特表 2022-542968 抗原特異的Ｔ細胞バンク及びそれを製造する方法並びにそれを治療に使用する方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2022-10-07

(54)【発明の名称】抗原特異的Ｔ細胞バンク及びそれを製造する方法並びにそれを治療に使用する方法

(51)【国際特許分類】

   C12Q 1/68 20180101AFI20220930BHJP

   A61K 35/17 20150101ALI20220930BHJP

   A61P 31/12 20060101ALI20220930BHJP

   A61P 35/00 20060101ALI20220930BHJP

   A61P 37/02 20060101ALI20220930BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20220930BHJP

   C12Q 1/02 20060101ALI20220930BHJP

   C12N 5/0783 20100101ALI20220930BHJP

   C12N 1/00 20060101ALI20220930BHJP

   C12Q 1/04 20060101ALI20220930BHJP

   C40B 40/02 20060101ALI20220930BHJP

【ＦＩ】

C12Q1/68

A61K35/17 Z

A61P31/12

A61P35/00

A61P37/02

A61P43/00 121

C12Q1/02

C12N5/0783

C12N1/00 T

C12Q1/04

C40B40/02

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2022506160

(86)(22)【出願日】2020-07-29

(85)【翻訳文提出日】2022-03-25

(86)【国際出願番号】 US2020044080

(87)【国際公開番号】W WO2021021937

(87)【国際公開日】2021-02-04

(31)【優先権主張番号】62/880,006

(32)【優先日】2019-07-29

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(31)【優先権主張番号】62/887,802

(32)【優先日】2019-08-16

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(31)【優先権主張番号】63/054,161

(32)【優先日】2020-07-20

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】391058060

【氏名又は名称】ベイラー カレッジ オブ メディスン

【氏名又は名称原語表記】ＢＡＹＬＯＲ ＣＯＬＬＥＧＥ ＯＦ ＭＥＤＩＣＩＮＥ

(74)【代理人】

【識別番号】110000729

【氏名又は名称】特許業務法人 ユニアス国際特許事務所

(72)【発明者】

【氏名】ヴェラ ヴァルデス、フアン フェルナンド

(72)【発明者】

【氏名】リーン、アン マリー

(72)【発明者】

【氏名】ツァンノウ、イフィゲネイア

【テーマコード（参考）】

4B063

4B065

4C087

【Ｆターム（参考）】

4B063QA05

4B063QA13

4B063QA18

4B063QQ03

4B063QQ08

4B063QQ42

4B063QQ79

4B063QR32

4B063QR48

4B063QR72

4B063QR77

4B065AA94X

4B065AC12

4B065AC20

4B065BA21

4B065BA25

4B065CA24

4B065CA44

4C087AA01

4C087BB44

4C087BB64

4C087NA14

4C087ZB07

4C087ZB26

4C087ZB33

4C087ZC75

(57)【要約】

【課題】抗原特異的細胞バンク及びそれを製造する方法、及びそれを治療の為に使用する方法を提供する。
【解決手段】本開示の実施形態には、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクの構築に使用するための適切なドナーを同定および選択する方法；抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンク；ならびにそのようなミニバンクの複数から成るドナーバンクが含まれる。本開示は、そのようなドナーミニバンク又はドナーバンクからの少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を患者（例えば、移植手順において移植ドナーから移植物を受け取った人）に投与することを含む疾患又は状態を治療する方法、並びに特定の患者に対してドナーミニバンク内の最良のＨＬＡ適合抗原特異的Ｔ細胞株を選択するための方法を含む。
【選択図】図１

【特許請求の範囲】

【請求項1】

抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクの構築において使用するのに適したドナーを同定する方法であって、前記方法は、
（ａ）第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者と比較する工程；
（ｂ）工程（ａ）における比較に基づいて、前記第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のＨＬＡアレルが適合する前記第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程；
（ｃ）前記第１のドナーミニバンクに含めるために前記第１の最適合ドナーを選択する工程；
（ｄ）前記第１のドナープールから前記第１の最適合ドナーを除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーを除く前記第１のドナープール由来の前記第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程；
（ｅ）前記第１の複数の見込み患者から、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く前記第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程；および
（ｆ）工程（ｄ）および（ｅ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、工程（ａ）～（ｅ）をさらに１回以上反復する工程であって、ここで、工程（ｃ）に従って追加の最適合ドナーが選択されるたびに、工程（ｄ）に従ってそれぞれのドナープールからその追加の最適合ドナーが除去され；次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｅ）に従ってそれぞれの複数の見込み患者から次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者が除去され；それにより、前記第１のドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数が、前記方法の各サイクル後に１ずつ増加し、それにより、前記選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従って前記方法の各サイクル後に前記患者集団内の前記複数の見込み患者の数が減少し；前記第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが前記複数の見込み患者に残るまで、または前記ドナープールにドナーが残らなくなるまで、工程（ａ）～（ｅ）を反復する、工程
を含む、方法。

【請求項2】

工程（ａ）～（ｅ）が、前記第１の見込み患者集団の５％以下が前記複数の見込み患者に残るまで工程（ｆ）に従って繰り返される、請求項１に記載の方法。

【請求項3】

前記第１のドナーミニバンクが、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する１つ以上の抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を備える、請求項１または２に記載の方法。

【請求項4】

前記第１のドナーミニバンクが、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する１つ以上の抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を提供する、請求項１または２に記載の方法。

【請求項5】

工程（ｂ）および（ｅ）からの前記２つ以上のアレルが、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレル；少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレル；または少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む、請求項１～４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項6】

前記第１のドナープールが、少なくとも１０人のドナーを含む、請求項１～５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項7】

前記第１の見込み患者集団が、少なくとも１００人の患者を含む、請求項１～６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項8】

前記第１の見込み患者集団が、全世界もしくは全米の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団；および／または全世界もしくは全米の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項１～７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項9】

前記第１の見込み患者集団が、米国の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項１～７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項10】

抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクの構築において使用するのに適したドナーを同定する方法であって、前記方法は、
Ａ）請求項１に記載の方法に示された全工程を行い、それにより、第１のミニバンクを構築する工程；および
Ｂ）請求項１に記載の方法に示されたように工程（ａ）～（ｆ）の第２ラウンドを１回以上反復して、１つ以上の第２のミニバンクを構築する工程であって、ここで、前記方法の各第２ラウンドを開始する前に、前記方法は、
（ｉ）新しいドナープールを作製する工程であって、前記新しいドナープールは、
ｉａ．先の各サイクルの工程（ｄ）に従って前記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから除去された任意の最適合ドナーを差し引いた前記第１のドナープール；
ｉｂ．前記第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団；または
ｉｃ．ｉａとｉｂとの組み合わせ
を含む、工程；および
（ｉｉ）先の各サイクルの工程（ｅ）に従って前記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから以前に除去されたすべての見込み患者を戻すことによって、前記第１の見込み患者集団から前記第１の複数の見込み患者を再構築する工程
を含む、方法。

【請求項11】

前記方法の各ラウンドについて、工程（ｆ）に従って、前記第１の見込み患者集団の５％以下が前記複数の見込み患者に残るまで工程（ａ）～（ｅ）を繰り返し、ゆえに、各ドナーミニバンクが、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を前記１人以上の最適合ドナーの間に含む、請求項１０に記載の方法。

【請求項12】

各ドナーミニバンクが、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を前記抗原特異的Ｔ細胞株の間に含む、請求項１０または１１に記載の方法。

【請求項13】

各ドナーミニバンクが、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を前記抗原特異的Ｔ細胞株の間に提供する、請求項１０または１１に記載の方法。

【請求項14】

工程（ｂ）および（ｅ）からの前記２つ以上のアレルが、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレル；少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレル；または少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む、請求項１０～１３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項15】

前記第１のドナープールが、少なくとも１０人のドナーを含む、請求項１０～１４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項16】

前記第１の見込み患者集団が、少なくとも１００人の患者を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項17】

前記第１の見込み患者集団が、全世界もしくは全米の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団；および／または全世界もしくは全米の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項１０～１６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項18】

前記第１の見込み患者集団が、米国の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項１０～１６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項19】

前記ドナーバンクに含まれる各ドナーから血液を収集する工程または前記ドナーバンクに含まれる各ドナーから収集された血液を手に入れる工程をさらに含む、請求項１～１８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項20】

前記ドナーバンクに含まれる各ドナーから単核球（ＭＮＣ）を収集する工程または前記ドナーバンクに含まれる各ドナーから収集されたＭＮＣを手に入れる工程をさらに含む、請求項１～１９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項21】

前記ＭＮＣが、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）を含む、請求項２０に記載の方法。

【請求項22】

前記ＭＮＣを単離する工程または単離された前記ＭＮＣを手に入れる工程を含む、請求項２０に記載の方法。

【請求項23】

前記ＰＢＭＣを単離する工程または単離された前記ＰＢＭＣを手に入れる工程を含む、請求項２１に記載の方法。

【請求項24】

前記単離が、フィコール勾配または密度勾配によって行われる、請求項２２または２３に記載の方法。

【請求項25】

前記細胞を培養する工程または前記細胞を凍結保存する工程をさらに含む、請求項２０～２４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項26】

培養中の前記細胞を好適な培養条件下で１つ以上の抗原と接触させて、抗原特異的Ｔ細胞を刺激し、拡大する工程をさらに含み、ここで、必要に応じて、前記１つ以上の抗原は、（ｉ）１つ以上のウイルス抗原、（ｉｉ）１つ以上の腫瘍関連抗原；または（ｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）との組み合わせを含む、請求項２５に記載の方法。

【請求項27】

抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法であって、前記方法は、
（ａ）第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを第１の複数の各見込み患者と比較する工程；
（ｂ）工程（ａ）における比較に基づいて、前記第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のアレルが適合する第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程；
（ｃ）前記第１のドナーミニバンクに含めるために前記第１の最適合ドナーを選択する工程；
（ｄ）前記第１のドナープールから前記第１の最適合ドナーを除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーを除く前記第１のドナープール由来の前記第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程；
（ｅ）前記第１の複数の見込み患者から、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く前記第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程；
（ｆ）工程（ｄ）および（ｅ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、工程（ａ）～（ｅ）をさらに１回以上反復する工程であって、ここで、工程（ｃ）に従って追加の最適合ドナーが選択されるたびに、その最適合ドナーが、工程（ｄ）に従ってそれぞれのドナープールから除去され；次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｅ）に従ってそれぞれの複数の見込み患者から次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者が除去され；それにより、前記ドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数が、前記方法の各サイクル後に１ずつ増加し、それにより、前記選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従って前記方法の各サイクル後に前記患者集団内の前記複数の見込み患者の数が減少し；前記第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが前記複数の見込み患者に残るまで、または前記ドナープールにドナーが残らなくなるまで、工程（ａ）～（ｅ）を反復する、工程；
（ｇ）前記ドナーミニバンクに含まれるそれぞれの各ドナーから得られた血液からＭＮＣを単離するか、または前記血液から単離されたＭＮＣを手に入れる工程；
（ｈ）前記ＭＮＣを培養する工程；
（ｉ）培養中の前記ＭＮＣを１つ以上の抗原または１つ以上の抗原由来の１つ以上のエピトープと好適な培養条件下で接触させて、前記それぞれの各ドナーのＭＮＣ由来の抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を刺激し、拡大し；それにより、複数の抗原特異的Ｔ細胞株を作製する工程であって、前記抗原特異的Ｔ細胞株の各々は、それぞれの各ドナーのＭＮＣに由来する抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を含み、工程（ｇ）～（ｉ）の前記ＭＮＣは、必要に応じてＰＢＭＣである、工程；および
（ｊ）必要に応じて、前記複数の抗原特異的Ｔ細胞株を凍結保存する工程
を含む、方法。

【請求項28】

前記方法の各ラウンドについて、工程（ｆ）に従って、前記第１の見込み患者集団の５％以下が前記複数の見込み患者に残るまで工程（ａ）～（ｅ）を繰り返し、ゆえに、各ドナーミニバンクが、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する少なくとも１つの同種異系抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を前記１人以上の最適合ドナーの間に含む、請求項２７に記載の方法。

【請求項29】

前記ドナーミニバンクが、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する１つ以上の同種異系抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を前記抗原特異的Ｔ細胞株の間に含む、請求項２７または２８に記載の方法。

【請求項30】

前記ドナーミニバンクが、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、前記第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて前記患者のＨＬＡタイプに適合する１つ以上の同種異系抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を前記抗原特異的Ｔ細胞株の間に含む、請求項２７または２８に記載の方法。

【請求項31】

工程（ｂ）および（ｅ）からの前記２つ以上のアレルが、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレル；少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレル；または少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む、請求項２７～３０のいずれか１項に記載の方法。

【請求項32】

前記第１のドナープールが、少なくとも１０人のドナーを含む、請求項２７～３１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項33】

前記第１の見込み患者集団が、少なくとも１００人の患者を含む、請求項２７～３２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項34】

前記第１の見込み患者集団が、全世界もしくは全米の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団；および／または全世界もしくは全米の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項２７～３３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項35】

前記第１の見込み患者集団が、米国の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項２７～３３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項36】

前記培養工程が、気体透過性の培養表面を備える容器において行われる、請求項２７に記載の方法。

【請求項37】

前記容器が、気体透過性の部分を備える注入バッグ、または剛性容器である、請求項３６に記載の方法。

【請求項38】

前記容器が、ＧＲｅｘバイオリアクターである、請求項３６に記載の方法。

【請求項39】

前記ＰＢＭＣを１つ以上のサイトカインの存在下において培養する工程を含む、請求項２７～３８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項40】

前記サイトカインは、ＩＬ４、ＩＬ７、またはＩＬ４およびＩＬ７を含む、請求項３９に記載の方法。

【請求項41】

前記サイトカインは、ＩＬ４およびＩＬ７を含むが、ＩＬ２を含まない、請求項３９に記載の方法。

【請求項42】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣが、（ｉ）ホールタンパク質、（ｉｉ）各抗原の一部もしくは配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックス、または（ｉｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）との組み合わせの形態の１つ以上の抗原の存在下において培養される、請求項２７～４１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項43】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣが、複数のペプミックスの存在下において培養され、各ペプミックスは、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含む、請求項２７～４１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項44】

各抗原が、腫瘍関連抗原である、請求項２７～４３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項45】

少なくとも１つの抗原が、ウイルス抗原であり、少なくとも１つの抗原が、腫瘍関連抗原である、請求項２７～４３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項46】

各抗原が、ウイルス抗原である、請求項２７～４３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項47】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれ以上の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み、各ペプミックスは、抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含む、請求項２７～４６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項48】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを複数のペプミックスの存在下において培養する工程を含み、ここで、各ペプミックスは、前記複数のペプミックス内のその他の各ペプミックスによってカバーされる抗原とは異なる少なくとも１つの抗原をカバーし、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれ以上の異なる抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項２７～４７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項49】

少なくとも２つの異なるウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項４５～４８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項50】

前記ウイルス抗原が、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＪＣウイルス、ＨＨＶ６、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ボカウイルス、コロナウイルス、ＬＣＭＶ、ムンプス、麻疹、ヒトメタニューモウイルス、パルボウイルスＢ、ロタウイルス、メルケル細胞ウイルス、単純ヘルペスウイルス、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＨＰＶ、ＨＩＶ、ＨＴＬＶ１、ＨＨＶ８および西ナイルウイルス、ジカウイルス、エボラから選択されるウイルスに由来する、請求項４５～４９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項51】

少なくとも１つのペプミックスが、以下のウイルス：ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ヒトメタニューモウイルス（ＨＭＰＶ）の各々由来の抗原をカバーする、請求項４５～４９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項52】

前記インフルエンザ抗原が、インフルエンザＡ抗原であるＮＰ１、ＭＰ１およびそれらの組み合わせから選択され；前記ＲＳＶ抗原が、Ｎ、Ｆおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ｈＭＰＶ抗原が、Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１、Ｍおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＰＩＶ抗原が、Ｍ、ＨＮ、Ｎ、Ｆおよびそれらの組み合わせから選択される、請求項５０または５１に記載の方法。

【請求項53】

前記ＰＢＭＣが、インフルエンザＡ抗原であるＮＰ１およびＭＰ１；ＲＳＶ抗原であるＮおよびＦ；ｈＭＰＶ抗原であるＦ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭ；ならびにＰＩＶ抗原であるＭ、ＨＮ、ＮおよびＦを網羅するペプミックスの存在下において培養される、請求項５０～５２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項54】

少なくとも１つのペプミックスが、以下の各ウイルスＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＨＨＶ６の各々由来の抗原をカバーする、請求項４５～４９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項55】

前記ＥＢＶ抗原が、ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１、ＢＺＬＦ１およびそれらの組み合わせから選択され；前記ＣＭＶ抗原が、ＩＥ１、ｐｐ６５およびそれらの組み合わせから選択され；前記アデノウイルス抗原が、ヘキソン、ペントンおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＢＫウイルス抗原が、ＶＰ１、ラージＴおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＨＨＶ６抗原が、Ｕ９０、Ｕ１１、Ｕ１４およびそれらの組み合わせから選択される、請求項５０または５４に記載の方法。

【請求項56】

前記ＰＢＭＣが、ＥＢＶ抗原であるＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１およびＢＺＬＦ１；ＣＭＶ抗原であるＩＥ１およびｐｐ６５；アデノウイルス抗原であるヘキソンおよびペントン；ＢＫウイルス抗原であるＶＰ１およびラージＴ；ならびにＨＨＶ６抗原であるＵ９０、Ｕ１１およびＵ１４を網羅するペプミックスの存在下において培養される、請求項５０、５４または５５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項57】

ＨＢＶ由来の少なくとも１つの抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項４５～４８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項58】

前記ＨＢＶ抗原が、ＨＢＶコア抗原、ＨＢＶ表面抗原、またはＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原である、請求項５７に記載の方法。

【請求項59】

ＨＨＶ８由来の少なくとも１つの抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項４５～４８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項60】

前記ＨＨＶ８抗原が、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）およびそれらの組み合わせから選択される、請求項５９に記載の方法。

【請求項61】

コロナウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項４５～４８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項62】

前記コロナウイルスが、α－コロナウイルス（α－ＣｏＶ）である、請求項６１に記載の方法。

【請求項63】

前記コロナウイルスが、β－コロナウイルス（β－ＣｏＶ）である、請求項６１に記載の方法。

【請求項64】

前記β－ＣｏＶが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ、ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１およびＨＣｏＶ－ＯＣ４３から選択される、請求項６３に記載の方法。

【請求項65】

前記コロナウイルスが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２である、請求項６１に記載の方法。

【請求項66】

前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原が、ｎｓｐ１；ｎｓｐ３；ｎｓｐ４；ｎｓｐ５；ｎｓｐ６；ｎｓｐ７ａ、ｎｓｐ８、ｎｓｐ１０；ｎｓｐ１２；ｎｓｐ１３；ｎｓｐ１４；ｎｓｐ１５；およびｎｓｐ１６からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む、請求項６５に記載の方法。

【請求項67】

前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原が、スパイク（Ｓ）；エンベロープタンパク質（Ｅ）；マトリックスタンパク質（Ｍ）；およびヌクレオカプシドタンパク質（Ｎ）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む、請求項６５または６６に記載の方法。

【請求項68】

前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＡＰ３Ａ）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳ７）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳ８）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ１０）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ９Ｂ）；およびＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（Ｙ１４）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む、請求項６５～６７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項69】

前記ペプミックスが、１５ｍｅｒのペプチドを含む、請求項４２～６８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項70】

前記抗原を網羅する前記ペプミックス中のペプチドが、順に１１アミノ酸重複する、請求項４２～６９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項71】

前記抗原特異的Ｔ細胞を拡大する工程をさらに含む、請求項２７～７０のいずれか１項に記載の方法。

【請求項72】

前記抗原特異的Ｔ細胞を抗原特異的細胞傷害性について試験する工程をさらに含む、請求項２７～７１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項73】

請求項２７～７２のいずれか１項に記載の方法を介して作製される、抗原特異的Ｔ細胞株のミニバンク。

【請求項74】

請求項７３に記載のミニバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む、疾患または状態を処置する方法。

【請求項75】

前記患者への前記抗原特異的Ｔ細胞株の投与に対する唯一の基準が、前記患者が、前記抗原特異的Ｔ細胞株の製造において使用されるＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを単離してきたドナーと少なくとも２つのＨＬＡアレルを共有していることである、請求項７４に記載の方法。

【請求項76】

前記疾患が、ウイルス感染症である、請求項７４または７５に記載の方法。

【請求項77】

前記疾患が、癌である、請求項７４または７５に記載の方法。

【請求項78】

患者が、免疫無防備状態である、請求項７４～７６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項79】

前記患者が、前記疾患もしくは状態または別の疾患もしくは状態を処置するために前記患者が受けた処置に起因して免疫無防備状態である、請求項７８に記載の方法。

【請求項80】

前記患者が、年齢に起因して免疫無防備状態である、請求項７８に記載の方法。

【請求項81】

前記特許が、低年齢または高齢に起因して免疫無防備状態である、請求項８０に記載の方法。

【請求項82】

前記状態が、免疫不全である、請求項７４に記載の方法。

【請求項83】

前記免疫不全が、原発性免疫不全である、請求項８２に記載の方法。

【請求項84】

前記患者が、移植治療を必要としている、請求項８３に記載の方法。

【請求項85】

請求項１～２６のいずれか１項に記載の方法を介して選択された複数のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株のミニバンク。

【請求項86】

請求項１～２６のいずれか１項に記載の方法を介して選択された複数のドナーに由来する複数のミニバンクを含む、抗原特異的Ｔ細胞株のバンク。

【請求項87】

移植手技において移植ドナーから移植材料を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療において投与するために、第１の抗原特異的Ｔ細胞株を請求項７３もしくは８５に記載のミニバンクまたは請求項８６に記載のバンクに含まれるミニバンクから選択する方法であって、前記方法は、
（ａ）前記患者のＨＬＡタイプと前記移植ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者と前記移植ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの第１セットを特定する工程；
（ｂ）前記共有ＨＬＡアレルの第１セットを、請求項７３または８５に記載のミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーまたは請求項７４に記載のバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較して、前記共有ＨＬＡアレルの第１セットと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程；
（ｃ）工程（ｂ）において特定されたＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、Ｘという任意数値スコアを割り当て；７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１を割り当て；６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２を割り当てるなどする、工程；
（ｄ）前記患者のＨＬＡタイプと、請求項７３もしくは８５に記載のミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するかまたは請求項８６に記載のバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者とそれぞれの各Ｔ細胞株ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの１つ以上の追加セットを特定する工程；
（ｅ）Ｔ細胞株と前記患者との間で共通している工程（ｄ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、この請求項の工程（ｃ）において定義されたＸの５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、４）を割り当て；７つの共有アレルには、この請求項の工程（ｃ）において定義されたＸ１の５０％というスコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３．５）を割り当て；６つの共有アレルには、この請求項の工程（ｃ）において定義されたＸ２の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３）を割り当てるなどする、工程；
（ｆ）請求項７３もしくは８５に記載のミニバンク内または請求項８６に記載のバンクに含まれるミニバンク内の各抗原特異的Ｔ細胞株に対して、前記１次スコアと前記２次スコアとを合算する工程；および
（ｇ）工程（ｆ）で最高スコアを有する抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者への投与のために選択する工程
を含む、方法。

【請求項88】

前記移植材料が、幹細胞、実質臓器および／または骨髄を含む、請求項８７に記載の方法。

【請求項89】

請求項８７に記載の工程（ｇ）において選択された前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者に投与する工程をさらに含む、請求項８７または８８に記載の方法。

【請求項90】

Ｘ＝８である、請求項８７に記載の方法。

【請求項91】

前記投与が、ウイルス感染症または腫瘍を処置するための投与である、請求項８９または９０に記載の方法。

【請求項92】

前記投与が、移植前の原発性免疫不全に対する投与である、請求項８９または９０に記載の方法。

【請求項93】

第２の抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者に投与する工程をさらに含む、請求項８７～９２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項94】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株と同じミニバンクから選択される、請求項９３に記載の方法。

【請求項95】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株を得たミニバンクとは異なるミニバンクから選択される、請求項９３または９４に記載の方法。

【請求項96】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株以外の、前記ドナーバンクに残っているすべての抗原特異的Ｔ細胞株を用いて、請求項８７に記載の方法を反復することによって選択される、請求項９３～９５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項97】

抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクを構築する方法であって、前記方法は、
Ａ）請求項２７に記載の方法に示された工程（ａ）～（ｊ）を行い、それにより、第１のミニバンクを構築する工程；
Ｂ）請求項２７に記載の方法に示されたように工程（ａ）～（ｊ）の第２ラウンドを１回以上反復して、１つ以上の第２のミニバンクを構築する工程であって、ここで、前記方法の各第２ラウンドを開始する前に、前記方法は、
（１）新しいドナープールを作製する工程であって、前記新しいドナープールは、
ａ．先の各サイクルの工程（ｄ）に従って前記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから除去された任意の最適合ドナーを差し引いた前記第１のドナープール；
ｂ．前記第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団；または
ｃ．ａとｂとの組み合わせ
を含む、工程；および
（２）先の各サイクルの工程（ｅ）に従って前記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから以前に除去されたすべての見込み患者を戻すことによって、前記第１の見込み患者集団から前記第１の複数の見込み患者を再構築する工程
を含む、工程
を含み；
Ｃ）工程（ｇ）～（ｊ）は、必要に応じて、前記方法の各ラウンドの後に行われてもよいし、前記方法の工程Ａ）の後の任意の時点において行われてもよい、
方法。

【請求項98】

前記培養が、気体透過性の培養表面を備える容器において行われる、請求項９７に記載の方法。

【請求項99】

前記容器が、気体透過性の部分を備える注入バッグ、または剛性容器である、請求項９８に記載の方法。

【請求項100】

前記容器が、ＧＲｅｘバイオリアクターである、請求項９８に記載の方法。

【請求項101】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを１つ以上のサイトカインの存在下において培養する工程を含む、請求項９７～１００のいずれか１項に記載の方法。

【請求項102】

前記サイトカインは、ＩＬ４、ＩＬ７、またはＩＬ４およびＩＬ７を含む、請求項１０１に記載の方法。

【請求項103】

前記サイトカインは、ＩＬ４およびＩＬ７を含むが、ＩＬ２を含まない、請求項１０１に記載の方法。

【請求項104】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣが、（ｉ）ホールタンパク質、（ｉｉ）各抗原の一部もしくは配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックス、または（ｉｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）との組み合わせの形態の１つ以上の抗原の存在下において培養される、請求項９７～１０３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項105】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣが、複数のペプミックスの存在下において培養され、各ペプミックスは、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含む、請求項９７～１０３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項106】

各抗原が、腫瘍関連抗原である、請求項９７～１０５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項107】

少なくとも１つの抗原が、ウイルス抗原であり、少なくとも１つの抗原が、腫瘍関連抗原である、請求項９７～１０５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項108】

各抗原が、ウイルス抗原である、請求項９７～１０５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項109】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれ以上の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み、各ペプミックスは、抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含む、請求項９７～１０８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項110】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを複数のペプミックスの存在下において培養する工程を含み、ここで、各ペプミックスは、前記複数のペプミックス内のその他の各ペプミックスによってカバーされる抗原とは異なる少なくとも１つの抗原をカバーし、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれ以上の異なる抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項９７～１０９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項111】

少なくとも２つの異なるウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、前記複数のペプミックスによってカバーされる、請求項９７～１１０のいずれか１項に記載の方法。

【請求項112】

前記ウイルス抗原が、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＪＣウイルス、ＨＨＶ６、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ボカウイルス、コロナウイルス、ＬＣＭＶ、ムンプス、麻疹、ヒトメタニューモウイルス、パルボウイルスＢ、ロタウイルス、メルケル細胞ウイルス、単純ヘルペスウイルス、ＨＢＶ、ＨＣＶ、ＨＰＶ、ＨＩＶ、ＨＴＬＶ１、ＨＨＶ８、ジカウイルス、エボラおよび西ナイルウイルスから選択されるウイルスに由来する、請求項９７～１１１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項113】

少なくとも１つのペプミックスが、以下のウイルス：ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ヒトメタニューモウイルス（ＨＭＰＶ）の各々由来の抗原をカバーする、請求項１０７～１１１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項114】

前記インフルエンザ抗原が、インフルエンザＡ抗原であるＮＰ１、ＭＰ１およびそれらの組み合わせから選択され；前記ＲＳＶ抗原が、Ｎ、Ｆおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ｈＭＰＶ抗原が、Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１、Ｍおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＰＩＶ抗原が、Ｍ、ＨＮ、Ｎ、Ｆおよびそれらの組み合わせから選択される、請求項１１２または１１３に記載の方法。

【請求項115】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣが、インフルエンザＡ抗原であるＮＰ１およびＭＰ１；ＲＳＶ抗原であるＮおよびＦ；ｈＭＰＶ抗原であるＦ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭ；ならびにＰＩＶ抗原であるＭ、ＨＮ、ＮおよびＦを網羅するペプミックスの存在下において培養される、請求項１１２～１１４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項116】

少なくとも１つのペプミックスが、以下のウイルスＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＨＨＶ６の各々由来の抗原をカバーする、請求項１０７～１１１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項117】

前記ＥＢＶ抗原が、ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１、ＢＺＬＦ１およびそれらの組み合わせから選択され；前記ＣＭＶ抗原が、ＩＥ１、ｐｐ６５およびそれらの組み合わせから選択され；前記アデノウイルス抗原が、ヘキソン、ペントンおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＢＫウイルス抗原が、ＶＰ１、ラージＴおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＨＨＶ６抗原が、Ｕ９０、Ｕ１１、Ｕ１４およびそれらの組み合わせから選択される、請求項１１２または１１６に記載の方法。

【請求項118】

前記ＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣが、ＥＢＶ抗原であるＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１およびＢＺＬＦ１；ＣＭＶ抗原であるＩＥ１およびｐｐ６５；アデノウイルス抗原であるヘキソンおよびペントン；ＢＫウイルス抗原であるＶＰ１およびラージＴ；ならびにＨＨＶ６抗原であるＵ９０、Ｕ１１およびＵ１４を網羅するペプミックスの存在下において培養される、請求項１１２、１１６または１１７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項119】

少なくとも１つの抗原が、ＨＢＶに由来する、請求項９７～１１１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項120】

前記ＨＢＶ抗原が、ＨＢＶコア抗原、ＨＢＶ表面抗原、またはＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原である、請求項１１９に記載の方法。

【請求項121】

少なくとも１つの抗原が、ＨＨＶ８に由来する、請求項９７～１１１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項122】

前記ＨＨＶ８抗原が、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）およびそれらの組み合わせから選択される、請求項１２１に記載の方法。

【請求項123】

少なくとも１つの抗原が、コロナウイルスに由来する、請求項９７～１１１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項124】

前記コロナウイルスが、α－コロナウイルス（α－ＣｏＶ）である、請求項１２３に記載の方法。

【請求項125】

前記コロナウイルスが、β－コロナウイルス（β－ＣｏＶ）である、請求項１２３に記載の方法。

【請求項126】

前記β－ＣｏＶが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ、ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１およびＨＣｏＶ－ＯＣ４３から選択される、請求項１２５に記載の方法。

【請求項127】

前記コロナウイルスが、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２である、請求項１２３に記載の方法。

【請求項128】

前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原が、ｎｓｐ１；ｎｓｐ３；ｎｓｐ４；ｎｓｐ５；ｎｓｐ６；ｎｓｐ７ａ、ｎｓｐ８、ｎｓｐ１０；ｎｓｐ１２；ｎｓｐ１３；ｎｓｐ１４；ｎｓｐ１５；およびｎｓｐ１６からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む、請求項１２７に記載の方法。

【請求項129】

前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原が、スパイク（Ｓ）；エンベロープタンパク質（Ｅ）；マトリックスタンパク質（Ｍ）；およびヌクレオカプシドタンパク質（Ｎ）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む、請求項１２７または１２８に記載の方法。

【請求項130】

前記ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原が、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＡＰ３Ａ）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳ７）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳ８）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ１０）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ９Ｂ）；およびＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（Ｙ１４）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む、請求項１２７～１２９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項131】

前記ペプミックスが、１５ｍｅｒのペプチドを含む、請求項１０４～１３０のいずれか１項に記載の方法。

【請求項132】

前記抗原を網羅する前記ペプミックス中のペプチドが、順に１１アミノ酸重複する、請求項１０４～１３２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項133】

前記抗原特異的Ｔ細胞を拡大する工程をさらに含む、請求項９７～１３２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項134】

前記抗原特異的Ｔ細胞株を抗原特異的細胞傷害性について試験する工程をさらに含む、請求項９７～１３３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項135】

抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクを含むドナーバンクであって、前記ドナーバンクは、請求項９７～１３４のいずれか１項に記載の方法を介して作製される、ドナーバンク。

【請求項136】

疾患または状態を処置する方法であって、請求項１３５に記載のドナーバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む、方法。

【請求項137】

前記患者への前記抗原特異的Ｔ細胞株の投与に対する唯一の基準が、前記患者が、少なくとも２つのＨＬＡアレルを、前記Ｔ細胞株の製造において使用されるＭＮＣ、必要に応じてＰＢＭＣを単離してきたドナーと共有していることである、請求項１３６に記載の方法。

【請求項138】

前記疾患が、ウイルス感染症である、請求項１３６または１３７に記載の方法。

【請求項139】

前記疾患が、癌である、請求項１３６または１３７に記載の方法。

【請求項140】

患者が、免疫無防備状態である、請求項１３６～１３９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項141】

前記患者が、前記疾患もしくは状態または別の疾患もしくは状態を処置するために前記患者が受けた処置に起因して免疫無防備状態である、請求項１４０に記載の方法。

【請求項142】

前記患者が、年齢に起因して免疫無防備状態である、請求項１４０に記載の方法。

【請求項143】

前記特許が、低年齢または高齢に起因して免疫無防備状態である、請求項１４２に記載の方法。

【請求項144】

前記状態が、免疫不全である、請求項１３６に記載の方法。

【請求項145】

前記免疫不全が、原発性免疫不全である、請求項１４４に記載の方法。

【請求項146】

前記患者が、移植治療を必要としている、請求項１４５に記載の方法。

【請求項147】

移植手技において移植ドナーから移植材料を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療において投与するために、第１の抗原特異的Ｔ細胞株を請求項１３５に記載のドナーバンクから選択する方法であって、前記方法は、
（ａ）前記患者のＨＬＡタイプと前記移植ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者と前記移植ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの第１セットを特定する工程；
（ｂ）前記共有ＨＬＡアレルの第１セットを、請求項１３５に記載のドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する前記各ドナーのＨＬＡタイプと比較して、前記共有ＨＬＡアレルの第１セットと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程；
（ｃ）工程（ｂ）において特定されたＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、８というスコアを割り当て、７つの共有アレルには、７というスコアを割り当てるなどする、工程；
（ｄ）前記患者のＨＬＡタイプと、請求項１３５に記載のドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者とそれぞれの各Ｔ細胞株ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの１つ以上の追加セットを特定する工程；
（ｅ）Ｔ細胞株と前記患者との間で共通している工程（ｄ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、８の５０％、すなわち４というスコアを割り当て；７つの共有アレルには、７の５０％、すなわち３．５というスコアを割り当てるなどする、工程；
（ｆ）請求項１３５に記載のバンク内の各抗原特異的Ｔ細胞株に対して、前記１次スコアと前記２次スコアとを合算する工程；および
（ｇ）工程（ｆ）で最高スコアを有する第１の抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者への投与のために選択する工程
を含む、方法。

【請求項148】

前記移植材料が、幹細胞、実質臓器および／または骨髄を含む、請求項１４７に記載の方法。

【請求項149】

請求項１２３に記載の工程（ｇ）において選択された第１の抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者に投与する工程をさらに含む、請求項１４７または１４８に記載の方法。

【請求項150】

投与がＧＶＨＤをもたらさない、請求項１４９に記載の方法。

【請求項151】

前記投与が、ウイルス感染症または腫瘍を処置するための投与である、請求項１４９または１５０に記載の方法。

【請求項152】

前記投与が、移植前の原発性免疫不全に対する投与である、請求項１４９または１５０に記載の方法。

【請求項153】

第２の抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者に投与する工程をさらに含む、請求項１４９～１５２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項154】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株と同じドナーバンクから選択される、請求項１５３に記載の方法。

【請求項155】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株とは異なるドナーミニバンクから選択される、請求項１５３または１５４に記載の方法。

【請求項156】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株以外の、前記ドナーバンク内の残りのすべてのＴ細胞株を用いて請求項１２３に記載の方法を反復することによって選択される、請求項１５３～１５５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項157】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株が処置有効性を示した後に前記患者に投与される、請求項９３～９６および１５３～１５６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項158】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株が処置有効性を示さなかった後に前記患者に投与される、請求項９３～９６および１５３～１５６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項159】

前記処置有効性が、ウイルス感染症に対するものである、請求項１５７または１５８に記載の方法。

【請求項160】

前記処置有効性が、（ｉ）感染のウイルス血症の消失、（ｉｉ）感染のウイルス尿症の消失、および／または（ｉｉｉ）前記患者由来のサンプル中のウイルス量の消失に基づいて計測され、ここで、前記サンプルは、必要に応じて、前記抗原特異的Ｔ細胞株の投与後の、前記患者由来の組織サンプル、前記患者由来の体液サンプル、前記患者由来の脳脊髄液（ＣＳＦ）、前記患者由来のＢＡＬ、前記患者由来の便、およびそれらの組み合わせから選択される、請求項１５９に記載の方法。

【請求項161】

前記処置有効性が、前記患者の末梢血中の検出可能なウイルス量をモニタリングすることによって計測される、請求項１５９または１６０のいずれか１項に記載の方法。

【請求項162】

前記処置有効性が、（ｉ）肉眼的血尿の消失；ＣＴＣＡＥ－ＰＲＯまたは患者および／もしくは臨床医が報告するアウトカムを調べる類似の評価ツールによって計測される出血性膀胱炎症状の低減を含む、請求項１５９～１６１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項163】

前記処置有効性が、癌に対するものである、請求項１５７または１５８に記載の方法。

【請求項164】

前記処置有効性が、前記抗原特異的Ｔ細胞株の投与後の腫瘍サイズの減少に基づいて計測される、請求項１６３に記載の方法。

【請求項165】

前記処置有効性が、前記患者の末梢血／血清中の検出可能な疾患負荷および／もしくは腫瘍溶解のマーカーをモニタリングすること、画像診断を介して腫瘍の状態をモニタリングすること、またはそれらの組み合わせによって計測される、請求項１６３または１６４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項166】

前記第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、前記第１の抗原特異的Ｔ細胞株が有害臨床反応をもたらした後に前記患者に投与される、請求項９３～９６および１５３～１６５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項167】

前記有害臨床反応が、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、サイトカイン放出症候群などの炎症反応を含む、請求項１６６に記載の方法。

【請求項168】

炎症反応が、（ｉ）発熱、悪寒、頭痛、倦怠感、疲労、悪心、嘔吐、関節痛から選択される全身症状；（ｉｉ）低血圧を含む血管症状；（ｉｉｉ）不整脈を含む心臓症状；（ｉｖ）呼吸困難；（ｖ）腎不全および尿毒症を含む腎症状；ならびに（ｖｉ）凝固障害および血球貪食性リンパ組織球症様症候群を含む検査症状から選択される１つ以上の症状または徴候を観察することによって検出される、請求項１６７に記載の方法。

