(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2022-10-19
(54)【発明の名称】改善された機能を有する治療用免疫細胞及びその作製方法
(51)【国際特許分類】
C12N 5/10 20060101AFI20221012BHJP
C12N 15/09 20060101ALI20221012BHJP
A61P 35/00 20060101ALI20221012BHJP
A61K 35/17 20150101ALI20221012BHJP
C12N 15/13 20060101ALN20221012BHJP
C12N 15/12 20060101ALN20221012BHJP
C12N 15/62 20060101ALN20221012BHJP
C12N 15/86 20060101ALN20221012BHJP
C12N 15/867 20060101ALN20221012BHJP
【FI】
C12N5/10 ZNA
C12N15/09 110
A61P35/00
A61K35/17 Z
C12N15/13
C12N15/12
C12N15/62 Z
C12N15/86 Z
C12N15/867 Z
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2022509616
(86)(22)【出願日】2020-08-13
(85)【翻訳文提出日】2022-04-12
(86)【国際出願番号】 IB2020057625
(87)【国際公開番号】W WO2021033089
(87)【国際公開日】2021-02-25
(32)【優先日】2019-08-16
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】509087759
【氏名又は名称】ヤンセン バイオテツク,インコーポレーテツド
(74)【代理人】
【識別番号】100092783
【氏名又は名称】小林 浩
(74)【代理人】
【識別番号】100095360
【氏名又は名称】片山 英二
(74)【代理人】
【識別番号】100120134
【氏名又は名称】大森 規雄
(74)【代理人】
【識別番号】100093676
【氏名又は名称】小林 純子
(74)【代理人】
【識別番号】100153693
【氏名又は名称】岩田 耕一
(72)【発明者】
【氏名】ハー、シャン
(72)【発明者】
【氏名】カロス マイケル
【テーマコード(参考)】
4B065
4C087
【Fターム(参考)】
4B065AA94X
4B065AB01
4B065BA02
4B065CA44
4C087AA01
4C087AA02
4C087BB63
4C087NA14
4C087ZB26
(57)【要約】
本開示は、改善された機能及び特性を有する免疫細胞を提供する。オートファジーモジュレーターを過剰発現させる、又は異所的に発現させる免疫細胞が提供される。オートファジーモジュレーターの発現の増加は、キメラ抗原受容体(CAR)を発現させるT細胞又はNK細胞の機能を改善することができる。例えば、ATG5又はATG7を異所的に発現させるCAR-T細胞は、抗原に応答して改善された刺激を示す。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
キメラ抗原受容体(CAR)をコードするヌクレオチド配列を含む第1のベクター及びオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含む第2のベクターを発現させる、免疫細胞。
【請求項2】
キメラ抗原受容体(CAR)をコードする第1のヌクレオチド配列及びオートファジーモジュレーターをコードする第2のヌクレオチド配列を含むベクターを発現させる、免疫細胞。
【請求項3】
オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターを含む、免疫細胞。
【請求項4】
前記免疫細胞はCARを更に含む、請求項3に記載の免疫細胞。
【請求項5】
前記免疫細胞のゲノムは1つ以上の追加のオートファジーモジュレーター遺伝子を含む、請求項1、2及び4のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項6】
オートファジーモジュレーター遺伝子のプロモーターは構成的プロモーターで置換される、請求項1、2及び4のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項7】
オートファジーモジュレーター遺伝子のエンハンサー配列は、前記オートファジーモジュレーター遺伝子の転写を増加させるのに有効である第2のエンハンサー配列で置換される、請求項1、2、4及び6のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項8】
前記免疫細胞はリンパ球である、請求項1~7のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項9】
前記免疫細胞は腫瘍透過性リンパ球である、請求項8に記載の免疫細胞。
【請求項10】
前記免疫細胞はT細胞又はナチュラルキラー(NK)細胞である、請求項8又は請求項9に記載の免疫細胞。
【請求項11】
前記CARは、B細胞成熟抗原(BCMA)、CD19抗原、CD30抗原、CD123抗原、FLT3抗原、及びカリクレイン-2抗原に特異的に結合する細胞外ドメインを含む、請求項1、2、及び3~9のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項12】
前記オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53,DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2である、請求項1~11のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項13】
前記オートファジーモジュレーターはATG5である、請求項12に記載の免疫細胞。
【請求項14】
前記ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD(配列番号:1)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項13に記載の免疫細胞。
【請求項15】
前記ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD(配列番号:2)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項13に記載の免疫細胞。
【請求項16】
前記オートファジーモジュレーターはATG7である、請求項12に記載の免疫細胞。
【請求項17】
前記ATG7は、MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI(配列番号:3)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項16に記載の免疫細胞。
【請求項18】
前記ATG7は、MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV(配列番号:4)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項16に記載の免疫細胞。
【請求項19】
前記ベクターはレンチウイルスベクターである、請求項1~18のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項20】
前記オートファジーモジュレーターの発現は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞における前記オートファジーモジュレーターの発現レベルの少なくとも4倍である、請求項1~19のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項21】
前記免疫細胞の細胞傷害性活性は、前記オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞の細胞傷害性活性よりも低くない、請求項1~20のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項22】
前記免疫細胞は、前記オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞よりも大きな程度で増殖することができる、請求項1~21のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項23】
前記免疫細胞は、前記オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞よりも遅い時間にT細胞枯渇の状態に入る、請求項1~21のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項24】
前記免疫細胞はT細胞枯渇を受けない、請求項1~21のいずれか一項に記載の免疫細胞。
【請求項25】
請求項1~24のいずれか一項に記載の有効量の免疫細胞と、医薬的に許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
【請求項26】
前記第1のベクター及び前記第2のベクターを免疫細胞に導入することを含む、請求項1~24のいずれか一項に記載の免疫細胞を調製する方法。
【請求項27】
前記第1のベクター、前記第2のベクター、又は前記第1のベクター及び前記第2のベクターの両方が前記免疫細胞に形質導入される、請求項26に記載の方法。
【請求項28】
前記第1のベクターはウイルスベクターであり、前記第2のベクターはウイルスベクターであり、又は前記第1のベクターと前記第2のベクターの両方がウイルスベクターである、請求項27に記載の方法。
【請求項29】
遺伝子編集システムを用いて、前記第1のベクター及び/又は前記第2のベクターを前記免疫細胞に導入する、請求項26に記載の方法。
【請求項30】
前記遺伝子編集システムは、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、及びメガヌクレアーゼシステムからなる群から選択される、請求項29に記載の方法。
【請求項31】
前記第1のベクター及び/又は前記第2のベクターは、前記免疫細胞のゲノムに組み込まれる、請求項29又は請求項30に記載の方法。
【請求項32】
前記第1のベクター及び/又は前記第2のベクターは、前記ゲノムのTRAC遺伝子座に組み込まれる、請求項31に記載の方法。
【請求項33】
前記ベクターを免疫細胞に導入することを含む、請求項2~24のいずれか一項に記載の免疫細胞を調製する方法。
【請求項34】
前記ベクターは前記免疫細胞に形質導入される、請求項33に記載の方法。
【請求項35】
前記ベクターはウイルスベクターである、請求項33又は請求項34に記載の方法。
【請求項36】
遺伝子編集システムを用いて、前記ベクターを前記免疫細胞に導入する、請求項33に記載の方法。
【請求項37】
前記遺伝子編集システムは、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、及びメガヌクレアーゼシステムからなる群から選択される、請求項36に記載の方法。
【請求項38】
前記ベクターは、前記免疫細胞のゲノムに組み込まれる、請求項36又は請求項37に記載の方法。
【請求項39】
前記ベクターは、前記ゲノムのTRAC遺伝子座に組み込まれる、請求項38に記載の方法。
【請求項40】
請求項1~24のいずれか一項に記載の免疫細胞を被験体に投与することを含む、疾患又は症状を治療する方法。
【請求項41】
癌を有する被験体を治療する方法であって、
請求項1~24のいずれか一項に記載の治療有効量の免疫細胞を、それを必要とする被験体に投与することを含み、それによって、前記免疫細胞は、前記被験体における癌細胞の死滅を誘導する、前記方法。
【請求項42】
T細胞をオートファジーモジュレーター及び/又は前記オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、T細胞枯渇を低減する方法。
【請求項43】
NK細胞をオートファジーモジュレーター及び/又は前記オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、NK細胞枯渇を低減する方法。
【請求項44】
前記免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又は前記オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、免疫細胞の増殖を増加させる方法。
【請求項45】
免疫細胞のエフェクター/記憶分化の調節を改善する方法であって、前記免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又は前記オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、前記方法。
【請求項46】
免疫細胞のミトコンドリア機能を改善する方法であって、前記免疫細胞をオートファジーモジュレーター、前記オートファジーモジュレーターをコードし、オートファジー代謝を増加させるヌクレオチド配列を含むベクター、又はそれらの任意の組み合わせと接触させることを含む、前記方法。
【請求項47】
前記オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53,DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2である、請求項42~46のいずれか一項に記載の方法。
【請求項48】
前記オートファジーモジュレーターはATG5である、請求項42~47のいずれか一項に記載の方法。
【請求項49】
前記ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD(配列番号:1)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項48に記載の方法。
【請求項50】
前記ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD(配列番号:2)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項48に記載の方法。
【請求項51】
前記オートファジーモジュレーターはATG7である、請求項42~47のいずれか一項に記載の方法。
【請求項52】
前記ATG7は、MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI(配列番号:3)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項51に記載の方法。
【請求項53】
前記ATG7は、MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV(配列番号:4)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項51に記載の方法。
【請求項54】
前記ベクターはレンチウイルスベクターである、請求項42~53のいずれか一項に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
(配列表)
本出願は、ASCII形式で電子的に提出された配列表を含み、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。当該ASCIIコピーは、2020年7月30日に作成され、JBI6140WOPCT1_SL.txtという名前で、サイズは22,954バイトである。
【0002】
(発明の分野)
本発明は、キメラ抗原受容体(chimeric antigen receptor、CAR)を発現させる免疫細胞の機能的属性を改善するための方法に関する。CAR-T細胞におけるオートファジー経路の機能の調節は、例えば、CAR-T細胞において1つ以上のオートファジー経路モジュレーター(例えば、ATG5又はATG7)を異所的に発現させて、CAR-T細胞の機能及び生存を改善することによって行うことができる。腫瘍浸潤リンパ球の機能及び生存はまた、これらの細胞においてオートファジー経路遺伝子を異所的に発現させることによって改善することができる。
【背景技術】
【0003】
遺伝子操作されたリンパ球を用いた養子細胞療法は、特に血液悪性腫瘍においてかなりの見込みを示している。しかしながら、より強力で、より安全で、より効果的な細胞療法製品に対する切実な医学的及び実際的な必要性が存在する。関心のある1つの特定の領域は、増殖能力が強化され、より多くの「中央メモリー」とより少ない「消耗」表現型も保持する細胞製品の生成である。理想的には、そのような製品は強力な抗腫瘍活性を保持し、患者においてしっかりと拡大し、より少ない数で投与することができ、そしてより少ないサイトカイン放出症候群を示すであろう。これらの特性を有する細胞療法製品を生成するために、培養及び選択条件、並びに遺伝子工学(例えば、tet-2)を含めて、複数の戦略が追求されており、これからも追求され続ける。
【発明の概要】
【課題を解決するための手段】
【0004】
本明細書では、効力、安全性及び有効性に対する上記の必要性に対処する、治療用免疫細胞(例えば、T細胞、NK細胞、及びB細胞)組成物及びそのような組成物を作製するための方法が提供される。例えば、CAR T細胞におけるオートファジー経路関連遺伝子(例えば、ATG5又はATG7)の異所性発現は、これらのT細胞の機能を改善することができる。理論に拘束されることを望むものではないが、オートファジー経路関連遺伝子の調節は、免疫細胞をより機能的に望ましい代謝状態に向かわせ、細胞の持続性を高める可能性がある。逆に、細胞のオートファジーが減少すると、リンパ球が自らを維持して機能する能力が損なわれる可能性がある。
【0005】
本明細書では、より強力で、効果的で、より安全な細胞療法製品を促進するために、レンチウイルスベクター技術を使用してオートファジー経路関連遺伝子の異所性発現を誘導し、リンパ球の免疫代謝を適応させることについて説明する。本開示のデータは、リンパ球におけるオートファジー経路遺伝子ATG5又はATG7の異所性発現が、優れた操作された細胞療法製品を提供することを示し、これらの製品は、標的細胞への反復曝露時に拡大する能力の向上、及び標的細胞に応答して増強されたサイトカイン及び細胞傷害性によって測定される優れた機能特性を示す。
【0006】
一態様では、キメラ抗原受容体(CAR)をコードするヌクレオチド配列を含む第1のベクター及びオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含む第2のベクターを発現させる、免疫細胞が提供される。
【0007】
別の態様では、キメラ抗原受容体(CAR)をコードする第1のヌクレオチド配列及びオートファジーモジュレーターをコードする第2のヌクレオチド配列を含むベクターを発現させる、免疫細胞が提供される。
【0008】
別の態様では、オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターを含む、免疫細胞が提供される。一実施形態では、免疫細胞は更にCARを含む。
【0009】
上記態様の様々な実施形態では、免疫細胞のゲノムは、1つ以上の追加のオートファジーモジュレーター遺伝子を含む。上記態様の様々な実施形態では、オートファジーモジュレーター遺伝子のプロモーターは、構成的プロモーター(例えば、TRACプロモーター、β-2mプロモーター、CMVプロモーター、又はEF1aプロモーター)で置換される。プロモーターの置換は、遺伝子編集システム(例えば、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、又はメガヌクレアーゼシステム)を用いて行うことができる。上記態様の様々な実施形態では、オートファジーモジュレーター遺伝子のエンハンサー配列は、オートファジーモジュレーター遺伝子の転写を増加させるのに有効である第2のエンハンサー配列で置換される。
【0010】
上記態様の一部の実施形態では、免疫細胞はリンパ球である。一部の実施形態では、免疫細胞は、腫瘍透過性リンパ球である。様々な実施形態では、免疫細胞は、T細胞、ナチュラルキラー(Natural Killer、NK)細胞、又はB細胞である。
【0011】
上記態様の様々な実施形態では、CARは、B細胞成熟抗原(B-cell maturation antigen、BCMA)、CD19抗原、CD30抗原、CD123抗原、FLT3抗原、及びカリクレイン-2抗原に特異的に結合する細胞外ドメインを含む。
【0012】
上記態様の一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53,DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2である。特定の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、エピジェネティックな調節因子である。エピジェネティックな調節因子の例としては、ヒストンメチルトランスフェラーゼ(例えば、EZH2(zeste 2ポリコム抑制性複合体2サブユニットのエンハンサー)又はG9a)、DNAメチルトランスフェラーゼ(例えば、DNMT3)、及びヒストンデアセチラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。
【0013】
一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG5である。一部の実施形態では、ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD(配列番号:1)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD(配列番号:2)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0014】
一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG7である。一部の実施形態では、ATG7は、MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI(配列番号:3)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0015】
一部の実施形態では、ATG7は、MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV(配列番号:4)の配列と少なくとも95%の同一性を有するミノ酸配列を含む。
【0016】
上記態様の様々な実施形態では、ベクターはレンチウイルスベクターである。
【0017】
