(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】
(24)【登録日】2024-01-19
(45)【発行日】2024-01-29
(54)【発明の名称】PD-1およびPD-L1結合物質
(51)【国際特許分類】
C12N 15/12 20060101AFI20240122BHJP
C07K 16/28 20060101ALI20240122BHJP
C07K 19/00 20060101ALI20240122BHJP
C07K 14/56 20060101ALI20240122BHJP
C07K 14/565 20060101ALI20240122BHJP
C12N 1/15 20060101ALI20240122BHJP
C12N 1/19 20060101ALI20240122BHJP
C12N 1/21 20060101ALI20240122BHJP
C12N 5/10 20060101ALI20240122BHJP
A61K 38/20 20060101ALI20240122BHJP
A61K 38/21 20060101ALI20240122BHJP
A61K 38/17 20060101ALI20240122BHJP
A61K 39/395 20060101ALI20240122BHJP
A61P 35/00 20060101ALI20240122BHJP
A61P 35/02 20060101ALI20240122BHJP
A61P 31/00 20060101ALI20240122BHJP
A61P 37/06 20060101ALI20240122BHJP
A61P 37/02 20060101ALI20240122BHJP
A61P 43/00 20060101ALI20240122BHJP
A61K 47/68 20170101ALI20240122BHJP
【FI】
C12N15/12 ZNA
C07K16/28
C07K19/00
C07K14/56
C07K14/565
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
C12N5/10
A61K38/20
A61K38/21
A61K38/17
A61K39/395 N
A61K39/395 T
A61K39/395 U
A61P35/00
A61P35/02
A61P31/00
A61P37/06
A61P37/02
A61P43/00 121
A61K47/68
(21)【出願番号】P 2020507585
(86)(22)【出願日】2018-08-08
(86)【国際出願番号】 US2018045743
(87)【国際公開番号】W WO2019032663
(87)【国際公開日】2019-02-14
【審査請求日】2021-08-06
(32)【優先日】2017-08-09
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(73)【特許権者】
【識別番号】519287378
【氏名又は名称】オリオンズ バイオサイエンス インコーポレイテッド
(73)【特許権者】
【識別番号】519287389
【氏名又は名称】オリオンズ バイオサイエンス ビーブイ
(74)【代理人】
【識別番号】100084995
【氏名又は名称】加藤 和詳
(72)【発明者】
【氏名】クレイ、ニコライ
(72)【発明者】
【氏名】タベルニエ、ジャン
(72)【発明者】
【氏名】ザベアウ、レナルト
(72)【発明者】
【氏名】デプラ、エリク
【審査官】斉藤 貴子
(56)【参考文献】
【文献】国際公開第2017/077382(WO,A1)
【文献】国際公開第2018/077893(WO,A1)
(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
C12N
C07K
A61K
A61P
CAplus/REGISTRY/MEDLINE/EMBASE/BIOSIS(STN)
UniProt/GeneSeq
JSTPlus/JMEDPlus/JST7580(JDreamIII)
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号301、287、290、300、305、306、および309のうちの1つと少なくとも
95%の同一性を有するアミノ酸配列を含
む、PD-L1結合物質
であって、
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号301と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号199または181のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号259または260のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号268のアミノ酸配列からなる、または
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号287と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号196または178のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号241または242のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号268のアミノ酸配列からなる、または
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号290と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号199または181のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号245または246のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号268のアミノ酸配列からなる、または
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号300と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号199または181のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号245または246のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号268のアミノ酸配列からなる、または
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号305と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号206または189のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号263または264のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号277のアミノ酸配列からなる、または
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号306と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号201または183のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号249または250のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号272のアミノ酸配列からなる、または
配列番号86の、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列を含まない配列番号309と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む前記PD-L1結合物質は、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分をさらに含み、ここで、CDR1が、配列番号199または181のアミノ酸配列からなり;CDR2が、配列番号245または246のアミノ酸配列からなり;CDR3が、配列番号268のアミノ酸配列からなる、
前記PD-L1結合物質。
【請求項2】
前記少なくとも1つの標的化部分が、単一ドメイン抗体である、請求項
1に記載のPD-L1結合物質。
【請求項3】
前記少なくとも1つの標的化部分が、V
HHまたはヒト化V
HHを含む、請求項
2に記載のPD-L1結合物質。
【請求項4】
インターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子のうちの1つまたは複数から選択され、これらはいずれも改変されていてもよい、1種類または複数種類のシグナル伝達物質を含む、請求項1~
3のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
【請求項5】
1つまたは複数の追加の標的化部分を含む、請求項1~
4のいずれか1項に記載のPD
-L1結合物質。
【請求項6】
前記1つまたは複数の追加の標的化部分が腫瘍抗原または免疫細胞上の抗原を認識し、前記1つまたは複数の追加の標的化部分はそれぞれ腫瘍抗原または免疫細胞上の抗原を機能的に調節してもよい、請求項
5に記載のPD-L1結合物質。
【請求項7】
前記免疫細胞が、T細胞、B細胞、樹状細胞、マクロファージ、好中球、およびNK細胞からなる群から選択される、請求項
6に記載のPD-L1結合物質。
【請求項8】
細胞傷害性T細胞を腫瘍細胞にまたは腫瘍環境に動員する、請求項1~
7のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
【請求項9】
PD-L1を認識してPD-L1に結合し、その活性を機能的に調節するかあるいはその活性を機能的に調節しない、請求項1~
8のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
【請求項10】
請求項1~
9のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質をコードする組換え核酸。
【請求項11】
請求項
10に記載の組換え核酸を含む宿主細胞。
【請求項12】
請求項1~
9に記載のPD-L1結合物質、ならびに
インターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子のうちの1つまたは複数から選択され、これらはいずれも改変されていてもよいシグナル伝達物質
を含むキメラを含む、癌の治療または予防における使用のための医薬。
【請求項13】
前記癌が、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳および中枢神経系癌、乳癌、腹膜の癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸および直腸癌、結合組織癌、消化器系の癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部の癌、胃癌(胃腸癌を含む)、神経膠芽腫、肝癌、ヘパトーマ、上皮内腫瘍、腎臓癌または腎性癌(kidney or renal cancer)、喉頭癌、白血病、肝臓癌、肺癌(例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、および肺扁平上皮癌)、黒色腫、骨髄腫、神経芽腫、口腔癌(唇
、舌、口内、および咽頭を含む)、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌腫、肉腫、皮膚癌、扁平上皮細胞癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮または子宮内膜癌、泌尿器系の癌、外陰癌、リンパ腫(例えば、ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫、ならびにB細胞リンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL)、小リンパ球性(SL)NHL、中悪性度/濾胞性NHL、中悪性度びまん性NHL、高悪性度免疫芽細胞NHL、高悪性度リンパ芽球性NHL、高悪性度小型非切れ込み核細胞性NHL、巨大腫瘤病変NHL、マントル細胞リンパ腫、エイズ関連リンパ腫、およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症を含む))、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性リンパ性白血病(ALL)、毛様細胞性白血病、慢性骨髄芽球性白血病、ならびに他の癌腫および肉腫、および移植後リンパ増殖性疾患(PTLD)、ならびに母斑症、浮腫(例えば脳腫瘍に関連するもの)、およびメグズ症候群に関連する異常血管増殖のうちの1つまたは複数から選択される、請求項
12に記載の医薬。
【請求項14】
請求項1~
9のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質を含む、癌、感染症、免疫異常、または自己免疫疾患のうちの少なくとも1つの治療における使用のための医薬。
【請求項15】
(a)請求項1~
9のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質;および
(b)野生型IFNα2に比べて改善された安全性を付与する1つまたは複数の変異を有する改変ヒトIFNα2
を含むキメラタンパク質であって、
少なくとも1つの標的化部分および改変シグナル伝達物質が、1つまたは複数のリンカーにより連結されていてもよい、
キメラタンパク質。
【請求項16】
前記改変ヒトIFNα2が、位置R120、M148、R149、およびL153に1つまたは複数の変異を含む、請求項
15に記載のキメラタンパク質。
【請求項17】
前記改変ヒトIFNα2が、R120E、R149A、およびL153Aからなる群から選択される1つまたは複数の変異を含む、請求項
16に記載のキメラタンパク質。
【請求項18】
(a)請求項1~
9のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質;および
(b)野生型IFNβに比べて改善された安全性を付与する1つまたは複数の変異を有する改変ヒトIFNβ
を含むキメラタンパク質であって、
少なくとも1つの標的化部分および改変シグナル伝達物質が、1つまたは複数のリンカーにより連結されていてもよい、
キメラタンパク質。
【請求項19】
前記改変ヒトIFNβが、位置W22、R27、L32、R35、V148、L151、R152、およびY155に1つまたは複数の変異を含む、請求項
18に記載のキメラタンパク質。
【請求項20】
前記改変ヒトIFNβが、W22G、R27G、L32A、L32G、R35A、R35G、V148G、L151G、R152A、およびR152Gからなる群から選択される1つまたは複数の変異を含む、請求項
19に記載のキメラタンパク質。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願の相互参照
本出願は、2017年8月9日出願の米国特許仮出願第62/542,921号の利益および優先権を主張する。この特許の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0002】
発明の分野
本発明は、一部は、PD-1またはPD-L1を結合する結合物質および治療薬および診断薬としてのそれらの使用に関する。
【0003】
電子申請したテキストファイルの説明
本明細書と共に電子申請された次記のテキストファイルの内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる:配列リストのコンピュータ可読形式コピー(ファイル名:ORN-034PC_ST25、作成日付:2018年8月8日、ファイルサイズ:827KB)。
【背景技術】
【0004】
身体の免疫系を癌の方向に向け直すための免疫療法が開発されている。免疫療法は、化学療法および放射線療法などの他の治療方式が欠く、細胞特異性の利点をもたらす。従って、免疫に基づく療法の効力を高めるための方法は、臨床的に有益であり得る。例えば、共刺激または共抑制シグナルをもたらす免疫チェックポイント分子は、腫瘍細胞に対するT細胞免疫応答の調節において中心的な役割を果たす。
【0005】
しかし、例えば、ヤーボイ、キイトルーダ、およびオプジーボの承認に至った臨床試験を含む、チェックポイント分子を標的とする物質に対する患者の著しい応答にもかかわらず、チェックポイント阻害療法などの免疫療法は、圧倒的多数の患者ではまだ成功していない。さらに未だに、多くの免疫療法では、治療のための患者の治療濃度域を大きく狭めかつ患者を他の疾患によりかかりやすくする、副作用が併発する。
【0006】
したがって、最小限の副作用にしながら癌に対する標的療法を提供できる、改善された免疫療法薬の必要性が残されている。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0007】
種々の態様では、本発明は、PD-1またはPD-L1に特異的に結合する少なくとも1つの標的化部分を有する結合物質に関する。種々の実施形態では、これらの結合物質は、PD-1またはPD-L1に結合し、これを機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に中和する)。種々の実施形態では、これらの結合物質は、PD-1またはPD-L1に結合するが、これを機能的に調節しない(例えば、部分的にまたは完全に中和しない)。したがって、種々の実施形態では、本発明の結合物質は、例えば、PD-1発現細胞またはPD-L1発現細胞にPD-1またはPD-L1を介してシグナル伝達させつつそのPD-1発現細胞またはPD-L1発現細胞を目的の部位に直接または間接的に動員するのに使用される(すなわち、PD-1またはPD-L1結合物質の結合は、目的の部位でのPD-1またはPD-L1シグナル伝達を低減せず排除しない)。ある実施形態では、標的化部分は単一ドメイン抗体(VHH)である。
【0008】
種々の実施形態では、本発明の結合物質は、シグナル伝達物質、例えば、限定されないが、活性を弱めるように改変され得るインターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子をさらに含む。種々の実施形態では、結合物質は、目的とする他の標的(例えば、抗原、受容体)に結合する追加の標的化部分を含む。ある実施形態では、目的とする他の標的(例えば、抗原、受容体)は、腫瘍細胞上に存在する。別の実施形態では、目的とする他の標的(例えば、抗原、受容体)は、免疫細胞上に存在する。いくつかの実施形態では、本発明の結合物質は、免疫細胞、(例えば、樹状細胞)を、作用の部位(例えば、非限定的例であるが、腫瘍微小環境など)に直接的にまたは間接的に動員し得る。いくつかの実施形態では、本発明の結合物質は、樹状細胞による抗原(例えば、腫瘍抗原)の提示を促進する。
【0009】
種々の実施形態では、本発明の結合物質は、癌、感染症、免疫異常、ならびに他の疾患および障害などの種々の疾患または障害の治療で使用され、さらに本発明は、治療の様々な方法を包含する。
【図面の簡単な説明】
【0010】
【
図1】
図1は、実施例1に記載のPD-1またはPD-L1 AcTaferonのクローニング方法の概略図を示す。
【
図2】
図2は、PD-L1(上段パネル)またはPD-1(下段パネル)AcTaferonの遺伝子導入Hek293T細胞への結合を示す。
【
図3】
図3は、末梢血単核球(PBMC)中のpSTAT1の状態により評価したPD-1標的化を示す。データは、非刺激pSTAT1平均蛍光強度(MFI)のパーセンテージとしてプロットされる。
【
図4】
図4は、遺伝子導入Hek293T細胞中のpSTAT1の状態により評価したPD-1標的化を示す。pSTAT1細胞パーセンテージがプロットされている。
【
図5】
図5は、MDA-MB-231細胞中のpSTAT1の状態により評価したPD-L1標的化を示す。データは、平均蛍光強度(MFI)のプロットである。
【
図6】
図6は、遺伝子導入Hek293T細胞へのPD-L1 VHHの結合を示す。データは、平均蛍光強度(MFI)のプロットである。
【
図7A】
図7Aは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、2LIG3であった。
【
図7B】
図Bは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、2LIG27(
図7B)であった。
【
図7C】
図7Cは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、2LIG97であった。
【
図7D】
図7Dは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、2LIG99であった。
【
図7E】
図7Eは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、2LIG176であった。
【
図7F】
図7Fは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、2LIG189であった。
【
図7G】
図7Gは、PD-L1 VHH AcTaferon(AFN)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。ルシフェラーゼ活性は、過剰(20μg/ml)の対応するPD-L1 VHHの存在下または非存在下で、段階希釈のPD-L1 VHH AFNにより誘導された。試験したPD-L1 VHHは、3LIG8であった。
【
図8】
図8は、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)でのアテゾリズマブ-AcTaferon(ate-AFN;すなわち、Ate-IFNa2mut)の生物活性を示すグラフである。生物活性は、過剰(50μg/ml)のアテゾリズマブ(ate)の存在下または非存在下で、段階希釈のate-AFNにより誘導したルシフェラーゼ活性により測定された。
【
図9】
図9は、ヒト化免疫系を有するマウスでのRL腫瘍モデルにおける2LIG99ベースAFNのインビボ抗腫瘍活性を示すグラフである。
【
図10A】
図10Aは、ヒトPD-1または空のベクターを遺伝子導入し、段階希釈の102C3 AFN(
図10A)で刺激したHek293T細胞中のpSTAT1を示すグラフである。pSTAT1陽性細胞のパーセンテージがグラフでプロットされている。
【
図10B】
図10Bは、ヒトPD-1または空のベクターを遺伝子導入し、段階希釈の102C12 AFN(
図10B)で刺激したHek293T細胞中のpSTAT1を示すグラフである。pSTAT1陽性細胞のパーセンテージがグラフでプロットされている。
【
図10C】
図10Cは、ヒトPD-1または空のベクターを遺伝子導入し、段階希釈の野生型IFNa2で刺激したHek293T細胞中のpSTAT1を示すグラフである。pSTAT1陽性細胞のパーセンテージがグラフでプロットされている。
【発明を実施するための形態】
【0011】
本発明は、一部は、PD-1またはPD-L1を認識し、それに結合する結合物質(例えば、非限定的例であるが、VHHなどの抗体)の発見に基づいている。いくつかの実施形態では、本発明の結合物質は、1つまたは複数の標的化部分および/または1種類または複数種類のシグナル伝達物質とのキメラまたは融合タンパク質の一部である。種々の実施形態では、これらの結合物質は、PD-1またはPD-L1に結合し、これを機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に中和する)。いくつかの実施形態では、これらの結合物質は、PD-1またはPD-L1に結合するが、これを機能的に調節しない。
【0012】
本発明は、結合物質を含む医薬組成物および、癌、自己免疫疾患、および/または神経変性疾患を含む、種々の疾患の治療におけるそれらの使用をさらに提供する。
【0013】
PD-1またはPD-L1結合物質
種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1またはPD-L1に特異的に結合できるタンパク質ベースの物質である。種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1またはPD-L1を機能的に調節することなくPD-1またはPD-L1に特異的に結合できるタンパク質ベースの物質である。
【0014】
PD-1および表面抗原分類279(CD279)としても知られるプログラム細胞死タンパク質1は、活性化T細胞、B細胞、およびマクロファージ上で主に発現される細胞表面受容体である。PD-1は、そのリガンド(PD-L1および/またはPD-L2)の結合時に、抗原受容体シグナル伝達を負に制御することが示されている。PD-1は、免疫系の下方制御およびT細胞炎症活性の抑制による自己寛容の促進において重要な役割を果たす。PD-1は、リガンド結合に関与するIg可変型(V型)ドメインおよびシグナル伝達分子の結合に関与する細胞質側末端を含むI型膜貫通型糖タンパク質である。PD-1の細胞質側末端は、2つのチロシンベースシグナル伝達モチーフである、ITIM(免疫受容抑制性チロシンモチーフ)およびITSM(免疫受容体チロシン依存性スイッチモチーフ)を含む。
【0015】
種々の実施形態では、本発明のPD-1結合物質は、PD-1上に存在するエピトープを認識する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、PD-1上に存在する1つまたは複数の線形エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、線形エピトープは、PD-1上に存在するアミノ酸の任意の連続配列を指す。別の実施形態では、抗原認識ドメインは、PD-1上に存在する1つまたは複数の立体構造エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、立体構造エピトープは、抗原認識ドメインにより認識され得る特徴および/または形状および/または三次構造を備えた3次元表面を形成する1つまたは複数のアミノ酸の部分(これは不連続であってよい)を指す。
【0016】
種々の実施形態では、本発明のPD-1結合物質は、ヒトPD-1の完全長型および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然のまたは合成の類似体、バリアント、または変異体に結合し得る。種々の実施形態では、本発明のPD-1結合物質は、任意の形態のヒトPD-1に結合し得る。ある実施形態では、PD-1結合物質は、リン酸化型のPD-1に結合する。
【0017】
ある実施形態では、本発明のPD-1結合物質は、ヒトPD-1上に存在する1つまたは複数のエピトープを認識する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、ヒトPD-1は、配列番号1のアミノ酸配列を含む。
【0018】
別の実施形態では、ヒトPD-1は、アミノ末端シグナルペプチドを含まない配列番号1のアミノ酸配列を含む。
【0019】
種々の実施形態では、本発明のPD-1結合物質は、特異的に結合できる標的化部分を含む。種々の実施形態では、PD-1結合物質は、抗体またはその誘導体などの抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、PD-1結合物質は、抗体である標的化部分を含む。種々の実施形態では、抗体は、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む完全長マルチマータンパク質である。それぞれの重鎖は、1つの可変領域(例えば、VH)および少なくとも3つの定常領域(例えば、CH1、CH2およびCH3)を含み、それぞれの軽鎖は、1つの可変領域(VL)および1つの定常領域(CL)を含む。可変領域は抗体の特異性を決定する。それぞれの可変領域は、4つの比較的保存されたフレームワーク領域(FR)により挟まれた、相補性決定領域(CDR)としても知られる、3つの高頻度可変領域を含む。3つのCDRは、CDR1、CDR2、およびCDR3と呼ばれ、抗体の結合特異性に寄与する。いくつかの実施形態では、抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化抗体である。
【0020】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、特定の抗体誘導体または抗体フォーマットである標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1結合物質は、次の標的化部分を含む:単一ドメイン抗体、組み換え型の重鎖抗体(重鎖抗体)(VHH)、単鎖抗体(scFv)、サメの重鎖抗体(VNAR)、マイクロタンパク質(システインノットタンパク質、ノッチン)、DARPin;テトラネクチン;アフィボディ;トランスボディ;アンチカリン;アドネクチン;アフィリン;アフィマー;ミクロボディ;アプタマー;alterase;プラスチック抗体;フィロマー;ストラドボディ;マキシボディ;エビボディ;フィノマー;アルマジロリピートタンパク質(armadillo repeat protein);クニッツドメイン、アビマー、アトリマー、プロボディ、イムノボディ、トリオマブ、トロイボディ、ペプボディ、ワクシボディ、ユニボディ;デュオボディ、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2、ペプチド模倣分子、または合成分子。これらは、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第7,417,130号、米国特許出願公開第2004/132094号、米国特許第5,831,012号、米国特許出願公開第2004/023334号、米国特許第7,250,297号、米国特許第6,818,418号、米国特許出願公開第2004/209243号、米国特許第7,838,629号、米国特許第7,186,524号、米国特許第6,004,746号、米国特許第5,475,096号、米国特許出願公開第2004/146938号、米国特許出願公開第2004/157209号、米国特許第6,994,982号、米国特許第6,794,144号、米国特許出願公開第2010/239633号、米国特許第7,803,907号、米国特許出願公開第2010/119446号、および/または米国特許第7,166,697号に記載されている。Storz MAbs.2011 May-Jun;3(3):310-317、も参照されたい。
【0021】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、VHHなどの単一ドメイン抗体である標的化部分を含む。VHHは、例えば、ラクダ類、サメなどのVHH抗体を産生する生物からから誘導されるか、またはVHHは設計されたVHHであってもよい。VHHは、天然起源の重鎖抗体の特有の構造および機能特性を含む、抗体由来の治療用タンパク質である。VHH技術は、軽鎖を欠くラクダ類由来の完全に機能的な抗体に基づいている。これらの重鎖抗体は、単一可変ドメイン(VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。
【0022】
ある実施形態では、PD-1結合物質はVHHを含む。いくつかの実施形態では、VHHは、ヒト化VHHまたはラクダ化VHHである。
【0023】
いくつかの実施形態では、VHHは、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODY(Crescendo Biologics,Cambridge,UK)を含む。いくつかの実施形態では、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODYは、一価、二価、または三価である。いくつかの実施形態では、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODYは、単一特異性、二重特異性、または三重特異性などの単一特異性または多重特異性である。例示の完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODIESは、例えば、国際公開第2016/113555号および国際公開第2016/113557号に記載されている。これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0024】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、4つの「フレームワーク領域」またはFRおよび3つの「相補性決定領域」またはCDRを有する単一アミノ酸鎖を含むVHHである標的化部分を含む。本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」または「FR」は、CDR間に位置する可変ドメイン中の領域を意味する。本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」または「CDR」は、抗原性標的に特異的に結合できるアミノ酸配列を含むVHH中の可変領域を指す。
【0025】
種々の実施形態では、PD-1結合物質は、少なくとも1つのCDR1、CDR2、および/またはCDR3配列を含む可変ドメインを有するVHHを含む。種々の実施形態では、PD-1結合物質は、少なくとも1つのFR1、FR2、FR3、および/またはFR4配列を含む可変領域を有するVHHを含む。
【0026】
いくつかの実施形態では、PD-1 CDR1配列は、下記から選択される:GFSMDYYAIA(配列番号2);GFSVDYYAIA(配列番号3);GGFNRVSYMG(配列番号4);GIIKSINFMG(配列番号5);GFILDYYGIG(配列番号6);GLSLDYDGVG(配列番号7);GRTFSSLGMG(配列番号8);GFAFGSYDMG(配列番号9);GFSFGNNDMS(配列番号10);IHAMG(配列番号11);INAMA(配列番号12);SGTMG(配列番号13);GSIASIHAM(配列番号14);GSIASIHAMG(配列番号15);FYGMG(配列番号16);GGTFSFYGMG(配列番号17);YYAIA(配列番号18);VSYMG(配列番号19);INFMG(配列番号20);SLGMG(配列番号21);SYDMG(配列番号22);およびNNDMS(配列番号23)。
【0027】
いくつかの実施形態では、PD-1 CDR2配列は、下記から選択される:CITGSDFMVDT(配列番号24);SVTSGGEI(配列番号25);STTSDGRT(配列番号26);CISSSDGST(配列番号27);AIAWNGAST(配列番号28);GINSGGRIT(配列番号29);AINSGGGST(配列番号30);AITWSGGITYYEDSVKG(配列番号31);VITWSGGITYYADSVKG(配列番号32);VITVSGGITYYADSVKG(配列番号33);AITWSGGITYYADSLKG(配列番号34);LISWSGGSTYYEDSVKG(配列番号35);SIPWSGGRIYYADSVKG(配列番号36);VITWSGGITY(配列番号37);VITVSGGITY(配列番号38);DIRTSAGRTYYADSVKG(配列番号39);DIRTSAGRTY(配列番号40);CITGSDFMVDTY(配列番号41);CITGSDFMVDTYYVASVKG(配列番号42);SVTSGGEIT(配列番号43);SVTSGGEITIADSVKG(配列番号44);SVTSGGEITVADSVKG(配列番号45);STTSDGRTT(配列番号46);STTSDGRTTVADSVKG(配列番号47);CISSSDGSTY(配列番号48);AIAWNGASTY(配列番号49);AIAWNGASTYYTESVKG(配列番号50);GINSGGRITD(配列番号51);GINSGGRITDYADSVTG(配列番号52);AINSGGGSTY(配列番号53);およびAINSGGGSTYYADSVKG(配列番号54)。
【0028】
いくつかの実施形態では、PD-1 CDR3配列は、下記から選択される:AVRSTANTLCPSHYSVMDY(配列番号55);AVRSTANTLCPSHYSIMDY(配列番号56);NADIWVSDARMYNY(配列番号57);NADIWLPSDRMYNY(配列番号58);ATATLCDGGIWGY(配列番号59);AASGLGSVVVTANEYDY(配列番号60);AQGDRSSWHYYGMDY(配列番号61);ATKSDPMTNEYDL(配列番号62);DRAESSWYDY(配列番号63);DKHQSSWYDY(配列番号64);DKHQSSFYDY(配列番号65);DRAQSSWYDY(配列番号66);DRVDSNWYDY(配列番号67);KERSTGWDFAS(配列番号68);およびEMSGISGWDY(配列番号69)。
【0029】
種々の代表的実施形態では、PD-1結合物質は、下記の配列から選択されるアミノ酸配列を含む:
2PD23
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSMDYYAIAWFRQAPGKEREEISCITGSDFMVDTYYVASVKGRFTISRDNAENTAYLQMNNLKPEDTGVYFCAVRSTANTLCPSHYSVMDYWGKGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号70);
2PD26
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFSMDYYAIAWFRQAPGKEREEISCITGSDFMVDTYYVASVKGRFTISRDNAENTAYLQMNNLKPEDTGVYFCAVRSTANTLCPSHYSVMDYWGKGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号71);
2PD90
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCSASGFSVDYYAIAWFRQAPGKEREEISCITGSDFMVDTYYVASVKGRFTISRDNAKNTAYLQMNSLKPEDTGVYFCAVRSTANTLCPSHYSIMDYWGKGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号72);
2PD-106
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCSASGFSMDYYAIAWFRQAPGKEREEISCITGSDFMVDTYYVASVKGRFTISRDNAKNTAHLQMNSLKPEDTGVYFCAVRSTANTLCPSHYSVMDYWGKGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号73);
2PD-16
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGFNRVSYMGWYRQAPGTKRELVASVTSGGEITIADSVKGRFTVSRDNSKNTLYLQMNGLKPEDGATYWCNADIWVSDARMYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号74);
2PD71
QVQLQESGGGLVQTGESLRLSCAASGGFNRVSYMGWYRQAPGSKRELVASVTSGGEITVADSVKGRFTVSRDNNKNTLYLQMNGLKPEDGATYWCNADIWVSDARMYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号75);
2PD-152
QVQLQESGGGLVQTGESLRLSCAASGIIKSINFMGWYRQPPGTKRELVASTTSDGRTTVADSVKGRFTISRDNAKNTIYLEMSSLKPEDTATYWCNADIWLPSDRMYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号76);
2PD-12
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAVSGFILDYYGIGWFRQAPGKEREAVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNALNTLYLQMNSLKPEDTAVYHCATATLCDGGIWGYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号77);
3PD55
QVQLQESGGGLAQAGGSLRLSCEGSGLSLDYDGVGWFRQAPGKEREAVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRGNALNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCATATLCDGGIWGYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号78);
3PD82
QVQLQESGGGSVQPGGSLRLSCAVSGFILDYYGIGWFRQAPGKEREAVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNALNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCATATLCDGGIWGYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号:79);
2PD8
QVQLQESGGGSVQAGDSLRLSCTASGRTFSSLGMGWFRQAPGKEREFVSAIAWNGASTYYTESVKGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPTDTAVYFCAASGLGSVVVTANEYDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号80);
2PD27
QVQLQESGGGSVQPGKSLRLSCAASGRTFSSLGMGWFRQAPGKEREFVSAIAWNGASTYYTESVKGRFTISRDDAKNTVYLQMNSLKPTDTAVYFCAASGLGSVVVTANEYDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号81);
2PD82
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTTSGFAFGSYDMGWVRQAPGKGPEWVSGINSGGRITDYADSVTGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCAQGDRSSWHYYGMDYWGKGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号82);または
3PD36
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFSFGNNDMSWVRQAPGKGPEWVSAINSGGGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCATKSDPMTNEYDLWGXGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号83)。
【0030】
種々の代表的実施形態では、PD-1結合物質は、末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、HHHHHH;配列番号84)を含まない配列番号70~配列番号83から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0031】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、HAタグ(すなわち、YPYDVPDYGS;配列番号85)を含まない配列番号70~83(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0032】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、AAAリンカーを含まない配列番号70~83(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0033】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、AAAYPYDVPDYGSHHHHHH;配列番号86)を含まない配列番号70~83(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0034】
種々の代表的実施形態では、PD-1結合物質は、下記の配列から選択されるアミノ酸配列を含む:
102C3:
QVQLQESGGGLVQAGKSLRLSCAASGSIFSIHAMGWFRQAPGKEREFVAAITWSGGITYYEDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAADRAESSWYDYWGQGTQVTVSS(配列番号1246);または
102C12:
QVQLQESGGGLVQAGKSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTQVTVSS(配列番号1247)。
【0035】
種々の実施形態では、PD-1結合物質は、米国特許出願公開第2017/0137517号に記載のアミノ酸配列を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。一例として、いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、米国特許出願公開第2017/0137517号中の次の配列のうちの1つを含む:
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号87);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTATYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号88);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTATYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSS(配列番号89);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTQVQVSS(配列番号90);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVKS(配列番号91);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVQS(配列番号92);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVKVSS(配列番号93);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVQVSS(配列番号94);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVKS(配列番号95);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVQS(配列番号96);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVSS(配列番号97);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVKVSS(配列番号98);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVQVSS(配列番号99);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVKS(配列番号100);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVQS(配列番号101);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEREFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVSS(配列番号102);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVSS(配列番号103);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEREFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTSSA(配列番号104);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTATYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVKVSSA(配列番号105);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVQVSSA(配列番号106);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVKSA(配列番号107);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVQSA(配列番号108);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVKVSSA(配列番号109);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVQVSSA(配列番号110);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVKSA(配列番号111);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVQSA(配列番号112);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVSSA(配列番号113);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVKVSSA(配列番号114);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVQVSSA(配列番号115);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVKSA(配列番号116);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVQSA(配列番号117);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVSSA(配列番号118);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAAEMSGISGWDYWGQGTLVTVSSA(配列番号119);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号120);
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号121);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号122);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGSDTLYADSVKGRFTISRDNAKTTLYLQMNSLRPEDTALYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSSA(配列番号123);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGSDTLYADSVKGRFTISRDNAKTTLYLQMNSLRPEDTALYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSSA(配列番号124);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号125);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDQSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号126);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDPSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号127);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDPSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号128);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDQSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号129);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDSSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号130);
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWERQAPGKEREEVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGSDTLYADSVKGRFTISRDNAKTTLYLQMNSLRPEDTAVYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSS(配列番号131);および
MQIPQAPWPVVWAVLQLGWRPGWFLDSPDRPWNPPTFSPALLVVTEGDNATFTCSFSNTSESFVLNWYRMSPSNQTDKLAAFPEDRSQPGQDCRFRVTQLPNGRDFHMSVVRARRNDSGTYLCGAISLAPKAQIKESLRAELRVTERRAEVPTAHPSPSPRPAGQFQTLVVGVVGGLLGSLVLLVWVLAVICSRAARGTIGARRTGQPLKEDPSAVPVFVDYGELDFQWREKTPEPPVPCVPEQTEYATIVFPSGMGTSSPARRGSADGPRSAQPLRPEDGHCSWPL(配列番号132)。
【0036】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、位置1、11、14,52a、73、74、83、89、100a、110、および112(Kabatナンバリングによる)に1つまたは複数の置換を有する配列番号87~132から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、位置1のアミノ酸はEまたはDである。いくつかの実施形態では、位置11のアミノ酸はLまたはVである。いくつかの実施形態では、位置14のアミノ酸はAまたはPである。いくつかの実施形態では、位置52aのアミノ酸はWまたはVである。いくつかの実施形態では、位置73のアミノ酸はN、S、PまたはQである。いくつかの実施形態では、位置74のアミノ酸はAまたはSである。いくつかの実施形態では、位置83のアミノ酸はKまたはRである。いくつかの実施形態では、位置89のアミノ酸はT、V、IまたはLである。いくつかの実施形態では、位置100aのアミノ酸はWまたはFである。いくつかの実施形態では、位置110のアミノ酸はT、K、またはQである。いくつかの実施形態では、位置112のアミノ酸はS、K、またはQである。
【0037】
種々の実施形態では、PD-1結合物質は、国際公開第2017/087587号に記載のアミノ酸配列を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。一例として、いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、国際公開第2017/087587号中の次の配列のうちの1つを含む:
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGGTFSFYGMGWFRQAPGKEQEFVADIRTSAGRTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCAAEMSGISGWDYWGQGTQVTVSS(配列番号133);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTATYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号134);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSS(配列番号135);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVQVSS(配列番号136);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVKS(配列番号137);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVQS(配列番号138);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSS(配列番号139);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVQVSS(配列番号140);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVKS(配列番号141);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVQS(配列番号142);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号143);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSS(配列番号144);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVQVSS(配列番号145);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVKS(配列番号146);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVQS(配列番号147);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号148);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号149);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTATYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSA(配列番号150);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSSA(配列番号151);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVQVSSA(配列番号152);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVKSA(配列番号153);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMCWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVQSA(配列番号154);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMCWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSSA(配列番号155);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVQVSSA(配列番号156);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVKSA(配列番号157);
EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVQSA(配列番号158);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSA(配列番号159);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVKVSSA(配列番号160);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVQVSSA(配列番号161);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVKSA(配列番号162);
EVQLVESGGGVVQAGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVQSA(配列番号163);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSA(配列番号164);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSA(配列番号165);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAIITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号166);
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号167);
EVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSS(配列番号168);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGSDTLYADSVKGRFTISRDNAKTTLYLQMNSLRPEDTALYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSSA(配列番号169);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTLVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGVVQPGNSLRLSCAASGFTFSSFGMSWVRQAPGKGLEWVSSISGSGSDTLYADSVKGRFTISRDNAKTTLYLQMNSLRPEDTALYYCTIGGSLSRSSQGTLVTVSSA(配列番号170);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDNSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号171);
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDQSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号172);および
DVQLVESGGGVVQPGGSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITVSGGITYYADSVKGRFTISRDPSKNTVYLQMNSLRPEDTALYYCAGDKHQSSFYDYWGQGTLVTVSS(配列番号173)。
【0038】
いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、位置1、11、14,52a、73、74、83、89、100a、110、および112(Kabatナンバリングによる)に1つまたは複数の置換を有する配列番号133~173から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、位置1のアミノ酸はEまたはDである。いくつかの実施形態では、位置11のアミノ酸はLまたはVである。いくつかの実施形態では、位置14のアミノ酸はAまたはPである。いくつかの実施形態では、位置52aのアミノ酸はWまたはVである。いくつかの実施形態では、位置73のアミノ酸はN、S、PまたはQである。いくつかの実施形態では、位置74のアミノ酸はAまたはSである。いくつかの実施形態では、位置83のアミノ酸はKまたはRである。いくつかの実施形態では、位置89のアミノ酸はT、V、IまたはLである。いくつかの実施形態では、位置100aのアミノ酸はWまたはFである。いくつかの実施形態では、位置110のアミノ酸はT、K、またはQである。いくつかの実施形態では、位置112のアミノ酸はS、K、またはQである。
【0039】
種々の実施形態では、本発明は、本明細書に記載の本発明のPD-1結合物質の任意の天然のまたは合成の類似体、変異体、バリアント、アレル、同族体およびオーソログ(本明細書では、ひとまとめにして「類似体」と呼ぶ)の使用を意図している。種々の実施形態では、PD-1結合物質のアミノ酸配列は、アミノ酸類似体、アミノ酸誘導体、またはその他の非古典的アミノ酸をさらに含む。
【0040】
種々の実施形態では、本発明は、PD-L1結合物質をさらに提供する。プログラム死リガンド1(PD-L1)は、表面抗原分類274(CD274)またはB7ホモログ1(B7-H1)としても知られ、免疫系の抑制に大きな役割を果たすと推測されている1型膜貫通タンパク質である。PD-LIは、LPSおよびGM-CSF処理に応答してマクロファージおよび樹状細胞(DC)上で、ならびにTCRおよびB細胞受容体シグナル伝達時にT細胞およびB細胞上で発現上昇される。
【0041】
種々の実施形態では、本発明のPD-L1結合物質は、PD-L1上に存在するエピトープを認識する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、PD-L1上に存在する1つまたは複数の線形エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、線形エピトープは、PD-L1上に存在するアミノ酸の任意の連続配列を指す。別の実施形態では、抗原認識ドメインは、PD-L1上に存在する1つまたは複数の立体構造エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、立体構造エピトープは、抗原認識ドメインにより認識され得る特徴および/または形状および/または三次構造を備えた3次元表面を形成する1つまたは複数のアミノ酸の部分(これは不連続であってよい)を指す。
【0042】
種々の実施形態では、本発明のPD-L1結合物質は、ヒトPD-L1の完全長型および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然のまたは合成の類似体、バリアント、または変異体に結合し得る。種々の実施形態では、本発明のPD-L1結合物質は、任意の形態のヒトPD-L1に結合し得る。ある実施形態では、PD-L1結合物質は、リン酸化型のPD-L1に結合する。ある実施形態では、PD-L1結合物質は、アセチル化型のPD-L1に結合する。
【0043】
ある実施形態では、本発明のPD-L1結合物質は、ヒトPD-L1上に存在する1つまたは複数のエピトープを認識する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、ヒトPD-L1は、下記のアミノ酸配列(下線はシグナルペプチド)を含む:
【化1】
【0044】
