特許 7476177 細菌細胞由来のタンパク産物の収量を増加させるための系および方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】

(24)【登録日】2024-04-19

(45)【発行日】2024-04-30

(54)【発明の名称】細菌細胞由来のタンパク産物の収量を増加させるための系および方法

(51)【国際特許分類】

   C12P 21/00 20060101AFI20240422BHJP

   C12M 1/00 20060101ALI20240422BHJP

   C12M 1/04 20060101ALI20240422BHJP

   C12M 1/12 20060101ALI20240422BHJP

   C12M 1/33 20060101ALI20240422BHJP

   C12N 1/00 20060101ALI20240422BHJP

   C12P 7/00 20060101ALI20240422BHJP

【ＦＩ】

C12P21/00 B

C12M1/00 D

C12M1/04

C12M1/12

C12M1/33

C12N1/00 A

C12N1/00 K

C12N1/00 N

C12P7/00

【請求項の数】 17

(21)【出願番号】P 2021516531

(86)(22)【出願日】2019-05-21

(65)【公表番号】

(43)【公表日】2021-10-14

(86)【国際出願番号】 US2019033408

(87)【国際公開番号】W WO2019226709

(87)【国際公開日】2019-11-28

【審査請求日】2022-04-06

(31)【優先権主張番号】62/674,604

(32)【優先日】2018-05-21

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(31)【優先権主張番号】16/416,127

(32)【優先日】2019-05-17

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(73)【特許権者】

【識別番号】520314674

【氏名又は名称】ジュペン バイオ （エイチケイ） リミテッド

(74)【代理人】

【識別番号】100094569

【弁理士】

【氏名又は名称】田中 伸一郎

(74)【代理人】

【識別番号】100103610

【弁理士】

【氏名又は名称】▲吉▼田 和彦

(74)【代理人】

【識別番号】100109070

【弁理士】

【氏名又は名称】須田 洋之

(74)【代理人】

【識別番号】100119013

【弁理士】

【氏名又は名称】山崎 一夫

(74)【代理人】

【識別番号】100123777

【弁理士】

【氏名又は名称】市川 さつき

(74)【代理人】

【識別番号】100111796

【弁理士】

【氏名又は名称】服部 博信

(74)【代理人】

【識別番号】100168631

【弁理士】

【氏名又は名称】佐々木 康匡

(72)【発明者】

【氏名】フルクトル マッキンジー エス

(72)【発明者】

【氏名】セナラトネ ライアン エイチ

【審査官】山▲崎▼ 真奈

(56)【参考文献】

【文献】国際公開第２０１６／１８７４９４（ＷＯ，Ａ１）

【文献】特開昭４９－０４８８９５（ＪＰ，Ａ）

【文献】特表２０００－５１３２３３（ＪＰ，Ａ）

【文献】特表２００３－５２３１９６（ＪＰ，Ａ）

【文献】国際公開第２０１７／１６５２４４（ＷＯ，Ａ１）

【文献】特表２０１６－５３３７４３（ＪＰ，Ａ）

【文献】米国特許第０３８８７４３１（ＵＳ，Ａ）

【文献】米国特許出願公開第２０１０／０１７８６７４（ＵＳ，Ａ１）

【文献】米国特許出願公開第２００９／０１７０１８４（ＵＳ，Ａ１）

【文献】特表平０９－５０８０２４（ＪＰ，Ａ）

【文献】米国特許出願公開第２０１６／０３３８３８０（ＵＳ，Ａ１）

【文献】特表２０１３－５４２７１０（ＪＰ，Ａ）

【文献】米国特許出願公開第２０１６／０２８１１１５（ＵＳ，Ａ１）

【文献】国際公開第２０１１／１４９９５６（ＷＯ，Ａ２）

【文献】特表２０１６－５００２５８（ＪＰ，Ａ）

【文献】米国特許出願公開第２０１２／０３１６３２０（ＵＳ，Ａ１）

(58)【調査した分野】(Int.Cl.，ＤＢ名)

Ｃ１２Ｎ

Ｃ１２Ｍ

Ａ２３

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

嫌気性細菌細胞から精製されるタンパク質含有生成物を高回収率で得る方法であって、
発酵容器内で嫌気性細菌細胞によってガス状基質を発酵液体ブロスに発酵させる工程、ここで前記発酵液体ブロスは第１のｐＨ値を有する、
開始細胞濃度で前記発酵容器から送達された前記発酵液体ブロスの第１の量を、第１の細胞セパレータにより、第１の細胞非含有浸透液と、前記嫌気性細菌細胞を含有する第１の細胞含有懸濁液とに分離する工程、
前記第１の細胞非含有浸透液を含酸素炭化水素質化合物に加工する工程、
開始細胞濃度で前記発酵容器から送達された前記発酵液体ブロスの第２の量を、第２の細胞セパレータにより、第２の細胞非含有浸透液と、前記嫌気性細菌細胞を含有する第２の細胞含有懸濁液とに分離する工程、
１種または複数のｐＨ調整剤を供給して、前記第２の細胞含有懸濁液のｐＨを調整する工程、ここで前記第２の細胞含有懸濁液のｐＨは、前記第１のｐＨ値より高い第２のｐＨ値に調整される、
前記第２の細胞含有懸濁液中に含まれる前記嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第１のタンパク質回収率のタンパク質含有生成物を有するホモジネートを得る工程、ここで前記タンパク質回収率は、前記タンパク質含有生成物のタンパク質濃度（グラム／リットル）を前記開始細胞濃度（グラム／リットル）で割ったパーセンテージである、及び
前記ホモジネートを、第２のタンパク質回収率の第１のタンパク質含有画分と、第３のタンパク質回収率のタンパク質含有細胞残屑画分とに分画する工程、
を含む、方法。

【請求項2】

前記第２のｐＨ値が、５～１２の範囲である、請求項１に記載の方法。

【請求項3】

前記第２のｐＨ値が、７～１２の範囲である、請求項１に記載の方法。

【請求項4】

前記１種または複数のｐＨ調整剤が、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１に記載の方法。

【請求項5】

前記嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊する前に、前記嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を、前記第２のｐＨ値で、細胞含有保持タンク内に保持する工程をさらに含む、請求項１に記載の方法。

【請求項6】

前記嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊した後に、前記ホモジネートを、前記第２のｐＨ値で、細胞含有保持タンク中内に保持する工程をさらに含む、請求項１に記載の方法。

【請求項7】

前記第１のタンパク質回収率が、１０％～９５％の間である、請求項１に記載の方法。

【請求項8】

前記第２のタンパク質回収率が、１０％～８５％の間であり、前記第３のタンパク質回収率が、１０％～７５％の間である、請求項１に記載の方法。

【請求項9】

嫌気性細菌細胞から精製されるタンパク質含有生成物の回収率を上げるための方法であって、
発酵容器内で嫌気性細菌細胞によってガス状基質を発酵液体ブロスに発酵させる工程、ここで前記発酵液体ブロスは第１のｐＨ値を有する、
開始細胞濃度で前記発酵容器から送達された前記発酵液体ブロスの第１の量を、第１の細胞セパレータにより、第１の細胞非含有浸透液と、前記嫌気性細菌細胞を含有する第１の細胞含有懸濁液とに分離する工程、
前記第１の細胞非含有浸透液を含酸素炭化水素質化合物に加工する工程、
開始細胞濃度で前記発酵容器から送達された前記発酵液体ブロスの第２の量を、第２の細胞セパレータにより、第２の細胞非含有浸透液と、前記嫌気性細菌細胞を含有する第２の細胞含有懸濁液とに分離する工程、
１種または複数のｐＨ調整剤を供給して、前記第２の細胞含有懸濁液のｐＨを調整する工程、ここで前記第２の細胞含有懸濁液のｐＨは、前記第１のｐＨ値より高い第２のｐＨ値に調整される、
前記第２の細胞含有懸濁液中に含まれる前記嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第１のタンパク質回収率のタンパク質含有生成物を有するホモジネートを得る工程、ここで前記タンパク質回収率は、前記タンパク質含有生成物のタンパク質濃度（グラム／リットル）を前記開始細胞濃度（グラム／リットル）で割ったパーセンテージである、
第１の分画装置を使用して、前記ホモジネートを、第２のタンパク質回収率の第１のタンパク質含有画分と、第３のタンパク質回収率のタンパク質含有細胞残屑画分とに分画する工程、
前記第１のタンパク質含有画分を第２の分画装置に送達する工程、
第２の分画装置を使用して、前記第１のタンパク質含有画分を第２のタンパク質含有画分に分画する工程、及び
前記第２のタンパク質含有画分を収集する工程、
を含む、方法。

【請求項10】

前記第２のｐＨ値が７～１２の範囲であり、前記１種または複数のｐＨ調整剤が、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項９に記載の方法。

【請求項11】

嫌気性細菌細胞から精製されるタンパク質含有生成物の回収率を上げるためのシステムであって、
嫌気性細菌細胞によってガス状基質を、第１のｐＨ値の発酵液体ブロスに発酵させるために、前記ガス状基質を、前記嫌気性細菌細胞を含有する発酵容器に流し入れるためのガス入口ラインに接続された発酵容器と、
前記発酵容器から前記発酵液体ブロスの第１の量を受け取り、前記発酵液体ブロスの第１の量を分離して、第１の細胞非含有浸透液と、前記嫌気性細菌細胞を含有する第１の細胞含有懸濁液を得るように前記発酵容器に接続された第１の細胞セパレータと、
前記第１の細胞非含有浸透液を前記第１の細胞セパレータから受け取り、前記第１の細胞非含有浸透液を含酸素炭化水素質化合物に加工するための、前記第１の細胞セパレータの１つまたは複数の第２の出口ラインに接続された加工室と、
前記発酵容器から前記発酵液体ブロスの第２の量を受け取り、前記発酵液体ブロスの第２の量を分離して、第２の細胞非含有浸透液と、前記嫌気性細菌細胞を含有する第２の細胞含有懸濁液を得るように前記発酵容器に接続された第２の細胞セパレータと、
前記第２の細胞含有懸濁液中に含まれる前記嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第１のｐＨ値より高い第２のｐＨ値のホモジネートを得るための、第２の細胞セパレータの１つまたは複数の第１の出口に接続された１つまたは複数の破壊装置と、
前記１つまたは複数の破壊装置から前記ホモジネートを受け取り、前記ホモジネートを、タンパク質含有生成物を有する１つまたは複数のタンパク質含有画分と、１つまたは複数のタンパク質含有細胞残屑画分とに分画するために、前記１つまたは複数の破壊装置に接続された１つまたは複数の分画装置と、
を含む、システム。

【請求項12】

前記第２の細胞セパレータから流出された前記第２の細胞含有懸濁液を受け取るように前記第２の細胞セパレータに接続された保持タンクをさらに含むか、又は前記ホモジネートを分画する前に、前記１つ又は複数の破壊装置から流出された前記ホモジネートを受け取るように前記１つ又は複数の破壊装置に接続された保持タンクをさらに含む、請求項１１に記載のシステム。

【請求項13】

前記第２のｐＨ値が、５～１２の範囲である、請求項１１に記載のシステム。

【請求項14】

前記１つまたは複数の破壊装置が、マイクロ流体装置、超音波処理装置、超音波装置、機械的破砕装置、フレンチプレス、冷凍器、加熱器、熱交換器、蒸留塔、低温殺菌装置、紫外線殺菌装置、ガンマ線殺菌装置、反応器、ホモジナイザー、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１１に記載のシステム。

【請求項15】

前記細胞セパレータが、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、限外濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除カラム濾過装置、クロスフローフィルターを有する濾過装置、遠心分離装置、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１１に記載のシステム。

【請求項16】

前記１つまたは複数の分画装置が、固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１１に記載のシステム。

【請求項17】

前記１つまたは複数の分画装置から得られた１つまたは複数の画分を受け取り、前記１つまたは複数の画分を脱水してタンパク質富化栄養素サプリメントを製造するための、１つまたは複数の脱水室をさらに含むシステムであって、前記１つまたは複数の画分が、第１のタンパク質含有画分、タンパク質含有細胞残屑画分、およびこれらの組合せからなる群から選択され、前記１つまたは複数の脱水室が、噴霧乾燥装置、ドラム乾燥機、フリーズドライヤー、凍結乾燥装置、およびこれらの組合せからなる群から選択される、請求項１１に記載のシステム。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

関連出願の相互参照
本出願は、２０１８年５月２１日に出願された米国特許仮出願第６２／６７４，６０４号および２０１９年５月１７日に出願された米国特許出願第１６／４１６，１２７号の利益を主張するものであり、上記の出願はすべて、参照により本明細書に組み込まれる。

【背景技術】

【0002】

微生物発酵は、微生物が炭素基質を与えられると生じ、微生物は炭素基質を利用して様々な産物に加工することができ、こうした産物を回収、分離、および精製することができる。選択される炭素基質は、使用する微生物のタイプおよびその代謝経路によって決まり、使用する微生物のタイプは、所望の産物のタイプをもたらす能力を有する微生物菌株の識別および選択に基づく。炭素基質としては、一酸化炭素（ＣＯ）、二酸化炭素（ＣＯ２）、メタノール、メチル、エタノール、ｎ－アルカン、グルコース、セルロース、バガス、糖蜜、および亜硫酸廃液を挙げることができる。細菌発酵によって生成される有用な産物および物質としては、エタノール、乳酸、アセテート、ならびに他のバイオ燃料および化学物質が挙げられ、これらは、エネルギー源および様々な追加の用途として使用することができる。

【0003】

例として、嫌気性微生物（酢酸生成微生物など）による細菌発酵は、一酸化炭素（ＣＯ）、水素ガス（Ｈ２）、および／または二酸化炭素（ＣＯ２）などのガス状基質の発酵を通して、発酵産物（例えば、エタノール、ブタノール、アセテート、ブチレート、酪酸、２，３－ブタンジオール、および他の関連産物）を生成することができる。エタノールおよびブタノールは、多くの場合、輸送に関連する液体燃料として使用され、一方、アセテートおよび２，３－ブタンジオールは、化学産業において使用される。微生物発酵に使用されるバイオエタノール生産アセトゲンの例としては、クロストリジウム属およびアセトバクテリウム属に由来するものが挙げられる。例えば、米国特許第５，１７３，４２９号は、合成ガスからエタノールおよびアセテートを生成するＣｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ Ｉｊｕｎｇｄａｈｌｉｉ ＡＴＣＣ番号４９５８７の嫌気性微生物を記載する。米国特許第５，８０７，７２２号は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ Ｉｊｕｎｇｄａｈｌｉｉ ＡＴＣＣ番号５５３８０を使用して、廃ガスを有機酸およびアルコールに変換するための方法および装置を記載する。米国特許第６，１３６，５７７号は、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ Ｉｊｕｎｇｄａｈｌｉｉ ＡＴＣＣ番号５５９８８および５５９８９を使用して、廃ガスをエタノールに変換するための方法および装置を記載する。

【0004】

発酵産物に加えて、大規模の微生物発酵は、大量の微生物発酵培養ブロスも生成し、死滅細胞または不活性細胞の大部分の除去を必要とし得る。過剰のまたは細胞除去された培養ブロスから微生物バイオマスへの過剰細菌細胞の回収は、動物用飼料および／または動物用飼料の栄養素もしくはサプリメントのための供給原料として有用な単細胞タンパク質（ＳＣＰ）ならびにタンパク質、アミノ酸、および炭水化物源として再利用するための他の成分の生成につなげることができる。すべての動物は、最適成長、繁殖、授乳、および維持に必要なタンパク質の構成要素であるアミノ酸を必要とする。ウシの小腸内で吸収されるアミノ酸は、第一胃で消化されるタンパク質に由来し、一般的に、その消化系は、ウシが自己生成できない１０種の必須アミノ酸（アルギニン、ヒスチジン、イソロイシン、ロイシン、リジン、メチオニン、フェニルアラニン、トレオニン、トリプトファン、およびバリンなど）を供給しなければならない。理論的には、１種が不足すると、他種の利用を制限し得るため、吸収される各必須アミノ酸の相対的比率は、ウシが必要とするアミノ酸供給に正確に一致すると考えられる。

【0005】

しかしながら、単細胞タンパク質を標的とする本方法は、動物用飼料または水産養殖に使用するための全細胞バイオマスとして微生物細胞を直接取り入れることが多い。微生物発酵プロセスにおいて、発酵ブロスは、細菌細胞および細胞残屑を含む。これらの方法は、２つを区別せず、動物または水産養殖生物（例えば、魚またはエビなど）に有害であり得るバイオマス内容物を含有することが多い。例えば、微生物全細胞バイオマスは、消化に適さない高含有量の核酸または適切に消化することができない他の内容物を含有し得る。これらの従来の方法のほとんどは、動物用飼料に全細胞バイオマスを取り入れる前に、追加の細胞破壊または細胞分裂技法による全細胞バイオマスの加工を行わない。加えて、細菌発酵から細菌タンパク質を回収する本方法は、栄養に関連した目的に適した十分に高いタンパク質含有量を達成しない。細菌発酵プロセスからタンパク質富化サプリメントを得るための方法および系、ならびにそのような任意の栄養素サプリメントおよび動物用飼料の組成物が必要とされている。

【発明の概要】

【0006】

本発明の実施形態は、無数の細胞破壊およびタンパク質分画および精製技法を用いた嫌気性細菌発酵プロセス後の微生物細胞バイオマスに由来するタンパク質富化栄養素サプリメントおよび／または動物用飼料を製造して得るための方法、系（システム）、および組成物を提供する。タンパク質富化栄養素サプリメントは、直接供給原料として、またはヒトもしくは動物用のサプリメントとして他の栄養素と一緒に使用することができる。
一実施形態において、発酵プロセスからタンパク質含有部分を製造する細菌発酵系が提供され、これは、１つまたは複数の発酵容器、１つまたは複数の細胞セパレータ、１つまたは複数の加工室、１つまたは複数の細胞破壊装置、および１つまたは複数の分画装置を含む。別の実施形態では、本発明は、様々な動物およびヒトが摂取するために有用な用途を有する嫌気性細菌を使用した発酵プロセスから生成されるタンパク質富化栄養素サプリメントの組成物をさらに提供する。

【0007】

さらに別の実施形態において、嫌気性細菌細胞から精製された高回収率のタンパク質含有生成物を得るための方法が提供される。一態様において、方法は、発酵容器内で、嫌気性細菌細胞を有するガス状基質を発酵して発酵液状ブロスにし、ここで、発酵液状ブロスは、第１のｐＨ値を有することと、開始細胞濃度で発酵容器から送達された発酵液体ブロスを、細胞非含有浸透液と、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離することと、１種または複数のｐＨ調整剤を供給して細胞含有懸濁液のｐＨを調整し、細胞含有懸濁液のｐＨが、第１のｐＨ値より高い第２のｐＨ値に調整されることとを含む。
方法は、細胞含有懸濁液中に含まれる嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第１のタンパク質回収率のタンパク質含有生成物を有するホモジネートを生成し、ここで、第１のタンパク質回収率が、タンパク質含有生成物のタンパク質濃度（１リットル当たりのグラム数）を開始細胞濃度（１リットル当たりのグラム数）で割ったパーセンテージであることと、ホモジネートを、第２のタンパク質回収率の第１のタンパク質含有部分と、第３のタンパク質回収率のタンパク質含有細胞残屑部分とに分画することと、をさらに含む。

【0008】

本発明の別の実施形態は、嫌気性細菌細胞から精製されたタンパク質含有生成物の回収率を上げるための系を提供する。系は、嫌気性細菌細胞によってガス状基質を発酵させて第１のｐＨ値の発酵液体ブロスにするために、ガス状基質を、嫌気性細菌細胞を含有する発酵容器中に流し入れるためのガス入口ラインに接続された発酵容器と、発酵容器から発酵液体ブロスを受け取り、発酵液体ブロスを、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液に分離するために発酵容器に接続された細胞セパレータとを含む。
系は、細胞含有懸濁液中に含まれる嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第２のｐＨ値（第２のｐＨ値は、第１のｐＨ値より高い）のホモジネートを生成するための第１のセパレータの１つまたは複数の第１の出口に接続された１つまたは複数の破壊装置と、１つまたは複数の破壊装置からホモジネートを受け取り、ホモジネートを、タンパク質含有生成物を有する１つまたは複数のタンパク質含有部分と、１つまたは複数のタンパク質含有細胞残屑部分とに分画するための、１つまたは複数の破壊装置に接続された１つまたは複数の分画装置と、をさらに含む。

【0009】

したがって、上述の本発明の特徴、より具体的には上記で簡潔にまとめた本発明の説明を詳細に理解することができるように、実施形態を参照してよく、そのいくつかは、添付の図面に例示されている。しかしながら、添付の図面は、本発明の典型的な実施形態のみを例示するものであり、したがって、その範囲を限定するものとはみなさず、他の同等に有効な実施形態が認められ得ることに留意されたい。

【図面の簡単な説明】

【0010】

【図1A】嫌気性細菌の培養物をその中に有する発酵プロセスから得た細胞含有懸濁液を加工し、本発明の１つまたは複数の実施形態によるタンパク質富化栄養素サプリメントとして第１のタンパク質含有部分および／またはタンパク質含有細胞残屑部分を得る方法のフローチャートを示す。

【図1B】嫌気性細菌の培養物をその中に有する発酵プロセスから得た細胞含有懸濁液を加工し、本発明の１つまたは複数の実施形態によるタンパク質富化栄養素サプリメントとして第１のタンパク質含有部分および／またはタンパク質含有細胞残屑部分を得る別の方法のフローチャートを示す。

【図2A】嫌気性細菌の培養物をその中に有する発酵プロセスから得た細胞含有懸濁液を加工し、本発明の１つまたは複数の実施形態によるタンパク質富化栄養素サプリメントとして第２のタンパク質含有部分を得る方法のフローチャートを示す

【図2B】嫌気性細菌の培養物をその中に有する発酵プロセスから得た細胞含有懸濁液を加工し、本発明の１つまたは複数の実施形態によるタンパク質富化栄養素サプリメントとして第３のタンパク質含有部分を得る別の方法のフローチャートを示す。

【図3A】嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスから細胞含有懸濁液および１種または複数の含酸素炭化水素質化合物を製造するための細菌発酵系３００Ａであって、本発明の１つまたは複数の実施形態による、１つまたは複数の細胞セパレータ、１つまたは複数の加工室、および任意の１つまたは複数の脱水室を含む細菌発酵系３００Ａの概略図を示す。

【図3B】嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスから１種または複数の細胞含有懸濁液および１種または複数の含酸素炭化水素質化合物を製造するための細菌発酵系３００Ｂであって、本発明の１つまたは複数の実施形態による、２つの細胞セパレータ、無細胞保持タンク、加工室、および任意の脱水室を含む細菌発酵系３００Ｂの概略図を示す。

【図4A】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ａであって、１つまたは複数の細胞セパレータ、１つまたは複数の加工室、１つまたは複数の破壊装置、１つまたは複数の分画装置、１つまたは複数の脱水室、およびｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ラインを有する細菌発酵系４００Ａの概略図を示す。

