特表 2023-501950 サイクリン依存性キナーゼ７（ＣＤＫ７）の阻害剤を用いてバイオマーカーにより特定された患者におけるがんを処置する方法

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2023-01-20

(54)【発明の名称】サイクリン依存性キナーゼ７（ＣＤＫ７）の阻害剤を用いてバイオマーカーにより特定された患者におけるがんを処置する方法

(51)【国際特許分類】

   A61K 31/506 20060101AFI20230113BHJP

   A61P 35/00 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 31/4162 20060101ALI20230113BHJP

   A61P 35/02 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 45/00 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 31/437 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 31/439 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 31/5377 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 33/42 20060101ALI20230113BHJP

   A61K 31/5415 20060101ALI20230113BHJP

【ＦＩ】

A61K31/506

A61P35/00

A61K31/4162

A61P35/02

A61K45/00

A61K31/437

A61K31/439

A61K31/5377

A61K33/42

A61K31/5415

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2022525292

(86)(22)【出願日】2020-10-29

(85)【翻訳文提出日】2022-06-27

(86)【国際出願番号】 US2020057998

(87)【国際公開番号】W WO2021087138

(87)【国際公開日】2021-05-06

(31)【優先権主張番号】62/927,561

(32)【優先日】2019-10-29

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】517342268

【氏名又は名称】サイロス ファーマシューティカルズ， インコーポレイテッド

(74)【代理人】

【識別番号】100078282

【弁理士】

【氏名又は名称】山本 秀策

(74)【代理人】

【識別番号】100113413

【弁理士】

【氏名又は名称】森下 夏樹

(74)【代理人】

【識別番号】100181674

【弁理士】

【氏名又は名称】飯田 貴敏

(74)【代理人】

【識別番号】100181641

【弁理士】

【氏名又は名称】石川 大輔

(74)【代理人】

【識別番号】230113332

【弁護士】

【氏名又は名称】山本 健策

(72)【発明者】

【氏名】ホジソン， ジェイ． グレーム

(72)【発明者】

【氏名】ヨハネセン， リブ ヘレナ

【テーマコード（参考）】

4C084

4C086

【Ｆターム（参考）】

4C084AA19

4C084ZB261

4C084ZB262

4C086AA01

4C086AA02

4C086BC42

4C086BC73

4C086CB03

4C086CB05

4C086GA07

4C086GA10

4C086GA12

4C086GA16

4C086HA19

4C086MA01

4C086MA02

4C086MA04

4C086NA05

4C086NA14

4C086ZB26

4C086ZB27

(57)【要約】

本発明は、単独で、または第２の治療剤（例えば、別の抗がん治療）と組み合わせて投与または使用した場合のどちらかで、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩による処置に応答する可能性がより高い、様々なタイプのがんに罹患している患者を特定する方法に関する。患者は、ある特定のバイオマーカー（例えば、ＲＢ１またはＥ２Ｆ経路の別のメンバー）の１つまたは複数の特徴（例えば、遺伝子コピー数または発現レベル）に基づいて特定される。さらに、本発明は、特定された患者を、単独で、または第２の治療剤と組み合わせた、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩により処置する方法に関する。別の態様では、本発明は、本明細書に記載されている通りに特定された患者を処置するための指示書を含むキットを特徴とする。

【特許請求の範囲】

【請求項1】

選択された患者におけるがんの処置における、構造式（Ｉ）：

【化29】

の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用であって、式中、
環Ａは、

【化30】

から選択される二環式６，５－環系であり、４個以下の環窒素原子を含み、
Ｘは、ＮまたはＣ（Ｒ^６）であり、
各Ｙは独立して、ＮまたはＣ（Ｒ^７）であり、
Ｚは、ＮまたはＣ（Ｒ^８）であり、
Ｒ^１は、水素、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリル、－Ｃ（Ｏ）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ＮＲ^１’－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ＮＲ^１’－ＳＯ_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）または－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２であり、Ｒ^１のいずれかのカルボシクリル、ヘテロシクリルまたはヘテロアリール部分は、必要に応じて置換されており、Ｒ^１のいずれかのアルキルまたはアルキレン部分は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されており、
各Ｒ^１’は独立して、水素もしくは必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_６アルキルであるか、または
２個のＲ^１’は、それらが結合される窒素原子と必要に応じて一緒になって、Ｎ、ＯおよびＳから選択される最大２個の追加のヘテロ原子を含む４～６員の必要に応じて置換されたヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成し、
各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、ハロ、－ＯＨ、－ＣＮ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－アリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロアリール、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル）、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキレン）－カルボシクリル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロシクリル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロアリール、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－アリール、－ＮＨ－Ｃ（Ｏ）－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルもしくは－Ｃ（Ｏ）－ＮＨ－（非置換のＣ_１～Ｃ_４アルキル）であるか、または
Ｒ^１およびいずれかのＲ^２は、それらが結合される原子と一緒になって、ピペリジン環に縮合、スピロ縮合もしくは架橋された、必要に応じて置換されたヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成するか、または
２個のＲ^２は一緒になって、オキソを形成するか、もしくはそれらが結合される原子（単数または複数）およびいずれかの介在する環原子と一緒になって、ピペリジン環に縮合、スピロ縮合もしくは架橋された、必要に応じて置換されたアリール、カルボシクリル、ヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成し、
Ｒ^２のいずれかのカルボシクリル、ヘテロシクリルもしくはヘテロアリール部分、Ｒ^１をＲ^２と一緒にすることによって形成されたいずれかの環、または２個のＲ^２を一緒にすることによって形成されたいずれかの環は、必要に応じて置換されており、Ｒ^２のいずれかのアルキルまたはアルキレン部分は、他に指定がない限り、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されており、
Ｒ^３は、水素、ハロ、－ＣＮ、必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_６アルキルまたは必要に応じて置換されたカルボシクリルであり、
Ｒ^４は、ハロ、－ＣＮ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｃ_２～Ｃ_６アルケニル、Ｃ_２～Ｃ_６アルキニル、－Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｓ－Ｃ_１～Ｃ_６アルキルまたはカルボシクリルであり、Ｒ^４のいずれかのアルキル、アルケニル、アルキニルまたはカルボシクリル部分は、必要に応じて置換されており、
各Ｒ^５は独立して、ハロ、－ＯＨ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－ＣＮ、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）ＯＨ、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）（Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロアリール、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル）、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－Ｏ－（Ｃ_０～Ｃ_６－アルキレン）－カルボシクリル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロシクリル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロアリール、フェニル、－（Ｃ_２～Ｃ_４アルケニレン）－フェニル、－Ｓ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ（Ｏ）－ＯＨ、もしくは－Ｓ（Ｏ）_２－ＯＨであり、Ｒ^５のいずれかのアルキル、アルキレン、アルケニレン、カルボシクリル、ヘテロシクリル、フェニルおよびヘテロアリール部分は、必要に応じて置換されているか、または
２個の隣接Ｒ^５は、それらが結合される環原子と一緒になって、必要に応じて置換されたカルボシクリルもしくは必要に応じて置換されたヘテロシクリルを形成し、各カルボシクリルもしくはヘテロシクリルは、環Ａに縮合されており、
Ｒ^５’は、水素、－ＣＮ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－アリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_３アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－（Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－カルボシクリル、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－ヘテロアリール、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－ヘテロシクリル、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－（Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、および－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）ＯＨであり、Ｒ^５’のいずれかのアルキル、アルキレン、カルボシクリル、ヘテロシクリルおよびヘテロアリール部分は、必要に応じて置換されており、
Ｒ^５’およびいずれかのＲ^５は、それらが結合される環原子と一緒になって、必要に応じて置換されたヘテロシクリルを形成し、各ヘテロシクリルは、環Ａに縮合されており、
Ｒ^６は、水素、－ＣＮ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２Ｆ、－ＣＨＦ_２または－ＣＦ_３であり、
各Ｒ^７は独立して、水素またはＲ^５であり、
Ｒ^８は、水素またはフルオロであり、
ｎは、０、１、２、３または４であり、
前記化合物が、以下の化合物または薬学的に許容されるその塩：

【化31】

のうちの１つ以外のものであり、前記患者が、
（ａ）ＲＢ１、ＲＢＬ１、ＲＢＬ２、ＣＤＫＮ２Ａ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＣＤＫＮ１ＣおよびＦＢＷＸ７から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に欠失している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているタンパク質をコードする、
（ｂ）Ｅ２Ｆ１、Ｅ２Ｆ２、Ｅ２Ｆ３、Ｅ２Ｆ４、Ｅ２Ｆ５、Ｅ２Ｆ６、Ｅ２Ｆ７、Ｅ２Ｆ８、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＤ１、ＣＣＮＤ２、ＣＣＮＤ３、ＣＣＮＥ１およびＣＣＮＥ２から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に獲得もしくは増幅されている、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が増大しているタンパク質をコードする、または
（ｃ）遺伝子Ｂｃｌ２様１が、変異している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているＢＣＬ－ｘＬタンパク質をコードする
がんを有すると決定されている、使用。

【請求項2】

環Ａが、

【化32】

である、請求項１に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項3】

環Ａが、

【化33】

である、請求項２に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項4】

Ｒ^１が、水素、シクロプロピル、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２もしくは－ＣＨ_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２であるか、またはＲ^１が、１個のＲ^２および各々が付着される原子と一緒になって、架橋された環を形成し、これが、Ｒ^１およびＲ^２が結合される環と一緒になって、

【化34】

を形成する、請求項１から３のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項5】

Ｒ^１が水素である、請求項１から４のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項6】

ｎが、０、１、２または３であり、各Ｒ^２が、存在する場合、独立して、フルオロ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＯＨ、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－Ｃ（Ｏ）ＮＨＣＨ_３、－ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ_２ＣＨ_３、３－メチル－１，２，４－オキサジアゾール－５－イル、１，２，４－トリアゾロ［４，３－ａ］ピリジン－３－イル、８－メチルスルホニル－１，２，４－トリアゾロ［４，３－ａ］ピリジン－３－イル、ピロリジン－１－イルカルボニル、３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニルもしくは非置換のフェニルであるか、または
異なる原子における２個のＲ^２が、それらが結合される原子およびいずれかの介在する環原子と一緒になって、環を形成し、これが、両方のＲ^２が結合されるピペリジン環と一緒になって、

【化35】

であるか、または
同じ環原子に結合される２個のＲ^２が一緒になって、オキソを形成するか、もしくはそれらが結合される原子と一緒になって、環を形成し、これが、両方のＲ^２が結合されるピペリジン環と一緒になって、

【化36】

である、請求項１から５のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項7】

ｎが、０、１、２または３であり、各Ｒ^２が、存在する場合、独立して、フルオロ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＯＨ、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－Ｃ（Ｏ）ＮＨＣＨ_３、－ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ_２ＣＨ_３、３－メチル－１，２，４－オキサジアゾール－５－イル、１，２，４－トリアゾロ［４，３－ａ］ピリジン－３－イル、８－メチルスルホニル－１，２，４－トリアゾロ［４，３－ａ］ピリジン－３－イル、ピロリジン－１－イルカルボニル、３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニルもしくは非置換のフェニルであるか、または
異なる原子における２個のＲ^２が、それらが結合される原子およびいずれかの介在する環原子と一緒になって、環を形成し、これが、両方のＲ^２が結合されるピペリジン環と一緒になって、

【化37】

であるか、または
同じ環原子に結合される２個のＲ^２が一緒になって、オキソを形成するか、もしくはそれらが結合される原子と一緒になって、環を形成し、これが、両方のＲ^２が結合されるピペリジン環と一緒になって、

【化38】

である、請求項１から６のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項8】

ｎが０である、請求項２に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項9】

Ｒ^３が水素である、請求項１から８のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項10】

Ｒ^４が、クロロ、フルオロ、ブロモ、ヨード、シクロプロピル、－ＣＮ、－ＣＦ_３、－ＣＨ_２ＣＦ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２Ｆ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－ＣＨ_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－ＯＣＨ_３、－ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ_３、－ＣＨ＝ＣＨ_２、－Ｃ（Ｏ）ＣＨ_３、－ＯＣＨＦ_２、Ｓ－ＣＨ_３、－Ｓ－ＣＨＦ_２、－Ｓ－ＣＦ_３または－Ｃ≡ＣＨである、請求項１から９のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項11】

各Ｒ^７が、水素、フルオロ、クロロ、ブロモ、－ＣＮ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２Ｃ（ＣＨ_３）_２ＯＨ、－Ｃ（Ｏ）－ＣＨ_３、－Ｃ（Ｏ）ＯＨ、－Ｃ（Ｏ）－ＮＨ－ＣＨ_３、－Ｐ（＝Ｏ）（ＯＣＨ_２ＣＨ_３）_２、－Ｐ（＝Ｏ）（ＯＣＨ_２ＣＨ_３）ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_３、－Ｐ（Ｏ）－（ＣＨ_３）_２、－Ｐ（Ｏ）－（ＣＨ_２ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_２Ｆ、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨＦ_２、－ＳＣＨＦ_２、－Ｓ（Ｏ）ＣＨＦ_２、－Ｓ（Ｏ）ＯＨ、－Ｓ（Ｏ）_２ＯＨ、－Ｓ（Ｏ）_２ＮＨＣＨ_３、－（ＣＨ_２）_４ＣＨ_３、－ＣＨ_２Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２－ＣＨ_２ＣＨ_３、１Ｈ－ピラゾール－４－イル、１－メチルピラゾール－４－イル、１，３－ジメチル－ピラゾール－４－イル、５－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル、１－メチル－２－オキソイミダゾリジン－３－イル、４－メチルイミダゾール－１－イル、モルホリン－４－イル、ピリジン－４－イル、ピリダジン－４－イル、４－ヒドロキシシクロヘキシル、４－ヒドロキシ－４－メチルシクロヘキシル、５－メチル－１，２，４－トリアゾール－３－イル、５－メチル、１，２，４－オキサジアゾール－３－イル、１，３－ジメチルピリダジン－４－イル、１，５－ジメチルピリダジン－４－イル、３－メチル－１Ｈ－ピリダジン－４－イル、１－（２－メチル－２－ヒドロキシプロピル）ピリダジン－４－イル、イミダゾール－１－イル、１－メチル－５－シアノピロール－３－イル、５－シアノ－１Ｈ－ピロール－３－イル、およびピリダジン－４－イル、１Ｈ－ピラゾール－３－イル、１－ジフルオロメチル－ピラゾール－３－イル、１－ジフルオロメチル－ピラゾール－４－イル、１－メチルピラゾール－３－イル、３－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル、３－メチル－３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニル、３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニル、４－ヒドロキシシクロヘキシル、４－ヒドロキシシクロヘキサ－１－エニル、１，１－ジオキソチオモルホリン－４－イル、４－シアノ－１Ｈ－イミダゾール－１－イル、２，３－ジメチル－１，２，４－トリアゾール－５－イル、１，５－ジメチル－ピラゾール－４－イル、ピリジン－３－イル、１－（２－メチル－２－ヒドロキシプロパン－１－イル）ピラゾール－４－イル、ピロリジン－１－イル、ピロリジン－１－イルカルボニル、１Ｈ－ピラゾール－２－イル、３－ヒドロキシ－３－トリフルオロメチルピロリジン－１－イルカルボニル、３－メトキシピロリジン－１－イルカルボニル、３－シアノピロリジン－１－イルカルボニル、４－ヒドロキシ－４－メチルピペリンジン（ｍｅｔｈｙｌｐｉｐｅｒｉｎｄｉｎ）－１－イルカルボニル、３－オキソピロリジン－１－イルカルボニル、３－（ピロリジン－１－イルカルボニル）フェニル、３－フェノキシフェニル、チアゾール－２－イル、ピラジン－２－イル、２，４－ジオキソ－１Ｈ，３Ｈ－ピリミジン－５－イル、３－メチル－３－ヒドロキシピロリジン－１－イルスルホニル、５－フルオロピリジン－３－イル、２－ヒドロキシピリジン－３－イル、３，３－ジフルオロ－４－ヒドロキシ、３，５－ジメチルオキサゾール－４－イル、３－フルオロフェニル、４－メチルピリジン－３－イル、２－ヒドロキシメチルピリジン－３－イル、６－ヒドロキシメチルピリジン－２－イル、５－ヒドロキシメチルピリジン－３－イル、１－メチル－６－オキソピリジン－３－イル、４－アミノスルホニルフェニル、３－アミノスルホニルフェニル、３－ヒドロキシ－３－エチルピロリジン－１－イルカルボニル、３－シアノ－４－ヒドロキシフェニル、ベンゾ［ｄ］チアゾール－６－イル、２Ｈ－インダゾール－６－イル、１Ｈ－ベンゾイミダゾール－５－イル、２－オキソ－３－シアノ－４－メチルピリジン－５－イル、２－アミノベンゾ［ｄ］チアゾール－２－イル、３－アミノカルボニルフェニル、６－トリフルオロメチル－１Ｈ－ピロロ［３，２－ｃ］ピリジン－３－イル、２－アミノキナゾリン－８－イル、スチリル、１－メチル－１Ｈ－インダゾール－６－イル、２，３－ジヒドロベンゾ［ｂ］［１，４］ジオキシン－７－イル、２－エトキシフェニル、３－（２－ヒドロキシエチル）フェニル、３－（メチルカルボニルアミノメチル）フェニル、１－メチル－６－トリフルオロメチル－１Ｈ－ピロロ［３，２－ｃ］ピリジン－３－イル、キノリン－４－イル、イソキノリン－５－イル、イソキノリン－７－イル、または２－オキソ－３，４－ジヒドロキノリン－７－イルである、請求項１から１０のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項12】

Ｒ^５’が、水素、Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－（Ｃ_０～Ｃ_３アルキレン）－アリールまたは－（Ｃ_１～Ｃ_３アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）である、請求項１から１１のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項13】

Ｒ^６が、水素またはメチルである、請求項１から１２のいずれか一項に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項14】

前記化合物が、式（ＩＩ）の化合物：

【化39】

または薬学的に許容されるその塩であり、式中、
Ｙ^３は、ＮまたはＣ（Ｒ^７ｅ）であり、
Ｒ^２ａおよびＲ^２ｂの各々は独立して、水素もしくはＣ_１～Ｃ_３アルキルであるか、または
Ｒ^２ａおよびＲ^２ｂは一緒になって、ピペリジン環にスピロ縮合されたシクロアルキルもしくは複素環を形成し、前記シクロアルキルもしくは複素環は、１つもしくは複数の独立して選択されたＣ_１～Ｃ_４アルキルもしくはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
Ｒ^７ｄは、水素、－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－ＣＮ、または１つもしくは複数の独立して選択されたＣ_１～Ｃ_４アルキルもしくはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルにより必要に応じて置換されたヘテロアリールであり、
Ｒ^７ｅは、存在する場合、水素、ハロ、－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－Ｃ（Ｏ）ＮＨ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＮＨ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、または１つもしくは複数の独立して選択されたＣ_１～Ｃ_４アルキルもしくはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルにより必要に応じて置換されたヘテロアリールであり、
Ｒ^１４は、Ｃ_１～Ｃ_３アルキルまたはＣ_１～Ｃ_３ハロアルキルである、
請求項１に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項15】

Ｒ^２ａが、水素または－ＣＨ_３であり、
Ｒ^２ｂが、水素または－ＣＨ_３であり、
Ｒ^７ｄが、水素、－ＣＮ、ピラジン－２－イル、チアゾール－２－イルまたは３，５－ジメチルイソオキサゾール－４－イルであり、
Ｒ^７ｅが、存在する場合、水素、フルオロ、－Ｃ（Ｏ）ＮＨＣＨ_３、－Ｐ（Ｏ）（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、１，３－ジメチルピラゾール－４－イルまたはピリダジン－４－イルであり、
Ｒ^１４が、－ＣＨ_２ＣＨ_３または－ＣＦ_３である、
請求項１４に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項16】

選択された患者におけるがんの処置における、構造式（ＩＶ）：

【化40】

の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用であって、式中、
Ｒ^１５は、水素、各々１～３個のハロゲンによって必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_６アルキルもしくはＣ_３～Ｃ_６シクロアルキルであり、
Ｒ^１６は、水素、ハロゲン、Ｃ_１～Ｃ_６アルキルまたはＣ_１～Ｃ_６ハロアルキルであり、
Ｒ^１７は、ハロゲン、－ＣＮ、Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、Ｃ_３～Ｃ_６シクロアルキルおよびＣ_１～Ｃ_６ハロアルキルからなる群から選択される１～３個の置換基で必要に応じて置換されたフェニルであり、前記患者が、
（ａ）ＲＢ１、ＲＢＬ１、ＲＢＬ２、ＣＤＫＮ２Ａ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＣＤＫＮ１ＣおよびＦＢＷＸ７から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に欠失している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているタンパク質をコードする、
（ｂ）Ｅ２Ｆ１、Ｅ２Ｆ２、Ｅ２Ｆ３、Ｅ２Ｆ４、Ｅ２Ｆ５、Ｅ２Ｆ６、Ｅ２Ｆ７、Ｅ２Ｆ８、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＤ１、ＣＣＮＤ２、ＣＣＮＤ３、ＣＣＮＥ１およびＣＣＮＥ２から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に獲得もしくは増幅されている、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が増大しているタンパク質をコードする、または
（ｃ）遺伝子Ｂｃｌ２様１が、変異している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているＢＣＬ－ｘＬタンパク質をコードする
がんを有すると決定されている、使用。

【請求項17】

Ｒ^１５が、水素、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキルまたはＣ_３～Ｃ_６－シクロアルキルである、請求項１６に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項18】

Ｒ^１６が、水素またはハロゲンである、請求項１６または請求項１７に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項19】

Ｒ^１７が、ハロゲンおよび－ＣＮからなる群から選択される１個の置換基により必要に応じて置換されたフェニルである、請求項１６から１８のいずれかに記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項20】

Ｒ^１５が、水素、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキルまたはＣ_３～Ｃ_６－シクロアルキルであり、Ｒ^１６が、水素またはハロゲンであり、Ｒ^１７が、ハロゲンおよび－ＣＮからなる群から選択される１個の置換基により必要に応じて置換されたフェニルである、請求項１６に記載の化合物または薬学的に許容されるその塩の使用。

【請求項21】

選択された患者におけるがんの処置における、化合物

【化41】

または薬学的に許容されるその塩の使用であって、前記患者が、
（ａ）ＲＢ１、ＲＢＬ１、ＲＢＬ２、ＣＤＫＮ２Ａ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＣＤＫＮ１ＣおよびＦＢＷＸ７から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に欠失している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているタンパク質をコードする、
（ｂ）Ｅ２Ｆ１、Ｅ２Ｆ２、Ｅ２Ｆ３、Ｅ２Ｆ４、Ｅ２Ｆ５、Ｅ２Ｆ６、Ｅ２Ｆ７、Ｅ２Ｆ８、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＤ１、ＣＣＮＤ２、ＣＣＮＤ３、ＣＣＮＥ１およびＣＣＮＥ２から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に獲得もしくは増幅されている、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が増大しているタンパク質をコードする、または
（ｃ）遺伝子Ｂｃｌ２様１が、変異している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているＢＣＬ－ｘＬタンパク質をコードする
がんを有すると決定されている、使用。

【請求項22】

選択された患者におけるがんの処置における、化合物

【化42】

またはＹＫＬ－５－１２４もしくはＹＫＬ－５－１６７の薬学的に許容される塩の使用であって、前記患者が、
（ａ）ＲＢ１、ＲＢＬ１、ＲＢＬ２、ＣＤＫＮ２Ａ、ＣＤＫＮ２Ｂ、ＣＤＫＮ２Ｃ、ＣＤＫＮ２Ｄ、ＣＤＫＮ１Ａ、ＣＤＫＮ１Ｂ、ＣＤＫＮ１ＣおよびＦＢＷＸ７から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に欠失している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているタンパク質をコードする、
（ｂ）Ｅ２Ｆ１、Ｅ２Ｆ２、Ｅ２Ｆ３、Ｅ２Ｆ４、Ｅ２Ｆ５、Ｅ２Ｆ６、Ｅ２Ｆ７、Ｅ２Ｆ８、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＤ１、ＣＣＮＤ２、ＣＣＮＤ３、ＣＣＮＥ１およびＣＣＮＥ２から選択される遺伝子が、変異している、遺伝的に獲得もしくは増幅されている、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が増大しているタンパク質をコードする、または
（ｃ）遺伝子Ｂｃｌ２様１が、変異している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで翻訳され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているＢＣＬ－ｘＬタンパク質をコードする
がんを有すると決定されている、使用。

【請求項23】

前記がんが、血液がん、好ましくは急性骨髄性白血病（ＡＭＬ）、乳がん、好ましくはトリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）またはホルモン受容体ポジティブ（ＨＲ＋）乳がん、ユーイング肉腫、卵管がん、ＧＩ管がん、好ましくは結腸直腸がん、神経膠腫、肺がん、好ましくは非小細胞肺がん、黒色腫、骨肉腫、卵巣がん、好ましくは高悪性度漿液性卵巣がん、上皮性卵巣がんまたは明細胞卵巣がん、膵臓がん、原発性腹膜がん、前立腺がん、網膜芽細胞腫または頭頸部扁平上皮細胞がんである、必要に応じて医薬組成物内にある、先行する請求項のいずれかに記載の化合物の使用。

【請求項24】

前記患者が、遺伝子Ｂｃｌ２様１が、変異している、エピジェネティックな変化を含有する、転座している、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写される、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているＢＣＬ－ｘＬタンパク質をコードする、好ましくは前記がんにおけるＢｃｌ２様１ ｍＲＮＡのレベルが、前記所定の閾値レベルに等しいかまたはそれより低い、がんを有すると決定されており、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項２３に記載の化合物の使用。

【請求項25】

前記患者が、Ｂｃｌ－２阻害剤、好ましくはＡＰＧ－１２５２、ＡＰＧ－２５７５、ＢＰ１００２（プレキシゲベルセン）、オブリメルセン（Ｇ３１３９）として知られているアンチセンスオリゴヌクレオチド、Ｓ５５７４６／ＢＣＬ２０１、またはベネトクラックスによる処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けるように処方されている、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項２３または請求項２４に記載の化合物の使用。

【請求項26】

前記Ｂｃｌ－２阻害剤が、ベネトクラックスであり、そして／または前記患者が、乳がん、好ましくはＴＮＢＣ；血液がん、好ましくはＡＭＬ；卵巣がん；または肺がん、好ましくは非小細胞肺がんを有する、請求項２５に記載の化合物の使用。

【請求項27】

前記患者が、
（ａ）ＲＢ１またはＣＤＫＮ２Ａが、変異しており、エピジェネティックな変化を含有し、転座しており、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写され、または所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベルで転写され、もしくは参照標準に対して活性が低下しているタンパク質をコードする、好ましくはＲＢ１またはＣＤＫＮ２Ａ ｍＲＮＡ、好ましくはＲＢ１ ｍＲＮＡが、所定の閾値に等しいまたはそれ未満である、および／または
（ｂ）ＣＤＫ６、ＣＣＮＤ２またはＣＣＮＥ１が、変異しており、コピー数変化を有し、エピジェネティックな変化を含有し、転座しており、所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで転写され、または所定の閾値に等しいもしくはそれより高いレベルで転写され、もしくは参照標準に対して活性が増大しているタンパク質をコードする、好ましくはＣＤＫ６、ＣＣＮＤ２またはＣＣＮＥ１ ｍＲＮＡ、好ましくはＣＣＮＥ１ ｍＲＮＡが、所定の閾値レベルに等しいまたはそれより高い、
がんを有すると決定されている、請求項２３または請求項２４に記載の化合物の使用。

