特表 2024-520205 ＵＮＣ１３Ａの発現を調節するための化合物

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2024-05-22

(54)【発明の名称】ＵＮＣ１３Ａの発現を調節するための化合物

(51)【国際特許分類】

   C12N 15/113 20100101AFI20240515BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 25/00 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 21/02 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 25/28 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 21/00 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 3/00 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 1/00 20060101ALI20240515BHJP

   A61P 11/00 20060101ALI20240515BHJP

   A61K 31/7088 20060101ALI20240515BHJP

   A61K 9/08 20060101ALI20240515BHJP

   A61K 47/02 20060101ALI20240515BHJP

   A61K 31/713 20060101ALI20240515BHJP

   A61K 31/7105 20060101ALI20240515BHJP

   A61K 47/51 20170101ALI20240515BHJP

【ＦＩ】

C12N15/113 Z ZNA

A61P43/00 111

A61P25/00

A61P21/02

A61P25/28

A61P21/00

A61P3/00

A61P1/00

A61P11/00

A61K31/7088

A61K9/08

A61K47/02

A61K31/713

A61K31/7105

A61K47/51

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2023571857

(86)(22)【出願日】2022-05-20

(85)【翻訳文提出日】2023-12-20

(86)【国際出願番号】 US2022030335

(87)【国際公開番号】W WO2022246251

(87)【国際公開日】2022-11-24

(31)【優先権主張番号】63/191,905

(32)【優先日】2021-05-21

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】595104323

【氏名又は名称】アイオーニス ファーマシューティカルズ， インコーポレーテッド

【氏名又は名称原語表記】Ｉｏｎｉｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌｓ，Ｉｎｃ．

(74)【代理人】

【識別番号】100118902

【弁理士】

【氏名又は名称】山本 修

(74)【代理人】

【識別番号】100106208

【弁理士】

【氏名又は名称】宮前 徹

(74)【代理人】

【識別番号】100196508

【弁理士】

【氏名又は名称】松尾 淳一

(74)【代理人】

【識別番号】100163784

【弁理士】

【氏名又は名称】武田 健志

(72)【発明者】

【氏名】バラス，ルーベン・イー

(72)【発明者】

【氏名】リン，カー・ユン・カレン

【テーマコード（参考）】

4C076

4C086

【Ｆターム（参考）】

4C076AA11

4C076AA12

4C076DD26Z

4C076EE59

4C076FF61

4C086AA01

4C086AA02

4C086EA16

4C086MA01

4C086MA04

4C086MA16

4C086MA17

4C086MA22

4C086MA23

4C086MA24

4C086MA52

4C086MA57

4C086MA66

4C086NA14

4C086ZA01

4C086ZA15

4C086ZA22

4C086ZA60

4C086ZA66

4C086ZA94

4C086ZC02

4C086ZC21

(57)【要約】

細胞もしくは動物におけるＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量もしくは活性を増加させ、及び／または細胞もしくは動物における隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を減少させ、特定の場合では、細胞または動物におけるＵＮＣ１３Ａタンパク質の量を増加させるためのオリゴマー化合物及び医薬組成物が提供される。そのようなオリゴマー化合物及び医薬組成物は、神経変性疾患（筋萎縮性側索硬化症及び前頭側頭型認知症など）の治療に有用である。
【選択図】なし

【特許請求の範囲】

【請求項1】

８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分及び修飾インターヌクレオシド結合から選択される少なくとも１つの修飾を有する、前記オリゴマー化合物。

【請求項2】

前記ＵＮＣ１３Ａ核酸が、配列番号１または配列番号２の核酸塩基配列を有する、請求項１に記載のオリゴマー化合物。

【請求項3】

前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１、４８，４３２～４８，４６５、または４８，４６６～４８，５６１のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的である、請求項１または請求項２に記載のオリゴマー化合物。

【請求項4】

前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である、請求項１～３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項5】

８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号２１～３３２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分及び修飾インターヌクレオシド結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。

【請求項6】

前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号２１～３３２のいずれかの核酸塩基配列を含む、請求項５に記載のオリゴマー化合物。

【請求項7】

前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２１～３３２のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、請求項５に記載のオリゴマー化合物。

【請求項8】

配列番号２９０、２９１、２９３、もしくは２９４、
配列番号８５～１０１、または
配列番号２１～３０、３２～４１、４３～５２、５４～６０、６２～６６、もしくは３２６～３３２
の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を前記修飾オリゴヌクレオチドが有する、請求項５～７のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項9】

前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的であり、前記ＵＮＣ１３Ａ核酸が、配列番号１または配列番号２の核酸塩基配列を有する、請求項５～８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項10】

１２～５０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、
配列番号１の４８，１２８～４８，１５１、
配列番号１の４８，４３２～４８，４６５、または
配列番号１の４８，４６６～４８，５６１
と相補的な少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が含む、前記オリゴマー化合物。

【請求項11】

前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０～２５個、１０～３０個、１０～５０個、１２～２０個、１２～２５個、１２～３０個、１２～５０個、１３～２０個、１３～２５個、１３～３０個、１３～５０個、１４～２０個、１４～２５個、１４～３０個、１４～５０個、１５～２０個、１５～２５個、１５～３０個、１５～５０個、１６～１８個、１６～２０個、１６～２５個、１６～３０個、１６～５０個、１７～２０個、１７～２５個、１７～３０個、１７～５０個、１８～２０個、１８～２２個、１８～２５個、１８～３０個、１８～５０個、１９～２０個、１９～２５個、１９～３０個、１９～５０個、２０～２５個、２０～３０個、２０～５０個、２１～２５個、２１～３０個、２１～５０個、２２～２５個、２２～３０個、２２～５０個、２３～２５個、２３～３０個、または２３～５０個の連結ヌクレオシドからなる、請求項１～１０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項12】

前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドからなる、請求項１～１１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項13】

前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドが修飾糖部分を含む、請求項１～１２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項14】

前記修飾糖部分が、二環式糖部分を含む、請求項１３に記載のオリゴマー化合物。

【請求項15】

前記二環式糖部分が、－Ｏ－ＣＨ_２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ_３）－から選択される２’－４’架橋を含む、請求項１４に記載のオリゴマー化合物。

【請求項16】

前記修飾糖部分が、非二環式の修飾糖部分を含む、請求項１３に記載のオリゴマー化合物。

【請求項17】

前記非二環式の修飾糖部分が、２’－ＭＯＥ糖部分、２’－ＯＭｅ糖部分、２’－ＮＭＡ糖部分、または２’－Ｆ糖部分である、請求項１６に記載のオリゴマー化合物。

【請求項18】

前記修飾オリゴヌクレオチド化合物の少なくとも１つのヌクレオシドが糖代替部分を含む、請求項１～１７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項19】

前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾糖部分を含む、請求項１３～１８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項20】

各修飾糖部分が、２’－ＭＯＥ糖部分である、請求項１９に記載のオリゴマー化合物。

【請求項21】

各修飾糖部分が、２’－ＮＭＡ糖部分である、請求項１９に記載のオリゴマー化合物。

【請求項22】

前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾インターヌクレオシド結合を含む、請求項１～２１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項23】

少なくとも１つの修飾インターヌクレオシド結合が、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である、請求項２２に記載のオリゴマー化合物。

【請求項24】

各インターヌクレオシド結合が、修飾インターヌクレオシド結合である、請求項２２または請求項２３に記載のオリゴマー化合物。

【請求項25】

各インターヌクレオシド結合が、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である、請求項２４に記載のオリゴマー化合物。

【請求項26】

前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのインターヌクレオシド結合が、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合である、請求項２２～２３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項27】

前記修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合が、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合またはホスホロチオエートインターヌクレオシド結合から独立して選択される、請求項１～２４または２６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項28】

前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、または１７個のインターヌクレオシド結合が、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である、請求項１～２３または２６～２７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項29】

前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、請求項１～２８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項30】

前記修飾核酸塩基が、５－メチルシトシンである、請求項２９に記載のオリゴマー化合物。

【請求項31】

各シトシンが、５－メチルシトシンである、請求項３０に記載のオリゴマー化合物。

【請求項32】

前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、請求項１～３１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項33】

前記修飾オリゴヌクレオチドが、その薬学的に許容される塩である、請求項１～３２のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項34】

ナトリウム、カリウム、カルシウム、及びマグネシウムから選択される１つ以上のカチオンを含む薬学的に許容される塩である、請求項３３に記載のオリゴマー化合物。

【請求項35】

前記オリゴマー化合物が、コンジュゲート基を含む、請求項１～３１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項36】

前記コンジュゲート基が、コンジュゲートリンカー及びコンジュゲート部分を含む、請求項３５に記載のオリゴマー化合物。

【請求項37】

前記コンジュゲートリンカーが、単結合からなる、請求項３６に記載のオリゴマー化合物。

【請求項38】

前記コンジュゲートリンカーが、切断可能である、請求項３６または請求項３７に記載のオリゴマー化合物。

【請求項39】

前記コンジュゲートリンカーが、１～３つのリンカーヌクレオシドを含む、請求項３６～３８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項40】

前記コンジュゲートリンカーが、いずれのリンカーヌクレオシドも含まない、請求項３６～３８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項41】

前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で、前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項３５～４０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項42】

前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で、前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、請求項３５～４０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項43】

前記オリゴマー化合物が、末端基を含む、請求項１～４２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【請求項44】

前記末端基が、脱塩基糖部分である、請求項４３に記載のオリゴマー化合物。

【請求項45】

前記オリゴマー化合物が、一本鎖オリゴマー化合物である、請求項１～４４のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【請求項46】

請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物のキラル的に富化された集団であって、前記集団において、特定の立体化学的配置である特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を少なくとも１つ含む修飾オリゴヌクレオチドが富化されている前記集団。

【請求項47】

（Ｓｐ）配置または（Ｒｐ）配置である特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を少なくとも１つ含む修飾オリゴヌクレオチドが富化されている、請求項４６に記載のキラル的に富化された集団。

【請求項48】

前記ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のそれぞれが、独立して選択した特定の立体化学的配置である修飾オリゴヌクレオチドが前記集団中で富化されている、請求項４６に記載のキラル的に富化された集団。

【請求項49】

１つの特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合が（Ｒｐ）配置を有し、残りのホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のそれぞれが（Ｓｐ）配置を有する修飾オリゴヌクレオチドが前記集団中で富化されている、請求項４６に記載のキラル的に富化された集団。

【請求項50】

５’→３’方向でＳｐ配置、Ｓｐ配置、及びＲｐ配置をとる少なくとも３つの連続したホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を有する修飾オリゴヌクレオチドが前記集団中で富化されている、請求項４６に記載のキラル的に富化された集団。

【請求項51】

前記修飾オリゴヌクレオチドのホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のすべてが、ステレオランダムである、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物の集団。

【請求項52】

第１のオリゴマー化合物と、第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物と、を含む二本鎖オリゴマーであって、前記第１のオリゴマー化合物が、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物である、前記二本鎖オリゴマー。

【請求項53】

前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、８～８０個の連結ヌクレオシドからなり、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、第１の修飾オリゴヌクレオチドのうちの等しい長さの部分と少なくとも９０％相補的な少なくとも８つの核酸塩基の相補的領域を含む、請求項５２に記載の二本鎖オリゴマー。

【請求項54】

アンチセンス化合物を含むアンチセンス剤であって、前記アンチセンス化合物が、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、または請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマーである、前記アンチセンス剤。

【請求項55】

前記アンチセンス剤が、ＵＮＣ１３Ａ核酸のスプライシングを調節することが可能なスプライス調節剤である、請求項５４に記載のアンチセンス剤。

【請求項56】

前記アンチセンス剤が、コンジュゲート基を含み、前記コンジュゲート基が、細胞標的化部分を含む、請求項５４または請求項５５に記載のアンチセンス剤。

【請求項57】

請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、または請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤と、薬学的に許容される希釈剤または担体と、を含む、医薬組成物。

【請求項58】

前記薬学的に許容される希釈剤が、リン酸緩衝生理食塩水または人工脳脊髄液である、請求項５７に記載の医薬組成物。

【請求項59】

前記医薬組成物が、前記オリゴマー化合物、前記集団、前記二本鎖オリゴマー、または前記アンチセンス剤と、リン酸緩衝生理食塩水または人工脳脊髄液と、から本質的になる、請求項５８に記載の医薬組成物。

【請求項60】

請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物を対象に投与することを含む方法。

【請求項61】

ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患の治療方法であって、前記方法が、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患またはその発症リスクを有する対象に対して、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物を治療的に有効な量で投与し、それによって前記ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療することを含む、前記方法。

【請求項62】

前記ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患が、神経変性疾患である、請求項６１に記載の方法。

【請求項63】

前記神経変性疾患が、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である、請求項６２に記載の方法。

【請求項64】

前記神経変性疾患の少なくとも１つの症状が改善される、請求項６３に記載の方法。

【請求項65】

前記少なくとも１つの症状が、運動機能障害、筋力低下、筋肉消耗、シナプス機能障害、疲労、発話困難、嚥下困難、息切れ、認識機能障害、寿命の短期化、またはそれらの組み合わせである、請求項６４に記載の方法。

【請求項66】

請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物を投与することで、運動機能の改善、筋力の改善、筋量の増加、発話の改善、嚥下の改善、呼吸の改善、シナプス機能の改善、認知の改善、または寿命の長期化が生じる、請求項６５に記載の方法。

【請求項67】

前記対象が、ヒトである、請求項６０～６６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項68】

細胞におけるＵＮＣ１３Ａの発現の増加方法であって、前記方法が、前記細胞と、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物と、を接触させることを含む、前記方法。

【請求項69】

細胞における隠れエキソン含有ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量の低減方法であって、前記方法が、前記細胞と、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物と、を接触させることを含む、前記方法。

【請求項70】

前記隠れエキソンが、ＵＮＣ１３Ａのエキソン２０とエキソン２１との間に存在する、請求項６９に記載の方法。

【請求項71】

前記隠れエキソンが、ＣＥ－１、ＣＥ－２、及びＣＥ－３から選択される、請求項７０に記載の方法。

【請求項72】

前記細胞が、ニューロンまたはグリア細胞であり、任意選択で、前記細胞が、アストロサイトまたはミクログリア細胞である、請求項６８～７１のいずれかに記載の方法。

【請求項73】

前記細胞が、ヒト細胞である、請求項６８～７２のいずれかに記載の方法。

【請求項74】

ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療するための、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物の使用。

【請求項75】

ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療するための医薬の製造における、請求項１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、請求項４６～５１のいずれかに記載の集団、請求項５２もしくは請求項５３に記載の二本鎖オリゴマー、請求項５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または請求項５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物の使用。

【請求項76】

前記ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患が、神経変性疾患である、請求項７４または請求項７５に記載の使用。

【請求項77】

前記神経変性疾患が、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である、請求項７６に記載の使用。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

配列表
本願は、電子形式の配列表とともに出願されている。その配列表は、２０２２年５月２０日に作成されたＢＩＯＬ０４２６ＷＯＳＥＱ＿ＳＴ２５．ｔｘｔという名称のファイルとして提供されており、そのサイズは１９６ＫＢである。電子形式の配列表内の情報は、参照により、その全体が本明細書に援用される。