種々の実施形態では、本発明のPD-L1結合物質は、特異的結合ができる標的化部分を含む。種々の実施形態では、PD-L1結合物質は、抗体またはその誘導体などの抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、PD-L1結合物質は、抗体である標的化部分を含む。種々の実施形態では、抗体は、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む完全長マルチマータンパク質である。それぞれの重鎖は、1つの可変領域(例えば、VH)および少なくとも3つの定常領域(例えば、CH1、CH2およびCH3)を含み、それぞれの軽鎖は、1つの可変領域(VL)および1つの定常領域(CL)を含む。可変領域は抗体の特異性を決定する。それぞれの可変領域は、4つの比較的保存されたフレームワーク領域(FR)により挟まれた、相補性決定領域(CDR)としても知られる、3つの高頻度可変領域を含む。3つのCDRは、CDR1、CDR2、およびCDR3と呼ばれ、抗体の結合特異性に寄与する。いくつかの実施形態では、抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化抗体である。
【0045】
いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、特定の抗体誘導体または抗体フォーマットである標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、本発明のPD-L1結合物質は、次の標的化部分を含む:単一ドメイン抗体、組み換え型の重鎖抗体(重鎖抗体)(VHH)、単鎖抗体(scFv)、サメの重鎖抗体(VNAR)、マイクロタンパク質(システインノットタンパク質、ノッチン)、DARPin;テトラネクチン;アフィボディ;トランスボディ;アンチカリン;アドネクチン;アフィリン;アフィマー;ミクロボディ;アプタマー;alterase;プラスチック抗体;フィロマー;ストラドボディ;マキシボディ;エビボディ;フィノマー;アルマジロリピートタンパク質(armadillo repeat protein);クニッツドメイン、アビマー、アトリマー、プロボディ、イムノボディ、トリオマブ、トロイボディ、ペプボディ、ワクシボディ、ユニボディ;デュオボディ、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2、ペプチド模倣分子、または合成分子。これらは、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第7,417,130号、米国特許出願公開第2004/132094号、米国特許第5,831,012号、米国特許出願公開第2004/023334号、米国特許第7,250,297号、米国特許第6,818,418号、米国特許出願公開第2004/209243号、米国特許第7,838,629号、米国特許第7,186,524号、米国特許第6,004,746号、米国特許第5,475,096号、米国特許出願公開第2004/146938号、米国特許出願公開第2004/157209号、米国特許第6,994,982号、米国特許第6,794,144号、米国特許出願公開第2010/239633号、米国特許第7,803,907号、米国特許出願公開第2010/119446号、および/または米国特許第7,166,697号に記載されている。Storz MAbs.2011 May-Jun;3(3):310-317、も参照されたい。
【0046】
いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、VHHなどの単一ドメイン抗体である標的化部分を含む。VHHは、例えば、ラクダ類、サメなどのVHH抗体を産生する生物からから誘導するか、またはVHHは設計によるVHHであってもよい。VHHは、天然起源の重鎖抗体の特有の構造および機能特性を含む、抗体由来の治療用タンパク質である。VHH技術は、軽鎖を欠くラクダ類由来の完全に機能的な抗体に基づいている。これらの重鎖抗体は、単一可変ドメイン(VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。
【0047】
ある実施形態では、PD-L1結合物質はVHHを含む。いくつかの実施形態では、VHHは、ヒト化VHHまたはラクダ化VHHである。
【0048】
いくつかの実施形態では、VHHは、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODY(Crescendo Biologics,Cambridge,UK)を含む。いくつかの実施形態では、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODYは、一価、二価、または三価である。いくつかの実施形態では、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODYは、単一特異性、二重特異性、または三重特異性などの単一特異性または多重特異性である。例示的な完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODIESは、例えば、国際公開第2016/113555号および国際公開第2016/113557号に記載されている。これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0049】
いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、4つの「フレームワーク領域」またはFRおよび3つの「相補性決定領域」またはCDRを有する単一アミノ酸鎖を含むVHHである標的化部分を含む。本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」または「FR」は、CDRの間に位置する可変ドメイン中の領域を意味する。本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」または「CDR」は、抗原性標的に特異的に結合できるアミノ酸配列を含むVHH中の可変領域を指す。
【0050】
種々の実施形態では、PD-L1結合物質は、少なくとも1つのCDR1、CDR2、および/またはCDR3配列を含む可変ドメインを有するVHHを含む。種々の実施形態では、PD-L1結合物質は、少なくとも1つのFR1、FR2、FR3、および/またはFR4配列を含む可変領域を有するVHHを含む。
【0051】
いくつかの実施形態では、PD-L1 CDR1配列は、下記から選択される:GFTLDYYAIG(配列番号177);GTIFSINHMD(配列番号178);GFTFDDYGMS(配列番号179);GFTLDYYAIN(配列番号180);GTIFSINRMD(配列番号181);GFTFSSYGMS(配列番号182);GKIFSGNDMG(配列番号183);GFTFNDYAMS(配列番号184);GFNLDPYAIA(配列番号185);GFTFTAYAMS(配列番号186);GFTFDYYAIG(配列番号187);GFNLDPYAIG(配列番号188);ESIFSIEAMG(配列番号189);GRTFSISAMG(配列番号190);YYAIG(配列番号191);YYAKC(配列番号192);QYDVG(配列番号193);NSAMG(配列番号194);DSIVS(配列番号195);INHMD(配列番号196);DYGMS(配列番号197);YYAIN(配列番号198);INRMD(配列番号199);SYGMS(配列番号200);GNDMG(配列番号201);DYAMS(配列番号202);PYAIA(配列番号203);AYAMS(配列番号204);PYAIG(配列番号205);IEAMG(配列番号206);およびISAMG(配列番号207)。
【0052】
いくつかの実施形態では、PD-L1 CDR2配列は、下記から選択される:ISSSDGSTY(配列番号208);ITSDGFPT(配列番号209);IRWNGGSTN(配列番号210);ITSDGTPT(配列番号211);IDSGGGSTS(配列番号212);ITSGGITD(配列番号213);ITSDGTPT(配列番号214);IDSGGGSTS(配列番号215);IRSNGGYTN(配列番号216);ISSSDVGTY(配列番号217);INSSDGSTY(配列番号218);ISGSDSSTY(配列番号219);ISSSDVGTY(配列番号220);ITSDGTPT(配列番号221);ITSDGTPA(配列番号222);IDSGGGSTS(配列番号223);ISSGDGSKY(配列番号224);ISSSDVGTY(配列番号225);IFGGGFTN(配列番号226);ITSGGITD(配列番号227);IDSGGGSTS(配列番号228);ITSDGTPT(配列番号229);IDSGGGSTS(配列番号230);ISSSDVGTY(配列番号231);ITWSGGSTS(配列番号232);IDSGGGSTS(配列番号233);IRSNGGYTN(配列番号234);SISSSDGSTYYADSVKG(配列番号235);CISSSDGSTYYADSVKG(配列番号236);CISGGDNSTYYADSVKG(配列番号237);FSSSGGRTIYPDSVKG(配列番号238);RITGGGLIAYTDSVKG(配列番号239);GISNGGTIKYAESVLG(配列番号240);LITSDGFPT(配列番号241);LITSDGFPTYADSAKG(配列番号242);AIRWNGGSTN(配列番号243);AIRWNGGSTNYADSVKG(配列番号244);LITSDGTPT(配列番号245);LITSDGTPTYADSAKG(配列番号246);AIDSGGGSTS(配列番号247);AIDSGGGSTSYADSVKG(配列番号248);IITSGGITD(配列番号249);IITSGGITDYADAVKG(配列番号250);GIRSNGGYTN(配列番号251);GIRSNGGYTNYADSVKG(配列番号252);CISSSDVGTY(配列番号253);CISSSDVGTYYADSVKG(配列番号254);CINSSDGSTY(配列番号255);CINSSDGSTYYADSVKG(配列番号256);CISGSDSSTY(配列番号257);CISGSDSSTYYADSVKG(配列番号258);LITSDGTPA(配列番号259);LITSDGTPAYADSAKG(配列番号260);CISSGDGSKY(配列番号261);CISSGDGSKYYADSVKG(配列番号262);AIFGGGFTN(配列番号263);AIFGGGFTNYADSVKG(配列番号264);AITWSGGSTS(配列番号265);およびAITWSGGSTSYTDSVKG(配列番号266)。
【0053】
いくつかの実施形態では、CDR3配列は、下記から選択される:DGWSSCRHGINEYLYW(配列番号267);SSGVYNYW(配列番号268);QGYYCSGYGCPR(配列番号269);SGWRLCRPTDEYDYSYW(配列番号270);QGYYCSGYGCSDYW(配列番号271);RDRTIWW(配列番号272);QGYYCSGYGCYP(配列番号273);DGYYYCSDYPHPLYW(配列番号274);DGWRDCTWSNEYAYW(配列番号275);TGWRTCRGLNEYDYW(配列番号276);DLVSGSSRLYDYW(配列番号277);MGRTNYGVIYDPNMYNYW(配列番号278);SGWRLCRPTDEYDYLYW(配列番号279);SQAPITIATMMKPFYDY(配列番号280);RHGGPLTVEYFFDY(配列番号281);GGWKYCSGYDPEYIY(配列番号282);DWYLNSY(配列番号283);INSRDG(配列番号284);およびRQY(配列番号285)。
【0054】
種々の代表的実施形態では、PD-L1結合物質は、下記の配列から選択されるアミノ酸配列を含む:
2LIG2
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREEVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVNLQMNSLKPEDTAVYYCATDGWSSCRHGIN-EYLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号286);
または
2LIG3
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCTASGTIFSINHMDWFRQAPGKQRELVALITSDGFPTYADSAKGRFTISRDNTKKTVSLQMNSLKPEDTAVYYCHVSSGVYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号287);
または
2LIG16
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDDYGMSWVRQAPGKGLEWVSAIRWNGGSTNYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKSEDTAVYYCA-QGYY-CSGYGCPRGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号288);
または
2LIG22
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAINWFRQAPGKEREEVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATSGWRLCRPTDEYDYSYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号289);
または
2LIG27
QVQLQESGGGVVQAGGSLRLSCTASGTIFSINRMDWFRQAPGKQRELVALITSDGTPTYADSAKGRFTISRDNTKKTVSLQMNSLKPEDTAVYYCHVSSGVYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号290);
または
2LIG29
QVQLQESGGGLVQTGGSLRLSCAASGFTFSSYGMSWVRQTPGKGPEWVSAIDSGGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCA-QGYY-CSGYGCSDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号291);
または
2LIG30
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGKIFSGNDMGWYRQAPGKQRELVGIITSGGITDYADAVKGRFTISRDNAKNMMYLQMNSLKPEDTAVYYCNMRDRTIWWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号292);
または
2LIG34
QVQLQESGGGSVQAGGSLRLSCTASGTIFSINRMDWFRQAPGKQRELVALITSDGTPTYADSAKGRFTISRDNTKKTVSLQMNSLKPEDTAVYYCHVSSGVYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号293);
または
2LIG35
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYGMSWVRQTPGKGPEWVSAIDSGGGSTSYADSVKGRFTTSRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCA-QGYY-CSGYGCSDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号294);
または
2LIG48
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFNDYAMSWVRQAPGKGLEWVSGIRSNGGYTNYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKSEDTAVYYCA-QGYY-CSGYGCYPGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号295);
または
2LIG65
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFNLDPYAIAWFRQAPGKEREEVSCISSSDVGTYYADSVKGRFTISRDNAKKTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDGYYYCSDYPHPLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号296);
または
2LIG85
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFTAYAMSWFRQAPGKEREEVSCINSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYHCATDGWRDCTWSNEYAYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号297);
または
2LIG86
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFDYYAIGWFRQAPGKEREEVSCISGSDSSTYYADSVKGRFTIVRDNAQNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAVTGWRTCRGLNEYDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号298);
または
2LIG89
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNLDPYAIAWFRQAPGKEREEVSCISSSDVGTYYADSVKGRFTISRDNTKKTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDGYYYCSDYPHPLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号299);
または
2LIG97
QVQLQESGGGLVQAGESLRLSCTASGTIFSINRMDWFRQAPGKQRELVALITSDGTPTYADSAKGRFTISRDNTKKTVSLQMNSLKPEDTAVYYCHVSSGVYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号300);
または
2LIG99
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCTASGTIFSINRMDWFRQAPGKQRELVALITSDGTPAYADSAKGRFTISRDNTKKTVSLQMNSLKPEDTAVYYCHVSSGVYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号301);
または
2LIG109
QVQLQESGGGLVQSGGSLRLSCKTSGFTFSSYGMSWVRQTPGKGPEWVSAIDSGGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCAQGYY-CSGYGCSDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号302);
または
2LIG127
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNLDPYAIGWFRQAPGKEREEVSCISSGDGSKYYADSVKGRFTMSRDNAKKTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDGYYYCSDYPHPLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号303);
または
2LIG139
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAVSGFNLDPYAIAWFRQAPGKEREEVSCISSSDVGTYYADSVKGRFTISRDNAKKTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDGYYYCSDYPHPLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号304);
または
2LIG176
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASESIFSIEAMGWYRQAPGKQRELVAAIFGGGFTNYADSVKGRFTISRDNANRTVYLQMNSLKPEDTAVYYCNADLVSGSSRLYDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号305);
または
2LIG189
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGKIFSGNDMGWYRQAPGKQRELVGIITSGGITDYADAVKGRFTISRDNAKNMMYLQMNSLKPEDTAVYYCNMRDRTIWWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号306);
または
3LIG3
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREEVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVNLQMNSLKPEDTAVYYCATDGWSSCRHGINEYLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号307);
または
3LIG7
QVQLQESGGGLVQAGGSLRLSCAASGFTFSSYGMSWVRQTPGKGPEWVSAIDSGGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCAQGYY-CSGYGCSDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号308);
または
3LIG8
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCTASGTIFSINRMDWFRQAPGKQRELVALITSDGTPTYADSAKGRFTISRDNTKKTVSLQMNSLKPEDTAVYYCHVSSGVYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号309);
または
3LIG9
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTFSSYGMSWVRQTPGKGPEWVSAIDSGGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCAQGYYCSGYGCSDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号310);
または
3LIG18
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNLDPYAIAWFRQAPGKEREEVSCISSSDVGTYYADSVKGRFTISRDNAKKTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATDGYYYCSDYPHPLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号311);
または
3LIG20
QVQLQESGGGLVXAGGSLRLSCAASGRTFSISAMGWFRQAPGKEREFVAAITWSGGSTSYTDSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAIYYCAAMGRTNYGVIYDPNMYNYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号312);
または
3LIG28
QVQLQESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFTLDYYAINWFRQAPGKEREEVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAVYYCATSGWRLCRPTDEYDYLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号313);
または
3LIG29
QVQLQESGGGLVQAGGSMRLSCAASGFTFSSYGMSWVRQTPGKGPEWVSAIDSGGGSTSYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKPEDTAVYYCAQGYYCSGYGCSDYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号314);
または
3LIG30
QVQLQESGGGTVQAGGSLRLSCAASGFTFNDYAMSWVRQAPGKGLEWVSGIRSNGGYTNYADSVKGRFTISRDNAKNTLYLQMNSLKSEDTAVYYCAQGYYCSGYGCYPGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号315);
または
3LIG33
QVQLQESGGGLVQPGTSLRLSCAASGFTLDYYAIGWFRQAPGKEREEVSCISSSDGSTYYADSVKGRFTISRDNAKNTVNLQMNSLKPEDTAVYYCATDGWSSCRHGINEYLYWGQGTQVTVSSAAAYPYDVPDYGSHHHHHH(配列番号316)。
【0055】
種々の例示的実施形態では、PD-L1結合物質は、末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、HHHHHH:配列番号84)を含まない上記配列のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む。
【0056】
いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、HAタグ(すなわち、YPYDVPDYGS;配列番号85)を含まない配列番号286~316(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0057】
いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、AAAリンカーを含まない配列番号286~316(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0058】
いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、AAAYPYDVPDYGSHHHHHH;配列番号86)を含まない配列番号286~316(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0059】
種々の実施形態では、本発明は、本明細書に記載の本発明のPD-L1結合物質の任意の天然または合成類似体、変異体、バリアント、アレル、同族体およびオーソログ(本明細書では、ひとまとめにして「類似体」と呼ぶ)の使用を意図している。種々の実施形態では、PD-L1結合物質のアミノ酸配列は、アミノ酸類似体、アミノ酸誘導体、またはその他の非古典的アミノ酸をさらに含む。
【0060】
種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに少なくとも60%同一である配列を含む標的化部分を含む。例えば、PD-1またはPD-L1結合物質は、本明細書で開示の配列のうちのいずれかに、少なくとも約60%、少なくとも約61%、少なくとも約62%、少なくとも約63%、少なくとも約64%、少なくとも約65%、少なくとも約66%、少なくとも約67%、少なくとも約68%、少なくとも約69%、少なくとも約70%、少なくとも約71%、少なくとも約72%、少なくとも約73%、少なくとも約74%、少なくとも約75%、少なくとも約76%、少なくとも約77%、少なくとも約78%、少なくとも約79%、少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一(例えば、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、約99%または約100%の配列同一性)である配列を含む標的化部分を含み得る。
【0061】
種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに関して1つまたは複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む標的化部分を含む。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに関して1個、または2個、または3個、または4個、または5個、または6個、または7個、または8個、または9個、または10個、または15個、または20個のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および短縮化から独立に選択され得る。
【0062】
いくつかの実施形態では、アミノ酸変異は、アミノ酸置換であり、保存的および/または非保存的置換を含み得る。
【0063】
「保存的置換」は、例えば、関与するアミノ酸残基の極性、電荷、サイズ、溶解度、疎水性、親水性、および/または両親媒特性における類似性に基づいて行われ得る。20種類の天然アミノ酸は、次の6つの標準的アミノ酸グループに分類できる:(1)疎水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile;(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr;Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)塩基性:His、Lys、Arg;(5)鎖配向に影響を与える残基:Gly、Pro;および(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
【0064】
本明細書で使用される場合、「保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸グループの同じグループ内に記載の別のアミノ酸による交換として定義される。例えば、AspのGluによる交換は、そのように改変されたポリペプチド中で1つの負電荷を保持する。さらに、グリシンおよびプロリンは、それらのαヘリックスを破壊する能力に基づいて相互に置換され得る。
【0065】
本明細書で使用される場合、「非保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸グループ(1)~(6)の異なるグループに記載の別のアミノ酸による交換として定義される。
【0066】
種々の実施形態では、置換は非古典的アミノ酸も含んでよい。代表的非古典的アミノ酸としては、限定されないが、セレノシステイン、ピロールリジン、N-ホルミルメチオニンβ-アラニン、GABAおよびδ-アミノレブリン酸、4-アミノ安息香酸(PABA)、共通アミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、Abu、2-アミノ酪酸、γ-Abu、ε-Ahx、6-アミノヘキサン酸、Aib、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、β-アラニン、フルオロアミノ酸、βメチルアミノ酸などのデザイナーアミノ酸、C α-メチルアミノ酸、N α-メチルアミノ酸、およびアミノ酸類似体一般が挙げられる。
【0067】
種々の実施形態では、アミノ酸変異は、標的化部分のCDR(例えば、CDR1、CDR2またはCDR3領域)中にあってもよい。別の実施形態では、アミノ酸変化は、標的化部分のフレームワーク領域(FR)(例えば、FR1、FR2、FR3、またはFR4領域)中にあってもよい。
【0068】
アミノ酸配列の改変は、任意の当該技術分野において、周知の技術、例えば、部位特異的変異誘発またはPCRベース変異誘発を用いて実現され得る。このような技術は、例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Plainview,N.Y.,1989 and Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York,N.Y.,1989に記載されている。
【0069】
種々の実施形態では、変異は、PD-1またはPD-L1に特異的に結合する本発明のPD-1またはPD-L1結合物質の能力を実質的に低下させない。種々の実施形態では、変異は、PD-1またはPD-L1に特異的に結合する本発明のPD-1またはPD-L1結合物質の能力を実質的に低下させず、さらにPD-1またはPD-L1を機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に中和する)こともない。
【0070】
種々の実施形態では、ヒトPD-1またはPD-L1の完全長および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/またはモノマーおよび/またはダイマー型および/または任意のその他の天然のまたは合成類似体、バリアント、または変異体(モノマー、ダイマー型を含む)に対する本発明のPD-1またはPD-L1結合物質の結合親和性は、平衡解離定数(KD)により特徴付けられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、ヒトPD-1またはPD-L1の完全長および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意のその他の天然のまたは合成類似体、バリアント、または変異体(モノマーおよび/またはダイマー型を含む)に、約1uM、約900nM、約800nM、約700nM、約600nM、約500nM、約400nM、約300nM、約200nM、約100nM、約90nM、約80nM、約70nM、約60nM、約50nM、約40nM、約30nM、約20nM、約10nM、または約5nM、または約1nM未満のKDで結合する標的化部分を含む。
【0071】
種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、目的の抗原、すなわち、PD-1またはPD-L1を結合するが機能的に調節(例えば、部分的にまたは完全に中和)しない標的化部分を含む。例えば、種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質の標的化部分は、単に抗原を標的とするが、抗原が有する生物学的作用を実質的に機能的に調節(例えば、部分的にまたは完全に阻害するかあるいは中和する)しない。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質の標的化部分は、生物活性にとって重要な抗原部位(例えば、抗原の活性部位)から物理的に離れたエピトープを結合する。
【0072】
種々の実施形態では、これらの結合物質は、PD-1またはPD-L1に結合し、かつこれを機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に中和する)。
【0073】
PD-1またはPD-L1結合物質を含む治療薬
シグナル伝達物質とのキメラおよび融合体
種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、1種類または複数種類のシグナル伝達物質とのキメラまたは融合体の一部である。したがって、本発明は、例えば、PD-1またはPD-L1に対する標的化部分および1種類または複数種類のシグナル伝達物質を含むキメラまたは融合タンパク質を提供する。
【0074】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1つまたは複数のその受容体に対する低減された親和性または活性を有するように改変され、それによりキメラまたは融合タンパク質の活性の減弱化(アゴニズムまたはアンタゴニズムを含む)を可能にし、および/または非特異的シグナル伝達または望ましくない隔離を防止する。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は野生型の形態で拮抗性であり、そのアンタゴニスト活性を弱める1つまたは複数の変異を有する。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1つまたは複数の変異に起因して拮抗性であり、例えば、アゴニストシグナル伝達物質はアンタゴニストシグナル伝達物質に変換され、このような変換されたシグナル伝達物質は、場合により、そのアンタゴニスト活性を弱める1つまたは複数の変異も有する(例えば、国際公開第2015/007520号に記載のように、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる)。
【0075】
したがって、種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1つまたは複数の改変(例えば、変異)を有する改変された(変異した)型のシグナル伝達物質である。種々の実施形態では、変異は改変シグナル伝達物質が、非変異型、すなわち、野生型形態のシグナル伝達物質に比べて(例えば、野生型形態と改変(例えば、変異)形態での同じシグナル伝達物質を比較して)、低減された結合親和性、低減された内在性活性、および低減された特定の生物活性のうちの1つまたは複数などの1つまたは複数の弱められた活性を有することを可能にする。いくつかの実施形態では、結合または親和性を弱めるまたは低減する変異は、結合または活性を実質的に低減または除去する変異を含む。いくつかの実施形態では、結合または親和性を弱めるまたは低減する変異は、結合または活性を実質的に低減または除去する変異とは異なる。結果として、種々の実施形態では、変異は、シグナル伝達物質が、非変異型、すなわち、野生型シグナル伝達物質に比べて(例えば、野生型形態と改変(例えば、変異)形態での同じシグナル伝達物質を比較して)、向上した安全性、例えば、低減された全身毒性、低減された副作用、および低減されたオフターゲット効果を有することを可能にする。
【0076】
本明細書に記載のように、物質は、1つまたは複数の改変、例えば、変異により、向上した安全性を有し得る。種々の実施形態では、向上した安全性は、本キメラタンパク質がより低い毒性(例えば、全身性毒性および/または組織/器官関連毒性);および/または低減されたまたは実質的に除去された副作用;および/または高められた耐容性、低減されたまたは実質的に除去された有害事象;および/または低減されたまたは実質的に除去された;および/または拡大された治療濃度域をもたらすことを意味する。
【0077】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1つまたは複数のその受容体に対する結合親和性または活性を低減する1つまたは複数の変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、受容体に対する結合親和性または活性を実質的に低減または除去する1つまたは複数の変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、野生型シグナル伝達物質により与えられる活性は、受容体に対するアゴニズム(例えば、治療の部位での細胞効果の活性化)である。例えば、野生型シグナル伝達物質は、その受容体を活性化し得る。このような実施形態では、変異は、受容体に対する活性化作用を低減または除去するように改変されたシグナル伝達物質をもたらす。例えば、変異は、標的細胞に低減された活性化シグナルを送るように改変されたシグナル伝達物質をもたらし得る、または活性化シグナルが除去され得る。いくつかの実施形態では、野生型シグナル伝達物質により与えられる作用は、受容体に対するアンタゴニズム(例えば、治療の部位での細胞効果の遮断または抑制)である。例えば、野生型シグナル伝達物質は、受容体をアンタゴナイズするかあるいは阻害し得る。これらの実施形態では、変異は、受容体に対するアンタゴナイズ活性を低減または除去するように改変されたシグナル伝達物質をもたらす。例えば、変異は、標的細胞に低減された阻害シグナルを送るように改変されたシグナル伝達物質をもたらし得る、または阻害シグナルが除去され得る。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、1つまたは複数の変異に起因して拮抗性であり、例えば、アゴニストシグナル伝達物質はアンタゴニストシグナル伝達物質に変換され(例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号に記載のように)、また、このような変換されたシグナル伝達物質は、場合により、1つまたは複数のその受容体に対するその結合親和性または活性を低減する、または1つまたは複数のその受容体に対する結合親和性または活性を実質的に低減または除去する1つまたは複数の変異も有する。
【0078】
いくつかの実施形態では、受容体に対し低減された親和性または活性は、本明細書に記載の1つまたは複数の標的化部分(例えば、PD-1またはPD-L1に対する標的化部分)の結合により回復可能である。他の実施形態では、受容体に対し低減された親和性または活性は、1つまたは複数の標的化部分の活性により実質的に回復可能でない。
【0079】
種々の実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、それらのシグナル伝達物質が受容体に対する結合親和性または活性を弱めるまたは除去する変異を有するという理由で、オフターゲット効果を低減させる。種々の実施形態では、例えば、野生型シグナル伝達物質と比べて、副作用におけるこの低減が観察される。種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、標的細胞に対し活性である。理由は、標的化部分(単数または複数)が、実質的な活性化に必要とされる欠損した/不十分な結合(例えば、限定されないが、および/または結合力)を補償するためである。種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、治療作用部位へ向かう途上では実質的に不活性であり、特異的に標的とされる細胞型に対してその効果を実質的に有し、これにより望ましくない副作用を大きく低減する。
【0080】
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、1つの受容体(すなわち、治療受容体)に対する結合または親和性を弱めるまたは低減させる1つまたは複数の変異および第2の受容体に対する結合または活性を実質的に低減または除去する1つまたは複数の変異を含み得る。このような実施形態では、これらの変異は、同じまたは異なる位置にあってよい(すなわち、同じ変異または複数の変異)。いくつかの実施形態では、1つの受容体に対し結合および/または活性を低減する変異(単数または複数)は、別の受容体に対し実質的に低減または除去する変異(単数または複数)とは異なる。いくつかの実施形態では、1つの受容体に対し結合および/または活性を低減する変異(単数または複数)は、別の受容体に対し実質的に低減または除去する変異(単数または複数)と同じである。いくつかの実施形態では、本キメラタンパク質は、治療受容体に対し結合および/または活性を弱めしたがってより制御されたオンターゲット治療効果(例えば、野生型シグナル伝達物質に比較して)を可能にする変異および、別の受容体に対する結合および/または活性を実質的に低減または除去ししたがって副作用を低減する(例えば、野生型シグナル伝達物質に比べて)変異の両方を有する改変シグナル伝達物質を有する。
【0081】
いくつかの実施形態では、結合または活性の実質的な低減または除去は、標的化部分(PD-1またはPD-L1に対する標的化部分または本明細書に記載の任意のその他の標的化部分)を用いて実質的に回復可能ではない。いくつかの実施形態では、結合または活性の実質的な低減または除去は、標的化部分を用いて回復可能である。種々の実施形態では、第2の受容体に対する結合または活性の実質的な低減または除去は、他の受容体により媒介される有害作用も防止し得る。あるいは、または加えて、他の受容体に対する結合または活性の実質的な低減または除去は、治療作用部位から離れて治療キメラタンパク質を隔離するのを低減するかあるいは無くするので、治療効果を改善させる。例えば、いくつかの実施形態では、これは、他の受容体での損失を補償するための高用量の本発明のキメラタンパク質の必要性を無くする。このような投与量を低減する能力は、さらに副作用の可能性を低くする。
【0082】
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1つまたは複数のその受容体に対し、シグナル伝達物質に、親和性、例えば、結合(例えば、KD)および/または活性化(例えば、改変シグナル伝達物質がその受容体のアゴニストである場合、例えば、KAおよび/またはEC50として測定可能である)および/または阻害(例えば、改変シグナル伝達物質がその受容体のアンタゴニストである場合、例えば、KIおよび/またはIC50として測定可能である)を低減、実質的に低減、または除去する1つまたは複数の変異を含む。種々の実施形態では、免疫調節薬の受容体に対する低減された親和性は、活性の減弱化(アゴニズムまたはアンタゴニズムを含む)を可能にする。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、野生型シグナル伝達物質に比較して、受容体に対する約1%、または約3%、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、または約10%~20%、約20%~40%、約50%、約40%~60%、約60%~80%、約80%~100%の親和性を有する。いくつかの実施形態では、結合親和性は、野生型シグナル伝達物質に比べて、少なくとも約2倍低い、約3倍低い、約4倍低い、約5倍低い、約6倍低い、約7倍低い、約8倍低い、約9倍低い、少なくとも約10倍低い、少なくとも約15倍低い、少なくとも約20倍低い、少なくとも約25倍低い、少なくとも約30倍低い、少なくとも約35倍低い、少なくとも約40倍低い、少なくとも約45倍低い、少なくとも約50倍低い、少なくとも約100倍低い、少なくとも約150倍低い、または約10~50倍低い、約50~100倍低い、約100~150倍低い、約150~200倍低い、または200倍超低い。
【0083】
改変シグナル伝達物質が1つの受容体に対し結合を低減しかつ第2の受容体に対し結合を実質的に低減または除去する変異を有するいくつかの実施形態では、1つの受容体に対する改変シグナル伝達物質の結合親和性の減弱または低減は、他の受容体に対する親和性の実質的な低減または除去より小さい。いくつかの実施形態では、1つの受容体に対する改変シグナル伝達物質の結合親和性の減弱または低減は、他の受容体に対する親和性の実質的低減または除去よりも、約1%、または約3%、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、または約95%だけ小さい。種々の実施形態では、実質的な低減または除去は、減弱または低減よりも大きい結合親和性および/または活性の低減を指す。
【0084】
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、例えば、野生型シグナル伝達物質に比べて、シグナル伝達物質の内在性活性を、約75%、または約70%、または約60%、または約50%、または約40%、または約30%、または約25%、または約20%、または約10%、または約5%、または約3%、または約1%に低減する1つまたは複数の変異を含む。
【0085】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、シグナル伝達物質が、その受容体に対する標的化部分の結合親和性より低い、その受容体に対する低減された親和性を有するようにさせる1つまたは複数の変異を含む。いくつかの実施形態では、この結合親和性の差異は、同じ細胞上のシグナル伝達物質/受容体と標的化部分/受容体との間に存在する。いくつかの実施形態では、この結合親和性の差異は、シグナル伝達物質、例えば、変異シグナル伝達物質が、局在化されたオンターゲット効果を有し、かつ野生型シグナル伝達物質で観察される副作用の根底にあるオフターゲット効果を最小化するのを可能にする。いくつかの実施形態では、この結合親和性は、少なくとも約2倍、または少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍、または少なくとも約15倍低い、または少なくとも約25倍、または少なくとも約50倍低い、または少なくとも約100倍、または少なくとも約150倍低い。
【0086】
受容体結合活性は、当該技術分野において既知の方法を使用して測定され得る。例えば、親和性および/または結合活性は、スキャッチャードプロット分析および結合データのコンピューターフィッティング(例えば、Scatchard,1949)またはBrechtら(1993)により記載のように、フロースルー条件下で反射型干渉分光法により評価し得る。これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【0087】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は、免疫調節薬、例えば、インターロイキン、インターフェロン、および腫瘍壊死因子のうちの1つまたは複数である。
【0088】
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、インターロイキンまたは改変インターロイキンであり、例えば、IL1、IL2、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL8、IL9、IL10、IL11、IL12、IL13、IL14、IL15、IL16、IL17、IL18、IL19、IL20、IL21、IL22、IL23、IL24、IL25、IL26、IL27、IL28、IL29、IL30、IL31、IL32、IL33、IL35、IL36またはそのフラグメント、バリアント、類似体、またはファミリーメンバーを含む。インターロイキンは、リンパ球、単球、およびマクロファージにより合成される多機能サイトカイン群である。既知の機能は、免疫細胞(例えば、ヘルパーT細胞、B細胞、好酸球、およびリンパ球)の増殖の刺激、好中球およびTリンパ球の遊走作用、および/またはインターフェロンの阻害を含む。インターロイキン活性は、当該技術分野において既知のアッセイを使用して測定できる(Matthews et al.,in Lymphokines and Interferons:A Practical Approach,Clemens et al.,eds,IRL Press,Washington,D.C.1987,pp.221-225;and Orencole & Dinarello(1989)Cytokine 1,14-20)。
【0089】
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、インターフェロンまたはインターフェロンI、II、およびIII型などの改変型のインターフェロンである。インターフェロンの例としては、例えば、インターフェロンα-1、2、4、5、6、7、8、10、13、14、16、17、および21、インターフェロンβおよびインターフェロンγ、インターフェロンκ、インターフェロンε、インターフェロンτ、およびインターフェロンωが挙げられる。
【0090】
いくつかの実施形態では、シグナル伝達物質は、腫瘍壊死因子(TNF)または腫瘍壊死因子(TNF)の改変型またはTNFファミリーのタンパク質であり、限定されないが、TNFα、TNFβ、LTβ、CD40L、CD27L、CD30L、FASL、4-1BBL、OX40L、およびTRAILを含む。
【0091】
本明細書に記載の野生型シグナル伝達物質のアミノ酸配列は、当該技術分野において、周知である。したがって、種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、本明細書に記載のシグナル伝達物質の既知の野生型アミノ酸配列との少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
【0092】
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、本明細書に記載のシグナル伝達物質のうちのいずれかのアミノ酸配列との少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
【0093】
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1つまたは複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および短縮化から独立に選択され得る。いくつかの実施形態では、アミノ酸変異はアミノ酸置換であり、本明細書の他の場所で記載のように、保存的置換および/または非保存的置換を含み得る。種々の実施形態では、本明細書の他の場所で記載のように、置換は非古典的アミノ酸も含んでよい。
【0094】
本明細書に記載のように、改変シグナル伝達物質は、1つまたは複数の受容体に対し親和性および/または活性に影響を与える変異を有する。種々の実施形態では、治療受容体、例えば、それにより目的の治療効果が媒介される(例えば、アゴニズムまたはアンタゴニズム)受容体に対する低減された親和性および/または活性が存在する。種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、受容体、例えば、それにより目的の治療効果が媒介されない(例えば、結合の混乱状態の結果として)受容体に対する親和性および/または活性が実質的に低減または除去される変異を有する。改変シグナル伝達物質の受容体、例えば、本明細書に記載のサイトカイン、成長因子、およびホルモンのうちの1つの受容体は当技術分野において既知である。
【0095】
受容体に対し低減された親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)をもたらす変異の例は、国際公開第2013/107791号および国際出願第PCT/EP2017/061544号(例えば、インターフェロンに関して)、国際公開第2015/007542号(例えば、インターロイキンに関して)、および国際公開第2015/007903号(例えば、TNFに関して)で見出され、これらのそれぞれの全内容は参照により本明細書に組み込まれる。治療受容体に対する親和性および/または活性(例えば、アンタゴニスト活性)を低減する変異の例は、国際公開第2015/007520号で見出され、この全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0096】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、シグナル伝達物質のI型サイトカイン受容体、II型サイトカイン受容体、ケモカイン受容体、腫瘍壊死因子受容体(TNFR)スーパーファミリーの受容体、TGFベータ受容体、免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーの受容体、および/またはチロシンキナーゼスーパーファミリーの受容体に対する親和性および/または活性を低減させる1つまたは複数の変異を含む。
【0097】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、I型サイトカイン受容体である。I型サイトカイン受容体は当技術分野において既知であり、限定されないが、IL2(ベータサブユニット)、IL3、IL4、IL5、IL6、IL7、IL9、IL11、IL12、GM-CSF、G-CSF、LIF、CNTFに対する受容体、および同様に、トロンボポエチン(TPO)、プロラクチン、および成長ホルモンに対する受容体が挙げられる。例示I型サイトカイン受容体としては、限定されないが、GM-CSF受容体、G-CSF受容体、LIF受容体、CNTF受容体、TPO受容体、およびI型IL受容体が挙げられる。
【0098】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、II型サイトカイン受容体である。II型サイトカイン受容体は、異種のサブユニットからなる多量体受容体であり、主にインターフェロンに対する受容体である。この受容体ファミリーは、限定されないが、インターフェロンα、インターフェロンβおよびインターフェロンγ、IL10、IL22、および組織因子に対する受容体を含む。例示II型サイトカイン受容体としては、限定されないが、IFNα受容体(例えば、IFNAR1およびIFNAR2)、IFNβ受容体、IFNγ受容体(例えば、IFNGR1およびIFNGR2)、およびII型IL受容体が挙げられる。
【0099】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、Gタンパク質共役受容体である。ケモカイン受容体は、7回膜貫通型構造を有し、シグナル伝達のためにGタンパク質に結合されるGタンパク質共役受容体である。ケモカイン受容体としては、限定されないが、CCケモカイン受容体、CXCケモカイン受容体、CX3Cケモカイン受容体、およびXCケモカイン受容体(XCR1)が挙げられる。代表的ケモカイン受容体には、限定されないが、CCR1、CCR2、CCR3、CCR4、CCR5、CCR6、CCR7、CCR8、CCR9、CCR10、CXCR1、CXCR2、CXCR3、CXCR3B、CXCR4、CXCR5、CSCR6、CXCR7、XCR1、およびCX3CR1が挙げられる。
【0100】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、TNFRファミリーメンバーである。腫瘍壊死因子受容体(TNFR)ファミリーメンバーは、細長い分子を作成するCXXCXXCのコアモチーフを取り囲む3つのジスルフィド結合から形成されるシステインリッチドメイン(CRD)を共有する。代表的腫瘍壊死因子受容体ファミリーとしては、下記が挙げられる:CD120a(TNFRSF1A)、CD120b(TNFRSF1B)、リンホトキシンベータ受容体(LTBR、TNFRSF3)、CD134(TNFRSF4)、CD40(CD40、TNFRSF5)、FAS(FAS、TNFRSF6)、TNFRSF6B(TNFRSF6B)、CD27(CD27、TNFRSF7)、CD30(TNFRSF8)、CD137(TNFRSF9)、TNFRSF10A(TNFRSF10A)、TNFRSF10B(TNFRSF10B)、TNFRSF10C(TNFRSF10C)、TNFRSF10D(TNFRSF10D)、RANK(TNFRSF11A)、破骨細胞分化抑制因子(TNFRSF11B)、TNFRSF12A(TNFRSF12A)、TNFRSF13B(TNFRSF13B)、TNFRSF13C(TNFRSF13C)、TNFRSF14(TNFRSF14)、神経成長因子受容体(NGFR、TNFRSF16)、TNFRSF17(TNFRSF17)、TNFRSF18(TNFRSF18)、TNFRSF19(TNFRSF19)、TNFRSF21(TNFRSF21)、およびTNFRSF25(TNFRSF25)。ある実施形態では、TNFRファミリーメンバーは、CD120a(TNFRSF1A)またはTNF-R1である。別の実施形態では、TNFRファミリーメンバーは、CD120b(TNFRSF1B)またはTNF-R2である。
【0101】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、TGFベータ受容体である。TGFベータ受容体は、1回膜貫通型セリン/トレオニンキナーゼ受容体である。TGFベータ受容体としては、限定されないが、TGFBR1、TGFBR2、およびTGFBR3が挙げられる。
【0102】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、Igスーパーファミリー受容体である。免疫グロブリン(Ig)スーパーファミリーの受容体は、免疫グロブリンとの構造的相同性を共有する。Igスーパーファミリーの受容体としては、限定されないが、インターロイキン-1受容体、CSF-1R、PDGFR(例えば、PDGFRAおよびPDGFRB)、およびSCFRが挙げられる。
【0103】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質に対する受容体は、チロシンキナーゼスーパーファミリー受容体である。チロシンキナーゼチロシンキナーゼスーパーファミリーの受容体は、当該技術分野において周知である。20のサブファミリーに分類される約58個の受容体チロシンキナーゼ(RTK)が存在する。チロシンキナーゼスーパーファミリーの受容体としては、限定されないが、FGF受容体およびそれらの種々のアイソフォーム、例えば、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、およびFGFR5が挙げられる。
【0104】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターフェロンαである。このような実施形態では、改変IFNα物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変IFNα物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対し、実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0105】
変異型のインターフェロンαは、当業者に既知である。ある例示的実施形態では、改変シグナル伝達物質は、配列番号317のアミノ酸配列を有するアレル型IFNα2aである。
【0106】
ある例示的実施形態では、改変シグナル伝達物質は、配列番号318(アミノ酸位置23でIFNα2aと異なる)のアミノ酸配列を有するアレル型のIFNα2bである。
【0107】
いくつかの実施形態では、上記IFNα2変異体(IFNα2aまたはIFNα2b)は、位置144~154、例えば、アミノ酸位置148、149および/または153に、1つまたは複数のアミノ酸の変異が導入されている。いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、L153A、R149A、およびM148Aから選択される1つまたは複数の変異を含む。このような変異体は、例えば、国際公開第2013/107791号およびPiehlerら、(2000)J.Biol.Chem,275:40425-33に記載されている。これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【0108】
いくつかの実施形態では、IFNα2変異体は、IFNAR1に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、国際公開第2010/030671号に記載のように、IFNα2変異体は、F64A、N65A、T69A、L80A、Y85A、およびY89Aから選択される1つまたは複数の変異を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0109】
いくつかの実施形態では、国際公開第2008/124086号に記載のように、IFNα2変異体は、K133A、R144A、R149A、およびL153Aから選択される1つまたは複数の変異を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0110】
いくつかの実施形態では、国際公開第2015/007520号および国際公開第2010/030671号に記載のように、IFNα2変異体は、R120EおよびR120E/K121Eから選択される1つまたは複数の変異を含む。これらの特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、上記IFNα2変異体は、野生型IFNα2活性をアンタゴナイズする。このような実施形態では、上記変異体IFNα2は、IFNAR1に対する低減された親和性および/または活性を有するが、IFNAR2に対する活性は保持される。
【0111】
いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、(1)R120EおよびR120E/K121Eから選択される1つまたは複数の変異(理論に束縛されることを望むものではないが、これらはアンタゴニスト効果を作り出す)、および(2)K133A、R144A、R149A、およびL153Aから選択される1つまたは複数の変異(理論に束縛されることを望むものではないが、これらは、例えば、IFNAR2に対する減弱化効果を可能とする)を含む。ある実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、R120EおよびL153Aを含む。
【0112】
いくつかの実施形態では、ヒトIFNα2変異体は、国際公開第2013/059885号に開示のように、L15A、A19W、R22A、R23A、L26A、F27A、L30A、L30V、K31A、D32A、R33K、R33A、R33Q、H34A、D35A、Q40A、D114R、L117A、R120A、R125A、K134A、R144A、A145G、A145M、M148A、R149A、S152A、L153A、およびN156Aから選択される1つまたは複数の変異を含み、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、国際公開第2013/059885号で開示のように、ヒトIFNα2変異体は、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはL30Aを含む。いくつかの実施形態では、国際公開第2013/059885号で開示のように、ヒトIFNα2変異体は、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはR33Aを含む。いくつかの実施形態では、国際公開第2013/059885号で開示のように、ヒトIFNα2変異体は、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはM148Aを含む。いくつかの実施形態では、国際公開第2013/059885号で開示のように、ヒトIFNα2変異体は、変異H57Y、E58N、Q61S、および/またはL153Aを含む。いくつかの実施形態では、国際公開第2013/059885号で開示のように、ヒトIFNα2変異体は、変異N65A、L80A、Y85A、および/またはY89Aを含む。いくつかの実施形態では、国際公開第2013/059885号で開示のように、ヒトIFNα2変異体は、変異N65A、L80A、Y85A、Y89Aおよび/またはD114Aを含む。
【0113】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターフェロンβである。このような実施形態では、改変インターフェロンβ物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変IFNβ物質は、IFNα/β受容体(IFNAR)、すなわち、IFNAR1および/またはIFNAR2鎖に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0114】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIFNβである。種々の実施形態では、IFNβは、官能性誘導体、類似体、前駆物質、アイソフォーム、スプライスバリアント、またはIFNβのフラグメントを包含する。種々の実施形態では、IFNβは、任意の種由来のIFNβを包含する。ある実施形態では、キメラタンパク質は、改変型のマウスIFNβを含む。ある実施形態では、キメラタンパク質は、改変型のヒトIFNβを含む。ヒトIFNβは、166個のアミノ酸残基を含む約22kDaの分子量を有するポリペプチドである。ヒトIFNβのアミノ酸配列は、配列番号319である。
【0115】
いくつかの実施形態では、ヒトIFNβは、ヒトIFNβのグリコシル化型であるIFNβ1aである。いくつかの実施形態では、IFNβは、Met-1欠失およびCys-17のSerへの変異を有する非グリコシル化型のヒトIFNβであるIFNβ1bである。
【0116】
