゴム粒子回収工程を行った後に回収されたゴム粒子は更なる特別な処理を経ずに通常の天然ゴムと同様に用いることができる。
【0133】
更に、第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドは、上記ゴム粒子を以下の固化工程に供することで回収することができる。
【0134】
上記固化工程において、固化する方法としては、特に限定されず、エタノール、メタノール、アセトン等のポリイソプレノイドを溶解しない溶媒にゴム粒子を添加する方法やゴム粒子に酸を添加する方法等が挙げられる。固化工程を行うことにより、ゴム粒子からゴム（ポリイソプレノイドの１種）を固形分として回収できる。得られたゴムは、必要に応じて乾燥してから使用すればよい。
【0135】
このように、第１の本発明によれば、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質をゴム粒子に結合させることで、ゴム粒子中にポリイソプレノイドを合成することができ、効率的に反応槽（試験管、プラントなど）内でポリイソプレノイドを生産することが可能となる。
すなわち、ポリイソプレノイドを合成する方法であって、該方法は、生体外（例えば、反応槽（試験管、プラントなど）内）で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質を、ゴム粒子に結合させる結合工程を含むポリイソプレノイドを合成する方法もまた、第１の本発明の１つである。
なお、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質を、ゴム粒子に結合させる結合工程については、上述したとおりである。
すなわち、ポリイソプレノイドを合成する方法であって、該方法は、生体外（例えば、反応槽（試験管、プラントなど）内）で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質を、ゴム粒子に結合させる結合工程を含むポリイソプレノイドを合成する方法もまた、第１の本発明の１つである。
なお、生体外で、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を発現させた蛋白質を、ゴム粒子に結合させる結合工程については、上述したとおりである。
【0136】
なお、本明細書において、ポリイソプレノイドは、イソプレン単位（Ｃ５Ｈ８）で構成された重合体の総称である。ポリイソプレノイドとしては、例えばセスタテルペン（Ｃ２５）、トリテルペン（Ｃ３０）、テトラテルペン（Ｃ４０）、ゴムなどの重合体が挙げられる。また、本明細書において、イソプレノイドは、イソプレン単位（Ｃ５Ｈ８）を有する化合物を意味し、ポリイソプレノイドをも含む概念である。
【0137】
（ゴム製品の製造方法）
第１の本発明のゴム製品の製造方法は、上記第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法である。
第１の本発明のゴム製品の製造方法は、上記第１の本発明のポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法である。
【0138】
ゴム製品としては、ゴム（好ましくは天然ゴム）を使用して製造できるゴム製品であれば特に限定されず、例えば、空気入りタイヤ、ゴムローラ、ゴム防舷材、手袋、医療用ゴムチューブ等が挙げられる。
【0139】
ゴム製品が空気入りタイヤの場合、すなわち、第１の本発明のゴム製品の製造方法が第１の本発明の空気入りタイヤの製造方法の場合、上記生ゴム製品成形工程は、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程に、上記加硫工程は、上記生タイヤを加硫する加硫工程に相当する。すなわち、第１の本発明の空気入りタイヤの製造方法は、上記ポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び上記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法である。
【0140】
＜混練工程＞
混練工程では、上記ポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る。
混練工程では、上記ポリイソプレノイドの製造方法により得られたポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る。
【0141】
添加剤としては特に限定されず、ゴム製品の製造に用いられる添加剤を使用できる。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、例えば、上記ポリイソプレノイド以外のゴム成分、カーボンブラック、シリカ、炭酸カルシウム、アルミナ、クレー、タルクなどの補強用充填剤、シランカップリング剤、酸化亜鉛、ステアリン酸、加工助剤、各種老化防止剤、オイルなどの軟化剤、ワックス、硫黄などの加硫剤、加硫促進剤等が挙げられる。
【0142】
混練工程における混練は、オープンロール、バンバリーミキサー、密閉式混練機などのゴム混練装置を用いて行えばよい。
【0143】
＜生ゴム製品成形工程（タイヤの場合は生タイヤ成形工程）＞
生ゴム製品成形工程では、混練工程により得られた混練物から生ゴム製品（タイヤの場合は生タイヤ）を成形する。
生ゴム製品の成形方法としては特に限定されず、生ゴム製品の成形に用いられる方法を適宜適用すればよい。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、混練工程により得られた混練物を、各タイヤ部材の形状に合わせて押し出し加工し、タイヤ成型機上にて通常の方法にて成形し、各タイヤ部材を貼り合わせ、生タイヤ（未加硫タイヤ）を成形すればよい。
生ゴム製品成形工程では、混練工程により得られた混練物から生ゴム製品（タイヤの場合は生タイヤ）を成形する。
生ゴム製品の成形方法としては特に限定されず、生ゴム製品の成形に用いられる方法を適宜適用すればよい。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、混練工程により得られた混練物を、各タイヤ部材の形状に合わせて押し出し加工し、タイヤ成型機上にて通常の方法にて成形し、各タイヤ部材を貼り合わせ、生タイヤ（未加硫タイヤ）を成形すればよい。
【0144】
＜加硫工程＞
加硫工程では、生ゴム製品成形工程により得られた生ゴム製品を加硫することにより、ゴム製品が得られる。
生ゴム製品を加硫する方法としては特に限定されず、生ゴム製品の加硫に用いられる方法を適宜適用すればよい。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、生ゴム製品成形工程により得られた生タイヤ（未加硫タイヤ）を加硫機中で加熱加圧して加硫することにより空気入りタイヤが得られる。
加硫工程では、生ゴム製品成形工程により得られた生ゴム製品を加硫することにより、ゴム製品が得られる。
生ゴム製品を加硫する方法としては特に限定されず、生ゴム製品の加硫に用いられる方法を適宜適用すればよい。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、生ゴム製品成形工程により得られた生タイヤ（未加硫タイヤ）を加硫機中で加熱加圧して加硫することにより空気入りタイヤが得られる。
【0145】
（第２の本発明）
（ベクター）
第２の本発明のベクターは、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターに、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を機能的に連結させた塩基配列を含むベクターである。このようなベクターを植物に導入して形質転換を行うことにより、当該ベクターに含まれる、ポリイソプレノイド生合成に関わる蛋白質をコードする遺伝子が乳管特異的に発現し、当該植物におけるシス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドの生産量を向上させることが可能となる。これは、乳液の生産性向上のために導入した外来遺伝子の発現が乳管以外の部位で促進されると、植物体の代謝や乳液の生産に負荷がかかり、悪影響を及ぼすためと推測される。
（ベクター）
第２の本発明のベクターは、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターに、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を機能的に連結させた塩基配列を含むベクターである。このようなベクターを植物に導入して形質転換を行うことにより、当該ベクターに含まれる、ポリイソプレノイド生合成に関わる蛋白質をコードする遺伝子が乳管特異的に発現し、当該植物におけるシス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドの生産量を向上させることが可能となる。これは、乳液の生産性向上のために導入した外来遺伝子の発現が乳管以外の部位で促進されると、植物体の代謝や乳液の生産に負荷がかかり、悪影響を及ぼすためと推測される。
【0146】
なお、本明細書において、プロモーターが乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するとは、所望の遺伝子を当該プロモーターと機能的に連結させて植物に導入した場合に、当該所望の遺伝子が乳管で特異的に発現されるように遺伝子発現を制御する活性を有することを意味する。ここで、乳管特異的に遺伝子が発現するとは、当該遺伝子が植物中、乳管以外の部位では全く又はほとんど発現せず、当該遺伝子が実質的に乳管でのみ専ら発現しているといえる状態を意味する。また、遺伝子をプロモーターと機能的に連結させるとは、当該プロモーターの制御を受けるように、当該プロモーターの下流に当該遺伝子配列を連結することを意味する。