【請求項169】

抗原特異的Ｔ細胞の第１のドナーミニバンクの構築において使用するのに適したドナーを同定する方法であって、前記方法は、
（ａ）第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを決定するかまたは決定されている、工程；
（ｂ）第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプを決定するかまたは決定されている、工程；
（ｃ）第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプと、第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプとを比較する工程；
（ｄ）工程（ｃ）における比較に基づいて、前記第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のアレルが適合する前記第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程；
（ｅ）第１のドナーミニバンクに含めるために前記第１の最適合ドナーを選択する工程；
（ｆ）前記第１のドナープールから前記第１の最適合ドナーを除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーを除く前記第１のドナープール由来の前記第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程；
（ｇ）前記第１の複数の見込み患者から、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く前記第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程；および
（ｈ）工程（ｆ）および（ｇ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、工程（ｃ）～（ｇ）をさらに１回以上反復する工程であって、ここで、追加の最適合ドナーが、工程（ｅ）に従って選択されるたびに、その最適合ドナーが、工程（ｆ）に従ってそれぞれのドナープールから除去され；次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｇ）に従って次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者がそれぞれの複数の見込み患者から除去され；それにより、前記第１のドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数が、前記方法の各サイクル後に１ずつ増加し、それにより、前記選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従って前記方法の各サイクル後に前記患者集団内の前記複数の見込み患者の数が減少し；前記第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが前記複数の見込み患者に残るまで、または前記ドナープールにドナーが残らなくなるまで、工程（ｃ）～（ｇ）を反復する、工程
を含む、方法。

【請求項170】

抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法であって、前記方法は、
（ａ）第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを決定するかまたは決定されている、工程；
（ｂ）第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプを決定するかまたは決定されている、工程；
（ｃ）前記第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを前記第１の複数の各見込み患者と比較する工程；
（ｄ）工程（ｃ）における比較に基づいて、前記第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のアレルが適合する前記第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程；
（ｅ）前記第１のドナーミニバンクに含めるために前記第１の最適合ドナーを選択する工程；
（ｆ）前記第１のドナープールから前記第１の最適合ドナーを除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーを除く前記第１のドナープール由来の前記第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程；
（ｇ）前記第１の複数の見込み患者から、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去し、それにより、前記第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く前記第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程；
（ｈ）工程（ｆ）および（ｇ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、工程（ｃ）～（ｇ）をさらに１回以上反復する工程であって、ここで、追加の最適合ドナーが、工程（ｅ）に従って選択されるたびに、その最適合ドナーが、工程（ｆ）に従ってそれぞれのドナープールから除去され；次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｇ）に従って次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者がそれぞれの複数の見込み患者から除去され；それにより、前記ドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数が、前記方法の各サイクル後に１ずつ増加し、それにより、前記選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従って前記方法の各サイクル後に前記患者集団内の前記複数の見込み患者の数が減少し；前記第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが前記複数の見込み患者に残るまで、または前記ドナープールにドナーが残らなくなるまで、工程（ｃ）～（ｇ）を反復する、工程；
（ｉ）前記ドナーミニバンクに含まれるそれぞれの各ドナーから得られた血液からＭＮＣを単離するか、または前記血液から単離されたＭＮＣを手に入れる工程；
（ｊ）前記ＭＮＣを培養する工程；
（ｋ）培養中の前記ＭＮＣを１つ以上の抗原または１つ以上の抗原由来の１つ以上のエピトープと好適な培養条件下で接触させて、前記それぞれの各ドナーのＭＮＣ由来の抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を刺激し、拡大し；それにより、複数の抗原特異的Ｔ細胞株を作製する工程であって、前記抗原特異的Ｔ細胞株の各々は、それぞれの各ドナーのＭＮＣに由来する抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を含み、工程（ｉ）～（ｋ）の前記ＭＮＣは、必要に応じてＰＢＭＣである、工程；および
（ｌ）必要に応じて、前記複数の抗原特異的Ｔ細胞株を凍結保存する工程
を含む、方法。

【請求項171】

比較される前記ＨＬＡタイプが、ＨＬＡアレルであるＨＬＡ Ａ、ＨＬＡ Ｂ、ＤＲＢ１およびＤＱＢ１を含む、請求項８７～９６および１４７～１６８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項172】

比較される前記ＨＬＡタイプが、ＨＬＡアレルであるＨＬＡ Ａ、ＨＬＡ Ｂ、ＤＲＢ１およびＤＱＢ１からなる、請求項８７～９６および１４７～１６８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項173】

前記方法が、まず第１に、前記ミニバンク内の各細胞株を前記患者のＨＬＡタイプと比較し、次いで第２に、前記ミニバンク内の各細胞株を前記移植ドナーのＨＬＡタイプと比較し、適合する細胞株の順位階層を確立するために用いられる総スコアを生成する、請求項８７～９６、１４７～１６８および１７１～１７２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項174】

細胞株が、前記患者および前記移植ドナーと２つ以上のＨＬＡアレルにおいて適合する場合、前記細胞株は、患者への注入に好適であると見なされる、請求項８７～９６、１４７～１６８および１７１～１７３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項175】

移植手技において移植ドナー由来の臓器移植材料を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療において投与するために、ドナーミニバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法であって、前記方法は、
（ａ）前記移植ドナーのＨＬＡタイプと、前記ドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記移植ドナーと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程；
（ｂ）工程（ａ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、Ｘという任意数値スコアを割り当て；７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１を割り当て；６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２を割り当て、５つの共有アレルには、Ｘの５／８である数値スコアＸ３を割り当て、４つの共有アレルには、Ｘの４／８である数値スコアＸ４を割り当て、３つの共有アレルには、Ｘの３／８である数値スコアＸ５を割り当て、２つの共有アレルには、Ｘの２／８である数値スコアＸ６を割り当て、１つの共有アレルには、Ｘの１／８である数値スコアＸ７を割り当てる、工程；
（ｃ）前記患者のＨＬＡタイプと、前記ドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者と１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程；
（ｄ）工程（ｃ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて２次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、Ｘという任意数値スコアを割り当て；７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１を割り当て；６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２を割り当て、５つの共有アレルには、Ｘの５／８である数値スコアＸ３を割り当て、４つの共有アレルには、Ｘの４／８である数値スコアＸ４を割り当て、３つの共有アレルには、Ｘの３／８である数値スコアＸ５を割り当て、２つの共有アレルには、Ｘの２／８である数値スコアＸ６を割り当て、１つの共有アレルには、Ｘの１／８である数値スコアＸ７を割り当て；前記２次数値スコアは、必要に応じて前記１次スコアより低く重み付けされる、工程
を含む、方法。

【請求項176】

前記実質臓器が腎臓であり、前記２次数値スコアには前記１次数値スコアの２５％の重みが付けられる、請求項１７５に記載の方法。

【請求項177】

移植手技において移植ドナーから骨髄移植を受けた患者に同種異系Ｔ細胞治療において投与するために、第１の抗原特異的Ｔ細胞株を請求項６１もしくは７３に記載のミニバンクまたは請求項７４に記載のバンクに含まれるミニバンクから選択する方法であって、前記方法は、
（ａ）前記患者のＨＬＡタイプと、前記移植ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者と前記移植ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの第１セットを特定する工程；
（ｂ）前記共有ＨＬＡアレルの第１セットを、請求項６１または７３に記載のミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーまたは請求項７４に記載のバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較して、前記共有ＨＬＡアレルの第１セットと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程；
（ｃ）工程（ｂ）において特定されたＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、Ｘという任意数値スコアを割り当て；７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１を割り当て；６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２を割り当てるなどする、工程；
（ｄ）前記患者のＨＬＡタイプと、請求項６１もしくは７３に記載のミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するかまたは請求項７４に記載のバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、前記患者とそれぞれの各Ｔ細胞株ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの１つ以上の追加セットを特定する工程；
（ｅ）Ｔ細胞株と前記患者との間で共通している工程（ｄ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアを割り当てる工程であって、ここで、８つの共有アレルの完全一致には、Ｘの任意数値スコアを割り当て；７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１を割り当て；６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２を割り当て、５つの共有アレルには、Ｘの５／８である数値スコアＸ３を割り当て、４つの共有アレルには、Ｘの４／８である数値スコアＸ４を割り当て、３つの共有アレルには、Ｘの３／８である数値スコアＸ５を割り当て、２つの共有アレルには、Ｘの２／８である数値スコアＸ６を割り当て、１つの共有アレルには、Ｘの１／８である数値スコアＸ７を割り当て；前記２次数値スコアは、前記１次スコアより低く重み付けされる、工程
（ｆ）請求項６１もしくは７３に記載のミニバンク内または請求項７４に記載のバンクに含まれるミニバンク内の各抗原特異的Ｔ細胞株に対して、前記１次スコアと前記２次スコアとを合算する工程；および
（ｇ）工程（ｆ）で最高スコアを有する抗原特異的Ｔ細胞株を前記患者への投与のために選択する工程
を含む、方法。

【請求項178】

前記２次数値スコアに前記１次数値スコアの５０％の重みが付けられる、請求項１７７に記載の方法。

【請求項179】

複数の異なるドナーに由来する複数の抗原特異的Ｔ細胞株を含むミニバンクであって、ここで、各ドナーのＨＬＡタイプは、少なくとも１つのＨＬＡアレルにおいて異なり、各ドナーのＨＬＡタイプは、前記複数の異なるドナーが集合的に、見込み患者集団内の可能な限り多くの患者と少なくとも２つのアレルにおいて適合することが確実なものとなるように選択される、ミニバンク。

【請求項180】

３０人以下の異なるドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含む、請求項１７９に記載のミニバンク。

【請求項181】

４～３０人の異なるドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含む、請求項１７９に記載のミニバンク。

【請求項182】

４、５、６、７、８、９または１０人の異なるドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含む、請求項１７９に記載のミニバンク。

【請求項183】

前記ドナーが集合的に、前記見込み患者集団の少なくとも９５％と少なくとも２つのアレルにおいて適合する、請求項１７９～１８２のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項184】

前記２つ以上のアレルが、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレル；少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレル；または少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む、請求項１７９～１８３のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項185】

前記見込み患者集団が、少なくとも１００人の患者を含む、請求項１７９～１８４のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項186】

前記見込み患者集団が、全世界もしくは全米の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団；および／または全世界もしくは全米の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項１７９～１８５のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項187】

前記見込み患者集団が、米国の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項１７９～１８５のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項188】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、ポリクローナルである、請求項１７９～１８７のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項189】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、同じ標的抗原を対象としている、請求項１７９～１８８のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項190】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、ＣＤ４＋Ｔリンパ球およびＣＤ８＋Ｔリンパ球を含む、請求項１７９～１８９のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項191】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、αβＴ細胞レセプターを発現しているＴ細胞を含む、請求項１７９～１９０のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項192】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、ＭＨＣ拘束性Ｔリンパ球を含む、請求項１７９～１９１のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項193】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、少なくとも１つの腫瘍関連抗原を標的とする、請求項１７９～１９２のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項194】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、少なくとも１つのウイルス抗原を標的とする、請求項１７９～１９２のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項195】

各抗原特異的Ｔ細胞株が、少なくとも１つのウイルス抗原および少なくとも１つの腫瘍関連抗原を標的とする、請求項１７９～１９２のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項196】

前記抗原特異的Ｔ細胞株によって標的とされる各抗原が、ウイルス抗原である、請求項１７９～１９２のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項197】

少なくとも２つの異なるウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、各抗原特異的Ｔ細胞株によって標的とされる、請求項１７９～１９６のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項198】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＪＣウイルス、ＨＨＶ６、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ボカウイルス、コロナウイルス、ＬＣＭＶ、ムンプス、麻疹、ヒトメタニューモウイルス、パルボウイルスＢ、ロタウイルス、メルケル細胞ウイルス、単純ヘルペスウイルス、ＨＰＶ、ＨＢＶ、ＨＩＶ、ＨＴＬＶ１、ＨＨＶ８、ジカウイルス、エボラおよび西ナイルウイルスから選択されるウイルス由来の少なくとも１つのウイルス抗原を標的とする、請求項１７９～１９７のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項199】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、以下のウイルス：ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ヒトメタニューモウイルス（ＨＭＰＶ）の各々由来の少なくとも１つのウイルス抗原を標的とする、請求項１７９～１９８のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項200】

前記インフルエンザ抗原が、インフルエンザＡ抗原であるＮＰ１、ＭＰ１およびそれらの組み合わせから選択され；前記ＲＳＶ抗原が、Ｎ、Ｆおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ｈＭＰＶ抗原が、Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１、Ｍおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＰＩＶ抗原が、Ｍ、ＨＮ、Ｎ、Ｆおよびそれらの組み合わせから選択される、請求項１９８または１９９に記載のミニバンク。

【請求項201】

前記インフルエンザＡ抗原が、ＮＰ１およびＭＰ１であり；前記ＲＳＶ抗原が、ＮおよびＦであり；前記ｈＭＰＶ抗原が、Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭであり；前記ＰＩＶ抗原が、Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦである、請求項１９８～１９９のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項202】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、以下のウイルス：ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＨＨＶ６の各々由来の少なくとも１つのウイルス抗原を標的とする、請求項１７９～１９８のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項203】

前記ＥＢＶ抗原が、ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１、ＢＺＬＦ１およびそれらの組み合わせから選択され；前記ＣＭＶ抗原が、ＩＥ１、ｐｐ６５およびそれらの組み合わせから選択され；前記アデノウイルス抗原が、ヘキソン、ペントンおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＢＫウイルス抗原が、ＶＰ１、ラージＴおよびそれらの組み合わせから選択され；前記ＨＨＶ６抗原が、Ｕ９０、Ｕ１１、Ｕ１４およびそれらの組み合わせから選択される、請求項１９８または２０２に記載のミニバンク。

【請求項204】

前記ＥＢＶ抗原が、ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１およびＢＺＬＦ１であり；前記ＣＭＶ抗原が、ＩＥ１およびｐｐ６５であり；前記アデノウイルス抗原が、ヘキソンおよびペントンであり；前記ＢＫウイルス抗原が、ＶＰ１およびラージＴであり；前記ＨＨＶ６抗原が、Ｕ９０、Ｕ１１およびＵ１４である、請求項１９８または２０２～２０３に記載のミニバンク。

【請求項205】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、ＨＢＶ由来の少なくとも１つのウイルス抗原を標的とする、請求項１７９～１９８のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項206】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、ＨＢＶコア抗原；ＨＢＶ表面抗原、またはＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原の各々を標的とする、請求項２０５に記載のミニバンク。

【請求項207】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、ＨＨＶ８由来の少なくとも１つのウイルス抗原を標的とする、請求項１７９～１９８のいずれか１項に記載のミニバンク。

【請求項208】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）およびそれらの組み合わせから選択されるＨＨＶ８抗原を標的とする、請求項２０７に記載のミニバンク。

【請求項209】

前記抗原特異的Ｔ細胞株が、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）から選択される少なくとも２つのＨＨＶ８抗原を標的とする、請求項２０７に記載のミニバンク。

【請求項210】

前記抗原特異的Ｔ細胞株、ＨＢＶコア抗原；ＨＢＶ表面抗原、またはＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原の各々、請求項２０５に記載のミニバンク。

【請求項211】

複数の異なるドナーに由来する複数の抗原特異的Ｔ細胞株を含むユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品であって、ここで、各ドナーのＨＬＡタイプは、少なくとも１つのＨＬＡアレルにおいて異なり、各ドナーのＨＬＡタイプは、前記複数の異なるドナーが集合的に、見込み患者集団内の可能な限り多くの患者と少なくとも２つのアレルにおいて適合することが確実なものとなるように選択される、ユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。
各々が個別の細胞株として別々に作製された前記複数の抗原特異的Ｔ細胞株のプールを含む、請求項２１１に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項212】

前記複数の抗原特異的Ｔ細胞株が集合的に、前記見込み患者集団の＞９５％と少なくとも２つのアレルにおいて適合する少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を互いに対して備える、請求項２１１または２１２に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項213】

５つ以下の抗原特異的Ｔ細胞株を含む、請求項２１１～２１３のいずれか１項に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項214】

１０個以下の抗原特異的Ｔ細胞株を含む、請求項２１１～２１３のいずれか１項に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項215】

前記複数の抗原特異的Ｔ細胞株の中の各細胞株が、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレル；少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレル；または少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む、請求項２１１～２１５のいずれか１項に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項216】

前記第１の見込み患者集団が、少なくとも１００人の患者を含む、請求項２１１～２１６のいずれか１項に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項217】

前記第１の見込み患者集団が、全世界もしくは全米の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団；全世界もしくは全米の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団；および／または全世界もしくは全米の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項２１１～２１６のいずれか１項に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項218】

前記第１の見込み患者集団が、米国の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む、請求項２１１～２１６のいずれか１項に記載のユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【請求項219】

請求項１７９～２１０のいずれか１項に記載のミニバンクに含まれるすべての前記抗原特異的Ｔ細胞株のプールを含む、ユニバーサル抗原特異的Ｔ細胞治療製品。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

関連出願の相互参照
本出願は、２０１９年７月２９日に出願された米国仮出願第６２／８８０，００６号、２０１９年８月１６日に出願された米国仮出願第６２／８８７，８０２号、及び２０２０年７月２０日に出願された米国仮出願第６３／０５４，１６１号の優先権を主張し、これらの出願はそれぞれ参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。

【0002】

本開示の実施形態は、少なくとも細胞生物学、分子生物学、免疫学、及び医学の分野に関するものである。

【背景技術】

【0003】

ウイルス感染は、様々な疾患の治療法として選択される同種造血幹細胞移植（ａｌｌｏ－ＨＳＣＴ）後の罹患率と死亡率の重大な原因である。しかし、移植後においても、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、原疾患の再発、ウイルス感染症は、依然として罹患率と死亡率の主要な原因である。ウイルス性病原体に関連する感染症には、ＣＭＶ、ＢＫウイルス（ＢＫＶ）、及びアデノウイルス（ＡｄＶ）などがあるが、これらに限定されるものではない。ウイルス感染は、同種移植片のレシピエントの大部分で検出される。一部のウイルスには抗ウイルス剤が使用されているが、必ずしも有効ではなく、新しい治療法の必要性が強調されている。これらのウイルス感染症を治療する一つの戦略は、養子免疫療法、例えば、ドナー由来のウイルス特異的Ｔ細胞の少なくとも輸注を含む養子Ｔ細胞移植である。このアプローチでは、ドナーから細胞を抽出し、生体外でウイルス特異的集団を拡大し、最後に、Ｔ細胞産物を幹細胞移植のレシピエントに注入することができる。同様のアプローチで、腫瘍関連抗原に特異性を持つＴ細胞を養子移入して、がんを治療することも可能である。

【0004】

養子免疫療法は、疾患特異的細胞や操作されたＴ細胞（抗原特異的Ｔ細胞、キメラ抗原受容体（ＣＡＲ）発現Ｔ細胞など）を個体に移植・注入し、疾患関連細胞を認識・標的化し、破壊することを目的とした治療法である。養子免疫療法は、がん、移植後リンパ増殖性疾患、感染症（ウイルスなどの病原体感染症）、自己免疫疾患など、多くの疾患や障害の治療法として期待されている。例えば、Ａｄｖ、ＥＢＶ、ＣＭＶ、ＢＫ、ＨＨＶ６を標的とするｉｎ ｖｉｔｒｏで増幅したドナー由来および第三者のウイルス特異的Ｔ細胞は、ウイルス感染症を有する幹細胞移植患者に養子移入しても安全であることが示されている。ウイルス特異的Ｔ細胞は、Ａｄｖ、ＥＢＶ、ＣＭＶ、ＢＫ、ＨＨＶ６に対する抗ウイルス免疫を再構成し、病変の除去に有効であり、生体内でかなりの拡大性を示すことがわかった。

【0005】

養子免疫療法には、主に２つのタイプがある。自己免疫療法は、患者からＴ細胞のような細胞（例えば、抗原特異的Ｔ細胞）を分離、生産、および／または拡大し、必要に応じてその同じ患者に再投与するために患者から採取した細胞を保存することを含む。同種免疫療法は、患者と健康なドナーの２人が関与する。Ｔ細胞（例えば、抗原特異的Ｔ細胞）などの細胞は、健康なドナーから分離され、その後、いくつかのＨＬＡアレルに基づくヒト白血球抗原（ＨＬＡ）タイプが一致する（または部分的に一致する）患者への投与用に製造、および／または拡大、保管される。ＨＬＡは、ヒト主要組織適合性複合体（ＭＨＣ）とも呼ばれる。ＨＬＡ分子は、臓器移植のためのマッチングや、ウイルスに対する適応免疫反応において重要な役割を担っている移植免疫学において重要な役割を担っている。ＨＬＡクラスＩ分子はＣＤ８＋ Ｔ細胞にウイルスペプチドを提示し、ＨＬＡクラスＩＩ分子はＣＤ４＋ Ｔ細胞にウイルスペプチドを提示する。

【0006】

Ａｌｌｏ－ＨＳＣＴは、様々な悪性および非悪性の血液疾患に対して治癒的であるが、Ｔ細胞免疫不全の期間があり、患者はサイトメガロウイルス、アデノウイルス、エプスタイン－バーウイルス、ヒトヘルペスウイルス６およびＢＫウイルスなどの一連のウイルスに対して脆弱な状態にある。いくつかの研究により、養子的に移植された同種Ｔ細胞が共通のＨＬＡアレルを介して抗ウイルス活性を持つことが確認されており、Ｔ細胞の抗ウイルス反応におけるＨＬＡ相互作用の重要な役割が強調されている。同種幹細胞移植のドナーは、血縁者（通常、ＨＬＡが厳密に適合した同胞またはＨＬＡが半分適合したハプロアイデンティカル・ドナー（例えば、子供のための親ドナー））または非血縁者（血縁者以外のドナーでＨＬＡの適合度が非常に近いことが判明したドナー）でなければならない。しばしば、患者がドナーと高度にＨＬＡが一致した場合でも、レシピエントは移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）を軽減するために免疫抑制剤を必要とする。

【0007】

移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）は、同種移植に特有の炎症性疾患である。移植された白血球または再構成された白血球によるレシピエントの組織に対する攻撃である。これは、ドナーとレシピエントがＨＬＡ同一であっても、免疫系が細胞／組織間の他の相違を認識することができるため、起こり得る。急性ＧＶＨＤは通常、移植後３ヵ月以内に起こり、皮膚、腸、肝臓を侵すことがある。プレドニゾンのようなコルチコステロイドが標準的な治療法である。

【0008】

慢性ＧＶＨＤは同種移植の後にも発症することがあり、晩期合併症の主な原因となっている。炎症に加えて、慢性ＧＶＨＤは、線維症、又は強皮症と同様の瘢痕組織の発生、又は他の自己免疫疾患を引き起こし、機能障害や長期の免疫抑制療法の必要性を引き起こす可能性がある。ＧＶＨＤは通常、Ｔ細胞が宿主のＭＨＣ上に提示された外来ペプチドに反応する際に介在する。したがって、養子Ｔ細胞療法の使用は、しばしば、ＭＨＣの不一致によって課される障壁によって制限される。本開示は、これらの障壁に対する解決策を提供する。

【発明の概要】

【0009】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株などの細胞治療製品を含むドナーミニバンクを開発するための方法を含む。本開示は、見込み患者の大部分と適合する様々なＨＬＡ（ヒト白血球抗原）アレル型を有する少なくとも１つのドナープールから１人以上の適切なドナーを同定するための方法を含む。いくつかの実施形態では、見込み患者は、同種造血幹細胞移植（ＨＳＣＴ）を受けたことがある。いくつかの実施形態では、見込み患者は、抑制された免疫を有するか、又は免疫不全に陥っている。様々な実施形態において、本開示における方法は、免疫不全である患者のＴ細胞免疫の回復に関係する。

【0010】

いくつかの実施形態では、本開示の方法における１つ以上の適切なドナーの同定は、複数の細胞療法製品を含む第１のドナーミニバンクの構築に関する。いくつかの実施形態では、第１のドナーミニバンクは、抗原特異的Ｔ細胞株を含む。いくつかの実施形態では、本開示における方法は、ドナー選択方法を含む。いくつかの実施形態では、ドナー選択方法は、（ａ）第１のドナープールからの第１の複数の潜在ドナーの各々のＨＬＡ型を、第１の見込み患者集団からの第１の複数の見込み患者の各々と比較すること、（ｂ）上記ステップ（ａ）における比較に基づいて、第１の最大適合ドナーを決定することを含み、ここで、第１の最大適合ドナーは、第１の複数の見込み患者における最大数の患者と２以上のＨＬＡアレル一致を有する第１のドナープールからのドナーとして定義することができ、（ｃ）第１のドナーミニバンクに含めるために第１の最大適合ドナーを選択し、（ｄ）第１のドナープールから第１の最大適合ドナーを除去することを含む。ここで、上記ステップ（ｄ）は、第１ドナープールから第１最大マッチドナーを除く第１複数のドナー候補の各々からなる第２ドナープールを生成し得る；（ｅ）第１複数の見込み患者から、第１最大マッチドナーと２以上のアレル一致を有する各見込み患者を除去し、ここで上記ステップ（ｅ）は、第１最大マッチドナーと２以上のアレル一致を有する各見込み患者以外の第１複数の見込み患者の各々からなる第２複数の見込み患者を生成することを含み、ここで、第１複数の見込み患者から、第１最大マッチドナーを除く第１複数のドナー候補の各々のアレルを有する見込みのあるドナーのみを除去し、ここで、上記ステップ（ｅ）は、第１複数のドナー候補から、第１最大マッチドナーのアレルを有する見込みのあるドナーのみを除去することを含む。そして、（ｆ）前述のステップ（ｄ）および（ｅ）に従って既に除去されていない全てのドナーおよび見込み患者を用いて、前述のステップ（ａ）～（ｅ）を１回以上追加で繰り返すステップと、を含む。いくつかの実施形態では、追加の最大適合ドナーが前述のステップ（ｃ）に従って選択されるたびに、その追加の最大適合ドナーは、前述のステップ（ｄ）に従って、それぞれのドナープールから除去される。いくつかの実施形態では、後続の最大一致ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、その後続の最大一致ドナーと２以上のアレル一致を有する各見込み患者が、前述のステップ（ｅ）に従って、それぞれの複数の見込み患者から除去される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、方法の各サイクルに続いて、第１のドナーミニバンク内の選択された最大一致ドナーの数を順次１ずつ増加させることができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の方法は、方法の各サイクルに続いて、患者集団における複数の見込み患者の数を、選択された最大一致ドナーへのそれらのＨＬＡ一致に従って減少させることができる。他の実施形態では、前述のステップ（ａ）～（ｅ）は、第１の見込み患者集団の所望の割合が複数の見込み患者集団に残るまで繰り返すことができる。他の実施形態では、前述のステップ（ａ）～（ｅ）は、ドナープールにドナーが残らなくなるまで繰り返すことができる。

【0011】

本開示は、本明細書に記載の方法の前述のステップ（ａ）～（ｅ）が、第１の見込み患者集団の５％以下が複数の見込み患者の中に残るまで、前述のステップ（ｆ）に従って循環され得ることを提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第１のドナーミニバンクは、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含むことができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第１のドナーミニバンクは、１０、９、８、７、６、５、４、３、又は２のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株から構成されることができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第１のドナーミニバンクは、第１の見込み患者集団の９５％超に、少なくとも２つのＨＬＡアレル上で患者のＨＬＡ型に一致する１つ以上の抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ変動性を含むことができる。他の実施形態では、本明細書に記載の第１のドナーミニバンクは、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株から構成され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の第１のドナーミニバンクは、第１の見込み患者集団の９５％超に、少なくとも２つのＨＬＡアレル上の患者のＨＬＡ型に一致する１つ以上の抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ変動性を提供することができる。いくつかの実施形態では、前述のステップ（ｂ）及び（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレルを含むことができる。いくつかの実施形態では、前述のステップ（ｂ）及び（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレルから構成され得る。いくつかの実施形態では、前述のステップ（ｂ）及び（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレル及び少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルから構成され得る。いくつかの実施形態では、前述のステップ（ｂ）及び（ｅ）からの２つ以上のアレルは、ＨＬＡアレルＨＬＡ Ａ、ＨＬＡ Ｂ、ＤＲＢ１、及びＤＱＢ１を含むことができる。

【0012】

いくつかの実施形態では、本開示で使用される第１のドナープールは、少なくとも１０人のドナーを含むことができる。いくつかの実施形態では、本開示で提供される第１の見込み患者集団は、少なくとも１００人の患者から構成され得る。いくつかの実施形態では、第１の見込み患者集団は、全世界の同種造血幹細胞移植（ＨＳＣＴ）集団全体を構成することができる。いくつかの実施形態では、第１の見込み患者集団は、米国の同種造血幹細胞移植集団の全体を構成することができる。いくつかの実施形態では、第１の見込み患者集団は、世界的なウェブアドレスｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｂｅｔｈｅｍａｔｃｈｃｌｉｎｉｃａｌ．ｏｒｇで利用できる全米骨髄バンク（ＮＭＤＰ）データベースに含まれる全ての患者を構成することができる。いくつかの実施形態では、第１の見込み患者集団は、世界的なウェブアドレス：ｅｂｍｔ．ｏｒｇ／ｅｂｍｔ－ｐａｔｉｅｎｔ－ｒｅｇｉｓｔｒｙで利用可能な欧州血液骨髄移植学会（ＥＢＭＴ）データベースに含まれる全ての患者から構成され得る。いくつかの実施形態では、全世界の同種造血幹細胞移植集団全体は、１６歳以下の小児を含むことができる。いくつかの実施形態では、米国の同種造血幹細胞移植集団全体は、１６歳以下の小児を含むことができる。いくつかの実施形態では、全世界の同種造血幹細胞移植集団全体は、６５歳以上の個人を含むことができる。いくつかの実施形態では、米国の同種造血幹細胞移植集団全体は、６５歳以上の個人を含むことができる。いくつかの実施形態では、全世界の同種造血幹細胞移植集団全体は、５歳以下の小児を含むことができる。いくつかの実施形態では、米国の同種造血幹細胞移植集団全体は、年齢５歳以下の小児を含むことができる。

【0013】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクからなるドナーバンクを構築する際に使用するための適切なドナーを同定する方法を提供する。いくつかの実施形態では、ドナーバンクを構築することは、本明細書に記載されるように、最初に第１のミニバンクを開発することを含み得る。いくつかの実施形態では、第１のミニバンクを開発することは、前述のステップ（ａ）～（ｆ）の全てを実行することを含むことができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるドナーバンクのための第１のミニバンクを開発することは、１つ以上の第２のラウンドを含む前述のステップ（ａ）～（ｆ）を繰り返して、１つ以上の第２のミニバンクを構築することを含むことができる。

【0014】

いくつかの実施形態では、バンクを構築するための各第２ラウンドを開始する前に、新しいドナー・プールを生成することを含むことができる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の新しいドナープールは、第１のドナープールから、第１のラウンド及び任意の前の第２のラウンドから前述のステップ（ｄ）の各前のサイクルに従って除去された任意の最大マッチドナーを差し引いたものから構成され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の新たなドナープールは、第１のドナープールに含まれない潜在ドナーの全く新しい集団から構成され得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載の新規ドナープールは、第１ドナープールから、第１ラウンド及び任意の先行する第２ラウンドからの前述のステップ（ｄ）の各サイクルにしたがって除去された任意の最大マッチドナーと、第１ドナープールに含まれない潜在ドナーの全く新しい集団との組み合わせからなることが可能である。いくつかの実施形態では、本方法に記載のバンクを構築することは、本方法の第１ラウンド及び任意の先行する第２ラウンドから前述のステップ（ｅ）の各先行サイクルに従って以前に除去された全ての見込み患者を戻すことにより、第１見込み患者集団から第１複数の見込み患者を再構成することを含むことができる。

【0015】

いくつかの実施形態では、本明細書に記載の１つ以上のミニバンクを構築するための各ラウンドは、複数の見込み患者のうち第１の見込み患者の５％以下が残るまで、上記ステップ（ａ）～（ｅ）を上記ステップ（ｆ）に従って循環させることを含み得る。いくつかの実施形態では、各ドナーミニバンクは、少なくとも２つのＨＬＡアレル上で患者のＨＬＡ型に適合する少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を第１の見込み患者集団の９５％超提供するために、１つまたは複数の最大適合ドナーの間の十分なＨＬＡ変動を含み得る。いくつかの実施形態では、結果として得られる各ドナーミニバンクは、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株から構成され得る。いくつかの実施形態では、各結果ドナーミニバンクは、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み得る。
いくつかの実施形態において、得られる各ドナーミニバンクは、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み得る。いくつかの実施形態において、前述の工程（ｂ）および（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含み得る。他の実施形態において、前述の工程（ｂ）および（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含み得る。

【0016】

いくつかの実施形態において、ドナーバンクを構築するために用いられる第１のドナープールは、少なくとも１０人のドナーを含み得る。いくつかの実施形態において、ドナーバンクを構築するために用いられる第１の見込み患者集団は、少なくとも１００人の患者を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、ワールドワイドウェブアドレスｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｂｅｔｈｅｍａｔｃｈｃｌｉｎｉｃａｌ．ｏｒｇにおいて利用可能なＮａｔｉｏｎａｌ Ｍａｒｒｏｗ Ｄｏｎｏｒ Ｐｒｏｇｒａｍ（ＮＭＤＰ）データベースに含まれるすべての患者を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、ワールドワイドウェブアドレス：ｅｂｍｔ．ｏｒｇ／ｅｂｍｔ－ｐａｔｉｅｎｔ－ｒｅｇｉｓｔｒｙにおいて利用可能なＥｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂｌｏｏｄ ａｎｄ Ｍａｒｒｏｗ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ（ＥＢＭＴ）データベースに含まれるすべての患者を含み得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、１６歳以下の小児を含み得る。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、１６歳以下の小児を含み得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上の個体を含み得る。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上の個体を含み得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、５歳以下の小児を含み得る。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、５歳以下の小児を含み得る。

【0017】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ドナーバンクに含まれる各ドナーから血液を収集する工程を含み得る。他の実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ドナーバンクに含まれる各ドナーから収集した血液を手に入れる工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ドナーバンクに含まれる各ドナーから単核球（ＭＮＣ）を収集する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ドナーバンクに含まれる各ドナーから収集したＭＮＣを手に入れる工程を含み得る。いくつかの実施形態において、各ドナーからＭＮＣを収集する工程は、ＭＮＣを単離する工程または単離されたＭＮＣを手に入れる工程を含み得る。１つの実施形態において、ＭＮＣは、末梢血単核球（例えば、ＰＢＭＣ）を含む。１つの実施形態において、ＭＮＣは、血液アフェレーシス単核球を含む。いくつかの実施形態において、各ドナーからＭＮＣを収集する工程は、ＰＢＭＣを単離する工程または単離されたＰＢＭＣを手に入れる工程を含み得る。いくつかの実施形態において、ＭＮＣを単離する工程は、フィコール勾配によって行われ得る。いくつかの実施形態において、ＭＮＣを単離する工程は、密度勾配によって行われ得る。他の実施形態において、本明細書中に開示されるようなＭＮＣを収集する工程は、その細胞を培養する工程を含み得る。他の実施形態において、本明細書中に開示されるようなＭＮＣを収集する工程は、その細胞を凍結保存する工程を含み得る。

【0018】

いくつかの実施形態において、培養されたＭＮＣまたは凍結保存されたＭＮＣは、培養中の細胞を１つ以上の抗原と好適な培養条件下で接触させて、抗原特異的Ｔ細胞を刺激し、拡大することを含み得る。他の実施形態において、細胞と接触させる１つ以上の抗原は、１つ以上のウイルス抗原を含み得る。他の実施形態において、細胞と接触させる１つ以上の抗原は、１つ以上の腫瘍関連抗原を含み得る。いくつかの実施形態において、細胞と接触させる１つ以上の抗原は、１つ以上のウイルス抗原と１つ以上の腫瘍関連抗原との組み合わせを含み得る。

【0019】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法を提供する。いくつかの実施形態において、その方法は、第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプと第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプとを比較する工程（ａ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、このパラグラフに記載されている方法の工程（ａ）における比較に基づいて、第１の最適合ドナーを決定する工程（ｂ）を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の最適合ドナーは、第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のアレルが適合する第１のドナープール由来のドナーと定義され得る。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナーミニバンクに含めるために第１の最適合ドナーを選択する工程（ｃ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナープールから第１の最適合ドナーを除去する工程（ｄ）を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法の工程（ｄ）は、第１の最適合ドナーを除く第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程を含み得る。

【0020】

いくつかの実施形態において、その方法は、第１の複数の見込み患者から、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去する工程（ｅ）を含み得る。いくつかの実施形態において、このパラグラフに記載されているような工程（ｅ）は、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程を含み得る。

【0021】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法は、本明細書中に開示されるような工程（ｄ）および（ｅ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、本明細書中に開示されるような工程（ａ）～（ｅ）をさらに１回以上反復する工程を含み得る。いくつかの実施形態では、工程（ｃ）に従って追加の最適合ドナーが選択されるたびに、その最適合ドナーは、工程（ｄ）に従ってそれぞれのドナープールから除去される。いくつかの実施形態では、次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｅ）に従って次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者がそれぞれの複数の見込み患者から除去される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数を、その方法の各サイクル後に１ずつ増加させ得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従ってその方法の各サイクル後に患者集団内の複数の見込み患者の数を減少させ得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築するための工程（ａ）～（ｅ）は、第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが複数の見込み患者に残るまで反復され得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築するための工程（ａ）～（ｅ）は、ドナープールにドナーが残らなくなるまで反復され得る。

【0022】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ドナーミニバンクに含まれるそれぞれの各ドナーから得られた血液からＭＮＣを単離するか、またはその血液から単離されたＭＮＣを手に入れる工程（ｇ）を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法の工程（ｈ）は、それぞれの各ドナーから得られたＭＮＣを培養する工程を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、培養中のＭＮＣを１つ以上の抗原と好適な培養条件下で接触させて、それぞれの各ドナーのＭＮＣ由来の抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を刺激し、拡大する工程（ｉ）を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、培養中のＭＮＣを１つ以上の抗原由来の１つ以上のエピトープと好適な培養条件下で接触させて、それぞれの各ドナーのＭＮＣ由来の抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を刺激し、拡大する工程（ｉ）を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、複数の抗原特異的Ｔ細胞株を作製する工程を含む。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の各々は、それぞれの各ドナーのＭＮＣに由来する抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような工程（ｇ）～（ｉ）のＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、上記方法の工程（ｊ）は、複数の抗原特異的Ｔ細胞株を凍結保存する工程を含み得る。

【0023】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法は、工程（ｆ）に従って、第１の見込み患者集団の５％以下が複数の見込み患者に残るまで工程（ａ）～（ｅ）を繰り返す工程を含み得る。いくつかの実施形態において、各ドナーミニバンクは、第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて患者のＨＬＡタイプに適合する少なくとも１つの抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を１人以上の最適合ドナーの間に含み得る。いくつかの実施形態において、得られる各ドナーミニバンクは、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み得る。いくつかの実施形態において、得られる各ドナーミニバンクは、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み得る。いくつかの実施形態において、工程（ｂ）および（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含み得る。他の実施形態において、工程（ｂ）および（ｅ）からの２つ以上のアレルは、少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含み得る。

【0024】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法において用いられる第１のドナープールは、少なくとも１０人のドナーを含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法において用いられる第１のドナープールは、少なくとも１００人のドナーを含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団を含み得る。いくつかの実施形態において、上記方法において用いられる第１の見込み患者集団は、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、ワールドワイドウェブアドレスｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｂｅｔｈｅｍａｔｃｈｃｌｉｎｉｃａｌ．ｏｒｇにおいて利用可能なＮａｔｉｏｎａｌ Ｍａｒｒｏｗ Ｄｏｎｏｒ Ｐｒｏｇｒａｍ（ＮＭＤＰ）データベースに含まれるすべての患者を含み得る。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、ワールドワイドウェブアドレス：ｅｂｍｔ．ｏｒｇ／ｅｂｍｔ－ｐａｔｉｅｎｔ－ｒｅｇｉｓｔｒｙにおいて利用可能なＥｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂｌｏｏｄ ａｎｄ Ｍａｒｒｏｗ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ（ＥＢＭＴ）データベースに含まれるすべての患者を含み得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、１６歳以下の小児を含み得る。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、１６歳以下の小児を含み得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上の個体を含み得る。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上の個体を含み得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、５歳以下の小児を含み得る。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、５歳以下の小児を含み得る。

