特表 2024-502183 合成プロセス

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2024-01-17

(54)【発明の名称】合成プロセス

(51)【国際特許分類】

   C07K 7/06 20060101AFI20240110BHJP

   A61K 38/12 20060101ALI20240110BHJP

   A61P 31/04 20060101ALI20240110BHJP

【ＦＩ】

C07K7/06

A61K38/12

A61P31/04

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2023541725

(86)(22)【出願日】2022-01-10

(85)【翻訳文提出日】2023-09-05

(86)【国際出願番号】 EP2022050354

(87)【国際公開番号】W WO2022148868

(87)【国際公開日】2022-07-14

(31)【優先権主張番号】PA202100027

(32)【優先日】2021-01-11

(33)【優先権主張国・地域又は機関】DK

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】505371232

【氏名又は名称】クセリア ファーマシューティカルズ エーピーエス

【氏名又は名称原語表記】Ｘｅｌｌｉａ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ ＡｐＳ

【住所又は居所原語表記】１１ Ｄａｌｓｌａｎｄｓｇａｄｅ，ＤＫ－２３００ Ｃｏｐｅｎｈａｇｅｎ Ｓ，ＤＥＮＭＡＲＫ

(74)【代理人】

【識別番号】100105957

【弁理士】

【氏名又は名称】恩田 誠

(74)【代理人】

【識別番号】100068755

【弁理士】

【氏名又は名称】恩田 博宣

(74)【代理人】

【識別番号】100142907

【弁理士】

【氏名又は名称】本田 淳

(74)【代理人】

【識別番号】100152489

【弁理士】

【氏名又は名称】中村 美樹

(72)【発明者】

【氏名】ビョルンスタ、ヴィダル

(72)【発明者】

【氏名】ボニー、カール ジェームズ

【テーマコード（参考）】

4C084

4H045

【Ｆターム（参考）】

4C084AA06

4C084BA01

4C084BA08

4C084BA17

4C084CA04

4C084CA59

4C084DA43

4C084NA20

4C084ZB351

4C084ZB352

4H045AA10

4H045AA20

4H045AA30

4H045BA05

4H045BA14

4H045BA50

4H045DA83

4H045EA20

4H045FA10

(57)【要約】

ダルババンシンを合成する最適化された方法を提供する。その方法において、Ａ－４０９２６のエステル化生成物を沈殿させるため、ｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）またはジメトキシエタン（ＤＭＥ）などの有機貧溶媒が用いられる。

【特許請求の範囲】

【請求項1】

（ｉ）式Ｉの化合物またはその塩を提供する工程と、

【化1】

（ｉｉ）式ＩＩの前記化合物を得るために、酸を含むアルコール溶液を式Ｉの前記化合物に添加することによってエステル化工程を行う工程と、

【化2】

ここでＸはＣｌ、Ｂｒ、ＨＳＯ_４、ＳＯ_４、Ｈ_２ＰＯ_４、ＨＰＯ_４、ＰＯ_４、ＮＯ_３、Ｆ_３ＣＣＯ_２、Ｆ_３ＣＳＯ_３、Ｈ_３ＣＳＯ_３またはｐ－トルエンスルホン酸塩であり、ＲはＣ_１～Ｃ_６アルキル基であり、
（ｉｉｉ）ｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテルまたはジメトキシエタンを適量添加することで沈殿物を形成させる工程と、
（ｉｖ）式ＩＩＩの化合物を得るペプチドカップリングを行うため、前記沈殿物に３－（ジメチルアミノ）－１－プロピルアミンを添加する工程と、

【化3】

ここで、ＲはＣ_１～Ｃ_６アルキル基であってもよく、
（ｖ）ダルババンシンまたはその塩を得るエステル加水分解工程を行う工程と、
を含むダルババンシンの合成プロセス。

【請求項2】

ｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテルを用いて沈殿工程（ｉｉｉ）を行う請求項１に記載のプロセス。

【請求項3】

工程（ｉｉ）における前記酸が酸無水物である請求項３に記載のプロセス。

【請求項4】

前記アルコール溶液にアシルハロゲン化物を添加することにより直接前記アルコール溶液中で工程（ｉｉ）における前記酸が生成される請求項１～３のいずれか一項に記載のプロセス。

