特許 7557469 ＡＰＰの発現を低減するための化合物及び方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】特許公報(B2)

(11)【特許番号】

(24)【登録日】2024-09-18

(45)【発行日】2024-09-27

(54)【発明の名称】ＡＰＰの発現を低減するための化合物及び方法

(51)【国際特許分類】

   C12N 15/113 20100101AFI20240919BHJP

   A61K 31/7115 20060101ALI20240919BHJP

   A61K 31/712 20060101ALI20240919BHJP

   A61K 31/7125 20060101ALI20240919BHJP

   A61P 25/28 20060101ALI20240919BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20240919BHJP

【ＦＩ】

C12N15/113 Z ZNA

A61K31/7115

A61K31/712

A61K31/7125

A61P25/28

A61P43/00 105

【請求項の数】 28

(21)【出願番号】P 2021544144

(86)(22)【出願日】2020-01-29

(65)【公表番号】

(43)【公表日】2022-03-17

(86)【国際出願番号】 US2020015701

(87)【国際公開番号】W WO2020160163

(87)【国際公開日】2020-08-06

【審査請求日】2023-01-25

(31)【優先権主張番号】62/798,353

(32)【優先日】2019-01-29

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(31)【優先権主張番号】62/915,764

(32)【優先日】2019-10-16

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(31)【優先権主張番号】62/841,169

(32)【優先日】2019-04-30

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(73)【特許権者】

【識別番号】595104323

【氏名又は名称】アイオーニス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド

【氏名又は名称原語表記】Ｉｏｎｉｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．

(74)【代理人】

【識別番号】100118902

【弁理士】

【氏名又は名称】山本 修

(74)【代理人】

【識別番号】100106208

【弁理士】

【氏名又は名称】宮前 徹

(74)【代理人】

【識別番号】100196508

【弁理士】

【氏名又は名称】松尾 淳一

(74)【代理人】

【識別番号】100163784

【弁理士】

【氏名又は名称】武田 健志

(72)【発明者】

【氏名】フレアー，スーザン・エム

(72)【発明者】

【氏名】ブイ，フィン・ホア

(72)【発明者】

【氏名】コルダシェヴィッチ，ホリー

(72)【発明者】

【氏名】スウェイジ，エリック・イー

【審査官】上條 のぶよ

(56)【参考文献】

【文献】特表２０１１－５１４１５８（ＪＰ，Ａ）

【文献】国際公開第２００５／０４２７７７（ＷＯ，Ａ２）

【文献】米国特許出願公開第２０１７／００４４５２６（ＵＳ，Ａ１）

【文献】特表２０１６－５３３７１７（ＪＰ，Ａ）

【文献】特表２０１６－５３１５７０（ＪＰ，Ａ）

【文献】特表２０１６－５２１５５６（ＪＰ，Ａ）

(58)【調査した分野】(Int.Cl.，ＤＢ名)

Ｃ１２Ｎ １５／１１３

Ａ６１Ｋ ３１／７１１５

Ａ６１Ｋ ３１／７１２

Ａ６１Ｋ ３１／７１２５

ＪＳＴＰｌｕｓ／ＪＭＥＤＰｌｕｓ／ＪＳＴ７５８０（ＪＤｒｅａｍＩＩＩ）

ＣＡｐｌｕｓ／ＲＥＧＩＳＴＲＹ／ＭＥＤＬＩＮＥ／ＥＭＢＡＳＥ／ＢＩＯＳＩＳ（ＳＴＮ）

ＧｅｎＢａｎｋ／ＥＭＢＬ／ＤＤＢＪ／ＧｅｎｅＳｅｑ

(57)【特許請求の範囲】

【請求項1】

修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、
該修飾オリゴヌクレオチドは、１５～３０個の連結したヌクレオシドからなり、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１の核酸塩基６５２～６９７の等長部分の少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、又は少なくとも２１個の連続した核酸塩基に相補的であり、
該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含み、
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体にわたって測定した場合に、配列番号１～７の核酸塩基配列のうちのいずれかに、少なくとも９０％相補的であり、
該オリゴマー化合物が、細胞または動物におけるＡＰＰ ＲＮＡ及び／又はタンパク質の量を低下させることができる、
上記オリゴマー化合物。

【請求項2】

修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、
該修飾オリゴヌクレオチドは、１５～３０個の連結したヌクレオシドからなり、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、
ａ）配列番号４２、４３、１１６、１１７、１９１、１９２、２６５、２６６、３３８、４１３、４１４、又は４７８～４８７の核酸塩基配列のうちのいずれかの少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、又は少なくとも１８個の核酸塩基；または
ｂ）配列番号５０５～５０７又は５１３～５１６の核酸塩基配列のうちのいずれかの少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、又は２０個の核酸塩基；または
ｃ）配列番号５９９の核酸塩基配列の少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、少なくとも２１、少なくとも２２、又は２３個の核酸塩基；
を含み、
該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含み、
該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体にわたって測定した場合に、配列番号１～７の核酸塩基配列のうちのいずれかに、少なくとも９０％相補的であり、
該オリゴマー化合物が、細胞または動物におけるＡＰＰ ＲＮＡ及び／又はタンパク質の量を低下させることができる、
上記オリゴマー化合物。

【請求項3】

修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体にわたって測定した場合に、配列番号１～７の核酸塩基配列のうちのいずれかに、少なくとも９５％相補的、又は１００％相補的である、請求項１又は２に記載のオリゴマー化合物。

【請求項4】

修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項１～３のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項5】

修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが二環式糖部分を含む、または、該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、該２’－４’橋が、－Ｏ－ＣＨ _２ －又はＯ－ＣＨ（ＣＨ _３ ）－である、請求項４に記載のオリゴマー化合物。

【請求項6】

修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが非二環式修飾糖部分を含む、または、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－ＭＯＥ修飾糖部分、２’－ＯＭｅ修飾糖部分、又は２’－Ｆ修飾糖部分である非二環式修飾糖部分を含む、請求項４又は５に記載のオリゴマー化合物。

【請求項7】

ａ）修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが非二環式修飾糖部分を含む；または
ｂ）修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－ＭＯＥ修飾糖部分、２’－ＯＭｅ修飾糖部分、又は２’－Ｆ修飾糖部分である非二環式修飾糖部分を含む；
請求項４～６のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項8】

修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、または、修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ及びＰＮＡから選択される糖代替物を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、請求項１～７のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項9】

修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、請求項１～８のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項10】

ａ）修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合がホスホロチオエートヌクレオシド間結合である；または
ｂ）修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である；または
ｃ）修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合である；または
ｄ）修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合から独立して選択される；
請求項１～９のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項11】

修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾核酸塩基を含む、または、修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾核酸塩基を含み、該修飾核酸塩基が５－メチルシトシンである、請求項１～１０のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項12】

ａ）修飾オリゴヌクレオチドが、１５～１７、１５～２５、１６～２０、１６～１８、１８～２２、１８～２５、１８～２０、２０～２５、又は２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる；または
ｂ）修飾オリゴヌクレオチドが、１８、２０、２１、又は２３個の連結したヌクレオシドからなる；
請求項１～１１のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項13】

オリゴマー化合物がＲＮａｓｅ Ｈ化合物である、または、オリゴマー化合物がＲＮａｓｅ Ｈ化合物であり、修飾オリゴヌクレオチドがギャップマーである、請求項１～１２のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項14】

ａ）修飾オリゴヌクレオチドが、
１～６個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域；
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域；及び
１～６個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域；
を含む糖モチーフを有し、
該５’領域の最も３’側のヌクレオシド及び該３’－領域の最も５’側のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、
該中央領域ヌクレオシドの各々が、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシド及び２’－置換糖部分を含むヌクレオシドから選択され、該中央領域が、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む少なくとも６個のヌクレオシド及び２’－置換糖部分を含む２つ以下のヌクレオシドを含む；または
ｂ）修飾オリゴヌクレオチドが、
１～６個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域；
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域；及び
１～６個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域；
を含む糖モチーフを有し、
該５’－領域ヌクレオシドの各々及び該３’－領域ヌクレオシドの各々が修飾糖部分を含み、該中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む；または
ｃ）修飾オリゴヌクレオチドが、
５個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域；
１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域；及び
５個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域；
を含む糖モチーフを有し、
該５’－領域ヌクレオシドの各々及び該３’－領域ヌクレオシドの各々がｃＥｔ修飾糖部分又は２’－ＭＯＥ修飾糖部分のいずれかを含み、該中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む；
請求項１～１３のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項15】

オリゴマー化合物が、ＲＮＡｉ化合物である、請求項１～１２のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項16】

オリゴマー化合物が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含む標的領域を含むアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含み、
ａ）該標的領域がＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも９０％、少なくとも９５％、又は１００％相補的である；および／または
ｂ）アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、少なくとも１９、２０、２１、又は２５個の連続した核酸塩基を含む；および／または
ｃ）ＡＰＰ ＲＮＡが、配列番号１～７のいずれかの核酸塩基配列を有する；および／または
ｄ）アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、２’－ＮＭＡ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、又はＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む；および／または
ｅ）アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、又は１００％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む；および／または
ｆ）オリゴマー化合物が、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含む；および／または
ｇ）オリゴマー化合物が、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含み、該安定化したリン酸基が、シクロプロピルホスホネート又は（Ｅ）－ビニルホスホネートを含む；
請求項１～１５のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項17】

オリゴマー化合物が一本鎖オリゴマー化合物である、請求項１～１６のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項18】

オリゴマー化合物が、修飾オリゴヌクレオチド、ＲＮＡｉ化合物、又はアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドからなる、請求項１～１７のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項19】

ａ）オリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む；または
ｂ）オリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役リンカーが単結合からなる；または
ｃ）オリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役リンカーが切断可能である；または
ｄ）オリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役リンカーが１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む；および／または
ｅ）オリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役基が、修飾オリゴヌクレオチド又はアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端または３’末端に結合される；および／または
ｆ）オリゴマー化合物が、末端基を含む；
請求項１～１７のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項20】

オリゴマー化合物がリンカー－ヌクレオシドを含まない、請求項１～１９のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項21】

請求項１６～２０のいずれか１項に記載のアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物と、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物と、を含むオリゴマー二重鎖であって、
該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、１７～３０個の連結したヌクレオシドからなり、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含むアンチセンスハイブリダイズ領域を含み、アンチセンスハイブリダイズ領域が、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの等長部分に少なくとも９０％相補的である、上記オリゴマー二重鎖。

【請求項22】

ａ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、１８～２５、２０～２５、又は２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる、又は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、２１又は２３個の連結したヌクレオシドからなる；および／または
ｂ）アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も３’側のヌクレオシド、もしくはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も３’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである；および／または、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も５’側のヌクレオシド、もしくはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も５’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである；または
ｃ）二重鎖がアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端で平滑末端を有する、または、二重鎖がアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端で平滑末端を有する；および／または
ｄ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、又はＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む；または
ｅ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、又はＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含み、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分又は糖代替物を含む；または
ｆ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、又はＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含み、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分又は糖代替物を含み、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、又は１００％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む；および／または
ｇ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾核酸塩基を含む；および／または
ｈ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である；または
ｉ）センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合であり、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である；および／または
ｊ）化合物が、アンチセンス又はセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端又は両端に結合した１～５個の脱塩基糖部分を含む；および／または
ｋ）オリゴマー二重鎖が、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドからなる；
請求項２１に記載のオリゴマー二重鎖。

【請求項23】

ａ）第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む；または
ｂ）第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役リンカーが単結合からなる；または
ｃ）第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役リンカーが切断可能である；または
ｄ）第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役リンカーが、１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む；および／または
ｅ）第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含み、該共役基が、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端または３’末端に結合される、または、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの内部位置にあるリボシル糖部分の２’位を介して結合している；および／または
ｆ）第２のオリゴマー化合物が末端基を含む；
請求項２１又は２２に記載のオリゴマー二重鎖。

【請求項24】

共役基がＣ_１６アルキル基を含む、請求項１９に記載のオリゴマー化合物又は請求項２３に記載のオリゴマー二重鎖。

【請求項25】

請求項１～２０及び２４のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物、又は請求項２１～２４のいずれか１項に記載のオリゴマー二重鎖、及び薬学的に許容される担体又は希釈剤を含む、医薬組成物。

【請求項26】

薬学的に許容される希釈剤が、人工脳脊髄液、滅菌生理食塩水、又はＰＢＳである；および／または、医薬組成物が、
（ａ）修飾オリゴヌクレオチド及び滅菌生理食塩水；または
（ｂ）修飾オリゴヌクレオチド及び人工脳脊髄液
から本質的になる、請求項２５に記載の医薬組成物。

【請求項27】

動物におけるＡＰＰ関連疾患を治療するための、請求項２５又は２６に記載の医薬組成物。

【請求項28】

ａ）ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、又は脳アミロイド血管症である；または
ｂ）ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、又は脳アミロイド血管症であり、該ＡＰＰ関連疾患の少なくとも１つの症状又は特徴が改善される；および／または
ｃ）ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、又は脳アミロイド血管症であり、該ＡＰＰ関連疾患の少なくとも１つの症状又は特徴が改善され、該症状又は特徴が、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、及び／又は異常なアミロイド沈着を含む、認知障害である；
請求項２７に記載の医薬組成物。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

配列表
本出願は、電子形式の配列表とともに出願されている。配列表は、２０２０年１月２２日に作成された、サイズが５８０ＫＢのＢＩＯＬ０３５１ＷＯＳＥＱ＿ＳＴ２５．ｔｘｔと題されたファイルとして提供されている。配列表の電子形式の情報は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0002】

細胞または動物におけるＡＰＰ ＲＮＡの量または活性を低下させ、場合によっては、細胞または動物におけるＡＰＰタンパク質の量を低下させるための、化合物、方法、及び医薬組成物を提供する。特定のそのような化合物、方法、及び医薬組成物は、神経変性疾患の少なくとも１つの症状または特徴を改善するのに有用である。そのような症状及び特徴には、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、ならびに異常なアミロイド沈着を含む、認知障害が含まれる。このような神経変性疾患には、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、及び脳アミロイド血管症が含まれる。

【背景技術】

【0003】

アルツハイマー病（ＡＤ）は、加齢性認知症の最も一般的な原因であり、年間推定５７０万人のアメリカ人に影響を及ぼしている（Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ａｓｓｏｃｉａｔｉｏｎ．２０１８ Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ｄｉｓｅａｓｅ Ｆａｃｔｓ ａｎｄ Ｆｉｇｕｒｅｓ．Ａｌｚｈｅｉｍｅｒ’ｓ Ｄｅｍｅｎｔ．２０１８；１４（３）：３６７－４２９）。ＡＤは、顕在的な臨床症状が現れる前に、脳内にβ－アミロイド斑が蓄積することを特徴とする。このような顕在的な臨床症状には、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、ならびに進行性認知症を含む、認知障害が含まれる。

【0004】

ダウン症（ＤＳ）患者は、早期発症アルツハイマー病（ＡＤ ｉｎ ＤＳ）を経験する可能性があり、ＤＳ患者の多くは４０歳までにアミロイド斑の形成が観察され、ダウン症患者の５０％超では５０歳までにアルツハイマー型認知症が観察される。

【0005】

脳アミロイド血管症（ＣＡＡ）は、ＣＮＳの血管にβ－アミロイドが沈着することを特徴とする関連疾患である。ＣＡＡは、剖検時にＡＤ患者において観察されることが多いが、ＡＤの臨床徴候がなくても加齢と関連している。

【0006】

ＡＤ、ＡＤ ｉｎ ＤＳ、及びＣＡＡは、いずれもβ－アミロイド斑の異常な蓄積を特徴とする。β－アミロイド（Ａβ）は、ＡＰＰがα－、β－、及びγ－セクレターゼによってプロセシングされる際の、アミロイド前駆体タンパク質（ＡＰＰ）に由来する。４２のアミノ酸フラグメントＡβに加えて、ＡＰＰの他の様々なフラグメントも形成され、そのうちのいくつかは、ＡＤにおける認知症の発症に寄与すると考えられている（Ｎｈａｎ，ｅｔ ａｌ．，“Ｔｈｅ ｍｕｌｔｉｆａｃｅｔｅｄ ｎａｔｕｒｅ ｏｆ ａｍｙｌｏｉｄ ｐｒｅｃｕｒｓｏｒ ｐｒｏｔｅｉｎ ａｎｄ ｉｔｓ ｐｒｏｔｅｏｌｙｔｉｃ ｆｒａｇｍｅｎｔｓ： ｆｒｉｅｎｄｓ ａｎｄ ｆｏｅｓ”，Ａｃｔａ Ｎｅｕｒｏｐａｔｈ．，２０１５，１２９（１）：１－１９に概説される）。ＡＤ ｉｎ ＤＳ患者における発症率の増加は、２１番染色体上に存在するＡＰＰ遺伝子のコピー数の増加に直接関係していると考えられている。

【0007】

特定のＲＮＡｉ化合物について説明されてきた。ＲＮＡｉ化合物は、ＲＮＡサイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）と相互作用し、最終的に標的核酸を切断する。例えば、Ｓｈａｒｐ ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．１５：４８５；Ｂｅｒｎｓｔｅｉｎ，ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｎａｔｕｒｅ，４０９：３６３；Ｎｙｋａｎｅｎ，ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｃｅｌｌ，１０７：３０９；Ｅｌｂａｓｈｉｒ，ｅｔ ａｌ．，２００１，Ｇｅｎｅｓ Ｄｅｖ．１５：１８８；Ｌｉｍａ ｅｔ ａｌ．，（２０１２） Ｃｅｌｌ １５０：８８３－８９４を参照のこと。

【0008】

現在、ＡＤ、ＡＤ ｉｎ ＤＳ、及びＣＡＡなどの神経変性疾患を治療するための許容可能な選択肢が不足している。したがって、そのような疾患を治療するための化合物、方法、及び医薬組成物を提供することが、本明細書の目的である。

【発明の概要】

【0009】

ＡＰＰ ＲＮＡの量または活性を低下させ、特定の実施形態においては、細胞または動物におけるＡＰＰタンパク質の量を低下させるための、化合物、方法、及び医薬組成物を提供する。特定の実施形態では、動物は、神経変性疾患に罹患する。特定の実施形態では、動物は、アルツハイマー病（ＡＤ）に罹患する。特定の実施形態では、動物は、ダウン症候群と関連したアルツハイマー病（ＡＤ ｉｎ ＤＳ）に罹患する。特定の実施形態では、動物は、脳アミロイド血管症（ＣＡＡ）に罹患する。特定の実施形態では、ＡＰＰ ＲＮＡの発現を減少させるのに有用な化合物は、オリゴマー化合物である。特定の実施形態では、ＡＰＰ ＲＮＡの発現を減少させるのに有用な化合物は、修飾オリゴヌクレオチドである。

【0010】

また、神経変性疾患の少なくとも１つの症状または特徴を改善するのに有用な方法も提供される。特定の実施形態では、神経変性疾患はアルツハイマー病である。特定の実施形態では、神経変性疾患はダウン症患者におけるアルツハイマー病である。特定の実施形態では、神経変性疾患は脳アミロイド血管症（ＣＡＡ）である。特定の実施形態では、症状または特徴には、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、または異常なアミロイド沈着を含む、認知障害が含まれる。

【発明を実施するための形態】

【0011】

当該一般的な説明及び以下の詳細な説明はどちらも例示的かつ説明的であるにすぎず、限定するものではないと理解すべきである。本明細書において、単数形の使用は、別段の明示がある場合を除き、複数形を含む。本明細書で使用される場合、「または（ｏｒ）」の使用は、別段の言明がある場合を除き、「及び／または（ａｎｄ／ｏｒ）」を意味する。さらに、「～を含む（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに「～を含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」及び「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」などの他の形態の使用は、限定的ではない。また、「要素」または「成分」などの用語は、別段の言明がある場合を除き、１つのユニットを含む要素及び成分と２つ以上のサブユニットを含む要素及び成分をどちらも包含する。

【0012】

本明細書で使用する節の見出しは、構成上の目的のためだけにあり、記述の主題を限定するものとして解釈されるべきではない。本出願に挙げる全ての文書、または文書の部分は、これらに限定されないが、特許、特許出願、記事、書籍、及び論文を含み、本明細書で検討する文書の部分を参照することにより、その全体が本明細書に明示的に組み込まれる。

【0013】

定義
特定の定義が与えられない限り、本明細書に記載する分析化学、合成有機化学、ならびに医化学及び製薬化学に関連して用いられる術語、ならびにそれらの手順及び技法は、周知であり、当技術分野で一般に使用されるものである。許可されている場合、本開示全体を通じて言及されている全ての特許、出願、公開出願及び他の刊行物、ならびに他のデータは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0014】

別段の指示がある場合を除き、以下の用語は、以下の意味を有する。

【0015】

定義
本明細書で使用される場合、「２’－デオキシヌクレオシド」は、２’－Ｈ（Ｈ）デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。特定の実施形態では、２’－デオキシヌクレオシドは、２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドであり、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含み、これは、天然に存在するデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）に見られるようなβ－Ｄ配置を有する。特定の実施形態では、２’－デオキシヌクレオシド、または非修飾２’－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含み得るか、またはＲＮＡ核酸塩基（ウラシル）を含み得る。

【0016】

本明細書で使用される場合、「２’－置換ヌクレオシド」は、２’－置換糖部分を含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用される場合、糖部分に関する「２’－置換」は、ＨまたはＯＨ以外の少なくとも１つの２’－置換基を含む糖部分を意味する。

【0017】

本明細書で使用される場合、「３’標的部位」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸にハイブリダイズされる場合、アンチセンスオリゴヌクレオチドに相補的である標的核酸の最も３’側のヌクレオチドを指す。

【0018】

本明細書で使用される場合、「５’標的部位」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸にハイブリダイズされる場合、アンチセンスオリゴヌクレオチドに相補的である標的核酸の最も５’側のヌクレオチドを指す。

【0019】

本明細書で使用される場合、「５－メチルシトシン」は、５位に結合したメチル基で修飾されたシトシンを意味する。５－メチルシトシンは、修飾核酸塩基である。

【0020】

本明細書で使用される場合、「脱塩基糖部分」は、核酸塩基に結合していないヌクレオシドの糖部分を意味する。そのような脱塩基糖部分は、当技術分野では「脱塩基ヌクレオシド」と呼ばれることがある。

【0021】

本明細書で使用される場合、「投与」または「投与すること」は、動物に薬剤または組成物を提供することを意味する。

【0022】

本明細書で使用される場合、「動物」は、ヒトまたは非ヒト動物を意味する。

【0023】

本明細書で使用される場合、「アンチセンス活性」は、アンチセンス化合物のその標的核酸へのハイブリダイゼーションに起因する任意の検出可能及び／または計測可能な変化を意味する。特定の実施形態では、アンチセンス活性は、アンチセンス化合物の非存在下での標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルと比較した、かかる標的核酸によってコードされる標的核酸またはタンパク質の量または発現の減少である。

【0024】

本明細書で使用される場合、「アンチセンス化合物」は、少なくとも１つのアンチセンス活性を達成することができるオリゴマー化合物を意味する。

【0025】

本明細書で使用される場合、「アンチセンスオリゴヌクレオチド」は、標的核酸に相補的であり、少なくとも１つのアンチセンス活性を達成することができるオリゴマー化合物のオリゴヌクレオチド部分を含む、オリゴヌクレオチドを意味する。アンチセンスオリゴヌクレオチドには、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮａｓｅ Ｈオリゴヌクレオチドが含まれるが、これらに限定されない。

【0026】

本明細書で使用される場合、治療に関する「改善」は、治療がない場合の同じ症状と比較して、少なくとも１つの症状に改善が見られることを意味する。特定の実施形態では、改善は、症状の重症度もしくは頻度の低下、または症状の重症度もしくは頻度における発症の遅延もしくは進行の遅延である。特定の実施形態では、症状または特徴は、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、または異常なアミロイド沈着を含む、認知障害である。

【0027】

本明細書で使用される場合、「二環式ヌクレオシド」または「ＢＮＡ」は、二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0028】

本明細書で使用される場合、「二環式糖」または「二環式糖部分」は、２つの環を含む修飾糖部分を意味し、第２の環は、第１の環における原子の２つを接続する架橋を介して形成されることにより、二環式構造を形成する。特定の実施形態では、二環式糖部分の第１の環は、フラノシル部分である。特定の実施形態では、二環式糖部分は、フラノシル部分を含まない。

【0029】

本明細書で使用される場合、２つのオリゴヌクレオチドによって形成される二重鎖に関する「平滑」または「平滑末端」は、末端の対になっていないヌクレオチドがない（すなわち、オーバーハングヌクレオチドがない）ことを意味する。二本鎖ＲＮＡｉ化合物の一端または両末端は平滑であってもよい。

【0030】

本明細書で使用される場合、「切断可能な部分」は、生理学的条件下で、例えば、細胞、動物、またはヒトの内部で切断される結合または原子団を意味する。

【0031】

本明細書で使用される場合、オリゴヌクレオチドに関する「相補的」は、オリゴヌクレオチドまたはその１つ以上の領域の核酸塩基、及び別の核酸またはその１つ以上の領域の核酸塩基の少なくとも７０％が、オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列及び他の核酸が対向する方向にアラインメントしている場合、互いに水素結合することができることを意味する。相補的核酸塩基とは、互いに水素結合を形成することができる核酸塩基を意味する。相補的な核酸塩基対には、アデニン（Ａ）及びチミン（Ｔ）、アデニン（Ａ）及びウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）及びグアニン（Ｇ）、５－メチルシトシン（ｍＣ）及びグアニン（Ｇ）が挙げられる。天然の核酸塩基または他の修飾核酸塩基と対になる特定の修飾核酸塩基は、当技術分野で知られている。例えば、イノシンは、アデノシン、シトシン、またはウラシルと対形成することができる。相補的オリゴヌクレオチド及び／または核酸は、各ヌクレオシドにおける核酸塩基相補性を有することを必要としない。むしろ、いくつかのミスマッチが許容される。本明細書で使用される場合、オリゴヌクレオチドに関して「完全に相補的な」または「１００％相補的な」は、オリゴヌクレオチドが、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドにおいて別のオリゴヌクレオチドまたは核酸に相補的であることを意味する。

【0032】

本明細書で使用される場合、「共役基」は、オリゴヌクレオチドに直接結合される原子団を意味する。共役基には、共役部分と、共役部分をオリゴヌクレオチドに結合する共役リンカーが含まれる。

【0033】

本明細書で使用される場合、「共役リンカー」は、共役部分をオリゴヌクレオチドに接続する少なくとも１つの結合を含む単結合または原子団を意味する。

【0034】

本明細書で使用される場合、「共役部分」は、共役リンカーを介してオリゴヌクレオチドに結合する原子団を意味する。

【0035】

本明細書で使用される場合、オリゴヌクレオチドの文脈における「連続した」は、互いに直接隣接するヌクレオシド、核酸塩基、糖部分、またはヌクレオシド間結合を指す。例えば、「連続した核酸塩基」は、配列において互いに直接隣接する核酸塩基を意味する。

【0036】

本明細書で使用される場合、「拘束エチル」または「ｃＥｔ」または「ｃＥｔ修飾糖部分」は、二環式糖の第２の環が、β－Ｄリボシル糖部分の４’炭素及び２’炭素を接続する架橋を介して形成されるβ－Ｄリボシル二環式糖部分を意味し、該架橋は式４’－ＣＨ（ＣＨ_３）－Ｏ－２’を有し、該架橋のメチル基はＳ配置にある。

【0037】

本明細書で使用される場合、「ｃＥｔヌクレオシド」は、ｃＥｔ修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0038】

本明細書で使用される場合、「キラルが豊富な集団」は、同一の分子式の複数の分子を意味し、特定のキラル中心に特定の立体化学配置を含む集団内の分子の数またはパーセンテージが、特定のキラル中心がステレオランダムである場合、集団内の同じ特定のキラル中心に同じ特定の立体化学配置を含むと予想される分子の数またはパーセンテージよりも大きい。各分子内に複数のキラル中心を有する分子のキラルが豊富な集団は、１つ以上のステレオランダムキラル中心を含有することができる。特定の実施形態では、分子は修飾オリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、分子は修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物である。

【0039】

本明細書で使用される場合、「二本鎖」は、互いにハイブリダイズした核酸（オリゴヌクレオチドを含むが、これに限定されない）の相補鎖によって形成される二重鎖を意味する。特定の実施形態では、二本鎖領域の２本の鎖は別個の分子である。特定の実施形態では、２本の鎖は、それ自体の上に折りたたまれた同じ分子の領域である（例えば、ヘアピン構造）。

【0040】

本明細書で使用される場合、「二重鎖」または「二重鎖領域」は、互いにハイブリダイズする２つのオリゴヌクレオチドまたはその部分によって形成される構造を意味する。

【0041】

本明細書で使用される場合、「ギャップマー」は、１個以上のヌクレオシドを有する外部領域の間に配置されたＲＮａｓｅ Ｈ切断を支持する複数のヌクレオシドを有する内部領域を含む修飾オリゴヌクレオチドを意味し、該内部領域を含むヌクレオシドの少なくとも１つが、各外部領域の少なくとも１個のヌクレオシドとは化学的に異なる。具体的には、内部領域と各外部領域の境界を定義するヌクレオシドは、化学的に異なる必要がある。内部領域は「ギャップ」と呼んでもよく、外部領域は「ウィング」と呼んでもよい。別段の指示がある場合を除き、「ギャップマー」は糖モチーフを指す。特定の実施形態では、ギャップの各ヌクレオシドの糖部分は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分である。特定の実施形態では、ギャップは、ギャップの１、２、３、４、または５位に１個の２’－置換ヌクレオシドを含み、ギャップのヌクレオシドの残りは２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドである。別段の指示がある場合を除き、ギャップマーは、１個以上の修飾ヌクレオシド間結合及び／または修飾核酸塩基を含み得、そのような修飾は、必ずしも糖修飾のギャップマーパターンに従うとは限らない。本明細書で使用される場合、「混合ギャップマー」という用語は、２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドを含むギャップと、少なくとも２つの異なる糖修飾を含む修飾ヌクレオシドを含むウィングを有するギャップマーを指す。

【0042】

本明細書で使用される場合、「ホットスポット領域」は、標的核酸上の核酸塩基の範囲であり、オリゴマー化合物の介在によるその標的核酸の量または活性の低下の影響を受けやすい範囲である。