上記態様の一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターの発現は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞におけるオートファジーモジュレーターの発現レベルの少なくとも4倍である。一部の実施形態では、免疫細胞の細胞傷害性活性は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞の細胞傷害性活性よりも低くない。一部の実施形態では、免疫細胞は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞よりも大きな程度で増殖することができる。一部の実施形態では、免疫細胞はT細胞であり、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞よりも遅い時間にT細胞枯渇の状態に入る。一部の実施形態では、免疫細胞は、T細胞枯渇を受けないT細胞である。
【0018】
別の態様では、有効量の上記の免疫細胞のいずれかと、医薬的に許容される賦形剤とを含む医薬組成物が提供される。
【0019】
別の態様では、上記の免疫細胞のいずれかを調製する方法が提供され、この方法は、ベクター(例えば、第1のベクター及び/又は第2のベクター)を免疫細胞に導入することを含む。一部の実施形態では、ベクターは免疫細胞に形質導入される。一部の実施形態では、ベクターは、ウイルスベクターである。一部の実施形態では、第1のベクターはウイルスベクターであり、第2のベクターはウイルスベクターであり、又は第1のベクターと第2のベクターの両方がウイルスベクターである。様々な実施形態では、遺伝子編集システムを用いて、ベクターを免疫細胞に導入する。遺伝子編集システムは、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、及びメガヌクレアーゼシステムからなる群から選択されてもよい。様々な実施形態では、ベクターは免疫細胞のゲノムに組み込まれる。特定の実施形態では、ベクターは、ゲノムのTRAC遺伝子座に組み込まれる。
【0020】
別の態様では、上記の免疫細胞のいずれかを被験体に投与することを含む、疾患又は症状を治療する方法が提供される。
【0021】
別の態様では、癌を有する被験体を治療する方法が提供され、この方法は、治療有効量の上記の免疫細胞のいずれかを、それを必要とする被験体に投与することを含み、それにより、免疫細胞は、被験体における癌細胞の死滅を誘導する。
【0022】
別の態様では、T細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、T細胞枯渇を低減する方法が提供される。関連する態様では、遺伝子編集システム(例えば、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、又はメガヌクレアーゼシステム)を用いて、オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列をT細胞に導入することを含む、T細胞枯渇を低減する方法が提供される。
【0023】
別の態様では、NK細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、NK細胞枯渇を低減する方法が提供される。関連する態様では、遺伝子編集システム(例えば、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、又はメガヌクレアーゼシステム)を用いて、オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列をNK細胞に導入することを含む、NK細胞枯渇を低減する方法が提供される。
【0024】
別の態様では、免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、免疫細胞の増殖を増加させる方法が提供される。関連する態様では、遺伝子編集システム(例えば、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、又はメガヌクレアーゼシステム)を用いて、オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を免疫細胞に導入することを含む、免疫細胞の増殖を増加させる方法が提供される。
【0025】
別の態様では、免疫細胞のエフェクター/記憶分化の調節を改善する方法が提供され、この方法は、免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む。関連する態様では、遺伝子編集システム(例えば、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、又はメガヌクレアーゼシステム)を用いて、オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を免疫細胞に導入することを含む、免疫細胞のエフェクター/記憶分化の調節を改善する方法が提供される。
【0026】
上記方法の様々な実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53, DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2である。一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG5である。特定の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、エピジェネティックな調節因子である。エピジェネティックな調節因子の例としては、ヒストンメチルトランスフェラーゼ(例えば、EZH2(zeste 2ポリコム抑制性複合体2サブユニットのエンハンサー)又はG9a)、DNAメチルトランスフェラーゼ(例えば、DNMT3)、及びヒストンデアセチラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。一部の実施形態では、ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD(配列番号:1)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。一部の実施形態では、ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD(配列番号:2)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0027】
一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG7である。一部の実施形態では、ATG7は、MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI(配列番号:3)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0028】
一部の実施形態では、ATG7は、MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV(配列番号:4)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0029】
上記方法の様々な実施形態では、ベクターはレンチウイルスベクターである。
【図面の簡単な説明】
【0030】
前述のことは、添付の図面に示されているように、例示的な実施形態のより具体的な説明から明らかになるであろう。
【
図1】(i)レンチウイルスベクターを介してATG5及びmCherryマーカーを異所的に発現させるBMCA T細胞、及び(ii)レンチウイルスベクターを介してATG7及びGFPを異所的に発現させるBMCA T細胞、の細胞選別分析の結果を示す図である。これらの細胞では、ATG5及びATG7の効率的な発現が観察された。
【
図2】BCMA CAR T細胞におけるATG5及びATG7の相対的発現を示す図である。レンチウイルスベクターを介してATG5及びATG7を異所的に発現させるBMCA T細胞を、スクランブルベクターを異所的に発現させるものと比較した。スクランブルベクター(「Mock」)を発現させる細胞と比較して、ATG5遺伝子発現の約8倍の増加及びATG7遺伝子発現の約14倍の増加があった。
【
図3】(i)BCMA-CARのみ、(ii)BCMA-CARとATG5、及び(iii)BCMA-CARとATG7、を発現させるBCMA-CAR T細胞の拡大の程度を比較した結果を示す図である。細胞をBCMA発現H929細胞で0、7、14及び21日目に刺激した。反復刺激は、BCMA-CARのみを発現させるT細胞の数を増加させた。しかし、ATG5とATG7のいずれかでBCMA-CARを発現させる細胞では、はるかに大きな比較可能な増加が見られた。このデータは、ATG5又はATG7の異所性発現が、反復腫瘍抗原刺激時にBCMA CAR-Tの拡大を促進する可能性があることを示す。矢印は各刺激を示す。
【
図4】腫瘍抗原が、ATG5又はATG7を発現させるBCMA CAR-TのT細胞増殖を促進することを示す図である。非特異的細胞拡大の対照として、非形質導入T細胞(Mock)を含めた。BCMA-CAR細胞も対照として用いた。グラフの左側の部分は、BCMA発現H929細胞による刺激時に観察された異なる細胞の絶対増加倍数を示す。ATG5又はATG7を発現させるBCMA CAR細胞では、より大きな拡大が見られた。グラフの右側の部分は、ATG5又はATG7を発現させるBCMA CAR細胞において有意な拡大の増加を伴わずに、IL-2による刺激時に観察された異なる細胞の絶対増加倍数を示す。結果は、ATG5又はATG7の過剰発現が腫瘍抗原駆動T増殖を増強するが、サイトカイン誘導増殖を増強しないことを示す。
【
図5】ATG5及びATG7の異所性発現がCAR T細胞の細胞傷害性活性を損なわないことを示す図である。H929を発現させるルシフェラーゼと一晩共培養した後に、BCMA-CAR細胞(ATG5又はATG7で形質導入)の細胞傷害性能力を、形質導入されていない模擬トランスフェクト細胞と共に測定した。ATG5又はATG7の過剰発現は、CAR T細胞傷害性能力に大きな影響を与えない。
【
図6】(上部パネル)は、BCMA-CAR細胞(左)、ATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞(中央)、及びATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞(右)のそれぞれにおけるIFN-γ及びTNF-αの発現のフローサイトメトリープロットを示す図である。BCMA-CAR
+、BCMA-CAR
+ATG5
+、及びBCMA-CAR
+ATG7
+の集団は、
図1に示されるように決定される。
図6の上部パネルは、IFN-γ及びTNF-αによる細胞内染色を示す。象限ゲートは、分析された細胞を4つの隣接する別個の亜集団に分割する。左上の象限はTNF
+IFN
-集団を表し、右上の象限はTNF
+IFN
+集団を表し、右下の象限はTNF
-IFN
+集団を表し、左下の象限はTNF
-IFN
+集団を表す。下部パネルは、IFN-γ
+、TNF-α
+及びIFN-γ
+TNF-α
+細胞の割合の3つの棒グラフを示す。白いバーはBCMA-CAR細胞を表し、灰色のバーはATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞を表し、黒いバーはATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞を表す。データは、ATG5及びATG7の過剰発現が、エフェクターサイトカインIFN-γ及びTNF-αのCAR T細胞産生を有意に増加させる可能性があることを示す。
【
図7】BCMA-CAR細胞(左)、ATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞(中央)、及びATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞(右)のそれぞれにおける、CD45RO、CCR7(上部パネルのドットプロット)及びCD27(中央パネルのヒストグラム)の発現のフローサイトメトリープロットを示す図である。下部パネルは、CD45RO
-CCR7
+(ナイーブ様)、CD45RO
+CCR7
+(中央メモリー、Tcm)、及びCD27発現細胞の割合の3つの棒グラフを示す。Pan-T細胞をIL-2(50U/ml)の存在下でCD3/CD28 Abで刺激し、続いてBCMA-CAR及びATG5又はATG7のレンチウイルス形質導入を行い、次に、刺激後10日目に分析した。データは、ATG5及びATG7の過剰発現が、初期活性化中にCAR-T分化に有意な影響を与えないことを示す。
【
図8】CD45RO
-CCR7
+(ナイーブ様)、CD45RO
+CCR7
+(Tcm)、CD45RO
+CCR7
-(エフェクター、Te)、及びCD27発現細胞の割合の4つの棒グラフを示す図である。細胞をBCMA発現H929細胞で0、7、14及び21日目に刺激した。反復刺激は、CAR-T細胞のエフェクターT細胞への分化を誘導し、CD27の発現を減少させた。しかしながら、ATG5を発現させるCAR T細胞は、レパートリーがエフェクター/エフェクターメモリー細胞によって支配されたBCMA-CARのみを発現させるT細胞とは異なるナイーブ様表現型を有していた。更に、CD27の発現は、ATG5及びATG7のいずれかでBCMA-CARを発現させる細胞において有意に増加した。このデータは、ATG5又はATG7の異所性発現がCAR-Tエフェクターの分化を遅らせるが、反復刺激時にCAR-Tメモリー表現型を維持する可能性があることを示した。
【
図9】BCMA-CAR細胞(左)、ATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞(中央)、及びATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞(右)のそれぞれにおけるグランザイムB(Granzyme B、GZMB)及びパーフォリン(Perforin、PRF)の発現のフローサイトメトリープロット(上部パネル)を示す図である。下部パネルは、GZMB
+、PRF
+、及びGZMB
+PRF
+細胞の割合の3つの棒グラフを示す。白いバーはBCMA-CAR細胞を表し、黒いバーはATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞を表し、灰色のバーはATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞を表す。データは、ATG5及びATG7の過剰発現が、細胞傷害性分子GZMB又はPRFのCAR T細胞産生を阻害しなかったことを示した。
【
図10】細胞外フラックス分析器を用いたミトコンドリアストレス試験の概略図に応答するJurkat細胞(ATG5で又はATG5なしで形質導入)の代表的なO2消費速度(O2 consumption rate、OCR)を示す図である(上部パネル)。薬剤の添加前に(基礎OCR)及び指定された薬剤の添加後にOCRを測定した。オリゴマイシン投与後のOCRの減少は、ミトコンドリアのATP生成に消費されたO2の量を示した。酸化的リン酸化脱共役剤であるカルボニルシアニド-4-(トリフルオロメトキシ)フェニルヒドラゾン(FCCP)の投与により、H+は、ATP合成酵素とは無関係にマトリックスに戻ることができ、細胞は、H+を膜間腔に戻すことにより、FCCP後の化学浸透勾配を維持しようとし、そのためには、電子伝達系(electron transport chain、ETC)の使用と、最終的な電子受容体としてのO2の消費が必要であった。FCCP投与後、酸化的リン酸化(oxidative phosphorylation、OXPHOS)を使用するミトコンドリアの最大能力が明らかになった。予備呼吸能(Spare respiratory capacity、SRC)は、最大OCRと基礎OCRの差である。ロテノンとアンチマイシンAを共に投与すると、ETCは完全に停止し、ひいてはミトコンドリアの酸素消費も停止した。下部パネルは、基礎OCR、最大OCR、予備呼吸能及びATPのレベルの4つの棒グラフを示す図である。白いバーはJurkat細胞を表し、黒いバーはATG5を異所的に発現させるJurkat細胞を表す。データは、ATG5の過剰発現が細胞ミトコンドリア機能を有意に増強したことを示す。
【発明を実施するための形態】
【0031】
以下に例示的な実施形態を説明する。
【0032】
本開示はまた、関連する核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞、細胞の集団、抗体、又はそれらの抗原結合部分、並びに本発明の免疫細胞及びCAR発現免疫細胞に関連する医薬組成物を提供する。
【0033】
本発明のいくつかの態様を、例示のみを目的とした例を参照して以下に説明する。本発明の完全な理解を提供するために、多数の特定の詳細、関係、及び方法が記載されていることを理解されたい。しかしながら、当業者であれば、本発明は、1つ以上の特定の詳細なしに実施できること、又は他の方法、プロトコル、試薬、細胞株及び動物を用いて実施できることを容易に認識するであろう。いくつかの行為は、異なる順序で、及び/又は他の行為若しくはイベントと同時に発生する可能性があるため、本発明は、行為又はイベントの例示された順序によって限定されない。更に、本発明による方法を実施するために、例示されたすべての行為、ステップ、又はイベントが必要とされるわけではない。本明細書に記載又は参照される技術及び手順の多くは、当業者によって十分に理解されており、従来の方法を使用して一般的に使用されている。
【0034】
別段の定義がない限り、本明細書で使用されるすべての技術用語、表記、及び他の科学用語又は専門用語は、本発明が関係する当業者によって一般的に理解される意味を有することが意図される。場合によっては、一般的に理解される意味を有する用語は、明確にするため及び/又はすぐに参照できるために本明細書で定義され、本明細書にそのような定義を含めることは、当技術分野において一般的に理解されているものとの実質的な違いを表すと必ずしも解釈されるべきではない。一般的に使用される辞書で定義されているような用語は、関連技術の文脈におけるそれらの意味と一致する意味を有するものとして、及び/又は本明細書で他の方法で定義されるものとして解釈されるべきであることが更に理解されるであろう。
【0035】
定義
オートファジー又は「自食」は、細胞の内部成分がリソソーム内で大量に分解される生物学的過程である。オートファジーは、細胞小器官とタンパク質凝集体の大規模な分解及び除去のための唯一の既知の手段である。オートファジーは、抗原を提示し、損傷したタンパク質からアミノ酸をリサイクルし、機能しなくなった細胞小器官を分解し、エネルギー要件のための代謝物を生成するために使用される。マクロオートファジー(本明細書ではオートファジーと呼ぶ)は、出芽酵母で最初に報告された。オートファジーに必要な15個の遺伝子(ATG1-15)が出芽酵母で同定され、哺乳類を含む高等真核生物で保存されていることがわかっている。「オートファジーモジュレーター」は、オートファジーを増加又は減少させるタンパク質である。ATG5は、細胞内のオートファジーの程度をアップレギュレート又は増加させるオートファジーモジュレーターの一例である。ATG7は、細胞内のオートファジーの程度をアップレギュレート又は増加させるオートファジーモジュレーターの別の例である。理論に拘束されることを望むものではないが、ATG5タンパク質はATG12タンパク質と結合して、オートファゴソーム膜の形成を促進する。ATG7は、ATG12及びATG8を活性化することにより、オートファゴソームの集合も調節する。ユビキチン化は、ATG5及びATG7が他のオートファジータンパク質にシグナルを送り、オートファジー経路又はオートファジーカスケードで作用する手段である。
【0036】
「免疫細胞」という用語は、リンパ球及び免疫系の他の細胞を指す。「免疫細胞」という用語は、「免疫応答性細胞」という用語と交換可能に使用される。T細胞及びナチュラルキラー細胞は2つの例示的な免疫細胞である。腫瘍浸潤リンパ球は、別のタイプの例示的な免疫細胞である。腫瘍浸潤リンパ球は、末梢血から腫瘍へと移動した免疫細胞である。これらのリンパ球は腫瘍を攻撃する能力を持っている可能性がある。腫瘍浸潤リンパ球の機能は、腫瘍環境において変化する可能性がある。癌治療という状況では、腫瘍浸潤リンパ球が患者の腫瘍から取り出されてから治療される(例えば、物質と接触させる、及び/又は実験室で操作される)。治療は、リンパ球を活性化して、患者の癌細胞を標的にして破壊する効果を高めるのに効果的であり得る。
【0037】
「T細胞」及び「Tリンパ球」という用語は交換可能であり、本明細書では同義的に使用される。本明細書で使用される場合、T細胞は、胸腺細胞、ナイーブTリンパ球、未成熟Tリンパ球、成熟Tリンパ球、休止Tリンパ球、又は活性化Tリンパ球を含む。T細胞は、Tヘルパー(Th)細胞、例えば、Tヘルパー1(Th1)又はTヘルパー2(Th2)細胞であり得る。T細胞は、ヘルパーT細胞(HTL、CD4+T細胞)CD4+T細胞、細胞傷害性T細胞(CTL、CD8+T細胞)、腫瘍浸潤細胞傷害性T細胞(TIL、CD8+T細胞)、CD4+CD8+T細胞、又はT細胞の任意の他のサブセットであってもよい。特定の実施形態で使用するのに適したT細胞の他の例示的な集団には、ナイーブT細胞及びメモリーT細胞が含まれる。また、「NKT細胞」も含まれ、これは、半不変αβT細胞受容体を発現させるが、NK1.1などのNK細胞に通常関連する様々な分子マーカーも発現させるT細胞の特殊な集団を指す。NKT細胞としては、NK1.1+及びNK1.1-、並びにCD4+、CD4-、CD8+及びCD8-細胞が挙げられる。NKT細胞上のTCRは、MHC I様分子CD Idによって提示される糖脂質抗原を認識するという点で独特である。NKT細胞は、炎症又は免疫寛容のいずれかを促進するサイトカインを産生する能力により、保護効果又は有害効果のいずれかを有し得る。また、「ガンマデルタT細胞(γδT細胞)」も含まれ、これは、表面に異なるTCRを有するT細胞の小さなサブセットの特殊な集団を指し、TCRがα及びβ-TCR鎖と呼ばれる2つの糖タンパク質鎖で構成されるT細胞の大部分とは異なり、γδT細胞におけるTCRは、γ鎖及びδ鎖で構成される。γδT細胞は、免疫監視及び免疫調節において役割を果たすことができ、IL-17の重要な供給源であること、及び強力なCD8+細胞傷害性T細胞応答を誘導することが見出された。また、異常又は過剰な免疫応答を抑制し、免疫寛容において役割を果たすT細胞を指す「制御性T細胞」又は「Treg」も含まれる。Tregs細胞は典型的には、転写因子Foxp3陽性CD4+T細胞であり、また、IL-10産生CD4+T細胞である転写因子Foxp3陰性制御性T細胞も含むことができる。
【0038】
「ナチュラルキラー細胞」及び「NK細胞」という用語は、本明細書において交換可能にかつ同義的に使用される。本明細書で使用される場合、NK細胞は、CD16+CD56+及び/又はCD57+TCR-表現型を有する分化リンパ球を指す。NKは、特定の細胞溶解性酵素の活性化によって「自己」MHC/HLA抗原を発現させることができない細胞に結合してそれを殺す能力、NK活性化受容体のリガンドを発現させる腫瘍細胞又は他の疾患細胞を殺す能力、及び免疫応答を刺激又は阻害するサイトカインと呼ばれるタンパク質分子を放出する能力を特徴とする。
