特表 2022-547330 自閉症スペクトラム障害を治療するための組成物および方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2022-11-11

(54)【発明の名称】自閉症スペクトラム障害を治療するための組成物および方法

(51)【国際特許分類】

   A61K 35/747 20150101AFI20221104BHJP

   A61P 25/00 20060101ALI20221104BHJP

   A61K 35/741 20150101ALI20221104BHJP

【ＦＩ】

A61K35/747

A61P25/00

A61K35/741

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2022516131

(86)(22)【出願日】2020-09-11

(85)【翻訳文提出日】2022-05-10

(86)【国際出願番号】 US2020050525

(87)【国際公開番号】W WO2021050965

(87)【国際公開日】2021-03-18

(31)【優先権主張番号】62/899,874

(32)【優先日】2019-09-13

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(31)【優先権主張番号】62/950,805

(32)【優先日】2019-12-19

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】517396180

【氏名又は名称】フィンチ セラピューティクス ホールディングス エルエルシー

(74)【代理人】

【識別番号】100108453

【弁理士】

【氏名又は名称】村山 靖彦

(74)【代理人】

【識別番号】100110364

【弁理士】

【氏名又は名称】実広 信哉

(74)【代理人】

【識別番号】100133400

【弁理士】

【氏名又は名称】阿部 達彦

(72)【発明者】

【氏名】マーク・スミス

(72)【発明者】

【氏名】クリストファー・ウェイデンメイヤー

【テーマコード（参考）】

4C087

【Ｆターム（参考）】

4C087AA01

4C087AA02

4C087AA03

4C087BC56

4C087CA09

4C087MA01

4C087NA10

4C087ZA02

(57)【要約】

本開示は、自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）を治療するための組成物および方法に関する。本明細書において、ヒトドナーの糞便に由来する非培養糞便細菌調製物、ならびに細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型（例えば、ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株）のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または少なくとも三つすべて、を含む医薬組成物および製剤、ならびに当該組成物を用いてＡＳＤ患者を治療する方法を提供する。さらにＬ．ロイテリを含む医薬組成物の製造方法も提供される。

【特許請求の範囲】

【請求項1】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含む、医薬組成物。

【請求項2】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ある種のラクトバチルスを含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記非培養糞便細菌調製物は、前記ラクトバチルス属の種を含まない、医薬組成物。

【請求項3】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記細菌混合物中の前記細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である、医薬組成物。

【請求項4】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記細菌混合物中の前記細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、前記非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い、医薬組成物。

【請求項5】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記細菌単離株は、ある種の構成員であり、前記細菌単離株は、前記細菌混合物中の前記種の唯一の構成員である、医薬組成物。

【請求項6】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記非培養糞便細菌の調製物は、前記細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まない、医薬組成物。

【請求項7】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記細菌単離株は、前記組成物を投与された対象の回腸に生着する、医薬組成物。

【請求項8】

その必要のある対象において、自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法であって、請求項１～７のいずれか一項に記載の医薬組成物を前記対象に投与することを含む、方法。

【請求項9】

その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法であって、前記対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団を含む医薬組成物であって、前記細菌集団は、培養されていない、医薬組成物、および（ｉｉ）ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株、を投与することを含む、方法。

【請求項10】

ヒトの腸にラクトバチルス・ロイテリを生着させる方法であって、前記ヒトに、（ｉ）非培養糞便細菌調製物、および（ｉｉ）Ｌ・ロイテリを含む細菌単離株、を含む医薬組成物を投与することを含み、前記組成物を投与された後の前記ヒトの腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量は、前記組成物を投与される前の前記腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量よりも多い、方法。

【請求項11】

健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団を抽出すること、および前記細菌集団と、ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株とを混合すること、を含み、前記細菌集団は、培養されない、方法。

【請求項12】

ドナーの糞便微生物叢中のラクトバチルスの少なくとも一つの構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、
前記ドナーの糞便から、細菌集団を抽出することであって、前記細菌集団は、ラクトバチルスの前記少なくとも一つの構成員を含む、抽出すること、
前記細菌集団を、医薬組成物に組み込むことであって、前記細菌集団は、培養されない、組み込むこと、を含む方法。

【請求項13】

医薬組成物を製造する方法であって、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団を抽出すること、および前記抽出された細菌集団を前記医薬組成物に組み込むこと、を含み、前記細菌集団は、前記健康なヒトドナーによって摂取されたプロバイオティクスに由来する細菌株を含む、方法。

【請求項14】

健康なヒトドナーの細菌集団を含む医薬組成物を製造する方法であって、
前記ドナーによる細菌株を含むプロバイオティクスの摂取の後に、前記ドナーから糞便を受け取ること、
前記糞便から、前記細菌集団を抽出することであって、前記細菌集団は、前記細菌株を含む、抽出すること、
前記細菌集団を、前記医薬組成物に組み込むことであって、前記細菌集団は培養されない、組み込むこと、を含み、
前記ドナーによる前記プロバイオティクスの摂取の前に、前記ドナーの糞便は、前記細菌株を含まない、方法。

【請求項15】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ラクトバチルス種の非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、前記細菌混合物中の前記ラクトバチルス種の生細胞の相対的存在量は、前記糞便の糞便細菌中の前記ラクトバチルス種の生細胞の相対的存在量よりも多い、医薬組成物。

【請求項16】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、前記混合物中の非病原性微生物型のうちの前記少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である、医薬組成物。

【請求項17】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、前記混合物中の非病原性微生物型のうちの前記少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての生細胞の相対的存在量は、前記非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い、医薬組成物。

【請求項18】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、前記細菌単離株は、第一の種の構成員であり、前記細菌単離株は、前記混合物中の前記第一の種の唯一の構成員であり、前記真菌単離株は、第二の種の構成員であり、前記真菌単離株は、前記混合物中の前記第二の種の唯一の構成員であり、前記古細菌単離株は、第三の種の構成員であり、前記古細菌単離株は、前記混合物中の前記第三の種の唯一の構成員である、医薬組成物。

【請求項19】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便微生物の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、前記非培養糞便微生物の調製物は、前記細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まず、前記非培養糞便微生物の調製物は、前記真菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する真菌株を含まず、前記非培養糞便微生物の調製物は、前記古細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する古細菌株を含まない、医薬組成物。

【請求項20】

（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物であって、非病原性微生物型のうちの前記少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてが、前記組成物を投与された対象の回腸に生着する、医薬組成物。

【請求項21】

その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療するための方法であって、前記対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団を含む医薬組成物であって、前記細菌集団は、培養されていない、医薬組成物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を投与することを含む、方法。

【請求項22】

健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団を抽出すること、ならびに前記細菌集団と、（ｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、とを混合すること、を含み、前記細菌集団は、培養されない、方法。

【請求項23】

ドナーの糞便微生物叢中の少なくとも一つの構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、前記ドナーの糞便から、微生物集団を抽出することであって、前記微生物集団は、前記少なくとも一つの構成員を含む、抽出すること、および前記微生物集団を医薬組成物へと組み込むこと、を含み、前記微生物集団は、培養されず、前記少なくとも一つの構成員は、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含む、方法。

【請求項24】

医薬組成物を製造する方法であって、健康なヒトドナーの糞便から、微生物集団を抽出すること、および前記抽出された微生物集団を前記医薬組成物へと組み込むこと、を含み、前記微生物集団は、前記健康なヒトドナーにより摂取されたプロバイオティクスに由来する少なくとも一つの構成員を含み、前記少なくとも一つの構成員は、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含む、方法。

【請求項25】

健康なヒトドナーの微生物集団を含む医薬組成物を製造する方法であって、前記ドナーが、細菌単離株、真菌単離株または古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含むプロバイオティクスを摂取した後に、前記ドナーから糞便を受け取ること、前記糞便から、前記微生物集団を抽出することであって、前記微生物集団は、非病原性微生物型のうちの前記少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含む、抽出すること、前記微生物集団を、前記医薬組成物に組み込むこと、を含み、前記微生物集団は、培養されず、前記ドナーが前記プロバイオティクスを摂取する前に、前記ドナーの糞便は、非病原性微生物型のうちの前記少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての微生物を含まない、方法。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

関連出願の相互参照
本出願は、２０１９年１２月１９日に出願された米国仮特許出願第６２／９５０，８０５号明細書、および２０１９年９月１３日に出願された米国仮特許出願第６２／８９９，８７４号明細書の利益を主張するものであり、それら出願は参照によりその全体で本明細書に組み込まれる。

【背景技術】

【0002】

自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ：Ａｕｔｉｓｍ ｓｐｅｃｔｒｕｍ ｄｉｓｏｒｄｅｒ）は、社会的な相互作用およびコミュニケーションの様々な異常、ならびに限局的な関心および反復性の行動を特徴とする複雑な神経発達異常疾患である。多くの場合、生後３年の間にＡＳＤは顕在化し、特徴的な症状または行動形質として現れる。現在のＡＳＤの診断には、以前には別個に診断されていたいくつかの状態：自閉性障害、特定不能の広汎性発達障害（ｐｅｒｖａｓｉｖｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｄｉｓｏｒｄｅｒ ｎｏｔ ｏｔｈｅｒｗｉｓｅ ｓｐｅｃｉｆｉｅｄ（ＰＤＤ－ＮＯＳ））、およびアスペルガー症候群が含まれる。現在、これらの状態はすべて米国精神医学会の精神疾患の診断および統計マニュアル第５版（ＤＳＭ－Ｖ）に明記される、自閉症スペクトラム障害の診断基準に包含される。

【0003】

これらの主要な診断基準内に見られる症状スペクトラムに加えて、ＡＳＤの患者は、知的障害、てんかん、ならびに不安および気分障害を含む広範な神経学的併存疾患、ならびに血液高セロトニン血症、免疫調節異常、およびＧＩ機能障害（例えば、慢性的な便秘、下痢、腹痛、および胃食道逆流）を含む非神経学的併存疾患を呈する。

【0004】

哺乳動物は、その消化管（ＧＩ）中に多様な微生物種を保有する。これらの微生物間の相互作用、および微生物と、例えば宿主免疫系などの宿主との間の相互作用によって、微生物叢が形成される。健康的な微生物叢は、広域な病原体に対して抵抗性のコロニー形成、必須栄養素の生合成と吸収、ならびに健康な腸上皮および適切に制御された全身免疫を維持する免疫刺激を含む、複数の利益を宿主にもたらす。アンバランスな微生物叢（「腸内毒素症」または破壊された共生関係ともいわれる）は、その機能を失い、病原体に対する脆弱性の増加、代謝プロファイルの変化、または局所的もしくは全身性の炎症または自己免疫がもたらされ得る炎症促進性シグナルの誘導が生じる場合がある。さらに、そのような破壊された微生物叢は、他の症状の中でも特に疼痛、下痢、ガス、および便秘を引き起こし得る、侵入病原体に感染する場合がある。ゆえに腸内微生物叢は、例えば腸の病原性感染症などの多くの障害の病因に重要な役割を果たしている。

【0005】

ヒト結腸内微生物叢を病気の患者の腸内へと移植または投与することは、糞便微生物叢移植（ＦＭＴ：Ｆｅｃａｌ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ Ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎ）と呼ばれており、糞便細菌製剤療法としても一般的に知られている。ＦＭＴは、腸に多様な微生物を再度生息させ、重大な病原体の増殖と生存に対して有害な生態環境を作り出すことによって、それら病原体を制御すると考えられている。ＦＭＴは、正常な組成と機能の腸微生物叢の迅速な再構成を可能にする治療プロトコルである。

【0006】

ＦＭＴを使用して、クロストリジウム・ディフィシレ感染（ＣＤＩ：Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｄｉｆｆｉｃｉｌｅ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ）の治療が行われている。ＦＭＴは、大腸菌やバンコマイシン耐性腸球菌（ＶＲＥ）などの他の腸管感染性病原体の治療にも提唱されている。ＦＭＴは、ホモジナイズされた糞便の形態、もしくは例えばクロストリジウムなどの培養糞便成分の形態のいずれかのヒト微生物叢の、結腸鏡、浣腸を通じた注入、または経鼻空腸チューブを介した注入を行って結腸に移植し、それにより例えばクロストリジウム・ディフィシレなどの病原性細菌を駆逐または根絶させることを伴う。糞便細菌製剤療法は、例えば、ＡＳＤ、パーキンソン病、および多発性硬化症、ならびに慢性疲労症候群などの神経学的要素を有する状態の治療にも成功している。

【先行技術文献】

【特許文献】

【0007】

【特許文献1】WO2018/218159

【特許文献2】WO2012/016287

【特許文献3】WO2013/053836

【発明の概要】

【発明が解決しようとする課題】

【0008】

少なくとも一部の事例では、例えばＡＳＤなどの状態を治療するように糞便細菌製剤療法が作用する正確なメカニズムは不明である。例えば、糞便細菌製剤療法中に患者に投与される典型的なドナー糞便微生物叢は、数百もの細菌株を含有する可能性があり、ＡＳＤの治療に必要な株の属性、ならびにそのように導入された株が互いに相互作用するメカニズム、および患者の内在性微生物叢の細菌と相互作用するメカニズムは、ほぼ不明である。さらに、（ｉ）様々なドナーサンプル全体での特定の細菌株の属性および相対的存在量における潜在的な変動、および（ｉｉ）特定の細菌株が、細菌製剤療法レシピエントの腸内に生着する程度における潜在的な変動は、障害に罹患する患者群全体、または障害に感受性のある患者群全体での糞便細菌製剤療法の有効性に関し、不確実性をもたらす可能性がある。

【課題を解決するための手段】

【0009】

一つの態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ラクトバチルス・ロイテリ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｒｅｕｔｅｒｉ）を含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供する。

【0010】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ある種のラクトバチルスを含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該非培養糞便細菌調製物は、ラクトバチルス属の種を含まない。

【0011】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である。

【0012】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い。

【0013】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該細菌単離株は、ある種の構成員であり、この場合において当該細菌単離株は、細菌混合物中の当該種の唯一の構成員である。

【0014】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該非培養糞便細菌の調製物は、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まない。

【0015】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該細菌単離株は、当該組成物を投与された対象の回腸に生着する。

【0016】

別の態様では、本開示は、その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法を提供するものであり、当該方法は、当該対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団または細菌群を含む医薬組成物であって、当該細菌集団または細菌群は、培養されていないもの、および（ｉｉ）ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株、を投与することを含む。

【0017】

別の態様では、本開示は、ヒトの腸にラクトバチルス・ロイテリを生着させるための方法を提供するものであり、当該方法は、当該ヒトに、（ｉ）非培養糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）Ｌ・ロイテリを含む細菌単離株、を含む医薬組成物を投与することを含み、当該組成物を投与された後のヒトの腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量は、当該組成物を投与される前の腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量よりも多い。

【0018】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団または細菌群を抽出すること、および当該細菌集団または細菌群と、ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株とを混合すること、を含む方法を提供するものであり、この場合において当該細菌集団または細菌群は、培養されない。

【0019】

さらに別の態様では、本開示は、ドナーの糞便微生物叢中のラクトバチルスの少なくとも一つの構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、当該ドナーの糞便から、細菌集団または細菌群を抽出することであって、当該細菌集団または細菌群は、ラクトバチルスの当該少なくとも一つの構成員を含むこと、および当該細菌集団または細菌群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団または細菌群は、培養されないこと、を含む方法を提供する。

【0020】

さらなる態様では、本開示は、医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団または細菌群を抽出すること、当該抽出された細菌集団または細菌群を当該医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団または細菌群は、当該健康なヒトドナーによって摂取されたプロバイオティクスに由来する細菌株を含むこと、を含む。

【0021】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの細菌集団または細菌群を含む医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、当該ドナーが、細菌株を含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、細菌集団または細菌群を抽出することであって、当該細菌集団または細菌群は、当該細菌株を含むこと、当該細菌集団または細菌群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団または細菌群は培養されず、および当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該細菌株を含まないこと、を含む。

【0022】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該混合物中の真菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である。

【0023】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該混合物中の真菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い。

【0024】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該真菌単離株は、ある種の構成員であり、この場合において当該真菌単離株は、混合物中の当該種の唯一の構成員である。

【0025】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便微生物の調製物、および（ｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該非培養糞便微生物の調製物は、当該真菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する真菌株を含まない。

【0026】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該真菌単離株は、当該組成物を投与された対象の回腸に生着する。

【0027】

別の態様では、本開示は、その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法を提供するものであり、当該方法は、当該対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団または細菌群を含む医薬組成物であって、当該細菌集団または細菌群は、培養されていないもの、および（ｉｉ）真菌単離株、を投与することを含む。

【0028】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団または細菌群を抽出すること、当該細菌集団または細菌群と、真菌単離株とを混合すること、を含む方法を提供するものであり、この場合において当該細菌集団または細菌群は、培養されない。

【0029】

さらに別の態様では、本開示は、ドナーの糞便微生物叢中の少なくとも一つの真菌の構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、当該ドナーの糞便から、微生物集団または微生物群を抽出することであって、当該微生物集団または微生物群は、当該少なくとも一つの真菌の構成員を含むこと、および当該微生物集団または微生物群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、培養されないこと、を含む方法を提供する。

【0030】

さらなる態様では、本開示は、医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、健康なヒトドナーの糞便から、微生物集団または微生物群を抽出すること、当該抽出された微生物集団または微生物群を当該医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、当該健康なヒトドナーによって摂取されたプロバイオティクスに由来する真菌株を含むこと、を含む。

【0031】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの微生物集団または微生物群を含む医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、当該ドナーが、真菌株を含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、微生物集団または微生物群を抽出することであって、当該微生物集団または微生物群は、当該真菌株を含むこと、当該微生物集団または微生物群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、培養されず、および当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該真菌株を含まないこと、を含む。

【0032】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、（ｉｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該混合物中の当該細菌単離株の生細胞の相対的存在量、および／または当該真菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である。

【0033】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、（ｉｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該混合物中の細菌単離株および／または真菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い。

【0034】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、（ｉｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該細菌単離株は、第一の種の構成員であり、この場合において当該細菌単離株は、混合物中の第一の種の唯一の構成員であり、この場合において当該真菌単離株は、第二の種の構成員であり、この場合において当該真菌単離株は、混合物中の第二の種の唯一の構成員である。

【0035】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便微生物の調製物、（ｉｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において非培養糞便微生物の調製物は、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まず、この場合において非培養糞便微生物の調製物は、当該真菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する真菌株を含まない。

【0036】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、（ｉｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉｉ）非病原性真菌単離株、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、この場合において当該細菌単離株および当該真菌単離株は、当該組成物を投与された対象の回腸に生着する。

【0037】

別の態様では、本開示は、その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法を提供するものであり、当該方法は、当該対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団または細菌群を含む医薬組成物であって、当該細菌集団または細菌群は、培養されていないもの、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉｉ）非病原性真菌単離株、を投与することを含む。

【0038】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団または細菌群を抽出すること、ならびに当該細菌集団または細菌群と、（ｉ）非病原性細菌単離株および（ｉｉ）非病原性真菌単離株とを混合すること、を含む方法を提供するものであり、この場合において当該細菌集団または細菌群は、培養されない。

【0039】

さらに別の態様では、本開示は、ドナーの糞便微生物叢中の少なくとも一つの細菌種および／または少なくとも一つの真菌種の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、当該ドナーの糞便から、微生物集団または微生物群を抽出することであって、当該微生物集団または微生物群は、当該少なくとも一つの細菌の構成員および／または当該少なくとも一つの真菌の構成員を含むこと、および当該微生物集団または微生物群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、培養されないこと、を含む方法を提供する。

【0040】

さらなる態様では、本開示は、医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、健康なヒトドナーの糞便から、微生物集団または微生物群を抽出すること、当該抽出された微生物集団または微生物群を当該医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、当該健康なヒトドナーによって摂取されたプロバイオティクスに由来する細菌株および／または真菌株を含むこと、を含む。

【0041】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの微生物集団または微生物群を含む医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、当該ドナーが、細菌株および／または真菌株を含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、微生物集団または微生物群を抽出することであって、当該微生物集団または微生物群は、当該細菌株および／または当該真菌株を含むこと、当該微生物集団または微生物群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、培養されず、および当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該細菌株および／または当該真菌株を含まないこと、を含む。

【0042】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該混合物中の非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である。

【0043】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該混合物中の非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い。

【0044】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、当該細菌単離株は、第一の種の構成員であり、当該細菌単離株は、混合物中の第一の種の唯一の構成員であり、当該真菌単離株は、第二の種の構成員であり、当該真菌単離株は、混合物中の第二の種の唯一の構成員であり、当該古細菌単離株は、第三の種の構成員であり、当該古細菌単離株は、混合物中の第三の種の唯一の構成員である。

【0045】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便微生物の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、非培養糞便微生物の調製物は、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まず、非培養糞便微生物の調製物は、当該真菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する真菌株を含まず、非培養糞便微生物の調製物は、当該古細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する古細菌株を含まない。

【0046】

別の態様では、本開示は、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物を提供するものであり、非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてが、当該組成物を投与された対象の回腸に生着する。

【0047】

別の態様では、本開示は、その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法を提供するものであり、当該方法は、当該対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団または細菌群を含む医薬組成物であって、当該細菌集団または細菌群は、培養されていないもの、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を投与することを含む。

【0048】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団または細菌群を抽出すること、ならびに当該細菌集団または細菌群と、（ｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、とを混合すること、を含む方法を提供するものであり、この場合において当該細菌集団または細菌群は、培養されない。

【0049】

さらに別の態様では、本開示は、ドナーの糞便微生物叢中の少なくとも一つの構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、当該ドナーの糞便から、微生物集団または微生物群を抽出することであって、当該微生物集団または微生物群は、当該少なくとも一つの構成員を含むこと、および当該微生物集団または微生物群を医薬組成物へと組み込むこと、を含む方法を提供するものであり、この場合において当該微生物集団または微生物群は、培養されず、この場合において当該少なくとも一つの構成員は、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つ全てを含む。

【0050】

さらなる態様では、本開示は、医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、健康なヒトドナーの糞便から、微生物集団または微生物群を抽出すること、および当該抽出された微生物集団または微生物群を医薬組成物へと組み込むこと、を含み、この場合において当該微生物集団または微生物群は、当該健康なヒトドナーにより摂取されたプロバイオティクスに由来する少なくとも一つの構成員を含み、この場合において当該少なくとも一つの構成員は、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つ全てを含む。

【0051】

別の態様では、本開示は、健康なヒトドナーの微生物集団または微生物群を含む医薬組成物を製造する方法を提供するものであり、当該方法は、当該ドナーが、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、微生物集団または微生物群を抽出することであって、当該微生物集団または微生物群は、当該非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つ全てを含むこと、当該微生物集団または微生物群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該微生物集団または微生物群は、培養されず、当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての微生物を含まない。

【図面の簡単な説明】

【0052】

【図1】図１：健康な糞便ドナーの糞便微生物叢中のラクトバチルス・ロイテリの変動的な相対的存在量を示すグラフ。

【図2】図２：非選択ドナー由来の糞便微生物叢（ＦＳＭ）の単独、または選択された細菌単離株と組み合わされたときの免疫刺激効果を示すＰＢＭＣ刺激アッセイ。ＩＦＮ－ガンマのレベルにより測定された。

【図3】図３：非選択ドナー由来の糞便微生物叢（ＦＳＭ）の単独、または選択された細菌単離株と組み合わされたときの免疫刺激効果を示すＰＢＭＣ刺激アッセイ。ＩＬ－１２ｐ７０のレベルにより測定された。

【図4】図４：非選択ドナー由来の糞便微生物叢（ＦＳＭ）の単独、または選択された細菌単離株と組み合わされたときの免疫刺激効果を示すＰＢＭＣ刺激アッセイ。ＩＬ－２３のレベルにより測定された。

【図5】図５：非選択ドナー由来の糞便微生物叢（ＦＳＭ）の単独、または選択された細菌単離株と組み合わされたときの免疫刺激効果を示すＰＢＭＣ刺激アッセイ。ＧＭ－ＣＳＦのレベルにより測定された。

【図6】図６：非選択ドナー由来の糞便微生物叢（ＦＳＭ）の単独、または選択された細菌単離株と組み合わされたときの免疫刺激効果を示すＰＢＭＣ刺激アッセイ。ＩＬ－１０とＩＬ－１２ｐ７０の間の比率により測定された。

【図7】図７：対象の細菌株と組み合わされたドナー由来細菌組成物を使用したＡＳＤ治療に関する第一の試験デザイン。

【図8】図８：対象の細菌株と組み合わされたドナー由来細菌組成物を使用したＡＳＤ治療に関する第二の試験デザイン。

【発明を実施するための形態】

【0053】

別段の規定がない限り、本明細書で使用される全ての技術用語および科学用語は、本開示が属する分野の当業者によって普遍的に理解される意味と同じ意味を有する。

【0054】

本明細書に言及されるすべての公表文献、特許および特許出願が、個々の公表文献、特許または特許出願のそれぞれが具体的に、および個々に参照により援用されることが示されている場合と同程度に、参照により本明細書に援用される。

【0055】

本明細書および添付の請求の範囲において使用される場合、文脈から別段であることが明白でない限り、単数形（ａ、ａｎおよびｔｈｅ）は複数の指示対象も含む。例示として、「ａｎ ｅｌｅｍｅｎｔ」とは、少なくとも一つの要素を意味し、複数の要素を含むことができる。

【0056】

本明細書で使用される場合、「実質的に」という用語は、性質を修飾するために使用される場合、概してその性質が失われることのないある程度の変動を許容する。例えば、特定の態様では、当該変動の程度は、０．１％未満、約０．１％未満、約０．２％未満、約０．３％未満、約０．４％未満、約０．５％未満、約０．６％未満、約０．７％未満、約０．８％未満、約０．９％未満、約１％未満、１～２％未満、２～３％未満、３～４％未満、４～５％未満、または５％超、または１０％超であってもよい。

【0057】

値の範囲が提供される場合、当該範囲の上限と下限の間にある各値、および当該記載範囲の任意の他の記載値または間にある任意の他の値は、本開示内に包含されることが理解される。より小さな範囲の上限および下限は独立して当該より小さな範囲に含まれ得、また記載範囲中の任意の特に除外された上下限を条件として、本開示内にも包含される。記載範囲が、上下限の一方または両方を含む場合、それら含有される上下限のいずれか両方を除外する範囲も、本開示に含まれる。

【0058】

あらゆる疑念を回避するために、本明細書で使用される、例えば、「約」、「少なくとも」、「少なくとも約」、「最大でも」、「未満」、「超」、「内」などの用語または文言は、パーセンテージの一連の列記が続く場合、当該用語または文言は、副詞、前置詞、または他の修飾語が一つ一つの言葉の前に再現されたかどうかに関わらず、一連の列記中のありとあらゆるパーセンテージの数を修飾するとみなされる。

【0059】

本明細書で使用される場合、「相対的存在量」という用語は、特定の集団（例えば、非培養糞便細菌の調製物または細菌混合物）において、類似した性質の全ての生物体と比較した、特定の種類の生物体（例えば、細菌株、細菌種または細菌属など）の相対的な表現を指す。相対的存在量は、特定の集団中の特定の種類の生物体の数を、特定の集団中の類似した性質の全ての生物体の合計数で割ることによって計算される。ある態様では、相対的存在量は、１６Ｓ配列のすべてを標的とするユニバーサルプライマーで生成されたＰＣＲ産物に対して、特定の対象細菌株を標的とする１６Ｓプライマーで生成されたＰＣＲ産物を比較するｑＰＣＲによって測定される。例えば、Ｃｈｕ，Ｎ．，ｅｔ ａｌ．，“Ｐｒｏｆｉｌｉｎｇ ｌｉｖｉｎｇ ｂａｃｔｅｒｉａ ｉｎｆｏｒｍｓ ｐｒｅｐａｒａｔｉｏｎ ｏｆ ｆｅｃａｌ ｍｉｃｒｏｂｉｏｔａ ｔｒａｎｓｐｌａｎｔａｔｉｏｎｓ．”ＰＬｏＳ Ｏｎｅ １２（１）：１－１６（２０１７）を参照のこと。別の態様では、相対的存在量は、Ｇｅｖｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，“Ｔｈｅ ｔｒｅａｔｍｅｎｔ－ｎａｉｖｅ ｍｉｃｒｏｂｉｏｍｅｓ ｉｎ ｎｅｗ－ｏｎｓｅｔ Ｃｒｏｈｎ’ｓ ｄｉｓｅａｓｅ．”Ｃｅｌｌ Ｈｏｓｔ ＆ Ｍｉｃｒｏｂｅ，１５（３）：３８２－９２（２０１４）に記載されるように、ハイスループットシーケンスを介して検出されるシーケンスリードの数に基づいて測定される。ある態様では、ハイスループットシーケンスは、１６Ｓ ｒＲＮＡ遺伝子のシーケンスに基づいている。別の態様では、ハイスループットシーケンスは、全ゲノムのショットガンメタゲノムシーケンスに基づいている。別段の特定が無い限り、本明細書において言及される細菌の相対的存在量は、Ｇｅｖｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，Ｃｅｌｌ Ｈｏｓｔ ＆ Ｍｉｃｒｏｂｅ，１５（３）：３８２－９２（２０１４）に記載されるＶ４可変領域を標的とする、１６Ｓ ｒＲＮＡのハイスループットシーケンスを介して測定される。さらなる態様では、Ｃｈｕ ｅｔ ａｌ．，ＰＬｏＳ Ｏｎｅ １２（１）：１－１６（２０１７）に示されるように、プロピジウムモノアジド（ＰＭＡ）を使用して、生きている糞便微生物と死んだ糞便微生物を識別する。

【0060】

本明細書で使用される場合、「治療すること」という用語は、（ｉ）疾患、障害、または状態を完全に、または部分的に阻害すること、例えば、その発生を停止させること、（ｉｉ）疾患、障害、または状態を完全に、または部分的に緩和すること、例えば、疾患、障害、および／または状態の退行を引き起こすこと、または（ｉｉｉ）疾患、障害、および／または状態にかかりやすい可能性があるが、まだそれを有すると診断されていない患者において、患者が疾患、障害、または状態を発生させることを完全に、または部分的に予防すること、を指す。同様に、「治療」とは、治療的処置、ならびに予防的手段または棒指摘手段の両方を指す。自閉症スペクトラム障害の文脈において、自閉症スペクトラム障害に関連する一つ以上の症状の軽減、改善、発症の遅延、進行の阻害、または重症度の低下が包含される。

【0061】

本明細書で使用される場合、「対象」は、ヒト、実験動物（例えば、霊長類、ラット、マウス）、家畜（例えば、ウシ、ヒツジ、ヤギ、ブタ、七面鳥、ニワトリ）、および家庭用ペット（例えば、イヌ、ネコ、齧歯類など）を含む任意の動物対象を指す。好ましい対象は、ヒト対象である。ヒト対象は、小児、成人、または高齢の対象であり得る。一部の態様では、「患者」および「対象」という用語は相互互換可能に使用される。対象は、健康であってもよく、またはＡＳＤの一つ以上の症状を患っていてもよい。

【0062】

本明細書で使用される場合、「微生物叢」および「フロラ」とは、真核生物、古細菌、細菌、およびウイルス（細菌ウイルス（すなわちファージ）を含む）を含む、持続可能に、および一過性の両方で、対象の身体内または身体上に生息する微生物の集団を指す。「糞便微生物叢」または「糞便微生物叢調製物」とは、対象の糞便に存在する、または対象の糞便から調製された微生物の集団を指す。典型的には、本明細書に記載の医薬組成物は、糞便から糞便微生物叢を精製した後に、当該糞便微生物叢を培養することなく、当該糞便微生物叢を組成物中に組み込むことにより調製される。本明細書において、「非培養糞便細菌の調製物」とは、一つ以上の糞便サンプルから採取された、抽出された、または精製された複数の生細菌株を指し、（例えば培養培地中での）当該株の培養は伴わない。

【0063】

一部の態様では、非培養糞便細菌の調製物は、非選択糞便細菌を含む。本明細書において、「非選択糞便細菌」とは、一つ以上の糞便サンプルから抽出された（例えば、糞便微生物叢中に存在する）生きた糞便細菌株の集団または群を指し、当該抽出された集団または群は、細菌の特定のタイプ、状態または分類学的階級を（例えば、特定の細菌株を故意に除去することにより、例えばエタノールまたはクロロホルムなどの物質で当該集団または群を処置することにより、または培養することにより）意図的に選択する環境条件に曝されない。そのような非選択糞便細菌は、正常で健康なヒトの糞便または腸の微生物叢中の対応する細菌株に比例した含有量の細菌株を含み得る。糞便サンプルから糞便細菌の集団または群を非選択的に抽出するために取られる工程としては、例えば、糞便サンプルのホモジナイゼーションおよび濾過を行い、例えば繊維や粗粒子状物質などの非細胞性糞便物質から糞便細菌株を分離すること、ならびに例えば真核宿主細胞やウイルスなどから糞便細菌株を分離することが挙げられる。本明細書では典型的には、非選択糞便細菌調製物は、好気性条件もしくは嫌気性条件、またはそれらの組み合わせのいずれかで調製され得る。特定の態様では、非選択糞便細菌の調製物は、糞便サンプルの糞便微生物叢の細菌のすべて、または実質的にすべてを含む。特定の態様では、非選択糞便細菌の調製物は、糞便サンプルの糞便微生物叢の株のすべて、または実質的にすべてを含む。特定の態様では、非選択糞便細菌の調製物は、糞便サンプルの糞便微生物叢の種のすべて、または実質的にすべてを含む。特定の態様では、非選択糞便細菌の調製物は、糞便サンプルの糞便微生物叢の属のすべて、または実質的にすべてを含む。特定の態様では、非選択糞便細菌の調製物は、糞便サンプルの糞便微生物叢の門のすべて、または実質的にすべてを含む。したがって、そうした非選択糞便微生物叢は、そうした糞便サンプル中に存在する微生物構成要素、および細菌の集団または群の構造に実質的に類似し得る。

【0064】

ある態様では、非培養細菌の集団または群は、少なくとも２、５、１０、２０、３０、４０、５０、１００、２００、３００、４００、５００、または６００の細菌種または細菌株を含む。別の態様では、非培養細菌の集団または群は、２～５、５～１０、１０～２０、２０～３０、３０～４０、４０～５０、５０～６０、６０～１００、１００～２００、２００～３００、３００～４００、４００～５００、または５００～６００の細菌種または細菌株を含む。

【0065】

ある態様では、非培養糞便細菌および／または非選択糞便細菌の調製物は、抗生物質耐性の細菌群を含まない。

【0066】

別の態様では、非培養糞便細菌の調製物の製造は、細菌の特定のタイプ、状態、または分類学的階級を（例えば、特定の細菌株を故意に除去することにより、および／または例えばエタノールまたはクロロホルムなどの選択剤で当該群を処置することにより）選択する工程を含み得る。特定の態様では、非培養糞便細菌のそのような調製物は、一つ以上の細菌単離株と混合されて、医薬組成物への組み込みのための細菌混合物を形成し得る。例えば、糞便、または糞便から抽出された糞便細菌は、一定期間、例えばエタノールなどの選択剤と共にインキュベートされてもよく、インキュベーション後にエタノールは取り除かれ、インキュベートされた細菌は、一つ以上の細菌単離株と混合されて、細菌混合物を生成し得る。ある態様では、選択剤とのインキュベーション後に調製物中に残留する生細菌は実質的に胞子を含み、または胞子からなる。

【0067】

本明細書において、非培養糞便細菌の調製物は、例えば細菌単離株などの単一の精製された細菌株とは区別される。本明細書で使用される場合、「細菌単離株」とは、単一の前駆細菌細胞から（例えば、細菌を培養することにより）二分裂で増殖させることにより生成された実質的に遺伝的に同一な細菌細胞の単離群を指す。典型的には、細菌単離株は、単一細胞として、または遺伝的に純粋な細胞群として元々単離され、例えば、固形培地上の単一コロニーとして、または液体培養物中の連続希釈を介して元々単離され、その後、（例えば凍結ストックとして）アーカイブ保管され、一貫性があり安定した単離株の供給源を提供する。単離されると、一部の態様では、細菌単離株は、純粋な細胞培養物として増殖され得る。他の態様では、複数の細菌単離株が、混合培養物として同じ容器内で同時に増殖され得る。細菌の文脈では、「実質的に遺伝的に同一」という用語は、共通の前駆物から増殖することに起因して、汚染されていない細菌単離株の純粋な組成物中で、様々な細胞が非常に高い（例えば、＞９９．９％）遺伝的同一性を共有することを指すが、比較的稀な突然変異の蓄積に起因した細胞間のわずかな遺伝的相違も含まれる。一般的に、細菌単離株は、細菌細胞の純粋培養物と同義である。典型的には、本明細書において、細菌単離株は、非病原性細菌からなる。ある態様では、細菌単離株は、プロバイオティクスであってもよく、またはプロバイオティクス中の成分であってもよい。

【0068】

本明細書で使用される場合、場合により「細菌共同体」または「合成細菌混合物」と呼ばれる「細菌カクテル」という用語は、規定された複数の細菌単離株の共同体を含む、細菌の操作された混合物を指す。「規定された複数の細菌単離株の共同体」という用語は、細菌カクテルが二つ以上の細菌単離株を含有すること、およびカクテル中の各細菌単離株の同一性が判明していること、ゆえに当該カクテルは一貫性をもって（例えば、単離された細菌株を組み合わせることにより）生成され、別々のバッチ全体にわたり安定した組成と特性を有し得ることを意味する。本明細書において、細菌単離株の「同一性」とは、単離株の任意の特徴を指す場合があり、当該特徴は、一つ以上の他の細菌単離株または細菌株とは異なるものとして当該単離株を特異的に識別する。細菌単離株の識別特徴の例としては、例えば１６Ｓ ｒＲＮＡ配列などのヌクレオチド配列、核酸の一つ以上のコード領域または非コード領域の配列、およびゲノム配列全体、遺伝子発現のレベル、生理学的もしくは代謝的な形質、または例えば染色パターンもしくは細胞壁の特徴などの解剖学的形質が挙げられる。

【0069】

本明細書で使用される場合、「細菌混合物」とは、生細菌細胞を含む操作された組成物を指し、一部の態様では、一つ以上の非病原性細菌単離株、および／または非培養細菌細胞の調製物を含み得る。一部の態様では、細菌混合物は、一つ以上の非病原性細菌単離株を含む。一部の態様では、細菌混合物は、非培養糞便細菌の調製物を含む。一部の態様では、細菌混合物は、一つ以上の非病原性細菌単離株と、非培養糞便細菌の調製物の両方を含む。

【0070】

本明細書で使用される場合、「真菌単離株」とは、単一の前駆真菌細胞から（例えば、真菌を培養することにより）二分裂で増殖させることにより生成された実質的に遺伝的に同一な真菌細胞の単離群を指す。典型的には、真菌単離株は、単一細胞として、または遺伝的に純粋な細胞群として元々単離され、例えば、固形培地上の単一コロニーとして、または液体培養物中の連続希釈を介して元々単離され、その後、（例えば凍結ストックとして）アーカイブ保管され、一貫性があり安定した単離株の供給源を提供する。単離されると、一部の態様では、真菌単離株は、純粋な細胞培養物として増殖され得る。他の態様では、複数の真菌単離株が、混合培養物として同じ容器内で同時に増殖され得る。真菌の文脈では、「実質的に遺伝的に同一」という用語は、共通の前駆物から増殖することに起因して、汚染されていない真菌単離株の純粋な組成物中で、様々な細胞が非常に高い（例えば、＞９９．９％）遺伝的同一性を共有することを指すが、比較的稀な突然変異の蓄積に起因した細胞間のわずかな遺伝的相違も含む。一般的に、真菌単離株は、真菌細胞の純粋培養物と同義である。典型的には、本明細書において、真菌単離株は、非病原性真菌からなる。ある態様では、真菌単離株は、プロバイオティクスであってもよく、またはプロバイオティクス中の成分であってもよい。

【0071】

細菌単離株を参照する、または細菌単離株に関連する、本明細書に記載される任意の態様は、真菌単離株に等しく適用することができる。例えば、一つ以上の細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に関する、本明細書のすべての開示および記載は、一つ以上の真菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に等しく適用される。さらに例えば、一つ以上の細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に関する、本明細書のすべての開示および記載は、一つ以上の細菌単離株および一つ以上の真菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に等しく適用される。

【0072】

本明細書で使用される場合、「古細菌単離株」とは、単一の前駆古細菌細胞から（例えば、古細菌を培養することにより）二分裂で増殖させることにより生成された実質的に遺伝的に同一な古細菌細胞の単離群を指す。典型的には、古細菌単離株は、単一細胞として、または遺伝的に純粋な細胞群として元々単離され、例えば、固形培地上の単一コロニーとして、または液体培養物中の連続希釈を介して元々単離され、その後、（例えば凍結ストックとして）アーカイブ保管され、一貫性があり安定した単離株の供給源を提供する。単離されると、一部の態様では、古細菌単離株は、純粋な細胞培養物として増殖され得る。他の態様では、複数の古細菌単離株が、混合培養物として同じ容器内で同時に増殖され得る。古細菌の文脈では、「実質的に遺伝的に同一」という用語は、共通の前駆物から増殖することに起因して、汚染されていない古細菌単離株の純粋な組成物中で、様々な細胞が非常に高い（例えば、＞９９．９％）遺伝的同一性を共有することを指すが、比較的稀な突然変異の蓄積に起因した細胞間のわずかな遺伝的相違も含まれている。一般的に、古細菌単離株は、古細菌細胞の純粋培養物と同義である。典型的には、本明細書において、古細菌単離株は、非病原性古細菌からなる。ある態様では、古細菌単離株は、プロバイオティクスであってもよく、またはプロバイオティクス中の成分であってもよい。

【0073】

細菌単離株を参照する、または細菌単離株に関連する、本明細書に記載される任意の態様は、古細菌単離株にも等しく適用することができる。例えば、一つ以上の細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に関する、本明細書のすべての開示および記載は、一つ以上の古細菌単離株（および／または一つ以上の真菌単離株）を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に等しく適用される。さらに例えば、一つ以上の細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に関する、本明細書のすべての開示および記載は、一つ以上の細菌単離株および一つ以上の古細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に等しく適用される。同様に、一つ以上の細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に関する、本明細書のすべての開示および記載は、一つ以上の細菌単離株、一つ以上の古細菌単離株、および一つ以上の古細菌単離株を富化された、補充された、または「スパイクされた」非培養糞便細菌の調製物を含む混合物に等しく適用される。

【0074】

本明細書で使用される場合、「治療有効量」、「有効量」、または「薬学的に活性な用量」とは、指名された疾患、障害、状態、または症状の治療に有効な組成物の量を指す。

【0075】

本明細書で使用される場合、「単離された」または「精製された」とは、（１）（自然界または実験環境下で最初に作製されたかにかかわらず）最初に作製されたときに関連付けられた構成要素の少なくとも一部から分離された、および／または（２）ヒトの手により作製、調製、精製および／もしくは製造された、細菌、または他の実体もしくは物質を指す。単離された、または精製された細菌は、最初に関連付けられた他の構成要素の少なくとも約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、約９０％、またはそれ以上から分離され得る。

【0076】

本明細書で使用される場合、細菌または他の生物体もしくは実体に関連した「非病原性」という用語は、当該生物体または実体を含有する宿主生物体の疾患、障害、または状態を引き起こすことができない、または罹患させることができない、任意のかかる生物体または実体を含む。

【0077】

本明細書で使用される場合、「胞子」または「胞子」の集団は、一般的に生存可能であり、同細菌の栄養型よりも例えば熱などの環境的影響および殺菌剤に対して耐性が高く、典型的には発芽と成長が可能な細菌（または他の単一細胞生物体）を含む。「胞子形成体」、または「胞子を形成することができる」細菌は、適切な環境条件下で胞子を産生するための遺伝子、および他の必要な能力を含有する細菌である。

【0078】

本明細書で使用される場合、「コロニー形成単位」（ＣＦＵ）は、所与のサンプル中の生存微生物細胞の数の推定値を指す。ＣＦＵの数は、サンプル中の生存細菌細胞の数を決定するための標準的な方法にあるように、寒天プレート上でコロニー数を数えることにより評価され得る。

【0079】

本明細書で使用される場合、「生きた」とは、増殖能力を有することを意味する。細菌集団の生存率は、細胞の膜の完全性の関数としてモニタリングすることができる。膜が損なわれた細胞は、死んだ、または死につつあるとみなされ、一方で損なわれていない膜を有する細胞は、生きているとみなされる。例えば、ＳＹＴＯ９およびヨウ化プロピジウムを使用して、生細菌および死細菌を染色し、識別する。Ｓｔｏｃｋｓ，Ｃｙｔｏｍｅｔｒｙ Ａ．２００４ Ｏｃｔ；６１（２）：１８９－９５を参照のこと。細胞生存率は、例えば、生細胞に関連した核酸と、不活化細胞に関連した核酸を識別することができるＰＣＲを基にした方法などの分子生物学的な生存率解析を介して評価されることもできる。Ｃａｎｇｅｌｏｓｉ ａｎｄ Ｍｅｓｃｈｅｋｅ，Ａｐｐｌ Ｅｎｖｉｒｏｎ Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ．２０１４ Ｏｃｔ；８０（１９）：５８８４－５８９１を参照のこと。

【0080】

本明細書で使用される場合、「シャノン多様性指標（Ｓｈａｎｎｏｎ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｉｎｄｅｘ）」とは、式

【数1】

を使用して所与の集団中に存在する種の存在量と均一性を説明する多様性指標を指し、式中、Ｈは、シャノン多様性指標であり、Ｒは、当該集団中の種の総数であり、ｐ_ｉは、ｉ番目の種から構成されるＲの比率である。値が高いほど、多様で均一に分布した集団を示しており、値０は、所与の集団中にただ一つの種のみが存在することを示す。さらなる参照については、Ｓｈａｎｎｏｎ ａｎｄ Ｗｅａｖｅｒ，（１９４９）Ｔｈｅ ｍａｔｈｅｍａｔｉｃａｌ ｔｈｅｏｒｙ ｏｆ ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎ．Ｔｈｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ ｏｆ Ｉｌｌｉｎｏｉｓ Ｐｒｅｓｓ，Ｕｒｂａｎａ．１１７ｐｐを参照のこと。

【0081】

本明細書で使用される場合、「抗生物質」とは、細菌を殺傷する、細菌の増殖を阻害する、または細菌の生存率を低下させることにより、細菌感染を治療および／または予防するために使用される物質を指す。

【0082】

本明細書で使用される場合、「有害事象（ＡＥ）」とは、処置に関連した、もしくは微生物叢に関連した兆候または症状をもたらす任意の投与を指す。本明細書で使用される場合、「重篤な有害事象（ＳＡＥ）」とは、任意の用量で、死に至る、または生命を脅かす任意の医療上の出来事を指す。本明細書で使用される場合、「生命を脅かす」とは、患者が当該事象の時点で死亡のリスクにある事象を指す。有害事象は、当分野の当業者により使用される尺度（例えば、国立がん研究所（ＮＣＩ：Ｎａｔｉｏｎａｌ Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ）のＣｏｍｍｏｎ Ｔｅｒｍｉｎｏｌｏｇｙ Ｃｒｉｔｅｒｉａ ｆｏｒ Ａｄｖｅｒｓｅ Ｅｖｅｎｔｓ（ＣＴＣＡＥ））に従って等級分けされる。

【0083】

本明細書では、細菌を含む医薬組成物、およびＡＳＤの治療に当該医薬組成物を使用する方法が記載される。自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）は、社会的相互作用やコミュニケーション、限定された関心、反復行動における障害を特徴とする神経発達障害である。自閉症スペクトラムの患者は、軽度から重度まで、様々な程度とタイプの障害を経験する。利益を最大化し、症状の重症度を低下させるためには、早期の発見と介入が推奨されるが、すべての年齢の患者が、症状を減少させ、技能および能力を高めることができる介入および療法から利益を得ることができる。本明細書に記載される方法に対して適した対象としては限定されないが、自閉症スペクトラム障害を有すると診断された、または有する疑いがあると診断されたヒトが挙げられる。一部の例では、本明細書に提供される方法に適した対象は、ＡＳＤ発症のリスクが高い（例えば、中程度または高いリスク）と考えられる。一部の事例では、対象は、ＤＳＭ－Ｖに明記されるＡＳＤの診断基準を満たす状態を有すると診断されている。他の事例では、対象は、自閉障害、アスペルガー障害、または他の方法では特定されない広汎性の発達障害（ＰＤＤ－ＮＯＳ：ｐｅｒｖａｓｉｖｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｄｉｓｏｒｄｅｒ ｎｏｔ ｏｔｈｅｒｗｉｓｅ ｓｐｅｃｉｆｉｅｄ）に関する、確立されたＤＳＭ－ＩＶの診断がなされている。

【0084】

理論に拘束されるものではないが、マイクロバイオーム機能は、例えば、腸関門の完全性の低下、調節された粘膜免疫組織、および不適切に刺激された迷走神経を含む、いくつかの相関関係のある経路を介して、ＡＳＤの症状と関連付けられ得る。さらに、理論に拘束されるものではないが、ＡＳＤマイクロバイオームは、局所的および全身的な炎症の調子に影響を及ぼす粘膜免疫細胞において、変化を誘導する可能性がある。ＡＳＤの小児における免疫活性の変化は、マイクロバイオーム組成の変化と関連しており、さらにＧＩ症状も経験するＡＳＤの小児のサブセットにおいては、より顕著である。例えば、粘膜免疫細胞集団の機能は、ＡＳＤおよびＧＩの症状を有する小児においては、炎症性のプロファイルに変化する。末梢Ｔｒｅｇ集団は、すべてのＡＳＤ小児において低下している。一方で、Ｔｒｅｇと炎症性Ｔｈ１７細胞の比率の変化は、ＡＳＤとＧＩの症状を有する小児においてのみ見られる。Ｔｒｅｇと炎症性Ｔｈ１７の比率の低さは、自己免疫性障害を連想させる。さらに、免疫細胞集団の変化は、ＡＳＤ患者の脳にも見出される。ＡＳＤの脳の皮質において、孔形成性タイトジャンクションタンパク質が増加し、バリアシーリングＴＪタンパク質が減少していることから、血液脳関門の機能変化が示唆される。血管周辺の血管周囲リンパ球（ＣＤ４＋、ＣＤ８＋Ｔ細胞およびＢ細胞）は、ＡＳＤ患者の皮質において著しく増加しており、このことから、炎症活動の増加が示唆される。

