特許 7346710 新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用医薬組成物

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】

(24)【登録日】2023-09-08

(45)【発行日】2023-09-19

(54)【発明の名称】新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用医薬組成物

(51)【国際特許分類】

   A61K 31/501 20060101AFI20230911BHJP

   A61K 31/4709 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/496 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/122 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/706 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/551 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/41 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/7048 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/7072 20060101ALI20230911BHJP

   A61K 31/70 20060101ALI20230911BHJP

   A61P 31/14 20060101ALI20230911BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20230911BHJP

【ＦＩ】

A61K31/501

A61K31/4709

A61K31/496

A61K31/122

A61K31/706

A61K31/551

A61K31/41

A61K31/7048

A61K31/7072

A61K31/70

A61P31/14

A61P43/00 121

【請求項の数】 9

(21)【出願番号】P 2022506385

(86)(22)【出願日】2021-04-27

(65)【公表番号】

(43)【公表日】2023-02-20

(86)【国際出願番号】 KR2021005306

(87)【国際公開番号】W WO2021221435

(87)【国際公開日】2021-11-04

【審査請求日】2022-04-27

(31)【優先権主張番号】10-2020-0052509

(32)【優先日】2020-04-29

(33)【優先権主張国・地域又は機関】KR

(31)【優先権主張番号】10-2020-0127319

(32)【優先日】2020-09-29

(33)【優先権主張国・地域又は機関】KR

(73)【特許権者】

【識別番号】514291196

【氏名又は名称】コリア アドバンスト インスティチュート オブ サイエンス アンド テクノロジー

(73)【特許権者】

【識別番号】522040229

【氏名又は名称】アンスティテュ パストゥール コリア

【氏名又は名称原語表記】ＩＮＳＴＩＴＵＴ ＰＡＳＴＥＵＲ ＫＯＲＥＡ

(74)【代理人】

【識別番号】100139594

【弁理士】

【氏名又は名称】山口 健次郎

(74)【代理人】

【氏名又は名称】森田 憲一

(72)【発明者】

【氏名】イ サンヨプ

(72)【発明者】

【氏名】チャン ウデ

(72)【発明者】

【氏名】キム スンテク

(72)【発明者】

【氏名】チョン サンウン

【審査官】鶴見 秀紀

(56)【参考文献】

【文献】Advanced Herbal Medicine，2019年，Vol.5,No.2，pp.42-53

【文献】International Journal of Antimicrobial Agents，2020年，Vol.55，pp.1-3

【文献】Cell Research，Vol.30，2020年，pp,269-271

(58)【調査した分野】(Int.Cl.，ＤＢ名)

Ａ６１Ｋ ３１／００－３１／８０

Ａ６１Ｐ ３１／１４

Ａ６１Ｐ ４３／００

ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）

ＣＡｐｌｕｓ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ（ＳＴＮ）

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＲｄＲＰに特異的に結合する化合物を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物であって、
前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、オミパリシブ（Ｏｍｉｐａｌｉｓｉｂ）及びチピファルニブ（Ｔｉｐｉｆａｒｎｉｂ）からなる群から選ばれる、医薬組成物。

【請求項2】

ブロナンセリン（Ｂｌｏｎａｎｓｅｒｉｎ）、エモジン（Ｅｍｏｄｉｎ）、及びレムデシビル（Ｒｅｍｄｅｓｉｖｉｒ）からなる群から選ばれる１つ以上の化合物を更に含む、請求項１に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項3】

チピファルニブ及びブロナンセリンを含み、
前記チピファルニブは２．７５μＭ～１１μＭの濃度で含み、
前記ブロナンセリンは１．５０μＭ～４７．８７μＭの濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項4】

チピファルニブ及びエモジンを含み、
前記チピファルニブは０μＭ超過１１μＭ以下の濃度で含み、前記エモジンは１．９７μＭ～３１．４５μＭの濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項5】

チピファルニブ及びオミパリシブを含み、
前記チピファルニブは１．３８μＭ～１１μＭの濃度で含み、前記オミパリシブは０．２５μＭ～１．９７μＭの濃度で含むか；又は
前記チピファルニブは０μＭ超過１１μＭ以下の濃度で含み、前記オミパリシブは０μＭ超過０．２５μＭ以下の濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項6】

レムデシビル及びチピファルニブを含み、
前記レムデシビルは０μＭ超過２０．１８μＭ以下の濃度で含み、前記チピファルニブは０μＭ超過１１μＭ以下の濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項7】

ブロナンセリン及びオミパリシブを含み、
前記ブロナンセリンは１．５μＭ～４７．８７μＭの濃度で含み、前記オミパリシブは０μＭ超過０．４９μＭ以下の濃度で含むか；又は
前記ブロナンセリンは０μＭ超過４７．８７μＭ以下の濃度で含み、前記オミパリシブは０．４９μＭ～１．９７μＭの濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項8】

エモジン及びオミパリシブを含み、
前記エモジンは０μＭ超過１２５．８１μＭ以下の濃度で含み、前記オミパリシブは０μＭ超過１．９７μＭ以下の濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【請求項9】

レムデシビル及びオミパリシブを含み、
前記レムデシビルは０μＭ超過４０．３６μＭ以下の濃度で含み、前記オミパリシブは０μＭ超過１．９７μＭ以下の濃度で含むことを特徴とする、請求項１又は２に記載の新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療に使用するための組成物。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

本発明は、新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用医薬組成物に関し、より具体的には、薬物仮想スクリーニング技術を用いた既存薬再開発技術で導出した新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用医薬組成物に関する。

【背景技術】

【0002】

コロナウイルスは、外皮を持つ一本鎖の陽性ＲＮＡウイルスであり、ゲノムサイズが２５～３２ｋｂであって、いままで知られたＲＮＡウイルスの中では比較的大きいウイルスに属する。外皮に棍棒状の突起であるスパイク（ｓｐｉｋｅ）タンパク質が突き出して火炎又は王冠様の特異的構造を有し、ラテン語で王冠という意味であるコロナ（Ｃｏｒｏｎａ）からウイルス名が付けられた。１９３７年に鶏から初めて発見されて以来、コウモリ、鳥、猫、犬、牛、豚、ネズミなどの様々な鳥類と動物から発見されたコロナウイルスは、４個のグループ（アルファ－、ベータ－、ガンマ－、デルタ－コロナウイルス）に分けられる。アルファとベータコロナウイルスグループは、哺乳類に主に感染し、ガンマとデルタコロナウイルスグループは鳥類から発見することができる。コロナウイルスは動物において胃腸病及び呼吸器疾患のような様々な疾患を起こすことが知られている。人に感染するヒトコロナウイルスは、１９６０年代に発見されたＨＣｏＶ－２２９Ｅ及びＨＣｏＶ－ＯＣ４３、ＳＡＲＳの大流行以降に発見されたＨＣｏＶ－ＮＬ６３（２００４年）及びＨＣｏＶ－ＨＫＵ１（２００５年）であり、これらは一般に上気道感染症と関係があると知られているが、免疫欠乏患者には深刻な肺疾患を招くこともある。主として冬や早春にコロナウイルスへの感染率が増加すると報告されており、成人風邪患者においてコロナウイルスが原因病原体である比率が非常に高いと知られている。

【0003】

新型コロナウイルス感染症は、２０１９年１２月に中国武漢市で発生したウイルス性呼吸器疾患である。‘武漢肺炎’、‘ＣＯＶＩＤ－１９’、‘新型コロナ’とも呼ばれる。新種コロナウイルスによる流行性疾患であって、呼吸器から感染し、症状がほとんどない感染初期に伝染性が強いという特徴を示す。感染後には咽喉痛、高熱、せき、呼吸困難などの症状を経て肺炎に発展する。世界各地で感染が拡大し、２０２０年３月世界保健機構はこの疾患に対してパンデミックを宣言した。

【0004】

新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）は主に呼吸器で感染する。感染すると、ウイルスは肺を侵犯し、高熱とせき、呼吸困難などの症状が発生し、肺炎と類似の症状を示すが、深刻な場合、肺胞が損傷して呼吸不全によって死亡に至ることもある。潜伏期は３～７日であるが、最長１４日になることもある。２０２０年１月３０日、中国では潜伏期が２３日まで増えた事例があると発表した。新型コロナウイルス感染症は、症状が現れない潜伏期にも伝染する事例があると報告されている。

【0005】

第２型重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２，Ｓｅｖｅｒｅ ａｃｕｔｅ ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ ｓｙｎｄｒｏｍｅ ｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ ２）は、新型コロナウイルス感染症流行の原因ウイルスである。当該ウイルスの人から人への感染は学界で確認され［４］、このコロナウイルスは、特に２ｍ半径内のせきや鼻水による呼吸器飛沫への密接接触によって主に伝播される（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｃｄｃ．ｇｏｖ／ｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ／２０１９－ｎｃｏｖ／ａｂｏｕｔ／ｔｒａｎｓｍｉｓｓｉｏｎ．ｈｔｍｌ）。汚染した表面や物を接触後に目、鼻、口を触ることも、当該感染症にかかり得る他の原因である。このウイルスのＲＮＡは、感染した患者の大便検査標本からも発見された（ＭＬ．Ｈｏｌｓｈｕｅ ｅｔ ａｌ．，Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ．Ｖｏｌ．３８２，ｐｐ．９２９－９３６，２０２０．）。