【0043】

本明細書で使用される場合、「ハイブリダイゼーション」は、相補的なオリゴヌクレオチド及び／または核酸の対形成またはアニーリングを意味する。特定の機構に限定するわけではないが、ハイブリダイゼーションの最も一般的な機構では水素結合を伴い、これは、相補的な核酸塩基間のワトソン－クリック型、フーグスティーン型または逆フーグスティーン型の水素結合であり得る。

【0044】

本明細書で使用される場合、「ヌクレオシド間結合」は、オリゴヌクレオチド中の隣接したヌクレオシド間の共有結合である。本明細書で使用される場合、「修飾ヌクレオシド間結合」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合以外の任意のヌクレオシド間結合を意味する。「ホスホロチオエートヌクレオシド間結合」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合の非架橋酸素原子のうちの１つが硫黄原子で置換された、修飾されたヌクレオシド間結合である。

【0045】

本明細書で使用される場合、「逆位ヌクレオシド（ｉｎｖｅｒｔｅｄ ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅ）」は、本明細書に示されるように、３’から３’及び／または５’から５’のヌクレオシド間結合を有するヌクレオチドを意味する。

【0046】

本明細書で使用される場合、「逆位糖部分（ｉｎｖｅｒｔｅｄ ｓｕｇａｒ ｍｏｉｅｔｙ）」は、３’から３’及び／または５’から５’のヌクレオシド間結合を有する、逆位ヌクレオシドの糖部分または脱塩基糖部分を意味する。

【0047】

本明細書で使用される場合、「リンカー－ヌクレオシド」は、オリゴヌクレオチドを共役部分に直接的または間接的に連結するヌクレオシドを意味する。リンカー－ヌクレオシドは、オリゴマー化合物の共役リンカー内に位置する。リンカー－ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドと連続している場合でも、オリゴマー化合物のオリゴヌクレオチド部分の一部とは見なされない。

【0048】

「脂質ナノ粒子」または「ＬＮＰ」は、核酸分子、例えば、ＲＮＡｉまたはＲＮＡｉが転写されるプラスミドなどの薬学的に活性な分子をカプセル化する脂質層を含む小胞である。ＬＮＰは、例えば、米国特許第６，８５８，２２５号、第６，８１５，４３２号、第８，１５８，６０１号、及び第８，０５８，０６９号に記載されており、その全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。

【0049】

本明細書で使用される場合、「非二環式修飾糖部分」は、第２の環を形成するための糖の２つの原子間に架橋を形成しない、置換基などの修飾を含む修飾糖部分を意味する。

【0050】

本明細書で使用される場合、「ミスマッチ」または「非相補的」は、第１及び第２の核酸配列がアラインメントされている場合に、第２の核酸配列または標的核酸の対応する核酸塩基と相補的ではない第１の核酸配列の核酸塩基を意味する。

【0051】

本明細書で使用される場合、「ＭＯＥ」はＯ－メトキシエチルを意味する。「２’－ＭＯＥ」または「２’－ＭＯＥ修飾糖」は、リボシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりに２’－ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３基を意味する。本明細書で使用される場合、「２’－ＭＯＥヌクレオシド」は、２’－ＭＯＥ糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0052】

本明細書で使用される場合、「モチーフ」は、オリゴヌクレオチドにおける、非修飾及び／または修飾糖部分、核酸塩基、及び／またはヌクレオシド間結合のパターンを意味する。

【0053】

本明細書で使用される場合、「神経変性疾患」は、神経機能の喪失及びニューロンの死を含む、機能または構造の進行性の喪失によって特徴付けられる状態を意味する。特定の実施形態では、神経変性疾患はアルツハイマー病である。特定の実施形態では、神経変性疾患はダウン症患者におけるアルツハイマー病である。特定の実施形態では、神経変性疾患は脳アミロイド血管症である。

【0054】

本明細書で使用される場合、「核酸塩基」は、非修飾核酸塩基または修飾核酸塩基を意味する。核酸塩基は複素環式部分である。本明細書で使用される場合、「非修飾核酸塩基」は、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）、ウラシル（Ｕ）、またはグアニン（Ｇ）である。本明細書で使用される場合、「修飾核酸塩基」は、少なくとも１つの他の核酸塩基と対形成することができる、非修飾Ａ、Ｔ、Ｃ、Ｕ、またはＧ以外の原子団である。「５－メチルシトシン」は、修飾核酸塩基である。ユニバーサル塩基は、５つの非修飾核酸塩基の任意の１つと対形成できる修飾核酸塩基である。

【0055】

本明細書で使用される場合、「核酸塩基配列」は、任意の糖またはヌクレオシド間結合修飾と関係のない核酸またはオリゴヌクレオチドの連続した核酸塩基の順序を意味する。

【0056】

本明細書で使用される場合、「ヌクレオシド」は、核酸塩基及び糖部分を含む化合物または化合物のフラグメントを意味する。核酸塩基及び糖部分は、それぞれ独立して、非修飾であるか、または修飾される。

【0057】

本明細書で使用される場合、「ヌクレオシドオーバーハング」は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのハイブリダイゼーションによって形成された二重鎖の一方または両末端にある対になっていないヌクレオチドを指す。

【0058】

本明細書で使用される場合、「修飾ヌクレオシド」は、修飾核酸塩基及び／または修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0059】

本明細書で使用される場合、「連結ヌクレオシド」は、連続した配列で接続されているヌクレオシドである（すなわち、連結されたものの間に追加のヌクレオシドが存在しない）。

【0060】

本明細書で使用される場合、「オリゴマー化合物」は、オリゴヌクレオチド、及び任意選択で、共役基または末端基などの１つ以上の追加の特徴を意味する。オリゴマー化合物は、第１のオリゴマー化合物に相補的であるか、または対になっていない可能性がある第２のオリゴマー化合物と対形成し得る。「一本鎖オリゴマー化合物」は、対になっていないオリゴマー化合物である。「オリゴマー二重鎖」という用語は、相補的な核酸塩基配列を有する２つのオリゴマー化合物によって形成される二重鎖を意味する。オリゴマー二重鎖の各オリゴマー化合物は、「二重鎖オリゴマー化合物」と呼ばれることがある。

【0061】

本明細書で使用される場合、「オリゴヌクレオチド」は、ヌクレオシド間結合を介して接続した連結ヌクレオシドのポリマーを意味し、各ヌクレオシド及びヌクレオシド間結合は修飾されても、または非修飾でもよい。別段の指示がある場合を除き、オリゴヌクレオチドは８～５０個の連結ヌクレオシドからなる。オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドに相補的な第２のオリゴヌクレオチドと対形成し得るか、または対にならない可能性がある。「一本鎖オリゴヌクレオチド」は、対になっていないオリゴヌクレオチドである。「二本鎖オリゴヌクレオチド」は、第２のオリゴヌクレオチドと対形成されるオリゴヌクレオチドである。「オリゴヌクレオチド二重鎖」は、相補的な核酸塩基配列を有する２つの対形成されたオリゴヌクレオチドによって形成される二重鎖を意味する。オリゴヌクレオチド二重鎖の各オリゴは、「二重鎖オリゴヌクレオチド」または「二本鎖オリゴヌクレオチド」である。

【0062】

本明細書で使用される場合、「修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも１個のヌクレオシドまたはヌクレオシド間結合が修飾されている、オリゴヌクレオチドを意味する。本明細書で使用される場合、「非修飾オリゴヌクレオチド」は、いずれのヌクレオシド修飾またはヌクレオシド間修飾も含まないオリゴヌクレオチドを意味する。したがって、非修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、ＤＮＡまたはＲＮＡヌクレオシドであり、各ヌクレオシド間結合はホスホジエステル結合である。

【0063】

本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体または希釈剤」は、動物への投与に使用するのに好適な任意の物質を意味する。このような特定の担体は、対象による経口摂取用の医薬組成物、例えば、錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー剤、懸濁剤、及びロゼンジ剤の製剤化を可能にする。特定の実施形態では、薬学的に許容される担体または希釈剤は、滅菌水、滅菌生理食塩水、滅菌緩衝液、または滅菌人工脳脊髄液である。

【0064】

本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される塩」は、化合物の生理学的及び薬学的に許容される塩を意味する。薬剤的に許容される塩は、親化合物の所望の生物学的活性を保持し、かつそれに望ましくない毒物学的影響を与えない。

【0065】

本明細書で使用される場合、「医薬組成物」は、対象への投与に好適な物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は、オリゴマー化合物及び無菌水溶液を含み得る。特定の実施形態では、医薬組成物は、特定の細胞株におけるフリー取込みアッセイ（ｆｒｅｅ ｕｐｔａｋｅ ａｓｓａｙ）において活性を示す。

【0066】

本明細書で使用される場合、「プロドラッグ」は、動物またはその細胞内で第２の形態に変換される、体外にある第１の形態の治療薬を意味する。典型的には、プロドラッグの動物内での変換は、細胞または組織に存在する酵素（例えば、内因性またはウイルス性酵素）もしくは化学物質の作用によって、及び／または生理学的条件によって促進される。特定の実施形態では、プロドラッグの第１の形態は、第２の形態よりも活性が低い。

【0067】

本明細書で使用される場合、「量または活性を低下させるかまたは阻害する」は、未処置試料または対照試料における転写発現または活性と比べた、転写発現または活性の低下または遮断を指し、必ずしも転写発現または活性の完全消失を示すわけではない。

【0068】

本明細書で使用される場合、「ＲＮＡｉ化合物」は、少なくとも部分的に、ＲＩＳＣまたはＡｇｏ２を介して作用して、標的核酸及び／または標的核酸によってコードされるタンパク質を調節するアンチセンス化合物を意味する。ＲＮＡｉ化合物としては、二本鎖ｓｉＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡ（ｓｓＲＮＡ）、及びマイクロＲＮＡ模倣物を含むマイクロＲＮＡが挙げられるが、これに限定されるものではない。ＲＮＡｉ化合物は、共役基及び／または末端基を含み得る。特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物は、標的核酸の量、活性、及び／またはスプライシングを調節する。ＲＮＡｉ化合物という用語では、ＲＮａｓｅ Ｈを介して作用するアンチセンス化合物は除外される。

【0069】

本明細書で使用される場合、「ＲＮＡｉオリゴヌクレオチド」は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドまたはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを意味する。

【0070】

本明細書で使用される場合、「アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド」は、標的配列に相補的であり、ＲＮＡｉに好適な少なくとも１つの化学修飾を含む領域を含むオリゴヌクレオチドを意味する。

【0071】

本明細書で使用される場合、「センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド」は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの領域に相補的であり、そのようなアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと二重鎖を形成することができる領域を含むオリゴヌクレオチドを意味する。アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドによって形成される二重鎖は、二本鎖ＲＮＡｉ化合物（ｄｓＲＮＡｉ）または短鎖干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）と呼ばれる。

【0072】

本明細書で使用される場合、「ＲＮａｓｅ Ｈ化合物」は、少なくとも部分的に、ＲＮａｓｅ Ｈを介して作用して、標的核酸及び／または標的核酸によってコードされるタンパク質を調節するアンチセンス化合物を意味する。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ化合物は一本鎖である。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ化合物は二本鎖である。ＲＮａｓｅ Ｈ化合物は、共役基及び／または末端基を含み得る。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ化合物は、標的核酸の量または活性を調節する。ＲＮａｓｅ Ｈ化合物という用語は、主にＲＩＳＣ／Ａｇｏ２を介して作用するアンチセンス化合物を除外する。

【0073】

本明細書で使用される場合、「アンチセンスＲＮａｓｅ Ｈオリゴヌクレオチド」は、標的配列に相補的であり、ＲＮａｓｅ Ｈの介在による核酸還元に好適な少なくとも１つの化学修飾を含む領域を含むオリゴヌクレオチドを意味する。

【0074】

本明細書で使用される場合、オリゴヌクレオチドに関して「自己相補的な」は、それ自体に対して少なくとも部分的にハイブリダイズするオリゴヌクレオチドを意味する。

【0075】

本明細書で使用される場合、「一本鎖」は、対になっておらず、二重鎖の一部ではない核酸（オリゴヌクレオチドを含むが、これに限定されない）を意味する。一本鎖化合物は、相補的な核酸とハイブリダイズして二重鎖を形成することができ、その時点で、それらはもはや一本鎖ではない。

【0076】

本明細書で使用される場合、「安定化したリン酸基」は、ＤＮＡまたはＲＮＡ上で天然に生じる５’－リン酸よりも代謝的により安定である５’－リン酸類似体を意味する。

【0077】

本明細書で使用される場合、「標準細胞アッセイ」は、実施例１または５に記載のアッセイ及びその合理的な変形を意味する。

【0078】

本明細書で使用される場合、同一の分子式の分子の集団の文脈における「ステレオランダムキラル中心」は、ランダムな立体化学的配置を有するキラル中心を意味する。例えば、ステレオランダムキラル中心を含む分子の集団において、ステレオランダムキラル中心の（Ｓ）配置を有する分子の数は、ステレオランダムキラル中心の（Ｒ）配置を有する分子の数と同じであり得るが、必ずしも同じではない。キラル中心の立体化学的配置は、立体化学的配置を制御するように設計されていない合成方法の結果である場合、ランダムであると見なされる。特定の実施形態では、ステレオランダムキラル中心は、ステレオランダムホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。

【0079】

本明細書で使用される場合、「糖部分」は、非修飾糖部分または修飾糖部分を意味する。本明細書で使用される場合、「非修飾糖部分」は、ＲＮＡに見られるような２’－ＯＨ（Ｈ）リボシル部分（「非修飾ＲＮＡ糖部分」）、またはＤＮＡに見られるような２’－Ｈ（Ｈ）デオキシリボシル糖部分（「非修飾ＤＮＡ糖部分」）を意味する。非修飾糖部分は、１’、３’、及び４’位の各々に１個の水素、３’位に１個の酸素、５’位に２個の水素を有する。本明細書で使用される場合、「修飾糖部分」または「修飾糖」は、修飾フラノシル糖部分または糖代替物を意味する。

【0080】

本明細書で使用される場合、「糖代替物」は、別の基（例えば、オリゴヌクレオチドのヌクレオシド間結合、共役基、または末端基）に核酸塩基を連結することができる、フラノシル糖部分以外を有する修飾糖部分を意味する。糖代替物を含む修飾ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチド内の１つ以上の位置に組み込むことができ、そのようなオリゴヌクレオチドは、相補的なオリゴマー化合物または標的核酸にハイブリダイズすることができる。

【0081】

本明細書で使用される場合、「症状または特徴」は、疾患または障害の存在または程度を示す物理的特徴または試験結果を意味する。特定の実施形態では、症状は、対象、または該対象を検査もしくは試験する医療専門家にとって明らかなものである。特定の実施形態では、特徴は、死後検査を含むが、これに限定されない侵襲的診断検査で明らかである。

【0082】

本明細書で使用される場合、「標的核酸」及び「標的ＲＮＡ」は、アンチセンス化合物が影響を与えるように設計されている核酸を意味する。標的ＲＮＡとはＲＮＡ転写産物を意味し、別様に明記されない限り、プレｍＲＮＡ及びｍＲＮＡが含まれる。

【0083】

本明細書で使用される場合、「標的領域」は、オリゴマー化合物がハイブリダイズするように設計される標的核酸の一部を意味する。

【0084】

本明細書で使用される場合、「末端基」は、オリゴヌクレオチドの末端に共有結合する、化学基または原子団を意味する。

【0085】

本明細書で使用される場合、「治療有効量」は、動物に治療効果をもたらす薬剤または組成物の量を意味する。例えば、治療有効量は、病気の症状を改善する。

【0086】

特定の実施形態
本開示は、以下の非限定的な番号付けされた実施形態を提供する。

【0087】

実施形態１．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも８０％相補的であり、該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖、糖代替物、及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、該オリゴマー化合物。

【0088】

実施形態２．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、配列番号１２～５０１のいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８の核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、オリゴマー化合物。

【0089】

実施形態３．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、配列番号５０２～５１６のいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９または２０の核酸塩基を含む核酸塩基配列を有する、オリゴマー化合物。

【0090】

実施形態４．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、
配列番号１の核酸塩基４０～７８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６９～１４６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基８３～１２９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１９４～２３１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１９４～２３８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６～２６８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２５８～２８４の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２８５～３１１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２９６～３２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３０７～３３０の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３３９～３８３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１５～４３９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１５～４７７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５０６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５２３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５４１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基５３０～５５７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６３６～６６１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６５２～６９７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基９２０～９５０の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１１５２～１１７９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２２７～１２６５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２２７～１２７４の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５１８～１５４３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５３１～１５９３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５４４～１５９３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１６３５～１６５７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１７７８～１８００の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１８８２～１９０８の等長部分、または
配列番号１の核酸塩基２０５１～２０７４の等長部分の、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、または少なくとも２０個の連続した核酸塩基に相補的な核酸塩基配列を有する、オリゴマー化合物。

【0091】

実施形態５．該修飾オリゴヌクレオチドが、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体にわたって測定した場合に、配列番号１～７の核酸塩基配列のいずれかに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％相補的である核酸塩基配列を有する、実施形態１～４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0092】

実施形態６．該修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１～５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0093】

実施形態７．該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態６に記載のオリゴマー化合物。

【0094】

実施形態８．該修飾オリゴヌクレオチドが、二環式糖部分を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態７に記載のオリゴマー化合物。

【0095】

実施形態９．該修飾オリゴヌクレオチドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含み、該２’－４’橋が、－Ｏ－ＣＨ_２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ_３）－から選択される、実施形態８に記載のオリゴマー化合物。

【0096】

実施形態１０．該修飾オリゴヌクレオチドが、非二環式修飾糖部分を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態５～９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0097】

実施形態１１．該修飾オリゴヌクレオチドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含む少なくとも１個のヌクレオシドと、非二環式修飾糖部分を含む少なくとも１個のヌクレオシドと、を含む、実施形態７に記載のオリゴマー化合物。

【0098】

実施形態１２．該非二環式修飾糖部分が、２’－ＭＯＥ修飾糖部分または２’－ＯＭｅ修飾糖部分である、実施形態１０または１１に記載のオリゴマー化合物。

【0099】

実施形態１３．該二環式修飾糖部分が、２’－４’橋を有し、該２’－４’橋が、－Ｏ－ＣＨ_２及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ_３）－から選択される、実施形態１１に記載のオリゴマー化合物。

【0100】

実施形態１４．該修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１～１３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0101】

実施形態１５．該修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ及びＰＮＡから選択される糖代替物を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１４に記載のオリゴマー化合物。

【0102】

実施形態１６．該修飾オリゴヌクレオチドが、
１～５個の連結した５’領域ヌクレオシドからなる５’領域、
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
１～５個の連結した３’領域ヌクレオシドからなる３’領域、を含む糖モチーフを有し、
該５’－領域ヌクレオシドの各々及び該３’－領域ヌクレオシドの各々が修飾糖部分を含み、該中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態１～１３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0103】

実施形態１７．該修飾オリゴヌクレオチドが、
５個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
５個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
該５’－領域ヌクレオシドの各々及び該３’－領域ヌクレオシドの各々がｃＥｔ修飾糖部分または２’－ＭＯＥ修飾糖部分のいずれかを含み、該中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態１６に記載のオリゴマー化合物。

【0104】

実施形態１８．該修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態１～１７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0105】

実施形態１９．該修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態１８に記載のオリゴマー化合物。

【0106】

実施形態２０．少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１８または１９に記載のオリゴマー化合物。

【0107】

実施形態２１．該修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態１８または２０に記載のオリゴマー化合物。

【0108】

実施形態２２．各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合から独立して選択される、実施形態１８、２０、または２１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0109】

実施形態２３．該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾核酸塩基を含む、実施形態１～２２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0110】

実施形態２４．該修飾核酸塩基が５－メチルシトシンである、実施形態２３に記載のオリゴマー化合物。

【0111】

実施形態２５．該修飾オリゴヌクレオチドが、１２～２２、１２～２０、１４～１８、１４～２０、１５～１７、１５～２５、１６～２０、１６～１８、１８～２２、または１８～２０個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１～２４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0112】

実施形態２６．該修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１～２５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0113】

実施形態２７．該修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１～２５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0114】

実施形態２８．該修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態１～２７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0115】

実施形態２９．共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む、実施形態１～２７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0116】

実施形態３０．該共役リンカーが単結合からなる、実施形態２９に記載のオリゴマー化合物。

【0117】

実施形態３１．該共役リンカーが切断可能である、実施形態２９に記載のオリゴマー化合物。

【0118】

実施形態３２．該共役リンカーが１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む、実施形態２９に記載のオリゴマー化合物。

【0119】

実施形態３３．該共役基が、該修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で該修飾オリゴヌクレオチドに結合される、実施形態２９～３２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0120】

実施形態３４．該共役基が、該修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で該修飾オリゴヌクレオチドに結合される、実施形態２９～３２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0121】

実施形態３５．末端基を含む、実施形態１～２７及び２９～３４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0122】

実施形態３６．該オリゴマー化合物が一本鎖オリゴマー化合物である、実施形態１～３５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0123】

実施形態３７．該オリゴマー化合物がリンカー－ヌクレオシドを含まない、実施形態１～３１または３３～３６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0124】

実施形態３８．実施形態１～２７、２９～３５、または３７のいずれかに記載のオリゴマー化合物を含むオリゴマー二重鎖。

【0125】

実施形態３９．実施形態１～３７のいずれかに記載のオリゴマー化合物または実施形態３８に記載のオリゴマー二重鎖を含むか、またはそれらからなるアンチセンス化合物。

【0126】

実施形態４０．実施形態１～３７のいずれかに記載のオリゴマー化合物、または実施形態３８に記載のオリゴマー二重鎖、及び薬学的に許容される担体もしくは希釈剤を含む、医薬組成物。

【0127】

実施形態４１．該薬学的に許容される希釈剤が、人工脳脊髄液、滅菌生理食塩水、またはＰＢＳである、実施形態４０に記載の医薬組成物。

【0128】

実施形態４２．該医薬組成物が、該修飾オリゴヌクレオチド及び滅菌生理食塩水から本質的になる、実施形態４１に記載の医薬組成物。

【0129】

実施形態４３．実施形態４０～４２のいずれかに記載の医薬組成物を動物に投与することを含む方法。

【0130】

実施形態４４．ＡＰＰに関連した疾患を治療する方法であって、ＡＰＰに関連した疾患に罹患しているかまたは発症のリスクがある個体に、実施形態４０～４２のいずれかに記載の治療有効量の医薬組成物を投与し、それによりＡＰＰに関連した該疾患を治療することを含む、該方法。

【0131】

実施形態４５．該ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、または脳アミロイド血管症である、実施形態４４に記載の方法。

【0132】

実施形態４６．該ＡＰＰ関連疾患の少なくとも１つの症状または特徴が改善される、実施形態４３～４５のいずれかに記載の方法。

【0133】

実施形態４７．該症状または特徴が、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、及び／または異常なアミロイド沈着を含む、認知障害である、実施形態４６に記載の方法。

【0134】

実施形態４８．１７～３０個の連結したヌクレオシドからなるアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含むＲＮＡｉ化合物であって、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含む標的領域を含み、該標的領域は、ＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも９０％相補的であり、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドは、修飾糖部分または糖代替物を含む修飾ヌクレオシドである、該ＲＮＡｉ化合物。

【0135】

実施形態４９．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが１８～２５個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態４８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0136】

実施形態５０．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２０～２５個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態４８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0137】

実施形態５１．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態４８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0138】

実施形態５２．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２１個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態４８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0139】

実施形態５３．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２３個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態４８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0140】

実施形態５４．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、ＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも９５％相補的である、実施形態４８～５３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0141】

実施形態５５．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、ＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に１００％相補的である、実施形態４８～５３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0142】

実施形態５６．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、少なくとも１９個の連続した核酸塩基を含む、実施形態４８～５５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0143】

実施形態５７．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、少なくとも２１個の連続した核酸塩基を含む、実施形態４８～５５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0144】

実施形態５８．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、少なくとも２５個の連続した核酸塩基を含む、実施形態４８～５５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0145】

実施形態５９．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体を構成する、実施形態４８～５５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0146】

実施形態６０．該アンチセンスオリゴヌクレオチドの標的領域が、配列番号１～７の等長部分に相補的である、実施形態４８～５９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0147】

実施形態６１．該ＡＰＰ ＲＮＡが配列番号１～３または配列番号４～７のいずれかの核酸塩基配列を有する、実施形態４８～６０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0148】

実施形態６２．該アンチセンスＲＮＡｉ化合物の標的領域の核酸塩基配列が、配列番号５１７～６６５、８１５～８４０、または８６７～８８８のいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、１０、２１個の核酸塩基である、実施形態４８～６１のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0149】

実施形態６３．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、２’－ＮＭＡ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、またはＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む、実施形態４８～６２のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0150】

実施形態６４．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分または糖代替物を含む、実施形態４８～６３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0151】

実施形態６５．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態４８～６４のいずれかに記載の化合物。

【0152】

実施形態６６．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも９０％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態６５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0153】

実施形態６７．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態６６に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0154】

実施形態６８．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４ヌクレオシドが、２’－Ｆ修飾糖部分を含む、実施形態４８～６７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0155】

実施形態６９．２’－Ｆ修飾糖部分を含む該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドのうちの少なくとも２つが互いに隣接している、実施形態６８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0156】

実施形態７０．２’－Ｆ修飾糖部分を含む該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも３個のヌクレオシドが連続している、実施形態６９に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0157】

実施形態７１．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドが、ＧＮＡ糖代替物を含む、実施形態４８～６６または６８～７０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0158】

実施形態７２．該ＧＮＡ糖代替物が（Ｓ）－ＧＮＡである、実施形態７１に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0159】

実施形態７３．該ＧＮＡ糖代替物を含むヌクレオシドが、５’末端から数えて該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの７位にある、実施形態７１または７２に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0160】

実施形態７４．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの１個のヌクレオシドがＵＮＡである、実施形態４８～６６または６８～７３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0161】

実施形態７５．該ＵＮＡ糖代替物を含むヌクレオシドが、５’末端から数えて該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの７位にある、実施形態７４に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0162】

実施形態７６．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾核酸塩基を含む、実施形態４８～７５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0163】

実施形態７７．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも１個の核酸塩基がイノシンである、実施形態７６に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0164】

実施形態７８．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態４８～７７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0165】

実施形態７９．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態７８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0166】

実施形態８０．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択される、実施形態４８～７９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0167】

実施形態８１．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各末端にある１～３個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態７９～８０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0168】

実施形態８２．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各末端にある１～３個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシド間結合の全てがホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態８１に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0169】

実施形態８３．１７～３０個の連結したヌクレオシドからなるセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む、実施形態４８～８２のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物であって、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含むアンチセンスハイブリダイズ領域を含み、該アンチセンスハイブリダイズ領域が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの等長部分に少なくとも９０％相補的であり、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、互いにハイブリダイズして二重鎖を形成する、該ＲＮＡｉ化合物。

【0170】

実施形態８４．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが１８～２５個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態８３に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0171】

実施形態８５．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２０～２５個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態８３に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0172】

実施形態８６．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態８３に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0173】

実施形態８７．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２１個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態８３に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0174】

実施形態８８．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが２３個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態８３に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0175】

実施形態８９．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの等長部分に少なくとも９５％相補的である、実施形態８３～８８のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0176】

実施形態９０．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの等長部分に１００％相補的である、実施形態８３～８８のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0177】

実施形態９１．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域が、少なくとも２０個の連続した核酸塩基を含む、実施形態８３～９０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0178】

実施形態９２．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域が、少なくとも２１個の連続した核酸塩基を含む、実施形態８３～９０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0179】

実施形態９３．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域が、少なくとも２５個の連続した核酸塩基を含む、実施形態８３～９０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0180】

実施形態９４．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域が、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体を構成する、実施形態８３～９３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0181】

実施形態９５．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も３’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、実施形態８３～９４のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0182】

実施形態９６．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も５’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、実施形態８３～９５のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0183】

実施形態９７．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も３’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、実施形態８３～９６のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0184】

実施形態９８．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も４’側のヌクレオシドがオーバーハングヌクレオシドである、実施形態８３～９７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0185】

実施形態９９．該二重鎖が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端で平滑末端を有する、実施形態８３～９４のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0186】

実施形態１００．該二重鎖が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端で平滑末端を有する、実施形態８３～９４、または９９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0187】

実施形態１０１．少なくとも１つのオーバーハングヌクレオシドがデオキシリボヌクレオシドである、実施形態９５～９７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0188】

実施形態１０２．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態８３～１０１のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0189】

実施形態１０３．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、ＬＮＡ、ｃＥｔから選択される修飾糖部分、またはＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む、実施形態１０２に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0190】

実施形態１０４．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分または糖代替物を含む、実施形態８３～１０３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0191】

実施形態１０５．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態８３～１０４のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0192】

実施形態１０６．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態１０５に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0193】

実施形態１０７．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個のヌクレオシドが２’－Ｆ修飾糖部分を含む、実施形態８３～１０６のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0194】

実施形態１０８．２’－Ｆ修飾糖部分を含む該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも２個のヌクレオシドが互いに隣接している、実施形態８３～１０７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0195】

実施形態１０９．２’－Ｆ修飾糖部分を含む該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも３個のヌクレオシドが連続している、実施形態１０８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0196】

実施形態１１０．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドがＧＮＡである、実施形態８３～１０５または１０７～１０９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0197】

実施形態１１１．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドがＧＮＡである、実施形態８３～１０５または１０７～１０９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0198】

実施形態１１２．該ＧＮＡ糖代替物が、（Ｓ）－ＧＮＡである、実施形態１１０または１１１に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0199】

実施形態１１３．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドがＵＮＡである、実施形態８３～１０５または１０７～１０９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0200】

実施形態１１４．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドがＵＮＡである、実施形態８３～１０５または１０７～１０９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0201】

実施形態１１５．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが修飾核酸塩基を含む、実施形態８３～１１４のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0202】

実施形態１１６．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個の核酸塩基がヒポキサンチンである、実施形態１１５に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0203】

実施形態１１７．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態８３～１１６のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0204】

実施形態１１８．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１１７に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0205】

実施形態１１９．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合から選択される、実施形態１１８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0206】

実施形態１２０．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各末端にある１～３個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１１７～１１９のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0207】

実施形態１２１．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各末端の１～３個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合であり、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの残りのヌクレオシド間結合の全てがホスホジエステルヌクレオシド間結合である、実施形態１２０に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0208】

実施形態１２２．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含む、実施形態４８～１２１のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0209】

実施形態１２３．該安定化したリン酸基が、（Ｅ）－ビニルホスホネートを含む、実施形態１２２に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0210】

