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特許7583014二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質を使用する方法
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】特許公報(B2)
(11)【特許番号】
(24)【登録日】2024-11-05
(45)【発行日】2024-11-13
(54)【発明の名称】二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質を使用する方法
(51)【国際特許分類】
   A61K 39/395 20060101AFI20241106BHJP
   A61P 35/02 20060101ALI20241106BHJP
   A61K 47/68 20170101ALI20241106BHJP
   A61P 43/00 20060101ALI20241106BHJP
   C07K 16/46 20060101ALI20241106BHJP
   C07K 16/28 20060101ALI20241106BHJP
【FI】
A61K39/395 N ZNA
A61P35/02
A61K47/68
A61P43/00 121
C07K16/46
C07K16/28
【請求項の数】 19
【外国語出願】
(21)【出願番号】P 2022211080
(22)【出願日】2022-12-28
(62)【分割の表示】P 2020196489の分割
【原出願日】2016-05-26
(65)【公開番号】P2023036896
(43)【公開日】2023-03-14
【審査請求日】2023-01-26
(31)【優先権主張番号】62/168,641
(32)【優先日】2015-05-29
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】62/266,438
(32)【優先日】2015-12-11
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(73)【特許権者】
【識別番号】523375766
【氏名又は名称】アンジ ブルーノ リミテッド ライアビリティ カンパニー
(74)【代理人】
【識別番号】100102978
【弁理士】
【氏名又は名称】清水 初志
(74)【代理人】
【識別番号】100205707
【弁理士】
【氏名又は名称】小寺 秀紀
(74)【代理人】
【識別番号】100160923
【弁理士】
【氏名又は名称】山口 裕孝
(74)【代理人】
【識別番号】100119507
【弁理士】
【氏名又は名称】刑部 俊
(74)【代理人】
【識別番号】100142929
【弁理士】
【氏名又は名称】井上 隆一
(74)【代理人】
【識別番号】100148699
【弁理士】
【氏名又は名称】佐藤 利光
(74)【代理人】
【識別番号】100188433
【弁理士】
【氏名又は名称】梅村 幸輔
(74)【代理人】
【識別番号】100128048
【弁理士】
【氏名又は名称】新見 浩一
(74)【代理人】
【識別番号】100129506
【弁理士】
【氏名又は名称】小林 智彦
(74)【代理人】
【識別番号】100114340
【弁理士】
【氏名又は名称】大関 雅人
(74)【代理人】
【識別番号】100214396
【弁理士】
【氏名又は名称】塩田 真紀
(74)【代理人】
【識別番号】100121072
【弁理士】
【氏名又は名称】川本 和弥
(74)【代理人】
【識別番号】100221741
【弁理士】
【氏名又は名称】酒井 直子
(74)【代理人】
【識別番号】100114926
【弁理士】
【氏名又は名称】枝松 義恵
(72)【発明者】
【氏名】イブニン,ルーク
(72)【発明者】
【氏名】ゲノ,ジャンマリー
(72)【発明者】
【氏名】クンケル,ローリ
【審査官】柴原 直司
(56)【参考文献】
【文献】特表2012-504403(JP,A)
【文献】特表2010-524851(JP,A)
【文献】Future Oncol., (2012), 8, [6], p.687-695
(58)【調査した分野】(Int.Cl.,DB名)
A61K 39/395
CAplus/MEDLINE/EMBASE/BIOSIS(STN)
JSTPlus/JMEDPlus/JST7580(JDreamIII)
(57)【特許請求の範囲】
【請求項1】
造血幹細胞移植を受けた患者における急性骨髄性白血病(AML)の処置のための医薬であって、該医薬が、第1のポリペプチドと第2のポリペプチドとを含むタンデムダイアボディを含み、
各ポリペプチドが、逐次的に結合されている少なくとも4つの可変鎖ドメインを有し、
ここで、各ポリペプチドが、
(i)ヒトCD33に特異的な可変重鎖(VH)ドメイン;
(ii)ヒトCD33に特異的な可変軽鎖(VL)ドメイン;
(iii)ヒトCD3に特異的なVHドメイン;および、
(iv)ヒトCD3に特異的なVLドメイン
を含み、
前記可変鎖ドメインが、
VL(CD3)-L1-VH(CD33)-L2-VL(CD33)-L3-VH(CD3);
VH(CD3)-L1-VL(CD33)-L2-VH(CD33)-L3-VL(CD3);
VL(CD33)-L1-VH(CD3)-L2-VL(CD3)-L3-VH(CD33);または、
VH(CD33)-L1-VL(CD3)-L2-VH(CD3)-L3-VL(CD33)
の順序でペプチドリンカーL1、L2およびL3によって逐次的に結合されており、ならびに
(i)ヒトCD33に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:22に従うCDR1配列、SEQ ID NO:29に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:36に従うCDR3配列を含み
ヒトCD33に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:43に従うCDR1配列、SEQ ID NO:50に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:58~60からなる群から選択されるCDR3配列を含み
ヒトCD3に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:90に従うCDR1配列、SEQ ID NO:91に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:92に従うCDR3配列を含み、ならびに
ヒトCD3に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:72に従うCDR1配列、SEQ ID NO:73に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:75に従うCDR3配列を含み
(ii)ヒトCD33に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:23に従うCDR1配列、SEQ ID NO:30に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:37に従うCDR3配列を含み
ヒトCD33に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:44に従うCDR1配列、SEQ ID NO:51に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:61に従うCDR3配列を含み
ヒトCD3に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:90に従うCDR1配列、SEQ ID NO:91に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:92に従うCDR3配列を含み、ならびに
ヒトCD3に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:72に従うCDR1配列、SEQ ID NO:73に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:75に従うCDR3配列を含み;または
(iii)ヒトCD33に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:26に従うCDR1配列、SEQ ID NO:33に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:40に従うCDR3配列を含み
ヒトCD33に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:47に従うCDR1配列、SEQ ID NO:54に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:63に従うCDR3配列を含み
ヒトCD3に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:90に従うCDR1配列、SEQ ID NO:91に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:92に従うCDR3配列を含み、ならびに
ヒトCD3に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:72に従うCDR1配列、SEQ ID NO:73に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:に従うCDR3配列を含む、
医薬。
【請求項2】
移植が同種異型である、請求項1に記載の医薬。
【請求項3】
移植が自家である、請求項1に記載の医薬。
【請求項4】
ヒトCD33に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:22に従うCDR1配列、SEQ ID NO:29に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:36に従うCDR3配列を含み
ヒトCD33に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:43に従うCDR1配列、SEQ ID NO:50に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:58~60からなる群から選択されるCDR3配列を含
ヒトCD3に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:90に従うCDR1配列、SEQ ID NO:91に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:92に従うCDR3配列を含み、ならびに
ヒトCD3に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:72に従うCDR1配列、SEQ ID NO:73に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:75に従うCDR3配列を含む、
請求項1乃至3のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項5】
ヒトCD33に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:23に従うCDR1配列、SEQ ID NO:30に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:37に従うCDR3配列を含み
ヒトCD33に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:44に従うCDR1配列、SEQ ID NO:51に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:61に従うCDR3配列を含
ヒトCD3に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:90に従うCDR1配列、SEQ ID NO:91に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:92に従うCDR3配列を含み、ならびに
ヒトCD3に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:72に従うCDR1配列、SEQ ID NO:73に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:75に従うCDR3配列を含む、
請求項1乃至3のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項6】
ヒトCD33に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:26に従うCDR1配列、SEQ ID NO:33に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:40に従うCDR3配列を含み
ヒトCD33に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:47に従うCDR1配列、SEQ ID NO:54に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:63に従うCDR3配列を含
ヒトCD3に特異的なVLドメインが、SEQ ID NO:90に従うCDR1配列、SEQ ID NO:91に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:92に従うCDR3配列を含み、ならびに
ヒトCD3に特異的なVHドメインが、SEQ ID NO:72に従うCDR1配列、SEQ ID NO:73に従うCDR2配列、およびSEQ ID NO:75に従うCDR3配列を含む、
請求項1乃至3のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項7】
リンカーL1、L2およびL3が、2個以下のアミノ酸残基からなる、請求項1乃至のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項8】
リンカーL1、L2およびL3がそれぞれ、SEQ ID NO:95、SEQ ID NO:96、またはSEQ ID NO:97から独立して選択される、請求項1乃至のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項9】
タンデムダイアボディが、SEQ ID NO:134、137、138、141、および144からなる群から選択される配列を含む、請求項1乃至のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項10】
タンデムダイアボディが、タンデムダイアボディ12(SEQ ID NO:134)、たは16(SEQ ID NO:138)である、請求項1乃至のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項11】
シタラビン、アザシチジン、デシタビン、アントラサイクリン、フルダラビン、クロファラビン、クラドリビン、ネララビン、メトトレキサート、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、メルファラン、イブルチニブ、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、アプレミラスト、エピポドフィロトキシン、アントラセンジオン、リツキシマブ、オクレリズマブ、オファツムマブ、またはこれらの組み合わせと組み合わせて用いられることを特徴とする、請求項1乃至10のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項12】
AMLが、再発性遺伝的異常を有するAML、骨髄形成異常関連の変化を有するAML、治療関連の骨髄性の新生物、骨髄性肉腫、ダウン症候群と関連する骨髄増殖、芽球の形質細胞様樹状細胞新生物、または他に分類されないAMLである、請求項1乃至11のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項13】
AMLが、AML-M0、AML-M1、AML-M2、AML-M3、AML-M4、AML-M5、AML-M6、またはAML-M7である、請求項1乃至12のいずれか一項に記載の医薬。
【請求項14】
SEQ ID NO:134、137、138、141、および144から選択される配列を含む、ヒトCD33およびヒトCD3に特異的な二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディ。
【請求項15】
SEQ ID NO:134を含むタンデムダイアボディ12である、請求項14に記載の二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディ。
【請求項16】
SEQ ID NO:137を含むタンデムダイアボディ15である、請求項14に記載の二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディ。
【請求項17】
SEQ ID NO:138を含むタンデムダイアボディ16である、請求項14に記載の二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディ。
【請求項18】
SEQ ID NO:141を含むタンデムダイアボディ19である、請求項14に記載の二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディ。
【請求項19】
SEQ ID NO:144を含むタンデムダイアボディ22である、請求項14に記載の二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディ。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
相互参照
本出願は、2015年5月29日に出願された米国仮特許出願62/168,641号と、2015年12月11日に出願された米国仮特許出願62/266,438号の恩典を主張し、両文献は参照により全体として本明細書に組み込まれる。
【0002】
配列表
本出願は、ASCIIフォーマットで電子的に提出され、参照により全体として本明細書に組み込まれる配列表を含んでいる。2016年5月25日に作成された上記のASCIIコピーは、45375_705_601_SeqList.txtと命名され、250,173バイトのサイズである。
【背景技術】
【0003】
発明の背景
急性骨髄性白血病(AML)は成人および小児の急性白血病である。AMLの骨髄芽球の大多数において、CD33が発現される。一部の報告書によると、CD33は一般に、初期の多系統の骨髄系前駆細胞に限定され、正常な多能性造血幹細胞には存在しない。
【発明の概要】
【0004】
ヒトCD33と特異的に結合する結合タンパク質、およびヒトCD33とヒトCD3に特異的に結合する二重特異性の結合タンパク質が本明細書で提供される。さらに、例えばタンデムダイアボディなどといった、いくつかの二重特異性CD33/CD3結合タンパク質を生成するための抗CD33可変ドメインと抗CD3可変ドメインが、本明細書で提供される。さらにまた、CD33とCD3に結合する二重特異性タンデムダイアボディ、ならびに急性骨髄性白血病(AML)および他の血液系の悪性腫瘍、障害または状態の免疫療法ためのその使用が、本明細書で提供される。
【0005】
特に、カニクイザルとヒトの両方のCD33との結合を呈する結合タンパク質が提供される。これらのCD33/CD3タンデムダイアボディが、AML患者由来の自己由来T細胞のみならず、健康なドナー由来のポリクローナルCD3T細胞を、低いE:T細胞比でCD33AML細胞を効率的に溶解するように再指向させることができることが、実施例で実証されている。CD33標的細胞とT細胞の両方の存在に依存するこのプロセスでは、再指向されたT細胞は、CD25とCD69の誘発によって示されるように活性化され、刺激されて増殖する。これらのタンデムダイアボディの抗AML効果は、E:T細胞比のみならず、使用された抗体の濃度に依存することが示されている。タンデムダイアボディは四価であり、CD33のための2つの結合部位とCD3のための2つの結合部位を有する。本明細書に記載されるCD33/CD3タンデムダイアボディの特別な特徴は、それらが、各抗原、すなわちCD33およびCD3へのアビディティを与える二価結合の結果として、強力かつ効率的なアポトーシスを促進するということである。
【0006】
まとめると、本明細書に記載される提供されたCD33/CD3結合タンパク質、とりわけタンデムダイアボディは、インビトロでCD33白血病細胞と原発性AML細胞の強力な細胞溶解を引き起こす。タンデムダイアボディの抗体フォーマットの二重特異性CD33/CD3結合タンパク質の例は、細胞株、原発性AML細胞、ならびにAML細胞株および患者由来の原発性AML細胞を有するインビボモデルにおいて、インビボで細胞溶解活性を実証する。これはストリンジェントなAML PDXモデルにおいて特に注目に値する高いインビボ活性を示す。さらに、タンデムダイアボディの抗体フォーマットの二重特異性CD33/CD3結合タンパク質の例は、新規に診断された患者、再発した患者、および難治性の患者を含む、AMLの全ての段階の患者からのサンプル中で、細胞溶解活性をエクスビボで実証する。
【0007】
さらに、本明細書に記載されるこれらのCD33/CD3結合タンパク質は、約4時間以内にCD33発現細胞の有意な溶解を達成することができる。CD33/CD3結合タンパク質は、したがって、低いエフェクター:標的(E:T)比での高い細胞毒性のみならず、細胞表面上の低いCD33密度でも高い細胞毒性を示す。加えて、本明細書に記載されるCD33/CD3結合タンパク質は、ヒトタンパク質に対する強力なCD33およびCD3結合親和性を呈するだけではなく、例えば、ヒト:カニクイザルのKの比率5~0.2で、対応するカニクイザルタンパク質との優れた交差反応性も示す。さらに、本明細書に記載されたCD33/CD3結合タンパク質は、CD33標的細胞がない状態で、サイトカイン放出の有意な誘発を示さず、このことは、これらの分子の安全性プロファイルの不可欠な要素である。さらに、本明細書に記載されるCD33/CD3タンデムダイアボディは、8~24時間の近似範囲の半減期を有する分子のクラスに属し、このことは都合のよい投薬を可能にするはずである。
【0008】
1つの態様において、ヒトCD33のエピトープに特異的に結合するCD33結合タンパク質が本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、結合タンパク質は重鎖可変ドメインと、ヒトに由来する軽鎖可変ドメインを含む。
【0009】
いくつかの実施形態では、CD33結合タンパク質は、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインを含む少なくとも1つの結合部位を有し、ここで、軽鎖可変ドメインは、SEQ ID NO:21~27からなる群から選択された配列からなるCDR1と、SEQ ID NO:28~34からなる群から選択された配列からなるCDR2と、SEQ ID NO:35~41からなる群の配列からなるCDR3を含む。
【0010】
いくつかの実施形態では、CD33結合タンパク質は、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインを含む少なくとも1つの結合部位を有し、ここで、重鎖可変ドメインは、SEQ ID NO:42~48からなる群から選択された配列からなるCDR1と、SEQ ID NO:49~55からなる群から選択された配列からなるCDR2と、SEQ ID NO:56~63からなる群の配列から選択されたCDR3を含む。
【0011】
ある例では、軽鎖可変ドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、SEQ ID NO:21、28および35;SEQ ID NO:22、29および36;SEQ ID NO:23、30および37;SEQ ID NO:24、31および38;SEQ ID NO:25、32および39;SEQ ID NO:26、33および40;ならびに、SEQ ID NO:27、34および41からなる群から選択される。
【0012】
ある例では、重鎖可変ドメインのCDR1、CDR2およびCD3は、SEQ ID NO:42、49および56;SEQ ID NO:43、50および57;SEQ ID NO:43、50および58;SEQ ID NO:43、50および59;SEQ ID NO:43、50および60;SEQ ID NO:44、51および61;SEQ ID NO:45、52および62;SEQ ID NO:46、53および63;SEQ ID NO:47、54および63;ならびに、SEQ ID NO:48、55および63からなる群から選択される。
【0013】
ある例では、可変重鎖ドメインと可変軽鎖ドメインのヒトCD33結合部位は、SEQ ID NO:1とSEQ ID NO:11;SEQ ID NO:2とSEQ ID NO:12;SEQ ID NO:3とSEQ ID NO:13;SEQ ID NO:4とSEQ ID NO:14;SEQ ID NO:5とSEQ ID NO:15;SEQ ID NO:6とSEQ ID NO:16;SEQ ID NO:7とSEQ ID NO:17;SEQ ID NO:8とSEQ ID NO:18;SEQ ID NO:9とSEQ ID NO:19;およびSEQ ID NO:10とSEQ ID NO:20からなる群から選択される。
【0014】
いくつかの実施形態では、CD33エピトープは、ヒトCD33の62DQEVQEETQ70(SEQ ID NO:94)(SEQ ID NO:93のアミノ酸残基62~70)の範囲内である。
【0015】
上記の実施形態のいずれかにおいて、CD33結合タンパク質は、少なくとも1つのさらなる機能ドメインを含む。いくつかの例では、機能ドメインは、エフェクター細胞へ結合するエフェクタードメインである。ある例では、エフェクタードメインは、ヒトCD3への抗原結合部位を形成する、少なくとも1つの抗体可変重鎖ドメインと少なくとも1つの可変軽鎖ドメインを含むCD3結合部位である。
【0016】
ある例では、CD3結合部位は、STYAMN(SEQ ID NO:72)のCDR1配列、RIRSKYNNYATYYADSVKD(SEQ ID NO:73)のCDR2配列、およびHGNFGNSYVSWFAY(SEQ ID NO:74)のCDR3配列を含む、重鎖可変ドメインを含む。他の例では、CD3結合部位は、RSSTGAVTTSNYAN(SEQ ID NO:90)のCDR1配列、GTNKRAP(SEQ ID NO:91)のCDR2配列、およびALWYSNL(SEQ ID NO:92)のCDR3配列を含む軽鎖可変ドメインを含む。
【0017】
ある例では、CD3結合部位は、SEQ ID NO:64の重鎖可変ドメインと、SEQ ID NO:68の可変軽鎖ドメイン;SEQ ID NO:65の重鎖可変ドメインとSEQ ID NO:69の可変軽鎖ドメイン;SEQ ID NO:66の重鎖可変ドメインとSEQ ID NO:70の可変軽鎖ドメイン;または、SEQ ID NO:67の重鎖可変ドメインとSEQ ID NO:71の可変軽鎖ドメインを含む。
【0018】
上記の実施形態のいずれかにおいて、CD33結合タンパク質は二量体のタンパク質である。上記の実施形態のいずれかにおいて、CD33結合タンパク質は多機能である。
【0019】
ある例では、多機能のCD33結合タンパク質はCD33とCD3について二重特異性を有し、結合特異性は、SEQ ID NO:2、12、65および69;SEQ ID NO:3、13、65および69;SEQ ID NO:4、14、65および69;SEQ ID NO:5、15、65および69;SEQ ID NO:1、11、64および68;SEQ ID NO:2、12、64および68;SEQ ID NO:2、12、66および70;SEQ ID NO:4、14、66および70;SEQ ID NO:5、15、66および70;SEQ ID NO:3、13、64および68;SEQ ID NO:3、13、67および71;SEQ ID NO:4、14、64および68;SEQ ID NO:5、15、64および68;SEQ ID NO:7、17、64および68;SEQ ID NO:6、16、64および68;SEQ ID NO:6、16、67および71;SEQ ID NO:8、18、64および68;SEQ ID NO:9、19、64および68;SEQ ID NO:9、19、67および71;ならびに、SEQ ID NO:10、20、64および68からなる群から選択されたCD33とCD3についての重鎖可変ドメインと軽鎖可変ドメインによって提供される。
【0020】
別の態様において、ヒトCD3とヒトCD33に特異的な二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディが本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、タンデムダイアボディは第1のポリペプチドと第2のポリペプチドを含み、各ポリペプチドは、逐次的に結合した少なくとも4つの可変鎖ドメインを有し、各ポリペプチドはヒトCD33に特異的な可変重鎖ドメイン;ヒトCD33に特異的な可変軽鎖ドメイン;ヒトCD3に特異的な可変重鎖ドメイン、およびヒトCD3に特異的な可変軽鎖ドメインを含み、各ポリペプチドにおいて、4つの可変鎖ドメインは、VL(CD3)-L1-VH(CD33)-L2-VL(CD33)-L3-VH(CD3);VH(CD3)-L1-VL(CD33)-L2-VH(CD33)-L3-VL(CD3);VL(CD33)-L1-VH(CD3)-L2-VL(CD3)-L3-VH(CD33);またはVH(CD33)-L1-VL(CD3)-L2-VH(CD3)-L3-VL(CD33)の順に、ペプチドリンカーL1、L2、およびL3によって逐次的に結合されている。
【0021】
いくつかの実施形態では、ヒトCD33に特異的なVLドメインは、SEQ ID NO:21~27からなる群から選択された配列からなるCDR1、SEQ ID NO:28~34からなる群から選択された配列からなるCDR2、およびSEQ ID NO:35~41からなる群の配列からなるCDR3を含む。
【0022】
いくつかの実施形態では、ヒトCD33に特異的なVHドメインは、SEQ ID NO:42~48からなる群から選択された配列からなるCDR1、SEQ ID NO:49~55からなる群から選択された配列からなるCDR2、および、SEQ ID NO:56~63からなる群から選択された配列からなるCDR3を含む。
【0023】
いくつかの実施形態では、ヒトCD33に特異的なVLドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、SEQ ID NO:21、28および35;SEQ ID NO:22、29および36;SEQ ID NO:23、30および37;SEQ ID NO:24、31および38;SEQ ID NO:25、32および39;SEQ ID NO:26、33および40;ならびに、SEQ ID NO:27、34および41からなる群から選択された配列である。
【0024】
いくつかの実施形態では、ヒトCD33に特異的なVHドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、SEQ ID NO:42、49および56;SEQ ID NO:43、50および57;SEQ ID NO:43、50および58;SEQ ID NO:43、50および59;SEQ ID NO:43、50および60;SEQ ID NO:44、51および61;SEQ ID NO:45、52および62;SEQ ID NO:46、53および63;SEQ ID NO:47、54と63;ならびに、SEQ ID NO:48、55および63からなる群から選択された配列である。
【0025】
いくつかの実施形態では、CD33に特異的なVLおよびVHドメインは、SEQ ID NO:1とSEQ ID NO:11;SEQ ID NO:2とSEQ ID NO:12;SEQ ID NO:3とSEQ ID NO:13;SEQ ID NO:4とSEQ ID NO:14;SEQ ID NO:5とSEQ ID NO:15;SEQ ID NO:6とSEQ ID NO:16;SEQ ID NO:7とSEQ ID NO:17;SEQ ID NO:8とSEQ ID NO:18;SEQ ID NO:9とSEQ ID NO:19;およびSEQ ID NO:10とSEQ ID NO:20からなる群から選択された配列である。
【0026】
いくつかの実施形態では、ヒトCD3に特異的なVHドメインは、STYAMN(SEQ ID NO:72)のCDR1配列、RIRSKYNNYATYYADSVKD(SEQ ID NO:73)のCDR2配列、およびHGNFGNSYVSWFAY(SEQ ID NO:74)またはHGNFGNSYVSYFAY(SEQ ID NO:75)のCDR3配列を含む。
【0027】
いくつかの実施形態では、ヒトCD3に特異的なVLドメインは、RSSTGAVTTSNYAN(SEQ ID NO:90)のCDR1配列、GTNKRAP(SEQ ID NO:91)のCDR2配列、およびALWYSNL(SEQ ID NO:92)のCDR3配列を含む。
【0028】
いくつかの実施形態では、CD3に特異的なVLおよびVHドメインは、SEQ ID NO:64とSEQ ID NO:68;SEQ ID NO:65とSEQ ID NO:69;SEQ ID NO:66とSEQ ID NO:70;およびSEQ ID NO:67とSEQ ID NO:71からなる群から選択された配列である。
【0029】
いくつかの実施形態では、各ポリペプチドは、SEQ ID NO:2、12、65および69;SEQ ID NO:3、13、65および69;SEQ ID NO:4、14、65および69;SEQ ID NO:5、15、65および69;SEQ ID NO:1、11、64および68;SEQ ID NO:2、12、64および68;SEQ ID NO:2、12、66および70;SEQ ID NO:4、14、66および70;SEQ ID NO:5、15、66および70;SEQ ID NO:3、13、64および68;SEQ ID NO:3、13、67および71;SEQ ID NO:4、14、64および68;SEQ ID NO:5、15、64および68;SEQ ID NO:7、17、64および68;SEQ ID NO:6、16、64および68;SEQ ID NO:6、16、67および71;SEQ ID NO:8、18、64および68;SEQ ID NO:9、19、64および68;SEQ ID NO:9、19、67および71;ならびに、SEQ ID NO:10、20、64および68からなる群から選択された4つの可変鎖ドメインを含む。
【0030】
いくつかの実施形態では、リンカーL1、L2およびL3は、約12以下のアミノ酸残基からなる。ある例では、リンカーL1、L2およびL3はそれぞれ独立して、GGSGGS(SEQ ID NO:95)、GGSG(SEQ ID NO:96)、またはGGSGG(SEQ ID NO:97)である。他の例では、リンカーL1とL3は、GGSGGS(SEQ ID NO:95)であり、リンカーL2は、GGSG(SEQ ID NO:96)またはGGSGG(SEQ ID NO:97)である。
【0031】