【0147】
第２の本発明のベクターは、一般的に植物の形質転換用ベクターとして知られているベクターに、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターの塩基配列、及び、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子の塩基配列を従来公知の方法により挿入することで作製することができる。第２の本発明のベクターを作製するために使用することができるベクターとしては、例えば、ｐＢＩ系のベクターや、ｐＧＡ４８２、ｐＧＡＨ、ｐＢＩＧなどのバイナリーベクター、ｐＬＧＶ２３Ｎｅｏ、ｐＮＣＡＴ、ｐＭＯＮ２００などの中間系プラスミド、ＧＡＴＥＷＡＹカセットを含むｐＨ３５ＧＳなどが挙げられる。
【0148】
第２の本発明のベクターは、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターの塩基配列、及び、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子の塩基配列を含む限り、その他の塩基配列を含んでいてもよい。通常、ベクターにはこれらの塩基配列に加えて、ベクター由来の配列が含まれており、更に、制限酵素認識配列、スペーサ―配列、マーカー遺伝子の配列、レポーター遺伝子の配列などが含まれる。
【0149】
上記マーカー遺伝子としては、例えば、カナマイシン耐性遺伝子、ハイグロマイシン耐性遺伝子、ブレオマイシン耐性遺伝子等の薬剤耐性遺伝子が挙げられる。また、上記レポーター遺伝子は、植物体中での発現部位を確認するために導入するものであり、例えば、ルシフェラーゼ遺伝子、ＧＵＳ（βグルクロニダーゼ）遺伝子、ＧＦＰ（緑色蛍光タンパク質）、ＲＦＰ（赤色蛍光タンパク質）等が挙げられる。
【0150】
上記ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子は、その由来は特に制限されず、微生物由来であっても、動物由来であっても、植物由来であってもよいが、植物由来であることが好ましく、Ｓｏｌａｎｕｍ属由来であることがより好ましい。中でも、トマト由来であることが特に好ましい。
【0151】
なお、第２の本発明におけるネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子、ネリル二リン酸合成酵素については、上述の第１の本発明で述べたとおりである。
【0152】
第２の本発明のベクターにおいては、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターの塩基配列、及び、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子の塩基配列を含む限り、更にその他の蛋白質をコードする遺伝子の塩基配列を含んでいてもよい。
【0153】
上記その他の蛋白質をコードする遺伝子としては、第１の本発明において上述したものと同様のものが挙げられる。
【0154】
上記乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターとしては、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）をコードする遺伝子のプロモーター、Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）をコードする遺伝子のプロモーター、及び、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）をコードする遺伝子のプロモーターからなる群より選択される少なくとも１種であることが好ましい。
【0155】
なお、本明細書において、Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物のラテックスに存在するゴム粒子に結合するゴム粒子結合蛋白質のことであり、ゴム粒子が安定化するのに寄与する。
Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物のラテックスに存在するゴム粒子に結合するゴム粒子結合蛋白質のことである。
Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物の乳管細胞に多く発現している蛋白質のことであり、ゴム粒子の凝集に関与し、抗真菌活性を有するものである。
また、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物のラテックスで多く発現している、ジャスモン酸シグナルに関わる転写因子のことである。ここで、ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（転写因子）とは、遺伝子の転写量を増加若しくは減少（好ましくは増加）させる活性を有する蛋白質を意味する。すなわち、本明細書において、ＭＹＣ１は、ジャスモン酸シグナルに関わる蛋白質のうち少なくとも１種の蛋白質をコードする遺伝子の転写量を増加若しくは減少（好ましくは増加）させる活性（転写因子活性）を有する蛋白質のことである。
Ｓｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ（ＳＲＰＰ）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物のラテックスに存在するゴム粒子に結合するゴム粒子結合蛋白質のことである。
Ｈｅｖｅｉｎ２．１（ＨＥＶ２．１）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物の乳管細胞に多く発現している蛋白質のことであり、ゴム粒子の凝集に関与し、抗真菌活性を有するものである。
また、ＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（ＭＹＣ１）は、パラゴムノキ（Ｈｅｖｅａ ｂｒａｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）等のゴム産生植物のラテックスで多く発現している、ジャスモン酸シグナルに関わる転写因子のことである。ここで、ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒ（転写因子）とは、遺伝子の転写量を増加若しくは減少（好ましくは増加）させる活性を有する蛋白質を意味する。すなわち、本明細書において、ＭＹＣ１は、ジャスモン酸シグナルに関わる蛋白質のうち少なくとも１種の蛋白質をコードする遺伝子の転写量を増加若しくは減少（好ましくは増加）させる活性（転写因子活性）を有する蛋白質のことである。
【0156】
（Ｒｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒ（ＲＥＦ）をコードする遺伝子のプロモーター）
上記ＲＥＦをコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
上記ＲＥＦをコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
【0157】
上記ＲＥＦをコードする遺伝子のプロモーターは、下記［Ａ１］～［Ａ３］のいずれかで表されるＤＮＡであることが好ましい。
［Ａ１］配列番号３で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ａ２］配列番号３で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ａ３］配列番号３で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ａ１］配列番号３で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ａ２］配列番号３で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ａ３］配列番号３で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
【0158】
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、上述したのと同様である。また、上記ストリンジェントな条件についても、上述したのと同様である。
【0159】
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なＤＮＡのように、プロモーターの塩基配列は、元の塩基配列とある程度の配列同一性を有している場合には、同様にプロモーター活性を有する場合があることが知られている。プロモーター活性を維持するための、配列番号３で表される塩基配列との配列同一性としては、少なくとも６０％以上、好ましくは８０％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９５％以上、より更に好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上である。
【0160】
（ＳＲＰＰをコードする遺伝子のプロモーター）
上記ＳＲＰＰをコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
上記ＳＲＰＰをコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
【0161】
上記ＳＲＰＰをコードする遺伝子のプロモーターは、下記［Ｂ１］～［Ｂ３］のいずれかで表されるＤＮＡであることが好ましい。