【0006】

ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の細胞への進入は、ウイルス外皮にあり、外形上に‘コロナ’のように外部に突き出た１２７３個アミノ酸で構成されたスパイク（Ｓ）ウイルスタンパク質がアンギオテンシン転換酵素２（ＡＣＥ２）受容体と結合してなされる。ＡＣＥ２は、３種のコロナウイルス菌株であるＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＮＬ６３及びＳＡＲＳＣｏＶ－２の細胞進入を媒介し、特に、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ２はアミノ酸配列において７６％の同一性を共有することにより、ＡＣＥ２との結合に対するそれらのウイルスの傾向を説明する。ウイルス進入過程の第一の段階は、ウイルスタンパク質単位Ｓ１のＮ末端部分がＡＣＥ２受容体のポケットに結合することである。ウイルス進入において最も重要とされる第二の段階は、Ｓ１とＳ２単位間のタンパク質切断であり、Ｈｅｐｓｉｎ／ＴＭＰＲＳＳサブファミリーの構成員である受容体膜貫通タンパク質セリン２（ＴＭＰＲＳＳ２）によって媒介されると知られている（Ｐｏｌｏ Ｖ．ｅｔ ａｌ．，Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｉｎｔｅｒｎａｌ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ，２０２０）。

【0007】

一方、既存薬再開発は、既に市販中であるか、或いは臨床段階で安定性以外の理由で失敗した薬物を対象に、新しい適応症を究明する新薬開発戦略の一つである。既存薬再開発は、同一の薬物ターゲットから新しい適応症の効果を確認したり、或いは新規薬物ターゲットを見つけ出して新しい適応症に効果があることを立証することである。既存薬再開発は、薬物候補物質の発掘にかかる費用と時間を画期的に減らすことができ、既に臨床的に安全性が確保された候補物質を対象とするため、薬物の安全性問題から臨床中間段階で失敗することを解決できるという長所がある。

【0008】

薬物仮想スクリーニング技術は、実際の化合物ライブラリー製造に先立ち、薬効があると予想される活性化合物で構成された化合物ライブラリーをコンピュータを用いて迅速に作製することを目標とする。薬物仮想スクリーニングは、リガンドベース、薬物作用発生団（ｐｈａｒｍａｃｏｐｈｏｒｅ）ベース、タンパク質構造ベースのスクリーニングのように様々な戦略を一般に順次適用して行われる。リガンドベースのスクリーニングは、薬物ターゲットに既に知られた活性化合物の構造をレファレンスにして化合物の２次元又は３次元構造類似度が高い化合物をデータベースから探索する。薬物作用発生団ベースのスクリーニング方式は、薬理作用を示す分子の特定作用基の３次元配列情報が類似な化合物をスクリーニングする方式である。タンパク質構造ベースのスクリーニングは、薬物ターゲットに対する化合物の親和力をドッキングシミュレーションで計算して候補物質を評価する方式である。この過程でエネルギーを計算する評価関数は、力場ベース（ｆｏｒｃｅ－ｆｉｅｌｄ ｂａｓｅｄ）、経験上（ｅｍｐｉｒｉｃａｌ）、知識ベース（ｋｎｏｗｌｅｄｇｅ－ｂａｓｅｄ）、コンセンサス・スコアリング（ｃｏｎｓｅｎｓｕｓ ｓｃｏｒｉｎｇ）方式などを用いることができる。

【0009】

薬物仮想スクリーニングを用いた既存薬再開発方法は、少ない費用で最大限の効果が得られる効率的な新薬開発方法の一つであり、ウイルス大流行のような緊急状況で迅速に薬物候補物質を導出するための最適の技術として評価されている。

【0010】

新型コロナウイルス感染症は２０２１年４月基準で全世界に１億４千万人を超える感染者と３００万人以上の死亡者が発生しており、人類の健康に致命的な脅威になっている状況である。しかし、まだ、明確な抗ウイルス効果が立証された治療剤やワクチンが開発されていない実情である。現在、カレトラ、クロロキン、シクレソニド、ナファモスタット、レボビル、レムデシビルなどの薬物が既存薬再開発技術によって新型コロナウイルス感染症治療用途に臨床試験中である。

【0011】

カレトラは、ロピナビル／リトナビル（Ｌｏｐｉｎａｖｉｒ／ｒｉｔｏｎａｖｉｒ，ＬＰＶ／ｒ）の商標名を有し、エイズ治療剤としてＨＩＶウイルスの複製を防ぐタンパク質分解酵素抑制剤として知られている（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｄｒｕｇｓ．ｃｏｍ／ｍｏｎｏｇｒａｐｈ／ｌｏｐｉｎａｖｉｒ－ａｎｄ－ｒｉｔｏｎａｖｉｒ．ｈｔｍｌ）。

【0012】

クロロキンは、マラリアの影響力がある地域でマラリアの予防及び治療に用いられる薬物であり、特定の種類のマラリア、耐性菌、複合的なケースには一般に、他の薬物又は追加の薬物と共に使用し、腸外で発生するアメーバ性感染、リウマチ関節炎、ループス病にも間欠的に使用するものと知られている（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｄｒｕｇｓ．ｃｏｍ／ｍｏｎｏｇｒａｐｈ／ａｒａｌｅｎ－ｐｈｏｓｐｈａｔｅ．ｈｔｍｌ）。

【0013】

シクレソニドは、喘息及びアレルギー性鼻炎を治療するために用いられるグルココルチコイドと知られており、頭痛、鼻腔出血及び鼻腔内感染などの副作用があると知られている（Ｍｕｔｃｈ Ｅ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｙ，Ｖｏ．７３（１０）、ｐｐ．１６５７－６４，２００７．）。

【0014】

ナファモスタットは、セリンプロテアーゼ阻害剤であり、短時間作用（ｓｈｏｒｔ－ａｃｔｉｎｇ）抗凝固剤、抗ウイルス剤及び抗癌剤としての機能が知られており、フィブリノーゲンがフィブリンに分解されることを阻害するのに用いられ、デング熱において血球が破壊されることを防止するものと知られている（Ｃｈｅｎ Ｘ ｅｔ ａｌ．，Ｆｒｏｎｔ Ｏｎｃｏｌ．Ｖｏｌ．９，ｐｐ．８５２，２０１９）。

【0015】

レボビルは、活動性ウイルスの複製が確認され、血清アミノ転移酵素の上昇が確認された慢性Ｂ型肝炎ウイルス感染症患者のウイルス増殖抑制用の抗ウイルス剤として知られている（ｈｔｔｐ：／／ｗｗｗ．ｈｅａｌｔｈ．ｋｒ／ｓｅａｒｃｈＤｒｕｇ／ｒｅｓｕｌｔ＿ｄｒｕｇ．ａｓｐ・ｄｒｕｇ＿ｃｄ＝Ａ１１ＡＯＯＯＯＯ９９６０）。

【0016】

レムデシビルは、特定ヌクレオチド類似体プロドラッグとして作られた抗ウイルス剤である。もともとはギリアドサイエンシズ社がエボラ出血熱とマールブルグウイルス治療のための薬品として開発したが、以降の様々な実験から、一本鎖ＲＮＡウイルスである呼吸器細胞融合ウイルス、フニンウイルス、ラッサ熱ウイルス、ヘニパウイルス、コロナウイルス（ＭＥＲＳ及びＳＡＲＳウイルスを含む）の抗ウイルス効果を発揮するものとして知られた（Ｍｉｃｈａｅｌ Ｋ．Ｌｏ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ ｒｅｐｏｒｔｓ，Ｖｏｌ．７，ｐｐ．４３３９５，２０１７）。

【0017】

そこで、本発明者らは、上記の問題点を解決し、新型コロナウイルス感染症を治療するための薬物を開発するために鋭意努力した結果、薬物仮想スクリーニングを用いた既存薬再開発により、ＳＡＲＳ－コロナウイルス－２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）のＭｐｒｏ又はＲｄＲＰと結合してそれぞれの機能を阻害する治療剤候補物質を導出した。導出された治療剤候補物質を、霊長類細胞（Ｖｅｒｏ）及びヒト肺細胞であるＣａｌｕ－３に、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルスと共に処理し、低いＩＣ５０値において優れた抗ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２効果を示す治療剤物質を導出した。さらに、導出された薬物のシナジー効果を検証し、優れたシナジー効果を示す薬物の組合せ及び濃度を確認し、本発明を完成した。

【0018】

本背景技術の部分に記載された上記情報は単に本発明の背景に関する理解を向上させるためのものであり、したがって、本発明の属する技術の分野における通常の知識を有する者に既に知られた先行技術を形成する情報を含まなくてもよい。

【発明の概要】

【0019】

本発明の目的は、新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用医薬組成物を提供することである。

【0020】

本発明の他の目的は、前記組成物を用いた新型コロナウイルス感染症を治療する方法に関する。

【0021】

本発明のさらに他の目的は、前記組成物の新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用用途に関する。

【0022】

上記の目的を達成するために、本発明は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏに特異的に結合する化合物又はＲｄＲＰに特異的に結合する化合物を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用医薬組成物を提供する。

【0023】

本発明は、また、ブロナンセリン（Ｂｌｏｎａｎｓｅｒｉｎ）、エモジン（Ｅｍｏｄｉｎ）、オミパリシブ（Ｏｍｉｐａｌｉｓｉｂ）、チピファルニブ（Ｔｉｐｉｆａｒｎｉｂ）及びレムデシビル（Ｒｅｍｄｅｓｉｖｉｒ）からなる群から選ばれる２つ以上の化合物を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用医薬組成物を提供する。

【0024】

本発明は、また、前記組成物を投与する段階を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療方法を提供する。

【0025】

本発明は、また、患者にＭｐｒｏに特異的に結合する化合物又はＲｄＲＰに特異的に結合する化合物を投与する段階を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の治療方法を提供する。

【0026】

本発明は、また、ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルからなる群から選ばれる２つ以上の化合物を併用投与する段階を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療方法を提供する。

【0027】

本発明は、また、前記組成物の新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用用途を提供する。

【0028】

本発明は、また、新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用薬剤の製造のための前記組成物の使用を提供する。