いくつかの実施形態において、C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを伴う二重特異性タンデムダイアボディは、SEQ ID NO:98~121からなる群から選択された配列を含む。他の実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディは、タンデムダイアボディ01(SEQ ID NO:98)、02(SEQ ID NO:99)、03(SEQ ID NO:100)、04(SEQ ID NO:101)、05(SEQ ID NO:102)、06(SEQ ID NO:103)、07(SEQ ID NO:104)、08(SEQ ID NO:105)、09(SEQ ID NO:106)、10(SEQ ID NO:107)、11(SEQ ID NO:108)、12(SEQ ID NO:109)、13(SEQ ID NO:110)、14(SEQ ID NO:111)、15(SEQ ID NO:112)、16(SEQ ID NO:113)、17(SEQ ID NO:114)、18(SEQ ID NO:115)、19(SEQ ID NO:116)、20(SEQ ID NO:117)、21(SEQ ID NO:118)、22(SEQ ID NO:119)、23(SEQ ID NO:120)、または24(SEQ ID NO:121)である。
【0032】
いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディは、SEQ ID NO:123~146からなる群から選択された配列を含む。他の実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディは、タンデムダイアボディ01(SEQ ID NO:123)、02(SEQ ID NO:124)、03(SEQ ID NO:125)、04(SEQ ID NO:126)、05(SEQ ID NO:127)、06(SEQ ID NO:128)、07(SEQ ID NO:129)、08(SEQ ID NO:130)、09(SEQ ID NO:131)、10(SEQ ID NO:132)、11(SEQ ID NO:133)、12(SEQ ID NO:134)、13(SEQ ID NO:135)、14(SEQ ID NO:136)、15(SEQ ID NO:137)、16(SEQ ID NO:138)、17(SEQ ID NO:139)、18(SEQ ID NO:140)、19(SEQ ID NO:141)、20(SEQ ID NO:142)、21(SEQ ID NO:143)、22(SEQ ID NO:144)、23(SEQ ID NO:145)または24(SEQ ID NO:146)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ01(SEQ ID NO:123)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ02(SEQ ID NO:124)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ03(SEQ ID NO:125)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ04(SEQ ID NO:126)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ05(SEQ ID NO:127)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ06(SEQ ID NO:128)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ07(SEQ ID NO:129)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ08(SEQ ID NO:130)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ09(SEQ ID NO:131)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ10(SEQ ID NO:132)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ11(SEQ ID NO:133)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ12(SEQ ID NO:134)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ13(SEQ ID NO:135)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ14(SEQ ID NO:136)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ15(SEQ ID NO:137)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ16(SEQ ID NO:138)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ17(SEQ ID NO:139)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ18(SEQ ID NO:140)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ19(SEQ ID NO:141)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ20(SEQ ID NO:142)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ21(SEQ ID NO:143)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ22(SEQ ID NO:144)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ23(SEQ ID NO:145)である。いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ24(SEQ ID NO:146)である。
【0033】
いくつかの実施形態では、二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディは、HL-60、KG-1およびU-937から選択されたCD33腫瘍細胞上のCD33に対し50nM以下の結合Kを有する。いくつかの実施形態では、二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディは、HL-60、KG-1およびU-937から選択されたCD33腫瘍細胞上のCD33に対し10nM以下の結合Kを有する。いくつかの実施形態では、二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディは、CD33HL-60腫瘍細胞上のCD33に対し15nM以下の結合Kを有する。
【0034】
いくつかの実施形態において、二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディは、ヒトCD33の62DQEVQEETQ70(SEQ ID NO:94)(SEQ ID NO:93のアミノ酸残基62~70)の範囲内であるヒトCD33のエピトープに特異的に結合する。
【0035】
別の態様では、上記の実施形態のいずれかのCD33結合タンパク質または二重特異性タンデムダイアボディをコードするポリヌクレオチドが本明細書で提供される。別の態様では、記載されたポリヌクレオチドを含むベクターが本明細書で提供される。別の態様では、記載されたベクターで形質転換した宿主細胞が本明細書で提供される。
【0036】
また別の態様では、上記の実施形態のいずれかのCD33結合タンパク質または二重特異性タンデムダイアボディと、薬学的に許容可能な担体とを含む医薬組成物が本明細書で提供される。
【0037】
また別の態様において、上記の実施形態のいずれかのCD33結合タンパク質または二重特異性タンデムダイアボディを産生する方法が本明細書で提供され、該方法は、上記の実施形態のいずれかのCD33結合タンパク質もしくは二重特異性タンデムダイアボディをコードするポリヌクレオチドまたは記載されたポリヌクレオチドを含むベクターを宿主細胞へ導入する工程と、CD33結合タンパク質または二重特異性タンデムダイアボディが発現される条件下で宿主細胞を培養する工程と、発現されたCD33結合タンパク質または二重特異性タンデムダイアボディを精製する工程とを含む。
【0038】
さらに、上記の実施形態のいずれかの二重特異性タンデムダイアボディの、CD33癌に苦しむ個体への投与を含む、CD33癌の処置のための方法も、本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、CD33癌は、急性骨髄性白血病(AML)、急性リンパ芽球性白血病(ALL)、B前駆細胞リンパ芽球性白血病、骨髄性肉腫、多発性骨髄腫、急性リンパ腫、急性リンパ芽球性リンパ腫、または慢性骨髄単球性白血病(CMML)である。いくつかの実施形態では、CD33癌は急性骨髄性白血病(AML)である。いくつかの実施形態では、CD33癌は多発性骨髄腫である。いくつかの実施形態では、CD33癌は急性リンパ芽球性白血病(ALL)である。
【0039】
さらに、上記の実施形態のいずれかの二重特異性タンデムダイアボディの、AMLに苦しむ個体への投与を含む、急性骨髄性白血病(AML)の処置のための方法も、本明細書で提供される。いくつかの実施形態では、AMLは、再発性遺伝的異常を有するAML、骨髄形成異常関連の変化を有するAML、治療関連の骨髄性の新生物、骨髄性肉腫、ダウン症候群と関連する骨髄増殖、芽球の形質細胞様樹状細胞新生物、または他に分類されないAMLである。いくつかの実施形態では、AMLは、AML-M0、AML-M1、AML-M2、AML-M3、AML-M4、AML-M5、AML-M6、またはAML-M7である。さらなる実施形態では、AMLは新規に診断されたか、再発性か、または難治性である。
【0040】
さらに、上記の実施形態のいずれかの二重特異性タンデムダイアボディの、骨髄性の形成異常症候群(MDS)に苦しむ個体への投与を含む、MDSの処置のための方法も、本明細書で提供される。
【0041】
さらに、上記の実施形態のいずれかの二重特異性タンデムダイアボディの、骨髄増殖性疾患(MPD)に苦しむ個体への投与を含む、MPDの処置のための方法も、本明細書で提供される。
【0042】
さらに、上記の実施形態のいずれかの二重特異性タンデムダイアボディの、慢性骨髄単球性白血病(CMML)に苦しむ個体への投与を含む、CMMLの処置のための方法も、本明細書で提供される。
【0043】
さらに、上記の実施形態のいずれかの二重特異性タンデムダイアボディの、免疫抑制に苦しむ個体への投与を含む、骨髄由来の抑制細胞(MDSC)による免疫抑制の処置のための方法も、本明細書で提供される。
【0044】
処置のための上記方法において、特定の実施例では、該方法は、シタラビン、アザシチジン、デシタビン、アントラサイクリン(例えばダウノルビシン、イダルビシン、ドキソルビシンなど)、アムサクリン、フルダラビン、クロファラビン、クラドリビン、ネララビン、メトトレキサート、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、メルファラン、イブルチニブ、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、アプレミラスト、エピポドフィロトキシン(例えばエトポシド、テニポシドなど)、アントラセンジオン(例えばミトキサントロン、ピクサントロン、ロソキサントロン、ピロキサントロン、アメタントロンなど)、抗CD20薬剤(例えばリツキシマブ、オクレリズマブ、オファツムマブなど)またはそれらの組み合わせを投与する工程をさらに含む。
【0045】
造血幹細胞移植を受けた患者における急性骨髄性白血病(AML)の処置のための方法が本明細書で提供され、該方法は、ヒトCD33とヒトCD3に結合する治療上有効な量のタンパク質を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、該方法が提供され、移植は同種異型である。いくつかの実施形態において、該方法が提供され、移植は自家である。いくつかの実施形態において、該方法が提供され、患者は移植前処置を受けない。いくつかの実施形態において、該方法が提供され、該方法は、患者へ移植前処置を施す工程をさらに含む。いくつかの実施形態において、該方法が提供され、移植前処置は骨髄破壊性である。いくつかの実施形態において、該方法が提供され、移植前処置は骨髄非破壊性である。
【0046】
上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は移植前処置の後に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、患者は完全寛解している。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、患者は微小残存病変を有する。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、患者は化学療法または放射線が不成功に終わったことがある。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、患者は導入化学療法が不成功に終わったことがある。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、患者は、地固めまたは維持(寛解後)化学療法が不成功に終わったことがある。
【0047】
上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、AMLは再発性である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、AMLは難治性である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、AMLは高リスクであり、かつ寛解にある。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は造血幹細胞移植の直後に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は造血幹細胞移植の3日後に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は造血幹細胞移植の7日後に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は造血幹細胞移植の2週間後に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は造血幹細胞移植の4週間後に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は4週、8週、3か月、4か月、6か月、8か月、10か月、12か月、18か月、および24か月からなる群から選択された期間、投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は、ドナーリンパ球と共に、同種異型設定において疾患進行時に投与される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は、ドナーリンパ球を伴わずに、同種異型設定において疾患進行時に投与される。
【0048】
上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質はヒトCD33およびヒトCD3に特異的な重鎖および軽鎖ドメインを含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は抗体または抗体の誘導体である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質はFab、Fab’、またはF(ab’)フラグメントを含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は、単鎖Fv、タンデム単鎖Fv、二重特異性T細胞エンゲージャー、二重親和性再標的化抗体、ダイアボディ、または二重特異性タンデムダイアボディである。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンパク質は二重特異性タンデムダイアボディである。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンデムダイアボディは、第1のポリペプチドと第2のポリペプチドを含み、各ポリペプチドは、逐次的に結合した少なくとも4つの可変鎖ドメインを有し、ここで、各ポリペプチドはヒトCD33に特異的な可変重鎖(VH)ドメイン;ヒトCD33に特異的な可変軽鎖(VL)ドメイン;ヒトCD3に特異的なVHドメイン、および、ヒトCD3に特異的なVLドメインを含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、各ポリペプチドにおいて、4つの可変鎖ドメインは、VL(CD3)-L1-VH(CD33)-L2-VL(CD33)-L3-VH(CD3);VH(CD3)-L1-VL(CD33)-L2-VH(CD33)-L3-VL(CD3);VL(CD33)-L1-VH(CD3)-L2-VL(CD3)-L3-VH(CD33);またはVH(CD33)-L1-VL(CD3)-L2-VH(CD3)-L3-VL(CD33)の順序でペプチドリンカーL1、L2およびL3によって逐次的に結合されている。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、ヒトCD33に特異的なVLドメインは、SEQ ID NO:21~27からなる群から選択された配列からなるCDR1、SEQ ID NO:28~34からなる群から選択された配列からなるCDR2、およびSEQ ID NO:35~41からなる群の配列からなるCDR3を含む。
【0049】
上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、ヒトCD33に特異的なVHドメインは、SEQ ID NO:42~48からなる群から選択された配列からなるCDR1、SEQ ID NO:49~55からなる群から選択された配列からなるCDR2、および、SEQ ID NO:56~63からなる群から選択された配列からなるCDR3を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、ヒトCD33に特異的なVLドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、SEQ ID NO:21、28および35;SEQ ID NO:22、29および36;SEQ ID NO:23、30および37;SEQ ID NO:24、31および38;SEQ ID NO:25、32および39;SEQ ID NO:26、33および40;ならびに、SEQ ID NO:27、34および41からなる群から選択された配列である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、CD33に特異的なVHドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、SEQ ID NO:42、49および56;SEQ ID NO:43、50および57;SEQ ID NO:43、50および58;SEQ ID NO:43、50および59;SEQ ID NO:43、50および60;SEQ ID NO:44、51および61;SEQ ID NO:45、52および62;SEQ ID NO:46、53および63;SEQ ID NO:47、54、および63;ならびに、SEQ ID NO:48、55および63からなる群から選択された配列である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、CD33に特異的なVLおよびVHドメインは、SEQ ID NO:1とSEQ ID NO:11;SEQ ID NO:2とSEQ ID NO:12;SEQ ID NO:3とSEQ ID NO:13;SEQ ID NO:4とSEQ ID NO:14;SEQ ID NO:5とSEQ ID NO:15;SEQ ID NO:6とSEQ ID NO:16;SEQ ID NO:7とSEQ ID NO:17;SEQ ID NO:8とSEQ ID NO:18;SEQ ID NO:9とSEQ ID NO:19;および、SEQ ID NO:10とSEQ ID NO:20からなる群から選択された配列である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、ヒトCD3に特異的なVHドメインは、STYAMN(SEQ ID NO:72)のCDR1配列、RIRSKYNNYATYYADSVKD(SEQ ID NO:73)のCDR2配列、およびHGNFGNSYVSWFAY(SEQ ID NO:74)またはHGNFGNSYVSYFAY(SEQ ID NO:75)のCDR3配列を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、ヒトCD3に特異的なVLドメインは、RSSTGAVTTSNYAN(SEQ ID NO:90)のCDR1配列、GTNKRAP(SEQ ID NO:91)のCDR2配列、およびALWYSNL(SEQ ID NO:92)のCDR3配列を含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、CD3に特異的なVLおよびVHドメインは、SEQ ID NO:64とSEQ ID NO:68;SEQ ID NO:65とSEQ ID NO:69;SEQ ID NO:66とSEQ ID NO:70;および、SEQ ID NO:67とSEQ ID NO:71からなる群から選択された配列である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、各ポリペプチドは、SEQ ID NO:2、12、65および69;SEQ ID NO:3、13、65および69;SEQ ID NO:4、14、65および69;SEQ ID NO:5、15、65および69;SEQ ID NO:1、11、64および68;SEQ ID NO:2、12、64および68;SEQ ID NO:2、12、66および70;SEQ ID NO:4、14、66および70;SEQ ID NO:5、15、66および70;SEQ ID NO:3、13、64および68;SEQ ID NO:3、13、67および71;SEQ ID NO:4、14、64および68;SEQ ID NO:5、15、64および68;SEQ ID NO:7、17、64および68;SEQ ID NO:6、16、64および68;SEQ ID NO:6、16、67および71;SEQ ID NO:8、18、64および68;SEQ ID NO:9、19、64および68;SEQ ID NO:9、19、67および71;ならびに、SEQ ID NO:10、20、64および68からなる群から選択された4つの可変鎖ドメインを含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、リンカーL1、L2およびL3は約12以下のアミノ酸残基からなる。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、リンカーL1、L2およびL3はそれぞれ、GGSGGS(SEQ ID NO:95)、GGSG(SEQ ID NO:96)、またはGGSGG(SEQ ID NO:97)から独立して選択される。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを伴うタンデムダイアボディは、SEQ ID NO:98~121からなる群から選択された配列を有する。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ01(SEQ ID NO:98)、02(SEQ ID NO:99)、03(SEQ ID NO:100)、04(SEQ ID NO:101)、05(SEQ ID NO:102)、06(SEQ ID NO:103)、07(SEQ ID NO:104)、08(SEQ ID NO:105)、09(SEQ ID NO:106)、10(SEQ ID NO:107)、11(SEQ ID NO:108)、12(SEQ ID NO:109)、13(SEQ ID NO:110)、14(SEQ ID NO:111)、15(SEQ ID NO:112)、16(SEQ ID NO:113)、17(SEQ ID NO:114)、18(SEQ ID NO:115)、19(SEQ ID NO:116)、20(SEQ ID NO:117)、21(SEQ ID NO:118)、22(SEQ ID NO:119)、23(SEQ ID NO:120)、または24(SEQ ID NO:121)である。
【0050】
上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンデムダイアボディはSEQ ID NO:123~146からなる群から選択された配列を有する。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、タンデムダイアボディはタンデムダイアボディ01(SEQ ID NO:123)、02(SEQ ID NO:124)、03(SEQ ID NO:125)、04(SEQ ID NO:126)、05(SEQ ID NO:127)、06(SEQ ID NO:128)、07(SEQ ID NO:129)、08(SEQ ID NO:130)、09(SEQ ID NO:131)、10(SEQ ID NO:132)、11(SEQ ID NO:133)、12(SEQ ID NO:134)、13(SEQ ID NO:135)、14(SEQ ID NO:136)、15(SEQ ID NO:137)、16(SEQ ID NO:138)、17(SEQ ID NO:139)、18(SEQ ID NO:140)、19(SEQ ID NO:141)、20(SEQ ID NO:142)、21(SEQ ID NO:143)、22(SEQ ID NO:144)、23(SEQ ID NO:145)または24(SEQ ID NO:146)である。
【0051】
上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、該方法は、シタラビン、アザシチジン、デシタビン、アントラサイクリン、フルダラビン、クロファラビン、クラドリビン、ネララビン、メトトレキサート、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、メルファラン、イブルチニブ、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、アプレミラスト、エピポドフィロトキシン、アントラセンジオン、抗CD20薬剤、またはこれらの組み合わせを投与する工程をさらに含む。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、AMLは、再発性遺伝的異常を有するAML、骨髄形成異常関連の変化を有するAML、治療関連の骨髄性の新生物、骨髄性肉腫、ダウン症候群と関連する骨髄性の増殖、芽球の形質細胞様樹状細胞新生物、または他に分類されないAMLである。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、AMLは、AML-M0、AML-M1、AML-M2、AML-M3、AML-M4、AML-M5、AML-M6、またはAML-M7である。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、骨髄破壊性の移植前処置を受けた後に、同種異型の造血幹細胞移植を受けた患者において、タンパク質を投与する工程は、該タンパク質による治療に対する全奏効率の改善をもたらす。上記の実施形態のいずれかにおいて、該方法が提供され、骨髄非破壊性の移植前処置を受けた後に、同種異型の造血幹細胞移植を受けた患者において、タンパク質を投与する工程は、該タンパク質による治療に対する全奏効率の改善をもたらす。
【0052】
[本発明1001]
造血幹細胞移植を受けた患者における急性骨髄性白血病(AML)の処置のための方法であって、
該方法は、
ヒトCD33とヒトCD3に結合する治療上有効な量のタンパク質を投与する工程を含む、方法。
[本発明1002]
移植は同種異型である、本発明1001の方法。
[本発明1003]
移植は自家性である、本発明1001の方法。
[本発明1004]
患者は移植前処置を受けない、本発明1001-1003のいずれかの方法。
[本発明1005]
患者へ移植前処置を施す工程をさらに含む、本発明1001-1003のいずれかの方法。
[本発明1006]
移植前処置は骨髄破壊性である、本発明1005の方法。
[本発明1007]
移植前処置は非骨髄破壊性である、本発明1005の方法。
[本発明1008]
タンパク質は移植前処置の後に投与される、本発明1005-1007のいずれかの方法。
[本発明1009]
患者は完全寛解している、本発明1001-1008のいずれかの方法。
[本発明1010]
患者は微小残存病変を有する、本発明1001-1008のいずれかの方法。
[本発明1011]
患者は化学療法または放射線療法に失敗したことがある、本発明1001-1008のいずれかの方法。
[本発明1012]
患者は誘導型化学療法に失敗したことがある、本発明1001-1008のいずれかの方法。
[本発明1013]
患者は、強化または維持(寛解後)の化学療法に失敗したことがある、本発明1001-1008のいずれかの方法。
[本発明1014]
AMLは再発性である、本発明1001-1013のいずれかの方法。
[本発明1015]
AMLは難治性である、本発明1001-1013のいずれかの方法。
[本発明1016]
AMLはリスクが高く、寛解期にある、本発明1001-1013のいずれかの方法。
[本発明1017]
タンパク質は造血幹細胞移植直後に投与される、本発明1001-1016のいずれかの方法。
[本発明1018]
タンパク質は造血幹細胞移植の3日後に投与される、本発明1001-1016のいずれかの方法。
[本発明1019]
タンパク質は造血幹細胞移植の7日後に投与される、本発明1001-1016のいずれかの方法。
[本発明1020]
タンパク質は造血幹細胞移植の2週間後に投与される、本発明1001-1016のいずれかの方法。
[本発明1021]
タンパク質は造血幹細胞移植の4週間後に投与される、本発明1001-1016のいずれかの方法。
[本発明1022]
タンパク質は4週、8週、3か月、4か月、6か月、8か月、10か月、12か月、18か月、および24か月からなる群から選択された期間、投与される、本発明1001-1021のいずれかの方法。
[本発明1023]
タンパク質は、ドナーリンパ球とともに、同種異型設定において進行時に投与される、本発明1001-1002のいずれかの方法。
[本発明1024]
タンパク質は、ドナーリンパ球を用いずに、同種異型設定において進行時に投与される、本発明1001-1002のいずれかの方法。
[本発明1025]
タンパク質はヒトCD33とヒトCD3に特異的な重鎖と軽鎖のドメインを含む、本発明1001-1024のいずれかの方法。
[本発明1026]
タンパク質は抗体または抗体の誘導体である、本発明1001-1025のいずれかの方法。
[本発明1027]
タンパク質はFab、Fab’、あるいはF(ab’) 2 のフラグメントを含む、本発明1001-1025のいずれかの方法。
[本発明1028]
タンパク質は、単鎖Fv、タンデム単鎖Fv、二重特異性のT細胞エンゲージャー、二重親和性再標的化抗体、二重特異性抗体、あるいは二重特異性のタンデム二重特異性抗体である、本発明1001-1025のいずれかの方法。
[本発明1029]
タンパク質は二重特異性のタンデム二重特異性抗体である、本発明1001-1025のいずれかの方法。
[本発明1030]
タンデム二重特異性抗体は、第1のポリペプチドと第2のポリペプチドを含み、各ポリペプチドは次々に結合した少なくとも4つの可変鎖ドメインを有し、ここで、各ポリペプチドは、
(i)ヒトCD33に特異的な可変重鎖(VH)ドメイン;
(ii)ヒトCD33に特異的な可変軽鎖(VL)ドメイン;
(iii)ヒトCD3に特異的なVHドメイン、および、
(iv)ヒトCD3に特異的なVLドメイン、
を含む、本発明1029の方法。
[本発明1031]
各ポリペプチドでは、4つの可変鎖ドメインは:
VL(CD3)-L1-VH(CD33)-L2-VL(CD33)-L3-VH(CD3);
VH(CD3)-L1-VL(CD33)-L2-VH(CD33)-L3-VL(CD3);
VL(CD33)-L1-VH(CD3)-L2-VL(CD3)-L3-VH(CD33);あるいは、
VH(CD33)-L1-VL(CD3)-L2-VH(CD3)-L3-VL(CD33)
の順序でペプチドリンカーL1、L2およびL3によって次々に結合される、本発明1030の方法。
[本発明1032]
ヒトCD33に特異的なVLドメインは、SEQ ID NO:21-27からなる群から選択された配列からなるCDR1、SEQ ID NO:28-34からなる群から選択された配列からなるCDR2、およびSEQ ID NO:35-41からなる群の配列からなるCDR3を含む、本発明1029-1031のいずれかの方法。
[本発明1033]
ヒトCD33に特異的なVHドメインは、SEQ ID NO:42-48からなる群から選択された配列からなるCDR1、SEQ ID NO:49-55からなる群から選択された配列からなるCDR2、および、SEQ ID NO:56-63からなる群から選択された配列からなるCDR3を含む、本発明1029-1032のいずれかの方法。
[本発明1034]
ヒトCD33に特異的なVLドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、
(i)SEQ ID NO:21、28および35;
(ii)SEQ ID NO:22、29および36;
(iii)SEQ ID NO:23、30および37;
(iv)SEQ ID NO:24、31および38;
(v)SEQ ID NO:25、32および39;
(vi)SEQ ID NO:26、33および40;ならびに、
(vii)SEQ ID NO:27、34および41
からなる群から選択された配列である、本発明1031-1033のいずれかの方法。
[本発明1035]
CD33に特異的なVHドメインのCDR1、CDR2およびCDR3は、
(i)SEQ ID NO:42、49および56;
(ii)SEQ ID NO:43、50および57;
(iii)SEQ ID NO:43、50および58;
(iv)SEQ ID NO:43、50および59;
(v)SEQ ID NO:43、50および60;
(vi)SEQ ID NO:44、51および61;
(vii)SEQ ID NO:45、52および62;
(viii)SEQ ID NO:46、53および63;
(ix)SEQ ID NO:47、54、および63;ならびに、
(x)SEQ ID NO:48、55および63
からなる群から選択された配列である、本発明1029-1034のいずれかの方法。
[本発明1036]
CD33に特異的なVLおよびVHのドメインは、
(i)SEQ ID NO:1とSEQ ID NO:11;
(ii)SEQ ID NO:2とSEQ ID NO:12;
(iii)SEQ ID NO:3とSEQ ID NO:13;
(iv)SEQ ID NO:4とSEQ ID NO:14;
(v)SEQ ID NO:5とSEQ ID NO:15;
(vi)SEQ ID NO:6とSEQ ID NO:16;
(vii)SEQ ID NO:7とSEQ ID NO:17;
(viii)SEQ ID NO:8とSEQ ID NO:18;
(ix)SEQ ID NO:9とSEQ ID NO:19;および、
(x)SEQ ID NO:10とSEQ ID NO:20
からなる群から選択された配列である、本発明1029-1035のいずれかの方法。
[本発明1037]
ヒトCD3に特異的なVHドメインは、STYAMN(SEQ ID NO:72)のCDR1配列、RIRSKYNNYATYYADSVKD(SEQ ID NO:73)のCDR2配列、およびHGNFGNSYVSWFAY(SEQ ID NO:74)あるいはHGNFGNSYVSYFAY(SEQ ID NO:75)のCDR3配列を含む、本発明1029-1036のいずれかの方法。
[本発明1038]