実施形態１２４．該安定化したリン酸基が、シクロプロピルホスホネートを含む、実施形態１２２に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0211】

実施形態１２５．該化合物が、該アンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端または両端に結合した１～５個の脱塩基糖部分を含む、実施形態４８～１２４のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0212】

実施形態１２６．該化合物が、該アンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端または両端に結合した１個の脱塩基糖部分を含む、実施形態１２５に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0213】

実施形態１２７．各脱塩基糖部分が逆位である、実施形態１２５または１２６に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0214】

実施形態１２８．該脱塩基糖部分が、ホスホロチオエート結合を介して該アンチセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドに結合している、実施形態１２５～１２７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0215】

実施形態１２９．該化合物が、該センスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端または両端に結合した１～５個の脱塩基糖部分を含む、実施形態４８～１２８のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0216】

実施形態１３０．該化合物が、該センスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端または両端に結合した１個の脱塩基糖部分を含む、実施形態１２９に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0217】

実施形態１３１．各脱塩基糖部分が逆位である、実施形態１２９または１３０に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0218】

実施形態１３２．該脱塩基糖部分が、ホスホロチオエート結合を介して該センスＲＮＡオリゴヌクレオチドに結合している、実施形態１２９～１３１のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0219】

実施形態１３３．該ＲＮＡｉ化合物がプロドラッグである、実施形態４８～１３２のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0220】

実施形態１３４．該化合物が共役基を含む、実施形態４８～１３２のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0221】

実施形態１３５．該共役基が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに共役される、実施形態１３４に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0222】

実施形態１３６．該共役基が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に共役される、実施形態１３５に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0223】

実施形態１３７．該共役基が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に共役される、実施形態１３５に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0224】

実施形態１３８．該共役基が、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに共役される、実施形態１３４に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0225】

実施形態１３９．該共役基が、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に共役される、実施形態１３８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0226】

実施形態１４０．該共役基が、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に共役される、実施形態１３８に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0227】

実施形態１４１．該共役基が、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに直接結合している、実施形態１３８～１４０のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0228】

実施形態１４２．該共役基が１～５個の脱塩基糖部分を介して該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに結合している、実施形態１３８～１４１のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0229】

実施形態１４３．該１～５個の脱塩基糖部分が逆位である、実施形態１４２に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0230】

実施形態１４４．該共役基がピロリジンリンカーを含む、実施形態１３４～１４３のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0231】

実施形態１４５．該共役基が細胞標的部分を含む、実施形態１３４～１４４のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物。

【0232】

実施形態１４６．該細胞標的部分が神経伝達物質受容体リガンドである、実施形態１４５に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0233】

実施形態１４７．該標的リガンドがＧＡＢＡトランスポーターを標的とする、実施形態１４６に記載のＲＮＡｉ化合物。

【0234】

実施形態１４８．実施形態４８～１４７のいずれかに記載のＲＮＡｉ化合物、及び薬剤的に許容される担体または希釈剤を含む、医薬組成物。

【0235】

実施形態１４９．該薬学的に許容される希釈剤が、人工脳脊髄液、滅菌生理食塩水、またはＰＢＳである、実施形態１４８に記載の医薬組成物。

【0236】

実施形態１５０．該医薬組成物が、該ＲＮＡｉ化合物及び滅菌生理食塩水から本質的になる、実施形態１４９に記載の医薬組成物。

【0237】

実施形態１５１．脂質を含む、実施形態１４８または１４９に記載の医薬組成物。

【0238】

実施形態１５２．脂質ナノ粒子を含む、実施形態１５１に記載の医薬組成物。

【0239】

実施形態１５３．実施形態１４８～１５２のいずれかに記載の医薬組成物を動物に投与することを含む方法。

【0240】

実施形態１５４．ＡＰＰに関連した疾患を治療する方法であって、ＡＰＰに関連した疾患に罹患しているかまたは発症のリスクがある個体に、実施形態１４８～１５２のいずれかに記載の治療有効量の医薬組成物を投与し、それによりＡＰＰに関連した該疾患を治療することを含む、該方法。

【0241】

実施形態１５５．該ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、または脳アミロイド血管症である、実施形態１５４に記載の方法。

【0242】

実施形態１５６．該ＡＰＰ関連疾患の少なくとも１つの症状または特徴が改善される、実施形態１５５に記載の方法。

【0243】

実施形態１５７．該症状または特徴が、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、及び／または異常なアミロイド沈着を含む、認知障害である、実施形態１５６に記載の方法。

【0244】

実施形態１５８．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも８０％相補的であり、該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖、糖代替物、及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、該オリゴマー化合物。

【0245】

実施形態１５９．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１２～５０１のうちのいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８個の核酸塩基を含み、該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、該オリゴマー化合物。

【0246】

実施形態１６０．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号５０２～５１６のうちのいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の核酸塩基を含み、該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、該オリゴマー化合物。

【0247】

実施形態１６１．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号５１７～６６５、８１５～８４０、または８６７～８８８のうちのいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、または２３個の核酸塩基を含み、該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、該オリゴマー化合物。

【0248】

実施形態１６２．１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、
配列番号１の核酸塩基４０～７８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６９～１４６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基８３～１２９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基８３～２４６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基９４～２２５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１９４～２３１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１９４～２３８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６～２６８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２５８～２８８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２８５～３１１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２９６～３２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３０７～３３０の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３２９～３５２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３３０～３５２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３３９～３８３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１５～４３９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１３～４７７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１５～４７７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５０６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５２３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５４１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基５３０～５５７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基５８１～６３８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６３６～６６１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６５２～６９７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基７２８～８２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基７７０～８２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基９２０～９５０の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１００６～１０４９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１１５２～１１７９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２２７～１２６５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２２７～１２７４の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２６８～１３３２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２６８～１３１１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２８９～１３３２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５１８～１５４３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５３１～１５９３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５４４～１５９３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１６３４～１６５７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１７７８～１８００の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１８８２～１９０８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２０５１～２０７４の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６０～３１１７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２４０２～３１１７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６０～２６５５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２４０２～２６５５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２６７５～３０５４の等長部分、または
配列番号３の核酸塩基３１９２～３２７７の等長部分の、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、または少なくとも２１個の連続した核酸塩基に相補的であり、該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、該オリゴマー化合物。

【0249】

実施形態１６３．該修飾オリゴヌクレオチドが、該修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体にわたって測定した場合に、配列番号１～７の核酸塩基配列のいずれかに少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％相補的である核酸塩基配列を有する、実施形態１５８～１６２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0250】

実施形態１６４．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、実施形態１５８～１６２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0251】

実施形態１６５．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、実施形態１６４に記載のオリゴマー化合物。

【0252】

実施形態１６６．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが二環式糖部分を含む、実施形態１６５に記載のオリゴマー化合物。

【0253】

実施形態１６７．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、該２’－４’橋が、－Ｏ－ＣＨ_２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ_３）－から選択される、実施形態１６６に記載のオリゴマー化合物。

【0254】

実施形態１６８．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、非二環式修飾糖部分を含む、実施形態１６２～１６７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0255】

実施形態１６９．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、非二環式修飾糖部分を含む、実施形態１６８に記載のオリゴマー化合物。

【0256】

実施形態１７０．該非二環式修飾糖部分が２’－ＭＯＥ修飾糖部分、２’－ＯＭｅ修飾糖部分、または２’－Ｆ修飾糖部分である、実施形態１６８または１６９に記載のオリゴマー化合物。

【0257】

実施形態１７１．該修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、糖代替物を含む、実施形態１５８～１７０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0258】

実施形態１７２．該修飾オリゴヌクレオチドが、モルホリノ及びＰＮＡから選択される糖代替物を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、実施形態１７１に記載のオリゴマー化合物。

【0259】

実施形態１７３．該修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、実施形態１５８～１７２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0260】

実施形態１７４．該修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態１７３に記載のオリゴマー化合物。

【0261】

実施形態１７５．少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態１７３または１７４に記載のオリゴマー化合物。

【0262】

実施形態１７６．該修飾オリゴヌクレオチドが少なくとも１個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、実施形態１７３または１７５に記載のオリゴマー化合物。

【0263】

実施形態１７７．各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合から独立して選択される、実施形態１７３、１７５、または１７６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0264】

実施形態１７８．該修飾オリゴヌクレオチドが、修飾核酸塩基を含む、実施形態１５８～１７７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0265】

実施形態１７９．該修飾核酸塩基が５－メチルシトシンである、実施形態１７８に記載のオリゴマー化合物。

【0266】

実施形態１８０．該修飾オリゴヌクレオチドが、１２～２２、１２～２０、１４～１８、１４～２０、１５～１７、１５～２５、１６～２０、１６～１８、１８～２２、１８～２５、１８～２０、２０～２５、または２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる、実施形態１５８～１７９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0267】

実施形態１８１．該修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１５８～１８０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0268】

実施形態１８２．該修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１５８～１８０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0269】

実施形態１８３．該修飾オリゴヌクレオチドが、２１個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１５８～１８０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0270】

実施形態１８４．該修飾オリゴヌクレオチドが、２３個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１５８～１８０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0271】

実施形態１８５．該オリゴマー化合物がＲＮａｓｅ Ｈ化合物である、実施形態１５８～１８４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0272】

実施形態１８６．該修飾オリゴヌクレオチドがギャップマーである、実施形態１８５に記載のオリゴマー化合物。

【0273】

実施形態１８７．該修飾オリゴヌクレオチドが、
１～６個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
１～６個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
該５’領域の最も３’側のヌクレオシド及び該３’－領域の最も５’－側のヌクレオシドは、修飾糖部分を含み、
該中央領域ヌクレオシドの各々が、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシド及び２’－置換糖部分を含むヌクレオシドから選択され、該中央領域が、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む少なくとも６個のヌクレオシド及び２’－置換糖部分を含む２つ以下のヌクレオシドを含む、請求項１５８～１８６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0274】

実施形態１８８．該修飾オリゴヌクレオチドが、
１～６個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
１～６個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
該５’－領域ヌクレオシドの各々及び該３’－領域ヌクレオシドの各々が修飾糖部分を含み、該中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態１５８～１８３または１８５～１８７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0275】

実施形態１８９．該修飾オリゴヌクレオチドが、
５個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
５個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
該５’－領域ヌクレオシドの各々及び該３’－領域ヌクレオシドの各々がｃＥｔ修飾糖部分または２’－ＭＯＥ修飾糖部分のいずれかを含み、該中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む、実施形態１８８に記載のオリゴマー化合物。

【0276】

実施形態１９０．該オリゴマー化合物がＲＮＡｉ化合物である、実施形態１５８～１８４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0277】

実施形態１９１．該オリゴマー化合物が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含む標的領域を含むアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含み、該標的領域がＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも９０％相補的である、実施形態１５８～１９０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0278】

実施形態１９２．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、ＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に対して少なくとも９５％相補的であるか、または１００％相補的である、実施形態１９１に記載のオリゴマー化合物。

【0279】

実施形態１９３．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、少なくとも１９、２０、２１、または２５個の連続した核酸塩基を含む、実施形態１９１～１９２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0280】

実施形態１９４．該ＡＰＰ ＲＮＡが配列番号１～７のいずれかの核酸塩基配列を有する、実施形態１９１～１９３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0281】

実施形態１９５．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、２’－ＮＭＡ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、またはＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む、実施形態１９１～１９４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0282】

実施形態１９６．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾糖部分または糖代替物を含む、実施形態１９１～１９５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0283】

実施形態１９７．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、または１００％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態１９１～１９６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0284】

実施形態１９８．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含む、実施形態１９１～１９７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0285】

実施形態１９９．該安定化したリン酸基がシクロプロピルホスホネートまたは（Ｅ）－ビニルホスホネートを含む、実施形態１９８に記載のオリゴマー化合物。

【0286】

実施形態２００．該オリゴマー化合物が一本鎖オリゴマー化合物である、実施形態１５８～１９９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0287】

実施形態２０１．該修飾オリゴヌクレオチドまたは該ＲＮＡｉアンチセンスオリゴヌクレオチドからなる、実施形態１５８～２００のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0288】

実施形態２０２．共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む、実施形態１５８～２００のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0289】

実施形態２０３．該共役リンカーが単結合からなる、実施形態２０２に記載のオリゴマー化合物。

【0290】

実施形態２０４．該共役リンカーが切断可能である、実施形態２０２に記載のオリゴマー化合物。

【0291】

実施形態２０５．該共役リンカーが１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む、実施形態２０２に記載のオリゴマー化合物。

【0292】

実施形態２０６．該共役基が該修飾オリゴヌクレオチドまたは該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に結合される、実施形態２０２～２０５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0293】

実施形態２０７．該共役基が該修飾オリゴヌクレオチドまたは該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に結合される、実施形態２０２～２０５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0294】

実施形態２０８．末端基を含む、実施形態１５８～２００または２０２～２０６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0295】

実施形態２０９．該オリゴマー化合物がリンカー－ヌクレオシドを含まない、実施形態１５８～２０４または２０６～２０８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0296】

実施形態２１０．実施形態１８８～２０９のいずれかのアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物と、１７～３０個の連結したヌクレオシドからなるセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物と、を含むオリゴマー二重鎖であって、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含むアンチセンスハイブリダイズ領域を含み、該アンチセンスハイブリダイズ領域が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの等長部分に少なくとも９０％相補的である、該オリゴマー二重鎖。

【0297】

実施形態２１１．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、１８～２５、２０～２５、または２１～２３個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態２１０に記載のオリゴマー二重鎖。

【0298】

実施形態２１２．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、２１または２３個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態２１１に記載のオリゴマー二重鎖。

【0299】

実施形態２１３．該アンチセンスまたは該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も３’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、実施形態２１０～２１２のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0300】

実施形態２１４．該アンチセンスまたはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も５’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、実施形態２１０～２１３のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0301】

実施形態２１５．該二重鎖が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端で平滑末端を有する、実施形態２１０～２１４のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0302】

実施形態２１６．該二重鎖が、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端で平滑末端を有する、実施形態２１０～２１４のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0303】

実施形態２１７．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、ＬＮＡ、ｃＥｔから選択される修飾糖部分、またはＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む、実施形態２１０～２１６のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0304】

実施形態２１８．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分または糖代替物を含む、実施形態２１７に記載のオリゴマー二重鎖。

【0305】

実施形態２１９．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、または１００％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、実施形態２１８に記載のオリゴマー二重鎖。

【0306】

実施形態２２０．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾核酸塩基を含む、実施形態２１０～２１９のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0307】

実施形態２２１．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、実施形態２１０～２２０のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0308】

実施形態２２２．該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、実施形態２２１に記載のオリゴマー二重鎖。

【0309】

実施形態２２３．該化合物が、該アンチセンスまたはセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端または両端に結合した１～５個の脱塩基糖部分を含む、実施形態２１０～２２２のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0310】

実施形態２２４．該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドからなる、実施形態２１０～２２３のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0311】

実施形態２２５．該第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む、実施形態２１０に記載のオリゴマー二重鎖。

【0312】

実施形態２２６．該共役リンカーが単結合からなる、実施形態２２５に記載のオリゴマー二重鎖。

【0313】

実施形態２２７．該共役リンカーが切断可能である、実施形態２２５に記載のオリゴマー二重鎖。

【0314】

実施形態２２８．該共役リンカーが１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む、実施形態２２５に記載のオリゴマー二重鎖。

【0315】

実施形態２２９．該共役基が該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に結合される、実施形態２２５～２２８のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0316】

実施形態２３０．該共役基が該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に結合される、実施形態２２５～２２５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0317】

実施形態２３１．該共役基が該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド内の内部位置でリボシル糖部分の２’位を介して結合される、実施形態２２５～２２５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0318】

実施形態２３２．少なくとも１つの共役基がＣ_１６アルキル基を含む、実施形態２０２～２０７のいずれかに記載のオリゴマー化合物または実施形態２２５～２３１のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。

【0319】

実施形態２３３．該第２のオリゴマー化合物が末端基を含む、実施形態２１０に記載のオリゴマー二重鎖。

【0320】

実施形態２３４．実施形態１５８～２０９のいずれかに記載のオリゴマー化合物または実施形態２１０～２３３に記載のオリゴマー二重鎖、及び薬学的に許容される担体もしくは希釈剤を含む、医薬組成物。

【0321】

実施形態２３５．該薬学的に許容される希釈剤が、人工脳脊髄液、滅菌生理食塩水、またはＰＢＳである、実施形態２３４に記載の医薬組成物。

【0322】

実施形態２３６．該医薬組成物が、該修飾オリゴヌクレオチド及び滅菌生理食塩水から本質的になる、実施形態２３４に記載の医薬組成物。

【0323】

実施形態２３７．実施形態２３４～２３６のいずれかに記載の医薬組成物を、動物に投与することを含む方法。

【0324】

実施形態２３８．ＡＰＰに関連した疾患を治療する方法であって、ＡＰＰに関連した疾患に罹患しているかまたは発症のリスクがある個体に、実施形態２３４～２３６のいずれかに記載の治療有効量の医薬組成物を投与し、それによりＡＰＰに関連した該疾患を治療することを含む、該方法。

【0325】

実施形態２３９．該ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、または脳アミロイド血管症である、実施形態２３８に記載の方法。

【0326】

実施形態２４０．該ＡＰＰ関連疾患の少なくとも１つの症状または特徴が改善される、実施形態２３８～２３９のいずれかに記載の方法。

【0327】

実施形態２４１．該症状または特徴が、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、及び／または異常なアミロイド沈着を含む、認知障害である、実施形態２４０に記載の方法。

【0328】

Ｉ．特定のオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、連結ヌクレオシドからなる、オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物が本明細書に提供される。オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチド（ＲＮＡまたはＤＮＡ）であり得るか、または修飾オリゴヌクレオチドであり得る。修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾ＲＮＡまたはＤＮＡと比較して少なくとも１つの修飾を含む。すなわち、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド（修飾糖部分及び／または修飾核酸塩基を含む）及び／または少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態では、ＡＰＰに相補的なアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド、及び任意にアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに相補的なセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含むＲＮＡｉ化合物が本明細書に提供される。アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、典型的には、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド及び／または少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む。修飾オリゴヌクレオチドにおける使用に好適な特定の修飾ヌクレオシド及び修飾ヌクレオシド間結合は、以下に記載のとおりである。

【0329】

Ａ．特定の修飾ヌクレオシド
修飾ヌクレオシドには、修飾糖部分もしくは修飾核酸塩基、または修飾糖部分及び修飾核酸塩基の両方が含まれる。特定の実施形態では、以下の修飾糖部分及び／または以下の修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び／またはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに組み込まれ得る。

【0330】

１．特定の糖部分
特定の実施形態では、修飾糖部分は、非二環式修飾糖部分である。特定の実施形態では、修飾糖部分は、二環式または三環式糖部分である。特定の実施形態では、修飾糖部分は、糖代替物である。そのような糖代替物は、他の種類の修飾糖部分のものに対応する１つ以上の置換を含み得る。

【0331】

特定の実施形態では、修飾糖部分は、１つ以上の置換基を有するフラノシル環を含む非二環式修飾糖部分であり、そのいずれも、フラノシル環の２つの原子を架橋して二環式構造を形成しない。そのような非架橋置換基は、２’、３’、４’、及び／または５’位にある置換基を含むがこれらに限定されない、フラノシルの任意の位置にあってもよい。特定の実施形態では、非二環式修飾糖部分の１つ以上の非架橋置換基は分岐している。非二環式修飾糖部分に好適な２’－置換基の例としては、２’－Ｆ、２’－ＯＣＨ_３（「ＯＭｅ」または「Ｏ－メチル」）、及び２’－Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＣＨ_３（「ＭＯＥ」）が含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、２’－置換基は、ハロ、アリル、アミノ、アジド、ＳＨ、ＣＮ、ＯＣＮ、ＣＦ_３、ＯＣＦ_３、Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_１０アルコキシ、Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_１０置換アルコキシ、Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_１０アルキル、Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_１０置換アルキル、Ｓ－アルキル、Ｎ（Ｒ_ｍ）－アルキル、Ｏ－アルケニル、Ｓ－アルケニル、Ｎ（Ｒ_ｍ）－アルケニル、Ｏ－アルキニル、Ｓ－アルキニル、Ｎ（Ｒ_ｍ）－アルキニル、Ｏ－アルキレニル－Ｏ－アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、Ｏ－アルカリル、Ｏ－アラルキル、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＳＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ）またはＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ）の中から選択され、式中、各Ｒ_ｍ及びＲ_ｎは、独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のＣ_１～Ｃ_１０アルキル、－Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（ＣＨ３）２（「ＤＭＡＯＥ」）、２’－ＯＣＨ２ＯＣＨ２Ｎ（ＣＨ２）２（「ＤＭＡＥＯＥ」）、ならびにＣｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，５３１，５８４；Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８５９，２２１、及びＣｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，００５，０８７に記載されている２’－置換基である。これらの２’－置換基の特定の実施形態は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ（ＮＯ_２）、チオール、チオアルコキシ、チオアルキル、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、及びアルキニルの中から独立して選択される１つ以上の置換基でさらに置換され得る。特定の実施形態では、非二環式修飾糖部分は、３’位に置換基を含む。修飾糖部分の３’位に好適な置換基の例には、アルコキシ（例えば、メトキシ）、アルキル（例えば、メチル、エチル）が挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、非二環式修飾糖部分は、４’位に置換基を含む。非二環式修飾糖部分に好適な４’－置換基の例には、アルコキシ（例えば、メトキシ）、アルキル、及びＭａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ ２０１５／１０６１２８に記載されているものが挙げられるが、これらに限定されない。非二環式修飾糖部分に好適な５’－置換基の例には、５’－メチル（ＲまたはＳ）、５’－ビニル、エチル、及び５’－メトキシが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、非二環式修飾糖部分は、Ｍｉｇａｗａ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ ２００８／１０１１５７及びＲａｊｅｅｖ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２０１３／０２０３８３６に記載の、２つ以上の非架橋糖置換基、例えば、２’－Ｆ－５’－メチル糖部分、ならびに修飾糖部分及び修飾ヌクレオシドを含む。

【0332】

特定の実施形態では、２’－置換非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＮＨ_２、Ｎ_３、ＯＣＦ_３、ＯＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_３ＮＨ_２、ＣＨ_２ＣＨ＝ＣＨ_２、ＯＣＨ_２ＣＨ＝ＣＨ_２、ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＳＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ）、Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、及びＮ－置換アセトアミド（ＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ））から選択される非架橋２’－置換基を含む糖部分を含み、式中、各Ｒ_ｍ及びＲ_ｎは、独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のＣ_１～Ｃ_１０アルキルである。

【0333】

特定の実施形態では、２’－置換ヌクレオシド非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＦ_３、ＯＣＨ_３、ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＳＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（ＣＨ_３）_２、Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、Ｏ（ＣＨ２）２ＯＮ（ＣＨ３）２（「ＤＭＡＯＥ」）、ＯＣＨ２ＯＣＨ２Ｎ（ＣＨ２）２（「ＤＭＡＥＯＥ」）、及びＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｈ）ＣＨ_３（「ＮＭＡ」）から選択される非架橋２’－置換基を含む糖部分を含む。

【0334】

特定の実施形態では、２’－置換非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＨ_３、及びＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３から選択される非架橋２’置換基を含む糖部分を含む。

【0335】

天然に存在する核酸では、糖は３’と５’で互いに連結している。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、代替位置、例えば２’において連結された、または５’から３’に逆に連結した、１個以上のヌクレオシドもしくは糖部分を含む。例えば、連結が２’位にある場合、２’－置換基は、代わりに３’位にあり得る。

【0336】

特定の修飾糖部分は、第２の環を形成して二環式糖部分をもたらすフラノシル環の２つの原子を架橋する置換基を含む。そのような二環式糖部分を含むヌクレオシドは、二環式ヌクレオシド（ＢＮＡ）、ロックドヌクレオシド、または立体配座が制限された（ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌｌｙ ｒｅｓｔｒｉｃｔｅｄ）ヌクレオチド（ＣＲＮ）と呼ばれている。特定のそのような化合物は、米国特許公開第２０１３／０１９０３８３号及びＰＣＴ公開ＷＯ２０１３／０３６８６８に記載されている。特定のそのような実施形態では、二環式糖部分は、４’及び２’フラノース環原子との間に架橋を含む。特定のそのような実施形態では、フラノース環はリボース環である。そのような４’と２’を架橋する糖置換基には、４’－ＣＨ_２－２’、４’－（ＣＨ_２）_２－２’、４’－（ＣＨ_２）_３－２’、４’－ＣＨ_２－Ｏ－２’（「ＬＮＡ」）、４’－ＣＨ_２－Ｓ－２’、４’－（ＣＨ_２）_２－Ｏ－２’（「ＥＮＡ」）、４’－ＣＨ（ＣＨ_３）－Ｏ－２’（Ｓ配置の場合に「拘束エチル」または「ｃＥｔ」と称される）、４’－ＣＨ_２－Ｏ－ＣＨ_２－２’、４’－ＣＨ_２－Ｎ（Ｒ）－２’、４’－ＣＨ（ＣＨ_２ＯＣＨ_３）－Ｏ－２’（「拘束ＭＯＥ」または「ｃＭＯＥ」）及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，３９９，８４５，Ｂｈａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５６９，６８６，Ｓｗａｙｚｅ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，７４１，４５７、及びＳｗａｙｚｅ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０２２，１９３を参照のこと）、４’－Ｃ（ＣＨ_３）（ＣＨ_３）－Ｏ－２’及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，２８３を参照のこと）、４’－ＣＨ_２－Ｎ（ＯＣＨ_３）－２’及びその類似体（例えば、Ｐｒａｋａｓｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，４２５を参照のこと）、４’－ＣＨ_２－Ｏ－Ｎ（ＣＨ_３）－２’（例えば、Ａｌｌｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，６９６，３４５及びＡｌｌｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，１２４，７４５を参照のこと）、４’－ＣＨ_２－Ｃ（Ｈ）（ＣＨ_３）－２’（例えば、Ｚｈｏｕ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００９，７４，１１８－１３４を参照のこと）、４’－ＣＨ_２－Ｃ（＝ＣＨ_２）－２’及びその類似体（例えば、Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２７８，４２６を参照のこと）、４’－Ｃ（Ｒ_ａＲ_ｂ）－Ｎ（Ｒ）－Ｏ－２’、４’－Ｃ（Ｒ_ａＲ_ｂ）－Ｏ－Ｎ（Ｒ）－２’、４’－ＣＨ_２－Ｏ－Ｎ（Ｒ）－２’、及び４’－ＣＨ_２－Ｎ（Ｒ）－Ｏ－２’が挙げられるが、これらに限定されず、式中、各Ｒ、Ｒ_ａ、及びＲ_ｂは、独立して、Ｈ、保護基、またはＣ_１～Ｃ_１２アルキルである（例えば、Ｉｍａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，４２７，６７２を参照のこと）。

【0337】

特定の実施形態では、このような４’と２’の架橋は、独立して、－［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ－、－［Ｃ（Ｒａ）（Ｒｂ）］ｎ－Ｏ－、Ｃ（Ｒａ）＝Ｃ（Ｒｂ）－、Ｃ（Ｒａ）＝Ｎ－、Ｃ（＝ＮＲａ）－、－Ｃ（＝Ｏ）－、－Ｃ（＝Ｓ）－、－Ｏ－、－Ｓｉ（Ｒａ）２－、－Ｓ（＝Ｏ）ｘ－、及びＮ（Ｒａ）－から独立して選択される１～４個の連結基を含み、
式中、
ｘは、０、１、または２であり、
ｎは、１、２、３、または４であり、
各Ｒａ及びＲｂは、独立して、Ｈ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ１～Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１～Ｃ１２アルキル、Ｃ２～Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２～Ｃ１２アルケニル、Ｃ２～Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２～Ｃ１２アルキニル、Ｃ５～Ｃ２０アリール、置換Ｃ５～Ｃ２０アリール、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、Ｃ５～Ｃ７脂環式ラジカル、置換Ｃ５－Ｃ７脂環式ラジカル、ハロゲン、ＯＪ１、ＮＪ１Ｊ２、ＳＪ１、Ｎ３、ＣＯＯＪ１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）－Ｈ）、置換アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）２－Ｊ１）、またはスルホキシル（Ｓ（＝Ｏ）－Ｊ１）；ならびに各Ｊ１及びＪ２は、独立して、Ｈ、Ｃ１～Ｃ１２アルキル、置換Ｃ１－Ｃ１２アルキル、Ｃ２～Ｃ１２アルケニル、置換Ｃ２～Ｃ１２アルケニル、Ｃ２～Ｃ１２アルキニル、置換Ｃ２～Ｃ１２アルキニル、Ｃ５～Ｃ２０アリール、置換Ｃ５～Ｃ２０アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）－Ｈ）、置換アシル、複素環ラジカル、置換複素環ラジカル、Ｃ１～Ｃ１２アミノアルキル、置換Ｃ１～Ｃ１２アミノアルキル、または保護基である。

【0338】

追加の二環式糖部分が当技術分野で知られている、例えば、Ｆｒｅｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，２５（２２），４４２９－４４４３，Ａｌｂａｅｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００６，７１，７７３１－７７４０，Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．，１９９８，４，４５５－４５６；Ｋｏｓｈｋｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９８，５４，３６０７－３６３０；Ｗａｈｌｅｓｔｅｄｔ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，２０００，９７，５６３３－５６３８；Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９８，８，２２１９－２２２２；Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９８，６３，１００３５－１００３９；Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００７，１２９，８３６２－８３７９；Ｅｌａｙａｄｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｉｎｖｅｎｓ．Ｄｒｕｇｓ，２００１，２，５５８－５６１；Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．，２００１，８，１－７；Ｏｒｕｍ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．，２００１，３，２３９－２４３；Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，０５３，２０７，Ｉｍａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，２６８，４９０，Ｉｍａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．Ｕ．Ｓ．６，７７０，７４８，Ｉｍａｎｉｓｈｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．ＲＥ４４，７７９；Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，７９４，４９９，Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，６７０，４６１；Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，０３４，１３３，Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８０，６４４；Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０３４，９０９；Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，１５３，３６５；Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５７２，５８２；ａｎｄ Ｒａｍａｓａｍｙ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，５２５，１９１，Ｔｏｒｓｔｅｎ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ ２００４／１０６３５６，Ｗｅｎｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ １９９９／０１４２２６；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ ２００７／１３４１８１；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，５４７，６８４；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，６６６，８５４；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８８，７４６；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，７５０，１３１；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０３０，４６７；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，２６８，９８０；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５４６，５５６；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５３０，６４０；Ｍｉｇａｗａ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．９，０１２，４２１；Ｓｅｔｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，５０１，８０５；Ａｌｌｅｒｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２００８／００３９６１８；及びＭｉｇａｗａ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２０１５／０１９１７２７を参照のこと。特定の実施形態では、二環式糖部分及びそのような二環式糖部分を組み込むヌクレオシドは、異性体配置によってさらに定義される。例えば、ＬＮＡヌクレオシド（本明細書に記載の）は、α－Ｌ配置またはβ－Ｄ配置であってもよい。