【0002】

細胞もしくは動物におけるＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量もしくは活性を増加させ、及び／または細胞もしくは動物における隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を減少させ、特定の場合では、細胞または動物におけるＵＮＣ１３Ａタンパク質の量を増加させるためのオリゴマー剤、オリゴマー化合物、アンチセンス剤、及び医薬組成物が提供される。そのようなオリゴマー剤、オリゴマー化合物、アンチセンス剤、及び医薬組成物は、神経変性疾患（筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）及び前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）など）の治療に有用である。

【背景技術】

【0003】

ＵＮＣ１３Ａ遺伝子はＵＮＣ１３Ａ（ＵＮＣ１３タンパク質ファミリーのメンバー）（カルシウム誘発性のシナプス小胞放出に関与する）をコードする（Ｄｉｔｔｍａｎ，Ｊ．Ｓ．，２０１９，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎ．Ｎｅｕｒｏｂｉｏｌ．５７，１７－２５）。ＵＮＣ１３Ａ中の変異は、神経変性疾患（筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）及び前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）など）と関連している（Ｄｉｅｋｓｔｒａ，Ｆ．Ｐ．，ｅｔ ａｌ．，２０１４，Ａｎｎ．Ｎｅｕｒｏｌ．７６：１２０－１３３）。

【0004】

ＡＬＳ（ルー・ゲーリック病としても知られる）は、上位運動ニューロン及び下位運動ニューロンが選択的に変性することによって特徴付けられる障害である（Ｒｏｗｌａｎｄ，Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．２００１，３４４，１６８８－１７００）。ＡＬＳは、常に３０，０００人もの米国人が罹患している進行性の破壊的神経変性疾患である。ＡＬＳでは運動ニューロンの変性が進行することで、最終的に患者は死に至る。運動ニューロンが死滅すると、筋運動を開始及び制御する脳の能力が失われる。随意的な筋動作が進行性に影響を受けることで、当該疾患の後期の患者は全身麻痺になり得る。

【0005】

ＦＴＤは、脳の前頭葉または側頭葉において神経細胞が進行性に失われることによって引き起こされる一群の障害を指す。ＦＴＤによって引き起こされる神経細胞損傷は前頭葉または側頭葉の機能喪失を引き起こし、この機能喪失によって、行動及び性格の悪化、言語障害、または筋機能もしくは運動機能の変化が可変的に生じる。

【0006】

ＡＬＳ及びＦＴＤは共に、ＴＤＰ－４３プロテイノパチーと関連する神経変性疾患である。ＴＤＰ－４３は、ＲＮＡのナンセンス変異依存分解を引き起こす隠れエキソンが含まれることを抑制するものであり、ＴＤＰ－４３が失われると、隠れエキソン含有ＲＮＡの量が増加して、転写産物のナンセンス変異依存分解が引き起こされる。ＡＬＳにおいてもＦＴＤにおいても、脳中及び脊髄中のニューロンの核からＲＮＡ結合タンパク質ＴＤＰ－４３が枯渇することで、隠れエキソンを含む遺伝子の発現が減少し、細胞死が引き起こされる（Ｌｉｎｇ，Ｐ．ｅｔ ａｌ．，２０１５，Ｓｃｉｅｎｃｅ ３４９，６５０－６５５、Ｈｕｍｐｈｒｅｙ，ｅｔ ａｌ．，２０１７，ＢＭＣ Ｍｅｄｉｃａｌ Ｇｅｎｏｍｉｃｓ １０，３８）。

【0007】

ＵＮＣ１３Ａ遺伝子は、ナンセンス変異依存分解を促進する隠れエキソンを含む。ＴＤＰ－４３レベルが枯渇した場合、転写産物中に隠れエキソンが含まれるようになる結果、ＵＮＣ１３Ａタンパク質の発現が不十分になる。ＡＬＳ及びＦＴＤと関連するＵＮＣ１３Ａ中の一塩基多型（ＳＮＰ）は、ＵＮＣ１３Ａ転写産物中に隠れエキソンが含まれるリスクの増加と関連している（Ｂｒｏｗｎ，Ａ－Ｌ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８１７０、Ｍａ．，Ｘ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８２１３（Ｍａ．，Ｘ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，２０２２，Ｎａｔｕｒｅ ６０３，１２４－１３０においても公開されている））。

【0008】

現時点では、ＡＬＳ、ＦＴＤ、及び他の神経変性疾患を治療するための許容可能な選択肢はない。したがって、本明細書の目的は、このような疾患を治療するためのオリゴマー剤、オリゴマー化合物、アンチセンス剤、及び医薬組成物を提供することである。

【発明の概要】

【0009】

本明細書に記載の特定の実施形態のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、アンチセンス剤、及び医薬組成物は、細胞または動物におけるＵＮＣ１３Ａの発現増加に有用である。特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、アンチセンス剤、及び医薬組成物は、細胞または動物におけるＵＮＣ１３ＡのＲＮＡレベルまたはタンパク質レベルを上昇させる。特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、アンチセンス剤、及び医薬組成物は、細胞または動物における隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を減少させる。特定の実施形態では、動物は、神経変性疾患を有する対象であり、特定の実施形態では、対象は、ＡＬＳまたはＦＴＤを有する。いくつかの実施形態では、対象は、ＡＬＳを有する。いくつかの実施形態では、対象は、ＦＴＤを有する。

【0010】

神経変性疾患の少なくとも１つの症状の改善に有用な方法も提供される。特定の実施形態では、神経変性疾患は、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である。特定の実施形態では、症状は、運動機能障害、筋力低下、筋肉消耗、シナプス機能障害、疲労、発話困難、嚥下困難、息切れ、認識機能障害、または寿命の短期化を含む。特定の実施形態では、こうした症状が改善する結果、運動機能の改善、筋力の改善、筋量の増加、発話の改善、嚥下の改善、呼吸の改善、シナプス機能の改善、認知の改善、または寿命の長期化が生じる。

【発明を実施するための形態】

【0011】

上記の一般的な説明及び下記の詳細な説明はいずれも、例示及び説明するためのものに過ぎず、限定するものではないことを理解されたい。本明細書では、別段の具体的な記載のない限り、単数形が使われている際には、複数形が含まれる。本明細書で使用する場合、別段の記載のない限り、「または」が使われている際には、「及び／または」を意味する。さらに、「含むこと（ｉｎｃｌｕｄｉｎｇ）」という用語、ならびに「含む（ｉｎｃｌｕｄｅｓ）」及び「含まれる（ｉｎｃｌｕｄｅｄ）」のような他の形態が使われている際には、限定ではない。また、別段の具体的な記載のない限り、「要素」または「成分」のような用語には、１つの単位を含む要素及び成分と、２つ以上のサブユニットを含む要素及び成分が含まれる。

【0012】

本明細書で用いられている、節の見出しは、系統立ててまとめるためのものに過ぎず、記載されている主題を限定するものとして解釈すべきではない。本願で引用されている文書または文書の一部（その文書としては、特許、特許出願、論文、書籍及び専門書が挙げられるが、これらに限らない）はいずれも、参照により、本明細書で論じられているその文書の一部、及びその全体が明示的に援用される。

【0013】

定義
具体的な定義が示されていない限り、分析化学、合成有機化学、医薬品化学及び薬化学と関連して用いられている命名法、ならびに分析化学、合成有機化学、医薬品化学及び薬化学の手順及び技法のうち、本明細書に記載されている命名法、手順及び技法は、当該技術分野において周知かつ広く用いられているものである。認められる場合、本開示の全体において言及されている特許、出願、公開出願及びその他の刊行物、ならびにその他のデータはいずれも、参照により、その全体が本明細書に援用される。

【0014】

別段に示されていない限り、下記の用語は、以下の意味である。

【0015】

本明細書で使用する場合、「２’－デオキシヌクレオシド」は、２’－Ｈ（Ｈ）デオキシフラノシル糖部分を含むヌクレオシドを意味する。特定の実施形態では、２’－デオキシヌクレオシドは２’－β－Ｄ－デオキシヌクレオシドであり、２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分を含み、この２’－β－Ｄ－デオキシリボシル糖部分は、天然起源のデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）に見られるβ－Ｄリボシル配置を有する。特定の実施形態では、２’－デオキシヌクレオシドは、修飾核酸塩基を含んでよく、あるいは、ＲＮＡ核酸塩基（ウラシル）を含んでもよい。

【0016】

本明細書で使用する場合、「２’－ＭＯＥ」は、フラノシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりの２’－ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３基を意味する。「２’－ＭＯＥ糖部分」は、フラノシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりに２’－ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３基を有する糖部分を意味する。別段の指定がない限り、２’－ＭＯＥ糖部分は、β－Ｄ－リボシル配置をとる。「ＭＯＥ」は、Ｏ－メトキシエチルを意味する。

【0017】

本明細書で使用する場合、「２’－ＭＯＥヌクレオシド」は、２’－ＭＯＥ糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0018】

本明細書で使用する場合、「２’－ＮＭＡ」は、リボシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりの－Ｏ－ＣＨ_２－Ｃ（＝Ｏ）－ＮＨ－ＣＨ_３基を意味する。「２’－ＮＭＡ糖部分」は、リボシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりに２’－Ｏ－ＣＨ_２－Ｃ（＝Ｏ）－ＮＨ－ＣＨ_３基を有する糖部分である。別段の指定がない限り、２’－ＮＭＡ糖部分は、β－Ｄ配置をとる。「ＮＭＡ」は、Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミドを意味する。

【0019】

本明細書で使用する場合、「２’－ＮＭＡヌクレオシド」は、２’－ＮＭＡ糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0020】

本明細書で使用する場合、「２’－ＯＭｅ」は、フラノシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりの２’－ＯＣＨ_３基を意味する。「２’－Ｏ－メチル糖部分」または「２’－ＯＭｅ糖部分」は、フラノシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりに２’－ＯＣＨ_３基を有する糖部分を意味する。別段の指定がない限り、２’－ＯＭｅ糖部分は、β－Ｄ－リボシル配置をとる。

【0021】

本明細書で使用する場合、「２’－ＯＭｅヌクレオシド」は、２’－ＯＭｅ糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0022】

本明細書で使用する場合、「２’－Ｆ」は、リボシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりの２’－フルオロ基を意味する。「２’－Ｆ糖部分」または「２’－フルオロリボシル糖部分」は、リボシル糖部分の２’－ＯＨ基の代わりに２’－Ｆ基を有する糖部分を意味する。別段の指定がない限り、２’－Ｆは、β－Ｄリボシル立体化学的配置を有する。

【0023】

本明細書で使用する場合、「２’－Ｆヌクレオシド」は、２’－Ｆ糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0024】

本明細書で使用する場合、「２’－置換ヌクレオシド」は、２’－置換糖部分を含むヌクレオシドを意味する。本明細書で使用する場合、糖部分に関する「２’－置換」は、ＨまたはＯＨ以外の２’－置換基を少なくとも１つ含む糖部分を意味する。

【0025】

本明細書で使用する場合、「３’標的部位」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸とハイブリダイズするときにアンチセンスオリゴヌクレオチドと相補的な標的核酸の３’最末端ヌクレオチドを指す。

【0026】

本明細書で使用する場合、「５’標的部位」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドが標的核酸とハイブリダイズするときにアンチセンスオリゴヌクレオチドと相補的な標的核酸の５’最末端ヌクレオチドを指す。

【0027】

本明細書で使用する場合、「５－メチルシトシン」は、５位に結合したメチル基で修飾されたシトシンを意味する。５－メチルシトシンは、修飾核酸塩基である。

【0028】

本明細書で使用する場合、「脱塩基糖部分」は、核酸塩基に結合していないヌクレオシドの糖部分を意味する。そのような脱塩基糖部分は、当該技術分野では「脱塩基ヌクレオシド」と称されることがある。

【0029】

本明細書で使用する場合、「投与」または「投与すること」は、医薬剤または組成物を動物に与えることを意味する。

【0030】

本明細書で使用する場合、治療に関連する「改善」とは、少なくとも１つの症状または特質が、その治療を行わない場合の同じ症状または特質と比べて改善することを意味する。特定の実施形態では、改善は、症状または特質の重症度または頻度の低下、あるいは症状または特質の発症遅延または重症度もしくは頻度の進行減速である。指標の進行または重症度は、主観的または客観的な尺度によって決定することができ、こうした尺度は当業者に知られている。

【0031】

本明細書で使用する場合、「動物」は、ヒトまたはヒト以外の動物を意味する。

【0032】

本明細書で使用する場合、「二環式糖」または「二環式糖部分」は、２つの環を含む修飾糖部分であって、その第２の環が、第１の環の原子のうちの２つを連結する架橋によって形成されることによって、二環式構造を形成する修飾糖部分を意味する。特定の実施形態では、その二環式糖部分の第１の環は、フラノシル部分である。特定の実施形態では、フラノシル糖部分は、リボシル糖部分である。特定の実施形態では、その二環式糖部分は、フラノシル部分を含まない。

【0033】

本明細書で使用する場合、「二環式ヌクレオシド」または「ＢＮＡ」は、二環式糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0034】

本明細書で使用する場合、「キラル的に富化された集団」とは、同じ分子式の複数の分子であって、特定のキラル中心がステレオランダムであった場合の集団内の分子のうち、その特定のキラル中心が特定の立体化学的配置であると予測される分子の数またはパーセンテージよりも、同じ特定のキラル中心が同じ特定の立体化学的配置である分子の、集団内における数またはパーセンテージが大きい複数の分子を意味する。キラル的に富化された分子集団であって、各分子内にキラル中心を複数有する分子集団は、ステレオランダムなキラル中心を１つ以上含み得る。特定の実施形態では、それらの分子は、修飾オリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、それらの分子は、修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物である。

【0035】

本明細書で使用する場合、「脳脊髄液」または「ＣＳＦ」は、脳及び脊髄の周囲空間を満たす液体を意味する。「人工脳脊髄液」または「ａＣＳＦ」は、脳脊髄液と同様の特定の特性（例えば、モル浸透圧濃度、ｐＨ、及び／または電解質）を有する調製液体または製造液体を意味し、ＣＳＦと生体適合性である。