ヒトCD3に特異的なVLドメインは、RSSTGAVTTSNYAN(SEQ ID NO:90)のCDR1配列、GTNKRAP(SEQ ID NO:91)のCDR2配列、およびALWYSNL(SEQ ID NO:92)のCDR3配列を含む、本発明1029-1037のいずれかの方法。
[本発明1039]
CD3に特異的なVLおよびVHのドメインは、
(i)SEQ ID NO:64とSEQ ID NO:68;
(ii)SEQ ID NO:65とSEQ ID NO:69;
(iii)SEQ ID NO:66とSEQ ID NO:70;および、
(iv)SEQ ID NO:67とSEQ ID NO:71
からなる群から選択された配列である、本発明1027-1036のいずれかの方法。
[本発明1040]
各ポリペプチドは、
(i)SEQ ID NO:2、12、65および69;
(ii)SEQ ID NO:3、13、65および69;
(iii)SEQ ID NO:4、14、65および69;
(iv)SEQ ID NO:5、15、65および69;
(v)SEQ ID NO:1、11、64および68;
(vi)SEQ ID NO:2、12、64および68;
(vii)SEQ ID NO:2、12、66および70;
(viii)SEQ ID NO:4、14、66および70;
(ix)SEQ ID NO:5、15、66および70;
(x)SEQ ID NO:3、13、64および68;
(xi)SEQ ID NO:3、13、67および71;
(xii)SEQ ID NO:4、14、64および68;
(xiii)SEQ ID NO:5、15、64および68;
(xiv)SEQ ID NO:7、17、64および68;
(xv)SEQ ID NO:6、16、64および68;
(xvi)SEQ ID NO:6、16、67および71;
(xvii)SEQ ID NO:8、18、64および68;
(xviii)SEQ ID NO:9、19、64および68;
(xix)SEQ ID NO:9、19、67および71;ならびに、
(xx)SEQ ID NO:10、20、64および68
からなる群から選択された4つの可変鎖ドメインを含む、本発明1029-1039のいずれかの方法。
[本発明1041]
リンカーL1、L2およびL3は約12以下のアミノ酸残基からなる、本発明1029-1040のいずれかの方法。
[本発明1042]
リンカーL1、L2およびL3はそれぞれ、GGSGGS(SEQ ID NO:95)、GGSG(SEQ ID NO:96)、あるいはGGSGG(SEQ ID NO:97)から独立して選択される、本発明1029-1041のいずれかの方法。
[本発明1043]
タンデム二重特異性抗体は、SEQ ID NO:98-121からなる群から選択された配列を含む、本発明1029-1042のいずれかの方法。
[本発明1044]
タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体01(SEQ ID NO:98)、02(SEQ ID NO:99)、03(SEQ ID NO:100)、04(SEQ ID NO:101)、05(SEQ ID NO:102)、06(SEQ ID NO:103)、07(SEQ ID NO:104)、08(SEQ ID NO:105)、09(SEQ ID NO:106)、10(SEQ ID NO:107)、11(SEQ ID NO:108)、12(SEQ ID NO:109)、13(SEQ ID NO:110)、14(SEQ ID NO:111)、15(SEQ ID NO:112)、16(SEQ ID NO:113)、17(SEQ ID NO:114)、18(SEQ ID NO:115)、19(SEQ ID NO:116)、20(SEQ ID NO:117)、21(SEQ ID NO:118)、22(SEQ ID NO:119)、23(SEQ ID NO:120)、あるいは24(SEQ ID NO:121)である、本発明1029-1043のいずれかの方法。
[本発明1045]
タンデム二重特異性抗体はSEQ ID NO:123-146からなる群から選択された配列を含む、本発明1029-1042のいずれかの方法。
[本発明1046]
タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体01(SEQ ID NO:123)、02(SEQ ID NO:124)、03(SEQ ID NO:125)、04(SEQ ID NO:126)、05(SEQ ID NO:127)、06(SEQ ID NO:128)、07(SEQ ID NO:129)、08(SEQ ID NO:130)、09(SEQ ID NO:131)、10(SEQ ID NO:132)、11(SEQ ID NO:133)、12(SEQ ID NO:134)、13(SEQ ID NO:135)、14(SEQ ID NO:136)、15(SEQ ID NO:137)、16(SEQ ID NO:138)、17(SEQ ID NO:139)、18(SEQ ID NO:140)、19(SEQ ID NO:141)、20(SEQ ID NO:142)、21(SEQ ID NO:143)、22(SEQ ID NO:144)、23(SEQ ID NO:145)あるいは24(SEQ ID NO:146)である、本発明1029-1042および1045のいずれかの方法。
[本発明1047]
該方法は、シタラビン、アザシチジン、デシタビン、アントラサイクリン、フルダラビン、クロファラビン、クラドリビン、ネララビン、メトトレキサート、ボルテゾミブ、カルフィルゾミブ、メルファラン、イブルチニブ、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、アプレミラスト、エピポドフィロトキシン、アントラセンジオン、抗CD20薬剤、あるいはこれらの組み合わせを投与する工程をさらに含む、本発明1001-1046のいずれかの方法。
[本発明1048]
AMLは、再発性遺伝的異常を備えたAML、骨髄形成異常関連の変化を備えたAML、治療関連の骨髄性の新生物、骨髄性肉腫、ダウン症候群と関連する骨髄増殖、芽細胞の形質細胞様樹状細胞新生物、あるいはさもなければ分類されないAMLである、本発明1001-1047のいずれかの方法。
[本発明1049]
MLは、AML-M0、AML-M1、AML-M2、AML-M3、AML-M4、AML-M5、AML-M6、あるいはAML-M7である、本発明1001-1048のいずれかの方法。
[本発明1050]
骨髄破壊性の移植前処置を受けた後に、同種異型の造血幹細胞移植を受けた患者において、タンパク質を投与する工程は、タンパク質による治療に対する全体的な反応率の改善をもたらす、本発明1001-1049のいずれかの方法。
[本発明1051]
非骨髄破壊性の移植前処置を受けた後に、同種異型の造血幹細胞移植を受けた患者において、タンパク質を投与する工程は、タンパク質による治療に対する全体的な反応率の改善をもたらす、本発明1001-1049のいずれかの方法。
[本発明1052]
ヒトCD33およびヒトCD3に特異的な二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体であって、二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体は、SEQ ID NO:123-146から選択された配列を含む、二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1053]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体は、タンデム二重特異性抗体01(SEQ ID NO:123)、02(SEQ ID NO:124)、03(SEQ ID NO:125)、04(SEQ ID NO:126)、05(SEQ ID NO:127)、06(SEQ ID NO:128)、07(SEQ ID NO:129)、08(SEQ ID NO:130)、09(SEQ ID NO:131)、10(SEQ ID NO:132)、11(SEQ ID NO:133)、12(SEQ ID NO:134)、13(SEQ ID NO:135)、14(SEQ ID NO:136)、15(SEQ ID NO:137)、16(SEQ ID NO:138)、17(SEQ ID NO:139)、18(SEQ ID NO:140)、19(SEQ ID NO:141)、20(SEQ ID NO:142)、21(SEQ ID NO:143)、22(SEQ ID NO:144)、23(SEQ ID NO:145)あるいは24(SEQ ID NO:146)である、本発明1052の二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1054]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体は、HL-60、KG-1およびU-937から選択されたCD33 腫瘍細胞上のCD33との50nM以下の結合K を有する、本発明1053の二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1055]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体は、CD33 HL-60腫瘍細胞上のCD33に15nM以下の結合K を有する、本発明1054の二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1056]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体は、ヒトCD33の 62 DQEVQEETQ 70 (SEQ ID NO:94)(SEQ ID NO:93のアミノ酸残基62-70)内にあるヒトCD33のエピトープに特異的に結合する、本発明1055の二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1057]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体01(SEQ ID NO:123)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1058]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体02(SEQ ID NO:124)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1059]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体03(SEQ ID NO:125)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1060]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体04(SEQ ID NO:126)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1061]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体05(SEQ ID NO:127)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1062]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体06(SEQ ID NO:128)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1063]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体07(SEQ ID NO:129)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1064]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体08(SEQ ID NO:130)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1065]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体09(SEQ ID NO:131)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1066]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体10(SEQ ID NO:132)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1067]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体11(SEQ ID NO:133)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1068]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体12(SEQ ID NO:134)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1069]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体13(SEQ ID NO:135)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1070]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体14(SEQ ID NO:136)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1071]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体15(SEQ ID NO:137)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1072]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体16(SEQ ID NO:138)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1073]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体17(SEQ ID NO:139)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1074]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体18(SEQ ID NO:140)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1075]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体19(SEQ ID NO:141)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1076]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体20(SEQ ID NO:142)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1077]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体21(SEQ ID NO:143)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1078]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体22(SEQ ID NO:144)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1079]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体23(SEQ ID NO:145)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
[本発明1080]
二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体はタンデム二重特異性抗体24(SEQ ID NO:146)である、本発明1052-1056のいずれかの二重特異性の抗原結合タンデム二重特異性抗体。
<参照による組み込み>
本明細書で言及される公開物、特許、および特許出願はすべて、あたかも個々の公開物、特許あるいは特許出願がそれぞれ参照により組み込まれるように具体的かつ個々に指示されるかのような同じ程度、参照により本明細書に組込まれる。
【図面の簡単な説明】
【0053】
本発明の新規な特徴は、添付の請求項に詳細に記載される。本発明の特徴および利点のより良い理解は、本発明の原理が用いられる例示的実施形態を記載する以下の詳細な説明と、以下の添付図面とを参照することによって得られるであろう。
【0054】
図1】CD3/CD33タンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))の遺伝子構成およびドメイン順序の概略図である。タンデムダイアボディは、単鎖ペプチドリンカーL1、L2およびL3によって接続された4つの可変ドメインから構成された単一のポリペプチドとして発現される。発現後、2つのモノマーポリペプチドは、ヘッドトゥーテールで(head-to-tail)非共有的に会合して、機能的なホモ二量体のタンデムダイアボディ分子を形成する。L1、L2、L3:リンカー;V:重鎖可変ドメイン;V:軽鎖可変ドメイン。
図2】CD3結合タンデムダイアボディとその作用機序。タンデムダイアボディは、CD3への結合を介して細胞毒性T細胞に結合することができる四価の二重特異性のタンパク質である。タンデムダイアボディは、4つの結合ドメインのうちの2つでCD33腫瘍細胞と結合し、他の2つの結合ドメインでCD3と結合する。このT細胞/標的細胞結合(架橋)事象はT細胞の活性化を促進し、ADCCによる腫瘍細胞のその後の破壊を促進する。
図3】CD33/CD3タンデムダイアボディのドメイン順の変異体。タンデムダイアボディをコードする遺伝子配列内の可変重鎖(VH)と可変軽鎖(VL)のドメイン順序の変動は、分子の内部または外部に位置するCD33およびCD3特異性を備えた抗体の産生を可能にする。ドメインの特異性、ならびに、シグナル配列(ss)、リンカー(L1、L2、L3)、アフィニティタグ(His)、そして5’-末端および3’-末端の位置が示されている。
図4】正に濃縮された健康なドナーT細胞vs負に選択された健康なドナーT細胞の比較。KG-1a細胞を、示されるように1:1または3:1のE:T細胞比で、選択された10のタンデムダイアボディのうちの1つの10pM(およそ1ng/mL)および25pM(およそ2.5ng/mL)と、負に選択された健康なドナーT細胞または正に選択された健康なドナーT細胞のいずれかと共にインキュベートした。48時間後、細胞数を決定し、細胞毒性をDAPI染色で評価した。結果は、複製のウェルで行われた3つの独立した実験からの、死細胞(上部パネル)の割合および特定の細胞毒性(下部パネル)の割合の平均±SEMとして示される。
図5】分析戦略。1つの健康なドナーT細胞アリコートと1つの代表的なAML細胞株(HL-60)と原発性AML検体(AMP002)からの分散とヒストグラムのプロットであり、それぞれはタンデムダイアボディにより誘発された細胞毒性を決定するために追求された戦略を例証する。FSC、前方散乱;SSC、側面散乱。
図6】CD33AML細胞株における細胞毒性スクリーニングアッセイ。親HL-60(A、B)およびKG-1a(C、D)細胞を、示されるように、1:1(A、C)または5:1(B、D)のいずれかのE:T細胞比で、22のCD33/CD3タンデムダイアボディ分子のうちの1つの10pM(およそ1ng/mL)および25pM(およそ2.5ng/mL)または非結合対照タンデムダイアボディ(00)と健康なドナーT細胞と共にインキュベートした。48時間後、細胞数を決定し、細胞毒性をDAPI染色で評価して、薬物に特異的な細胞毒性を定量化した。結果は、複製のウェルで行われた3つの独立した実験からのDAPI細胞の割合の平均±SEMとして示される。細胞毒性が特定の細胞毒性の割合として示された時、質的に同様の結果が得られた。
図7】研究用の原発性AML検体の選択。原発性ヒトAML検体の合計から冷凍されたアリコートを得て、分析に用いた。解凍後のAML芽球の割合はCD45/側方散乱特性に基づいたフローサイトメトリーによって決定された。検体の生存率を、解凍時と48時間後に、生細胞/死細胞マーカーとしてDAPIを使用するフローサイトメトリーにより、サイトカインを含有する液体培養(タンデムダイアボディ分子または健康なドナーT細胞の添加なく)で測定した。解凍後と48時間の生存率の結果が全ての検体について描かれており、これは>58%のAML芽球であった。四角形:サイトカインを含有する液体培養での解凍時>50%、48時間後>50%の生存率を示した、最終分析に含まれる原発性AML検体。
図8】原発性AML検体におけるタンデムダイアボディにより誘発された細胞毒性。原発性AML検体を、健康なドナーT細胞を添加せずに(A)、または示されるように1:3(B)または1:1(C)のいずれかのE:T細胞比で健康なドナーT細胞と共に、9つのタンデムダイアボディ分子のうちの1つの2.5pM(およそ250pg/mL)、10pM(およそ1ng/mL)、および25pM(およそ2.5ng/mL)と共にインキュベートした。48時間後、細胞数を決定し、細胞毒性をDAPI染色で評価して、薬物に特異的な細胞毒性を定量化した。結果は、複製のウェルで行われた実験からの特定の細胞毒性の割合の平均±SEMとして示される。
図9】ヒトCD33(aa18~259)(SEQ ID NO:93)の細胞外ドメインのアミノ酸配列。
図10-1】アミノ酸配列(A)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ1の完全な配列(SEQ ID NO:98);(B)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ2の完全な配列(SEQ ID NO:99)(C)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ3の完全な配列(SEQ ID NO:100);(D)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ4の完全な配列(SEQ ID NO:101);(E)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ5の完全な配列(SEQ ID NO:102);(F)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ6の完全な配列(SEQ ID NO:103);(G)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ7の完全な配列(SEQ ID NO:104);(H)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ8の完全な配列(SEQ ID NO:105);(I)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ9の完全な配列(SEQ ID NO:106);(J)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ10の完全な配列(SEQ ID NO:107);(K)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ11の完全な配列(SEQ ID NO:108);(L)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ12の完全な配列(SEQ ID NO:109);(M)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ13の完全な配列(SEQ ID NO:110);(N)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ14の完全な配列(SEQ ID NO:111);(O)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ15の完全な配列(SEQ ID NO:112);(P)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ16の完全な配列(SEQ ID NO:113);(Q)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ17の完全な配列(SEQ ID NO:114);(R)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ18の完全な配列(SEQ ID NO:115);(S)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ19の完全な配列(SEQ ID NO:116);(T)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ20の完全な配列(SEQ ID NO:117);(U)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ21の完全な配列(SEQ ID NO:118);(V)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ22の完全な配列(SEQ ID NO:119);(W)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ23の完全な配列(SEQ ID NO:120);および、(X)C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを備えたタンデムダイアボディ24の完全な配列(SEQ ID NO:121)。強調された配列はリンカーL1、L2およびL3を表す。
図10-2】図10-1の説明を参照のこと。
図10-3】図10-1の説明を参照のこと。
図10-4】図10-1の説明を参照のこと。
図10-5】図10-1の説明を参照のこと。
図10-6】図10-1の説明を参照のこと。
図10-7】図10-1の説明を参照のこと。
図10-8】図10-1の説明を参照のこと。
図11-1】アミノ酸配列(A)タンデムダイアボディ1の完全な配列(SEQ ID NO:123);(B)タンデムダイアボディ2の完全な配列(SEQ ID NO:124);(C)タンデムダイアボディ3の完全な配列(SEQ ID NO:125);(D)タンデムダイアボディ4の完全な配列(SEQ ID NO:126);(E)タンデムダイアボディ5の完全な配列(SEQ ID NO:127);(F)タンデムダイアボディ6の完全な配列(SEQ ID NO:128);(G)タンデムダイアボディ7の完全な配列(SEQ ID NO:129);(H)タンデムダイアボディ8の完全な配列(SEQ ID NO:130);(I)タンデムダイアボディ9の完全な配列(SEQ ID NO:131);(J)タンデムダイアボディ10の完全な配列(SEQ ID NO:132);(K)タンデムダイアボディ11の完全な配列(SEQ ID NO:133);(L)タンデムダイアボディ12の完全な配列(SEQ ID NO:134);(M)タンデムダイアボディ13の完全な配列(SEQ ID NO:135);(N)タンデムダイアボディ14の完全な配列(SEQ ID NO:136);(O)タンデムダイアボディ15の完全な配列(SEQ ID NO:137);(P)タンデムダイアボディ16の完全な配列(SEQ ID NO:138);(Q)タンデムダイアボディ17の完全な配列(SEQ ID NO:139);(R)タンデムダイアボディ18の完全な配列(SEQ ID NO:140);(S)タンデムダイアボディ19の完全な配列(SEQ ID NO:141);(T)タンデムダイアボディ20の完全な配列(SEQ ID NO:142);(U)タンデムダイアボディ21の完全な配列(SEQ ID NO:143);(V)タンデムダイアボディ22の完全な配列(SEQ ID NO:144);(W)タンデムダイアボディ23の完全な配列(SEQ ID NO:145)。および、(X)タンデムダイアボディ24の完全な配列(SEQ ID NO:146)。強調された配列はリンカーL1、L2およびL3を表す。
図11-2】図11-1の説明を参照のこと。
図11-3】図11-1の説明を参照のこと。
図11-4】図11-1の説明を参照のこと。
図11-5】図11-1の説明を参照のこと。
図11-6】図11-1の説明を参照のこと。
図11-7】図11-1の説明を参照のこと。
図11-8】図11-1の説明を参照のこと。
図12】NOD/scidマウス中のHL-60細胞の成長に対するタンデムダイアボディ16と12の効果。免疫不全のNOD/scidマウスの8つの実験群は、0日目に4x10 HL-60細胞の懸濁液の皮下注射によって異種移植された。注入の前に、HL-60細胞は健康なドナーからの3x10精製T細胞と混合された。腫瘍細胞とT細胞を移植された実験群の動物は全て、指示されたような3つの異なる投与量レベル(0.1μg、1μg、および10μg)で、ビヒクル(対照)、またはタンデムダイアボディ16もしくは12を、0、1、2、3、および4日目に静脈内ボーラスで受けた。エフェクター細胞なしのビヒクル処置群を、追加の陰性対照とした。
図13】AML異種移植片モデル中のタンデムダイアボディ16の抗腫瘍活性。NOD/scidマウスは致死量以下に照射され(2Gy)、4x10 HL-60細胞を皮下に接種した。9日目に、動物は抗アシアロGM1ウサギAbの1回のボーラス注入を受けた。10日目に腫瘍が50~150mm(平均73±11mm)の体積に達したら、10匹の動物を3つの処置群に割り当てた。第2群と第3群(n=8)に、1.5x10拡張および活性化ヒトT細胞を腹腔内に注入した。13日目から21日目まで(qdxd9)、動物は、外側の尾静脈(第1の群と第2の群)にタンデムダイアボディ16(第3群)またはビヒクルのいずれかを受けた。
図14】5μg(0.25mg/kg)または50μg(2.5mg/kg)のCD33/CD3のタンデムダイアボディ12および16での処置後38日目の、NSGマウスの骨髄(BM)および脾臓中のヒトAML芽球の相対量(A)および絶対数(B)。
図15】CD33/CD3タンデムダイアボディ16を媒介とした標的細胞溶解の動力学。1x10のカルセイン標識したHL-60標的細胞は、30分、1時間、2時間、3時間、4時間、または5時間の間、タンデムダイアボディ16の段階希釈の存在下で、または抗体のない状態(w/o)で、E:T比25:1でエフェクター細胞としての初代ヒトT細胞と共にインキュベートされた。各時間点では、溶解された標的細胞から放出された蛍光性のカルセインは、特定の溶解の計算に用いられた。3つの複製の平均とSDがプロットされる。
図16】CD33/CD3タンデムダイアボディ16に関するEC50と特異的溶解値の動力学。EC50値(黒い実線円)とタンデムダイアボディ16を媒介とした標的細胞溶解(白い四角)は、非線形回帰/S字形の用量反応によって指示されたインキュベーション時間でカルセイン放出細胞毒性アッセイにおいて測定され、プロットされた。
図17】新規に診断されたAML患者、再発したAML患者、および難治性AML患者のサンプル中の細胞毒性活性。
【発明を実施するための形態】
【0055】
発明の詳細な説明
第1の態様によれば、少なくともCD33、好ましくはヒトCD33について特異性を有する結合タンパク質が本明細書で記載される。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は、ヒトとカニクイザルのCD33について特異性を有し、つまり、交差反応性である。いくつかの実施形態において、これらの交差反応性の結合タンパク質は、同様の親和性でヒトとカニクイザルのCD33に結合する。
【0056】
CD33は、例えば、急性骨髄性白血病(AML)の芽球などの骨髄性細胞上で発現される。ヒトCD33などのCD33に特異的な抗体ドメインの単離のために、抗体ライブラリがスクリーニングされることがある。例えば、IgMファージディスプレイライブラリは、例えば、ヒトCD33(図9、SEQ ID NO:93)の細胞外ドメインのアミノ酸1~243を含む、組換えCD33-Fc融合タンパク質を使用することにより、スクリーニング可能である。
【0057】
いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は、軽鎖可変ドメインと重鎖可変ドメインを含む、少なくとも1つのCD33結合部位を有する。軽鎖可変ドメインは、軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3を含み、重鎖可変ドメインは重鎖CDR1、CDR2およびCDR3を含む。いくつかの実施形態において、これらの軽鎖CDR(CDR1、CDR2およびCDR3)は、表1に示されるヒトCDR配列から選択される(SEQ ID NO:21~41)。ある例では、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:21~27から選択される。ある例では、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:28~34から選択される。ある例では、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:35~41から選択される。
【0058】
いくつかの実施形態において、これらの重鎖CDR(重鎖CDR1、CDR2およびCDR3)は、表2に示されるヒトCDR配列から選択される(SEQ ID NO:42~63)。ある例では、重鎖CDR1はSEQ ID NO:42~48から選択される。ある例では、重鎖CDR2はSEQ ID NO:49~55から選択される。ある例では、重鎖CDR3はSEQ ID NO:56~63から選択される。
【0059】
いくつかの実施形態において、軽鎖と重鎖のCDRは、それぞれの可変ドメインの周囲のフレームワーク配列を伴わずに選択され、これらは、他の免疫グロブリンからのフレームワーク配列またはコンセンサスフレームワーク領域を含み、任意で、他の適切なフレームワーク配列によりさらに変異させられ、および/または該適切なフレームワーク配列と取り替えられる。したがって、いくつかの実施形態では、軽鎖可変ドメインを含むCD33結合タンパク質が本明細書で提供され、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:21であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:28であり、および、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:35である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:22であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:29であり、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:36である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:23であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:30であり、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:37である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:24であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:31であり、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:38である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:25であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:32であり、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:39である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:26であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:33であり、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:40である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は軽鎖可変ドメインを含み、軽鎖CDR1はSEQ ID NO:27であり、軽鎖CDR2はSEQ ID NO:34であり、軽鎖CDR3はSEQ ID NO:41である。