【0085】

ある態様では、治療されるＡＳＤ対象は、バリア保護性のＳＣＦＡ（例えば酪酸塩）の産生の減少、および／またはバリア破壊性のフェノール（例えば、４ＥＰＳ、ｐ－クレゾール）の増加を呈する。別の態様では、治療されるＡＳＤ対象は、腸関門の完全性の低下を呈しており、これにより、以下のうちの一つ以上が生じ得る：行動異常へとつながる、細菌産物およびＧＩ代謝物の移転増加、血清代謝物の変化、局所炎症およびＧＩ損傷、ならびにＩＦＮγ、ＩＬ－６およびＴＮＦのＬＰＳ誘導性活性化。

【0086】

ある態様では、治療されるＡＳＤ対象は、マイクロバイオームの多様性および組成における逸脱、および／またはＭＡＭＰ（例えば、ＬＰＳ）シグナルの局所免疫集団の発現変化を呈する。別の態様では、治療されるＡＳＤ対象は、調節された粘膜免疫組織を呈し、これにより以下のうちの一つ以上が生じ得る：ＴｒｅｇおよびＴｈ集団の粘膜集団ならびに末梢集団における、より炎症性プロファイルへと向かう変化、ＩＬ－１７ａおよび他のサイトカインの誘導、局所炎症およびＧＩ損傷、ならびに全身性炎症／神経炎症、ならびに行動異常。

【0087】

ある態様では、治療されるＡＳＤ対象は、腸神経系の微生物刺激を呈する。別の態様では、治療されるＡＳＤ対象は、不適切に刺激された迷走神経を呈し、これにより以下のうちの一つ以上が生じ得る：迷走神経依存性の視床下部傍室核の活性誘導、オキシトシンおよび他の神経ペプチドの内因性産生、行動の調節、ＧＩ運動性に影響を与える腸神経系の潜在的な調節。

【0088】

本開示の態様では、医薬組成物は、非培養糞便細菌、例えば非選択糞便細菌の調製物を含む細菌混合物を含む。ある態様では、細菌混合物は、単一の細菌単離株または複数の細菌単離株（例えば、細菌カクテルの形態）を含む。ある態様では、医薬組成物は、（ｉ）非培養糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）少なくとも一つの細菌単離株、を含む細菌混合物を含む。かかる細菌混合物は、一つ以上の細菌単離株を富化、補充、または「スパイク」された非培養糞便細菌の調製物とも呼称され得る。一つ以上の非病原性細菌単離株を有する健康なドナーの糞便サンプルに由来する非培養糞便細菌（例えば、糞便微生物叢）の調製物を富化またはスパイクすることにより、特定の細菌株（すなわち、スパイクインされた細菌単離株）の量が計算され、正確に制御され得た組成物が作製され得る。理論に拘束されるものではないが、例えば、非培養糞便細菌の調製物に少なくとも一つの細菌単離株をスパイクすることは有益で、対象（例えば、ＡＳＤの一つ以上の症状を有する、または発生させやすい対象）の治療にとって重要であり、または対象の治療に含まれるが、それだけでは、対象において強化された治療応答、または最適な治療応答を導くには不充分である。プロバイオティクスは、単一の細菌単離株または少数の細菌単離株の投与に関連する効果に関して当てにされている。プロバイオティクスとは異なり、非培養糞便細菌（すなわち、健康なドナーに由来する）の調製物とともに、一つ以上の細菌単離株をＡＳＤ対象に投与することによって、当該対象に、投与された細菌単離株の利点と、非培養微生物の調製物中に存在する追加的な糞便細菌株によって与えられる多因子的な利益の組み合わせが提供される。これらの追加的な糞便細菌株を組み合わせて、（例えば一つ以上の放出因子を介して）必要とされる状況または相互作用を提供し、それにより細菌単離株が対象において最適な応答を誘導できるようにしてもよく、または対象において、細菌単離株により誘導される応答を組み合わせて、および／または応答との相乗効果を発揮させて、対象を治療するような応答（例えば宿主細胞からのサイトカイン産生の調節）を直接誘導させてもよい。したがって、特定の態様では、一つ以上の細菌単離株と、非培養糞便細菌調製物の混合物を含む医薬組成物は、細菌単離株のみを含む組成物よりも、対象（例えば、ＡＳＤの一つ以上の症状を有する、または発生させやすい対象）の治療において効果が高い可能性がある。

【0089】

非培養糞便細菌の調製物を、一つ以上の微生物単離株で富化、補充、またはスパイク（して、「非培養糞便細菌調製物の「スパイクされた」バージョンを作製）することは、微生物単離株が富化、補充またはスパイクされていない非培養糞便細菌調製物を超える多くの利点を有する。例えば、理論に拘束されるものではないが、第一に、非培養糞便細菌調製物に添加される一つ以上の細菌単離株は、非培養糞便細菌調製物を製造するために使用されたドナー由来糞便中の細菌株の中では代表的ではない、または低い相対的存在量でのみ存在する場合がある。したがって、非培養糞便細菌調製物に細菌単離株を加えることにより、当該細菌混合物を投与された患者の腸内における、一つ以上の対応する細菌株（すなわち、当該一つ以上のスパイクされた細菌単離株を起源とする細菌株）の相対的存在量を増加させることができ、その結果、望ましい細菌株が患者の腸内に生着する可能性が高くなる。例えば、非培養糞便細菌調製物中で比較的低い存在量の細菌株（例えば、Ｌ．ロイテリ）は、ドナーの腸粘膜層または小腸内に存在し、ゆえに概して、非培養糞便細菌調製物の製造に使用されるドナー糞便中に高レベルでは存在できない可能性がある。理論に拘束されるものではないが、第二には、スパイクされた非培養糞便細菌調製物は、ドナーの糞便の細菌株組成中の不均一性（例えば、同じドナーの異なる時間で採取された糞便間の不均一性または異なるドナーの糞便間の不均一性）も軽減し得る。例えば、特定の細菌株は、一部のドナーの糞便中には存在し、または豊富であるが、他のドナーの糞便中には存在しないか、または少ない（例えば、Ｌ．ロイテリ、図１を参照）。そのような問題は、ドナー由来の非培養糞便細菌調製物に、ドナー間でレベルの変動を示す一つ以上の微生物単離株を補充することによって対処することができる。理論に拘束されるものではないが、第三には、スパイクされたバージョンは、重要な株または重要な機能の冗長性を促進または増大させることもできる。ドナー由来の糞便抽出物医薬品中に株が存在しても、患者に投与されたときの当該株の生着は保証されない。生着の成功は、例えば患者の腸内微生物叢の生態、医薬品中の当該株の存在量、および微生物株の遺伝子などの様々な要因に依存し得る。微生物種が患者の腸において望ましい機能と関連付けられる場合、治療中に当該種／機能が患者の腸内に導入される可能性は、医薬品中で当該種の異なる複数の株を同時投与することにより増加させることができる。したがって、特定の株が、医薬品の糞便微生物構成要素中の望ましい種となる場合、スパイクインされる構成要素に、当該種の異なる株を導入することにより、当該株のうちの一つが生着して望ましい機能を提供する可能性を増加させることができる。

【0090】

（例えば、「骨格」としてドナー由来糞便抽出物を使用し、スパイクされたバージョンを作製するために）、非培養糞便細菌調製物に一つ以上の微生物単離株を富化、補充またはスパイクすることは、非培養糞便細菌調製物を含まない、同一の一つ以上の微生物単離株（例えば、いずれか単一の細菌単離株または細菌単離株の共同体）を使用するよりも、多くの利点を保有する。理論に拘束されるものではないが、第一に、スパイクされたバージョンは、製品の品質を損なうことなく、患者を治療するために投与される単離株の共同体の複雑性（すなわち単離株の数）を低下させることができ、その結果、製造スケジュールが改善され、コストが低下する。理論に拘束されるものではないが、第二に、スパイクされた組成物は潜在的に、レシピエントの腸内の一つ以上の細菌株の生着を改善することができる。理論に拘束されるものではないが、第三に、腸内細菌により障害が予防または治療されることの根底にある作用機序が不明である場合、健康なドナー由来の微生物の集団全体の組成に含有されることにより、予防または治療のメカニズムの根底にある微生物が確実に現れてくる。

【0091】

別の態様では、一つ以上の細菌単離株と、非培養糞便細菌の調製物の混合物を含む医薬組成物は、非培養糞便細菌調製物のみを含む組成物よりも、対象（例えば、ＡＳＤの一つ以上の症状を有する、または発生させやすい対象）の治療において効果が高い可能性がある。例えば、理論に拘束されるものではないが、非培養糞便細菌調製物に添加される細菌単離株は、例えば非培養糞便細菌調製物が当該細菌単離株と同じ分類学的階級の細菌株を欠いているために（または閾値レベルを超える当該細菌単離株との遺伝的同一性割合％を有する細菌株を欠いているために）、または当該細菌単離株に対して遺伝的に対応する細菌株（例えば、当該細菌単離株と同じ分類学的階級にある細菌株）の非培養糞便細菌調製物中の存在量が閾値レベルを下回るために、非培養糞便細菌調製物には欠けている活性（すなわち、ＡＳＤの一つ以上の症状の治療または予防に有効な活性）を保有する可能性がある。

【0092】

ある態様では、医薬組成物は、細菌単離株と、当該細菌単離株と同じ分類学的階級の細菌株を欠く非培養糞便細菌調製物（例えば、健康なヒトドナーの糞便微生物叢から調製された調製物）を含む。例えば、細菌単離株は、非培養糞便細菌調製物中には存在しない門、綱、目、科、属または種の細菌単離株であってもよい。別の態様では、医薬組成物は、細菌単離株と、当該細菌単離株と１００％の遺伝的同一性を有する（例えば、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列と、非培養糞便細菌調製物の細菌株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列の間の遺伝的同一性の比較、または全ゲノム配列間の遺伝的同一性の比較によって決定される）細菌株を欠く非培養糞便細菌調製物を含む。別の態様では、医薬組成物は、細菌単離株と、当該細菌単離株と８０％、８１％、８２％、８３％、８４％、８５％、８６％、８７％、８８％、８９％、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％、または９９．９％を超える遺伝的同一性を有する（例えば、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列と、非培養糞便細菌調製物の細菌株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列の間の遺伝的同一性の比較、または全ゲノム配列間の遺伝的同一性の比較によって決定される）細菌株を欠く非培養糞便細菌調製物を含む。

【0093】

別の態様では、医薬組成物は、細菌単離株と、当該細菌単離株と同じ分類学的階級の一つ以上の細菌株を含むが、閾値レベルを下回る存在量または相対的存在量で含む非培養糞便細菌調製物（例えば、健康なヒトドナーの糞便微生物叢から調製された調製物）を含む。例えば、非培養糞便細菌調製物は、当該細菌単離株と同じ門、綱、目、科、属または種の一つ以上の細菌株を含み得るが、閾値レベルを下回る存在量または相対的存在量で含み得る。様々な態様では、当該細菌単離株と同じ分類学的階級の非培養糞便細菌調製物の一つ以上の細菌株は、非培養糞便細菌調製物の単位重量（例えば、グラム）当たり、１０^１、１０^２、１０^３、１０^４、１０^５、１０^６、１０^７、１０^８、１０^９、または１０^１０ＣＦＵの閾値存在量を下回ってもよい。様々な態様では、当該細菌単離株と同じ分類学的階級の非培養糞便細菌調製物の一つ以上の細菌株は、非培養糞便細菌調製物において、０．１％、０．２％、０．３％、０．４％、０．５％、０．６％、０．７％、０．８％、０．９％、１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、１２％、１４％、１５％、１６％、１８％、２０％、２２％、２４％、２５％、２６％、２８％、３０％、３５％、４０％、または５０％の閾値相対的存在量を下回ってもよい。

【0094】

ある態様では、医薬組成物は、細菌単離株と、非培養糞便細菌調製物の細菌混合物を含み、それにより、当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌調製物の生細胞の相対的存在量よりも低くなる（すなわち、当該細菌混合物は、ただ一つの細菌単離株のみを含み、当該細菌混合物の生細胞の５０％未満が、当該細菌単離株の細胞である）。ある態様では、細菌単離株と非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、５０％未満、４５％未満、４０％未満、３５％未満、３０％未満、２５％未満、２０％未満、１５％未満、１０％未満、５％未満、３％未満、または１％未満である。

【0095】

ある態様では、医薬組成物は、細菌単離株と非培養糞便細菌調製物の細菌混合物を含み、それにより、当該細菌混合物中の非培養糞便細菌調製物の生細胞の相対的存在量は、細菌単離株の生細胞の相対的存在量よりも低くなる（すなわち、当該細菌混合物は、ただ一つの細菌単離株のみを含み、当該細菌混合物の生細胞の５０％未満が、非培養糞便細菌調製物の細胞である）。別の態様では、非培養糞便細菌調製物と細菌単離株を含む細菌混合物中の非培養糞便細菌調製物の生細胞の相対的存在量は、５０％未満、４５％未満、４０％未満、３５％未満、３０％未満、２５％未満、２０％未満、１５％未満、１０％未満、５％未満、３％未満、または１％未満である。

【0096】

ある態様では、医薬組成物は、細菌単離株と非培養糞便細菌調製物の細菌混合物を含み、それにより、非培養糞便細菌調製物の生細胞の相対的存在量は、細菌単離株の生細胞の相対的存在量とほぼ等しい（すなわち、当該細菌混合物は、ただ一つの細菌単離株のみを含み、当該細菌混合物の生細胞の約５０％が、細菌単離株の細胞であり、当該細菌混合物の生細胞の約５０％が、非培養糞便細菌調製物の細胞である）。

【0097】

ある態様では、医薬組成物は、細菌単離株と非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を含み、それにより、細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌調製物中の任意の細菌株、任意の細菌種、任意の細菌属、任意の細菌科、任意の細菌目、任意の細菌綱、または任意の細菌門の生細胞の相対的存在量よりも高い。

【0098】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも一つの非病原性細菌単離株、および／または弱毒化病原性を有する細菌単離株を含む細菌混合物を含む。細菌単離株は、任意の非生物源（例えば、土壌）、またはヒツジ、ブタ、ウシ、霊長類もしくはヒトなどの哺乳動物を含む任意の生物源（例えば、動物）から単離されてもよい。動物から単離される場合、細菌単離株は、例えば腸、口腔、乳、唾液、または糞便を含む、臓器、液体または分泌物などの動物の任意の部分から誘導または単離されてもよい。別の態様では、細菌単離株は、ヒトから誘導される。別の態様では、細菌単離株は、ヒトの糞便微生物叢または腸内微生物叢から誘導される。ある態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、糞便細菌を含む。別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、健康なヒトドナーの糞便サンプルから抽出された、単離された、および／または培養された一つ以上の細菌単離株を含む。

【0099】

一部の態様では、本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれる細菌単離株は、生植物細胞を含む。一部の態様では、細菌単離株は、胞子を形成する能力を有する細菌を含む。一部の態様では、細菌単離株は、例えば、生存可能な胞子などの胞子の形態の細菌を含む。一部の態様では、細菌単離株は、生植物細胞と胞子の形態の細菌を含む。一部の態様では、細菌単離株は、生植物細胞を実質的に含まない。一部の態様では、細菌カクテル全体は、生植物細胞を実質的に含まない。一部の態様では、細菌単離株は、胞子を実質的に含まない。一部の態様では、細菌カクテル全体は、胞子を実質的に含まない。

【0100】

ある態様では、医薬組成物は、例えば、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）、ドレア（Ｄｏｒｅａ）、ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、プレボテラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、ベイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、バシラス（Ｂａｃｃｉｌｌｕｓ）、またはそれらの組み合わせの種を含む、（例えば、非培養糞便細菌調製物と組み合わされた、または調製物にスパイクされた）細菌単離株を含み得る。別の態様では、医薬組成物は、ベイロネラ科（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａｃｅａｅ）、ファーミキューテス門（Ｆｉｒｍｉｃｕｔｅｓ）、ガンマプロテオバクテリア綱（Ｇａｍｍａｐｒｏｔｅｏｂａｃｔｅｒｉａ）、バクテロイデス門（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｔｅｓ）、またはそれらの組み合わせの種を含む細菌単離株を含み得る。別の態様では、医薬組成物は、細菌胞子を含む細菌単離株を含み得る。一つの態様では、糞便細菌の胞子は、クロストリジウムの胞子、バシラスの胞子、またはそれらの組み合わせである。

【0101】

ある態様では、医薬組成物は、ラクトバチルスの種を含む細菌単離株を含む。ある態様では、医薬組成物は、一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、五つ以上、または六つ以上の細菌単離株を含み、それらは各々ラクトバチルスの種を含む。医薬組成物に単独で、または組み合わされて組み込まれ得るラクトバチルス種の非限定的な例としては、Ｌ．アセトトレランス（Ｌ ａｃｅｔｏｔｏｌｅｒａｎｓ）、Ｌ．アシジファリナエ（Ｌ．ａｃｉｄｉｆａｒｉｎａｅ）、Ｌ．アシジピスシス（Ｌ．ａｃｉｄｉｐｉｓｃｉｓ）、Ｌ．アシドフィルス（Ｌ．ａｃｉｄｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．アジリス（Ｌ．ａｇｉｌｉｓ）、Ｌ．アルギダス（Ｌ．ａｌｇｉｄｕｓ）、Ｌ．アリメンタリウス（Ｌ．ａｌｉｍｅｎｔａｒｉｕｓ）、Ｌ．アリリ（Ｌ．ａｌｌｉｉ）、Ｌ．アルベイ（Ｌ．ａｌｖｅｉ）、Ｌ．アルビ（Ｌ．ａｌｖｉ）、Ｌ．アミロリティキュス（Ｌ．ａｍｙｌｏｌｙｔｉｃｕｓ）、Ｌ．アミロフィルス（Ｌ．ａｍｙｌｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．アミロトロフィキュス（Ｌ．ａｍｙｌｏｔｒｏｐｈｉｃｕｓ）、Ｌ．アミロボルス（Ｌ．ａｍｙｌｏｖｏｒｕｓ）、Ｌ．アニマリス（Ｌ．ａｎｉｍａｌｉｓ）、Ｌ．アニマタ（Ｌ．ａｎｉｍａｔａ）、Ｌ．アントリ（Ｌ．ａｎｔｒｉ）、Ｌ．アピノラム（Ｌ．ａｐｉｎｏｒｕｍ）、Ｌ．アピス（Ｌ．ａｐｉｓ）、Ｌ．アポデミ（Ｌ．ａｐｏｄｅｍｉ）、Ｌ．アクアチキュス（Ｌ．ａｑｕａｔｉｃｕｓ）、Ｌ．アビアリウス（Ｌ．ａｖｉａｒｉｕｓ）、Ｌ．アビアリウス亜種アラフィノサス（Ｌ．ａｖｉａｒｉｕｓ ｓｕｂｓｐ．ａｒａｆｆｉｎｏｓｕｓ）、Ｌ．アビアリウス亜種アビアリウス（Ｌ．ａｖｉａｒｉｕｓ ｓｕｂｓｐ．ａｖｉａｒｉｕｓ）、Ｌ．バッキイ（Ｌ．ｂａｃｋｉｉ）、Ｌ．バンブサエ（Ｌ．ｂａｍｂｕｓａｅ）、Ｌ．ビフェルメンタンス（Ｌ．ｂｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｌ．ボンミ（Ｌ．ｂｏｍｍｉ）、Ｌ．ボンミコラ（Ｌ．ｂｏｍｍｉｃｏｌａ）、Ｌ．ブランタエ（Ｌ．ｂｒａｎｔａｅ）、Ｌ．ブレビス（Ｌ．ｂｒｅｖｉｓ）、Ｌ．ブレビス亜種コアグランス（Ｌ．ｂｒｅｖｉｓ ｓｕｂｓｐ．ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、Ｌ．ブレビス亜種グラベセンシス（Ｌ．ｂｒｅｖｉｓ ｓｕｂｓｐ．ｇｒａｖｅｓｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ブレビシミリス（Ｌ．ｂｒｅｖｉｓｉｍｉｌｉｓ）、Ｌ．ブフネリ（Ｌ．ｂｕｃｈｎｅｒｉ）、Ｌ．カカオナム（Ｌ．ｃａｃａｏｎｕｍ）、Ｌ．カメリアエ（Ｌ．ｃａｍｅｌｌｉａｅ）、Ｌ．カピラタス（Ｌ．ｃａｐｉｌｌａｔｕｓ）、Ｌ．カゼイ（Ｌ．ｃａｓｅｉ）、Ｌ．カゼイ亜種カゼイ（Ｌ．ｃａｓｅｉ ｓｕｂｓｐ．ｃａｓｅｉ）、Ｌ．キアイエンシス（Ｌ．ｃｈｉａｙｉｅｎｓｉｓ）、Ｌ．パラカゼイ（Ｌ．ｐａｒａｃａｓｅｉ）、Ｌ．パラカゼイ亜種パラカゼイ（Ｌ．ｐａｒａｃａｓｅｉ ｓｕｂｓｐ．ｐａｒａｃａｓｅｉ）、Ｌ．パラカゼイ亜種トレランス（Ｌ．ｐａｒａｃａｓｅｉ ｓｕｂｓｐ．ｔｏｌｅｒａｎｓ）、Ｌ．ゼアエ（Ｌ．ｚｅａｅ）、Ｌ．カテネホルニス（Ｌ．ｃａｔｅｎｅｆｏｒｎｉｓ）、Ｌ．カビアエ（Ｌ．ｃａｖｉａｅ）、Ｌ．セレビジアエ（Ｌ．ｃｅｒｅｖｉｓｉａｅ）、Ｌ．セチ（Ｌ．ｃｅｔｉ）、Ｌ．コレオホミニス（Ｌ．ｃｏｌｅｏｈｏｍｉｎｉｓ）、Ｌ．コリニ（Ｌ．ｃｏｌｉｎｉ）、Ｌ．コリノイデス（Ｌ．ｃｏｌｌｉｎｏｉｄｅｓ）、Ｌ．コムポスチ（Ｌ．ｃｏｍｐｏｓｔｉ）、Ｌ．コンカブス（Ｌ．ｃｏｎｃａｖｕｓ）、Ｌ．コリニホルミス（Ｌ．ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）、Ｌ．コリニホルミス亜種コリニホルミス（Ｌ．ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ ｓｕｂｓｐ．ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ）、Ｌ．コリニホルミス亜種トルクエンス（Ｌ．ｃｏｒｙｎｉｆｏｒｍｉｓ ｓｕｂｓｐ．ｔｏｒｑｕｅｎｓ）、Ｌ．クリスパツス（Ｌ．ｃｒｉｓｐａｔｕｓ）、Ｌ．クルストルム（Ｌ．ｃｒｕｓｔｏｒｕｍ）、Ｌ．クリエアエ（Ｌ．ｃｕｒｉｅａｅ）、Ｌ．クルツス（Ｌ．ｃｕｒｔｕｓ）、Ｌ．クルバツス（Ｌ．ｃｕｒｖａｔｕｓ）、Ｌ．デルブルエッキイ（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ブルガリクス（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ ｓｕｂｓｐ．ｂｕｌｇａｒｉｃｕｓ）、Ｌ．デルブルエッキイ亜種デルブルエッキイ（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ ｓｕｂｓｐ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ）、Ｌ．デルブルエッキイ亜種インジクス（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ ｓｕｂｓｐ．ｉｎｄｉｃｕｓ）、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ジャコブセニイ（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ ｓｕｂｓｐ．ｊａｋｏｂｓｅｎｉｉ）、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ラクチス（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ ｓｕｂｓｐ．ｌａｃｔｉｓ）、Ｌ．デルブルエッキイ亜種スンキイ（Ｌ．ｄｅｌｂｒｕｅｃｋｉｉ ｓｕｂｓｐ．ｓｕｎｋｉｉ）、Ｌ．デクストリニクス（Ｌ．ｄｅｘｔｒｉｎｉｃｕｓ）、Ｌ．ジオリボランス（Ｌ．ｄｉｏｌｉｖｏｒａｎｓ）、Ｌ．エクイ（Ｌ．ｅｑｕｉ）、Ｌ．エクイクルソリス（Ｌ．ｅｑｕｉｃｕｒｓｏｒｉｓ）、Ｌ．エクイゲネロシ（Ｌ．ｅｑｕｉｇｅｎｅｒｏｓｉ）、Ｌ．ファビフェルメンタンス（Ｌ．ｆａｂｉｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｌ．ファエシス（Ｌ．ｆａｅｃｉｓ）、Ｌ．ファエニ（Ｌ．ｆａｅｎｉ）、Ｌ．ファルシミニス（Ｌ．ｆａｒｃｉｍｉｎｉｓ）、Ｌ．ファラジニス（Ｌ．ｆａｒｒａｇｉｎｉｓ）、Ｌ．フェルメンツム（Ｌ．ｆｅｒｍｅｎｔｕｍ）、Ｌ．フロリコラ（Ｌ．ｆｌｏｒｉｃｏｌａ）、Ｌ．フロルム（Ｌ．ｆｌｏｒｕｍ）、Ｌ．ホルモセンシス（Ｌ．ｆｏｒｍｏｓｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ホルニカリス（Ｌ．ｆｏｒｎｉｃａｌｉｓ）、Ｌ．フルクチボランス（Ｌ．ｆｒｕｃｔｉｖｏｒａｎｓ）、Ｌ．フルメンチ（Ｌ．ｆｒｕｍｅｎｔｉ）、Ｌ．フチュエンシス（Ｌ．ｆｕｃｈｕｅｎｓｉｓ）、Ｌ．フルフリコラ（Ｌ．ｆｕｒｆｕｒｉｃｏｌａ）、Ｌ．フトサイイ（Ｌ．ｆｕｔｓａｉｉ）、Ｌ．ガリナルム（Ｌ．ｇａｌｌｉｎａｒｕｍ）、Ｌ．ガセリ（Ｌ．ｇａｓｓｅｒｉ）、Ｌ．ガストリクス（Ｌ．ｇａｓｔｒｉｃｕｓ）、Ｌ．ガネンシス（Ｌ．ｇｈａｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ジゲリオルム（Ｌ．ｇｉｇｅｒｉｏｒｕｍ）、Ｌ．ジンセノシジムタンス（Ｌ．ｇｉｎｓｅｎｏｓｉｄｉｍｕｔａｎｓ）、Ｌ．ゴリラエ（Ｌ．ｇｏｒｉｌｌａｅ）、Ｌ．グラミニス（Ｌ．ｇｒａｍｉｎｉｓ）、Ｌ．グイズホウエンシス（Ｌ．ｇｕｉｚｈｏｕｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ハロフィルス（Ｌ．ｈａｌｏｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．ハムメシイ（Ｌ．ｈａｍｍｅｓｉｉ）、Ｌ．ハムステリ（Ｌ．ｈａｍｓｔｅｒｉ）、Ｌ．ハルビネンシス（Ｌ．ｈａｒｂｉｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ハヤキテンシス（Ｌ．ｈａｙａｋｉｔｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ヘイロンジアンゲンシス（Ｌ．ｈｅｉｌｏｎｇｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ヘルシンボルゲンシス（Ｌ．ｈｅｌｓｉｎｇｂｏｒｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ヘルベチクス（Ｌ．ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ）、Ｌ．ヘルベチクス亜種ジュグルチ（Ｌ．ｈｅｌｖｅｔｉｃｕｓ ｓｕｂｓｐ．ｊｕｇｕｒｔｉ）、Ｌ．ヘルバルム（Ｌ．ｈｅｒｂａｒｕｍ）、Ｌ．ヘテロヒオチイ（Ｌ．ｈｅｔｅｒｏｈｉｏｃｈｉｉ）、Ｌ．ヒルガルジ（Ｌ．ｈｉｌｇａｒｄｉ）、Ｌ．ホッカイドネンシス（Ｌ．ｈｏｋｋａｉｄｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ホミニス（Ｌ．ｈｏｍｉｎｉｓ）、Ｌ．ホモヒオチイ（Ｌ．ｈｏｍｏｈｉｏｃｈｉｉ）、Ｌ．ホルデイ（Ｌ．ｈｏｒｄｅｉ）、Ｌ．イアタエ（Ｌ．ｉａｔａｅ）、Ｌ．イネルス（Ｌ．ｉｎｅｒｓ）、Ｌ．イングルビエイ（Ｌ．ｉｎｇｌｕｖｉｅｉ）、Ｌ．インセクチス（Ｌ．ｉｎｓｅｃｔｉｓ）、Ｌ．インシシイ（Ｌ．ｉｎｓｉｃｉｉ）、Ｌ．インテルメジウス（Ｌ．ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、Ｌ．インテスチナリス（Ｌ．ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、Ｌ．イワテンシス（Ｌ．ｉｗａｔｅｎｓｉｓ）、Ｌ．イクソラエ（Ｌ．ｉｘｏｒａｅ）、Ｌ．ジャポニクス（Ｌ．ｊａｐｏｎｉｃｕｓ）、Ｌ．ジェンセニイ（Ｌ．ｊｅｎｓｅｎｉｉ）、Ｌ．ジョンソニイ（Ｌ．ｊｏｈｎｓｏｎｉｉ）、Ｌ．カリキセンシス（Ｌ．ｋａｌｉｘｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ケフィラノファシエン（Ｌ．ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｃｉｅｎ）、Ｌ．ケフィラノファシエンス亜種ケフィラノファシエンス（Ｌ．ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｃｉｅｎｓ ｓｕｂｓｐ．ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｃｉｅｎｓ）、Ｌ．ケフィラノファシエンス亜種ケフィルグラヌム（Ｌ．ｋｅｆｉｒａｎｏｆａｃｉｅｎｓ ｓｕｂｓｐ．ｋｅｆｉｒｇｒａｎｕｍ）、Ｌ．ケフィリ（Ｌ．ｋｅｆｉｒｉ）、Ｌ．キムブラジイ（Ｌ．ｋｉｍｂｌａｄｉｉ）、Ｌ．キムキクス（Ｌ．ｋｉｍｃｈｉｃｕｓ）、Ｌ．キムキエンシス（Ｌ．ｋｉｍｃｈｉｅｎｓｉｓ）、Ｌ．キソネンシス（Ｌ．ｋｉｓｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．キタサトニス（Ｌ．ｋｉｔａｓａｔｏｎｉｓ）、Ｌ．コレエンシス（Ｌ．ｋｏｒｅｅｎｓｉｓ）、Ｌ．コソイ（Ｌ．ｋｏｓｏｉ）、Ｌ．クラベルゲンシス（Ｌ．ｋｕｌｌａｂｅｒｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．クンケエイ（Ｌ．ｋｕｎｋｅｅｉ）、Ｌ．ラルバエ（Ｌ．ｌａｒｖａｅ）、Ｌ．レイクマンニイ（Ｌ．ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ）、Ｌ．レチバジ（Ｌ．ｌｅｔｉｖａｚｉ）、Ｌ．リンドネリ（Ｌ．ｌｉｎｄｎｅｒｉ）、Ｌ．マレフェルメンタンス（Ｌ．ｍａｌｅｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｌ．マリ（Ｌ．ｍａｌｉ）、Ｌ．マニホチボランス（Ｌ．ｍａｎｉｈｏｔｉｖｏｒａｎｓ）、Ｌ．メリフェル（Ｌ．ｍｅｌｌｉｆｅｒ）、Ｌ．メリス（Ｌ．ｍｅｌｌｉｓ）、Ｌ．メリベントリス（Ｌ．ｍｅｌｌｉｖｅｎｔｒｉｓ）、Ｌ．メトリオプテラエ（Ｌ．ｍｅｔｒｉｏｐｔｅｒａｅ）、Ｌ．ミチェネリ（Ｌ．ｍｉｃｈｅｎｅｒｉ）、Ｌ．ミンデンシス（Ｌ．ｍｉｎｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ミクスチパブリ（Ｌ．ｍｉｘｔｉｐａｂｕｌｉ）、Ｌ．モビリス（Ｌ．ｍｏｂｉｌｉｓ）、Ｌ．モデスチサリトレランス（Ｌ．ｍｏｄｅｓｔｉｓａｌｉｔｏｌｅｒａｎｓ）、Ｌ．ムコサエ（Ｌ．ｍｕｃｏｓａｅ）、Ｌ．ムダンジアンゲンシス（Ｌ．ｍｕｄａｎｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ムリヌス（Ｌ．ｍｕｒｉｎｕｓ）、Ｌ．ムサエ（Ｌ．ｍｕｓａｅ）、Ｌ．ナゲリイ（Ｌ．ｎａｇｅｌｉｉ）、Ｌ．ナムレンシス（Ｌ．ｎａｍｕｒｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ナンテンシス（Ｌ．ｎａｎｔｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ナスエンシス（Ｌ．ｎａｓｕｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ネンジアンゲンシス（Ｌ．ｎｅｎｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ノデンシス（Ｌ．ｎｏｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ヌルキ（Ｌ．ｎｕｒｕｋｉ）、Ｌ．オドラチトフイ（Ｌ．ｏｄｏｒａｔｉｔｏｆｕｉ）、Ｌ．オエニ（Ｌ．ｏｅｎｉ）、Ｌ．オリゴフェルメンタンス（Ｌ．ｏｌｉｇｏｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、Ｌ．オリス（Ｌ．ｏｒｉｓ）、Ｌ．オリザエ（Ｌ．ｏｒｙｚａｅ）、Ｌ．オタキエンシス（Ｌ．ｏｔａｋｉｅｎｓｉｓ）、Ｌ．オゼンシス（Ｌ．ｏｚｅｎｓｉｓ）、Ｌ．パニス（Ｌ．ｐａｎｉｓ）、Ｌ．パニサピウム（Ｌ．ｐａｎｉｓａｐｉｕｍ）、Ｌ．パンテリス（Ｌ．ｐａｎｔｈｅｒｉｓ）、Ｌ．パラブレビス（Ｌ．ｐａｒａｂｒｅｖｉｓ）、Ｌ．パラブフネリ（Ｌ．ｐａｒａｂｕｃｈｎｅｒｉ）、Ｌ．パラコリノイデス（Ｌ．ｐａｒａｃｏｌｌｉｎｏｉｄｅｓ）、Ｌ．パラファラギニス（Ｌ．ｐａｒａｆａｒｒａｇｉｎｉｓ）、Ｌ．パラガゼリ（Ｌ．ｐａｒａｇａｓｓｅｒｉ）、Ｌ．パラケフィリ（Ｌ．ｐａｒａｋｅｆｉｒｉ）、Ｌ．パラリメンタリウス（Ｌ．ｐａｒａｌｉｍｅｎｔａｒｉｕｓ）、Ｌ．パラプランタルム（Ｌ．ｐａｒａｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．パスツーリイ（Ｌ．ｐａｓｔｅｕｒｉｉ）、Ｌ．パウシボランス（Ｌ．ｐａｕｃｉｖｏｒａｎｓ）、Ｌ．ペントシフィルス（Ｌ．ｐｅｎｔｏｓｉｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．ペントサス（Ｌ．ｐｅｎｔｏｓｕｓ）、Ｌ．ペロレンス（Ｌ．ｐｅｒｏｌｅｎｓ）、Ｌ．プラジョミ（Ｌ．ｐｌａｊｏｍｉ）、Ｌ．プランタルム（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．プランタルム亜種アルゲントランテンシス（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ ｓｕｂｓｐ．ａｒｇｅｎｔｏｒａｔｅｎｓｉｓ）、Ｌ．プランタルム亜種プランタルム（Ｌ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ ｓｕｂｓｐ．ｐｌａｎｔａｒｕｍ）、Ｌ．プブジヒイ（Ｌ．ｐｏｂｕｚｉｈｉｉ）、Ｌ．ポンチス（Ｌ．ｐｏｎｔｉｓ）、Ｌ．ポルシ（Ｌ．ｐｏｒｃｉ）、Ｌ．ポルシナエ（Ｌ．ｐｏｒｃｉｎａｅ）、Ｌ．シッタシ（Ｌ．ｐｓｉｔｔａｃｉ）、Ｌ．ケヌイアエ（Ｌ．ｑｕｅｎｕｉａｅ）、Ｌ．ラオウルチイ（Ｌ．ｒａｏｕｌｔｉｉ）、Ｌ．ラピ（Ｌ．ｒａｐｉ）、Ｌ．
レンナキルフィ（Ｌ．ｒｅｎｎａｎｑｕｉｌｆｙ）、Ｌ．レンニニ（Ｌ．ｒｅｎｎｉｎｉ）、Ｌ．ロイテリ（Ｌ．ｒｅｕｔｅｒｉ）、Ｌ．ラムノサス（Ｌ．ｒｈａｍｎｏｓｕｓ）、Ｌ．ロデンチウム（Ｌ．ｒｏｄｅｎｔｉｕｍ）、Ｌ．ロゴサエ（Ｌ．ｒｏｇｏｓａｅ）、Ｌ．ロッシアエ（Ｌ．ｒｏｓｓｉａｅ）、Ｌ．ルミニス（Ｌ．ｒｕｍｉｎｉｓ）、Ｌ．サエリムネリ（Ｌ．ｓａｅｒｉｍｎｅｒｉ）、Ｌ．サケイ（Ｌ．ｓａｋｅｉ）、Ｌ．サケイ亜種カルノサス（Ｌ．ｓａｋｅｉ ｓｕｂｓｐ．ｃａｒｎｏｓｕｓ）、Ｌ．サケイ亜種サケイ（Ｌ．ｓａｋｅｉ ｓｕｂｓｐ．ｓａｋｅｉ）、Ｌ．サリバリウス（Ｌ．ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ）、Ｌ．サンフランシスセンシス（Ｌ．ｓａｎｆｒａｎｃｉｓｃｅｎｓｉｓ）、Ｌ．サニビリ（Ｌ．ｓａｎｉｖｉｒｉ）、Ｌ．サツメンシス（Ｌ．ｓａｔｓｕｍｅｎｓｉｓ）、Ｌ．セカリフィルス（Ｌ．ｓｅｃａｌｉｐｈｉｌｕｓ）、Ｌ．セランゴレンシス（Ｌ．ｓｅｌａｎｇｏｒｅｎｓｉｓ）、Ｌ．セニオリス（Ｌ．ｓｅｎｉｏｒｉｓ）、Ｌ．センマイズケイ（Ｌ．ｓｅｎｍａｉｚｕｋｅｉ）、Ｌ．シャーペアエ（Ｌ．ｓｈａｒｐｅａｅ）、Ｌ．シェンゼネンシス（Ｌ．ｓｈｅｎｚｈｅｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．シセラエ（Ｌ．ｓｉｃｅｒａｅ）、Ｌ．シラゲ（Ｌ．ｓｉｌａｇｅ）、Ｌ．シラギンコラ（Ｌ．ｓｉｌａｇｉｎｃｏｌａ）、Ｌ．シリギニス（Ｌ．ｓｉｌｉｇｉｎｉｓ）、Ｌ．シミリス（Ｌ．ｓｉｍｉｌｉｓ）、Ｌ．ソングアジアンゲンシス（Ｌ．ｓｏｎｇｈｕａｊｉａｎｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．スピチェリ（Ｌ．ｓｐｉｃｈｅｒｉ）、Ｌ．スシコラ（Ｌ．ｓｕｃｉｃｏｌａ）、Ｌ．スエビクス（Ｌ．ｓｕｅｂｉｃｕｓ）、Ｌ．スンキイ（Ｌ．ｓｕｎｋｉｉ）、Ｌ．タイワネンシス（Ｌ．ｔａｉｗａｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．テラエ（Ｌ．ｔｅｒｒａｅ）、Ｌ．タイランデンシス（Ｌ．ｔｈａｉｌａｎｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．チンベルラケイ（Ｌ．ｔｉｍｂｅｒｌａｋｅｉ）、Ｌ．チモネンシス（Ｌ．ｔｉｍｏｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ツッセチ（Ｌ．ｔｕｃｃｅｔｉ）、Ｌ．ウルツネンシス（Ｌ．ｕｌｔｕｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ウバルム（Ｌ．ｕｖａｒｕｍ）、Ｌ．バッシノステルクス（Ｌ．ｖａｃｃｉｎｏｓｔｅｒｃｕｓ）、Ｌ．バギナリス（Ｌ．ｖａｇｉｎａｌｉｓ）、Ｌ．ヴェルミフォルメ（Ｌ．ｖｅｒｍｉｆｏｒｍｅ）、Ｌ．ベルスモルデンシス（Ｌ．ｖｅｒｓｍｏｌｄｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ベスプラエ（Ｌ．ｖｅｓｐｕｌａｅ）、Ｌ．ビニ（Ｌ．ｖｉｎｉ）、Ｌ．ワサチェンシス（Ｌ．ｗａｓａｔｃｈｅｎｓｉｓ）、Ｌ．シャンファンゲンシス（Ｌ．ｘｉａｎｇｆａｎｇｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ヨンギネンシス（Ｌ．ｙｏｎｇｉｎｅｎｓｉｓ）、Ｌ．ザイマエ（Ｌ．ｚｙｍａｅ）、またはそれらの組み合わせが挙げられる。

【0102】

ある態様では、医薬組成物は、ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株を含む。本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれ得る非限定的で例示的なＬ．ロイテリ細菌単離株としては、ＡＴＣＣ ＰＴＡ ６４７５、ＤＳＭ １７９３８、ＡＴＣＣ ５５７３０、ＡＴＣＣ ＰＴＡ ５２８９、ＤＳＭ １２２４６、ＲＣ－１４（登録商標）（ＣＨＲ Ｈａｎｓｅｎ）、またはそれらの組み合わせが挙げられる。

【0103】

ある態様では、医薬組成物は、ラクトバチルス・プランタルムを含む細菌単離株を含む。本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれ得るＬ．プランタルム細菌単離株の非限定的な例としては、ＷＣＦＳ１、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－７９３、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－２８３８、ＡＴＣＣ １０２４１、ＡＴＣＣ １００１２、ＡＴＣＣ ８０１４、またはそれらの組み合わせが挙げられる。別の態様では、Ｌ．プランタルム細菌単離株は、ラクトバチルス・プランタルム亜種プランタルム ＰＳ１２８である。別の態様では、Ｌ．プランタルム細菌単離株は、ＤＳＭＺ アクセッション番号ＤＳＭ ２８６３２（ＵＳ２０１５０３０６１５７Ａ１を参照のこと）である。

【0104】

ある態様では、医薬組成物は、Ｌ．ラムノサスを含む細菌単離株を含む。本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれ得るＬ．ラムノサス細菌単離株の非限定的な例としては、ＡＴＣＣ ７４６９、ＡＴＣＣ ５３１０３、ＡＴＣＣ ９５９５、１９０７０－２、またはそれらの組み合わせが挙げられる。

【0105】

ある態様では、医薬組成物は、Ｌ．アシドフィルスを含む細菌単離株を含む。本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれ得るＬ．アシドフィルス細菌単離株の非限定的な例としては、ＡＴＣＣ ４３５６、ＡＴＣＣ ５３６７１、またはそれらの組み合わせが挙げられる。

【0106】

ある態様では、医薬組成物は、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ブルガリクスを含む細菌単離株を含む。本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれ得るＬ．デルブルエッキイ亜種 ブルガリクス細菌単離株の非限定的な例としては、ＡＴＣＣ １１８４２、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－３６５、またはそれらの組み合わせが挙げられる。

【0107】

ある態様では、医薬組成物は、Ｌ．パラカゼイを含む細菌単離株を含む。本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれ得るＬ．パラカゼイ細菌単離株の非限定的な例としては、ＡＴＣＣ ２５３０２、ＡＴＣＣ １１５７８、ＡＴＣＣ ２７２１６、ＡＴＣＣ ２５５９８、またはそれらの組み合わせが挙げられる。

【0108】

ある態様では、医薬組成物は、ビフィドバクテリウムの種を含む細菌単離株を含む。ある態様では、医薬組成物は、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）を含む細菌単離株（例えば、ＵＣＤ２７２、ＡＴＣＣ １５７０７、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－２７５３、またはそれらの組み合わせ）を含む。ある態様では、医薬組成物は、ビフィドバクテリウム・ロンガム亜種インファンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ，ｓｕｂｓｐ．ｉｎｆａｎｔｉｓ）（例えば、ＡＴＣＣ １５６９７）の種を含む細菌単離株を含む。ある態様では、医薬組成物は、ビフィドバクテリウム・ブレーベ（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｒｅｖｅ）を含む細菌単離株（例えば、ＡＴＣＣ １５７００、ＡＴＣＣ １５６９８、ＡＴＣＣ １５７０１、またはそれらの組み合わせ）を含む。

【0109】

ある態様では、医薬組成物は、ストレプトコッカスの種を含む細菌単離株を含む。ある態様では、医薬組成物は、ストレプトコッカス・サリバリウス亜種サーモフィルス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ，ｓｕｂｓｐ．ｔｈｅｒｍｏｐｈｉｌｕｓ）を含む細菌単離株（例えば、ＡＴＣＣ １９２５８、ＡＴＣＣ ＢＡＡ－４９１、ＡＴＣＣ １４４８５、またはそれらの組み合わせ）を含む。

【0110】

ある態様では、医薬組成物は、バクテロイデスの種を含む細菌単離株を含む。ある態様では、医薬組成物は、バクテロイデス・フラギリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ）を含む細菌単離株（例えば、ＡＴＣＣ ２５２８５またはＡＴＣＣ ２３７４５）を含む。

【0111】

ある態様では、医薬組成物は、上記の細菌単離株または細菌株のうちの二つ以上を含む細菌混合物を含む。例えば、ある態様では、医薬組成物は、Ｌ．ラムノサスを含む細菌単離株（例えば、１９０７０－２）と組み合わされたＬ．ロイテリを含む細菌単離株（例えば、ＤＳＭ １２２４６）を含み得る。ある態様では、医薬組成物は、二つ以上、三つ以上、四つ以上、五つ以上、六つ以上、七つ以上、または八つの細菌単離株を含み得、各細菌単離株は、ストレプトコッカス・サーモフィルス、ビフィドバクテリウム・ブレーベ、ビフィドバクテリウム・ロンガム、ビフィドバクテリウム・ロンガム亜種インファンティス、ラクトバチルス・アシドフィルス、ラクトバチルス・プランタルム、ラクトバチルス・パラカゼイ、またはラクトバチルス・デルブルエッキイ亜種ブルガリクスのうちの一つを含む。ある態様では、医薬組成物は、細菌カクテルおよび／またはプロバイオティクスの形態で複数の細菌単離株を含み得る。医薬組成物に含まれ得る細菌カクテルの例は、ＶＳＬ＃３（登録商標）（Ａｌｆａｓｉｇｍａ（登録商標））である。

【0112】

ある態様では、本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれる細菌単離株は、プロバイオティクス、またはプロバイオティクスの成分である。ある態様では、本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれる複数の細菌単離株は、プロバイオティクス、またはプロバイオティクスの成分である。ある態様では、一つ以上の細菌単離株は、医薬組成物に組み込まれるとき、プロバイオティクスの形態である。

【0113】

本開示の態様では、医薬組成物は、複数の細菌単離株（例えば、細菌カクテルとして）を含む細菌混合物を含み得る。本開示の態様では、細菌混合物は、少なくとも２の細菌単離株、少なくとも３の細菌単離株、少なくとも４の細菌単離株、少なくとも５の細菌単離株、少なくとも６の細菌単離株、少なくとも７の細菌単離株、少なくとも８の細菌単離株、少なくとも９の細菌単離株、少なくとも１０の細菌単離株、またはさらに多い数の細菌単離株、例えば、１５、２０、２５、３０、またはそれ以上の細菌単離株を含み得る。

【0114】

様々な態様では、医薬組成物は、対象への組成物の投与後に、対象のＧＩ管に生着することができる一つ以上の細菌単離株を含む。本明細書では、「生着すること」または「生着」とは、（例えば、本明細書に記述される組成物を、例えば、経口的にまたは直腸に投与することによって、対象の腸管内に細菌株または単離株を導入した後に）対象の腸管において、細菌株または細菌単離株の細胞が経時的に安定的に存在することを指す。典型的には、（例えば、経口投与および／または直腸投与によって）対象の腸内に導入された細菌単離株の生着は、対象への細菌単離株の投与の前後の対象の糞便サンプル中の細菌単離株の存在量を比較することにより、超軸方向に、または経時的に測定される。ある態様では、対象の腸内に導入された細菌単離株は、投与前には存在していなかった。別の態様では、対象の腸内に導入された細菌単離株は、投与前に腸内に存在していたが、投与後に存在量が増加する。特定の態様では、生着は、対象への細菌株の投与後、少なくとも１日、少なくとも２日、少なくとも３日、少なくとも４日、少なくとも５日、少なくとも６日、少なくとも７日、少なくとも８日、少なくとも９日、少なくとも１０日、少なくとも１１日、少なくとも１２日、少なくとも１３日、少なくとも１４日、少なくとも１週間、少なくとも２週間、少なくとも３週間、少なくとも４週間、少なくとも５週間、少なくとも６週間、少なくとも７週間、少なくとも８週間、少なくとも１カ月、少なくとも２カ月、少なくとも３カ月、少なくとも４カ月、少なくとも５カ月、少なくとも６カ月、または６カ月よりも後に、対象の腸に投与された細菌株の存在量が増加したことを特定することにより判定される。

