特表 2024-520067 上皮起源の腫瘍を有する患者の処置のための治療用組成物の使用

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2024-05-21

(54)【発明の名称】上皮起源の腫瘍を有する患者の処置のための治療用組成物の使用

(51)【国際特許分類】

   A61K 45/06 20060101AFI20240514BHJP

   A61P 35/00 20060101ALI20240514BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20240514BHJP

   A61P 37/06 20060101ALI20240514BHJP

   A61K 38/18 20060101ALI20240514BHJP

   A61K 47/64 20170101ALI20240514BHJP

   A61K 39/39 20060101ALI20240514BHJP

   A61K 39/395 20060101ALI20240514BHJP

   C12Q 1/6869 20180101ALI20240514BHJP

   C07K 14/82 20060101ALN20240514BHJP

   C07K 14/485 20060101ALN20240514BHJP

   C07K 16/28 20060101ALN20240514BHJP

【ＦＩ】

A61K45/06

A61P35/00 ZNA

A61P43/00 121

A61P37/06

A61K38/18

A61K47/64

A61K39/39

A61K39/395 D

A61K39/395 N

C12Q1/6869 Z

C07K14/82

C07K14/485

C07K16/28

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2023573145

(86)(22)【出願日】2022-05-19

(85)【翻訳文提出日】2024-01-18

(86)【国際出願番号】 CU2022050004

(87)【国際公開番号】W WO2022247972

(87)【国際公開日】2022-12-01

(31)【優先権主張番号】2021-0045

(32)【優先日】2021-05-26

(33)【優先権主張国・地域又は機関】CU

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】509352381

【氏名又は名称】セントロ デ インミュノロヒア モレキュラル

(71)【出願人】

【識別番号】523444442

【氏名又は名称】イノベーティブ イミュノセラピー アライアンス エセ．ア．

(74)【代理人】

【識別番号】110000855

【氏名又は名称】弁理士法人浅村特許事務所

(72)【発明者】

【氏名】クロムベット ラモス、タニア

(72)【発明者】

【氏名】メサ パルディージョ、キルセ

(72)【発明者】

【氏名】レオン モンソン カレト

(72)【発明者】

【氏名】マソーラ ヘレーラ、サイマ

(72)【発明者】

【氏名】サアベドラ エルナンデス、ダナイ

(72)【発明者】

【氏名】ロレンツォ － ルアセス アルバレス、パトリシア

(72)【発明者】

【氏名】ディーワイ、グレイス

(72)【発明者】

【氏名】レイド、メアリー

(72)【発明者】

【氏名】エヴァンス、レイチェル

(72)【発明者】

【氏名】ムヒッチ、ジェイソン

(72)【発明者】

【氏名】リー、ケルビン

(72)【発明者】

【氏名】ハトソン、アラン

(72)【発明者】

【氏名】ジョンソン、キャンディス

【テーマコード（参考）】

4B063

4C076

4C084

4C085

4H045

【Ｆターム（参考）】

4B063QA01

4B063QA05

4B063QA13

4B063QA17

4B063QA18

4B063QA19

4B063QQ02

4B063QQ42

4B063QR08

4B063QR32

4B063QR62

4B063QS10

4B063QS25

4B063QS39

4C076CC07

4C076CC41

4C076EE59

4C084AA02

4C084AA20

4C084BA44

4C084DB53

4C085AA13

4C085AA14

4C085AA38

4C085BB11

4C085EE03

4C085EE06

4C085FF03

4C085FF13

4C085FF17

4C085FF18

4C085FF19

4C085FF21

4H045AA10

4H045AA11

4H045AA30

4H045BA10

4H045BA42

4H045CA40

4H045CA41

4H045DA20

4H045DA76

4H045EA20

4H045EA31

(57)【要約】

本発明は、バイオテクノロジー及び医学の分野に関する。上皮起源の腫瘍、特にヒトＫＲＡＳタンパク質の天然型を発現する腫瘍の処置における、上皮成長因子を遮断する化合物及びＰＤ－１／ＰＤ－１リガンドシグナル伝達経路を遮断する抗体を含む治療用組成物の使用が記載されている。当該治療用組成物で処置した天然のＫＲＡＳを発現する上皮起源のがんを有する患者では、その生存率の増加が観察された。

【特許請求の範囲】

【請求項1】

上皮成長因子（ＥＧＦ）に対する特異的抗体（Ａｂ）の産生を誘導するワクチン組成物と、ＰＤ１／ＰＤ１リガンド（ＰＤ－１Ｌ）シグナル伝達経路を遮断する化合物とを含む、上皮起源の腫瘍を処置するための治療用組成物の使用。

【請求項2】

上皮起源の腫瘍が野生型形態のヒトＫＲＡＳタンパク質を発現する、請求項１に記載の使用。

【請求項3】

野生型ＫＲＡＳが、配列番号１及び配列番号２からなる群から選択される配列を有することを特徴とする、請求項２に記載の使用。

【請求項4】

ＥＧＦに対するＡｂ産生を誘導するワクチン組成物が、有効成分として、ヒト組換えＥＧＦと担体タンパク質との間でコンジュゲートされたものを含む、請求項１に記載の使用。

【請求項5】

担体タンパク質が、
コレラ毒素Ｂサブユニット、
破傷風トキソイド、
ＫＬＨ及び
髄膜炎菌（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）のＰ６４ｋ
からなる群から選択される、請求項４に記載の使用。