【0036】

本明細書で使用する場合、「切断可能な部分」は、生理的条件下、例えば、細胞、動物またはヒトの内部で切断される結合手または原子団を意味する。

【0037】

本明細書で使用する場合、オリゴヌクレオチドに関する「相補的」は、オリゴヌクレオチドの核酸塩基の少なくとも７０％と、別の核酸またはその１つ以上の領域の核酸塩基とが、オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列ともう一方の核酸の核酸塩基配列とが相対する方向に並んだ場合に互いに水素結合することが可能であることを意味する。オリゴヌクレオチドの領域に関する「相補的領域」は、その領域の核酸塩基の少なくとも７０％と、別の核酸またはその１つ以上の領域の核酸塩基とが、オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列ともう一方の核酸の核酸塩基配列とが相対する方向に並んだ場合に互いに水素結合することが可能であることを意味する。「相補的核酸塩基」は、互いに水素結合を形成することが可能な核酸塩基を意味する。相補的核酸塩基対には、アデニン（Ａ）とチミン（Ｔ）、アデニン（Ａ）とウラシル（Ｕ）、シトシン（Ｃ）とグアニン（Ｇ）、５－メチルシトシン（ｍＣ）とグアニン（Ｇ）が含まれる。当該技術分野では天然の核酸塩基または他の修飾核酸塩基と対形成する特定の修飾核酸塩基が知られているが、そうした特定の修飾核酸塩基は、別段の指定がない限り、本明細書で定義される相補的核酸塩基とは見なされない。例えば、イノシンは、アデノシン、シトシン、またはウラシルとの対形成が可能であるが、それと相補的とは見なされない。相補的オリゴヌクレオチド及び／または相補的核酸では、各ヌクレオシドの核酸塩基が相補的である必要はない。むしろ、多少のミスマッチが許容される。本明細書で使用する場合、オリゴヌクレオチドに関する「完全に相補的な」または「１００％相補的な」とは、オリゴヌクレオチドが、別のオリゴヌクレオチド、すなわち、そのオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドの核酸と相補的であることを意味する。

【0038】

本明細書で使用する場合、「隠れエキソン」または「ナンセンス変異依存分解（ＮＭＤ）エキソン」は、ｍＲＮＡ転写産物に含まれた場合にナンセンス変異依存分解（ＮＭＤ）経路を活性化し得るエキソンまたは偽エキソンである。

【0039】

本明細書で使用する場合、「コンジュゲート基」は、オリゴヌクレオチドに直接結合している原子団を意味する。コンジュゲート基は、コンジュゲート部分と、そのコンジュゲート部分をオリゴヌクレオチドに結合させるコンジュゲートリンカーを含む。

【0040】

本明細書で使用する場合、「コンジュゲートリンカー」は、コンジュゲート部分をオリゴヌクレオチドに連結する結合を少なくとも１つ含む単結合または原子団を意味する。

【0041】

本明細書で使用する場合、「コンジュゲート部分」は、コンジュゲート部分を有さない同一分子と比較して分子の１つ以上の特性を改変する原子団を意味し、こうした特性には、限定されないが、薬力学、薬物動態、安定性、結合性、吸収性、組織分布、細胞分布、細胞取り込み、荷電、及びクリアランスが含まれる。

【0042】

本明細書で使用する場合、「拘束エチル」または「ｃＥｔ」または「ｃＥｔ修飾糖部分」または「ｃＥｔ糖部分」はβ－Ｄリボシル二環式糖部分を意味し、この二環式糖の第２の環は、β－Ｄリボシル糖部分の４’－炭素と２’－炭素とを連結する架橋を介して形成されており、架橋は、４’－ＣＨ（ＣＨ_３）－Ｏ－２’という式を有し、架橋のメチル基はＳ配置をとる。

【0043】

本明細書で使用する場合、「ｃＥｔヌクレオシド」は、ｃＥｔ修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。

【0044】

本明細書で使用する場合、オリゴヌクレオチドに関連する「連続した」とは、ヌクレオシド、核酸塩基、糖部分またはインターヌクレオシド結合が、互いと直接隣接することを指す。例えば、「連続した核酸塩基」は、配列内で、互いと直接隣接する核酸塩基を意味する。

【0045】

本明細書で使用する場合、「希釈剤」は、薬理学的活性は有さないが、薬学的に必要または望ましい組成物中成分を意味する。例えば、注射組成物中の希釈剤は、液体（例えば、ａＣＳＦ、ＰＢＳ、または生理食塩水）であり得る。

【0046】

本明細書で使用する場合、領域またはオリゴヌクレオチドに関する「二本鎖」は、核酸（限定されないが、オリゴヌクレオチドを含む）の相補鎖が互いにハイブリダイズすることによって形成される二本鎖を意味する。特定の実施形態では、二本鎖領域の２つの鎖は、別々の分子である。特定の実施形態では、２つの鎖は、同じ分子がフォールディングして自体に重なっている領域（例えば、ヘアピン構造）である。

【0047】

本明細書で使用する場合、「ホットスポット領域」は、オリゴマー剤介在性またはオリゴマー化合物介在性に標的核酸の量または活性が低減されやすい、標的核酸上の核酸塩基範囲である。

【0048】

本明細書で使用する場合、「インターヌクレオシド結合」は、オリゴヌクレオチド中の隣接するインターヌクレオシド間の共有結合である。本明細書で使用する場合、「修飾インターヌクレオシド結合」は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合以外のいずれかのインターヌクレオシド結合を意味する。「ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合」または「ＰＳインターヌクレオシド結合」は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合の非架橋酸素原子のうちの１つが、硫黄原子に置き換わっている修飾インターヌクレオシド結合である。

【0049】

本明細書で使用する場合、「逆位ヌクレオシド」は、本明細書で示される３’－３’及び／または５’－５’インターヌクレオシド結合を有するヌクレオチドを意味する。

【0050】

本明細書で使用する場合、「逆位糖部分」は、３’－３’及び／または５’－５’インターヌクレオシド結合を有する逆位ヌクレオシドの糖部分または脱塩基糖部分を意味する。

【0051】

本明細書で使用する場合、「連結ヌクレオシド」は、連続配列において連結されているヌクレオシドである（すなわち、連結されているヌクレオシドの間に追加のヌクレオシドは存在しない）。

【0052】

本明細書で使用する場合、「リンカーヌクレオシド」は、オリゴヌクレオチドをコンジュゲート部分に直接または間接的に連結するヌクレオシドを意味する。リンカーヌクレオシドは、オリゴマー化合物のコンジュゲートリンカー内に位置する。リンカーヌクレオシドは、オリゴマー化合物のオリゴヌクレオチドと連続していても、そのオリゴヌクレオチド部分の一部とはみなされない。

【0053】

本明細書で使用する場合、「ミスマッチ」または「非相補的」とは、第１の核酸配列と第２の核酸配列（すなわち標的核酸）を相対する方向にアラインメントしたときに、第１の核酸配列の核酸塩基が、第２の核酸配列の対応する核酸塩基と相補的ではないことを意味する。

【0054】

本明細書で使用する場合、「モチーフ」は、オリゴヌクレオチドにおける非修飾及び／または修飾型の糖部分、核酸塩基及び／またはインターヌクレオシド結合のパターンを意味する。

【0055】

本明細書で使用する場合、「修飾ヌクレオシド」は、修飾核酸塩基及び／または修飾糖部分を含むヌクレオシドを意味する。修飾ヌクレオシドには、核酸塩基が欠損している脱塩基ヌクレオシドが含まれる。

【0056】

本明細書で使用する場合、「非二環式の修飾糖部分」は、その糖の２つの原子の間に架橋を形成して第２の環を形成するものではない修飾（置換など）を含む修飾糖部分を意味する。

【0057】

本明細書で使用する場合、「核酸塩基」は、非修飾核酸塩基または修飾核酸塩基を意味する。核酸塩基は、複素環式部分である。本明細書で使用する場合、「非修飾核酸塩基」は、アデニン（Ａ）、チミン（Ｔ）、シトシン（Ｃ）、ウラシル（Ｕ）またはグアニン（Ｇ）である。本明細書で使用する場合、「修飾核酸塩基」は、修飾されていないＡ、Ｔ、Ｃ、ＵまたはＧ以外の原子団であって、少なくとも１つの他の核酸塩基と対合できる原子団である。「５－メチルシトシン」は、修飾核酸塩基である。ユニバーサル塩基は、上記の５つの非修飾核酸塩基のうちのいずれか１つと対合できる修飾核酸塩基である。

【0058】

本明細書で使用する場合、「核酸塩基配列」は、核酸またはオリゴヌクレオチドにおける連続した核酸塩基の順序であって、糖またはインターヌクレオシド結合のいずれの修飾からも独立した順序を意味する。

【0059】

本明細書で使用する場合、「ヌクレオシド」は、核酸塩基と糖部分を含む化合物または化合物の断片を意味する。その核酸塩基と糖部分はそれぞれ独立して、修飾されていないか、または修飾されている。

【0060】

本明細書で使用する場合、「オリゴマー剤」は、オリゴマー化合物及び任意選択の１つ以上の追加の特徴（第２のオリゴマー化合物など）を意味する。オリゴマー剤は、一本鎖オリゴマー化合物であり得るか、または２つの相補的オリゴマー化合物によって形成される二本鎖オリゴマーであり得る。

【0061】

本明細書で使用する場合、「オリゴマー化合物」は、オリゴヌクレオチドと、任意に、１つ以上の追加の構造部（コンジュゲート基または末端基など）を意味する。オリゴマー化合物は、その第１のオリゴマー化合物と相補的である第２のオリゴマー化合物と対合していても、対合していなくてもよい。「一本鎖オリゴマー化合物」は、不対合のオリゴマー化合物である。

【0062】

「二本鎖オリゴマー」という用語は、相補的な核酸塩基配列を有する２つのオリゴマー化合物によって形成された二本鎖を意味する。

【0063】

本明細書で使用する場合、「オリゴヌクレオチド」は、インターヌクレオシド結合を介して連結された連結ヌクレオシド鎖を意味し、その各ヌクレオシドとインターヌクレオシド結合部は、修飾されていても、修飾されていなくてもよい。別段に示されていない限り、オリゴヌクレオチドは、８～５０個の連結ヌクレオシドからなる。本明細書で使用する場合、「修飾オリゴヌクレオチド」は、少なくとも１つのヌクレオシドまたはインターヌクレオシド結合部が修飾されているオリゴヌクレオチドを意味する。本明細書で使用する場合、「非修飾オリゴヌクレオチド」は、いずれのヌクレオシド修飾部またはインターヌクレオシド修飾部を含まないオリゴヌクレオチドを意味する。

【0064】

本明細書で使用する場合、「薬学的に許容される担体または希釈剤」は、動物に投与する際に使用するのに適するいずれかの物質を意味する。特定のこのような担体は、医薬組成物を、例えば、対象が経口摂取するための錠剤、丸剤、糖衣錠、カプセル剤、液剤、ゲル剤、シロップ剤、スラリー、懸濁剤及びロゼンジ剤として調合可能にする。特定の実施形態では、薬学的に許容される担体または希釈剤は、滅菌水、滅菌生理食塩水、滅菌緩衝液または滅菌人工脳脊髄液である。

【0065】

本明細書で使用する場合、「薬学的に許容される塩」は、化合物の生理学的及び薬学的に許容される塩を意味する。薬学的に許容される塩は、親化合物の所望の生物学的活性を維持させるとともに、望ましくない毒性作用をその化合物に付与しない。

【0066】

本明細書で使用する場合、「医薬組成物」は、対象に投与するのに適する物質の混合物を意味する。例えば、医薬組成物は、オリゴマー化合物と、滅菌水溶液を含んでよい。特定の実施形態では、医薬組成物は、特定の細胞株におけるｆｒｅｅ ｕｐｔａｋｅアッセイで活性を示す。

【0067】

本明細書で使用する場合、「プロドラッグ」は、体外にある時の第１の形態が、動物またはその細胞の中で、第２の形態に変換される治療剤を意味する。典型的には、動物の体内でのプロドラッグの変換は、細胞もしくは組織内の酵素（例えば、内因性酵素もしくはウイルス酵素）または化学物質の作用によって、及び／または生理的条件によって促される。特定の実施形態では、プロドラッグの第１の形態は、第２の形態よりも活性が低い。

【0068】

本明細書で使用する場合、「一本鎖」は、対を形成しておらず、二本鎖の一部ではない核酸（限定されないが、オリゴヌクレオチドを含む）を意味する。一本鎖化合物は、相補的核酸とハイブリダイズして二本鎖を形成することが可能であり、二本鎖形成時点では、もはや一本鎖ではなくなる。

【0069】

本明細書で使用する場合、「安定化リン酸基」は、非修飾ヌクレオシドの非修飾５’－リン酸の安定性と比較して生物学的条件の下でオリゴヌクレオチドの５’－末端ヌクレオシドの５’－リン酸部分が安定化する５’－化学部分を指す。５’－リン酸基のそのような安定化には、限定されないが、ホスファターゼによる除去に対する抵抗性が含まれる。安定化リン酸基には、限定されないが、５’－ビニルホスホネート及び５’－シクロプロピルホスホネートが含まれる。

【0070】

本明細書で使用する場合、「標準的な細胞アッセイ」は、実施例２または実施例３に記載されているアッセイと、その合理的な変形形態を意味する。

【0071】

本明細書で使用する場合、分子式が同一の分子の集団に関する「ステレオランダムなキラル中心」は、立体化学的配置がランダムであるキラル中心を意味する。例えば、ステレオランダムなキラル中心を含む分子の集団では、（Ｓ）配置のステレオランダムなキラル中心を有する分子の数は、（Ｒ）配置のステレオランダムなキラル中心を有する分子の数と同じであり得るが、必ずしも同じとは限らない。立体化学的配置を制御するようには設計されていない合成方法に起因するときには、キラル中心の立体化学的配置は、ランダムとみなす。特定の実施形態では、ステレオランダムなキラル中心は、ステレオランダムなホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である。

【0072】

本明細書で使用する場合、「対象」は、ヒトまたは非ヒト動物を意味する。特定の実施形態では、対象は、ヒトである。

【0073】

本明細書で使用する場合、「糖部分」は、非修飾糖部分または修飾糖部分を意味する。本明細書で使用する場合、「非修飾糖部分」は、ＲＮＡに見られるような２’－ＯＨ（Ｈ）リボシル部分（「非修飾ＲＮＡ糖部分」）、またはＤＮＡに見られるような２’－Ｈ（Ｈ）デオキシリボシル糖部分（「非修飾ＤＮＡ糖部分」）を意味する。非修飾糖部分は、１’位、３’位及び４’位のそれぞれに１個の水素、３’位に１個の酸素、５’位に２個の水素を有する。本明細書で使用する場合、「修飾糖部分」または「修飾糖」は、修飾フラノシル糖部分または糖代替部分を意味する。

【0074】

本明細書で使用する場合、「糖代替部分」は、オリゴヌクレオチドにおいて核酸塩基を別の基（インターヌクレオシド結合部、コンジュゲート基または末端基など）に連結できる、フラノシル部分以外を有する修飾糖部分を意味する。糖代替部分を含む修飾ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチド内の１つ以上の位置に導入でき、そのようなオリゴヌクレオチドは、相補的なオリゴマー化合物または標的核酸とハイブリダイズできる。

【0075】

本明細書で使用する場合、「症状または特質」は、疾患または障害の存在または程度を示す任意の身体的特徴または検査結果を意味する。特定の実施形態では、症状は、対象にとって明らかであるか、または当該対象を試験もしくは検査する医療専門家にとって明らかなものである。特定の実施形態では、特質は、侵襲的な診断検査（限定されないが、死後検査を含む）の際に明らかになるものである。

【0076】

本明細書で使用する場合、「標的核酸」及び「標的ＲＮＡ」は、オリゴマー化合物が作用を及ぼすように設計されている核酸を意味する。標的ＲＮＡはＲＮＡ転写産物を意味し、別段の指定がない限り、ｐｒｅ－ｍＲＮＡ及び成熟ｍＲＮＡを含む。