種々の実施形態では、改変IFNβは、IFNARのIFNAR1サブユニットに対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異を有する。一実施形態では、改変IFNβは、IFNAR1に対する低減された親和性および/または活性を有する。種々の実施形態では、改変IFNβは、ヒトIFNβであり、位置F67、R71、L88、Y92、I95、N96、K123、およびR124に1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、1つまたは複数の変異は、F67G、F67S、R71A、L88G、L88S、Y92G、Y92S、I95A、N96G、K123G、およびR124Gから選択される置換である。ある実施形態では、改変IFNβは、F67G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、K123G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、F67GおよびR71A変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、L88GおよびY92G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、Y92G、I95A、およびN96G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、K123GおよびR124G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、F67G、L88G、およびY92G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、F67S、L88S、およびY92S変異を含む。
【0117】
いくつかの実施形態では、改変IFNβは、IFNARのIFNAR2サブユニットに対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異を有する。一実施形態では、改変IFNβは、IFNAR2に対する低減された親和性および/または活性を有する。種々の実施形態では、改変IFNβは、ヒトIFNβであり、位置W22、R27、L32、R35、V148、L151、R152、およびY155に1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、1つまたは複数の変異は、W22G、R27G、L32A、L32G、R35A、R35G、V148G、L151G、R152A、R152G、およびY155Gから選択される置換である。ある実施形態では、改変IFNβは、W22G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、L32A変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、L32G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、R35A変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、R35G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、V148G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、R152A変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、R152G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、Y155G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、W22GおよびR27G変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、L32AおよびR35A変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、L151GおよびR152A変異を含む。ある実施形態では、改変IFNβは、V148GおよびR152A変異を含む。
【0118】
いくつかの実施形態では、改変IFNβは、1つまたは複数の次の変異を有する:R35A、R35T、E42K、M62I、G78S、A141Y、A142T、E149K、およびR152H。いくつかの実施形態では、改変IFNβは、1つまたは複数の次の変異を有する:C17SまたはC17Aと組み合わせた、R35A、R35T、E42K、M62I、G78S、A141Y、A142T、E149K、およびR152H。
【0119】
いくつかの実施形態では、改変IFNβは、1つまたは複数の次の変異を有する:本明細書で記載の他のIFNβ変異と組み合わせた、R35A、R35T、E42K、M62I、G78S、A141Y、A142T、E149K、およびR152H。
【0120】
ヒトIFNβの結晶構造は既知であり、Karpusas et al.,(1998)PNAS,94(22):11813-11818に記載されている。特に、ヒトIFNβの構造は、5つのαヘリックス(すなわち、A、B、C、D、およびE)およびこれらのヘリックスを連結する4つのループ領域(すなわち、AB、BC、CD、およびDEループ)を含むことが示された。種々の実施形態では、改変IFNβは、A、B、C、D、Eヘリックスおよび/またはAB、BC、CD、およびDEループ中に、IFNARなどの治療受容体に対するその結合親和性または活性を低減させる1つまたは複数の変異を有する。代表的変異は、国際公開第2000/023114号および米国特許出願公開第20150011732号に記載されている。これらの全内容は参照により本明細書に組み込まれる。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置15、16、18、19、22、および/または23にアラニン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置28~30、32、および33にアラニン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置36、37、39、および42にアラニン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置64および67にアラニン置換を含み、位置68にセリン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置71~73にアラニン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置92、96、99、および100にアラニン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置128、130、131、および134にアラニン置換を含むヒトIFNβである。代表的実施形態では、改変IFNβは、アミノ酸位置149、153、156、および159にアラニン置換を含むヒトIFNβである。いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびW22での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0121】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびR27での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0122】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびW22での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにR27での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0123】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびL32での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0124】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびR35での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0125】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびL32での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにR35での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0126】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびF67での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0127】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびR71での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0128】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびF67での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにR71での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0129】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびL88での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0130】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびY92での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0131】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびF67での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、およびL88での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、およびY92での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0132】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびL88での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにY92での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0133】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびI95での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにY92での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0134】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびN96での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにY92での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0135】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびY92での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、およびI95での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、およびN96での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0136】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびK123での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0137】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびR124での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0138】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号188およびK123での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにR124での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0139】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびL151での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0140】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびR152での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0141】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびL151での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにR152での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0142】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびV148での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、およびメチオニン(M)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0143】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびV148での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基であり、さらにR152での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0144】
いくつかの実施形態では、変異体IFNβは、配列番号319およびY155での変異を含み、変異は、グリシン(G)、アラニン(A)、ロイシン(L)、イソロイシン(I)、メチオニン(M)、およびバリン(V)から選択される脂肪族疎水性残基である。
【0145】
いくつかの実施形態では、本発明は、(1)配列番号319のアミノ酸配列および位置W22に変異を有し、変異は脂肪族疎水性残基である改変IFNβ;および(b)1つまたは複数の標的化部分を含むキメラタンパク質に関し、上記標的化部分は、目的の抗原または受容体(例えば、PD-1またはPD-L1)に特異的に結合する認識ドメインを含み、改変IFNβおよび標的化部分は、任意に1つまたは複数のリンカーにより連結されていてもよい。種々の実施形態では、位置W22の変異は、G、A、L、I、M、およびVから選択される脂肪族疎水性残基である。種々の実施形態では、位置W22の変異はGである。
【0146】
追加の代表的IFNβ変異体は、国際出願第PCT/EP2017/061544号で提供される。この全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0147】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターフェロンγである。このような実施形態では、改変インターフェロンγ物質は、インターフェロンガンマ受容体(IFNGR)、すなわち、IFNGR1および/またはIFNGR2鎖に対し、低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変インターフェロンγ物質は、インターフェロンガンマ受容体(IFNGR)、すなわち、IFNGR1および/またはIFNGR2鎖に対し、実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0148】
IFNγは、II型クラスのインターフェロンの唯一のメンバーである。IFNγは、主にナチュラルキラー(NK)細胞およびナチュラルキラーT(NKT)細胞により自然免疫応答の一部として産生される。IFNγは、CD4 Th1およびCD8細胞傷害性Tリンパ球(CTL)エフェクターT細胞、マクロファージ、樹状細胞、およびB細胞によっても産生される。活性化されたIFNγは、二量体を形成し、IFNγ受容体1およびIFNγ受容体2サブユニットからなるヘテロダイマー受容体(すなわち、IFNγまたはIFNγR)を介して作用する。IFNγ受容体1は、主要なリガンド結合サブユニットであり、一方、IFNγ受容体2は、シグナル伝達に必要であり、また、IFNγ受容体1のそのリガンドに対する親和性を高める。IFNγ二量体の受容体に対する結合は、JAK-STATシグナル伝達経路活性化し、種々の生物学的作用を誘発する。
【0149】
種々の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、改変型のIFNγをシグナル伝達物質として含む。種々の実施形態では、IFNγは、官能性誘導体、類似体、前駆物質、アイソフォーム、スプライスバリアント、またはIFNγのフラグメントを包含する。種々の実施形態では、IFNγは、任意の種由来のIFNγを包含する。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、改変型のマウスIFNγを含む。別の実施形態では、改変シグナル伝達物質は、改変型のヒトIFNγを含む。
【0150】
ヒトIFNγは、166個のアミノ酸残基を含むポリペプチドである。ある実施形態では、ヒトIFNγは、配列番号320のアミノ酸配列を有する。
【0151】
本明細書で使用される場合、ヒトIFNγはまた、N末端シグナルペプチドのない成熟ヒトIFNγを指す。この実施形態では、成熟ヒトIFNγは、143個のアミノ酸を含み、配列番号321のアミノ酸配列を有する。
【0152】
いくつかの実施形態では、ヒトIFNγは、グリコシル化型のヒトIFNγである。いくつかの実施形態では、ヒトIFNγは、非グリコシル化型のヒトIFNγである。
【0153】
IFNγの配列は、当技術分野において既知である種々の実施形態では、改変IFNγは、IFNγの既知の野生型アミノ酸配列と少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
【0154】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、配列番号320のアミノ酸配列を有するヒトIFNγと少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
【0155】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、配列番号321のアミノ酸配列を有するヒトIFNγと少なくとも約60%、または少なくとも約61%、または少なくとも約62%、または少なくとも約63%、または少なくとも約64%、または少なくとも約65%、または少なくとも約66%、または少なくとも約67%、または少なくとも約68%、または少なくとも約69%、または少なくとも約70%、または少なくとも約71%、または少なくとも約72%、または少なくとも約73%、または少なくとも約74%、または少なくとも約75%、または少なくとも約76%、または少なくとも約77%、または少なくとも約78%、または少なくとも約79%、または少なくとも約80%、または少なくとも約81%、または少なくとも約82%、または少なくとも約83%、または少なくとも約84%、または少なくとも約85%、または少なくとも約86%、または少なくとも約87%、または少なくとも約88%、または少なくとも約89%、または少なくとも約90%、または少なくとも約91%、または少なくとも約92%、または少なくとも約93%、または少なくとも約94%、または少なくとも約95%、または少なくとも約96%、または少なくとも約97%、または少なくとも約98%、または少なくとも約99%の配列同一性(例えば、約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、または約99%の配列同一性)を有するアミノ酸配列を含む。
【0156】
種々の実施形態では、改変IFNγは、1つまたは複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および短縮化から独立に選択され得る。
【0157】
いくつかの実施形態では、アミノ酸変異は、アミノ酸置換であり、保存的および/または非保存的置換を含み得る。
【0158】
「保存的置換」は、例えば、関与するアミノ酸残基の極性、電荷、サイズ、溶解度、疎水性、親水性、および/または両親媒特性における類似性に基づいて行われ得る。20種類の天然アミノ酸は、次の6つの標準的アミノ酸グループに分類できる:(1)疎水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile;(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr;Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)塩基性:His、Lys、Arg;(5)鎖配向に影響を与える残基:Gly、Pro;および(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
【0159】
本明細書で使用される場合、「保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸グループの同じグループ内に記載の別のアミノ酸による交換として定義される。例えば、AspのGluによる交換は、そのように改変されたポリペプチド中で1つの負電荷を保持する。さらに、グリシンおよびプロリンは、それらのαヘリックスを破壊する能力に基づいて相互に置換され得る。
【0160】
本明細書で使用される場合、「非保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸グループ(1)~(6)の異なるグループに記載の別のアミノ酸による交換として定義される。
【0161】
種々の実施形態では、置換はまた、非古典的アミノ酸(例えば、セレノシステイン、ピロールリジン、N-ホルミルメチオニンβ-アラニン、GABAおよびδ-アミノレブリン酸、4-アミノ安息香酸(PABA)、共通アミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、Abu、2-アミノ酪酸、γ-Abu、ε-Ahx、6-アミノヘキサン酸、Aib、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、β-アラニン、フルオロアミノ酸、βメチルアミノ酸などのデザイナーアミノ酸、C α-メチルアミノ酸、N α-メチルアミノ酸、および一般的にアミノ酸類似体)も含む。
【0162】
種々の実施形態では、IFNγは、1つまたは複数の変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、変異は改変IFNγが、非変異型、例えば、野生型形態のIFNγに比べて、低減された結合親和性、低減された内在性活性、および低減された特定の生物活性のうちの1つまたは複数などの1つまたは複数の弱められた活性を有することを可能にする。例えば、非変異型、例えば、野生型のIFNγに比べて、低減された結合親和性、低減された内在性活性、および低減した特定の生物活性などの1つまたは複数の弱められた活性は、IFNγ受容体などの治療受容体に対するものであり得る。結果として、種々の実施形態では、変異は、改変可溶性物質が、非変異型、例えば、野生型IFNγに比べて、低減された全身毒性、低減された副作用、および低減されたオフターゲット効果を有することを可能にする。
【0163】
種々の実施形態では、IFNγは、IFNγ受容体1およびIFNγ受容体2サブユニットを含むIFNγ受容体などの治療受容体に対するその結合親和性および/または活性を低減する変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、野生型IFNγにより与えられる活性は、治療受容体に対するアゴニズム(例えば、治療の部位での細胞効果の活性化)である。例えば、野生型IFNγは、治療受容体を活性化し得る。このような実施形態では、変異は、治療受容体に対する活性化作用を低減するように改変されたIFNγをもたらす。
【0164】
いくつかの実施形態では、治療受容体(例えば、IFNγ受容体)に対する低減された親和性および/または活性は、標的化部分の結合により回復可能である。他の実施形態では、治療受容体に対する低減された親和性および/または活性は、標的化部分への結合により実質的に回復され得ない。種々の実施形態では、本発明の治療キメラタンパク質は、IFNγが治療受容体に対する結合親和性および/または活性を弱める変異を有するという理由で、オフターゲット効果を低減する。種々の実施形態では、これは、例えば、野生型IFNγで観察される副作用を低減する。種々の実施形態では、改変IFNγは、治療作用部位へ向かう途上では実質的に不活性であり、特異的に標的とされる細胞型に対してその効果を実質的に有し、これにより望ましくない副作用を大きく低減する。
【0165】
種々の実施形態では、改変IFNγは、IFNγに、1つまたは複数の治療受容体(例えば、IFNγ受容体)に対して、弱められたまたは低減された親和性および/または活性、例えば、結合(例えば、KD)および/または活性化(例えば、KAおよび/またはEC50として測定可能な)を持たせる1つまたは複数の変異を有する。種々の実施形態では、治療受容体に対する低減された親和性および/または活性は、治療受容体からの活性および/またはシグナル伝達の減弱化を可能にする。
【0166】
種々の実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1サブユニットに対するその結合または親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数の変異を有する。一実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1サブユニットに対する低減された親和性および/または活性を有する。種々の実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1サブユニットに対する結合に関与するアミノ酸残基で1つまたは複数の変異を有するヒトIFNγである。いくつかの実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1サブユニットとの境界に位置するアミノ酸で1つまたは複数の変異を有するヒトIFNγである。種々の実施形態では、1つまたは複数の変異は、限定されないが、Q1、V5、E9、K12、H19、S20、V22、A23、D24、N25、G26、T27、L30、K108、H111、E112、I114、Q115、A118、E119、およびK125から選択されるアミノ酸の位置に存在する(それぞれ、N末端シグナル配列を欠いている野生型ヒトIFNγである配列番号321を基準にして)。いくつかの実施形態では、1つまたは複数の変異は、V5E、S20E、V22A、A23G、A23F、D24G、G26Q、H111A、H111D、I114A、Q115A、およびA118Gから選択される置換である(それぞれ、配列番号321を基準にして)。いくつかの実施形態では、1つまたは複数の変異は、V22A、A23G、D24G、H111A、H111D、I114A、Q115A、およびA118Gから選択される置換である。
【0167】
ある実施形態では、改変IFNγは、変異A23GおよびD24Gを含む。別の実施形態では、改変IFNγは、変異I114AおよびA118Gを含む。さらなる実施形態では、改変IFNγは、変異V5E、S20E、A23F、およびG26Qを含む。
【0168】
種々の実施形態では、改変IFNγは、1つまたは複数の次記変異を有する:残基A23の欠失、残基D24の欠失、S20I置換、A23V弛緩、D21K置換およびD24A置換。
【0169】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体2サブユニットに対するその結合または親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数の変異を有する。
【0170】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1およびIFNγ受容体2サブユニットの両方に対するその結合または親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数の変異を有する。
【0171】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1に対するその結合または親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数の変異、およびIFNγ受容体2に対する結合またはその親和性および/または生物活性を実質的に低減または除去する1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、このような改変IFNγを有するキメラタンパク質は、標的選択的IFNγ受容体1活性を提供できる(例えば、IFNγ受容体1活性は、標的化部分を介する標的化により回復可能である)。
【0172】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、IFNγ受容体1に対するその結合または親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数の変異、およびIFNγ受容体1に対する結合またはその親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、このような改変IFNγを有するキメラタンパク質は、標的選択的IFNγ受容体1および/またはIFNγ受容体1活性を提供できる(例えば、IFNγ受容体1およびIFNγ受容体2活性は、標的化部分を介する標的化により回復可能である)。
【0173】
種々の実施形態では、改変IFNγは、C末端で短縮化されている。いくつかの実施形態では、改変IFNγは、C末端の欠失を有する配列番号321のアミノ酸配列を含む成熟IFNγである。このような実施形態では、成熟IFNγは、少なくとも約1個、約2個、約3個、約4個、約5個、約6個、約7個、約8個、約9個、約10個、約11個、約12個、約13個、約14個、約15個、約16個、約17個、約18個、約19個、約20個、約21個、約22個、約23個、約24個、または約25個のアミノ酸残基のC末端短縮化を含み得る。ある実施形態では、改変IFNγは、5個のアミノ酸のC末端の欠失を有する配列番号321のアミノ酸配列を含む成熟IFNγである。ある実施形態では、改変IFNγは、7個のアミノ酸のC末端の欠失を有する配列番号321のアミノ酸配列を含む成熟IFNγである。ある実施形態では、改変IFNγは、14個のアミノ酸のC末端の欠失を有する配列番号321のアミノ酸配列を含む成熟IFNγである。ある実施形態では、改変IFNγは、15個のアミノ酸のC末端の欠失を有する配列番号321のアミノ酸配列を含む成熟IFNγである。ある実施形態では、改変IFNγは、16個のアミノ酸のC末端の欠失を有する配列番号321のアミノ酸配列を含む成熟IFNγである。本発明で利用し得るC末端短縮化を有するさらなる改変IFNγは、Haelewyn et al.,Biochem.J.(1997),324:591-595およびLundell et al.,Protein Eng.(1991)4:335-341に記載されている。これらの全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0174】
種々の実施形態では、改変IFNγは、例えば、Randal et al.(2001)Structure 9:155-163およびRandal et al.(1998)Protein Sci.7:1057-1060に記載されているように、単鎖IFNγである。これらの全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、単鎖IFNγは、C末端で第2のIFNγ鎖のN-末端に連結された第1のIFNγ鎖を含む。種々の実施形態では、第1と第2のIFNγ鎖は、本明細書で他の場所で記載のように、リンカーにより連結される。
【0175】
いくつかの実施形態では、第1のIFNγ鎖は、少なくとも約1個、約2個、約3個、約4個、約5個、約6個、約7個、約8個、約9個、約10個、約11個、約12個、約13個、約14個、約15個、約16個、約17個、約18個、約19個、約20個、約21個、約22個、約23個、約24個、または約25個のアミノ酸残基のC末端短縮化を含む。ある実施形態では、第1のIFNγ鎖は、約24個のアミノ酸残基のC末端短縮化を含む。いくつかの実施形態では、第2のIFNγは、少なくとも約1個、約2個、約3個、約4個、または約5個のアミノ酸残基のN末端短縮化を含む。ある実施形態では、第2のIFNγ鎖は、約3個のアミノ酸残基のN末端短縮化を含む。いくつかの実施形態では、第2のIFNγ鎖は、少なくとも約1個、約2個、約3個、約4個、約5個、約6個、約7個、約8個、約9個、約10個、約11個、約12個、約13個、約14個、約15個、約16個、約17個、約18個、約19個、約20個、約21個、約22個、約23個、約24個、または約25個のアミノ酸残基のC末端短縮化を含む。種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、本明細書の別の場所で記載のように、Q1、V5、E9、K12、H19、S20、V22、A23、D24、N25、G26、T27、L30、K108、H111、E112、I114、Q115、A118、E119、およびK125の位置に1つまたは複数のアミノ酸変異を有する。種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、V5E、S20E、V22A、A23G、A23F、D24G、G26Q、H111A、H111D、I114A、Q115A、およびA118Gから選択される1つまたは複数の置換を含む。種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、V22A、A23G、D24G、H111A、H111D、I114A、Q115A、およびA118Gから選択される1つまたは複数の置換を含む。種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、A23GおよびD24G置換を含む。種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、I114AおよびA118G置換を含む。別の実施形態では、変異は、V5E、S20E、A23F、およびG26Qである。
【0176】
種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、本明細書で開示の1つまたは複数の置換を含み、さらに第1および/または第2のIFNγ鎖は、本明細書で開示のC末端短縮化を含む。
【0177】
種々の実施形態では、第1および/または第2のIFNγ鎖は、1つまたは複数の本明細書で開示の置換および本明細書で開示のC末端短縮化を含む。
【0178】
ヒトIFNγの結晶構造は既知であり、例えば、Ealick et al.,(1991)Science,252:698-702に記載されている。特に、ヒトIFNγの構造は、6個のαヘリックスのコアおよびC末端領域における延長されたアンフォールド配列を含むことが示された。種々の実施形態では、改変IFNγは、治療受容体(例えば、IFNγ受容体)に対するその結合親和性および/または生物活性を低減する1つまたは複数のヘリックス中の1つまたは複数の変異を有する。
【0179】
種々の実施形態では、改変IFNγは、野生型IFNγに比較して、約1%、または約3%、約5%、約10%、約15%、約20%、約25%、約30%、約35%、約40%、約45%、約50%、約60%、約65%、約70%、約75%、約80%、約85%、約90%、約95%、または約10%~20%、約20%~40%、約50%、約40%~60%、約60%~80%、約80%~100%の治療受容体(例えば、IFNγ受容体またはそのIFNγ受容体1およびIFNγ受容体2サブユニットのうちのいずれか1つ)に対する親和性および/または生物活性を有する。いくつかの実施形態では、結合親和性および/または生物活性は、野生型IFNγに比べて、少なくとも約2倍低い、約3倍低い、約4倍低い、約5倍低い、約6倍低い、約7倍低い、約8倍低い、約9倍低い、少なくとも約10倍低い、少なくとも約15倍低い、少なくとも約20倍低い、少なくとも約25倍低い、少なくとも約30倍低い、少なくとも約35倍低い、少なくとも約40倍低い、少なくとも約45倍低い、少なくとも約50倍低い、少なくとも約100倍低い、少なくとも約150倍低い、または約10~50倍低い、約50~100倍低い、約100~150倍低い、約150~200倍低い、または200倍超低い。
【0180】
種々の実施形態では、改変IFNγは、例えば、野生型IFNγに比べて、IFNγの内在性活性を、約75%、または約70%、または約60%、または約50%、または約40%、または約30%、または約25%、または約20%、または約10%、または約5%、または約3%、または約1%に低減する1つまたは複数の変異を含む。
【0181】
いくつかの実施形態では、改変IFNγは、IFNγに受容体に対する親和性および/または生物活性を低減させる1つまたは複数の変異を含む。いくつかの実施形態では、改変IFNγの受容体に対する結合親和性および/または生物活性は、標的化部分のその受容体に対する結合親和性および/または生物活性より低い。いくつかの実施形態では、この結合親和性および/または生物活性の差異は、同じ細胞上の改変IFNγ/受容体と標的化部分/受容体との間に存在する。いくつかの実施形態では、この結合親和性および/または生物活性の差異は、改変IFNγが、局在化されたオンターゲット効果を有し、さらに野生型IFNγで観察される副作用の根底にあるオフターゲット効果を最小化するのを可能にする。いくつかの実施形態では、この結合親和性および/または生物活性は、少なくとも約2倍、または少なくとも約5倍、または少なくとも約10倍、または少なくとも約15倍低い、または少なくとも約25倍、または少なくとも約50倍低い、または少なくとも約100倍、または少なくとも約150倍低い。
【0182】
受容体結合活性は、当該技術分野において既知の方法を使用して測定され得る。例えば、親和性および/または結合活性は、スキャッチャードプロット分析および結合データのコンピューターフィッティング(例えば、Scatchard,1949)またはBrechtら(1993)により記載のように、フロースルー条件下で反射型干渉分光法により評価し得る。これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【0183】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質はコンセンサスインターフェロンである。コンセンサスインターフェロンは、いくつかのヒト非アレルIFNαサブタイプの配列を走査し、それぞれ対応する位置で最も高頻度に観察されるアミノ酸を割り当てることにより、生成される。コンセンサスインターフェロンは、166個のアミノ酸のうちの20個でIFNα2bとは異なり(88%相同性)、IFNβとの比較は、30%を超えるアミノ酸位置で同一性を示す。種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、配列番号322のアミノ酸配列を含む。
【0184】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、配列番号323のアミノ酸配列を含み、これは、配列番号322のアミノ酸配列とは、1つのアミノ酸だけ異なり、すなわち、配列番号323は、配列番号322の最初のメチオニン残基を欠いている。
【0185】
種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、改変型のコンセンサスインターフェロン、すなわち、コンセンサスインターフェロンバリアントをシグナル伝達物質として含む。種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、機能性誘導体、類似体、前駆物質、アイソフォーム、スプライスバリアント、またはコンセンサスインターフェロンのフラグメントを包含する。
【0186】
ある実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、米国特許第4,695,623号、同第4,897,471号、同第5,541,293号、および同第8,496,921号で開示されるコンセンサスインターフェロンバリアントから選択される。これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例えば、コンセンサスインターフェロンバリアントは、米国特許第4,695,623号、同第4,897,471号、および同第5,541,293号で開示のような、IFN-CON2またはIFNCON3のアミノ酸配列を含み得る。ある実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFN-CON2のアミノ酸配列、配列番号324を含む。
【0187】
ある実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFN-CON3のアミノ酸配列、配列番号325を含む。
【0188】
ある実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、米国特許第8,496,921号で開示のバリアントのうちのいずれか1つのアミノ酸配列を含む。例えば、コンセンサスバリアントは、配列番号326のアミノ酸配列を含み得る。
【0189】
別の実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、配列番号327のアミノ酸配列を含み得る。
【0190】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、ペグ化され得、すなわち、PEG部分を含む。ある実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、配列番号327のS156Cの位置で結合されたPEG部分を含み得る。
【0191】
いくつかの実施形態では、遺伝子改変インターフェロンは、ヒトIFNα2aのバリアントであり、配列番号328の配列の位置41の近傍へのAspの挿入により配列番号329が得られ(これはIFNα2a配列に対する配列の再番号割当をもたらす)、次の変異Arg23Lys、Leu26Pro、Glu53Gln、Thr54Ala、Pro56Ser、Asp86Glu、Ile104Thr、Gly106Glu、Thr110Glu、Lys117Asn、Arg125Lys、およびLys136Thrを有する。コンセンサスインターフェロンについて記載する本明細書の全ての実施形態は、同様に、この遺伝子改変インターフェロンに該当する。
【0192】
種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、1つまたは複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および短縮化から独立に選択され得る。
【0193】
いくつかの実施形態では、アミノ酸変異は、アミノ酸置換であり、保存的および/または非保存的置換を含み得る。
【0194】
種々の実施形態では、置換はまた、非古典的アミノ酸(例えば、セレノシステイン、ピロールリジン、N-ホルミルメチオニンβ-アラニン、GABAおよびδ-アミノレブリン酸、4-アミノ安息香酸(PABA)、共通アミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、Abu、2-アミノ酪酸、γ-Abu、ε-Ahx、6-アミノヘキサン酸、Aib、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、β-アラニン、フルオロアミノ酸、βメチルアミノ酸などのデザイナーアミノ酸、C α-メチルアミノ酸、N α-メチルアミノ酸、および一般的にアミノ酸類似体)も含む。
【0195】
種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、1つまたは複数の変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、変異はコンセンサスインターフェロンバリアントが、非変異型、例えば、野生型のコンセンサスインターフェロン(例えば、配列番号325または326のアミノ酸配列を有するコンセンサスインターフェロン)に比べて、低減された結合親和性、低減された内在性活性、および低減された特定の生物活性のうちの1つまたは複数などの1つまたは複数の弱められた活性を有することを可能にする。例えば、非変異型、例えば、野生型のコンセンサスインターフェロンに比べて、低減された結合親和性、低減された内在性活性、および低減した特定の生物活性などの1つまたは複数の弱められた活性は、IFNARなどの治療受容体に対するものであり得る。結果として、種々の実施形態では、変異は、コンセンサスインターフェロンバリアントが、非変異型、例えば、野生型のコンセンサスインターフェロンに比べて、低減された全身毒性、低減された副作用、および低減されたオフターゲット効果を有することを可能にする。
【0196】
種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、IFNARなどの治療受容体に対するその結合親和性または活性を低減する変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンにより与えられる活性は、治療受容体に対するアゴニズム(例えば、治療の部位での細胞効果の活性化)である。例えば、コンセンサスインターフェロンは、治療受容体を活性化し得る。このような実施形態では、変異は、治療受容体に対し低減された活性化作用を有するコンセンサスインターフェロンバリアントをもたらす。
【0197】
いくつかの実施形態では、治療受容体に対する低減された親和性または活性は、標的化部分の結合により回復可能である。他の実施形態では、治療受容体に対する低減された親和性または活性は、標的化部分への結合により実質的に回復され得ない。種々の実施形態では、本発明の治療Fcベースキメラタンパク質は、コンセンサスインターフェロンバリアントが、治療受容体に対する結合親和性または活性を弱める変異を有するという理由で、オフターゲット効果を低減させる。種々の実施形態では、これは、例えば、野生型コンセンサスインターフェロンで観察される副作用を低減する。種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、治療作用部位へ向かう途上では実質的に不活性であり、特異的に標的とされる細胞型に対してその効果を実質的に有し、これにより望ましくない副作用を大きく低減する。
【0198】
種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、コンセンサスインターフェロンバリアントが、1つまたは複数の治療受容体に対する弱められたまたは低減された親和性、例えば、結合(例えば、KD)および/または活性化(例えば、KAおよび/またはEC50として測定可能な)を有するようにさせる1つまたは複数の変異を有する。種々の実施形態では、治療受容体に対する低減された親和性は、治療受容体からの活性および/またはシグナル伝達の減弱化を可能にする。
【0199】
種々の実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNARのIFNAR1サブユニットに対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異を有する。一実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNAR1に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNARのIFNAR2サブユニットに対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNAR1およびIFNAR2サブユニットに対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異を有する。
【0200】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNAR1に対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異、およびIFNAR2に対する結合またはその親和性を実質的に低減または除去する1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、このようなコンセンサスインターフェロンバリアントを有するFcベースキメラタンパク質は、標的選択的IFNAR1活性を提供できる(例えば、IFNAR1活性は、標的化部分、例えば、SIRPαを介する標的化により回復可能である)。
【0201】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNAR2に対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異、およびIFNAR1に対する結合またはその親和性を実質的に低減または除去する1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、このようなコンセンサスインターフェロンバリアントを有するFcベースキメラタンパク質は、標的選択的IFNAR2活性を提供できる(例えば、IFNAR2活性は、標的化部分、例えば、SIRPαを介する標的化により回復可能である)。
【0202】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンバリアントは、IFNAR1に対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異、およびIFNAR2に対するその結合または親和性を低減する1つまたは複数の変異を有する。いくつかの実施形態では、このようなコンセンサスインターフェロンバリアントを有するFcベースキメラタンパク質は、標的選択的IFNAR1および/またはIFNAR2活性を提供できる(例えば、IFNAR1およびIFNAR2活性は、標的化部分、例えば、SIRPαを介する標的化により回復可能である)。
【0203】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、配列番号326を基準にして、位置145~155、例えば、アミノ酸位置149、150および/または154に、1つまたは複数のアミノ酸の変異を有するように改変されている。いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、配列番号326を基準にして、位置145~155、例えば、アミノ酸位置149、150および/または154に、1つまたは複数のアミノ酸の変異を有するように改変され、場合により、置換は疎水性であり、アラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシンから選択される。いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロン変異体は、配列番号323を基準にして、M149A、R150A、およびL154Aから選択される1つまたは複数の変異を含む。
【0204】
いくつかの実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、配列番号323を基準にして、アミノ酸位置121(すなわち、K121)に変異を有するように改変されている。ある実施形態では、コンセンサスインターフェロンは、配列番号323を基準にして、K121E変異を含む。
【0205】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、血管内皮細胞増殖因子(VEGF)である。VEGFは、生理学的であるが病的でもある血管新生において重要な役割を果たし、血管透過性を調節し、VEGF受容体を発現する細胞に対して成長因子として作用できる、強力な成長因子である。さらなる機能は、特に、マクロファージ系統および内皮細胞の細胞遊走の刺激を含む。少なくとも3個の受容体(VEGFR1、VEGFR2およびVEGFR3)に加えて、VEGF成長因子ファミリーのいくつかのメンバーが存在する。VEGFファミリーのメンバーは、2種以上のVEGFRタイプを結合し活性化できる。例えば、VEGF-Aは、VEGFR1およびVEGFR2を結合し、一方、VEGF-Cは、VEGFR2およびVEGFR3を結合できる。VEGFR1およびVEGFR2活性化は、血管新生を調節し、VEGFR3活性化は、リンパ脈管新生に関与する。大部分の血管新生促進シグナルは、VEGFR2の活性化から生成される。VEGFR1活性化は、血管新生の負の役割と関連する可能性があることが報告された。VEGFR1シグナル伝達は、腫瘍の骨髄由来VEGFR1陽性細胞を介したインビボ進行にも重要である(骨中の転移前微小環境の形成の一因となる)ことも報告された。治療抗体を指向する/治療抗体を中和するVEGF-Aをベースにしたいくつかの治療法が、主に、血管新生に依存する種々のヒト腫瘍の治療での使用のために開発されてきた。しかし、これらは、副作用がないわけではない。これは、これらが一般的な非細胞/組織特異的VEGF/VEGFR相互作用阻害剤として作用することを考慮すると驚くべきことではない。従って、特定の標的細胞(例えば、腫瘍血管系内皮細胞)に対するVEGF(例えば、VEGF-A)/VEGFR2阻害を制限することが望ましいであろう。
【0206】
いくつかの実施形態では、VEGFは、VEGF-A、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D、またはVEGF-EおよびVEGF121、VEGF121b、VEGF145、VEGF165、VEGF165b、VEGF189、およびVEGF206などの種々のVEGF-Aのアイソフォームを含むこれらのアイソフォームである。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR-1(Flt-1)および/またはVEGFR-2(KDR/Flk-1)に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR-1(Flt-1)および/またはVEGFR-2(KDR/Flk-1)に対する低減または除去された親和性および/または活性を有する。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR-2(KDR/Flk-1)に対する低減された親和性および/または活性を有し、および/またはVEGFR-1(Flt-1)に対する低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態は、例えば、創傷治癒方法または虚血関連疾患の治療で使用される(理論に束縛されることを意図するものではないが、内皮細胞機能および血管新生に対するVEGFR2の効果により媒介されて)。種々の実施形態では、癌および炎症促進性活性と関連するVEGFR-1(Flt-1)への結合が回避される。種々の実施形態では、VEGFR-1(Flt-1)は、デコイ受容体として機能し、そのため、この受容体に対する親和性を実質的に低減または除去し、治療薬の隔離を回避する。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR-1(Flt-1)に対する低減または除去された親和性および/または活性を有し、および/またはVEGFR-2(KDR/Flk-1)に対する低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR3に対する低減された親和性および/または活性を有する。あるいは、改変シグナル伝達物質は、VEGFR3に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0207】
血管新生促進治療法はまた、種々の疾患(例えば、虚血性心疾患、出血など)において重要であり、VEGFベース治療薬を含む。VEGFR2の活性化は血管新生促進性である(内皮細胞上で作用する)。VEGFR1は、炎症細胞(例えば、マクロファージを含む)の遊走の刺激を生じ、血管過多透過性に関連する炎症をもたらし得る。VEGFR1の活性化はまた、腫瘍微小環境形成に関連する骨髄を活性化できる。従って、VEGFR2活性化に対し選択性があるVEGFベース治療薬は、この場合には望ましいであろう。さらに、例えば、内皮細胞を特異的に標的とする細胞が望ましいであろう。
【0208】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR-2に対する低減された親和性および/または活性(例えば、拮抗的な)を有し、および/またはVEGFR-1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。腫瘍内皮細胞マーカー(例えば、PSMAなど)に結合する標的化部分を介して腫瘍血管系内皮細胞を標的にする場合、このような構築物は、このようなマーカー陽性細胞上で特異的にVEGFR2活性化を阻害するが、標的細胞へ向かう途上および標的細胞上では(活性が除去された場合)VEGFR1を活性化せず、従って、例えば、炎症反応の誘導を無くする。これは、VEGF-A中和療法に比べて、多くの腫瘍型に対するより選択的で安全な抗血管新生薬療法を提供することになろう。
【0209】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、VEGFR-2に対する低減された親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)を有し、および/またはVEGFR-1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。血管内皮細胞への標的化により、いくつかの実施形態では、このような構築物は、VEGFR1が関連する炎症反応誘導を生じることなく、血管新生を促進する。従って、このような構築物は、VEGFR2ならびにVEGFR1の全身性活性化に起因する副作用の実質的に低減されたリスクを有する、標的化血管新生促進効果を有するであろう。
【0210】
ある例示的実施形態では、改変シグナル伝達物質は、配列番号330のアミノ酸を有するVEGF165である。
【0211】
別の例示的実施形態では、改変シグナル伝達物質は、配列番号331のアミノ酸配列を有するVEGF165bである。
【0212】
これらの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、アミノ酸I83に変異を有する(例えば、I83での置換変異、例えば、I83K、I83R、またはI83H)。理論に束縛されることを意図するものではないが、このような変異は、低減された受容体結合親和性を生じ得ると考えられている。例えば、米国特許第9,078,860号を参照されたい。この全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0213】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTNFαである。TNFは、細胞増殖、分化、アポトーシス、腫瘍形成、ウイルス複製、自己免疫、免疫細胞機能および輸送、炎症、ならびに敗血性ショックの調節を含む、多くの多様な機能を有する多面的サイトカインである。それは、標的細胞:TNFR1(p55)およびTNFR2(p75)上の2つの別々の膜受容体に結合する。TNFR1は非常に広範な発現パターンを示すが、TNFR2はリンパ球、Treg、内皮細胞、特定のニューロン、ミクログリア、心筋細胞および間葉系幹細胞の特定の集団上で選択的に発現される。受容体活性化に応答して、全く別々の生物学的経路が活性化されるが、若干の重なり合いも存在する。一般原則として、理論に束縛されることを望むものではないが、TNFR1シグナル伝達はアポトーシス(細胞死)の誘導に関連し、TNFR2シグナル伝達は細胞生存シグナルの活性化に関連する(例えば、NFκB経路の活性化)。TNFの投与は、全身的毒性であり、これは主にTNFR1の関与のためである。しかし、TNFR2の活性化もまた、TNFR1と同様に、多様な作用に関連し、TNF系治療薬の開発においては、TNF標的化および活性に対する制御が重要であることに留意されたい。
【0214】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1および/またはTNFR2に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1および/またはTNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。TNFR1はほとんどの組織で発現され、かつ細胞死シグナル伝達に関与するが、対照的に、TNFR2は細胞生存シグナルに関与する。したがって、癌の治療法に関する実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1に対する低減された親和性および/または活性を有し、および/またはTNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。これらの実施形態では、キメラタンパク質は、アポトーシスが望ましい細胞、例えば、腫瘍細胞または腫瘍血管内皮細胞を標的にし得る。例えば、神経変性障害の治療のためのニューロン新生における、細胞生存を促進する方法に関する実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR2に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。言い方を変えれば、本キメラタンパク質は、いくつかの実施形態では、死シグナルまたは生存シグナルのどちらかを優先できる改変TNFα物質を含む。
【0215】
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、TNFR1に対する低減された親和性および/または活性および/またはTNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する改変TNFを有する。このようなキメラは、いくつかの実施形態では、野生型TNFおよび/またはTNFR1に対する低減された親和性および/または活性をもたらす変異のみを有するキメラに比べて、より強力なアポトーシスの誘導因子である。このようなキメラは、いくつかの実施形態では、腫瘍細胞死または腫瘍血管内皮細胞死の誘導に使用される(例えば、癌の治療において)。また、いくつかの実施形態では、これらのキメラは、例えば、TNFR2を介してTreg細胞の活性化を回避または低減し、したがってインビボでのTNFR1介在性抗腫瘍活性をさらに支持する。
【0216】
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、TNFR2に対する低減された親和性および/または活性を有し、および/またはTNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する改変TNFを有する。このようなキメラは、いくつかの実施形態では、いくつかの細胞型での細胞生存のより強力な活性化因子であり、これは種々の疾患における具体的治療目的であり得、限定されないが、ニューロン新生の刺激を含む。さらに、このようなTNFR2選択キメラはまた、自己免疫疾患(例えば、クローン病、糖尿病、MS、大腸炎など、および本明細書に記載の多くの他の疾患)の治療において有用である。いくつかの実施形態では、キメラは自己反応性T細胞を標的にする。いくつかの実施形態では、キメラは、Treg細胞活性化および細胞傷害性T細胞の間接的抑制を促進する。
【0217】
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、例えば、TNFR2の活性化および/またはTNFR1の回避により(例えば、TNFR2に対する低減された親和性および/または活性を有し、および/またはTNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する改変TNFにより)自己反応性T細胞の死をもたらす。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの自己反応性T細胞は、NFκB経路活性/シグナル伝達の変化により、変更されたアポトーシス/生存シグナルを有する。いくつかの実施形態では、キメラは、細胞死(アポトーシス)/生存シグナル特性の不均衡の根底にある、NFκB経路での損傷または変更および、場合により特定の死誘導シグナルに対する変更された感受性(例えば、TNFR2活性化)を有する自己反応性T細胞の死をもたらす。
【0218】
いくつかの実施形態では、TNFR2ベースキメラは、種々の自己免疫疾患、特に、心臓疾患、脱髄性および神経変性障害、および感染症を含む疾患に対する追加の治療用途を有する。
【0219】
ある実施形態では、野生型TNFαは、配列番号332のアミノ酸配列を有する。
【0220】
このような実施形態では、改変TNFα物質は、1つまたは複数のアミノ酸位置29、31、32、84、85、86、87、88、89、145、146および147に変異を有し、これが、低減された受容体結合親和性を有する改変TNFαをもたらす。例えば、米国特許第7,993,636号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0221】
いくつかの実施形態では、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007903号に記載のように、改変ヒトTNFα部分は、アミノ酸位置R32、N34、Q67、H73、L75、T77、S86、Y87、V91、I97、T105、P106、A109、P113、Y115、E127、N137、D143、A145、およびE146のうちの1つまたは複数に変異を有する(ジェンバンク受入番号BAG70306、バージョンBAG70306.1 GI:197692685、ヒトTNF配列に従ってナンバリング)。いくつかの実施形態では、改変ヒトTNFα部分は、L29S、R32G、R32W、N34G、Q67G、H73G、L75G、L75A、L75S、T77A、S86G、S86T、Y87Q、Y87L、Y87A、Y87F、Y87H、V91G、V91A、I97A、I97Q、I97S、T105G、P106G、A109Y、P113G、Y115G、Y115A、E127G、N137G、D143N、A145G、A145R、A145T、E146D、E146K、およびS147Dから選択される置換変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、Y87Q、Y87L、Y87A、およびY87F、およびY87Hから選択される変異を有する。別の実施形態では、ヒトTNFα部分は、I97A、I97Q、およびI97Sから選択される変異を有する。さらなる実施形態では、ヒトTNFα部分は、Y115AおよびY115Gから選択される変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、E146K変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、Y87HおよびE146K変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、Y87HおよびA145R変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、R32WおよびS86T変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、R32WおよびE146K変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、L29SおよびR32W変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、D143NおよびA145R変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、D143NおよびA145R変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、A145T、E146D、およびS147D変異を有する。ある実施形態では、ヒトTNFα部分は、A145T、およびS147D変異を有する。