【0060】
さらにいくつかの実施形態では、重鎖可変ドメインを含むCD33結合タンパク質が本明細書で提供され、重鎖CDR1はSEQ ID NO:42であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:49であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:56である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:43であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:50であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:57である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:43であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:50であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:58である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:43であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:50であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:59である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:43であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:50であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:60である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:44であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:51であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:61である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:45であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:52であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:62である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:46であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:53であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:63である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:47であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:54であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:63である。いくつかの実施形態において、CD33結合タンパク質は重鎖可変ドメインを含み、重鎖CDR1はSEQ ID NO:48であり、重鎖CDR2はSEQ ID NO:55であり、重鎖CDR3はSEQ ID NO:63である。
【0061】
さらなる実施形態において、CD33結合タンパク質は、表3に示されるアミノ酸配列SEQ ID NO:1~10から選択された可変軽鎖ドメインを含む。さらなる実施形態では、CD33結合タンパク質は、表4に示されるアミノ酸配列SEQ ID NO:11~20から選択された可変重鎖ドメインを含む。またさらなる実施形態では、CD33結合タンパク質は、表3に示されるアミノ酸配列SEQ ID NO:1~10から選択された可変軽鎖ドメインと、表4に示されるアミノ酸配列SEQ ID NO:11~20から選択された可変重鎖ドメインとを含む。
【0062】
用語「結合タンパク質」は、抗原結合特性、つまり、抗原結合部位を含む免疫グロブリンポリペプチドまたはそのフラグメントを備えた免疫グロブリン誘導体を指す。結合タンパク質は、抗体またはそのフラグメントの可変ドメインを含む。各抗原結合ドメインは、抗体(つまり、免疫グロブリン)可変重鎖ドメイン(VH)と、同じエピトープへ結合する抗体可変軽鎖ドメイン(VL)とによって形成されるが、可変重鎖ドメイン(VH)は3つの重鎖相補性決定領域(CDR):CDR1、CDR2およびCDR3を含み、可変軽鎖ドメイン(VL)は3つの軽鎖相補性決定領域(CDR):CDR1、CDR2およびCDR3を含む。いくつかの例では、本明細書に記載されるいくつかの実施形態に係る結合タンパク質は、免疫グロブリン定常ドメインが欠けている。いくつかの例では、抗原結合部位を形成する可変軽鎖ドメインおよび可変重鎖ドメインは、例えば、ペプチドリンカーによって、互いに共有結合し、または他の例では、可変軽鎖ドメインおよび可変重鎖ドメインは、互いに非共有的に会合して、抗原結合部位を形成する。用語「結合タンパク質」は、例えば、Fab、Fab’、F(ab’)、Fvフラグメント、単鎖Fv、タンデム単鎖Fv(scFv)、二重特異性T細胞エンゲージャー(BiTE(登録商標))、二重親和性再標的化抗体(DART(商標))、ダイアボディ、およびタンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))を含む、抗体フラグメントまたは抗体誘導体も指す。さらに、ある例では、結合タンパク質は多価であり、つまり、CD33のための2つ、3つ、またはそれ以上の結合部位を有する。
【0063】
(表1)抗CD33可変軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列
【0064】
(表2)抗CD33可変重鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列
【0065】
(表3)全ての抗CD33可変軽鎖ドメインのアミノ酸配列(可変軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は、太字かつ下線が引かれている)
【0066】
(表4)抗CD33可変重鎖ドメインのアミノ酸配列(可変重鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は、太字かつ下線が引かれている)
【0067】
いくつかの実施形態では、CD33に特異性を与える結合タンパク質は、表3および表4に示される、ヒトCD33結合部位を形成する可変重鎖ドメインと可変軽鎖ドメインの以下の組み合わせの1つから選択される。限定しない例は、(i)SEQ ID NO:1およびSEQ ID NO:11、(ii)SEQ ID NO:2およびSEQ ID NO:12、(iii)SEQ ID NO:3およびSEQ ID NO:13、(iv)SEQ ID NO:4およびSEQ ID NO:14、(v)SEQ ID NO:5およびSEQ ID NO:15、(vi)SEQ ID NO:6およびSEQ ID NO:16、(vii)SEQ ID NO:7およびSEQ ID NO:17、(viii)SEQ ID NO:8およびSEQ ID NO:18、(ix)SEQ ID NO:9およびSEQ ID NO:19、ならびに(x)SEQ ID NO:10およびSEQ ID NO:20を含む。
【0068】
本明細書にはまた、CD33に対する特異性を有するだけでなく、少なくとも1つのさらに機能的なドメインも有する、結合タンパク質が記載される。さらなる実施形態では、少なくとも1つのさらに機能的なドメインは、エフェクタードメインである。「エフェクタードメイン」は、エフェクター細胞に特異的な抗体の結合部位を含み、これは、細胞毒性、食作用、抗原提示、サイトカイン放出を刺激するかまたは引き起こすことができる。例えば、そのようなエフェクター細胞は、限定されないが、T細胞である。特に、エフェクタードメインは、T細胞上の抗原、例えば、ヒトCD3などに対する抗原結合部位を形成する、少なくとも1つの抗体可変重鎖ドメインおよび少なくとも1つの可変軽鎖ドメインを含む。
【0069】
したがって、いくつかの実施形態では、CD33結合タンパク質は多機能性である。本明細書に使用される多機能性という用語は、結合タンパク質が2つ以上の異なる生物学的機能を示すことを意味する。例えば、異なる生物学的機能は、異なる抗原に対する異なる特異性である。特定の例では、多機能性CD33結合タンパク質は、多特異性である、つまり、CD33と1つ以上のさらなる抗原とに対する結合特異性を有している。特定の例では、結合タンパク質は、CD33およびCD3に対する特異性を有する二重特異性である。そのような二重特異性結合タンパク質は、例えば、クラスIgA、IgD、IgE、IgG、またはIgMの二重特異性モノクローナル抗体、ダイアボディ、単鎖ダイアボディ(scDb)、タンデム単鎖Fv(scFv)2、例えばBi特異的T細胞エンゲージャー(BiTE(登録商標))、二重親和性再標的化抗体(DART(商標))、タンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))、およびフレキシボディ(flexibody)を含む。
【0070】
特定の実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、ヒトCD3、およびいくつかの例では、カニクイザルCD3に対する特異性を有する。そのような結合部位の例は、表5に示される配列(SEQ ID NO:64~67)からのVHドメインCDR1、CDR2およびCDR3、および表6に示される配列(SEQ ID NO:68~71)からのVLドメインCDR1、CDR2およびCDR3を含む、ポリペプチドである。特定の例では、CD3結合部位は、SEQ ID NO:64の可変重鎖ドメインとSEQ ID NO:68の可変軽鎖ドメインとの組み合わせである。特定の例では、CD3結合部位は、SEQ ID NO:65の可変重鎖ドメインとSEQ ID NO:69の可変軽鎖ドメインとの組み合わせである。特定の例では、CD3結合部位は、SEQ ID NO:66の可変重鎖ドメインとSEQ ID NO:70の可変軽鎖ドメインとの組み合わせである。特定の例では、CD3結合部位は、SEQ ID NO:67の可変重鎖ドメインとSEQ ID NO:71の可変軽鎖ドメインとの組み合わせである。
【0071】
(表5)抗CD3可変重鎖ドメインのアミノ酸配列(可変重鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は、太字かつ下線が引かれている)
【0072】
(表6)抗CD3可変軽鎖ドメインのアミノ酸配列(可変軽鎖CDR1、CDR2およびCDR3のアミノ酸配列は、太字かつ下線が引かれている)
【0073】
さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、STYAMN(SEQ ID NO:72)であるCDR1配列を含む可変重鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、RIRSKYNNYATYYADSVKD(SEQ ID NO:73)であるCDR2配列を含む可変重鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、HGNFGNSYVSWFAY(SEQ ID NO:74)であるCDR3配列を含む可変重鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、HGNFGNSYVSYFAY(SEQ ID NO:75)であるCDR3配列を含む可変重鎖ドメインを有する。またさらなる実施形態では、CD3結合部位は、それぞれSEQ ID NO:72~74であるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む可変重鎖ドメインを有する。またさらなる実施形態では、CD3結合部位は、それぞれSEQ ID NO:72、73および75であるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む可変重鎖ドメインを有する。
【0074】
さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、NTYAMN(SEQ ID NO:76)、NTYAMH(SEQ ID NO:77)およびNKYAMN(SEQ ID NO:78)からなる群から選択されるCDR1配列を含む、可変重鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、RIRNKYNNYATYYADSVKD(SEQ ID NO:79)、RIRNKYNNYATEYADSVKD(SEQ ID NO:80)、RIRSKYNNYATEYAASVKD(SEQ ID NO:81)、RIRNKYNNYATEYAASVKD(SEQ ID NO:82)、RIRSKYNNYATYYADSVKG(SEQ ID NO:83)およびRIRSKYNNYATEYADSVKS(SEQ ID NO:84)からなる群から選択されるCDR2配列を含む、可変重鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、HGNFGDSYVSWFAY(SEQ ID NO:85)、HGNFGNTYVSWFAY(SEQ ID NO:86)、HGNFGCSYVSWFAY(SEQ ID NO:87)、HGNFGNSYISYWAY(SEQ ID NO:88)およびHGNFGNSYVSFFAY(SEQ ID NO:89)からなる群から選択されるCDR3配列を含む、可変重鎖ドメインを有する。
【0075】
またさらなる実施形態では、CD3結合部位は、それぞれSEQ ID NO:76、73および74、それぞれSEQ ID NO:76、79および74、それぞれSEQ ID NO:76、80および74、それぞれSEQ ID NO:76、81および74、それぞれSEQ ID NO:76、82および74、それぞれSEQ ID NO:76、83および74、それぞれSEQ ID NO:72、83および74、それぞれSEQ ID NO:72、83および85、それぞれSEQ ID NO:76、83および86、それぞれSEQ ID NO:77、83および74、それぞれSEQ ID NO:72、83および87、それぞれSEQ ID NO:78、73および88、またはそれぞれSEQ ID NO:78、84および89であるCDR1、CDR2およびCDR3配列を含む可変重鎖ドメインを有する。
【0076】
さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、RSSTGAVTTSNYAN(SEQ ID NO:90)であるCDR1配列を含む可変軽鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、GTNKRAP(SEQ ID NO:91)であるCDR2配列を含む可変軽鎖ドメインを有する。さらなる実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質のCD3結合部位は、ALWYSNL(SEQ ID NO:92)であるCDR3配列を含む可変軽鎖ドメインを有する。またさらなる実施形態では、CD3結合部位は、それぞれSEQ ID NO:90~92であるCDR1、CD2およびCD3配列を含む可変軽鎖ドメインを有する。
【0077】
特定の例では、CD3結合部位は、CD3に対する高親和性を有している。代替的に、他の例では、重鎖ドメインおよび軽鎖ドメイン、または任意で、可変軽鎖ドメインおよび可変重鎖ドメインからのCDR1、CDR2、CDR3は、例えば、UCHT1、ムロモナブ-CD3(OKT3)、オテリキシズマブ(TRX4)、テプリズマブ(MGA031)、ビジリズマブ(Nuvion)などの、他のCD3抗体に由来する。
【0078】
別の態様において、本明細書には、ヒト化型または完全ヒト型、つまり、ヒト起源の、CD33結合タンパク質ならびに二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質が記載される。
【0079】
いくつかの実施形態では、二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質は、CD33およびCD3に対する可変軽鎖ドメインおよび可変重鎖ドメインによってCD33およびCD3特異性を提供する以下の組み合わせの1つを有する:限定されないが、(i)SEQ ID NO:2、12、65および69、(ii)SEQ ID NO:3、13、65および69、(iii)SEQ ID NO:4、14、65および69、(iv)SEQ ID NO:5、15、65および69、(v)SEQ ID NO:1、11、64および68、(vi)SEQ ID NO:2、12、64および68、(vii)SEQ ID NO:2、12、66および70、(viii)SEQ ID NO:4、14、66および70、(ix)SEQ ID NO:5、15、66および70、(x)SEQ ID NO:3、13、64および68、(xi)SEQ ID NO:3、13、67および71、(xii)SEQ ID NO:4、14、64および68、(xiii)SEQ ID NO:5、15、64および68、(xiv)SEQ ID NO:7、17、64および68、(xv)SEQ ID NO:6、16、64および68、(xvi)SEQ ID NO:6、16、67および71、(xvii)SEQ ID NO:8、18、64および68、(xviii)SEQ ID NO:9、19、64および68;(xix)SEQ ID NO:9、19、67および71、ならびに(xx)SEQ ID NO:10、20、64および68。
【0080】
CDR配列ならびに重鎖ドメインおよび軽鎖ドメインの保存変異体
代替的な実施形態では、重鎖ドメインおよび軽鎖ドメインは、本明細書に記載されるCDR配列の免疫学的に活性な同族体または変異体を組み込む。したがって、いくつかの実施形態では、CD33またはCD3に結合する重鎖ドメインまたは軽鎖ドメインにおけるCDR配列は、SEQ ID NO:21~63または72~92に描写されたアミノ酸配列と同一ではないが、それに類似している。特定の例では、CDR変異体配列は、SEQ ID NO:21~63または72~90の配列と比較して、99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、90%、89%、88%、87%、86%、85%、84%、83%、82%、81%、または80%の配列同一性を有し、かつ免疫学的に活性である。
【0081】
さらなる例では、CDR変異体配列は、1、2、3、4、または5個の保存されたアミノ酸置換を組み込む。保存的置換は、所与のアミノ酸を類似した特性を持つ別のアミノ酸で置換するアミノ酸置換を含み、脂肪族アミノ酸の中のアラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシンの交換;ヒドロキシル残基セリンおよびトレオニンの交換、酸性残基アスパラギン酸塩およびグルタミン酸塩の交換、アミド残基アスパラギンおよびグルタミンの間の置換、塩基性残基リジンおよびアルギニンの交換、ならびに芳香族残基の中のフェニルアラニンおよびチロシンの交換をさらに含む。
【0082】
またさらなる例では、CDR変異体配列は、安定性、プロテアーゼに対する耐性および/またはCD33またはCD3に対する結合親和性の増加などといった、CDRの特性を増強する置換を組み込む。
【0083】
他の例では、CDR変異体配列は、重要でない残基または重要でない領域における残基を変更するために修飾される。重要でないアミノ酸は、親和性成熟、CDRウォーキング、部位特異的変異誘発、結晶化、核磁気共鳴、光親和性標識、またはアラニン-系統的変異導入法などの、既知の方法によって特定することができる。
【0084】
さらなる代替的な実施形態では、CD33およびCD3結合タンパク質は、本明細書に提供される重鎖ドメイン配列および軽鎖ドメイン配列の免疫学的に活性な同族体または変異体である、重鎖ドメインおよび軽鎖ドメインを含む。したがって、いくつかの実施形態では、CD33およびCD3結合タンパク質は、SEQ ID NO:1~20または64~71に描写されたアミノ酸配列と同一ではないが、それに類似している重鎖ドメイン配列または軽鎖ドメイン配列を含む。特定の例では、変異体の重鎖ドメイン配列または軽鎖ドメイン配列は、SEQ ID NO:1~20または64~71の配列と比較して、99%、98%、97%、96%、95%、94%、93%、92%、91%、90%、89%、88%、87%、86%、85%、84%、83%、82%、81%、または80%の配列同一性を有し、かつ免疫学的に活性である。
【0085】
さらなる例では、変異体の重鎖ドメイン配列または軽鎖ドメイン配列は、1、2、3、4、または5個の保存されたアミノ酸置換を組み込む。保存的置換は、所与のアミノ酸を類似した特性を持つ別のアミノ酸で置換するアミノ酸置換を含み、脂肪族アミノ酸の中のアラニン、バリン、ロイシン、およびイソロイシンの交換;ヒドロキシル残基セリンおよびトレオニンの交換、酸性残基アスパラギン酸塩およびグルタミン酸塩の交換、アミド残基アスパラギンおよびグルタミンの間の置換、塩基性残基リジンおよびアルギニンの交換、ならびに芳香族残基の中のフェニルアラニンおよびチロシンの交換をさらに含む。
【0086】
またさらなる例では、変異体の重鎖ドメイン配列または軽鎖ドメイン配列は、安定性、プロテアーゼに対する耐性および/またはCD33またはCD3に対する結合親和性の増加などといった、CDRの特性を増強する置換を組み込む。
【0087】
他の例では、変異体の重鎖ドメイン配列または軽鎖ドメイン配列は、重要でない残基または重要でない領域における残基を変更するために修飾される。重要でないアミノ酸は、親和性成熟、CDRウォーキング、部位特異的変異誘発、結晶化、核磁気共鳴、光親和性標識、またはアラニンスキャニング変異導入法などの、既知の方法によって特定することができる。
【0088】
CD33およびCD3二重特異性タンデムダイアボディ
別の態様では、CD33結合タンパク質または二重特異性CD33およびCD3結合タンパク質は、二量体である、つまり、CD33およびCD3に対する抗原結合部位を有する2つのポリペプチドを含む。
【0089】
また別の態様において本明細書には、タンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))のフォーマットでの二量体で二重特異性のCD33およびCD3結合タンパク質が提供される。そのようなタンデムダイアボディは、単一の遺伝子構築物において4つの抗体可変結合ドメイン(2つの重鎖可変ドメイン(VH)および2つの軽鎖可変ドメイン(VL))を結合することによって構築され(図1)、ホモ二量体化が可能になる。そのようなタンデムダイアボディでは、リンカー長さは、可変ドメインの分子内対合を防ぐような長さであり、それによって、分子は、それ自身の上に折り重なって単鎖ダイアボディを形成することはできず、別の鎖の相補ドメインと対になることを強いられる。これらドメインはまた、対応するVHおよびVLドメインが、この二量体化の間に対になるように配される。単一の遺伝子構築物からの発現後に、2つの同一のポリペプチド鎖が、ヘッドトゥーテールで折り畳まれ、およそ105kDaの機能的な非共有結合のホモ二量体を形成する(図1)。分子間共有結合の欠如にもかかわらず、このホモ二量体は、一旦形成されると高度に安定しており、無傷のままであり、単量体形態に戻らない。
【0090】
タンデムダイアボディは、従来のモノクローナル抗体および他のより小さな二重特異性分子よりも、利点を提供する特性を多く有している。タンデムダイアボディは、抗体可変ドメインのみを含有し、それ故、副作用またはFc部分に付随し得る非特異的相互作用を有さないことが企図される。例えば、Fcドメインに結合することができるFc受容体は、白血球(例えば、好塩基球、B細胞、好酸球、ナチュラルキラー細胞、好中球など)またはクッパー細胞などの、多数の細胞型上で見られる。タンデムダイアボディが、CD33およびCD3の各々に対する二価結合を可能にするために、そのアビディティはIgGのアビディティと同じである。タンデムダイアボディのサイズは、およそ105kDaであり、IgGのサイズより小さく、これは腫瘍浸潤の増強を可能にし得る。しかしながら、このサイズは、初回通過クリアランスの腎閾値を十分に上回っており、抗体結合ドメインまたは非抗体スキャフォールドに基づくより小さな二重特異性フォーマットと比較して、薬物動態学的利点を提供する。さらに、タンデムダイアボディは、この薬物動態学的特性およびアビディティ特性に基づいて、BiTEまたはDART分子などの他の二重特異性結合タンパク質よりも利点があり、結果としてより長い固有の半減期および急速な細胞毒性をもたらす。タンデムダイアボディは、宿主細胞、例えば、哺乳動物のCHO細胞中で良好に発現される。堅固な上流および下流の製造プロセスが、タンデムダイアボディのために利用可能であることが企図される。
【0091】
本明細書に記載されるCD33およびCD3の二重特異性タンデムダイアボディは、細胞傷害性T細胞を動員することによってCD33腫瘍細胞を特異的に標的とすることを可能にするように設計されている。これは、単独の抗原に向けられており細胞傷害性T細胞を直接動員することができない全長抗体と比較して、ADCC(抗体依存性細胞媒介性細胞傷害)を改善する。対照的にタンデムダイアボディは、これらの細胞上で特異的に発現されたCD3分子を結合することによって、非常に特異的な様式でCD33腫瘍細胞と細胞傷害性T細胞とを架橋することができ、それによって、そのような分子の細胞毒性の潜在力が著しく増加する。この機構は図2に概説される。タンデムダイアボディは、強力で、特異的かつ効率的なADCCを示す。T細胞が腫瘍増殖を制御する役割を果たすことができることが報告されている。例えば、大腸腫瘍における細胞傷害性T細胞およびNHL患者からのリンパ節の存在が、より優れた臨床転帰と相関することが示された。さらに、T細胞応答を誘発するように設計された治療の潜在性が、メラノーマワクチンの他、T細胞活性化の負の制御因子であるCTLA-4に対する抗体に関しても実証された。本明細書に記載されるタンデムダイアボディは、表面に発現されたCD3に結合することによって細胞傷害性T細胞に結合し、それによってT細胞受容体の一部が形成される。特定の腫瘍細胞の表面上で発現されたCD3およびCD33へのこのタンデムダイアボディの同時結合は、T細胞活性化を引き起こし、続いて腫瘍細胞の溶解を媒介する(図2)。
【0092】
それ故、さらなる態様は、多特異性のタンデムダイアボディである。いくつかの実施形態では、多特異性タンデムダイアボディは、2つ、3つまたはそれ以上の異なるエピトープに対する特異性を有し、ここで2つ以上のエピトープは、同じまたは異なる抗原標的であり得る。特定の実施形態では、多特異性のタンデムダイアボディは、二重特異性かつ四価である、つまり、4つの抗原結合部位を含む。そのような二重特異性タンデムダイアボディは、少なくとも1つの抗原結合部位で、ヒトCD3およびヒトCD33に結合し、特定の例では、タンデムダイアボディは、2つの抗原結合部位でヒトCD3に結合し、他の2つの抗原結合部位でヒトCD33に結合する、つまり、タンデムダイアボディは、各抗原に二価で結合する。
【0093】
いくつかの実施形態では、二重特異性の抗原結合タンデムダイアボディは、ヒトCD33およびヒトCD3に特異的であり、ここで、前記タンデムダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、各ポリペプチドは、逐次的に結合されている少なくとも4つの可変鎖ドメインを有し、ここで各ポリペプチドは以下を含む:
(i)ヒトCD33に特異的な可変重鎖(VH)ドメイン;
(ii)ヒトCD33に特異的な可変軽鎖(VL)ドメイン;
(iii)ヒトCD3に特異的なVHドメイン;および
(iv)ヒトCD3に特異的なVLドメイン。
【0094】
特定の実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディは、ヒトCD33の62DQEVQEETQ70(SEQ ID NO:94)(SEQ ID NO:93のアミノ酸残基62~70)の範囲内であるヒトCD33のエピトープに特異的に結合する。特定の例では、そのようなタンデムダイアボディは、第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含み、各ポリペプチドは、逐次的に結合されている少なくとも4つの可変鎖ドメインを有し、ここで、各ポリペプチドは以下を含む:
(i)ヒトCD33の62DQEVQEETQ70(SEQ ID NO:94)(SEQ ID NO:93のアミノ酸残基62~70)の範囲内であるヒトCD33のエピトープに特異的な可変重鎖ドメイン;
(ii)ヒトCD33の62DQEVQEETQ70(SEQ ID NO:94)(SEQ ID NO:93のアミノ酸残基62~70)の範囲内であるヒトCD33のエピトープに特異的な可変軽鎖ドメイン;
(iii)ヒトCD3に特異的な可変重鎖ドメイン;および
(iv)ヒトCD3に特異的な可変軽鎖ドメイン。
【0095】
他の実施形態において、本明細書には、CD33細胞上のCD33に対して10nM以下、5nM以下、1nM以下、または0.5nM以下のKの親和性を有している、CD33/CD3タンデムダイアボディが記載されている。CD33細胞は、例えば、HL-60またはKG-1などの腫瘍細胞から選択され得る。
【0096】
さらなる実施形態では、本明細書に記載されるCD33/CD3タンデムダイアボディは、10nM、5nM以下、または2nM以下のKで、CD3に結合し、特定の例では、CD3細胞、特にT細胞上でCD3のイプシロン鎖に結合する。
【0097】
いくつかの実施形態では、二重特異性タンデムダイアボディの各ポリペプチドは、4つの可変鎖ドメインの以下の組み合わせの1つを含む:(i)SEQ ID NO:2、12、65および69、(ii)SEQ ID NO:3、13、65および69、(iii)SEQ ID NO:4、14、65および69、(iv)SEQ ID NO:5、15、65および69、(v)SEQ ID NO:1、11、64および68、(vi)SEQ ID NO:2、12、64および68、(vii)SEQ ID NO:2、12、66および70、(viii)SEQ ID NO:4、14、66および70、(ix)SEQ ID NO:5、15、66および70、(x)SEQ ID NO:3、13、64および68、(xi)SEQ ID NO:3、13、67および71、(xii)SEQ ID NO:4、14、64および68、(xiii)SEQ ID NO:5、15、64および68、(xiv)SEQ ID NO:7、17、64および68、(xv)SEQ ID NO:6、16、64および68、(xvi)SEQ ID NO:6、16、67および71、(xvii)SEQ ID NO:8、18、64および68、(xviii)SEQ ID NO:9、19、64および68;(xix)SEQ ID NO:9、19、67および71、ならびに(xx)SEQ ID NO:10、20、64および68。
【0098】
本明細書で使用される「二量体」は、2つのポリペプチドの複合体を指す。特定の実施形態では、2つのポリペプチドは、互いに非共有結合され、特に、2つのポリペプチド間に共有結合がないことを条件とする。特定の例では、2つのポリペプチドは、二量体の安定化を助けるために形成されるジスルフィド結合などの共有結合性会合を有する。特定の実施形態では、二量体は、ホモ二量体である、つまり、2つの同一のポリペプチドを含む。用語「ポリペプチド」は、アミド結合によって結合されたアミノ酸残基のポリマーを指す。ポリペプチドは、特定の例において、分枝されていない単鎖融合タンパク質である。ポリペプチドにおいて、可変抗体ドメインは逐次的に結合されている。ポリペプチドは、他の例において、可変ドメインN末端および/またはC末端残基に加えて、連続するアミノ酸残基を有し得る。例えば、そのような連続するアミノ酸残基は、いくつかの例ではC末端でタグ配列を含み得、これは、ポリペプチドの精製および検出のために有用であることが企図される。
【0099】
一態様では、二重特異性タンデムダイアボディの各ポリペプチドは、4つの可変ドメイン、すなわち、CD3結合タンパク質の可変軽鎖(VL)および可変重鎖(VH)ならびにCD33結合タンパク質の可変軽鎖(VL)および可変重鎖(VH)を含む。特定の実施形態では、4つの可変ドメインは、ペプチドリンカーL1、L2およびL3によって結合され、いくつかの例では、以下のようにN末端からC末端に配される:
ドメインの順序:
(1)VL(CD3)-L1-VH(CD33)-L2-VL(CD33)-L3-VH(CD3);または、
(2)VH(CD3)-L1-VL(CD33)-L2-VH(CD33)-L3-VL(CD3);または、
(3)VL(CD33)-L1-VH(CD3)-L2-VL(CD3)-L3-VH(CD33);または、
(4)VH(CD33)-L1-VL(CD3)-L2-VH(CD3)-L3-VL(CD33)。
【0100】
報告された試験によると、リンカーの長さは抗原結合タンデムダイアボディの柔軟性に影響を与える。したがって、いくつかの実施形態では、ペプチドリンカーL1、L2およびL3の長さは、1つのポリペプチドのドメインが、別のポリペプチドのドメインと分子間で会合し、二量体抗原結合タンデムダイアボディを形成することができるような長さである。特定の実施形態では、そのようなリンカーは、「短い」、つまり、0、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11または12個のアミノ酸残基からなる。したがって、特定の例では、リンカーは、約12個以下のアミノ酸残基からなる。アミノ酸残基が0個の場合には、リンカーはペプチド結合である。そのような短いリンカーは、異なるポリペプチドの抗体可変軽鎖ドメインと抗体可変重鎖ドメインとの間に結合し、正しい抗原結合部位を形成することによって、2つのポリペプチドの分子間の二量体化を支持する。リンカーを約12個以下のアミノ酸残基に短縮することによって、一般に、同じポリペプチド鎖の隣接ドメインが互いに分子内で相互作用することが防がれる。いくつかの実施形態では、これらのリンカーは、約3から約10個、例えば、4、5または6個の連続するアミノ酸残基からなる。
【0101】
リンカーのアミノ酸組成に関して、2つのポリペプチドの二量体化に干渉しないペプチドが選択される。例えば、グリシンおよびセリン残基を含むリンカーは、一般にプロテアーゼ耐性を提供する。リンカーのアミノ酸配列は、例えば、抗原結合ポリペプチド二量体の抗原結合および生産収率を改善するファージディスプレイ方法によって、最適化することができる。いくつかの実施形態におけるタンデムダイアボディに適したペプチドリンカーの例は、GGSGGS(SEQ ID NO:95)、GGSG(SEQ ID NO:96)、またはGGSGG(SEQ ID NO:97)である。