【0025】

いくつかの実施形態において、ＭＮＣの培養は、気体透過性の培養表面を備える容器において行われ得る。１つの実施形態において、その容器は、気体透過性の部分を備える注入バッグであり得る。１つの実施形態において、その容器は、剛性容器であり得る。１つの実施形態において、その容器は、ＧＲｅｘバイオリアクターであり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築するためのＰＢＭＣを培養する工程は、１つ以上のサイトカインの存在下において行われ得る。１つの実施形態において、そのサイトカインには、ＩＬ４が含まれ得る。１つの実施形態において、そのサイトカインには、ＩＬ７が含まれ得る。１つの実施形態において、そのサイトカインには、ＩＬ４およびＩＬ７が含まれ得る。１つの実施形態において、そのサイトカインには、ＩＬ４およびＩＬ７が含まれ得るが、ＩＬ２は含まれない。

【0026】

抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法は、ＭＮＣを１つ以上の抗原の存在下において培養する工程を含み得る。１つの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原は、ホールタンパク質（ｗｈｏｌｅ ｐｒｏｔｅｉｎ）の形態であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原は、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックスの形態であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原は、ホールタンパク質の形態と、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックスの形態との組み合わせの形態であり得る。

【0027】

抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法は、ＭＮＣを複数のペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。１つの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、複数のペプミックス由来の各ペプミックスは、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含み得る。

【0028】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築するための各抗原は、腫瘍関連抗原であり得る。いくつかの実施形態において、各抗原は、ウイルス抗原であり得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築するための少なくとも１つの抗原は、ウイルス抗原であり得、少なくとも１つの抗原は、腫瘍関連抗原であり得る。

【0029】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＭＮＣを少なくとも２つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも３つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも４つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも５つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも６つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも７つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも８つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも９つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１０個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１１個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１２個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１３個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１４個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１５個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１６個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１７個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１８個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１９個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも２０個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも２０個を超える異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスは、ある抗原の一部を網羅する一連の重複ペプチドを含み得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスは、ある抗原の配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含み得る。

【0030】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＭＮＣを複数のペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスは、複数のペプミックス中の他の各ペプミックスによってカバーされる抗原とは異なる少なくとも１つの抗原をカバーし得る。いくつかの実施形態において、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０個の異なる抗原が、複数のペプミックスによってカバーされ得る。いくつかの実施形態において、少なくとも２０個を超える異なる抗原が、複数のペプミックスによってカバーされ得る。いくつかの実施形態において、少なくとも２つの異なるウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、複数のペプミックスによってカバーされ得る。

【0031】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための方法において使用される抗原は、ＥＢＶ（エプスタイン・バーウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＣＭＶ（サイトメガロウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、アデノウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＢＫウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＪＣ（Ｊｏｈｎ Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍウイルス）ウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＨＶ６（ヘルペスウイルス６）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＨＶ８（ヘルペスウイルス８）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＢＶ（Ｂ型肝炎ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＲＳＶ（ヒト呼吸器合胞体ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、インフルエンザ由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、パラインフルエンザ由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ボカウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、コロナウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＬＣＭＶ（リンパ球脈絡髄膜炎ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ムンプス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、麻疹由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ヒトメタニューモウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、パルボウイルスＢ由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ロタウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、メルケル細胞ウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、単純ヘルペスウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＰＶ（ヒトパピローマウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＩＶ（ヒト免疫不全ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＴＬＶ１（ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、西ナイルウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ジカウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、エボラ由来であり得る。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのペプミックスが、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザおよびＨＭＰＶ（ヒトメタニューモウイルス）の各々由来の抗原をカバーし得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるインフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるインフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ ＭＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるインフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ抗原であるＮＰ１およびＭＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｎタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｎタンパク質およびＲＳＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｎタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｍ２－１タンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｍタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｆタンパク質とｈＭＰＶ Ｎタンパク質とｈＭＰＶ Ｍ２－１とｈＭＰＶ Ｍタンパク質との組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｍタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ ＨＮタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｎタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｍタンパク質とＰＩＶ ＨＮタンパク質とＰＩＶ Ｎタンパク質とＰＩＶ Ｆタンパク質との組み合わせであり得る。

【0032】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＰＢＭＣを、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１およびインフルエンザＡ抗原ＭＰ１を網羅するペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＲＳＶ抗原ＮおよびＲＳＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｎを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｍを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｍを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原ＨＮを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｎを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。

【0033】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＰＢＭＣを、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫおよびＨＨＶ６の各々由来の抗原をカバーするペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのペプミックスが、ＥＢＶ由来の抗原をカバーし得、少なくとも１つのペプミックスが、ＣＭＶ由来の抗原をカバーし得、少なくとも１つのペプミックスが、アデノウイルス由来の抗原をカバーし得、少なくとも１つのペプミックスが、ＢＫ由来の抗原をカバーし得、少なくとも１つのペプミックスが、ＨＨＶ６由来の抗原をカバーし得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＬＭＰ２であり得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＥＢＮＡ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＢＺＬＦ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＣＭＶ抗原の組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ＩＥ１由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ｐｐ６５由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ＩＥ１とｐｐ６５との組み合わせ由来であり得る。いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ヘキソン由来であり得る。いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ペントン由来であり得る。いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ヘキソンとペントンとの組み合わせ由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ＶＰ１由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ラージＴ由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ＶＰ１とラージＴとの組み合わせ由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ９０由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ１１由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ１４由来であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ９０とＵ１１とＵ１４との組み合わせ由来であり得る。

【0034】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、ＥＢＶ抗原であるＬＭＰ２を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＥＢＶ抗原であるＥＢＮＡ１を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＥＢＶ抗原であるＢＺＬＦ１を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＣＭＶ抗原であるＩＥ１を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＣＭＶ抗原であるｐｐ６５を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、アデノウイルス抗原であるヘキソンを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ペントンを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＢＫウイルス抗原であるＶＰ１を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＢＫウイルス抗原であるラージＴを網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＨＨＶ６抗原であるＵ９０を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＨＨＶ６抗原であるＵ１１を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＨＨＶ６抗原であるＵ１４を網羅するペプミックスの存在下においてＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。

【0035】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＰＢＭＣを、コロナウイルス由来の抗原をカバーするペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、コロナウイルスは、β－コロナウイルス（β－ＣｏＶ）である。いくつかの実施形態において、コロナウイルスは、α－コロナウイルス（α－ＣｏＶ）である。いくつかにおいて、β－ＣｏＶは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ、ＨＣｏＶＨＫＵｌおよびＨＣｏＶ－ＯＣ４３から選択される。いくつかの実施形態において、ＨＣｏＶ－Ｅ２２９およびＨＣｏＶ－ＮＬ６３から選択されるα－ＣｏＶ。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、ＰＢＭＣを複数のペプミックスライブラリーと培養する工程を含み得、各ペプミックスライブラリーは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原または１つ以上の追加のウイルス由来の抗原の全部もしくは一部を網羅する複数の重複ペプチドを含む。いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、複数のペプミックスライブラリーでプライミングされたＤＣなどのＡＰＣとＴ細胞を接触させることによって作製され、各ペプミックスライブラリーは、ウイルス抗原の全部または一部を網羅する複数の重複ペプチドを含み、その複数のペプミックスライブラリーの少なくとも１つは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２由来の第１の抗原を網羅し、その複数のペプミックスライブラリーの少なくとも１つの追加のペプミックスライブラリー（または１つの追加のペプミックスライブラリーの一部）は、それぞれ第２の抗原を網羅する。いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、少なくとも１つのＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原をコードする少なくとも１つのＤＮＡプラスミドまたはその一部および各第２の抗原をコードする少なくとも１つのＤＮＡプラスミドまたはその一部でヌクレオフェクトされたＤＣなどのＡＰＣとＴ細胞を接触させることによって作製される。いくつかの実施形態において、そのプラスミドは、少なくとも１つのＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原またはその一部、および少なくとも１つの追加の抗原またはその一部をコードする。いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、ＣＤ４＋Ｔリンパ球およびＣＤ８＋Ｔリンパ球を含む。いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、αβＴ細胞レセプターを発現する。いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、ＭＨＣ拘束性である。いくつかの実施形態において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原は、ｎｓｐ１；ｎｓｐ３；ｎｓｐ４；ｎｓｐ５；ｎｓｐ６；ｎｓｐ７ａ、ｎｓｐ８、ｎｓｐ１０；ｎｓｐ１２；ｎｓｐ１３；ｎｓｐ１４；ｎｓｐ１５；およびｎｓｐ１６からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む。いくつかの実施形態において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原は、スパイク（Ｓ）；エンベロープタンパク質（Ｅ）；マトリックスタンパク質（Ｍ）；およびヌクレオカプシドタンパク質（Ｎ）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む。いくつかの実施形態において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＡＰ３Ａ）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳＳ）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦｌＯ）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ９Ｂ）；およびＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（Ｙｌ４）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＰＢＭＣを、１つ以上のＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原、ならびにＰＩＶ抗原Ｍ、ＰＩＶ抗原ＨＮ、ＰＩＶ抗原Ｎ、ＰＩＶ抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰｌ、インフルエンザ抗原ＭＰｌ、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原ＮおよびＡｄＶ抗原ヘキソン、ＡｄＶ抗原ペントンならびにそれらの組み合わせからなる群より選択される１つ以上の追加の抗原をカバーするペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、追加の抗原は、ＰＩＶ抗原Ｍ、ＰＩＶ抗原ＨＮ、ＰＩＶ抗原Ｎ、ＰＩＶ抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰｌ、インフルエンザ抗原ＭＰｌ、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｎ、ＡｄＶ抗原ヘキソン、ＡｄＶ抗原ペントンおよびそれらの組み合わせを含む。

【0036】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＰＢＭＣを、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）由来の抗原をカバーするペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、ＨＢＶ抗原は、ＨＢＶコア抗原、ＨＢＶ表面抗原、ならびにＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原の各々から選択される。

【0037】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、選択されたドナー由来のＰＢＭＣを、ヒトヘルペスウイルス－８（ＨＨＶ－８）由来の抗原をカバーするペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ－８抗原は、潜在性抗原を含む。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ－８抗原は、溶解性抗原を含む。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ－８抗原は、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）およびそれらの組み合わせから選択される。

【0038】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株（例えば、ＶＳＴ）のドナーミニバンクを構築するための本明細書中に記載されるような方法は、抗原特異的Ｔ細胞株をＩＬ－７とＩＬ－４の両方の存在下においてエキソビボで培養する工程を含む。いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、患者への投与の準備が整うように、９～１８日以内の培養で十分に拡大されたものである。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスは、１５ｍｅｒのペプチドを含み得る。１つの実施形態において、抗原を網羅するペプミックス中のペプチドは、順に１１アミノ酸重複し得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクの構築は、抗原特異的Ｔ細胞を拡大することを含み得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクの構築は、抗原特異的Ｔ細胞を抗原特異的細胞傷害性について試験することを含み得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のミニバンクは、本明細書中に開示されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法を介して作製され得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のミニバンクは、本明細書中に記載されるような方法を介して選択された複数のドナーに由来し得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株のバンクは、本明細書中に記載されるような方法を介して選択された複数のドナーに由来する複数のミニバンクを含み得る。

【0039】

本開示は、本明細書中に記載されるようなミニバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与することによって疾患または状態を処置する方法を提供する。いくつかの実施形態において、患者に投与するために抗原特異的Ｔ細胞株を選択する場合の唯一の基準は、その患者が、抗原特異的Ｔ細胞株の製造において使用されるＭＮＣを単離してきたドナーと少なくとも２つのＨＬＡアレルを共有していることである。１つの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、処置される疾患は、ウイルス感染症またはウイルス関連疾患であり得る。いくつかの実施形態において、処置される疾患は、癌であり得る。

【0040】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなミニバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株によって処置される患者は、免疫無防備状態であり得る。いくつかの実施形態において、それらの患者は、その疾患もしくは状態または別の疾患もしくは状態を処置するために患者が受けた処置に起因して免疫無防備状態である。いくつかの実施形態において、それらの患者は、年齢に起因して免疫無防備状態である。１つの実施形態において、患者は、低年齢に起因して免疫無防備状態である。１つの実施形態において、患者は、高齢に起因して免疫無防備状態である。いくつかの実施形態において、処置される状態は、免疫不全であり得る。１つの実施形態において、免疫不全は、原発性免疫不全である。いくつかの実施形態において、患者は、移植治療を必要としている。

【0041】

本開示は、本明細書中に記載されるようなミニバンクから、被験体に投与するための第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を含む。本開示は、本明細書中に記載されるようなバンクに含まれるミニバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を含む。いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株の選択は、移植手技において移植ドナーから移植材料（例えば、幹細胞）を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療を施すための選択であり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法は、（ａ）患者のＨＬＡタイプと移植ドナーまたは複数の移植ドナー（例えば、ダブル臍帯血移植の場合）のＨＬＡタイプとを比較して、その患者と移植ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの第１セットを特定する工程；（ｂ）共有ＨＬＡアレルの第１セットを、本明細書中に記載されるようなミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーまたは本明細書中に記載されるようなバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較して、共有ＨＬＡアレルの第１セットと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程；（ｃ）工程（ｂ）において特定されたＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程；（ｄ）患者のＨＬＡタイプと、本明細書中に記載されるようなミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するかまたは本明細書中に記載されるようなバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、患者とそれぞれの各Ｔ細胞株ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの１つ以上の追加セットを特定する工程；（ｅ）Ｔ細胞株と患者との間で共通している工程（ｄ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアを割り当てる工程；および（ｆ）本明細書中に記載されるようなミニバンク内の各抗原特異的Ｔ細胞株に対して、１次スコアと２次スコアとを合算する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、それらの方法は、このパラグラフの工程（ｆ）から得たスコアが最も高い抗原特異的Ｔ細胞株を、患者に投与するために選択する工程（ｇ）を含み得る。

【0042】

いくつかの実施形態において、８つの共有アレルの完全一致には、１次スコアにおいてＸという任意数値スコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、５つの共有アレルには、Ｘの５／８である数値スコアＸ３が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、４つの共有アレルには、Ｘの４／８である数値スコアＸ４が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、３つの共有アレルには、Ｘの３／８である数値スコアＸ５が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、２つの共有アレルには、Ｘの２／８である数値スコアＸ６が割り当てられ得る。１つの実施形態において、Ｘという任意数値スコアは、８に等しい。

【0043】

いくつかの実施形態において、２次スコアにおける８つの共有アレルの完全一致には、１次スコアの５０％の重みが付けられた数値スコアが割り当てられ得る。したがって、直前のパラグラフの工程（ｃ）において定義されたような１次スコアＸが８である場合（すなわち、Ｘ＝８である場合、４）。いくつかの実施形態において、７つの共有アレルには、直前のパラグラフの工程（ｃ）において定義されたように、Ｘ１の５０％（すなわち、Ｘ＝８である場合、３．５）というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、６つの共有アレルには、直前のパラグラフの工程（ｃ）において定義されたように、Ｘ２の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３）が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、２つ以上の任意の数の共有アレルには、このパラグラフに記載されているように工程（ｅ）に従うことによってスコアが割り当てられ得る。

【0044】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、幹細胞を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、実質臓器を含み得る。いくつかの実施形態において、実質臓器は、腎臓である。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、骨髄を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、幹細胞、実質臓器および骨髄を含み得る。いくつかの実施形態において、上記方法は、直前のパラグラフに記載されているように工程（ｇ）において選択された第１の抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む。

【0045】

いくつかの実施形態において、患者への投与は、ウイルス感染症を処置するための投与であり得る。いくつかの実施形態において、患者への投与は、腫瘍を処置するための投与であり得る。いくつかの実施形態において、患者への投与は、移植前の原発性免疫不全に対する投与であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、第２の抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株と同じミニバンクから選択され得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が得られたミニバンクとは異なるミニバンクから選択され得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株以外のドナーバンクに残っているすべての抗原特異的Ｔ細胞株を用いて、本明細書中に記載されるようなミニバンクまたはバンクに含まれるミニバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を反復することによって選択され得る。

【0046】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクを構築する方法を提供する。いくつかの実施形態において、その方法は、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法に示された工程（ａ）～（ｊ）を行う工程Ａ）を含み得る。いくつかの実施形態において、第１のミニバンクが構築される。いくつかの実施形態において、その方法は、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法に示された工程（ａ）～（ｊ）を反復する工程Ｂ）を含み得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のミニバンクを構築するために、１回以上の第２ラウンドが行われ得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法の各第２ラウンドを開始する前に、新しいドナープールが作製され得る。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから先の各サイクルの工程（ｄ）に従って除去された任意の最適合ドナーを差し引いた第１のドナープールを含み得る。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団を含み得る。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから先の各サイクルの工程（ｄ）に従って除去された任意の最適合ドナーを差し引いた第１のドナープールを含む新しいドナープールと、第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団との組み合わせを含み得る。

【0047】

いくつかの実施形態において、上記方法は、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法に示されている先の各サイクルの工程（ｅ）に従って第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから以前に除去されたすべての見込み患者を戻すことによって第１の見込み患者集団由来の第１の複数の見込み患者を再構成する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法に示されている工程（ｇ）～（ｊ）は、必要に応じて、その方法の各ラウンド後に行われてもよいし、直前のパラグラフに記載されたように工程Ａ）の後の任意の時点において行われてもよい。

【0048】

いくつかの実施形態において、ＭＮＣの培養は、気体透過性の培養表面を備える容器において行われ得る。１つの実施形態において、その容器は、気体透過性の部分を備える注入バッグであり得る。１つの実施形態において、その容器は、剛性容器であり得る。１つの実施形態において、その容器は、ＧＲｅｘバイオリアクター（Ｗｉｌｓｏｎ Ｗｏｌｆ，Ｓｔ Ｐａｕｌ，ＭＮ）であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築するためのＭＮＣの培養は、１つ以上のサイトカインの存在下において行われ得る。１つの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＭＢＣであり得る。１つの実施形態において、サイトカインには、ＩＬ４が含まれ得る。１つの実施形態において、サイトカインには、ＩＬ７が含まれ得る。１つの実施形態において、サイトカインには、ＩＬ４およびＩＬ７が含まれ得る。１つの実施形態において、サイトカインには、ＩＬ４およびＩＬ７が含まれ得るが、ＩＬ２は含まれない。

【0049】

いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原は、ホールタンパク質の形態であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原は、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックスの形態であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原は、ホールタンパク質の形態と、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックスの形態との組み合わせの形態であり得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクを構築するための方法は、ＭＮＣを複数のペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。１つの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、複数のペプミックス由来の各ペプミックスは、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含み得る。抗原は、樹状細胞上に提示され得る。抗原は、本明細書中に開示される方法を介して選択されたドナー由来のＭＮＣ（例えば、ＰＢＭＣ）と直接接触され得る。

【0050】

他の実施形態において、上記細胞と接触される各抗原は、腫瘍関連抗原を含み得る。他の実施形態において、各抗原は、ウイルス抗原であり得る。いくつかの実施形態において、上記細胞と接触される少なくとも１つの抗原は、ウイルス抗原であり得、上記細胞と接触される少なくとも１つの抗原は、腫瘍関連抗原であり得る。

【0051】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクを構築する方法は、ＭＮＣを少なくとも２つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも３つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも４つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも５つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも６つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも７つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも８つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも９つの異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１０個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１１個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１２個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１３個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１４個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１５個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１６個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１７個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１８個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも１９個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも２０個の異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを少なくとも２０個を超える異なるペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスは、ある抗原の一部を網羅する一連の重複ペプチドを含み得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスは、ある抗原の配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含み得る。

【0052】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＭＮＣを複数のペプミックスの存在下において培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスは、複数のペプミックス中の他の各ペプミックスによってカバーされる抗原とは異なる少なくとも１つの抗原をカバーし得る。いくつかの実施形態において、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８、少なくとも９、少なくとも１０、少なくとも１１、少なくとも１２、少なくとも１３、少なくとも１４、少なくとも１５、少なくとも１６、少なくとも１７、少なくとも１８、少なくとも１９、少なくとも２０個の異なる抗原が、複数のペプミックスによってカバーされ得る。いくつかの実施形態において、少なくとも２０個を超える異なる抗原が、複数のペプミックスによってカバーされ得る。いくつかの実施形態において、少なくとも２つの異なるウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、複数のペプミックスによってカバーされ得る。

【0053】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＥＢＶ（エプスタイン・バーウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＣＭＶ（サイトメガロウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、アデノウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＢＫウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＪＣウイルス（Ｊｏｈｎ Ｃｕｎｎｉｎｇｈａｍウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＨＶ６（ヘルペスウイルス６）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＲＳＶ（ヒト呼吸器合胞体ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、インフルエンザ由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、パラインフルエンザ由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ボカウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、コロナウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＬＣＭＶ（リンパ球脈絡髄膜炎ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ムンプス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、麻疹由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ヒトメタニューモウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、パルボウイルスＢ由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ロタウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、メルケル細胞ウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、単純ヘルペスウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＰＶ（ヒトパピローマウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＩＶ（ヒト免疫不全ウイルス）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＴＬＶ１（ヒトＴ細胞白血病ウイルス１型）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ＨＨＶ８（ヘルペスウイルス８）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、Ｂ型肝炎ウイルス（ＨＢＶ）由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、西ナイルウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、ジカウイルス由来であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法において使用される抗原は、エボラ由来であり得る。

【0054】

いくつかの実施形態において、少なくとも１つのペプミックスは、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザおよびＨＭＰＶ（ヒトメタニューモウイルス）の各々由来の抗原をカバーし得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるインフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるインフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ ＭＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるインフルエンザ抗原は、インフルエンザＡインフルエンザＡ抗原ＮＰ１およびインフルエンザＡ ＭＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｎタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｎタンパク質およびＲＳＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｎタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｍ２－１タンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｍタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるｈＭＰＶ抗原は、ｈＭＰＶ Ｆタンパク質とｈＭＰＶ Ｎタンパク質とｈＭＰＶ Ｍ２－１とｈＭＰＶ Ｍタンパク質との組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｍタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ ＨＮタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｎタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｆタンパク質であり得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスにおいて使用されるＰＩＶ抗原は、ＰＩＶ Ｍタンパク質とＰＩＶ ＨＮタンパク質とＰＩＶ Ｎタンパク質とＰＩＶ Ｆタンパク質との組み合わせであり得る。

【0055】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１およびインフルエンザＡ抗原ＭＰ１を網羅するペプミックスの存在下においてＭＮＣまたはＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＲＳＶ抗原ＮおよびＲＳＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｎを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１を網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｍを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｍを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原ＨＮを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｎを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。

【0056】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１およびインフルエンザＡ抗原ＭＰ１を網羅するペプミックスの存在下においてＭＮＣまたはＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＲＳＶ抗原ＮおよびＲＳＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｎを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１を網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ｈＭＰＶ抗原Ｍを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｍを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原ＨＮを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｎを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＰＩＶ抗原Ｆを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。

【0057】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような少なくとも１つのペプミックスは、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫおよびＨＨＶ６由来の抗原をカバーし得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＬＭＰ２であり得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＥＢＮＡ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＢＺＬＦ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１およびＢＺＬＦ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ＩＥ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ｐｐ６５であり得る。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ＩＥ１およびｐｐ６５であり得る。

【0058】

いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ヘキソンであり得る。いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ペントンであり得る。いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ヘキソンおよびペントンであり得る。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ＶＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ラージＴであり得る。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ＶＰ１およびラージＴであり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ９０であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ１１であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ１４であり得る。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ９０、Ｕ１１およびＵ１４であり得る。

【0059】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＥＢＶ抗原であるＬＭＰ２、ＥＢＶ抗原であるＥＢＮＡ１およびＥＢＶ抗原であるＢＺＬＦ１を網羅するペプミックスの存在下においてＭＮＣまたはＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＣＭＶ抗原ＩＥ１およびＣＭＶ抗原ｐｐ６５を網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、アデノウイルス抗原であるヘキソンおよびアデノウイルス抗原であるペントンを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＢＫウイルス抗原であるＶＰ１およびラージＴを網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＨＨＶ６抗原であるＵ９０、ＨＨＶ６抗原であるＵ１１およびＨＨＶ６抗原であるＵ１４を網羅するペプミックスの存在下における培養を含み得る。

【0060】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＨＢＶコア抗原、ＨＢＶ表面抗原、ならびにＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原の各々を網羅するペプミックスの存在下においてＭＮＣまたはＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。

【0061】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）およびそれらの組み合わせから選択されるＨＨＶ－８抗原を網羅するペプミックスの存在下においてＭＮＣまたはＰＢＭＣを培養する工程を含み得る。

【0062】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなペプミックスは、１５ｍｅｒのペプチドを含み得る。１つの実施形態において、抗原を網羅するペプミックス中のペプチドは、順に１１アミノ酸重複し得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクの構築は、抗原特異的Ｔ細胞を拡大することを含み得る。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクの構築は、抗原特異的Ｔ細胞を抗原特異的細胞傷害性について試験することを含み得る。

【0063】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクを含み得るドナーバンクを提供する。いくつかの実施形態において、そのドナーバンクは、抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクを構築する方法を介して作製され得る。本開示は、本明細書中に記載されるようなドナーバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む、疾患または状態を処置する方法を提供する。

【0064】

本開示は、本明細書中に記載されるようなドナーバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与することによって疾患または状態を処置する方法を提供する。いくつかの実施形態において、患者への抗原特異的Ｔ細胞株の投与に対する唯一の基準は、患者が、抗原特異的Ｔ細胞株の製造において使用されるＭＮＣを単離してきたドナーと少なくとも２つのＨＬＡアレルを共有していることである。１つの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣであり得る。いくつかの実施形態において、処置される疾患は、ウイルス感染症であり得る。いくつかの実施形態において、処置される疾患は、癌であり得る。

【0065】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなドナーバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株によって処置される患者は、免疫無防備状態であり得る。いくつかの実施形態において、それらの患者は、その疾患もしくは状態または別の疾患もしくは状態を処置するために患者が受けた処置に起因して免疫無防備状態である。いくつかの実施形態において、それらの患者は、年齢に起因して免疫無防備状態である。１つの実施形態において、患者は、低年齢に起因して免疫無防備状態である。１つの実施形態において、患者は、高齢に起因して免疫無防備状態である。いくつかの実施形態において、処置される状態は、免疫不全であり得る。１つの実施形態において、免疫不全は、原発性免疫不全である。いくつかの実施形態において、患者は、移植治療を必要としている。

【0066】

本開示は、移植手技において移植ドナーから移植材料を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療を施すために、本明細書中に記載されるようなドナーバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を提供する。いくつかの実施形態において、その方法は、患者のＨＬＡタイプと移植ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、その患者と移植ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの第１セットを特定する工程（ａ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、その共有ＨＬＡアレルの第１セットを、本明細書中に記載されるようなドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較して、共有ＨＬＡアレルの第１セットと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定する工程（ｂ）を含み得る。

【0067】

いくつかの実施形態において、上記方法は、工程（ｂ）において特定されたＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程（ｃ）を含み得る。いくつかの実施形態において、８つの共有アレルの完全一致には、８というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、７つの共有アレルには、７というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、６つの共有アレルには、６というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、５つの共有アレルには、５というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、５つの共有アレルには、５というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、３つの共有アレルには、３というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、２つの共有アレルには、２というスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、上記方法は、患者のＨＬＡタイプと、本明細書中に記載されるようなドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、患者とそれぞれの各Ｔ細胞株ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの１つ以上の追加セットを特定する工程（ｄ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、Ｔ細胞株と患者との間で共通している工程（ｄ）において特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアを割り当てる工程（ｅ）を含む。

【0068】

いくつかの実施形態において、８つの共有アレルの完全一致には、工程（ｄ）において特定されたＸの５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、４）が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、７つの共有アレルには、工程（ｄ）において特定されたＸ１の５０％のスコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３．５）が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、６つの共有アレルには、工程（ｄ）において特定されたＸ２の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３）が割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、２つ以上の任意の数の共有アレルには、工程（ｄ）に従ってスコアが割り当てられ得る。いくつかの実施形態において、上記方法は、本明細書中に記載されるようなバンク内の各抗原特異的Ｔ細胞株に対して、１次スコアと２次スコアとを合算する工程（ｆ）を含み得る。いくつかの実施形態において、上記方法は、工程（ｆ）から得たスコアが最も高い第１の抗原特異的Ｔ細胞株を、患者に投与するために選択する工程（ｇ）を含み得る。

【0069】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、幹細胞を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、実質臓器を含み得る。いくつかの実施形態において、実質臓器は、腎臓である。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、骨髄を含み得る。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような患者によって受け取られた移植材料は、幹細胞、実質臓器および骨髄を含み得る。いくつかの実施形態において、上記方法は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株をドナーバンクから選択する方法の工程（ｇ）において選択された第１の抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む。

【0070】

いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株の投与は、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）をもたらさない。いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株の投与は、ウイルス感染症を処置するための投与であり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株の投与は、腫瘍を処置するための投与であり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株の投与は、移植前の原発性免疫不全に対する投与であり得る。いくつかの実施形態において、上記方法は、第２の抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含み得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株と同じドナーバンクから選択され得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株とは異なるドナーミニバンクから選択され得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株以外のドナーバンクに残っているすべてのＴ細胞株を用いて、本明細書中に記載されるようなドナーバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を反復することによって選択され得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が処置有効性を示した後に、患者に投与され得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が処置有効性を示さなかった後に、患者に投与され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、ウイルス感染症に対するものであり得る。

【0071】

いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者からの感染のウイルス血症の消失に基づいて計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者からの感染のウイルス尿症の消失（ｖｉｒｕｒｉｃ ｒｅｓｏｌｕｔｉｏｎ）に基づいて計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者由来のサンプル中のウイルス量の消失に基づいて計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、感染のウイルス血症の消失、感染のウイルス尿症の消失、および患者由来のサンプル中のウイルス量の消失に基づいて計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、抗原特異的Ｔ細胞株の投与後に計測され得る。

【0072】

いくつかの実施形態において、サンプルは、患者由来の組織サンプルから選択され得る。いくつかの実施形態において、サンプルは、患者由来の体液サンプルから選択され得る。いくつかの実施形態において、サンプルは、患者由来の脳脊髄液（ＣＳＦ）から選択され得る。いくつかの実施形態において、サンプルは、患者由来の気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）から選択され得る。いくつかの実施形態において、サンプルは、患者由来の便から選択され得る。いくつかの実施形態において、サンプルは、患者由来の組織サンプル、体液サンプル、ＣＳＦ、ＢＡＬおよび便から選択され得る。

【0073】

いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血中の検出可能なウイルス量をモニタリングすることによって計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、肉眼的血尿の消失を含み得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、ＣＴＣＡＥ－ＰＲＯまたは患者および／もしくは臨床医が報告するアウトカムを調べる類似の評価ツールによって計測される出血性膀胱炎症状の低減を含み得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、癌に対するものである。いくつかの実施形態において、処置有効性は、抗原特異的Ｔ細胞株の投与後の腫瘍サイズの減少に基づいて計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、疾患負荷のマーカーをモニタリングすることによって計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血／血清中の検出可能な腫瘍溶解をモニタリングすることによって計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血／血清中の検出可能な疾患負荷および腫瘍溶解のマーカーをモニタリングすることによって計測され得る。いくつかの実施形態において、処置有効性は、画像診断を介して腫瘍の状態をモニタリングすることによって計測され得る。他の実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血／血清中の検出可能な疾患負荷のマーカーと腫瘍溶解と、画像診断を介した腫瘍の状態との組み合わせをモニタリングすることによって計測され得る。

【0074】

いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が有害臨床反応をもたらした後に患者に投与され得る。いくつかの実施形態において、有害臨床反応には、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）が含まれ得る。いくつかの実施形態において、有害臨床反応には、炎症反応が含まれ得る。１つの実施形態において、炎症反応には、サイトカイン放出症候群が含まれ得る。

【0075】

いくつかの実施形態において、炎症反応は、１つ以上の症状または徴候を観察することによって検出され得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の症状または徴候には、全身症状が含まれ得る。いくつかの実施形態において、全身症状は、発熱、悪寒、頭痛、倦怠感、疲労、悪心、嘔吐または関節痛であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の症状または徴候には、低血圧を含む血管症状が含まれ得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の症状または徴候には、心臓症状が含まれ得る。１つの実施形態において、心臓症状は、不整脈である。いくつかの実施形態において、１つ以上の症状または徴候には、呼吸困難が含まれ得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の症状または徴候には、腎症状が含まれ得る。１つの実施形態において、腎症状は、腎不全である。１つの実施形態において、腎症状は、尿毒症である。いくつかの実施形態において、１つ以上の症状または徴候には、検査症状（ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ ｓｙｍｐｔｏｍｓ）が含まれ得る。１つの実施形態において、検査症状は、凝固障害および血球貪食性リンパ組織球症様症候群であり得る。

【0076】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞の第１のドナーミニバンクの構築において使用するのに適したドナーを同定する方法を提供する。本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法を提供する。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを決定するかまたは決定されている工程（ａ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプを決定するかまたは決定されている工程（ｂ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプと、第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプとを比較する工程（ｃ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、このパラグラフに記載されているような工程（ｄ）における比較に基づいて、第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のアレルが適合する第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程（ｄ）を含み得る。

【0077】

いくつかの実施形態において、上記方法は、第１のドナーミニバンクに含めるために第１の最適合ドナーを選択する工程（ｅ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナープールから第１の最適合ドナーを除去し、それにより、第１の最適合ドナーを除く第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程（ｆ）を含み得る。いくつかの実施形態において、その方法は、第１の複数の見込み患者から、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去する工程（ｇ）を含み得る。いくつかの実施形態において、工程（ｇ）は、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得ることを含み得る。

【0078】

いくつかの実施形態において、上記方法は、工程（ｆ）および（ｇ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、工程（ｃ）～（ｇ）をさらに１回以上反復する工程（ｈ）を含み得る。いくつかの実施形態において、追加の最適合ドナーが、工程（ｅ）に従って選択されるたびに、その最適合ドナーが、工程（ｆ）に従ってそれぞれのドナープールから除去される。いくつかの実施形態において、次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｇ）に従って次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者がそれぞれの複数の見込み患者から除去される。いくつかの実施形態において、工程（ｈ）は、第１のドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数を、その方法の各サイクル後に１ずつ増加させる。いくつかの実施形態において、工程（ｈ）は、選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従ってその方法の各サイクル後に患者集団内の複数の見込み患者の数を減少させることを含み得る。いくつかの実施形態において、工程（ｃ）～（ｇ）は、第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが複数の見込み患者に残るまで反復され得る。いくつかの実施形態において、工程（ｃ）～（ｇ）は、ドナープールにドナーが残らなくなるまで反復され得る。

【0079】

いくつかの実施形態において、本開示は、パラインフルエンザウイルス３型（ＰＩＶ－３）由来の少なくとも１つの第１の抗原および１つ以上の第２のウイルス由来の少なくとも１つの第２の抗原を含む複数のウイルス抗原を含むドナーミニバンクまたは複数のドナーミニバンクでできたドナーバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与することを提供する。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの第２の抗原は、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）である。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの第２の抗原は、インフルエンザである。いくつかの実施形態において、少なくとも１つの第２の抗原は、ヒトメタニューモウイルス（ｈＭＰＶ）である。

【図面の簡単な説明】

【0080】

【図1】図１は、難治性ウイルス感染症を有する患者において使用するためのドナーバンクの選択プロセスの全体的な概要を表している。略語：ＨＬＡ：ヒト白血球抗原。ＨＳＣＴ：造血幹細胞移植。

【0081】

【図2】図２は、ドナー選択プロセスの一部を表している。各ドナーを患者集団と比較して、２アレルという最低閾値でのＨＬＡ適合に基づいて抗原特異的Ｔ細胞株によって患者の大部分に対応するドナーを特定する。

【0082】

【図3】図３は、ドナー選択プロセスの一部を表している。患者の大部分に対応するドナーは、（ｉ）抗原特異的Ｔ細胞株作製の一次選考を通過し；（ｉｉ）全体のドナープールから除去され；（ｉｉｉ）このドナーによって対応されるすべての患者が、患者集団から除去される。

【0083】

【図4】図４は、ドナー選択プロセスの一部を表している。図２に記載されたのと同じ工程であって、残りの患者を最もカバーするドナーを特定し、次いで、その後の考慮からそのドナーと対応される患者の両方を除去する工程を反復する。

【0084】

【図5】図５は、ドナー選択プロセスの一部を表している。図３に記載されたのと同じ工程であって、残りの患者を最もカバーするドナーを特定し、次いで、その後の考慮からそのドナーと対応される患者の両方を除去する工程を反復する。

【0085】

【図6】図６は、ドナー選択プロセスの一部を表している。図２に記載されたのと同じ工程であって、残りの患者を最もカバーするドナーを特定し、次いで、その後の考慮からそのドナーと対応される患者の両方を除去する工程を反復する。

【0086】

【図7】図７は、ドナー選択プロセスの一部を表している。図３に記載されたのと同じ工程であって、残りの患者を最もカバーするドナーを特定し、次いで、その後の考慮からそのドナーと対応される患者の両方を除去する工程を反復する。

【0087】

【図8】図８は、ドナー選択プロセスの一部を表している。図２に記載されたのと同じ工程であって、残りの患者を最もカバーするドナーを特定し、次いで、その後の考慮からそのドナーと対応される患者の両方を除去する工程を反復する。

【0088】

【図9】図９は、ドナー選択プロセスの一部を表している。図３に記載されたのと同じ工程であって、残りの患者を最もカバーするドナーを特定し、次いで、その後の考慮からそのドナーと対応される患者の両方を除去する工程を反復する。

【0089】

【図10】図１０は、患者の少なくとも９５％をカバーする（患者ｍおよびｋだけが適合しない）ミニバンク（ドナー２、３、５および６を含む）の作製を示している。

【0090】

【図11】図１１は、抗原特異的Ｔ細胞株の製造の一般概念を示している。

【0091】

【図12】図１２は、抗原特異的Ｔ細胞株の製造のフローチャートを示している。

【0092】

【図13】図１３は、ＩＦＮ－γ ＥＬＩＳＰＯＴアッセイを用いて評価したときのＡｄｖ、ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６に対する抗原特異的Ｔ細胞株の効力を示している。

【0093】

【図14】図１４は、Ａｄｖ、ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６に対して効力のある抗原特異的Ｔ細胞株と効力のない抗原特異的Ｔ細胞株とを区別するための効力閾値の定義を示している。

【0094】

【図15】図１５は、効力のある抗原特異的Ｔ細胞株での処置に成功した２０人のＢＫ－ＨＣ患者における、抗原特異的Ｔ細胞株の効力と臨床的有用性との相関を示している。Ｔ細胞株の効力が無いことと、処置後の患者におけるＢＫウイルス濃度の上昇とが相関している。

【0095】

【図16】図１６は、効力閾値を超える抗原特異的Ｔ細胞株の使用と、ＢＫウイルスに対する臨床的有用性との相関関係を示しており、処置後にＢＫウイルスレベルが全体的に低下していることを示している。