【請求項5】

前記アルコール溶液に塩化アシルを添加することにより前記酸が生成される請求項４に記載のプロセス。

【請求項6】

前記アルコール溶液に塩化アセチルを添加することにより前記酸が生成される請求項５に記載のプロセス。

【請求項7】

ＸがＣｌである請求項１～６のいずれか一項に記載のプロセス。

【請求項8】

ＸがＢｒである請求項１～７のいずれか一項に記載のプロセス。

【請求項9】

前記アルコール溶液に臭化アシルを添加することにより前記酸が生成される請求項４に記載のプロセス。

【請求項10】

前記アルコール溶液に臭化アセチルを添加することにより前記酸が生成される請求項９に記載のプロセス。

【請求項11】

工程（ｉｉ）における前記アルコール溶液がメタノール溶液である請求項１～１０のいずれか一項に記載のプロセス。

【請求項12】

Ｒがメチル基である請求項１～１１のいずれか一項に記載のプロセス。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

（本発明の分野）
本発明はダルババンシン（ｄａｌｂａｖａｎｃｉｎ）を合成するための方法に関連する。

【背景技術】

【0002】

（背景）
ダルババンシンは半合成リポグリコペプチド（ｌｉｐｏｇｌｙｃｏｐｅｐｔｉｄｅ）であり、細胞壁の生合成をかく乱することによって殺菌効果を発揮する。ダルババンシンは成長中のペプチドグリカン鎖上のＤ－アラニル－Ｄ－アラニル残基に結合し、ペプチド転移が起こらないようにすることでペプチドグリカンの伸長および細胞壁形成を妨げる。

【0003】

ダルババンシンは、天然グリコペプチド複合体Ａ－４０９２６を生成するＮｏｎｏｍｕｒａｅａ選抜株の発酵によって製造される。その後、この前駆体はその前駆体の糖部分におけるカルボキシル基が選択的にエステル化され、その前駆体のペプチジルカルボキシル基がアミド化され、Ｎ－アシルアミノグルクロン酸カルボキシル基のエステルがけん化される。この産物は、密接に関連する２つの構造ファミリー（ＡおよびＢ）の化合物混合物であり、さらに計５つのサブタイプに細分できる（下表参照）。

【0004】

【化1】

【0005】

【表1】

【0006】

前駆体Ａ－４０９２６をダルババンシンに変換する様々な方法が存在しており、すべてエステル化工程、アミド化工程および加水分解工程を含む。
米国特許第６９００１７５号（特許文献１）には、０℃の硫酸メタノール溶液を用いたエステル化工程の後、トリエチルアミンを用いたｐＨ調整により当該生成物の双性イオン形態を沈殿させることでその生成物を単離し、続いて遠心分離および真空オーブン乾燥することが記述されている。

【先行技術文献】

【特許文献】

【0007】

【特許文献1】米国特許第６９００１７５号明細書

【発明の概要】

【0008】

（概要）
本発明は、前駆体Ａ－４０９２６からダルババンシンを合成する代替・改良プロセスを提供する。前記プロセスは、以下の工程を含む。

【0009】

（ｉ）Ａ－４０９２６とも称される式Ｉの化合物またはその塩を提供する工程。

【0010】

【化2】

【0011】

（ｉｉ）式ＩＩの前記化合物を得るためエステル化工程を行う工程。

【0012】

【化3】

【0013】

ここでＸはＣｌ、Ｂｒ、ＨＳＯ_４、ＳＯ_４、Ｈ_２ＰＯ_４、ＨＰＯ_４、ＰＯ_４、ＮＯ_３、Ｆ_３ＣＣＯ_２、Ｆ_３ＣＳＯ_３、Ｈ_３ＣＳＯ_３またはｐ－トルエンスルホン酸塩であってもよく、ＲはＣ_１～Ｃ_６アルキル基であってもよい。

【0014】

（ｉｉｉ）ｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテルまたはジメトキシエタンを適量添加することで沈殿物を形成させる工程。
（ｉｖ）式ＩＩＩの化合物を得るペプチドカップリングを行うため、前記沈殿物に３－（ジメチルアミノ）－１－プロピルアミンを添加する工程。