【図4B】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｂであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、２つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｂの概略図を示す。

【図4C】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｃであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、１つの分画装置、および２つ以上の脱水室を有する細胞発酵系４００Ｃの概略図を示す。

【図4D】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｄであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および任意の追加の脱水室を有する細胞発酵系４００Ｄの概略図を示す。

【図4E】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｅであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および任意の３つの脱水室を有する細胞発酵系４００Ｅの概略図を示す。

【図4F】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｆであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および任意の３つの脱水室を有する細胞発酵系４００Ｆの概略図を示す。

【図4G】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｇであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および任意の３つの脱水室を有する細胞発酵系４００Ｇの概略図を示す。

【図4H】本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスのための細菌発酵系４００Ｈであって、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および任意の３つの脱水室を有する細胞発酵系４００Ｈの概略図を示す。

【図5A】本発明の１つまたは複数の実施形態による、嫌気性細菌発酵プロセスから収集された細胞を破壊し、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を得るための例示的な細菌発酵系の概略図である。

【図5B】本発明の１つまたは複数の実施形態による、嫌気性細菌発酵プロセスから収集された細胞を破壊し、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を得るための別の例示的な細菌発酵系の概略図である。

【図5C】本発明の１つまたは複数の実施形態による、嫌気性細菌発酵プロセスから収集された細胞を破壊し、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を得るための細菌発酵系の別の例の概略図である。

【図5D】本発明の１つまたは複数の実施形態による、嫌気性細菌発酵プロセスから収集された細胞を破壊し、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を得るための細菌発酵系のさらに別の例の概略図である。

【図5E】本発明の１つまたは複数の実施形態による、嫌気性細菌発酵プロセスから収集された細胞を破壊し、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を得るための別の例示的な細菌発酵系の概略図である。

【図6】本発明の１つまたは複数の実施形態による、嫌気性細菌発酵プロセスから収集された細胞を破壊し、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を得るための細菌発酵系のさらに別の例の概略図である。

【図7A】本発明の１つまたは複数の実施形態による、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞を破壊してホモジネートを得る前の細胞含有懸濁液の一例の電子顕微鏡写真を示す。

【図7B】本発明の１つまたは複数の実施形態による、細菌発酵液体ブロスの細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞を破壊した後に破壊装置から得られたホモジネートの一例の電子顕微鏡写真を示す。

【図7C】本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置内で破壊した後の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞を示す電子顕微鏡写真のさらに別の例である。

【図7D】本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置によって高圧で破壊した後の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の破壊された細胞膜を示すホモジネートの電子顕微鏡写真の別の例である。

【図7E】本発明の１つまたは複数の実施形態による、本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置によって非常に高圧で破壊した後の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の破壊された細胞膜を示すホモジネートの電子顕微鏡写真のさらに別の例である。

【図8A】本発明の１つまたは複数の実施形態による、一例の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞を破壊した後に破壊装置から得られるホモジネート中の一例の可溶性タンパク質の濃度のグラフを示す。

【図8B】本発明の１つまたは複数の実施形態による、別の例の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊した後に破壊装置から得られる別の例の可溶性タンパク質の濃度の別のグラフを示す。

【発明を実施するための形態】

【0011】

本発明の実施形態は、無数の細胞破壊およびタンパク質分画および精製技法を用いた嫌気性細菌発酵プロセス後、微生物細胞バイオマスに由来するタンパク質富化栄養素サプリメントおよび／または動物用飼料の製造を増加させる方法、系、および組成物を提供する。より具体的には、本発明は、発酵プロセスから微生物バイオマスを分離し、微生物バイオマスの細胞を破壊してホモジネートを得、ホモジネートから１つまたは複数のタンパク質含有画分を分画および精製することによって、１つまたは複数のタンパク質含有画分をさらに加工して、動物およびヒトの両方より摂取可能な栄養素サプリメントとなる組成物とすることができる方法に関する。タンパク質富化栄養素サプリメントは、供給原料として直接使用しても、ヒトまたは動物用のサプリメントとしての他の栄養素と一緒に使用してもよい。

【0012】

タンパク質富化栄養素サプリメントおよび動物用飼料サプリメントは、合成ガス、炭素源基質、一酸化炭素（ＣＯ）含有ガス、二酸化炭素（ＣＯ２）、水素ガス（Ｈ２）、合成ガス、およびこれらの組合せなどの１種または複数のガス状基質を使用する細菌発酵系における発酵プロセス後に加工して、１つまたは複数のタンパク質含有画分から得ることができる。本発明は、動物およびヒトによる摂取に有用な用途を有するタンパク質富化栄養素サプリメントの組成物をさらに提供する。

【0013】

一態様において、嫌気性細菌細胞から精製されたタンパク質含有生成物の回収率を上げるための方法を提供する。方法は、発酵容器内で嫌気性細菌細胞によってガス状基質を、第１のｐＨ値を有する発酵液体ブロスに発酵させることと、発酵容器から送達された発酵液体ブロスを、細胞非含有浸透液と、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離することとを含む。方法は、１種または複数のｐＨ調整剤を供給して、細胞含有懸濁液のｐＨを調整し、細胞含有懸濁液のｐＨが、第１のｐＨ値より高い第２のｐＨ値に調整されることと、細胞含有懸濁液中に含まれる嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第１のタンパク質回収率のタンパク質含有生成物を有するホモジネートを得、第１のタンパク質回収率が、タンパク質含有生成物のタンパク質濃度（グラム／リットル）を開始細胞濃度（グラム／リットル）で割ったパーセンテージであることと、をさらに含む。
別の態様において、第１のタンパク質含有画分を第２の分画装置に送達する前に、第１の分画装置を使用して、ホモジネートを、第２のタンパク質回収率の第１のタンパク質含有画分と、第３のタンパク質回収率のタンパク質含有細胞残屑画分とに分画する。さらに別の態様において、第２の分画装置を使用して、第１のタンパク質含有画分を第２のタンパク質含有画分に分画した後、第２のタンパク質含有画分を収集する。

【0014】

一実施形態において、第１のタンパク質回収率は、１０％～９５％、例えば３０％～８５％、または５０％～８０％である。一態様において、第２のタンパク質回収率は、１０％～８５％、例えば３０％～８０％である。別の態様において、第３のタンパク質回収率は、１０％～７５％、例えば４５％～６５％である。別の実施形態において、第１のタンパク質含有画分および／またはタンパク質含有細胞残屑画分を加工し、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造することができる。別の態様において、第１のタンパク質含有画分を、タンパク質含有量が約１０％以上、例えば４０％以上、５０％以上、６０％以上、７０％以上、または８０％以上、９０％以上、例えば約１０％～約８０％、または約１０％～約９５％、例えば約１０％～約９８％のタンパク質富化栄養素サプリメントとして製造する。

【0015】

一態様において、第２のｐＨ値は、５～１２の範囲である。別の態様では、第２のｐＨ値は、７～１２の範囲である。一実施形態において、１種または複数のｐＨ調整剤は、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素、および溶液のｐＨ値を上下させるために使用できる任意の助剤、ならびにこれらの組合せからなる群から選択される。
一態様において、嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊する前に、１種または複数のｐＨ調整剤を細胞含有懸濁液に添加する。別の態様では、嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊した後に、１種または複数のｐＨ調整剤を細胞含有懸濁液に添加する。

【0016】

さらに別の態様において、方法は、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を細胞含有保持タンク中に保持することと、細胞含有懸濁液を細胞含有保持タンクから、ある送達速度で破壊装置へ送達することと、をも含んでよい。細胞含有保持タンクは、細胞含有懸濁液の貯蔵容器または前処理室として機能することもできる。一例では、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を１種または複数の添加剤（細胞含有保持タンクに接続された入口ラインを通して供給される、第２のｐＨ値のｐＨ調整剤など）で処理する前処理工程を実施するために細胞含有保持タンクを使用する。添加剤の例としては、これらに限定されないが、界面活性剤、洗剤、ＥＤＴＡ、Ｔｗｅｅｎ－２０、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００、ドデシル硫酸ナトリウム、ＣＨＡＰＳ、酵素、プロテアーゼ、リゾチーム、ベンゾナーゼ、ヌクレアーゼ、ｐＨ調整剤、およびこれらの組合せが挙げられる。
別の態様において、方法は、嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊する前に、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を１種または複数の添加剤で処理することをさらに含む。あるいは、方法は、破壊プロセス後、および細胞含有細胞残屑画分から第１のタンパク質含有画分を分離する前に、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を１種または複数の添加剤で処理することを含む。

【0017】

さらに別の態様において、本発明の系および方法は、嫌気性細菌の細胞を含有する細胞含有懸濁液を第２の細胞含有懸濁液に濃縮することをさらに提供してもよい。一例では、第２の細胞含有懸濁液を細胞含有保持タンクへ送達し、その中で濃縮および／または貯蔵される。別の例では、保持タンク中の第２の細胞含有懸濁液は、嫌気性細菌細胞を含有する第２の細胞含有懸濁液を、細胞含有保持タンクに接続された入口を通して供給される１種または複数の添加剤で処理する前処理工程を経る。次いで、第２の細胞含有懸濁液を保持タンクから破壊装置へ送達する。破壊装置は、第２の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊し、ホモジネートを生成する。次いで追加のタンパク質含有画分を、ホモジネート中の細胞含有細胞残屑画分から分離する。

【0018】

さらに別の態様において、方法は、第１のタンパク質含有画分を１つまたは複数の分画装置へ送達することと、１つまたは複数の分画装置を使用して、第１のタンパク質含有画分を、第２のタンパク質含有画分および／または第３以上のタンパク質含有画分に分画することと、第２および第３以上のタンパク質含有画分を収集することと、をさらに含んでもよい。分画装置の例としては、これらに限定されないが、固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが挙げられる。

【0019】

一実施形態において、第１のタンパク質含有画分を濾過装置へ送達して、濾過装置を通して濾過し、保持液画分と濾過液画分とに分画することによって濾過液画分をタンパク質富化栄養素サプリメントとして製造することができる。別の実施形態では、保持液画分をタンパク質富化栄養素サプリメントとして製造する。さらに別の実施形態において、第１のタンパク質含有画分を遠心分離機へ送達し、遠心分離によって上清タンパク質含有画分とペレットタンパク質含有画分とに分画することで、上清タンパク質含有画分および／またはペレットタンパク質含有画分をタンパク質富化栄養素サプリメントとして製造することができる。
本発明の別の実施形態は、嫌気性細菌細胞から精製されたタンパク質含有生成物の回収率を上げるための系を提供する。系は、ガス状基質を、嫌気性細菌細胞を含有する発酵容器に流し入れ、嫌気性細菌細胞によってガス状基質を、第１のｐＨ値の発酵液体ブロスに発酵するためのガス用入口ラインに接続された発酵容器と、発酵容器から発酵液体ブロスを受け取り、発酵液体ブロスを、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液に分離するための発酵容器に接続された細胞セパレータと、を含む。

【0020】

系は、細胞含有懸濁液中に含まれる嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して、第２のｐＨ値（第２のｐＨ値は、第１のｐＨ値より高い）のホモジネートを生成するための、第１のセパレータの１つまたは複数の第１の出口に接続された１つまたは複数の破壊装置と、１つまたは複数の破壊装置からホモジネートを受け取り、ホモジネートを、タンパク質含有生成物を有する１つまたは複数のタンパク質含有画分と、１つまたは複数のタンパク質含有細胞残屑画分とに分画するための、１つまたは複数の破壊装置に接続された１つまたは複数の分画装置と、をさらに含む。
本発明のさらに別の実施形態において、１種または複数のｐＨ調整剤を、第１のセパレータの１つまたは複数の第１の出口に供給し、細胞含有懸濁液のｐＨを調整することにより、第２のｐＨ値は、第１のｐＨ値より高い。別の実施形態では、１種または複数のｐＨ調整剤を１つまたは複数の破壊装置に供給し、細胞含有懸濁液のｐＨを調整することにより、第２のｐＨ値は、第１のｐＨ値より高い。

【0021】

本発明の一実施形態において、系は、１つまたは複数の破壊装置に接続された保持タンクと、嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊する前に、細胞セパレータから流れ出る細胞含有懸濁液を受け取るための細胞セパレータと、をさらに含む。一実施形態において、１種または複数のｐＨ調整剤を保持タンクに供給し、保持タンク中の細胞含有懸濁液のｐＨを調整することにより、第２のｐＨ値は、第１のｐＨ値より高い。代替の実施形態において、１種または複数のｐＨ調整剤を、１つまたは複数の破壊装置に接続された保持タンクの１つまたは複数の第２の出口に供給し、１つまたは複数の破壊装置中の細胞含有懸濁液のｐＨを調整することにより、第２のｐＨ値は、第１のｐＨ値より高い。本発明の一実施形態において、第２のｐＨ値は、５～１２の範囲である。

【0022】

本発明の一実施形態において、系の細胞セパレータは、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、限外濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除カラム濾過装置、クロスフローフィルターを有する濾過装置、遠心分離装置、およびこれらの組合せからなる群から選択される。
本発明の一実施形態において、系の１つまたは複数の分画装置は、固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、およびこれらの組合せからなる群から選択される。

【0023】

本発明の一実施形態において、系は、１つまたは複数の分画装置から得られる１つまたは複数の画分を受け取り、１つまたは複数の画分を脱水してタンパク質富化栄養素サプリメントを製造するための１つまたは複数の脱水室をさらに含み、ここで、１つまたは複数の画分は、第１のタンパク質含有画分、タンパク質含有細胞残屑画分、およびこれらの組合せからなる群から選択され、１つまたは複数の脱水室は、噴霧乾燥装置、ドラム乾燥機、およびフリーズドライヤー、凍結乾燥装置、およびこれらの組合せからなる群から選択される。

【0024】

一実施形態において、細胞の破壊は、マイクロ流体装置によって達成される。別の実施形態では、細胞の破壊は、超音波発生装置を使用して達成される。さらに別の実施形態では、細胞の破壊は、５，０００～２５，０００ポンド／平方インチ（ｐｓｉ）の範囲の加工圧力でマイクロ流体装置を使用して達成される。さらに別の実施形態では、細胞の破壊は、１５，０００～２０，０００ポンド／平方インチ（ｐｓｉ）の範囲の加工圧力でマイクロ流体装置を使用して達成される。さらに別の実施形態では、細胞の破壊は、１５，０００ポンド／平方インチ（ｐｓｉ）の加工圧力でマイクロ流体装置を使用して達成される。
一態様において、細菌発酵系は、発酵容器および破壊装置に接続された第１の細胞セパレータを含む。第１の細胞セパレータは、第１の細胞濃度の発酵液を発酵容器から受け取り、発酵液を細胞非含有浸透液と第２の細胞濃度の細胞含有懸濁液とに分離する。別の態様において、細菌発酵系は、ある量の第１の細胞含有懸濁液を受け取るために第１の細胞セパレータに接続された細胞含有保持タンクをさらに含む。さらに別の態様において、細菌発酵系は、第２の発酵液体ブロス流を発酵容器から受け取り、第２の発酵液体ブロス流を第２の細胞含有懸濁液と第２の細胞非含有浸透液とに分離するための、発酵容器の第４の出口ラインに接続された第２の細胞セパレータをさらに含む。

【0025】

Ｉ．発酵由来タンパク質を生成するための微生物バイオマスの加工
細菌発酵プロセスは、一般的に、合成ガスまたは一酸化炭素（ＣＯ）含有ガス状基質などのガス状基質を、特に嫌気性細菌または酢酸生成細菌などの細菌によって発酵することと、二酸化炭素（ＣＯ２）、エタノール、ブタノール、酪酸、酢酸などを含む発酵製品を生成することと、を含む。さらに重要なことには、嫌気性細菌発酵プロセス後、大量の微生物バイオマスが得られる。大量の微生物バイオマスは、細菌発酵プロセスの間またはその後に除去することができる。細胞除去が完了した際、または細菌発酵プロセスの間、このような大量の微生物バイオマスは、他の用途に有用であり得る。しかしながら、例えば栄養素サプリメントまたは動物用供給原料として有用になるような高品質（すなわち、有害物質または汚染物質がない状態）になるまで発酵由来タンパク質を大量に抽出するには、さらに複雑な加工が必要となる。具体的には、本発明は、このような発酵由来タンパク質を細菌発酵プロセス由来の細胞バイオマスから抽出するプロセスを含む。より具体的には、本発明は、栄養素サプリメントまたは動物用飼料に加工するための、１つまたは複数の発酵由来タンパク質含有画分を細胞集団または微生物バイオマスから抽出する細菌発酵プロセスのための系を含む。

【0026】

図１Ａは、細菌発酵系からタンパク質富化栄養素サプリメントを製造する方法１００の一例のフローチャートである。ガス状基質の細菌発酵の方法１００は、所望の発酵製品レベル、例えばアルコール製造レベルを維持しながら、炭化水素質化合物、炭水化物、特異タンパク質、特異アミノ酸、および／または他の所望の成分の形成が有利な条件下で操作してよい。
工程１１０は、第１のｐＨ値の培地を含有する発酵容器中で、ガス状基質を嫌気性細菌によって発酵することを含む。工程１１０で、発酵培地を発酵容器に加えて細菌発酵プロセスを実施する。加えて、１種または複数のガス状基質を発酵容器に送達し、細菌培養物（嫌気性細菌を含有する培養物など）によって発酵する。最初に、発酵容器に含まれる液体発酵培地は、様々なタイプの好適な細菌培地、発酵培地または液体栄養培地を含んでもよい。栄養培地は、使用する微生物の増殖を可能にする、かつ／または特定の生成物の生成に有利な有効量の１種または複数のビタミンおよびいくつかのミネラルを含む。

【0027】

合成ガス、例えば一酸化炭素および水素ガスまたは別の好適な基質を使用して、１種または複数の含酸素炭化水素質化合物、例えば、特に様々なタイプのエタノール、ブタノール、酢酸などを製造する際に発酵プロセスに適した嫌気性細菌増殖に適した培地を使用することができる。好適な発酵培地の一例は、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第７，２８５，４０２号に記載されている。他の好適な培地の例は、米国特許第６１／６５０，０９８号および同第６１／６５０，０９３号に記載されており、両方とも参照により本明細書に組み込まれる。
加えて、方法１００の細菌発酵プロセスで使用する１種または複数のガス状基質としては、様々な合成用ガス（synthesis gas）（すなわち、合成ガス（syngas））、鋼生産プロセス由来の排ガス、鉄生産プロセス由来の排ガス、石炭生産プロセス由来の排ガス、または任意の他の好適な工業生産プラント由来のガス源を挙げることができる。一実施形態において、細菌発酵プロセスで使用されるガス状基質としては、一酸化炭素（ＣＯ）含有ガス状基質および／または追加のガス、例えば水素ガス、二酸化炭素（ＣＯ２）、窒素ガス（Ｎ２）、およびこれらの組合せが挙げられる。

【0028】

一例において、一酸化炭素含有ガス状基質は、大量の一酸化炭素含有産業煙道ガスであってもよい。いくつかの態様において、一酸化炭素を含むガスは、炭素含有排ガスに由来する。炭素含有排ガスとしては、産業排ガスまたは他の都市固形もしくは液状廃棄物のガス化が挙げられる。そのようなものとして、該産業プロセスは、周辺環境に排気されると思われる炭素を捕捉するための効果的なプロセスを表す。産業煙道ガスの例としては、鉄類製品の製造、非鉄製品の製造、石油精製プロセス、石炭のガス化、バイオマスのガス化、電力生産、カーボンブラック生産、アンモニア生産、メタノール生産、コークス製造の間に生成されるガスが挙げられる。

【0029】

一例において、一酸化炭素含有合成ガスを、使用する発酵容器のサイズおよびタイプに応じて様々な速度で、発酵容器中に導入する。一態様において、合成ガスを、約１０～約５０フィート³／秒の速度でガス入口に導入する。別の態様において、合成ガスを、約２５～約３５フィート³／秒の速度で導入する。用語「合成ガス（syngas）」または「合成用ガス（synthesis gas）」は、これらに限定されないが、一酸化炭素（ＣＯ）および水素（Ｈ₂）を多く含むガス混合物、例えば水素を生成する天然ガスまたは炭化水素の蒸気改質から生成されるガス混合物、石炭のガス化、またはいくつかのタイプの廃棄物熱源転換ガス化設備で生成される他のガスにおける合成ガスが挙げられる。合成ガスは、可燃性であり、燃料源としてまたは他の化学物質の生成のための中間体として使用されることが多い。合成ガスは、任意の既知の源から得ることができる。

【0030】

例えば、合成ガスは、炭素質材料のガス化から供給してもよい。ガス化は、酸素供給が限られた環境内のバイオマスの部分燃焼を要する。得られるガスは、主に、一酸化炭素ガスおよび水素ガスを含む。合成ガスは、少なくとも約１０モル％の一酸化炭素、または少なくとも約２０モル％、または１０～約１００モル％、または２０～約１００モル％、３０～約９０モル％の一酸化炭素、または約４０～約８０モル％の一酸化炭素、または約５０～約７０モル％の一酸化炭素を含有する。合成ガスは、少なくとも約０．７５、また少なくとも１．０、または少なくとも約１．５のモル比の一酸化炭素／二酸化炭素を有する。好適なガス化方法およびその装置は、米国特許出願第１３／４２７，１４４号、同第１３／４２７，１９３号、および同第１３／４２７，２４７号ならびに米国特許出願第６１／５１６，６６７号、同第６１／５１６，７０４号、および同第６１／５１６，６４６号で提供されており、これらはすべて、参照により本明細書に組み込まれる。

【0031】

さらに、工程１１０で、細菌培養物を発酵容器中に植菌する。発酵培地を滅菌して不要な微生物を除去し、細菌発酵容器または発酵バイオリアクターに、選択した微生物または混合細菌培養物を植菌する。一態様において、細菌培養物に使用する細菌は、嫌気性細菌である。使用する嫌気性細菌の例としては、酢酸生成細菌、例えば、クロストリジウム属のもの、例えば、国際公開第２０００／６８４０７号、欧州特許第１１７３０９号、米国特許第５，１７３，４２９号、同第５，５９３，８８６号および同第６，３６８，８１９号、国際公開第１９９８／００５５８号および国際公開第２００２／０８４３８号に記載のものを含めたクロストリジウム・リュングダリイの菌株など、国際公開第２００７／１１７１５７号および国際公開第２００９／１５１３４２号に記載のものを含めたクロストリジウム・オートエタノゲナムの菌株（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ １００６１およびＤＳＭ １９６３０）、ならびにクロストリジウム・ラグスダレイ（Ｐ１１、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－６２２）ならびに米国特許第７，７０４，７２３号および「Biofuels and Bioproducts from Biomass-Generated Synthesis Gas」, Hasan Atiyeh, presented in Oklahoma EPSCoR Annual State Conference, April 29, 2010のそれぞれに記載のものを含めたアルカリバクルム・バッキ（ＣＰ１１、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－１７７２）ならびに米国特許出願第２００７／０２７６４４７号に記載のクロストリジウム・カルボキシディボランスが挙げられる。これらの各参考文献は、参照により本明細書に組み込まれる。他の好適な細菌としては、モーレラ種ＨＵＣ２２－１などのモーレラ属のもの、およびカルボキシドサーマス属のものが挙げられる。一実施形態において、混合細菌培養物を使用し、混合細菌培養物は、２種以上の細菌性微生物を含む。