【0096】

【図17A】作製されたＣＭＶＳＴ株の特色およびスクリーニングされた被験体との適合度。トリパンブルー排除法を用いた細胞数に基づいて２０日間にわたって達成されたＣＭＶＳＴのＴ細胞拡大（ｎ＝８）。

【図17B】作製されたＣＭＶＳＴ株の特色およびスクリーニングされた被験体との適合度。凍結保存の当日における拡大されたＣＭＶＳＴ株の表現型（平均±ＳＥＭ、ｎ＝８）。

【図17C】作製されたＣＭＶＳＴ株の特色およびスクリーニングされた被験体との適合度。ＩＥ１抗原およびｐｐ６５抗原を網羅するペプミックスでＣＭＶＳＴを一晩刺激した後のＩＦＮ－γ ＥＬＩＳｐｏｔアッセイによって測定されたときの抗原特異的Ｔ細胞の頻度。結果は、プレーティングした２×１０^５ＶＳＴあたりのスポット形成細胞（ＳＦＣ）として報告されている。合計≧３０ＳＦＣ／２×１０^５を有したＣＭＶＳＴ株を陽性とみなした（ｎ＝８）。

【図17D】作製されたＣＭＶＳＴ株の特色およびスクリーニングされた被験体との適合度。スクリーニングされた患者のレシピエントＨＬＡと臨床で使用するために特定されたＣＭＶＳＴ株とで適合するＨＬＡ抗原の数（合計８つのうち）（ｎ＝２９）。

【0097】

【図18】サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）に感染した個々の患者における処置のアウトカム。ＣＭＶＳＴを注入する２週間前（－２週目に最も近いウイルス量レベル）、注入の直前（ｐｒｅ）および注入後（ｐｏｓｔ）（２、４および６週目）の患者の血漿中ＣＭＶウイルス量（ＩＵ／ｍＬ）の描写。矢印は注入時点を示している。

【0098】

【図19A】インビボにおけるＣＭＶ特異的Ｔ細胞の頻度。ＩＥ１およびｐｐ６５ウイルスペプミックスで一晩刺激した後のＩＦＮ－γ ＥＬＩＳｐｏｔアッセイによって計測したときの注入前（ｐｒｅ）および注入後（ｐｏｓｔ）の末梢血中のＣＭＶＳＴの頻度。結果は、投入した５×１０^５細胞あたりのスポット形成細胞（ＳＦＣ）（平均±ＳＥＭ、ｎ＝１０）として表現されている。

【図19B】インビボにおけるＣＭＶ特異的Ｔ細胞の頻度。個々の患者における注入されたＣＭＶＳＴの持続。ＣＭＶＳＴ株にしかないＨＬＡ抗原またはレシピエントとＣＭＶＳＴ株とで共有されるＨＬＡ抗原に限定されるエピトープ特異的ＣＭＶペプチドで刺激した後のＩＦＮ－γ ＥＬＩＳｐｏｔアッセイによって計測したときの末梢血中のＴ細胞の頻度。

【0099】

【図20A】図２０は、健康ドナーからのポリクローナルマルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製例を示している。（Ａ）は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴ作製プロトコルの概略図を示している。

【図20B】図２０は、健康ドナーからのポリクローナルマルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製例を示している。（Ｂ）は、トリパンブルー排除法を用いた細胞数に基づいて１０～１３日間にわたって達成された拡大倍率を示している（ｎ＝１２）。

【図20C】図２０は、健康ドナーからのポリクローナルマルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製例を示している。（Ｃ）は、拡大された細胞の表現型を示している（平均値±ＳＥＭ、ｎ＝１２）。

【図20D】図２０は、健康ドナーからのポリクローナルマルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製例を示している。（Ｄ）は、拡大された細胞の表現型を示している（平均値±ＳＥＭ、ｎ＝１２）。

【0100】

【図21】図２１は、拡大されたＣＤ４＋Ｔ細胞集団内の制御性Ｔ細胞（Ｔｒｅｇ；ＣＤ４＋ＣＤ２５＋ＦｏｘＰ３＋）の検出が最小だったことを示している（平均値±ＳＥＭ、ｎ＝８）。

【0101】

【図22A】図２２は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴの特異性および濃縮を示している。（Ａ）は、各標的ウイルス由来の個々の刺激抗原に曝露した後の、拡大されたＴ細胞株内のウイルス反応性Ｔ細胞の特異性を示している。データは、平均値±ＳＥＭ ＳＦＣ／２×１０^５として表されている（ｎ＝１２）。

【図22B】図２２は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴの特異性および濃縮を示している。（Ｂ）は、特異性の濃縮倍率を表している（ＰＢＭＣ 対 マルチ－Ｒ－ＶＳＴ；ｎ＝１２）。

【図22C】図２２は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴの特異性および濃縮を示している。（Ｃ）は、１人の代表的なドナーにおけるウイルス刺激後のＣＤ４ヘルパーＴ細胞（上）およびＣＤ８細胞傷害性Ｔ細胞（下）からのＩＣＳによって評価したときのＩＦＮｙ産生を示している（ドットプロットはＣＤ３＋細胞についてゲーティングされたもの）。

【図22D】図２２は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴの特異性および濃縮を示している。（Ｄ）は、スクリーニングされた９人のドナーの要約結果を示している（平均値±ＳＥＭ）。

【0102】

【図23】図２３は、個々の刺激抗原（インフルエンザ、ＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３）に応答するドナー由来ＶＳＴ株の数を示している。

【0103】

【図24】図２４は、各標的ウイルス由来のプールされた刺激抗原に滴定濃度で曝露した後の拡大されたＴ細胞株内のウイルス反応性Ｔ細胞の特異性を示している。データは、平均値±ＳＥＭ ＳＦＣ／２×１０^５として表されている（ｎ＝７）。

【0104】

【図25】図２５は、各標的ウイルス由来の個々の刺激抗原に曝露した後の健康ドナーの末梢血中のＧＡＲＶ特異的Ｔ細胞の頻度を示している。データは、平均値±ＳＥＭ ＳＦＣ／５×１０^５として表されている（ｎ＝１２）。

【0105】

【図26】図２６は、末梢血ＧＡＲＶ特異的前駆体が主にＣＤ４＋コンパートメント内に検出されることを示している。各標的ウイルス由来の個々の刺激抗原に曝露した後の健康ドナーの末梢血から単離され、磁気ソーティングされたＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞集団内のＧＡＲＶ特異的Ｔ細胞の頻度がここに示されている。データは、平均値±ＳＥＭ ＳＦＣ／５×１０^５として表されている（ｎ＝４）。

【0106】

【図27A】図２７は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴがポリクローナルであり、多機能であることを示している。（Ａ）は、１人の代表的なドナーにおける、ＩＣＳによって評価したときのＣＤ３＋Ｔ細胞からのＩＦＮｙとＴＮＦａとの二重産生を示している。

【図27B】図２７は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴがポリクローナルであり、多機能であることを示している。（Ｂ）は、スクリーニングされた９人のドナーの要約結果を示している（平均値±ＳＥＭ）。

【図27C】図２７は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴがポリクローナルであり、多機能であることを示している。（Ｃ）は、マルチプレックスビーズアレイによって計測したときのマルチ－Ｒ－ＶＳＴのサイトカインプロファイルを示している。

【図27D】図２７は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴがポリクローナルであり、多機能であることを示している。（Ｄ）では、ＥｌｌｓｐｏｔアッセイによってグランザイムＢの産生を評価している。結果は、ＳＦＣ／２×１０^５投入ＶＳＴとして報告されている（平均値±ＳＥＭ、ｎ＝９）。

【0107】

【図28A】図２８は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴが、ウイルスに感染した標的にもっぱら反応性であることを示している。（Ａ）には、ペプミックスでパルスされた自己ＰＨＡ芽球を標的とし（Ｅ：Ｔ ４０：１；ｎ＝８）、負荷されていないＰＨＡ芽球をコントロールとして使用して、標準的な４時間のＣｒ５１放出アッセイによって評価したマルチ－Ｒ－ＶＳＴの細胞溶解能力が図示されている。結果は、特異的溶解のパーセンテージとして表されている（平均値±ＳＥＭ）。

【図28B】図２８は、マルチ－Ｒ－ＶＳＴが、ウイルスに感染した標的にもっぱら反応性であることを示している。（Ｂ）は、Ｃｒ^５１放出アッセイによって評価したとき、マルチ－Ｒ－ＶＳＴが、感染していない自己ＰＨＡ芽球または同種異系ＰＨＡ芽球に対して活性を示さないことを実証している。

【0108】

【図29】図２９は、ペプミックスでパルスされた自己ＰＨＡ芽球を標的とし（Ｅ：Ｔ ４０：１、２０：１、１０：１、５：１）、負荷されていないＰＨＡ芽球をコントロールとして使用して、標準的な４時間のＣｒ^５１放出アッセイによって評価したマルチ－Ｒ－ＶＳＴの細胞傷害活性を示している。結果は、特異的溶解のパーセンテージとして表されている（平均値±ＳＥＭ、ｎ＝８）。

【0109】

【図30A】図３０は、ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中のＲＳＶ特異的Ｔ細胞およびｈＭＰＶ特異的Ｔ細胞の検出を示している。３つの感染症に関する２人のＨＳＣＴレシピエントから単離されたＰＢＭＣを、読出しとしてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔを用いて感染ウイルスに対する特異性について試験した。（Ａ）は、制御されたＲＳＶ関連ＵＲＴＩを有する２人の患者の結果を示しており、その制御は、内在性のＲＳＶ特異的Ｔ細胞の検出可能な増加と同時に起きていた。ＡＬＣ：絶対リンパ球数。

【図30B】図３０は、ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中のＲＳＶ特異的Ｔ細胞およびｈＭＰＶ特異的Ｔ細胞の検出を示している。３つの感染症に関する２人のＨＳＣＴレシピエントから単離されたＰＢＭＣを、読出しとしてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔを用いて感染ウイルスに対する特異性について試験した。（Ｂ）は、制御されたＲＳＶ関連ＵＲＴＩを有する２人の患者の結果を示しており、その制御は、内在性のＲＳＶ特異的Ｔ細胞の検出可能な増加と同時に起きていた。ＡＬＣ：絶対リンパ球数。

【図30C】図３０は、ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中のＲＳＶ特異的Ｔ細胞およびｈＭＰＶ特異的Ｔ細胞の検出を示している。３つの感染症に関する２人のＨＳＣＴレシピエントから単離されたＰＢＭＣを、読出しとしてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔを用いて感染ウイルスに対する特異性について試験した。（Ｃ）は、ｈＭＰＶ－ＬＲＴＩのクリアランスおよび内在性のｈＭＰＶ特異的Ｔ細胞の拡大を示している。ＡＬＣ：絶対リンパ球数。

【0110】

【図31A】図３１は、ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中のＲＳＶ特異的Ｔ細胞およびＰＩＶ３特異的Ｔ細胞の検出を示している。３つの感染症に関する３人のＨＳＣＴレシピエントから単離されたＰＢＭＣを、読出しとしてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔを用いて感染ウイルスに対する特異性について試験した。（Ａ）は、制御されたＲＳＶ関連およびＰＩＶ３関連のＵＲＴＩおよびＬＲＴＩを有する２人の患者の結果を示しており、その制御は、内在性のウイルス特異的Ｔ細胞の検出可能な増加と同時に起きていた。ＡＬＣ：絶対リンパ球数。

【図31B】図３１は、ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中のＲＳＶ特異的Ｔ細胞およびＰＩＶ３特異的Ｔ細胞の検出を示している。３つの感染症に関する３人のＨＳＣＴレシピエントから単離されたＰＢＭＣを、読出しとしてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔを用いて感染ウイルスに対する特異性について試験した。（Ｂ）は、制御されたＲＳＶ関連およびＰＩＶ３関連のＵＲＴＩおよびＬＲＴＩを有する２人の患者の結果を示しており、その制御は、内在性のウイルス特異的Ｔ細胞の検出可能な増加と同時に起きていた。ＡＬＣ：絶対リンパ球数。

【図31C】図３１は、ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中のＲＳＶ特異的Ｔ細胞およびＰＩＶ３特異的Ｔ細胞の検出を示している。３つの感染症に関する３人のＨＳＣＴレシピエントから単離されたＰＢＭＣを、読出しとしてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔを用いて感染ウイルスに対する特異性について試験した。（Ｃ）は、ウイルスに対してＴ細胞応答を開始しなかった、進行中のＰＩＶ３関連の重症ＵＲＴＩを有する患者の結果を示している。ＡＬＣ：絶対リンパ球数。

【0111】

【図32】図３２は、５４人の見込み患者を用いたＰＯＣ研究において、臨床で使用するためのシミュレーションで特定されたＶｉｒａｌｙｍ－Ｍ株のＨＬＡ適合を示している。

【0112】

【図33】図３３は、Ｂａｙｌｏｒ’ｓ Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｃｅｌｌ ａｎｄ Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙにおいて＞６５０人の同種異系ＨＳＣＴ患者集団全体を処置する際の、臨床で使用するためのシミュレーションで特定されたＶｉｒａｌｙｍ－Ｍ株のＨＬＡ適合を示している。

【0113】

【図34】図３４は、ＨＬＡ不適合の標的に対する細胞傷害活性を計測することによって評価したとき、マルチウイルス特異的Ｔ細胞（Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ細胞）のアロ反応性が無かったことを示している。

【0114】

【図35】図３５は、奏効とＨＬＡの適合度との関係を示している。ＣＲ：完全奏効；ＰＲ：部分奏効；ＮＲ：非応答者。

【0115】

【図36】図３６は、臨床試験の患者集団全体にわたる、ＨＬＡ－クラスＩ、ＩＩ、またはクラスＩとクラスＩＩの両方におけるＨＬＡ適合の程度を示している。

【0116】

【図37】図３７は、ＨＬＡ適合アレル（ＨＬＡ－クラスＩ、ＩＩ、またはクラスＩとクラスＩＩの両方）に基づく１２週目の奏効を示している。

【発明を実施するための形態】

【0117】

本発明の詳細を下記の添付の説明に示す。本明細書中に記載される方法および材料と類似または等価な方法および材料を本発明の実施または試験において使用することができるが、ここでは例証的な方法および材料を説明する。本発明の他の特徴、目的および利点は、この説明および請求項から明らかになるだろう。明細書および添付の請求項では、文脈が明らかに他のことを指示しない限り、単数形は、複数形も含む。別段定義されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者が通常理解している意味と同じ意味を有する。本明細書において引用されるすべての特許および刊行物は、その全体が参照により本明細書中に援用される。
一般的な方法

【0118】

本発明の実施は、別段示されない限り、当該分野の技術範囲内である、細胞培養、分子生物学（組換え手法を含む）、微生物学、細胞生物学、生化学および免疫学の従来の手法を用いる。そのような手法は、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，ｔｈｉｒｄ ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｓａｍｂｒｏｏｋ ｅｔ ａｌ．，２００１）Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｐｒｅｓｓ；Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ（Ｐ．Ｈｅｒｄｅｗｉｊｎ，ｅｄ．，２００４）；Ａｎｉｍａｌ Ｃｅｌｌ Ｃｕｌｔｕｒｅ（Ｒ．Ｉ．Ｆｒｅｓｈｎｅｙ），ｅｄ．，１９８７）；Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ（Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）；Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｅｘｐｅｒｉｍｅｎｔａｌ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（Ｄ．Ｍ．Ｗｅｉｒ ＆ Ｃ．Ｃ．Ｂｌａｃｋｗｅｌｌ，ｅｄｓ．）；Ｇｅｎｅ Ｔｒａｎｓｆｅｒ Ｖｅｃｔｏｒｓ ｆｏｒ Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｃｅｌｌｓ（Ｊ．Ｍ．Ｍｉｌｌｅｒ ＆ Ｍ．Ｐ．Ｃａｌｏｓ，ｅｄｓ．，１９８７）；Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕｂｅｌ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，１９８７）；ＰＣＲ：Ｔｈｅ Ｐｏｌｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ，（Ｍｕｌｌｉｓ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，１９９４）；Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（Ｊ．Ｅ．Ｃｏｌｉｇａｎ ｅｔ ａｌ．，ｅｄｓ．，１９９１）；Ｓｈｏｒｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ（Ｗｉｌｅｙ ａｎｄ Ｓｏｎｓ，１９９９）；Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ（Ｂ．Ｄｅｔｒｉｃｋ，Ｎ．Ｒ．Ｒｏｓｅ，ａｎｄ Ｊ．Ｄ．Ｆｏｌｄｓ ｅｄｓ．，２００６）；Ｉｍｍｕｎｏｃｈｅｍｉｃａｌ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ（Ｊ．Ｐｏｕｎｄ，ｅｄ．，２００３）；Ｌａｂ Ｍａｎｕａｌ ｉｎ Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ：Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ ａｎｄ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（Ａ．Ｎｉｇａｍ ａｎｄ Ａ．Ａｙｙａｇａｒｉ，ｅｄｓ．２００７）；Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｙ Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍａｎｕａｌ：Ｔｈｅ Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ Ｓｏｕｒｃｅｂｏｏｋ ｏｆ Ｔｅｃｈｎｉｑｕｅｓ（Ｉｖａｎ Ｌｅｆｋｏｖｉｔｓ，ｅｄ．，１９９６）；Ｕｓｉｎｇ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ：Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ（Ｅ．Ｈａｒｌｏｗ ａｎｄ Ｄ．Ｌａｎｅ，ｅｄｓ．，１９８８）などの文献において十分に説明されている。
定義

【0119】

別段定義されない限り、本明細書中で使用されるすべての専門用語および科学用語は、本発明が属する分野の当業者が通常理解している意味と同じ意味を有する。本明細書中に記載される方法および材料と類似または等価な方法および材料を本発明の実施または試験において使用することができるが、好ましい方法および材料を説明する。本発明のために、以下の用語を下記で定義する。

【0120】

本明細書中で使用されるとき、語「ａ」または「ａｎ」の使用は、請求項および／または明細書において用語「～を含む」とともに使用されるとき、「１つ」を意味し得るが、「１つ以上」、「少なくとも１つ」および「１つまたは１つより多い」の意味とも一致する。例としては、「エレメント（ａｎ ｅｌｅｍｅｎｔ）」は、１つのエレメントまたは１つより多いエレメントを意味する。本発明のいくつかの実施形態は、本発明の１つ以上のエレメント、方法工程および／または方法からなり得るかまたは本質的になり得る。本明細書中に記載される任意の方法または組成物が、本明細書中に記載される他の任意の方法または組成物に関して実行され得ることが企図される。

【0121】

ある数値の直前の用語「約」は、その数値の±０％～１０％、±０％～１０％、±０％～９％、±０％～８％、±０％～７％、±０％～６％、±０％～５％、±０％～４％、±０％～３％、±０％～２％、±０％～１％、±０％～１％未満、またはこれらの中の他の任意の値もしくは値の範囲を意味する。例えば、「約４０」は、４０の±０％～１０％（すなわち、３６～４４）を意味する。

【0122】

用語「および／または」は、別段示されない限り、「および」または「または」のいずれかを意味するために本開示において使用される。

【0123】

本明細書全体にわたって、文脈が他のことを要求しない限り、語「～を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅ）」、「～を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｅｓ）」および「～を含む（ｃｏｍｐｒｉｓｉｎｇ）」は、記載の工程もしくはエレメントまたは工程群もしくはエレメント群を包含するが、他の任意の工程もしくはエレメントまたは工程群もしくはエレメント群を排除しないことを暗に示すと理解される。「～からなる」は、句「～からなる」の前に何が置かれたとしても、「～を含み、それらに限定される」ことを意味する。したがって、句「～からなる」は、列挙されたエレメントが、不可欠または必須であること、および他のエレメントが存在しない可能性があることを示す。「～から本質的になる」は、この句の前に列挙される任意のエレメント、および列挙されたエレメントについて本開示に明示される活性または作用を干渉しないまたはそれらに寄与しない他のエレメントに限定されるエレメントを含むことを意味する。したがって、句「～から本質的になる」は、列挙されたエレメントが、不可欠または必須であるが、他のエレメントは自由選択であり、それらが列挙されたエレメントの活性または作用に実質的に影響するか否かに応じて、存在してもよいか、または存在してはならないことを示す。

【0124】

用語「障害」は、疾患、状態または疾病を意味するために本開示において使用され、別段示されない限り、それらの用語と交換可能に使用される。

【0125】

「有効量」は、治療薬（例えば、本明細書中に開示される抗原特異的Ｔ細胞製品または抗原特異的Ｔ細胞株）に関連して使用されるとき、本明細書中に記載されるような被験体における疾患または障害を処置または予防するために有効な量である。

【0126】

用語「例えば（ｅ．ｇ．）」は、「例えば（ｆｏｒ ｅｘａｍｐｌｅ）」を意味するために本明細書中で使用され、記載の工程もしくはエレメントまたは工程群もしくはエレメント群を包含するが、他の任意の工程もしくはエレメントまたは工程群もしくはエレメント群を排除しないことを暗に示すと理解される。

【0127】

「自由選択の」または「必要に応じて」は、その後に記載される事象または状況が起きるかもしれないし、起きないかもしれないこと、およびその説明にはその事象または状況が起きる場合および起きない場合が含まれることを意味する。

【0128】

本明細書中で使用される用語「腫瘍関連抗原」とは、腫瘍細胞上で産生／発現され、かつ宿主において免疫応答を引き起こす、抗原性物質のことを指す。

【0129】

例示的な腫瘍抗原としては、少なくとも以下が挙げられる：腸癌の場合の癌胎児抗原（ＣＥＡ）；卵巣癌の場合のＣＡ－１２５；乳癌の場合のＭＵＣ－１または上皮性腫瘍抗原（ＥＴＡ）またはＣＡ１５－３；悪性黒色腫の場合のチロシナーゼまたはメラノーマ関連抗原（ＭＡＧＥ）；および種々のタイプの腫瘍の場合の、ｒａｓの異常産物であるｐ５３；ヘパトーマ、卵巣癌または精巣癌の場合のアルファフェトプロテイン；精巣癌を有する男性の場合の、ｈＣＧのベータサブユニット；前立腺癌の場合の前立腺特異抗原；複数のミエローマおよび一部のリンパ腫の場合のベータ２ミクログロブリン；直腸結腸癌、胆管癌および膵癌の場合のＣＡ１９－９；肺癌および前立腺癌の場合のクロモグラニンＡ；メラノーマ、軟部組織肉腫ならびに乳癌、結腸癌および肺癌の場合のＴＡ９０。腫瘍抗原の例は、当該分野で、例えばＣｈｅｅｖｅｒ ｅｔ ａｌ．，２００９（その全体が参照により本明細書中に援用される）において、公知である。

【0130】

腫瘍抗原の具体例としては、例えば少なくともＣＥＡ、ＭＨＣ、ＣＴＬＡ－４、ｇｐ１００、メソテリン、ＰＤ－Ｌ１、ＴＲＰ１、ＣＤ４０、ＥＧＦＰ、Ｈｅｒ２、ＴＣＲアルファ、ｔｒｐ２、ＴＣＲ、ＭＵＣ１、ｃｄｒ２、ｒａｓ、４－１ＢＢ、ＣＴ２６、ＧＩＴＲ、ＯＸ４０、ＴＧＦ－α．ＷＴ１、ＭＵＣ１、ＬＭＰ２、ＨＰＶ Ｅ６ Ｅ７、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＨＥＲ－２／ｎｅｕ、ＭＡＧＥ Ａ３、ｐ５３非変異体、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＰＳＭＡ、ＧＤ２、Ｍｅｌａｎ Ａ／ＭＡＲＴ１、Ｒａｓ変異体、ｇｐ１００、ｐ５３変異体、プロテイナーゼ３（ＰＲ１）、ｂｃｒ－ａｂｌ、チロシナーゼ、サバイビン、ＰＳＡ、ｈＴＥＲＴ、ＥｐｈＡ２、ＰＡＰ、ＭＬ－ＩＡＰ、ＡＦＰ、ＥｐＣＡＭ、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２ ＥＴＳ融合遺伝子）、ＮＡ１７、ＰＡＸ３、ＡＬＫ、アンドロゲンレセプター、サイクリンＢ１、ポリシアル酸、ＭＹＣＮ、ＲｈｏＣ、ＴＲＰ－２、ＧＤ３、フコシルＧＭ１、メソテリン、ＰＳＣＡ、ＭＡＧＥ Ａ１、ｓＬｅ（ａ）、ＣＹＰ１Ｂ１、ＰＬＡＣ１、ＧＭ３、ＢＯＲＩＳ、Ｔｎ、ＧｌｏｂｏＨ、ＥＴＶ６－ＡＭＬ、ＮＹ－ＢＲ－１、ＲＧＳ５、ＳＡＲＴ３、ＳＴｎ、炭酸脱水酵素ＩＸ、ＰＡＸ５、ＯＹ－ＴＥＳ１、精子タンパク質１７、ＬＣＫ、ＨＭＷＭＡＡ、ＡＫＡＰ－４、ＳＳＸ２、ＸＡＧＥ１、Ｂ７Ｈ３、レグマイン（Ｌｅｇｕｍａｉｎ）、Ｔｉｅ２、Ｐａｇｅ４、ＶＥＧＦＲ２、ＭＡＤ－ＣＴ－１、ＦＡＰ、ＰＤＧＦＲ－β、ＭＡＤ－ＣＴ－２およびＦｏｓ関連抗原１が挙げられる。

【0131】

用語「ウイルス抗原」は、本明細書中で使用されるとき、天然におけるタンパク質である抗原のことを指し、ウイルス粒子と密接に関連する。具体的な実施形態において、ウイルス抗原は、コートタンパク質である。

【0132】

ウイルス抗原の具体例としては、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＪＣウイルス、ＨＨＶ６、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ボカウイルス、コロナウイルス、ＬＣＭＶ、ムンプス、麻疹、ヒトメタニューモウイルス、パルボウイルスＢ、ロタウイルス、メルケル細胞ウイルス、単純ヘルペスウイルス、ＨＰＶ、ＨＢＶ、ＨＩＶ、ＨＴＬＶ１、ＨＨＶ８および西ナイルウイルス、ジカウイルス、エボラから選択されるウイルスが少なくとも挙げられる。

【0133】

用語「ウイルス特異的Ｔ細胞」または「ＶＳＴ」または「ウイルス特異的Ｔ細胞株」または「ＶＳＴ細胞株」は、被験体の外で拡大および／または製造された、かつ目的のウイルスに対して特異性および効力を有する、Ｔ細胞株、例えば、本明細書中に記載されるようなＴ細胞株のことを指すために本明細書中で交換可能に使用される。ＶＳＴは、いくつかの実施形態において、モノクローナルまたはオリゴクローナルであり得る。特定の実施形態において、ＶＳＴは、ポリクローナルである。本明細書中に記載されるとき、いくつかの実施形態では、あるウイルス抗原またはいくつかのウイルス抗原が、末梢血単核球中の天然のＴ細胞またはメモリーＴ細胞に対して提示され、それに応答して、それらのウイルス抗原に対して特異性を有する天然のＣＤ４＋および／またはＣＤ８＋Ｔ細胞集団が拡大する。例えば、好適なドナーから得られたＰＢＭＣのサンプル中のＥＢＶに対するウイルス特異的Ｔ細胞は、ＥＢＶ抗原（例えば、必要に応じてＭＨＣによって提示される、ＥＢＶ抗原由来のペプチドエピトープ）を認識（に結合）でき、これは、ＥＢＶに特異的なＴ細胞の拡大を引き起こし得る。別の例では、好適なドナーから得られたＰＢＭＣのサンプル中のＢＫウイルスに対するウイルス特異的Ｔ細胞、ＰＢＭＣのサンプル中のアデノウイルスに対するウイルス特異的Ｔ細胞は、それぞれ、ＢＫウイルス抗原およびアデノウイルス抗原（例えば、必要に応じてＭＨＣによって提示される、それぞれ、ＢＫウイルス抗原およびアデノウイルス抗原由来のペプチドエピトープ）を認識し、それらに結合でき、これは、ＢＫウイルスに特異的なＴ細胞およびアデノウイルスに特異的なＴ細胞の拡大を引き起こし得る。

【0134】

本明細書中で使用されるとき、用語「細胞治療製品」とは、被験体の外で拡大および／または製造された細胞株、例えば、本明細書中に記載されるような細胞株のことを指す。例えば、用語「細胞治療製品」は、培養において作製された細胞株を包含する。その細胞株は、エフェクター細胞を含み得るか、またはエフェクター細胞から本質的になり得る。その細胞株は、ＮＫ細胞を含み得るか、またはＮＫ細胞から本質的になり得る。その細胞株は、Ｔ細胞を含み得るか、またはＴ細胞から本質的になり得る。例えば、用語「細胞治療製品」は、培養において作製された抗原特異的Ｔ細胞株を包含する。そのような抗原特異的Ｔ細胞株には、場合によっては、メモリーＴ細胞の拡大集団、ナイーブＴ細胞を刺激することによって作製されたＴ細胞の拡大集団、および操作されたＴ細胞（例えば、キメラＴ細胞レセプターまたは組換えＴ細胞レセプター、共刺激レセプターなどのような外来性タンパク質を発現するＣＡＲ－Ｔ細胞およびＴ細胞）の拡大集団が含まれる。特に、用語「細胞治療製品」は、いくつかの実施形態において、ウイルス特異的Ｔ細胞株または腫瘍特異的Ｔ細胞株（例えば、ＴＡＡ特異的Ｔ細胞株）を含む。その細胞株は、モノクローナルまたはオリゴクローナルであり得る。特定の実施形態において、その細胞株は、ポリクローナルである。そのようなポリクローナル細胞株は、いくつかの実施形態において、多様な抗原特異性を有する細胞（例えば、抗原特異的Ｔ細胞）の複数の拡大集団を含む。例えば、用語「細胞治療製品」に包含される細胞株の非限定的な１つの例としては、Ｔ細胞の複数の拡大クローン集団（それらの少なくとも２つが、異なるウイルス抗原に対して特異性を有する）を含むウイルス特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団が挙げられる。そのようなポリクローナルなウイルス特異的Ｔ細胞は、当該分野で公知であり、ＷＯ２０１１０２８５３１、ＷＯ２０１３１１９９４７、ＷＯ２０１７０４９２９１およびＰＣＴ／ＵＳ２０２０／０２４７２６（これらの各々はその全体が参照により本明細書中に援用される）をはじめとした本発明者らが出願した様々な特許出願に開示されている。

【0135】

本明細書中で使用される用語「ドナーミニバンク」は、そのドナーミニバンクが、標的患者集団内の規定のパーセンテージの患者に対して十分に適合する少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含むように、多様なドナープールから集合的に得られる複数の細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含む細胞バンクのことを指す。例えば、ある特定の実施形態において、本明細書中に記載されるドナーミニバンクは、標的患者集団（例えば、同種異系の造血幹細胞移植レシピエントまたは免疫無防備状態の被験体）の少なくとも９５％に対して少なくとも１つの十分に適合する細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含む。本明細書中で使用される用語「ドナーバンク」は、複数のドナーミニバンクのことを指す。様々な実施形態では、「ドナーバンク」に含めるためのいくつかの冗長でないミニバンクを作製して、確実に１人の見込み患者が２つ以上の十分に適合する細胞治療製品を利用できるようにすることが有益である。細胞バンクは、凍結保存され得る。凍結保存の方法は、当該分野で公知であり、例えば、－７０℃での、例えば、アクセスが規制されている領域における気相の液体窒素中での、細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）の貯蔵が挙げられ得る。細胞治療製品の別個のアリコートが、複数の有効な液体窒素デュアーの中の容器（例えば、バイアル）において調製され、保存され得る。容器（例えば、バイアル）は、検索を可能にするユニークな識別番号でラベルされ得る。

【0136】

本明細書中で使用されるとき、用語「患者」または「被験体」は、ヒト、飼育動物および家畜ならびに動物園の動物、競技用動物およびペット動物（例えば、イヌ、ウマ、ネコ、ウシ、ヒツジ、ブタ、ヤギ、ラット、モルモットまたは非ヒト霊長類（例えば、サル、チンパンジー、ヒヒまたはアカゲザル））をはじめとした任意の哺乳動物のことを指すために交換可能に使用される。１つの好ましい哺乳動物は、成人、小児および高齢者を含むヒトである。

【0137】

本明細書中で使用されるとき、用語「潜在ドナー」とは、本明細書中に開示される細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞）によって標的とされる抗原に対して血清陽性である個体（例えば、健康個体）のことを指す。いくつかの実施形態において、ドナープールに含めるのに適格であるすべての潜在ドナーが、標的抗原についてプレスクリーニングされ、かつ／または標的抗原に対して血清陽性とみなされる。

【0138】

用語「標的患者集団」は、いくつかの実施形態において、本明細書中に記載される細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞製品）を必要とする複数の患者（または交換可能に「被験体」）を説明するために使用される。いくつかの実施形態において、この用語は、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、ワールドワイドウェブアドレスｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｂｅｔｈｅｍａｔｃｈｃｌｉｎｉｃａｌ．ｏｒｇにおいて利用可能なＮａｔｉｏｎａｌ Ｍａｒｒｏｗ Ｄｏｎｏｒ Ｐｒｏｇｒａｍ（ＮＭＤＰ）データベースに含まれるすべての患者を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、ワールドワイドウェブアドレス：ｅｂｍｔ．ｏｒｇ／ｅｂｍｔ－ｐａｔｉｅｎｔ－ｒｅｇｉｓｔｒｙにおいて利用可能なＥｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂｌｏｏｄ ａｎｄ Ｍａｒｒｏｗ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ（ＥＢＭＴ）データベースに含まれるすべての患者を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全世界の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全米の１６歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全世界の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全米の５歳以下の小児の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全世界の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。いくつかの実施形態において、この用語は、全米の６５歳以上の個体の同種異系ＨＳＣＴ集団を包含する。

【0139】

本明細書中で使用される用語「処置する（ｔｒｅａｔ）」、「処置する（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」、「処置」などは、別段示されない限り、そのような用語が適用される疾患、障害もしくは状態のプロセスまたはそのような疾患、障害もしくは状態の１つ以上の症状を逆転させる、軽減する、阻害する、あるいはその疾患、障害もしくは状態またはそのような疾患、障害もしくは状態の１つ以上の症状を予防することを指し、その症状もしくは合併症の発生を予防するための本明細書中に記載される組成物、薬学的組成物もしくは剤形のいずれかを投与すること、またはその症状もしくは合併症を軽減すること、またはその疾患、状態もしくは障害を無くすことを含む。場合によっては、処置は、治癒的または回復的である。

【0140】

いくつかの実施形態における用語「第三者」への本明細書中での言及は、ドナーと同じではない被験体（例えば、患者）を意味する。したがって、例えば、「第三者の抗原特異的Ｔ細胞製品」（例えば、第三者のＶＳＴ製品）で被験体を処置するという言及は、その製品がドナー組織（例えば、ドナーの血液から単離されたＰＢＭＣ）に由来すること、および被験体（例えば、患者）がドナーと同じ被験体ではないことを意味する。様々な実施形態において、同種異系細胞治療（例えば、同種異系抗原特異的Ｔ細胞治療）は、「第三者」細胞治療である。

【0141】

被験体に関する用語「予防する（ｐｒｅｖｅｎｔ）」または「予防する（ｐｒｅｖｅｎｔｉｎｇ）」とは、疾患または障害が被験体を苦しめないようにすることを指す。予防には、予防的処置が含まれる。例えば、予防は、ある被験体が疾患に苦しむ前に本明細書中に開示される化合物をその被験体に投与することを含み得、その投与は、被験体がその疾患に苦しめられないようにする。

【0142】

本明細書中で使用される用語「投与する（ａｄｍｉｎｉｓｔｅｒｉｎｇ）」、「投与する（ａｄｍｉｎｉｓｔｅｒ）」、「投与」などは、治療薬による処置を必要とする被験体にそのような作用物質を移す、送達する、導入するまたは輸送する任意の様式のことを指す。そのような様式としては、眼内投与、経口投与、局所投与、静脈内投与、腹腔内投与、筋肉内投与、皮内投与、鼻腔内投与および皮下投与が挙げられるが、これらに限定されない。

【0143】

用語「ＶＳＴ」は、ウイルス特異的Ｔ細胞を意味するために本明細書中で使用される。

【0144】

様々な実施形態において、用語「十分に適合する」は、所与の患者と所与の細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）とが、少なくとも２つのＨＬＡアレルを共有する（すなわち少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合する）場合を説明するために、その患者および細胞治療製品に関して本明細書中で使用される。

【0145】

本発明の他の目的、特徴および利点は、以下の詳細な説明から明らかになるだろう。しかしながら、この詳細な説明から当業者には本発明の趣旨および範囲内での様々な変更および改変が明らかになるので、その詳細な説明および具体例は、本開示の具体的な実施形態を示すが、単に例証として与えられることを理解するべきである。

【0146】

以下の議論は、本発明の様々な実施形態を対象にしている。用語「発明」は、任意の特定の実施形態のことを指すと意図されていないし、本開示の範囲を限定すると意図されていない。これらの実施形態のうちの１つ以上が好ましい場合もあるが、開示された実施形態は、請求項を含む本開示の範囲を限定するものとして解釈または使用されるべきでない。さらに、当業者であれば、以下の説明が広範な適用を有し、任意の実施形態の議論が、その実施形態を例示することだけを意味し、請求項を含む本開示の範囲がその実施形態に限定されることを暗示すると意図されていないことを理解するだろう。
概要

【0147】

本開示の実施形態は、複数の細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含むドナーミニバンクおよび複数のそのようなドナーミニバンクから構成されるドナーバンク、ならびに疾患または障害を処置するための養子免疫療法において使用するために、そのようなドナーミニバンク、ドナーバンク、およびそれらに含まれる細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を作製し、使用する（単独で、またはユニバーサル細胞治療製品として一緒に）方法を含む。

【0148】

特定の実施形態において、本開示は、確実に各ドナーミニバンクが、標的集団の所望のパーセンテージに対して少なくとも１つの十分に適合する細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含むように、ドナーミニバンクに含まれる細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）の構築において使用するための適切に多様なドナーセット（ＨＬＡタイピングに関して）を特定し、選択するための方法およびコンピュータ実装アルゴリズムを含む。本明細書中でさらに議論されるように、所与のミニバンク内の少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）に十分に適合する標的集団のパーセンテージは、そのミニバンクを構築するとき予め決定され得るパラメータであって、標的集団のＨＬＡタイプおよびドナーミニバンクに含まれる細胞治療製品の数に基づき得るパラメータである。場合によっては、各ドナーミニバンクは、標的集団内の見込み患者の少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、少なくとも９９．９％（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）と十分に適合する少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含む。したがって、いくつかの実施形態において、本明細書中に開示される方法は、確実にドナーミニバンク内の少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）が所与の標的集団の９５％以上と少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合するように、好適なドナー多様性（ＨＬＡタイピングに関して）を備えたそのようなドナーミニバンクの構築を可能にする。

【0149】

特定の実施形態において、そのようなドナーミニバンクに含まれるそのような細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）の作製において利用されるドナーは、標的患者集団の少なくとも９５％が、ミニバンク内の少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）と２つ以上のＨＬＡアレルにおいて適合するようにドナー間で十分なＨＬＡ多様性を確保するために、本明細書中に開示されるドナー選択方法を用いて慎重に選択される。本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株（例えば、ＶＳＴ細胞株）などの、部分的にしかＨＬＡが適合しない細胞治療が第三者において安全かつ有効であるという驚くべき発見に部分的に基づく。実際に、実施例１～３に示されるように、本発明者らの臨床試験では、わずか１つというＨＬＡアレルしか適合しない被験体に投与されても、第三者のＶＳＴが安全であり、有効であることが実証された（例えば、図３５～３７を参照のこと）。