［Ｂ１］配列番号４で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ｂ２］配列番号４で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｂ３］配列番号４で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｂ１］配列番号４で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ｂ２］配列番号４で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｂ３］配列番号４で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
【0162】
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、上述したのと同様である。また、上記ストリンジェントな条件についても、上述したのと同様である。
【0163】
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なＤＮＡのように、プロモーターの塩基配列は、元の塩基配列とある程度の配列同一性を有している場合には、同様にプロモーター活性を有する場合があることが知られている。プロモーター活性を維持するための、配列番号４で表される塩基配列との配列同一性としては、少なくとも６０％以上、好ましくは８０％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９５％以上、より更に好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上である。
【0164】
（ＨＥＶ２．１をコードする遺伝子のプロモーター）
上記ＨＥＶ２．１をコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
上記ＨＥＶ２．１をコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
【0165】
上記ＨＥＶ２．１をコードする遺伝子のプロモーターは、下記［Ｃ１］～［Ｃ３］のいずれかで表されるＤＮＡであることが好ましい。
［Ｃ１］配列番号５で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ｃ２］配列番号５で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｃ３］配列番号５で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｃ１］配列番号５で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ｃ２］配列番号５で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｃ３］配列番号５で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
【0166】
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、上述したのと同様である。また、上記ストリンジェントな条件についても、上述したのと同様である。
【0167】
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なＤＮＡのように、プロモーターの塩基配列は、元の塩基配列とある程度の配列同一性を有している場合には、同様にプロモーター活性を有する場合があることが知られている。プロモーター活性を維持するための、配列番号５で表される塩基配列との配列同一性としては、少なくとも６０％以上、好ましくは８０％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９５％以上、より更に好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上である。
【0168】
（ＭＹＣ１をコードする遺伝子のプロモーター）
上記ＭＹＣ１をコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
上記ＭＹＣ１をコードする遺伝子のプロモーターは、その由来は特に制限されないが、植物由来であることが好ましく、ゴム産生植物由来であることがより好ましく、Ｈｅｖｅａ属、Ｓｏｎｃｈｕｓ属、Ｔａｒａｘａｃｕｍ属、及びＰａｒｔｈｅｎｉｕｍ属からなる群より選択される少なくとも１種の属に属する植物由来であることが更に好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種の植物由来であることがより更に好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキ由来であることである。
【0169】
上記ＭＹＣ１をコードする遺伝子のプロモーターは、下記［Ｄ１］～［Ｄ３］のいずれかで表されるＤＮＡであることが好ましい。
［Ｄ１］配列番号６で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ｄ２］配列番号６で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｄ３］配列番号６で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｄ１］配列番号６で表される塩基配列からなるＤＮＡ
［Ｄ２］配列番号６で表される塩基配列と相補的な塩基配列からなるＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
［Ｄ３］配列番号６で表される塩基配列と６０％以上の配列同一性を有する塩基配列からなり、かつ乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡ
【0170】
ここでいう「ハイブリダイズする」とは、上述したのと同様である。また、上記ストリンジェントな条件についても、上述したのと同様である。
【0171】
上記したストリンジェントな条件下でハイブリダイズ可能なＤＮＡのように、プロモーターの塩基配列は、元の塩基配列とある程度の配列同一性を有している場合には、同様にプロモーター活性を有する場合があることが知られている。プロモーター活性を維持するための、配列番号６で表される塩基配列との配列同一性としては、少なくとも６０％以上、好ましくは８０％以上、より好ましくは９０％以上、更に好ましくは９５％以上、より更に好ましくは９８％以上、特に好ましくは９９％以上である。
【0172】
上記したＤＮＡとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするＤＮＡや、上記したＤＮＡと６０％以上の配列同一性を有するＤＮＡが、乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するＤＮＡであることを確認する方法としては、例えば、従来公知の方法である、β－ガラクトシダーゼ、ルシフェラーゼ、又はＧＦＰ（Ｇｒｅｅｎ Ｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｔ Ｐｒｏｔｅｉｎ）等をレポーター遺伝子としたレポーターアッセイなどにより確認する方法が挙げられる。
【0173】
また、上記プロモーターの塩基配列を同定する方法は、従来公知の方法を用いることができ、例えば、生育する植物から、ＣＴＡＢ（Ｃｅｔｙｌ Ｔｒｉｍｅｔｈｙｌ Ａｍｍｏｎｉｕｍ Ｂｒｏｍｉｄｅ）法によりゲノムＤＮＡを抽出する。次に上記プロモーターの既知の塩基配列を基に特異的なプライマーと、ランダムプライマーを設計し、抽出したゲノムＤＮＡを鋳型にしてＴＡＩＬ（Ｔｈｅｒｍａｌ Ａｓｙｍｍｅｔｒｉｃ Ｉｎｔｅｒｌａｃｅｄ）－ＰＣＲ法を行って、上記プロモーターを含む遺伝子の増幅を行い、塩基配列を同定する。
【0174】
第２の本発明のベクター（乳管特異的に遺伝子を発現させるプロモーター活性を有するプロモーターに、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子を機能的に連結させた塩基配列を含むベクター）を植物に導入することにより、ポリイソプレノイド生合成に関わる所定の蛋白質を乳管特異的に発現するように形質転換された形質転換植物が得られる。そして、当該形質転換植物では、ポリイソプレノイド生合成に関わる所定の蛋白質が乳管特異的に発現することにより、第２の本発明のベクターが導入された植物体内で新たに該蛋白質が有する所定の酵素活性等の機能が乳管内で増強されてポリイソプレノイドの生合成経路の一部が増強され、結果的に植物体でのシス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドの生産量を向上させることができる。
【0175】
次に、上記形質転換植物の作製方法について簡単に説明するが、このような形質転換植物は従来公知の方法により作製することができる。
【0176】
上記形質転換植物を作出するために、第２の本発明のベクターが導入される植物としては、特に限定されないが、中でも、ポリイソプレノイドを生合成できる植物でネリル二リン酸合成酵素を発現させることにより、ポリイソプレノイドの生産性の向上、ポリイソプレノイドの製造量の増大が特に期待できることから、上記植物としては、ゴム産生植物が好ましい。中でも、パラゴムノキ、ノゲシ、グアユール及びロシアンタンポポからなる群より選択される少なくとも１種のゴム産生植物であることがより好ましく、特に好ましくは、パラゴムノキであることである。
【0177】