【0032】

この方法１００の発酵プロセスにおいて培養するのに有用な細菌としては、アセトゲニウム・キブイ、アセトアナエロビウム・ノテラエ、アセトバクテリウム・ウッディイ、アルカリバクルム・バッキＣＰ１１（ＡＴＣＣ ＢＡＡ－１７７２）、ブラウティア・プロダクタ、ブチリバクテリウム・メチロトロフィカム、カルダナエロバクター・サブテラネウス、カルダナエロバクター・サブテラネウス・パシフィカス、カルボキシドサーマス・ヒドロゲノホルマンス、クロストリジウム・アセチカム、クロストリジウム・アセトブチリカム、クロストリジウム・アセトブチリカムＰ２６２（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ １９６３０）、クロストリジウム・オートエタノゲナム（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ １９６３０）、クロストリジウム・オートエタノゲナム（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ １００６１）、クロストリジウム・オートエタノゲナム（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ ２３６９３）、クロストリジウム・オートエタノゲナム（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ ２４１３８）、クロストリジウム・カルボキシジボランスＰ７（ＡＴＣＣ ＰＴＡ－７８２７）、クロストリジウム・コスカティイ（ＡＴＣＣ ＰＴＡ－１０５２２）、クロストリジウム・ドラケイ、クロストリジウム・リュングダリイＰＥＴＣ（ＡＴＣＣ ４９５８７）、クロストリジウム・リュングダリイＥＲＩ２（ＡＴＣＣ ５５３８０）、クロストリジウム・リュングダリイＣ－０１（ＡＴＣＣ ５５９８８）、クロストリジウム・リュングダリイ０－５２（ＡＴＣＣ ５５８８９）、クロストリジウム・マグナム、クロストリジウム・パストゥリアナム（ＤＳＭＺ ＧｅｒｍａｎｙのＤＳＭ ５２５）、クロストリジウム・ラグスダリＰ１１（ＡＴＣＣ ＢＡＡ－６２２）、クロストリジウム・スカトロゲネス、クロストリジウム・サーモアセチカム、クロストリジウム・ウルツネンセ、デスルホトマクルム・クズネツォビイ、ユーバクテリウム・リモーサム、ゲオバクター・スルフレデュセンス、メタノサルシナ・アセチボランス、メタノサルシナ・バーケリ、モーレラ・サーモアセチカ、モーレラ・サーモオートトロフィカ、オキソバクター・フェニギイ、ペプトストレプトコッカス・プロダクツス、ルミノコッカス・プロダクツス、サーモアナエロバクター・キブイ、およびこれらの組合せが挙げられる。他の酢酸生成細菌または嫌気性細菌も、本明細書に記載の方法１００における使用のために選択することができる。

【0033】

一例において、使用する細菌は、約５０％以下のゲノムＤＮＡ Ｇ＋Ｃ含有量を有する酢酸生成細菌細胞を含む。酢酸生成細菌は、活性、不活性または両方の組合せであってもよい。この態様において、Ｇ＋Ｃ含有量は、当該技術分野において公知の任意の方法によって決定することができる。例えば、Sambrookら、(1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor)（「Maniatis」としても公知で、参照により本明細書に組み込まれる）に記載のものなどの方法を用いてゲノムが配列され得る。次いでＧ＋Ｃ含有量は、手動で、または例えばBohlinら、「Analysis of Intragenomic GC Content Homogenicity within Prokaryotes」, BMC Genomics 2010, 11: 464（参照により本明細書に組み込まれる）などのいくつものプログラムを用いて決定することができる。他のＧ＋Ｃ含有量の決定方法としては、米国特許第８，１４３，０３７号、Mesbahら、(1989) 「Measurement of Deoxyguanosine/Thymidine Ratios in Complex Mixtures by High-Performance Liquid Chromatography for Determination of the Mole Percentage Guanine + Cytosine of DNA. J. Chromatogr. 479: 279-306、およびTanner ら、 「Costridium ljungdahlii sp. nov., an Acetogenic Species in Clostridial rRNA Homology Group I」, International Journal of Systematic Bacteriology, Apr. 1993, p.232-236（これらはすべて、参照により本明細書に組み込まれる）が挙げられる。

【0034】

工程１１０で、細菌培養物を発酵容器中に植菌する際、微生物（例えば、嫌気性細菌）の初期集団の有効な増殖および後続する発酵のための初期供給ガスの供給速度が確立する。発酵容器は、嫌気性細菌を培養するための環境を提供する。好適な発酵容器としては、これらに限定されないが、連続撹拌槽型反応器（ＣＳＴＲ）、固定化細胞反応器（ＩＣＲ）、トリクルベッド反応器（ＴＢＲ）、移動床生物膜反応器（ＭＢＢＲ）、気泡塔、ガスリフト発酵槽、膜反応器（例えば、中空繊維膜バイオリアクター（ＨＦＭＢＲ））、静的ミキサー、容器、配管、塔、ループ型反応器、およびこれらの組合せのうちの１つまたは複数を挙げることができる。方法１００において、任意の既知の発酵容器または発酵バイオリアクターを利用してもよい。バイオリアクターのいくつかの例が、２０１１年６月３０日に出願された米国特許第６１／５７１，６５４号および同第６１／５７１，５６５号、２０１１年９月１３日に出願された米国特許第６１／５７３，８４５号、２０１２年５月１５日に出願された米国特許第１３／４７１，８２７号および同第１３／４７１，８５８号、ならびに２０１２年５月１６日に出願された米国特許第１３／４７３，１６７号に記載されており、これらすべては、参照により本明細書に組み込まれる。

【0035】

一実施形態において、発酵容器は、第２のバイオリアクターに接続された第１のバイオリアクターを含み、第１のバイオリアクターは、発酵液を第２のバイオリアクターに供給し、第２のバイオリアクター中でエタノール製造が行われる。例えば、発酵容器は、培養安定性の改善のために２段階ＣＳＴＲ系であってもよい。例として、発酵容器は、第１のＣＳＴＲ室を用いた第１の増殖段階と、第２のＣＳＴＲ室を用いた第２の製造段階とを任意で含んでもよい。

【0036】

一例において、増殖段階ＣＳＴＲに液体培地を供給し、製造段階ＣＳＴＲから非変換基質ガスを増殖段階ＣＳＴＲに供給する。一般に、製造段階ＣＳＴＲに新しいガス供給が供給され、新しい培地および細菌培養物が増殖段階ＣＳＴＲから供給される。製造段階ＣＳＴＲから細菌細胞を得るために細胞のリサイクルを用い、発酵生成物から分離し、製造段階ＣＳＴＲに送り戻して、高い細菌発酵効率を得てもよい。一般に、細菌細胞は、増殖段階ＣＳＴＲにはリサイクルされない。米国特許第１０／３１１，６５５号は、連続発酵プロセスを記載しており、参照により本明細書に組み込まれる。用語「発酵」、「発酵プロセス」、「細菌発酵プロセス」、「発酵反応」、「細菌発酵反応」などは、プロセスの増殖段階と生成物の生合成段階の両方を包含することが意図される。一態様において、発酵は、一酸化炭素からアルコールへの変換を指す。一態様において、細菌発酵プロセスは、その中に細菌を含有する発酵容器への好適な発酵培地および１種または複数のガス状基質の添加と共に開始する。

【0037】

一般に、発酵液体ブロスは、細菌発酵プロセスが開始すると、発酵容器内で生成される。発酵液体ブロスは、発酵容器内に含まれる培地、１種または複数のガス状基質、および細菌に加えて、１種または複数の発酵生成物を含んでもよい。発酵液体ブロス中に含まれ、発酵容器内で細菌発酵プロセスによって生成される発酵生成物は、１種または複数の含酸素炭化水素質化合物、例えば、アルコールなど、例えばこれらに限定されないが、エタノール、２－ブタノール、２－ブタノン、２，３－ブタンジオール、アセトン、ブタジエン、ブタン、ブタノール、ブチレート、酪酸、エチレン、および脂肪酸、酢酸、ならびにこれらの組合せを含んでもよい。

【0038】

一態様において、エタノールと酢酸との混合物を生成することができる。別の態様では、エタノールとブタノールとの混合物が生成される。一例において、発酵容器中にて、１日当たり１０ｇ／Ｌ超の比産出力でエタノールを生成し、一方、５ｇ／Ｌ未満の遊離酢酸で遊離酢酸濃縮液が維持される。発酵液体ブロス中に存在するエタノールおよびアセテートのエタノール：アセテート比は、１：１～２０：１の範囲であってもよい。
発酵容器内に含まれる発酵液体ブロスは、希釈濃度のエタノールを含有してよく、品質および／または濃度の面でさらに加工する必要があり得る。例えば、発酵液体ブロス中に含まれる発酵生成物を発酵容器から蒸留室または他のタイプの反応器へ送達して、高濃度の最終蒸留生成物を得、それをさらに加工し、回収することができる。

【0039】

発酵液体ブロスは、死滅または不活性細菌細胞も含み得る。これらの細菌細胞は、その他の場合では細菌細胞または嫌気性細菌細胞として公知である。大規模の細菌発酵プロセスによる細胞の蓄積は、細胞集団または使用済みバイオマスとして公知である。用語「不活性酢酸生成細菌」または「不活性細菌細胞」は、細菌発酵プロセスを経た後に複製能力を失った死滅細胞を指す。用語「細胞集団」は、全体として微生物バイオマスを形成する細菌細胞を指す。微生物バイオマスは、細菌発酵中に蓄積し得、本明細書に記載の方法および系によって加工して発酵由来タンパク質を得るのに有用である。発酵液体ブロスは、様々なタンパク質、アミノ酸、炭水化物、核酸、および他の部分も含み得る。核酸の例としては、ヌクレオチド、例えばＤＮＡ、ＲＮＡおよびこれらの任意の誘導体および類似体が挙げられる。発酵ブロス中の細胞集団または微生物バイオマスの蓄積により、発酵ブロス自体が有意なカロリー値をもたらし得る。発酵液体ブロスは、約０．５％、１％、５％、１０％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、および約５０％の乾燥分を有し得る。

【0040】

図１Ａに示すように、方法１００の工程１２０で、ある程度の量の第１の濃度の嫌気性細菌の細胞を含有する発酵液体ブロスおよび発酵生成物が、細菌発酵容器から送達される。一般に、細胞が発酵容器内で恒常的増殖に達したとき、細菌細胞を含有する発酵液体ブロスは、発酵容器から送達され得る。恒常的増殖段階の後の発酵プロセスでは、発酵液体ブロス中に含まれる細菌細胞の第１のバッチの第１の開始細胞濃度は、０．５ｇ／Ｌ（乾燥細胞集団）、例えば１．０ｇ／Ｌ以上、または２．０ｇ／Ｌ以上、または５．０ｇ／Ｌ以上、または１５．０ｇ／Ｌ以上、または３０．０ｇ／Ｌ以上であってもよい。
工程１３０で、例えば１つまたは複数の細胞セパレータを使用して、発酵液体ブロス由来の嫌気性細菌の細胞を、細胞非含有浸透液と細胞含有懸濁液とに分離する。この工程での目的は、発酵液体ブロスから細菌細胞を分離して取り出し、細胞非含有浸透液と細胞含有懸濁液を別々に得ることである。細胞非含有浸透液は、発酵プロセスによって生成された発酵生成物を主に含有し、蒸留および他のプロセスによるさらなる加工の準備ができている。細胞含有懸濁液は、発酵プロセス後の細菌細胞から主に構成される。細胞含有懸濁液中の細菌細胞は、第２の濃度（または第２の細胞密度）で測定することができ、一実施形態において、細胞含有懸濁液中の第２の濃度の細菌細胞は、発酵液体ブロス中に含まれる第１の濃度の細菌細胞より同じか、またはより高い濃度である。

【0041】

発酵容器中の微生物培養物の所望の細胞濃度を維持するために、細菌発酵プロセスは、一部の発酵液体ブロスを除去することを含む。細胞濃度の増加に伴い、発酵中の操作に関連する問題、例えば不要な遊離酢酸の濃度の増加が多くなり、アセテート製造がエタノール製造より優先されるようになる。したがって、細胞密度を監視し、発酵液体ブロスの定期的または連続的な細胞除去を行うことが重要となる。用語「細胞密度」は、発酵培地の単位体積当たりの微生物の質量、例えばグラム／リットルを意味する。
細菌発酵容器中の細胞の濃度の安定化は、バイオリアクター中のすべての還元ガスまたは栄養基質を利用し、発酵バイオリアクターブロス中に存在するアセテートの遊離酢酸画分が高濃度を超える場合（例えば、１ｇ／Ｌ以上、または２ｇ／Ｌ以上の濃度の遊離酢酸）に水の供給速度を高めて、安定性の恒常的濃度より低い細胞濃度まで発酵容器から細菌細胞を除去することによって達成される。大規模の連続細菌発酵は、追加の培養補給なしで発酵容器中の細胞濃度を一定に維持することによって、長期間（例えば、何カ月も）維持することができる。発酵容器中の細菌培養物に、この期間中、ビタミンおよび他の必須栄養素を含有する液体栄養培地と共に、１種または複数のガス（例えば、ＣＯ、ＣＯ２、Ｈ２および他の炭素源基質）を供給する。

【0042】

発酵液体ブロス中の細胞含有懸濁液から細胞非含有浸透液を分離するために使用することができる好適な細胞セパレータとしては、これらに限定されないが、任意の濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、限外濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除カラム濾過装置、またはこれらの組合せが挙げられる。本発明の濾過式細胞セパレータで使用することができる好適なフィルターとしては、これらに限定されないが、螺旋巻き膜／フィルター、クロスフローフィルターが挙げられる。加えて、細胞非含有浸透液からの細胞分離の別の好適な手段は、１つまたは複数の遠心分離装置の使用によるものである。

【0043】

一実施形態において、工程１３０で使用する細胞セパレータは、細菌細胞を細菌含有懸濁液と細胞非含有浸透液とに分離し、かつ／または細胞含有懸濁液を、細胞セパレータによって細胞分離する前の発酵液体ブロス中の細胞濃度より高い濃度になるように濃縮するように機能する。代替の実施形態において、発酵液体ブロス中の細胞を、細胞セパレータに数回通過させて（例えば、１つもしくは複数のフィルター型濾過装置に数回通過させて、または同一もしくは異なる遠心分離速度で１つもしくは複数の遠心分離機に数回かけて遠心分離することによって）、分離および濃縮することができる。

【0044】

好ましい実施形態において、細胞分離の後、細胞含有懸濁液中の細胞濃度（または細胞密度）は、発酵液体ブロスの細胞濃度より高い。本発明の一態様において、螺旋巻きフィルターを有する１つまたは複数の濾過装置を使用して、発酵液体ブロスを螺旋巻きフィルターに数回通過させて細胞を濃縮する。
別の態様において、細胞のリサイクルを実施し、これは一般に、細胞非含有浸透液から細菌細胞含有懸濁液を分離して、この分離した細菌細胞の全部または一部を発酵容器に戻すことを指す。一実施形態において、濾過装置などの細胞セパレータによる限外濾過を用いて、細胞の分離および／または細胞のリサイクルを達成する。

【0045】

さらに別の態様において、発酵容器中で培養される細菌の恒常的細菌増殖の間、発酵容器からの細胞除去を行い、細菌細胞を高濃度の細胞含有懸濁液または半乾性微生物バイオマスで収集する。一実施形態において、細胞除去は、細菌細胞および発酵培地に含まれる他の物質を含有する発酵液体ブロスをある程度の量で必要とする。例えば、細胞除去は、細菌発酵中に発酵容器から除去された発酵物または発酵液体ブロスであってもよい。別の実施形態において、細胞除去は、発酵容器から第１の細胞濃度の発酵液を除去し、第２の細胞濃度の細胞含有懸濁液になるように細胞をさらに濃縮することによって、濃縮された細胞含有懸濁液を得ることを必要とし得る。細胞含有懸濁液は、発酵容器から除去された発酵液の細胞密度より高い細胞密度を有する。これらの工程は、特定の粒子の効果的な除去をもたらし、方法１００から製造される最終タンパク質富化栄養素サプリメント中の高収率のタンパク質含有量を可能にする。
一態様において、細胞除去は、連続細菌発酵中に行われる。別の態様において、細胞除去は、細菌発酵の後に行われ、ここで、細菌発酵プロセスを中断または停止して、発酵容器からの微生物バイオマスの除去を可能にする。
次に、方法１００の工程１４０は、ｐＨ調整剤を供給することと、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊して第１のタンパク質回収率のホモジネートを生成することと、を含む。ｐＨ調整剤は、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素、溶液のｐＨ値を上下させるために使用することができる任意の助剤、およびこれらの組合せからなる群から選択することができる。

【0046】

方法１００の工程１４０で、細胞含有懸濁液中に含まれる細菌細胞をホモジネートに破壊する。破壊装置は、細胞含有懸濁液中の細菌細胞の細胞膜を破壊および／または溶解するために使用することができる。細菌細胞を破壊するための破壊装置の例としては、これらに限定されないが、様々なタイプのマイクロ流体装置、超音波処理装置、超音波装置、機械的破砕装置、フレンチプレス、冷凍器、加熱器、熱交換器、蒸留塔、温度変化を起こす熱を適用する任意の装置、高温反応器、ホモジナイザー、およびこれらの組合せが特に挙げられる。

【0047】

図１Ａに示すように、細胞含有懸濁液中の細菌細胞が壊れて開いた、および／または破壊した後、得られる破壊細胞混合物、例えばホモジネートを、工程１５０で、微生物バイオマスのホモジネート中の細胞残屑画分からタンパク質含有画分を分離して取り出し、追加のタンパク質含有画分をさらに精製および抽出してタンパク質富化栄養素サプリメントを製造することによってさらに加工することができる。このような分離は、１つまたは複数の分画装置を使用して実施されることが企図される。一態様において、１つまたは複数のタンパク質含有画分が得られ、１つまたは複数のタンパク質含有画分は、遊離アミノ酸、全アミノ酸、およびペプチドも含み得る。

【0048】

工程１５０で、ホモジネートを分画するための１つまたは複数の分画装置の好適な例としては、これらに限定されないが、様々なタイプの固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが特に挙げられる。
一実施形態において、工程１５０で、１つまたは複数の破壊装置によって細菌細胞を破壊した後に得られるホモジネートを第１の分画装置に送達し、第１のタンパク質含有画分と第１のタンパク質含有細胞残屑画分とが得られる。一態様において、第１のタンパク質含有画分は、少なくとも１％以上、３％以上、５％以上、１０％以上、２０％以上、３０％以上、４０％以上、５０％以上、６０％以上、７０％以上、８０％以上、または９５％以上のタンパク質含有量を有する。

【0049】

一実施形態において、工程１６０で、ホモジネートに由来する第１のタンパク質含有画分は、タンパク質富化栄養素サプリメント組成物、細胞増殖培地サプリメント／組成物、医薬組成物、および／または動物用飼料（例えば、魚飼料、エビ飼料、鶏用飼料など）に直接取り入れることができる。このような混入は、第１のタンパク質含有画分を乾燥して低水分（例えば、ペーストまたは粉末形態）にすることと、１つまたは複数のタイプの栄養素サプリメントを作製するために、第１のタンパク質含有画分を他の成分（例えば、追加の動物用飼料の栄養素、医薬充填剤、配合剤、可塑剤など）と直接ブレンドすることと、を要し得る。本明細書に記載の工程１６０は、第１のタンパク質含有画分の品質および濃度を向上および増強するために、第１のタンパク質含有画分のｐＨの調節、１種または複数の溶解度増強剤の添加、第１のタンパク質含有画分からの有害なタンパク質の除去、および／またはこれらの組合せの追加の加工工程を含んでもよい。加えて、第１のタンパク質含有画分は、細菌発酵由来タンパク質の抽出および精製を実施し、タンパク質富化栄養素サプリメントとして使用するために再度目的を持たせることによって、さらなる下流加工を施してもよい。このような例を、図２Ａおよび図２Ｂに示す。

【0050】

あるいは、工程１６５で、ホモジネートに由来する第１のタンパク質含有細胞残屑画分を、タンパク質富化栄養素サプリメント組成物、医薬組成物、細胞増殖培地サプリメント／組成物、および／または動物用飼料（例えば、魚飼料、エビ飼料、鶏用飼料など）に直接混入させてもよい。同様に、第１のタンパク質含有細胞残屑画分の品質および濃度を向上および増強するために、第１のタンパク質含有細胞残屑画分のｐＨの調整、タンパク質含有細胞残屑画分への１種または複数の溶解度増強剤の添加、第１のタンパク質含有細胞残屑画分からの有害なタンパク質の除去、および／またはこれらの組合せの追加の加工工程が必要なことがある。一態様において、第１のタンパク質含有細胞残屑画分の可溶性タンパク質のみが回収される場合、回収されたタンパク質を得て、動物またはヒトが摂取するための栄養素富化サプリメントとして直接混入させることができる。しかしながら、ヒトへの摂取用の高品質の栄養素富化サプリメントに混入する第１のタンパク質含有細胞残屑画分には、栄養素およびタンパク質分を精製および回収するためのさらなる下流加工が必要となる場合がある。別の態様において、この方法で回収される不溶性タンパク質にさらなる下流加工を施し、次いで第１のタンパク質含有画分と合わせて、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造することができる。

【0051】

図１Ｂは、細菌発酵系からタンパク質富化栄養素サプリメントを製造するための方法１００の別の例のフローチャートである。ガス状基質の細菌発酵の方法１００は、アルコール製造レベルなどの所望の発酵製品レベルを維持しながら、炭化水素質化合物、炭水化物、特異タンパク質、特異アミノ酸、および／または他の所望の成分の形成に有利な条件下で操作してよい。
方法１００の工程１３０は、発酵液由来の嫌気性細菌の細胞を、細胞非含有浸透液と、第２の細胞濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離することを含む。方法１００の工程１３５は、第２のｐＨ値の細胞含有懸濁液を第１の保持タンク中に保持することを含んでもよい。