【0102】
本明細書に記載されるようなタンデムダイアボディの限定しない例は、表7に従う、抗CD33 VLおよびVHドメイン、抗CD3 VLおよびVHドメイン、ドメインの順序、およびリンカーを有する、タンデムダイアボディである。
【0103】
(表7)例示的なCD33/CD3タンデムダイアボディ(TandAb)
【0104】
いくつかの実施形態では、タンデムダイアボディは、C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグに結合される。いくつかの実施形態では、C末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグを有するタンデムダイアボディは、図10Aから10Xに示されるように、タンデムダイアボディ 01(SEQ ID NO:98)、02(SEQ ID NO:99)、03(SEQ ID NO:100)、04(SEQ ID NO:101)、05(SEQ ID NO:102)、06(SEQ ID NO:103)、07(SEQ ID NO:104)、08(SEQ ID NO:105)、09(SEQ ID NO:106)、10(SEQ ID NO:107)、11(SEQ ID NO:108)、12(SEQ ID NO:109)、13(SEQ ID NO:110)、14(SEQ ID NO:111)、15(SEQ ID NO:112)、16(SEQ ID NO:113)、17(SEQ ID NO:114)、18(SEQ ID NO:115)、19(SEQ ID NO:116)、20(SEQ ID NO:117)、21(SEQ ID NO:118)、22(SEQ ID NO:119)、23(SEQ ID NO:120)、または24(SEQ ID NO:121)である。
【0105】
いくつかの実施形態では、タンデムダイアボディは、図11Aから11Xに示されるように、タンデムダイアボディ 01(SEQ ID NO:123)、02(SEQ ID NO:124)、03(SEQ ID NO:125)、04(SEQ ID NO:126)、05(SEQ ID NO:127)、06(SEQ ID NO:128)、07(SEQ ID NO:129)、08(SEQ ID NO:130)、09(SEQ ID NO:131)、10(SEQ ID NO:132)、11(SEQ ID NO:133)、12(SEQ ID NO:134)、13(SEQ ID NO:135)、14(SEQ ID NO:136)、15(SEQ ID NO:137)、16(SEQ ID NO:138)、17(SEQ ID NO:139)、18(SEQ ID NO:140)、19(SEQ ID NO:141)、20(SEQ ID NO:142)、21(SEQ ID NO:143)、22(SEQ ID NO:144)、23(SEQ ID NO:145)、または24(SEQ ID NO:146)である。
【0106】
本明細書に記載されるCD33結合タンパク質およびCD33/CD3二重特異性結合タンパク質(例えばCD33/CD3二重特異性タンデムダイアボディ)は、いくつかの実施形態において、もう一つの同一のポリペプチドと会合するタンデムダイアボディのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを発現して抗原結合タンデムダイアボディを形成することによって生成される。それ故、別の態様は、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディのポリペプチドをコードするポリヌクレオチド、例えばDNAまたはRNAである。
【0107】
ポリヌクレオチドは、ペプチドリンカーによって隔てられた、または他の実施形態ではペプチド結合によって直接結合された、少なくとも4つの抗体可変ドメインをコードする遺伝子を、適切なプロモーター、および任意で適切な転写ターミネーターに作動可能に結合された単一の遺伝子構築物へと組み合わせ、それを細菌または例えばCHO細胞などの他の適切な発現系において発現させるなどの既知の方法によって、構築される。利用されるベクター系および宿主に依存して、構成的および誘導性のプロモーターを含む、任意数の適切な転写および翻訳要素が使用されてもよい。プロモーターは、それぞれの宿主細胞においてポリヌクレオチドの発現を駆動するために選択される。
【0108】
いくつかの実施形態では、ポリヌクレオチドは、ベクター、好ましくは発現ベクターへと挿入され、これはさらなる実施形態を表す。この組換えベクターは、既知の方法に従って構築され得る。
【0109】
記載された抗原結合タンデムダイアボディのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するおよび発現するために、様々な発現ベクター/宿主系が利用され得る。大腸菌(E.coli)における発現のための発現ベクターの例は、哺乳動物細胞における発現のためのpSKK(Le Gall et al., J Immunol Methods. (2004) 285(1):111-27)またはpcDNA5(Invitrogen)である。
【0110】
したがって、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、いくつかの実施形態において、上に記載されるようなポリペプチドをコードするベクターを宿主細胞へと導入し、ポリペプチド鎖が発現され、単離され得、任意でさらに精製される条件下で前記宿主細胞を培養することによって生成される。
【0111】
他の態様では、本明細書に記載されるCD33結合タンパク質またはCD33/CD3二重特異性結合タンパク質(例えばCD33/CD3の二重特異性タンデムダイアボディ)は、修飾を有する。典型的な修飾は、限定されないが、アセチル化、アシル化、ADPリボシル化、アミド化、フラビンの共有結合、ヘム部分の共有結合、ヌクレオチドまたはヌクレオチド誘導体の共有結合、脂質または脂質誘導体の共有結合、ホスファチジルイノシトールの共有結合、薬物コンジュゲーション、架橋、環化、ジスルフィド結合形成、脱メチル化、共有結合架橋の形成、シスチンの形成、ピログルタミン酸の形成、フォルミル化、ガンマカルボキシル化、グリコシル化、GPIアンカー形成、ヒドロキシル化、ヨウ素化、メチル化、ミリストイル化、酸化、タンパク質プロセシング、リン酸化、プレニル化、ラセミ化、セレノイル化、硫酸化、アルギニル化(arginylation)などのタンパク質へのアミノ酸の転移RNA媒介性の付加、およびユビキチン化を含む。さらなる実施形態では、CD33結合タンパク質またはCD33/CD3二重特異性結合タンパク質は、リーダーまたは分泌配列、またはポリペプチドの精製のための配列などの、追加のアミノ酸で修飾される。
【0112】
他の態様において、本明細書には、CD33結合タンパク質、抗原結合タンデムダイアボディ、抗原結合タンデムダイアボディのポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含むベクター、またはこのベクターによって形質転換された宿主細胞と、少なくとも1つの薬学的に許容可能な担体とを含む、医薬組成物が提供される。用語「薬学的に許容可能な担体」は、限定されないが、成分の生物活性の有効性に干渉しないおよび投与される患者に対して毒性ではない任意の担体を含む。適切な薬学的担体の例は、当該技術分野で周知であり、リン酸緩衝食塩水溶液、水、油/水エマルジョンなどのエマルジョン、様々なタイプの湿潤剤、滅菌溶液などを含む。そのような担体は、従来の方法によって製剤化することができ、適切な用量で対象に投与することができる。好ましくは、組成物は無菌である。これらの組成物はまた、防腐剤、乳化剤および分散剤などのアジュバントを含有し得る。微生物の作用の防止は、様々な抗菌剤および抗真菌剤の包含によって確かなものとされ得る。
【0113】
CD33およびCD3に対する高親和性の結合を有する二重特異性CD33/CD3結合タンパク質は、多くの原発性AML検体中で高度に活性であり、これは、これらの分子が、最小のCD33発現の場合においても、細胞遺伝学的疾患/分子病のスペクトル全体にわたって、ヒトAMLに対して活性であり得ることを示唆している。留意すべきこととして、薬物特異的な細胞毒性も、残余の自己由来T細胞の存在下で観察され、制御された量の健康なドナーT細胞の追加によって有意に増大される(実施例6を参照)。
【0114】
CD33/CD3二重特異性結合タンパク質、特にタンデムダイアボディは、インビトロでCD33白血病細胞の強力な細胞溶解を誘発することができる。データは、CD33およびCD3の両方への高親和性の結合が、二重特異性タンパク質誘発性のT細胞活性化および抗AML効能を最大化することを示す。本明細書に記載されるタンデムダイアボディなどの、CD33/CD3に向けられた高親和性の二重特異性結合タンパク質は、インビトロで原発性AMLにおいて細胞溶解活性を示す。したがって、これらの二重特異性結合タンパク質およびタンデムダイアボディは、急性骨髄白血病(AML)または他の血液系悪性腫瘍(例えば、骨髄異形成症候群(MDS)または骨髄増殖性疾患(MPD))の処置に対する治療手段に適している。
【0115】
それ故、本明細書には、本明細書で上に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディが、CD33癌(例えば急性骨髄白血病(AML))、疾患または状態の処置のために、対象、例えば患者に有効量で投与される方法が提供される。CD33癌は、限定されないが、急性骨髄白血病、前駆B細胞リンパ芽球性白血病を含む急性リンパ芽球性白血病(ALL)などの急性白血病、骨髄性肉腫、多発性骨髄腫、急性リンパ芽球性リンパ腫などの急性リンパ腫、慢性骨髄単球性白血病などを含む。CD33疾患および状態は、特定の癌および慢性炎症において骨髄系由来サプレッサー細胞(MDSC)に起因する免疫抑制の状態または環境を含む。
【0116】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、急性骨髄白血病(AML)の処置のために投与される。特定の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、急性骨髄白血病のサブタイプの処置のために投与される。
【0117】
FAB分類系は、AMLを8つのサブタイプに分割する:AML-M0(分化は最小限)、AML-M1(成熟なし)、AML-M2(顆粒球成熟を有する)、AML-M3(前骨髄球性白血病または急性前骨髄球性白血病)、AML-4(急性骨髄単球性白血病)、AML-M5(急性の単芽球性白血病または単球性白血病)、AML-M6(急性赤白血病)、およびAML-M7(急性巨核芽球性白血病)。特定の例では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、AML-M0、AML-M1、AML-M2、AML-M3、AML-M4、AML-M5、AML-M6、またはAML-M7の処置のために投与される。
【0118】
WHO AML分類表は、以下のサブタイプに従ってAMLを組織化する:再発性遺伝的異常を有するAML、脊髄形成異常関連の変化を有するAML、治療関連の骨髄性新生物、骨髄性肉腫、ダウン症候群に関連する骨髄増殖、芽球の形質細胞様樹状細胞新生物、および他に分類されないAML。特定の他の例では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、再発性遺伝的異常を有するAML、脊髄形成異常関連の変化を有するAML、治療関連の骨髄性新生物、骨髄性肉腫、ダウン症候群に関連する骨髄増殖、芽球の形質細胞様樹状細胞新生物、または他に分類されないAMLの処置のために投与される。
【0119】
他のいくつかの実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、新規に診断されたAML、再発性AML、または難治性のAMLの処置のために投与される。
【0120】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質、例えば抗原結合タンデムダイアボディは、再発性または難治性のAMLの処置のために、造血幹細胞移植(HCT)を受けた患者に投与される。HCTを受けた患者は、AMLの処置のためにCD33およびCD3結合タンパク質を適用可能な特異的な患者集団である。HCTを受けたことで、患者は、リンパ球を含む自身の免疫系を再確立し、それによって、CD33およびCD3結合タンパク質は、より有効に細胞傷害性T細胞に結合し、腫瘍細胞を死滅させることができることが企図される。
【0121】
多くのまたはほとんどの場合に、HCTを受ける患者は、化学療法または放射線療法などのAMLの処置のための以前の治療が不成功に終わり、寛解にある。いくつかの実施形態では、HCTを受ける患者は、初回化学療法または放射線療法が不成功に終わった。いくつかの実施形態では、HCTを受ける患者は、単回化学療法または放射線療法が不成功に終わった。HCTを受ける何人かのAML患者は、初回完全寛解(CR1)にある。いくつかの実施形態では、HCTを受けるAML患者は、第2回完全寛解(CR2)にある再発性AML患者である。
【0122】
いくつかの実施形態では、造血幹細胞移植は同種である(allo-HCT)。Allo-HCTでは、幹細胞は、ヒト白血球抗原(HLA)の一致した、患者以外のドナーに源を有する。一致したドナーは、患者に関連し得るかまたは関連し得ない。いくつかの場合では、1つの抗原が一致しない部分的に一致したドナーは、allo-HCTに使用することができる。ドナーからの細胞の共通ソースは、骨髄および末梢血の幹細胞を含む。HLAの一致したまたは部分的に一致した関連するまたは関連しないドナーが利用可能でない患者のために、代替的なドナー源が使用されてもよい。例示的な代替のドナーのオプションは、臍帯移植またはハプロタイプ一致の移植を含む。allo-HCTの利点としては、腫瘍のない移植片の使用、および免疫媒介性の移植片対白血病効果が挙げられる。ドナー免疫細胞は、身体へと注入される時に、あらゆる残存白血病細胞を異質であるとして認識し、それらを攻撃し得る。allo-HCTの欠点としては、一致したまたは部分的に一致したドナーを発見することの困難性、およびドナーの細胞によって確立された免疫系が患者自身の組織を異質であるものとして認識してそれらを攻撃する移植片対宿主病が挙げられる。
【0123】
他のいくつかの実施形態では、造血幹細胞移植は自家である(auto-HCT)。自家HCTは、患者からの造血幹細胞の、一般にアフェレーシスによる抽出、および採取した細胞の冷凍庫中での保存を必要とする。その後、患者は、部分的または完全な骨髄除去、言いかえれば新しい血液細胞を成長させるための患者の骨髄機能の破壊と引き換えに、患者の悪性細胞集団を根絶することを意図して、放射線療法と共にまたはそれなしで高用量化学療法によって処置される。その後、患者自身の保存された幹細胞が、患者の血流へと注入され、ここで、幹細胞は、破壊された組織を交換し、患者の正常な血液細胞産生を再開する。免疫機能の回復が急速であるため、自家移植は、処置の免疫無防備の期間の間の感染のリスクがより少ないという利点を有する。また、急性または慢性の移植片対宿主病である拒絶反応を患者が経験する発生率は、ドナーとレシピエントとが同じ個体であるため非常にまれである。
【0124】
さらなる実施形態では、患者はHCT前に移植前処置を受ける。いくつかの実施形態では、HCT前の移植前処置は、移植を保証しかつ著しい毒性を有さないために十分な免疫抑制を提供することができる。移植前処置は、骨髄破壊性または骨髄非破壊性であり、強度軽減移植前(RIC)処置としても知られている。
【0125】
いくつかの実施形態では、移植前処置は骨髄破壊性である。骨髄破壊性の移植前処置は、AML細胞を含む骨髄中の細胞を除去するものであり、全身照射(TBI)、シクロホスファミドの投与、ブスルファンの投与、またはそれらの組み合わせによって通常実行される。例示的なシクロホスファミドは、エンドキサン(endoxan)、シトキサン(cytoxan)、ネオサール(neosar)、プロシトックス(procytox)、レビミュン(revimmune)、およびシクロブラスチン(cycloblastin)を含む。いくつかの実施形態では、移植前処置は骨髄非破壊性である、すなわち、強度軽減移植前(RIC)である。RIC処置は、骨髄破壊性の治療より少ない化学療法および/または放射線の用量を含む。したがって、RIC処置は、全ての骨髄細胞を根絶はしないより軽い処置であると考えられ、骨髄破壊性の移植前処置を受けることができない高齢者などの患者において使用することができる。
【0126】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載される、CD33およびCD3結合タンパク質、例えば抗原結合タンデムダイアボディは、骨髄破壊性の移植前処置の後にauto-HCTを受けたAML患者に投与される。いくつかの実施形態では、抗原結合タンデムダイアボディは、骨髄破壊性の移植前処置の後にallo-HCTを受けたAML患者に投与される。いくつかの実施形態では、骨髄破壊性の移植前処置の後にallo-HCTを受ける患者は、完全寛解(CR)にあり、allo-HCT後に本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を投与することによって、再発性または難治性のAMLの発生確率が低下する。いくつかの実施形態では、骨髄破壊性の移植前処置の後にallo-HCTを受ける患者は、CRにあるが、微小残存病変(MRD)を有し、allo-HCT後に本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を投与することによって、再発性または難治性のAMLの発生確率が低下する。いくつかの実施形態では、骨髄破壊性の移植前処置の後にallo-HCTを受ける患者は、MRDを有し、allo-HCT後に本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を投与することによって、再発性または難治性のAMLの発生確率が低下する。
【0127】
特定の前臨床試験は、より強力な移植前処置が、結果として、急性移植片対宿主病の進行を支持する炎症促進性サイトカイン環境につながることを示した。例示的な強化移植前処置は、非常に高用量のTBI処置を含む。いくつかの実施形態では、強化移植前処置の後にallo-HCTを受けたAML患者に本明細書に記載されるCD33およびCD3結合タンパク質を投与することは、結果として炎症促進性サイトカイン環境にはつながらず、急性移植片対宿主病の発生確率を低下させる。
【0128】
さらなる実施形態では、CD33およびCD3結合タンパク質、例えば抗原結合タンデムダイアボディは、RIC処置の後にauto-HCTを受けたAML患者に投与される。いくつかの実施形態では、抗原結合タンデムダイアボディは、RIC処置の後にallo-HCTを受けたAML患者に投与される。例示的な最小強度の移植前処置は、TBIと組み合わせてフルダラビンを投与することを含む。いくつかの実施形態では、フルダラビンは、2GyのTBIと共に、3日間、30mg/m/日の用量で投与される。いくつかの試験は、骨髄非破壊性またはRICの移植前処置が、34%から50%の2年間全生存率、22%から34%の2年間非再発死亡率(NRM)、33%から35%の急性移植片対宿主病率、および41%から53%の慢性移植片対宿主病率に関係することを報告した。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質は、RIC移植前処置の後にallo-HCTを受けたAML患者に投与される。いくつかの実施形態では、RIC移植前処置の後にallo-HCTを受けたAML患者に本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディを投与することによって、結果として、全生存率の改善、NRM率の低下、および/または急性もしくは慢性の移植片対宿主病の発生率の低下につながる。
【0129】
いくつかの実施形態では、CD33およびCD3結合タンパク質は、RIC処置の後にallo-HCTを受けたAML患者に投与される。いくつかの実施形態では、RIC処置後にallo-HCTを受ける患者は、完全寛解(CR)にあり、allo-HCT後に本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を投与することによって、再発性または難治性のAMLの発生確率が低下する。いくつかの実施形態では、RIC処置後にallo-HCTを受ける患者は、CRにあるが、微小残存病変(MRD)を有し、allo-HCT後に本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディを投与することによって、再発性または難治性のAMLの発生確率が低下する。いくつかの実施形態では、RIC処置後にallo-HCTを受ける患者は、MRDを有し、allo-HCT後に本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディを投与することによって、再発性または難治性のAMLの発生確率が低下する。
【0130】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質は、AML進行中に、allo-HCTを受けた患者にドナーリンパ球と共に投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、AML進行中に、allo-HCTを受けた患者にドナーリンパ球を伴わずに投与される。
【0131】
いくつかの実施形態では、allo-HCT後に本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を投与されたAML患者における全奏効率は、事前のallo-HCTなしで本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を投与されたAML患者における全奏効率より高い。いくつかの実施形態では、骨髄破壊性または強度軽減の移植前処置の後にallo-HCTを受けるAML患者は、本明細書に記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質の結合のための機能的なT細胞を有し、記載されるようなCD33およびCD3結合タンパク質を機能的なT細胞の存在下で投与することによって、結果としてAMLの処置の成功率が改善される。
【0132】
さらなる実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、骨髄異形成症候群(MDS)または骨髄増殖性疾患(MPD)などの前白血病の血液疾患の処置のために投与される。特定の例では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MDSの処置のために投与される。特定の例では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MPDの処置のために投与される。
【0133】
他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、多発性骨髄腫の処置のために投与される。さらなる実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、慢性骨髄単球性白血病(CMML)の処置のために投与される。
【0134】
他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、骨髄系由来サプレッサー細胞(MDSC)の阻害または除去のために投与される。MDSCは、特定の単離された病変組織においてCD33を高度に過剰発現し、強い免疫抑制活性を有する。特定のヒト癌(CD33および非CD33)では、MDSCは、増殖し、腫瘍特異的なCD4T細胞応答を抑制するおよびTreg細胞を誘発するように活性化されて、腫瘍または癌が微小環境中でよく成長することを可能にする。慢性炎症では、MDSCは、T細胞免疫機能を抑制するために、増殖し、炎症部位で見出されると報告されている。他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MDSCに関連する状態を処置するために投与される。さらに他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、免疫抑制を処置するために投与される。さらに他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MDSCによって抑制された炎症を処置するために投与される。さらに他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MDSCによって引き起こされた低下した免疫反応を処置するために投与される。さらに他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MDSCによって促進される、血管新生、腫瘍浸潤または癌の転移を処置するために投与される。さらに他の実施形態では、本明細書に記載されるような抗原結合タンデムダイアボディは、MDSCによって増強されるか、増大されるか、悪化されるか、または増加される癌または腫瘍を処置するために投与される。
【0135】
本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、薬物として使用するために企図される。投与は、様々な方法、例えば静脈内、腹腔内、皮下、筋肉内、局所、または皮内投与により達成される。いくつかの実施形態において、投与経路は、治療の種類、および医薬組成物に含まれる化合物の種類に依存する。投与レジメンは、主治医および他の臨床学的因子により決定される。1人の患者への投与量は、患者の大きさ、体表面積、年齢、性別、投与される特定の化合物、投与の時間と経路、治療の種類、健康状態、および同時に投与される他の薬物を含む多くの要因に依存する。「有効な量」は、疾患の経過と重症度に影響を及ぼすことにより病状の減少または寛解を引き起こすのに十分な活性成分の量を指す。AMLの処置および/または予防に有用な「有効な量」は、既知の方法を使用して決定され得る。
【0136】
さらなる実施形態において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、CD33の癌、疾患、または状態に対する標準的治療と組み合わせて投与される。標準的治療は、化学療法、免疫療法、ホルモン療法、放射線、手術、遺伝子治療などを含む。特定の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、標準のAML治療と組み合わせて投与される。特定の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、シタラビン、アザシチジン、デシタビン、アントラサイクリン(例えばダウノルビシン、イダルビシン、ドキソルビシンなど)、アムサクリン、フルダラビン、クロファラビン、クラドリビン、ネララビン、メトトレキサート、ボルテゾミブ、カーフィルゾミブ、メルファラン、イブルチニブ、サリドマイド、レナリドミド、ポマリドミド、アプレミラスト、エピポドフィロトキシン(例えばエトポシド、テニポシドなど)、アントラセンジオン(例えばミトキサントロン、ピクサントロン、ロソキサントロン、ピロキサントロン、アメタントロンなど)、抗CD20薬剤(例えばリツキシマブ、オクレリズマブ、オファツムマブ)、或いはそれらの組み合わせと組み合わせて、投与される。特定の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、シタラビン(ara-C)と組み合わせて投与される。特定の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、アザシチジンと組み合わせて投与される。特定の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、デシタビンと組み合わせて投与される。さらなる例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、アントラサイクリン(例えばダウノルビシン、イダルビシン、ドキソルビシンなど)と組み合わせて投与される。他の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、チェックポイント阻害剤(例えばPD-1阻害剤、CTLA-4阻害剤など)と組み合わせて投与される。また他の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、エピポドフィロトキシン(例えばエトポシド、テニポシドなど)と組み合わせて投与される。また他の例において、本明細書に記載される抗原結合タンデムダイアボディは、アントラセンジオン(例えばミトキサントロン、ピクサントロン、ロソキサントロン、ピロキサントロン、アメタントロンなど)と組み合わせて投与される。
【0137】
以下の実施例は、本発明の範囲を制限することなく、記載された実施形態をさらに示すものである。
【実施例
【0138】
実施例1
単鎖Fv抗体をコードするDNA発現構築物のクローニング
大腸菌中での抗CD33単鎖Fv(scFv)抗体の細菌発現のために、全ての分子のDNAコード配列を、細菌発現ベクターにクローニングした。ペリプラズムへの抗体分泌および精製をそれぞれ促進するために、N末端シグナルペプチドおよびC末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグのコード配列を含むように、全ての発現構築物を設計した。全ての抗CD33 scFvクローンからのVLおよびVHドメインのアミノ酸配列を、表3と表4に示す。
【0139】
大腸菌中での組換え抗CD33 scFv抗体の発現
組換えscFv抗体を、大腸菌ペリプラズムにおいて可溶性の分泌タンパク質として発現させた。第1の工程において、アンピシリンを補った少量の培養培地に、形質転換した細菌を播種し、28℃で16時間インキュベートした。その後、アンピシリンを補った第2の培地を加えることにより光学密度を調整し、光学密度が600nmで0.6~0.8の範囲に到達するまで28℃でもう1回インキュベートした。50μMのIPTGの追加、および、16時間までの21~28℃で200rpmでの培養物のインキュベーションを介して、タンパク質発現を誘発した。インキュベーション後、細胞をペレット状にし(30分、4℃、7500rpm)、さらに処理するまで-20℃で保存した。
【0140】
抗CD33単鎖Fv抗体の精製
細胞ペレットを緩衝液中に再懸濁することによる細菌細胞培養物の遠心分離、および穏やかに撹拌しながらの室温で30分間のインキュベーションの後、組換えscFvを大腸菌ペリプラズムから抽出した。細胞をペレット状にし、組換えタンパク質を含む上清を維持した。この手順をもう1回繰り返してから、上清をプールし、超音波処理により均質化した。ホモジネートを希釈し、低濃度のイミダゾールを補い、予め充填済みの固定化金属アフィニティクロマトグラフィー(IMAC)カラム(GE Healthcare)に添加した。ベースラインに到達するまでカラムを洗浄し、その後結合されたタンパク質をイミダゾール緩衝液で溶出した。抗体含有画分をプールし、その後、サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)により精製した。最後に、タンパク質溶出液を限外濾過により濃縮し、保存緩衝液に対して透析した。低pHでの処置後(37℃で20~24時間、pH3.0でのインキュベーション)、Trisを使用してサンプルを中和した。精製されたタンパク質を、使用するまで-80℃でアリコートとして保存した。
【0141】
実施例2
タンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))をコードするDNA発現構築物のクローニング
CHO細胞中での二重特異性タンデムダイアボディの発現のために、全ての分子のコード配列を、哺乳動物発現ベクターシステムへとクローニングした。実施例1の抗CD33 scFvドメインを使用して、抗CD3 scFvドメインと組み合わせてCD33/CD3タンデムダイアボディを構築した。そのドメインは表7と図3に示されるように編成される。簡潔に、ペプチドリンカーにより隔てられた抗CD33 VHおよびVLドメイン(VH-リンカーVLまたはVL-リンカー-VH)をコードする遺伝子配列を合成し、サブクローニングした。結果として生じる構築物を消化し、リンカー配列内に位置するBam HI制限部位を利用して別個のVHおよびVLのコード配列を生成した。その後、これらVHおよびVLフラグメントを、抗CD3のVHおよびVLドメイン(VH-リンカー-VLまたはVL-リンカー-VH)をコードするDNAフラグメントでライゲートして、最終構築物を得た。CD33/CD3タンデムダイアボディのドメイン順序変異体1~3を、図3に示す。抗体分泌および精製をそれぞれ促進するために、N末端シグナルペプチドおよびC末端ヘキサヒスチジン(6xHis)タグのコード配列を含むように、全ての発現構築物を設計した。
【0142】
安定してトランスフェクトされたCHO細胞におけるタンデムダイアボディの発現
CHO細胞発現系(Flp-In(登録商標), Life Technologies)、CHO-K1チャイニーズハムスター卵巣細胞の誘導体(ATCC、CCL-61)(Kao and Puck, Proc. Natl. Acad Sci USA 1968; 60(4):1275-81)を使用した。Life Technologiesにより提供される標準の細胞培養プロトコルに従って、付着細胞を継代培養した。
【0143】
懸濁液中での成長に対する適応のために、細胞を組織培養フラスコから引き離し、無血清培地に配した。懸濁液に適応した細胞を、10%のDMSOを含む培地中で凍結保存した。
【0144】
分泌されたタンデムダイアボディを安定して発現する組換えCHO細胞株を、懸濁液に適応した細胞のトランスフェクションにより生成した。抗菌性のハイグロマイシンBでの選択中、生細胞密度を週に2回測定し、細胞を遠心分離し、0.1×10生細胞/mLの最大密度で新鮮な選択培地の中に再懸濁した。タンデムダイアボディを安定して発現させる細胞プールを選択の2~3週間後に回収し、その時点で細胞を振盪フラスコ中の標準培養培地に移した。組換え分泌タンパク質の発現を、タンパク質のゲル電気泳動またはフローサイトメトリーの実行により確認した。安定した細胞プールを、DMSO含有培地中で凍結保存した。
【0145】
安定してトランスフェクトされたCHO細胞株を、10日間流加回分培養することにより、細胞培養上清への分泌によってタンデムダイアボディを生成した。典型的に>75%の培養物の生存率で、細胞培養上清を10日後に採取した。サンプルを一日おきに生成培養物から集め、細胞密度と生存率を評価した。採取の当日、さらなる使用の前に、細胞培養上清を遠心分離と真空濾過により清澄化した。
【0146】
細胞培養上清におけるタンパク質発現の力価および生成物の完全性をSDS-PAGEにより分析した。
【0147】
タンデムダイアボディの精製
タンデムダイアボディを2工程の手順でCHO細胞培養上清から精製した。His6タグを付けた構築物を、第1工程でNi-NTA Superflowクロマトグラフィーに供し、次いで、第2工程でSuperdex 200上での分取サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)に供した。溶出されたタンデムダイアボディを、それらのホモ二量体(タンデムダイアボディ)内容物に関して特徴付けし、ホモ二量体内容物が90%以上であった場合にプールした。最後に、プールされたサンプルを緩衝液交換し、限外濾過により濃縮することで>1mg/mLの典型的な濃度とした。最終サンプルの純度および均質性(典型的に>90%)を、還元条件および非還元条件下でのSDS PAGE、次いで抗Hisタグ抗体を使用する免疫ブロット法、および分析的SECのそれぞれによって評価した。精製されたタンパク質を、使用するまで-80℃でアリコートとして保存した。
【0148】
CD33/CD3タンデムダイアボディのポリペプチドを、表7と図3に示す。各タンデムダイアボディは、2つの同一のポリペプチドからなる(図1)。外側のリンカーL1とL3の両方は、6つのアミノ酸GGSGGS(SEQ ID NO:95)で構成され、一方、中央のペプチドリンカー2は長さが様々であり(4~6個のアミノ酸)、配列GGSG(SEQ ID NO:96)、GGSGG(SEQ ID NO:97)、またはGGSGGS(SEQ ID NO:95)をそれぞれ有している。