【0150】

本開示は、ドナーミニバンク（および複数のそのようなドナーミニバンクを含むドナーバンク）を含み、そのドナーミニバンクは、本明細書中に開示されるドナー選択方法、ならびに疾患または障害を処置または予防するためにそのような細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株製品、例えば、ＶＳＴ製品を含む）を作製、投与および使用する方法を介して特定されたそのような好適な第三者供血者から回収された血液サンプルに由来するそのような細胞治療製品を含む。したがって、様々な実施形態において、そのようなドナーミニバンクは、本明細書中に開示されるドナー選択方法を用いて慎重に選択されたドナーから得られるサンプル（例えば、ＰＢＭＣなどの単核球）に由来する複数の細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含み、そのための細胞治療製品は、標的患者集団の少なくとも９５％が、ミニバンク内の少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）と２つ以上のＨＬＡアレルにおいて適合するように、互いの間に十分なＨＬＡ多様性を備える。

【0151】

様々な実施形態において、本明細書中に開示されるドナーミニバンクに含まれる１つ以上の細胞治療製品が、本明細書中に開示される患者適合方法に基づいて、そのような治療を必要とする、十分に適合する被験体に投与される。いくつかの実施形態において、ドナーミニバンクに含まれる複数のそのような細胞治療製品は、本明細書中に開示される患者適合方法に基づいて、十分に適合する被験体に投与される。いくつかの実施形態では、ドナーミニバンクに含まれる複数のそのような細胞治療製品は、被験体のＨＬＡタイプが既知であるか否かに関係なく、被験体に投与される。例えば、下記でさらに議論されるように、いくつかのそのような実施形態では、被験体には、ドナーミニバンクに含まれる各細胞治療製品が投与され得、そのミニバンクは、本明細書中に開示されるドナー選択方法を用いて慎重に選択されたドナーから得られたサンプル（例えば、ＰＢＭＣ）に由来する複数の細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を含むので、その細胞治療製品は、標的患者集団の少なくとも９５％がそのミニバンク内の少なくとも１つの細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）と２つ以上のＨＬＡアレルにおいて適合するように互いの間に十分なＨＬＡ多様性を備える。このように、ドナーミニバンクは、標的患者集団の＞９５％と適合性である（すなわち、十分に適合する）ユニバーサル細胞治療製品として働く。被験体に一緒に投与される複数の細胞治療製品は、連続的に投与されてもよいし、同時に投与されてもよい。いくつかの実施形態において、複数の細胞治療製品は、合わせてプールされており、単一のユニバーサル細胞治療製品として被験体に投与される。ドナーミニバンクに含まれるそのような細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）のプールは、それを必要とする被験体への後の投与のために、細胞バンクに（例えば、凍結保存で）保存され得る。

【0152】

いくつかの実施形態において、本明細書中に開示されるドナーミニバンクの構築において利用されるドナーは、血清陽性についてプレスクリーニングされ、かつ／またはそれらのドナーは、健康である。本開示は、これらの抗原特異的Ｔ細胞株を、将来を見越して作製し、次いで凍結保存することで、感染ウイルスまたは複数のウイルスに対して実証できるほどの免疫活性を有する「既製品」としてすぐに利用できるようにする。

【0153】

本開示は、いくつかの実施形態において、ポリクローナルＶＳＴが、製造プロセスにおいて生ウイルスの存在または組換えＤＮＡ技術を必要とすることなく作製され得ることを提供する。いくつかの実施形態では、Ｔ細胞集団を拡大し、ウイルス特異性について濃縮して、その結果、アロ反応性Ｔ細胞が減少する。本開示は、細胞治療（例えば、ＶＳＴ）ドナーバンクよびドナーミニバンクが、いくつかの実施形態において、同種異系ＨＳＣＴ患者集団（例えば、米国の同種異系ＨＳＣＴ患者集団）の＞９５％に対応できるようにデザインされ得ることも提供する。さらに、細胞治療（例えば、ＶＳＴ）ドナーバンクおよびドナーミニバンクは、ウイルス感染細胞に対して抗ウイルス効果を媒介するほど十分にＨＬＡが適合している。例えば、十分にＨＬＡが適合しているとは、少なくとも２つのアレルが適合していることを指す。本開示は、いくつかの実施形態において、被験体の幹細胞ドナーと部分的にだけ適合している細胞治療製品、例えばＶＳＴを提供するが、そのような細胞治療製品（例えば、ＶＳＴ）は結果的に、幹細胞ドナーの細胞がレシピエント内で完全に再増殖する時点（この時点においてその細胞療法製品（例えばＶＳＴ）は、再構成された患者の免疫系によって拒絶される）までしか循環しないと予想される。

【0154】

いくつかの実施形態において、ＶＳＴは、レシピエント内を最大１週間、２週間、３週間、４週間、５週間、６週間、７週間、８週間、９週間、１０週間、１１週間、１２週間、１３週間、１４週間、１５週間、１６週間、１７週間、１８週間（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）循環する。１つの実施形態において、ＶＳＴは、レシピエント内を最大１２週間循環する。

【0155】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクの構築において使用するのに適したドナーを同定する方法は、第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者と比較する工程（ａ）を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような工程（ａ）における比較に基づいて、第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のＨＬＡアレルが適合する第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程（図２）。いくつかの実施形態において、患者の大部分に対応するドナーは、（ｉ）抗原特異的Ｔ細胞株作製の一次選考を通過し、（ｉｉ）全体のドナープールから除去され、（ｉｉｉ）このドナーによって対応されるすべての患者が、患者集団から除去される（図３）。いくつかの実施形態において、第１の最適合ドナーは、第１のドナーミニバンクのために選択される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、第１のドナープールから第１の最適合ドナーを除去し、それにより、第１の最適合ドナーを除く第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程（ｄ）を含む。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような方法は、第１の複数の見込み患者から、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去し、それにより、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程（ｅ）を含む。

【0156】

いくつかの実施形態において、第１のドナーミニバンクは、１０人以下、９人以下、８人以下、７人以下、６人以下、５人以下、４人以下、３人以下または２人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含み、第１の見込み患者集団の＞９５％に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて患者のＨＬＡタイプに適合する１つ以上の抗原特異的Ｔ細胞株を提供するのに十分なＨＬＡ多様性を備える。いくつかの実施形態において、第１のドナーミニバンクは、１０人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含む。いくつかの実施形態において、第１のドナーミニバンクは、５人以下のドナーに由来する抗原特異的Ｔ細胞株を含む。

【0157】

いくつかの実施形態において、図４～図１０に示されているように、本方法は、工程（ｄ）および（ｅ）に従って、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者を用いて、本明細書中に記載されるような工程（ａ）～（ｅ）をさらに少なくとも１回、少なくとも２回、少なくとも３回、少なくとも４回、少なくとも５回、少なくとも６回、少なくとも７回、少なくとも右回、少なくとも９回、少なくとも１０回またはそれ以上反復する工程（ｆ）を含む。いくつかの実施形態において、工程（ａ）～（ｅ）は、第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージが複数の見込み患者に残るまで、またはドナープールにドナーが残らなくなるまで、反復される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような工程（ａ）～（ｅ）は、第１の見込み患者集団の５％以下が複数の見込み患者に残るまで、工程（ｆ）に従って繰り返される。図１１に示されているように、選択されたドナーが、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、少なくとも９９．９％の見込み患者（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）に相当し得るとき、第１のドナーミニバンクは完成となる。

【0158】

いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、少なくとも９５人、少なくとも９７人、少なくとも９９人、少なくとも１００人、少なくとも１０５人、少なくとも１１０人、少なくとも１１５人、少なくとも１２０人の患者を含む。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、少なくとも１００人の患者を含む。

【0159】

いくつかの実施形態では、本明細書中に記載されるような工程（ｃ）に従って追加の最適合ドナーが選択されるたびに、工程（ｄ）に従ってそれぞれのドナープールからその追加の最適合ドナーが除去される。いくつかの実施形態では、次の最適合ドナーがそれぞれのドナープールから除去されるたびに、工程（ｅ）に従ってそれぞれの複数の見込み患者から次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者が除去される。

【0160】

いくつかの実施形態では、本明細書中に記載されるような工程（ａ）～（ｅ）を反復することにより、第１のドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数が、上記方法の各サイクル後に１ずつ増加し、それにより、選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従って上記方法の各サイクル後に患者集団内の複数の見込み患者の数が減少する。いくつかの実施形態では、選択されたドナー集団が患者の少なくとも９５％をカバーできたら、第１のドナーミニバンクは完成となる。いくつかの実施形態において、確実に各患者が複数の抗原特異的Ｔ細胞株の選択肢を有するように、本明細書中に記載されるのと同じストラテジーを用いて追加のミニバンクが構築され得る。

【0161】

いくつかの実施形態において、上記の２つ以上のアレルは、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩアレルを含む。いくつかの実施形態において、上記の２つ以上のアレルは、少なくとも２つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む。いくつかの実施形態において、上記の２つ以上のアレルは、少なくとも１つのＨＬＡクラスＩアレルおよび少なくとも１つのＨＬＡクラスＩＩアレルを含む。

【0162】

いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団を含む。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、ワールドワイドウェブアドレスｂｉｏｉｎｆｏｒｍａｔｉｃｓ．ｂｅｔｈｅｍａｔｃｈｃｌｉｎｉｃａｌ．ｏｒｇにおいて利用可能なＮａｔｉｏｎａｌ Ｍａｒｒｏｗ Ｄｏｎｏｒ Ｐｒｏｇｒａｍ（ＮＭＤＰ）データベースに含まれるすべての患者を含む。いくつかの実施形態において、第１の見込み患者集団は、ワールドワイドウェブアドレス：ｅｂｍｔ．ｏｒｇ／ｅｂｍｔ－ｐａｔｉｅｎｔ－ｒｅｇｉｓｔｒｙにおいて利用可能なＥｕｒｏｐｅａｎ Ｓｏｃｉｅｔｙ ｆｏｒ Ｂｌｏｏｄ ａｎｄ Ｍａｒｒｏｗ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ（ＥＢＭＴ）データベースに含まれるすべての患者を含む。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、代用物を使用することによって決定することができ、ここで、前記代用物のサンプルサイズは、十分大きく、米国の同種異系のＨＳＣＴ集団の代表でもある。例として、Ｂａｙｌｏｒ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ（Ｈｏｕｓｔｏｎ，ＴＸ）における６６６人の同種異系のＨＳＣＴレシピエントが、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団の好適な代用物であり得る。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、代用物を使用することによって決定することができ、ここで、前記代用物のサンプルサイズは、十分大きく、全世界の同種異系のＨＳＣＴ集団の代表である。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、３歳以下、４歳以下、５歳以下、６歳以下、７歳以下、８歳以下、９歳以下、１０歳以下、１１歳以下、１２歳以下、１３歳以下、１４歳以下、１５歳以下、１６歳以下、１７歳以下の小児を含む。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、５歳以下の小児を含む。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、１６歳以下の小児を含む。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上、７０歳以上、７５歳以上、８０歳以上、８５歳以上、９０歳以上の個体を含む。いくつかの実施形態において、全世界の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上の個体を含む。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、３歳以下、４歳以下、５歳以下、６歳以下、７歳以下、８歳以下、９歳以下、１０歳以下、１１歳以下、１２歳以下、１３歳以下、１４歳以下、１５歳以下、１６歳以下、１７歳以下の小児を含む。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、５歳以下の小児を含む。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、１６歳以下の小児を含む。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上、７０歳以上、７５歳以上、８０歳以上、８５歳以上、９０歳以上の個体を含む。いくつかの実施形態において、全米の同種異系ＨＳＣＴ集団は、６５歳以上の個体を含む。

【0163】

いくつかの実施形態において、ドナーバンクは、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の第１のミニバンクを構築することによって作製され得る。いくつかの実施形態において、ドナーバンクの作製は、本明細書中に記載されるような第１のミニマンクを構築するすべての工程を反復することを含む。いくつかの実施形態において、ドナーバンクの作製は、１つ以上の第２のミニバンクを構築するための１回以上の第２ラウンドを含む。

【0164】

各第２ラウンドを始める前に、新しいドナープールが作製される。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、上記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから、第１のドナーミニバンクを構築する先の各サイクルの工程（ｄ）に従って除去された任意の最適合ドナーを差し引いた第１のドナープールを含む。いくつかの実施形態において、新しいドナープールは、第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団を含む。例えば、新しいドナープールは、第１のドナープールとは全く異なる潜在ドナーを含み得る。いくつかの実施形態において、新しいドナープールは、上記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから、第１のドナーミニバンクを構築する先の各サイクルの工程（ｄ）に従って除去された任意の最適合ドナーを差し引いた第１のドナープールと、第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団との組み合わせを含み得る。例として、新しいドナープールは、第１のドナープール由来の３人のドナーおよび第１のドナープールに含まれない７人の新しいドナーを含み得る。

【0165】

いくつかの実施形態において、各第２ラウンドを始める前に、ドナーバンクを構築する方法は、第１の見込み患者集団から第１の複数の見込み患者を再構築する工程を含む。いくつかの実施形態において、再構築は、先の各サイクルの工程（ｅ）（すなわち、第１の複数の見込み患者から、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去し、それにより、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者を得る工程）に従って上記方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから以前に除去されたすべての見込み患者を戻すことを含む。

【0166】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株の第１のドナーミニバンクを構築する方法は、ドナーミニバンクに含まれるそれぞれの各ドナーから得られた血液からＭＮＣを単離するか、またはその血液から単離されたＭＮＣを手に入れる工程を含む。ドナーバンクに含まれる各ドナー由来の血液が、収集され得る。いくつかの実施形態では、ドナーバンクに含まれる各ドナー由来の収集された血液中の単核球（ＭＮＣ）が回収される。ＭＮＣおよびＰＢＭＣは、当業者に公知の方法を用いることによって単離される。例として、密度遠心分離（勾配）（フィコール－パーク）が、ＰＢＭＣを単離するため使用され得る。他の例では、回収されたばかりの血液を含む細胞調製チューブ（ＣＰＴ）およびＳｅｐＭａｔｅチューブが、ＰＢＭＣを単離するために使用され得る。

【0167】

いくつかの実施形態において、ＭＮＣは、ＰＢＭＣである。例として、ＰＢＭＣには、リンパ球、単球および樹状細胞が含まれ得る。例として、リンパ球には、Ｔ細胞、Ｂ細胞およびＮＫ細胞が含まれ得る。いくつかの実施形態において、本明細書中で使用されるＭＮＣは、培養または凍結保存される。いくつかの実施形態において、それらの細胞を培養または凍結保存するプロセスは、培養中の細胞を１つ以上の抗原と好適な培養条件下で接触させて、抗原特異的Ｔ細胞を刺激し、拡大することを含み得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原には、１つ以上のウイルス抗原が含まれ得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の抗原には、１つ以上の腫瘍関連抗原が含まれ得る。他の実施形態において、１つ以上の抗原には、１つ以上のウイルス抗原と１つ以上の腫瘍関連抗原との組み合わせが含まれ得る。例えば、培養または凍結保存されたＭＮＣまたはＰＭＢＣを、１つのアデノウイルス、ＣＴＬＡ－４およびｇｐ１００と接触させ得る。他の実施形態において、各抗原は、腫瘍関連抗原である。他の実施形態において、各抗原は、ウイルス抗原である。他の実施形態では、少なくとも１つの抗原がウイルス抗原であり、少なくとも１つの抗原が腫瘍関連抗原である。

【0168】

いくつかの実施形態において、上記細胞を培養または凍結保存するプロセスは、培養中の細胞を１つ以上の抗原由来の１つ以上のエピトープと好適な培養条件下で接触させることを含み得る。いくつかの実施形態において、ＭＮＣまたはＰＢＭＣを１つ以上の抗原または１つ以上の抗原由来の１つ以上のエピトープと接触させることにより、それぞれの各ドナーのＭＮＣまたはＰＭＢＣ由来の抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を刺激し、拡大する。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞株は、凍結保存され得る。

【0169】

いくつかの実施形態において、上記の１つ以上の抗原は、ホールタンパク質の形態であり得る。いくつかの実施形態において、上記の１つ以上の抗原は、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックスであり得る。いくつかの実施形態において、上記の１つ以上の抗原は、ホールタンパク質と、各抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含むペプミックスとの組み合わせであり得る。

【0170】

いくつかの実施形態において、ＰＢＭＣまたはＭＮＣの培養は、気体透過性の培養表面を備える容器において行われる。１つの実施形態において、その容器は、気体透過性の部分を備える注入バッグ、または剛性容器である。１つの実施形態において、その容器は、ＧＲｅｘバイオリアクターである。１つの実施形態において、その容器は、本明細書中に記載されるようなＰＢＭＣまたはＭＮＣの培養に適した任意の容器、バイオリアクターなどであり得る。

【0171】

いくつかの実施形態において、ＰＢＭＣまたはＭＮＣは、１つ以上のサイトカインの存在下において培養される。いくつかの実施形態において、サイトカインは、ＩＬ４である。いくつかの実施形態において、サイトカインは、ＩＬ７である。いくつかの実施形態において、サイトカインは、ＩＬ４およびＩＬ７である。いくつかの実施形態において、サイトカインにはＩＬ４およびＩＬ７が含まれるが、ＩＬ２は含まれない。いくつかの実施形態において、サイトカインは、本明細書中に記載されるようなＰＢＭＣまたはＭＮＣの培養に適したサイトカインの任意の組み合わせであり得る。

【0172】

いくつかの実施形態において、ＭＮＣまたはＰＢＭＣの培養は、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれ以上の異なるペプミックスの存在下において行われ得る。複数のペプチドであるペプミックスは、ある抗原の一部または配列全体を網羅する一連の重複ペプチドを含む。いくつかの実施形態において、ＭＮＣまたはＰＢＭＣは、複数のペプミックスの存在下において培養され得る。この場合、各ペプミックスは、複数のペプミックス中の他の各ペプミックスによってカバーされる抗原とは異なる少なくとも１つの抗原をカバーする。いくつかの実施形態では、少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０個またはそれ以上の異なる抗原が、複数のペプミックスによってカバーされる。いくつかの実施形態では、少なくとも２つの異なるウイルス由来の少なくとも１つの抗原が、複数のペプミックスによってカバーされる。図１１および図１２は、抗原特異的Ｔ細胞株を構築する一般的なＧＭＰ製造プロトコルの例を示している。

【0173】

いくつかの実施形態において、ペプミックスは、１５ｍｅｒのペプチドを含む。いくつかの実施形態において、ペプミックスは、本明細書中に記載されるような方法に適したペプチドを含む。いくつかの実施形態において、抗原を網羅するペプミックス中のペプチドは、順に８アミノ酸、９アミノ酸、１０アミノ酸、１１アミノ酸、１２アミノ酸、１３アミノ酸、１４アミノ酸、１５アミノ酸重複する。いくつかの実施形態において、抗原を網羅するペプミックス中のペプチドは、順に１１アミノ酸重複する。

【0174】

いくつかの実施形態において、１つ以上のペプミックス中のウイルス抗原は、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫ、ＪＣウイルス、ＨＨＶ６、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ボカウイルス、コロナウイルス、ＬＣＭＶ、ムンプス、麻疹、ヒトメタニューモウイルス、パルボウイルスＢ、ロタウイルス、メルケル細胞ウイルス、単純ヘルペスウイルス、ＨＰＶ、ＨＩＶ、ＨＴＬＶ１、ＨＨＶ８および西ナイルウイルス、ジカウイルス、エボラから選択されるウイルスに由来する。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのペプミックスは、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ヒトメタニューモウイルス（ＨＭＰＶ）由来の抗原をカバーする。いくつかの実施形態において、ウイルスは、任意の好適なウイルスであり得る。

【0175】

いくつかの実施形態において、インフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、インフルエンザ抗原は、インフルエンザＡ抗原ＭＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、インフルエンザ抗原は、ＮＰ１とＭＰ１との組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、ＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｎであり得る。いくつかの実施形態において、ＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ Ｆであり得る。いくつかの実施形態において、ＲＳＶ抗原は、ＲＳＶ ＮとＦとの組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、ｈＭＰＶ抗原は、Ｆであり得る。いくつかの実施形態において、ｈＭＰＶ抗原は、Ｎであり得る。いくつかの実施形態において、ｈＭＰＶ抗原は、Ｍ２－１であり得る。いくつかの実施形態において、ｈＭＰＶ抗原は、Ｍであり得る。いくつかの実施形態において、ｈＭＰＶ抗原は、ＦとＮとＭ２－１とＭとの組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、ＰＩＶ抗原は、Ｍであり得る。いくつかの実施形態において、ＰＩＶ抗原は、ＨＮであり得る。いくつかの実施形態において、ＰＩＶ抗原は、Ｎであり得る。いくつかの実施形態において、ＰＩＶ抗原は、Ｆであり得る。いくつかの実施形態において、ＰＩＶ抗原は、ＭとＨＮとＮとＦとの組み合わせであり得る。

【0176】

他の実施形態において、少なくとも１つのペプミックスは、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫおよびＨＨＶ６由来の抗原をカバーする。いくつかの実施形態において、ＥＢＶ抗原は、ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１、ＢＺＬＦ１およびそれらの組み合わせに由来する。いくつかの実施形態において、ＣＭＶ抗原は、ＩＥ１、ｐｐ６５およびそれらの組み合わせに由来する。いくつかの実施形態において、アデノウイルス抗原は、ヘキソン、ペントンおよびそれらの組み合わせに由来する。いくつかの実施形態において、ＢＫウイルス抗原は、ＶＰ１、ラージＴおよびそれらの組み合わせに由来する。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ６抗原は、Ｕ９０、Ｕ１１、Ｕ１４およびそれらの組み合わせに由来する。

【0177】

いくつかの実施形態において、ＰＢＭＣまたはＭＮＣは、インフルエンザＡ抗原ＮＰ１およびインフルエンザＡ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原ＮおよびＦ、ｈＭＰＶ抗原Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭ、ならびにＰＩＶ抗原Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦを網羅するペプミックスの存在下において培養される。いくつかの実施形態において、ＰＢＭＣまたはＭＮＣは、ＥＢＶ抗原ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１およびＢＺＬＦ１、ＣＭＶ抗原ＩＥ１およびｐｐ６５、アデノウイルス抗原ヘキソンおよびペントン、ＢＫウイルス抗原ＶＰ１およびラージＴ、ならびにＨＨＶ６抗原Ｕ９０、Ｕ１１およびＵ１４を網羅するペプミックスの存在下において培養される。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞は、抗原特異的細胞傷害性について試験される。

【0178】

図１３は、アデノウイルス、ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６に対する抗原特異的Ｔ細胞株のそれぞれの効力を、効力閾値より低いネガティブコントロールと比べて示している。これらのＴ細胞は、特異的なＴ細胞株の合格と不合格とを区別するための閾値である＞３０ＳＦＣ／２×１０^５投入ＶＳＴによって指摘されるように、５つすべてのウイルスに特異的である。＞３０ＳＦＣ／２×１０^５投入ＶＳＴという効力閾値は、内部ネガティブコントロールとして働く、標的ウイルスの１つ以上について血清陰性の（血清学的スクリーニングに基づいて）ドナーから作製されたＴ細胞株を用いた実験データに基づいて確立された（図１４）。

【0179】

本開示は、本明細書中に記載されるようなミニバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む、疾患または状態を処置する方法を提供する。いくつかの実施形態において、患者への投与に対して抗原特異的Ｔ細胞株を認定することに対する唯一の基準は、患者が、抗原特異的Ｔ細胞株の製造において使用されたＭＮＣまたはＰＢＭＣを単離してきたドナーと少なくとも２つのＨＬＡアレルを共有していることである。いくつかの実施形態において、本開示は、所与の患者への投与のためにドナーミニバンクから最も適した細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を特定するための方法を含む。いくつかの実施形態において、その患者は、造血幹細胞移植を受けたことがある。いくつかのそのような実施形態において、患者への投与に対して抗原特異的Ｔ細胞株を認定することに対する唯一の基準は、患者および患者の造血幹細胞ドナーが、抗原特異的Ｔ細胞株の製造において使用されたＭＮＣまたはＰＢＭＣを単離してきたドナーと少なくとも２つの適合ＨＬＡアレルを共有していることである。いくつかの実施形態において、本開示は、造血幹細胞移植を受けたことがある所与の患者と幹細胞ドナー（またはダブル臍帯血移植の場合は複数のドナー）との間の、細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）に対するＨＬＡ適合の全レベルに基づいて、そのＨＳＣＴ患者への投与のためにドナーミニバンクから最も適した細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）を特定するための方法を含む。その方法は、コンピュータアルゴリズムを用いて行われ得る。その方法のいくつかの実施形態では、患者のＨＬＡタイプが入手され、記録に残される。幹細胞ドナーのＨＬＡタイプ（または「移植ＨＬＡ」）が入手され、記録に残される。ＨＬＡ情報を入手した後、患者のＨＬＡタイプと移植ＨＬＡタイプとを比較し、共有ＨＬＡアレルを特定する（図１の工程１～３）。図１の工程４によって、ドナーミニバンクを構成する個々の株のＨＬＡタイプのアクセスが可能になる。ドナーミニバンクに含まれるそれぞれの各細胞治療製品（例えば、抗原特異的Ｔ細胞株）のＨＬＡタイプを、工程３において特定された共有ＨＬＡアレルと比較する。そのような各比較によって、共有ＨＬＡアレルの数に基づいて数値スコア（１次スコア）を割り当てる（図１の工程５）。ゆえに、共有するアレルが多いほど、スコアが高くなる。さらに、アルゴリズムは、感染組織に相当する工程１において特定されたような患者のＨＬＡタイプと、ドナーミニバンク内のそれぞれの各細胞治療製品のＨＬＡタイプを比較する。そのような各比較によって、共有ＨＬＡアレルの数に基づいて数値スコア（２次スコア）を割り当てる（図１の工程６）。ゆえに、共有するアレルが多いほど、スコアが高くなる。この２次スコアには、１次スコアの５０％の重みが付けられる。次いで、細胞バンク内の各株に対する１次スコアと２次スコアとを合算する（図１の工程７）。次いで、上記のランキングに基づいてスコアが最も高いＴ細胞組成物を、患者の処置のために選択する（図１の工程８）。

【0180】

いくつかの実施形態において、処置される疾患は、ウイルス感染症である。いくつかの実施形態において、処置される疾患は、癌である。いくつかの実施形態において、処置される状態は、免疫不全である。いくつかの実施形態において、免疫不全は、原発性免疫不全である。

【0181】

いくつかの実施形態において、患者は、免疫無防備状態である。本明細書中で使用されるとき、免疫無防備状態は、免疫系が弱くなっていることを意味する。例えば、免疫無防備状態の患者は、感染症および他の疾患と戦う能力が低下している。いくつかの実施形態において、患者は、その疾患もしくは状態または別の疾患もしくは状態を処置するためにその患者が受けた処置に起因して免疫無防備状態である。いくつかの実施形態において、免疫無防備状態の原因は、年齢に起因する。１つの実施形態において、免疫無防備状態の原因は、低年齢に起因する。１つの実施形態において、免疫無防備状態の原因は、高齢に起因する。いくつかの実施形態において、患者は、移植治療を必要としている。

【0182】

本開示は、移植手技において移植ドナーから移植材料を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療において投与するために、ミニバンクまたはドナーバンクに含まれるミニバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を提供する。１つの実施形態において、投与は、ウイルス感染症を処置するための投与である。１つの実施形態において、投与は、腫瘍を処置するための投与である。１つの実施形態において、投与は、ウイルス感染症および腫瘍を処置するための投与である。１つの実施形態において、投与は、移植前の原発性免疫不全に対する投与である。いくつかの実施形態において、移植材料には、幹細胞が含まれる。いくつかの実施形態において、移植材料には、実質臓器が含まれる。いくつかの実施形態において、移植材料には、骨髄が含まれる。いくつかの実施形態において、移植材料には、幹細胞、実質臓器および骨髄が含まれる。

【0183】

本明細書中に記載されるような方法は、ＨＬＡアレルの適合に従って数値スコアを割り当てることに基づく。いくつかの実施形態では、患者のＨＬＡタイプと移植ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、その患者と移植ドナーとに共通する共有ＨＬＡアレルの第１セットが特定される。いくつかの実施形態において、患者と移植ドナーとに共通する共有ＨＬＡアレルの第１セットは、ミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較される。いくつかの実施形態において、患者と移植ドナーとに共通する共有ＨＬＡアレルの第１セットは、ドナーバンク含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較される。いくつかの実施形態において、その比較によって、共有ＨＬＡアレルの第１セットと１つ以上のＨＬＡアレルを共有するＴ細胞株を特定することが可能になる。

【0184】

いくつかの実施形態では、特定された共有ＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアが割り当てられる。いくつかの実施形態において、８つの共有アレルの完全一致には、Ｘという任意数値スコアが割り当てられる。いくつかの実施形態において、Ｘは、８に等しい。いくつかの実施形態において、７つの共有アレルには、Ｘの７／８である数値スコアＸ１が割り当てられる。いくつかの実施形態において、６つの共有アレルには、Ｘの６／８である数値スコアＸ２が割り当てられる。いくつかの実施形態において、５つの共有アレルには、Ｘの５／８である数値スコアＸ３が割り当てられる。いくつかの実施形態において、４つの共有アレルには、Ｘの４／８である数値スコアＸ４が割り当てられる。いくつかの実施形態において、３つの共有アレルには、Ｘの３／８である数値スコアＸ５が割り当てられる。いくつかの実施形態において、２つの共有アレルには、Ｘの２／８である数値スコアＸ６が割り当てられる。いくつかの実施形態において、１つの共有アレルには、Ｘの１／８である数値スコアＸ７が割り当てられる。

【0185】

いくつかの実施形態では、患者とそれぞれの各Ｔ細胞株ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの１つ以上の追加セットが特定される。いくつかの実施形態において、ミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するまたはドナーバンクに含まれるミニバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプと患者のＨＬＡタイプとが比較される。

【0186】

いくつかの実施形態において、Ｔ細胞株と患者との間で共通する共有ＨＬＡアレルの数に基づいて、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアが割り当てられる。いくつかの実施形態において、８つの共有アレルの完全一致には、１次スコアＸの５０％である２次数値スコアが割り当てられる。例えば、Ｘ＝８である場合、２次数値スコアは４である。いくつかの実施形態において、７つの共有アレルには、Ｘ１の５０％というスコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３．５）を割り当てる。いくつかの実施形態において、６つの共有アレルには、Ｘ２の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、３）を割り当てる。いくつかの実施形態において、５つの共有アレルには、Ｘ３の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、２．５）を割り当てる。いくつかの実施形態において、４つの共有アレルには、Ｘ４の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、２）を割り当てる。いくつかの実施形態において、３つの共有アレルには、Ｘ５の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、１．５）を割り当てる。いくつかの実施形態において、２つの共有アレルには、Ｘ６の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、１）を割り当てる。いくつかの実施形態において、１つの共有アレルには、Ｘ７の５０％である数値スコア（すなわち、Ｘ＝８である場合、０．５）を割り当てる。

【0187】

いくつかの実施形態において、それぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアが割り当てられ、ここで、その２次数値スコアは、１次スコアより低く重み付けされる。いくつかの実施形態において、２次数値スコアには、１次数値スコアの１０％、１５％、２０％、２５％、３０％、３５％、４０％、４５％、５０％、５５％、６０％、６５％、７０％、７５％、８０％、８５％または９０％の重みが付けられる。

【0188】

いくつかの実施形態において、本開示は、総合スコアが最も高い抗原特異的Ｔ細胞株を患者への投与のために選択することを提供する。いくつかの実施形態において、総合スコアが最も高い抗原特異的Ｔ細胞株が、患者に投与される第１の抗原特異的Ｔ細胞株である。いくつかの実施形態において、総合スコアは、ミニバンク内のまたはドナーバンクに含まれるミニバンク内の各抗原特異的Ｔ細胞株に対する１次スコアと２次スコアとを合算することによって計算される。

【0189】

いくつかの実施形態では、第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、患者に投与される。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株と同じミニバンクから選択される。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が得られたミニバンクとは異なるミニバンクから選択される。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株以外のドナーバンクに残っているすべての抗原特異的Ｔ細胞株を用いて、本明細書中に記載されるような第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を反復することによって選択される。

【0190】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクで構成されたドナーバンクを構築する方法を提供する。本明細書中で使用されるとき、「複数」は、抗原特異的Ｔ細胞株の１つより多いミニバンクを意味する。例えば、ドナーバンクは、２、３、４、５または６つのミニバンクを含み得る。いくつかの実施形態において、ドナーバンクの構築は、本明細書中に記載されるような第１のドナーミニバンクを構築するための工程および手順を含む。それらの工程および手順には、１回以上の第２ラウンドを行って、１つ以上の第２のミニバンクを構築することが含まれる。いくつかの実施形態において、その方法の各第２ラウンドを始める前に、その新しいドナープールが作製され得る。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、本明細書中に開示されるような方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから除去された任意の最適合ドナーを差し引いた第１のドナープールを含む。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団を含む。いくつかの実施形態において、その新しいドナープールは、本明細書中に開示されるような方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから除去された任意の最適合ドナーを差し引いた第１のドナープールならびに第１のドナープールに含まれていない全く新しい潜在ドナー集団を含む。いくつかの実施形態において、新しいドナープールの作製は、本明細書中に記載されるような方法の第１ラウンドおよび先の任意の第２ラウンドから以前に除去されたすべての見込み患者を戻すことによって第１の見込み患者集団由来の第１の複数の見込み患者を再構築することを含む。いくつかの実施形態において、選択および除去の各ラウンドの後に、ドナーミニバンクに含まれるそれぞれの各ドナーから得られた血液からＭＮＣが単離される。いくつかの実施形態において、そのＭＮＣは、好適な培養条件下で１つ以上の抗原または１つ以上の抗原由来の１つ以上のエピトープとともに培養および接触される。いくつかの実施形態において、ＭＮＣは、刺激され、抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を拡大する。いくつかの実施形態では、複数のＴ細胞株が作製される。培養する方法、抗原を接触させる方法、およびペプミックスを調製する方法は、本明細書中に記載されるような第１のドナーミニバンクを構築するためのプロセスと同じである。

【0191】

本開示は、疾患または状態を処置する方法を提供し、その方法は、本明細書中に記載されるような抗原特異的Ｔ細胞株の複数のミニバンクを含むドナーバンク由来の１つ以上の好適な抗原特異的Ｔ細胞株を患者に投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、本開示は、移植手技において移植ドナーから移植材料を受け取った患者に同種異系Ｔ細胞治療において投与するために、本明細書中に記載されるようなドナーバンクから第１の抗原特異的Ｔ細胞株を選択する方法を提供する。そのプロセスは、患者のＨＬＡタイプと移植ドナーのＨＬＡタイプとを比較して、その患者と移植ドナーとに共通している共有ＨＬＡアレルの第１セットを特定する工程、その共有ＨＬＡアレルの第１セットを、ドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞株が由来する各ドナーのＨＬＡタイプと比較する工程、ＨＬＡアレルの数に基づいて１次数値スコアを割り当てる工程、患者のＨＬＡタイプと、ドナーバンク内の抗原特異的Ｔ細胞が由来するそれぞれの各ドナーのＨＬＡタイプとを比較する工程、および共有ＨＬＡアレルの数に基づいてそれぞれの各Ｔ細胞株に２次数値スコアを割り当てる工程を含むが、これらに限定されない。次いで、１次スコアと２次スコアが最も高い第１の抗原特異的Ｔ細胞株が患者に投与される。

【0192】

いくつかの実施形態において、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が、患者に投与するために選択される。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株が、患者に投与するために選択される。いくつかの実施形態において、その投与は、ＧＶＨＤをもたらさない。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が処置有効性を示した後に患者に投与される。他の実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が処置有効性を示さなかった後に患者に投与される。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株が有害臨床反応をもたらした後に患者に投与される。その有害臨床反応には、移植片対宿主病（ＧＶＨＤ）、サイトカイン放出症候群などの炎症反応が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、第２の抗原特異的Ｔ細胞株は、第１の抗原特異的Ｔ細胞株の投与後の好適な時点において投与される。

【0193】

炎症反応は、（ｉ）発熱、悪寒、頭痛、倦怠感、疲労、悪心、嘔吐、関節痛から選択される全身症状；（ｉｉ）低血圧を含む血管症状；（ｉｉｉ）不整脈を含む心臓症状；（ｉｖ）呼吸困難；（ｖ）腎不全および尿毒症を含む腎症状；ならびに（ｖｉ）凝固障害および血球貪食性リンパ組織球症様症候群を含む検査症状のうちの１つ以上の症状または徴候を観察することによって検出され得る。いくつかの実施形態において、炎症反応は、既知のまたは一般的な任意の徴候を観察することによって検出され得る。

【0194】

いくつかの実施形態において、処置有効性は、抗原特異的Ｔ細胞株の投与後に計測される。他の実施形態において、処置有効性は、感染のウイルス血症の消失に基づいて計測される。他の実施形態において、処置有効性は、感染のウイルス尿症の消失に基づいて計測される。他の実施形態において、処置有効性は、患者由来のサンプル中のウイルス量の消失に基づいて計測される。他の実施形態において、処置有効性は、感染のウイルス血症の消失、感染のウイルス尿症の消失および患者由来のサンプル中のウイルス量の消失に基づいて計測される。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血中の検出可能なウイルス量をモニタリングすることによって計測される。いくつかの実施形態において、処置有効性は、肉眼的血尿の消失を含む。いくつかの実施形態において、処置有効性は、ＣＴＣＡＥ－ＰＲＯまたは患者および／もしくは臨床医が報告するアウトカムを調べる類似の評価ツールによって計測されるような出血性膀胱炎症状の低減を含む。いくつかの実施形態において、処置有効性は、その処置が癌に対する処置であるとき、抗原特異的Ｔ細胞株の投与後の腫瘍サイズの減少に基づいて計測される。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血／血清中の検出可能な疾患負荷のマーカーをモニタリングすることによって計測される。いくつかの実施形態において、処置有効性は、患者の末梢血／血清中の検出可能な腫瘍溶解のマーカーをモニタリングすることによって計測される。いくつかの実施形態において、処置有効性は、画像診断を介して腫瘍の状況をモニタリングすることによって計測される。

【0195】

サンプルは、患者由来の組織サンプルから選択される。サンプルは、患者由来の体液サンプルから選択される。サンプルは、患者由来の脳脊髄液（ＣＳＦ）から選択される。サンプルは、患者由来のＢＡＬから選択される。サンプルは、患者由来の便から選択される。

【0196】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞の第１のドナーミニバンクの構築において使用するのに適したドナーを同定する方法を提供する。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを決定する工程または決定した状態である工程を含む。いくつかの実施形態において、その方法は、第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプを決定する工程または決定した状態である工程を含む。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプを第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者と比較する工程を含む。いくつかの実施形態において、その方法は、第１の複数の見込み患者の中で最も多くの患者と２つ以上のＨＬＡアレルが適合する第１のドナープール由来のドナーと定義される第１の最適合ドナーを決定する工程を含む。いくつかの実施形態において、その方法は、第１のドナーミニバンクに含めるために第１の最適合ドナーを選択する工程を含む。

【0197】

いくつかの実施形態において、上記方法は、第１のドナープールから第１の最適合ドナーを除去し、それにより、第１の最適合ドナーを除く第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーからなる第２のドナープールを作製する工程を含む。いくつかの実施形態において、その方法は、第１の複数の見込み患者から、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去する工程を含む。次いで、第１の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除く第１の複数の各見込み患者からなる第２の複数の見込み患者が得られる。いくつかの実施形態において、その方法は、まだ除去されていないすべてのドナーおよび見込み患者に対して、本明細書中に記載されるような工程およびプロセスを反復する工程（例えば、第１のドナープール由来の第１の複数の各潜在ドナーのＨＬＡタイプと、第１の見込み患者集団由来の第１の複数の各見込み患者のＨＬＡタイプとを比較する工程、最も適合するものを決定し、ドナーミニバンクのために選択する工程、第１のドナープールから第１の最適合ドナーおよび見込み患者を除去する工程）を含む。

