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特表2024-519888カプシド変異を有する組換えアデノ随伴ウイルス及びその応用
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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-05-21
(54)【発明の名称】カプシド変異を有する組換えアデノ随伴ウイルス及びその応用
(51)【国際特許分類】
   C07K 14/015 20060101AFI20240514BHJP
   C12N 7/00 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 15/35 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 15/63 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 1/15 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 1/21 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 5/10 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 1/19 20060101ALI20240514BHJP
   A61K 35/76 20150101ALI20240514BHJP
   A61K 31/7088 20060101ALI20240514BHJP
   A61K 48/00 20060101ALI20240514BHJP
   A61P 27/02 20060101ALI20240514BHJP
   C12N 15/864 20060101ALN20240514BHJP
【FI】
C07K14/015 ZNA
C12N7/00
C12N15/35
C12N15/63 Z
C12N1/15
C12N1/21
C12N5/10
C12N1/19
A61K35/76
A61K31/7088
A61K48/00
A61P27/02
C12N15/864 100Z
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2023571788
(86)(22)【出願日】2022-05-27
(85)【翻訳文提出日】2023-11-17
(86)【国際出願番号】 CN2022095422
(87)【国際公開番号】W WO2022247917
(87)【国際公開日】2022-12-01
(31)【優先権主張番号】202110594986.X
(32)【優先日】2021-05-28
(33)【優先権主張国・地域又は機関】CN
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】523435750
【氏名又は名称】上海瑞宏迪医薬有限公司
【氏名又は名称原語表記】Shanghai Regenelead Therapies Co., LTD.
【住所又は居所原語表記】Second Floor, No.13 Building, No. 27 Xinjinqiao Road, Free Trade Pilot Zone, Pudong New Area, Shanghai 201206, China
(74)【代理人】
【識別番号】100145403
【弁理士】
【氏名又は名称】山尾 憲人
(74)【代理人】
【識別番号】100106518
【弁理士】
【氏名又は名称】松谷 道子
(74)【代理人】
【識別番号】100138911
【弁理士】
【氏名又は名称】櫻井 陽子
(72)【発明者】
【氏名】張 文涛
(72)【発明者】
【氏名】廖 成
(72)【発明者】
【氏名】寧 威
【テーマコード(参考)】
4B065
4C084
4C086
4C087
4H045
【Fターム(参考)】
4B065AA95X
4B065AA95Y
4B065AB01
4B065AC14
4B065BA02
4B065CA44
4C084AA13
4C084NA05
4C084NA06
4C084NA13
4C084ZA331
4C084ZA332
4C086AA01
4C086AA02
4C086EA16
4C086MA02
4C086MA05
4C086MA66
4C086NA05
4C086NA13
4C086NA14
4C086ZA33
4C087AA01
4C087AA02
4C087BC83
4C087CA12
4H045AA10
4H045AA20
4H045AA30
4H045BA10
4H045CA01
4H045EA20
4H045FA74
(57)【要約】
カプシド変異を有する組換えアデノ随伴ウイルス及びその応用を提供する。具体的には、変異体アデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質、上記変異体AAVカプシドタンパク質を含む組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)のウイルス粒子及びその標的細胞(例えば、網膜細胞)に遺伝子産物を送達する応用を提供する。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
親AAVカプシドタンパク質と比較して挿入したポリペプチドを含む変異体アデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質であって、
前記挿入したポリペプチドは、以下の1)~6):
1)LGDTTRP(配列番号12)又はLALGDTTRPA(配列番号18)、
2)LAETTRP(配列番号11)又はLALAETTRPA(配列番号17)、
3)LGETTRN(配列番号13)又はLALGETTRNA(配列番号19)、
4)KADTTKN(配列番号14)又はLAKADTTKNA(配列番号20)、
5)KDDTTRN(配列番号15)又はLAKDDTTRNA(配列番号21)、
6)LADTTKN(配列番号16)又はLALADTTKNA(配列番号22)
からなる群より選ばれた何れか一項に示されるポリペプチド又はそれらの任意の組み合わせを含む、
変異体AAVカプシドタンパク質。
【請求項2】
前記1)~6)の何れか一項のポリペプチド又はそれらの任意の組み合わせは、前記AAVカプシドタンパク質のGH環内に位置し、
好ましくは、親AAV2カプシドタンパク質のVP1をコードするアミノ酸配列の第570位と611位との間の任意のアミノ酸残基の後に位置し、
より好ましくは、親AAV2カプシドタンパク質のVP1をコードするアミノ酸配列の第587位と588位との間、又は親AAV9カプシドタンパク質のVP1をコードするアミノ酸配列の第588位と589位との間、又は他の親AAV血清型カプシドタンパク質の対応する位置に位置する、
請求項1に記載の変異体AAVカプシドタンパク質。
【請求項3】
1L、15P、34A、57D、66K、81Q、101R、109T、144K、144M、164K、176P、188I、196Y、226E、236V、240T、250S、312K、363L、368H、449D、456K、463Y、472N、484C、524T、535S、551S、593E、698V、708I、719M、721L及び735Qからなる群より選ばれた1つ又は複数のアミノ酸残基の点変異を更に含み、前記変異の位置は、配列番号1に示されるAAV2のカプシドタンパク質、又は他のAAV血清型カプシドタンパク質の対応する位置に基づき、
好ましくは、前記点変異は708Iである、
請求項1又は2に記載の変異体AAVカプシドタンパク質。
【請求項4】
アミノ酸配列は、配列番号3~9及び23~27の何れか1つに示されるか、或いはそれと少なくとも90%又は95%の配列同一性を有する、
請求項1~3の何れか一項に記載の変異体AAVカプシドタンパク質。
【請求項5】
組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ウイルス粒子であって、
(a)請求項1~4の何れか一項に記載の変異体AAVカプシドタンパク質と、
(b)異種ポリヌクレオチドと、を含む、
(rAAV)ウイルス粒子。
【請求項6】
前記異種ポリヌクレオチドは、ポリペプチド、干渉RNA又はアプタマーから選ばれる遺伝子産物をコードするポリヌクレオチドを含み、
前記ポリペプチドは、好ましくは抗体又はその抗原結合断片、融合タンパク質である、
請求項5に記載のrAAVウイルス粒子。
【請求項7】
前記異種ポリヌクレオチドは、以下の(a)~(g):
(a)5’末端逆位反復配列(5’ITR)及び/又は3’末端逆位反復配列(3’ITR)、
(b)5’未翻訳領域(5’UTR)及び/又は3’未翻訳領域(3’UTR)、
(c)プロモーター、
(d)エンハンサー、
(e)転写後調節エレメント、
(f)ポリアデニル化シグナル(polyA)、及び
(g)Kozak配列
からなる群より選ばれた1つ又は複数を更に含み、
好ましくは、前記異種ポリヌクレオチドは、以下の(a)~(g):
(a)AAV2に由来する5’ITR及び/又は3’ITR、
(b)Xenopus globinに由来する5’UTR及び/又は3’UTR、
(c)CMVプロモーター、
(d)CMVエンハンサー、
(e)WPRE、
(f)SV40 polyA、及び
(g)Kozak配列
からなる群より選ばれた1つ又は複数を更に含む、
請求項6に記載のrAAVウイルス粒子。
【請求項8】
前記異種ポリヌクレオチドは、5’末端から3’末端へ、下記のように操作可能に連結され、以下の(a)~(h):
(a)エンハンサー、
(b)プロモーター、
(c)5’UTR、
(d)Kozak配列、
(e)遺伝子産物をコードするポリヌクレオチド、
(f)3’UTR、
(g)WPRE、
(h)polyA
のように順序付けられたポリヌクレオチドを含む、
請求項7に記載のrAAVウイルス粒子。
【請求項9】
前記ポリペプチドは、神経保護ポリペプチド、抗血管新生ポリペプチド、網膜細胞機能を強化するポリペプチドであり、
好ましくは、前記抗血管新生ポリペプチドはVEGFアンタゴニストであり、
より好ましくは、前記VEGFアンタゴニストはアフリベルセプト(aflibercept)である、
請求項6~8の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子。
【請求項10】
前記異種ポリヌクレオチドは、配列番号38に示されるアフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを含み、
好ましくは、前記異種ポリヌクレオチドは、配列番号39~41の何れか1つに示されるか、或いはそれと少なくとも90%又は95%の配列同一性を有するポリヌクレオチドを含む、
請求項5~9の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子。
【請求項11】
分離したポリヌクレオチドであって、
請求項1~4の何れか一項に記載の変異体AAVカプシドタンパク質をコードする、
ポリヌクレオチド。
【請求項12】
ベクターであって、
(a)請求項11に記載の分離したポリヌクレオチドと、又は
(b)請求項11に記載の分離したポリヌクレオチド及び請求項5~10の何れか一項に記載の異種ポリヌクレオチドと、を含む、
ベクター。
【請求項13】
請求項12に記載のベクターを含む、
宿主細胞。
【請求項14】
医薬組成物であって、
(a)請求項5~10の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子と、
(b)1種又は複数種の薬学的に許容されるベクター、希釈剤、賦形剤又は緩衝液と、を含む、
医薬組成物。
【請求項15】
網膜細胞に特異的に感染する方法であって、
有効量の請求項5~10の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子、請求項5~10の何れか一項に記載の異種ポリヌクレオチド又は請求項14に記載の医薬組成物を眼内に注射するステップを含み、好ましくは、硝子体内注射又は網膜下注射による、
方法。
【請求項16】
眼部関連疾患を治療する方法であって、
予防又は治療有効量の請求項5~10の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子、請求項5~10の何れか一項に記載の異種ポリヌクレオチド又は請求項14に記載の医薬組成物を、必要とする対象に投与することを含み、好ましくは、硝子体内注射又は網膜下注射による、
方法。
【請求項17】
前記眼部関連疾患は網膜細胞疾患であり、好ましくは、前記網膜細胞疾患は、光受容細胞、網膜神経節細胞、Muller細胞、双極細胞、アマクリン細胞、水平細胞又は網膜色素上皮細胞から選ばれる疾患である、
請求項16に記載の方法。
【請求項18】
前記眼部関連疾患は、網膜色素変性、黄斑変性、湿性AMD、乾性AMD、網膜血管新生、脈絡膜血管新生、糖尿病性網膜病変、増殖性糖尿病網膜病変、網膜静脈閉塞症、網膜中心静脈閉塞症、網膜静脈分枝閉塞症、糖尿病性黄斑浮腫、糖尿病性網膜虚血、虚血性網膜病変、糖尿病性網膜浮腫、網膜剥離、緑内障、レーベル先天性黒内障及び/又は色盲から選ばれる、
請求項16又は17に記載の方法。
【請求項19】
体外及び/又は体内で標的細胞に異種ポリヌクレオチドを送達する方法であって、
前記標的細胞を、請求項5~10の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子、請求項5~10の何れか一項に記載の異種ポリヌクレオチド又は請求項14に記載の医薬組成物と接触させることを含む、
方法。
【請求項20】
rAAVウイルス粒子産生システムであって、
(a)請求項11に記載の分離したポリヌクレオチドと、
(b)遺伝子産物をコードする異種ポリヌクレオチドと、
(c)遺伝子産物をコードする(b)の異種ポリヌクレオチドを(a)の変異体AAVカプシドにパッケージングするのに十分なAAV rep機能及びヘルパー機能を有するヘルパーエレメントと、を含む、
システム。
【請求項21】
請求項5~10の何れか一項に記載のrAAVウイルス粒子を産生又は製造する方法であって、
請求項12に記載のベクター、ヘルパーエレメントを含むベクターを産生細胞に導入し、前記rAAVウイルス粒子をパッケージング、精製することを含む、
方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本願は、2021年05月28日に提出された、出願番号が202110594986.Xである中国特許出願の優先権を主張する。
【0002】
本開示は、組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)技術分野に関し、具体的には、カプシド変異を有するrAAVウイルス粒子及び標的細胞(例えば、網膜細胞)に遺伝子産物を送達するその応用に関する。
【背景技術】
【0003】
アデノ随伴ウイルス(AAV)は、パルボウイルス科(Parvoviridae)のディペンドウイルス属(Dependovirus)に属し、小さな(25nm)、非エンベロープ単鎖DNAウイルスであり、核酸が二十面体カプシド(cap)でカプセル化されている。AAVは、ゲノム複製に必要な4つのタンパク質(Rep78、Rep68、Rep52及びRep40)をコードするためのrep、ウイルスカプシド構築に必要な3つの構造タンパク質(VP1~VP3)をコードするためのcapである2つのオープンリーディングフレームを含む。
【0004】
AAVは、ベクターとして、遺伝性疾患、先天性疾患の治療に対する大きな潜在力を示し、遺伝子補充療法(遺伝子強化療法とも呼ばれる)に使用されている。欠失した遺伝子機能を補完することにより、変異による遺伝子機能の喪失や調節不全を回復して、目的細胞の生物学的機能を正常な生理状態に回復させる。臨床前疾患モデル及びヒト臨床試験におけるAAVに基づいたベクターの表現が、幾つかの疾患治療の適用の将来性を示し、例えば、遺伝子の網膜細胞への効率的な転移及び長期的且つ持続的発現を達成することができることが研究により示されている(Boye et al. Mol Ther.2013 Mar、21(3):509-19. Trapani et al. Prog Retin Eye Res. 2014 Nov、43:108-28.)。現在、臨床で使用されているAAVベクターは、遺伝子工学改変により、ヘルパーウイルス無しで潜伏状態を呈し、その安全性及び導入遺伝子の長期発現は、齧歯類動物モデル、非ヒト霊長類動物及び複数の人体試験で広く試験されている(MacLaren et al. Lancet.2014 Mar 29、383(9923):1129-37、Maguire et al. N Engl J Med. 2008 May 22、358(21):2240-8、Simonelli et al. Mol Ther. 2010 Mar、18(3):643-50、Nathwani et al. N Engl J Med. 2014 Nov 20、371(21):1994-2004)。
【0005】
