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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2023-10-25
(54)【発明の名称】微生物叢シグネチャ
(51)【国際特許分類】
   C12Q 1/04 20060101AFI20231018BHJP
   C12Q 1/6869 20180101ALI20231018BHJP
   C12Q 1/689 20180101ALI20231018BHJP
   C12M 1/00 20060101ALI20231018BHJP
   A61K 8/99 20170101ALI20231018BHJP
   A61Q 19/00 20060101ALI20231018BHJP
   C12N 1/00 20060101ALN20231018BHJP
【FI】
C12Q1/04 ZNA
C12Q1/6869 Z
C12Q1/689 Z
C12M1/00 A
A61K8/99
A61Q19/00
C12N1/00 A
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2023522371
(86)(22)【出願日】2021-10-12
(85)【翻訳文提出日】2023-06-09
(86)【国際出願番号】 EP2021078111
(87)【国際公開番号】W WO2022078985
(87)【国際公開日】2022-04-21
(31)【優先権主張番号】2016237.6
(32)【優先日】2020-10-13
(33)【優先権主張国・地域又は機関】GB
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】501105842
【氏名又は名称】ジボダン エス エー
(74)【代理人】
【識別番号】110003971
【氏名又は名称】弁理士法人葛和国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】ザンチェッタ,キャサリン
(72)【発明者】
【氏名】ヴィラノヴァ,ダヴィド
(72)【発明者】
【氏名】ジャリン,シリル
【テーマコード(参考)】
4B029
4B063
4B065
4C083
【Fターム(参考)】
4B029AA07
4B029BB01
4B029FA01
4B063QA13
4B063QA18
4B063QQ05
4B063QQ52
4B063QR08
4B063QR62
4B063QS36
4B063QX02
4B065AA01X
4B065AA57X
4B065AC20
4B065BD50
4B065CA44
4B065CA50
4B065CA60
4C083AA031
4C083CC01
4C083EE12
(57)【要約】
本発明は、特定の皮膚特性を予測する微生物シグネチャを識別する方法、及びシグネチャを使用して皮膚特性を予測する方法に関する。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
対象が、ヒト対象において高レベルの第1の皮膚特性、低レベルの第1の皮膚特性、又は中間レベルの第1の皮膚特性を有するかを予測する方法であって、
a)対象から採取された皮膚微生物試料を提供し、皮膚微生物試料から試験微生物プロファイルを生成することと、
b)試験微生物プロファイルを、高レベルの第1の特性又は低レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャと比較することと、
c)試験微生物プロファイルが、高レベルの第1の特性、低レベルの第1の特性、又は中間レベルの第1の特性を有する皮膚のものであるかを決定することと
を含む、前記方法。
【請求項2】
試験微生物プロファイルを生成することは、
a ii)高レベルの第1の皮膚特性又は低レベルの第1の皮膚特性を予測する微生物シグネチャの各属の存在を検出すること、及び/又は存在量を決定すること、及び/又は存在率を計算すること、並びに任意に、
a iii)高レベルの第1の特性を予測する各属の存在率又は存在量を合計し、低レベルの第1の特性を予測する各属の存在率を合計することと、任意に
a iv)高レベルの第1の特性を予測する各属の存在率の合計の、低レベルの第1の特性を予測する各属の存在率の合計に対する比を計算して、試験比を生成すること
を含む、請求項1に記載の方法。
【請求項3】
a v)(a iv)の試験比を、所定の上側閾値比及び所定の下側閾値比と比較することであって、上側閾値比より大きい試験比は、対象が高レベルの第1の特性を有する皮膚を有することを予測し、下側閾値比よりも低い試験比は、対象が低レベルの第1の特性を有する皮膚を有することを予測し、上側閾値比と下側閾値比との間の試験比は、中間の皮膚特性を予測する、比較すること、並びに/又は
a vi)(a ii)で決定された高レベルまたは低レベルの特性を予測する属の存在、存在量若しくは存在率、又は(a iii)の存在量若しくは存在率の合計を、微生物シグネチャと比較すること
を含む、請求項2に記載の方法。
【請求項4】
高レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャは、以下の属:
Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及びXanthomonas
のいずれか1以上を含む、請求項1~3のいずれか一項に記載の方法。
【請求項5】
低レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャは、以下の属:
Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及びXanthomonas
のいずれか1以上を含む、請求項1~4のいずれか一項に記載の方法。
【請求項6】
高レベルの特性は高レベルの加齢皮膚であり、かつ低レベルの特性は低レベルの加齢皮膚であり、
高レベルの特性は高レベルの褐色斑点であり、かつ低レベルの特性は低レベルの褐色斑点であり、
高レベルの特性は高レベルの敏感性であり、かつ低レベルの特性は低レベルの敏感性であり、
高レベルの特性は高レベルの皮脂であり、かつ低レベルの特性は低レベルの皮脂であり、
高レベルの特性は高レベルの水分量であり、かつ低レベルの特性は低レベルの水分量であり、
高レベルの特性は喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚であり、かつ低レベルの特性は喫煙にリンクされる低レベルの加齢皮膚であり、及び/又は
高レベルの特性は高レベルのバリア機能であり、かつ低レベルの特性は低レベルのバリア機能である、請求項1~5のいずれか一項に記載の方法。
【請求項7】
高レベルの第1の特性は高レベルの年齢であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの年齢であり、および
高レベルの年齢を予測する属は、
a)Eikenella及び/若しくはBrochothrix、
b)Eikenella、Aerococcus及び/若しくはGlutamicibacter、
c)Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/若しくはPantoea、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、請求項1~6のいずれか一項に記載の方法。
【請求項8】
高レベルの第1の特性は高レベルの年齢であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの年齢であり、および
低レベルの年齢を予測する属は、
a)Finegoldia、Lawsonella及び/若しくはPeptoniphilus、
b)Finegoldia及び/若しくはLawsonella、
c)Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及び/若しくはUndibacterium、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、請求項1~7のいずれか一項に記載の方法。
【請求項9】
高レベルの第1の特性は、高レベルの年齢であり、かつ低レベルの第1の特性は、低レベルの年齢であり、および
a)高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella及び/又はBrochothrixのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia、Lawsonella及び/又はPeptoniphilusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella、Aerococcus及び/又はGlutamicibacterのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia及び/又はLawsonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの年齢を予測する属は、Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/又はPantoeaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの年齢を予測する属は、Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~8のいずれか一項に記載の方法。
【請求項10】
高レベルの第1の特性は高レベルの褐色斑点であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの褐色斑点であり、
高褐色斑点を予測する属は、
a)Eikenella、
b)Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas及び/若しくはBrevibacterium、
c)Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella及び/若しくはAerococcus、
d)Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella及び/若しくはXanthomonas、並びに/又は
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の方法。
【請求項11】
高レベルの第1の特性は高レベルの褐色斑点であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの褐色斑点であり、
低褐色斑点を予測する属は、
a)Micrococcus及び/若しくはParacoccus、
b)Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/若しくはBergeyella、
c)Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/若しくはParacoccus、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、請求項1~10のいずれか一項に記載の方法。
【請求項12】
高レベルの第1の特性は高レベルの褐色斑点であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの褐色斑点であり、および
a)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas及び/又はBrevibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella及び/又はAerococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~11のいずれか一項に記載の方法。
【請求項13】
高レベルの第1の特性は高レベルの皮脂であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの皮脂であり、
高皮脂を予測する属は、
a)Cutibacterium及び/若しくはEikenella、
b)Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/若しくはTuricella、並びに/又は
c)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、請求項1~12のいずれか一項に記載の方法。
【請求項14】
高レベルの第1の特性は高レベルの皮脂であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの皮脂であり、
低レベルの皮脂を予測する属は、
a)Haemophilus、Kocuria及び/若しくはNeisseria、
b)Haemophilus、Kocuria、Neisseria及び/若しくはPaucibacter、
c)Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/若しくはBrochothix、
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、請求項1~13のいずれか一項に記載の方法。
【請求項15】
高レベルの第1の特性は高レベルの皮脂であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの皮脂であり、
a)高皮脂を予測する属は、Cutibacterium及び/又はEikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低皮脂を予測する属は、Haemophilus、Kocuria、Neisseriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高皮脂を予測する属は、Cutibacterium及び/又はEikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低皮脂を予測する属は、Haemophilus、Kocuria、Neisseria、Paucibacterのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/又はBrochothixのいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~14のいずれか一項に記載の方法。
【請求項16】
高レベルの第1の特性は高レベルの敏感性であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの敏感性であり、および
高レベルの敏感性を予測する属は、
a)Corynebacterium及び/若しくはKocuria、
b)Anaerococcus、Kocuria及び/若しくはSnodgrassella、
c)Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas及び/若しくはSnodgrassella、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~15のいずれか一項に記載の方法。
【請求項17】
高レベルの第1の特性は高レベルの敏感性であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの敏感性であり、および
低レベルの敏感性を予測する属は、
a)Cutibacterium、
b)Cutibacterium及び/又はStaphylococcus、
c)Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/又はStenotrophomonas、
d)Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及び/又はUndibacterium、
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/又はXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~16のいずれか一項に記載の方法。
【請求項18】
高レベルの第1の特性は高レベルの敏感性であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの敏感性であり、および
a)高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの敏感性を予測する属は、Anaerococcus、Kocuria及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/又はStenotrophomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacterium及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの敏感性を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~17のいずれか一項に記載の方法。
【請求項19】
高レベルの第1の特性は高レベルの水分量であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの水分量であり、および
高レベルの水分量を予測する属は、
a)Haemophilus及び/若しくはSnodgrassella、
b)Bacillus、Haemophilus及び/若しくはKocuria、
c)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/若しくはSnodgrassella、
d)Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/若しくはSnodgrassella、並びに/又は
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~18のいずれか一項に記載の方法。
【請求項20】
高レベルの第1の特性は高レベルの水分量であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの水分量であり、および
低レベルの水分量を予測する属は、
a)Brochothrix及び/若しくはPseudomonas、
b)Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/若しくはStaphylococcus、
c)Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及び/若しくはUndibacterium、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~19のいずれか一項に記載の方法。
【請求項21】
高レベルの第1の特性は高レベルの水分量であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルの水分量であり、および
a)高レベルの水分量を予測する属は、Haemophilus及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix及び/又はPseudomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの水分量を予測する属は、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~20のいずれか一項に記載の方法。
【請求項22】
高レベルの第1の特性は、高レベルのバリア機能年齢であり、かつ低レベルの第1の特性は、低レベルのバリア機能であり、および
低レベルのバリア機能を予測する属は、
a)Cutibacterium、
b)Eikenella及び/若しくはCutibacterium、
c)Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/若しくはVeillonella、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~21のいずれか一項に記載の方法。
【請求項23】
高レベルの第1の特性は高レベルのバリア機能であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルのバリア機能であり、および
高レベルのバリア機能を予測する属は、
a)Paracoccus及び/若しくはBrevundimonas、
b)Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及び/若しくはXanthomonas、
c)Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及び/若しくはBacillus、
d)Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及び/若しくはXanthomonas、並びに/又は
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~22のいずれか一項に記載の方法。
【請求項24】
高レベルの第1の特性は高レベルのバリア機能であり、かつ低レベルの第1の特性は低レベルのバリア機能であり、
a)低レベルのバリア機能を予測する属は、Cutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
高レベルのバリア機能を予測する属は、Paracoccus及び/又はBrevundimonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
高レベルのバリア機能を予測する属は、Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
高レベルのバリア機能を予測する属は、Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及び/又はBacillusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)低レベルのバリア機能を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/又はVeillonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、かつ
高レベルのバリア機能を予測する属は、Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含む、
請求項1~23のいずれか一項に記載の方法。
【請求項25】
高レベルの第1の特性は、喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚であり、かつ低レベルの第1の特性性は、喫煙にリンクされる低レベルの加齢皮膚であり、および
喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚を予測する属は、
a)Micrococcus、Bacillus、Eikenella、Gemella、Corynebacterium、Finegoldia、Cutibacterium及び/又はAnaerococcus
を含む、請求項1~24のいずれか一項に記載の方法。
【請求項26】
微生物叢は、チェック、前額部及び/又は頭皮で測定される、請求項25に記載の方法。
【請求項27】
ステップ(a)において試験微生物プロファイルを生成することは、微生物ゲノムの領域を配列決定することを伴う、請求項1~26のいずれか一項に記載の方法。
【請求項28】
配列決定することは、Illumina配列決定によって実行され、任意にMiSeq装置を使用して、又はnanopore配列決定技術により実行される、請求項27に記載の方法。
【請求項29】
増幅に使用されるプライマー及び/又は配列は、
順方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3'[配列番号1]及び
逆方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3'[配列番号2]
であるか、又は