【0115】

本開示の態様では、対象の腸内の細菌単離株の生着は、細菌単離株が閾値用量で、または閾値用量を超えて対象に投与される時に発生する。本開示の態様では、対象の腸内の細菌単離株の生着は、閾値用量未満で細菌単離株が対象に投与される時には、発生しない、または（患者全体で）比較的非効率的に発生する。例えば、対象の腸内への細菌単離株の生着は、細菌単離株が、少なくとも１０^６個の細胞、少なくとも１０^７個の細胞、少なくとも１０^８個の細胞、少なくとも１０^９個の細胞、少なくとも１０^１０個の細胞、少なくとも１０^１１個の細胞、または少なくとも１０^１２個の細胞の用量で、対象に（例えば本明細書に記載される医薬組成物中、経口的または直腸に）投与されるときに、発生し得る。

【0116】

本開示の態様では、対象の腸内の細菌単離株の生着は、細菌単離株が閾値用量で、または閾値用量未満で対象に投与される時に発生する。ある態様では、対象の腸内の細菌単離株の生着は、閾値用量を超えて細菌単離株が対象に投与される時には、発生しない、または（患者全体で）比較的非効率的に発生する。例えば、対象の腸内への細菌単離株の生着は、細菌単離株が、１０^８個の細胞以下、１０^９個の細胞以下、１０^１０個の細胞以下、１０^１１個の細胞以下、または１０^１２個の細胞以下の用量で、対象に（例えば本明細書に記載される医薬組成物中、経口的または直腸に）投与されるときに、発生し得る。

【0117】

ある態様では、その必要のある患者への一つ以上の細菌単離株の投与は、細菌単離株の生着閾値に依存し得る。

【0118】

ある態様では、対象に投与される医薬組成物中の細菌単離株は、対象の十二指腸に生着する。ある態様では、対象に投与される医薬組成物中の細菌単離株は、対象の空腸に生着する。ある態様では、対象に投与される医薬組成物中の細菌単離株は、対象の回腸に生着する。ある態様では、対象に投与される医薬組成物中の細菌単離株は、対象の結腸に生着する。

【0119】

一部の態様では、細菌単離株は、非病原性細菌株である。ある態様では、非病原性細菌株は、病原性および／または毒性を引き起こす遺伝子を欠く、またはその発現を欠くゲノムを含む。例えば、一部の態様では、一つ以上の細菌単離株を含む細菌カクテルは、当該細菌カクテルを投与された対象において、疾患または障害を引き起こすことができる生物体または実体を実質的に含まない（例えば、病原性細菌を実質的に含まない）。

【0120】

ある態様では、細菌単離株は、健康なヒトドナーの糞便サンプルから元々取得された実験用ストックまたは細菌株の細菌細胞バンクから取得してもよい。例えば、糞便微生物叢（例えば、本明細書に記載の方法を使用して糞便サンプルから精製された）を、本明細書に記載の医薬組成物に組み込まれる細菌単離株の供給源として使用してもよい。特定の態様では、糞便サンプルの糞便微生物叢のすべてまたは一部が固形培地基質上で培養され、一つ以上の細菌単離株が単一コロニーとして特定される。他の態様では、糞便微生物叢のすべてまたは一部が、液体培養物に接種されて混合細菌培養物が生成され、次いでこれを連続希釈して、細菌単離株の単一細胞を含有する培養物が生成される。ある態様では、次いで特定された細菌単離株が公知の技術を使用して（固形培地または液体培地中で）培養され、拡張されてもよい。細菌株を単離、精製、および／または培養する方法は、ＳａｄｏｗｓｋｙらのＷＯ２０１２／１２２４７８に記載され、およびＢｏｒｏｄｙらのＷＯ２０１２／０１６２８７に記載されており、それら各文献が参照により本明細書に組み込まれる。

【0121】

ある態様では、本明細書に記載の細菌混合物は、真核細胞（例えば、ＡＳＤを治療するために細菌混合物を投与された哺乳動物の細胞）によるサイトカインの産生または放出を調節する。本明細書において、「真核細胞」とは、本明細書に記載される組成物を投与される対象の体内で、原位置（ｉｎ ｓｉｔｕ）に位置する細胞（例えば腸細胞）、ならびに例えば培養培地中など、生物体の外側で生体外（ｅｘ ｖｉｖｏ）増殖された、または増殖する細胞の両方を指す。

【0122】

ある態様では、本明細書に記載される細菌混合物は、対象に投与されると、当該対象の細胞（本明細書において「宿主細胞」と呼称される）においてサイトカインの産生を調節することができる。複数の実施形態では、細菌混合物中の細菌は、対象の宿主細胞からのサイトカインの産生および／または分泌を調節し、この場合において当該サイトカインは、当該対象の組織（例えば腸組織）に対し、抗炎症性の効果を発揮する傾向がある。本明細書に記載される組成物中で投与される細菌（例えば、細菌単離株）の存在に応答して、宿主細胞から産生および／または分泌され得るこのような抗炎症性サイトカインの例としては、ＩＬ－１０、ＩＬ－１３、ＩＬ－４、ＩＬ－５、ＴＧＦ－β、ＧＭ－ＣＳＦ、およびそれらの組み合わせが挙げられる。他の実施形態では、本明細書に記載の組成物中で投与される細菌混合物は、対象の宿主細胞からのサイトカインの産生および／または分泌を阻害し、この場合において当該サイトカインは、対象の組織（例えば、腸組織）に対して炎症促進性の効果を発揮する傾向がある。そのような炎症促進性サイトカインの例としては、ＩＦＮγ、ＩＬ－１２ｐ７０、ＩＬ－１（例えば、ＩＬ－１α、ＩＬ－１β）、ＩＬ－６、ＩＬ－８、ＩＬ－１２、ＩＬ－１７、ＩＬ－１８、ＩＬ－２３、ＭＣＰ１、ＭＩＰ１α、ＭＩＰ１β、ＴＮＦα、ＴＮＦ－γ、およびそれらの組み合わせが挙げられる。宿主細胞を誘導して、抗炎症性サイトカインを産生および／または分泌させることができる、または宿主細胞による炎症促進性サイトカインの産生および／または分泌を阻害することができる細菌混合物を含有する組成物を提供することにより、本明細書に記載される組成物は、自閉症と関連した炎症を治療、軽減、阻害および／または予防することができる。本明細書において、宿主細胞によるサイトカインの産生および／または分泌を調節することができる細菌混合物または細菌単離株は、「免疫調節性」と呼称される。

【0123】

複数の実施形態では、細菌混合物は、医薬組成物を投与された対象の細胞からのサイトカインの産生および／または放出を、直接的および／または間接的に調節することができる。一つの実施形態では、免疫調節性細菌（例えば、細菌単離株）は、例えば、細菌混合物中の細菌によって分泌される、または細菌の表面上に提示される微生物関連分子パターン（ＭＡＭＰＳ：ｍｉｃｒｏｂｅ－ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｐａｔｔｅｒｎｓ）を介して、対象の宿主細胞に直接作用することができる。そのようなＭＡＭＰＳは、特定の細菌種に対する宿主免疫応答において、主要な役割を果たす。ＭＡＭＰＳは、細菌と接触しているほとんどの宿主細胞型上で発現されるパターン認識受容体（ＰＲＲ：ｐａｔｔｅｒｎ ｒｅｃｏｇｎｉｔｉｏｎ ｒｅｃｅｐｔｏｒｓ）によって感知される。本明細書に記載の細菌混合物中の細菌のＭＡＭＰＳの例としては、非メチル化２－デオキシリボ（シチジン－リン酸塩－グアニン）（ＣｐＧ）ジヌクレオチド、細菌ペプチドグリカン、細菌リポ多糖類（ＬＰＳ、共受容体のＭＤ－２、ＣＤ１４、およびＬＰＢと相互作用して、ＴＬＲ－４への高アフィニティ結合とその後の宿主細胞活性化を促進する）、細菌リポタンパク質（ＬＰｓ）、リポタイコ酸、フラジェリン、膜小胞、およびエキソ多糖類が挙げられる。ＭＡＭＰＳとの相互作用を介してサイトカイン産生の調節を介在することができる腸内の宿主細胞および常在腸管免疫細胞により発現されるＰＲＲの例としては、Ｔｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）、ヌクレオチド結合オリゴマー化ドメイン（Ｎｏｄｓ）、ＮＯＤ様受容体、およびＣ型レクチンが挙げられる。腸管細胞ＰＲＲと微生物リガンドとの相互作用によって、免疫寛容と腸の健康の維持に必要な自然免疫系と獲得免疫系に関連するシグナル伝達経路が誘発される。

【0124】

別の実施形態では、免疫調節性細菌は、例えば、対象の宿主細胞の活性を調節する代謝物を分泌することによって、例えば、サイトカインを発現するように細胞を誘導することによって、医薬組成物を投与された対象の細胞（例えば、免疫細胞）に間接的に作用することができる。

【0125】

サイトカインの産生および／または放出が本明細書に記載の細菌混合物によって調節され得る宿主細胞の例としては、腸細胞、上皮細胞、腸粘膜細胞、腸上皮細胞、腸粘膜固有層細胞、内皮細胞、線維芽細胞、間質細胞、マクロファージ、Ｂリンパ球、Ｔリンパ球、マスト細胞、および末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）が挙げられる。

【0126】

別の実施形態では、本明細書に記載の細菌混合物は、細菌単離株が真核細胞と共培養されたとき、培養培地内にある、または培養培地中で増殖する真核細胞（例えば、ＰＢＭＣ）によるサイトカインの産生および／または放出を調節する（例えば、サイトカイン産生を増加させる）ことができる。

【0127】

ある態様では、一つ以上の細菌単離株（例えば、ラクトバチルス単離株）の組み合わせと、非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物が、対象に投与され、サイトカイン産生を調節する（例えば、抗炎症性サイトカインのレベルを上昇させ、または炎症促進性サイトカインのレベルを低下させることにより調節する）。複数の実施形態では、非培養糞便細菌調製物と、細菌単離株の組み合わせを含む細菌混合物の投与は、非培養糞便細菌、または細菌単離株のいずれか単独の投与により生じる調節よりも高度に、真核細胞により産生されるサイトカインのレベルを調節する。

【0128】

特定の実施形態では、本明細書に記載の細菌単離株は、抗炎症性サイトカインのプロファイルを誘導することができる。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して高いＩＬ－１０のレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して低いＩＬ－１２のレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して高いＧＭ－ＣＳＦのレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して低いＩＦＮ－ガンマのレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して低いＴＮＦ－アルファのレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して低いＩＬ－２３のレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して低いＩＬ－１２のレベルを生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して高いＩＬ－１０：ＩＬ－１２の比率を生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。ある実施形態では、細菌単離株は、対照株のレベルと比較して高いＩＬ－１０：ＴＮＦ－アルファの比率を生じさせるとき、抗炎症性サイトカインのプロファイルを呈する。

【0129】

ある態様では、医薬組成物は、例えば非選択糞便細菌、および／または糞便の実質的に完全な糞便微生物叢もしくはその一部（例えば、健康なヒトドナーに由来する）などの非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を含む。本明細書において、「実質的に完全な糞便微生物叢」という用語は、当該糞便微生物叢が抽出された糞便中の生細菌細胞を代表する細菌分類群のすべて、または実質的にすべてに由来する生きた細菌細胞を含む、非培養糞便細菌調製物を指す。ある態様では、実質的に完全な糞便微生物叢中の分類群のうちの少なくとも二つに由来する生細菌細胞の相対的存在量は、当該糞便微生物叢が抽出された糞便中の当該分類群に由来する生細胞の相対的存在量に比例する。ある態様では、細菌混合物はさらに、一つ以上の細菌単離株を含む。ある態様では、細菌混合物は、細菌単離株を含まない。

【0130】

一つの態様では、非培養糞便細菌調製物は、糞便サンプルに由来するドナーの糞便微生物叢全体、または実質的に完全な糞便微生物叢を含む。一つの態様では、非培養糞便細菌調製物は、非選択糞便微生物叢を含む。別の態様では、非培養糞便細菌調製物は、生きた非病原性糞便細菌の単離された、もしくは精製された集団または群を含む。さらなる態様では、非培養糞便細菌調製物は、単一のドナーに由来する非選択的で実質的に完全な糞便微生物叢調製物を含む。別の態様では、本明細書において使用される医薬組成物は、生きた非病原性の細菌単離株と、生きた非病原性の精製または抽出された非培養糞便細菌調製物の混合物を含む。

【0131】

ある態様では、非培養糞便細菌調製物の製造には、エタノール処理、洗剤処理、熱処理、照射、およびソニケーションからなる群から選択される処理が含まれる。別の態様では、非培養糞便細菌調製物の製造には、エタノール処理、洗剤処理、熱処理、照射、およびソニケーションからなる群から選択される処理が含まれない。一つの態様では、非培養糞便細菌調製物の製造には、密度勾配、濾過（例えば、ふるい、ナイロンメッシュ）およびクロマトグラフィーからなる群から選択される分離工程が含まれる。一つの態様では、非培養糞便細菌調製物の製造には、密度勾配、濾過（例えば、ふるい、ナイロンメッシュ）およびクロマトグラフィーからなる群から選択される分離工程が含まれない。一つの態様では、非培養糞便細菌調製物は、対象の糞便サンプルに由来する糞便微生物叢全体、または実質的に全体を含む。別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、ドナー真核細胞を実質的に含まない糞便微生物叢を含む。

【0132】

ある態様では、本明細書において提供され、投与される医薬組成物は、０．３以上、０．４以上、０．５以上、０．６以上、０．７以上、０．８以上、０．９以上、１．０以上、１．１以上、１．２以上、１．３以上、１．４以上、１．５以上、１．６以上、１．７以上、１．８以上、１．９以上、２．０以上、２．１以上、２．２以上、２．３以上、２．４以上、２．５以上、３．０以上、３．１以上、３．２以上、３．３以上、３．４以上、３．５以上、３．６以上、３．７以上、３．８以上、３．９以上、４．０以上、４．１以上、４．２以上、４．３以上、４．４以上、４．５以上、または５．０以上のシャノン多様性指標を含む、非培養糞便細菌調製物を含む。別の態様では、医薬組成物は、０．１～３．０、０．１～２．５、０．１～２．４、０．１～２．３、０．１～２．２、０．１～２．１、０．１～２．０、０．４～２．５、０．４～３．０、０．５～５．０、０．７～５．０、０．９～５．０、１．１～５．０、１．３～５．０、１．５～５．０、１．７～５．０、１．９～５．０、２．１～５．０、２．３～５．０、２．５～５．０、２．７～５．０、２．９～５．０、３．１～５．０、３．３～５．０、３．５～５．０、３．７～５．０、３１．９～５．０、または４．１～５．０のシャノン多様性指標を含む糞便微生物叢を含む。一つの態様では、シャノン多様性指標は、門レベルで計算される。別の態様では、シャノン多様性指標は、科レベルで計算される。一つの態様では、シャノン多様性指標は、属レベルで計算される。別の態様では、シャノン多様性指標は、種レベルで計算される。さらなる態様では、医薬組成物は、正常で健康なヒト糞便フロラに類似した比例含有量のフロラ調製物を含む。

【0133】

さらなる態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、または２０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。さらに別の態様では、医薬組成物は、少なくとも２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、または３０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。さらなる態様では、医薬組成物は、少なくとも３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、または４０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９、または５０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。別の態様では、医薬組成物は、１～１０、１０～２０、２０～３０、３０～４０、４０～５０種類の異なる科に由来する糞便細菌を含む。ある態様では、本明細書において提供および投与される医薬組成物は、０．０５％以下、０．１％以下、０．２％以下、０．３％以下、０．４％以下、０．５％以下、０．６％以下、０．７％以下、０．８％以下、０．９％以下、１％以下、２％以下、３％以下、４％以下、５％以下、６％以下、７％以下、８％以下、９％以下、または１０％以下の非生存物質重量／生物学的物質重量を含む、非培養糞便細菌調製物を含む。ある態様では、本明細書において提供および投与される医薬組成物は、２０％以下、２５％以下、３０％以下、３５％以下、４０％以下、４５％以下、５０％以下、５５％以下、６０％以下、６５％以下、７０％以下、７５％以下、８０％以下、８５％以下、９０％以下、または９５％以下の非生存物質重量／生物学的物質重量を含む、非培養糞便微生物叢を含む。別の態様では、本明細書において提供および投与される医薬組成物は、２．０ｍｍ、１．０ｍｍ、０．５ｍｍ、０．３３ｍｍ，０．２５ｍｍ、０．２１２ｍｍ、０．１８０ｍｍ、０．１５０ｍｍ、０．１２５ｍｍ、０．１０６ｍｍ、０．０９０ｍｍ、０．０７５ｍｍ、０．０６３ｍｍ、０．０５３ｍｍ、０．０４５ｍｍ、０．０３８ｍｍ、０．０３２ｍｍ、０．０２５ｍｍ、０．０２０ｍｍ、０．０１ｍｍ、または０．００２ｍｍのふるいフィルターサイズ、排除フィルターサイズ、または粒子フィルターサイズを有する、ふるい、カラムまたは類似のろ過デバイスを通過する、糞便サンプルの非生存物質の粒子および／または生物学的物質の粒子を含み、からなり、または本質的にからなる。「非生存物質」は、処理された糞便物質に添加される例えば凍結保護剤などの薬学的に不活性な物質などの賦形剤を含まない。「生物学的物質」とは、糞便物質中の生きた物質を指し、例えば細菌および古細菌などの原核細胞（例えば、生きた原核生物細胞、および胞子形成して生きた原核生物細胞となることができる胞子）、例えば原生生物や真菌などの真核細胞、ならびにウイルスを含む微生物が含まれる。一つの態様では、「生物学的物質」とは、例えば正常で健康なヒトの結腸に存在する微生物、真核細胞、およびウイルスなどの生きた物質を指す。ある態様では、本明細書において提供または投与される医薬組成物は、ヒト糞便の抽出物を含み、この場合において当該組成物は実質的に無臭である。ある態様では、本明細書において提供または投与される医薬組成物は、凍結乾燥製剤、粗製剤、半精製製剤または精製製剤における、糞便物質または糞便フロラ調製物を含む。

【0134】

ある態様では、医薬組成物に含まれる非培養糞便細菌調製物は、高度に純化または精製された糞便フロラを含み、例えば、非フロラ糞便物質を実質的に含まない。ある態様では、ドナーから採取された非培養糞便微生物叢（非培養糞便細菌調製物を含む）はさらに処理されて、例えば、ふるいの前、後、またはふるい前後にマイクロ濾過を経てもよい。別の態様では、高度に精製された糞便微生物叢産物は、超濾過されて、高分子が除去されるが、例えば細菌などの治療用マイクロフロラは保持される。

【0135】

別の態様では、本明細書において使用される医薬組成物中の非培養糞便細菌調製物は、少なくとも約９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、９９％、９９．５％、９９．６％、９９．７％、９９．８％もしくは９９．９％で単離され、または純粋である糞便フロラの単離物、または約０．１％、０．２％、０．３％、０．４％、０．５％、０．６％、０．７％、０．８％、０．９％もしくは１．０％以上の非糞便フロラ物質を有する糞便フロラの単離物である、実質的に単離された、もしくは精製された糞便フロラ、または全（または実質的に全）微生物叢、またはＳａｄｏｗｓｋｙらのＷＯ２０１２／１２２４７８Ａ１もしくはＢｏｒｏｄｙらのＷＯ２０１２／０１６２８７Ａ２に記載されるように、実質的に単離され、精製され、または実質的に全微生物叢を含み、または本質的にからなる。

【0136】

ある態様では、医薬組成物中に含有される非培養糞便細菌調製物は、ドナーの実質的に糞便微生物叢全体、または非選択糞便微生物叢を含む。別の態様では、医薬組成物中の糞便微生物叢は、抗生物質耐性の集団を含まない。別の態様では、医薬組成物は、非培養糞便微生物叢を含み、外来性物質（例えば、残留繊維、ＤＮＡ、ＲＮＡ、ウイルス被覆物質、非生存物質などの無細胞物質を含む非生存物質、および糞便物質のドナーに由来する真核細胞などの生存物質）をほとんど含まない。

【0137】

ある態様では、医薬組成物中の非培養糞便細菌調製物は、ヒトドナーの疾患スクリーニングされた糞便サンプルに由来する。ある態様では、糞便サンプルは、抗生物質耐性の集団を含まない。例えば、組成物は、抗生物質耐性の集団を含まない正常で健康なヒト糞便フロラに類似した、比例含有量であり得る生存フロラの調製物を含み得る。

【0138】

一つの態様では、本明細書に記載され、使用される非培養糞便細菌調製物は、アシダミノコッカス（Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、アッカーマンシア（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アリスティペス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）、アナエロツルンカス（Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブラウティア（Ｂｌａｕｔｉａ）、ブチリビブリオ（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）、コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ドレア（Ｄｏｒｅａ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、ユーバクテリウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ヘモフィルス（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ホールディマニア（Ｈｏｌｄｅｍａｎｉａ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、モラクセラ（Ｍｏｒａｘｅｌｌａ）、パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、プレボテラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、プロピオニバクテリウム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラオウルテラ（Ｒａｏｕｌｔｅｌｌａ）、ロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、スタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、サブドリグラヌルム（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）、およびベイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、または五つ以上の生きた糞便微生物を含む。一つの態様では、糞便微生物叢調製物は、バクテロイデス・フラギリス亜種ブルガツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｖｕｌｇａｔｕｓ）、コリンセラ・アエロファシエンス（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ）、バクテロイデス・フラギリス亜種 シータイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、ぺプトストレプトコッカス・プロダクツス ＩＩ（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ ＩＩ）、パラバクテロイデス・ディスタソニス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）、コプロコッカス・エウタクツス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｅｕｔａｃｔｕｓ）、ぺプトストレプトコッカス・プロダクツス Ｉ（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ Ｉ）、ルミノコッカス・ブロミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｂｒｏｍｉｉ）、ビフィドバクテリウム・アドレッセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、ゲムミゲル・ホルミシリス（Ｇｅｍｍｉｇｅｒ ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）、ユーバクテリウム・シラエウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｉｒａｅｕｍ）、ルミノコッカス・トークス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｔｏｒｑｕｅｓ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、ユーバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｅｌｉｇｅｎｓ）、バクテロイデス・エッゲルチイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ）、くろす・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｌｅｐｔｕｍ）、バクテロイデス・フラギリス亜種Ａ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．Ａ）、ユーバクテリウム・ビホルメ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｏｒｍｅ）、ビフィドバクテリウム・インファンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｉｎｆａｎｔｉｓ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、コプロコッカス・コメス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｍｅｓ）、シュードフラボニフラクター・カピローサス（Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ）、ルミノコッカス・アルブス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ａｌｂｕｓ）、ドレア・ホルミシゲネランス（Ｄｏｒｅａ ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、ユーバクテリウム・ハリイ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｈａｌｌｉｉ）、ユーバクテリウム・ベントリサム Ｉ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ Ｉ）、フソバクテリウム・ルッシ（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｕｓｓｉ）、ルミノコッカス・オベウム（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｏｂｅｕｍ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、クロストリジウム・ラモサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｒａｍｏｓｕｍ）、ラクトバチルス・ライヒマンニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ）、ルミノコッカス・カリダス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｌｌｉｄｕｓ）、ブチリビブリオ・クロッソタス（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ ｃｒｏｓｓｏｔｕｓ）、アシダミノコッカス・フェルメンタンス（Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、ユーバクテリウム・ベントリサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ）、バクテロイデス・フラギリス亜種 フラギリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｆｒａｇｉｌｉｓ）、コプロコッカス・カツス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｔｕｓ）、アエロスティペス・ハドラス（Ａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ ｈａｄｒｕｓ）、ユーバクテリウム・シリンドロイデス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ）、ユーバクテリウム・ルミナンチウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ）、スタフィロコッカス・エピデルミディス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）、ユーバクテリウム・リモサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｍｏｓｕｍ）、チッシレラ・プラエアクタ（Ｔｉｓｓｉｒｅｌｌａ ｐｒａｅａｃｕｔａ）、フソバクテリウム・モルチフェラム Ｉ（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ Ｉ）、フソバクテリウム・ナビホルメ（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｎａｖｉｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・イノキュウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｉｎｎｏｃｕｕｍ）、クロストリジウム・ラモサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｒａｍｏｓｕｍ）、プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ）、ルミノコッカス・フラベファシエンス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ）、バクテロイデス・フラギリス亜種 オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｏｖａｔｕｓ）、フソバクテリウム・ヌクレアツム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｎｕｃｌｅａｔｕｍ）、フソバクテリウム・モルチフェラム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ）、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）、ゲメラ・モルビロラム（Ｇｅｍｅｌｌａ ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ）、フィネゴルディア・マグヌス（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ ｍａｇｎｕｓ）、ストレプトコッカス・インターメディウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、ルミノコッカス・ラクタリス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔａｒｉｓ）、ユーバクテリウム・テヌエ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｅｎｕｅ）、ユーバクテリウム・ラムルス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒａｍｕｌｕｓ）、バクテロイデス・クロストリジイホルミス亜種クロストリジイホルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｆｏｒｍｉｓ ｓｓｐ．ｃｌｏｓｔｒｉｄｌｉｆｏｒｍｉｓ）、バクテロイデス・コアグランス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、プレボテラ・オラリス（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｏｒａｌｉｓ）、プレボテラ・ルミニコラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｒｕｍｉｎｉｃｏｌａ）、オドリバクター・スプランクニクス（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ）、およびデスイフォモナス・ピグラ（Ｄｅｓｕｉｆｏｍｏｎａｓ ｐｉｇｒａ）からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、または五つ以上の生存糞便微生物を含む。

【0139】

一つの態様では、本明細書に記載され、使用される糞便微生物叢調製物は、アシダミノコッカス（Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、アッカーマンシア（Ａｋｋｅｒｍａｎｓｉａ）、アリスティペス（Ａｌｉｓｔｉｐｅｓ）、アナエロツルンカス（Ａｎａｅｒｏｔｒｕｎｃｕｓ）、バクテロイデス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、ビフィドバクテリウム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ブラウティア（Ｂｌａｕｔｉａ）、ブチリビブリオ（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ）、クロストリジウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ）、コリンセラ（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ）、コプロコッカス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ）、コリネバクテリウム（Ｃｏｒｙｎｅｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ドレア（Ｄｏｒｅａ）、エンテロコッカス（Ｅｎｔｅｒｏｃｏｃｃｕｓ）、エシェリキア（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ）、ユーバクテリウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、フィーカリバクテリウム（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ヘモフィルス（Ｈａｅｍｏｐｈｉｌｕｓ）、ホールディマニア（Ｈｏｌｄｅｍａｎｉａ）、ラクトバチルス（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ）、モラクセラ（Ｍｏｒａｘｅｌｌａ）、パラバクテロイデス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ）、プレボテラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ）、プロピオニバクテリウム（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ）、ラオウルテラ（Ｒａｏｕｌｔｅｌｌａ）、ロゼブリア（Ｒｏｓｅｂｕｒｉａ）、ルミノコッカス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ）、スタフィロコッカス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ）、ストレプトコッカス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ）、サブドリグラヌルム（Ｓｕｂｄｏｌｉｇｒａｎｕｌｕｍ）、およびベイロネラ（Ｖｅｉｌｌｏｎｅｌｌａ）からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、または五つ以上の生きた糞便微生物を欠くか、または実質的に有さない。一つの態様では、糞便微生物叢調製物は、バクテロイデス・フラギリス亜種ブルガツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｖｕｌｇａｔｕｓ）、コリンセラ・アエロファシエンス（Ｃｏｌｌｉｎｓｅｌｌａ ａｅｒｏｆａｃｉｅｎｓ）、バクテロイデス・フラギリス亜種シータイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、ぺプトストレプトコッカス・プロダクツス ＩＩ（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ ＩＩ）、パラバクテロイデス・ディスタソニス（Ｐａｒａｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、フィーカリバクテリウム・プラウスニッツイ（Ｆａｅｃａｌｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｐｒａｕｓｎｉｔｚｉｉ）、コプロコッカス・エウタクツス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｅｕｔａｃｔｕｓ）、ぺプトストレプトコッカス・プロダクツス Ｉ（Ｐｅｐｔｏｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｐｒｏｄｕｃｔｕｓ Ｉ）、ルミノコッカス・ブロミイ（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｂｒｏｍｉｉ）、ビフィドバクテリウム・アドレッセンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｄｏｌｅｓｃｅｎｔｉｓ）、ゲムミゲル・ホルミシリス（Ｇｅｍｍｉｇｅｒ ｆｏｒｍｉｃｉｌｉｓ）、ビフィドバクテリウム・ロンガム（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｏｎｇｕｍ）、ユーバクテリウム・シラエウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｓｉｒａｅｕｍ）、ルミノコッカス・トークス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｔｏｒｑｕｅｓ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、ユーバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｅｌｉｇｅｎｓ）、バクテロイデス・エッゲルチイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ）、くろす・レプツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｌｅｐｔｕｍ）、バクテロイデス・フラギリス亜種Ａ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．Ａ）、ユーバクテリウム・ビホルメ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｂｉｆｏｒｍｅ）、ビフィドバクテリウム・インファンティス（Ｂｉｆｉｄｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｉｎｆａｎｔｉｓ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、コプロコッカス・コメス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｍｅｓ）、シュードフラボニフラクター・カピローサス（Ｐｓｅｕｄｏｆｌａｖｏｎｉｆｒａｃｔｏｒ ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ）、ルミノコッカス・アルブス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ａｌｂｕｓ）、ドレア・ホルミシゲネランス（Ｄｏｒｅａ ｆｏｒｍｉｃｉｇｅｎｅｒａｎｓ）、ユーバクテリウム・ハリイ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｈａｌｌｉｉ）、ユーバクテリウム・ベントリサム Ｉ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ Ｉ）、フソバクテリウム・ルッシ（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｕｓｓｉ）、ルミノコッカス・オベウム（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｏｂｅｕｍ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、クロストリジウム・ラモサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｒａｍｏｓｕｍ）、ラクトバチルス・ライヒマンニイ（Ｌａｃｔｏｂａｃｉｌｌｕｓ ｌｅｉｃｈｍａｎｎｉｉ）、ルミノコッカス・カリダス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｌｌｉｄｕｓ）、ブチリビブリオ・クロッソタス（Ｂｕｔｙｒｉｖｉｂｒｉｏ ｃｒｏｓｓｏｔｕｓ）、アシダミノコッカス・フェルメンタンス（Ａｃｉｄａｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｆｅｒｍｅｎｔａｎｓ）、ユーバクテリウム・ベントリサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｖｅｎｔｒｉｏｓｕｍ）、バクテロイデス・フラギリス亜種フラギリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｆｒａｇｉｌｉｓ）、コプロコッカス・カツス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｔｕｓ）、アエロスティペス・ハドラス（Ａｅｒｏｓｔｉｐｅｓ ｈａｄｒｕｓ）、ユーバクテリウム・シリンドロイデス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｃｙｌｉｎｄｒｏｉｄｅｓ）、ユーバクテリウム・ルミナンチウム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｕｍｉｎａｎｔｉｕｍ）、スタフィロコッカス・エピデルミディス（Ｓｔａｐｈｙｌｏｃｏｃｃｕｓ ｅｐｉｄｅｒｍｉｄｉｓ）、ユーバクテリウム・リモサム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｌｉｍｏｓｕｍ）、チッシレラ・プラエアクタ（Ｔｉｓｓｉｒｅｌｌａ ｐｒａｅａｃｕｔａ）、フソバクテリウム・モルチフェラム Ｉ（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ Ｉ）、フソバクテリウム・ナビホルメ（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｎａｖｉｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・イノキュウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｉｎｎｏｃｕｕｍ）、クロストリジウム・ラモサム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｒａｍｏｓｕｍ）、プロピオニバクテリウム・アクネス（Ｐｒｏｐｉｏｎｉｂａｃｔｅｒｉｕｍ ａｃｎｅｓ）、ルミノコッカス・フラベファシエンス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｆｌａｖｅｆａｃｉｅｎｓ）、バクテロイデス・フラギリス亜種 オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ ｓｓｐ．ｏｖａｔｕｓ）、フソバクテリウム・ヌクレアツム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｎｕｃｌｅａｔｕｍ）、フソバクテリウム・モルチフェラム（Ｆｕｓｏｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｍｏｒｔｉｆｅｒｕｍ）、エシェリキア・コリ（Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ）、ゲメラ・モルビロラム（Ｇｅｍｅｌｌａ ｍｏｒｂｉｌｌｏｒｕｍ）、フィネゴルディア・マグヌス（Ｆｉｎｅｇｏｌｄｉａ ｍａｇｎｕｓ）、ストレプトコッカス・インターメディウス（Ｓｔｒｅｐｔｏｃｏｃｃｕｓ ｉｎｔｅｒｍｅｄｉｕｓ）、ルミノコッカス・ラクタリス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｌａｃｔａｒｉｓ）、ユーバクテリウム・テヌエ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｔｅｎｕｅ）、ユーバクテリウム・ラムルス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒａｍｕｌｕｓ）、バクテロイデス・クロストリジイホルミス亜種クロストリジイホルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｉｆｏｒｍｉｓ ｓｓｐ．ｃｌｏｓｔｒｉｄｌｉｆｏｒｍｉｓ）、バクテロイデス・コアグランス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｏａｇｕｌａｎｓ）、プレボテラ・オラリス（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｏｒａｌｉｓ）、プレボテラ・ルミニコラ（Ｐｒｅｖｏｔｅｌｌａ ｒｕｍｉｎｉｃｏｌａ）、オドリバクター・スプランクニクス（Ｏｄｏｒｉｂａｃｔｅｒ ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ）、およびデスイフォモナス・ピグラ（Ｄｅｓｕｉｆｏｍｏｎａｓ ｐｉｇｒａ）からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、または五つ以上の生存糞便微生物を欠くか、または実質的に有さない。

【0140】

ある態様では、医薬組成物への組み込みのための非培養糞便細菌調製物は、クロストリジウム・アブソヌム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ａｂｓｏｎｕｍ）、クロストリジウム・アルゲンチネンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ａｒｇｅｎｔｉｎｅｎｓｅ）、クロストリジウム・ハラチイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｂａｒａｔｉｉ）、クロストリジウム・ボツリヌム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｂｏｔｕｌｉｎｕｍ）、クロストリジウム・カダベリス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｃａｄａｖｅｒｉｓ）、クロストリジウム・カルニス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｃａｒｎｉｓ）、クロストリジウム・セラツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｃｅｌａｔｕｍ）、クロストリジウム・ショウベイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｃｈａｕｖｏｅｉ）、クロストリジウム・クロストリジオホルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｏｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・コクレアリウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｃｏｃｈｌｅａｒｉｕｍ）、クロストリジウム・ファラックス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｆａｌｌａｘ）、クロストリジウム・フェルシネウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｆｅｌｓｉｎｅｕｍ）、クロストリジウム・ゴニイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｇｈｏｎｉｉ）、クロストリジウム・グリコリクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｇｌｙｃｏｌｉｃｕｍ）、クロストリジウム・ヘモリチクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｈａｅｍｏｌｙｔｉｃｕｍ）、クロストリジウム・ハスティホルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｈａｓｔｉｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・ヒストリチクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｈｉｓｔｏｌｙｔｉｃｕｍ）、クロストリジウム・インドーリス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｉｎｄｏｌｉｓ）、クロストリジウム・イレギュラレ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｉｒｒｅｇｕｌａｒｅ）、クロストリジウム・リモスム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｌｉｍｏｓｕｍ）、クロストリジウム・マレノミナツム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｍａｌｅｎｏｍｉｎａｔｕｍ）、クロストリジウム・ノービイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｎｏｖｙｉ）、クロストリジウム・オロティクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｏｒｏｔｉｃｕｍ）、クロストリジウム・パラプトリフィクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｐａｒａｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ）、クロストリジウム・パーフリンゲンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｐｅｒｆｒｉｎｇｅｎｓ）、クロストリジウム・ピリフォルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｐｉｌｉｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・プトレファシエンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｐｕｔｒｅｆａｃｉｅｎｓ）、クロストリジウム・プトリフィクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｐｕｔｒｉｆｉｃｕｍ）、クロストリジウム・サルディニエンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓａｒｄｉｎｉｅｎｓｅ）、クロストリジウム・サルタゴフォルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓａｒｔａｇｏｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・シンデンス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｃｉｎｄｅｎｓ）、クロストリジウム・スペティクム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｅｐｔｉｃｕｍ）、クロストリジウム・ソルデリイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｏｒｄｅｌｌｉｉ）、クロストリジウム・スフェノイデス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐｈｅｎｏｉｄｅｓ）、クロストリジウム・スピロフォルメ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐｉｒｏｆｏｒｍｅ）、クロストリジウム・スポロゲネス（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｐｏｒｏｇｅｎｅｓ）、クロストリジウム・スブテルミナレ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｕｂｔｅｒｍｉｎａｌｅ）、クロストリジウム・シンビオスム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｓｙｍｂｉｏｓｕｍ）、クロストリジウム・テルチウム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｔｅｒｔｉｕｍ）、クロストリジウム・テタニ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｔｅｔａｎｉ）、クロストリジウム・ウェルチイ（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｗｅｌｃｈｉｉ）、およびクロストリジウム・ビロスム（Ｃｌｏｓｔｒｉｄｉｕｍ ｖｉｌｌｏｓｕｍ）からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、または四つ以上のクロストリジウム属の非病原性胞子を含む。ある態様では、医薬組成物は、バクテロイデス・コプロコラ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｏｐｒｏｃｏｌａ）、バクテロイデス・プレベイウス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｐｌｅｂｅｉｕｓ）、バクテロイデス・マッシリエンシス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｍａｓｓｉｌｉｅｎｓｉｓ）、バクテロイデス・ブルガツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｖｕｌｇａｔｕｓ）、バクテロイデス・ヘルコゲネス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｈｅｌｃｏｇｅｎｅｓ）、バクテロイデス・ピオゲネス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｐｙｏｇｅｎｅｓ）、バクテロイデス・テクツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｔｅｃｔｕｓ）、バクテロイデス・ユニフォルミス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｕｎｉｆｏｒｍｉｓ）、バクテロイデス・ステルコリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｓｔｅｒｃｏｒｉｓ）、バクテロイデス・エガーシイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｅｇｇｅｒｔｈｉｉ）、バクテロイデス・フィネゴルジイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｉｎｅｇｏｌｄｉｉ）、バクテロイデス・シータイオタオミクロン（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｔｈｅｔａｉｏｔａｏｍｉｃｒｏｎ）、バクテロイデス・オバツス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｏｖａｔｕｓ）、バクテロイデス・アシディファシエンス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ａｃｉｄｉｆａｃｉｅｎｓ）、バクテロイデス・カッカエ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃａｃｃａｅ）、バクテロイデス・ノルジイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｎｏｒｄｉｉ）、バクテロイデス・サルエルシアエ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｓａｌｙｅｒｓｉａｅ）、バクテロイデス・フラギリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｒａｇｉｌｉｓ）、バクテロイデス・インテスチナリス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｉｎｔｅｓｔｉｎａｌｉｓ）、バクテロイデス・コプロスイス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｏｐｒｏｓｕｉｓ）、バクテロイデス・ディスタソニス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｄｉｓｔａｓｏｎｉｓ）、バクテロイデス・ゴルドステイニイ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｇｏｌｄｓｔｅｉｎｉｉ）、バクテロイデス・メルダエ（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｍｅｒｄａｅ）、バクテロイデス・フォーサイサス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｆｏｒｓｙｔｈｕｓ）、バクテロイデス・スプランキニクス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｓｐｌａｎｃｈｎｉｃｕｓ）、バクテロイデス・カピロサス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃａｐｉｌｌｏｓｕｓ）、バクテロイデス・セルロソルベンス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｃｅｌｌｕｌｏｓｏｌｖｅｎｓ）、およびバクテロイデス・ウレオリチカス（Ｂａｃｔｅｒｏｉｄｅｓ ｕｒｅｏｌｙｔｉｃｕｓ）の群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、または四つ以上の非病原性バクテロイデス種を含む。

【0141】

ある態様では、医薬組成物は、生きた非病原性のクロストリジウムと、コリンセラ、コプロコッカス、ドレア、ユーバクテリウムおよびルミノコッカスからなる群から選択される一つ以上の属に由来する複数の生きた非病原性の微生物を含む。別の態様では、医薬組成物は、クロストリジウム、コリンセラ、コプロコッカス、ドレア、ユーバクテリウムおよびルミノコッカスからなる群から選択される一つ以上の属に由来する複数の生きた非病原性の微生物を含む。

【0142】

ある態様では、医薬組成物は、コリンセラ、コプロコッカス、ドレア、ユーバクテリウム、およびルミノコッカスからなる群から選択される二つ以上の属を含む。別の態様では、医薬組成物は、コプロコッカス、ドレア、ユーバクテリウム、およびルミノコッカスからなる群から選択される二つ以上の属を含む。さらなる態様では、医薬組成物は、コプロコッカス・カツス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃａｔｕｓ）、コプロコッカス・コメス（Ｃｏｐｒｏｃｏｃｃｕｓ ｃｏｍｅｓ）、ドレア・ロンギカテナ（Ｄｏｒｅａ ｌｏｎｇｉｃａｔｅｎａ）、ユーバクテリウム・エリゲンス（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｅｌｉｇｅｎｓ）、ユーバクテリウム・ハドルム（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｈａｄｒｕｍ）、ユーバクテリウム・ハリイ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｈａｌｌｉｉ）、ユーバクテリウム・レクタレ（Ｅｕｂａｃｔｅｒｉｕｍ ｒｅｃｔａｌｅ）、およびルミノコッカス・トルクエス（Ｒｕｍｉｎｏｃｏｃｃｕｓ ｔｏｒｑｕｅｓ）からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、または五つ以上の種を含む。

【0143】

ある態様では、本明細書に記載される非培養糞便細菌調製物は、当該糞便細菌が由来する糞便において代表される１００％の生きた細菌分類群に由来する生細胞を含む。ある態様では、本明細書に記載される非培養糞便細菌調製物は、当該糞便細菌が由来する糞便において代表される生きた細菌分類群の少なくとも９９％に由来する生細胞を含む。ある態様では、本明細書に記載される非培養糞便細菌調製物は、当該糞便細菌が由来する糞便において代表される生きた細菌分類群の少なくとも９８％に由来する生細胞を含む。ある態様では、本明細書に記載される非培養糞便細菌調製物は、当該糞便細菌が由来する糞便において代表される生きた細菌分類群の少なくとも９７％に由来する生細胞を含む。ある態様では、本明細書に記載される非培養糞便細菌調製物は、当該糞便細菌が由来する糞便において代表される生きた細菌分類群の９６％に由来する生細胞を含む。ある態様では、本明細書に記載される非培養糞便細菌調製物は、当該糞便細菌が由来する糞便において代表される生きた細菌分類群の少なくとも９５、９４、９３、９２、９１、９０、８９、８８、８７、８５、８４、８３、８２、８１、８０、７５、７０、６５、６０、５５、５０、４５、または４０％に由来する生細胞を含む。

【0144】

ある態様では、本明細書に開示される医薬組成物は、滅菌糞便ろ過物または非細胞性糞便ろ過物を含む。一つの態様では、滅菌糞便ろ過物は、ドナーの糞便に由来する。別の態様では、滅菌糞便ろ過物は、培養微生物に由来する。別の態様では、滅菌糞便ろ過物は、非細胞性で非粒子性の糞便成分を含む。一つの態様では、滅菌糞便ろ過物は、２０１４年５月３０日に公開されたＷＯ２０１４／０７８９１１に記載されるように作製される。別の態様では、滅菌糞便ろ過物は、Ｏｔｔ ｅｔ ａｌ．，Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌｏｇｙ １５２：７９９－９１１（２０１７）に記載されるように作製される。

【0145】

一つの態様では、糞便ろ過物は、分泌された成分、排泄された成分、もしくは別手段による液体成分、または微生物叢を含み、例えば抗生物質または抗炎症薬であり得る生物学的活性分子（ＢＡＭ）が、フロラ抽出物中に保存され、保持され、または再構成される。

【0146】

一つの態様では、糞便ろ過物を含む例示的な医薬組成物は、規定のドナープールからのドナーに由来する開始物質を含み、この場合において当該ドナーは糞便を提供し、当該糞便はホモジナイズおよび遠心分離されて、例えば多くの場合は約５マイクロメーター直径未満の金属ふるいまたはミリポアフィルターなどを使用した超高レベルのろ過を受けて、最終的に細菌起源の細胞のみが残留する。最初の遠心分離後に固形物質を液体から分離することができ、次いで当該固形物を、例えばミリポアろ過を使用して、および任意選択的にナノ膜ろ過の使用も含み、漸減サイズフィルターおよび接線フィルターにおいてろ過する。ろ過は、ＷＯ ２０１２／１２２４７８に記載されるようなふるいにより行われてもよいが、対照的に、．０１２０ｍｍより小さく、約．０１１０ｍｍまでのふるいを使用すると、細菌細胞のみが最終的に存在するようになる。

【0147】

遠心分離中に分離された上清は、一部の態様では、例えばミリポアろ過または同等のシステムなどのろ過において漸進的にろ過されて液体を生成し、これを約０．２２ミクロンフィルターを通して微細濾過する。これにより、細菌およびウイルスを含む、すべての生存物質を含むすべての粒子状物質が除去される。その後、生成物は滅菌される。しかし目的は、細菌を除去するが、その分泌物、特に抗微生物性バクテリオシン、細菌由来サイトカイン様生成物、および付随する全ての生物活性分子（ＢＡＭ）を維持することであり、当該分子としては、スリシン（ドナー糞便においてバシラス綱により分泌される）、バクテリオシン（コリシン（ｃｏｌｉｃｉｎ）、トロウデュリキシン（ｔｒｏｕｄｕｌｉｘｉｎｅ）またはプタインディシン（ｐｕｔａｉｎｄｉｃｉｎｅ）、またはマイクロシン（ｍｉｃｒｏｃｉｎ）またはサブチロシンＡ（ｓｕｂｔｉｌｏｓｉｎ Ａ））、ランビオティクス（ｌａｎｂｉｏｔｉｃｓ）（ニシン（ｎｉｓｉｎ）、サブチリン（ｓｕｂｔｉｌｉｎ）、エピデルミン（ｅｐｉｄｅｒｕｍｉｎ）、ムタシン（ｍｕｔａｃｉｎ）、メルサシジン（ｍｅｒｓａｃｉｄｉｎ）、アンタガルジン（ａｎｔａｇａｒｄｉｎｅ）、シンナマイシン（ｃｉｎｎａｍｙｃｉｎ））、ラクチシン（ｌａｃｔｉｃｉｎｓ）および他の抗微生物性化合物または抗炎症性化合物が挙げられる。

【0148】

一つの態様では、医薬組成物は、精製された糞便微生物叢（非培養糞便細菌調製物を含む）および非細胞性糞便ろ過物の組み合わせから本質的になる、生構成された糞便フロラを含む。別の態様では、医薬組成物は、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分を補充された精製糞便微生物叢（非培養糞便細菌調製物を含む）を含む。一つの態様では、医薬組成物は、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分を含む。一つの態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、合成分子、糞便微生物によって産生される生物活性分子、またはその両方を含む。別の態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、生物学的に活性なタンパク質もしくはペプチド、微量栄養素、脂肪、糖、低炭水化物、微量元素、無機塩、灰分、粘液、アミノ酸、栄養素、ビタミン、ミネラル、またはそれらの任意の組み合わせを含む。一つの態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、バクテリオシン、ランビオティクス、およびラクチシンからなる群から選択される一つ以上の生物活性分子を含む。別の態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、コリシン、トロウデュリキシン、プタインディシン、マイクロシンおよびサブチロシンＡからなる群から選択される一つ以上のバクテリオシンを含む。一つの態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、スリシン、ニシン、サブチリン、エピデルミン、ムタシン、メルサシジン、アクタガルジン（ａｃｔａｇａｒｄｉｎｅ）、およびシンナマイシンからなる群から選択される一つ以上のランビオティクスを含む。別の態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、抗胞子化合物、抗微生物化合物、抗炎症化合物、またはそれらの任意の組み合わせを含む。さらなる態様では、一つ以上の非細胞性非粒子状糞便成分は、インターロイキン、サイトカイン、ロイコトリエン、エイコサノイド、またはそれらの任意の組み合わせを含む。

【0149】

別の態様では、医薬組成物は、例えばヒトＧＩ微生物叢の部分的または完全な代表物である非培養糞便細菌調製物と、フロラ（微生物叢）の単離された、処理された、ろ過された、濃縮された、再構成された、および／または人工の液体成分（例えば糞便ろ過物）の両方を含み、液体成分は他の成分の中でも細菌分泌産物、例えばバクテリオシン（細菌により産生されるタンパク質毒素、コリシン、トロウデュリキシンもしくはプタインディシン、またはマイクロシンもしくはサブチロシンＡを含む）、ランビオティクス（特徴的な多環式チオエーテルアミノ酸のランチオニン（ｌａｎｔｈｉｏｎｉｎｅ）またはメチルランチオニン（ｍｅｔｈｙｌｌａｎｔｈｉｏｎｉｎｅ）および不飽和アミノ酸であるデヒドロアラニンと２－アミノイソ酪酸を含有するペプチド抗生物質種、スリシン（ドナー糞便中でバシラス綱により分泌される）、ニシン、サブチリン、エピデルミン、ムタシン、メルサシジン、アクタガルジン、シンナマイシンを含む）、ラクチシン（孔形成ペプチド毒素ファミリー）、および他の抗微生物化合物もしくは抗炎症性化合物、ならびに／または微生物叢の細菌もしくは他の微生物により産生され、ならびに／または微生物叢の「液体成分」中に存在する追加の生物活性分子（ＢＡＭ）、を含む。

