(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2023-10-06
(54)【発明の名称】EGFR結合複合体、その製造及び使用方法
(51)【国際特許分類】
C12N 15/13 20060101AFI20230929BHJP
C07K 16/28 20060101ALI20230929BHJP
C07K 16/46 20060101ALI20230929BHJP
C12N 15/63 20060101ALI20230929BHJP
C12N 1/15 20060101ALI20230929BHJP
C12N 1/19 20060101ALI20230929BHJP
C12N 1/21 20060101ALI20230929BHJP
C12N 5/10 20060101ALI20230929BHJP
C12P 21/08 20060101ALI20230929BHJP
A61K 38/02 20060101ALI20230929BHJP
A61P 35/00 20060101ALI20230929BHJP
A61P 37/02 20060101ALI20230929BHJP
A61P 31/00 20060101ALI20230929BHJP
A61K 47/68 20170101ALI20230929BHJP
A61K 39/395 20060101ALI20230929BHJP
【FI】
C12N15/13
C07K16/28 ZNA
C07K16/46
C12N15/63 Z
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
C12N5/10
C12P21/08
A61K38/02
A61P35/00
A61P37/02
A61P31/00
A61K47/68
A61K39/395 Y
A61K39/395 E
A61K39/395 T
【審査請求】有
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2023518081
(86)(22)【出願日】2021-09-21
(85)【翻訳文提出日】2023-04-27
(86)【国際出願番号】 US2021051165
(87)【国際公開番号】W WO2022061256
(87)【国際公開日】2022-03-24
(32)【優先日】2020-09-21
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(32)【優先日】2020-11-05
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(81)【指定国・地域】
【公序良俗違反の表示】
(特許庁注:以下のものは登録商標)
(71)【出願人】
【識別番号】517218697
【氏名又は名称】システィミューン, インク.
【氏名又は名称原語表記】SYSTIMMUNE, INC.
(71)【出願人】
【識別番号】522263714
【氏名又は名称】バイリ-バイオ(チェンドゥ)ファーマスーティカル シーオー.,エルティーディー.
(74)【代理人】
【識別番号】110001139
【氏名又は名称】SK弁理士法人
(74)【代理人】
【識別番号】100130328
【氏名又は名称】奥野 彰彦
(74)【代理人】
【識別番号】100130672
【氏名又は名称】伊藤 寛之
(72)【発明者】
【氏名】ガレット,デニス アール.
(72)【発明者】
【氏名】マック,ガー シー アマンダ
(72)【発明者】
【氏名】ツー, ハイ
(72)【発明者】
【氏名】ツー, イ
【テーマコード(参考)】
4B064
4B065
4C076
4C084
4C085
4H045
【Fターム(参考)】
4B064AG27
4B064CA19
4B064CC24
4B064DA01
4B064DA05
4B065AA01X
4B065AA57X
4B065AA72X
4B065AA87X
4B065AA94Y
4B065AB01
4B065AC14
4B065BA02
4B065CA25
4B065CA44
4C076AA95
4C076CC27
4C076CC41
4C076EE41
4C076EE59
4C084AA02
4C084BA01
4C084NA13
4C084ZB26
4C085AA14
4C085AA27
4C085BB11
4C085EE01
4H045AA11
4H045AA30
4H045DA76
4H045EA20
4H045EA28
4H045FA74
(57)【要約】
ヒトEGFR(上皮成長因子受容体)に対して結合特異性を有する結合ドメインは、VHドメインと、VLドメインを有し、VH及びVLドメインは、それぞれ独立して本明細書で開示されるアミノ酸配列と少なくとも90%の配列同一性を有する配列を含む。本発明は、前記結合ドメインを含む抗体をさらに提供する。
【選択図】
図1A
【特許請求の範囲】
【請求項1】
ヒトEGFRに対して結合特異性を有するヒト上皮成長因子受容体(EGFR)結合ペプチドであって、
配列番号1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、57、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83と少なくとも98%、95%又は92%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、EGFR結合ペプチド。
【請求項2】
可変重(VH)鎖と、可変軽(VL)鎖を含み、
前記VH鎖は、配列番号1、5、9、13、17、21、25、29、33、37又は41と少なくとも98%、95%又は92%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、
前記VL鎖は、配列番号3、7、11、15、19、23、27、31、35、39又は43と少なくとも98%、95%又は92%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項1に記載のEGFR結合ペプチド。
【請求項3】
scFvドメインを含み、
前記scFvドメインは、前記VH鎖と、前記VL鎖を含み、
前記scFvドメインは、配列番号57、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81又は83と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項2に記載のEGFR結合ペプチド。
【請求項4】
前記scFvドメイン少なくとも1つの末端に結合したヒスチジン残基を含み、
前記EGFR結合ペプチドは、配列番号57と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項3に記載のEGFR結合ペプチド。
【請求項5】
Fabドメインを含み、
前記Fabドメインは、前記VH鎖と、前記VL鎖を含む、請求項2に記載のEGFR結合ペプチド。
【請求項6】
前記Fabドメインに結合したFcドメインをさらに含んでFab-モノFc融合タンパク質を提供し、
前記Fcドメインは、配列番号45及び47から選択されるアミノ酸配列と少なくとも98%の配列同一性を有する配列を含む、請求項5に記載のEGFR結合ペプチド。
【請求項7】
ヒトEGFRに対して結合特異性を有する抗体様タンパク質であって、
可変重(VH)鎖と、可変軽(VL)鎖を有するEGFR結合ドメインを含み、
前記VH鎖は、配列番号1、5、9、13、17、21、25、29、33、37又は41と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、
前記VL鎖は、配列番号3、7、11、15、19、23、27、31、35、39又は43と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、抗体様タンパク質。
【請求項8】
scFvドメインを含み、
前記scFvドメインは、配列番号57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83又はそれらの組み合わせと少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項9】
前記抗体様タンパク質は、単一特異性抗体であり、配列番号137、139;141、143;141、149、151,139;145、147又はそれらの組み合わせと少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項10】
前記抗体様タンパク質は、二重特異性抗体であり、配列番号137、145、139、147、141、145、143、147、141、145、149、147、151、145、139、147又はそれらの組み合わせと少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項11】
前記抗体様タンパク質は、五重特異性抗体であり、配列番号85、87;89、91;93、95、97、99、101、103、105、107又はそれらの組み合わせと少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項12】
前記抗体様タンパク質は、六重特異性抗体であり、配列番号109、111、113、115、117、119又はそれらの組み合わせと少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項13】
重鎖(HC)と軽鎖(LC)を含み、
前記HCは、配列番号85、89、93、97、101、105、109、113、117、137、141、145又は151と少なくとも98%、95%又は92%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含み、
前記LCは、配列番号87、91、95、99、103、107、111、115、119、139、143、147又は149と少なくとも98%、95%又は92%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項14】
重鎖モノマーと、軽鎖モノマーを含み、
前記重鎖モノマーは、N末端と、C末端を有し、前記N末端から前記C末端まで
前記N末端にある任意の第1結合ドメイン(D1)と、
第2結合ドメイン(D2)としての、軽鎖を含むFabドメインと、
Fcドメインと、
任意の第3結合ドメイン(D3)と、
前記C末端にある任意の第4結合ドメイン(D4)と、
をタンデムに含み、
前記軽鎖は、前記C末端に共有結合した任意の第5結合ドメイン(D5)、前記N末端に共有結合した任意の第6結合ドメイン(D6)、又はそれらの組み合わせを含み、
D1、D2、D3、D4、D5及びD6の少なくとも1つは、前記EGFR結合ドメインを含む、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項15】
D1又はD2の少なくとも1つは、前記EGFR結合ドメインを含む、請求項14に記載の抗体様タンパク質。
【請求項16】
D3、D4、D5及びD6は、それぞれ前記EGFR結合ドメインを含む、請求項14に記載の抗体様タンパク質。
【請求項17】
前記抗体様タンパク質は、二重特異性抗体であり、配列番号137、145、139、147; 141、145、143、147;141、145、149、147;151、145、139又は147と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項14に記載の抗体様タンパク質。
【請求項18】
前記二重特異性抗体は、前記EGFR結合ドメインを含む前記D2と非対称であり、前記D3は、CD3に対して結合特異性を有する、請求項17に記載の抗体様タンパク質。
【請求項19】
N末端と、C末端を有し、
前記N末端から前記C末端まで、第1結合ドメイン(mD1)、可変重(VH)鎖、CH1ドメイン、第1ヒンジ、第1CH2ドメイン、第1CH3ドメイン、及び第4結合ドメイン(mD4)を含む第1モノマーと、
前記N末端から前記C末端まで、第2結合ドメイン(mD2)、可変軽(VL)鎖、CLドメイン、第2ヒンジ、第2CH2ドメイン、第2CH3ドメイン、及び第5結合ドメイン(mD5)を含む第2モノマーと、
を含み、
前記CH鎖及びCL鎖は、第3結合ドメイン(mD3)を形成し、
前記第1モノマーと、前記第2モノマーとは、前記CH1ドメインと前記CLドメインとの間の少なくとも1つのジスルフィド結合、及び前記第1ヒンジと前記第2ヒンジとの間の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して共有結合でペアとなり、
前記多重特異性抗体様タンパク質は、少なくとも二重特異性である、請求項7に記載の抗体様タンパク質。
【請求項20】
前記mD1、mD2、mD3、mD5及びmD5の少なくとも1つは、前記EGFR結合ドメインを含む、請求項19に記載の抗体様タンパク質。
【請求項21】
前記mD3又はmD2ドメインの少なくとも1つは、前記EGFR結合ドメインを含む、請求項19に記載の抗体様タンパク質。
【請求項22】
前記mD2、mD4及びmD5は、それぞれ前記EGFR結合ドメインを含む、請求項19に記載の抗体様タンパク質。
【請求項23】
配列番号121、123、125、127、129、131、133、135又はそれらの組み合わせと少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、請求項19に記載の抗体様タンパク質。
【請求項24】
配列番号121、125、129又は133と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、重鎖。
【請求項25】
配列番号123、127、131又は135と少なくとも98%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む、軽鎖。
【請求項26】
請求項7に記載の抗体様タンパク質をコードする、単離された核酸配列。
【請求項27】
請求項26に記載の単離された核酸配列を含む、発現ベクター。
【請求項28】
請求項26に記載の単離された核酸配列を含む、宿主細胞。
【請求項29】
請求項7に記載の抗体様タンパク質と、薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
【請求項30】
請求項7に記載の抗体様タンパク質と、細胞毒性剤を含む、免疫複合体。
【請求項31】
請求項30に記載の免疫複合体と、薬学的に許容される担体を含む、医薬組成物。
【請求項32】
対象のがん、自己免疫疾患又は感染症を治療又は予防するための方法であって、
精製された請求項7に記載の抗体様タンパク質を含む医薬組成物を前記対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項33】
請求項7に記載の抗体様タンパク質の製造方法であって、
請求項9に記載の抗体様タンパク質をコードするDNA配列が発現されるように宿主細胞を培養するステップと、
前記多重特異性抗体様タンパク質を精製するステップと、
を含む、方法。
【請求項34】
有効濃度の請求項7に記載の抗体様タンパク質を含む溶液であって、
前記溶液は、対象の血漿である、溶液。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
(関連出願の相互参照)
本願は、35U.S.C.119(e)に基づいて2020年9月21日に出願された米国仮出願第63/081,315号及び2020年11月5日に出願された米国仮出願第63/109,877号の優先権を主張し、これらの全開示は、参照により本明細書に組み込まれる。
【0002】
本開示は、抗体を用いるがん治療の技術分野に関し、より具体的には、多重特異性抗体の製造と使用に関する。
【背景技術】
【0003】
セツキシマブは、ヒト上皮成長因子受容体(EGFR)を標的とするキメラ(マウス/ヒト)モノクローナル抗体である。2004年に米国とEUで結腸直腸がんの治療薬として承認され、頭頸部がんの治療にも使用されている1-3。mAbに加えて、セツキシマブは、T細胞リダイレクト二重特異性抗体4、抗体-ペプチド融合及び抗体-薬物複合体にも使用されている5。
セツキシマブは、通常腫瘍細胞で過剰発現するEGFRの細胞外ドメインのドメインIIIに結合することができる。腫瘍細胞へのセツキシマブの結合は、EGF及び他のリガンドの結合を競合的に阻害し、EGFRの二量体化を防ぎ、受容体チロシンの自己リン酸化を抑制する。阻害とEGFR媒介シグナル伝達の減少の結果として、セツキシマブの結合は、アポトーシスを誘導しながら、腫瘍細胞の増殖、血管新生及び転移を効果的にダウンレギュレートする。EGFRを標的とすることに加えて、セツキシマブのFcドメインは、CD16aや他のFc受容体に結合し、抗体依存性細胞傷害などの免疫機構を動員して活性化することができる4。これらの抗腫瘍特性により、セツキシマブは、単剤又はレジメンの一部として併用療法の開発に非常に望ましいものである。しかし、セツキシマブの可変領域(VH/Vk)は、マウスハイブリドーマから単離された後、マウスのフレームワークに残るという懸念がある。マウスVH/Vkなどのマウス配列を使用すると、タンパク質をヒト患者に投与した場合、免疫原性の発生率が高くなることが示されている。したがって、ヒト化VH/Vk領域を用いたタンパク質治療薬は、ヒトにおけるセツキシマブに起因する免疫原性のリスクを低下させる可能性がある。
【発明の概要】
【0004】
以下の概要は単なる例示であり、決して限定することを意図するものではない。上記の例示的な態様、実施形態、及び特徴に加えて、さらなる態様、実施形態、及び特徴は、図面及び以下の詳細な説明を参照することによって明らかになるであろう。
【0005】
本発明は、ヒト上皮成長因子受容体(EGFR)に対して結合特異性を有する結合ドメイン及びペプチド、本明細書に開示される抗EGFR結合ドメイン及びペプチドを組み込んだ抗体様タンパク質、本明細書に開示される抗EGFR結合ドメイン及びペプチドを組み込んだ免疫複合体及び医薬組成物、このような抗EGFR結合ドメインの製造及び使用方法、ペプチド及び抗体様タンパク質を提供する。一実施形態において、抗EGFR抗体様タンパク質は、抗体、モノクローナル抗体、ヒト化抗体、又はキメラ抗体を含む。一実施形態において、抗EGFR抗体は、単一特異性又は多重特異性であってもよい。一実施形態において、多重特異性抗EGFR抗体は、二重特異性、三重特異性、四重特異性、五重特異性、又は六重特異性であってもよい。一実施形態において、抗EGFR抗体は、対称又は非対称であってもよい。
【0006】
一態様において、本発明は、ヒトEGFRに対して結合特異性を有するヒトEGFR結合ペプチドを提供する。前記ペプチドは、配列番号1、3、5、7、9、11、13、15、17、19、21、23、25、27、29、31、33、35、37、39、41、43、57、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。
【0007】
一実施形態において、EGFR結合ペプチドは、可変重(VH)鎖と可変軽(VL)鎖を含む。一実施形態において、VH鎖は、配列番号1、5、9、13、17、21、25、29、33、37、41と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一実施形態において、VL鎖は、配列番号3、7、11、15、19、23、27、31、35、39、43と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0008】
一実施形態において、EGFR結合ペプチドはscFvドメインを含み、scFvドメインは本明細書に開示されるVH鎖及びVL鎖を含む。
【0009】
一実施形態において、本発明は、抗EGFR scFvドメイン又はこのscFvドメインを形成するペプチドを提供する。一実施形態において、前記scFvドメインは、配列番号57、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81、83と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一実施形態において、前記scFvドメインは、本明細書に開示されるVH鎖及びVL鎖を含む。
【0010】
一実施形態において、EGFR結合ペプチドは、scFvドメインの少なくとも1つの末端に結合したヒスチジン残基を含んでもよい(例えば、ScFV-HIS)。一実施形態において、前記EGFR結合ペプチドは、配列番号57と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。
【0011】
一実施形態において、EGFR結合ペプチドは、Fabドメインを含んでもよく、Fabドメインは、本明細書に開示されるVH鎖及びVL鎖を含む。一実施形態において、Fab-モノFc融合タンパク質を提供するために、EGFR結合ペプチドは、Fabドメインに結合したFcドメインをさらに含んでもよい。一実施形態において、前記Fcドメインは、配列番号45及び47から選択されるアミノ酸配列と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有する配列を含む。
【0012】
別の態様において、本発明は、ヒトEGFRに対して結合特異性を有する抗体様タンパク質を提供する。抗体様タンパク質は、可変重(VH)鎖及び可変軽(VL)鎖を有するEGFR結合ドメインを含んでもよい。一実施形態において、前記VH鎖は、配列番号1、5、9、13、17、21、25、29、33、37又は41と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。一実施形態において、前記VL鎖は、配列番号3、7、11、15、19、23、27、31、35、39又は43と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。