【図面の簡単な説明】

【0029】

【図1】本発明で用いられる薬物仮想スクリーニング手順を示す図である。

【図2】本発明で用いられる薬物ターゲットであるＭｐｒｏの構造を示す図である。

【図3】本発明で用いられる薬物ターゲットであるＲｄＲｐの構造を示す図である。

【図4】本発明で用いられる薬物ターゲットであるＲｄＲｐに結合すると予測された薬物候補物質の結合様相を示す図である。

【図5】本発明で用いられる薬物ターゲットであるＭｐｒｏに結合すると予測された薬物候補物質の結合様相を示す図である。

【図6】本発明で用いられる薬物の抗ウイルス効果を比較するために用いられたレファレンス薬物３種（クロロキン（ｃｈｌｏｒｏｑｕｉｎｅ）、ロピナビル（ｌｏｐｉｎａｖｉｒ）、レムデシビル（Ｒｅｍｄｅｓｉｖｉｒ））の容量反応曲線（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｃｕｒｖｅ）を示す図である。

【図7】Ａは、本発明で用いられる薬物の抗ウイルス効果実験過程を示し、Ｂは、各薬物の容量による抗ウイルス効果を示し、Ｃは、Ｖｅｒｏ細胞における単一薬物のそれぞれの容量反応曲線を示す図である。

【図8】Ｃａｌｕ－３細胞における単一薬物（オミパリシブ、チピファルニブ、ブロナンセリン、ヒペリシン（Ｈｙｐｅｒｉｃｉｎ）、ＬＧＨ－４４７、ＮＳ－３７２８及びエモジン）のそれぞれの容量反応曲線を示す図である。

【図9】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、ブロナンセリン）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックス（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｍａｔｒｉｘ）である。

【図10】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、ブロナンセリン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性（Ｌｏｅｗｅ ａｄｄｉｔｉｖｉｔｙ）モデルベースで示す図である。

【図11】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、ブロナンセリン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性（Ｂｌｉｓｓ ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｃｅ）モデルベースで示す図である。

【図12】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、ブロナンセリン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰ（Ｚｅｒｏ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ Ｐｏｔｅｎｃｙ）モデルベースで示す図である。

【図13】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、ブロナンセリン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡ（Ｈｉｇｈｅｓｔ Ｓｉｎｇｌｅ Ａｇｅｎｔ）モデルベースで示す図である。

【図14】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、エモジン）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックス（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｍａｔｒｉｘ）である。

【図15】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図16】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図17】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図18】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図19】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、オミパリシブ）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図20】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図21】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図22】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図23】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図24】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、レムデシビル）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図25】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図26】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図27】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図28】本発明で用いられる組合せ薬物（チピファルニブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図29】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、エモジン）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図30】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図31】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図32】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図33】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、エモジン）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図34】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、オミパリシブ）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図35】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図36】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図37】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図38】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図39】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、レムデシビル）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図40】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図41】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図42】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図43】本発明で用いられる組合せ薬物（ブロナンセリン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図44】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、オミパリシブ）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図45】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図46】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図47】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図48】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、オミパリシブ）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図49】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、レムデシビル）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図50】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図51】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図52】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図53】本発明で用いられる組合せ薬物（エモジン、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【図54】本発明で用いられる組合せ薬物（オミパリシブ、レムデシビル）の容量による抗ウイルス効果を示す図である。左側はそれぞれ、単一薬物の容量反応曲線であり、右側は、各単一薬物の容量による容量反応マトリックスである。

【図55】本発明で用いられる組合せ薬物（オミパリシブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をロエベ相加性モデルベースで示す図である。

【図56】本発明で用いられる組合せ薬物（オミパリシブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をブリス独立性モデルベースで示す図である。

【図57】本発明で用いられる組合せ薬物（オミパリシブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＺＩＰモデルベースで示す図である。

【図58】本発明で用いられる組合せ薬物（オミパリシブ、レムデシビル）の抗ウイルス薬物シナジー効果をＨＳＡモデルベースで示す図である。

【発明を実施するための形態】

【0030】

別に断りのない限り、本明細書で使われる技術的及び科学的用語はいずれも、本発明の属する技術の分野における熟練した専門家によって通常理解されるのと同じ意味を有する。一般に、本明細書における命名法及び以下に記述する実験方法は、本技術分野でよく知られており、通常用いられるものである。

【0031】

本発明では、既存に承認されたか或いは臨床試験が進行中である薬物の構造をデータベース化し、様々な基準でＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の特定ターゲットタンパク質との結合の有無を分析することによって、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対して高い抗ウイルス効果を示す薬物を導出し、新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用薬物を確認した。

【0032】

コロナウイルスは変異型が発見し続いており、変異による薬物の抵抗性問題が発生する恐れもある。したがって、本発明者らは、ウイルス複製に中枢的な役割を担うと同時に、他のコロナ系列ウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ）と比較して配列が保存的である２種の酵素（Ｍｐｒｏ、ＲｄＲｐ）を、治療に適する薬物ターゲットとして決めた（Ｚｈｏｕ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ，（２０２０）５７９（７７９８）、２７０－２７３．）。

【0033】

すなわち、本発明の一実施例では、様々なデータベースから収集した６，２１８個の化合物とＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のタンパク質であるＭｐｒｏとＲｄＲｐが結合する３次元構造物（１，８６５，４００）のリガンド形態を比較し、一定の類似度以上を有する化合物を選別し、ドッキングエネルギー、相互作用パターンの類似度などを基準に薬物候補群をスクリーニングした。

【0034】

その後、選別した候補群をそれぞれＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した細胞に処理し、抗ウイルス効果を示す化合物を最終新型コロナウイルス感染症治療剤として選別した（図１）。また、最終選別された新型コロナウイルス感染症治療剤の組合せの併用投与に対して各薬物の容量による抗ウイルス効果又は薬物組合せの抗ウイルス効果を確認した。

【0035】

したがって、本発明は、一観点において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏに特異的に結合する化合物又はＲｄＲＰに特異的に結合する化合物を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用医薬組成物に関し、

【0036】

前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、アロブレシブ（Ａｌｏｂｒｅｓｉｂ）、ＣＥ－３２６５９７、ブロナンセリン（Ｂｌｏｎａｎｓｅｒｉｎ）及びエモジン（Ｅｍｏｄｉｎ）からなる群から選ばれ、

【0037】

前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、ヒペリシン（Ｈｙｐｅｒｉｃｉｎ）、オミパリシブ（Ｏｍｉｐａｌｉｓｉｂ）、ＬＧＨ－４４７、ＮＳ－３７２８、チピファルニブ（Ｔｉｐｉｆａｒｎｉｂ）、バロピシタビン（Ｖａｌｏｐｉｃｉｔａｂｉｎｅ）、エルサミトルシン（Ｅｌｓａｍｉｔｒｕｃｉｎ）、ＮＲＣ－ＡＮ－０１９、デヌホソル（Ｄｅｎｕｆｏｓｏｌ）及びイサトリビン（Ｉｓａｔｏｒｉｂｉｎｅ）からなる群から選ばれる、医薬組成物に関する。

【0038】

本発明の用語“Ｍｐｒｏ”とは、タンパク質分解酵素（ｐｒｏｔｅａｓｅ）であり、ウイルスのポリペプチドを分解し、ウイルスを構成するタンパク質と複製に必須なタンパク質を生成する役割を担う（Ｊｉｎ，Ｚ．ｅｔ ａｌ．Ｎａｔｕｒｅ，（２０２０）１－５．）。本発明では、Ｍｐｒｏの活性部位（ａｃｔｉｖｅ ｓｉｔｅ）の阻害剤はウイルス増殖に必須なタンパク質の合成を抑制させることができ、抗ウイルス効果を示すことができる。本発明の用語“ＲｄＲｐ”とは、ＲＮＡ複製酵素（ＲＮＡ ｒｅｐｌｉｃａｓｅ）であり、ウイルスのＲＮＡ複製に直接的な役割を担う酵素である。ＲｄＲｐを阻害する代表薬物がレムデシビルであり、作用機序がタンパク質３次元構造で究明された（Ｙｉｎ，Ｗ．ｅｔ ａｌ．Ｓｃｉｅｎｃｅ（２０２０）．）。本発明では、ＲｄＲｐの活性部位阻害剤はウイルス複製過程を抑制して抗ウイルス効果を示すことができる。

【0039】

本発明において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏ又はＲｄＲＰに結合する化合物の例は、実施例の表７に示す通りであるが、これに制限されない。

【0040】

本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、Ｍｐｒｏに－７．０ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギー（ｄｏｃｋｉｎｇ ｅｎｅｒｇｙ）を有することを特徴とし、より好ましくは、－７．５ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギを有することを特徴とし得る。

【0041】

本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏタンパク質に特異的に結合してタンパク質の合成を阻害することを特徴とし得る。

【0042】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、ＲｄＲＰに－６．４ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギーを有することを特徴とし、より好ましくは、－６．７ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギーを有することを特徴とし得る。

【0043】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＲｄＲＰタンパク質に特異的に結合してウイルスの複製を阻害することを特徴とし得る。
本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、好ましくはブロナンセリン又はエモジン、より好ましくはエモジンであることを特徴とし得る。

【0044】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、好ましくはヒペリシン、オミパリシブ、ＬＧＨ－４４７、ＮＳ－３７２８、及びチピファルニブからなる群から選ばれるものであり、より好ましくはオミパリシブ、又はチピファルニブであることを特徴とし得る。