第２の本発明のベクターを植物（カルスや、培養細胞、スフェロプラスト、プロトプラストといった植物細胞を含む）に導入する方法としては、植物細胞にＤＮＡを導入する方法であればいずれも用いることができ、例えば、アグロバクテリウム（Ａｇｒｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）を用いる方法（特開昭５９－１４０８８５号公報、特開昭６０－７００８０号公報、国際公開第９４／００９７７号）、エレクトロポレーション法（特開昭６０－２５１８８７号公報）、パーティクルガン（遺伝子銃）を用いる方法（特許第２６０６８５６号、特許第２５１７８１３号）等を挙げることができる。中でも、アグロバクテリウムを用いる方法（アグロバクテリウム法）を用いて第２の本発明のベクターを植物に導入して形質転換植物（形質転換植物細胞）を作製するのが好ましい。
なお更には、第２の本発明のベクターを、上記ＤＮＡを導入する方法などにより、微生物、酵母、動物細胞、昆虫細胞等の、生物体、生物体の一部、器官、組織や培養細胞、スフェロプラスト、プロトプラストなどに導入することによって、シス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドを生産することも可能である。
なお更には、第２の本発明のベクターを、上記ＤＮＡを導入する方法などにより、微生物、酵母、動物細胞、昆虫細胞等の、生物体、生物体の一部、器官、組織や培養細胞、スフェロプラスト、プロトプラストなどに導入することによって、シス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドを生産することも可能である。
【0178】
以上の方法等により、上記形質転換植物（形質転換植物細胞）が得られる。なお、上記形質転換植物は、上述の方法で得られた形質転換植物細胞のみならず、その子孫又はクローン、さらにそれらを継代させて得られる子孫植物の全てを含む概念である。一旦、第２の本発明のベクターが導入された形質転換植物細胞が得られれば、該形質転換植物細胞から有性生殖、無性生殖、組織培養、細胞培養、細胞融合等により子孫又はクローンを得ることが可能である。また、該形質転換植物細胞やその子孫あるいはクローンから繁殖材料（例えば、種子、果実、切穂、塊茎、塊根、株、不定芽、不定胚、カルス、プロトプラスト等）を得て、それらを基に該形質転換植物を量産することも可能である。
【0179】
形質転換植物細胞から植物体（形質転換植物）を再生する方法としては、例えば、ユーカリでは土肥らの方法（特願平１１－１２７０２５号公報）、イネではＦｕｊｉｍｕｒａらの方法（Ｆｕｊｉｍｕｒａら（１９９５）， Ｐｌａｎｔ Ｔｉｓｓｕｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｌｅｔｔ．，ｖｏｌ．２：ｐ７４－）、トウモロコシではＳｈｉｌｌｉｔｏらの方法（Ｓｈｉｌｌｉｔｏら（１９８９）， Ｂｉｏ／Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，ｖｏｌ．７：ｐ５８１－）、ジャガイモではＶｉｓｓｅｒらの方法（Ｖｉｓｓｅｒら（１９８９）， Ｔｈｅｏｒ．Ａｐｐｌ．Ｇｅｎｅｔ．，ｖｏｌ．７８：ｐ５８９－）、シロイヌナズナではＡｋａｍａらの方法（Ａｋａｍａら（１９９２）， Ｐｌａｎｔ Ｃｅｌｌ Ｒｅｐ．，ｖｏｌ．１２：ｐ７－）が知られており、当業者であれば、これらを参照して形質転換植物細胞から植物体を再生できる。
【0180】
再生した植物体において、周知の手法を用いることで、目的の蛋白質遺伝子の発現を確認することが出来る。例えば、目的の蛋白質の発現をウエスタンブロット解析すればよい。
【0181】
上記形質転換植物から種子を得る方法としては、例えば、形質転換植物を適当な培地において発根させ、その発根体を水分含有の土を入れたポットに移植する。適当な栽培条件下で生育させ、最終的に種子を形成させて、該種子を得る。また、種子から植物体を得る方法としては、例えば、前記のようにして得られた形質転換植物由来の種子を、水分含有の土に播種し、適当な栽培条件下で生育させることにより植物体を得ることができる。
【0182】
第２の本発明では、第２の本発明のベクターを植物に導入することにより、該ベクターに含まれるポリイソプレノイド生合成に関わる蛋白質をコードする遺伝子（特に好ましくは、ネリル二リン酸合成酵素をコードする遺伝子）が乳管特異的に発現し、当該植物におけるシス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドの生産量を向上させることができる。具体的には、上述の方法で得られた形質転換植物細胞、形質転換植物細胞から得られたカルス、該カルスから再分化した細胞等を適当な培地で培養したり、形質転換植物細胞から再分化した形質転換植物、該形質転換植物から得られた種子から得られた植物体等を適当な栽培条件下で生育させたりすることにより、シス型イソプレノイド、ポリイソプレノイドを製造することができる。
【0183】
このように、第２の本発明のベクターを植物に導入することにより、該植物におけるシス型イソプレノイドの生産量を向上させる方法もまた、第２の本発明の１つである。また、第２の本発明のベクターを植物に導入することにより、該植物におけるポリイソプレノイドの生産量を向上させる方法もまた、第２の本発明の１つである。
【0184】
（ゴム製品の製造方法）
第２の本発明のゴム製品の製造方法は、上記第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法である。
第２の本発明のゴム製品の製造方法は、上記第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生ゴム製品を成形する生ゴム製品成形工程、及び上記生ゴム製品を加硫する加硫工程を含むゴム製品の製造方法である。
【0185】
ゴム製品としては、第１の本発明において上述したものと同様である。
【0186】
ゴム製品が空気入りタイヤの場合、すなわち、第２の本発明のゴム製品の製造方法が第２の本発明の空気入りタイヤの製造方法の場合、上記生ゴム製品成形工程は、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程に、上記加硫工程は、上記生タイヤを加硫する加硫工程に相当する。すなわち、第２の本発明の空気入りタイヤの製造方法は、上記第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る混練工程、上記混練物から生タイヤを成形する生タイヤ成形工程、及び上記生タイヤを加硫する加硫工程を含む空気入りタイヤの製造方法である。
【0187】
＜混練工程＞
混練工程では、上記第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る。
混練工程では、上記第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドと、添加剤とを混練して混練物を得る。
【0188】
上記第２の本発明のベクターを植物に導入することにより得られる形質転換植物から得られるポリイソプレノイドは、上記形質転換植物からラテックスを採取し、採取したラテックスを以下の固化工程に供することにより得られる。
なお、上記形質転換植物からのラテックスの採取方法は特に制限されず、通常行われる方法を採用することができるが、例えば、植物の幹を傷つけてにじみ出る乳液を回収したり（タッピング）、根など形質転換植物の一部を切断し、切断した部分からにじみ出る乳液を回収したり、切断した組織を粉砕し、有機溶媒を用いて抽出して採取したりすることができる。
なお、上記形質転換植物からのラテックスの採取方法は特に制限されず、通常行われる方法を採用することができるが、例えば、植物の幹を傷つけてにじみ出る乳液を回収したり（タッピング）、根など形質転換植物の一部を切断し、切断した部分からにじみ出る乳液を回収したり、切断した組織を粉砕し、有機溶媒を用いて抽出して採取したりすることができる。
【0189】
＜固化工程＞
上記採取されたラテックスは、固化工程に供される。固化する方法としては、特に限定されず、エタノール、メタノール、アセトン等のポリイソプレノイドを溶解しない溶媒にラテックスを添加する方法やラテックスに酸を添加する方法等が挙げられる。固化工程を行うことにより、ラテックスからゴム（ポリイソプレノイドの１種）を固形分として回収できる。得られたゴムは、必要に応じて乾燥してから使用すればよい。
上記採取されたラテックスは、固化工程に供される。固化する方法としては、特に限定されず、エタノール、メタノール、アセトン等のポリイソプレノイドを溶解しない溶媒にラテックスを添加する方法やラテックスに酸を添加する方法等が挙げられる。固化工程を行うことにより、ラテックスからゴム（ポリイソプレノイドの１種）を固形分として回収できる。得られたゴムは、必要に応じて乾燥してから使用すればよい。
【0190】
添加剤としては特に限定されず、ゴム製品の製造に用いられる添加剤を使用できる。例えば、ゴム製品が空気入りタイヤの場合、例えば、上記ラテックスから得られたゴム以外のゴム成分、カーボンブラック、シリカ、炭酸カルシウム、アルミナ、クレー、タルクなどの補強用充填剤、シランカップリング剤、酸化亜鉛、ステアリン酸、加工助剤、各種老化防止剤、オイルなどの軟化剤、ワックス、硫黄などの加硫剤、加硫促進剤等が挙げられる。
【0191】
混練工程における混練は、オープンロール、バンバリーミキサー、密閉式混練機などのゴム混練装置を用いて行えばよい。
【0192】
＜生ゴム製品成形工程（タイヤの場合は生タイヤ成形工程）＞
生ゴム製品成形工程では、第１の本発明において上述した工程と同様である。
生ゴム製品成形工程では、第１の本発明において上述した工程と同様である。
【0193】
＜加硫工程＞
加硫工程は、第１の本発明において上述した工程と同様である。
加硫工程は、第１の本発明において上述した工程と同様である。
【実施例】
【0194】
実施例に基づいて、本発明を具体的に説明するが、本発明はこれらのみに限定されるものではない。
【0195】
（実施例１）
〔ベクターの構築〕
トマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）ネリル二リン酸合成酵素遺伝子（ＮＤＰＳ）のＢＬＡＳＴに公開されている情報（配列番号１）をもとに、開始コドンから終始コドンまでの領域のうち、シグナル配列をコードする塩基配列部分（配列番号１の４塩基目から１３２塩基目まで）を取り除いたｔｒＮＤＰＳ１遺伝子を遺伝子合成サービスをもとに合成して作成した。
なお、配列番号１で示されるＮＤＰＳの塩基配列によってコードされるＮＤＰＳのアミノ酸配列を配列番号２に示す。
〔ベクターの構築〕
トマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）ネリル二リン酸合成酵素遺伝子（ＮＤＰＳ）のＢＬＡＳＴに公開されている情報（配列番号１）をもとに、開始コドンから終始コドンまでの領域のうち、シグナル配列をコードする塩基配列部分（配列番号１の４塩基目から１３２塩基目まで）を取り除いたｔｒＮＤＰＳ１遺伝子を遺伝子合成サービスをもとに合成して作成した。
なお、配列番号１で示されるＮＤＰＳの塩基配列によってコードされるＮＤＰＳのアミノ酸配列を配列番号２に示す。
【0196】
上述の方法により、ｔｒＮＤＰＳ１が得られた。その配列を同定し、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定した。ｔｒＮＤＰＳ１の塩基配列を配列番号７に示した。ｔｒＮＤＰＳ１のアミノ酸配列を配列番号８に示した。
【0197】
上記取得したＤＮＡ断片は、ｐＵＣ５７に挿入し、ｐＵＣ５７－ｔｒＮＤＰＳ１を作製した。
【0198】
〔大腸菌の形質転換〕
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて大腸菌ＤＨ５αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとＸ－ｇａｌを含むＬＢ寒天培地上で培養し、青／白スクリーニング法によって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて大腸菌ＤＨ５αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとＸ－ｇａｌを含むＬＢ寒天培地上で培養し、青／白スクリーニング法によって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
【0199】
〔プラスミドの抽出〕
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、ＬＢ液体培地上で３７℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はＦａｓｔ Ｇｅｎｅプラスミドミニキット（日本ジェネティクス社製）を使用した。
回収したプラスミドに挿入された遺伝子の塩基配列に変異がないことをシークエンス解析により確認した。
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、ＬＢ液体培地上で３７℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はＦａｓｔ Ｇｅｎｅプラスミドミニキット（日本ジェネティクス社製）を使用した。
回収したプラスミドに挿入された遺伝子の塩基配列に変異がないことをシークエンス解析により確認した。
【0200】
〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕
無細胞発現系の遺伝子の挿入はＳＬｉＣＥ（Ｓｅａｍｌｅｓｓ Ｌｉｇａｔｉｏｎ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｅｘｔｒａｃｔ）法を用いて行った。
上記〔ベクターの構築〕で獲得したｐＵＣ５７－ｔｒＮＤＰＳ１を鋳型に下記するプライマー１、２を用いてＰＣＲ反応を行い、ｔｒＮＤＰＳ１遺伝子の両端に１９～２１塩基の無細胞発現用ベクターに含まれる配列を付加したＰＣＲ断片を得た。
プライマー１：５′－ＣＴＧＴＡＴＴＴＴＣＡＧＧＧＣＧＧＡＴＡＴＴＣＴＧＣＴＣＧＴＧＧＡＣＴＣＡＡＣ－３′
プライマー２：５′－ＣＡＡＡＡＣＴＡＧＴＧＣＧＧＣＣＧＣＧＴＣＡＡＴＡＴＧＴＧＴＧＴＣＣＡＣＣ－３′
無細胞発現系の遺伝子の挿入はＳＬｉＣＥ（Ｓｅａｍｌｅｓｓ Ｌｉｇａｔｉｏｎ Ｃｌｏｎｉｎｇ Ｅｘｔｒａｃｔ）法を用いて行った。
上記〔ベクターの構築〕で獲得したｐＵＣ５７－ｔｒＮＤＰＳ１を鋳型に下記するプライマー１、２を用いてＰＣＲ反応を行い、ｔｒＮＤＰＳ１遺伝子の両端に１９～２１塩基の無細胞発現用ベクターに含まれる配列を付加したＰＣＲ断片を得た。
プライマー１：５′－ＣＴＧＴＡＴＴＴＴＣＡＧＧＧＣＧＧＡＴＡＴＴＣＴＧＣＴＣＧＴＧＧＡＣＴＣＡＡＣ－３′
プライマー２：５′－ＣＡＡＡＡＣＴＡＧＴＧＣＧＧＣＣＧＣＧＴＣＡＡＴＡＴＧＴＧＴＧＴＣＣＡＣＣ－３′
【0201】
無細胞発現用ベクターｐＥＵ－Ｅ０１－Ｈｉｓ－ＴＥＶ－ＭＣＳ―Ｎ２は制限酵素ＥｃｏＲＩとＫｐｎＩで処理し、ゲル回収によって精製した。ＳＬｉＣＥ反応に用いるＳＬｉＣＥ溶液は、以下のように作成した。
培養した大腸菌ＤＨ５α ０．３～０．４ｇを３％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００を含む５０ｍＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣＬ（ｐＨ８．０）１．２ｍＬで穏やかに懸濁し、室温で１０分間インキュベートした。インキュベート後、４℃、２００００×ｇの条件下で２分間遠心し、上清を回収した。回収した上清に等量の８０％グリセロール溶液を添加し、ＳＬｉＣＥ溶液とした。ＳＬｉＣＥ溶液は一定量ごとに小分けし、使用するまで－８０℃で保管した。得られたＰＣＲ断片、制限酵素処理したベクターを１：１～３：１の比率になるように混ぜ、１０×ＳＬｉＣＥ Ｂｕｆｆｅｒ（５００μＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣＬ（ｐＨ７．５）、１００ｍＭ ＭｇＣｌ２、１０ｍＭ ＡＴＰ、１０ｍＭ ＤＴＴ）を反応系最終容量の１０分の１量、ＳＬｉＣＥ溶液を反応系最終容量の１０分の１量加え、３７℃で１５分反応させ、ｐＥＵ－Ｈｉｓ－Ｎ２－ｔｒＮＤＰＳ１を作製した。
培養した大腸菌ＤＨ５α ０．３～０．４ｇを３％ Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００を含む５０ｍＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣＬ（ｐＨ８．０）１．２ｍＬで穏やかに懸濁し、室温で１０分間インキュベートした。インキュベート後、４℃、２００００×ｇの条件下で２分間遠心し、上清を回収した。回収した上清に等量の８０％グリセロール溶液を添加し、ＳＬｉＣＥ溶液とした。ＳＬｉＣＥ溶液は一定量ごとに小分けし、使用するまで－８０℃で保管した。得られたＰＣＲ断片、制限酵素処理したベクターを１：１～３：１の比率になるように混ぜ、１０×ＳＬｉＣＥ Ｂｕｆｆｅｒ（５００μＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣＬ（ｐＨ７．５）、１００ｍＭ ＭｇＣｌ２、１０ｍＭ ＡＴＰ、１０ｍＭ ＤＴＴ）を反応系最終容量の１０分の１量、ＳＬｉＣＥ溶液を反応系最終容量の１０分の１量加え、３７℃で１５分反応させ、ｐＥＵ－Ｈｉｓ－Ｎ２－ｔｒＮＤＰＳ１を作製した。
【0202】
〔大腸菌の形質転換〕
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて大腸菌ＤＨ５αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとＸ－ｇａｌを含むＬＢ寒天培地上で培養し、コロニーＰＣＲによって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて大腸菌ＤＨ５αの形質転換を行い、形質転換体はアンピシリンとＸ－ｇａｌを含むＬＢ寒天培地上で培養し、コロニーＰＣＲによって目的遺伝子を導入した大腸菌の選別を行った。
【0203】
〔プラスミドの抽出〕
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、ＬＢ液体培地上で３７℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はＦａｓｔ Ｇｅｎｅプラスミドミニキット（日本ジェネティクス社製）を使用した。
目的遺伝子を含むプラスミドで形質転換された大腸菌は、ＬＢ液体培地上で３７℃で一晩培養したのち、菌体を回収し、プラスミドの回収を行った。プラスミドの回収はＦａｓｔ Ｇｅｎｅプラスミドミニキット（日本ジェネティクス社製）を使用した。
【0204】
〔ゴム粒子の調製〕
ゴム粒子は、５段階の遠心分離によってパラゴムノキのラテックス（Ｈｅｖｅａラテックス）から調製した。Ｈｅｖｅａラテックス９００ｍＬに、２０ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）１００ｍＬを添加し、ラテックス溶液を調製した。得られたラテックス溶液を、１０００×ｇ、２０００×ｇ、８０００×ｇ、２００００×ｇ、５００００×ｇの異なる遠心速度で段階的に遠心分離した。遠心分離はいずれも４℃、４５分で行った。５００００×ｇでの遠心分離で残ったゴム粒子層に、３－[（３－コラミドプロピル）ジメチルアミノ]－プロパンスルホン酸（ＣＨＡＰＳ）を終濃度０．１～２．０×ＣＭＣ（臨界ミセル濃度ＣＭＣの０．１～２．０倍）になるように加え、ゴム粒子を洗浄した。洗浄処理後、洗浄されたゴム粒子を超遠心分離（４００００×ｇ、４℃、４５分）によって回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