16S-Mi341F順方向プライマー5'-CCTACGGGNGGCWGCAG-3'[配列番号3]及び16S-Mi805R逆方向プライマー5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3'[配列番号4]
であり、任意に、Nanopore技術が使用される場合、プライマーは配列番号1及び2であり、Illumina技術が使用される場合、プライマーは配列番号3及び4である、請求項に記載の方法。
【請求項30】
ステップ(a)において微生物プロファイルを生成することは、微生物試料から微生物を培養することを伴う、請求項1~29のいずれか一項に記載の方法。
【請求項31】
微生物試料は、細菌、酵母及び真菌のいずれか1以上を含む、請求項1~30のいずれか一項に記載の方法。
【請求項32】
微生物プロファイルは、細菌、酵母及び/又は真菌のうちのいずれか1以上のプロファイルであり、任意に、微生物プロファイルは細菌プロファイルである、請求項1~31のいずれか一項に記載の方法。
【請求項33】
皮膚タイプを以下の特性:
a)低レベルの敏感性、高レベルの敏感性、又は中間レベルの敏感性、
b)低レベルの皮脂、高レベルの皮脂、又は中間レベルの皮脂、
c)低レベルの水分量、高レベルの水分量、又は中間レベルの水分量、
d)低レベルの褐色斑点、高レベルの褐色斑点、又は中間レベルの褐色斑点、
e)低レベルの加齢皮膚、高レベルの加齢皮膚、又は中間レベルの加齢皮膚、
f)低レベルのバリア機能、高レベルのバリア機能、又は中間レベルのバリア機能、
の各々に類別するための方法であって、皮膚微生物試料中の以下の属:
Brevundimonas、Brochothrix、Corynebacterium、Cutibacterium、Eikenella、Finegoldia、Haemophilus、Kocuria、Lawsonella、Micrococcus、Neisseria、Paracoccus、Peptoniphilus、Pseudomonas及びSnodgrassella
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項34】
皮膚タイプを低レベルの年齢、高レベルの年齢、又は中間レベルの年齢に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Eikenella、Brochothrix、Finegoldia、Lawsonella及びPeptoniphilus、任意に、
高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella及び/又はBrochothrixのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia、Lawsonella及び/又はPeptoniphilusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Eikenella、Aerococcus、Glutamicibacter、Finegoldia及びLawsonella、任意に、
高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella、Aerococcus及び/又はGlutamicibacterのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia及び/又はLawsonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter、Pantoea、Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及びUndibacterium、任意に、
高レベルの年齢を予測する属は、Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/又はPantoeaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの年齢を予測する属は、Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む、
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項35】
皮膚タイプを低レベルの褐色斑点、高レベルの褐色斑点、又は中間レベルの褐色斑点に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Eikenella、Micrococcus及びParacoccus、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas、Brevibacterium、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及びBergeyella、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas及び/又はBrevibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella、Aerococcus、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及びBergeyella、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella及び/又はAerococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及びParacoccus、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含む、
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項36】
皮膚タイプを低レベルの敏感性、高レベルの敏感性、又は中間レベルの敏感性に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Corynebacterium、Kocuria及びCutibacterium、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacteriumを含み、
b)Anaerococcus、Kocuria、Snodgrassella、Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及びStenotrophomonas、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Anaerococcus、Kocuria及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/又はStenotrophomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Corynebacterium、Kocuria、Cutibacterium及びStaphylococcus、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacterium及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas、Snodgrassella、Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及びUndibacterium、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及びUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む、
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項37】
皮膚タイプを低レベルの皮脂、高レベルの皮脂、又は中間レベルの皮脂に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Cutibacterium、Eikenella、Haemophilus、Kocuria及びNeisseria、任意に、
高皮脂を予測する属は、Cutibacterium及び/又はEikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低皮脂を予測する属は、Haemophilus、Kocuria、Neisseriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Cutibacterium、Eikenella、Haemophilus、Kocuria、Neisseria及びPaucibacter、任意に、
高皮脂を予測する属は、Cutibacterium及び/又はEikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低皮脂を予測する属は、Haemophilus、Kocuria、Neisseria、Paucibacterのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus、Turicella、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas及びStreptococcus、任意に、
高皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus、Turicella、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及びBrochothix、任意に、
高レベルの皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/又はBrochothixのいずれか1以上、又はすべてを含む、
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項38】
皮膚タイプを低レベルの水分量、高レベルの水分量、又は中間レベルの水分量に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Haemophilus、Snodgrassella、Brochothrix及びPseudomonas、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Haemophilus及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix及び/又はPseudomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及びStaphylococcus、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/又はSnodgrassella、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter、Snodgrassella、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及びStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
e)Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter、Snodgrassella、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及びUndibacterium、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む、
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項39】
皮膚タイプを低レベルのバリア機能、高レベルのバリア機能、又は中間レベルのバリア機能に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Cutibacterium、Paracoccus及びBrevundimonas、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Cutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Paracoccus及び/又はBrevundimonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Eikenella、Cutibacterium、Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及びXanthomonas、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Eikenella、Cutibacterium、Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及びBacillus、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及び/又はBacillusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella、Veillonella、Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及びXanthomonas、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/又はVeillonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含む、
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、前記方法。
【請求項40】
皮膚タイプを、喫煙にリンクされる低レベルの加齢皮膚、喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚、又は喫煙にリンクされる中間レベルの加齢皮膚に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属:
a)Micrococcus、Bacillus、Eikenella、Gemella、Corynebacterium、Finegoldia、Cutibacterium及び/又はAnaerococcus
の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、方法。
【請求項41】
各属の存在率、存在量又は存在を決定することは、微生物ゲノム、任意に細菌ゲノムの領域を配列決定することを含む、請求項33~40のいずれか一項に記載の方法。
【請求項42】
増幅に使用されるプライマー及び配列は、
順方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3'[配列番号1]及び
逆方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3'[配列番号2]
であるか、又は
16S-Mi341F順方向プライマー5'-CCTACGGGNGGCWGCAG-3'[配列番号3]及び16S-Mi805R逆方向プライマー5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3'[配列番号4]
であり、任意に、Nanopore技術が使用される場合、プライマーは配列番号1及び2であり、Illumina技術が使用される場合、プライマーは配列番号3及び4である、請求項41に記載の方法。
【請求項43】
高レベルの特性に関連付けられたすべての属の総存在量の、低レベルの特性に関連付けられたすべての属の総存在量に対する比を決定することを含む、請求項33~42のいずれか一項に記載の方法。
【請求項44】
高レベルの第1の特性又は低レベルの同じ第1の特性のいずれかを予測する微生物シグネチャを識別する方法であって、
a)(i)高レベルの特性を示す1人より多くの対象から採取された複数の対照皮膚微生物試料を提供し、皮膚微生物試料から微生物プロファイルを生成し、任意に、各試料中の各属の存在率を計算することと、
b)(ii)低レベルの特性を示す1人より多くの対象から採取された複数の対照皮膚微生物試料を提供し、皮膚微生物試料から微生物プロファイルを生成し、任意に、各試料中の各属の存在率を計算することと、
任意に、
c)高レベルの特性を示す対照試料から各属の平均存在率を生成することと、
d)低レベルの特性を示す対照試料から各属の平均存在率を生成することと、
e)高レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を識別することと、
f)低レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を識別することと、
任意に、
g)
i)高レベルの特性を示す対照皮膚試料について、(e)で識別された各属の平均存在率を合計し、(f)で識別された各属の平均存在率を合計し、
ii)(e)で識別された各属の平均存在率の合計の、(f)で識別された各属の平均存在率の合計に対する比を計算して、上側閾値比を与え、
iii)低レベルの特性を示す対照皮膚試料について、(e)で識別された各属の平均存在率を合計し、(f)で識別された各属の平均存在率を合計し、
iv)(e)で識別された各属の平均存在率の合計の、(f)で識別された各属の平均存在率の合計に対する比を計算して、下側閾値を与えることと
を含み、
上側閾値比よりも大きい試験比を有する試験試料は、高レベルの特性を有する試料であると考えられ、
下側閾値比よりも低い試験比を有する試験試料は、低レベルの特性を有する試料であると考えられ、
上側閾値比と下側閾値比との間の試験比を有する試験試料は、中間レベルの特性を有する試料であると考えられ、及び/又は
h)高レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を含む試験試料は、皮膚が高レベルの特性を有することを予測すると考えられ、低レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を含む試験試料は、皮膚が低レベルの特性を有することを予測すると考えられる、前記方法。
【請求項45】
高レベルの特性は高レベルの敏感性であり、かつ低レベルの特性は低レベルの敏感性であり、
高レベルの特性は高レベルの皮脂であり、かつ低レベルの特性は低レベルの皮脂であり、
高レベルの特性は高レベルの水分量であり、かつ低レベルの特性は低レベルの水分量であり、
高レベルの特性は高レベルの褐色斑点であり、かつ低レベルの特性は低レベルの褐色斑点であり、
高レベルの特性は高レベルの加齢皮膚であり、かつ低レベルの特性は低レベルの加齢皮膚であり、及び/又は
高レベルの特性は高レベルのバリア機能であり、かつ低レベルの特性は低レベルのバリア機能である、請求項44に記載の方法。
【請求項46】
種又は属は、それらが高レベルの特性を有する対象から採取された対照試料の10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%若しくは80%を超えて識別されなかった場合、さらなる分析から破棄されるステップ、及び/又は
種又は属は、それらが低レベルの特性を有する対象から採取された対照試料の10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%又は80%を超えて識別されなかった場合、さらなる分析から破棄されるステップ
を含む、請求項44~45のいずれかに記載の方法。
【請求項47】
高レベルの第1の皮膚特性又は低レベルの第1の皮膚特性を予測する第1の微生物シグネチャと、高レベルの第2の皮膚特性又は低レベルの第2の特性を予測する第2の微生物シグネチャとを識別することを含み、第1の微生物シグネチャと第2の微生物シグネチャとは異なる、請求項44~46のいずれかに記載の方法。
【請求項48】
先行する請求項のいずれか一項に記載の方法に従って、対象が高レベルの第1の皮膚特性又は低レベルの第1の皮膚特性を有するかを予測することと、第1の皮膚特性の状態を改善するように選択された化粧品を用いて皮膚に処置を施すこととを含む、美容的処置の方法。
【請求項49】
(i)対象から採取された第1の試験皮膚微生物試料を提供し、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法に従って、対象が高レベルの少なくとも第1の皮膚特性、低レベルの少なくとも第1の皮膚特性、又は中間レベルの少なくとも第1の皮膚特性を有するかを予測することと、
(ii)少なくとも1つの特性のレベルを調節するように選択された化粧品を用いて皮膚に処置を施すことと、
(iii)対象から採取された第2の試験皮膚微生物試料を提供し、先行する請求項のいずれか一項に記載の方法に従って、対象が高レベルの少なくとも第1の皮膚特性、低レベルの少なくとも第1の皮膚特性、又は中間レベルの少なくとも第1の皮膚特性を有するかを予測することと、
(iv)少なくとも第1の皮膚特性のレベルが望ましいように調節されたかを決定することと
を含む、美容的処置の有効性を監視する方法。
【請求項50】
先行する請求項のいずれかに記載の細菌属の組み合わせのいずれか1以上の存在率、存在量、又は存在を検出することができる携帯型装置。
【請求項51】
請求項1~50のいずれか一項に記載の微生物シグネチャ。
【請求項52】
いずれかの追加の微生物、任意にいずれかの追加の細菌、任意に:
Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/又はXanthomonas
から選択されるいずれかの追加の細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む、先行する請求項のいずれかに記載の方法。
【請求項53】
請求項1~52のいずれか一項に記載の細菌属のいずれか1つ又は複数を含む美容的組成物。

【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、美容的皮膚処置及び皮膚の質を改善する方法の分野にある。
【背景技術】
【0002】
皮膚微生物叢は、皮膚の表面上で生きている微小生命体を表す。
腸内微生物叢に特化した多数の研究及びヒトの健康へのその主要な寄与の実証を受けて、皮膚性又は皮膚(cutaneous or skin)の微生物叢の研究はここ数年でかなり成長している。座瘡、アトピー性皮膚炎又は乾癬などの皮膚疾患の治癒は、皮膚微生物叢の調査における推進力であり続けている。今日、皮膚微生物叢の重要性の承知は、病原性皮膚微生物生態学の範囲を大きく超えており、健康なヒト皮膚とそれに生息する微小生命体との間の複雑な相互作用の理解は、皮膚美容の分野における大きな発展を約束する。したがって、健康で美しい皮膚の自然な微生物のバランスを保つことができる美容製品への関心が高まっている。
【0003】
細菌、真菌、ウイルス及び古細菌は、特有の環境に生息する微生物集団として定義される微生物叢を構成する主要な微小生命体である。ヒトでは、主に細菌レベルにおいて、異なる身体部位の生態系及びそれらに関連付けられた微生物集団を特徴付けるために多くの努力がなされており、これらはヒト関連微生物叢上で最も豊富な微小生命体である。
異なる生態系により特徴付けられる異なる皮膚部位に加えて、異なる皮膚タイプは特徴的な微生物プロファイルを有する。例えば、Jarrin et al 2020(1)IFSCC 45-54は、非敏感性皮膚表現型ではなく、敏感性皮膚表現型に特徴的な微生物プロファイルを示す。
しかしながら、適切な美容的処置が助言及び使用され得るように、敏感性皮膚と他の皮膚タイプの両方をより良好に特徴付ける必要がある。
【0004】
本発明者らは、驚くべきことに、高レベルの、水分量又は皮脂などの特定の特性、低レベルのその特性、又は中間レベルのその特性を有する皮膚を対象が有するかを予測することができる皮膚微生物シグネチャを確実に生成するための手段を識別した。この手段は、任意の皮膚特性についての微生物シグネチャを決定するために使用され得、皮脂、水分量、年齢、褐色斑点、敏感性及び皮膚バリア機能に関して本明細書で例示される。
本発明はまた、対象が上記特性のいずれか1つ又は複数に該当する皮膚タイプを有するかを予測するために使用され得るか、又は皮膚特性のすべてを決定するために使用され得る広範な微生物シグネチャを提供する。本方法はまた、美容的使用のための特定の微生物シグネチャに関連付けられた微生物を含む様々な組成物と共に、本発明の方法のいずれかを実施するための様々なキット及び装置を提供する。