【0045】

一方、本発明の他の実施例では、最終選別された単一候補薬物（ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ及びチピファルニブ）及び臨床承認されたコロナ治療剤であるレムデシビルを任意に組み合わせて細胞株に注入した後、各薬物の容量による抗ウイルス効果又は薬物組合せの抗ウイルス効果を確認した。確認された候補薬物組合せの濃度反応マトリックス及び４つのシナジー評価モデル（１．ロエベ相加性（Ｌｏｅｗｅ ａｄｄｉｔｉｖｉｔｙ）モデル；２．ブリス独立性（Ｂｌｉｓｓ ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｃｅ）モデル、３）ＺＩＰ（Ｚｅｒｏ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ Ｐｏｔｅｎｃｙ）モデル、４）ＨＳＡ（Ｈｉｇｈｅｓｔ Ｓｉｎｇｌｅ Ａｇｅｎｔ）モデル）に基づいてシナジー効果を評価し、高いシナジー効果を示す最適の化合物の組合せ及び濃度を導出した。特に、ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルのうちの任意の２つの化合物を組み合わせる１０通りの場合に、ＣｏＶｉｄ－１９の予防又は治療に対して、単独使用による期待効果よりも１０％～８０％優れたシナジー効果を示した（図７～図５４）。

【0046】

したがって、本発明は、他の観点において、ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルからなる群から選ばれる２つ以上の化合物を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用医薬組成物に関する。

【0047】

本発明において、好ましくは、前記ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルからなる群から選ばれる２つの化合物を含むことを特徴とし得る。

【0048】

本発明において、（１）前記組成物がチピファルニブ及びブロナンセリンの組合せを含む場合、前記チピファルニブは２．７５～１１μＭの濃度で含まれ、前記ブロナンセリンは１．５０～４７．８７μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0049】

本発明において、（２）前記組成物がチピファルニブ及びエモジンの組合せを含む場合、前記チピファルニブは０超過１１以下μＭの濃度で含まれ、前記エモジンは１．９７～３１．４５μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0050】

本発明において、（３）前記組成物がチピファルニブ及びオミパリシブの組合せを含む場合、前記チピファルニブは０超過１１以下μＭの濃度で含まれ、前記オミパリシブは０超過０．２５以下μＭの濃度で含まれたり、或いは前記チピファルニブは１．３８～１１μＭの濃度で含まれ、前記オミパリシブは０超過０．２５以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0051】

本発明において、（４）前記組成物がチピファルニブ及びレムデシビルの組合せを含む場合、前記チピファルニブは０超過１１以下μＭの濃度で含まれ、前記レムデシビルは０超過２０．１８以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0052】

本発明において、（５）前記組成物がブロナンセリン及びエモジンの組合せを含む場合、前記ブロナンセリンは０超過５．９８以下μＭの濃度で含まれ、前記エモジンは７．８６～６２．９μＭの濃度で含まれたり、或いは前記ブロナンセリンは５．９８～４７．８７μＭの濃度で含まれ、前記エモジンは０超過６２．９以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0053】

本発明において、（６）前記組成物がブロナンセリン及びオミパリシブの組合せを含む場合、前記ブロナンセリンは０超過４７．８７以下μＭの濃度で含まれ、前記オミパリシブは０．４９～１．９７μＭの濃度で含まれたり、或いは前記ブロナンセリンは１．５～４７．８７μＭの濃度で含まれ、前記オミパリシブは０超過０．４９以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0054】

本発明において、（７）前記組成物がブロナンセリン及びレムデシビルの組合せを含む場合、前記ブロナンセリンは０超過１．５以下μＭの濃度で含まれ、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で含まれたり、或いは前記ブロナンセリンは５．０～４０μＭの濃度で含まれ、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0055】

本発明において、（８）前記組成物がエモジン及びオミパリシブの組合せを含む場合、前記エモジンは０超過１２５．８１以下μＭの濃度で含まれ、前記オミパリシブは０超過１．９７以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0056】

本発明において、（９）前記組成物がエモジン及びレムデシビルの組合せを含む場合、前記エモジンは０超過１２５．８１以下μＭの濃度で含まれ、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0057】

本発明において、（１０）前記組成物がオミパリシブ及びレムデシビルを含む場合、前記オミパリシブは０超過１．９７以下μＭの濃度で含まれ、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で含まれることを特徴とし得る。

【0058】

本発明において、前記薬学組成物は、好ましくは、霊長類の治療用途に用いられる場合、前記１０通りの組合せを含むことを特徴とし、より好ましくは、ｉ）レムデシビル及びチピファルニブ、ｉｉ）オミパリシブ及びエモジン、ｉｉｉ）レムデシビル及びエモジン、ｉｖ）レムデシビル及びオミパリシブ、ｖ）オミパリシブ及びチピファルニブ、又はｖｉ）オミパリシブ及びブロナンセリンの組合せを含むことを特徴とし得る。

【0059】

本発明において、前記薬学組成物は、より好ましくは、人の治療用途に用いられる場合、レムデシビル、チピファルニブ、オミパリシブ及びエモジンからなる群から選ばれる２つ以上の化合物、好ましくは、前記群から選ばれる２つの化合物を含むことを特徴とし得る。

【0060】

本発明に係る組成物は、特に、新型コロナウイルス感染症（ＣｏＶｉｄ－１９）を治療するために使用することが意図される。

【0061】

本発明において用語“新型コロナウイルス感染症”は、人間又は動物有機体がＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）に感染される細胞を有することを意味する。感染は、特に、呼吸器サンプルから検出する及び／又はウイルス滴定を行うか或いは血液－循環ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２特異的抗体を検定することによって確立することができる。このような特定ウイルスに感染された個体における検出は、当業者に周知の、特に分子生物学の通常の診断方法（ＰＣＲ）によってなされる。

【0062】

本発明の用語“予防”及び“治療”は、最広義の概念で解釈されるべきであり、“予防”とは、疾患に露出されたり或いは疾患にかかりやすいが、疾患の症状をまだ経験又は表出していない患者において疾患の臨床的症状の一つ以上が進行されないようにすることを意味する。“治療”とは、疾患又はその一つ以上の臨床的症状の発達を阻止又は減少させるあらゆる行為を意味する。

【0063】

本発明において、用語“治療”とは、人間又は動物有機体においてＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２感染と戦うことを意味する。本発明に係る少なくとも一つの組成物の投与によって、有機体でのウイルス感染率（感染力価）は減少するはずであり、好ましくは、ウイルスは有機体から完全に消えることができる。本発明において、用語“治療”とは、また、ウイルス感染に関連した症状（呼吸器症候群、腎不全、熱）を弱化させることを意味する。

【0064】

本発明の前記新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用組成物は、薬学的に許容可能な担体をさらに含むことができ、担体と共に製剤化されてよい。

【0065】

本発明において、用語“薬学的に許容可能な担体”とは、生物体を刺激しなく、投与化合物の生物学的活性及び特性を阻害しない担体又は希釈剤のことを指す。液状溶液に製剤化される組成物において許容される薬剤学的担体としては、滅菌及び生体に適するものとして、食塩水、滅菌水、リンゲル液、緩衝食塩水、アルブミン注射溶液、デキストロース溶液、マルトデキストリン溶液、グリセロール、エタノール及びこれらの成分のうち１成分以上を混合して使用でき、必要によって、抗酸化剤、緩衝液、静菌剤などの他の通常の添加剤を添加することができる。また、希釈剤、分散剤、界面活性剤、結合剤及び潤滑剤をさらに添加し、水溶液、懸濁液、乳濁液などのような注射用剤形、丸薬、カプセル、顆粒又は錠剤として製剤化してもよい。

【0066】

本発明の前記化合物及び薬学的に許容可能な担体を含む新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用組成物は、これを有効成分として含むいかなる剤形も適用可能であり、経口用又は非経口用の剤形にすることができる。本発明の薬学的剤形は、吸入（ｉｎｈａｌａｔｉｏｎ）、口腔（ｏｒａｌ）、直腸（ｒｅｃｔａｌ）、鼻腔（ｎａｓａｌ）、局所（ｔｏｐｉｃａｌ；頬及び舌下を含む）、皮下、膣（ｖａｇｉｎａｌ）又は非経口（ｐａｒｅｎｔｅｒａｌ；筋肉内、皮下及び静脈内を含む）投与に適当なもの又は注入（ｉｎｓｕｆｆｌａｔｉｏｎ）による投与に適当な形態を含む。

【0067】

本発明の組成物を有効成分として含む経口投与用剤形には、例えば、錠剤、トローチ剤、ロジェンジ、水溶性又は油性懸濁液、調製粉末又は顆粒、エマルジョン、ハード又はソフトカプセル、シロップ、又はエリキシル剤として製剤化できる。錠剤及びカプセルなどの剤形に製剤化するために、ラクトース、サッカロース、ソルビトール、マンニトール、澱粉、アミロペクチン、セルロース又はゼラチンのような結合剤、リン酸二カルシウムのような賦形剤、トウモロコシ澱粉又はサツマイモ澱粉のような崩壊剤、ステアリン酸マグネシウム、ステアリン酸カルシウム、フマル酸ステアリルナトリウム又はポリエチレングリコールワックスのような潤滑油を含むことができ、カプセル剤形の場合、前記言及した物質の他にも、脂肪油のような液体担体をさらに含有することができる。

【0068】

本発明の組成物を有効成分として含む非経口投与用剤形には、皮下注射、静脈注射又は筋肉内注射などの注射用形態、坐剤注入方式、又は呼吸器を通して吸入可能にするエアゾール剤などのスプレー用に製剤化できる。注射用剤形として製剤化するためには、本発明の組成物を安定剤又は緩衝剤と共に水で混合して溶液又は懸濁液として製造し、これをアンプル又はバイアルの単位投与用に製剤化できる。坐剤で注入するためには、ココアバター又は他のグリセリドなどの通常の坐薬ベースを含む坐薬又は浣腸剤のような直腸投与用組成物として製剤化できる。エアゾール剤などのスプレー用に剤形化する場合、水分散された濃縮物又は湿潤粉末が分散されるように推進剤などが添加剤と共に配合されてもよい。

【0069】

本発明は、さらに他の観点において、前記新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用医薬組成物を投与することを含む、新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療する方法に関する。