【0150】

一つの態様では、非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物は、糞便の非細胞性ろ過物を基にした医薬組成物と同時に使用される。別の態様では、患者は、第一の糞便非細胞性ろ過物を基にした医薬組成物で治療され、その後、非培養糞便細菌調製物を含む第二の医薬組成物を与えられる。その逆も然り。さらなる態様では、治療方法は、以下の三つの工程を含む：第一の工程は、抗生物質での前処理を行い、感染性病原体を非選択的に除去する工程；第二の工程は、糞便非細胞性ろ過物を基にした治療工程であり、選択感染性病原体をさらに抑制する工程；そして第三の工程は、非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を用いた治療を行い、機能性腸内微生物叢を再確立させる工程。

【0151】

ある態様では、対象（例えば、ＡＳＤ患者）に投与される非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を含む組成物は、投与された細菌混合物に由来する細菌細胞と、対象の腸内フロラに内在性の細菌細胞を置き換えることを基にした、治癒、症状の減少、または症状のパーセンテージの減少を生じさせる。フロラの変化は、可能な限り「ほぼ完全」であってもよい。典型的には、腸内フロラの変化は、健康なヒトドナーの糞便に由来するフロラのアレイを、対象の胃腸系に導入することを含み、これにより、そのような治療を必要とする患者（例えば、ＡＳＤ患者）の病原性腸内フロラを実質的にまたは完全に置き換えることができる。

【0152】

本明細書に記載される医薬組成物は、例えば健康なヒトドナーなどのドナーの糞便サンプルに由来する細菌などの微生物を含んでもよい。ある態様では、組成物は、健康なヒトドナーの糞便サンプルの糞便微生物叢のすべて、または一部に由来する非培養糞便細菌調製物を組み込む。例えば、組成物は、健康なヒトドナーの糞便サンプルの実質的に完全な糞便微生物叢を組み込んでもよい。ある態様では、組成物は、糞便微生物叢の細菌単離株を組み込み、この場合において当該細菌単離株は、健康なヒトドナーからの糞便サンプルの糞便微生物叢のすべてまたは一部から精製され、および／または培養される。したがって、糞便サンプルからの糞便微生物叢の採取、抽出および／または精製は、非培養糞便細菌調製物または細菌単離株のうちの少なくとも一つを含む組成物を調製するために実施されてもよい。

【0153】

一つの態様では、本明細書に記載される組成物（例えば、非培養糞便細菌調製物と少なくとも一つの細菌単離株のうちの一つ以上を含む細菌混合物を含む）の調製における使用のための例示的な糞便微生物叢は、ヒトドナー由来の開始物質を含む。別の態様では、例示的な糞便微生物叢は、一つ以上の健康なヒトドナーに由来する物質を含む。さらに別の態様では、例示的な糞便微生物叢は、公知の規定ドナーのプールに由来する開始物質を含む。別の態様では、ドナーは、成人男性である。さらなる態様では、ドナーは、成人女性である。さらに別の態様では、ドナーは、青年期の男性である。別の態様では、ドナーは、青年期の女性である。別の態様では、ドナーは、女児である。別の態様では、ドナーは、男児である。別の態様では、ドナーは、健康である。一つの態様では、ヒトドナーは、約１８、１５、１２、１０、８、６、４、３、２、または１歳未満の子供である。別の態様では、ヒトドナーは、高齢者である。さらなる態様では、ヒトドナーは、約３０歳、３５歳、４０歳、４５歳、５０歳、５５歳、６０歳、６５歳、７０歳、７５歳、８０歳、８５歳、９０歳、または９５歳を超える個体である。別の態様では、ドナーは、１～５、２～１０、３～１８、２１～５０、２１～４０、２１～３０、５０～９０、６０～９０、７０～９０、６０～８０、または６５～７５歳である。一つの態様では、ドナーは、前期高齢者の個体（６５～７４歳）である。一つの態様では、ドナーは、中期高齢者の個体（７５～８４歳）である。一つの態様では、ドナーは、高齢の個体（＞８５歳）である。さらに別の態様では、ドナーは、注意深くスクリーニングされた、健康で神経学的機能が正常なヒトである。

【0154】

ある態様では、糞便ドナーは、自身の糞便マイクロバイオームのプロファイルについて事前スクリーニングされる。別の態様では、糞便ドナーは、ドナーの糞便中の一つ以上の糞便細菌の綱、科、属または種の存在について選択される。別の態様では、糞便ドナーは、ドナーの糞便中の一つ以上の閾値存在量を超えるレベルの糞便細菌の綱、科、属、種または株の存在について選択される。ある態様では、糞便ドナーは、ラクトバチルス、ビフィドバクテリウム、ストレプトコッカス、プレボテラ、デスルフォビブリオ（Ｄｅｓｕｌｆｏｖｉｂｒｉｏ）、およびそれらの組み合わせからなる群から選択されるドナー糞便中の一つ以上の細菌属の存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。ある態様では、糞便ドナーは、クロストリジウム、バクテロイデス、エガセラ、ビフィドバクテリウム、プレボテラ、およびデスルフォビブリオ、およびそれらの組み合わせからなる群から選択されるドナー糞便中の一つ以上の細菌属の存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。ある態様では、糞便ドナーは、プレボテラ、コプロコッカス、プレボテラセアエ、およびベイロネラセアエ、ならびにそれらの組み合わせからなる群から選択されるドナー糞便中の一つ以上の細菌分類群の存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。ある態様では、糞便ドナーは、ラクトバチルス、ビフィドバクテリウム、ストレプトコッカス、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される一つ以上の細菌属の存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。ある態様では、糞便ドナーは、ラクトバチルス属のドナー糞便中の存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。ある態様では、糞便ドナーは、ドナー糞便中のラクトバチルス・ロイテリの存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。

【0155】

ある態様では、糞便サンプルは、当該糞便サンプル中の一つ以上の細菌の綱、科、属、種もしくは株の存在、または存在量を基にして、医薬組成物への組み込みのための非培養糞便細菌調製物の供給源として選択されてもよい。ある態様では、糞便サンプルは、ラクトバチルス、ビフィドバクテリウム、ストレプトコッカス、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される細菌属の構成員の存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。ある態様では、糞便サンプルは、糞便サンプル中のラクトバチルス・ロイテリの存在、または閾値存在量を基にして選択されてもよい。

【0156】

一つ以上の細菌の属、種または株の存在または存在量（例えば、Ｌ．ロイテリの存在または存在量）を基にして選択されたドナーの糞便から抽出された非培養糞便細菌調製物は、当該調製物に任意の細菌単離株を添加することなく、本明細書に記載される医薬組成物内に直接組み込まれてもよく、あるいは選択の基となったものと同じ属、種または株の細菌単離株をスパイクされてもよい。

【0157】

ある態様では、糞便ドナーは、プロバイオティクスおよび／またはプレバイオティクスの摂取が無い状態での細菌の属、種または株の相対的な糞便存在量と比較して、ドナーの腸管内の細菌の属、種もしくは株の増殖または存在を促進するプロバイオティクスおよび／またはプレバイオティクスの摂取により、当該細菌の属、種または株の相対的糞便存在量が高い。

【0158】

別の態様では、糞便提供を行う前に、ドナーは、例えばオリゴフルクトース、イヌリン、大麦プレバイオティクス、または別の食物繊維などの特定のプレバイオティクスを受け取り、または摂取する。別の態様では、糞便提供を行う前に、ドナーは、選択された糞便細菌に対する増殖刺激剤を受け取り、または摂取する。別の態様では、糞便提供を行う前に、ドナーは、りんごペクチン、Ｎ－アセチルグルコサミン、システイン、グルタチオン、リボフラビン、およびフラビンのうちの一つ以上を受け取り、または摂取する。

【0159】

ある態様では、注意深くスクリーニングされたドナーは、完全な既往歴および身体検査を受ける。ドナーは、感染因子のリスクがある場合、除外される。追加の除外基準には、以下が含まれる：
１．Ｂ型肝炎、Ｃ型肝炎、またはＨＩＶによるウイルス感染が判明している
２．任意の時点でのＨＩＶまたは肝炎ウイルスへの暴露が判明している
３．薬物または金銭に対する性交渉、男性との性交渉を行う男性、過去１２か月間に性的パートナーが複数人、過去に静脈薬剤または鼻腔内コカインを使用、投監歴を含む、ハイリスクな行動。
４．１２か月以内に刺青またはボディピアス。
５．旅行者の下痢のリスクが米国よりも高い地域への旅行。
６．現在の伝染性疾患、例えば、上気道ウイルス感染。
７．過敏性腸症候群の既往歴。具体的な症状には、頻繁な腹部痙攣、過剰なガス、膨満感、腹部膨満、便意切迫感、下痢、便秘が含まれ得る。
８．例えばクローン病、潰瘍性大腸炎、顕微鏡的大腸炎などの炎症性腸疾患の既往歴。
９．慢性的な下痢。
１０．慢性的な便秘症または便秘薬の使用。
１１．消化管の悪性腫瘍の既往歴、または結腸ポリープ症が判明している。
１２．例えば胃バイパス、腸切除、虫垂切除術、胆嚢摘出術などの任意の腹部手術の既往歴。
１３．消化制御の目的で、ドナー候補者によりプロバイオティクス、または任意の他の市販の補助剤が使用される。ヨーグルトやケフィア製品は、栄養補助食品ではなく単に食品として摂取した場合には許可される。
１４．過去６か月以内に何らかの適応症に対する抗生物質。
１５．何らかの免疫抑制薬または抗腫瘍薬が処方された。
１６．メタボリックシンドロームの確立または出現。ここでの定義に使用される基準は、いずれの確立基準よりも厳格である。これには、血圧上昇の既往歴、糖尿病の既往歴、またはグルコース不耐性の既往歴が含まれる。
１７．全身性自己免疫性疾患、例えば、結合組織疾患、多発性硬化症が判明している。
１８．喘息または湿疹を含むアトピー性疾患が判明している。
１９．線維筋痛症、慢性疲労症候群を含む慢性疼痛症候群。
２０．吸入剤または局所用クリームおよび軟膏を含む、任意の処方薬の継続的な（断続的であっても）使用。
２１．自閉症、パーキンソン病を含む、神経学的で神経発達上の神経変性疾患。
２２．概則。ボディマスインデックス＞２６ｋｇ／ｍ２、ウェスト：ヒップの比率＞０．８５（男性）および＞０．８０（女性）により定義される中心性肥満。
２３．収縮期血圧＞１３５ｍｍＨｇ、および拡張期血圧＞８５ｍｍＨｇ。
２４．皮膚－１年以内に、発疹が存在、タトゥーもしくはボディピアスを施術、または黄疸。
２５．肥大リンパ節。
２６．聴診での喘鳴。
２７．肝腫大、または肝疾患の兆候。
２８．関節腫脹または圧痛関節。筋力低下。
２９．神経学的検査の異常。
３０．ＰＣＲ試験により、糞便クロストリジウム・ディフィシレ毒素Ｂが陽性。
３１．サルモネラ菌、赤痢菌、エルシニア菌、カンピロバクター菌、大腸菌０１５７：Ｈ７を含む日常的な病原体のいずれかに関し、糞便培養陽性。
３２．卵および寄生虫検査の異常。
３３．ジアルジア、クリプトスポリジウム、またはヘリコバクターピロリ抗原の陽性。
３４．ＨＩＶ１および２、Ａ型肝炎ウイルスＩｇＭ、肝炎表面抗原およびコアＡｂを含む、任意のウイルス病に対するスクリーニング陽性。
３５．異常ＲＰＲ（梅毒のスクリーニング）。
３６．アルカリホスファターゼ、アスパラギン酸アミノトランスアミナーゼ、アラニンアミノトランスフェラーゼを含む、任意の肝機能検査の異常。
３７．血清トリグリセリドの上昇＞１５０ｍｇ／Ｄｌ
３８．ＨＤＬコレステロール＜４０ｍｇ／ｄＬ（男性）および＜５０ｍｇ／ｄＬ（女性）
３９．高感度ＣＲＰ＞２．４ｍｇ／Ｌ
４０．空腹時血漿グルコース上昇（＞１００ｍｇ／ｄＬ）

【0160】

一つの態様では、本明細書において、糞便サンプルを収集および処理して、非培養糞便細菌調製物および／または一つ以上の細菌単離株を形成するプロセスが提供される。当該プロセスは最初に、一つ以上の健康な（例えばスクリーニングされた）ドナーから糞便サンプルを収集することを含んでもよい。一つの態様では、新鮮な糞便は、糞便収集デバイスを介して輸送され、当該デバイスは、適切に無酸素（または実質的に無酸素）な好適な容器を提供し、または含み得る。一つの態様では、容器は、例えば、米国特許第７，５４１，０９１号に記載されるような酸素除去ペレットなど、備え付け型、またはクリップ留め型の酸素除去メカニズムを容器に組み込むことにより、無酸素となり得る。別の態様では、容器それ自体が、例えばＯ２ＢＬＯＣＫＴＭに記載されるような酸素除去鉄またはその同等物などの酸素除去物質から作製される。当該酸素除去物質は、酸素除去鉄の性能強化担体として精製および改変された層状粘土を使用する。活性鉄はポリマー中に直接分散される。一つの態様では、酸素除去ポリマーを使用して、容器それ自体が作製され、または容器がコーティングされ、または添加されるペレットとして酸素除去ポリマーが使用される。例えば、米国特許出願公開２０１１００４５２２２（参照によりその全体で本明細書に組み込まれる）は、一つ以上の不飽和オレフィンホモポリマーまたはコポリマー；一つ以上のポリアミドホモポリマーまたはコポリマー；一つ以上のポリエチレンテレフタレートホモポリマーまたはコポリマーを有するポリマー混合物を記載しており、それらは酸素除去活性を呈する。一つの態様では、酸素除去ポリマーを使用して、容器それ自体が作製され、または容器がコーティングされ、または添加されるペレットとして酸素除去ポリマーが使用される。例えば、米国特許出願公開２０１１０００８５５４（本明細書においてその全体が参照により本明細書に組み込まれる）は、ポリエステル、コポリエステルエーテル、および酸化触媒を含む組成物を記載しており、この場合においてコポリエステルエーテルは、ポリ（テトラメチレン－コ－アルキレンエーテル）を含むポリエーテルセグメントを含んでいる。一つの態様では、酸素除去ポリマーを使用して、容器それ自体が作製され、または容器がコーティングされ、または添加されるペレットとして酸素除去ポリマーが使用される。例えば、米国特許出願公開２０１０００２５５２３１（参照によりその全体で本明細書に組み込まれる）は、ポリマーマトリクス中に分散された鉄／塩粒子、および酸素除去粒子を含む酸素除去フィルムを記載している。

【0161】

あるいは酸素除去メカニズムに加えて、または代わりに、容器内の空気を窒素および／または他の不活性非反応性ガスと（完全にまたは実質的に）置き換えてもよい。一つの態様では、容器は、部分的に、実質的に、または完全に嫌気性環境を模倣する（生成する）。

【0162】

一つの態様では、糞便（例えば、糞便サンプル）は、漏出せず、臭いもせずに、嫌気性環境を維持する審美的に許容可能な容器中に保持される。一つの態様では、容器は滅菌され、その後に糞便フロラを受け取る。

【0163】

一つの態様では、本明細書に提供される糞便サンプルは、その輸送および／または例えば「糞便バンク」での保存のほとんどの間、またはずっと、室温で維持される。例えば、「処理糞便バンク」に送達されると、例えば室温などの大気温度で保存される。一つの態様では、例えばグリセロールなどの安定化剤が、採取および／または保存された物質に添加される。

【0164】

一つの態様では、上述のように、糞便は様々な病原体に関して検査される。一つの態様では、感染因子が除去されると、糞便サンプルはホモジナイズされ、ろ過されて、大きな粒子の物質が取り除かれる。一つの態様では、糞便は、所望の量へとさらに分割され、例えば、５ｃｃ～３リットル以上であってもよい。例えば一つの態様では、容器は、５０グラム（ｇ）の糞便を含み、例えば含金属ポリエチレンテレフタレートポリエステルフィルム、または含金属ＭＹＬＡＲＴＭなどの適切な酸素耐性プラスチック中に保持されてもよい。

【0165】

一つの態様では、糞便は、例えば、混合、かき混ぜ、攪拌または振とうすることによってホモジナイゼーションされる。特定の態様では、糞便サンプルは、ホモジナイゼーション前にホモジナイゼーション緩衝液で希釈される。ホモジナイゼーション緩衝液は、例えば、凍結保護剤（例えば、トレハロース）、抗酸化剤または還元剤（例えば、システイン）、および緩衝液（例えば、ｐＨ７．４の０．２５Ｘ ＰＢＳ）を含有してもよい。

【0166】

一つの態様では、糞便微生物叢から非細菌成分を分離するために、糞便はホモジナイゼーションされ、粗粒子状物質からろ過されてもよい。一つの態様では、微細な繊維／非生存物質はその後、細菌から分離される。例えば、典型的な細菌サイズまで漸減するフィルターサイズを用いた反復ろ過などを含む、いくつかの方法を使用してもよい。

【0167】

一つの態様では、様々なフィルターを使用して細菌種が単離され、またはガーゼを用いた粗いろ過技術を使用するＷｉｌｌｉａｍｓのＷＯ２０１１／０３３３１０Ａ１（その全体で参照により本明細書に組み込まれる）により使用される技術を使用して細菌種が単離される。

【0168】

一つの態様では、糞便全体を濾過するためのろ過手順を好適に使用して、ほぼ１００％の最高細菌濃度に達する。一つの態様では、ろ過手順は、初期の清浄化のためのガラス繊維深層フィルターを適切に使用した二工程の手順である。一つの態様では、糞便は、陽圧下でろ過される。一つの態様では、当該ろ過は、３０ミクロンのＰＶＤＦフィルターとの組み合わせ、またはサンドイッチ構造を使用する。一つの態様では、このサンドイッチ手順は、陽圧下で生成物を濾過する。その後、膜濃縮は、一つの態様では、ろ過物の体積を減少させるための別の工程として使用されてもよい。一つの態様では、当該ろ過は、凍結乾燥の前、または窒素カバー下での噴霧乾燥の前に行われてもよい。

【0169】

ろ過に使用され得る代替的な膜としては限定されないが、ナイロンフィルター、硝酸セルロースフィルター、ポリエーテルスルホン（ＰＥＳ）フィルター、ポリテトラフルオレチレン（ＰＴＦＥ）フィルター、ＴＥＦＬＯＮ（商標）フィルター、混合セルロースエステルフィルター、ポリカーボネートフィルター、ポリプロピレンフィルター、ポリビニルクロリド（ＰＶＣ）フィルター、または石英フィルターが挙げられる。これらの様々な組み合わせを使用して、固形物および液体が除去された高純度の細菌を得てもよい。

【0170】

医薬組成物、製剤、および投与
本明細書において、様々な製剤中に、非培養糞便細菌調製物および／または一つ以上の細菌単離株を含む細菌混合物を含む医薬組成物が提供される。本明細書に記載される任意の医薬組成物は、錠剤、丸薬、ペレット、カプセル、液体含有カプセル、多粒子含有カプセル、粉末、溶液、エマルション、液滴、座薬、エマルション、エアロゾル、スプレー、懸濁液、徐放性製剤、持続放出製剤、制御放出製剤の形態、または使用に適した任意の他の形態を取ってもよい。

【0171】

医薬組成物を含む製剤は、単位剤形で簡便に提示されてもよい。例えば、剤形は、治療剤を担体と関連付ける工程を含む方法によって調製されてもよく、当該担体は、一つ以上の補助成分を構成する。例えば、製剤は、治療剤を液体担体、微細に分割された固形担体、またはその両方と均一に、および密接に関連付け、その後、必要に応じて、所望の製剤の剤形へと生成物を成形する（例えば、湿潤造粒または乾燥造粒、粉末ブレンドなど、その後に打錠）ことにより調製される。

【0172】

別の態様では、医薬組成物は、薬学的に許容可能な担体とともに提供されてもよい。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容可能な担体」とは、非毒性の溶媒、分散剤、賦形剤、アジュバント、または、例えば、患者への投与が可能な剤形などの医薬組成物の形成を可能にするために生の細菌と混合される他の物質を指す。薬学的に許容可能な担体は、液体（例えば、生理食塩水）、ゲル、もしくは固形形態の希釈剤、アジュバント、賦形剤、または酸耐性カプセル化成分であってもよい。適切な希釈剤および賦形剤としては、医薬グレードの生理食塩水、デキストロース、グリセロール、マンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、炭酸マグネシウムなど、およびそれらの組み合わせが挙げられる。別の態様では、医薬組成物は、例えば湿潤剤もしくは乳化剤、安定化剤またはｐＨ緩衝剤などの補助物質を含有してもよい。一つの態様では、医薬組成物は、約１％～５％、５％～１０％、１０％～１５％、１５～２０％、２０％～２５％、２５～３０％、３０～３５％、４０～４５％、５０％～５５％、１％～９５％、２％～９５％、５％～９５％、１０％～９５％、１５％～９５％、２０％～９５％、２５％～９５％、３０％～９５％、３５％～９５％、４０％～９５％、４５％～９５％、５０％～９５％、５５％～９５％、６０％～９５％、６５％～９５％、７０％～９５％、４５％～９５％、８０％～９５％または８５％～９５％の活性成分を含有する。一つの態様では、医薬組成物は、約２％～７０％、５％～６０％、１０％～５０％、１５％～４０％、２０％～３０％、２５％～６０％、３０％～６０％または３５％～６０％の活性成分を含有する。

【0173】

ある態様では、医薬組成物は、錠剤、ドレンチ、ボーラス、カプセル、プレミックスまたはパッチに組み込まれてもよい。こうした剤形へのこれらの活性成分の製剤化は、製剤処方分野において公知の方法により実現されてもよい。例えば、米国特許第４，３９４，３７７号を参照のこと。ゼラチンカプセルを任意の所望の形態の活性成分で充填すると、カプセルが簡単に製造される。望ましい場合、これらの物質は、例えば糖、デンプン、粉末ミルク、精製結晶セルロースなどの不活性粉末希釈剤で希釈されて、カプセル充填の利便性のために体積を増加させることができる。

【0174】

ある態様では、例えば錠剤などの固形組成物を調製するために、活性成分は、例えばコーンスターチ、ラクトース、スクロース、ソルビトール、滑石、ステアリン酸、ステアリン酸マグネシウム、リン酸二カルシウム、もしくはゴム、または例えば水などの他の医薬希釈剤などの従来的な打錠成分となどの医薬担体と混合されて、本明細書に記載される組成物の均質混合物を含有する固形プレ製剤組成物を形成する。これらのプレ製剤組成物を均質と言及する場合、組成物が、例えば錠剤、丸薬およびカプセルなどの均等な有効単位剤形へと容易に分割され得るように、活性成分が、組成物全体にわたって均一に分散されることを意味する。次に、この固形プレ製剤組成物は、所望の量の活性成分（例えば、少なくとも約１０^５、１０^６、１０^７、１０^８、１０^９、１０^１０、１０^１１、１０^１２、または１０^１３ＣＦＵ）を含有する上述のタイプの単位剤形に分割される。本明細書に記載される医薬組成物は、風味付けられてもよい。

【0175】

ある態様では、本明細書に記載の細菌混合物（および任意で一つ以上の追加の治療剤）を含む医薬組成物は、本明細書に記載の投与様式に適合された組成物として製剤化される。

【0176】

様々な態様では、医薬組成物の投与は、経口、静脈内、腹腔内、および非経口のうちのいずれか一つである。例えば、投与経路としては限定されないが、経口、腹腔内、静脈内、筋肉内、または直腸内が挙げられる。様々な態様では、医薬組成物の投与は、経口、経鼻胃、順行性胃腸、逆行性胃腸、内視鏡、または浣腸である。

【0177】

ある態様では、本明細書に記載の医薬組成物は、経口投与に適合された組成物として製剤化されてもよい。経口送達用の組成物は、例えば、錠剤、トローチ、水性もしくは油性の懸濁液、顆粒、粉末、ふりかけ、エマルション、カプセル、シロップ、またはエリキシルの形態であってもよい。経口投与される組成物は、例えば、フルクトース、アスパルテーム、またはサッカリンなどの甘味剤；例えば、ペパーミント、ウインターグリーン油、またはチェリーなどの香味剤；着色剤；および保存剤などの一つ以上の剤を含有して、薬学的に口当たりの良い調製物を提供してもよい。さらに、錠剤または丸薬の形態では、組成物をコーティングして崩壊を遅延させ、長期間にわたる細菌混合物の持続的な送達を提供してもよい。浸透圧的に活性な剤を囲む選択的な透過膜も、経口投与組成物に適している。これら後者のプラットフォームでは、カプセル周囲からの流体は、運搬化合物により吸収され、膨潤して、開口部を通じて剤組成物を移動させる。これらの送達プラットフォームは、即時放出製剤のスパイクプロファイルとは対照的に、本質的にゼロ次の送達プロファイルを提供することができる。例えばモノステアリン酸グリセロールまたはステアリン酸グリセロールなどの時間遅延物質も有用であり得る。経口組成物は、例えばマンニトール、ラクトース、デンプン、ステアリン酸マグネシウム、サッカリンナトリウム、セルロース、エタクリル酸および誘導体ポリマー、ならびに炭酸マグネシウムなどの標準的な賦形剤を含み得る。ある態様では、賦形剤は、医薬グレードである。活性化合物に加えて、懸濁液は、例えばエトキシル化イソステアリルアルコール、ポリオキシエチレンソルビトール、およびソルビタンエステル、微結晶性セルロース、アルミニウムメタヒドロキシド、ベントナイト、アガー‐アガー、トラガカント、ならびにそれらの混合物などの懸濁化剤を含有し得る。

【0178】

様々な態様では、医薬組成物は、例えば、錠剤、分散性粉末、顆粒、またはカプセルなどの固形剤形として製剤化される。ある態様では、医薬組成物は、カプセルとして製剤化される。別の態様では、医薬組成物は、錠剤として製剤化される。さらに別の態様では、医薬組成物は、軟質ゲルカプセルとして製剤化される。さらなる態様では、医薬組成物は、ゼラチンカプセルとして製剤化される。

【0179】

ある態様では、医薬組成物は、適切な希釈剤で再構成され得る、浣腸組成物の形態、腸溶性コーティングカプセルの形態、腸溶性マイクロカプセルの形態、酸耐性錠剤の形態、酸耐性カプセルの形態、酸耐性マイクロカプセルの形態、経鼻腸内注入または結腸内視鏡注入に適した希釈剤を用いた再構成のための粉末の形態、経口摂取用の適切な希釈剤、香味剤、および胃酸抑制剤を用いた再構成のための粉末の形態、食品または飲料を用いた再構成のための粉末の形態、または組成物、粉末、ゼリーもしくは液体の腸溶コーティングおよび／または酸耐性マイクロカプセルを含む食品、または食品サプリメントの形態、である。

【0180】

ある態様では、本明細書に記載の医薬組成物は、マイクロカプセルの形態で製剤化される。マイクロカプセル化は、揮発を抑制し、化学的劣化から保護する保護壁物質を用いた液体または固体のコーティングである。壁物質内に含有される固体または液体はコアとして知られ、完全なマイクロカプセル化粒子はマイクロカプセルとして知られている。本明細書で使用され得る壁物質としては、アラビアゴム、カルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ホエイタンパク質、カゼイン酸ナトリウム、および大豆タンパク質が挙げられる。

【0181】

ある態様では、（ａ）非培養糞便細菌調製物、および（ｂ）一つ以上の細菌単離株、の混合物が、同じマイクロカプセルプール中に一緒にカプセル封入され、対象に投与される。別の態様では、非培養糞便細菌調製物は、一つ以上の細菌単離株とは別にマイクロカプセル化され、別々（例えば連続して）、または一緒に（例えば、異なる封入内容を有するマイクロカプセルを混合した後に）対象に投与される。さらなる態様では、異なる各細菌単離株からの細菌が、別々にマイクロカプセル化され、得られたマイクロカプセルはその後、細菌単離株の各々の望ましい比率または割合に従って、対象への投与用に一緒に（非培養糞便細菌調製物を含有する別のマイクロカプセルとともに、または伴わずに）混合される。

【0182】

マイクロカプセル化は、マイクロ流体液滴生成装置またはカプセル封入装置を含むマイクロカプセル化デバイスを用いて実施することができる。例示的なマイクロカプセル化デバイスは、例えば、米国特許第７，４８２，１５２号に記載されており、当該特許は、その全体で参照により本明細書に組み込まれる。マイクロカプセルは、一つ以上の安定剤またはゲル化剤を含んでもよく、それらを使用して、マイクロカプセルまたはエマルションが安定化され得る。安定剤またはゲル化剤としては限定されないが、アルギン酸塩（またアルギンもしくはアルギン酸）およびアガーが挙げられる。アルギン酸塩は、限定されないが、例えばアルギン酸ナトリウム、アルギン酸カリウム、アルギン酸カルシウム、およびそれらの組み合わせなどの無機塩を含む、様々な形態で使用され得る。アルギン酸塩は、例えば海草（例えば、マクロシスティス・ピリフェラ（Ｍａｃｒｏｃｙｓｔｉｓ ｐｙｒｉｆｅｒａ）、アスコフィラム・ノドサム（Ａｓｃｏｐｈｙｌｌｕｍ ｎｏｄｏｓｕｍ）、ラミナリア亜種（Ｌａｍｉｎａｒｉａ ｓｐｐ．））または細菌（例えば、シュードモナス亜種（Ｐｓｅｕｄｏｍｏｎａｓ ｓｐｐ．）、アゾトバクター亜種（Ａｚｏｔｏｂａｃｔｅｒ ｓｐｐ．）などの源から誘導され得る。例えば塩化カルシウムなどの架橋剤または溶液を使用して、マイクロカプセルを安定化またはゲル化することができる。ある態様では、アルギン酸系のマイクロカプセルが、ＵＳ２０１６０３１７５８３に従って作製され、使用される。ある態様では、アルギン酸ポリマーは約２．５％（ｗ／ｖ）の濃度を有し、この場合においてマイクロカプセルは、ポリ－Ｌ－リシンの追加的な連続外部表面コーティングを含む。さらなる態様では、マイクロカプセルは、カルシウムまたはバリウム、またはカルシウムとバリウムの混合物の群から選択される二価カチオンを含み、アルギン酸ポリマーをマイクロカプセルへと架橋させる。

【0183】

マイクロカプセルは、サイズ（例えば、直径）によって特徴付けられ得る。マイクロカプセルのサイズは、約０．００１、０．００２、０．００３、０．００４、０．００５、０．００６、０．００７、０．００８、０．００９、０．０１、０．０２、０．０３、０．０４、０．０５、０．０６、０．０７、０．０８、０．０９、０．１、０．１５、０．２、０．２５、０．３、０．３５、０．４、０．４５、０．５、０．５５、０．６、０．６５、０．７、０．７５、０．８、０．８５、０．９、０．９５、１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、５．５、６、６．５、７、７．５、８、８．５、９、９．５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、または５００ミリメーターであってもよい。マイクロカプセルのサイズは、約０．００１、０．００２、０．００３、０．００４、０．００５、０．００６、０．００７、０．００８、０．００９、０．０１、０．０２、０．０３、０．０４、０．０５、０．０６、０．０７、０．０８、０．０９、０．１、０．１５、０．２、０．２５、０．３、０．３５、０．４、０．４５、０．５、０．５５、０．６、０．６５、０．７、０．７５、０．８、０．８５、０．９、０．９５、１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、５．５、６、６．５、７、７．５、８、８．５、９、９．５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、または５００ミリメーター以下であってもよい。マイクロカプセルのサイズは、約０．００１、０．００２、０．００３、０．００４、０．００５、０．００６、０．００７、０．００８、０．００９、０．０１、０．０２、０．０３、０．０４、０．０５、０．０６、０．０７、０．０８、０．０９、０．１、０．１５、０．２、０．２５、０．３、０．３５、０．４、０．４５、０．５、０．５５、０．６、０．６５、０．７、０．７５、０．８、０．８５、０．９、０．９５、１、１．５、２、２．５、３、３．５、４、４．５、５、５．５、６、６．５、７、７．５、８、８．５、９、９．５、１０、１５、２０、２５、３０、３５、４０、４５、５０、５５、６０、６５、７０、７５、８０、８５、９０、９５、１００、１５０、２００、２５０、３００、３５０、４００、４５０、または５００ミリメーター以上であってもよい。マイクロカプセルのサイズは、約０．０５～約１ミリメートルであってもよい。マイクロカプセル集団におけるサイズ分布は、均一であってもよく、または実質的に均一であってもよい。例えば、マイクロカプセル集団は、約２０、１９、１８、１７、１６、１６、１５、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、５、４．９、４．８、４．７、４．６、４．５、４．４、４．３、４．２、４．１、４．０、３．９、３．８、３．７、３．６、３．５、３．４、３．３、３．２、３．１、３．０、２．９、２．８、２．７、２．６、２．５、２．４、２．３、２．２、２．１、２．０、１．９、１．８、１．７、１．６、１．５、１．４５、１．４０、１．３５、１．３０、１．２５、１．２０、１．１５、１．１４、１．１３、１．１２、１．１１、１．１０、１．０９、１．０８、１．０７、１．０６、１．０５、１．０４、１．０３、１．０２、１．０１、または１．００以下の分散指数または多分散指数（ＰＤＩ）により特徴付けられ得る。

【0184】

様々な態様では、製剤は、薬学的に許容可能な担体または賦形剤を追加的に含んでもよい。当業者であれば、製剤は、望ましい用途および投与経路に適した任意の適切な形態であり得ることが認識される。

【0185】

一部の剤形では、本明細書に記載される医薬組成物は、例えばクエン酸ナトリウム、リン酸二カルシウムなどの不活性で薬学的に許容可能な賦形剤または担体の少なくとも一つ、および／またはａ）例えばデンプン、ラクトース、スクロース、グルコース、マンニトール、ケイ酸、微結晶セルロースおよびＢａｋｅｒｓ Ｓｐｅｃｉａｌ Ｓｕｇｅｒなどの充填剤もしくは増量剤、ｂ）例えばカルボキシメチルセルロース、アルギン酸塩、ゼラチン、ポリビニルピロリドン、スクロース、アカシア、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース（ＨＰＣ）、およびヒドロキシメチルセルロースなどの結合剤、ｃ）例えばグリセロールなどの保湿剤、ｄ）例えばアガー－アガー、炭酸カルシウム、ジャガイモデンプンもしくはタピオカデンプン、アルギン酸、特定のケイ酸塩、炭酸ナトリウム、架橋ポリマー、例えばクロスポビドン（架橋ポリビニルピロリドン）、クロスカルメロースナトリウム（架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム）、デンプングリコール酸ナトリウムなどの崩壊剤、ｅ）例えばパラフィンなどの溶解遅延剤、ｆ）例えば四級アンモニウム化合物などの吸収加速剤、ｇ）例えばセチルアルコールおよびモノステアリン酸グリセロールなどの湿潤剤、ｈ）例えばカオリンおよびベントナイトクレイなどの吸収剤、ならびにｉ）例えば滑石、ステアリン酸カルシウム、ステアリン酸マグネシウム、ポリエチレングリコール固形物、ラウリル硫酸ナトリウム、ベヘン酸グリセリルなどの潤滑剤、ならびにそれら賦形剤の混合物と混合される。当業者であれば、特定の賦形剤が、経口剤型において二つ以上の機能を有し得ることを認識するであろう。経口剤型の場合、例えば、カプセルまたは錠剤などの剤形は、緩衝剤も含み得る。

【0186】

ある態様では、細菌混合物を含む医薬組成物は、一つ以上の薬学的に許容可能な凍結保護剤、凍結乾燥保護剤、結合剤、崩壊剤、賦形剤、充填剤、および／もしくは防腐剤、酸抑制剤、制酸剤、Ｈ２アンタゴニスト、ならびにプロトンポンプ阻害剤、またはそれらの組み合わせと組み合わされる。ある態様では、細菌混合物を含む医薬組成物は、味覚マスキングのために、一つ以上の薬学的に許容可能な剤（例えば、味覚マスキング剤）と組み合わされる。ある態様では、細菌混合物を含む医薬組成物は、一つ以上の薬学的に許容可能な混合粉末と組み合わされて、ＡＳＤ患者、特に小児ＡＳＤ患者での投与を簡単にするための色彩的な魅力、味、および／または風味が改善される。例示的な味覚マスキング剤としては、Ｓｍｏｏｔｈｅｎｏｌが挙げられる。例示的な風味としては、桃、オレンジ、イチゴ、ブドウ、パパイヤ、ミックスベリー、ダークチョコレート、パイン、およびブルーベリーが挙げられる。

【0187】

ある態様では、細菌混合物を含む医薬組成物は、例えば制酸剤などの他のアジュバントと組み合わされて、胃内での細菌不活性化を減衰させる。（例えば、Ｍｙｌａｎｔａ、Ｍｕｃａｉｎｅ、Ｇａｓｔｒｏｇｅｌ）。別の態様では、胃内の酸分泌は、Ｈ２－アンタゴニストまたはプロトンポンプ阻害剤を使用して薬理学的にも抑制され得る。Ｈ２－アンタゴニストの例は、ラニチジンである。プロトンポンプ阻害剤の例は、オメプラゾールである。一つの態様では、酸抑制剤は、医薬組成物を投与する前に、または医薬組成物と同時投与で投与される。

【0188】

一つの態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、酸抑制剤、制酸剤、Ｈ２アンタゴニスト、プロトンポンプ阻害剤、またはそれらの組み合わせをさらに含む。一つの態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、非生存物質を実質的に含まない。別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、残留繊維、ＤＮＡ、ウイルスコート物質、および非生存物質からなる群から選択される無細胞物質を実質的に含まない。別の態様では、投与される医薬組成物は、酸抑制剤、制酸剤、Ｈ２アンタゴニスト、プロトンポンプ阻害剤、またはそれらの組み合わせを含まない。さらに別の態様では、投与される医薬組成物は、酸抑制剤を含まない。別の態様では、投与される医薬組成物は、制酸剤を含まない。別の態様では、投与される医薬組成物は、Ｈ２アンタゴニストを含まない。別の態様では、投与される医薬組成物は、プロトンポンプ阻害剤を含まない。別の態様では、投与される医薬組成物は、メトクロプラミドを含まない。

【0189】

ある態様では、細菌混合物は、例えば、凍結乾燥された細菌細胞／胞子を含むとき、または乾燥結合剤、充填剤、および分散剤を含むとき、乾燥している。あるいは、例えば、非乾燥結合剤、充填剤、および分散剤を含むとき、細菌混合物は水性であってもよい。

【0190】

ある態様では、本明細書に記載の細菌混合物は、凍結乾燥されてもよい。本明細書で使用される場合、「凍結乾燥」または「フリーズドライ）とは、最初に物質を凍結させ、その後、その中の氷を真空環境中で昇華させることによって、物質を乾燥させるプロセスを指す。

【0191】

一つの態様では、細菌混合物は、還元剤および／または抗酸化剤をさらに含む凍結乾燥製剤を含む。特定の態様では、還元剤は、Ｄ－システインおよびＬ－システインからなる群から選択されるシステインを含む。別の態様では、システインは、少なくとも約０．０２５％の濃度である。一つの態様では、システインは、約０．０２５％の濃度である。別の態様では、システインは、０．０２５％の濃度である。別の態様では、システイン以外の別の還元剤がシステインの代わりに使用され、またはシステインと組み合わせて使用される。ある態様では、別の還元剤は、アスコルビン酸、アスコルビン酸ナトリウム、チオグリコール酸、亜硫酸ナトリウム、重亜硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸ナトリウム、メタ重亜硫酸カリウム、グルタチオン、メチオニン、チオグリセロール、およびアルファトコフェロールを含む群から選択される。

【0192】

一つの態様では、システインは、少なくとも約０．００５％、少なくとも約０．０１％、少なくとも約０．０１５％、少なくとも約０．０２％、少なくとも約０．０２５％、少なくとも約０．０３％、少なくとも約０．０３５％、少なくとも約０．０４％、少なくとも約０．０４５％、少なくとも約０．０５％、少なくとも約０．０５５％、少なくとも約０．０６％、少なくとも約０．０６５％、少なくとも約０．０７％、少なくとも約０．０７５％、少なくとも約０．０８％、少なくとも約０．０８５％、少なくとも約０．０９％、少なくとも約０．０９５％、少なくとも約０．１％、少なくとも約０．１２％、少なくとも約０．１４％、少なくとも約０．１６％、少なくとも約０．１８％、少なくとも約０．２％、少なくとも約０．２５％、少なくとも約０．３％、少なくとも約０．４％、少なくとも約０．５％、少なくとも約０．６％、少なくとも約０．７％、少なくとも約０．８％、少なくとも約０．９％、少なくとも約１％、少なくとも約２％、少なくとも約４％、少なくとも約６％、少なくとも約８％、少なくとも約１０％、少なくとも約１２％、少なくとも約１４％、少なくとも約１６％、少なくとも約１８％、少なくとも約２０％、少なくとも約２２％、少なくとも約２４％、または少なくとも約２６％の濃度である。

【0193】

一つの態様では、細菌混合物は、凍結保護剤、または凍結保護剤の混合物を含む。本明細書で使用される場合、「凍結保護剤」とは、凍結中に活性成分を保護するために製剤に添加される物質を指す。例えば、凍結保護剤は、ポリエチレングリコール、スキムミルク、エリスリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトース、アラニン、グリシン、プロリン、スクロース、ラクトース、リボース、トレハロース、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）もしくは同等物、グリセロール、ポリエチレングリコール（ＰＥＧ）もしくは同等物、またはアミノ酸（例えば、アラニン、グリシン、プロリン）を含み得、本質的にこれらからなり得、またはこれらからなり得る。本開示のある態様では、凍結保護剤は、５％のスクロース、１０％スクロース、１０％スキムミルク、２．５％スクロースを含む１０％トレハロース、２．５％スクロースを含む５％トレハロース、５％マンニトール、０．１％ポリソルベート８０を含む５％マンニトール、１０％マンニトール、０．１％ポリソルベート８０を含む１０％マンニトール、５％トレハロース、０．１％ポリソルベート８０を含む５％トレハロース、１０％トレハロース；および０．１％ポリソルベート８０を含む１０％トレハロース、を含む群から選択され得る。

【0194】

ある態様では、細菌混合物は、凍結乾燥保護剤を含む。本明細書で使用される場合、「凍結乾燥保護剤」とは、凍結乾燥（凍結－乾燥としても知られる）の段階の間に活性成分を保護するために製剤に添加される物質を指す。一つの態様では、同じ物質、または同じ物質の組み合わせが、凍結保護剤および凍結乾燥保護剤の両方として使用される。例示的な凍結乾燥保護剤としては、例えばスクロースまたはトレハロースなどの糖、例えばグルタミン酸一ナトリウムまたはヒスチジンなどのアミノ酸、例えばベタインなどのメチルアミン、例えば硫酸マグネシウムなどの離液性の塩、例えばグリセリン、エリスリトール、グリセロール、アラビトール、キシリトール、ソルビトール、およびマンニトールなどの三価アルコールまたは高級糖アルコールなどのポリオール、プロピレングリコール、ポリエチレングリコール、Ｐｌｕｒｏｎｉｃｓ、およびそれらの組み合わせ、が挙げられる。ある態様では、凍結乾燥保護剤は、例えばトレハロースまたはスクロースなどの非還元糖である。ある態様では、凍結保護剤または凍結乾燥保護剤は、本段落および上記段落に言及される一つ以上の物質から本質的になり、またはこれらからなる。

【0195】

ある態様では、凍結保護剤または凍結乾燥保護剤は、細胞内の剤、例えば、ＤＭＳＯ、グリセロール、またはＰＥＧを含み、これらは細胞内に浸透して、膜破壊をもたらし得る氷結晶の形成を防止する。ある態様では、凍結保護剤または凍結乾燥保護剤は、細胞外の剤、例えばスクロース、トレハロースまたはデキストロースを含み、これらは細胞膜内に浸透しないが、凍結中に発生する浸透圧不均衡を改善するよう作用する。

【0196】

一つの態様において、本開示は、少なくとも約１２．５％のトレハロースを含む凍結乾燥剤を含む、凍結乾燥糞便微生物調製物を含む医薬組成物を提供する。

【0197】

ある態様では、凍結乾燥製剤は、トレハロースを含む。ある態様では、凍結乾燥製剤は、２％～３０％、３％～２５％、４％～２０％、５％～１５％、６％～１０％、２％～３０％、２％～２５％、２％～２０％、２％～１５％、または２％～１０％のトレハロースを含む。ある態様では、凍結乾燥製剤は、少なくとも２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、または１５％のトレハロースを含む。ある態様では、凍結乾燥製剤は、最大で２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％、１０％、または１５％のトレハロースを含む。別の態様では、凍結乾燥製剤は、約５％のトレハロースを含む。別の態様では、凍結乾燥製剤は、トレハロースおよびスクロースを含む。別の態様では、凍結乾燥製剤は、約１．５％～３．５％のスクロースを含む約８％～１２％のトレハロース、および約０．５％～１．５％のＮａＣｌを含む。

【0198】

一つの態様では、凍結乾燥製剤は、少なくとも約５％、少なくとも約７．５％、少なくとも約１０％、少なくとも約１２．５％、少なくとも約１３％、少なくとも約１３．５％、少なくとも約１４％、少なくとも約１４．５％、少なくとも約１５％、少なくとも約１５．５％、少なくとも約１６％、少なくとも約１６．５％、少なくとも約１７％、少なくとも約１７．５％、少なくとも約１８％、少なくとも約１８．５％、少なくとも約１９％、少なくとも約１９．５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２２．５％、少なくとも約２５％、少なくとも約２７．５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３２．５％、少なくとも約３５％、少なくとも約３７．５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４２．５％、少なくとも約４５％、少なくとも約４７．５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５２．５％、少なくとも約５５％、少なくとも約５７．５％、または少なくとも約６０％のトレハロースを含む。

【0199】

ある態様では、本明細書に提供される医薬組成物は、大気温度以下での少なくとも１２週間の保存の後、ＡＳＤを有する対象の治療に有効である。ある態様では、医薬組成物は、大気温度以下での少なくとも４、８、１０、１６、２０、２４、３０、４０、５０、６０、７０、８０、または１００週間の保存の後でも効果を持続する。

【0200】

ある態様では、本明細書に記載される医薬組成物は、凍結乾燥または凍結して乾燥され、周囲温度（例えば、室温）、凍結温度、または約２℃～８℃で保存され得る。ある態様では、凍結乾燥することにより、細胞の大部分が生存を維持することが可能となり、粉末へと穏やかに微紛化され得る粉末形態の製品が製造される。次いで粉末、または凍結乾燥組成物もしくは凍結され乾燥された組成物は、担体、例えば、錠剤、ジェルタブ、丸薬またはカプセル、例えば、腸溶コーティングカプセルにカプセル封入されてもよく、または摂取用のオイル充填カプセル内に置かれてもよい。あるいは凍結乾燥製品もしくは凍結され乾燥された製品、または粉末は、例えば、生理食塩水、緩衝剤、または例えば流体－グルコース－セルロースアガー（ＲＧＣＡ）培地などの滅菌流体などの流体中で、個体への送達前に大気温度で再構成され得る。

【0201】

ある態様では、凍結乾燥のために、細菌は、解凍時の細胞の破裂を防止する液体中に保持される。当該液体には様々な安定剤、例えばグリセロールおよび適切な緩衝剤、ならびに／またはエチレングリコールが含まれ得る。ある態様では、凍結保護プロセスは、使用される安定剤に応じて、約１０％～８０％、２０％～７０％、３０％～６０％、または４０％～５０％の最終濃度の安定剤を使用する。ある態様では、凍結保護プロセスは、そうでなければタンパク質構造を破壊するであろう氷結晶の形成を防止することにより、タンパク質の安定化に役立つ。

【0202】

ある態様では、生細菌の破壊を減少させるのに役立つ安定剤としては、スキムミルク、エリスリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトース、および他のポリオールが挙げられる。例えばデキストランおよびポリエチレングリコールなどのポリマーも、細菌細胞を安定化させるために使用され得る。

【0203】

ある態様では、医薬組成物の製造は、以下の工程を含み得る：（１）分離カプセル（すなわち、別々のカプセル本体とカプセルのキャップを含む）の外側を、外側腸溶コーティングでコーティングする工程、（２）カプセル本体に細菌混合物（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む）を充填する工程、および（３）カプセル本体上にカプセルキャップを締め、それにより腸溶コーティングカプセル中に細菌混合物をカプセル封入する工程。

【0204】

任意選択的に、医薬組成物の製造は、以下の工程を含み得る：（１）分離カプセル（すなわち、別々のカプセル本体とカプセルのキャップを含む）の外側を、外側腸溶コーティングでコーティングする工程、（２）分離カプセルの内側を、内側コーティングでコーティングする工程、（３）カプセル本体に細菌混合物（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む）を充填する工程、および（４）カプセル本体上にカプセルキャップを締め、それにより二重コーティングカプセル中に細菌混合物をカプセル封入する工程。

【0205】

あるいは医薬組成物の製造は、以下の工程を含み得る：（１）分離カプセル（すなわち、別々のカプセル本体とカプセルのキャップを含む）の内側を、内側コーティングでコーティングする工程、（２）分離カプセルの外側を、外側腸溶コーティングでコーティングする工程、（３）カプセル本体に細菌混合物（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む）を充填する工程、および（４）カプセル本体上にカプセルキャップを締め、それにより二重コーティングカプセル中に細菌混合物をカプセル封入する工程。