【請求項28】

前記患者が、選択的エストロゲン受容体モジュレーター（ＳＥＲＭ）、好ましくはタモキシフェン、ラロキシフェンまたはトレミフェン；選択的エストロゲン受容体ディグレーダー（ＳＥＲＤ）、好ましくはフルベストラント；またはＰＡＲＰ阻害剤、好ましくはオラパリブまたはニラパリブ；またはシスプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、カルボプラチン、フェナントリプラチン、ピコプラチン、サトラプラチン（ＪＭ２１６）もしくは四硝酸トリプラチン、好ましくはカルボプラチンまたはオキサリプラチンなどの白金をベースとする治療剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を処方されている、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項２３または請求項２４に記載の化合物の使用。

【請求項29】

ＳＥＲＭまたはＳＥＲＤによる処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けるよう処方されている前記患者が、ＨＲ＋乳がんを有し；ＰＡＲＰ阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けるよう処方されている前記患者が、乳がん、好ましくはＴＮＢＣまたはＨｅｒ２^＋／ＥＲ^－／ＰＲ^－乳がん、卵管がん、神経膠腫、卵巣がん、好ましくは上皮性卵巣がんまたは原発性腹膜がんを有し；または白金をベースとする治療剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けるよう処方されている前記患者が、卵巣がんを有する、請求項２８に記載の化合物の使用。

【請求項30】

前記患者が、ＡＢＢＶ－０７５、ＢＡＹ－２９９、ＢＡＹ－１２３８０９７、ＢＭＳ－９８６１５８、ＣＰＩ－０６１０、ＣＰＩ－２０３、ＦＴ－１１０１、ＧＳ－５８２９、ＧＳＫ－２８２０１５１、ＧＳＫ－５２５７６２、Ｉ－ＢＥＴ１５１、Ｉ－ＢＥＴ７６２、ＩＮＣＢ０５４３２９、ＪＱ１、ＭＳ４３６、ＯＴＸ０１５、ＰＦＩ－１、ＰＬＸ５１１０７、ＲＶＸ２１３５、ＴＥＮ－０１０、ＺＥＮ－３６９４または米国出願第１２／８１０，５６４号に開示されている化合物などのＢＥＴ阻害剤；ＢＰＩ－１１７８、Ｇ１Ｔ３８、パルボシクリブ、リボシクリブ、ＯＮ１２３３００、トリラシクリブまたはアベマシクリブ、好ましくはパルボシクリブなどのＣＤＫ４／６阻害剤；ＣＤＸ－３０１、ＣＧ’８０６、ＣＴ０５３ＰＴＳＡ、クレノラニブ（例えば、ベシル酸クレノラニブ）、ＥＮＭＤ－２０７６、ＦＦ－１０１０１－０１、ＦＬＹＳＹＮ、ギルテリチニブ（ＡＳＰ２２１５）、ＨＭ４３２３９、レスタウチニブ、ポナチニブ、ＮＭＳ－０８８、ソラフェニブ、スニチニブ、パクリチニブ、ペキシダルチニブ／ＰＬＸ３３９７、クイザルチニブ、ミドスタウリン、ＳＥＬ２４、ＳＫＩ－Ｇ－８０１またはＳＫＬＢ１０２８、好ましくはクレノラニブ、ギルテリチニブもしくはミドスタウリンなどのＦＬＴ３阻害剤；またはトラメチニブなどのＭＥＫ阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けるように処方されている、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項２３または請求項２４に記載の化合物の使用。

【請求項31】

ＣＤＫ４／６阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を処方されている前記患者が、乳がん、好ましくはＴＮＢＣまたはエストロゲン受容体－ポジティブ（ＥＲ^＋）乳がん、膵臓がんまたは頭頸部扁平上皮細胞がんを有し；ＦＬＴ３阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けるように処方されている前記患者が、血液がん、好ましくはＡＭＬを有し；ＢＥＴ阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を処方されている前記患者が、乳がん、好ましくはＴＮＢＣ、血液がん、好ましくはＡＭＬ、ユーイング肉腫または骨肉腫を有する、請求項３０に記載の化合物の使用。

【請求項32】

前記患者が、第２の抗がん剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を処方されている、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項１から２０のいずれか一項に記載の化合物の使用。

【請求項33】

前記第２の抗がん剤が、ＡＰＧ－１２５２、ＡＰＧ－２５７５、ＢＰ１００２（プレキシゲベルセン）、オブリメルセン（Ｇ３１３９）として知られているアンチセンスオリゴヌクレオチド、Ｓ５５７４６／ＢＣＬ２０１またはベネトクラックスなどのＢｃｌ－２阻害剤；アルボシジブ／ＤＳＰ－２０３３／フラボピリドール、ＡＴ７５１９、ＡＺＤ５５７６、ＢＡＹ１２５１１５２、ＢＡＹ１１４３５７２、ＣＹＣ０６５、ナノフラボピリドール、ＮＶＰ２、セリシクリブ（ＣＹＣ２０２）、ＴＧ０２、ＴＰ－１２８７、ＶＳ２－３７０またはボルシクリブ（以前のＰ１４４６Ａ－０５）などのＣＤＫ９阻害剤；フルベストラントなどのホルモン受容体（例えば、エストロゲン受容体）分解剤；ＣＤＸ－３０１、ＣＧ’８０６、ＣＴ０５３ＰＴＳＡ、クレノラニブ（例えば、ベシル酸クレノラニブ）、ＥＮＭＤ－２０７６、ＦＦ－１０１０１－０１、ＦＬＹＳＹＮ、ギルテリチニブ（ＡＳＰ２２１５）、ＨＭ４３２３９、レスタウチニブ、ポナチニブ、ＮＭＳ－０８８、ソラフェニブ、スニチニブ、パクリチニブ、ペキシダルチニブ／ＰＬＸ３３９７、クイザルチニブ、ミドスタウリン、ＳＥＬ２４、ＳＫＩ－Ｇ－８０１またはＳＫＬＢ１０２８などのＦｌｔ３（ＦＭＳ様チロシンキナーゼ３）阻害剤；オラパリブ、ルカパリブ、タラゾパリブ、ベリパリブ（ＡＢＴ－８８８）またはニラパリブなどのＰＡＲＰ阻害剤；ＡＢＢＶ－０７５、ＢＡＹ－２９９、ＢＡＹ－１２３８０９７、ＢＭＳ－９８６１５８、ＣＰＩ－０６１０、ＣＰＩ－２０３、ＦＴ－１１０１、ＧＳ－５８２９、ＧＳＫ－２８２０１５１、ＧＳＫ－５２５７６２、Ｉ－ＢＥＴ１５１、Ｉ－ＢＥＴ７６２、ＩＮＣＢ０５４３２９、ＪＱ１、ＭＳ４３６、ＯＴＸ０１５、ＰＦＩ－１、ＰＬＸ５１１０７、ＲＶＸ２１３５、ＴＥＮ－０１０、ＺＥＮ－３６９４または米国出願第１２／８１０，５６４号（現在は、米国特許第８，４７６，２６０号）に開示されている化合物などのＢＥＴ阻害剤；シスプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、カルボプラチン、フェナントリプラチン、ピコプラチン、サトラプラチン（ＪＭ２１６）または四硝酸トリプラチンなどの白金をベースとする治療剤；ＢＰＩ－１１７８、Ｇ１Ｔ３８、パルボシクリブ、リボシクリブ、ＯＮ１２３３００、トリラシクリブまたはアベマシクリブなどのＣＤＫ４／６阻害剤；トラメチニブなどのＭＥＫ阻害剤；または必要に応じてクラスＩ（例えば、クラスＩＡ）の、および／もしくは特定のＰＩ３Ｋアイソフォームを必要に応じて指向するホスホイノシチド３－キナーゼ（ＰＩ３キナーゼ）阻害剤（イデラリシブ、コパンリシブ、デュベリシブまたはアルペリシブなど）；またはカペシタビンである、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項３２に記載の化合物の使用。

【請求項34】

前記第２の薬剤が、ベネトクラックスなどのＢｃｌ－２阻害剤、オラパリブまたはニラパリブなどのＰＡＲＰ阻害剤、カルボプラチンまたはオキサリプラチンなどの白金をベースとする抗がん剤、パクリタキセルなどのタキサン、パルボシクリブ、リボシクリブ、アベマシクリブまたはトリラシクリブなどのＣＤＫ４／６阻害剤、タモキシフェンなどの選択的エストロゲン受容体モジュレーターまたはフルベストラントなどの選択的エストロゲン受容体ディグレーダーから選択される、必要に応じて医薬組成物内にある、請求項３３に記載の化合物の使用。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

関連出願の相互参照
本出願は、２０１９年１０月２９日出願の米国仮出願第６２／９２７，５６１号の出願日の利益を主張するものであり、その内容は、これによりその全体が参照により本明細書に組み込まれる。

【背景技術】

【0002】

発明の背景
健康管理の長期的な進化が、バイオマーカー分析の有望性が実現され始めているという時期に到達している。医師が、患者を、多数の類似した生理的特徴を共有しかつ所与の疾患の共通する症状を示す患者でさえも、さらに特定のグループに階層化することができると、医師は処置を一層、良好に調節して、各患者に対する転帰を最適化することができる。しかし、分子診断法の開発は難題であり、実用化されていない。

【発明の概要】

【課題を解決するための手段】

【0003】

発明の概要
本発明は、とりわけ、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤による処置についてがん患者を特定する診断方法（すなわち、処置について患者を選択する診断方法）、および特定された患者を、このような阻害剤を単独で、またはさらに以下に記載されている１種または複数の追加の治療剤（例えば、第２の抗がん剤）と組み合わせて用いて処置する方法を特徴とする。本診断方法は、以下にさらに示されかつ記載されている、本明細書に記載のＣＤＫ７阻害剤による処置に十分に応答する可能性が高いがんに罹患している患者を特定するステップを含む。本処置法は、特定された患者へのこのようなＣＤＫ７阻害剤を投与するステップであって、患者の応答が、例えば、有意な腫瘍成長阻害（ＴＧＩ；例えば、約８０～９０％を超えるＴＧＩであり、そして／または処置の停止後でさえ腫瘍抑制が継続される）であり得る、ステップを含む。したがって、本発明は、患者が処置に対する良好な候補となる診断されるだけの方法（すなわち、処置を特定する）、処置に対する良好な候補になると決定された患者（例えば、既に特定された）が処置される方法、および患者が本明細書に記載されている通りの診断および処置の両方を受ける必要がある方法を包含する。

【0004】

「本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤」について参照する場合、式（Ｉ）の化合物：

【化1】

または薬学的に許容されるその塩（式中、
環Ａは、

【化2】

から選択される二環式６，５－環系であり、４個以下の環窒素原子を含み、
Ｘは、ＮまたはＣ（Ｒ^６）であり、Ｒ^６は、水素、－ＣＮ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２Ｆ、－ＣＨＦ_２または－ＣＦ_３であり、
各Ｙは独立して、ＮまたはＣ（Ｒ^７）であり、Ｒ^７は、水素またはＲ^５であり、
Ｚは、ＮまたはＣ（Ｒ^８）であり、Ｒ^８は、水素またはフルオロであり、
Ｒ^１は、水素、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ＮＲ^１’－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ＮＲ^１’－ＳＯ_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）または－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２であり、Ｒ^１のいずれかのアルキル、アルキレン、シクロアルキル、ヘテロシクリルまたはヘテロアリール部分は、必要に応じて置換されており、
各Ｒ^１’は独立して、水素もしくは必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_６アルキルであるか、または
２個のＲ^１’は、それらが結合される窒素原子と必要に応じて一緒になって、Ｎ、ＯおよびＳから選択される最大２個の追加のヘテロ原子を含む４～６員の必要に応じて置換されたヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成し、
各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、ハロ、－ＯＨ、－ＣＮ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－アリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロアリール、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル）；－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）；－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロシクリル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロアリールもしくは－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－アリールであるか、または
Ｒ^１およびいずれかのＲ^２は、それらが結合される原子と一緒になって、ピペリジン環に縮合、スピロ縮合もしくは架橋された、必要に応じて置換されたヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成するか、または
２個のＲ^２は一緒になって、オキソ（＝Ｏ）を形成するか、もしくはそれらが結合される原子（単数または複数）およびいずれかの介在する環原子と一緒になって、ピペリジン環に縮合、スピロ縮合もしくは架橋された、必要に応じて置換されたアリール、シクロアルキル、ヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成し、
Ｒ^２のいずれかのアルキル、アルキレン、シクロアルキル、ヘテロシクリルもしくはヘテロアリール部分、Ｒ^１をＲ^２と一緒にすることによって形成されたいずれかの環、または２個のＲ^２を一緒にすることによって形成されたいずれかの環は、必要に応じて置換されており、
Ｒ^３は、水素、ハロ、－ＣＮ、必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_６アルキルまたは必要に応じて置換されたＣ_３～Ｃ_８シクロアルキルであり、
Ｒ^４は、ハロ、－ＣＮ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｃ_２～Ｃ_６アルケニル、Ｃ_２～Ｃ_６アルキニル、－Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｓ－Ｃ_１～Ｃ_６アルキルまたはＣ_３～Ｃ_８シクロアルキルであり、Ｒ^４のいずれかのアルキル、アルケニルまたはアルキニル部分は、必要に応じて置換されており、
各Ｒ^５は独立して、ハロ、－ＯＨ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－ＣＮ、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）ＯＨ、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）（Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－ヘテロアリール、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル）、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－Ｏ－（Ｃ_０～Ｃ_６－アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロシクリル、もしくは－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－ヘテロアリールであり、Ｒ^５のいずれかのアルキル、アルキレン、シクロアルキル、ヘテロシクリルおよびヘテロアリール部分は、必要に応じて置換されているか、または
２個の隣接Ｒ^５は、それらが結合される環原子と一緒になって、必要に応じて置換されたシクロアルキルもしくは必要に応じて置換されたヘテロシクリルを形成し、各シクロアルキルもしくはヘテロシクリルは、環Ａに縮合されており、
Ｒ^５’は、水素、－ＣＮ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－アリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロシクリル、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－ヘテロアリール、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_３アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－（Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－ヘテロアリール、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｏ－ヘテロシクリル、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｐ（Ｏ）－（Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、または－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｃ（Ｏ）ＯＨであり、Ｒ^５’のいずれかのアルキル、アルキレン、シクロアルキル、ヘテロシクリルまたはヘテロアリール部分は、必要に応じて置換されており、
ｎは、０、１、２、３または４である）を含む、本明細書に記載されているもののいずれか１つを含む化合物を意味するものとする。疑念がある場合には、このような化合物の各々は、後述する実施形態および別個の化合物の各々と同様に、「本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤」である。

【0005】

様々な実施形態では、Ｒ^１は、－Ｃ（Ｏ）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキル）または－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリルであり、カルボシクリルは、必要に応じて置換されている。

【0006】

様々な実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、－ＮＨ－Ｃ（Ｏ）－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－Ｃ（Ｏ）－ＮＨ－（非置換のＣ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリルまたは－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキレン）－カルボシクリルであり、各アルキレンまたはカルボシクリルは、必要に応じて置換されている。

【0007】

一部の実施形態では、Ｒ^３はその上、必要に応じて置換されたカルボシクリルから選択される。

【0008】

一部の実施形態では、Ｒ^４はその上、必要に応じて置換されたカルボシクリルから選択される。

【0009】

一部の実施形態では、各Ｒ^５はその上、－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－カルボシクリル、－Ｏ－（Ｃ_０～Ｃ_６－アルキレン）－カルボシクリル、フェニル、－（Ｃ_２～Ｃ_４アルケニレン）－フェニル、－Ｓ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ（Ｏ）－ＯＨおよび－Ｓ（Ｏ）_２－ＯＨから選択され、いずれかのアルキル、アルキレン、アルケニレン、カルボシクリルまたはフェニルは、必要に応じて置換されている。

【0010】

一部の実施形態では、Ｒ^５’およびいずれかのＲ^５は、それらが結合される環原子と一緒になって、必要に応じて置換されたヘテロシクリルを形成し、各ヘテロシクリルは、環Ａに縮合されている。

【0011】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、

【化3】

または前述の薬学的な塩ではない。

【0012】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、

【化4】

または前述のいずれかの薬学的に許容される塩ではない。

【0013】

一部の実施形態では、環Ａは、

【化5】

である。

【0014】

一部の実施形態では、環Ａは、インドール－３－イルまたはインダゾール－３－イルである。一部の実施形態では、環Ａは、インドール－３－イルである。一部の実施形態では、環Ａは、

【化6】

である。

【0015】

一部の実施形態では、Ｒ^１のいずれかのアルキルまたはアルキレン部分は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基（例えば、このような置換基は、＝Ｏを含まない）により必要に応じて置換されている。

【0016】

一部の実施形態では、Ｒ^１のいずれかのヘテロシクリルまたはヘテロアリール部分は、ハロ、Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、Ｃ_３～Ｃ_６シクロアルキル、－ＯＨ、＝Ｏ、－ＣＮ、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ^１’）_２、－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）および－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２から独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じてかつ独立して置換されており；Ｒ^１のいずれかのアルキル、アルキレンもしくはシクロアルキル部分またはそこに置かれた置換基は、フッ素、ＯＨおよびＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されている。

【0017】

一部の実施形態では、Ｒ^１は、水素、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_６－アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ＮＲ^１’－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－ＮＲ^１’－ＳＯ_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－（Ｃ_１～Ｃ_６アルキレン－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２または－（Ｃ_０～Ｃ_６アルキレン）－（Ｃ_３～Ｃ_８シクロアルキル）であり、Ｒ^１のいずれかのアルキルまたはアルキレン部分は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されており、Ｒ^１のいずれかのシクロアルキル部分は、１つまたは複数の独立して選択される置換基により必要に応じて置換されており；各Ｒ^１’は独立して、水素または必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_６アルキルである（すなわち、２個のＲ^１’は、一緒になって環を形成することができない）。

【0018】

一部の実施形態では、Ｒ^１は、水素、シクロプロピル、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２もしくは－ＣＨ_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２であるか、またはＲ^１は、１個のＲ^２および各々が付着される環原子と一緒になって、架橋された環を形成し、これは、Ｒ^１およびＲ^２が結合される環と一緒になって、

【化7】

を形成する。一部の実施形態では、Ｒ^１は、水素、－ＣＨ_３または－ＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３である。一部の実施形態では、Ｒ^１は、水素である。

【0019】

一部の実施形態では、いずれかのＲ^１’における各アルキルは、フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されている。

【0020】

一部の実施形態では、２個のＲ^１’から形成されるいずれかのヘテロシクリルおよびヘテロアリール環は、ハロ；Ｃ_１～Ｃ_４アルキル；フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されているＣ_３～Ｃ_６シクロアルキル；－ＯＨ；＝Ｏ；－ＣＮ；－Ｃ（Ｏ）ＮＨ_２；－Ｃ（Ｏ）ＮＨ（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）；－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２；－Ｓ（Ｏ）_２－Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル；－Ｓ（Ｏ）_２－ＮＨ_２；－Ｓ（Ｏ）_２－ＮＨ（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）；ならびに－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２から独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されており、２個のＲ^１’から形成されたいずれかのヘテロシクリルおよびヘテロアリール環における置換基のいずれかのアルキル部分は、フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数のさらなる置換基により必要に応じて置換されている。

【0021】

一部の実施形態では、Ｒ^２のいずれかのアルキル、アルキレンまたはアリール部分は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されている。例えば、Ｒ^２のいずれかのアルキル、アルキレン、アリール、シクロアルキル、ヘテロシクリルもしくはヘテロアリール部分、Ｒ^１をＲ^２と一緒にすることによって形成されたいずれかの環、または２個のＲ^２を一緒にすることによって形成されたいずれかの環は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されていてよい。

【0022】

一部の実施形態では、Ｒ^２のいずれかのヘテロシクリルおよびヘテロアリール部分は、ハロ、－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－ＯＨ、＝Ｏ、－ＣＮ、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ^１’）_２、－Ｃ（Ｏ）ＯＲ^１’、－Ｃ（Ｏ）ＯＨ、－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル）、－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２から独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されており；Ｒ^２のいずれかのアルキル、アルキレンおよびシクロアルキル部分またはそこに置かれた置換基は、フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されている。

【0023】

一部の実施形態では、２個のＲ^２が一緒になって環を形成する場合、またはＲ^１およびＲ^２が一緒になって環を形成する場合、結果として生じる環は、ハロ、Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－ＯＨ、＝Ｏ、－ＣＮ、－Ｃ（Ｏ）ＮＲ^１’_２、－Ｓ（Ｏ）_２－Ｃ_１～Ｃ_４－アルキル、－Ｓ（Ｏ）_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２から独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されており；２個のＲ^２が一緒になって環を形成する場合に、またはＲ^１およびＲ^２が一緒になる場合に形成された環における置換基のいずれかのアルキル部分は、フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されている。一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、ハロ、－ＯＨ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－ＮＨＣ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｃ（Ｏ）ＮＨ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－Ｃ（Ｏ）－（必要に応じて置換されたヘテロシクリル）、必要に応じて置換されたアリールおよび必要に応じて置換されたヘテロアリールから独立して選択されるか、または
Ｒ^１およびいずれかのＲ^２は、それらが結合される原子と一緒になって、ピペリジン環に縮合、スピロ縮合もしくは架橋された、必要に応じて置換されたヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成するか、または
２個のＲ^２は一緒になって、オキソ（＝Ｏ）を形成するか、もしくはそれらが結合される原子（単数または複数）およびいずれかの介在する環原子と一緒になって、ピペリジン環に縮合、スピロ縮合もしくは架橋された、必要に応じて置換されたアリール、シクロアルキル、ヘテロシクリルもしくはヘテロアリール環を形成し、
Ｒ^２のいずれかのアルキルまたはアルキレン部分、Ｒ^１をＲ^２と一緒にすることによって形成されたいずれかの環、または２個のＲ^２を一緒にすることによって形成されたいずれかの環は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されている。

【0024】

一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、ハロ、＝Ｏ、－ＯＨ、必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、必要に応じて置換されたフェニルまたは必要に応じて置換されたヘテロアリールである。一部の実施形態では、－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルまたはフェニルである各Ｒ^２は、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換されている。一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、ハロまたは必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルである。一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、ハロまたは１つもしくは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルである。一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、ハロである。一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルである。一部の実施形態では、各Ｒ^２は、存在する場合、１つまたは複数の独立して選択された一価置換基により必要に応じて置換された－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルである。

【0025】

一部の実施形態では、ｎは、０、１、２または３である。

【0026】

一部の実施形態では、ｎは、０、１、２または３であり、各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、フルオロ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＯＨもしくは非置換のフェニルであるか、または２個のＲ^２は一緒になって、オキソを形成する。

【0027】

一部の実施形態では、ｎは、０、１、２または３であり、各Ｒ^２は、存在する場合、独立して、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－Ｃ（Ｏ）ＮＨＣＨ_３、－ＮＨＣ（Ｏ）ＣＨ_２ＣＨ_３、３－メチル－１，２，４－オキサジアゾール－５－イル、１，２，４－トリアゾロ［４，３－ａ］ピリジン－３－イル、８－（メチルスルホニル）－１，２，４－トリアゾロ［４，３－ａ］ピリジン－３－イル、ピロリジン－１－イルカルボニルもしくは３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニルであるか；または異なる原子における２個のＲ^２は、それらが結合される原子およびいずれかの介在する環原子と一緒になって、環を形成し、これは、両方のＲ^２が結合されるピペリジン環と一緒になって、

【化8】

であるか；または同じ環原子に結合された２個のＲ^２は、それらが結合される原子と一緒になって、環を形成し、これは、両方のＲ^２が結合されるピペリジン環と一緒になって、

【化9】

である。

【0028】

一部の実施形態では、Ｒ^３の各アルキルまたはシクロアルキル部分は、１つまたは複数のフッ素により必要に応じてかつ独立して置換されている。

【0029】

一部の実施形態では、Ｒ^３は、水素である。

【0030】

一部の実施形態では、Ｒ^４のいずれかのアルキル、アルケニル、アルキニルまたはシクロアルキル部分は、－ＯＨおよびフッ素から独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じてかつ独立して置換されている。

【0031】

一部の実施形態では、Ｒ^４は、ハロ、－ＣＮ、必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_４アルキル、必要に応じて置換されたＣ_２～Ｃ_４アルキニル、必要に応じて置換された－Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキルまたは必要に応じて置換されたＣ_３～Ｃ_６シクロアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、ハロ、－ＣＮ、必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_４アルキルまたは必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、ハロ、Ｃ_１～Ｃ_４アルキルまたはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、Ｃ_１～Ｃ_４アルキルである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、Ｃ_１～Ｃ_４ハロアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、ハロである。

【0032】

一部の実施形態では、Ｒ^４は、水素または－Ｃ（Ｏ）－（必要に応じて置換されたＣ_１～Ｃ_４アルキル）である。

【0033】

一部の実施形態では、Ｒ^４は、クロロ、フルオロ、ブロモ、ヨード、シクロプロピル、－ＣＮ、－ＣＦ_３、－ＣＨ_２ＣＦ_３、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－ＣＨ_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－ＯＣＨ_３または－Ｃ≡ＣＨである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、クロロ、フルオロ、－ＣＦ_３、－ＣＨ_２ＣＦ_３、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３または－Ｃ≡ＣＨである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、クロロ、－ＣＦ_３、－ＣＨ_３または－ＣＨ_２ＣＨ_３である。一部の実施形態では、Ｒ^４は、クロロまたは－ＣＦ_３である。一部の実施形態では、Ｒ^４は、クロロである。一部の実施形態では、Ｒ^４は、－ＣＦ_３である。

【0034】

一部の実施形態では、Ｒ^４は、－ＣＨ_２ＣＨ_２Ｆ、－ＣＨ_２ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ（ＯＨ）ＣＨ_３、－ＣＨ＝ＣＨ_２、－Ｃ（Ｏ）ＣＨ_３、－ＯＣＨＦ_２、－Ｓ－ＣＨ_３、－Ｓ－ＣＨＦ_２または－Ｓ－ＣＦ_３である。

【0035】

一部の実施形態では、各Ｒ^５のいずれかのヘテロシクリルもしくはヘテロアリール部分または２個の隣接Ｒ^５が一緒になる場合に形成された環は、ハロ、－ＣＮ、Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－ＯＨ、＝Ｏ、－Ｃ（Ｏ）ＮＲ^１’_２または－ＳＯ_２－ＮＲ^１’_２から独立して選択される１または２個の置換基により必要に応じてかつ独立して置換されており；Ｒ^５のいずれかのアルキル、アルキレンおよびシクロアルキル部分、Ｒ^５における置換基、または２個のＲ^５を一緒にすることにより形成された環における置換基は、フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されている。

【0036】

一部の実施形態では、１個のＲ^５は、必要に応じて置換されたヘテロアリールまたは必要に応じて置換されたヘテロシクリルである。例えば、ヘテロアリールまたはヘテロシクリルは、ピラゾール－４－イル、イミダゾール－１－イル、モルホリン－４－イル、ピリジン－４－イル、ピリダジン－４－イル、１Ｈ－ピロール－３－イル、ピリダジン－４－イル、１，２，４－トリアゾール－３－イルまたは１，２，４－オキサジアゾール－３－イルであり；ハロ、－ＣＮ、Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－ＯＨ、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｒ^１’）_２および－ＳＯ_２－Ｎ（Ｒ^１’）_２から選択される１または２個の置換基により必要に応じて置換されている。