【0339】

【化1】

【0340】

α－Ｌ－メチレンオキシ（４’－ＣＨ_２－Ｏ－２’）またはα－Ｌ－ＬＮＡ二環式ヌクレオシドは、アンチセンス活性を示したオリゴヌクレオチドに組み込まれている（Ｆｒｉｅｄｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００３，２１，６３６５－６３７２）。ロックド核酸をｓｉＲＮＡに添加すると、血清中のｓｉＲＮＡの安定性が高まり、オフターゲット効果が減少することが示されている（Ｅｌｍｅｎ，Ｊ．ｅｔ ａｌ．，（２００５）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３３（１）：４３９－４４７；Ｍｏｏｋ，ＯＲ．ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｍａｌ Ｃａｎｅ Ｔｈｅｒ ６（３）：８３３－８４３；Ｇｒｕｎｗｅｌｌｅｒ，Ａ．ｅｔ ａｌ．，（２００３）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３１（１２）：３１８５－３１９３）。本明細書では、二環式ヌクレオシドの一般的な説明に両方の異性体配置が含まれる。特定の二環式ヌクレオシド（例えば、ＬＮＡまたはｃＥｔ）の位置が本明細書の例示的な実施形態で特定される場合、別様に明記されない限り、それらはβ－Ｄ配置である。

【0341】

特定の実施形態では、修飾糖部分は、１つ以上の非架橋糖置換基及び１つ以上の架橋糖置換基（例えば５’－置換基及び４’－２’架橋糖）を含む。

【0342】

特定の実施形態では、修飾糖部分は、糖代替物である。特定のそのような実施形態では、糖部分の酸素原子は、例えば硫黄、炭素または窒素原子で置き換えられる。特定のそのような実施形態では、このような修飾糖部分は、本明細書に記載の架橋及び／または非架橋置換基も含む。例えば、特定の糖代替物には、４’－硫黄原子ならびに２’位（例えばＢｈａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，８７５，７３３及びＢｈａｔ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．７，９３９，６７７を参照のこと）及び／または５’位に置換が含まれる。

【0343】

特定の実施形態では、糖代替物は５原子以外を有する環を含む。例えば、特定の実施形態では、糖代替物は６員のテトラヒドロピラン（「ＴＨＰ」）を含む。そのようなテトラヒドロピランは、さらに修飾または置換され得る。このような修飾テトラヒドロピランを含むヌクレオシドには、これらに限定されないが、ヘキシトール核酸（「ＨＮＡ」）、アニトール核酸（「ＡＮＡ」）、マニトール核酸（「ＭＮＡ」）（例えば、Ｌｅｕｍａｎｎ，ＣＪ．Ｂｉｏｏｒｇ．＆Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２００２，１０，８４１－８５４を参照のこと）、フルオロＨＮＡ：

【0344】

【化2】

【0345】

（「Ｆ－ＨＮＡ」，例えば、Ｓｗａｙｚｅ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，０８８，９０４；Ｓｗａｙｚｅ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，４４０，８０３；Ｓｗａｙｚｅ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．８，７９６，４３７；及びＳｗａｙｚｅ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．９，００５，９０６を参照のこと；Ｆ－ＨＮＡは、Ｆ－ＴＨＰまたは３’－フルオロテトラヒドロピランとも称すことができる）、及び、以下の式を有する追加の修飾ＴＨＰ化合物を含むヌクレオシドが挙げられる：

【0346】

【化3】

【0347】

式中、上記の修飾ＴＨＰヌクレオシドの各々について、独立して
Ｂｘは、核酸塩基部分であり、
Ｔ_３及びＴ_４は、それぞれ独立して、修飾ＴＨＰヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残りに連結するヌクレオシド間連結基であるか、またはＴ_３及びＴ_４のうちの一方が修飾ＴＨＰヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残りに連結するヌクレオシド間連結基であり、Ｔ_３及びＴ_４のうちの他方がＨ、ヒドロキシル保護基、連結共役基、または５’もしくは３’末端基であり、
ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６、及びｑ_７は、それぞれ独立して、Ｈ、Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、置換Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、Ｃ_２～Ｃ_６アルケニル、置換Ｃ_２～Ｃ_６アルケニル、Ｃ_２～Ｃ_６アルキニル、または置換Ｃ_２～Ｃ_６アルキニルであり、
Ｒ_１及びＲ_２の各々は、水素、ハロゲン、置換もしくは非置換アルコキシ、ＮＪ_１Ｊ_２、ＳＪ_１、Ｎ_３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ_１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ_１Ｊ_２、ＮＪ_３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ_１Ｊ_２、及びＣＮの中から独立して選択され、式中、ＸはＯ、Ｓ、またはＮＪ_１であり、各Ｊ_１、Ｊ_２、及びＪ_３は、独立して、ＨまたはＣ_１～Ｃ_６アルキルである。

【0348】

特定の実施形態では、修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供され、ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６、及びｑ_７はそれぞれＨである。特定の実施形態では、ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６、及びｑ_７のうちの少なくとも１つはＨ以外である。特定の実施形態では、ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６、及びｑ_７のうちの少なくとも１つはメチルである。特定の実施形態では、Ｒ_１及びＲ_２の１つがＦである修飾ＴＨＰヌクレオシドが提供される。特定の実施形態では、Ｒ_１はＦであり、Ｒ_２はＨであり、特定の実施形態では、Ｒ_１はメトキシであり、Ｒ_２はＨであり、特定の実施形態では、Ｒ_１はメトキシエトキシであり、Ｒ_２はＨである。

【0349】

特定の実施形態では、糖代替物が、５超の原子及び２つ以上のヘテロ原子を有する環を含む。例えば、モルホリノ糖部分を含むヌクレオシド、及びオリゴヌクレオチドにおけるそれらの使用が報告されている（例えば、Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００２，４１，４５０３－４５１０及びＳｕｍｍｅｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６９８，６８５；Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１６６，３１５；Ｓｕｍｍｅｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１８５，４４４；ならびにＳｕｍｍｅｒｔｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，０３４，５０６を参照のこと）。本明細書で使用される場合、用語「モルホリノ」は以下の構造を有する糖代替物を意味する：

【0350】

【化4】

【0351】

特定の実施形態では、モルホリノは、例えば、様々な置換基を付加するか、または改変することによって、上記モルホリノ構造から修飾されてもよい。そのような糖代替物を本明細書では「修飾モルホリノ」と称する。

【0352】

特定の実施形態では、糖代替物は非環式部分を含む。そのような非環式糖代替物を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドの例には、ペプチド核酸（「ＰＮＡ」）、非環式ブチル核酸（例えば、Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２０１３，１１，５８５３－５８６５を参照のこと）、ならびにＭａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ２０１１／１３３８７６に記載のヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、糖代替物は非環式部分を含む。そのような非環式糖代替物を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドの例には、ペプチド核酸（「ＰＮＡ」）、非環式ブチル核酸（例えば、Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２０１３，１１，５８５３－５８６５を参照のこと）、ならびにＭａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２０１３／１３０３７８に記載のヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが含まれるが、これらに限定されない。ＰＮＡ化合物の調製を教示する代表的な米国特許としては、米国特許第５，５３９，０８２号；同第５，７１４，３３１号；及び同第５，７１９，２６２号が挙げられるが、これらに限定されない。本発明のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドでの使用に好適な追加のＰＮＡ化合物は、例えば、Ｎｉｅｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９９１，２５４，１４９７－１５００に記載されている。

【0353】

特定の実施形態では、糖代替物は、ＵＮＡ（アンロックド核酸）ヌクレオシドの「アンロックド」糖構造である。ＵＮＡは、アンロックド非環式核酸であり、糖の結合のいずれもが除去されており、アンロックド糖代替物が形成される。ＵＮＡの調製を教示する代表的な米国刊行物には、これらに限定されるわけではないが、米国特許第８，３１４，２２７号、及び米国特許公開番号第２０１３／００９６２８９号、同第２０１３／００１１９２２号、及び同第２０１１／０３１３０２０号が挙げられ、その全内容は、参照により本明細書に組み込まれる。

【0354】

特定の実施形態では、糖代替物は、以下に示されるように、ＧＮＡ（グリコール核酸）ヌクレオシドに見られるようなグリセロールであり；
（Ｓ）－ＧＮＡ

【0355】

【化5】

【0356】

式中、Ｂｘは任意の核酸塩基を表す。

【0357】

多くの他の二環式糖及び三環式糖ならびに糖代替物が当技術分野で知られており、これらは修飾ヌクレオシドに使用することができる。

【0358】

２．特定の修飾核酸塩基
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾核酸塩基を含む１個以上のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む１個以上のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、脱塩基ヌクレオシドと称される核酸塩基を含まない、１個以上のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上のイノシンヌクレオシド（すなわち、ヒポキサンチン核酸塩基を含むヌクレオシド）を含む。

【0359】

特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、５－置換ピリミジン、６－アザピリミジン、アルキルまたはアルキニル置換ピリミジン、アルキル置換プリン、ならびにＮ－２、Ｎ－６及びＯ－６置換プリンから選択される。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、５－メチルシトシン、２－アミノプロピルアデニン、５－ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２－アミノアデニン、６－Ｎ－メチルグアニン、６－Ｎ－メチルアデニン、２－プロピルアデニン、２－チオウラシル、２－チオチミン及び２－チオシトシン、５－プロピニル（－Ｃ≡Ｃ－ＣＨ_３）ウラシル、５－プロピニルシトシン、６－アゾウラシル、６－アゾシトシン、６－アゾチミン、５－リボシルウラシル（シュードウラシル）、４－チオウラシル、８－ハロ、８－アミノ、８－チオール、８－チオアルキル、８－ヒドロキシル、８－アザ及び他の８－置換プリン、５－ハロ、特に５－ブロモ、５－トリフルオロメチル、５－ハロウラシル、及び５－ハロシトシン、７－メチルグアニン、７－メチルアデニン、２－Ｆ－アデニン、２－アミノアデニン、７－デアザグアニン、７－デアザアデニン、３－デアザグアニン、３－デアザアデニン、６－Ｎ－ベンゾイルアデニン、２－Ｎ－イソブチリルグアニン、４－Ｎ－ベンゾイルシトシン、４－Ｎ－ベンゾイルウラシル、５－メチル４－Ｎ－ベンゾイルシトシン、５－メチル４－Ｎ－ベンゾイルウラシル、ユニバーサル塩基、疎水性塩基、広域塩基（ｐｒｏｍｉｓｃｕｏｕｓ ｂａｓｅ）、サイズ拡張塩基（ｓｉｚｅ－ｅｘｐａｎｄｅｄ ｂａｓｅ）及びフッ素化塩基から選択される。さらなる修飾核酸塩基としては、三環式ピリミジン、例えば１，３－ジアザフェノキサジン－２－オン、１，３－ジアザフェノチアジン－２－オン、及び９－（２－アミノエトキシ）－１，３－ジアザフェノキサジン－２－オン（Ｇ－クランプ）が挙げられる。修飾核酸塩基としては、プリンまたはピリミジン塩基が他の複素環により置き換えられているもの、例えば７－デアザ－アデニン、７－デアザグアノシン、２－アミノピリジン及び２－ピリドンを挙げることもできる。さらなる核酸塩基としては、Ｍｅｒｉｇａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．３，６８７，８０８に開示されているもの、Ｔｈｅ Ｃｏｎｃｉｓｅ Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ Ｏｆ Ｐｏｌｙｍｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ａｎｄ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ，Ｊ．Ｉ．，Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ＆Ｓｏｎｓ，１９９０，８５８－８５９；Ｅｎｇｌｉｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ Ｃｈｅｍｉｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１，３０，６１３；Ｓａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．ａｎｄ Ｌｅｂｌｅｕ，Ｂ．，Ｅｄｓ．，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，１９９３，２７３－２８８に開示されているもの、ならびにＣｈａｐｔｅｒｓ ６及び１５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｄｒｕｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｒｏｏｋｅ Ｓ．Ｔ．，Ｅｄ．，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，２００８，１６３－１６６及び４４２－４４３に開示されているものが挙げられる。

【0360】

上述の修飾核酸塩基及び他の修飾核酸塩基のうちのいくつかについて調製を教示する刊行物には、Ｍａｎｏｈａｒａ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２００３／０１５８４０３、Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２００３／０１７５９０６、Ｄｉｎｈ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．４，８４５，２０５、Ｓｐｉｅｌｖｏｇｅｌ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１３０，３０２、Ｒｏｇｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１３４，０６６、Ｂｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，１７５，２７３、Ｕｒｄｅａ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，３６７，０６６、Ｂｅｎｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４３２，２７２、Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４３４，２５７、Ｇｍｅｉｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５７，１８７、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５９，２５５、Ｆｒｏｅｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４８４，９０８、Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５０２，１７７、Ｈａｗｋｉｎｓ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５２５，７１１、Ｈａｒａｌａｍｂｉｄｉｓ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５５２，５４０、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５８７，４６９、Ｆｒｏｅｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５９４，１２１、Ｓｗｉｔｚｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５９６，０９１、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６１４，６１７、Ｆｒｏｅｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６４５，９８５、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，６８１，９４１、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８１１，５３４、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，７５０，６９２、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，９４８，９０３、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，５８７，４７０、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，４５７，１９１、Ｍａｔｔｅｕｃｃｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，７６３，５８８、Ｆｒｏｅｈｌｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８３０，６５３、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．５，８０８，０２７、Ｃｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，６，１６６，１９９、及びＭａｔｔｅｕｃｃｉ ｅｔ ａｌ．，Ｕ．Ｓ．６，００５，０９６が挙げられるが、これに限定されない。

【0361】

３．特定の修飾ヌクレオシド間結合
ＲＮＡ及びＤＮＡの天然に存在するヌクレオシド間結合は、３’から５’へのホスホジエステル結合である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、１個以上の修飾ヌクレオシド間結合を使用して一緒に連結され得る。ヌクレオシド間結合基の２つの主なクラスは、リン原子の存在または非存在により規定される。代表的なリン含有ヌクレオシド間結合としては、限定されるものではないが、ホスホジエステル結合（「Ｐ＝Ｏ」）を含有するホスフェート（非修飾または天然存在結合とも称される）、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホラミデート、及びホスホロチオエート（「Ｐ＝Ｓ」）、及びホスホロジチオエート（「ＨＳ－Ｐ＝Ｓ」）が挙げられる。代表的な非リン酸を含有するヌクレオシド間結合基には、メチレンメチルイミノ（－ＣＨ_２－Ｎ（ＣＨ_３）－Ｏ－ＣＨ_２－）、チオジエステル、チオノカルバメート（－Ｏ－Ｃ（＝Ｏ）（ＮＨ）－Ｓ－）、シロキサン（－Ｏ－ＳｉＨ_２－Ｏ－）、及びＮ，Ｎ’－ジメチルヒドラジン（－ＣＨ_２－Ｎ（ＣＨ_３）－Ｎ（ＣＨ_３）－）が含まれるが、これらに限定されない。天然のリン酸結合と比較して、修飾ヌクレオシド間結合は、オリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を変える（通常は増加させる）ために使用され得る。特定の実施形態では、キラル原子を有するヌクレオシド間結合は、ラセミ混合物として、または別個の鏡像異性体として調製され得る。リン含有及び非リン含有ヌクレオシド間結合の調製方法は、当業者に周知である。

【0362】

キラル中心を有する代表的ヌクレオシド間結合には、アルキルホスホネート及びホスホロチオエートが含まれるが、これに限定されるものではない。キラル中心を有するヌクレオシド間結合を含む修飾オリゴヌクレオチドは、ステレオランダムなヌクレオシド間結合を含む修飾オリゴヌクレオチドの集団としても、また特定の立体化学配置をしたホスホロチオエート結合を含む修飾オリゴヌクレオチドの集団としても調製することができる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を含み、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合はいずれもステレオランダムである。そのような修飾オリゴヌクレオチドは、各ホスホロチオエート結合の立体化学配置がランダムに選択される合成方法を使用して作製することができる。それにもかかわらず、それぞれ個々のオリゴヌクレオチド分子の各々個々のホスホロチオエートには定義された立体配置がある。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、独立して選択される特定の立体化学配置にある特定のホスホロチオエートヌクレオシド間結合を１つ以上含む修飾オリゴヌクレオチドが豊富である。特定の実施形態では、特定の立体配置の特定のホスホロチオエート結合は、集団内分子の少なくとも６５％に存在する。特定の実施形態では、特定の立体配置の特定のホスホロチオエート結合は、集団内分子の少なくとも７０％に存在する。特定の実施形態では、特定の立体配置の特定のホスホロチオエート結合は、集団内分子の少なくとも８０％に存在する。特定の実施形態では、特定の立体配置の特定のホスホロチオエート結合は、集団内分子の少なくとも９０％に存在する。特定の実施形態では、特定の立体配置の特定のホスホロチオエート結合は、集団内分子の少なくとも９９％に存在する。修飾オリゴヌクレオチドのそのようなキラルが豊富な集団は、当該技術分野で公知の合成方法、例えば、Ｏｋａ ｅｔ ａｌ．，ＪＡＣＳ １２５，８３０７（２００３）、Ｗａｎ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ．Ｒｅｓ．４２，１３４５６（２０１４）、及びＷＯ２０１７／０１５５５５などに記載の方法を使用して作製することができる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、（Ｓｐ）立体配置にある指示されたホスホロチオエートを少なくとも１つ有する修飾オリゴヌクレオチドが豊富である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、（Ｒｐ）立体配置にあるホスホロチオエートを少なくとも１つ有する修飾オリゴヌクレオチドが豊富である。特定の実施形態では、（Ｒｐ）ホスホロチオエート及び／または（Ｓｐ）ホスホロチオエートを含む修飾オリゴヌクレオチドは、それぞれ、以下の式：の１つ以上を含み、式中、「Ｂ」は核酸塩基を示す。

【0363】

【化6】

【0364】

別段の指示がある場合を除き、本明細書に記載する修飾オリゴヌクレオチドのキラルなヌクレオシド間結合は、ステレオランダムでも、特定の立体化学配置でもあり得る。

【0365】

中性ヌクレオシド間結合には、限定することなく、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ＭＭＩ（３’－ＣＨ_２－Ｎ（ＣＨ_３）－Ｏ－５’）、アミド－３（３’－ＣＨ_２－Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｈ）－５’）、アミド－４（３’－ＣＨ_２－Ｎ（Ｈ）－Ｃ（＝Ｏ）－５’）、ホルムアセタール（３’－Ｏ－ＣＨ_２－Ｏ－５’）、メトキシプロピル（ＭＯＰ）、及びチオホルムアセタール（３’－Ｓ－ＣＨ_２－Ｏ－５’）が含まれる。さらなる中性ヌクレオシド間結合には、シロキサン（ジアルキルシロキサン）、カルボン酸エステル、カルボキサミド、硫化物、スルホン酸エステル及びアミドを含む非イオン性結合が含まれる（例えば、Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ；Ｙ．Ｓ．Ｓａｎｇｈｖｉ ａｎｄ Ｐ．Ｄ．Ｃｏｏｋ，Ｅｄｓ．，ＡＣＳ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ Ｓｅｒｉｅｓ ５８０；Ｃｈａｐｔｅｒｓ ３及び４，４０－６５を参照のこと）。さらなる中性ヌクレオシド間結合には、Ｎ、Ｏ、Ｓ及びＣＨ_２の構成成分部を混合で含む非イオン結合が含まれる。

【0366】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド（アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び／またはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドなど）は、以下に示すように、１つ以上の逆位ヌクレオシドを含み：

【0367】

【化7】

【0368】

式中、各Ｂｘは、独立して任意の核酸塩基を表す。

【0369】

特定の実施形態では、逆位ヌクレオシドは末端（すなわち、オリゴヌクレオチドの一端の最後のヌクレオシド）であり、したがって、上に示したヌクレオシド間結合は１個だけ存在する。特定のそのような実施形態では、追加の特徴（共役基など）を逆位ヌクレオシドに結合させてもよい。そのような末端逆位ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドの一端または両末端に結合させることができる。

【0370】

特定の実施形態では、そのような基は核酸塩基を欠き、本明細書では逆位糖部分と呼ばれる。特定の実施形態では、逆位糖部分は末端（すなわち、オリゴヌクレオチドの一端の最後のヌクレオシドに結合している）であり、したがって、上記ヌクレオシド間結合は１個だけ存在する。特定のそのような実施形態では、追加の特徴（共役基など）は、逆位糖部分に結合させてもよい。このような末端逆位糖部分は、オリゴヌクレオチドの一端または両末端に結合させることができる。

【0371】

特定の実施形態では、核酸は、標準的な３’から５’への連結ではなく、２’から５’への連結であり得る。このような結合を以下に示す。

【0372】

【化8】

【0373】

式中、各Ｂｘは任意の核酸塩基を表す。

【0374】

Ｂ．特定のモチーフ
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド間結合を１つ以上含む。そのような実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの、修飾、非修飾、及び異なる修飾の、糖部分、核酸塩基、及び／またはヌクレオシド間結合がパターンまたはモチーフを定義する。特定の実施形態では、糖部分、核酸塩基、及びヌクレオシド間結合のパターンはそれぞれ互いに独立している。したがって、修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ、及び／またはヌクレオシド間結合モチーフによって表され得る（本明細書で使用する場合、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列とは関係のない核酸塩基に対する修飾を表す）。

【0375】

１．特定の糖モチーフ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、定義されたパターンまたは糖モチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された１種以上の修飾糖及び／または非修飾糖部分を含む。特定の例では、そのような糖モチーフには本明細書で論じる糖修飾のうち任意のものが含まれるが、これに限定されるものではない。

【0376】

均一に修飾されたオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、完全に修飾された糖モチーフを有する領域を含むか、またはそれからなる。そのような実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの完全に修飾された領域の各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド全体の各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、完全に修飾された糖モチーフを有する領域を含むか、またはそれからなり、完全に修飾された領域内の各ヌクレオシドは、本明細書において均一に修飾された糖モチーフと呼ばれる同じ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、完全に修飾されたオリゴヌクレオチドは、均一に修飾されたオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、均一に修飾されたヌクレオチドの各ヌクレオシドは、同じ２’修飾を含む。

【0377】

ギャップマーオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、２つの外部領域、すなわち「ウィング」及び中央もしくは内部領域、すなわち「ギャップ」によって定義される、ギャップマーモチーフを有する領域を含むか、またはそれからなる。ギャップマーモチーフの３つの領域（５’ウィング、ギャップ、及び３’ウィング）は、ヌクレオシドの連続した配列を形成し、各ウィングのヌクレオシドの糖部分の少なくともいくつかは、ギャップのヌクレオシドの糖部分の少なくともいくつかとは異なる。具体的には、少なくともギャップに最も近い各ウィングのヌクレオシドの糖部分（５’－ウィングの最も３’側のヌクレオシド及び３’－ウィングの最も５’－側のヌクレオシド）は、隣接するギャップヌクレオシドの糖部分とは異なり、したがって、ウィングとギャップの間の境界（すなわち、ウィング／ギャップ接合部）を定義する。特定の実施形態では、ギャップ内の糖部分は、互いに同一である。特定の実施形態では、ギャップは、ギャップの１個以上の他のヌクレオシドの糖部分とは異なる糖部分を有する１個以上のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、２個のウィングの糖モチーフは、互いに同一である（対称性ギャップマー）。特定の実施形態では、５’－ウィングの糖モチーフは、３’－ウィングの糖モチーフとは異なる（非対称性ギャップマー）。

【0378】

特定の実施形態では、ギャップマーのウィングは、１～６個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、ギャップマーの各ウィングの各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーの各ウィングの少なくとも１個のヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーの各ウィングの少なくとも２個のヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーの各ウィングの少なくとも３個のヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーの各ウィングの少なくとも４個のヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。

【0379】

特定の実施形態では、ギャップマーのギャップは、７～１２個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、ギャップマーのギャップの各ヌクレオシドは、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーのギャップの少なくとも１個のヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。

【0380】

特定の実施形態では、ギャップマーはデオキシギャップマーである。特定の実施形態では、各ウィング／ギャップ接合部のギャップ側のヌクレオシドは、２’－デオキシリボシル糖部分を含み、各ウィング／ギャップ接合部のウィング側のヌクレオシドは修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップの各ヌクレオシドは、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーの各ウィングの各ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーのギャップの少なくとも１個のヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、ギャップマーのギャップの少なくとも１個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ糖部分を含む。

【0381】

本明細書では、ギャップマーの３つの領域の長さ（ヌクレオシドの数）は、表記法［５’－ウィング中のヌクレオシドの数］－［ギャップ中のヌクレオシドの数］－［３’－ウィング中のヌクレオシドの数］を用いて提供されてもよい。したがって、３－１０－３ギャップマーは、各ウィング中の３個の連結ヌクレオシドと、ギャップ中の１０個の連結ヌクレオシドからなる。そのような用語が特定の修飾を伴う場合、この修飾は各ウィングの各糖部分の修飾であり、ギャップヌクレオシドは２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む。したがって、５－１０－５ＭＯＥギャップマーは、５’－ウィング中の５個の連結２’－ＭＯＥヌクレオシドと、ギャップ中の１０個の連結２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドと、３’－ウィング中の５個の連結２’－ＭＯＥヌクレオシドからなる。３－１０－３ｃＥｔギャップマーは、５’ウィング中の３個の連結ｃＥｔヌクレオシドと、ギャップ中の１０個の連結２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドと、３’ウィング中の３個の連結ｃＥｔヌクレオシドからなる。５－８－５ギャップマーは、５’ウィング中の修飾糖部分を含む５個の連結ヌクレオシドと、ギャップ中の８個の連結２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドと、３’ウィング中の修飾糖部分を含む５個の連結ヌクレオシドからなる。５－８－５混合ギャップマーは、５’－及び／または３’－ウィングに少なくとも２つの異なる修飾糖部分を有する。

【0382】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、５－１０－５ＭＯＥギャップマーである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、３－１０－３ＢＮＡギャップマーである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、３－１０－３ｃＥｔギャップマーである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、３－１０－３ＬＮＡギャップマーである。

【0383】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、５’ウィング中の５個の連結２’－ＭＯＥヌクレオシド、ギャップ中の８個の連結２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシド、ならびに３’－ウィング中のｃＥｔ及び２’－ＭＯＥヌクレオシドの混合物からなる５－８－５混合ギャップマーである。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、ｅｅｅｅｅｄｄｄｄｄｄｄｄｋｋｅｅｅの糖モチーフを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ修飾糖部分を含むヌクレオシドを表し、各「ｄ」は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドを表し、各「ｋ」は、ｃＥｔ修飾糖部分を含むヌクレオシドを表す。特定の実施形態では、修飾ヌクレオシドは、ｅｅｅｅｅｄｄｄｄｄｄｄｄｋｅｅｅｅの糖モチーフを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ修飾糖部分を含むヌクレオシドを表し、各「ｄ」は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドを表し、各「ｋ」は、ｃＥｔ修飾糖部分を含むヌクレオシドを表す。

【0384】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドの糖部分は、修飾糖部分である。

【0385】

特定のそのような実施形態では、少なくとも１個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも２個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも５個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも８個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１０個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１２個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１４個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１５個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１７個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定のそのような実施形態では、少なくとも１８個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定のそのような実施形態では、少なくとも２０個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定のそのような実施形態では、少なくとも２１個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。

【0386】

特定の実施形態では、少なくとも１個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも２個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも３個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも４個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、１個ではあるが１個以下のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖を含む。特定の実施形態では、１または２個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、１～３個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１～４個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、２～４個の連続した２’－Ｆ修飾ヌクレオシドのブロックを有する。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの４個のヌクレオシドは２’－Ｆ修飾ヌクレオシドであり、それらの２’－Ｆ修飾ヌクレオシドのうちの３個は連続している。特定のそのような実施形態では、ヌクレオシドの残りは２’ＯＭｅ修飾されている。

【0387】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの少なくとも１個のヌクレオシドの糖部分は、修飾糖部分である。

【0388】

特定のそのような実施形態では、少なくとも１個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも２個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも５個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも８個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１０個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１２個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１４個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１５個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１７個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定のそのような実施形態において、少なくとも１８個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定のそのような実施形態において、少なくとも２０個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。特定のそのような実施形態において、少なくとも２１個のヌクレオシドは、２’－ＯＭｅ修飾糖部分を含む。

【0389】

特定の実施形態では、少なくとも１個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも２個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも３個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも４個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、１個ではあるが１個以下のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、１または２個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖を含む。特定の実施形態では、１～３個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、少なくとも１～４個のヌクレオシドは、２’－Ｆ修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、２～４個の連続した２’－Ｆ修飾ヌクレオシドのブロックを有する。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの４個のヌクレオシドは２’－Ｆ修飾ヌクレオシドであり、それらの２’－Ｆ修飾ヌクレオシドのうちの３個は連続している。特定のそのような実施形態では、ヌクレオシドの残りは２’ＯＭｅ修飾されている。

【0390】

２．特定の核酸塩基モチーフ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、定義されたパターンまたはモチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された修飾及び／または非修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態では、各核酸塩基が修飾される。特定の実施形態では、核酸塩基のうちのいずれも修飾されない。特定の実施形態では、各プリンまたは各ピリミジンが修飾される。特定の実施形態では、各アデニンが修飾される。特定の実施形態では、各グアニンが修飾される。特定の実施形態では、各チミンが修飾される。特定の実施形態では、各ウラシルが修飾される。特定の実施形態では、各シトシンが修飾される。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのシトシン核酸塩基の一部または全ては、５－メチルシトシンである。特定の実施形態では、全てのシトシン核酸塩基は５－メチルシトシンであり、修飾オリゴヌクレオチドの他の全ての核酸塩基は非修飾核酸塩基である。

【0391】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基のブロックを含む。特定のそのような実施形態では、ブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端に存在する。特定の実施形態では、ブロックは、オリゴヌクレオチドの３’末端の３個のヌクレオチド内に存在する。特定の実施形態では、ブロックは、オリゴヌクレオチドの５’末端に存在する。特定の実施形態では、ブロックは、オリゴヌクレオチドの５’末端の３個のヌクレオチド内に存在する。