【0206】

ある態様では、一つ以上の追加の治療剤が医薬組成物中に含有されてもよく、およびカプセルにより封入されてもよい。

【0207】

ある態様では、ゼラチンカプセルの本体およびキャップ（例えば、サイズ＃００）は分離される。外側腸溶コーティング懸濁液は、溶液中の他の構成要素と共に一つ以上の腸溶コーティングポリマーを分散させることによって調製される。外側腸溶コーティング懸濁液は、例えば流動層のＷｕｒｓｔｅｒ ｃｏｌｕｍｎ ｃｏａｔｅｒ、Ｆｌｕｉｄ Ｂｅｄ Ｃｏａｔｅｒ、または同等のものを使用して、分離されたカプセル本体とキャップの外側に塗布される。カプセルは製品ボウル内で流動化され、外側腸溶性コーティング懸濁液が噴霧されて、約２ｍｇ／ｃｍ２～６ｍｇ／ｃｍ２、例えば３ｍｇ／ｃｍ２の標的とした外側コーティングが生成される。この工程の完了後、カプセルは、例えば約８時間～２４時間、乾燥させるように設定される。乾燥後、例示的なカプセルを計量して、外側腸溶コーティングからの体重増加を計算する。カプセルは、凹凸に関して検査されてもよい。

【0208】

ある態様では、ＥＵＤＲＡＧＩＴ（登録商標）Ｓ１００（ポリ（メタクリル酸、メチルメタクリル酸））、デンプン、クエン酸トリエチル、およびＰｌａｓＡＣＲＹＬ（登録商標）Ｔ２０を、水、エタノール、およびｎ－ブタノールの溶液中に溶解して混合し、次いで適切な噴霧装置に充填する。次いで溶液をカプセル本体とカプセルキャップの外側表面上に噴霧コーティングして、標的体重に増加させる。カプセル本体とカプセルキャップは、例えば、細菌混合物で充填するなどのさらなる処理の前に、約８時間～約２４時間、またはそれ以上、例えば、１週間、１か月、またはそれ以上、乾燥させられる。

【0209】

ある態様では、カプセル本体内に組成物を提供することに加えて、カプセルのキャップにもある量の細菌混合物を提供することが望ましい場合がある。この態様では、より多くの組成物がカプセルに含まれ、および／またはより少量の空気が密閉カプセル中に含有される。

【0210】

ある態様では、カプセルの内側表面は、内部コーティング、例えば、水不溶性の内部コーティングを含む。

【0211】

上述の組成物および物質（例えば、細菌混合物、内側コーティング、カプセル、および外側コーティング）のいずれかを、本明細書に記載される医薬組成物に組み合わせてもよい。当業者であれば、自身の現在のニーズに従い、内側コーティング、カプセルおよび外側コーティングを選択する方法を知っているであろう。この選択は、例えば、組成物内に組み込まれる特定の細菌単離株、および／または細菌単離株が送達されるべき、対象の望ましい送達位置（例えば、回腸、空腸、または十二指腸を含む、結腸または小腸）に基づいてもよい。

【0212】

ある態様では、ラクトバチルス属の細菌を含む細菌単離株を含む医薬組成物は、腸の回腸において当該細菌単離株を放出する。ある態様では、細菌単離株は、ラクトバチルス・ロイテリを含む。

【0213】

追加的な関連する教示は、ＷＯ２００７１２２３７４に開示されており、当該文献は、その全体で参照により本明細書に組み込まれる。

【0214】

ある態様では、医薬組成物の製造中、薬学的に許容可能な凍結保護剤、凍結乾燥保護剤、結合剤、崩壊剤、充填剤、保存剤、酸抑制剤、制酸剤、Ｈ２アンタゴニスト、およびプロトンポンプ阻害剤、またはそれらの組み合わせを医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）内に混合して、望ましい特性を促進してもよい。

【0215】

ある態様では、医薬組成物は、表面活性剤を含む。使用に好適な表面活性剤としては限定されないが、任意の薬学的に許容可能な非毒性の界面活性剤が挙げられる。使用に好適な界面活性剤の種類としては限定されないが、ポリエトキシ化脂肪酸、ＰＥＧ－脂肪酸ジエステル、ＰＥＧ－脂肪酸モノエステル混合物およびジエステル混合物、ポリエチレングリコールグリセロール脂肪酸エステル、アルコール－油トランスエステル化生成物、ポリグリセリド化（ｐｏｌｙｇｌｙｃｅｒｉｚｅｄ）脂肪酸、プロピレングリコール脂肪酸エステル、プロピレングリコールエステル－グリセロールエステルの混合物、モノグリセリドおよびジグリセリド、ステロールおよびステロール誘導体、ポリエチレングリコールソルビタン脂肪酸エステル、ポリエチレングリコールアルキルエーテル、糖エステル、ポリエチレングリコールアルキルフェノール、ポリオキシエチレン－オリオキシプロピレンブロックコポリマー、ソルビタン脂肪酸エステル、低級アルコール脂肪酸エステル、イオン界面活性剤、およびそれらの混合物が挙げられる。一部の態様では、組成物は、限定されないが、ラウリル硫酸ナトリウム、ポリソルベート２０、ポリソルベート４０、ポリソルベート６０、ポリソルベート８０、およびクエン酸トリエチルをはじめとする一つ以上の界面活性剤を含んでもよい。

【0216】

ある態様では、医薬組成物は、例えば柔軟性および硬度などの望ましい機械的特性を得るために、薬学的に許容可能な可塑剤を含む。そのような可塑剤としては限定されないが、トリアセチン、クエン酸エステル、クエン酸トリエチル、フタル酸エステル、セバシン酸ジブチル、セチルアルコール、ポリエチレングリコール、ポリソルベート、または他の可塑剤が挙げられる。

【0217】

別の態様では、医薬組成物は、一つ以上の適用溶媒を含む。例えば、遅延放出コーティング組成物などの適用に使用され得るより一般的な溶媒のいくつかとしては、イソプロピルアルコール、アセトン、塩化メチレンなどが挙げられる。

【0218】

さらに別の態様では、医薬組成物は、一つ以上のアルカリ物質を含む。組成物における使用に好適なアルカリ物質としては限定されないが、例えばリン酸、炭酸、クエン酸、および他のアルミニウム／マグネシウム化合物などの酸のナトリウム塩、カリウム塩、カルシウム塩、マグネシウム塩、およびアルミニウム塩が挙げられる。さらにアルカリ物質は、例えば水酸化アルミニウム、水酸化カルシウム、水酸化マグネシウム、および酸化マグネシウムなどの制酸物質から選択されてもよい。

【0219】

不活性希釈剤に加えて、経口投与される組成物は、例えば甘味剤、香味剤、および香料などのアジュバントも含んでもよい。

【0220】

様々な態様では、医薬組成物は、全身送達または局所送達に対して製剤化される。ある態様では、投与は全身的である。別の態様では、治療を必要とする領域に局所的に投与することが望ましい場合がある。

【0221】

様々な方法を使用して、本明細書に記載される医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）を製剤化し、および／または対象の位置に送達してもよい。例えば、医薬組成物は、ＧＩ管への送達用に製剤化されてもよい。ＧＩ管は、例えば口、食道、胃、小腸、十二指腸、空腸、回腸、大腸、および直腸などの消化器系の器官を含み、そのすべてのサブセクションを含む（例えば、小腸は、十二指腸、空腸、および回腸を含む場合があり、大腸は、横行結腸、下行結腸、上行結腸、Ｓ状結腸、および盲腸を含む場合がある）。例えば、組成物は、胃、小腸、大腸、および直腸、またはその任意のサブセクション（例えば、十二指腸、空腸および回腸、横行結腸、下行結腸、上行結腸、Ｓ状結腸および盲腸）のうちの一つ以上への一つ以上の活性剤の送達に対して製剤化されてもよい。一部の態様では、本明細書に記載の組成物は、上部または下部のＧＩ管に送達するように製剤化されてもよい。ある態様では、組成物は、例えば、ＧＩ管の粘膜組織と組成物とを直接的または間接的に接触させることによって、対象に投与されてもよい。

【0222】

様々な態様では、医薬組成物の投与は、例えば、経口送達、経鼻胃管、腸挿管（例えば、空腸チューブまたは胃－空腸チューブなどの経腸チューブまたは栄養チューブ）、直接注入（例えば、十二指腸注入）、内視鏡、結腸内視鏡、または浣腸を介した、ＧＩ管内への投与である。

【0223】

一つの態様では、方法は、医薬組成物を経口的に、浣腸によって、または直腸座薬を介して投与することを含む。一つの態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、腸溶性コーティングされた（および／または酸耐性の）カプセルまたはマイクロカプセルとして製剤化され、または食品、食品添加物、乳製品、大豆系製品もしくはその誘導体、ゼリー、ゼラチン系チュアブル（例えば、グミ）、風味のある液体、氷ブロック、アイスクリーム、またはヨーグルトの一部として製剤化され、またはそれらと一緒に投与される。別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、酸耐性の腸溶性コーティングカプセルとして製剤化される。医薬組成物は、食品または飲料と組み合わされて販売するための粉末として提供されてもよい。食品または飲料は、乳製品または大豆製品であってもよい。別の態様では、食品または食品サプリメントは、医薬組成物を含有する腸溶コーティング、および／または酸耐性のマイクロカプセルを含有する。

【0224】

ある態様では、医薬組成物は、液体培養物を含む。別の態様では、医薬組成物は、ホモジナイズされ、凍結乾燥され、粉砕され、そして粉末化される。次いで例えば生理食塩水などに溶解され、浣腸として注入されてもよい。あるいは粉末は、経口投与のための腸溶性コーティング、および／または酸耐性遅延放出型カプセルとして封入されてもよい。ある態様では、粉末は、経口投与用の酸耐性／遅延放出型カプセルで二重に封入されてもよい。これらのカプセルは、腸溶性コーティング、および／または酸耐性の遅延放出型マイクロカプセルの形態を取ってもよい。粉末は、飲料用に再構成するための、または食品添加物としての再構成するための口当たりの良い形態で提供されてもよい。さらなる態様では、食品は、ヨーグルトである。一つの態様では、粉末は、再構成されて、経鼻十二指腸注入を介して注入されてもよい。

【0225】

別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、液体、凍結、凍結乾燥、噴霧乾燥、発泡乾燥、凍結乾燥、または粉末の形態である。さらなる態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、遅延型または漸次型の腸溶放出形態として製剤化される。別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、賦形剤、生理食塩水、緩衝液、緩衝剤、または流体－グルコース－セルロースアガー（ＲＧＣＡ）培地を含む。別の態様では、本明細書において投与される医薬組成物は、凍結保護剤を含む。一つの態様では、凍結保護剤は、ポリエチレングリコール、スキムミルク、エリスリトール、アラビトール、ソルビトール、グルコース、フルクトース、アラニン、グリシン、プロリン、スクロース、ラクトース、リボース、トレハロース、ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）、グリセロール、またはそれらの組み合わせを含む。

【0226】

様々な態様では、本明細書において、細菌混合物を含む（例えば、非培養糞便細菌調製物と組み合わされた一つ以上の細菌単離株を含む）、放出調節製剤が提供され、この場合において当該製剤は、相当量の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）をＧＩ管の一つ以上の領域に放出する。例えば、製剤は、胃の後ろ、ＧＩ管の一つ以上の領域に、細菌単離株の少なくとも約６０％を放出してもよい。

【0227】

様々な態様では、放出調節製剤は、胃の後ろ、腸の一つ以上の領域内に、少なくとも６０％の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）を放出してもよい。例えば、放出調節製剤は、腸において、少なくとも６０％、少なくとも６１％、少なくとも６２％、少なくとも６３％、少なくとも６４％、少なくとも６５％、少なくとも６６％、少なくとも６７％、少なくとも６８％、少なくとも６９％、少なくとも７０％、少なくとも７１％、少なくとも７２％、少なくとも７３％、少なくとも７４％、少なくとも７５％、少なくとも７６％、少なくとも７７％、少なくとも７８％、少なくとも７９％、少なくとも８０％、少なくとも８１％、少なくとも８２％、少なくとも８３％、少なくとも８４％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）を放出する。

【0228】

様々な態様では、放出調節製剤は、小腸において、少なくとも６０％の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）を放出してもよい。例えば、放出調節製剤は、小腸（例えば、十二指腸、空腸、回腸および回盲部のうちの一つ以上）において、少なくとも６０％、少なくとも６１％、少なくとも６２％、少なくとも６３％、少なくとも６４％、少なくとも６５％、少なくとも６６％、少なくとも６７％、少なくとも６８％、少なくとも６９％、少なくとも７０％、少なくとも７１％、少なくとも７２％、少なくとも７３％、少なくとも７４％、少なくとも７５％、少なくとも７６％、少なくとも７７％、少なくとも７８％、少なくとも７９％、少なくとも８０％、少なくとも８１％、少なくとも８２％、少なくとも８３％、少なくとも８４％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）を放出する。

【0229】

様々な態様では、放出調節製剤は、大腸において、少なくとも６０％の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）を放出してもよい。例えば、放出調節製剤は、大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸またはＳ状結腸部分および直腸のうちの一つ以上）において、少なくとも６０％、少なくとも６１％、少なくとも６２％、少なくとも６３％、少なくとも６４％、少なくとも６５％、少なくとも６６％、少なくとも６７％、少なくとも６８％、少なくとも６９％、少なくとも７０％、少なくとも７１％、少なくとも７２％、少なくとも７３％、少なくとも７４％、少なくとも７５％、少なくとも７６％、少なくとも７７％、少なくとも７８％、少なくとも７９％、少なくとも８０％、少なくとも８１％、少なくとも８２％、少なくとも８３％、少なくとも８４％、少なくとも８５％、少なくとも８６％、少なくとも８７％、少なくとも８８％、少なくとも８９％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％の細菌単離株（および／または追加の治療剤）を放出する。

【0230】

一部の態様では、医薬組成物は、胃内での放出用に製剤化される。他の態様では、医薬組成物は、胃内で細菌混合物を実質的に放出しないように製剤化される。

【0231】

特定の態様では、放出調節製剤は、特定のｐＨで、細菌混合物（および任意で追加の治療剤）を放出する。例えば、一部の態様では、放出調節製剤は、酸性環境下で実質的に安定であり、ほぼ中性～アルカリ性の環境下では実質的に不安定（例えば、急速に溶解し、または物理的に不安定）である。一部の態様では、安定は、実質的に放出しないことを示し、一方で不安定は、実質的に放出することを示す。例えば、一部の態様では、放出調節製剤は、約７．０以下、または約６．５以下、または約６．０以下、または約５．５以下、または約５．０以下、または約４．５以下、または約４．０以下、または約３．５以下、または約３．０以下、または約２．５以下、または約２．０以下、または約１．５以下、または約１．０以下のｐＨで、実質的に安定である。一部の態様では、本製剤は、低ｐＨ領域で安定であり、したがって、例えば胃内では実質的に放出されない。一部の態様では、放出調節製剤は、約１～約４以下のｐＨで実質的に安定であり、より大きなｐＨ値では実質的に不安定である。これらの態様では、放出調節製剤は、胃内で実質的に放出されない。これらの態様では、放出調節製剤は、小腸（例えば、十二指腸、空腸、および回腸のうちの一つ以上）および／または大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、およびＳ状結腸のうちの一つ以上）で実質的に放出する。一部の態様では、放出調節製剤は、約４～約５以下のｐＨで実質的に安定であり、その結果として、より大きなｐＨ値では実質的に不安定である。したがって胃および／または小腸（例えば、十二指腸、空腸、および回腸のうちの一つ以上）で実質的に放出されない。これらの態様では、放出調節製剤は、大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、およびＳ状結腸のうちの一つ以上）で実質的に放出する。様々な態様では、本明細書に列挙されたｐＨ値は、例えば、絶食状態または食後状態のいずれであるかなど、対象の状態に対処するために、当分野で公知のように調整されてもよい。

【0232】

一部の態様では、放出調節製剤は、胃液中では実質的に安定であり、腸液中では実質的に不安定であり、したがって、小腸（例えば、十二指腸、空腸、および回腸のうちの一つ以上）および／または大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、およびＳ状結腸のうちの一つ以上）で実質的に放出される。

【0233】

一部の態様では、放出調節製剤は、胃液で安定であり、または酸性環境下で安定である。これらの放出調節製剤は、約４～約５以下のｐＨの胃液中で、または約４～５以下のｐＨの擬似胃液中で、約１５分または約３０分または約４５分または約６０分または約９０分で、当該放出調節製剤中の医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）の約３０重量％以下を放出する。放出調節製剤は、４～５以下のｐＨの胃液中で、または４～５以下のｐＨの擬似胃液中で、約１５分または約３０分または約４５分または約６０分または約９０分で、当該放出調節製剤中の組成物の約０重量％～約３０重量％、約０重量％～約２５重量％、約０重量％～約２０重量％、約０重量％～約１５重量％、約０重量％～約１０重量％、約５重量％～約３０重量％、約５重量％～約２５重量％、約５重量％～約２０重量％、約５重量％～約１５重量％、約５重量％～約１０重量％を放出し得る。放出調節製剤は、５以下のｐＨの胃液中で、または５以下のｐＨの擬似胃液中で、約１５分または約３０分または約４５分または約６０分または約９０分で、当該放出調節製剤中の総組成物の約１重量％、約２重量％、約３重量％、約４重量％、約５重量％、約６重量％、約７重量％、約８重量％、約９重量％または約１０重量％を放出し得る。

【0234】

一部の態様では、放出調節製剤は、腸液中で不安定である。これらの放出調節製剤は、腸液中または擬似腸液中で、約１５分または約３０分または約４５分または約６０分または約９０分で、当該放出調節製剤中の細菌混合物および／または追加の治療剤の約７０重量％以上を放出する。一部の態様では、放出調節製剤は、ほぼ中性からアルカリ性の環境下で不安定である。これらの放出調節製剤は、約４～５以上のｐＨの腸液中または約４～５のｐＨの擬似腸液中で、約１５分または約３０分または約４５分または約６０分または約９０分で、当該放出調節製剤中の細菌混合物および／または追加の治療剤の約７０重量％以上を放出する。ほぼ中性またはアルカリ性の環境下で不安定である放出調節製剤は、約５よりも大きいｐＨの流体（例えば、約５～約１４、約６～約１４、約７～約１４、約８～約１４、約９～約１４、約１０～約１４、または約１１～約１４）のｐＨの流体）中、約５分～約９０分、または約１０分～約９０分、または約１５分～約９０分、または約２０分～約９０分、または約２５分～約９０分、または約３０分～約９０分、または約５分～約６０分、または約１０分～約６０分、または約１５分～約６０分、または約２０分～約６０分、または約２５分～約９０分、または約３０分～約６０分で、当該放出調節製剤中の医薬組成物（例えば、微生物カクテルを含む）の７０重量％以上を放出し得る。

【0235】

擬似胃液および擬似腸液の例としては限定されないが、２００５ Ｐｈａｒｍａｃｏｐｅｉａ ２３ＮＦ／２８ＵＳＰ ｉｎ Ｔｅｓｔ Ｓｏｌｕｔｉｏｎｓの２８５８頁に開示されるもの、および／または当業者に公知の他の擬似胃液および擬似腸液が挙げられ、例えば酵素を用いずに調製された擬似胃液および／または擬似腸液が挙げられる。

【0236】

様々な態様では、放出調節製剤は、糜汁において実質的に安定であり得る。例えば、一部の態様では、細菌混合物中の細菌の活性または生存能力の約５０％または約４０％または約３０％または約２０％または約１０％未満が、投与から約１０、または９、または８、または７、または６、または５、または４、または３、または２、または１時間で失われる。

【0237】

様々な態様では、放出調節製剤は、即時放出用（例えば摂取時）に設計されてもよい。様々な態様では、放出調節製剤は、持続的放出プロファイルを有してもよく、すなわち、長期間にわたり身体（例えば、ＧＩ管）において活性成分をゆっくり放出する。様々な態様では、放出調節製剤は、遅延放出プロファイルを有してもよく、すなわち、摂取時に活性成分を即時に放出しない。例えば、小腸（例えば、十二指腸、空腸、回腸のうちの一つ以上）または大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸またはＳ状部分結腸、および直腸のうちの一つ以上）における放出に関して、組成物がＧＩ管内で弱るまで、活性成分の放出は先送りされる。例えば、組成物は、小腸または大腸に達するまで活性成分の放出を遅延させるための腸溶コーティングが為されてもよい。

【0238】

様々な態様では、放出調節製剤は、例えば遅延放出コーティングなどの一つ以上の放出調節コーティングを利用して、任意で追加の治療剤とともに、ＧＩ管へ細菌混合物を効果的に遅延させながらしっかりと送達させることができる。

【0239】

ある態様では、遅延放出コーティングは、酸性環境下では実質的に安定であり、ほぼ中性からアルカリ性の環境下では実質的に不安定である腸溶剤を含む。ある態様では、遅延放出コーティングは、胃液中では実質的に安定な腸溶剤を含む。腸溶剤は、例えば、メタクリル酸コポリマー、酢酸フタル酸セルロース、フタル酸ヒドロキシプロピルメチルセルロース、酢酸フタル酸ポリビニル、カルボキシメチルエチルセルロース、およびＥＵＤＲＡＧＩＴ（登録商標）タイプのポリマー（ポリ（メタクリル酸、メチルメタクリレート）、酢酸コハク酸ヒドロキシプロピルメチルセルロース、酢酸トリメリット酸セルロース、シェラックまたは他の適切な腸溶性コーティングポリマーの溶液または分散液から選択されてもよい。ＥＵＤＲＡＧＩＴ（登録商標）タイプのポリマーとしては例えば、ＥＵＤＲＡＧＩＴ（登録商標）ＦＳ ３０Ｄ、Ｌ ３０ Ｄ－５５、Ｌ １００－５５、Ｌ １００、Ｌ １２，５、Ｌ １２，５ Ｐ、ＲＬ ３０ Ｄ、ＲＬ ＰＯ、ＲＬ １００、ＲＬ １２，５、ＲＳ ３０ Ｄ、ＲＳ ＰＯ、ＲＳ １００、ＲＳ １２，５、ＮＥ ３０ Ｄ、ＮＥ ４０ Ｄ、ＮＭ ３０ Ｄ、Ｓ １００、Ｓ １２，５、およびＳ １２，５ Ｐが挙げられる。類似したポリマーとしては、Ｋｏｌｌｉｃｏａｔ（登録商標）ＭＡＥ ３０ ＤＰおよびＫｏｌｌｉｃｏａｔ（登録商標）ＭＡＥ １００ Ｐが挙げられる。一部の態様では、ＥＵＤＲＡＧＩＴ（登録商標）ＦＳ ３０Ｄ、Ｌ ３０ Ｄ－５５、Ｌ １００－５５、Ｌ １００、Ｌ １２，５、Ｌ １２，５ Ｐ ＲＬ ３０ Ｄ、ＲＬ ＰＯ、ＲＬ １００、ＲＬ １２，５、ＲＳ ３０ Ｄ、ＲＳ ＰＯ、ＲＳ １００、ＲＳ １２，５、ＮＥ ３０ Ｄ、ＮＥ ４０ Ｄ、ＮＭ ３０ Ｄ、Ｓ １００、Ｓ １２，５ Ｓ １２，５ Ｐ、Ｋｏｌｌｉｃｏａｔ（登録商標）ＭＡＥ ３０ ＤＰおよびＫｏｌｌｉｃｏａｔ（登録商標）ＭＡＥ １００ Ｐのうちの一つ以上が使用される。様々な態様では、腸溶剤は、前述の溶液または分散液の組み合わせであってもよい。

【0240】

特定の態様では、一つ以上のコーティングシステム添加剤が、腸溶剤とともに使用される。例えば、一つ以上のＰｌａｓＡＣＲＹＬＴＭ添加剤が、抗タッキング剤コーティング添加剤として使用されてもよい。例示的なＰｌａｓＡＣＲＹＬＴＭ添加剤としては限定されないが、ＰｌａｓＡＣＲＹＬＴＭ ＨＴＰ２０およびＰｌａｓＡＣＲＹＬＴＭ Ｔ２０が挙げられる。

【0241】

別の態様では、遅延放出コーティングは、ｐＨに関係なく水溶液中では、および／または溶液中に酵素が存在する場合には、時間関数として分解してもよい。そのようなコーティングは、水不溶性ポリマーを含んでもよい。したがって水溶液中の溶解性は、ｐＨに依存しない。本明細書で使用される場合、「ｐＨ非依存性」という用語は、ポリマーの水浸透性、および薬学的成分を放出する能力が、ｐＨの関数ではなく、および／またはｐＨに非常にわずかに依存するに過ぎないことを意味する。そのようなコーティングを使用して、例えば、持続的放出製剤を調製してもよい。適切な水不溶性ポリマーは、溶液のｐＨとは無関係に、例えば水などの水性媒体中で実質的に不溶性である薬学的に許容可能な非毒性ポリマーを含む。適切なポリマーとしては限定されないが、セルロースエーテル、セルロースエステル、またはセルロースエーテル－エステル、すなわち、セルロース骨格上のヒドロキシ基の一部がアルキル基で置換され、一部がアルカノイル基で修飾されるセルロース誘導体が挙げられる。例としては、エチルセルロース、アセチルセルロース、ニトロセルロースなどが挙げられる。不溶性ポリマーの他の例としては限定されないが、ラッカー、ならびにアクリルおよび／またはメタクリルのエステルポリマー、低四級アンモニウム含量の有するアクリル酸塩とメタクリル酸塩のポリマーもしくはコポリマー、またはそれらの混合物などが挙げられる。不溶性ポリマーの他の例としては、ＥＵＤＲＡＧＩＴ ＲＳ（登録商標）、ＥＵＤＲＡＧＩＴ ＲＬ（登録商標）、およびＥＵＤＲＡＧＩＴ ＮＥ（登録商標）が挙げられる。不溶性ポリマーとしては、ポリビニルエステル、ポリビニルアセタール、ポリアクリル酸エステル、ブタジエンスチレンコポリマーなどが挙げられる。ある態様では、結腸送達は、ゆっくりと崩れるワックスプラグ（例えば、ＰＥＧ６０００を含む様々なＰＥＧＳ）の使用によって実現される。

【0242】

さらなる態様では、遅延放出コーティングは、腸内細菌叢中に存在する微生物酵素によって分解されてもよい。ある態様では、遅延放出コーティングは、小腸内に存在する細菌によって分解されてもよい。別の態様では、遅延放出コーティングは、大腸内に存在する細菌によって分解されてもよい。

【0243】

様々な態様では、放出調節製剤は、結腸での放出用に設計されてもよい。様々な結腸特異的な送達方法を利用することができる。例えば、放出調節製剤は、例えば、その全内容が参照により本明細書に組み込まれるＬｉ ｅｔ ａｌ．，ＡＡＰＳ ＰｈａｒｍＳｃｉＴｅｃｈ（２００２），３（４）：１－９に記載されるような結腸特異的な薬剤送達システム（ＣＯＤＥＳ）を使用して製剤化されてもよい。そのようなシステムでの薬物放出は、ｐＨ感受性ポリマーコーティングと結合した結腸微生物叢によって誘発される。例えば、製剤は、３層のポリマーを有するコア錠剤として設計されてもよい。第一のコーティングは、酸可溶性ポリマー（例えば、ＥＵＤＲＡＧＩＴＥ）であり、外側コーティングは腸溶性であり、その間にヒドロキシプロピルメチルセルロースバリア層が挟まれる。別の態様では、結腸送達は、例えばペクチンなど、結腸内で分解する特定のポリマーを用いて医薬組成物（例えば、微生物カクテルを含む）を製剤化することによって実現されてもよい。ペクチンはさらにゲル化されてもよく、例えば亜鉛カチオンなどのカチオンと架橋されてもよい。ある態様では、製剤は、イオン架橋されたペクチンビーズの形態であり、当該ビーズはさらにポリマー（例えば、ＥＵＤＲＡＧＩＴポリマー）でコーティングされる。追加の結腸特異的な製剤としては限定されないが、圧力制御薬物送達システム（例えば、エチルセルロースで調製される）、および浸透圧制御薬物送達システム（すなわち、ＯＲＤＳ－ＣＴ）が挙げられる。

【0244】

本明細書に記載の細菌混合物（および任意で追加の治療剤）の結腸特異的な送達のための製剤は、例えば、インビトロ溶出試験を使用して評価されてもよい。例えば、異なる緩衝液中で並行する溶解試験を実施して、異なるｐＨレベルでの製剤の挙動を特徴解析してもよい。あるいは、インビトロ酵素試験を実施してもよい。例えば、製剤は、細菌に適した培地を含有する発酵槽中でインキュベートされてもよく、異なる時間間隔で放出される薬剤の量が決定される。薬剤放出試験は、酵素含有緩衝液培地中で、またはラットもしくはモルモットもしくはウサギの盲腸内容物を含有する緩衝培地中で行われてもよく、特定の時間で放出された薬剤の量が決定される。さらなる態様では、例えばイヌ、モルモット、ラット、およびブタなどの動物モデルを使用して、インビボ評価が実施されてもよい。さらに、結腸特異的な薬物送達製剤の臨床評価は、薬剤送達指標（ＤＤＩ）を計算することにより評価されてもよく、当該指標は、ＲＳＣ（血中の相対的薬剤量、すなわち薬剤への相対的全身暴露）に対するＲＣＥ（薬物への相対的結腸組織曝露）の相対比率を検討するものである。ＤＤＩが高い薬剤は、結腸薬剤送達が良いことを示す。結腸からの薬物の吸収は、結腸内視鏡検査および挿管によってモニタリングされてもよい。

【0245】

様々な態様では、本製剤は、ＧＩ管内の放出領域における、細菌混合物（および任意の追加治療剤）の実質的に均一な送達を提供する。ある態様では、本製剤は、細菌混合物の斑状または不均一な放出を最小化する。

【0246】

様々な態様では、本製剤は、ＧＩ管に沿った一つ以上の細菌混合物の複数用量の放出を提供する。例えば、組成物および／または製剤は、腸に沿った様々な場所で、異なるときに、および／または異なるｐＨで、同じ細菌混合物の複数用量を放出することができる。あるいは、組成物および／または製剤は、腸に沿った様々な場所で、異なるときに、および／または異なるｐＨで、異なる細菌混合物の用量を放出することができる。ある態様では、医薬組成物は、腸内の第一の位置で放出される一つ以上の細菌単離株を含む第一の細菌混合物、および腸内の第二の場所で放出される非培養糞便細菌調製物を含む第二の細菌混合物を含む。ある態様では、第一の細菌混合物は、回腸で放出され、第二の細菌混合物は、結腸で放出される。

【0247】

そのような製剤の全体的な放出プロファイルは、例えば、複数の粒子タイプまたは複数の層を使用して調整することができる。例えば、ある態様では、第一の細菌混合物（または細菌混合物の第一の用量）は、例えば、小腸（例えば、十二指腸、空腸、回腸のうちの一つ以上）での放出用に製剤化されてもよく、一方で第二の細菌混合物（または細菌混合物の第二の用量）は、例えば、大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、またはＳ状結腸部分、および直腸のうちの一つ以上）での遅延放出用に製剤化される。別の態様では、第一の細菌混合物（または細菌混合物の第一の用量）は、例えば、小腸（例えば、十二指腸、空腸、回腸のうちの一つ以上）での放出用に製剤化されてもよく、一方で第二の細菌混合物（または細菌混合物の第二の用量）は、例えば、小腸の別の部分（例えば、十二指腸、空腸、回腸のうちの一つ以上）での遅延放出用に製剤化される。別の態様では、第一の細菌混合物（または細菌混合物の第一の用量）は、例えば、大腸（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸またはＳ状結腸部分、および直腸のうちの一つ以上）での放出用に製剤化されてもよく、一方で第二の細菌混合物（または細菌混合物の第二の用量）は、例えば、大腸の別の部分（例えば、盲腸、上行結腸、横行結腸、下行結腸、またはＳ状結腸部分、および直腸のうちの一つ以上）での遅延放出用に製剤化される。様々な態様では、組成物および／または製剤は、腸に沿った異なる場所で、異なるときに、および／または異なるｐＨで、少なくとも一つの用量、少なくとも二つの用量、少なくとも三つの用量、少なくとも四つの用量、または少なくとも五つの用量の細菌混合物を放出することができる。同様に様々な態様では、組成物および／または製剤は、腸に沿った異なる場所で、異なるときに、および／または異なるｐＨで、少なくとも一つの細菌混合物、少なくとも二つの細菌混合物、少なくとも三つの細菌混合物、少なくとも四つの細菌混合物、または少なくとも五つの細菌混合物を放出することができる。

【0248】

別の態様では、遅延放出製剤または漸次腸溶放出製剤は、二層の錠剤またはカプセルの使用を含み、それらはポリアルキレンオキシド、ポリビニルピロリドン、潤滑剤、またはそれらの混合物を含む第一の層、およびポリエチレンオキシド、カルボキシメチルセルロース、またはその両方を含む第二の浸透圧押し出し層を含む。ある態様では、遅延放出製剤または漸次腸溶放出製剤は、アクリル酸ポリマー、セルロース、ワックス、脂肪酸、シェラック、ゼイン、硬化植物油、硬化ひまし油、ポリビニルピロリドン、酢酸ビニルコポリマー、ビニルアルコールコポリマー、ポリエチレンオキシド、アクリル酸とメタクリル酸のコポリマー、メタクリル酸メチルコポリマー、メタクリル酸エトキシエチルポリマー、メタクリル酸シアノエチルポリマー、メタクリル酸アミノアルキルコポリマー、ポリ（アクリル酸）、ポリ（メタクリル酸）、メタクリル酸アルキルアミドコポリマー、ポリ（メタクリル酸メチル）、ポリ（メタクリル酸無水物）、メタクリル酸メチルポリマー、ポリメタクリル酸塩、ポリ（メタクリル酸メチル）コポリマー、ポリアクリルアミド、メタクリル酸アミノアルキルコポリマー、メタクリル酸グリシジルコポリマー、メチルセルロース、エチルセルロース、カルボキシメチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、ヒドロキシメチルセルロース、ヒドロキシエチルセルロース、ヒドロキシプロピルセルロース、架橋カルボキシメチルセルロースナトリウム、架橋ヒドロキシプロピルセルロース、天然ワックス、合成ワックス、脂肪アルコール、脂肪酸、脂肪酸エステル、脂肪酸グリセリド、硬化油脂、炭化水素ワックス、ステアリン酸、ステアリルアルコール、蜜蝋、グリコワックス、キャスターワックス、カルナバワックス、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、乳酸とグリコール酸のコポリマー、カルボキシメチルデンプン、メタクリル酸カリウム／ジビニルベンゼンコポリマー、架橋ポリビニルピロリドン、ポリインイルアルコール、ポリビニルアルコールコポリマー、ポリエチレングリコール、非架橋ポリビニルピロリドン、ポリビニル酢酸塩、ポリビニル酢酸塩コポリマー、またはそれらの任意の組み合わせからなる群から選択される放出遅延マトリクス物質の使用を含む。ある態様では、遅延放出製剤または漸次腸溶放出製剤は、微小環境ｐＨ改変剤の使用を含む。

【0249】

本明細書に記載される医薬組成物は、複数の別個の細菌混合物を含み、例えば、各細菌混合物に対して異なる送達位置プロファイルが実現され得ることが理解される。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも二つの細菌混合物を含み、それにより、第一の細菌混合物は、一つ以上の細菌単離株を含み、第二の細菌混合物は、非培養糞便細菌調製物を含む。ある態様では、第二の細菌混合物はさらに、第一の細菌混合物の細菌単離株とは異なる一つ以上の細菌単離株を含む。あるいは、第二の細菌混合物は、非培養糞便細菌調製物から本質的になり得る。別の態様では、第一の細菌混合物は、ただ一つの細菌単離株のみを含む。医薬組成物は、任意の数の細菌混合物、例えば１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれ以上の細菌混合物を含んでもよく、各々が異なる細菌単離株、細菌単離株の異なる組み合わせ、非培養糞便細菌調製物、または非培養糞便細菌調製物と一つ以上の細菌単離株の調製物の異なる組み合わせを含む。

【0250】

ある態様では、医薬組成物は、ドレンチであってもよい。一つの態様では、ドレンチは、医薬組成物の生理食塩水懸濁形態を選択することによって調製される。一つ成分の懸濁液と、他の成分の水溶液とを調製することにより、他の成分の水不溶性形態と併せた、一つの成分の水溶性形態が使用され得る。いずれか活性成分の水不溶性形態は、懸濁液として調製されてもよく、または例えばポリエチレングリコールなどのいくつかの生理学的に許容可能な溶媒中で調製されてもよい。いずれか活性成分の水不溶性形態の懸濁液は、例えばピーナッツ油、トウモロコシ油、ゴマ油などの油中、例えばプロピレングリコールまたはポリエチレングリコールなどのグリコール中、または特定の活性成分の溶解性に応じて水中、で調製され得る。活性成分が懸濁状態であり続けるために、好適な生理学的に許容可能なアジュバントが必要となる場合がある。アジュバントは、例えばカルボキシメチルセルロース、ポリビニルピロリドン、ゼラチン、およびアルギン酸塩などの増粘剤を含んでもよく、およびそれらから選択されてもよい。界面活性剤は概して、活性成分、特に脂溶性のプロピオン酸強化化合物の懸濁に役立つ。液体非溶媒で懸濁液を作製するために最も有用なのは、アルキルフェノールポリエチレンオキシド付加物、ナフタレンスルホン酸塩、アルキルベンゼン－スルホン酸塩、およびポリオキシエチレンソルビタンエステルである。さらに液体の親水性、密度、および表面張力に影響を与える多くの物質が、個々の事例ケースで懸濁液の作製を補助し得る。例えば、シリコーン消泡剤、グリコール、ソルビトール、および糖が、有用な懸濁剤であり得る。

【0251】

ある態様では、医薬組成物は、パッチにより投与されてもよい。

【0252】

一部の態様では、本明細書に記載の細菌単離株は、生植物細胞の形態である。一部の態様では、本明細書に記載の細菌単離株は、胞子の形態である。一部の態様では、本明細書に記載の細菌単離株は、凍結乾燥されている。非限定的な例として、凍結乾燥は、その内容が参照によりその全体で本明細書に組み込まれる米国特許第７，７９９，３２８号に記載される方法を含む、当分野に公知の方法によるものであってもよい。一部の態様では、本明細書に記載の凍結乾燥細菌混合物は、腸溶コーティングされた軟質ゲルまたはカプセル中に配置される。

【0253】

様々な態様では、製剤は、米国特許第８，５３５，７１３号および第８，９１１７，７７号、ならびに米国特許公開２０１２０１４１５８５、２０１２０１４１５３１、２００６／００１８９６、２００７／０２９２５２３、２００８／００２００１８、２００８／０１１３０３１、２０１０／０２０３１２０、２０１０／０２５５０８７、２０１０／０２９７２２１、２０１１／００５２６４５、２０１３／０２４３８７３、２０１３／０３３０４１１、２０１４／００１７３１３、および２０１４／０２３４４１８のうちの一つ以上に記載される形態を取ってもよく、それら文献の内容はその全体で参照により本明細書に組み込まれる。

【0254】

様々な態様では、製剤は、国際特許出願公開ＷＯ２００８／１３５０９０に記載されるものの形態を取ってもよく、当該文献の内容は、その全体で参照により本明細書に組み込まれる。

【0255】

様々な態様では、製剤は、米国特許第４，１９６，５６４号、第４，１９６，５６５号、第４，２４７，００６号、第４，２５０，９９７号、第４，２６８，２６５号、第５，３１７，８４９号、第６，５７２，８９２号、第７，７１２，６３４号、第８，０７４，８３５号、第８，３９８，９１２号、第８，４４０，２２４号、第８，５５７，２９４号、第８，６４６，５９１号、第８，７３９，８１２号、第８，８１０，２５９号、第８，８５２，６３１号、および第８，９１１，７８８号、ならびに米国特許出願公開２０１４／０３０２１３２、２０１４／０２２７３５７、２０１４００８８２０２、２０１３０２８７８４２、２０１３／０２９５１８８、２０１３／０３０７９６２、および２０１３０１８４２９０のうちの一つ以上に記載されるものの形態を取ってもよく、それら文献の内容は、その全体で参照により本明細書に組み込まれる。

【0256】

投与および用量
医薬組成物の投与、またはその中の細菌細胞（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物）の投与は、例えば、特定の剤形、対象への投与様式、もしあれば組成物中の細菌単離株の同一性、もしあれば組成物中の細菌単離株の数、および組成物中の非培養糞便細菌調製物の存在または非存在などに応じて変化することが理解される。これらの因子、ならびに細菌混合物中の細菌の活性を改変し得る変数（例えば、対象の体重、性別および食事、投与時間、投与経路、排泄速度、対象の状態、薬剤の組み合わせ、遺伝的形質、ならびに反応感受性など）が当業者により考慮されて、患者におけるＡＳＤの少なくとも一つの症状の治療または予防のための有効投与量または用量レジメンが作製されてもよい。投与は、連続的に実施されてもよく、または最大耐用量内で一つ以上の個別の投与で実施されてもよい。所与の条件セットに対する最適な投与速度は、従来の用量投与試験を使用して当業者によって確認されてもよい。

【0257】

様々な態様では、医薬組成物またはその中の細菌細胞（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物）の投与は、ＡＳＤの一つ以上の症状を治療または防止するために、患者のマイクロバイオームを調節して生態学的バランスに有利に働くのに効果的である。

【0258】

一つの態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）細菌単離株の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、少なくとも１０^５、少なくとも１０^６、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９、少なくとも１０^１０、少なくとも１０^１１、少なくとも１０^１２、少なくとも１０^１３、少なくとも１０^１４または少なくとも１０^１５ＣＦＵの細菌単離株を含む。別の態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）細菌単離株の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、最大で１０^５、最大で１０^６、最大で１０^７、最大で１０^８、最大で１０^９、最大で１０^１０、最大で１０^１１、最大で１０^１２、最大で１０^１３、最大で１０^１４または最大で１０^１５ＣＦＵの細菌単離株を含む。さらなる態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）細菌単離株の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、１０^８ＣＦＵｓ～１０^１４、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１３ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１２ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１１ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１２ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１１ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１０ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１３ＣＦＵｓ、１０^１１ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓ、１０^１１ＣＦＵｓ～１０^１３ＣＦＵｓ、１０^１２ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓおよび１０^１３ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓの細菌単離株からなる群から選択される。

【0259】

ある態様では、医薬組成物は、一つ以上の細菌単離株を含み、各細菌単離株は、前述の薬学的に活性な用量または治療有効用量のうちの一つで、約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０グラムの単位重量、または約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０ミリリットルの単位体積で、各単位用量中に存在する。

【0260】

一つの態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）細菌単離株の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、少なくとも１０^５、少なくとも１０^６、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９、少なくとも１０^１０、少なくとも１０^１１、少なくとも１０^１２、少なくとも１０^１３、少なくとも１０^１４もしくは少なくとも１０^１５ 個の細菌単離株の細胞または胞子を含む。別の態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）細菌単離株の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、最大で１０^５、最大で１０^６、最大で１０^７、最大で１０^８、最大で１０^９、最大で１０^１０、最大で１０^１１、最大で１０^１２、最大で１０^１３、最大で１０^１４もしくは最大で１０^１５ 個の細菌単離株の細胞または胞子を含む。さらなる態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）細菌単離株の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、１０^８～１０^１４、１０^９～１０^１３、１０^１０～１０^１２、１０^１０～１０^１１、１０^９～１０^１４、１０^９～１０^１２、１０^９～１０^１１、１０^９～１０^１０、１０^１０～１０^１４、１０^１０～１０^１３、１０^１１～１０^１４、１０^１１～１０^１３、１０^１２～１０^１４，、および１０^１３～１０^１４個の細菌単離株の細胞または胞子からなる群から選択される。

【0261】

ある態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量の細菌単離株の細胞数は、生細胞に対してである。一つ態様では、医薬組成物は、一つ以上の細菌単離株を含み、各細菌単離株は、前述の薬学的に活性な用量または治療有効用量のうちの一つで、約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０グラムの単位重量、または約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０ミリリットルの単位体積で、各用量単位中に存在する。

【0262】

ある態様では、本明細書に記載される医薬組成物は、カプセルの形態であり、各カプセルは、少なくとも１０^５、少なくとも１０^６、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９、少なくとも１０^１０、少なくとも１０^１１、少なくとも１０^１２、少なくとも１０^１３、少なくとも１０^１４もしくは少なくとも１０^１５個の細菌単離株の細胞または胞子を含む。ある態様では、本明細書に記載の医薬組成物は、カプセルの形態であり、各カプセルは、１０^８～１０^１４、１０^９～１０^１３、１０^１０～１０^１２、１０^１０～１０^１１、１０^９～１０^１４、１０^９～１０^１２、１０^９～１０^１１、１０^９～１０^１０、１０^１０～１０^１４、１０^１０～１０^１３、１０^１１～１０^１４、１０^１１～１０^１３、１０^１２～１０^１４もしくは１０^１３～１０^１４個の細菌単離株の細胞または胞子を含む。

【0263】

一つの態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）非培養糞便細菌調製物の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、少なくとも１０^５、少なくとも１０^６、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９、少なくとも１０^１０、少なくとも１０^１１、少なくとも１０^１２、少なくとも１０^１３、少なくとも１０^１４または少なくとも１０^１５ＣＦＵの非培養糞便細菌調製物を含む。別の態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）非培養糞便細菌調製物の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、最大で１０^５、最大で１０^６、最大で１０^７、最大で１０^８、最大で１０^９、最大で１０^１０、最大で１０^１１、最大で１０^１２、最大で１０^１３、最大で１０^１４または最大で１０^１５ＣＦＵの非培養糞便細菌調製物を含む。さらなる態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）非培養糞便細菌調製物の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、１０^８ＣＦＵｓ～１０^１４、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１３ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１２ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１１ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１２ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１１ＣＦＵｓ、１０^９ＣＦＵｓ～１０^１０ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓ、１０^１０ＣＦＵｓ～１０^１３ＣＦＵｓ、１０^１１ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓ、１０^１１ＣＦＵｓ～１０^１３ＣＦＵｓ、１０^１２ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓおよび１０^１３ＣＦＵｓ～１０^１４ＣＦＵｓの非培養糞便細菌調製物からなる群から選択される。

【0264】

ある態様では、非培養糞便細菌調製物は、前述の薬学的に活性な用量または治療有効用量のうちの一つで、約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０グラムの単位重量、または約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０ミリリットルの単位体積で、医薬組成物の各単位用量中に存在する。

【0265】

一つの態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）非培養糞便細菌調製物の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、少なくとも１０^５、少なくとも１０^６、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９、少なくとも１０^１０、少なくとも１０^１１、少なくとも１０^１２、少なくとも１０^１３、少なくとも１０^１４または少なくとも１０^１５個の非培養糞便細菌調製物の細胞または胞子を含む。別の態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）非培養糞便細菌調製物の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、最大で１０^５、最大で１０^６、最大で１０^７、最大で１０^８、最大で１０^９、最大で１０^１０、最大で１０^１１、最大で１０^１２、最大で１０^１３、最大で１０^１４または最大で１０^１５の非培養糞便細菌調製物の合計細胞または胞子を含む。さらなる態様では、ＡＳＤの少なくとも一つの症状を治療するために対象に投与される（すなわち、単回投与または複数回投与で投与される）非培養糞便細菌調製物の薬学的に活性な用量、または治療有効用量は、１０^８～１０^１４、１０^９～１０^１３、１０^１０～１０^１２、１０^１０～１０^１１、１０^９～１０^１４、１０^９～１０^１２、１０^９～１０^１１、１０^９～１０^１０、１０^１０～１０^１４、１０^１０～１０^１３、１０^１１～１０^１４、１０^１１～１０^１３、１０^１２～１０^１４，、および１０^１３～１０^１４個の非培養糞便細菌調製物細胞または胞子からなる群から選択される。

【0266】

ある態様では、薬学的に活性な用量または治療有効用量の非培養糞便細菌調製物の細胞数は、生細胞に対してである。一つの態様では、非培養糞便細菌調製物は、前述の薬学的に活性な用量または治療有効用量のうちの一つで、約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０グラムの単位重量、または約０．２、０．４、０．６、０．８または１．０ミリリットルの単位体積で、医薬組成物の各単位用量中に存在する。

【0267】

ある態様では、本明細書に記載される医薬組成物は、カプセルの形態であり、各カプセルは、少なくとも１０^５、少なくとも１０^６、少なくとも１０^７、少なくとも１０^８、少なくとも１０^９、少なくとも１０^１０、少なくとも１０^１１、少なくとも１０^１２、少なくとも１０^１３、少なくとも１０^１４もしくは少なくとも１０^１５個の非培養糞便細菌調製物の細胞または胞子を含む。ある態様では、本明細書に記載の医薬組成物は、カプセルの形態であり、各カプセルは、１０^８～１０^１４、１０^９～１０^１３、１０^１０～１０^１２、１０^１０～１０^１１、１０^９～１０^１４、１０^９～１０^１２、１０^９～１０^１１、１０^９～１０^１０、１０^１０～１０^１４、１０^１０～１０^１３、１０^１１～１０^１４、１０^１１～１０^１３、１０^１２～１０^１４もしくは１０^１３～１０^１４個の非培養糞便細菌調製物の細胞または胞子を含む。