【0039】
本明細書で使用される「キメラ抗原受容体」又は「CAR」という用語は、細胞外標的結合ドメイン、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含む細胞表面受容体として定義され、これらはすべて、単一のタンパク質上に共に自然に存在しない組み合わせである。これには、特に、細胞外ドメイン及び細胞内シグナル伝達ドメインが単一の受容体タンパク質上に共に自然には存在しない受容体が含まれる。キメラ抗原受容体は主に、T細胞及びナチュラルキラー(NK)細胞などのリンパ球での使用が意図される。
【0040】
本明細書で使用される場合、「抗原」という用語は、T細胞受容体が結合することができる任意の作用物質(例えば、タンパク質、ペプチド、多糖、糖タンパク質、糖脂質、核酸、それらの一部、又はそれらの組み合わせ)分子を指す。抗原は、免疫応答を引き起こすこともできる。
【0041】
「宿主細胞」という用語は、異種核酸を含有する任意の細胞を意味する。異種核酸は、ベクター(例えば、発現ベクター)であり得る。例えば、宿主細胞は、細胞による物質の産生、例えば、遺伝子、DNA若しくはRNA配列、タンパク質又は酵素の細胞による発現のために、任意の方法で選択、改変、形質転換、増殖、使用又は操作される任意の生物由来の細胞であり得る。適切な宿主を決定することができる。例えば、宿主細胞は、ベクターバックボーン及び所望の結果に基づいて選択され得る。例として、プラスミド又はコスミドは、いくつかのタイプのベクターの複製のために原核生物宿主細胞に導入することができる。限定されるものではないが、DH5α、JM109、KCB、SURE(登録商標)コンピテント細胞、及びSOLOPACK Gold細胞などの細菌細胞は、ベクター複製及び/又は発現のための宿主細胞として使用することができる。更に、大腸菌LE392などの細菌細胞は、ファージウイルスの宿主細胞として使用することができる。宿主細胞として使用できる真核細胞には、酵母(例えば、YPH499、YPH500及びYPH501)、昆虫及び哺乳動物が含まれるが、これらに限定されない。ベクターの複製及び/又は発現のための哺乳動物真核宿主細胞の例としては、HeLa、NIH3T3、Jurkat、293、COS、CHO、Saos、及びPC12が挙げられるが、これらに限定されない。
【0042】
本開示の宿主細胞には、オートファジーモジュレーター、CARをコードするDNA又はRNA配列を含み、かつ細胞表面上でCARを発現させるT細胞及びナチュラルキラー細胞が含まれる。宿主細胞は、T細胞活性、ナチュラルキラー細胞活性、癌の治療、及び自己免疫疾患の治療を増強するために使用され得る。
【0043】
「活性化」又は「刺激」は、細胞の生物学的状態の変化を誘導することを意味し、この変化によって、細胞(例えば、T細胞及びNK細胞)は、活性化マーカーを発現させ、サイトカインを産生し、より多くのオートファジーを受け、及び/又は標的細胞に対して細胞傷害性になる。これらの変化はすべて、一次刺激シグナルによって生じ得る。共刺激シグナルは、一次シグナルの大きさを増幅し、初期刺激後の細胞死を抑制することができ、その結果、より耐久性のある活性化状態、ひいてはより高い細胞傷害性能力をもたらす。「共刺激シグナル」は、TCR/CD3ライゲーションなどの一次シグナルと組み合わせて、T細胞及び/又はNK細胞の増殖及び/又は重要な分子のアップレギュレーション若しくはダウンレギュレーションを引き起こすシグナルを指す。オートファジーの活性化又は刺激は、オートファジーの速度又は程度を増加させる1つ以上のオートファジーモジュレーター、例えば、ATG5又はATG7の異所性発現によって発生する可能性がある。
【0044】
「増殖」という用語は、細胞の対称的又は非対称的な分裂のいずれかである細胞分裂の増加を指す。「拡大」という用語は、細胞分裂及び細胞死の結果を指す。
【0045】
「分化」という用語は、細胞の能力若しくは増殖を減少させるか、又は細胞をより発達的に制限された状態に移動させる方法を指す。
【0046】
「発現させる」及び「発現」という用語は、遺伝子又はDNA配列の情報が生成されることを可能にするか又は引き起こすこと、例えば、対応する遺伝子又はDNA配列の転写及び翻訳に関与する細胞機能を活性化することによってタンパク質を産出することを意味する。DNA配列は、細胞内で又は細胞によって発現され、タンパク質などの「発現産物」を形成する。発現産物自体、例えば、得られたタンパク質は、細胞によって「発現された」とも言える。発現産物は、細胞内、細胞外、又は膜貫通として特徴付けることができる。
【0047】
「トランスフェクション」という用語は、組換えDNA技術を使用して「外来」(即ち、外因性又は細胞外)核酸を細胞に導入することを意味する。「遺伝子改変」という用語は、「外来」(即ち、外因性又は細胞外)遺伝子、DNA又はRNA配列を宿主細胞に導入することを意味し、その結果、宿主細胞は、導入された遺伝子又は配列を発現させて、所望の物質、典型的には、導入された遺伝子又は配列によってコードされるタンパク質又は酵素を産生する。導入された遺伝子又は配列はまた、「クローン化された」又は「外来」遺伝子又は配列と呼ばれてもよく、開始配列、終止配列、プロモーター配列、シグナル配列、分泌配列、又は細胞の遺伝機構によって使用される他の配列など、キメラ抗原受容体をコードするポリヌクレオチドに操作可能に結合した調節配列又は制御配列を含み得る。遺伝子又は配列は、非機能性配列又は既知の機能を有さない配列を含み得る。導入されたDNA又はRNAを受け取って発現させる宿主細胞は、「遺伝子操作」されている。宿主細胞に導入されたDNA又はRNAは、宿主細胞と同じ属若しくは種の細胞を含む任意の供給源、又は異なる属若しくは種に由来することができる。
【0048】
「形質導入」という用語は、ウイルスベクターを使用して外来核酸を細胞に導入することを意味する。
【0049】
「調節エレメント」という用語は、核酸配列の発現のいくつかの側面を制御する任意のシス作用性遺伝子エレメントを指す。一部の実施形態では、「プロモーター」という用語は、本質的に、転写を開始するために必要な最小の配列を含む。一部の実施形態では、「プロモーター」という用語は、転写を開始するための配列を含み、更に、それぞれ一般に「エンハンサーエレメント」及び「リプレッサーエレメント」と呼ばれる、転写をアップレギュレート又はダウンレギュレートすることができる配列も含む。
【0050】
本明細書で使用される場合、「操作可能に結合した」という用語及び類似の語句は、核酸又はアミノ酸に関して使用される場合、それぞれ、互いに機能的な関係に置かれた核酸配列又はアミノ酸配列の操作可能な結合を指す。例えば、操作可能に結合したプロモーター、エンハンサーエレメント、オープンリーディングフレーム、5’及び3’UTR、並びにターミネーター配列は、核酸分子(例えば、RNA)の正確な産生をもたらす。一部の実施形態では、操作可能に結合した核酸エレメントは、オープンリーディングフレームの転写をもたらし、そして最終的にはポリペプチドの産生(即ち、オープンリーディングフレームの発現)をもたらす。別の例として、操作可能に結合したペプチドは、機能ドメインが互いに適切な距離を置いて配置されて、各ドメインの意図された機能を付与するものである。
【0051】
「増強する」又は「促進する」又は「増加する」又は「拡大する」又は「改善する」は、一般に、ビヒクル又は対照分子/組成物のいずれかによって引き起こされる応答と比較して、より大きな生理学的応答(即ち、下流効果)を生じさせるか、誘発するか、又は引き起こす、本明細書で企図される組成物の能力を指す。測定可能な生理学的応答は、当該技術分野及び本明細書の記載における理解から明らかなものの中で、とりわけ、T細胞の拡大、活性化、エフェクター機能、持続性の増加、及び/又は癌細胞死殺傷能力の増加を含み得る。特定の実施形態では、「増加した」又は「増強された」量は、「統計的に有意な」量であってもよく、ビヒクル又は対照組成物によって生じた応答の1.1倍、1.2倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍以上(例えば、500倍、1000倍)(1以上のすべての整数及び小数点、例えば、1.5、1.6、1.7、1.8などを含む)である増加を含み得る。
【0052】
「減少する」又は「より低い」又は「より少なくする」又は「低下させる」又は「弱める」は、一般に、ビヒクル又は対照分子/組成物のいずれかによって引き起こされる応答と比較して、より少ない生理学的応答(即ち、下流効果)を生じさせるか、誘発するか、又は引き起こす、本明細書で企図される組成物の能力を指す。特定の実施形態では、「減少する」又は「減少した」量は、「統計的に有意な」量であってもよく、ビヒクル、対照組成物によって生じた応答(参照応答)、又は特定の細胞系譜における応答の1.1倍、1.2倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍以上(例えば、500倍、1000倍)(1以上のすべての整数及び小数点、例えば、1.5、1.6、1.7、1.8などを含む)である減少を含み得る。
【0053】
用量又は量に適用される「有効な」という用語は、それを必要とする被験体への投与時に所望の活性をもたらすのに十分な化合物又は医薬組成物の量を指す。有効成分の組み合わせが投与される場合、この組み合わせの有効量は、個々に投与された場合に有効であったであろう各成分の量を含む場合も含まない場合もあることに留意されたい。必要とされる正確な量は、被験体の種、年齢、及び全身状態、治療される症状の重症度、使用される特定の薬物、投与方法などに応じて、被験体によって異なる。
【0054】
「医薬的に許容される」という語句は、本明細書に記載の組成物に関連して使用される場合、生理学的に許容可能であり、哺乳動物(例えば、ヒト)に投与されたときに通常は有害反応を生じない分子実体及びそのような組成物の他の成分を指す。好ましくは、「医薬的に許容される」という用語は、哺乳動物、より具体的にはヒトで使用するために、連邦政府若しくは州政府の規制機関によって承認済みであること、又は米国薬局方若しくは他の一般的に認められた薬局方に記載されていることを意味する。
【0055】
本明細書で使用される「タンパク質」という用語は、すべての長さのタンパク質断片を含むあらゆる種類の天然及び合成タンパク質、糖タンパク質を含むがこれに限定されない融合タンパク質及び修飾タンパク質、並びに他のすべての種類の修飾タンパク質(例えば、リン酸化、アセチル化、ミリストイル化、パルミトイル化、グリコシル化、酸化、ホルミル化、アミド化、ポリグルタミル化、ADP-リボシル化、ペグ化、ビオチン化などから得られるタンパク質)を包含する。
【0056】
「核酸」、「ヌクレオチド」、及び「ポリヌクレオチド」という用語は、特に明記しない限り、DNA及びRNAの両方を包含する。「核酸配列」又は「ヌクレオチド配列」は、アミノ酸をコードする核酸配列を意味し、これらの用語はまた、リンカーによってコードされる任意のアミノ酸を含む、クローニングのアーチファクトとして追加された任意のアミノ酸をコードする部分を含む核酸配列を指す場合もある。
【0057】
「担体」という用語は、化合物が共に投与される希釈剤、補助剤、賦形剤、又はビヒクルを指す。そのような医薬担体は、ピーナッツ油、大豆油、鉱油、ゴマ油などの石油、動物、植物、又は合成起源のものを含めて、水及び油などの無菌液体であり得る。水又は水溶液、生理食塩水、水性デキストロース及びグリセロール水溶液は、特に注射溶液用の担体として好ましく使用される。あるいは、担体は、結合剤(圧縮錠剤用)、流動促進剤、カプセル化剤、香味剤、及び着色剤のうちの1つ以上を含むがこれらに限定されない固体剤形担体であってもよい。好適な医薬担体は、E.W. Martinによる「Remington’s Pharmaceutical Sciences」に記載されている。
【0058】
「約」又は「およそ」という用語は、値の統計的に意味のある範囲内にあることを含む。このような範囲は、所与の値又は範囲の1桁以内、好ましくは50%以内、より好ましくは20%以内、更により好ましくは10%以内、更により好ましくは5%以内であり得る。「約」又は「およそ」という用語が包含する許容可能な変動は、研究中の特定のシステムに依存し、当業者によって容易に理解することができる。
【0059】
本明細書で使用される用語は、特定の実施形態を説明することのみを目的としており、限定することを意図するものではない。本明細書で使用される場合、文脈上特に明記されていない限り、不定冠詞「a」、「an」及び「the」は、複数の指示語を含むものと理解されるべきである。
【0060】
オートファジーが調節された免疫細胞におけるキメラ抗原受容体
本発明は、概して、所望のキメラ抗原受容体を安定して発現させるように遺伝子改変され、オートファジーが調節された免疫細胞の使用に関する。一部の免疫細胞では、オートファジーは、例えば、オートファジーの速度又は程度を増加させることによって、活性化又はアップレギュレートされる。オートファジーは、ATG5又はATG7などのオートファジーモジュレーターの異所性発現によってアップレギュレートされ得る。オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53, DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2を含むが、これらに限定されない。特定の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、エピジェネティックな調節因子である。エピジェネティックな調節因子の例としては、ヒストンメチルトランスフェラーゼ(例えば、EZH2(zeste 2ポリコム抑制性複合体2サブユニットのエンハンサー)又はG9a)、DNAメチルトランスフェラーゼ(例えば、DNMT3)、及びヒストンデアセチラーゼが挙げられるが、これらに限定されない。
【0061】
キメラ抗原受容体(CAR)は、T細胞シグナル伝達ドメインに結合した抗体(scFv)の抗原結合ドメインを含む人工的に構築されたハイブリッドタンパク質又はポリペプチドである。CARの特徴としては、モノクローナル抗体の抗原結合特性を利用して、T細胞の特異性と反応性を選択された標的に非MHC制限的に向け直す能力を挙げることができる。非MHC制限抗原認識により、CARを発現させるT細胞は、抗原処理とは無関係に抗原を認識することができるため、腫瘍回避の主要なメカニズムを回避する。更に、T細胞で発現される場合、CARは有利には、内因性T細胞受容体(T cell receptor、TCR)アルファ及びベータ鎖と二量体化しない。CARを発現させるT細胞は、本明細書では、CAR T細胞、CAR-T細胞、又はCAR修飾T細胞と呼ばれ、これらの用語は、本明細書では交換可能に使用される。細胞は、その表面に抗体結合ドメインを安定して発現させるように遺伝的に改変することができ、MHC非依存性の新規の抗原特異性を付与する。
【0062】
場合によっては、T細胞は、特定の抗体の抗原認識ドメインとCD3-ゼータ鎖又はFcγRIタンパク質の細胞内ドメインとを組み合わせて単一のキメラタンパク質にするCARを安定して発現させるように遺伝的に改変される。一実施形態では、刺激分子は、T細胞受容体複合体に関連するゼータ鎖である。
【0063】
「細胞内シグナル伝達ドメイン」という用語は、本明細書で使用される場合、分子の細胞内部分を指す。これは、タンパク質の機能的部分であり、セカンドメッセンジャーを生成することにより定義されたシグナル伝達経路を介して細胞内で情報を伝達して細胞活動を調節することによって、又はそのようなメッセンジャーに応答することによりエフェクターとして機能することによって作用する。細胞内シグナル伝達ドメインは、CAR含有細胞、例えば、CAR-T細胞の免疫エフェクター機能を促進するシグナルを生成する。例えば、CAR-T細胞における免疫エフェクター機能の例としては、サイトカインの分泌を含む細胞溶解活性及びヘルパー活性が挙げられる。
【0064】
一実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、一次細胞内シグナル伝達ドメインを含むことができる。一次細胞内シグナル伝達ドメインの例としては、一次刺激又は抗原依存性シミュレーションに関与する分子に由来するものが挙げられる。一実施形態では、細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激細胞内ドメインを含むことができる。共刺激細胞内シグナル伝達ドメインの例としては、共刺激シグナル又は抗原非依存性刺激に関与する分子に由来するものが挙げられる。例えば、CAR-Tの場合、一次細胞内シグナル伝達ドメインは、T細胞受容体の細胞質配列を含むことができ、共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共受容体又は共刺激分子からの細胞質配列を含むことができる。
【0065】
一次細胞内シグナル伝達ドメインは、免疫受容体チロシンベースの活性化モチーフ又はITAMとして知られるシグナル伝達モチーフを含むことができる。一次細胞質シグナル伝達配列を含むITAMの例としては、CD3-ゼータ、FcRガンマ、FcRベータ、CD3ガンマ、CD3デルタ、CD3イプシロン、CD5、CD22、CD79a、CD79b、CD66d DAP10及びDAP12に由来するものが挙げられるが、これらに限定されない。
【0066】
「ゼータ」又は代替的に「ゼータ鎖」、「CD3-ゼータ」又は「TCR-ゼータ」という用語は、GenBankアクセッション番号BAG36664.1として提供されるタンパク質、又は非ヒト種、例えば、ネズミ、ウサギ、霊長類、マウス、齧歯類、サル、類人猿などからの同等の残基として定義され、「ゼータ刺激ドメイン」又は代替的に「CD3-ゼータ刺激ドメイン」又は「TCR-ゼータ刺激ドメイン」は、T細胞活性化に必要な初期シグナルを機能的に伝達するのに十分なゼータ鎖の細胞質ドメインからのアミノ酸残基として定義される。一態様では、ゼータの細胞質ドメインは、GenBankアクセッション番号BAG36664.1の残基52~164、又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、類人猿などからのその機能的オルソログである同等の残基を含む。
【0067】
「共刺激分子」という用語は、共刺激リガンドと特異的に結合し、それによって、T細胞による共刺激応答、例えば、限定されないが、増殖を媒介するT細胞上の同族結合パートナーを指す。共刺激分子は、効率的な免疫応答に必要な抗原受容体又はそのリガンド以外の細胞表面分子である。共刺激分子としては、MHCクラス1分子、BTLA、及びTollリガンド受容体、並びにOX40、CD2、CD27、CD28、CDS、ICAM-1、LFA-1(CD11a/CD18)、及び4-1BB(CD137)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0068】
共刺激細胞内シグナル伝達ドメインは、共刺激分子の細胞内部分であり得る。共刺激分子は、TNF受容体タンパク質、免疫グロブリン様タンパク質、サイトカイン受容体、インテグリン、シグナル伝達リンパ球活性化分子(SLAMタンパク質)、及び活性化NK細胞受容体というタンパク質ファミリーで表すことができる。そのような分子の例としては、CD27、CD28、4-1BB(CD137)、OX40、GITR、CD30、MyD88、CD40、ICOS、BAFFR、HVEM、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、SLAMF7、NKp80、CD160、B7-H3、及びCD83と特異的に結合するリガンドなどが挙げられる。
【0069】
細胞内シグナル伝達ドメインは、それが由来する分子の細胞内部分全体、又は天然の細胞内シグナル伝達ドメイン全体、又はそれらの機能的断片を含むことができる。
【0070】
「4-1BB」又は代替的に「CD137」という用語は、GenBankアクセッション番号AAA62478.2として提供されるアミノ酸配列を有するTNFRスーパーファミリーのメンバー、又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、類人猿などからの同等の残基を指し、「4-1BB共刺激ドメイン」は、GenBankアクセッション番号AAA62478.2のアミノ酸残基214~255、又は非ヒト種、例えば、マウス、齧歯類、サル、及び類人猿などからの同等の残基として定義される。
【0071】
一実施形態では、CAR内のドメインの1つに自然に関連する膜貫通ドメインが使用される。別の実施形態では、膜貫通ドメインは、受容体複合体の他のメンバーとの相互作用を最小限にするために、同じ又は異なる表面膜タンパク質の膜貫通ドメインへのそのようなドメインの結合を回避するために、アミノ酸置換によって選択又は修飾することができる。1つの例示的な実施形態では、膜貫通ドメインは、CD8αヒンジドメインを含む。
【0072】
一部の実施形態では、細胞質シグナル伝達ドメインは、本明細書で定義されるような少なくとも1つの共刺激分子に由来する1つ以上の機能的シグナル伝達ドメインを更に含む。一実施形態では、共刺激分子は、4-1BB(即ち、CD137)、CD27、CD3-ゼータ及び/又はCD28から選択される。一部の実施形態では、CARは、CD8を含む細胞内ヒンジドメインと、CD28、4-1BB、及びCD3-ゼータを含む細胞内T細胞受容体シグナル伝達ドメインとを含む。別の実施形態では、CARは、細胞内ヒンジドメインと、CD28、4-1BB及びCD3-ゼータを含む細胞内T細胞受容体シグナル伝達ドメインとを含み、ヒンジドメインは、CD8、CD4又はCD28の細胞外領域の全部又は一部、抗体定常領域の全部又は一部、FcRIIIA受容体の全部又は一部、IgGヒンジ、IgMヒンジ、IgAヒンジ、IgDヒンジ、IgEヒンジ、又はIgヒンジを含む。IgGヒンジは、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4、IgM1、IgM2、IgA1、IgA2、IgD、IgE、又はこれらのキメラに由来し得る。
【0073】
本明細書に記載のCARは、少なくとも細胞外抗原結合ドメインと、膜貫通ドメインと、例えば以下に定義される刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメイン(本明細書では「細胞質シグナル伝達ドメイン」とも呼ばれる)とを含む組換えポリペプチド構築物を提供する。
【0074】
一実施形態では、CARは、細胞外抗原認識ドメインと、膜貫通ドメインと、刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ融合タンパク質を含む。一実施形態では、CARは、細胞外抗原認識ドメインと、膜貫通ドメインと、共刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメイン及び刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ融合タンパク質を含む。一実施形態では、CARは、細胞外抗原認識ドメインと、膜貫通ドメインと、1つ以上の共刺激分子に由来する少なくとも2つの機能的シグナル伝達ドメイン及び刺激分子に由来する機能的シグナル伝達ドメインを含む細胞内シグナル伝達ドメインとを含むキメラ融合タンパク質を含む。