【0015】

【化4】

【0016】

ここで、ＲはＣ_１～Ｃ_６アルキル基であってもよい。
（ｖ）ダルババンシンまたはその塩を得るエステル加水分解工程を行う工程。

【発明を実施するための形態】

【0017】

（詳細な開示）
本発明で記述されるプロセスでは、天然に存在する化合物Ａ－４０９２６からダルババンシンは調製される。Ａ－４０９２６は下記の式Ｉで表現される。Ａ－４０９２６中の２つのカルボキシル基のうちの１つを（ジメチルアミノ）プロピルアミドに変換することを経てダルババンシンは調製される。

【0018】

本発明によるプロセスでは、ダルババンシンは式Ｉの化合物から合成される。

【0019】

【化5】

【0020】

式Ｉから分かるとおり、Ａ－４０９２６は２つのカルボキシル基（ｃａｒｂｏｘｙｌｉｃ ｇｒｏｕｐ）と１つのペプチジルカルボキシル基（ｐｅｐｔｉｄｙｌ ｃａｒｂｏｘｙｌｉｃ ｇｒｏｕｐ）と１つのＮ－アシルアミノグルクロン酸基とを有する。ダルババンシンを得るためペプチジルカルボキシル基をアミド化する。したがって、Ｎ－アシルアミノグルクロン酸基をアミド化から保護するためにＮ－アシルアミノグルクロン酸基の選択的なアルキルエステル化を行う必要があり、合成プロセスの第一工程は式ＩＩの化合物を得るためのエステル化工程である。

【0021】

【化6】

【0022】

エステル化工程は酸を含むアルコール溶液にＡ－４０９２６を添加することで行われる。酸としては、例えばＨＣｌ、ＨＢｒ、Ｈ_２ＳＯ_４、Ｈ_３ＰＯ_４、ＨＮＯ_３、Ｆ_３ＣＣＯ_２Ｈ、Ｆ_３ＣＳＯ_３Ｈ、Ｈ_３ＣＳＯ_３Ｈまたはｐ－トルエンスルホン酸のうちのいずれかの酸である。

【0023】

したがって、用いた酸により式ＩＩのＸはＣｌ、Ｂｒ、ＨＳＯ_４、ＳＯ_４、Ｈ_２ＰＯ_４、ＨＰＯ_４、ＰＯ_４、ＮＯ_３、Ｆ_３ＣＣＯ_２、Ｆ_３ＣＳＯ_３、Ｈ_３ＣＳＯ_３またはｐ－トルエンスルホン酸塩となりうる。

【0024】

「アルコール溶液」という用語はアルコールを含みかつ最大２％しか水が存在しない溶液と理解される。ある実施形態においては最大１．９％、１．８％、１．７％、１．６％、１．５％、１．４％、１．３％、１．２％、１．１％、１．０％、０．９％、０．８％、０．７％、０．６％、０．５％、０．４％、０．３％、０．２％、０．１％または０．０５％である。

【0025】

ある実施形態においてアルコール溶液における水の量は０．０５％から２％の範囲内である。
アルコールはメタノール、エタノールまたはＣ_３～Ｃ_６アルコールであってよい。

【0026】

用いたアルコールによって式ＩＩのＲはＣ_１～Ｃ６アルキル基となりうる。
「Ｃ_１～Ｃ_６アルキル基」という用語は例えばメチル基、エチル基、プロピル基、ｎ－ブチル基、ｎ－ペンチル基、ｎ－ヘキシル基またはそれらの分岐構造の化合物を意味する。

【0027】

ある実施形態においては、用いたアルコールはメタノール、エタノールまたはプロパノールであり、ＲはそれぞれＣＨ_３、ＣＨ_３ＣＨ_２またはＣＨ_３ＣＨ_２ＣＨ_２である。
ある実施形態においては、用いたアルコールがメタノールであり、ＲはＣＨ_３である。