【0077】

本明細書で使用する場合、「標的領域」は、標的核酸の部分のうち、オリゴマー化合物がハイブリダイズするように設計されている部分を意味する。

【0078】

本明細書で使用する場合、「末端基」は、オリゴヌクレオチドの末端に共有結合している化学基または原子団を意味する。

【0079】

本明細書で使用する場合、「治療すること」は、本明細書に記載のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤を投与することによって対象の疾患または状態を改善させることを意味する。特定の実施形態では、対象を治療することで、治療が行われなかった場合の同じ症状と比較して症状が改善する。特定の実施形態では、治療は、症状の重症度もしくは頻度の低下、症状の発症の遅延、症状の進行の遅延、または症状の重症度もしくは頻度の遅延を生じさせる。

【0080】

本明細書で使用する場合、「ＲＮＡ」はＲＮＡ転写産物を意味し、別段の指定がない限り、ｐｒｅ－ｍＲＮＡ及び成熟ｍＲＮＡを含む。

【0081】

本明細書で使用する場合、「アンチセンス活性」は、アンチセンス化合物がその標的核酸とハイブリダイズしたことに起因するいずれかの検出可能及び／または測定可能な変化を意味する。特定の実施形態では、アンチセンス活性は、標的核酸、またはそのような標的核酸によってコードされるタンパク質の量または発現が、そのアンチセンス化合物の非存在下における標的核酸レベルまたは標的タンパク質レベルと比べて低下することである。特定の実施形態では、アンチセンス活性は、標的ｐｒｅ－ｍＲＮＡのスプライシングの調節である。

【0082】

本明細書で使用する場合、「アンチセンス剤」は、アンチセンス化合物及び任意選択の１つ以上の追加の特徴（センス化合物など）を意味する。

【0083】

本明細書で使用する場合、「アンチセンス化合物」は、アンチセンスオリゴヌクレオチド及び任意選択の１つ以上の追加の特徴（コンジュゲート基など）を意味する。

【0084】

本明細書で使用する場合、「センス化合物」は、センスオリゴヌクレオチド及び任意選択の１つ以上の追加の特徴（コンジュゲート基など）を意味する。

【0085】

本明細書で使用する場合、「アンチセンスオリゴヌクレオチド」は、標的核酸にハイブリダイズすることが可能であり、少なくとも１つのアンチセンス活性を示すことが可能なオリゴヌクレオチド（アンチセンス化合物のオリゴヌクレオチド部分を含む）を意味する。アンチセンスオリゴヌクレオチドには、限定されないが、スプライス調節オリゴヌクレオチド、アンチセンスＲＮＡｉオリゴヌクレオチド、及びアンチセンスＲＮａｓｅ Ｈオリゴヌクレオチドが含まれる。

【0086】

本明細書で使用する場合、「センスオリゴヌクレオチド」は、アンチセンスオリゴヌクレオチドにハイブリダイズすることが可能なオリゴヌクレオチド（センス化合物のオリゴヌクレオチド部分を含む）を意味する。

【0087】

本明細書で使用する場合、「細胞標的化部分」は、特定の細胞型（複数可）に結合することが可能なコンジュゲート基またはコンジュゲート基の一部を意味する。

【0088】

本明細書で使用する場合、「ハイブリダイゼーション」は、オリゴヌクレオチド及び／または核酸のアニーリングを意味する。特定の機序に限定されないが、最も一般的なハイブリダイゼーション機序は、水素結合を伴うものであり、その水素結合は、相補的な核酸塩基間のワトソン－クリック型、フーグスティーン型または逆フーグスティーン型の水素結合であってよい。特定の実施形態では、相補的核酸分子には、限定されないが、アンチセンス化合物及び核酸標的が含まれる。特定の実施形態では、相補的核酸分子には、限定されないが、オリゴヌクレオチド及び核酸標的が含まれる。

【0089】

本明細書で使用する場合、「ＲＮＡｉ剤」は、ＲＩＳＣまたはＡｇｏ２を少なくとも部分的には介して働くことで、標的核酸及び／または標的核酸によってコードされるタンパク質を調節するアンチセンス剤を意味する。ＲＮＡｉ剤には、限定されないが、二本鎖ｓｉＲＮＡ、一本鎖ＲＮＡｉ（ｓｓＲＮＡｉ）、及びマイクロＲＮＡ（マイクロＲＮＡ模倣物を含む）が含まれる。ＲＮＡｉ剤は、コンジュゲート基及び／または末端基を含み得る。特定の実施形態では、ＲＮＡｉ剤は、標的核酸の量及び／または活性を調節する。ＲＮＡｉ剤という用語は、ＲＮａｓｅ Ｈを介して働くアンチセンス剤を除外する。

【0090】

本明細書で使用する場合、「ＲＮａｓｅ Ｈ剤」は、ＲＮａｓｅ Ｈ介して働くことで、標的核酸及び／または標的核酸によってコードされるタンパク質を調節するアンチセンス剤を意味する。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ剤は一本鎖である。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ剤は二本鎖である。ＲＮａｓｅ Ｈ化合物は、コンジュゲート基及び／または末端基を含み得る。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ剤は、標的核酸の量及び／または活性を調節する。ＲＮａｓｅ Ｈ剤という用語は、ＲＩＳＣ／Ａｇｏ２介して主に働くアンチセンス剤を除外する。

【0091】

特定の実施形態
実施形態１．
８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的であり、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分及び修飾インターヌクレオシド結合から選択される少なくとも１つの修飾を有する、前記オリゴマー化合物。

【0092】

実施形態２．
前記ＵＮＣ１３Ａ核酸が、配列番号１または配列番号２の核酸塩基配列を有する、実施形態１に記載のオリゴマー化合物。

【0093】

実施形態３．
前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１、核酸塩基４８，４３２～４８，４６５、または核酸塩基４８，４６６～４８，５６１のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的である、実施形態１または実施形態２に記載のオリゴマー化合物。

【0094】

実施形態４．
前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、前記ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分の核酸塩基配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である、実施形態１～３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0095】

実施形態５．
８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号２１～３３２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を含み、前記修飾オリゴヌクレオチドが、修飾糖部分及び修飾インターヌクレオシド結合から選択される少なくとも１つの修飾を含む、前記オリゴマー化合物。

【0096】

実施形態６．
前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、配列番号２１～３３２のいずれかの核酸塩基配列を含む、実施形態５に記載のオリゴマー化合物。

【0097】

実施形態７．
前記修飾オリゴヌクレオチドが、配列番号２１～３３２のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する、実施形態５に記載のオリゴマー化合物。

【0098】

実施形態８．
配列番号２９０、２９１、２９３、もしくは２９４、
配列番号８５～１０１、または
配列番号２１～３０、３２～４１、４３～５２、５４～６０、６２～６６、もしくは３２６～３３２
の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を含む核酸塩基配列を前記修飾オリゴヌクレオチドが有する、実施形態５～７のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【0099】

実施形態９．
前記修飾オリゴヌクレオチドの前記核酸塩基配列が、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分の核酸塩基配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的であり、前記ＵＮＣ１３Ａ核酸が、配列番号１または配列番号２の核酸塩基配列を有する、実施形態５～８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0100】

実施形態１０．
１２～５０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物であって、
配列番号１の４８，１２８～４８，１５１、
配列番号１の４８，４３２～４８，４６５、または
配列番号１の４８，４６６～４８，５６１
と相補的な少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を、前記修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が含む、前記オリゴマー化合物。

【0101】

実施形態１１．
前記修飾オリゴヌクレオチドが、１０～２５個、１０～３０個、１０～５０個、１２～２０個、１２～２５個、１２～３０個、１２～５０個、１３～２０個、１３～２５個、１３～３０個、１３～５０個、１４～２０個、１４～２５個、１４～３０個、１４～５０個、１５～２０個、１５～２５個、１５～３０個、１５～５０個、１６～１８個、１６～２０個、１６～２５個、１６～３０個、１６～５０個、１７～２０個、１７～２５個、１７～３０個、１７～５０個、１８～２０個、１８～２２個、１８～２５個、１８～３０個、１８～５０個、１９～２０個、１９～２５個、１９～３０個、１９～５０個、２０～２５個、２０～３０個、２０～５０個、２１～２５個、２１～３０個、２１～５０個、２２～２５個、２２～３０個、２２～５０個、２３～２５個、２３～３０個、または２３～５０個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１～１０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0102】

実施形態１２．
前記修飾オリゴヌクレオチドが、１８個の連結ヌクレオシドからなる、実施形態１～１１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0103】

実施形態１３．
前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドが修飾糖部分を含む、実施形態１～１２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0104】

実施形態１４．
前記修飾糖部分が、二環式糖部分を含む、実施形態１３に記載のオリゴマー化合物。

【0105】

実施形態１５．
前記二環式糖部分が、－Ｏ－ＣＨ_２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ_３）－から選択される２’－４’架橋を含む、実施形態１４に記載のオリゴマー化合物。

【0106】

実施形態１６．
前記修飾糖部分が、非二環式の修飾糖部分を含む、実施形態１３に記載のオリゴマー化合物。

【0107】

実施形態１７．
前記非二環式の修飾糖部分が、２’－ＭＯＥ糖部分、２’－ＯＭｅ糖部分、２’－ＮＭＡ糖部分、または２’－Ｆ糖部分である、実施形態１６に記載のオリゴマー化合物。

【0108】

実施形態１８．
前記修飾オリゴヌクレオチド化合物の少なくとも１つのヌクレオシドが糖代替部分を含む、実施形態１～１７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0109】

実施形態１９．
前記修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドが修飾糖部分を含む、実施形態１３～１８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0110】

実施形態２０．
各修飾糖部分が、２’－ＭＯＥ糖部分である、実施形態１９に記載のオリゴマー化合物。

【0111】

実施形態２１．
各修飾糖部分が、２’－ＮＭＡ糖部分である、実施形態１９に記載のオリゴマー化合物。

【0112】

実施形態２２．
前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾インターヌクレオシド結合を含む、実施形態１～２１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0113】

実施形態２３．
少なくとも１つの修飾インターヌクレオシド結合が、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である、実施形態２２に記載のオリゴマー化合物。

【0114】

実施形態２４．
各インターヌクレオシド結合が、修飾インターヌクレオシド結合である、実施形態２２または実施形態２３に記載のオリゴマー化合物。

【0115】

実施形態２５．
各インターヌクレオシド結合が、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である、実施形態２４に記載のオリゴマー化合物。

【0116】

実施形態２６．
前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのインターヌクレオシド結合が、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合である、実施形態２２～２３のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0117】

実施形態２７．
前記修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合が、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合またはホスホロチオエートインターヌクレオシド結合から独立して選択される、実施形態１～２４または２６のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0118】

実施形態２８．
前記修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、または１７個のインターヌクレオシド結合が、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である、実施形態１～２３または２６～２７のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0119】

実施形態２９．
前記修飾オリゴヌクレオチドが、少なくとも１つの修飾核酸塩基を含む、実施形態１～２８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0120】

実施形態３０．
前記修飾核酸塩基が、５－メチルシトシンである、実施形態２９に記載のオリゴマー化合物。

【0121】

実施形態３１．
各シトシンが、５－メチルシトシンである、実施形態３０に記載のオリゴマー化合物。

【0122】

実施形態３２．
前記修飾オリゴヌクレオチドからなる、実施形態１～３１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0123】

実施形態３３．
前記修飾オリゴヌクレオチドが、その薬学的に許容される塩である、実施形態１～３２のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【0124】

実施形態３４．
ナトリウム、カリウム、カルシウム、及びマグネシウムから選択される１つ以上のカチオンを含む薬学的に許容される塩である、実施形態３３に記載のオリゴマー化合物。

【0125】

実施形態３５．
前記オリゴマー化合物が、コンジュゲート基を含む、実施形態１～３１のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0126】

実施形態３６．
前記コンジュゲート基が、コンジュゲートリンカー及びコンジュゲート部分を含む、実施形態３５に記載のオリゴマー化合物。

【0127】

実施形態３７．
前記コンジュゲートリンカーが、単結合からなる、実施形態３６に記載のオリゴマー化合物。

【0128】

実施形態３８．
前記コンジュゲートリンカーが、切断可能である、実施形態３６または実施形態３７に記載のオリゴマー化合物。

【0129】

実施形態３９．
前記コンジュゲートリンカーが、１～３つのリンカーヌクレオシドを含む、実施形態３６～３８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0130】

実施形態４０．
前記コンジュゲートリンカーが、いずれのリンカーヌクレオシドも含まない、実施形態３６～３８のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0131】

実施形態４１．
前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの５’末端で、前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、実施形態３５～４０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0132】

実施形態４２．
前記コンジュゲート基が、前記修飾オリゴヌクレオチドの３’末端で、前記修飾オリゴヌクレオチドに結合している、実施形態３５～４０のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0133】

実施形態４３．
前記オリゴマー化合物が、末端基を含む、実施形態１～４２のいずれかに記載のオリゴマー化合物。

【0134】

実施形態４４．
前記末端基が、脱塩基糖部分である、実施形態４３に記載のオリゴマー化合物。

【0135】

実施形態４５．
前記オリゴマー化合物が、一本鎖オリゴマー化合物である、実施形態１～４４のいずれか１項に記載のオリゴマー化合物。

【0136】

実施形態４６．
実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物のキラル的に富化された集団であって、前記集団において、特定の立体化学的配置である特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を少なくとも１つ含む修飾オリゴヌクレオチドが富化されている前記集団。

【0137】

実施形態４７．
（Ｓｐ）配置または（Ｒｐ）配置である特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を少なくとも１つ含む修飾オリゴヌクレオチドが富化されている、実施形態４６に記載のキラル的に富化された集団。

【0138】

実施形態４８．
前記ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のそれぞれが、独立して選択した特定の立体化学的配置である修飾オリゴヌクレオチドが富化されている、実施形態４６に記載のキラル的に富化された集団。

【0139】

実施形態４９．
１つの特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合が（Ｒｐ）配置を有し、残りのホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のそれぞれが（Ｓｐ）配置を有する修飾オリゴヌクレオチドが前記集団中で富化されている、実施形態４６に記載のキラル的に富化された集団。

【0140】

実施形態５０．
５’→３’方向でＳｐ配置、Ｓｐ配置、及びＲｐ配置をとる少なくとも３つの連続したホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を有する修飾オリゴヌクレオチドが前記集団中で富化されている、実施形態４６に記載のキラル的に富化された集団。

【0141】

実施形態５１．
前記修飾オリゴヌクレオチドのホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のすべてが、ステレオランダムである、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物の集団。

【0142】

実施形態５２．
第１のオリゴマー化合物と、第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物と、を含む二本鎖オリゴマーであって、前記第１のオリゴマー化合物が、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物である、前記二本鎖オリゴマー。

【0143】

実施形態５３．
前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、８～８０個の連結ヌクレオシドからなり、前記第２の修飾オリゴヌクレオチドが、第１の修飾オリゴヌクレオチドのうちの等しい長さの部分と少なくとも９０％相補的な少なくとも８つの核酸塩基の相補的領域を含む、実施形態５２に記載の二本鎖オリゴマー。