【請求項6】

ワクチン組成物が、
不完全なフロイントのアジュバント、
スクアレン系アジュバント、
合成起源アジュバント、
鉱物起源アジュバント、
植物起源アジュバント、
動物起源アジュバント、
粒子状タンパク質アジュバント及び
リポソーム
からなる群から選択されるアジュバントをさらに有する、請求項５に記載の使用。

【請求項7】

ＰＤ１／ＰＤ－１Ｌシグナル伝達経路を遮断する化合物が、
抗ＰＤ１ Ａｂ及び
抗ＰＤ－Ｌ１ Ａｂ
からなる群から選択される、請求項１に記載の使用。

【請求項8】

抗ＰＤ１ Ａｂが、ニボルマブ、ペンブロリズマブ、セミプリマブ、ＭＥＤＩ０６０８及びピジリズマブからなる群から選択される、請求項７に記載の使用。

【請求項9】

抗ＰＤ１Ｌ Ａｂが、アテゾリズマブ、デュルバルマブ、アベルマブ及びＭＤＸ－１１０５からなる群から選択される、請求項７に記載の使用。

【請求項10】

患者の腫瘍細胞の試料中の野生型ＫＲＡＳの存在又は非存在を決定することによって患者が選択され、腫瘍試料において野生型ＫＲＡＳが検出された患者が処置のために選択される、請求項１～９のいずれか一項に記載の使用。

【請求項11】

非小細胞肺がん、頭頸部扁平上皮がん、尿路上皮がん腫、結腸直腸がん、胃がん、食道がん、子宮頸がん、肝細胞がん腫、メルケル細胞がん腫、腎細胞がん腫、子宮内膜がん腫、乳がん及び皮膚がんからなる群から選択される腫瘍の処置のための請求項１～１０のいずれか一項に記載の使用。

【請求項12】

ＥＧＦを遮断する化合物及びＰＤ１／ＰＤ－Ｌ１シグナル伝達経路を遮断するＡｂを含む治療用組成物による処置に対する応答者又は非応答者に患者を層別化する方法であって、患者の腫瘍細胞の試料中の野生型ＫＲＡＳの存在又は非存在を決定することによって患者が選択される、上記方法。

【請求項13】

野生型ＫＲＡＳが腫瘍試料において検出された場合に、患者が処置に応答性であると判断される、請求項１２に記載の方法。

【請求項14】

患者の腫瘍試料において、ＰＤ－Ｌ１レベルが１％未満である、請求項１３に記載の方法。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

本発明は、バイオテクノロジー及び医学の分野に関する。特に、上皮成長因子及びＰＤ１／ＰＤ１リガンドのシグナル伝達経路の同時遮断による上皮起源の腫瘍を有する患者の処置のための治療用組成物の使用が記載される。

【背景技術】

【0002】

ＰＤ１受容体及びそのＰＤＬ１リガンドが目立つ「チェックポイント」と呼ばれる分子は、免疫系によって生成される抗腫瘍応答を負に調節する。これらのチェックポイントでの阻害性シグナルの伝達を遮断するモノクローナル抗体（ｍＡｂ）（抗ＣＰＩ）は、より効率的な抗腫瘍応答を誘導する。２０２０年１２月現在、黒色腫、肺がん、頭頸部扁平上皮腫瘍、肝細胞がん腫、尿路上皮がん、胃がん、乳房及び結腸直腸の腫瘍などの多数の「免疫感受性」悪性腫瘍の処置には、７つの抗ＣＰＩ ｍＡｂが承認されている（Ｒａｖｉｎｄｒａｎａｔｈａｎ Ｄ ｅｔ ａｌ．（２０２１）Ｂｉｏｌｏｇｙ，１０：３２５）。

【0003】

最も成功した抗ＣＰＩ ｍＡｂの中には、ＰＤ１特異的（抗ＰＤ１）ニボルマブ及びペンブロリズマブ並びにＰＤＬ１に対するアテゾリズマブ及びデュルバルマブがある。これらの治療法は、ＰＤＬ１分子を発現し、高頻度の突然変異を有し、阻害シグナルが遮断された場合に腫瘍を攻撃することが潜在的に可能な免疫細胞の浸潤を有する腫瘍においてより効果的であることが示されている（Ｇｉｂｎｅｙ ＧＴ ｙ ｃｏｌｓ．（２０１６）Ｌａｎｃｅｔ Ｏｎｃｏｌ．１７（１２）：ｅ５４２－ｅ５５１）。ＰＤ１／ＰＤＬ１に対して低分子量阻害剤も開発されており、免疫系に関連する有害作用を示すことなくこのシグナル伝達経路を遮断するという点で有望な結果が得られている（Ｌｉｕ Ｃｈ ｙ ｃｏｌｓ．（２０２１）Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｌｌ Ｉｎｔ．２１：ｅ１－ｅ１７）。