【0052】

方法１００の工程１４０は、破壊装置によって、第２のｐＨ値の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊してホモジネートを生成することを含む。方法１００の工程１４５は、破壊した後に、第２のｐＨ値の細胞含有懸濁液を第１の保持タンク中に保持することを含んでもよい。
方法１００の工程１５０は、第１の分画装置を使用して、ホモジネートを第１のタンパク質含有画分とタンパク質含有細胞残屑画分とに分画することを含む。方法１００の工程１６０は、タンパク質富化栄養素サプリメントとして第１のタンパク質含有画分を得ることを含む。方法１００の工程１６５は、タンパク質富化栄養素サプリメントとしてタンパク質含有細胞残屑画分を得ることを含む。
図２Ａは、発酵プロセス由来の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液（例えば、方法１００の工程１３０由来の第２の濃度の細胞含有懸濁液）を加工して、タンパク質富化栄養素サプリメントとして第２のタンパク質含有画分を得る方法２００Ａの一例である。この方法には、細胞含有懸濁液中の好気性細胞の細胞膜を破壊する前に、工程２０２で、細胞含有懸濁液を１種または複数の添加剤で処理し、ホモジネートを生成する任意の加工工程がある。

【0053】

工程２０２の細胞の前処理プロセスにおいて、細胞含有懸濁液を前処理室内または前処理用の保持タンク中で加工し、工程２０４で、１種または複数の添加剤で処理して、嫌気性細菌細胞の細胞壁および細胞膜を破壊するために細胞破壊効率を助長および向上することができる。一態様において、濃縮細菌細胞は保持タンクに入り、そこで、破壊装置が大容量の細胞をまとめて加工するための準備ができるまで収容される。別の態様において、保持タンクに収容されている間、細菌細胞に、タンパク質含有量が高く、摂取に適切なタンパク質富化サプリメントを生成するのに備えて前処理を施すことができる。さらに別の態様において、工程２０２における前処理プロセスで添加した１種または複数の添加剤は、工程２０４で細菌細胞を破壊し、高品質のホモジネートを生成する条件を最適化するのを助けることもできる。

【0054】

工程２０２で使用する好適な添加剤としては、これらに限定されないが、洗剤、ｐＨ調整剤、酵素、ヌクレアーゼ、プロテアーゼ、加水分解酵素、アルカリ性緩衝液、酸性緩衝液、またはこれらの組合せが挙げられる。一実施形態において、方法２００Ａの工程２０２は、発酵由来細菌細胞の細胞含有懸濁液の核酸含有量を減少させることを含む。このような前処理プロセスは、細菌細胞をヌクレアーゼで処理することによって達成される。使用するヌクレアーゼの例としては、これらに限定されないが、デオキシリボヌクレアーゼ、リボヌクレアーゼ、ベンゾナーゼ、およびヌクレアーゼが挙げられる。細胞含有懸濁液のヌクレアーゼ処理は、アルカリ加水分解および化学的抽出、例えば硫安沈殿法、エタノール沈殿法、ポリエチレンイミン沈殿法によってさらに助長させることができる。一態様において、細胞含有懸濁液の核酸含有量を、約１．５％～５％、または約２％～１８％に減少させる。

【0055】

細胞破壊の後、工程２０６で、ホモジネートは追加の抽出および精製プロセスを経ることができ、例えば、第１の分画装置を使用して第１のタンパク質含有画分とタンパク質含有細胞残屑画分とに分画することができる。ホモジネートを分画するための第１の分画装置の例としては、これらに限定されないが、様々なタイプの固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが特に挙げられる。

【0056】

あるいは、工程２０４で、濃縮細菌細胞の細胞含有懸濁液は、破壊装置に直接移行してもよく、次いで工程２０２に関して記述したように前処理プロセスを経て、工程２０６においてホモジネートを分離および分画する条件の最適化を助ける。別の態様において、方法２００Ａから回収されたタンパク質は、さらなる下流加工を経て、次いで第１のタンパク質含有画分と合わせ、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造することができる。

【0057】

工程２０８で、第１のタンパク質含有画分を第２の分画装置へ送達し、工程２１０で第２の分画装置を使用して第２のタンパク質含有画分に分画する。タンパク質含有画分を分画するための第２の分画装置の例としては、これらに限定されないが、様々なタイプの固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが特に挙げられる。

【0058】

工程２１２で、得られた第２のタンパク質含有画分を、タンパク質富化栄養素サプリメント、医薬組成物、細胞増殖培地／組成物、および／または動物用飼料（例えば、魚飼料、エビ飼料、鶏用飼料など）に製剤化することができる。このような混入には、第２のタンパク質含有画分を乾燥して低水分（例えば、ペーストまたは粉末形態）にし、第２のタンパク質含有画分を他の成分（例えば、追加の動物用飼料栄養素、医薬用充填剤、混合剤、可塑剤など）と直接ブレンドして１つまたは複数のタイプの栄養素サプリメントを作製することを要し得る。
例として、工程２０４で得たホモジネートを濾過装置に入れて、第１のタンパク質含有画分（例えば、濾過装置による濾過後のタンパク質含有画分の濾過液）を得ることができる。濾過されたタンパク質含有画分は、部分的に精製されたタンパク質産物である。次いで、一実施形態において、濾過されたタンパク質含有画分を遠心分離（例えば、第２の分画装置／遠心分離装置によって）し、追加の可溶性タンパク質画分および細胞固体画分を得る。このような第２のタンパク質含有画分は、タンパク質富化栄養素サプリメントとして、個別に使用しても、組み合わせて使用してもよい。

【0059】

別の例として、工程２０４で得たホモジネートを遠心分離にかけてもよく、その後、上清タンパク質含有画分を収集する。上清タンパク質含有画分は分画装置に入り、第２の濾過液のタンパク質含有画分が収集される。さらに別の例として、第１のタンパク質含有画分のみが濾過装置に入り、その後、濾過液のタンパク質含有画分が収集され、タンパク質富化サプリメントとして使用される。さらに別の例として、第１のタンパク質含有画分のみを遠心分離にかけ、その後、分画されたタンパク質または上清がタンパク質含有画分として収集される。１つまたは複数のタンパク質含有画分と細胞残屑タンパク質の分離は、１つまたは複数の分画装置によって達成される。

【0060】

一態様において、２つの分画装置を有する発酵系が使用される。別の実施形態において、３つの分画装置を有する発酵系が使用される。図２Ｂは、３つの分画装置を使用して、本発明の１つまたは複数の実施形態によるタンパク質富化栄養素サプリメントとして第３のタンパク質含有画分を得る発酵プロセスの細胞含有懸濁液を加工する方法２００Ｂの一例である。
図２Ｂに示すように、方法２００Ｂは、工程２１４で、第２のタンパク質含有画分を第３の分画装置に送達し、工程２１６で、第３のタンパク質含有画分を第２のタンパク質含有画分から分画して抽出することを含む。第３のタンパク質含有画分を工程２１８で収集し、工程２２０で、第３のタンパク質含有画分をタンパク質富化栄養素サプリメントとして得る。
例として、工程２１０の第２のタンパク質含有画分を第３の分画装置（例えば、濾過装置）へ送達し、濾過液のタンパク質含有画分を収集して得、タンパク質富化サプリメントとして使用することができる。別の例としては、第２のタンパク質含有画分を遠心分離にかけ、その後、上清タンパク質含有画分およびペレット状細胞残屑画分を収集する。濾過液のタンパク質含有画分を濾過装置から収集し、タンパク質含有量が約１％～３％、３％～７％、７％～１０％、約１０％～１４％、約１１％～２０％、約２１％～３５％、および約３５％以上のタンパク質富化栄養素サプリメントとして製造する。

【0061】

一実施形態において、工程１６０、１６５、２１２、２２０から得られた１つまたは複数のタンパク質含有画分を脱水室へ送達し、その後、脱水したタンパク質含有画分を収集し、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造する。あるいは、２つまたは複数の脱水室を設け、各工程から得られた各タンパク質含有画分を、個別の脱水室へ送達する。脱水室は、タンパク質含有画分を受け取り、乾燥して低水分のペースト形態または乾燥粉末形態にし、ヒトへの摂取および／または動物供給原料用のタンパク質富化栄養素サプリメントに混入させる準備が整う。脱水室の好適な例としては、これらに限定されないが、オーブン乾燥機、噴霧乾燥室、ドラム乾燥機、およびフリーズドライヤー、凍結乾燥装置、真空乾燥機、およびこれらの組合せが挙げられる。

【0062】

一実施形態において、本発明は、嫌気性細菌を使用する発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを製造する方法である。方法は、発酵容器中で嫌気性細菌によってガス状基質を発酵させることと、発酵容器から、第１の濃度の嫌気性細菌の細胞を含有する発酵液のある程度の量を得、発酵液からの嫌気性細菌の細胞を、細胞非含有浸透液と第２の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離することと、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊してホモジネートを得ることと、ホモジネート中の細胞残屑画分から第１のタンパク質含有画分を分離することと、を含む。

【0063】

一態様において、方法は、発酵容器中で嫌気性細菌によってガス状基質を発酵させることを含む。ガス状基質は、発酵容器中へ流れる１種または複数のガスのＣＯ含有ガス状基質である。使用する１種または複数のガスは、炭素源基質、一酸化炭素（ＣＯ）、二酸化炭素（ＣＯ２）、水素（Ｈ₂）ガス、合成ガス、およびこれらの組合せからなる群から選択される。嫌気性細菌としては、これらに限定されないが、１種または複数の酢酸生成細菌株（クロストリジウム・アセトバクテリウム属など）およびこれらの類似の変異株が挙げられる。発酵容器は、クロストリジウム細菌を培養するのに快適な環境を提供するものであり、この発酵容器中へ発酵培地が流入して、栄養素、ビタミン、および他の必須ミネラルを細菌に供給する発酵培地がある。
方法は、発酵容器から、第１の細胞濃度の嫌気性細菌の細胞を含有する発酵液のある程度の量を得ることをさらに含む。発酵液の集合体を、細菌発酵系中の１つまたは複数の装置へ送達することができる。一態様において、後続して操作された量の発酵液は、第２、第３、および第４の細胞濃度である。大部分の態様において、第２の細胞濃度の操作発酵液は、第１の細胞濃度の第１の発酵液より高濃度である。

【0064】

方法は、嫌気性細菌細胞を含有する発酵液のある程度の量を受け取る第１の細胞セパレータを含む。第１の細胞セパレータは、発酵液を、嫌気性細菌細胞を含有する第１の細胞含有懸濁液と第１の細胞非含有浸透液とに分離する。第１の細胞セパレータへ送達された発酵液は、第１の細胞濃度を有する。第１の細胞セパレータによって生成された第１の細胞含有懸濁液は、第２の細胞濃度を有する。第２の細胞濃度の第１の細胞含有懸濁液は、第１の細胞濃度の発酵液より高濃度である。第１の細胞非含有浸透液を、第１の細胞セパレータに接続された加工室へ送達する。いくつかの態様において、一部の第１の細胞含有懸濁液を発酵容器へ送り戻す。
別の態様において、エタノール製造のためのさらなる加工のために、第１の発酵液の第１の流れを第１の細胞セパレータへ送達する。タンパク質富化栄養素サプリメントとして使用可能なタンパク質含有生成物を製造するためのさらなる加工のために、第２の発酵液の第２の流れを第２の細胞セパレータへ送達する。
本発明の方法は、発酵プロセスで使用する細菌細胞中の有用な部分に再度目的を持たすと同時に、高い生産力のエタノール製造を実現する同時手法を提供する。収集した発酵液は、第１の濃度の嫌気性細胞細菌である。細胞セパレータは、第２の濃度の嫌気性細胞を含む細胞含有懸濁液を生成する。一実施形態において、細胞セパレータは、第２の濃度の細胞含有懸濁液を破壊装置へ送達する。別の実施形態では、細胞セパレータは、細胞含有懸濁液を保持タンクへ送達する。

【0065】

収集したら、集合体をさらに加工して、発酵液の嫌気性細菌の細胞を、細胞非含有浸透液と、第２の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離することができる。第２の濃度の細胞含有懸濁液は、第１の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する発酵液より高濃度である。細胞非含有浸透液を加工室へ送り戻し、そこでエタノール製造のためにエタノールを蒸留する。これは、依然として有用なエタノール含有の細胞非含有浸透液を廃棄しない効率的な系を提供する。
方法は、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊してホモジネートを得ることをさらに含む。一態様において、これは、破壊装置で行われる。嫌気性細菌の細胞を含有する細胞含有懸濁液が破壊装置に入り、そこで、細胞含有懸濁液は、強力な力（例えば、機械的、音、または圧力）を受ける。高剪断力が細胞含有懸濁液に入ると、細胞の細胞膜を破壊し、細胞を切り開かせ、細胞の中身を浮遊させる。破壊装置は、ホモジネートを生成し、このホモジネートをさらに加工して第１のタンパク質含有画分を得る。ホモジネートは、タンパク質、金属（例えば、Ｃａ、Ｃｌ、Ｃｏ、Ｋ、Ｍｇ、Ｎｉ、Ｐ、Ｓ、Ｓｅ、Ｗ、Ｚｎ、Ｎａ、Ｆｅ）、脂質、核酸、および糖を含めた発酵由来細菌細胞中に一般に存在するいくつかの部分を含有する。

【0066】

第１のタンパク質含有画分を得るために、方法は、ホモジネート中の細胞残屑画分から第１のタンパク質含有画分を分離することをさらに含む。一態様において、ホモジネートを遠心分離し、次いで濾過して、第１のタンパク質含有画分を得る。第１のタンパク質含有画分を第１の分画装置へ送達し、第１のタンパク質含有画分から第２のタンパク質含有画分を分離し、第２のタンパク質含有画分を第１の分画装置から収集させる。
一態様において、方法は、ホモジネートの細胞残屑画分から分離した第１のタンパク質含有画分を脱水することを含む。この態様において、系は、第１の分画装置に接続された脱水室を有する。第１の分画装置は、第１のタンパク質含有画分を脱水室へ送達し、脱水室が、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造される乾燥タンパク質含有画分を生成する。

【0067】

別の態様において、方法は、ホモジネートの細胞残屑画分を脱水することを含む。この態様において、破壊装置は、細胞残屑画分を脱水室へ送達して、さらなる下流加工の準備を整える。細胞残屑画分は、高レベルのタンパク質含有量を含む不溶性画分である。典型的には、これには、不溶性の細胞壁または細胞膜成分が含まれる。また、低濃度の核酸またはタンパク質凝集体も含有し得る。大部分の態様において、大部分の核酸は、第１のタンパク質含有画分中に放出される。場合によっては、これらのタンパク質凝集体は、可溶化するのが困難であり、細胞残屑画分中に残留する。第１のタンパク質含有画分および細胞残屑画分中のタンパク質含有量の決定は、全細胞集団およびタンパク質の量、可溶性および不溶性を中心とした質量平衡の仮定に基づく。例として、不溶性タンパク質回収の計算は、全細胞集団から可溶性タンパク質の集団を引いて、不溶性集団の近似値を求めることを含む。

【0068】

ＩＩ．酢酸生成バイオマスを加工して発酵由来タンパク質を生成するための細菌発酵系
細菌発酵系は、これらに限定されないが、ｐＨ調整剤を系に送達するための１つまたは複数の入口ライン、細菌発酵容器、１つまたは複数の破壊装置、１つまたは複数の細胞セパレータ、および１つまたは複数の分画装置を含む。加えて、得られたタンパク質含有画分のタンパク質濃度を増加し、その水分を減少させるために、１つまたは複数の脱水室が１つまたは複数の破壊装置および／または１つまたは複数の分画装置に接続されている。細菌発酵系は、細菌細胞または細胞含有懸濁液を保持するための１つまたは複数の保持タンク、貯蔵室、および／または前処理室をさらに含んでもよい。
図３Ａ～３Ｂ、４Ａ～４Ｈ、５Ａ～５Ｅ、および６は、嫌気性細菌の培養物を使用した発酵プロセスから細胞含有懸濁液および１種または複数の含酸素炭化水素質化合物を製造するための例示的な細菌発酵系を示している。図３Ａは、２つの細胞セパレータおよび１つの脱水室を使用した、細胞含有懸濁液および１種または複数の含酸素炭化水素質化合物を製造するための細菌発酵系３００Ａの概略図である。
図３Ａ中、細菌発酵系３００Ａは、発酵容器３１０、細胞セパレータ３２０、細胞セパレータ３３０、加工室３５０、および任意の脱水室３７５を含む。一実施形態において、細菌発酵系３００Ａは、連続細菌発酵系であってもよい。あるいは、細菌発酵系３００Ａは、回分細菌発酵系であってもよい。

【0069】

２つ以上の入口ライン、例えば入口ライン３０２および入口ライン３０４が、発酵容器３１０に接続されている。入口ライン３０２は、ガス状基質、追加のサプリメント、および／または他の固体もしくは液体基質を発酵容器３１０に送達するために使用することができる。入口ライン３０４は、発酵培地または他の培地を発酵容器３１０に送達するために使用することができる。ガス状基質および発酵培地の変換は、発酵容器３１０中で生じる。本明細書で使用する発酵培地は、選択された嫌気性細菌を増殖させるために十分なビタミン、塩、およびミネラルを含有する従来の細菌増殖培地を含む。ビタミンカクテルの形態のビタミンが、発酵培地内に添加される。ビタミンは、チアミン（Ｂ１）、パントテン酸（Ｂ５）、ビオチン（Ｂ７）、他のアミノ酸およびこれらの組合せを含むが、これらに限定されない、ビタミンＢ群のいくつかを含む。

【0070】

発酵容器３１０内で、ガス状基質および発酵培地を、発酵容器３１０中に含まれる嫌気性細菌によって、第１の濃度の嫌気性細菌の細胞を含有する発酵液体ブロスに発酵させる。次いで、出口ライン３１４によって細菌発酵系３００Ａから反応器のガスを排出させる。発酵容器３１０は、嫌気性細菌によってガス状基質を発酵させる環境を提供する。一態様において、ガス状基質は、炭素源基質、一酸化炭素（ＣＯ）、二酸化炭素（ＣＯ２）、水素ガス（Ｈ₂）、および合成ガスからなる１種または複数のガスであるが、嫌気性細菌は、クロストリジウム属、アセトバクテリウム属、およびそれらの変異体から選択される１種または複数の嫌気性細菌である。

【0071】

発酵容器３１０は、３つ以上の出口ライン、例えば出口ライン３１４、出口ライン３１６、および出口ライン３１２を含んでもよい。出口ライン３１４は、発酵容器３１０から抜かれるガス、排出ガス、余分なガスの送達に使用することができる。出口ライン３１２は、細菌発酵系３００Ａから出た発酵液体ブロスの一部を細胞セパレータ３２０に送達するために使用することができる。出口ライン３１６は、細菌発酵系３００Ａから出た発酵液体ブロスの一部を細胞セパレータ３３０に送達するために使用することができる。発酵容器３１０からの発酵液体ブロスの一部を、出口ライン３１２および出口ライン３１６によってそれぞれ細胞セパレータ３２０および細胞セパレータ３３０に送達し供給する。細胞セパレータ３２０および細胞セパレータ３３０のそれぞれの内部で、発酵液体ブロス（第１の濃度の細菌細胞を含有する）に含まれる嫌気性細菌の細胞を、細胞非含有浸透液と、保持液（例えば、第２の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液）とに分離する。

【0072】

出口ライン３２２および出口３３２は、細胞セパレータ３２０および細胞セパレータ３３０それぞれから細胞非含有浸透液を排出させ、加工室３５０へ送達するために使用される。加工室３５０内で、細胞非含有浸透液を加工して、含酸素炭化水素質化合物を生成する。加工室３５０は、水を含めた蒸留水分を、出口ライン３５４に通して発酵容器３１０へ戻して再利用することもできる。一例では、蒸留液は、主に水を含んでよく、他の内容物も含有してもよい。例えば、一般的な蒸留水流は、９５％の水、約５％の酢酸、および幾分かの他の内容物を含有する。次いで、加工室３５０は、さらなる下流加工のために、出口ライン３５２を通じて含酸素炭化水素質化合物の最終生成物を送り出す。一実施形態において、加工室３５０は、細胞非含有浸透液を加工し、蒸留して高品質の含酸素炭化水素質化合物（例えば、高濃度および／または無水形態のエタノール、ブタノール、例えば９５％ｗ／ｗまたはさらに高濃度のエタノールなど）を得る蒸留室である。

【0073】

細胞セパレータ３２０を通過した後に得られる細胞含有懸濁液は、細胞再利用のために、出口ライン３２４を介して送達して発酵容器３１０に戻すことができ、それによって細胞含有懸濁液中の細胞は、さらなる発酵プロセスを経ることができる。一方、細胞セパレータ３３０を通過した後に得られる細胞含有懸濁液は、細胞セパレータ３３０によって濃縮し、出口ライン３３６を介して脱水室３７５に送達して混合物へと破断させ、乾燥することができる。脱水室３７５は、オーブン乾燥機、パドル乾燥機、噴霧乾燥装置、ドラム乾燥機、凍結乾燥装置、およびこれらの組合せであってもよい。次いで、細胞セパレータ３３０中の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液の一部を、さらなる発酵プロセスのために、出口ライン３３４を介して送達して発酵容器３１０に戻す。

【0074】

タンパク質富化サプリメントを得るための細胞含有懸濁液の加工の一例としては、高温加工室内、例えば噴霧乾燥脱水室内で摂氏約１００℃以上（例えば、摂氏２５０℃以上）の高温に細胞懸濁液をさらし、細胞を破壊して、細胞含有懸濁液の水分を減少させてペーストまたは粉末の形態にするものがある。細胞含有懸濁液の加工の別の例としては、低温加工室内で摂氏約０℃以下の温度に細胞懸濁液をさらすものがある。
出口ライン３７６が脱水室３７５に接続され、脱水室３７５から排出された破壊および脱水形態の細胞含有懸濁液を送達し、タンパク質富化サプリメントの組成物にブレンドされる状態にする。脱水室３７５中で脱水プロセスを経た後、タンパク質富化栄養素サプリメントが得られ、出口ライン３７６を介して細菌発酵系３００Ａから収集される。

【0075】

図３Ｂは、２つの細胞セパレータ、１つの保持タンクおよび１つの脱水室を使用した、細胞含有懸濁液および１種または複数の含酸素炭化水素質化合物を製造するための細菌発酵系３００Ｂの概略図である。図３Ｂ中、上で考察されるように、細菌発酵系３００Ｂは、入口ライン３０２に接続された発酵容器３１０、入口ライン３０４およびいくつかの出口ライン、出口ライン３１２、出口ライン３２２、および出口ライン３２４に接続された細胞セパレータ３２０、出口ライン３１６および出口ライン３３６に接続された細胞セパレータ３３０、ならびに出口ライン３３６および出口ライン３７６に接続された脱水室３７５を含む。