【0013】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、配列番号57、59、61、63、65、67、69、71、73、75、77、79、81又は83と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を有するscFvドメインを含んでもよい。
【0014】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は単一特異性抗体であってもよい。一実施形態において、前記抗体は、配列番号137、139、141、143; 141、149、151、139、145、147又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記単一特異性抗体は、配列番号137と139、141と143、141と149、151と139、及び145と147の配列組み合わせから選択される軽鎖と重鎖又はそれらの断片のペアを含んでもよい。
【0015】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、腫瘍抗原、免疫シグナル伝達抗原又はそれらの組み合わせから選択される少なくとも2つの異なる抗原に対して結合特異性を有してもよい。
【0016】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、二重特異性抗体であってもよい。一実施形態において、前記二重特異性抗体は、配列番号137、145、139、147、141、145、143、147、141、145、149、147、151、145、139、147又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記二重特異性抗体は、配列番号137と145と139と147、141と145と143と147、141と145と149と147、151と145と139と147の配列組み合わせから選択される軽鎖と重鎖(又はそれらの断片)の組み合わせを含んでもよい。
【0017】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、腫瘍抗原、免疫シグナル伝達抗原又はそれらの組み合わせから選択される少なくとも3つの異なる抗原に対して結合特異性を有してもよい。
【0018】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、腫瘍抗原、免疫シグナル伝達抗原又はそれらの組み合わせから選択される少なくとも4つの異なる抗原に対して結合特異性を有してもよい。
【0019】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、腫瘍抗原、免疫シグナル伝達抗原又はそれらの組み合わせから選択される少なくとも5つの異なる抗原に対して結合特異性を有してもよい。一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、五重特異性抗体であってもよい。
【0020】
一実施形態において、前記五重特異性抗体は、配列番号85、87、89、91、93、95、97、99、101、103、105、107又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記五重特異性抗体は、配列番号85と87、89と91、93と95、97と99、101と103、及び105と107の配列組み合わせから選択される軽鎖と重鎖又はそれらの断片のペアを含んでもよい。
【0021】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、腫瘍抗原、免疫シグナル伝達抗原又はそれらの組み合わせから選択される少なくとも6つの異なる抗原に対して結合特異性を有してもよい。一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、六重特異性抗体であってもよい。
【0022】
一実施形態において、前記六重特異性抗体は、配列番号109、111、113、115、117、119又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記六重特異性抗体は、配列番号109と111、113と115、及び117と119の組み合わせから選択される軽鎖と重鎖又はそれらの断片の組み合わせを含んでもよい。
【0023】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、重鎖(HC)及び軽鎖(LC)を含んでもよい。一実施形態において、前記HCは、配列番号85、89、93、97、101、105、109. 113、117、137、141、145、151と少なくとも98%、95%又は92%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。前記LCは、配列番号87、91、95、99、103、107、111、115、119、139、143、147、149と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0024】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、重鎖モノマー及び軽鎖モノマーを含んでもよい。前記重鎖モノマーは、N末端及びC末端を有し、N末端からC末端まで、N末端にある任意の第1結合ドメイン(D1)と、軽鎖を含む第2結合ドメイン(D2)としてのFab領域と、Fcドメインと、任意の第3結合ドメイン(D3)と、C末端にある任意の第4結合ドメイン(D4)とをタンデムに含む。前記軽鎖は、C末端に共有結合した任意の第5結合ドメイン(D5)、N末端に共有結合した任意の第6結合ドメイン(D6)、又はそれらの組み合わせを含んでもよい。D1、D2、D3、D4、D5及びD6の少なくとも1つは、本明細書で開示されるEGFR結合ドメインを含む。
【0025】
一実施形態において、D1は、EGFR結合ドメインを含む。一実施形態において、D2は、EGFR結合ドメインを含む。一実施形態において、D3、D4、D5及びD6のそれぞれは、EGFR結合ドメインを含む。一実施形態において、D1、D2、D3、D4、D5及びD6は、それぞれ異なる抗原に対して結合特異性を有する。前記抗原は、腫瘍抗原、免疫シグナル伝達抗原又はそれらの組み合わせである。
【0026】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、二重特異性抗体であってもよい。一実施形態において、前記二重特異性抗体はEGFR結合ドメインを含むD2と非対称であり、D3はCD3に対して結合特異性を有する。
【0027】
一実施形態において、二重特異性抗体は、配列番号137、145、139、147、141、145、143、147、141、145、149、147、151、145、139、147又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記二重特異性抗体は、147、141と145と149と147、及び151と145と139と147の配列組み合わせから選択される軽鎖と重鎖又はそれらの断片を含んでもよい。
【0028】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、配列番号137、139、141、143、141、149、151、139、145、147又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性 toを有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記二重特異性抗体は、配列番号137と139、141と143、141と149、151と139、及び145と147の配列組み合わせから選択される軽鎖と重鎖又はそれらの断片の組み合わせを含んでもよい。
【0029】
一態様において、本発明は、Fab-Fc構造に結合した1つ以上の結合ドメインを含むFab-Fc構造を有する抗体様タンパク質を提供する。一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、N末端及びC末端を有し、第1モノマー及び第2モノマーを含む。前記第1モノマーは、N末端からC末端まで、第1結合ドメイン(mD1)と、可変重(VH)鎖と、CH1ドメインと、第1ヒンジと、第1CH2ドメインと、第1CH3ドメインと、第4結合ドメイン(mD4)とを含む。前記第2モノマーは、N末端からC末端まで、第2結合ドメイン(mD2)と、可変軽(VL)鎖と、CLドメインと、第2ヒンジと、第2CH2ドメインと、第2CH3ドメインと、第5結合ドメイン(mD5)とを含む。前記CH鎖とCL鎖は第3結合ドメイン(mD3)を構成する。前記第1モノマーと前記第2モノマーは、CH1ドメインとCLドメインの間の少なくとも1つのジスルフィド結合、及び第1ヒンジと第2ヒンジの間の少なくとも1つのジスルフィド結合を介して共有結合でペアとなることができ、前記抗体様タンパク質は、少なくとも二重特異性である。
【0030】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質におけるmD1、mD2、mD3、mD5及びmD5の少なくとも1つは、本明細書で開示されるEGFR結合ドメインを含んでもよい。一実施形態において、mD3ドメインは、EGFR結合ドメインを含む。一実施形態において、mD2ドメインは、EGFR結合ドメインを含む。一実施形態において、mD2、mD4、mD5は、それぞれEGFR結合ドメインを含む。
【0031】
一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、配列番号121、123、125、127、129、131、133、135又はそれらの組み合わせと少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。一実施形態において、前記抗体様タンパク質は、121と123、125と127、129と131、133と135の配列組み合わせから選択されるペプチド又はそれらの断片の組み合わせを含んでもよい。
【0032】
一態様において、本発明は、重鎖を提供する。一実施形態において、前記重鎖は、配列番号121、125、129、133と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。
【0033】
一態様において、本発明は、軽鎖を提供する。一実施形態において、前記軽鎖は、配列番号123、127、131、135と少なくとも70%、80%、85%、90%、92%、95%、98%、99%又は100%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含んでもよい。
【0034】
一態様において、本発明は、本明細書で開示される抗体様タンパク質、軽鎖、重鎖及びペプチド配列をコードする単離された核酸配列を提供する。
【0035】
一態様において、本発明は、本明細書で開示される単離された核酸配列を含む発現ベクターを提供する。
【0036】
一態様において、本発明は、抗体様タンパク質、軽鎖、重鎖又はそれらの組み合わせを製造するための宿主細胞を提供する。一実施形態において、前記宿主細胞は、本明細書で開示される単離された核酸配列を含む。一実施形態において、前記宿主細胞は、原核細胞又は真核細胞であってもよい。
【0037】
一態様において、本発明は、免疫複合体を含んでもよい。一実施形態において、前記免疫複合体は、本明細書で開示される抗体様タンパク質、抗体、抗EGFR結合ドメイン又はペプチドと、細胞毒性剤とを含んでもよい。一実施形態において、前記細胞毒性剤は、化学療法剤、増殖抑制剤、毒素、又は放射性同位元素を含んでもよい。
【0038】
一態様において、本発明は、疾患又は健康状態を治療するための医薬組成物を提供する。一実施形態において、前記医薬組成物は、本明細書で開示される抗体様タンパク質、抗体、免疫複合体、抗EGFR結合ドメイン又はペプチドと、薬学的に許容される担体とを含んでもよい。
【0039】
一実施形態において、前記医薬組成物は、治療剤をさらに含んでもよい。一実施形態において、前記治療剤は、化学療法剤、増殖抑制剤、毒素、放射性同位元素又はそれらの組み合わせであってもよい。一実施形態において、前記治療剤は、例えば、カペシタビン、シスプラチン、トラスツズマブ、フルベストラント、タモキシフェン、レトロゾール、エキセメスタン、アナストロゾール、アミノグルテチミド、テストラクトン、ボロゾール、ホルメスタン、ファドロゾール、レトロゾール、エルロチニブ、アファチニブ、ダサチニブ、ゲフィチニブ、イマチニブ、パゾパニブ、ラパチニブ、スニチニブ、ニロチニブ、ソラフェニブ、ナブパリタキセル、それらの誘導体又は組み合わせであってもよい。
【0040】
一態様において、本発明は、対象のがん、自己免疫疾患又は感染症を治療又は予防するための方法を提供する。一実施形態において、前記方法は、前記対象に本明細書で開示される精製した抗体様タンパク質、抗体、抗EGFRドメイン又はペプチドを含む医薬組成物を投与するステップを含んでもよい。一実施形態において、前記対象は、哺乳類である。一実施形態において、前記対象は、ヒトである。
【0041】
一実施形態において、前記方法は、有効量の治療剤を共投与するステップをさらに含んでもよい。一実施形態において、前記治療剤は、抗体、化学療法剤、酵素又はそれらの組み合わせであってもよい。
【0042】
一実施形態において、前記がんは、HER3又はEGFRを発現する細胞を含んでもよい。一実施形態において、前記がんは、例えば、乳がん、結腸直腸がん、膵臓がん、頭頸部がん、黒色腫、卵巣がん、前立腺がん、非小細胞肺細胞がん、小細胞肺がん、神経膠腫、食道がん、鼻咽頭がん、腎臓がん、胃がん、肝臓がん、膀胱がん、子宮頸がん、脳腫瘍、リンパ腫、白血病、骨髄腫であってもよい。
一態様において、本発明は、本明細書で開示される抗体様タンパク質、抗体、抗EGFRドメイン、又はペプチドを調製する方法を提供する。一実施形態において、前記方法は、本明細書で開示される抗体様タンパク質、抗EGFRドメイン又はペプチドをコードするDNA配列が発現されるように宿主細胞を培養するステップと、本明細書で開示される多重特異性抗体様タンパク質、抗EGFRドメイン又はペプチドを精製するステップとを含んでもよい。
【0043】
一態様において、本発明は、有効濃度の本明細書で開示される抗体様タンパク質、抗EGFRドメイン又はペプチドを含む溶液を提供する。一実施形態において、前記溶液は、対象の血漿である。一実施形態において、前記対象は、ヒトである。
【図面の簡単な説明】
【0044】
本明細書の開示の前述及び他の特徴は、添付の図面と併せて、以下の説明及び添付の特許請求の範囲からより完全に明らかになるであろう。図面は、本明細書の開示に従って用意されたいくつかの実施形態のみを示しており、従って、その範囲を限定するものと見なされるべきではなく、本明細書の開示は、添付の図面の使用を通じてさらなる特異性及び詳細が説明され得る。
【0045】
【
図1】セツキシマブ由来のVH(A)及びVL(B)配列のアラインメント(Kabatナンバリング)を示す。
図1において、N85Eはアグリコシル化セツキシマブであり、H1からH11はヒト化バリアントである。
【0046】
【
図2】MixMHC2predアルゴリズムに基づくセツキシマブ由来のVH(A)及びVk(B)ドメインのT20ヒト性スコア(humanness score)、並びに(C)セツキシマブ由来の可変領域におけるMHCII結合ペプチドの予測数を示す。
【0047】
【
図3】Hisタグ付き抗EGFR scFvドメインのSECプロファイルを示し、SI-79R1(セツキシマブ)をSI-79R2(H1)にヒト化することで凝集が低下したことを示している。
【0048】
【
図4】Hisタグ付き抗EGFR scFvドメインのOctet結合分析を示し、ヒト化セツキシマブH1がマウスscFvと同様にヒトEGFRに結合することを実証している。
【0049】
【
図5】Hisタグ付き抗EGFR scFvドメインの熱安定性分析の結果を示し、DLSによって測定されるように、ヒト化セツキシマブSI-79R2がSI-79R1よりも顕著に安定する(より高い温度でアンフォールディングする)ことを示している。
【0050】
【
図6】Hisタグ付き抗EGFR scFvドメインの化学変性安定性分析の結果を示し、グアニジンと尿素の変性によって測定されるように、ヒト化セツキシマブSI-79R2がSI-79R1よりも顕著に安定する(アンフォールディングのためにより高い濃度のグアニジン/尿素が必要である)ことを示している。
【0051】
【
図7】第1ステップのプロテインA精製の直後でのscFv-モノFc(A)及びmAbタンパク質(B)の分析サイズ排除クロマトグラフ、並びに精製scFv-モノFcタンパク質の非還元SDS-PAGE(C)を示す。データは、2つの独立した発現と精製の代表であり、N85Eは、アグリコシル化セツキシマブであり、H1からH11は、ヒト化バリアントである。
【0052】
【
図8】抗ヒトFc(AHC)センサ及びヒトEGFRの可溶性組換え細胞外ドメインを用いたバイオレイヤー干渉法によって決定されたセツキシマブ由来のscFv-モノFcタンパク質(A)及びmAb(B)の結合動力学を示す。データは、2つの独立した実験の代表であり、KD値は、表6-8に示され、N85Eは、アグリコシル化セツキシマブであり、H1からH11は、ヒト化バリアントである。
【0053】
【
図9】動的光散乱によって決定されたセツキシマブ由来のscFv-モノFcタンパク質(A)及びmAb(B)の熱安定性を示す。データは、2つの独立した実験の代表であり、アンフォールディング温度(半径が10nmを超えた点)は、表7-8に示され、N85Eは、アグリコシル化セツキシマブであり、H1からH11は、ヒト化バリアントである。
【0054】
【
図10】αCD3×αEGFR二重特異性抗体並びにそれらの親αCD3及びαEGFR抗体の陽イオン交換クロマトグラフィーを示し、それらの特徴的な保持時間を示している。
【0055】
【
図11】αCD3×αEGFR二重特異性抗体のT細胞依存性細胞傷害(TDCC)を示し、ここで、ルシフェラーゼ処理されたEGFR担持BxPC-3細胞株を標的細胞として活性化T細胞及びαEGFRアームと共にインキュベートし(野生型セツキシマブ、アグリコシル化セツキシマブ(N85E)及びヒト化バージョンH7を含む)、発光シグナルを72時間後の生BxPC-3細胞のエンドポイントとする(EC50値は表8に示される)。
【0056】
【
図12】1)黒色で示されるFabの可変領域(D2)、白色で示されるFabの定常領域及びFc領域の両方;2)影付きボックスで示される追加の抗原結合ドメイン(それぞれ受容体-リガンド結合によって置換可能);3)D1をN末端に結合させ、並びに/或いは、D4を介してD3及び/又はD4をC末端にタンデムに結合させる重鎖モノマー;4)D5及び/又はD6をそのN末端及びC末端に結合させてそれぞれヘキサGNC抗体とペンタGNC抗体が得られる軽鎖モノマー;を示すGNC抗体の模式図を示す。
【0057】
【
図13】ヒト化抗EGFR scFv(SI-55P3、H1 scFv;SI-55P4、H1 scFv;SI-79P2、H4 scFv;SI-79P3、H4 scFv;及びSI-55P9、H7 scFv)又はFab領域(SI-77P1、H7 Fab)を含む抗huEGFRペンタGNC抗体の分析SECプロファイルを示し、プロテインA精製後に凝集が少ないことを示している。
【0058】
【
図14】抗huEGFRペンタGNC抗体のOctet結合分析を示し、ヒト化抗EGFR scFv(SI-55P3、H1 scFv;SI-79P2、H4 scFv;及びSI-79P3、H4 scFv)又はFab領域(SI-77P1、H7 Fab)を有するペンタGNC抗体が緊密な結合を維持することを示している。
【0059】
【
図15】ヒト化抗EGFR scFv(SI-55P9、H7 scFv)又はFab(SI-77P1、H7 Fab)を有するペンタGNC抗体がEGFR発現腫瘍細胞に対する強力なTDCCを誘導することを証明している。
【0060】
【
図16】抗huEGFRヘキサGNC抗体の分析SECプロファイルを示し、ヒト化抗EGFR scFv(SI-55H11、H7 scFv)又はFab領域(SI-77H4、H7 Fab)を有するヘキサGNC抗体は、セツキシマブに由来の抗EGFRドメインを有するヘキサGNCよりも凝集が少ないことを示している。
【0061】
【
図17】抗huEGFRヘキサGNC抗体のOctet結合分析を示し、ヒト化抗EGFR scFv(SI-55H11、H7 scFv)又はFab領域(SI-77H4、H7 Fab)を有するヘキサGNC抗体がセツキシマブ由来ヘキサGNC抗体SI-77H4と同様のEGFRに対する結合を維持することを示している。
【0062】
【
図18】ヒト化抗EGFR scFv(SI-55H11、H7 scFv)を有するヘキサGNC抗体がEGFR発現腫瘍細胞に対する強力なTDCCを誘導することを示す。
【0063】
【
図19】
図19Aは、非対称二重特異性抗体の模式図を示し、ここで、EGFR Fabは、3つのセツキシマブFabの1つに由来し(N85Eを有するか若しくはない野生型、又はヒト化VH/VLを有する野生型)であり、2番目のFabは、CD3 Fabであり、CH3ドメインは、K409R変異を含む。