【0037】

一部の実施形態では、各Ｒ^７は独立して、水素、ハロ、－Ｃ_１～Ｃ_６アルキル、－ＣＮ、－Ｃ（Ｏ）ＯＨ、－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｃ（Ｏ）－Ｎ（Ｒ^１’）_２、－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）－Ｏ－Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－Ｐ（Ｏ）（Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル））_２、ヘテロシクリルまたはヘテロアリールであり、いずれかのアルキル、ヘテロシクリルまたはヘテロアリールは、必要に応じて置換されている。

【0038】

一部の実施形態では、各Ｒ^７は独立して、－Ｃ（Ｏ）－ヘテロシクリル、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ（Ｒ^１’）_２、－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキレン）－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、カルボシクリル、－Ｏ－（Ｃ_０～Ｃ_６－アルキレン）－カルボシクリル、フェニル、－（Ｃ_２～Ｃ_４アルケニレン）－フェニル、－Ｓ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ（Ｏ）－ＯＨまたは－Ｓ（Ｏ）_２－ＯＨであり、いずれかのアルキル、アルキレン、アルケニレン、カルボシクリル、フェニルまたはヘテロシクリルは、必要に応じて置換されている。

【0039】

一部の実施形態では、各Ｒ^７は独立して、水素、フルオロ、クロロ、ブロモ、－ＣＮ、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２Ｃ（ＣＨ_３）_２ＯＨ、－Ｃ（Ｏ）－ＣＨ_３、－Ｃ（Ｏ）ＯＨ、－Ｃ（Ｏ）－ＮＨ－ＣＨ_３、－Ｐ（＝Ｏ）（ＯＣＨ_２ＣＨ_３）_２、－Ｐ（＝Ｏ）（ＯＣＨ_２ＣＨ_３）ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_３、１Ｈ－ピラゾール－４－イル、１－メチルピラゾール－４－イル、１，３－ジメチル－ピラゾール－４－イル、５－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル、１－メチル－２－オキソイミダゾリジン－３－イル、４－メチルイミダゾール－１－イル、モルホリン－４－イル、ピリジン－４－イル、４－ヒドロキシシクロヘキシル、４－ヒドロキシ－４－メチルシクロヘキシル、５－メチル－１，２，４－トリアゾール－３－イル、５－メチル、１，２，４－オキサジアゾール－３－イル、１，３－ジメチルピリダジン－４－イル、１，５－ジメチルピリダジン－４－イル、３－メチル－１Ｈ－ピリダジン－４－イル、１－（２－メチル－２－ヒドロキシプロピル）ピリダジン－４－イル、イミダゾール－１－イル、１－メチル－５－シアノピロール－３－イル、５－シアノ－１Ｈ－ピロール－３－イル、またはピリダジン－４－イルである。

【0040】

一部の実施形態では、各Ｒ^７は独立して、－Ｐ（Ｏ）－（ＣＨ_３）_２、－Ｐ（Ｏ）－（ＣＨ_２ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_２Ｆ、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨＦ_２、－ＳＣＨＦ_２、－Ｓ（Ｏ）ＣＨＦ_２、－Ｓ（Ｏ）ＯＨ、－Ｓ（Ｏ）_２ＯＨ、－Ｓ（Ｏ）_２ＮＨＣＨ_３、－（ＣＨ_２）_４ＣＨ_３、－ＣＨ_２Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２－ＣＨ_２ＣＨ_３、１Ｈ－ピラゾール－３－イル、１－ジフルオロメチル－ピラゾール－３－イル、１－ジフルオロメチル－ピラゾール－４－イル、１－メチルピラゾール－３－イル、３－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル、３－メチル－３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニル、３－ヒドロキシピロリジン－１－イルカルボニル、４－ヒドロキシシクロヘキシル、４－ヒドロキシシクロヘキサ－１－エニル、１，１－ジオキソチオモルホリン－４－イル、４－シアノ－１Ｈ－イミダゾール－１－イル、２，３－ジメチル－１，２，４－トリアゾール－５－イル、１，５－ジメチル－ピラゾール－４－イル、ピリジン－３－イル、１－（２－メチル－２－ヒドロキシプロパン－１－イル）ピラゾール－４－イル、ピロリジン－１－イル、ピロリジン－１－イルカルボニル、１Ｈ－ピラゾール－２－イル、３－ヒドロキシ－３－トリフルオロメチルピロリジン－１－イルカルボニル、３－メトキシピロリジン－１－イルカルボニル、３－シアノピロリジン－１－イルカルボニル、４－ヒドロキシ－４－メチルピペリンジン（ｍｅｔｈｙｌｐｉｐｅｒｉｎｄｉｎ）－１－イルカルボニル、３－オキソピロリジン－１－イルカルボニル、３－（ピロリジン－１－イルカルボニル）フェニル、３－フェノキシフェニル、チアゾール－２－イル、ピラジン－２－イル、２，４－ジオキソ－１Ｈ，３Ｈ－ピリミジン－５－イル、３－メチル－３－ヒドロキシピロリジン－１－イルスルホニル、５－フルオロピリジン－３－イル、２－ヒドロキシピリジン－３－イル、３，３－ジフルオロ－４－ヒドロキシ、３，５－ジメチルオキサゾール－４－イル、３－フルオロフェニル、４－メチルピリジン－３－イル、２－ヒドロキシメチルピリジン－３－イル、６－ヒドロキシメチルピリジン－２－イル、５－ヒドロキシメチルピリジン－３－イル、１－メチル－６－オキソピリジン－３－イル、４－アミノスルホニルフェニル、３－アミノスルホニルフェニル、３－ヒドロキシ－３－エチルピロリジン－１－イルカルボニル、３－シアノ－４－ヒドロキシフェニル、ベンゾ［ｄ］チアゾール－６－イル、２Ｈ－インダゾール－６－イル、１Ｈ－ベンゾイミダゾール－５－イル、２－オキソ－３－シアノ－４－メチルピリジン－５－イル、２－アミノベンゾ［ｄ］チアゾール－２－イル、３－アミノカルボニルフェニル、６－トリフルオロメチル－１Ｈ－ピロロ［３，２－ｃ］ピリジン－３－イル、２－アミノキナゾリン－８－イル、スチリル、１－メチル－１Ｈ－インダゾール－６－イル、２，３－ジヒドロベンゾ［ｂ］［１，４］ジオキシン－７－イル、２－エトキシフェニル、３－（２－ヒドロキシエチル）フェニル、３－（メチルカルボニルアミノメチル）フェニル、１－メチル－６－トリフルオロメチル－１Ｈ－ピロロ［３，２－ｃ］ピリジン－３－イル、キノリン－４－イル、イソキノリン－５－イル、イソキノリン－７－イル、または２－オキソ－３，４－ジヒドロキノリン－７－イルである。

【0041】

一部の実施形態では、Ｒ^５’の各ヘテロシクリルおよびヘテロアリール部分は、ハロ、Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－ＯＨ、＝Ｏ、－ＣＮ、－Ｃ（Ｏ）ＮＲ^１’_２および－ＳＯ_２－ＮＲ^１’_２から独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されており、Ｒ^５’の各アルキル、アルキレンおよびシクロアルキル部分またはＲ^５’の置換基は、フッ素、－ＯＨおよび－ＣＮから独立して選択される１つまたは複数の置換基により必要に応じて置換されている。

【0042】

一部の実施形態では、Ｒ^５’は、水素、Ｃ_１～Ｃ_４アルキル、－（Ｃ_０～Ｃ_３アルキレン）－アリールまたは－（Ｃ_１～Ｃ_３アルキレン）－Ｏ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）である。例えば、Ｒ^５’は、水素、メチル、イソプロピル、－ＣＨ_２－Ｏ－ＣＨ_３、－（ＣＨ_２）_２－Ｏ－ＣＨ_３またはフェニルであり得る。一部の実施形態では、Ｒ^６は、水素またはメチルである。

【0043】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、式（Ｉ－ａ）の化合物：

【化10】

または薬学的に許容されるその塩（式中、環Ａ、Ｒ^１、Ｒ^２、Ｒ^３、Ｒ^４およびｎの各々は、式（Ｉ）に関して定義されている通りである）である。

【0044】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、式（Ｉ－ｂ）の化合物：

【化11】

または薬学的に許容されるその塩（式中、環Ａ、Ｒ^１、Ｒ^２、Ｒ^３、Ｒ^４およびｎの各々は、式（Ｉ）に関して定義されている通りである）である。

【0045】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、式（Ｉ－ｃ）の化合物：

【化12】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｘ、Ｒ^２、Ｒ^４、Ｒ^５’、Ｒ^７、Ｒ^８およびｎの各々は、式（Ｉ）に関して定義されている通りであり；Ｙ^１は、ＮまたはＣ（Ｒ^７ａ）であり；Ｙ^２は、ＮまたはＣ（Ｒ^７ｂ）であり；Ｘ、Ｙ^１またはＹ^２のうち１つ以下は、Ｎであり、Ｒ^７ａ、Ｒ^７ｂおよびＲ^７ｃの各々は独立して、式（Ｉ）に関して定義されている通りのＲ^７から選択される）である。

【0046】

一部の実施形態では、式（Ｉ－ｃ）の化合物は、式（Ｉ－ｃ１）の化合物：

【化13】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｒ^６もまた、式（Ｉ）に関して定義されている通りである）である。

【0047】

一部の実施形態では、式（Ｉ－ｃ）の化合物は、式（Ｉ－ｃ２）の化合物：

【化14】

または薬学的に許容されるその塩である。

【0048】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、式（ＩＩ）の化合物：

【化15】

または薬学的に許容されるその塩であり、式中、
Ｙ^３は、ＮまたはＣ（Ｒ^７ｅ）であり、
Ｒ^２ａおよびＲ^２ｂの各々は独立して、水素もしくはＣ_１～Ｃ_３アルキルであるか、または
Ｒ^２ａおよびＲ^２ｂは一緒になって、ピペリジン環にスピロ縮合されたシクロアルキルもしくは複素環を形成し、前記シクロアルキルもしくは複素環は、１つもしくは複数の独立して選択されたＣ_１～Ｃ_４アルキルもしくはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルにより必要に応じて置換されており、
Ｒ^７ｄは、水素、－Ｃ（Ｏ）－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－ＣＮ、または１つもしくは複数の独立して選択されたＣ_１～Ｃ_４アルキルもしくはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルにより必要に応じて置換されたヘテロアリールであり、
Ｒ^７ｅは、存在する場合、水素、ハロ、－Ｓ（Ｏ）_２－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｐ（Ｏ）（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－Ｃ（Ｏ）ＮＨ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｃ（Ｏ）Ｎ（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＮＨ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ－（Ｃ_１～Ｃ_４アルキル）_２、または１つもしくは複数の独立して選択されたＣ_１～Ｃ_４アルキルもしくはＣ_１～Ｃ_４ハロアルキルにより必要に応じて置換されたヘテロアリールであり、
Ｒ^１４は、Ｃ_１～Ｃ_３アルキルまたはＣ_１～Ｃ_３ハロアルキルである。

【0049】

一部の実施形態では、式（ＩＩ）の化合物は、式（ＩＩａ）の化合物：

【化16】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｙ^３、Ｒ^２ａ、Ｒ^２ｂ、Ｒ^７ｄ、Ｒ^７ｅおよびＲ^１４は、式（ＩＩ）に定義されている通りである）である。

【0050】

一部の実施形態では、式（ＩＩ）の化合物は、式（ＩＩｂ）の化合物：

【化17】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｙ^３、Ｒ^２ａ、Ｒ^２ｂ、Ｒ^７ｄ、Ｒ^７ｅおよびＲ^１４は、式（ＩＩ）に定義されている通りである）である。

【0051】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、式（ＩＩＩ）の化合物：

【化18】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｙ^３、Ｒ^２ａ、Ｒ^２ｂ、Ｒ^７ｄ、Ｒ^７ｅおよびＲ^１４は、式（ＩＩ）に定義されている通りである）である。

【0052】

一部の実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩａ）の化合物：

【化19】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｙ^３、Ｒ^２ａ、Ｒ^２ｂ、Ｒ^７ｄ、Ｒ^７ｅおよびＲ^１４は、式ＩＩに定義されている通りである）である。

【0053】

一部の実施形態では、式（ＩＩＩ）の化合物は、式（ＩＩＩｂ）の化合物：

【化20】

または薬学的に許容されるその塩（式中、Ｙ^３、Ｒ^２ａ、Ｒ^２ｂ、Ｒ^７ｄ、Ｒ^７ｅおよびＲ^１４は、式（ＩＩ）に定義されている通りである）である。

【0054】

一部の実施形態では、式（ＩＩ）、（ＩＩａ）、（ＩＩｂ）、（ＩＩＩ）、（ＩＩＩａ）または（ＩＩＩｂ）のうちいずれか１つの化合物において、
Ｒ^２ａは、水素もしくは－ＣＨ_３であり、
Ｒ^２ｂは、水素、－ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３もしくは－ＣＨ（ＣＨ_３）_２であるか、またはＲ^２ａおよびＲ^２ｂは一緒になって、オキセタン－３－イルを形成し、
Ｒ^７ｄは、水素、－Ｃ（Ｏ）ＣＨ_３、－ＣＮ、ピリジン－３－イル、ピリジン－４－イル、１－メチル－５－シアノピロール－３－イル、１－メチルピラゾール－４－イル、１－メチルピラゾール－３－イル、１Ｈ－ピラゾール－４－イル、１Ｈ－ピラゾール－３－イル、１Ｈ－イミダゾール－２－イル、１，３－ジメチルピラゾール－４－イル、１，５－ジメチルピラゾール－４－イル、１，５－ジメチル－１，２，４－トリアゾール－３－イル、イミダゾール－１－イル、１－ジフルオロメチルピラゾール－３－イル、１－ジフルオロメチルピラゾール－４－イルまたはチアゾール－２－イルであり、
Ｒ^７ｅは、存在する場合、水素、フルオロ、クロロ、ブロモ、－ＣＮ、－Ｐ（Ｏ）（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_２ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、－Ｃ（Ｏ）ＮＨＣＨ_３、ピリジン－４－イル、ピリダジン－４－イル、５－メチル－１Ｈ－ピラゾール－４－イル、１－メチルピラゾール－４－イル、４－メチル－１Ｈ－イミダゾール－１－イル、１Ｈ－ベンゾ［ｄ］イミダゾール－５－イル、６－（トリフルオロメチル）－１Ｈ－ピロロ［３，２－ｃ］ピリジン－３－イル、１－メチル－６－（トリフルオロメチル）－１Ｈ－ピロロ［３，２－ｃ］ピリジン－３－イル、イソキノリン－７－イル、イソキノリン－５－イル、ピラジン－２－イル、２Ｈ－インダゾール－６－イル、３，５－ジメチルイソオキサゾール－４－イル、チアゾール－２－イル、４－メチルピリジン－３－イル、１－メチルインダゾール－６－イル、キノリン－４－イル、ベンゾ［ｄ］チアゾール－６－イル、または１，３－ジメチルピラゾール－４－イルであり、
Ｒ^１４は、－ＣＨ_３、－ＣＦ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_３、－ＣＨ_２ＣＦ_３、－ＣＨ_２ＣＨ_２Ｆまたは－ＣＨ（ＣＨ_３）_２である。

【0055】

一部の実施形態では、式（ＩＩ）の化合物において、Ｒ^２ａは、水素または－ＣＨ_３であり、Ｒ^２ｂは、水素または－ＣＨ_３であり、Ｒ^７ｄは、水素、－ＣＮ、ピラジン－２－イル、チアゾール－２－イルまたは３，５－ジメチルイソオキサゾール－４－イルであり、Ｒ^７ｅは、存在する場合、水素、フルオロ、－Ｃ（Ｏ）ＮＨＣＨ_３、－Ｐ（Ｏ）（ＣＨ_３）_２、－Ｓ（Ｏ）_２ＣＨ_３、－Ｓ（Ｏ）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、１，３－ジメチルピラゾール－４－イルまたはピリダジン－４－イルであり、Ｒ^１４は、－ＣＨ_２ＣＨ_３または－ＣＦ_３である。

【0056】

一部の実施形態では、式（Ｉ）の化合物は、図１Ａ～図１Ｘの表における化合物のうちいずれか１つである、または薬学的に許容されるその塩である。

【0057】

本明細書に記載されている診断および治療方法は、ピラゾロ［１，５－ａ］ピリミジン－５，７－ジアミンに関係する化合物を用いることもできる（すなわち、このような化合物は、本明細書に記載されている様式で処置のために特定された患者に投与することができる）：

【化21】

【0058】

また、反復するために、後述する亜属の化合物を含むあらゆるこのような化合物は、「本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤」への本発明者らの参照によって包含される。より具体的には、４－［［（７－アミノピラゾロ［１，５－ａ］ピリミジン－５－イル）アミノ］メチル］ピペリジン－３－オール：

【化22】

に関係する。さらにより具体的には、用いられる化合物は、以下の構造式を有する式（ＩＶ）の、ある特定の置換された４－［［（７－アミノピラゾロ［１，５－ａ］ピリミジン－５－イル）アミノ］メチル］ピペリジン－３－オールである（式中、Ｒ^１５、Ｒ^１６およびＲ^１７は、本明細書に定義される通りである）。

【化23】

（式中、Ｒ^１５は、水素、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル（例えば、メチル）またはＣ_３～Ｃ_６－シクロアルキルであり、各々、１～３（例えば、１または２）個のハロゲン（例えば、フルオロ）によって必要に応じて置換されており；Ｒ^１６は、水素、ハロゲン、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキルまたはＣ_１～Ｃ_６－ハロアルキルであり；Ｒ^１７は、ハロゲン（例えば、フルオロ）、－ＣＮ、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル（例えば、メチル）、Ｃ_３～Ｃ_６－シクロアルキルおよびＣ_１～Ｃ_６－ハロアルキルから選択される１～３（例えば、１または２）個の置換基により必要に応じて置換されたフェニルである）。
一部の実施形態では、Ｒ^１５は、水素、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキルまたはＣ_３～Ｃ_６－シクロアルキルである。一部の実施形態では、Ｒ^１５は、水素、エチル、イソプロピルまたはシクロプロピルである。一部の実施形態では、Ｒ^１６は、水素またはハロゲンである。一部の実施形態では、Ｒ^１７は、ハロゲン、－ＣＮ、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキル、Ｃ_３～Ｃ_６－シクロアルキルおよびＣ_１～Ｃ_６－ハロアルキルからなる群から選択される１個の置換基により必要に応じて置換されたフェニルである。一部の実施形態では、Ｒ^１７は、ハロゲンおよび－ＣＮから選択される１個の置換基により必要に応じて置換されたフェニルである。一部の実施形態では、Ｒ^１５は、水素、Ｃ_１～Ｃ_６－アルキルまたはＣ_３～Ｃ_６－シクロアルキルであり；Ｒ^１６は、水素またはハロゲンであり；Ｒ^１７は、ハロゲンおよび－ＣＮから選択される１個の置換基により必要に応じて置換されたフェニルである。
例示的な／有用な化合物は、図２の表Ｘに示される。本診断および／または治療方法は、同様に「本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤」である以下の化合物（ＩＣＥＣ０９４２）を用いて実行することができる：

【化24】

本明細書に記載されている診断および治療方法は、式（Ｘ）の化合物を用いることもできる（すなわち、このような化合物は、本明細書に記載されている様式で処置のために特定された患者に投与することができる）：

【化25】

［式中、Ｒ^Ａ６は、Ｃ_１～Ｃ_６アルキルであり；Ｒ^Ａ７は、Ｃ_１～Ｃ_６アルキルであり；Ｒ^２は、結合であり；Ｑは、必要に応じて置換された二価ヘテロアリールであり；Ｒ^３は、Ｃ_１～Ｃ_４アルキレンであり；Ｚは、単環式ヘテロアリールであり；Ｒ^４は、式（ｉｉ－１）：

【化26】

（式中、Ｌ^３は、結合であり；Ｙは、Ｏ、ＳまたはＮ（Ｒ^６）であり、Ｒ^６は、水素であり；Ｒ^Ｅ１は、水素であり；Ｒ^Ｅ２は、水素であり；Ｒ^Ｅ３は、ＣＨ_２Ｎ（Ｒ^９）_２であり、Ｒ^９は、水素または非置換のアルキルである）である］。他の実施形態では、式（Ｘ）の化合物において、Ｒ^Ａ６は、メチルであり；Ｒ^Ａ７は、Ｃ_３アルキル（例えば、ＣＨ_２（ＣＨ_３）_２などの分枝状Ｃ_３アルキル）であり；Ｑは、非置換の二価ピペリジンであり；Ｒ^３は、Ｃ_２アルキレンであり；Ｚは、ピロリルであり；Ｙは、Ｏであり；Ｒ^９は、メチルである。一実施形態では、Ｒ^３は、第１のメチレン単位が－Ｏ－により置き換えられ、第２のメチレン単位が－Ｃ（Ｏ）－により置き換えられた、Ｃ_２アルキレンである。一実施形態では、Ｒ^Ａ７は、分枝状Ｃ_３アルキル（ＣＨ_２（ＣＨ_３）_２）であり、Ｒ^３は、第１のメチレン単位が－Ｏ－により置き換えられ、第２のメチレン単位が－Ｃ（Ｏ）－により置き換えられた、Ｃ_２アルキレンである。
例えば、化合物／ＣＤＫ７阻害剤は、

【化27】

であり得る。本方法において有用な他のＣＤＫ７阻害剤は、

【化28】

である。ＹＫＬ－５－１２４およびＹＫＬ－５－１６７ならびに他の同様の化合物の合成に関する情報、ならびに例えば、投薬量および適応症に関するガイダンスは、その内容全体がこれにより参照により本明細書に組み込まれる、米国特許出願公開第２０１９／００５５２４８号に見出すことができる。

【0059】

処置に対する患者を特定する診断方法は、バイオマーカーの状態に関する情報を決定することにより、この情報の決定を完了することにより、またはその情報を受け取ることにより、患者から取得した生体試料中の本明細書に記載されている１つまたは複数のバイオマーカーを分析するステップを含む。様々な実施形態では、状態は、野生型もしくは変異体形態でのバイオマーカー遺伝子の存在、非存在（例えば、遺伝的欠失）、場所（例えば、染色体転座）もしくはコピー数、エピジェネティック修飾の包含、スーパーエンハンサー（ＳＥ）もしくはある特定の強度、蔓延（ｐｒｅｖａｌｅｎｃｅ）ランクもしくは順序ランクのＳＥとバイオマーカー遺伝子の関連、バイオマーカー遺伝子の発現のレベル（例えば、そのＲＮＡ（例えば、一次ＲＮＡ転写物またはｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））発現レベルによって証明されるような）、および／またはバイオマーカー遺伝子によってコードされるタンパク質の発現もしくは活性のレベルに基づき評価され、これらの各々は、さらに後述される。当業者は、ＲＮＡ配列を逆転写して、相補的ＤＮＡ（ｃＤＮＡ）を生成することができ、本明細書に記載されているＲＮＡから生成されたｃＤＮＡを用いて、本明細書に記載されている方法および使用のいずれかを実行することができる（すなわち、患者のバイオマーカー状況は、ＲＮＡではなくｃＤＮＡを使用して決定されていてよい）ことを理解するであろう。バイオマーカーの状態は、使用されている的確なバイオマーカーまたはバイオマーカーが評価されている正確な方法もしくは文脈に関係なく、単に収載されている特色のうちいずれか１つまたは複数の観点から評価することができる。所与のバイオマーカーの状態（例えば、そのコピー数、関連するエンハンサー、発現レベルまたは活性）は、さらに後述する通り、所定の閾値レベルもしくはカットオフに等しくもしくはそれより高く、または所定の閾値レベルもしくはカットオフに等しくもしくはそれより低くなることができる。本発明の方法において、遺伝子ＢＲＡＦ、ｃ－ｍｙｃ（ＭＹＣとしても公知）、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、およびＥ２Ｆ経路メンバーをコードするある特定の遺伝子（下の表を参照）、またはこれらによってコードされるタンパク質から選択されるバイオマーカーを、このようなバイオマーカーの状態が、所定の閾値レベル（ＲＢ１－Ｅ２Ｆファミリーメンバーについては、下の表および添付の教示を参照）に等しいまたはそれより高い（例えば、それより高い）という情報を決定することにより、この情報の決定を完了することにより、および／またはその情報を受け取ることにより、分析することができる。その代わりにまたはその上、遺伝子ＢＣＬ２様１、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫＮ２ＡおよびＲＢ（ＲＢ１または別のＥ２Ｆ経路メンバーとしても公知）、ならびに／またはこれらによってコードされるタンパク質から選択されるバイオマーカーを、このようなバイオマーカー状態が、所定の閾値レベル（ＲＢ／Ｅ２Ｆファミリーメンバーについては、下の表を参照）に等しいまたはそれより低い（例えば、それより低い）という情報を決定することにより、この情報の決定を完了することにより、および／またはその情報を受け取ることにより、分析することができる。いずれのバイオマーカー（複数可）を利用するべきかについての選択は、一部には、患者が患う特定のがんと共に、本明細書に記載されている他の因子に依存することができる。ＣＤＫ１８は、ＣＤＫ１８をコードし、ＣＤＫ１９は、ＣＤＫ１９（メディエーターコアクチベーター複合体の成分）をコードし；ＣＣＮＥ１は、サイクリンＥ１をコードし（Ｋｏｆｆ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ ６６：１２１７－１２２８， １９９１を参照）；ＦＧＦＲ１は、チロシンキナーゼ活性を有する細胞表面膜受容体であるＦＧＦＲ１をコードし；ＲＢは、アクチベーターＥ２Ｆのアクチベータードメインに結合するｐＲＢをコードし；ＢＣＬ２様１は、ミトコンドリアにおける膜貫通タンパク質であるＢＣＬ－ＸＬをコードし；ＣＤＫ７は、ＣＤＫ７をコードし；ＣＤＫ９は、ＣＤＫ９をコードし；ＣＤＫＮ２Ａは、ｐ１６およびｐ１４ａｒｆをコードする。別の面では、Ｈｏｍｏ ｓａｐｉｅｎｓ以外の種における、バイオマーカーとして本明細書に記載されている遺伝子およびタンパク質の染色体上の場所、スプライスバリアントおよびホモログは、当技術分野で公知である。

【0060】

本発明の処置法および対応する「使用」は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤（例えば、式（Ｉ）の化合物）を投与するステップまたはその使用を含み、これらのいずれも、薬学的に許容される組成物に含まれ得、経路およびレジメン（例えば、本明細書にさらに記載されている）によって、本明細書に記載されている通りに（例えば、本明細書に記載されているがんの種類を有すると）特定された患者に投与され得る。

【図面の簡単な説明】

【0061】

【図1-1】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-2】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-3】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-4】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-5】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-6】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-7】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-8】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-9】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-10】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-11】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-12】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-13】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-14】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-15】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-16】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-17】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-18】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-19】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-20】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-21】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-22】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-23】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図1-24】図１Ａ～図１Ｘは、式（Ｉ）の例示的な／有用な化合物の表である。追加の例示的な／有用な化合物は、直ぐ下で言及する表Ｘに示される。