【0076】

加えて、細菌発酵系３００Ｂは、一部の細胞非含有浸透液を保持および貯蔵するための保持タンクまたは貯蔵タンクをさらに含む。例えば、保持タンク３４０（例えば、細胞非含有浸透液保持タンク）は、それぞれ出口ライン３２２および出口ライン３３２を介して細胞セパレータ３２０および細胞セパレータ３３０に接続されている。細胞セパレータ３２０および細胞セパレータ３３０による細胞の分離後に得られた細胞非含有浸透液を、保持タンク３４０中に保持された細胞非含有浸透液を加工して高品質の形態の含酸素炭化水素質化合物の最終生成物を得る準備として、前処理または大量貯蔵することができる。一実施形態において、保持タンク３４０から出口ライン３４２を介して送達された細胞非含有浸透液を、加工室３５０内でさらに加工してエタノールを製造する。その後、加工された含酸素炭化水素質化合物の最終生成物を加工室３５０から出口ライン３５２を介して送達して出し、加工室３５０で製造された水、酢酸、栄養素、および他の材料は、出口ライン３５４を介して発酵容器３１０に戻して再利用することができる。
図４Ａは、本発明の１つまたは複数の実施形態による嫌気性細菌の培養物を使用し、細菌発酵からタンパク質富化栄養素サプリメントを得る発酵プロセスのための、ｐＨ調整剤を発酵プロセスに送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの破壊装置、１つの分画装置、および２つの脱水室を有する、細菌発酵系４００Ａの概略図を示す。細菌発酵系４００Ａは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５Ａ、脱水室４７５Ｂ、出口ライン４７６Ａ、および出口ライン４７６Ｂを含む。

【0077】

細菌発酵系４００Ａは、一実施形態において、連続細菌発酵系であってもよい。まず、発酵培地の流れを、入口ライン４０２によって細菌発酵系４００Ａに供給する。次に、ガス状基質の流れを、入口ライン４０４によって細菌発酵系４００Ａに供給する。次いでガス状基質および発酵培地の流れが、嫌気性細菌を培養する発酵容器４１０に入る。発酵容器４１０は、嫌気性細菌によってガス状基質を発酵させる環境を提供する。ガス状基質および発酵培地の変換は、発酵容器４１０内で生じる。発酵容器４１０内で、ガス状基質および発酵培地の発酵が、発酵容器中に含まれる嫌気性細菌によって促進されて、第１の濃度の嫌気性細菌の細胞を含有する発酵液体ブロスが生成される。次いで未反応の反応性ガスが放出され、細菌容器４１０から出口ライン４１４によって排出される。

【0078】

さらに、出口ライン４１２によって発酵液体ブロスを細胞セパレータ４２０に送達して供給する。細胞セパレータ４２０内で、発酵液体ブロス中に含まれる嫌気性細菌の細胞を、細胞非含有浸透液と、第２の濃度の細胞含有嫌気性細菌細胞とに分離する。次いで、細胞セパレータ４２０中の細胞非含有浸透液を、出口ライン４２２を介して加工室４５０へ送達する。次いで細胞セパレータ４２０中のある程度の量の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液は、出口ライン４２４を介して発酵容器４１０に送達して戻され、さらなる発酵プロセスを経る。細胞セパレータ４２０中の別の量の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液は、出口ライン４２６を介して破壊装置４６０へ送達する。

【0079】

一実施形態において、発酵系４００Ａは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、細胞セパレータ４２０から排出された嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液のｐＨ値を調整するための、出口ライン４２６に接続された入口ライン４０６Ａをさらに含む。ｐＨ調整剤による細胞の処理により、細胞膜が、細菌細胞の機械的破砕の影響をより受けやすくなる。このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入るときに行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０によって破壊された後に行ってもよく、嫌気性細菌細胞を含有するホモジネートが、１種または複数のｐＨ調整剤で処理される。

【0080】

一実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。一実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を５に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を６に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を７に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を８に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を９に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を１０に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を１１に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を１２に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液のｐＨ値を５～１２の間の任意の値に調整することができる。
加工室４５０内で、細胞非含有浸透液を加工して含酸素炭化水素質化合物を得る。加工室４５０はまた、出口ライン４５４を介して発酵容器４１０に水を戻して再利用する。加工室４５０は、出口ライン４５２を通じて合計で９５％のエタノールをさらなる下流加工のために送り出す。

【0081】

破壊装置４６０内で、細胞含有懸濁液中に含まれる嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊してホモジネートを生成する。ホモジネートを出口ライン４６２に通して分画装置４７０へ送達する。一態様において、出口ライン４７４は、分画装置４７０に接続され、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造される第１のタンパク質含有画分を送達する。出口ライン４７２は、分画装置４７０に接続され、細胞残屑画分を、さらなる下流加工のための別の装置に流入させる。別の態様において、１つまたは複数のタンパク質含有画分は、１つまたは複数の分画装置を経て不要な不純物および残屑を除去した後、再度合わせ、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造する。

【0082】

本明細書で使用できる例示的な破壊装置としては、これらに限定されないが、マイクロ流体装置、超音波処理装置、超音波装置、機械的破砕装置、フレンチプレス、冷凍器、加熱器、低温殺菌装置、熱交換器、蒸留塔、プロセスの流れおよび保持タンクの温度を上昇させる装置、紫外線殺菌装置、ガンマ線殺菌装置、反応器、ホモジナイザー、およびこれらの組合せが挙げられる。
破壊装置４６０の一例としては、細菌性微生物の細胞膜および細胞壁の構造に不可逆変化をもたらし、細菌細胞の内容物のさらなる操作を可能にする装置がある。細菌細胞の内容物は、核酸、アミノ酸、タンパク質、グリコーゲン、顔料、脂肪滴、結晶、および他の栄養素（種々の形態の炭素、窒素、硫黄、カルシウムなど）を含む。

【0083】

一態様において、破壊装置４６０は、強力な力を用いて嫌気性細菌細胞の細胞膜を破壊することによって細胞を壊して開ける。細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞に、音、圧力、または機械的手段などによって高い剪断力を加える。本発明では、方法は、第２の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を破壊装置４６０へ送ることを含む。破壊装置４６０は、強力な力（例えば、機械的、音、圧力）で細胞の細胞膜を破壊することによって細胞を壊して開け、細菌細胞が破壊された状態下、細菌細胞中の有用な部分（例えば、タンパク質）に対してより容易にアクセスすることができる中で、ホモジネートを生成する。あるいは、方法は、ホモジネートを第１の分画装置に送達する前に、ホモジネートを第２の破壊装置に送達することを含む。第２の破壊装置は、ホモジネートの細胞をさらに破壊し、その後、タンパク質富化栄養素サプリメントが製造される。
例として、破壊装置４６０は、マイクロ流体装置である。マイクロ流体装置は、これらに限定されないが、反応室、管、ポンプ、フランジ管、リング、ガスケット、高圧逆止め弁を含む。マイクロ流体装置の反応室は、セラミック反応室、耐摩耗室、スプール反応室であってもよく、シングルスロット付き、マルチスロット付きであり、マイクロチャネリングを有する。

【0084】

別の例として、破壊装置４６０は、酵素処理装置である。さらに別の例として、破壊装置は、超音波装置である。超音波装置は、超音波プローブまたは超音波浴である。超音波装置は、高周波音波を使用して細胞を撹拌および破壊することによって、細胞を剪断する。さらに別の例として、破壊装置は、凍結装置である。凍結装置は、凍結および解凍サイクルを有し、細菌細胞は、複数回の凍結－解凍サイクルに入り、細胞は、バッファー中で凍結し、次いで解凍する。さらに別の例として、破壊装置は、機械的破壊装置である。機械的破壊装置は、細菌細胞の細胞壁および／または細胞膜を分解するための機械的ブレードまたはビーズを含む。

【0085】

別の代替の実施形態において、発酵系４００Ａは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、破壊装置４６０中の嫌気性細菌細胞のｐＨ値を調整するために、破壊装置４６０に接続された入口ライン４０６Ｂをさらに含む。一実施形態において、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態において、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、破壊装置４６０中で、５～１２の間の任意の値に調整することができる。

【0086】

別の代替の実施形態において、発酵系４００Ａは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊されたホモジネートのｐＨ値を調整するために、出口ライン４６２に接続された入口ライン４０６Ｃをさらに含む。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前の発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、５に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、６に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、７に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、８に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、９に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、１０に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、１１に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、１２に調整することができる。別の実施形態において、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、５～１２の間の任意の値に調整することができる。

【0087】

入口ライン４０６Ａ、４０６Ｂ、および４０６Ｃを介して系に送達することができるｐＨ調整剤としては、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素および溶液のｐＨ値を上下させるために使用することができる任意の助剤が挙げられる。

【0088】

次いで分画装置４７０内で、ホモジネートを、第１のタンパク質含有画分と、タンパク質含有細胞残屑画分とに分画する。次に、第１のタンパク質含有細胞残屑画分を、出口ライン４７２を介して脱水室４７５Ａへ送達する。次いで、第１のタンパク質含有画分を、出口ライン４７４を介して脱水室４７５Ｂへ送達する。例示的な分画装置には、これらに限定されないが、様々なタイプの固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが挙げられる。
脱水室４７５Ａおよび脱水室４７５Ｂ中で行われる脱水プロセスの後、タンパク質富化栄養素サプリメントを得ることができ、脱水室４７５Ａおよび脱水室４７５Ｂそれぞれから、出口ライン４７６Ａおよび４７６Ｂの両方を介して収集することができる。

【0089】

図４Ｂは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、２つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｂの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｂは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、出口ライン４１６、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、出口ライン４２６、細胞セパレータ４３０、出口ライン４３２、出口ライン４３４、出口ライン４３６、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５、出口ライン４７６、分画装置４８０、出口ライン４８２、出口ライン４８４、脱水室４８５Ａ、出口ライン４８６Ａ、脱水室４８５Ｂ、および出口ライン４８６Ｂを含む。

【0090】

一態様において、細胞セパレータ４３０は、細胞濃縮機である。本発明では、方法は、発酵容器から、第１の濃度の嫌気性細菌の細胞を含有する発酵液体ブロスをある程度の量を収集することを含む。この収集物は、発酵容器４１０を接続する出口ライン４１６を通して細胞セパレータ４３０へ送達される。細胞セパレータ４３０中で、発酵液体ブロスを、細胞非含有浸透液と、第１の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離し、第２の濃度（例えば、発酵液体ブロスの第１の濃度より高い高濃度の細胞）に濃縮する。細胞非含有浸透液を、加工室４５０と細胞セパレータ４３０を接続する出口ライン４３２に通して加工室４５０へ送達する。第２の濃度の細胞を含有する細胞含有懸濁液を、破壊装置４６０と細胞セパレータ４３０を接続する出口ライン４３６に通して破壊装置４６０へ送達する。

【0091】

一実施形態において、発酵系４００Ｂは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、細胞セパレータ４３０から送り出される嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液のｐＨ値を調整するための出口ライン４３６に接続された入口ライン４０６Ａをさらに含む。細胞をｐＨ調整剤で処理すると、細胞膜が、細菌細胞の機械的破砕の影響を受けやすくなる。このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る際の間行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０によって破壊された後に行うことができ、嫌気性細菌細胞を含有するホモジネートは、１種または複数のｐＨ調整剤で処理される。
一実施形態において、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、５、６、７、８、９、１０、１１および１２などの値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、５～１２の間の任意の値に調整することができる。

【0092】

別の代替の実施形態において、発酵系４００Ｂは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、破壊装置４６０中で嫌気性細菌細胞のｐＨ値を調整するために破壊装置４６０に接続された入口ライン４０６Ｂをさらに含む。一実施形態において、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、破壊装置４６０中で、５、６、７、８、９、１０、１１および１２などの値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、破壊装置４６０中で、５～１２の間の任意の値に調整することができる。

【0093】

一態様において、破壊装置４６０によって加工した後、ホモジネートを分画装置４７０へ送達して、タンパク質含有画分と細胞残屑画分とに分離する。分画装置４７０は、出口ライン４６２を介して破壊装置４６０に接続されている。分画装置４７０は、少なくとも２つの出口ラインを有し、出口ライン４７２は、細胞残屑画分を送達するために使用され、第２の出口ライン４７４は、タンパク質含有画分を送達するために使用される。

【0094】

別の代替の実施形態において、発酵系４００Ｂは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊されたホモジネートのｐＨ値を調整するために出口ライン４６２に接続された入口ライン４０６Ｃをさらに含む。一実施形態において、ホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態では、ホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、５、６、７、８、９、１０、１１および１２などの値に調整することができる。別の実施形態では、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有溶液から破壊された後のホモジネートのｐＨ値を、ホモジネートが分画装置４７０に入る前に、５～１２の間の任意の値に調整することができる。
入口ライン４０６Ａ、４０６Ｂ、および４０６Ｃを介して系へ送達することができるｐＨ調整剤には、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素および溶液のｐＨ値を上下させるように設定できる任意の助剤が挙げられる。

【0095】

一態様において、第１のタンパク質含有画分を分画装置４８０へ送達し、第１のタンパク質含有画分から第２のタンパク質含有画分をさらに分離する。分画装置４８０は、出口４７４を介して分画装置４７０に接続されている。分画装置４８０は、少なくとも２つの出口を有し、第１の出口４８２から細胞残屑が流れ、第２の出口４８４から第２のタンパク質含有画分が流れる。方法は、第２の分画装置から第２のタンパク質含有画分を収集することをさらに含む。さらに別の態様において、２つ以上の分画装置が設けられる。さらに別の態様において、本発明に使用される細菌発酵系の中に１つの分画装置のみが存在し、その分画装置から第１のタンパク質含有画分が収集される。例示的な分画装置としては、これらに限定されないが、様々なタイプの固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが挙げられる。

【0096】

図４Ｃは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、１つの分画装置、および２つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｃの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｃは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、出口ライン４２６、細胞非含有保持タンク４４０、出口ライン４４２、出口ライン４４４、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５Ａ、出口ライン４７６Ａ、脱水室４７５Ｂ、および出口ライン４７６Ｂを含む。

【0097】

図４Ｄは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｄの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｄは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、出口ライン４２６、細胞非含有保持タンク４４０、出口ライン４４２、出口ライン４４４、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５、出口ライン４７６、分画装置４８０、出口ライン４８２、出口ライン４８４、脱水室４８５Ａ、出口ライン４８６Ａ、脱水室４８５Ｂ、および出口ライン４８６Ｂを含む。

【0098】

図４Ｅは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｅの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｅは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、細胞セパレータ４３０、出口ライン４３２、出口ライン４３６、細胞非含有保持タンク４４０、出口ライン４４２、出口ライン４４４、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５、出口ライン４７６、分画装置４８０、出口ライン４８２、出口ライン４８４、脱水室４８５Ａ、出口ライン４８６Ａ、脱水室４８５Ｂ、および出口ライン４８６Ｂを含む。

【0099】

図４Ｆは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｆの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｆは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、入口ライン４０６Ｄ、入口ライン４０６Ｅ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、出口ライン４２６、細胞非含有保持タンク４４０、出口ライン４４２、出口ライン４４４、細胞含有保持タンク４４５、出口ライン４４６、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５、出口ライン４７６、分画装置４８０、出口ライン４８２、出口ライン４８４、脱水室４８５Ａ、出口ライン４８６Ａ、脱水室４８５Ｂ、および出口ライン４８６Ｂを含む。

【0100】

一実施形態において、発酵系４００Ｆは、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達し、細胞セパレータ４２０から送り出された嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液のｐＨ値を調整するために出口ライン４２６に接続された入口ライン４０６Ｄを含む。細胞をｐＨ調整剤で処理すると、細胞膜が、細菌細胞の機械的破砕の影響を受けやすくなる。このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク４４５に入る前に行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク４４５に入る際の間行うことができる。あるいは、このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る際の間、または細胞含有懸濁液が破壊装置４６０によって破壊され、嫌気性細菌細胞を含有するホモジネートが、１種もしくは複数のｐＨ調整剤で処理された後に行うことができる。
一実施形態において、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク４４５に入る前に、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、５、６、７、８、９、１０、１１および１２などの値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に、５～１２の間の任意の値に調整することができる。

【0101】

一態様において、細菌発酵系４００Ｆは、細菌発酵容器から送達される細菌細胞を収容するための保持タンク（例えば、細胞含有保持タンク４４５）を含む。一実施形態において、保持タンクは、発酵容器から収集される微生物バイオマスの嫌気性細菌細胞を貯蔵する貯蔵容器である。これは、破壊装置４６０に過負担をかけずに、細菌細胞を連続的に細菌発酵容器４１０から収集し、破壊装置４６０へ送達することによって、細菌細胞が発酵容器４１０から破壊装置４６０へ移動するときの隘路問題に関する懸念を軽減する。濃縮細菌細胞の破壊装置４６０への送達速度は、細胞セパレータ／濃縮機から出される発酵液体ブロスの送達速度より遅い速度であってもよい。

【0102】

別の実施形態では、保持タンク（例えば、細胞含有保持タンク４４５）は、細菌細胞が１種または複数の添加剤を受けて破壊効率を増加させる前処理装置として機能する。細胞を添加剤で処理すると、細胞膜は、細菌細胞の機械的破砕の影響をより受けやすくなる。この前処理は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０に入る前に行うことができる。あるいは、前処理は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０によって破壊され、嫌気性細菌細胞を含有するホモジネートを１種または複数の添加剤で処理した後に行うことができる。細胞含有保持タンク４４５の例としては、これらに限定されないが、加工室、タンク、ステンレス製タンク、プラスチック製タンクなどが挙げられる。
細菌発酵系４００Ｆにおいて、細胞を含有する細胞含有懸濁液を、細胞含有保持タンク４４５内で、１種または複数の添加剤で前処理することができる。１種または複数の添加剤、例えば、界面活性剤、洗剤、ＥＤＴＡ、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００、Ｔｗｅｅｎ－２０、ドデシル硫酸ナトリウム、ＣＨＡＰＳ、酵素、プロテアーゼ、リゾチーム、ベンゾナーゼ、ヌクレアーゼ、リボヌクレアーゼ（ＲＮａｓｅ）、デオキシリボヌクレアーゼ（ＤＮａｓｅ）、加水分解誘発剤、ｐＨ調整剤、およびこれらの組合せは、入口ライン４０６Ｅを介して細胞含有保持タンク４４５に添加することができる。ｐＨ調整剤としての添加剤の別の例には、塩化水素がある。

【0103】

一実施形態において、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有保持タンク４４５中で、発酵液体ブロスのｐＨ値より高い値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有保持タンク４４５中で、５、６、７、８、９、１０、１１および１２などの値に調整することができる。別の実施形態では、細胞含有懸濁液のｐＨ値を、細胞含有保持タンク４４５中で、５～１２の間の任意の値に調整することができる。
入口ライン４０６Ａ、４０６Ｂ、４０６Ｃ、４０６Ｄ、および４０６Ｅを介して系に送達することができるｐＨ調整剤には、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素および溶液のｐＨ値を上下させるために使用することができる任意の助剤が挙げられる。

【0104】

一態様において、前処理装置は、発酵容器４１０に接続されている細胞セパレータ／濃縮機（例えば、細胞セパレータ４２０および／または細胞セパレータ４３０）に接続されている。別の態様において、前処理装置は、発酵容器４１０に直接接続され、前処理装置の構成要素は、細胞セパレータおよび濃縮機である。前処理装置は、特定の添加剤を導入して、細菌細胞の細胞膜を、他の破砕技術に対してより影響を受けやすくする、前処理室および入口（例えば、入口ライン４０６）を含む。使用する添加剤のタイプおよび使用する破壊装置のタイプには、細胞の破壊効率を上げるために、いくつもの組合せが可能である。

【0105】

図４Ｇは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｇの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｇは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、入口ライン４０６Ｄ、入口ライン４０６Ｅ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、出口ライン４１６、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、細胞セパレータ４３０、出口ライン４３２、出口ライン４３６、細胞非含有保持タンク４４０、出口ライン４４２、出口ライン４４４、細胞含有保持タンク４４５、出口ライン４４６、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５、出口ライン４７６、分画装置４８０、出口ライン４８２、出口ライン４８４、脱水室４８５Ａ、出口ライン４８６Ａ、脱水室４８５Ｂ、および出口ライン４８６Ｂを含む。

【0106】

図４Ｈは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系４００Ｈの概略図を示す。細菌発酵系４００Ｈは、入口ライン４０２、入口ライン４０４、入口ライン４０６Ａ、入口ライン４０６Ｂ、入口ライン４０６Ｃ、入口ライン４０６Ｄ、入口ライン４０６Ｅ、発酵容器４１０、出口ライン４１２、出口ライン４１４、出口ライン４１６、細胞セパレータ４２０、出口ライン４２２、出口ライン４２４、細胞セパレータ４３０、出口ライン４３２、出口ライン４３６、細胞非含有保持タンク４４０、出口ライン４４２、出口ライン４４４、細胞含有保持タンク４４５、出口ライン４４６、加工室４５０、出口ライン４５２、出口ライン４５４、破壊装置４６０、出口ライン４６２、戻りライン４６４、分画装置４７０、出口ライン４７２、出口ライン４７４、脱水室４７５、出口ライン４７６、分画装置４８０、出口ライン４８２、出口ライン４８４、脱水室４８５Ａ、出口ライン４８６Ａ、脱水室４８５Ｂ、および出口ライン４８６Ｂを含む。

【0107】

特定の実施形態において、細菌発酵系４００Ｈは、１つまたは複数の再循環ラインをさらに含む。一実施形態において、再循環ラインは、破壊装置４６０に接続された戻りライン４６４である。戻りライン４６４は、破壊装置から一部の生成物混合物を取り、破壊装置４６０に再度入る。これによって、複数回の破壊装置４６０を経る通過が可能になり、その結果、破壊量および嫌気性細菌細胞のタンパク質含有ホモジネートのタンパク質濃度が増加し、さらなる加工のために細菌細胞中のタンパク質化合物への十分な到達が確保される。

【0108】

図５Ａは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、１つの分画装置、および２つの脱水室を有する細菌発酵系５００Ａの概略図を示す。細菌発酵系５００Ａは、入口ライン５０２、入口ライン５０４、入口ライン５０６Ａ、入口ライン５０６Ｂ、入口ライン５０６Ｃ、入口ライン５０６Ｄ、入口ライン５０６Ｅ、発酵容器５１０、出口ライン５１２、出口ライン５１４、細胞セパレータ５２０、出口ライン５２２、出口ライン５２４、出口ライン５２６、加工室５５０、出口ライン５５２、出口ライン５５４、細胞含有保持タンク５４５、入口ライン５０６、出口ライン５４２、ミキサー５４８、破壊装置５６０、出口ライン５６２、出口ライン５６４、分画装置５７０、出口ライン５７２、出口ライン５７４、脱水室５７５Ａ、出口ライン５７６Ａ、脱水室５７５Ｂ、および出口ライン５７６Ｂを含む。

【0109】

細胞セパレータ５２０中で、発酵容器５１０からの発酵液体ブロスを、細胞非含有浸透液と、第２の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離する。細胞非含有浸透液を、加工室５５０と細胞セパレータ５２０とを接続する出口ライン５２２に通して加工室５５０へ送達する。第２の濃度の嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を、細胞含有保持タンク５４５と細胞セパレータ５２０とを接続する出口ライン５２６に通して細胞含有保持タンク５４５へ送達する。