ゴム粒子は、５段階の遠心分離によってパラゴムノキのラテックス（Ｈｅｖｅａラテックス）から調製した。Ｈｅｖｅａラテックス９００ｍＬに、２０ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）１００ｍＬを添加し、ラテックス溶液を調製した。得られたラテックス溶液を、１０００×ｇ、２０００×ｇ、８０００×ｇ、２００００×ｇ、５００００×ｇの異なる遠心速度で段階的に遠心分離した。遠心分離はいずれも４℃、４５分で行った。５００００×ｇでの遠心分離で残ったゴム粒子層に、３－[（３－コラミドプロピル）ジメチルアミノ]－プロパンスルホン酸（ＣＨＡＰＳ）を終濃度０．１～２．０×ＣＭＣ（臨界ミセル濃度ＣＭＣの０．１～２．０倍）になるように加え、ゴム粒子を洗浄した。洗浄処理後、洗浄されたゴム粒子を超遠心分離（４００００×ｇ、４℃、４５分）によって回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
【0205】
〔無細胞蛋白合成反応（ＳＴＥＰ１ ｍＲＮＡの転写反応）〕
無細胞蛋白合成は、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔ（（株）セルフリーサイエンス製）を使用して行った。上記〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕で獲得したベクターを鋳型に、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って、ｍＲＮＡの転写反応を行った。
無細胞蛋白合成は、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔ（（株）セルフリーサイエンス製）を使用して行った。上記〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕で獲得したベクターを鋳型に、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って、ｍＲＮＡの転写反応を行った。
【0206】
〔ｍＲＮＡの精製〕
転写反応後、得られたｍＲＮＡはエタノール沈殿により精製した。
転写反応後、得られたｍＲＮＡはエタノール沈殿により精製した。
【0207】
〔無細胞蛋白合成反応（ＳＴＥＰ２ 透析法による蛋白合成）〕
透析カップ（ＭＷＣＯ １２０００）（Ｂｉｏ－Ｔｅｃｋ社製）中に、以下の量をそれぞれ添加した。ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って全量６０μＬで反応溶液を調整した。反応溶液にゴム粒子を１～２ｍｇ添加した。さらに、ＰＰ容器Ｎｏ．２（マルエム容器）にＳＵＢ－ＡＭＩＸ ６５０μＬを添加した。
透析カップをＰＰ容器Ｎｏ．２にはめ、２６℃で蛋白合成反応を開始した。反応開始から２度のｍＲＮＡの追加と透析外液（ＳＵＢ－ＡＭＩＸ）の交換を行った。反応は２４時間行った。透析法を行っている様子の概略図を図１に示す。
透析カップ（ＭＷＣＯ １２０００）（Ｂｉｏ－Ｔｅｃｋ社製）中に、以下の量をそれぞれ添加した。ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って全量６０μＬで反応溶液を調整した。反応溶液にゴム粒子を１～２ｍｇ添加した。さらに、ＰＰ容器Ｎｏ．２（マルエム容器）にＳＵＢ－ＡＭＩＸ ６５０μＬを添加した。
透析カップをＰＰ容器Ｎｏ．２にはめ、２６℃で蛋白合成反応を開始した。反応開始から２度のｍＲＮＡの追加と透析外液（ＳＵＢ－ＡＭＩＸ）の交換を行った。反応は２４時間行った。透析法を行っている様子の概略図を図１に示す。
【0208】
〔反応後のゴム粒子の回収〕
透析カップの溶液を新しい１．５μＬチューブに移し、反応後のゴム粒子を超遠心分離（４００００×ｇ、４℃、４５分）によって回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
透析カップの溶液を新しい１．５μＬチューブに移し、反応後のゴム粒子を超遠心分離（４００００×ｇ、４℃、４５分）によって回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
【0209】
〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を以下の方法により測定した。
まず、５０ｍＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣｌ（ｐＨ７．５）、２ｍＭ ＤＴＴ、５ｍＭ ＭｇＣｌ２、１５μＭ ジメチルアリル二リン酸（ＤＭＡＰＰ）、１００μＭ １－１４Ｃイソペンテニル二リン酸（［１－１４Ｃ］ＩＰＰ）（比活性：５Ｃｉ／ｍｏｌ）、１０μＬ ゴム粒子溶液を混合した反応溶液（Ｔｏｔａｌ １００μＬ）を調製し、３０℃で１６時間反応させた。
反応後、飽和ＮａＣｌを２００μＬ加え、１ｍＬのジエチルエーテルでイソペンテノールなどを抽出した。次に、水相のポリプレニル二リン酸を１ｍＬの食塩水飽和ＢｕＯＨで抽出し、その後さらに、水相の超長鎖ポリイソプレノイド（ゴム）を１ｍＬのトルエン／ヘキサン（１：１）で抽出し、放射活性を計測した。各層の放射活性は液体シンチレーションカウンターで１４Ｃのカウントを計測した。放射活性（ｄｐｍ）が高いほど、超長鎖ポリイソプレノイド（ゴム）が多く生産されており、ゴム合成活性が高いことを示す。
結果を表１に示す。
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を以下の方法により測定した。
まず、５０ｍＭ Ｔｒｉｓ－ＨＣｌ（ｐＨ７．５）、２ｍＭ ＤＴＴ、５ｍＭ ＭｇＣｌ２、１５μＭ ジメチルアリル二リン酸（ＤＭＡＰＰ）、１００μＭ １－１４Ｃイソペンテニル二リン酸（［１－１４Ｃ］ＩＰＰ）（比活性：５Ｃｉ／ｍｏｌ）、１０μＬ ゴム粒子溶液を混合した反応溶液（Ｔｏｔａｌ １００μＬ）を調製し、３０℃で１６時間反応させた。
反応後、飽和ＮａＣｌを２００μＬ加え、１ｍＬのジエチルエーテルでイソペンテノールなどを抽出した。次に、水相のポリプレニル二リン酸を１ｍＬの食塩水飽和ＢｕＯＨで抽出し、その後さらに、水相の超長鎖ポリイソプレノイド（ゴム）を１ｍＬのトルエン／ヘキサン（１：１）で抽出し、放射活性を計測した。各層の放射活性は液体シンチレーションカウンターで１４Ｃのカウントを計測した。放射活性（ｄｐｍ）が高いほど、超長鎖ポリイソプレノイド（ゴム）が多く生産されており、ゴム合成活性が高いことを示す。
結果を表１に示す。
【0210】
〔合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布測定〕
上記合成した超長鎖ポリイソプレノイド（ゴム）の分子量分布を下記の条件でＲａｄｉｏ ＨＰＬＣにより測定した。結果を図２に示す。
ＨＰＬＣシステム：ＧＩＬＳＯＮ社製
カラム：ＴＯＳＯＨ社製のＴＳＫｇｕａｒｄｃｏｌｕｍｎ ＭＰ（ＸＬ），ＴＳＫｇｅｌ Ｍｕｌｔｉｐｏｒｅ ＨＸＬ－Ｍ（２本）
カラム温度：４０℃
溶媒：Ｍｅｒｃｋ社製のＴＨＦ
流速：１ｍｌ／分
ＵＶ検出：２１５ｎｍ
ＲＩ検出：Ｒａｍｏｎａ Ｓｔａｒ（Ｒａｙｔｅｓｔ ＧｍｂＨ）
上記合成した超長鎖ポリイソプレノイド（ゴム）の分子量分布を下記の条件でＲａｄｉｏ ＨＰＬＣにより測定した。結果を図２に示す。
ＨＰＬＣシステム：ＧＩＬＳＯＮ社製
カラム：ＴＯＳＯＨ社製のＴＳＫｇｕａｒｄｃｏｌｕｍｎ ＭＰ（ＸＬ），ＴＳＫｇｅｌ Ｍｕｌｔｉｐｏｒｅ ＨＸＬ－Ｍ（２本）
カラム温度：４０℃
溶媒：Ｍｅｒｃｋ社製のＴＨＦ
流速：１ｍｌ／分
ＵＶ検出：２１５ｎｍ
ＲＩ検出：Ｒａｍｏｎａ Ｓｔａｒ（Ｒａｙｔｅｓｔ ＧｍｂＨ）
【0211】
（実施例２）
〔ベクターの構築〕
トマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）ネリル二リン酸合成酵素遺伝子（ＮＤＰＳ）のＢＬＡＳＴに公開されている情報（配列番号１）をもとに、実施例１と同様に、開始コドンから終始コドンまでの領域のうち、シグナル配列をコードする塩基配列部分（配列番号１の４塩基目から１３２塩基目まで）を取り除き、更にＨｅｌｉｘ３部位をコードする塩基配列部分（配列番号１の４３９塩基目から４８９塩基目まで）を、炭素数５０以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼであるシロイヌナズナ由来のＣＰＴ４（ＡｔＣＰＴ４）のＨｅｌｉｘ３部位をコードする塩基配列と置換したｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａ遺伝子を遺伝子合成サービスをもとに合成して作成した。
〔ベクターの構築〕
トマト（Ｓｏｌａｎｕｍ ｌｙｃｏｐｅｒｓｉｃｕｍ）ネリル二リン酸合成酵素遺伝子（ＮＤＰＳ）のＢＬＡＳＴに公開されている情報（配列番号１）をもとに、実施例１と同様に、開始コドンから終始コドンまでの領域のうち、シグナル配列をコードする塩基配列部分（配列番号１の４塩基目から１３２塩基目まで）を取り除き、更にＨｅｌｉｘ３部位をコードする塩基配列部分（配列番号１の４３９塩基目から４８９塩基目まで）を、炭素数５０以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼであるシロイヌナズナ由来のＣＰＴ４（ＡｔＣＰＴ４）のＨｅｌｉｘ３部位をコードする塩基配列と置換したｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａ遺伝子を遺伝子合成サービスをもとに合成して作成した。
【0212】
上述の方法により、ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａが得られた。その配列を同定し、全長の塩基配列及びアミノ酸配列を同定した。ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａの塩基配列を配列番号１１に示した。ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａのアミノ酸配列を配列番号１２に示した。