【0004】

上皮成長因子受容体（ＥＧＦＲ）はチロシンキナーゼ受容体であり、７つの天然リガンドによって活性化される既知のがん遺伝子（Ｙａｒｄｅｎ Ｙ．（２００１）Ｅｕｒｏｐｅａｎ Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｃａｎｃｅｒ．３７：Ｓ３－Ｓ８）である。いくつかの研究では、ＥＧＦＲに結合するリガンドに応じて、ＥＧＦＲシグナル伝達カスケードの示差的活性化が報告されている。ＥＧＦなどのリガンドは、腫瘍増殖に有利なシグナル伝達を誘導し、アンフィレグリンなどの低親和性リガンドは分化を促進する（Ｆｒｅｅｄ ＤＭ ｙ ｃｏｌｓ．（２０１７）Ｃｅｌｌ １７１：１－１３）。リガンド依存性シグナル伝達カスケードの示差的活性化は、例えば抗ＥＧＦＲ ｍＡｂ又はＴＫＩシグナル伝達カスケードの阻害剤による直接的な受容体遮断とは対照的に、これらの分子に対する標的化療法において重要であり得る。そのような違いは、処置の忍容性／安全性、並びに異なる治療状況でのより大きい又はより小さい臨床的有効性に影響を及ぼし得る。この意味で、ＥＧＦＲリガンドを標的とする治療様式は、リガンドに対する特異的抗体（Ａｂ）を誘導し、その結果、ＥＧＦＲとのその相互作用を遮断するワクチン組成物の使用である。この治療戦略の一例は、ヒト上皮成長因子（ＥＧＦ）に対する特異的ｍＡｂを生成し、この重要なリガンドを腫瘍から奪うＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦワクチンである。ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦで免疫した非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）患者における多数の臨床試験は、ワクチンが安全で免疫原性であることを示している。臨床応答の観点から、ワクチンの投与は患者の生存を有意に増加させた（Ｒｏｄｒｉｇｕｅｚ ＰＣ ｙ ｃｏｌｓ．（２０１６）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．２２（１５）：３７８２－９０）。

【0005】

ＥＧＦＲシグナル伝達に関与する最も重要な分子の１つは、ＧＴＰアーゼＫＲＡＳである。この分子はまた、腫瘍形成に関与する複数のシグナル伝達カスケードを活性化する。すべてのヒト腫瘍の約３０％が、ＫＲＡＳをコードする遺伝子に突然変異を有し、これにより、従来の膜受容体活性化とは無関係に、ＥＧＦ－Ｒカスケードの何らかの構成的活性化が誘導される（Ｆｅｒｎａｎｄｅｚ－Ｍｅｄａｒｄｅ，Ａ ｙ ｃｏｌｓ．（２０１１）Ｇｅｎｅｓ ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ．２：３４４－３５８）。

【0006】

この遺伝子の突然変異は、これらの新生物の一部、例えば膵臓腺がんにおいて優勢であり、腫瘍の９０％において突然変異を示す。結腸などの他の腺がんでは、それは、それらの４０％に存在する。肺の場合、ＫＲＡＳ突然変異は、すべての非小細胞肺腫瘍の３０％、主に腺がん組織学に存在する（Ｍｏｏｒｅ ＡＲ ｙ ｃｏｌｓ．（２０２０）Ｎａｔ Ｒｅｖ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ．１９（８）：５３３－５５２）。

【0007】

膵臓及び結腸などの腫瘍では、ＫＲＡＳ突然変異の存在は、腫瘍増殖及び治療に対する耐性に有利である（Ｈａｉｇｉｓ ＫＭ ｅｔ ａｌ．（２００８）Ｎａｔ Ｇｅｎｅｔ．４０：６００－８．；Ｂｏｕｒｎｅｔ Ｂ ｅｔ ａｌ．（２０１６）Ｃｌｉｎ Ｔｒａｎｓｌ Ｇａｓｔｒｏｅｎｔｅｒｏｌ．７：ｅ１５７）。しかしながら、肺腺がんなどの他のものでは、この遺伝子における突然変異の予後値に関する議論の余地のあるデータがある（Ｓｈｅｐｈｅｒｄ ＦＡ ｅｔ ａｌ．（２０１３）Ｊ Ｃｌｉｎ．Ｏｎｃｏｌ．３１（１７）：２１７３－８１；Ｚｅｒ Ａ ｅｔ ａｌ．（２０１６）Ｊ Ｔｈｏｒａｃｉｃ．Ｏｎｃｏｌ．１１（１３）：３１２－２３）。進行した結腸腫瘍において、天然のＫＲＡＳの存在は、ＥＧＦＲ特異的ｍＡｂであるパニツムマブ及びセツキシマブによる処置の臨床的利益の予測因子である。さらに、ゲニシタビンと組み合わせたニモツズマブ（別の抗ＥＧＦＲ）の使用は、腫瘍がＫＲＡＳに対して天然である進行膵臓がんを有する患者において臨床的利益を提供する（Ｓｃｈｕｌｔｈｅｉｓ Ｂ ｅｔ ａｌ．（２０１７）Ａｎｎ．Ｏｎｃｏｌ．２８：２４２９－３５）。しかし、ＮＳＣＬＣの処置のためのセツキシマブの使用は、特にＫＲＡＳを含むＥＧＦＲシグナル伝達カスケードに突然変異を有する患者のサブグループのいずれにおいても臨床的利点を示していない。一方、腫瘍におけるＫＲＡＳの突然変異又は非変異は、それ自体では、抗ＰＤ１／ＰＤＬ１ ｍＡｂに対する患者の臨床応答に影響を及ぼさないか、又は調整しない。肺がんにおける抗ＰＤ１／ＰＤＬ１ ｍＡｂを用いた第ＩＩＩ相臨床試験では、突然変異ＫＲＡＳ腫瘍を有する患者について有意な臨床的利益が観察された（Ｂｏｒｇｈａｅｉ，Ｈ ｅｔ ａｌ．（２０１５）Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ．３７３（１７）：１６２７－１６３９；Ｓｏｃｉｎｓｋｉ Ｍａｙ ｃｏｌｓ．（２０１８）Ｎ Ｅｎｇｌ Ｊ Ｍｅｄ．３７８（２４）：２２８８－２３０１）。この知見と一致して、最近の臨床試験は、ＫＲＡＳ突然変異（同時突然変異）と組み合わせた他の突然変異の存在が、抗ＰＤ１／ＰＤＬ１ ｍＡｂで処置された患者においてより良好な又はより悪い応答を調整し得ることを示している。特に、ＫＲＡＳがＴＰ５３遺伝子と同時突然変異する肺腺がんは、ＣＰＩに対する感受性がより高い免疫原性腫瘍をもたらす。対照的に、ＳＴＫ１１における同時突然変異は、炎症を起こさず、このタイプの治療に対してより抵抗性である腫瘍をもたらす（Ｄｏｎｇ ＺＹ ｅｔ ａｌ．（２０１７）Ｃｌｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ ２３：３０１２－３０２４；Ｓｋｏｕｌｉｄｉｓ Ｆｙ ｃｏｌｓ．（２０１８）Ｃａｎｃｅｒ Ｄｉｓｃｏｖ；８：８２２－８３５）。