【0222】
いくつかの実施形態では、国際公開第2008/124086号に記載のように、改変TNFα物質は、N39Y、S147Y、およびY87Hから選択される1つまたは複数の変異を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0223】
いくつかの実施形態では、改変ヒトTNFα部分は、国際出願第PCT/IB2016/001668号に記載のような受容体選択性をもたらす変異を有する。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、TNFに対する変異は、TNFR1選択的である。いくつかの実施形態では、TNFR1選択的であるTNFに対する変異は、位置R32、S86、およびE146のうちの1つまたは複数に対するものである。いくつかの実施形態では、TNFR1選択的であるTNFに対する変異は、R32W、S86T、およびE146Kのうちの1つまたは複数である。いくつかの実施形態では、TNFR1選択的であるTNFに対する変異は、R32W、R32W/S86T、R32W/E146KおよびE146Kのうちの1つまたは複数である。いくつかの実施形態では、TNFに対する変異は、TNFR2選択的である。いくつかの実施形態では、TNFR2選択的であるTNFに対する変異は、位置A145、E146、およびS147のうちの1つまたは複数に対するものである。いくつかの実施形態では、TNFR2選択的であるTNFに対する変異は、A145T、A145R、E146D、およびS147Dのうちの1つまたは複数である。いくつかの実施形態では、TNFR2選択的であるTNFに対する変異は、A145R、A145T/S147D、およびA145T/E146D/S147Dのうちの1つまたは複数である。
【0224】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTNFβである。TNFβは、LTβ(LTα1β2)と、ホモトリマーまたはヘテロトリマーを形成できる。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TNFR1および/またはTNFR2および/またはヘルペスウイルス侵入メディエーター(HEVM)および/またはLTβRに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0225】
ある実施形態では、野生型TNFβは、配列番号333のアミノ酸配列を有する。
【0226】
このような実施形態では、改変可溶性物質は、1つまたは複数のアミノ酸位置106~113に変異を含み得、これが、TNFR2に対する低減された受容体結合親和性を有する改変TNFβをもたらす。ある実施形態では、改変可溶性物質は、アミノ酸位置106~113に1つまたは複数の置換変異を有する。例示的実施形態では、置換変異は、Q107E、Q107D、S106E、S106D、Q107R、Q107N、Q107E/S106E、Q107E/S106D、Q107D/S106E、およびQ107D/S106Dから選択される。別の実施形態では、改変可溶性物質は、位置106~113に、約1~約3個のアミノ酸の挿入を有する。
【0227】
いくつかの実施形態では、国際公開第2015/007903号に記載のように、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これは、単鎖トリマー型であり得る。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0228】
いくつかの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これは、TNFR1に対し、低減された親和性および/または活性、すなわちアンタゴニスト活性(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007520号を参照)を有する。これらの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これもまた、場合により、TNFR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これは、TNFR2に対し、低減された親和性および/または活性、すなわちアンタゴニスト活性(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)を有する。これらの実施形態では、改変物質は、TNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)であり、これも同様に、場合により、TNFR1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態の構築物は、例えば、細胞特異的な様式でTNF応答を抑制する方法において使用される。いくつかの実施形態では、アンタゴニストTNFファミリーメンバー(例えば、TNFα、TNFβ)は、国際公開第2015/007903号に記載のように、単鎖トリマー型である。
【0229】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTRAILである。いくつかの実施形態では、改変TRAIL物質は、DR4(TRAIL-RI)および/またはDR5(TRAIL-RII)および/またはDcR1および/またはDcR2に対して、低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変TRAIL物質は、DR4(TRAIL-RI)および/またはDR5(TRAIL-RII)および/またはDcR1および/またはDcR2に対して、低減された親和性および/または活性を有する。
【0230】
ある実施形態では、野生型TRAILは、配列番号334のアミノ酸配列を有する。
【0231】
このような実施形態では、改変TRAIL物質は、アミノ酸位置T127~R132、E144~R149、E155~H161、Y189~Y209、T214~1220、K224~A226、W231、E236~L239、E249~K251、T261~H264およびH270~E271に変異を含み得る(ジェンバンク受入番号NP_003801、バージョン10NP_003801.1、GI:4507593、ヒト配列に基づいてナンバリング;上記参照)。
【0232】
いくつかの実施形態では、改変TRAIL物質は、TRAIL-R1に対するその親和性および/または活性を実質的に低減する1つまたは複数の変異を含み得る。このような実施形態では、改変TRAIL物質は、TRIL-R2に特異的に結合し得る。代表的変異は、アミノ酸位置Y189、R191、Q193、H264、I266、およびD267のうちの1つまたは複数に変異を含む。例えば、変異は、Y189Q、R191K、Q193R、H264R、I266LおよびD267Qのうちの1つまたは複数であり得る。ある実施形態では、改変TRAIL物質は、変異Y189Q、R191K、Q193R、H264R、I266LおよびD267Qを含む。
【0233】
いくつかの実施形態では、改変TRAIL物質は、TRAIL-R2に対するその親和性および/または活性を実質的に低減する1つまたは複数の変異を含み得る。このような実施形態では、改変TRAIL物質は、TRIL-R1に特異的に結合し得る。代表的変異には、アミノ酸位置G131、R149、S159、N199、K201、およびS215のうちの1つまたは複数の変異が挙げられる。例えば、変異は、G131R、R149I、S159R、N199R、K201H、およびS215Dのうちの1つまたは複数であり得る。ある実施形態では、改変TRAIL物質は、変異G131R、R149I、S159R、N199R、K201H、およびS215Dを含む。さらなるTRAIL変異は、例えば、Trebing et al.,(2014)Cell Death and Disease,5:e1035に記載されている。これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0234】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTGFαである。このような実施形態では、改変TGFα物質は、上皮成長因子受容体(EGFR)に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変TGFα物質は、上皮成長因子受容体(EGFR)に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0235】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はTGFβである。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TGFBR1および/またはTGFBR2に対する低減された親和性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TGFBR1および/またはTGFBR2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、場合により、TGFBR3に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有し、これは、理論に束縛されることを意図するものではないが、TGFベータ受容体に対するリガンドのリザーバーとして作用し得る。いくつかの実施形態では、TGFβは、TGFBR2よりもTGFBR1またはTGFBR1よりもTGFBR2を選択する。同様に、理論に束縛されることを意図するものではないが、LAPは、TGFベータ受容体に対するリガンドのリザーバーとして作用し得る。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、TGFBR1および/またはTGFBR2に対する低減された親和性および/または活性および/または潜在関連ペプチド(LAP)に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、このようなキメラは、カムラチ・エンゲルマン病、または不適切なTGFβシグナル伝達に関連する他の疾患において使用される。
【0236】
いくつかの実施形態では、改変物質は、TGFファミリーメンバー(例えば、TGFα、TGFβ)であり、これは、TGFBR1、TGFBR2、TGFBR3のうちの1つまたは複数に対し、低減された親和性および/または活性、すなわち、アンタゴニスト活性(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果であるアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)を有する。これらの実施形態では、改変物質は、TGFファミリーメンバー(例えば、TGFα、TGFβ)であり、これも同様に、場合により、TGFBR1、TGFBR2、TGFBR3のうちの1つまたは複数に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0237】
いくつかの実施形態では、改変物質は、TGFファミリーメンバー(例えば、TGFα、TGFβ)であり、これは、TGFBR1および/またはTGFBR2に対して、低減された親和性および/または活性、すなわち、アンタゴニスト活性(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果であるアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)を有する。これらの実施形態では、改変物質は、TGFファミリーメンバー(例えば、TGFα、TGFβ)であり、これも同様に、場合により、TGFBR3に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0238】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はインターロイキンである。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL1である。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL1αまたはIL1βである。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R1および/またはIL1RAcPに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R1および/またはIL1RAcPに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R2に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL1R2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。例えば、いくつかの実施形態では、本改変IL1物質は、IL1R2に対する相互作用を回避し、したがって、治療薬に対するデコイおよび/またはシンクとしてのその機能を実質的に低減する。
【0239】
ある実施形態では、野生型IL1βは、配列番号335のアミノ酸配列を有する。
【0240】
IL1は、炎症促進性のサイトカインであり、重要な免疫系制御因子である。それは、CD4 T細胞応答の強力な活性化因子であり、Th17細胞の比率を高め、IFNγおよびIL4産生細胞の増殖を増大させる。IL1はまた、CD8+ T細胞の強力な制御因子であり、抗原特異的CD8+ T細胞増殖、分化、周辺部への移動および記憶を強化する。IL1受容体は、IL1R1およびIL1R2を含む。IL1R1への結合およびIL1R1を介したシグナル伝達は、それによりIL1が多くのその生物学的(および病理学的)作用を媒介する機序を構成する。IL1R2は、デコイ受容体として機能でき、それにより、IL1R1を介した相互作用およびシグナル伝達のためのIL1の利用可能性を減らす。
【0241】
いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R1に対する低減された親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)を有する。いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、回復可能なIL1/IL1R1シグナル伝達ならびにILR2に対する治療用キメラの損失の防止およびその結果としての必要なIL1投与量の削減(例えば、野生型またはILR1に対する減弱化変異のみを有するキメラに比べて)がもたらされる。このような構築物は、例えば、免疫系を刺激して抗癌応答を開始することを含む、例えば、癌を治療する方法で使用される。
【0242】
いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R1に対し、低減された親和性および/または活性(例えば、アンタゴニスト活性、例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)を有する。いくつかの実施形態では、改変IL1は、IL1R2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、IL1/IL1R1シグナル伝達は回復可能でなく、また、ILR2に対する治療用キメラの損失の防止およびその結果として必要とされるIL1投与量の削減(例えば、野生型またはILR1に対する減弱化変異のみを有するキメラに比べて)がもたらされる。このような構築物は、例えば、免疫系を抑制することを含む、例えば、自己免疫疾患を治療する方法で使用される。
【0243】
このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、アミノ酸52~54の欠失を有し、これは、I型IL1Rに対して、低減された結合親和性および低減された生物活性を有する改変ヒトIL1βを産生する。例えば、国際公開第1994/000491号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、改変ヒトIL1βは、A117G/P118G、R120X、L122A、T125G/L126G、R127G、Q130X、Q131G、K132A、S137G/Q138Y、L145G、H146X、L145A/L147A、Q148X、Q148G/Q150G、Q150G/D151A、M152G、F162A、F162A/Q164E、F166A、Q164E/E167K、N169G/D170G、I172A、V174A、K208E、K209X、K209A/K210A、K219X、E221X、E221S/N224A、N224S/K225S、E244K、N245Qから選択される1つまたは複数の置換変異(Xはアミノ酸の任意の変化、例えば、非保存的変化であり得る)を有し、これらは、例えば、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007542号および国際公開第2015/007536号に記載のように、IL1Rに対し低減された結合を示す(ジェンバンク受入番号NP_000567、バージョンNP-000567.1、GI:10835145、ヒトIL1β配列に基づいてナンバリング)。いくつかの実施形態では、改変ヒトIL1βは、R120A、R120G、Q130A、Q130W、H146A、H146G、H146E、H146N、H146R、Q148E、Q148G、Q148L、K209A、K209D、K219S、K219Q、E221SおよびE221Kから選択される1つまたは複数の変異を有し得る。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異Q131GおよびQ148Gを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異Q148GおよびK208Eを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびQ131Gを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Aを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Nを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Rを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Eを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびH146Gを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120GおよびK208Eを含む。ある実施形態では、改変ヒトIL1βは、変異R120G、F162A、およびQ164Eを含む。
【0244】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL2である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL2Rαおよび/またはIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL2Rαに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。このような実施形態は、例えば、改変IL2がIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対し拮抗的である場合、癌の治療に適切であり得る。例えば、本発明の構築物は、IL2受容体βおよびγを有するCD8+ T細胞(抗腫瘍効果を与えることができる)の減弱化された活性化を優先し、IL2受容体α、β、およびγを有するTreg(免疫抑制効果、腫瘍促進効果を与えることができる)を優先しない。さらに、いくつかの実施形態では、IL2RαよりもIL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する選択性は、肺水腫などのIL2副作用を回避させる。また、IL2ベースキメラは、例えば、改変IL2が、IL2Rβおよび/またはIL2Rγに対してアンタゴニスト(例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)である場合、自己免疫疾患の治療に有用である。例えば、本発明の構築物は、IL2受容体βおよびγを有するCD8+ T細胞の抑制の減弱化(したがって、免疫応答を抑制する)を優先し、IL2受容体α、β、およびγを有するTregを優先しない。あるいは、いくつかの実施形態では、IL2を有するキメラは、Tregの活性化、したがって免疫抑制を優先し、CD8+ T細胞の活性化を優先しない。例えば、これらの構築物は、疾患または免疫抑制により恩恵を受けると思われる疾患、例えば、自己免疫障害の治療に使用される。
【0245】
いくつかの実施形態では、キメラタンパク質は、CD8+ T細胞を指向する本明細書に記載の標的化部分を有し、改変IL2物質は、IL2Rβおよび/またはIL2Rγに対する低減された親和性および/または活性および/またはIL2Rαに対し実質的に低減されたまたは除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、これらの構築物は、CD8+ T細胞活性を標的とし、通常、Treg細胞に対して不活性である(または実質的に低減された活性を有する)。いくつかの実施形態では、このような構築物は、野生型IL2に比べて、高められた免疫刺激効果を有し(理論に束縛されることを望むものではないが、Tregを刺激しないことにより)、一方で、IL2に関連する全身毒性を除去または低減する。
【0246】
ある実施形態では、野生型IL2は、配列番号336のアミノ酸配列を有する。
【0247】
このような実施形態では、改変ヒトIL2物質は1つまたは複数の変異を、アミノ酸L72の位置(L72G、L72A、L72S、L72T、L72Q、L72E、L72N、L72D、L72R、またはL72K)、F42の位置(F42A、F42G、F42S、F42T、F42Q、F42E、F42N、F42D、F42R、またはF42K)およびY45の位置(Y45A、Y45G、Y45S、Y45T、Y45Q、Y45E、Y45N、Y45D、Y45RまたはY45K)に有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL2物質は、野性型IL2と比べて、高親和性IL2受容体に対して低減された親和性を有し、中間的親和性IL2受容体に対しては親和性をそのまま維持すると考えられる。例えば、米国特許出願公開第2012/0244112号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0248】
いくつかの実施形態では、改変IL2物質は、アミノ酸位置R38、F42、Y45、およびE62に1つまたは複数の変異を有する。例えば、改変IL2物質は、R38A、F42A、Y45A、およびE62Aのうちの1つまたは複数を含み得る。いくつかの実施形態では、改変IL2物質は、C125で変異を含み得る。例えば、C125Sであってよい。このような実施形態では、改変IL2物質は、例えば、Carmenate et al.(2013)The Journal of Immunology,190:6230-6238に記載されているように、IL2Rαに対して実質的に低減された親和性および/または活性を有し得る。この全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、R38、F42、Y45、および/またはE62に変異を有する改変IL2物質は、CD8+ T細胞およびNK細胞を含むが、Treg細胞を含まない、エフェクター細胞の増殖を誘導できる。いくつかの実施形態では、R38、F42、Y45、および/またはE62に変異を有する改変IL2物質は、野生型IL2物質よりも少ない毒性である。IL2Rαに対する実質的に低減された親和性および/または活性を有する改変IL2物質を含むキメラタンパク質は、例えば、腫瘍学において用途が見出され得る。
【0249】
他の実施形態では、改変IL2物質は、例えば、国際公開第2016/025385号に記載されているように、IL2Rβに対して実質的に低減された親和性および/または活性を有し得る。この全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、改変IL2物質は、Treg細胞の増殖を誘導し得るが、CD8+ T細胞およびNK細胞などのエフェクター細胞の増殖を誘導し得ない。IL2Rβに対する実質的に低減された親和性および/または活性を有する改変IL2物質を含むキメラタンパク質は、例えば、自己免疫疾患の治療で用途が見出され得る。いくつかの実施形態では、改変IL2物質は、アミノ酸位置N88、D20、および/またはA126に1つまたは複数の変異を有し得る。例えば、改変IL2物質は、N88R、N88I、N88G、D20H、Q126L、およびQ126Fのうちの1つまたは複数を含み得る。
【0250】
種々の実施形態では、改変IL2物質は、D109またはC125に変異を含み得る。例えば、変異は、D109CまたはC125Sであってよい。いくつかの実施形態では、D109またはC125に変異を有する改変IL2は、PEG部分への結合のために利用され得る。
【0251】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL3である。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL3受容体に対する低減された親和性および/または活性を有し、IL3受容体は共通のベータ(ベータcまたはCD131)サブユニットと対になった特有のアルファ鎖を有するヘテロダイマーである。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL3受容体に対して実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有し、IL3受容体は共通のベータ(ベータcまたはCD131)サブユニットと対になった特有のアルファ鎖を有するヘテロダイマーである。
【0252】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL4である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1型および/または2型IL4受容体に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、1型および/または2型IL4受容体に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。1型IL4受容体は、共通のγ鎖を有するIL4Rαサブユニットから構成され、IL4を特異的に結合する。2型IL4受容体は、IL13Rα1として知られる異なるサブユニットに結合したIL4Rαサブユニットを含む。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、2型IL4受容体に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0253】
ある実施形態では、野生型IL4は、配列番号337のアミノ酸配列を有する。
【0254】
このような実施形態では、改変IL4物質は、アミノ酸R121(R121A、R121D、R121E、R121F、R121H、R121I、R121K、R121N、R121P、R121T、R121W)、E122(E122F)、Y124(Y124A、Y124Q、Y124R、Y124S、Y124T)およびS125(S125A)に1つまたは複数の変異を有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL4物質は、I型受容体により媒介される活性を維持するが、その他の受容体により媒介される生物活性を顕著に低減すると考えられる。例えば、米国特許第6,433,157号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0255】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL6である。IL6は、リガンド結合IL6R鎖(CD126)およびシグナル伝達成分gp130を含む細胞表面I型サイトカイン受容体複合体を介して信号を伝達する。IL6はまた、可溶性型のIL6R(sIL6R)にも結合し得、これは、IL6Rの細胞外の部分である。sIL6R/IL6複合体は、神経突起の成長およびニューロンの生存に関与し、したがって、再ミエリン化による神経再生に重要であり得る。したがって、いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL6R/gp130および/またはsIL6Rに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL6R/gp130および/またはsIL6Rに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0256】
ある実施形態では、野生型IL6は、IL6(成熟型、野生型)(配列番号338)のアミノ酸配列を有する。
【0257】
このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、アミノ酸58、160、163、171または177に1つまたは複数の変異を有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL6物質は、IL6Rαに対し低減された結合親和性および低減された生物活性を示すと考えられている。例えば、国際公開第97/10338号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0258】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL10である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL10受容体1およびIL10受容体2に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL10受容体1およびIL10受容体2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0259】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL11である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL11Rαおよび/またはIL11Rβおよび/またはgp130に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL11Rαおよび/またはIL11Rβおよび/またはgp130に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0260】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL12である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL12Rβ1および/またはIL12Rβ2に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL12Rβ1および/またはIL12Rβ2に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0261】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL13である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL4受容体(IL4Rα)およびIL13Rα1に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL4受容体(IL4Rα)またはIL13Rα1に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0262】
ある実施形態では、野生型IL13は、IL13(成熟型、野生型)(配列番号339)のアミノ酸配列を有する。
【0263】
このような実施形態では、改変IL13物質は、アミノ酸13、16、17、66、69、99、102、104、105、106、107、108、109、112、113および114に1つまたは複数の変異を有する。理論に束縛されることを望むものではないが、これらの改変IL13物質は、低減された生物活性を示すと考えられている。例えば、国際公開第2002/018422号を参照されたい。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0264】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL18である。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL18Rαおよび/またはIL18Rβに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IL18Rαおよび/またはIL18Rβに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、シグナル伝達に必要なTIRドメインを欠くIL18RαのアイソフォームであるIL18Rα2型に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0265】
ある実施形態では、野生型IL18は、IL18(野生型)(配列番号340)のアミノ酸配列を有する。
【0266】
このような実施形態では、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007542号に記載のように、改変IL18物質は、Y37~K44、R49~Q54、D59~R63、E67~C74、R80、M87~A97、N127~K129、Q139~M149、K165~K171、R183およびQ190~N191から選択されるアミノ酸またはアミノ酸領域に1つまたは複数の変異を含み得る(ジェンバンク受入番号AAV38697、バージョンAAV38697.1、GI:54696650、ヒトIL18配列に基づいてナンバリング)。
【0267】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIL33である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ST2受容体1およびIL1RAcPに対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ST2受容体およびIL1RAcPに対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。
【0268】
ある実施形態では、野生型IL33は、配列番号341のアミノ酸配列を有する。
【0269】
このような実施形態では、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、国際公開第2015/007542号に記載のように、改変IL33物質は、I113~Y122、S127~E139、E144~D157、Y163~M183、E200、Q215、L220~C227およびT260~E269から選択されるアミノ酸またはアミノ酸領域に1つまたは複数の変異を含み得る(ジェンバンク受入番号NP_254274、バージョン254274.1、Gl:15559209、ヒト配列に基づいてナンバリング)。
【0270】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は上皮増殖因子(EGF)である。EGFは、強力な成長因子のファミリーである。メンバーは、EGF、HB-EGF、およびTGFα、アンフィレギュリン、ニューレグリン、エピレギュリン、ベータセルリンなどの他のものを含む。EGFファミリー受容体は、EGFR(ErbB1)、ErbB2、ErbB3およびErbB4を含む。これらは、ホモダイマーおよび/またはヘテロダイマー受容体サブタイプとして機能し得る。異なるEGFファミリーメンバーは、種々の受容体サブタイプに対して、他と異なる選択性を示す。例えば、EGFは、ErbB1/ErbB1、ErbB1/ErbB2、ErbB4/ErbB2およびいくつかの他のヘテロダイマーサブタイプと結合する。HB-EGFは、類似のパターンを有するが、ErbB4/4と結合する。EGF(EGF様)増殖因子シグナル伝達の正または負方向への調節は、大きな治療上の観点から関心がもたれている。例えば、EGFRシグナル伝達の阻害は、EGFRシグナル伝達が主要な成長促進シグナルを構成する種々の癌の治療で関心がもたれている。あるいは、EGFRシグナル伝達の刺激は、例えば、創傷治癒(急性および慢性)、口腔粘膜炎(限定されないが、放射線療法を含む種々の癌療法の主要な副作用)における治療上の観点から関心が持たれている。
【0271】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ErbB1、ErbB2、ErbB3、および/またはErbB4に対する低減された親和性および/または活性を有する。このような実施形態は、例えば、創傷の治療方法で使用される。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ErbB1、ErbB2、ErbB3、およびErbB4のうちの1つまたは複数に結合し、その受容体の活性をアンタゴナイズする。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ErbB1、ErbB2、ErbB3、および/またはErbB4に対する低減された親和性および/または活性を有し、これにより、その受容体の活性が、弱められる様式でアンタゴナイズされる。このような実施形態は、例えば、癌の治療で使用される。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ErbB1に対する低減された親和性および/または活性を有する。ErbB1は、キナーゼ阻害剤の治療標的であるが-大抵の場合、副作用があり、その理由は、それらがあまり選択的でないためである(例えば、ゲフィチニブ、エルロチニブ、アファチニブ、ブリガチニブおよびイコチニブ)。いくつかの実施形態では、弱められた拮抗的ErbB1シグナル伝達は、EGFの受容体を標的とする他の物質より、オンターゲットであり、少ない副作用を有する。
【0272】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ErbB1に対し、低減された親和性および/または活性(例えば、アンタゴニスト活性、例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照、この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)および/またはErbB4またはそれが相互作用し得る他のサブタイプに対し実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。標的化部分を介した特異的標的化により、ErbB1/ErbB1受容体活性化の細胞選択的抑制(アンタゴニズム、例えば、天然のアンタゴニスト活性または1つまたは複数の変異の結果としてのアンタゴニスト活性、例えば、国際公開第2015/007520号を参照、この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)が達成されるであろう-阻害関連副作用に関連する可能性のある他の受容体サブタイプを関与させず。従って、身体中の全ての細胞型のEGFR活性を阻害するEGFRキナーゼ阻害剤と対照的に、このような構築物は、副作用の低減された細胞選択的(例えば、受容体の増幅、過剰発現などよる活性化EGFRシグナル伝達を有する腫瘍細胞)抗EGFR(ErbB1)薬物作用を提供するであろう。
【0273】
いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、ErbB4および/またはそれが相互作用する他のサブタイプに対する低減された親和性および/または活性(例えば、アゴニスト活性)を有する。標的化部分を介した特定の標的細胞に対する標的化により、ErbB1シグナル伝達の選択的活性化が達成される(例えば、上皮細胞)。このような構築物は、いくつかの実施形態では、副作用が低減された創傷の治療(創傷治癒の促進)、特に慢性状態の治療および治療薬局所投与以外の適用(例えば、全身性創傷治癒)のために使用される。
【0274】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、インスリンまたはインスリン類似体である。いくつかの実施形態では、改変インスリンまたはインスリン類似体は、インスリン受容体および/またはIGF1またはIGF2受容体に対する低減された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変インスリンまたはインスリン類似体は、インスリン受容体および/またはIGF1またはIGF2受容体に対する低減または除去された親和性および/または活性を有する。インスリン受容体に対する弱められた応答は、糖尿病、肥満症、代謝障害などの制御を可能にし、同時に、IGF1またはIGF2受容体から離すことにより、癌促進性作用を回避する。
【0275】
ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、インスリン様増殖因子-Iまたはインスリン様増殖因子-II(IGF1またはIGF2)である。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質はIGF1である。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、インスリン受容体および/またはIGF1受容体に対する低減された親和性および/または活性を有する。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IGF1受容体に結合し、受容体の活性をアンタゴナイズする。このような実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IGF1受容体に対する低減された親和性および/または活性を有し、これにより、受容体の活性が、弱められる形式でアンタゴナイズされることを可能にする。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IGF1受容体に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有する。いくつかの実施形態では、改変シグナル伝達物質は、IGF2受容体に対する低減された親和性および/または活性を有し、これにより、受容体の活性が、弱められる形式でアンタゴナイズされることを可能にする。ある実施形態では、改変シグナル伝達物質は、インスリン受容体に対する実質的に低減または除去された親和性および/または活性を有し、したがって、インスリンシグナル伝達を妨げない。種々の実施形態では、これは、癌治療に適用される。種々の実施形態では、本物質は、IRアイソフォームAが癌治療に対し耐性を生じるのを防止し得る。
【0276】
一実施形態では、本キメラタンパク質は、本明細書に記載のうちのいずれかの改変または変異シグナル伝達物質と共に、(i)PD-1またはPD-L1に対する標的化部分および(ii)腫瘍細胞を指向する標的化部分を有する。
【0277】
一実施形態では、本キメラタンパク質は、本明細書に記載のうちのいずれかの改変または変異インターフェロンと共に、(i)PD-1またはPD-L1に対する標的化部分および(ii)チェックポイント阻害剤マーカーを指向する標的化部分を有する。
【0278】
種々の実施形態では、シグナル伝達物質は毒素または毒性酵素である。いくつかの実施形態では、毒素または毒性酵素は、植物および細菌から誘導される。毒素または毒性酵素の例としては、ジフテリア毒素、シュードモナス毒素、炭疽病毒素、リシンおよびサポリンなどのリボソーム不活化タンパク質(RIP)、モデシン、アブリン、ゲロニン、およびヤマゴボウ抗ウイルスタンパク質が挙げられるが、これらに限定されない。追加の毒素は、Mathew et al.,(2009)Cancer Sci 100(8):1359-65、に開示のものを含む。この文献の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、細胞型特異的に細胞死を誘導するのに利用し得る。このような実施形態では、毒素は改変されて、例えば、変異導入されて、本明細書で他のシグナル伝達物質に関し記載のように、効果を弱めるために毒素の親和性および/または活性を低減させ得る。
【0279】
シグナル伝達物質との多重特異的キメラおよび融合体
種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、本明細書に記載の1種類または複数種類のシグナル伝達物質および/または1つまたは複数の追加の標的化部分のキメラまたは融合体の一部である。したがって、本発明は、例えば、1種類または複数種類のシグナル伝達物質およびPD-1またはPD-L1に対する標的化部分および/または1つまたは複数の追加の標的化部分を含むキメラまたは融合タンパク質を提供する。
【0280】
種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、多重特異的であり、すなわち、PD-1またはPD-L1結合物質は、2つ以上の標的、例えば、抗原、または受容体、またはエピトープを認識して結合する認識ドメインを有する2つ以上の標的化部分を有する。このような実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、同じ抗原上または異なる抗原上の2個以上のエピトープを認識して結合する認識ドメインを有する2つ以上の標的化部分を含み得る。種々の実施形態では、このような多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、向上した結合力および/または改善された選択性などの有利な性質を示す。ある実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、2つの標的化部分を含み、二重特異性であり、すなわち、同じ抗原上または異なる抗原上の2個のエピトープに結合し、それを認識する。
【0281】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、それぞれの標的化部分が本明細書に記載の抗体または抗体誘導体である2つ以上の標的化部分を含む。ある実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1またはPD-L1に対する抗原認識ドメインを含む少なくとも1種類のVHHおよび腫瘍抗原に対する抗原認識ドメインを含む1種類の抗体または抗体誘導体を含む。
【0282】
種々の実施形態では、本多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、異なる抗原または受容体を標的とする2つ以上の標的化部分を有し、1つの標的化部分は、その抗原または受容体に対し減弱化され得、例えば、標的化部分はその抗原または受容体を低親和性または結合力で結合する(例えば、その他の標的化部分がその抗原または受容体に対して有する親和性または結合力より低い親和性または結合力で結合することを含み、例えば、結合親和性の間の差異は、約10倍、または25倍、または50倍、または100倍、または300倍、または500倍、または1000倍、または5000倍であってよく;例えば、より低い親和性または結合力の標的化部分はその抗原または受容体に中~高nMまたは低~中μMの範囲のKDで結合し得るが、より高い親和性または結合力の標的化部分は、中~高pMまたは低~中nMの範囲のKDで結合し得る)。例えば、いくつかの実施形態では、本多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、無差別の抗原または受容体を指向する減弱化標的化部分を含み、これは、目的の細胞に対する標的化を改善し(例えば、その他の標的化部分を介して)かつ治療用の標的にされないものを含む、複数細胞型間にまたがる効果を防止し得る(例えば、これらの実施形態で与えられるものより高い親和性で無差別の抗原または受容体に結合することによる)。
【0283】
本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、当該技術分野において既知の方法を使用して構築し得る。例えば、米国特許第9,067,991号、米国特許出願公開第20110262348号および国際公開第2004/041862号を参照されたい。これらの特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、2つ以上の標的化部分を含む本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、例えば、アミノ酸残基と、全内容が参照により本明細書に組み込まれる、Blattler et al.,Biochemistry 24,1517-1524および欧州特許第294703号に記載のような有機誘導体化試薬とを反応させることにより、化学架橋により構築され得る。別の例示的実施形態では、2つ以上の標的化部分を含む多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、遺伝子融合、すなわち、個別の標的化部分のポリペプチドを含む単一ポリペプチドを構築することにより、構築される。例えば、PD-1またはPD-L1に対する抗原認識ドメインを有する第1のVHHおよび腫瘍抗原に対する抗原認識ドメインを有する第2の抗体または抗体誘導体をコードする、単一ポリペプチド構築物を形成し得る。二価または多価性のVHHポリペプチド構築物を産生する方法は、国際公開第96/34103号に開示され、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。さらなる例示的実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、リンカーを用いて構築され得る。例えば、PD-1またはPD-L1に対する抗原認識ドメインを有する第1のVHHのカルボキシ末端を、腫瘍抗原に対する抗原認識ドメインを有する第2の抗体または抗体誘導体のアミノ末端に連結され得る(または逆もまた同様)。使用し得る代表的リンカーは、本明細書に記載されている。いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質の成分は、リンカーを使用せずに、相互に直接連結される。
【0284】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1またはPD-L1および1つまたは複数の免疫細胞上に見つけた1つまたは複数の抗原を認識して、それらに結合する。免疫細胞には、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、好酸球、単球、マクロファージ、ナチュラルキラー細胞、Tリンパ球(例えば、細胞傷害性Tリンパ球、ヘルパーT細胞)、Bリンパ球、プラズマ細胞、樹状細胞、またはこれらのサブセットを含め得るが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、目的の抗原に特異的に結合し、直接または間接的に1つまたは複数の免疫細胞を効果的に動員する。
【0285】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1またはPD-L1および腫瘍細胞上に見つけた1つまたは複数の抗原を認識して、それらに結合する。これらの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、免疫細胞を直接的にまたは間接的に腫瘍細胞にまたは腫瘍微小環境に動員し得る。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、免疫細胞、例えば、腫瘍を死滅させるおよび/または抑制することができる免疫細胞(例えば、CTL)を、作用部位(非限定的例であるが、腫瘍微小環境など)に直接的にまたは間接的に動員し得る。
【0286】
いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍の免疫攻撃に有利なように免疫細胞のバランスを変化させることができ、または免疫細胞のバランスを変化させることを含む方法において使用される。例えば、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、臨床的に重要な部位の免疫細胞の比率を、腫瘍を死滅させるおよび/または抑制することができる細胞(例えば、T細胞、細胞傷害性Tリンパ球、ヘルパーT細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞、ナチュラルキラーナチュラルキラーT(NKT)細胞、抗腫瘍マクロファージ(例えば、M1マクロファージ)、好中球、B細胞、樹状細胞またはこれらのサブセット)に有利なように、および腫瘍を保護する細胞(例えば、骨髄由来サプレッサー細胞(MDSC)、制御性T細胞(Treg);腫瘍関連好中球(TAN)、M2マクロファージ、腫瘍関連マクロファージ(TAM)、またはこれらのサブセット)に不利なように変化させることができる。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、エフェクターT細胞の制御性T細胞に対する比率を高めることができる。
【0287】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍細胞関連抗原に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、腫瘍細胞を直接または間接的に動員する。例えば、いくつかの実施形態では、腫瘍細胞の動員は、腫瘍細胞を死滅させることができるおよび/または抑制できる1つまたは複数のエフェクター細胞(例えば、本明細書に記載の免疫細胞)に対するものである。いくつかの実施形態では、標的化部分は、腫瘍およびCD8陽性免疫細胞(例えば、T細胞)上で、それらのそれぞれの抗原と相互作用する2つの標的化部分によって、T細胞を腫瘍細胞に直接または間接的に動員する。
【0288】
腫瘍細胞、または癌細胞は、身体の器官およびシステムの正常な機能動作を妨害する、細胞または組織の無制御な増殖および/または細胞生存の異常な増大および/またはアポトーシスの抑制の異常な増大を指す。例えば、腫瘍細胞は、良性および悪性の癌、ポリープ、過形成、ならびに休眠腫瘍または微小転移を含む。腫瘍細胞の例としては、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳および中枢神経系癌、乳癌、腹膜の癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸および直腸癌、結合組織癌、消化器系の癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部の癌、胃癌(胃腸癌を含む)、神経膠芽腫、肝癌、ヘパトーマ、上皮内腫瘍、腎臓癌または腎臓癌(kidney or renal cancer)、喉頭癌、白血病、肝臓癌、肺癌(例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、および肺扁平上皮癌)、黒色腫、骨髄腫、神経芽腫、口腔癌(唇、舌状、舌、口内、および咽頭)、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌腫、肉腫、皮膚癌、扁平上皮細胞癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮または子宮内膜癌、泌尿器系の癌、外陰癌、ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫、ならびにB細胞リンパ腫を含むリンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む)、小リンパ球性(SL)NHL、中悪性度/濾胞性NHL、中悪性度びまん性NHL、高悪性度免疫芽細胞NHL、高悪性度リンパ芽球性NHL、高悪性度小型非切れ込み核細胞性NHL、巨大腫瘤病変NHL、マントル細胞リンパ腫、エイズ関連リンパ腫、およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性リンパ性白血病(ALL)、毛様細胞性白血病、慢性骨髄芽球性白血病、ならびにその他の癌腫および肉腫、および移植後リンパ増殖性疾患(PTLD)、ならびに母斑症、浮腫(例えば、脳腫瘍に関連するもの)、およびメグズ症候群と関連する異常血管増殖の細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
【0289】
腫瘍細胞または癌細胞としては、癌腫、例えば、種々のサブタイプ(例えば、腺癌、基底細胞癌、扁平上皮細胞癌、および移行性上皮癌を含む)、肉腫(例えば、骨および軟組織を含む)、白血病(例えば、急性骨髄性、急性リンパ芽球性、慢性骨髄性、慢性リンパ球性、およびヘアリー細胞を含む)、リンパ腫および骨髄腫(例えば、ホジキンおよび非ホジキンリンパ腫、軽鎖型、非分泌型MGUS、および形質細胞腫を含む)、および中枢神経系癌(例えば、脳腫瘍(例えば、神経膠腫(例えば、星状細胞腫、乏突起細胞腫および上衣腫)、髄膜腫、下垂体腺腫、および神経腫)、および脊髄腫瘍(例えば、髄膜腫および神経線維腫))も挙げられるが、これらに限定されない。
【0290】
腫瘍抗原の例としては、MART-1/Melan-A、gp100、ジペプチジルペプチダーゼIV(DPPIV)、アデノシンデアミナーゼ結合タンパク質(ADAbp)、シクロフィリンb、結腸直腸関連性抗原(CRC)-0017-1A/GA733、癌胎児抗原(CEA)およびその免疫原性エピトープCAP-1およびCAP-2、etv6、aml1、前立腺特異抗原(PSA)およびその免疫原性エピトープPSA-1、PSA-2、およびPSA-3、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、T細胞受容体/CD3-ゼータ鎖、MAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A5、MAGE-A6、MAGE-A7、MAGE-A8、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A11、MAGE-A12、MAGE-Xp2(MAGE-B2)、MAGE-Xp3(MAGE-B3)、MAGE-Xp4(MAGE-B4)、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-C4、MAGE-C5)、GAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7、GAGE-8、GAGE-9)、BAGE、RAGE、LAGE-1、NAG、GnT-V、MUM-1、CDK4、チロシナーゼ、p53、MUCファミリー、HER2/neu、p21ras、RCAS1、α-フェトプロテイン、E-カドヘリン、α-カテニン、β-カテニンおよびγ-カテニン、p120ctn、gp100 Pmel117、PRAME、NY-ESO-1、cdc27、大腸腺腫症タンパク質(APC)、フォドリン、コネキシン37、Ig-イディオタイプ、p15、gp75、GM2およびGD2ガングリオシド、ヒトパピローマウイルスタンパク質などのウイルス産物、Smadファミリーの腫瘍抗原、lmp-1、NA、EBV-コード化核内抗原(EBNA)-1、脳グリコーゲンホスホリラーゼ、SSX-1、SSX-2(HOM-MEL-40)、SSX-1、SSX-4、SSX-5、SCP-1 CT-7、c-erbB-2、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD37、CD56、CD70、CD74、CD138、AGS16、MUC1、GPNMB、Ep-CAM、PD-L1、PD-L2、PMSA、およびBCMA(TNFRSF17)が挙げられるが、これらに限定されない。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの腫瘍抗原を結合する標的化部分を含む。
【0291】
いくつかの実施形態では、存在する多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍細胞上のPD-1またはPD-L1ならびに抗原を認識し、それに結合する。
【0292】
種々の実施形態では、本多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、2個の異なる細胞(例えば、シナプスを作るために)または同じ細胞(例えば、より高濃度のシグナル伝達物質効果を得るために)を標的とする標的化部分を有する。
【0293】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、T細胞関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、直接または間接的にT細胞を動員する。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、エフェクターT細胞に特異的に結合する。いくつかの実施形態では、抗原認識ドメインは、エフェクターT細胞を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1つまたは複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)に直接または間接的に動員する。エフェクターT細胞の例としては、細胞傷害性T細胞(例えば、αβTCR、CD3+、CD8+、CD45RO+);CD4+エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3+、CD4+、CCR7+、CD62Lhi、IL7R/CD127+);CD8+ エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3+、CD8+、CCR7+、CD62Lhi、IL7R/CD127+);エフェクターメモリーT細胞(例えば、CD62Llow、CD44+、TCR、CD3+、IL7R/CD127+、IL15R+、CCR7low);セントラルメモリーT細胞(例えば、CCR7+、CD62L+、CD27+;またはCCR7hi、CD44+、CD62Lhi、TCR、CD3+、IL7R/CD127+、IL15R+);CD62L+ エフェクターT細胞;早期エフェクターメモリーT細胞(CD27+ CD62L-)および後期エフェクターメモリーT細胞(CD27- CD62L-)(それぞれ、TemEおよびTemL)を含むCD8+ エフェクターメモリーT細胞(TEM);CD127(+)CD25(low/-)エフェクターT細胞;CD127(-)CD25(-)エフェクターT細胞;CD8+
幹細胞メモリーエフェクター細胞(TSCM)(例えば、CD44(low)CD62L(high)CD122(high)sca(+));TH1エフェクターT細胞(例えば、CXCR3+、CXCR6+およびCCR5+;またはαβTCR、CD3+、CD4+、IL12R+、IFNγR+、CXCR3+)、TH2エフェクターT細胞(例えば、CCR3+、CCR4+およびCCR8+;またはαβTCR、CD3+、CD4+、IL4R+、IL33R+、CCR4+、IL17RB+、CRTH2+);TH9エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3+、CD4+);TH17エフェクターT細胞(例えば、αβTCR、CD3+、CD4+、IL23R+、CCR6+、IL1R+);CD4+CD45RO+CCR7+ エフェクターT細胞、ICOS+ エフェクターT細胞;CD4+CD45RO+CCR7(-)エフェクターT細胞;およびIL2、IL4および/またはIFN-γを分泌するエフェクターT細胞が挙げられる。
【0294】
目的とするT細胞抗原の例としては、例えば、下記が挙げられる(該当する場合には、細胞外ドメインも含む):CD8、CD3、SLAMF4、IL2Rα、4-1BB/TNFRSF9、IL2Rβ、ALCAM、B7-1、IL4R、B7-H3、BLAME/SLAMFS、CEACAM1、IL6R、CCR3、IL7Rα、CCR4、CXCRl/ILSRA、CCR5、CCR6、IL10Rα、CCR7、IL10Rβ、CCRS、IL12Rβ1、CCR9、IL12Rβ2、CD2、IL13Rα1、IL13、CD3、CD4、ILT2/CDS5j、ILT3/CDS5k、ILT4/CDS5d、ILT5/CDS5a、lutegrin α4/CD49d、CDS、インテグリンαE/CD103、CD6、インテグリンαM/CD11b、CDS、インテグリンαX/CD11c、インテグリンβ2/CDlS、KIR/CD15S、CD27/TNFRSF7、KIR2DL1、CD2S、KIR2DL3、CD30/TNFRSFS、KIR2DL4/CD15Sd、CD31/PECAM-1、KIR2DS4、CD40リガンド/TNFSF5、LAG-3、CD43、LAIR1、CD45、LAIR2、CDS3、ロイコトリエンB4-R1、CDS4/SLAMF5、NCAM-L1、CD94、NKG2A、CD97、NKG2C、CD229/SLAMF3、NKG2D、CD2F-10/SLAMF9、NT-4、CD69、NTB-A/SLAMF6、共通γ鎖/IL2Rγ、オステオポンチン、CRACC/SLAMF7、PD-1、CRTAM、PSGL-1、CTLA-4、RANK/TNFRSF11A、CX3CR1、CX3CL1、L-セレクチン、CXCR3、SIRPβ1、CXCR4、SLAM、CXCR6、TCCR/WSX-1、DNAM-1、サイモポエチン、EMMPRIN/CD147、TIM-1、EphB6、TIM-2、Fas/TNFRSF6、TIM-3、Fasリガンド/TNFSF6、TIM-4、FcγRIII/CD16、TIM-6、TNFR1/TNFRSF1A、グラニュライシン、TNFRIII/TNFRSF1B、TRAILRl/TNFRSF10A、ICAM-1/CD54、TRAILR2/TNFRSF10B、ICAM-2/CD102、TRAILR3/TNFRSF10C、IFN-γR1、TRAILR4/TNFRSF10D、IFN-γR2、TSLP、IL1R1およびTSLPR。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的T細胞抗原を結合する標的化部分を含む。
【0295】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、4つの「フレームワーク領域」またはFRおよび3つの「相補性決定領域」またはCDRを有する単一アミノ酸鎖を含むVHHであるCD8に対する標的化部分を含む。本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」または「FR」は、CDRの間に位置する可変ドメイン中の領域を意味する。本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」または「CDR」は、抗原性標的に特異的に結合できるアミノ酸配列を含むVHH中の可変領域を指す。
【0296】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、CDR1、CDR2、および/またはCDR3配列のうちの少なくとも1つを含む可変ドメインを有するCD8に対するVHHを含む。
【0297】
いくつかの実施形態では、CDR1配列は、配列番号342または配列番号343から選択される。
【0298】
いくつかの実施形態では、CDR2配列は、配列番号344または配列番号345から選択される。
【0299】