【発明を実施するための形態】
【0005】
本明細書に記載されるように、本発明者らは、皮膚の微生物プロファイルを識別し、それを高レベルの特性、低レベルの特性、又は中間レベルの特性を予測する1つ又は複数の微生物シグネチャと比較することによって、対象が任意の1つ又は複数の特定の特性、例えば1以上の美容的特性、又は1以上の医学的特性を有する皮膚を有するかを予測することが可能であることを見出した。好ましい実施形態では、特性は美容的特性である。しかしながら、当業者は、異なるタイプの皮膚に異なる微生物叢が生存しているという本発明の根底にある前提が、湿疹対非湿疹の皮膚などの医学的状態にも適用され得ることを認識するであろう。したがって、本開示は美容の実施形態に焦点を当てているが、それは医療用皮膚特性に等しく適用されると解釈されるべきである。精密な予測を行うためには、高レベル及び低レベルの特定の特性を有する皮膚の微生物プロファイルを理解し、高レベル又は低レベルの特性を指し示す特定の「シグネチャ」を識別することが重要である。このシグネチャは、1以上の微生物種若しくは属の存在若しくは非存在であってもよく、又は1以上の微生物種若しくは属の存在量若しくは相対存在量であってもよい。例えば、単純に、低レベルではなく高レベルの特性を指し示す属A及びBの存在であるだけでなく、高レベルの特性を指し示す属と低レベルの特性を指し示す属との相対比であってもよい。
【0006】
本発明は、高レベルの第1の特性又は低レベルの同じ第1の特性のいずれかを予測する微生物シグネチャを識別する方法であって、
a)(i)高レベルの特性を示す1人より多くの対象から採取された複数の対照皮膚微生物試料を提供し、皮膚微生物試料から微生物プロファイルを生成し、任意に、各試料中の各属の存在率を計算することと、b)(ii)低レベルの特性を示す1人より多くの対象から採取された複数の対照皮膚微生物試料を提供し、皮膚微生物試料から微生物プロファイルを生成し、任意に、各試料中の各属の存在率を計算することと、
任意に、
c)高レベルの特性を示す試料から各属の平均存在率を生成することと、
d)低レベルの特性を示す試料から各属の平均存在率を生成することと、
e)高レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を識別することと、
f)低レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を識別することと、
任意に、
g) i)高レベルの特性を示す対照皮膚試料について、
(e)で識別された各属の平均存在率を合計し、(f)で識別された各属の平均存在率を合計し、
ii)(e)で識別された各属の平均存在率の合計の、(f)で識別された各属の平均存在率の合計に対する比を計算して、上側閾値比を与え、
iii)低レベルの特性を示す対照皮膚試料について、
(e)で識別された各属の平均存在率を合計し、(f)で識別された各属の平均存在率を合計し、
iv)(e)で識別された各属の平均存在率の合計の、(f)で識別された各属の平均存在率の合計に対する比を計算して、下側閾値を与えることと
を含む、方法を提供し、
上側閾値比よりも大きい試験比を有する試験試料は、高レベルの特性を有する試料であると考えられ、
下側閾値比よりも低い試験比を有する試験試料は、低レベルの特性を有する試料であると考えられ、
上側閾値比と下側閾値比との間の試験比を有する試験試料は、中間レベルの特性を有する試料であると考えられ、及び/又は
h)高レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を含む試験試料は、皮膚が高レベルの特性を有することを予測すると考えられ、低レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を含む試験試料は、皮膚が低レベルの特性を有することを予測すると考えられる。
【0007】
本発明の方法は、身体の任意の所望のエリア、顔からだけでなく、頭皮、腋窩又は前腕からも取得されたヒト皮膚微生物試料に対して実行され得る。
ヒト皮膚試料は、任意の適切な方法によって、実例として、スワブ採取、擦り洗い又は掻き取りによって取得され得る。非侵襲的試料採取法が一般に好まれる。
【0008】
好ましい実施形態では、皮膚微生物試料は、皮膚のスワブ採取、好ましくは対象の顔、例えば頬又は前額部からの皮膚のスワブ採取によって取得されている。
一実施形態では、ヒト皮膚試料はスワブ採取によって取得される。実例として、スワブ採取は、好ましくは生理学的血清(例、serum physiologique、Mercurochrome)、滅菌NaCl溶液(例、0.15M NaCl)、又はそれらの混合物を用いて湿らせた滅菌スワブ(例、Medicomp、Hartmann;又はSarstadt製の法医学スワブ;スワブはビスコースで作製されていてもよく、任意に、いくらかのポリエステル、例100%ビスコース又は70%ビスコース+30%ポリエステルも含有し得る)を使用して実行され得る。スワブ採取の前にスワブを加湿することは、皮膚の摩耗を避けるのに役立つ。
【0009】
本方法の目的は、高レベル及び低レベルの特性を有する対象を表すプロファイルを生成することである。これは、高レベルの特性を有する対象からの少なくとも2つの試料が使用され、低レベルの特性を有する特性のレベルが低い対象からの少なくとも2つの試料が使用されることを要求とする。これらの試料は対照試料であると考えられることができ、これらは、低レベル又は高レベルのいずれかの特性を有することが既知の対象から採取される。当業者は、そのような方法について、試料サイズが大きいほど検定力が大きいことを認識する。したがって、一実施形態では、高レベルの特性を有する対象からの、使用される試料の数は、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100又はそれを越え、低レベルの特性を有する対象からの、使用される試料の数は、少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100又はそれを越える。
【0010】
すべての対象間の唯一の変数が分析中の特性のレベルであることが好まれる。例えば、一実施形態では、対象は、複数の特性について評価され、調査中のもの以外のすべての条件について一致される場合にのみ、方法に含めるために選択される(例えば、表1を参照)。
微生物プロファイルは、任意の利用可能な手段によって生成され得る。例えば、一実施形態では、核酸は、試料中に存在する微生物から抽出され、分析は、核酸に対して実行され、例えば、微生物を識別するために、核酸は増幅され、次いで配列決定され得る。いくつかの実施形態では、核酸を抽出する必要がない場合があり、増幅及び配列決定は、微生物試料の粗溶解物に対して実行され得る。
代替的に、微生物プロファイルは、試料中に存在する微生物の培養を伴い得る。この方法の欠点は、一部の微生物が容易に培養できないことである。しかし、培養可能なもののうち、高又は低レベルの特性を有する皮膚間における、培養可能な微小生命体のプロファイルの差を識別することは依然として可能であると考えられる。別の実施形態では、抗体に基づく検出方法などの他の方法が使用され得る。
【0011】
好ましくは、核酸が抽出され、核酸増幅及び配列決定によって微生物が識別される。
核酸抽出、増幅及び配列決定の方法は公知であり、適切な方法は当業者によって選択され得る。例えば、定量される微生物のタイプに応じて、当業者は、核酸の適切な領域が増幅され、配列決定されるように、適切なプライマー及びサイクル条件を選択することができる。PCT出願PCT/EP20201075530は、適切な方法の詳細を提供する(参照により本明細書に組み込まれる)。本明細書に記載の一実施形態では、DNAは、以下の改変を加えたDNeasy PowerLyzer PowerSoil DNA単離キット(米国メリーランド州ゲルマンタウンのQiagen)を使用して試料から抽出される。各スワブの先端が滅菌外科用ブレードで取り外され、750μLのビーズ溶液を含有する1.5mLチューブに移される。サンプリングされたバイオマスは、撹拌及びピペッティングによって懸濁され、次いでビーズ破砕チューブに移される。残りのステップは、製造業者の説明書に従って実行され得る。DNA濃度は、QuBit dsDNA HS蛍光定量キット(フランス、クールタブフのThermoFisher ScientificのInvitrogen)を製造者の説明書に従って使用して決定された。
【0012】
一実施形態では、全ゲノム配列決定アプローチが使用される(例、次世代配列決定、例、サンガー配列決定を使用する)。
好ましくは、より標的化されたアプローチが使用される。分類学では、データベース情報と比較するために、あらゆる種及び配列に固有であると考えられるゲノムの特定の領域のみを単純に増幅することが一般的である。細菌の微生物叢を評価するための最も一般的な戦略は、第2世代の大量配列決定技術を使用して、16S rRNA遺伝子の特有の領域を増幅及び配列決定することである。この細菌マーカー遺伝子は、細菌に広く見出され、分類学を推論するために使用され得る9つの超可変領域(V1~V9)を有する。
【0013】
したがって、一実施形態では、本方法は、16S rRNA細菌遺伝子の領域を増幅して配列決定すること、又は単純に配列決定することを含み、一実施形態では、本方法は、16S rRNA細菌遺伝子のV1、V2、V3、V4、V5、V6、V7又はV9領域のいずれか1つ又は複数を増幅して配列決定すること、又は単純に配列決定することを含む。
一実施形態では、V3及びV4 16S rRNA遺伝子のDNA増幅及び配列決定が実行される。
【0014】
一実施形態では、使用される増幅プライマーは、以下:
順方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3'[配列番号1]及び
逆方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3'[配列番号2]
であるか、又は
16S-Mi341F順方向プライマー5'-CCTACGGGNGGCWGCAG-3'[配列番号3]及び16S-Mi805R逆方向プライマー5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3'[配列番号4]
であり、任意に、Nanopore技術が使用される場合、プライマーは配列番号1及び2であり、Illumina技術が使用される場合、プライマーは配列番号3及び4である。
配列番号1及び2のプライマーは、全長16S(27F及び1492R位置に対応する)の増幅を可能にする。配列番号3及び4のプライマーは、およそ460bpのアンプリコンを生成する。
【0015】
いくつかの実施形態では、配列決定は、Illumina技術を使用して、任意に、MiSeq装置を使用して実行される。いくつかの実施形態では、配列決定は、Nanopore技術を使用して実行される。いくつかの実施形態では、配列決定は、Illumina及びNanopore両方の技術を使用して実行される。
対照試料の各々における種及び/又は属を識別することは、当業者の技能の範囲内である。特定の方法が実施例に記載されているが、本質的に、識別が配列決定を伴う場合、配列は配列データベースと比較され、存在する各微生物は種又は属レベルで識別される。
【0016】
これは、対照試料中に存在する微生物、例えば細菌の異なる種又は属に関する情報を与える。配列決定情報はまた、それらの微生物、例えば細菌の各々の相対的存在量の指標を与えることができる。第1の種又は属にマッピングされるリードの数が多いのに対して、第2の種又は属にマッピングされるリードの数が少ないことは、皮膚試料において、第1の種の存在量が第2の種よりも多かったことを指し示す。このようにして、各種又は属の存在量は定量化され得る。
微生物プロファイルは、高レベル又は低レベルの特性を有する皮膚に生息する、種又は属の数又はタイプの差を示し得る。微生物プロファイルはまた、高レベル又は低レベルの特性を有する皮膚間における、同じ種又は属の相対的存在量の差を示し得る。微生物プロファイルは、特定の属が高レベルの特性を有する皮膚に生息し、属の異なるセットが低レベルの特性を有する皮膚に生息することを示し得る。いくつかの実施形態では、それは、高レベルの特性を有する皮膚に生息する属の存在量又は存在率と、低レベルの特性を有する皮膚に生息する属の存在量又は存在率との間の相対差である。
【0017】
いくつかの実例では、微生物プロファイルは、単純に、2つのセットの対照試料中に存在する異なる微生物のパネル、例えば高レベルの特性を有する皮膚に見出される異なる細菌属又は種と、低レベルの特性を有する皮膚に見出される異なる微生物、例えば異なる細菌属又は種のパネルとを含み得る。例えば、単純なプロファイルは、高レベルの特性を有する対象が皮膚上に細菌属A、B、C及びDを有する傾向があるのに対して、低レベルの特性を有する対象は皮膚上に代わりに細菌属E、F、G及びHを有する傾向があることであり得る。
したがって、いくつかの実施形態では、微生物プロファイルは、異なる種又は属、例えば、高レベルの特性及び低レベルの特性を有する皮膚上に見出される異なる細菌属又は種のプロファイルである。
【0018】
2つの対照微生物プロファイル、すなわち、高レベルの特性を有する複数の対象から採取された試料から生成された第1の対照微生物プロファイル、及び低レベルの特性を有する複数の対象から採取された試料から生成された第2の対照微生物プロファイルは、任意の公知の手段によって互いに比較され得る。いくつかの実例では、単純に2つのプロファイルを見ることによって、予測微生物シグネチャを識別することが可能であり得る。他の実例では、予測シグネチャを識別するために、コンピュータ技術、例えばアルゴリズムの使用が使用され得る。そのようなアプローチの例は、実施例に与えられている。
【0019】
しかしながら、特に上記の例では、皮膚上で、高レベルの特性を有する対象がいくつかの種又は属F~Hも有し得、低レベルの特性を有する対象がいくつかの種又は属A~Dを有し得ることが可能であるため、より適切な微生物シグネチャは、種又は属の各々の相対的存在量を考慮に入れる。これらの属又は種の各々の存在率を考慮することは、全体的に対象が、高レベルの特性に関連付けられたより多くの存在量の属又は種を有する皮膚を有するか、又は全体的に対象が、低レベルの特性に関連付けられたより多くの存在量の属又は種を有する皮膚を有するかの指標を与える。
【0020】
したがって、一実施形態では、対照試料中の微生物、例えば細菌の識別が(属又は種のレベルで)確認されると、各試料中の各種又は属の存在率が決定される。図6及び図7は、2人の対象の皮膚から取得された属の存在率の例を示す。いくつかの好ましい実施形態では、2つの個体群中の各種又は属についての存在率の平均(高又は低レベルの特性)が生成される。これは、高レベルの特性を有する対象の群における関連属の各々の平均存在量、及び低レベルの特性を有する対象の関連属又は種の平均存在量を提供する。例えば、そのようなデータは以下のようになり得る。
【表1】
【0021】
したがって、一実施形態では、本方法は、
c)高レベルの特性を示す対照試料から、各属の平均存在率を生成すること、及び
d)低レベルの特性を示す対照試料から、各属の平均存在率を生成すること
を含む。
【0022】
これらの平均値から、高レベルの特性を有する皮膚でより優勢な微生物の種又は属、例えば細菌の属、及び低レベルの特性を有する皮膚でより優勢な微生物の種又は属を識別することが可能である。上記の例では、属A~Dが高レベルの状態でより優勢であり、属E~Hが低レベルの状態でより優勢であることを見ることができる。しかしながら、そのようなパターン又はシグネチャは、必ずしも容易に見つけることができず、統計的に有意なパターンを識別するために、アルゴリズムの使用が使用され得る。例は、DESeq2(Bioconductor)パッケージを使用する、これを行う1つの手法の説明を提供する。これは、種/属の各々の相対的存在量を比較し、どの種又は属が各特性(高又は低レベル)と有意に関連付けられるかを識別する。他の適切なパッケージが利用可能である。
【0023】
最終的なシグネチャの一部である種又は属が、試験した皮膚試料中にごくまれにしか見られない種又は属を含まない場合、有利である。したがって、1つの実施形態では、例えば、種又は属は、それらが対照試料の10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%又は80%を超えて識別されなかった場合、さらなる分析から破棄され、例えば、
種又は属は、それらが高レベルの特性を有する対象から採取された対照試料の10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%若しくは80%を超えて検出されなかった場合、さらなる分析から破棄され、及び/又は
種又は属は、それらが低レベルの特性を有する対象から採取された対照試料の10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%若しくは80%を超えて検出されなかった場合、さらなる分析から破棄される。
【0024】
実施例に示す特定の一実施形態では、次いで、特有の皮膚状態を特徴付けるためにどの細菌が関係があるかをより正確に定義するために、ランダムフォレスト分類器(R社のRamdomForestパッケージ)に基づく機械学習アプローチを使用して、p値<0.05、0.1%より高い相対存在量を有し、試料の少なくとも30%で見出された微小生命体は分類された。ランダムフォレストアプローチは、何千もの系統樹を使用して、どの細菌属が主要変数(すなわち、特性のレベル)に従って試料をより良好に区別することを可能にするかを定義する。
【0025】
属又は種が広範な異なる方法によって検出可能である場合も有利である。いくつかの配列決定方法は長い配列リードを生成することができ、いくつかはより短いリードを生成することしかできないことは公知である。当業者はこれを承知しており、それに応じて増幅及び配列決定プライマーを設計して、適切な固有配列が確実に配列決定されるようにすることができる。細菌などの存在する微生物を識別するための最初の16S rRNA配列決定に続いて、微生物シグネチャを構成する重要な属又は種のみを標的とすることができ、対象試料の実際の試験に使用される特有のプライマーを設計することが可能である。すなわち、微生物シグネチャに特有ではないプライマーを最初に確立する場合、すなわち、すべての微生物、例えば細菌の16S rRNA配列を増幅又は配列決定することができるプライマーが一般に使用されるが、どのスキンケア製品が最も適しているかに関する推奨を提供するためにシグネチャを実際に使用する場合、これらのプライマーを使用する必要はなく、関連微生物に特有のプライマーが使用され得る。これらのプライマーはまた、任意のタイプの配列決定方法、例えばIllumina方法又はNanopore方法で機能するように設計され得る。本発明は、本明細書に記載の微生物の任意の組み合わせを増幅及び配列決定するためのそのようなプライマー及びそのようなプライマーの組み合わせを提供する。
【0026】
微生物、例、高レベルの状態を有する皮膚においてより優勢である細菌又は低レベルの状態を有する皮膚においてより優勢である細菌が識別されたら、いくつかの実施形態では、一般的に使用される配列決定方法のほとんどを使用して容易に増幅及び/又は配列決定され得ない任意の微生物、例、細菌をさらなる分析から除去することが有利である。したがって、いくつかの実施形態では、微生物、例、高レベルの状態を有する皮膚においてより優勢である細菌又は低レベルの状態を有する皮膚においてより優勢である細菌が識別されたら、任意の微生物、例えば細菌、例えばIllumina及び/又はNanopore技術を使用して配列決定され得ない属又は種の細菌は、さらなる分析から除去される。この目的は、可能な限り多くの異なる配列決定システムを用いて微生物シグネチャが使用され得ることを確実にすることである。
【0027】
どの種/属がIllumia対Nanoporeを用いて増幅及び配列決定され得るかの間に差が存在し得るが、これらの差は主に、使用されるプライマーが両方の条件に対して同時に最適化されないためであると考えられる。適切なプライマーが使用されるならば、微生物、例、細菌のすべての種及び属は、Illumina及びNanoporeの両方によって配列決定され得ると考えられる。当業者は、広範な状況に対するプライマーの設計に精通しており、適切なプライマーを設計することができる。実施例は、Illumina技術とNanopore技術の両方を使用して本発明を実施する手段を詳述している。
【0028】
各属/種の平均存在率が計算され、高又は低レベルの特性を有する皮膚でより優勢な属又は種(上記のステップ(e)及び(f))が識別されると、これらの平均存在率は、微生物シグネチャとして直接使用され得、試験試料はこれらの値の各々と比較され得る。
【0029】
しかしながら、試験対象の皮膚の特性のレベルを予測するために使用される場合、単一の試験値をシグネチャと比較することを伴い、したがってスキンケア技術者にとって使用するのがより単純であると考えられ得る微生物シグネチャを作成するさらなる実施形態は、
g)
i)高レベルの特性を示す対照皮膚試料について、
(e)で識別された各属の平均存在率を合計し、(f)で識別された各属の平均存在率を合計し、
ii)(e)で識別された各属の平均存在率の合計の、(f)で識別された各属の平均存在率の合計に対する比を計算して、上側閾値比を与え、
iii)低レベルの特性を示す対照皮膚試料について、
(e)で識別された各属の平均存在率を合計し、(f)で識別された各属の平均存在率を合計し、
iv)(e)で識別された各属の平均存在率の合計の、(f)で識別された各属の平均存在率の合計に対する比を計算して、下側閾値を与えること
を含む。
【0030】
上記の表の例示的なデータを使用すると、これは:
高レベルの特性試料:高レベルの特性に関連付けられた平均存在率の合計=20+10+30+20=80低レベルの特性に関連付けられた存在率の合計=2+3+5+10=20
上側閾値比=80/20=4
低レベルの特性試料:高レベルの特性に関連付けられた平均存在率の合計=2+3+5+10=20。低レベルの特性に関連付けられた存在率の合計=20+10+30+20=80。
下側閾値比=20/80=0.25
をもたらす。
【0031】
閾値比は、それを超えると試験試料が高レベルの特性を有すると考えられ、それを下回ると試験試料が低レベルの特性を有すると考えられ、試験試料が比として2つの閾値の間にある試験試料である場合、試料が中間レベルの特性を有すると考えられる上側比及び下側比を定義する。この場合、4以上の試験比を有する対象は、高レベルの特性を有する皮膚を有すると考えられ、比が0.25以下であれば、低レベルの特性を有する皮膚を有すると考えられ、0.25を超えるが4未満の比は、中間レベルの特性である。
「高」及び「低」という用語は、当分野で標準的である。例えば、当業者は、「高」レベルの皮脂又は「低」レベルの皮脂であると考えられるものを理解するであろう。
【0032】
したがって、一実施形態では、本方法によって決定される微生物シグネチャは、高レベルの特性を指し示すと考えられる微生物種又は属、例えば細菌属のセット、及び低レベルの特性を指し示すと考えられる微生物種又は属、例えば細菌属のセットであり、2つの閾値比は上記で定義された通りである。このシグネチャを使用するために、試験試料は処理されて、シグネチャ中の各種又は属の存在率を決定し、高レベルの状態を指し示す種又は属の存在量の、低レベルの状態を指し示す種又は属の存在量に対する比が計算され、2つの閾値比と比較され、対象の皮膚における特性のレベル、すなわち、高、低又は中間を予測する。
【0033】
上述の閾値比の生成を伴わない手法で微生物シグネチャが使用され得ることは、当業者には明らかであろう。例えば、高レベルの状態を有する皮膚からの試料から生成された初期微生物プロファイルが、低レベルの状態を有する皮膚から任意の手段によって採取された試料から取得された微生物プロファイルと比較され得る。例えば、高又は低レベルの状態のみに関連付けられた微小生命体の固有のサブセットを識別することが可能であり得る。他の実施形態では、微生物シグネチャは、単純に、高レベルの状態に関連付けられた各属の存在量の合計であってもよく、すなわち、低レベルの状態に関連付けられた細菌属などの任意の種又は属の存在量と比較する必要はない場合がある。そのような実例では、実際に使用される場合、対象の皮膚を試験する当業者は、単純に、1つ又は複数の種又は属、例えば細菌属の存在を決定するだけでよいため、閾値比を生成する必要はない場合がある。
【0034】