【0075】
本開示は、本明細書に記載のCAR、核酸、ポリペプチド、及びタンパク質の変異体、例えば機能的変異体を更に提供する。「変異体」は、1つ以上の修飾、例えば、置換、挿入、又は欠失によって参照ポリペプチド又は参照ポリヌクレオチドとは異なるポリペプチド又はポリヌクレオチドを指す。本明細書で使用される「機能的変異体」という用語は、親CAR、ポリペプチド、又はタンパク質と実質的又は有意な配列同一性又は類似性を有するCAR、ポリペプチド、又はタンパク質を指し、この機能的変異体は、変異体であるCAR、ポリペプチド、又はタンパク質の生物学的活性を保持する。機能的変異体は、例えば、本明細書に記載のCAR、ポリペプチド、又はタンパク質(親CAR、ポリペプチド、又はタンパク質)の変異体を包含し、親CAR、ポリペプチド、又はタンパク質と同様の程度、同程度、又はより高い程度で標的細胞を認識する能力を保持する。親CAR、ポリペプチド、又はタンパク質に関して、機能的変異体は、例えば、アミノ酸配列において親CAR、ポリペプチド、又はタンパク質と少なくとも約30%、約40%、約50%、約60%、約75%、約80%、約85%、約90%、約91%、約92%、約93%、約94%、約95%、約96%、約97%、約98%、約99%以上同一であり得る。
【0076】
本開示の実施形態のCAR、ポリペプチド、及びタンパク質(機能的部分及び機能的変異体を含む)は、任意の長さであってもよく、即ち、任意の数のアミノ酸を含み得るが、ただし、CAR、ポリペプチド、又はタンパク質(又はその機能的部分若しくは機能的変異体)は、その生物学的活性、例えば、抗原に特異的に結合する能力、宿主内の罹患細胞(例えば、癌細胞)を検出する能力、又は宿主中の疾患を治療若しくは予防する能力を保持することを条件とする。例えば、ポリペプチドは、約50~約5000個のアミノ酸長、例えば、約50、約70、約75、約100、約125、約150、約175、約200、約225、約250、約275、約300、約325、約350、約375、約400、約425、約450、約475、約500、約525、約550、約575、約600、約625、約650、約675、約700、約725、約750、約775、約800、約825、約850、約875、約900、約925、約950、約975、約1000個以上のアミノ酸長であり得る。本発明のポリペプチドは、オリゴペプチドも含む。
【0077】
本明細書に記載の実施形態のオートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、及びタンパク質(本発明の機能的部分及び機能的変異体を含む)は、1つ以上の天然に存在するアミノ酸の代わりに合成アミノ酸を含むことができる。そのような合成アミノ酸は、当該技術分野において公知であり、例えば、アミノシクロヘキサンカルボン酸、ノルロイシン、α-アミノn-デカン酸、ホモセリン、S-アセチルアミノメチル-システイン、トランス-3-及びトランス-4-ヒドロキシプロリン、4-アミノフェニルアラニン、4-ニトロフェニルアラニン、α-(2-アミノ-2-ノルボルナン)-カルボン酸、α,γ-ジアミノ酪酸、α,β-ジアミノプロピオン酸、ホモフェニルアラニン、4-クロロフェニルアラニン、4-カルボキシフェニルアラニン、β-フェニルセリンβ-ヒドロキシフェニルアラニン、フェニルグリシン、α-ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニン、シクロヘキシルグリシン、N’-ベンジル-N’-メチル-リジン、N’,N’-ジベンジル-リジン、6-ヒドロキシリジン、オルニチン、α-アミノシクロペンタンカルボン酸、α-アミノシクロヘキサンカルボン酸、α-アミノシクロヘプタンカルボン酸、インドリン-2-カルボン酸、1,2,3,4-テトラヒドロイソキノリン-3-カルボン酸、アミノマロン酸、アミノマロン酸モノアミド、及びα-tert-ブチルグリシンが挙げられる。
【0078】
本明細書に記載の実施形態のオートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、及びタンパク質(機能的部分及び機能的変異体を含む)は、翻訳後修飾を受けることができる。それらは、例えばジスルフィド架橋を介してグリコシル化、エステル化、N-アシル化、アミド化、カルボキシル化、リン酸化、エステル化、環化することができ、又は酸付加塩に変換することができる。一部の実施形態では、それらは、二量体化又は重合又は結合される。
【0079】
本発明の実施形態のオートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、及び/又はタンパク質(それらの機能的部分及び機能的変異体を含む)は、当該技術分野で公知の方法によって得ることができる。ポリペプチド及びタンパク質をデノボ合成する好適な方法は、Chan et al.,Fmoc Solid Phase Peptide Synthesis,Oxford University Press,Oxford,United Kingdom,2000、Peptide and Protein Drug Analysis,ed.Reid,R.,Marcel Dekker,Inc.,2000、及びEpitope Mapping, ed. Westwood et al.,Oxford University Press,Oxford,United Kingdom,2001などの参考文献に記載されている。また、ポリペプチド及びタンパク質は、標準的な組換え方法を用いて、本明細書に記載の核酸を使用して組換え的に産生することができる。例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,3rd ed.,Cold Spring Harbor Press,Cold Spring Harbor,N.Y.2001、及びAusubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,Greene Publishing Associates and John Wiley & Sons,NY,1994を参照されたい。更に、本発明の一部のオートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、及びタンパク質(それらの機能的部分及び機能的変異体を含む)は、植物、細菌、昆虫、哺乳動物などのような供給源から単離及び/又は精製することができる。単離及び精製の方法は当該技術分野において公知である。あるいは、本明細書に記載のオートファジーモジュレーター、CaR、ポリペプチド、及び/又はタンパク質(それらの機能的部分及び機能的変異体を含む)は、商業的に合成することができる。この点に関して、オートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、及びタンパク質は、合成、組換え、単離、及び/又は精製することができる。
【0080】
本明細書に記載のポリペプチドを産出するために利用される組換え核酸を生成するために使用することができる修飾ヌクレオチドの例としては、5-フルオロウラシル、5-ブロモウラシル、5-クロロウラシル、5-ヨードウラシル、ヒポキサンチン、キサンチン、4-アセチルシトシン、5-(カルボキシヒドロキシメチル)ウラシル、カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウラシル、ジヒドロウラシル、N6-置換アデニン、7-メチルグアニン、5-メチルアミノメチルウラシル、5-メトキシアミノメチル-2-チオウラシル、ベータ-D-マンノシルキューオシン、5”-メトキシカルボキシメチルウラシル、5-メトキシウラシル、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデニン、ウラシル-5-オキシ酢酸(v)、ワイブトキソシン、シュードウラシル、キューオシン、ベータ-D-ガラクトシルキューオシン、イノシン、N6-イソペンテニルアデニン、1-メチルグアニン、1-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアニン、2-メチルアデニン、2-メチルグアニン、3-メチルシトシン、5-メチルシトシン、2-チオシトシン、5-メチル-2-チオウラシル、2-チオウラシル、4-チオウラシル、5-メチルウラシル、ウラシル-5-オキシ酢酸メチルエステル、3-(3-アミノ-3-N-2-カルボキシプロピル)ウラシル、及び2,6-ジアミノプリンが挙げられるが、これらに限定されない。
【0081】
核酸は、オートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、又はタンパク質、あるいはそれらの機能的部分若しくは機能的変異体のいずれかをコードする任意の単離又は精製されたヌクレオチド配列を含むことができる。あるいは、ヌクレオチド配列は、任意の配列又は縮重配列の組み合わせに縮重しているヌクレオチド配列を含むことができる。
【0082】
本発明の一部の実施形態はまた、単離又は精製された核酸を提供し、これは、本明細書に記載の核酸のいずれかのヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列、又は本明細書に記載の核酸のいずれかのヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む。
【0083】
ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列は、高ストリンジェンシー条件下でハイブリダイズする可能性がある。「高ストリンジェンシー条件」は、ヌクレオチド配列が、非特異的ハイブリダイゼーションよりも検出可能な程度に強い量で標的配列(本明細書に記載の核酸のいずれかのヌクレオチド配列)に特異的にハイブリダイズすることを意味する。高ストリンジェンシー条件は、正確な相補配列を有するポリヌクレオチド、又は少数の散在するミスマッチのみを含むポリヌクレオチドを、ヌクレオチド配列と一致した少数の小さな領域(例えば、3~12塩基)をたまたま有していたランダム配列と区別する条件を含む。そのような小さな相補性領域は、14~17塩基以上の完全長相補体よりも容易に融解し、高ストリンジェンシーのハイブリダイゼーションにより、それらは容易に区別できる。比較的高いストリンジェンシー条件は、例えば、約50~70℃の温度で、約0.02~0.1MのNaCl又は同等物によって提供されるような低塩条件及び/又は高温条件を含む。そのような高ストリンジェンシー条件は、ヌクレオチド配列とテンプレート鎖又は標的鎖との間のミスマッチがあったとしてもほとんど許容せず、本明細書に記載のCARのいずれかの発現を検出するのに特に好適である。ホルムアミドの添加量を増加させることによって、条件をより厳しくすることができることが一般的に理解されている。
【0084】
一実施形態では、本発明の核酸は、組換え発現ベクターに組み込むことができる。本開示は、本発明の核酸のいずれかを含む組換え発現ベクターを提供する。本明細書で使用される場合、「組換え発現ベクター」という用語は、宿主細胞によるmRNA、タンパク質、ポリペプチド、又はペプチドの発現を可能にする遺伝的改変オリゴヌクレオチド又はポリヌクレオチド構築物を意味し、この場合、構築物は、mRNA、タンパク質、ポリペプチド、又はペプチドをコードするヌクレオチド配列を含み、ベクターは、細胞内でmRNA、タンパク質、ポリペプチド、又はペプチドを発現させるのに十分な条件下で細胞と接触される。本明細書に記載のベクターは、全体として天然に存在するものではなく、ただし、ベクターの一部は、天然に存在し得る。記載された組換え発現ベクターは、限定されないが、DNA及びRNAを含む任意のタイプのヌクレオチドを含むことができ、これらは、一本鎖又は二本鎖であり、合成又は部分的に天然源から得ることができ、そして天然、非天然又は改変されたヌクレオチドを含むことができる。
【0085】
組換え発現ベクターは、天然に存在する又は天然に存在しないヌクレオチド間結合、又は両方のタイプの結合を含むことができる。天然に存在しない若しくは改変されたヌクレオチド又はヌクレオチド間結合は、ベクターの転写又は複製を阻害しない。
【0086】
ベクターは、キメラ抗原受容体(CAR)をコードするヌクレオチド配列、並びにオートファジーモジュレーターをコードする第2のヌクレオチド配列を含み得る。あるいは、1つのベクターは、キメラ抗原受容体(CAR)をコードするヌクレオチド配列を含んでもよく、別のベクターは、オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含む。
【0087】
一実施形態では、本発明の組換え発現ベクターは、任意の適切な組換え発現ベクターであってもよく、任意の適切な宿主を形質転換又はトランスフェクトするために使用され得る。好適なベクターとしては、プラスミド及びウイルスなどの増殖及び拡大又は発現又はその両方のために設計されたものが挙げられる。ベクターは、pUCシリーズ(Fermentas Life Sciences,Glen Burnie,Md.)、pBluescriptシリーズ(Stratagene,La Jolla,Calif.)、pETシリーズ(Novagen,Madison,Wis.)、pGEXシリーズ(Pharmacia Biotech, Uppsala,Sweden)、及びpEXシリーズ(Clontech,Palo Alto,Calif.)からなる群から選択することができる。λGT10、λGT11、λEMBL4、及びλNM1149、λZapII(Stratagene)などのバクテリオファージベクターを使用することができる。植物発現ベクターの例としては、pBI01、pBI01.2、pBI121、pBI101.3、及びpBIN19(Clontech)が挙げられる。動物発現ベクターの例としては、pEUK-Cl、pMAM、及びpMAMneo(Clontech)が挙げられる。組換え発現ベクターは、ウイルスベクター、例えば、レトロウイルスベクター、例えば、ガンマレトロウイルスベクターであり得る。
【0088】
一実施形態では、本発明の組換え発現ベクターは、例えば、Sambrook et al.,supra及びAusubel et al.,supraに記載の標準的な組換えDNA技術を使用して調製される。環状又は線状である発現ベクターの構築物は、原核又は真核宿主細胞で機能する複製系を含有するように調製することができる。複製系は、例えば、ColE1、SV40、2μプラスミド、λ、ウシ乳頭腫ウイルスなどに由来し得る。
【0089】
組換え発現ベクターは、ベクターがDNAベースであるかRNAベースであるかを考慮して、必要に応じて、ベクターが導入される宿主のタイプ(例えば、細菌、植物、真菌、又は動物)に特異的な調節配列、例えば転写及び翻訳の開始及び終止コドンを含み得る。
【0090】
組換え発現ベクターは、形質転換又はトランスフェクトされた宿主の選択を可能にする1つ以上のマーカー遺伝子を含むことができる。マーカー遺伝子は、殺生物剤耐性、例えば、抗生物質、重金属などに対する耐性、栄養要求性宿主における原栄養性を提供するための相補性などを含む。記載された発現ベクターに好適なマーカー遺伝子としては、例えば、ネオマイシン/G418耐性遺伝子、ヒスチジノールx耐性遺伝子、ヒスチジノール耐性遺伝子、テトラサイクリン耐性遺伝子、及びアンピシリン耐性遺伝子が挙げられる。
【0091】
組換え発現ベクターは、オートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、若しくはタンパク質(それらの機能的部分及び機能的変異体を含む)をコードするヌクレオチド配列、又はCAR、ポリペプチド、若しくはタンパク質をコードするヌクレオチド配列に相補的であるか、又はそれにハイブリダイズするヌクレオチド配列に操作可能に結合した天然又は標準プロモーターを含むことができる。例えば、強、弱、組織特異的、誘導性及び発達特異的プロモーターの選択は、当業者の通常の技術の範囲内である。同様に、ヌクレオチド配列をプロモーターと組み合わせることも当業者の技術範囲内である。プロモーターは、非ウイルスプロモーター又はウイルスプロモーター、例えば、サイトメガロウイルス(cytomegalovirus、CMV)プロモーター、RSVプロモーター、SV40プロモーター、又はマウス幹細胞ウイルスの長い末端反復に見出されるプロモーターであり得る。
【0092】
組換え発現ベクターは、一過性発現、安定発現、又はその両方のために設計することができる。また、組換え発現ベクターは、構成的発現又は誘導性発現のために作製することができる。
【0093】
特定の実施形態では、プロモーターは、小分子によって調節される活性を有する。プロモーターは小分子薬物の存在下でより活性になる可能性があり、その結果、小分子薬物が被験体又は免疫細胞に投与されると、プロモーターに操作可能に結合したオートファジーモジュレーター(例えば、ATG5又はATG7)の発現が増加する。逆に、プロモーターは、小分子薬物の存在下で活性が低下する可能性があり、その結果、小分子薬物が被験体又は免疫細胞に投与されると、プロモーターに操作可能に結合したオートファジーモジュレーター(例えば、ATG5又はATG7)の発現が増加する。特定の実施形態では、プロモーターは、免疫細胞のオートファジーモジュレーター遺伝子を標的にして破壊するように構成された遺伝子工学成分(例えば、CRISPR/Cas9)に操作可能に結合することができ、その結果、細胞への小分子薬物の投与がオートファジーモジュレーター遺伝子の異所性発現を阻止するのに有効である。
【0094】
更に、組換え発現ベクターは、自殺遺伝子を含むように作製することができる。本明細書で使用される場合、「自殺遺伝子」という用語は、自殺遺伝子を発現させる細胞を死滅させる遺伝子を指す。自殺遺伝子は、遺伝子を発現させる細胞に、例えば薬物などの薬剤に対する感受性を付与し、細胞が薬剤に接触又は曝露されたときに細胞を死滅させる遺伝子であり得る。自殺遺伝子は、当該技術分野で公知であり、例えば、単純ヘルペスウイルス(HSV)チミジンキナーゼ(TK)遺伝子、シトシンデアミナーゼ、プリンヌクレオシドホスホリラーゼ、及びニトロレダクターゼが挙げられる。
【0095】
オートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、若しくはタンパク質(それらの機能的部分又は変異体のいずれかを含む)のいずれかを含む、例えば、生体共役反応により形成された物質などの共役体、宿主細胞、核酸、組換え発現ベクター、宿主細胞の集団、又は抗体、又はそれらの抗原結合部分は、本発明の範囲内に含まれる。共役体、並びに共役体を一般的に合成する方法は、当該技術分野で公知である(例えば、Hudecz,F.,Methods Mol.Biol.298:209-223(2005)及びKirin et al.,Inorg Chem.44(15):5405-5415(2005)を参照)。
【0096】
また、本明細書に記載のオートファジーモジュレーター、CAR、ポリペプチド、又はタンパク質(それらの機能的部分及び機能的変異体を含む)のいずれかをコードするヌクレオチド配列を含む核酸も本開示によって提供される。オートファジーモジュレーター(例えば、ATG5及びATG7)の発現の増加は、免疫細胞におけるオートファジーの速度を増加させることができる。オートファジーの増加は、免疫細胞の生存を改善することができる。オートファジーの増加はまた、免疫細胞が刺激に応答して増殖する能力を改善することができる。更に、オートファジーの増加は、免疫細胞の枯渇(例えば、T細胞の枯渇及びNK細胞の枯渇)を低減することができる。
【0097】
特定の実施形態では、単一のベクターは、(i)CAR及び(ii)オートファジーモジュレーター(例えば、ATG5又はATG7のいずれか)、を発現させる。このようなベクターでは、オートファジーモジュレーターコード配列は、CARリーダー配列の上流、又はCAR CD3ζドメイン配列の下流であり得る。一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG5である。一部の実施形態では、オートファジーモジュレーターは、ATG7である。IRES又は2Aペプチドコード配列は、CARとオートファジーモジュレーター(例えば、ATG5又はATG7のいずれか)との間に挿入される。一部の実施形態では、単一ベクターは、(i)CAR、(ii)ATG5、及び(iii)ATG7、を発現させる。IRES又は2Aペプチドは、CAR、ATG5、及びATG7のそれぞれの間に挿入される。
【0098】
一態様では、本開示は、細胞外抗原結合ドメイン、膜貫通ドメイン、及び細胞内シグナル伝達ドメインを含むCARを提供し、細胞外抗原結合ドメインは、BCMA抗原に結合する。米国特許第9,765,342号及び同第10,294,304号、米国特許公開第2018/0085444号及び同第2018/0187149号、並びに国際公開第2018/085690号、同第2019/090003号、同第2019/108900号に記載されているものを含めて、BCMA抗原に結合する抗原結合ドメインを含む様々なCARを使用することができ、当該特許文献のそれぞれは、その全体が参照により本明細書に組み込まれる。
【0099】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターは、配列番号1と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0100】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターは、配列番号2と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0101】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターは、配列番号3と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0102】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターは、配列番号4と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0103】
一態様では、本開示は、本明細書に記載のCAR、並びに本明細書に記載の1つ以上のオートファジーモジュレーターを含む単離された免疫応答性細胞を提供する。一部の実施形態では、単離された免疫応答性細胞は、CARで形質導入され、例えば、CARは、免疫応答性細胞の表面上で構成的に発現される。一部の実施形態では、単離された免疫応答性細胞は、オートファジーモジュレーター、例えば、ATG5又はATG7で形質導入される。様々な実施形態では、免疫応答性細胞は、別個のベクター、例えば、レンチウイルスベクター上のCAR及びオートファジーモジュレーターコード配列で形質導入される。様々な実施形態では、免疫応答性細胞は、同じベクター、例えば、同じレンチウイルスベクター上のCAR及びオートファジーモジュレーターで、同じベクターからのCAR及びオートファジーモジュレーターの両方の転写を可能にするIRES又は他のそのような配列で形質導入される。