【0008】

ＥＧＦＲシグナル伝達遮断療法及びＣＰＩの成功を考慮して、いくつかの研究では、異なる処置適所における両方のアプローチの併用処置の利益が評価されており、結果は様々である。いくつかの著者らは、抗ＰＤ１／ＰＤＬ１ ｍＡｂを、肺がん患者における突然変異ＥＧＦＲバリアントによる異常なシグナル伝達を遮断するＴＫＩ療法と組み合わせることの簡便さの有無を調査した。これらの研究は、組み合わせの利点がなく、毒性が有意に増加したことを示した（Ｙａｎｇ ＪＣ ｅｔ ａｌ．（２０１９）Ｊ Ｔｈｏｒａｃ Ｏｎｃｏｌ．；１４（３）：５５３－９；Ｓｃｈｏｅｎｆｅｌｄ ＡＪ ｅｔ ａｌ．（２０１９）Ａｎｎ Ｏｎｃｏｌ．３０（５）：８３９－４４）。他の著者らは、肺がん患者においてネシツムマブ（別の抗ＥＧＦＲ ｍＡｂ）との組み合わせを評価した。この試験では、毒性は管理可能であったが、臨床的に関連する効果の証拠はなかった（Ｂｅｓｓｅ Ｂ ｅｔ ａｌ．（２０２０）Ｌｕｎｇ Ｃａｎｃｅｒ．１４２：６３－６９）。これらの試験のいずれにおいても、ＫＲＡＳ分子の状態との関連は報告されていない。

【発明の概要】

【課題を解決するための手段】

【0009】

本発明は、天然のＫＲＡＳを有する患者における、ＰＤ１とＰＤＬ１との間の相互作用を遮断するｍＡｂと自己ヒトＥＧＦに対するＡｂを誘導するワクチン組成物とを組み合わせた治療用組成物の使用を初めて報告する。得られた結果は、治療が十分に忍容され、天然のＫＲＡＳを示す腫瘍を有する患者に特異的に利益をもたらすことを示している。さらに、この治療法は、抗ＰＤ１／ＰＤＬ１ ｍＡｂ治療に対してあまり感受性ではない、ＰＤ－Ｌ１発現が低い腫瘍を有する患者に利益をもたらす。

【0010】

１つの実施形態において、本発明は、上皮起源の腫瘍を処置するための治療用組成物の使用に関する。これらの組成物は、ＥＧＦに対する特異的Ａｂの産生を誘導するワクチン組成物及びＰＤ１／ＰＤ１リガンドシグナル伝達経路を遮断する化合物の使用を特徴とする。特に、上述の治療用組成物の使用は、ＫＲＡＳタンパク質の天然型を発現する上皮起源の腫瘍、好ましくは配列番号１及び配列番号２に記載される配列を有する腫瘍において記載される。

【0011】

特に、ＥＧＦに対するＡｂの産生を誘導するワクチン組成物は、有効成分として、組換えヒトＥＧＦと担体タンパク質との間のコンジュゲートを含む。当該担体タンパク質は、コレラ毒素Ｂ、破傷風トキソイド、ＫＬＨ及び髄膜炎菌（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）ｐ６４ｋタンパク質を含む群から選択される。

【0012】

さらに、ＥＧＦに対するＡｂの産生を誘導するワクチン組成物は、不完全なフロイントのアジュバント、スクアレンに基づくもの、合成起源のもの、鉱物起源のもの、植物起源のもの、動物起源のもの、粒子状タンパク質及びリポソームを含む群から選択されるアジュバントを有する。