したがって、一実施形態では、高レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を含む試験試料は、皮膚が高レベルの特性を有することを予測すると考えられ、低レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属を含む試験試料は、皮膚が低レベルの特性を有することを予測すると考えられる。いくつかの実施形態では、高レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の存在は、皮膚が高レベルの特性を有することを予測すると考えられ、同じ又は他の実施形態では、低レベルの特性を示す皮膚においてより優勢な微生物の属の存在は、皮膚が低レベルの状態を有することを予測すると考えられる。同じ又は他の実施形態では、高レベルの状態を有する皮膚においてより優勢な種又は属の存在量の合計は、例えば、存在量の合計が高レベルの状態に関連付けられた何らかの閾値を上回る場合、皮膚が高レベルの状態を有することを指し示す。代替的又は追加的に、低レベルの状態を有する皮膚においてより優勢な種又は属の存在量の合計は、例えば、存在量の合計が低レベルの状態に関連付けられた何らかの閾値を上回る場合、皮膚が低レベルの状態を有することを指し示す。
【0035】
上述のように、Illumina対Nanoporeを使用して検出可能な種/属の間には差があり得る。一実施形態では、生成された微生物シグネチャは、Illumina及びNanopore技術の両方を使用して、広範な試料で試験される。いくつかの実施形態では、生成された微生物シグネチャは、試料がIllumina及びNanopore技術を使用して処理される場合、試験試料の少なくとも60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%、94%、96%、98%又は100%において同じ予測(すなわち、高、低、又は中間レベルの特性)を提供する。
【0036】
いくつかの実施形態では、Illuminaを使用して取得された予測とNanoporeを使用して取得された予測との間の相関は、LOW Illumina予測がLOW Nanopore予測に対応し、HIGH Illumina予測がHIGH Nanopore予測に対応する場合に真の相関であると考えられる。いくつかの実施形態では、一方の技術を使用して取得された中間予測は、他方の技術の中間、HIGH又はLOW予測に対応する場合、他方の技術との真の相関と考えられ得る。
任意の皮膚特性、例えば任意の美容的皮膚特性又は医療用皮膚特性を予測することができる微生物シグネチャを生成するために、本発明の方法が使用され得る。
【0037】
いくつかの実施形態では、美容的皮膚特性は、皮膚敏感性、皮脂レベル、水分量、褐色斑点、加齢皮膚、及びバリア機能のレベルを含む。
【0038】
したがって、一実施形態では、本方法は、以下のうちの少なくとも2つを予測する微生物シグネチャの組み合わせを含む:
高レベルの特性は高レベルの敏感性であり、低レベルの特性は低レベルの敏感性であり、
高レベルの特性は高レベルの皮脂であり、低レベルの特性は低レベルの皮脂であり、
高レベルの特性は高レベルの水分量であり、低レベルの特性は低レベルの水分量であり、
高レベルの特性は高レベルの褐色斑点であり、低レベルの特性は低レベルの褐色斑点であり、
高レベルの特性は高レベルの加齢皮膚であり、低レベルの特性は低レベルの加齢皮膚であり、及び/又は
高レベルの特性は高レベルのバリア機能であり、低レベルの特性は低レベルのバリア機能である。
いくつかの実施形態では、微生物シグネチャ(又は微生物シグネチャの組み合わせ)は:
高レベルの特性は高レベルの敏感性であり、低レベルの特性は低レベルの敏感性であり、
高レベルの特性は高レベルの皮脂であり、低レベルの特性は低レベルの皮脂であり、
高レベルの特性は高レベルの水分量であり、低レベルの特性は低レベルの水分量であり、
高レベルの特性は高レベルの褐色斑点であり、低レベルの特性は低レベルの褐色斑点であり、
高レベルの特性は高レベルの加齢皮膚であり、低レベルの特性は低レベルの加齢皮膚であり、及び
高レベルの特性は高レベルのバリア機能であり、低レベルの特性は低レベルのバリア機能である
のすべてを予測する。
【0039】
これらの特性はすべて、化粧品産業において日常的に評価されており、当業者は、これらのパラメータの各々のレベルを決定する方法をよく承知している。
例えば、皮脂レベルは、Sebumeter(登録商標)を使用して測定され得る。それは測光法である。吸収された脂質と接触すると透明になる合成リボンが、正確に30秒間測定ゾーンに適用される。その透明性は、接触している脂質膜からの皮脂の量に比例して増加する。透過光の増加を定量化し、表面単位によって排泄される脂質の総質量(μg/cm2)を決定するために、反射率測定記録が使用される。例えば、該Sebumenterを使用して、低皮脂=>23と考えられ得、高皮脂レベル=>63と考えられ得る。
【0040】
水分量レベルは、Corneometer(登録商標)を使用して測定され得る。角質層の水分量は、その電気的特性の変化を引き起こす。角質層は誘電体のようなものである。その水分量ステートメントのいかなる改変も、コンデンサによって測定される電気容量の変動を引き起こす。その双極性が環境の電気誘電率及びその導電率を増加させるので、水分量が高いと、電気容量が高くなる。測定は、Corneometer(登録商標)CM 825 TM(Courage&Khazaka electronics)によって実行された。コンデンサにリンクされたプローブは、測定を妨害せず、良好な実験条件再現性を取得するために、常に同じ圧力を外皮に適用することを可能にする。例えば、該Corneometerを使用すると、低水分量<=45.4、高水分量=>50と考えられ得る。
【0041】
経表皮水分蒸散量(TEWL)はバリア機能の指標を与えるので、バリア機能のレベルは、Tewameter(登録商標)を使用して測定され得る。TEWLは、体の内部から外部への角質層を通じた水の受動的拡散である。その測定は、バリア機能の完全性を認識することを可能にする。皮膚表面上に確立された水蒸気の勾配を測定するために、皮膚と接触している円筒形チャンバ、すなわち環境条件の変動を部分的に克服するための開放チャンバを画定するプローブが使用される。測定単位はg/m2/hである。高TEWL(実施例のデータで使用されるように高い)は、本文で使用される低レベルのバリア機能を指し示し、実施例及び図のデータで使用される低TEWLは、本文で使用される高レベルのバリア機能を指し示す。例えば、TEWL(バリア機能)は、低<=11.2;及び高=>16.2と考えられ得る。
敏感性皮膚表現型は、カプサイシン試験に対する有害な感覚反応に基づいて確立され得る。
【0042】
褐色斑点(皮膚表面及びその下の色素沈着及び変色)は、Canfield(登録商標)イメージングシステムのVisia CR 2.3(登録商標)を使用して測定され得る。VISIAは、異なるタイプの照明で写真を撮ること、及び画像の非常に迅速な取り込みを可能にする。マルチスペクトルイメージングの下で撮影された一連の写真及び分析は、皮膚の外観に作用する視覚情報を取り込むことを可能にする。CanfieldのRBX(登録商標)技術は、クモ静脈、色素沈着過剰、炎症及び他の状態などの、色の集中をもたらす状態の不均等な視覚化のために、赤及び茶色の皮膚成分の固有色シグネチャを分離する。ボランティアの顔のサイズの差のために、斑点の数の正規化は、測定のために考えられた表面を使用して行われる。例えば、低斑点エリア=>1061、高斑点エリア=>2237と考えられ得る。
【0043】
「加齢皮膚のレベル」によって、本発明者らは皮膚の年齢を意味する。この言語は、使用される残りの用語と一致するように使用される。しかしながら、例えば、高又は低レベルの加齢皮膚を予測する微生物シグネチャを識別する方法では、本発明者らが、シグネチャが皮膚の見かけの年齢を予測し得ることを意味していることは当業者には明白であろう。シグネチャが決定されたら(すなわち、どの種/属がより老化した皮膚とより若い皮膚に関連付けられるか)、対象からの試験試料の皮膚の年齢を予測することが可能になる。次いで、これは、試験対象の実際の年齢と比較され得、被験体が早期加齢皮膚を有するか否かを確立することができる。例えば、低年齢<=25、高年齢=>42と考えられ得る。
【0044】
皮膚敏感性、皮脂レベル、水分量、褐色斑点、加齢皮膚、及びバリア機能のレベルのうちのただ1つのレベルを予測することができる微生物シグネチャを識別するために、本方法は使用され得る。しかしながら、本方法はまた、皮膚敏感性、皮脂レベル、水分量、褐色斑点、加齢皮膚、及びバリア機能のレベルのうちの1つより多く、又はすべてのレベルを予測することができる微生物シグネチャの組み合わせを生成するために使用され得る。
したがって、一実施形態では、本方法は、高レベル又は低レベルのいずれかの少なくとも2、3、4、5、6、7、8、9、10又はそれより多くの特性を予測する微生物シグネチャを識別する方法であり、任意に、特性は、皮膚敏感性、皮脂レベル、水分量、褐色斑点、加齢皮膚、及びバリア機能のレベルから選択される。
【0045】
高又は低レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャが、高又は低レベルの第2、第3、第4、第5又は第6の特性を予測する微生物シグネチャと異なる場合、明らかに有利である。したがって、一実施形態では、本方法は、高レベルの第1の皮膚特性又は低レベルの第1の皮膚特性を予測する第1の微生物プロファイル、及び高レベルの第2の皮膚特性又は低レベルの第2の特性を予測する第2の微生物プロファイルを識別することを含み、第1及び第2の微生物シグネチャは異なる(任意に、第3、第4、第5、第6、第7、第8、第9、第10又はそれより多くの特性)。
【0046】
上述のように、微生物試料は、任意の1つ又は複数のタイプの微小生命体の試料であり得、例えば、試料中の細菌、酵母及び真菌のいずれか1つ又は複数の試料であり得る。
上述のように、微生物プロファイルは、任意の1つ又は複数のタイプの微小生命体のプロファイルであり得、例えば、試料中の細菌、酵母及び真菌のうちのいずれか1つ又は複数のプロファイルであり得る。好ましい実施形態では、微生物プロファイルは細菌プロファイルである。
【0047】
いくつかの実施形態では、微生物プロファイルは、試料内の個々の種の微生物プロファイルである。他の実施形態では、微生物プロファイルは、試料中の関連生物の属のプロファイルである。例えば、いくつかの実施形態では、微生物プロファイルは、試料中の細菌属のプロファイルである。
【0048】
皮膚特性のレベル(高又は低)を予測する微生物シグネチャを確立又は識別する方法を提供することに加えて、本発明はまた、
対象が、ヒト対象において高レベルの第1の皮膚特性、低レベルの第1の皮膚特性、又は中間レベルの第1の皮膚特性を有するかを予測する方法であって、
a)対象から採取された皮膚微生物試料を提供し、皮膚微生物試料から試験微生物プロファイルを生成することと、
b)試験微生物プロファイルを、高レベルの第1の特性又は低レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャと比較することと、
c)試験微生物プロファイルが、高レベルの第1の特性、低レベルの第1の特性、又は中間レベルの第1の特性を有する皮膚のものであるかを決定することと
を含む、方法を提供する。
【0049】
本発明のこの態様の選好は、他の箇所に記載されている通りであり、例えば、特性、試料などに対する選好である。
いくつかの実施形態では、微生物シグネチャは、本明細書に記載の本発明の方法を使用して確立又は識別される。
【0050】
いくつかの実施形態では、試験微生物プロファイルを生成することは、
a ii)高レベルの第1の皮膚特性又は低レベルの第1の皮膚特性を予測する微生物シグネチャの各属の存在を検出すること及び/又は存在を決定すること及び/又は存在率を計算すること、並びに任意に、
a iii)高レベルの第1の特性を予測する各属の存在率を合計し、低レベルの第1の特性を予測する各属の存在率を合計すること
を含む。
【0051】
いくつかの実施形態では、本方法は、
a iv)高レベルの第1の特性を予測する各属の存在率の合計の、低レベルの第1の特性を予測する各属の存在率の合計に対する比を計算して、試験比を生成すること
をさらに含む。いくつかの実施形態では、本方法はまた、
a v)(a iv)の試験比を所定の上側閾値比及び所定の下側閾値比と比較すること
を含み、上側閾値比より大きい試験比は、対象が高レベルの第1の特性を有する皮膚を有することを予測し、下側閾値比よりも低い試験比は、対象が低レベルの第1の特性を有する皮膚を有することを予測し、上側閾値比と下側閾値比との間の試験比は、中間の皮膚特性を予測する。
【0052】
いくつかの実施形態では、ステップ(a iv)及び(a v)の代わりに、又はそれらと共に、本方法は、(a ii)で決定された高レベルまたは低レベルの特性を予測する属の存在、存在量若しくは存在率、又は(a iii)の存在量若しくは存在率の合計を、微生物シグネチャと比較することを含むことができる。
【0053】
典型的には、「を予測する属」により、本発明者らは、該属の存在量が高いほど、その特性の予測が強くなるという意味を含む。したがって、高レベルの特性を予測する属の高存在量は、属の低存在量よりも高レベルの特性をより予測する。
高存在量の特定の属又は種、例えば細菌の属が高レベルの特性を指し示す場合、低存在量の同じ特定の属又は種、例えば細菌の属が低レベルの特性を指し示すことが当業者には明白であろう。
【0054】
いくつかの実施形態では、高レベルの特性を予測する属又は種、及び低レベルの特性を予測する属又は種は、同じ種又は属であり、存在量は、高レベル又は低レベルが予測されるかを決定するものである。
好ましい実施形態では、高レベルの特性を予測する属又は種と、低レベルの特性を予測する属又は種とは、異なる種又は属である。特定のレベルの特性を予測する種又は属の存在量は、高くても低くてもよい。
【0055】
好ましい実施形態では、高レベルの特性を予測する属又は種、及び低レベルの特性を予測する属又は種は、及び各場合において高存在量の種又は属は、高レベル又は低レベルの状態を予測する。例えば、第1の高存在量の第1の種又は属のセットは、高レベルの特性を予測し、第2の高存在量の第2の種又は属のセットは、低レベルの特性を予測する。いくつかの実施形態では、皮膚の特性を決定するために、第1の存在量及び第2の存在量が比較される。このようにして、次いで、どの種又は属のセットが全体的に最も高い存在量を有するかを決定することが可能であり、したがって、特性がどのレベルであるか、すなわち高いか低いかが予測される。比較は、比又は減算の形態であり得る。
【0056】
いくつかの実施形態では、上側及び下側閾値比は、本明細書に記載の本発明の方法に従って決定される。
いくつかの実施形態では、高レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャは、以下の属のいずれか1つ又は複数を含む:
Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及びXanthomonas。
【0057】
同じ又は異なる実施形態では、低レベルの第1の特性を予測する微生物シグネチャは、以下の属のいずれか1つ又は複数を含む:
Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及びXanthomonas。
【0058】
いくつかの実施形態では、
高レベルの特性は高レベルの敏感性であり、低レベルの特性は低レベルの敏感性であり、
高レベルの特性は高レベルの皮脂であり、低レベルの特性は低レベルの皮脂であり、
高レベルの特性は高レベルの水分量であり、低レベルの特性は低レベルの水分量であり、
高レベルの特性は高レベルの褐色斑点であり、低レベルの特性は低レベルの褐色斑点であり、
高レベルの特性は高レベルの加齢皮膚であり、低レベルの特性は低レベルの加齢皮膚であり、及び/又は
高レベルの特性は高レベルのバリア機能であり、低レベルの特性は低レベルのバリア機能である。
【0059】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの皮脂であり、低レベルの第1の特性は低レベルの皮脂であり、
高皮脂を予測する属は、
a)Cutibacterium及び/若しくはEikenella、
b)Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/若しくはTuricella、並びに/又は
c)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0060】
同じ又は異なる実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの皮脂であり、低レベルの第1の特性は低レベルの皮脂であり、低レベルの皮脂を予測する属は、
a)Haemophilus、Kocuria及び/若しくはNeisseria、
b)Haemophilus、Kocuria、Neisseria及び/若しくはPaucibacter、
c)Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/若しくはBrochothix、
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0061】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの皮脂であり、低レベルの第1の特性は低レベルの皮脂であり、
a)高皮脂を予測する属は、
b)Cutibacterium及び/又はEikenella
のいずれか1以上、又はすべてを含み、低皮脂を予測する属は、
Haemophilus、Kocuria、Neisseria
のいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高皮脂を予測する属は、
d)Cutibacterium及び/又はEikenella
のいずれか1以上、又はすべてを含み、低皮脂を予測する属は、
Haemophilus、Kocuria、Neisseria、Paucibacter
のいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高皮脂を予測する属は、
Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricella
のいずれか1以上、又はすべてを含み、低皮脂を予測する属は、
Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus
のいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/又はBrochothixのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0062】
いくつかの実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの敏感性であり、低レベルの第1の特性は低レベルの敏感性であり、高レベルの敏感性を予測する属は、
a)Corynebacterium及び/若しくはKocuria、
b)Anaerococcus、Kocuria及び/若しくはSnodgrassella、
c)Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas及び/若しくはSnodgrassella、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0063】
同じ又は異なる実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの敏感性であり、低レベルの第1の特性は低レベルの敏感性であり、低レベルの敏感性を予測する属は、
a)Cutibacterium、
b)Cutibacterium及び/又はStaphylococcus、
c)Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/又はStenotrophomonas、
d)Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及び/又はUndibacterium、
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/又はXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0064】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの敏感性であり、低レベルの第1の特性は低レベルの敏感性であり、
a)高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの敏感性を予測する属は、Anaerococcus、Kocuria及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの敏感性を予測する属は、
Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/又はStenotrophomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacterium及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの敏感性を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0065】
いくつかの実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの水分量であり、低レベルの第1の特性は低レベルの水分量であり、高レベルの水分量を予測する属は、
a)Haemophilus及び/若しくはSnodgrassella、
b)Bacillus、Haemophilus及び/若しくはKocuria、
c)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/若しくはSnodgrassella、
d)Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/若しくはSnodgrassella、並びに/又は
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0066】
同じ又は異なる実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの水分量であり、低レベルの第1の特性は低レベルの水分量であり、低レベルの水分量を予測する属は、
a)Brochothrix及び/若しくはPseudomonas、
b)Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/若しくはStaphylococcus、
c)Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及び/若しくはUndibacterium、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0067】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの水分量であり、低レベルの第1の特性は低レベルの水分量であり、
a)高レベルの水分量を予測する属は、Haemophilus及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix及び/又はPseudomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、低水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの水分量を予測する属は、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0068】
いくつかの実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの褐色斑点であり、低レベルの第1の特性は低レベルの褐色斑点であり、高褐色斑点を予測する属は、
a)Eikenella、
b)Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas及び/若しくはBrevibacterium、
c)Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella及び/若しくはAerococcus、