【0110】

ホモジネートを送達する破壊装置５６０は、分画装置５７０に接続される。分画装置５７０中で、方法５００Ａは、細胞含有懸濁液を第１のタンパク質含有画分と細胞残屑画分とに分離することを含む。分画装置５７０は、出口５６２を介して破壊装置５６０に接続される。分画装置５７０は、少なくとも２つの出口を有し、第１の出口５７４から細胞残屑画分を流し、第２の出口５７２から第１のタンパク質含有画分を流す。使用する分画装置のタイプとしては、これらに限定されないが、様々なタイプの固液分画装置、遠心分離装置、連続遠心分離装置、デカンター遠心分離装置、ディスクスタック遠心分離装置、濾過装置、中空糸濾過装置、螺旋巻き濾過装置、セラミックフィルター装置、クロスフロー濾過装置、サイズ排除装置、１本または一連のサイズ排除カラム、１本または一連のイオン交換カラム、１本または一連の炭素重合体カラム、流入式磁気分別装置、限外濾過装置、１本または一連の親和性クロマトグラフィーカラム、１本または一連のゲル濾過カラム、およびこれらの組合せが挙げられる。

【0111】

一例において、細菌発酵系５００Ａは、前処理室として機能する細胞含有保持タンク５４５をさらに含む。嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液は、細胞含有保持タンク５４５中で、１種または複数の添加剤で処理される。細胞含有保持タンク５４５は、１種または複数の添加剤（例えば、洗剤、酵素、緩衝剤、ｐＨ調整剤など）を供給する入口ライン５０６Ｅに接続されている。入口５０６Ｅは、通常は締められており、必要な場合に開くことができる。細胞含有保持タンク５４５は、細胞が高い細胞密度（高濃度）に達し、特定の量の細胞含有懸濁液の破壊装置５６０への時限送達を行うように機能できるようになるまで、嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を保持する。
細胞含有保持タンク５４５内のミキサー５４８は、撹拌装置、例えば内部にプロペラを備えた撹拌装置である。破壊装置５６０は、出口ライン５４２を介して細胞含有保持タンク５４５に接続されている。破壊装置５６０は、嫌気性細菌細胞のホモジネートを生成する。細胞含有保持タンク５４５中で特定の期間を経た後、細胞含有懸濁液を破壊装置５６０へ送達する。
一態様において、分画装置５７０は、１つまたは複数のタンパク質含有画分を受け取って乾燥させる、１つまたは複数の脱水室（例えば、脱水室５７５Ａおよび５７５Ｂ）に接続されている。使用される乾燥技法には、乾燥、噴霧乾燥、凍結乾燥などが挙げられる。次いで、タンパク質含有画分をさらに加工し、ブレンドして、タンパク質富化栄養素サプリメントにする。タンパク質含有画分は、タンパク質富化栄養素サプリメントの１０％以上（例えば、１０％～８０％または５０％～９５％）のタンパク質含有量を占め得る。

【0112】

一実施形態において、発酵系５００Ａは、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達し、細胞セパレータ５２０から送り出された嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液のｐＨ値を調整するために出口ライン５２６に接続された入口ライン５０６Ｄを含む。細胞をｐＨ調整剤で処理すると、細胞膜が、細菌細胞の機械的破砕の影響をより受けやすくなる。このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク５４５に入る前に行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク５４５に入る際の間、入口ライン５０６Ｅを介して行うことができる。あるいは、このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置５６０に入る前に入口ライン５０６Ａを介して、細胞含有懸濁液が破壊装置５６０に入る際の間に入口ライン５０６Ｂを介して、または細胞含有懸濁液が破壊装置５６０によって破壊された後に入口ライン５０６Ｃを介して行うことができ、嫌気性細菌細胞を含有するホモジネートは、１種または複数のｐＨ調整剤で処理される。

【0113】

入口ライン５０６Ａ、５０６Ｂ、５０６Ｃ、５０６Ｄおよび５０６Ｅを介して系内へ送達できるｐＨ調整剤としては、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素および溶液のｐＨ値を上下させるのに使用できる任意の助剤が挙げられる。

【0114】

図５Ｂは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの破壊装置、１つの細胞含有保持タンク、１つの分画装置、および２つの脱水室を有する細菌発酵系５００Ｂの概略図を示す。細菌発酵系５００Ｂは、入口ライン５０２、入口ライン５０４、入口ライン５０６Ａ、入口ライン５０６Ｂ、入口ライン５０６Ｃ、入口ライン５０６Ｄ、入口ライン５０６Ｅ、発酵容器５１０、出口ライン５１２、出口ライン５１４、細胞セパレータ５２０、出口ライン５２２、出口ライン５２４、出口ライン５２６、加工室５５０、出口ライン５５２、出口ライン５５４、細胞含有保持タンク５４５、入口ライン５０６、出口ライン５４２、ミキサー５４８、破壊装置５６０、出口ライン５６２、出口ライン５６４、分画装置５８０、出口ライン５８２、出口ライン５８４、脱水室５８５Ａ、出口ライン５８６Ａ、脱水室５８５Ｂ、および出口ライン５８６Ｂを含む。

【0115】

図５Ｃは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系５００Ｃの概略図を示す。細菌発酵系５００Ｃは、入口ライン５０２、入口ライン５０４、入口ライン５０６Ａ、入口ライン５０６Ｂ、入口ライン５０６Ｃ、入口ライン５０６Ｄ、入口ライン５０６Ｅ、発酵容器５１０、出口ライン５１２、出口ライン５１４、細胞セパレータ５２０、出口ライン５２２、出口ライン５２４、出口ライン５２６、加工室５５０、出口ライン５５２、出口ライン５５４、細胞含有保持タンク５４５、入口ライン５０６、ミキサー５４８、出口ライン５４２、破壊装置５６０、出口ライン５６２、出口ライン５６４、分画装置５７０、出口ライン５７２、出口ライン５７４、脱水室５７５、出口ライン５７６、分画装置５９０、出口ライン５９２、出口ライン５９４、脱水室５９５Ａ、出口ライン５９６Ａ、脱水室５９５Ｂ、および出口ライン５９６Ｂを含む。

【0116】

図５Ｄは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、１つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの破壊装置、２つの分画装置、および４つの脱水室を有する細菌発酵系５００Ｄの概略図を示す。細菌発酵系５００Ｄは、入口ライン５０２、入口ライン５０４、入口ライン５０６Ａ、入口ライン５０６Ｂ、入口ライン５０６Ｃ、発酵容器５１０、出口ライン５１２、出口ライン５１４、細胞セパレータ５２０、出口ライン５２２、出口ライン５２４、出口ライン５２６、加工室５５０、出口ライン５５２、出口ライン５５４、破壊装置５６０、出口ライン５６２、出口ライン５６４、分画装置５７０、出口ライン５７２、出口ライン５７４、分画装置５７０、出口ライン５９２Ａ、出口ライン５９４Ａ、分画装置５９０、出口ライン５９２Ｂ、出口ライン５９４Ｂ、脱水室５９５Ａ、出口ライン５９６Ａ、脱水室５９５Ｂ、出口ライン５９６Ｂ、脱水室５９５Ｃ、出口ライン５９６Ｃ、脱水室５９５Ｄ、および出口ライン５９６Ｄを含む。一態様において、破壊装置５６０は、複数回の破壊装置５６０を経る通過を可能にする再循環流ライン（例えば、出口ライン５６４）を有する。

【0117】

図５Ｅは、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、２つの細胞セパレータ、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および３つの脱水室を有する細菌発酵系５００Ｅの概略図を示す。細菌発酵系５００Ｅは、入口ライン５０２、入口ライン５０４、入口ライン５０６Ａ、入口ライン５０６Ｂ、入口ライン５０６Ｃ、入口ライン５０６Ｄ、入口ライン５０６Ｅ、発酵容器５１０、出口ライン５１２、出口ライン５１４、出口ライン５１６、細胞セパレータ５２０、出口ライン５２２、出口ライン５２４、加工室５５０、出口ライン５５２、出口ライン５４４、破壊装置５３０、出口ライン５３２、出口ライン５３４、出口ライン５３６、細胞含有保持タンク５４５、入口ライン５０６、出口ライン５４２、ミキサー５４８、破壊装置５６０、出口ライン５６２、分画装置５７０、出口ライン５７２、出口ライン５７４、脱水室５７５、出口ライン５７６、分画装置５８０、出口ライン５８２、出口ライン５８４、脱水室５８５Ａ、出口ライン５８６Ａ、脱水室５８５Ｂ、および出口ライン５８６Ｂを含む。

【0118】

図６は、細菌発酵プロセスからタンパク質富化栄養素サプリメントを得るための、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達するための１つまたは複数の入口ライン、１つの発酵容器、２つの細胞セパレータ、１つの細胞非含有保持タンク、１つの加工室、１つの細胞含有保持タンク、１つの破壊装置、２つの分画装置、および２つの脱水室を有する細菌発酵系６００の概略図を示す。細菌発酵系６００は、入口ライン６０２、入口ライン６０４、入口ライン６０６Ａ、入口ライン６０６Ｂ、入口ライン６０６Ｃ、入口ライン６０６Ｄ、入口ライン６０６Ｅ、発酵容器６１０、出口ライン６１２、出口ライン６１４、出口ライン６１６、細胞セパレータ６２０、出口ライン６２２、出口ライン６２４、細胞非含有保持タンク６４０、出口ライン６４２、出口ライン６４４、加工室６５０、出口ライン６５２、出口ライン６５４、細胞セパレータ６３０、出口ライン６３２、出口ライン６３６、細胞含有保持タンク６４５、入口ライン６０６、出口ライン６４６、破壊装置６６０、出口ライン６６２、分画装置６７０、出口ライン６７２、出口ライン６７４、脱水室６７５、出口ライン６７６、分画装置６９０、入口ライン６９２、出口ライン６９４、脱水室６９５、および出口ライン６９６を含む。

【0119】

一実施形態において、発酵系６００は、ｐＨ調整剤を発酵系内へ送達し、細胞セパレータ６２０から送り出された嫌気性細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液のｐＨ値を調整するために出口ライン６３６に接続された入口ライン６０６Ｄを含む。細胞をｐＨ調整剤で処理すると、細胞膜が細菌細胞の機械的破砕の影響をより受けやすくなる。このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク６４５に入る前に行うことができる。あるいは、ｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が細胞含有保持タンク６４５に入る際の間、入口ライン６０６Ｅを介して行うことができる。あるいは、このｐＨ調整は、細胞含有懸濁液が破壊装置６６０に入る前に入口ライン６０６Ａを介して、細胞含有懸濁液が破壊装置６６０に入る際の間に入口ライン６０６Ｂを介して、または細胞含有懸濁液が破壊装置６６０によって破壊された後に入口ライン６０６Ｃを介して行うことができ、嫌気性細菌細胞を含有するホモジネートが、１種または複数のｐＨ調整剤で処理される。

【0120】

入口ライン６０６Ａ、６０６Ｂ、６０６Ｃ、６０６Ｄ、および６０６Ｅを介して系内へ送達できるｐＨ調整剤としては、水酸化ナトリウム、水酸化カリウム、水酸化アンモニウム、重炭酸塩、塩酸、硝酸、リン酸、塩化水素および溶液のｐＨ値を上下させるのに使用できる任意の助剤が挙げられる。
一実施形態において、マイクロ流体装置である１つの破壊装置であって、その装置内で、細胞が破壊装置に入り、反応室内で高剪断力を受け、嫌気性細菌の細胞壁および細胞膜が分裂される、１つの破壊装置が存在する。次いで破壊された細菌細胞を、遠心分離、濾過、嫌気性細菌細胞を脱水するための様々な方法（例えば、乾燥、冷凍乾燥、凍結乾燥など）、ブレンド、重金属イオンの除去、栄養素サプリメントとしての摂取可能な物質中への取込み、またはこれらの組合せによってさらに加工する。

【0121】

別の実施形態において、細菌発酵系は、２つ以上の破壊装置を有する。第１の破壊装置はまた、発酵液から分離した細胞含有懸濁液中の細菌細胞を保持する保持タンクまたは貯蔵容器にもなり得る。前処理装置である第１の破壊装置が存在し、細胞含有懸濁液が、第１の破壊装置に入り、添加剤で処理されて破壊効率が増強される。使用する添加剤としては、これらに限定されないが、１種または複数の洗剤、酵素、化学物質、またはこれらの組合せが挙げられる。マイクロ流体装置である第２の破壊装置が存在し、細胞が第２の破壊装置に入り、反応室内で高剪断力を受ける。細胞含有懸濁液は、マイクロチャネリングを通して押し出され、それによって細菌細胞の細胞壁および細胞膜が破壊して開かれ、細菌細胞の中身が、発酵液中を浮遊するようになる。これは、第１のタンパク質集合体の回収を可能にし、遠心分離、濾過、脱水などによってさらに操作することができる。

【0122】

ＩＩＩ．発酵由来タンパク質を含む栄養素サプリメントの組成物
本明細書に記載の細菌発酵系から回収された１つまたは複数のタンパク質含有画分に、供給原料組成物との直接のブレンド、乾燥、沈降、濾過、限外濾過、精密濾過、真空濾過、遠心分離、連続遠心分離、冷凍乾燥、凍結、加水分解、およびこれらの組合せを行い、非常に純粋な形態のタンパク質をより高いタンパク質濃度で生成して得ることができる。微生物バイオマスが加水分解される態様において、加水分解は、熱処理、酸加水分解、酵素加水分解、アルカリ加水分解、およびこれらの組合せによって実施することができる。

【0123】

方法の一実施形態において、第１のタンパク質含有画分を、タンパク質富化栄養素サプリメントとして製造する。第１のタンパク質含有画分は、６０％～８０％のタンパク質含有量を占める。別の態様では、第１のタンパク質含有画分は、４０％～６０％のタンパク質含有量を占める。さらに別の態様では、第１のタンパク質含有画分は、１０％～４０％のタンパク質含有量を占める。
一実施形態において、本発明は、タンパク質富化栄養素サプリメントである組成物を提供する。この組成物は、酢酸生成細菌培養物を使用する発酵プロセスから生成される。この組成物は、ホモジネートの細胞残屑画分から分離されるタンパク質含有画分を含み、該ホモジネートは、酢酸生成細菌培養物の細胞を含有する細胞含有懸濁液を破壊して得られ、細胞含有懸濁液は、酢酸生成細菌培養物を使用してガス状基質を発酵させる間、発酵容器から送り出される発酵液から得られる。

【0124】

一態様において、酢酸生成細菌培養物は、クロストリジウム菌、アセトバクテリウム菌、およびこれらの組合せからなる群から選択される。発酵されたガス状基質は、炭素源基質、一酸化炭素（ＣＯ）、二酸化炭素（ＣＯ２）、水素（Ｈ₂）ガス、合成ガス、およびこれらの組合せからなる群から選択される１種または複数のガスを含む。
別の態様において、組成物のタンパク質含有画分は、組成物の約１０％～約８０％の含有量のタンパク質、組成物の約５％～約３５％の含有量の炭水化物、および組成物の約５％～約１５％の含有量の核酸を含む。タンパク質含有画中のタンパク質含有量は、タンパク質含有画分中の炭水化物含有量より多い。さらに別の態様では、核酸含有量は、組成物の２％を超えない。これは、ヒトおよび動物などが摂取可能な組成物である。
別の実施形態において、タンパク質富化栄養素サプリメントの組成物は、ホモジネートの第１の量のタンパク質含有画分と第２の量の細胞残屑画分から分離された精製タンパク質産物を含み、該ホモジネートは、酢酸生成細菌培養物の細胞を含有する細胞含有懸濁液を破壊して得られ、該細胞含有懸濁液は、酢酸生成細菌培養物を使用したガス状基質の発酵中に発酵容器から送り出された発酵液から得られる。細胞残屑画分は、細胞壁粒子、細胞膜粒子、タンパク質凝集体、封入体、核酸、および嫌気性細菌細胞の他の成分を含む。発酵容器から送り出された発酵液体ブロスを、細胞非含有浸透液と、酢酸生成細菌培養物の細胞を含有する細胞含有懸濁液とに分離する。一態様において、部分的に精製されたタンパク質産物は、２％を超えない含有量で核酸を有する。別の態様では、核酸含有量は８％～１２％以下である。

【0125】

一態様において、組成物は、組成物の約１０％～約８０％のタンパク質含有量、組成物の約５％～約３５％の炭水化物含有量、および組成物の約５％～約１５％の核酸含有量を含む。タンパク質含有画分中のタンパク質含有量は、タンパク質含有画分中の炭水化物含有量より多い。
別の態様において、組成物は、組成物の約１０％～約８０％のタンパク質含有量、組成物の約５％～約３５％の炭水化物含有量、および組成物の２％を超えない核酸含有量を含む。

【0126】

さらに別の実施形態において、細菌発酵容器から除去されたときの供給原料組成物は、乾燥質量基準で、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約２２０ｋｃａｌ以上をもたらし、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約１５グラム以上の炭水化物を含み得る。この態様において、供給原料の炭水化物とタンパク質の質量比は、約１．０以下である。別の態様において、供給原料は、乾燥質量基準で、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約１８ｍｇ以上のカルシウム、細胞集団１００グラム当たり約１５０ｍｇ以上の鉄、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約２５ｍｇ以上のナトリウム、バイオマス１００グラム当たり約１２００ｍｇ以上のカリウム、またはこれらの組合せを含む。供給原料組成物は、必須アミノ酸および可欠アミノ酸の両方を含む。供給原料組成物は、ヌクレオチドも含み得る。

【0127】

一態様において、供給原料組成物は、すべて乾燥質量基準で、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約６０グラム以上、別の態様では、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約６０～約９０グラム、別の態様では、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約６５～約８５グラム、別の態様では、酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約７０～約８０グラムのタンパク質含有量をもたらす。
別の態様において、供給原料組成物は、乾燥酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約２２０ｋｃａｌ以上、別の態様では、約２２０ｋｃａｌ～約４００ｋｃａｌ、別の態様では、約２５０ｋｃａｌ～約３５０ｋｃａｌ、別の態様では、約３００ｋｃａｌ～約３２５ｋｃａｌ、および別の態様では、約２２０ｋｃａｌ～約３００ｋｃａｌをもたらす。

【0128】

別の態様において、供給原料組成物は、乾燥酢酸生成バイオマス１００グラム当たり約１５グラム以上、別の態様では、約１５グラム～約６０グラム、別の態様では、約２０～約４０グラム、別の態様では、約２５～約３５グラム、および別の態様では、約３０～約３５グラムの炭水化物をもたらす。この態様において、供給原料の炭水化物とタンパク質の質量比は、約１．０以下、別の態様では、約０．７５以下、別の態様では、０．５以下、別の態様では、約０．２５以下、および別の態様では、０．１以下である。一態様において、供給原料は、検出可能な炭水化物がなく、タンパク質のみを含む。別の態様では、炭水化物は、エタノールおよび／または水溶性糖類を含み得る。
供給原料組成物は、繊維も含み得る。繊維は、酸性洗剤繊維、中性洗剤繊維、可消化繊維、および／または不消化繊維を含み得る。供給原料組成物は、デンプンも含み得る。さらに別の態様において、供給原料組成物は、カルシウム、鉄、ナトリウムおよびカリウムを以下の量（すべて、乾燥質量基準で、酢酸生成バイオマス１００グラム当たりのｍｇ数で表す）で、すなわち、カルシウム：約１８ｍｇ以上、別の態様では、約２０ｍｇ以上、別の態様では、約２５ｍｇ以上、別の態様では、約３０ｍｇ以上；鉄：約１５０ｍｇ以上、別の態様では、約１７５ｍｇ以上、別の態様では、約２００ｍｇ以上、および別の態様では、約２２５ｍｇ以上；ナトリウム：約２５ｍｇ以上、別の態様では、約３０ｍｇ以上、別の態様では、約３５ｍｇ以上、および別の態様では、約４０ｍｇ以上；カリウム：約１２００ｍｇ以上、別の態様では、約１３００ｍｇ以上、別の態様では、約１４００ｍｇ以上、および別の態様では、約１５００ｍｇ以上で含む。

【0129】

一態様において、供給原料組成物は、僅少な量の金属を含み得る。代替の態様において、供給原料は、特定の所望レベルの金属を含み得る。供給原料中に存在し得るまたは存在し得ない金属の例としては、亜鉛、モリブデン、カドミウム、スカンジウム、チタン、バナジウム、クロム、マンガン、鉄、コバルト、ニッケル、銅、タングステンおよびセレンが挙げられる。

【0130】

別の態様において、酢酸生成バイオマスは、以下のアミノ酸のうちのいずれか１種を、単独でまたは任意の組合せで含み得る（乾燥質量基準で、酢酸生成バイオマス１００グラム当たりのグラム数で表す）：必須アミノ酸含有量：アルギニン：一態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、および別の態様では、約７．０グラム以上；ヒスチジン：一態様では、約１．５グラム以上、別の態様では、約２．０グラム以上、別の態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、および別の態様では、約６．０グラム以上；イソロイシン：一態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、別の態様では、約７．０グラム以上、別の態様では、約８．０グラム以上、および別の態様では、約９．０グラム以上；ロイシン：一態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、別の態様では、約６．５グラム以上、別の態様では、約７．０グラム以上、別の態様では、約８．０グラム以上、および別の態様では、約９．０グラム以上；リジン：一態様では、約６．０グラム以上、別の態様では、約６．５グラム以上、別の態様では、約７．０グラム以上、別の態様では、約７．５グラム以上、別の態様では、約８．０グラム以上、別の態様では、約９．０グラム以上、別の態様では、約１０．０グラム以上、別の態様では、約１２．０グラム以上；メチオニン：一態様では、約１．５グラム以上、別の態様では、約２．０グラム以上、別の態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、および別の態様では、約６．０グラム以上；フェニルアラニン：一態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、および別の態様では、約６．０グラム以上；トレオニン：一態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、別の態様では、約７．０グラム以上、および別の態様では、約８．０グラム以上；トリプトファン：一態様では、約０．４グラム以上、別の態様では、約０．５グラム以上、別の態様では、約０．６グラム以上、別の態様では、約０．７グラム以上、別の態様では、約０．８グラム以上、別の態様では、約０．９グラム以上、別の態様では、約１．０グラム以上、および別の態様では、約１．５グラム以上；バリン：一態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、別の態様では、約７．０グラム以上、別の態様では、約８．０グラム以上、および別の態様では、約９．０グラム以上。