【図2】図２は、本発明の方法において有用な追加のＣＤＫ７阻害剤を説明する表（表Ｘ）である。

【発明を実施するための形態】

【0062】

詳細な説明
本発明者らは、本明細書に記載されている通りのＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩の有効性が、ある特定の遺伝的シグネチャー（すなわち、同様に本明細書に記載されている通り、特定の状態にある１つまたは複数のバイオマーカー）を有する患者において一層高くなるであろうと考えている。さらに、本発明者らは、このような化合物およびその塩の有効性が、本明細書に記載されている通り、本明細書に記載されているがんを有する患者および／または本明細書に記載されている通りにバイオマーカーに基づいて特定された患者を含む患者において、他の抗がん治療と組み合わせた場合に増強され得ると考えている。

【0063】

以下の定義は、特に文脈が明白に示さない限り、本明細書に記載されている組成物、方法および使用に当てはまり、必要な場合または望ましい場合、特許請求の範囲が定義の範囲内の文言を含むよう修正されてもよいことを理解すべきである。さらに、この定義は、定義されている用語の言語上および文法上の変化形（例えば、単数形態および複数形態の用語）に該当し、一部の言語上の変化形は、特に、以下に明記されている（例えば、「投与」と「投与すること」）。化学元素は、Ｐｅｒｉｏｄｉｃ Ｔａｂｌｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｅｌｅｍｅｎｔｓ， ＣＡＳ ｖｅｒｓｉｏｎ， Ｈａｎｄｂｏｏｋ ｏｆ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ａｎｄ Ｐｈｙｓｉｃｓ， ７５ｔｈ Ｅｄに従って特定される。さらに、有機化学の一般原理は十分に確立されており、当業者は、所望の場合、Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ ｂｙ Ｔｈｏｍａｓ Ｓｏｒｒｅｌｌ， Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ｂｏｏｋｓ， Ｓａｕｓａｌｉｔｏ， １９９９； Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｍａｒｃｈ， Ｍａｒｃｈ’ｓ Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｃｈｅｍｉｓｔｒｙ， ５^ｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ， Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ， Ｉｎｃ．， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， ２００１； Ｌａｒｏｃｋ， Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｔｒａｎｓｆｏｒｍａｔｉｏｎｓ， ＶＣＨ Ｐｕｂｌｉｓｈｅｒｓ， Ｉｎｃ．， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， １９８９； ａｎｄ Ｃａｒｒｕｔｈｅｒｓ， Ｓｏｍｅ Ｍｏｄｅｒｎ Ｍｅｔｈｏｄｓ ｏｆ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ， ３^ｒｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｐｒｅｓｓ， Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ， １９８７を参考にすることができる。

【0064】

値を参照して使用する場合、用語「約」は、明記した値のプラスまたはマイナス１０％となる、任意の値または値の範囲（例えば、明記されている値のプラスまたはマイナス１％、２％、３％、４％、５％、６％、７％、８％、９％または１０％の範囲内）を表す。例えば、約１０ｍｇの用量は、１０ｍｇより１０％少ない任意の用量（９ｍｇ）、１０ｍｇより１０％多い任意の用量（１１ｍｇ）、およびそれらの間の任意の用量または投与量範囲（例えば、９～１１ｍｇ；９．１～１０．９ｍｇ；９．２～１０．８ｍｇなど）を意味する。別の例として、約８０％の集団における有病率ランクは、７２～８８％（例えば、７９．２～８０．８％）の有病率ランクを意味する。疑念がある場合、「約Ｘ」は、「Ｘ」（例えば、約８０％は８０％であり得る）であり得る。明記した値を超えることができない（例えば、１００％）場合、「約」は、明記した値よりも最大で１０％（これを含む）小さい任意の値または範囲を表す（例えば、約１００％の純度は、９０％～１００％純粋であることを意味する（例えば、９５％～１００％純粋、９６％～１００％純粋、９７％～１００％純粋などである））。値を測定する機器または技法が、１０％を超える誤差範囲を有する事象では、所与の値は、それらがそのような機器または技法に関する誤差の範囲内にどちらもある場合、明記されている値とほぼ同じになる。

【0065】

用語「投与」、および「投与すること」などのその変化形は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤（本明細書に開示される式に適合する化合物またはそれらの薬学的に許容される塩、追加剤／第２の薬剤、またはいずれかのそのような化合物のうちの１つまたは複数を含有する組成物を含む）を対象（例えば、ヒト患者）または系（例えば、ｅｘ ｖｉｖｏで維持される細胞または組織をベースとする系）に投与することを指す。投与の結果として、前記化合物または該化合物を含有する組成物（例えば、医薬組成物）は、対象または系に導入される。本発明の組成物および併用療法に有用な第２の薬剤に加えて、それらのいずれもが化合物であり得る、ポジティブ対照、ネガティブ対照およびプラセボとして使用される物品もまた、「投与される」ことができる。当業者は、対象または系に投与するために、適切な状況で利用することができる、様々な経路であることに気付く。例えば、投与経路は、経口であってもよく（すなわち、医薬組成物を嚥下することによる）、または非経口であってもよい。より詳細には、投与経路は、気管支（例えば、気管支点滴による）、口による（すなわち、経口）、皮膚による（これは、真皮への局所適用または皮内、皮下または経皮投与であり得るか、またはこれらを含むことができる）、胃内または腸内（すなわち、それぞれ、胃または腸に直接）、髄内、筋肉内、鼻内、腹腔内、鞘内、腫瘍内、静脈内（または動脈内）、心室内、特定の臓器（例えば、肝内）、粘膜（例えば、口内、直腸、舌下または膣）、皮下、気管（例えば、気管内点滴による）、または眼（例えば、局所、結膜下または硝子体内）への適用または注入によるものであり得る。投与は、断続的投与（すなわち、様々な時間により間隔が設けられた用量）、および／または定期的投与（すなわち、一般的な期間（例えば、多くの時間毎に、毎日（例えば、１日１回の経口投与）、毎週、１週間あたり２回など））により間隔が設けられた用量）を含むことができる。他の実施形態では、投与は、選択した時間の間（例えば、約１～２時間）の連続投与（例えば、潅流）を含むことができる。

【0066】

２つの事象、２つの実体、または１つの事象と１つの実体は、第１の特徴の１つまたは複数（例えば、その存在、レベルおよび／または形態）が、第２の特徴と相関する場合、互いに「関連している」。例えば、第１の実体（例えば、酵素（例えば、ＣＤＫ７））、遺伝子発現プロファイル、遺伝子シグネチャー（すなわち、遺伝子発現の特異的な特徴パターンを有する、細胞における遺伝子の単一群または複合群）、代謝産物または事象（例えば、骨髄浸潤）の存在、レベルおよび／または形態が、疾患（例えば、本明細書において開示されているがん）の出現率、その重症度および／または疾患への感受性に相互関連する場合、それらは、ある事象（例えば、特定の疾患の発病または進行）と関連している。本明細書に記載されているバイオマーカーは、本明細書に記載されている方法で特定された患者に関連する（例えば、その発現のレベルによる）。関連性は、通常、関連集団にわたり評価される。２つまたはそれより多くの実体が、直接、または間接的に相互作用する場合、それらは、互いに物理的に「関連する」ことになり、その結果、これらの実体は、所与の状況（例えば、生理的条件下で維持されている細胞内（例えば、細胞培養物内）または医薬組成物内）において互いに物理的に近接し、そして／またはそのような状態にある。互いに物理的に関連する実体は、互いに共有結合により連結され得るか、または例えば、水素結合、ファンデルワールス力、疎水性相互作用、磁力またはそれらの組合せにより非共有結合により結合され得る。本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩は、ＣＤＫ７と非共有結合により会合し得る。

【0067】

用語「生体試料」とは、目的の生物学的供給源（例えば、組織または生物（例えば、動物またはヒト患者）または細胞培養物）から取得または誘導される試料を指す。例えば、生体試料は、本発明の方法により診断および／または処置される疾患（または、動物モデルの場合、ヒト疾患におけるそのような疾患のシミュレーション）に罹患している個体（例えば、患者または動物モデル）から、または参照もしくは対照（または、その試料は、参照標準または対照集団に寄与する）となる役割を果たすことに役立つ個体から得られる試料であり得る。生体試料は、生物細胞、組織または流体またはそれらの任意の組合せを含有することができる。例えば、生体試料は、腹水；血液；血液細胞；体液（それらのいずれも、細胞（例えば、腫瘍細胞（例えば、少なくとも血液またはリンパ液管に見出される、血中循環腫瘍細胞（ＣＴＣ））を含んでもよく、またはこれを除外してもよい）；骨髄またはその構成成分（例えば、造血細胞、骨髄脂肪組織または間質細胞）；脳脊髄液（ＣＳＦ）；糞便；フレクチュアル流体（ｆｌｅｘｕｒａｌ ｆｌｕｉｄ）；自由遊走核酸（例えば、循環性腫瘍ＤＮＡ）；婦人科医学的流体；免疫浸潤物質；リンパ液；腹膜流体；血漿；唾液；痰；外科的に得られた試験体；皮膚または粘膜（例えば、鼻、口または膣）から掻き取ったまたは拭いとった組織；組織または微細ニードル生検試料；尿；乳管洗浄または気管支肺胞洗浄などの洗液または洗浄液；または他の体液、組織、分泌物および／または排出液であり得るか、またはこれらを含むことができる。体液（例えば、血液、ＣＳＦ、リンパ液、血漿または尿）の試料またはこれから得られる試料は、腫瘍細胞（例えば、ＣＴＣ）、および／または腫瘍の自由遊走核酸もしくは細胞不含核酸を含んでもよい。試料中の細胞（例えば、がん細胞）は、処置が意図されている個々の患者から得られてもよい。試料が得られる形態で使用される試料は、「一次」試料と称することができ、さらに操作された試料（例えば、試料の１つまたは複数の構成成分を除去することによる）は、「二次」試料または「処理済み」試料と称されることがある。このような処理済み試料は、特定の細胞タイプ（例えば、腫瘍細胞であり得るＣＤＫ７発現細胞）、細胞の構成成分（例えば、膜の画分）または細胞物質（例えば、ＣＤＫ７、ＤＮＡ、またはＣＤＫ７をコードすることができる、および増幅が施され得るＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））を含めた１種または複数の細胞タンパク質）を含有するか、またはそれに富むことがある。本明細書で使用する場合、用語「バイオマーカー」とは、実体であって、その状態が特定の生物学的事象と相互に関係し、その結果、その事象に対する「マーカー」と考えられる、実体を指す（例えば、特定のがんの存在、および／または本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩への感受性）。バイオマーカーは、核酸またはタンパク質レベルで分析され得る。核酸レベルでは、野性型または変異体形態の遺伝子の存在（例えば、コピー数変化（ＣＮＡ））、その非存在もしくは染色体位置、エピジェネティックな変化（例えば、メチル化において）、そのスーパー－エンハンサーとの関係性、および／またはその発現のレベル（例えば、一次ＲＮＡ転写またはｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベルによって証明される）を分析することができる。タンパク質レベルでは、バイオマーカー遺伝子によってコードされるタンパク質の発現および／または活性のレベルを分析することができる。バイオマーカーは、その治療的転帰または可能性（例えば、可能性の増大）を示すことがある。したがって、バイオマーカーは、予測的または予後的であり得、したがって、本明細書に記載されている患者を特定または処置する方法に有用であり得る。

【0068】

用語「がん」は、生物細胞が、疾患を有する患者に有害となる程度に細胞増殖の制御を失うことにより特徴付けられる異常な成長表現型を示す疾患を指す。がんは、がんの元々の組織のタイプ（組織学的タイプ）、および／またはがんが最初に発生した身体の原発部位によって分類することができる。組織学的タイプに基づいて、がんは、一般に、６つの主要なカテゴリー：癌腫；肉腫；骨髄腫；白血病；リンパ腫；および複合タイプに分類される。本明細書に記載されている通りに処置されるがんは、これらのタイプのいずれか１つであり得、前がん性（例えば、良性）、悪性、前転移性、転移性および／または非転移性の細胞を含むことができる。悪性腫瘍または悪性病変を有する患者は、がんを有する。本開示は、その教示が特に関連し得るある特定のがんを具体的に表し、これらのがんの１つまたは複数は、固形腫瘍によって、または血液がん（例えば、本明細書に記載されているタイプ）としても知られることがある血液学的腫瘍により特徴付けられ得る。すべてのがんが、固形腫瘍として現れるわけではないが、本発明者らは、いかなる悪性細胞も指すよう、用語「がん細胞」および「腫瘍細胞」を互換的に使用することがある。

【0069】

用語「併用療法」とは、対象が、単一疾患（例えば、がん）を処置するために、２つまたはそれより多くの治療レジメン（例えば、２種またはそれより多種の治療剤）にさらされるそのような状況を指す。２種またはそれより多種のレジメン／薬剤は、同時にまたは逐次に投与されてもよい。第１の薬剤の用量および第２の薬剤の用量は、同時に投与される場合、ほぼ同じ時間に投与され、こうして、両方の薬剤が、同時に患者に対して効果を発揮するか、または第１の薬剤が、期間の重なる間に、第２の薬剤よりも速く、または遅く作用する。第１の薬剤および第２の薬剤の用量が、逐次に投与される場合、それらは、時間内で分けられ、その結果、それらは、患者に同時に効果を発揮することがあるか、または発揮しないことがある。例えば、第１および第２の薬剤は、同じ時間または同日内に投与されてもよく、この場合、第１の薬剤は、第２の薬剤が投与される際に、依然として活性である可能性が高い。代替的に、第１の薬剤と第２の薬剤の投与の間に、かなり一層長い期間が経過することがあり、その結果、第１の薬剤は、第２の薬剤が投与される際にもはや活性でない（例えば、不応性がんを処置する際に行うことができる通り、第１のレジメンの全用量は、投与の同一経路または異なる経路によって、第２のレジメンの任意の用量の投与前に投与される）。明確にするため、併用療法は、２種の薬剤が、単一組成物で一緒に、または同時に投与されることを必要とするものではないが、一部の実施形態では、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩、および本明細書に記載されている第２の薬剤を含めた、２種またはそれより多種の薬剤が、同一期間内に投与されてもよい（例えば、同じ時間、日時、週数または月数）。

【0070】

用語「カットオフ」および「カットオフ値」は、集団の２つのサブセット間の分割線を定義するアッセイにおいて測定される値を意味する（例えば、可能性として、応答者および非応答者（例えば、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩への応答者および非応答者））。一部の例では、カットオフ値に等しいまたはそれより高い値は、集団のサブセットの１つを規定し、カットオフ値より小さな値は、集団の他のサブセットを規定する。他の例では、カットオフ値に等しいまたはそれより低い値は、集団のサブセットを規定し、カットオフ値より大きな値は、他を規定する。さらに以下に記述されている通り、カットオフまたはカットオフ値は、閾値を規定することができる。

【0071】

本明細書で使用する場合、「診断情報」は、患者が疾患を有するかどうかを決定する際、および／または疾患を、遺伝子型分類もしくは表現型分類、または疾患の予後またはその処置（一般的な処置または本明細書に記載されている任意の特定の処置のいずれか）に対して応答する可能性に関して重要性を有する任意の分類に分類する（階層化する）際に有用となる情報のことである。同様に、「診断」とは、以下に限定されないが、患者が疾患を有するまたは発症する可能性があるかどうか；その疾患がある特定の状態もしくは段階を有する、あるいはそれらに到達する可能性があるまたは特定の特徴（例えば、治療剤に対する抵抗性）を示す可能性があるどうか；腫瘍の性質または分類に関連する情報；予後に関連する情報（これは、抵抗性に関連することもある）；および／または適切な処置を選択する際に有用な情報（例えば、このような阻害剤または他の処置に応答する可能性のあるがんを有すると特定された患者のために、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を選択する）を含めた、任意のタイプの診断情報を得ることまたは提供することを指す。本明細書に記載されている方法により分類（階層化）されて、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩による処置について選択された患者は、処置に十分に応答する可能性があり、このことは、このような患者が、同じタイプのがんを有する患者であって、そのように特定されておらず、かつ同じ階層にない患者よりも首尾よく処置される可能性が高いことを意味する。利用可能な処理は、治療剤、および手術、放射線照射などの他の処置モダリティを含み、適切な処置の選択は、特定の治療剤を差し控える選択、投与レジメンの選択、および併用療法を使用する選択を包含する。診断情報は、患者を階層化するために使用することができ、したがって、例えばバイオマーカー状態に応じて、所与の患者を特定および分類するのに有用である。診断情報の取得は、本明細書に記載されている患者階層法のいずれかにおけるステップを構成することができる。

【0072】

当業者は、用語「剤形」は、患者に投与するための、活性剤（例えば、治療剤または診断剤）の物理的に個別の単位を指すために使用することができることを認識する。通常、このような単位はそれぞれ、所定量の活性剤を含有する。一部の実施形態では、このような量は、関連集団に投与すると（すなわち、治療的投与レジメンを用いて）、所望のまたは有益な転帰と相関するよう決定された、投与レジメンに従って投与するのに適切な、単位投与量（または、その全体の画分）である。当業者は、特定の患者に投与される治療組成物または薬剤の総量は、１名または複数の主治医により決定され、多回剤形の投与を含んでもよいことを認識している。

【0073】

当業者は、用語「投与レジメン」は、同じ期間または同じではない期間によって間隔が設けられている、患者に個々に投与される、一組の単位用量（通常、１つ超）を指すために使用することができることを理解する。所与の治療剤は、通常、推奨投与レジメンを有しており、このレジメンは、１つまたは複数の用量を含んでもよく、それらはそれぞれ、同じ単位用量の量または異なる量を含有してもよい。一部の実施形態では、投与レジメンは、第１の投与量において第１の用量と、その後の第１の投与量と異なる第２の用量の１つまたは複数の追加の用量を含む。一部の実施形態では、投与レジメンは、関連集団全体に投与されると、所望のまたは有益な転帰と相互関連する（すなわち、レジメンは、治療的投与レジメンである）。

【0074】

本明細書で使用する場合、式（Ｉ）の化合物または本明細書に記載される他のＣＤＫ７阻害剤などの薬剤の「有効量」（例えば、本明細書に記載されている化学的化合物）とは、そのために投与される所望の効果を生じる、または生じることが予期される量を指す。有効量は、以下にさらに議論され、当分野において認識される、所望の生物学的エンドポイント、投与される化合物の薬物動態、処置される状態、投与形式、および患者の特徴などの因子に応じて様々となる。この用語は、治療的方法および予防的方法に適用することができる。例えば、治療有効量は、疾患の兆候もしくは症状のうちの１つまたは複数の出現率および／あるいは重症度を低減するものである。例えば、がんの処置において、有効量は、腫瘍負荷を軽減する、腫瘍成長を阻害する、転移を阻害するまたは患者生存を延長することができる。当業者は、この用語は、実際には、任意の特定の個体において実現される処置の成功を必要とするものではないことを理解する。むしろ、治療有効量は、このような処置を必要とする患者に投与されると、かなり多数の患者に特定の所望の薬理学的応答を実現する量である。一部の実施形態では、治療有効量を言う場合、１つまたは複数の特定の組織（例えば、疾患により罹患している組織）または流体（例えば、血液、唾液、血清、汗、涙液、尿など）において、投与される量または測定される量のことが言及され得る。有効量は、（例えば、投与レジメンの一部として）単回用量もしくは多回用量で製剤化および／または投与されてもよい。

【0075】

本明細書で使用する場合、「エンハンサー」とは、遺伝子の発現を調節する一助となる最大でおよそ１Ｍｂｐ離れたゲノムＤＮＡの領域のことである。エンハンサーは、重なることがあるが、多くの場合、遺伝子コード化領域から構成されない。エンハンサーは、多くの場合、転写因子により結合されており、特異的なヒストンマークによって表される。

【0076】

「ｍＲＮＡ」は、遺伝子のコード配列のうち１つまたは複数を含む、ＤＮＡの転写によって合成された一本鎖ＲＮＡ産物である。ｍＲＮＡは、前駆体（プレｍＲＮＡ）の形態であっても、またはイントロンを欠くｍＲＮＡの成熟形態へとさらにプロセシングされてもよい。

【0077】

用語「患者」とは、例えば、実験目的、診断目的、予防目的および／または治療目的で、本明細書に記載されている診断方法が施されるもしくは施されることがある生物、あるいは本明細書に記載されている化合物もしくはそれらの薬学的に許容される塩が投与される、または投与されることがある任意の生物を指す。典型的な患者は、動物（例えば、マウス、ラット、ウサギ、非ヒト霊長類およびヒトなどの哺乳動物；イヌおよびネコなどの家畜動物；および家禽、または農業的価値もしくは商業的価値のある任意の動物）を含む。患者は、本明細書に記載されている疾患に罹患している可能性があるか、または疾患に罹患し易い（すなわち、発症する平均リスクよりも高いリスクを有する）恐れがあり、その１つもしくは複数の兆候または症状を示すことがある。

【0078】

用語「薬学的に許容される」は、本明細書において開示されている組成物（例えば、医薬組成物）を製剤化するために使用される担体に適用される場合、組成物の他の成分と適合可能であり、かつ患者に有害ではない（例えば、必要量および／または投与量（例えば、単位剤形中）において非毒性である）担体を意味する。

【0079】

用語「薬学的に許容される」は、塩に適用した場合、許容できない毒性、刺激、アレルギー反応などなしに、妥当な医療的判断の範囲内で、ヒト（例えば、患者）および下等動物（以下に限定されないが、実験研究に使用されるマウスおよびラットを含む）の組織に接触して使用するのに好適であり、かつ妥当な利益／リスク比に見合うように使用され得る、化合物の塩形態を指す。多数の薬学的に許容される塩が、当分野で周知である（例えば、Ｂｅｒｇｅ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｐｈａｒｍ． Ｓｃｉ． ６６：１－１９， １９７７を参照されたい）。本明細書において記載されている化合物の薬学的に許容される塩は、好適な無機酸および有機酸、ならびに無機塩基および有機塩基から誘導されるものを含む。薬学的に許容される非毒性酸付加塩の例は、塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸および過塩素酸などの無機酸、または酢酸、シュウ酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸もしくはマロン酸などの有機酸と共に形成される、またはイオン交換などの当分野において公知の他の方法を使用することにより形成されるアミノ基の塩である。他の薬学的に許容される塩には、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、硫酸水素塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、カンファースルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、二グルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸塩、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、２－ヒドロキシ－エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸塩、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩（ＭＡＬＡＴ１ｅ）、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタ
ンスルホン酸塩、２－ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩（ｐｅｃｔｉｎａｔｅ）、過硫酸塩、３－フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバル酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、ｐトルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが含まれる。適切な塩基から誘導される塩には、アルカリ金属、アルカリ土類金属、アンモニウムおよびＮ^＋（Ｃ_１～４アルキル）_４塩が含まれる。代表的なアルカリ金属塩またはアルカリ土類金属塩には、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどが含まれる。さらに、薬学的に許容される塩には、適切な場合、非毒性のアンモニウム、四級アンモニウム、およびハロゲン化物イオン、水酸化物イオン、カルボン酸イオン、硫酸イオン、リン酸イオン、硝酸イオン、低級アルキルスルホン酸イオンおよびアリールスルホン酸イオンなどの対イオンを使用して形成されるアミン陽イオンが含まれる。

【0080】

本明細書で使用する場合、用語「集団」とは、より規模の大きな群における、その集団において測定される値の分布に妥当な程度に反映するのに十分な、いくつかの数の項目（例えば、少なくとも３０、４０、５０またはそれより多い）を意味する。本発明の文脈では、集団は、データ収集および分析の目的で、少なくとも１つの共通した特徴により特定される、ヒト、実験室用動物または細胞系（例えば）の離散群であり得る。例えば、「試料の集団」とは、より規模の大きな群の試料における、値（例えば、バイオマーカーの状態に関連する値）の分布に妥当な程度に反映するのに十分に大きな複数の試料を指す。集団における項目は、本明細書に記載されている生体試料であってもよい。例えば、試料の集団における各試料は、患者から取得された細胞系もしくは生体試料の細胞、または異種移植片（例えば、腫瘍形成性細胞系または患者試料をマウスに埋め込むことによって、マウス中で成長させた腫瘍）であり得る。留意される通り、集団内の個体は、共通した特徴により特定される離散群であり得、これは、同じタイプのがんに罹患している生物、またはそのようながんを呈する細胞系もしくは異種移植片から試料が取得されたかどうかに関わりなく、同じ疾患（例えば、同じタイプのがん）であり得る。

【0081】

用語「有病率カットオフ」は、指定値（例えば、本明細書に開示されるバイオマーカーに関連するＳＥの強度）を参照して本明細書で使用する場合、集団の２つのサブセット間を分割する線を規定する有病率ランクを意味する（例えば、「応答者」のサブセットおよび「非応答者」のサブセットであり、これらは、名称が暗示する通り、それぞれ、治療剤または薬剤に対して有益な応答を起こす可能性があるまたは起こす可能性がない患者を含む）。したがって、有病率カットオフに等しいまたはこれより大きな（例えば、百分率の値がより小さい）有病率ランクは、集団の１つのサブセットを規定する。有病率カットオフより小さな（例えば、百分率の値がより大きい）有病率ランクは、集団の他のサブセットを規定する。

【0082】

本明細書で使用する場合、指定値（例えば、指定したバイオマーカーのｍＲＮＡレベル）に対する用語「有病率ランク」は、その指定値に等しいまたはそれより大きな集団の百分率を意味する。例えば、試験細胞における指定したバイオマーカーのｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）の量に対する３５％有病率ランクは、その集団の３５％が、そのレベルのバイオマーカーｍＲＮＡを有するか、または試験細胞よりも高いレベルを有することを意味する。

【0083】

「一次ＲＮＡ転写物」は、ＤＮＡの転写によって合成された一本鎖リボ核酸（ＲＮＡ）産物であり、これは、プロセシングされて、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡおよびｒＲＮＡなどの様々な成熟ＲＮＡ産物を生じる。ｍＲＮＡとして指定された一次ＲＮＡ転写物は、１つまたは複数の遺伝子コード領域（エクソン）を含むＤＮＡ配列から転写され、遺伝子に関連する調節領域（例えば、エンハンサーまたはスーパーエンハンサー）から転写された配列を含むことができる。このような一次ＲＮＡ転写物は、翻訳に備えて修飾される。前駆体ｍＲＮＡ（プレｍＲＮＡ）は、転写により創出されたＲＮＡの最初の形態であり、これが修飾されて、イントロンを欠く成熟ｍＲＮＡになる。

【0084】

本明細書で使用する場合、用語「予後情報」および「予測情報」は、処置の非存在下または存在下のどちらかにおいて、疾患または状態の経過の任意の様子を示すために使用され得る任意の診断情報を指すために使用される。このような情報は、以下に限定されないが、患者の平均余命、患者が所与の時間量（例えば、６か月、１年、５年など）の間に生存する可能性、患者が疾患から治癒する可能性、患者の疾患が特定の治療法に応答する可能性（この場合、応答は、様々な方法のいずれかにおいて定義され得る）を含むことができる。診断情報は、予後的または予測的であり得る。