【0392】

ギャップマーオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを含む。特定のそのような実施形態では、修飾核酸塩基を含む１個のヌクレオシドは、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチドの中央ギャップにある。特定のそのような実施形態では、該ヌクレオシドの糖部分は、２’－デオキシリボシル糖部分である。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、２－チオピリミジン及び５－プロピンピリミジンから選択される。

【0393】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドは、ＵＮＡである。
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドは、ＧＮＡである。
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個のヌクレオシドは、ＤＮＡである。特定のそのような実施形態では、１～４個のＤＮＡヌクレオシドは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの一端または両端にある。

【0394】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドは、ＵＮＡである。

【0395】

特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１個のヌクレオシドは、ＧＮＡである。

【0396】

特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個のヌクレオシドは、ＤＮＡである。特定のそのような実施形態において、１～４個のＤＮＡヌクレオシドは、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの一端または両端にある。

【0397】

３．特定のヌクレオシド間結合モチーフ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、定義されたパターンまたはモチーフでオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って配置された修飾及び／または非修飾ヌクレオシド間結合を含む。特定の実施形態では、各ヌクレオシド間結合基は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合（Ｐ＝Ｏ）である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合基は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合（Ｐ＝Ｓ）である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合及びホスホジエステルヌクレオシド間結合から独立して選択される。特定の実施形態では、各ホスホロチオエートヌクレオシド間結合は、ステレオランダムホスホロチオエート（Ｓｐ）ホスホロチオエート、及び（Ｒｐ）ホスホロチオエートから独立して選択される。

【0398】

ギャップマーオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの糖モチーフはギャップマーであり、ギャップ内のヌクレオシド間結合は全て修飾されている。特定のそのような実施形態では、ウィングにおけるヌクレオシド間結合のいくつかまたは全ては、非修飾ホスホジエステルヌクレオシド間結合である。特定の実施形態では、末端ヌクレオシド間結合は修飾されている。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの糖モチーフはギャップマーであり、ヌクレオシド間結合モチーフは、少なくとも１つのウィングに少なくとも１個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含み、少なくとも１つのホスホジエステル結合は、末端ヌクレオシド間結合ではなく、残りのヌクレオシド間結合は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。特定のそのような実施形態では、全てのホスホロチオエート結合はステレオランダムである。特定の実施形態では、ウィング内の全てのホスホロチオエート結合は、（Ｓｐ）ホスホロチオエートであり、ギャップは少なくとも１つのＳｐ、Ｓｐ、Ｒｐモチーフを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、そのようなヌクレオシド間結合モチーフを含む修飾オリゴヌクレオチドが豊富である。

【0399】

特定の実施形態では、修飾ヌクレオチドは、ｓｏｓｏｓｓｓｓｓｓｓｓｓｏｓｓｓのヌクレオシド間結合モチーフを有し、各「ｓ」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「ｏ」はリン酸ヌクレオシド間結合を表す。特定の実施形態では、修飾ヌクレオチドは、ｓｏｏｏｓｓｓｓｓｓｓｓｓｏｏｓｓのヌクレオシド間結合モチーフを有し、各「ｓ」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「ｏ」は、リン酸ヌクレオシド間結合を表す。特定の実施形態では、修飾ヌクレオチドは、ｓｏｏｏｓｓｓｓｓｓｓｓｓｏｏｓｓのヌクレオシド間結合モチーフを有し、各「ｓ」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「ｏ」は、リン酸ヌクレオシド間結合を表す。

【0400】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１つの結合は、修飾結合である。特定の実施形態では、最も５’側の結合（すなわち、５’末端から最初のヌクレオシドを５’末端から第２のヌクレオシドに結合する）は、修飾されている。特定の実施形態では、２つの最も５’側の結合は、修飾されている。特定の実施形態では、３’末端からの最初の１つまたは２つの結合は、修飾されている。特定のそのような実施形態では、修飾結合は、ホスホロチオエート結合である。特定の実施形態では、残りの結合は、全て非修飾のホスホジエステル結合である。

【0401】

特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１つの結合は、逆位結合である。

【0402】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１つの結合は、修飾結合である。特定の実施形態では、最も５’側の結合（すなわち、５’末端から最初のヌクレオシドを５’末端から第２のヌクレオシドに結合する）は、修飾されている。特定の実施形態では、２つの最も５’側の結合は、修飾されている。特定の実施形態では、３’末端からの最初の１つまたは２つの結合は、修飾されている。特定のそのような実施形態では、修飾結合は、ホスホロチオエート結合である。特定の実施形態では、残りの結合は、全て非修飾のホスホジエステル結合である。

【0403】

特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１つの結合は、逆位結合である。

【0404】

Ｃ．特定の長さ
活性を失わずに、オリゴヌクレオチドの長さを増減することが可能である。例えば、Ｗｏｏｌｆ ｅｔ ａｌ．（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：７３０５－７３０９，１９９２）において、卵母細胞注射モデルにおいて標的ＲＮＡの切断を誘導するそれらの能力について、１３～２５核酸塩基長の一連のオリゴヌクレオチドを試験した。オリゴヌクレオチドの末端近くに８または１１のミスマッチ塩基を有する２５核酸塩基長のオリゴヌクレオチドは、ミスマッチを含まないオリゴヌクレオチドほどではなかったものの、標的ＲＮＡの特異的切断を導くことができた。同様に、標的特異的切断が、１３核酸塩基オリゴヌクレオチド（１つまたは３つのミスマッチを有するものを含む）を使用して達成された。

【0405】

特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド（修飾オリゴヌクレオチドを含む）は、任意の様々な長さ範囲を有し得る。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、Ｘ～Ｙ個の連結ヌクレオシドからなり、Ｘは、当該範囲のヌクレオシドの最小数を表し、Ｙは、当該範囲のヌクレオシドの最大数を表す。特定のそのような実施形態では、Ｘ及びＹは、Ｘ≦Ｙの条件で、それぞれ独立して、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９及び５０から選択される。例えば、特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１２～１３個、１２～１４個、１２～１５個、１２～１６個、１２～１７個、１２～１８個、１２～１９個、１２～２０個、１２～２１個、１２～２２個、１２～２３個、１２～２４個、１２～２５個、１２～２６個、１２～２７個、１２～２８個、１２～２９個、１２～３０個、１３～１４個、１３～１５個、１３～１６個、１３～１７個、１３～１８個、１３～１９個、１３～２０個、１３～２１個、１３～２２個、１３～２３個、１３～２４個、１３～２５個、１３～２６個、１３～２７個、１３～２８個、１３～２９個、１３～３０個、１４～１５個、１４～１６個、１４～１７個、１４～１８個、１４～１９個、１４～２０個、１４～２１個、１４～２２個、１４～２３個、１４～２４個、１４～２５個、１４～２６個、１４～２７個、１４～２８個、１４～２９個、１４～３０個、１５～１６個、１５～１７個、１５～１８個、１５～１９個、１５～２０個、１５～２１個、１５～２２個、１５～２３個、１５～２４個、１５～２５個、１５～２６個、１５～２７個、１５～２８個、１５～２９個、１５～３０個、１６～１７個、１６～１８個、１６～１９個、１６～２０個、１６～２１個、１６～２２個、１６～２３個、１６～２４個、１６～２５個、１６～２６個、１６～２７個、１６～２８個、１６～２９個、１６～３０個、１７～１８個、１７～１９個、１７～２０個、１７～２１個、１７～２２個、１７～２３個、１７～２４個、１７～２５個、１７～２６個、１７～２７個、１７～２８個、１７～２９個、１７～３０個、１８～１９個、１８～２０個、１８～２１個、１８～２２個、１８～２３個、１８～２４個、１８～２５個、１８～２６個、１８～２７個、１８～２８個、１８～２９個、１８～３０個、１９～２０個、１９～２１個、１９～２２個、１９～２３個、１９～２４個、１９～２５個、１９～２６個、１９～２９個、１９～２８個、１９～２９個、１９～３０個、２０～２１個、２０～２２個、２０～２３個、２０～２４個、２０～２５個、２０～２６個、２０～２７個、２０～２８個、２０～２９個、２０～３０個、２１～２２個、２１～２３個、２１～２４個、２１～２５個、２１～２６個、２１～２７個、２１～２８個、２１～２９個、２１～３０個、２２～２３個、２２～２４個、２２～２５個、２２～２６個、２２～２７個、２２～２８個、２２～２９個、２２～３０個、２３～２４個、２３～２５個、２３～２６個、２３～２７個、２３～２８個、２３～２９個、２３～３０個、２４～２５個、２４～２６個、２４～２７個、２４～２８個、２４～２９個、２４～３０個、２５～２６個、２５～２７個、２５～２８個、２５～２９個、２５～３０個、２６～２７個、２６～２８個、２６～２９個、２６～３０個、２７～２８個、２７～２９個、２７～３０個、２８～２９個、２８～３０個、または２９～３０個の連結ヌクレオシドからなる。

【0406】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～２５個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～２３個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～２１個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１８～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２０～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１８～２５個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２０～２２個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１～２３個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３～２４個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２２個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３個の連結ヌクレオシドからなる。

【0407】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～２５個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～２３個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１７～２１個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１８～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２０～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３～３０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは１８～２５個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２０～２２個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１～２３個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３～２４個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２０個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２２個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３個の連結ヌクレオシドからなる。

【0408】

Ｄ．特定の修飾オリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、上記の修飾（糖、核酸塩基、ヌクレオシド間結合）は、修飾オリゴヌクレオチドに組み込まれる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、それらの修飾モチーフ及び全長によって特徴付けられる。特定の実施形態では、そのようなパラメータはそれぞれ、互いに独立している。したがって、別段の指示がある場合を除き、ギャップマー糖モチーフを有するオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合は、修飾されても修飾されなくてもよく、糖修飾のギャップマー修飾パターンに従っても従わなくてもよい。例えば、糖ギャップマーのウィング領域内のヌクレオシド間結合は、互いに同一であるか、または異なり得、糖モチーフのギャップ領域のヌクレオシド間結合と同一であるか、または異なり得る。同様に、そのような糖ギャップマーオリゴヌクレオチドは、糖修飾のギャップマーパターンとは関係なく、１個以上の修飾核酸塩基を含み得る。別段の指示がある場合を除き、全ての修飾は、核酸塩基配列とは無関係である。

【0409】

Ｅ．修飾オリゴヌクレオチドの特定の集団
集団の修飾オリゴヌクレオチドの全てが同一の分子式を有する修飾オリゴヌクレオチドの集団は、ステレオランダム集団またはキラルが豊富な集団とすることができる。修飾オリゴヌクレオチドの全てのキラル中心のうちの全ては、ステレオランダム集団においてステレオランダムである。キラルが豊富な集団において、少なくとも１つの特定のキラル中心は、集団の修飾オリゴヌクレオチドにおいてステレオランダムではない。特定の実施形態では、キラルが豊富な集団の修飾オリゴヌクレオチドは、β－Ｄリボシル糖部分が豊富であり、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合の全てがステレオランダムである。特定の実施形態では、キラルが豊富な集団の修飾オリゴヌクレオチドは、特定の立体化学的配置において、β－Ｄリボシル糖部分、及び少なくとも１つの特定のホスホロチオエートヌクレオシド間結合の両方が豊富である。

【0410】

Ｆ．核酸塩基配列
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド（非修飾または修飾オリゴヌクレオチド）は、それらの核酸塩基配列によってさらに説明される。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、第２のオリゴヌクレオチド、または標的核酸などの同定された参照核酸に相補的な核酸塩基配列を有する。特定のそのような実施形態では、オリゴヌクレオチドの領域は、第２のオリゴヌクレオチド、または標的核酸などの同定された参照核酸に相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの領域または全長の核酸塩基配列は、第２のオリゴヌクレオチドまたは標的核酸などの核酸に、少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である。

【0411】

ＩＩ．特定のオリゴマー化合物
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド（修飾または非修飾）及び任意選択で１つ以上の共役基及び／または末端基からなるオリゴマー化合物が本明細書に提供される。共役基は、１つ以上の共役部分と、共役部分をオリゴヌクレオチドに連結する共役リンカーとからなる。共役基は、オリゴヌクレオチドの一端または両末端、及び／または任意の内部位置に結合し得る。特定の実施形態では、共役基は修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの２’位に結合する。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの一端または両末端に結合する共役基は、末端基である。特定のそのような実施形態では、共役基または末端基は、オリゴヌクレオチドの３’及び／または５’末端に結合する。特定のそのような実施形態では、共役基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの３’末端に結合する。特定の実施形態では、共役基は、オリゴヌクレオチドの３’末端付近に結合する。特定の実施形態では、共役基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合する。特定の実施形態では、共役基は、オリゴヌクレオチドの５’末端付近に結合する。

【0412】

末端基の例には、共役基、キャッピング基、リン酸部分、保護基、修飾または非修飾のヌクレオシド、及び独立して修飾または非修飾である２つ以上のヌクレオシドが含まれるが、これらに限定されない。

【0413】

Ａ．特定のＲＮＡｉ化合物
ＲＮＡｉ化合物は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び任意選択でセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む。ＲＮＡｉ化合物はまた、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドまたはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド（存在する場合）に結合し得る末端基及び／または共役基を含み得る。

【0414】

二重鎖
アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含むＲＮＡｉ化合物は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドがアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに相補的なアンチセンスハイブリダイズ領域を含むため、二重鎖を形成する。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各核酸塩基は、互いに相補的である。特定の実施形態では、２つのＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、互いに相対した少なくとも１つのミスマッチを有する。

【0415】

特定の実施形態では、アンチセンスハイブリダイズ領域は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの全長を構成する。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのうちの一方または両方は、ハイブリダイズしない一端または両末端に追加のヌクレオシド（オーバーハングヌクレオシド）を含む。特定の実施形態では、オーバーハングヌクレオシドはＤＮＡである。特定の実施形態では、オーバーハングヌクレオシドは、互いに（２つ以上が存在する場合）、ホスホロチオエート結合を有する第１の非オーバーハングヌクレオシドに連結されている。

【0416】

Ｂ．特定の共役基
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは１つ以上の共役基に共有結合する。特定の実施形態では、共役基は、薬力学的特性、薬物動態学的特性、安定特性、結合特性、吸収特性、組織分布特性、細胞分布特性、細胞取り込み特性、電荷特性、及びクリアランス特性を含むが、これらに限定されない、結合オリゴヌクレオチドの１つ以上の特性を修飾する。

【0417】

特定の実施形態では、１つ以上の炭水化物部分の修飾オリゴヌクレオチドへの共役は、修飾オリゴヌクレオチドの１つ以上の特性を最適化することができる。特定の実施形態では、炭水化物部分は、修飾オリゴヌクレオチドの修飾サブユニットに結合している。例えば、修飾オリゴヌクレオチドのうちの１つ以上のリボヌクレオチドサブユニットのリボース糖は、別の部分、例えば、炭水化物リガンドが結合している非炭水化物（好ましくは環状）担体で置き換えることができる。サブユニットのリボース糖がそのように置換されたリボヌクレオチドサブユニットは、本明細書では、修飾糖部分であるリボース置換修飾サブユニット（ＲＲＭＳ）と呼ばれる。環状担体は、炭素環系であり得る、すなわち、１つ以上の環原子は、ヘテロ原子、例えば、窒素、酸素、硫黄であり得る。環状担体は、単環式環系であり得るか、または２つ以上の環、例えば、縮合環を含み得る。環状担体は、完全に飽和した環系であり得るか、または、それは１つ以上の二重結合を含み得る。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドはギャップマーである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドはアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドである。

【0418】

特定の実施形態では、共役基は、結合オリゴヌクレオチドに新たな特性、例えばオリゴヌクレオチドの検出を可能にするフルオロフォアまたはレポーター基を付与する。特定の共役基及び共役部分は、以前から説明されてきた、例えば、コレステロール部分（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９８９，８６，６５５３－６５５６）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９４，４，１０５３－１０６０）、チオエーテル、例えば、ヘキシル－Ｓ－トリチルチオール（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，１９９２，６６０，３０６－３０９；Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９３，３，２７６５－２７７０）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９２，２０，５３３－５３８）、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオールまたはウンデシル残基（Ｓａｉｓｏｎ－Ｂｅｈｍｏａｒａｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．，１９９１，１０，１１１１－１１１８；Ｋａｂａｎｏｖ ｅｔ ａｌ．，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ．，１９９０，２５９，３２７－３３０；Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ，１９９３，７５，４９－５４）、リン脂質、例えば、ジヘキサデシル－ｒａｃ－グリセロールまたはトリエチルアンモニウム１，２－ジ－Ｏ－ヘキサデシル－ｒａｃ－グリセロ－３－Ｈ－ホスホネート（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１－３６５４；Ｓｈｅａ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９０，１８，３７７７－３７８３）、ポリアミンまたはポリエチレングリコール鎖（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ ＆ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，１９９５，１４，９６９－９７３）、またはアダマンタン酢酸、パルミチル部分（Ｍｉｓｈｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ，１９９５，１２６４，２２９－２３７）、オクタデシルアミンまたはヘキシルアミノ－カルボニル－オキシコレステロール部分（Ｃｒｏｏｋｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．，１９９６，２７７，９２３－９３７）、トコフェノール基（Ｎｉｓｈｉｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ，２０１５，４，ｅ２２０；及びＮｉｓｈｉｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，２００８，１６，７３４－７４０）、またはＧａｌＮＡｃクラスター（例えば、ＷＯ２０１４／１７９６２０）。

【0419】

特定の実施形態では、共役基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、Ｃ５アルキル、Ｃ２２アルケニル、Ｃ２０アルケニル、Ｃ１６アルケニル、Ｃ１０アルケニル、Ｃ２１アルケニル、Ｃ１９アルケニル、Ｃ１８アルケニル、Ｃ１５アルケニル、Ｃ１４アルケニル、Ｃ１３アルケニル、Ｃ１２アルケニル、Ｃ１１アルケニル、Ｃ９アルケニル、Ｃ８アルケニル、Ｃ７アルケニル、Ｃ６アルケニル、またはＣ５アルケニルのいずれかから選択され得る。

【0420】

特定の実施形態では、共役基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、及びＣ５アルキルのいずれかから選択され得、該アルキル鎖は１つ以上の不飽和結合を有する。

【0421】

１．共役部分
共役部分には、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ペプチド、糖（例えば、ＧａｌＮＡｃ）、ビタミン部分、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コール酸部分、葉酸、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、フルオロフォア、及び色素が含まれるが、これらに限定されない。

【0422】

特定の実施形態では、共役部分には、有効成分、例えばアスピリン、ワーファリン、フェニルブタゾン、イブプロフェン、スプロフェン、フェンブフェン、ケトプロフェン、（Ｓ）－（＋）－プラノプロフェン、カルプロフェン、ダンシルサルコシン、２，３，５－トリヨード安息香酸、フィンゴリモド、フルフェナム酸、フォリン酸、ベンゾチアジアジン、クロロチアジド、ジアゼピン、インドメタシン（ｉｎｄｏ－ｍｅｔｈｉｃｉｎ）、バルビツレート、セファロスポリン、サルファ薬、抗糖尿病薬、抗菌薬、または抗生物質が含まれる。

【0423】

２．共役リンカー
共役部分は、共役リンカーを介してオリゴヌクレオチドに結合する。特定のオリゴマー化合物では、共役リンカーは単結合である（すなわち、共役部分は単結合を介してオリゴヌクレオチドに直接結合している）。特定の実施形態では、共役リンカーは、ヒドロカルビル鎖、またはエチレングリコール、ヌクレオシド、もしくはアミノ酸単位などの繰り返し単位のオリゴマーなどの鎖構造を含む。

【0424】

特定の実施形態では、共役リンカーは、ピロリジンを含む。

【0425】

特定の実施形態では、共役リンカーは、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル、及びヒドロキシルアミノから選択される１つ以上の基を含む。特定のそのような実施形態では、共役リンカーは、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、及びエーテル基から選択される基を含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、アルキル及びアミド基から選択される基を含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、アルキル及びエーテル基から選択される基を含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、少なくとも１つのリン部分を含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、少なくとも１つのリン酸基を含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、少なくとも１つの中性結合基を含む。

【0426】

特定の実施形態では、上記の共役リンカーを含む共役リンカーは、二官能性の連結部分、例えば本明細書で提供されるオリゴヌクレオチドなど、化合物への結合共役基として有用であることが当分野で知られているものである。一般に、二官能性連結部分には少なくとも２つの官能基が含まれる。官能基のうち一方は、化合物の特定の部位に結合するために選択され、他方は共役基に結合するために選択される。二官能性連結部分に使用される官能基の例としては、求核性基と反応するための求電子基、及び求電子基と反応するための求核性基が含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、二官能性連結部分には、アミノ、ヒドロキシル、カルボン酸、チオール、アルキル、アルケニル、及びアルキニルから選択される１つ以上の基が含まれる。

【0427】

共役リンカーの例としては、ピロリジン、８－アミノ－３，６－ジオキサオクタン酸（ＡＤＯ）、スクシンイミジル４－（Ｎ－マレイミドメチル）シクロヘキサン－１－カルボキシレート（ＳＭＣＣ）、及び６－アミノヘキサン酸（ＡＨＥＸまたはＡＨＡ）が含まれるが、これらに限定されない。他の共役リンカーには、置換もしくは非置換のＣ_１～Ｃ_１０アルキル、置換もしくは非置換のＣ_２～Ｃ_１０アルケニル、または置換もしくは非置換のＣ_２～Ｃ_１０アルキニルが含まれるが、これらに限定されず、好ましい置換基の非限定的な一覧には、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル、及びアルキニルが挙げられる。

【0428】

特定の実施形態では、共役リンカーは１～１０個のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは２～５個のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは正確に３個のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、ＴＣＡモチーフを含む。特定の実施形態では、そのようなリンカー－ヌクレオシドは修飾ヌクレオシドである。特定の実施形態では、そのようなリンカー－ヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、リンカー－ヌクレオシドは非修飾である。特定の実施形態では、リンカー－ヌクレオシドは、プリン、置換プリン、ピリミジン、または置換ピリミジンから選択される任意に保護された複素環式塩基を含む。特定の実施形態では、切断可能な部分は、ウラシル、チミン、シトシン、４－Ｎ－ベンゾイルシトシン、５－メチルシトシン、４－Ｎ－ベンゾイル－５－メチルシトシン、アデニン、６－Ｎ－ベンゾイルアデニン、グアニン、及び２－Ｎ－イソブチリルグアニンから選択されるヌクレオシドである。リンカー－ヌクレオシドは、標的組織に到達した後、オリゴマー化合物から切断されることが一般的に望ましい。したがって、リンカー－ヌクレオシドは、典型的には、互いに、及び切断可能な結合を介してオリゴマー化合物の残りの部分に、連結されている。特定の実施形態では、そのような切断可能な結合は、ホスホジエステル結合である。

【0429】

本明細書では、リンカー－ヌクレオシドはオリゴヌクレオチドの一部とは見なされない。したがって、オリゴマー化合物が、特定の数または範囲の連結ヌクレオシド及び／または参照核酸に対する特定の相補性パーセントからなるオリゴヌクレオチドを含み、該オリゴマー化合物が、リンカー－ヌクレオシドを含む共役リンカーを含む共役基も含む実施形態において、これらのリンカー－ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドの長さにはカウントされず、参照核酸に対するオリゴヌクレオチドの相補性パーセントの決定にも使用されない。例えば、オリゴマー化合物は、（１）８～３０個のヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチド、及び（２）修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドと連続する１～１０個のリンカー－ヌクレオシドを含む共役基を含み得る。そのようなオリゴマー化合物中の連続する連結ヌクレオシドの総数は３０を超える。あるいは、オリゴマー化合物は、８～３０個のヌクレオシドからなり、共役基を含まない修飾オリゴヌクレオチドを含み得る。そのようなオリゴマー化合物中の連続する連結ヌクレオシドの総数は３０以下である。特に明記しない限り、共役リンカーは１０個以下のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、５個以下のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、３個以下のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、２個以下のリンカー－ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、共役リンカーは、１個以下のリンカー－ヌクレオシドを含む。

【0430】

特定の実施形態では、共役基がオリゴヌクレオチドから切断されることが望ましい。例えば、特定の状況では、特定の共役部分を含むオリゴマー化合物は、特定の細胞型によりよく取り込まれるが、オリゴマー化合物が取り込まれると、共役基が切断されて、非共役または親オリゴヌクレオチドが放出されることが望ましい。したがって、特定の共役リンカーは、１つ以上の切断可能な部分を含み得る。特定の実施形態では、切断可能な部分は、切断可能な結合である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、少なくとも１つの切断可能な結合を含む原子団である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、１個、２個、３個、４個、または５個以上の切断可能な結合を有する原子団を含む。特定の実施形態では、切断可能な部分は、リソソームなどの細胞内部または細胞内区画で選択的に切断される。特定の実施形態では、切断可能な部分は、ヌクレアーゼなどの内因性酵素によって選択的に切断される。

【0431】

特定の実施形態では、切断可能な結合は、アミド結合、エステル結合、エーテル結合、一方または両方のホスホジエステルのエステル結合、リン酸エステル結合、カルバメート結合、またはジスルフィド結合の中から選択される。特定の実施形態では、切断可能な結合は、一方または両方のホスホジエステルのエステルである。特定の実施形態では、切断可能な部分は、リン酸またはホスホジエステルを含む。特定の実施形態では、切断可能な部分は、オリゴヌクレオチドと共役部分または共役基との間のリン酸結合である。

【0432】

特定の実施形態では、切断可能な部分は、１つ以上のリンカー－ヌクレオシドを含むか、またはそれからなる。特定のそのような実施形態では、１つ以上のリンカー－ヌクレオシドは、互いに、及び／または切断可能な結合を介してオリゴマー化合物の残りの部分に連結される。特定の実施形態では、そのような切断可能な結合は、非修飾ホスホジエステル結合である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、リン酸ヌクレオシド間結合によってオリゴヌクレオチドの３’または５’末端ヌクレオシドのいずれかに結合し、リン酸またはホスホロチオエート結合によって共役リンカーまたは共役部分の残りに共有結合する２’－デオキシヌクレオシドである。特定のそのような実施形態では、切断可能な部分は、２’－デオキシアデノシンである。

【0433】

３．細胞標的部分
特定の実施形態では、共役基は細胞標的部分を含む。特定の実施形態では、共役基は、以下の一般式を有し：

【0434】

【化9】

【0435】

式中、ｎは１～約３であり、ｎが１の場合ｍは０、ｎが２以上の場合ｍは１、ｊは１または０、及びｋは１または０である。

【0436】

特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは１である。

【0437】

特定の実施形態では、共役基は少なくとも１つのテザーリガンドを有する細胞標的部分を含む。特定の実施形態では、細胞標的部分は、分枝基に共有結合する２つのテザーリガンドを含む。特定の実施形態では、細胞標的部分は、分枝基に共有結合する３つのテザーリガンドを含む。

【0438】

特定の実施形態では、細胞標的部分の各リガンドは、標的細胞上の少なくとも１つの受容体型に親和性を有する。特定の実施形態では、各リガンドは、哺乳動物の肝臓細胞の表面上の少なくとも１つの受容体型に親和性を有する。特定の実施形態では、各リガンドは、肝臓のアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ－Ｒ）に親和性を有する。特定の実施形態では、各リガンドは、炭水化物である。

【0439】

特定の実施形態では、細胞標的部分は、ニューロンを標的とする。特定の実施形態では、細胞標的部分は、神経伝達物質受容体を標的とする。特定の実施形態では、細胞標的部分は、神経伝達物質トランスポーターを標的とする。特定の実施形態では、細胞標的部分は、ＧＡＢＡトランスポーターを標的とする。例えば、ＷＯ２０１１／１３１６９３、ＷＯ２０１４／０６４２５７を参照のこと。

【0440】

Ｃ．特定の末端基
特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、１個以上の末端基を含む。特定のそのような実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾オリゴヌクレオチドの５’末端にリン含有基を含む。特定の実施形態では、リン含有基は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び／またはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端にある。特定の実施形態では、末端基は、リン酸安定化リン酸基である。５’末端リン含有基は、５’末端リン酸（５’－Ｐ）、５’末端ホスホロチオエート（５’－ＰＳ）、５’末端ホスホロジチオエート（５’－ＰＳ_２）、５’末端ビニルホスホネート（５’－ＶＰ）、５’末端メチルホスホネート（ＭｅＰｈｏｓ）、または５’－デオキシ－５’－Ｃ－マロニルがあり得る。５’末端リン含有基が５’末端ビニルホスホネートである場合、５’ＶＰは５’－Ｅ－ＶＰ異性体（すなわち、トランス－ビニルホスホネート）、５’－Ｚ－ＶＰ異性体（すなわち、シス－ビニルホスホネート）、またはそれらの混合物のいずれかであり得る。そのようなリン酸基は、任意の修飾オリゴヌクレオチドに結合することができるが、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドへのそのような基の結合が特定のＲＮＡｉ化合物の活性を改善することが特に示されている。例えば、Ｐｒａｋａｓｈ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，４３（６）：２９９３－３０１１，２０１５；Ｅｌｋａｙａｍ，ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，４５（６）：３５２８－３５３６，２０１７；Ｐａｒｍａｒ，ｅｔ ａｌ．ＣｈｅｍＢｉｏＣｈｅｍ，１７（１１）９８５－９８９；２０１６；Ｈａｒａｓｔｚｉ，ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，４５（１３）：７５８１－７５９２，２０１７を参照のこと。特定の実施形態では、リン酸安定化基は、５’－シクロプロピルホスホネートである。例えば、ＷＯ／２０１８／０２７１０６を参照のこと。

【0441】

特定の実施形態では、末端基は、１つ以上の脱塩基ヌクレオシド及び／または逆位ヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、末端基は、１つ以上の２’連結ヌクレオシドを含む。特定のそのような実施形態では、２’連結ヌクレオシドは脱塩基ヌクレオシドである。

【0442】

Ｄ．特定のＲＮＡｉモチーフ
ＲＮＡｉ化合物は、モチーフまたは特定の機能によって説明することができる。

【0443】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、及び
（ｉｉｉ）１、３、５、７、９～１１、１３、１７、１９、及び２１位での２’－Ｆ修飾、ならびに２、４、６、８、１２、１４～１６、１８、及び２０位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３、５、９、１１～１３、１５、１７、１９、２１、及び２３位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、４、６～８、１０、１４、１６、１８、２０、及び２２位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｉｉ）２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端の２つのヌクレオチドはオーバーハングヌクレオシドであり、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端を構成するＲＮＡｉ化合物二重鎖の末端は平滑末端を有する（すなわち、どちらのオリゴヌクレオチドもその末端にオーバーハングヌクレオシドを有しておらず、代わりにセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのハイブリダイズ領域はセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も３’側のヌクレオシドを含み、そのヌクレオシドはアンチセンスオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドとハイブリダイズする）。