【0070】

本発明において、用語“投与”は、いずれかの適切な方法で患者に本発明の医薬組成物を導入することを意味する。本発明の組成物の投与経路は、目的組織に到達できる限り、経口又は非経口の様々な経路で投与されてよく、具体的に、吸入（ｉｎｈａｌａｔｉｏｎ）、口腔、直腸、局所、静脈内、腹腔内、筋肉内、動脈内、経皮、鼻内、眼球内又は血内経路で通常の方式によって投与されてよい。

【0071】

本発明の治療方法は、本発明の新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用組成物を薬学的有効量で投与することを含む。適切な総１日使用量は、正確な医学的判断範囲内で処置医によって決定可能であることは、当業者には明らかであろう。特定患者に対する具体的な治療的有効量は、達成しようとする反応の種類と程度、場合によって別の製剤が使用されるか否かをはじめとする具体的組成物、患者の年齢、体重、一般健康状態、性別及び食餌、投与時間、投与経路及び組成物の分泌率、治療期間、具体的組成物と共に使用されるか同時使用される薬物をはじめとする様々な因子と医薬分野に周知の類似因子によって個別に適用することが好ましい。したがって、本発明の目的に適する新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用組成物の有効量は、前述した事項を考慮して決定することが好ましい。

【0072】

また、本発明の治療方法は、新型コロナウイルス感染症が発生し得る任意の動物に適用可能であり、動物は、ヒト及び霊長類の他、ウシ、ブタ、ヒツジ、ウマ、イヌ及びネコなどの家畜も含む。

【0073】

本発明に係る使用のための組成物は、前記化合物を含み、これはさらに、適切な薬学的に許容される担体以外に他の活性化合物も含むことができることは明らかである。これは、このような化合物の活性を改善可能にする化合物であってもよく、ひいては特定活性として公知されたその他活性剤であってもよい。このような追加の活性化合物は、国際出願ＷＯ２０１５／１５７２２３に言及された作用剤の薬学的部類、すなわち、抗菌剤、抗寄生虫剤、神経伝達抑制剤、エストロゲン受容体抑制剤、ＤＮＡ合成及び複製抑制剤、タンパク質成熟抑制剤、キナーゼ経路抑制剤、細胞骨格抑制剤、脂質代謝抑制剤、抗炎症剤、イオンチャンネル抑制剤、細胞自滅死（ａｐｏｐｔｏｓｉｓ）抑制剤及びカテプシン抑制剤から選ばれてよい。このような活性化合物は、特に、抗菌剤、イオンチャネル抑制剤、免疫抑制剤及び抗ウイルス剤から選ばれてよい。抗ウイルス剤としてアシクロビルを特に挙げることができる。

【0074】

本発明の医薬組成物は、前記化合物の他に、少なくともさらに他の抗ウイルス剤も含むことができる。前記抗ウイルス剤は、抗ウイルス作用を有するのに必要な投薬量で使用されるはずであり、このような投薬量は“有効”なものと示され、このような投薬量は当業者にとって容易に決定可能であることが理解される。抗ウイルス剤は、本発明の目的のために、関連したウイルス感染の抑制及び／又は減速及び／又は予防によってウイルスに作用する化合物のことを指す。

【0075】

抗ウイルス剤は、その作用方式によって異なるカテゴリーに分類される。これは、特に下記を含む：
－ ＤＮＡ又はＲＮＡ合成を妨害又は中断させるヌクレオチド類似体；及びＤＮＡ又はＲＮＡ合成に関与する酵素の抑制剤（ヘリカーゼ、レプリカーゼ）；
－ それの複製サイクル中にウイルス成熟段階を抑制する化合物；
－ 細胞膜結合又は宿主細胞におけるウイルス進入を妨害する化合物（融合又は進入抑制剤）；
－ ウイルスがそれの進入後に宿主細胞内で発現することを、細胞内におけるそれの分解を遮断することによって防止する作用剤；
－ 他の細胞へのウイルス伝播を制限する作用剤。

【0076】

標的細胞におけるプロテアーゼ抑制剤、ヘリカーゼ抑制剤及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス細胞進入抑制剤のようなＲＮＡウイルスと戦うように意図された、当業者に公知の抗ウイルス剤を特に挙げることができる。

【0077】

当業者に公知の抗ウイルス剤のうち、より正確にはリバビリン、広い抗ウイルススペクトルを有するグアノシンヌクレオシド類似体；及び宿主細胞においてウイルス複製を抑制することによって作用するインターフェロンを挙げることができる。

【0078】

本発明の医薬組成物が他の抗ウイルス剤を含む場合、前記他の抗ウイルス剤は、下記化合物：リバビリン、インターフェロン又はこれら両者の組合せから選ばれることを特徴とし得る。

【0079】

本発明の目的のために、“インターフェロン”は、免疫システムの細胞によって分泌される糖タンパク質であるインターフェロン系列に属する化合物を意味する。

【0080】

インターフェロンは、約１５０００～２１０００ダルトンの分子量を有する小さなタンパク質分子の系列である。下記３つの主要インターフェロン部類が識別されている：アルファ、ベータ及びガンマ。このような３つの主要部類は、それ自体が相同するのではなく、様々な異なるインターフェロン分子種を集めることができる。１４個超過の遺伝的に異なるヒトアルファインターフェロンが識別されている。

【0081】

本発明に係る医薬組成物において、インターフェロンとしては、実験室で合成される組換えポリペプチドを使用できることが理解される。

【0082】

特に、使用されるインターフェロンは、生体内（ｉｎ ｖｉｖｏ）及び試験管内（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）ウイルス複製に対する効率が立証された組換えインターフェロンアルファ－２ｂであってよい。

【0083】

本発明は、さらに他の観点において、前記組成物を投与する段階を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療方法に関する。

【0084】

本発明は、さらに他の観点において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏに特異的に結合する化合物又はＲｄＲＰに特異的に結合する化合物を患者に投与する段階を含む、新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療方法に関する。

【0085】

本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、Ｍｐｒｏに－７．０ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギー（ｄｏｃｋｉｎｇ ｅｎｅｒｇｙ）を有することを特徴とし、より好ましくは、－７．５ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギーを有することを特徴とし得る。

【0086】

本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏタンパク質に特異的に結合してタンパク質の合成を阻害することを特徴とし得る。

【0087】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、ＲｄＲＰに－６．４ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギーを有することを特徴とし、より好ましくは、－６．７ｋｃａｌ／ｍｏｌ以下の結合エネルギーを有することを特徴とし得る。

【0088】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＲｄＲＰタンパク質に特異的に結合してウイルスの複製を阻害することを特徴とし得る。

【0089】

本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、アロブレシブ、ＣＥ－３２６５９７、ブロナンセリン及びエモジンからなる群から選ばれることを特徴とし得る。

【0090】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、ヒペリシン、オミパリシブ、ＬＧＨ－４４７、ＮＳ－３７２８、チピファルニブ、バロピシタビン、エルサミトルシン、ＮＲＣ－ＡＮ－０１９、デヌホソル及びイサトリビンからなる群から選ばれることを特徴とし得る。

【0091】

本発明において、前記Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物は、好ましくはブロナンセリン又はエモジン、より好ましくはエモジンであることを特徴とし得る。

【0092】

本発明において、前記ＲｄＲＰに特異的に結合する化合物は、好ましくはヒペリシン、オミパリシブ、ＬＧＨ－４４７、ＮＳ－３７２８、及びチピファルニブからなる群から選ばれるものであり、より好ましくはオミパリシブ、又はチピファルニブであることを特徴とし得る。

【0093】

本発明はさらに他の観点において、ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルからなる群から選ばれる２つ以上の化合物を併用投与する段階を含む新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療方法に関する。

【0094】

本発明において、それぞれの化合物は、前記組成物において記載された濃度で投与されることを特徴とし得る。

【0095】

本発明において、前記ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルからなる群から選ばれる２つ以上の化合物を２つ以上併用投与することによって、単一薬物使用時と比較して、優れた相乗効果を得ることができる。

【0096】

本発明において、前記併用投与は、ブロナンセリン、エモジン、オミパリシブ、チピファルニブ及びレムデシビルからなる群から選ばれる２つ以上の化合物の有効量を混合した混合剤（例えば、本発明の医薬組成物）を投与することによって行うことができる。

【0097】

（１）本発明において、チピファルニブ及びブロナンセリンの組合せを併用投与する場合、前記チピファルニブは２．７５～１１μＭの濃度で投与し、前記ブロナンセリンは１．５０～４７．８７μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0098】

（２）本発明において、チピファルニブ及びエモジンの組合せを併用投与する場合、前記チピファルニブは０超過１１以下μＭの濃度で投与し、前記エモジンは１．９７～３１．４５μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0099】

（３）本発明において、チピファルニブ及びオミパリシブの組合せを併用投与する場合、前記チピファルニブは０超過１１以下μＭの濃度で投与し、前記オミパリシブは０超過０．２５以下μＭの濃度で投与するか、或いは前記チピファルニブは１．３８～１１μＭの濃度で投与し、前記オミパリシブは０超過０．２５以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0100】

（４）本発明において、チピファルニブ及びレムデシビルの組合せを併用投与する場合、前記チピファルニブは０超過１１以下μＭの濃度で投与し、前記レムデシビルは０超過２０．１８以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0101】

（５）本発明において、ブロナンセリン及びエモジンの組合せを併用投与する場合、前記ブロナンセリンは０超過５．９８以下μＭの濃度で投与し、前記エモジンは７．８６～６２．９μＭの濃度で投与するか、或いは前記ブロナンセリンは５．９８～４７．８７μＭの濃度で投与し、前記エモジンは０超過６２．９以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0102】

（６）本発明において、ブロナンセリン及びオミパリシブの組合せを併用投与する場合、前記ブロナンセリンは０超過４７．８７以下μＭの濃度で投与し、前記オミパリシブは０．４９～１．９７μＭの濃度で投与するか、或いは前記ブロナンセリンは１．５～４７．８７μＭの濃度で投与し、前記オミパリシブは０超過０．４９以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0103】