【0085】

本明細書で使用する場合、用語「ランク順位付け」とは、最高値から最低値まで、または最低値から最高値までの値の順序を意味する。

【0086】

本明細書で使用する場合、用語「ＲＢ－Ｅ２Ｆ経路」および「ＲＢ－Ｅ２Ｆファミリー」とは、一連の遺伝子、およびそれらによりコードされるタンパク質であって、文脈が明らかにするように、その発現または活性がＲＢ遺伝子ファミリーの活性を調節し、ひいては、細胞周期に進入して、これを介して進行するために必要な転写因子のＥ２Ｆファミリーの活性を調節する、上記の遺伝子およびタンパク質を指す。以下の表は、ＲＢ－Ｅ２Ｆファミリーにおける遺伝子の一覧表示、コードされるタンパク質の現在理解されている機能の表示、およびがんにおけるこれらのバイオマーカーの状態を含む。本発明者らは、遺伝子の属性（例えば、そのコピー数または発現のレベル）または遺伝子がコードするタンパク質（例えば、その発現または活性のレベル）が、健常な対象よりも、ある特定のがんを有する一部の患者において高いことを示すために、省略した「活性化されている、または過剰発現されている」を使用する。このような活性化されたまたは過剰発現されたＲＢ－Ｅ２Ｆファミリーメンバーに関する所定の閾値は、比較分析によって求めることができ、がん患者において見出された場合または超えた場合、本明細書に記載されている処置に対する候補として、患者を特定するレベル（例えば、ｍＲＮＡレベル（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）、タンパク質レベル、遺伝子コピー数、遺伝子に関連するエンハンサーの強度）である。本発明者らは、遺伝子の属性（例えば、そのコピー数または発現のレベル）または遺伝子がコードするタンパク質（例えば、その発現または活性のレベル）が、健常な対象よりも、ある特定のがんを有する一部の患者において低いことを示すために、省略した「不活性化されているまたは過少発現されている」を使用する。このような不活性化されたまたは過少発現されたＲＢ－Ｅ２Ｆファミリーメンバーに関する所定の閾値は、比較分析によって求めることができ、がん患者において得られない場合、本明細書に記載されている処置に対する候補として、その患者を特定するレベル（例えば、ｍＲＮＡレベル、タンパク質レベル、遺伝子コピー数、遺伝子に関連するエンハンサーの強度）である。

【表3】

【0087】

本明細書で使用する場合、「参照」とは、標準品または対照であって、それらに対して比較が行われる、標準品または対照を指す。例えば、目的の薬剤、患者、集団、試料、配列または値は、参照となる薬剤、患者、集団、試料、配列または値と比較される。参照は、目的の項目の分析もしくは決定と実質的に同時に分析または決定され得るか、ある時点の早期時点において決定され、有形媒体に必要に応じて統合されている、過去の標準または対照を構成してもよい。当業者は、目的の項目によって直面されるものと同等の条件下で通常、決定または特徴付けられる、適切な参照の選択に十分な訓練を受けている。当業者は、十分な類似性が存在する場合に、標準品または対照として、特定の考えられる参照への信頼性および／または比較を妥当とみなすことを理解する。

【0088】

本明細書で使用する場合、処置への「応答」とは、処置に起因する、または処置に相関する患者の状態における何らかの有益な変化のことである。変化は、状態の安定化（例えば、処置の非存在下で起こると思われる悪化の阻害）、状態の１つもしくは複数の兆候または症状の改善、その開始の遅延および／またはその頻度の低下、状態の治癒の見込みの改善、一層長い生存期間などであり得る。応答は、患者の応答または腫瘍の応答であり得る。

【0089】

本明細書で使用する場合、用語「強度」は、エンハンサーまたはＳＥの一部を指すように使用される場合、この用語は、Ｈ３Ｋ２７Ａｃの数の曲線下面積、または分析されたゲノムＤＮＡセグメントの長さに対してプロットした他のゲノムマーカーの読取り値を意味する。したがって、「強度」とは、測定するよう選択される領域を規定する塩基対の間隔に対する、所与の塩基対における印を測定することに起因するシグナルの統合のことである。

【0090】

本明細書で使用する場合、用語「スーパー－エンハンサー」（ＳＥ）とは、特定の細胞または細胞タイプにおける、他のエンハンサーに対する、ヒストンマークおよび／または転写タンパク質の不均衡な共有を含有する、エンハンサーのサブセットを指す。ＳＥによって調節される遺伝子は、細胞の機能に対して重要性が高いと予期される。ＳＥは、強度に基づいた細胞中のエンハンサーのすべてをランク順序付けることによって、およびＲＯＳＥなどの入手可能なソフトウェア（ｂｉｔｂｕｃｋｅｔ．ｏｒｇ／ｙｏｕｎｇ＿ｃｏｍｐｕｔａｔｉｏｎ／ｒｏｓｅ）を使用して、細胞におけるメジアンエンハンサーよりも強度がかなり大きなエンハンサーのサブセットを決定することによって通常、決定される（例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第９，１８１，５８０号を参照されたい）。

【0091】

用語「閾値」および「閾値レベル」は、集団（例えば、応答者および非応答者）の２つのサブセット間を分割する線を規定するレベルを意味する。閾値または閾値レベルは、有病率カットオフまたはカットオフ値を規定することができる。

【0092】

本明細書で使用する場合、用語「処置（ｔｒｅａｔｍｅｎｔ）」、「処置する（ｔｒｅａｔ）」および「処置すること（ｔｒｅａｔｉｎｇ）」とは、本明細書に記載されている「病的状態」（例えば、がんなどの疾患）を反転させ、軽減し、その始まりを遅延させ、そして／またはその進行を阻害することを指す。一部の実施形態では、「処置」、「処置する」および「処置すること」は、疾患の兆候または症状が発症した、または観察されることを必要とする。他の実施形態では、処置は、疾患もしくは状態の兆候または症状の非存在下で行われることがある（例えば、症状歴に照らし合わせて、および／または遺伝的もしくは他の感受性因子に照らし合わせて）。処置はまた、症状が解決した後に、例えば再発を遅延または阻害させるために継続されてもよい。

【0093】

本発明は、がんを有する患者を診断および処置するための組成物および方法に関するので、用語「活性剤」、「抗がん剤」、「医薬剤」および「治療剤」は、互換的に使用され（特に文脈が明白に示さない限り）、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤およびそれらの薬学的に許容される塩は、活性剤、抗がん剤、医薬剤または治療剤として当業者によって理解される。留意される通り、処置法および使用は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩が投与されるか、または本明細書に記載されている１種もしくは複数の追加剤（例えば、追加の抗がん治療剤）と組み合わせて使用される、併用療法／使用を包含する。習慣に沿って、２種の薬剤を必要とするいずれかの実施形態では、本発明者らは、１つを「第１の」薬剤と称して、もう一方を「第２の」薬剤と称して、第１の薬剤および第２の薬剤が互いに区別されることを強調することができる。

【0094】

本発明はまた、本明細書に記載されている通りのＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と、好適な／特定された患者、処置のためにこのような患者を特定する方法（例えば、本明細書に記載されている診断的層別化法のうちいずれか１つにより）、および／またはＣＤＫ７阻害剤を単独でもしくは少なくとも１つの他の治療剤（例えば、追加の／第２の抗がん治療薬）と組み合わせて投与するための指示を記載する教材とを含むキットを特色とする。本発明のキットは、本明細書に記載されている第２の薬剤のうちいずれか１つまたは複数を含む第２の薬剤（例えば、抗がん剤）と、記載されている通りに特定された患者の集団における使用のための指示とを含むこともできる。

【0095】

表示されている通り、本明細書に開示されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を使用する各治療的方法および任意の診断方法はまた、使用に関して表現されることがあり、その反対であることもある。例えば、本発明は、本明細書に記載されている疾患（例えば、がん）を処置するための、本明細書に記載されている化合物または組成物の使用；疾患（例えば、がん）の診断および／または処置に使用するための化合物または組成物；および本明細書に記載されている疾患（例えば、がん）を処置する医薬を調製するための化合物または組成物の使用を包含する。

【0096】

本明細書に記載されているがんの診断および／または処置に関する本発明の方法（または、このような目的のためのＣＤＫ７阻害剤の使用）は、本明細書に記載されているタイプのがんのうちのいずれか１つまたは複数を具体的に除外してもよい。例えば、本発明は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を投与することによりがんを処置する方法を特徴とするが、但し、がんは乳がんではいこと、但し、がんは乳がんでも白血病でもないこと、但し、がんは、乳がん、白血病または卵巣がんではないことなどを条件とし、除外物は、本明細書において列挙されている疾患のタイプのいずれかから選択され、本発明の他の態様に関連する要素の一覧表示から変数を除外する（例えば、本明細書に記載される化合物の化学置換基またはキットおよび医薬組成物の構成成分）という同じ概念を伴う。

【0097】

一態様では、本発明は、（ａ）患者から取得されたがん細胞を含む生体試料中のＢＣＬ２様１ ＲＮＡ（例えば、ＢＣＬ－ＸＬをコードする一次ＲＮＡ転写物またはｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））のレベルであって、所定の閾値に等しいもしくはそれより低いレベル；または（ｂ）そのＤＮＡの変化（例えば、変異）、エピジェネティックな変化、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））の発現のレベルの変化、もしくはコードされるタンパク質の発現もしくは活性のレベルの変化を有するＲＢ－Ｅ２Ｆ経路における少なくとも１つの遺伝子を有することに基づいて特定された患者におけるがんの処置における、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩の使用を特色とする。そのような患者は、第２の薬剤としての白金をベースとする治療剤（例えば、カルボプラチンまたはオキサリプラチン）により処置することができる；そのがんが、白金をベースとする治療剤（例えば、カルボプラチンまたはオキサリプラチン）に対する抵抗性を発生させた患者であり得る；または単独で、もしくはアロマターゼ阻害剤、選択的エストロゲン受容体モジュレーターもしくは選択的エストロゲン受容体ディグレーダーのうち１つもしくは複数と組み合わせて使用されるＣＤＫ４／６阻害剤による処置を受けている患者であり得る。患者のがんは、ＣＤＫ４／６阻害剤に対して抵抗性になっていてよい、またはそうなるリスクがあってよい。本明細書に記載されている使用の文脈において（例えば、患者が、所定の閾値レベルに等しいまたはそれより低いＢＬＣ２様１ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベルを有することに基づいて選択された場合の）、がんは、乳がん（例えば、トリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）、卵巣がん、肺がん（例えば、非小細胞肺がん）または血液がん（例えば、急性骨髄性白血病（ＡＭＬ））であり得、それらのいずれも、新たに診断されたものであっても（処置ナイーブ）、または再発であっても、または以前の処置に対して不応性であってもよい。

【0098】

患者は、ベネトクラクスなどのＢｃｌ－２阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けることになる（例えば、その処置を処方された）患者であり得る。この使用の文脈において、患者は、ａ）所定の閾値に等しいもしくはそれより高い、がんにおけるＣＣＮＥ１遺伝子コピー数、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）もしくはタンパク質のレベル；ｂ）所定の閾値に等しいもしくはそれより低い、がんにおけるＲＢ１遺伝子コピー数、ｍＲＮＡもしくはタンパク質のレベル、もしくは発現された野生型ＲＢ１遺伝子の非存在；ｃ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより高いＣＤＫ６ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル；ｄ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより高いＣＣＮＤ２ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル；またはｅ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより低いＣＤＫＮ２Ａ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベルのうち１つまたは複数を有することに基づいて選択することができる。具体的な実施形態では、患者は、所定の閾値に等しいもしくはそれより高い、がんにおけるＣＣＮＥ１遺伝子コピー数、ｍＲＮＡもしくはタンパク質のレベル；所定の閾値に等しいもしくはそれより低い、がんにおけるＲＢ１遺伝子コピー数、ｍＲＮＡもしくはタンパク質のレベル；または発現された野生型ＲＢ１遺伝子の非存在を有することに基づいて選択される。この使用の文脈において、患者は、卵巣がん、乳がん、ＴＮＢＣまたはホルモン受容体陽性乳がんに罹患している可能性があり、患者は、タモキシフェンなどの選択的エストロゲン受容体モジュレーター、フルベストラントなどの選択的エストロゲン受容体ディグレーダーおよび／またはオラパリブもしくはニラパリブなどのＰＡＲＰ阻害剤による処置を受けていた、現在その処置を受けている、またはその処置を受けることになる患者であり得る。

【0099】

別の態様では、本発明は、がんを有する患者の処置における有効量の第２の薬剤との併用療法による、本明細書に記載されている通りに特定された患者の処置における、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩の使用であって、（ａ）がんが、ＴＮＢＣ、エストロゲン受容体陽性（ＥＲ^＋）乳がん、膵がんまたは頭部もしくは頸部の扁平上皮がんであり；第２の薬剤が、ＣＤＫ４／６阻害剤である；（ｂ）がんが、乳がんまたは卵巣がんであり；第２の薬剤が、ＰＡＲＰ阻害剤である；（ｃ）がんが、ＡＭＬであり；第２の薬剤が、ＦＬＴ３阻害剤である；（ｄ）がんが、卵巣がんであり；第２の薬剤が、白金をベースとする抗がん剤である；（ｅ）がんが、ＴＮＢＣ、ＡＭＬ、ユーイング肉腫または骨肉腫であり；第２の薬剤が、ＢＥＴ阻害剤である；（ｆ）がんが、ＴＮＢＣ、ＡＭＬ、卵巣がんまたは非小細胞肺がんであり；第２の薬剤が、Ｂｃｌ－２阻害剤である、使用を特色とする。特定の実施形態では、がんは、ＡＭＬ（例えば、単球性サブタイプの、例えば、ＡＭＬのＭ４またはＭ５サブタイプの）であり、第２の薬剤は、ベネトクラクスなどのＢｃｌ－２阻害剤である；がんは、卵巣上皮がん、卵管がん、原発性腹膜がん、トリプルネガティブ乳がんまたはＨｅｒ２^＋／ＥＲ^－／ＰＲ^－乳がんであり、第２の薬剤は、オラパリブまたはニラパリブなどのＰＡＲＰ阻害剤である；がんは、卵巣がんであり、第２の薬剤は、カルボプラチンまたはオキサリプラチンなどの白金をベースとする抗がん剤である。

【0100】

一実施形態では、本発明は、がんを処置する方法であって、有効量の本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩を、所定の閾値に等しいまたはそれより低い、がん（例えば、処置されるべき患者から取得された生体試料）におけるＢ細胞リンパ腫－エクストララージ（ｅｘｔｒａ ｌａｒｇｅ）（ＢＣＬ－ＸＬ）ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベルを有すると特定された患者（例えば、ヒト患者）（すなわち、「特定された患者」）に投与するステップを含む方法を特色とする。方法は、患者由来のがん細胞の試料中に存在するＢＣＬ－ＸＬ ｍＲＮＡのレベルを決定するステップをさらに含むことができ、これは一般に、本明細書に記載されている処置方法に当てはまる；分析されているバイオマーカーまたは問題になっているがんの型に関係なく、処置方法は、バイオマーカーを分析する明確なステップを用いずに、またはバイオマーカーが分析される（例えば、患者から生体試料を取得することにより）明確なステップを用いて、特定された患者において実行することができる。ヒト患者は、決定に対して応答性があるＣＤＫ７阻害剤に対して感受性があるがんを有すると診断されていてよく、ＢＣＬ－ＸＬバイオマーカーの状態は、本明細書に記載されている追加的な仕方のいずれかで決定することができる。所定の閾値は、カットオフ値または蔓延（ｐｒｅｖａｌｅｎｃｅ）カットオフである。ＣＤＫ７阻害剤に対して感受性があるがんを有すると決定された患者はその上、Ｂｃｌ－２阻害剤（例えば、ベネトクラクス（Ｖｅｎｃｌｅｘｔａ（登録商標）として入手可能））を投与されてよく、本明細書に記載されている通りに選択された患者（ＢＣＬ－ＸＬの状態の分析により）は、乳がん、卵巣がん、肺がんまたは血液学的がんに罹患している可能性がある。より具体的には、患者は、ＴＮＢＣ、卵巣がん、非小細胞肺がんまたはＡＭＬに罹患している可能性がある。

【0101】

一実施形態では、本発明は、がん（例えば、ＴＮＢＣまたはＨＲ＋乳がんを含む、本明細書に記載されている通りの乳がん）を処置する方法であって、有効量の本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩を、ｃ－ｍｙｃの変異、コピー数変化（ＣＮＡ）、染色体転座もしくは転写上方制御（例えば、所定の閾値レベルに等しいまたはそれより高いＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））レベルによって証明される通り）、所定の閾値よりも高いｃ－ｍｙｃ ＳＥもしくはＳＥ強度、またはＭＹＣの発現もしくは活性の増大によって特定された患者（例えば、ヒト患者）に投与するステップを含む方法を特色とする（Ｋａｌｋａｔ ｅｔ ａｌ．， Ｇｅｎｅｓ ８（６）：１５１， ２０１７を参照）。ｃ－ｍｙｃは、６２，０００および６６，０００の見かけ分子量を有する少なくとも２つのリンタンパク質をコードし（Ｒａｍｓａｙ ｅｔ ａｌ．， Ｐｒｏｃ． Ｎａｔｌ． Ａｃａｄ． Ｓｃｉ． （ＵＳＡ） ８１（２４）：７７４２－７７４６， １９８４を参照されたい）、ｃｈｒ８：１２８６２８０８８－１２８７７８３０８（ヒトゲノムビルドｈｇ１９／ＧＲＣｈ３７のジーンコードｖ１９アノテーション）におけるＭＹＣ遺伝子に関連するＳＥ遺伝子座が存在するＨ３Ｋ２７Ａｃ ＣｈＩＰ－ｓｅｑ（ＣｈＩＰ配列決定）法により決定された。

【0102】

本方法において、ＣＤＫ１８ ＳＥ（例えば、所定の閾値よりも高いＣＤＫ１８ ＳＥ強度を特定すること）またはＦＧＦＲ１ ＳＥ（例えば、所定の閾値よりも高いＦＧＦＲ１ ＳＥ強度を特定すること）を評価することができる。一部の実施形態では、方法は、患者由来のがん細胞を含む生体試料におけるＳＥを分析するステップ（例えば、その存在もしくは非存在および／またはその強度を決定することにより）をさらに含む。ヒト患者は、決定に対して応答性があるＣＤＫ７阻害剤に対して感受性があるがんを有すると診断されていてよい。本明細書に記載されている通りに選択された患者（ＭＹＣ、ＣＤＫ１８またはＦＧＦＲ１の状態の分析により）は、乳がん（例えば、ＴＮＢＣ）に罹患している可能性がある。患者を特定する診断ステップは、ＭＹＣ ＳＥまたはＣＤＫ１８ ＳＥの存在（または非存在）または強度に基づき得る。これらの方法および他の方法において、患者は、卵巣がんに罹患している可能性があり、診断は、ＭＹＣ、ＣＤＫ１８またはＦＧＦＲ１ ＳＥの存在、非存在または強度に基づき得る。

【0103】

一実施形態では、本発明は、がんを有するヒト患者を診断および処置する方法であって、（ａ）患者由来のがん細胞の試料を分析することによって以前に決定された、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫ１８およびＣＤＫ１９から選択されるバイオマーカーの状態（例えば、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル）に基づき、患者が、ＣＤＫ７阻害剤に対して感受性があるがんを有するかどうかを診断するステップと、（ｂ）有効量の本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩を、がんを有すると特定された患者に投与するステップであって、（ｉ）ＣＤＫ１８もしくはＣＤＫ１９バイオマーカーの状態（例えば、ＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベル）が、所定の閾値に等しいもしくはそれより高いか、または（ｉｉ）ＣＤＫ７もしくはＣＤＫ９バイオマーカーの状態（例えば、ＣＤＫ７またはＣＤＫ９ ｍＲＮＡレベル（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））が、所定の閾値に等しいまたはそれより低いのいずれかである（すなわち、「選択された対象」）ステップとを含む方法を特色とする。これらの方法は、対象のがん細胞におけるＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫ１８およびＣＤＫ１９から選択されるＣＤＫバイオマーカーの状態を決定するステップ；患者から生体試料を取得するステップを含むことができる能動的（ａｃｔｉｖｅ）分析ステップによって決定するステップをさらに含むことができる。患者は、決定に対して応答性があるＣＤＫ７阻害剤に対して感受性があるがんを有すると診断されていてよい。他の実施形態と同様に、ＣＤＫ７阻害剤は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩であり得る。バイオマーカーが、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９である場合、患者は、リンパ腫を有し得、診断／特定ステップは、より具体的には、ＣＤＫ７（例えば、ＣＤＫ７ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル）の分析に基づき得る；患者は、ＴＮＢＣを有し得、診断／特定ステップは、より具体的には、ＣＤＫ９（例えば、ＣＤＫ９ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル）に基づく；患者は、ＴＮＢＣを有し得、診断ステップは、より具体的には、ＣＤＫ１８（例えば、ＣＤＫ１８ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル）に基づく；患者は、ＴＮＢＣまたはＳＣＬＣを有し得、診断ステップは、より具体的には、ＣＤＫ１９（例えば、ＣＤＫ１９ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル）に基づく。

【0104】

併用療法に関すると、本明細書に記載されている通りに特定された患者は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を第２の薬剤と組み合わせて処置することができ、上記の第２の薬剤は、以下に限定されないが、ＡＰＧ－１２５２、ＡＰＧ－２５７５、ＢＰ１００２（プレキシゲベルセン）、オブリメルセン（Ｇ３１３９）として知られているアンチセンスオリゴヌクレオチド、Ｓ５５７４６／ＢＣＬ２０１またはベネトクラックス（例えば、Ｖｅｎｃｌｅｘｔａ（登録商標）として上市されているベネトクラックス錠剤）などのＢｃｌ－２阻害剤；アルボシジブ／ＤＳＰ－２０３３／フラボピリドール、ＡＴ７５１９、ＡＺＤ５５７６、ＢＡＹ１２５１１５２、ＢＡＹ１１４３５７２、ＣＹＣ０６５、ナノフラボピリドール、ＮＶＰ２、セリシクリブ（ＣＹＣ２０２）、ＴＧ０２、ＴＰ－１２８７、ＶＳ２－３７０またはボルシクリブ（以前のＰ１４４６Ａ－０５）などのＣＤＫ９阻害剤；フルベストラント（例えば、Ｆａｓｌｏｄｅｘ（登録商標）および他のものとして上市されている）などのホルモン受容体（例えば、エストロゲン受容体）分解剤；ＣＤＸ－３０１、ＣＧ’８０６、ＣＴ０５３ＰＴＳＡ、クレノラニブ（例えば、ベシル酸クレノラニブ）、ＥＮＭＤ－２０７６、ＦＦ－１０１０１－０１、ＦＬＹＳＹＮ、ギルテリチニブ（ＡＳＰ２２１５）、ＨＭ４３２３９、レスタウチニブ、ポナチニブ（例えば、Ｉｃｌｕｓｉｇ（登録商標）として上市されており、以前のＡＰ２４５３４）、ＮＭＳ－０８８、ソラフェニブ（例えば、Ｎｅｘａｖａｒ（登録商標）として上市されている）、スニチニブ、パクリチニブ、ペキシダルチニブ／ＰＬＸ３３９７、クイザルチニブ、ミドスタウリン（例えば、Ｒｙｄａｐｔ（登録商標）として上市されている）、ＳＥＬ２４、ＳＫＩ－Ｇ－８０１またはＳＫＬＢ１０２８などのＦｌｔ３（ＦＭＳ様チロシンキナーゼ３）阻害剤；オラパリブ（例えば、Ｌｙｎｐａｒｚａ（登録商標）として上市されている）、ルカパリブ（例えば、Ｒｕｂｒａｃａ（登録商標）として上市されている）、タラゾパリブ（例えば、Ｔａｌｚｅｎｎａ（登録商標）として上市されている）、ベリパリブ（ＡＢＴ－８８８）またはニラパリブ（例えば、Ｚｅｊｕｌａ（登録商標）として上市されている）などのＰＡＲＰ阻害剤；ＡＢＢＶ－０７５、ＢＡＹ－２９９、ＢＡＹ－１２３８０９７、ＢＭＳ－９８６１５８、ＣＰＩ－０６１０、ＣＰＩ－２０３、ＦＴ－１１０１、ＧＳ－５８２９、ＧＳＫ－２８２０１５１、ＧＳＫ－５２５７６２、Ｉ－ＢＥＴ１５１、Ｉ－ＢＥＴ７６２、ＩＮＣＢ０５４３２９、ＪＱ１、ＭＳ４３６、ＯＴＸ０１５、ＰＦＩ－１、ＰＬＸ５１１０７、ＲＶＸ２１３５、ＴＥＮ－０１０、ＺＥＮ－３６９４、またはその全体が参照により本明細書に組み込まれている米国出願第１２／８１０，５６４号（現在の米国特許第８，４７６，２６０号）に開示されている化合物などのＢＥＴ阻害剤；シスプラチン、オキサリプラチン（例えば、Ｅｌｏｘａｔｉｎ（登録商標）として上市されている）、ネダプラチン、カルボプラチン（例えば、Ｐａｒａｐｌａｔｉｎ（登録商標）として上市されている）、フェナントリプラチン、ピコプラチン、サトラプラチン（ＪＭ２１６）または四硝酸トリプラチンなどの白金をベースとする治療剤；ＢＰＩ－１１７８、Ｇ１Ｔ３８、パルボシクリブ（例えば、Ｉｂｒａｎｃｅ（登録商標）として上市されている）、リボシクリブ（例えば、Ｋｉｓｑａｌｉ（登録商標）として上市されている）、ＯＮ１２３３００、トリラシクリブまたはアベマシクリブ（例えば、Ｖｅｒｚｅｎｉｏ（登録商標）として上市されている）などのＣＤＫ４／６阻害剤；トラメチニブ（例えば、Ｍｅｋｉｎｉｓｔ（登録商標）として上市されている）などのＭＥＫ阻害剤；または必要に応じてクラスＩ（例えば、クラスＩＡ）の、および／または特定のＰＩ３Ｋアイソフォームを必要に応じて指向するホスホイノシチド３－キナーゼ（ＰＩ３キナーゼ）阻害剤であり得る。ＰＩ３Ｋ阻害剤は、イデラリシブ（例えば、Ｚｙｄｅｌｉｇ（登録商標）として上市されている）、コパンリシブ（例えば、Ａｌｉｑｏｐａ（登録商標）として上市されている）、デュベリシブ（例えば、Ｃｏｐｉｋｔｒａ（登録商標）として上市されている）またはアルペリシブ（例えば、Ｐｉｑｒａｙ（登録商標）として上市されている）であり得る。他の実施形態では、追加剤／第２の薬剤は、カペシタビン（例えば、Ｘｅｌｏｄａ（登録商標）として上市されている）であり得る。