【0013】

ＰＤ１／ＰＤ１リガンドシグナル伝達経路を遮断する化合物は、その中でもニボルマブ、ペンブロリズマブ、ＭＥＤＩ０６０８及びピジリズマブである抗ＰＤ１ Ａｂと、アテゾリズマブ、デュルバルマブ、アベルマブ及びＭＤＸ－１１０５であり得る抗ＰＤＬ１ Ａｂとを含む群から選択される。

【0014】

本発明の一実施形態では、患者は、それらの腫瘍細胞の試料中の天然ＫＲＡＳの存在又は非存在によってスクリーニングされる。天然のＫＲＡＳが存在するものを処置のために選択する。処置される腫瘍の種類には、非小細胞肺がん、頭頸部扁平上皮がん、尿路上皮がん腫、結腸直腸がん、胃がん、食道がん、子宮頸がん、肝細胞がん腫、メルケル細胞がん腫、腎細胞がん腫、子宮内膜がん腫、乳がん及び皮膚がんがある。

【0015】

さらなる実施形態では、本発明は、患者を本明細書に記載の治療用組成物による処置に対して応答者又は非応答者に層別化する方法に関する。患者は、腫瘍細胞の試料中の天然のＫＲＡＳの存在又は非存在を決定することによって層別化され、天然のＫＲＡＳの存在が検出された患者は、処置に対する応答者と見なされる。好ましくは、腫瘍試料のＰＤＬ１レベルが１％未満である患者が応答者と見なされる。

【0016】

発明の詳細な説明
ＫＲＡＳ
本発明の方法及び使用は、上皮性腫瘍が野生型タンパク質ＫＲＡＳを発現する患者の処置及び／又は層別化のために想定される。用語「野生型」ＫＲＡＳは、天然に存在するＫＲＡＳアイソフォームを指す（Ｕｎｉｐｒｏｔ Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｐ０１１１６、２０２１年４月７日のバージョン２４６）。野生型ＫＲＡＳは、配列番号１又は配列番号２に対応する配列を含むことが想定される。特に、野生型ＫＲＡＳは、配列番号１又は配列番号２に対応する配列からなり得る。

【0017】

「野生型ＫＲＡＳ」という用語は、一般に、配列番号１（ＫＲＡＳ４Ａ）又は配列番号２（ＫＲＡＳ４Ｂ）に示される参照配列に対して突然変異を有するＫＲＡＳポリペプチドも包含し、本明細書に記載の配列番号１（ＫＲＡＳ４Ａ，Ｕｎｉｐｒｏｔ Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｐ０１１１６－１）又は配列番号２（ＫＲＡＳ４Ｂ，Ｕｎｉｐｒｏｔ Ａｃｃ．Ｎｏ．Ｐ０１１１６－２）に示されるアミノ酸配列とある程度の同一性として共有するアミノ酸配列を有するポリペプチドも包含する。より具体的には、「野生型ＫＲＡＳ」には、配列番号１（ＫＲＡＳ４Ａ）又は配列番号２（ＫＲＡＳ４Ｂ）と少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％又は１００％の同一性を有するＫＲＡＳポリペプチドが含まれる。特に、ＫＲＡＳアイソフォーム４Ａ及び４Ｂは、「野生型ＫＲＡＳ」という用語に包含される。好ましくは、「野生型ＫＲＡＳ」は、それぞれ配列番号１又は配列番号２と比較して、そのアミノ酸配列に突然変異を含まない。

【0018】

治療用組成物
本発明は、特に標的ＥＧＦ及びシグナル伝達経路ＰＤ１／ＰＤ１リガンドを遮断することを目的とする、がんを処置するための治療用組成物に関する。本発明は、上皮起源の腫瘍、特に典型的には免疫療法に応答する腫瘍を有する患者の亜集団における、ＰＤ１又はそのリガンドＰＤＬ１に対する化合物と、ＥＧＦの濃度を低下させる薬剤との組み合わせの有効な使用を記載する。

【0019】

ＰＤ１又はそのリガンドに対する化合物の中には、本発明において使用されるＭＡｂ抗ＰＤ１がある。そのような化合物はすべて、細胞表面受容体ＰＤ１に特異的に結合し、阻害経路ＰＤ１／ＰＤＬ１を遮断するものである。これらの抗ＰＤ１ ＭＡｂの中には、米国特許第８，００８，４４９号に記載されているニボルマブ、米国特許第８，３５４，５０９号及び米国特許第８，９００，５８７号に記載されているペンブロリズマブ、ＭＥＤＩ０６０８（米国特許第８，６０９，０８９号）、ピジリズマブ（米国特許第８，６８６，１１９号）及びセミプリマブがある。

【0020】

本発明で使用される抗ＰＤＬ１ ＭＡｂはすべて、ＰＤＬ１に特異的に結合し、阻害経路ＰＤ１／ＰＤＬ１を遮断するものである。これらの抗ＰＤＬ１ ＭＡｂの中には、米国特許第８，２１７，１４９号に記載されているアテゾリズマブ、デュルバルマブ（米国特許第８，７７９，１０８号）、米国特許第９，６２４，２９８号に記載されているアベルマブ及びＭＤＸ－１１０５（米国特許第７９４３７４３号）がある。