（７）本発明において、ブロナンセリン及びレムデシビルの組合せを併用投与する場合、前記ブロナンセリンは０超過１．５以下μＭの濃度で投与し、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で投与するか、或いは前記ブロナンセリンは５．０～４０μＭの濃度で投与し、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0104】

（８）本発明において、エモジン及びオミパリシブの組合せを併用投与する場合、前記エモジンは０超過１２５．８１以下μＭの濃度で投与し、前記オミパリシブは０超過１．９７以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0105】

（９）本発明において、エモジン及びレムデシビルの組合せを併用投与する場合、前記エモジンは０超過１２５．８１以下μＭの濃度で投与し、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0106】

（１０）本発明において、オミパリシブ及びレムデシビルを併用投与する場合、前記オミパリシブは０超過１．９７以下μＭの濃度で投与し、前記レムデシビルは０超過４０．３６以下μＭの濃度で投与することを特徴とし得る。

【0107】

本発明において、前記併用投与される化合物は、同時又は順次に投与でき、順次に投与する場合、その順序は制限されない。

【0108】

前記患者は、ヒト、サルなどを含む霊長類、マウス、ラットなどを含む齧歯類などを含む哺乳類であってよい。また、前記患者は、コロナウイルスに感染した患者でよく、より好ましくはＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した新型コロナウイルス感染症（ＣＯＶＩＤ－１９）患者でよい。

【0109】

本発明において、前記方法が霊長類の治療のために用いられる場合、前記１０通りの組合せで投与されることを特徴とし、より好ましくは、ｉ）レムデシビル及びチピファルニブ、ｉｉ）オミパリシブ及びエモジン、ｉｉｉ）レムデシビル及びエモジン、ｉｖ）レムデシビル及びオミパリシブ、ｖ）オミパリシブ及びチピファルニブ、又はｖｉ）オミパリシブ及びブロナンセリンの組合せで投与されることを特徴とし得る。

【0110】

本発明において、前記方法がヒトの治療のために用いられる場合、レムデシビル、チピファルニブ、オミパリシブ及びエモジンからなる群から選ばれる２つ以上の化合物、好ましくは前記群から選ばれる２つの化合物の組合せで投与されることを特徴とし得る。
本発明は、さらに他の観点において、前記組成物の新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用用途に関する。

【0111】

本発明は、さらに他の観点において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏに特異的に結合する化合物又はＲｄＲＰに特異的に結合する化合物の新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用用途に関する。
本発明は、さらに他の観点において、新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用薬剤の製造のための前記組成物の使用に関する。

【0112】

本発明は、さらに他の観点において、新型コロナウイルス感染症（Ｃｏｖｉｄ－１９）の予防又は治療用薬剤の製造のための前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＭｐｒｏに特異的に結合する化合物又はＲｄＲＰに特異的に結合する化合物の使用に関する。
本発明の各観点の具体的な具現例は、本発明の上述した他の観点で開示したのと同じ特徴を共有することができる。

【0113】

本明細書に記載の各化合物の好ましい濃度は、“超過”、“未満”などのように、意図的に除外されない限り、その臨界範囲を含むものであり、本発明は、上に記載された濃度範囲の他に、本明細書の記載から通常の技術者によって導出可能な実質的に同じものと理解され得る範囲も含むと解釈されるべきである。

【実施例】

【0114】

以下、実施例を挙げて本発明をより詳細に説明する。これらの実施例は単に本発明を例示するためのものであり、本発明の範囲がこれらの実施例によって制限されると解釈されないことは、当業界における通常の知識を有する者にとって明らかであろう。

【0115】

実施例１：薬物仮想スクリーニングのための化合物ライブラリー構築
既存に承認されたか或いは臨床が進行された薬物を収集するために、ＤｒｕｇＢａｎｋ（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｄｒｕｇｂａｎｋ．ｃａ／）、ＺＩＮＣ１５（ｈｔｔｐｓ：／／ｚｉｎｃ１５．ｄｏｃｋｉｎｇ．ｏｒｇ／）及びＣｈＥＭＢＬ（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋ／ｃｈｅｍｂｌ／）データベースを用いて重複無しで６，２１８個の化合物を収集した。

【0116】

ＤｒｕｇＢａｎｋからは“ａｐｐｒｏｖｅｄ ｄｒｕｇｓ”と“ｉｎｖｅｓｔｉｇａｔｅｄ ｄｒｕｇｓ”の項目に分類された化合物構造をそれぞれダウンロードした。ＺＩＮＣ１５からは“ｉｎ－ｔｒｉａｌｓ”の項目に分類された全ての化合物構造をダウンロードした。ＣｈＥＭＢＬからは“ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ”、“ｐｒｏｔｅａｓｅ”、“ａｎｔｉｖｉｒａｌ”の項目のうち少なくとも一つに活性を有し、少なくとも臨床１相が進行された化合物に対してダウンロードした。

【0117】

３つのデータベースから収集した化合物構造は、ＩｎＣｈＩに変換した後、重複性の有無を検査した。データベースから得た核酸類似体薬物はプロドラッグ（ｐｒｏｄｒｕｇ）の形態で存在する場合が多かったため、実際に体内で作用する活性形態に変換する作業を行った。分子内でリボースをサブ構造として含む場合、５’－炭素位置に三リン酸（ｔｒｉｐｈｏｓｐｈａｔｅ）を付ける作業を自動方式で行った。活性形態に転換された核酸類似体薬物の場合、プロドラッグと活性形態の両構造とも、薬物仮想スクリーニングのためのデータベースに含めた。化合物構造変換過程は、オープンソースであるＲＤＫｉｔパッケージを用いてパイソン自体スクリプトで行った（図１）。

【0118】

実施例２：タンパク質－リガンドドッキングのためのウイルス薬物ターゲット３次元構造確保
実施例２－１：ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｍｐｒｏ構造
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２の核心プロテアーゼ（Ｍｐｒｏ）の３次元構造は、Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｄａｔａ Ｂａｎｋデータベースに複数個保存されており、その中でも、結晶構造の解像度が１．９５Åと優れており、活性リガンドが付いている構造を選定した（図２、ＰＤＢ ＩＤ：６Ｙ２Ｆ）。活性部位の付近に欠失したアミノ酸が２個（Ｇｌｕ４７、Ａｓｐ４８）確認され、その部分を挿入した後、ＧＲＯＭＡＣＳ ４．５パッケージを用いて最急降下法（ｓｔｅｅｐｅｓｔ ｄｅｓｃｅｎｔ ｍｅｔｈｏｄ）でエネルギー最適化過程を行った。

【0119】

実施例２－２：ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ＲｄＲｐ構造
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＲｄＲｐ構造は、Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｄａｔａ Ｂａｎｋデータベースに低温電子顕微鏡（ｃｒｙｏ－Ｅｌｅｃｔｒｏｎ Ｍｉｃｒｏｓｃｏｐｙ）方式で解釈された構造を使用した（図３、ＰＤＢ ＩＤ：６Ｍ７１）。この構造は、解像度が２．９０Åであり、ＲＮＡが結合する活性部位に、ＲＮＡが結合する空間が十分でないことが確認された。したがって、ＧＲＯＭＡＣＳ ４．５パッケージを用いて分子動力学（ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｄｙｎａｍｉｃｓ）シミュレーションを行った後、ＲＭＳＤ（ｒｏｏｔ ｍｅａｎ－ｓｑｕａｒｅ ｄｅｖｉａｔｉｏｎ）値を基準に、複数の時間によるタンパク質構造のスナップショットに対するクラスタリング分析を行った。

【0120】

高い頻度で確認されるタンパク質構造のうち、ＲＮＡが結合する活性部位に十分の空間が確保される構造を、最終ドッキングシミュレーションに使用する構造として選定した。実際に薬物がタンパク質の活性部位に結合時の構造を最大限に摸写した。

【0121】

実施例３：薬物仮想スクリーニングを用いたＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｍｐｒｏ阻害剤予測
実施例３－１：リガンド形態類似度（ｌｉｇａｎｄ ｓｈａｐｅ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ）を用いたスクリーニング
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｍｐｒｏに結合するものと知られた活性物質を、タンパク質共結晶構造（ｃｏ－ｃｒｙｓｔａｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ）から得ることができ、それらをレファレンス構造とし、実施例１で得た化合物ライブラリーの化合物とリガンド形態の類似度を比較した。実施例１で得た化合物ライブラリーは、３次元構造ではなく２次元構造で保存されているため、３次元構造に変換する作業を先行した。ＲＤＫｉｔパッケージの ＥＴＫＤＧ（ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ－ｔｏｒｓｉｏｎ ｂａｓｉｃ ｋｎｏｗｌｅｄｇｅ ｄｉｓｔａｎｃｅ ｇｅｏｍｅｔｒｙ）方法を用いて実験的に最も可能性の高い３次元構造コンフォーマー（ｃｏｎｆｏｒｍｅｒ）を各化合物当たりに最大で３００個ずつ生成した。６，２１８個の化合物に対して総１，８６５，４００個の３次元構造コンフォーマーが生成された。これらのコンフォーマーは、知られた活性リガンドとリガンド形態類似度計算が行われた。リガンド形態類似度計算方法は、ＵＳＲ（Ｕｌｔｒａｆａｓｔ Ｓｈａｐｅ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ）、ＵＳＲＣＡＴ（ＵＳＲ ｗｉｔｈ Ｃｒｅｄｏ Ａｔｏｍ Ｔｙｐｅｓ）、ＥｌｅｃｔｒｏＳｈａｐｅの合計３つの方式を用いた。３つの方法の平均値を計算した後、０．４以上の値を有する化合物４，０１９個に対して、次の段階であるドッキングシミュレーション分析を行った。