【0105】

ＡＰＧ－１２５２は、ＳＣＬＣまたは別の固形腫瘍を有する患者に、２８日間のサイクルで、３週間、毎週２回、静脈内に１０～４００ｍｇの間（例えば、１６０ｍｇ）を投与すると、早期臨床試験において有望であることを示したデュアルＢｃｌ－２／Ｂｃｌ－ｘＬ阻害剤である（Ｌａｋｈａｎｉ ｅｔ ａｌ．， Ｊ． Ｃｌｉｎ． Ｏｎｃｏｌ． ３６：１５＿ｓｕｐｐｌ， ２５９４およびＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０３０８０３１１を参照されたい）。ＡＰＧ－２５７５は、イブルチニブと組み合わせたＦＬおよびＤＬＢＣＬの前臨床研究において有望であることを示したＢｃｌ－２選択的阻害剤であり（Ｆａｎｇ ｅｔ ａｌ．， ＡＡＣＲ Ａｎｎｕａｌ Ｍｅｅｔｉｎｇ ２０１９， Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ． ７９（１３ Ｓｕｐｐｌ）：Ａｂｓｔｒａｃｔ Ｎｏ． ２０５８を参照されたい）、血液がんを有する患者に対して単剤処置として臨床試験が開始された；用量漸増試験では、患者は、１サイクルとして４週間連続して、経口により１日１回、２０ｍｇの投与を受けている。ＭＴＤを特定するため、５０、１００、２００、４００、６００および８００ｍｇの漸増が計画され（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０３５３７４８２を参照されたい）。ＢＰ１００２は、他のアンチセンスアナログほど有害作用を有さないことがあるＢｃｌ－２ ｍＲＮＡを標的とする非電荷Ｐ－エトキシアンチセンスオリゴデオキシヌクレオチドであり、４日間、ＢＰ１００２と共にインキュベートしたヒトリンパ腫細胞系、およびＳＣＩＤマウスに埋め込まれたＣＪ細胞（形質変換ＦＬ細胞）の成長を阻害するのに有望であることを示した（Ａｓｈｉｚａｗａ ｅｔ ａｌ．， ＡＡＣＲ Ａｎｎｕａｌ Ｍｅｅｔｉｎｇ ２０１７， Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ． ７７（１３ Ｓｕｐｐｌ）：Ａｂｓｔｒａｃｔ Ｎｏ． ５０９１を参照されたい）。ＢＰ１００２もまた、ＡＭＬを有する患者にシタラビン（ＬＤＡＣ）と組み合わせて投与されている（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号 ＮＣＴ０４０７２４５８を参照されたい）。Ｓ５５７４６／ＢＣＬ２０１は、経口利用可能な選択的Ｂｃｌ－２阻害剤であり、マウスでは、２つの血液がん異種移植片モデルにおいて抗腫瘍効力があることを実証した（Ｃａｓａｒａ ｅｔ ａｌ．， Ｏｎｃｏｔａｒｇｅｔ ９（２８）：２００７５－８８， ２０１８）。ＣＬＬまたはＢ細胞ＮＨＬ（ＦＬ、ＭＣＬ、ＤＬＢＣＬ、ＳＬＬ、ＭＺＬおよびＭＭを含む）を有する患者への、最大で１５００ｍｇの用量で、５０または１００ｍｇのＳ５５７４６を含有するフィルムコート錠剤を投与する第Ｉ相用量漸増研究を設計した（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０２９２０６９７を参照されたい）。ベネトクラックス錠剤は、ＣＬＬまたはＳＬＬを有する成人患者を処置するため、および少なくとも７５歳であるか、または強力な誘導化学療法の使用不可能にする共存症を有する患者において、新たに診断されたＡＭＬを処置するため、アザシチジンまたはデシタビンまたは低用量のシタラビンと組み合わせて承認されている。ＣＬＬ／ＳＬＬの投与は、５週間の強化スケジュールの後に行うことができ、ＡＭＬの投与は、４日間の強化スケジュールの後に行うことができ、どちらも、他の適切な情報と共に製品インサートに記載されている（それらの全体が参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第８，５４６，３９９号；同第９，１７４，９８２号；および同第９，５３９，２５１号も参照されたい）。アルボシジブは、ＡＭＬを有する患者において、シタラビン／ミトキサントロンまたはシタラビン／ダウノルビシンと組み合わせて研究が行われ、投与の詳細は、識別番号ＮＣＴ０３５６３５６０を有するＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖにおいて入手可能である（Ｙｅｈ ｅｔ ａｌ．， Ｏｎｃｏｔａｒｇｅｔ ６（５）：２６６７－２６７９， ２０１５， Ｍｏｒａｌｅｓ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ Ｃｙｃｌｅ １５（４）：５１９－５２７， ２０１６およびＺｅｉｄｎｅｒ ｅｔ ａｌ．， Ｈａｅｍａｔｏｌｏｇｉｃａ １００（９）：１１７２－１１７９， ２０１５も参照されたい）。ＡＴ７５１９は、不応性固形腫瘍を有する適格患者への用量漸増形式で投与されている。臨床活性の証拠がいくらか存在するが、ＱＴｃ長期化が見られたので、Ｍａｈａｄｅｖａｎらにより記載されている用量スケジュールでのさらなる開発は行われなかった（Ｊ． Ｃｌｉｎ． Ｏｎｃｏｌ． ＡＳＣＯ Ａｂｓｔｒａｃｔ Ｎｏ． ３５３３；ＭＭにおいてＡＴ７５１９の前臨床活性を説明する、Ｓａｎｔｏ ｅｔ ａｌ．， Ｏｎｃｏｇｅｎｅ ２９：２３２５－２３３６， ２０１０も参照されたい）。ＡＺＤ５５７６は、ナノモル濃度レベルで、乳がんおよび肺がん細胞系におけるアポトーシスを誘導し（Ｌｉ ｅｔ ａｌ．， Ｂｉｏｏｒｇ． Ｍｅｄ． Ｃｈｅｍ． Ｌｅｔｔ． ２７（１５）：３２３１－３２３７， ２０１７を参照されたい）、ＮＨＬの処置の場合、単独で、およびアカラブルチニブと組み合わせて試験されている（ＡＡＣＲ ２０１７ Ａｂｓｔｒａｃｔ Ｎｏ． ４２９５を参照されたい）。ＢＡＹ１２５１１５２は、進行性血液がんを有する患者において、ＭＴＤを特徴付ける第Ｉ相臨床試験の対象であった。この薬剤は２１日間のサイクルで毎週、注入された（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０２７４５７４３を参照されたい；Ｌｕｅｃｋｉｎｇ ｅｔ ａｌ．， ＡＡＣＲ ２０１７ Ａｂｓｔｒａｃｔ Ｎｏ． ９８４もやはり参照されたい）。ボルシクリブは、ＭＣＬ－１を抑制し、ＢＣＬ２阻害剤に対する高いリスクのＤＬＢＣＬを感作する、臨床段階にある経口ＣＤＫ９阻害剤である。Ｄｅｙら（Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ Ｒｅｐｏｒｔｓ ７：１８００７， ２０１７）は、ボルシクリブおよびベネトクラックスを組み合わせると、高いリスクにあるＤＬＢＣＬ患者の小集団に有望であることを示唆している（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０３５４７１１５もまた参照されたい）。フルベストラントは、進行性ホルモン受容体（ＨＲ）－ポジティブ乳がん、ＨＥＲ２－ネガティブ乳がんを有する閉経後女性、他の抗エストロゲン治療法による処置、およびパルボシクリブ（Ｉｂｒａｎｃｅ（登録商標））と組み合わせた処置の後にその疾患が進行したＨＲポジティブ転移性乳がんを有する閉経後女性への投与に承認されている。フルベストラントは、１日目、１５日目および２９日目、およびこれ以降毎月１回、５００ｍｇまたは２５０ｍｇ（中度の肝障害を有する患者の場合、一層少ない用量が推奨される）で筋肉内注射することにより投与される（追加情報に関しては、製品インサートを参照されたい；それらの各々の全体が参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第６，７４４，１２２号；同第７，４５６，１６０号；同第８，３２９，６８０号；および同第８，４６６，１３９号も参照されたい）。ポナチニブは、臨床試験において、ＣＭＬまたはＡＬＬ（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ００６６０９２０７２、ＮＣＴ０１２０７４４０１９７３、ＮＣＴ０２４６７２７０、ＮＣＴ０３７０９０１７、ＮＣＴ０２４４８０９５、ＮＣＴ０３６７８４５４およびＮＣＴ０２３９８８２５を参照されたい）、ならびに胆道がんおよびＮＳＣＬＣなどの固形腫瘍（ＮＣＴ０２２６５３４１、ＮＣＴ０２２７２９９８、ＮＣＴ０１８１３７３４、ＮＣＴ０２２６５３４１、ＮＣＴ０２２７２９９８、ＮＣＴ０１８１３７３４、ＮＣＴ０２２６５３４１、ＮＣＴ０２２７２９９８、ＮＣＴ０１８１３７３４、ＮＣＴ０１９３５３３６、ＮＣＴ０３１７１３８９およびＮＣＴ０３７０４６８８；Ｔａｎ ｅｔ ａｌ．， Ｏｎｃｏ． Ｔａｒｇｅｔｓ Ｔｈｅｒ． １２：６３５－６４５， ２０１９による総説も参照されたい）を有する患者に投与されている。投与レジメンに関する追加情報は、製品インサートに見出すことができる。それらの各々の全体が参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第８，１１４，８７４号；同第９，０２９，５３３号；および同第９，４９３，４７０号も参照されたい。ソラフェニブは、腎臓および肝臓がん、ＡＭＬ、および放射活性ヨウ素抵抗性の進行性甲状腺がんを処置するために承認されており、デスモイド型線維腫症を有する患者において、臨床試験が開始された（ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０２０６６１８１を参照されたい）。投与量に関する情報は、製品インサートに見出すことができ、このインサートは、４００ｍｇの錠剤２個を１日２回、投与するよう助言している。それらの各々の全体が参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第７，２３５，５７６号；同第７，３５１，８３４号；同第７，８９７，６２３号；同第８，１２４，６３０号；同第８，６１８，１４１号；同第８，８４１，３３０号；同第８，８７７，９３３号；および同第９，７３７，４８８号も参照されたい。ミドスタウリンは、ＡＭＬ、ＭＤＳまたは全身性肥満細胞症を有する患者に投与されており、慣用的な誘導治療法および地固め療法と組み合わせた場合、ＦＬＴ３変異ＡＭＬ患者の生存を有意に延ばすことを見出されている（Ｓｔｏｎｅ ｅｔ ａｌ．， ＡＳＨ ５７ｔｈ Ａｎｎｕａｌ Ｍｅｅｔｉｎｇ， ２０１５およびＧａｌｌｏｇｌｙ ｅｔ ａｌ．， Ｔｈｅｒ． Ａｄｖ． Ｈｅｍａｔｏｌ． ８（９）：２４５－２５１， ２０１７を参照されたい；臨床は、製品インサート、ＣｌｉｎｉｃａｌＴｒｉａｌｓ．ｇｏｖ識別番号ＮＣＴ０３５１２１９７、およびそれらのそれぞれの全体が参照により本明細書に組み込まれている、米国特許第７，９７３，０３１号；同第８，２２２，２４４号；および同第８，５７５，１４６号も参照されたい）。ここで提示されている、および公表されている情報を使用して、本発明の方法および使用を実践することができる。疑念がある場合、本発明は、本発明の化合物またはそれらの薬学的に許容される塩およびいずれか１つまたは複数の追加剤／第２の薬剤を必要とする併用療法を包含し、これは、単一使用に現在承認されている投与量（例えば、上記の通り）でまたはそれ未満で本明細書に記載されている患者に投与され得る。

【0106】

併用療法が、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤、および：ＣＤＫ４／６阻害剤を使用する場合、患者は、乳がん（例えば、ＴＮＢＣまたはＥＲ＋乳がん）、膵臓がん、肺がん（例えば、ＳＣＬＣまたはＮＳＣＬＣ）または頭頸部扁平上皮細胞がんを有することができ；ＣＤＫ９阻害剤を使用する場合、患者は、乳がん、およびより詳細には、Ｈｅｒ２^＋／ＥＲ^－／ＰＲ^－乳がんを有することができ；ＦＬＴ３阻害剤（例えば、ミドスタウリン）を使用する場合、患者は、血液学的がん（例えば、ＡＭＬ）を有することができ；ＢＥＴ阻害剤を使用する場合、患者は、血液学的がん（例えば、ＡＭＬ）、乳がん（例えば、ＴＮＢＣ）、骨肉腫またはユーイング肉腫を有することができ；Ｂｃｌ－２阻害剤（例えば、ベネトクラックス）を使用する場合、患者は、乳がん（例えば、ＴＮＢＣ）、卵巣がん、肺がん（例えば、ＮＳＣＬＣ）または血液学的がん（例えば、ＡＭＬ（例えば、新たに診断されたＡＭＬ）、慢性リンパ球性白血病（ＣＬＬ）または小リンパ球性リンパ腫（ＳＬＬ）（１７ｐ欠失ありまたはなし））を有することができ；またはＰＡＲＰ阻害剤（例えば、ニラパリブまたはオラパリブ）を有する場合、患者は、乳がん（例えば、ＴＮＢＣまたはＨｅｒ２^＋／ＥＲ^－／ＰＲ^－乳がん）、卵巣がん（例えば、上皮性卵巣がん）、卵管がんまたは原発性腹膜がんを有することができる。患者が、本明細書に記載されている通りのＣＤＫ７阻害剤およびＢｃｌ－２阻害剤（例えば、ベネトクラクス）により処置される場合、患者は、アザシチジン、デシタビンおよび低用量シタラビンから選択される第３の薬剤により同様に処置することができる。

【0107】

本発明は、がんを処置するための医薬品キットであって、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と、必要に応じて、（ａ）Ｂｃｌ－２阻害剤、（ｂ）ＣＤＫ９阻害剤、（ｃ）Ｆｌｔ３阻害剤、（ｄ）ＰＡＲＰ阻害剤、（ｅ）ＢＥＴ阻害剤および（ｆ）ＣＤＫ４／６阻害剤から選択される第２の治療剤とを含み、これらのいずれも、本明細書に開示されているものから選択することができ、本明細書に記載されている通りに、または製造業者によって指示される通りに投与することができる、医薬品キットを提供する。キットは、（ａ）本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤もしくは薬学的に許容されるその塩および／または第２の治療剤を再構成するため（必要であれば）；（ｂ）本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤もしくは薬学的に許容されるその塩および／または第２の治療剤の各々を投与するため；ならびに／または（ｃ）キットが有用となる具体的ながんもしくはがんが決定され得る診断方法のリストのための、必要に応じた指示を含むことができる。キットは、その中に含有される活性薬剤（複数可）の投与において有用な用具のいずれかの型を含むこともできる（例えば、管状材料、シリンジ、針、無菌包帯材、テープおよびその他）。

【0108】

本発明は、がんを有するヒト患者を処置する方法であって、ＲＢ－Ｅ２Ｆ経路に関与する遺伝子の少なくとも１つにおいて、（１）ＤＮＡの変化（例えば、遺伝子コピー数、変異、メチル化）；（２）エピジェネティックな変化（例えば、ヒストンメチル化、ヒストンアセチル化）；または（３）ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））もしくはタンパク質の発現のレベルの変化を有すると特定された患者に、有効量の本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩を投与するステップを含む方法を提供する。患者は、ＲＢ－Ｅ２Ｆ経路に関与する少なくとも１つの遺伝子から発現されるｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベルの変化を有すると特定された（すなわち、選択された）患者である。この態様では、患者に有効量の本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩を投与する前に、患者は、所定の閾値に等しいもしくはそれより高い、ＲｂＥ２Ｆ経路に関与する少なくとも１つの遺伝子のＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））のレベル、または所定の閾値に等しいまたはそれより低い、ＲＢ－Ｅ２Ｆ経路に関与する少なくとも１つの遺伝子のＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））のレベルのいずれかを有すると決定される。

【0109】

当業者には、がんにおいて活性化または過剰発現されるＲＢ－Ｅ２Ｆ経路における遺伝子に関して、（１）増大された発現をもたらした、このような遺伝子をコードするＤＮＡの変化（例えば、上昇された遺伝子コピー数、増大された活性を生じた変異、増大された発現を生じたメチル化の変化）；（２）増大された発現をもたらした、当該遺伝子に関連するエピジェネティックな変化（例えば、増大された発現を生じたヒストンメチル化またはヒストンアセチル化パターン）；または（３）ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）もしくは当該遺伝子によってコードされるタンパク質の発現のレベルの増大を有する患者を選択するであろうことが容易に明らかとなるであろう。がんにおいて不活性化または過小発現されるＲＢ－Ｅ２Ｆ経路における遺伝子のために、（１）低下された発現もしくは活性をもたらした、当該遺伝子をコードするＤＮＡの変化（例えば、低減された遺伝子コピー数、低下された活性または不活性を生じた変異、低下された発現を生じたメチル化の変化）；（２）低下された発現をもたらした、当該遺伝子に関連するエピジェネティックな変化（例えば、低下された発現を生じた、ヒストンメチル化またはヒストンアセチル化パターン）；または（３）ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）もしくは当該遺伝子によってコードされるタンパク質の発現のレベルの低下を有する患者を選択するであろう。

【0110】

バイオマーカーとしてＲＢ－Ｅ２Ｆ経路遺伝子の使用に関する一部の態様では、本発明は、がんを有しているヒト患者を処置する方法であって、（ａ）所定の閾値に等しいかまたはそれより高いＣＣＮＥ１ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）またはがんのタンパク質のレベル、および／または（ｂ）所定の閾値に等しいかまたはそれより低いＲＢ１ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）またはがんのタンパク質のレベルのどちらかを有すると特定された患者に、有効量のＣＤＫ７阻害剤を投与するステップを含む、方法を提供する。これらの方法の一部の実施形態では、当業者は、患者に由来するがん細胞の試料中に存在する、ＲＢ１および／またはＣＣＮＥ１ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）またはタンパク質のレベルを求めることができる。一部の実施形態では、ヒト患者は、その決定に応答するＣＤＫ７阻害剤に感受性のあるがんを有すると診断されている；ヒト患者は、卵巣がんに罹患している；および／またはヒト患者は、乳がんに罹患している。一部の実施形態では、ヒト患者は、トリプルネガティブ乳がん（ＴＮＢＣ）またはホルモン受容体陽性（ＨＲ^＋（例えば、ＨＲ＋／ＨＥＲ２－）乳がんを患う。これらの実施形態のいずれかでは、ＣＤＫ７阻害剤は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩であり、この阻害剤またはその塩は、ＰＡＲＰ阻害剤またはタモキシフェンもしくはフルベストラントなどのＳＥＲＭもしくはＳＥＲＤと必要に応じて同時投与される。これらの実施形態の一部では、がんは、パルボシクリブに対して不応性である。

【0111】

本発明は、ＣＤＫ７阻害剤およびがんに対する白金をベースとする標準治療（ＳＯＣ）の抗がん剤またはタキサンの組み合わせを患者に投与することによってヒト患者におけるがんを処置する方法を提供する。がんは、卵巣がんであり得、ＳＯＣ抗がん剤は、白金をベースとする抗がん剤（例えば、カルボプラチン、シスプラチンまたはオキサリプラチン）および本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩であり得る。一部の実施形態では、ヒト患者は、単剤療法として、またはＣＤＫ７阻害剤以外の抗がん剤と組み合わせてのどちらか一方で投与した場合に、白金をベースとする抗がん剤に対して抵抗性がある、抵抗性があると決定される、または抵抗性になっている（いくらかの初期応答後）。本実施形態の一部の態様では、ヒト患者は、以前の処置の初期有効性がいくらかあった後に、単剤療法として、またはＣＤＫ７阻害剤以外の抗がん剤と組み合わせてのどちらか一方で投与した場合に、白金をベースとする抗がん剤に抵抗性になったと決定される。本実施形態の一部の態様では、ＳＯＣ抗がん剤は、タキサン（例えば、パクリタキセル）である。

【0112】

本発明はまた、ＣＤＫ４／６阻害剤による処置に抵抗性があることに基づいて選択されるヒト患者における、ＨＲ^＋乳がんを処置する方法であって、患者に本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を投与するステップを含む、方法も提供する。一部の実施形態では、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を投与する前に、患者は、ＣＤＫ４／６阻害剤を単独で、またはＣＤＫ７阻害剤以外の乳がんのための別のＳＯＣ剤（アロマターゼ阻害剤（例えば、レトロゾール、アナストロゾール）またはＳＥＲＭ（例えば、タモキシフェンまたはフルベストラントなどのＳＥＲＤ）と組み合わせた処置の前に、抵抗性である、抵抗性があると決定された、または抵抗性になっている（いくらかの初期応答後）。言い換えると、特定された患者は、ＣＤＫ４／６阻害剤を単独で、またはＣＤＫ７阻害剤以外の、乳がんのための別のＳＯＣ剤と組み合わせて処置する前に抵抗性であることに基づいて、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩による処置について選択される。一部の実施形態では、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩は、アロマターゼ阻害剤またはフルベストラントに関する失敗の後に、アロマターゼ阻害剤（例えば、アナストロゾール、エキセメスタンまたはレトロゾール）などの別のＳＯＣ剤、またはタモキシフェンまたはフルベストラントなどのＳＥＲＭもしくはＳＥＲＤ、または第２選択処置と共投与される。一部の実施形態では、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩の投与前に、患者は、ＣＤＫ４／６阻害剤を単独で、またはアロマターゼ阻害剤（例えば、アナストロゾール、エキセメスタンまたはレトロゾール）、またはＳＥＲＭ、またはタモキシフェンなどのＳＥＲＤ、またはフルベストラントなどのＣＤＫ７阻害剤以外の、乳がんのための別のＳＯＣ剤と組み合わせた処置に抵抗性である、抵抗性があると決定された、または抵抗性になっている；本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩は、乳がん（例えば、アロマターゼ阻害剤、またはＳＥＲＭ、またはタモキシフェンなどのＳＥＲＤ、またはフルベストラントの失敗の後の第２選択処置）のためのＳＯＣ剤と共投与される。

【0113】

本発明は、がんを有するヒト患者を診断および処置する方法であって、（ａ）患者由来のがん細胞の試料において以前に決定された、ＦＧＦＲ１、ＣＤＫ６、ＣＣＮＤ２もしくはＣＤＫＮＡ２のレベルまたは野生型ＲＢ１遺伝子の非存在に基づき、患者が、ＣＤＫ７阻害剤に対して感受性があるがんを有するかどうかを診断するステップと、（ｂ）有効量のＣＤＫ７阻害剤を、がんを有すると特定された患者に投与するステップとを含み、（ａ）ＦＧＦＲ１、ＣＤＫ６もしくはＣＣＮＤ２Ａ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベルが、所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより高いか；（ｂ）ＣＤＫＮ２Ａ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベルが、所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより低いか；または（ｃ）患者が、野生型ＲＢ１遺伝子の存在を欠く、方法を提供する。これらの実施形態の一部の態様では、化合物は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩である。これらの実施形態の一部の態様では、がんは、卵巣がんである。

【0114】

関連する実施形態では、本発明は、（ａ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより高い、ＦＧＦＲ１ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル；（ｂ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより高い、ＣＤＫ６ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル；（ｃ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより高い、ＣＣＮＤ２ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル；（ｄ）所定の閾値レベルに等しいもしくはそれより低い、ＣＤＫＮ２Ａ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）のレベル；または（ｅ）野生型ＲＢ１遺伝子の非存在のうち１つまたは複数を有するがんに基づいて選択されたヒト患者におけるがんを処置する方法であって、選択された患者が、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩を投与される、方法を提供する。一部の実施形態では、がんは、卵巣がんである。

【0115】

エンハンサーまたはＳＥは、当分野において公知の様々な方法によって特定することができる（その各々の全体が、参照により本明細書に組み込まれている、Ｈｉｎｓｚ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ， １５５：９３４－９４７， ２０１３； ＭｃＫｅｏｗｎ ｅｔ ａｌ．， Ｃａｎｃｅｒ Ｄｉｓｃｏｖ．， ７（１０）：１１３６－５３， ２０１７；およびＰＣＴ／ＵＳ２０１３／０６６９５７を参照されたい）。ＳＥの特定は、患者（例えば、生検、または本明細書に記載されている他の起源）に由来する生体試料を取得することによって実現することができる。エンハンサー測定に対する重要な測定基準は、二次元で行われる：ゲノムマーカー（例えば、Ｈ３Ｋ２７Ａｃ）が連続的に検出されるＤＮＡの長さに沿って、およびそのＤＮＡのスパンに沿った各塩基対におけるゲノムマーカーの編集された発生率、すなわちこれらの大きさを構成する編集された発生率。長さおよび大きさの分析の統合に由来する曲線下面積（「ＡＵＣ」）の測定により、エンハンサーの強度が決まる。適切な参照に対する、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（上方制御されるものについての表を参照のこと）のＳＥをコードするある特定の遺伝子の強度は、患者を診断（階層化）するために使用することができ、それにより、患者は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩に十分に応答する可能性が高いかどうかを決定することができる。特に、本明細書に鑑みると、ゲノムマーカーが検出されるＤＮＡの長さが、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（上方制御されるものについての表を参照のこと）をコードするある特定の遺伝子、および参照／対照の各々に関して同じであれば、対照に対する、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（上方制御されるものについての表を参照のこと）のＳＥをコードするある特定の遺伝子の大きさの比は強度と等価となり、この比をやはり使用して、患者は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩に応答するかどうかを決定することができる。細胞における、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（上方制御されるものについての表を参照のこと）のＳＥをコードするある特定の遺伝子の強度は、これらを他の試料と比較する前に正規化することができる。正規化は、すべての細胞において同様のレベルで存在する、ユビキタスＳＥまたはエンハンサーを含むことが知られている同じ細胞中の領域と比較することによって実現される。このようなユビキタススーパーエンハンサー領域の一例は、ＭＡＬＡＴ１スーパー－エンハンサー座位（ｃｈｒ１１：６５２６３７２４－６５２６６７２４）（ゲノムビルドｈｇ１９）である。

【0116】

Ｈ３Ｋ２７Ａｃ ＣｈＩＰ－ｓｅｑ（ＣｈＩＰ配列決定）法により、ｃｈｒ１：２０５３９９０８４－２０５５１５３９６におけるＣＤＫ１８遺伝子に関連するＳＥ遺伝子座に関連するＳＥ遺伝子座；ｃｈｒ６：１１０８０３５２３－１１０８９６２７７におけるＣＤＫ１９遺伝子に関連するＳＥ遺伝子座；ｃｈｒ１９：３０４１８５０３－３０４４１４５０におけるＣＣＮＥ１遺伝子に関連するＳＥ遺伝子座；およびｃｈｒ８：３８２３３３２６－３８５９５４８３におけるＦＧＦＲ１遺伝子に関連するＳＥ遺伝子座が存在することが決定された。すべての遺伝子座は、ヒトゲノムビルドｈｇ１９／ＧＲＣｈ３７のジーンコードｖ１９アノテーションに基づく。

【0117】

ＣｈＩＰ－ｓｅｑを使用し、ＤＮＡ関連タンパク質の結合部位を特定するため、クロマチン免疫沈降（ＣｈＩＰ）と大部分が平行なＤＮＡ配列決定とを組み合わせることによって、ＤＮＡとのタンパク質相互作用を分析する。ＣｈＩＰ－ｓｅｑを使用して、目的の任意のタンパク質に対して、全結合部位を正確にマッピングすることができる。以前には、ＣｈＩＰ－オン－チップが、これらのタンパク質－ＤＮＡの関係を研究するために利用された最も一般的な技法であった。ＣｈＩＰ－ｓｅｑの成功は、超音波処理強度および方法、緩衝液組成、抗体の質および細胞数を含めた、多数の因子に依存する（例えば、Ｆｕｒｅｙ， Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １３：８４０－８５２， ２０１２）； Ｍｅｔｚｋｅｒ， Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １１：３１－４６， ２０１０；および Ｐａｒｋ， Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖｉｅｗｓ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ １０：６６９－６８０， ２００９を参照されたい）。ＣｈＩＰ－ｓｅｑを使用して、ＳＥを特定するために使用することができる、Ｈ３Ｋ２７Ａｃ以外のゲノムマーカーは、Ｐ３００、ＣＢＰ、ＢＲＤ２、ＢＲＤ３、ＢＲＤ４、メディエータ複合体の構成成分（Ｌｏｖｅｎ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ， １５３（２）：３２０－３３４， ２０１３）、ヒストン３リシン４モノメチル化（Ｈ３Ｋ４ｍｅ１）、および他の組織特異的エンハンサー付き転写因子（Ｓｍｉｔｈ ａｎｄ Ｓｈｉｌａｔｉｆａｒｄ， Ｎａｔｕｒｅ Ｓｔｒｕｃｔ． Ｍｏｌ． Ｂｉｏｌ．， ２１（３）：２１０－２１９， ２０１４；およびＰｏｔｔ ａｎｄ Ｌｉｅｂ， Ｎａｔｕｒｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ， ４７（１）：８－１２， ２０１５）を含む。エンハンサー強度の定量およびＳＥの同定は、ＳＥスコアを使用して決定することができる（ＭｃＫｅｏｗｎ ｅｔ ａｌ．， Ｃａｎｃｅｒ Ｄｉｓｃｏｖ． ７（１０）：１１３６－１１５３， ２０１７； ＤＯＩ： １０．１１５８／２１５９－８２９０．ＣＤ－１７－０３９９）。