【0268】

対象は、ＡＳＤの一つ以上の症状の治療のために、非培養糞便細菌調製物と組み合わされた一つ以上の細菌単離株を投与されてもよい。そのような場合、細菌単離株および非培養糞便細菌調製物は、同一の医薬組成物中で一緒に、または別個の組成物中で対象に投与されてもよい。さらに、医薬組成物（例えば、一つ以上の細菌単離株、非培養糞便細菌調製物、またはその両方を含む）は、例えば投薬レジメンの一部として、単回単位用量、または複数単位用量で対象に投与されてもよい。ある態様では、対象に投与される非培養糞便細菌調製物の用量（例えば、ＣＦＵまたは細胞数／胞子数によって測定される）は、細菌単離株の用量よりも多い。あるいは、対象に投与される非培養糞便細菌調製物の用量（例えば、ＣＦＵまたは細胞数／胞子数によって測定される）は、細菌単離株の用量よりも少なくてもよい。別の態様では、対象に投与される非培養糞便細菌調製物の用量（例えば、ＣＦＵまたは細胞数／胞子数によって測定される）は、細菌単離株の用量とほぼ同じであってもよい。例えば、ある態様では、対象は、ＡＳＤの一つ以上の症状を治療または予防するために、約１０^１０細胞の用量の細菌単離株（例えば、ラクトバチルス・ロイテリ）と、約１０^１０細胞の用量の非培養糞便細菌調製物を投与されてもよい。

【0269】

ある態様では、ＡＳＤの一つ以上の症状を治療するために対象に投与される細菌単離株の細胞数は、対象に投与される非培養糞便細菌調製物の細胞の合計数とほぼ同じであるか、またはそれよりも多い。あるいは、ＡＳＤの一つ以上の症状を治療するために対象に投与される細菌単離株の細胞数は、対象に投与される非培養糞便細菌調製物の細胞の合計数とほぼ同じであるか、またはそれより少なくてもよい。

【0270】

ある態様では、医薬組成物は、複数の細菌単離株を含む細菌混合物を含む。別の態様では、少なくとも２個の細菌単離株が、ほぼ同じ量または用量で存在する（例えば、ほぼ同じ数の生細胞もしくは胞子、またはほぼ同じＣＦＵで存在する）。別の態様では、少なくとも３個の細菌単離株、少なくとも４個の細菌単離株、少なくとも５個の細菌単離株、少なくとも６個の細菌単離株、少なくとも７個の細菌単離株、少なくとも８個の細菌単離株、少なくとも９個の細菌単離株、少なくとも１０個の細菌単離株、または１０個よりも多い細菌単離株が、ほぼ同じ量または用量で医薬組成物中に存在する（例えば、ほぼ同じ数の生細胞もしくは胞子、またはほぼ同じＣＦＵで存在する）。別の態様では、細菌混合物中の細菌単離株の全てが、ほぼ同じ量で存在する。

【0271】

ある態様では、医薬組成物は、複数の細菌単離株を含む細菌混合物を含み、複数の細菌単離株のうちの少なくとも２個は、異なる量または用量で存在する（例えば、異なる数の生細胞もしくは胞子、または異なるＣＦＵで存在する）。別の態様では、少なくとも３個、少なくとも４個、少なくとも５個、少なくとも６個、少なくとも７個、少なくとも８個、少なくとも９個、少なくとも１０個、または１０個より多い細菌単離株が、異なる量または用量で細菌混合物中に存在する。

【0272】

医薬組成物は、非培養糞便細菌調製物と組み合わされた、複数の細菌単離株を含む細菌混合物を含んでもよい。ある態様では、各細菌単離株は、非培養糞便細菌調製物の量または用量よりも多い量または用量で、組成物中に存在する（生細胞もしくは胞子、またはＣＦＵとして測定される）。別の態様では、各細菌単離株は、非培養糞便細菌調製物の量または用量よりも少ない量または用量で、組成物中に存在する（例えば、生細胞もしくは胞子、またはＣＦＵとして測定される）。別の態様では、少なくとも１個の細菌単離株が、非培養糞便細菌調製物の量または用量よりも多い量または用量で組成物中に存在し、少なくとも１個の細菌単離株が、非培養糞便細菌調製物の量または用量よりも少ない量または用量で組成物中に存在する（例えば、生細胞もしくは胞子、またはＣＦＵの数として測定される）。

【0273】

ある態様では、医薬組成物は、対象に投与され、対象の腸内で細菌単離株の生着が発生するために必要とされる細菌単離株の最小の量または用量で、またはそれを超える量または用量で、一つ以上の細菌単離株を含む。例えば、対象の腸内に細菌単離株が生着するために必要とされる細菌単離株の最小の用量は、少なくとも１０^６個の細胞、少なくとも１０^７個の細胞、少なくとも１０^８個の細胞、少なくとも１０^９個の細胞、少なくとも１０^１０個の細胞、少なくとも１０^１１個の細胞、または少なくとも１０^１２個の細胞であってもよい。ある態様では、微生物カクテルの第一および第二の細菌単離株は、異なる最小用量または最小量で対象の腸内に生着し、微生物カクテル中の第一および第二の細菌単離株の各々の用量または量は、各細菌単離株の生着に必要とされるそれぞれの最小用量または最小量に応じて変化する。

【0274】

医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）の個々の用量は、例えば、単位剤形当たり、約０．０１ｍｇ～約５，０００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約４，０００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約３，０００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約２，０００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約１，０００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約９５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約９００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約８５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約８００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約７５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約７００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約６５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約６００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約５５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約５００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約４５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約４００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約３５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約３００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約２５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約２００ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約１５０ｍｇ、約０．０１ｍｇ～約１００ｍｇ、約０．１ｍｇ～約９０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約８０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約７０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約６０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約５０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約４０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約３０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約２０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約１０ｍｇ、約０．１ｍｇ～約５ｍｇ、約０．１ｍｇ～約３ｍｇ、約０．１ｍｇ～約１ｍｇの活性成分、または単位剤形当たり、約５ｍｇ～約８０ｍｇを含有する単位剤形（例えば、錠剤またはカプセル）で投与されてもよい。例えば、単位剤形は、その間の全ての値および範囲を含む、約０．０１ｍｇ、約０．０２ｍｇ、約０．０３ｍｇ、約０．０４ｍｇ、約０．０５ｍｇ、約０．０６ｍｇ、約０．０７ｍｇ、約０．０８ｍｇ、約０．０９ｍｇ、約０．１ｍｇ、約０．２ｍｇ、約０．３ｍｇ、約０．４ｍｇ、約０．５ｍｇ、約０．６ｍｇ、約０．７ｍｇ、約０．８ｍｇ、約０．９ｍｇ、約１ｍｇ、約２ｍｇ、約３ｍｇ、約４ｍｇ、約５ｍｇ、約６ｍｇ、約７ｍｇ、約８ｍｇ、約９ｍｇ、約１０ｍｇ、約１５ｍｇ、約２０ｍｇ、約２５ｍｇ、約３０ｍｇ、約３５ｍｇ、約４０ｍｇ、約４５ｍｇ、約５０ｍｇ、約５５ｍｇ、約６０ｍｇ、約６５ｍｇ、約７０ｍｇ、約７５ｍｇ、約８０ｍｇ、約８５ｍｇ、約９０ｍｇ、約９５ｍｇ、約１００ｍｇ、約１５０ｍｇ、約２００ｍｇ、約２５０ｍｇ、約３００ｍｇ、約３５０ｍｇ、約４００ｍｇ、約４５０ｍｇ、約５００ｍｇ、約５５０ｍｇ、約６００ｍｇ、約６５０ｍｇ、約７００ｍｇ、約７５０ｍｇ、約８００ｍｇ、約８５０ｍｇ、約９００ｍｇ、約９５０ｍｇ、約１，０００ｍｇ、約２，０００ｍｇ、約３，０００ｍｇ、約４，０００ｍｇ、または約５，０００ｍｇの活性成分を含んでもよい。

【0275】

ある態様では、医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）は、毎日、約０．０１ｍｇ～約１００ｍｇの量で、毎日、約０．０１ｍｇ～約５，０００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約４，０００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約３，０００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約２，０００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約１，０００ｍｇ、毎日、薬０．０１ｍｇ～約９５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約９００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約８５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約８００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約７５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約７００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約６５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約６００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約５５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約５００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約４５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約４００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約３５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約３００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約２５０ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約２００ｍｇ、毎日、約０．０１ｍｇ～約１５０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約１００ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約９５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約９０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約８５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約８０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約７５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約７０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約６５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約６０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約５５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約５０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約４５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約４０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約３５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約３０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約２５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約２０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約１５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約１０ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約５ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約３ｍｇ、毎日、約０．１ｍｇ～約１ｍｇ、または毎日、約５ｍｇ～約８０ｍｇの量で、投与される。様々な態様では、細菌混合物は、その間の全ての値および範囲を含む、約０．０１ｍｇ、約０．０２ｍｇ、約０．０３ｍｇ、約０．０４ｍｇ、約０．０５ｍｇ、約０．０６ｍｇ、約０．０７ｍｇ、約０．０８ｍｇ、約０．０９ｍｇ、約０．１ｍｇ、約０．２ｍｇ、約０．３ｍｇ、約０．４ｍｇ、約０．５ｍｇ、約０．６ｍｇ、約０．７ｍｇ、約０．８ｍｇ、約０．９ｍｇ、約１ｍｇ、約２ｍｇ、約３ｍｇ、約４ｍｇ、約５ｍｇ、約６ｍｇ、約７ｍｇ、約８ｍｇ、約９ｍｇ、約１０ｍｇ、約１５ｍｇ、約２０ｍｇ、約２５ｍｇ、約３０ｍｇ、約３５ｍｇ、約４０ｍｇ、約４５ｍｇ、約５０ｍｇ、約５５ｍｇ、約６０ｍｇ、約６５ｍｇ、約７０ｍｇ、約７５ｍｇ、約８０ｍｇ、約８５ｍｇ、約９０ｍｇ、約９５ｍｇ、約１００ｍｇ、約１５０ｍｇ、約２００ｍｇ、約２５０ｍｇ、約３００ｍｇ、約３５０ｍｇ、約４００ｍｇ、約４５０ｍｇ、約５００ｍｇ、約５５０ｍｇ、約６００ｍｇ、約６５０ｍｇ、約７００ｍｇ、約７５０ｍｇ、約８００ｍｇ、約８５０ｍｇ、約９００ｍｇ、約９５０ｍｇ、約１，０００ｍｇ、約２，０００ｍｇ、約３，０００ｍｇ、約４，０００ｍｇ、または約５，０００ｍｇの１日用量で投与される。

【0276】

一部の態様では、医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）の適切な用量は、その間の全ての値および範囲を含む、約０．０１ｍｇ／対象の体重ｋｇ～約１００ｍｇ／対象の体重ｋｇの範囲、例えば、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０２ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０３ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０４ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０６ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０７ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０８ｍｇ／体重ｋｇ、約０．０９ｍｇ／体重ｋｇ、約０．１ｍｇ／体重ｋｇ、約０．２ｍｇ／体重ｋｇ、約０．３ｍｇ／体重ｋｇ、約０．４ｍｇ／体重ｋｇ、約０．５ｍｇ／体重ｋｇ、約０．６ｍｇ／体重ｋｇ、約０．７ｍｇ／体重ｋｇ、約０．８ｍｇ／体重ｋｇ、約０．９ｍｇ／体重ｋｇ、約１ｍｇ／体重ｋｇ、約１．１ｍｇ／体重ｋｇ、約１．２ｍｇ／体重ｋｇ、約１．３ｍｇ／体重ｋｇ、約１．４ｍｇ／体重ｋｇ、約１．５ｍｇ／体重ｋｇ、約１．６ｍｇ／体重ｋｇ、約１．７ｍｇ／体重ｋｇ、約１．８ｍｇ／体重ｋｇ，１．９ｍｇ／体重ｋｇ、約２ｍｇ／体重ｋｇ、約３ｍｇ／体重ｋｇ、約４ｍｇ／体重ｋｇ、約５ｍｇ／体重ｋｇ、約６ｍｇ／体重ｋｇ、約７ｍｇ／体重ｋｇ、約８ｍｇ／体重ｋｇ、約９ｍｇ／体重ｋｇ、約１０ｍｇ／体重ｋｇ、約２０ｍｇ／体重ｋｇ、約３０ｍｇ／体重ｋｇ、約４０ｍｇ／体重ｋｇ、約５０ｍｇ／体重ｋｇ、約６０ｍｇ／体重ｋｇ、約７０ｍｇ／体重ｋｇ、約８０ｍｇ／体重ｋｇ、約９０ｍｇ／体重ｋｇ、または約１００ｍｇ／体重ｋｇの範囲である。他の態様では、適切な組成物の用量は、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約１００ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約９０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約８０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約７０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約６０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約５０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約４０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約３０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約２０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約１０ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約９ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約８ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約７ｍｇ／体重ｋｇの範囲、０．０１ｍｇ／体重ｋｇ～約６ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ～約５ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ～約４ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ～約３ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ～約２ｍｇ／体重ｋｇの範囲、約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ～約１．５ｍｇ／体重ｋｇの範囲、または約０．０５ｍｇ／体重ｋｇ～約１ｍｇ／体重ｋｇの範囲である。

【0277】

特定の態様によれば、医薬組成物（例えば、細菌混合物を含む）は、例えば、１日２回以上、１日約１回、およそ１日おき、およそ３日おき、およそ１週間に１回、およそ２週間に１回、およそ１か月に１回、およそ２カ月に１回、およそ３か月に１回、およそ６か月に１回、またはおよそ１年に１回、投与されてもよい。

【0278】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、少なくとも２日間連続で、その必要のある患者に投与されてもよい。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２週間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１週間当たり２回、３回、４回または５回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２週間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して投与される。さらなる態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２の週または月で連続して投与される。さらに別の態様では、医薬組成物は、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の月または年で連続して、少なくとも１回投与される。

【0279】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、少なくとも２日間連続で、その必要のある患者に投与されてもよい。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２週間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の週または月で連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の月または年で連続で、少なくとも２回投与される。

【0280】

本開示のある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、少なくとも２日間連続で、その必要のある患者に投与されてもよい。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で投与される。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２週間連続で投与される。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して投与される。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の週または月で連続で投与される。ある態様では、医薬組成物は、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の月または年で連続で、少なくとも３回投与される。

【0281】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、または１日２回の投与スケジュールで、少なくとも３の日または週で連続で、その必要のある患者に投与されてもよい。ある態様では、用量は、少なくとも１日１回、２回または３回、１～１２週、２～１２週、３～１２週、４～１２週、５～１２週、６～１２週、７～１２週、８～１２週、９～１２週、１０～１２週、１～２週、２～３週、３～４週、４～５週、５～６週、６～７週、７～８週、８～９週、９～１０週、または１０～１１週の期間、投与される。

【0282】

ある態様では、医薬組成物は、１週に１回、１週に２回、または１週に３回の投与スケジュールで、その必要のある患者に投与されてもよい。「１週に１回」という用語は、典型的には１週間で１回のみ、例えば各週の同じ日に用量が投与されることを意味する。「１週に２回」とは、典型的には１週間で２回のみ、例えば各週間の同じ２日間に用量が投与されることを意味する。「１週に３回」とは、典型的には１週間で３回のみ、例えば各週間の同じ３日間に用量が投与されることを意味する。

【0283】

ある態様では、医薬組成物は、その必要のある患者に投与されてもよく、この場合において投与は、第一の投与スケジュールとそれに続く第二の投与スケジュールを含む。ある態様では、第一の投与スケジュールは、治療用量または導入用量を含む。ある態様では、第二の投与スケジュールは、維持用量を含む。例えば、第二の投与スケジュールの薬学的に活性な維持用量は、第一の投与スケジュールの薬学的に活性な導入用量以下であってもよい。他の例では、第二の投与スケジュールの維持用量は、第一の投与スケジュールの導入用量よりも高くてもよい。

【0284】

医薬組成物を投与するための第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、少なくとも１日１回を少なくとも１日間、組成物を投与することを含んでもよい。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、少なくとも１日１回で少なくとも２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で組成物を投与することを含む。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、少なくとも１日１回で少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２週間連続で組成物を投与することを含む。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して組成物を投与することを含む。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の週または月で連続で組成物を投与することを含む。ある態様では、第一または第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の月または年で連続で組成物を投与することを含む。

【0285】

ある態様では、方法で使用される第一または第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、週に１回、週に２回、または週に３回であってもよい。

【0286】

ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、少なくとも約２、４、６、８、１０、１２、１８、２４、３６、４８、７２、または９６カ月間、継続してもよい。ある態様では、第二の投与スケジュールは、治療される対象の全人生にわたり、または無期限に、永久的に継続する。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、連続的な投与スケジュールである。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、断続的な投与スケジュールである。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４日間の治療期間と、それに続く少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４日間の休息期間を含む断続的な投与スケジュールである。ある態様では、第一および第二の投与スケジュールのうちの少なくとも一つは、一日おき、二日おき、または３、４、５、６、７、８日おきに用量を投与することを含む。ある態様では、用量は、漸増（または別手段により用量または投与スケジュールを変更すること）を伴う、または伴わない長期間にわたって投与される。

【0287】

ある態様では、第一の投与スケジュールと第二の投与スケジュールの間の間隔は、少なくとも約１、２、３、４、５、６もしくは７日間、または少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２週間、または少なくとも約１、２、３、４、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２カ月間である。

【0288】

ある態様では、第二の投与スケジュール（例えば維持用量）は、第一の投与スケジュール（例えば、初期導入用量）で使用される用量よりも、約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、２０、３０、４０、５０、７５、１００、２００、４００、８００、１０００、５０００倍以上少ない用量を含む。別の態様では、第二の投与スケジュール（例えば、維持投与スケジュール）は、第一の投与スケジュール（例えば、初期治療投与スケジュール）と等しい、または少ない投与頻度を有する。ある態様では、第二の投与スケジュール（例えば、維持投与スケジュール）は、第一の投与スケジュール（例えば、初期治療投与スケジュール）よりも多い投与間隔を有する。ある態様では、初期治療投与スケジュールの全ての投与は、一人のドナーに由来する。別の態様では、初期治療投与スケジュールの投与は、複数のドナーに由来する。ある態様では、維持投与スケジュールの全ての投与は、一人のドナーに由来する。別の態様では、維持投与スケジュールの投与は、複数のドナーに由来する。

【0289】

ある態様では、第一の投与スケジュールは、対象への医薬組成物の一つの用量の投与を含む。ある態様では、第二の投与スケジュールは、対象への医薬組成物の一つの用量または複数の用量のいずれかの投与を含み、この場合いおいて第二の投与スケジュール中の医薬組成物の用量は、第一の投与スケジュール中の医薬組成物の用量よりも少ない。

【0290】

様々な態様では、本明細書に記載の方法は、ヒト対象の治療に有用である。一部の態様では、ヒトは、小児である。他の態様では、ヒトは、成人である。他の態様では、ヒトは、老人である。他の態様では、ヒトは、患者と呼称される場合もある。一部の態様では、ヒトは、女性である。一部の態様では、ヒトは、男性である。

【0291】

特定の態様では、ヒトは、約１～約１８カ月齢、約１８～３６カ月齢、約１～約５歳、約５～約１０歳、約１０～約１５歳、約１５～約２０歳、約２０～約２５歳、約２５～約３０歳、約３０～約３５歳、約３５～約４０歳、約４０～約４５歳、約４５～約５０歳、約５０～約５５歳、約５５～約６０歳、約６０～約６５歳、約６５～約７０歳、約７０～約７５歳、約７５～約８０歳、約８０～約８５歳、約８５～約９０歳、約９０～約９５歳、または約９５～約１００歳の範囲の年齢である。

【0292】

一つの態様では、治療される対象は、ヒト患者である。一つの態様では、患者は、男性患者である。一つの態様では、患者は、女性患者である。一つの態様では、患者は、早生児である。一つの態様では、患者は、新生児期間である。一つの態様では、患者は、新生児である。一つの態様では、患者は、乳児である。一つの態様では、患者は、幼児である。一つの態様では、患者は、小児である。一つの態様では、患者は、子供である。一つの態様では、患者は、青年である。一つの態様では、患者は、小児患者である。一つの態様では、患者は、高齢患者である。一つの態様では、ヒト患者は、約１８、１５、１２、１０、８、６、４、３、２、または１歳未満の子供の患者である。別の態様では、ヒト患者は、成人患者である。別の態様では、ヒト患者は、年配の患者である。さらなる態様では、ヒト患者は、約３０歳、３５歳、４０歳、４５歳、５０歳、５５歳、６０歳、６５歳、７０歳、７５歳、８０歳、８５歳、９０歳、または９５歳を超える患者である。別の態様では、患者は、約１～５、２～１０、３～１８、２１～５０、２１～４０、２１～３０、５０～９０、６０～９０、７０～９０、６０～８０、または６５～７５歳である。一つの態様では、患者は、前期高齢者の患者（６５－７４歳）である。一つの態様では、患者は、中期高齢者の患者（７５～８４歳）である。一つの態様では、患者は、高齢の患者（＞８５歳）である。

【0293】

追加の治療剤および合剤化
本明細書に記載される医薬組成物は、細菌混合物に加えて、一つ以上の治療剤を含んでもよく、それらは本明細書に記載の方法において、その必要のある対象に投与されてもよい。追加の治療剤は、本明細書に記載される細菌混合物（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む）と同時に、または連続して投与されてもよい。さらに、本発明の組成物および製剤は、（例えば、合剤化を介して）追加の治療剤を含んでもよい。例えば、追加の治療剤、一つ以上の細菌単離株、および非培養糞便細菌調製物は、一つの製剤内で組み合わされてもよい。

【0294】

ある態様では、追加の治療剤と細菌混合物は、対象に同時に投与される。本明細書で使用される場合、「同時に」という用語は、追加の治療剤と細菌混合物が、約６０分以下、例えば約３０分以下、約２０分以下、約１０分以下、約５分以下、または約１分以下の時間分離で投与されることを意味する。追加の治療剤と細菌混合物は、一つの製剤（例えば、追加の治療剤と細菌混合物を含む製剤）の同時投与、または別個の製剤（例えば、追加の治療剤を含む第一の製剤と細菌混合物を含む第二の製剤）の同時投与によるものであってもよい。

【0295】

その投与のタイミングが、追加の治療剤と細菌混合物（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む）の薬理活性が時間内に重複するような場合、同時投与は、追加の治療剤が同時に投与されることを必要としない。例えば、追加の治療剤と細菌混合物は、連続して投与されてもよい。本明細書で使用される場合、「連続して」という用語は、追加の治療剤と細菌混合物が、約６０分を超える時間分離で投与されることを意味する。例えば、追加の治療剤と細菌混合物の連続投与の間の時間は、約６０分超、約２時間超、約５時間超、約１０時間超、約１日超、約２日超、約３日超、または約１週間超の間隔であってもよい。最適な投与時間は、投与される追加の治療剤と細菌混合物の代謝速度、排泄、および／または薬力学的活性に依存する。追加の治療剤または細菌混合物のいずれかが、最初に投与されてもよい。

【0296】

さらなる態様では、追加の治療剤と細菌混合物は、対象に同時に投与されてもよいが、ＧＩ管における各剤形（または合剤化の場合には、単一の単位用量）からの追加の治療剤と細菌混合物の放出は、連続して発生してもよい。

【0297】

また、同時投与は、複数の追加の治療剤が細菌混合物と同じ投与経路によって対象に投与されることを必要とはしない。むしろ、各追加の治療剤は、任意の適切な経路、例えば、非経口的にまたは経口的に投与されてもよい。

【0298】

一部の態様では、追加の治療剤は、対象においてＡＳＤの一つ以上の症状を治療するために使用される剤である。一部の態様では、追加の治療剤は、イスペリドン、フルオキセチン、アリピプラゾール、ビタミンＤ、レボカルニチン、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される。

【0299】

一部の態様では、追加の治療剤は、例えばステロイド系抗炎症剤または非ステロイド系抗炎症剤（ＮＳＡＩＤＳ）などの抗炎症剤である。ステロイド、特に副腎コルチコステロイドおよびその合成類似体は、当分野で公知である。追加の治療剤として対象に投与され得るコルチコステロイドの非限定的な例としては、ヒドロキシルトリアムシノロン、アルファ－メチルデキサメタゾン、ベータ－メチルベタメタゾン、ジプロピオン酸ベクロメタゾン、安息香酸ベタメタゾン、ジプロピオン酸ベタメタゾン、吉草酸ベタメタゾン、吉草酸クロベタゾール、デソニド、デソキシメタゾン、デキサメタゾン、二酢酸ジフロラゾン、吉草酸ジフルコルトロン、フルアドレノロン、フルクロロロンアセトニド、ピバル酸フルメタゾン、フルオシノロンアセトニド、フルオシノニド、フルコルチンブチルエステル、フルオコルトロン、酢酸フルプレドニデン（フルプレドニリデン）、フルランドレノロン、ハルシノニド、酢酸ヒドロコルチゾン、酪酸ヒドロコルチゾン、メチルプレドニゾロン、トリアムシノロンアセトニド、コルチゾン、コルトドキソン、フルセトニド、フルドロコルチゾン、二酢酸ジフルオロゾン、フルラドレノロンアセトニド、メドリゾン、アムシナフェル、アムシナフィド、ベタメタゾンおよびそのエステルの釣り合うもの、クロロプレドニゾン、クロコルテロン、クレシノロン、ジクロリゾン、ジフルプレドネート、フルクロロニド、フルニソリド、フルオロメタロン、フルペロロン、フルプレドニゾロン、ヒドロコルチゾン、メプレドニゾン、パラメタゾン、プレドニゾロン、プレドニゾン、ジプロピオン酸ベクロメタゾンが挙げられる。使用され得るＮＳＡＩＤＳとしては限定されないが、サリチル酸、アセチルサリチル酸、サリチル酸メチル、サリチル酸グリコール、サリチルアミド、ベンジル－２，５－ジアセトキシ安息香酸、イブプロフェン、フリンダク、ナプロキセン、ケトプロフェン、エトフェナメート、フェニルブタゾン、インドメタシン、およびそれらの組み合わせが挙げられる。追加の抗炎症剤は、例えば、米国特許第４，５３７，７７６号に記載されており、当該文献の全内容が、参照によりその全体で本明細書に組み込まれる。

【0300】

一部の態様では、医薬組成物に組み込まれ得る追加の治療剤は、プレバイオティクスである。プレバイオティクスは、対象に投与されて対象の腸内の一つ以上の微生物（例えば微生物叢）の成長、増殖または活性を（例えば、当該一つ以上の微生物により代謝される基質を提供することによって）促進する化合物（例えば、一つ以上の栄養素を含む）である。理論に拘束されることは望まないが、プレバイオティクスは医薬組成物に添加されて、対象の内因性マイクロバイオーム中の細菌および／または医薬組成物それ自体の中の細菌を栄養的に補い、例えば、非培養糞便細菌調製物の一つ以上の株および／または一つ以上の細菌単離株の成長または活性を刺激することができる。さらに一つ以上のプレバイオティクスが組成物に添加されて、例えば非培養糞便細菌調製物の単離および／または精製の後に、または凍結、凍結乾燥、噴霧乾燥、溶液中での再構成などの前後に、細菌細胞が新たな環境へと移行する際の細菌細胞に対する「ショック」を和らげることができる。

【0301】

医薬組成物に添加され得るプレバイオティクスの非限定的な例としては、アミノ酸、乳酸、硝酸アンモニウム、アミロース、大麦マルチ、ビオチン、炭酸塩、セルロース、キチン、コリン、フルクトオリゴ糖（ＦＯＳ）、フルクトース、ガラクトリオリゴ糖（ＧＯＳ）、グルコース、グリセロール、ヘテロ多糖類、ヒスチジン、ホモ多糖類、ヒドロキシアパタイト、イヌリン、イソマルツロース、ラクトース、ラクツロース、マルトデキストリン、マルトース、マンノオリゴ糖、窒素、オリゴデキストロース、オリゴフルクトース、オリゴフルクトース富化イヌリン、オリゴ糖、ペクチン、リン酸塩、リン、ポリデキストロース、ポリオール、カリ、カリウム、硝酸ナトリウム、デンプン、スクロース、硫黄、サンファイバー、タガトース、チアミン、トランス－ガラクトリオリゴ糖、トレハロース、ビタミン、水溶性炭水化物、キシロオリゴ糖（ＸＯＳ）、およびそれらの組み合わせが挙げられる。例示的なプレバイオティクスとしては、複雑な炭水化物、アミノ酸、ペプチド、または細菌組成物の生存のための他の必須栄養成分が挙げられる。

【0302】

ある態様では、対象は、医薬組成物を用いた治療前にプレバイオティクスで前治療されない。別の態様では、医薬組成物は、プレバイオティックスを補充されない。

【0303】

ある態様では、プレバイオティックスは、例えば、細菌混合物を含む、本明細書に記載の医薬組成物中に（例えば、乾燥形態または液体形態で）含有されてもよい。

【0304】

あるいは、または追加的に、対象（例えば、ＡＳＤの一つ以上の症状を有する）に投与されるプレバイオティクスは、細菌混合物を欠く別個の医薬組成物中に（乾燥形態または液体形態で）含有されてもよい。

【0305】

プレバイオティクスは、細菌混合物を含む医薬組成物の投与の前、投与と同時、および／または投与の後に、同じ医薬組成物中で、または別個の医薬組成物中のいずれかで対象に投与されてもよい。

【0306】

プレバイオティクスは、単回用量または複数用量で提供され、投与されてもよい。単回用量として提供される場合、一つの組成物は、ただ一つのプレバイオティクス、またはプレバイオティクスの混合物を含んでもよい。複数用量で提供される場合、対象に投与される各組成物は、一つのプレバイオティクスまたはプレバイオティクスの混合物を含んでもよく、および／または対象に投与される第一の組成物は、対象に投与される第二の組成物とは異なるプレバイオティクスを含んでもよい。

【0307】

例として、複数用量が提供される場合、プレバイオティクスを含む第一の組成物は、例えばイヌリンなどの第一のプレバイオティクスを含んでもよく、第二の組成物は、例えばペクチンなどの異なるプレバイオティクスを、第一のプレバイオティクスとともに、または伴わずに含んでもよい。あるいは第一の組成物は、例えばイヌリンとペクチンなど、プレバイオティクスの組み合わせを含んでもよく、第二の組成物は、例えばイヌリンとＦＯＳなど、プレバイオティクスの異なる組み合わせを含んでもよい。第一の組成物は、プレバイオティクスの組み合わせを含んでもよく、第二の組成物は、ただ一つのプレバイオティクスのみを含んでもよい。

【0308】

組成物中に含まれるプレバイオティクスの量は、具体的なプレバイオティクス、当該プレバイオティクスの標的となる具体的な細菌株、および／または対象／患者の疾患状態に依存する。

【0309】

一部の態様では、医薬組成物に組み込まれ得る追加の治療剤は、下痢止め剤である。本明細書に記載される医薬組成物への含有に適した下痢止め剤の非限定的な例としては限定されないが、ＤＰＰ－ＩＶ阻害剤、天然オピオイド、例えばアヘンのチンキ剤、パレゴリック、およびコデイン、合成オピオイド、例えばジフェノキシレート、ジフェノキシン、およびロペラミド、次サリチル酸ビスマス、ランレオチド、バプレオチド、およびオクトレオチド、モチリンアンタゴニスト、セレコキシブなどのＣＯＸ２阻害剤、グルタミン、サリドマイドおよび従来の下痢止め治療薬、例えばカオリン、ペクチン、ベルベリン、およびムスカリン剤、ならびにそれらの組み合わせが挙げられる。

【0310】

一部の態様では、医薬組成物に組み込まれ得る追加の治療剤は、鎮痛剤である。本明細書に記載の組成物および方法に有用な鎮痛剤としては限定されないが、モルヒネ、コデイン、ヘロイン、メタドン、および関連化合物、テバイン、オルピアビンおよびそれらの誘導体、ブプレノルフィン、ピペリジン、モルフィナン、ベンゾモルファン、テトラヒドロイソキノリン、チアンブタン（ｔｈｉａｍｂｕｔａｎｅｓ）、ベンジルアミン、チリジン、ビミノール、ネフォパム、カプサイシン（８－メチル－Ｎ－バニリル－６Ｅ－ノネナミド）、「合成」カプサイシン（Ｎ－バニリルノナミド）、および関連化合物、ならびにそれらの組み合わせが挙げられる。

【0311】

一部の態様では、追加の治療剤は、抗菌剤であり、限定されないが、セファロスポリン抗生物質（セファレキシン、セフロキシム、セファドロキシル、セファゾリン、セファロチン、セファクロル、セファマンドール、セフォキシチン、セフプロジル、およびセフトビプロール）、フルオロキノロン抗生物質（シプロ、レバクイン、フロキシン、テクイン、アベロクス、およびノルフロクス）、テトラサイクリン抗生物質（テトラサイクリン、ミノサイクリン、オキシテトラサイクリン、およびドキシサイクリン）、ペニシリン抗生物質（アモキシシリン、アンピシリン、ペニシリンＶ、ジクロキサシリン、カルベニシリン、バンコマイシン、およびメチシリン）、モノバクタム抗生物質（アズトレオナム）、カルバペネム抗生物質（エルタペネム、ドリペネム、イミペネム／シラスタチン、およびメロペネム）、およびそれらの組み合わせ、が挙げられる。一部の態様では、抗菌剤は、ペニシリン抗生物質、セファロスポリン抗生物質、モノバクタム抗生物質、およびカルバペネム抗生物質、またはそれらの組み合わせのいずれかであってもよい。

【0312】

一つの態様では、方法は、治療用細菌混合物を投与する前に、対象を抗生物質組成物で前治療することをさらに含む。一つの態様では、本明細書において投与される抗生物質組成物は、リファブチン、クラリスロマイシン、クロファジミン、バンコマイシン、リファンピシン、ニトロイミダゾール、クロラムフェニコール、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される抗生物質を含む。別の態様では、本明細書において投与される抗生物質組成物は、リファキシミン、リファマイシン誘導体、リファンピシン、リファブチン、リファペンチン、リファラジル、ビコザマイシン、アミノグリコシド、ゲンタマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、パロモマイシン、ベルダマイシン、ムタマイシン、シソマイシン、ネチルマイシン、レチマイシン（ｒｅｔｙｍｉｃｉｎ）、カナマイシン、アズトレオナム、アズトレオナムマクロライド、クラリスロマイシン、ジリスロマイシン、ロキシスロマイシン、テリスロマイシン、アジスロマイシン、次サリチル酸ビスマス、バンコマイシン、ストレプトマイシン、フィダキソマイシン、アミカシン、アルベカシン、ネオマイシン、ネチルマイシン、パロモマイシン、ロドストレプトマイシン、トブラマイシン、アプラマイシン、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される抗生物質を含む。別の態様では、対象は、細菌混合物を投与する前に抗生物質組成物で前治療されない。別の態様では、医薬組成物は、抗生物質組成物を補充されない。さらなる態様では、方法は、細菌混合物の投与前に、抗炎症剤を用いて対象を前治療することをさらに含む。さらに別の態様では、対象は、細菌混合物の投与前に、抗炎症剤で前治療されない。別の態様では、細菌混合物は、抗炎症剤を補充されない。

【0313】

追加の治療剤の送達は、本明細書に記載されるように、ＧＩ管の様々な部分を標的としてもよい。

【0314】

本明細書に記載される医薬組成物（例えば、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物を含む一つ以上の細菌混合物を含む）は、一つ以上の障害、疾患もしくは状態の治療または予防のために、その必要のある対象に投与されてもよい。ある態様では、医薬組成物は、対象においてＡＳＤの一つ以上の症状を予防または治療するために、対象に投与される。本明細書において、その必要のある対象においてＡＳＤの一つ以上の症状を治療または予防する方法が提供され、当該方法は、本明細書に記載される医薬組成物を対象に投与することを含む。

【0315】

本明細書に提供される方法は、限定されないが、視覚刺激に対するアイトラッキング、皮膚コンダクタンスおよび／またはＥＥＧ測定値、社会的相互作用に携わることおよび応答することの困難性、言語コミュニケーションおよび非言語コミュニケーションの問題、反復行動、知的障害、運動協調の困難性、注意の問題点、睡眠障害、ならびに例えば胃腸障害などの身体の健康上の問題点における変化を含む、ＡＳＤの一つ以上の指標または症状における検出可能な改善を生じさせ、または改善の実現を目的としている。

【0316】

対象の社会的およびコミュニケーション的な発達を評価するためのいくつかのスクリーニング手段が当分野に公知であり、コミュニケーションスキル、社会的相互作用、および自閉症スペクトラム障害の特徴である行動上の限定的、反復的および常同的なパターンにおける、障害の重症度のスクリーニングおよび障害の重症度の変化の検出における補助として使用することができる。評価には、詳細な認知検査および言語検査とともに、神経学的評価および遺伝的評価が含まれ得る。自閉症の診断および評価に対して特別に開発された追加の尺度としては、自閉症診断面接改訂版（ＡＤＩ－Ｒ：Ａｕｔｉｓｍ Ｄｉａｇｎｏｓｉｓ Ｉｎｔｅｒｖｉｅｗ－Ｒｅｖｉｓｅｄ）、自閉症診断観測スケジュール（ＡＤＯＳ－Ｇ：Ａｕｔｉｓｍ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ Ｏｂｓｅｒｖａｔｉｏｎ Ｓｃｈｅｄｕｌｅ）、および小児自閉症評定尺度（ＣＡＲＳ：Ｃｈｉｌｄｈｏｏｄ Ａｕｔｉｓｍ Ｒａｔｉｎｇ Ｓｃａｌｅ）が挙げられる。

【0317】

自閉症診断面接改訂版（ＡＤＩ－Ｒ）は、２時間の構造化された面接であり、自閉症および自閉症スペクトラム障害の臨床診断に使用される主要なツールの一つである。本明細書で使用される場合、ＡＤＩ－Ｒを使用して、ＡＳＤの診断を検証してもよい。ＡＤＩ－Ｒは、小児および成人の介護者のための標準化された半構造化臨床レビューである。面接には９３項目が含まれており、以下の三つのコンテンツ領域またはドメインにおける行動に焦点を当てている：社会的相互作用の質（例えば、感情の共有、快適性の提供と追及、社会的笑顔、ならびに他の小児に対する応答）；コミュニケーションおよび言語（例えば、常同的な発話、代名詞の逆転、言語の社会的利用）；ならびに反復的で限定的、および常同的な関心と行動（例えば、普通ではない没頭、手および指の癖、普通ではない感覚的関心）。この尺度には、例えば自傷行為や過活動など、治療計画に関連する他の項目も含まれる。応答は、子供の行動に関する介護者の説明に基づいて、臨床医によって採点される。ＡＤＩ－Ｒ面接は、三つのコンテンツ領域（すなわち、コミュニケーションおよび言語、社会的相互作用、ならびに限定的で反復的な行動）の各々においてスコアを生成する。スコアの上昇は、特定の領域における問題行動を示す。スコアは、子供の行動および発育に関する介護者の報告後の医師の判断に基づく。各項目について、医師は０～３の範囲のスコアを与える。スコア０は、符号化において指定されるタイプの行動が存在しないことを示す。スコア１は、指定されたタイプの行動が異常な形態で存在するが、２の基準を満たすほど重度または頻繁ではないことを示す。スコア２は、指定された基準を満たす明白な異常行動を示す。スコア３は、極度に重症な指定された行動を示す。この尺度の著者は、アルゴリズムの計算において、３を２として再符号化する。さらに特定の状況下で与えられるスコア７（符号化の通常領域ではあるが、指定されたタイプのものではない、明白な異常を示す）、スコア８（該当なしを示す）、およびスコア９（不明または求められていないことを示す）も存在し、それらはすべて、アルゴリズム計算において０へと変換される。

【0318】

自閉症の分類は、コミュニケーション、社会的相互作用、行動パターンの三つのコンテンツ領域すべてにおけるスコアが、指定されたカットオフ値を満たすか、またはそれを超えるときに与えられ、障害の発症は、３６ヵ月齢までに明白である。同じアルゴリズムが、１８か月から成人期までの精神年齢の子供に使用され、小さな改変を含む以下の三つのバージョンが存在する：１）一生涯のバージョン；２）現在の行動に基づくバージョン；および３）４歳未満の子供に使用するバージョン。このアルゴリズムは各領域における最小スコアを指定し、ＩＣＤ－１０（疾病および関連保健問題の国際統計分類の第１０版：１０^ｔｈ ｖｅｒｓｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｃｌａｓｓｉｆｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ Ｄｉｓｅａｓｅｓ ａｎｄ Ｒｅｌａｔｅｄ Ｈｅａｌｔｈ Ｐｒｏｂｌｅｍｓ）およびＤＳＭ－ＩＶ（精神疾患の診断および統計マニュアル、第４版：Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ ａｎｄ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｍａｎｕａｌ ｏｆ Ｍｅｎｔａｌ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ，４ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ）に記載される自閉症の診断が為される。コミュニケーションおよび言語ドメインの合計カットオフスコアは、言語対象では８、非言語対象では７である。すべての対象について、社会的相互作用ドメインのカットオフは１０であり、限定的で反復的な行動のカットオフは３である。

【0319】

ＣＡＲＳによると、評価者は、対象を１５の領域それぞれについて１～４の尺度で評価する：ヒトに関する；模倣；情動反応；身体使用；物体の使用 変化への適応；視覚的応答；反応を聞く；味覚、臭覚および触覚の反応および使用；恐れ；言語コミュニケーション；非言語コミュニケーション；活動；理知的な反応のレベルおよび一貫性；および一般的な印象。

【0320】

小児自閉症評定尺度―２またはＣＡＲＳ－２として知られるＣＡＲＳの第２版は、Ｓｃｈｏｐｌｅｒらにより開発された（小児自閉症評定尺度－第２版（ＣＡＲＳ２）：Ｍａｎｕａｌ．Ｌｏｓ Ａｎｇｅｌｅｓ：Ｗｅｓｔｅｒｎ Ｐｓｙｃｈｏｌｏｇｉｃａｌ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ，２０１０）。オリジナルのＣＡＲＳは主に、併存疾患の知的機能を有する個人で開発されており、ＡＳＤを有する高度に機能的な個人を正確に特定しないと批判された。ＣＡＲＳ－２は、若い、または機能性が低い個人での使用に関して元のＣＡＲＳ型を保持している（現在は「標準型」に対してＣＡＲＳ２－ＳＴと改名された）が、機能性の高い個人での使用については別の評定尺度（「高機能型」についてはＣＡＲＳ２－ＨＦと命名）、およびＣＡＲＳ２ＳＴやＣＡＲＳ２－ＨＦの評定に関して有用性を有する非スコア化情報収集尺度（「両親および介護者に対する質問票」またはＣＡＲＳ－ＱＰＣ）も含んでいる。

【0321】

本明細書に提供される方法による治療の前、治療の間、または治療の後の症状の重症度における変化を評価するのに有用な別の症状評定手段は、異常行動チェックリスト（ＡＢＣ：Ａｂｅｒｒａｎｔ Ｂｅｈａｖｉｏｒ Ｃｈｅｃｋｌｉｓｔ）である。Ａｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｓｙｃｈｏｍｅｔｒｉｃ ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｓｔｉｃｓ ｏｆ ｔｈｅ ａｂｅｒｒａｎｔ ｂｅｈａｖｉｏｒ ｃｈｅｃｋｌｉｓｔ．Ａｍ Ｊ Ｍｅｎｔ Ｄｅｆｉｃ．１９８５ Ｍａｒ；８９（５）：４９２－５０２を参照のこと。ＡＢＣは、発達障害（知的障害、ＡＳＤ、脳性麻痺、てんかん）を有する子供および成人の問題行動を評価するための症状チェックリストである。ＡＢＣは、自宅で、教育現場で、コミュニティ系施設、および発達センターにおいて、発達障害を有する子供および青年の問題行動を分類するのにも有用である。ＡＢＣは、五つの下位尺度に分けられる５８個の項目を含み、管理時間は１０～１５分である。

【0322】

ＡＢＣは、その人が観察された状況と、機能的制限の存在／重症度を特定する。特定の症状を評価し、詳細なマニュアルによって、評価された各行動についての包括的な説明が提供される。ＡＢＣの五つの下位尺度には以下が含まれる：（１）易刺激性／興奮性、（２）無気力／引きこもり、（３）常同行動、（４）多動性／不順守、および（５）不適切な発言。ＡＢＣ－２は、ＡＢＣの改訂版である。ＡＢＣ－２にも、ＡＢＣと同じ五つの下位尺度に分けられる５８個の項目が含まれる。

【0323】

本明細書に提供される方法による治療の前、治療の間、または治療の後の症状の重症度における変化を評価するのに有用な別の症状評定手段は、社会的反応性尺度（ＳＲＳ：Ｓｏｃｉａｌ Ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅｎｅｓｓ Ｓｃａｌｅ）である。ＳＲＳ尺度は６５項目の尺度であり、社会的認識、社会的情報処理、相互的な社会的コミュニケーションの能力、社会的な不安／回避性、および自閉症的な没入感や特質を含む、自閉症の中心的問題である社会的障害を評価する。Ｃｏｎｓｔａｎｔｉｎｏ ｅｔ ａｌ．，Ｖａｌｉｄａｔｉｏｎ ｏｆ ａ ｂｒｉｅｆ ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅ ｍｅａｓｕｒｅ ｏｆ ａｕｔｉｓｔｉｃ ｔｒａｉｔｓ：ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｓｏｃｉａｌ ｒｅｓｐｏｎｓｉｖｅｎｅｓｓ ｓｃａｌｅ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ａｕｔｉｓｍ ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃ ｉｎｔｅｒｖｉｅｗ－ｒｅｖｉｓｅｄ．Ｊ Ａｕｔｉｓｍ Ｄｅｖ Ｄｉｓｏｒｄ． ２００３ Ａｕｇ；３３（４）：４２７－３３を参照のこと。

【0324】

本明細書で使用される場合、ＳＲＳ－２は、ＳＲＳの更新版である。ＳＲＳ－２も、６５項目の尺度であり、社会的認識、社会的情報処理、相互的な社会的コミュニケーションの能力、社会的な不安／回避性、および自閉症的な没入感や特質を含む、自閉症の中心的問題である社会的障害を評価する。

【0325】

本明細書で使用される場合、ヴァインランド適応行動尺度ＩＩ（Ｖｉｎｅｌａｎｄ Ａｄａｐｔｉｖｅ Ｂｅｈａｖｉｏｒ Ｓｃａｌｅ ＩＩ：ＶＡＢＳ－ＩＩ）は、四つの異なるドメイン：コミュニケーション、日常生活スキル、社会化、および運動スキルと、１１の下位ドメインにおける、機能性レベルの尺度である。素点は、年齢相当スコアへと変換される。これはＡＢＣを補完するものであり、問題行動を評価する。Ｓａｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｖｉｎｅｌａｎｄ Ａｄａｐｔｉｖｅ Ｂｅｈａｖｉｏｒ Ｓｃａｌｅｓ，Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ（Ｖｉｎｅｌａｎｄ（商標）－ＩＩ），Ｐｅａｒｓｏｎ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ，２００５を参照のこと。ＶＡＢＳ－ＩＩの範囲には、０～８０の境界適応機能が含まれる。５１～７０：適応機能が軽度に欠損。３５～５０：適応行動が中程度に欠損。２０～３５：適応行動が重度に欠損。２０未満：適応行動が著しく、または大きく欠損。８０を超えるスコアは、ＩＱスコアとほぼ同じ範囲（平均より下、平均、平均を上回る、上位）に分類される。

【0326】

本明細書で使用される場合、ＶＡＢＳバージョンＩＩＩ（ＶＡＢＳ－ＩＩＩ）は、知的障害、発達障害、および他の障害を有する個人の評価に使用される、適応行動に関する個々の管理尺度である。この尺度は、四つの主要ドメイン：コミュニケーション、日常生活スキル、社会化、および粗大運動スキルにおける適応行動を測定する。これらのドメインのうちの最初の三つは、いくつかの下位ドメイン（コミュニケーション受容型コミュニケーション、表現型コミュニケーション、文書コミュニケーション、日常生活スキル、家庭内スキル、個人的スキル、コミュニティスキル、社会的対人関係、遊び／レジャー、対処スキル）を含む。ＶＡＢＳ－ＩＩＩは、Ｑ－ｇｌｏｂａｌ（安全なオンライン検査プラットフォーム）を介してオンラインで親に提供され、完了までに約４０分かかる。親は一度でツールをすべて完了する必要はなく、完了まで必要に応じてツールを開始および停止してもよい。すべての採点はオンラインで完了し、ツールの完了時にはスポンサーが利用可能となる。この測定の完了は、来院の４８時間前まで行ってもよいが、来院当日よりも遅くなってはいけない。

【0327】

本明細書で使用される場合、親の全体的印象－ＩＩＩ（ＰＧＩ－ＩＩＩ：Ｐａｒｅｎｔ Ｇｌｏｂａｌ Ｉｍｐｒｅｓｓｉｏｎｓ－ＩＩＩ）は、ＰＧＩ－Ｒの拡張版である。Ａｄａｍｓ ｅｔ ａｌ．，Ｅｆｆｅｃｔ ｏｆ ａ Ｖｉｔａｍｉｎ／Ｍｉｎｅｒａｌ Ｓｕｐｐｌｅｍｅｎｔ ｏｎ Ｃｈｉｌｄｒｅｎ ｗｉｔｈ Ａｕｔｉｓｍ，ＢＭＣ Ｐｅｄｉａｔｒｉｃｓ，１１：１１１（２０１１）を参照のこと。ＰＧＩ－ＩＩＩは、１７の領域、および全体としての変化を、「非常に悪い」から「非常に良い」の範囲の７段階評価を使用して評価する。「平均変化」は、ＰＧＩ－ＩＩＩ－Ｆｉｎａｌの１８点すべての平均を計算することによって算出される。観察された変化について親に直接尋ねる方が、開始時と終了時に症状の重症度を推定し、その差を計算するよりも信頼性が高いことが判明したため、ＰＧＩ－ＩＩＩの方が好ましい。また、７段階評価を使用して変化を検出することにより、変化に対する感受性が高くなると思われる。