AAVカプシドタンパク質は、組成及び構造において異なる天然に存在し、異なるカプシドは、異なる組織指向性を有する。複数の相同霊長類AAV血清型及び非ヒト霊長類AAV血清型が同定されており、異なる改変されたAAV変異体(AAV血清型とも呼ばれる)が開発されている。AAVベクターは、様々な生体及び組織において、ある程度の拡散感染が示されているが、多くの臨床試験、特に眼部遺伝子治療における応用において、何れも局所的な病変領域注入が使用されている。現在の主な眼部臨床実施形態は、網膜下腔注射(即ち、RPEと光受容細胞との間に液体を注射した後に形成された空洞)及び硝子体腔注射である。網膜下腔注射により、AAVがRPE及び光受容細胞に十分に接触でき、局所感染効果が高いが、注射操作に対するリスクが高く、網膜脱落を引き起こしやすい。硝子体腔注射の場合、AAV製剤は、まず硝子体液中に均一に分布し、次に網膜を層ごとに拡散感染する。網膜層の緻密な構造及び複雑な細胞集団構成のため、眼部に対する強い浸潤性を有するネイティブ血清型のAAV8、AAV2は、硝子体腔注射時に効果が低いが、部分的に改変されたカプシドは、硝子体腔注射を実施する時に強い感染能力(例えば、AAVDJ、AAV2.7M8など)が示されている。
【0006】
当該分野では、依然として新型AAV変異体が必要である。本開示は、新しい構造のカプシドタンパク質を有し、網膜組織に対する感染指向性が高く、異種遺伝子に対する発現効率が高い組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)のウイルス粒子を提供するため、臨床治療のためにより潜在力のある方法を提供する。
【発明の概要】
【0007】
本開示は、変異体AAVカプシドタンパク質及びそれが保有し得る遺伝子産物、上記カプシドタンパク質を含むrAAVウイルス粒子、医薬組成物、上記rAAVウイルス粒子に感染する細胞(例えば、網膜細胞)、疾患(例えば、眼部疾患)を治療及び予防する方法並びに製薬用途を提供する。
【0008】
変異体アデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質
本開示は、親AAVカプシドタンパク質と比較して挿入したポリペプチドを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質を提供しており、上記挿入したポリペプチドは、以下の1)~6):
1)LAETTRP(配列番号11)又は配列番号11からなるポリペプチド、
2)LGDTTRP(配列番号12)又は配列番号12からなるポリペプチド、
3)LGETTRN(配列番号13)又は配列番号13からなるポリペプチド、
4)KADTTKN(配列番号14)又は配列番号14からなるポリペプチド、
5)KDDTTRN(配列番号15)又は配列番号15からなるポリペプチド、
6)LADTTKN(配列番号16)又は配列番号16からなるポリペプチド
からなる群より選ばれた何れか一項に示されるポリペプチド又はそれらの任意の組み合わせを含む。
【0009】
本開示は、親AAVカプシドタンパク質と比較して挿入したポリペプチドを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質を提供しており、上記ポリペプチドは、XTTX(配列番号35)を含むか、又は配列番号35からなり、そのうち、XはL又はKから選ばれ、XはG、D又はAから選ばれ、XはD又はEから選ばれ、XはR又はKから選ばれ、XはP又はNから選ばれる。
【0010】
幾つかの実施形態において、上記1)~6)又は配列番号35に示されるポリペプチドは、そのアミノ末端及び/又はカルボキシ末端において1個~4個のスペーサーアミノ酸(Y~Y)を有する。幾つかの具体的な実施形態において、上記スペーサーアミノ酸は、A、L、G、S及びTを含むが、これらに限定されない。
【0011】
本開示は、親AAVカプシドタンパク質と比較して挿入したポリペプチドを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質を提供しており、上記ポリペプチドは、YTTX(配列番号36)を含むか、又は配列番号36からなり、そのうち、XはL又はKから選ばれ、XはG、D又はAから選ばれ、XはD又はEから選ばれ、XはR又はKから選ばれ、XはP又はNから選ばれ、Y、Y、Y、Yは独立的に存在又は非存在であってもよく、Y、Y、Y、Yは独立的にA、L、G、S及びTから選ばれてもよい。例えば、YはL、YはA、YはA、Yは存在しない。
【0012】
本開示は、親AAVカプシドタンパク質と比較して挿入したポリペプチドを含むアデノ随伴ウイルス(AAV)カプシドタンパク質を提供しており、上記挿入したポリペプチドは、以下の1-1)~1-6):
1-1)LALAETTRPA(配列番号17)を含むか、又は配列番号17からなるポリペプチド、
2-1)LALGDTTRPA(配列番号18)を含むか、又は配列番号18からなるポリペプチド、
3-1)LALGETTRNA(配列番号19)を含むか、又は配列番号19からなるポリペプチド、
4-1)LAKADTTKNA(配列番号20)を含むか、又は配列番号20からなるポリペプチド、
5-1)LAKDDTTRNA(配列番号21)を含むか、又は配列番号21からなるポリペプチド、
6-1)LALADTTKNA(配列番号22)を含むか、又は配列番号22からなるポリペプチド
からなる群より選ばれた何れか一項に示されるポリペプチド又はそれらの任意の組み合わせを含む。
【0013】
幾つかの実施形態において、上記AAVカプシドタンパク質は、AAV2カプシドタンパク質、又はAAV9カプシドタンパク質である。
【0014】
幾つかの実施形態において、上記1)~6)、1-1)~6-1)、配列番号35又は36のポリペプチドは、親AAVカプシドタンパク質のGH環又はIV環(環状ドメインIV)に、例えばAAVカプシドタンパク質のGH環又はIV環の溶媒接近性部分に位置する(van Vliet et al.(2006)Mol.Ther.14:809、Padron et al.(2005)J.Virol.79:5047、及びShen et al.(2007)Mol.Ther.15:1955を参照)。「親AAVカプシドタンパク質」は、挿入したポリペプチドを含まない同じAAV血清型のカプシドタンパク質を指す(野生型AAV血清型又はその変異体カプシドタンパク質、例えば本開示の配列番号1に示されるAAV2カプシドタンパク質又は配列番号37に示されるAAV9カプシドタンパク質を含み、上記AAV2カプシドタンパク質はV708I変異を有してもよく有さなくてもよい)。
【0015】
幾つかの実施形態において、上記AAVは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10(AAVrh10を含む)から選ばれる。
【0016】
幾つかの実施形態において、上記挿入したポリペプチドは、親AAVカプシドタンパク質のアミノ酸残基の411位と650位との間に、又は432位と640位との間に、又は570位と671位との間に、又は570位と614位との間に、又は570位と610位との間に、又は580位と600位との間に、又は570位と575位との間に、又は575位と580位との間に、又は580位と585位との間に、又は585位と590位との間に、又は590位と600位との間に、又は600位と614位との間に位置する。例えば、親AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸残基の570位と611位との間に、親AAV1カプシドタンパク質のアミノ酸残基の571位と612位との間に、親AAV5カプシドタンパク質のアミノ酸残基の560位と601位との間に、親AAV6カプシドタンパク質のアミノ酸の571位と612位との間に、親AAV7カプシドタンパク質のアミノ酸残基の572位と613位との間に、親AAV8カプシドタンパク質のアミノ酸残基の573位と614位との間に、親AAV9カプシドタンパク質のアミノ酸残基の571位と612位との間に、又は親AAV10(AAVrh10を含む)カプシドタンパク質のアミノ酸残基の573位と614位との間に位置する。
【0017】
幾つかの実施形態において、上記挿入したポリペプチドは、親AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸残基の587位と588位との間に、又は親AAV9カプシドタンパク質のアミノ酸残基の588位と589位との間に、又は他の親AAV血清型のカプシドタンパク質の対応する位置に位置する。幾つかの実施形態において、挿入したポリペプチドは、親AAV2カプシドタンパク質のアミノ酸残基の587位と588位との間に、又は親AAV9カプシドタンパク質のアミノ酸残基の588位と589位との間に、又は他の親AAV血清型のカプシドタンパク質の対応する位置に位置する。他の血清型は、例えばAAV1、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8又はAAV10(AAVrh10を含む)から選ばれる。AAV2のカプシドタンパク質VP1のアミノ酸570~611に対応する異なるAAV血清型における配列は、当該分野で公知である(例えば、WO2012145601Aの図6、及び、GenBank登録番号NP_049542のAAV1、AAD13756のAAV5、AAB95459のAAV6、YP_077178のAAV7、YP_077180のAAV8、AAS99264のAAV9及びAAT46337のAAV10を参照)。幾つかの実施形態において、挿入したポリペプチドは、親AAV1カプシドタンパク質のアミノ酸残基の590位と591位との間に、親AAV5カプシドタンパク質のアミノ酸残基の575位と576位との間に、親AAV6カプシドタンパク質のアミノ酸残基の590位と591位との間に、親AAV7カプシドタンパク質のアミノ酸残基の589位と590位との間に、親AAV8カプシドタンパク質のアミノ酸残基の590位と591位との間に、親AAV10(AAVrh10を含む)カプシドタンパク質のアミノ酸残基の588位と589位との間に位置する。
【0018】
本開示のアミノ酸残基の数は、AAVカプシドタンパク質のVP1をコードするアミノ酸配列のN末端から自然数でカウントされている。例えば、「挿入したポリペプチドがAAV2カプシドタンパク質のアミノ酸残基の587位と588位との間に位置する」とは、上記ポリペプチドがAAV2カプシドタンパク質のVP1をコードするアミノ酸配列の第587位と588位との間に位置し、VP2をコードするアミノ酸配列において第450位と451位との間に対応し、VP3をコードするアミノ酸配列において第385位と386位との間に対応する。
【0019】
幾つかの実施形態において、上記挿入したポリペプチドは、親AAVカプシドタンパク質のアミノ酸残基の450位と460位との間に、例えば親AAV2のアミノ酸残基の453位、親AAV1のアミノ酸残基の454位、親AAV6のアミノ酸残基の454位、親AAV7のアミノ酸残基の456位、親AAV8のアミノ酸残基の456位、親AAV9のアミノ酸残基の454位、親AAV10(AAVrh10を含む)のアミノ酸残基の456位の前又は後に位置する。WO2012145601Aの図17に示される異なるAAV血清型のカプシドタンパク質のアミノ酸残基及びそれらの対応関係の全体は、ここに組み込まれている。
【0020】
幾つかの実施形態において、本開示は、上記1)~6)、1-1)~6-1)、配列番号35又は36のポリペプチドを含む変異体AAVカプシドタンパク質を提供する。
【0021】
幾つかの実施形態において、本開示の上記変異体AAVカプシドタンパク質は、1つ又は複数のアミノ酸残基の点変異(置換、欠失及び/又は付加を含む)を更に含む。
【0022】
幾つかの実施形態において、上記アミノ酸残基の点変異は、1位、15位、34位、57位、66位、81位、101位、109位、144位、164位、176位、188位、196位、226位、236位、240位、250位、312位、363位、368位、449位、456位、463位、472位、484位、524位、535位、551位、593位、698位、708位、719位、721位及び735位に位置する1つ又はそれらの任意の組み合わせである。
【0023】
幾つかの実施形態において、上記アミノ酸残基の点変異(置換)は、1L、15P、34A、57D、66K、81Q、101R、109T、144K又はM、164K、176P、188I、196Y、226E、236V、240T、250S、312K、363L、368H、449D、456K、463Y、472N、484C、524T、535S、551S、593E、698V、708I、719M、721L及び735Qからなる群より選ばれた1つ又はそれらの任意の組み合わせであり、例えば312K、449D、472N、551S、698V、735Q、273F、444F、500F、730F、708Iの1つ又は複数、例えば708Iである。
【0024】
幾つかの実施形態において、上記アミノ酸残基の点変異(置換)は、M1L、L15P、P34A、N57D、N66K、R81Q、Q101R、S109T、R144K、R144M、Q164K、T176P、L188I、S196Y、G226E、G236V、I240T、P250S、N312K、P363L、D368H、N449D、T456K、S463Y、D472N、R484C、A524T、P535S、N551S、A593E、I698V、V708I、V719M、S721L、L735Q、Y273F、Y444F、Y500F、Y730Fからなる群より選ばれた1つ又はそれらの任意の組み合わせであり、例えばN312K、N449D、D472N、N551S、I698V、L735Q、Y273F、Y444F、Y500F、Y730F、V708Iの1つ又は複数である。
【0025】
幾つかの具体的な実施形態において、上記アミノ酸残基の点変異(置換)は708I及び/又は449D、或いは、V708I及び/又はN449Dである。幾つかの具体的な実施形態において、上記アミノ酸残基の変異(置換)は273F、444F、500F及び/又は730F、或いは、Y273F、Y444F、Y500F及び/又はY730Fである。
【0026】
上記点変異は、対応する親AAVカプシドタンパク質の対応する位置に対するものであり、例えば、親AAV2カプシドタンパク質の対応する位置に対するものである。
【0027】
WO2012145601A、WO2017197355A、WO2018022905Aのカプシドタンパク質の変異の全体は、本開示に組み込まれている。
【0028】
幾つかの実施形態において、本開示のAAVカプシドはキメラカプシドである。例えば、カプシドは、第1のAAV血清型AAVカプシドの一部及び第2の血清型AAVカプシドの一部を含み、上記血清型は、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV10(AAVrh10を含む)を含むが、これらに限定されない。例えば、上記AAVカプシドは、AAV2及びAAV9に由来する配列を含むAAV2G9であってもよく、US20160017005のAAV2G9配列の全体は、ここに組み込まれている。
【0029】
幾つかの実施形態において、本開示の変異体AAVカプシドタンパク質は、分離されるか、及び/又は精製される。
【0030】
幾つかの実施形態において、本開示は、対応する親AAV2カプシドタンパク質(例えば配列番号1に示される)と比較してカプシドタンパク質GH環又はIV環(環状ドメインIV)においてポリペプチドを含む変異体AAV2カプシドタンパク質を提供しており、上記ポリペプチドは、上記1)~6)、1-1)~6-1)、配列番号35又は36から選ばれる。幾つかの具体的な実施形態において、ポリペプチドは、配列番号12又は18であるか、又はそれらを含む。幾つかの具体的な実施形態において、ポリペプチドは、親AAV2カプシドタンパク質のVP1の第587位と588位のアミノ酸残基の間に位置する。
【0031】
幾つかの実施形態において、本開示は、対応する親AAV9カプシドタンパク質(例えば配列番号37に示される)と比較してカプシドタンパク質GH環又はIV環(環状ドメインIV)においてポリペプチドを含む変異体AAV9カプシドタンパク質を提供しており、上記ポリペプチドは、上記1)~6)、1-1)~6-1)、配列番号35又は36から選ばれる。幾つかの具体的な実施形態において、ポリペプチドは、配列番号12又は18であるか、又はそれらを含む。幾つかの具体的な実施形態において、ポリペプチドは、親AAV9カプシドタンパク質のVP1の第588位と589位のアミノ酸残基の間に位置する。
【0032】
幾つかの実施形態において、本開示は、変異体AAVカプシドタンパク質を提供しており、そのアミノ酸配列が配列番号3~9、23~27の何れか1つに示されるか、又はそれと少なくとも85%、少なくとも90%、少なくとも95%、少なくとも96%、少なくとも97%、少なくとも98%、少なくとも99%の配列同一性を有する。
【0033】
幾つかの実施形態において、本開示により提供される変異体AAVカプシドタンパク質は、
(a)対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子の眼組織(例えば、網膜細胞)の感染性と比較して、眼組織(例えば、網膜細胞)の感染性が増加する、特に網膜神経細胞層の感染性が増加すること、
(b)対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子の指向性と比較して、細胞指向性が変化すること、