【0021】

さらに、相互作用ＰＤ１／ＰＤＬ１を抑制する低分子量阻害剤を、本発明によるＥＧＦ濃度を低下させる薬剤と組み合わせることができる。これらの阻害剤の中には、ＢＭＳ１１６６、ＢＭＳ２０２及びＣＡ－１７０がある。

【0022】

本発明において提供されるＥＧＦの濃度を低下させる薬剤はすべて、自己ヒトＥＧＦに対する特異的Ａｂの産生を誘導するワクチン組成物である。そのようなＡｂは、ＥＧＦ受容体とのＥＧＦの相互作用を遮断し、このことは血清ＥＧＦのレベルの低下及び／又は排除に寄与する。これらのワクチン組成物の例は、組換えヒトＥＧＦ（ＥＧＦｈｒ）と輸送体タンパク質との間のコンジュゲートを有効成分として含むすべてのものである。この輸送タンパク質は、コレラ毒素Ｂ、破傷風トキソイド、ＫＬＨ及び髄膜炎菌（Ｎｅｉｓｓｅｒｉａ ｍｅｎｉｎｇｉｔｉｄｉｓ）由来のＰ６４ｋであり得るが、これらに限定されない。さらに、これらのワクチン組成物は、フロイント不完全アジュバント、スクアレン系アジュバント、合成起源、鉱物起源、植物起源、動物起源、粒子状タンパク質アジュバント及びリポソームから選択されるアジュバントを含む。

【0023】

患者の特定及び／又は選択の方法
特定の患者が本発明の方法によって処置される患者の集団に属するか否かは、当技術分野で公知の日常的な実験を用いて評価することができる。例えば、上皮性腫瘍が野生型ＫＲＡＳを発現するかどうかを決定するために、腫瘍試料を典型的には評価される患者から得て、ＫＲＡＳ核酸配列をそれぞれ試料から得て増幅し、シーケンシングに供する。或いは、ポリメラーゼ連鎖反応は、ＫＲＡＳ遺伝子の存在を検出することができる。

【0024】

別の方法は、ＫＲＡＳがん遺伝子を有する循環腫瘍細胞を膜マイクロアレイを用いて検出することができる血漿又は血清試料に関する。これに関して、血漿又は血清中の陽性ＫＲＡＳ當津善変異は腫瘍中のＫＲＡＳ突然変異を示唆するが、血漿又は血清中にＫＲＡＳ突然変異が存在しないことは、膵臓腫瘍組織における同様の突然変異の欠如を必ずしも証明しない。

【0025】

追加的又は代替的に、野生型ＫＲＡＳの発現は、腫瘍試料中の突然変異及び／又は野生型ＫＲＡＳポリペプチドを検出することによって、例えば、それぞれ野生型又は突然変異ＫＲＡＳに特異的なエピトープに結合する特異的抗体を使用することによって決定することができる。野生型ＫＲＡＳを発現する上皮性腫瘍を有する患者は処置のために選択されるが、発現突然変異ＫＲＡＳの患者は処置のために選択されないことが想定される。

【0026】

本明細書の他の箇所に記載されているように、突然変異ＫＲＡＳ、特に１つ又は複数の突然変異を有するＫＲＡＳを発現する上皮性腫瘍を有する患者は、本発明の方法で使用される治療用組成物による処置に対して応答性が低いか又は非応答性であると考えられる。したがって、本発明はまた、上皮性腫瘍を有する患者を層別化するための方法を提供する。「層別化」は、本明細書で使用される場合、上皮性腫瘍を有する患者を、本発明の治療用組成物による処置から利益を得る可能性のある患者と、利益を得ない可能性のある患者に分類することを意味する。上皮性腫瘍が野生型ＫＲＡＳを発現しない患者、特に上皮性腫瘍が突然変異ＫＲＡＳを発現する患者は、本明細書に記載の治療用組成物による処置から利益を得る（応答する）可能性が低いことが想定される。

【0027】

そうでなければ、ＰＤＡＣ腫瘍が本明細書の他の箇所で定義される野生型ＫＲＡＳ、ＨＲＡＳ又はＮＲＡＳを発現する患者は、本明細書に記載される処置から利益を得る（応答性である）可能性が高い。当該「野生型」ＫＲＡＳは、好ましくは配列番号１又は配列番号２に対応する配列を有する。

【0028】

本明細書で提供される処置方法の文脈における「応答性である」という用語は、患者又は腫瘍が、臨床試験における応答評価基準（ｉＲＥＣＩＳＴ）に従って、本明細書で定義される治療用組成物を投与した後に完全奏効、部分奏効又は疾患安定化を示すことを意味する。本明細書で使用される「非応答性」という用語は、ｉＲＥＣＩＳＴに従って本明細書で定義される治療用組成物を投与した後、患者又は腫瘍が安定疾患又は進行性疾患を示すことを意味する。ｉＲＥＣＩＳＴは、Ｓｅｙｍｏｕｒ Ｌ ｙ ｃｏｌｓ．ＲＥＣＩＳＴ ｗｏｒｋｉｎｇ ｇｒｏｕｐ（２０１７）Ｌａｎｃｅｔ Ｏｎｃｏｌ．１８（３）：ｅ１４３－ｅ１５２に記載されている。