【0213】
上記取得したＤＮＡ断片は、ｐＵＣ５７に挿入し、ｐＵＣ５７－ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａを作製した。
【0214】
〔大腸菌の形質転換〕
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて、実施例１と同様にして行った。
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて、実施例１と同様にして行った。
【0215】
〔プラスミドの抽出〕
実施例１と同様にして行った。
実施例１と同様にして行った。
【0216】
〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕
実施例１と同様にＳＬｉＣＥ法を用いて無細胞発現用ベクターｐＥＵ－Ｅ０１－Ｈｉｓ－ＴＥＶ－ＭＣＳ－Ｎ２に挿入し、ｐＥＵ－Ｈｉｓ－Ｎ２－ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａを作製した。
実施例１と同様にＳＬｉＣＥ法を用いて無細胞発現用ベクターｐＥＵ－Ｅ０１－Ｈｉｓ－ＴＥＶ－ＭＣＳ－Ｎ２に挿入し、ｐＥＵ－Ｈｉｓ－Ｎ２－ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａを作製した。
【0217】
〔大腸菌の形質転換〕
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて、実施例１と同様にして行った。
上記作製したＶｅｃｔｏｒを用いて、実施例１と同様にして行った。
【0218】
〔プラスミドの抽出〕
実施例１と同様にして行った。
実施例１と同様にして行った。
【0219】
〔ゴム粒子の調製〕
実施例１と同様にして行った。
実施例１と同様にして行った。
【0220】
〔無細胞蛋白合成反応（ＳＴＥＰ１ ｍＲＮＡの転写反応）〕
無細胞蛋白合成は、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔ（（株）セルフリーサイエンス製）を使用して行った。上記〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕で獲得したベクターｐＥＵ－Ｈｉｓ－Ｎ２－ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａを鋳型に、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って、ｍＲＮＡの転写反応を行った。
無細胞蛋白合成は、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔ（（株）セルフリーサイエンス製）を使用して行った。上記〔無細胞蛋白合成法用ベクターの作製〕で獲得したベクターｐＥＵ－Ｈｉｓ－Ｎ２－ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａを鋳型に、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って、ｍＲＮＡの転写反応を行った。
【0221】
〔ｍＲＮＡの精製〕
転写反応後、得られたｍＲＮＡはエタノール沈殿により精製した。
転写反応後、得られたｍＲＮＡはエタノール沈殿により精製した。
【0222】
〔無細胞蛋白合成反応（ＳＴＥＰ２ 透析法による蛋白合成）〕
上記ｍＲＮＡを用いた以外は、実施例１と同様にして行った。
上記ｍＲＮＡを用いた以外は、実施例１と同様にして行った。
【0223】
〔反応後のゴム粒子の回収〕
実施例１と同様にして反応後のゴム粒子を回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
実施例１と同様にして反応後のゴム粒子を回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
【0224】
〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を、実施例１と同様にして測定した。
結果を表１に示す。
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を、実施例１と同様にして測定した。
結果を表１に示す。
【0225】
〔合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布測定〕
上記〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕で合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布を、実施例１と同様にして測定した。結果を図２に示す。
上記〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕で合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布を、実施例１と同様にして測定した。結果を図２に示す。
【0226】
（比較例１）
〔ゴム粒子の調製〕
実施例１と同様にして行った。
〔ゴム粒子の調製〕
実施例１と同様にして行った。
【0227】
〔無細胞蛋白合成反応（ＳＴＥＰ１ ｍＲＮＡの転写反応）〕
無細胞蛋白合成は、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔ（（株）セルフリーサイエンス製）を使用して行った。無細胞発現用ベクターｐＥＵ－Ｅ０１－Ｈｉｓ－ＴＥＶ－ＭＣＳ－Ｎ２を鋳型に、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って、ｍＲＮＡの転写反応を行った。
無細胞蛋白合成は、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔ（（株）セルフリーサイエンス製）を使用して行った。無細胞発現用ベクターｐＥＵ－Ｅ０１－Ｈｉｓ－ＴＥＶ－ＭＣＳ－Ｎ２を鋳型に、ＷＥＰＲＯ７２４０Ｈ Ｅｘｐｒｅｓｓｉｏｎ ｋｉｔのプロトコルに従って、ｍＲＮＡの転写反応を行った。
【0228】
〔ｍＲＮＡの精製〕
転写反応後、得られたｍＲＮＡはエタノール沈殿により精製した。
転写反応後、得られたｍＲＮＡはエタノール沈殿により精製した。
【0229】
〔無細胞蛋白合成反応（ＳＴＥＰ２ 透析法による蛋白合成）〕
上記ｍＲＮＡを用いた以外は、実施例１と同様にして行った。
上記ｍＲＮＡを用いた以外は、実施例１と同様にして行った。
【0230】
〔反応後のゴム粒子の回収〕
実施例１と同様にして反応後のゴム粒子を回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
実施例１と同様にして反応後のゴム粒子を回収し、等量の２ｍＭのジチオスレイトール（ＤＴＴ）を含む１００Ｍ Ｔｒｉｓ緩衝液（ｐＨ７．５）に再懸濁した。
【0231】
〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を、実施例１と同様にして測定した。
結果を表１に示す。
回収した反応後のゴム粒子のゴム合成活性を、実施例１と同様にして測定した。
結果を表１に示す。
【0232】
〔合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布測定〕
上記〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕で合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布を、実施例１と同様にして測定した。結果を図２に示す。
上記〔反応後のゴム粒子のゴム合成活性の測定〕で合成した超長鎖ポリイソプレノイドの分子量分布を、実施例１と同様にして測定した。結果を図２に示す。
【0233】
【表1】
【0234】
表１より、ネリル二リン酸合成酵素をゴム粒子に結合させることにより（実施例１～２）、ゴム粒子に何も結合させなかった場合（比較例１）に比べて、超長鎖ポリイソプレノイドの生産量を向上させることができることが確認できた。このことから、実施例１～２において、比較例１からの超長鎖ポリイソプレノイド生産量の増加分が、ゴム粒子に結合させた蛋白質が関与して製造された超長鎖ポリイソプレノイドと考えられる。ここで、ネリル二リン酸合成酵素（ｔｒＮＤＰＳ１；実施例１）は、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、イソプレン単位がシス型で連結されたネリル二リン酸を合成する反応を触媒する酵素であり、ゴム粒子上で、この合成されたネリル二リン酸を開始末端として、イソプレノイド化合物の鎖長をシス型に延長する反応が進行することで、ポリイソプレノイドが合成されると推測されることから、反応に関与する酵素の反応特異性に鑑み、合成されるポリイソプレノイドは、トランス型が含まれず、全てのイソプレン単位がシス型で連結された、１００％シス型のポリイソプレノイドであると考えられる。
また、変異型ネリル二リン酸合成酵素（ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａ；実施例２）は、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、イソプレノイド化合物の鎖長をネリル二リン酸以上にシス型に延長する反応をも触媒することができるために、実施例１に比べて実施例２では更に超長鎖ポリイソプレノイドの生産量が向上しているものと考えられる。