【0444】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１、３、５、７、９～１１、１３、１７、１９、及び２１位での２’－Ｆ修飾、ならびに２、４、６、８、１２、１４、１６、１８、及び２０位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３、５、７、９、１１～１３、１５、１７、１９、及び２１～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、４、６、８、１０、１４、１６、１８、及び２０位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを含み、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を含む。

【0445】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１～６、８、１０、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに７及び９位での２’－Ｆ修飾、ならびに１１位でのデオキシヌクレオチド（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３、７、９、１１、１３、１５、１７、及び１９～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、４～６、８、１０、１２、１４、１６、及び１８位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを有し、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を有する。

【0446】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１～６、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに７、及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～５、７、８、１０～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、６、９、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを有し、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を有する。

【0447】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１～６、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに７、及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～５、７、１０～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、６、８、９、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを有し、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を有する。

【0448】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）１９ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１～４、６、及び１０～１９位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに５、及び７～９位での２’－Ｆ修飾、ならびに、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～５、７、１０～１３、１５、及び１７～２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、６、８、９、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、１９と２０位ヌクレオシドの間、及び２０と２１位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを有し、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を有する。

【0449】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）６位で結合した共役部（５’末端から数えて）、
（ｉｉｉ）７及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに１～５、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、１９と２０位ヌクレオシドの間、及び２０と２１位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～５、７、１０～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、６、８、９、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｖ）最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを含み、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を含む。

【0450】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）７及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに１～６、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～５、７～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、６位での（Ｓ）－ＧＮＡ修飾、ならびに２、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを含み、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を含む。

【0451】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）３’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）７及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに１～６、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、及び２と３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～６、８～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、７位での（Ｓ）－ＧＮＡ修飾、ならびに２、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを含み、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を含む。

【0452】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）６位で結合した共役部（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｉｉ）７及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに１～５、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、１９と２０位ヌクレオシドの間、及び２０と２１位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～５、７～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、６位での（Ｓ）－ＧＮＡ修飾、ならびに２、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｖ）最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含み、
該ＲＮＡｉ二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に２つのヌクレオチドオーバーハングを含み、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に平滑末端を含む。

【0453】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）６位で結合した共役部（５’末端から数えて）、
（ｉｉｉ）７及び９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに１～５、８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾（５’末端から数えて）、ならびに
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、１９と２０位ヌクレオシドの間、及び２０と２１位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２３ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３～６、８～１３、１５、及び１７～２３位での２’－ＯＭｅ修飾、７位での（Ｓ）－ＧＮＡ修飾、ならびに２、１４、及び１６位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、２１と２２位ヌクレオシドの間、及び２２と２３位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｖ）最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含み、
該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端の２つのヌクレオチドはオーバーハングヌクレオシドであり、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端を構成するＲＮＡｉ化合物二重鎖の末端は平滑末端を有する（すなわち、どちらのオリゴヌクレオチドもその末端にオーバーハングヌクレオシドを有しておらず、代わりにセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのハイブリダイズ領域はセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も３’側のヌクレオシドを含み、そのヌクレオシドはアンチセンスオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドとハイブリダイズする）。

【0454】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）５’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１～８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに９～１１位での２’－Ｆ修飾、ならびに、
（ｉｖ）最も５’側のヌクレオシドと最も３’側のヌクレオシドの両方に結合した逆位の脱塩基糖部分、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、及び２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、及び２０位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、３と４位ヌクレオシドの間、及び２０と２１位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含む。

【0455】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）５’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）１～８、及び１２～２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに９～１１位での２’－Ｆ修飾、
（ｉｖ）１と２位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｖ）最も３’側のヌクレオシドに結合した逆位の脱塩基糖部分、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）２１ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、及び２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、及び２０位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、３と４位ヌクレオシドの間、及び２０と２１位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含む。

【0456】

特定の実施形態では、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、
（ａ）以下を有するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）１９ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）５’末端に結合した共役部、
（ｉｉｉ）２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、及び２０位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、及び２１位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｖ）１７と１８位ヌクレオシドの間、及び１８と１９位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、
ならびに、
（ｂ）以下を有するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド：
（ｉ）１９ヌクレオチドの長さ、
（ｉｉ）１、３、５、７、９、１１、１３、１５、１７、１９、及び２１位での２’－ＯＭｅ修飾、ならびに２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、及び２０位での２’Ｆ修飾（５’末端から数えて）、ならびに、
（ｉｉｉ）１と２位ヌクレオシドの間、２と３位ヌクレオシドの間、１７と１８位ヌクレオシドの間、及び１８と１９位ヌクレオシドの間のホスホロチオエートヌクレオシド間結合（５’末端から数えて）、を含む。

【0457】

上記の実施形態のいずれにおいても、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端の共役部は、標的部分を含み得る。特定のそのような実施形態では、標的部分は、神経伝達物質受容体を標的とする。特定の実施形態では、細胞標的部分は、神経伝達物質トランスポーターを標的とする。特定の実施形態では、細胞標的部分は、ＧＡＢＡトランスポーターを標的とする。例えば、ＷＯ２０１１／１３１６９３、ＷＯ２０１４／０６４２５７を参照のこと。

【0458】

特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物は、２１ヌクレオチドのセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び２３ヌクレオチドのアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含み、該センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、５’末端から９、１０、１１位に３つの連続した２’－Ｆ修飾ヌクレオシドの少なくとも１つのモチーフを含み、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、５’末端から１１、１２、１３位に３個の連続したヌクレオチドに３個の２’－Ｏ－メチル修飾のモチーフを少なくとも１つ含み、該ＲＮＡｉ化合物の一端は平滑末端を有し、他方の端は２個のヌクレオチドオーバーハングを含む。好ましくは、２ヌクレオチドのオーバーハングは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端にある。

【0459】

特定の実施形態では、２個のヌクレオチドオーバーハングがアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端にある場合、末端３個のヌクレオチド間に２個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合があり得、該３個のヌクレオチドのうちの２個はオーバーハングヌクレオチドであり、第３のヌクレオチドはオーバーハングヌクレオチドの隣にある対をなすヌクレオチドである。特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端の両方で、末端３個のヌクレオチド間に２個のホスホロチオエートヌクレオシド間結合をさらに有する。特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物のセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの全てのヌクレオチドは、修飾ヌクレオチドである。特定の実施形態では、各ヌクレオチドは、例えば、交互モチーフにおいて、２’－Ｏ－メチルまたは３’－フルオロで独立して修飾される。任意選択で、ＲＮＡｉ化合物は共役部を含む。

【0460】

特定の実施形態では、モチーフの一部であるヌクレオチドを含む、ＲＮＡｉ化合物のセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドにおける全てのヌクレオチドは、修飾され得る。各ヌクレオチドは、同じまたは異なる修飾で修飾することができ、これは、非連結リン酸酸素の一方または両方の１つ以上の変化、リボース糖、例えば、リボース糖上の２’ヒドロキシルの構成成分の変化、「脱ホスホ」リンカーによるリン酸部分の大規模置換、天然に存在する塩基の修飾または置換、及び、リボース－リン酸骨格の置換または修飾を含むことができる。

【0461】

特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、ＬＮＡ、ｃＥｔ、ＵＮＡ、ＨＮＡ、ＣｅＮＡ、２’－ＭＯＥ、２’－ＯＭｅ、２’－Ｏ－アリル、２’－Ｃ－アリル、２’－デオキシ、２’－ヒドロキシル、または２’－フルオロで独立して修飾される。ＲＮＡｉ化合物は、２つ以上の修飾を含むことができる。一実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、２’－Ｏ－メチルまたは２’－Ｆで独立して修飾される。特定の実施形態では、修飾は２’－ＮＭＡ修飾である。

【0462】

本明細書で使用される「交互モチーフ」という用語は、１つ以上の修飾を有するモチーフを指し、各修飾は、１つのＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの交互ヌクレオチド上で起こる。交互ヌクレオチドとは、１ヌクレオチドおきに１つ、または３ヌクレオチドおきに１つ、または同様のパターンを指し得る。例えば、Ａ、Ｂ、及びＣがそれぞれヌクレオチドに対する１つのタイプの修飾を表す場合、交互モチーフは、「ＡＢＡＢＡＢＡＢＡＢＡＢ．．．」、「ＡＡＢＢＡＡＢＢＡＡＢＢ．．．」、「ＡＡＢＡＡＢＡＡＢＡＡＢ．．．」、「ＡＡＡＢＡＡＡＢＡＡＡＢ．．．」、「ＡＡＡＢＢＢＡＡＡＢＢＢ．．．」、または「ＡＢＣＡＢＣＡＢＣＡＢＣ．．．」、などであり得る。

【0463】

交互モチーフに含まれる修飾のタイプは、同じであっても異なっていてもよい。例えば、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄがそれぞれヌクレオチドの１つのタイプの修飾を表す場合、交互パターン、すなわち１ヌクレオチドおきの修飾が同じである可能性があるが、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドまたはアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各々は、「ＡＢＡＢＡＢ．．．」、「ＡＣＡＣＡＣ．．．」、「ＢＤＢＤＢＤ．．．」、または「ＣＤＣＤＣＤ．．．」など、交互モチーフ内の修飾のいくつかの可能性から選択され得る。

【0464】

特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド上の交互モチーフの修飾パターンと比較した、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド上の交互モチーフの修飾パターンは、シフトされる。このシフトは、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの修飾ヌクレオチドのグループがアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの異なって修飾されたヌクレオチドのグループに対応するようなものであり得、逆もまた同様である。例えば、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、ＲＮＡｉ二重鎖においてアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと対にされた場合、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの交互モチーフは、ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’－３’から「ＡＢＡＢＡＢ」で始まってもよく、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの交互モチーフは、二重鎖領域内のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’－３’から「ＢＡＢＡＢＡ」で始まってもよい。別の例として、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの交互モチーフは、ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’－３’から「ＡＡＢＢＡＡＢＢ」で始まってもよく、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの交互モチーフは、二重鎖領域内のＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’－３’から「ＢＢＡＡＢＢＡＡ」で始まってもよく、その結果、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドとアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドとの間に１０個の修飾パターンの完全または部分的なシフトが存在する。

【0465】

特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの２’－Ｏ－メチル修飾と２’－Ｆ修飾の交互モチーフのパターンを含むＲＮＡｉ化合物は、最初にアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの２’－Ｏ－メチル修飾と２’－Ｆ修飾の交互モチーフのパターンと比較したシフトを最初に有する、すなわち、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの２’－Ｏ－メチル修飾ヌクレオチドは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの２’－Ｆ修飾ヌクレオチドと塩基対形成し、逆もまた同様である。センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１位は２’－Ｆ修飾で始まってもよく、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１位は２’－Ｏ－メチル修飾で始まってもよい。

【0466】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び／またはアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドへの３つの連続したヌクレオチド上の３つの同一の修飾の１つ以上のモチーフの導入は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び／またはアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに存在する初期修飾パターンを中断する。センス及び／またはアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドへの３つの連続したヌクレオチド上の３つの同一の修飾の１つ以上のモチーフを導入することによるセンス及び／またはアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの修飾パターンのこの中断は、驚くべきことに、標的遺伝子に対する遺伝子サイレンシング活性を増強する。一実施形態では、３つの連続した２５ヌクレオチド上の３つの同一の修飾のモチーフがＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのいずれかに導入される場合、モチーフの隣のヌクレオチドの修飾は、モチーフの修飾とは異なる修飾である。例えば、モチーフを含む配列の部分は、「．．．ＮａＹＹＹＮｂ．．．」であり、ここで「Ｙ」は３つの連続したヌクレオチド上の３つの同一の修飾のモチーフの修飾を表し、「Ｎａ」及び「Ｎｂ」は、Ｙの修飾とは異なる、モチーフ「ＹＹＹ」の隣のヌクレオチドの修飾を表し、Ｎａ及びＮｂは同じ修飾でも異なる修飾でもよい。あるいは、ウィング修飾が存在する場合、Ｎａ及び／またはＮｂが存在するか、または存在しない可能性がある。

【0467】

特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、式（Ｉ）によって表され得る：
５’ｎ_ｐ－Ｎ_ａ－（Ｘ Ｘ Ｘ ）ｉ－Ｎ_ｂ－Ｙ Ｙ Ｙ －Ｎ_ｂ－（Ｚ Ｚ Ｚ ）_ｒＮ_ａ－ｎ_ｑ３’（Ｉ）
式中、
ｉ及びｊは、それぞれ独立して０または１であり、
ｐ及びｑは、それぞれ独立して０～６であり、
各Ｎ_ａは、独立して、少なくとも２つの異なる修飾ヌクレオシドを含む０～２５個の連結ヌクレオシドを表し、
各Ｎ_ｂは、独立して０～１０個の連結ヌクレオシドを表し、
各ｎ_ｐ及びｎ_ｑは、独立してオーバーハングヌクレオシドを表し、
式中、Ｎ_ｂ及びＹは同じ修飾を有さず、
ＸＸＸ、ＹＹＹ、及びＺＺＺはそれぞれ独立して修飾ヌクレオシドを表し、各Ｘヌクレオシドは同じ修飾を有し、各Ｙヌクレオシドは同じ修飾を有し、各Ｚヌクレオシドは同じ修飾を有する。特定の実施形態では、各Ｙは２’－Ｆ修飾を含む。

【0468】

特定の実施形態では、Ｎ_ａ及びＮ_ｂは、交互パターンの修飾を含む。

【0469】

特定の実施形態では、ＹＹＹモチーフは、標的核酸の切断部位に、またはその近くに存在する。例えば、ＲＮＡｉ化合物が１７～２３ヌクレオチド長の二重鎖領域を有する場合、ＹＹＹモチーフは、センスＲＮＡｉのオリゴヌクレオチドの切断部位に、またはその近くに存在し得る（例えば、６、７、８；７、８、９；８、９、１０；９、１０、１１；１０、１１、１２；または１１、１２、１３位に存在し得る）、その順番は、５’末端から１番目のヌクレオチドから数え始めるか、または必要に応じて、５’末端から、二重鎖領域内の１番目の対をなすヌクレオチドから始める。

【0470】

特定の実施形態では、ＲＮＡｉのアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、次の式によって表され得る：
５’ｎ_ｑ－Ｎ_ａ’－（Ｚ’Ｚ’Ｚ’）_ｋ－Ｎ_ｂ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ｂ’－（Ｘ’Ｘ’Ｘ’）_ｌ－Ｎ’_ａ－ｎ_ｐ３’（ＩＩ）
式中、
ｋ及びｌは、それぞれ独立して０または１であり、
ｐ’及びｑ’は、それぞれ独立して０～６であり、
各Ｎ_ａ’は、独立して、少なくとも２個の異なって修飾されたヌクレオチドを含む０～２５個の連結ヌクレオチドを表し、
各Ｎ_ｂ’は、独立して、０～１０の連結ヌクレオチドを表し、
各ｎ_ｐ’及びｎ_ｑ’は、独立して、オーバーハングヌクレオシドを表し、
式中、Ｎ_ｂ’及びＹ’は同じ修飾を有さず、
Ｘ’Ｘ’Ｘ’、Ｙ’Ｙ’Ｙ’、及びＺ’Ｚ’Ｚ’は、それぞれ独立して修飾ヌクレオシドを表し、各Ｘ’ヌクレオシドは同じ修飾を有し、各Ｙ’ヌクレオシドは同じ修飾を有し、各Ｚ’ヌクレオシドは同じ修飾を有する。特定の実施形態では、各Ｙ’は２’－Ｆ修飾を含む。特定の実施形態では、各Ｙ’は２’－ＯＭｅ修飾を含む。

【0471】

特定の実施形態では、Ｎ_ａ’及び／またはＮ_ｂ’は、交互パターンの修飾を含む。

【0472】

特定の実施形態では、Ｙ’Ｙ’Ｙ’モチーフは、標的核酸の切断部位に、またはその近くに存在する。例えば、ＲＮＡｉ化合物が１７～２３ヌクレオチド長の二重鎖領域を有する場合、Ｙ’Ｙ’Ｙ’モチーフは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの９、１０、１１；１０、１１、１２；１１、１２、１３；１２、１３、１４；または１３、１４、１５位に存在し得る、その順番は、５’末端から１番目のヌクレオチドから数え始めるか、または必要に応じて、５’末端から、二重鎖領域内の１番目の対をなすヌクレオチドから始める。好ましくは、Ｙ’Ｙ’Ｙ’モチーフは、１１、１２、１３位に存在する。

【0473】

特定の実施形態では、ｋが１でｌが０、またはｋが０でｌが１、またはｋ及びｌの両方が１である。

【0474】

したがって、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは次の式で表すことができる：
５’ｎ_ｑ’－Ｎ_ａ’－Ｚ’Ｚ’Ｚ’－Ｎ_ｂ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ａ’－ｎ_ｐ’３’（ＩＩｂ）；
５’ｎ_ｑ’－Ｎ_ａ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ｂ’－Ｘ’Ｘ’Ｘ’－ｎ_ｐ’３’（ＩＩｃ）または、
５’ｎ_ｑ’－Ｎ_ａ’－Ｚ’Ｚ’Ｚ’－Ｎ_ｂ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ｂ’－Ｘ’Ｘ’Ｘ’－Ｎ_ａ’－ｎ_ｐ’３’（ＩＩｄ）。

【0475】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが式ＩＩｂで表される場合、Ｎ_ｂ’は０～１０、０～７、０～５、０～４、０～２、または０個の連結ヌクレオシドを表す。各Ｎ_ａ’は、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。

【0476】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが式ＩＩｃで表される場合、Ｎ_ｂ’は０～１０、０～７、０～５、０～４、０～２、または０個の連結ヌクレオシドを表す。各Ｎ_ａ’は、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。

【0477】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが式ＩＩｄで表される場合、Ｎ_ｂ’は０～１０、０～７、０～５、０～４、０～２、または０個の連結ヌクレオシドを表す。各Ｎ_ａ’は、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。好ましくは、Ｎ_ｂ’は０、１、２、３、４、５、または６である。

【0478】

特定の実施形態では、ｋが０でｌが０であり、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、以下の式で表すことができる：
５’ｎ_ｐ’－Ｎａ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ａ’－ｎ_ｑ’３’（Ｉａ）。

【0479】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが式ＩＩａで表される場合、各Ｎ_ａ’は、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。

【0480】

各Ｘ’、Ｙ’、及びＺ’は、互いに同じでも異なっていてもよい。

【0481】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドは、ＬＮＡ、ＵＮＡ、ｃＥｔ、ＨＮＡ、ＣｅＮＡ、２’－メトキシエチル、２’－Ｏ－メチル、２’－Ｏ－アリル、２’－Ｃ－アリル、２’－ヒドロキシル、または２’－フルオロで独立して修飾することができる。例えば、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオチドは、２’－Ｏ－メチルまたは２’－フルオロで独立して修飾される。特に、各Ｘ、Ｙ、Ｚ、Ｘ’、Ｙ’、及びＺ’は、２’－Ｏ－メチル修飾または２’－フルオロ修飾を表し得る。特定の実施形態では、修飾は２’－ＮＭＡ修飾である。

【0482】

特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物のセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、二重鎖領域が２１ヌクレオチドの場合、ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの９、１０、及び１１位に存在するＹＹＹモチーフを含み得、その順番は、５’末端から１番目のヌクレオチドから数え始めるか、または必要に応じて５’末端から、二重鎖領域内の１番目の対をなすヌクレオチドから数え始め、Ｙは２’－Ｆ修飾を表す。センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、二重鎖領域の反対側の末端にウィング修飾としてＸＸＸモチーフまたはＺＺＺモチーフをさらに含み得、ＸＸＸ及びＺＺＺは、それぞれ独立して２’－Ｏ－メチル修飾または２’－フルオロ修飾を表す。

【0483】

特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１１、１２、１３位に存在するＹ’Ｙ’Ｙ’モチーフを含み得、その順番は、５’末端から１番目のヌクレオチドから数え始めるか、または必要に応じて５’末端から、二重鎖領域内の１番目の対をなすヌクレオチドから数え始め、Ｙは２’－Ｏ－メチル修飾を表す。アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、二重鎖領域の反対側の末端にウィング修飾としてＸ’Ｘ’Ｘ’モチーフまたはＺ’Ｚ’Ｚ’モチーフをさらに含み得、Ｘ’Ｘ’Ｘ’またはＺ’Ｚ’Ｚ’は、それぞれ独立して２’－Ｏ－メチル修飾または２’－フルオロ修飾を表す。

【0484】

上記の式Ｉａ、Ｉｂ、Ｉｃ、及びＩｄのいずれか１つによって表されるセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、それぞれ式ＩＩａ、ＩＩｂ、ＩＩｃ、及びＩＩｄのいずれか１つによって表されるアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドと二重鎖を形成する。

【0485】

したがって、本明細書に記載のＲＮＡｉ化合物は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含み得、各ＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、１４～３０ヌクレオチドを有し、該ＲＮＡｉ二重鎖は、式（ＩＩＩ）によって表され：
センス： ５’ｎ_ｐ－Ｎ_ａ－（ＸＸＸ）_ｉ－Ｎ_ｂ－ＹＹＹ－Ｎ_ｂ－（ＺＺＺ）_ｊ－Ｎ_ａ－ｎ_ｑ３’
アンチセンス： ３’ｎ_ｐ’－Ｎ_ａ’－（Ｘ’Ｘ’Ｘ’）_ｋ－Ｎ_ｂ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ｂ’－（Ｚ’Ｚ’Ｚ’）_ｌ－Ｎ_ａ’－ｎ_ｑ’５’
式中、
ｉ、ｊ、ｋ、及びｌは、それぞれ独立して０または１であり、
ｐ、ｐ’、ｑ、及びｑ’は、それぞれ独立して０～６であり、
各Ｎ_ａ及びＮ_ａ’は、独立して０～２５個の連結ヌクレオシドを表し、各配列は少なくとも２個の異なって修飾されたヌクレオチドを含み、
各Ｎ_ｂ及びＮ_ｂ’は、独立して０～１０個の連結ヌクレオシドを表し、
式中、それぞれが存在する場合も存在しない場合もある各ｎ_ｐ’、ｎ_ｐ、ｎ_ｑ’、及びｎ_ｑは、独立してオーバーハングヌクレオチドを表し、
ＸＸＸ、ＹＹＹ、Ｘ’Ｘ’Ｘ’、Ｙ’Ｙ’Ｙ’、及びＺ’Ｚ’Ｚ’は、それぞれ、３つの連続したヌクレオチド上の３つの同一の修飾の１つのモチーフを独立して表す。

【0486】

特定の実施形態では、ｉが０でｊが０である、またはｉが１でｊが０である、またはｉが０でｊが１である、またはｉ及びｊの両方が０である、またはｉ及びｊの両方が１である。別の実施形態では、ｋが０でｌが０である、またはｋが１でｌが０である、またはｋが０でｌが１である、またはｋ及びｌの両方が０である、またはｋ及びｌの両方が１である。

【0487】

ＲＮＡｉ二重鎖を形成するセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドとアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの例示的な組み合わせには、以下の式が含まれる：
５’ｎ_ｐ－Ｎ_ａ－Ｙ Ｙ Ｙ－Ｎ_ａ－ｎ_ｑ３’
３’ｎｐ’－Ｎ_ａ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ａ’ｎ_ｑ’５’
（ＩＩＩａ）
５’ｎ_ｐ－Ｎ_ａ－Ｙ Ｙ Ｙ－Ｎ_ｂ－Ｚ Ｚ Ｚ－Ｎ_ａ－ｎ_ｑ３’
３’ｎ_ｐ’－Ｎ_ａ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎｂ’－Ｚ’Ｚ’Ｚ’－Ｎ_ａ’ｎ_ｑ’５’
（ＩＩＩｂ）
５’ｎｐ－Ｎ_ａ－Ｘ Ｘ Ｘ－Ｎ_ｂ－Ｙ Ｙ Ｙ－Ｎ_ａ－ｎ_ｑ３’
３’ｎｐ’－Ｎ_ａ’－Ｘ’Ｘ’Ｘ’－Ｎ_ｂ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ａ’－ｎ_ｑ’５’
（ＩＩＩｃ）
５’ｎｐ－Ｎ_ａ－Ｘ Ｘ Ｘ－Ｎ_ｂ－Ｙ Ｙ Ｙ－Ｎ_ｂ－Ｚ Ｚ Ｚ－Ｎ_ａ－ｎ_ｑ３’
３’ｎｐ’－Ｎ_ａ’－Ｘ’Ｘ’Ｘ’－Ｎ_ｂ’－Ｙ’Ｙ’Ｙ’－Ｎ_ｂ’－Ｚ’Ｚ’Ｚ’－Ｎ_ａ－ｎ_ｑ’５’
（Ｉｌｌｄ）

【0488】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩａで表される場合、各Ｎ_ａは、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。

【0489】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｂで表される場合、各Ｎ_ｂは、独立して１～１０、１～７、１～５、または１～４個の連結ヌクレオシドを表す。各Ｎ_ａは、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。

【0490】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｃで表される場合、各Ｎ_ｂ、Ｎ_ｂ’は、独立して０～１０、０～７、０～１０、０～７、０～５、０～４、０～２、または０個の連結ヌクレオシドを表す。各Ｎ_ａは、独立して２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドを表す。

【0491】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｄで表される場合、各Ｎ_ｂ、Ｎ_ｂ’は、独立して０～１０、０～７、０～１０、０～７、０～５、０～４、０～２、または０個の連結ヌクレオシドを表す。各Ｎ_ａ、Ｎ_ａ’は、独立して、２～２０、２～１５、または２～１０個の連結ヌクレオシドである。各Ｎ_ａ、Ｎ_ａ’、Ｎ_ｂ、Ｎ_ｂ’は、独立して交互パターンの修飾を含む。

【0492】

式ＩＩＩ、ＩＩＩａ、ＩＩＩｂ、ＩＩＩｃ、及びＩＩＩｄのＸ、Ｙ、及びＺの各々は、互いに同じであっても異なっていてもよい。

【0493】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩ、ＩＩＩａ、ＩＩＩｂ、ＩＩＩｃ、及び／またはＩＩＩｄによって表される場合、Ｙヌクレオチドの少なくとも１つは、Ｙ’ヌクレオチドの１つと塩基対を形成し得る。あるいは、Ｙヌクレオチドのうちの少なくとも２つは、対応するＹ’ヌクレオチドと塩基対を形成し得る、または、３つのＹヌクレオチド全てが、対応するＹ’ヌクレオチドと塩基対を形成し得る。

【0494】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｂまたはＩＩＩｄによって表される場合、Ｚヌクレオチドのうちの少なくとも１つは、Ｚ’ヌクレオチドのうちの１つと塩基対を形成し得る。あるいは、Ｚヌクレオチドのうちの少なくとも２つは、対応するＺ’ヌクレオチドと塩基対を形成し得る、または、３つのＺヌクレオチド全てが、対応するＺ’ヌクレオチドと塩基対を形成し得る。

【0495】

ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｃまたはＩＩＩｄによって表される場合、Ｘヌクレオチドのうちの少なくとも１つは、Ｘ’ヌクレオチドのうちの１つと塩基対を形成し得る。あるいは、Ｘヌクレオチドのうちの少なくとも２つは、対応するＸ’ヌクレオチドと塩基対を形成し得る、または、３つのＸヌクレオチド全てが、対応するＸ’ヌクレオチドと塩基対を形成し得る。

【0496】

特定の実施形態では、Ｙヌクレオチドの修飾はＹ’ヌクレオチドの修飾とは異なり、Ｚヌクレオチドの修飾はＺ’ヌクレオチドの修飾とは異なり、及び／またはＸヌクレオチドの修飾はＸ’ヌクレオチドの修飾とは異なる。

【0497】

特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｄによって表される場合、Ｎ_ａ修飾は、２’－Ｏ－メチルまたは２’－フルオロ修飾である。別の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｄによって表される場合、Ｎ_ａ修飾は２’－Ｏ－メチルまたは２’－フルオロ修飾であり、ｎ_ｐ’＞０であり、少なくとも１つのｎ_ｐ’は隣接ヌクレオチドにホスホロチオエート結合を介して連結されている。他の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｄで表される場合、Ｎ_ａ修飾は２’－Ｏ－メチルまたは２’－フルオロ修飾であり、ｎ_ｐ’＞０であり、少なくとも１つのｎ_ｐ’が隣接ヌクレオチドにホスホロチオエート結合を介して連結されており、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、２価または３価の分岐リンカーを通じて結合した１つ以上の細胞標的化基に共役する。特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩｄで表される場合、Ｎ_ａ修飾は２’－Ｏ－メチルまたは２’－フルオロ修飾であり、ｎ_ｐ’＞０であり、少なくとも１つのｎ_ｐ’が隣接ヌクレオチドにホスホロチオエート結合を介して連結されており、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは少なくとも１つのホスホロチオエート結合を含み、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２価または３価の分岐リンカーを通じて結合した１つ以上の細胞標的化基に共役する。

【0498】

特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物が式ＩＩＩａで表される場合、Ｎ_ａ修飾は２’－Ｏ－メチルまたは２’－フルオロ修飾であり、ｎ_ｐ’＞０であり、少なくとも１つのｎ_ｐ’が隣接ヌクレオチドにホスホロチオエート結合を介して連結されており、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは少なくとも１つのホスホロチオエート結合を含み、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２価または３価の分岐リンカーを通じて結合した１つ以上の細胞標的化基に共役する。

【0499】

特定の実施形態では、修飾は２’－ＮＭＡ修飾である。

【0500】

特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含み得る。特定の実施形態では、安定化したリン酸基は、（Ｅ）－ビニルホスホネートを含む。特定の実施形態では、安定化したリン酸基は、シクロプロピルホスホネートを含む。

【0501】

特定の実施形態では、アンチセンス鎖は、シードペアリング不安定化修飾を含み得る。特定の実施形態では、シードペアリング不安定化修飾は、６位（５’末端から数えて）に位置する。特定の実施形態では、シードペアリング不安定化修飾は、７位（５’末端から数えて）に位置する。特定の実施形態では、シードペアリング不安定化修飾は、ＧＮＡ糖代替物である。特定の実施形態では、シードペアリング不安定化修飾は、（Ｓ）－ＧＮＡである。特定の実施形態では、シードペアリング不安定化修飾は、ＵＮＡである。特定の実施形態では、シードペアリング不安定化修飾は、モルホリノである。