図19Bは、miniGNC抗体様タンパク質の模式図を示し、そのヘテロ二量体構成は、1)黒色で示される単一Fabの可変領域(mD3)、白色で示されるFabの定常領域及びFc領域の両方;2)影付きボックスで示される追加の抗原結合ドメイン(それぞれ受容体-リガンド結合によって置換可能である);3)mD1をそのN末端に、mD4をそのC末端に結合させる鎖Aモノマー;並びに4)mD2をそのN末端に、mD5をそのC末端に結合させる鎖Bモノマー;を含む。
【0064】
【
図20】抗huEGFRペンタminiGNC抗体の分析SECプロファイルを示し、ヒト化抗EGFR scFv(SI-68P7、H1 scFv;SI-79P1、H4 scFv;及びSI-68P13、H7 scFv)又はFabドメイン(SI-68P17、H7 Fab)を有するペンタminiGNC抗体は、凝集が少ないことを示している。
【0065】
【
図21】抗huEGFRペンタminiGNC抗体のOctet結合分析を示し、ヒト化抗EGFR scFv(SI-709P1、H4 scFv;SI-68P13、H7 scFv)又はFab領域(SI-68P17、H7 Fab)を有するペンタminiGNC抗体がEGFRに対する結合を維持することを示している。
【0066】
【
図22】ヒト化抗EGFR scFv(SI-68P13、H7 scFv)又はFab領域(SI-68P17、H7 Fab)を有するペンタminiGNC抗体がEGFR発現腫瘍細胞に対する強力なTDCCを誘導することを示している。
【発明を実施するための形態】
【0067】
以下の詳細な説明では、本明細書の一部を形成する添付図面を参照する。図面では、文脈からそうでないことが示されない限り、同様の記号は通常は、同様のコンポーネントを識別する。詳細な説明、図面、及び特許請求の範囲に記載されている例示的な実施形態は、限定することを意図していない。本明細書に提示される主題の精神又は範囲から逸脱することなく、他の実施形態を利用することができ、他の変更を加えることができる。本明細書に一般的に記載され、図に示される本開示の態様は、多種多様な異なる構成で配置、置換、組み合わせ、分離、及び設計できることは容易に理解されよう。これらはすべて本明細書で明確に検討されている。
【0068】
本開示は、単離された抗体、前記抗体の製造方法、モノクローナル及び/又は組換え単一特異性抗体、多重特異性抗体、抗体薬物複合体、及び/又は前記抗体若しくは抗原結合フラグメントから構成される免疫複合体;前記抗体、モノクローナル及び/又は組換え単一特異性抗体、多重特異性抗体、抗体薬物複合体及び/又は免疫複合体を含む医薬組成物;前記抗体及び組成物の製造方法、前記抗体及び組成物を用いてがんを治療する方法を提供する。具体的には、本開示は、ヒトEGFRに対して結合特異性を有する単離されたモノクローナル抗体(mAb)又はその抗原結合断片を提供する(表1、
図1)。前記単離されたmAb又は抗原結合断片は、配列番号1及び3;5及び7;9及び11;13及び15;17及び19;21及び23;25及び27;29及び31;33及び35;37及び39;41及び43;55;57;59;61;63;65;67;69;71;73;75;77;79;81;83;85及び87;89及び91;93及び95;97及び99;101及び103;105及び107;109及び111;113及び115;117及び119;121及び123;125及び127;129及び131;133及び135;137及び139;141及び143;141及び149;151及び139;145及び147; 137、145、139及び147;141、145、143及び147;141、145、149及び147;151、145、139及び147から選択される配列と同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0069】
本明細書で使用される「a」、「an」、及び「the」という用語は、「1つ以上」を意味すると定義され、文脈が不適切でない限り複数形を含む。
【0070】
本明細書で使用される「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という用語は互換性があり、ペプチド結合によって連結されたアミノ酸から構成される生体分子を意味すると定義される。
【0071】
「抗原」という用語は、生物、特に動物、より具体的にはヒトを含む哺乳動物において免疫応答を誘発することができる実体又はその断片を指す。この用語は、抗原性又は抗原決定基に関与する免疫原及びその領域を含む。
【0072】
「抗原又はエピトープ結合部分もしくは断片」、「可変領域」、「可変領域配列」又は「結合ドメイン」という用語は、抗原(本発明では、例えば、EGFR)に結合することができる抗体の断片を指す。抗原結合断片(Fab)は、抗原に結合する抗体上の領域(Fab領域)である。これらの断片は、インタクト抗体の抗原結合機能及び追加機能の能力を有していてもよい。結合断片の例は、合成リンカーによって単一ポリペプチド鎖に接続された抗体の単一アームの可変軽鎖(VL)及び可変重鎖(VH)ドメインからなる単鎖Fv断片(scFv)、又はVL、定常軽鎖(CL)、VH、及び定常重鎖1(CH1)ドメインからなる一価断片であるFab断片を含むが、これらに限定されない。
【0073】
抗体断片はさらに小さいサブ断片であり、単一のCDRドメイン、特にVL及び/又はVHドメインのいずれかからのCDR3領域と同じくらい小さいドメインで構成できる(例えば、Beiboer et al.,J.Mol.Biol.296:833-49(2000)参照)。抗体断片は、当業者に知られている従来の方法を使用して生産される。抗体断片は、インタクト抗体で使用される同じ技術を使用して、有用性に関してスクリーニングできる。
【0074】
「抗原、エピトープ結合部分又は断片」、「可変領域」、「可変領域配列」又は「結合ドメイン」は、多くの当技術分野で既知の技術によって本開示の抗体から誘導され得る。例えば、精製されたモノクローナル抗体は、ペプシンなどの酵素で切断し、HPLCゲル濾過にかけることができる。抗体のパパイン消化により、それぞれが単一の抗原結合部位を有する2つの同一の抗原結合断片(「Fab」断片と呼ばれる)と、その名前が容易に結晶化する能力を反映した残りの「Fc」フラグメントが産生される。ペプシン処理により、2つの抗原結合部位を有するとともに依然として抗原を架橋できるF(ab')2断片が得られる。次に、Fab断片を含む適切な画分を収集し、膜濾過などにより濃縮し得る。抗体の活性断片の単離のための一般的な技術のさらなる説明については、例えば、Khaw,B.A.et al.J.Nucl.Med.23:1011-1019(1982)、Rousseaux et al.Methods Enzymology,121:663-69,Academic Press,1986を参照。
【0075】
「抗体」という用語は最も広い意味で使用され、望ましい生物学的活性を示す限り、単一のモノクローナル抗体及び/又は組換え抗体(アゴニスト及びアンタゴニスト抗体を含む)、ポリエピトープ特異性を有する抗体組成物、及び抗体断片(例えば、Fab、F(ab')2、及びFv)を具体的にカバーする。いくつかの実施形態では、抗体は、モノクローナル、ポリクローナル、キメラ、単鎖、多特異性又は多効性、ヒト及びヒト化抗体、並びにその活性断片であってもよい。既知の抗原に結合する分子の活性断片の例には、Fab、F(ab′)2、scFv及びFv断片が含まれ、Fab免疫グロブリン発現ライブラリーの産物、並びに上記の抗体及び断片のいずれかのエピトープ結合断片を含む。
【0076】
「Fv」という用語は、完全な抗原認識及び結合部位を含む最小の抗体断片である。この領域は、1つの重鎖可変ドメインと1つの軽鎖可変ドメインのダイマーで構成され、非共有結合で緊密に結合している。この構成では、各可変ドメインの3つのCDRが相互作用して、VH-VLダイマーの表面に抗原結合部位を規定する。集合的に、6つのCDRは抗体に抗原結合特異性を付与する。但し、単一の可変ドメイン(又は、抗原に特異的な3つのCDRのみを含むFvの半分)でも、結合部位全体よりも低い親和性でありながら、抗原を認識して結合してもよい。
【0077】
いくつかの実施形態において、抗体は、免疫グロブリン分子及び免疫グロブリン分子の免疫学的活性部分、即ち抗原に免疫特異的に結合する結合部位を含む分子を含んでいてもよい。典型的な抗体は、典型的には2本の重(H)鎖と2本の軽(L)鎖を有するヘテロテトラマー蛋白質を指す。各重鎖は、重鎖可変ドメイン(VHと略記)及び重鎖定常ドメインで構成される。各軽鎖は、軽鎖可変ドメイン(VLと略記)及び軽鎖定常ドメインで構成される。任意の脊椎動物種の抗体(免疫グロブリン)の軽鎖は、それらの定常ドメインのアミノ酸配列に基づいて、カッパとラムダと呼ばれる2つの明確に異なるタイプのいずれかに割り当てることができる。VH及びVL領域は、超可変相補性決定領域(CDR)のドメインと、フレームワーク領域(FR)と呼ばれるより保存された領域にさらに細分化してもよい。各可変ドメイン(VH又はVL)は典型的には、次の順序で配置された3つのCDRと4つのFRで構成される。アミノ末端からカルボキシ末端までがFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4。軽鎖及び重鎖の可変領域内には、抗原と相互作用する結合領域がある。
【0078】
重鎖の定常ドメインのアミノ酸配列に応じて、免疫グロブリンを異なるクラスに割り当てることができる。免疫グロブリンには5つの主要なクラスがある。IgA、IgD、IgE、IgG、IgM、及びこれらのいくつかは、サブクラス(アイソタイプ)、例えば、IgG-1、IgG-2、IgG-3、IgG-4、IgA-1及びIgA-2にさらに分けられ得る。免疫グロブリンの異なるクラスに対応する重鎖定常ドメインは、それぞれα、デルタ、イプシロン、γ、及びμと呼ばれる。免疫グロブリンの異なるクラスのサブユニット構造と三次元配置はよく知られている。
【0079】
本明細書で使用される「モノクローナル抗体」という用語は、実質的に均一な抗体の集団から得られる抗体を指す。即ち、集団を含む個々の抗体は、少量存在する可能性のある自然発生突然変異を除いて同一である。モノクローナル抗体は非常に特異的であり、単一の抗原部位に向けられる。さらに、異なる決定基(エピトープ)に対する異なる抗体を典型的に含む従来の(ポリクローナル)抗体調製物とは対照的に、各モノクローナル抗体は抗原上の単一の決定基に向けられる。それらの特異性に加えて、モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ培養により合成され、他の免疫グロブリンにコンタミネーションされていないという点で有利である。修飾語「モノクローナル」は、抗体の実質的に均一な集団から得られるという抗体の特性を示し、特定の方法による抗体の生産を必要とすると解釈されない。例えば、本明細書の開示に従って使用されるモノクローナル抗体は、Kohler&Milstein,Nature,256:495(1975)によって最初に記載されたハイブリドーマ法によって作製されてもよく、又は組換えDNA法によって作製されてもよい(例えば、U.S.Pat.No.4,816,567参照)。「組換え」とは、外因性宿主細胞において組換え核酸技術により抗体を生成することを意味する。
【0080】
モノクローナル抗体は、様々な方法により調製することができる。このような方法は、マウスハイブリドーマ、ファージディスプレイ、組換えDNA、初代B細胞から直接抗体の分子クローニング及び抗体発見法(Siegel.Transfus.Clin.Biol.2002;Tiller.New Biotechnol.2011;Seeber et al.PLOS One.2014)。モノクローナル抗体は、特定の種に由来する、又は特定の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体の対応する配列と重鎖及び/又は軽鎖の一部が同一又は相同であり、一方、鎖の残りの部分は、所望の生物活性を示す限り、別の種に由来する、又は別の抗体クラス又はサブクラスに属する抗体、並びにそのような抗体の断片の対応する配列と同一又は相同である「キメラ」抗体(免疫グロブリン)を含んでいてもよい(U.S.Pat.No.4,816,567、及びMorrison et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA,81:6851-6855[1984])。
【0081】
本明細書で使用される「多重特異性」抗体という用語は、少なくとも2つの結合部位を有する抗体を指し、これらの結合部位は、それぞれ抗原のエピトープに結合親和性を有する。本明細書で使用される「二重特異性、三重特異性、四特異性、五重特異性又は六重特異性」抗体という用語は、 2、3、4、5又は6個の抗原結合部位を有する抗体を指す。例えば、本明細書に記載の抗体は、5つの結合部位を有する場合に五重特異性であり、6つの結合部位を有する場合に六重特異性である。
【0082】
「ガイダンス及びナビゲーションコントロール(GNC)」という用語は、少なくとも1つのエフェクター細胞(例えば、免疫細胞)抗原及び少なくとも1つのターゲット細胞(例えば、腫瘍細胞、免疫細胞又は微生物細胞)抗原に結合可能な多重特異性タンパク質を指す(WO2019191120A1;その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。GNCタンパク質は、抗体コアに結合した様々な結合ドメインを有するFab領域及びFc領域を含む抗体コア構造を採用してもよい。この場合、GNCタンパク質は、GNC抗体とも呼ばれる。GNCタンパク質は、抗体様構造を採用してもよい。この場合、Fv断片は、非抗体ベースの結合ドメイン(例えば、NKG2D、4-1BBL(4-1BB受容体リガンド)、4-1BBのための4-1BBLトリマー)又は受容体で置換されてもよい。
【0083】
「GNC抗体」という用語は、少なくとも1つのエフェクター細胞(例えば、免疫細胞)及び少なくとも1つのターゲット細胞(例えば、腫瘍細胞、免疫細胞又は微生物細胞)に同時に結合可能な抗体構造を有するGNCタンパク質を指す。本明細書で使用される「バイ(bi-)GNC、トリ(tri-)GNC、テトラ(tetra-)GNC、ペンタ(ペンタ)GNC又はヘキサ(hexa-)GNC」抗体とは、2、3、4、5又は6個の抗原結合部位を有するGNC抗体を指し、少なくとも1つの抗原結合部位は、免疫細胞に結合親和性を有し、少なくとも1つの抗原結合部位は、腫瘍細胞に結合親和性を有する。一実施形態では、本明細書に記載のGNC抗体は、それぞれ4つから6つの結合部位(又は結合ドメイン)を有し、テトラGNC、ペンタGNCペンタGNC及びヘキサGNC抗体である。いくつかの実施形態において、GNC抗体は、抗体結合ドメイン(例えば、Fab及びscFv)を含み、Fc領域における別途なタンパク質工学を必要としない。一実施形態では、GNC抗体は、各標的抗原の二価性を保持する利点をさらに有する。さらなる実施形態では、GNC抗体は、抗原に対する高親和性及び低解離速度をもたらすアビディティ効果の利点を有する。各抗原に対するこの二価性は、多くの多重特異性プラットフォームと異なり、これらの多重特異性プラットフォームは各標的抗原に対して一価であるため、抗体結合を非常に強くする有益なアビディティ効果を失うことがよくある。
【0084】
「ヒト化抗体」は、非ヒトドナー免疫グロブリンに由来するCDRを有し、分子の残りの免疫グロブリン由来部分が1つ(又はそれ以上)のヒト免疫グロブリンに由来する操作された抗体のタイプを指す。さらに、フレームワークサポート残基は、結合親和性を保持するために変更されてもよい。「ヒト化抗体」を得る方法は、当業者によく知られている。(例えば、Queen et al.,Proc.Natl Acad Sci USA,86:10029-10032(1989),Hodgson et al.,Bio/Technology,9:421(1991)参照)。
【0085】
「単離」又は「精製」とは、それが自然に発生する成分の少なくともいくつかを含まない生体分子を意味する。「単離」又は「精製」とは、本明細書に開示の様々なポリペプチドを説明するために使用される場合、発現元の細胞又は細胞培養物から同定及び分離及び/又は回収されたポリペプチドを意味する。典型的には、精製されたポリペプチドは、少なくとも1つの精製工程により調製される。「単離又は精製された抗体」とは、異なる抗原結合特異性を有する他の抗体を実質的に含まない抗体を指す。
【0086】
「免疫原性」という用語は、抗体、T細胞、又は免疫原性物質に対する他の反応性免疫細胞の産生を誘発又は増強し、ヒト又は動物の免疫応答に寄与する物質を指す。免疫応答は、個体が、治療される障害を緩和又は軽減するために、投与された本発明の免疫原性組成物に対して十分な抗体、T細胞及び他の反応性免疫細胞を産生するときに起こる。免疫原性応答には一般に、免疫応答の細胞性(T細胞)と体液性(抗体)の両方のアームが含まれ、治療用タンパク質に対する抗体(抗薬物抗体、ADA)は、IgM、IgG、IgE及び/又はIgAアイソタイプで構成される。
【0087】
特定の抗原又はエピトープに対する「特異的結合」又は「特異的に結合する」又は「特異的」とは、非特異的相互作用とは明らかに異なる結合を意味する。特異的結合は、例えば、一般に結合活性を持たない同様の構造の分子である対照分子の結合と比較して、分子の結合を決定することにより測定し得る。例えば、特異的結合は、標的に類似した制御分子との競合により決定し得る。
【0088】
「親和性」という用語は、抗体/抗原、受容体/リガンドなどの2つのポリペプチド間の引力の尺度を指す。2つのポリペプチド間の固有の引力は、特定の相互作用の結合親和性平衡解離定数(KD)として表すことができる。KD結合親和性定数は、例えば、バイオレイヤー干渉法によって測定することができる。ここで、KDは、kdis(解離速度定数)とkon(結合速度定数)の比、即ち、KD=kdis/konである。
【0089】
特定の抗原又はエピトープに対する特異的結合は、例えば、少なくとも約10-4M、少なくとも約10-5M、少なくとも約10-6M、少なくとも約10-7M、少なくとも約10-8M、少なくとも約10-9M、少なくとも約10-10M、少なくとも約10-11M、少なくとも約10-12M、又はそれ以上の抗原又はエピトープに対するKDを有する抗体によって示され得る。ここで、KDは特定の抗体-抗原相互作用の平衡解離定数を指す。典型的には、抗原に特異的に結合する抗体は、抗原又はエピトープに対して対照分子の20~、50~、100~、500~、1000~、5000~、10000~倍、又はより大きいKDを有してもよい。
【0090】
また、特定の抗原又はエピトープに対する特異的結合は、例えば、対照に対するエピトープについて少なくとも20~、50~、100~、500~、1000~、5000~、10000~倍、又はより大きい抗原又はエピトープに対するKA又はKaを有する抗体により示すことができる。ここで、KA又はKaは、特定の抗体-抗原相互作用の結合(association)速度を意味する。
【0091】
セツキシマブの潜在的な欠点は、その可変領域がマウスで発見され、これらの領域が非ヒト配列を保持していることである。キメラ抗体は、ヒト化抗体又はヒト抗体と比較した場合、より高い免疫原性の能力を有する可能性があることが実証されている6。一方、ヒト化は、フレームワーク領域の適合性を高めることにより、抗体の安定性を高めることができる7。もう1つの懸念は、VH N85(Kabat)のグリカン占有部位であり、Fabグリコシル化が抗体の生物学的特性に影響を与える可能性があり、製造中に十分に制御する必要があるグリカンの不均質を導入する可能性がある8,9。セツキシマブの免疫原性は、抗セツキシマブIgG応答の発生率が低い(5%)ことで低いが、過敏症は、よく見られるものであり、SP2/0細胞で発現されるVHを修飾するガラクトース-α-1,3-ガラクトースオリゴ糖に対する既存のIgE抗体が主な原因である10-12。
【0092】
これらの欠点を克服するために、セツキシマブは、翻訳後修飾部位の除去、抗体の安定化、EGFR に対する高い親和性を維持しながら免疫原性の可能性を低減するという目的でヒト化された。ヒト化の戦略には、安定したヒトフレームワークへの直接のCDR移植、最も類似した生殖細胞系又はコンセンサスフレームワークへの配列誘導移植、及びヒト化変異の予測される安定性効果に基づく構造誘導アプローチが含まれる。その結果、優れた生物物理学的特性を備えたヒト化セツキシマブ配列のパネルが得られた。その構造モデリングアプローチは、EGFR親和性を損なうことなく安定したバインダーを生成するのに最も成功した。
【0093】
非ヒト種で発見された抗体のヒト化は、免疫原性を低下させるだけでなく、安定性を高め、配列の欠陥を取り除くためにも一般的な方法である。この研究では、セツキシマブscFvは、偏りのないCDR移植、配列誘導ヒト化、及びモデル誘導ヒト化を含む3つの異なる戦略によりヒト化された(表2)。それぞれのアプローチはヒト性が向上したEGFRバインダーの産生に成功したが、ヒト化戦略全体で安定性と親和性保持に明確な傾向があった。単純なCDR移植片は不安定化及び抗原親和性の最大(4倍)の損失をもたらしたが、配列相同性アプローチは安定化及び親和性のより緩やかな減少(2倍)をもたらし、モデルガイドアプローチは、最も成功し、顕著な安定化をもたらし、抗原親和性の変化がなかった。
【0094】
mAbとして発現された場合、ヒト化バージョンH7は、二重特異性αEGFRxαCD3の形式に変換した場合、セツキシマブと比較して力価と熱安定性が増加し、結合動力学が変化せず、同様のTDCC効力を示した(表8)。
【0095】