【0028】

上述の通りアルコール溶液はさらに酸を含んでもよい。酸としては例えばＨＣｌ、ＨＢｒ、Ｈ_２ＳＯ_４、Ｈ_３ＰＯ_４、ＨＮＯ_３、Ｆ_３ＣＣＯ_２Ｈ、Ｆ_３ＣＳＯ_３Ｈ、Ｈ_３ＣＳＯ_３Ｈまたはｐ－トルエンスルホン酸などである。

【0029】

ある実施形態において酸は酸無水物の形態でアルコール溶液に添加されてもよい。
しかし、すべての酸が酸無水物として利用可能ではない。ある実施形態において、前記アルコール溶液にアシルハロゲン化物を添加することによりアルコール溶液中で（ｉｎ ｓｉｔｕ）酸が生成されてもよい。

【0030】

「アシル基」という用語はＣ_１～Ｃ_６の直鎖または分岐アルキル鎖を含むものを意味する。
酸性水溶液を添加することに対し、アシルハロゲン化物を用いて酸を溶液中で（ｉｎ ｓｉｔｕ）生成することでより速い反応が可能となる。なぜなら大量の水が存在するとエステル化反応が遅くなるためである。

【0031】

ある実施形態においてハロゲン化物は塩化物であり、前記アルコール溶液に塩化アシルを添加することにより前記酸（ＨＣｌ）は生成される。
ある実施形態においてアシル基はアセチル基であり、前記アルコール溶液に塩化アセチルを添加することにより前記酸は生成される。

【0032】

本発明におけるある実施形態では前記アルコールはメタノールであり、ＨＣｌを溶液中で（ｉｎ ｓｉｔｕ）生成するために塩化アセチルを加える。
ある実施形態においてハロゲン化物は臭化物であり、前記アルコール溶液に臭化アシルを添加することにより前記酸（ＨＢｒ）は生成される。

【0033】

ある実施形態においてアシル基はアセチル基であり、前記アルコール溶液に臭化アセチルを添加することにより前記酸は生成される。
本発明におけるある実施形態では前記アルコールはメタノールであり、ＨＢｒを溶液中で（ｉｎ ｓｉｔｕ）生成するために臭化アセチルを加える。

【0034】

エステル化工程は温度－２０℃から１０℃で行われてもよく、例えば－１５℃から５℃、－１４℃から５℃、－１３℃から５℃、－１２℃から５℃、－１１℃から５℃、－１０℃から５℃、－１０℃から４℃、－１０℃から３℃、－１０℃から２℃、－１０℃から１℃、－１０℃から０℃、－９℃から０℃、－８℃から０℃、－７℃から０℃、－７℃から－１℃、－７℃から－２℃、－７℃から－３℃、－７℃から－４℃などで行われてもよい。

【0035】

ある実施形態において前記反応は温度５℃、４℃、３℃、２℃、１℃、０℃、－１℃、－２℃、－３℃、－４℃、－５℃、－６℃、－７℃、－８℃、－９℃または－１０℃で行われる。

【0036】

反応時間は適用温度に依存することとなり、１時間から５０時間であってよく、例えば１時間から４５時間、２時間から４０時間、２時間から３０時間、２時間から２４時間、３時間から２３時間、４時間から２２時間、５時間から２１時間であってもよい。

【0037】

エステル化工程は塩化アセチル：Ａ－４０９２６のモル比が３０：１から５：１までで行われてもよく、例えば２５：１から５：１まで、２０：１から５：１まで、２５：１から１０：１まで、２０：１から１０：１までなどであってもよい。

【0038】

ある実施形態において前記反応は塩化アセチル：Ａ－４０９２６のモル比が２０：１、１９：１、１８：１、１７：１、１６：１、１５：１、１４：１、１３：１、１２：１、１１：１または１０：１で行われる。