【0149】
一連の抗CD33可変ドメインおよび抗CD3可変ドメインを使用して、多数のタンデムダイアボディ分子を生成し、これは、トランスフェクトされた細胞株において安定して生成されると共に、体温で、および凍結/解凍のサイクルの繰り返しの後に、安定性を維持した。さらなる開発および前臨床毒性研究を促進するために、ヒトおよびカニクイザル両方のCD33への結合を示したタンデムダイアボディ分子の選択に重点を置いた。完全なアミノ酸配列の例を、図10L、10N、および10Pそれぞれにおいて、タンデムダイアボディ12(SEQ ID NO:109)、14(SEQ ID NO:111)、および16(SEQ ID NO:113)の単鎖について示す。この例において、可変ドメインの順序、および構造に関するそれらのリンカーは、次のとおりである:VL(CD3)-L1-VH(CD33)-L2-VL(CD33)-L3-VH(CD3)。C末端ヘキサヒスチジン(6×His)タグは、精製中に切断される。ヘキサヒスチジンタグの除去後の、上述のタンデムダイアボディの完全なアミノ酸配列は、図11L、11N、および11Pそれぞれに示されるように、タンデムダイアボディ12(SEQ ID NO:134)、タンデムダイアボディ14(SEQ ID NO:136)、およびタンデムダイアボディ16(SEQ ID NO:138)である。
【0150】
実施例3
フローサイトメトリーによる抗体親和性の判定
段階希釈した100μLのCD33/CD3タンデムダイアボディと共に細胞をインキュベートした。FACS緩衝液で3回洗浄した後、細胞を、氷の上で45分間、同じ緩衝液中で、10μg/mLのマウスモノクローナル抗His抗体0.1mLと共にインキュベートした。2回目の洗浄サイクルの後、細胞を、以前と同じ条件下で15μg/mLのFITCコンジュゲートヤギ抗マウスIgG抗体0.1mLと共にインキュベートした。対照として、細胞を、抗His IgG、その後、抗CD33タンデムダイアボディがないFITCコンジュゲートヤギ抗マウスIgG抗体と共にインキュベートした。その後、細胞を再び洗浄し、死細胞を除外するために2μg/mLのヨウ化プロピジウム(PI)を含有する0.2mLのFACS緩衝液中で再懸濁した。1×10の生細胞の蛍光を、MXPソフトウェア(Beckman-Coulter, Krefeld, Germany)を使用するBeckman-Coulter FC500 MPLフローサイトメーター、または、Incyteソフトウェア(Merck Millipore, Schwalbach, Germany)を使用するMillipore Guava EasyCyteフローサイトメーターを用いて測定した。細胞サンプルの平均蛍光強度を、CXPソフトウェア(Beckman-Coulter, Krefeld, Germany)またはIncyteソフトウェア(Merck Millipore, Schwalbach, Germany)を使用して計算した。第二および第三の試薬単独で染色した細胞の蛍光強度値を減算した後、この値を、GraphPad Prism(version 6.00 for Windows, GraphPad Software, La Jolla California USA)の1サイト結合(双曲線)の方程式でのK値の計算に使用した。
【0151】
タンデムダイアボディを、ヒトCD3およびCD33細胞ならびにカニクイザルCD3およびCD33細胞に対するそれらの結合親和性について試験した。選択されたタンデムダイアボディの例示的な結合データを表8に要約する。
【0152】
(表8)CD33/CD3タンデムダイアボディのCD3およびCD33結合特徴
【0153】
#K比率カニクイザルCD33/ヒトCD33は、カニクイザルCD33およびヒトCD33をそれぞれ発現させるCHO細胞について測定されたK値に基づいて計算した。
比率hu CD3/hu CD33は、Jurkat細胞(hu CD3)について測定されたK値、および、3つのヒトCD33腫瘍細胞株(HL-60、KG-1、U937)の平均Kに基づいて計算した。
【0154】
CD3結合親和性および交差反応性を、CD3Jurkat細胞(Dr. Moldenhauer, DKFZ Heidelbergにより提供;ヒト急性T細胞白血病)およびカニクイザルCD3HSC-F細胞株(JCRB, cat.:JCRB1164)に対する滴定およびフローサイトメトリー実験において評価した。CD33結合および交差反応性を、ヒトCD33腫瘍細胞株:HL-60(DSMZ, cat.:ACC 3、ヒトB前駆細胞白血病)、U-937(DSMZ, cat.:ACC5;ヒト細網肉腫)、およびKG-1(DSMZ, cat.:ACC14;急性骨髄性白血病)について評価した。交差反応性のK比率を、組換えヒト抗原または組換えカニクイザル抗原を発現するCHO細胞株について判定されたK値を使用して、計算した。
【0155】
タンデムダイアボディは、試験された大半の腫瘍細胞株上のヒトCD33に対し、1nM未満の比較的高い親和性を示した。ヒトCD3に対する親和性は、2nM以下であると判定された。
【0156】
実施例4
細胞毒性アッセイ
細胞毒性アッセイのために、標準条件下で培養された標的細胞を採取し、洗浄し、PKH67 Green Fluorescent Cell Linker Mini Kitに提供される希釈剤Cの中で、2×10細胞/mLの密度に再懸濁した。その後、細胞懸濁液を、等量の2倍濃縮したPKH67標識溶液と混合し、RTで2~5分間インキュベートした。等量のFCSを加えて1分間インキュベートすることにより、染色反応を実行した。標識した標的細胞を完全RPMI培地で洗浄した後、細胞を計数し、完全RPMI培地において2×10細胞/mLの密度に再懸濁した。その後、2×10の標的細胞を、マイクロタイタープレートの個々のウェルにおいて、200μL/ウェルの総量で濃度を増大させた示されたタンデムダイアボディの存在下、E:T比5:1でエフェクター細胞としての濃縮ヒトT細胞と共に播種した。抗体がない状態での自発的な細胞死、およびT細胞による標的の死滅を、各プレート上で少なくとも3つの複製について測定した。遠心分離後、アッセイプレートを、5%のCOを含む加湿雰囲気中37℃で、示された期間にわたりインキュベートした。インキュベーションの後、培養物をFACS緩衝液で1回洗浄し、次いで、2μg/mLのPIを補った150μLのFACS緩衝液の中で再懸濁した。標的生細胞の絶対量を、Beckman-Coulter FC500 MPLフローサイトメーター(Beckman-Coulter)またはMillipore Guava EasyCyteフローサイトメーター(Merck Millipore)を使用して、PKH67でのポジティブグリーン染色およびPIのネガティブ染色により測定した。測定された残存する標的生細胞に基づき、特定の細胞溶解のパーセンテージを、以下の式に従い計算した:[1-(生きた標的(サンプル)の数/生きた標的(自発)の数)]×100%。S字状の用量応答曲線とEC50値を、GraphPadソフトウェアを使用して非線形回帰/4つのパラメータのロジスティックフィットにより計算した。与えられた抗体濃度について得られた溶解値を使用して、Prismソフトウェアを用いて4つのパラメータのロジスティックフィット分析によりS字状の用量応答曲線を計算した。
【0157】
EC50値を、5:1の比でエフェクター細胞としての濃縮ヒトT細胞を伴う、CD33U-937(DSMZ, cat.:ACC5;ヒト細網肉腫)標的細胞についての20~24時間のアッセイにおいて測定した。いくつかのタンデムダイアボディも、標的細胞CD33KG-1(DSMZ, cat.:ACC14;急性骨髄性白血病)およびHL-60についての細胞毒性分析において試験した。具体的には、比較的高度なCD33細胞表面発現を有するAMLのモデル(任意のMFI[平均±SEM]:3,133±215;n=3)としてHL-60細胞を選択し、CD33発現が非常に制限されているAMLのモデル(任意のMFI:277±11;n=3)としてKG-1aを選択した。選択されたタンデムダイアボディの例示的な細胞毒性データを表9に要約する。HL-60細胞株の追加的な細胞毒性データは、表8の最後の列にて見出される。
【0158】
(表9)異なるCD33腫瘍細胞株に対するCD33/CD3タンデムダイアボディのインビトロでの効力
【0159】
20~24時間インキュベートされた示された標的細胞株について、E:T比5:1でエフェクター細胞として初代ヒトT細胞を用いるFACSベースの細胞毒性分析において、EC50値を測定した。タンデムダイアボディをそれぞれ、少なくとも2回の独立した実験において各腫瘍細胞株に対し試験した。平均値を提示する。
【0160】
実施例5
48時間でのヒトCD33AML細胞株におけるさらなる細胞毒性スクリーニング実験
上述のように、有意な細胞毒性は早ければ24時間で検出されたが、より高レベルの毒性は48時間で検出され得る。次のアッセイのために、48時間の時点を選択した。タンデムダイアボディで誘発された細胞毒性に対するT細胞選択の影響を試験した。これを達成するために、健康なボランティアドナーから未刺激のPBMCを得て、CD3細胞を、CD3マイクロビーズの使用による単純な「正の濃縮」、ならびに、CD14、CD15、CD16、CD19、CD34、CD36、CD56、CD123、およびCD235aに対する抗体のマイクロビーズカクテルによるより複雑な「負の選択」の両方によって、単離した。図4に表されるように、タンデムダイアボディで誘発された細胞毒性は、正の選択を受けたT細胞よりも、負の選択を受けた健康なドナーT細胞の方が大きかった。しかし、個々のタンデムダイアボディの相対的な細胞毒性活性は、T細胞選択の方法により影響を受けなかった。それ故、後のアッセイを、正の濃縮を受けた健康なドナーT細胞で実行した。
【0161】
FHCRC Institutional Review Boardにより承認された研究プロトコル下でのFred Hutchinson Cancer Research Center(FHCRC)Hematopoietic Cell Processing Core(Core Center of Excellence)による白血球アフェレーシスを介して、健康な成人ボランティアから未刺激の単核細胞を集めた。T細胞を、CD3マイクロビーズ(「正の濃縮」)またはPan T細胞細胞分離キット(「負の選択」)(共にMiltenyi Biotec, Auburn, CAから)のいずれかを介した磁気細胞分類により濃縮して、アリコート中で凍結し、液体窒素中で保存した。解凍した細胞アリコートを、製造業者の指示に従い3μMのCellVue Burgundy(eBioscience, San Diego, CA)で標識した。精製したPBMCを、様々な濃度のタンデムダイアボディ分子の存在下で培養した。
【0162】
薬物で誘発された細胞毒性の定量化のために、細胞を、実施例4におけるように、異なるE:T細胞比で、(5%のCOおよび空気の中)37℃でインキュベートした。24~72時間後、細胞数および薬物で誘発された細胞毒性を、生育不能な細胞を検出するためのDAPIを使用して、LSRII血球計算器(BD Biosciences)により判定し、FlowJoで分析した。AML細胞を、前方/側方散乱特性、および、健康なドナーT細胞が加えられた実験においてはCellVue Burgundy色素について陰性であることにより識別した(図5)。薬物で誘発された具体的な細胞毒性を次のように提示する:%細胞毒性=100×(1-標的生細胞処置/標的生細胞対照)。細胞毒性アッセイの結果を、平均値±標準誤差(SEM)として提示する。スピアマンのノンパラメトリック相関性を使用して、連続的なサンプル特徴間の相関性を計算した。P値は全て両側性である。統計分析を、GraphPad Prismソフトウェアを使用して実行した。
【0163】
健康なドナーT細胞がない状態では、いずれのCD33/CDタンデムダイアボディも、T細胞不在下でAML細胞株に対して顕著な細胞毒性効果を及ぼさず、このことにより、それらの細胞毒性効果に対するT細胞の絶対的な必要性が確認された(データは示されず)。T細胞の存在下では、タンデムダイアボディで誘発された特異的な細胞毒性の範囲は、タンデムダイアボディの濃度およびE:T細胞比に依存していた。CD33/CD3に向けられたタンデムダイアボディ分子と1つの対照タンデムダイアボディ(00)との直接の比較は、HL-60細胞(図6A/Bと表10)およびKG-1a細胞(図6C/Dと表10)の両方において、抗体で誘発された細胞毒性の相当な差異を示し、結果は、繰り返しの実験において高度に複製可能であった。全体として、タンデムダイアボディで誘発された細胞毒性の程度は、初代ヒトT細胞上のCD3の結合親和性と相関した(KG-1a細胞における細胞毒性について、25pM(およそ2.5ng/mL)およびE:T=5:1: r=-0.542、p=0.009;HL-60細胞における細胞毒性について、25pMおよびE:T=5:1: r=-0.391、p=0.07)。タンデムダイアボディ12、14、16は、HL-60およびKG-1a細胞の両方に対し高度に細胞毒性であった。
【0164】
(表10)CD33/CD3タンデムダイアボディの48時間でのCD25およびCD69の誘導および細胞毒性
1タンデムダイアボディ(TandAb)は、CD3親和性が高い順に列挙される。
2CD25およびCD69誘導は、未分画PBMC培養物において24時間後に測定した。
3CD33+細胞が存在する状態で、未分画PBMCにおいてCD33/CD3タンデムダイアボディにより誘導されるT細胞増殖。
4二つ組のウェルにおいて行われた3回の独立実験から、E:T細胞比5:1で、健康ドナーT細胞の存在下、タンデムダイアボディ濃度25pMでのDAPI+細胞の48時間後の細胞毒性(%)。
ND:CD25活性化が検出できない。
【0165】
実施例6
原発性ヒトAML検体におけるタンデムダイアボディのさらなる特徴付け
これら候補の細胞毒性特性の包括的な特徴付けのために、AML患者由来の検体を、研究用にFHCRC検体貯蔵所から得た。
【0166】
成人AML患者からの前処置(「診断的」)末梢血または骨髄の検体からフィコール分離された単核細胞の冷凍アリコートを、FHCRCにある貯蔵所から得た。AMLを定義するために2008年のWHOの基準(Vardiman et al.; Blood. 2009; 114(5):937-951)、および、細胞遺伝学的リスクを割り当てるために改良英国医学研究評議会(MRC)基準(Grimwalde et al.; Blood. 2010;116(3):354-365)を使用した。患者は、FHCRC治験審査委員会により承認されたプロトコルの下での研究目的用の生体検体の収集および使用についてのインフォームドコンセントの文書を提供した。医療保険の相互運用性と説明責任に関する法律の規則に従い、臨床データを匿名化した。解凍後、細胞を、CD33(クローンP67.6;PE-Cy7コンジュゲート)、CD3(クローンSK7;PerCPコンジュゲート)、CD34(クローン8G12;APCコンジュゲート;全てBD Biosciences, San Jose, CA由来)、およびCD45(クローンHI30;APC-eFluor(登録商標)780コンジュゲート;eBioscience)を認識する直接標識された抗体で染色した。生育不能な細胞を識別するために、サンプルを4’,6-ジアミジノ-2-フェニルインドール(DAPI)で染色した。少なくとも10,000の事象を、Canto IIフローサイトメーター(BD Biosciences)上で獲得し、DAPI細胞をFlowJo(Tree Star, Ashland, OR)を使用して分析した。
【0167】
解凍後、CD45/側方散乱特性に基づいてフローサイトメトリーにより判定されるように、検体には>58%のAML芽球があった。検体には、解凍直後に>50%の生細胞、およびサイトカイン含有液体培養の48時間後に>50%の生細胞があった(図7)。患者の中央年齢は58.1(範囲:23.9~76.2)歳であり;細胞遺伝学的な疾病リスクは、2人において良好、18人において中間、7人において有害であった。NPM1、FLT3、およびCEBPAの突然変異状態に関する情報は不完全であるが、1つのサンプルはCEBPA二重突然変異体であることが分かっており、別のサンプルはNPM1pos/FLT3-ITDnegであった。研究された検体における骨髄芽球およびCD3T細胞のパーセンテージの中央値は、それぞれ86.1%(範囲:58.4~97.0%)および2.0%(範囲:0~11.9%)であり、培養の48時間後のサンプル生存率の中央値は80.1%(範囲:53.6~93.6%)であった。患者のうち15人は新規にAMLと診断され、一方、12人は検体採取の時点で再発性(n=7)または難治性(n=5)いずれかの疾患を有していた。表11に要約されるように、新規に診断されたAMLを有する患者由来の検体の基本特徴は、骨髄芽球上でのCD33発現、自己由来T細胞の量、骨髄芽球の比率、および培養生存率に関して、再発性/難治性疾患を持つ患者と同様であった。
【0168】
AML検体の培養物へのタンデムダイアボディ分子の添加の結果、穏当な用量依存性の細胞毒性(図8A)がもたらされ、このことは、活性AMLを有する患者由来の検体に含まれる自己由来T細胞が、白血病細胞を溶解するように結合され得ることを実証している。健康なドナーT細胞の存在下では、個々のタンデムダイアボディの細胞毒性活性は、薬物用量とE:T細胞比に厳密に依存していた(図8B/C)。しかし、タンデムダイアボディの高活性は、AML芽球上で非常に低いCD33発現を伴う一部の検体においてさえも観察された。タンデムダイアボディ分子の中で、12が最も活性であると考えられ、その理由として、E:T=1:3およびE:T=1:1の両方で、低濃度(2.5pM(およそ250ng/mL)、およびより顕著でない程度に10pM(およそ1ng/mL))で、最も高い細胞毒性を有していたためである。
【0169】
CD33/CD3タンデムダイアボディを、代表的なAML患者の血液サンプルでスクリーニングした。このサンプルは、患者の性別、年齢、疾患ステージ(新規に診断されたもの、再発性、難治性)、CD33発現の程度、および細胞遺伝学的リスクに関して様々であった(表11)。注目すべきことに、多くの検査されたタンデムダイアボディ(例えば、02、08、09、11、12、14、16、19、22、および23)は、図17に示されるように疾患スペクトラムにわたりほぼ全ての患者サンプルにおいて非常に活性であった。さらに、活性の程度と範囲は、新規に診断された患者、再発性の患者、および難治性の患者を含む、AMLの全てのステージにおいて、同様である。
【0170】
(表11)原発性AML検体の特徴
【0171】
実施例7
異なるレベルのCD33を発現させる様々な起源の異なるCD33細胞株に対する、CD33/CD3タンデムダイアボディ12および16の効力と効果
CD33/CD3タンデムダイアボディの効力と効果が標的細胞上のCD33密度に依存するのかどうかを評価するために、様々なヒトCD33腫瘍細胞株、および、組換えヒトCD33を発現するCHO細胞を、QIFIKIT定量化キットと抗CD33 mAb WM53を使用して、それらのCD33発現レベルについて試験した。表12の結果は、腫瘍細胞株上のCD33密度が、およそ1300SABC(標準化された抗体結合能力)~およそ46000SABCの範囲にあったことを示している。CHO-CD33細胞上での発現はおよそ197000SABCであり、これは腫瘍細胞株上のものよりも実質的に高かった。試験したCD33細胞株の全てを、段階希釈したCD33/CD3タンデムダイアボディ12およびタンデムダイアボディ16の存在下、標的対エフェクター比5:1で、エフェクター細胞としてのヒトT細胞を用いた、少なくとも3回の独立したFACSベースの細胞毒性分析において、標的細胞として使用した。各アッセイにおいて、EC50およびタンデムダイアボディを媒介とした溶解値を、非線形回帰により計算した。その結果、12および16の効力(EC50値)も効果(%溶解)も、標的細胞の表面上のCD33の密度とは相互に関連しないことが実証される。
【0172】
注目すべきことに、少なくとも12と16は、1500SABC未満という非常に低いCD33密度を持つSEMのような細胞に対しても、細胞毒性活性を示している。
【0173】
(表12)CD33標的細胞表面発現、ならびにCD33/CD3タンデムダイアボディ12および16の細胞毒性の効力
【0174】
CD33細胞株に対する標準化された抗体結合能力(SABC)を、QIFIKITおよび抗CD33 mAb WM53を使用して判定した。タンデムダイアボディ12とタンデムダイアボディ16で再指向された標的細胞溶解のEC50値を、E:T比5:1でエフェクター細胞としてのヒト初代T細胞を用いたFACSベースの細胞毒性分析において20~24時間のインキュベーションで判定し、CD33を発現するCHO細胞でのアッセイでは、40~48時間インキュベートした。少なくとも3回の独立したアッセイの平均およびSDを示す。
【0175】
実施例8
T細胞のTandAb活性化、およびAML細胞のインビトロでの死滅
TandAbを、精製されたヒトT細胞、およびVPD-450で標識したヒトCD33白血病細胞株KG-1、またはCD33ヒトALL細胞株G2と共にインキュベートした(E:T 5:1)。フローサイトメトリーを使用して、TandAbによる標的細胞溶解を評価した(10-15~10-8M;24時間、37℃)。
【0176】
TandAb 12、16、および19をヒトT細胞と共にインキュベーションすることにより、KG-1細胞を効率的に溶解した(それぞれ、IC50~0.01、0.5、および5pM)。40%までのT細胞が活性化し(CD25+)、細胞毒性活性が増加した。無関係の標的を持つ対照TandAb、00(>10-7M)は、インビトロでKG-1の有意な死滅をもたらさなかった。別々に、16はKG-1細胞の溶解を誘発し(IC50=5×10-12M)、一方で1×10-8MではCD33-G2細胞に対して効果がなかった。この結果は、CD33/CD3 TandAbによりCD33白血病細胞(KG-1)および初代CD33AML芽球を標的とすると、T細胞が活性化されるようになり、強力に腫瘍細胞を溶解することを示している。
【0177】
実施例9
エピトープマッピング
CD33結合エピトープを識別するために、異なるCD33結合部分を含むタンデムダイアボディを、CLIPS Technology(Pepscan)を使用したエピトープマッピングに供した。
【0178】
CLIPS Technologyは、単一ループ、二重ループ、三重ループ、シート状の折り畳み、螺旋状の折り畳み、およびそれらの組み合わせへのペプチドの構造化を促進して、標的分子の不連続的なエピトープをマッピングする可能性を提供する。
【0179】
7000を超える独立したペプチドのアレイを合成し、ペプチドに対する各抗体の結合をELISAで試験した。
【0180】
タンデムダイアボディ12、14、16、および22は、ヒトCD33の第1のIg様ドメインにおいてストレッチ62DQEVQEETQ70(SEQ ID NO:94)に結合する。それぞれのアミノ酸ストレッチを、図10と11において下線と太字で示す。タンデムダイアボディ01、02、04、06、08、09、13、および23は、タンデムダイアボディ12、14、16、および12と同じCD33結合ドメイン(SEQ ID NO:2と12、3と13、5と15、9と19)を共有するため、このエピトープにも結合することが企図される。
【0181】
実施例10
予防的なインビボの腫瘍モデルにおける用量応答
ヒトT細胞と共に再構成されたNOD/scidマウスの予防的HL-60腫瘍異種移植片モデルにおいて、タンデムダイアボディ12と16を異なる用量レベルで比較する。用量応答を達成するために、10、1、および0.1μg(0.5、0.05、および0.005mg/kg)の3つの用量レベルを選択した。
【0182】
免疫不全のNOD/scidマウスの8つの実験群に、4×10のHL-60細胞の懸濁液を皮下注射により異種移植した。注射前に細胞を、負の選択を利用してバフィーコート(健康なドナー)から分離された3×10のT細胞と混合した。ドナーによるT細胞のばらつきの可能性に対処するために、実験群の各々を3つのコホートに細分し、各々1つの個体のドナーのみのT細胞を受けた。腫瘍細胞およびT細胞を移植した実験群の動物は全て、0、1、2、3、および4日目に(qdxd5)、ビヒクル(対照)、または示されるような3つの異なる用量レベル(0.1μg、1μg、および10μg)の16もしくは12のいずれかの静脈内ボーラスを受けた。エフェクター細胞のない1つのビヒクル処置群を、追加の対照とした。表13は、群の割当と投薬スケジュールを要約している。
【0183】
(表13)
【0184】
HL-60異種移植片モデルにおけるインビボ用量応答研究のための処置群。対照群の動物は全て、確実に腫瘍を発達させ、均質的な腫瘍増殖を示した。T細胞の存在は、腫瘍増殖に対して影響がなかった。ビヒクルで処置した対照群にT細胞がある状態またはない状態で、HL-60の増殖における差異は観察されなかった。
【0185】
両方の試験アイテムでの処置により、明らかな用量依存性の抗腫瘍効果が明らかとなった(図12)。2つのタンデムダイアボディ間で、実質的な差異は見出されなかった。図12における平均腫瘍体積のプロットは、処置群の大半が完了した29日までに限定した。45日目まで研究を継続し、無腫瘍生存について動物を観察した。10μgまたは1μgの16で処置した群において、9匹の動物のうち6匹には、観察期間の終わりに腫瘍がなく、10μgの12を受けた9匹の動物のうち5匹は、45日目に腫瘍がなくなった。1匹の動物は、1μgの12で処置した時に腫瘍がないままであった。
【0186】
対照群の動物は全て、確実に腫瘍を発達させ、均質的な腫瘍増殖を示した。タンデムダイアボディのいずれかでの処置は、用量依存性の抗腫瘍効果を明らかにし、29日目まで2つのタンデムダイアボディ間で実質的な差異は見出されなかった。
【0187】
検出可能な差異は、長期の観察(45日)の後にのみ観察され、その時点で、低用量群および対照群は既に、大きな腫瘍の増殖により終了していた。16で処置した群には、より多くの、腫瘍のない動物がいた。
【0188】
実施例11
樹立した腫瘍モデル
16を利用して、予め樹立したHL-60腫瘍を持つNOD/scidマウスの異種移植片モデルを作製し、概念証明を実証した。
【0189】
簡潔に、メスの免疫不全NOD/scidマウスを亜致死的に照射し(2Gy)、4×10のHL-60細胞を皮下に接種した。9日目に、動物は、抗アシアロGM1ウサギ抗体(Wako, Neuss, Germany)の単一ボーラス注射を受け、マウスナチュラルキラー(NK)細胞を枯渇させた。10日目に、腫瘍が50~150mm(平均73±11mm)の体積に達したら、動物を3つの処置群に割り当てた。群2と3(各々8匹の動物)に、1.5×10の活性化ヒトT細胞を腹腔内注射した。注射前に、負の選択を利用してバフィーコート(健康なドナー)からT細胞を分離した。製造業者の使用書に従い(Miltenyi Biotech)、T細胞活性化/拡張キットによりT細胞を拡張かつ活性化させた。ドナーによるばらつきの可能性に対処するために、群2と群3を2つのコホートに細分し、各々、一個人のドナーから拡張かつ活性化されたT細胞を受けた。コホートはそれぞれ、1つの個体のT細胞ドナーのみに由来するT細胞を受けた。
【0190】
(表14)樹立したHL-60異種移植片モデルの処置群
【0191】
13日目以降、群3の動物は105mmの平均腫瘍体積を示し、50μgのタンデムダイアボディ16(qdx9d)を合計9回静脈内投与することで処置した。表14は群の割当と投与スケジュールを示す。群1と群2はビヒクルのみで処置した。体重と腫瘍体積を27日目まで測定した。
【0192】
全ての動物は腫瘍を確実に発達させ、このことは6日目に明白であった。ビヒクル処置群1および2(HL-60)の動物の平均腫瘍体積は、27日目の研究終了時まで持続的に増大した(図13)。HL-60腫瘍細胞に加えて初代活性化ヒトT細胞を受けた群2の動物において、平均腫瘍体積は、群1(HL-60のみ)と比較して、より急速に増大した。
【0193】
ヒトT細胞の存在下でのタンデムダイアボディ16(50μg/動物;2.5mg/kg)による13日目~21日目(qdxd9)の繰り返しの静脈内の処置(群3)は、群1と群2に比べて腫瘍増殖を急速に遅らせた。タンデムダイアボディ16は、ビヒクル処置対照群(群2)と比較して、およそ4~5日まで群3における腫瘍増殖を遅らせた。6日目から27日目までの期間における統計的有意差を、22日目(p<0.05)、23日目(p<0.01)、および27日目(p<0.01)に、群2(HL-60、T細胞、ビヒクル)と群3(HL-60、T細胞、16)との間で識別した(Bonferroniの事後試験を用いた二元配置反復測定ANOVA)。群1の腫瘍の増殖の異常な遅さにより、群1と群3の間に統計的有意差は存在しなかった。
【0194】
異なるドナー由来のT細胞を受ける群の中のコホート1とコホート2における腫瘍成長を比較した時には、T細胞活性に関してドナーによるばらつきは観察されなかった(表14を参照)。
【0195】
実施例10は、予め樹立したHL-60腫瘍(AML)および腹腔内移植されたヒトT細胞を持つNOD/scidマウスの異種移植片モデルが、成功裡に発達したことを示している。ある単回投与レベルでのタンデムダイアボディ16の繰り返しの投与は、それぞれのビヒクル処置対照群と比較して、腫瘍増殖の統計的に有意な遅延をもたらした。生成されたデータは、CD33/CD3 BiTE(商標)による同様の研究について公開された結果に匹敵している(Aigner et al., 2012; Leukemia, 2013, Apr;27(5):1107-15)。
【0196】
実施例12
NSGマウスのAML PDXモデルにおけるCD33/CD3タンデムダイアボディの効果
CD33白血病が2~4%のCD3T細胞を含んでいた、AML患者由来の凍結保存細胞を使用して、NSGマウスのAML PDXモデルを樹立した。照射された(250cGy)NSGマウスへの腫瘍細胞の注射の1時間後、CD33/CD3タンデムダイアボディ16または12を、2種の静脈内投与(50μgまたは5μg;n=8マウス/群)のいずれかで、200μLのボーラス中で注射した。タンデムダイアボディの追加の注射を、次の4日間毎日行った。マウスの体重を週に1回量り、その後38日目に屠殺し、フローサイトメトリーによる分析のために末梢血、骨髄、および脾臓を収集した(huCD33、huCD34、huCD45、muCD45、huCD14、huCD3、huCD4、huCD8、および7AAD)。結果を図14に示す。
【0197】
図14は、未処置のマウスが、38日後に骨髄および脾臓に相当な量のヒト芽球を有していたことを示している。対照的に、タンデムダイアボディ12または16の静脈内注射を毎日受けたマウスは、骨髄および脾臓において実質的に少ない数のヒトAML芽球を提示した。CD33/CD3タンデムダイアボディの強力な抗AML効果を、両方の用量レベル(5μgおよび50μg/注射)で観察した。
【0198】
CD33/CD3タンデムダイアボディ12および16の両方について観察された抗AML効果は、同じマウスモデルにおいてAMLを標的とするCD123/CD3 DART(登録商標)抗体の効果(Hussaini et al.:“Targeting CD123 In Leukemic Stem Cells Using Dual Affinity Re-Targeting Molecules(DART(登録商標)) November 15, 2013; Blood: 122 (21))よりもはるかに強力であった。骨髄および脾臓においてほぼ全てのAML芽球を排除したCD33/CD3タンデムダイアボディとは対照的に、Hussainiらは、CD123/CD3 DART(登録商標)が、2.5および0.25mg/kgでPDXモデルの骨髄および脾臓におけるAML芽球の数を50~1000倍だけしか減らさなかったことを報告しており、かつ、CD123/CD3 DART(商標)が、0.5mg/kgで、PDXモデルの骨髄および脾臓におけるAML芽球の数を40~78%しか減少させなかったことを報告している。
【0199】
実施例13
CD33/CD3タンデムダイアボディ16により媒介される標的細胞溶解の迅速な開始
CD33/CD3タンデムダイアボディにより媒介される標的細胞溶解のキネティクスを評価するために、異なるインキュベーション時間でのカルセイン放出細胞毒性分析を行った。カルセインで標識したCD33HL-60標的細胞を、E:T比25:1でエフェクター細胞としての初代ヒトT細胞の存在下で、段階希釈したタンデムダイアボディ16と共に、30分、1時間、2時間、3時間、4時間、または5時間にわたりインキュベートした。各時点で、溶解された標的細胞から放出されたカルセインを使用して、EC50値を計算し、非線形回帰/S字状の用量応答を用いて、タンデムダイアボディ16により媒介された標的細胞溶解を計算した。図15は、タンデムダイアボディにより媒介された標的細胞溶解の予想外に迅速な開始を示しており、飽和濃度のタンデムダイアボディでの30分のインキュベーション後、40%を超える溶解が見られた。4時間のインキュベーション後、標的細胞溶解は90%超に到達した。表15と図16は、30分~5時間のインキュベーション時間におけるタンデムダイアボディ16について判定されたEC50および具体的な溶解値を要約している。その結果は、使用されたアッセイ条件下で、2時間のインキュベーション後に最大限の効力(最低のEC50値)に到達し、5時間のインキュベーション後に標的細胞はほぼ全て溶解したことをさらに実証している。まとめると、これらの結果は、CD33/CD3タンデムダイアボディにより媒介される、非常に迅速で、強力で、かつ効果的な標的細胞溶解を実証している。
【0200】
(表15)タンデムダイアボディ16について判定された、EC50および溶解値のキネティクス
【0201】
実施例14
AML患者へのCD33/CD3タンデムダイアボディの投与のための、概念実証の臨床試験プロトコル
これは、急性骨髄性白血病(AML)の処置として、CD33/CD3タンデムダイアボディ16を研究するための第I/II相臨床試験である。
【0202】
研究目的
第1:CD33/CD3タンデムダイアボディ16の最大耐用量
第2:CD33/CD3タンデムダイアボディ16のインビトロでの応答が臨床応答に関連するかどうかを判定すること
【0203】
第I相
最大耐用量(MTD)を、試験の第I相セクションにおいて判定する。
1.1 最大耐用量(MTD)を、試験の第I相セクションにおいて判定する。
1.2 適格基準を満たす患者を、CD33/CD3タンデムダイアボディ16に対する試験に参加させる。
1.3 目標は、参加者において重度または管理不能な副作用なしに、安全に投与され得るCD33/CD3タンデムダイアボディ16の最高用量を識別することである。与えられる用量は、以前の研究に登録された参加者の数、および用量にどれくらい十分な耐性があったかに依存する。全ての参加者が同じ用量を受けるわけではない。
【0204】
第II相
2.1 次の第II相セクションは、MTDで処理し、その目標は、CD33/CD3タンデムダイアボディ16による治療が、少なくとも20%の奏効率を結果としてもたらすかどうかを判定することである。
第II相の第1の目的---CD33/CD3タンデムダイアボディ16の治療により、少なくとも20%の患者が臨床応答(芽球奏効、最小奏効、部分奏効、または完全奏効)を達成したかどうかを判定すること。
【0205】
適格性
急性前骨髄球性白血病(APL)の患者を除く、末梢血および骨髄の分析により確認されWHOの基準を満たしているAML。
一次導入化学療法に対し難治性のAMLを有するか、再発性疾患を有するか、または、60歳以上の年齢であり、かつ処置する医師によると、年齢、パフォーマンスステータス、および/または有害な危険因子のために標準の細胞毒性治療に適切でない、患者
年齢≧18歳
カルノフスキーパフォーマンスステータス≧50%、またはECOGパフォーマンスステータス0~2
平均余命≧6週
【0206】
特定の実施形態が、本明細書に示されかつ記載されているが、このような実施形態が、ほんの一例として提供されていることは当業者に明白であろう。多数の変形、変更、および置換は、本発明から逸脱することなく、当業者によって現在想到されるものである。本明細書に記載される実施形態の様々な代替案が、本実施形態を実行する際に利用され得ることを理解されたい。添付の特許請求の範囲は本発明の範囲を定義するものであり、これら特許請求の範囲およびその同等物の範囲内の方法および構造は、それに包含されることが意図されている。