優れた生物物理学的特性に加えて、ヒト化バージョンは、セツキシマブのマウス可変領域に関連する配列障害を取り除いた。VHとVLヒト性は、すべてのヒト化で顕著に増加し、免疫原性ペプチドの存在は、MHCII対立遺伝子に対する予測された親和性に基づいて減少したように見えた(表1)。治療用抗体の免疫原性を予測することは困難であるが、ヒト性の増加、T細胞エピトープ数の減少により免疫原性の発生率が大幅に低下する可能性がある17,18,20。さらに、グリコシル化及び脱アミド化部位の除去により、非ヒト細胞で発現された場合でも、ロット間の特徴解析の複雑さが減少し、免疫原性Fabサッカリドの可能性が排除される。
【0096】
ヒト化後、scFvの凝集を減少させる手段として、VLの3つのC末端残基の追加の修飾が試みられた13,15,16。CH1/CLドメインがないため、scFvの表面が不自然に溶媒にさらされる。ヒトVλは、Vκよりも荷電残基が少なく疎水性の高いC末端を有するため(LTVL対LEIK)、最後のβシートのパッキングが優れている可能性がある。実際、この就職により、3つのケースの全てでは凝集が減少し(平均で8%)、3つのケースのうち2つのケースでは力価と熱安定性が向上した(表6)。
【0097】
さらに、IgG抗体は、上部Fcドメイン内のCH2ドメインに位置するN297に保存されたN-グリコシル化部位を有する。さらに、少数の抗体は、可変領域内に存在することがあるN-グリコシル化モチーフのために、Fab領域でグリコシル化される(8)。抗体医薬品のグリカンプロファイルは、大規模な発現及び精製中に一貫した均一なタンパク質が得られるように、バッチごとに定期的に特徴解析する必要がある。グリカン部位が抗体のFabとFcの両方にある場合、各部位のグリカンプロファイルを明確に識別するために分子を消化するか、デコンボリューションする必要があるため、課題が生じる。しかし、Fabドメイン内のグリカンを除去すると、グリカンが活性な抗原結合立体構造を安定化できるため、標的抗原に対する親和性が損なわれることがよくある。セツキシマブの場合、抗体はVHドメインのN99(AHo)でグリコシル化される(9)。グリコシル化は、そのグリカン部位を特徴解析するための品質管理ステップを追加する必要があるため、商品のコストを増加させる。EGFRに対する元の親和性を保持しながらFabグリカンを除去することは、特徴解析が容易でありながら完全な有効性を保持する抗体の産生における大きな飛躍を表している。
【0098】
セツキシマブは、他の戦略を使用して以前にヒト化されている。セツキシマブの1つのCDR移植研究では、EGFRを過剰発現する細胞に結合できる抗体が産生されたが、親和性が9倍低下した21,22。このKDの増加は、本研究におけるCDR移植について観察された親和性の変化を反映している。また、セツキシマブは、α-1,3-ガラクトースエピトープを除去するように糖鎖改変されており、この抗体の免疫原性を低下させる別のアプローチを示している23。まとめて、ここに提示されたデータは、セツキシマブのタンパク質工学がその安定性と免疫原性特性を改善できることを示しており、より一般的には、配列、特に構造ガイド方法により、優れた安定性と結合特性を有するヒト化抗体を産生できることを示唆している。
【0099】
本開示は、本明細書に含まれる特定の実施形態及び実施例の以下の詳細な説明を参照することによって、より容易に理解され得る。本開示は、その特定の実施形態の特定の詳細を参照して説明されてきたが、そのような詳細が本開示の範囲に対する限定と見なされるべきであることは意図されていない。
【0100】
実施例
実施例1:ヒト化EGFR結合配列
T20スコア(範囲は0から100であり、100は最適なヒト性を示す)を提供するLake Pharma Antibody Analyzer(https://dm.lakepharma.com/bioinformatics/)を用いて配列のヒト性を計算した(表1、
図2C)。特に、野生型マウス配列は、フレームワーク領域のみのスコアを計算した結果、66.44(VH)及び70.38(VK)と低いスコアであった。これに対し、ヒト化バリアント(H1-H11)の配列は、T20ヒト性スコア(76.95から88.10(VH)及び81.44から91.04(VK))が顕著により高かった。したがって、ヒト化バリアントの配列は、MHCII結合が低く、ヒト性が高いため、マウス配列よりも免疫原性が低いと予測される。
【0101】
セツキシマブ可変領域のヒト性を向上させ、免疫原性の潜在力を低減させるために、マウスのVH及びVkドメインをよりヒト性フレームワークに変換した(
図1)。バージョンH1は、安定したヒトフレームワークへのKabat CDR残基の単純な移植に基づいた13。バージョンH8、H9、H10、及びH11は、ヒト生殖細胞系列配列との配列同一性に基づいて設計された。特に、バージョンH10及びH11では、フレームワーク残基は、最も類似したヒト生殖細胞系列配列と一致するように変異した。バージョンH8及びH9では、フレームワーク残基は、ヒト抗体のコンセンサス残基に変異した。残りのヒト化バージョン(H2、H3、H4、H5、H6、H7)は、セツキシマブの構造解析に基づいて、フレームワーク残基を、インシリコで最も安定した構造を引き起こしたヒト生殖細胞系列で少なくとも5%の頻度で発生する残基に変異させることによりた設計された。このタイプのヒト化のエネルギー分析は入力モデルに依存するため、いくつかの入力構造を調べた。バージョンH2は、セツキシマブ結晶構造1YY9を使用した14。バージョンH3、H4、H5、H6及びH7は、セツキシマブ可変ドメインの配列に基づいて、Discovery Studioの抗体モデリング機能から生成されたscFvモデルを使用した。バージョンH4、H5、H6及びH7では、VH C末端とヒトのコンセンサス配列との類似性を高めるか、又はVκ C末端をよりVλ様にするために、入力配列に変更を組み込んだ。Discovery Studioでヒト化した後、Vκドメインの最後の3つの残基をλJ遺伝子の対応する残基に変換することにより、H7、H9及びH11をさらに修飾した。scFvの安定性と凝集傾向を決定する際の最後のVLβ鎖の既知の重要性、及び相互作用を安定させるためのパッキングエネルギーを提供できるVλ末端のより高い疎水性の性質のため、上記の変更を評価した13,15,16。すべてのヒト化戦略を表2にまとめて示す。
【0102】
ヒト化バージョンH1では、セツキシマブKabat CDRは、上記の安定したフレームワークに移植された13。他のすべての人間化されたバージョンは、Discovery Studio 2020スイートを使用して設計された。バージョンH8~H11は、クエリ配列としてセツキシマブのアミノ酸配列のみに基づく予測ヒト化変異(Predict Humanizing Mutations)プロトコルを使用して設計された。 Identity Threshold(同一性閾値)を50に設定し、Frequent Residue Substitution Tolerance(頻繁な残基置換耐性)を20に設定し、Germline Substitution Tolerance(生殖細胞系列置換耐性)を0に設定し、Kabat CDR残基、IMGT CDR残基、Vernier Zone残基及びヒト生殖細胞系残基の置換を除外した。バージョンH10及びH11は、生殖細胞系置換に基づいて生成されたが、バージョンH8及びH9は頻繁な残基置換を使用した。最良の単一変異配列を生成するために、バージョンH2~H7は、セツキシマブの様々な入力モデルを使用し、Calculate Mutation Energy(計算変異エネルギー)をTrue(CHARMm力場)に設定して設計された。クエリ構造は、表2 に示すように、セツキシマブの様々なモデルであった。バージョンH2では、結合状態のCDRのポーズを取得するために、PDB 1YY9のセツキシマブコンポーネント(EGFRと複合体を形成したセツキシマブ)を使用した。バージョンH3~H7は、Discovery StudioのAntibody Modeling Cascadeによって生成されたセツキシマブモデルを使用した。入力配列(Input Sequences)については、H3ではセツキシマブVHとVL、H4及びH7ではセツキシマブVH(TVSAではなくTVSSで終わる)とVL、H5ではセツキシマブVHとVL(LELKではなくLTVLで終わる)、及びH6ではセツキシマブVH(TVSAではなくTVSSで終わる)とVL(LELKではなくLTVLで終わる)であった。上位5つのフレームワークテンプレートは、10の配列類似性カットオフで使用された。CDRループ定義をHoneggerに設定し、ループごとの最大テンプレート数を3に設定し、最適化レベルを高に設定した。ヒト化配列を産生した後、VLの最後の4つの残基をLTVLに置換してラムダ抗体の安定したFR4を模倣することにより、バージョンH10、H8及びH4をそれぞれH11、H9及びH7に変更した。
【0103】
セツキシマブの可変ドメイン及びそのヒト化バージョンの配列を
図1に示す。
図1A及び
図1Bは、それぞれVH及びVL配列のアラインメントを示している。CDR領域に隣接するバーニアゾーン残基及び構造的に重要なフレームワーク領域におけるバーニアゾーン残基は、保存されて抗原結合を維持した。配列間のアミノ酸同一性の検査(表3)は、ヒト化VH配列がセツキシマブと84~87%の同一性を有し、互いに79~100%の同一性を有することを明らかにした。定義により、対応する非修飾ヒト化に対して100%のVH同一性を有する修飾λJ領域を有するバージョンの比較を除いて、ヒト化VH配列間の最大同一性は95%であった。ヒト化VL配列は、セツキシマブと79~86%の同一性を有し、互いに76~98%の同一性を有した。なお、フレームワーク領域のみを比較した場合、配列の同一性が低下した(セツキシマブVHとヒト化VHでは同一性は70~82%、セツキシマブVLとヒト化VLでは同一性は60~82%であった)。
【0104】
Fcグリカンに加えて、野生型セツキシマブは、VHドメイン(Kabat N85;グリコシル化されることが知られている)とVKドメイン(Kabat N41;NGSグリコシル化モチーフの一部)にそれぞれ2つの潜在的なグリコシル化部位を有する。さらに、この同じVK N49は、NG脱アミド化モチーフを形成するため、脱アミド化されている可能性がある。これらの翻訳後修飾部位の安定性と製造評価に関連する不利益を取り除くために、すべてのヒト化配列H1-H11において3つの不利益(2つのグリコシル化と1つの脱アミド化)を除去した(
図1)。特に、セツキシマブにおける占めされたNDTグリコシル化モチーフを含むKabat残基VH N85は、ヒト化でA、D又はEアミノ酸に修飾されてこの既知のグリカン部位が除去された。同様に、セツキシマブにおけるNGSグリコシル化モチーフを含むVL N41は、すべてのヒト化でより典型的なG残基に変更された。
野生型セツキシマブ及びヒト化可変領域の人間性は、フレームワーク領域の配列に基づくT20ヒト性スコアを使用して計算された17。セツキシマブは、マウス可変領域を有するキメラ抗体であり、そのT20スコアが66.44(VH)及び70.38(Vκ)と低かった。ヒト化VHドメインのT20スコアは66.44から76.95~88.10の範囲に増加し(表1、
図2A)、ヒト化Vκドメインのスコアは70.38から81.44~91.04の範囲に増加した(表1、
図2B)。したがって、セツキシマブ可変領域のヒト化により、これらの配列のヒト性が大幅に改善され、ヒト生殖細胞系列との配列同一性の増加は免疫原性を低下させることができる。
【0105】
生物製剤中の非ヒト配列の存在は、抗薬物抗体(ADA)の形で免疫原性を引き起こす可能性があるが、強力な高親和性ADAは、問題のB細胞が活性化されてIgGサブタイプへのクラススイッチ組換えを経験する場合にのみ発生する。このB細胞の活性化には、提示されたMHCII-ペプチドがCD4+T細胞上の適合するT細胞受容体に結合する必要がある。したがって、治療用抗体がMHCクラスIIに安定して結合するペプチドを含む場合、望ましくないADA応答が発生する可能性が高くなる。
【0106】
MixMHC2predアルゴリズム(https://github.com/GfellerLab/MixMHC2pred)を使用して、抗体配列内のMHCII結合リガンドを予測した18。このアルゴリズムは、安定したT細胞エピトープを形成するのに十分な親和性でMHCIIに結合する特定のアミノ酸配列内の「コア」ペプチドの数を検出することができる。配列において識別されるMHCII結合ペプチドの数が多いほど、この配列に含まれる潜在的なT細胞エピトープが多くなる。なお、アルゴリズムは、免疫原性ペプチドと寛容原性ペプチドを区別できない。しかし、コアペプチドの数が多いと、免疫原性促進(pro-immunogenic)ペプチドが含まれる可能性が高くなる。MixMHC2predアルゴリズムは、GitHubリポジトリから購入してダウンロードされた。(G4S)4リンカーを含むVL/VH scFv配列に対してアルゴリズムを実行した後、異なる配列についてコアペプチドの数を計算して表にした。スコアリングは、MHCIIの任意の対立遺伝子に対する強力なリガンドの存在について配列を評価できるように複数の対立遺伝子にわたって実行された。コアペプチドの数は、相互作用の上位0.2%のスコアで任意のMHCII対立遺伝子に結合できる配列内のペプチドの数に基づいて計算された。
【0107】
セツキシマブ可変領域内のMHCIIエピトープの存在を評価するために、VH及びVL配列を、MHCII結合親和性を予測する計算機にかけた。アルゴリズムMixMHC2predは、異なるHLA-II対立遺伝子への約100,000のペプチドの結合に基づくものである18。入力配列に基づいて、MixMHC2predは配列内の各ペプチドの各HLA-II対立遺伝子への結合を評価し、任意の対立遺伝子との最も強い相互作用に基づいて各残基のランク付けされたスコアを返す。MHCに結合するコアペプチドの数は、すべての相互作用の上位0.2%内にランクされた固有のペプチドの数に基づいて計算された。スコアリングシステムをVH-VLペアごとに1つの値に簡素化するために、配列はVHとVLの両方内のペプチドから構成されるscFv[VL-(G4S)3-VH]として実行された。このシステムを使用して、セツキシマブとヒト化配列のMHCIIコアペプチドの数を計算した(表1、
図2C)。MHCII結合がヒト化の基準として使用されなかったが、すべてのヒト化配列における相互作用の0.2%以内にスコアリングされたペプチドの数が減少した。セツキシマブには12個のコア ペプチドがあるのに対し、ヒト化配列には7~11個のコアペプチドがあった。このMHCII結合の減少は、より多くのヒト配列と組み合わせて、ヒト化可変領域の免疫原性の可能性を低下させることができる。さらに、マウス配列において、MHCII結合ペプチドの一部であると予測されるCDR内の12個の残基を同定した。多くのヒト化バリアント(H2、H3、H4、H5、H6、H7、H10及びH11)において、MHCII結合ペプチドにおけるCDR残基の数は減少した。
【0108】
実施例2:ヒト化EGFR結合ペプチド、ドメイン、抗体及び抗体様タンパク質の製造及び特徴解析方法
様々な単一治療薬の形でヒト化抗EGFR可変領域を特徴解析するために、下記の方法により、EGFR結合複合体、huEGFR変異体(huEGFR)、Hisタグ付きscFvタンパク質(scFv-6His)、組換えscFv-モノFcモノマー(scFv-モノFc)、モノクローナル抗体(mAb)、二重特異性抗体(二重特異性)、ペンタGNC抗体(pentaGNC)、ヘキサGNC抗体(HexaGNC)及びペンタminiGNC抗体(miniGNC)を産生して特徴解析した(表4)。
【0109】
2a.EGFR結合複合体の発現及び精製
タンパク質の安定性は、フォールディング状態とアンフォールディング状態の間の自由エネルギーの差によって定義される重要なパラメーターである。タンパク質治療薬の場合、安定性は免疫原性、薬物動態、さらには有効性に影響を与える可能性があり(7)、凝集の減少は、製造が容易で患者にとってより安全な治療薬の開発に役立つ。さらに、発現効率とタンパク質収量は、タンパク質治療薬のコストを直接決定する。タンパク質をより効率的に発現させて、より高い力価を達成し、精製タンパク質の収量を増やすことができれば、製造コストを大幅に削減できる。
【0110】
タンパク質は、Hisタグ付きscFv又はscFv-モノFc(単一プラスミド)の発現プラスミドをトランスフェクションするか、重鎖と軽鎖(他の形式の場合)をExpiCHOシステム(Thermo Fisher)でコトランスフェクションすることにより発現され、EGFR結合複合体と総称される。簡単に言えば、10μgの各発現プラスミド(又は20μgの非対合プラスミド)をOptiPRO SFM培地で1mlにした。80μlのExpifectamine CHO試薬を含む1mlのOptiPRO SFM培地をDNAに添加し、室温で2.5分間インキュベートした。次いで、得られた混合物を、125mlのエルレンマイヤーフラスコ中の25mlのExpiCHO細胞に6×106細胞/mlで添加し、37℃、5%CO2、150rpmでインキュベートした。トランスフェクションの24時間後に、細胞にExpiCHOフィード8.75mlとCHOエンハンサー150μlを供給し、32℃、5%CO2、150rpmに変更した。トランスフェクションの48時間後に、細胞に8.75mlのExpiCHOフィードを供給した。トランスフェクションの8日後に培養上清を回収し、4500rpmで1時間遠心して細胞をペレット化し、0.2mmフィルターに通した。
【0111】
回収した上清から、1mlのMAbSelect PrismAプロテインAカラム(GE Healthcare)を用いてFc含有タンパク質を精製した。カラムをリン酸緩衝生理食塩水で平衡化した。次いで、上清を流速2ml/分でカラムに通した。カラムをPBS 10ml+0.1% Triton X-100、続いてPBS 10ml+300mM NaCl、最後にPBS 10mlで洗浄した。次いで、5mlの50mM酢酸ナトリウム(pH3.5)をカラムに通してタンパク質を溶出させた。溶出されたタンパク質を、0.5mlの1M Tris-Cl(pH8.0)を添加して直ちに中和した。
【0112】
1mlのHisTrap HPカラム又は1mlのプロテインL(CaptoL)カラム(GE)を使用して、回収した上清からHisタグ付きscFvタンパク質を精製した。カラムを、0.5MのNaCl及び20mMのイミダゾールを含むリン酸緩衝生理食塩水(pH7.4)(HisTrap)又はPBS(プロテインL)で平衡化した。上清を、0.5MのNaCl及び20mMのイミダゾール(Hisトラップのみ)に到達するように10x結合バッファーでスパイクし、2ml/分の流速でカラムを通過させた。カラムを、10カラム容量の0.5M NaCl及び20mMイミダゾール(His Trap)を含むPBS又はPBS(プロテインL)で洗浄した。次いで、タンパク質を、0.5M NaCl及び500mMイミダゾールを含むPBS(pH7.4)(HisTrap)又は50mM酢酸ナトリウム(pH3.5)で溶出し、その後0.5mlの1M Tris(pH8.0)(プロテインL)で中和した。
【0113】
第1段階のプロテインA又はHisタグ精製の直後に、Waters Acquity UPLC H-ClassとACQUITY UPLC(登録商標)Protein BEH SEC 200A、4.6mmx150mm、1.7μmカラムを使用して、scFv-モノFcタンパク質を分析SECで分析した。PBS(125mMリン酸ナトリウム、137mM塩化ナトリウム、pH6.8)を移動相として使用し、0.3ml/minで10分間実行し、10μgのタンパク質を注入した。より高い分解能を得るために、XBridge BEH SEC 300A、7.8x300 mm、3.5μmカラムを備えたAcquity Arc Waters HPLCを使用して、代わりに分析SECでmAbを分析した。PBS(150mMリン酸ナトリウム、100mM塩化ナトリウム、pH6.8)を移動相として使用し、0.714ml/分で20分間実行し、50μgのタンパク質を注入した。各タンパク質について2つの別々の精製を評価し、目的のピークの%値を平均±標準偏差として報告した。
【0114】
2b.EGFR結合複合体の結合特異性と親和性を特徴解析するためのアッセイ
バイオレイヤー干渉法(Octet)結合アッセイをOctet96又はOctet384機器で実行し、ヒト化セツキシマブ結合ドメインを含むタンパク質がその同族抗原への結合を保持していることを確認した。Fc含有タンパク質を10μg/mlで180秒間ロードして抗ヒトFc(AHC)センサーチップに捕捉した。あるいは、メーカーのプロトコルを使用してHisタグ付きタンパク質を10ug/mlでAR2Gチップに共有結合させた。60秒のベースラインステップの後、連続希釈(0~200 nM;1:2.5希釈係数)又はアッセイバッファー中の単一100nM濃度の精製ヒトEGFRを用いた180~300秒の会合段階を実施し、その後、アッセイバッファーにおいて300~600秒の会合段階を実施した。10mMグリシン(pH1.5)を使用して再生を達成した。解離定数KDを抽出するために、結合曲線を1:1モデルにグローバルフィッティングした。各タンパク質の結合動力学を2回評価し、表にまとめた値を平均±標準偏差として報告した。
【0115】
2c.EGFR結合複合体のTDCCを特徴解析するためのアッセイ
多重特異性抗体におけるヒト化抗EGFRドメイン(総称してGNC抗体として知られている)の腫瘍標的特性は、T細胞活性化に関与し、T細胞媒介性細胞溶解をリダイレクトし、最終的に標的細胞を殺しながら、腫瘍特異的細胞傷害を誘発する能力をテストすることによって評価された。発光ベースのT細胞依存性細胞傷害(TDCC)アッセイを使用して、ルシフェラーゼの構成的発現による細胞生存率の定量化により、抗体誘導性細胞傷害の程度を測定した。
【0116】