(c)対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子と比較して、内境界膜(ILM)に結合する及び/又はそれを通過する能力が増加すること、及び/又は
(d)対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子と比較して、眼組織(例えば、網膜組織、房水、硝子体)において、カプセル化又は保有される遺伝子産物に対する発現量が増加すること、
という特性を有する。
【0034】
組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)ウイルス粒子
本開示は、以下を含む組換えアデノ随伴ウイルス(rAAV)のウイルス粒子を提供し、
(a)本開示の任意の変異体AAVカプシドタンパク質を含み、
(b)場合により、異種ポリヌクレオチドを含む。
【0035】
幾つかの実施形態において、上記異種ポリヌクレオチドは、遺伝子産物を発現又はコードするポリヌクレオチドを含む。幾つかの実施形態において、上記遺伝子産物はAAVに対して異種である。幾つかの実施形態において、上記遺伝子産物は標的細胞に対して異種又は内因性である。幾つかの実施形態において、上記遺伝子産物は1つ又は複数(例えば、2個、3個、4個)である。
【0036】
幾つかの実施形態において、上記異種ポリヌクレオチドには、遺伝子産物の発現又はコードを調節する調節配列を含む。
【0037】
遺伝子産物について:
幾つかの実施形態において、上記遺伝子産物は疾患、病状に対して治療的又は予防的である。
【0038】
幾つかの実施形態において、上記遺伝子産物は、干渉RNA(RNAi)、アプタマー、ポリペプチドから選ばれる。
【0039】
幾つかの具体的な実施形態において、上記遺伝子産物はRNAiであり、例えば細胞におけるアポトーシス因子又は血管新生因子のレベルを減少、低減するRNAiである。例えば、RNAiは、細胞におけるアポトーシスを誘導又は促進する遺伝子産物のレベルを低減するshRNA又はsiRNAであってもよく、上記アポトーシスを促進する遺伝子産物は、Bax、Bid、Bak及びBadなどの遺伝子産物を含む(US7,846,730を参照し、且つ全てここに組み込まれている)。別の例として、RNAiは、例えばVEGF(例えばCand5、US2011/0143400、US2008/0188437を参照し、且つ全てここに組み込まれている)、VEGFR1(例えばSirna-027、Kaiser et al.(2010)Am.J.Ophthalmol.150:33、及びShen et al.(2006)Gene Ther.13:225を参照し、且つ全てここに組み込まれている)又はVEGFR2(例えばKou et al.(2005)Biochem.44:15064を参照し、且つ全てここに組み込まれている)などの血管新産生物に対するものであってもよい。
【0040】
幾つかの具体的な実施形態において、上記遺伝子産物は、VEGFに対する特異的アプタマー(例えば5’-cgcaaucagugaaugcuuauacauccg-3’、Ng et al.(2006)Nat.Rev.Drug Discovery5:123、及びLee et al.(2005)Proc.Natl.Acad.Sci.USA 102:18902を参照し、且つ全てここに組み込まれている)、PDGFに対する特異的アプタマー(例えばE10030、NiとHui(2009)Ophthalmologica 223:401、及びAkiyama et al.(2006)J.CellPhysiol.207:407を参照し、且つ全てここに組み込まれている)などのアプタマーである。
【0041】
幾つかの具体的な実施形態において、上記遺伝子産物はポリペプチドである。
【0042】
幾つかの具体的な実施形態において、上記遺伝子産物は、神経保護ポリペプチド、抗血管新生ポリペプチド又は網膜細胞機能を強化するポリペプチドである。
【0043】
幾つかの具体的な実施形態において、上記ポリペプチドは、網膜細胞の機能を強化する、例えば、桿体若しくは錐体光受容細胞、網膜神経節細胞、Muller細胞、双極細胞、アマクリン細胞、水平細胞又は網膜色素上皮細胞の機能を強化することができる。
【0044】
幾つかの具体的な実施形態において、上記ポリペプチドは、神経保護ポリペプチド(例えば、GDNF、CNTF、NT4、NGF及びNTN)、抗血管新生ポリペプチド(例えば、可溶性血管内皮成長因子(VEGF)受容体、抗VEGF抗体又はその抗原結合断片、エンドスタチン(endostatin)、タムスタチン(tumstatin)、アンギオスタチン(angiostatin)、可溶性Fltポリペプチド及びFc領域との融合タンパク質(Lai et al.(2005)Mol.Ther.12:659、Pechan et al.(2009)Gene Ther.16:10を参照)、色素上皮衍生因子(PEDF)、可溶性Tie-2受容体など)、組織金属プロテアーゼ阻害剤-3(TIMP-3)、光応答性オプシン(例えばロドプシン)、抗アポトーシスポリペプチド(例えばBcl-2、Bcl-Xl)などを含むか、又はそれらから選ばれる。
【0045】
幾つかの具体的な実施形態において、上記ポリペプチドは、上皮成長因子、ロドプシン、X連鎖アポトーシス阻害タンパク質を含むが、これらに限定されない。
【0046】
幾つかの具体的な実施形態において、上記ポリペプチドは、網膜スプリットタンパク質(retinoschisin)、網膜色素変性GTP酵素モジュレーター(RGPR)相互作用タンパク質-1(GenBank Accession NO. Q96KN7、Q9EPQ2、Q9GLM3)、末梢タンパク質-2(Prph2)(GenBank Accession NO. NP_000313)、網膜色素上皮特異的タンパク質(RPE65)(GenBank Accession NO. AAC39660)を含むが、これらに限定されない。
【0047】
幾つかの具体的な実施形態において、上記ポリペプチドは、欠損又は欠失の場合に、CHM(脈絡膜欠損(choroidermia)(Rabエスコートタンパク質1))(Donnelly et al.(1994)Hum.Mol.Genet.3:1017)などの無脈絡膜を引き起こすポリペプチド、欠損又は欠失の場合に、デブリホモログ1(CRB1)(GenBank Accession NO. CAM23328)などのレーベル先天性黒内障を引き起こすポリペプチド及び色素性網膜炎を引き起こすポリペプチド、欠損又は欠失の場合に、桿体光受容cGMP-ゲートチャネルサブユニットα(CNGA3)(GenBank Accession NO. NP_001289)、桿体光受容cGMP-ゲートチャネルβサブユニット(CNGB3)、グアニンヌクレオチド結合タンパク質(Gタンパク質)、α形質導入活性ポリペプチド2(GNAT2)(ACHM4)、ACHM5、L-オプシン、M-オプシン及びS-オプシンなどの色盲を引き起こすポリペプチドを含むが、これらに限定されない。
【0048】
幾つかの具体的な実施形態において、上記遺伝子産物は、遺伝子機能の部位特異性をノックダウンするための部位特異的エンドヌクレアーゼを提供しており、例えば、エンドヌクレアーゼは網膜疾患に関連する対立遺伝子をノックアウトする。例えば、優性対立遺伝子が、野生型に属する時の網膜構造タンパク質及び/又は正常な網膜機能を提供する遺伝子の欠損コピーをコードする場合、部位特異的エンドヌクレアーゼは、欠損対立遺伝子を標的とし、欠損対立遺伝子をノックアウトすることができる。上記部位特異的エンドヌクレアーゼは、例えば、ジンクフィンガーヌクレアーゼ(ZFNs)及び転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALENs)であり、そのうち、このような部位特異的エンドヌクレアーゼは、天然に存在せず、特定の遺伝子を標的とするように修飾されている。
【0049】
また、WO2012145601A、WO2017197355A、WO2018022905Aの上記遺伝子産物の配列、由来は、本開示によりその全体が組み込まれている。
【0050】
幾つかの具体的な実施形態において、本開示の遺伝子産物は、抗VEGF抗体若しくはその抗原結合断片などの抗血管新生ポリペプチドを含む抗血管新生剤であり、別の例として、VEGFアンタゴニスト(例えばVEGF-A、B、Cアンタゴニスト)又はPDGFアンタゴニストである。
【0051】
幾つかの具体的な実施形態において、VEGFアンタゴニストは、ラニビズマブ(ranibizumab)、ベバシズマブ(bevacizumab)、アフリベルセプト(aflibercept)、KH902 VEGF受容体-Fc融合タンパク質、2C3抗体、ORA102、ペガプタニブナトリウム(pegaptanib)、ベバシラニブ(bevasiranib)、SIRNA-027、デクルシン(decursin)、デクルシノール(decursinol)、ピクロポドフィリン(picropodophyllin)、ググルステロン(guggulsterone)、PLG101、エイコサノイドLXA4、PTK787、パゾパニブ(pazopanib)、アキシチニブ(axitinib)、CDDO-Me、CDDO-Imm、シコニン(shikonin)、β-ヒドロキシイソバレリルシコニン(beta-hydroxyisovalerylshikonin)、又はガングリオシドGM3、DC101抗体、Mab25抗体、Mab73抗体、4A5抗体、4E10抗体、5F12抗体、VA01抗体、BL2抗体、VEGF関連タンパク質、sFLT01、sFLT02、ペプチドB3、TG100801、ソラフェニブ(sorafenib)、スニトナブ(sunitnab)、G6-31抗体、又はその薬学的に許容される塩を含むが、これらに限定されない。WO2018160686AのVEGFアンタゴニスト情報は、全てここに組み込まれている。
【0052】
ラニビズマブ(Lucentis(登録商標))の配列情報はUS7,060,269(図1)を参照し、ベバシズマブ(Avastin(登録商標))の配列情報はUS6,054,297(図1)を参照し、アフリベルセプト(Eyelea(登録商標))の配列情報はDo et al.(Br J Ophthalmol.2009,93:144-9)を参照し、ここでその全体が参照により組み込まれる。
【0053】
幾つかの実施形態において、VEGFアンタゴニストは、天然に存在するタンパク質sFlt-1若しくはその機能断片であるか、又はそれらを含む(例えば、sFlt-1ドメイン2、US5,861,484のsFlt-1配列情報、US2013/0323302のsFlt-1ドメイン2配列情報を参照し、全てここに組み込まれている)。
【0054】
幾つかの実施形態において、VEGFアンタゴニストはVEGF結合融合タンパク質であり、US7、635、474のVEGFに結合する融合タンパク質の配列情報の全体は、ここに組み込まれている。
【0055】
幾つかの具体的な実施形態において、アフリベルセプト(aflibercept)のアミノ酸配列は配列番号38に示され、配列番号38をコードするポリヌクレオチド配列、例えば、コドンにより最適化されたポリヌクレオチド配列を提供し、配列番号39~41の何れか1つに示される。
【0056】
調節配列について:
幾つかの実施形態において、上記ポリヌクレオチドは、以下の(a)~(h):
(a)5’末端逆位反復配列(5’ITR)及び/又は3’末端逆位反復配列(3’ITR)、
(b)5’未翻訳領域(5’UTR)及び/又は3’未翻訳領域(3’UTR)、
(c)プロモーター、
(d)エンハンサー、
(e)イントロン(intron)、
(f)転写後調節エレメント、
(g)ポリアデニル化シグナル(polyA)、
(h)Kozak配列
の何れか一項のポリヌクレオチド(調節配列)又は任意の組み合わせを含む。
【0057】
幾つかの実施形態において、AAV ITRは、野生型ヌクレオチド配列を有する必要がなく、ヌクレオチドの挿入、欠失又は置換により変更されてもよく、或いは、AAV ITRは、幾つかのAAV血清型、例えばAAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9及びAAV10の何れか1つから得られてもよい。幾つかの具体的な実施形態において、5’ITR及び3’ITRはAAV2の5’ITR及び3’ITRである。
【0058】
幾つかの実施形態において、遺伝子産物をコードするヌクレオチド配列は、組織特異的若しくは細胞型特異的調節エレメントに操作可能に連結され、例えば光受容性特異的調節エレメント(例えば、光受容性特異的プロモーター)に操作可能に連結され、別の例として、光受容性細胞内に操作可能に連結された遺伝子の選択的発現を付与する調節エレメントに連結される。
【0059】
幾つかの具体的な実施形態において、(a)~(h)の任意の組み合わせは、遺伝子産物(例えば、抗血管新生剤(又は抗血管新生ポリペプチド)、別の例として、抗VEGF抗体若しくはその抗原結合断片、アフリベルセプト)発現の機能、例えば対象の眼組織(例えば房水、網膜組織)発現の機能を満たすことができる。
【0060】
幾つかの具体的な実施形態において、上記(a)~(h)の何れか一項のポリヌクレオチド又は任意の組み合わせは、上記遺伝子産物をコードするポリヌクレオチドに操作可能に接続される。
【0061】
幾つかの具体的な実施形態において、上記5’ITR及び/又は3’ITRは、AAV1、AAV2、AAV3、AAV4、AAV5、AAV6、AAV7、AAV8、AAV9、AAV9.47、AAV9(hu14)、AAV10、AAV11、AAV12、AAVrh8、AAVrh10、AAV-DJ又はAAV-DJ8に由来し、例えば、AAV2、AAV9に由来する。
【0062】
幾つかの具体的な実施形態において、上記5’UTR及び/又は3’UTRは、ヘモペキシン(hemopexin、HPX)、βグロビン(hemoglobin subunit beta、HBB)、HSPB1、CCL13、ツメガエルグロビン(Xenopus globin)に由来する。例えば、5’UTRの配列は配列番号30に示され、3’UTRの配列は配列番号32に示される。
【0063】
幾つかの具体的な実施形態において、上記プロモーターは、構成的プロモーター又は誘導性プロモーターであってもよい。
【0064】
幾つかの具体的な実施形態において、上記プロモーターは、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、ラウス肉腫ウイルス(RSV)プロモーター、UB6プロモーター、ニワトリβ-アクチンプロモーター、CAGプロモーター、RPE65プロモーター、CBhプロモーター、EFSプロモーター、EF1(例えばEF-1α)プロモーター、PGKプロモーター、SV40プロモーター、Ubiプロモーター、オプシンプロモーター又はそれらの任意の組み合わせから選ばれる。上記オプシンプロモーターは、ロドプシンプロモーター、ロドプシンキナーゼプロモーター(Young et al.(2003)Ophthalmol.Vis.Sci.44:4076)、βホスホジエステラーゼ遺伝子プロモーター(Nicoud et al.(2007)J.Gene Med.9:1015)、網膜色素変性症遺伝子プロモーター(Nicoud et al.(2007)上記と同様)、光受容性レチノイン酸結合タンパク質(IRBP)遺伝子プロモーター(Yokoyama et al.(1992)Exp Eye Res.55:225)を含むが、これらに限定されない。例えば、プロモーターはCMVプロモーターであり、その配列は、例えば配列番号29に示される。
【0065】
幾つかの具体的な実施形態において、上記エンハンサーは、Ubi、CMV、RSV、IRBP遺伝子エンハンサー(Nicoud et al.(2007)J.Gene Med.9:1015)又はその任意の組み合わせから選ばれる。例えば、エンハンサーはCMVエンハンサーであり、その配列は、例えば配列番号28に示される。
【0066】
幾つかの具体的な実施形態において、上記イントロンは、MVM、SV40、β Globin、EF1(例えばEF-1α)、hybridイントロン、又はその任意の組み合わせから選ばれる。
【0067】
幾つかの具体的な実施形態において、上記polyAは、PA75 polyA、SV40 polyA、hGH polyA、BGH polyA、rbGlob polyA又はそれらの任意の組み合わせから選ばれる。例えば、polyAはSV40 polyAであり、その配列は、例えば配列番号34に示される。
【0068】
幾つかの具体的な実施形態において、上記転写後調節エレメントは、WPRE、HPRE又はその組み合わせから選ばれる。例えば、転写後調節エレメントはWPREであり、その配列は、例えば配列番号33に示される。
【0069】
幾つかの実施形態において、上記ポリヌクレオチドは、以下の(a)~(g):
(a)AAV2に由来する5’ITR及び/又は3’ITR、
(b)Xenopus globinに由来する5’UTR及び/又は3’UTR、
(c)CMVプロモーター、
(d)CMVエンハンサー、
(e)WPRE、
(f)Kozak配列、
(g)SV40 polyA
の何れか一項のポリヌクレオチド(調節配列)又は任意の組み合わせを含む。
【0070】
例示的には、ポリヌクレオチドは、5’末端から3’末端への順序は、以下の通りである(括弧内は、任意の調節配列である)。
【0071】