【0122】

実施例３－２：ドッキングシミュレーション（ｄｏｃｋｉｎｇ ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎｓ）を用いたスクリーニング
タンパク質と化合物間の結合様相及び結合力強度を予測するために、ＡｕｔｏＤｏｃｋ Ｖｉｎａを用いて分子ドッキングシミュレーションを行った。ＡｕｔｏＤｏｃｋ Ｖｉｎａプログラムの入力（ｉｎｐｕｔ）ファイルであるＰＤＢＱＴファイルを、ＯｐｅｎＢａｂｅｌとＭＧＬＴｏｏｌｓパッケージを用いてタンパク質とリガンドに対してそれぞれ生成した。タンパク質の活性部位にリガンドが結合している結晶構造（ＰＤＢ ＩＤ：６Ｙ２Ｆ）を参照して、リガンドの中心からグリッドボックスを設定した（１２Å＊１２Å＊１２Å）。ドッキング結合エネルギー値－７．０ｋｃａｌ／ｍｏｌを基準に、より小さいか等しい化合物３０個を選別した（表１）。

【0123】

【表1】

【0124】

さらに、ドッキング結合エネルギー値－７．５ｋｃａｌ／ｍｏｌを基準に、より小さいか等しい化合物１９個を選別した（表２）。

【0125】

【表2】

【0126】

実施例３－３：タンパク質－リガンド相互作用類似度（ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ）を用いたスクリーニング
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｍｐｒｏ結合するものと知られた活性リガンドのタンパク質－リガンド３次元相互作用パターンとドッキングシミュレーションから得た３０個の化合物を対象にタンパク質－リガンド３次元相互作用パターンの類似度を比較し、相互作用が類似する化合物をさらに選別した。総６個の相互作用を考慮した（水素結合（ｈｙｄｒｏｇｅｎ ｂｏｎｄｓ）、疎水性接触（ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃ ｃｏｎｔａｃｔｓ）、π－スタッキング（ｐｉ－ｓｔａｃｋｉｎｇ）、π－カチオン相互作用（ｐｉ－ｃａｔｉｏｎ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ）、塩橋（ｓａｌｔ ｂｒｉｄｇｅｓ）、及びハロゲン結合（ｈａｌｏｇｅｎ ｂｏｎｄｓ））。相互作用類似度は、谷本類似度測定方式を用いて定量的な比較を行った。相互作用類似度が０．５以上である候補薬物２０個を対象にタンパク質－リガンド間の結合様相が化学的に可能であるか確認する過程を経て最終候補薬物１０個を選定した（表３）。

【0127】

【表3】

【0128】

実施例４：薬物仮想スクリーニングを用いたＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ＲｄＲｐ阻害剤予測
実施例４－１：リガンド形態類似度（ｌｉｇａｎｄ ｓｈａｐｅ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ）を用いたスクリーニング
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＲｄＲｐと類似な他のウイルスのＲｄＲｐに結合するものと知られた活性物質を、タンパク質共結晶構造（ｃｏ－ｃｒｙｓｔａｌ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ）から得ることができ、それらをレファレンス構造とし、実施例１で得た化合物ライブラリーの化合物とリガンド形態の類似度を比較した。実施例１で得た化合物ライブラリーは、３次元構造ではなく２次元構造で保存されているため、３次元構造に変換する作業を先行した。ＲＤＫｉｔパッケージのＥＴＫＤＧ方法を用いて実験的に最も可能性の高い３次元構造コンフォーマー（ｃｏｎｆｏｒｍｅｒ）を、各化合物当たりに最大で３００個ずつ生成した。これらのコンフォーマーは、知られた活性リガンドとリガンド形態類似度計算が行われた。リガンド形態類似度計算方法は、ＵＳＲ（Ｕｌｔｒａｆａｓｔ Ｓｈａｐｅ Ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ）、ＵＳＲＣＡＴ（ＵＳＲ ｗｉｔｈ Ｃｒｅｄｏ Ａｔｏｍ Ｔｙｐｅｓ）、ＥｌｅｃｔｒｏＳｈａｐｅの合計３つの方式を用いた。３つの方法の平均値を計算した後、０．４以上の値を有する化合物４，５５４個に対して、次の段階であるドッキングシミュレーション分析を行った。

【0129】

実施例４－２：ドッキングシミュレーション（ｄｏｃｋｉｎｇ ｓｉｍｕｌａｔｉｏｎｓ）を用いたスクリーニング
タンパク質と化合物間の結合様相及び結合力強度を予測するために、ＡｕｔｏＤｏｃｋ Ｖｉｎａを用いて分子ドッキングシミュレーションを行った。ＡｕｔｏＤｏｃｋ Ｖｉｎａプログラムの入力ファイルであるＰＤＢＱＴファイルを、ＯｐｅｎＢａｂｅｌとＭＧＬＴｏｏｌｓパッケージを用いてタンパク質とリガンドに対してそれぞれ生成した。タンパク質の活性部位にリガンドが結合されている結晶構造（ＰＤＢ ＩＤ：３Ｎ６Ｍ）を参照して、リガンドの中心からグリッドボックスを設定した（１２Å＊１２Å＊１２Å）。ドッキング結合エネルギー値－６．４ｋｃａｌ／ｍｏｌを基準に、より小さいか等しい化合物３６個を選別した（表４）。

【0130】

【表4】

【0131】

さらに、ドッキング結合エネルギー値－６．７ｋｃａｌ／ｍｏｌを基準に、より小さいか等しい化合物１８個を選別した（表５）。

【0132】

【表5】

【0133】

実施例４－３：タンパク質－リガンド相互作用類似度（ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｙ）を用いたスクリーニング
ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２のＲｄＲｐと類似する他のウイルスのＲｄＲｐ結合するものと知られた活性リガンドのタンパク質－リガンド３次元相互作用パターンとドッキングシミュレーションから得た３８個の化合物を対象にタンパク質－リガンド３次元相互作用パターンの類似度を比較し、相互作用が類似する化合物をさらに選別した。総６個の相互作用を考慮した（水素結合（ｈｙｄｒｏｇｅｎ ｂｏｎｄｓ）、疎水性接触（ｈｙｄｒｏｐｈｏｂｉｃ ｃｏｎｔａｃｔｓ）、π－スタッキング（ｐｉ－ｓｔａｃｋｉｎｇ）、π－カチオン相互作用（ｐｉ－ｃａｔｉｏｎ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ）、塩橋（ｓａｌｔ ｂｒｉｄｇｅｓ）、及びハロゲン結合（ｈａｌｏｇｅｎ ｂｏｎｄｓ））。相互作用類似度は、谷本類似度測定方式を用いて定量的な比較を行った。相互作用類似度が０．５以上である候補薬物２４個を対象にタンパク質－リガンド間の結合様相が化学的に可能であるか確認する過程を経て最終候補薬物１０個を選定した（表６）。

【0134】

【表6】

【0135】

実施例５：候補物質細胞実験
実施例５－１：Ｖｅｒｏ細胞における単一候補薬物性能検証
Ｖｅｒｏ細胞（サル腎臓細胞、ＡＴＣＣ（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）から購入）に、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２と実施例３及び４で導出した候補薬物のうち、Ｍｐｒｏに特異的に結合する化合物１５種及びＲｄＲＰに特異的に結合する化合物２３種の合計３８種の薬物を注入した後、免疫蛍光法（ｉｍｍｕｎｏｆｌｕｏｒｅｓｃｅｎｃｅ）でウイルスの感染程度と細胞数をイメージ分析により定量的に測定した（表７）。現在臨床で使用中である新型コロナウイルス感染症治療剤３種（クロロキン、ロピナビル、レムデシビル）をレファレンス薬物として使用した（図６）。

【0136】

【表7】

【0137】

各候補薬物に対する容量反応曲線（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｃｕｒｖｅ）から抗ウイルス活性を定量的に測定した（図７）。現在基準でＦＤＡが新型コロナウイルス感染症治療剤として正式承認した薬物は、レムデシビルが唯一である。

【0138】

その結果、表８に示すように、オミパリシブはＩＣ５０値がレムデシビルの２０倍以下と現れ、チピファルニブ及びブロナンセリンはレムデシビルと類似なＩＣ５０値を示した。ヒペリシン、ＬＧＨ－４４７、ＮＳ－３７２８、及びエモジンは、レムデシビルよりも高いＩＣ５０値を示したが、有意の抗ウイルス活性を示し、これら７種の化合物をＣｏＶｉｄ－１９の治療剤の単一候補薬物として決定した（図７）。

【0139】

【表8】

【0140】

実施例５－２：Ｃａｌｕ－３細胞における単一候補薬物性能検証
実施例５－１でＶｅｒｏ細胞を用いて導出したＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に抗ウイルス活性を示した化合物７種（表８）が、Ｃａｌｕ－３細胞（ヒト肺細胞、ＡＴＣＣ（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）から購入）においても優れた抗ウイルス活性を示すか評価した。実施例５－１のＶｅｒｏ細胞に対する評価と同じ免疫蛍光法を用いてウイルスの感染程度と細胞数をイメージ分析により定量的に測定した。現在、臨床で新型コロナウイルス感染症治療剤として使用中であるレムデシビルをレファレンス薬物とした。

【0141】

各候補薬物に対する容量反応曲線（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｃｕｒｖｅ）から候補薬物７種に対する抗ウイルス活性を定量的に測定した（図８）。その結果、７種の候補薬物のうち３種の薬物（オミパリシブ、チピファルニブ、エモジン）は、ヒト肺細胞であるＣａｌｕ－３においても抗ウイルス活性が確認された。表９に示すように、オミパリシブはＩＣ５０値がレムデシビルの２００倍以下と現れ、チピファルニブもレムデシビルと類似なレベルのＩＣ５０値を示した。