【0104】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターをコードする配列を含むレンチウイルスベクターは、配列番号5と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するポリヌクレオチド配列を含む。
【0105】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターをコードする配列を含むレンチウイルスベクターは、配列番号6と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するポリヌクレオチド配列を含む。
【0106】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターをコードする配列を含むレンチウイルスベクターは、配列番号7と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するポリヌクレオチド配列を含む。
【0107】
一実施形態では、オートファジーモジュレーターをコードする配列を含むレンチウイルスベクターは、配列番号8と少なくとも50、少なくとも55、少なくとも60、少なくとも65、少なくとも70、少なくとも75、少なくとも80、少なくとも85、少なくとも90、少なくとも95、少なくとも98又は少なくとも99%の配列同一性を有するポリヌクレオチド配列を含む。
【0108】
特定の実施形態では、単離された免疫応答性細胞は、少なくとも1つの共刺激リガンドで更に形質導入され、その結果、免疫応答性細胞は少なくとも1つの共刺激リガンドを発現させる。特定の実施形態では、少なくとも1つの共刺激リガンドは、4-1BBL、CD48、CD70、CD80、CD86、OX40L、TNFRSF14、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。特定の実施形態では、単離された免疫応答性細胞は、少なくとも1つのサイトカインで更に形質導入され、その結果、免疫応答性細胞は少なくとも1つのサイトカインを分泌する。特定の実施形態では、少なくともサイトカインは、IL-2、IL-3、IL-6、IL-7、IL-11、IL-12、IL-15、IL-17、IL-21、及びそれらの組み合わせからなる群から選択される。一部の実施形態では、単離された免疫応答性細胞は、Tリンパ球(T細胞)、ナチュラルキラー(NK)細胞、細胞傷害性Tリンパ球(CTL)、制御性T細胞、ヒト胚性幹細胞、リンパ系前駆細胞、T細胞前駆細胞、及びリンパ系細胞を分化させる可能性のある多能性幹細胞からなる群から選択される。
【0109】
一実施形態では、本開示のCAR T細胞は、所望のCAR、例えば、抗hK 2、CD8αヒンジ及び膜貫通ドメイン、並びにヒト4-1BB及びCD3-ゼータシグナル伝達ドメインを含むCARを含むレンチウイルスベクターを細胞に導入することによって生成することができる。本発明のCAR T細胞は、インビボで複製することができ、その結果、持続的な腫瘍制御につながる可能性のある長期持続性をもたらす。
【0110】
本発明の実施形態は、本明細書に記載の組換え発現ベクターのいずれかを含む宿主細胞を更に提供する。本明細書で使用される場合、「宿主細胞」という用語は、組換え発現ベクターを含むことができる任意のタイプの細胞を指す。宿主細胞は、真核細胞、例えば、植物、動物、若しくは藻類、真菌であってもよく、又は原核細胞、例えば、細菌若しくは原生動物であってもよい。宿主細胞は、培養細胞又は初代細胞、即ち、生物、例えば、ヒトから直接単離された細胞であり得る。宿主細胞は、接着細胞又は懸濁細胞、即ち、懸濁液中で増殖する細胞であり得る。好適な宿主細胞は、当該技術分野において公知であり、例えば、DH5α大腸菌細胞、チャイニーズハムスター卵巣細胞、サルVERO細胞、COS細胞、HEK293細胞などが挙げられる。組換え発現ベクターを増幅又は複製する目的で、宿主細胞は、原核細胞、例えば、DH5α細胞であり得る。
【0111】
組換えCAR、ポリペプチド、又はタンパク質を産生する目的で、宿主細胞は、哺乳動物細胞であり得る。宿主細胞はヒト細胞であり得る。宿主細胞は任意の細胞型であってもよく、任意のタイプの組織に由来してもよく、そして任意の発達段階のものであり得るが、宿主細胞は末梢血リンパ球(peripheral blood lymphocyte、PBL)であり得る。宿主細胞は、T細胞又はNK細胞などの免疫応答性細胞であり得る。宿主細胞は、組換えCAR及びオートファジーモジュレーターの両方をコードする単一のベクターを含み得る。宿主細胞は、組換えCARをコードする単一のベクター及びオートファジーモジュレーターをコードする単一のベクターを含み得る。様々な実施形態では、1つ以上のオートファジーモジュレーター(例えば、ATG5及びATG7)の発現の増加は、宿主細胞におけるオートファジーの速度を増加させることができる。宿主細胞としての免疫細胞におけるオートファジーの増加は、免疫細胞の生存を改善することができる。オートファジーの増加はまた、免疫細胞が刺激に応答して増殖する能力を改善することができる。更に、オートファジーの増加は、免疫細胞の枯渇(例えば、T細胞の枯渇及びNK細胞の枯渇)を低減することができる。
【0112】
様々な実施形態では、宿主細胞のゲノムは、オートファジーモジュレーターの転写及び/又は発現を増加させるように改変され得る。オートファジーモジュレーターの内因性プロモーターは、より強力な構成的プロモーターで置換されてもよい。オートファジーモジュレーターの1つ以上の内因性エンハンサーエレメントは、より強力なエンハンサーエレメントで置換されてもよい。オートファジーモジュレーター遺伝子の1つ以上の追加コピーは、様々な構成的プロモーター及び/又はエンハンサーエレメントを含む場合と含まない場合があり、細胞に導入することができる。
【0113】
CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、メガヌクレアーゼシステム、及びアルゴノートのような様々な遺伝子編集及びゲノム工学技術を用いて、オートファジーモジュレーター遺伝子、構成的プロモーター、及び/又は構成的エンハンサーを宿主細胞ゲノムに導入することができる。これらのシステムは、その全体が参照により本明細書に組み込まれている米国特許出願公開第2018/0258149号に記載されている。オートファジーモジュレーター(例えば、ATG5又はATG7)の発現を増加させるようにゲノムが改変された免疫細胞、及びそのような免疫細胞の子孫は、生存の増加、抗原ベースの刺激に応答した増殖の増加、及び免疫細胞の枯渇を受ける傾向の減少という特性の1つ以上を有することができる。
【0114】
一態様では、免疫細胞(例えば、CAR T細胞及びCAR NK細胞)は、オートファジーモジュレーター遺伝子(例えば、ATG5又はATG7)を含む。一部の実施形態では、免疫細胞は、ゲノム上の任意の位置を標的とする遺伝子編集システムを更に含む。一部の実施形態では、免疫細胞は、オートファジーモジュレーター遺伝子(プロモーター及びエンハンサー配列を含む)内の1つ以上の部位を標的とする遺伝子編集システムを更に含む。一部の実施形態では、免疫細胞は、ゲノム上の任意の位置を標的とする遺伝子編集システムを更に含む。遺伝子編集システムは、遺伝子編集システムの1つ以上の成分をコードする核酸を含み得る。様々な実施形態では、遺伝子編集システムは、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、メガヌクレアーゼシステム、及びアルゴノートシステムからなる群から選択される。
【0115】
一部の実施形態では、遺伝子編集システムは、オートファジーモジュレーター遺伝子(例えば、ATG5又はATG7)の上流のプロモーター配列を標的とする。遺伝子編集システムは、オートファジーモジュレーター遺伝子の内因性プロモーター配列を構成的プロモーターで置換するように構成された配列を含み得る。例示的な構成的プロモーターとしては、TRACプロモーター、β-2mプロモーター、CMVプロモーター、又はEF1aプロモーターが挙げられるが、これらに限定されない。遺伝子編集システムは、オートファジーモジュレーター遺伝子をTRAC遺伝子座又はβ-2m遺伝子座に挿入するように構成することができる。一部の実施形態では、遺伝子編集システムは、CAR及びオートファジーモジュレーター遺伝子の両方をTRAC遺伝子座又はβ-2m遺伝子座に挿入するように構成することができる。オートファジーモジュレーターをCARと同時に発現させるために、IRES配列又は2Aペプチド配列は、オートファジーモジュレーターコード配列とCARコード配列との間に挿入される。特定の実施形態では、複数のオートファジーモジュレーター(例えば、ATG5及びATG7の両方)は、IRES配列又は2Aペプチド配列がオートファジーモジュレーターコード配列の間に挿入された状態で、遺伝子編集配列で発現され得る。
【0116】
一部の実施形態では、遺伝子編集システムは、オートファジーモジュレーター遺伝子の発現を減少させるようにオートファジーモジュレーター遺伝子の配列を標的とし、ここで、オートファジーモジュレーター遺伝子は、オートファジーを阻害するタンパク質(即ち、オートファジー阻害剤)をコードする。遺伝子編集システムは、コード配列に突然変異を導入することによって(例えば、時期尚早の終止コドン又は欠失を導入することによって)、及び/又はプロモーター配列のすべて若しくは一部を欠失させることによって、オートファジーモジュレーター遺伝子の発現を破壊することができる。遺伝子が破壊される可能性のある例示的なオートファジー阻害剤としては、G9a、mTOR、GADD45A、p38 MAPK、及びSGK1が挙げられるが、これらに限定されない。
【0117】
様々な実施形態では、免疫細胞におけるオートファジー阻害剤遺伝子の発現は、RNA干渉を用いて抑制される。オートファジー阻害剤に特異的な低分子干渉RNA(Small interfering RNA、siRNA)が免疫細胞に導入される。このようなsiRNAは、オートファジー阻害剤、例えば、G9a、mTOR、GADD45A、p38 MAPK、及びSGK1に特異的な約20塩基のRNA配列からなる。様々な実施形態では、免疫細胞は、siRNAと接触される。siRNAは免疫細胞におけるオートファジーを増加させるのに有効であり得る。
【0118】
様々な実施形態では、免疫細胞は、オートファジーを活性化するのに有効なマイクロRNA(micro RNA、miRNA)と接触される。オートファジーを活性化できる例示的なmiRNAとしては、miR-155(Wang et al.,PLOS Pathogens,2013,9(10):e1003697、miR-451(Song et al.,J.Cell.Mol.Med.,2014,18(11)、及びmiR-378(Li et al.,PNAS,2018,115(46)E10849-E10858)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0119】
様々な実施形態では、免疫細胞は、オートファジーの速度を活性化又は増加させるのに有効なRNAを過剰発現させるように操作される。過剰発現及び/又は遺伝子工学は、本明細書に記載の方法のいずれかに従って実施することができる。オートファジーを活性化できる例示的なRNA配列としては、HOTAIR(Yang et al., Molecular BioSystems,2016,12,2605-2612)、GBCDRlnc1(Cai et al.,Molecular Cancer,2019,18:82)、及びMalat1(Si et al.,Cellular & Molecular Biology Letters,2019,24:50)が挙げられるが、これらに限定されない。
【0120】
本明細書に記載の様々な実施形態及び態様では、T細胞は、培養T細胞、例えば、初代T細胞、又はJurkat、SupT1などの培養T細胞株からのT細胞、又は哺乳動物から得られるT細胞などの任意のT細胞であり得る。哺乳動物から得られる場合、T細胞は、骨髄、血液、リンパ節、胸腺、又は他の組織若しくは体液を含むがこれらに限定されない多くの供給源から得ることができる。T細胞はまた、濃縮又は精製され得る。T細胞は、ヒトT細胞であり得る。T細胞は、ヒトから単離されたT細胞であり得る。T細胞は、任意のタイプのT細胞であってもよく、任意の発達段階のものであってもよく、限定されないが、CD4+/CD8+二重陽性T細胞、CD8+T細胞(例えば、細胞傷害性T細胞)、Th1及びTh2細胞などのCD4+ヘルパーT細胞、末梢血単核細胞(peripheral blood mononuclear cell、PBMC)、末梢血白血球(peripheral blood leukocyte、PBL)、腫瘍浸潤細胞、メモリーT細胞、ナイーブT細胞などを含む。T細胞は、CD8+T細胞又はCD4+T細胞であり得る。
【0121】
理論に拘束されることを望むものではないが、オートファジーモジュレーターをT細胞又はNK細胞に導入すると、細胞の増殖、機能及び/又は生存が増強する可能性がある。この利点は、CAR-T又はCAR-NK療法で使用するために、すでに罹患している患者からT細胞又はNK細胞を単離する場合に役立つことができる。オートファジーモジュレーターをT細胞又はNK細胞に導入すると、エフェクター/記憶分化の調節が改善される可能性がある。オートファジーモジュレーターをT細胞又はNK細胞に導入すると、T細胞又はNK細胞の機能障害及び枯渇が逆転する可能性がある。これらの効果の1つ以上は、それによってリンパ球の増殖及び/又は機能を増加させる可能性がある。
【0122】
理論に拘束されることを望むものではないが、オートファジーモジュレーターをT細胞又はNK細胞に導入すると、細胞のミトコンドリア機能が増強する可能性がある。ミトコンドリアは細胞生理学とエネルギー代謝を維持するためのエネルギーの供給に関与しているため、これは有益であり得る。オートファジーはミトコンドリアの数と健康を制御するが、同時にミトコンドリアはオートファジー過程に影響を及ぼすことができる。これら2つのシステム間のクロストークは、両方のシステムの寄与を強化し、それによってより多くの中央メモリーを維持しながら細胞の増殖能力を増強し、その結果、消耗が少なくなる。これらの効果の1つ以上は、それによってリンパ球の生存、増殖、及び/又は機能を増加させる可能性がある。
【0123】
理論に拘束されることを望むものではないが、オートファジーモジュレーターをT細胞又はNK細胞に導入すると、より長く持続する細胞及び/又は低分化細胞が生成される可能性がある。T細胞又はNK細胞の分化が養子免疫療法を損ない、効力を低下させる可能性があるため、これは有益であり得る。T細胞分化マーカーとしては、CD45 RA又はRO、CD62L、CCR7、CD27、及びCD28が挙げられるが、これらに限定されない。NK細胞分化マーカーとしては、CD16、CD56、CD57、CD94、CD122、NKp30、NKG2D及びKIRが挙げられるが、これらに限定されない。これらの効果の1つ以上は、それによってリンパ球の生存、増殖、及び/又は機能を増加させる可能性がある。
【0124】
操作されたB細胞
別の態様では、遺伝子操作されたB細胞の機能、生存、及び/又は有効性を改善するための方法が提供され、この方法は、免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む。理論に拘束されることを望むものではないが、オートファジーは、B細胞の発達、活性化、及び分化において重要な役割を果たし、細胞の寿命にわたって遭遇する表現型及び環境の変化に適応する。オートファジーの増加は、B細胞がそのような発達、活性化、及び/又は分化を受ける能力を改善する可能性がある。遺伝子操作されたB細胞は、特定のタンパク質を発現させるために使用することができ、体がその特定のタンパク質を産生することができない様々な疾患及び症状を治療する。遺伝子操作されたB細胞は導入されたタンパク質を発現させ、免疫障害を治療するために使用することができ、ここで操作されたB細胞における導入されたタンパク質を使用して、異常な免疫応答をオフにし、又は特定のタンパク質を発現させる既知の保護抗体を分泌することによって感染症を無力化して、体がその特定のタンパク質を産生することができない様々な疾患及び症状を治療することができる。これらの操作されたB細胞のいずれかにおけるオートファジーモジュレーターの発現は、タンパク質の発現を改善するのに有効であり得る。
【0125】
医薬組成物/投与
本開示の実施形態において、CAR-及びオートファジーモジュレーター発現細胞は、組成物、例えば、(i)CAR-及びオートファジーモジュレーター発現細胞、並びに(ii)医薬的に許容される担体、を含む適切な医薬組成物で提供され得る。一態様では、本開示は、有効量の(i)本明細書に記載のCAR及びオートファジーモジュレーターの1つ以上を発現させるリンパ球、及び(ii)医薬的に許容される賦形剤、を含む医薬組成物を提供する。本開示の医薬組成物は、1つ以上の医薬的又は生理学的に許容される担体、賦形剤又は希釈剤と組み合わせて、オートファジーモジュレーターも発現させるCAR発現細胞、例えば、本明細書に記載されるようなオートファジーモジュレーターを発現させる複数のCAR発現細胞を含み得る。医薬的に許容される担体は、有効成分以外の医薬組成物中の成分であってもよく、これは被験体に対して無毒性である。
【0126】
本開示の実施形態において、1つ以上のオートファジーモジュレーターを発現させる腫瘍浸潤リンパ球は、組成物、例えば、(i)1つ以上のオートファジーモジュレーターを発現させる腫瘍浸潤リンパ球、及び(ii)医薬的に許容される担体、を含む適切な医薬組成物で提供され得る。一態様では、本開示は、有効量の(i)本明細書に記載の1つ以上のオートファジーモジュレーターを発現させる腫瘍浸潤リンパ球、及び(ii)医薬的に許容される賦形剤、を含む医薬組成物を提供する。本開示の医薬組成物は、1つ以上の医薬的又は生理学的に許容される担体、賦形剤又は希釈剤と組み合わせて、本明細書に記載されるような1つ以上のオートファジーモジュレーターを発現させる腫瘍浸潤リンパ球を含み得る。医薬的に許容される担体は、有効成分以外の医薬組成物中の成分であってもよく、これは被験体に対して無毒性である。
【0127】
医薬的に許容される担体としては、緩衝液、賦形剤、安定剤、又は防腐剤を挙げることができるが、これらに限定されない。医薬的に許容される担体の例は、塩、緩衝液、抗酸化剤、糖類、水性若しくは非水性担体、防腐剤、湿潤剤、界面活性剤若しくは乳化剤、又はそれらの組み合わせなどの生理学的に適合性のある溶媒、分散媒体、コーティング、抗菌剤及び抗真菌剤、等張剤及び吸収遅延剤などである。医薬組成物中の医薬的に許容される担体の量は、担体の活性及び製剤の所望の特性、例えば安定性及び/又は最小酸化に基づいて実験的に決定することができる。
【0128】
そのような組成物は、酢酸、クエン酸、ギ酸、コハク酸、リン酸、炭酸、リンゴ酸、アスパラギン酸、ヒスチジン、ホウ酸、トリス緩衝液、HEPPSO、HEPES、中性緩衝生理食塩水、リン酸緩衝生理食塩水などの緩衝液;グルコース、マンノース、スクロース又はデキストラン、マンニトールなどの炭水化物;タンパク質;グリシンなどのポリペプチド又はアミノ酸;酸化防止剤;EDTA又はグルタチオンなどのキレート剤;補助剤(例えば水酸化アルミニウム);抗菌剤及び抗真菌剤;及び防腐剤を含み得る。
【0129】
本開示の組成物は、非経口投与又は経口投与の様々な手段のために製剤化することができる。一実施形態では、組成物は、注入又は静脈内投与用に製剤化することができる。本明細書に開示される組成物は、例えば、無菌液体調製物、例えば、等張水溶液、エマルション、懸濁液、分散液、又は粘性組成物として提供することができ、これらは、所望のpHに緩衝され得る。経口投与に適した製剤としては、液体溶液、カプセル、サッシェ、錠剤、ドロップ剤、トローチ剤、適切な液体及びエマルション中の粉末液体懸濁液を挙げることができる。
【0130】
医薬組成物に関して本明細書で使用される「医薬的に許容される」という用語は、動物及び/又はヒトで使用するために、連邦政府若しくは州政府の規制機関によって承認済みであること、又は米国薬局方若しくは他の一般的に認められた薬局方に記載されていることを意味する。
【0131】
一態様では、本開示は、癌を有するか又は癌を有するリスクのある被験体の治療のために、リンパ球注入を使用して、オートファジーモジュレーター及びCARを発現させる遺伝子改変T細胞を投与することに関する。少なくとも1つの実施形態では、自己リンパ球注入が治療に使用される。自己PBMCは、治療を必要とする被験体から収集され、T細胞は、本明細書に記載され、当該技術分野で公知の方法を用いて活性化及び増殖され、次いで被験体に注入されて戻される。
【0132】
一態様では、本開示は、癌を有するか又は癌を有するリスクのある被験体の治療のために、リンパ球注入を使用して、オートファジーモジュレーター及びCARを発現させる腫瘍浸潤リンパ球を投与することに関する。
【0133】
一態様では、本開示は、一般に、癌を発症するリスクのある被験体の治療に関する。本発明はまた、被験体における化学療法及び/又は免疫療法が有意な免疫抑制をもたらし、それによって被験体が癌を発症するリスクを増大させる悪性疾患又は自己免疫疾患を治療することを含む。一態様では、本開示は、癌を予防する方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、本明細書に記載のCARの1つ以上と共に記載されたオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる一定量のリンパ球を投与することを含む。別の態様では、本開示は、癌を予防する方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、本明細書に記載のオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる一定量の腫瘍浸潤リンパ球を投与することを含む。
【0134】
一態様では、本開示は、癌を有する被験体を治療する方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、本明細書に記載のCARの1つ以上と共に本明細書に記載のオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる治療有効量のリンパ球を投与することを含み、それによってリンパ球は被験体における癌細胞の死滅を誘導又は調節する。別の態様では、本開示は、癌を有する被験体を治療する方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、本明細書に記載のオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる治療有効量の腫瘍浸潤リンパ球を投与することを含み、それによって、リンパ球は被験体における癌細胞の死滅を誘導又は調節する。
【0135】