d)Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella及び/若しくはXanthomonas、並びに/又は
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0069】
同じ又は異なる実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの褐色斑点であり、低レベルの第1の特性は低レベルの褐色斑点であり、
低褐色斑点を予測する属は、
a)Micrococcus及び/若しくはParacoccus、
b)Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/若しくはBergeyella、
c)Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/若しくはParacoccus、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0070】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの褐色斑点であり、低レベルの第1の特性は低レベルの褐色斑点であり、
a)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas及び/又はBrevibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella及び/又はAerococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)高レベルの褐色斑点を予測する属は、Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0071】
いくつかの実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの年齢であり、低レベルの第1の特性は低レベルの年齢であり、高レベルの年齢を予測する属は、
a)Eikenella及び/若しくはBrochothrix、
b)Eikenella、Aerococcus及び/若しくはGlutamicibacter、
c)Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/若しくはPantoea、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0072】
同じ又は異なる実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルの年齢であり、低レベルの第1の特性は低レベルの年齢であり、
低レベルの年齢を予測する属は、
a)Finegoldia、Lawsonella及び/若しくはPeptoniphilus、
b)Finegoldia及び/若しくはLawsonella、
c)Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及び/若しくはUndibacterium、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0073】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は、高レベルの年齢であり、低レベルの第1の特性は、低レベルの年齢であり、
a)高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella及び/又はBrochothrixのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia、Lawsonella及び/又はPeptoniphilusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella、Aerococcus及び/又はGlutamicibacterのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia及び/又はLawsonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)高レベルの年齢を予測する属は、
Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/又はPantoea
のいずれか1以上、又はすべてを含み、低レベルの年齢を予測する属は、Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0074】
いくつかの実施形態では、高レベルの第1の特性は、高レベルのバリア機能年齢であり、低レベルの第1の特性は、低レベルのバリア機能であり、低レベルのバリア機能を予測する属は、
a)Cutibacterium、
b)Eikenella及び/若しくはCutibacterium、
c)Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/若しくはVeillonella、並びに/又は
d)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。同じ又は異なる実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルのバリア機能年齢であり、低レベルの第1の特性は低レベルのバリア機能であり、高レベルのバリア機能を予測する属は、
a)Paracoccus及び/若しくはBrevundimonas、
b)Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及び/若しくはXanthomonas、
c)Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及び/若しくはBacillus、
d)Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及び/若しくはXanthomonas、並びに/又は
e)Acinetobacter、Actinobacillus、Aerococcus、Alloiococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Anaerococcus、Atopobium、Bacillus、Bergeyella、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Brochothrix、Campylobacter、Chryseobacterium、Cloacibacterium、Corynebacterium、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Enhydrobacter、Eubacterium、Exiguobacterium、Falsirhodobacter、Filifactor、Finegoldia、Frigoribacterium、Fusobacterium、Gemella、Glutamicibacter、Granulicatella、Haematobacter、Haemophilus、Klebsiella、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactobacillus、Lactococcus、Lautropia、Lawsonella、Leptotrichia、Micrococcus、Moraxella、Neisseria、Pantoea、Paracoccus、Paucibacter、Peptoniphilus、Photobacterium、Porphyromonas、Pseudomonas、Roseomonas、Serratia、Snodgrassella、Staphylococcus、Stenotrophomonas、Streptococcus、Turicella、Undibacterium、Veillonella及び/若しくはXanthomonas
のいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0075】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は高レベルのバリア機能年齢であり、低レベルの第1の特性は低レベルのバリア機能であり、
a)低レベルのバリア機能を予測する属は、Cutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、
高レベルのバリア機能を予測する属は、Paracoccus及び/又はBrevundimonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、
高レベルのバリア機能を予測する属は、Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、
高レベルのバリア機能を予測する属は、Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及び/又はBacillusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)低レベルのバリア機能を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/又はVeillonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
高レベルのバリア機能を予測する属は、Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0076】
特定の実施形態では、高レベルの第1の特性は、喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚であり、低レベルの第1の特性性は、喫煙にリンクされる低レベルの加齢皮膚であり、
喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚を予測する属は、
a)Micrococcus、Bacillus、Eikenella、Gemella、Corynebacterium、Finegoldia、Cutibacterium及び/又はAnaerococcus
を含む。特定の実施形態では、微生物叢は、チェック、前額部及び/又は頭皮で測定される。
【0077】
微生物プロファイルを取得するための選好は、本明細書及び上記に記載の通りであり、例えば、微生物ゲノムの領域を配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、本明細書の他の箇所に記載されるように、細菌ゲノムの該領域は、16S rRNA可変領域の領域、任意に、V3V4可変領域である。いくつかの実施形態では、増幅に使用されるプライマー及び/又は配列は、
順方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3'[配列番号1]及び
逆方向16Sプライマー:
5'-ATCGCCTACCGTGAC-バーコード-CGGTTACCTTGTTACGACTT-3'[配列番号2]
であるか、又は
16S-Mi341F順方向プライマー5'-CCTACGGGNGGCWGCAG-3'[配列番号3]及び16S-Mi805R逆方向プライマー5'-GACTACHVGGGTATCTAATCC-3'[配列番号4]
(Nは「任意の塩基」(A、T、G又はC)を意味し、Wは弱い=A又はTを表し、Mはアミノ=A又はCを表す)であり、
任意に、Nanopore技術が使用される場合、プライマーは配列番号1及び2であり、Illumina技術が使用される場合、プライマーは配列番号3及び4である。
【0078】
配列番号1及び2のプライマーは、全長16S(27F及び1492R位置に対応する)の増幅を可能にする。配列番号3及び4のプライマーは、およそ460bpのアンプリコンを生成する。
【0079】
いくつかの実例では、配列決定は、任意に、MiSeq装置を使用して、Illumina配列決定によって実行される。他の実例では、配列決定はnanopore配列決定技術を使用して実行される。
試料から微生物を培養することによって試験微生物プロファイルを生成することも可能である。一実施形態では、試験微生物プロファイルを取得する方法は、微生物シグネチャを生成するために使用された対照微生物プロファイルを取得するために使用された方法と同じである。
【0080】
微生物の選好は、本明細書の他の箇所に記載されている通りである。いくつかの実施形態では、微生物試料は、細菌、酵母及び真菌のいずれか1つ又は複数を含む。好ましくは、微生物試料は細菌を含む。
微生物プロファイルは、細菌、酵母及び/又は真菌のうちのいずれか1つ又は複数のプロファイルであり得、好ましくは微生物プロファイルは細菌プロファイルである。
【0081】
本明細書の開示から、本発明がまた、皮膚タイプを以下の特性の各々に類別するための方法を提供することは明らかであろう:
a)低レベルの敏感性、高レベルの敏感性、又は中間レベルの敏感性、
b)低レベルの皮脂、高レベルの皮脂、又は中間レベルの皮脂、
c)低レベルの水分量、高レベルの水分量、又は中間レベルの水分量、
d)低レベルの褐色斑点、高レベルの褐色斑点、又は中間レベルの褐色斑点、
e)低レベルの加齢皮膚、高レベルの加齢皮膚、又は中間レベルの加齢皮膚、
f)低レベルのバリア機能、高レベルのバリア機能、又は中間レベルのバリア機能。
いくつかの実施形態では、本方法は、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む:
Brevundimonas、Brochothrix、Corynebacterium、Cutibacterium、Eikenella、Finegoldia、Haemophilus、Kocuria、Lawsonella、Micrococcus、Neisseria、Paracoccus、Peptoniphilus、Pseudomonas及びSnodgrassella。
【0082】
本発明はまた、皮膚タイプを低レベルの敏感性、高レベルの敏感性、又は中間レベルの敏感性に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Corynebacterium、Kocuria及びCutibacterium、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacteriumを含み、
b)Anaerococcus、Kocuria、Snodgrassella、Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及びStenotrophomonas、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Anaerococcus、Kocuria及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/又はStenotrophomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Corynebacterium、Kocuria、Cutibacterium及びStaphylococcus、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Corynebacterium及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Cutibacterium及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas、Snodgrassella、Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及びUndibacterium、任意に、
高レベルの敏感性を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Corynebacterium、Filifactor、Kocuria、Roseomonas及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの敏感性を予測する属は、Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及びUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む。本発明はまた、皮膚タイプを低レベルの皮脂、高レベルの皮脂、又は中間レベルの皮脂に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Cutibacterium、Eikenella、Haemophilus、Kocuria及びNeisseria、任意に、
高皮脂を予測する属は、Cutibacterium及び/又はEikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低皮脂を予測する属は、Haemophilus、Kocuria、Neisseriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Cutibacterium、Eikenella、Haemophilus、Kocuria、Neisseria及びPaucibacter、任意に、
高皮脂を予測する属は、Cutibacterium及び/又はEikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低皮脂を予測する属は、
Haemophilus、Kocuria、Neisseria、Paucibacter
のいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus、Turicella、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas及びStreptococcus、任意に、
高皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus、Turicella、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及びBrochothix、任意に、
高レベルの皮脂を予測する属は、Actinobacillus、Anaerococcus、Bacillus、Cutibacterium、Eikenella、Peptoniphilus、Snodgrassella、Staphylococcus及び/又はTuricellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
並びに
低レベルの皮脂を予測する属は、Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/又はBrochothixのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0083】
本発明は、皮膚タイプを低レベルの水分量、高レベルの水分量、又は中間レベルの水分量に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Haemophilus、Snodgrassella、Brochothrix及びPseudomonas、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Haemophilus及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix及び/又はPseudomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及びStaphylococcus、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus及び/又はKocuriaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/又はSnodgrassella、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter、Snodgrassella、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及びStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas及び/又はStaphylococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
e)Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter、Snodgrassella、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及びUndibacterium、任意に、
高レベルの水分量を予測する属は、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/又はSnodgrassellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの水分量を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Pseudomonas、Serratia、Staphylococcus、Turicella及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0084】
本発明は、皮膚タイプを低レベルの褐色斑点、高レベルの褐色斑点、又は中間レベルの褐色斑点に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Eikenella、Micrococcus及びParacoccus、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas、Brevibacterium、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及びBergeyella、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Eikenella、Aerococcus、Xanthomonas及び/又はBrevibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella、Aerococcus、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及びBergeyella、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Brevibacterium、Eikenella及び/又はAerococcusのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/又はBergeyellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella、Xanthomonas、Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及びParacoccus、任意に、
高レベルの褐色斑点を予測する属は、Aerococcus、Brevibacterium、Eikenella、Klebsiella、Paucibacter、Turicella及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの褐色斑点を予測する属は、Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/又はParacoccusのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0085】
本発明はまた、皮膚タイプを低レベルの年齢、高レベルの年齢、又は中間レベルの年齢に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Eikenella、Brochothrix、Finegoldia、Lawsonella及びPeptoniphilus、任意に、