【0039】

エステル化反応後には、結果生じる中間体をアミド化工程用に準備する必要がある。当技術分野で周知のダルババンシンを合成する方法において、エステル化工程からの中間体は、あらゆる望ましくない溶媒を除去する目的で、沈殿させ、結果生じる固形物を分離し、乾燥させることにより、アミド化工程用に準備される。しかしながら、これは望ましくない不純物形成の増加につながる可能性があり、特に分解生成物であるマンノシルアグリコン（ｍａｎｎｏｓｙｌ ａｇｌｙｃｏｎｅ（ＭＡＧ））およびデマンノシル誘導体（ｄｅｍａｎｎｏｓｙｌ ｄｅｒｉｖａｔｉｖｅ）が（ｐＨに応じて）形成されうる。加えて生成物を沈殿させるためのｐＨ調整が行われる当技術分野で周知の方法は、迅速なろ過に適さない固形物を生じる可能性があるし、後続のアミドカップリング前に、痕跡量の溶媒水および痕跡量の溶媒アルコールをすべて除去するため加熱真空オーブンで完全に乾燥する必要があろう。

【0040】

【化7】

【0041】

本発明者は驚くべきことにｔｅｒｔ－ブチルメチルエーテル（ＴＢＭＥ）やジメトキシエタン（ＤＭＥ）などの有機貧溶媒を適量用い式ＩＩの化合物を沈殿させることで、結果生じる沈殿物を、ろ過工程後さらに真空オーブンなどのオーブンで乾燥させる必要なく、後続のアミド化反応に直接用いることができることを見つけた。本発明者はＴＢＭＥやＤＭＥを用いることで簡単にろ過できる沈殿物が形成されることを見つけた。その沈殿物はより容易なかつ時間効率がより高いろ過に適しており、それにより遠心分離の必要がなくなる。本発明者は、本方法が簡単にろ過できる沈殿物を生成するため特にスケールの大きい合成プロセスでの使用に適すること、および、開始化合物Ａ－４０９２６が５００グラムまたはそれより大きなスケールにおいて成功裏に本プロセスが用いられたことを見つけた。他の先行する周知方法では、小スケールではろ過可能であるが大スケールではろ過不能であるか実用的ではない沈殿物を生成する可能性がある。

【0042】

本発明におけるある実施形態ではＴＢＭＥを用いて沈殿を行う。エステル化に用いられるアルコールのＴＢＭＥに対する比は約１から５．０までであってよく、例えば１から４．９まで、１から４．８まで、１から４．７まで、１から４．６まで、１から４．５まで、１から４．４まで、１から４．３まで、１から４．２まで、１から４．１まで、１から４．０まで、１から３．９まで、１から３．８まで、１から３．７まで、１から３．６まで、１から３．５まで、１から３．４まで、１から３．３まで、１から３．２まで、１から３．１まで、１から３．０まで、１から２．９まで、１から２．８まで、１から２．７まで、１から２．６まで、１から２．５まで、１から２．４まで、１から２．３まで、１から２．２まで、１から２．１まで、１から２．０までなどであってよい。

【0043】

沈殿した式ＩＩの化合物を含む溶液は工程（ｉｖ）の前にろ過されてもよい。
沈殿した式ＩＩの化合物を含む溶液は重力のみによりろ過されてもよい。
したがって、実施形態においてろ過工程はフィルターに加圧せずまたは減圧せず行われる。

【0044】

ろ過工程は、エステル化プロセスの生成物をフィルター上でガス流にさらすことにより、その生成物を後続のアミド化反応用に準備することによって完了してもよい。ガスとしては例えば乾燥した窒素ガスが挙げられる。このプロセスは早く１時間ほどで完了でき、それにより真空オーブンで乾燥させる場合などと違って分解生成物の形成が回避される。

【0045】

沈殿した式ＩＩの化合物を含む溶液はヌッチェフィルター（Ｎｕｔｓｃｈｅ ｆｉｌｔｅｒ）を用いてろ過されてもよい。ある実施形態においては重力下でろ過し、かつ／または乾燥した窒素ガスでフィルター上流にて加圧しつつろ過し、かつ／またはヌッチェフィルター（Ｎｕｔｓｃｈｅ ｆｉｌｔｅｒ）下流にて減圧しつつろ過する。

【0046】

沈殿した式ＩＩの化合物を含む溶液のろ過後、適した溶媒に沈殿物を溶解させる。溶媒としては例えばＤＭＳＯ（ジメチルスルホキシド）、ＤＭＦ（ジメチルホルムアミド）、ＤＭＡ（ジメチルアセトアミド）、ＴＨＦ（テトラヒドロフラン）、ＮＭＰ（Ｎ－メチル－２－ピロリドン）またはそれらの混合物などが挙げられる。得られた溶液に標準アミンカップリング試薬および３－（ジメチルアミノ）－１－プロピルアミンが添加された。これは式ＩＩＩの化合物を得るためである。