別の態様では、本開示は、癌を有する被験体における腫瘍負荷を低減する方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、本明細書に記載のCARの1つ以上と共に記載されたオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる治療有効量のリンパ球を投与することを含み、それによってリンパ球は、被験体における癌細胞の死滅を誘導する。別の態様では、本開示は、癌を有する被験体における腫瘍負荷を低減する方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、記載されたオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる治療有効量の腫瘍浸潤リンパ球を投与することを含み、それによって、リンパ球は被験体における癌細胞の死滅を誘導する。
【0136】
別の態様では、本開示は、癌を有する被験体の生存を増加させる方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、記載されたCARの1つ以上と共に本明細書に記載のオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる治療有効量のリンパ球を投与することを含み、それによって、被験体の生存が延長される。別の態様では、本開示は、癌を有する被験体の生存を増加させる方法を提供し、この方法は、それを必要とする被験体に、本明細書に記載のオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させる治療有効量の腫瘍浸潤リンパ球を投与することを含み、それによって、被験体の生存が延長される。
【0137】
一般に、(i)オートファジー阻害剤及びCARを発現させるリンパ球、及び(ii)オートファジー阻害剤を発現させる腫瘍浸潤リンパ球、は、被験体における癌細胞の死滅を誘導し、被験体における腫瘍/癌細胞の減少又は根絶をもたらす。
【0138】
一態様では、本明細書に記載の方法は、癌性疾患に発展するリスクがある非癌性疾患の治療に適用可能である。
【0139】
一態様では、癌細胞の標的殺傷の方法が開示され、この方法は、癌細胞を、記載されたCARの1つ以上と共に記載されたオートファジー阻害剤の1つ以上を発現させるリンパ球と接触させることを含み、それによってリンパ球は癌細胞の死滅を誘導する。転移性癌細胞を含めて、標的とすることができる癌細胞の非限定的なリストには、前立腺癌及びその組み合わせが含まれる。一実施形態では、癌細胞は、前立腺癌細胞である。
【0140】
本開示の医薬組成物は、治療される(又は予防される)疾患に適切な方法で投与され得る。投与の量及び頻度は、被験体の状態、被験体の疾患の種類と重症度などの要因によって決定されるが、適切な投与量は臨床試験によって決定される場合がある。
【0141】
「治療する」又は「治療」という用語は、望ましくない生理学的変化若しくは疾患を遅らせる(軽減する)こと、又は治療中に有益な若しくは所望の臨床転帰を提供することを目的とする治療処置を指す。有益な又は所望の臨床転帰には、検出可能又は検出不可能であるか否かにかかわらず、症状の緩和、疾患の程度の軽減、疾患の安定した(即ち、悪化しない)状態、疾患の進行の遅延又は緩慢化、病状の改善又は緩和、及び/又は寛解(部分的又は全体的)が含まれる。「治療」はまた、被験体が治療を受けていない場合に予想される生存と比較して、生存を延長することを意味することができる。治療を必要とする被験体には、望ましくない生理学的変化又は疾患をすでに患っている被験体、並びに生理学的変化又は疾患を患いやすい被験体が含まれる。
【0142】
本明細書において交換可能に使用される「治療有効量」又は「有効量」は、必要な投薬量及び期間で所望の治療結果を達成するのに有効な量を指す。治療有効量は、個体の病状、年齢、性別、及び体重、並びに個体において所望の応答を誘発する治療薬又は治療薬の組み合わせの能力などの要因によって異なる可能性がある。有効な治療薬又は治療薬の組み合わせの例示的な指標としては、例えば、患者の健康状態の改善、腫瘍負荷の低減、腫瘍の増殖の停止若しくは遅延、及び/又は体内の他の場所への癌細胞の転移の欠如が挙げられる。
【0143】
本明細書で使用される場合、「被験体」という用語は、動物を指す。「被験体」及び「患者」という用語は、被験体に関して本明細書で交換可能に使用されてもよい。したがって、「被験体」は、患者として、疾患又は疾患の予防のために治療されているヒトを含む。本明細書に記載の方法は、任意の分類に属する動物被験体を治療するために使用することができる。そのような動物の例としては、哺乳動物が挙げられる。哺乳動物としては、マウスやハムスターなどの齧歯目哺乳動物、及びウサギなどの兎形目哺乳動物が挙げられるが、これらに限定されない。哺乳動物は、ネコ科(ネコ)及びイヌ科(イヌ)を含む食肉目からのものであり得る。哺乳動物は、ウシ亜科(ウシ)及びイノシシ科(ブタ)を含む偶蹄目、又はウマ科(ウマ)を含む奇蹄目からのものであり得る。哺乳動物は、霊長目、セボイド目、若しくはシモイド目(サル)、又は真猿亜目(ヒト及び類人猿)のものであり得る。一実施形態では、哺乳動物は、ヒトである。
【0144】
治療有効量が示される場合、投与される本開示の組成物の正確な量は、被験体の年齢、体重、腫瘍サイズ、感染又は転移の程度、及び状態における個人差を考慮して、医師によって決定されることができる。本明細書に記載のT細胞、NK細胞又はB細胞を含む医薬組成物は、約104~約1010細胞/kg体重、場合によって105~約106細胞/kg体重の投与量(これらの範囲内のすべての整数値を含めて)で投与され得ると一般に述べることができる。一部の実施形態では、本明細書に記載のT細胞、NK細胞又はB細胞を含む医薬組成物は、約106細胞/kg体重の投与量で投与され得る。T細胞、NK細胞又はB細胞組成物はまた、これらの投与量で複数回投与され得る。細胞は、免疫療法で一般的に知られている注入技術を使用して投与することができる(例えば、Rosenberg et al.,New Eng.J.of Med.319:1676,1988を参照)。
【0145】
本発明の実施形態の文脈において有用な送達システムは、徐放性、遅延放出、及び持続性放出送達システムを含むことができ、その結果、T細胞、NK細胞又はB細胞組成物の送達が、治療される部位の感作の前に、そしてそれを引き起こすのに十分な時間で行われる。組成物は、他の治療薬又は治療法と併用することができる。そのようなシステムは、組成物の反復投与を回避することができ、それにより、被験体及び医師に対して利便性を高め、本発明の特定の組成物の実施形態に特に適している可能性がある。
【0146】
多くのタイプの放出送達システムが利用可能であり、当業者に公知である。これらには、ポリ(ラクチド-グリコリド)、コポリオキサレート、ポリエステルアミド、ポリオルトエステル、ポリカプロラクトン、ポリヒドロキシ酪酸、及びポリ無水物などのポリマー系システムが含まれる。前述の薬物含有ポリマーのマイクロカプセルは、例えば、米国特許第5,075,109号に記載されている。送達システムとしては、コレステロール、コレステロールエステル、及び脂肪酸などのステロール、又はモノジグリセリド及びトリグリセリドなどの中性脂肪を含む脂質である非ポリマーシステム、シラスティックシステム、ペプチド系システム、ヒドロゲル放出システム、ワックスコーティング、従来の結合剤及び賦形剤を使用した圧縮錠剤、部分的に融合したインプラントなども挙げられる。具体的な例としては、(a)米国特許第4,452,775号、同第4,667,014号、同第4,748,034号、及び同第5,239,660号に記載されているものなど、活性組成物がマトリックス内の形態で含有される侵食システム、並びに(b)米国特許第3,854,480号及び同第3,832,253号に記載されているものなど、活性成分が制御された速度でポリマーから浸透する拡散システム、が挙げられるが、これらに限定されない。更に、ポンプベースのハードウェア送達システムを使用することができ、その一部は移植に適合している。
【0147】
特定の態様では、活性化T細胞、NK細胞又はB細胞を被験体に投与し、その後、血液を再採取し(又はアフェレーシスを実施し)、本開示に従ってT細胞、NK細胞又はB細胞を活性化し、これらの活性化及び拡大したT細胞、NK細胞又はB細胞を被験体に再注入することが望ましい場合がある。このプロセスは、数週間ごとに複数回実施することができる。特定の態様では、T細胞、NK細胞又はB細胞は、10cc~400ccの採血から活性化することができる。特定の態様では、T細胞、NK細胞又はB細胞は、20cc、30cc、40cc、50cc、60cc、70cc、80cc、90cc又は100ccの採血から活性化される。
【0148】
CAR-T細胞及び組成物の投与は、任意の方法、例えば、エアロゾル吸入、注射、注入、摂取、輸血、埋め込み又は移植を含む非経口投与又は経口投与によって行うことができる。例えば、本明細書に記載のCAR-T細胞及び組成物は、経動脈的に、皮内に、皮下に、腫瘍内に、髄内に、結節内に、筋肉内に、静脈内(i.v.)注射によって、又は腹腔内に患者に投与することができる。一態様では、本開示の組成物は、i.v.注射によって投与される。一態様では、本開示の組成物は、皮内注射又は皮下注射によって被験体に投与される。T細胞又はNK細胞の組成物は、例えば、腫瘍、リンパ節、組織、器官、又は感染部位に直接注射することができる。
【0149】
投与は、自家又は非自家であり得る。例えば、ヒトBCMA特異的CARを発現させる免疫応答性細胞は、1人の被験体から得ることができ、同じ被験体又は適合性のある異なる被験体に投与することができる。本開示の末梢血由来のT細胞若しくはNK細胞、又は拡大したT細胞若しくはNK細胞(例えば、インビボ、エクスビボ又はインビトロ由来)は、例えば、静脈注射、局所注射、全身注射、カテーテル投与、又は非経口投与を介して投与することができる。
【0150】
特定の実施形態では、被験体は、白血球アフェレーシスを受けることができ、その場合、白血球を、エクスビボで収集、濃縮、又は枯渇させ、目的の細胞、例えば、T細胞又はNK細胞を選択及び/又は単離する。これらのT細胞又はNK細胞単離物を、当該技術分野で公知の方法によって拡大し、処理することができ、それにより、本開示の1つ以上のCAR構築物を導入することができ、それによってCAR-T細胞又はCAR-NK細胞を作製する。それを必要とする被験体は、その後、高用量化学療法とそれに続く末梢血幹細胞移植による標準治療を受けることができる。特定の態様では、移植に続いて、又は移植と同時に、被験体は、拡大したCAR-T細胞又はCAR-NK細胞の注入を受ける。一態様では、拡大した細胞は、手術の前又は後に投与される。
【0151】
悪性腫瘍を有する患者に投与される投与量は、治療されている疾患を軽減するか、又は少なくとも部分的に阻止するのに十分である(「治療有効量」)。被験体に投与される上記治療の投与量は、治療されている症状の正確な性質及び治療のレシピエントによって変化する。ヒト投与のための投与量の増減は、当該技術分野において一般的に受け入れられている慣行に従って実施することができる。
【0152】
本発明のCAR T細胞は、インビボでのT細胞拡大を受けることができ、血液及び骨髄中で長期間高レベルで持続するBCMA特異的メモリー細胞を樹立することができる。場合によっては、被験体に注入された本発明のCAR T細胞は、進行した化学療法抵抗性癌を有する被験体においてインビボで癌細胞を排除することができる。
【0153】
一実施形態では、本開示のCARを、例えば、インビトロ転写を用いてT細胞に導入し、被験体(例えば、ヒト)に、本開示のCAR-T細胞を初回投与し、そしてCAR-T細胞を1回以上後続投与し、ここで、1回以上の後続投与は、前回の投与から15日未満、例えば、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、又は2日後に投与される。一実施形態では、CAR-T細胞を、1週間に被験体(例えば、ヒト)に2回以上投与し、例えば、CAR-T細胞を1週間に2回、3回、又は4回投与する。一実施形態では、被験体に、1週間にCAR-T細胞を2回以上投与し(例えば、1週間に2回、3回又は4回投与)(本明細書中ではサイクルとも呼ばれる)、その後、1週間はCAR-T細胞を投与せず、次いで、CAR-T細胞を被験体に1回以上追加投与する(例えば、1週間にCAR-T細胞を2回以上投与)。別の実施形態では、被験体に、CAR-T細胞を2サイクル以上で投与し、各サイクル間の時間は、10、9、8、7、6、5、4、又は3日未満である。一実施形態では、1週間に3回の投与のために、CAR-T細胞を1日おきに投与する。一実施形態では、CAR-T細胞を、少なくとも2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、8週間、又はそれ以上の週にわたって投与する。
【0154】
一実施形態では、本開示のCARを、例えばインビトロ転写を用いてNK細胞に導入し、被験体(例えば、ヒト)に、本開示のCAR-NK細胞を初回投与し、そしてCAR-NK細胞を1回以上後続投与し、ここで、1回以上の後続投与は、前回の投与から15日未満、例えば、14、13、12、11、10、9、8、7、6、5、4、3、又は2日後に投与される。一実施形態では、CAR-NK細胞を、1週間に被験体(例えば、ヒト)に2回以上投与し、例えば、CAR-NK細胞を1週間に2回、3回、又は4回投与する。一実施形態では、被験体に、1週間にCAR-NK細胞を2回以上投与し(例えば、1週間に2回、3回又は4回投与)(本明細書中ではサイクルとも呼ばれる)、その後、1週間はCAR-NK細胞を投与せず、次いで、CAR-NK細胞を被験体に1回以上追加投与する(例えば、1週間にCAR-NK細胞を2回以上投与)。別の実施形態では、被験体に、CAR-NK細胞を2サイクル以上で投与し、各サイクル間の時間は、10、9、8、7、6、5、4又は3日未満である。一実施形態では、1週間に3回の投与のために、CAR-NK細胞を1日おきに投与する。一実施形態では、CAR-NK細胞を、少なくとも2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、8週間、又はそれ以上の週にわたって投与する。
【0155】
一実施形態では、投与は、1日、2日、3日、4日、5日、6日、1週間、2週間、3週間、1ヶ月、5週間、6週間、7週間、2ヶ月、3ヶ月、4ヶ月、5ヶ月、6ヶ月又はそれ以上の後に繰り返すことができる。長期投与と同様に、治療の繰り返しコースも可能である。反復投与は、同じ用量であっても異なる用量であってもよい。
【0156】
CAR-T及びCAR-NK細胞は、本発明の方法において、例えば、6ヶ月以上の期間にわたって週に1回などの維持療法によって投与することができる。
【0157】
一実施形態では、CAR-T細胞は、レンチウイルスなどのレンチウイルスウイルスベクターを使用して生成される。そのようなウイルスベクターで生成されたCAR-T細胞は、一般的に安定したCAR発現を有する。本実施形態では、CAR-T細胞はまた、同じレンチウイルスベクター上、又は追加のレンチウイルスベクター上にオートファジーモジュレーターコード配列を含む。
【0158】
一実施形態では、CAR-NK細胞は、レンチウイルスなどのレンチウイルスウイルスベクターを使用して生成される。そのようなウイルスベクターで生成されたCAR-NK細胞は、一般的に安定したCAR発現を有する。本実施形態では、CAR-NK細胞はまた、同じレンチウイルスベクター上、又は追加のレンチウイルスベクター上にオートファジーモジュレーターコード配列を含む。
【0159】
一実施形態では、CAR-T又はCAR-NK細胞は、形質導入後4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15日目にCARベクターを一過性に発現させる。CARの一過性発現は、RNA CARベクターの送達によって影響を受ける可能性がある。CARは、オートファジーモジュレーターを一過性に発現させる可能性もある。あるいは、CARは、ウイルスベクターにおいてオートファジーモジュレーターを発現させる可能性がある。一実施形態では、CAR RNA及び/又はオートファジーモジュレーターベクターは、エレクトロポレーションによってT細胞に形質導入される。別の実施形態では、CAR-T又はCAR-NK細胞において、内因性オートファジーモジュレーター遺伝子のプロモーターは、構成的プロモーター(例えば、TRACプロモーター、β-2mプロモーター、CMVプロモーター、又はEF1aプロモーター)で置換される。プロモーターの置換は、遺伝子編集システム(例えば、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、又はメガヌクレアーゼシステム)を用いて行うことができる。
【0160】
患者が一過性CAR療法の過程で抗CAR抗体応答を起こすリスクが高い場合(RNA形質導入によって生成されるものなど)、CAR-T又はCAR-NK注入の中断は10~14日を超えてはならない。
【0161】
本明細書に記載のCAR発現細胞は、他の既知の薬剤及び治療法と組み合わせて使用することができる。本明細書で使用される場合、「組み合わせて」投与されるとは、被験体の治療の過程中に、2つ(又はそれ以上)の異なる治療が被験体に送達されることを意味し、例えば、被験体が癌と診断された後、かつその癌が治癒又は排除される前、あるいは他の理由で治療が中止される前に、2つ以上の治療が送達される。一部の実施形態では、1つの治療の送達は、第2の治療の送達が開始されるときにまだ行われているため、投与に関して重複がある。これは、本明細書では「同時」又は「同時送達」と呼ばれることもある。他の実施形態では、1つの治療の送達は、もう1つの治療の送達が開始される前に終了する。いずれかの場合の一部の実施形態では、併用投与のため、治療はより効果的である。例えば、第2の治療はより効果的であり、例えば、第2の治療が少ない場合に同等の効果が見られ、又は第2の治療は、第1の治療なしで第2の治療を行った場合よりも症状を大幅に軽減し、又は第1の治療で同様の状況が見られる。一部の実施形態では、送達は、障害に関連する症状又は他のパラメータの減少が、他の治療なしで1つの治療が行われた場合に観察されるものよりも大きいようなものである。2つの治療の効果は、部分的に相加的、完全に相加的、又は相加的以上であり得る。送達は、送達された第1の治療の効果が、第2の治療が送達されたときに依然として検出可能であるようなものであり得る。
【0162】
一実施形態では、因子などの他の治療剤は、CAR-T又はCAR-NK細胞の前、後、又は同じ時間に(同時に)投与することができ、これは、例えば、IL-2、IL-3、IL 6、IL-7、IL-11、IL-12、IL-15、IL-21、及び他のインターロイキンなどのインターロイキン、G-、M-及びGM-CSFなどのコロニー刺激因子、並びにγ-インターフェロンなどのインターフェロンを含むが、これらに限定されない。
【0163】
本明細書に記載のCAR発現細胞及び少なくとも1つの追加の治療剤は、同じ又は別個の組成物で同時に又は連続して投与することができる。連続投与の場合、本明細書に記載のCAR発現細胞を最初に投与し、次に追加の薬剤を投与することができ、又は投与の順序を逆にすることができる。
【0164】
更なる実施形態では、本明細書に記載のCAR発現細胞は、手術、放射線、化学療法、メトトレキサート、シクロスポリン、アザチオプリン、ミコフェノール酸、及びFK506などの免疫抑制剤、抗体、又は抗CD3抗体若しくは他の抗体療法薬などの他の免疫除去剤、サイトキシン、フルダラビン、シクロスポリン、FK506、ラパマイシン、ミコフェノール酸、ステロイド、FR901228、サイトカイン、及び照射と組み合わせて治療レジメンで使用することができる。
【0165】
一実施形態では、本明細書に記載のCAR発現細胞は、化学療法剤と組み合わせて使用することができる。化学療法剤の例としては、アントラサイクリン(例えば、ドキソルビシン(例えば、リポソームドキソルビシン))、ビンカアルカロイド(例えば、ビンブラスチン、ビンクリスチン、ビンデシン、ビノレルビン)、アルキル化剤(例えば、シクロホスファミド、デカルバジン、メルファラン、イホスファミド、テモゾロミド)、免疫細胞抗体(例えば、アレムツズマブ、ゲムツズマブ、リツキシマブ、トシツモマブ)、代謝拮抗剤(例えば、葉酸拮抗薬、ピリミジン類似体、プリン類似体、及びアデノシンデアミナーゼ阻害剤(例えば、フルダラビン)を含む)、mTOR阻害剤、TNFRグルココルチコイド誘導性TNFR関連タンパク質(GITR)アゴニスト、プロテアソーム阻害剤(例えば、アクラシノマイシンA、グリオトキシン又はボルテゾミブ)、サリドマイド又はサリドマイド誘導体(例えば、レナリドミド)などの免疫調節薬が挙げられるが、これらに限定されない。
【0166】
併用療法での使用が考えられる化学療法剤の非網羅的なリストには、アナストロゾール(Arimidex(登録商標))、ビカルタミド(Casodex(登録商標))、ブレオマイシン硫酸塩(Blenoxane(登録商標))、ブスルファン(Myleran(登録商標))、ロイコボリンカルシウム、メルファラン(Alkeran(登録商標))、6-メルカプトプリン(Purinethol(登録商標))、メトトレキサート(Folex(登録商標))、ミトキサトロン(Novantrone(登録商標))、マイロターグ、パクリタキセル(Taxol(登録商標))、フェニックス(Yttrium90/MX-DTPA)、ペントスタチン、カルムスチンインプラント含有ポリフェプロサン20(Gliadel(登録商標))、ダクチノマイシン(Actinomycin D、Cosmegan)、ダウノルビシン塩酸塩(Cerubidine(登録商標))、ダウノルビシンクエン酸リポソーム注射剤(DaunoXome(登録商標))、デキサメタゾン、ドセタキセル(Taxotere(登録商標))、ドキソルビシン塩酸塩(Adriamycin(登録商標)、Rubex(登録商標))、エトポシド(Vepesid(登録商標))、ブスルファン注射液(Busulfex(登録商標))、カペシタビン(Xeloda(登録商標))、N4-ペントキシカルボニル-5-デオキシ-5-フルオロシチジン、カルボプラチン(Paraplatin(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、シスプラチン(Platinol(登録商標))、クラドリビン(Leustatin(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)又はNeosar(登録商標))、シタラビン、シトシンアラビノシド(Cytosar-U(登録商標))、シタラビンリポソーム注射液(DepoCyt(登録商標))、ダカルバジン(DTIC-Dome(登録商標))、リン酸フルダラビン(Fludara(登録商標))、5-フルオロウラシル(Adrucil(登録商標)、Efudex(登録商標))、フルタミド(Eulexin(登録商標))、テザシチビン、ゲムシタビン(ジフルオロデオキシシチジン)、ヒドロキシ尿素(Hydrea(登録商標))、イダルビシン(Idamycin(登録商標))、イホスファミド(IFEX(登録商標))、イリノテカン(Camptosar(登録商標))、L-アスパラギナーゼ(ELSPAR(登録商標))、クエン酸タモキシフェン(Nolvadex(登録商標))、テニポシド(Vumon(登録商標))、6-チオグアニン、チオテパ、チラパザミン(Tirazone(登録商標))、注射用トポテカン塩酸塩(Hycamptin(登録商標))、ビンブラスチン(Velban(登録商標))、ビンクリスチン(Oncovin(登録商標))、及びビノレルビン(Navelbine(登録商標))が含まれる。