高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella及び/又はBrochothrixのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia、Lawsonella及び/又はPeptoniphilusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Eikenella、Aerococcus、Glutamicibacter、Finegoldia及びLawsonella、任意に、
高レベルの年齢を予測する属は、Eikenella、Aerococcus及び/又はGlutamicibacterのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの年齢を予測する属は、Finegoldia及び/又はLawsonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter、Pantoea、Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及びUndibacterium、任意に、
高レベルの年齢を予測する属は、Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/又はPantoeaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
低レベルの年齢を予測する属は、Bergeyella、Cloacibacterium、Finegoldia、Lawsonella、Peptoniphilus及び/又はUndibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0086】
本発明はさらに、皮膚タイプを低レベルのバリア機能、高レベルのバリア機能、又は中間レベルのバリア機能に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Cutibacterium、Paracoccus及びBrevundimonas、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Cutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Paracoccus及び/又はBrevundimonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
b)Eikenella、Cutibacterium、Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及びXanthomonas、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Micrococcus、Paracoccus、Brevundimonas、Bacillus及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含み、
c)Eikenella、Cutibacterium、Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及びBacillus、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Eikenella及び/又はCutibacteriumのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Enhydrobacter、Micrococcus、Brevundimonas、Paracoccus及び/又はBacillusのいずれか1以上、又はすべてを含み、
d)Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella、Veillonella、Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及びXanthomonas、任意に、
低レベルのバリア機能を予測する属は、Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/又はVeillonellaのいずれか1以上、又はすべてを含み、並びに
高レベルのバリア機能を予測する属は、Aerococcus、Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Chryseobacterium、Enhydrobacter、Filifactor、Granulicatella、Klebsiella、Micrococcus、Paracoccus、Paucibacter及び/又はXanthomonasのいずれか1以上、又はすべてを含む。
【0087】
本発明はさらに、皮膚タイプを、喫煙にリンクされる低レベルの加齢皮膚、喫煙にリンクされる高レベルの加齢皮膚、又は喫煙にリンクされる中間レベルの加齢皮膚に類別する方法であって、皮膚微生物試料中における、以下の属の各々からの細菌の存在率、存在量、又は存在を決定することを含む方法を提供する:
a)Micrococcus、Bacillus、Eikenella、Gemella、Corynebacterium、Finegoldia、Cutibacterium及び/又はAnaerococcus。
【0088】
これらの方法のいくつかの実施形態では、各属の存在率、存在量又は存在を決定することは、微生物ゲノム、任意に細菌ゲノムの領域を配列決定することを含む。配列決定の選好は他の箇所に記載され、Illumina配列決定を含み、任意にMiSeq装置を使用し、又はnanopore配列決定技術により、任意に16S rRNA可変領域、任意にV3V4可変領域に関する。
【0089】
方法の他の特徴、例えば試料のタイプ及び試料を取得する方法の選好は、他の箇所に記載されている。
上述のように、いくつかの実例では、微生物シグネチャは、試験試料が比較されなければならない閾値比を含む。これらの方法のいくつかの実施形態では、方法は、高レベルの特性に関連付けられたすべての属の総存在量の、低レベルの特性に関連付けられたすべての属の総存在量に対する比を決定することを含む。
いくつかの実施形態では、皮膚微生物試料は、皮膚、好ましくは頬などの対象の顔の皮膚から、例えばスワブ採取によって取得されている。
【0090】
本明細書に記載の方法は、対象が高又は低レベルの特定の特性を有する皮膚を有するかに関する予測を行うことを可能にする。この予測に基づいて、特定の美容的処置、例えば保湿剤の使用を助言することが可能であり、これは、特性が不利に高すぎるか又は低すぎること、例えば低レベルの水分量、又は高レベルの皮脂が見出された場合、特性に対処することができると考えられる。水分量のレベルを増加させ、皮脂のレベルを低減することが有利であろう。どの特性が不利であり、調節を要求すると考えられるかは、当業者に公知である。
【0091】
したがって、本発明はまた、本明細書に記載の方法に従って、対象が高レベルの第1の皮膚特性又は低レベルの第1の皮膚特性を有するかを予測することと、第1の皮膚特性の状態を改善するように選択された化粧品を用いて皮膚に処置を施すこととを含む、美容的処置の方法を提供する。
【0092】
適切な化粧品は当業者に公知である。以下は、非網羅的なリストである。
皮膚の年齢を改善するために、
加齢徴候に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標)(グリセリン(及び)水(及び)マンノースリン酸ナトリウム(及び)マンノース);Brightenyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ジグルコシル没食子酸);Revivyl(商標)(プロパンジオール(及び)Orobanche Rapum抽出物);Synchronight(商標)(グリセリン(及び)ベタイン(及び)水(及び)Gardenia Jasminoides果実抽出物(及び)マルトデキストリン);Vetivyne(商標)(Vetiveria Zizanoides根抽出物(及び)プロパンジオール(及び)水);Yogurtene(登録商標)Balance(イヌリン(及び)ヨーグルト粉末)
【0093】
加齢徴候に対する証明された活性を有する活性物質:
BlurHD(登録商標)(ジプロピレングリコール(及び)Gardenia Florida果実抽出物);Commipheroline(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Commiphora Mukul樹脂抽出物);Depollutine(登録商標)(水(及び)アルギニンPCA(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物);Easyliance(登録商標)2.0(Acacia Senegalガム(及び)リゾビアンガム);Eau de Source Marine(海底湧水)(海水);Eau Vitale(商標)d'Algue Bleue(水(及び)Spirulina Platensis抽出物)
Ellagi-C(商標)(プロパンジオール(及び)Anogeissus LeiocarpA樹皮抽出物);Hyalusphere(登録商標)(封入ヒアルロン酸ナトリウム);Hydrintense(商標)(海水(及び)プロパンジオール(及び)Porphyridium Cruentum抽出物)Inoveol(登録商標)CAFA(水(及び)カフェイルグルコシド)Inoveol(登録商標)EGCG(水(及び)没食子酸エピガロカテキングルコシド);Inoveol(登録商標)OLEU(水(及び)オロイロペイニルグルコシド);メガサン(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物;Neodermyl(商標)(グリセリン(及び)水(及び)メチルグルコシドリン酸(及び)(リシネート/プロリネート)銅);NovHyal(商標)Biotech G(グリセリン(及び)水(及び)アセチルグルコサミンリン酸二ナトリウム);PrimalHyal 3K(加水分解ヒアルロン酸);PrimalHyal(商標)50(加水分解ヒアルロン酸);PrimalHyal(商標)Gold(水(及び)PEG-8カプリル酸/カプリン酸グリセリド(及び)ヒアルロン酸ナトリウム(及び)オクチルドデセス-25);PrimalHyal(商標)Ultrafiller(アセチル化ヒアルロン酸ナトリウム);Redens'In(商標)(Commiphora Mukul樹脂抽出物(及び)封入ヒアルロン酸ナトリウム);Rosmarinyl(商標)グルコシド(水(及び)ロスマリニルグルコシド)
Rubixyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ヘキサペプチド-48 HCL)
Softalia(登録商標)(Fusanus Spicatus核油);StimulHyal(登録商標)(ケトグルコン酸カルシウム);Tightenyl(商標)(グリセリン(及び)水(及び)アセチルグルコサミンリン酸二ナトリウム(及び)グルクロン酸ナトリウム(及び)硫酸マグネシウム);Unichondrin(商標)ATP(水(及び)ブチレングリコール(及び)加水分解植物タンパク質(及び)アデノシン三リン酸(及び)コンドロイチン硫酸ナトリウム);Unilactamin(商標)L-17(水(及び)ブチレングリコール(及び)アデノシン三リン酸(及び)加水分解乳タンパク質(及び)ナイアシンアミド);Unilucent(商標)HR-14(水(及び)Haberlea Rhodopensis葉抽出物);Unilucent(商標)PA-13(三酢酸パンテニル(及び)アセチルRheum Rhaponticum根抽出物);Uniprosyn(登録商標)PS-18(水(及び)ブチレングリコール(及び)ナイアシンアミド(及び)アデノシン三リン酸(及び)加水分解オーツ麦タンパク質);Uniprotect(登録商標)PT-3(三酢酸パンテニル(及び)リノール酸エチル(及び)オレイルアルコール(及び)トコフェロール);Unirepair(登録商標)T-43(水(及び)ブチレングリコール(及び)アセチルチロシン(及び)プロリン(及び)加水分解植物タンパク質(及び)アデノシン三リン酸);Unisteron(商標)Y-50(オレイルアルコール(及び)Dioscorea Villosa(自然薯)根抽出物(及び)ヘキシルデカノール(及び)Glycine Soja(ダイズ)ステロール);Unisurrection(商標)S-61(水(及び)Beta Vulgaris(ビーツ)根抽出物(及び)グリセリン(及び)Haberlea Rhodopensis葉抽出物(及び)酵母抽出物);Yogurtene(登録商標)(ヨーグルト粉末)。
【0094】
-敏感性状態を改善する
敏感性状態に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物資:
Sensityl(商標)(水(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物(及び)ペンチレングリコール)
【0095】
敏感性状態に対する証明された活性を有する活性物質:
Biogomm'age(商標)UEシリーズ(セルロース(及び)ヒドロキシプロピルセルロース(及び)酢酸トコフェリル(及び)CI77007);Biogomm'age(商標)WDシリーズ(セルロース(及び)ヒドロキシプロピルセルロース(及び)パンテニルトリアセタート)、BisaboLife(商標)(ビサボロール);D-パンテニルトリアセタート(パンテニルトリアセタート);Endothelyol(商標)(グリセリン(及び)ロスマリニルグルコシド(及び)カフェイルグルコシド(及び)没食子酸グルコシド);Erasyal(商標)(グリセリン(及び)アセチル二ナトリウム(及び)グルコサミンリン酸(及び)カフェイルグルコシド);Grevilline(商標)PF(グリセリン(及び)水(及び)Skeletonema Costatum抽出物);Inoveol(登録商標)CAFA(水(及び)カフェイルグルコシド);Inoveol(登録商標)EGCG(水(及び)没食子酸エピガロカテキングルコシド)
Inoveol(登録商標)OLEU(水(及び)オロイロペイニルグルコシド);Mariliance(商標)(水(及び)プロパンジオール(及び)Rhodosorus Marinus抽出物);Neurophroline(商標)(水(及び)プロパンジオール
(及び)Tephrosia Purpurea種子抽出物);Ocaline(商標)(海水(及び)水(及び)Cucurbita Pepo(カボチャ)種子抽出物(及び)クエン酸);Rosmarinyl(商標)グルコシド(水(及び)ロスマリニルグルコシド);Soothex(登録商標)(イソステアリルアルコール(及び)Boswellia Serrataガム);Uniglucan(商標)G-51(水(及び)ブチレングリコール(及び)酵母多糖類);Uniprotect(登録商標)PT-3(三酢酸パンテニル(及び)リノール酸エチル(及び)オレイルアルコール(及び)トコフェロール);Unirepair(登録商標)T-43(水(及び)ブチレングリコール(及び)
アセチルチロシン(及び)プロリン(及び)加水分解植物タンパク質(及び)アデノシン三リン酸);Unisooth(商標)EG-28(水(及び)没食子酸プロピル(及び)没食子酸グルコシド(及び)没食子酸エピガロカテキングルコシド);Unisooth(商標)PN-47(三酢酸パンテニル(及び)ナリンゲニン);Unisooth(商標)ST-32(水(及び)ペンチレングリコール(及び)Tamarindus Indica種子ガム(及び)ステビオシド);Unispheres(登録商標)Colour boosting(CI 77499(及び)マンニトール(及び)セルロース(及び)Carapa Guaianensis種子油(及び)ヒドロキシプロピルメチルセルロース(及び)CI 77891(及び)CI 77289);Unispheres(登録商標)Flashtone G(マンニトール(及び)セルロース(及び)硫酸バリウム(及び)アクリレートコポリマー(及び)シリカ(及び)ヒドロキシプロピルメチルセルロース)
【0096】
-皮膚バリア機能を改善する(推奨は、LOW水分量プロファイルの場合も同じであろう):
バリア機能に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標)(グリセリン(及び)水(及び)マンノースリン酸ナトリウム(及び)マンノース)
Brightenyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ジグルコシル没食子酸)
Sensityl(商標)(水(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物(及び)ペンチレングリコール)
Vetivyne(商標)(Vetiveria Zizanoides根抽出物(及び)プロパンジオール(及び)水)
Yogurtene(登録商標)Balance(イヌリン(及び)ヨーグルト粉末)
【0097】
バリア機能に対する証明された活性を有する活性物質:
Abdoliance(商標)(Paullinia Cupana種子抽出物(及び)封入ヘスペレチン)
Appygreen(商標)812(水(及び)デシルグルコシド(及び)キシロース(及び)デシルアルコール)
Axolight(登録商標)(水(及び)加水分解小麦粉)、B-Lightyl
Bamboosilk(Bambusa arundinacea茎粉末);Biogomm'age(商標)UEシリーズ
(セルロース(及び)ヒドロキシプロピルセルロース(及び)トコフェリルアセタート(及び)CI77007)
Biogomm'age(商標)WDシリーズ(セルロース(及び)ヒドロキシプロピルセルロース(及び)パンテニルトリアセタート);BisaboLife(商標)(ビサボロール);BlurHD(登録商標)(ジプロピレングリコール(及び)Gardenia Florida果実抽出物);Ceramide II/Uniblend(商標)2G(セラミドNG、水(及び)PEG-7グリセリルココエート(及び)PEG60水素化ヒマシ油(及び)セラミドNG(及び)グルコノラクトン);Commipheroline(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Commiphora Mukul樹脂抽出物);Cristalhyal(登録商標)Range(ヒアルロン酸ナトリウム);D-パンテニルトリアセタート(パンテニルトリアセタート);Depollutine(登録商標)(水(及び)アルギニンPCA(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物);Easyliance(登録商標)2.0(Acacia Senegalガム(及び)リゾビアンガム)
Eau de Source Marine(海底湧水)海水;Eau Vitale(商標)d'Algue Bleue
(水(及び)Spirulina Platensis抽出物);Ellagi-C(商標)(プロパンジオール(及び)Anogeissus LeiocarpA樹皮抽出物);Endothelyol(商標)(グリセリン(及び)ロスマリニルグルコシド(及び)カフェイルグルコシド(及び)没食子酸グルコシド);Erasyal(商標)(グリセリン(及び)アセチル二ナトリウム
(及び)グルコサミンリン酸(及び)カフェイルグルコシド)
Evercool(登録商標)Skin(メンチルPCA(及び)ラクトアミドMEA(及び)メンタンカルボキサミドエチルピリジン);Exfoliance Range(Prunus Armeniaca(アプリコット)種子粉末、Oryza Sativa(イネ)外皮粉末);Glossyliance(商標)(水(及び)Saccharum Officinarum(サトウキビ)抽出物(及び)Citrus Limon(レモン)皮抽出物(及び)乳酸(及び)リンゴ酸(及び)クエン酸);Grevilline(商標)PF(グリセリン(及び)水(及び)Skeletonema Costatum抽出物)
Hairsphere;Hyalusphere(登録商標)(封入ヒアルロン酸ナトリウム);Hydreis(商標)(水(及び)加水分解ベータ-グルカン);Hydrintense(商標)(海水(及び)プロパンジオール(及び)Porphyridium Cruentum抽出物);Inoveol(登録商標)CAFA(水(及び)カフェイルグルコシド)
Inoveol(登録商標)EGCG(水(及び)没食子酸エピガロカテキングルコシド);Inoveol(登録商標)OLEU(水(及び)オロイロペイニルグルコシド);K-phyto[SC]Camellia
K-phyto[PP]GHK;カラニヤ油(Pongamia Glabra種子油);ケンジ油(Aleurites Moluccanus種子油);Lipsphere;Lithocosmetics(トルマリン、ネフライト粉末、サファイア粉末、ルビー粉末、ダイヤモンド粉末)
Mariliance(商標)(水(及び)プロパンジオール(及び)Rhodosorus Marinus抽出物)
Megassane(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物)
Muciliance(登録商標)Fruit(ガラクタル酸);Neodermyl(商標)(グリセリン(及び)水(及び)
メチルグルコシドリン酸(及び)(リシネート/プロリネート)銅)
Neurophroline(商標)(水(及び)プロパンジオール(及び)Tephrosia Purpurea種子抽出物)
NovHyal(商標)Biotech G(グリセリン(及び)水(及び)アセチルグルコサミンリン酸二ナトリウム);テリハボク油(Calophyllum Inophyllum種油);Ocaline(商標)
(海水(及び)水(及び)Cucurbita Pepo(カボチャ)種子抽出物(及び)クエン酸);Pongamia抽出物Pongamia Glabra種子油;PrimalHyal 3K加水分解ヒアルロン酸
;PrimalHyal(商標)300加水分解ヒアルロン酸
PrimalHyal(商標)50加水分解ヒアルロン酸
PrimalHyal(商標)Gold水(及び)PEG-8カプリル酸/カプリン酸グリセリド(及び)ヒアルロン酸ナトリウム(及び)オクチルドデセス-25
PrimalHyal(商標)Ultrafiller;Pro-DG(商標)水(及び)Dysmorphococcus Globosus抽出物;Questice(登録商標)Range「Questice Liquid:メンチルPCA;Questice Plus:メンチルPCA(及び)メントール(及び)ジプロピレングリコール」;Redensyl(商標)水(及び)グリセリン(及び)
メタ重亜硫酸ナトリウム(及び)グリシン(及び)Larix Europaea木材抽出物(及び)塩化亜鉛(及び)Camellia Sinensis葉抽出物;Redens'In(商標)Commiphora Mukul
樹脂抽出物(及び)封入ヒアルロン酸ナトリウム;ResistHyal(商標)水(及び)
加水分解ヒアルロン酸(及び)ヒアルロン酸ナトリウム
Revivyl(商標)プロパンジオール(及び)Orobanche Rapum抽出物;Rosmarinyl(商標)グルコシド水
(及び)ロスマリニルグルコシド;Rubixyl(登録商標)水(及び)グリセリン(及び)ヘキサペプチド-48 HCL
Safester(商標)A-75リノール酸エチル;Sens'Hyal(商標)水(及び)リゾビアンガム(及び)ヒアルロン酸ナトリウム;Silkalun(商標)カリウムミョウバン(及び)ステアリン酸マグネシウム;Sinodor(登録商標)シトロネリルメチルクロトネート;Softalia(登録商標)Fusanus Spicatus核油;Softolive(商標)水素化
エチルヘキシルオリベート(及び)水素化オリーブオイル不鹸化物
Soligel(商標)リゾビアンガム;Soothex(登録商標)イソステアリルアルコール(及び)Boswellia Serrataガム;Sophogreen(商標)Plus水(及び)加水分解Candida Bombicola抽出物;Sopholiance(商標)S
Candida bombicola(及び)グルコース(及び)ナタネ油脂肪酸メチル発酵物
StimulHyal(登録商標)ケトグルコン酸カルシウム;Synchronight;Syner-GX(商標)(Cyamopsis Tetragonoloba)
Tightenyl(商標);Unichondrin(商標)ATP水(及び)ブチレングリコール(及び)加水分解植物タンパク質(及び)アデノシン三リン酸(及び)コンドロイチン硫酸ナトリウム