5’ITR-エンハンサー-プロモーター-5’UTR-(Kozak配列)-遺伝子産物-3’UTR-(WPRE)-polyA-3’ITR、又は
エンハンサー-プロモーター-5’UTR-(Kozak配列)-遺伝子産物-3’UTR-(WPRE)-polyA、
プロモーター-(5’UTR)-(Kozak配列)-遺伝子産物-(3’UTR)~(WPRE)-polyA。
【0072】
rAAVウイルス粒子の効果について:
幾つかの実施形態において、rAAVウイルス粒子は感染性を有し、別の幾つかの実施形態において、rAAVウイルス粒子は感染性を有しない。
【0073】
幾つかの実施形態において、対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子の細胞への感染性と比較して、本開示の上記rAAVウイルス粒子は、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも10倍、少なくとも15倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも50倍又はそれ以上が強化された細胞感染性を示し、上記細胞は、
1)網膜細胞、
2)光受容細胞、
3)RPE細胞、
4)双極細胞、
5)アマクリン細胞、及び/又は
6)水平細胞
から選ばれる。
【0074】
幾つかの実施形態において、対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子の内境界膜(ILM)を通過する能力と比較して、本開示の上記rAAVウイルス粒子は、少なくとも2倍、少なくとも3倍、少なくとも4倍、少なくとも5倍、少なくとも10倍、少なくとも15倍、少なくとも20倍、少なくとも25倍、少なくとも50倍又は50倍以上が強化された、ILMを通過する能力を示す。
【0075】
幾つかの実施形態において、本開示の上記rAAVウイルス粒子は、網膜細胞に選択的に感染し、例えば、本開示の上記rAAVウイルス粒子は、非網膜細胞(例えば非眼組織細胞)よりも2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、15倍、20倍、25倍、50倍又は50倍以上強く網膜細胞に特異的に感染する。
【0076】
幾つかの実施形態において、AAV2.7m8カプシドタンパク質を含むrAAVウイルス粒子と比較して、本開示の上記rAAVウイルス粒子(例えば、カプシドタンパク質にseq2が含まれたrAAVウイルス粒子)は、眼全体組織における遺伝子産物(例えばアフリベルセプト)の発現量が2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、15倍、20倍、25倍、50倍又は50倍以上強化される。
【0077】
幾つかの実施形態において、AAV2.7m8カプシドタンパク質を含むrAAVウイルス粒子と比較して、本開示の上記rAAVウイルス粒子(例えば、カプシドタンパク質にseq2が含まれたrAAVウイルス粒子)は、房水における遺伝子産物(例えばアフリベルセプト)の発現量が2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、15倍、20倍、25倍、50倍又は50倍以上強化される。
【0078】
幾つかの実施形態において、AAV2.7m8カプシドタンパク質を含むrAAVウイルス粒子と比較して、本開示の上記rAAVウイルス粒子(例えば、カプシドタンパク質にseq2が含まれたrAAVウイルス粒子)は、硝子体における遺伝子産物(例えばアフリベルセプト)の発現量が2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、15倍、20倍、25倍、50倍又は50倍以上強化される。
【0079】
幾つかの実施形態において、AAV2.7m8カプシドタンパク質を含むrAAVウイルス粒子と比較して、本開示の上記rAAVウイルス粒子(例えば、カプシドタンパク質にseq2が含まれたrAAVウイルス粒子)は、網膜組織における遺伝子産物(例えばアフリベルセプト)の発現量が2倍、3倍、4倍、5倍、10倍、15倍、20倍、25倍、50倍又は50倍以上強化される。
【0080】
幾つかの実施形態において、上記rAAVウイルス粒子の投与方法は硝子体内注射である。
【0081】
ポリヌクレオチド及び(発現)ベクター
本開示はアフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを提供し、コードされているアミノ酸配列は配列番号38に示される。
【0082】
幾つかの実施形態において、本開示は、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするコドンにより最適化されたポリヌクレオチドを提供し、配列番号39~41の何れか1つに示されるか、又はそれと少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%の配列同一性を有する。
【0083】
本開示は、本開示の上記の任意の遺伝子産物をコードするポリヌクレオチドを提供する。
【0084】
本開示は、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質をコードするポリヌクレオチドを提供する。
【0085】
幾つかの実施形態において、上記ポリヌクレオチドは、RNA、DNA又はcDNAであってもよい。
【0086】
幾つかの実施形態において、上記ポリヌクレオチドは、分離したポリヌクレオチドである。
【0087】
本開示のポリヌクレオチドはベクター形態であってもよく、ベクター内に存在する及び/又はベクターの一部であってもよく、当該ベクターは、例えばプラスミド、コステロプラスミド、YAC又はウイルスベクターであってもよい。ベクターは、例えば、発現ベクター、即ち、体外及び/又は体内で(即ち、適切な宿主細胞、宿主有機体及び/又は発現システム中で)ポリヌクレオチドの発現を提供することができるベクターであってもよい。当該発現ベクターは通常、少なくとも1つの本開示のポリヌクレオチドを含み、それが1つ又は複数の適切な発現調節エレメント(例えばプロモーター、エンハンサー、ターミネーターなど)に操作可能に連結する。
【0088】
本開示のポリヌクレオチドは、既知の方法(例えば、自動DNA合成及び/又は組換えDNA技術)により製造又は取得されてもよく、及び/又は、適切な天然源から分離されてもよい。
【0089】
本開示は、以下を含むベクターを提供する。
【0090】
(a)本開示の上記任意の変異体AAVカプシドタンパク質(配列番号3~9及び23~27の何れか1つに示されるか、又はそれと少なくとも90%若しくは95%の配列同一性を有する)をコードする分離したポリヌクレオチド、
(b)本開示の上記任意の変異体AAVカプシドタンパク質(配列番号3~9及び23~27の何れか1つに示されるか、又はそれと少なくとも90%若しくは95%の配列同一性を有する)をコードする分離したポリヌクレオチド、及び/又は、上記遺伝子産物をコードする異種ポリヌクレオチド(配列番号38に示されるアフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチド、配列番号39~41の何れか1つに示されるか、又はそれと少なくとも90%若しくは95%の配列同一性を有するポリヌクレオチド)。
【0091】
幾つかの実施形態において、(b)における変異体AAVカプシドタンパク質をコードするポリヌクレオチド及び遺伝子産物をコードする異種ポリヌクレオチドは、異なるベクターに存在する。
【0092】
宿主細胞
本開示は、本開示の上記任意のポリヌクレオチド又は(発現)ベクターを含む宿主細胞を提供する。
【0093】
幾つかの実施形態において、上記宿主細胞は、分離した細胞、例えば体外細胞培養物に由来する細胞であってもよい。このような細胞は、本開示の上記任意のrAAVカプシドタンパク質、遺伝子産物又はrAAVウイルス粒子を産生するために使用され、産生細胞とも呼ばれる。
【0094】
幾つかの具体的な実施形態において、産生細胞は細菌細胞、真菌細胞又は哺乳動物細胞である。例示的な産生細胞は、HeLa、CHO、293(293Tを含む)、Vero、NIH 3T3、Huh-7、BHK、PC12、COS(COS-7を含む)、RAT1、HepG2細胞などを含むが、これらに限定されない。例示的な哺乳動物細胞は、293(293T)、COS、HeLa、Vero、3T3、C3H10T1/2、CHO細胞を含むが、これらに限定されない。産生細胞は、両生類細胞、昆虫細胞、植物細胞、及び当該分野でタンパク質、ウイルス粒子を発現するための任意の他の細胞を使用してもよい。例示的な昆虫細胞は、ツマジロクサヨトウ、ショウジョウバエ(Drosophila)細胞株、又はヒトスジシマカ(Aedesalbopictus)由来細胞株などの蚊細胞株を含むが、これらに限定されず、Se301、SeIZD2109、SeUCR1、Sf9、Sf900+、Sf21、BTI-TN-5B1-4、MG-1、Tn368、HzAm1、Ha2302、Hz2E5、HighFive(Invitrogen、CA、USA)、AO38及びBM-N細胞を含むが、これらに限定されない。
【0095】
rAAVウイルス粒子の産生、製造方法
rAAVウイルス粒子を産生する方法は、当該分野において一般的である。WO200028004、WO200123001、WO2004112727、WO2005005610、WO2005072364、WO2013123503、WO2015191508及びUS20130195801におけるrAAVウイルス粒子の産生、製造方法の全体は、本開示に組み込まれている。上記rAAVウイルス粒子は送達効率を向上させる特性を有し、効率的にパッケージングすることができ、高頻度及び最小限の毒性で標的細胞(例えば哺乳動物又はヒト細胞)にうまく感染することができる。
【0096】
本開示は、本開示の任意のポリヌクレオチドをAAVカプシドにパッケージングすることを含む、rAAVウイルス粒子を産生、製造する方法を提供する。
【0097】
幾つかの実施形態において、本開示の上記の遺伝子産物をコードするポリヌクレオチド又はその(発現)ベクター、本開示の上記の任意のAAVカプシドタンパク質をコードするポリヌクレオチド又はその(発現)ベクター、及びヘルパー機能プラスミド(例えば、pHelper)を、産生細胞(例えば293細胞)に導入し、パッケージングし、精製し、rAAVウイルス粒子を得ることを含む、rAAVウイルス粒子を産生、製造する方法提供する。
【0098】
幾つかの実施形態において、rAAVウイルス粒子を産生、製造する産生方法を提供し、
1)本開示の任意の遺伝子産物をコードするポリヌクレオチド又は(発現)ベクター、本開示の上記の任意のAAVカプシドタンパク質をコードするポリヌクレオチドを含むRep及びCap遺伝子を発現するベクター(例えば、pR2C9)、及びヘルパーベクター(ヘルパー機能を実現するもの、例えばpHelper)は、哺乳動物細胞(例えば293細胞)に同時コトランスフェクションする方法と、
2)遺伝子産物をコードするポリヌクレオチドを含むrAAVウイルス粒子を取得、精製する方法と、を含む。
【0099】
幾つかの実施形態において、本開示の上記任意のrAAVウイルス粒子を産生するためのrAAVウイルス粒子の産生システムを提供し、
1)AAVカプシドタンパク質をコードするポリヌクレオチドと、
2)本開示の任意の遺伝子産物をコードする異種ポリヌクレオチド又はその(発現)ベクター(例えば、pGOIプラスミド)と、
3)十分なAAV rep機能及びヘルパー機能を有し、2)における遺伝子産物をコードする異種ポリヌクレオチドをAAVカプシドにパッケージングするためのヘルパーエレメントと、を含む。
【0100】
幾つかの具体的な実施形態において、十分なAAV rep機能及びヘルパー機能は、パッケージング細胞又はpHelper、pR2C9、pGOIの3つのプラスミドにより提供され、上記パッケージング細胞は、pHelper、pR2C9、pGOIという3つのプラスミドを含んでもよい。
【0101】
幾つかの実施形態において、Rep遺伝子は、AAVゲノムの複製などの機能を調節する非構造タンパク質をコードし、Rep78、Rep68、Rep52、Rep40から選ばれてもよい。Rep78及びRep68は通常、p5プロモーターから転写されるが、Rep52及びRep40は通常、p19プロモーターから転写される。Cap遺伝子は、ウイルスのカプシドを形成するために構築する構造タンパク質VP1、VP2及び/又はVP3をコードする。Cap遺伝子は通常、p40プロモーターから転写される。
幾つかの実施形態において、上記AAV産生方法又は産生システムにより産生されたrAAVウイルス粒子を提供する。
【0102】
医薬組成物
本開示は、
(a)本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質又はrAAVウイルス粒子と、
(b)1種又は複数種の薬学的に許容されるベクター、希釈剤、賦形剤又は緩衝液と、を含む医薬組成物を提供する。
【0103】
本開示は、
(a)予防又は治療有効量の活性成分と、
(b)1種又は複数種の薬学的に許容されるベクター、希釈剤、賦形剤又は緩衝液と、を含む医薬組成物を提供する。
【0104】
上記活性成分は、例えば、本開示の上記任意のrAAVウイルス粒子、配列番号39~41又はそれと少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性配列を有する遺伝子産物をコードするポリヌクレオチドから選ばれる。
【0105】
幾つかの実施形態において、上記医薬組成物の単位用量には、0.01重量%~99重量%のポリヌクレオチド(例えばVEGF阻害剤、別の例として、アフリベルセプトをコードするポリヌクレオチド)又はrAAVウイルス粒子が含まれてもよい。幾つかの具体的な実施形態において、医薬組成物の単位用量に含まれている遺伝子産物(例えばVEGF阻害剤、別の例として、アフリベルセプト)のコピー量は0.1~10×1013である。幾つかの具体的な実施形態において、医薬組成物におけるrAAVウイルス粒子の濃度は、1×10個/mL又はそれ以上であり、一般的には1×1015個/mL以下である。
【0106】
幾つかの実施形態において、本開示の上記任意のrAAVウイルス粒子で細胞にトランスフェクトし、次に上記細胞を対象に移転又は移植することができる。
【0107】
幾つかの実施形態において、医薬組成物には本開示の上記任意のrAAVウイルス粒子が含まれ、上記rAAVウイルス粒子にポリヌクレオチドがカプセル化され、上記ポリヌクレオチドは、配列番号39~41の何れか1つに示されるか、又はそれと少なくとも80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%の同一性配列を有する。
【0108】
疾患を治療、予防する方法及び製薬用途
本開示は、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを疾患又は症状の治療、寛解又は改善として使用する方法又は用途を提供する。
【0109】
幾つかの実施形態において、必要とする対象に遺伝子産物を送達する方法であって、有効量の本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを上記対象に投与することを含む、方法を提供する。
【0110】
幾つかの実施形態において、標的細胞に遺伝子産物を送達する方法であって、上記標的細胞を本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドと接触させることを含む、方法を提供する。幾つかの具体的な実施形態において、標的細胞は、肝細胞、膵臓細胞、骨格筋細胞、心筋細胞、線維芽細胞、網膜細胞、滑膜関節細胞、肺細胞、T細胞、ニューロン、神経膠細胞、幹細胞、内皮細胞又はがん細胞から選ばれる。幾つかの具体的な実施形態において、標的細胞は体外であり、別の幾つかの具体的な実施形態において、標的細胞は体内である。本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを使用して標的細胞に異種核酸を送達する製薬用途を同時に提供する。
【0111】
幾つかの実施形態において、網膜細胞に特異的に感染する方法であって、予防又は治療有効量の本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを眼内に投与すること、例えば硝子体内注射又は網膜下注射によることを含む、方法を提供する。本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを使用して網膜細胞に特異的に感染する薬剤の製造における製薬用途を同時に提供する。
【0112】
幾つかの具体的な実施形態において、光受容細胞、網膜神経節細胞、Muller細胞、双極細胞、アマクリン細胞、水平細胞又は網膜色素上皮細胞からなる群より選ばれた網膜細胞の疾患又は病状を治療するための、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを提供する。幾つかの場合において、網膜細胞は光受容細胞、例えば桿体細胞又は錐体細胞である。
【0113】