【0144】

実施形態５４．
アンチセンス化合物を含むアンチセンス剤であって、前記アンチセンス化合物が、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、または実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマーである、前記アンチセンス剤。

【0145】

実施形態５５．
前記アンチセンス剤が、ＵＮＣ１３Ａ核酸のスプライシングを調節することが可能なスプライス調節剤である、実施形態５４に記載のアンチセンス剤。

【0146】

実施形態５６．
前記アンチセンス剤が、コンジュゲート基を含み、前記コンジュゲート基が、細胞標的化部分を含む、実施形態５４または実施形態５５に記載のアンチセンス剤。

【0147】

実施形態５７．
実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、または実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤と、薬学的に許容される希釈剤または担体と、を含む医薬組成物。

【0148】

実施形態５８．
前記薬学的に許容される希釈剤が、リン酸緩衝生理食塩水または人工脳脊髄液である、実施形態５７に記載の医薬組成物。

【0149】

実施形態５９．
前記医薬組成物が、前記オリゴマー化合物、前記集団、前記二本鎖オリゴマー、または前記アンチセンス剤と、リン酸緩衝生理食塩水または人工脳脊髄液と、から本質的になる、実施形態５８に記載の医薬組成物。

【0150】

実施形態６０．
実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物を対象に投与することを含む方法。

【0151】

実施形態６１．
ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患の治療方法であって、前記方法が、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患またはその発症リスクを有する対象に対して、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物を治療的に有効な量で投与し、それによって前記ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療することを含む、前記方法。

【0152】

実施形態６２．
前記ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患が、神経変性疾患である、実施形態６１に記載の方法。

【0153】

実施形態６３．
前記神経変性疾患が、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である、実施形態６２に記載の方法。

【0154】

実施形態６４．
前記神経変性疾患の少なくとも１つの症状が改善される、実施形態６３に記載の方法。

【0155】

実施形態６５．
前記少なくとも１つの症状が、運動機能障害、筋力低下、筋肉消耗、シナプス機能障害、疲労、発話困難、嚥下困難、息切れ、認識機能障害、寿命の短期化、またはそれらの組み合わせである、実施形態６４に記載の方法。

【0156】

実施形態６６．
実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物を投与することで、運動機能の改善、筋力の改善、筋量の増加、発話の改善、嚥下の改善、呼吸の改善、シナプス機能の改善、認知の改善、または寿命の長期化が生じる、実施形態６５に記載の方法。

【0157】

実施形態６７．
前記対象が、ヒトである、実施形態６０～６６のいずれか１項に記載の方法。

【0158】

実施形態６８．
細胞におけるＵＮＣ１３Ａの発現の増加方法であって、前記方法が、前記細胞と、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物と、を接触させることを含む、前記方法。

【0159】

実施形態６９．
細胞における隠れエキソン含有ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量の低減方法であって、前記方法が、前記細胞と、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物と、を接触させることを含む、前記方法。

【0160】

実施形態７０．
前記隠れエキソンが、ＵＮＣ１３Ａのエキソン２０とエキソン２１との間に存在する、実施形態６９に記載の方法。

【0161】

実施形態７１．
前記隠れエキソンが、ＣＥ－１、ＣＥ－２、及びＣＥ－３から選択される、実施形態７０に記載の方法。

【0162】

実施形態７２．
前記細胞が、ニューロンまたはグリア細胞であり、任意選択で、前記細胞が、アストロサイトまたはミクログリア細胞である、実施形態６８～７１のいずれかに記載の方法。

【0163】

実施形態７３．
前記細胞が、ヒト細胞である、実施形態６８～７２のいずれかに記載の方法。

【0164】

実施形態７４．
ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療するための、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物の使用。

【0165】

実施形態７５．
ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療するための医薬の製造における、実施形態１～４５のいずれかに記載のオリゴマー化合物、実施形態４６～５１のいずれかに記載の集団、実施形態５２もしくは実施形態５３に記載の二本鎖オリゴマー、実施形態５４～５６のいずれかに記載のアンチセンス剤、または実施形態５７～５９のいずれかに記載の医薬組成物の使用。

【0166】

実施形態７６．
前記ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患が、神経変性疾患である、実施形態７４または実施形態７５に記載の使用。

【0167】

実施形態７７．
前記神経変性疾患が、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である、実施形態７６に記載の使用。

【0168】

特定のオリゴマー剤及びオリゴマー化合物
特定の実施形態は、ＵＮＣ１３Ａ核酸を標的とするオリゴマー剤を提供する。特定の実施形態では、ＵＮＣ１３Ａ核酸は、配列番号１（ＧＥＮＢＡＮＫアクセッション番号ＮＣ＿００００１９．１０のヌクレオシド１７５９８００１から１７６９１０００までの切断鎖の相補鎖）または配列番号２（ＧＥＮＢＡＮＫアクセッション番号ＮＭ＿００１０８０４２１．２）に示される配列を有し、これらはそれぞれ、その全体が参照によって組み込まれる。特定の実施形態では、オリゴマー剤は、一本鎖オリゴマー化合物である。特定の実施形態では、オリゴマー剤は、二本鎖オリゴマーである。

【0169】

特定の実施形態は、８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物を提供し、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的であり、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖部分及び修飾インターヌクレオシド結合から選択される少なくとも１つの修飾を有する。特定の実施形態では、ＵＮＣ１３Ａ核酸は、配列番号１または２の核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である。

【0170】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８１０４～４８１２１、４８１０６～４８１２３、４８１０８～４８１２５、４８１１０～４８１２７、４８１１２～４８１２９、４８１１４～４８１３１、４８１１６～４８１３３、４８１１８～４８１３５、４８１２０～４８１３７、４８１２２～４８１３９、４８１２４～４８１４１、４８１２６～４８１４３、４８１２８～４８１４５、４８１３０～４８１４７、４８１３２～４８１４９、４８１３４～４８１５１、４８１３６～４８１５３、４８１３８～４８１５５、４８１４０～４８１５７、４８１４２～４８１５９、４８１４４～４８１６１、４８１４６～４８１６３、４８１４８～４８１６５、４８１５０～４８１６７、４８１５２～４８１６９、４８１５４～４８１７１、４８１５６～４８１７３、４８１５８～４８１７５、４８１６０～４８１７７、４８１６２～４８１７９、４８１６４～４８１８１、４８１６６～４８１８３、４８１６８～４８１８５、４８１７０～４８１８７、４８１７２～４８１８９、４８１７４～４８１９１、４８１７６～４８１９３、４８１７８～４８１９５、４８１８０～４８１９７、４８１８２～４８１９９、４８１８４～４８２０１、４８１８６～４８２０３、４８１８８～４８２０５、４８１９０～４８２０７、４８１９２～４８２０９、４８１９４～４８２１１、４８１９６～４８２１３、４８１９８～４８２１５、４８２００～４８２１７、４８２０２～４８２１９、４８２０４～４８２２１、４８２０６～４８２２３、４８２０８～４８２２５、４８２１０～４８２２７、４８２１２～４８２２９、４８２１４～４８２３１、４８２１６～４８２３３、４８２１８～４８２３５、４８２２０～４８２３７、４８２２２～４８２３９、４８２２４～４８２４１、４８２２６～４８２４３、４８２２８～４８２４５、４８２３０～４８２４７、４８２３２～４８２４９、４８２３４～４８２５１、４８２３６～４８２５３、４８２３８～４８２５５、４８２４０～４８２５７、４８２４２～４８２５９、４８２４４～４８２６１、４８２４６～４８２６３、４８２４８～４８２６５、４８２５０～４８２６７、４８２５２～４８２６９、４８２５４～４８２７１、４８２５６～４８２７３、４８２５８～４８２７５、４８２６０～４８２７７、４８２６２～４８２７９、４８２６４～４８２８１、４８２６６～４８２８３、４８２６８～４８２８５、４８２７０～４８２８７、４８２７２～４８２８９、４８２７４～４８２９１、４８２７６～４８２９３、４８２７８～４８２９５、４８２８０～４８２９７、４８２８２～４８２９９、４８２８４～４８３０１、４８２８６～４８３０３、４８２８８～４８３０５、４８２９０～４８３０７、４８２９２～４８３０９、４８２９４～４８３１１、４８２９６～４８３１３、４８２９８～４８３１５、４８３００～４８３１７、４８３０２～４８３１９、４８３０４～４８３２１、４８３０６～４８３２３、４８３０８～４８３２５、４８３１０～４８３２７、４８３１２～４８３２９、４８３１４～４８３３１、４８３１６～４８３３３、４８３１８～４８３３５、４８３２０～４８３３７、４８３２２～４８３３９、４８３２４～４８３４１、４８３２６～４８３４３、４８３２８～４８３４５、４８３３０～４８３４７、４８３３２～４８３４９、４８３３４～４８３５１、４８３３６～４８３５３、４８３３８～４８３５５、４８３４０～４８３５７、４８３４２～４８３５９、４８３４４～４８３６１、４８３４６～４８３６３、４８３４８～４８３６５、４８３５０～４８３６７、４８３５２～４８３６９、４８３５４～４８３７１、４８３５６～４８３７３、４８３５８～４８３７５、４８３６０～４８３７７、４８３６２～４８３７９、４８３６４～４８３８１、４８３６６～４８３８３、４８３６８～４８３８５、４８３７０～４８３８７、４８３７２～４８３８９、４８３７４～４８３９１、４８３７６～４８３９３、４８３７８～４８３９５、４８３８０～４８３９７、４８３８２～４８３９９、４８３８４～４８４０１、４８３８５～４８４０２、４８３８６～４８４０３、４８３８７～４８４０４、４８３８８～４８４０５、４８３８９～４８４０６、４８３９０～４８４０７、４８３９１～４８４０８、４８３９２～４８４０９、４８３９３～４８４１０、４８３９４～４８４１１、４８３９５～４８４１２、４８３９６～４８４１３、４８３９７～４８４１４、４８３９８～４８４１５、４８３９９～４８４１６、４８４００～４８４１７、４８４０１～４８４１８、４８４０２～４８４１９、４８４０３～４８４２０、４８４０４～４８４２１、４８４０５～４８４２２、４８４０６～４８４２３、４８４０７～４８４２４、４８４０８～４８４２５、４８４０９～４８４２６、４８４１０～４８４２７、４８４１１～４８４２８、４８４１２～４８４２９、４８４１３～４８４３０、４８４１４～４８４３１、４８４１５～４８４３２、４８４１６～４８４３３、４８４１７～４８４３４、４８４１８～４８４３５、４８４１９～４８４３６、４８４２０～４８４３７、４８４２１～４８４３８、４８４２２～４８４３９、４８４２３～４８４４０、４８４２４～４８４４１、４８４２５～４８４４２、４８４２６～４８４４３、４８４２７～４８４４４、４８４２８～４８４４５、４８４２９～４８４４６、４８４３０～４８４４７、４８４３１～４８４４８、４８４３２～４８４４９、４８４３３～４８４５０、４８４３４～４８４５１、４８４３５～４８４５２、４８４３６～４８４５３、４８４３７～４８４５４、４８４３８～４８４５５、４８４３９～４８４５６、４８４４０～４８４５７、４８４４１～４８４５８、４８４４２～４８４５９、４８４４３～４８４６０、４８４４４～４８４６１、４８４４５～４８４６２、４８４４６～４８４６３、４８４４７～４８４６４、４８４４８～４８４６５、４８４４９～４８４６６、４８４５０～４８４６７、４８４５１～４８４６８、４８４５２～４８４６９、４８４５３～４８４７０、４８４５４～４８４７１、４８４５５～４８４７２、４８４５６～４８４７３、４８４５７～４８４７４、４８４５８～４８４７５、４８４５９～４８４７６、４８４６０～４８４７７、４８４６１～４８４７８、４８４６２～４８４７９、４８４６３～４８４８０、４８４６４～４８４８１、４８４６５～４８４８２、４８４６６～４８４８３、４８４６７～４８４８４、４８４６８～４８４８５、４８４６９～４８４８６、４８４７０～４８４８７、４８４７１～４８４８８、４８４７２～４８４８９、４８４７３～４８４９０、４８４７４～４８４９１、４８４７５～４８４９２、４８４７６～４８４９３、４８４７７～４８４９４、４８４７８～４８４９５、４８４７９～４８４９６、４８４８０～４８４９７、４８４８１～４８４９８、４８４８２～４８４９９、４８４８３～４８５００、４８４８４～４８５０１、４８４８６～４８５０３、４８４８８～４８５０５、４８４９０～４８５０７、４８４９２～４８５０９、４８４９４～４８５１１、４８４９６～４８５１３、４８４９８～４８５１５、４８５００～４８５１７、４８５０２～４８５１９、４８５０４～４８５２１、４８５０６～４８５２３、４８５０８～４８５２５、４８５１０～４８５２７、４８５１２～４８５２９、４８５１４～４８５３１、４８５１６～４８５３３、４８５１８～４８５３５、４８５２０～４８５３７、４８５２２～４８５３９、４８５２４～４８５４１、４８５２６～４８５４３、４８５２８～４８５４５、４８５３０～４８５４７、４８５３２～４８５４９、４８５３４～４８５５１、４８５３６～４８５５３、４８５３８～４８５５５、４８５４０～４８５５７、４８５４２～４８５５９、４８５４４～４８５６１、４８５４６～４８５６３、４８５４８～４８５６５、４８５５０～４８５６７、４８５５２～４８５６９、４８５５４～４８５７１、４８５５６～４８５７３、４８５５８～４８５７５、４８５６０～４８５７７、４８５６２～４８５７９、４８５６４～４８５８１、４８５６６～４８５８３、４８５６８～４８５８５、４８５７０～４８５８７、４８５７２～４８５８９、４８５７４～４８５９１、４８５７６～４８５９３、４８５７８～４８５９５、４８５８０～４８５９７、４８５８２～４８５９９、４８５８４～４８６０１、４８５８６～４８６０３、４８５８８～４８６０５、４８５９０～４８６０７、４８５９２～４８６０９、４８５９４～４８６１１、４８５９６～４８６１３、４８５９８～４８６１５、４８６００～４８６１７、４８６０２～４８６１９、４８６０４～４８６２１、４８６０６～４８６２３、４８６０８～４８６２５、４８６１０～４８６２７、４８６１２～４８６２９、４８６１４～４８６３１、４８６１６～４８６３３、４８６１８～４８６３５、４８６２０～４８６３７、４８６２２～４８６３９、４８６２４～４８６４１、４８６２６～４８６４３のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分の核酸塩基配列と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である。

【0171】

特定の実施形態は、８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物を提供し、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号２１～３３２の核酸塩基配列のいずれかの少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を含む。

【0172】

特定の実施形態は、１８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物を提供し、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、配列番号２１～３３２の核酸塩基配列のいずれかの核酸塩基配列を含む。

【0173】

特定の実施形態は、１８～８０個の連結ヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物を提供し、修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号２１～３３２の核酸塩基配列のいずれかの核酸塩基配列からなる核酸塩基配列を有する。

【0174】

本明細書で提供されるオリゴマー化合物のいずれかでは、修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的であり得、ＵＮＣ１３Ａ核酸は、配列番号１または２の核酸塩基配列を有する。