いくつかの実施形態では、CDR3配列は、配列番号346または配列番号347または配列番号348から選択される。
【0300】
種々の実施形態では、CD8標的化部分は、次の配列:R3HCD27(配列番号349)またはR3HCD129(配列番号350)またはR2HCD26(配列番号351)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0301】
種々の実施形態では、CD8標的化部分は、後述のようにCDR1、CDR2、および/またはCDR3配列のうちの少なくとも1つを含む可変ドメインを有するVHHを含む。
【0302】
いくつかの実施形態では、CDR1配列は、配列番号352~配列番号420から選択される。
【0303】
いくつかの実施形態では、CDR2配列は、配列番号421~配列番号489から選択される。
【0304】
いくつかの実施形態では、CDR3配列は、配列番号490~配列番号558から選択される。
【0305】
種々の実施形態では、CD8標的化部分は、1CDA7(配列番号559)または1CDA12(配列番号560)または1CDA14(配列番号561)または1CDA15(配列番号562)または1CDA17(配列番号563)または1CDA18(配列番号564)または1CDA19(配列番号565)または1CDA24(配列番号566)または1CDA26(配列番号567)または1CDA28(配列番号568)または1CDA37(配列番号569)または1CDA43(配列番号570)または1CDA45(配列番号571)または1CDA47(配列番号572)または1CDA48(配列番号573)または1CDA58(配列番号574)または1CDA65(配列番号575)または1CDA68(配列番号576)または1CDA73(配列番号577)または1CDA75(配列番号578)または1CDA86(配列番号579)または1CDA87(配列番号580)または1CDA88(配列番号581)または1CDA89(配列番号582)または1CDA92(配列番号583)または1CDA93(配列番号584)または2CDA1(配列番号585)または2CDA5(配列番号586)または2CDA22(配列番号587)または2CDA28(配列番号588)または2CDA62(配列番号589)または2CDA68(配列番号590)または2CDA73(配列番号591)または2CDA74(配列番号592)または2CDA75(配列番号593)または2CDA77(配列番号594)または2CDA81(配列番号595)または2CDA87(配列番号596)または2CDA88(配列番号597)または2CDA89(配列番号598)または2CDA91(配列番号599)または2CDA92(配列番号600)または2CDA93(配列番号601)または2CDA94(配列番号602)または2CDA95(配列番号603)または3CDA3(配列番号604)または3CDA8(配列番号605)または3CDA11(配列番号606)または3CDA18(配列番号607)または3CDA19(配列番号608)または3CDA21(配列番号609)または3CDA24(配列番号610)または3CDA28(配列番号611)または3CDA29(配列番号612)または3CDA31(配列番号613)または3CDA32(配列番号614)または3CDA33(配列番号615)または3CDA37(配列番号616)または3CDA40(配列番号617)または3CDA41(配列番号618)または3CDA48(配列番号619)または3CDA57(配列番号620)または3CDA65(配列番号621)または3CDA70(配列番号622)または3CDA73(配列番号623)または3CDA83(配列番号624)または3CDA86(配列番号625)または3CDA88(配列番号626)または3CDA90(配列番号627)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0306】
種々の代表的実施形態では、CD8標的化部分は、末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、HHHHHH:配列番号84)を含まない上記配列のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む。
【0307】
いくつかの実施形態では、CD8標的化部分は、HAタグ(すなわち、YPYDVPDYGS;配列番号85)を含まない配列番号559~627(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0308】
いくつかの実施形態では、CD8標的化部分は、AAAリンカーを含まない配列番号559~627(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0309】
いくつかの実施形態では、CD8標的化部分は、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、AAAYPYDVPDYGSHHHHHH;配列番号86)を含まない配列番号559~627(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。種々の実施形態では、CD8標的化部分は、米国特許出願公開第2014/0271462号に記載のアミノ酸配列を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。種々の実施形態では、CD8標的化部分は、米国特許出願公開第2014/0271462号の表0.1、表0.2、表0.3、および/または
図1A~12Iに記載のアミノ酸配列を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。種々の実施形態では、CD8標的化部分は、配列番号628、配列番号629、または配列番号630で提供される、配列番号22または23のHCDR1のHCDR1および/または配列番号22または23のHCDR1のHCDR2および/または配列番号22または23のHCDR1のHCDR3および/または配列番号24のLCDR1のLCDR1および/または配列番号24のLCDR1のLCDR2および/または配列番号24のLCDR1のLCDR3を含む。
【0310】
種々の実施形態では、本発明は、本明細書に記載の本発明のCD8を指向する標的化部分の任意の天然または合成類似体、変異体、バリアント、アレル、同族体およびオーソログ(本明細書では、ひとまとめにして「類似体」と呼ぶ)の使用を意図している。種々の実施形態では、CD8を指向する標的化部分のアミノ酸配列は、アミノ酸類似体、アミノ酸誘導体、またはその他の非古典的アミノ酸をさらに含む。
【0311】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、B細胞関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1つまたは複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)に、直接または間接的にB細胞を動員する。目的のB細胞抗原の例としては、例えば、CD10、CD19、CD20、CD21、CD22、CD23、CD24、CD37、CD38、CD39、CD40、CD70、CD72、CD73、CD74、CDw75、CDw76、CD77、CD78、CD79a/b、CD80、CD81、CD82、CD83、CD84、CD85、CD86、CD89、CD98、CD126、CD127、CDw130、CD138、CDw150、およびB細胞成熟抗原(BCMA)が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的B細胞抗原を結合する標的化部分を含む。
【0312】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、ナチュラルキラー細胞関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、例えば、いくつかの実施形態では、ナチュラルキラー細胞を、治療部位(例えば、1つまたは複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)へ直接または間接的に動員する。目的のナチュラルキラー細胞抗原の例としては、例えば、TIGIT、2B4/SLAMF4、KIR2DS4、CD155/PVR、KIR3DL1、CD94、LMIR1/CD300A、CD69、LMIR2/CD300c、CRACC/SLAMF7、LMIR3/CD300LF、Kir1alpha、DNAM-1、LMIR5/CD300LB、Fc-イプシロンRII、LMIR6/CD300LE、Fc-γRl/CD64、MICA、Fc-γRIIB/CD32b、MICB、Fc-γRIIC/CD32c、MULT-1、Fc-γRIIA/CD32a、Nectin-2/CD112、Fc-γRIII/CD16、NKG2A、FcRH1/IRTA5、NKG2C、FcRH2/IRTA4、NKG2D、FcRH4/IRTA1、NKp30、FcRH5/IRTA2、NKp44、Fc-受容体様3/CD16-2、NKp46/NCR1、NKp80/KLRF1、NTB-A/SLAMF6、Rae-1、Rae-1α、Rae-1β、Rae-1δ、H60、Rae-1ε、ILT2/CD85j、Rae-1γ、ILT3/CD85k、TREM-1、ILT4/CD85d、TREM-2、ILT5/CD85a、TREM-3、KIR/CD158、TREML1/TLT-1、KIR2DL1、ULBP-1、KIR2DL3、ULBP-2、KIR2DL4/CD158dおよびULBP-3が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的NK細胞抗原を結合する標的化部分を含む。
【0313】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、マクロファージ/単球関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、例えば、いくつかの実施形態では、マクロファージ/単球を直接または間接的に、治療部位(例えば、1つまたは複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)に動員する。目的のマクロファージ/単球抗原の例としては、例えば、SIRP1a、B7-1/CD80、ILT4/CD85d、B7-H1、ILT5/CD85a、共通β鎖、インテグリンα4/CD49d、BLAME/SLAMF8、インテグリンαX/CDllc、CCL6/C10、インテグリンβ2/CD18、CD155/PVR、インテグリンβ3/CD61、CD31/PECAM-1、Latexin、CD36/SR-B3、ロイコトリエンB4R1、CD40/TNFRSF5、LIMPIIISR-B2、CD43、LMIR1/CD300A、CD45、LMIR2/CD300c、CD68、LMIR3/CD300LF、CD84/SLAMF5、LMIR5/CD300LB、CD97、LMIR6/CD300LE、CD163、LRP-1、CD2F-10/SLAMF9、MARCO、CRACC/SLAMF7、MD-1、ECF-L、MD-2、EMMPRIN/CD147、MGL2、エンドグリン/CD105、オステオアクチビン/GPNMB、Fc-γRI/CD64、オステオポンチン、Fc-γRIIB/CD32b、PD-L2、Fc-γRIIC/CD32c、Siglec-3/CD33、Fc-γRIIA/CD32a、SIGNR1/CD209、Fc-γRIII/CD16、SLAM、GM-CSFRα、TCCR/WSX-1、ICAM-2/CD102、TLR3、IFN-γRl、TLR4、IFN-gannnaR2、TREM-1、IL-1RII、TREM-2、ILT2/CD85j、TREM-3、ILT3/CD85k、TREML1/TLT-1、2B4/SLAMF 4、IL10Rα、ALCAM、IL10Rβ、アミノペプチダーゼN/ANPEP、ILT2/CD85j、共通β鎖、ILT3/CD85k、ClqR1/CD93、ILT4/CD85d、CCR1、ILT5/CD85a、CCR2、CD206、インテグリンα4/CD49d、CCR5、インテグリンαM/CDll b、CCR8、インテグリンαX/CDllc、CD155/PVR、インテグリンβ2/CD18、CD14、インテグリンβ3/CD61、CD36/SR-B3、LAIR1、CD43、LAIR2、CD45、ロイコトリエンB4-R1、CD68、LIMPIIISR-B2、CD84/SLAMF5、LMIR1/CD300A、CD97、LMIR2/CD300c、CD163、LMIR3/CD300LF、凝固因子III/組織因子、LMIR5/CD300LB、CX3CR1、CX3CL1、LMIR6/CD300LE、CXCR4、LRP-1、CXCR6、M-CSF R、DEP-1/CD148、MD-1、DNAM-1、MD-2、EMMPRIN/CD147、MMR、エンドグリン/CD105、NCAM-L1、Fc-γRI/CD64、PSGL-1、Fc-γRIIIICD16、RP105、G-CSF R、L-セレクチン、GM-CSFRα、シグレック-3/CD33、HVEM/TNFRSF14、SLAM、ICAM-1/CD54、TCCR/WSX-1、ICAM-2/CD102、TREM-1、IL6R、TREM-2、CXCR1/IL8RA、TREM-3およびTREMLl/TLT-1が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的マクロファージ/単球抗原を結合する標的化部分を含む。
【0314】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、樹状細胞関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1つまたは複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)に、直接または間接的に樹状細胞を動員する。目的の樹状細胞抗原の例としては、例えば、CLEC9A、XCR1、RANK、CD36/SRB3、LOX-1/SR-E1、CD68、MARCO、CD163、SR-A1/MSR、CD5L、SREC-1、CL-Pl/COLEC12、SREC-II、LIMPIIISRB2、RP105、TLR4、TLR1、TLR5、TLR2、TLR6、TLR3、TLR9、4-IBBリガンド/TNFSF9、IL12/I L23p40、4-アミノ-1,8-ナフタルイミド、ILT2/CD85j、CCL21/6Ckine、ILT3/CD85k、8-oxo-dG、ILT4/CD85d、8D6A、ILT5/CD85a、A2B5、lutegrin α4/CD49d、Aag、インテグリンβ2/CD18、AMICA、Langerin、B7-2/CD86、ロイコトリエンB4 Rl、B7-H3、LMIR1/CD300A、BLAME/SLAMF8、LMIR2/CD300c、ClqR1/CD93、LMIR3/CD300LF、CCR6、LMIR5/CD300LBCCR7、LMIR6/CD300LE、CD40/TNFRSF5、MAG/Siglec-4-a、CD43、MCAM、CD45、MD-1、CD68、MD-2、CD83、MDL-1/CLEC5A、CD84/SLAMF5、MMR、CD97、NCAMLl、CD2F-10/SLAMF9、Osteoactivin GPNMB、Chern23、PD-L2、CLEC-1、RP105、CLEC-2、CLEC-8、シグレック-2/CD22、CRACC/SLAMF7、シグレック-3/CD33、DC-SIGN、DEC205、シグレック-5、DC-SIGNR/CD299、シグレック-6、DCAR、シグレック-7、DCIR/CLEC4A、シグレック-9、DEC-205、シグレック-10、Dectin-1/CLEC7A、シグレック-F、Dectin-2/CLEC6A、SIGNR1/CD209、DEP-1/CD148、SIGNR4、DLEC、SLAM、EMMPRIN/CD147、TCCR/WSX-1、Fc-γR1/CD64、TLR3、Fc-γRIIB/CD32b、TREM-1、Fc-γRIIC/CD32c、TREM-2、Fc-γRIIA/CD32a、TREM-3、Fc-γRIII/CD16、TREML1/TLT-1、ICAM-2/CD102、DEC205、およびバニロイドR1が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的DC抗原を結合する標的化部分を含む。
【0315】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、4つの「フレームワーク領域」またはFRおよび3つの「相補性決定領域」またはCDRを有する単一アミノ酸鎖を含むVHHであるClec9Aに対する標的化部分を含む。本明細書で使用される場合、「フレームワーク領域」または「FR」は、CDRの間に位置する可変ドメイン中の領域を意味する。本明細書で使用される場合、「相補性決定領域」または「CDR」は、抗原性標的に特異的に結合できるアミノ酸配列を含むVHH中の可変領域を指す。
【0316】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、CDR1、CDR2、および/またはCDR3配列のうちの少なくとも1つを含む可変ドメインを有するClec9Aに対するVHHを含む。
【0317】
例示的実施形態では、CDR1配列は、配列番号631~配列番号650から選択される。
【0318】
例示的実施形態では、CDR2配列は、配列番号651~配列番号672から選択される。
【0319】
例示的実施形態では、CDR3配列は、配列番号673~配列番号687;またはLGR;またはVIKから選択される。
【0320】
種々の実施形態では、Clec9A標的化部分は、次記の配列から選択されるアミノ酸配列を含む:R2CHCL8(配列番号688);R1CHCL50(配列番号689);R1CHCL21(配列番号690);R2CHCL87(配列番号691);R2CHCL24(配列番号692);R2CHCL38(配列番号693);R1CHCL16(配列番号694);R2CHCL10(配列番号695);R1CHCL34(配列番号696);R1CHCL82(配列番号697);R2CHCL3(配列番号698);R2CHCL69(配列番号699);R1CHCL56(配列番号700);R2CHCL32(配列番号701);R2CHCL49(配列番号702);R2CHCL53(配列番号703);R2CHCL22(配列番号704);R2CHCL25(配列番号705);R2CHCL18(配列番号706);R1CHCL23(配列番号707);R1CHCL27(配列番号708);R2CHCL13(配列番号709);R2CHCL14(配列番号710);R2CHCL42(配列番号711);R2CHCL41(配列番号712);R2CHCL94(配列番号713);またはR2CHCL27(配列番号714)。
【0321】
種々の実施形態では、Clec9A標的化部分は、後述のように少なくとも1つのCDR1、CDR2、および/またはCDR3配列を含む可変ドメインを有するVHHを含む。
【0322】
いくつかの実施形態では、CDR1配列は、配列番号715~配列番号780から選択される。
【0323】
いくつかの実施形態では、CDR2配列は、配列番号781~配列番号846から選択される。
【0324】
いくつかの実施形態では、CDR3配列は、配列番号847~配列番号912から選択される。
【0325】
種々の例示的実施形態では、Clec9A標的化部分は、次記の配列から選択されるアミノ酸配列を含む:1LEC7(配列番号913)。
【0326】
種々の例示的実施形態では、Clec9A標的化部分は、末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、HHHHHH:配列番号84)を含まない上記配列のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む。
【0327】
いくつかの実施形態では、Clec9A標的化部分は、HAタグ(すなわち、YPYDVPDYGS;配列番号85)を含まない配列番号913~978から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0328】
いくつかの実施形態では、Clec9A標的化部分は、AAAリンカーを含まない配列番号913~978(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0329】
いくつかの実施形態では、Clec9A標的化部分は、AAAリンカー、HAタグ、および末端ヒスチジンタグ配列(すなわち、AAAYPYDVPDYGSHHHHHH;配列番号86)を含まない配列番号913~978(上記で提供)から選択されるアミノ酸配列を含む。
【0330】
ある実施形態では、標的化部分は、Tullett et al.,JCI Insight.2016;1(7):e87102で開示の抗Clec9A抗体を含む。この文献の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。
【0331】
種々の実施形態では、本発明は、本明細書に記載の本発明のClec9Aを指向する標的化部分の任意の天然または合成類似体、変異体、バリアント、アレル、同族体およびオーソログ(本明細書では、ひとまとめにして「類似体」と呼ぶ)の使用を意図している。種々の実施形態では、Clec9Aを指向する標的化部分のアミノ酸配列は、アミノ酸類似体、アミノ酸誘導体、またはその他の非古典的アミノ酸をさらに含む。
【0332】
種々の実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに少なくとも60%同一であるアミノ酸配列を含む標的化部分を含む。例えば、キメラタンパク質は、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに、少なくとも約60%、少なくとも約61%、少なくとも約62%、少なくとも約63%、少なくとも約64%、少なくとも約65%、少なくとも約66%、少なくとも約67%、少なくとも約68%、少なくとも約69%、少なくとも約70%、少なくとも約71%、少なくとも約72%、少なくとも約73%、少なくとも約74%、少なくとも約75%、少なくとも約76%、少なくとも約77%、少なくとも約78%、少なくとも約79%、少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一(例えば、本明細書で開示の配列のうちのいずれか1つに約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、約99%または約100%の配列同一性)であるアミノ酸配列を含む標的化部分を含み得る。
【0333】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、限定されないが、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、および好酸球から選択される免疫細胞上の標的(例えば、抗原、受容体)を特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、抗原認識ドメインは、巨核球、血小板、赤血球、マスト細胞、好塩基球、好中球、および好酸球を、例えば、いくつかの実施形態では、治療部位(例えば、1つまたは複数の疾患細胞または治療効果を得るために調節されるべき細胞を有する部位)に、直接または間接的に動員する。
【0334】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、巨核球および/または血小板関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。巨核球および/または血小板抗原の例としては、例えば、GPIIb/IIIa、GPIb、vWF、PF4、およびTSPが挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的巨核球および/または血小板抗原を結合する標的化部分を含む。
【0335】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、赤血球関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。目的の赤血球抗原の例としては、例えば、CD34、CD36、CD38、CD41a(血小板糖タンパク質IIb/IIIa)、CD41b(GPIIb)、CD71(トランスフェリン受容体)、CD105、グリコホリンA、グリコホリンC、c-kit、HLA-DR、H2(MHC-II)、およびRh抗原が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの例示的赤血球抗原を結合する標的化部分を含む。
【0336】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、マスト細胞関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。目的のマスト細胞抗原の例としては、例えば、SCFR/CD117、FcεRI、CD2、CD25、CD35、CD88、CD203c、C5R1、CMAl、FCERlA、FCER2、TPSABlが挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらのマスト細胞抗原を結合する標的化部分を含む。
【0337】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、好塩基球関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。目的の好塩基球抗原の例としては、例えば、FcεRI、CD203c、CD123、CD13、CD107a、CD107b、およびCD164が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの好塩基球抗原を結合する標的化部分を含む。
【0338】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、好中球関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。目的の好中球抗原の例としては、例えば、7D5、CD10/CALLA、CD13、CD16(FcRIII)、CD18タンパク質(LFA-1、CR3、およびp150、95)、CD45、CD67、およびCD177が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの好中球抗原を結合する標的化部分を含む。
【0339】
いくつかの実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、好酸球関連標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。目的の好酸球抗原の例としては、例えば、CD35、CD44およびCD69が挙げられる。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの好酸球抗原を結合する標的化部分を含む。
【0340】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、当業者に既知の任意の適切な抗原または受容体または細胞表面マーカーに特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。いくつかの実施形態では、抗原または細胞表面マーカーは、組織特異的マーカーである。組織特異的マーカーの例としては、ACE、CD14、CD34、CDH5、ENG、ICAM2、MCAM、NOS3、PECAMl、PROCR、SELE、SELP、TEK、THBD、VCAMl、VWFなどの内皮細胞表面マーカー;ACTA2、MYHlO、MYHl 1、MYH9、MYOCDなどの平滑筋細胞表面マーカー;ALCAM、CD34、COLlAl、COL1A2、COL3A1、FAP、PH-4などの線維芽細胞(間質)細胞表面マーカー;CDlD、K6IRS2、KRTlO、KRT13、KRT17、KRT18、KRT19、KRT4、KRT5、KRT8、MUCl、TACSTDlなどの上皮細胞表面マーカー;CD13、TFNA、アルファ-v ベータ-3(αVβ3)、E-セレクチンなどの新生血管マーカー;およびADIPOQ、FABP4、およびRETNなどの脂肪細胞表面マーカーが挙げられるが、これらに限定されない。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数のこれらの抗原を結合する標的化部分を含む。
【0341】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、T細胞上に発現されるチェックポイントマーカー、例えば、PD-1、CD28、CTLA4、ICOS、BTLA、KIR、LAG3、CD137、OX40、CD27、CD40L、TIM3、およびA2aRのうちの1つまたは複数に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。
【0342】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、チェックポイントマーカー、例えば、PD-1/PD-L1またはPD-L2、CD28/CD80またはCD86、CTLA4/CD80またはCD86、ICOS/ICOSLまたはB7RP1、BTLA/HVEM、KIR、LAG3、CD137/CD137L、OX40/OX40L、CD27、CD40L、TIM3/Gal9、およびA2aRのうちの1つまたは複数に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。
【0343】
非限定的例であるが、種々の実施形態では、本多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、(i)CD8;(ii)T細胞上に発現されるチェックポイントマーカー、例えば、PD-1、CD28、CTLA4、ICOS、BTLA、KIR、LAG3、CD137、OX40、Cd27、CD40L、TIM3、およびA2aRのうちの1つまたは複数を指向する標的化部分を含み、および/または(iii)標的化部分は、本明細書に記載のうちのいずれかの改変(例えば、変異体)シグナル伝達物質と協調して、腫瘍細胞を指向する。
【0344】
種々の実施形態では、本多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、本明細書の他の場所で開示のPD-1結合VHHとは別に、PD-1を指向する1つまたは複数の標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1ポリペプチドを選択的に結合する1つまたは複数の標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-1ポリペプチドを選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、または融合タンパク質のうちの1つまたは複数を含む。いくつかの実施形態では、PD-1結合物質は、本明細書で開示の1種類または複数種類のシグナル伝達物質と共に、1種類または複数種類の下記で開示のPD-1結合物質を含む。
【0345】
ある実施形態では、標的化部分は、抗PD-1抗体ペムブロリズマブ(別名MK-3475、キイトルーダ)、またはそのフラグメントを含む。ペムブロリズマブおよびその他のヒト化抗PD-1抗体は、Hamid,et al.(2013)New England Journal of Medicine 369(2):134-44,US 8,354,509、および国際公開第2009/114335号に開示されている。これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するためのペムブロリズマブまたはその抗原結合フラグメントは、配列番号979のアミノ酸配列を含む重鎖および/または配列番号980のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0346】
ある実施形態では、標的化部分は、抗PD-1抗体、ニボルマブ(別名BMS-936558、MDX-1106、ONO-4538、オプジーボ)、またはそのフラグメントを含む。PD-1に特異的に結合するニボルマブ(クローン5C4)およびその他のヒトモノクローナル抗体は、米国特許第8,008,449号および国際公開第2006/121168号に開示されている。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、ニボルマブまたはその抗原結合フラグメントは、配列番号981のアミノ酸配列を含む重鎖および/または配列番号982のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0347】
ある実施形態では、標的化部分は、抗PD-1抗体ピディリズマブ(別名CT-011、hBATまたはhBAT-1)、またはそのフラグメントを含む。ピディリズマブおよびその他のヒト化抗PD-Iモノクローナル抗体は、米国特許出願公開第2008/0025980号および国際公開第2009/101611号に開示されている。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗PD-1抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2008/0025980の配列番号15~18:米国特許出願公開第2008/0025980の配列番号15(配列番号983);米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号16(配列番号984);米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号17(配列番号985);米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号18(配列番号986)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域、および/または米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号20~24:米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号20(配列番号987);米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号21(配列番号988);米国特許出願公開第2008号/0025980の配列番号22(配列番号989);米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号23(配列番号990);または米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号24(配列番号991)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖を含む。
【0348】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号18を含む軽鎖および米国特許出願公開第2008/0025980号の配列番号22を含む重鎖を含む。
【0349】
ある実施形態では、標的化部分は、AMP-514(別名MEDI-0680)を含む。
【0350】
ある実施形態では、標的化部分は、pd-l2-Fc融合タンパク質AMP-224を含み、これは、国際公開第2010/027827号および同第2011/066342号に開示されている。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。このような実施形態では、標的化部分は、国際公開第2010/027827号の配列番号4(配列番号992)を含む標的化ドメインおよび/または国際公開第2010/027827号の配列番号83(配列番号993)を含むB7-DC融合タンパク質を含み得る。
【0351】
ある実施形態では、標的化部分は、ペプチドAUNP12または米国特許出願公開第2011/0318373号または米国特許第8,907,053号に開示のうちのいずれかの他のペプチドを含む。例えば、標的化部分は、配列番号994の次記配列を有するAUNP12(すなわち、米国特許出願公開第2011/0318373号の化合物8または配列番号49)を含み得る:
SNTSESFK(SNTSESF)FRVTQLAPKAQIKE-NH2
【化2】
【0352】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、標的化部分は、抗PD-1抗体1E3またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための1E3またはその抗原結合フラグメントは、配列番号995のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号996のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0353】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、標的化部分は、抗PD-1抗体1E8またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための1E8またはその抗原結合フラグメントは、配列番号997のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号998のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0354】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、標的化部分は、抗PD-1抗体1H3またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための1H3またはその抗原結合フラグメントは、配列番号999のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1000のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0355】
ある実施形態では、標的化部分は、例えば、米国特許第8,907,065号および国際公開第2008/071447号に開示のように、PD-1を指向するVHHを含む。これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、PD-1に対するVHHは、米国特許第8,907,065号の配列番号347~351:米国特許第8,907,065号の配列番号347(配列番号1001);米国特許第8,907,065号の配列番号348(配列番号1002);米国特許第8,907,065号の配列番号349(配列番号1003);米国特許第8,907,065号の配列番号350(配列番号1004);または米国特許第8,907,065号の配列番号351(配列番号1005)を含む。
【0356】
いくつかの実施形態では、PD-1標的化部分は、位置11、37、44、45、47、83、84、103、104、および108(Kabatナンバリングによる)に1つまたは複数の置換を有する配列番号1001~1005から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、位置11のアミノ酸はL、M、S、V、またはWである。いくつかの実施形態では、位置37のアミノ酸はF、Y、H、I、L、またはVである。いくつかの実施形態では、位置44のアミノ酸はG、E、A、D、Q、R、S、またはLである。いくつかの実施形態では、位置45のアミノ酸はL、R、C、I、L、P、Q、またはVである。いくつかの実施形態では、位置47のアミノ酸はW、L、F、A、G、I、M、R、S、V、またはYである。いくつかの実施形態では、位置83のアミノ酸はR、K、N、E、G、I、M、Q、またはTである。いくつかの実施形態では、位置84のアミノ酸はP、A、L、R、S、T、D、またはVである。いくつかの実施形態では、位置103のアミノ酸はW、P、R、またはS;位置104のGまたはDである。いくつかの実施形態では、位置108のアミノ酸はQ、L、またはRである。
【0357】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2011/0271358号および国際公開第2010/036959号に開示のように、抗PD-1抗体またはそのフラグメントのうちのいずれか1種類を含み、これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号25~29:米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号25(配列番号1006);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号26(配列番号1007);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号27(配列番号1008);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号28(配列番号1009);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号29(配列番号1010)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖;および/または米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号30~33:米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号30(配列番号1011);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号31(配列番号1012);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号32(配列番号1013);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号33(配列番号1014)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0358】
種々の実施形態では、本多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、TSR-042(Tesaro,Inc.)、REGN2810(Regeneron Pharmaceuticals,Inc.)、PDR001(Novartis Pharmaceuticals)、およびBGB-A317(BeiGene Ltd.)から選択されるPD-1を指向する1つまたは複数の抗体、またはその抗体フラグメントを含む。
【0359】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-L1を指向する1つまたは複数の標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-L1ポリペプチドに選択的に結合する1つまたは複数の標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-L1ポリペプチドに選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、または融合タンパク質のうちの1つまたは複数を含む。いくつかの実施形態では、PD-L1結合物質は、本明細書で開示の1種類または複数種類のシグナル伝達物質と共に、1種類または複数種類の下記で開示のPD-1結合物質を含む。
【0360】
ある実施形態では、標的化部分は、抗PD-L1抗体MEDI4736(別名デュルバルマブ)、またはそのフラグメントを含む。MEDI4736は、PD-L1に対し選択的であり、PD-L1のPD-1およびCD80受容体に対する結合を阻止する。本明細書で提供される方法で使用するためのMEDI4736およびその抗原結合フラグメントは、重鎖および軽鎖または重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含む。MEDI4736の配列は、国際公開第2016/06272号に開示され、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するためのMEDI4736またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1015のアミノ酸配列を含む重鎖および/または配列番号1016のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0361】
例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するためのMEDI4736またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2016/06272号の配列番号4(配列番号1017)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2016/06272号の配列番号3(配列番号1018)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0362】
ある実施形態では、標的化部分は、抗PD-L1抗体アテゾリズマブ(別名MPDL3280A、RG7446)、またはそのフラグメントを含む。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するためのアテゾリズマブまたはその抗原結合フラグメントは、配列番号1019のアミノ酸配列を含む重鎖;および/または配列番号1020のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0363】
ある実施形態では、標的化部分は、抗PD-L1抗体アベルマブ(別名MSB0010718C)、またはそのフラグメントを含む。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するためのアテゾリズマブまたはその抗原結合フラグメントは、配列番号1021のアミノ酸配列を含む重鎖;および/または配列番号1022のアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0364】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体BMS-936559(別名12A4、MDX-1105)、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するためのBMS-936559またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1023のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1024のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0365】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体3G10、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための3G10またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1025のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1026のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0366】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体10A5、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための10A5またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1027のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1028のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0367】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体5F8、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための5F8またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1029のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1030のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0368】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体10H10、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための10H10またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1031のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1032のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0369】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体1B12、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための1B12またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1033のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1034のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0370】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体7H1、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法での使用のための7H1またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1035のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1036のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0371】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体11E6、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための11E6またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1037のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1038のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0372】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体12B7、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための12B7またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1039のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1040のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0373】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2013/0309250号および国際公開第2007/005874号に開示のように、抗PD-L1抗体13G4、またはそのフラグメントを含む。これら特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための13G4またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1041のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1042のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0374】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体1E12またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための1E12またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1043アミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1044のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0375】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体1F4またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための1F4またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1045のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1046のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0376】
ある実施形態では、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2G11またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2G11またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1047のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1048のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0377】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号に開示のように、抗PD-L1抗体3B6、またはそのフラグメントを含む。この特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための3B6またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1049のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1050のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0378】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2014/0044738号および国際公開第2012/145493号に開示のように、抗PD-L1抗体3D10、またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための3D10またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1051のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1052のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0379】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2011/0271358号および国際公開第2010/036959号に開示のうちのいずれか1種類の抗PD-L1抗体を含む。これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号34~38:米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号34(配列番号1053);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号35(配列番号1054);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号36(配列番号1055);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号37(配列番号1056);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号38(配列番号1057)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖;および/または米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号39~42:米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号39(配列番号1058);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号40(配列番号1059);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号41(配列番号1060);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号42(配列番号1061)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0380】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2.7A4またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2.7A4またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号2(配列番号1062)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1063のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0381】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2.9D10またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2.9D10またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号12(配列番号1064)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1065のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0382】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2.14H9またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2.14H9またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号22(配列番号1066)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2011/066389号の配列番号27(配列番号1067)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0383】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2.20A8またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2.20A8またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号32(配列番号1068)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2011/066389号の配列番号37(配列番号1069)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0384】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体3.15G8またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための3.15G8またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号42(配列番号1070)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2011/066389号の配列番号47(配列番号1071)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0385】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体3.18G1またはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための3.18G1またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号52(配列番号1072)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2011/066389号の配列番号57(配列番号1073)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0386】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2.7A4OPTまたはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2.7A4OPTまたはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号62(配列番号1074)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2011/066389号の配列番号67(配列番号1075)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0387】
ある実施形態では、国際公開第2011/066389号、米国特許第8,779,108号、および米国特許出願公開第2014/0356353号に開示のように、標的化部分は、抗PD-L1抗体2.14H9OPTまたはそのフラグメントを含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための2.14H9OPTまたはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2011/066389号の配列番号72(配列番号1076)のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または国際公開第2011/066389号の配列番号77(配列番号1077)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0388】
ある実施形態では、標的化部分は、国際公開第2016/061142号に開示されるいずれか1種類の抗PD-L1抗体を含む。この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗体またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2016/061142号の配列番号18、30、38、46、50、54、62、70、および78:国際公開第2016/061142号の配列番号18(配列番号1078);国際公開第2016/061142号の配列番号30(配列番号1079);国際公開第2016/061142号の配列番号38(配列番号1080);国際公開第2016/061142号の配列番号46(配列番号1081);国際公開第2016/061142号の配列番号50(配列番号1082);国際公開第2016/061142号の配列番号54(配列番号1083);国際公開第2016/061142号の配列番号62(配列番号1084);国際公開第2016/061142号の配列番号70(配列番号1085);国際公開第2016/061142号の配列番号78(配列番号1086)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖;および/または、国際公開第2016/061142号の配列番号22、26、34、42、58、66、74、82、および86:国際公開第2016/061142号の配列番号22(配列番号1087);国際公開第2016/061142号の配列番号26(配列番号1088);国際公開第2016/061142号の配列番号34(配列番号1089);国際公開第2016/061142号の配列番号42(配列番号1090);国際公開第2016/061142号の配列番号58(配列番号1091);国際公開第2016/061142号の配列番号66(配列番号1092);国際公開第2016/061142号の配列番号74(配列番号1093);国際公開第2016/061142号の配列番号82(配列番号1094);国際公開第2016/061142号の配列番号86(配列番号1095)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0389】
ある実施形態では、標的化部分は、国際公開第2016/022630号に開示されるいずれか1種類の抗PD-L1抗体を含む。この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗体またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2016/022630号の配列番号2、6、10、14、18、22、26、30、34、38、42、および46:国際公開第2016/022630号の配列番号2(配列番号1096);国際公開第2016/022630号の配列番号6(配列番号1097);国際公開第2016/022630号の配列番号10(配列番号1098);国際公開第2016/022630号の配列番号14(配列番号1099);国際公開第2016/022630号の配列番号18(配列番号1100);国際公開第2016/022630号の配列番号22(配列番号1101);国際公開第2016/022630号の配列番号26(配列番号1102);国際公開第2016/022630号の配列番号30(配列番号1103);国際公開第2016/022630号の配列番号34(配列番号1104);国際公開第2016/022630号の配列番号38(配列番号1105);国際公開第2016/022630号の配列番号42(配列番号1106);国際公開第2016/022630号の配列番号46(配列番号1107)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖;および/または、国際公開第2016/022630号の配列番号4、8、12、16、20、24、28、32、36、40、44、および48:国際公開第2016/022630号の配列番号4(配列番号1108);国際公開第2016/022630号の配列番号8(配列番号1109);国際公開第2016/022630号の配列番号12(配列番号1110);国際公開第2016/022630号の配列番号16(配列番号1111);国際公開第2016/022630号の配列番号20(配列番号1112);国際公開第2016/022630号の配列番号24(配列番号1113);国際公開第2016/022630号の配列番号28(配列番号1114);国際公開第2016/022630号の配列番号32(配列番号1115);国際公開第2016/022630号の配列番号36(配列番号1116);国際公開第2016/022630号の配列番号40(配列番号1117);国際公開第2016/022630号の配列番号44(配列番号1118);国際公開第2016/022630号の配列番号48(配列番号1119)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0390】