ルシフェラーゼ処理されたBXPC3腫瘍細胞(ATCC)を10%ウシ胎児血清を含むRPMI1640培地で37℃、5%CO2で培養した。細胞生存率は、Vi-CELL自動セルカウンター(Beckman Coulter)でモニターした。1ウェルあたり500個の腫瘍細胞(20μL)を384ウェルの白色平底ポリスチレンTC処理マイクロプレート(Corning)に播種し、37℃、5%CO2でインキュベートした。24時間後、エフェクターとターゲット(E-T)の比率が5:1になるようにヒト汎T細胞を加え、5倍希釈系列(0~30nM)で抗体を加えた。Multidropバルク液体ディスペンサー(BIOTEK)を使用して細胞を分配した。抗体希釈液を加え(10μL/ウェル)、プレートをさらに37℃、5%CO2で72時間インキュベートした後、発光ベースの細胞生存率を定量化した。
【0117】
構成的に発現されたホタルルシフェラーゼによる発光を定量化するために、Bright-Glo Luciferase Assay System(Promega)を使用した。BrightGlo試薬を室温で加え(1ウェルあたり20μL)、発光を発光検出プレートリーダー(BMG Labtech)で定量した。抗体のEC50は、データをMicrosoft Excelに変換し、GraphPad Prism 6ソフトウェア「log(agonist) vs. response-variable gradient(4 parameters)」で解析して決定した。得られたEC50値を報告した。TDCCアッセイは、プレート間の再現性が良好な4重(quadruplicate)で行われ、プレート上の異なる位置から有意な変動は見られなかった。
【0118】
実施例3:Hisタグ付きEGFR結合scFvタンパク質
【0119】
ヒト化(H1)抗EGFR結合ドメインをコードする配列を、scFvのC末端に残基GSHHHHHHを含むHisタグ付きscFv発現フォーマットにクローニングした。発現ベクターを25mLのExpiCHOにトランスフェクションし、8日間発現させた後、プロテインLアフィニティークロマトグラフィーで回収及び精製した。H1バリアントは、マウスバージョンよりも力価が顕著に高かった(表5)。
【0120】
プロテインL精製後の分析SECデータは、ヒト化scFvが野生型マウス配列によってコードされるscFvよりも顕著に少ない凝集を示したことを示している(
図3、表5)。さらに、メインピークは右にシフトし、グリコシル化部位の修飾及び得られたVHのアグリコシル化(aglycosylation)と一致した。
【0121】
Octetによりヒト化scFvタンパク質がヒトEGFRに結合できることを確認した(
図4)。Hisタグ付きscFvタンパク質を共有結合によりAR2Gセンサー上に10ug/mlでロードし、連続希釈(最高200nM、1:2.5希釈)のHisタグ付きヒトEGFRに結合させた。得られた1:1結合モデルへのグローバルフィッティングは、野生型マウスscFv及びヒト化scFvタンパク質の両方が低ナノモル範囲の親和性でEGFRに結合することを示した(表5)。
【0122】
動的光散乱によりscFvタンパク質の熱安定性を比較した(
図5)。温度を25℃から75℃まで0.5℃/minで上昇させ、scFvタンパク質の半径(1mg/ml)をWyatt DynaPro Plate ReaderIIIでモニターした。データは、H1バージョンのTm値が顕著に高いことを示し(表5)、向上した安定性と一致した。
【0123】
化学変性に対する安定性も、グアニジン及び尿素アンフォールディングアッセイにより調べた(
図6)。0.1mg/ml濃度のタンパク質を、0から5.4Mの24グアニジンHCl濃度又は0から7.2Mの尿素濃度で一晩インキュベートした。蛍光強度(励起295nm、発光360nm)をCLARIOstarプレートリーダーで測定し、蛍光強度を正規化してアンフォールディングタンパク質の割合を表し、シグモイドフィットにより安定性比較のためにEC50値を抽出した。ヒト化バリアントH1は、得られたEC50値によると、グアニジン変性によるアンフォールディングに対して野生型よりも耐性であった(表5)。
【0124】
実施例4:ヒト化EGFR結合scFv-モノFc融合タンパク質
ヒト化セツキシマブVH及びVLドメインの生物物理学的特性を評価するために、配列をscFvフォマードにクローニングし、モノFcに融合して精製とOctet分析を促進した19。scFvドメインはVL-VH方向にあり、VHドメインとVLドメインの間に(G4S)4リンカーを含んだ。なお、scFvパネルの生成は、重鎖と軽鎖の別々のクローニングが必要である対応mAbパネルの生成よりも効率的であった。コントロールとして、野生型セツキシマブscFvと、修飾されたアスパラギン残基の変異によって生成されたアグリコシル化バージョン(VH N85E)も生成された。
【0125】
野生型、アグリコシル化(N85E)及びヒト化scFv-モノFcタンパク質をコードするプラスミドをExpiCHO細胞に一過性にトランスフェクションし、プロテインAアフィニティークロマトグラフィーを使用して細胞上清からタンパク質を精製した。表6に示すように、ヒト化タンパク質の大部分は、同じモノFcドメインを含み、コドン最適化に同じアルゴリズムを使用しているにもかかわらず、セツキシマブの野生型及び単純なアグリコシル化バージョンよりも優れた発現力価を有した。野生型及びアグリコシル化セツキシマブの平均力価はそれぞれ163及び116μg/mlであったが、ヒト化バージョンの平均力価は、H8及びH7でそれぞれ220~506μg/mlの範囲であった。
【0126】
最初のステップのプロテインA精製の後、分析用サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を使用して、scFv-モノFcタンパク質の凝集を評価した(
図7A、表6)。野生型及びアグリコシル化セツキシマブは、少量の凝集により、それぞれ93.6%及び94.9%の目的のタンパク質を有し、ヒト化バージョンは、平均して同様の凝集レベルを有した。凝集が最も少ないバージョン(H9)には目的タンパク質が97.4%含まれたが、最も凝集したバージョン(H4)には対象タンパク質が82.6%含まれた。Vλからの配列を含むようにVκC末端を修飾すると、凝集が減少するように見えた。これらのVλ残基を含むヒト化バージョン(H11、H9及びH7)は、元のVκ残基が使用された対応バージョン(それぞれH10、H8及びH4)よりも凝集が少なかった。凝集体を除去し、保存バッファーに交換し、その後の生物物理学的アッセイの精度を確保するために、すべてのタンパク質に対して分取SECを実行した。精製されたscFv-モノFcタンパク質のSDS-PAGEは、野生型セツキシマブと比較してN85E及びすべてのヒト化バージョンの移動度の増加を示し、これらのバリアントのグリコシル化の欠如を確認した(
図7C)。
【0127】
scFv-モノFcタンパク質を、NuPAGE4~12%のBis-Trisゲル(Thermo Fisher、NP0323BOX)及びMESランニングバッファー(Thermo Fisher、NP0002)を用いたSDS-PAGEで分析した。10mMのDTTを含む又は含まないLDSサンプルバッファー(Thermo Fisher、NP0007)で各タンパク質3μgを調製し、70℃で10分間加熱した。ゲルを150Vで50分間泳動し、SimplyBlue(Thermo Fisher、LC6065)で染色し、イメージングの前に水で脱色した。
【0128】
ヒトEGFRへのscFv-モノFcタンパク質の結合をバイオレイヤー干渉計によって評価し、ヒト化プロセスが結合動力学を変化させたかどうかを明らかにした(表6、
図8A)。モノFcドメインを使用して抗ヒトFc(AHC)センサーにタンパク質をロードした後、scFvをヒトEGFRの細胞外ドメインの連続希釈物に結合させた。野生型セツキシマブscFvは、以前の報告と一致して、3.18nMの親和性を有した。アグリコシル化バリアント(N85E)は、3.16nMのKDで非常に類似した結合動態を示し、グリコシル化が抗原結合に必須ではないことを示している。
【0129】
ヒト化バージョンのKD値は、3つの主要なカテゴリに分類された。安定したヒトフレームワーク(H1)に直接CDR移植を使用したヒト化バージョンでは、解離速度の増加によって結合親和性が4倍低下した。単一のヒト生殖細胞系列(H10、H11)又はヒト生殖細胞系列のグローバルデータセット(H8、H9)との配列同一性に基づくヒト化では、結合親和性が一貫して2倍低下し、より速い解離が動力的決定要因となった。最後に、構造的相同性に基づくヒト化(H2からH7)では、結合親和性の顕著な低下はなかった。
【0130】
scFv-モノFcタンパク質の熱安定性は、温度が25℃から85℃に上昇したときの流体力学的半径の増加を観察することにより、動的光散乱(表6、
図9A)によって評価された。
【0131】
アンフォールディング曲線の形状は複雑で、サンプルごとに均一ではないため、半径が10nmを超えた温度を使用して、タンパク質の安定性を客観的に比較した。この測定基準を使用する場合、野生型セツキシマブタンパク質は47.2℃でアンフォールディングし、アグリコシル化N85Eバリアントはわずかに安定性が低く、44.5℃でアンフォールディングした。したがって、占めされたグリコシル化部位は、野生型セツキシマブscFvのフォールディング立体構造を安定化するのに役立つ可能性がある。
【0132】
結合結果と同様に、3つのカテゴリの安定性を観察した。無関係なヒトフレームワークへのCDR移植に基づくヒト化では、野生型セツキシマブと比較して安定性がわずかに低下した。5つのヒト化バージョンは、セツキシマブと比較して同様の安定性又はわずかに高い安定性を示した。これらのうちの2つは、ヒト生殖細胞系列(H8、H9)のグローバルデータセットに対する配列同一性に基づくものであり、3つ(H4、H5、H7)は構造モデリングに基づくものであった。最後に、5つのヒト化バージョンは、他のタンパク質よりも大幅に安定しているように見えた。H10及びH11は、最も配列的に相同なヒトフレームワークへのCDR移植によって生成され、H2、H3及びH6はホモロジーモデルに基づくものであった。λJ遺伝子のC末端残基を使用することで凝集が体系的に減少することを示すSECデータとは対照的に、DLSデータは、安定性に対するこれらの残基の一貫した影響を示さなかった。バージョンH11とH7は、それぞれH10とH4に比べて安定性がわずかに向上した一方、実際には、H9は関連したH8よりも安定性が低かった。
【0133】
実施例5:ヒト化抗EGFRモノクローナル抗体
scFv-モノFcタンパク質の特性がIgGフォーマットに変換されるかどうかを理解するために、野生型セツキシマブ、アグリコシル化バリアントN85E及びセツキシマブのヒト化バージョンのmAbを生成した。最高のタンパク質発現、低凝集、改善された熱安定性、及び不変の結合親和性に基づいて、ヒト化バージョンH7を選択してmAbフォーマットに変換した。この3つのmAbタンパク質は、ExpiCHO細胞での一過性トランスフェクションによって産生され、9日間の発現後に回収された。
【0134】
scFv-モノFcの結果として、力価の差がscFv-mFcフォーマットほど顕著ではなかったが、ヒト化H7の発現力価は、野生型又は非グリコシル化セツキシマブの発現力価と比較して増加した(表8)。プロテインAの精製後、すべてのタンパク質を分析SECで評価した結果、純度は99%以上であった(表8、
図7B)。なお、対応するscFv-mFcタンパク質よりもmAbの凝集が顕著に少なく、これは、scFv及びモノFcドメインに対するIgGバックボーンの固有の安定性による可能性がある。SECデータは、野生型セツキシマブの保持時間が、アグリコシル化N85E又はヒト化H7バージョンのいずれよりも顕著に短いことも示している。この見かけの分子サイズの違いは、N85E及びヒト化バージョンに存在しないセツキシマブのグリコシル化に起因する可能性がある。
【0135】
バイオレイヤー干渉法によりmAbのヒトEGFRへの結合動力学を評価した結果(表8、
図8B)、バージョン間で結合親和性又は動力学に違いがないことを示している。これらの結果は、scFv-モノFcタンパク質の結果を裏付けるものであり、アグリコシル化変異N85E及びH7のヒト化変異は、セツキシマブCDRとその抗原との相互作用を妨害しないことを示している。mAbの結合親和性は、対応するscFv-モノFcタンパク質の結合親和性と同様であった。
【0136】
最後に、DLS実験を繰り返してmAbの安定性を評価した(表8、
図9B)。野生型とアグリコシル化セツキシマブの安定性は非常に似ており(アンフォールディング温度はそれぞれ68.3℃と68.1℃)、H7バージョンのアンフォールディング温度は72.5℃と高くなった。したがって、ヒト化バージョンH7は、scFvフォーマット又はmAbフォーマットのいずれにおいても、野生型セツキシマブよりも安定した。
【0137】
実施例6:T細胞エンゲージャーとヒト化EGFR結合を有する二重特異性抗体
セツキシマブの二重特異性バージョンを生成し、T細胞依存性細胞傷害(TDCC)アッセイにより機能活性の最終評価を行った。セツキシマブmAbの3つのバージョン(野生型、N85E、H7)は、CH3ドメインにK409R変異を含むため、相補的なF405L変異を含む抗CD3 抗体とインキュベートした場合、制御されたFabアーム交換の発生が可能になった。相補的な抗EGFR及び抗CD3mAbからのαEGFR×αCD3二重特異性抗体の形成は、陽イオン交換クロマトグラフィーによって確認された(
図10)。抗体は、Agilent 1260 Infinity Quaternary HPLCとThermo Scientific ProPacTM SCX-10 HPLCカラム(4x250mm、10μm、35℃)を用いた陽イオン交換クロマトグラフィーによって分析された。Thermo Scientific CX-1 pHグラジエントバッファーを移動相として使用した(表7にグラジエントステップが含まれる)。50μgのタンパク質サンプルをロードし、流速0.5ml/minで分離し、下表に示す勾配で35分間溶出した。
【0138】
TDCC活性を評価するために、二重特異性抗体及び対照mAbの連続希釈を、活性化T細胞及びルシフェクター化EGFR担持BxPC3標的細胞と共に、384ウェルプレートにおいて5:1のエフェクター:標的比でインキュベートした(
図11、表8)。37℃で3日間インキュベートした後、BrightGlo試薬を添加して残りの標的細胞の数に比例する発光を読み取った。二重特異性セツキシマブxαCD3抗体は、24.6nMのEC50値で強力な腫瘍細胞殺傷を示した。アグリコシル化N85Eとヒト化H7は、95%の信頼区間が重複して類似のEC50値(それぞれ30.7及び20.3pM)を示した。これに対し、対照mAb(αCD3、セツキシマブ又はセツキシマブH7)のいずれも、最大30nMのBxPC3殺傷を示さなかった。これは、細胞毒性には腫瘍細胞とT細胞の両方を同時に標的にする必要があることを示している。したがって、TDCCアッセイで試験した結果、セツキシマブのヒト化バージョンは、セツキシマブの生物学的機能を保持した。
【0139】
実施例7:ヒト化抗EGFR scFv又はFabドメインを有するペンタGNC抗体
ヒト化EGFR結合バリアントH1、H4及びH7を構成し、4つのscFv位置又はFab位置のいずれかでPentaGNCフォーマットにクローニングした(
図12、D1又はD2位置)。タンパク質を25mLのExpiCHOにトランスフェクションし、8日間発現させた後、プロテインAアフィニティクロマトグラフィーで回収、精製した。タンパク質は良好な力価で発現された(表9)。
【0140】
プロテインA精製後の分析SECデータは、scFv又はFabとしてヒト化抗EGFRドメインを含むペンタGNC抗体が低凝集で発現できることを示している(
図13、表9)。
【0141】
Octeにより、ヒト化抗EGFRドメイン(例えば、H1、H4、H7)を有するペンタGNC抗体がヒトEGFRに結合できることを確認した(
図14)。ペンタGNC抗体をAHCセンサーを介して10ug/mlでロードし、連続希釈(最大200nM、1:2.5希釈)又は単一の100nM濃度のHisタグ付きヒトEGFRに結合させた。得られた1:1結合モデルへのグローバルフィットは、ペンタGNC抗体が低ナノモル範囲の親和性でEGFRに結合することを示している(表10)。
【0142】
ルシフェラーゼ処理された(luciferized)BXPC3細胞を標的細胞として使用して、2つのペンタGNC抗体についてTDCC活性を試験した(
図15)。ペンタGNC抗体の5倍連続希釈液(0~30nM)を、500個のBxPC3細胞と2500個の活性化T細胞の混合物(5:1のエフェクター:ターゲット)に投与し、72時間インキュベートした後、標的細胞の生存率に対応する発光の読み取り値を測定した。得られたシグモイド関数へのフィットにより、ペンタGNC抗体のEGFR結合ドメイン(H7)は、サブピコモル範囲内のEC50値によって実証されるように、共培養されたT細胞による殺傷のためにBxPC3腫瘍細胞を効率的に標的にしたことが明らかになった(表9)。
【0143】
実施例8:ヒト化抗EGFR scFv又はFabドメインを有するヘキサGNC抗体
ヒト化抗EGFR結合バリアントH7を構成し、5つのscFv位置の1つ又はFab位置(
図12、D1又はD2位置)のいずれかでヘキサGNCフォーマットにクローニングした。タンパク質を25mLのExpiCHOにトランスフェクションし、8日間発現させた後、プロテインAアフィニティクロマトグラフィーで回収及び精製した。タンパク質は良好な力価で発現された(表11)。
【0144】
プロテインA精製後の分析SECデータは、ヒト化抗EGFRドメイン、scFv又はFabのいずれかを含むヘキサGNC分子が低凝集で発現できることを示している(
図16、表11)。なお、バージョンH7を含むタンパク質は、両方ともセツキシマブを含むタンパク質よりも凝集が顕著に減少した。
【0145】
Octetによりヒト化抗EGFRドメインを含むヘキサGNC抗体がヒトEGFRに結合できることを確認した(
図17)。ヘキサGNCタンパク質を、AHCセンサーを介して10ug/mlでロードし、連続希釈(最大200nM、1:2.5希釈)又は単一の100nM濃度のHisタグ付きヒトEGFRに結合させた。得られた1:1結合モデルへのグローバルフィットは、ヘキサGNC抗体が低ナノモル範囲の親和性でEGFRに結合することを示している(表11)。
【0146】
ルシフェラーゼ処理されたBXPC3細胞を標的細胞として用いたTDCCバイオアッセイにより1つのHexaGNCについて活性を試験した(
図18)。ヘキサGNC抗体の5倍連続希釈液(0-30nM)を、500個のBxPC3細胞と2500個の活性化T細胞の混合物に投与し、72時間インキュベートした後、標的細胞の生存率に対応する発光の読み取り値を測定した。得られたシグモイド関数へのフィットにより、ヘキサGNC抗体のEGFR結合ドメイン(H7)は、サブピコモル範囲内のEC50値によって実証されるように、共培養されたT細胞による殺傷のためにBxPC3腫瘍細胞を効率的に標的にしたことが明らかになった(表11)。
【0147】
実施例9:ヒト化抗EGFR scFv又はFabドメインを有するペンタminiGNC抗体
ヒト化EGFR結合バリアントH1、H4及びH7を構成し、4つのscFv位置(mD1、mD2、mD4、mD5)又はFab(mD3)位置のいずれかでペンタminiGNCフォーマットにクローニングした(PCT/US2021/022847;その全体が参照により本明細書に組み込まれる)(
図19)。タンパク質を25mLのExpiCHOにトランスフェクションし、8日間発現させた後、プロテインAアフィニティクロマトグラフィーで回収、精製した。タンパク質は良好な力価で発現された(表12)。
【0148】
プロテインA精製後の分析SECデータは、ヒト化抗EGFRドメインを含むペンタminiGNC分子が低凝集で発現できることを示している(
図20、表12)。
【0149】
Octetによりヒト化抗EGFRドメイン(H4、H7)を含むペンタminiGNC抗体がヒトEGFRに結合できることを確認した(
図21)。ペンタminiGNC抗体をAHCセンサーを介して10ug/mlでロードし、連続希釈(最大200nM、1:2.5希釈)又は単一の100nM濃度のHisタグ付きヒトEGFRに結合させた。得られた1:1結合モデルへのグローバルフィットは、ペンタminiGNC抗体が低ナノモル範囲内の親和性でEGFRに結合することを示している(表12)。
【0150】
ルシフェラーゼ処理されたBXPC3細胞を標的細胞として使用して、2つのペンタminiGNC抗体についてTDCC活性を試験した(
図22)。ペンタminiGNC抗体の5倍連続希釈液(0~30nM)を、500個のBxPC3細胞と2500個の活性化T細胞の混合物(5:1のエフェクター:ターゲット)に投与し、72時間インキュベートした後、標的細胞の生存率に対応する発光の読み取り値を測定した。得られたシグモイド関数へのフィットにより、ペンタminiGNC抗体のEGFR結合バリアントH7は、サブピコモル範囲内のEC50値によって実証されるように、共培養されたT細胞による殺傷のためにBxPC3腫瘍細胞を効率的に標的にしたことが明らかになった(表12)。
【0151】
表
表1:VH/VK領域のヒト化は免疫原性の低下とヒト性スコアの向上をもたらす(フレームワーク領域のみ)
【表1】
【0152】
表2:ヒト化セツキシマブバリアントの産生方法
【表2】
【0153】
表3:野生型セツキシマブ、アグリコシル化セツキシマブ(N85E)、及びヒト化セツキシマブ バージョン(H1-H11)のそれぞれのVHドメイン全体(A)、VHフレームワーク領域(Kabat CDR残基を除くVHドメイン全体)(B)、VLドメイン全体(C)、VLフレームワーク領域(Kabat CDR残基を除くVLドメイン全体)(D)の配列同一性マトリックス