【0175】

本明細書で提供されるオリゴマー化合物のいずれかでは、修飾オリゴヌクレオチドは、１０～２５個、１０～３０個、１０～５０個、１２～２０個、１２～２５個、１２～３０個、１２～５０個、１３～２０個、１３～２５個、１３～３０個、１３～５０個、１４～２０個、１４～２５個、１４～３０個、１４～５０個、１５～２０個、１５～２５個、１５～３０個、１５～５０個、１６～１８個、１６～２０個、１６～２５個、１６～３０個、１６～５０個、１７～２０個、１７～２５個、１７～３０個、１７～５０個、１８～２０個、１８～２５個、１８～３０個、１８～５０個、１９～２０個、１９～２５個、１９～３０個、１９～５０個、２０～２５個、２０～３０個、２０～５０個、２１～２５個、２１～３０個、２１～５０個、２２～２５個、２２～３０個、２２～５０個、２３～２５個、２３～３０個、または２３～５０個の連結ヌクレオシドからなり得る。

【0176】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、少なくとも１８個、または少なくとも１９個であり、かつ５０個以下の連結ヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、１６個、１７個、１８個、１９個、または２０個の連結ヌクレオシドからなる。

【0177】

本明細書で提供されるオリゴマー化合物のいずれかでは、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドは、修飾糖部分を含み得る。特定の実施形態では、修飾糖部分は、二環式糖部分（－Ｏ－ＣＨ２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ３）－から選択される２’－４’架橋など）を含む。特定の実施形態では、修飾糖部分は、非二環式の修飾糖部分（２’－ＭＯＥ糖部分または２’－ＯＭｅ糖部分など）を含む。特定の実施形態では、修飾糖部分は、２’－Ｏ－Ｎ－アルキルアセトアミド糖部分（２’－Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミド糖部分など）を含む。

【0178】

本明細書で提供されるオリゴマー化合物のいずれかでは、修飾オリゴヌクレオチド化合物の少なくとも１つのヌクレオシドは、糖代替部分を含み得る。

【0179】

本明細書で提供されるオリゴマー化合物のいずれかでは、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのインターヌクレオシド結合は、修飾インターヌクレオシド結合（ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合など）を含み得る。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合は修飾インターヌクレオシド結合であり得るか、または修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合はホスホロチオエートインターヌクレオシド結合であり得る。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのインターヌクレオシド結合は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合であり得る。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合またはホスホロチオエートインターヌクレオシド結合から独立して選択され得る。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、または少なくとも６つのインターヌクレオシド結合は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合であり得る。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または少なくとも１８個のインターヌクレオシド結合は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合であり得る。

【0180】

本明細書で提供されるオリゴマー化合物のいずれかでは、修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つの核酸塩基は修飾核酸塩基（５－メチルシトシンなど）であり得る。特定の実施形態では、各シトシンは、５－メチルシトシンである。

【0181】

特定の二本鎖オリゴマー
特定の実施形態は、第１のオリゴマー化合物及び第２のオリゴマー化合物を含む二本鎖オリゴマーを対象とする。

【0182】

特定の実施形態では、二本鎖オリゴマーは、
８～８０個の連結ヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物であって、第１の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号１の核酸塩基４８１０４～４８１２１、４８１０６～４８１２３、４８１０８～４８１２５、４８１１０～４８１２７、４８１１２～４８１２９、４８１１４～４８１３１、４８１１６～４８１３３、４８１１８～４８１３５、４８１２０～４８１３７、４８１２２～４８１３９、４８１２４～４８１４１、４８１２６～４８１４３、４８１２８～４８１４５、４８１３０～４８１４７、４８１３２～４８１４９、４８１３４～４８１５１、４８１３６～４８１５３、４８１３８～４８１５５、４８１４０～４８１５７、４８１４２～４８１５９、４８１４４～４８１６１、４８１４６～４８１６３、４８１４８～４８１６５、４８１５０～４８１６７、４８１５２～４８１６９、４８１５４～４８１７１、４８１５６～４８１７３、４８１５８～４８１７５、４８１６０～４８１７７、４８１６２～４８１７９、４８１６４～４８１８１、４８１６６～４８１８３、４８１６８～４８１８５、４８１７０～４８１８７、４８１７２～４８１８９、４８１７４～４８１９１、４８１７６～４８１９３、４８１７８～４８１９５、４８１８０～４８１９７、４８１８２～４８１９９、４８１８４～４８２０１、４８１８６～４８２０３、４８１８８～４８２０５、４８１９０～４８２０７、４８１９２～４８２０９、４８１９４～４８２１１、４８１９６～４８２１３、４８１９８～４８２１５、４８２００～４８２１７、４８２０２～４８２１９、４８２０４～４８２２１、４８２０６～４８２２３、４８２０８～４８２２５、４８２１０～４８２２７、４８２１２～４８２２９、４８２１４～４８２３１、４８２１６～４８２３３、４８２１８～４８２３５、４８２２０～４８２３７、４８２２２～４８２３９、４８２２４～４８２４１、４８２２６～４８２４３、４８２２８～４８２４５、４８２３０～４８２４７、４８２３２～４８２４９、４８２３４～４８２５１、４８２３６～４８２５３、４８２３８～４８２５５、４８２４０～４８２５７、４８２４２～４８２５９、４８２４４～４８２６１、４８２４６～４８２６３、４８２４８～４８２６５、４８２５０～４８２６７、４８２５２～４８２６９、４８２５４～４８２７１、４８２５６～４８２７３、４８２５８～４８２７５、４８２６０～４８２７７、４８２６２～４８２７９、４８２６４～４８２８１、４８２６６～４８２８３、４８２６８～４８２８５、４８２７０～４８２８７、４８２７２～４８２８９、４８２７４～４８２９１、４８２７６～４８２９３、４８２７８～４８２９５、４８２８０～４８２９７、４８２８２～４８２９９、４８２８４～４８３０１、４８２８６～４８３０３、４８２８８～４８３０５、４８２９０～４８３０７、４８２９２～４８３０９、４８２９４～４８３１１、４８２９６～４８３１３、４８２９８～４８３１５、４８３００～４８３１７、４８３０２～４８３１９、４８３０４～４８３２１、４８３０６～４８３２３、４８３０８～４８３２５、４８３１０～４８３２７、４８３１２～４８３２９、４８３１４～４８３３１、４８３１６～４８３３３、４８３１８～４８３３５、４８３２０～４８３３７、４８３２２～４８３３９、４８３２４～４８３４１、４８３２６～４８３４３、４８３２８～４８３４５、４８３３０～４８３４７、４８３３２～４８３４９、４８３３４～４８３５１、４８３３６～４８３５３、４８３３８～４８３５５、４８３４０～４８３５７、４８３４２～４８３５９、４８３４４～４８３６１、４８３４６～４８３６３、４８３４８～４８３６５、４８３５０～４８３６７、４８３５２～４８３６９、４８３５４～４８３７１、４８３５６～４８３７３、４８３５８～４８３７５、４８３６０～４８３７７、４８３６２～４８３７９、４８３６４～４８３８１、４８３６６～４８３８３、４８３６８～４８３８５、４８３７０～４８３８７、４８３７２～４８３８９、４８３７４～４８３９１、４８３７６～４８３９３、４８３７８～４８３９５、４８３８０～４８３９７、４８３８２～４８３９９、４８３８４～４８４０１、４８３８５～４８４０２、４８３８６～４８４０３、４８３８７～４８４０４、４８３８８～４８４０５、４８３８９～４８４０６、４８３９０～４８４０７、４８３９１～４８４０８、４８３９２～４８４０９、４８３９３～４８４１０、４８３９４～４８４１１、４８３９５～４８４１２、４８３９６～４８４１３、４８３９７～４８４１４、４８３９８～４８４１５、４８３９９～４８４１６、４８４００～４８４１７、４８４０１～４８４１８、４８４０２～４８４１９、４８４０３～４８４２０、４８４０４～４８４２１、４８４０５～４８４２２、４８４０６～４８４２３、４８４０７～４８４２４、４８４０８～４８４２５、４８４０９～４８４２６、４８４１０～４８４２７、４８４１１～４８４２８、４８４１２～４８４２９、４８４１３～４８４３０、４８４１４～４８４３１、４８４１５～４８４３２、４８４１６～４８４３３、４８４１７～４８４３４、４８４１８～４８４３５、４８４１９～４８４３６、４８４２０～４８４３７、４８４２１～４８４３８、４８４２２～４８４３９、４８４２３～４８４４０、４８４２４～４８４４１、４８４２５～４８４４２、４８４２６～４８４４３、４８４２７～４８４４４、４８４２８～４８４４５、４８４２９～４８４４６、４８４３０～４８４４７、４８４３１～４８４４８、４８４３２～４８４４９、４８４３３～４８４５０、４８４３４～４８４５１、４８４３５～４８４５２、４８４３６～４８４５３、４８４３７～４８４５４、４８４３８～４８４５５、４８４３９～４８４５６、４８４４０～４８４５７、４８４４１～４８４５８、４８４４２～４８４５９、４８４４３～４８４６０、４８４４４～４８４６１、４８４４５～４８４６２、４８４４６～４８４６３、４８４４７～４８４６４、４８４４８～４８４６５、４８４４９～４８４６６、４８４５０～４８４６７、４８４５１～４８４６８、４８４５２～４８４６９、４８４５３～４８４７０、４８４５４～４８４７１、４８４５５～４８４７２、４８４５６～４８４７３、４８４５７～４８４７４、４８４５８～４８４７５、４８４５９～４８４７６、４８４６０～４８４７７、４８４６１～４８４７８、４８４６２～４８４７９、４８４６３～４８４８０、４８４６４～４８４８１、４８４６５～４８４８２、４８４６６～４８４８３、４８４６７～４８４８４、４８４６８～４８４８５、４８４６９～４８４８６、４８４７０～４８４８７、４８４７１～４８４８８、４８４７２～４８４８９、４８４７３～４８４９０、４８４７４～４８４９１、４８４７５～４８４９２、４８４７６～４８４９３、４８４７７～４８４９４、４８４７８～４８４９５、４８４７９～４８４９６、４８４８０～４８４９７、４８４８１～４８４９８、４８４８２～４８４９９、４８４８３～４８５００、４８４８４～４８５０１、４８４８６～４８５０３、４８４８８～４８５０５、４８４９０～４８５０７、４８４９２～４８５０９、４８４９４～４８５１１、４８４９６～４８５１３、４８４９８～４８５１５、４８５００～４８５１７、４８５０２～４８５１９、４８５０４～４８５２１、４８５０６～４８５２３、４８５０８～４８５２５、４８５１０～４８５２７、４８５１２～４８５２９、４８５１４～４８５３１、４８５１６～４８５３３、４８５１８～４８５３５、４８５２０～４８５３７、４８５２２～４８５３９、４８５２４～４８５４１、４８５２６～４８５４３、４８５２８～４８５４５、４８５３０～４８５４７、４８５３２～４８５４９、４８５３４～４８５５１、４８５３６～４８５５３、４８５３８～４８５５５、４８５４０～４８５５７、４８５４２～４８５５９、４８５４４～４８５６１、４８５４６～４８５６３、４８５４８～４８５６５、４８５５０～４８５６７、４８５５２～４８５６９、４８５５４～４８５７１、４８５５６～４８５７３、４８５５８～４８５７５、４８５６０～４８５７７、４８５６２～４８５７９、４８５６４～４８５８１、４８５６６～４８５８３、４８５６８～４８５８５、４８５７０～４８５８７、４８５７２～４８５８９、４８５７４～４８５９１、４８５７６～４８５９３、４８５７８～４８５９５、４８５８０～４８５９７、４８５８２～４８５９９、４８５８４～４８６０１、４８５８６～４８６０３、４８５８８～４８６０５、４８５９０～４８６０７、４８５９２～４８６０９、４８５９４～４８６１１、４８５９６～４８６１３、４８５９８～４８６１５、４８６００～４８６１７、４８６０２～４８６１９、４８６０４～４８６２１、４８６０６～４８６２３、４８６０８～４８６２５、４８６１０～４８６２７、４８６１２～４８６２９、４８６１４～４８６３１、４８６１６～４８６３３、４８６１８～４８６３５、４８６２０～４８６３７、４８６２２～４８６３９、４８６２４～４８６４１、４８６２６～４８６４３のうちの等しい長さの部分と少なくとも８０％相補的である、第１のオリゴマー化合物と、
８～８０個の連結ヌクレオシドからなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物であって、第２の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、第１の修飾オリゴヌクレオチドのうちの等しい長さの部分と少なくとも９０％相補的である少なくとも８つの核酸塩基の相補的領域を含む、第２のオリゴマー化合物と、
を含む。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である。

【0183】

特定の実施形態では、二本鎖オリゴマーは、
８～８０個の連結ヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物であって、第１の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号２１～３３２のいずれかの核酸塩基配列の少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、または１８個の連続した核酸塩基を含み、各チミンが、ウラシルによって置き換えられている、第１のオリゴマー化合物と、
８～８０個の連結ヌクレオシドからなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物であって、第２の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、第１の修飾オリゴヌクレオチドのうちの等しい長さの部分と少なくとも９０％相補的である少なくとも８つの核酸塩基の相補的領域を含む、第２のオリゴマー化合物と、
を含む。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列は、ＵＮＣ１３Ａ核酸のうちの等しい長さの部分と少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％、または１００％相補的である。

【0184】

特定の実施形態では、第１のオリゴマー化合物は、アンチセンス化合物である。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、第２のオリゴマー化合物は、センス化合物である。特定の実施形態では、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、センスオリゴヌクレオチドである。

【0185】

特定の実施形態では、二本鎖オリゴマーは、
１８～８０個の連結ヌクレオシドからなる第１の修飾オリゴヌクレオチドを含む第１のオリゴマー化合物であって、第１の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、配列番号２１～３３２のいずれかの核酸塩基配列を含み、各チミンが、ウラシルによって置き換えられている、第１のオリゴマー化合物と、
１８～８０個の連結ヌクレオシドからなる第２の修飾オリゴヌクレオチドを含む第２のオリゴマー化合物であって、第２の修飾オリゴヌクレオチドの核酸塩基配列が、第１の修飾オリゴヌクレオチドのうちの等しい長さの部分と少なくとも９０％相補的である少なくとも１６個の核酸塩基の相補的領域を含む、第２のオリゴマー化合物と、
を含む。

【0186】

特定の実施形態では、第１のオリゴマー化合物は、アンチセンス化合物である。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチドである。特定の実施形態では、第２のオリゴマー化合物は、センス化合物である。特定の実施形態では、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、センスオリゴヌクレオチドである。

【0187】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドは、修飾糖部分を含み得る。適切な修飾糖部分の例としては、限定されないが、二環式糖部分（－Ｏ－ＣＨ２－及び－Ｏ－ＣＨ（ＣＨ３）－から選択される２’－４’架橋など）ならびに非二環式糖部分（２’－ＭＯＥ糖部分、２’－Ｆ糖部分、２’－ＯＭｅ糖部分、または２’－ＮＭＡ糖部分など）が挙げられる。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの少なくとも８０％、少なくとも９０％、または１００％は、２’－Ｆ及び２’－ＯＭｅから選択される修飾糖部分を含む。