ある実施形態では、標的化部分は、国際公開第2015/112900号に開示されるいずれか1種類の抗PD-L1抗体を含む。この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗体またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2015/112900号の配列番号38、50、82、および86:国際公開第2015/112900号の配列番号38(配列番号1120);国際公開第2015/112900号の配列番号50(配列番号1121);国際公開第2015/112900号の配列番号82(配列番号1122);国際公開第2015/112900号の配列番号86(配列番号1123)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖;および/または国際公開第2015/112900号の配列番号42、46、54、58、62、66、70、74、および78:国際公開第2015/112900号の配列番号42(配列番号1124);国際公開第2015/112900号の配列番号46(配列番号1125);国際公開第2015/112900号の配列番号54(配列番号1126);国際公開第2015/112900号の配列番号58(配列番号1127);国際公開第2015/112900号の配列番号62(配列番号1128);国際公開第2015/112900号の配列番号66(配列番号1129);国際公開第2015/112900号の配列番号70(配列番号1130);国際公開第2015/112900号の配列番号74(配列番号1131);国際公開第2015/112900号の配列番号78(配列番号1132)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0391】
ある実施形態では、標的化部分は、国際公開第2010/077634号および米国特許第8,217,149号に開示されるいずれか1種類の抗PD-L1抗体を含む。これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗PD-L1またはその抗原結合フラグメントは、国際公開第2010/077634号の配列番号20(配列番号1133)のアミノ酸配列を含む重鎖領域;および/または国際公開第2010/077634号の配列番号21(配列番号1134)のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0392】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第20120039906号に開示されているように、CNCM受託番号CNCM I-4122、CNCM I-4080およびCNCM I-4081により入手可能なハイブリドーマから得ることができるいずれか1種類の抗PD-L1抗体を含む。これらの特許の全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0393】
ある実施形態では、標的化部分は、例えば、米国特許第8,907,065号および国際公開第2008/071447号に開示のように、PD-L1抗体を指向するVHHを含む。これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、PD-L1に対するVHHは、米国特許第8,907,065号の配列番号394~399:米国特許第8,907,065号の配列番号394(配列番号1135);米国特許第8,907,065号の配列番号395(配列番号1136);米国特許第8,907,065号の配列番号396(配列番号1137);米国特許第8,907,065号の配列番号397(配列番号1138);米国特許第8,907,065号の配列番号398(配列番号1139);米国特許第8,907,065号の配列番号399(配列番号1140)を含む。
【0394】
いくつかの実施形態では、PD-L1標的化部分は、位置11、37、44、45、47、83、84、103、104、および108(Kabatナンバリングによる)に1つまたは複数の置換を有する配列番号1135~1140から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、位置11のアミノ酸はL、M、S、V、またはWである。いくつかの実施形態では、位置37のアミノ酸はF、Y、H、I、L、またはVである。いくつかの実施形態では、位置44のアミノ酸はG、E、A、D、Q、R、S、またはLである。いくつかの実施形態では、位置45のアミノ酸はL、R、C、I、L、P、Q、またはVである。いくつかの実施形態では、位置47のアミノ酸はW、L、F、A、G、I、M、R、S、V、またはYである。いくつかの実施形態では、位置83のアミノ酸はR、K、N、E、G、I、M、Q、またはTである。いくつかの実施形態では、位置84のアミノ酸はP、A、L、R、S、T、D、またはVである。いくつかの実施形態では、位置103のアミノ酸はW、P、R、またはS;位置104のGまたはDである。いくつかの実施形態では、位置108のアミノ酸はQ、L、またはRである。
【0395】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-L2を指向する1つまたは複数の標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-L2ポリペプチドに選択的に結合する1つまたは複数の標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PD-L2ポリペプチドを選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、または融合タンパク質のうちの1つまたは複数を含む。
【0396】
ある実施形態では、標的化部分は、例えば、米国特許第8,907,065号および国際公開第2008/071447号に開示のように、PD-L2を指向するVHHを含む。これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、PD-1に対するVHHは、米国特許第8,907,065号の配列番号449~455:米国特許第8,907,065号の配列番号449(配列番号1141);米国特許第8,907,065号の配列番号450(配列番号1142);米国特許第8,907,065号の配列番号451(配列番号1143);米国特許第8,907,065号の配列番号452(配列番号1144);米国特許第8,907,065号の配列番号453(配列番号1145);米国特許第8,907,065号の配列番号454(配列番号1146);または米国特許第8,907,065号の配列番号455(配列番号1147)を含む。
【0397】
いくつかの実施形態では、PD-L2標的化部分は、位置11、37、44、45、47、83、84、103、104、および108(Kabatナンバリングによる)に1つまたは複数の置換を有する配列番号1141~1147から選択されるアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、位置11のアミノ酸はL、M、S、V、またはWである。いくつかの実施形態では、位置37のアミノ酸はF、Y、H、I、L、またはVである。いくつかの実施形態では、位置44のアミノ酸はG、E、A、D、Q、R、S、またはLである。いくつかの実施形態では、位置45のアミノ酸はL、R、C、I、L、P、Q、またはVである。いくつかの実施形態では、位置47のアミノ酸はW、L、F、A、G、I、M、R、S、V、またはYである。いくつかの実施形態では、位置83のアミノ酸はR、K、N、E、G、I、M、Q、またはTである。いくつかの実施形態では、位置84のアミノ酸はP、A、L、R、S、T、D、またはVである。いくつかの実施形態では、位置103のアミノ酸はW、P、R、またはS;位置104のGまたはDである。いくつかの実施形態では、位置108のアミノ酸はQ、L、またはRである。
【0398】
種々の実施形態では、PD-L2標的化部分は、少なくとも1つのCDR1、CDR2、および/またはCDR3配列を含む可変ドメインを有するVHHを含む。種々の実施形態では、PD-L2結合物質は、少なくとも1つのFR1、FR2、FR3、および/またはFR4配列を含む可変領域を有するVHHを含む。
【0399】
いくつかの実施形態では、PD-L2 CDR1配列は、配列番号1148~配列番号1154から選択される。
【0400】
いくつかの実施形態では、PD-L2 CDR2配列は、配列番号1155~配列番号1161から選択される。
【0401】
いくつかの実施形態では、PD-L2 CDR3配列は、配列番号1162~配列番号1168から選択される。
【0402】
ある実施形態では、標的化部分は、米国特許出願公開第2011/0271358号および国際公開第2010/036959号に開示のうちのいずれか1種類の抗PD-L2抗体を含む。これらの特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。例示的実施形態では、本明細書で提供される方法で使用するための抗体またはその抗原結合フラグメントは、米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号43~47:米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号43(配列番号1169);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号44(配列番号1170);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号45(配列番号1171);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号46(配列番号1172);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号47(配列番号1173)から選択されるアミノ酸配列を含む重鎖;および/または米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号48~51:米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号48(配列番号1174);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号49(配列番号1175);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号50(配列番号1176);米国特許出願公開第2011/0271358号の配列番号51(配列番号1177)から選択されるアミノ酸配列を含む軽鎖を含む。
【0403】
種々の実施形態では、本発明の標的化部分は、本明細書で開示の配列のうちのいずれかに少なくとも約60%、少なくとも約61%、少なくとも約62%、少なくとも約63%、少なくとも約64%、少なくとも約65%、少なくとも約66%、少なくとも約67%、少なくとも約68%、少なくとも約69%、少なくとも約70%、少なくとも約71%、少なくとも約72%、少なくとも約73%、少なくとも約74%、少なくとも約75%、少なくとも約76%、少なくとも約77%、少なくとも約78%、少なくとも約79%、少なくとも約80%、少なくとも約81%、少なくとも約82%、少なくとも約83%、少なくとも約84%、少なくとも約85%、少なくとも約86%、少なくとも約87%、少なくとも約88%、少なくとも約89%、少なくとも約90%、少なくとも約91%、少なくとも約92%、少なくとも約93%、少なくとも約94%、少なくとも約95%、少なくとも約96%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、少なくとも約99%、または100%同一(例えば、本明細書で開示の配列のうちのいずれかと約60%、または約61%、または約62%、または約63%、または約64%、または約65%、または約66%、または約67%、または約68%、または約69%、または約70%、または約71%、または約72%、または約73%、または約74%、または約75%、または約76%、または約77%、または約78%、または約79%、または約80%、または約81%、または約82%、または約83%、または約84%、または約85%、または約86%、または約87%、または約88%、または約89%、または約90%、または約91%、または約92%、または約93%、または約94%、または約95%、または約96%、または約97%、または約98%、約99%または約100%の配列同一性)である、PD-1、PD-L1、および/またはPD-L2を標的とする配列を含み得る。
【0404】
種々の実施形態では、本発明の標的化部分は、本明細書で開示のPD-1、PD-L1、および/またはPD-L2を標的とする重鎖、軽鎖、重鎖可変領域、軽鎖可変領域、相補性決定領域(CDR)、およびフレームワーク領域配列のいずれの組み合わせを含み得る。
【0405】
PD-1、PD-L1および/またはPD-L2を選択的に結合するかあるいは標的にする追加の抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチドまたは融合タンパク質は、国際公開第2011/066389号、米国特許出願公開第2008/0025980号、米国特許出願公開第2013/0034559号、米国特許第8,779,108号、米国特許出願公開第2014/0356353号、米国特許第8,609,089号、米国特許出願公開第2010/028330号、米国特許出願公開第2012/0114649号、国際公開第2010/027827号、国際公開第2011/066342号、米国特許第8,907,065号、国際公開第2016/062722号、国際公開第2009/101611号、国際公開第2010/027827号、国際公開第2011/066342号、国際公開第2007/005874号、国際公開第2001/014556号、米国特許出願公開第2011/0271358号、国際公開第2010/036959号、国際公開第2010/077634号、米国特許第8,217,149号、米国特許出願公開第2012/0039906号、国際公開第2012/145493号、米国特許出願公開第2011/0318373号、米国特許第8,779,108号、米国特許出願公開第2014/0044738号、国際公開第2009/089149号、国際公開第2007/00587号、国際公開第2016/061142号、国際公開第2016/02263号、国際公開第2010/077634号、および国際公開第2015/112900号で開示されている。これらの特許の全開示は参照により本明細書に組み込まれる。
【0406】
種々の実施形態では、本技術の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、シグナル調節タンパク質α-1(SIRP1α)に対する標的化部分を含む。SIRP1α(SIRPαとしても知られる)は、阻害性(SIRPα)、活性化(SIRPβ)、非シグナル伝達性(SIRPγ)および可溶性(SIRPδ)のメンバーを包含する細胞免疫受容体ファミリーに属する。SIRP1αは、主に、マクロファージ、顆粒球、骨髄細胞(DC)、マスト細胞、および造血幹細胞を含むそれらの前駆物質で発現される。SIRP1αは、広範に発現される膜貫通型糖タンパク質CD47と相互作用して食作用を調節する抑制性受容体として作用する。特に、標的細胞上に発現されるCD47によるマクロファージ上のSIRP1αの結合は、標的細胞の食作用を負に調節する抑制シグナルを生成する。
【0407】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、マクロファージ上のSIRP1αを特異的に認識して結合する標的化部分である。
【0408】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、単球上のSIRP1αを特異的に認識して結合する標的化部分である。
【0409】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、TAM上のSIRP1αを特異的に認識して結合する標的化部分である。
【0410】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、限定されないが、cDC2およびpDCを含む樹状細胞上のSIRP1αを特異的に認識して結合する標的化部分である。
【0411】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αを認識する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、SIRP1α上に存在する1つまたは複数の線形エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、線形エピトープは、SIRP1α上に存在するアミノ酸の任意の連続配列を指す。別の実施形態では、抗原認識ドメインは、SIRP1α上に存在する1つまたは複数の立体構造エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、立体構造エピトープは、抗原認識ドメインにより認識できる特徴および/または形状および/または三次構造を備えた3次元表面を形成する1つまたは複数のアミノ酸の部分(これは不連続であってよい)を指す。
【0412】
いくつかの実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αの完全長型および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然または合成の類似体、バリアント、または変異体に結合し得る。ある実施形態では、SIRP1αはヒトSIRP1αである。種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、モノマー、ダイマー、ヘテロダイマー、マルチマーおよび会合型を含む、任意の形態のヒトSIRP1αに結合し得る。ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、モノマー型のSIRP1αに結合する。別の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、ダイマー型のSIRP1αに結合する。
【0413】
ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、ヒトSIRP1α上に存在する1つまたは複数のエピトープを認識する認識ドメインを含む。ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、シグナルペプチド配列を有するヒトSIRP1αを認識する認識ドメインを含む。シグナルペプチド配列を有する代表的ヒトSIRP1αポリペプチドは、配列番号1178である。
【0414】
ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、シグナルペプチド配列のないヒトSIRP1αを認識する認識ドメインを含む。シグナルペプチド配列のない代表的ヒトSIRP1αポリペプチドは、配列番号1179である。
【0415】
ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、ヒトSIRP1αアイソフォーム2(配列番号1180)をコードするポリペプチドを認識する認識ドメインを含む。
【0416】
ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、ヒトSIRP1αアイソフォーム4(配列番号1181)をコードするポリペプチドを認識する認識ドメインを含む。
【0417】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、抗体またはその誘導体などの、特異的結合の可能な任意のタンパク質ベース物質であり得る。ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、抗体を含む。種々の実施形態では、抗体は、2つの重鎖および2つの軽鎖を含む完全長マルチマータンパク質である。それぞれの重鎖は、1つの可変領域(例えば、VH)および少なくとも3つの定常領域(例えば、CH1、CH2およびCH3)を含み、それぞれの軽鎖は、1つの可変領域(VL)および1つの定常領域(CL)を含む。可変領域は抗体の特異性を決定する。それぞれの可変領域は、4つの比較的保存されたフレームワーク領域(FR)により挟まれた、相補性決定領域(CDR)としても知られる、3つの高頻度可変領域を含む。3つのCDRは、CDR1、CDR2、およびCDR3と呼ばれ、抗体の結合特異性に寄与する。いくつかの実施形態では、抗体はキメラ抗体である。いくつかの実施形態では、抗体はヒト化抗体である。
【0418】
いくつかの実施形態では、SIRP1α標的化部分は、抗体誘導体またはフォーマットを含む。いくつかの実施形態では、本発明のSIRP1α標的化部分は、単一ドメイン抗体、組み換え型の重鎖抗体(重鎖抗体)(VHH)、単鎖抗体(scFv)、サメの重鎖抗体(VNAR)、マイクロタンパク質(システインノットタンパク質、ノッチン)、DARPin;テトラネクチン;アフィボディ;トランスボディ;アンチカリン;アドネクチン;アフィリン;ミクロボディ;ペプチドアプタマー;alterase;プラスチック抗体;フィロマー;ストラドボディ;マキシボディ;エビボディ;フィノマー;アルマジロリピートタンパク質(armadillo repeat protein);クニッツドメイン、アビマー、アトリマー、プロボディ、イムノボディ、トリオマブ、トロイボディ、ペプボディ、ワクシボディ、ユニボディ;アフィマー、デュオボディ、Fv、Fab、Fab’、F(ab’)2、ペプチド模倣分子、または合成分子である。これらは、その全内容が参照により本明細書に組み込まれる、米国特許第7,417,130号、米国特許出願公開第2004/132094号、米国特許第5,831,012号、米国特許出願公開第2004/023334号、米国特許第7,250,297号、米国特許第6,818,418号、米国特許出願公開第2004/209243号、米国特許第7,838,629号、米国特許第7,186,524号、米国特許第6,004,746号、米国特許第5,475,096号、米国特許出願公開第2004/146938号、米国特許出願公開第2004/157209号、米国特許第6,994,982号、米国特許第6,794,144号、米国特許出願公開第2010/239633号、米国特許第7,803,907号、米国特許出願公開第2010/119446号、および/または米国特許第7,166,697号に記載されている。Storz MAbs.2011 May-Jun;3(3):310-317、も参照されたい。
【0419】
一実施形態では、SIRP1α標的化部分は、例えば、ラクダ類、サメなどのVHH抗体を産生する生物由来のVHH、または設計されたVHHなどの単一ドメイン抗体を含む。VHHは、天然起源の重鎖抗体の特有の構造および機能特性を含む、抗体由来の治療用タンパク質である。VHH技術は、軽鎖を欠くラクダ類由来の完全に機能的な抗体に基づいている。これらの重鎖抗体は、単一可変ドメイン(VHH)および2つの定常ドメイン(CH2およびCH3)を含む。
【0420】
ある実施形態では、SIRP1α標的化部分は、VHHを含む。いくつかの実施形態では、VHHは、ヒト化VHHまたはラクダ化VHHである。
【0421】
いくつかの実施形態では、VHHは、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODY(Crescendo Biologics,Cambridge,UK)を含む。いくつかの実施形態では、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODYは、一価、二価、または三価である。いくつかの実施形態では、完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODYは、単一特異性、二重特異性、または三重特異性などの単一特異性または多重特異性である。例示完全ヒトVHドメイン、例えば、HUMABODIESは、例えば、国際公開第2016/113555号および国際公開第2016/113557号に記載されている。これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0422】
例えば、いくつかの実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αを選択的に結合する、抗体、抗体誘導体もしくはフォーマット、ペプチドもしくはポリペプチド、VHH、または融合タンパク質のうちの1つまたは複数を含む。いくつかの実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αに特異的に結合する抗体またはこれらの誘導体を含む。いくつかの実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αに特異的に結合するラクダ類重鎖抗体(VHH)である。
【0423】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αを認識およびそれに結合することが既知である、重鎖、軽鎖、重鎖可変領域、軽鎖可変領域、相補性決定領域(CDR)、およびフレームワーク領域配列のうちのいずれかの組み合わせを含み得る。
【0424】
種々の実施形態では、本技術は、本明細書で記載のSIRP1α標的化部分の任意の天然または合成類似体、変異体、バリアント、アレル、ホモログおよびオルソログ(本明細書では、ひとまとめにして「類似体」と呼ぶ)の使用を意図している。種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分のアミノ酸配列は、アミノ酸類似体、アミノ酸誘導体、またはその他の非古典的アミノ酸をさらに含む。
【0425】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αを認識し、それに結合することが既知のうちのいずれかの標的化部分配列に対して1つまたは複数のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む。種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、SIRP1αを認識し、それに結合することが既知のうちのいずれかの標的化部分配列に対して、1個、または2個、または3個、または4個、または5個、または6個、または7個、または8個、または9個、または10個、または15個、20個、30個、40個、または50個のアミノ酸変異を有するアミノ酸配列を含む。いくつかの実施形態では、1つまたは複数のアミノ酸変異は、置換、挿入、欠失、および短縮化から独立に選択され得る。
【0426】
いくつかの実施形態では、アミノ酸変異は、アミノ酸置換であり、保存的および/または非保存的置換を含み得る。
【0427】
「保存的置換」は、例えば、関与するアミノ酸残基の極性、電荷、サイズ、溶解度、疎水性、親水性、および/または両親媒特性の類似性に基づいて行われ得る。20種類の天然アミノ酸は、次の6つの標準的アミノ酸グループに分類できる:(1)疎水性:Met、Ala、Val、Leu、Ile;(2)中性親水性:Cys、Ser、Thr;Asn、Gln;(3)酸性:Asp、Glu;(4)塩基性:His、Lys、Arg;(5)鎖配向に影響を与える残基:Gly、Pro;および(6)芳香族:Trp、Tyr、Phe。
【0428】
本明細書で使用される場合、「保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸グループの同じグループ内に記載の別のアミノ酸による交換として定義される。例えば、AspのGluによる交換は、そのように改変されたポリペプチド中で1つの負電荷を保持する。さらに、グリシンおよびプロリンは、それらのαヘリックスを破壊する能力に基づいて相互に置換され得る。
【0429】
本明細書で使用される場合、「非保存的置換」は、あるアミノ酸の、上記6つの標準的アミノ酸グループ(1)~(6)の異なるグループに記載の別のアミノ酸による交換として定義される。
【0430】
種々の実施形態では、置換は非古典的アミノ酸も含んでよい。代表的非古典的アミノ酸としては、限定されないが、セレノシステイン、ピロールリジン、N-ホルミルメチオニンβ-アラニン、GABAおよびδ-アミノレブリン酸、4-アミノ安息香酸(PABA)、共通アミノ酸のD-異性体、2,4-ジアミノ酪酸、α-アミノイソ酪酸、4-アミノ酪酸、Abu、2-アミノ酪酸、γ-Abu、ε-Ahx、6-アミノヘキサン酸、Aib、2-アミノイソ酪酸、3-アミノプロピオン酸、オルニチン、ノルロイシン、ノルバリン、ヒドロキシプロリン、サルコシン、シトルリン、ホモシトルリン、システイン酸、t-ブチルグリシン、t-ブチルアラニン、フェニルグリシン、シクロヘキシルアラニン、β-アラニン、フルオロアミノ酸、βメチルアミノ酸などのデザイナーアミノ酸、C α-メチルアミノ酸、N α-メチルアミノ酸、およびアミノ酸類似体一般が挙げられる。
【0431】
種々の実施形態では、アミノ酸変異は、標的化部分のCDR(例えば、CDR1、CDR2またはCDR3領域)中にあってもよい。別の実施形態では、アミノ酸変化は、標的化部分のフレームワーク領域(FR)(例えば、FR1、FR2、FR3、またはFR4領域)中にあってもよい。
【0432】
アミノ酸配列の改変は、任意の当該技術分野において、周知の技術、例えば、部位特異的変異誘発またはPCRベース変異誘発を用いて実現され得る。このような技術は、例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Press,Plainview,N.Y.,1989 and Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley & Sons,New York,N.Y.,1989に記載されている。
【0433】
種々の実施形態では、変異は、SIRP1αを特異的に認識し、それに結合するSIRP1α標的化部分の能力を実質的に低下させない。種々の実施形態では、変異は、SIRP1αに特異的に結合するSIRP1α標的化部分の能力を実質的に低下させず、また、SIRP1αを機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に中和する)こともない。
【0434】
種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、目的の抗原、すなわち、SIRP1αを結合するが機能的に調節しない。例えば、種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、抗原を標的とするのみであり、抗原が有する生物学的作用を実質的に機能的に調節(例えば、部分的にまたは完全に阻害するかあるいは中和することを)しない。種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、その生物活性にとって重要な抗原部位(例えば、抗原の活性部位)から物理的に離れたエピトープを結合する。
【0435】
他の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、目的の抗原、すなわち、SIRP1αを結合し機能的に調節する。例えば、種々の実施形態では、SIRP1α標的化部分は、抗原、すなわち、SIRP1αを標的とし、さらに、抗原が有する生物学的作用を機能的に調節する(例えば、部分的にまたは完全に阻害または中和する)。このような結合は、機能的調節と共に、本発明のキメラタンパク質がエフェクター抗原を介して必要な部位に活性免疫細胞を直接的にまたは間接的に動員するのに用いられる方法を含む、本発明の種々の実施形態で使用される。
【0436】
種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、例えばDC上で、XCR1に特異的に結合する抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。種々の実施形態では、本発明の多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、XCL1の全体または一部を含む抗原認識ドメインを有する標的化部分を含む。
【0437】
種々の実施形態では、多重特異的PD-1またはPD-L1結合物質は、非細胞構造の一部である標的(例えば、抗原、受容体)に特異的に結合する認識ドメインを有する標的化部分を有する。いくつかの実施形態では、抗原または受容体は、無傷の細胞または細胞構造の不可欠な構成要素ではない。いくつかの実施形態では、抗原または受容体は、細胞外の抗原または受容体である。いくつかの実施形態では、標的は、非タンパク質性の非細胞マーカーであり、これらは、限定されないが、例えば、壊死腫瘍細胞から放出されたDNA、などのDNAまたはRNAを含む、核酸またはコレステロールなどの細胞外沈着物を含む。
【0438】
いくつかの実施形態では、目的の標的(例えば、抗原、受容体)は、ストローマもしくは細胞外マトリックス(ECM)の非細胞成分またはそれと関連するマーカーの一部である。本明細書で使用される場合、ストローマは、組織または器官の連結および支持フレームワークを指す。ストローマは、細胞外マトリックス(ECM)および細胞外分子と共に線維芽細胞/筋線維芽細胞/膠細胞、上皮、脂肪、免疫、血管、平滑筋、および免疫細胞などの細胞の寄せ集めを含み得る。種々の実施形態では、目的の標的(例えば、抗原、受容体)は、細胞外マトリックスおよび細胞外分子などのストローマの非細胞成分の一部である。本明細書で使用される場合、ECMは、全ての組織および器官内に存在する非細胞成分を指す。ECMは、限定されないが、タンパク質、糖タンパク質、プロテオグリカン、および多糖類を含む生化学的に別々の成分の多数の集まりからなる。これらのECM成分は通常、隣接する細胞により産生され、エキソサイトーシスによりECM中に分泌される。分泌されると、ECM成分は多くの場合、集合して、巨大分子の複合体ネットワークを形成する。種々の実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、ECMの任意の成分上に位置する標的(例えば、抗原または受容体または非タンパク質分子)を認識する標的化部分を含む。ECMの成分の例としては、限定されないが、プロテオグリカン、非プロテオグリカン多糖類、繊維および他のECMタンパク質またはECM非タンパク質、例えば、多糖類および/または脂質、またはECM関連分子(例えば、タンパク質または非タンパク質、例えば、多糖類、核酸および/または脂質)が挙げられる。
【0439】
いくつかの実施形態では、標的化部分は、ECMプロテオグリカン上の標的(例えば、抗原、受容体)を認識する。プロテオグリカンはグリコシル化タンパク質である。塩基性プロテオグリカン単位は、1つまたは複数の共有結合グリコサミノグリカン(GAG)鎖を有するコアタンパク質を含む。プロテオグリカンは、正電荷のナトリウムイオン(Na+)を引き付ける正味負電荷を有し、これは、浸透を介して水を引き付け、ECMおよび常在性細胞を水和した状態に保持する。プロテオグリカンはまた、成長因子を捕捉し、ECM内に貯蔵し得る。本発明のキメラタンパク質により標的とされ得るプロテオグリカンの例としては、ヘパラン硫酸、コンドロイチン硫酸、およびケラタン硫酸が挙げられるが、これらに限定されない。ある実施形態では、標的化部分は、ヒアルロン酸などの非プロテオグリカン多糖類上の標的(例えば、抗原、受容体)を認識する。
【0440】
いくつかの実施形態では、標的化部分は、ECM繊維上の標的(例えば、抗原、受容体)を認識する。ECM繊維は、コラーゲン繊維およびエラスチン繊維を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、コラーゲンまたはコラーゲン繊維上の1つまたは複数のエピトープを認識する。コラーゲンは、ECM中で最も豊富なタンパク質である。コラーゲンはECM中に線維性タンパク質として存在し、常在性細胞に対し構造支持を与える。1つまたは複数の実施形態では、標的化部分は、限定されないが、線維性コラーゲン(I、II、III、V、XI型)、FACITコラーゲン(IX、XII、XIV型)、短鎖コラーゲン(VIII、X型)、基底膜コラーゲン(IV型)、および/またはVI、VII、またはXIII型コラーゲンを含む、ECM内に存在する様々な種類のコラーゲンを認識し、これに結合する。エラスチン繊維は、組織に弾性を与え、組織が必要に応じ伸縮し、その後、元の状態に戻ることを可能にする。いくつかの実施形態では、標的化部分は、エラスチンまたはエラスチン繊維上の1つまたは複数のエピトープを認識する。
【0441】
いくつかの実施形態では、標的化部分は、限定されないが、テネイシン、フィブロネクチン、フィブリン、ラミニン、またはナイドジェン/エンタクチンを含む、1種類または複数種類のECMタンパク質を認識する。
【0442】
ある実施形態では、標的化部分は、テネイシンを認識し、これに結合する。テネイシン(TN)ファミリーの糖タンパク質は、少なくとも4種類のメンバー:テネイシン-C、テネイシン-R、テネイシン-X、およびテネイシン-Wを含む。テネイシンタンパク質の一次構造は、同じ連続配列中に順序づけられたいくつかの共通のモチーフ:アミノ末端7個の反復、上皮増殖因子(EGF)様反復、フィブロネクチンIII型ドメイン反復、およびカルボキシル末端フィブリノーゲン様球状ドメインを含む。それぞれのタンパク質メンバーは、EGF様およびフィブロネクチンIII型反復の数および性質における典型的な変動に関連付けられる。アイソフォームバリアントはまた、特にテネイシン-Cに対して存在する。27種を超えるテネイシン-Cのスプライスバリアントおよび/またはアイソフォームが知られている。特定の実施形態では、標的化部分は、テネイシン-CA1を認識し、これに結合する。同様に、テネイシン-Rはまた、種々のスプライスバリアントおよびアイソフォームを有する。テネイシン-Rは通常、ダイマーまたはトリマーとして存在する。テネイシン-Xは、テネイシンファミリーの最大メンバーであり、トリマーとして存在することが知られている。テネイシン-Wは、トリマーとして存在する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、テネイシンタンパク質上の1つまたは複数のエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、モノマーおよび/またはダイマーおよび/またはトリマーおよび/またはヘキサマー型のテネイシンタンパク質を認識する。
【0443】
ある実施形態では、標的化部分は、フィブロネクチンを認識し、これに結合する。フィブロネクチンは、細胞をECM中のコラーゲン繊維と連結し、細胞がECM中を移動することを可能にする糖タンパク質である。インテグリンに結合時には、フィブロネクチンは折り畳みをほどいて機能的ダイマーを形成する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、モノマーおよび/またはダイマー型のフィブロネクチンを認識する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、フィブロネクチン上の1つまたは複数のエピトープを認識する。例示的実施形態では、標的化部分は、フィブロネクチン細胞外ドメインA(EDA)またはフィブロネクチン細胞外ドメインB(EDB)を認識する。EDAレベルの上昇は、乾癬、関節リウマチ、糖尿病、および癌を含む種々の疾患および障害に関連する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、EDAアイソフォームを含むフィブロネクチンを認識し、癌細胞を含む疾患細胞にキメラタンパク質を標的化するのに使用し得る。いくつかの実施形態では、標的化部分は、EDBアイソフォームを含むフィブロネクチンを認識する。種々の実施形態では、このような標的化部分は、腫瘍新生血管を含む腫瘍細胞にキメラタンパク質を標的化するのに使用し得る。
【0444】
ある実施形態では、標的化部分は、フィブリンを認識し、これに結合する。フィブリンは、ECMのマトリックスネットワーク中に見つかることが多い、もう1つのタンパク質物質である。フィブリンは、フィブリノーゲンに対するプロテアーゼトロンビンの作用により形成され、これにより、フィブリンを重合させる。いくつかの実施形態では、標的化部分は、フィブリン上の1つまたは複数のエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、モノマーならびに重合型のフィブリンを認識する。
【0445】
ある実施形態では、標的化部分は、ラミニンを認識し、これに結合する。ラミニンは、基底膜の主要成分であり、細胞および器官のためのタンパク質ネットワーク基盤である。ラミニンは、α鎖、β鎖、およびγ鎖を含むヘテロトリマータンパク質である。いくつかの実施形態では、標的化部分は、ラミニン上の1つまたは複数のエピトープを認識する。いくつかの実施形態では、標的化部分は、モノマー、ダイマーならびにトリマー型のラミニンを認識する。
【0446】
ある実施形態では、標的化部分は、ナイドジェンまたはエンタクチンを認識し、これらに結合する。ナイドジェン/エンタクチンは、高度に保存された硫酸化糖タンパク質ファミリーである。それらは基底膜の主要構造的成分をなし、ラミニンと、基底膜中のコラーゲンIVネットワークを連結するように機能する。このファミリーのメンバーは、ナイドジェン-1およびナイドジェン-2を含む。種々の実施形態では、標的化部分は、ナイドジェン-1および/またはナイドジェン-2上のエピトープを認識する。
【0447】
種々の実施形態では、標的化部分は、本明細書に記載のうちのいずれかの標的(例えば、ECMタンパク質)上に存在するエピトープを認識する抗原認識ドメインを含む。ある実施形態では、抗原認識ドメインは、タンパク質上に存在する1つまたは複数の線形エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、線形エピトープは、タンパク質上に存在するアミノ酸の任意の連続配列を指す。別の実施形態では、抗原認識ドメインは、タンパク質上に存在する1つまたは複数の立体構造エピトープを認識する。本明細書で使用される場合、立体構造エピトープは、抗原認識ドメインにより認識され得る特徴および/または形状および/または三次構造を備えた3次元表面を形成する1つまたは複数のアミノ酸の部分(これは不連続であってよい)を指す。
【0448】
種々の実施形態では、標的化部分は、本明細書に記載のうちのいずれかの標的(例えば、ECMタンパク質)の完全長型および/または成熟型および/またはアイソフォームおよび/またはスプライスバリアントおよび/またはフラグメントおよび/または任意の他の天然または合成の類似体、バリアント、または変異体に結合し得る。種々の実施形態では、標的化部分は、モノマー、ダイマー、トリマー、テトラマー、ヘテロダイマー、マルチマーおよび会合型を含む、本明細書に記載の任意の型のタンパク質に結合し得る。種々の実施形態では、標的化部分は、グリコシル化および/またはリン酸化型などの、本明細書に記載の任意の翻訳後修飾型のタンパク質に結合し得る。
【0449】
種々の実施形態では、標的化部分は、DNAなどの細胞外分子を認識する抗原認識ドメインを含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、DNAを認識する抗原認識ドメインを含む。ある実施形態では、DNAは、壊死細胞またはアポトーシス腫瘍細胞または他の疾患細胞から細胞外間隙中に脱落する。
【0450】
種々の実施形態では、標的化部分は、アテローム斑と関連する1種類または複数種類の非細胞構造を認識する抗原認識ドメインを含む。2つのタイプのアテローム斑が知られている。線維-脂質(線維-脂肪)斑(fibro-lipid(fibro-fatty)plaque)は、動脈の内膜の下の脂質を取り込んだ(lipid-laden)細胞の蓄積を特徴とする。内皮の下には、アテローム性のプラークコアを覆う繊維状キャップが存在する。コアは、増大した組織コレステロールおよびコレステロールエステル含量を有する脂質を取り込んだ細胞(マクロファージおよび平滑筋細胞)、フィブリン、プロテオグリカン、コラーゲン、エラスチン、ならびに壊死細胞片を含む。進行型プラークでは、プラークの中心コアは通常、細胞外のコレステロール沈着物(死細胞から放出)を含み、これは、空の針状間隙を有するコレステロール結晶の領域を形成する。プラークの周辺部には、より若い泡沫状細胞および毛細血管がある。繊維状プラークはまた、動脈壁内の内膜下にも局在し、壁の肥厚化および増殖、および時には、筋層の若干の萎縮を伴う内腔の飛び飛びに局在化した狭小化をもたらす。繊維状プラークは、コラーゲン繊維(エオシン好性)、カルシウムの沈殿物(ヘマトキシリン好性)および脂質を取り込んだ細胞を含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、フィブリン、プロテオグリカン、コラーゲン、エラスチン、壊死細胞片、およびカルシウムまたは他の鉱物沈着物または沈殿物などのこれらのプラークの1種類または複数種類の非細胞成分を認識し、これに結合する。いくつかの実施形態では、壊死細胞片は、核酸、例えば、死細胞から放出される DNAまたはRNAである。
【0451】
種々の実施形態では、標的化部分は、神経変性疾患と関連する脳プラーク中で見つかる1種類または複数種類の非細胞構造を認識する抗原認識ドメインを含む。いくつかの実施形態では、標的化部分は、アルツハイマー病の患者の脳中で見つかるアミロイド斑中に局在する1種類または複数種類の非細胞構造を認識し、これに結合する。例えば、標的化部分は、ペプチドアミロイドベータを認識し、これに結合する。ペプチドアミロイドベータは、アミロイド斑の主要な成分である。いくつかの実施形態では、標的化部分は、ハンチントン病の患者で見つかる脳プラーク中にある1種類または複数種類の非細胞構造を認識し、これに結合する。種々の実施形態では、標的化部分は、レヴィー小体認知症および封入体筋炎などの他の神経変性疾患または筋骨格疾病と関連するプラークで見つかる1種類または複数種類の非細胞構造を認識し、これに結合する。
【0452】
リンカーおよび官能基
種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1つまたは複数の官能基、残基、または部分を含み得る。種々の実施形態では、1つまたは複数の官能基、残基、または部分は、本明細書に記載のうちのいずれかのシグナル伝達物質または標的化部分に結合されるか、または遺伝的に融合される。いくつかの実施形態では、このような官能基、残基または部分は、1つまたは複数の望ましい特性または官能基を本発明のPD-1またはPD-L1結合物質に付与する。このような官能基およびそれらをPD-1またはPD-L1結合物質に導入する技術の例は、当技術分野において既知であり、例えば、Remington’s Pharmaceutical Sciences,16th ed.,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.(1980)を参照されたい。
【0453】
種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、別の物質と複合化および/または融合して、半減期を延長するか、または別の方法で薬力学的および薬物動態学的特性を改善し得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、PEG、XTEN(例えば、rPEGとして)、ポリシアル酸(POLYXEN)、アルブミン(例えば、ヒト血清アルブミンまたはHAS)、エラスチン様タンパク質(ELP)、PAS、HAP、GLK、CTP、トランスフェリンなどのうちの1つまたは複数と融合または複合化され得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、抗体またはFcフラグメントなどの抗体フラグメントと融合または複合化され得る。例えば、キメラタンパク質は、ヒト免疫グロブリン(Ig)GのFcドメインのN-末端またはC末端に融合され得る。種々の実施形態では、それぞれ個々のキメラタンパク質は、BioDrugs(2015)29:215-239に記載の1種類または複数種類の物質に融合され、この文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【0454】
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、好適な薬学的に許容可能なポリマー、例えばポリ(エチレングリコール)(PEG)またはその誘導体(例えば、メトキシポリ(エチレングリコール)またはmPEG)を含む。いくつかの実施形態では、PEG部分の結合は、半減期を伸ばし、および/またはPD-1またはPD-L1結合タンパク質の免疫原性を低減する。例えば、抗体および抗体フラグメント(限定されないが、VHHなどの単一ドメイン抗体を含む)に対し当該技術分野で用いられるペグ化などの任意の好適な形態のペグ化が通常用いられる;例えば、Chapman,Nat.Biotechnol.,54,531-545(2002);VeroneseおよびHarrisによる、Adv.Drug Deliv.Rev.54,453-456(2003),HarrisおよびChessによる、Nat.Rev.Drug.Discov.,2,(2003)ならびに国際公開第04/060965号を参照されたい。これらの文献の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。タンパク質のペグ化のための種々の試薬も、例えば、Nektar Therapeutics,USAから市販されている。いくつかの実施形態では、特に、システイン残基を介した部位特異的なペグ化が使用される(例えば、Yang et al.,Protein Engineering,16,10,761-770(2003)を参照されたい、この文献の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)。例えば、このために、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質中の天然のシステイン残基に結合され得る。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、PEGの結合のための1つまたは複数のシステイン残基を適切に導入するように修飾されるか、またはPEGの結合のための1つまたは複数のシステイン残基を含むアミノ酸配列が、当該技術分野において既知の技術を使用してPD-1またはPD-L1結合物質のアミノ末端および/またはカルボキシ末端に融合され得る。
【0455】
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分には、N結合型またはO結合型グリコシル化を含む。いくつかの実施形態では、N結合型またはO結合型グリコシル化は、翻訳時修飾および/または翻訳後修飾の一部として導入される。
【0456】
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、1つまたは複数の検出可能なラベルまたはその他のシグナル生成基または部分を含む。好適なラベルおよびそれらの結合、使用および検出のための技術は、当技術分野において、既知であり、限定されないが、蛍光標識(例えば、フルオレセイン、イソチオシアネート、ローダミン、フィコエリトリン、フィコシアニン、アロフィコシアニン、o-フタルアルデヒド、ならびにフルオレサミンおよび蛍光金属、例えば、Euまたはランタニド系列の他の金属)、リン光標識、化学発光ラベルまたは生物発光ラベル(例えば、ルミノール、イソルミノール、セロマティックアクリジニウム・エステル、イミダゾール、アクリジニウム塩、オキサレートエステル、ジオキセタンまたはGFPおよびその類似体)、放射性同位体、金属、金属キレートもしくは金属カチオンまたはインビボ、インビトロまたはインサイツ診断および画像処理での使用に特に適している他の金属もしくは金属カチオン、ならびに発色団および酵素(例えば、リンゴ酸脱水素酵素、ブドウ球菌ヌクレアーゼ、デルタ-V-ステロイドイソメラーゼ、酵母アルコール脱水素酵素、アルファグリセロリン酸脱水素酵素、トリオースリン酸イソメラーゼ、ビオチンアビジンペルオキシダーゼ、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アルカリフォスファターゼ、アスパラギナーゼ、グルコースオキシダーゼ、ベータガラクトシダーゼ、リボヌクレアーゼ、ウレアーゼ、カタラーゼ、グルコース-VI-リン酸脱水素酵素、グルコアミラーゼおよびアセチルコリンエステラーゼ)を含む。他の好適なラベルとしては、NMRまたはESR分光法を用いて検出できる部分が挙げられる。このように標識した本発明のVHHおよびポリペプチドは、特定の標識の選択により、例えば、インビトロ、インビボまたはインサイツアッセイ(これ自体ELISA、RIAおよびEIAおよびその他の「サンドイッチ法」などとして知られるイムノアッセイ)ならびにインビボ診断および画像処理の目的に使用し得る。
【0457】
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分には、PD-1またはPD-L1結合物質に結合または遺伝的に融合されたタグが含まれる。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、単一タグまたは複数タグを含み得る。例えば、タグは、PD-1またはPD-L1結合物質のPD-1もしくはPD-L1またはいずれか他の腫瘍抗原などの目的抗原に対する結合を阻害または妨害しない、ペプチド、糖、またはDNA分子である。種々の実施形態では、タグは、少なくとも約:3~5アミノ酸長さ、5~8アミノ酸長さ、8~12アミノ酸長さ、12~15アミノ酸長さ、または15~20アミノ酸長さである。タグの例は、例えば、米国特許出願公開第2013/0058962号に記載されている。いくつかの実施形態では、タグは、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)およびヒスチジン(His)タグなどの親和性タグである。ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質はHisタグを含む。
【0458】
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、例えば、金属または金属カチオンのうちの1つをキレートするためのキレート化基を含む。好適なキレート化基は、例えば、限定されないが、ジエチレントリアミン五酢酸(DTPA)またはエチレンジアミン四酢酸(EDTA)を含む。
【0459】
いくつかの実施形態では、官能基、残基、または部分は、ビオチン-(ストレプト)アビジン結合対などの、特異的結合対の片方の一部である官能基を含む。このような官能基を使って、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質を、結合対のもう一方の半分に結合した別のタンパク質、ポリペプチドまたは化学化合物に、すなわち、結合対の結合を介して、連結し得る。例えば、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をビオチンに複合化させ、アビジンまたはストレプトアビジンに複合化させた別のタンパク質、ポリペプチド、化合物または担体に連結し得る。例えば、検出可能なシグナル生成物質がアビジンまたはストレプトアビジンに複合化される診断システムにおいて、このような結合PD-1またはPD-L1結合物質を、例えば、レポーターとして用い得る。例えば、このような結合対を使用して、PD-1またはPD-L1結合物質を医薬品目的に好適な担体などの担体に結合し得る。1つの非限定的例は、Cao and Suresh,Journal of Drug Targeting,8,4,257(2000)に記載されたリポソーム製剤である。また、このような結合対を使用して、治療活性薬剤を、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質に連結し得る。
【0460】
いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、必要に応じ、1つまたは複数のリンカーを含む。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、結合領域および/または標的化部分をそれぞれ連結するリンカーを含む。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、シグナル伝達物質および標的化部分をそれぞれ連結する(または2つ以上の標的化部分の場合、シグナル伝達物質を標的化部分のうちの1つに連結する)リンカーを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、本明細書に記載の種々の官能基、残基、または部分をPD-1またはPD-L1結合物質に連結するのに利用し得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、結合領域および結合タンパク質の安定性、配向、結合、中和、および/または排出特性に影響を与えない、またはそれらを低下させない単一アミノ酸または複数のアミノ酸である。種々の実施形態では、リンカーは、ペプチド、タンパク質、糖、または核酸から選択される。
【0461】
いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、標的化部分とシグナル伝達物質とを連結するリンカーを含む。いくつかの実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、シグナル伝達物質内にリンカーを含む(例えば、単鎖TNFの場合には、トリマーを生じる2つのリンカーを含み得る)。
【0462】
本発明は、種々のリンカー配列の使用を意図する。種々の実施形態では、リンカーは、天然のマルチドメインタンパク質から誘導され得るか、または、例えば、Chichili et al.,(2013),Protein Sci.22(2):153-167;Chen et al.,(2013),Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369に記載されている経験的リンカーである。これらの文献の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、リンカーは、リンカー設計データベースおよびChen et al.,(2013),Adv Drug Deliv Rev.65(10):1357-1369 and Crasto et al.,(2000),Protein Eng.13(5):309-312に記載のものなどのコンピュータープログラムを用いて設計し得る。種々の実施形態では、リンカーは機能性であり得る。例えば、限定されないが、リンカーは、折り畳みおよび/または安定性を改善するように、発現を改善するように、薬物動態学を改善するように、および/または本発明のPD-1またはPD-L1結合物質の生物活性を改善するように機能し得る。
【0463】
いくつかの実施形態では、リンカーはポリペプチドである。いくつかの実施形態では、リンカーは約100アミノ酸長未満である。例えば、リンカーは、約100、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約12、約11、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、または約2アミノ酸長未満であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーはポリペプチドである。いくつかの実施形態では、リンカーは約100アミノ酸長を超える。例えば、リンカーは、約100、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約12、約11、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、または約2アミノ酸長超であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーはフレキシブルである。別の実施形態では、リンカーは剛性である。
【0464】
いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、標的化部分とシグナル伝達物質のそれらの受容体への効果的結合を可能にする。例えば、いくつかの実施形態では、リンカー長さは、1つの標的化部分とシグナル伝達物質の同じ細胞上の受容体への効果的結合、ならびにその他の標的化部分の別の細胞への効果的結合を可能にする。細胞対の例は、本明細書の他の場所で提供される。
【0465】
いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、少なくとも、同じ細胞上の1つの標的化部分およびシグナル伝達物質の受容体への結合部位の間の最短距離に等しい。いくつかの実施形態では、リンカーの長さは、同じ細胞上の1つの標的化部分およびシグナル伝達物質の受容体への結合部位の間の最短距離の、少なくとも2倍、または3倍、または4倍、または5倍、または10倍、または20倍、または25倍、または50倍、または100倍、または、それを超える。
【0466】
いくつかの実施形態では、あるリンカーは2つの標的化部分を相互に連結し、このリンカーは短い長さを有し、また、あるリンカーは標的化部分とシグナル伝達物質を連結し、このリンカーは2つの標的化部分を連結するリンカーより長い。例えば、2つの標的化部分を連結するリンカーと、標的化部分とシグナル伝達物質とを連結するリンカーの間のアミノ酸長さの差異は、約100、約95、約90、約85、約80、約75、約70、約65、約60、約55、約50、約45、約40、約35、約30、約25、約20、約19、約18、約17、約16、約15、約14、約13、約12、約11、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、または約2アミノ酸長であり得る。いくつかの実施形態では、リンカーはフレキシブルである。別の実施形態では、リンカーは剛性である。
【0467】
種々の実施形態では、リンカーは、グリシンおよびセリン残基から実質的に構成される(例えば、約30%、または約40%、または約50%、または約60%、または約70%、または約80%、または約90%、または約95%、または約97%のグリシンとセリン)。例えば、いくつかの実施形態では、リンカーは(Gly4Ser)nであり、式中、nは、約1~約8、例えば、1、2、3、4、5、6、7、または8(配列番号1182~1189)である。ある実施形態では、リンカー配列は、GGSGGSGGGGSGGGGS(配列番号1190)である。追加のリンカーの例としては、限定されないが、次記配列を有するリンカーが挙げられる:LE、GGGGS(配列番号1182)、(GGGGS)n(n=1~4)(配列番号1182~1185)、(Gly)8(配列番号1191)、(Gly)6(配列番号1192)、(EAAAK)n(n=1~3)(配列番号1193~1195)、A(EAAAK)nA(n=2~5)(配列番号1196~1199)、AEAAAKEAAAKA(配列番号1196)、A(EAAAK)4ALEA(EAAAK)4A(配列番号1200)、PAPAP(配列番号1201)、KESGSVSSEQLAQFRSLD(配列番号1202)、EGKSSGSGSESKST(配列番号1203)、GSAGSAAGSGEF(配列番号1204)、および(XP)n;Xは、任意のアミノ酸、例えば、Ala、Lys、またはGluを示す。種々の実施形態では、リンカーは(GGS)n(n=1~20)(配列番号1205~配列番号1224)である。いくつかの実施形態では、リンカーはGである。いくつかの実施形態では、リンカーはAAAである。いくつかの実施形態では、リンカーは(GGGGS)n(n=9~20)(配列番号1225~1236)である。
【0468】
いくつかの実施形態では、リンカーは、GGGSE(配列番号1237)、GSESG(配列番号1238)、GSEGS(配列番号1239)、GEGGSGEGSSGEGSSSEGGGSEGGGSEGGGSEGGS(配列番号1240)、および4アミノ酸間隔毎にランダムに配置されたG、S、およびEのリンカーのうちの1つまたは複数である。
【0469】
いくつかの実施形態では、リンカーは抗体(例えば、IgG、IgA、IgD、およびIgE、サブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、およびIgA1およびIgA2)を含む)のヒンジ部である。種々の実施形態では、リンカーは抗体(例えば、IgG、IgA、IgD、およびIgE、サブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、およびIgA1およびIgA2)を含む)のヒンジ部である。IgG、IgA、IgD、およびIgEクラス抗体で見つかるヒンジ部は、フレキシブルスペーサーとして機能し、Fab部が空間中で自由に動くことを可能にする。定常領域と対照的に、ヒンジドメインは、構造上多様であり、免疫グロブリンクラスおよびサブクラス中の配列および長さの両方で変動する。例えば、ヒンジ部の長さおよび可撓性は、IgGサブクラス内で変動する。IgG1のヒンジ部は、アミノ酸216~231を包含し、それが自由にフレキシブルであるために、Fabフラグメントは、それらの対称軸の周りで回転でき、2つの重鎖間ジスルフィド架橋の最初の位置を中心とする球内で移動できる。IgG2は、IgG1より短いヒンジを有し、12個のアミノ酸残基と4個のジスルフィド架橋を有する。IgG2のヒンジ部は、グリシン残基を欠き、比較的短く、また、追加の重鎖間ジスルフィド架橋により安定化された剛性ポリプロリン二重らせん体を含む。これらの特性は、IgG2分子の可撓性を制限する。IgG3は、62個のアミノ酸を含む(21個のプロリンと11個のシステインを含む)その特有の延長されたヒンジ部(IgG1ヒンジの約4倍の長さ)により、他のサブクラスとは異なり、柔軟性を欠くポリプロリン二重らせん体を形成する。IgG3では、Fabフラグメントは、Fcフラグメントから比較的遠くに離れており、より大きな可撓性を分子に与える。IgG3の伸びたヒンジは、他のサブクラスに比べて、そのより高分子量の原因でもある。IgG4のヒンジ部は、IgG1より短く、その可撓性は、IgG1とIgG2との中間である。ヒンジ部の可撓性は、次の順に低下すると報告されている:IgG3>IgG1>IgG4>IgG2。
【0470】
結晶学的調査によれば、免疫グロブリンヒンジ部は、機能的に次の3つの領域にさらに細分できる:上部ヒンジ部、コア部、および下部ヒンジ部。Shin et al.,1992 Immunological Reviews 130:87を参照されたい。上部ヒンジ部は、CH1のカルボキシル末端~運動を制限するヒンジ中の最初の残基、通常は2つの重鎖間の鎖間ジスルフィド結合を形成する最初のシステイン残基のアミノ酸を含む。上部ヒンジ部の長さは、抗体のセグメントの可撓性と相関する。コアヒンジ部は重鎖間ジスルフィド架橋を含み、下部ヒンジ部はCH2ドメインのアミノ末端に繋がり、CH2中の残基を含む(前出文献)。野性型ヒトIgG1のコアヒンジ部は、配列番号1241を含み、これは、ジスルフィド結合形成により二量体化されると、環状オクタペプチドを生成し、これが旋回軸として機能することにより、可撓性を付与すると考えられている。種々の実施形態では、本発明のリンカーは、任意の抗体(例えば、IgG、IgA、IgD、およびIgE、サブクラス(例えば、IgG1、IgG2、IgG3、およびIgG4、およびIgA1およびIgA2)を含む)の1、または2、または3個の上部ヒンジ部、コア部および下部ヒンジ部を含む。ヒンジ部はまた、1つまたは複数のグリコシル化部位も含み得、これは、多くの構造上異なるタイプの炭水化物付着部位を含む。例えば、IgA1は、ヒンジ部の17アミノ酸セグメント内に5つのグリコシル化部位を含み、腸内プロテアーゼに対するヒンジ部ポリペプチドの耐性を付与し、これは、分泌性免疫グロブリンにとって、有利な性質であると考えられる。種々の実施形態では、本発明のリンカーは、1つまたは複数のグリコシル化部位を含む。種々の実施形態では、リンカーは、ヒトIgG4抗体のヒンジ-CH2-CH3ドメインである。
【0471】