【0167】
アルキル化剤の例としては、限定されないが、ナイトロジェンマスタード、エチレンイミン誘導体、スルホン酸アルキル、ニトロソウレア及びトリアゼン:ウラシルマスタード(Aminouracil Mustard(登録商標)、Chlorethaminacil(登録商標)、Haemanthamine(登録商標)、Nordopan(登録商標)、Uracil Nitrogen Mustard(登録商標)、Uracillost(登録商標)、Uracilmostaza(登録商標)、Uramustin(登録商標)、Uramustine(登録商標))、クロルメチン(Mustargen(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)、Neosar(登録商標)、Clafen(登録商標)、Endoxan(登録商標)、Procytox(登録商標)、Revimmune(商標))、イホスファミド(Mitoxana(登録商標))、メルファラン(Alkeran(登録商標))、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、ピポブロマン(Amedel(登録商標)、Vercyte(登録商標))、トリエチレンメラミン(Hemel(登録商標)、Hexylen(登録商標)、Hexastat(登録商標))、Demethyldopan(登録商標)、Desmethyldopan(登録商標)、トリエチレンチオホスフォルアミン、テモゾロミド(Temodar(登録商標))、チオテパ(Thioplex(登録商標))、ブスルファン(Busilvex(登録商標)、Myleran(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、ロムスチン(CeeNU(登録商標))、ストレプトゾシン(Zanosar(登録商標))、及びダカルバジン(DTIC-Dome(登録商標))が挙げられる。アルキル化剤の更なる例としては、限定されないが、オキサリプラチン(Eloxatin(登録商標))、メルファラン(L-PAM、L-サルコリシン、及びフェニルアラニンマスタードとしても知られている、Alkeran(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン(HMM)としても知られている、Hexylen(登録商標))、カルムスチン(BiCNU(登録商標))、ベンダムスチン(Treanda(登録商標))、ブスルファン(Busulfex(登録商標)及びMyleran(登録商標))、カルボプラチン(Paraplatin(登録商標))、テモゾロミド(Temodar(登録商標)及びテモダール(登録商標))、ダクチノマイシン(アクチノマイシン-Dとしても知られている、Cosmegen(登録商標))、ロムスチン(CCNUとしても知られている、CeeNU(登録商標))、シスプラチン(CDDPとしても知られている、Platinol(登録商標)及びPlatinol(登録商標)-AQ)、クロラムブシル(Leukeran(登録商標))、シクロホスファミド(Cytoxan(登録商標)及びNeosar(登録商標))、ダカルバジン(DTIC、DIC及びイミダゾールカルボキサミドとしても知られている、DTIC-DOME(登録商標))、アルトレタミン(ヘキサメチルメラミン(HMM)としても知られている、Hexylen(登録商標))、イホスファミド(Ifex(登録商標))、プレドヌムスチン、プロカルバジン(Matulane(登録商標))、メクロレタミン(ナイトロジェンマスタード、ムスチン及びメクロレタミン塩酸塩としても知られている、Mustargen(登録商標))、ストレプトゾシン(Zanosar(登録商標))、チオテパ(チオホスホアミド、TESPA及びTSPAとしても知られている、Thioplex(登録商標))、シクロホスファミド(Endoxan(登録商標)、Cytoxan(登録商標)、Neosar(登録商標)、Procytox(登録商標)、Revimmune(登録商標))、及びベンダムスチン塩酸塩(Treanda(登録商標))が挙げられる。
【0168】
本明細書で有用な免疫調節薬の例としては、限定されないが、例えば、アフツズマブ(Roche(登録商標)から入手可能)、ペグフィルグラスチム(Neulasta(登録商標))、レナリドミド(CC-5013、Revlimid(登録商標))、サリドマイド(Thalomid(登録商標))、アクチミド(CC4047)、及びIRX-2(インターロイキン1、インターロイキン2、及びインターフェロン-γを含むヒトサイトカインの混合物、CAS 951209-71-5、IRX Therapeuticsから入手可能)が挙げられる。
【0169】
一実施形態では、被験体に、CAR発現細胞の活性を増強する薬剤を投与することができる。例えば、一実施形態では、薬剤は、阻害分子を阻害する薬剤であり得る。阻害分子、例えば、Programmed Death 1(PD1)は、一部の実施形態では、免疫エフェクター応答を開始するCAR発現細胞の能力を低下させることができる。阻害分子の例としては、PD1、PD-L1、CTLA4、TIM3、LAG3、VISTA、BTLA、TIGIT、LAIR1、CD160、2B4、及びTGFRベータが挙げられる。
【0170】
以下、例示的な実施形態について説明する。
1.キメラ抗原受容体(CAR)をコードするヌクレオチド配列を含む第1のベクター及びオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含む第2のベクターを発現させる、免疫細胞。
2.キメラ抗原受容体(CAR)をコードする第1のヌクレオチド配列及びオートファジーモジュレーターをコードする第2のヌクレオチド配列を含むベクターを発現させる、免疫細胞。
3.オートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターを含む、免疫細胞。
4.免疫細胞はCARを更に含む、実施形態3に記載の免疫細胞。
5.免疫細胞のゲノムは1つ以上の追加のオートファジーモジュレーター遺伝子を含む、実施形態1、2及び4のいずれか一つに記載の免疫細胞。
6.オートファジーモジュレーター遺伝子のプロモーターは構成的プロモーターで置換される、実施形態1、2及び4のいずれか一つに記載の免疫細胞。
7.オートファジーモジュレーター遺伝子のエンハンサー配列は、オートファジーモジュレーター遺伝子の転写を増加させるのに有効である第2のエンハンサー配列で置換される、実施形態1、2、4及び6のいずれか一つ記載の免疫細胞。
8.免疫細胞はリンパ球である、実施形態1~7のいずれか一つに記載の免疫細胞。
9.免疫細胞は腫瘍透過性リンパ球である、実施形態8に記載の免疫細胞。
10.免疫細胞はT細胞、ナチュラルキラー(NK)細胞又はB細胞である、実施形態8又は実施形態9に記載の免疫細胞。
11.CARは、B細胞成熟抗原(BCMA)、CD19抗原、CD30抗原、CD123抗原、FLT3抗原、及びカリクレイン-2抗原に特異的に結合する細胞外ドメインを含む、実施形態1、2、及び3~9のいずれか一つに記載の免疫細胞。
12.オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53, DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2である、実施形態1~11のいずれか一つに記載の免疫細胞。
13.オートファジーモジュレーターはATG5である、実施形態12に記載の免疫細胞。
14.ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD(配列番号:1)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態13に記載の免疫細胞。
15.ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD(配列番号:2)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態13に記載の免疫細胞。
16.オートファジーモジュレーターはATG7である、実施形態12に記載の免疫細胞。
17.ATG7は、MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI(配列番号:3)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態16に記載の免疫細胞。
18.ATG7は、MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV(配列番号:4)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態16に記載の免疫細胞。
19.ベクターはレンチウイルスベクターである、実施形態1~18のいずれか一つに記載の免疫細胞。
20.オートファジーモジュレーターの発現は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞におけるオートファジーモジュレーターの発現レベルの少なくとも4倍である、実施形態1~19のいずれか一つに記載の免疫細胞。
21.免疫細胞の細胞傷害性活性は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞の細胞傷害性活性よりも低くない、実施形態1~20のいずれか一つに記載の免疫細胞。
22.免疫細胞は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞よりも大きな程度で増殖することができる、実施形態1~21のいずれか一つに記載の免疫細胞。
23.免疫細胞は、オートファジー阻害剤の正常な発現を伴う同等の免疫細胞よりも遅い時間にT細胞枯渇の状態に入る、実施形態1~21のいずれか一つに記載の免疫細胞。
24.免疫細胞はT細胞枯渇を受けない、実施形態1~21のいずれか一つに記載の免疫細胞。
25.実施形態1~24のいずれか一つに記載の有効量の免疫細胞と、医薬的に許容される賦形剤とを含む、医薬組成物。
26.第1のベクター及び第2のベクターを免疫細胞に導入することを含む、実施形態1~24のいずれか一つに記載の免疫細胞を調製する方法。
27.第1のベクター、第2のベクター、又は第1のベクター及び第2のベクターの両方が免疫細胞に形質導入される、実施形態26に記載の方法。
28.第1のベクターはウイルスベクターであり、第2のベクターはウイルスベクターであり、又は第1のベクターと第2のベクターの両方がウイルスベクターである、実施形態27に記載の方法。
29.遺伝子編集システムを用いて、第1のベクター及び/又は第2のベクターを免疫細胞に導入する、実施形態26に記載の方法。
30.遺伝子編集システムは、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、及びメガヌクレアーゼシステムからなる群より選択される、実施形態29に記載の方法。
31.第1のベクター及び/又は第2のベクターは、免疫細胞のゲノムに組み込まれる、実施形態29又は実施形態30に記載の方法。
32.第1のベクター及び/又は第2のベクターは、ゲノムのTRAC遺伝子座に組み込まれる、実施形態31に記載の方法。
33.ベクターを免疫細胞に導入することを含む、実施形態2~24のいずれか一つに記載の免疫細胞を調製する方法。
34.ベクターは免疫細胞に形質導入される、実施形態33に記載の方法。
35.ベクターはウイルスベクターである、実施形態33又は実施形態34に記載の方法。
36.遺伝子編集システムを用いて、ベクターを免疫細胞に導入する、実施形態33に記載の方法。
37.遺伝子編集システムは、CRISPR/Cas9システム、CRISPR/Cpf1システム、ジンクフィンガーヌクレアーゼシステム、TALENシステム、及びメガヌクレアーゼシステムからなる群より選択される、実施形態36に記載の方法。
38.ベクターは、免疫細胞のゲノムに組み込まれる、実施形態36又は実施形態37に記載の方法。
39.ベクターは、ゲノムのTRAC遺伝子座に組み込まれる、実施形態38に記載の方法。
40.実施形態1~24のいずれか一つに記載の免疫細胞を被験体に投与することを含む、疾患又は症状を治療する方法。
41.癌を有する被験体を治療する方法であって、
実施形態1~24のいずれか一つに記載の治療有効量の免疫細胞を、それを必要とする被験体に投与することを含み、それによって、免疫細胞は、被験体における癌細胞の死滅を誘導する、方法。
42.T細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、T細胞枯渇を低減する方法。
43.NK細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、NK細胞枯渇を低減する方法。
44.T細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、T細胞分化を低減する方法。
45.NK細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、NK細胞分化を低減する方法。
46.T細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、T細胞の生存を増加させる方法。
47.NK細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、NK細胞の生存を増加させる方法。
48.免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、免疫細胞の増殖を増加させる方法。
49.免疫細胞のエフェクター/記憶分化の調節を改善する方法であって、免疫細胞をオートファジーモジュレーター及び/又はオートファジーモジュレーターをコードするヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、方法。
50.免疫細胞のミトコンドリア機能を改善する方法であって、免疫細胞をオートファジーモジュレーター、オートファジーモジュレーターをコードし、及び/又はオートファジー代謝を増加させる(例えば、オートファジー異化作用を促進し、及び/又はオートファジー関連の同化過程を可能にする小分子又は大分子などの外因性モジュレーターを介して)ヌクレオチド配列を含むベクターと接触させることを含む、方法。
51.オートファジーモジュレーターは、ATG1、ATG2、ATG3、ATG4、ATG5、ATG6、ATG7、ATG8、ATG8、ATG10、ATG11、ATG12、ATG13、ATG14、ATG15、ATG16、ATG17、ATG18、ATG19、ATG20、ATG21、ATG22、ATG23、ATG24、ATG25、ATG26、ATG27、ATG28、ATG29、ATG30、ATG31、ATG101、LC3、RAB7、VPS15、VPS34、VPS35、LC3I、LC3II、UVRAG、Beclin1、Protor、CAMKKbeta、BCL2、BCL-XL、AKT、ULK1、ULK2、ULK3、ULK4、DapK1、FIP200、TSC1、TSC2、STRAD、AMPK、Redd1、LKB、MO25、PTEN、mTOR、Deptor、Rictor、Protor、PRAS40、LST8、Rheb、RAG A、RAG B、RAG C、RAG D、Raptor、PDK1、PI3K、IRS1、インスリン/IGF1受容体、ERK、Rab40b、p53, DRAM1、NDFIP、MEK、RAF、SIN1、MAP4K3、Plac8、ドミナントネガティブ(DN)Rab7、Rab7、ドミナントアクティブ(DA)Rab7、SLC7A5、又はSLC3A2である、実施形態42~50のいずれか一つに記載の方法。
52.オートファジーモジュレーターはATG5である、実施形態42~51のいずれか一つに記載の方法。
53.ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD(配列番号:1)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態52に記載の方法。
54.ATG5は、MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD(配列番号:2)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態52に記載の方法。
55.オートファジーモジュレーターはATG7である、実施形態42~51のいずれか一つに記載の方法。
56.ATG7は、MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI(配列番号:3)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態55に記載の方法。
57.ATG7は、MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV(配列番号:4)の配列と少なくとも95%の同一性を有するアミノ酸配列を含む、実施形態55に記載の方法。
58.ベクターはレンチウイルスベクターである、実施形態42~57のいずれか一つに記載の方法。
【実施例】
【0171】
本明細書に開示された実施形態の一部を更に説明するために、以下の実施例を提供する。実施例は、開示された実施形態を限定するものではなく、例示することを意図している。
【0172】
実施例1:BCMA-CAR T細胞におけるATG5及びATG7の構築及び発現
材料及び方法
15cmの293-T細胞からレンチウイルスを以下のように調製した。簡単に説明すると、-1日目に1100万個の293T細胞を、コラーゲンコーティングした15cmの皿に播種した。0日目に、EndoFectin Lenti(Genecopoeia)を使用して、(i)5.75μgのレンチウイルス発現プラスミド(BCMA-CAR、ATG5-IRES-mcherry又はATG7-IRES-GFPをコードする配列を含むベクター)、及び(ii)450μLのOpti-MEM(登録商標)I(Invitrogen)中の11.5μL(0.5μg/μL)のLenti-Pac HIV mix(Genecopoeia)、をトランスフェクトした。16時間後、培地を変更した。培地を変更した後、2日目及び3日目にウイルス上清を回収した。ウイルスをLenti-X濃縮器(3:1体積比、Clonetech、Cat#:63-123-1)で濃縮した。
【0173】
レンチウイルス粒子を、以下のようにSupT1細胞での限界希釈によって力価測定した。ウイルスを1:3から1:1:6561に希釈した。50μLの希釈レンチウイルスを、96ウェルプレート(100μL/ウェル)で培養したSUPT1細胞(2e4)に添加した。細胞を3日間培養した。次に、サンプルを回収し、FACS分析のために回収した。各ベクターのサンプル希釈率対サンプル力価のグラフを作成し、以下のように分析した。希釈率が増加し、陽性細胞の割合が20%を下回ると、曲線は0の傾き(即ち、水平線)に近づくはずである。各希釈率での各ベクターについて、力価を次の式に従って計算した:力価(TU/mL)=(%陽性/100)x2E4x20x希釈率。(陽性SupT1細胞の割合が20%未満である第1の希釈率を選択し、次に%陽性細胞を計算した。)
【0174】
ATG5又はATG7の異所性発現を伴うBCMA-CART細胞を以下のように生成した。T細胞を解凍し、次にTexMACS培地(Miltenyi)中に1e6/mLで再懸濁した。TransACTを、1e6細胞/mL(TransACTの1:17.5希釈率)で57.14μL TransACT/mL細胞の濃度で添加した。次に、2mL/ウェルを12ウェルプレートに平板培養し、又は0.2mL/ウェルを96ウェルプレートに平板培養し、次いで37℃でインキュベートした。1日後、異なる量の1つのウイルス(ATG5、MOI=5)を1つのT細胞集団に添加し、異なる量の他のウイルス(ATG7、MOI=5)を第2のT細胞集団に添加し、培養物を穏やかに混合し、細胞を2500rpmで30℃で2時間遠心分離した。第3のT細胞集団は、ATG5又はATG7のいずれかでトランスフェクトしなかった。細胞をもう1日インキュベーターに入れ、次に異なる量の、BCMA-CARをコードする別のウイルス(MOI=5)を3つのT細胞集団すべてに添加した。培養物を穏やかに混合し、次に2500rpmで30℃で2時間遠心分離した。細胞を更に8日間培養した。
【0175】
レンチウイルス形質導入効率を以下のように測定した。BCMA CARレンチウイルス形質導入効率を分析するために、細胞を染色緩衝液で2回洗浄した。次に、細胞ペレットを100μLの染色緩衝液で再懸濁した。2μLのFc block(BD Bioscience)、BCMA-Fc-ビオチン(1.25uL/各、AcroBiosystems)及びNear-IR Live/dead mix(Invitrogen)をウェルに添加し、次いで暗所で4℃で30分間インキュベートした。細胞を2回洗浄した後、ストレプトアビジン-APC(1:500)と共に暗所で4℃で30分間インキュベートした。細胞をFACS Fortessa(BD)上で取得した。プレゼンテーション用のデータ処理を、Flow Jo(Treestar Inc.)プログラムを用いて行った。APC+、GFP+、及びmCherry+の集団は、それぞれBCMA CAR、ATG7、及びATG5で形質導入された細胞を表す。
【0176】
T細胞におけるDNAレベルでのATG5及びATG7の過剰発現の効率を調べるために、定量的逆転写ポリメラーゼ連鎖反応(qRT-PCR)を行った。RNeasy Micro Kit(Qiagen)を用いてRNAを抽出した。次に、RT PCR用のSuperscript IIIファーストストランド合成システム(Invitrogen)を用いて、mRNAを一本鎖相補的DNA(cDNA)に逆転写した。Applied Biosystemsサーマルサイクラーを用いてリアルタイムPCRを行った。SYBRベースのプロトコルを用いて遺伝子発現を検出した(Applied Biosystems SYBR Green PCR Master Mix)。PCR反応を96ウェルプレート中で行い、メーカーの推奨サイクルパラメータを用いて3連で実行した(95°Cで3分間、続いて95°Cで15秒間、60°Cで30秒間を40サイクル)。目的の遺伝子のサイクル閾値(Ct)値を18sのCtに標準化した。18sは、試験したサンプル間の相対的遺伝子発現を定量するための内部対照として役立つ。qRT-PCRに用いたプライマーは、18s(フォワードプライマー:GGCCCTGTAATTGGAATGAGTC、リバースプライマー:CAAGATCCAACTACGAGCTT)であり、ATG5及びATG7プライマーはGenecopoeiaから入手した。
【0177】
