【図1】 Ａは、ライブラリーの多様性、指向性進化及び新規な抗原フットプリントの濃縮の解析結果を示すバブルプロットである。Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＭｉＳｅｑプラットフォームを用いて、親ＡＡＶライブラリーに対して高スループットシーケンシングを行った。カスタムＰｅｒｌスクリプトによる解析後、濃縮されたアミノ酸配列をプロットした。各バブルは、別個のカプシドアミノ酸配列を表し、バブルの半径は、それぞれのライブラリーにおけるそのバリアントのリード数に比例する。ｙ軸は、ｌｏｇ（底＝２）に変換した絶対リード数を表している。データは、見やすいように、ｘ軸沿いに拡散されている。Ｂは、ライブラリーの多様性、指向性進化及び新規な抗原フットプリントの濃縮の解析結果を示すバブルプロットである。Ｉｌｌｕｍｉｎａ ＭｉＳｅｑプラットフォームを用いて、進化させたＡＡＶライブラリーに対して高スループットシーケンシングを行った。カスタムＰｅｒｌスクリプトによる解析後、濃縮されたアミノ酸配列をプロットした。各バブルは、別個のカプシドアミノ酸配列を表し、バブルの半径は、それぞれのライブラリーにおけるそのバリアントのリード数に比例する。ｙ軸は、ｌｏｇ（底＝２）に変換した絶対リード数を表している。データは、見やすいように、ｘ軸沿いに拡散されている。ユニーククローンの割合の低下（９３．４％）によって、第１ラウンドの進化後に、多くの「不適合な」配列が除去されたことが直接的に示されている。

【図2】 Ａは、第１ラウンドの進化における親（インプット）ライブラリーを示すバブルプロットである。Ｂは、第１ラウンドの進化におけるアウトプットライブラリーを示すバブルプロットであり、このアウトプットライブラリーは、第２ラウンドの進化におけるインプットライブラリーとして使用した。Ｃは、第２ラウンドの進化におけるアウトプットライブラリーを示すバブルプロットであり、このアウトプットライブラリーは、第３ラウンドの進化におけるインプットライブラリーとして使用した。Ｄは、第３ラウンドの進化におけるアウトプットライブラリーを示すバブルプロットであり、ユニーククローンが全体的に、Ａに示されている親ライブラリーと比較して９７．３％減少している。注目すべきことに、Ａには、図１Ａと同じデータ、Ｂには、図１Ｂと同じデータが示されているが、そのデータは、総リードに対する割合に正規化したものであり、第２ラウンド以降の進化にわたって縦方向の比較が可能になっている。

【図3】 組み換えＡＡＶ（ＡＡＶ－ＳＢ１、ＡＡＶ－ＳＢ２、ＡＡＶ－ＳＢ３、ＡＡＶ－ＳＢ４、ＡＡＶ－ＳＢ５）に１０，０００ｖｇ／細胞の用量で感染させた後のヒト肝細胞（ＨｅｐＧ２、Ｈｕｈ７）におけるルシフェラーゼ発現量である。

【図4】 ヒト静注用免疫グロブリン（ＩＶＩＧ）による組み換えＡＡＶ（ＡＡＶ－ＳＢ１、ＡＡＶ－ＳＢ２、ＡＡＶ－ＳＢ３、ＡＡＶ－ＳＢ４、ＡＡＶ－ＳＢ５）の中和を、親ＡＡＶ８の中和と比較したものである。データは、ＩＶＩＧで処理した後の形質導入を、ＩＶＩＧによる処理を行わなかった形質導入に対する割合として表されている。

【図5】 様々な用量のＩＶＩＧ（０～４ｍｇ／ｍＬ）によって処理した後の親ＡＡＶ８及びＡＡＶ－ＳＢ１の形質導入率（％）（すなわち中和度）を示す曲線である。

【図6】 Ａは、示されているカプシドで中和されたドナー試料及び中和されなかったドナー試料（合計１００個の試料）の割合（％）である。Ｂは、年齢群ごとのセロポジティブドナー試料の内訳である。

【図7】 親ＡＡＶ８またはＡＡＶ－ＳＢ１のいずれかに３×１０12ｖｇ／ｍＬの用量で感染させた後の正常なマウスから得た肝臓の代表的な免疫組織化学（ＩＨＣ）像である。

【図8】 ＧＦＰをパッケージングした親ＡＡＶ８ベクター、ＡＡＶ－ＳＢ１ベクターまたはＡＡＶ－ＳＢ６ベクターをＭＯＩ４０，０００で形質導入してから４８時間後のＵ８７細胞の代表的な蛍光顕微鏡像である。参照のために、代表的な光学顕微鏡像も示されている。