また、変異型ネリル二リン酸合成酵素（ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａ；実施例２）は、イソペンテニル二リン酸とジメチルアリル二リン酸とを基質として、イソプレノイド化合物の鎖長をネリル二リン酸以上にシス型に延長する反応をも触媒することができるために、実施例１に比べて実施例２では更に超長鎖ポリイソプレノイドの生産量が向上しているものと考えられる。
【0235】
また、図２より、実施例１～２において合成される超長鎖ポリイソプレノイドは、重量平均分子量（Ｍｗ）１００万程度のＧＰＣ溶出時間のところにピークトップを有する長鎖のゴムであることが分かる。また、分子量分布パターンとして同等といえる超長鎖ポリイソプレノイドが実施例１～２において合成されているといえる。なお、図２の結果は、サンプル間で規格化されていないため、ピークの高さで活性を比較することはできないものである。
【0236】
なお、実施例において用いられたネリル二リン酸合成酵素（ＮＤＰＳ（配列番号２）、ｔｒＮＤＰＳ１（配列番号８）、ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａ（配列番号１２））のアミノ酸配列のマルチプルシーケンスアライメントを行った様子を図３に示す。図３中、シグナル配列部分、Ｈｅｌｉｘ３部位を囲んでいる。また、マイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）〔ＵＤＰ（Ｍ．ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６ＣＰＴ）〕、ネリル二リン酸合成酵素（ＮＤＰＳ（配列番号２）、シロイヌナズナ由来のＣＰＴ４（ＡｔＣＰＴ４）、ｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａ（配列番号１２））のアミノ酸配列のマルチプルシーケンスアライメントを行った様子を図４に示す。図４では、Ｈｅｌｉｘ３部位周辺のアライメントの結果が示されている。図４中、Ｈｅｌｉｘ３部位を囲んでいる。マルチプルシーケンスアライメントは、Ｇｅｎｅｔｙｘ Ｖｅｒ．１１と呼ばれるソフトを用いて行った。
【0237】
図５で示される種々の生物由来の炭素数３５以上のイソプレノイド鎖を生成するシス型プレニルトランスフェラーゼのマルチプルシーケンスアライメントを行った。Ｈｅｌｉｘ３部位周辺のアライメントの結果を図５に示す。図５中、Ｈｅｌｉｘ３部位を囲んでいる。マルチプルシーケンスアライメントは、上記同様、Ｇｅｎｅｔｙｘ Ｖｅｒ．１１と呼ばれるソフトを用いて行った。
【0238】
図５中、ＵＤＰ（Ｍ．ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６ＣＰＴ）は、マイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）の７５位から１２９位を抜粋したものである。
ＵＰＰＳ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）．は、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）の７１位から１２５位を抜粋したものである。
Ｓｒｔ１（Ｙｅａｓｔ ＣＰＴ）は、酵母由来のＳＲＴ１の１２１位から１８０位を抜粋したものである。
ＨＤＳ（Ｈｕｍａｎ ＣＰＴ）は、ヒト由来のＨＤＳの８０位から１３７位を抜粋したものである。
ＵＰＰＳ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）．は、大腸菌（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）の７１位から１２５位を抜粋したものである。
Ｓｒｔ１（Ｙｅａｓｔ ＣＰＴ）は、酵母由来のＳＲＴ１の１２１位から１８０位を抜粋したものである。
ＨＤＳ（Ｈｕｍａｎ ＣＰＴ）は、ヒト由来のＨＤＳの８０位から１３７位を抜粋したものである。
【0239】
図５より、マイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）のＨｅｌｉｘ３部位（配列番号１５で表されるマイクロコッカス属菌（Ｍｉｃｒｏｃｏｃｃｕｓ ｌｕｔｅｕｓ Ｂ－Ｐ ２６）由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）における９０位から１１０位のアミノ酸配列）が、大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）においては、配列番号１４で表される大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）における８６位から１０６位のアミノ酸配列に対応し、酵母由来のＳＲＴ１においては、配列番号１６で表される酵母由来のＳＲＴ１における１３６位から１６１位のアミノ酸配列に対応し、ヒト由来のＨＤＳにおいては、配列番号１７で表されるヒト由来のＨＤＳにおける９５位から１１８位のアミノ酸配列に対応することが分かる。
【0240】
（配列表フリーテキスト）
配列番号１：トマト由来のＮＤＰＳをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号２：トマト由来のＮＤＰＳのアミノ酸配列
配列番号３：パラゴムノキ由来のＲｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒをコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号４：パラゴムノキ由来のＳｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎをコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号５：パラゴムノキ由来のＨｅｖｉｅｎ２．１をコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号６：パラゴムノキ由来のＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒをコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号７：実施例１で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号８：実施例１で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１のアミノ酸配列
配列番号９：プライマー１
配列番号１０：プライマー２
配列番号１１：実施例２で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号１２：実施例２で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａのアミノ酸配列
配列番号１３：シロイヌナズナ由来のＣＰＴ４（ＡｔＣＰＴ４）における１４７位から１６７位のアミノ酸配列
配列番号１４：大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）における８６位から１０６位のアミノ酸配列
配列番号１５：マイクロコッカス属菌由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）における９０位から１１０位のアミノ酸配列
配列番号１６：酵母由来のＳＲＴ１における１３６位から１６１位のアミノ酸配列
配列番号１７：ヒト由来のＨＤＳにおける９５位から１１８位のアミノ酸配列
配列番号１：トマト由来のＮＤＰＳをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号２：トマト由来のＮＤＰＳのアミノ酸配列
配列番号３：パラゴムノキ由来のＲｕｂｂｅｒ Ｅｌｏｎｇａｔｉｏｎ Ｆａｃｔｏｒをコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号４：パラゴムノキ由来のＳｍａｌｌ Ｒｕｂｂｅｒ Ｐａｒｔｉｃｌｅ Ｐｒｏｔｅｉｎをコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号５：パラゴムノキ由来のＨｅｖｉｅｎ２．１をコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号６：パラゴムノキ由来のＭＹＣ１ ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ ｆａｃｔｏｒをコードする遺伝子のプロモーターの塩基配列
配列番号７：実施例１で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１をコードする遺伝子の塩基配列
配列番号８：実施例１で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１のアミノ酸配列
配列番号９：プライマー１
配列番号１０：プライマー２
配列番号１１：実施例２で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａをコードする遺伝子の塩基配列
配列番号１２：実施例２で得られるトマト由来のｔｒＮＤＰＳ１ Ｃｈｉｍｅｒａのアミノ酸配列
配列番号１３：シロイヌナズナ由来のＣＰＴ４（ＡｔＣＰＴ４）における１４７位から１６７位のアミノ酸配列
配列番号１４：大腸菌由来のウンデカプレニルリン酸合成酵素（ＵＰＰＳ）における８６位から１０６位のアミノ酸配列
配列番号１５：マイクロコッカス属菌由来のウンデカプレニル二リン酸合成酵素（ＵＰＳ）における９０位から１１０位のアミノ酸配列
配列番号１６：酵母由来のＳＲＴ１における１３６位から１６１位のアミノ酸配列
配列番号１７：ヒト由来のＨＤＳにおける９５位から１１８位のアミノ酸配列
【図1】
【図2】
【図3】
【図4】
【図5】
【配列表】