【0142】

【表9】

【0143】

実施例５－３：薬物のシナジー効果検証
抗ウイルス活性が実験から検証された単一薬物を組合せにより薬物シナジー効果をさらに検証した。薬物組合せの効果を極大化させるために、薬物ターゲット別にＩＣ５０基準で抗ウイルス活性に優れていた薬物を２種ずつを選定した（Ｍｐｒｏ：ブロナンセリン、エモジン；ＲｄＲｐ：オミパリシブ、チピファルニブ）。また、現在基準で唯一にＦＤＡ正式承認を受けたレムデシビルも薬物組合せの候補群に含めた。

【0144】

合計５つの薬物で１０通りの薬物組合せを構成し、抗ウイルス活性検証実験を行った（表１０）。単一薬物の実験方法と同様に、Ｖｅｒｏ細胞にＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２と候補組合せ薬物を濃度別（各単一薬物のＩＣ５０値の４倍濃度から２倍ずつ希釈して８個ポイントの濃度を使用）に注入した後、免疫蛍光法でウイルスの感染程度と細胞数をイメージ分析により定量的に測定し、それぞれの組合せによる容量反応マトリックス（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｍａｔｒｉｘ）を作成した（それぞれ、図９、図１４、図１９、図２４、図２９、図３４、図３９、図４４、図４９、図５４の右側）。

【0145】

【表10】

【0146】

組合せ薬物の容量反応マトリックス（ｄｏｓｅ－ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｍａｔｒｉｘ）に基づいて抗ウイルス活性に対する薬物シナジー効果を評価するために、ｓｙｎｅｒｇｙｆｉｎｄｅｒプログラム（Ｉａｎｅｖｓｋｉ，Ａ．ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ，Ｖｏｌ．３３（１５）、ｐｐ．２４１３－２４１５，２０１７．）を使用した。

【0147】

薬物シナジー評価モデルは、次のように４つの薬物シナジー評価モデルをそれぞれ適用した；１）ロエベ相加性（Ｌｏｅｗｅ ａｄｄｉｔｉｖｉｔｙ）モデル（Ｌｏｅｗｅ，Ｓ．，Ａｒｚｎｅｉｍｉｔｔｅｌｆｏｒｓｃｈｕｎｇ，Ｖｏｌ．３，ｐｐ．２８５－２９０，１９５３．）、２）ブリス独立性（Ｂｌｉｓｓ ｉｎｄｅｐｅｎｄｅｎｃｅ）モデル（Ｂｌｉｓｓ，Ｃ．Ｉ．，Ａｎｎａｌｓ ｏｆ ａｐｐｌｉｅｄ ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｖｏｌ．２６（３）、ｐｐ．５８５－６１５，１９３９．）、３）ＺＩＰ（Ｚｅｒｏ Ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎ Ｐｏｔｅｎｃｙ）モデル（Ｙａｄａｖ，Ｂ．ｅｔ ａｌ．，Ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎａｌ ａｎｄ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ ｊｏｕｒｎａｌ，Ｖｏｌ．１３，ｐｐ．５０４－５１３，２０１５．）４）ＨＳＡ（Ｈｉｇｈｅｓｔ Ｓｉｎｇｌｅ Ａｇｅｎｔ）モデル（Ｂｅｒｅｎｂａｕｍ，Ｍ．Ｃ．，Ｐｈａｒｍａｃｏｌｏｇｉｃａｌ ｒｅｖｉｅｗｓ，Ｖｏｌ．４１（２）、ｐｐ．９３－１４１，１９８９．）。

【0148】

図９～図５８に示すそれぞれの薬物組合せに対して４つのモデルの平均シナジースコア（ｓｙｎｅｒｇｙ ｓｃｏｒｅ）のうち、最もスコアの高いモデルを選定し、該当のモデルにおいて高いシナジー効果（赤色）を示す濃度を基準に各薬物組合せ別最適の濃度を選定した（表１１）。

【0149】

【表11】

【0150】

チピファルニブ（Ｔｉｐｉｆａｒｎｉｂ）及びブロナンセリン（Ｂｌｏｎａｎｓｅｒｉｎ）組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、チピファルニブ濃度が２．７５～１１μＭであるとともにブロナンセリン濃度が１．５～４７μＭである区間で確認された（図１１～図１３）。特に、チピファルニブ濃度が５．５μＭであり、ブロナンセリン濃度が２３μＭである区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも４０％向上した抗ウイルス活性を示した（図１３）。

【0151】

チピファルニブ及びエモジン（Ｅｍｏｄｉｎ）組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、チピファルニブ濃度が０～１１μＭであるとともにエモジン濃度が１．９７～３１．４５μＭである区間で確認された（図１６～図１８）。特に、チピファルニブ濃度が５．５μＭであり、エモジン濃度が８μＭである区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも２０％向上した抗ウイルス活性を示した（図１６～図１８）。

【0152】

チピファルニブ及びオミパリシブ（Ｏｍｉｐａｌｉｓｉｂ）組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、チピファルニブ濃度が０～１１μＭであるととともにオミパリシブ濃度が０．５μＭ以下である区間で確認された（図２０～図２３）。特に、チピファルニブ濃度が５．５μＭであり、オミパリシブ濃度が０．０６μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも３０％向上した抗ウイルス活性を示した（図２１～図２３）。

【0153】

チピファルニブ及びレムデシビル（Ｒｅｍｄｅｓｉｖｉｒ）組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、チピファルニブ濃度が０～１１μＭであるとともにレムデシビル濃度が０～２０μＭである区間で確認された（図２５～図２８）。特に、チピファルニブ濃度が５．５μＭであり、レムデシビル濃度が２．５μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも６０％向上した抗ウイルス活性を示した（図２６～図２８）。

【0154】

ブロナンセリン及びエモジン組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、ブロナンセリン濃度が５．９８～４７．８７μＭであるとともにエモジン濃度が０～６２．９μＭである区間で確認された（図３３）。特に、ブロナンセリン濃度が２５μＭ付近であり、エモジン濃度が１５付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも６０％向上した抗ウイルス活性を示した（図３３）。

【0155】

ブロナンセリン及びオミパリシブ組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、ブロナンセリン濃度が２．９９～４７．８７μＭであるととともにオミパリシブ濃度が０～１．９７μＭである区間で確認された（図３６～図３８）。特に、ブロナンセリン濃度が４０μＭ付近であり、オミパリシブ濃度が０．１２μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも３０～６０％向上した抗ウイルス活性を示した（図３６～図３８）。

【0156】

ブロナンセリン及びレムデシビル組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、ブロナンセリン濃度が５．９８～４７．８７μＭであるとともにレムデシビル濃度が０～４０．３６μＭである区間で確認された（図４０～図４３）。特に、ブロナンセリン濃度が２３．９４μＭ付近であり、レムデシビル濃度が２．５２μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも５０％向上した抗ウイルス活性を示した（図４１～図４３）。

【0157】

エモジン及びオミパリシブ組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、エモジン濃度が０～１２５．８１μＭであるとともにオミパリシブ濃度が０～１．９７μＭである区間で確認された（図４５～図４８）。特に、エモジン濃度が１５μＭ付近であり、オミパリシブ濃度が０．２５μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも４０％向上した抗ウイルス活性を示した（図４８）。

【0158】

エモジン及びレムデシビル組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、エモジン濃度が０～１２５．８１μＭであるととともにレムデシビル濃度が０～４０．３６μＭである区間で確認された（図５０～図５３）。特に、エモジン濃度が１５μＭ付近であり、レムデシビル濃度が４μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも６０％～８０％向上した抗ウイルス活性を示した（図５１～図５３）。

【0159】

オミパリシブ及びレムデシビル組合せのシナジー効果は、薬物組合せ予測モデルを基準に、オミパリシブ濃度が０～１．９７μＭであるととともにレムデシビル濃度が０～４０．３６μＭである区間で確認された（図５５～図５８）。特に、オミパリシブ濃度が０．２μＭ付近であり、レムデシビル濃度が５μＭ付近である区間で、薬物組合せ予測モデルの期待効果よりも４０％～６０％向上した抗ウイルス活性を示した（図５６～図５８）。

【0160】

上記の結果に基づき、Ｓｙｎｅｒｇｙｆｉｎｄｅｒプログラムで計算される平均シナジースコア値を基準に、一つ以上の評価モデルで平均シナジースコアが１０以上と最も優れたシナジー効果を示すか或いは特定濃度範囲で高いシナジースコアが確認された６個の薬物組合せを確認した（表１２）。一般に、シナジースコア値が１０以上である場合、非常に強力なシナジー効果を示すことを意味する。

【0161】

【表12】

【0162】

以上、本発明内容の特定の部分を詳細に記述したところ、当業界における通常の知識を有する者にとって、このような具体的記述は単に好ましい実施様態に過ぎず、これによって本発明の範囲が制限されない点は明らかであろう。したがって、本発明の実質的な範囲は、添付する請求項及びそれらの等価物によって定義されるといえよう。

【産業上の利用可能性】

【0163】

本発明に係る新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用医薬組成物は、既存薬再開発技術を用いて、既に薬効が立証された薬物の他の新型コロナウイルス感染症の予防又は治療用用途を導出したものであり、新しい薬物に比べて副作用が顕著に低く、臨床に早く適用できるので有用である。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【図9】

【図10】

【図11】

【図12】

【図13】

【図14】

【図15】

【図16】

【図17】

【図18】

【図19】

【図20】

【図21】

【図22】

【図23】

【図24】

【図25】

【図26】

【図27】

【図28】

【図29】

【図30】

【図31】

【図32】

【図33】

【図34】

【図35】

【図36】

【図37】

【図38】

【図39】

【図40】

【図41】

【図42】

【図43】

【図44】

【図45】

【図46】

【図47】

【図48】

【図49】

【図50】

【図51】

【図52】

【図53】

【図54】

【図55】

【図56】

【図57】

【図58】