サイトカイン産生アッセイを以下のように実施した。エフェクター細胞(CAR T細胞)を、エフェクターで異なる標的細胞と共培養した。標的細胞比は1:5及び1:1である。16時間後に細胞を回収した。培養の最後の5時間でGolgi stopを添加した。細胞を回収し、IFN-γ及びTNF-αの発現について染色した。
【0178】
T細胞増殖アッセイを以下のように実施した。BCMA発現標的細胞に応答したCAR T細胞増殖を評価した。標的細胞株は、BCMA陽性多発性骨髄腫細胞株及びNCI-H929-lucであった。CAR T細胞をCellometerで計数した。標的細胞をcell trace violet(10μM、Invitrogen)で染色し、50,000radで照射した後、7日ごとに1:1及び5:1の比率でCAR-T細胞と共培養した。陰性対照として、培地のみをCAR-T細胞に添加した。7日目に、培養細胞をCD8-percp/cy5.5及びNear-IR Live/Deadで20分間染色し、フローサイトメトリーで測定した。CAR発現を、(i)ビオチン化-BCMA-Fc及び(ii)ストレプトアビジン-APCのそれぞれを氷上で20分間、2段階インキュベートすることによって測定した。フローサイトメトリーデータを、BD Fortessaを用いて取得し、FlowJoソフトウェアによって分析した。
【0179】
結果
BCMA CAR-T細胞におけるATG5及びATG7の過剰発現を、以下のように検証した。ATG5及びATG7のそれぞれを発現させるBMCA CAR-T細胞を上記の方法に従って調製した。ATG5を発現させるT細胞はmCherryマーカーも発現させたが、ATG7を発現させるT細胞はGFPも発現させた。スクランブルベクターを発現させるBMCA CAR-T細胞も対照として調製した。レンチウイルス形質導入効率を上記のように測定した。データを
図1に示す。
【0180】
データは、ATG5 ORFに感染したBCMA CAR-T細胞がmCherryを発現させ、ATG7 ORFに感染したBCMA CAR-T細胞がGFPを発現させることを示す。GFP及びmCherryの発現を、レンチウイルス感染後6日目にFACSによって測定した。観察されたmCherry及びGFPの発現によれば、T細胞の80%超がATG5又はATG7で形質導入された。
【0181】
ATG5-及びATG7-レンチウイルスに感染したT細胞におけるATG5及びATG7のmRNA発現レベルを測定するために、qRT-PCR実験を実施した。データを
図2に示す。スクランブルベクター(「Mock」)と比較して、ATG5遺伝子発現の約8倍の増加及びATG7遺伝子発現の約14倍の増加があった。このデータは、レンチウイルスがATG5及びATG7のmRNAレベルを増加させることができたことを示す。
【0182】
ATG5又はATG7の異所性発現は、反復刺激時にCAR-T細胞の拡大を増加させる。ドナーBCMA-CAR細胞の増殖を、BCMA発現H929細胞による反復刺激に応答して測定した。Pan-T細胞を、BCMA-CARのみ、BCMA-CAR+ATG5、又はBCMA-CAR+ATG7のいずれかで形質導入した。細胞を7日ごとにH929細胞(エフェクター:標的比1:5)で刺激した。1mLあたりの総細胞数をBeckman Coulter Vi-Cellによって計数した。CAR-T細胞数を、総細胞数にフローサイトメトリーで分析したCARの割合を掛けることによって計算した。データを
図3に示しており、矢印は、刺激が発生した各日を示す。このデータは、ATG5又はATG7の異所性発現が、反復腫瘍抗原刺激時にBCMA CAR-Tの拡大を促進する可能性があることを示す。矢印は各刺激を示す。ここでは、技術的3連反復の代表的な実験を示す。P値を両側スチューデントt検定を用いて決定した。
*P<0.05、
**P<0.01、及び
***P<0.001である。
【0183】
ATG5又はATG7の異所性発現は、抗原刺激がない場合、BCMA CAR-Tの拡大を増加させない。BCMA CAR-T細胞(ATG5又はATG7で形質導入)を、IL-2の存在下で、又はBCMA発現H929細胞による刺激時に培養した。CAR-T細胞数を計数し、データを
図4に示した。非特異的細胞拡大の対照として、非形質導入T細胞(Mock)を含めた。
図4に示すように、ATG5又はATG7の過剰発現は、腫瘍Ag駆動T増殖を増強するが、サイトカイン誘導増殖を増強しない。
【0184】
ATG5及びATG7の異所性発現はCAR T細胞の細胞傷害性活性を損なわない。BCMA-CAR細胞(ATG5又はATG7で形質導入)の細胞傷害性能力を、ルシフェラーゼ発現H929細胞との一晩の共培養後に測定した(技術的2連反復を伴う1つの代表的な実験)。非形質導入T細胞(Mock)、及びATG 5-及びATG 7-形質導入T細胞を、非特異的溶解を制御するための追加グループとして含めた。データを
図5に示しており、それは、ATG5又はATG7の過剰発現がCAR T細胞の傷害性能力に影響しないことを示す。
【0185】
ATG5又はATG7の異所性発現がIFN-γ-及びTNF-α産生CAR-T細胞に及ぼす影響を以下のようにアッセイした。多発性骨髄腫患者由来のBCMA-CAR細胞をBCMA陽性細胞(H929、E:T=1:5)と16時間共培養した。BCMA-CAR細胞のサイトカイン産生を測定した(3~4回の技術的3連反復の1つの代表的な実験からのデータを示す)。データを
図6に示しており、代表的なフローサイトメトリープロットはIFN-γ及びTNF-αの発現を示す。棒グラフはIFN-γ
+、TNF-α
+及びIFN-γ
+TNF-α
+細胞の割合を示した。ゲートされた集団の微細な頻度。データは、ATG5及びATG7の過剰発現が、エフェクターサイトカインIFN-γ及びTNF-αのCAR T細胞産生を有意に増加させる可能性があることを示す。
*P<0.05、
**P<0.01、及び
***P<0.001である。
【0186】
BCMA-CAR細胞におけるATG5及びATG7の異所性発現は、初期活性化中にCAR-T細胞の分化に有意な影響を与えなかった。このデータを
図7に示しており、フローサイトメトリープロットは、BCMA-CAR細胞、ATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞、及びATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞のそれぞれにおけるCD45RO、CCR7、及びCD27の発現を示す。Pan-T細胞をIL-2の存在下でCD3/CD28 Abで刺激し、続いてBCMA-CAR及びATG5又はATG7のレンチウイルス形質導入を行い、刺激後10日目に分析した。データは、ATG5及びATG7の過剰発現が、初期活性化中にCAR-T分化に有意な影響を与えないことを示す。
【0187】
また、BCMA-CAR細胞におけるATG5及びATG7の異所性発現は、長期間持続する低分化CAR-T細胞の生成を促進することが示された。このデータを
図8に示しており、代表的なグラフは、CD45RO
-CCR7
+(ナイーブ様)、CD45RO
+CCR7
+(Tcm)、CD45RO
+CCR7
-(Te)及びCD27発現細胞の画分におけるATG5及びATG7の発現を示す。細胞をBCMA発現H929細胞で0、7、14及び21日目に刺激した。この反復刺激は、CAR-T細胞のエフェクターT細胞への分化を誘導し、CD27の発現を減少させた。しかし、ATG5を発現させるCAR-T細胞は、ナイーブ様表現型を有していた。この表現型は、BCMA-CARのみを発現させるT細胞とは異なり、その表現型はエフェクター/エフェクターメモリー細胞によって支配されていた。更に、CD27の発現は、ATG5及びATG7のいずれかでBCMA-CARを発現させる細胞において有意に増加した。このデータは、ATG5又はATG7の異所性発現が、長期間持続する低分化CAR-T細胞の生成を促進する可能性があることを示した。
*P<0.05、
**P<0.01、及び
***P<0.001である。
【0188】
ATG5及びATG7の異所性発現は、グランザイムB(GZMB)及びパーフォリン(PRF)の発現によって測定されたCAR T細胞の細胞傷害性活性を損なわない。
図9は、BCMA-CAR細胞、ATG5を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞、及びATG7を異所的に発現させるBCMA-CAR細胞のそれぞれにおけるこれらの細胞傷害性分子のそれぞれの発現を示す。データは、ATG5及びATG7の過剰発現がGZMB又はPRFのCAR-T細胞産生を損なわなかったこと、及びATG5又はATG7の過剰発現がCAR T細胞傷害性能力に影響を与えないことを示す(
図5も参照)。
【0189】
ATG5は細胞のミトコンドリア機能を改善することができる。
図10は、Jurkat細胞(ATG5で又はATG5なしで形質導入)の代表的な酸素消費速度(OCR)を示す。薬剤の添加前に(基礎OCR)及び指定された薬剤の添加後にOCRを測定した。ATG5を過剰発現させる細胞におけるミトコンドリアストレス試験のすべての段階でのOCRの増加に基づいて、ATG5の過剰発現は細胞ミトコンドリア機能を有意に増強した。
*P<0.05、
**P<0.01、及び
***P<0.001である。
【0190】
本明細書で引用されたすべての特許、公開された出願及び参考文献の教示は、それらの全体が参照により組み込まれる。
【0191】
例示的な実施形態を具体的に示し、説明してきたが、添付の特許請求の範囲に包含される実施形態の範囲から逸脱することなく、形態及び詳細の様々な変更がをその中で行うことができることが当業者によって理解されるであろう。
【0192】
配列表
配列番号:1-ヒトATG5配列
TDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDISEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAIEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPAEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLKEVCPSAIDPEDGEKKNQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIIPQPTD
【0193】
配列番号:2-マウスATG5配列
MTDDKDVLRDVWFGRIPTCFTLYQDEITEREAEPYYLLLPRVSYLTLVTDKVKKHFQKVMRQEDVSEIWFEYEGTPLKWHYPIGLLFDLLASSSALPWNITVHFKSFPEKDLLHCPSKDAVEAHFMSCMKEADALKHKSQVINEMQKKDHKQLWMGLQNDRFDQFWAINRKLMEYPPEENGFRYIPFRIYQTTTERPFIQKLFRPVAADGQLHTLGDLLREVCPSAVAPEDGEKRSQVMIHGIEPMLETPLQWLSEHLSYPDNFLHISIVPQPTD
【0194】
配列番号:3-ヒトATG7配列
MAAATGDPGLSKLQFAPFSSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPARLTLEFSAFDMSAPTPARCCPAIGTLYNTNTLESFKTADKKLLLEQAANEIWESIKSGTALENPVLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCYPALCLPESLPLIQGPVGLDQRFSLKQIEALECAYDNLCQTEGVTALPYFLIKYDENMVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITIGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSSSFQSVEVVCFRDRTMQGARDVAHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSECMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHITFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAADRLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSSVTLEQARRDVEQLEQLIESHDVVFLLMDTRESRWLPAVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPNHPVASADLLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSSKVLDQYEREGFNFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDDETI
【0195】
配列番号:4-マウスATG7配列
MGDPGLAKLQFAPFNSALDVGFWHELTQKKLNEYRLDEAPKDIKGYYYNGDSAGLPTRLTLEFSAFDMSASTPAHCCPAMGTLHNTNTLEAFKTADKKLLLEQSANEIWEAIKSGAALENPMLLNKFLLLTFADLKKYHFYYWFCCPALCLPESIPLIRGPVSLDQRLSPKQIQALEHAYDDLCRAEGVTALPYFLFKYDDDTVLVSLLKHYSDFFQGQRTKITVGVYDPCNLAQYPGWPLRNFLVLAAHRWSGSFQSVEVLCFRDRTMQGARDVTHSIIFEVKLPEMAFSPDCPKAVGWEKNQKGGMGPRMVNLSGCMDPKRLAESSVDLNLKLMCWRLVPTLDLDKVVSVKCLLLGAGTLGCNVARTLMGWGVRHVTFVDNAKISYSNPVRQPLYEFEDCLGGGKPKALAAAERLQKIFPGVNARGFNMSIPMPGHPVNFSDVTMEQARRDVEQLEQLIDNHDVIFLLMDTRESRWLPTVIAASKRKLVINAALGFDTFVVMRHGLKKPKQQGAGDLCPSHLVAPADLGSSLFANIPGYKLGCYFCNDVVAPGDSTRDRTLDQQCTVSRPGLAVIAGALAVELMVSVLQHPEGGYAIASSSDDRMNEPPTSLGLVPHQIRGFLSRFDNVLPVSLAFDKCTACSPKVLDQYEREGFTFLAKVFNSSHSFLEDLTGLTLLHQETQAAEIWDMSDEETV
【0196】
配列番号:5-ヒトATG5配列(cDNA)
GTCTGGACTTGTGGTGCGCTGCCAGGGATCCGCAGCGTTGCCGGTTGTATTCGCTGGATACCAGAGGGCGGAAGTGCAGCAGGGTTCAGCTCCGACCTCCGCGCCGGTGCTTTTTGCGGCTGCGCGGGCTTCCTGGAGTCCTGCTACCGCGTCCCCGCAGGACAGTGTGTCAGGCGGGCAGCTTGCCCCGCCGCCCCACCGGAGCGCGGAATCTGGGCGTCCCCACCAGTGCGGGGAGCCGGAAGGAGGAGCCATAGCTTGGAGTAGGTTTGGCTTTGGTTGAAATAAGAATTTAGCCTGTATGTACTGCTTTAACTCCTGGAAGAATGACAGATGACAAAGATGTGCTTCGAGATGTGTGGTTTGGACGAATTCCAACTTGTTTCACGCTATATCAGGATGAGATAACTGAAAGGGAAGCAGAACCATACTATTTGCTTTTGCCAAGAGTAAGTTATTTGACGTTGGTAACTGACAAAGTGAAAAAGCACTTTCAGAAGGTTATGAGACAAGAAGACATTAGTGAGATATGGTTTGAATATGAAGGCACACCACTGAAATGGCATTATCCAATTGGTTTGCTATTTGATCTTCTTGCATCAAGTTCAGCTCTTCCTTGGAACATCACAGTACATTTTAAGAGTTTTCCAGAAAAAGACCTTCTGCACTGTCCATCTAAGGATGCAATTGAAGCTCATTTTATGTCATGTATGAAAGAAGCTGATGCTTTAAAACATAAAAGTCAAGTAATCAATGAAATGCAGAAAAAAGATCACAAGCAACTCTGGATGGGATTGCAAAATGACAGATTTGACCAGTTTTGGGCCATCAATCGGAAACTCATGGAATATCCTGCAGAAGAAAATGGATTTCGTTATATCCCCTTTAGAATATATCAGACAACGACTGAAAGACCTTTCATTCAGAAGCTGTTTCGTCCTGTGGCTGCAGATGGACAGTTGCACACACTAGGAGATCTCCTCAAAGAAGTTTGTCCTTC
【0197】
配列番号:6-マウスATG5配列(cDNA)
ATGACAGATGACAAAGATGTGCTTCGAGATGTGTGGTTTGGACGAATTCCAACTTGCTTTACTCTCTATCAGGATGAGATAACTGAAAGAGAAGCAGAACCATACTATTTGCTTTTGCCAAGAGTCAGCTATTTGACGTTGGTAACTGACAAAGTGAAAAAGCACTTTCAGAAGGTTATGAGACAAGAAGATGTTAGTGAGATATGGTTTGAATATGAAGGCACACCCCTGAAATGGCATTATCCAATTGGTTTACTATTTGATCTTCTTGCATCAAGTTCAGCTCTTCCTTGGAACATCACAGTACATTTCAAGAGTTTTCCAGAAAAGGACCTTCTACACTGTCCATCCAAGGATGCGGTTGAGGCTCACTTTATGTCGTGTATGAAAGAAGCTGATGCTTTAAAGCATAAAAGTCAAGTGATCAACGAAATGCAGAAAAAAGACCACAAGCAGCTCTGGATGGGACTGCAGAATGACAGATTTGACCAGTTTTGGGCCATCAACCGGAAACTCATGGAATATCCTCCAGAAGAAAATGGATTTCGTTATATCCCCTTTAGAATATATCAGACCACGACGGAGCGGCCTTTCATCCAGAAGCTGTTCCGGCCTGTGGCCGCAGATGGACAGCTGCACACACTTGGAGATCTCCTCAGAGAAGTCTGTCCTTCCGCAGTCGCCCCTGAAGATGGAGAGAAGAGGAGCCAGGTGATGATTCACGGGATAGAGCCAATGCTGGAAACCCCTCTGCAGTGGCTGAGCGAGCATCTGAGCTACCCAGATAACTTTCTTCATATTAGCATTGTCCCCCAGCCAACAGATTGA
【0198】
配列番号:7-ヒトATG7配列(cDNA)
GGAAGTTGAGCGGCGGCAAGAAATAATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGGGTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTTATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCTCCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGCAGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAAACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTTTGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTCACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTTACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGTCAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAATTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTACCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCAGATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGAATGTATGGACCCT
【0199】
配列番号:8-マウスATG7配列(cDNA)
ATGGGGGACCCTGGACTGGCCAAGTTGCAGTTCGCCCCCTTTAATAGTGCCCTGGACGTTGGCCTCTGGCACGAACTGACCCAGAAGAAGTTGAACGAGTACCGCCTGGACGAGGCACCCAAAGACATCAAGGGCTATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGTCTGCCCACCCGCTTGACGTTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCCTCCACGCCTGCCCACTGCTGCCCGGCCATGGGAACCCTGCACAACACCAACACACTTGAGGCTTTTAAGACAGCAGACAAGAAGCTCCTTCTGGAGCAGTCAGCAAATGAGATCTGGGAAGCCATAAAGTCAGGTGCTGCTCTCGAAAACCCCATGCTCCTCAACAAGTTTCTGCTCCTGACCTTCGCGGACCTAAAGAAGTACCACTTCTACTACTGGTTTTGCTGCCCCGCCCTCTGTCTTCCTGAGAGCATCCCTCTAATCCGGGGACCTGTGAGCTTGGATCAAAGGCTTTCACCAAAACAGATCCAGGCCCTGGAGCATGCCTATGATGATCTGTGTCGAGCCGAAGGCGTCACGGCCCTGCCCTACTTCTTATTCAAGTACGATGACGACACTGTTCTGGTCTCCTTGCTCAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGTCAAAGGACAAAGATAACAGTTGGTGTGTACGATCCCTGTAACCTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAATTTTTTGGTCCTGGCAGCCCACAGATGGAGCGGCAGTTTCCAGTCCGTTGAAGTCCTCTGCTTTCGGGACCGCACCATGCAGGGAGCTAGAGACGTGACACATAGCATCATCTTTGAAGTGAAACTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCAGATTGTCCTAAAGCTGTTGGCTGGGAGAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGTCCGAGGATGGTGAACCTCAGTGGATGTATGGACCCCAAAAGGCTGGCTGAGTCATCTGTGGATCTGAATCTCA
【配列表】
【国際調査報告】