配列情報
SEQUENCE LISTING
<110> AMPHIVENA THERAPEUTICS, INC.
<120> METHODS OF USING BISPECIFIC CD33 AND CD3 BINDING PROTEINS
<150> US 62/168,641
<151> 2015-05-29
<150> US 62/266,438
<151> 2015-12-11
<160> 146
<170> PatentIn version 3.5

<210> 1
<211> 108
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 1
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1 5 10 15
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20 25 30
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65 70 75 80
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100 105

<210> 2
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 2
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
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20 25 30
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35 40 45
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50 55 60
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85 90 95
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115

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<213> Homo sapiens
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<210> 14
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<210> 15
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<211> 123
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 16
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100 105 110
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<210> 17
<211> 119
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<213> Homo sapiens
<400> 17
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Glu
1 5 10 15
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85 90 95
Ala Arg His Lys Arg Gly Ser Asp Ala Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly
100 105 110
Thr Thr Val Thr Val Ser Ser
115

<210> 18
<211> 122
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 18
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Ala Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Tyr Pro Ile Phe Gly Ser Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Tyr Tyr Tyr Asp Ser Ser Glu Trp Ala Phe Asp Ile Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120

<210> 19
<211> 122
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 19
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Ser Ser Tyr
20 25 30
Gly Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Ser Ala His Tyr Ala Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Tyr Tyr Tyr Asp Ser Ser Glu Trp Ala Phe Asp Ile Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120