幾つかの具体的な実施形態において、急性黄斑神経網膜病変、ベーチェット病、脈絡膜血管新生、糖尿病性ブドウ膜炎、ヒストプラズマ症、急性黄斑変性、非滲出性加齢性黄斑変性症及び滲出性加齢性黄斑変性症などの黄斑変性、黄斑浮腫、黄斑嚢胞様浮腫及び糖尿病性黄斑浮腫などの浮腫、多巣性脈絡膜炎、眼の後部部位又は位置に影響を及ぼす眼外傷、眼の腫瘍、網膜中心静脈閉塞症、糖尿病性網膜病変(増殖性糖尿病性網膜病変を含む)、増殖性硝子体網膜病変(PVR)、網膜動脈閉塞性疾患、網膜剥離及びブドウ膜炎性網膜疾患などの網膜病状、交感性眼炎、フォークト・小柳・原田病(Vogt Koyanagi-Harada)(VKH)症候群、ブドウ膜拡散、眼科レーザー治療によって引き起こされるか、又はそれによって影響を受ける後眼部の病状、光線力学治療によって引き起こされるか、又はそれによって影響を受ける後眼部の病状、光凝固法、放射性網膜病変、網膜前膜病状、網膜静脈分枝閉塞症、前部虚血性視神経病変、非網膜病変、糖尿病性網膜機能障害、網膜剥離症、網膜色素変性、緑内障、アッシャー症候群、錐体-桿体栄養失調、スターガルト病(眼底黄斑症)、遺伝性黄斑変性、脈絡膜網膜変性、レーベル先天性黒内障、先天性定常夜盲症、コロイデレミア、バルデー・ビードル症候群、黄斑毛細血管拡張症、レーベル遺伝性視神経病変、未熟児網膜病変、及び全色盲、赤色盲、緑色盲及び青色盲を含む色覚病状、遺伝性網膜色素変性からなる群より選ばれた網膜細胞の疾患又は病状を治療するための、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを提供する。
【0114】
幾つかの実施形態において、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを眼部疾患の治療として使用する方法又は用途であって、上記眼部疾患が、加齢性黄斑変性症(AMD)、湿性AMD、乾性AMD、網膜血管新生、脈絡膜血管新生、糖尿病性網膜病変、増殖性糖尿病網膜病変、網膜静脈閉塞症、網膜中心静脈閉塞症、網膜静脈分枝閉塞症、糖尿病性黄斑浮腫、糖尿病性網膜虚血、虚血性網膜病変又は糖尿病性網膜浮腫を含むが、これらに限定されない、方法又は用途を提供する。選択的に、硝子体内注射又は網膜下注射による。
【0115】
幾つかの実施形態において、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを使用して網膜関連疾患を治療する方法又は用途を提供する。
【0116】
本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを使用して上記疾患を治療又は予防する薬剤の製造における製薬用途を同時に提供する。
【0117】
投与方法
本開示は、本開示の上記任意のAAVカプシドタンパク質、rAAVウイルス粒子、医薬組成物、アフリベルセプト(aflibercept)をコードするポリヌクレオチドを上記眼部疾患(例えば網膜関連疾患)の治療として使用する投与方法であって、眼内注射によって投与される、方法を提供する。
【0118】
幾つかの実施形態において、眼内注射は、硝子体内注射、網膜下注射、脈絡膜上注射又はrAAVウイルス粒子の眼への送達をもたらす任意の他の好適な投与形態又は投与経路を含む。他の好適な投与形態又は投与経路は、静脈内、動脈内、眼周囲、前房内、結膜下及び眼球嚢下の注射並びに局所投与及び鼻内投与を含むが、これらに限定されない。
【図面の簡単な説明】
【0119】
図1】AAV2カプシドタンパク質配列及びVP1、VP2、VP3の開始部位、環状ドメインI~Vの模式図である。
図2】708部位変異を有する、587位と588位との間にペプチド断片が挿入された本開示の変異体AAVカプシドタンパク質の模式図である。
図3】マウス網膜に感染した本開示のrAAVベクターウイルスAAV2 seq1、AAV2 seq2、AAV2 seq3、AAV2 seq4、AAV2 seq5、AAV2 seq6及びAAV2、AAV2.7m8の蛍光シグナル検査結果図である。
図4A】及び
図4B】マウス網膜に感染した本開示のrAAVベクターウイルスAAV2 seq1、AAV2 seq2、AAV2 seq3、AAV2 seq4、AAV9 seq2及びAAV2、AAV2.7m8の蛍光シグナル検査結果図であり、図4Aは1週目の眼底検査結果、図4Bは4週目の眼底検査結果である。
図5A】VEGF Trap(アフリベルセプト)を発現する核酸分子を含むベクター構成図である。
図5B】AAVパッケージングプラスミドの模式図である。
図6】マウス眼球において目的遺伝子(アフリベルセプト)を発現するrAAVベクターウイルスAAV2 seq2及びAAV2.7m8の検査結果である。
図7】ウサギ眼球において目的遺伝子(アフリベルセプト)タンパク質を発現するrAAVベクターウイルスAAV2 seq2及びAAV2.7m8の検査結果であり、それは、ウイルス注射の14日後に、房水中の目的遺伝子タンパク質含有量の検出である。
図8】ウサギ眼球において目的遺伝子タンパク質を発現するrAAVベクターウイルスAAV2 seq2及びAAV2.7m8の検査結果であり、それは、ウイルス注射の28日後に、房水中の目的遺伝子タンパク質のモル濃度の検出である。
【発明を実施するための形態】
【0120】
本開示が更に容易に理解されるように、以下、幾つかの技術・科学用語を具体的に定義する。本明細書で別途明確に定義しない限り、本明細書に使用される他の技術・科学用語の全ては、当業者に通常理解されている意味を持っている。
【0121】
「AAV」は、アデノ随伴ウイルスの略語であり、且つウイルス自体又はその誘導体を指すために使用することができる。別途指定しない限り、当該用語は全てのAAVアイソフォーム及び天然存在形態と組換え形態を包含する。「AAV」は、AAV1型(AAV1)、AAV2型(AAV2)、AAV3型(AAV3)、AAV4型(AAV4)、AAV5型(AAV5)、AAV6型(AAV6)、AAV7型(AAV7)、AAV8型(AAV8)、AAV9型(AAV9)、AAV10型(AAV10)、AAVrh10型(AAVrh10)、並びに、様々な種類のトリAAV、ウシAAV、イヌAAV、ウマAAV、霊長類AAV、非霊長類AAVとヒツジAAVを含むが、これらに限定されない。
【0122】
AAVは、非エンベロープ二十面体カプシドに含まれる4.7 kb単鎖DNAゲノムで構成された非病原性パルボウイルスであり、ゲノムには、ウイルス複製及びパッケージングシグナルの起点として機能する末端逆位反復配列(ITR)に隣接する3つのオープンリーディングフレーム(ORF)が含まれる。Rep ORFは、ウイルス複製、転写調節、部位特異的組込み、及びウイルス粒子構築において機能する4つの非構造タンパク質をコードする。Cap ORFは、60量体ウイルスカプシドを形成するために構築する3つの構造タンパク質(VP1-3)をコードする。最終的に、cap遺伝子内の代替リーディングフレームとして存在するORFは、細胞核内でAAVカプシドタンパク質を局在させ、カプシドの構築中に機能するウイルスタンパク質である構築活性化タンパク質(AAP)を産生する。
【0123】
様々な血清型AAVのゲノム配列及び天然末端逆位反復配列(ITR)、Repタンパク質配列及びカプシドサブユニット配列は、当該分野で公知である。このような配列は、文献又はGenBankなどのパブリックデータベースから見出すことができる。例えば、GenBank登録番号NC_002077.1(AAV1)、AF063497.1(AAV1)、NC_001401.2(AAV2)、AF043303.1(AAV2)、J01901.1(AAV2)、U48704.1(AAV3)、NC_001729.1(AAV3)、NC_001829.1(AAV4)、U89790.1(AAV4)、NC_006152.1(AAV5)、AF085716.1(AAV5)、AF028704.1(AAV6)、NC_006260.1(AAV7)、AF513851.1(AAV7)、AF513852.1(AAV8)NC_006261.1(AAV8)、AY530579.1(AAV9)、及びSrivistava et al.(1983)J.Virology45:555、Chiorini et al.(1998)J.Virology71:6823、Chiorini et al.(1999)J.Virology73:1309、Bantel-Schaal et al.(1999)J.Virology73:939、Xiao et al.(1999)J.Virology73:3994、Muramatsu et al.(1996)Virology221:208、Shade et al.(1986)J.Virol.58:921、Gao et al.(2002)Proc.Nat.Acad.Sci.USA99:11854、Moris et al.(2004)Virology33:375-383、及びWO00/28061、WO99/61601、WO98/11244、US6156303、WO2012145601A、WO2017197355A、WO2018022905Aを参照する。以上の内容は、本開示によりその全体が組み込まれている。
【0124】
AAVカプシドのGH環又は環IVについては、例えばvan Vliet et al.(2006)Mol.Ther.14:809、Padron et al.(2005)J.Virol.79:5047、及びShen et al.(2007)Mol.Ther.15:1955を参照する。
【0125】
「AAVビリオン」又は「AAVウイルス粒子」は、少なくとも1つのAAVカプシドタンパク質及びカプシド化AAVポリヌクレオチドで構成されたビリオンを指す。
【0126】
「rAAV」は組換えアデノ随伴ウイルスを指し、ポリヌクレオチドに適用される「組換え」は、ポリヌクレオチドがクローニング、制限又はライゲーションの様々な組み合わせの産物であること、及び天然に見出されるものとは異なるポリヌクレオチドの構築物をもたらす他のプロセスを指す。組換えウイルスは、組換えポリヌクレオチドを含むビリオンである。
【0127】
「AAVウイルス粒子」が異種ポリヌクレオチド(即ち、標的細胞に送達される遺伝子産物(例えば、導入遺伝子、RNAiなど)などの、野生型AAVゲノム以外のポリヌクレオチド)を含む場合、これは、一般的に「組換えAAV(rAAV)ウイルス粒子」又は「rAAVビリオン」又は「rAAVベクターウイルス」と呼ばれる。一般的には、異種ポリヌクレオチドの両側は少なくとも1つ、一般的には2つのAAV末端逆位反復配列(ITR)である。
【0128】
「rAAVベクター」は、rAAVポリヌクレオチドを含むrAAVウイルス粒子を包含し、且つrAAVをコードするポリヌクレオチド(例えば、rAAVをコードする単鎖ポリヌクレオチド(ss-rAAV)、rAAVをコードする二本鎖ポリヌクレオチド(ds-rAAV)、例えばrAAVをコードするプラスミドなど)も包含する。
【0129】
「AAV変異体」、「AAV突然変異体」又は「カプシド変異rAAV」は、以下からなるビリオンを意味する:(a)対応する親AAVカプシドタンパク質と比較して少なくとも1つのアミノ酸相違(例えばアミノ酸置換、挿入又は欠失)を含み、天然に存在するAAVカプシドタンパク質のアミノ酸配列と異なるか、又は非対応である、変異体AAVカプシドタンパク質、及び任意選択的に、(b)異種遺伝子産物をコードする異種ポリヌクレオチドを含み、変異体AAVカプシドタンパク質が、対応する親AAVカプシドタンパク質を含むAAVウイルス粒子への結合と比較して、ヘパリン様又はヘパリン硫酸プロテオグリカンとの増加した結合を付与する。
【0130】
「パッケージング」は、AAV粒子の構築及びカプシド化をもたらす一連の細胞内事象を指す。
【0131】
「rep」及び「cap」遺伝子は、アデノ随伴ウイルスの複製タンパク質及びカプシド化タンパク質をコードするポリヌクレオチド配列を指す。AAV rep及びcapは、本明細書ではAAV「パッケージング遺伝子」と呼ばれる。
【0132】
「ヘルパーウイルス」は、AAV(例えば、野生型AAV)が哺乳動物細胞によって複製され、パッケージングされることを可能にするウイルスを指す。AAVの様々なヘルパーウイルスが当該分野で公知であり、アデノウイルス、ヘルペスウイルス及びワクシニアなどのポックスウイルスを含む。アデノウイルスは多くの異なる亜集団を包含するが、C亜集団のアデノウイルス5型が最もよく使用され、ヘルペスファミリーのウイルスには、例えば、単純ヘルペスウイルス(HSV)及びエシェリウイルス(EBV)並びにサイトメガロウイルス(CMV)及び偽狂犬病ウイルス(PRV)が含まれる。ヒト、非ヒト哺乳動物及び鳥類由来の多くのアデノウイルス、ヘルペスウイルスなどが知られており、ATCCなどのメカニズムから入手可能である。
【0133】
「ヘルパーウイルス機能」又は「ヘルパー機能」は、AAVの複製及びパッケージングを可能にするヘルパーウイルスゲノムにコードされた機能を指す(本明細書に記載される複製及びパッケージングに対する他の必要性と組み合わせて行われる)。本開示において、「ヘルパーウイルス機能」は、ヘルパーウイルスを提供すること、又は例えば、輸送中の産生細胞に必須機能をコードするポリヌクレオチド配列を提供することを含む、多くの方法で提供することができる。
【0134】
「感染性」ウイルス又はビリオンは、適切に構築されたウイルスカプシドを含み、ウイルス種が好む細胞にポリヌクレオチド成分を送達することができ、ウイルスが複製能力を有することを必ずしも示唆していないウイルス又はビリオンである。感染性ビリオンのカウントを行う測定は、当該分野で公知である。ウイルス感染性は、全ビリオンに対する感染性ビリオンの比として発現することができる。全ビリオンに対する感染性ビリオンの比を決定する方法は、当該分野で公知である。例えば、Grainger et al.(2005)『分子療法(Mol.Ther.)』11:S337(TCID50感染力価が測定される)、Zolotukhin et al.(1999)『遺伝子療法(Gene Ther.)』6:973を参照する。
【0135】
「指向性」又は「特異的」は、ウイルス(例えば、AAV)が特定の宿主種の細胞又は宿主種内の特定の細胞型を優先的に標的とすることを指す。例えば、心臓、肺、肝臓及び筋肉の細胞に感染できるウイルスは、肺及び筋肉の細胞にのみ感染する可能性のあるウイルスよりも広い(即ち増加する)指向性を有する。指向性は、宿主の特定の種類の細胞表面分子に対するウイルス依存性を更に含んでもよい。例えば、幾つかのウイルスは、表面グリコサミノグリカンを有する細胞にのみ感染することができるが、他のウイルスは、シアル酸を有する細胞にのみ感染することができる(この依存性は、特定の種類の分子を欠く様々な細胞株を、ウイルス感染のための潜在的な宿主細胞として使用して試験してもよい)。場合によっては、ウイルス指向性はウイルスの相対的な好みを記述する。例えば、第1ウイルスは全ての細胞型に感染できる可能性があるが、表面グリコサミノグリカンによる感染においてより成功する。第2ウイルスも同じ特徴を好む(例えば、第2ウイルスは、表面グリコサミノグリカンによる細胞の感染においてもより成功する)場合、第2ウイルスは、絶対的形質導入効率が類似していない場合であっても、第1ウイルスと類似(又は一致)する指向性を有すると考えられる。例えば、第2ウイルスは、試験される各々の所定の細胞型に感染する際に第1ウイルスよりも効果的であるが、相対的好みが類似(又は一致)する場合、第2ウイルスは、依然として第1ウイルスと類似(又は一致)する指向性を有すると考えられてもよい。幾つかの実施例において、天然に存在するウイルス粒子と比較して、本開示の変異体AAVカプシドタンパク質を含むウイルス粒子の指向性は変化していない。幾つかの実施例において、天然に存在するウイルス粒子と比較して、本開示の変異体AAVカプシドタンパク質を含むウイルス粒子の指向性は拡張される(即ち、広くなる)。幾つかの実施例において、天然に存在するウイルス粒子と比較して、本開示の変異体AAVカプシドタンパク質を含むウイルス粒子の指向性は低減する。
【0136】
「ポリヌクレオチド」は、デオキシリボヌクレオチド又はリボヌクレオチドを含む、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態又はその類似体を指す。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチド及びヌクレオチド類似体などの修飾ヌクレオチドを含んでもよく、且つ非ヌクレオチド成分によって分断されてもよい。ヌクレオチド構造に対する修飾は、ポリマーを構築する前後に行うことができる。ポリヌクレオチドは、二本鎖分子及び単鎖分子を互換可能に指し、別段の指示がない限り、本開示のポリヌクレオチドは、二本鎖形態、及び二本鎖形態を構成する2つの相補的な単鎖形態を包含する。
【0137】