【0131】

他のアミノ酸含有量：アラニン：一態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、別の態様では、約７．０グラム以上、別の態様では、約８．０グラム以上、別の態様では、約９．０グラム以上、別の態様では、約１０．０グラム以上、および別の態様では、約１１．０グラム以上；アスパラギン酸：一態様では、約７．０グラム以上、別の態様では、約７．５グラム以上、別の態様では、約８．０グラム以上、別の態様では、約９．０グラム以上、別の態様では、約１０．０グラム以上、別の態様では、約１１．０グラム以上、別の態様では、約１２．０グラム以上、および別の態様では、約１４．０グラム以上；システイン：一態様では、約１．０グラム以上、別の態様では、約１．５グラム以上、別の態様では、約２．０グラム以上、別の態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、および別の態様では、約５．０グラム以上；グルタミン酸：一態様では、約９．０グラム以上、別の態様では、約９．５グラム以上、別の態様では、約１０．０グラム以上、別の態様では、約１２．０グラム以上、別の態様では、約１４．０グラム以上、別の態様では、約１６．０グラム以上、別の態様では、約１８．０グラム以上、および別の態様では、約２０．０グラム以上；グリシン：一態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、および別の態様では、約７．０グラム以上；メチオニン：一態様では、約１．５グラム以上、別の態様では、約２．０グラム以上、別の態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、および別の態様では、約６．０グラム以上；プロリン：一態様では、約２．０グラム以上、別の態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約６．０グラム以上、および別の態様では、約７．０グラム以上；セリン：一態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、および別の態様では、約６．０グラム以上；チロシン：一態様では、約２．５グラム以上、別の態様では、約３．０グラム以上、別の態様では、約３．５グラム以上、別の態様では、約４．０グラム以上、別の態様では、約４．５グラム以上、別の態様では、約５．０グラム以上、別の態様では、約５．５グラム以上、および別の態様では、約６．０グラム以上。

【0132】

一実施形態において、供給原料組成物は、動物用飼料の供給原料として利用してもよい。さらに別の実施形態において、供給原料組成物は、水産養殖における供給原料として利用してもよい。さらに別の実施形態において、供給原料組成物をさらに加工して、動物およびヒトなどが摂取可能な栄養素サプリメントとして利用され得る。

【0133】

一態様において、本組成物は、細菌発酵プロセスに有効な量の栄養素をもたらす。この態様において、「有効な量」は、全アルコール約１ｇ以上／（Ｌ・日）のＳＴＹの全アルコールの生産のうちの少なくとも１つを含み得る健康的な発酵プロセスを促進し、約２．０グラム／リットル以上の細胞密度をもたらし、培養物を定常状態で維持する上での使用を説明する。細菌発酵プロセスは、ＣＯ含有ガス状基質の発酵であってよく、供給原料を本来誘導した細菌発酵プロセスと同じであってもよい。

【0134】

別の態様において、本組成物は、有効な量の栄養素を動物にもたらす。「有効な量」は、動物の健康的な成長を促進する使用が、以下、すなわち、動物における細菌負荷の阻害、家禽における壊死性腸炎の予防または軽減、動物における免疫応答の刺激、給餌または別法で動物に投与された抗生物質およびワクチンの効力の強化、給餌量当たりの成長率の増加、乳汁産生の増加、死亡率の低下、などのうちの少なくとも１つを促進させるのに十分な量であることを説明する。動物に適合される有効な量を決定する上で、限定されないが、動物の年齢、活動のレベル、ホルモンバランス、および総体的な健康状態を含めた、いくつかの要因が考慮され得、例えば低用量で開始し、用量を漸増して有効な量を決定する。

【0135】

本組成物を摂取して利益を得ることができる動物としては、例えば、鶏、鴨、ガチョウ、七面鳥、ウズラ、雛鳥などの家禽；肉牛および乳牛、ブタ、ヤギなど；イヌおよびネコなどの愛玩動物；鮭、サケ科魚類、マス、テラピア、エビ、ロブスターなどの水生動物；ならびにヒトが挙げられる。タンパク質富化栄養素サプリメントの使用は、ウシ、ブタ、家禽、および魚を太らせることを含む。本組成物の他の使用は、多数の消耗品（焼き菓子、スープ、包装済み食品、スマートフード、およびダイエット食品を含む）の栄養価を改善するための乳化剤として機能することを含む。さらに他の使用は、紙加工、皮革加工、および泡の安定化を含む。

【実施例】

【0136】

（実施例１）
連続細菌発酵プロセス
ＣＯおよび／またはＣＯ₂／Ｈ₂を含有する合成物ならびに廃ガスを、クロストリジウム・リュングダーリイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｌｊｕｎｇｄａｈｌｉｉ）の株が入っている撹拌タンクバイオリアクター内に、ビタミン、微量の金属、および塩を含有する発酵培地と共に連続して導入する。使用される適切な発酵培地を、以下の表１に報告する。

【0137】

【表1】

【0138】

１０％以下の培養接種材料を使用した方法の始動中、反応器はバッチ式液相により操作され、発酵培地は反応器に連続して供給されない。したがって反応器内の液相は、公称濃度の１種または複数の制限栄養素、例えばパントテン酸カルシウム、コバルトを含むバッチ分の発酵培地からなる。あるいは、酵母抽出物、トリプチケース、またはその他の複合栄養素を含有する富栄養培地を用いることもできる。

【0139】

理想的には、始動時の気相はＣＯ₂を含まずに過剰なＨ₂を含有する。気体速度および撹拌速度を低レベルに保持して（Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）発酵バイオリアクターにおいて５００ｒｐｍ未満）、ＣＯおよびＨ₂が僅かに過剰に得られるが、同時にＣＯ基質阻害が回避される。例として、１リットルの実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）発酵バイオリアクターでは、供給ガス組成が６３％ Ｈ₂、３２％ ＣＯ、および５％ ＣＨ₄であるが、始動開始のための撹拌速度は４００ｒｐｍであり、気体速度は２０ｍｌ／分である。始動中にエタノール製造を行うため、Ｈ₂および液体栄養素が共に過剰にある。発酵培地中のある特定の栄養素に対する制限が、後に課される。したがって、過剰な液体栄養素（例えば、パントテン酸カルシウム、コバルト）が、始動中に実際に存在して、低栄養に対する望ましくない培養順化が回避される。

【0140】

細菌発酵が、接種後数時間にわたり進行するにつれ、ＣＯ₂はＣＯの変換から生成され、Ｈ₂はＣＯ₂と共に消費されるが、これは気体物質移動の制限を回避するために撹拌速度を名目上増大させるシグナルである。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）ＣＳＴＲでは、出口ガスが、２５％ ＣＯ、６７％ Ｈ₂、２％ ＣＯ₂、および６％ ＣＨ₄である。撹拌速度が非常に素早く増大する場合、撹拌の増大後のメタン濃度の減少によって明らかなように、ＣＯ基質阻害が生ずる。このように、撹拌速度は典型的には、２４時間で２００ｒｐｍ増大し得る。

【0141】

撹拌速度を名目上増大させながらＣＯ₂生成（またはＨ₂変換）をモニターする手順は、目標撹拌速度に到達するまで比較的迅速に行われる。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）発酵バイオリアクターにおける典型的な目標撹拌速度は、９００ｒｐｍである。バッチ式液体培養で撹拌速度が増大する期間中、細胞生成のモニタリングを、生成物発酵を促すよりも優先して行う。したがって約１．５ｇ／Ｌの細胞濃度が得られ、一方、典型的な生成物濃度は、バッチ式培養から１０ｇ／Ｌエタノールおよび２ｇ／Ｌアセテートである。
目標撹拌速度に到達すると、系は、最大限のＨ₂取込みまで成長可能になる。酢酸生成を制限しながらエタノール製造を確実にするために、非常に高いＨ₂出口濃度（典型的には＞６０％）を有することが望ましい。次いで液体発酵培地供給を始めて（保存培養からのバッチ式接種材料を有する系に関し）、連続液体供給を開始し、気体供給速度を目標の流量に向かって増大させる。実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）発酵バイオリアクターにおいて、液体供給速度は典型的には０．５ｍｌ／分であり、一方、気体流量は、目標速度１２５ｍｌ／分に向かって２４時間ごとに１０～１５％増大させる。
気体流量が増大するにつれ、目標の生産性で、Ｈ₂変換の小さな降下によって明らかなように、反応器が最終的には液相栄養素（例えば、パントテン酸カルシウム、コバルト）に限定されるまで、細胞生成が増大する。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）ＣＳＴＲでは、これは２０ｇ／Ｌ・日の目標生産性でのＨ₂変換率の１０％降下によって理解される。

【0142】

次いで生成方法および細菌発酵反応器システムは、１５～３５ｇ／Ｌのエタノールおよび０～５ｇ／Ｌのアセテートを生成物として生成する定常状態で維持され、制限栄養素、液体速度、および気体速度では時折りの小さな調節しかなされない。細胞リサイクルのない、実験室用Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）発酵バイオリアクターでの典型的な定常状態の条件は、２０分の気体保持時間（気体流量／反応器液体体積）、３０時間の液体保持時間（液体流量／反応器液体体積）、および９００ｒｐｍの撹拌速度であり、９２％のＣＯ変換率および６０％のＨ₂変換率をパントテネートの制限と共にもたらす。

【0143】

一実施形態では、この時、気体速度の調節（増大）および第１の栄養素の濃度の調節（減少）と共に細胞リサイクルを反応器システムに加える。Ｎｅｗ Ｂｒｕｎｓｗｉｃｋ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｂｉｏｆｌｏ（登録商標）ＣＳＴＲでの細胞リサイクルにより、気体保持時間は典型的には８分であり、液体保持時間が１２時間であり、細胞保持時間は４０時間であり、撹拌速度は９００ｒｐｍである。これらの条件は、典型的には９２％のＣＯ変換率および５０％のＨ₂変換率を、パントテネートの制限と共にもたらす。連続発酵のこの方法は、安定した操作条件下、低い副生成物アセテート濃度と共に、高いエタノール濃度の連続生成および維持を可能にして、エタノール製造のための工業規模での対象の細菌の使用を高める。

【0144】

（実施例２）
発酵生成物比を制御するための、発酵容器からの細菌細胞の除去
ガス状基質（３０％ＣＯ、１５％Ｈ₂、１０％ＣＯ₂、４５％Ｎ₂）発酵は、Ｃ．リュングダーリイ株Ｃ－０１を利用するＣＳＴＲ（ｐＨ＝５．０、温度＝３８℃、圧力＝２０ｐｓｉｇ）で、細胞リサイクル（細胞保持時間＝４０時間、および液体保持時間＝６時間）と共に行われ、培養は、コバルト、パントテン酸カルシウム、または任意の他の栄養素による成長に限定されない。培養物が成長するにつれ、細胞密度は、特異的な取込み（分当たりの乾燥細胞のグラム当たりのＣＯのｍｍｏｌ）が０．５よりも低くなるように、かつ酢酸がエタノールよりも優先して生成されるように、実現される。この結果を防止するために、細胞除去速度を増大させて細胞密度の増大を防止し、それによって細胞の定常濃度が、分当たりの乾燥細胞のグラム当たり０．５ｍｍｏｌ ＣＯよりも高い特異的取込みを維持するのに十分低く保持されるようにする。そのようにすることで、細胞保持時間は６～２５時間に短縮される。Ｃ．リュングダーリイの株の細菌発酵プロセス中の細胞濃度のモニタリングに関する、表２を参照されたい。

【0145】

【表2】

【0146】

（実施例３）
酢酸生成細菌細胞の細胞バイオマスの分析
クロストリジウム・リュングダーリイＣ－０１を、合成ガスを用いてバイオリアクター内で成長させた。バイオリアクターからの発酵物の試料、およびバイオマス細胞の濃縮乾燥質量を、以下の表３の手順に従い分析した。

【0147】

【表3】

【0148】

細胞バイオマスの濃縮された乾燥質量の分析の結果を、表４に示す。

【表4】

細胞バイオマスの濃縮乾燥質量のアミノ酸分析の結果を、以下の表５に示す。

【0149】

（実施例４）
酢酸生成細菌細胞のタンパク質、炭水化物、および核酸含有量の分析
クロストリジウム・リュングダーリイＣ－０１を、合成ガスを用いてバイオリアクター内で成長させた。細胞培養物を４，０００ＲＰＭで遠心分離して、培地を除去した。ペレットを収集し、１００Ｃの炉内で一晩乾燥した。破砕された乾燥ペレット１００グラムを、実施例３で記述したものと同じ炭水化物およびタンパク質に関する試験を使用して、分析に供した。表６は、細胞質量の最大８０％がタンパク質であることを示す。

【0150】

【表5】

【表6】

【0151】

（実施例５）
１つまたは複数のマイクロ流体化破壊装置による細菌細胞の破壊、およびマイクロ流体化破壊装置による細菌細胞の破壊のためのタンパク質の回収
マイクロ流体工学によるマイクロ流体化装置は、発酵プロセスからの嫌気性細菌細胞を破壊し、かつタンパク質含有部分を生成する、破壊装置と確認された。ある体積の発酵液体は、発酵容器から得た。試料を、遠心分離によって１．５倍にまたは例えば約２０ｇ／Ｌ以上の細胞濃度に濃縮した。例えば、発酵液体約１５ｇ／Ｌは発酵容器から得られ、試料は、遠心分離により濃縮して２２．４ｇ／Ｌ以上の細胞密度を得た。
得られる細胞を、溶液に再懸濁し（例えば、細胞を約４４ｇ含有し得る２Ｌ溶液に）、マイクロ流体装置に送った。マイクロ流体化プロセスでは、高圧でマイクロ流体反応室内のマイクロチャネルに細胞を強制的に通すことによって創出された高剪断力で、細胞を破壊する。

【0152】

各試料を、異なる時間の長さでかつ異なる圧力で流した。試験された圧力は、１回または多数回の通過に関して平方インチ当たり１０，０００～３０，０００ポンド（ｐｓｉ）の範囲に及んだ。各通過は、マイクロ流体化装置を通過させる実験操作を構成する。圧力は、破壊装置を介して一定速度で加えた。マイクロ流体化装置は、６種の均質化試料を発生させた。細胞含有懸濁液は、１種または複数の添加剤（例えば、洗剤、酵素など）で処理することができ、マイクロ流体化装置を通過させることができる（例えば、３，０００ｐｓｉ以上の高剪断または圧力で）。

【0153】

いくつかの実験を行った。各試料を、異なる長さの時間でかつ異なる圧力で流した。それらの中で、６つの、例示的な試料の処理実験に関する条件を示す：（１）１回の通過を１８，０００ｐｓｉで；（２）２回の通過を１８，０００ｐｓｉで；（３）１回の通過を２３，０００ｐｓｉで；（４）２回の通過を２３，０００ｐｓｉで；（５）１回の通過を２８，０００ｐｓｉで；（６）２回の通過を２８，０００ｐｓｉで。各通過は、マイクロ流体化装置を通過する実験を構成する。圧力は、破壊装置を介して一定速度で加えた。結果的に得られるタンパク質含有画分の６種の均質化試料は、マイクロ流体化装置による処理の後に発生した。タンパク質含有画分の各試料を、Ｂｆａｄｆｏｒｄアッセイを使用して、タンパク質含有量に関して分析した。
１つの実験では、いくつかの試料を、マイクロ流体化装置に１回だけ通過させて処理した。１回の通過後、第１のタンパク質含有部分を、ホモジネートから分離した。次いで第１のタンパク質含有部分を噴霧乾燥して、タンパク質含有粉末を得ることができる。

【0154】

第２の実験では、試料を、マイクロ流体化装置を２回通過させることにより処理し、前処理された細胞含有懸濁液はリサイクル流中を流動して２回目にマイクロ流体化装置に再度進入した。２回通過後、タンパク質含有部分が得られた。次いでタンパク質含有部分の粉末形態を得ることができる。例えば、３つの異なる乾燥技法（高温での乾燥、噴霧乾燥、および凍結乾燥）を、タンパク質含有部分が得られた後に試験した。

【0155】

（実施例６）
１つまたは複数の濾過型分画装置による、破壊された細菌細胞のホモジネートの分画
実施例５の処理プロセス後のタンパク質含有部分のホモジネートを、ナイロンフィルターに通して濾過した。ホモジネートの濾過により、当初の微生物バイオマスの５～１５％を、表７に示されるように可溶性タンパク質として回収することが可能になった。

【表7】

【0156】

（実施例７）
１つまたは複数の遠心分離型分画装置による破壊細菌細胞のホモジネートの分画
実施例４のホモジネートに、２，０００～１０，０００ＲＰＭの速度で６分間、遠心分離を行い、タンパク質含有量を、Ｂｒａｄｆｏｒｄタンパク質アッセイを使用して分析した。可溶性タンパク質の回収率パーセントを、基本的に出発時のバイオマス濃度を使用して計算した。結果は、タンパク質の最大２５％がマイクロ流体化後に回収されたことを示し、このことは、マイクロ流体化およびその後の遠心分離が、細胞を溶解しかつ可溶性タンパク質を回収するための実現可能な方法であることを示している。
別の実施例では、細胞密度が２２．４ｇ／Ｌである細胞懸濁液（発酵ブロス中の細胞）を、マイクロ流体化装置に送った。１つの試料をマイクロ流体化装置に１８，０００ｐｓｉで通過させ、別の試料を同じ型のマイクロ流体化装置に２８，０００ｐｓｉの圧力で２回通過させた。結果を比較し、表８に示されるように得られた。

【0157】

１８，０００ｐｓｉで１回通過する試料では、ホモジネート中のタンパク質濃度が９．５ｍｇ／ｍｌ＿であった。次いで試料を濾過しまたは遠心分離し、さらに分析した。０．４５μｍのフィルターに通した濾過の後、タンパク質に富む画分は、タンパク質を２．４ｍｇ／ｍＬ含有していた。２，０００ＲＰＭで８分間遠心分離した後、タンパク質に富む画分のタンパク質濃度は、約３．２ｍｇ／ｍＬのタンパク質である。より高い遠心分離速度は、より少ないタンパク質をもたらした（５，０００ＲＰＭで、回収された画分のタンパク質濃度は約１．０ｍｇ／ｍＬ以上、または約１．９ｍｇ／ｍＬ以上であった。１０，０００ＲＰＭのさらに高い遠心分離速度で、スピン後に得られた上澄み画分のタンパク質濃度は約１．４ｍｇ／ｍＬであった）。

【0158】

【表8】

【0159】

別の試料群を、２８，０００ｐｓｉでマイクロ流体化装置に２回通過させることにより処理し、先に溶解した細胞含有懸濁液をリサイクル流中に流して、２回目にマイクロ流体化装置に再度進入させた。ホモジネート中で得られたタンパク質含有部分のタンパク質濃度は、約８．５ｍｇ／ｍｌで測定された。次いで試料を濾過および／または遠心分離した。０．４５μｍのフィルターに通した濾過の後、得られたタンパク質濃度は約１．８ｍｇ／ｍｌであった。２０００ＲＰＭで８分間遠心分離した後、得られたタンパク質濃度は約３．０ｍｇ／ｍｌであった。より高い遠心分離速度は、少ないタンパク質をもたらした（５０００ＲＰＭで、２．０ｍｇ／ｍｌであった；１００００ＲＰＭで、１．３ｍｇ／ｍｌであった）。

【0160】

（実施例８）
１つまたは複数のマイクロ流体化破壊装置による細菌細胞の破壊からの細胞溶解
破壊プロセスを実行するのに選択される破壊装置は、マイクロ流体化装置およびその他の市販の装置とすることができる。図７Ｂ～図７Ｅにおいて、破壊プロセスを実行するのに選択された破壊装置は、マイクロ流体化装置である。破壊装置内の破壊プロセスは、圧力および通過回数を含む種々の変数の下で実行することができる。
図７Ａは、溶解に供されなかった細胞含有懸濁液の電子顕微鏡写真を示す。電子顕微鏡写真は、顕微鏡により１００×の倍率でホモジネートを標的として撮影された。
破壊装置内の破壊プロセスを受けるために選択された細胞含有懸濁液は、種々の密度のものとすることができる。図７Ａにおいて、破壊プロセスを受けなかった細胞含有懸濁液の密度は、約１０ｇ／Ｌ以上、例えば約１６ｇ／Ｌ以上である。
図７Ｂは、本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置４６０、５６０、または６６０内で得られる、かつ破壊装置４６０、５６０、または６６０内の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の破壊細胞膜からの生成物である、ホモジネートの別の電子顕微鏡写真を示す。

【0161】

電子顕微鏡写真は、顕微鏡によって、１００×の倍率で、ホモジネートを標的として撮影された。この図７Ｂにおいて、破壊プロセスを実行するのに選択された破壊装置は、マイクロ流体化装置である。この図７Ｂにおいて、破壊プロセスは、１，０００ｐｓｉ以上の圧力（例えば、平方インチ当たり１，０００ポンド（ｐｓｉ）～９，０００ｐｓｉまたはそれ以上）で、細胞含有懸濁液に対してかつ１回の通過により実行される。また、図７Ｂでは、破壊装置内でのこの破壊プロセスのために選択された細胞含有懸濁液の細胞密度は、約１０ｇ／Ｌ以上、例えば約１６ｇ／Ｌ以上である。視覚的に、マイクロ流体化プロセスの結果として、細胞膜に対してなされた著しい損傷がある。
図７Ｃは、本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置４６０、５６０、または６６０内で破壊される前の、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜の電子顕微鏡写真を示す。

【0162】

電子顕微鏡写真は、顕微鏡によって、１００×の倍率で、ホモジネートを標的として撮影された。図７Ｃでは、破壊装置内でこの破壊プロセス用に選択された細胞含有懸濁液の細胞密度は、約１０ｇ／Ｌ以上、例えば約１６ｇ／Ｌ以上である。破壊プロセスは、約１，０００ｐｓｉ以上（例えば、平方インチ当たり１，０００ポンド（ｐｓｉ）～２０，０００ｐｓｉまたはそれ以上）の圧力で、細胞含有懸濁液に対してかつ１回の通過で実行される。図７Ａの結果と比較すると、図７Ｃに示される結果は、この処理圧力で生じた細胞膜の著しい破壊を示す。
図７Ｄは、本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置４６０、５６０、または６６０内で得られたかつ破壊装置４６０、５６０、または６６０内で細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の破壊細胞膜からの生成物であるホモジネートの、別の電子顕微鏡写真を示す。

【0163】

電子顕微鏡写真は、顕微鏡によってかつ８００×の倍率で、ホモジネートを標的として撮影された。この図７Ｄにおいて、破壊プロセスを実行するのに選択された破壊装置は、マイクロ流体化装置である。この図７Ｄでは、破壊プロセスは、１，０００ｐｓｉの圧力（例えば、平方インチ当たり１，０００ポンド（ｐｓｉ）～２２，０００ｐｓｉまたはそれ以上）で細胞含有懸濁液に対してかつ１回の通過で実行される。また、図７Ｄでは、破壊装置内でのこの破壊プロセスのために選択された細胞含有懸濁液の密度が、約１５ｇ／Ｌ以上、例えば約２０ｇ／Ｌ以上、または約２２．４ｇ／Ｌ以上である。
図７Ｅは、本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置４６０、５６０、または６６０内で得られる、かつ破壊装置４６０、５６０、または６６０内の細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の破壊細胞膜からの生成物である、ホモジネートの、別の電子顕微鏡写真を示す。