【0328】

本明細書で使用される場合、別の症状評定手段は、臨床全般印象尺度（ＣＧＩ：Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｇｌｏｂａｌ Ｉｍｐｒｅｓｓｉｏｎｓ Ｓｃａｌｅ）であり、この尺度は、精神症状を有する対象における疾患の重症度ならびに治療反応性を測定する３項目の尺度である。評定は、医師または訓練を受けた評定者によって行われる。初期評価（ＣＧＩ－重症度、またはＣＧＩ－Ｓ）の後、連続的な評価を行って、介入に対する反応を判定する。ＣＧＩ改善（ＣＧＩ－Ｉ）は、疾患の重症度、臨床経過、および治療的な「有効性」を測定する（後者は、治療関連ＡＥならびに有効性の評価を含む）。

【0329】

ＣＧＩ－Ｓ尺度は、患者の精神疾患を以下のように評価する７段階評価の評定である：１＝正常、疾患では全くない。２＝境界的な精神疾患。３＝軽度の疾患。４＝中等度の疾患。５＝著しい疾患。６＝重度の疾患。７＝特に最も極端な疾患患者。その全体で参照により本明細書に組み込まれるＢｕｓｎｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｔｈｅ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｇｌｏｂａｌ Ｉｍｐｒｅｓｓｉｏｎｓ Ｓｃａｌｅ，Ｐｓｙｃｈｉａｔｒｙ，４（７）：２８－３７，２００７を参照のこと。（“Ｂｕｓｎｅｒ ２００７”）

【0330】

ＣＧＩ－Ｉ尺度は、７点の評定尺度でもあり、患者の全体的な臨床状態を、投薬開始（または基準来院時）の直前の１週間と比較している。患者の状態は、投薬開始前と比較して以下のように評定される：１＝治療開始から非常に改善された。２＝大きく改善された。３＝最小限に改善された。４＝基準時（治療開始時）から変化なし。５＝最小限に悪化した。６＝大きく悪化した。７＝治療開始から非常に悪化した。Ｂｕｓｎｅｒ ２００７を参照のこと。

【0331】

有効性指標は、４段階評価で測定される（「変化なしまたは悪化、および副作用が治療効果を上回る」から、「著しい改善、および副作用なし」までの範囲）。基準時スクリーニングでは、ＣＧＩ－Ｓのみが評価される。その後の来院時には、全体的な改善および有効性の指標（ＣＧＩ－Ｉ）が測定される。最終来院時（例えば３２週目）には、三つの測定全てが実施されなければならない。

【0332】

ＣＧＩで評価される特定のパラメータ（すなわち、重症度、改善、および治療の影響に関するもの）は、初期ＣＹ－ＢＯＣＳで特定されたアンカーポイントまたは１～３個の主要行動から導出されなければならない。

【0333】

小児用Ｙａｌｅ Ｂｒｏｗｎ強迫観念・強迫行為尺度（ＣＹ－ＢＯＣＳ：Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ Ｙａｌｅ Ｂｒｏｗｎ Ｏｂｓｅｓｓｉｖｅ Ｃｏｍｐｕｌｓｉｖｅ Ｓｃａｌｅ）は、６～１７歳の青年期の強迫性障害の重症度を評定するために設計された尺度である。ＣＹ－ＢＯＣＳは、強迫性障害の診断、現在および過去の症状の確認、ならびにある期間にわたる強迫性障害の重症度の評価に利用される。重症度におけるＣＹ－ＢＯＣＳスコアは、以下の範囲である：０～７＝無症状、８～１５＝軽度、１６～２３＝中等度、２４～３１＝重度、および３２～４０＝極度。ＭｃＫａｙ ｅｔ ａｌ．，Ｔｈｅ Ｃｈｉｌｄｒｅｎ’ｓ Ｙａｌｅ－Ｂｒｏｗｎ Ｏｂｓｅｓｓｉｖｅ－Ｃｏｍｐｕｌｓｉｖｅ Ｓｃａｌｅ：ｉｔｅｍ ｓｔｒｕｃｔｕｒｅ ｉｎ ａｎ ｏｕｔｐａｔｉｅｎｔ ｓｅｔｔｉｎｇ，Ｐｓｙｃｈｏｌ Ａｓｓｅｓｓ，１５（４）：５７８－８１，２００３を参照のこと。当該文献は、その全体で参照により本明細書に組み込まれる。本明細書で使用される場合、ＣＹ－ＢＯＣＳは、医師にアンカーポイントまたは１～３個の主要行動を提供し、それらを医師はＣＧＩ－Ｉスコアリングシステムを使用して経時的に追跡する。

【0334】

本発明者らは、腸内細菌の種多様性の回復が、その必要のある患者における自閉症の症状の治療に役立つことを見出した。一つの態様では、本出願は、その必要のある対象における自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の一つ以上の症状を治療するための方法を提供するものであり、当該方法は、ＡＳＤの治療に有効な医薬組成物の量を対象に投与することを含み、この場合において医薬組成物は、非培養糞便細菌調製物と少なくとも一つの細菌単離株を含み、この場合において対象は、治療開始前と比較して、治療後にＡＳＤ症状の重症度において少なくとも１０％の低下を呈する。一つの態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、小児自閉症評定尺度（ＣＡＲＳ）によって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、小児自閉症評定尺度２－標準型（ＣＡＲＳ２－ＳＴ）によって評価される。さらなる態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、小児自閉症評定尺度２－高機能型（ＣＡＲＳ２－ＨＦ）によって評価される。一つの態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、異常行動チェックリスト（ＡＢＣ）によって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、社会的反応性尺度（ＳＲＳ）によって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、ヴァインランド適応行動尺度ＩＩ（ＶＡＢＳ－ＩＩ）によって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、ＣＧＩによって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、ＣＧＩ－Ｓによって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、ＣＹ－ＢＯＣＳによって評価される。別の態様では、ＡＳＤ症状の重症度は、ＡＤＩ－Ｒによって評価される。一つの態様では、治療は、ＡＳＤ患者において、リーター国際作業尺度（Ｌｅｉｔｅｒ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ Ｓｃａｌｅ）（Ｒｏｉｄ，Ｇ．Ｈ．，＆ Ｍｉｌｌｅｒ，Ｌ．Ｊ．（１９９７）．Ｌｅｉｔｅｒ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｐｅｒｆｏｒｍａｎｃｅ Ｓｃａｌｅ－Ｒｅｖｉｓｅｄ．Ｗｏｏｄ Ｄａｌｅ，ＩＬ：Ｓｔｏｅｌｔｉｎｇを参照のこと）に基づき、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の改善をもたらす。別の態様では、リータースコアの改善は、少なくとも８、１６、２４、３２、４０、５０、６０、または８０週間の治療後に測定され、治療前のリータースコアと比較される。

【0335】

当業者であれば、前述の評価システムは、ＡＳＤ関連の社会的および認知的な症状を評価するためのツールの例にすぎないことを理解する。他の類似ツールを使用して、または設計して、中心的なＡＳＤ関連症状を評価してもよい。例えば、一つの態様では、治療は、自閉症治療評価チェックリスト（ＡＴＥＣ）に基づき、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の改善をもたらす。Ｒｉｍｌａｎｄ ａｎｄ Ｅｄｅｌｓｏｎ：Ａｕｔｉｓｍ Ｔｒｅａｔｍｅｎｔ Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ Ｃｈｅｃｋｌｉｓｔ：Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ａｎａｌｙｓｅｓ．Ａｕｔｉｓｍ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ２０００を参照のこと。別の態様では、治療は、広汎性発達障害行動評価尺度（ＰＤＤ－ＢＩ：Ｐｅｒｖａｓｉｖｅ Ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ Ｄｉｓｏｒｄｅｒｓ Ｂｅｈａｖｉｏｒ Ｉｎｖｅｎｔｏｒｙ）に基づき、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の改善をもたらす。 Ｃｏｈｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｈｅ ＰＤＤ Ｂｅｈａｖｉｏｒ Ｉｎｖｅｎｔｏｒｙ：ａ ｒａｔｉｎｇ ｓｃａｌｅ ｆｏｒ ａｓｓｅｓｓｉｎｇ ｒｅｓｐｏｎｓｅ ｔｏ ｉｎｔｅｒｖｅｎｔｉｏｎ ｉｎ ｃｈｉｌｄｒｅｎ ｗｉｔｈ ｐｅｒｖａｓｉｖｅ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔａｌ ｄｉｓｏｒｄｅｒ．Ｊ Ａｕｔｉｓｍ Ｄｅｖ Ｄｉｓｏｒｄ．２００３ ３３（１）：３１－４５を参照のこと。さらに別の態様では、治療は、自閉症の重症度尺度（ＳＡＳ：Ｓｅｖｅｒｉｔｙ ｏｆ Ａｕｔｉｓｍ Ｓｃａｌｅ）に基づき、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の改善をもたらす。Ａｄａｍｓ ｅｔ ａｌ．，Ｔｈｅ ｓｅｖｅｒｉｔｙ ｏｆ ａｕｔｉｓｍ ｉｓ ａｓｓｏｃｉａｔｅｄ ｗｉｔｈ ｔｏｘｉｃ ｍｅｔａｌ ｂｏｄｙ ｂｕｒｄｅｎ ａｎｄ ｒｅｄ ｂｌｏｏｄ ｃｅｌｌ ｇｌｕｔａｔｈｉｏｎｅ ｌｅｖｅｌｓ．Ｊ Ｔｏｘｉｃｏｌ．２００９，２００９：５３２６４０を参照のこと。さらなる態様では、自閉症関連症状の改善または症状の重症度の低下は、Ａｍａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｏｕｔｃｏｍｅ Ｍｅａｓｕｒｅｓ ｆｏｒ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ｄｒｕｇ Ｔｒｉａｌｓ ｉｎ Ａｕｔｉｓｍ，ＣＮＳ Ｓｐｅｃｔｒ．９（１）：３６－４７（２００４）に言及されるシステムまたは尺度のうちのいずれか一つに基づき評価される。さらなる態様では、自閉症関連症状の改善または症状重症度の低下は、表１に列挙される症状の特徴解析システムのうちのいずれか一つに基づき評価される。一つの態様では、前述のシステムのいずれか一つでの症状の改善は、少なくとも８、１６、２４、３２、４０、５０、６０、または８０週間の治療後に測定され、治療前のリータースコアと比較される。一つの態様では、前述のシステムのいずれか一つでの症状の改善は、少なくとも２、４、６、８、１０週間以上、治療を中断した後に測定され、治療前の測定値と比較される。

【0336】

【表1-1】

【表1-2】

【表1-3】

【0337】

一つの態様では、本明細書に記載される医薬組成物を用いた治療は、治療開始前と比較して、２週間以上の治療の後、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ、ＣＡＲＳ２－ＳＴ、ＣＡＲＳ２－ＨＦ、ＡＢＣ、ＳＲＳ、およびＶＡＢＳ－ＩＩからなる群から選択される方法により評価される。一つの態様では、治療は、治療開始前と比較して、４週間以上の治療後のＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、子供自閉症評定尺度－２（ＣＡＲＳ－２）、異常行動チェックリスト－２（ＡＢＣ－２）、レイノルド知能評価尺度（Ｒｅｙｎｏｌｄｓ Ｉｎｔｅｌｌｅｃｔｕａｌ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ Ｓｃａｌｅｓ）－非言語（ＲＩＡＳ－ＮＶ）、社会的反応性尺度－２（ＳＲＳ－２）、および親の全体的印象－ＩＩＩ（ＰＧＩ－ＩＩＩ）からなる群から選択される方法により評価される。一つの態様では、治療は、治療開始前と比較して、６週間以上の治療後のＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、子供自閉症評定尺度－２（ＣＡＲＳ－２）、異常行動チェックリスト－２（ＡＢＣ－２）、レイノルド知能評価尺度（Ｒｅｙｎｏｌｄｓ Ｉｎｔｅｌｌｅｃｔｕａｌ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ Ｓｃａｌｅｓ）－非言語（ＲＩＡＳ－ＮＶ）、社会的反応性尺度－２（ＳＲＳ－２）、および親の全体的印象－ＩＩＩ（ＰＧＩ－ＩＩＩ）からなる群から選択される方法により評価される。一つの態様では、治療は、治療開始前と比較して、２週間以上の治療後のＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、子供自閉症評定尺度－２（ＣＡＲＳ－２）、異常行動チェックリスト－２（ＡＢＣ－２）、レイノルド知能評価尺度（Ｒｅｙｎｏｌｄｓ Ｉｎｔｅｌｌｅｃｔｕａｌ Ａｓｓｅｓｓｍｅｎｔ Ｓｃａｌｅｓ）－非言語（ＲＩＡＳ－ＮＶ）、社会的反応性尺度－２（ＳＲＳ－２）、および親の全体的印象－ＩＩＩ（ＰＧＩ－ＩＩＩ）からなる群から選択される方法により評価される。

【0338】

別の態様では、本明細書に記載される医薬組成物を用いた治療は、治療開始前と比較して、２週間以上の治療の後、ＡＳＤ症状の重症度において、１０％～２０％、１０％～３０％、１０％～４０％、１０％～５０％、１０％～６０％、１０％～７０％、１０％～８０％、１０％～９０％、２０％～３０％、２０％～４０％、２０％～５０％、２０％～６０％、２０％～７０％、２０％～８０％、２０％～９０％、３０％～４０％、３０％～５０％、３０％～６０％、３０％～７０％、３０％～８０％、３０％～９０％、４０％～５０％、４０％～６０％、４０％～７０％、４０％～８０％、４０％～９０％、５０％～６０％、５０％～７０％、５０％～８０％、または５０％～９０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される方法により評価される。別の態様では、治療は、治療開始前と比較して、２週間以上の治療の後、ＡＳＤ症状の重症度において、１０％～９０％、２０％～８０％、３０％～７０％、または４０％～６０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される方法により評価される。別の態様では、治療は、治療開始前と比較して、１２週間以上の治療の後、ＡＳＤ症状の重症度において、１０％～９０％、２０％～８０％、３０％～７０％、または４０％～６０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される方法により評価される。別の態様では、治療は、治療開始前と比較して、２週間以上の治療の後、ＡＳＤ症状の重症度において、１０％～９０％、２０％～８０％、３０％～７０％、または４０％～６０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される方法により評価される。別の態様では、治療は、治療開始前と比較して、２４週間以上の治療の後、ＡＳＤ症状の重症度において、１０％～９０％、２０％～８０％、３０％～７０％、または４０％～６０％の低下を実現し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される方法により評価される。

【0339】

一つの態様では、本明細書に記載される医薬組成物を用いた治療は、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、治療中断後、少なくとも８、１２、１６、２０、２４、または２８週間、症状重症度の低下を実質的に維持し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳにより評価される。一つの態様では、治療は、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、治療中断後、少なくとも８、１２、１６、２０、２４、または２８週間、症状重症度の低下を実質的に維持し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ２－ＳＴにより評価される。一つの態様では、治療は、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、治療中断後、少なくとも８、１２、１６、２０、２４、または２８週間、症状重症度の低下を実質的に維持し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＣＡＲＳ２－ＨＦにより評価される。一つの態様では、治療は、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、治療中断後、少なくとも８、１２、１６、２０、２４、または２８週間、症状重症度の低下を実質的に維持し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＡＢＣにより評価される。一つの態様では、治療は、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、治療中断後、少なくとも８、１２、１６、２０、２４、または２８週間、症状重症度の低下を実質的に維持し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＳＲＳにより評価される。一つの態様では、治療は、ＡＳＤ症状の重症度において、少なくとも１０％、２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を実現し、治療中断後、少なくとも８、１２、１６、２０、２４、または２８週間、症状重症度の低下を実質的に維持し、この場合においてＡＳＤ症状の重症度は、ＶＡＢＳ－ＩＩにより評価される。

【0340】

一つの態様では、治療されるＡＳＤ対象は、治療開始前に胃腸（ＧＩ）症状を呈さない。一つの態様では、治療されるＡＳＤ対象は、治療前の少なくとも１日、２日、３日、４日、５日、６日、１週間、２週間、３週間、４週間、１ヶ月、２ヶ月、６ヶ月、１年、または２年の間、胃腸（ＧＩ）症状を呈さない。別の態様では、治療されるＡＳＤ対象は、治療開始前に、一つ以上のＧＩ症状を呈する。一つの態様では、治療されるＡＳＤ対象は、治療前の少なくとも１日、２日、３日、４日、５日、６日、１週間、２週間、３週間、４週間、１ヶ月、２ヶ月、６ヶ月、１年、または２年の間、継続的に、または断続的に、胃腸（ＧＩ）症状を呈する。一つの態様では、治療されるＡＳＤ対象は、少なくとも１年間、慢性的で異常な腸機能の症状を呈する。慢性的で異常な腸機能のかかる症状としては、例えば、便秘および／または下痢が含まれる。一つの態様では、治療されるＡＳＤ対象は、治療開始前と比較して、治療後にＧＩ症状の重症度において、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％の低下を呈する。一つの態様では、ＧＩ症状の重症度は、消化管症状評定尺度（ＧＳＲＳ：Ｇａｓｔｒｏｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ Ｓｙｍｐｔｏｍ Ｒａｔｉｎｇ Ｓｃａｌｅ）によって評価される。別の態様では、ＧＩ症状の重症度は、自閉症のための消化管の糞便と症状の質問票（ＧＳＳＱＡ：Ｇａｓｔｒｏｉｎｔｅｓｔｉｎａｌ Ｓｔｏｏｌ ａｎｄ Ｓｙｍｐｔｏｍ Ｑｕｅｓｔｉｏｎｎａｉｒｅ ｆｏｒ Ａｕｔｉｓｍ）によって評価される。別の態様では、治療は、治療開始前と比較して、２週間以上の治療後に、ＡＳＤ患者のＧＩ症状の重症度において、２０％～３０％、２０％～４０％、２０％～５０％、２０％～６０％、２０％～７０％、２０％～８０％、２０％～９０％、３０％～４０％、３０％～５０％、３０％～６０％、３０％～７０％、３０％～８０％、３０％～９０％、４０％～５０％、４０％～６０％、４０％～７０％、４０％～８０％、４０％～９０％、５０％～６０％、５０％～７０％、５０％～８０％、または５０％～９０％の低下を実現し、この場合においてＧＩ症状の重症度は、ＧＳＲＳまたはＧＳＳＱＡによって評価される。

【0341】

ＧＳＲＳは、逆流、腹部疼痛、消化不良、下痢および便秘を表現する五つの症状クラスターに組み合わされた１５個の項目の疾患特異的な尺度である。Ｓｖｅｄｌｕｎｄ ｅｔ ａｌ．，Ｄｉｇ．Ｄｉｓ．Ｓｃｉ．，３３（２）：１２９－３４（１９８８）を参照のこと。ＧＳＲＳは、７段階評価のリッカート型尺度を有し、０は、厄介な症状が無いことを表し、３は、極度の症状を表し、尺度の感受性を増すための半段階を伴う。一つの態様では、本明細書に提供される治療方法は、上腹部痛、疝痛性腹痛、鈍い腹部疼痛、漠然とした腹部痛、胸やけ、胃酸逆流、みぞおちの吸引感覚、吐き気と嘔吐、腹鳴、腹部膨満、おくび、腸内ガスの増加、便通減少、便通増加、軟便、固形便、急な排便、不完全な排泄感覚からなる群から選択される一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、五つ以上、六つ以上、または七つ以上のＧＩ症状を低下させ、軽減し、または消滅させる。別の態様では、本明細書に提供される治療方法は、上腹部痛、疝痛性腹痛、鈍い腹部疼痛、漠然とした腹部痛、胸やけ、胃酸逆流、みぞおちの吸引感覚（ｓｕｃｋｉｎｇ ｓｅｎｓａｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ｅｐｉｇａｓｔｒｉｕｍ）、吐き気と嘔吐、腹鳴、腹部膨満、おくび、腸内ガスの増加、便通減少、便通増加、軟便、固形便、急な排便、不完全な排泄感覚、および１週当たり３回未満の完全に自発的な排便からなる群から選択される２～４、４～６、６～８、８～１０、１０～１２、２～３、２～４、２～５、２～６、２～７、２～８、２～９、２～１０、２～１１、２～１２、３～４、３～５、３～６、３～７、３～８、３～９、３～１０、３～１１、３～１２、４～５、４～６、４～７、４～８、４～９、４～１０、４～１１、４～１２、５～６、５～７、５～８、５～９、５～１０、５～１１、５～１２、６～７、６～８、６～９、６～１０、６～１１、６～１２、７～８、７～９、７～１０、７～１１、または７～１２のＧＩ症状を低下させ、軽減し、または消滅させる。

【0342】

自閉症のための消化管の糞便と症状の質問票（ＧＳＳＱＡ）は、自閉症の４～１７歳の個人における、ＧＩ症状の臨床評価ツールである。ＧＳＳＱＡは、観察者報告による転帰（ＯｂｓＲＯ：Ｏｂｓｅｒｖｅｒ－Ｒｅｐｏｒｔｅｄ Ｏｕｔｃｏｍｅ）を利用する。

【0343】

一つの態様では、治療された対象の腹部疼痛は、高い重症度から低い重症度へと減少し、この場合において疼痛レベルは、すべての社会的活動に対する影響を伴う重度または激しい痛み、緩和が必要で多くの社会的活動を妨害する長時間で厄介な痛みおよび疼痛、いくらかの社会的活動を妨害する時折の痛みおよび疼痛、ならびに無痛または一過性の疼痛、からなる群から選択される。

【0344】

別の態様では、治療された対象の胸やけは、高い重症度から低い重症度へと減少し、この場合において疼痛レベルは、制酸剤により一過性にのみ緩和される継続的な不快感、頻繁で長期的な不快感のエピソード；緩和を必要とする、時折の短時間の不快感、および胸やけなし、または一過性の胸やけ、からなる群から選択される。

【0345】

別の態様では、治療された対象の胃酸逆流状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、一日に数回の逆流；制酸剤により一過性でわずかな緩和のみ、１日１回または２回の逆流；緩和を必要とする、時折の厄介な逆流、および逆流無しまたは一過性の逆流、からなる群から選択される。

【0346】

別の態様では、治療された対象のみぞおちの吸引感覚は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、継続的な不快感；食事と食事の間に食物または制酸剤を頻繁に必要とする、頻繁で長期的な不快感のエピソード、食事と食事の間に食物と制酸剤を必要とする、時折で短期間の不快感；食事と食事の間に食物または制酸剤を必要とせず、および吸引感覚が無いか、または一過性、からなる群から選択される。本明細書で使用される場合、みぞおちの吸引感覚とは、食物または制酸剤により緩和される、みぞおちにおける吸引感覚を表す。食物または制酸剤が利用できない場合、吸引感覚は痛みや疼痛に進行する。

【0347】

別の態様では、治療された対象の吐き気および嘔吐の状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、頻繁な嘔吐を伴う継続的な吐き気、嘔吐を伴わない頻繁で長期的な吐き気、短期間で時折の吐き気のエピソード、および吐き気無し、からなる群から選択される。

【0348】

別の態様では、治療された対象の腹鳴の状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、社会的能力を著しく妨害する継続的な腹鳴、社会的能力を損なわない動きにより管理され得る、頻繁で長期的なエピソード、時折で厄介な短期の腹鳴、および腹鳴無しまたは一過性の腹鳴、からなる群から選択される。

【0349】

別の態様では、治療された対象の腹部膨満の状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、社会的能力を著しく妨害する継続的な不快感、衣類を調整することにより管理され得る、頻繁で長期的なエピソード、時折で短期的な不快感、および膨満無しまたは一過性の膨満、からなる群から選択される。

【0350】

別の態様では、治療された対象のおくびの状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、社会的能力を著しく妨害する頻繁なエピソード、いくらかの社会的活動を妨害する頻繁なエピソード、稀で厄介なおくび、およびおくび無し、または一過性のおくび、からなる群から選択される。

【0351】

別の態様では、治療された対象の腸内ガスが増加した状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合において状態のレベルは、社会的能力を著しく妨害する頻繁なエピソード、いくらかの社会的活動を妨害する頻繁で長期的なエピソード、稀で短期的な不快感、および腸内ガスの増加無し、からなる群から選択される。

【0352】

別の態様では、治療された対象の排便回数の減少は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合においてレベルは、７日毎またはそれ以下の頻度で、６日毎、５日毎、４日毎、３日毎、２日毎、および１日１回からなる群から選択される。

【0353】

別の態様では、治療された対象の排便回数の増加は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合においてレベルは、１日７回またはそれ以上の頻度、１日６回、１日５回、１日４回、１日３回、１日２回、および１日１回からなる群から選択される。

【0354】

別の態様では、治療された対象の軟便状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合においてレベルは、水様、低粘性、いくらか柔らかい、および正常な硬さ、からなる群から選択される。

【0355】

別の態様では、治療された対象の固形便状態は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合においてレベルは、硬く断片化され、時折下痢を伴う、硬い、いくらか硬い、および正常な硬さ、からなる群から選択される。ある態様では、治療された対象の糞便は、毎日の糞便記録（ＤＳＲ：Ｄａｉｌｙ Ｓｔｏｏｌ Ｒｅｃｏｒｄｓ）を使用して評価される。一つの態様では、治療された対象は、ＤＳＲに従って、タイプ１の硬い糞便、タイプ２の硬い糞便、タイプ６の柔らかい糞便、タイプ７の液状の糞便、および異常な糞便の全てにおける低下を呈する。

【0356】

別の態様では、治療された対象の急な排便は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合においてレベルは、排便の制御不能、社会的能力を妨害する突然のトイレの必要性を伴う頻繁で急な排便感覚、時折の急な排便感覚、および正常な排便制御、からなる群から選択される。

【0357】

別の態様では、治療された対象の不完全な排泄感覚は、高い重症度から低い重症度へと改善され、この場合においてレベルは、習慣的な不完全な排泄感覚を伴う著しく困難な排便、しばしば不完全な排泄感覚を伴う明白に困難な排便、いくらか困難な排便；時折の不完全な排泄感覚、およびいきみを伴わない完全な排泄感覚、からなる群から選択される。

【0358】

別の態様では、治療を受けた対象の一週間当たりの完全に自発的な排便（ＣＳＢＭ：ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓ ｂｏｗｅｌ ｍｏｖｅｍｅｎｔ）の回数は、基準時と比較して増加する。別の態様では、治療された対象のＣＳＢＭは、少なくとも１、２、３、４、５、６、７または８週間の治療の後、１週当たり、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０回の完全に自発的な排便（ＣＳＢＭ）まで増加する。別の態様では、対象の完全に自発的な排便（ＣＳＢＭ）の回数は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、または７週間以上の治療の後、１週当たり、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０回のＣＳＢＭまで増加する。さらなる態様では、治療された対象の１週当たりのＣＳＢＭの回数は、治療完了後、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、または２４週間、維持される。別の態様では、治療された対象の１週当たりのＣＳＢＭの回数は、基準時と比較して、４、８、１６、および３２週で、１週当たり、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０回のＣＳＢＭまで増加する。

【0359】

一つの態様では、症状の重症度の低下（例えば、ＡＳＤ症状、ＧＩ症状またはその両方に関する）は、治療中に進行し、または治療終了後もしくは治療中断後にも持続される。一つの態様では、症状の重症度の低下（例えば、ＡＳＤ症状、ＧＩ症状またはその両方に関する）は、治療中または治療後の特定の時点、例えば治療開始後、約２、４、６、８、１２、１８、２４、３２、４０、４８週の時点で、または治療終了後もしくは治療中断後の約２、４、６、８、１２、１８、２４、３２、４０、４８週の時点で、評価される。

【0360】

一つの態様では、方法は、糞便微生物調製物を含む医薬組成物を対象に投与する前に、対象に抗生物質を投与することをさらに含む。別の態様では、方法は、対象に、腸洗浄を受けさせることをさらに含む。

【0361】

別の態様では、本明細書において、ヒト対象の自閉症スペクトラム障害を治療する方法が提供される。例示的な態様では、方法は、以下の工程を含む、または以下の工程から本質的になる：ヒト対象に抗生物質を投与する工程、抗生物質の投与後、当該ヒト対象に、腸洗浄を受けさせる工程、および腸洗浄後、当該ヒト対象に、本明細書に記載される医薬組成物を投与する工程であって、自閉症スペクトラム障害が、当該ヒト対象において治療される工程。

【0362】

例示的な態様では、ＡＳＤの治療は、ＡＳＤに特徴的な一つ以上、二つ以上、三つ以上、四つ以上、五つ以上、六つ以上、七つ以上、八つ以上の症状の軽減、改善、発症の遅延、進行の阻害、または重症度の低下を含む。一つの態様では、治療は、一つ以上の社会的、および認知的な主要ＡＳＤ関連症状を緩和、改善、発症を遅延、進行を阻害、または重症度を低下させる。一部の態様では、症状は、以下からなる群から選択される：（ｉ）単調性に対するこだわり、または変化に対する抵抗；（ｉｉ）要求の表現が困難；（ｉｉｉ）正常で応答性のある言語の代わりに、単語や語句を反復する；（ｉｖ）他人には明白ではない理由で、笑い、泣き、苦悩を示す；（ｖ）一人でいることを好む、またはよそよそしい態度；（ｖｉ）かんしゃく；（ｖｉｉ）他者と交わることが困難；（ｖｉｉｉ）抱き締める、または抱き締められることを欲しない場合がある；（ｉｘ）アイコンタクトがほとんどないか、全くない；（ｘ）通常の教育方法に反応しない；（ｘｉ）持続的で奇妙な遊び；（ｘｉｉ）疼痛に対する明白な過剰な感受性、または不充分な感受性；（ｘｉｉｉ）危険に対する現実的な恐怖がほとんどないか、または全くない；（ｘｉｖ）顕著な身体的過活動または極度の低活動；（ｘｖ）粗大運動スキル／微細運動スキルにむらがある；および／または（ｘｖｉ）言語的合図に対する非応答性。一部の態様では、症状は、強迫行動、儀式的行動、限定的行動、常同行動、単調性または自傷からなる群から選択される。本明細書に記載する方法は、前述の症状の任意の組み合わせの改善をもたらし得る。

【0363】

例示的な態様では、ヒト対象は、ＡＳＤ評定尺度に従って評価される自閉症の症状の重症度において、有意な低下を呈する。一部の例では、例えば、ヒト対象は、小児自閉症評定尺度（ＣＡＲＳ）によって評価される自閉症の症状の重症度において、方法を開始する前に評価された重症度と比較して、少なくとも１０％または２０％の低下を呈する。

【0364】

本明細書において提供される方法による治療に適した対象は、本明細書に提供される方法を開始する前に、胃腸の機能不全症状を呈しておらず、または報告していない場合がある。一部の例では、例えば本明細書に提供される方法による治療に適したヒト対象は、治療開始前、または治療開始時に、胃腸の症状を現さない。一つの態様では、本明細書において治療されたＡＳＤ対象は、腹部疼痛、逆流、消化不良、過敏性腸症候群、慢性で持続的な下痢、下痢、腹部膨張、便秘、および便秘／下痢の交互の発生からなる群から選択される一つ以上、または二つ以上のＧＩ症状を呈する。

【0365】

胃腸の機能不全症状の有無に関わらず、本明細書に提供される方法に適したヒト対象は、典型的には、神経が正常なヒトと比較して、当該治療方法前の腸内細菌叢の種類が有意に少ない。一部の例では、本方法によって治療されるヒト対象は、神経が正常なヒトと比較して、医薬組成物の投与前に、少なくとも２０％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、または９０％少ない種類の腸内細菌叢を呈する。

【0366】

一つの態様では、治療された対象は、治療中の有害事象が低下する。別の態様では、治療された対象は、治療中の有害事象が無い。本開示のある態様では、有害事象は、腹部痙攣、膨満感、腹部膨張、鼓張症、下痢、血便、発熱、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される。別の態様では、有害事象は、重症度、任意の臨床的に意義のある臨床検査所見異常、または身体検査中に検出された任意の異常に関わらない、任意の兆候または症状である。さらに別の態様では、有害事象は、薬学的に活性な用量に起因する。さらなる態様では、有害事象は、薬学的に活性な用量に起因しない。さらに別の態様では、有害事象は、応答型の有害事象、非応答型の有害事象、重篤な有害事象、またはそれらの組み合わせを含む。ある態様では、重篤な有害事象は、入院またはすでに入院している期間の延長を必要とし、持続的または重大な身体障碍および／または就労不能をもたらし、先天性異常および／または出生異常をもたらし、または、医学的および科学的な判断に基づく任意の重要な医学的事象であって、直ちに生命を脅かすものでも、死亡または入院をもたらすものでもないが、患者に相当なリスクをもたらすか、または上記に列挙された他の転帰のうちの一つを防止するために医学的介入を必要とする場合がある。

【0367】

本開示の一つの態様では、治療された対象は、２、４、６、８、１０、１２、１４、１６、１８、２０、２２、２４、２６、２８、３０、または３２週の治療期間を通して、有害事象が低下したか、または有害事象が無い。

【0368】

また本明細書において、自閉症のヒト対象における自閉症の重症度を低下させる方法が提供される。例示的な態様では、方法は、以下の工程を含む、または以下の工程から本質的になる：自閉症のヒト対象に非吸収性の抗生物質を投与する工程、当該自閉症のヒト対象に腸洗浄を受けさせる工程、および一つ以上の細菌単離株と神経が正常なヒトドナーに由来する非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を、当該ヒト対象に投与する工程であって、当該ヒト対象は、当該方法開始前と比較して、当該方法後の小児自閉症評定尺度（ＣＡＲＳ）によって評価される自閉症の症状の重症度において有意な低下を呈する工程。一部の例では、ヒト対象は、小児自閉症評定尺度（ＣＡＲＳ）によって評価される自閉症の症状の重症度において、方法を開始する前に評価された重症度と比較して、少なくとも１０％または２０％の低下を呈する。

【0369】

一つの態様では、本開示は、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、本明細書に記載の医薬組成物の薬学的に活性な用量を当該対象に経口投与することを含み、この場合において当該薬学的に活性な用量は、少なくとも５０ｍｌの水と共に投与される。別の態様では、方法は、食物、または水以外の液体の摂取から２時間以上後に細菌混合物を投与する工程を含む。さらに別の態様では、方法は、細菌混合物の投与から１時間以上後に、食物または水を摂取する工程を含む。ある態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象において、ＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、任意の固形物または液体のカロリー摂取から少なくとも２時間後に医薬組成物を投与する工程を含む。別の態様では、方法は、任意の固形物または液体のカロリー摂取の少なくとも１時間前に、医薬組成物を投与する工程を含む。

【0370】

一つの態様では、本開示は、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、当該方法は、評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効な医薬組成物の量を当該対象に投与する工程を含む。ある態様では、医薬組成物は、非培養糞便細菌調製物（例えば、実質的に完全な糞便微生物叢）と、一つ以上の細菌単離株を含む細菌混合物を含む。別の態様では、対象は、一定期間、一週当たり３回未満の完全に自発的な排便を伴う、ＧＩ症状の便秘を有する。さらに別の態様では、対象は、治療開始前と比較して、治療後の評価スコアにおいて改善を呈し、この場合において当該評価スコアは、臨床全般印象尺度（ＣＧＩ）、小児用Ｙａｌｅ Ｂｒｏｗｎ強迫観念・強迫行為尺度（ＣＹ－ＢＯＣＳ）、異常行動チェックリスト（ＡＢＣ）、ヴァインランド適応行動尺度ＩＩ（ＶＡＢＳ－ＩＩ）、およびＶＡＢＳ－ＩＩＩからなる群から選択される評価システムに基づく。

【0371】

一つの態様では、本開示は、ある量の本明細書に記載の医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合においてその必要のある対象は、１週当たり３回未満の完全に自発的な排便を伴うＧＩ症状の便秘を有する。別の態様では、その必要のある対象は、一週当たり２回未満の完全に自発的な排便を伴う、ＧＩ症状の便秘を有する。さらなる態様では、その必要のある対象は、一週当たり２回未満の完全に自発的な排便を伴う、ＧＩ症状の便秘を有する。また別の態様では、その必要のある対象は、一週当たり１回未満の完全に自発的な排便を伴う、ＧＩ症状の便秘を有する。ある態様では、その必要のある対象は、約１、２、３、および４週間からなる群から選択される期間にわたって、ＧＩ症状の便秘を有する。別の態様では、その必要のある対象は、約１０、２０、３０、および４０日間からなる群から選択される期間にわたって、ＧＩ症状の便秘を有する。別の態様では、その必要のある対象は、約１０～１５、１５～２０、２０～２５、２５～３０、３０～３５、３５～４０日間の期間にわたって、ＧＩ症状の便秘を有する。

【0372】

一つの態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合においてその必要のある対象は、ＧＩ症状の便秘を有し、便秘は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８週間の治療の後、１週当たり、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、または１０回の完全に自発的な排便（ＣＳＢＭ：ｃｏｍｐｌｅｔｅ ｓｐｏｎｔａｎｅｏｕｓ ｂｏｗｅｌ ｍｏｖｅｍｅｎｔｓ）まで改善する。別の態様では、その必要のある対象は、ＧＩ症状の便秘を有し、便秘は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、または７週間以上の治療の後、１週当たり、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９または１０回の完全に自発的な排便（ＣＳＢＭ）まで改善する。さらなる態様では、その必要のある対象は、ＧＩ症状の便秘を有し、便秘は、治療完了後、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８週間、改善を維持する。

【0373】

一つの態様では、本開示は、本明細書に記載の医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合においてその必要のある対象は、１週当たり３回未満の完全に自発的な排便を伴うＧＩ症状の便秘を有し、治療前にＡＳＤ適格評価スコアを呈する。ある態様では、適格評価スコアは、臨床全般印象尺度（ＣＧＩ）、小児用Ｙａｌｅ Ｂｒｏｗｎ強迫観念・強迫行為尺度（ＣＹ－ＢＯＣＳ）、異常行動チェックリスト（ＡＢＣ）、自閉症診断面接－改訂版（ＡＤＩ－Ｒ）、自閉症診断面接ヴァインランド適応行動尺度ＩＩ（ＶＡＢＳ－ＩＩ）、およびＶＡＢＳ－ＩＩＩからなる群から選択される評価システムに基づく。

【0374】

ある態様では、本開示は、本明細書に記載の医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合においてその必要のある対象は、治療前、２、３、４、５、６、または７のＣＧＩ－Ｓスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、治療前に２以上、３以上、４以上、５以上、または６以上のＣＧＩ－Ｓスコアを有する。さらに別の態様では、その必要のある対象はさらに、一週当たり３回未満のＣＳＢＭを伴う、便秘を含むＧＩ症状を有する。

【0375】

ある態様では、本開示は、本明細書に記載の医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該対象は、１週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある患者は、２週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。さらなる態様では、その必要のある対象は、３週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、４週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、５週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。さらなる態様では、その必要のある対象は、６週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、７週間以上の治療後、１、２、３、または４のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、２週間以上の治療後、１、２、または３のＣＧＩ－Ｉスコアを有する。さらに別の態様では、その必要のある対象は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８週間の治療後、５から４、５から３、５から２、５から１、４から３、４から２、４から１、３から２、３から１、または２から１に改善するＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、または８週間の治療後、５から４、５から３、５から２、５から１、４から３、４から２、４から１、３から２、３から１、または２から１に改善するＣＧＩ－Ｉスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、または８週間の治療後、少なくとも１、２、３または４点まで改善するＣＧＩ－Ｉスコアを有する。

【0376】

ある態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該治療は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される一つ以上の評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。ある態様では、その必要のある対象は、治療開始前、一週当たり３回未満のＣＳＢＭを伴う、便秘を含むＧＩ症状を有する。ある態様では、一つ以上の評価スコアにおける１０％の改善は、治療から少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間後である。別の態様では、治療は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される二つ以上の評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、治療は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される三つ以上の評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、治療は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される四つ以上の評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。

【0377】

ある態様では、本開示は、本明細書に記載の医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において方法は、治療前、治療中、および治療後に、血液、糞便または尿中の対象の代謝物プロファイルを分析することを含む。別の態様では、方法は、治療中に少なくとも２回、および治療後に少なくとも１回、血液、糞便、または尿中の対象の代謝物プロファイルを分析することをさらに含む。別の態様では、方法は、治療開始前に、血液中の対象の代謝物プロファイルを分析することをさらに含む。

【0378】

本開示のある態様では、その必要のある対象は、５歳から１７歳である。別の態様では、その必要のある対象は、少なくとも５歳である。別の態様では、その必要のある対象は、１７歳よりも若い。

【0379】

別の態様では、その必要のある対象は、投薬量の調整を必要とする何らかの重篤な医学的障害を有しておらず、この場合において当該重篤な医学的障害は、単一遺伝子障害、広範な脳奇形、経管栄養、即時治療を必要とする重篤なＧＩの問題（生命を脅かす）、セリアック病の診断、好酸球性胃腸炎、重度の低体重／栄養不良、および最近の外科手術／外科手術の予定、からなる群から選択される。

【0380】

ある態様では、本開示は、プラセボを含有するカプセルを少なくとも７日間連続して投与することによって、順守に関して個人をスクリーニングするための方法を提供する。別の態様では、プラセボカプセルは、少なくとも１４日間連続で投与される。

【0381】

ある態様では、本開示は、その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）を治療する方法を提供するものであり、方法は、当該対象に、治療開始前と比較して、治療後の小児用Ｙａｌｅ Ｂｒｏｗｎ強迫観念・強迫行為尺度（ＣＹ－ＢＯＣＳ）の評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を提供するのに有効な本明細書に記載される医薬組成物の量を投与することを含む。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。

【0382】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。

【0383】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。

【0384】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。

【0385】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。

【0386】

別の態様では、その必要のある対象は、治療前に８以上のＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、治療前に１６以上のＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアを有する。ある態様では、その必要のある対象は、治療開始前、一週当たり３回未満のＣＳＢＭを伴う、便秘を含むＧＩ症状をさらに含む。

【0387】

ある態様では、その必要のある対象は、治療前に８～１５、１６～２３、２４～３１、３２～４０のＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。ある態様では、その必要のある対象は、治療から少なくとも１、２、３、４、５、６、７、または８週間後に、０～７、８～１５、または１６～２３のＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、０～７、８～１５、１６～２３のＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、重度もしくは極度から中程度、軽度または無症状まで改善するＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。また別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、または８週間の治療後、少なくとも１の重症度範囲まで改善するＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、少なくとも２の重症度範囲まで改善するＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、少なくとも３の重症度範囲まで改善するＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。また別の態様では、その必要のある対象は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、少なくとも４の重症度範囲まで改善するＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。さらなる態様では、その必要のある対象は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６週間の治療の間維持されるＣＹ－ＢＯＣＳスコアを有する。

【0388】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。

【0389】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。

【0390】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。

【0391】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。

【0392】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＡＢＣ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。

【0393】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＡＲＳ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。

【0394】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。

【0395】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。

【0396】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。

【0397】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＡＲＳ－２評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。

【0398】

ある態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該医薬組成物は、ヴァインランド適応行動尺度ＩＩ（ＶＡＢＳ－ＩＩ）評価スコアにおいて、治療開始前と比較して、治療後、少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。ある態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。

【0399】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。

【0400】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。

【0401】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。

【0402】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＶＡＢＳ－ＩＩまたはＶＡＢＳ－ＩＩＩ評価スコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。

【0403】

ある態様では、その必要のある対象は、治療開始前、８５以下のＶＡＢＳ－ＩＩドメイン評価スコア、および１２以下の少なくとも一つの下位ドメインスコアを呈する。別の態様では、その必要のある対象は、治療開始前、７５以下のＶＡＢＳ－ＩＩドメイン評価スコア、および１２以下の少なくとも一つの下位ドメイン評価スコアを呈する。別の態様では、その必要のある対象は、治療開始前、６５以下のＶＡＢＳ－ＩＩドメイン評価スコア、および１２以下の少なくとも一つの下位ドメイン評価スコアを呈する。別の態様では、医薬組成物は、治療開始前と比較して、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、または８週間の治療後に、ＶＡＢＳ－ＩＩ評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。さらに別の態様では、ＶＡＢＳ－ＩＩ評価スコアにおける１０％の改善は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間、維持される。

【0404】

ある態様では、本開示は、その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）を治療する方法を提供するものであり、方法は、当該対象に、治療開始前と比較して、レイノルド知能評価尺度（商標）－非言語（ＲＩＡＳ－ＮＶ）ＩＱスコアにおいて、少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効な、本明細書に記載される医薬組成物の量を当該対象に投与することを含む。ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２週間の治療後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコア評価スコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１０％の改善を維持するのに有効である。

【0405】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１５％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上の後に、ＣＹ－ＢＯＣＳ評価スコアにおいて少なくとも１５％の改善を維持するのに有効である。

【0406】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも２０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上後、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも２０％の改善を維持するのに有効である。

【0407】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも３０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上後、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも３０％の改善を維持するのに有効である。

【0408】

ある態様では、医薬組成物は、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間の治療後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、または１６週間の治療の後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、１～３、３～５、５～７、７～９、９～１１、１１～１３、１３～１６週間の治療の間、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも４０％の改善をもたらすのに有効である。別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３または２４週間後に、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。また別の態様では、医薬組成物は、治療が完了してから１週間以上、２週間以上、３週間以上、４週間以上、５週間以上、６週間以上、７週間以上、８週間以上、９週間以上、１０週間以上、１１週間以上、１２週間以上、１３週間以上、１４週間以上、１５週間以上、１６週間以上、１７週間以上、１８週間以上、１９週間以上、２０週間以上、２１週間以上、２２週間以上、２３週間以上、または２４週間以上後、ＲＩＡＳ－ＮＶスコアにおいて少なくとも４０％の改善を維持するのに有効である。

【0409】

ある態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該医薬組成物は、評価スコアにおいて、少なくとも１０％の改善をもたらすのに有効であり、この場合において当該対象は、自閉症診断面接－改訂版（ＡＤＩ－Ｒ）評価により特定される自閉症スペクトラム障害の基準を呈している。別の態様では、その必要のある対象は、ＡＤＩ－Ｒ評価により特定される自閉症スペクトラム障害の基準を呈しており、１週当たり、３回未満のＣＳＢＭを伴うＧＩ症状の便秘をさらに含む。別の態様では、その必要のある対象は、ＡＤＩ－Ｒ評価により特定される自閉症スペクトラム障害の基準を呈しており、評価スコアにおける少なくとも１０％の改善は、ＣＡＲＳ－２、ＡＢＣ－２、ＲＩＡＳ－ＮＶ、ＳＲＳ－２、およびＰＧＩ－ＩＩＩからなる群から選択される評価システムに基づく。別の態様では、その必要のある対象は、ＡＤＩ－Ｒ評価により特定される自閉症スペクトラム障害の基準を呈しており、評価スコアにおける少なくとも１０％の改善は、ＣＧＩ、ＣＹ－ＢＯＣＳ、ＡＢＣ、ＶＡＢＳ－ＩＩおよびＶＡＢＳ－ＩＩＩからなる群から選択される評価システムに基づく。

【0410】

一つの態様では、本開示は、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、本明細書に記載の医薬組成物の薬学的に活性な用量または治療有効用量を当該対象に投与することを含む。一つの態様では、本開示は、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、本明細書に記載の医薬組成物の治療有効用量を当該対象に毎日投与することを含む。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、少なくとも２日間連続で、その必要のある患者に投与される。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間連続で投与される。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日１回、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６の週または月で連続で投与される。さらなる態様では、医薬組成物は、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６の月または年で連続で、少なくとも１回投与される。

【0411】

一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、少なくとも２日間連続で、その必要のある患者に投与される。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間連続で投与される。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日２回、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６の週または月で連続で投与される。さらなる態様では、医薬組成物は、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の月または年で連続で、少なくとも２回投与される。

【0412】

一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、少なくとも２日間連続で、その必要のある患者に投与される。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、または１５日間連続で投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間連続で投与される。一つの態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、最大で４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９もしくは２０の日または週で連続して投与される。別の態様では、医薬組成物は、少なくとも１日３回、最大で１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５または１６の週または月で連続で投与される。さらなる態様では、医薬組成物は、対象の全人生にわたり慢性的に、または無期限に、１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１もしくは１２の月または年で連続で、少なくとも３回投与される。

【0413】

一つの態様では、本開示は、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、細菌混合物を含む医薬組成物の治療活性用量を当該対象に経口投与することを含み、この場合において当該用量は、少なくとも３日間連続または３週連続で少なくとも１日１回または２回の投与スケジュールで投与される。別の態様では、用量は、少なくとも１日１回、２回または３回、１～１６週、２～１６週、３～１６週、４～１６週、５～１６週、６～１６週、７～１６週、８～１６週、１０～１６週、１２～１６週、１～１２週、２～１２週、３～１２週、４～１２週、５～１２週、６～１２週、７～１２週、８～１２週、９～１２週、１０～１２週、１～２週、２～３週、３～４週、４～５週、５～６週、６～７週、７～８週、８～９週、９～１０週、または１０～１１週の期間、投与される。

【0414】

一つの態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、単回投与スケジュールを含む。一つの態様では、投与スケジュールは、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間連続の治療期間を含む。ある態様では、投与スケジュールは、毎日、１日おき、２日おき、または３、４、５、６、７、８日おきに用量を投与することを含む。