【0188】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドは、糖代替部分を含み得る。適切な糖代替部分の例としては、限定されないが、モルホリノ、ペプチド核酸（ＰＮＡ）、グリコール核酸（ＧＮＡ）、及び非架橋型核酸（ＵＮＡ）が挙げられる。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのヌクレオシドは、糖代替部分を含み、この糖代替部分は、ＧＮＡであり得る。

【0189】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのインターヌクレオシド結合は、修飾インターヌクレオシド結合を含み得る。特定の実施形態では、修飾インターヌクレオシド結合は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である。特定の実施形態では、第１の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端及び／または３’末端から１つ目、２つ目、または３つ目のインターヌクレオシド結合のうちの少なくとも１つは、ホスホロチオエート結合を含む。特定の実施形態では、第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端及び／または３’末端から１つ目、２つ目、または３つ目のインターヌクレオシド結合のうちの少なくとも１つは、ホスホロチオエート結合を含む。

【0190】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つのインターヌクレオシド結合は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合を含み得る。

【0191】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合またはホスホロチオエートインターヌクレオシド結合から独立して選択され得る。

【0192】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチド及び／または第２の修飾オリゴヌクレオチドの少なくとも１つの核酸塩基は、修飾核酸塩基であり得る。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、５－メチルシトシンである。

【0193】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、５’最末端ヌクレオシドの５’位に結合した安定化リン酸基を含み得る。特定の実施形態では、安定化リン酸基は、シクロプロピルホスホネートまたは（Ｅ）－ビニルホスホネートを含む。

【0194】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第１の修飾オリゴヌクレオチドは、コンジュゲート基を含み得る。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、コンジュゲートリンカー及びコンジュゲート部分を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、第１の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端において第１の修飾オリゴヌクレオチドに結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、第１の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端において当該修飾オリゴヌクレオチドに結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｎ－アセチルガラクトサミンを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、トランスフェリン受容体（ＴｆＲ）（ＴｆＲ１及びＣＤ７１としても知られる）に親和性を有する細胞標的化部分を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、抗ＴｆＲ１抗体またはその断片を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なタンパク質またはペプチドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なアプタマーを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、Ｃ５アルキル、Ｃ２２アルケニル、Ｃ２０アルケニル、Ｃ１６アルケニル、Ｃ１０アルケニル、Ｃ２１アルケニル、Ｃ１９アルケニル、Ｃ１８アルケニル、Ｃ１５アルケニル、Ｃ１４アルケニル、Ｃ１３アルケニル、Ｃ１２アルケニル、Ｃ１１アルケニル、Ｃ９アルケニル、Ｃ８アルケニル、Ｃ７アルケニル、Ｃ６アルケニル、またはＣ５アルケニルのいずれかから選択されるコンジュゲート部分を含み得る。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、またはＣ５アルキルのいずれかから選択されるコンジュゲート部分を含み得、アルキル鎖は、１つ以上の不飽和結合を有する。

【0195】

本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかでは、第２の修飾オリゴヌクレオチドは、コンジュゲート基を含み得る。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、コンジュゲートリンカー及びコンジュゲート部分を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、第２の修飾オリゴヌクレオチドの５’末端において第２の修飾オリゴヌクレオチドに結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、第２の修飾オリゴヌクレオチドの３’末端において当該修飾オリゴヌクレオチドに結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｎ－アセチルガラクトサミンを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、トランスフェリン受容体（ＴｆＲ）（ＴｆＲ１及びＣＤ７１としても知られる）に親和性を有する細胞標的化部分を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、抗ＴｆＲ１抗体またはその断片を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なタンパク質またはペプチドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なアプタマーを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、Ｃ５アルキル、Ｃ２２アルケニル、Ｃ２０アルケニル、Ｃ１６アルケニル、Ｃ１０アルケニル、Ｃ２１アルケニル、Ｃ１９アルケニル、Ｃ１８アルケニル、Ｃ１５アルケニル、Ｃ１４アルケニル、Ｃ１３アルケニル、Ｃ１２アルケニル、Ｃ１１アルケニル、Ｃ９アルケニル、Ｃ８アルケニル、Ｃ７アルケニル、Ｃ６アルケニル、またはＣ５アルケニルのいずれかから選択されるコンジュゲート部分を含み得る。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、またはＣ５アルキルのいずれかから選択されるコンジュゲート部分を含み得、アルキル鎖は、１つ以上の不飽和結合を有する。

【0196】

特定の実施形態では、アンチセンス剤は、アンチセンス化合物を含み、アンチセンス化合物は、本明細書に記載のオリゴマー化合物または二本鎖オリゴマーを含む。特定の実施形態では、アンチセンス剤（本明細書に記載のオリゴマー化合物または二本鎖オリゴマーを含み得る）は、ＲＩＳＣ／Ａｇｏ２の活性化を介してＵＮＣ１３Ａ核酸の量を調節することが可能なＲＮＡｉ剤である。

【0197】

特定の実施形態は、２つ以上の二本鎖オリゴマーを含むオリゴマー剤を提供する。特定の実施形態では、オリゴマー剤は、本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかを２つ以上含み得る。特定の実施形態では、オリゴマー剤は、同じ二本鎖オリゴマーを２つ以上含み、この二本鎖オリゴマーは、本明細書に記載の二本鎖オリゴマーのいずれかであり得る。特定の実施形態では、２つ以上の二本鎖オリゴマーは、一緒に連結される。特定の実施形態では、２つ以上の二本鎖オリゴマーは、共有結合で一緒に連結される。特定の実施形態では、２つ以上の二本鎖オリゴマーの第２の修飾オリゴヌクレオチは、共有結合で一緒に連結される。特定の実施形態では、２つ以上の二本鎖オリゴマーの第２の修飾オリゴヌクレオチドは、それらの３’末端において共有結合で一緒に連結される。特定の実施形態では、２つ以上の二本鎖オリゴマーは、グリコールリンカー（テトラエチレングリコールリンカーなど）によって共有結合で一緒に連結される。特定のそのような化合物については、例えば、Ａｌｔｅｒｍａｎ，ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ Ｂｉｏｔｅｃｈ．，３７：８４４－８９４，２０１９に記載されている。

【0198】

Ｉ．特定のオリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、本発明で提供するのは、連結ヌクレオシドからなるオリゴヌクレオチドを含むオリゴマー化合物である。オリゴヌクレオチドは、非修飾オリゴヌクレオチド（ＲＮＡまたはＤＮＡ）であっても、修飾オリゴヌクレオチドであってもよい。修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾ＲＮＡまたは非修飾ＤＮＡに対する修飾を少なくとも１つ含む。すなわち、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾ヌクレオシド（修飾糖部分及び／または修飾核酸塩基を含むヌクレオシド）を少なくとも１つ、及び／または修飾インターヌクレオシド結合を少なくとも１つ含む。以下では、修飾オリゴヌクレオチドにおける使用に適した特定の修飾ヌクレオシド及び修飾インターヌクレオシド結合について記載される。

【0199】

Ａ．特定の修飾ヌクレオシド
修飾ヌクレオシドは、修飾糖部分、修飾核酸塩基、または修飾糖部分及び修飾核酸塩基の両方を含む。特定の実施形態では、下記の修飾糖部分及び／または下記の修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドが、修飾オリゴヌクレオチドに導入され得る。

【0200】

１．特定の糖部分
特定の実施形態では、修飾糖部分は、非二環式の修飾糖部分である。特定の実施形態では、修飾糖部分は、二環式または三環式の糖部分である。特定の実施形態では、修飾糖部分は、糖代替部分である。このような糖代替部分は、他の種類の修飾糖部分の置換に対応する置換を１つ以上含んでよい。

【0201】

特定の実施形態では、修飾糖部分は、置換基を１つ以上有するフラノシル環を含む非二環式の修飾糖部分であり、その置換基には、そのフラノシル環のうちの２つの原子を架橋して、二環式構造を形成させるものは存在しない。このような非架橋置換基は、そのフラノシルのいずれの位置にあってもよく、２’位、３’位、４’位及び／または５’位にある置換基が挙げられるが、これらに限らない。特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分の、１つ以上の非架橋置換基は、分岐状のものである。非二環式の修飾糖部分に適する２’－置換基の例としては、２’－Ｆ、２’－ＯＣＨ_３（「ＯＭｅ」または「Ｏ－メチル」）、２’－Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＣＨ_３（「ＭＯＥ」または「Ｏ－メトキシエチル」）、及び２’－Ｏ－Ｎ－アルキルアセトアミド（例えば、２’－Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミド（「ＮＭＡ」）、２’－Ｏ－Ｎ－ジメチルアセトアミド、２’－Ｏ－Ｎ－エチルアセトアミド、または２’－Ｏ－Ｎ－プロピルアセトアミド）が挙げられるが、これらに限らない。例えば、Ｕ．Ｓ．６，１４７，２００，Ｐｒａｋａｓｈ ｅｔ ａｌ．，２００３，Ｏｒｇ．Ｌｅｔｔ．，５，４０３－６を参照のこと。以下には、「２’－Ｏ－Ｎ－メチルアセトアミドヌクレオシド」、すなわち「２’－ＮＭＡヌクレオシド」が示される：

【0202】

【化1】

【0203】

特定の実施形態では、２’－置換基は、ハロ、アリル、アミノ、アジド、ＳＨ、ＣＮ、ＯＣＮ、ＣＦ_３、ＯＣＦ_３、Ｏ－Ｃ_１－Ｃ_１０アルコキシ、Ｏ－Ｃ_１－Ｃ_１０置換アルコキシ、Ｏ－Ｃ_１－Ｃ_１０アルキル、Ｏ－Ｃ_１－Ｃ_１０置換アルキル、Ｓ－アルキル、Ｎ（Ｒ_ｍ）－アルキル、Ｏ－アルケニル、Ｓ－アルケニル、Ｎ（Ｒ_ｍ）－アルケニル、Ｏ－アルキニル、Ｓ－アルキニル、Ｎ（Ｒ_ｍ）－アルキニル、Ｏ－アルキレニル－Ｏ－アルキル、アルキニル、アルカリル、アラルキル、Ｏ－アルカリル、Ｏ－アラルキル、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＳＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ）またはＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ）（式中、各Ｒ_ｍ及びＲ_ｎは独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のＣ_１－Ｃ_１０アルキルである）、－Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（ＣＨ_３）_２（「ＤＭＡＯＥ」）、２’－Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２（「ＤＭＡＥＯＥ」）、ならびにＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．６，５３１，５８４、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，８５９，２２１及びＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．６，００５，０８７に記載されているような２’－置換基の中から選択されている。これらの２’－置換基の特定の実施形態は、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ（ＮＯ_２）、チオール、チオアルコキシ、チオアルキル、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルの中から独立して選択した１つ以上の置換基でさらに置換されていることができる。特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分は、３’位に置換基を含む。修飾糖部分の３’位に適した置換基の例としては、限定されないが、アルコキシ（例えば、メトキシ）、アルキル（例えば、メチル、エチル）が挙げられる。特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分は、４’位に置換基を含む。非二環式の修飾糖部分に適する４’－置換基の例としては、アルコキシ（例えばメトキシ）、アルキル、及びＭａｎｏｈａｒａｎらのＷＯ２０１５／１０６１２８に記載されているような基が挙げられるが、これらに限らない。非二環式の修飾糖部分に適する５’－置換基の例としては、５’－メチル（ＲまたはＳ）、５’－ビニル、エチル、及び５’－メトキシが挙げられるが、これらに限らない。特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分は、２つ以上の非架橋糖置換基、例えば２’－Ｆ－５’－メチル糖部分、ならびに、ＭｉｇａｗａらのＷＯ２００８／１０１１５７及びＲａｊｅｅｖらのＵＳ２０１３／０２０３８３６に記載されている修飾糖部分及び修飾ヌクレオシドを含む。

【0204】

特定の実施形態では、２’－置換非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＮＨ_２、Ｎ_３、ＯＣＦ_３、ＯＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_３ＮＨ_２、ＣＨ_２ＣＨ＝ＣＨ_２、ＯＣＨ_２ＣＨ＝ＣＨ_２、ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＳＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ）、Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２及びＮ－置換アセトアミド（ＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｒ_ｍ）（Ｒ_ｎ））（式中、各Ｒ_ｍ及びＲ_ｎは独立して、Ｈ、アミノ保護基、または置換もしくは非置換のＣ_１－Ｃ_１０アルキルであり、例えば、ＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｈ）ＣＨ_３（「ＮＭＡ」）である）から選択した非架橋２’－置換基を含む糖部分を含む。

【0205】

特定の実施形態では、２’－置換ヌクレオシドである非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＦ_３、ＯＣＨ_３、ＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＳＣＨ_３、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（ＣＨ_３）_２、Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２、Ｏ（ＣＨ_２）_２ＯＮ（ＣＨ_３）_２（「ＤＭＡＯＥ」）、Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｏ（ＣＨ_２）_２Ｎ（ＣＨ_３）_２（「ＤＭＡＥＯＥ」）、及びＯＣＨ_２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｈ）ＣＨ_３（「ＮＭＡ」）から選択した非架橋２’－置換基を含む糖部分を含む。

【0206】

特定の実施形態では、２’－置換非二環式修飾ヌクレオシドは、Ｆ、ＯＣＨ_３及びＯＣＨ_２ＣＨ_２ＯＣＨ_３、ならびにＯＣＨ２Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｈ）ＣＨ３から選択した非架橋２’－置換基を含む糖部分を含む。

【0207】

特定の実施形態では、修飾フラノシル糖部分、及びそのような修飾フラノシル糖部分が導入されたヌクレオシドは、異性配置によってさらに定義される。例えば、２’－デオキシフラノシル糖部分は、天然起源のβ－Ｄ－デオキシリボシル配置以外にも７つの異性配置をとり得る。そのような修飾糖部分については、例えば、ＷＯ２０１９／１５７５３１に記載されており、当該文献は、参照によって本明細書に組み込まれる。２’修飾糖部分は、２’－デオキシフラノシル糖部分と比較して２’位に追加の立体中心を有する。したがって、そのような糖部分がとり得る異性配置は全部で１６種類存在する。本明細書に記載の２’修飾糖部分は、別段の指定がない限り、β－Ｄ－リボシル異性配置をとる。

【0208】

特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分は、４’位に置換基を含む。修飾糖部分の４’位に適した置換基の例としては、限定されないが、アルコキシ（例えば、メトキシ）、アルキル、及びＭａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，ＷＯ２０１５／１０６１２８に記載のものが挙げられる。

【0209】

特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分は、３’位に置換基を含む。修飾糖部分の３’位に適した置換基の例としては、限定されないが、アルコキシ（例えば、メトキシ）及びアルキル（例えば、メチル、エチル）が挙げられる。

【0210】

特定の実施形態では、非二環式の修飾糖部分は、５’位に置換基を含む。修飾糖部分の５’位に適した置換基の例としては、限定されないが、ビニル、アルコキシ（例えば、メトキシ）、及びアルキル（例えば、メチル（ＲまたはＳ）、エチル）が挙げられる。