【表3】
表4:ヒト化EGFR結合配列バリアント(可変領域H1-H11)、Hisタグ付きscFvタンパク質(scFv-6His)、組換えscFv-モノFcモノマー(scFv-モノFc)、モノクローナル抗体(mAb)、二重特異性抗体(二重特異性)、ペンタGNC抗体(ペンタGNC)、ヘキサGNC抗体(ヘキサGNC)及びペンタminiGNC抗体(miniGNC)の形態にあるEGFR結合複合体
【表4】
【0154】
表5:Hisタグ付きヒト化抗EGFR scFvの特徴解析
【表5】
【0155】
表6:セツキシマブ由来のscFv-monoFcタンパク質の生物物理学的特性
値は、2つの独立した実験の平均と標準偏差である。
【表6】
【0156】
表7:αEGFR及びαCD3抗体の陽イオン交換分離のための勾配法
【表7】
【0157】
表8:セツキシマブ由来のモノクローナル抗体の生物物理学的特性
値は、2つの独立した実験の平均と標準偏差である。
【表8】
*αCD3×αEGFR二重特異性抗体を使用してEGFR+BxPC3細胞を枯渇させた場合のEC50値。括弧内に95%信頼区間が示される。
【0158】
表9:ヒト化抗EGFR scFvドメイン又はヒト化抗EGFR Fab領域を含むペンタGNC抗体の特徴解析
【表9】
【0159】
表10:EGFR結合複合体のOctet結合分析
【表10】
【0160】
表11:ヒト化抗EGFR scFvドメイン又はヒト化抗EGFR Fab領域を含むヘキサGNC抗体の特徴解析
【表11】
【0161】
表12:ヒト化抗EGFR scFvドメイン又はヒト化抗EGFR Fabドメインを含むペンタminiGNC抗体の特徴解析
【表12】
【0162】
配列表
【0163】
ヒト化EGFR結合配列バリアント(H1-H11)の配列
【表13】
【0164】
抗体定常領域、リンカーモチーフ及びタグの配列
【表14】
【0165】
αEGFR scFv-Hisタンパク質の配列
【表15】
【0166】
αEGFR scFv-モノFcタンパク質の配列
【表16】
【0167】
ヒト化EGFR結合ドメインを含むペンタGNCタンパク質の配列
【表17】
【0168】
ヒト化EGFR結合ドメインを含むヘキサGNCタンパク質の配列
【表18】
【0169】
ヒト化EGFR結合ドメインを含むペンタminiGNCタンパク質の配列
【表19】
【0170】
αEGFR mAb及びαCD3 mAbの配列
【表20】
【0171】
αEGFRxαCD3二重特異性抗体の配列
【表21】
【0172】
>Sequence ID 1: Cetuximab H1 VH amino acid sequence
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKVSGFSLTNYGVHWVRQAPGKGLEWVGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTISRDTSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 2: Cetuximab H1 VH nucleotide sequence
GAAGTTCAGCTGGTGGAATCCGGCGGAGGATTGGTTCAACCTGGCGGCTCTCTGAGACTGTCCTGTAAGGTGTCTGGCTTCTCCCTGACCAACTACGGCGTGCACTGGGTCCGACAGGCACCTGGAAAAGGACTGGAATGGGTCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCTCTCGGGACACCTCCAAGAACACCGTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGAGAGCCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTATGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACAGTCTCCTCT
>Sequence ID 3: Cetuximab H1 VL amino acid sequence
EIVMTQSPSTLSASVGDRVIITCRASQSIGTNIHWYQQKPGKAPKLLIYYASESISGIPSRFSGSGSGAEFTLTISSLQPDDFATYYCQQNNNWPTTFGQGTKLTVL
>Sequence ID 4: Cetuximab H1 VL nucleotide sequence
GAGATCGTGATGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCCGCCTCTGTGGGCGACAGAGTGATCATCACCTGTAGAGCCAGCCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCTGGCAAGGCCCCTAAGCTGCTGATCTACTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGATCTGGCGCTGAGTTTACCCTGACAATCTCCAGCCTGCAGCCTGACGACTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCCAGGGCACCAAACTGACAGTTCTT
>Sequence ID 5: Cetuximab H2 VH amino acid sequence
QVQLQQSGPGLVKPSQTLSITCTVSGFSLTNYGVHWIRQAPGKGLEWLGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTISKDNSKNQVYFKLRSLRAEDTAIYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 6: Cetuximab H2 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGTTGCAGCAGTCTGGCCCTGGCCTCGTGAAGCCTTCTCAGACCCTGTCTATCACCTGTACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGACTGGAATGGCTGGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCTCCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACTTCAAGCTGCGGTCCCTGAGAGCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGCACACTGGTCACAGTCTCTTCT
>Sequence ID 7: Cetuximab H2 VL amino acid sequence
EIVLTQSPSILSVSPGERATFSCRASQSIGTNIHWYQQRPGKPPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTEFTLTITSVQSEDIAVYYCQQNNNWPTTFGPGTKLELK
>Sequence ID 8: Cetuximab H2 VL nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCATCCTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGCGGCCTGGCAAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGATCTGGCACCGAGTTCACCCTGACCATCACCTCCGTGCAGTCCGAGGATATCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGGAATTGAAA
>Sequence ID 9: Cetuximab H3 VH amino acid sequence
QVQLVQSGPGLVKPSQTLSLTCTVSGFSLTNYGVHWIRQAPGKGLEWLGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTITKDNSKNQVYFKLRSVRSEDTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 10: Cetuximab H3 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGGTTCAGTCTGGCCCTGGCCTCGTGAAGCCTTCTCAGACCCTGTCTCTGACCTGCACCGTGTCTGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGACTGGAATGGCTGGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCACCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACTTCAAGCTGAGATCCGTGCGGAGCGAGGACACCGCCGTGTACTATTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGCACACTGGTCACAGTCTCTTCT
>Sequence ID 11: Cetuximab H3 VL amino acid sequence
EIVLTQSPSILSVSPGERVTFSCRASQSIGTNIHWYQQRPGKPPRLLIKYASESISGIPARFSGSGSGTEFTLTISSVQSEDFATYYCQQNNNWPTTFGPGTKLELK
>Sequence ID 12: Cetuximab H3 VL nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCATCCTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGCGGCCTGGCAAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGCCAGATTTTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCACCTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGGAATTGAAA
>Sequence ID 13: Cetuximab H4 VH amino acid sequence
QVQLQQSGPGLVKPSETLSITCTVSGFSLTNYGVHWIRQAPGKGLEWLGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTITKDNSKNQVYFKLRSVRADDTAIYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 14: Cetuximab H4 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGTTGCAGCAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCTGAGACACTGTCCATCACCTGTACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGACTGGAATGGCTGGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCACCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACTTCAAGCTGCGGAGCGTGCGGGCTGATGACACCGCCATCTACTACTGTGCTCGGGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTTGCTTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACAGTTTCTTCT
>Sequence ID 15: Cetuximab H4 VL amino acid sequence
EIVLTQSPSTLSVSPGERATFSCRASQSIGTNIHWYQQKPGKPPRLLIKYASESISGIPDRFSGSGSGTEFTLTISSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGPGTKLELK
>Sequence ID 16: Cetuximab H4 VL nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCAAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGGAATTGAAA
>Sequence ID 17: Cetuximab H5 VH amino acid sequence
QVQLLQSGPGLVKPSETLSLTCTVSGFSLTNYGVHWIRQAPGKGLEWIGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTISKDNSKNQVYFKLRSLTSEDTAIYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 18: Cetuximab H5 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGTTGCAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCCGAAACACTGTCTCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTATGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTGGAATGGATCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCTCCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACTTCAAGCTGCGGTCCCTGACCTCTGAGGACACCGCCATCTACTACTGCGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGCACACTGGTCACAGTCTCTTCT
>Sequence ID 19: Cetuximab H5 VL amino acid sequence
EIQLTQSPSTLSVSPGERATFSCRASQSIGTNIHWYQQKTGQPPRLLIKYASESISGIPDRFSGSGSGTEFTLSITSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGPGTKLEIL
>Sequence ID 20: Cetuximab H5 VL nucleotide sequence
GAGATCCAGCTGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAAACCGGCCAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTCACCCTGTCTATCACCTCCGTGCAGTCCGAGGACTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGGAAATTCTT
>Sequence ID 21: Cetuximab H6 VH amino acid sequence
QVQLLQSGPGLVKPSETLSITCTVSGFSLTNYGVHWIRQAPGKGLEWIGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTITKDNSKNQVFFKLRSVRAEDTALYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 22: Cetuximab H6 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGTTGCAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCCGAGACACTGTCCATCACCTGTACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGCCTGGAATGGATCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCACCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTTCTTCAAGCTGCGGAGCGTGCGCGCTGAGGATACCGCTCTGTACTATTGCGCTCGGGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTTGCTTACTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTTTCTTCT
>Sequence ID 23: Cetuximab H6 VL amino acid sequence
EIVLTQSPSTLSVSPGERVSFSCRASQSIGTNIHWYQQRTGQPPRLLIKYASESISGIPARFSGSGSGTEFTLTITSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGQGTKLDIK
>Sequence ID 24: Cetuximab H6 VL nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGTCCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAGAACCGGCCAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGCCAGATTTTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTCACCCTGACCATCACCTCCGTGCAGTCTGAGGACTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCCAGGGCACCAAGCTGGATATCAAA
>Sequence ID 25: Cetuximab H7 VH amino acid sequence
QVQLQQSGPGLVKPSETLSITCTVSGFSLTNYGVHWIRQAPGKGLEWLGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTITKDNSKNQVYFKLRSVRADDTAIYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 26: Cetuximab H7 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGTTGCAGCAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCTGAGACACTGTCCATCACCTGTACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGACTGGAATGGCTGGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCACCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACTTCAAGCTGCGGAGCGTGCGGGCTGATGACACCGCCATCTACTACTGTGCTCGGGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTTGCTTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACAGTTTCTTCT
>Sequence ID 27: Cetuximab H7 VL amino acid sequence
EIVLTQSPSTLSVSPGERATFSCRASQSIGTNIHWYQQKPGKPPRLLIKYASESISGIPDRFSGSGSGTEFTLTISSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGPGTKLTVL
>Sequence ID 28: Cetuximab H7 VL nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCAAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGACAGTTCTT
>Sequence ID 29: Cetuximab H8 VH amino acid sequence