「相同性」又は「同一性」は、2つのポリヌクレオチド配列間又は2つのポリペプチド間の配列の類似性を指す。2つの比較される配列における位置が何れも同じヌクレオチド又はアミノ酸モノマーサブユニットに占められる場合、例えば、2つのDNA分子のそれぞれの位置が同じヌクレオチドに占められる場合、上記分子は当該位置で相同である。2つの配列間の相同性百分率は、2つの配列の共有するマッチング又は相同位置数を比較される位置数で割って100%をかける関数である。例えば、配列が最適にアラインメントされる場合、2つの配列における10個の位置のうち6個がマッチングするか又は相同である場合、2つの配列は60%相同である。配列類似性は、多くの異なる方法で測定することができる。配列同一性を測定するために、インターネットアドレスncbi.nlm.nih.gov/BLAST/から得ることができるBLASTなどの方法及びコンピュータプログラムを使用して配列をアラインメントすることができる。別のアライメントアルゴリズムは、Madison, Wisconsin, USA, a wholly owned subsidiary of Oxford Molecular Group, IncのGenetics Computing Group(GCG)パッケージングから得ることができるFASTAである。他のアラインメント技術は、Enzymology, Vol.266: Computer Methods for Macromolecular Sequence Analysis(1996), Doolittle ed., Academic Press, Inc., adivision of Harcourt Brace&Co., SanDiego, California, USAの方法に記載されている。特に興味深いのは、配列におけるギャップを許容する比較手順である。Smith-Watermanは、配列アライメントにおけるギャップを許容するアルゴリズムの一種である。Meth.Mol.Biol.70:173~187(1997)を参照する。Needleman及びWunsch比較法を使用するGAPプログラムも、配列アライメントとして使用することができる。J.Mol.Biol.48:443-453(1970)を参照する。
【0138】
「遺伝子」は、転写及び場合によって翻訳後に特定の遺伝子産物をコードすることができる少なくとも1つのオープンリーディングフレームを含むポリヌクレオチドを指す。「遺伝子」又は「コード配列」は、遺伝子産物をコードする体外又は体内のヌクレオチド配列を指す。幾つかの場合において、遺伝子は、コード配列、即ち遺伝子産物をコードする配列からなるか、又は本質的にそれからなる。他の場合において、遺伝子は、別の非コード配列を含む。例えば、遺伝子は、コード領域の前後の領域(例えば、5’UTR、3’UTR、及び各コード領域(エクソン)間の挿入配列(イントロン))を含んでもよく、含まなくてもよい。
【0139】
「遺伝子産物」は、特定の遺伝子の発現によって生成される分子、例えば、ポリペプチド、アプタマー、干渉RNA、mRNAなどである。幾つかの実施形態において、「遺伝子産物」は、ポリペプチド、ペプチド、タンパク質又は干渉RNAであり、短鎖干渉RNA(siRNA)、miRNA又は短鎖ヘアピンRNA(shRNA)を含む。幾つかの具体的な実施形態において、遺伝子産物は、治療用ポリペプチドなどの治療用遺伝子産物である。上記治療用遺伝子産物は、それが存在する細胞、組織又は哺乳動物に、病状或いは疾患の徴候又は症状の改善、病状或いは疾患の予防又は阻害、若しくは所望の特徴の付与を含む有益な効果を付与する。遺伝子がポリペプチドをコードする場合、「遺伝子産物」と「目的遺伝子発現産物」は、互換的に使用される。
【0140】
「RNA干渉剤」又は「RNAi試薬」は、遺伝子(上記で定義される通り)の発現を変化させるために有用な任意の試薬(又はそのような試薬をコードするポリヌクレオチド)を含む。当業者に公知のRNAi試薬の実例は、(i)siRNA試薬(「低分子干渉」又は「短鎖干渉RNA」(又はsiRNA))、(ii)アンチセンスRNA、(iii)CRISPR試薬、(iv)ジンクフィンガーヌクレアーゼ試薬、及び(v)転写活性化因子様エフェクターヌクレアーゼ(TALEN)試薬を含むが、これらに限定されない。WO2017197355Aによる(i)~(v)の定義の全体は、本開示に組み込まれている。
【0141】
そのうち、siRNA試薬は、目的の遺伝子(「標的遺伝子」)のヌクレオチドを標的とするRNA二本鎖である。「RNA二本鎖」は、RNA分子の2つの領域間の相補的ペアリングによって形成され、それによって二本鎖RNAの領域(dsRNA)を形成する構造を指す。siRNAの二本鎖部分のヌクレオチド配列が標的遺伝子のヌクレオチド配列と相補的であるため、siRNAが遺伝子を「標的」とする。幾つかの実施形態において、siRNAの二重鎖の長さは、30ヌクレオチド未満である。幾つかの実施形態において、二本鎖は、29、28、27、26、25、24、23、22、21、20、19、18、17、16、15、14、13、12、11又は10ヌクレオチド長であってもよい。幾つかの実施形態において、二本鎖の長さは、19~25ヌクレオチド長である。siRNAのRNA二本鎖部分は、ヘアピン構造の一部であってもよい。ヘアピンを含むsiRNA試薬は、「shRNA(短鎖ヘアピンRNA)試薬」と呼ばれてもよい。ヘアピン構造は、二本鎖部分に加えて、二本鎖を形成する2つの配列の間に位置する環部分を含んでもよい。環の長さが変化してもよい。幾つかの実施形態において、環の長さは、5、6、7、8、9、10、11、12又は13ヌクレオチドである。ヘアピン構造は、3’又は5’突出末端部分を更に含んでもよい。幾つかの実施形態において、突出末端は、0、1、2、3、4又は5ヌクレオチド長の3’又は5’突出末端である。一般的には、標的遺伝子の発現産物(例えば、mRNA、ポリペプチドなど)のレベルは、5’非翻訳(UTR)領域、ORF、又は3’UTR領域を含む、標的遺伝子の転写産物の19~25ヌクレオチド長のセグメント(例えば、20~21ヌクレオチド配列)に少なくとも相補的な特定の二本鎖ヌクレオチド配列を含むsiRNA試薬(例えば、siRNA、shRNAなど)によって低減される。幾つかの実施形態において、短鎖干渉RNAの長さは約19~25 ntである。例えば、PCT出願WO0/44895、WO99/32619、WO01/75164、WO01/92513、WO01/29058、WO01/89304、WO02/16620、及WO02/29858、及び米国特許公開番号20040023390(siRNA技術に関する記載)を参照する。siRNA及び/又はshRNAは核酸配列によってコードされてもよく、且つ当該核酸配列はプロモーターを更に含んでもよい。核酸配列は、ポリアデニル化シグナルを更に含んでもよい。幾つかの実施形態において、ポリアデニル化シグナルは、合成された最小ポリアデニル化シグナルである。
【0142】
そのうち、アンチセンスRNAは、遺伝子発現産物に相補的なRNAである。例えば、特定のmRNAを標的とするアンチセンスRNAは、mRNAに相補的なRNAベースの試薬であり(又は修飾RNAであってもよく)、そのうち、mRNAに対するアンチセンスRNAのハイブリダイゼーションは、mRNAの発現を変更する(例えば、RNAの安定性の変更、RNAの翻訳の変更などによる)。アンチセンスRNAをコードする核酸も、「アンチセンスRNA」に含まれる。
【0143】
「VEGF」は、例えば、VEGF-A/VPF遺伝子の代替的スプライシングによって産生される、様々なアイソフォームのVEGF(血管透過因子(VPF)及びVEGF-Aとも呼ばれる)を含む、血管新生又は血管新生プロセスを誘導する血管内皮成長因子を指し(米国特許出願公開第20120100136号の図2(A)及び(B)を参照する)、VEGF121、VEGF165及びVEGF189を含む。更に、「VEGF」は、PIGF(胎盤成長因子)、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D及びVEGF-EなどのVEGF関連血管新生因子を含み、上記VEGF関連血管新生因子は、血管新生又は血管新生プロセスを誘導するように同種VEGF受容体(即ちVEGFR)によって作用する。
【0144】
本明細書において、「sFlt-1」又は「sFlt-1タンパク質」は、sFlt-1タンパク質又はポリペプチドがVEGF及び/又はVEGF受容体に結合するように、天然に存在するヒトsFLT-1配列に対して少なくとも90%又はそれ以上相同であるポリペプチド配列又はその機能断片を指す。
【0145】
「ポリペプチド」、「ペプチド」及び「タンパク質」は、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指し、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、リン酸化又は標識成分との複合などによって修飾されたアミノ酸のポリマーを更に含む。
【0146】
「調節エレメント」又は「調節配列」は、複製、反復、転写、スプライシング、翻訳又は分解を含むポリヌクレオチドの機能調節を促進する分子の相互作用に関与するヌクレオチド配列である。調節は、プロセスの頻度、速度又は特異性に影響を与え、本質的には、増強又は阻害特性を有する。既知の制御エレメントは、プロモーター及びエンハンサーなどの転写調節配列を含む。プロモーターは、ある条件でRNAポリメラーゼに結合し、且つ通常プロモーターの下流(3’方向)に位置するコード領域の転写を開始することができるDNA領域である。
【0147】
「発現ベクター」は、目的遺伝子産物をコードする領域を含むベクターであり、且つ目的の標的細胞において遺伝子産物の発現を実現するために用いられ、上記ベクターは目的の遺伝子産物をコードするポリヌクレオチドを含む。発現ベクターは、標的における遺伝子産物の発現を促進するために、コード領域に操作可能に連結された制御エレメントを更に含む。プロモーター、エンハンサー、UTR、miRNA標的配列などの制御エレメントと、発現のためにそれらと操作可能に連結された1つ又は複数の遺伝子との組み合わせは、「発現カセット」と呼ばれる場合がある。多くの発現カセットは、当該分野で公知で、且つ取得可能であるか、又は当該分野で取得可能な成分から容易に構築することができる。
【0148】
「操作的に連結された」又は「操作可能に連結された」は、遺伝子エレメントが、意図された形式で操作することを可能にする関係にある、遺伝子エレメントの並列を指す。例えば、プロモーターがコードポリヌクレオチド配列の転写の開始を補助する場合、プロモーターは、コードポリヌクレオチド配列に操作的に連結され、この機能的関係が維持される限り、プロモーターとコードポリヌクレオチド配列との間に挿入された核酸残基が存在する可能性がある。
【0149】
「投与」又は「導入」は、組換え遺伝子又はタンパク質の発現のためのベクターを、細胞、対象の細胞及び/又は器官、或いは対象に送達することを指す。そのような投与又は導入は、体内、体外又はエクスビボで起こり得る。遺伝子産物を発現するためのベクターは、物理的手段(例えば、リン酸カルシウムトランスフェクション、エレクトロポレーション、マイクロインジェクション又はリポトランスフェクション)によって異種DNAを細胞内に挿入することを通常意味するトランスフェクション、感染剤即ちウイルスによって導入されることを通常意味する感染、細胞に細胞を安定的に感染させること、又はウイルス剤(例えば細菌性ファージ)を介してある微生物からの遺伝子材料を、別の微生物に移入することを通常意味する形質導入によって細胞内に導入することができる。「形質転換」は、一般的に、異種DNAを含む細菌、又はがん遺伝子を発現し、且つ連続的な増殖パターンに転換された細胞、例えば腫瘍細胞を指すために使用される。細胞を「形質転換」するために使用されるベクターは、プラスミド、ウイルス、又は他のビヒクルであってもよい。異種DNA(即ち、ベクター)を細胞に投与、導入又は挿入するための方法に応じて、細胞は、一般的に、「形質導入」、「感染」、「トランスフェクション」又は「形質転換」と呼ばれる。「形質導入」、「トランスフェクション」及び「形質転換」は、異種DNAの導入方法を考慮せず、本明細書において互換可能に使用される。
【0150】
「宿主細胞」は、ベクターで形質導入、感染、トランスフェクト又は形質転換された細胞を指し、最初の形質導入、感染、トランスフェクト又は形質転換された細胞及びその子孫を包含する。ベクターは、プラスミド、ビリオン、ファージなどであってもよい。温度、pHなどの培養条件は、当業者にとって明らかである。
【0151】
「治療」は、一般的に、所望の薬理学的及び/又は生理学的効果を得ることを意味するように使用される。効果は、疾患又はその症状の完全又は部分的な予防において予防的であってもよく、例えば、対象における疾患又はその症状の発症の可能性を低減し、及び/又は、疾患及び/又は疾患によって引き起こされる不良反応の部分的又は完全な治癒において治療的であってもよい。「治療」は、哺乳動物における疾患の任意の治療を網羅し、(a)疾患にかかっている傾向がある可能性があるが、疾患にかかっていると診断されていない対象において疾患が発生することを防止すること、(b)疾患の進行を阻害又は中断すること、或いは(c)疾患(又はそれに起因する症状)を軽減するか、又は疾患を退行させることを含む。疾患又は傷害の発症前、発症中又は発症後に治療剤を投与することができる。特に進行中の疾患の治療の場合、上記治療は、患者の望ましくない臨床症状を安定化又は低減する。幾つかの好ましい形態において、そのような治療は、影響を受ける組織の機能が完全に失われる前に行われる。幾つかの好ましい形態において、本開示の治療は、疾患の症状期の間に、及び場合によっては疾患の症状期の後に投与される。
【0152】
「有効量」は、医学障害の症状又は病状を改善又は予防するために十分な量を含む。有効量は、診断の許容又は促進に十分な量を更に意味する。特定の対象に使用される有効量は、治療される病状、対象の全体的健康状態、投与の方法、経路や用量、及び副作用の重症度といった要因に応じて変化することができる。有効量は、顕著な副作用又は毒性作用を回避する最大用量又は投与計画であってもよい。
【0153】
本開示における「網膜細胞」は、網膜を含む細胞型の何れか1つを指してもよく、例えば、網膜神経節細胞、アマクリン細胞、水平細胞、双極細胞、桿体及び錐体を含む光受容細胞、ミラーグリア細胞(Muller glial cell)、星状細胞(例えば網膜星状細胞)及び網膜色素上皮細胞である。
【0154】
「個体」、「対象」及び「患者」は、本明細書において互換可能に使用され、ヒト及び非ヒト霊長類動物、例えばサル、ヒト及び他の哺乳類動物(例えばウマ、ヒツジ、ヤギ、イヌ、ネコ及び齧歯動物(例えばマウス、ラットなど))を含むが、これらに限定されず、好ましくはヒトである。
【0155】
本開示において、「ポリペプチド」及び「タンパク質」は、互換可能に使用される。
実施例
【0156】
以下、実施例と合わせて本開示を更に説明するが、これらの実施例は本開示の範囲を限定するものではない。本開示の実施例において具体的な条件が明記されていない実験方法は、一般的に、通常の条件に従い、又は原料や商品のメーカーにより勧められた条件に従う。具体的な供給源が明記されていない試薬である場合、当該試薬は、何れかの分子生物学的試薬の供給元から、分子生物学的応用のための品質/純度で得ることができる。
実施例1. AAVカプシド改変
【0157】
分子動力学シミュレーション及びタンパク質フィンガープリント技術は、タンパク質工学、抗体親和性改変において広く適用され、抗体及び受容体の物理化学的性質の動力学シミュレーションを通して、アミノ酸改変による局所親和性影響をある程度で予測することができる。
【0158】
ヘパラン硫酸受容体は、網膜及び視神経細胞の感染に重要な役割を果たすAAV細胞感染を媒介する最も重要な受容体であることが証明されており、AAV2ネイティブ血清型カプシドタンパク質のアミノ酸配列には、その空間構造特徴に従い、5つの環状ドメイン(図1に示す)がウイルス感染能力に関与していることが研究により証明された。そのうち、環状ドメインIVの第587位と第588位との間に7~12アミノ酸の短いペプチドを挿入することは、ウイルスカプシドタンパク質の構築に影響を与えず、同時にAAVカプシドと細胞受容体(ヘパラン硫酸)との相互作用の形式を大幅に変化させることができ、それにより宿主細胞に対するAAV感染能力に影響を与える。
【0159】
本開示は、AAV2ネイティブ血清型カプシドタンパク質のアミノ酸配列における第587位と第588位との間に幾つかのランダムアミノ酸配列(7~12アミノ酸長)を挿入し、且つカプシドタンパク質とヘパラン硫酸受容体との間の相互作用を予測するために、自律的に開発されたバイオインフォマティクスアルゴリズムを利用する。後続の検証を行うために、アルゴリズムにおける、感染能力を大きく向上及び予測できる配列を選択する。アルゴリズム予測に従って、各配列の長さがそれぞれ10アミノ酸長である、表1に示す6個のアミノ酸配列seq1~seq6を選択した。同時に、AAV2ネイティブ血清型カプシドタンパク質のアミノ酸配列における第708位のアミノ酸-バリン(V)をイソロイシン(I)に置換した。第587位と第588位との間の挿入方法及び第708位におけるアミノ酸の置換方法は図2に示されており、工学的に改変されたAAVカプシドタンパク質配列を得た。同時に、AAV9の対応する位置にseq2を挿入したカプシドを製造した。
【0160】
【表1】
AAVカプシドタンパク質は、発現後にVP1、VP2、VP3の3つの単量体タンパク質が一定の割合で構築され、通常の組換えタンパク質と比較してより高次の構造を有するため、AAVカプシドタンパク質に生じるポリペプチド挿入による機能的影響は、それによる物理化学的性質の変化に限定されず、VP1、VP2、VP3の3つの単量体タンパク質の構築においてより複雑な影響を与える可能性が高い。
実施例2. rAAVベクターウイルス感染マウスモデルの網膜機能の検出
【0161】