必要に応じ、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は抗体Fc領域に連結されてよく、CH2およびCH3ドメインの片方または両方、および場合によりヒンジ部を含む。例えば、単一ヌクレオチド配列としてFc領域に連結された本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードするベクターを用いて、このようなポリペプチドを調製できる。
【0472】
いくつかの実施形態では、リンカーはPEGなどの合成リンカーである。
【0473】
種々の実施形態では、リンカーは機能性であり得る。例えば、限定されないが、リンカーは、折り畳みおよび/または安定性を改善するように、発現を改善するように、薬物動態学を改善するように、および/または本発明のPD-1またはPD-L1結合物質の生物活性を改善するように機能し得る。別の例では、リンカーは、PD-1またはPD-L1結合物質を特定の細胞型または部位に標的化するように機能し得る。
【0474】
PD-1またはPD-L1結合物質の改変および産生
種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、VHHである標的化部分を含む。種々の実施形態では、VHHは、特定の生物源または特定の調製法に限定されない。例えば、VHHは通常、次記により得ることができる:(1)天然の重鎖抗体のVHHドメインを単離することにより;(2)天然のVHHドメインをコードするヌクレオチド配列の発現により;(3)天然のVHHドメインの「ヒト化」により、またはこのようなヒト化VHHドメインをコードする核酸の発現により;(4)ヒト由来などの哺乳動物種由来などの任意の動物種由来の天然のVHドメインの「ラクダ化」、またはこのようなラクダ化VHドメインをコードする核酸の発現により;(5)当該技術分野で記載の「ドメイン抗体」または「Dab」の「ラクダ化」により、またはこのようなラクダ化VHドメインをコードする核酸の発現により;(6)当該技術分野において既知のタンパク質、ポリペプチドまたはその他のアミノ酸配列のための合成または半合成技術を用いることにより;(7)当該技術分野において既知の核酸合成技術を用いてVHHをコードする核酸を調製し、続けて、こうして得られた拡散を発現させることにより;および/または(8)前述の1つまたは複数の任意の組み合わせにより。
【0475】
ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、ヒトPD-1またはPD-L1を指向する天然の重鎖抗体のVHHドメインに対応するVHHを含む。いくつかの実施形態では、このようなVHH配列は通常、ラクダ科の動物種をPD-1またはPD-L1分子で適切に免疫化する(すなわち、PD-1またはPD-L1に対する免疫応答を生じさせる、および/またはPD-1またはPD-L1に対する重鎖抗体を産生させるように免疫化する)ことにより、ラクダ科の動物から好適な生物試料(例えば、血液試料、またはB細胞の任意の試料)を得ることにより、および任意の好適な既知の技術を用いて、試料から出発して、PD-1またはPD-L1に対するVHH配列を生成することにより、生成または得ることができる。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1に対する天然のVHHドメインは、ラクダ科の動物VHH配列の未処理ライブラリーから、例えば、当技術分野で既知の1種類または複数種類のスクリーニング技術を使って、PD-1またはPD-L1、またはその少なくとも1つの部分、フラグメント、抗原決定基またはエピトープを用いてこのようなライブラリーをスクリーニングすることにより、得ることができる。このようなライブラリーおよび技術は、例えば、国際公開第99/37681号、国際公開第01/90190号、国際公開第03/025020号、および国際公開第03/035694号に記載されている。これらの特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、例えば、国際公開第00/43507号に記載のランダム変異誘発および/またはCDRシャッフリングなどの技術により未処理VHHライブラリーから得られたVHHライブラリーなどの未処理VHHライブラリー由来の改善された合成または半合成ライブラリーを使用し得る。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1に対するVHH配列を得る別の技術は、重鎖抗体を発現できる遺伝子導入哺乳動物を適切に免疫化し(すなわち、PD-1またはPD-L1に対する免疫応答を生じさせる、および/またはPD-1またはPD-L1に対する重鎖抗体を産生させるように免疫化し)、遺伝子導入哺乳動物から好適な生物試料(例えば、血液試料、またはB細胞の任意の試料)を得て、その後、任意の好適な既知の技術を用いて、試料から出発して、PD-1またはPD-L1に対するVHH配列を生成することを含む。例えば、このために、国際公開第02/085945号および国際公開第04/049794号(これらの特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる)に記載の重鎖抗体発現マウスおよびさらなる方法および技術を使用できる。
【0476】
ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、「ヒト化された」、すなわち、天然のVHH配列(および特に、フレームワーク配列中の)のアミノ酸配列中の1つまたは複数のアミノ酸残基を、ヒトの従来の4鎖抗体由来のVHドメイン中の対応する位置(単一または複数)にある1つまたは複数のアミノ酸残基で置換することによるVHHを含む。これは、当該技術分野において既知のヒト化技術を使用して実施できる。いくつかの実施形態では、可能なヒト化置換またはヒト化置換の組み合わせは、当該技術分野において既知の方法、例えば、VHHの配列と天然のヒトVHドメインの配列との間の比較により決定し得る。いくつかの実施形態では、ヒト化置換は、得られたヒト化VHHが有利な機能特性をなお保持するように選択される。通常、ヒト化の結果として、本発明のVHHは、より「ヒト様」になり得るが、対応する天然のVHHドメインと比較して、低減された免疫原性などの好ましい特性を依然として保持している。種々の実施形態では、本発明のヒト化VHHは、当該技術分野において既知の任意の好適な方法で得ることができ、したがって、出発材料として天然のVHHドメインを含むポリペプチドを用いて得たポリペプチドに厳密に限定されない。
【0477】
ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、「ラクダ化」、すなわち、従来の4鎖抗体由来の天然のVHドメインのアミノ酸配列中の1つまたは複数のアミノ酸残基を、ラクダ科の動物の重鎖抗体のVHHドメイン中の対応する位置(単一または複数)にある1つまたは複数のアミノ酸残基で置換しているVHHを含む。いくつかの実施形態では、このような「ラクダ化」置換は、VH-VLインターフェースを形成するおよび/または、そこに存在するアミノ酸位置に、および/またはいわゆるラクダ科の顕著な特徴残基(例えば、国際公開第94/04678号を参照されたい、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる)の位置に挿入されるいくつかの実施形態では、ラクダ化VHHを生成するかあるいは設計するための出発材料または出発点として用いられるVH配列は、哺乳動物由来のVH配列、例えば、VH3配列などの、ヒトのVH配列である。種々の実施形態では、ラクダ化VHHは、当該技術分野において既知の任意の好適な方法で得ることができ(すなわち、上記(1)~(8)で示したような)、したがって、出発材料として天然のVHドメインを含むポリペプチドを用いて得たポリペプチドに厳密に限定されない。
【0478】
種々の実施形態では、「ヒト化」および「ラクダ化」の両方は、天然のVHHドメインまたはVHドメインをコードするヌクレオチド配列をそれぞれ用意し、次に、当該技術分野において既知の方法で、ヌクレオチド配列中の1つまたは複数のコドンを新規ヌクレオチド配列がそれぞれ「ヒト化」または「ラクダ化」VHHをコードするような方法で変更することにより実施することができる。この核酸は、その後、本発明の目的のVHHを得るように、当該技術分野において既知の方法で発現させることができる。あるいは、天然のVHHドメインまたはVHドメインそれぞれのアミノ酸配列に基づいて、目的の本発明のヒト化またはラクダ化VHHのそれぞれのアミノ酸配列を設計し、その後、当該技術分野において既知のペプチド合成技術を用いて新規に合成できる。また、天然のVHHドメインまたはVHドメインそれぞれのアミノ酸配列またはヌクレオチド配列に基づいて、目的のヒト化またはラクダ化VHHのそれぞれをコードするヌクレオチド配列を設計し、次に当該技術分野において既知の核酸合成技術を用いて新規に合成でき、その後、こうして得られた核酸を、本発明の目的のVHHが得られるように、当該技術分野において既知の方法で発現させることができる。天然のVH配列またはVHH配列から出発して、本発明のVHHおよび/またはそれをコードする核酸を得るその他の好適な方法および技術は、当技術分野において既知であり、例えば、1つまたは複数の天然のVH配列(1つまたは複数のFR配列および/またはCDR配列など)中の1つまたは複数の部分、1つまたは複数の天然のVHH配列(1つまたは複数のFR配列またはCDR配列など)中の1つまたは複数の部分、および/または1つまたは複数の合成または半合成配列を、本発明のVHHまたはそれをコードするヌクレオチド配列もしくは核酸を得るように、好適な方法で組み合わせることを含み得る。
【0479】
本発明のPD-1またはPD-L1結合物質を産生する方法は、本明細書に記載されている。例えば、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードするDNA配列は、当該技術分野において既知の方法を使用して化学的に合成できる。合成DNA配列は、例えば、発現制御配列を含む他の適切なヌクレオチド配列に連結し、目的のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする遺伝子発現構築物を産生できる。したがって、種々の実施形態では、本発明は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードするヌクレオチド配列を含む単離核酸を提供する。
【0480】
本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする核酸は、発現ベクター中に組み込まれ(連結され)てよく、このベクターは、遺伝子導入、形質転換、または形質導入技術により宿主細胞中に導入できる。例えば、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする核酸を、レトロウイルス形質導入により宿主細胞中に導入できる。宿主細胞の例は、大腸菌細胞、チャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞、ヒト胎児腎臓293(HEK293)細胞、ヒーラ細胞、仔ハムスター腎(BHK)細胞、サル腎培養細胞(COS)、またはヒト肝細胞癌細胞(例えば、Hep G2)、および骨髄腫細胞である。形質転換宿主細胞は、宿主細胞に、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする遺伝子を発現させるのを可能とする条件下で増殖させることができる。したがって、種々の実施形態では、本発明は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする核酸を含む発現ベクターを提供する。種々の実施形態では、本発明は、このような発現ベクターを含む宿主細胞をさらに提供する。
【0481】
特定の発現および精製条件は、用いられる発現系に応じて変化する。例えば、遺伝子が大腸菌中で発現される場合、遺伝子は最初に、操作された遺伝子を細菌プロモーター、例えば、TrpまたはTac、および原核生物シグナル配列の下流に配置することにより発現ベクター中に挿入される。別の例では、操作された遺伝子が真核生物宿主細胞、例えば、CHO細胞中で発現される場合、遺伝子は最初に、例えば、好適な真核生物プロモーター、分泌シグナル、転写促進因子、および種々のイントロンを含む発現ベクター中に挿入される。遺伝子構築物は、遺伝子導入、形質転換、または形質導入技術を用いて宿主細胞中に導入できる。
【0482】
本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、タンパク質の発現を許容する条件下で、PD-1またはPD-L1結合物質をコードする発現ベクターを形質導入した宿主細胞を増殖させることにより産生できる。発現後、タンパク質を収集し、例えば、グルタチオン-S-トランスフェラーゼ(GST)およびヒスチジン(His)などの親和性タグまたはクロマトグラフィーにより、当該技術分野において周知の技術を用いて精製できる。ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質はHisタグを含む。ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質はHisタグおよびHisタグの切断を可能にするタンパク分解部位を含む。
【0483】
したがって、種々の実施形態では、本発明は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする核酸を提供する。種々の実施形態では、本発明は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする核酸を含む宿主細胞を提供する。
【0484】
種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質またはPD-1またはPD-L1結合物質を含むキメラタンパク質は、例えば、患者中でインビボ発現され得る。例えば、種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質またはPD-1またはPD-L1結合物質を含むキメラタンパク質は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質またはPD-1またはPD-L1結合物質を含むキメラタンパク質をコードする核酸の形態で投与され得る。種々の実施形態では、核酸はDNAまたはRNAである。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質またはPD-1またはPD-L1結合物質を含むキメラタンパク質は、修飾mRNA、すなわち、1種類または複数種類の修飾ヌクレオチドを含むmRNAによりコードされる。いくつかの実施形態では、修飾mRNAは、米国特許第8,278,036号で見出される1つまたは複数の修飾を含む。この特許の全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。いくつかの実施形態では、修飾mRNAは、m5C、m5U、m6A、s2U、Ψ、および2’-O-メチル-Uのうちの1つまたは複数を含む。いくつかの実施形態では、本発明は、本発明の1種類または複数種類のキメラタンパク質をコードする修飾mRNAの投与に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、修飾mRNAを含む遺伝子治療ベクターに関する。いくつかの実施形態では、本発明は、修飾mRNAを含む遺伝子治療ベクターに関する。種々の実施形態では、核酸は、腫瘍溶解性ウイルス、例えば、アデノウイルス、レオウイルス、はしか、単純ヘルペス、ニューカッスル病ウイルスまたはワクシニアの形態である。
【0485】
薬学的に許容可能な塩および賦形剤
本明細書で記載のPD-1またはPD-L1結合物質(および/またはいずれか他の治療薬)は、無機酸もしくは有機酸と反応できる、充分に塩基性の官能基を有し、または無機酸もしくは有機酸と反応できる、カルボキシル基を有して、薬学的に許容可能な塩を形成できる。薬学的に許容可能な酸付加塩は、当該技術分野でよく知られているように、薬学的に許容可能な酸から形成される。このような塩は、例えば、Journal of Pharmaceutical Science,66,2-19(1977およびThe Handbook of Pharmaceutical Salts;Properties,Selection,and Use.P.H.Stahl and C.G.Wermuth(eds.),Verlag,Zurich(Switzerland)2002、に挙げられた薬学的に許容可能な塩を含む。これらの文献は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0486】
薬学的に許容可能な塩としては、非限定的例であるが、硫酸塩、クエン酸塩、酢酸塩、シュウ酸塩、塩化物、臭化物、ヨウ化物、硝酸塩、重硫酸塩、ホスフェート、酸性リン酸塩、イソニコチン酸塩、乳酸塩、サリチル酸塩、酸性クエン酸塩、酒石酸塩、オレイン酸塩、タンニン酸塩、パントテン酸塩、酒石酸水素塩、アスコルビン酸塩、コハク酸塩、マレイン酸塩、ゲンチシン酸塩、フマル酸塩、グルコン酸塩、グルカロン酸塩、サッカリン酸塩、ギ酸塩、安息香酸塩、グルタミン酸塩、メタンスルホン酸塩、エタンスルホン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩、樟脳スルホン酸塩、パモ酸塩、フェニル酢酸塩、トリフルオロ酢酸塩、アクリル酸塩、クロロ安息香酸塩、ジニトロ安息香酸塩、ヒドロキシ安息香酸塩、メトキシ安息香酸塩、メチル安息香酸塩、o-アセトキシ安息香酸塩、ナフタレン-2-安息香酸塩、イソ酪酸塩、フェニル酪酸塩、α-ヒドロキシ酪酸塩、ブチン-1,4-ジカルボキシレート、ヘキシン-1,4-ジカルボキシレート、カプリン酸塩、カプリル酸塩、ケイ皮酸塩、グリコール酸塩、ヘプタン酸塩、ヒプル酸塩、リンゴ酸塩、ヒドロキシマレイン酸塩、マロン酸塩、マンデル酸塩、メシル酸塩、ニコチン酸塩、フタル酸塩、テラフタル酸塩、プロピオール酸塩、プロピオン酸塩、フェニルプロピオン酸塩、セバシン酸塩、スベリン酸塩、p-ブロモベンゼンスルホン酸塩、クロロベンゼンスルホン酸塩、エチルスルホン酸塩、2-ヒドロキシエチルスルホン酸塩、メチルスルホン酸塩、ナフタレン-1-スルホン酸塩、ナフタレン-2-スルホン酸塩、ナフタレン-1,5-スルホン酸塩、キシレンスルホン酸塩、および酒石酸塩が挙げられる。
【0487】
「薬学的に許容可能な塩」という用語はまた、カルボン酸官能基などの酸性官能基、および塩基を有する本発明の組成物の塩を指す。適切な塩基としては、限定されないが、ナトリウム、カリウム、およびリチウムなどのアルカリ金属の水酸化物;カルシウムおよびマグネシウムなどのアルカリ土類金属の水酸化物;アルミニウムおよび亜鉛などのその他の金属の水酸化物;アンモニア、および非置換またはヒドロキシ置換のモノ-、ジ-、またはトリ-アルキルアミン、ジシクロヘキシルアミンなどの有機アミン;トリブチルアミン;ピリジン;N-メチル、N-エチルアミン;ジエチルアミン;トリエチルアミン;モノ-、ビス-、またはトリス-(2-ヒドロキシエチル)アミン、2-ヒドロキシ-tert-ブチルアミン、またはトリス-(ヒドロキシメチル)メチルアミンなどのモノ-、ビス-、またはトリス-(2-OH-低級アルキルアミン)、N,N-ジメチル-N-(2-ヒドロキシエチル)アミンまたはトリ-(2-ヒドロキシエチル)アミンなどのN,N-ジ-低級アルキル-N-(ヒドロキシル-低級アルキル)-アミン;N-メチル-D-グルカミン;およびアルギニン、リシンなどのアミノ酸などが挙げられる。
【0488】
いくつかの実施形態では、本明細書で記載の組成物は、薬学的に許容可能な塩の形態である。
【0489】
医薬組成物および製剤
種々の実施形態では、本発明は、本明細書で記載のPD-1またはPD-L1結合物質(および/またはいずれか他の治療薬)および薬学的に許容可能な担体または賦形剤を含む医薬組成物に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質を含む医薬組成物に関する。別の実施形態では、本発明は、本明細書に記載のうちのいずれか他の治療薬を含む医薬組成物に関する。さらなる実施形態では、本発明は、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質と本明細書に記載のうちのいずれか他の治療薬との組み合わせを含む医薬組成物に関する。本明細書で記載のいずれの医薬組成物も、薬学的に許容可能な担体またはビークルを含む組成物の成分として、対象に投与することができる。このような組成物は必要に応じ、適切な投与用の形態を与えるように、適切な量の薬学的に許容可能な賦形剤を含み得る。
【0490】
種々の実施形態では、医薬賦形剤は、ピーナッツオイル、大豆油、ミネラルオイル、ゴマ油などの石油、動物、植物、または人工起源のものを含む、水および油などの液体であり得る。医薬賦形剤は、例えば、食塩水、アカシアゴム、ゼラチン、デンプンペースト、滑石、ケラチン、コロイド状シリカ、尿素などであってよい。さらに、助剤、安定化剤、増粘化剤、潤滑剤、および着色料を使用することができる。一実施形態では、薬学的に許容可能な賦形剤は、対象に投与される場合、無菌である。本明細書で記載のうちのいずれかの薬剤が静脈内に投与される場合、水は有用な賦形剤である。生理食塩水および水性デキストロースならびにグリセリン溶液はまた、液体賦形剤として、特に注射可能溶液に用いることができる。適切な医薬賦形剤としては、デンプン、グルコース、ラクトース、ショ糖、ゼラチン、麦芽、米、小麦粉、シリカゲル、ステアリン酸ナトリウム、グリセリンモノステアレート、滑石、塩化ナトリウム、乾燥脱脂乳、グリセリン、プロピレン、グリコール、水、エタノールなども挙げられる。本明細書で記載のいずれの薬剤も、必要に応じ、少量の湿潤剤もしくは乳化剤、またはpH緩衝剤を含んでよい。適切な医薬賦形剤のそのほかの例は、Remington’s Pharmaceutical Sciences 1447-1676(Alfonso R.Gennaro eds.,19th ed.1995)に記載されている。この文献は参照により本明細書に組み込まれる。
【0491】
本発明は、種々の製剤中に記載医薬組成物(および/または追加の治療薬)を含む。本明細書で記載のいずれの本発明の医薬組成物(および/または追加の治療薬)も、液剤、懸濁剤、乳濁液、点滴剤、錠剤、丸薬、ペレット、カプセル剤、液体含有カプセル剤、ゼラチンカプセル剤、散剤、徐放製剤、坐剤、乳剤、エアロゾル、噴霧剤、懸濁剤、凍結乾燥散剤、凍結懸濁剤、乾燥散剤、または使用に適する他の任意の形態をとってよい。一実施形態では、組成物はカプセルの形態である。別の実施形態では、組成物は錠剤の形態である。さらに別の実施形態では、医薬組成物は、軟質ゲルカプセルの形態に処方される。さらなる実施形態では、医薬組成物は、ゼラチンカプセルの形態に処方される。さらに別の実施形態では、医薬組成物は、液剤として処方される。
【0492】
必要に応じて、本発明の医薬組成物(および/または追加の薬剤)は、可溶化剤も含み得る。また、薬剤は当技術分野において既知の適切なビークルまたは送達装置を使って送達することができる。本明細書で概要を述べた併用療法剤は、単一の送達ビークルまたは送達担体で同時送達できる。
【0493】
本発明の医薬組成物(および/または追加の薬剤)を含む製剤は単位剤形として好都合に提供でき、薬学の分野でよく知られたいずれかの方法により調製され得る。このような方法は通常、治療薬を担体と混合するステップを含み、担体は1種類または複数種類の補助成分を構成する。通常、製剤は、治療薬と、液体担体、微粉化固相担体、または両方とを均一に、完全に混合すること、その後、必要に応じ、生成物を所望の製剤の剤形に成形すること(例えば、湿式または乾式造粒、散剤ブレンド、など、それに続く当該技術分野で既知の従来の方法を使って錠剤化すること)により調製される。
【0494】
種々の実施形態では、本明細書で記載のいずれの医薬組成物(および/または追加の薬剤)も、本明細書で記載の投与方法に適合された組成物として、ルーチン手順に従って処方される。
【0495】
投与経路は、例えば、経口、皮内、筋肉内、腹腔内、静脈内、皮下、鼻腔内、硬膜外、舌下、鼻腔内、脳内、膣内、経皮、直腸内、吸入、または局所を含む。投与は局所的または全身性であり得る。いくつかの実施形態では、投与は、経口により行われる。別の実施形態では、投与は非経口の注射による。投与方法は、開業医の自由裁量に任すことができ、1部には、病状の部位に依存する。大抵の場合、投与は本明細書で記載のうちのいずれかの薬剤の血流中への放出をもたらす。
【0496】
一実施形態では、本明細書で記載のPD-1またはPD-L1結合物質は、経口投与に適合された組成物として、常法に従って処方される。経口送達用の組成物は、例えば、錠剤、トローチ剤、水性または油性懸濁剤、粒剤、散剤、乳剤、カプセル剤、シロップ剤、またはエリキシル剤の形態であってよい。経口投与される組成物は、薬学的に口当たりの良い製剤を提供するために、1種類または複数種類の薬剤、例えば、ラクトース、アスパルテームまたはサッカリンなどの甘味料、ペパーミント、冬緑油またはチェリー油などの調味料、着色料および保存剤を含み得る。さらに、タブレットまたは丸薬形態では、組成物をコートして、消化管での崩壊および吸収を遅らせることにより長期間にわたり持続作用を可能とすることができる。本明細書に記載のうちのいずれかのPD-1またはPD-L1結合物質を運ぶ浸透圧的に活性な物質を取り囲む選択的透過性膜も、経口投与組成物として好適である。これらの後者のプラットフォームでは、カプセルの周りの環境からの液体が運搬化合物により吸収され、この化合物は膨潤し、開口部を介して薬剤または薬剤組成物を追い出す。これらの送達プラットフォームは、即時放出製剤の急上昇プロファイルとは対照的に、基本的に0次の送達プロファイルを提供することができる。グリセロールモノステアレートまたはグリセロールステアレートなどの時間遅延物質も使用することができる。経口組成物には、標準的な賦形剤、例えば、マンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、ナトリウムサッカリン、セルロース、および炭酸マグネシウムを含んでよい。一実施形態では、賦形剤は医薬品グレードである。活性化合物に加えて、懸濁剤は、例えば、エトキシ化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトールおよびソルビタンエステル、微結晶セルロース、アルミニウムメタヒドロオキシド、ベントナイト、寒天、トラガント、など、およびこれらの混合物などの沈殿防止剤を含んでよい。
【0497】
非経口投与(例えば、静脈内、筋肉内、腹腔内、皮下および関節内注射および注入)に好適な剤形は、例えば、液剤、懸濁剤、分散剤、乳剤、などを含む。それらは、無菌の固相組成物(例えば、凍結乾燥組成物)の形態で製造されてよく、これは、使用直前に、無菌の注入可能媒体中に溶解または懸濁され得る。それらは、例えば、当該技術分野において、既知の懸濁剤または分散剤を含み得る。非経口的投与に好適な製剤成分としては、注射用の水、食塩水溶液、不揮発性油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール、またはその他の合成溶媒などの無菌希釈剤、ベンジルアルコールまたはメチルパラベンなどの抗菌剤、アスコルビン酸もしくは亜硫酸水素ナトリウムなどの酸化防止剤、EDTAなどのキレート化剤、アセテート、シトレート、またはホスフェートなどの緩衝剤、および塩化ナトリウムまたはデキストロースなどの浸透圧調節剤が挙げられる。
【0498】
静脈内投与の場合、好適な担体としては、生理食塩水、静菌性水、クレモフォアELTM(BASF,Parsippany,NJ)またはリン酸緩衝生理食塩水(PBS)が挙げられる。担体は、製造および貯蔵条件下で安定でなければならず、微生物に対し保護されなければならない。担体は、例えば、水、エタノール、ポリオール(例えば、グリセロール、プロピレングリコール、および液体ポリエチレングリコール)、およびこれらの好適な混合物を含む、溶媒または分散媒であってよい。
【0499】
本明細書にて提供される組成物は、単独でまたは他の好適な成分と組み合わせて、吸入により投与されるエーロゾル製剤(すなわち、「噴霧化」製剤)を作製することができる。エーロゾル製剤は、ジクロロジフルオロメタン、プロパン、窒素などの許容され得る加圧化噴射剤中に入れることができる。
【0500】
本明細書で記載のいずれの本発明の医薬組成物(および/または追加の薬剤)も、当業者に既知の制御放出によりまたは徐放手段または送達装置により投与可能である。例としては、米国特許第3,845,770号;同第3,916,899号;同第3,536,809号;同第3,598,123号;同第4,008,719号、同第5,674,533号、同第5,059,595号、同第5,591,767号、同第5,120,548号、同第5,073,543号、同第5,639,476号、同第5,354,556号、および同第5,733,556号に記載のものが挙げられるが、これらに限定されない。これらの特許のそれぞれは参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。このような剤形は、例えば、ヒドロプロピルセルロース、ヒドロプロピルメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、その他のポリマーマトリクス、ゲル、浸透膜、浸透系、多層被膜、微粒子、リポソーム、マイクロスフェア、またはこれらの組み合わせを用いて、1つまたは複数の有効成分の制御放出または徐放を可能にするために有用であり、様々な割合での所望の放出プロファイルを提供することができる。本明細書に記載されたものを含む当業者に既知の適切な制御放出または徐放製剤は、本明細書で記載の薬剤の有効成分と共に使用する上で容易に選択することができる。本発明はこのように、限定されないが、制御放出または徐放に適合された錠剤、カプセル、ジェルカプセルおよびカプレットなどの経口投与に好適な単位剤形を提供する。
【0501】
有効成分の制御放出または徐放は、限定されないが、pH変化、温度変化、適切な波長の光による刺激、酵素の濃度もしくは利用可能性、水の濃度または利用可能性、または他の生理学的条件または化合物を含む、種々の条件により刺激できる。
【0502】
別の実施形態では、徐放系を、治療される標的領域の近傍に配置でき、したがって全身用量の一部のみを必要とする(例えば、Goodson,in Medical Applications of Controlled Release,supra,vol.2,pp.115-138(1984)を参照)。Langer,1990,Science 249:1527-1533、中の概説で考察されている他の放出制御系を使用し得る。
【0503】
医薬製剤は好ましくは無菌である。無菌化は、例えば、無菌濾過膜で濾過することにより達成される。組成物が凍結乾燥される場合、凍結乾燥および再構成の前またはその後でフィルター滅菌を行うことができる。
【0504】
投与および投与量
本発明により投与されるPD-1またはPD-L1結合物質および/または本明細書に記載のうちのいずれかの治療薬の実際の用量は、特定の剤形および投与方法に応じて変わることは理解されよう。当業者なら、PD-1またはPD-L1結合物質の作用を変え得る多くの要因(例えば、体重、性別、食事、投与時期、投与経路、排出速度、対象の状態、薬剤の組み合わせ、遺伝的素因および反応感度)を考慮に入れることができる。投与は、最大耐量の範囲内で連続的にまたは1種類または複数種類の別々の投与量で実施できる。与えられた一連の条件に対する最適投与速度は、従来の用量投与試験を使って、当業者により確認できる。
【0505】
いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質および/または本明細書に記載のうちのいずれかの治療薬の好適な投与量は、対象の体重の約0.01mg/kg~約10g/kg、対象の体重の約0.01mg/kg~約1g/kg、対象の体重の約0.01mg/kg~約100mg/kg、対象の体重の約0.01mg/kg~約10mg/kgの範囲であり、例えば、約0.01mg/kg、約0.02mg/kg、約0.03mg/kg、約0.04mg/kg、約0.05mg/kg、約0.06mg/kg、約0.07mg/kg、約0.08mg/kg、約0.09mg/kg、約0.1mg/kg、約0.2mg/kg、約0.3mg/kg、約0.4mg/kg、約0.5mg/kg、約0.6mg/kg、約0.7mg/kg、約0.8mg/kg、約0.9mg/kg、約1mg/kg、約1.1mg/kg、約1.2mg/kg、約1.3mg/kg、約1.4mg/kg、約1.5mg/kg、約1.6mg/kg、約1.7mg/kg、約1.8mg/kg、1.9mg/kg、約2mg/kg、約3mg/kg、約4mg/kg、約5mg/kg、約6mg/kg、約7mg/kg、約8mg/kg、約9mg/kg、約10mg/kg体重、約100mg/kg体重、約1g/kg体重、約10g/kg体重(これらの間の全ての値および範囲を含む)である。
【0506】
PD-1またはPD-L1結合物質および/または本明細書に記載のうちのいずれかの治療薬の個々の投与量は、例えば、単位剤形当たり約0.01mg~約100g、約0.01mg~約75g、約0.01mg~約50g、約0.01mg~約25g、約0.01mg~約10g、約0.01mg~約7.5g、約0.01mg~約5g、約0.01mg~約2.5g、約0.01mg~約1g、約0.01mg~約100mg、約0.1mg~約100mg、約0.1mg~約90mg、約0.1mg~約80mg、約0.1mg~約70mg、約0.1mg~約60mg、約0.1mg~約50mg、約0.1mg~約40mgの有効成分、約0.1mg~約30mg、約0.1mg~約20mg、約0.1mg~約10mg、約0.1mg~約5mg、約0.1mg~約3mg、約0.1mg~約1mg、または単位剤形当たり約5mg~約80mgを含む単位剤形で投与できる。例えば、単位剤形は、約0.01mg、約0.02mg、約0.03mg、約0.04mg、約0.05mg、約0.06mg、約0.07mg、約0.08mg、約0.09mg、約0.1mg、約0.2mg、約0.3mg、約0.4mg、約0.5mg、約0.6mg、約0.7mg、約0.8mg、約0.9mg、約1mg、約2mg、約3mg、約4mg、約5mg、約6mg、約7mg、約8mg、約9mg約10mg、約15mg、約20mg、約25mg、約30mg、約35mg、約40mg、約45mg、約50mg、約55mg、約60mg、約65mg、約70mg、約75mg、約80mg、約85mg、約90mg、約95mg、約100mg、約200mg、約500mg、約1g、約2.5g、約5g、約10g、約25g、約50g、約75g、約100g(これらの間の全ての値および範囲を含む)であってよい。
【0507】
一実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質および/または本明細書に記載のうちのいずれかの治療薬は、毎日約0.01mg~約100g、毎日約0.01mg~約75g、毎日約0.01mg~約50g、毎日約0.01mg~約25g、毎日約0.01mg~約10g、毎日約0.01mg~約7.5g、毎日約0.01mg~約5g、毎日約0.01mg~約2.5g、毎日約0.01mg~約1g、毎日約0.01mg~約100mg、毎日約0.1mg~約100mg、毎日約0.1mg~約95mg、毎日約0.1mg~約90mg、毎日約0.1mg~約85mg、毎日約0.1mg~約80mg、毎日約0.1mg~約75mg、毎日約0.1mg~約70mg、毎日約0.1mg~約65mg、毎日約0.1mg~約60mg、毎日約0.1mg~約55mg、毎日約0.1mg~約50mg、毎日約0.1mg~約45mg、毎日約0.1mg~約40mg、毎日約0.1mg~約35mg、毎日約0.1mg~約30mg、毎日約0.1mg~約25mg、毎日約0.1mg~約20mg、毎日約0.1mg~約15mg、毎日約0.1mg~約10mg、毎日約0.1mg~約5mg、毎日約0.1mg~約3mg、毎日約0.1mg~約1mg、または毎日約5mg~約80mgの量で投与される。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、約0.01mg、約0.02mg、約0.03mg、約0.04mg、約0.05mg、約0.06mg、約0.07mg、約0.08mg、約0.09mg、約0.1mg、約0.2mg、約0.3mg、約0.4mg、約0.5mg、約0.6mg、約0.7mg、約0.8mg、約0.9mg、約1mg、約2mg、約3mg、約4mg、約5mg、約6mg、約7mg、約8mg、約9mg約10mg、約15mg、約20mg、約25mg、約30mg、約35mg、約40mg、約45mg、約50mg、約55mg、約60mg、約65mg、約70mg、約75mg、約80mg、約85mg、約90mg、約95mg、約100mg、約200mg、約500mg、約1g、約2.5g、約5g、約7.5g、約10g、約25g、約50g、約75g、約100g(これらの間の全ての値および範囲を含む)の1日量で投与される。
【0508】
本発明の特定の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質および/または本明細書に記載のうちのいずれかの治療薬を含む医薬組成物は、例えば、1日2回以上(例えば、毎日約2回、約3回、約4回、約5回、約6回、約7回、約8回、約9回、または約10回)、1日約1回、約1日おき、約3日おき、週約1回、2週毎に約1回、毎月約1回、2ヶ月毎に約1回、3ヶ月毎に約1回、6ヶ月毎に約1回、または毎年約1回投与されてよい。
【0509】
併用療法および追加の治療薬
種々の実施形態では、本発明の医薬組成物は、追加の治療薬と共に同時投与される。同時投与は、同時または順次であってよい。
【0510】
一実施形態では、追加の治療薬および本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、対象に同時に投与される。本明細書で使用される場合、用語の「同時に」は、追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質が約60分程度、例えば、約30分程度、約20分程度、約10分程度、約5分程度、または約1分程度の時間間隔で投与されることを意味する。追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質の投与は、単一製剤(例えば、追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質を含む製剤)または別々の製剤(例えば、追加の治療薬を含む第1の製剤およびPD-1またはPD-L1結合物質を含む第2の製剤)の同時投与により行うことが可能である。
【0511】
同時投与は、それらの投与のタイミングが、追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質の薬理学的活性が時間経過と共に重なりあい、それにより組み合わされた治療効果が発揮されるような場合には、治療薬が同時に投与される必要はない。例えば、追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質は、順次に投与できる。本明細書で使用される場合、用語の「順次に」は、追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質が約60分を超える時間間隔で投与されることを意味する。例えば、追加の治療薬とPD-1またはPD-L1結合物質との逐次投与の間の時間間隔を、約60分を超えて、約2時間を超えて、約5時間を超えて、約10時間を超えて、約1日を超えて、約2日を超えて、約3日を超えて、約1週間を超えて間隔を開ける、約2週間を超えて間隔を開ける、または約1ヶ月を越えて間隔を開けることができる。最適投与時間は、投与される追加の治療薬およびPD-1またはPD-L1結合物質の代謝、排泄速度、および/または薬力学的活性に依存するであろう。追加の治療薬またはPD-1もしくはPD-L1結合物質のうちのいずれかを、最初に投与してよい。
【0512】
同時投与はまた、治療薬が同じ投与経路により対象に投与される必要はない。むしろ、それぞれの治療薬は、任意の適切な経路、例えば、非経口または経口(non-parenterally)で投与できる。
【0513】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のPD-1またはPD-L1結合物質は、別の治療薬と同時投与されると、相乗的に作用する。このような実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質および追加の治療薬は、その治療薬が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。
【0514】
いくつかの実施形態では、本発明は、追加の治療薬としての化学療法剤に関する。例えば、限定されないが、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質と化学療法剤とのこのような組み合わせは、本明細書の別の場所で記載のように、癌の治療に使用される。化学療法剤の例としては、アルキル化剤、例えば、チオテパ、CYTOXAN(シクロホスファミド)、スルホン酸アルキル、例えば、ブスルファン、インプロスルファンおよびピポスルファン、アジリジン、例えば、ベンゾドーパ,カルボコン、メツレドーパ、およびウレドーパ、エチレンイミン、メチラメラミン例えば、アルトレタミン、トリエチルエネメラミン、トリエチレンネフォスフォラミド、トリエチレンチオフォスフォラミドおよび、トリメチロールメラミン、アセトゲニン(例えば、ブラタシン、ブラタチノン)、カントテシン(合成類似剤トポテカンを含む)、ブリオスタチン、カリスタチン(cally statin)、CC-1065(アドゼレシン、カルゼルシンおよびビゼレシン合成類似体を含む)、クリプトフィシン(例えば、クリプトフィシン1、クリプトフィシン8など)、ドラスタチン、デュオカルマイシン(合成類似薬KW-2189およびCB1-TM1を含む)、エレウテロビン、パンクラチスタチン、サルコディクチン、スポンギスタチン、ナイトロジェンマスタード、例えば、クロラムブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、酸化メクロルエタミン塩酸塩、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタード、ニトロソウレア、例えば、カルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチンおよびラニムスチン(ranimnustine)、抗生物質、例えば、エンジイン抗生物質(カリチアマイシン、特にカリチアマイシンガンマIIとカリチアマイシンオメガII(Agnew,Chem.Intl.Ed.Engl.,33:183-186(1994)を参照)、ダイネマイシン、ダイネマイシンAを含む、ビスフォスフォネート、例えば、クロドロネート、エスペラマイシン、ならびに、ネオカルジノスタチン発色団および関連色素タンパク質エンジイン抗生物質発色団)、アクラシノマイシン、アクチノマイシン、オースラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カラビシン、カルミノマイシン(caminomycin)、カルジノフィリン、クロモマイシン(chromomycinis)、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、アドリアマイシン(ドキソルビシン)(モルフォリノドキソルビシン、シアノモルフォリノドキソルビシン、2-ピロリノドキソルビシンおよびデオキシドキソルビシンを含む)、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルセロマイシン、マイトマイシン(例えば、マイトマイシンC)、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、クエラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、チュベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシン、代謝拮抗薬、例えば、メトトレキセートおよび5-フルオロウラシル(5-FU)、葉酸の類似体、例えば、デノプテリン、メトトレキセート、プテロプテリン、トリメトレキサート、プリン類似体、例えば、フルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニン、ピリミジン類似体、例えば、アンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン、アンドロゲン、例えば、カルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトン、抗副腎物質、例えば、アミノグルテチミド(minoglutethimide)、ミトタン、トリロスタン、葉酸補充液、例えば、フロリン酸(frolinic acid)、アセグラトン、アルドホスファミドグリコシド、アミノレブリン酸、エニルウラシル、アムサクリン、ベストラブシル、ビサントレン、エダトラキセート(edatraxate)、デメコルチ ン、ジアジクオン、エルフォルミチン(elformithine)、エリプチニウムアセテート、エポチロン、エトグルシド、ガリウムニトレート、ヒドロキシ尿素、レンチナン、ロニダミン(lonidainine)、メイタンシノイド、例えば、メイタンシンおよびアンサマイトシン、ミトグアゾン、ミトキサントロン、モピダモール、ニトラエリン、ペントスタチン、フェナメット、ピラルビシン、ロソキサントロン、ポドフィリン酸、2-エチルヒドラジド、プロカルバジン、PSK多糖複合体(JHS Natural Products,Eugene,Oreg.)、ラゾキサン、リゾキシン、シゾフィラン、スピロゲルマニウム、テヌアゾン酸、2,2’,2”-トリクロロトリエチルアミン、トリコテセン(例えば、T2毒、ベラクリンA、ロリジンA、およびアングイディン)、ウレタン、ビンデシン、ダカルバジン、マンノムスチン、ミトブロニトール、ミトラクトール、ピポブロマン、ガシトシン、アラビノシド(アラ-C)、シクロホスファミド、チオテパ、タキソイド、例えば、タキソールパクリタキセル(Bristol-Myers Squibb Oncology,Princeton,N.J.)、アブラキサンクレモフォアフリー、アルブミン処理ナノ粒子形成パクリタキセル(American Pharmaceutical Partners,Schaumberg,111.)、タキソテールドキセタキセル(Rhone-Poulenc Rorer,Antony,France)、クロランブシル、ジェムザール(ゲムシタビン)、6-チオグアニン、メルカプトプリン、メトトレキセート、白金類似体、例えば、シスプラチン、オキサリプラチンおよびカルボプラチン、ビンブラスチン、白金、エトポシド(VP-16)、イホスファミド、ミトキサントロン、ビンクリスチン、ナベルビン(ビノレルビン)、ノバントロン、テニポシド、エダトレキセート、ダウノマイシン、アミノプテリン、ゼローダ、イバンドロネート、イリノテカン(キャンプトサー,CPT-11)(イリノテカンと5-FUおよびロイコボリンの治療法を含む)、トポイソメラーゼ阻害剤RFS2000、ヂルルオロメチルオルニチン(DMFO)、レチノイド、例えば、レチノイン酸、カペシタビン、コンブレタスタチン、ロイコボリン(LV)、オキサリプラチン、オキサリプラチン治療法(FOLFOX)を含む、ラパチニブ(Tykerb)、PKC-α、Raf、H-Ras、EGFRの阻害剤(例えば、エルロチニブ(Tarceva)および細胞増殖を抑制するVEGF-Aならびに上述のうちのいずれかの薬剤の薬学的に許容可能な塩、酸または誘導体、が挙げられるが、これらに限定されない。さらに、治療の方法は、放射線の使用をさらに含み得る。さらに、治療の方法は、光線力学的治療の使用をさらに含み得る。
【0515】
したがって、いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1またはPD-L1結合物質および化学療法剤を用いる併用療法に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、化学療法剤を用いる治療を受けている患者に対するPD-1またはPD-L1結合物質の投与に関する。いくつかの実施形態では、化学療法剤は、DNA挿入剤、例えば、限定されないが、ドキソルビシン、シスプラチン、ダウノルビシン、およびエピルビシンである。ある実施形態では、DNA挿入剤は、ドキソルビシンである。
【0516】
例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、ドキソルビシンと同時投与されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍または癌の治療での使用において、ドキソルビシンと同時投与されると相乗的に作用する。例えば、PD-1またはPD-L1結合物質とドキソルビシンとの同時投与は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質とドキソルビシンの組み合わせは、単剤療法の場合に単独で使用される物質に比べて、改善された安全性プロファイルを示し得る。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質およびドキソルビシンは、その物質が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、変異IFNαなどの変異インターフェロンを含む。例示的実施形態では、変異IFNαは、配列番号317または配列番号318に対して、M148A、R149A、およびL153Aなどのように、148、149および153の位置に1つまたは複数の変異を含む。
【0517】
いくつかの実施形態では、本発明は、1種類または複数種類の免疫調節薬、例えば、限定されないが、免疫チェックポイントを調節する物質を用いる併用療法に関する。種々の実施形態では、免疫調節薬は、PD-1、PD-L1、およびPD-L2のうちの1つまたは複数を標的とする。種々の実施形態では、免疫調節薬は、PD-1阻害剤である。種々の実施形態では、免疫調節薬は、PD-1、PD-L1、およびPD-L2のうちの1つまたは複数に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、例えば、ニボルマブ(ONO-4538/BMS-936558、MDX1106、オプジーボ、BRISTOL MYERS SQUIBB)、ペムブロリズマブ(キイトルーダ、MERCK)、ピディリズマブ(CT-011,CURE TECH)、MK-3475(MERCK)、BMS936559(BRISTOL MYERS SQUIBB)、MPDL328OA(ROCHE)などの抗体である。いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、CD137またはCD137Lのうちの1つまたは複数を標的とする。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CD137またはCD137Lのうちの1つまたは複数に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、例えば、ウレルマブ(BMS-663513および抗4-1BB抗体としても知られる)などの抗体である。いくつかの実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、固形腫瘍および/またはB細胞非ホジキンリンパ腫および/または頭頸部癌および/または多発性骨髄腫の治療のために、ウレルマブと組み合わされる(必要に応じ、ニボルマブ、リリルマブ、およびウレルマブのうちの1つまたは複数と組み合わされる)。いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、CTLA-4、AP2M1、CD80、CD86、SHP-2、およびPPP2R5Aのうちの1つまたは複数を標的とする物質である。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CTLA-4、AP2M1、CD80、CD86、SHP-2、およびPPP2R5Aのうちの1つまたは複数に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、例えば、イピリムマブ(MDX-010、MDX-101、ヤーボイ、BMS)および/またはトレメリムマブ(Pfizer)などの抗体である。いくつかの実施形態では、本発明のキメラタンパク質は、黒色腫、前立腺癌、および肺癌のうちの1つまたは複数の治療のために、イピリムマブと組み合わされる(必要に応じ、バビツキシマブと組み合わされる)。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CD20を標的とする。種々の実施形態では、免疫調節薬は、CD20に特異的な抗体である。例えば、いくつかの実施形態では、免疫調節薬は、限定されないが、オファツムマブ(GENMAB)、オビヌツズマブ(GAZYVA)、AME-133v(APPLIED MOLECULAR EVOLUTION)、オクレリズマブ(GENENTECH)、TRU-015(TRUBION/EMERGENT)、ベルツズマブ(IMMU-106)などの抗体である。
【0518】
いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1またはPD-L1結合物質およびチェックポイント阻害剤を用いる併用療法に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、チェックポイント阻害剤を用いる治療を受けている患者に対するPD-1またはPD-L1結合物質の投与に関する。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤は、PD-1、PD-L1、PD-L2、およびCTLA-4(本明細書に記載の抗PD-1、抗PD-L1、抗PD-L2、および抗CTLA-4物質のうちのいずれかを含む)のうちの1つまたは複数を標的とする物質である。いくつかの実施形態ではチェックポイント阻害剤は、ニボルマブ(ONO-4538/BMS-936558、MDX1106、オプジーボ、BRISTOL MYERS SQUIBB)、ペムブロリズマブ(キイトルーダ、MERCK)、ピディリズマブ(CT-011,CURE TECH)、MK-3475(MERCK)、BMS936559(BRISTOL MYERS SQUIBB)、MPDL328OA(ROCHE)、イピリムマブ(MDX-010、MDX-101、ヤーボイ、BMS)およびトレメリムマブ(Pfizer)のうちの1つまたは複数である。ある実施形態では、チェックポイント阻害剤はPD-L1に対する抗体である。
【0519】
例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、抗PD-L1抗体と同時投与されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍または癌の治療での使用において、抗PD-L1抗体と同時投与されると相乗的に作用する。例えば、PD-1またはPD-L1結合物質と抗PD-L1抗体との同時投与は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質と抗PD-L1抗体の組み合わせは、単剤療法の場合に単独で使用される物質に比べて、改善された安全性プロファイルを示し得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質および抗PD-L1抗体は、その物質が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、変異IFNαなどの変異インターフェロンを含む。例示的実施形態では、変異IFNαは、配列番号317または配列番号318に準拠して、M148A、R149A、およびL153Aなどのように、148、149および153の位置に1つまたは複数の変異を含む。
【0520】
いくつかの実施形態では、本発明は、PD-1またはPD-L1結合物質および免疫抑制剤を用いる併用療法に関する。いくつかの実施形態では、本発明は、免疫抑制剤を用いる治療を受けている患者に対するPD-1またはPD-L1結合物質の投与に関する。ある実施形態では、免疫抑制剤は、TNFである。
【0521】
例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、TNFと同時投与されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍または癌の治療での使用において、TNFと同時投与されると相乗的に作用する。例えば、PD-1またはPD-L1結合物質とTNFとの同時投与は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質とTNFの組み合わせは、単剤療法の場合に単独で使用される物質に比べて、改善された安全性プロファイルを示し得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質およびTNFは、その物質が単剤療法で使用される場合に採用される用量よりも低い用量で投与され得る。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、変異IFNαなどの変異インターフェロンを含む。例示的実施形態では、変異IFNαは、配列番号317または配列番号318に準拠して、M148A、R149A、およびL153Aなどのように、148、149および153の位置に1つまたは複数の変異を含む。
【0522】
いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、キメラ抗原受容体(CAR)T細胞療法と組み合わせて使用されると、相乗的に作用する。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍または癌の治療において、CAR T細胞療法と組み合わせて使用されると相乗的に作用する。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、血液系腫瘍の治療において、CAR T細胞療法と組み合わせて使用されると相乗的に作用する。例示的実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、固形腫瘍の治療において、CAR T細胞療法と組み合わせて使用されると相乗的に作用する。例えば、PD-1またはPD-L1結合物質とCAR T細胞との使用は、相乗的に作用して、腫瘍または癌を低減または除去し得、または腫瘍または癌の増殖および/または進行および/または転移を遅らせ得る。種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、CAR T細胞分裂を誘導する。種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、CAR T細胞増殖を誘導する。種々の実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、CAR T細胞増のアナジーを防止する。
【0523】
種々の実施形態では、CAR T細胞療法は、抗原(例えば、腫瘍抗原)、例えば、限定されないが、炭酸脱水酵素IX(CAIX)、5T4、CD19、CD20、CD22、CD30、CD33、CD38、CD47、CS1、CD138、Lewis-Y、L1-CAM、MUC16、ROR-1、IL13Rα2、gp100、前立腺幹細胞抗原(PSCA)、前立腺特異的膜抗原(PSMA)、B細胞成熟抗原(BCMA)、ヒトパピローマタイプ16 E6(HPV-16 E6)、CD171、葉酸受容体アルファ(FRα)、GD2、ヒト上皮成長因子受容体2(HER2)、メソテリン、EGFRvIII、線維芽細胞活性化タンパク質(FAP)、癌胎児抗原(CEA)、および血管内皮細胞増殖因子受容体2(VEGFR2)、ならびに当該技術分野において周知のその他の腫瘍抗原を標的とするCAR T細胞を含む。追加の腫瘍抗原の例としては、MART-1/Melan-A、gp100、ジペプチジルペプチダーゼIV(DPPIV)、アデノシンデアミナーゼ結合タンパク質(ADAbp)、シクロフィリンb、結腸直腸関連性抗原(CRC)-0017-1A/GA733、癌胎児抗原(CEA)およびその免疫原性エピトープCAP-1およびCAP-2、etv6、aml1、前立腺特異抗原(PSA)およびその免疫原性エピトープPSA-1、PSA-2、およびPSA-3、T細胞受容体/CD3-ゼータ鎖、MAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A5、MAGE-A6、MAGE-A7、MAGE-A8、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A11、MAGE-A12、MAGE-Xp2(MAGE-B2)、MAGE-Xp3(MAGE-B3)、MAGE-Xp4(MAGE-B4)、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-C4、MAGE-C5)、GAGEファミリーの腫瘍抗原(例えば、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE-7、GAGE-8、GAGE-9)、BAGE、RAGE、LAGE-1、NAG、GnT-V、MUM-1、CDK4、チロシナーゼ、p53、MUCファミリー、HER2/neu、p21ras、RCAS1、α-フェトプロテイン、E-カドヘリン、α-カテニン、β-カテニンおよびγ-カテニン、p120ctn、gp100 Pmel117、PRAME、NY-ESO-1、cdc27、大腸腺腫症タンパク質(APC)、フォドリン、コネキシン37、Ig-イディオタイプ、p15、gp75、GM2およびGD2ガングリオシド、ヒトパピローマウイルスタンパク質などのウイルス産物、Smadファミリーの腫瘍抗原、lmp-1、NA、EBV-コード化核内抗原(EBNA)-1、脳グリコーゲンホスホリラーゼ、SSX-1、SSX-2(HOM-MEL-40)、SSX-1、SSX-4、SSX-5、SCP-1 CT-7、c-erbB-2、CD19、CD37、CD56、CD70、CD74、CD138、AGS16、MUC1、GPNMB、Ep-CAM、PD-L1、およびPD-L2が挙げられるが、これらに限定されない。
【0524】
代表的CAR T細胞療法としては、JCAR014(Juno Therapeutics)、JCAR015(Juno Therapeutics)、JCAR017(Juno Therapeutics)、JCAR018(Juno Therapeutics)、JCAR020(Juno Therapeutics)、JCAR023(Juno Therapeutics)、JCAR024(Juno Therapeutics)、CTL019(Novartis)、KTE-C19(Kite Pharma)、BPX-401(Bellicum Pharmaceuticals)、BPX-501(Bellicum Pharmaceuticals)、BPX-601(Bellicum Pharmaceuticals)、bb2121(Bluebird Bio)、CD-19 Sleeping Beauty cells(眠れる森の美女細胞)(Ziopharm Oncology)、UCART19(Cellectis)、UCART123(Cellectis)、UCART38(Cellectis)、UCARTCS1(Cellectis)、OXB-302(Oxford BioMedica、MB-101(Mustang Bio)およびInnovative Cellular Therapeuticsにより開発されたCAR T細胞が挙げられるが、これらに限定されない。
【0525】
いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、限定されないが、3-インターフェロン、酢酸グラチラマー、T-インターフェロン、IFNβ2(米国特許出願公開第2002/0025304号)、スピロゲルマニウム(例えば、N-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジメチル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン、N-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジエチル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン、N-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジプロピル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン、およびN-(3-ジメチルアミノプロピル-2-アザ-8,8-ジブチル-8-ゲルマスピロ[4:5]デカン)、ビタミンD類似体(例えば、1,25(OH)2D3、(例えば、米国特許第5,716,946号を参照))、プロスタグランジン(例えば、ラタノプロスト、ブリモニジン、PGE1、PGE2およびPGE3、例えば、米国特許出願公開第2002/0004525号を参照)、テトラサイクリンと誘導体(例えば、ミノサイクリンおよびドキシサイクリン、例えば、米国特許出願公開第2002/0022608号を参照)、VLA-4結合抗体(例えば、米国特許出願公開第2009/0202527号を参照)、副腎皮質刺激ホルモン、副腎皮質ステロイド、プレドニゾン、メチルプレドニソン、2-クロロデオキシアデノシン、ミトキサントロン、スルファサラジン、メトトレキセート、アザチオプリン、シクロホスファミド、シクロスポリン、フマレート、抗CD20抗体(例えば、リツキシマブ)、および チザニジン塩酸塩を含むMS治療薬のうちの1つまたは複数と組み合わせて多発性硬化症(MS)の治療方法で使用される。
【0526】
いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、MSの1つまたは複数の症状または副作用を治療する1種類または複数種類の治療薬と組み合わせて使用される。このような薬剤としては、アマンタジン、バクロフェン、パパベリン、メクリジン、ヒドロキシジン、スルファメトキサゾール、シプロフロキサシン、ドクセート、ペモリン、ダントロレン、デスモプレシン、デキサメタゾン、トルテロジン、フェニトイン(phenyloin)、オキシブチニン、ビサコジル、ベンラファキシン、アミトリプチリン、メテナミン、クロナゼパム、イソニアジド、バルデナフィル、ニトロフラントイン、車前子親水性粘漿薬、アルプロスタジル、ガバペンチン、ノルトリプチリン、パロキセチン、プロパンテリンブロミド、モダフィニル、フルオキセチン、フェナゾピリジン、メチルプレドニゾロン、カルバマゼピン、イミプラミン、ジアゼパム、シルデナフィル、ブプロピオン、およびセルトラリンが挙げられるが、これらに限定されない。
【0527】
いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1種類または複数種類の本明細書に記載の疾患修飾治療薬(DMT)(例えば、表Aの物質)と組み合わせて多発性硬化症の治療方法で使用される。いくつかの実施形態では、本発明は、1種または複数種類の開示結合物質を含まない場合の、1つまたは複数の本明細書に記載の類DMT(例えば、下表に挙げた物質)と比べて、改善された治療効果を提供する。ある実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質と1種類または複数種類のDMTの組み合わせは、相乗的治療効果をもたらす。
【表1】
【表2】
【表3】
【表4】
【0528】
MS疾患進行は、疾患進行の最初期段階で、最も激しく、最も多くの損害を与え得る。したがって、例えば、コストと副作用緩和を考慮した多くの償還方針および医療業務とは逆に、例えば、いわゆる二次治療として、最も強力なDMTを用いて治療を開始することが患者の長期疾患状態にとって最も有益である可能性がある。いくつかの実施形態では、患者は二次治療と組み合わせたPD-1またはPD-L1結合物質の投与計画により治療される。このような組み合わせを用いて、1種類または複数種類の二次治療の副作用プロファイルが低減される。いくつかの実施形態では、この組み合わせを用いて、1種類または複数種類の二次治療の投与頻度用量が低減される。例えば、組み合わせた場合、上記表に列挙された物質の用量を、約50%、または約40%、または約30%、または約25%低減し得、および/または投与頻度を通常の半分、または通常の1/3に、または例えば、毎日から隔日もしくは毎週に、隔日から毎週もしくは2週毎に、毎週から2週毎もしくは毎月に、等々減らせ得る。したがって、いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、より都合のよい治療計画を可能にすることにより、患者のアドヒアランスを高める。さらに、いくつかのDMTは、例えば、ミトキサントロンに対する生涯の投与量限度として、140mg/m2の生涯累積投与量、または2、3年の治療に厳密に制限されるべきことが示唆されている。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質を補充し、このDMTのより低い用量またはより少ない頻度の投与を可能にすることにより、患者のミトキサントロンへの接触が維持される。