【0047】

【化8】

【0048】

ここで、ＲはＣ_１～Ｃ_６アルキル基であってもよい。
用いられうるアミンカップリング試薬の例としてはＤＣＣ（ｄｉｃｙｃｌｏｈｅｘｙｌｃａｒｂｏｉｉｍｉｄｅ、ジシクロヘキシルカルボイイミド）、ＤＩＣ（ジイソプロピルカルボジイミド）、ＥＤＣ（Ｎ－エチル－Ｎ’－（３－ジメチルアミノプロピル）カルボジイミド）、ＨＯＢｔ（ヒドロキシベンゾトリアゾール）、ＨＯＡｔ（１－ヒドロキシ－７－アザベンゾトリアゾール）、ＰｙＢＯＰ（ベンゾトリアゾール－１－イル－オキシトリピロリジノホスホニウムヘキサフルオロリン酸）、ＨＡＴＵ（Ｏ－（７－アザベンゾトリアゾール－１－イル）－Ｎ，Ｎ，Ｎ’，Ｎ’－テトラメチルウロニウムヘキサフルオロリン酸）が挙げられる。

【0049】

アミンカップリング工程の後、沈殿させ、ろ過し任意で真空乾燥することにより式ＩＩの化合物を得てもよい。
ダルババンシンを得るためにはＮ－アシルアミノグルクロン酸カルボキシル基にエステル化工程で付加したアルキル基を除去する必要がある。これはエステル加水分解工程によって行われる。

【0050】

本明細書で説明した合成プロセスにより得られるダルババンシンは、残存発酵に関連する不純物および／または合成およびプロセスに関連する不純物を除去するために、さらに精製されてもよい。

【0051】

本明細書および請求項のすべての数字は「約」という用語で修飾される。これは問われている数値または範囲の±１０％で定義されるわずかな変動を各数字が含むことを意味する。

【0052】

（実施例１）
（ａ）乾燥した窒素雰囲気下０℃でＡ４０９２６（６４５ｇ）をメタノール性塩酸溶液（０．５５Ｍ、１０．０Ｌ）に少しずつ添加した。その速度は温度が４℃を超えないことを保証する速度である。温度をその後４℃に調節し反応の進行をＨＰＬＣで一定時間ごとに監視した。反応が完了したとＨＰＬＣで判断したら、生成物を沈殿させるため約1時間かけてＴＢＭＥ（３２．０Ｌ）を添加した。固形物質をヌッチェフィルター（Ｎｕｔｓｃｈｅ ｆｉｌｔｅｒ）を用いてろ過し追加のＴＢＭＥで洗浄した（３×５Ｌ）。そのフィルターの固形物（ｆｉｌｔｅｒ ｃａｋｅ）は、乾燥した窒素ガス流を用いて固形物質が一貫して粉状になるまで乾燥させた。半乾燥物質は直接次の反応に用いた。

【0053】

（ｂ）半乾燥物質（１当量）をＤＭＦ（７５ｍＭ）に溶解させ０℃に冷却し、トリエチルアミン（２．０当量）とＨＡＴＵ（１．０当量）とを加えた。１０分後、３－（ジメチルアミノ）－１－プロピルアミン（１．０当量）を添加し前記混合物をさらに３０分かき混ぜた。酢酸エチルを加えて生成物を沈殿させ、ろ過し、追加の酢酸エチルで洗浄した。固形物質を３０℃真空オーブンで乾燥させ、さらなる精製なしに次の反応に用いた。

【0054】

（ｃ）カップリング生成物（６６７ｇ）と水（１２．５Ｌ）とのスラリーを２℃に冷却し、４℃より低い温度を維持するために５分かけて水酸化ナトリウム水溶液（２Ｍ、１．４Ｌ）を添加した。温度をその後６℃に調整し、この温度で反応混合物を３時間かき混ぜた。

【国際調査報告】