【0502】

特定の実施形態では、センス鎖は、最も５’側のヌクレオシドに結合した逆位の脱塩基糖部分を含み得る。特定の実施形態では、センス鎖は、最も３’側のヌクレオシドに結合した逆位の脱塩基糖部分を含み得る。特定の実施形態では、センス鎖は、最も５’側及び最も３’側のヌクレオシドの両方に結合した逆位の脱塩基糖部分を含み得る。

【0503】

特定の実施形態では、センス鎖は、６位（５’末端から数えて）に結合した共役部を含み得る。特定の実施形態では、共役部は、ヌクレオシドの２’位に結合している。特定の実施形態では、共役部は、Ｃ_１６脂質共役部である。特定の実施形態では、センス鎖の６位にある修飾ヌクレオシドは、２’－Ｏ－ヘキサデシル修飾糖部分を有する。

【0504】

ＩＶ．アンチセンス活性
特定の実施形態では、オリゴマー化合物及びオリゴマー二重鎖は、標的核酸にハイブリダイズすることができ、少なくとも１つのアンチセンス活性をもたらし、そのようなオリゴマー化合物及びオリゴマー二重鎖はアンチセンス化合物である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、それらが標準的な細胞アッセイにおいて標的核酸の量または活性を２５％以上減少または阻害する場合、アンチセンス活性を有する。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、１個以上の標的核酸に選択的に影響を及ぼす。そのようなアンチセンス化合物は、１つ以上の標的核酸にハイブリダイズして１つ以上の所望のアンチセンス活性をもたらし、１つ以上の非標的核酸にハイブリダイズしないか、または重大な望ましくないアンチセンス活性をもたらすような方法で１つ以上の非標的核酸にハイブリダイズしない、核酸塩基配列を含む。

【0505】

特定のアンチセンス活性において、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸を切断するタンパク質の動員をもたらす。例えば、特定のアンチセンス化合物は、ＲＮａｓｅ Ｈの介在による標的核酸の切断をもたらす。ＲＮａｓｅ Ｈは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二重鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞性エンドヌクレアーゼである。このようなＲＮＡ：ＤＮＡ二重鎖のＤＮＡは、非修飾ＤＮＡである必要はない。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ活性を誘発するのに十分に「ＤＮＡ様」であるアンチセンス化合物が、本明細書に記載される。特定の実施形態では、ギャップマーのギャップにおける１つ以上の非ＤＮＡ様ヌクレオシドは許容される。

【0506】

特定のアンチセンス活性では、アンチセンス化合物またはアンチセンス化合物の一部がＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）にロードされ、最終的に標的核酸の切断をもたらす。例えば、特定のアンチセンス化合物は、アルゴノートによる標的核酸の切断をもたらす。ＲＩＳＣにロードされるアンチセンス化合物はＲＮＡｉ化合物である。ＲＮＡｉ化合物は、二本鎖（ｓｉＲＮＡまたはｄｓＲＮＡｉ）または一本鎖（ｓｓＲＮＡ）の場合がある。

【0507】

特定の実施形態では、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、その標的核酸を切断するタンパク質の動員をもたらさない。特定の実施形態では、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸のスプライシングの変化をもたらす。特定の実施形態では、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸とタンパク質または他の核酸との間の結合相互作用の阻害をもたらす。特定の実施形態では、アンチセンス化合物の標的核酸へのハイブリダイゼーションは、標的核酸の翻訳の変化をもたらす。

【0508】

アンチセンス活性は、直接的または間接的に観察される可能性がある。特定の実施形態では、アンチセンス活性の観察または検出は、そのような標的核酸によってコードされる標的核酸またはタンパク質の量の変化、核酸もしくはタンパク質のスプライスバリアントの比率の変化、及び／または細胞もしくは動物の表現型の変化、の観察または検出を含む。

【0509】

Ｖ．特定の標的核酸
特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、またはそれからなる。特定の実施形態では、標的核酸は、内因性ＲＮＡ分子である。特定の実施形態では、標的核酸は、タンパク質をコードする。特定のそのような実施形態では、標的核酸は、イントロン、エクソン、及び非翻訳領域を含む、成熟ｍＲＮＡ及びプレｍＲＮＡから選択される。特定の実施形態では、標的ＲＮＡは成熟ｍＲＮＡである。特定の実施形態では、標的核酸はプレｍＲＮＡである。特定の実施形態では、標的領域は完全にイントロン内にある。特定の実施形態では、標的領域はイントロン／エクソン接合部にまたがる。特定の実施形態では、標的領域はイントロン内で少なくとも５０％である。特定の実施形態では、標的核酸はレトロジーンのＲＮＡ転写産物である。特定の実施形態では、標的核酸は非コードＲＮＡである。特定の実施形態では、標的非コードＲＮＡは、長い非コードＲＮＡ、短い非コードＲＮＡ、イントロンＲＮＡ分子から選択される。

【0510】

Ａ．標的核酸及び二重鎖相補性に対する相補性／ミスマッチ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長にわたって標的核酸に相補的である。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に９９％、９５％、９０％、８５％、または８０％相補的である。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、オリゴヌクレオチドの全長にわたって標的核酸に対して少なくとも８０％相補的であり、標的核酸に対して１００％または完全に相補的である領域を含む。特定の実施形態では、完全な相補性の領域は、６～２０、１０～１８、または１８～２０の核酸塩基長である。

【0511】

ギャップマーオリゴヌクレオチド
活性を失わずに、ミスマッチ塩基を導入することは可能である。例えば、Ｇａｕｔｓｃｈｉ ｅｔ ａｌ（Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．９３：４６３－４７１，Ｍａｒｃｈ ２００１）は、ｂｃｌ－２ ｍＲＮＡに対して１００％の相補性を有し、かつｂｃｌ－ｘＬ ｍＲＮＡに対して３つのミスマッチを有するオリゴヌクレオチドが、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏでｂｃｌ－２及びｂｃｌ－ｘＬ両方の発現を低減できることを実証した。さらに、このオリゴヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｖｏで強力な抗腫瘍活性を示した。Ｍａｈｅｒ及びＤｏｌｎｉｃｋ（Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ．Ｒｅｓ．１６：３３４１－３３５８，１９８８）は、一連のタンデム１４核酸塩基オリゴヌクレオチド、ならびにそれぞれ２つまたは３つの該タンデムオリゴヌクレオチドの配列で構成される２８及び４２核酸塩基オリゴヌクレオチドを、ヒトＤＨＦＲの翻訳を停止させるその能力について、ウサギ網状赤血球アッセイで試験した。３つの１４核酸塩基オリゴヌクレオチドの各々は単独で、２８または４２核酸塩基オリゴヌクレオチドよりもレベルは低かったものの、翻訳を阻害することができた。

【0512】

特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して１つ以上のミスマッチな核酸塩基を含む。特定の実施形態では、標的に対するアンチセンス活性は、そのようなミスマッチによって減少するが、非標的に対する活性は、より大きな量だけ減少する。したがって、特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの選択性が改善される。特定の実施形態では、ミスマッチは、ギャップマーモチーフを有するオリゴヌクレオチド内に特異的に配置される。特定の実施形態では、ミスマッチは、ギャップ領域の５’末端から１、２、３、４、５、６、７、または８位にある。特定の実施形態では、ミスマッチは、ギャップ領域の３’末端から９、８、７、６、５、４、３、２、１位にある。特定の実施形態では、ミスマッチは、ウィング領域の５’末端から１、２、３、または４位にある。特定の実施形態では、ミスマッチは、ウィング領域の３’末端から４、３、２、または１位にある。

【0513】

アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、標的核酸に対して１つ以上のミスマッチ核酸塩基を含む。特定の実施形態では、標的に対するＲＮＡｉ活性は、そのようなミスマッチによって減少するが、非標的に対する活性は、より大きな量だけ減少する。したがって、特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの選択性が改善される。

【0514】

特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、標的核酸に相補的な標的領域を含む。特定の実施形態では、標的領域は、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、少なくとも２１、少なくとも２２、少なくとも２３、少なくとも２５、または少なくとも２５の連続したヌクレオチドを含むか、またはそれらからなる。特定の実施形態では、標的領域は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの７０％、８０％、８５％、９０％、９５％を構成する。特定の実施形態では、標的領域は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの全てのヌクレオシドを構成する。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域は、標的核酸に対して少なくとも９９％、９５％、９０％、８５％、または８０％相補的である。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域は、標的核酸に対して１００％相補的である。

【0515】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、ＲＮＡｉ化合物は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む。そのような実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに相補的なアンチセンスハイブリダイズ領域を含む。特定の実施形態では、アンチセンスハイブリダイズ領域は、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、少なくとも２１、少なくとも２２、少なくとも２３、少なくとも２５、または少なくとも２５の連続したヌクレオチドを含むか、またはそれらからなる。特定の実施形態では、アンチセンスハイブリダイズ領域は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの７０％、８０％、８５％、９０％、９５％を構成する。特定の実施形態では、アンチセンスハイブリダイズ領域は、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの全てのヌクレオシドを構成する。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに対して少なくとも９９％、９５％、９０％、８５％、または８０％相補的である。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのアンチセンスハイブリダイズ領域は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに対して１００％相補的である。

【0516】

センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのハイブリダイズ領域は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドとハイブリダイズして二重鎖領域を形成する。特定の実施形態では、そのような二重鎖領域は、ヌクレオシドの７つのハイブリダイズしたペアからなる（各ペアの一方はアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド上にあり、各ペアの他方はセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド上にある）。特定の実施形態では、二重鎖領域は、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、少なくとも２１、少なくとも２２、少なくとも２３、少なくとも２５、または少なくとも２５の連続したハイブリダイズしたペアを含む。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、二重鎖領域において対をなしている（すなわち、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、オーバーハングヌクレオシドを有さない）。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、３’末端及び／または５’末端に対をなしていないヌクレオシド（オーバーハングヌクレオシド）を含む。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、二重鎖領域において対をなしている（すなわち、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、オーバーハングヌクレオシドを有さない）。特定の実施形態では、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、３’末端及び／または５’末端において対をなしていないヌクレオシド（オーバーハングヌクレオシド）を含む。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドによって形成される二重鎖は、一端または両端にオーバーハングを含まない。オーバーハングのないこのような末端は、平滑末端と呼ばれる。アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドがオーバーハングヌクレオシドを有する特定の実施形態では、それらのオーバーハングヌクレオシドのうちの１つ以上は、標的核酸に相補的である。アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドがオーバーハングヌクレオシドを有する特定の実施形態では、それらのオーバーハングヌクレオシドのうちの１つ以上は、標的核酸に相補的ではない。

【0517】

Ｂ．ＡＰＰ
特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、またはそれからなり、該標的核酸は、ＡＰＰである。特定の実施形態では、ＡＰＰ核酸は、配列番号１（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３４６７９８．７のｃＤＮＡ）に記載の配列または配列番号２の相補体（ヌクレオチド２５８７８００１～２６１７４０００が切断されたＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＣ＿０００２１．９が）を有する。特定の実施形態では、ＡＰＰ核酸は、配列番号３（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３５７９０３．７のｃＤＮＡ）、配列番号４（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３４８９９０．９のｃＤＮＡ）、配列番号５（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００４４０１２６．７のｃＤＮＡ）、配列番号６（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３５４１９２．７のｃＤＮＡ）、及び／または配列番号７（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３５８９１８．７のｃＤＮＡ）を含むがこれらに限定されない、ＡＰＰの既知のスプライスバリアントのいずれかに記載される配列を有する。特定の実施形態では、細胞を、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、または配列番号７に相補的なオリゴマー化合物と接触させることにより、ＡＰＰ ＲＮＡの量が減少し、特定の実施形態では、ＡＰＰタンパク質の量を減少させる。特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチドからなる。特定の実施形態では、細胞を、配列番号１、配列番号２、配列番号３、配列番号４、配列番号５、配列番号６、または配列番号７に相補的なオリゴマー化合物と接触させることにより、β－アミロイドの凝集の減少をもたらす。特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチドからなる。特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、修飾オリゴヌクレオチド及び共役基からなる。

【0518】

Ｃ．特定の組織における特定の標的核酸
特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、標的核酸に相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、またはそれからなり、該標的核酸は、薬理学的に関連する組織において発現される。特定の実施形態では、薬理学的に関連する組織は、中枢神経系を構成する細胞及び組織である。このような組織には、皮質、脊髄、及び海馬が含まれる。

【0519】

ＶＩ．特定の医薬組成物
特定の実施形態では、１つ以上のオリゴマー化合物を含む医薬組成物が本明細書に記載される。特定の実施形態では、１つ以上のオリゴマー化合物は、それぞれ修飾オリゴヌクレオチドからなる。特定の実施形態では、医薬組成物には、薬学的に許容される希釈剤または担体が含まれる。特定の実施形態では、医薬組成物は、滅菌生理食塩溶液及び１つ以上のオリゴマー化合物を含む、またはそれからなる。特定の実施形態では、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー化合物及び滅菌水を含む、またはそれからなる。特定の実施形態では、滅菌水は、医薬品グレードの水である。特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー化合物及びリン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）を含む、またはそれからなる。特定の実施形態では、滅菌ＰＢＳは医薬品グレードのＰＢＳである。特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー化合物及び人工脳脊髄液を含むか、またはそれからなる。特定の実施形態では、人工脳脊髄液は、医薬品グレードである。

【0520】

特定の実施形態では、医薬組成物には修飾オリゴヌクレオチド及び人工脳脊髄液が含まれる。特定の実施形態では、医薬組成物は、修飾オリゴヌクレオチド及び人工脳脊髄液からなる。特定の実施形態では、医薬組成物は、本質的に、修飾オリゴヌクレオチド及び人工脳脊髄液からなる。特定の実施形態では、人工脳脊髄液は、医薬品グレードである。

【0521】

特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー化合物及び１つ以上の賦形剤を含む。特定の実施形態では、賦形剤は、水、食塩水、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース、及びポリビニルピロリドンから選択される。

【0522】

特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、医薬組成物または製剤を調製するために薬剤的に許容される活性及び／または不活性物質と混合され得る。組成物及び医薬組成物を製剤化するための方法は、投与経路、疾患の程度、または投与される用量を含むが、これらに限定されないいくつかの基準によって決まる。

【0523】

特定の実施形態では、オリゴマー化合物を含む医薬組成物は、オリゴマー化合物の任意の薬学的に許容される塩、オリゴマー化合物のエステル、またはそのようなエステルの塩を包含する。特定の実施形態では、オリゴマー化合物を含む医薬組成物は、ヒトを含む動物への投与時に、生物学的に活性な代謝物またはその残渣を（直接的または間接的に）提供することができる１つ以上のオリゴヌクレオチドを含む。したがって、例えば、本開示は、オリゴマー化合物の薬剤的に許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの薬剤的に許容される塩、及び他の生物学的等価物を対象とする。好適な薬剤的に許容される塩には、ナトリウム塩及びカリウム塩が含まれるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、プロドラッグは、オリゴヌクレオチドに結合した１つ以上の共役基を含み、該共役基は、体内の内因性ヌクレアーゼによって切断される。

【0524】

脂質部分は、様々な方法で核酸療法において用いられている。特定のそのような方法において、核酸、例えばオリゴマー化合物は、カチオン性脂質と中性脂質の混合物から作られた事前形成されたリポソームまたはリポプレックスに導入される。特定の方法において、モノまたはポリカチオン性脂質とのＤＮＡ複合体は、中性脂質の存在なしで形成される。特定の実施形態では、脂質部分は、特定の細胞または組織への医薬品の分布を増加させるように選択される。特定の実施形態では、脂質部分は、脂肪組織への医薬品の分布を増加させるように選択される。特定の実施形態では、脂質部分は、筋肉組織への医薬品の分布を増加させるように選択される。

【0525】

特定の実施形態では、医薬組成物は、送達系を含む。送達系の例として、リポソーム及びエマルジョンが挙げられるが、これらに限定されない。特定の送達系は、疎水性化合物を含む医薬組成物を含む、特定の医薬組成物の調製に有用である。特定の実施形態では、ジメチルスルホキシドなどの特定の有機溶媒が用いられる。

【0526】

特定の実施形態では、医薬組成物は、本発明の１つ以上の薬剤を特定の組織または細胞型に送達するように設計された１つ以上の組織特異的送達分子を含む。例えば、特定の実施形態では、医薬組成物は、組織特異的抗体でコーティングされたリポソームを含む。

【0527】

特定の実施形態では、医薬組成物は、共溶媒系を含む。そのような共溶媒系のいくつかは、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー、及び水相を含む。特定の実施形態では、そのような共溶媒系は、疎水性化合物に用いられる。そのような共溶媒系の非限定的な例にはＶＰＤ共溶媒系があり、これは、３ｗ／ｖ％のベンジルアルコール、８ｗ／ｖ％の非極性界面活性剤ポリソルベート８０（商標）、及び６５ｗ／ｖ％のポリエチレングリコール３００を含む無水エタノールの溶液である。そのような共溶媒系の割合は、それらの溶解度及び毒性特性を著しく変化させることなく大幅に変化し得る。さらに、共溶媒成分の同一性は変化し得、例えば、他の界面活性剤をポリソルベート８０（商標）の代わりに使用してもよく、ポリエチレングリコールの画分サイズは変化し得、他の生体適合性ポリマーは、ポリエチレングリコール、例えば、ポリビニルピロリドンに取って代わり得、他の糖または多糖は、デキストロースと置き換わり得る。

【0528】

特定の実施形態では、医薬組成物は、口腔投与のために調製される。特定の実施形態では、医薬組成物は、バッカル投与のために調製される。特定の実施形態では、医薬組成物は、注入による投与（例えば、静脈内、皮下、筋肉内、髄腔内（ＩＴ）、脳室内（ＩＣＶ）など）のために調製される。ある特定のそのような実施形態では、医薬組成物は、担体を含み、水溶液、例えば、水または生理学的に相溶性の緩衝液、例えば、ハンクス溶液、リンガー溶液、または生理学的生理食塩水緩衝液などの中で製剤化される。特定の実施形態では、他の成分（例えば、溶解に役立つか、または防腐剤の役目を果たす成分）が含まれる。特定の実施形態では、注入可能な懸濁液は、適切な液体担体、懸濁化剤などを用いて調製される。注入用の特定の医薬組成物は、単位剤形で、例えば、アンプル単位で提供されるか、または多回投与容器内に提供される。注入用の特定の医薬組成物は、油性または水性ビヒクル中の懸濁液、溶液、またはエマルジョンであり、懸濁化剤、安定化剤、及び／または分散剤などの製剤化剤を含有し得る。注入用の医薬組成物における使用に好適な特定の溶媒には、親油性溶媒及び脂肪油、例えば、ゴマ油、合成脂肪酸エステル、例えば、オレイン酸エチルまたはトリグリセリド、及びリポソームが含まれるが、これらに限定されない。

【0529】

特定の条件下で、本明細書に開示される特定の化合物は酸として作用する。そのような化合物は、プロトン化（遊離酸）形態で、またはイオン化されて、及び陽イオン（塩）形態と会合して、描写または記載され得るが、そのような化合物の水溶液は、そのような形態の間で平衡状態で存在する。例えば、水溶液中のオリゴヌクレオチドのリン酸結合は、遊離酸、陰イオン、及び塩形態の間で平衡状態で存在する。別段の指示がある場合を除き、本明細書に記載の化合物は、そのような全ての形態を含むことを意図している。さらに、特定のオリゴヌクレオチドは、いくつかのそのような結合を有し、それらの各々は平衡状態にある。したがって、溶液中のオリゴヌクレオチドは、全て平衡状態にある複数の位置に形態の集合として存在する。「オリゴヌクレオチド」という用語は、そのような全ての形態を含むことを意図している。描写された構造は、必然的に単一の形態を表す。それにもかかわらず、別段の指示がある場合を除き、そのような図面は同様に対応する形態を含むことを意図している。本明細書において、「またはその塩」という用語が後に続く化合物の遊離酸を示す構造は、完全にまたは部分的に、プロトン化し得る／脱プロトン化し得る／カチオンと会合し得る、全てのそのような形態を明示的に含む。特定の場合には、１つ以上の特定の陽イオンが識別される。

【0530】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、ナトリウムを含む水溶液中にある。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、カリウムを含む水溶液中にある。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、ＰＢＳ中にある。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、水中にある。特定のそのような実施形態では、溶液のｐＨは、所望のｐＨを達成するために、ＮａＯＨ及び／またはＨＣｌで調整される。

【0531】

本明細書では、ある特定の用量について説明する。用量は、用量単位の形態であり得る。明確にするために、ミリグラム単位の修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物の用量（または投与単位）は、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物の遊離酸形態の質量を示す。上記のように、水溶液中で、遊離酸は陰イオン形態及び塩形態と平衡状態にある。しかしながら、用量を計算する目的で、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、無溶媒、酢酸ナトリウムを含まない、無水、遊離酸として存在すると想定されている。例えば、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物がナトリウムを含む溶液中にある場合（例えば、生理食塩水）、修飾オリゴヌクレオチドまたはオリゴマー化合物は、部分的または完全に脱プロトン化され、Ｎａ＋イオンと会合し得る。しかしながら、プロトンの質量は、なお用量の重量にカウントされ、Ｎａ＋イオンの質量は用量の重量にカウントされない。したがって、例えば、いくつかの完全にプロトン化された分子１０ｍｇの用量または投与単位は、１０ｍｇと計量される。これは、１０．５８ｍｇの無溶媒、酢酸ナトリウムを含まない、無水ナトリウム化（ｓｏｄｉａｔｅｄ）化合物番号６９９４６７、または１０．６５ｍｇの無溶媒、酢酸ナトリウムを含まない、無水ナトリウム化化合物番号１３８１７０９に相当する。オリゴマー化合物が共役基を含む場合、共役基の質量は、そのようなオリゴマー化合物の用量の計算に含まれる。共役基も酸を有する場合、その共役基は同様に用量を計算する目的で完全にプロトン化されると想定される。

【0532】

ＶＩＩ．特定のホットスポット領域
１．配列番号３の核酸塩基３１９２～９２７７
特定の実施形態では、配列番号３の核酸塩基３１９２～３２７７は、ホットスポット領域を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはオリゴマー二重鎖は、配列番号３の核酸塩基３１９２～３２７７内で相補的である修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、２３核酸塩基長である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、以下の糖モチーフ（５’から３’）：ｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｍｍを有し、「ｍ」は２’－Ｏメチルリボシル糖を表し、「ｆ」は２’－フルオロリボシル糖を表し、及びｓｓｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｓｓの連結モチーフ（５’から３’）を有し、「ｏ」はホスホジエステルヌクレオシド間結合を表し、「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表す。

【0533】

配列番号８２１～８２４の核酸塩基配列は、配列番号３の核酸塩基３１９２～３２７７内で相補的である。

【0534】

ＲＮＡｉ化合物１３８２１２０、１３８２１２３、１３８２１２４、及び１３８２１２８は、配列番号３の核酸塩基３１９２～３２７７内で相補的であるアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む。

【0535】

特定の実施形態では、配列番号３の核酸塩基５６３５～５６７７内で相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、標準的な細胞アッセイにおいて、ｉｎ ｖｉｔｒｏでＡＰＰ ＲＮＡの少なくとも９２％の減少を達成する。特定の実施形態では、配列番号３の核酸塩基５６３５～５６７７内で相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、標準的な細胞アッセイにおいて、ｉｎ ｖｉｔｒｏでＡＰＰ ＲＮＡの平均９４％の減少を達成する。

【0536】

２．追加のホットスポット領域
特定の実施形態では、以下の表に記載されている範囲は、ホットスポット領域を含む。各ホットスポット領域は、「開始部位配列番号１」列として識別される配列番号１の核酸塩基で始まり、「停止部位配列番号１」列として識別される配列番号１の核酸塩基で終わる。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはオリゴマー二重鎖は、以下の表に定義されるように、ホットスポット領域１～４７のいずれか内に相補的である修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは１８核酸塩基長である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは２０核酸塩基長である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは２３核酸塩基長である。特定の実施形態では、以下の表に示されるように、ＲＮＡｓｅＨベースのアンチセンスオリゴヌクレオチド及びＲＩＳＣベースのＲＮＡｉオリゴマー二重鎖の両方が、所与のホットスポット領域内で活性である。

【0537】

特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、ギャップマーである修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、糖モチーフｅｅｅｅｅｄｄｄｄｄｄｄｄｋｋｅｅｅを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｋ」は、ｃＥｔ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｄ」は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、糖モチーフｅｅｅｅｅｄｄｄｄｄｄｄｄｋｅｅｅｅを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｋ」は、ｃＥｔ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｄ」は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドである。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、５－１０－５ＭＯＥギャップマーである。

【0538】

特定の実施形態では、オリゴマー二重鎖は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含み、該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、所与のホットスポット領域内に相補的である。特定の実施形態では、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３ヌクレオシド長であり、以下の糖モチーフ（５’から３’）：ｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｍｍを有し、「ｍ」は２’－Ｏメチルリボシル糖を表し、「ｆ」は２’－フルオロリボシル糖を表し、及びｓｓｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｓｓの連結モチーフ（５’から３’）を有し、「ｏ」はホスホジエステルヌクレオシド間結合を表し、「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表す。いずれの場合もセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１ヌクレオシド長であり、以下の糖モチーフ（５’から３’）：ｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆを有し、「ｍ」は２’－Ｏメチルリボシル糖を表し、「ｆ」は２’－フルオロリボシル糖を表し、及びｓｓｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｓｓの連結モチーフ（５’から３’）を有し、「ｏ」はホスホジエステルヌクレオシド間結合を表し、「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表す。

【0539】

以下の表の「ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチド」／「範囲内の化合物ＩＤ」列にリストされているギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、指定されたホットスポット領域内の配列番号１に相補的である。以下の表の「ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチド」／「範囲内の配列番号」列にリストされているギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、指定されたホットスポット領域内の標的配列、配列番号１に相補的である。

【0540】

以下の表の「ＲＮＡｉ化合物」／「範囲内のＲＮＡｉ化合物ＩＤ」列にリストされているＲＮＡｉ化合物ＩＤに対応するアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、指定されたホットスポット領域内の配列番号１に相補的である。「ＲＮＡｉ化合物」／「範囲内の配列番号」列にリストされているアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドリストの核酸塩基配列は、指定されたホットスポット領域内の標的配列、番号１に相補的である。

【0541】

特定の実施形態では、ホットスポット領域内の核酸塩基に相補的なギャップマーは、以下の表に示すように、標準細胞アッセイにおけるｉｎ ｖｉｔｒｏでのＡＰＰ ＲＮＡの、少なくとも「ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチド」／「最小減少率（％）」（未処理の対照細胞と比較した最小減少率（％））を達成する。特定の実施形態では、ホットスポット領域内の核酸塩基に相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、以下の表に示すように、標準細胞アッセイにおけるｉｎ ｖｉｔｒｏでのＡＰＰ ＲＮＡの、「ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチド」／「平均減少率（％）」（未処理の対照細胞と比較した平均減少率（％））の平均を達成する。特定の実施形態では、ホットスポット領域内の核酸塩基に相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、以下の表に示すように、標準細胞アッセイにおけるｉｎ ｖｉｔｒｏでのＡＰＰ ＲＮＡの、「ギャップマーアンチセンスオリゴヌクレオチド」／「最大減少率（％）」（未処理の対照細胞と比較した最大減少率（％））の最大を達成する。

【0542】

特定の実施形態では、ホットスポット領域内の核酸塩基に相補的なアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを有するＲＮＡｉオリゴマー二重鎖は、以下の表に示すように、標準細胞アッセイにおけるｉｎ ｖｉｔｒｏでのＡＰＰ ＲＮＡの、少なくとも「ＲＮＡｉ化合物」／「ＲＮＡｉ最小減少率（％）」（未処理の対照細胞と比較した最小減少率（％））を達成する。特定の実施形態では、ホットスポット領域内の核酸塩基に相補的なアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを有するＲＮＡｉオリゴマー二重鎖は、以下の表に示すように、標準細胞アッセイにおけるｉｎ ｖｉｔｒｏでのＡＰＰ ＲＮＡの、「ＲＮＡｉ化合物」／「平均減少率（％）」（未処理の対照細胞と比較した平均減少率（％））の平均を達成する。特定の実施形態では、ホットスポット領域内の核酸塩基に相補的なアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを有するＲＮＡｉオリゴマー二重鎖は、以下の表に示すように、標準細胞アッセイにおけるｉｎ ｖｉｔｒｏでのＡＰＰ ＲＮＡの、「ＲＮＡｉ化合物」／「ＲＮＡｉ最大減少率（％）」（未処理の対照細胞と比較した最大減少率（％））の最大を達成する。

【0543】

【表1a-1】

【0544】

【表1a-2】

【0545】

【表1b-1】

【0546】

【表1b-2】

【0547】

【表1b-3】

【0548】

【表1b-4】

【0549】

【表1b-5】

【0550】

【表1b-6】

【0551】

【表1b-7】

【0552】

【表1b-8】

【0553】

参照による非限定的な開示及び組み込み
本明細書に列挙される文献及び特許公報の各々は、参照によりその全体が組み込まれる。

【0554】

本明細書に記載のある特定の化合物、組成物及び方法が、ある特定の実施形態に従った特異性を持って記載されたが、以下の実施例は、本明細書に記載の化合物を例示するためだけに機能し、その化合物を限定することを意図するものではない。本出願に引用される参考文献、ＧｅｎＢａｎｋ受入番号、ＥＮＳＥＭＢＬ識別番号などの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0555】