【0118】

一部の例では、Ｈ３Ｋ２７Ａｃ、または細胞系もしくは患者試料の全ゲノムの他のマーカーとなるＣｈＩＰ－ｓｅｑデータのＳＥマップは既に存在している。次に、ｃｈｒ８：１２８６２８０８８－１２８７７８３０８（ゲノムビルドｈｇ１９）座位におけるこのようなマップ中のエンハンサーまたはＳＥの強度、順序ランクまたは有病率ランクが、所定の閾値レベルに等しいか、またはそれより高いかどうかを単に決定する。一部の実施形態では、ｃｈｒ１：２０５３９９０８４－２０５５１５３９６（ゲノムビルドｈｇ１９）座位におけるこのようなマップ中のエンハンサーまたはスーパー－エンハンサーの強度または順序ランクが、所定の閾値レベルに等しいか、またはそれより高いかどうかを単に決定する。

【0119】

ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照のこと）およびＭＡＬＡＴ１をコードするある特定の遺伝子の特定の染色体位置は、様々なゲノムビルドおよび／または様々な細胞タイプに関して異なり得ることを理解すべきである。同じことが、ＢＣＬ２様１、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫＮ２ＡおよびＲＢ（ＲＢ１としても公知、またはがん（本明細書の表を参照のこと）において過少発現される別のＥ２Ｆ経路のメンバーにも当てはまる。しかし、当業者は、特に、本教示に鑑みると、ゲノムビルドｈｇ１９における遺伝子座に対応する、このような他のゲノムビルド特異的配列に配置することによって、このような異なる位置を決定することができる。

【0120】

本方法の文脈において、ＳＥを特定するために使用することができる他の方法は、クロマチン免疫沈降（Ｄｅｌｍｏｒｅ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ， １４６（６）：９０４－９１７， ２０１１）、チップアレイ（ＣｈＩＰ－ｃｈｉｐ）、およびクロマチン免疫沈降と、その後の同じ免疫沈降したゲノムマーカーおよびｃｈｒ８：１２８６２８０８８－１２８７７８３０８（ゲノムビルドｈｇ１９）ＭＹＣ座位またはｃｈｒ１：２０５３９９０８４－２０５５１５３９６（ゲノムビルドｈｇ１９）ＣＤＫ１８座位（例えば）にハイブリダイズするオリゴヌクレオチド配列を使用するｑＰＣＲ（ＣｈＩＰ－ｑＰＣＲ）を含む。ＣｈＩＰ－チップの場合、シグナルは、通常、他のアレイをベースとする技術と同様に、プローブとインプットアッセイ試料のハイブリダイゼーションに由来する蛍光強度により検出される。ＣｈＩＰ－ｑＰＣＲの場合、ＰＣＲ反応において生成する二本鎖ＤＮＡをインターカレートした後に蛍光になる色素を使用して、鋳型の増幅を測定する。

【0121】

一部の実施形態では、細胞が、必要な閾値レベルに等しいまたはそれより高い強度の、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のＳＥを有するかどうかの決定は、試験細胞中のＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度を、細胞試料の集団における対応するＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子の強度を比較することによって達成され、この場合、細胞試料はそれぞれ、処置される同じ疾患を反映する様々な起源（例えば、異なる患者、異なる細胞系、異なる異種移植片）から得られる。一部の実施形態では、閾値レベルを決定するため、患者に由来する原発腫瘍細胞の試料しか使用されない。これらの実施形態の一部の態様では、集団における試料の少なくとも一部は、（ａ）そのような特定の化合物に応答する集団における、試料のＭ ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの最低強度（「最低応答者」）；および、必要に応じて、（ｂ）その特定の化合物に応答しない集団における、試料のＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの最高強度（「最高非応答者」）を確立するため、特定のＣＤＫ７阻害剤（例えば、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩）への応答が試験されている。これらの実施形態では、試験細胞がそのような特定の化合物に応答したと考えられる、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度のカットオフは、ｉ）集団中の最低応答者において、５％に等しい、またはこれより最大で５％高い、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度；またはｉｉ）集団の最高非応答者において、５％に等しい、またはこれより最大で５％高い、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度；またはｉｉｉ）集団における、最低応答者と最高非応答者との間の、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度の値に設定される。

【0122】

上記の実施形態では、集団における試料のすべてが、必ずしも、特定のＣＤＫ７阻害剤（例えば、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩）に応答するかどうかを試験する必要はないが、試料はすべて、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度について測定される。一部の実施形態では、試料は、Ｍ ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度に基づいて、ランク順序付けされる。カットオフを確立するために使用する、上で説明した３つの方法のいずれを選択するかは、集団における、最低応答者と最高非応答者との間の、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度の差異に依存し、この目的は、擬陽性数を最小化するため、または潜在応答試料もしくは患者を見逃す機会を最小化するためである。最低応答者と最高非応答者との間の差異が、大きい場合（例えば、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度のランク順序付けにおける、最低応答者と最高非応答者との間に収まる応答について試験されていない多数の試料が存在する場合）、カットオフは、通常、集団の最低応答者における、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度に等しく、またはこれより最大で５％高く設定される。このカットオフは、潜在的な応答者の数を最大化する。この差異が、小さい場合（例えば、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度のランク順序付けにおける、最低応答者と最高非応答者との間に収まる応答について試験されていない試料がほとんどまたは全くない場合）、カットオフは、通常、最低応答者と最高非応答者との間の、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（上を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度の値に設定される。このカットオフは、擬陽性の数を最小化する。最高非応答者が、最低応答者よりも高い、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書における表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度を有する場合、カットオフは、通常、集団の最高非応答者における、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子のエンハンサーの強度に等しく、またはこれより最大で５％高く設定される。この方法はやはり、擬陽性の数を最小化する。

【0123】

一部の実施形態では、上に記述されている方法を用いて、患者由来の罹患細胞（例えば、がん細胞）が、本明細書に記載されている通りのバイオマーカー（例えば、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、もしくはＥ２Ｆ経路メンバーをコードするある特定の遺伝子（本明細書における表を参照）、またはそれらによってコードされるタンパク質）に関連するＳＥを有するかどうかを単純に決定することができる。ＳＥの存在は、患者が、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩に十分に応答する可能性があることを示す。エンハンサーが、ＭＡＬＡＴ－１に関連するエンハンサーに等しいまたはそれより高い強度を有する場合、細胞は、バイオマーカー（例えば、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、もしくはＥ２Ｆ経路メンバーをコードするある特定の遺伝子（本明細書における表を参照）、またはそれらによってコードされるタンパク質）に関連するＳＥを有すると決定される。代替的な実施形態では、ＢＲＡＦ関連性、ＭＹＣ関連性、ＣＤＫ１関連性、ＣＤＫ２関連性、ＣＤＫ４関連性、ＣＤＫ６関連性、ＣＤＫ１７関連性、ＣＤＫ１８関連性、ＣＤＫ１９関連性、ＣＣＮＡ１関連性、ＣＣＮＢ１関連性、ＣＣＮＥ１関連性、ＥＳＲ－１関連性、ＦＧＦＲ１関連性、ＰＩＣ３ＣＡ関連性、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）関連性エンハンサーをコードするある特定の遺伝子が、細胞におけるエンハンサーのすべてのメジアン強度よりも少なくとも１０倍高い強度を有する場合、細胞は、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子に関連するＳＥを有すると決定される。他の実施形態では、遺伝子関連エンハンサーが、正弦の傾きが細胞におけるエンハンサーの強度のランク順序付けグラフにおいて１となる点より大きな強度を有する場合、細胞は、上述の遺伝子に関連するＳＥを有すると決定される。

【0124】

ＣＤＫ１８が関与する実施形態では、エンハンサー強度に関するカットオフ値は、有病率カットオフへと変換することができ、有病率カットオフは、次に、所与のｍＲＮＡアッセイにおいて、ＣＤＫ１８ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベルに適用されて、ｍＲＮＡカットオフ値を求めることができる。

【0125】

一部の実施形態では、本明細書に記載されている遺伝的バイオマーカーの特色（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベル）は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩に対する患者の感受性の決定に使用される。

【0126】

一部の実施形態では、目的の遺伝子／患者におけるバイオマーカーｍＲＮＡレベル（例えば、患者から取得した生体試料において評価される）は、同一アッセイを使用して、同じ疾患または状態（あるいは効率的な比較を可能とするのに十分に類似である疾患または状態）を有する患者の集団における同じ目的の遺伝子／バイオマーカーｍＲＮＡレベルと比較し、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩に対する可能性のある応答者を特定する。バイオマーカーの別の特徴が分析に選択される場合（例えば、そのコピー数、染色体位置、一次ＲＮＡ転写物レベルまたはｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベルまたは発現するタンパク質レベル）、類似の比較を行うことができる。実施形態では、バイオマーカー（例えば、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９およびＣＣＮＥ１）が、本発明の化合物への応答に相互関連する場合（例えば、その発現（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）発現）がこの応答に相互関連するものである場合）、その集団における試料の少なくとも一部は、阻害剤（例えば、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩）に応答するかを検査して、（ａ）そのような特定の化合物に応答する集団の試料における最低レベル（例えば、ｍＲＮＡレベル）（「最低のｍＲＮＡ応答者」）；および必要に応じて、（ｂ）そのような特定の化合物に応答しない集団の試料の最高のレベル（例えば、最高のｍＲＮＡレベル）（「最高のｍＲＮＡ非応答者」）を確立する。これらの実施形態では、試験細胞が、そのような特定の化合物に応答するとみなされるよりも高いバイオマーカーｍＲＮＡレベルのカットオフは、ｉ）集団の最低のｍＲＮＡ応答者におけるレベル（例えば、ｍＲＮＡレベル）に等しい、またはそれより最大で５％高く、またはｉｉ）集団の最高のｍＲＮＡ非応答者において、レベル（例えば、ｍＲＮＡレベル）に等しい、またはそれより最大で５％高く；またはｉｉｉ）集団の最低応答者（例えば、最低のｍＲＮＡ応答者）と最高応答者（例えば、最高のｍＲＮＡ）非応答者との間のレベル（例えば、ｍＲＮＡレベル）の値に設定される。

【0127】

ｍＲＮＡレベルが、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩への感受性と正に相互関係する実施形態では、集団における試料のすべてに、前記化合物（または塩）に対する応答を試験する必要はないが、試料はすべて、目的のｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベルの遺伝子について測定される。一部の実施形態では、試料は、目的のｍＲＮＡレベルの遺伝子に基づいてランク順序付けされる。カットオフを確立するために使用する、上で説明した３つの方法のいずれを選択するかは、集団における最低のｍＲＮＡ応答者と最高のｍＲＮＡ非応答者との間の目的のｍＲＮＡレベルの遺伝子の差異に依存し、カットオフは、擬陽性を最小化するよう、または応答者の潜在数を最大化するよう設計される。この差が大きい場合（例えば、ｍＲＮＡレベルのランク順序付けにおける、最低のｍＲＮＡ応答者と最高のｍＲＮＡ非応答者との間に収まる応答について試験されていない多数の試料が存在する場合）、カットオフは、通常、最低のｍＲＮＡ応答者のｍＲＮＡレベルに等しく、またはそれより最大で５％高く設定される。この差が小さい場合（例えば、ｍＲＮＡレベルのランク順序付けにおける、最低のｍＲＮＡ応答者と最高のｍＲＮＡ非応答者との間に収まる応答について試験されていない試料がほとんどまたは全く存在しない場合）、カットオフは、通常、最低のｍＲＮＡ応答者と最高のｍＲＮＡ非応答者との間のｍＲＮＡレベルの値に設定される。最高のｍＲＮＡ非応答者が、最低のｍＲＮＡ応答者よりも大きなｍＲＮＡレベルを有する場合、カットオフは、通常、集団の最高のｍＲＮＡ非応答者におけるｍＲＮＡレベルに等しい、またはそれより最大で５％高い値に設定される。

【0128】

バイオマーカーが、そのｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）発現が、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩（すなわち、ＢＣＬ－ｘＬ、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、またはＲＢ１ファミリーメンバー）への応答に逆に相互関連するものである実施形態では、集団の試料の少なくとも一部は、（ａ）そのような特定の化合物に応答する集団における試料の最高のｍＲＮＡレベル（「最高のｍＲＮＡ応答者」）；および必要に応じて、（ｂ）そのような特定の化合物に応答しない集団における試料の最低のｍＲＮＡレベル（「最低のｍＲＮＡ非応答者」）を確立するため、前記化合物への応答が試験される。これらの実施形態では、試験細胞が、そのような特定の化合物に応答するとみなされるよりも高いｍＲＮＡレベルのカットオフは、ｉ）集団の最高のｍＲＮＡ応答者におけるｍＲＮＡレベルに等しい、またはそれより最大で５％低く；またはｉｉ）集団の最低のｍＲＮＡ非応答者において、ｍＲＮＡレベルに等しい、またはそれより最大で５％低く；またはｉｉｉ）集団における最低のｍＲＮＡ非応答者と最高のｍＲＮＡ応答者との間のｍＲＮＡレベルの値に設定される。

【0129】

ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベルが、本発明の化合物への感受性と反対に相互関係する実施形態では、集団における試料のすべてに、前記化合物に対する応答を試験する必要はないが、試料はすべて、目的のｍＲＮＡレベルの遺伝子について測定される。一部の実施形態では、試料は、目的のｍＲＮＡレベルの遺伝子に基づいてランク順序付けされる。カットオフを確立するために使用する、上で説明した３つの方法のいずれを選択するかは、集団における最高のｍＲＮＡ応答者と最低のｍＲＮＡ非応答者との間の目的のｍＲＮＡレベルの遺伝子の差異に依存し、カットオフは、擬陽性を最小化するよう、または応答者の潜在数を最大化するよう設計される。この差が大きい場合（例えば、ｍＲＮＡレベルのランク順序付けにおける、最高のｍＲＮＡ応答者と最低のｍＲＮＡ非応答者との間に収まる応答について試験されていない多数の試料が存在する場合）、カットオフは、通常、最高のｍＲＮＡ応答者のｍＲＮＡレベルに等しく、またはそれより最大で５％低く設定される。この差が小さい場合（例えば、ｍＲＮＡレベルのランク順序付けにおける、最高のｍＲＮＡ応答者と最低のｍＲＮＡ非応答者との間に収まる応答について試験されていない試料はほとんどまたは全くない場合）、カットオフは、通常、最高のｍＲＮＡ応答者と最低のｍＲＮＡ非応答者との間のｍＲＮＡレベルの値に設定される。最高のｍＲＮＡ応答者が、最低のｍＲＮＡ応答者よりも小さなＲＮＡレベルを有する場合、カットオフは、通常、集団の最低のｍＲＮＡ非応答者におけるｍＲＮＡレベルに等しい、またはそれより最大で５％低い値に設定される。

【0130】

ＣＤＫ１８を含む実施形態では、ＣＤＫ１８ ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベルのカットオフは、上記の通り、ＣＤＫ１８エンハンサー強度に基づいて確立した有病率カットオフを使用して決定されてもよい。こられの実施形態の一部の態様では、集団は、ｍＲＮＡレベルについて測定され、これまでに決定された有病率カットオフをその集団に適用して、ｍＲＮＡカットオフレベルを決定する。これらの実施形態の一部の態様では、集団におけるＣＤＫ１８ ｍＲＮＡレベルのランク順序の標準曲線が作製され、事前に決定された有病率カットオフが、その標準曲線を適用して、ＣＤＫ１８ ｍＲＮＡカットオフレベルを決定する。

【0131】

試験細胞または試料が、集団と比較される一部の実施形態では、その集団に対して取得したカットオフｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベル値は、有病率ランクへと変換され、ｍＲＮＡレベルのカットオフは、カットオフ値またはそれより高い、例えば有病率カットオフを有する集団の割合として表される。

【0132】

理論によって拘泥されないが、本出願人らは、集団における試験試料および有病率カットオフの有病率ランクは、ｍＲＮＡレベルを決定するために使用される方法に関わらず類似すると考えている。

【0133】

生体試料中の例えば、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡレベル）によって決定される、ＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（本明細書の表を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子の状態が、その集団における同じパラメータ（例えば、ｍＲＮＡレベル）を評価することによって、それぞれ、決定されるＢＲＡＦ、ＭＹＣ、ＣＤＫ１、ＣＤＫ２、ＣＤＫ４、ＣＤＫ６、ＣＤＫ１７、ＣＤＫ１８、ＣＤＫ１９、ＣＣＮＡ１、ＣＣＮＢ１、ＣＣＮＥ１、ＥＳＲ－１、ＦＧＦＲ１、ＰＩＣ３ＣＡ、またはＥ２Ｆ経路のメンバー（上を参照されたい）をコードするある特定の遺伝子の状態によって決定すると、集団において、約８０％、７９％、７８％、７７％、７６％、７５％、７４％、７３％、７２％、７１％、７０％、６９％、６８％、６７％、６６％、６５％、６４％、６３％、６２％、６１％、６０％、５９％、５８％、５７％、５６％、５５％、５４％、４３％、４２％、５１％、５０％、４９％、４８％、４７％、４６％、４５％、４４％、４３％、４２％、４１％、４０％、３９％、３８％、３７％、３６％、３５％、３４％、３３％、３２％、３１％、３０％、２９％、２８％、２７％、２６％、２５％、２４％、２３％、２２％、２１％または２０％の有病率ランクに相当する（例えば、これらに等しい、またはそれらより高い）場合、患者は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩に十分に応答する可能性が高いと特定され得る。ＢＣＬ２様１、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫＮ２ＡおよびＲＢの状態（患者に由来する生体試料における、例えば、ＲＮＡ（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））レベルまたは対応するタンパク質レベルによって決定される）が、その集団における同じパラメータ（例えば、ｍＲＮＡレベル）を評価することによって、それぞれ、決定されるＢＣＬ２様１、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫＮ２ＡおよびＲＢの状態によって決定すると、集団において、約８０％、７９％、７８％、７７％、７６％、７５％、７４％、７３％、７２％、７１％、７０％、６９％、６８％、６７％、６６％、６５％、６４％、６３％、６２％、６１％、６０％、５９％、５８％、５７％、５６％、５５％、５４％、４３％、４２％、５１％、５０％、４９％、４８％、４７％、４６％、４５％、４４％、４３％、４２％、４１％、４０％、３９％、３８％、３７％、３６％、３５％、３４％、３３％、３２％、３１％、３０％、２９％、２８％、２７％、２６％、２５％、２４％、２３％、２２％、２１％または２０％未満の有病率ランクである場合、患者は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩に十分に応答する可能性が高いと特定され得る。一部の実施形態では、カットオフ値または閾値は、バイオマーカー（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ））有病率値に基づいて確立される。

【0134】

一部の実施形態では、集団は、３つの群：応答者、部分応答者および非応答者に分類することができ、２つのカットオフ値または有病率カットオフ（または閾値）が、設定または決定される。部分応答者の群は、応答者、および非応答者、ならびにそれらの患者であって、その本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩に対する応答が応答者の群ほど高くはない患者を含むことができる。階層化のこのようなタイプは、集団において、最高の非応答者が、最低の応答者（同じパラメータ（例えば、ｍＲＮＡレベル）について評価した）の値（例えば、ｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）レベル）よりも高いｍＲＮＡレベルを有する場合に、特に有用であり得る。このシナリオでは、ＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９の場合、応答者と部分応答者との間のカットオフレベルまたは有病率カットオフは、最高のＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９ ｍＲＮＡの非応答者のＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９ ｍＲＮＡレベルに等しいか、またはそれより最大で５％高く設定され；部分応答者と非応答者との間のカットオフレベルまたは有病率カットオフは、最低のＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９ ｍＲＮＡ応答者のＣＤＫ１８またはＣＤＫ１９ ｍＲＮＡレベルに等しいか、またはそれより最大で５％低く設定される。ＢＣＬ－ｘＬ、ＣＤＫ７またはＣＤＫ９の場合、最高のｍＲＮＡ応答者が、最低のｍＲＮＡ非応答者のｍＲＮＡレベルよりも低いｍＲＮＡレベルを有する場合、このタイプの階層化が有用であり得る。このシナリオでは、ＢＣＬ－ｘＬ、ＣＤＫ７またはＣＤＫ９の場合、応答者と部分応答者との間のカットオフレベルまたは有病率カットオフは、最低のｍＲＮＡ非応答者のｍＲＮＡレベルに等しいか、またはそれより最大で５％低く設定され；部分応答者と非応答者との間のカットオフレベルまたは有病率カットオフは、最高のｍＲＮＡ応答者のｍＲＮＡレベルに等しいか、またはそれより最大で５％高く設定される。部分応答者に、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩が投与されるべきであるかどうかの決定は、処置する医師の判断、および／または規制機関による承認に依存する。

【0135】

生体試料中の特定の一次ＲＮＡ転写物を定量するために使用され得る方法は、当分野で公知であり、以下に限定されないが、ＮａｎｏＳｔｒｉｎｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓにより提供されるサービスおよび製品で利用されるものなどの蛍光ハイブリダイゼーション、アレイをベースとする技術（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）、ＳＹＢＲ（登録商標）グリーン（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）またはＴａｑＭａｎ（登録商標）テクノロジー（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）のような逆転写酵素ｑＰＣＲ、ＲＮＡ配列決定法（例えば、ＲＮＡ－ｓｅｑ）、ＲＮＡｓｃｏｐｅ（登録商標）（Ａｄｖａｎｃｅｄ Ｃｅｌｌ Ｄｉａｇｎｏｓｔｉｃｓ）と共に利用されるＲＮＡハイブリダイゼーションおよびシグナル増幅、またはノーザンブロットを含む。一部の場合、様々な細胞タイプにおける様々な遺伝子に関するｍＲＮＡ発現の値は、公表されている（例えば、ｂｒｏａｄｉｎｓｔｉｔｕｔｅ．ｏｒｇ／ｃｃｌｅ；およびＢａｒｒｅｔｉｎａ ｅｔ ａｌ．， Ｎａｔｕｒｅ， ４８３：６０３－６０７， ２０１２を参照されたい）。

【0136】

一部の実施形態では、試験生体試料と参照標準の両方、または集団のすべてのメンバーにおけるバイオマーカーの状態（例えば、一次ＲＮＡ転写のレベルによって評価される）は、比較前に正規化される。正規化は、あるＲＮＡ転写量の決定したレベルを、天然のおよび両細胞（例えば、ＧＡＤＰＨ ｍＲＮＡ、１８Ｓ ＲＮＡ）において等価なレベルで存在する別のＲＮＡ転写量のいずれかと、またはスーパーエンハンサー強度決定前に、各細胞の試料に「スパイクした」外因性ＲＮＡの固定したレベルと比較することによって調節することを含む（Ｌｏｖｅｎ ｅｔ ａｌ．， Ｃｅｌｌ， １５１（３）：４７６－８２， ２０１２； Ｋａｎｎｏ ｅｔ ａｌ．， ＢＭＣ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ ７：６４， ２００６； Ｖａｎ ｄｅ Ｐｅｐｐｅｌ ｅｔ ａｌ．， ＥＭＢＯ Ｒｅｐ．， ４：３８７－９３， ２００３）。

【0137】

本明細書に記載されているがんに罹患し、かつバイオマーカー状態に基づいて本明細書に記載されている通りに特定された患者（例えば、ヒト）は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩の前に投与された治療剤に抵抗性がある（または、初期のいくつかの有効性の後に、抵抗性を獲得した）および／または化学治療剤（例えばベネトクラックスなどのＢｃｌ－２阻害剤、ＢＥＴ阻害剤、パルボシクリブまたはリボシクリブなどのＣＤＫ４／６阻害剤、アルボシジブなどのＣＤＫ９阻害剤、ＦＬＴ３阻害剤、トラメチニブなどのＭＥＫ阻害剤、オラパリブまたはニラパリブなどのＰＡＲＰ阻害剤、アルペリシブまたはカペシタビンなどのＰＩ３Ｋ阻害剤、シスプラチン、オキサリプラチン、ネダプラチン、カルボプラチン、フェナントリプラチン、ピコプラチン、サトラプラチン（ＪＭ２１６）または四硝酸トリプラチンなどの白金をベースとする治療剤、タモキシフェン、ファロキシフェンまたはトレミフェンなどのＳＥＲＭ、またはステロイド受容体分解剤（例えば、フルベストラントなどのＳＥＲＤ）に対して抵抗性であると決定され得る。これらの薬剤のうちの１つまたは複数を含む併用療法（ここで投与は、本明細書に記載されるようにまたはその他の方法で選択された患者になされる）もまた、本発明の範囲内にあり、本明細書においてさらに議論される。例えば、一実施形態では、本方法は、パルボシクリブまたはリボシクリブなどのＣＤＫ４／６阻害剤による処置に抵抗性のがん（例えば、乳がん（例えば、ＥＲ＋乳がん（例えば、ＨＲ＋／ＨＥＲ２－がん）））を処置するための、フルベストラントなどのＳＥＲＤと組み合わせた、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩の使用または投与を包含する。

【0138】

一部の実施形態では、以前の治療剤は、単剤療法として、またはＳＯＣ剤と組み合わせて投与される白金をベースとする抗がん剤であり得る。大部分のがん患者は、以下の機構：（ｉ）細胞膜輸送タンパク質の分子改変により、白金剤の取り込み量が低下する；（ｉｉ）細胞が細胞死するのを防止するアポトーシスシグナル伝達経路の分子改変；（ｉｉｉ）細胞が白金剤誘導性ＤＮＡ損傷を修復する能力を回復させる、ある特定の遺伝子（例えば、ＢＲＣＡ１／２、ＣＨＥＫ１、ＣＨＥＫ２、ＲＡＤ５１）の分子改変の１つまたは複数による白金をベースとする治療法に最終的に抵抗性を発生させる。Ｋ．Ｎ． Ｙａｍａｍｏｔｏ ｅｔ ａｌ．， ＰｌｏＳ ＯＮＥ ９（８）：ｅ１０５７２４， ２０１４，。用語「分子改変」は、これらの機能に関与する遺伝子に由来するｍＲＮＡ（例えば、プレｍＲＮＡまたは成熟ｍＲＮＡ）発現量の増加または低下；このような遺伝子に由来するタンパク質の発現量の増加または低下；およびそのような遺伝子から発現されるｍＲＮＡ／タンパク質の変異を含む。