【0198】

プロセスを反復する毎に、追加の最適合ドナーを選択することができ、その次の最適合ドナーと２つ以上のアレルが適合する各見込み患者を除去することができる。本明細書中に記載されるようなプロセスは、第１のドナーミニバンク内の選択された最適合ドナーの数を、その方法の各サイクル後に１ずつ増加させる。次いで、そのプロセスは、選択された最適合ドナーとのＨＬＡ適合に従ってその方法の各サイクル後に患者集団内の複数の見込み患者の数を減少させる。そのプロセスは、第１の見込み患者集団の所望のパーセンテージ（例えば、５％未満）が複数の見込み患者に残るまでまたはドナープールにドナーが残らなくなるまで反復される。いくつかの実施形態において、そのプロセスは、見込み患者の９５％超が適合し、カバーされるまで反復される。

【0199】

ウイルス感染症は、同種異系造血幹細胞移植（アロＨＳＣＴ）の後の罹患および死亡の重大な原因である。ウイルスの再活性化は、無形成の相対免疫不全または絶対免疫不全の間、およびアロＨＳＣＴ後の免疫抑制療法中に起きる可能性が高い。サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、ＢＫウイルス（ＢＫＶ）およびアデノウイルス（ＡｄＶ）をはじめとしたウイルス病原体に関連する感染症は、アロＨＳＣＴ後にますます問題になり、有意な罹患および死亡に関連する。

【0200】

一般的な感染症のうち、依然としてＣＭＶが、同種異系造血幹細胞移植（ＨＳＣＴ）後の最も臨床的に有意な感染症である。Ｃｅｎｔｅｒ ｆｏｒ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｂｌｏｏｄ ａｎｄ Ｍａｒｒｏｗ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔ Ｒｅｓｅａｒｃｈ（ＣＩＢＭＴＲ）データは、ＣＭＶ血清陽性のＨＳＣＴレシピエントの３０％超において、移植後初期のＣＭＶの再活性化が起き、その結果、大腸炎、網膜炎、肺臓炎および死亡がもたらされ得ることを示している。ガンシクロビル、バルガンシクロビル、レテルモビル、ホスカルネットおよびシドフォビルをはじめとした抗ウイルス剤は、予防的と治療的の両方で使用されているが、それらは必ずしも有効でなく、骨髄抑制、腎毒性および究極的には非再発死亡を含む有意な毒性と関連する。依然として免疫再構成が感染制御にとって最も重要であるので、エキソビボで拡大／単離されたＣＭＶ特異的Ｔ細胞（ＣＭＶＳＴ）の養子移入が、抗ウイルスの利点を提供する有効な手段として台頭してきた。

【0201】

ＣＭＶを標的とする初期の免疫療法は、幹細胞ドナー由来のＴ細胞製品に焦点が当てられ、２０年を超える一連の学術的な第Ｉ／ＩＩ相試験において、安全性と有効性の両方が証明された。しかしながら、その治療の個別性ならびにウイルス免疫ドナー（ｖｉｒｕｓ－ｉｍｍｕｎｅ ｄｏｎｏｒｓ）の必要性（ウイルス無感作である可能性が高いより若いドナーを用いる利点を考えると重要な課題）が、広く実施することを妨げる障害として現れてきた。したがって、より最近では、臨床で必要になる前に将来を見越して調製し、バンク化（ｂａｎｋｅｄ）できる、部分的にＨＬＡが適合する第三者由来のウイルス特異的Ｔ細胞（ＶＳＴ）が治療様式の１つとして研究されている。これらのＶＳＴは、薬物抵抗性の感染症／疾患を有する１５０人を超えるＨＳＣＴレシピエントまたは臓器移植（ＳＯＴ）レシピエントにおいて、エプスタイン・バーウイルス、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＨＨＶ６およびＢＫウイルスを含む範囲のウイルスに対して完全かつ効果的であると証明されている。これらの研究により、重要な研究およびその後の商品化に向けて「既製」のウイルス特異的Ｔ細胞を前進させることへの関心が促され、残った疑問は、（ｉ）多様な移植集団に対応するために必要な細胞株の数、および（ｉｉ）臨床的有用性を保証するための株選択の基準の確立に関するものだった。

【0202】

さらに、潜伏ＢＫＶ（ポリオーマウイルス科のメンバー）の再活性化によって引き起こされる感染症の出現は、ＨＳＣＴ患者では重症の臨床疾患の原因となる。同種異系ＨＳＣＴ後のＢＫＶ感染の主な臨床症状は、出血性膀胱炎（ＢＫ－ＨＣ）である。これは、同種異系ＨＳＣＴレシピエントの最大２５％に起き、持続的な麻酔薬注入を必要とする重症のしばしば消耗性の腹痛を伴う肉眼的血尿として現れる。健康個体では、Ｔ細胞免疫が、ウイルスから防御する。アロＨＳＣＴレシピエントでは、強力な免疫抑制性レジメン（およびその後の関連する免疫低下）を使用すると、患者は重症のウイルス感染症にかかりやすくなる。

【0203】

呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、インフルエンザ、パラインフルエンザウイルス（ＰＩＶ）およびヒトメタニューモウイルス（ｈＭＰＶ）をはじめとした市中感染の呼吸器系ウイルス（ＣＡＲＶ）に起因する呼吸器系ウイルス感染症は、同種異系造血幹細胞移植（アロＨＳＣＴ）レシピエントの最大４０％において検出され、それらのレシピエントでは、それらのウイルスは、致死的であり得る細気管支炎および肺炎などの重度の疾患を引き起こす恐れがある。ＲＳＶ誘発性の細気管支炎は、１歳未満の小児における入院の最も一般的な理由であるが、疾病管理センター（ＣＤＣ）は、インフルエンザが毎年、世界中で最大３５６０万人が罹患し、１４０，０００～７１０，０００人が入院し、米国だけでもおよそ８７１億ドルの年間コストが疾患管理にかかり、１２，０００～５６，０００人が死亡していると推定している。

【0204】

本開示は、エキソビボで拡大された遺伝的に改変されていないウイルス特異的Ｔ細胞（ＶＳＴ）を投与することによってＴ細胞免疫の修復を提供して、移植患者自身の免疫系が回復するまでの期間にわたってウイルス感染症を制御し、症状を除去する。いかなる理論にも拘束されることを望むものではないが、ＶＳＴは、ウイルス由来のペプチドを提示している標的細胞上に発現された主要組織適合遺伝子複合体（ＭＨＣ）分子に結合する天然のＴ細胞レセプター（ＴＣＲ）を介してウイルス感染細胞を認識し、殺滅する。

【0205】

いくつかの実施形態において、ＨＬＡ部分適合の「既製」品として入手可能である、プレスクリーニングされた血清陽性の健康ドナーから獲得された末梢血単核球（ＰＢＭＣ）由来のＶＳＴ。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるようなＶＳＴは、少なくともＥＢＶ、ＣＭＶ、ＡｄＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６に応答する。ＶＳＴは、ＨＳＣＴが生着し、免疫系が再配置された後、患者が免疫能を回復するまでだけ循環するようにデザインされる。理論に拘束されることを望むものではないが、本明細書中に記載されるようなＶＳＴおよび方法は、患者が移植を受けて、内在性の免疫応答を開始させることができるようになるまで、免疫無防備状態の患者にＴ細胞免疫を提供する「免疫学的な橋渡し治療」である。

【0206】

ウイルス抗原

【0207】

本開示のいくつかの実施形態において、作製される抗原特異的Ｔ細胞は、ウイルス感染症、細菌感染症または真菌感染症をはじめとした病原性の感染症を有するかまたは有するリスクがある個体に提供される。その個体は、免疫系に欠陥を有しているかもしれないし、有していないかもしれない。場合によっては、その個体は、器官移植または幹細胞移植（造血幹細胞移植を含む）の後のウイルス感染症、細菌感染症または真菌感染症を有するか、または癌を有するか、または例えば癌の処置に供されたことがある。場合によっては、その個体は、後天性免疫系不全の後の感染症を有する。

【0208】

上記個体における感染症は、任意の種類であり得るが、具体的な実施形態では、その感染症は、１つ以上のウイルスの結果である。病原性のウイルスは、任意の種類であり得るが、具体的な実施形態では、それは、以下の科のうちの１つに由来する：アデノウイルス科、ピコルナウイルス科、ヘルペスウイルス科、ヘパドナウイルス科、フラビウイルス科、レトロウイルス科、オルトミクソウイルス科、パラミクソウイルス科、パポバウイルス科、ポリオーマウイルス科、ラブドウイルス科またはトガウイルス科。いくつかの実施形態において、ウイルスは、免疫優性の抗原または準優位な抗原を生成するか、または両方の種類を生成する。具体的な場合において、ウイルスは、ＥＢＶ、ＣＭＶ、アデノウイルス、ＢＫウイルス、ＨＨＶ６、ＲＳＶ、インフルエンザ、パラインフルエンザ、ボカウイルス、コロナウイルス、ＬＣＭＶ、ムンプス、麻疹、メタニューモウイルス、パルボウイルスＢ、ロタウイルス、西ナイルウイルス、スペインインフルエンザおよびそれらの組み合わせからなる群より選択される。

【0209】

いくつかの態様において、感染症は、ある病原菌の結果であり、本発明は、任意のタイプの病原菌に適用可能である。例示的な病原菌としては、少なくともＭｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｕｂｅｒｃｕｌｏｓｉｓ、Ｍｙｃｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｅｐｒａｅ、Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｂｏｔｕｌｉｎｕｍ、Ｂａｃｉｌｌｕｓ ａｎｔｈｒａｃｉｓ、Ｙｅｒｓｉｎｉａ ｐｅｓｔｉｓ、Ｒｉｃｋｅｔｔｓｉａ ｐｒｏｗａｚｅｋｉｉ、連鎖球菌属、シュードモナス属、シゲラ属、カンピロバクター属およびサルモネラ属が挙げられる。

【0210】

いくつかの態様において、感染症は、病原性真菌の結果であり、本発明は、任意のタイプの病原性真菌に適用可能である。例示的な病原性真菌としては、少なくともカンジダ属、アスペルギルス属、クリプトコッカス属、ヒストプラズマ属、ニューモシスチス属またはスタキボトリス属が挙げられる。いくつかの実施形態において、ウイルス抗原は、本開示に記載されるような使用に適した任意の抗原であり得る。

【0211】

腫瘍抗原

【0212】

癌の処置および／または予防のためにＴＡＡ特異的またはマルチＴＡＡ特異的な抗原特異的Ｔ細胞を使用する実施形態では、種々のＴＡＡが標的とされ得る。腫瘍抗原は、宿主において免疫応答を引き起こす、腫瘍細胞において産生される物質である。本明細書中で使用されるとき、用語「腫瘍抗原」と「腫瘍関連抗原」と「ＴＡＡ」とは交換可能に使用される。したがって、これらの用語は、腫瘍特異的抗原（腫瘍細胞上でのみ発現されている抗原であって、健康な細胞上では発現されていない抗原）と、腫瘍細胞上でアップレギュレート／過剰発現されていて、腫瘍細胞に特異的ではない腫瘍関連抗原の両方を包含する。

【0213】

例示的な腫瘍抗原としては、少なくとも以下が挙げられる：腸癌の場合の癌胎児抗原（ＣＥＡ）；卵巣癌の場合のＣＡ－１２５；乳癌の場合のＭＵＣ－１または上皮性腫瘍抗原（ＥＴＡ）またはＣＡ１５－３；悪性黒色腫の場合のチロシナーゼまたはメラノーマ関連抗原（ＭＡＧＥ）；および種々のタイプの腫瘍の場合の、ｒａｓの異常産物であるｐ５３；ヘパトーマ、卵巣癌または精巣癌の場合のアルファフェトプロテイン；精巣癌を有する男性の場合の、ｈＣＧのベータサブユニット；前立腺癌の場合の前立腺特異抗原；複数のミエローマおよび一部のリンパ腫の場合のベータ２ミクログロブリン；直腸結腸癌、胆管癌および膵癌の場合のＣＡ１９－９；肺癌および前立腺癌の場合のクロモグラニンＡ；メラノーマ、軟部組織肉腫ならびに乳癌、結腸癌および肺癌の場合のＴＡ９０。腫瘍抗原の例は、当該分野で、例えばＣｈｅｅｖｅｒ ｅｔ ａｌ．，２００９（その全体が参照により本明細書中に援用される）において、公知である。

【0214】

腫瘍抗原の具体例としては、例えば少なくともＣＥＡ、ＭＨＣ、ＣＴＬＡ－４、ｇｐ１００、メソテリン、ＰＤ－Ｌ１、ＴＲＰ１、ＣＤ４０、ＥＧＦＰ、Ｈｅｒ２、ＴＣＲアルファ、ｔｒｐ２、ＴＣＲ、ＭＵＣ１、ｃｄｒ２、ｒａｓ、４－１ＢＢ、ＣＴ２６、ＧＩＴＲ、ＯＸ４０、ＴＧＦ－α．ＷＴ１、ＭＵＣ１、ＬＭＰ２、ＨＰＶ Ｅ６ Ｅ７、ＥＧＦＲｖＩＩＩ、ＨＥＲ－２／ｎｅｕ、ＭＡＧＥ Ａ３、ｐ５３非変異体、ＮＹ－ＥＳＯ－１、ＰＳＭＡ、ＧＤ２、Ｍｅｌａｎ Ａ／ＭＡＲＴ１、Ｒａｓ変異体、ｇｐ１００、ｐ５３変異体、プロテイナーゼ３（ＰＲ１）、ｂｃｒ－ａｂｌ、チロシナーゼ、サバイビン、ＰＳＡ、ｈＴＥＲＴ、ＥｐｈＡ２、ＰＡＰ、ＭＬ－ＩＡＰ、ＡＦＰ、ＥｐＣＡＭ、ＥＲＧ（ＴＭＰＲＳＳ２ ＥＴＳ融合遺伝子）、ＮＡ１７、ＰＡＸ３、ＡＬＫ、アンドロゲンレセプター、サイクリンＢ１、ポリシアル酸、ＭＹＣＮ、ＲｈｏＣ、ＴＲＰ－２、ＧＤ３、フコシルＧＭ１、メソテリン、ＰＳＣＡ、ＭＡＧＥ Ａ１、ｓＬｅ（ａ）、ＣＹＰ１Ｂ１、ＰＬＡＣ１、ＧＭ３、ＢＯＲＩＳ、Ｔｎ、ＧｌｏｂｏＨ、ＥＴＶ６－ＡＭＬ、ＮＹ－ＢＲ－１、ＲＧＳ５、ＳＡＲＴ３、ＳＴｎ、炭酸脱水酵素ＩＸ、ＰＡＸ５、ＯＹ－ＴＥＳ１、精子タンパク質１７、ＬＣＫ、ＨＭＷＭＡＡ、ＡＫＡＰ－４、ＳＳＸ２、ＸＡＧＥ１、Ｂ７Ｈ３、レグマイン、Ｔｉｅ２、Ｐａｇｅ４、ＶＥＧＦＲ２、ＭＡＤ－ＣＴ－１、ＦＡＰ、ＰＤＧＦＲ－β、ＭＡＤ－ＣＴ－２およびＦｏｓ関連抗原１が挙げられる。いくつかの実施形態において、腫瘍抗原は、本開示に記載されるような使用に適した任意の抗原であり得る。

【0215】

ペプミックスライブラリーの作製

【0216】

本発明のいくつかの実施形態では、ペプチドのライブラリーがＰＢＭＣに提供されて、抗原特異的Ｔ細胞が最終的に作製される。そのライブラリーは、特定の場合において、同じ抗原の一部または全部を網羅するペプチドの混合物（「ペプミックス」）を含む。本発明において利用されるペプミックスは、ある特定の態様において、１５アミノ酸長のペプチドであって、互いに１１アミノ酸重複しているペプチドで構成されている、商業的に入手可能なペプチドライブラリー由来であり得る。場合によっては、それらは、合成的に作製され得る。例としては、ＪＰＴ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ（Ｓｐｒｉｎｇｆｉｅｌｄ，ＶＡ）製またはＭｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃ（Ａｕｂｕｒｎ，ＣＡ）製のものが挙げられる。特定の実施形態において、それらのペプチドは、例えば、少なくとも７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４もしくは３５アミノ酸長またはそれ以上であり、具体的な実施形態において、例えば、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３または３４アミノ酸長の重複がある。

【0217】

いくつかの実施形態において、ペプミックスにおいて使用されるようなアミノ酸は、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９、少なくとも９９．９％の純度（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）を有する。いくつかの実施形態において、ペプミックスにおいて本明細書中で使用されるようなアミノ酸は、少なくとも９０％の純度を有する。

【0218】

異なるペプチドの混合物は、任意の比の異なるペプチドを含み得るが、いくつかの実施形態において、特定の各ペプチドは、別の特定のペプチドと実質的に同じ数でその混合物中に存在する。広範な特異性を有するマルチウイルス抗原特異的Ｔ細胞用のペプミックスを調製および生成する方法は、ＵＳ２０１８／０１８７１５２（この全体が参照により援用される）に記載されている。

【0219】

ポリクローナルなウイルス特異的Ｔ細胞組成物

【0220】

本開示は、臨床的に有意なウイルスに対する特異性を有する、血清陽性ドナー（例えば、本明細書中に開示されるドナー選択方法を介して選択されたドナー）から作製される、ポリクローナルなウイルス特異的Ｔ細胞組成物を含む。いくつかの実施形態において、臨床的に有意なウイルスとしては、ＥＢＶ、ＣＭＶ、ＡｄＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６が挙げられ得るがこれらに限定されない。いくつかの実施形態において、ウイルス抗原は、ＢＫウイルス（ＶＰ１およびラージＴ）、ＡｄＶ（ヘキソンおよびペントン）、ＣＭＶ（ＩＥ１およびｐｐ６５）、ＥＢＶ（ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１、ＢＺＬＦ１）およびＨＨＶ６（Ｕ９０、Ｕ１１およびＵ１４）由来の免疫原性抗原を網羅する。

【0221】

本開示は、抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団は、複数のウイルス抗原を認識し得る。いくつかの実施形態において、複数のウイルス抗原は、パラインフルエンザウイルス３型（ＰＩＶ－３）由来の少なくとも１つの第１の抗原を含み得る。いくつかの実施形態において、複数のウイルス抗原は、１つ以上の第２のウイルス由来の少なくとも１つの第２の抗原を含み得る。

【0222】

いくつかの実施形態において、ポリクローナルなウイルス特異的Ｔ細胞組成物は、任意の臨床的に有意なウイルスまたは臨床的に関連性のあるウイルスに対する特異性を有する。例えば、ポリクローナルなウイルス特異的Ｔ細胞組成物は、ＣＭＶ、ＢＫＶ、ＰＩＶ３およびＲＳＶをはじめとしたウイルス抗原を含み得る。

【0223】

いくつかの実施形態において、第１の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍであり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原は、ＰＩＶ－３抗原ＨＮであり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｎであり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｆであり得る。いくつかの実施形態において、第１の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原ＮおよびＰＩＶ－３抗原Ｆの任意の組み合わせであり得る。いくつかの実施形態において、組成物は、１つの第１の抗原を含み得る。いくつかの実施形態において、組成物は、２つの第１の抗原を含み得る。いくつかの実施形態において、組成物は、３つの第１の抗原を含み得る。いくつかの実施形態において、組成物は、４つの第１の抗原を含み得る。いくつかの実施形態において、その４つの第１の抗原には、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原ＮおよびＰＩＶ－３抗原Ｆが含まれ得る。

【0224】

いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のウイルスは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のウイルスは、インフルエンザであり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のウイルスは、ヒトメタニューモウイルス（ｈＭＰＶ）であり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のウイルスは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、インフルエンザおよびヒトメタニューモウイルスを含み得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のウイルスは、呼吸器合胞体ウイルス（ＲＳＶ）、インフルエンザおよびヒトメタニューモウイルスからなり得る。いくつかの実施形態において、１つ以上の第２のウイルスは、本明細書中に記載されるような任意の好適なウイルスから選択され得る。

【0225】

いくつかの実施形態において、組成物は、２つまたは３つの第２のウイルスを含み得る。いくつかの実施形態において、組成物は、３つの第２のウイルスを含み得る。いくつかの実施形態において、その３つの第２のウイルスは、インフルエンザ、ＲＳＶおよびｈＭＰＶを含み得る。いくつかの実施形態において、組成物は、第２の各ウイルスにつき少なくとも２つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、１つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、２つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、３つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、４つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、５つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、６つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、７つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、８つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、９つの第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、１０個の第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、１１個の第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、１２個の第２の抗原を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、本明細書中に記載されるような組成物に適し得る任意の数の第２の抗原を含む。

【0226】

いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＮＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＭＰ１であり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ＲＳＶ抗原Ｎであり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ＲＳＶ抗原Ｆであり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｍであり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１であり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｆであり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｎであり得る。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原ＦおよびｈＭＰＶ抗原Ｎの任意の組み合わせであり得る。

【0227】

いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＮＰ１を含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＭＰ１を含む。いくつかの実施形態において、いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＮＰ１とインフルエンザ抗原ＭＰ１の両方を含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ＲＳＶ抗原Ｎを含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ＲＳＶ抗原Ｆを含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ＲＳＶ抗原ＮとＲＳＶ抗原Ｆの両方を含む。

【0228】

いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｍを含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１を含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｆを含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原Ｎを含む。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、ｈＭＰＶ抗原ＭとｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１とｈＭＰＶ抗原ＦとｈＭＰＶ抗原Ｎとの組み合わせを含む。

【0229】

いくつかの実施形態において、第２の抗原は、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｎの各々を含む。いくつかの実施形態において、複数の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原Ｎ、ＰＩＶ－３抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原ＦおよびｈＭＰＶ抗原Ｎを含む。いくつかの実施形態において、複数の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原Ｎ、ＰＩＶ－３抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原ＦおよびｈＭＰＶ抗原Ｎからなる。いくつかの実施形態において、複数の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原Ｎ、ＰＩＶ－３抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原ＦおよびｈＭＰＶ抗原Ｎから本質的になる。いくつかの実施形態において、第２の抗原は、本明細書中に記載されるような組成物に適した任意の抗原を含み得る。

【0230】

いくつかの実施形態において、臨床的に有意なウイルスとしては、ＨＨＶ８が挙げられ得るがこれに限定されない。いくつかの実施形態において、ウイルス抗原は、ＨＨＶ８由来の免疫原性抗原を網羅する。いくつかの実施形態において、ＨＨＶ８由来の抗原は、ＬＡＮＡ－１（ＯＲＦ３）；ＬＡＮＡ－２（ｖＩＲＦ３、Ｋ１０．５）；ｖＣＹＣ（ＯＲＦ７２）；ＲＴＡ（ＯＲＦ５０）；ｖＦＬＩＰ（ＯＲＦ７１）；Ｋａｐｏｓｉｎ（ＯＲＦ１２、Ｋ１２）；ｇＢ（ＯＲＦ８）；ＭＩＲ１（Ｋ３）；ＳＳＢ（ＯＲＦ６）；ＴＳ（ＯＲＦ７０）およびそれらの組み合わせから選択される。

【0231】

いくつかの実施形態において、臨床的に有意なウイルスとしては、ＨＢＶが挙げられ得るがこれに限定されない。いくつかの実施形態において、ウイルス抗原は、ＨＢＶ由来の免疫原性抗原を網羅する。いくつかの実施形態において、ＨＢＶ由来の抗原は、（ｉ）ＨＢＶコア抗原、（ｉｉ）ＨＢＶ表面抗原、ならびに（ｉｉｉ）ＨＢＶコア抗原およびＨＢＶ表面抗原から選択される。

【0232】

いくつかの実施形態において、臨床的に有意なウイルスとしては、コロナウイルスが挙げられ得るがこれに限定されない。いくつかの実施形態において、コロナウイルスは、α－コロナウイルス（α－ＣｏＶ）である。いくつかの実施形態において、コロナウイルスは、β－コロナウイルス（β－ＣｏＶ）である。いくつかの実施形態において、β－ＣｏＶは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２、ＭＥＲＳ－ＣｏＶ、ＨＣｏＶ－ＨＫＵ１およびＨＣｏＶ－ＯＣ４３から選択される。いくつかの実施形態において、コロナウイルスは、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２である。いくつかの実施形態において、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ２抗原は、（ｉ）ｎｓｐ１；ｎｓｐ３；ｎｓｐ４；ｎｓｐ５；ｎｓｐ６；ｎｓｐ１０；ｎｓｐ１２；ｎｓｐ１３；ｎｓｐ１４；ｎｓｐ１５；およびｎｓｐ１６；（ｉｉ）スパイク（Ｓ）；エンベロープタンパク質（Ｅ）；マトリックスタンパク質（Ｍ）；およびヌクレオカプシドタンパク質（Ｎ）；ならびに（ｉｉｉ）ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＡＰ３Ａ）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳ７）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＮＳ８）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ１０）；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（ＯＲＦ９Ｂ）；およびＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（Ｙ１４）からなる群より選択される１つ以上の抗原を含む。

【0233】

いくつかの実施形態において、組成物中の抗原特異的Ｔ細胞は、末梢血単核球（ＰＢＭＣ）を複数のペプミックスライブラリーと接触させることによって作製され得る。いくつかの実施形態において、各ペプミックスライブラリーは、ウイルス抗原の少なくとも一部を網羅する複数の重複ペプチドを含む。いくつかの実施形態において、複数のペプミックスライブラリーのうちの少なくとも１つは、ＰＩＶ－３由来の第１の抗原を網羅する。いくつかの実施形態において、複数のペプミックスライブラリーのうちの少なくとも１つの追加のペプミックスライブラリーは、第２の各抗原を網羅する。

【0234】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞は、少なくとも１つのＤＮＡプラスミドでヌクレオフェクトされた樹状細胞（ＤＣ）とＴ細胞を接触させることによって作製され得る。いくつかの実施形態において、そのＤＮＡプラスミドは、ＰＩＶ－３抗原をコードし得る。いくつかの実施形態において、少なくとも１つのＤＮＡプラスミドは、第２の各抗原をコードする。いくつかの実施形態において、プラスミドは、少なくとも１つのＰＩＶ－３抗原および少なくとも１つの第２の抗原をコードする。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、ＣＤ４＋Ｔリンパ球およびＣＤ８＋Ｔリンパ球を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、αβＴ細胞レセプターを発現している抗原特異的Ｔ細胞を含む。いくつかの実施形態において、組成物は、ＭＨＣ拘束性の抗原特異的Ｔ細胞を含む。

【0235】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞は、ＩＬ－７とＩＬ－４の両方の存在下においてエキソビボで培養され得る。いくつかの実施形態において、マルチウイルス抗原特異的Ｔ細胞は、培養の９日以内、１０日以内、１１日以内、１２日以内、１３日以内、１４日以内、１５日以内、１６日以内、１７日以内、１８日以内、１９日以内、２０日以内（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）に十分に拡大し、患者への投与の準備が整う。いくつかの実施形態において、マルチウイルス抗原特異的Ｔ細胞は、本明細書中に記載されるような組成物に適した任意の日数以内に十分に拡大した。

【0236】

本開示は、無視できるアロ反応性を示す抗原特異的Ｔ細胞を含む組成物を提供する。いくつかの実施形態において、より活性化を示さない抗原特異的Ｔ細胞を含む組成物は、ある患者から収集された抗原特異的Ｔ細胞の細胞死を、同じ患者から収集された対応する抗原特異的Ｔ細胞の細胞死よりも誘導した。いくつかの実施形態において、その組成物は、ＩＬ－７とＩＬ－４の両方の存在下において培養されない。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞を含む組成物は、７０％を超える生存能を示す。

【0237】

いくつかの実施形態において、組成物は、培養中の少なくとも１日間、少なくとも２日間、少なくとも３日間、少なくとも４日間、少なくとも５日間、少なくとも６日間、少なくとも７日間、少なくとも８日間、少なくとも９日間、少なくとも１０日間、細菌および真菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、組成物は、培養中の少なくとも７日間、細菌および真菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、組成物は、１ＥＵ／ｍｌ未満、２ＥＵ／ｍｌ未満、３ＥＵ／ｍｌ未満、４ＥＵ／ｍｌ未満、５ＥＵ／ｍｌ未満、６ＥＵ／ｍｌ未満、７ＥＵ／ｍｌ未満、８ＥＵ／ｍｌ未満、９ＥＵ／ｍｌ未満、１０ＥＵ／ｍｌ未満のエンドトキシンを示す。いくつかの実施形態において、組成物は、５ＥＵ／ｍｌ未満のエンドトキシンを示す。いくつかの実施形態において、組成物は、マイコプラズマに対して陰性である。

【0238】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を構築するために使用されるペプミックスは、化学的に合成される。いくつかの実施形態において、ペプミックスは、必要に応じて＞１０％、＞２０％、＞３０％、＞４０％、＞５０％、＞６０％、＞７０％、＞８０％、＞９０％（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）純粋である。いくつかの実施形態において、ペプミックスは、必要に応じて＞９０％純粋である。

【0239】

いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞は、Ｔｈ１に極性化している。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞は、ウイルス抗原を発現している標的細胞を溶解することができる。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞は、他の好適なタイプの、抗原を発現している標的細胞を溶解することができる。いくつかの実施形態において、組成物中の抗原特異的Ｔ細胞は、感染していない標的自己細胞を有意に溶解しない。いくつかの実施形態において、組成物中の抗原特異的Ｔ細胞は、感染していない同種異系の自己標的細胞を有意に溶解しない。

【0240】

本開示は、静脈内送達用に製剤化された任意の組成物を含む薬学的組成物（例えば、静脈内送達用に製剤化された本明細書中に記載されるドナーミニバンク由来の抗原特異的Ｔ細胞株を含む薬学的組成物）を提供する。いくつかの実施形態において、組成物は、培養中の少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８日間、少なくとも９日間、少なくとも１０日間、細菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、組成物は、培養中の少なくとも７日間、細菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、組成物は、培養中の少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５、少なくとも６、少なくとも７、少なくとも８日間、少なくとも９日間、少なくとも１０日間、真菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、組成物は、培養中の少なくとも７日間、真菌に対して陰性である。

【0241】

本薬学的組成物は、１ＥＵ／ｍｌ未満、２ＥＵ／ｍｌ未満、３ＥＵ／ｍｌ未満、４ＥＵ／ｍｌ未満、５ＥＵ／ｍｌ未満、６ＥＵ／ｍｌ未満、７ＥＵ／ｍｌ未満、８ＥＵ／ｍｌ未満、９ＥＵ／ｍｌ未満または１０ＥＵ／ｍｌ未満のエンドトキシンを示す。いくつかの実施形態において、本薬学的組成物は、マイコプラズマに対して陰性である。

【0242】

本開示は、標的細胞を溶解する方法を提供し、その方法は、標的細胞を、本明細書中に記載されるような組成物または薬学的組成物（例えば、本明細書中に記載されるドナーミニバンク由来の抗原特異的Ｔ細胞株または静脈内送達用に製剤化されたそのようなＴ細胞株を含む薬学的組成物）と接触させる工程を含む。いくつかの実施形態において、標的細胞と組成物または薬学的組成物との接触は、被験体内のインビボで行われる。いくつかの実施形態において、標的細胞と組成物または薬学的組成物との接触は、被験体への抗原特異的Ｔ細胞の投与を介してインビボで行われる。いくつかの実施形態において、被験体は、ヒトである。

【0243】

本開示は、ウイルス感染症を処置または予防する方法を提供し、その方法は、それを必要とする被験体に、本明細書中に記載されるような組成物または薬学的組成物（例えば、本明細書中に記載されるドナーミニバンク由来の抗原特異的Ｔ細胞株または静脈内送達用に製剤化されたそのようなＴ細胞株を含む薬学的組成物）を投与する工程を含む。いくつかの実施形態において、投与される抗原特異的Ｔ細胞の量は、５×１０^３～５×１０^９抗原特異的Ｔ細胞／ｍ^２、５×１０^４～５×１０^８抗原特異的Ｔ細胞／ｍ^２、５×１０^５～５×１０^７抗原特異的Ｔ細胞／ｍ^２、５×１０^４～５×１０^８抗原特異的Ｔ細胞／ｍ^２、５×１０^６～５×１０^９抗原特異的Ｔ細胞／ｍ^２（これらの間のすべての範囲および部分的な範囲を含む）の範囲である。いくつかの実施形態において、抗原特異的Ｔ細胞が、被験体に投与される。いくつかの実施形態において、被験体は、免疫無防備状態である。いくつかの実施形態において、被験体は、急性骨髄性白血病を有する。いくつかの実施形態において、被験体は、急性リンパ芽球性白血病を有する。いくつかの実施形態において、被験体は、慢性肉芽腫症を有する。

【0244】

いくつかの実施形態において、被験体は、１つ以上の病状を有し得る。いくつかの実施形態において、被験体は、抗原特異的Ｔ細胞を投与される前に、強度軽減移植前治療とともに適合血縁ドナー移植を受ける。いくつかの実施形態において、被験体は、抗原特異的Ｔ細胞を投与される前に、骨髄破壊的移植前治療とともに適合非血縁ドナー移植を受ける。いくつかの実施形態において、被験体は、抗原特異的Ｔ細胞を投与される前に、強度軽減移植前治療とともにハプロタイプ一致の移植を受ける。いくつかの実施形態において、被験体は、抗原特異的Ｔ細胞を投与される前に、骨髄破壊的移植前治療とともに適合血縁ドナー移植を受ける。いくつかの実施形態において、被験体は、臓器移植を受けたことがある。いくつかの実施形態において、被験体は、化学療法を受けたことがある。いくつかの実施形態において、被験体は、ＨＩＶに感染している。いくつかの実施形態において、被験体は、遺伝性免疫不全を有する。いくつかの実施形態において、被験体は、同種異系幹細胞移植を受けたことがある。いくつかの実施形態において、被験体は、このパラグラフに記載されているような１つより多い病状を有する。いくつかの実施形態において、被験体は、このパラグラフに記載されているようなすべての病状を有する。

【0245】

いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に複数回投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に１回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に２回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に３回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に４回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に５回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に６回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に７回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に８回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に９回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に１０回より多く投与される。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、被験体に適した回数だけ被験体に投与される。

【0246】

いくつかの実施形態において、組成物の投与は、被験体のウイルス感染症を効果的に処置または予防する。いくつかの実施形態において、そのウイルス感染症は、パラインフルエンザウイルス３型である。いくつかの実施形態において、そのウイルス感染症は、呼吸器合胞体ウイルスである。いくつかの実施形態において、そのウイルス感染症は、インフルエンザである。いくつかの実施形態において、そのウイルス感染症は、ヒトメタニューモウイルスである。

【0247】

本開示は、複数のウイルス抗原を認識する抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団を含む組成物、およびそのような抗原特異的Ｔ細胞を含む複数の細胞株を含む本明細書中に記載されるようなドナーミニバンクを提供する。本開示は、複数のウイルス抗原が少なくとも１つの抗原を含むことを提供する。いくつかの実施形態において、その少なくとも１つの抗原は、パラインフルエンザウイルス３型（ＰＩＶ－３）であり得る。いくつかの実施形態において、その少なくとも１つの抗原は、呼吸器合胞体ウイルスであり得る。いくつかの実施形態において、その少なくとも１つの抗原は、インフルエンザであり得る。いくつかの実施形態において、その少なくとも１つの抗原は、ヒトメタニューモウイルスであり得る。

【0248】

いくつかの実施形態において、本開示は、パラインフルエンザウイルス３型（ＰＩＶ－３）呼吸器合胞体ウイルス、インフルエンザおよびヒトメタニューモウイルスの各々由来の少なくとも１つの抗原を含む複数のウイルス抗原を認識する抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団、ならびにそのような抗原特異的Ｔ細胞を含む複数の細胞株を含む本明細書中に記載されるようなドナーミニバンクを提供する。いくつかの実施形態において、本開示は、パラインフルエンザウイルス３型（ＰＩＶ－３）呼吸器合胞体ウイルス、インフルエンザおよびヒトメタニューモウイルスの各々由来の少なくとも２つの抗原を含む複数のウイルス抗原を含む複数のウイルス抗原を認識する抗原特異的Ｔ細胞のポリクローナル集団、ならびにそのような抗原特異的Ｔ細胞を含む複数の細胞株を含む本明細書中に記載されるようなドナーミニバンクを提供する。

【0249】

いくつかの実施形態において、複数の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原Ｎ、ＰＩＶ－３抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原ＦおよびｈＭＰＶ抗原Ｎを含む。いくつかの実施形態において、複数の抗原は、ＰＩＶ－３抗原Ｍ、ＰＩＶ－３抗原ＨＮ、ＰＩＶ－３抗原Ｎ、ＰＩＶ－３抗原Ｆ、インフルエンザ抗原ＮＰ１、インフルエンザ抗原ＭＰ１、ＲＳＶ抗原Ｎ、ＲＳＶ抗原Ｆ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ、ｈＭＰＶ抗原Ｍ２－１、ｈＭＰＶ抗原ＦおよびｈＭＰＶ抗原Ｎのいずれかから選択され得る。

【0250】

いくつかの実施形態において、本開示は、静脈内送達用に製剤化された本明細書中に記載されるような組成物を含む薬学的組成物を提供する。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、細菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、真菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、培養中の少なくとも１日間、少なくとも２日間、少なくとも３日間、少なくとも４日間、少なくとも５日間、少なくとも６日間、少なくとも７日間、少なくとも８日間、少なくとも９日間、少なくとも１０日間、細菌または真菌に対して陰性である。いくつかの実施形態において、本明細書中に記載されるような組成物は、培養中の少なくとも７日間、細菌または真菌に対して陰性である。

【0251】

いくつかの実施形態において、静脈内送達用に製剤化された薬学的組成物は、１ＥＵ／ｍｌ未満、２ＥＵ／ｍｌ未満、３ＥＵ／ｍｌ未満、４ＥＵ／ｍｌ未満、５ＥＵ／ｍｌ未満、６ＥＵ／ｍｌ未満、７ＥＵ／ｍｌ未満、８ＥＵ／ｍｌ未満、９ＥＵ／ｍｌ未満または１０ＥＵ／ｍｌ未満のエンドトキシンを示す。いくつかの実施形態において、静脈内送達用に製剤化された薬学的組成物は、マイコプラズマに対して陰性である。