Unicontrozon(商標)C-49水(及び)プロピレングリコール(及び)Citrus Lemon(レモン)抽出物(及び)Fumaria Officinalis花/葉/茎抽出物(及び)フマル酸
Uniglucan(商標)G-51水(及び)ブチレングリコール(及び)酵母多糖類
Unilactamin(商標)L-17水(及び)ブチレングリコール(及び)アデノシン三リン酸(及び)加水分解乳タンパク質(及び)ナイアシンアミド;Unilucent(商標)HR-14水(及び)Haberlea Rhodopensis葉抽出物
Unilucent(商標)PA-13パンテニルトリアセタート(及び)アセチルRheum Rhaponticum根抽出物
Unimer U-6トリアコンタニルPVP;Unimer U-15 VP/エイコセンコポリマー;Unimer U-151 VP/ヘキサデセンコポリマー;Unimer U-1946 VP/ヘキサデセンコポリマー(及び)オクチルドデカノール;Unimoist(商標)U-125 G水(及び)グリセリン(及び)尿素(及び)糖加水分解物(及び)アスパラギン酸マグネシウム(及び)グリシン(及び)アラニン(及び)クレアチン
Uninontan(商標)U-34水(及び)プロピレングリコール(及び)クエン酸ナトリウム(及び)Citrus Limon(レモン)果実抽出物(及び)Cucumis Sativus(キュウリ)果実抽出物
Unipertan(商標)水(及び)ブチレングリコール(及び)アセチルチロシン(及び)加水分解植物タンパク質(及び)リボフラビンアデノシン三リン酸;Uniprosyn(登録商標)PS-18
(加水分解オーツ麦タンパク質);Uniprotect(登録商標)PT-3パンテニルトリアセタート(及び)リノール酸エチル(及び)オレイルアルコール(及び)トコフェロール;Unireduce(登録商標);Unirepair(登録商標);Unishapes;Unisooth(商標)
Unisooth(商標)PN-47;Unisooth(商標)ST-32;Unispheres(登録商標)Range;Unispheres(登録商標)Bicolour
Unispheres(登録商標)Flashtone Gマンニトール(及び)セルロース(及び)硫酸バリウム(及び)アクリレートコポリマー(及び)シリカ(及び)ヒドロキシプロピルメチルセルロース
Unispheres(登録商標)Flashwhite
Unisteron(商標)Y-50オレイルアルコール(及び)Dioscorea Villosa(自然薯)根抽出物(及び)ヘキシルデカノール(及び)Glycine Soja(ダイズ)ステロール
Unisurrection(商標)S-61水(及び)Beta Vulgaris(ビーツ)根抽出物(及び)グリセリン(及び)Haberlea Rhodopensis葉抽出物(及び)酵母抽出物
Unitamuron(商標)H-22水(及び)ペンチレングリコール(及び)Tamarindus Indica種子ガム
Unititamer(商標)T-40二酸化チタン(及び)トリアコンタニルPVP(及び)イソエイコサン
Unitrienol(商標)T-27ファルネシルアセタート(及び)ファルネソール(及び)パンテニルトリアセタート
Uvaxine(商標)水(及び)グリセリン(及び)ポリダチングルコシド
Vegetan(登録商標)ジヒドロキシアセトン;Vegetan(登録商標)FLジヒドロキシアセトン(及び)水;Vegetan(登録商標)FL Creationジヒドロキシアセトン(及び)水(及び)パルファム(及び)ポリソルベート20(及び)カプリリル/カプリル小麦ふすま/麦わらグリコシド;Vegetan(登録商標)Gold;Vegetan(登録商標)Life
Vitasphere;Wakamine(商標)水(及び)Undaria Pinnatifida抽出物
Whitesphere(商標)Glycyrrhiza Glabra(カンゾウ)根抽出物(及び)リン酸アスコルビルマグネシウム(及び)封入Undaria Pinnatifida抽出物
Xyliance(商標)セテアリル麦わらグリコシド(及び)セテアリルアルコール;Yogurtene(登録商標)ヨーグルト粉末
【0098】
-皮脂量を低減する:
皮脂制御に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Brightenyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ジグルコシル没食子酸)
Sopholiance(商標)S(Candida bombicola(及び)グルコース(及び)ナタネ油脂肪酸メチル発酵物(及び)水)
【0099】
皮脂制御に対する証明された活性を有する活性物質:
Bamboosilk(Bambusa arundinacea茎粉末);Erasyal(商標)(グリセリン(及び)アセチル二ナトリウム(及び)グルコサミンリン酸(及び)カフェイルグルコシド);K-phyto [PP] GHK(水(及び)カフェオイルトリペプチド-1);PrimalHyal(商標)300(加水分解ヒアルロン酸)
Safester(商標)A-75(リノール酸エチル);Unireduce(登録商標)R-35(ファルネシルアセタート(及び)パンテニルトリアセタート(及び)トコフェリルアセタート);Unisteron(商標)Y-50(オレイルアルコール(及び)Dioscorea Villosa(自然薯)根抽出物(及び)ヘキシルデカノール(及び)Glycine Soja(ダイズ)ステロール);Unitrienol(商標)T-27(ファルネシルアセタート(及び)ファルネソール(及び)パンテニルトリアセタート)
【0100】
-暗色斑点の素因を改善する:
暗色斑点調節に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標)(グリセリン(及び)水(及び)マンノースリン酸ナトリウム(及び)マンノース)
Brightenyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ジグルコシル没食子酸)
【0101】
暗色斑点調節に対する証明された活性を有する活性物質:
Axolight(登録商標)(水(及び)加水分解小麦粉);B-Lightyl(商標)(Himanthalia Elongata抽出物)
Ellagi-C(商標)(Anogeissus LeiocarpA樹皮抽出物);Megassane(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物);Neurophroline(商標)(Tephrosia Purpurea種子抽出物);Unilucent(商標)HR-14(Haberlea Rhodopensis葉抽出物)
Unilucent(商標)PA-13(アセチルRheum Rhaponticum根抽出物);Uninontan(商標)U-34(Citrus Limon(レモン)果実抽出物(及び)Cucumis Sativus(キュウリ)果実抽出物)
Unispheres(登録商標)Flashwhite(Citrus Limon(レモン)果実抽出物(及び)Cucumis Sativus(キュウリ)果実抽出物(及び)カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)グリセリルステアレートシトレート(及び)デシルグルコシド(及び)ヒドロキシプロピルメチルセルロース);Wakamine(商標)(水(及び)Undaria Pinnatifida抽出物);Whitesphere(商標)(Glycyrrhiza Glabra(カンゾウ)根抽出物(及び)リン酸アスコルビルマグネシウム(及び)封入Undaria Pinnatifida抽出物)
【0102】
本明細書に記載される方法は、どの微生物、例えばどの細菌属が高又は低レベルの特性に関連付けられるかを実証することができるので、微生物プロファイルの任意の変化を監視して、美容的処置が所望の効果を有するかを決定することが可能である。例えば、低水分量皮膚の微生物プロファイルが美容的処置後に高水分量皮膚の微生物プロファイルに向かって移り変わるかを監視することが可能である。
【0103】
したがって、本発明は、美容的処置の有効性を監視する方法であって、
(i)対象から採取された第1の試験皮膚微生物試料を提供し、前述された実施形態のいずれかの方法に従って、対象が高レベルの少なくとも第1の皮膚特性、低レベルの少なくとも第1の皮膚特性、又は中間レベルの少なくとも第1の皮膚特性を有するかを予測することと、
(ii)少なくとも1つの特性のレベルを調節するように選択された化粧品を用いて皮膚に処置を施すことと、
(iii)対象から採取された第2の試験皮膚微生物試料を提供し、前述された実施形態のいずれかの方法に従って、対象が高レベルの少なくとも第1の皮膚特性、低レベルの少なくとも第1の皮膚特性、又は中間レベルの少なくとも第1の皮膚特性を有するかを予測することと、
(iv)少なくとも第1の皮膚特性のレベルが望ましいように調節されたかを決定することと
を含む、方法を提供する。
【0104】
本方法の特徴、例えば皮膚特性の選好は、他の箇所に記載された通りである。
本発明はまた、ヒトの皮膚タイプの少なくとも1つの予測される特性に関するデータを含有するデータキャリアを準備する方法であって、前述された実施形態のいずれか1つの方法を実施することと、データキャリアに結果を記録することとを含む、方法を提供する。
【0105】
本発明はまた、前述された実施形態のいずれかの細菌属の組み合わせのいずれか1つ又は複数のゲノムの固有領域を増幅するように設計された、オリゴヌクレオチドを含むキットオブパーツを提供する。
【0106】
本発明はまた、前述された実施形態のいずれかの細菌属の組み合わせのいずれか1つ又は複数の存在及び/又は存在量を検出するように設計された、プローブセットを含むキットオブパーツを提供する。
【0107】
本発明はまた、前述された実施形態のいずれかの細菌属の組み合わせのいずれか1つ又は複数の存在率、存在量又は存在を検出することができる携帯型装置を提供する。いくつかの実施形態では、装置は、対象の皮膚から微生物試料を採取することができる。いくつかの実施形態では、装置は、試験試料中の細菌属の組み合わせの存在率、存在量、又は存在を所定の微生物シグネチャと比較し、対象が高レベルの第1の皮膚特性、中間レベルの第1の皮膚特性、又は低レベルの第1の皮膚特性を有するかに関する予測を作成することができる。いくつかの実施形態では、装置は、予測に基づいて提案された美容的処置を表示する。
【0108】
本発明は、本明細書に記載されるような、又は本発明の方法のいずれかによって決定されるような微生物シグネチャを提供する。
【0109】
本発明はまた、以下の細菌属の組み合わせのいずれか1つ又は複数を含む美容的組成物を提供する:
a)Haemophilus、Kocuria及び/若しくはNeisseria、
b)Haemophilus、Kocuria、Neisseria及び/若しくはPaucibacter、
c)Acinetobacter、Brachybacterium、Brevibacterium、Brevundimonas、Chryseobacterium、Fusobacterium、Gemella、Haematobacter、Haemophilus、Kocuria、Lachnoanaerobaculum、Lactococcus、Leptotrichia、Neisseria、Paracoccus、Paucibacter、Photobacterium、Porphyromonas、Roseomonas、Streptococcus及び/若しくはBrochothix、
d)Cutibacterium、
e)Cutibacterium及び/若しくはStaphylococcus、
f)Bacillus、Cutibacterium、Dolosigranulum、Eikenella、Staphylococcus及び/若しくはStenotrophomonas、
g)Bacillus、Campylobacter、Cutibacterium、Delftia、Dolosigranulum、Eikenella、Frigoribacterium、Glutamicibacter、Moraxella、Serratia、Staphylococcus、Stenotrophomonas及び/若しくはUndibacterium、
h)Haemophilus及び/若しくはSnodgrassella、
i)Bacillus、Haemophilus及び/若しくはKocuria、
j)Bacillus、Haemophilus、Kocuria、Paucibacter及び/若しくはSnodgrassella、
k)Allorhizobium、Amaricoccus、Bacillus、Brevundimonas、Falsirhodobacter、Haemophilus、Kocuria、Lautropia、Paucibacter及び/若しくはSnodgrassella、
l)Micrococcus及び/若しくはParacoccus、
m)Kocuria、Micrococcus、Paracoccus及び/若しくはBergeyella、
n)Alloiococcus、Bergeyella、Exiguobacterium、Kocuria、Micrococcus及び/若しくはParacoccus、
o)Eikenella及び/若しくはBrochothrix、
p)Eikenella、Aerococcus及び/若しくはGlutamicibacter、
q)Aerococcus、Atopobium、Bacillus、Brachybacterium、Brochothrix、Chryseobacterium、Eikenella、Eubacterium、Glutamicibacter及び/若しくはPantoea、
r)Cutibacterium、
s)Eikenella及び/若しくはCutibacterium、並びに/又は
t)Brochothrix、Cutibacterium、Eikenella、Lactobacillus、Turicella及び/若しくはVeillonella。
(a)~(c)の組み合わせは、皮脂レベルを低下させるのに役立つと考えられるため、本方法によって高レベルの皮脂を有すると識別された対象に有用であると考えられる。
(d)~(g)の組み合わせは、敏感性レベルを低下させるのに役立つと考えられるため、本方法によって高レベルの敏感性を有すると識別された対象に有用であると考えられる。
(h)~(k)の組み合わせは、水分量レベルを増加させるのに役立つと考えられるため、本方法によって低レベルの水分量を有すると識別された対象に有用であると考えられる。
(l)~(n)の組み合わせは、褐色斑点レベルを低下させるのに役立つと考えられるため、本方法によって高レベルの褐色斑点を有すると識別された対象に有用であると考えられる。
(o)~(q)の組み合わせは、皮膚の見かけの年齢レベルを低下させるのに役立つと考えられるため、本方法によって加齢又は早期加齢皮膚(すなわち、高レベルの年齢、又は真の年齢と比較されてより高レベルの年齢)を有すると識別された対象に有用であると考えられる。
(r)~(t)の組み合わせは、皮膚バリアレベルを増加させるのに役立つと考えられるため、本方法によって低レベルの皮膚バリア機能を有すると識別された対象に有用であると考えられる。
【0110】
本明細書における、明確に以前に公開された文書のリスト又は議論は、その文書が最新技術の一部であるか、又は共通の一般知識であるという承認として必ずしも解釈されるべきではない。
本発明の所与の態様、特徴又はパラメータの選好及び選択肢は、文脈が他を指し示さない限り、本発明の他のすべての態様、特徴及びパラメータのありとあらゆる選好及び選択肢と組み合わせて開示されていると見なされるべきである。
図面では、TEWLレベルの文脈におけるLOWは、高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
【図面の簡単な説明】
【0111】
図1-1】異なる特性を有する皮膚の微生物プロファイルを示す図である。斜線の太字で示されている属は、高レベルの特性(例、高レベルの皮脂)に関連付けられた属であり、非太字の斜線なしで示されている属は、低レベルの同じ状態に関連付けられた属である。A)皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。
図1-2】B)年齢評価に関係のある微小生命体。C)敏感性評価に関係のある微小生命体。
図1-3】D)斑点レベル評価に関係のある微小生命体。E)水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。
図1-4】F)TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
【0112】
図2-1】ランダムフォレスト分析を実行するために、上記の倍率変化アプローチで識別された細菌が使用される図である。この図は、Illumina MiSeq配列決定の使用において各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す。A)皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。
図2-2】B)年齢評価に関係のある微小生命体。
図2-3】C)敏感性評価に関係のある微小生命体。
図2-4】D)斑点レベル評価に関係のある微小生命体。
図2-5】E)水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。
図2-6】F)TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
【0113】
図3】Illumina MiSeq配列決定の使用において皮膚タイプを定義するための主要な関連細菌、及び各皮膚パラメータのシグネチャに関連付けられた精度を示す図である。
図4-1】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す図である。皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。年齢評価に関係のある微小生命体。敏感性評価に関係のある微小生命体。斑点レベル評価に関係のある微小生命体。水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
図4-2】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す図である。皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。年齢評価に関係のある微小生命体。敏感性評価に関係のある微小生命体。斑点レベル評価に関係のある微小生命体。水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
図4-3】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す図である。皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。年齢評価に関係のある微小生命体。敏感性評価に関係のある微小生命体。斑点レベル評価に関係のある微小生命体。水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
図4-4】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す図である。皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。年齢評価に関係のある微小生命体。敏感性評価に関係のある微小生命体。斑点レベル評価に関係のある微小生命体。水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
図4-5】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す図である。皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。年齢評価に関係のある微小生命体。敏感性評価に関係のある微小生命体。斑点レベル評価に関係のある微小生命体。水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
図4-6】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す図である。皮脂レベル評価に関係のある微小生命体。年齢評価に関係のある微小生命体。敏感性評価に関係のある微小生命体。斑点レベル評価に関係のある微小生命体。水分量レベルの評価に関係のある微小生命体。TEWL評価に関係のある微小生命体-TEWLレベルの文脈におけるLOWは高レベルのバリア機能を指し示し、TEWLレベルの文脈におけるHIGHは低レベルのバリア機能を指し示す。
【0114】
図5】Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出された属に限定する際に、皮膚タイプを定義するための関連細菌、及び各皮膚パラメータのシグネチャに関連付けられた精度を示す図である。
図6】ボランティアAのNanoporeリードの分類学的割り当ての図である。
図7】ボランティアAのNanoporeリードの分類学的割り当ての図である。
【0115】

実施例1
方法
試料は、PCT出願PCT/EP20201075530に従って、以下に記載されるように処理された。
微生物叢シグネチャを定義するために、異なる年齢、皮膚敏感性、水分量、皮脂及び暗色斑点レベルを報告する白人女性の頬に対してスワブ採取が実行された。1群あたり最低17人のボランティアが含まれていた(低水分量群、高皮脂量群)。研究開始前に書面によるインフォームドコンセントが取得された。到着時に、ボランティアは、試料収集前に、管理された環境(20℃、相対湿度45~50%)に最低10分間入れられた。
【0116】
同じパラメータで対抗する2つの群間で交絡因子は考えることができないため、群を設計し、研究される性質における群間の差を制限した。「高皮膚敏感性群」対「正常敏感性群」の例を考えると、これら2つの群の間で年齢、水分量、皮脂及び斑点のレベルの項目で有意差はなく、唯一の有意差は皮膚敏感性のレベルである(有意差はp値<0.05*を有することを意味する)。統計的差異を評価するために、t検定が使用された。
皮脂レベルは、Sebumeter(登録商標)を使用して測定される。それは測光法である。吸収された脂質と接触すると透明になる合成リボンが、正確に30秒間測定ゾーンに適用される。その透明性は、接触している脂質膜からの皮脂の量に比例して増加する。透過光の増加を定量化し、表面単位によって排泄される脂質の総質量(μg/cm2)を決定するために、反射率測定記録が使用される。
【0117】
水分量レベルは、Corneometer(登録商標)を使用して測定される。角質層の水分量は、その電気的特性の変化を引き起こす。角質層は誘電体のようなものである。その水分量ステートメントのいかなる改変も、コンデンサによって測定される電気容量の変動を引き起こす。その双極性が環境の電気誘電率及びその導電率を増加させるので、水分量が高いと、電気容量が高くなる。測定は、Corneometer(登録商標)CM 825 TM(Courage&Khazaka electronics)によって実行された。コンデンサにリンクされたプローブは、測定を妨害せず、良好な実験条件再現性を取得するために、常に同じ圧力を外皮に適用することを可能にする。
経表皮水分蒸散量(TEWL)はTewameter(登録商標)を用いて測定される。TEWLは、体内から外部への、角質層を通じた水の受動的拡散である。その測定は、バリア機能の完全性を認識することを可能にする。皮膚表面上に確立された水蒸気の勾配を測定するために、皮膚と接触している円筒形チャンバ、すなわち環境条件の変動を部分的に克服するための開放チャンバを画定するプローブが使用される。測定単位はg/m2/hである。
【0118】
pHレベルは、pHmeter(登録商標)を使用して測定される。pH 905プローブは、水素電位の測定を可能にする。これを行うには、単純に、プローブを測定ゾーンに置き、測定が直ちに与えられる。
敏感性皮膚表現型は、カプサイシン試験に対する有害な感覚反応に基づいて確立された。
【0119】