<210> 20
<211> 122
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 20
Gln Val Gln Leu Val Gln Ser Gly Ala Glu Val Lys Lys Pro Gly Ser
1 5 10 15
Ser Val Lys Val Ser Cys Lys Ala Ser Gly Gly Thr Phe Asp Ser Tyr
20 25 30
Ala Ile Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Gln Gly Leu Glu Trp Met
35 40 45
Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Ser Ala His Tyr Ser Gln Lys Phe
50 55 60
Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr Ser Thr Ala Tyr
65 70 75 80
Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys
85 90 95
Ala Arg Glu Tyr Tyr Tyr Asp Ser Ser Glu Trp Ala Phe Asp Ile Trp
100 105 110
Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120

<210> 21
<211> 11
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 21
Gly Gly Asn Asn Ile Gly Ser Thr Thr Val His
1 5 10

<210> 22
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 22
Ser Gly Ser Arg Ser Asn Ile Gly Ser Asn Thr Val Asn
1 5 10

<210> 23
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 23
Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Thr Val Asn
1 5 10

<210> 24
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 24
Thr Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ala Gly Tyr Asp Val His
1 5 10

<210> 25
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 25
Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Ile Val Asn
1 5 10

<210> 26
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 26
Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Ser Asn Thr Val Lys
1 5 10

<210> 27
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 27
Ser Gly Ser Ser Ser Asn Ile Gly Asp Asn Val Val Asn
1 5 10

<210> 28
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 28
Asp Asp Asn Glu Arg Pro Ser
1 5

<210> 29
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 29
Gly Asn Asn Gln Arg Pro Ser
1 5

<210> 30
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 30
Ser Asp Asn Gln Arg Pro Ser
1 5

<210> 31
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 31
Gly Asn Ser Asn Arg Pro Ser
1 5

<210> 32
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 32
Ser Asn Asn Gln Arg Pro Ser
1 5

<210> 33
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 33
Ser Asn Asn Gln Arg Ser Ser
1 5

<210> 34
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 34
Ser Thr Asn Lys Arg Pro Ser
1 5

<210> 35
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 35
Gln Val Trp Asp Ser Gly Ser Asp His
1 5

<210> 36
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 36
Ala Thr Trp Asp Asp Ser Leu Ile Gly
1 5

<210> 37
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 37
Ala Thr Trp Asp Asp Ser Leu Asn Gly
1 5

<210> 38
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 38
Gln Ser Tyr Asp Ser Ser Leu Ser Asp
1 5

<210> 39
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 39
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Lys Gly
1 5

<210> 40
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 40
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Asn Gly
1 5

<210> 41
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 41
Ala Ala Trp Asp Asp Ser Leu Ser Ala
1 5

<210> 42
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 42
Ser Asn Tyr Gly Ile His
1 5

<210> 43
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 43
Thr Ser Tyr Asp Ile Asn
1 5

<210> 44
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 44
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1 5

<210> 45
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 45
Thr Ser Tyr Trp Ile Gly
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<212> PRT
<213> Homo sapiens
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Ser Ser Tyr Ala Ile Ser
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<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
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Ser Ser Tyr Gly Ile Ser
1 5

<210> 48
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 48
Asp Ser Tyr Ala Ile Ser
1 5

<210> 49
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 49
Leu Ile Ser Tyr Asp Gly Asn Lys Lys Phe Tyr Ala Asp Ser Val Lys
1 5 10 15
Gly

<210> 50
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 50
Trp Met Asn Pro Asn Ser Gly Asn Thr Gly Phe Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly

<210> 51
<211> 18
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 51
Gly Ile Ile Asn Pro Ser Gly Gly Ser Thr Ser Tyr Ala Gln Lys Phe
1 5 10 15
Gln Gly

<210> 52
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 52
Ile Ile Tyr Pro Gly Asp Ser Asp Thr Arg Tyr Ser Pro Ser Phe Gln
1 5 10 15
Gly

<210> 53
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 53
Gly Ile Tyr Pro Ile Phe Gly Ser Ala Asn Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly

<210> 54
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 54
Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Ser Ala His Tyr Ala Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly

<210> 55
<211> 17
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 55
Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Ser Ala His Tyr Ser Gln Lys Phe Gln
1 5 10 15
Gly

<210> 56
<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 56
Asp Arg Leu Glu Ser Ala Ala Phe Asp Tyr
1 5 10

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<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 57
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1 5 10

<210> 58
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 58
Asp Arg Ala Val Thr Asp Tyr Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10

<210> 59
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 59
Asp Arg Ala Asn Thr Asp Tyr Ser Phe Gly Met Asp Val
1 5 10

<210> 60
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 60
Asp Arg Ala Asn Thr Asp Tyr Ser Leu Gly Met Asp Val
1 5 10

<210> 61
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 61
Asp Val Val Pro Ala Ala Ile Asp Tyr Tyr Gly Met Asp Val
1 5 10

<210> 62
<211> 10
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 62
His Lys Arg Gly Ser Asp Ala Phe Asp Ile
1 5 10

<210> 63
<211> 13
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 63
Glu Tyr Tyr Tyr Asp Ser Ser Glu Trp Ala Phe Asp Ile
1 5 10

<210> 64
<211> 125
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 64
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Ala Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Tyr Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125

<210> 65
<211> 125
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 65
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Ala Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125

<210> 66
<211> 125
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 66
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Ala Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125

<210> 67
<211> 125
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 67
Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Gln Pro Gly Gly
1 5 10 15
Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr
20 25 30
Ala Met Asn Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val
35 40 45
Gly Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp
50 55 60
Ser Val Lys Asp Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asp Ser Lys Asn Ser
65 70 75 80
Leu Tyr Leu Gln Met Asn Ser Leu Lys Thr Glu Asp Thr Ala Val Tyr
85 90 95
Tyr Cys Ala Arg His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe
100 105 110
Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser
115 120 125

<210> 68
<211> 110
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 68
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr
20 25 30
Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
35 40 45
Ala Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ser Arg
50 55 60
Phe Ser Gly Ser Leu Ile Gly Asp Lys Ala Thr Leu Thr Ile Ser Ser
65 70 75 80
Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser
85 90 95
Asn Leu Trp Val Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110

<210> 69
<211> 110
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 69
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr
20 25 30
Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
35 40 45
Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ala Arg
50 55 60
Phe Ser Gly Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser
65 70 75 80
Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser
85 90 95
Asn Leu Trp Val Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110

<210> 70
<211> 110
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 70
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr
20 25 30
Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
35 40 45
Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ser Arg
50 55 60
Phe Ser Gly Ser Leu Ile Gly Asp Lys Ala Thr Leu Thr Ile Ser Ser
65 70 75 80
Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser
85 90 95
Asn Leu Trp Val Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110

<210> 71
<211> 110
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 71
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr
20 25 30
Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
35 40 45
Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ser Arg
50 55 60
Phe Ser Gly Ser Leu Ile Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser
65 70 75 80
Leu Gln Pro Glu Asp Phe Ala Thr Tyr Tyr Cys Ala Leu Trp Tyr Ser
85 90 95
Asn Leu Trp Val Phe Gly Gln Gly Thr Lys Val Glu Ile Lys
100 105 110

<210> 72
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 72
Ser Thr Tyr Ala Met Asn
1 5

<210> 73
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 73
Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser
1 5 10 15
Val Lys Asp

<210> 74
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 74
His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Trp Phe Ala Tyr
1 5 10

<210> 75
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 75
His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Tyr Phe Ala Tyr
1 5 10

<210> 76
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 76
Asn Thr Tyr Ala Met Asn
1 5

<210> 77
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 77
Asn Thr Tyr Ala Met His
1 5

<210> 78
<211> 6
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 78
Asn Lys Tyr Ala Met Asn
1 5

<210> 79
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 79
Arg Ile Arg Asn Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser
1 5 10 15
Val Lys Asp

<210> 80
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 80
Arg Ile Arg Asn Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Glu Tyr Ala Asp Ser
1 5 10 15
Val Lys Asp

<210> 81
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 81
Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Glu Tyr Ala Ala Ser
1 5 10 15
Val Lys Asp

<210> 82
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 82
Arg Ile Arg Asn Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Glu Tyr Ala Ala Ser
1 5 10 15
Val Lys Asp

<210> 83
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 83
Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Tyr Tyr Ala Asp Ser
1 5 10 15
Val Lys Gly

<210> 84
<211> 19
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 84
Arg Ile Arg Ser Lys Tyr Asn Asn Tyr Ala Thr Glu Tyr Ala Asp Ser
1 5 10 15
Val Lys Ser

<210> 85
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 85
His Gly Asn Phe Gly Asp Ser Tyr Val Ser Trp Phe Ala Tyr
1 5 10

<210> 86
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 86
His Gly Asn Phe Gly Asn Thr Tyr Val Ser Trp Phe Ala Tyr
1 5 10

<210> 87
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 87
His Gly Asn Phe Gly Cys Ser Tyr Val Ser Trp Phe Ala Tyr
1 5 10

<210> 88
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 88
His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Ile Ser Tyr Trp Ala Tyr
1 5 10

<210> 89
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 89
His Gly Asn Phe Gly Asn Ser Tyr Val Ser Phe Phe Ala Tyr
1 5 10

<210> 90
<211> 14
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 90
Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr Ser Asn Tyr Ala Asn
1 5 10

<210> 91
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 91
Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro
1 5

<210> 92
<211> 7
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 92
Ala Leu Trp Tyr Ser Asn Leu
1 5

<210> 93
<211> 242
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 93
Asp Pro Asn Phe Trp Leu Gln Val Gln Glu Ser Val Thr Val Gln Glu
1 5 10 15
Gly Leu Cys Val Leu Val Pro Cys Thr Phe Phe His Pro Ile Pro Tyr
20 25 30
Tyr Asp Lys Asn Ser Pro Val His Gly Tyr Trp Phe Arg Glu Gly Ala
35 40 45
Ile Ile Ser Arg Asp Ser Pro Val Ala Thr Asn Lys Leu Asp Gln Glu
50 55 60
Val Gln Glu Glu Thr Gln Gly Arg Phe Arg Leu Leu Gly Asp Pro Ser
65 70 75 80
Arg Asn Asn Cys Ser Leu Ser Ile Val Asp Ala Arg Arg Arg Asp Asn
85 90 95
Gly Ser Tyr Phe Phe Arg Met Glu Arg Gly Ser Thr Lys Tyr Ser Tyr
100 105 110
Lys Ser Pro Gln Leu Ser Val His Val Thr Asp Leu Thr His Arg Pro
115 120 125
Lys Ile Leu Ile Pro Gly Thr Leu Glu Pro Gly His Ser Lys Asn Leu
130 135 140
Thr Cys Ser Val Ser Trp Ala Cys Glu Gln Gly Thr Pro Pro Ile Phe
145 150 155 160
Ser Trp Leu Ser Ala Ala Pro Thr Ser Leu Gly Pro Arg Thr Thr His
165 170 175
Ser Ser Val Leu Ile Ile Thr Pro Arg Pro Gln Asp His Gly Thr Asn
180 185 190
Leu Thr Cys Gln Val Lys Phe Ala Gly Ala Gly Val Thr Thr Glu Arg
195 200 205
Thr Ile Gln Leu Asn Val Thr Tyr Val Pro Gln Asn Pro Thr Thr Gly
210 215 220
Ile Phe Pro Gly Asp Gly Ser Gly Lys Gln Glu Thr Arg Ala Gly Val
225 230 235 240
Val His

<210> 94
<211> 9
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<400> 94
Asp Gln Glu Val Gln Glu Glu Thr Gln
1 5

<210> 95
<211> 6
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 95
Gly Gly Ser Gly Gly Ser
1 5

<210> 96
<211> 4
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 96
Gly Gly Ser Gly
1

<210> 97
<211> 5
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic peptide
<400> 97
Gly Gly Ser Gly Gly
1 5

<210> 98
<211> 494
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 98
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<211> 494
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 99
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<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 100
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<210> 101
<211> 494
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 101
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
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Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
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Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ala Arg
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<210> 102
<211> 495
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 102
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
1 5 10 15
Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr
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Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
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Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ala Arg
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<210> 103
<211> 495
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 103
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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Asp Arg Val Thr Ile Thr Cys Arg Ser Ser Thr Gly Ala Val Thr Thr
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Ser Asn Tyr Ala Asn Trp Val Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Pro Lys
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Gly Leu Ile Gly Gly Thr Asn Lys Arg Ala Pro Gly Val Pro Ala Arg
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<210> 104
<211> 491
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 104
Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly
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<210> 105
<211> 496
<212> PRT
<213> Artificial Sequence
<220>
<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
<400> 105
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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<223> Description of Artificial Sequence: Synthetic polypeptide
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145 150 155 160
Leu Glu Trp Met Gly Gly Ile Ile Pro Ile Phe Gly Ser Ala His Tyr
165 170 175
Ala Gln Lys Phe Gln Gly Arg Val Thr Ile Thr Ala Asp Glu Ser Thr
180 185 190
Ser Thr Ala Tyr Met Glu Leu Ser Ser Leu Arg Ser Glu Asp Thr Ala
195 200 205
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210 215 220
Phe Asp Ile Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr Val Ser Ser Gly Gly
225 230 235 240
Ser Gly Gln Ser Val Leu Thr Gln Pro Pro Ser Ala Ser Gly Thr Pro
245 250 255
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260 265 270
Ser Asn Thr Val Lys Trp Tyr Gln Gln Leu Pro Gly Thr Ala Pro Lys
275 280 285
Leu Leu Ile Tyr Ser Asn Asn Gln Arg Ser Ser Gly Val Pro Asp Arg
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305 310 315 320
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325 330 335
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340 345 350
Gly Gly Ser Gly Gly Ser Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly
355 360 365
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370 375 380
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Val Ser Ser

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<213> Artificial Sequence
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<223> Synthetic polypeptide
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165 170 175
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180 185 190
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195 200 205
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225 230 235 240
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Ser Tyr Val Ser Tyr Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu Val Thr
465 470 475 480
Val Ser Ser
図1
図2
図3
図4
図5
図6
図7
図8
図9
図10-1】
図10-2】
図10-3】
図10-4】
図10-5】
図10-6】
図10-7】
図10-8】
図11-1】
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図11-3】
図11-4】
図11-5】
図11-6】
図11-7】
図11-8】
図12
図13
図14
図15
図16
図17
【配列表】
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