【実施例】

【0252】

実施例１．ＣＭＶ特異的ＶＳＴ（ＣＭＶＳＴ）のドナーバンクの構築
ＣＭＶＳＴ作製用のドナーの選択：臨床的に有効な株を同種異系ＨＳＣＴ患者集団の大部分に提供できることを確実なものとするために、本発明者らは、所与の患者集団用の細胞治療製品を作製するために所与のドナープールから最良のドナーになり得るドナーを選択するためのドナー選択アルゴリズムを開発した。概して米国と類似の多様な人種構成を有するヒューストン地方（Ｈｏｕｓｔｏｎ ＭｅｔｈｏｄｉｓｔまたはＴｅｘａｓ Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ Ｈｏｓｐｉｔａｌ）において処置された６６６人の同種異系ＨＳＣＴレシピエントのＨＬＡタイプを解析した。次いで、これらのＨＳＣＴレシピエントのＨＬＡを、多様で健康な適格のＣＭＶ血清陽性ドナーのプールのＨＬＡタイプと比較した。最初の工程（図２、工程＃１）において、全体のドナープール内の各健康ドナーのＨＬＡタイプを、患者プール内の各患者のＨＬＡタイプと個別に比較し、最も適合度の高いドナー（本明細書中で「最適合ドナー」とも呼ぶ）を、患者プール内の最も多くの患者と少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合するドナーであると特定した（図２、工程＃２）。このドナーを全体のドナープールから除去し、また、このドナーによって対応される（すなわち、そのドナーと少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合する）すべての患者を、患者集団内の他の非適合患者から除去した。これにより、ドナープールは、ドナーが１人減り、非適合患者集団は、２つ以上のＨＬＡアレルにおいて第１のドナーと適合する患者の数だけ患者が減った（図２、工程＃３）。続いて、これらの工程を２回目、３回目などと、解析される患者集団内の患者の少なくとも９５％をカバーする（すなわち、それらの患者の少なくとも９５％と少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合する）ドナーのパネルが作製されるまで反復し（図１０）、その都度、その時点において非適合患者集団内に残っている最も多くの患者と少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合する、残りのドナープール内のドナーを特定し、その後の考慮からそのドナーとそのドナーと適合するそれらのすべての患者の両方を除去した（図４～９）。その第１のドナーパネルを、ウイルス特異的Ｔ細胞の第１のミニバンクの構築において使用するために取っておいた。

【0253】

この時点において、第１のドナーミニバンクの構築において非適合患者集団から除去された患者のすべてを患者集団に再導入し（しかし、先に除去されたどのドナーも全体のドナー集団に再導入しなかった）、次いで、この手順を２回目として反復して、解析される患者集団内の患者の少なくとも９５％をカバーする（すなわち、それらの患者の少なくとも９５％と少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合する）第２のドナーパネルを特定し、それにより、第２のドナーミニバンクを作製した。これにより、患者は、別個のドナーミニバンクにおいて１人より多い十分に適合する潜在ドナーオプションが手に入ることが確実になった。このモデルを使用すれば、たった８人の十分に選択されたドナーで、少なくとも２つのＨＬＡ抗原において適合するＴ細胞製品が患者集団の＞９５％に提供され得ることが見出され；この場合、ドナープールをさらに大きくしても、適合数は有意に増加しなかった。次いで、この多様な同種異系ＨＳＣＴレシピエント集団の≧９５％に対してＣＭＶ活性が確認された、カバー度が好適なＣＭＶＳＴ株（≧２の共有ＨＬＡ抗原）を提供する目的で、これらの８人のドナーを選択した。

【0254】

第三者ＣＭＶＳＴバンクの調製：すべてのドナーに、ＩＲＢが承認したプロトコルについて書面によるインフォームドコンセントを行い、これらの全ドナーが血液バンクの適格基準を満たした。製造に向けて、末梢血の採血によって血液単位を回収し、フィコール勾配によってＰＢＭＣを単離した。１０×１０^６個のＰＢＭＣをＧ－Ｒｅｘ５バイオリアクター（Ｗｉｌｓｏｎ Ｗｏｌｆ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）に播種し、８００Ｕ／ｍｌのＩＬ４および２０ｎｇ／ｍｌのＩＬ７（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）およびＩＥ１、ｐｐ６５ペプミックス（２ｎｇ／ペプチド／ｍｌ）（ＪＰＴ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｂｅｒｌｉｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を含むＴ細胞培地［Ａｄｖａｎｃｅｄ ＲＰＭＩ １６４０（ＨｙＣｌｏｎｅ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ Ｉｎｃ．Ｌｏｇａｎ，Ｕｔａｈ）、４５％Ｃｌｉｃｋ’ｓ（Ｉｒｖｉｎｅ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｓａｎｔａ Ａｎａ，ＣＡ）、２ｍＭ ＧｌｕｔａＭＡＸ^ＴＭ］ＴＭ－Ｉ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ，ＮＹ）および１０％ウシ胎児血清（Ｈｙｃｌｏｎｅ）］中で培養した。開始後９～１２日目に、Ｔ細胞を収集し、計数し、Ｇ－Ｒｅｘ－１００ＭにおいてＩＬ４（８００Ｕ／ｍｌ）およびＩＬ７（２０ｎｇ／ｍｌ）とともに、ペプミックスでパルスされた照射済みの自己ＰＢＭＣ［１：４エフェクター：ターゲット（Ｅ：Ｔ）－４×１０^５ＣＭＶＳＴ：１．６×１０^６照射ＰＢＭＣ／ｃｍ２］で再刺激した。培養の３～４日目に、細胞に２００ｎｇ／ｍｌのＩＬ２（Ｐｒｏｍｅｔｈｅｕｓ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）を供給し、２回目の刺激の９～１２日後に、Ｔ細胞を凍結保存に向けて収集した。凍結保存時に、各株を微生物学的に試験し、免疫表現型を決定し［ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１４、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２５、ＣＤ２７、ＣＤ２８、ＣＤ４５、ＣＤ４５ＲＡ、ＣＤ５６、ＣＤ６２Ｌ ＣＤ６９、ＣＤ８３、ＨＬＡ ＤＲおよび７ＡＡＤ（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ，Ｆｒａｎｋｌｉｎ Ｌａｋｅｓ，ＮＪ）］、ＩＦＮγ酵素結合イムノスポット（ＥＬＩＳｐｏｔ）アッセイによってウイルス特異性について評価した。ＩＦＮγ ＥＬＩＳｐｏｔアッセイによって計測した反応性細胞の頻度が、＞３０スポット形成細胞（ＳＦＣ）／２×１０^５投入ウイルス特異的Ｔ細胞だったとき、その細胞株を「反応性」と定義した。

【0255】

臨床試験デザイン：これは、食品医薬品局（ＦＤＡ）のＩＮＤの下で行われ、Ｂａｙｌｏｒ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｉｏｎａｌ Ｒｅｖｉｅｗ Ｂｏａｒｄ（ＩＲＢ）によって承認された、単一施設第Ｉ相試験（ＮＣＴ０２３１３８５７）だった。この試験は、ガンシクロビル、ホスカルネットまたはシドフォビルによる処置と定義される標準的治療にもかかわらずＣＭＶ感染症または少なくとも７日間持続していた疾患を有する同種異系ＨＳＣＴレシピエントに対して門戸が開かれた試験だった。除外規準には、≧０．５ｍｇ／ｋｇのプレドニゾン（または等価物）による処置、室内空気において酸素飽和が＜９０％の呼吸不全、他の制御されない感染症および≧グレードＩＩの活動性ＧＶＨＤが含まれた。投与予定日の２８日以内にＡＴＧ、Ｃａｍｐａｔｈ、他のＴ細胞免疫抑制性モノクローナル抗体、またはドナーリンパ球注入（ＤＬＩ）を投与された患者も、参加から除外した。まず患者に、好適なＶＳＴ株（≧２個の共有ＨＬＡ抗原を有する）の探索について同意を得て、利用可能であった場合、および患者が適格基準を満たした場合、それらの患者を本研究の処置部分に登録できた。各患者に、２×１０^７個のＨＬＡ部分適合ＶＳＴ／ｍ２の静脈内注入を１回行い、４週間後に２回目の注入を行い、その後隔週で追加の注入を行うオプションがあった。処置担当の医師の判断で、標準的な抗ウイルス薬剤による治療を行うことができた。

【0256】

安全性評価項目：このパイロット研究の主目的は、持続的なＣＭＶ感染症／疾患を有するＨＳＣＴレシピエントにおいてＣＭＶＳＴの安全性を判断することだった。ＮＣＩ Ｃｏｍｍｏｎ Ｔｅｒｍｉｎｏｌｏｇｙ Ｃｒｉｔｅｒｉａ ｆｏｒ Ａｄｖｅｒｓｅ Ｅｖｅｎｔｓ（ＣＴＣＡＥ），バージョン４．Ｘによって毒性を段階分けした。安全性評価項目には、最後のＣＭＶＳＴ投与の４２日以内の急性ＧｖＨＤグレードＩＩＩ～ＩＶ、注入の２４時間以内の注入関連毒性、または最後のＣＭＶＳＴ投与の２８日以内の、Ｔ細胞製品に関連し、かつ元々の悪性疾患または既存の併存症である既存の感染に起因し得ない、グレード３～５の造血系有害事象が含まれた。急性および慢性ＧＶＨＤが存在した場合、標準的な臨床上の定義に従ってそれらを段階分けした。１，２本研究は、Ｄａｎ Ｌ．Ｄｕｎｃａｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｎｔｅｒ Ｄａｔａ Ｒｅｖｉｅｗ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅがモニターした。

【0257】

アウトカムの評価：末梢血中のＣＭＶ量を、臨床検査改善修正法案（Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｉｍｐｒｏｖｅｍｅｎｔ Ａｍｅｎｄｍｅｎｔｓ）（ＣＬＩＡ）によって承認された研究室において定量的ＰＣＲ（ｑＰＣＲ）によってモニターした。処置に対するウイルスの完全奏効（ＣＲ）は、ｑＰＣＲによる検出閾値未満へのウイルス量の減少、ならびに組織疾患の臨床的徴候および症状（ベースライン時に存在した場合）の消失と定義された。部分奏効（ＰＲ）は、ベースラインからの少なくとも５０％のウイルス量の減少と定義された。臨床応答およびウイルス学的応答は、ＣＭＶＳＴ注入後の６週目に割り当てられた。

【0258】

免疫モニタリング：ＥＬＩＳｐｏｔ解析を使用して、ＣＭＶ抗原およびＣＭＶペプチドに応答してＩＦＮγを分泌する循環Ｔ細胞の頻度を求めた。注入前ならびに注入後の１、２、３、４、６および１２週目に臨床サンプルを回収した。ポジティブコントロールとして、ＰＢＭＣをブドウ球菌エンテロトキシンＢ（１μｇ／ｍｌ）（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｓｔ Ｌｏｕｉｓ，ＭＯ）で刺激した。１０００ｎｇ／ペプチド／ｍｌに希釈したＩＥ１およびｐｐ６５ペプミックス（ＪＰＴ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｂｅｒｌｉｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）を使用して、注入後のドナー由来ＣＭＶＳＴを追跡した。利用可能であるとき、公知のエピトープを表しているペプチド（Ｇｅｎｅｍｅｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ Ｉｎｃ．，Ｓａｎ Ａｎｔｏｎｉｏ，ＴＸ、１２５０ｎｇ／ｍｌに希釈されたもの）もＥＬＩＳｐｏｔアッセイにおいて使用した。ＥＬＩＳｐｏｔ解析に向けて、ＰＢＭＣを５×１０^６／ｍｌでＴ細胞培地に再懸濁し、９６ウェルＥＬＩＳｐｏｔプレートにプレーティングした。各条件を２つ組で行った。２０時間のインキュベーションの後に、プレートを、先に記載されたように展開し、室温の暗所において一晩乾燥させ、次いで、定量のためにＺｅｌｌｎｅｔ Ｃｏｎｓｕｌｔｉｎｇ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ，ＮＹ）に送った。インターフェロン－γスポット形成細胞（ＳＦＣ）および投入した細胞の数をプロットし、各抗原に特異的なＴ細胞の頻度を特異的ＳＦＣ／投入細胞数として表現した。

【0259】

統計解析：記述統計量を計算して、データを要約した。抗ウイルス応答を要約し、正確な９５％二項信頼区間とともに奏効率を推定した。ウイルス量およびＴ細胞頻度のデータをプロットして、免疫応答のパターンを経時的に図示した。注入前と注入後のウイルス量およびＴ細胞頻度の変化の比較を、ウィルコクソン符号順位検定を用いて行った。ＳＡＳシステム（Ｃａｒｙ，ＮＣ）バージョン９．４およびＲバージョン３．２．１を用いてデータを解析した。Ｐ値＜０．０５を統計学的に有意とみなした。

【0260】

結果

【0261】

第三者ＣＭＶＳＴバンク：ＣＭＶＳＴのバンクを、移植集団の多様なＨＬＡプロファイルを代表するように選択された８人のＣＭＶ血清陽性ドナーから作製した（表１）。７．７×１０^８ＰＢＭＣという中央値（範囲４．６～８．８×１０^８）が、１回の採血（４２５ｍｌという中央値）から単離された。ＣＭＶＳＴを拡大するために、ＰＢＭＣを、ｐｐ６５およびＩＥ１を網羅するペプミックスに、培養中の２０日超にわたって曝露したところ、１０２±１２という平均拡大倍率（図１７Ａ）が達成された。得られた細胞はほぼ例外なく、セントラルＣＤ４５ＲＡ－／６２Ｌ＋（５８．５±４．８％）およびエフェクターＣＤ４５ＲＡ－／６２Ｌ－（３５．３±４．６％）メモリマーカーを発現する、ＣＤ４＋（２１．３±７．５％）サブセットとＣＤ８＋（７４．７±７．８％）サブセットの両方を含むＣＤ３＋（９９．３±０．４％）だった（図１７Ｂ）。８つすべての株が、刺激性のＣＭＶ抗原に対して反応性だった（ＩＥ１ ４１９±１００ＳＦＣ／２×１０^５およびｐｐ６５ １０６９±２３０、図１７Ｃ）。表１に細胞株の特色が要約されている。これらの８つの株のうち、６つの製品を、処置される１０人の試験患者に投与した。

【0262】

スクリーニング：ＣＭＶに感染している２９人の同種異系ＨＳＣＴレシピエントが、主要ＢＭＴ提供者から試験参加にまわされ、８つの株のバンクから、２８例における注入に適した製品（最低２／８のＨＬＡ適合閾値）が特定された（９６．６％；９５％ＣＩ：８２．２％～９９．９％）。そのようなＨＬＡ適合製品の投与に関連する臨床的有用性を実証した以前の第三者試験において行われた遡及的解析に基づいて、２／８のＨＬＡ適合閾値を確立した。ＨＬＡクラスＩの適合であるかクラスＩＩの適合であるかは、アウトカムに影響しないとみられた。注目すべきことに、本研究では、ほとんどの製品が≧４の抗原で適合した（図１８Ｄ）。株が利用可能な２８人の患者のうち、１７人の患者が標準的な抗ウイルス処置に応答したこと、および１人の患者が最近のＤＬＩに起因して不適格だったことを理由に、細胞を投与されなかった。

【0263】

処置患者の特色：持続的な感染に対して処置される１０人の患者（小児ｎ＝７および成人ｎ＝３）の特色が表２に要約されており、それらの患者には、２人のアフリカ系アメリカ人レシピエント、３人のヒスパニック起源の白人患者および５人の非ヒスパニック系コーカサス人レシピエントが含まれた。それらの１０人の患者のうちの３人は、確定されたウイルス関連疾患［ＣＭＶ網膜炎（ｎ＝１）、ＣＭＶ大腸炎が原因の下痢（ｎ＝２）］を有した。移植後４６～３６５日目（中央値、１３３日目）に、ＣＭＶＳＴ（２～６／８のＨＬＡ抗原で適合）を投与した。７人の患者は、２４日間という中央値（４８日間という平均値；範囲１４～２１１日間）にわたって、標準的な抗ウイルス処置に抵抗性の感染症を有し、それらの患者のうちの３人が、従来の抗ウイルス薬に対する抵抗性を付与する変異があるウイルスを有した。免疫療法の介入前に、これらの患者のうちの６人が、従来の抗ウイルス薬に関連する重症有害事象（ＳＡＥ）を経験し、それには急性腎傷害（ｎ＝４）、ホスカルネット誘発性の腎細尿管症（ｎ＝１）および重症のホスカルネット関連膵炎（ｎ＝１）が含まれ、３例で、任意の従来の薬物によるさらなる処置が不可能になった。

【0264】

臨床上の安全性：すべての注入が良好な耐容性を示した。注入の８時間後に一過性の単発的な発熱を呈した１人の患者を除いて、即時型の毒性は観察されなかった。１人の患者が、体幹に軽度の斑状丘疹状皮疹を呈したが、これはウイルス性発疹を示唆するとみられ、局所処置または全身処置なしに数日以内に自然に消失した。サイトカイン放出症候群（ＣＲＳ）または注入したＣＭＶＳＴに関連する他の毒性の症例は観察されず、移植片不全、自己免疫性溶血性貧血または移植関連微小血管障害を発症した患者もいなかった。患者を、急性ＧｖＨＤについて６週間追跡し、慢性ＧｖＨＤについて１２ヶ月間追跡した。患者と注入細胞との間でＨＬＡが異なるにもかかわらず、急性ＧｖＨＤの前病歴［グレードＩＩ（ｎ＝２）またはＩＩＩ（ｎ＝１）］を有する３人の患者を含む患者で、処置後に再発性または新規の急性もしくは慢性のＧｖＨＤを発症した患者はいなかった（表３）。

【0265】

臨床応答：注入された１０人すべての患者がＣＭＶＳＴに応答し、７人がＣＲであり、３人がＰＲであり、６週目までに、１００％の累積奏効率だった（９５％ＣＩ：６９．２～１００．０％）。６週目における平均血漿ウイルス量の減少は、８９．８％（＋／－２１．４％）だった。処置されたすべての患者の連続的なウイルス量計測値に基づくウイルス学的アウトカムが図１８に要約されている。著しいことに、難治性感染症を有する患者だけでなく、組織疾患を有する３人の個体［ＣＭＶ網膜炎（ｎ＝１）、ＣＭＶ大腸炎が原因の下痢（ｎ＝２）］においても、臨床的有用性が達成された。

【0266】

８人の患者に、ＣＭＶＳＴの注入を１回行い、１人の患者（３９７６）には、注入を２回行い、１人（４２０１）には、ＣＭＶＳＴの注入を３回行った。患者３９７６は、６週目にＣＲを達成したが、１０週目にウイルス量が増えて再発した。その患者に、１回目の注入の８０日後に同じＣＭＶＳＴ株で２回目の注入を行ったところ、持続的なＣＲがもたらされた。患者４２０１には、最初の投与の２８日後に同じＣＭＶＳＴの２回目の注入を行ったが応答しなかったので、２週間後に異なるＣＭＶＳＴ株で３回目の注入を行ったところ、持続的なＣＲが達成された。これらの患者において達成された臨床応答およびウイルス学的応答は、１０人の処置患者のうち８人においてウイルス反応性ＣＭＶＳＴの増加［注入前の平均値１２６±８４ＳＦＣから４４３±１７８／５×１０^５ＰＢＭＣというピークに増加（ｐ＝０．０２３；図１９Ａ）］を伴った。

【0267】

Ｔ細胞の持続性：ＣＭＶＳＴ注入がこれらの患者において見られた防御作用に寄与したかを評価するため、およびこれらのＨＬＡ部分適合ＶＳＴのインビボ寿命を評価するために、注入される細胞株に限定されるＨＬＡ拘束性エピトープペプチドを用いて、注入前および注入後の患者ＰＢＭＣにおけるＣＭＶＳＴの特異性を調べた。確認された第三者起源の機能的Ｔ細胞が、ＨＬＡ拘束性ペプチド試薬が利用可能であった５人の患者において検出され、これは最大１２週間持続し；８人すべての患者において、患者とＣＭＶＳＴ株との間で共有されるＨＬＡアレルに限定される抗ウイルス応答（図１９Ｂ）が観察された。したがって、注入されたＣＭＶＳＴが、ＣＭＶ感染を制御する抗ウイルス効果を誘導したと推測された。

【0268】

上記の第Ｉ相試験では、少なくとも１４日間のガンシクロビルおよび／またはホスカルネットによる処置を失敗していたまたは標準的な抗ウイルス薬剤を許容できなかった同種異系ＨＳＣＴレシピエントにおけるＣＭＶ感染症／疾患を処置するために第三者ＣＭＶＳＴを投与した。注目すべき除外規準は、活動性ＧｖＨＤを有する患者またはコルチコステロイドを中用量もしくは高用量で投与された患者だった。人種的かつ民族的に多様な同種異系ＨＳＣＴ患者集団を幅広くカバーするように、ＨＬＡプロファイルに基づいて慎重に選択されたたった８人の健康ドナーからＣＭＶＳＴのバンクを作製した。実際に、試験参加についてスクリーニングされた２９人の患者のうち、２８人に対して好適な株（最低２つの共有ＨＬＡ抗原閾値）（９６．６％；９５％ＣＩ：８２．２～９９．９％）が特定されたことから、十分に選択された小さな細胞バンクで幅広い患者をカバーできるという実現可能性が証明された。これらの２８人の患者のうち、多様なバックグラウンドの１０人（２人のアフリカ系アメリカ人、３人のヒスパニック起源の白人および５人の非ヒスパニック系コーカサス人）を処置したところ、全員が急性もしくは慢性ＧｖＨＤまたは他の毒性を経験せずにウイルス学的有用性および臨床的有用性を達成した。６人が、従来の抗ウイルス薬に関係する急性腎傷害、腎細尿管症および膵炎をはじめとした重症有害事象を以前に経験していたので、これは注目すべきことであった。この第Ｉ相試験は、難治性ＣＭＶ感染症を処置するための、慎重にデザインされた小さなドナーバンクを起源とする第三者のウイルス反応性Ｔ細胞の投与に関連する安全性および臨床的有用性を示す。

【0269】

ＣＭＶは、最近数十年において疾患の割合が低下しているにもかかわらず、依然として同種異系ＨＳＣＴ後の主な罹患原因のままであり；最近のＣＩＢＭＴＲ報告では、９４６９人の患者［２００３～２０１０年にＡＭＬ（ｎ＝５３１０）、ＡＬＬ（ｎ＝１８８３）、ＣＭＬ（ｎ＝１０７９）およびＭＤＳ（ｎ＝１１９７）のために移植された患者］から得たデータを調べたところ、ＣＭＶの再活性化が、４つすべての疾患カテゴリーの間で、より高い非再発死亡率ならびにより低い全生存率に関連した。さらに、２００８～２０１３年に移植された２０８人の患者の最近の研究では、ＣＭＶが再活性化した患者において平均の入院期間が２６日延長することが見出され、１つより多いＣＭＶ再活性化エピソードの発生が、同種異系ＨＳＣＴのコストを２５～３０％上昇させた（ｐ＜０．０００１）ことから、ＣＭＶ管理の経済的負担が強調されることとなった。

【0270】

ホスカルネットおよびガンシクロビルは、ＨＳＣＴ後のＣＭＶ感染症を処置するために頻繁に使用されている。しかしながら、ＣＭＶ網膜炎に対するガンシクロビルを除いて、その使用は適応外であり、両方の薬物が、有意な副作用、特に腎疾患および移植片抑制に関連する。サイトメガロウイルスＤＮＡターミナーゼ複合体阻害剤であるレテルモビルは、予防的に使用されたとき、移植後のＣＭＶ感染／再活性化の発生率を低下させ６、２０１７年のＦＤＡ承認（成人ＨＳＣＴ患者におけるＣＭＶ予防のため）以来、高リスク患者においてますます使用されている。しかしながら、集学的なＣＭＶ Ｄｒｕｇ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ＦｏｒｕｍのＣＭＶ Ｒｅｓｉｓｔａｎｃｅ Ｗｏｒｋｉｎｇ Ｇｒｏｕｐは、レテルモビルをより広範に予防的に使用すると、ＣＭＶのブレークスルー感染が起きた場合に、従来の抗ウイルス薬に抵抗性である生物の出現が増加すると予想している。実際に、レテルモビル抵抗性ＣＭＶ株がますます報告されており、抵抗性疾患を有する患者の臨床成績は不良で、進行性の組織疾患および死亡に関連する。

【0271】

ＣＭＶＳＴは、本発明者らのグループなどが以前に報告したように、最初の再活性化と薬物抵抗性ウイルス株の両方を標的とする代替ストラテジーを提供する。実際に、本研究においてＣＭＶＳＴで処置された患者の３０％が、１つ以上の従来の抗ウイルス薬に抵抗性であると確認されたウイルス株に感染した。

【0272】

本研究の目標の１つは、処置にまわされる同種異系ＨＳＣＴレシピエントの大部分をカバーするのに十分な多様性を有するＣＭＶ特異的Ｔ細胞バンクを調製することだった。したがって、＞６００人の同種異系ＨＳＣＴレシピエントのＨＬＡタイプを、将来を見越して、ＣＭＶＳＴを作製できる多様で健康な適格の（ＣＭＶ血清陽性の）ドナーのプールと比較して、十分に適合する製品を患者に提供し得る最小のコホートを特定した。このモデルを用いて、十分に選択されたたった８人のドナーで、少なくとも２つのＨＬＡ抗原において適合するＴ細胞製品を患者集団の＞９５％に提供できることが見出された。ドナープールをさらに増加させても、適合数は有意に増加しない。臨床参加についてスクリーニングされた２９人の患者のうち２８人（９６．５％）に対して好適な株が特定された本研究は、そのようなドナーバンクが同種異系ＨＳＣＴ患者集団の大部分に効果的に供給できるという理論を裏付ける。

【0273】

移植患者集団内の人種的および民族的多様性を米国の移植集団のそれと比較した（表４）。これにより、本発明者らの患者集団内の多様性が、米国集団よりもわずかに多様でないが類似していることが明らかになった。これは、本研究のために開発された小さな細胞バンクを、この国全体にわたって臨床で使用するのに広く適用できることを示唆している。単一のドナーコレクションから＞２，０００回注入するための細胞を作製するのに十分な材料を生成できることにより、移植センターにわたって、試験されたＣＭＶＳＴをユニバーサルに使用することが、より実現可能になっている。したがって、「既製」の第三者のウイルス反応性Ｔ細胞の分散化分布モデルを想定することができ、細胞がオンデマンドで入手可能になることが確実になった。

【0274】

まとめると、上記データは、十分に選択されたたった８人の第三者ドナーから調製されたＣＭＶ反応性Ｔ細胞の十分に特徴付けられたバンクが、難治性ＣＭＶ感染症を有する患者の大部分に、安全かつ有効な抗ウイルス活性を提供できる適切に適合した株を供給できることを示している。

【表1】

【表2】

【表3】

【表4】

実施例２．呼吸器系ウイルス感染症を予防および処置するためのマルチウイルス特異的Ｔリンパ球の作製

【0275】

本発明者らのグループは以前に、インビトロで拡大されたウイルス特異的Ｔ細胞（ＶＳＴ）の養子移入によって、同種異系ＨＳＣＴレシピエントにおいて潜伏ウイルス［エプスタイン・バーウイルス（ＥＢＶ）、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）、ＢＫウイルス（ＢＫＶ）、ヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ６）と溶菌ウイルス［アデノウイルス（ＡｄＶ）］の両方に関連する感染症を安全かつ効果的に予防および処置できることを実証した。ＣＡＲＶに対する感受性が、基本的な細胞免疫不全に関連することから、本研究において本発明者らは、インフルエンザ、ＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３を含むようにＶＳＴ療法の治療範囲を拡大することの実現可能性を探索した。

【0276】

本発明者らは、本発明者らの４つの標的ウイルスに由来する１２個の免疫優性抗原に対して特異性を有するポリクローナル（ＣＤ４＋およびＣＤ８＋）ＶＳＴの単一調製物を、ＧＭＰ準拠の製造方法を用いて迅速に作製できる機構を説明した。刺激のために使用したウイルスタンパク質は、Ｔ細胞に対する免疫原性とそれらの配列保存の両方に基づいて選択した。拡大された細胞は、Ｔｈ１に極性化しており、多機能であり、感染していない自己または同種異系の標的に対しては活性を示さずに、ウイルス抗原を発現している標的細胞に選択的に反応し、殺滅することができることから、ウイルス標的に対する選択性と臨床での使用に対する安全性の両方が証明された。

【0277】

本研究において、本発明者らは、健康ドナー由来のＰＢＭＣを、ある特定の標的ウイルス由来の免疫原性抗原［インフルエンザ－ＮＰ１およびＭＰ１；ＲＳＶ－ＮおよびＦ；ｈＭＰＶ－Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭ；ＰＩＶ３－Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦ］を網羅するペプミックス（重複ペプチドライブラリー）のカクテルに曝露した後、Ｇ－Ｒｅｘにおいて活性化サイトカインの存在下で拡大した。１０～１３日間にわたって、本発明者らは、平均８．５倍の拡大を達成した（０．２５×１０^７ＰＢＭＣ／ｃｍ２から平均１．９±０．２×１０^７細胞／ｃｍ^２への増加；ｎ＝１２）。

【0278】

手短に言えば、Ｂａｙｌｏｒ Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ Ｍｅｄｉｃｉｎｅ ＩＲＢが承認したプロトコル（Ｈ－７６３４、Ｈ－７６６６）を用いてインフォームドコンセントを受けた健康志願者およびＨＳＣＴレシピエントからＰＢＭＣを得て、それを使用してフィトヘマグルチニン（ＰＨＡ）芽球およびマルチ－Ｒ－ＶＳＴを作製した。ＰＨＡ芽球は、以前に報告したように作製し、インターロイキン２（ＩＬ２）（１００Ｕ／ｍＬ；ＮＩＨ，Ｂｅｔｈｅｓｄａ，Ｍａｒｙｌａｎｄ）（２日ごとに補充する）が補充されたＶＳＴ培地［４５％ＲＰＭＩ１６４０（ＨｙＣｌｏｎｅ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｌｏｇａｎ，Ｕｔａｈ）、４５％Ｃｌｉｃｋ’ｓ培地（Ｉｒｖｉｎｅ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｓａｎｔａ Ａｎａ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ）、２ｍＭ ＧｌｕｔａＭＡＸ ＴＭ－Ｉ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｇｒａｎｄ Ｉｓｌａｎｄ，Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）および１０％ヒトＡＢ血清（Ｖａｌｌｅｙ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ，Ｗｉｎｃｈｅｓｔｅｒ，Ｖｉｒｇｉｎｉａ）］中で培養した。

【0279】

マルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製に向けて、ペプミックスを作製した。手短に言えば、インフルエンザＡ（ＮＰ１、ＭＰ１）、ＲＳＶ（Ｎ、Ｆ）、ｈＭＰＶ（Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１、Ｍ）（ＪＰＴ Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｂｅｒｌｉｎ，Ｇｅｒｍａｎｙ）およびＰＩＶ－３抗原（Ｍ、ＨＮ、Ｎ、Ｆ）（Ｇｅｎｅｍｅｄ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，Ｓａｎ Ａｎｔｏｎｉｏ，ＴＸ）を網羅するペプチドライブラリー（１１ａａ重複する１５ｍｅｒ）でＰＢＭＣを刺激した。凍結乾燥されたペプミックスをジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）で再構成し、－８０℃で保存した。マルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製に向けて、ＰＢＭＣ（２．５×１０^７）を、ＩＬ７（２０ｎｇ／ｍｌ）、ＩＬ４（８００Ｕ／ｍｌ）（Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ，Ｍｉｎｎｅａｐｏｌｉｓ，ＭＮ）およびペプミックス（２ｎｇ／ペプチド／ｍｌ）が補充された１００ｍｌのＶＳＴ培地が入ったＧ－Ｒｅｘ１０（Ｗｉｌｓｏｎ Ｗｏｌｆ Ｍａｎｕｆａｃｔｕｒｉｎｇ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ，Ｓｔ．Ｐａｕｌ，ＭＮ）に移し、１０～１３日間、３７℃、５％ＣＯ_２において培養した。

【0280】

次いで、ＣＤ３、ＣＤ２５、ＣＤ２８、ＣＤ４５ＲＯ、ＣＤ２７９（ＰＤ－１）［Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ（ＢＯ），Ｆｒａｎｋｌｉｎ Ｌａｋｅｓ，ＮＪ］、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１６、ＣＤ６２Ｌ、ＣＤ６９（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ，Ｂｒｅａ，ＣＡ）およびＣＤ３６６（ＴＩＭ－３）（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ，Ｓａｎ Ｄｉｅｇｏ，ＣＡ）に対するモノクローナル抗体で表面染色したマルチ－Ｒ－ＶＳＴに対してフローサイトメトリーを行った。細胞をＧａｌｌｉｏｓ^ＴＭＦｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｅｒにおいて取得し、Ｋａｌｕｚａ（登録商標）Ｆｌｏｗ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ）で解析した。詳細には、細胞をリン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）（Ｓｉｇｍａ－Ａｌｄｒｉｃｈ）中でペレットにし、次いで、抗体を飽和量（５μｌ）で加えた後、４℃で１５分間インキュベーションした。続いて、細胞を洗浄し、３００μｌのＰＢＳに再懸濁し、少なくとも２０，０００個の生細胞をＧａｌｌｉｏｓ^ＴＭＦｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｅｒにおいて取得し、Ｋａｌｕｚａ（登録商標）Ｆｌｏｗ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅ（Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ）で解析した。

【0281】

細胞内サイトカイン染色に向けて、マルチ－Ｒ－ＶＳＴを収集し、ＶＳＴ培地に再懸濁し（２×１０^６／ｍｌ）、９６ウェルプレートの１ウェルあたり２００μＬを加えた。細胞を、ブレフェルジンＡ（１μｇ／ｍｌ）、モネンシン（１μｇ／ｍｌ）、ＣＤ２８およびＣＤ４９ｄ（１μｇ／ｍｌ）（ＢＤ）とともに２００ｎｇの個々の試験ペプミックスまたはコントロールペプミックスと一晩インキュベートした。次に、ＶＳＴをＰＢＳで洗浄し、ペレットにし、ＣＤ８およびＣＤ３（５μ１／抗体／チューブ）で１５分間、４℃にて表面染色し、次いで、洗浄し、ペレットにし、固定し、４℃の暗所において２０分間、Ｃｙｔｏｆｉｘ／Ｃｙｔｏｐｅｒｍ溶液（ＢＤ）で透過処理した。Ｐｅｒｍ／Ｗａｓｈ Ｂｕｆｆｅｒ（ＢＤ）で洗浄した後、細胞を４℃の暗所において３０分間、１０μＬのＩＦＮγ抗体およびＴＮＦα抗体（ＢＤ）とインキュベートした。次いで、細胞をＰｅｒｍ／Ｗａｓｈ Ｂｕｆｆｅｒで２回洗浄し、少なくとも５０，０００個の生細胞をＧａｌｌｉｏｓ^ＴＭＦｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｅｒにおいて取得し、Ｋａｌｕｚａ（登録商標）Ｆｌｏｗ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅで解析した。

【0282】

ｅＢｉｏｓｃｉｅｎｃｅ ＦｏｘＰ３キット（Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ，Ｗａｌｔｈａｍ，ＭＡ）を製造者の指示書に従って用いて、ＦｏｘＰ３染色を行った。簡潔には、１×１０^６個の細胞をＣＤ３、ＣＤ４およびＣＤ２５抗体で表面染色し、次いで、洗浄し、１ｍｌの固定／透過処理緩衝液に再懸濁し、４℃の暗所において１時間インキュベートした。ＰＢＳで洗浄した後、細胞を透過処理緩衝液に再懸濁し、５μＬのアイソタイプ抗体またはＦｏｘＰ３抗体（Ｃｌｏｎｅ ＰＣＨ１０１）と４℃で３０分間インキュベートし、次いで、洗浄し、Ｇａｌｌｉｏｓ^ＴＭＦｌｏｗ Ｃｙｔｏｍｅｔｅｒにおいて取得した後、Ｋａｌｕｚａ（登録商標）Ｆｌｏｗ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｓｏｆｔｗａｒｅで解析した。

【0283】

酵素結合イムノスポット（ＥＬＩｓｐｏｔ）スポット解析を用いて、ＩＦＮγおよびグランザイムＢを分泌する細胞の頻度を定量化した。簡潔には、ＰＢＭＣ、磁気的に選択されたＴ細胞部分集団およびマルチ－Ｒ－ＶＳＴを、５×１０^６または２×１０^６細胞／ｍｌでＶＳＴ培地に再懸濁し、１００μｌの細胞を各ＥＬＩｓｐｏｔウェルに加えた。磁気ビーズおよびＬＳ分離カラム（Ｍｉｌｔｅｎｙｉ Ｂｉｏｔｅｃ，ＧｍｂＨ）を製造者の指示書に従って用いて、細胞選択を行った。個々の刺激ペプミックス［ＮＰ１、ＭＰ１（インフルエンザ）；Ｎ、Ｆ（ＲＳＶ）；Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１、Ｍ（ｈＭＰＶ）；Ｍ、ＨＮ、Ｎ、Ｆ（ＰＩＶ－３）］またはコントロールペプミックス（サバイビン、ＷＴ１）による直接刺激（５００ｎｇ／ペプチド／ｍｌ）の後、抗原特異的活性を計測した。ブドウ球菌エンテロトキシンＢ（ＳＥＢ）（１μｇ／ｍｌ）およびＰＨＡ（１μｇ／ｍｌ）を、それぞれＰＢＭＣおよびＶＳＴに対するポジティブコントロールとして使用した。２０時間のインキュベーションの後、プレートを先に記載されたように展開し、室温で一晩乾燥させ、次いで、定量のためにＺｅｌｌｎｅｔ Ｃｏｎｓｕｌｔｉｎｇ（Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ）に送った。スポット形成細胞（ＳＦＣ）および投入した細胞の数をプロットし、ＶＳＴに対する特異性閾値を≧３０ＳＦＣ／２×１０^５投入細胞と定義した。

【0284】

マルチ－Ｒ－ＶＳＴサイトカインプロファイルを、ＭＩＬＬＩＰＬＥＸ Ｈｉｇｈ Ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｈｕｍａｎ Ｃｙｔｏｋｉｎｅ Ｐａｎｅｌ（Ｍｉｌｌｉｐｏｒｅ，Ｂｉｌｌｅｒｉｃａ，ＭＡ）を用いて評価した。２×１０^５個のＶＳＴをペプミックス（ＮＰ１、ＭＰ１、Ｎ、Ｆ、Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１、Ｍ、Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦ）（１μｇ／ｍｌ）で一晩刺激した。続いて、上清を回収し、２つ組のウェルにプレーティングし、抗体が固定化されたビーズとともに４℃で一晩インキュベートし、次いで、洗浄し、ビオチン化検出抗体とともに室温で１時間プレーティングした。最後に、ストレプトアビジン－フィコエリトリンを室温で３０分間加えた。サンプルを洗浄し、ｘＰＯＮＥＮＴソフトウェアを用いてＬｕｍｉｎｅｘ ２００（ＸＭＡＰ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ）において解析した。

【0285】

クロム放出アッセイを用いた。手短に言えば、標準的な４時間のクロム（Ｃｒ_５１）放出アッセイを使用し、自己抗原を負荷されたＰＨＡ芽球を標的として用いて（２０ｎｇ／ペプミックス／１×１０^６標的細胞）、マルチ－Ｒ－ＶＳＴの特異的細胞溶解活性を計測した。４０：１、２０：１、１０：１および５：１というエフェクター：ターゲット（Ｅ：Ｔ）比を用いて、特異的溶解を解析した。特異的溶解のパーセンテージを計算した［（実験上の放出－自発的放出）／（最大放出－自発的放出）］×１００。マルチ－Ｒ－ＶＳＴ株の自己反応性およびアロ反応性の能力を計測するために、自己ＰＨＡ芽球および同種異系ＰＨＡ芽球だけを標的として使用した。

【0286】

健康ドナー由来のポリクローナルなマルチ－Ｒ－ＶＳＴの作製

【0287】

インフルエンザ、ＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３に対して反応性の細胞の部分集団を含むＶＳＴ特異的Ｔ細胞株を作製することの実現可能性を検討するために、本発明者らは、各標的ウイルス由来の免疫原性抗原［インフルエンザ－ＮＰ１およびＭＰ１；ＲＳＶ－ＮおよびＦ；ｈＭＰＶ－Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭ；ＰＩＶ－３－Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦ］を網羅する重複ペプチドライブラリーのプールを利用してＰＢＭＣを刺激した後、サイトカインが補充されたＶＳＴ培地が入ったＧ－Ｒｅｘ１０において培養した［図２０Ａ］。１０～１３日間にわたって、本発明者らは、平均８．５倍の細胞増加を達成した［図２０Ｂ］［０．２５×１０^７ＰＢＭＣ／ｃｍ２から平均値１．９±０．２×１０^７細胞／ｃｍ２への増加（中央値：２．０５×１０^７、範囲：０．６～２．８２×１０^７細胞／ｃｍ２ ｎ＝１２）。これはほぼ例外なく、ＣＤ３＋Ｔ細胞（９６．２±０．６％；平均値±ＳＥＭ）、および細胞傷害性Ｔ細胞（ＣＤ８＋；１８．１±１．３％）とヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋；７４．４±１．７％）との混合物［図２０Ｃ］からなり、ＣＤ４／ＣＤ２５／ＦｏｘＰ３＋染色によって評価したとき、制御性Ｔ細胞の増殖のエビデンスはなかった（図２１）。