【0164】

電子顕微鏡写真は、顕微鏡によって、かつ８００×の倍率でホモジネートを標的として、撮影された。この図７Ｅにおいて、破壊プロセスを実行するのに選択された破壊装置は、マイクロ流体化装置である。この図７Ｅでは、破壊プロセスは、圧力１，０００ｐｓｉ（例えば、平方インチ当たり２５，０００ポンド（ｐｓｉ）～３０，０００ｐｓｉまたはそれ以上）の圧力で、細胞含有懸濁液に対してかつ２回の通過により実行される。また、この図７Ｅでは、破壊装置内でのこの破壊プロセスのために選択される細胞含有懸濁液の細胞密度が、約１５ｇ／Ｌ以上、例えば約２０ｇ／Ｌ以上、または約２３ｇ／Ｌ以上である。

【0165】

（実施例９）
細胞含有保持タンクにおける細菌細胞の前処理での１つまたは複数のマイクロ流体化破壊装置による細菌細胞の破壊
マイクロ流体化破壊装置（例えば、マイクロ流体装置）を使用して、発酵プロセスからの嫌気性細菌細胞を破壊し、タンパク質含有部分を生成した。発酵液体ブロス（例えば、細胞密度が１５ｇ／Ｌ）を、発酵容器の高細胞密度実験室反応器から得た。試料を遠心分離によって濃縮して、細胞密度４５ｇ／Ｌを得た。得られる細胞懸濁液（細胞９０ｇを含有する２Ｌ）を、前処理のために細胞含有保持タンクに送った。
マイクロ流体化プロセスでは、高圧で１μｍ反応室に細胞を強制的に通すことにより創出された高剪断力で、細胞を破壊する。細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を、６つの試料に分割した。細胞含有懸濁液を、１種または複数の添加剤（例えば、洗剤、酵素など）で処理し、１５，０００ｐｓｉでマイクロ流体化装置内に通した。マイクロ流体化破壊装置内へのたった１回の通過が実行された。１回の通過後、第１のタンパク質含有部分をホモジネートから分離し、噴霧乾燥した。

【0166】

（実施例１０）
１つまたは複数の超音波処理破壊装置による細菌細胞の破壊
超音波処理装置は、発酵プロセスからの嫌気性細菌細胞を破壊しかつタンパク室含有部分を生成する破壊装置として特定された。１５ｇ／Ｌの発酵液体が、発酵容器の高細胞密度実験室反応器から得られた。試料を遠心分離によって濃縮して、細胞密度２２．４ｇ／Ｌを得た。得られた細胞再懸濁液（細胞４４ｇを含有する２Ｌ）を、超音波処理に供した。超音波処理プロセスでは、細胞を撹拌し細胞膜を破る超音波周波数での音響エネルギーを介した、高い力で細胞を破壊する。細菌細胞を含有する細胞含有懸濁液を、６つの試料に分割した。各試料を超音波処理に供した。

【0167】

（実施例１１）
細胞含有保持タンクにおける細菌細胞の前処理での１つまたは複数の超音波処理破壊装置による細菌細胞の破壊
超音波処理装置は、発酵プロセスからの嫌気性細菌細胞を破壊しかつタンパク質含有部分を生成する、破壊装置として特定された。発酵液体ブロスを、３つの高細胞密度発酵容器から得た。試料を、遠心分離を介して濃縮して、４～１０ｍｇ／ｍｌの細胞密度を得た。
例えば、細菌細胞を約４．２ｍｇ／ｍｌ含有する発酵容器（この実施例では、例示的な容器Ａ）から得られた発酵液体ブロスを、様々な緩衝剤中での超音波処理に供した。嫌気性細菌細胞約９．２ｍｇ／ｍｌを含有する別の発酵容器（例示的な容器Ｂ）からの細胞含有懸濁液を、様々な緩衝剤中での超音波処理に供した。細胞約７．１ｍｇ／ｍｌを含有する別の発酵容器（例示的な容器Ｃ）からの細胞含有懸濁液も、様々な緩衝剤中での超音波処理に供した。
発酵容器から発酵ブロスを収集した後、発酵ブロスからの細菌細胞を、遠心分離を介してスピンダウンし（例えば、４，０００ＲＰＭ以上の遠心分離速度で細菌細胞をスピンダウンする）、そのそれぞれの緩衝剤中に再懸濁した。

【0168】

細胞を、洗剤含有緩衝剤（ＴｒｉｓＳＣｌ ｐＨ８であり、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）、ＣＨＡＰＳ、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００、またはＴｗｅｅｎ ２０を含有する）または酵素含有緩衝剤（ＴｒｉｓＨＣｌ ｐＨ８であり、リゾチームを含有する）中に再懸濁した。ＴｒｉｓＨＣｌ ｐＨ８を、対照緩衝剤として使用した。得られた細胞懸濁液を、超音波処理に供した。
細胞を、５秒のパルスで超音波処理し、その後、それらの間で氷上に載置した。サイクルを３回繰り返した。超音波処理後、細胞を１０分間、２０Ｋ ＲＰＭでスピンダウンし、上澄みを除去した。可溶性タンパク質画分を、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用してタンパク質含有量に関して分析した。可溶性タンパク質回収率のパーセンテージを、超音波処理に供される細胞の濃度に基づいて計算した。
いくつかの試料を凍結／解凍サイクルにも供し、細胞を、ＴｒｉｓＨＣｌ緩衝剤中で完全に凍結させた。摂氏－８０度で凍結させた後、細胞を完全に解凍し、その後、再度凍結させた。このサイクルを５回で終了させた。終了後、細胞含有懸濁液を２０，０００ＲＰＭで１０分間スピンダウンし、上澄みを除去した。表９は、細胞含有懸濁液試料が供される緩衝剤のタイプによるタンパク質回収量を示す。可溶性タンパク質回収率のパーセンテージを、初期出発材料に基づいて計算した。出発材料は、液体栄養培地、その他の必須ミネラル、および酢酸生成バイオマスの蓄積物を含む、発酵液体を含む。

【0169】

発酵液体を、３つの高細胞密度発酵容器から得た。試料を、４，０００ＲＰＭでの遠心分離を介して濃縮して、４～１０ｍｇ／ｍｌの細胞密度を得た。細胞を、洗剤含有緩衝剤（ＴｒｉｓＨＣｌ ｐＨ８であり、ドデシル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）、ＣＨＡＰＳ、Ｔｒｉｔｏｎ Ｘ－１００、またはＴｗｅｅｎ ２０を含有する）または酵素含有緩衝剤（ＴｒｉｓＨＣｌ ｐＨ８であり、リゾチームを含有する）中に再懸濁した。ＴｒｉｓＨＣｌ ｐＨ８を、対照緩衝剤として使用した。得られた細胞懸濁液を、超音波処理に供した。超音波処理プロセスでは、細胞を撹拌し細胞膜を破る超音波周波数での音響エネルギーを介した、高い力で細胞を破壊する。

【0170】

細胞を、５秒のパルスで超音波処理し、その後、間に氷上に載置した。サイクルを３回繰り返した。超音波処理後、細胞を１０分間、２０，０００ＲＰＭでスピンダウンし、上澄みを除去した。可溶性タンパク質画分を、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、タンパク質含有量に関して分析した。可溶性タンパク質回収率のパーセンテージを、超音波処理に供される細胞の濃度に基づいて計算した。
表９に示される結果は、細胞が超音波処理に供されたとき、洗浄添加剤がタンパク質の溶解度を増大させることができることを示す。特に、ＳＤＳまたはリゾチームの添加は、膜タンパク質の溶解度を大幅に高める。

【0171】

（実施例１２）
１つまたは複数の濾過型分画装置による破壊細菌細胞のホモジネートの分画
実施例４のホモジネートを、ナイロンフィルターに通して濾過する。ホモジネートの濾過は、当初の微生物バイオマスの１０．７％を可溶性タンパク質として回収可能にした。

【表9】

【0172】

（実施例１３）
１つまたは複数の遠心分離型分画装置による破壊細菌細胞のホモジネートの分画
実施例４のホモジネートが２０００ｒｐｍでの遠心分離を受け、タンパク質３．３ｍｇを上澄み中に分画した。ホモジネートの遠心分離は、発酵容器から収集された初期微生物バイオマスの全細胞集団から分離された可溶性タンパク質の、１４．３％の回収率を可能にした。

【0173】

（実施例１４）
１つまたは複数の破壊装置を通した破壊の後に回収されたタンパク質に対する、細胞含有懸濁液中のｐＨの影響の決定
試料を、クロストリジウム・リュングダーリイの細胞が入っている高細胞密度発酵容器から収集した。収集時の細胞濃度は約２２ｇ／Ｌであり、約４．５のｐＨ値を有していた。ある体積の細胞培養物を、４，０００ＲＰＭで１０分間、スピンダウンした。細胞ペレットを、遠心分離後に除去された培地の体積と同じ体積のＴｒｉｓＨＣｌ中に再懸濁した（したがって試料は、濃縮されずまたは希釈されなかった）。多数の体積の細胞培養物を、０．５Ｍ ＮａＯＨの添加によってｐＨ調整に供し、培養ブロスの最終ｐＨが３．５～１０になるようにした。試料を、１０，０００～２０，０００ｐｓｉで、１回または多数回の通過に関して処理した。各試料を、１３，３００ＲＰＭで６分間、スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。

【0174】

表１０に示されるデータは、マイクロ流体化前の細胞試料のｐＨの上昇が、タンパク質溶解度を高めることを示す。特に、ｐＨが高いとき（７．６よりも上）可溶性タンパク質の回収は高められる。

【表10】

【0175】

（実施例１５）
１つまたは複数の破壊装置を通した破壊後に回収されたタンパク質に対する、細胞含有懸濁液中のｐＨの影響の決定
試料を、アセトバクテリウム・ウッディイ（Ａｃｅｔｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｗｏｏｄｉｉ）の細胞が入っている高細胞密度発酵容器から収集した。収集時の細胞濃度の乾燥細胞質量は約３ｇ／Ｌであり、約６．１のｐＨ値を有していた。ある体積の細胞培養物を、４，１００ＲＰＭで１０分間、スピンダウンした。細胞ペレットを、遠心分離後に除去された培地の体積と同じ体積のＴｒｉｓＨＣｌ中に再懸濁した（したがって試料は濃縮されておらずまたは希釈されなかった）。多数の体積の細胞培養物を、０．５Ｍ ＮａＯＨの添加によるｐＨ調整に供して、培養ブロスの最終ｐＨが６～１０になるようにした。試料を、１回の通過に関して１０，０００～２０，０００ｐｓｉで処理した。各試料を、９，８００ＲＰＭで３０分間スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。
表１１に示されるデータは、マイクロ流体化前の細胞試料のｐＨの上昇が、タンパク質溶解度を高めることを示す。特に、ｐＨが上昇したとき、可溶性タンパク質の回収率は高くなる。

【0176】

【表11】

【0177】

（実施例１６）
可溶性タンパク質回収率に対するリゾチームの影響の決定
試料を、高細胞密度発酵容器から収集した。ある体積の細胞培養物を、これまで述べてきたものと同じ手法で、スピンダウンしかつＴｒｉｓＨＣｌ緩衝剤中に再懸濁した。培養ブロスのｐＨを、０．５Ｍの水酸化ナトリウムを使用してｐＨ８に上昇させた。酵素前処理の影響を決定するために、０．５ｍｇ／ｍｌのリゾチームを使用した。培養ブロス試料では、リゾチームとのインキュベーションを約３０分、室温で継続した。ＴｒｉｓＨＣｌ試料では、リゾチームとのインキュベーションを室温で約４５分継続した（相違は、ボトルネックとしてマイクロ流体化装置による処理の遅延に起因する）。
試料を、１０，０００～２０，０００ｐｓｉで、１回または多数回の通過のために処理した。対照も同様に実験操作に供したが、試料はマイクロ流体化装置に通して処理しなかった。各試料を、１３，３００ＲＰＭで６分間、スピンダウンした。上澄みを収集し、ＬｏｗｒｙベースのおよびＢｒａｄｆｏｒｄベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定し、その結果を表１２に示す。

【0178】

【表12】

【0179】

（実施例１７）
リゾチーム濃度の減少およびインキュベーション時間の延長の影響の決定
試料を高細胞密度発酵容器から収集し、４，０００ＲＰＭでの１０分間の遠心分離を介して濃縮した。培養ブロスのｐＨを、７～１０に調節した。いくつかの試料を、１００ｎｇ／ｍｌのリゾチームと共に１時間、３７Ｃでインキュベートした。試料を１０分ごとに採取して、リゾチーム活性をモニターした。大量の試料を３０分および１時間で採取し、１０，０００～２０，０００ｐｓｉでマイクロ流体化装置に通して１回または複数回の通過のために処理した。各試料を１３，３００ＲＰＭで６分間、スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定し、その結果を表１３に示す。

【0180】

（実施例１８）
タンパク質の抽出に対するｐＨおよび細胞濃度の影響
高細胞密度発酵容器からの試料を、遠心分離を介して１～１０ｇ／Ｌの濃度に希釈し、培地に再懸濁した。培養ブロスｐＨを、０．５Ｍの水酸化ナトリウムを使用して６～１０に調節した。試料（発酵ｐＨでの非修飾培養ブロスを含む）を、マイクロ流体化装置に通して１０，０００～２０，０００ｐｓｉで、１回または複数回の通過で処理した。同様に、高細胞密度発酵容器から除去した非希釈培養物を、１つの酸性ｐＨ値および１つのアルカリ性ｐＨ値で処理した。各試料を、１３，３００ＲＰＭで６分間、スピンダウンした。

【0181】

【表13】

【0182】

上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。表１４は、培養ブロスのｐＨがマイクロ流体化前に上昇するにつれ、可溶性画分中に回収されたタンパク質の量が増大することを示す。

【0183】

【表14】

図８Ａは、本発明の１つまたは複数の実施形態による、破壊装置４６０、５６０、または６６０からおよび細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜から得られた可溶性タンパク質のグラフを示す。
破壊プロセスを実行するよう選択された破壊装置は、マイクロ流体化装置およびその他の市販の装置とすることができる。この図８Ａにおいて、破壊プロセスを実行するよう選択された破壊装置は、マイクロ流体化装置である。
破壊装置４６０、５６０、または６６０内での破壊プロセスは、圧力および通過回数を含む種々の変数の下で実行することができる。この図８Ａにおいて、破壊プロセスは、細胞含有懸濁液に対しておよびただ１回の通過の下で、平方インチ当たり１５，０００ポンド（ｐｓｉ）の圧力まで実行される。

【0184】

破壊装置４６０、５６０、または６６０内で破壊プロセスを受けるために選択された細胞含有懸濁液は、種々の密度のものにすることができる。この図８Ａにおいて、細胞含有懸濁液の４本の流れを、破壊装置４６０、５６０、または６６０内での破壊プロセス用に選択する。細胞含有懸濁液の密度のそれぞれは、１ｇ／Ｌ、５ｇ／Ｌ、１０ｇ／Ｌ、および１８．５ｇ／Ｌである。
線８０２のｙ軸は、本発明の１つまたは複数の実施形態による、密度が１８．５ｇ／Ｌの、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞から種々のｐＨ条件下（Ｘ軸）で調製された、破壊装置４６０、５６０、または６６０から破壊されかつ得られた細胞ホモジネートからのタンパク質の収率を表す。

【0185】

線８０４のｙ軸は、本発明の１つまたは複数の実施形態による、密度が１０ｇ／Ｌの、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞から種々のｐＨ条件下（Ｘ軸）で調製された、破壊装置４６０、５６０、または６６０から破壊されかつ得られた細胞ホモジネートからのタンパク質の収率を表す。
線８０６のｙ軸は、本発明の１つまたは複数の実施形態による、種々のｐＨ条件に対してプロットされた５ｇ／Ｌの密度を有する、細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞から種々のｐＨ条件下（Ｘ軸）で調製された、破壊装置４６０、５６０、または６６０から破壊されかつ得られた細胞ホモジネートからのタンパク質の収率を表す。
線８０８のｙ軸は、本発明の１つまたは複数の実施形態による、密度が１ｇ／Ｌの細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞から種々のｐＨ条件下（Ｘ軸）で調製された、破壊装置４６０、５６０、または６６０から破壊されかつ得られた細胞ホモジネートからのタンパク質の収率を表す。

【0186】

破壊装置４６０、５６０、または６６０内での破壊処理を受けるために選択された細胞含有懸濁液は、１～１４の範囲内にある異なるｐＨ値のものとすることができる。細胞含有懸濁液のｐＨ値は、酸、塩基、もしくは塩の添加、またはこれらの組合せを含む様々な方法によって、調節することができる。ここで図８Ａにおいて、細胞含有懸濁液のｐＨ値は、０．５Ｍの水酸化ナトリウムを使用して、約６または８に調節される。細胞含有懸濁液のｐＨ値は、細胞含有懸濁液が破壊装置４６０、５６０、または６６０内で破壊される前に、調節することができる。例えば、細胞含有懸濁液のｐＨ値は、細胞含有保持タンク４４５、５４５、または６４５内で調節することができる。

【0187】

（実施例１９）
高濃度のタンパク質含有懸濁液に対するｐＨの影響
試料を、高細胞密度発酵容器から収集し、細胞を１０分間、４，０００ＲＰＭで遠心分離することによって３倍濃縮した。細胞ペレットを、培地に再懸濁した。培地を、濃縮水酸化ナトリウムを使用して５～１０のｐＨに調節した。例えば、試料は、細胞を４，０００ＲＰＭで１０分間、遠心分離することによって、４５ｇ／Ｌに濃縮した。細胞ペレットを、培地に再懸濁した。得られた細胞混合物のｐＨを、０．５Ｍの水酸化ナトリウムを使用して、５、６、７、または８に修正した。試料を、１回の通過のためにマイクロ流体化装置に通して１５，０００ＰＳＩで処理した。各試料を、１３，３００ＲＰＭで６分間スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。
図８Ｂは、本発明の１つまたは複数の実施形態により、破壊装置４６０、５６０、または６６０から、および細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞の細胞膜から得られた、可溶性タンパク質の収率のチャートを示す。

【0188】

図８Ｂにおいて、破壊プロセスを実行するように選択された破壊デバイスは、マイクロ流体化装置である。図８Ｂにおいて、破壊プロセスは、１回または多数回の通過のために、細胞含有懸濁液に対して１０，０００～２０，０００ｐｓｉの圧力まで実行される。上澄みを、１３，３００ＲＰＭでの遠心分離を介して収集し、タンパク質を、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して分析した。表１５は、４～５から６～１０への培養ブロスのｐＨの上昇が、可溶性画分中に回収されたタンパク質のパーセントを著しく上昇させることを示す。
線８１２のｙ軸は、本発明の１つまたは複数の実施形態による、細胞含有懸濁液のｐＨ値の変化からの、密度が４５ｇ／Ｌの細胞含有懸濁液中の嫌気性細菌細胞から種々のｐＨ条件下（Ｘ軸）で調製された、破壊装置４６０、５６０、または６６０から破壊されかつ得られた細胞ホモジネートからのタンパク質の収率に対する、ｐＨの影響を表す。

【0189】

【表15】

【0190】

（実施例２０）
１つまたは複数の破壊装置を経て破壊後に回収されたタンパク質に対する、ホモジネート中のｐＨの影響の決定
試料を、クロストリジウム・リュングダーリイの細胞が入っている高細胞密度発酵容器から収集した。収集時の細胞濃度は約１８ｇ／Ｌであり、約４．５のｐＨ値を有していた。ある体積の細胞培養物を、４，０００ＲＰＭで１０分間、スピンダウンした。試料を、ゼロまたは１回の通過のために１５，０００ｐｓｉの間で処理した。次いで多数の体積の細胞培養物を、０．５Ｍ ＮａＯＨまたはＮＨ₄ＯＨの添加を通してｐＨ調製に供して、培養ブロスの最終ｐＨが約８の間になるようにした。各試料を、１３，３０００ＲＰＭで６分間スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。

【0191】

表１６に示されるデータは、マイクロ流体化後の細胞ホモジネートのｐＨ上昇が、タンパク質の溶解度を高めることを示す。特に、ｐＨが上昇しているとき、可溶性タンパク質の回収率は高められる。

【表16】

【0192】

（実施例２１）
破壊なしに回収されたタンパク質に対する、細胞試料中のｐＨの影響の決定
試料を、クロストリジウム・リュングダーリイの細胞が入っている高細胞密度発酵容器から収集した。収集時の細胞濃度は約１８ｇ／Ｌであり、約４．５のｐＨ値を有していた。ある体積の細胞培養物を、４，０００ＲＰＭで１０分間、スピンダウンした。次いで、多数の体積の細胞培養物を、０．５Ｍ ＮａＯＨまたはＮＨ₄ＯＨの添加を通したｐＨ調製に供して、培養ブロスの最終ｐＨが約８になるようにした。次に、試料を１５，０００ｐｓｉの間で処理しなかった。各試料を、１３，３００ＲＰＭで６分間スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。表１７に示されるデータは、マイクロ流体化前の細胞試料のｐＨ上昇が、タンパク質溶解度を高めることを示す。特に、ｐＨが高いとき、可溶性タンパク質の回収率は高められる。

【0193】

【表17】

【0194】

（実施例２２）
１つまたは複数の破壊装置を通した破壊後に回収されたタンパク質に対する、細胞試料中のｐＨの影響の決定
試料を、クロストリジウム・リュングダーリイの細胞が入っている高細胞密度発酵容器から収集した。収集時の細胞濃度は約１８ｇ／Ｌであり、約４．５のｐＨ値を有していた。ある体積の細胞培養物を、４，０００ＲＰＭで１０分間、スピンダウンした。次いで、多数の体積の細胞培養物を、０．５Ｍ ＮａＯＨまたはＮＨ₄ＯＨの添加を通したｐＨ調製に供して、培養ブロスの最終ｐＨが約８になるようにした。次に、試料を、１回の通過のために、１５，０００ｐｓｉの間で処理した。各試料を、１３，３００ＲＰＭで６分間スピンダウンした。上澄みを収集し、Ｌｏｗｒｙベースのタンパク質アッセイを使用して、可溶性画分中のタンパク質濃度を決定した。
表１８に示されるデータは、マイクロ流体化前の細胞試料のｐＨ上昇が、タンパク質溶解度を高めることを示す。特に、ｐＨが高いとき、可溶性タンパク質の回収率は高められる。

【0195】

【表18】

前述の内容は本発明の実施形態を対象とするが、本発明のその他およびさらなる実施形態が、その基本的な範囲から逸脱することなく考えられ、その範囲は、以下の特許請求の範囲によって決定される。

【図1A】

【図1B】

【図2A】

【図2B】

【図3A】

【図3B】

【図4A】

【図4B】

【図4C】

【図4D】

【図4E】

【図4F】

【図4G】

【図4H】

【図5A】

【図5B】

【図5C】

【図5D】

【図5E】

【図6】

【図7A】

【図7B】

【図7C】

【図7D】

【図7E】

【図8A】

【図8B】