【0529】
いくつかの実施形態では、患者は、1種類または複数種類のDMTでの治療を受けていない未処置患者であり、PD-1またはPD-L1結合物質が二次治療の副作用を和らげるために使用される。したがって、未処置患者は、疾患の最初に、二次治療の長期間の効果から利益を得ることができる。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、二次治療の使用の前のエントリー治療として使用される。例えば、PD-1またはPD-L1結合物質が、第一の約3ヶ月の治療期間投与されて疾患を安定化し、その後患者は二次薬剤の維持療法に移行され得る。
【0530】
未処置患者は、1種類または複数種類のDMTを受けたことがありかつおそらく失敗した患者に比べて、治療に応答する可能性が大きいと一般に考えられる。いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1種類または複数種類のDMTを受けたことがありかつおそらく失敗した患者に使用される。例えば、いくつかの実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質は、1種類または複数種類のDMTを受けたことがありかつおそらく失敗した患者の治療効果を高め、これらの患者が未処置患者のように応答することを可能にし得る。
【0531】
いくつかの実施形態では、患者は1種類または複数種類のDMTを受けたことがあるか受けているが、十分に応答していない。例えば、患者は1種類または複数種類のDMTに対し、不応性であるか、または応答が不十分であり得る。いくつかの実施形態では、患者は、テリフルノミド(AUBAGIO(GENZYME));インターフェロンβ1a(AVONEX(BIOGEN IDEC);インターフェロンβ1b(BETASERON(BAYER HEALTHCARE PHARMACEUTICALS,INC.);酢酸グラチラマー(COPAXONE(TEVA NEUROSCIENCE);インターフェロンβ1b(EXTAVIA(NOVARTIS PHARMACEUTICALS CORP.);フィンゴリモド(GILENYA(NOVARTIS PHARMACEUTICALS CORP.);アレムツズマブ(LEMTRADA(GENZYME);ミトキサントロン(NOVANTRONE(EMD SERONO);ペグ化インターフェロンβ1a(PLEGRIDY(BIOGEN IDEC);インターフェロンβ1a(REBIF(EMD SERONO,INC.);フマル酸ジメチル(BG-12)(TECFIDERA(BIOGEN IDEC);およびナタリズマブ(TYSABRI(BIOGEN IDEC)のうちの1つまたは複数に対し、不応性であるか、または応答が不十分である。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、患者における1種類または複数種類のDMTの治療効果をもたらし、したがって、DMTに対する非応答性を低減または除去する。例えば、これは、より高い用量または頻度での1種類または複数のDMTを用いる治療から患者を免れさせ得る。
【0532】
より侵攻性の疾患の患者では、1つの手法は、誘導治療モデルであり、この場合、強力な効力があるが安全性の懸念の強い治療を最初に投与し、続いて、維持療法を行う。このようなモデルの例は、アレムツズマブによる最初の治療に続けて、IFNβ、GA、またはBG-12による治療を含み得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質を用いて、療法を維持療法に切り替える必要性をなくす。いくつかの実施形態では、二次治療を含み、1種類または複数種類の開示結合物質を、1種類または複数のDMTに対する維持療法として用いる。いくつかの実施形態では、1種類または複数の開示結合物質を、例えば、一次治療などの、誘導療法での第一の治療として用い、続けて維持療法として別のDMTを用いる。
【0533】
いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質を、約3ヶ月の初期治療期間の間投与して疾患を安定させ、その後患者を一次治療薬による維持療法に移行し得る。
【0534】
種々の実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質を用いて、限定されないが、本明細書で開示のうちのいずれかの物質を含む、DMTの1種類または複数種類の副作用を低減する。例えば、1種類または複数種類の開示結合物質は、1種類または複数のDMTの用量を節約可能にし、したがって、より少ない副作用とする投与計画で使用し得る。例えば、いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、AUBAGIOまたは関連物質の1種類または複数の副作用を低減させ得る。この副作用は、毛髪菲薄化、下痢、インフルエンザ、悪心、異常な肝臓検査および手または足の異常な痺れまたは刺痛(知覚異常)、白血球のレベル(感染症のリスクの増大の可能性);血圧の増大;および重篤な肝障害を含み得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、AVONEXまたは関連物質の、注射後のインフルエンザ様症状、うつ、軽度の貧血、肝障害、アレルギー反応および心臓障害を含む1種類または複数の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、BETASERONまたは関連物質の、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、アレルギー反応、うつ、肝障害、および低白血球数を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、COPAXONEまたは関連物質の、注射部位反応、血管拡張(血管の拡張);胸部痛;不安症、胸部痛、動悸、息切れおよび顔面紅潮を含む注射直後の反応を含む、1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、EXTAVIAまたは関連物質の、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、アレルギー反応、うつ、肝障害、および低白血球数を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、GILENYAまたは関連物質の、頭痛、インフルエンザ、下痢、背部痛、肝臓酵素上昇、咳、最初の投与後の遅い心拍数、感染症、および眼の膨潤を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、発疹、頭痛、発熱、鼻詰まり、悪心、尿路感染症、疲労、不眠、上気道感染症、じん麻疹、そう痒、甲状腺障害、真菌感染、関節、四肢および背中の痛み、下痢、嘔吐、顔面紅潮、および輸注反応(悪心、じん麻疹、そう痒、不眠、悪寒、顔面紅潮、疲労、息切れ、味覚の変化、消化障害、眩暈、疼痛を含む)を含むLEMTRADAまたは関連物質の1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、ノバントロンまたは関連物質の、投与の24時間後の緑色尿;感染症、骨髄抑制(疲労、紫斑、低血液細胞数)、悪心、毛髪菲薄化、膀胱感染症、口のびらん、および深刻な肝障害および心臓障害を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、PLEGRIDYまたは関連物質の、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、うつ、軽度の貧血、肝障害、アレルギー反応および心臓障害を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、REBIFまたは関連物質の、注射後のインフルエンザ様症状、注射部位反応、肝障害、うつ、アレルギー反応、および低赤血球数または白血球数を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、TECFIDERAまたは関連物質の、顔面紅潮(熱またはそう痒の感覚、皮膚の紅潮)、消化管障害(悪心、下痢、腹痛)、発疹、尿中タンパク、肝酵素の上昇;および血中のリンパ球(白血球)数の減少を含む1種類または複数種類の副作用を低減し得る。いくつかの実施形態では、1種類または複数種類の開示結合物質は、頭痛、疲労、尿路感染症、うつ、気道感染症、関節痛、胃もたれ、腹部不快感、下痢、腟炎、腕または脚部痛、発疹、輸注の2時間以内のアレルギー性反応または過敏症反応(眩暈、発熱、発疹、そう痒、悪心、顔面紅潮、低血圧、呼吸困難、胸部痛)を含むTYSABRIまたは関連物質の1種類または複数種類の副作用を低減し得る。
【0535】
いくつかの実施形態では、本発明は、国際公開第2013/10779号、国際公開第2015/007536号、国際公開第2015/007520号、国際公開第2015/007542号、および国際公開第2015/007903号に記載の1種類または複数種類のキメラ物質との併用療法に関する。これらの特許の内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0536】
限定されないが、感染症適用を含む、いくつかの実施形態では、本発明は、追加の治療薬としての抗感染薬に関する。いくつかの実施形態では、抗感染薬は、抗ウイルス薬であり、これは、限定されないが、アバカビル、アシクロビル、アデホビル、アンプレナビル、アタザナビル、シドフォヴィル、ダルナビル、デラビルジン、ジダノシン、ドコサノール、エファビレンツ、エルビテグラビル、エムトリシタビン、エンフビルチド、エトラビリン、ファムシクロビル、およびホスカルネットを含む。いくつかの実施形態では、抗感染薬は抗菌剤であり、これは、限定されないが、セファロスポリン系抗生物質(セファレキシン、セフロキシム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファクロール、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、およびセフトビプロール);フルオロキノロン系抗生物質(シプロ、レヴァキン、フロキシン、テクイン、アベロックスおよびノルフロックス);テトラサイクリン系抗生物質(テトラサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、およびドキシサイクリン);ペニシリン系抗生物質(アモキシシリン、アンピシリン、ペニシリンV、ジクロキサシリン、カルベニシリン、バンコマイシン、およびメチシリン);モノバクタム系抗生物質(アズトレオナム);およびカルバペネム系抗生物質(エルタペネム、ドリペネム、イミペネム/シラスタチン、およびメロペネム)を含む。いくつかの実施形態では、抗感染薬は、抗マラリア薬(例えば、クロロキン、キニーネ、メフロキン、プリマキン、ドキシサイクリン、アーテメータ/ルメファントリン、アトバクオン/プログアニルおよびスルファドキシン/ピリメタミン)、メトロニダゾール、チニダゾール、イベルメクチン、パモ酸ピランテル、およびアルベンダゾールを含む。
【0537】
限定されないが、自己免疫疾患適用を含むいくつかの実施形態では、追加の治療薬は、免疫抑制剤である。いくつかの実施形態では、免疫抑制剤は、ステロイド性抗炎症剤または非ステロイド性抗炎症剤(NSAID)などの抗炎症剤である。ステロイド、特に副腎皮質ホルモン剤およびそれらの合成類似体は当該技術分野においてよく知られている。本発明で有用な副腎皮質ステロイドの例としては、ヒドロキシルトリアムシノロン、α-メチルデキサメタゾン、β-メチルβ-メタゾン、ベクロメタゾンジプロピオネート、β-メタゾンベンゾエート、β-メタゾンジプロピオネート、β-メタゾンバレレート、クロベタゾールバレレート、デソニド、デソキシメタゾン、デキサメタゾン、ジフロラソンジアセテート、ジフルコルトロンバレレート、フルアドレノロン、フルクロロロンアセトニド、フルメタゾンピバレート、フルオシノロンアセトニド、フルオシノニド、フルコルチンブチルエステル、フルオコルトロン、フルプレドニデン(フルプレドニリデン)アセテート、フルランドレノロン、ハルシノニド、ヒドロコルチゾンアセテート、ヒドロコルチゾンブチレート、メチルプレドニゾロン、トリアムシノロンアセトニド、コルチゾン、コルトドキソン、フルセトニド、フルドロコルチゾン、ジフルオロゾンジアセテート、フルラドレノロンアセトニド、メドリゾン、アムシナフェル、アムシナフィド、ベタメタゾンおよびその残りのエステル、クロロプレドニソン、クロコルテロン、クレシノロン、ジクロリゾン、ジフルプレドネート、フルクロロニド、フルニソリド、フルオロメタロン、フルペロロン、フルプレドニソロン、ヒドロコルチゾン、メプレドニゾン、パラメタゾン、プレドニゾロン、プレドニゾン、ベクロメタゾンジプロピオネートが挙げられるが、これらに限定されない。本発明で使用してよい(NSAIDS)としては、限定されないが、サリチル酸、アセチルサリチル酸、サリチル酸メチル、グリコールサリチレート、サリチルアミド、ベンジル-2,5-ジアセトキシ安息香酸、イブプロフェン、スリンダク(fulindac)、ナプロキセン、ケトプロフェン、エトフェナメート、フェニルブタゾン、およびインドメタシンが挙げられる。いくつかの実施形態では、免疫抑制剤は、アルキル化剤、代謝拮抗物質(例えば、アザチオプリン、メトトレキセート)、細胞傷害性抗生物質、抗体(バシリキシマブ、ダクリズマブ、およびムロモナブ)、抗イムノフィリン剤(例えば、シクロスポリン、タクロリムス、シロリムス)、インターフェロン、オピオイド、TNF結合タンパク質、ミコフェノレート、および小分子生物学的製剤(例えば、フィンゴリモド、ミリオシン)などの細胞分裂阻害薬であってよい。追加の抗炎症剤は、例えば、米国特許第4,537,776号に記載され、この特許の全内容は参照により本明細書に組み込まれる。
【0538】
いくつかの実施形態では、本明細書で記載のPD-1またはPD-L1結合物質は、修飾されている誘導体、すなわち、共有結合が組成物の活性を妨げないようにして、任意のタイプの分子の、組成物への共有結合により修飾されている誘導体を含む。例えば、限定するものではないが、誘導体は、特に、グリコシル化、脂質化、アセチル化、ペグ化、リン酸化、アミド化、既知の保護/ブロック基による誘導体化、タンパク質切断、細胞リガンドまたはその他のタンパク質への結合、などにより修飾されている組成物を含む。多くの化学修飾のうちのいずれかを既知の技術、例えば、限定されないが、特異的化学切断、アセチル化、ホルミル化、ツニカマイシンの代謝合成、などを使って行うことができる。
【0539】
さらにその他の実施形態では、本明細書に記載のPD-1またはPD-L1結合物質は、例示的実施形態では、毒素、化学療法剤、放射性同位元素、およびアポトーシスまたは細胞死を引き起こす物質を含む細胞傷害薬をさらに含む。このような物質は、本明細書に記載の組成物に複合化され得る。
【0540】
本明細書で記載のPD-1またはPD-L1結合物質をこのように翻訳後修飾して、化学リンカーなどのエフェクター部分、例えば、蛍光染料、酵素、基質、生物発光物質、放射性物質、および化学発光部分などの検出可能な部分、または、例えば、ストレプトアビジン、アビジン、ビオチン、細胞毒、細胞傷害性薬、および放射性物質などの機能的部分を付加し得る。
【0541】
細胞傷害薬の例としては、メトトレキセート、アミノプテリン、6-メルカプトプリン、6-チオグアニン、シタラビン、5-フルオロウラシルデカルバジン;アルキル化剤(例えば、メクロレタミン、チオテパ(thioepa)、クロラムブシル、メルファラン、カルムスチン(BSNU)、マイトマイシンC、ロムスチン(CCNU)、1-メチルニトロソウレア、シクロホスファミド(cyclothosphamide)、メクロレタミン、ブスルファン、ジブロモマンニトール、ストレプトゾトシン、マイトマイシンC、シス-ジクロロジアミン白金(II)(DDP)シスプラチンおよびカルボプラチン(パラプラチン));アントラサイクリン(ダウノルビシン(以前のダウノマイシン)およびドキソルビシン(アドリアマイシン)、デトルビシン、カルミノマイシン、イダルビシン、エピルビシン、ミトキサントロンおよびビサントレンを含む);抗生物質(ダクチノマイシン(アクチノマイシンD)、ブレオマイシン、カリチアマイシン、ミトラマイシン、およびアントラマイシン(AMC)を含む);有糸分裂阻害薬(antimytotic agent)(例えば、ビンカアルカロイドビンカアルカロイド、ビンクリスチンおよびビンブラスチン)が挙げられるが、これらに限定されない。その他の細胞傷害薬としては、パクリタキセル(タキソール)、リシン、緑膿菌外毒素、ゲムシタビン、サイトカラシンB、グラミシジンD、臭化エチジウム、エメチン、エトポシド、テノポシド、コルヒチン、ジヒドロキシアントラシンジオン、1-デヒドロテストステロン、グルココルチコイド、プロカイン、テトラカイン、リドカイン、プロプラノロール、ピューロマイシン、プロカルバジン、ヒドロキシ尿素、アスパラギナーゼ、副腎皮質ステロイド、ミトタン(mytotane)(O,P’-(DDD))、インターフェロン、およびこれらの細胞傷害薬の混合物が挙げられる。
【0542】
さらなる細胞傷害薬としては、化学療法剤、例えば、カルボプラチン、シスプラチン、パクリタキセル、ゲムシタビン、カリチアマイシン、ドキソルビシン、5-フルオロウラシル、マイトマイシンC、アクチノマイシンD、シクロホスファミド、ビンクリスチン、ブレオマイシン、VEGFアンタゴニスト、EGFRアンタゴニスト、プラチン、タキソール、イリノテカン、5-フルオロウラシル、ゲムシタビン(gemcytabine)、ロイコボリン、ステロイド類、シクロホスファミド、メルファラン、ビンカアルカロイド(例えば、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシンおよびビノレルビン)、ムスチン、チロシンキナーゼ阻害剤、放射線療法、性ホルモン拮抗薬、選択的アンドロゲン受容体調節薬、選択的エストロゲン受容体調節薬、PDGFアンタゴニスト、TNFアンタゴニスト、IL1アンタゴニスト、インターロイキン(例えば、IL12またはIL2)、IL12Rアンタゴニスト、毒素複合化モノクローナル抗体、腫瘍抗原特異的モノクローナル抗体、アービタックス、アバスチン、ペルツズマブ、抗CD20抗体、リツキサン、オクレリズマブ、オファツムマブ、DXL625、ハーセプチン(登録商標)、またはこれらの任意の組み合わせが挙げられるが、これらに限定されない。リシン、ジフテリア毒素およびシュードモナス毒素などの植物および細菌由来の毒性酵素は、治療薬(例えば、抗体)と複合体形成して、細胞型特異的殺作用剤を生成し得る(Youle,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 77:5483(1980);Gilliland,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 77:4539(1980);Krolick,et al.,Proc.Nat’l Acad.Sci.USA 77:5419(1980))。
【0543】
他の細胞傷害薬としては、Goldenbergによる米国特許第6.653,104号に記載される細胞傷害性リボヌクレアーゼが挙げられる。本発明の実施形態はまた、放射性免疫複合体に関し、複合体形成剤を使用してまたは使用せずに、アルファまたはベータ粒子を放出する放射性核種がPD-1またはPD-L1結合物質に安定に結合される。このような放射性核種としては、例えば、リン-32、スカンジウム-47、銅-67、ガリウム-67、イットリウム-88、イットリウム-90、ヨウ素-125、ヨウ素-131、サマリウム-153、ルテチウム-177、レニウム-186またはレニウム-188などのβ放射体、およびアスタチン-211、鉛-212、ビスマス-212、ビスマス-213またはアクチニウム-225などのα放射体が挙げられる。
【0544】
検出可能な部分の例としては、西洋ワサビペルオキシダーゼ、アセチルコリンエステラーゼ、アルカリフォスファターゼ、ベータガラクトシダーゼおよびルシフェラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。蛍光材料のさらなる例としては、ローダミン、フルオレセイン、フルオレセインイソチオシアネート、ウンベリフェロン、ジクロロトリアジニルアミン、フィコエリトリンおよびダンシルクロリドが挙げられるが、これらに限定されない。化学発光部分のさらなる例としては、ルミノールが挙げられるが、これに限定されない。生物発光材料のさらなる例としては、ルシフェリンおよびエクオリンが挙げられるが、これらに限定されない。放射性材料のさらなる例としては、ヨウ素-125、炭素-14、硫黄-35、トリチウムおよびリン-32が挙げられるが、これらに限定されない。
【0545】
治療方法
本明細書に記載の方法および組成物は、限定されないが、癌、感染症、免疫異常、および炎症性疾患または状態を含む、種々の疾患および障害を治療する用途がある。
【0546】
さらに、本発明の物質は、限定されないが、癌、感染症、免疫異常、炎症性疾患または状態、および自己免疫疾患を含む、種々の疾患および障害の治療、または治療用の薬物の製造において使用し得る。
【0547】
いくつかの実施形態では、本発明は、癌の治療、または癌の患者に関する。本明細書で使用される場合、癌は、身体の器官およびシステムの正常な機能動作を妨害し得る任意の制御されない細胞増殖を指し、原発性および転移性の腫瘍の両方を含む。元の位置から移動し重要な器官に播種される原発性腫瘍または癌は、罹患した器官の機能劣化により対象の死を最終的にもたらす場合がある。転移は、原発腫瘍部位のものとは異なる癌細胞または一群の癌細胞であり、原発腫瘍から身体の他の部位への癌細胞の播種から生ずる。転移は、最終的に対象の死をもたらす場合がある。例えば、癌は、良性および悪性の癌、ポリープ、過形成、ならびに休眠腫瘍または微小転移を含み得る。
【0548】
治療され得る癌の例としては、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳および中枢神経系癌、乳癌、腹膜の癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸および直腸癌、結合組織癌、消化器系の癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部の癌、胃癌(胃腸癌を含む)、神経膠芽腫、肝癌、ヘパトーマ、上皮内腫瘍、腎臓癌または腎臓癌(kidney or renal cancer)、喉頭癌、白血病、肝臓癌、肺癌(例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、および肺扁平上皮癌)、黒色腫、骨髄腫、神経芽腫、口腔癌(唇、舌状、舌、口内、および咽頭)、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌腫、肉腫、皮膚癌、扁平上皮細胞癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮または子宮内膜癌、泌尿器系の癌、外陰癌、ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫、ならびにB細胞リンパ腫を含むリンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む)、小リンパ球性(SL)NHL、中悪性度/濾胞性NHL、中悪性度びまん性NHL、高悪性度免疫芽細胞NHL、高悪性度リンパ芽球性NHL、高悪性度小型非切れ込み核細胞性NHL、巨大腫瘤病変NHL、マントル細胞リンパ腫、エイズ関連リンパ腫、およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性リンパ性白血病(ALL)、急性骨髄性白血病(AML)、毛様細胞性白血病、慢性骨髄芽球性白血病、ならびに他の癌腫および肉腫、および移植後リンパ増殖性疾患(PTLD)、ならびに母斑症、浮腫(例えば、脳腫瘍に関連するもの)、およびメグズ症候群に関連する異常血管増殖が挙げられるが、これらに限定されない。
【0549】
種々の実施形態では、本発明は、癌の治療のための改変シグナル伝達物質をさらに含むキメラの一部であるPD-1またはPD-L1結合物質を提供する。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、腫瘍を大きく低減および/または除去する。いくつかの実施形態では、本発明のPD-1またはPD-L1結合物質は、他の抗癌剤、例えば、化学療法剤、チェックポイント阻害剤、および免疫抑制剤と併せて対象に投与されると、腫瘍を大きく低減および/または除去する。種々の実施形態では、PD-1またはPD-L1結合物質と他の抗癌剤の組み合わせは、腫瘍サイズを相乗的に低減するおよび/または腫瘍細胞を除去する。
【0550】
種々の実施形態では、本発明は、1つまたは複数の標的化部分および1種類または複数種類の改変シグナル伝達物質を含むキメラの一部であるPD-1またはPD-L1結合物質を用いる癌併用療法に関する。したがって、本発明は、例えば、PD-1またはPD-L1に対する標的化部分および1種類または複数種類のシグナル伝達物質を含むキメラまたは融合タンパク質および抗癌剤と組み合わせたその使用を提供する。
【0551】
例えば、種々の実施形態では、本発明は、限定されないが、本明細書に記載のPD-1またはPD-L1結合物質と、ヒトインターフェロンアルファ2を含むIFNアルファなどの変異ヒトインターフェロンを含む改変シグナル伝達物質とのキメラを含む癌の併用療法剤に関する。
【0552】
いくつかの実施形態では、本発明は、微生物感染症および/または慢性感染症の治療、またはそれらの感染症を罹患している患者に関する。感染症の例としては、HIV/AIDS、結核、骨髄炎、B型肝炎、C型肝炎、エプスタイン・バールウイルスまたはパルボウイルス感染症、T細胞白血病ウイルス感染症、細菌過剰症候群、真菌または寄生虫感染症が挙げられるが、これらに限定されない。
【0553】
種々の実施形態では、本発明の組成物は、炎症、急性炎症、慢性炎症、呼吸器疾患、アテローム性動脈硬化症、再狭窄、喘息、アレルギー性鼻炎、アトピー性皮膚炎、敗血性ショック、関節リウマチ、炎症性腸疾患、炎症性骨盤疾患、痛み、眼の炎症性疾患、セリアック病、リー症候群、グリセロールキナーゼ欠損症、家族性好酸球増加症(FE)、常染色体劣性遺伝性脊髄小脳変性症、炎症性喉頭疾患、結核、慢性胆嚢炎、気管支拡張症、珪肺症および他の塵肺症などの1種類または複数種類の炎症性疾患または状態を治療または予防するために使用される。
【0554】
種々の実施形態では、本発明の組成物は、MS、糖尿病、ループス、セリアック病、クローン病、潰瘍性大腸炎、ギラン・バレー症候群、強皮症、グッドパスチャー症候群、ウェゲナー肉芽腫症、自己免疫性てんかん、ラスムッセン脳炎、原発性硬化性胆管炎、硬化性胆管炎、自己免疫性肝炎、アジソン病、橋本甲状腺炎、線維筋痛症、メニエール症候群(Menier’s syndrome)、移植拒絶反応(例えば、移植片拒絶の防止)、悪性貧血、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、皮膚筋炎、シェーグレン症候群、紅斑性狼瘡、重症筋無力症、ライター症候群、グレーブス病、およびその他の自己免疫疾患などの1種類または複数種類の自己免疫疾患および/または神経変性疾患または状態の治療または予防に使用される。
【0555】
種々の実施形態では、本発明は、自己免疫疾患および/または神経変性疾患を治療または予防するために用いられる。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患および/または神経変性疾患は、MS(限定されないが、本明細書に記載のサブタイプを含む)、アルツハイマー病(限定されないが、早期発症型アルツハイマー病、遅発性アルツハイマー病、および家族性アルツハイマー病(FAD)を含む)、パーキンソン病およびパーキンソニズム(限定されないが、特発性パーキンソン病、脳血管性パーキンソニズム、薬剤誘発性パーキンソニズム、レヴィー小体型痴呆、遺伝性パーキンソン病、若年性パーキンソン病を含む)、ハンチントン病、筋萎縮性側索硬化症(ALS、限定されないが、突発性ALS、家族性ALS、西太平洋ALS、若年性ALS、平山病(Hiramaya disease))から選択される。
【0556】
キット
本発明はまた、本明細書に記載のうちのいずれかのPD-1またはPD-L1結合物質の投与(例えば、追加の治療薬を含み、または含まず)のためのキットを提供する。キットは、本明細書に記載の少なくとも1種類の本発明の医薬組成物を含む、材料または成分の集合体である。したがって、いくつかの実施形態では、キットは、本明細書に記載の少なくとも1種類の医薬組成物を含む。
【0557】
キットを構成する成分の明確な性質は、その意図される目的に依存する。一実施形態では、キットは、ヒト対象用を治療する目的のために構成される。
【0558】
使用説明書をキット中に含めてもよい。使用説明書は、通常、癌の治療などの望まれる治療結果を達成するために、キットの成分を使用する際に採用すべき技術を説明する明確な表現を含む。必要に応じ、キットは、他の有用な成分、例えば、希釈剤、緩衝剤、薬学的に許容可能な担体、シリンジ、カテーテル、塗布具、ピペット操作または測定用ツール、包帯材料または当業者なら容易に気付くような他の有用な備品一式も含む。
【0559】
キットに組込まれる材料および成分は、それらの操作性および有用性を維持する任意の便利で適切な方法で保管され開業医に提供され得る。例えば、成分は、室温、冷蔵温度、または凍結温度で提供できる。成分は通常、適切な梱包材料に収容される。種々の実施形態では、梱包材料は、よく知られた方法、好ましくは、無菌の、混入物のない環境を与える方法で構築される。梱包材料は、内容物および/またはキットの目的および/またはその成分を表示する外部ラベルを有してよい。
【0560】
定義
本明細書で使用される場合、「a」、「an」、または「the」は、1つ(1種類)または2つ以上(2種類以上)を意味し得る。
【0561】
さらに、参照数値表示に関連して使われる用語の「約」は、参照数値表示±参照数値表示の最大で10%を意味する。例えば、用語の「約50」は、45~55の範囲を含む。
【0562】
「有効量」という用語は、医学的使用に関連して使用される場合、測定できるほどの目的の疾患の治療、予防、または発病速度の低下をもたらすのに効果的である量である。
【0563】
本明細書で使用される場合、物質または刺激の存在下で、このような調節の非存在下に比べて、活性および/または効果の出力値がかなりの量、例えば、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、またはそれを超えて、少なくとも最大約100%(約100%を含む)低減されるとき、何かが「減少され」ている。当業者により理解されるように、いくつかの実施形態では、活性は減少され、かついくつかの下流の出力値は減少されるが、他のものは増加し得る。
【0564】
逆に、物質または刺激の存在下で、このような物質または刺激の非存在下に比べて、活性および/または効果の出力値がかなりの量、例えば、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約40%、少なくとも約50%、少なくとも約60%、少なくとも約70%、少なくとも約80%、少なくとも約90%、少なくとも約95%、少なくとも約97%、少なくとも約98%、またはそれを超えて、最大少なくとも約100%(約100%を含む)またはそれを超えて、少なくとも約2倍、少なくとも約3倍、少なくとも約4倍、少なくとも約5倍、少なくとも約6倍、少なくとも約7倍、少なくとも約8倍、少なくとも約9倍、少なくとも約10倍、少なくとも約50倍、少なくとも約100倍増加する場合、活性は「増加され」る。
【0565】
本明細書において、参照される場合、全ての組成物に関するパーセンテージは、特に指定がない限り、総組成物の重量による。本明細書で使用する場合、「含む(include)」という単語とその変形物は、非限定であることを意図し、それにより、リスト中の項目の記載は、この技術の組成物および方法に有用である可能性を同様に有する他の類似項目の除外を意図するものではない。同様に、用語の「can」および「may」およびその変形物は、非限定であることを意図し、それにより、ある実施形態が特定の要素または特徴を含むことが「できる(can)」または含んでも「よい(may)」という記載は、これらの要素または特徴を含まない本発明の技術のその他の実施形態を排除するものではない。
【0566】
including、containing、またはhavingなどの用語の同義語としてのオープンエンド用語の「含む(comprising)」を本明細書で使用して本発明を記載および請求するが、本発明、またはその実施形態は、「からなる(consisting of)」または「から本質的になる(consisting essentially of)」などの代替用語を使って、代わりに記載することができる。
【0567】
本明細書で使用される場合、用語の「好ましい」および「好ましくは」は、特定の状況下で、特定の利点をもたらす本技術の実施形態を指す。しかしながら、同じまたは他の環境下で、他の実施形態も好ましい場合がある。さらに、1つまたは複数の好ましい実施形態の記載は、他の実施形態が有用でないことを示すものではなく、また、本技術の範囲から他の実施形態を排除することを意図するものではない。
【0568】
治療効果の達成に必要な本明細書で記載の組成物の量は、特定目的のための従来の手順に従って経験的に決定されてよい。一般に、治療目的のために治療薬を投与する場合、治療薬は薬理学的有効量で投与される。「薬理学的有効量」、「薬理学的有効用量」、「治療有効量」、または「有効量」は、特に障害または疾患を治療するために、目的の生理的な効果を生み出すのに十分な量または目的の結果を達成することができる量を意味する。本明細書で使用される場合、有効量は、例えば、障害または疾患の症状の進展を遅らせる、障害または疾患の症状の経過を変える(例えば、疾患の症状の進展を遅らせる)、障害または疾患のうちの1つまたは複数の症状または発症を減らすまたはなくす、および障害または疾患の症状を回復させるのに十分な量を含んでよい。治療効果はまた、改善が実現されるかどうかにかかわらず、根底にある疾患または障害の進行を止めるまたは遅らせることも含む。
【0569】
有効量、毒性、および治療効果は、例えば、細胞培養または実験動物によりLD50(集団の約50%に対する致死用量)およびED50(集団の約50%での治療的有効量)を測定するための標準的薬学的手順により決定できる。投与量は、用いられる剤形および利用される投与経路に応じて変化し得る。毒性と治療効果との間の用量比率は、治療指数であり、比率LD50/ED50で表すことができる。いくつかの実施形態では、大きな治療指数を示す組成物および方法が好ましい。治療有効量は、最初は、例えば、細胞培養アッセイを含むインビトロアッセイから推測することができる。また、用量は、細胞培養または適切な動物モデルで決定したIC50などの循環血漿中濃度を達成するように動物モデルで処方することができる。記載の組成物の血漿中レベルは、例えば、高速液体クロマトグラフィーにより測定することができる。いずれかの特定の投与量の効果は、適切なバイオアッセイによりモニターすることができる。投与量は医師により決定されてよく、必要に応じて、観察された治療の効果に適合するように調節できる。
【0570】
特定の実施形態では、効果は、少なくとも約10%、少なくとも約20%、少なくとも約30%、少なくとも約50%、少なくとも約70%、または少なくとも約90%の定量可能な変化をもたらすであろう。いくつかの実施形態では、効果は、約10%、約20%、約30%、約50%、約70%、またはさらに約90%以上の定量化可能な変化をもたらすであろう。治療効果はまた、改善が実現されるかどうかにかかわらず、根底にある疾患または障害の進行を止めるまたは遅らせることも含む。
【0571】
本明細書で使用される場合、「治療方法」は、本明細書に記載の疾患または障害の治療のための組成物および/または本明細書に記載の疾患または障害の治療のための薬剤の製造での使用および/または複数使用のための組成物に等しく適用可能である。
【実施例】
【0572】
本明細書では、場合により、インターフェロンベースキメラに言及するために、用語の「AcTaferon」(AFN)が使われる。
【0573】
下記の実施例では、特に断りのない限り、IFN対する変異は、ヒトIFNα2に対するものである。
【0574】
実施例1.単一特異性ヒトキメラのヒトPD-1またはPD-L1標的化の効率
PD-1またはPD-L1抗体を含むヒトAcTaferonアルファによる標的化の効率を、STAT1リン酸化のFACSベース定量化により調べた。具体的には、標的化を、一次末梢血単核球(PBMC)、遺伝子導入Hek293T細胞(PD-1標的化について)、またはヒト乳癌細胞株MDA-MB-321(PD-L1標的化について)で分析した。以下の抗体を使用した:
抗PD-1抗体:
-Pem:ペムブロリズマブ/キイトルーダ(Merck)
-Niv:ニボルマブ/オプジーボ(BMS)
抗PD-L1抗体:
-Ate:アテゾリズマブ/テセントリク/MPDL3280(Roche/Genetech)
-Dur:デュルバルマブ/MEDI4736(Celgene/AstraZeneca)
-Ave:アベルマブ/MSB0010718C(Merck/Pfizer)
-Bms:BMS-936559/MDX-1105(BMS)
【0575】
これらの抗体の配列は、本明細書の別の場所に記載されている。抗PD-L1 BMS-936559/MDX-1105抗体に関しては特に、この抗体の可変ドメインを、一般的なヒトIgGにグラフト化した。したがって、本明細書で提供される方法で使用するためのBMS-936559またはその抗原結合フラグメントは、配列番号1242のアミノ酸配列を含む重鎖可変領域;および/または配列番号1243のアミノ酸配列を含む軽鎖可変領域を含む。
【0576】
可変ドメインのヒトIgGへの生着後に、次の重鎖および軽鎖配列が得られた:
重鎖:配列番号1244
軽鎖:配列番号1245
【0577】
種々の抗体重鎖を、pMTW発現ベクター中でフレキシブル20*GGSリンカーを介してhIFNa2_R149配列(例えば、R149A変異を有するヒトIFNα2)に遺伝的に融合した(得られたベクター:pMTW-SIgK-重鎖-(GGS)
20-hIFNa2_R149A-GGS-(His)
9)。軽鎖を同じベクターに挿入した(得られたベクター:pMTW-SIgK-軽鎖)。クローニング方法を模式的に
図1に示す。PD-L1 AFNを、標準的プロトコルに従い25K PEI(ポリエチレンイミン)を用いるFreeStyle 293F細胞(ThermoFisher)中での両方のプラスミドの一時的遺伝子導入により産生した。培地を採取し、細胞を遠心分離により除去し、濾過滅菌した。組換えタンパク質を、製造業者の説明書に従いNi Excel樹脂(GE Healthcare)を用いて精製し、イミダゾールを、PD10カラム(GE Healthcare)を用いて試料から除去した。
【0578】
遺伝子導入Hek293T細胞へのPD-L1 Ab-AFNの結合
Hek293T細胞に、リン酸カルシウムを用いて膜結合型のPD-1またはPD-L1を遺伝子導入した。遺伝子導入の2日後に、細胞を再懸濁し、PD-L1 Ab-AFN(FACS緩衝液:2%FBS;0.5mM EDTAを補充したPBS中1μg/ml)と4℃で2時間インキュベートした。2回の洗浄後に、細胞をFITC標識THE HIS抗体(GenScript;4℃で1時間)とインキュベートした。結合を、CellQuest Pro Version 4.0.2ソフトウェア(BD Biosciences)を使用して、FACSCalibur測定器(BD Biosciences)で測定した。
図2中のデータは、PD-L1 AFNがPD-L1遺伝子導入細胞に選択的に結合し、一方でPD-1 AFNがPD-1発現細胞のみに結合したことを示す。
【0579】
PD-1標的化:末梢血単核球(PBMC)中のpSTAT1
健康なドナーのバフィーコート由来のPBMCを、Lymphoprep(StemCell Technologies)を用いる密度勾配遠心分離により単離した。細胞をFACS緩衝液(2%FBS、PBS中0.5mMのEDTA)で2回洗浄し、FITC結合抗ヒトPD-1(クローンPD-1.3.1.3;Miltenyi Biotec)を用いて4℃で20分間染色した。2回の洗浄剤後に、細胞を段階希釈PD-1 Ab-AFNを用いて37℃で15分間刺激した。固定(10分間、37℃、Fix Buffer I;BD Biosciences)および透過処理(30分、氷上、Perm III Buffer I;BD Biosciences)および洗浄後に、細胞を抗STAT1 pY701 Ab(BD Biosciences)で染色した。試料を、CellQuest Pro Version 4.0.2ソフトウェア(BD Biosciences)を使用して、FACSCalibur(BD Biosciences)で取得した。
図3のデータは、ペムブロリズマブおよびニボルマブ結合AcTaferonはPD-1陽性PBMC中でSTAT1をリン酸化できたが、PD-1陰性PBMC中ではリン酸化できなかったことを示す。
【0580】
PD-1標的化:遺伝子導入Hek293T細胞中のpSTAT1
Hek293T細胞に、リン酸カルシウムを用いてヒトPD-1または空のベクターを遺伝子導入した。2日後に、細胞を再懸濁し、段階希釈PD-1 AFNで刺激した(15分、37℃)。pSTAT1を上述のように定量化した。
図4のデータは、PD-1 Ab AFNが、PD-1発現Hek293T細胞ではSTAT1リン酸化を効率的に誘導するが、モック遺伝子導入細胞ではリン酸化を誘導しないことを示す。
【0581】
PD-L1標的化:MDA-MB-231細胞中のpSTAT1
MDA-MB-321細胞を、10%FBSを補充したDMEM培地中で、PD-(L)1 AFNを用いて37℃で15分間刺激した。刺激後、pSTAT1を上述のように定量化した。PD-L1結合AFNは、STAT1を効率的にリン酸化でき、それによりPD-L1標的化作用を示すが、PD-1結合AFNはそうではなかった(
図5)。
【0582】
実施例2.ヒトPD-1またはPD-L1に対し特異的なVHHの構築と評価
ELISAアッセイを、PD-1抗原に対して本明細書の別の場所で記載のように行って種々のPD-1 VHHの結合親和性を評価した。PD-1 VHHの親和性を、以下の表1に表す(列A/対照を参照):
【表5】
【0583】
PD-L1抗原に対して本明細書で記載のように種々のPD-L1 VHHの結合親和性も同様に、ELISAにより評価した。PD-1 VHHの親和性を、以下の表2に示す(列A/対照を参照);
【表6】
【0584】
PD-L1 VHHの遺伝子導入Hek293T細胞への結合も調べた。具体的には、ヒトPD-L1遺伝子導入Hek293T細胞をPD-L1 VHH(2μg/ml;4℃で2時間)およびFITC標識抗ヒス抗体(GenScript;4℃で1時間)で染色した。結合を、CellQuest Pro Version 4.0.2ソフトウェア(BD Biosciences)を使用して、FACSCalibur測定器(BD Biosciences)で測定した。結合アッセイの試験結果を
図6に示す。
【0585】
実施例3.ヒトPD-L1 VHH AcTaferonの特性評価
抗ヒトPD-L1 VHHの、PD-1との相互作用を阻害するそれらの能力についての最初のスクリーニング後に、次のPD-L1 VHHをさらなる特性評価用に選択した:2LIG3(配列番号287)、2LIG27(配列番号290)、2LIG97(配列番号300)、2LIG99(配列番号301)、3LIG8(配列番号309)、2LIG189(配列番号306)、および2LIG176(配列番号305)。
【0586】
PD-L1 VHH:2LIG3、2LIG27、2LIG97、2LIG99、3LIG8、2LIG189、および2LIG176をpHEN6C発現ベクター中で次のようにクローン化した:pHEN6C-PelB-PD-L1 VHH-(His)6。タンパク質をIPTG刺激により大腸菌中で一晩産生し、製造業者の説明書に従いTALON金属親和性樹脂(Clontech)を用いてペリプラズム抽出物から精製した。
【0587】
PD-1とPD-L1の間の相互作用に対するPD-L1 VHHの効果を、プレート結合アッセイで試験した。PD-L1の組換え細胞外ドメインを、そのC末端FLAGタグおよびM2抗FLAG Ab(Sigma)を用いて、Maxisorpプレート(Nunc)上に一晩固定した。プレートをブロッキングし(PBS+0.1%カゼイン)、段階希釈VHHの存在下または非存在下でhPD-1-hFc融合タンパク質(SinoBiologicals)とインキュベートした。洗浄後、結合PD-1を、HRP(西洋ワサビペルオキシダーゼ)結合抗ヒトAb(Jackson ImmunoReasearch)およびTMBペルオキシダーゼ基質(KPL)を用いて測定した。
【0588】
PD-L1 VHHのヒトおよびカニクイザルPD-L1に対する親和性を、バイオレイヤー干渉法:Octet RED96 system(ForteBio)を用いて測定した。VHHをペンタ-His(HIS1K)バイオセンサー(ForteBio)上に固定し、段階希釈ヒトPD-L1-FcまたはカニクイザルPD-L1-Fcタンパク質(両方とも、SinoBiologicalから入手)中に浸漬した。親和性を、Octetソフトウェア(ForteBio)を用いて計算した。
【0589】
表3は、試験した全てのPD-L1 VHHがPD-L1/PD-1相互作用を強力に抑制できたことを示す。さらに、全てのPD-L1 VHHは、ヒトおよびカニクイザルPD-L1に対し類似の結合親和性を示した。
【表7】
【0590】
PD-L1 VHH(すなわち、2LIG3、2LIG27、2LIG97、2LIG99、3LIG8、2LIG189、および2LIG176)を次に、pHEN6c発現ベクター中でAcTaferon(AFN)フォーマットにクローン化した(すなわち、pHEN6c-PelB-PD-L1_VHH-(GGS)20-hIFNa2_R149A-GGS-(His)6)、式中、PD-L1_VHHは、2LIG3、2LIG27、2LIG97、2LIG99、3LIG8、2LIG189、および2LIG176から選択される)。タンパク質を、IPTG刺激により大腸菌中で一晩産生し、製造業者の説明書に従いTALON金属親和性樹脂(Clontech)を用いてペリプラズム抽出物から精製した。
【0591】
生物活性を、親HL116細胞(p6-16ルシフェラーゼレポーターを安定に遺伝子導入したIFN応答性細胞株)で測定した。細胞を一晩播種し、過剰量(20μg/ml)の対応するVHHの存在下または非存在下(この後者は、非標的化状況を模倣する)で、段階希釈PD-L1 AFNで6時間刺激した。ルシフェラーゼ活性を、EnSight Multimode Plate Reader(Perkin Elmer)で測定した。
【0592】
図7A~Gに示すように、AcTaferonとしてフォーマットされた全てのPD-L1 VHHは、HL116細胞中でIFNルシフェラーゼレポーターを誘導することができた。AcTaferon活性の特異性を、IFN部分に連結されないそれぞれのPD-L1 VHHの過剰量の存在下でルシフェラーゼレポーター活性を比較することにより評価した(
図7A~G参照)。
【0593】
実施例4.ヒトPD-L1抗体AcTaferonのインビトロ効力
PD-L1標的化モノクローナル抗体であるモノクローナル抗体アテゾリズマブ(Ate)を、標的細胞に対するインターフェロン活性の特異性を評価するための試料として選択した。
【0594】
アテゾリズマブをInVivogenから入手した。アテゾリズマブ_hIFNa2(R149A)(Ate-IFNa2mut)を次のようにして生成した:Ab重鎖を、pMTW発現ベクター中でフレキシブル20*GGSリンカーを介してhIFNa2_R149配列に遺伝的に融合した(得られたベクター:pMTW-SIgK-重鎖-(GGS)
20-hIFNa2_R149A-GGS-(His)
9)。軽鎖を同じベクターにクローン化した(得られたベクター:pMTW-SIgK-軽鎖)。両方のプラスミドを、製造者ガイドラインに従ってExpiCHO細胞(ThermoFisher)に同時遺伝子導入した。得られたAte-IFNa2mutを、Niセファロースexcel樹脂(GE Healthcare)を用いて培地から精製した。Ate-IFNa2mutの効果を、特異性を示すために過剰量のアテゾリズマブ(Ate)(50μg/ml)を使って前の実施例3で記載した同じアッセイを用いてインビトロで実証した(
図8参照)。
【0595】
図8は、Ate-IFNa2mutがHL116細胞中でIFNルシフェラーゼレポーターを誘導できたことを示す。Ate-IFNa2mut活性の特異性を、IFN部分に連結されないアテゾリズマブ(Ate)の過剰量の存在下でルシフェラーゼレポーター活性を比較することにより評価した。
【0596】
実施例5.ヒトPD-L1抗体AcTaferonのインビボ効力
PD-L1 VHH 2LIG99を、ヒトPD-L1 VHH標的化AcTaferon(AFN)のインビボ抗腫瘍効力を評価するために選択した。
【0597】
ヒト化免疫系を有するマウスでのヒトRL濾胞性リンパ腫細胞株(RL)腫瘍モデル:ヒト化免疫系を有するマウスを次記のプロトコルに従って生成した。単核球を、HLA-A2+ヒト臍帯血試料からLymphoprepを用いる密度勾配遠心分離後に収集した。その後、ヒトCD34+造血幹細胞(HSC)をMACS技術により単離し、FACSを用いてCD34+純度およびCD3+混入について検査した。次に、80%を超える純度のCD34含有HSCを2~3日齢の100cGyの骨髄破壊的照射処理を受けたNSGマウスの肝内に注入した。HSC注入後8~12週で、ヒト細胞生着を、FACSを用いてpanleukocyteヒトおよびマウスCD45マーカーで分析し、総生存血中のリンパ球の5%を超えるヒトCD45細胞を有するマウスを、腫瘍埋め込みのために選択した。HSC注入の12週後に、マウスの皮下に2x106個のRL腫瘍細胞を注射した。5日後、マウスをFlt3Lの腹膜注入により18日目まで毎日治療した。PBS(対照)または2LIG99ベースAFN(すなわち、hIFNa2_R149Aに連結された2LIG99を含むAFN)による治療を、腫瘍注射の9日目(腫瘍が約10mm2のサイズに到達した時点)より病変周囲への投与により開始した。
【0598】
図9に示すように、2LIG99ベースAFNは、インビボで抗腫瘍効果を有した。
【0599】
実施例6.ヒトPD-1 AcTaferonのインビトロ効力
AcTaferon(AFN)のヒトPD-1(プログラム死1)標的化の効率を、FACSにおけるPD-1または空のベクター遺伝子導入Hek293T細胞中のSTAT1リン酸化の定量化により調べた。
【0600】
下記の2種類の異なるPD-1 VHHを分析のために選択した:
102C3:
QVQLQESGGGLVQAGKSLRLSCAASGSIFSIHAMGWFRQAPGKEREFVAAITWSGGITYYEDSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAADRAESSWYDYWGQGTQVTVSS(配列番号1246);および
102C12:
QVQLQESGGGLVQAGKSLRLSCAASGSIASIHAMGWFRQAPGKEREFVAVITWSGGITYYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNSLKPEDTAIYYCAGDKHQSSWYDYWGQGTQVTVSS(配列番号1247)。
【0601】
これらのPD-1 VHHをAcTaferon(AFN)に挿入した:AFNをpHEN6c発現ベクター中で次のようにクローン化した:pHEN6C-PelB-PD-1_VHH-(GGS)20-hIFNa2_R149A-GGS-(His)6(PD-1_VHHは、102C3または102C12;すなわち、102C3 AFNおよび102C12 AFNである)。 タンパク質を、IPTG刺激により大腸菌中で一晩産生し、製造業者の説明書に従いTALON金属親和性樹脂(Clontech)を用いてペリプラズム抽出物から精製した。
【0602】
Hek293T細胞に、標準的リン酸カルシウム技術を用いて空のベクターまたはヒトPD-1発現プラスミドを遺伝子導入した。遺伝子導入の2日後に、細胞をFACS緩衝液(2%FBS、PBS中1mMのEDTA)で2回洗浄し、段階希釈の102C3 AFNまたは102C12 AFNまたは野生型IFNa2(陽性対照)を用い、37℃で15分間刺激した。固定(10分間、37℃、Fix Buffer I;BD Biosciences)および透過処理(30分、氷上、Perm III Buffer;BD Biosciences)および洗浄後に、細胞を抗STAT1 pY701 Ab(BD Biosciences)で染色した。試料を、CellQuest Pro Version 4.0.2ソフトウェア(BD Biosciences)を用いて、FACS Calibur(BD Biosciences)で取得し、FlowJoソフトウェア(FlowJo)を用いて分析した。
【0603】
pSTAT1陽性細胞のパーセンテージをFACSで定量化し、濃度の関数としてプロットした。
図10A~Cは、102C3 AFNおよび102C12 AFNが、PD-1発現Hek293T細胞のSTAT1リン酸化を効率的に誘導するが、モック遺伝子導入細胞では遙かに少ない程度にしか誘導しないことを示す。これは、PD-1およびモック遺伝子導入HEK293T細胞に対し等しく活性である野生型IFNa2とは対照的である。
【0604】
等価物
本発明をその特定の実施形態と関連付けて説明してきたが、その実施形態はさらに修正が可能であり、本出願は、一般的に、本発明の原理に従った本発明の任意の変形、使用、または改変を包含することが意図され、本発明が属する技術内の既知のまたは日常的な実施の範囲に入る、および上に示されるおよび以下の添付の請求項の範囲に入る本質的な特徴に該当し得る本開示からの乖離を含むものと理解されよう。
【0605】
当業者は、本明細書で具体的に記載された特定の実施形態に対する多数の等価物を、ルーチン実験のみを用いて認識し、確認できるであろう。このような等価物は、次の請求項の範囲内に包含されることが意図されている。
【0606】
参照による組み込み
本明細書で引用されている全ての特許および刊行物は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0607】
本明細書で考察された出版物は、単に本出願の出願日に先行してそれらが開示されているという理由で提供されている。本明細書のいずれも、本発明が、先行発明の理由でこのような出版物に先行する権利がないことを容認すると解釈されるべきではない。
【0608】
本明細書で使用されている全ての見出しは、単に構成上の理由によるものであり、どんな形にせよ、本開示を限定することを意図するものではない。任意の個別のセクションの内容は、等しく全てのセクションに適用できる。
本発明の態様は以下を含む。
[付記1]
配列番号301、287、290、300、305、306、および309のうちの1つと少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含むPD-L1結合物質。
[付記2]
3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分を含むPD-L1結合物質であって、
(a)CDR1が、配列番号199、181、178、183、189、196、201、および206のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;
(b)CDR2が、配列番号259、260、241、242、245、246、263、および264のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;ならびに
(c)CDR3が、配列番号268、272、および277のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、
PD-L1結合物質。
[付記3]
前記標的化部分が、単一ドメイン抗体である、付記1または2に記載のPD-L1結合物質。
[付記4]
前記標的化部分が、VHH、ヒト化VHH、またはラクダ化VHHを含む、付記3に記載のPD-L1結合物質。
[付記5]
1種類または複数種類のシグナル伝達物質を含む、付記1~4のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
[付記6]
前記シグナル伝達物質が、インターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子のうちの1つまたは複数から選択され、これらはいずれも任意に改変されていてもよい、付記5に記載のPD-L1結合物質。
[付記7]
1種類または複数種類の追加のシグナル伝達物質を含む、付記1~6のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
[付記8]
前記1つまたは複数の追加の標的化部分が腫瘍抗原を認識し、任意に腫瘍抗原を機能的に調節してもよい、付記7に記載のPD-L1結合物質。
[付記9]
前記1つまたは複数の追加の標的化部分が免疫細胞上の抗原を認識し、任意に免疫細胞上の抗原を機能的に調節してもよい、付記8に記載のPD-L1結合物質。
[付記10]
前記免疫細胞が、T細胞、B細胞、樹状細胞、マクロファージ、好中球、およびNK細胞から選択される、付記9に記載のPD-L1結合物質。
[付記11]
細胞傷害性T細胞を腫瘍細胞にまたは腫瘍環境に動員する、付記1~10のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
[付記12]
PD-L1を認識してPD-L1に結合し、その活性を実質的に機能的に調節するかあるいはその活性を実質的に機能的に調節しない、付記1~11のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質。
[付記13]
付記1~12のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質をコードする組換え核酸組成物。
[付記14]
付記13に記載の核酸を含む宿主細胞。
[付記15]
3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分を含むPD-1結合物質であって、
(a)CDR1が、配列番号2~23のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;
(b)CDR2が、配列番号24~54のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;および
(c)CDR3が、配列番号55~69のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、
PD-1結合物質。
[付記16]
3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分を含むPD-L1結合物質であって、
(a)CDR1が、配列番号177~207のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;
(b)CDR2が、配列番号208~266のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;および
(c)CDR3が、配列番号267~285のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、
PD-L1結合物質。
[付記17]
前記標的化部分が、単一ドメイン抗体である、付記15または16に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記18]
前記標的化部分が、V
H
H、ヒト化V
H
H、またはラクダ化V
H
Hを含む、付記17に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記19]
配列番号70~83、1246、または1247のうちの1つと少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、付記18に記載のPD-1結合物質。
[付記20]
配列番号286~316のうちの1つと少なくとも90%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、付記18に記載のPD-L1結合物質。
[付記21]
1種類または複数種類のシグナル伝達物質を含む、付記15~20のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記22]
前記シグナル伝達物質が、インターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子のうちの1つまたは複数から選択され、これらはいずれも任意に改変されていてもよい、付記21に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記23]
1つまたは複数の追加の標的化部分を含む、付記15~22のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記24]
前記1つまたは複数の追加の標的化部分が腫瘍抗原を認識し、任意に腫瘍抗原を機能的に調節してもよい、付記23に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記25]
前記1つまたは複数の追加の標的化部分が免疫細胞上の抗原を認識し、任意に免疫細胞上の抗原を機能的に調節してもよい、付記24に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記26]
前記免疫細胞が、T細胞、B細胞、樹状細胞、マクロファージ、好中球、およびNK細胞から選択される、付記25に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記27]
細胞傷害性T細胞を腫瘍細胞にまたは腫瘍環境に動員する、付記15~26のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記28]
PD-1またはPD-L1を認識して結合し、その活性を実質的に機能的に調節するかあるいはその活性を実質的に機能的に調節しない、付記15~27のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記29]
付記15~28のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質をコードする組換え核酸組成物。
[付記30]
付記29に記載の核酸を含む宿主細胞。
[付記31]
癌、感染症、免疫異常、および/または自己免疫疾患のうちの1つまたは複数を有する患者における使用に適している、付記15~28のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記32]
PD-1またはPD-L1を標的とする抗原または受容体認識ドメインを含む標的化部分ならびにインターフェロン、インターロイキン、および腫瘍壊死因子のうちの1つまたは複数から選択されるシグナル伝達物質を含むキメラの有効量を、投与を必要とする患者に投与することを含む、癌を治療または予防するための方法。
[付記33]
前記シグナル伝達物質が、改変されている、付記32に記載の方法。
[付記34]
前記PD-1またはPD-L1結合物質が、付記1~12または付記15~28のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質である、付記32または付記33に記載の方法。
[付記35]
前記PD-1結合物質が、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分を含み、
(a)CDR1が、配列番号2~23のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;
(b)CDR2が、配列番号24~54のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;および
(c)CDR3が、配列番号55~69のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、
付記32~34のいずれか1項に記載の方法。
[付記36]
前記PD-L1結合物質が、3つの相補性決定領域(CDR1、CDR2、およびCDR3)を含む少なくとも1つの標的化部分を含み、
(a)CDR1が、配列番号177~207のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;
(b)CDR2が、配列番号208~266のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含み;および
(c)CDR3が、配列番号267~285のうちのいずれか1つから選択されるアミノ酸配列を含む、
付記32~34のいずれか1項に記載の方法。
[付記37]
前記癌が、基底細胞癌、胆道癌、膀胱癌、骨癌、脳および中枢神経系癌、乳癌、腹膜の癌、子宮頸癌、絨毛癌、結腸および直腸癌、結合組織癌、消化器系の癌、子宮内膜癌、食道癌、眼癌、頭頸部の癌、胃癌(胃腸癌を含む)、神経膠芽腫、肝癌、ヘパトーマ、上皮内腫瘍、腎臓癌または腎性癌(kidney or renal cancer)、喉頭癌、白血病、肝臓癌、肺癌(例えば、小細胞肺癌、非小細胞肺癌、肺腺癌、および肺扁平上皮癌)、黒色腫、骨髄腫、神経芽腫、口腔癌(唇、舌状、舌、口内、および咽頭)、卵巣癌、膵臓癌、前立腺癌、網膜芽細胞腫、横紋筋肉腫、直腸癌、呼吸器系癌、唾液腺癌腫、肉腫、皮膚癌、扁平上皮細胞癌、胃癌、精巣癌、甲状腺癌、子宮または子宮内膜癌、泌尿器系の癌、外陰癌、ホジキンリンパ腫および非ホジキンリンパ腫、ならびにB細胞リンパ腫を含むリンパ腫(低悪性度/濾胞性非ホジキンリンパ腫(NHL)を含む)、小リンパ球性(SL)NHL、中悪性度/濾胞性NHL、中悪性度びまん性NHL、高悪性度免疫芽細胞NHL、高悪性度リンパ芽球性NHL、高悪性度小型非切れ込み核細胞性NHL、巨大腫瘤病変NHL、マントル細胞リンパ腫、エイズ関連リンパ腫、およびワルデンシュトレームマクログロブリン血症、慢性リンパ性白血病(CLL)、急性リンパ性白血病(ALL)、毛様細胞性白血病、慢性骨髄芽球性白血病、ならびに他の癌腫および肉腫、および移植後リンパ増殖性疾患(PTLD)、ならびに母斑症、浮腫(例えば脳腫瘍に関連するもの)、およびメグズ症候群に関連する異常血管増殖のうちの1つまたは複数から選択される、付記32~36のいずれか1項に記載の方法。
[付記38]
癌、感染症、免疫異常、および/または自己免疫疾患のうちの1つまたは複数の治療における使用のための付記1~37のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質。
[付記39]
癌、感染症、免疫異常、および/または自己免疫疾患のうちの1つまたは複数を治療するための薬物の製造のための付記1~38のいずれか1項に記載のPD-1またはPD-L1結合物質の使用。
[付記40]
(a)付記1~12または16~28のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質;および
(b)野生型IFNα2に比べて改善された安全性を付与する1つまたは複数の変異を有する改変ヒトIFNα2
を含むキメラタンパク質であって、
前記標的化部分および前記改変シグナル伝達物質が、任意に1つまたは複数のリンカーにより連結されていてもよい、キメラタンパク質。
[付記41]
前記改変ヒトIFNα2が、位置R120、M148、R149、およびL153に1つまたは複数の変異を含む、付記40に記載のキメラタンパク質。
[付記42]
前記改変ヒトIFNα2が、R120E、R149A、およびL153Aから選択される1つまたは複数の変異を含む、付記40に記載のキメラタンパク質。
[付記43]
前記改変ヒトIFNα2が、R120E変異と、R149AまたはL153A変異のいずれかとを含む、付記40に記載のキメラタンパク質。
[付記44]
(a)付記1~12または付記16~28のいずれか1項に記載のPD-L1結合物質;および
(b)野生型IFNβに比べて改善された安全性を付与する1つまたは複数の変異を有する改変ヒトIFNβ
を含むキメラタンパク質であって、
前記標的化部分および前記改変シグナル伝達物質が、任意に1つまたは複数のリンカーにより連結されていてもよい、キメラタンパク質。
[付記45]
前記改変ヒトIFNβが、位置W22、R27、L32、R35、V148、L151、R152、およびY155に1つまたは複数の変異を含む、付記44に記載のキメラタンパク質。
[付記46]
前記改変ヒトIFNβが、W22G、R27G、L32A、L32G、R35A、R35G、V148G、L151G、R152A、R152Gから選択される1つまたは複数の変異を含む、付記45に記載のキメラタンパク質。
【配列表】