QVQLVESGPGLVQPSGSLSLTCTVSGFSLTNYGVHWVRQAPGKGLEWVGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTISKDNSKNQVYLKMNSLRAEDTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 30: Cetuximab H8 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGGTGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTTCAGCCTTCTGGCTCTCTGTCTCTGACCTGCACCGTGTCTGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGGTTCGACAGGCTCCAGGCAAAGGACTGGAATGGGTCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCTCCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACCTGAAGATGAACTCCCTGAGAGCCGAGGACACCGCTGTGTATTACTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACAGTCTCCTCT
>Sequence ID 31: Cetuximab H8 VL amino acid sequence
DIVLTQSPSSLSVSPGERVTISCRASQSIGTNIHWYQQKPGQAPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSVESEDFAVYYCQQNNNWPTTFGQGTKLEIK
>Sequence ID 32: Cetuximab H8 VL nucleotide sequence
GACATCGTGCTGACCCAGTCTCCATCCAGCCTGTCTGTGTCTCCTGGCGAGAGAGTGACCATCTCTTGCCGGGCCTCTCAGAGCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCTGGACAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACAGACTTTACCCTGACCATCAGCTCCGTGGAATCCGAGGACTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA
>Sequence ID 33: Cetuximab H9 VH amino acid sequence
QVQLVESGPGLVQPSGSLSLTCTVSGFSLTNYGVHWVRQAPGKGLEWVGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTISKDNSKNQVYLKMNSLRAEDTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 34: Cetuximab H9 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGGTGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTTCAGCCTTCTGGCTCTCTGTCTCTGACCTGCACCGTGTCTGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGGTTCGACAGGCTCCAGGCAAAGGACTGGAATGGGTCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCTCCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACCTGAAGATGAACTCCCTGAGAGCCGAGGACACCGCTGTGTATTACTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACAGTCTCCTCT
>Sequence ID 35: Cetuximab H9 VL amino acid sequence
DIVLTQSPSSLSVSPGERVTISCRASQSIGTNIHWYQQKPGQAPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSVESEDFAVYYCQQNNNWPTTFGQGTKLTVL
>Sequence ID 36: Cetuximab H9 VL nucleotide sequence
GACATCGTGCTGACCCAGTCTCCATCCAGCCTGTCTGTGTCTCCTGGCGAGAGAGTGACCATCTCTTGCCGGGCCTCTCAGAGCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCTGGACAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACAGACTTTACCCTGACCATCAGCTCCGTGGAATCCGAGGACTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCCAGGGCACCAAGCTGACAGTTCTT
>Sequence ID 37: Cetuximab H10 VH amino acid sequence
QVQLQESGPGLVKPSESLSLTCTVSGFSLTNYGVHWVRQPPGKGLEWIGVIWSGGNTDYNTPFTSRVTISKDNSKNQVSLKMNSLTAADTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 38: Cetuximab H10 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGCAAGAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCCGAATCTCTGTCTCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTATGGCGTGCACTGGGTTCGACAGCCTCCAGGCAAAGGCCTGGAATGGATCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCTCTAGAGTGACCATCAGCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTCCCTGAAGATGAACAGCCTGACCGCTGCCGACACCGCTGTGTACTATTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACAGTCTCCTCT
>Sequence ID 39: Cetuximab H10 VL amino acid sequence
DIVLTQSPATLSVSPGERATLSCRASQSIGTNIHWYQQKPGQAPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGQGTKLEIK
>Sequence ID 40: Cetuximab H10 VL nucleotide sequence
GACATCGTGCTGACCCAGTCTCCAGCCACACTGAGTGTGTCTCCAGGCGAGAGAGCTACCCTGTCCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCTGGACAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACAGACTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAA
>Sequence ID 41: Cetuximab H11 VH amino acid sequence
QVQLQESGPGLVKPSESLSLTCTVSGFSLTNYGVHWVRQPPGKGLEWIGVIWSGGNTDYNTPFTSRVTISKDNSKNQVSLKMNSLTAADTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSS
>Sequence ID 42: Cetuximab H11 VH nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTGCAAGAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCCGAATCTCTGTCTCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTATGGCGTGCACTGGGTTCGACAGCCTCCAGGCAAAGGCCTGGAATGGATCGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCTCTAGAGTGACCATCAGCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTCCCTGAAGATGAACAGCCTGACCGCTGCCGACACCGCTGTGTACTATTGTGCTAGAGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTCGCCTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACAGTCTCCTCT
>Sequence ID 43: Cetuximab H11 VL amino acid sequence
DIVLTQSPATLSVSPGERATLSCRASQSIGTNIHWYQQKPGQAPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLTISSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGQGTKLTVL
>Sequence ID 44: Cetuximab H11 VL nucleotide sequence
GACATCGTGCTGACCCAGTCTCCAGCCACACTGAGTGTGTCTCCAGGCGAGAGAGCTACCCTGTCCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCTGGACAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACAGACTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCCAGGGCACCAAACTGACAGTTCTT
>Sequence ID 45: MonoFc amino acid sequence
GSGGSPVAGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYASTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLRCHVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTKPVLDSDGSFFLYSTLTVDKSRWQQGNVFSCSVLHEALHNHYTQKSLSLSPGK
>Sequence ID 46: MonoFc nucleotide sequence
GGATCCGGCGGCTCTCCCGTCGCTGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACGCTAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGAGATGCCACGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGAAGCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTACAGCACCCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGCTCCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACACAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGCAAATGA
>Sequence ID 47: Human IgG1 amino acid sequence
ASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPG
>Sequence ID 48: Human IgG1 nucleotide sequence
GCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAACTCCTGGGGGGACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTTAA
>Sequence ID 49: Human C kappa amino acid sequence
RTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>Sequence ID 50: Human C kappa amino acid sequence CGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
>Sequence ID 51: (G4S)4 linker amino acid sequence
GGGGSGGGGSGGGGSGGGGS
>Sequence ID 52: (G4S)4 linker nucleotide sequence
GGCGGCGGAGGATCTGGCGGAGGTGGAAGCGGAGGCGGAGGAAGCGGTGGCGGCGGATCT
>Sequence ID 53: His tag amino acid sequence
GSHHHHHH
>Sequence ID 54: His tag nucleotide sequence
GGATCCCATCATCACCATCACCATTGA
>Sequence ID 55: SI-79R1 amino acid sequence
DILLTQSPVILSVSPGERVSFSCRASQSIGTNIHWYQQRTNGSPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVESEDIADYYCQQNNNWPTTFGAGTKLELKGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSQVQLKQSGPGLVQPSQSLSITCTVSGFSLTNYGVHWVRQSPGKGLEWLGVIWSGGNTDYNTPFTSRLSINKDNSKSQVFFKMNSLQSNDTAIYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSSGSHHHHHH
>Sequence ID 56: SI-79R1 nucleotide sequence
GACATCTTGCTGACTCAGTCTCCAGTCATCCTGTCTGTGAGTCCAGGAGAAAGAGTCAGTTTCTCCTGCAGGGCCAGTCAGAGTATTGGCACAAACATACACTGGTATCAGCAAAGAACAAATGGTTCTCCAAGGCTTCTCATAAAGTATGCTTCTGAGTCTATCTCTGGGATTCCTTCCAGGTTTAGTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTTACTCTTAGCATCAACAGTGTGGAGTCTGAAGATATTGCAGATTATTACTGTCAACAAAATAATAACTGGCCAACCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGAGCTGAAAGGCGGTGGCGGTAGTGGGGGAGGCGGTTCTGGCGGCGGAGGGTCCGGCGGTGGAGGATCACAGGTGCAGCTGAAGCAGTCAGGACCTGGCCTAGTGCAGCCCTCACAGAGCCTGTCCATCACCTGCACAGTCTCTGGTTTCTCATTAACTAACTATGGTGTACACTGGGTTCGCCAGTCTCCAGGAAAGGGTCTGGAGTGGCTGGGAGTGATATGGAGTGGTGGAAACACAGACTATAATACACCTTTCACATCCAGACTGAGCATCAACAAGGACAATTCCAAGAGCCAAGTTTTCTTTAAAATGAACAGTCTGCAATCTAATGACACAGCCATATATTACTGTGCCAGAGCCCTCACCTACTATGATTACGAGTTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTCACTGTCTCGAGTGGATCCCATCATCACCATCACCATTGA
>Sequence ID 57: SI-79R2 amino acid sequence
EIVMTQSPSTLSASVGDRVIITCRASQSIGTNIHWYQQKPGKAPKLLIYYASESISGIPSRFSGSGSGAEFTLTISSLQPDDFATYYCQQNNNWPTTFGQGTKLTVLGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCTVSGFSLTNYGVHWVRQAPGKGLEWVGVIWSGGNTDYNTPFTSRFTISRDTSKNTVYLQMNSLRAEDTAVYYCARALTYYDYEFAYWGQGTLVTVSSGSHHHHHH
>Sequence ID 58: SI-79R2 nucleotide sequence
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>Sequence ID 59: SI-79SF1 amino acid sequence
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>Sequence ID 60: SI-79SF1 nucleotide sequence
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>Sequence ID 61: SI-79SF2 amino acid sequence
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>Sequence ID 62: SI-79SF2 nucleotide sequence
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>Sequence ID 63: SI-79SF3 amino acid sequence
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>Sequence ID 64: SI-79SF3 nucleotide sequence
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>Sequence ID 65: SI-79SF4 amino acid sequence
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>Sequence ID 66: SI-79SF4 nucleotide sequence
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>Sequence ID 67: SI-79SF5 amino acid sequence
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>Sequence ID 68: SI-79SF5 nucleotide sequence
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>Sequence ID 69: SI-79SF6 amino acid sequence
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>Sequence ID 70: SI-79SF6 nucleotide sequence
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>Sequence ID 71: SI-79SF7 amino acid sequence
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>Sequence ID 72: SI-79SF7 nucleotide sequence
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>Sequence ID 73: SI-79SF8 amino acid sequence
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>Sequence ID 74: SI-79SF8 nucleotide sequence
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>Sequence ID 75: SI-79SF9 amino acid sequence