褐色斑点(皮膚表面及びその下の色素沈着及び変色)は、Canfield(登録商標)イメージングシステムのVisia CR 2.3(登録商標)を使用して測定される。VISIAは、異なるタイプの照明で写真を撮ること、及び画像の非常に迅速な取り込みを可能にする。マルチスペクトルイメージングの下で撮影された一連の写真及び分析は、皮膚の外観に作用する視覚情報を取り込むことを可能にする。CanfieldのRBX(登録商標)技術は、クモ静脈、色素沈着過剰、炎症及び他の状態などの、色の集中をもたらす状態の不均等な視覚化のために、赤及び茶色の皮膚成分の固有色シグネチャを分離する。ボランティアの顔のサイズの差のために、斑点の数の正規化は、測定のために考えられた表面を使用して行われる。
【0120】
皮膚パラメータ測定に関する結果は、表1に示される。
【表2】
【0121】
左右の頬(25cm2/頬)から皮膚細菌が収集された。0.15M NaClの滅菌溶液で湿らせた滅菌スワブが、非侵襲的スワブ採取法として使用された。標準化された手順を使用して、すべての試料が体系的にサンプリングされた。スワブは、DNA抽出まで-20℃で保存された。DNA抽出は、以下の改変を加えたDNeasy PowerLyzer PowerSoil DNA単離キット(米国メリーランド州ゲルマンタウンのQiagen)を使用して実行された。各スワブの先端が滅菌外科用ブレードで取り外され、750μLのビーズ溶液を含有する1.5mLチューブに移された。サンプリングされたバイオマスは、撹拌及びピペッティングによって懸濁され、次いでビーズ破砕チューブに移された。残りのステップは、製造業者の説明書に従って実行された。DNA濃度は、QuBit dsDNA HS蛍光定量キット(フランス、クールタブフのThermoFisher ScientificのInvitrogen)を製造者の説明書に従って使用して決定された。
【0122】
本発明者らが以前に報告したように、500サイクルのペアエンドランを通してMiSeq装置(米国カリフォルニア州サンディエゴのIllumina,Inc.)を使用して、16 S rRNA遺伝子配列決定のDNA増幅及び配列決定が実行された。簡潔には、V3V4 16S rRNA可変領域が標的とされた。全体的な手順は、2つのPCRステップを伴っていた。ライブラリー準備及びMiSeqランは、Givaudan Active BeautyによってGeT-PlaGeプラットフォーム(フランス、アウズビルのINRAe)によって実行された。
【0123】
MiSeqラン後、生データ配列は逆多重化され、品質をチェックして、曖昧な塩基を有するすべてのリードを除去した。インデックス及びプライマー配列は、cutadapt(v1.9;http://cutadapt.readthedocs.io/en/stable/index.html)を用いて除去され、28未満のfastqスコアを有するリードはトリミングされた。順方向及び逆方向配列は、bbmerge(https://jgi.doe.gov/data-and-tools/bbtools/)を使用して対にされた。5000未満の対にされた配列を有する試料は廃棄された。次いで、残りの対にされた配列は、PCRエラーを有するキメラ及びアンプリコンを除去するためにvsearchを使用する社内パイプラインを使用して処理された。次いで、swarm(v2.6)を使用して、1%の非類似性レベルにおいて、配列は、操作可能な分類単位(OTU、16S rRNAマーカー遺伝子配列の類似配列変異体のクラスター)に分割された。RDP分類器を使用した分類学的割り当てのために、固有アンプリコンが、SILVA SSU Ref NR 99(非冗長)データベース(リリース132;https://www.arb-silva.de/)にマッピングされた[20]。Bioconductorパッケージ(主にPhyloseq、DESeq2及びVeganライブラリー;http://www.bioconductor.org/)を使用して、R統計コンピューティング環境(v3.2.0;https://www.r-project.org/)R core team(2014)を使用して、データの正規化及び分析が行われた。
【0124】
各条件の関連微小生命体(p値<0.05)は、統計パッケージDESeq2(Bioconductor)を使用して、各分析された条件間でタクソンの相対存在量と関連微小生命体のサブセットを比較することによって取得された(皮脂、水分量、年齢、敏感性、暗色斑点)。padjは、複数の試験を使用して調整されたp値を表す。倍率変化は、ある状態と別の状態との間でどれだけの量が変化しているかを記述する。
【0125】
次いで、特有の皮膚状態を特徴付けるためにどの細菌がより関係があるかを正確に定義するために、ランダムフォレスト分類器(R社のRamdomForestパッケージ)に基づく機械学習アプローチを使用して、p値<0.05、0.1%より高い相対存在量を有し、試料の少なくとも30%で見出された微小生命体は分類された。手短に言えば、ランダムフォレストアプローチは、何千もの系統樹を使用して、どの細菌属が主要変数(変数の例:皮脂レベル)に従って試料をより良好に区別することを可能にするかを定義する。
予測された分類器の精度は、外部データセットを使用して検証され、モデルの精度を決定するために曲線下面積(AUC)が使用された。分類器の感度及び特異度は、混同行列(R社のConfusion matrixパッケージ)を使用して予測及び分類された個体の表を比較することによって取得された。
【0126】
実施例2
各皮膚状態で識別された微小生命体
図1に示す各皮膚状態で識別された微小生命体。
ランダムフォレスト分析を実行するために、上記で言及された倍率変化アプローチで識別された細菌が使用される。図2は、Illumina MiSeq配列決定の使用において各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示す。
図3は、Illumina MiSeq配列決定の使用において皮膚タイプを定義するための主要な関連細菌、及び各皮膚パラメータのシグネチャに関連付けられた精度を示す。
【0127】
図4は、Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出される属に限定する際の各皮膚タイプシグネチャを定義するための関連細菌を示し、図5は、Illumina MiSeq配列決定の使用においてシグネチャをNanopore配列決定技術でも検出される属に限定する際に、皮膚タイプを定義するための関連細菌及び各皮膚パラメータのシグネチャに関連付けられた精度を示す。
【0128】
実施例3
サンプリング、DNA調製、配列決定及びデータ処理は、16S全長アプローチを使用して、PCT出願PCT/EP 20201075530及び上記に記載されている通りであった。
良質のリードに対応する「パス」ファイルのNanoporeリードは、16Sデータベースを使用して細菌分類群に割り当てられる。
比の定義
【0129】
これらの比は、「LOW」皮膚パラメータ状態に典型的な1つ又は複数の細菌及び「HIGH」皮膚パラメータ状態に典型的な1つ又は複数の細菌を含む。異なる組み合わせが試みられており、関連性及び選択が以下のパラメータについて評価されている:1/検討される細菌は、最低3つの試料(検討12、試料の少なくとも25%で検出)においてNanopore技術で検出可能でなければならない、2/2つの皮膚パラメータは、同じ細菌の組み合わせを使用して評価され得ない、3/使用される細菌は、技術間で試料の80%超について同様の予測を提供しなければならない(LOW IlluminaがLOW Nanopore予測に対応するとき、及びHIGH Illuminaが定義されたHIGH Nanopore予測に対応するときの真の相関。本発明者らは、本技術の1つにおけるMIDDLE予測を、それが他の技術におけるMIDDLE、HIGH又はLOW予測に対応するかにかかわらず真として受け入れる。)
【0130】
検討される比率:(「LOW」皮膚プロファイルの選択された典型的な細菌の%の合計)/(「HIGH」皮膚プロファイルの選択された典型的な細菌の%の合計)
カットオフ(X値)の定義は、IlluminaとNanoporeの両方の技術で配列決定された試料を比較することで予測された。
比が<X1である場合、皮膚プロファイルは「LOW」として典型的であると考えられる。
比が>X2である場合、皮膚プロファイルは「HIGH」として典型的であると考えられる。
比率が>=X1かつ<=X2である場合、皮膚プロファイルは「MEDIUM」と考えられる。
ボランティアAのNanoporeリードの分類割り当てを図6に示し、ボランティアBのNanoporeリードの分類割り当てを図7に示す。
【0131】
ボランティアA:
目的の細菌の割合:
【表3】
【0132】
この微生物叢プロファイルに対応する皮膚タイプを定義するために、皮膚タイプに特有の細菌に関する比が使用される。
【表4】
【0133】
各皮膚パラメータに適合されたこれらの比を使用して、ボランティアAの皮膚プロファイルは、
-皮脂がHIGH=脂性皮膚
-加齢がHIGH=42歳を超える年齢=早期加齢皮膚(ボランティアが41歳であるため)
-敏感性がHIGH=敏感性皮膚
-斑点がHIGH=暗色斑点の素因のある皮膚
-水分量がHIGH=十分な水分量の皮膚
-TEWLがMIDDLE=正常な皮膚バリア機能
のように定義される。
3/これらの結果に関して、化粧品推奨は4つのタイプの活性物質を含み得る。活性物質は、それらの商品名と共に列挙され、それらのINCI名がその後に続く。微生物叢に対する効果が証明されている活性物質が最初に列挙される。
【0134】
-皮脂量を低減する:
皮脂制御に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Brightenyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ジグルコシル没食子酸)、Sopholiance(商標)S
(Candida bombicola(及び)グルコース(及び)ナタネ油脂肪酸メチル発酵物(及び)水)
【0135】
皮脂制御に対する証明された活性を有する活性物質:
Bamboosilk;Erasyal(商標);K-phyto [PP] GHK;PrimalHyal(商標)300;Safester(商標)A-75;Unireduce(登録商標)R-35
Unisteron(商標)Y-50;Unitrienol(商標)T-27
【0136】
-皮膚の年齢を改善する:
加齢徴候に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標);Brightenyl(登録商標);Revivyl(商標);Synchronight(商標);Vetivyne(商標);Yogurtene(登録商標)Balance
【0137】
加齢徴候に対する証明された活性を有する活性物質:
BlurHD(登録商標);Commipheroline(登録商標);Depollutine(登録商標);Easyliance(登録商標)2.0;Eau de Source Marine
Eau Vitale(商標)d'Algue Bleue;Ellagi-C(商標);Hyalusphere(登録商標);Hydrintense(商標);Inoveol(登録商標)CAFA
Inoveol(登録商標)EGCG;Inoveol(登録商標)OLEU;Megassane(登録商標);Neodermyl(商標);NovHyal(商標)Biotech G;PrimalHyal 3K;PrimalHyal(商標)50;PrimalHyal(商標)Gold;PrimalHyal(商標)Ultrafiller;Redens'In(商標);Rosmarinyl(商標);Rubixyl(登録商標);Softalia(登録商標);StimulHyal(登録商標);Tightenyl(商標);Unichondrin(商標)ATP;Unilactamin(商標)L-17;Unilucent(商標)HR-14;Unilucent(商標)PA-13;Uniprosyn(登録商標)PS-18;Uniprotect(登録商標)PT-3;Unirepair(登録商標)T-43;Unisteron(商標)Y-50;Unisurrection(商標)S-61;Yogurtene(登録商標)
【0138】
-敏感性状態を改善する
敏感性状態に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物資:
Sensityl(商標)
【0139】
敏感性状態に対する証明された活性を有する活性物質:
Biogomm'age(商標)UEシリーズ;Biogomm'age(商標)WDシリーズ;BisaboLife(商標)(ビサボロール)
D-パンテニルトリアセタート;Endothelyol(商標);Erasyal(商標);Grevilline(商標)PF;Inoveol(登録商標)CAFA;Inoveol(登録商標)EGCG;Inoveol(登録商標)OLEU;Mariliance(商標);Neurophroline(商標);Ocaline(商標);Rosmarinyl(商標);Soothex(登録商標);Uniglucan(商標)G-51;Uniprotect(登録商標)PT-3;Unirepair(登録商標)T-43;
Unisooth(商標)EG-28;Unisooth(商標)PN-47;Unisooth(商標)ST-32;Unispheres(登録商標)Colour boosting
Unispheres(登録商標)Flashtone
【0140】
-暗色斑点の素因を改善する:
暗色斑点調節に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標);Brightenyl(登録商標)
暗色斑点調節に対する証明された活性を有する活性物質:
Axolight(登録商標);B-Lightyl(商標);Ellagi-C(商標);Megassane(登録商標);Neurophroline(商標);Unilucent(商標)HR-14;
Unilucent(商標)PA-13 Uninontan(商標)U-34;Unispheres(登録商標)Flashwhite;Wakamine(商標)
Whitesphere(商標)
【0141】
ボランティアB:
目的の細菌の割合:
【表5】
2/この微生物叢プロファイルに対応する皮膚タイプを定義するために、皮膚タイプに特有の細菌に関する比が使用される。
【0142】
【表6】
各皮膚パラメータに適合されたこれらの比を使用して、ボランティアAの皮膚プロファイルは、
-皮脂がLOW=脂性皮膚ではない
-加齢がHIGH=42歳を超える年齢=早期加齢皮膚(ボランティアが39歳であるため)
-敏感性がHIGH=敏感性皮膚
-斑点がMIDDLE=暗色斑点の素因のない皮膚
-水分量がHIGH=十分な水分量の皮膚
-TEWLがLOW=低皮膚バリア機能
のように定義される。
3/これらの結果に関して、化粧品推奨は3つのタイプの活性物質を含み得る。
-皮膚の年齢を改善するために:
【0143】
加齢徴候に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標)、Brightenyl(登録商標)、Revivyl(商標)、Synchronight(商標)、Vetivyne(商標)
Yogurtene(登録商標)Balance
【0144】
加齢徴候に対する証明された活性を有する活性物質:
BlurHD(登録商標)(ジプロピレングリコール(及び)Gardenia Florida果実抽出物)
Commipheroline(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Commiphora Mukul樹脂抽出物)
Depollutine(登録商標)(水(及び)アルギニンPCA(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物)
Easyliance(登録商標)2.0(Acacia Senegalガム(及び)リゾビアンガム)
Eau de Source Marine(海底湧水)(海水)
Eau Vitale(商標)d'Algue Bleue(水(及び)Spirulina Platensis抽出物)
Ellagi-C(商標)(プロパンジオール(及び)Anogeissus LeiocarpA樹皮抽出物)
Hyalusphere(登録商標)(封入ヒアルロン酸ナトリウム)
Hydrintense(商標)(海水(及び)プロパンジオール(及び)Porphyridium Cruentum抽出物)
Inoveol(登録商標)CAFA(水(及び)カフェイルグルコシド)
Inoveol(登録商標)EGCG(水(及び)没食子酸エピガロカテキングルコシド)
Inoveol(登録商標)OLEU(水(及び)オロイロペイニルグルコシド)
Megassane(登録商標)(カプリル酸/カプリン酸トリグリセリド(及び)Phaeodactylum Tricornutum抽出物
Neodermyl(商標)グリセリン(及び)水(及び)メチルグルコシドリン酸(及び)(リシネート/プロリネート)銅)
NovHyal(商標)Biotech G(グリセリン(及び)水(及び)アセチルグルコサミンリン酸二ナトリウム)
PrimalHyal 3K(加水分解ヒアルロン酸)
PrimalHyal(商標)50(加水分解ヒアルロン酸)
PrimalHyal(商標)Gold(水(及び)PEG-8カプリル酸/カプリン酸グリセリド(及び)ヒアルロン酸ナトリウム(及び)オクチルドデセス-25)
PrimalHyal(商標)Ultrafiller(アセチル化ヒアルロン酸ナトリウム)
Redens'In(商標)(Commiphora Mukul樹脂抽出物(及び)封入ヒアルロン酸ナトリウム)
Rosmarinyl(商標)(グルコシド水(及び)ロスマリニルグルコシド)
Rubixyl(登録商標)(水(及び)グリセリン(及び)ヘキサペプチド-48 HCL)
Softalia(登録商標)(Fusanus Spicatus核油)
StimulHyal(登録商標)(ケトグルコン酸カルシウム)
Tightenyl(商標)(グリセリン(及び)水(及び)アセチルグルコサミンリン酸二ナトリウム(及び)グルクロン酸ナトリウム(及び)硫酸マグネシウム)
Unichondrin(商標)ATP(水(及び)ブチレングリコール(及び)加水分解植物タンパク質(及び)アデノシン三リン酸(及び)コンドロイチン硫酸ナトリウム)
Unilactamin(商標)L-17(水(及び)ブチレングリコール(及び)アデノシン三リン酸(及び)加水分解乳タンパク質(及び)ナイアシンアミド)
Unilucent(商標)HR-14(水(及び)Haberlea Rhodopensis葉抽出物)
Unilucent(商標)PA-13(パンテニルトリアセタート(及び)アセチルRheum Rhaponticum根抽出物)
Uniprosyn(登録商標)PS-18(水(及び)ブチレングリコール(及び)ナイアシンアミド(及び)アデノシン三リン酸(及び)加水分解オーツ麦タンパク質)
Uniprotect(登録商標)PT-3(三酢酸パンテニル(及び)リノール酸エチル(及び)オレイルアルコール(及び)トコフェロール)
Unirepair(登録商標)T-43(水(及び)ブチレングリコール(及び)アセチルチロシン(及び)プロリン(及び)加水分解植物タンパク質(及び)アデノシン三リン酸)
Unisteron(商標)(Y-50オレイルアルコール(及び)Dioscorea Villosa(自然薯)根抽出物(及び)ヘキシルデカノール(及び)Glycine Soja(ダイズ)ステロール)
Unisurrection(商標)S-61(水(及び)Beta Vulgaris(ビーツ)根抽出物(及び)グリセリン(及び)Haberlea Rhodopensis葉抽出物(及び)酵母抽出物)
Yogurtene(登録商標)(ヨーグルト粉末)
【0145】
-敏感性状態を改善する
敏感性状態に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物資:
Sensityl(商標)
【0146】
敏感性状態に対する証明された活性を有する活性物質:
Biogomm'age(商標)、Biogomm'age(商標)、BisaboLife(商標)、D-パンテニルトリアセタート、Endothelyol(商標)、Erasyal(商標)、Grevilline(商標)PF、Inoveol(登録商標)CAFA、Inoveol(登録商標)EGCG、Inoveol(登録商標)OLEU、Mariliance(商標)
Neurophroline(商標)、Ocaline(商標)、Rosmarinyl(商標)、Soothex(登録商標)、Uniglucan(商標)G-51、Uniprotect(登録商標)PT-3
Unirepair(登録商標)T-43、Unisooth(商標)EG-28、Unisooth(商標)PN-47、Unisooth(商標)ST-32、Unispheres(登録商標)Colour boosting、Unispheres(登録商標)Flashtone G
【0147】
-皮膚バリア機能を改善する(推奨は、LOW水分量プロファイルの場合も同じであろう):
バリア機能に対する、及び皮膚微生物叢に対する証明された活性を有する活性物質:
Agefinity(商標)、Brightenyl(登録商標)、Sensityl(商標)
Vetivyne(商標)、Yogurtene(登録商標)Balance
【0148】
バリア機能に対する証明された活性を有する活性物質:
Abdoliance(商標)、Appygreen(商標)812、Axolight(登録商標)、B-Lightyl、Bamboosilk、Biogomm'age(商標)UEシリーズ、
Biogomm'age(商標)WDシリーズ、BisaboLife(商標)、BlurHD(登録商標)、Ceramide II/Uniblend(商標)2G、Commipheroline(登録商標)
Cristalhyal(登録商標)Range、D-パンテニルトリアセタート、Depollutine(登録商標)、Easyliance(登録商標)2.0
Ellagi-C(商標)、Endothelyol(商標)、Erasyal(商標)、Evercool(登録商標)、Exfoliance Range、Glossyliance(商標)、Grevilline(商標)PF
Hairsphere、Hyalusphere(登録商標)、Hydreis(商標)、Hydrintense(商標)、Inoveol(登録商標)CAFA、Inoveol(登録商標)EGCG
Inoveol(登録商標)OLEU、K-phyto[SC]Camellia
K-phyto[PP]GHK、カラニヤ油、ケンジ油、Lithocosmetics、Mariliance(商標)、Megassane(登録商標)、Muciliance(登録商標)
Neodermyl(商標)、Neurophroline(商標)、NovHyal(商標)、Ocaline(商標)、Pongamia抽出物
PrimalHyal 3K、PrimalHyal(商標)300、PrimalHyal(商標)、PrimalHyal(商標)、Pro-DG(商標)
Questice(登録商標)Range、Questice Plus:、Redensyl(商標)、Redens'In(商標)、ResistHyal(商標)、Revivyl(商標)
Rosmarinyl、Rubixyl(登録商標)、Safester(商標)A-75、Sens'Hyal(商標)、Silkalun(商標)
Sinodor(登録商標)、Softolive(商標)、Soligel(商標)、Soothex(登録商標)
Sophogreen(商標)Plus、Sopholiance(商標)、StimulHyal(登録商標)、Synchronight
Syner-GX(商標)、Tightenyl(商標)、Unichondrin(商標)、Uniglucan(商標)G
【0149】
実施例4
喫煙は、喫煙者の前額部及び頭皮の微生物叢組成に影響を与える。
14人の非喫煙者/13人の喫煙者:それぞれ平均年齢32.1(8.1)及び33.3(9.0)。
sinにおける11パラメータの測定(水分量、皮脂、経皮的水分喪失、pH、しわ、褐色斑点、可読性、ポルフィリン、可視斑点)。
スワブ採取された4つのエリア(前額部、頬、頭皮)。前述されたような(MiSeqを使用した)16S rRNA遺伝子のV3V4サブユニットの配列決定。
結果:
皮膚微生物叢の多様性は、喫煙習慣によって有意に影響を受ける。喫煙者の微生物叢の前額部及び頭皮は、非喫煙者のものとは有意に異なる(表1、表2及び表3を参照)。皮膚微生物叢の改変は、加齢に伴って観察されるものに近い。皮膚微生物叢データに基づいて、喫煙習慣を定義するためにモデルが設定された。
【0150】
【表7】
【0151】
【表8】
【0152】
【表9】
図1-1】
図1-2】
図1-3】
図1-4】
図2-1】
図2-2】
図2-3】
図2-4】
図2-5】
図2-6】
図3
図4-1】
図4-2】
図4-3】
図4-4】
図4-5】
図4-6】
図5
図6
図7
【配列表】
2023544881000001.app
【国際調査報告】