本出願に添付される配列表が必要に応じて各配列を「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」のいずれか一方と特定するが、実際には、それらの配列は、化学修飾の任意の組み合わせで修飾され得る。当業者であれば、修飾オリゴヌクレオチドを説明するための「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」のそのような指定が、ある特定の事例において、任意であることを容易に認識するであろう。例えば、２’－ＯＨ糖部分及びチミン塩基を含むヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、修飾糖を有するＤＮＡ（ＤＮＡの１つの２’－Ｈに代えて２’－ＯＨ）または修飾塩基を有するＲＮＡ（ＲＮＡのウラシルに代えて、チミン（メチル化ウラシル））と記載され得る。したがって、配列表中のものを含むが、これらに限定されない本明細書に提供される核酸配列は、修飾核酸塩基を有するそのような核酸を含むが、これらに限定されない天然または修飾ＲＮＡ及び／またはＤＮＡの任意の組み合わせを含有する核酸を包含するよう意図される。さらなる例であって制限するものではなく、核酸塩基配列「ＡＴＣＧＡＴＣＧ」を有するオリゴマー化合物は、修飾または非修飾にかかわらず、ＲＮＡ塩基、例えば、配列「ＡＵＣＧＡＵＣＧ」を有するオリゴマー化合物、ならびに「ＡＵＣＧＡＴＣＧ」などのいくつかのＤＮＡ塩基及びいくつかのＲＮＡ塩基を有するオリゴマー化合物、ならびに「ＡＴ^ｍＣＧＡＵＣＧ」などの他の修飾核酸塩基を有するオリゴマー化合物を含むそのような化合物を含むが、これらに限定されないそのような核酸塩基配列を有する任意のオリゴマー化合物を包含し、式中、^ｍＣは、５位にメチル基を含むシトシン塩基を示す。

【0556】

本明細書に記載の特定の化合物（例えば、修飾オリゴヌクレオチド）は、１つ以上の不斉中心を含有し、それ故に、絶対立体化学の点で、（Ｒ）もしくは（Ｓ）、糖アノマーなどの場合、αもしくはβ、またはアミノ酸などの場合（Ｄ）もしくは（Ｌ）と定義され得る、鏡像異性体、ジアステレオマー、及び他の立体異性体配置を生じさせる。特定の立体異性体配置を有すると描写または記載される本明細書に提供される化合物には、指示された化合物のみが含まれる。未定義の立体化学を用いて描写または記載される本明細書に提供される化合物には、別途指定されない限り、それらのステレオランダム及び任意に純粋な形態を含む全てのそのような可能な異性体が含まれる。同様に、本明細書に記載の化合物の互変異性形態も、別途記載のない限り含まれる。別段の指示がある場合を除き、本明細書に記載の化合物は、対応する塩形態を含むことが意図される。

【0557】

本明細書に記載の化合物は、１つ以上の原子が、指示した元素の非放射性同位体または放射性同位体で置き換えられている変形例を含む。例えば、水素原子を含む本明細書に記載の化合物は、^１Ｈ水素原子の各々に対する全ての可能な重水素置換を包含する。本明細書に記載の化合物によって包含される同位体置換としては、^１Ｈの代わりに^２Ｈまたは^３Ｈ、^１２Ｃの代わりに^１３Ｃまたは^１４Ｃ、^１４Ｎの代わりに^１５Ｎ、^１６Ｏの代わりに^１７Ｏまたは^１８Ｏ、及び^３２Ｓの代わりに^３３Ｓ、^３４Ｓ、^３５Ｓ、または^３６Ｓが挙げられるが、これらに限定されない。特定の実施形態では、非放射性同位体置換は、治療用または研究用ツールとして使用するために有益である新しい特性をオリゴマー化合物に付与することができる。特定の実施形態では、放射性同位体置換は、化合物を撮像などの研究または診断目的に好適なものにすることができる。

【実施例】

【0558】

以下の実施例は、本開示の特定の実施形態を例示するものであり、限定するものではない。さらに、特定の実施形態が提供される場合、本発明者らは、それらの特定の実施形態の一般的適用を企図している。例えば、特定のモチーフを有するオリゴヌクレオチドの開示は、そのモチーフまたは同様のモチーフを有するさらなるオリゴヌクレオチドへの合理的な支持を提供する。同様に、例えば、特定の高親和性修飾が特定の位置に出現する場合、同一の位置での他の高親和性修飾は、別途示されない限り、好適であると見なされる。

【0559】

実施例１：ｉｎ ｖｉｔｒｏでのヒトＡＰＰ ＲＮＡの単回投与に対する混合ウィング及び混合バックボーン修飾オリゴヌクレオチドの効果
ヒトＡＰＰ核酸に相補的な修飾オリゴヌクレオチドを、ｉｎ ｖｉｔｒｏでＡＰＰ ＲＮＡレベルにおける効果について試験した。

【0560】

以下の表では、修飾オリゴヌクレオチドは１８ヌクレオシド長であり、糖モチーフｅｅｅｅｅｄｄｄｄｄｄｄｄｋｋｅｅｅを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｋ」は、ｃＥｔ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｄ」は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドである。ヌクレオシド間結合モチーフはｓｏｏｏｓｓｓｓｓｓｓｓｓｏｏｓｓであり、各「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「ｏ」はホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す。全てのシトシン残基は５－メチルシトシンである。

【0561】

「開始部位」は、修飾オリゴヌクレオチドがヒト遺伝子配列において相補的である最も５’側のヌクレオシドを示す。「停止部位」は、修飾オリゴヌクレオチドがヒト遺伝子配列において相補的である最も３’側のヌクレオシドを示す。以下の表に記載されている各修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号１（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３４６７９８．７のｃＤＮＡ）、配列番号２の相補体（ヌクレオチド２５８７８００１～２６１７４０００が切断されたＧＥＮＢＡＮＫ受入番号ＮＣ＿０００２１．９）、配列番号３（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３５７９０３．７のｃＤＮＡ）、配列番号４（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３４８９９０．９のｃＤＮＡ）、配列番号５（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００４４０１２６．７のｃＤＮＡ）、配列番号６（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３５４１９２．７のｃＤＮＡ）、及び／または配列番号７（Ｅｎｓｅｍｂｌ転写物ＥＮＳＴ０００００３５８９１８．７のｃＤＮＡ）に１００％相補的である。修飾オリゴヌクレオチドが配列番号１及び／または配列番号２に１００％相補的である場合、それはまた、配列番号３～７のいずれかに１００％相補的であり得るが、この情報は以下の表には表示されない。「Ｎ／Ａ」は、修飾オリゴヌクレオチドが、その特定の遺伝子配列に１００％相補的ではないことを示す。

【0562】

ウェルあたり２０，０００細胞の密度で培養されたＳＨ－ＳＹ５Ｙ細胞を、エレクトロポレーションによって７，０００ｎＭの修飾オリゴヌクレオチドで処理した。約２４時間の処理期間の後、全ＲＮＡが細胞から分離され、ＡＰＰ ＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＲＴＰＣＲによって測定した。ヒトＡＰＰプライマープローブセットＨＴＳ９６（順方向配列ＣＣＴＴＣＣＣＧＴＧＡＡＴＧＧＡＧＡＧＴＴ、本明細書で配列番号９１０と指定；逆配列ＣＡＣＡＧＡＧＴＣＡＧＣＣＣＣＡＡＡＡＧＡ、本明細書で配列番号９１１と指定；プローブ配列ＣＣＴＧＧＡＣＧＡＴＣＴＣＣＡＧＣＣＧＴＧＧ、本明細書で配列番号９１２と指定）を使用してＲＮＡレベルを測定した。ＡＰＰ ＲＮＡレベルは、ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）で測定された全ＲＮＡ含有量に応じて調節した。結果は、未処理の対照細胞と比較したＡＰＰ ＲＮＡレベル（％）として以下の表に示される。

【0563】

【表2-1】

【0564】

【表2-2】

【0565】

【表2-3】

【0566】

【表2-4】

【0567】

【表3-1】

【0568】

【表3-2】

【0569】

【表3-3】

【0570】

【表3-4】

【0571】

【表4-1】

【0572】

【表4-2】

【0573】

【表5-1】

【0574】

【表5-2】

【0575】

【表6-1】

【0576】

【表6-2】

【0577】

【表6-3】

【0578】

【表7-1】

【0579】

【表7-2】

【0580】

【表7-3】

【0581】

【表7-4】

【0582】

【表8】

【0583】

【表9】

【0584】

実施例２：ｉｎ ｖｉｔｒｏでのヒトＡＰＰの複数回投与に対する修飾オリゴヌクレオチドの効果
上記の例から選択された修飾オリゴヌクレオチドは、ＳＨ－Ｓ５Ｙ細胞において様々な用量で試験した。ウェルあたり２０，０００細胞の密度でプレーティングされた細胞を、以下の表に示されるように、エレクトロポレーションによって様々な修飾オリゴヌクレオチドで処理した。約２４時間の処理期間の後、全ＲＮＡが細胞から分離され、ＡＰＰ ＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＰＣＲによって測定した。本明細書で上記に記載されたヒトＡＰＰプライマープローブセットＨＴＳ９６を使用して、ＲＮＡレベルを測定した。ＡＰＰ ＲＮＡレベルはＧＡＤＰＨに対して正規化した。結果は、未処理の対照細胞と比較したＡＰＰ ＲＮＡレベル（％）として以下の表に示されている。各修飾オリゴヌクレオチドの最大阻害濃度の半分（ＩＣ_５０）も示されている。ＩＣ_５０は、ｅｘｃｅｌのデータの対数／線形プロットで線形回帰を使用して計算した。「Ｎ．Ｄ．」（「データなし」）は、その特定の実験において、その特定の修飾オリゴヌクレオチドについて阻害率（％）が決定されなかったことを示す。「Ｎ．Ｃ．」（「計算なし」）は、試験された濃度の範囲がＩＣ_５０の正確な計算に十分ではなかったことを示す。

【0585】

【表10】

【0586】

【表11】

【0587】

実施例３：ｉｎ ｖｉｔｒｏでのヒトＡＰＰ ＲＮＡの単回投与に対する混合ウィング及び混合バックボーンまたはＭＯＥ及び混合バックボーン修飾オリゴヌクレオチドの効果 ヒトＡＰＰに相補的な修飾オリゴヌクレオチドは、以下の表に示す化学修飾パターンで合成した。以下の表の修飾オリゴヌクレオチドはギャップマーである。ギャップマーは、２’－デオキシヌクレオシドを含む中央ギャップセグメントを有し、ｃＥｔヌクレオシド及び／または２’－ＭＯＥヌクレオシドを含む５’末端及び３’末端の両方にウィングセグメントが隣接している。各ギャップマー全体の全てのシトシン残基は５－メチルシトシンである。ヌクレオシド間結合は、混合ホスホジエステルヌクレオシド間結合及びホスホロチオエートヌクレオシド間結合である。

【0588】

ウェルあたり２０，０００細胞の密度で培養されたＳＨ－ＳＹ５Ｙ細胞を、エレクトロポレーションによって４，０００ｎＭの修飾オリゴヌクレオチドで処理した。約２４時間の処理期間の後、全ＲＮＡが細胞から分離され、ＡＰＰ ＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＲＴＰＣＲによって測定した。ヒトＡＰＰプライマープローブセットＲＴＳ３５５７１（順方向配列ＣＣＣＡＣＴＴＴＧＴＧＡＴＴＣＣＣＴＡＣＣ、本明細書で配列番号９１３と指定；逆配列ＡＴＣＣＡＴＣＣＴＣＴＣＣＴＧＧＴＧＴＡＡ、本明細書で配列番号９１４と指定；プローブ配列ＴＧＡＴＧＣＣＣＴＴＣＴＣＧＴＴＣＣＴＧＡＣＡＡ、本明細書で配列番号９１５と指定）を使用してＲＮＡレベルを測定した。ＡＰＰ ＲＮＡレベルは、ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）で測定された全ＲＮＡ含有量に応じて調節した。結果は、未処理の対照細胞と比較したＡＰＰ ＲＮＡレベル（％）として以下の表に示される。

【0589】

以下の表１２の修飾オリゴヌクレオチドは１８ヌクレオシド長であり、糖モチーフｅｅｅｅｅｄｄｄｄｄｄｄｄｋｅｅｅｅを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｋ」は、ｃＥｔ糖部分を含むヌクレオシドであり、各「ｄ」は、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシドである。ヌクレオシド間結合モチーフは、ｓｏｓｏｓｓｓｓｓｓｓｓｓｏｓｓｓであり、各「ｓ」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「ｏ」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す。全てのシトシン残基は５－メチルシトシンである。「開始部位」は、ギャップマーがヒト核酸配列において相補的である最も５’側のヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト核酸配列において相補的である最も３’側のヌクレオシドを示す。

【0590】

【表12-1】

【0591】

【表12-2】

【0592】

以下の表１３の修飾オリゴヌクレオチドは、２０ヌクレオシド長であり、５－１０－５ＭＯＥギャップマーである。ヌクレオシド間結合モチーフは、ｓｏｓｏｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｏｓｓｓであり、各「ｓ」は、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表し、各「ｏ」は、ホスホジエステルヌクレオシド間結合を表す。全てのシトシン残基は５－メチルシトシンである。「開始部位」は、ギャップマーがヒト核酸配列において相補的である最も５’側のヌクレオシドを示す。「停止部位」は、ギャップマーがヒト核酸配列において相補的である最も３’側のヌクレオシドを示す。

【0593】

【表13】

【0594】

実施例４：ヒトＡＰＰ核酸に相補的なアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを有するＲＮＡｉ化合物の設計
ヒトＡＰＰ核酸に相補的なアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド、及びアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドに相補的なセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含むＲＮＡｉ化合物を以下のように設計した。

【0595】

以下の表のＲＮＡｉ化合物は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及びセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドからなり、いずれの場合も該アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２３ヌクレオシド長であり、以下の糖モチーフ（５’から３’）：ｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｍｍを有し、「ｍ」は２’－Ｏメチルリボシル糖を表し、「ｆ」は２’－フルオロリボシル糖を表し、及びｓｓｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｓｓの連結モチーフ（５’から３’）を有し、「ｏ」はホスホジエステルヌクレオシド間結合を表し、「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表す。いずれの場合もセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは２１ヌクレオシド長であり、以下の糖モチーフ（５’から３’）：ｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆｍｆを有し、「ｍ」は２’－Ｏメチルリボシル糖を表し、「ｆ」は２’－フルオロリボシル糖を表し、及びｓｓｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｏｓｓの連結モチーフ（５’から３’）を有し、「ｏ」はホスホジエステルヌクレオシド間結合を表し、「ｓ」はホスホロチオエートヌクレオシド間結合を表す。各アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、標的核酸（ＡＰＰ）に相補的であり、各センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドは、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの２１個のヌクレオシド（５’から３’）の最初のものに相補的であり、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最後の２つの３’－ヌクレオシドは、センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドとペアになっていない（オーバーハングヌクレオシドである）。

【0596】

「開始部位」は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドがヒト遺伝子配列において相補的である最も５’側のヌクレオシドを示す。「停止部位」は、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドがヒト遺伝子配列において相補的である最も３’側のヌクレオシドを示す。以下の表に記載されている各修飾アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオシドは、以下の表に示されているように、配列番号１（本明細書に記載）、配列番号２（本明細書に記載）、または配列番号３（本明細書に記載）のいずれかに１００％相補的である。

【0597】

【表14-1】

【0598】

【表14-2】

【0599】

【表14-3】

【0600】

【表14-4】

【0601】

【表14-5】

【0602】

【表14-6】

【0603】

【表14-7】

【0604】

【表14-8】

【0605】

【表15-1】

【0606】

【表15-2】

【0607】

【表16-1】

【0608】

【表16-2】

【0609】

実施例５：ｉｎ ｖｉｔｒｏでのヒトＡＰＰ ＲＮＡの単回投与に対するＲＮＡｉ化合物の効果
上記の二本鎖ＲＮＡｉ化合物は、同じ培養条件下で一連の実験で試験した。各実験の結果は、以下の個別の表に示されている。

【0610】

ウェルあたり６０００細胞の密度で培養されたＨｅＬａ細胞は、２０ｎＭの二本鎖ＲＮＡｉを含むＲＮＡｉＭＡＸを使用してトランスフェクトした。約２４時間の処理期間の後、ＲＮＡが細胞から分離され、ＡＰＰ ＲＮＡレベルを定量的リアルタイムＲＴＰＣＲによって測定した。ヒトプライマープローブセットＲＴＳ３５５７１（本明細書で上記に記載された）を使用してＲＮＡレベルを測定した。ＡＰＰ ＲＮＡレベルは、ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）で測定された全ＲＮＡ含有量に対して正規化した。結果は、ＰＢＳ対照と比較して、ＡＰＰ ＲＮＡの変化率（％）として表される。記号「

【0611】

【化10】

【0612】

」は、修飾オリゴヌクレオチドがプライマープローブセットのアンプリコン領域内の標的転写物に相補的であり、したがって関連データが信頼できないことを示す。そのような場合、そのような修飾オリゴヌクレオチドの効力及び有効性を正確に評価するために、代替のプライマープローブを使用する追加のアッセイを実施しなければならない。

【0613】

【表17-1】

【0614】

【表17-2】

【0615】

【表17-3】

【0616】

【表18-1】

【0617】

【表18-2】

【0618】

【表18-3】

【0619】

【表19-1】

【0620】

【表19-2】

【0621】

実施例６：トランスジェニックマウスにおけるヒトＡＰＰに相補的な修飾オリゴヌクレオチドの活性
上記の化合物は、ＡＰＰを含む全ての既知のヒト２１番染色体（Ｈｓａ２１）遺伝子の９２％を含む自由に分離するほぼ完全なＨｓａ２１を含有するＴｃ１トランスジェニックマウスモデルにおいて試験する（Ｏ’Ｄｏｈｅｒｔｙ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２００５ ３０９（５７４３）：２０３３－２０３７）。化合物は、Ｌａｍｂ ｅｔ ａｌ．，Ｈｕｍａｎ Ｍｏｌ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １９９７，６（９）：１５３５－４１に記載されているように、スウェーデンの突然変異（Ｋ６７０Ｎ／Ｍ６７１Ｌ）を含むヒトＡＰＰ遺伝子全体を含有するＲ１．４０ ＹＡＣトランスジェニックマウスモデルにおいても試験する。２～３匹のマウスの群に３００μｇのＡＳＯまたはＰＢＳ対照をＩＣＶ注射し、投与後２週間で屠殺した。様々なＣＮＳ組織を収集した。ＡＰＰ ＲＮＡは、上記の実施例１に記載されているように、ＲＴ－ＰＣＲによって測定した。
ある態様において、本発明は以下であってもよい。
［態様１］１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列がＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも８０％相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。
［態様２］１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１２～５０１のうちのいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、または１８個の核酸塩基を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。
［態様３］１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号５０２～５１６のうちのいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０個の核酸塩基を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。
［態様４］１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号５１７～６６５、８１４～８４０、または８６７～８８８のうちのいずれかの少なくとも１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、または２３個の核酸塩基を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。
［態様５］１２～３０個の連結したヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、
配列番号１の核酸塩基４０～７８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６９～１４６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基８３～１２９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基８３～２４６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基９４～２２５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１９４～２３１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１９４～２３８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６～２６８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２５８～２８８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２８５～３１１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２９６～３２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３０７～３３０の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３２９～３５２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３３０～３５２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基３３９～３８３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１５～４３９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１３～４７７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４１５～４７７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５０６の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５２３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基４７７～５４１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基５３０～５５７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基５８１～６３８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６３６～６６１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基６５２～６９７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基７２８～８２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基７７０～８２１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基９２０～９５０の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１００６～１０４９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１１５２～１１７９の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２２７～１２６５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２２７～１２７４の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２６８～１３３２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２６８～１３１１の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１２８９～１３３２の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５１８～１５４３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５３１～１５９３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１５４４～１５９３の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１６３４～１６５７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１７７８～１８００の等長部分、
配列番号１の核酸塩基１８８２～１９０８の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２０５１～２０７４の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６０～３１１７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２４０２～３１１７の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２３６０～２６５５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２４０２～２６５５の等長部分、
配列番号１の核酸塩基２６７５～３０５４の等長部分、または
配列番号３の核酸塩基３１９２～３２７７の等長部分の、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０、または少なくとも２１個の連続した核酸塩基に相補的であり、
前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖及び修飾ヌクレオシド間結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。
［態様６］前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列全体にわたって測定した場合に、配列番号１～７の核酸塩基配列のうちのいずれかに、少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、または１００％相補的である、態様１～５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様７］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾ヌクレオシドである、態様１～６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様８］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾糖部分を含む、態様７に記載のオリゴマー化合物。
［態様９］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、二環式糖部分を含む、態様８に記載のオリゴマー化合物。
［態様１０］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、前記２’－４’橋が、－Ｏ－ＣＨ_２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ_３）－から選択される、態様９に記載のオリゴマー化合物。
［態様１１］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、非二環式修飾糖部分を含む、態様５～１０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様１２］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、２’－４’橋を有する二環式糖部分を含み、少なくとも１個のヌクレオシドが非二環式修飾糖部分を含む、態様１１に記載のオリゴマー化合物。
［態様１３］前記非二環式修飾糖部分が、２’－ＭＯＥ修飾糖部分、２’－ＯＭｅ修飾糖部分、または２’－Ｆ修飾糖部分である、態様１１または１２に記載のオリゴマー化合物。
［態様１４］前記修飾オリゴヌクレオチドが、糖代替物を含む少なくとも１個の修飾ヌクレオシドを含む、態様１～１３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様１５］前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１個の修飾ヌクレオシドが、モルホリノ及びＰＮＡから選択される糖代替物を含む、態様１４に記載のオリゴマー化合物。
［態様１６］前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個の修飾ヌクレオシド間結合を含む、態様１～１５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様１７］前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、態様１６に記載のオリゴマー化合物。
［態様１８］少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様１７または１８に記載のオリゴマー化合物。
［態様１９］前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１個のホスホジエステルヌクレオシド間結合を含む、態様１６または１８に記載のオリゴマー化合物。
［態様２０］各ヌクレオシド間結合が、ホスホジエステルヌクレオシド間結合またはホスホロチオエートヌクレオシド間結合から独立して選択される、態様１６、１８、または１９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２１］前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾核酸塩基を含む、態様１～２０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２２］前記修飾核酸塩基が、５－メチルシトシンである、態様２１に記載のオリゴマー化合物。
［態様２３］前記修飾オリゴヌクレオチドが、１２～２２、１２～２０、１４～１８、１４～２０、１５～１７、１５～２５、１６～２０、１６～１８、１８～２２、１８～２５、１８～２０、２０～２５、または２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる、態様１～２２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２４］前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結したヌクレオシドからなる、態様１～２３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２５］前記修飾オリゴヌクレオチドが、２０個の連結したヌクレオシドからなる、態様１～２３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２６］前記修飾オリゴヌクレオチドが、２１個の連結したヌクレオシドからなる、態様１～２３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２７］前記修飾オリゴヌクレオチドが、２３個の連結したヌクレオシドからなる、態様１～２３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２８］前記オリゴマー化合物が、ＲＮａｓｅ Ｈ化合物である、態様１～２７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様２９］前記修飾オリゴヌクレオチドが、ギャップマーである、態様２８に記載のオリゴマー化合物。
［態様３０］前記修飾オリゴヌクレオチドが、
１～６個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
１～６個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
前記５’領域の最も３’側のヌクレオシド及び前記３’－領域の最も５’側のヌクレオシドが、修飾糖部分を含み、
前記中央領域ヌクレオシドの各々が、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含むヌクレオシド及び２’－置換糖部分を含むヌクレオシドから選択され、前記中央領域が、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む少なくとも６個のヌクレオシド及び２’－置換糖部分を含む２つ以下のヌクレオシドを含む、態様１～２９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３１］前記修飾オリゴヌクレオチドが、
１～６個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
６～１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
１～６個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
前記５’－領域ヌクレオシドの各々及び前記３’－領域ヌクレオシドの各々が修飾糖部分を含み、前記中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む、態様１～２６または２８～２９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３２］前記修飾オリゴヌクレオチドが、
５個の連結した５’－領域ヌクレオシドからなる５’－領域、
１０個の連結した中央領域ヌクレオシドからなる中央領域、及び
５個の連結した３’－領域ヌクレオシドからなる３’－領域、を含む糖モチーフを有し、
前記５’－領域ヌクレオシドの各々及び前記３’－領域ヌクレオシドの各々がｃＥｔ修飾糖部分または２’－ＭＯＥ修飾糖部分のいずれかを含み、前記中央領域ヌクレオシドの各々が２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含む、態様３１に記載のオリゴマー化合物。
［態様３３］前記オリゴマー化合物が、ＲＮＡｉ化合物である、態様１～２７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３４］前記オリゴマー化合物が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含む標的領域を含むアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含み、前記標的領域がＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に少なくとも９０％相補的である、態様１～３３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３５］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、ＡＰＰ ＲＮＡの等長部分に対して少なくとも９５％相補的であるか、または１００％相補的である、態様３４に記載のオリゴマー化合物。
［態様３６］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの標的領域が、少なくとも１９、２０、２１、または２５個の連続した核酸塩基を含む、態様３４～３５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３７］前記ＡＰＰ ＲＮＡが、配列番号１～７のいずれかの核酸塩基配列を有する、態様３４～３６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３８］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、２’－ＮＭＡ、ＬＮＡ、及びｃＥｔから選択される修飾糖部分、またはＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む、態様３４～３７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様３９］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分または糖代替物を含む、態様３４～３５のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様４０］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、または１００％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、態様３４～３９のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様４１］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの最も５’側のヌクレオシドの５’位に結合した安定化したリン酸基を含む、態様３４～４０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様４２］前記安定化したリン酸基が、シクロプロピルホスホネートまたは（Ｅ）－ビニルホスホネートを含む、態様４１に記載のオリゴマー化合物。
［態様４３］前記オリゴマー化合物が一本鎖オリゴマー化合物である、態様１～４２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様４４］前記修飾オリゴヌクレオチドまたは前記ＲＮＡｉアンチセンスオリゴヌクレオチドからなる、態様１～４３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様４５］共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む、態様１～４４のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様４６］前記共役リンカーが単結合からなる、態様４５に記載のオリゴマー化合物。
［態様４７］前記共役リンカーが切断可能である、態様４５に記載のオリゴマー化合物。
［態様４８］前記共役リンカーが、１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む、態様４５に記載のオリゴマー化合物。
［態様４９］前記共役基が、前記修飾オリゴヌクレオチドまたは前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に結合される、態様４５～４８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様５０］前記共役基が、前記修飾オリゴヌクレオチドまたは前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に結合される、態様４５～４８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様５１］末端基を含む、態様１～５０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様５２］前記オリゴマー化合物がリンカー－ヌクレオシドを含まない、態様１～４７または４９～５１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。
［態様５３］態様３４～５２のいずれかに記載のアンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物と、１７～３０個の連結したヌクレオシドからなるセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物と、を含むオリゴマー二重鎖であって、前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、少なくとも１５個の連続した核酸塩基を含むアンチセンスハイブリダイズ領域を含み、前記アンチセンスハイブリダイズ領域が、前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの等長部分に少なくとも９０％相補的である、前記オリゴマー二重鎖。
［態様５４］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、１８～２５、２０～２５、または２１～２３個の連結したヌクレオシドからなる、態様５３に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様５５］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドが、２１または２３個の連結したヌクレオシドからなる、態様５３に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様５６］前記アンチセンスまたは前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も３’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、態様５３～５５のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様５７］前記アンチセンスまたはセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの１～４個の最も５’側のヌクレオシドが、オーバーハングヌクレオシドである、態様５３～５６のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様５８］前記二重鎖が前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端で平滑末端を有する、態様５３～５５のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様５９］前記二重鎖が前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端で平滑末端を有する、態様５３～５５のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６０］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、２’－Ｆ、２’－ＯＭｅ、ＬＮＡ、ｃＥｔから選択される修飾糖部分、またはＧＮＡ及びＵＮＡから選択される糖代替物を含む、態様５３～５９のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６１］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが、修飾糖部分または糖代替物を含む、態様６０に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６２］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、または１００％が、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む、態様６１に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６３］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシドが、修飾核酸塩基を含む、態様５３～６２のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６４］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、修飾ヌクレオシド間結合である、態様５３～６３のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６５］前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの少なくとも１個のヌクレオシド間結合が、ホスホロチオエートヌクレオシド間結合である、態様６４に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６６］前記化合物が、前記アンチセンスまたはセンスＲＮＡオリゴヌクレオチドの一端または両端に結合した１～５個の脱塩基糖部分を含む、態様５３～６５のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６７］前記アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド及び前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドからなる、態様５３～６６のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６８］前記第２のオリゴマー化合物が、共役部分及び共役リンカーを含む共役基を含む、態様５３～６６のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様６９］前記共役リンカーが単結合からなる、態様６８に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７０］前記共役リンカーが切断可能である、態様６９に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７１］前記共役リンカーが１～３個のリンカー－ヌクレオシドを含む、態様６９に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７２］前記共役基が前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの５’末端に結合される、態様６９～７１のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７３］前記共役基が前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの３’末端に結合される、態様６９～７１のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７４］前記共役基が、前記センスＲＮＡｉオリゴヌクレオチドの内部位置にあるリボシル糖部分の２’位を介して結合している、態様６９～７１のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７５］少なくとも１つの共役基がＣ_１６アルキル基を含む、態様４５～５０のいずれかに記載のオリゴマー化合物または態様６８～７４のいずれかに記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７６］前記第２のオリゴマー化合物が末端基を含む、態様５３に記載のオリゴマー二重鎖。
［態様７７］態様１～５２のいずれかに記載のオリゴマー化合物、または態様５３～７６に記載のオリゴマー二重鎖、及び薬学的に許容される担体または希釈剤を含む、医薬組成物。
［態様７８］前記薬学的に許容される希釈剤が、人工脳脊髄液、滅菌生理食塩水、またはＰＢＳである、態様７７に記載の医薬組成物。
［態様７９］前記医薬組成物が、前記修飾オリゴヌクレオチド及び滅菌生理食塩水から本質的になる、態様７８に記載の医薬組成物。
［態様８０］態様７７～７９のいずれかに記載の医薬組成物を動物に投与することを含む方法。
［態様８１］ＡＰＰに関連した疾患を治療する方法であって、ＡＰＰに関連した疾患に罹患しているかまたは発症のリスクがある個体に、態様７７～７９のいずれかに記載の治療有効量の医薬組成物を投与し、それによりＡＰＰに関連した前記疾患を治療することを含む方法。
［態様８２］前記ＡＰＰ関連疾患が、アルツハイマー病、ダウン症患者におけるアルツハイマー病、または脳アミロイド血管症である、態様８１に記載の方法。
［態様８３］前記ＡＰＰ関連疾患の少なくとも１つの症状または特徴が改善される、態様８０～８２のいずれかに記載の方法。
［態様８４］前記症状または特徴が、記憶及び言語能力の低下、無関心及び意欲の欠如などの行動及び心理症状、歩行障害及び発作、進行性認知症、及び／または異常なアミロイド沈着を含む、認知障害である、態様８３に記載の方法。

【配列表】

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