【0415】

一つの態様では、本開示は、本明細書に記載される医薬組成物を投与することによって、その必要のある対象においてＡＳＤを治療する方法を提供するものであり、この場合において当該方法は、第一の投与スケジュールに続く第二の投与スケジュールを含む。一つ態様では、第一の投与スケジュールは、治療用量または導入用量を含む。一つの態様では、第一の投与スケジュールは、連続的な投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、２日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、等しい用量の２日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、一日での用量を含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、３日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、４日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、５日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、６日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、７日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第一の投与スケジュールは、少なくとも３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、または１２日間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第二の投与スケジュールは、第一の投与スケジュールの薬学的に活性な用量以下の維持用量を含む。別の態様では、第二の投与スケジュールは、少なくとも約２、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１８、２４、３６、４８、７２、または９６週間にわたって継続する。別の態様では、第二の投与スケジュールは、少なくとも２、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１８、２４、３６、４８、７２、または９６週間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第二の投与スケジュールは、少なくとも２、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１８、２４、３６、４８、７２、または９６週間連続の投与スケジュールを含む。別の態様では、第二の投与スケジュールは、少なくとも１２、１４、２１、２８、３５、４２、４９、５６、６３、７０、または７７日間連続の投与スケジュールを含む。一つの態様では、第二の投与スケジュールは、治療される対象の全人生にわたり、または無期限に、永久的に継続する。一つの態様では、第二の投与スケジュールは、連続的な投与スケジュールである。別の態様では、第二の投与スケジュールは、断続的な投与スケジュールである。さらなる態様では、第二の投与スケジュールは、少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４日間の治療期間と、それに続く少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３または１４日間の休息期間を含む断続的な投与スケジュールである。別の態様では、第二の投与スケジュールは、一日おき、二日おき、または３、４、５、６、７、８日おきに第二の用量（例えば、維持用量）を投与することを含む。別の態様では、維持用量は、漸増（または別手段により用量または投与スケジュールを変更すること）を伴う、または伴わない長期間にわたって投与される。一つの態様では、第一および第二の投与スケジュールの間に間隔はない。別の態様では、第一の投与スケジュールと第二の投与スケジュールの間の間隔は、少なくとも１、２、３、４、５、６、または７日である。一つの態様では、第一の投与スケジュールと第二の投与スケジュールの間の間隔は、少なくとも約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、または１６週間である。ある態様では、第二の投与スケジュール（例えば維持用量）は、第一の投与スケジュール（例えば、初期治療用量）で使用される用量よりも、約２、３、４、５、１０、５０、１００、２００、４００、または５００倍少ない用量を含む。別の態様では、第二の投与スケジュール（例えば、維持投与スケジュール）は、第一の投与スケジュール（例えば、初期治療投与スケジュール）と等しい、または少ない投与頻度を有する。別の態様では、第二の投与スケジュール（例えば、維持投与スケジュール）は、第一の投与スケジュール（例えば、初期治療投与スケジュール）よりも多い投与間隔を有する。

【0416】

一つの態様では、本開示は、その必要のある対象を治療する方法を提供し、この場合において当該方法は、当該対象に、注意深くスクリーニングされた複数の健康なドナーの非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を含む医薬組成物の薬学的に活性な用量を投与することを含む。ある態様では、対象は、投与期間にわたり医薬組成物を投与され、この場合において第一の用量は、単一のドナーの非培養糞便細菌調製物を含む少なくとも一つの医薬組成物、および第一の用量のドナーとは異なる単一のドナーの非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物の第二の用量を含む。別の態様では、第一の用量は、単一のドナーの非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を含み、第二の用量は、ドナープールの非培養糞便細菌調製物を含む。第一および第二の用量は、対象への投与の順序を示すものではなく、むしろ別個のドナーに由来する非培養糞便細菌調製物が、非混合の形態で使用され得ることを示す。さらに別の態様では、注意深くスクリーニングされた複数の健康なドナーに由来する非培養糞便細菌調製物は、非混合の形態で提供される。

【0417】

ある態様では、本明細書で使用される医薬組成物は、予め選択された望ましい特性を有する、または特定の前処理を受けているドナーに由来する非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を含む。ある態様では、ドナーは、現在または過去にＡＳＤ診断を受けていないか、またはＡＳＤの症状を有していない。別の態様では、ドナーは、ＡＳＤと診断された、またはＡＳＤ症状を呈する家族がおらず、直径親族がいない。別の態様では、ドナーは、ＡＳＤと診断された、またはＡＳＤの症状を呈する兄弟姉妹、両親、または子供がいない。ある態様では、ドナーは、過去にいかなる糞便微生物移植も受けていない。ある態様では、ＡＳＤ治療のための糞便ドナーは、過去に、ＧＩ障害、例えば、Ｃ．ディフィシレ感染または炎症性腸疾患（ＩＢＤ）の治療用の糞便を寄贈した。

【0418】

ある態様では、本明細書に記載される治療を受ける対象は、妊娠中の女性である。別の態様では、本明細書の治療を受ける妊娠中の女性は、ＡＳＤと診断されたか、またはＡＳＤ症候群を呈する、年長児がいる。別の態様では、本明細書の治療を受ける妊娠中の女性は、ＡＳＤを有する子供を出産するリスクがある。別の態様では、糞便ドナーは、妊娠中である。さらなる態様では、妊娠中のドナーに由来する糞便から調製される非培養糞便細菌調製物は、ＡＳＤを有する子供を出産するリスクがある妊娠中の対象に（例えば、一つ以上の細菌単離株と組み合わせて）投与される。

【0419】

ある態様では、ＡＳＤを有する対象を治療する方法は、当該対象に、ラクトバチルス属の構成員を含む細菌混合物を含む医薬組成物を投与することを含む。例えば、医薬組成物中で対象に投与される細菌混合物は、（当該細菌混合物内に含まれる非培養糞便細菌調製物および／または細菌単離株中で）Ｌ．ロイテリを含むことができる。ＡＳＤの一つ以上の症状を呈する対象、またはＡＳＤの一つ以上の症状の発現に感受性のある対象に、細菌の特定の株（例えば、Ｌ．ロイテリ）を投与することで、ＡＳＤを治療またはＡＳＤを予防することができる。理論に拘束されるものではないが、対象へのＬ．ロイテリの投与の後、Ｌ．ロイテリは、対象の腸内に生着し、オキシトシン依存性の作用機序を介してＡＳＤを治療または予防するように作用することができる。例えば、Ｌ．ロイテリは、腸粘膜から、対象の行動に影響を及ぼす脳領域（例えば、視床下部傍室核、またはＰＶＮ）への求心性の迷走神経接続を介した神経シグナル伝達を刺激することができる。ある態様では、Ｌ．ロイテリは、ＰＶＮニューロンによるオキシトシン放出を誘導し、社会的行動を調節するオキシトシン受容体を介して、ドーパミン作動性ニューロンにおけるシナプス可塑性を調節することができる。

【0420】

ある態様では、本明細書において、対象の腸内に、ラクトバチルス属の構成員（例えば、Ｌ．ロイテリ）を生着させる方法が提供され、当該方法は、（ｉ）非培養糞便細菌調製物、および（ｉｉ）ラクトバチルスの構成員を含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含む医薬組成物を当該対象に投与することを含み、この場合において組成物投与後の当該対象の腸内におけるラクトバチルスの構成員の生着は、組成物投与前の生着よりも多い。生着は、例えば、糞便微生物叢などの対象の腸内微生物叢におけるラクトバチルスの当該構成員の相対的存在量を決定することにより測定することができる。ある態様では、腸内微生物叢中のラクトバチルスの当該構成員の相対的存在量は、非培養糞便細菌調製物と、ラクトバチルスの当該構成員を含む細菌単離株の両方の投与後のほうが、当該細菌単離株が単独で投与されたときの腸内微生物叢中のラクトバチルスの相対的存在量よりも多い。すなわち、ラクトバチルスの当該構成員を含む細菌単離株を組み合わされた非培養糞便細菌調製物を投与することで、対象の腸内におけるＬ．ロイテリ細菌単離株の生着が容易になり、促進され、および／または相乗効果が与えられる。

【0421】

ある態様では、本開示は、単一のドナーの非培養糞便細菌調製物、および任意で一つ以上の細菌単離株を含む医薬組成物の薬学的に活性な用量を対象に投与することにより、その必要のある対象を治療する方法を提供する。別の態様では、投与の後に、医薬組成物の薬学的に活性な用量の有効性を判定するための検査が行われる。別の態様では、対象の検査は、医薬組成物の活性用量を調整するべきかを判定するための結果を提供する。別の態様では、検査の後に、複数のドナーから混合された非培養糞便細菌調製物、および任意で一つ以上の微生物単離株を含む医薬組成物の投与が行われる。本開示の一つの態様では、方法は、（１）単一のドナーの非培養糞便細菌調製物（および任意で一つ以上の細菌単離株）を含む医薬組成物の薬学的に活性な用量を対象に投与すること、（２）追加用量が必要か、または用量を調節するべきか、有効性を判定するために対象を検査すること、（３）複数のドナーから混合された非培養糞便細菌調製物（および任意で一つ以上の細菌単離株）を含む第二の医薬組成物を投与すること、（４）任意で、追加用量が必要か、または用量を調節するべきか、有効性を判定するために対象を検査すること、および（５）任意で複数のドナーから混合された非培養糞便細菌調製物（および任意で一つ以上の細菌単離株）を含む第三の医薬組成物を投与することであって、この場合において当該複数のドナーは、（ａ）第二の医薬組成物からのドナーおよび追加のドナーの全てを含む、（ｂ）第二の医薬組成物に含まれない糞便細菌のドナーを含む、（ｃ）第二の医薬組成物に含まれる糞便細菌のドナーの全員ではないが一部を含む、または第二の医薬組成物に含まれていない糞便細菌のドナーを含むこと、を含む、その必要のある対象の治療を提供する。別の態様では、第一、第二、および第三の医薬組成物は、異なる順序で投与される（すなわち、第一、第三、第二；第三、第二、第一；第三、第一、第二；第二、第一、第三、など）。

【0422】

別の態様では、本開示は、その必要のある対象を、単一のドナーに由来する非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を含有するカプセルを用いて治療する方法を提供する。別の態様では、カプセルは、複数のドナーに由来する非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を含む。一つの態様では、対象は、単一であるが異なるドナーに由来する非培養糞便細菌調製物を含有する二つ以上の丸薬を投与される。

【0423】

一つの態様では、本開示は、その必要のある対象を、治療期間中の従前の投与に類似するが、異なる単一のドナーの非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を投与することを含む治療方法を提供する。別の態様では、治療期間は、単一ドナーの非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を含む第一の用量の投与と、複数のドナーの非培養糞便細菌調製物を含む医薬組成物を含む第二の用量の投与を含む。

【0424】

ある態様では、非培養糞便細菌調製物、および一つ以上の細菌単離株は、同じ医薬組成物中で本明細書に記載される方法に従い対象に投与される。ある態様では、非培養糞便細菌調製物、および一つ以上の細菌単離株は、異なる医薬組成物中で本明細書に記載される方法に従い対象に投与される。ある態様では、複数の細菌単離株は、同じ医薬組成物中で本明細書に記載される方法に従い対象に投与される。ある態様では、複数の細菌単離株は、異なる医薬組成物中で本明細書に記載される方法に従い対象に投与される。例えば、方法は、有効量の複数の医薬組成物、例えば、本明細書に開示される、二つ以上の医薬組成物、三つ以上の医薬組成物、四つ以上の医薬組成物、または五つ以上の医薬組成物を、その必要のある対象に投与することを含んでもよい。複数の医薬組成物は、同時にまたは連続的に提供されてもよい。したがって、対象が、例えば非培養糞便細菌調製物と二つの細菌単離株で治療される場合、第一の組成物は、当該細菌単離株の二つを含んでもよく、第二の組成物は、非培養糞便細菌調製物を含んでもよい。異なる例では、対象が、非培養糞便細菌調製物と二つの細菌単離株で治療される場合、第一の組成物は、第一の細菌単離株と組み合わされた（または「スパイクされた」）非培養糞便細菌調製物を含んでもよく、第二の組成物は、第二の細菌単離株を含んでもよい。異なる例では、対象が、非培養糞便細菌調製物と三つの細菌単離株で治療される場合、第一の組成物は、第一の細菌単離株を含んでもよく、第二の組成物は、第二の細菌単離株を含んでもよく、第三の組成物は、第三の細菌単離株を含んでもよく、および第四の組成物は、非培養糞便細菌調製物を含んでもよい。

【0425】

ある態様では、その必要のある対象においてＡＳＤの一つ以上の症状を治療する方法は、対象に、（ｉ）一つ以上の細菌単離株、（ｉｉ）非培養糞便細菌調製物、および（ｉｉｉ）一つ以上の抗生物質、を投与することを含む。（ｉ）～（ｉｉｉ）の様々な構成要素が、任意の順序で対象に投与されてもよい。例えば、対象は、一つ以上の抗生物質を投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物と一つ以上の細菌単離株の両方を含む細菌混合物を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上の抗生物質を投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物を投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上の抗生物質を投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株を投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物を投与されてもよい。上述の例の各々について、治療方法の任意の所与の構成要素が、複数回投与され得ることがさらに理解される。例えば、抗生物質が対象に投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物が投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株が投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物の２回目の投与がなされてもよい。

【0426】

ある態様では、その必要のある対象においてＡＳＤの一つ以上の症状を治療する方法は、対象に、（ｉ）一つ以上の細菌単離株、（ｉｉ）非培養糞便細菌調製物、および（ｉｉｉ）一つ以上のプレバイオティクス、を投与することを含む。（ｉ）～（ｉｉｉ）の様々な構成要素が、任意の順序で対象に投与されてもよい。例えば、対象は、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物と一つ以上の細菌単離株の両方を含む細菌混合物を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物を投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株を投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物のうちの一つまたは両方を投与されてもよい。上述の例の各々について、治療方法の任意の所与の構成要素が、複数回投与され得ることがさらに理解される。例えば、非培養糞便細菌調製物が対象に投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株が投与され、それに続いて、プレバイオティクスが投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物の２回目の投与がなされてもよい。

【0427】

ある態様では、その必要のある対象においてＡＳＤの一つ以上の症状を治療する方法は、対象に、（ｉ）一つ以上の細菌単離株、（ｉｉ）非培養糞便細菌調製物、（ｉｉｉ）一つ以上のプレバイオティクス、および（ｉｖ）一つ以上の抗生物質、を投与することを含む。（ｉ）～（ｉｖ）の様々な構成要素が、任意の順序で対象に投与されてもよい。例えば、対象は、一つ以上の抗生物質を投与され、それに続いて、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物と一つ以上の細菌単離株の両方を含む細菌混合物を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上の抗生物質を投与され、それに続いて、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物を投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株を投与されてもよい。別の例では、対象は、一つ以上の抗生物質を投与され、それに続いて、一つ以上のプレバイオティクスを投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株を投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物を投与されてもよい。別の例では、プレバイオティクスは、一つ以上の細菌単離株および／または非培養糞便細菌調製物のうちの一つまたは両方を投与した後に投与されてもよい。上述の例の各々について、治療方法の任意の所与の構成要素が、複数回投与され得ることがさらに理解される。例えば、抗生物質が対象に投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物が投与され、それに続いて、一つ以上の細菌単離株が投与され、それに続いて、プレバイオティクスが投与され、それに続いて、非培養糞便細菌調製物の２回目の投与がなされてもよい。

【0428】

上述の組み合わせ治療の各々において、異なる治療の間の期間（例えば、非培養糞便細菌調製物と一つ以上の細菌単離株の投与の間の期間）は、少なくとも１時間、少なくとも２時間、少なくとも６時間、少なくとも１２時間、少なくとも１日、少なくとも２日、少なくとも３日、少なくとも４日、少なくとも５日、少なくとも６日、少なくとも１週、少なくとも２週、少なくとも３週、少なくとも４週、少なくとも５週、少なくとも６週、少なくとも７週、少なくとも８週、または８週よりも長くてもよい。

【0429】

一つの態様では、治療される対象は、すでに障害（例えば、ＡＳＤ）を有する対象である。障害（例えば、ＡＳＤ）に対し遺伝的に罹り易い、または罹る傾向がある、臨床的に無症候性のヒト対象への本開示医薬組成物の投与も、臨床症状の発生の予防に有用である。遺伝的にＡＳＤに罹り易い、または罹る傾向があるヒトは、障害（例えば、ＡＳＤ）を呈する、もしくは罹患している近親者または親族を有するヒト対象であり得る。別の態様では、治療される対象は、ＡＳＤが予防される対象である。別の態様では、治療される対象は、障害（例えば、ＡＳＤ）に罹り易い、または感受性がある。別の態様では、治療される対象は、障害（例えば、ＡＳＤ）を有すると診断された対象である。一つの態様では、治療される対象は、その必要のある患者である。

【0430】

一つの態様では、治療される対象は、ヒト患者である。一つの態様では、患者は、男性患者である。一つの態様では、患者は、女性患者である。一つの態様では、患者は、早生児である。一つの態様では、患者は、新生児期間である。一つの態様では、患者は、新生児である。一つの態様では、患者は、乳児である。一つの態様では、患者は、幼児である。一つの態様では、患者は、小児である。一つの態様では、患者は、子供である。一つの態様では、患者は、青年である。一つの態様では、患者は、小児患者である。一つの態様では、患者は、高齢患者である。一つの態様では、ヒト患者は、約１８、１５、１２、１０、８、６、４、３、２、または１歳未満の小児患者である。別の態様では、ヒト患者は、成人患者である。別の態様では、ヒト患者は、年配の患者である。さらなる態様では、ヒト患者は、約３０歳、３５歳、４０歳、４５歳、５０歳、５５歳、６０歳、６５歳、７０歳、７５歳、８０歳、８５歳、９０歳、または９５歳を超える患者である。別の態様では、患者は、約１～５、２～１０、３～１８、２１～５０、２１～４０、２１～３０、５０～９０、６０～９０、７０～９０、６０～８０、または６５～７５歳である。一つの態様では、患者は、前期高齢者の患者（６５－７４歳）である。一つの態様では、患者は、中期高齢者の患者（７５～８４歳）である。一つの態様では、患者は、高齢の患者（＞８５歳）である。

【0431】

一つの態様では、方法は、医薬組成物を経口的に、浣腸によって、または直腸座薬を介して投与することを含む。一つの態様では、医薬組成物は、ジェルタブ、丸薬、マイクロカプセル、カプセル、または錠剤として製剤化される。一つの態様では、医薬組成物は、腸溶性コーティングされたカプセルまたはマイクロカプセル、酸耐性のカプセルまたはマイクロカプセルとして製剤化され、または食品、食品添加物、乳製品、大豆系製品もしくはその誘導体、ゼリー、またはヨーグルトの一部として製剤化され、またはそれらと一緒に投与される。別の態様では、医薬組成物は、酸耐性の腸溶性コーティングカプセルとして製剤化される。医薬組成物は、食品または飲料と組み合わされて販売するための粉末として提供されてもよい。食品または飲料は、乳製品または大豆製品であってもよい。別の態様では、食品または食品サプリメントは、医薬組成物を含有する腸溶コーティング、および／または酸耐性のマイクロカプセルを含有する。

【0432】

本明細書において、任意の本明細書に開示される医薬組成物、および使用説明書を含むキットが記載される。例えば、キットは、一つ以上の細菌混合物を含む単位剤形を含んでもよい。そのようなキットは、非培養糞便細菌調製物、および一つ以上の細菌単離株のうちの少なくとも一つを含む一つ以上の細菌混合物を含み、および任意で、組成物を対象に投与するための送達デバイス、または適切な送達経路を介して対象に用量を投与するための説明書を含む。一部の例では、剤形は、任意の適切な形態の生細菌（新鮮、凍結、凍結乾燥など）を含み、ヒト対象への経口投与、経鼻胃管による投与、結腸内視鏡による投与、または肛門投与に対して製剤化される。本明細書に記載される場合、本明細書に提供されるキットに適した剤形としては限定されないが、液体溶液、カプセル、錠剤、粉末、顆粒、および凍結乾燥の形態が挙げられる。

【0433】

キットの説明書は、例えば、キット中の一つ以上の医薬組成物の用量情報について記載してもよい。例として、組成物の投与頻度および用量、例えば、所与の時間に投与される医薬組成物のカプセルの数、および１日／１週当たりの投与回数などである。キットが、複数の組成物（例えば、複数の細菌混合物、または細菌混合物を欠く追加の医薬組成物）を含む態様では、説明書は、各組成物の投与に関して記載してもよい。例えば、一つの組成物が投与され、その後に別の組成物が投与されてもよい。例えば、連続投与される二つの医薬組成物は、分、時間、日、週、月、またはそれ以上の間隔で分けられてもよい。あるいは、二つの組成物を同時に投与してもよい。

【0434】

さらなる態様では、本明細書において、自閉症スペクトラム障害を治療するための医薬品の製造、または自閉症スペクトラム障害の一つ以上の症状の重症度を低下させるための医薬品の製造のための本明細書に記載される細菌混合物の使用が提供される。

【0435】

本明細書において、ドナーの糞便中の細菌分類群（例えば、門、綱、目、科、属、種または株）の存在量に基づきヒト糞便ドナーを選択すること、それに続いて非培養糞便細菌調製物を製造するための糞便細菌の供給源として使用されるドナーから糞便を収集すること、を含む方法が開示される。例えば、ドナー候補の糞便または糞便微生物叢は、特定の対象分類群（例えば、例えば、ラクトバチルス属またはＬ．ロイテリ種）の存在または存在量について、例えばＰＣＲ（例えば、定量的ＰＣＲ）などの核酸ハイブリダイゼーション系技術を使用してスクリーニングされてもよく、もし当該分類群が閾値存在量を超えるレベルで糞便中に存在する場合には、当該ドナーは、対象分類群を含む医薬組成物の調製における使用のための糞便ドナーとして選択されてもよい。ある態様では、ドナーの糞便（すなわち、対象分類群を含む）から調製された非培養糞便細菌調製物は、一つ以上の細菌単離株（例えば、Ｌ．ロイテリなどの対象の細菌分類群を含む）を補充され、非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物中の当該細菌分類群を増加させてもよい。

【0436】

別の態様では、糞便寄贈を行う前に、糞便ドナーは、例えば一つ以上のプロバイオティクスの形態で、一つ以上の細菌単離株（例えば、Ｌ．ロイテリなど、ラクトバチルス属の構成員）を摂取してもよい。ある態様では、糞便ドナーは、糞便寄贈の前に細菌単離株を摂取して、寄贈糞便の糞便微生物中に当該細菌単離株、すなわち細菌株として導入してもよい。したがって、医薬組成物の細菌混合物中に含有されることが望ましい細菌単離株を、ドナーによる細菌単離株の摂取を介して、糞便ドナーの糞便微生物叢内に導入してもよく、それによって、望ましい細菌単離株を起源とする細菌株を有する「出来合いの」または既に含有する糞便に由来する非培養糞便細菌の調製物が出来上がる。（例えば、プロバイオティクスの形態で）細菌単離株を摂取したドナーの糞便に由来する非培養糞便細菌調製物は、当該調製物に任意の追加的な細菌単離株を加えることなく、本明細書に記載される医薬組成物内に直接導入されることができ、あるいは、細菌単離株の追加用量をさらにスパイクされても、または富化されてもよい。糞便ドナーに投与された細菌単離株を起源とする一つ以上の望ましい細菌株を有する糞便ドナーの糞便微生物叢のそのような「プレスパイク」は、ドナーの糞便微生物叢が、当該細菌単離株と同じ分類学的階級（例えば、門、綱、目、科、属または種）の細菌株を内在的に含有していない場合、または当該細菌単離株に対し遺伝的同一性を有する（例えば、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対し、９７％を超える同一性、９８％を超える同一性、９９％を超える同一性、９９．１％を超える同一性、９９．２％を超える同一性、９９．３％を超える同一性、９９．４％を超える同一性、９９．５％を超える同一性、９９．６％を超える同一性、９９．７％を超える同一性、９９．８％を超える同一性、または９９．９％を超える同一性を有する１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する）、閾値レベルを超える細菌株を内在的に含有していない場合に特に有益であり得る。本明細書において、糞便微生物叢のドナーによる細菌単離株の摂取を介して糞便微生物叢に取り込まれる細菌単離株は、生体外で存在する精製細菌単離株との識別のために、「細菌株」（すなわち、摂取された細菌単離株を起源とする）と呼称される。

【0437】

ある態様では、ドナーは、プロバイオティクスの摂取前にはドナー糞便中で検出できない、または閾値存在量未満の相対的存在量で存在する、分類学的階級の細菌単離株を含むプロバイオティクスを摂取してもよい。例えば、ドナー糞便の微生物叢は、ドナー微生物叢中の特定の分類群（門、綱、目、科、属、種または株）の存在について、（例えば、ＰＣＲなどの核酸ハイブリダイゼーション技術を使用して）スクリーニングされてもよい。当該分類群が微生物叢中に存在しない場合、または閾値存在量未満の相対的存在量で存在する場合、ドナーは、当該分類群の細菌単離株を含むプロバイオティクスを投与され、または摂取してもよい。

【0438】

ある態様では、糞便ドナーは、ラクトバチルス・ロイテリを含有する細菌単離株を摂取して、ドナー糞便中のＬ．ロイテリのレベルを増加させてもよい。次いで、摂取された細菌単離株を起源とするＬ．ロイテリの株を含む非培養糞便細菌調製物が、糞便から抽出され、本明細書に記載される医薬組成物に組み込まれてもよい。ある態様では、非培養糞便細菌調製物は、ドナーにより摂取された株と同じ細菌単離株のある量、および／または一つ以上の追加の細菌単離株を補充される。任意で、ドナーの糞便微生物叢は、ドナーによりプロバイオティクスを摂取する前に、および／または摂取した後にスクリーニングされ、Ｌ．ロイテリが当該微生物叢中に存在するか否かを決定し、もし存在する場合には糞便微生物叢中の当該Ｌ．ロイテリの存在量を決定してもよい。

【0439】

ある態様では、糞便ドナーによる一つ以上の細菌単離株の摂取と、当該ドナーからの糞便（すなわち、当該一つ以上の細菌単離株を起源とする細菌株を含有する）の収集の間の期間は、変化し得る。例えば、例えば、当該期間は、少なくとも１時間、少なくとも２時間、少なくとも４時間、少なくとも６時間、少なくとも８時間、少なくとも１０時間、少なくとも１２時間、少なくとも１４時間、少なくとも１６時間、少なくとも１８時間、少なくとも２０時間、少なくとも２２時間、少なくとも２４時間、少なくとも２６時間、少なくとも２８時間、少なくとも３０時間、少なくとも３２時間、少なくとも３４時間、少なくとも３６時間、少なくとも３８時間、少なくとも４０時間、少なくとも４２時間、少なくとも４４時間、少なくとも４６時間、少なくとも４８時間、少なくとも５０時間、少なくとも５２時間、少なくとも５４時間、少なくとも５６時間、少なくとも５８時間、少なくとも６０時間、少なくとも６２時間、少なくとも６４時間、少なくとも６６時間、少なくとも６８時間、少なくとも７０時間、少なくとも７２時間、または７２時間よりも長くてもよい。

【0440】

ある態様では、ドナーは、一回または複数回、ある用量の細菌単離株を摂取して、ドナーの糞便微生物叢への細菌株としての細菌単離株の組み込みを促進してもよい。一つの態様では、ある用量の細菌単離株は、毎日少なくとも１回、または２回、少なくとも３日間連続、または少なくとも３週間連続で、ドナーにより摂取されてもよい。別の態様では、用量は、少なくとも１日１回、２回または３回、１～１６週、２～１６週、３～１６週、４～１６週、５～１６週、６～１６週、７～１６週、８～１６週、１０～１６週、１２～１６週、１～１２週、２～１２週、３～１２週、４～１２週、５～１２週、６～１２週、７～１２週、８～１２週、９～１２週、１０～１２週、１～２週、２～３週、３～４週、４～５週、５～６週、６～７週、７～８週、８～９週、９～１０週、または１０～１１週の期間、摂取される。

【0441】

本明細書において、医薬組成物を製造する方法が開示され、当該方法は、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団または細菌集団を抽出すること、当該抽出された細菌集団または細菌群を当該医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団または細菌群は、当該健康なヒトドナーによって摂取されたプロバイオティクスに由来する細菌株を含むこと、を含む。

【0442】

本明細書において、健康なヒトドナーの細菌集団または細菌群を含む医薬組成物を製造する方法が開示され、当該方法は、当該ドナーが、細菌株を含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、細菌集団または細菌群を抽出することであって、当該細菌集団または細菌群は、当該細菌株を含むこと、当該細菌集団または細菌群を、医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団または細菌群は培養されず、および当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該細菌株を含まないこと、を含む。

【0443】

本明細書に記載される組成物、剤形、および医薬品は、一つ以上の追加の化合物または薬医薬品が、精製された糞便微生物叢組成物に添加され、または別手段で同時投与される、併用の医薬組成物を含むことが理解される。

【0444】

本明細書は、以下の実施形態を提供し、およびそれらを含む。

【0445】

実施形態１。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含む、医薬組成物。

【0446】

実施形態２。
当該糞便、非培養糞便細菌調製物、またはその両方が、Ｌ．ロイテリを含まない、実施形態１に記載の医薬組成物。

【0447】

実施形態３。
当該糞便、非培養糞便細菌調製物、またはその両方が、Ｌ．ロイテリを含む細菌単離株と１００％の遺伝的同一性を有する細菌株を含まない、実施形態１に記載の医薬組成物。

【0448】

実施形態４。
当該非培養糞便細菌調製物が、Ｌ．ロイテリを含む細菌単離株と９８％を超える遺伝的同一性を有する細菌株を含まない、実施形態３に記載の医薬組成物。

【0449】

実施形態５。
当該遺伝的同一性は、Ｌ．ロイテリを含む細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列と、非培養糞便細菌調製物の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列とを比較することにより決定される、実施形態３または実施形態４に記載の医薬組成物。

【0450】

実施形態６。
当該非培養糞便細菌調製物は、５％未満の相対的存在量で、Ｌ．ロイテリ細菌を含む、実施形態１～５のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0451】

実施形態７。
当該非培養糞便細菌調製物は、３％未満の相対的存在量で、Ｌ．ロイテリ細菌を含む、実施形態１～６のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0452】

実施形態８。
当該非培養糞便細菌調製物は、１％未満の相対的存在量で、Ｌ．ロイテリ細菌を含む、実施形態１～７のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0453】

実施形態９。
当該非培養糞便細菌調製物は、０．５％未満の相対的存在量で、Ｌ．ロイテリ細菌を含む、実施形態１～８のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0454】

実施形態１０。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ある種のラクトバチルスを含む細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該非培養糞便細菌調製物は、ラクトバチルス属の種を含まない、医薬組成物。

【0455】

実施形態１１。
当該非培養糞便細菌調製物が、ある種のラクトバチルスを含む細菌単離株と９９％を超える遺伝的同一性を有する細菌株を含まない、実施形態１０に記載の医薬組成物。

【0456】

実施形態１２。
当該非培養糞便細菌調製物が、ある種のラクトバチルスを含む細菌単離株と９７％を超える遺伝的同一性を有する細菌株を含まない、実施形態１０または実施形態１１に記載の医薬組成物。

【0457】

実施形態１３。
当該遺伝的同一性は、ある種のラクトバチルスを含む細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列と、非培養糞便細菌調製物の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列とを比較することにより決定される、実施形態１１または実施形態１２に記載の医薬組成物。

【0458】

実施形態１４。
当該ある種のラクトバチルスが、Ｌ．ロイテリである、実施形態１０～１３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0459】

実施形態１５。
当該ある種のラクトバチルスが、Ｌ．プランタルムである、実施形態１０～１３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0460】

実施形態１６。
当該ある種のラクトバチルスが、Ｌ．アシドフィルスである、実施形態１０～１３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0461】

実施形態１７。
当該ある種のラクトバチルスが、Ｌ．パラカゼイである、実施形態１０～１３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0462】

実施形態１８。
当該ある種のラクトバチルスが、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ブルガリクスである、実施形態１０～１３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0463】

実施形態１９。
当該医薬組成物が、一つ以上の追加の細菌単離株をさらに含む、実施形態１～１８のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0464】

実施形態２０。
当該一つ以上の追加の細菌単離株が、ビフィドバクテリウム属またはストレプトコッカス属の構成員を含む、実施形態１９に記載の医薬組成物。

【0465】

実施形態２１。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である、医薬組成物。

【0466】

実施形態２２。
当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも３０％である、実施形態２１に記載の医薬組成物。

【0467】

実施形態２３。
当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、少なくとも４５％である、実施形態２１に記載の医薬組成物。

【0468】

実施形態２４。
当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌種の生細胞の相対的存在量よりも多い、実施形態２１～２３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0469】

実施形態２５。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い、医薬組成物。

【0470】

実施形態２６。
当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌調製物中の任意の細菌種の生細胞の相対的存在量よりも多い、実施形態２５のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0471】

実施形態２７。
当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌調製物中の任意の細菌属の生細胞の相対的存在量よりも多い、実施形態２５のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0472】

実施形態２８。
当該細菌混合物中の細菌単離株の生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌調製物中の任意の細菌門の生細胞の相対的存在量よりも多い、実施形態２５のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0473】

実施形態２９。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該細菌単離株は、ある種の構成員であり、当該細菌単離株は、細菌混合物中の当該種の唯一の構成員である、医薬組成物。

【0474】

実施形態３０。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該非培養糞便細菌の調製物は、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まない、医薬組成物。

【0475】

実施形態３１。
当該非培養糞便細菌調製物は、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９７％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まない、実施形態３０に記載の医薬組成物。

【0476】

実施形態３２。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該細菌単離株は、当該組成物を投与された対象の回腸に生着する、医薬組成物。

【0477】

実施形態３３。
当該細菌単離株が、ラクトバチルス属の構成員を含む、実施形態２１～３２のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0478】

実施形態３４。
当該ラクトバチルス属の構成員が、Ｌ．ロイテリ、Ｌ．プランタルム、Ｌ．アシドフィルス、Ｌ．パラカゼイ、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ブルガリクス、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態３３に記載の医薬組成物。

【0479】

実施形態３５。
当該ラクトバチルス属の構成員が、Ｌ．ロイテリである、実施形態３４に記載の医薬組成物。

【0480】

実施形態３６。
当該細菌単離株が、ビフィドバクテリウム属の構成員を含む、実施形態２１～３５のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0481】

実施形態３７。
当該ビフィドバクテリウム属の構成員が、Ｂ．ブレーベ、Ｂ．ロンガム、Ｂ．ロンガム亜種インファンティス、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態３５に記載の医薬組成物。

【0482】

実施形態３８。
当該細菌単離株が、ストレプトコッカス属の構成員を含む、実施形態２１～３６のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0483】

実施形態３９。
当該ストレプトコッカス属の構成員が、Ｓ．サリバリウス亜種サーモ（Ｓ．ｓａｌｉｖａｒｉｕｓ ｔｈｅｒｍｏ）である、実施形態３７に記載の医薬組成物。

【0484】

実施形態４０。
当該医薬組成物が、複数の細菌単離株を含む、実施形態２１～３９のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0485】

実施形態４１。
当該非培養糞便細菌調製物は、非選択糞便細菌を含む、実施形態１～４０のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0486】

実施形態４２。
当該細菌混合物が、凍結乾燥細菌を含む、実施形態１～４１のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0487】

実施形態４３。
当該細菌混合物が、凍結保護剤を含む、実施形態１～４２のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0488】

実施形態４４。
当該細菌混合物が、カプセル内に封入される、実施形態１～４３のいずれか一つに記載の医薬組成物。

【0489】

実施形態４５。
当該カプセルが、遅延放出カプセルである、実施形態４４に記載の医薬組成物。

【0490】

実施形態４６。
当該遅延放出カプセルが、組成物を投与された対象の回腸内で当該細菌単離株を放出するよう製剤化される、実施形態４５に記載の医薬組成物。

【0491】

実施形態４７。
その必要のある対象において、自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法であって、実施形態１～４７のいずれか一つに記載の医薬組成物を当該対象に投与することを含む、方法。

【0492】

実施形態４８。
その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する方法であって、当該対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団を含む医薬組成物であって、当該細菌集団は、培養されていない、医薬組成物、および（ｉｉ）ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株、を投与することを含む、方法。

【0493】

実施形態４９。
当該医薬組成物は、細菌単離株を含む、実施形態４８に記載の方法。

【0494】

実施形態５０。
当該細菌集団が、Ｌ．ロイテリを欠く、実施形態４８または実施形態４９に記載の方法。

【0495】

実施形態５１。
ヒトの腸にラクトバチルス・ロイテリを生着させる方法であって、前記ヒトに、（ｉ）非培養糞便細菌調製物、および（ｉｉ）Ｌ・ロイテリを含む細菌単離株、を含む医薬組成物を投与することを含み、当該組成物を投与された後の当該ヒトの腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量は、当該組成物を投与される前の腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量よりも多い、方法。

【0496】

実施形態５２。
当該腸内微生物叢は、回腸の微生物叢を含む、実施形態５１に記載の方法。

【0497】

実施形態５３。
当該腸内微生物叢は、糞便微生物叢を含む、実施形態５１に記載の方法。

【0498】

実施形態５４。
当該組成物を投与された後の当該ヒトの腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量は、当該細菌単離株を単独で投与された後の腸内微生物叢中のＬ．ロイテリの相対的存在量よりも多い、実施形態５１～５３のいずれか一つに記載の方法。

【0499】

実施形態５５。
当該組成物を投与することが、当該ヒトにおいて、自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療する、実施形態５１～５４のいずれか一つに記載の方法。

【0500】

実施形態５６。
健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団を抽出すること、および当該細菌集団と、ラクトバチルス・ロイテリを含む細菌単離株とを混合すること、を含み、当該細菌集団は、培養されない、方法。

【0501】

実施形態５７。
当該細菌集団と、追加の細菌単離株とを混合することをさらに含む、実施形態５６に記載の方法。

【0502】

実施形態５８。
ドナーの糞便微生物叢中のラクトバチルスの少なくとも一つの構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、当該ドナーの糞便から、細菌集団を抽出することであって、当該細菌集団は、ラクトバチルスの前記少なくとも一つの構成員を含む、抽出すること、および当該細菌集団を、医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団は、培養されないこと、を含む方法。

【0503】

実施形態５９。
当該方法はさらに、当該細菌集団と、ラクトバチルスの少なくとも一つの構成員を含む細菌単離株とを混合することをさらに含む、実施形態５８に記載の方法。

【0504】

実施形態６０。
当該ラクトバチルスの少なくとも一つの構成員が、Ｌ．ロイテリ、Ｌ．プランタルム、Ｌ．アシドフィルス、Ｌ．パラカゼイ、Ｌ．デルブルエッキイ亜種ブルガリクス、およびそれらの組み合わせからなる群から選択される、実施形態５８または５９に記載の方法。

【0505】

実施形態６１。
当該ラクトバチルス属の少なくとも一つの構成員が、Ｌ．ロイテリである、実施形態６０に記載の方法。

【0506】

実施形態６２。
医薬組成物を製造する方法であって、健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団を抽出すること、および当該抽出された細菌集団を当該医薬組成物に組み込むこと、を含み、当該細菌集団は、当該健康なヒトドナーによって摂取されたプロバイオティクスに由来する細菌株を含む、方法。

【0507】

実施形態６３。
健康なヒトドナーの細菌集団を含む医薬組成物を製造する方法であって、当該ドナーが、細菌株を含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、細菌集団を抽出することであって、当該細菌集団は、当該細菌株を含む、抽出すること、当該細菌集団を、当該医薬組成物に組み込むことであって、当該細菌集団は培養されない、組み込むこと、を含み、および当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該細菌株を含まない、方法。

【0508】

実施形態６４。
当該ドナーによるプロバイオティクスの摂取前、当該ドナーの糞便は、当該細菌株を含まない、実施形態６３に記載の方法。

【0509】

実施形態６５。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、および（ｉｉ）ラクトバチルス種の非病原性細菌単離株、を含む細菌混合物を含み、当該細菌混合物中のラクトバチルス種の生細胞の相対的存在量は、当該糞便の糞便細菌中のラクトバチルス種の生細胞の相対的存在量よりも多い、医薬組成物。

【0510】

実施形態６６。
当該ラクトバチルス種が、ラクトバチルス・ロイテリである、実施形態６５に記載の医薬組成物。

【0511】

実施形態６７。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、当該混合物中の非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての生細胞の相対的存在量は、少なくとも１０％である、医薬組成物。

【0512】

実施形態６８。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、当該混合物中の非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての生細胞の相対的存在量は、非培養糞便細菌の調製物中の任意の細菌株の生細胞の相対的存在量よりも多い、医薬組成物。

【0513】

実施形態６９。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、当該細菌単離株は、第一の種の構成員であり、当該細菌単離株は、混合物中の第一の種の唯一の構成員であり、当該真菌単離株は、第二の種の構成員であり、当該真菌単離株は、混合物中の第二の種の唯一の構成員であり、当該古細菌単離株は、第三の種の構成員であり、当該古細菌単離株は、混合物中の第三の種の唯一の構成員である、医薬組成物。

【0514】

実施形態７０。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便微生物の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含み、非培養糞便微生物の調製物は、当該細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する細菌株を含まず、非培養糞便微生物の調製物は、当該真菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する真菌株を含まず、非培養糞便微生物の調製物は、当該古細菌単離株の１６Ｓ ｒＲＮＡ配列に対して９９％を超えて同一な１６Ｓ ｒＲＮＡ配列を有する古細菌株を含まない、医薬組成物。

【0515】

実施形態７１。
（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する、非培養の糞便細菌の調製物、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を含む混合物を含む医薬組成物であって、非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてが、当該組成物を投与された対象の回腸に生着する、医薬組成物。

【0516】

実施形態７２。
その必要のある対象において自閉症スペクトラム障害（ＡＳＤ）の少なくとも一つの症状を治療するための方法であって、当該対象に、（ｉ）ヒトドナーの糞便に由来する細菌集団を含む医薬組成物であって、当該細菌集団は、培養されていないもの、ならびに（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、を投与することを含む、方法。

【0517】

実施形態７３。
健康なヒトドナーの糞便から、細菌集団を抽出すること、ならびに当該細菌集団と、（ｉ）非病原性細菌単離株、および（ｉｉ）細菌単離株、真菌単離株、および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべて、とを混合すること、を含み、当該細菌集団は、培養されない、方法。

【0518】

実施形態７４。
ドナーの糞便微生物叢中の少なくとも一つの構成員の存在量に基づいて、ヒト糞便ドナーを選択すること、当該ドナーの糞便から、微生物集団を抽出することであって、当該微生物集団は、当該少なくとも一つの構成員を含む、抽出すること、および当該微生物集団を医薬組成物へと組み込むこと、を含み、当該微生物集団は、培養されず、当該少なくとも一つの構成員は、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含む、方法。

【0519】

実施形態７５。
医薬組成物を製造する方法であって、健康なヒトドナーの糞便から、微生物集団を抽出すること、および当該抽出された微生物集団を当該医薬組成物へと組み込むこと、を含み、当該微生物集団は、当該健康なヒトドナーにより摂取されたプロバイオティクスに由来する少なくとも一つの構成員を含み、当該少なくとも一つの構成員は、細菌単離株、真菌単離株および古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含む、方法。

【0520】

実施形態７６。
健康なヒトドナーの微生物集団を含む医薬組成物を製造する方法であって、当該ドナーが、細菌単離株、真菌単離株または古細菌単離株からなる群から選択される非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべてを含むプロバイオティクスを摂取した後に、当該ドナーから糞便を受け取ること、当該糞便から、微生物集団を抽出することであって、当該微生物集団は、当該非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つ全てを含む、抽出すること、当該微生物集団を、医薬組成物に組み込むこと、を含み、当該微生物集団は、培養されず、当該ドナーがプロバイオティクスを摂取する前に、当該ドナーの糞便は、当該非病原性微生物型のうちの少なくとも一つ、少なくとも二つ、または三つすべての微生物を含まない、方法。

【0521】

本開示は、本開示の例示として提供される以下の非限定的な実施例を参照することにより、より深く理解され得る。以下の実施例は、本開示の好ましい態様をより完全に解説するために提示されているが、本開示の広範な範囲を限定するものとは決して解釈されないものとする。したがって、添付の特許請求の範囲は、本明細書に含まれる態様の記載に限定されないものとする。

【実施例】

【0522】

実施例１：ヒトドナー糞便中のラクトバチルス・ロイテリの相対的存在量の変動
ラクトバチルス属およびラクトバチルス・ロイテリ種に属する操作的分類単位（ＯＴＵ）は、ＧｒｅｅｎＧｅｎｅｓ（ｖ １３＿８）およびＳＩＬＶＡ（ＳＳＵ ｒ１３２）のデータベースに含まれる分類アノテーションを使用して、それらデータベースから特定された。ＧｒｅｅｎＧｅｎｅｓおよびＳＩＬＶＡのＯＴＵ表は、９０個の糞便ドナーを起源とする１１９５個のサンプル、および１５個のラン対照からのＮＧＳリード（Ｂｒｏａｄ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅにより行われたシーケンス）を、それぞれ９７％および９９％の同一性で、ＧｅｅｎＧｅｎｅｓデータベースおよびＳＩＬＶＡデータベースに対してマッピングすることにより構築された。

【0523】

図１は、各ドナーからのすべてのサンプルにおける、すべてのラクトバチルスＯＴＵ、およびラクトバチルス・ロイテリのみのＯＴＵの相対的存在量を合計した中央値を示す。グラフは、健康な糞便ドナーの糞便微生物叢中のラクトバチルス・ロイテリの相対的存在量に変動があることを示す。

【0524】

実施例２：糞便中のＬ．ロイテリの存在量を基にして選択されたドナーの糞便からの医薬組成物の製造。
図１の結果に基づき、ドナーの糞便中のＬ．ロイテリの存在量に基づき、ドナーが選択される。糞便サンプルをドナーから収集し、１５％トレハロースおよび０．０５％システインのＰＢＳ生理食塩水溶液で希釈し、ホモジナイズして、ろ過する。ろ過物を凍結乾燥し、凍結乾燥細菌混合物をカプセル封入して、医薬組成物を形成する。

【0525】

実施例３：細菌混合物の作製
糞便サンプルを、スクリーニングされた健康なヒトドナーから収集し、１５％トレハロースおよび０．０５％システインのＰＢＳ生理食塩水溶液で希釈し、ホモジナイズして、ろ過する。ろ過物を凍結乾燥させて、凍結乾燥した非培養糞便細菌調製物を作製する。凍結乾燥したラクトバチルス・ロイテリ（ＡＴＣＣ ＰＴＡ ６４７５の細菌単離株）を取得し、凍結乾燥した非培養糞便細菌調製物と混合して、Ｌ．ロイテリ細菌単離株と非培養糞便細菌調製物を含む細菌混合物を作製する。

【0526】

実施例４：吸収させた対象細菌株を含むドナー由来細菌組成物の作製
プレスクリーニングされた健康なドナーに、一つ以上の望ましい細菌株（例えば、ラクトバチルス）を含有するプロバイオティクス組成物を摂取させる。糞便サンプルをドナーから収集し、処理して、望ましいプロバイオティクスの細菌株を含む細菌集団を抽出する。そのような望ましい細菌株は、摂取前にはドナーの糞便微生物叢中には存在しないか、または低レベルでしか存在しない。次いで抽出された細菌集団を医薬組成物内で製剤化する。

【0527】

実施例５：対象の細菌株と組み合わされたドナー由来細菌組成物による免疫刺激効果
Ｌ．ロイテリ（ＡＴＣＣ ＰＴＡ ６４７５）、Ｌ．ロイテリ（ＤＳＭ １７９３８）、およびＬ．プランタルムを含むラクトバチルス単離株は、ｖＢＨＩ３液体培地中で培養される。細胞を洗浄し、１×１０^９ ＣＦＵ／ｍＬで再懸濁する（任意で、その後の共培養工程まで－８０℃で保存する）。ヒトＰＢＭＣを２４ウェルプレートに播種し、５％ ＣＯ_２中で一晩インキュベートする。ＰＢＭＣに対し、各細菌刺激を与え、２４時間共培養する。すべての単一刺激および共刺激に関して、ラクトバチルス株は、ＰＢＭＣの数に対して２Ｘの感染多重度（ＭＯＩ）で加えられる。非選択ドナー由来の糞便微生物叢（ＦＳＭ）成分は、２Ｘまたは１０ＸのいずれかのＭＯＩで加えられ、大腸菌は、０．４ＸのＭＯＩで加えられる。次いで共培養上清を収集し、サイトカインレベル（ＩＬ－１０、ＩＬ－１２ｐ７０、ＩＦＮ－ガンマ、ＧＭ－ＣＳＦ、ＴＮＦ－アルファ、およびＩＬ－２３）をＬｕｍｉｎｅｘによって定量する。ラクトバチルス株のＬ．ロイテリ（ＤＳＭ １７９３８）（図２～５）、Ｌ．プランタルム（図５）およびＬ．ロイテリ（ＡＴＣＣ ＰＴＡ ６４７５）（図２～６）とＦＳＭを組み合わせることによって、炎症性刺激（大腸菌）に反応した炎症促進性サイトカイン（図２～４）の下方制御、抗炎症性サイトカイン（図５）の上方制御、およびＩＬ－１０／ＩＬ－１２の比率の上昇が生じた。これらの結果は、非培養糞便細菌調製物と、ラクトバチルス細菌単離株の両方を含む細菌混合物を培養ヒト細胞に投与することによって、抗炎症性の免疫プロファイルを促進し得ることを示している。

【0528】

実施例６：ＡＳＤの治療
ＡＳＤ患者は群に分けられ、前治療（例えば、抗生物質（バンコマイシン）または腸管前処置）、治療の長さ（単回投与または複数回投与）、用量（個々の用量または全体用量のいずれか）、または投与頻度（毎日または毎週）（図７および８）が異なる、様々な治療レジメンを受ける。様々なドナーに由来する糞便材料を使用して、所与の用量で使用される細菌組成物を作製する。様々な用量レベルで使用される細菌組成物は、同じドナーに由来する糞便材料であってもよい。患者の症状が観察され、臨床評価が治療前、治療中、および治療後に実施される。治療前、治療中、および治療後、患者の糞便サンプルのＤＮＡメタゲノミクスも実施されて、細菌生着が判定される。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【図5】

【図6】

【図7】

【図8】

【国際調査報告】