機能を検証するために、本発明者らは、配列番号3~配列番号8、AAV2(配列番号1)、AAV2.7m8(配列番号2)の8つの配列を有するカプシドで、CMVプロモーターによって駆動されるEGFP目的遺伝子を含み、且つ発現できるプラスミドpGOIをそれぞれパッケージングした。EGFP発現能力を有する上記の異なるAAVカプシドでパッケージングしたAAVベクターを、マウス硝子体に同量注入し、蛍光眼底撮影によりEGFPの発現が検出され、EGFP蛍光シグナルの強度の差で網膜組織への異なるAAVカプシドの感染効率の差を評価した。
【0162】
rAAVベクターウイルスのパッケージング及び精製ステップは、pHelper、pR2C9、pGOIの3つのプラスミド系を293T接着細胞にトランスフェクトし、細胞及び上清を回収し、イオギソール遠心法により精製され、更に限外ろ過により濃縮し、緩衝液をDPBSに置換することを含む。ウイルスのパッケージング及び精製が完了した後、qPCRによって力価(単位:vg)が検出された。EGFP目的遺伝子を発現する8つのウイルス(カプシドは、それぞれAAV2、AAV2.7m8、AAV2 seq1、AAV2 seq2、AAV2 seq3、AAV2 seq4、AAV2 seq5、AAV2 seq6である)を、それぞれDPBS緩衝液で同じ力価1.03E+12に希釈した。週齢が10週のC57マウス(北京維通利華実験動物技術有限公司から購入)に、片側眼硝子体注射を1 μLの体積で行い、AAVベクター1種類あたり3匹(n=3)を注射し、注射後1週間から4週間まで、生体蛍光眼底撮影を毎週行った。
【0163】
結果の一部を図3に示す通りであり、AAV2群、AAV2 seq5群、AAV2 seq6群は、他の群よりも蛍光シグナルの強度が明らかに弱かった。AAV2 seq1群、AAV2 seq2群、AAV2 seq3群、AAV2 seq4群は、蛍光シグナルの強度がAAV2.7m8と比較的類似し、網膜組織への感染効率が比較的高いことを示した。
【0164】
表1の「LALGDTTRPA」配列をAAV9カプシド中の同じ位置(第588位と第589位との間)に挿入し、AAV9 seq2を得た。AAV2、AAV2.7m8、AAV2 seq1、AAV2 seq2、AAV2 seq3、AAV2 seq4、AAV9 seq2の合計7つのカプシドで、CMVプロモーターによって駆動されるEGFP目的遺伝子を含み、且つ発現することができるプラスミドベクターをそれぞれパッケージングした。EGFP発現能力を有する上記の異なるAAVカプシドでパッケージングしたAAVベクターを、マウス硝子体に同量注入し、蛍光眼底撮影によりEGFPの発現が検出され、EGFPシグナルの強度の差で網膜組織への異なるAAVカプシドの感染効率の差を評価した。
【0165】
上記の方法を用いて、AAVウイルスベクターをパッケージング及び精製した。EGFP目的遺伝子を発現する7つのウイルス(カプシドは、それぞれAAV2、AAV2.7m8、AAV2 seq1、AAV2 seq2、AAV2 seq3、AAV2 seq4、AAV2 seq5、AAV9 seq2である)を、それぞれDPBS緩衝液で同じ力価1.03E+12に希釈した。週齢が10週のC57マウスに、片側眼硝子体注射を1 μLの体積で行い、AAVベクター1種類あたり3匹(n=3)を注射し、注射後1週間から4週間まで、生体蛍光眼底撮影を毎週行った。
【0166】
結果を図4A図4Bに示すが、そのうち、AAV2群、AAV2 seq2群、AAV2 seq3群は、他の群よりも蛍光シグナルの強度が明らかに強く、且つAAV2.7m8と類似した。
実施例3. マウスモデルの網膜感染に対するrAAVベクターウイルスの生物学的機能の検出
【0167】
網膜組織へのseq2カプシドの感染能力及びそれらに関連する生物学的機能を更に検証するために、AAV2 seq2及びAAV2.7m8で、CMVプロモーターによって駆動されるアフリベルセプト(aflibercept)を含む目的プラスミドベクター(AAV2 seq2-aflibercept、AAV2.7m8-aflibercept)をそれぞれパッケージングし、2つのウイルスをそれぞれニュージーランドウサギ及びC57マウスに硝子体注射し、注射の2週間後に、眼組織に注射したアフリベルセプトタンパク質の含有量を検出して、網膜への対応するAAVウイルスの感染及びそれらに関連する生物学的機能を評価した。
【0168】
そのうち、rAAV送達遺伝子発現カセットの構造は、その5’末端から3’末端へ、CMVエンハンサー、プロモーター、5’UTR、Kozak配列(gccacc)、VEGF阻害剤であるアフリベルセプト、3’UTR、WPRE及びSV40polyAを含む(図5Aに示す)。そのうち、CMVエンハンサーの塩基配列は配列番号28に示され、CMVプロモーターの塩基配列は配列番号29に示され、5’UTRは配列番号30に示され、Kozak配列は配列番号31に示され、3’UTRは配列番号32に示され、WPREは配列番号33に示され、SV40polyAは配列番号34に示された。
【0169】
発現ベクターの構築は、CMVエンハンサー、プロモーター、5’UTR、Kozak配列(gccacc)、VEGF trap(アフリベルセプト)、3’UTR、WPRE及びSV40polyAを順に含む発現カセットを構築し、酵素切断、連結、形質転換及びクローニングスクリーニング同定などの従来の分子生物学的操作によってアフリベルセプトを発現するAAVパッケージングプラスミドを構築することであり、発現カセットの両側は末端逆位反復配列(ITR)であり、その構成図は図5Bに示され、EcoRV及びBSMIは酵素切断部位である。
【0170】
実施例2の方法に従って、ベクターのパッケージング及びrAAVベクターウイルスの精製を行った。
【0171】
精製されたAAV seq2-aflibercept及びAAV2.7m8-afliberceptの2つのウイルスを、DPBS緩衝液で同じ力価9E+12vg/mLにそれぞれ希釈し、週齢が8週~10週のC57マウスに、両眼硝子体注射を1 μLの体積で行い、rAAVベクターウイルス1種類あたり4匹(n=4)を注射した。注射後の2週間、マウスを屠殺し、眼組織を採取してそれぞれ研磨し、各注射群の左眼と右眼にそれぞれ異なる2種類の方法で組織研磨処理を行った。左眼は、PBS+プロテアーゼ阻害剤で研磨し、遠心分離後に上清を取るといった方法1を使用した。右眼は、RIP Buffer+プロテアーゼ阻害剤で研磨し、遠心分離後に上清を取るといった方法2を使用した。酵素結合免疫アッセイを用いて、上清中のアフリベルセプトタンパク質の含有量を検出した(1注射群当たり4個のサンプル、各サンプルについて3回の反復を検出した)。結果を図6に示された。そのうち、ブランク対照はPBS注射群であり、縦座標であるHRAMD/総タンパク質は、組織総タンパク質1 mg当たりのアフリベルセプトタンパク質のng数であった。
【0172】
【表2-1】
【表2-2】
図6、表2の結果は、マウスにおけるAAV seq2-aflibercept群の発現量がAAV2.7m8-aflibercept群よりも高いことを示した。
実施例4. ウサギモデル網膜感染に対するrAAVベクターウイルスの生物学的機能の検出
【0173】
実施例2の方法に従って、ベクターのパッケージング及びrAAVベクターウイルスの精製を行った。
【0174】
精製されたAAV seq2-aflibercept及びAAV2.7m8-afliberceptの2つのウイルスを、DPBS緩衝液で4E+9vg/mLにそれぞれ希釈し、週齢が8週~10週のニュージーランドウサギ(北京維通利華実験動物技術有限公司から購入)に、両眼硝子体注射を50 μLの体積で行い、rAAVベクターウイルス1種類あたり2匹(n=2)を注射した。注射後の2週間、ウサギを屠殺し、房水、硝子体及び全眼組織を採取してそれぞれ研磨し、各注射群の左眼と右眼にそれぞれ異なる2種類の方法で組織研磨処理を行った。左眼は、PBS+プロテアーゼ阻害剤で研磨し、遠心分離後に上清を取るといった方法1を使用した。右眼は、RIP Buffer+プロテアーゼ阻害剤で研磨し、遠心分離後に上清を取るといった方法2を使用した。酵素結合免疫アッセイを用いて、上清中のアフリベルセプトタンパク質の含有量を検出した(1注射群当たり2個のサンプル、各サンプルについて3回反復検出した)。結果を図7に示された。そのうち、ブランク対照はPBS注射群であり、縦座標であるHRAMD/総タンパク質は、組織総タンパク質1 mg当たりのアフリベルセプトタンパク質のng数であった。
【0175】
図7の結果は、ニュージーランドウサギにおけるAAV seq2-aflibercept群の発現量が何れもAAV2.7m8-aflibercept群よりも高いことを示した。ウサギは眼の体積が大きいため、アフリベルセプトは、全眼研磨処理後に組織液に希釈されるため、濃度が硝子体や房水よりも遥かに低い。AAVでパッケージされたベクターは、AAVウイルスが細胞への感染に成功した後にのみ、保有される目的遺伝子タンパク質の発現に成功するので、図7の結果は、細胞に対するAAV2 seq2カプシドの感染効率がAAV2.7m8カプシドよりも高いことを示した。
【0176】
また、AAV2 seq2及びAAV2.7m8カプシドにより送達された目的遺伝子タンパク質(VEGF阻害剤)の発現量を更に比較した。実験方法は、表3の用量に従って、8匹のニュージーランドウサギを両眼に注射し、各用量群で2匹のウサギを4つの眼に注射し、合計4群とした。注射後の28日目に、実験動物を屠殺して房水を抽出し、ELISA法を用いて房水サンプル中の目的遺伝子タンパク質のモル濃度を検出した。
【0177】
結果は、図8に示されるように、AAV2 seq2で発現される目的遺伝子タンパク質のモル濃度が、等用量注射でAAV2.7m8も明らかに高かった。
【0178】
【表3-1】
【表3-2】
以下は本開示の一部の配列である。
【0179】
> AAV2カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNRQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号1
> AAV2.7m8カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALGETTRPARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号2
> AAV2 seq1カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALAETTRPARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号3
> AAV2 seq2カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALGDTTRPARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL*
配列番号4
> AAV2 seq3カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALGETTRNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号5
> AAV2 seq4カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLAKADTTKNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号6

> AAV2 seq5カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLAKDDTTRNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号7
> AAV2 seq6カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALADTTKNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSINVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号8
> AAV9 seq2カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPQPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRLLEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSAGIGKSGAQPAKKRLNFGQTGDTESVPDPQPIGEPPAAPSGVGSLTMASGGGAPVADNNEGADGVGSSSGNWHCDSQWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNSTSGGSSNDNAYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTDNNGVKTIANNLTSTVQVFTDSDYQLPYVLGSAHEGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNDGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYEFENVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSKTINGSGQNQQTLKFSVAGPSNMAVQGRNYIPGPSYRQQRVSTTVTQNNNSEFAWPGASSWALNGRNSLMNPGPAMASHKEGEDRFFPLSGSLIFGKQGTGRDNVDADKVMITNEEEIKTTNPVATESYGQVATNHQSAQLALGDTTRPAAQAQTGWVQNQGILPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGMKHPPPQILIKNTPVPADPPTAFNKDKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSNNVEFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号9
> EGFPアミノ酸配列
MVSKGEELFTGVVPILVELDGDVNGHKFSVSGEGEGDATYGKLTLKFICTTGKLPVPWPTLVTTLTYGVQCFSRYPDHMKQHDFFKSAMPEGYVQERTIFFKDDGNYKTRAEVKFEGDTLVNRIELKGIDFKEDGNILGHKLEYNYNSHNVYIMADKQKNGIKVNFKIRHNIEDGSVQLADHYQQNTPIGDGPVLLPDNHYLSTQSALSKDPNEKRDHMVLLEFVTAAGITLGMDELYK
配列番号10
> seq1(リンカー無)
LAETTRP
配列番号11
> seq2(リンカー無)
LGDTTRP
配列番号12
> seq3(リンカー無)
LGETTRN
配列番号13
> seq4(リンカー無)
KADTTKN
配列番号14
> seq5(リンカー無)
KDDTTRN
配列番号15
> seq6(リンカー無)
LADTTKN
配列番号16
> seq1
LALAETTRPA
配列番号17
> seq2
LALGDTTRPA
配列番号18
> seq3
LALGETTRNA
配列番号19
> seq4
LAKADTTKNA
配列番号20
> seq5
LAKDDTTRNA
配列番号21
> seq6
LALADTTKNA
配列番号22
> AAV2 seq2カプシドアミノ酸配列(V708Iを含まない)
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALGDTTRPARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号23
> AAV2 seq3カプシドアミノ酸配列(V708Iを含まない)
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALGETTRNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号24
> AAV2 seq4カプシドアミノ酸配列(V708Iを含まない)
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLAKADTTKNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号25

> AAV2 seq5カプシドアミノ酸配列(V708Iを含まない)
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLAKDDTTRNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号26
> AAV2 seq6カプシドアミノ酸配列(V708Iを含まない)