【0029】

したがって、処置される患者又は患者の集団を選択する方法も本明細書で提供される。これは、各患者の上皮性腫瘍試料中の突然変異及び／又は野生型ＫＲＡＳの存在又は非存在を決定することによって達成される。腫瘍試料において突然変異ＫＲＡＳが検出され、及び／又は野生型ＫＲＡＳが検出されない患者は、処置に適格であると見なされないが、腫瘍試料において野生型ＫＲＡＳが検出され、及び／又は突然変異ＫＲＡＳが検出されない患者は、本発明による処置に適格であると見なされ、したがって、本発明による処置のために選択される。

【0030】

さらに、前述のように、本発明は、ＰＤＡＣ又は上皮性腫瘍に罹患している患者が本明細書に記載の治療用組成物による処置に対して応答性又は非応答性であるかどうかの予後診断のための方法を提供することを可能にする。前述のように、患者の腫瘍試料中の突然変異及び／又は野生型ＫＲＡＳの非存在又は存在は、当技術分野で公知であり、本明細書の他の箇所に記載されている日常的な方法を用いて評価することができる。上皮性腫瘍における突然変異ＫＲＡＳの発現は、患者又は上皮性腫瘍が処置に反応しないことを示すが、上皮性腫瘍における野生型ＫＲＡＳの発現は、患者が本明細書に記載の治療用組成物による処置に反応することを示す。

【0031】

本発明のさらに好ましい実施形態では、処置に応答する患者は、天然のＫＲＡＳを発現する患者であり、腫瘍試料中の免疫組織化学的技術によって測定したＰＤＬ１レベルが１％未満である。

【0032】

処置方法
本明細書中に記載される治療用組成物により処置され得るがんのタイプの中には、限定されないが、ＮＳＣＬＣ、頭頸部の扁平上皮がん、尿路上皮がん腫、結腸直腸がん、胃がん、食道がん、子宮頸がん、肝細胞がん腫、メルケル細胞がん腫、腎細胞がん腫、子宮内膜がん腫、乳がん、扁平上皮皮膚がん腫がある。さらに、本発明は、本発明の組み合わせを使用して増殖を阻害することができる難治性又は再発性新生物を含む。

【0033】

有効成分としてＥＧＦを含むワクチン組成物の投与は、好ましくは筋肉内で行われ；最初の４回の投与は１４日ごとに、残りは２８日ごとに、３日間の許容時間範囲で行われる。これらの組成物が使用される用量範囲は、重量１キログラム当たり２０～７０μＬ／ｋｇの重量又は２０～７０μｇの総タンパク質、又は最大５ｍｇの総タンパク質を含み、より推奨されるのは３０～６０μｇ／ｋｇである。処置段階は、６ヶ月の最小期間を有し、その後、得られた結果に応じて頻度及び用量を変えることができる維持段階が続く。この維持期間は、血清ＥＧＦ濃度の低下が保証されるならば、生成されたＡｂｓ力価並びに臨床徴候の改善及び／又は安定化を考慮して最適化することができる。このような血清ＥＧＦ濃度は、この目的のために市販されている診断セットのいずれかによって測定することができる。

【0034】

抗ＰＤ１及び抗ＰＤＬ１ ＭＡｂは、それぞれの場合について推奨される用量及びスケジュールで投与される。抗ＰＤ１ ＭＡｂの場合、１００～５００ｍｇの総タンパク質の用量範囲で静脈内に２～６週間の頻度で投与される。抗ＰＤＬ１ ＭＡｂは、２～５週間の頻度で６００～１８００ｍｇの総タンパク質の範囲で静脈内投与される。ワクチン及びＭＡｂの投与は、ＰＤ１／ＰＤ１Ｌシグナル伝達の遮断作用及びＥＧＦ媒介シグナル伝達の阻害と一致するように調整される。この原理に従って、投与は付随的又は連続的であり得る。特に、ワクチン組成物の投与は、ＭＡｂの投与スキームと重複し得る。

【0035】

本発明を、以下の例及び図面を用いてさらに詳述する。しかしながら、これらの例は、本発明の範囲の限定として解釈されるべきではない。

【図面の簡単な説明】

【0036】

【図1】ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦ及びニボルマブｍＡｂで処置された患者の血清中の抗ＥＧＦ抗体（Ａｂ）力価。

【図2】ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦ及びｍＡｂニボルマブで処置した患者の血清中のＥＧＦレベル。

【図3】天然ＫＲＡＳ及び突然変異ＫＲＡＳ腫瘍を有する患者における、ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦ及びニボルマブで処置された患者の経時的な累積生存。

【図4】天然ＫＲＡＳ又は突然変異ＫＲＡＳである１％未満のＰＤ－Ｌ１腫瘍を有する患者について、ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦ及びニボルマブで処置された患者の経時的な累積生存。

【実施例】

【0037】

例１．ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦと抗ＰＤ１ ｍＡｂニボルマブとの併用投与は安全であり、強力な抗ヒトＥＧＦ抗体応答を誘導する。
ニューヨーク州バッファローのロズウェルパーク総合がんセンター（Ｒｏｓｗｅｌｌ Ｐａｒｋ Ｃｏｍｐｒｅｈｅｎｓｉｖｅ Ｃａｎｃｅｒ Ｃｅｎｔｅｒ）における第Ｉ／ＩＩ相臨床試験（ＮＣＴ０２９５５２９０）では、抗ＰＤ１ ｍＡｂニボルマブとともに、ワクチン組成物ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦを含む治療用組成物を、進行したＮＳＣＬＣ患者の処置に使用した。