【0139】

抵抗性は、通常、処置中の疾患進行（例えば、腫瘍サイズおよび／または数の増加）、または腫瘍の収縮速度の低下によって決定される。一部の例では、患者のがんが、処置に応答し、その間に安定化するが、薬剤により処置して１～６か月後以内に進行した場合、患者は、白金をベースとする薬剤に抵抗性となったとみなされる。抵抗性は、白金剤による何らかの数の処置後に起こる恐れがある。一部の例では、疾患進行は、処置を完了する間、またはその１か月以内に起こる。この場合、患者は、この薬剤に対する応答を決して実証しなかったとみなされる。これもまた、処置に対する「不応性」と呼ばれる。抵抗性はまた、白金剤が、がんに対する有効な処置ともはやみなされなくなると、処置医師によって決定されることがある。

【0140】

一部の実施形態では、患者は、単剤療法として、またはＳＯＣ剤と組み合わせて投与されるＣＤＫ４／６阻害剤による処置に抵抗性があるか、または抵抗性があると決定されている。

【0141】

がん（例えば、本明細書に記載されるＨＲ^＋乳がん）におけるＣＤＫ４／６阻害剤は、Ｇ１停止を誘導することによって、細胞周期のＳ期への進入を遮断することが知られている。がん（例えば、ＨＲ^＋転移性乳がん）におけるＣＤＫ４／６阻害剤への抵抗性は、１）ＣＤＫ６、ＣＣＮＤ１またはＦＧＦＲ１の増幅などのＣＤＫ４／６活性を増大する（Ｆｏｒｍｉｓａｎｏ ｅｔ ａｌ．， ＳＡＢＣＳ ２０１７， Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ ＧＳ６－０５； Ｃｒｕｚ ｅｔ ａｌ．， ＳＡＢＣＳ ２０１７ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎ Ｎｕｍｂｅｒ ＰＤ４－０５）、または２）ＲＢ１損失およびＣＣＮＥ１増幅などのＣＤＫ４／６の細胞周期の下流での進入を再活性化する（Ｃｏｎｄｏｒｅｌｌｉ， Ａｎｎ． Ｏｎｃｏｌ．， ＰＭＩＤ： ２９２３６９４０， ２０１７； Ｈｅｒｒｅｒａ－Ａｂｒｅｕ， Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ＰＭＩＤ： ２７０２０８５７， ２０１６）、分子改変によって一部が媒介されることが示されている。

【0142】

パルボシクリブ、リボシクリブまたはアベマシクリブなどのＣＤＫ４／６阻害剤は、通常、ある期間投与されて、次いで処置のない期間が続く、白金をベースとする薬剤とは異なり、疾患進行が観察されるまで投与される。一部の例では、患者のがんが、最初に処置に応答し、その間に安定化するが、処置が依然として続いている間に、最終的に進行が始まる場合、患者は、ＣＤＫ４／６阻害剤に抵抗性になったとみなされる。一部の例では、患者は、処置の間に、何らかの有意な応答または安定化を実証することなくがんが進行する場合、ＣＤＫ４／６阻害剤による処置に抵抗性（または不応性）とみなされる。抵抗性はまた、ＣＤＫ４／６阻害剤が、がんに対する有効な処置ともはやみなされなくなると、処置医師によって決定されることがある。

【0143】

本発明の方法は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と、必要に応じて、薬学的に許容される担体とを含む医薬組成物を用いることができる。ある特定の実施形態では、医薬組成物は、本明細書に記載されている（一般的にまたは具体的に）式の化合物または薬学的に許容されるその塩を含む。記されている通り、医薬組成物は、１つまたは複数の薬学的に許容される担体を含むことができ、活性薬剤／成分は、有効量（例えば、治療有効量または予防有効量）でその中に提供することができる。何らかの疑念がある場合には、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩のいずれかは、本発明の医薬組成物中に含まれて、本明細書に記載されている診断および処置方法において使用されてよい。

【0144】

本発明の医薬組成物は、薬理学の分野において公知の関連方法によって調製され得る。一般に、このような調製方法は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩を含む本明細書に記載されている化合物を担体および／または１つもしくは複数の他の活性成分（例えば、本明細書に記載されている第２の薬剤）および／または副成分と混合するステップ、次に、必要な場合および／または所望の場合、この生成物を所望の単回用量単位または多回用量単位（例えば、経口投与向け）に成形するおよび／または包装するステップを含む。副成分は、本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩の生体利用率を改善することがあり、その代謝を低減および／または改変することがあり、その排出を阻害することがあり、そして／または身体内のその分布を改変する（例えば、罹患組織（例えば、腫瘍）を標的とすることによる）ことがある。本医薬組成物は、バルク容器中を含めた様々な方法で、単回単位用量（例えば、個別の所定量の活性剤を含有する）またはその複数物として包装され得、このような包装されたもしくは分割された剤形のいずれも、本発明の範囲内にある。活性成分の量は、単位投与量、または例えば、用量の２分の１または３分の１などの投与量の都合のよい割合を構成する量に等しくすることができる。

【0145】

本発明の医薬組成物中の活性剤／成分、薬学的に許容される担体および／または任意の追加の成分の相対量は、これらが何であるか、サイズおよび／または処置される対象の状態に応じて、ならびにさらには組成物が投与される経路および処置される疾患に応じて様々になり得る。例として、本組成物は、約０．１％～９９．９％（ｗ／ｗまたはｗ／ｖ）の間の活性剤／成分を含むことができる。

【0146】

本明細書に記載されている医薬組成物の製造に有用な薬学的に許容される担体は、医薬製剤の分野で周知であり、不活性希釈剤、分散剤および／もしくは造粒剤、表面活性剤および／もしくは乳化剤、崩壊剤、結合剤、保存剤、緩衝化剤、滑沢剤、ならびに／または油を含む。本明細書に記載されている医薬組成物の製造に有用な薬学的に許容される担体には、以下に限定されないが、イオン交換体、アルミナ、ステアリン酸アルミニウム、レシチン、ヒト血清アルブミンなどの血清タンパク質、リン酸塩、グリシン、ソルビン酸、ソルビン酸カリウムなどの緩衝物質、飽和植物性脂肪酸の部分グリセリド混合物、水、塩または電解質（硫酸プロタミン、リン酸水素二ナトリウム、リン酸水素カリウム、塩化ナトリウム、亜鉛塩など）、コロイド状シリカ、三ケイ酸マグネシウム、ポリビニルピロリドン、セルロースをベースとする物質、ポリエチレングリコール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、ポリアクリレート、ワックス、ポリエチレン－ポリオキシプロピレン－ブロックポリマー、ポリエチレングリコールおよび羊毛脂が含まれる。

【0147】

本明細書に記載されている通りに使用される医薬組成物は、経口投与されてもよい。このような経口許容される投与量形態は、固体（例えば、カプセル剤、錠剤、サシェ剤、散剤、顆粒剤および経口分散性フィルム剤）または液体（例えば、アンプル、半固体、シロップ剤、懸濁液剤または溶液剤（例えば、水性懸濁液剤または分散液剤および溶液剤））であり得る。錠剤の場合、一般に使用される担体には、ラクトースおよびトウモロコシデンプンが含まれる。ステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤も含まれ得る。カプセル剤の場合、有用な希釈剤は、ラクトースおよび乾燥トウモロコシデンプンを含む。水性懸濁液が製剤化される場合、活性剤／成分は、乳化剤および懸濁化剤と一緒にされ得る。任意の経口用製剤において、甘味剤、着香料または着色剤も添加されてもよい。本明細書に記載されている様々な実施形態のいずれかにおいて、経口用製剤は、即時放出または持続放出／遅延放出するよう製剤化され得、コーティングされていてもよく、またはコーティングされていなくてもよい。提供される組成物はまた、マイクロカプセル封入され得る。

【0148】

口内投与または舌下投与に好適な組成物は、錠剤、ロゼンジ剤およびパステル剤を含む。皮下、静脈内、筋肉内、眼内、硝子体内、関節内、滑膜内、胸骨内、鞘内、肝内、腹腔内、病巣内向けに、および頭蓋内注射または注入技法による製剤もまた調製され得る。好ましくは、本組成物は、経口、皮下、腹腔内または静脈内に投与される。本発明の組成物の滅菌注射剤形態は、水性または油性懸濁液剤であり得る。これらの懸濁液剤は、好適な分散剤または湿潤剤および懸濁化剤を使用して、当分野で公知の技法に従い、製剤化することができる。滅菌注射用調製物はまた、例えば１，３－ブタンジオール中の溶液剤として、非毒性の非経口的に許容される希釈剤または溶媒中の注射用滅菌溶液剤または懸濁液剤とすることもできる。使用することができる、許容されるビヒクルおよび溶媒の中には、水、リンゲル液および等張性塩化ナトリウム溶液がある。さらに、滅菌不揮発油が、溶媒または懸濁媒体として、慣用的に使用される。

【0149】

本明細書において提供される医薬組成物の説明は、ヒトへの投与に好適な医薬組成物を原理的に対象としているが、このような組成物は、一般に、すべての種類の動物への投与に好適であることが当業者によって理解される。組成物を様々な動物への投与に好適にするための、ヒトへの投与に好適な医薬組成物の改変が十分に理解され、当分野の獣医学の薬理学者は、このような改変を設計および／または実施することができる。

【0150】

本明細書に記載されている化合物は、投与を容易にするためおよび投与量を均質とするために、投与単位形態、例えば単一単位剤形で通常、製剤化される。任意の特定の対象または生物に対する具体的な治療的または予防的有効用量レベルは、処置される疾患および障害の重症度、使用される具体的な活性成分の活性、使用される具体的な組成物、対象の年齢、体重、一般的な健康、性別および食事、投与時間、投与経路ならびに使用される具体的な活性成分の排出速度、処置期間、使用される具体的な活性成分と組み合わせてまたは同時に使用される薬物、ならびに医療技術において周知の同様の因子を含めた様々な因子に依存する。

【0151】

有効量を達成するために必要な化合物の正確な量は、例えば、対象の人種、年齢および一般状態、副作用の重症度、処置される疾患、投与される特定の化合物が何であるか、投与様式などに応じて、対象毎に様々であり得る。所望の投与量は、１日３回、１日２回、１日１回、１日おき、３日毎、毎週、２週間毎、３週間毎または４週間毎に送達され得る。ある特定の実施形態では、所望の投与量は、多回投与（例えば、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、１１回、１２回、１３回、１４回またはそれより多くの投与）を使用して送達することができる。

【0152】

ある特定の実施形態では、成人ヒト（例えば、７０ｋｇ）に１日１回または複数回（例えば、１回）投与するＣＤＫ７阻害剤の有効量は、約１～１００ｍｇ、約１～５０ｍｇ、約１～３５ｍｇ（例えば、約１～５、１～１０、１～１５、１～２０、１～２５または１～３０ｍｇ）、約２～２０ｍｇ、約３～１５ｍｇまたは約１０～３０ｍｇ（例えば、１０～２０または１０～２５ｍｇ）を含むことができる。この場合およびどの範囲が参照されようとも、端点が含まれる。提示される投与量は、様々な体重または身体の表面をしている患者に対してスケールを調節することができ、患者の身体表面１ｍ^２あたりで表すことができる。

【0153】

ある特定の実施形態では、本発明の組成物は、１日１回、投与されてもよい。本明細書に記載されるＣＤＫ７阻害剤またはそれらの薬学的に許容される塩の投与量は、約１～１００ｍｇ、約１～５０ｍｇ、約１～２５ｍｇ、約２～２０ｍｇ、約５～１５ｍｇ、約１０～１５ｍｇまたは約１３～１４ｍｇであり得る。

【0154】

ある特定の実施形態では、本発明の組成物は、１日２回、投与されてもよい。一部の実施形態では、各投与のための式（Ｉ）またはその下位属（ｓｕｂｇｅｎｕｓ）または化学種の投与量は、約０．５ｍｇ～約５０ｍｇ、約０．５ｍｇ～約２５ｍｇ、約０．５ｍｇ～約１ｍｇ、約１ｍｇ～約１０ｍｇ、約１ｍｇ～約５ｍｇ、約３ｍｇ～約５ｍｇまたは約４ｍｇ～約５ｍｇである。

【0155】

本明細書に記載されている化合物または他の組成物（例えば、ＣＤＫ７阻害剤を含む医薬組成物）は、本明細書に記載されている第２の薬剤またはその複数との併用療法（例えば、本明細書に定義およびさらに記載されている通り）において投与することができる。併用療法において用いられる追加の／第２の薬剤は、同じ障害（例えば、同じがん）のために所望の効果を達成する可能性が最も高いが、これは、患者を助ける異なる効果を達成することができる。したがって、本発明は、治療有効量の、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と；各々治療有効量の、ベネトクラクスなどのＢｃｌ－２阻害剤、オラパリブまたはニラパリブなどのＰＡＲＰ阻害剤、カルボプラチン、シスプラチンまたはオキサリプラチンなどの白金をベースとする抗がん剤、パクリタキセルなどのタキサン、パルボシクリブ、リボシクリブ、アベマシクリブまたはトリラシクリブ（ｔｒｉｌａｃｉｃｌｉｂ）などのＣＤＫ４／６阻害剤、タモキシフェン（Ｎｏｌｖａｄｅｘ（商標）およびＳｏｌｔａｍｏｘ（商標）の商品名により入手可能）、ラロキシフェン（Ｅｖｉｓｔａ（商標）の商品名により入手可能）およびトレミフェン（Ｆａｒｅｓｔｏｎ（商標）として入手可能）などの選択的エストロゲン受容体モジュレーター（ＳＥＲＭ）、ならびにフルベストラント（Ｆａｓｌｏｄｅｘ（商標）として入手可能）などの選択的エストロゲン受容体ディグレーダーから選択される第２の薬剤と、薬学的に許容される担体とを含有する医薬組成物を特色とする。

【0156】

特定された患者は、「新たに診断」されてよく、したがって、本明細書に記載されている通りの第２の薬剤に以前に曝露されたことがなくてよく、この場合、患者は、処置ナイーブとして定義されてよい。

【0157】

他に指定がない限り、本発明の方法において本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩および第２の治療剤の組合せを用いる場合、第２の治療剤は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と同時発生的に、その前に、またはその後に投与することができる。第２の治療用医薬剤は、当該医薬剤のために決定された用量および／またはタイムスケジュールで投与することができる。第２の治療剤は、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と単一の剤形中で一緒に投与することも、異なる剤形中で別々に投与することもできる。一般に、本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩と組み合わせて利用される第２の治療剤が、それが個々に利用されるレベルを越えないレベルで利用されることが予想される。一部の実施形態では、組み合わせて利用される第２の治療剤のレベルは、相乗効果が原因で、単剤療法において利用されるものよりも低くなるであろう。

【0158】

本明細書に記載されているＣＤＫ７阻害剤または薬学的に許容されるその塩、および本明細書に記載されているもののうちいずれか１つから選択される追加の／第２の薬剤の組合せのため、２つの活性治療薬（またはそれよりも多い、例えば、第３の薬剤をさらに含む）の各々を含むキットを提供することができ、これは、本発明の範囲内にある。このようなキットは、本明細書に記載されている診断および処置方法のいずれかにおいて有用性を見出す。一部の例では、第１および第２の薬剤は、個別の容器（例えば、第１の容器に収容された第１の薬剤、および第２の容器に収容された第２の薬剤を含む）中にあり、そして／または第１の薬剤、第２の薬剤および薬学的に許容される担体を含む、必要に応じて単位剤形の薬学的に許容される組成物中に製剤化されている。一部の例では、キットは、がん（例えば、本明細書に記載されている）に罹患しており、かつ本明細書に記載されている方法による処置に適していると特定される患者において、２種（またはそれより多種の）治療剤を使用するための指示書を含む書面のインサートまたはラベルを含む。指示書は、治療剤を含む容器（単数または複数）に貼り付けられてもよく、またはそうでない場合、取り付けられてもよい。代替的に、指示書および容器は、互いに分けられているが、単一のキット、パッケージ、箱、バッグまたは他のタイプの容器に一緒に存在することができる。キット中の指示書は、通常、組合せ物の治療的使用を承認した政府機関により義務付けられるか、または推奨される（例えば、本明細書に記載されている通りに特定された患者集団において）。指示書は、各治療剤に関する投与情報、組合せ物の処置が承認されたもしくは処方されてもよいがんのタイプ、各治療剤に関する物理化学的情報、各治療剤に関する薬物動態情報、薬物－薬物相互作用情報、または診断情報（例えば、本明細書に記載されている処置のための患者を特定するバイオマーカーまたは方法に基づく）を必要に応じて含むことができる。本発明のキットはまた、本明細書に記載されている診断方法に有用な試薬も含むことができる。

【実施例】

【0159】

本明細書に記載されている発明についてより十分に理解することができるように、以下の実施例を示す。本出願に記載されている合成および生物学的実施例は、本明細書に提供されている化合物、医薬組成物および方法を説明するために提供されており、その範囲を限定するものとして解釈されるべきでは決してない。

【0160】

本明細書に提供されている化合物は、当業者にとって周知であろう下に示す具体的な合成プロトコールに対する修正を使用して、容易に入手可能な出発材料から調製することができる。典型的なまたは好まれるプロセス条件（すなわち、反応温度、時間、反応物のモル比、溶媒、圧力等）が示されている場合、他に断りがなければ、他のプロセス条件を使用することもできることが認められるであろう。最適な反応条件は、使用されている特定の反応物または溶媒と共に変動し得るが、このような条件は、慣用的な最適化手順により、当業者によって決定され得る。

【0161】

さらに、当業者には明白であるが、ある従来の官能基が望ましくない反応を受けるのを防止するため、保護基が必要であり得る。特定の官能基に好適な保護基、ならびに保護および脱保護の好適な条件の選択は、当分野で周知である。例えば、様々な保護基、ならびにその導入および除去は、Ｇｒｅｅｎｅら（Ｐｒｏｔｅｃｔｉｎｇ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ， Ｓｅｃｏｎｄ Ｅｄｉｔｉｏｎ， Ｗｉｌｅｙ， Ｎｅｗ Ｙｏｒｋ， １９９１、およびそれらに引用されている参照文献）に記載されている。

【0162】

図１Ａ～図１Ｘ由来の例示的な化合物の合成は、ＷＯ２０１８／０１３８６７に記載されている。

【0163】

（実施例１）
ＣＤＫキナーゼ活性の阻害。本発明の化合物を、キャリパー／ＬａｂＣｈｉｐ ＥＺリーダー（Ｐｅｒｋｉｎ Ｅｌｍｅｒ、Ｗａｌｔｈａｍ、ＭＡ）を用いて開発した各ＣＤＫに関するキナーゼアッセイを使用して、Ｂｉｏｒｔｕｓ Ｂｉｏｓｃｉｅｎｃｅｓ（Ｊｉａｎｇｙｉｎ、Ｊｉａｎｇｓｕ Ｐｒｏｖｉｎｃｅ、Ｐ．Ｒ．ｏｆ Ｃｈｉｎａ）においてＣＤＫ７、ＣＤＫ９、ＣＤＫ１２およびＣＤＫ２活性の阻害に関してアッセイした。これらのアッセイは、以下の構成成分：以下の緩衝液：２－（Ｎ－モルホリノ）エタンスルホネート（ＭＥＳ緩衝液、２０ｍＭ）、ｐＨ６．７５、０．０１％（ｖ／ｖ）Ｔｗｅｅｎ（登録商標）２０洗剤、０．０５ｍｇ／ｍＬウシ血清アルブミン（ＢＳＡ）中での試験化合物（３倍段階希釈シリーズで１０μＭから０．５０８ｎＭまで低下させた様々な濃度）、活性ＣＤＫキナーゼタンパク質（各ＣＤＫについて以下に列挙した、表示されているサイクリンを含む）、ＡＴＰ（２ｍＭ）および基質ペプチド（以下に列挙）を用いて、２７℃でのインキュベート期間の後の、全ペプチドの割合として生じたリン酸化ペプチド基質の量を測定する。

【0164】

具体的には、ＣＤＫ７阻害アッセイは、上で列挙した緩衝液組成物中の６ｍＭ ＭｇＣｌ_２を含む、ＣＤＫ７／サイクリンＨ／ＭＡＴ１複合体（６ｎＭ）および「５－ＦＡＭ－ＣＤＫ７ｔｉｄｅ」ペプチド基質（２μＭ、以下の配列：５－ＦＡＭ－ＹＳＰＴＳＰＳＹＳＰＴＳＰＳＹＳＰＴＳＰＳＫＫＫＫ（配列番号１）を有する合成フルオロフォア標識ペプチドであり、「５－ＦＡＭ」は、５－カルボキシフルオレセインを意味する）を使用した。さらに、ＣＤＫ９阻害アッセイは、上で列挙した緩衝液組成物中に１０ｍＭ ＭｇＣｌ_２を含む、ＣＤＫ９／サイクリンＴ１複合体（８ｎＭ）および「５－ＦＡＭ－ＣＤＫ９ｔｉｄｅ」ペプチド基質（２μＭ、以下の配列：５－ＦＡＭ－ＧＳＲＴＰＭＹ－ＮＨ_２有する合成フルオロフォア標識ペプチドであり、５－ＦＡＭは上で定義されており、ＮＨ_２はＣ末端アミドを表す）を使用した。ＣＤＫ１２阻害アッセイは、上記の緩衝液組成物中、２ｍＭ ＭｇＣｌ_２を含む、ＣＤＫ１２（ａａ６８６－１０８２）／サイクリンＫ複合体（５０ｎＭ）および上で定義した「５－ＦＡＭ－ＣＤＫ９ｔｉｄｅ」（２μＭ）を使用した。さらに、ＣＤＫ２阻害アッセイは、上で列挙した緩衝液組成物中、２ｍＭ ＭｇＣｌ_２を含む、ＣＤＫ２／サイクリンＥ１複合体（０．５ｎＭ）および上で定義した「５－ＦＡＭ－ＣＤＫ７ｔｉｄｅ」（２μＭ）を使用した。

【0165】

各ＣＤＫ阻害アッセイについて、２７℃でのインキュベート期間は、全ペプチド濃度に対する、各アッセイにおいて生成するリン酸化ペプチド生成物の割合が、非阻害キナーゼに関して約２０％（±５％）となるよう選択した（ＣＤＫ７の場合、３５分間、ＣＤＫ２の場合、３５分間、ＣＤＫ１２の場合、３時間、ＣＤＫ９の場合、１５分間）。化合物の滴定を試験し、ペプチド生成物の形成が阻害された場合、これらのデータをあてはめて、最良適合ＩＣ_５０値を生成した。これらのアッセイの結果を下の表１に示し、表中、「Ａ」は、２０ｎＭ未満の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｂ」は、２０ｎＭ～２００ｎＭ未満の間の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｃ」は、２００ｎＭ～５μＭ未満の間の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｄ」は、５μＭを超えるまたはこれに等しい計算されたＩＣ_５０を表し、「ＮＴ」は、指定の化合物が、指定のアッセイにおいて検査されなかったことを表す。

【0166】

表１． ＣＤＫ２、ＣＤＫ７、ＣＤＫ９およびＣＤＫ１２に対する本発明の選択された化合物の阻害活性

【表1-1】

【表1-2】

【表1-3】

【表1-4】

【0167】

（実施例２）
細胞増殖の阻害
Ａ６７３細胞：Ａ６７３細胞は、ヒト筋肉ユーイング肉腫に由来する細胞系である。本発明の代表的な化合物を、異なる濃度（４μＭ～１２６．４ｐＭ；０．５ｌｏｇ系列希釈）で、Ａ６７３細胞の増殖を阻害するその能力について検査した。公知ＣＤＫ阻害剤のディナシクリブまたはＮ－（（１Ｓ，３Ｒ）－３－（（５－クロロ－４－（１Ｈ－インドール－３－イル）ピリミジン－２－イル）アミノ）シクロヘキシル）－５－（（Ｅ）－４－（ジメチルアミノ）ブタ－２－エナミド（ｅｎａｍｉｄｏ））ピコリンアミド（ｐｉｃｏｌｉｎａｍｉｄｅ）およびトリプトライドを、陽性対照として使用した。細胞をダルベッコ変法イーグル培地、＋１０％ＦＢＳ＋１ｍＭピルビン酸ナトリウムにおいて育成した。３７℃、加湿チャンバー内で、５％ＣＯ_２の存在下、細胞を培養した。７２時間の期間にわたり増殖アッセイを行った。ＣｙＱＵＡＮＴ（登録商標）（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｃｈｉｃａｇｏ、ＩＬ ＵＳＡ）を使用して、製造業者の指示に従って、ＣｙＱＵＡＮＴ（登録商標）キットとともに供給されている試薬を利用して、化合物の抗増殖性効果を評価した。アッセイの結果を下の表１に示し、表中、「Ａ」は、２０ｎＭ未満の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｂ」は、２０ｎＭ～２００ｎＭ未満の間の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｃ」は、２００ｎＭ～５μＭ未満の間の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｄ」は、５μＭ超の計算されたＩＣ_５０を表す。

【0168】

ＨＣＣ７０細胞：ＨＣＣ７０細胞は、ヒトトリプルネガティブ乳がんに由来する細胞系である。本発明の代表的な化合物を、異なる濃度（４μＭ～１２６．４ｐＭ；０．５ｌｏｇ系列希釈）で、ＨＣＣ７０細胞の増殖を阻害するその能力について検査した。公知ＣＤＫ阻害剤のディナシクリブまたはＮ－（（１Ｓ，３Ｒ）－３－（（５－クロロ－４－（１Ｈ－インドール－３－イル）ピリミジン－２－イル）アミノ）シクロヘキシル）－５－（（Ｅ）－４－（ジメチルアミノ）ブタ－２－エナミド）ピコリンアミドおよびトリプトライドを陽性対照として使用した。細胞をＡＴＣＣ処方ＲＰＭＩ－１６４０培地（ＡＴＣＣ ３０－２００１）＋１０％ＦＢＳにおいて育成した。３７℃、加湿チャンバー内で、５％ＣＯ_２の存在下、細胞を培養した。７２時間の期間にわたり増殖アッセイを行った。ＣｙＱＵＡＮＴ（登録商標）Ｄｉｒｅｃｔ細胞増殖アッセイ（Ｌｉｆｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ、Ｃｈｉｃａｇｏ、ＩＬ ＵＳＡ）を使用して、製造業者の指示に従って、ＣｙＱＵＡＮＴ（登録商標）Ｄｉｒｅｃｔ細胞キットとともに供給されている試薬を利用して、化合物の抗増殖性効果を評価した。アッセイの結果を下の表２に示し、表中、「Ａ」は、１００ｎＭ未満の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｂ」は、１００ｎＭ～１０００ｎＭ未満の間の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｃ」は、１０００ｎＭ～５μＭ未満の間の計算されたＩＣ_５０を表し；「Ｄ」は、５μＭ超の計算されたＩＣ_５０を表す。

【0169】

表２． 本発明の化合物によるＡ６７３細胞およびＨＣＣ７０細胞の増殖の阻害

【表2-1】

【表2-2】

【表2-3】

【表2-4】

【図1-1】

【図1-2】

【図1-3】

【図1-4】

【図1-5】

【図1-6】

【図1-7】

【図1-8】

【図1-9】

【図1-10】

【図1-11】

【図1-12】

【図1-13】

【図1-14】

【図1-15】

【図1-16】

【図1-17】

【図1-18】

【図1-19】

【図1-20】

【図1-21】

【図1-22】

【図1-23】

【図1-24】

【図2】

【国際調査報告】