MAADGYLPDWLEDTLSEGIRQWWKLKPGPPPPKPAERHKDDSRGLVLPGYKYLGPFNGLDKGEPVNEADAAALEHDKAYDRQLDSGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRVLEPLGLVEEPVKTAPGKKRPVEHSPVEPDSSSGTGKAGQQPARKRLNFGQTGDADSVPDPQPLGQPPAAPSGLGTNTMATGSGAPMADNNEGADGVGNSSGNWHCDSTWMGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISSQSGASNDNHYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTQNDGTTTIANNLTSTVQVFTDSEYQLPYVLGSAHQGCLPPFPADVFMVPQYGYLTLNNGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFTFSYTFEDVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSRTNTPSGTTTQSRLQFSQAGASDIRDQSRNWLPGPCYRQQRVSKTSADNNNSEYSWTGATKYHLNGRDSLVNPGPAMASHKDDEEKFFPQSGVLIFGKQGSEKTNVDIEKVMITDEEEIRTTNPVATEQYGSVSTNLQRGNLALADTTKNARQAATADVNTQGVLPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGHFHPSPLMGGFGLKHPPPQILIKNTPVPANPSTTFSAAKFASFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYNKSVNVDFTVDTNGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号27
> CMVエンハンサー配列
CGTTACATAACTTACGGTAAATGGCCCGCCTGGCTGACCGCCCAACGACCCCCGCCCATTGACGTCAATAATGACGTATGTTCCCATAGTAACGCCAATAGGGACTTTCCATTGACGTCAATGGGTGGAGTATTTACGGTAAACTGCCCACTTGGCAGTACATCAAGTGTATCATATGCCAAGTACGCCCCCTATTGACGTCAATGACGGTAAATGGCCCGCCTGGCATTATGCCCAGTACATGACCTTATGGGACTTTCCTACTTGGCAGTACATCTACGTATTAGTCATCGCTATTACCATG
配列番号28
>CMVプロモーター配列
TGCTGATGCGGTTTTGGCAGTACACCAATGGGCGTGGATAGCGGTTTGACTCACGGGGATTTCCAAGTCTCCACCCCATTGACGTCAATGGGAGTTTGTTTTGGCACCAAAATCAACGGGACTTTCCAAAATGTCGTAATAACCCCGCCCCGTTGACGCAAATGGGCGGTAGGCGTGTACGGTGGGAGGTCTATATAAGCAGAGCTCGTTTAGTGAACCGTCAGATCGCCTGGAGAGGCCATCCACGCTGTTTTGACCTCCATAGTGGACACCGGGACCGATCCAGCCTCCGCGTCTCAGGGGAAGCTT
配列番号29
>5’UTR配列
CTTGTTCTTTTTGCAGAAGCTCAGAATAAACGCTCAACTTTGG
配列番号30
>Kozak配列
GCCACC
配列番号31
>3’UTR配列
GTCTAGAAACCAGCCTCAAGAACACCCGAATGGAGTCTCTAAGCTACATAATACCAACTTACACTTTACAAAATGTTGTCCCCCAAAATGTAGCCATTCGTATCTGCTCCTAATAAAAAGAAAGTTTCTTCAC
配列番号32
>WPRE配列
AATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTATCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTGGTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGGAACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAATCATCGTCCTTTCCTTGGCTGCTCGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGGCCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGC
配列番号33
>SV40polyA配列:
CCTAGGTAAGATACATTGATGAGTTTGGACAAACCACAACTAGAATGCAGTGAAAAAAATGCTTTATTTGTGAAATTTGTGATGCTATTGCTTTATTTGTAACCATTATAAGCTGCAATAAACAAGTTATCGATAGATCT
配列番号34
> AAV9カプシドアミノ酸配列
MAADGYLPDWLEDNLSEGIREWWALKPGAPQPKANQQHQDNARGLVLPGYKYLGPGNGLDKGEPVNAADAAALEHDKAYDQQLKAGDNPYLKYNHADAEFQERLKEDTSFGGNLGRAVFQAKKRLLEPLGLVEEAAKTAPGKKRPVEQSPQEPDSSAGIGKSGAQPAKKRLNFGQTGDTESVPDPQPIGEPPAAPSGVGSLTMASGGGAPVADNNEGADGVGSSSGNWHCDSQWLGDRVITTSTRTWALPTYNNHLYKQISNSTSGGSSNDNAYFGYSTPWGYFDFNRFHCHFSPRDWQRLINNNWGFRPKRLNFKLFNIQVKEVTDNNGVKTIANNLTSTVQVFTDSDYQLPYVLGSAHEGCLPPFPADVFMIPQYGYLTLNDGSQAVGRSSFYCLEYFPSQMLRTGNNFQFSYEFENVPFHSSYAHSQSLDRLMNPLIDQYLYYLSKTINGSGQNQQTLKFSVAGPSNMAVQGRNYIPGPSYRQQRVSTTVTQNNNSEFAWPGASSWALNGRNSLMNPGPAMASHKEGEDRFFPLSGSLIFGKQGTGRDNVDADKVMITNEEEIKTTNPVATESYGQVATNHQSAQAQAQTGWVQNQGILPGMVWQDRDVYLQGPIWAKIPHTDGNFHPSPLMGGFGMKHPPPQILIKNTPVPADPPTAFNKDKLNSFITQYSTGQVSVEIEWELQKENSKRWNPEIQYTSNYYKSNNVEFAVNTEGVYSEPRPIGTRYLTRNL
配列番号37
>アフリベルセプトタンパク質配列
MPLLLLLPLLWAGALASDTGRPFVEMYSEIPEIIHMTEGRELVIPCRVTSPNITVTLKKFPLDTLIPDGKRIIWDSRKGFIISNATYKEIGLLTCEATVNGHLYKTNYLTHRQTNTIIDVVLSPSHGIELSVGEKLVLNCTARTELNVGIDFNWEYPSSKHQHKKLVNRDLKTQSGSEMKKFLSTLTIDGVTRSDQGLYTCAASSGLMTKKNSTFVRVHEKDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK
配列番号38
>アフリベルセプト核酸配列1
ATGCCCCTGCTCCTGCTCCTGCCCCTGCTGTGGGCCGGCGCCCTGGCTAGCGACACCGGCAGACCCTTCGTGGAGATGTACAGCGAGATCCCCGAGATCATCCACATGACCGAGGGCAGAGAGCTGGTGATCCCCTGCAGAGTGACAAGCCCCAACATCACCGTGACCCTGAAAAAATTCCCTCTGGACACCCTGATCCCCGACGGCAAGAGAATCATCTGGGACAGCAGAAAGGGCTTCATCATCAGCAACGCCACCTACAAGGAGATCGGCCTGCTGACCTGCGAGGCCACCGTGAACGGCCACCTGTACAAGACCAACTACCTGACCCACAGACAGACCAACACCATCATCGACGTGGTGCTGAGCCCTAGCCACGGCATCGAGCTGAGCGTGGGCGAGAAGCTGGTGCTGAACTGCACCGCTAGAACCGAGCTGAACGTGGGCATCGACTTCAACTGGGAGTACCCTAGCAGCAAGCATCAGCACAAGAAGCTGGTGAACAGAGACCTGAAGACACAGAGCGGCAGCGAGATGAAGAAGTTCCTGAGCACCCTGACCATCGACGGCGTGACAAGAAGCGACCAAGGCCTGTACACCTGCGCCGCTAGCAGCGGCCTGATGACCAAGAAGAACAGCACCTTCGTGAGAGTGCATGAGAAGGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCCGCTCCTGAACTGCTGGGCGGCCCTAGCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACACTCATGATCAGCAGAACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTCGTGGACGTGAGCCACGAGGACCCCGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCTAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGAGTGGTGAGCGTGCTGACCGTGCTGCACCAAGACTGGCTGAACGGCAAGGAGTACAAGTGCAAGGTGAGCAACAAGGCCCTGCCCGCCCCCATCGAGAAGACCATCAGCAAGGCCAAGGGGCAGCCTAGAGAGCCCCAAGTGTACACCCTGCCCCCTAGCAGAGACGAGCTGACCAAGAACCAAGTGAGCCTGACCTGCCTGGTGAAGGGCTTCTACCCTAGCGACATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGGCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCCGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGAGCAGATGGCAGCAAGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACACAGAAGAGCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAGTGA
配列番号39
>アフリベルセプト核酸配列2
ATGCCTCTGCTCCTGCTGCTCCCTCTGCTGTGGGCCGGCGCCCTGGCCAGCGACACAGGCCGCCCCTTCGTGGAAATGTACAGCGAGATCCCTGAGATCATCCACATGACAGAGGGCCGGGAACTGGTCATCCCTTGTAGAGTGACATCTCCAAACATCACCGTGACCCTGAAAAAGTTCCCCCTGGACACACTGATCCCTGACGGCAAAAGAATCATCTGGGATTCCCGGAAGGGCTTCATCATCAGCAATGCCACCTACAAGGAAATCGGACTGCTGACCTGTGAAGCCACAGTGAACGGCCACCTGTACAAGACCAACTACCTGACCCATAGGCAGACCAATACCATCATCGATGTGGTGCTGTCTCCTTCTCACGGCATCGAGCTCAGCGTCGGCGAGAAACTGGTGCTGAACTGCACCGCCAGAACCGAGCTGAACGTGGGCATCGACTTCAACTGGGAATACCCCAGTTCTAAGCACCAGCACAAGAAACTGGTTAATAGAGATCTGAAGACCCAAAGCGGCAGCGAGATGAAAAAGTTTCTGTCTACACTGACAATTGACGGTGTTACCAGAAGCGATCAGGGCCTGTATACATGCGCCGCTTCTAGCGGCCTGATGACCAAGAAGAACAGCACCTTCGTGCGGGTGCACGAGAAGGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGTCCAGCTCCTGAACTGCTGGGAGGCCCTAGCGTGTTCCTGTTCCCTCCAAAGCCTAAGGACACCCTTATGATTAGCAGAACACCTGAGGTGACCTGCGTGGTGGTCGACGTGTCCCACGAGGACCCCGAGGTGAAATTTAACTGGTACGTGGATGGCGTGGAAGTTCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAACAGTACAACAGCACATATAGAGTGGTGTCCGTGCTGACCGTTCTGCACCAGGACTGGCTGAATGGAAAAGAGTACAAGTGCAAGGTGTCCAACAAGGCCCTGCCTGCCCCTATCGAGAAGACTATCAGCAAGGCTAAGGGCCAACCTCGGGAACCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGACGAGCTGACAAAGAACCAGGTGTCCCTGACATGCCTGGTGAAGGGATTTTACCCTAGCGATATCGCCGTGGAATGGGAGAGCAACGGCCAGCCTGAGAACAACTACAAAACGACCCCTCCTGTGCTGGACTCTGATGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGAGCAGATGGCAGCAGGGCAACGTGTTCTCATGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCATAATCACTACACCCAGAAAAGCCTGAGCCTGAGCCCTGGCAAGTGA
配列番号40
>アフリベルセプト核酸配列3
ATGCCACTGCTCTTGCTTTTGCCCTTGCTTTGGGCTGGTGCCCTTGCCTCAGACACTGGAAGGCCGTTCGTAGAAATGTACTCCGAGATCCCTGAAATAATCCACATGACGGAGGGGCGAGAGTTGGTGATACCATGTCGAGTTACGAGCCCGAATATTACAGTAACATTGAAGAAATTCCCACTCGACACTCTCATTCCAGATGGTAAGAGAATTATATGGGATTCACGAAAGGGCTTCATTATATCTAACGCTACTTACAAAGAGATAGGCTTGCTCACATGCGAGGCAACTGTCAATGGCCACTTGTATAAAACCAATTATCTCACACATAGGCAGACTAATACGATAATAGACGTTGTCCTTTCTCCGAGCCATGGCATTGAATTGAGTGTCGGTGAGAAGCTCGTATTGAACTGCACTGCTAGGACCGAGCTTAACGTAGGGATCGACTTTAACTGGGAGTACCCATCATCAAAGCATCAGCATAAAAAGCTCGTCAACCGGGACCTTAAGACGCAGAGTGGCTCAGAGATGAAGAAGTTCCTTTCTACACTGACCATCGATGGTGTAACCAGAAGTGACCAGGGACTCTATACCTGTGCCGCATCCTCCGGCCTTATGACGAAGAAAAACAGCACATTTGTTCGGGTCCACGAGAAGGACAAGACTCATACGTGTCCGCCGTGTCCAGCCCCAGAATTGCTCGGGGGGCCTTCCGTGTTTCTGTTCCCTCCAAAGCCAAAGGACACGCTTATGATTTCAAGGACTCCCGAAGTCACCTGCGTCGTGGTTGACGTTTCTCATGAGGACCCAGAGGTGAAATTCAACTGGTACGTGGATGGAGTAGAGGTACATAACGCCAAAACAAAACCACGAGAAGAGCAGTATAACTCAACGTATCGGGTAGTTTCTGTGCTTACGGTTCTCCACCAAGATTGGTTGAATGGAAAAGAGTATAAGTGTAAAGTCTCAAACAAAGCCCTGCCGGCACCCATCGAGAAGACCATTAGCAAAGCAAAAGGCCAACCTAGAGAACCGCAGGTGTACACGTTGCCACCGTCAAGGGATGAACTTACGAAGAATCAAGTATCACTCACATGTTTGGTTAAAGGATTTTATCCCAGCGACATCGCCGTAGAATGGGAGAGTAACGGCCAGCCTGAAAATAACTATAAGACGACACCCCCTGTTTTGGATTCTGACGGTTCATTTTTTTTGTATAGTAAACTCACAGTCGACAAGAGTCGCTGGCAACAAGGTAATGTATTTAGCTGTAGCGTGATGCATGAAGCTTTGCACAACCACTATACACAGAAGTCCTTGTCTCTGTCTCCGGGAAAATGA
配列番号41
図1
図2
図3
図4A
図4B
図5A
図5B
図6
図7
図8
【配列表】
2024519888000001.app
【国際調査報告】