【0038】

この研究では、第Ｉ相用量漸増及び第ＩＩ相有効性評価を行った。合計で２９人の転移性ＮＳＣＬＣ患者を含めた。ニボルマブは、２週間ごとに２４０ｍｇの用量で静脈内に使用した。ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦワクチン組成物を、誘導期中に２週間ごとに２．４ｍｇの用量で筋肉内投与し（４用量）、続いて維持期に毎月注射して使用した。最初の６人の患者は、半分の用量のＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦ（１．２ｍｇ）を受けた。

【0039】

安全性プロファイルは良好であり、適用された治療に関連する重篤な有害反応はなかった。ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦは、１：４０００以上の抗ＥＧＦ抗体（Ａｂ）力価によって定義されるように（血清希釈（図１））、すべての患者において良好な応答を誘導した。

【0040】

ＥＬＩＳＡ（ヒトＥＧＦ Ｑｕａｎｔｉｋｉｎｅ ＥＬＩＳＡキット、Ｒ＆Ｄ Ｓｙｓｔｅｍｓ）によって測定した患者の血清中のＥＧＦ濃度の急速な減少も、ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦ及びｍＡｂニボルマブで処置した患者で観察された（図２）。

【0041】

処置された２９人の患者の全生存期間の中央値は１０．３６ヶ月であった。１年全生存率は４４％であった。

【0042】

例２．ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦと抗ＰＤ１ ｍＡｂニボルマブとの併用投与は、天然のＫＲＡＳを有する患者に有意に利益をもたらす。
例１に記載の試験では、腫瘍におけるＫＲＡＳ遺伝子の突然変異の有無により患者を層別化して解析を行った。突然変異の有無及びＫＲＡＳ遺伝子のコピー数は、マルチパラメトリックＰＣＲベースのＤＮＡシーケンシングを使用する新世代シーケンシングアッセイを使用して検証した。驚くべきことに、天然のＫＲＡＳを有する患者の生存率は、突然変異ＫＲＡＳを有する患者の生存率よりも有意に高かった（図３）。

【0043】

生存期間中央値は、天然ＫＲＡＳ患者では２２．０６ヶ月であり、突然変異ＫＲＡＳ患者では１０．２６ヶ月であった。１年生存率は、天然ＫＲＡＳ患者では６９％、突然変異ＫＲＡＳ患者では３７％であった。

【0044】

さらに、併用療法後、天然のＫＲＡＳを有する患者は、疾患制御率の有意な改善を有した（ｉｒＲＥＣＩＳＴ基準により少なくとも疾患が安定している患者（Ｓｅｙｍｏｕｒ Ｌ ｅｔ ａｌ．ＲＥＣＩＳＴ ｗｏｒｋｉｎｇ ｇｒｏｕｐ（２０１７）Ｌａｎｃｅｔ Ｏｎｃｏｌ．１８（３）：ｅ１４３－ｅ１５２））。天然ＫＲＡＳを有する患者では、ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦとニボルマブとの組み合わせ後の疾患制御率は５６．３％であったのに対して、ＫＲＡＳ突然変異を含む腫瘍を有する患者では１２．５％であった。

【0045】

文献によれば、ＫＲＡＳ突然変異による層別化は、ニボルマブｍＡｂのみで処置された患者の生存率に影響を及ぼさないので、天然ＫＲＡＳを有する患者において併用療法で観察された生存率は臨床的に重要である。進行したＮＳＣＬＣを有するこれらの患者において、ニボルマブによる単独療法は、突然変異ＫＲＡＳ又は天然ＫＲＡＳを有する患者においてそれぞれ１１．２ヶ月及び１０ヶ月の生存期間中央値をもたらした（Ｐａｓｓｉｇｌｉａ Ｆ ｅｔ ａｌ．（２０１９）Ｂｒ Ｊ Ｃａｎｃｅｒ １２０（１）：５７－６２）。

【0046】

例３．ＣＩＭＡｖａｘ－ＥＧＦと抗ＰＤ１ Ａｂニボルマブとの併用投与は、天然のＫＲＡＳ腫瘍及びＰＤＬ１＜１％を有する患者に有意に利益をもたらす。
腫瘍におけるＰＤＬ１の発現が低い患者において抗ＰＤ１ ｍＡｂによる単剤療法に対するより低い応答に関する文献における既知の報告を考慮して、腫瘍がＰＤＬ１を発現しない患者（ＰＤＬ１＜１％）について例２の分析を繰り返した。ＰＤＬ１発現を、ＰＤＬ１決定のためにｐｈａｒｍＤｘアッセイ２８－８を使用して決定した。

【0047】

驚くべきことに、ＫＲＡＳの突然変異による患者の層別化は、患者の生存を再び区別することが観察された。生存期間中央値は、天然ＫＲＡＳ患者では２２．０６ヶ月であり、突然変異ＫＲＡＳ患者では１０．２６ヶ月であった。１年生存率は非常に高く、天然ＫＲＡＳ患者では８０％であった（図４）。

【図1】

【図2】

【図3】

【図4】

【配列表】

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【国際調査報告】