【0288】

さらに、拡大された細胞は、活性化マーカーＣＤ２５（５０．２±３．８％）、ＣＤ６９（５２．８±６．３％）、ＣＤ２８（８５．８±２％）のアップレギュレーション、ならびにセントラルメモリーマーカー（ＣＤ４５ＲＯ＋／ＣＤ６２Ｌ＋：６１．４±３％）およびエフェクターメモリーマーカー（ＣＤ４５ＲＯ＋／ＣＤ６２Ｌ－：２０．３±２．３％）の発現、ならびに最小のＰＤ１（６．９±１．４％）またはＴｉｍ３（１３．５±２．３％）の表面発現によって証明されるように、エフェクター機能および長期メモリーと一致する表現型を示した（図２０Ｃ～Ｄ］。

【0289】

マルチ－Ｒ－ＶＳＴの抗ウイルス特異性

【0290】

次に、拡大集団が抗原特異的であるかを判定するために、免疫原として個々の各刺激抗原を用いてＩＦＮｙ Ｅｌｌｓｐｏｔアッセイを行った。作製された１２個の株がすべて、標的ウイルスのすべてに対して反応性であることが判明した［表１、図２３］。図２２Ａには、各刺激抗原に対する活性の規模が要約されており、図２４は、漸増濃度のウイルス抗原に対する本発明者らの拡大ＶＳＴの応答を示している。著しいことに、培養中の１０～１３日間にわたって、本発明者らは、１４．６±４．３（ＰＩＶ－３－ＨＮ）～５０．４±９．９倍（ＲＳＶ－Ｎ）というウイルス特異的Ｔ細胞の濃縮を達成した［図２２Ｂ；ドナーＰＢＭＣ内でのＧＡＲＶ反応性Ｔ細胞の前駆体頻度が図２６および２７に要約されている］。まとめると、これらのデータは、呼吸器系ウイルス特異的Ｔ細胞がメモリープールに存在し、ＧＭＰ準拠の製造方法を用いてエキソビボで容易に増幅できることを示唆している。

【0291】

次に、ウイルス特異性が、ＣＤ４＋Ｔ細胞サブセットまたはＣＤ８＋Ｔ細胞サブセットまたは両Ｔ細胞サブセットとともに含まれているのかを評価するために、ＣＤ４＋およびＣＤ８＋ＩＦＮｙ産生細胞に対してゲーティングするＩＣＳを行った。図２２Ｃは、４つすべてのウイルスに対する活性が両方のＴ細胞コンパートメントにおいて検出された、１人のドナーからの代表的な結果を示しており［（ＣＤ４＋：インフルエンザ－５．２８％；ＲＳＶ－１１％；ｈＭＰＶ－６．５７％；ＰＩＶ－３－３．３７％）、（ＣＤ８＋：インフルエンザ－２．２６％；ＲＳＶ－４．３６％；ｈＭＰＶ－２．６９％；ＰＩＶ－３－２．１６％）］、図２２Ｄは、スクリーニングされた９人のドナーに対する要約結果を示しており、本発明者らのマルチ－Ｒ－ＶＳＴがポリクローナルであり、多特異的であることが確認された。

【0292】

マルチ－Ｒ－ＶＳＴの機能的特性

【0293】

複数の炎症促進性サイトカインの産生およびエフェクター分子の発現は、細胞溶解機能の増大およびインビボでのＴ細胞活性の改善と相関すると示されている。ゆえに、本発明者らは次に、抗原曝露後の本発明者らのマルチ－Ｒ－ＶＳＴのサイトカインプロファイルを調べた。図２７に示されているように、Ｌｕｍｉｎｅｘアレイ［図２７Ｃ－左のパネル］およびプロトタイプのＴｈ２／抑制性サイトカインのベースラインレベル［図２７Ｃ－右のパネル］によって計測したとき、ＩＦＮｙ産生細胞の大部分は、ＧＭ－ＣＳＦに加えて、ＴＮＦａも産生した［図２７Ａ－１人のドナーからの詳細なＩＣＳ結果；９人のドナーに対する要約結果；図２７Ｂ］。さらに、抗原刺激を行うと、本発明者らの細胞は、エフェクター分子のグランザイムＢを産生したことから、これらの拡大された細胞の細胞溶解能力が示唆された［図２７Ｄ、ｎ＝９］。まとめると、このデータから、本発明者らのマルチ－Ｒ－ＶＳＴの、Ｔｈ１に極性化した多機能な特色が実証された。

【0294】

マルチ－Ｒ－ＶＳＴは細胞溶解性であり、ウイルス負荷標的を殺滅する

【0295】

これらの拡大した細胞の細胞溶解能力をインビトロで検討するために、マルチ－Ｒ－ＶＳＴを、ウイルスペプミックスで負荷された自己のＣｒ５１標識ＰＨＡ芽球およびコントロールとして働く負荷されていないＰＨＡ芽球と共培養した。図２８Ａおよび図２９に示されているように、ウイルス抗原を負荷された標的は、本発明者らの拡大されたマルチ－Ｒ－ＶＳＴによって特異的に認識され、溶解された（４０：１ Ｅ：Ｔ－インフルエンザ：１３±５％、ＲＳＶ：３６±８％、ｈＭＰＶ：２６±７％、ＰＩＶ－３：２２±５％、ｎ＝８）。最後に、これらのＶＳＴは、１回だけ刺激を受けていたが、ＨＬＡ不適合のＰＨＡ芽球を標的として用いたとき、感染していないの自己標的に対する活性の証拠もなかったし、これらの細胞が同種異系ＨＳＣＴレシピエントに投与される場合に考慮すべき重要な事柄であるアロ反応性（移植片対宿主の可能性）の証拠もなかった（図２８Ｂ）。

【0296】

ＨＳＣＴレシピエントにおけるＣＡＲＶ特異的Ｔ細胞の検出

【0297】

最後に、マルチ－Ｒ－ＶＳＴの潜在的な臨床的関連性を評価するために、活動性／最近のＣＡＲＶ感染症を有する同種異系ＨＳＣＴレシピエントが、活動性のウイルスエピソード中／後に高レベルの反応性Ｔ細胞を示すかを検討した。図３０Ａは、強度軽減移植前治療とともに適合血縁ドナー（ＭＲＤ）移植を受けた、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）を有する６４歳男性である患者＃１の結果を示している。この患者は、ＨＳＣＴの９ヶ月後に重症のＵＲＴＩを発症し、これは、ＰＣＲ解析によってＲＳＶに関係すると確かめられた。この患者は、感染時には何らの免疫抑制も受けていなかったが、感染の診断当日に肺の炎症を制御するためにプレドニゾンを投与した。

【0298】

４週間以内に、その患者の症状は、具体的な抗ウイルス処置なしに消失した。Ｔ細胞免疫がウイルスのクリアランスに寄与したかを評価するために、その患者の感染経過にわたってＲＳＶ特異的Ｔ細胞の循環頻度を解析した。感染の直前に、この患者は、ＲＳＶ抗原ＮおよびＦに対して非常に弱い応答しか示していなかった（６．５ＳＦＣ／５×１０^５ＰＢＭＣ）。しかしながら、ウイルス曝露の１ヶ月以内に、ＲＳＶ特異的Ｔ細胞がインビボにおいて拡大し（５２７ＳＦＣ／５×１０^５ＰＢＭＣ）、図３０Ａに見られるように、反応性細胞が８１倍増加し、その後ウイルスクリアランスと同時に減少した。著しいことに、観察されたＲＳＶ特異的応答は、リンパ球／ＣＤ４＋数の全体的な増加を伴わなかったので、Ｔ細胞の拡大が、全般的な免疫再構成に起因するのではなく、ウイルスによって引き起こされたことが示唆される。同様に、骨髄破壊的移植前治療とともに適合非血縁ドナー（ＭＵＤ）移植を受けた急性リンパ芽球性白血病（ＡＬＬ）を有する２３歳男性である患者＃２も、漸減用量のタクロリムス投与中の、ＨＳＣＴの５ヶ月後に重症のＲＳＶ関連ＵＲＴＩを発症した。この患者の感染は、リバビリンの投与と同時に１週間以内に症候が消失した。内因性の免疫もウイルスクリアランスにおいて役割を果たすかを検討するために、反応性のＴ細胞の数を経時的にモニターした。

【0299】

図３０Ｂに見られるように、ウイルスクリアランスは、ＲＳＶ特異的Ｔ細胞の循環頻度の上昇（ピークは９３ＳＦＣ／５×１０^５ＰＢＭＣ）と同時に起き、この循環頻度はその後ベースラインレベルに戻った。当該患者は、その後の肺炎球菌性肺炎のために移植の７ヶ月後に入院し、同時に痰の中にｈＭＰＶが検出された（ＰＣＲによって）。この肺炎は、抗生物質で処置され、その後、ｈＭＰＶ特異的Ｔ細胞（Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭに対して反応性）の顕著な拡大（４ＳＦＣから７０ＳＦＣのピークに増加した）と同時に疾患の消失およびウイルスのクリアランスが生じ、

【0300】

その後、ベースラインレベルに低下した（図３０Ｃ）。この場合もまた、観察されたＲＳＶ特異的応答およびｈＭＰＶ特異的応答は、リンパ球／ＣＤ４＋数の全体的な増加と無関係だった。

【0301】

図３１は、ＣＡＲＶ感染症を発症した追加の３人のＨＳＣＴレシピエントの結果を示している。患者＃３は、強度軽減移植前治療とともにハプロタイプ一致の移植を受けた、ＡＭＬを有する１５歳女性であり、移植の５週間後のタクロリムス投与中にＲＳＶ誘発性のＵＲＴＩおよびＬＲＴＩを発症した。この患者には、リバビリンが投与され、４週間以内に感染は消失した。ＲＳＶ反応性Ｔ細胞を経時的にモニターしたところ、図３１Ａに見られるように、ＲＳＶ特異的Ｔ細胞の頻度の急上昇（０から５０６ＳＦＣ／５×１０^５ＰＢＭＣへ）と同時にウイルスクリアランスが起きた。同様に、骨髄破壊的移植前治療とともにＭＵＤ移植を受けたＡＬＬを有する１０歳男性患者である患者＃４は、タクロリムス投与中のＨＳＣＴの１ヶ月後に、ＰＩＶ３に関係するＵＲＴＩおよびＬＲＴＩを発症した。この患者の感染は、リバビリンの投与と同時に５週間以内に症候が消失した。

【0302】

内因性の免疫もウイルスのクリアランスにおいて役割を果たすかを検討するために、ＰＩＶ３反応性のＴ細胞数を経時的にモニターした。図３１Ｂに見られるように、ウイルスのクリアランスは、ＰＩＶ３抗原Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦに特異的なＴ細胞の循環頻度の上昇（ピークは３８ＳＦＣ／５×１０^５ＰＢＭＣ）と同時に起き、この循環頻度はその後ベースラインレベルに戻った。最後に、骨髄破壊的移植前治療とともにＭＲＤ移植を受けた慢性肉芽腫症を有する３歳男性である患者＃５を示す。この患者は、シクロスポリン投与中のＨＳＣＴの４ヶ月後に、ＰＩＶ３に関係する重症のＵＲＴＩを発症した。この患者は、リバビリンを投与されていたが（評価された最後の時点において）、疾患症状を示し続け、ＰＩＶ３特異的Ｔ細胞を示さなかった（図３１Ｃ）。まとめると、これらのデータは、免疫無防備状態患者におけるウイルス感染の制御におけるＧＡＲＶ特異的Ｔ細胞のインビボにおける関連性を示唆している。

【0303】

本発明者らは、エキソビボで拡大されたＴ細胞を使用して、臨床上問題になる複数の呼吸器系ウイルスを標的とする実現可能性を探索した。本発明者らは、免疫無防備状態の宿主における上気道・下気道感染症に関与する４つの季節性ＣＡＲＶ［インフルエンザ、ＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３］に由来する合計１２個の抗原に対して特異性を有するポリクローナルなＣＤ４＋およびＣＤ８＋Ｔ細胞を迅速に作製できることを示した。ＧＭＰ準拠の方法を用いて作製されるこれらの広範なＶＳＴは、Ｔｈ１に極性化しており、刺激されると複数のエフェクターサイトカインを産生し、自己反応性またはアロ反応性なしに、ウイルスに感染した標的を殺滅した。最後に、活動性のＣＡＲＶ感染症の排除に成功した同種異系ＨＳＣＴレシピエントの末梢血中に反応性Ｔ細胞集団が検出されたことから、そのようなマルチ－Ｒ－ＶＳＴの養子移入後の臨床的有用性の可能性が示唆される。

【0304】

ＣＡＲＶに関連する急性のＵＲＴＩおよびＬＲＴＩは、公衆衛生上の大きな問題であり、低年齢小児、高齢者、および免疫系が抑制されているまたは損なわれている人が最もかかりやすい。これらの感染症は、咳、呼吸困難および喘鳴をはじめとした症状を伴い、二重／複数の併存感染症が一般的であり、５歳未満の小児では４０％を超え得る頻度であり、罹患および入院のリスク上昇に関連する。免疫無防備状態の同種異系ＨＳＣＴレシピエントのうち、最大４０％が、軽度（鼻漏、咳および発熱を含む関連症状）から重度（細気管支炎および肺炎）まで様々であり得るＣＡＲＶ感染症を経験し、ＬＲＴＩを有するレシピエントでは、関連死亡率が５０％にも達する。治療法の選択肢は限られている。ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３の場合、現在、承認された予防用ワクチンも治療用の抗ウイルス薬も無く、ヌクレオシドアナログＲＢＶの適応外使用およびＤＡＳ－１８１（組換えシアリダーゼ融合タンパク質）の調査的使用の臨床的影響は限定的である。年１回の予防用インフルエンザワクチンは、同種異系ＨＳＣＴレシピエントに対しては移植後少なくとも６ヶ月まで推奨されず（および強化化学療法または抗Ｂ細胞抗体のレシピエントでは除外される）、ノイラミニダーゼ阻害剤は、活動性感染症の処置に必ずしも有効ではない。

【0305】

ＲＳＶについては、エアロゾル化ＲＢＶが、乳児および小児における重症の細気管支炎を処置するためにＦＤＡの承認を受けて
おり、また、ＵＲＴＩまたはＬＲＴＩを予防するため、およびＨＳＣＴレシピエントにおいてＲＳＶ肺炎を処置するために適応外使用されている。しかしながら、薬物送達のために必要な扱いにくい噴霧化デバイスおよび換気システム、ならびにかなりの関連コストのせいで、その普及には限界がある。例えば、２０１５年において、エアロゾル化ＲＢＶは、５日間が通常の処置コースで１日あたり２９，９５３ドルのコストがかかる。したがって、承認済みの処置が無いことと、抗ウイルス剤が高コストであることから、本発明者らは養子移入Ｔ細胞を使用して、この患者集団においてＣＡＲＶ感染症を予防および／または処置する可能性を探索することにした。

【0306】

ＣＡＲＶのウイルス制御を媒介する際の機能的なＴ細胞免疫の中心的役割は、ごく最近になって注目を集めるようになった。例えば、ＲＳＶ ＵＲＴＩを有する１８１人のＨＳＣＴ患者の遡及研究によって、ＬＲＴＩに進行し得る感染症を有する患者を特定する際の鍵となる決定因子としてリンパ球減少症（ＡＬＣ≦１００／ｍｍ^３と定義される）が報告されたが、ＲＳＶ中和抗体レベルは、疾患の進行と有意に関連しなかった。さらに、ＲＳＶ ＬＲＴＩを処置された、ＨＳＣＴを受けたまたは受けていない血液悪性腫瘍を有する１５４人の成人患者の最近の遡及的解析では、リンパ球減少症は、高死亡率と有意に関連した。これらの両研究が、インビボでの防御免疫の媒介における細胞性免疫の重要性を示唆している。

【0307】

本発明者らのグループは以前に、潜伏ウイルスであるＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶ、ＨＨＶ－６およびＡｄＶをはじめとした一連の臨床上問題になるウイルスを処置するための、エキソビボで拡大されたＶＳＴの実現可能性および臨床的有用性を実証した。本発明者らの最初の研究（および他の研究者らの研究）は、ドナー由来のＴ細胞株の安全性および活性を探索したが、より最近、本発明者らは「既製」のユニバーサルＴ細胞プラットフォームを開発した。これにより、５つすべてのウイルス（ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶ、ＨＨＶ－６、ＡｄＶ）に特異的なＶＳＴが、将来を見越して作製され、バンク化されたので、制御されていない感染症を有する免疫無防備状態の患者への投与に直ちに利用可能になることが確実になった。

【0308】

実際に、本発明者らの最近の第ＩＩ相臨床試験では、従来の抗ウイルス剤に抵抗性であると判明していた合計４５の感染を含む３８人の患者にこれらのＨＬＡ部分適合ＶＳＴを投与したところ、有意な毒性無しに９２％という全奏効率が達成された。養子移入されたＴ細胞を使用した臨床での成功というこの前例、ならびに一連のＣＡＲＶに対して有効な治療が無いということから、本発明者らはすぐに、ＶＳＴ治療の治療範囲をＨＳＣＴ後のインフルエンザ、ＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３感染症にまで広げる可能性を探索した。この文脈では、高リスク患者［例えば、低年齢（＜５歳）および高齢者、免疫系が損なわれている患者］に周期的に予防的にＶＳＴを投与するという選択肢も考慮され得る。

【0309】

あるいは、これらの細胞は、ＬＲＴへの進行を予防するために、従来の抗ウイルス薬剤が失敗に終わったＵＲＴＩを有する患者において治療的に使用され得る。したがって、本発明者らが確立したＧＭＰ準拠のＶＳＴ製造方法を用いて、本発明者らは、多様なハプロタイプを有する１２人のドナー由来の、Ｔ細胞に対する免疫原性とそれらの配列保存の両方に基づいて選択された一連のＧＡＲＶ由来抗原［インフルエンザ－ＮＰ１およびＭＰ１；ＲＳＶ－ＮおよびＦ；ｈＭＰＶ－Ｆ、Ｎ、Ｍ２－１およびＭ；ＰＩＶ－３－Ｍ、ＨＮ、ＮおよびＦ］に対して反応性であるＶＳＴを作製することの実行可能性を実証した。拡大された細胞は、ポリクローナル（ＣＤ４＋およびＣＤ８＋）であり、Ｔｈ１に極性化しており、多機能であり、感染していない自己または同種異系の標的は逃れさせるがウイルス抗原を発現している標的は溶解することができたことから、臨床で使用するためのウイルス特異性と安全性の両方が証明された。

【0310】

最後に、これらの知見の臨床的有意性を評価するために、活動性のＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ３感染症を有する５人の同種異系ＨＳＣＴレシピエントの末梢血を調べた。これらの患者のうち４人が１～５週間以内にウイルスの制御に成功し、これは内因性の反応性Ｔ細胞の増幅と同時発生的であり、その後ウイルスがクリアランスされるとベースラインレベルに戻ったが、１人の患者は、感染ウイルスに対する免疫応答を開始せず、現在までに感染は排除されていない。このデータは、エキソビボで拡大された細胞の養子移入が、自身の細胞性免疫が欠けている患者において臨床的に有益であるはずであることを示唆している。

【0311】

結論として、本発明者らは、インフルエンザ、ＲＳＶ、ｈＭＰＶおよびＰＩＶ－３に対して特異性を有するポリクローナルマルチ呼吸器系（マルチ－Ｒ）ＶＳＴの単一の調製物を、ＧＭＰ準拠の製造方法を用いて臨床的に妥当な数で迅速に作製することが実現可能であることを示した。このデータは、免疫無防備状態の患者においてＣＡＲＶ感染症を予防または処置するために養子移入されるマルチ－Ｒ－ＶＳＴの将来の臨床試験に対する理論的根拠を提供する。
実施例３．アロＨＳＣＴ後の感染症を予防および処置するためのマルチウイルス特異的Ｔリンパ球のドナーミニバンクの作製

【0312】

健康個体では、Ｔ細胞免疫がＢＫＶおよび他のウイルスから防御する。アロＨＳＣＴレシピエントでは、強力な免疫抑制性レジメン（およびその後の関連する免疫低下）を使用すると、患者は重症のウイルス感染症にかかりやすくなる。ゆえに、本発明者らのアプローチは、移植患者自身の免疫系が回復するまでの期間にわたってウイルス感染を制御するためおよび症状を無くすために、エキソビボで拡大された遺伝的に改変されていないウイルス特異的Ｔ細胞（ＶＳＴ）を投与することによってＴ細胞免疫を回復させることである。この目標を達成するために、本発明者らは将来を見越して、ＨＬＡ部分適合の「既製」品として入手可能である、プレスクリーニングされた（２１ ＣＦＲ Ｐａｒｔ １２７１，ｓｕｂｐａｒｔ Ｃによって義務づけられているような感染性物質および疾患の危険因子について）血清陽性の健康ドナー由来の末梢血単核球（ＰＢＭＣ）からＶＳＴを製造した。

【0313】

本発明者らのＶＳＴ製品の１つ（Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ）は、５つのウイルス［ＥＢＶ、ＣＭＶ、ＡｄＶ、ＢＫＶおよびヒトヘルペスウイルス６（ＨＨＶ６）］に特異的である。本発明者らはまず、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ細胞株を作製するために、実施例１に記載されたようなドナーミニバンクを構築しようと試みた。本発明者らの目標は、処置にまわされた同種異系ＨＳＣＴレシピエントの大部分をカバーするのに十分な多様性を有するミニバンクを作製することだった。したがって、上記の実施例におけるように、本発明者らはまず、米国の移植集団の人種的および民族的多様性を調べ、それをＢａｙｌｏｒ ＣＣＧＴにおいて同種異系幹細胞移植を受けた患者と比較した（表４および表５）。これにより、Ｂａｙｌｏｒ ＣＣＧＴ患者集団内の多様性は、米国集団よりもわずかに多様ではないにしても類似していることが実証された。

【表5】

【0314】

実施例１に記載された本発明者らのドナー選択モデルを検証するために、本発明者らは、実施例１における方法に従って見込みドナーのＨＬＡタイプを同種異系ＨＳＣＴレシピエントと比較し、これにより、標的患者の＞９５％をカバーし得る冗長でない５つのドナーミニバンクに含めるための２５人の個体（ミニバンク１つあたり５人のドナー）を特定するシミュレーションを行った。これらの５つのミンバンクを構築することによって、本発明者らは、各患者に対する冗長性を確保した（すなわち、各患者は、５つの各ミニバンクの中に好適な適合をおそらく有した）。
表６は、この方法に基づいてドナーミニバンクに含めるために特定されたＶｉｒａｌｙｍ－ＭドナーのＨＬＡタイプを示している。

【表6】

【0315】

シミュレートされた本発明者らのＶｉｒａｌｙｍ－Ｍドナーバンク（表６）が、記載のカバー度を実際に提供し得るかを正式に評価するために、本発明者らはまず、このバンクが、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合した効力のあるＴ細胞製品を用いる本発明者らのＰＯＣ第ＩＩ相試験に登録された患者に対応する能力を評価した。図３２に示されているように、本発明者らは実際に、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合した製品で５４人すべての患者（１００％）に対応することができ、５±１つの共有アレルという平均値を達成した（範囲２～７／８の適合アレル）。さらに、この解析を本発明者らの＞６５０人のＢａｙｌｏｒ ＣＣＧＴ同種異系ＨＳＣＴ患者集団全体にまで広げたときも、少なくとも２つのＨＬＡアレルにおいて適合した製品ですべての見込み患者の１００％に対応することができ、また、５±１つの共有アレルという平均値も達成した（範囲２～８／８の適合アレル）（図３３）。

【0316】

まとめると、これらのデータは、本発明者らのドナーミニバンク（慎重に選択されたドナーから作製されたウイルス特異的Ｔ細胞株を含む）が、最低２つのＨＬＡアレルにおいて適合した製品で米国の同種異系ＨＳＣＴ患者集団の少なくとも９５％をカバーできることを裏付けた。

【0317】

Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ製造プロセスは、本発明者らによってＷＯ２０１３／１１９９４７に、およびＴｚａｎｎｏｕ ｅｔ ａｌ．，Ｊ Ｃｌｉｎ Ｏｎｃｏｌ．２０１７ Ｎｏｖ １；３５（３１：３５４７－３５５７（これらの各々は、その全体が参照により本明細書中に援用され、図１２に概説されている）に、先に記載されたとおりだった。簡潔には、血清陽性の健康ドナーからＰＢＭＣを単離し、２５０×１０^６個のＰＢＭＣを、完全培地、Ｖｉｒａｌｙｍ Ｍ抗原をカバーするペプミックス（アデノウイルス、ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６）、ＩＬ－４およびＩＬ－７の存在下、Ｇ－Ｒｅｘ １００Ｍ培養システム（Ｗｉｌｓｏｎ Ｗｏｌｆ，Ｓａｉｎｔ Ｐａｕｌ，ＭＮ）において、およそ７～１４日間、３７℃、５％ＣＯ_２で培養した（場合によっては培養時間がおよそ１８日間まで延長し得る）。培養の後、Ｖｉｒａｌｙｍ Ｍ細胞株を収集し、洗浄し、品質管理の検査においてまたは治療薬として使用するまで液体窒素中で凍結保存するために分注した。

【0318】

図１３は、アデノウイルス、ＣＭＶ、ＥＢＶ、ＢＫＶおよびＨＨＶ６に対する抗原特異的Ｔ細胞株のそれぞれの効力を、効力閾値未満のネガティブコントロールと比べて示している。これらのＴ細胞は、特異的なＴ細胞株の合格と不合格とを区別するための閾値である＞３０ＳＦＣ／２×１０^５投入ＶＳＴによって指摘されるように、５つすべてのウイルスに特異的である。＞３０ＳＦＣ／２×１０^５投入ＶＳＴという効力閾値は、内部ネガティブコントロールとして働く、標的ウイルスの１つ以上について血清陰性の（血清学的スクリーニングに基づいて）ドナーから生成されたＴ細胞株を用いた実験データに基づいて確立された（図１４）。

【0319】

本発明者らは、処置抵抗性感染症を有する５８人の同種異系ＨＳＣＴ患者にＶＳＴを投与した第２相オープンラベル概念実証試験においてＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを評価した。本発明者らは、この試験をＣＨＡＲＭＳと呼ぶ。この研究のデータは、（Ｔｚａｎｎｏｕ ｅｔ ａｌ，ＪＣＯ，２０１７）に報告している。

【0320】

ＣＨＡＲＭＳは、優位性または有意性に対する統計的検出力が不足していたが、その主目的は、５つのウイルスに特異的なＨＬＡ部分適合マルチＶＳＴ治療の実行可能性およびその投与の安全性を、持続的なウイルス再活性化またはウイルス感染を有するＨＳＣＴ患者において判定することだった。患者は、標準的な抗ウイルス治療にもかかわらず、再発性であるか、再活性化されたかまたは持続的である、ＢＫＶ、ＣＭＶ、ＡｄＶ、ＥＢＶ、ＨＨＶ－６および／またはＪＣＶ感染症を有した場合、任意のタイプの同種異系移植後に適格となった。

【0321】

マルチウイルス特異的Ｔ細胞（Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ細胞）のアロ反応性の可能性を評価するために、本発明者らはまず、各ウイルス；Ａｄｖ（ヘキソンおよびペントン）、ＣＭＶ（ＩＥ１およびｐｐ６５）、ＥＢＶ（ＬＭＰ２、ＥＢＮＡ１、ＢＺＬＦ１）、ＢＫウイルス（ＶＰ１およびラージＴ）およびＨＨＶ６（Ｕ９０、Ｕ１１およびＵ１４）に由来する免疫原性抗原を網羅するペプチド混合物でＰＢＭＣを直接活性化した。次いで、ＩＬ４＋７（図１２に記載されているように）が補充されたＴ細胞培地が入ったＧ－Ｒｅｘデバイスに細胞を移し、ＨＬＡ不適合の標的に対する細胞傷害活性を評価した。図３４に示されているように、これらの細胞は、最小の／検出不可能なアロ反応性しか示さなかったことから、ＨＬＡ部分適合の「既製」品として投与したときのこれらの細胞の潜在的な安全性が裏付けられた。

【0322】

続いて、同種異系ＨＳＣＴ後の小児および成人における難治性ウイルス感染症を処置するために、部分的にＨＬＡが適合するＶｉｒａｌｙｍ－Ｍ細胞の安全性および臨床効果を探索した（Ｔｚａｎｎｏｕ ｅｔ ａｌ，ＪＣＯ，２０１７）。

【0323】

すべての注入が良好な耐容性を示した。注入の２４時間以内に一過性の発熱を呈した３人の患者およびリンパ節疼痛を呈した１人を除いて、急性毒性は観察されなかった。サイトカイン放出症候群（ＣＲＳ）を発症した患者はいなかった。注入後の数週間において、１人の患者が、急速なステロイド漸減の後に反復性のグレードＩＩＩ消化管（ＧＩ）ＧＶＨＤを発症し、８人の患者が、反復性（ｎ＝４）または新規（ｎ＝４）のグレードＩ～ＩＩ皮膚ＧＶＨＤを発症したが、コルチコステロイドの局所処置（ｎ＝７）および漸減後の再開（ｎ＝１）を行うことによって消失した。
臨床効果：

【0324】

評価可能なデータを提供した５２人の処置患者における６０の感染症について、下記に要約されるように、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ注入後の６週目までの累積臨床奏効率は９３％だった：
・ＢＫＶ：持続的なウイルスＢＫＶ感染および組織疾患を処置するために、２２人の患者にＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与した（２０人がＢＫ－出血性膀胱炎を有し、２人がＢＫＶ関連腎炎を有した）。２０人すべてのＢＫ－ＨＣ患者が、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与された後、臨床症状を消失させ、９人が完全奏効（ＣＲ）、１１人が部分奏効（ＰＲ）で、６週間の累積奏効は１００％だった。
・ＣＭＶ：持続的ＣＭＶに対して２０人の患者にＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与した。１９人の患者が、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍに応答し、７人がＣＲ、１２人がＰＲ、１人が非応答者（ＮＲ）で、６週間の累積奏効率は９５％だった。応答者には、大腸炎を有した３人の患者のうちの２人および脳炎を有した１人の患者が含まれた。
・ＡｄＶ：持続的ＡｄＶに対して１１人の患者にＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与し、注入によって、７人のＣＲ、２人のＰＲおよび２人のＮＲがもたらされ、６週間の累積奏効率は８１．８％だった。
・ＥＢＶ：持続的ＥＢＶを処置するために、３人の患者にＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与した。２人の患者がウイルス学的ＣＲを達成し、１人の患者がＰＲを達成した。
・ＨＨＶ６：ＨＨＶ６再活性化を処置するために、難治性脳炎を有する１人の患者を含む４人の患者にＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与したところ、３人の患者が、注入の６週間以内にＰＲを示した（脳炎を有した患者を含む）が、１人は処置に応答しなかった。
・二重感染：２つのウイルス感染に対して、８人の患者にＶｉｒａｌｙｍ－Ｍを投与したところ、１回の注入後に、全体として１２人のＣＲおよび４人のＰＲが認められた。すべての症例においてＣＭＶ、ＡｄＶおよびＥＢＶが排除され、ＢＫＶ ＨＣを有したすべての患者が、臨床上の改善（ｎ＝３）または疾患の消失（ｎ＝２）を示し、ＨＨＶ６脳炎を有した患者も臨床上の改善を示した。

【0325】

本発明者らは、臨床的有効性に関連するＨＬＡ適合の閾値が存在するかを判断するために、本発明者らの第Ｉ／ＩＩ相Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ研究から入手可能なデータを調べた。本発明者らの臨床試験において、臨床で使用された製品は、１／８（ｎ＝２）、２／８（ｎ＝１０）、３／８（ｎ＝１１）、４／８（ｎ＝１４）、５／８（ｎ＝１４）、６／８（ｎ＝４）または７／８（ｎ＝５）のＨＬＡアレルにおいて適合した。臨床成績とＨＬＡ適合の程度との間に相関関係があるかを判定するために、患者を完全奏効（ＣＲ）、部分奏効（ＰＲ）および非応答者（ＮＲ）に区分したが、図３５に要約されているように、結果から、ＨＬＡ適合アレルの数に基づいてはアウトカムに差がなかったと示唆された。

【0326】

本発明者らは次に、ＨＬＡクラスＩのみ、クラスＩＩのみまたはその両方の組み合わせにおいて適合する株の投与に基づいてアウトカムに差があったかを調べた。著しいことに、患者の大部分が、クラスＩアレルとクラスＩＩアレルの両方において適合する株を投与されており（図３６）、その結果から、この場合もまた、アウトカムはアレルの適合の程度に影響されなかったことが示唆された（図３７）。

【0327】

さらに、重要なことには、ＣＨＡＲＭＳ研究は、第２の株が高度に不適合であったとしても、１つより多い異なるＶＳＴ製品（Ｖｉｒａｌｙｍ Ｍ）の投与が安全であり、効果があることを実証した。例えば、Ｔｚａｎｎｏｕ（２０１７）の表２に報告されているように、数人の患者に２つの別個の細胞株の投与したところ、有益な応答があった：

【表7】

【0328】

さらに、下記の表８において改変されたＴｚａｎｎｏｕ（２０１７）の表Ａ７に示されているように、少なくとも２つの細胞株の投与を受けたこれらの患者は、６週目までにａＧＶＨＤを、または処置の１年以内にｃＧＶＨＤを全くまたはほとんど示さなかった。

【表8】

【0329】

したがって、この第Ｉ／ＩＩ相のデータからのこれらの結果は、患者の＞９５％が≧２のＨＬＡアレルにおいて適合した製品を投与され、それが臨床的有用性に関連したことを実証した。ＨＬＡクラスＩにおける適合かクラスＩＩにおける適合かは、アウトカムに影響しないとみられ、細胞の安全性プロファイルに影響しなかったし、第２の株が非常に不適合だったときでさえ、所与の患者に１つより多い細胞株を投与することにも影響しなかった。
実施例４．ユニバーサル細胞治療製品

【0330】

上で論じられたように、株選択のための判定基準としてＨＬＡ適合（≧２アレル閾値）を用いて同種異系ＨＳＣＴレシピエントに投与したとき、これらの細胞は、安全であることが判明し、本発明者らのＰＯＣ臨床試験（実施例３および臨床試験識別子ＮＣＴ０２１０８５２２）における５つすべての標的ウイルスに対して抗ウイルス活性を提供した。さらに、複数の異なる細胞株製品の注入は、その細胞株が高い不適合の程度を有したときでさえ、良好な耐容性を示した（例えば、２つのアレルにおいてしか適合しない第２の細胞株を注入された患者番号３７５５を参照のこと（対 ５つのアレルにおいて適合する第１の株）。

【0331】

これらの結果は、アレルの適合の程度が様々である複数の細胞株を１人の患者に投与するリスクがほとんどないか全くないことを示唆している。これらの結果に基づいて、所与のドナーミニバンク内のすべての細胞株をプールすることによってユニバーサル細胞治療製品が調製される。各ミニバンクが、標的患者集団の＞９５％をカバーするので、そのようなユニバーサル細胞治療製品は、見込み患者の＞９５％に適合する細胞治療製品を含む。したがって、場合によっては、ユニバーサル細胞治療製品は、被験体のＨＬＡタイプに関係なくそれを必要とする被験体に投与される。場合によっては、ユニバーサル細胞治療製品は、ユニバーサル細胞治療製品内の少なくとも１つの細胞株と少なくとも２つのアレルにおいてＨＬＡが適合している、それを必要とする被験体に投与される。被験体は、ＨＳＣＴレシピエントであり得る。

【0332】

場合によっては、ドナーミニバンク内の複数の細胞治療製品が被験体に連続的に投与される。例えば、１つの場合においては、ドナーミニバンク内のすべての細胞治療製品がそれを必要とする１人の被験体に投与される。
実施例５．患者をドナーミニバンク内の最適な細胞株とマッチさせる方法

【0333】

ドナーミニバンク内の考えられる最良の細胞治療製品が所与の患者に投与されるのを確実なものにするために、本発明者らは、図１に要約されているような、バンク化されたＶｉｒａｌｙｍ－Ｍ細胞と（ａ）ＨＳＣＴ患者および（ｂ）幹細胞ドナーとの間でＨＬＡ適合の総合レベルが最も高いものを選択する患者マッチアルゴリズムを開発した。詳細には、このアルゴリズムは、以下の段階的なプロセスを実行する：
工程：
１．当該患者のＨＬＡタイプを含む文書を入手する；
２．幹細胞ドナーのＨＬＡタイプ（以後「移植ＨＬＡ」と呼ぶ）を含む文書を入手する；
３．患者のＨＬＡ（工程１）と移植ＨＬＡ（工程２）のタイプを比較し、共有ＨＬＡアレルを特定する；
４．ドナーミニバンクを構成している個別の株（例えば、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ）のＨＬＡタイプにアクセスする；
５．１次スコア：ミニバンク内の各細胞株（例えば、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ）のＨＬＡタイプを工程３において特定された共有ＨＬＡアレルと比較する。共有ＨＬＡアレルの数に基づいて各比較に数値スコアを割り当てる；共有されるアレルが多いほど、スコアが高くなる；
６．２次スコア：ミニバンク内の各細胞株（例えば、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ）のＨＬＡタイプを工程１において特定された患者ＨＬＡ（感染組織に相当する）と比較する。共有ＨＬＡアレルの数に基づいて各比較にスコアを割り当てる。共有されるアレルが多いほど、スコアが高くなる。この２次スコアに１次スコアの５０％の重みを付ける；
７．細胞バンク内の各株に対する１次スコア（工程５）および２次スコア（工程６）を合算する；
８．次いで、上記の順位（工程７）に基づいて、スコアが最も高い細胞株（例えば、Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ）を当該患者の処置のために選択する。

【0334】

臨床で適用すると、このアプローチは、許容され得る安全性プロファイル（４例の新規のグレードＩ～ＩＩ皮膚ＧＶＨＤおよび１例のグレード３ ＧＩ ＧＶＨＤ発赤）ならびに感染および疾患の処置に対する概念証明を示し、現在までに処置された５４人の患者において９３％の奏効率が達成された。表９には、本発明者らの第Ｉ／ＩＩ相臨床試験において第三者Ｖｉｒａｌｙｍ－Ｍ細胞で処置された５４人すべての患者の安全性および臨床成績が要約されている。

【表9】

【0335】

このように、これらのデータは、本発明者らのミニバンク由来のＶｉｒａｌｙｍ Ｍ製品が、本発明者らの患者適合アルゴリズムを用いて十分に適合する患者に投与されたとき、良好な耐容性を示し、有効であったことを実証している。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【図9】

【図10】

【図11】

【図12】

【図13】

【図14】

【図15】

【図16-1】

【図16-2】

【図17】

【図18】

【図19】

【図20】

【図21】

【図22-1】

【図22-2】

【図23】

【図24】

【図25】

【図26】

【図27-1】

【図27-2】

【図28】

【図29】

【図30-1】

【図30-2】

【図31-1】

【図31-2】

【図32】

【図33】

【図34】

【図35】

【図36】

【図37】

【国際調査報告】