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>Sequence ID 76: SI-79SF9 nucleotide sequence
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>Sequence ID 77: SI-79SF10 amino acid sequence
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>Sequence ID 78: SI-79SF10 nucleotide sequence
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>Sequence ID 79: SI-79SF11 amino acid sequence
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>Sequence ID 80: SI-79SF11 nucleotide sequence
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>Sequence ID 81: SI-79SF12 amino acid sequence
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>Sequence ID 83: SI-79SF13 amino acid sequence
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>Sequence ID 84: SI-79SF13 nucleotide sequence
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>Sequence ID 86: SI-55P3 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 87: SI-55P3 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 88: SI-55P3 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 89: SI-55P4 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 90: SI-55P4 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 91: SI-55P4 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 92: SI-55P4 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 93: SI-79P2 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 94: SI-79P2 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 95: SI-79P2 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 96: SI-79P2 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 97: SI-79P3 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 98: SI-79P3 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 99: SI-79P3 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 100: SI-79P3 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 101: SI-55P9 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 102: SI-55P9 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 105: SI-77P1 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 106: SI-77P1 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 108: SI-77P1 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 110: SI-77H5 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 114: SI-55H11 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 122: SI-68P7 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 123: SI-68P7 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 124: SI-68P7 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 126: SI-79P1 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 129: SI-68P13 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 130: SI-68P13 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 131: SI-68P13 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 132: SI-68P13 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 133: SI-68P17 heavy chain amino acid sequence
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>Sequence ID 134: SI-68P17 heavy chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 135: SI-68P17 light chain amino acid sequence
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>Sequence ID 136: SI-68P17 light chain nucleotide sequence
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>Sequence ID 137: SI-79C1 HC and SI-79X1 HC1 amino acid sequence
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>Sequence ID 138: SI-79C1 HC and SI-79X1 HC1 nucleotide sequence
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>Sequence ID 139: SI-79C1 LC, SI-79C5 LC, SI-79X1 LC1, and SI-79X5 LC1 amino acid sequence
DILLTQSPVILSVSPGERVSFSCRASQSIGTNIHWYQQRTNGSPRLLIKYASESISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVESEDIADYYCQQNNNWPTTFGAGTKLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>Sequence ID 140: SI-79C1 LC, SI-79C5 LC, SI-79X1 LC1, and SI-79X5 LC1 nucleotide sequence
GACATCCTGCTGACCCAGTCTCCAGTGATCCTGTCCGTGTCTCCTGGCGAGAGAGTGTCCTTCAGCTGCAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGCGGACCAACGGCTCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCTATCAGCGGCATCCCCTCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTTCACCCTGTCCATCAACTCCGTGGAATCCGAGGATATCGCCGACTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGCGCTGGCACCAAGCTGGAATTGAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
>Sequence ID 141: SI-79C2 HC, SI-79C3 HC, SI-79X2 HC1, SI-79X3 HC1 amino acid sequence
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>Sequence ID 142: SI-79C2 HC, SI-79C3 HC, SI-79X2 HC1, SI-79X3 HC1 nucleotide sequence
CAAGTTCAGTTGCAGCAGTCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCTTCTGAGACACTGTCCATCACCTGTACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGATCAGACAGGCCCCTGGCAAAGGACTGGAATGGCTGGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCAGCCGGTTCACCATCACCAAGGACAACTCCAAGAACCAGGTGTACTTCAAGCTGCGGAGCGTGCGGGCTGATGACACCGCCATCTACTACTGTGCTCGGGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTTGCTTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACAGTTTCTTCTGCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAGGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTTGA
>Sequence ID 143: SI-79C2 LC and SI-79X2 LC1 amino acid sequence
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>Sequence ID 144: SI-79C2 LC and SI-79X2 LC1 nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCAAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGGAATTGAAACGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
>Sequence ID 145: SI-9C21 HC, SI-79X1 HC2, SI-79X2 HC2, SI-79X3 HC2, and SI-79X5 HC2 amino acid sequence
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>Sequence ID 146: SI-9C21 HC, SI-79X1 HC2, SI-79X2 HC2, SI-79X3 HC2, and SI-79X5 HC2 nucleotide sequence
GAAGTCCAATTGGTAGAAAGTGGCGGTGGTCTGGTGCAACCTGGTGGATCTCTTCGCCTCTCATGCACGGCTAGTGGCTTTACTATTTCAACTAATGCGATGAGCTGGGTTCGCCAGGCCCCCGGCAAAGGACTTGAGTGGGTCGGCGTCATCACCGGCAGGGACATTACATACTATGCGAGTTGGGCAAAGGGCAGGTTCACGATTAGCCGCGATACTTCAAAGAATACCGTTTACCTTCAAATGAATAGCTTGCGCGCGGAAGACACAGCTGTGTATTACTGCGCGCGGGATGGAGGTAGTTCCGCCATAACTTCCAACAACATATGGGGACAAGGCACGCTGGTTACTGTGTCGTCAGCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCCTGCTCTATAGCAAGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTTGA
>Sequence ID 147: SI-9C21 LC, SI-79X1 LC2, SI-79X2 LC2, SI-79X3 LC2, and SI-79X5 LC2 amino acid sequence
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>Sequence ID 148: SI-9C21 LC, SI-79X1 LC2, SI-79X2 LC2, SI-79X3 LC2, and SI-79X5 LC2 nucleotide sequence
GAAATCGTTATGACGCAGAGTCCCTCCACGCTCTCCGCTAGTGTCGGGGATCGCGTCATTATCACATGCCAGGCCTCCGAGTCAATCAGCAGCTGGCTTGCATGGTATCAACAGAAGCCGGGAAAAGCTCCTAAATTGCTGATCTATGAAGCGTCAAAATTGGCGTCTGGTGTCCCATCTAGGTTCTCCGGCTCTGGGTCTGGTGCGGAATTTACTTTGACAATCTCCAGTCTTCAACCAGACGATTTCGCTACCTACTACTGCCAAGGGTATTTCTATTTTATAAGCCGGACATATGTAAACTCCTTCGGCCAAGGAACAAAGTTGACTGTTCTTCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
>Sequence ID 149: SI-79C3 LC and SI-79X3 LC1 amino acid sequence
EIVLTQSPSTLSVSPGERATFSCRASQSIGTNIHWYQQKPGKPPRLLIKYASESISGIPDRFSGSGSGTEFTLTISSVQSEDFAVYYCQQNNNWPTTFGPGTKLTVLRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
>Sequence ID 150: SI-79C3 LC and SI-79X3 LC1 nucleotide sequence
GAGATCGTGCTGACCCAGTCTCCTTCCACACTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGCCACCTTCAGCTGTAGAGCCTCTCAGTCCATCGGCACCAACATCCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCAAGCCTCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCGAGTCCATCAGCGGCATCCCTGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGAGTTTACCCTGACCATCTCCTCCGTGCAGTCCGAGGATTTCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGAACAACAACTGGCCCACCACCTTTGGACCCGGCACCAAGCTGACCGTGCTGCGTACGGTGGCTGCACCATCTGTCTTCATCTTCCCGCCATCTGATGAGCAGTTGAAATCTGGAACTGCCTCTGTTGTGTGCCTGCTGAATAACTTCTATCCCAGAGAGGCCAAAGTACAGTGGAAGGTGGATAACGCCCTCCAATCGGGTAACTCCCAGGAGAGTGTCACAGAGCAGGACAGCAAGGACAGCACCTACAGCCTCAGCAGCACCCTGACGCTGAGCAAAGCAGACTACGAGAAACACAAAGTCTACGCCTGCGAAGTCACCCATCAGGGCCTGAGCTCGCCCGTCACAAAGAGCTTCAACAGGGGAGAGTGTTAG
>Sequence ID 151: SI-79C5 HC and SI-79X5 HC1 amino acid sequence
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>Sequence ID 152: SI-79C5 HC and SI-79X5 HC1 nucleotide sequence
CAAGTTCAGCTCAAGCAGTCTGGCCCTGGCCTGGTTCAGCCTTCTCAGAGCCTGAGCATCACCTGTACCGTGTCCGGCTTCTCCCTGACCAATTACGGCGTGCACTGGGTTCGACAGAGCCCTGGCAAAGGACTGGAATGGCTGGGAGTGATTTGGAGCGGCGGCAACACCGACTACAACACCCCTTTCACCTCTCGGCTGTCTATCAACAAGGACAACTCCAAGAGCCAGGTGTTCTTCAAGATGAACTCCCTGCAGTCCGAGGACACCGCCATCTACTACTGTGCTCGGGCCCTGACCTACTACGACTACGAGTTTGCTTACTGGGGCCAGGGCACCCTGGTCACAGTTTCTGCTGCTAGCACCAAGGGCCCATCGGTCTTCCCCCTGGCACCCTCCTCCAAGAGCACCTCTGGGGGCACAGCGGCCCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCGAACCGGTGACGGTGTCGTGGAACTCAGGCGCCCTGACCAGCGGCGTGCACACCTTCCCGGCTGTCCTACAGTCCTCAGGACTCTACTCCCTCAGCAGCGTGGTGACCGTGCCCTCCAGCAGCTTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAATCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTTGAGCCCAAATCTTGTGACAAAACTCACACATGCCCACCGTGCCCAGCACCTGAAGCCGCGGGGGCACCGTCAGTCTTCCTCTTCCCCCCAAAACCCAAGGACACCCTCATGATCTCCCGGACCCCTGAGGTCACATGCGTGGTGGTGGACGTGAGCCACGAAGACCCTGAGGTCAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCATAATGCCAAGACAAAGCCGCGGGAGGAGCAGTACAACAGCACGTACCGTGTGGTCAGCGTCCTCACCGTCCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGCAAGGAGTACAAGTGCGCGGTCTCCAACAAAGCCCTCCCAGCCCCCATCGAGAAAACCATCTCCAAAGCCAAAGGGCAGCCCCGAGAACCACAGGTGTACACCCTGCCCCCATCCCGGGATGAGCTGACCAAGAACCAGGTCAGCCTGACCTGCCTGGTCAAAGGCTTCTATCCCAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAATGGGCAGCCGGAGAACAACTACAAGACCACGCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCCTTCTTCCTCTATAGCAGGCTCACCGTGGACAAGAGCAGGTGGCAGCAGGGGAACGTCTTCTCATGCTCCGTGATGCATGAGGCTCTGCACAACCACTACACGCAGAAGAGCCTCTCCCTGTCTCCGGGTTGA
【0173】
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