【0211】

天然起源の核酸では、糖は、互いに３’→５’で連結されている。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、代替位置（例えば、２’位、逆位５’→３’）で連結された１つ以上のヌクレオシドまたは糖部分を含む。例えば、結合が２’位に対するものである場合、２’－置換基は、代わりに３’位に存在し得る。

【0212】

特定の修飾糖部分は、フラノシル環の２つの原子を架橋して、第２の環を形成することにより、二環式糖部分をもたらす置換を含む。そのような二環式糖部分を含むヌクレオシドは、二環式ヌクレオシド（ＢＮＡ）、架橋型ヌクレオチド、または立体配座的に拘束されたヌクレオチド（ＣＲＮ）と称されている。特定のそのような化合物については、米国特許公開公報第２０１３／０１９０３８３号及びＰＣＴ公開公報ＷＯ２０１３／０３６８６８に記載されている。特定のこのような実施形態では、その二環式糖部分は、４’フラノース環原子と２’フラノース環原子の間に架橋を含む。特定のそのような実施形態では、フラノース環は、リボース環である。４’から２’までを架橋するこのような糖置換基の例としては、４’－ＣＨ_２－２’、４’－（ＣＨ_２）_２－２’、４’－（ＣＨ_２）_３－２’、４’－ＣＨ_２－Ｏ－２’（「ＬＮＡ」）、４’－ＣＨ_２－Ｓ－２’、４’－（ＣＨ_２）_２－Ｏ－２’（「ＥＮＡ」）、４’－ＣＨ（ＣＨ_３）－Ｏ－２’（Ｓ配置をとる場合、「拘束エチル」または「ｃＥｔ」という）、４’－ＣＨ_２－Ｏ－ＣＨ_２－２’、４’－ＣＨ_２－Ｎ（Ｒ）－２’、４’－ＣＨ（ＣＨ_２ＯＣＨ_３）－Ｏ－２’（「拘束ＭＯＥ」または「ｃＭＯＥ」）及びその類似体（例えば、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．７，３９９，８４５、ＢｈａｔらのＵ．Ｓ．７，５６９，６８６、ＳｗａｙｚｅらのＵ．Ｓ．７，７４１，４５７及びＳｗａｙｚｅらのＵ．Ｓ．８，０２２，１９３を参照されたい）、４’－Ｃ（ＣＨ_３）（ＣＨ_３）－Ｏ－２’及びその類似体（例えば、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，２７８，２８３を参照されたい）、４’－ＣＨ_２－Ｎ（ＯＣＨ_３）－２’及びその類似体（例えば、ＰｒａｋａｓｈらのＵ．Ｓ．８，２７８，４２５を参照されたい）、４’－ＣＨ_２－Ｏ－Ｎ（ＣＨ_３）－２’（例えば、ＡｌｌｅｒｓｏｎらのＵ．Ｓ．７，６９６，３４５及びＡｌｌｅｒｓｏｎらのＵ．Ｓ．８，１２４，７４５を参照されたい）、４’－ＣＨ_２－Ｃ（Ｈ）（ＣＨ_３）－２’（例えば、Ｚｈｏｕ，ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００９，７４，１１８－１３４を参照されたい）、４’－ＣＨ_２－Ｃ（＝ＣＨ_２）－２’及びその類似体（例えば、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，２７８，４２６を参照されたい）、４’－Ｃ（Ｒ_ａＲ_ｂ）－Ｎ（Ｒ）－Ｏ－２’、４’－Ｃ（Ｒ_ａＲ_ｂ）－Ｏ－Ｎ（Ｒ）－２’、４’－ＣＨ_２－Ｏ－Ｎ（Ｒ）－２’、ならびに４’－ＣＨ_２－Ｎ（Ｒ）－Ｏ－２’（式中、各Ｒ、Ｒ_ａ及びＲ_ｂは独立して、Ｈ、保護基またはＣ_１－Ｃ_１２アルキルである）（例えば、ＩｍａｎｉｓｈｉらのＵ．Ｓ．７，４２７，６７２を参照されたい）が挙げられるが、これらに限らない。

【0213】

特定の実施形態では、このような４’から２’までの架橋部は独立して、－［Ｃ（Ｒ_ａ）（Ｒ_ｂ）］_ｎ－、－［Ｃ（Ｒ_ａ）（Ｒ_ｂ）］_ｎ－Ｏ－、－Ｃ（Ｒ_ａ）＝Ｃ（Ｒ_ｂ）－、－Ｃ（Ｒ_ａ）＝Ｎ－、－Ｃ（＝ＮＲ_ａ）－、－Ｃ（＝Ｏ）－、－Ｃ（＝Ｓ）－、－Ｏ－、－Ｓｉ（Ｒ_ａ）_２－、－Ｓ（＝Ｏ）_ｘ－及び－Ｎ（Ｒ_ａ）－から独立して選択した１～４個の連結基を含み、
式中、
ｘは、０、１または２であり、
ｎは、１、２、３または４であり、
各Ｒ_ａ及びＲ_ｂは独立して、Ｈ、保護基、ヒドロキシル、Ｃ_１－Ｃ_１２アルキル、置換Ｃ_１－Ｃ_１２アルキル、Ｃ_２－Ｃ_１２アルケニル、置換Ｃ_２－Ｃ_１２アルケニル、Ｃ_２－Ｃ_１２アルキニル、置換Ｃ_２－Ｃ_１２アルキニル、Ｃ_５－Ｃ_２０アリール、置換Ｃ_５－Ｃ_２０アリール、複素環式ラジカル、置換複素環式ラジカル、ヘテロアリール、置換ヘテロアリール、Ｃ_５－Ｃ_７脂環式ラジカル、置換Ｃ_５－Ｃ_７脂環式ラジカル、ハロゲン、ＯＪ_１、ＮＪ_１Ｊ_２、ＳＪ_１、Ｎ_３、ＣＯＯＪ_１、アシル（Ｃ（＝Ｏ）－Ｈ）、置換アシル、ＣＮ、スルホニル（Ｓ（＝Ｏ）_２－Ｊ_１）またはスルホキシル（Ｓ（＝Ｏ）－Ｊ_１）であり、
各Ｊ_１及びＪ_２は独立して、Ｈ、Ｃ_１－Ｃ_１２アルキル、置換Ｃ_１－Ｃ_１２アルキル、Ｃ_２－Ｃ_１２アルケニル、置換Ｃ_２－Ｃ_１２アルケニル、Ｃ_２－Ｃ_１２アルキニル、置換Ｃ_２－Ｃ_１２アルキニル、Ｃ_５－Ｃ_２０アリール、置換Ｃ_５－Ｃ_２０アリール、アシル（Ｃ（＝Ｏ）－Ｈ）、置換アシル、複素環式ラジカル、置換複素環式ラジカル、Ｃ_１－Ｃ_１２アミノアルキル、置換Ｃ_１－Ｃ_１２アミノアルキルまたは保護基である。

【0214】

さらなる二環式糖部分は、当該技術分野において知られており、例えば、Ｆｒｅｉｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９７，２５（２２），４４２９－４４４３、Ａｌｂａｅｋ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，２００６，７１，７７３１－７７４０、Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｃｏｍｍｕｎ．，１９９８，４，４５５－４５６、Ｋｏｓｈｋｉｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９８，５４，３６０７－３６３０、Ｗａｈｌｅｓｔｅｄｔ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．Ｕ．Ｓ．Ａ．，２０００，９７，５６３３－５６３８、Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９８，８，２２１９－２２２２、Ｓｉｎｇｈ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９８，６３，１００３５－１００３９、Ｓｒｉｖａｓｔａｖａ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．，２００７，１２９，８３６２－８３７９、Ｅｌａｙａｄｉ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｉｎｖｅｎｓ．Ｄｒｕｇｓ，２００１，２，５５８－５６１、Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｃｈｅｍ．Ｂｉｏｌ．，２００１，８，１－７、Ｏｒｕｍ ｅｔ ａｌ．，Ｃｕｒｒ．Ｏｐｉｎｉｏｎ Ｍｏｌ．Ｔｈｅｒ．，２００１，３，２３９－２４３、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．７，０５３，２０７、ＩｍａｎｉｓｈｉらのＵ．Ｓ．６，２６８，４９０、ＩｍａｎｉｓｈｉらのＵ．Ｓ．６，７７０，７４８、ＩｍａｎｉｓｈｉらのＵ．Ｓ．ＲＥ４４，７７９、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．６，７９４，４９９、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．６，６７０，４６１、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．７，０３４，１３３、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．８，０８０，６４４、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．８，０３４，９０９、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．８，１５３，３６５、ＷｅｎｇｅｌらのＵ．Ｓ．７，５７２，５８２、ＲａｍａｓａｍｙらのＵ．Ｓ．６，５２５，１９１、ＴｏｒｓｔｅｎらのＷＯ２００４／１０６３５６、ＷｅｎｇｅｌらのＷＯ１９９９／０１４２２６、ＳｅｔｈらのＷＯ２００７／１３４１８１、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．７，５４７，６８４、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．７，６６６，８５４、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，０８８，７４６、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．７，７５０，１３１、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，０３０，４６７、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，２６８，９８０、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，５４６，５５６、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，５３０，６４０、ＭｉｇａｗａらのＵ．Ｓ．９，０１２，４２１、ＳｅｔｈらのＵ．Ｓ．８，５０１，８０５、ＡｌｌｅｒｓｏｎらのＵＳ２００８／００３９６１８、及びＭｉｇａｗａらのＵＳ２０１５／０１９１７２７を参照されたい。特定の実施形態では、二環式糖部分、及びそのような二環式糖部分が導入されたヌクレオシドは、異性体の配置によってさらに定義されている。例えば、ＬＮＡヌクレオシド（本明細書に説明されている）は、α－Ｌ配置であっても、β－Ｄ配置であってもよい。

【0215】

【化2】

【0216】

α－Ｌ－メチレンオキシ（４’－ＣＨ_２－Ｏ－２’）またはα－Ｌ－ＬＮＡの二環式ヌクレオシドは、アンチセンス活性を示すオリゴヌクレオチドに導入されてきている（Ｆｒｉｅｄｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，２００３，２１，６３６５－６３７２）。架橋型核酸をｓｉＲＮＡに付加すると、血清中でのｓｉＲＮＡ安定性が向上すると共に、オフターゲット効果が減少することが示されている（Ｅｌｍｅｎ，Ｊ．ｅｔ ａｌ．，（２００５）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３３（１）：４３９－４４７、Ｍｏｏｋ，ＯＲ．ｅｔ ａｌ．，（２００７）Ｍａｌ Ｃａｎｅ Ｔｈｅｒ ６（３）：８３３－８４３、Ｇｒｕｎｗｅｌｌｅｒ，Ａ．ｅｔ ａｌ．，（２００３）Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ３１（１２）：３１８５－３１９３）。本明細書では、二環式ヌクレオシドという一般的な記載には、両方の異性体配置が含まれる。所定の二環式ヌクレオシド（例えばＬＮＡまたはｃＥｔ）の位置が、本発明の例示の実施形態で特定されている場合、別段の定めのない限り、それらはβ－Ｄ配置である。

【0217】

特定の実施形態では、修飾糖部分は、１つ以上の非架橋糖置換基と、１つ以上の架橋糖置換基（例えば、５’－置換糖と４’－２’架橋糖）を含む。

【0218】

特定の実施形態では、修飾糖部分は、糖代替部分である。特定のこのような実施形態では、その糖部分の酸素原子は、例えば、硫黄原子、炭素原子または窒素原子で置き換えられている。特定のこのような実施形態では、このような修飾糖部分は、本明細書に記載されているような架橋置換基及び／または非架橋置換基も含む。例えば、特定の糖代替部分は、４’－硫黄原子と、２’位の置換基（例えば、ＢｈａｔらのＵ．Ｓ．７，８７５，７３３及びＢｈａｔらのＵ．Ｓ．７，９３９，６７７を参照されたい）及び／または５’位の置換基を含む。

【0219】

特定の実施形態では、糖代替部分は、５個以外の原子を有する環を含む。例えば、特定の実施形態では、糖代替部分は、６員のテトラヒドロピラン（「ＴＨＰ」）を含む。このようなテトラヒドロピランは、さらに修飾または置換されていてもよい。このような修飾テトラヒドロピランを含むヌクレオシドとしては、ヘキシトール核酸（「ＨＮＡ」）、アニトール核酸（「ＡＮＡ」）、マンニトール核酸（「ＭＮＡ」）（例えば、Ｌｅｕｍａｎｎ，ＣＪ．Ｂｉｏｏｒｇ．＆ Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２００２，１０，８４１－８５４を参照されたい）、フルオロＨＮＡ

【0220】

【化3】

【0221】

（「Ｆ－ＨＮＡ」、例えば、ＳｗａｙｚｅらのＵ．Ｓ．８，０８８，９０４、ＳｗａｙｚｅらのＵ．Ｓ．８，４４０，８０３、ＳｗａｙｚｅらのＵ．Ｓ．８，７９６，４３７及びＳｗａｙｚｅらのＵ．Ｓ．９，００５，９０６を参照されたい。Ｆ－ＨＮＡは、Ｆ－ＴＨＰまたは３’－フルオロテトラヒドロピランと称することもできる）、及び以下の式を有する追加の修飾ＴＨＰ化合物を含むヌクレオシドが挙げられるが、これらに限らない。

【0222】

【化4】

【0223】

式中、独立して、当該修飾ＴＨＰヌクレオシドのそれぞれにおいて、
Ｂｘは、核酸塩基部分であり、
Ｔ_３及びＴ_４はそれぞれ独立して、その修飾ＴＨＰヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に連結するインターヌクレオシド連結基であるか、またはＴ_３及びＴ_４のうちの１つは、その修飾ＴＨＰヌクレオシドをオリゴヌクレオチドの残部に連結するインターヌクレオシド連結基であり、Ｔ_３及びＴ_４のうちのもう一方は、Ｈ、ヒドロキシル保護基、コンジュゲート基、または５’もしくは３’末端基であり、
ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６及びｑ_７はそれぞれ独立して、Ｈ、Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、置換Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、Ｃ_２－Ｃ_６アルケニル、置換Ｃ_２－Ｃ_６アルケニル、Ｃ_２－Ｃ_６アルキニルまたは置換Ｃ_２－Ｃ_６アルキニルであり、
Ｒ_１及びＲ_２のそれぞれは独立して、水素、ハロゲン、置換または非置換のアルコキシ、ＮＪ_１Ｊ_２、ＳＪ_１、Ｎ_３、ＯＣ（＝Ｘ）Ｊ_１、ＯＣ（＝Ｘ）ＮＪ_１Ｊ_２、ＮＪ_３Ｃ（＝Ｘ）ＮＪ_１Ｊ_２及びＣＮの中から選択されており、そのＸは、Ｏ、ＳまたはＮＪ_１であり、Ｊ_１、Ｊ_２及びＪ_３はそれぞれ、独立して、ＨまたはＣ_１－Ｃ_６アルキルである。

【0224】

特定の実施形態では、上記の式中、ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６及びｑ_７がそれぞれＨである修飾ＴＨＰヌクレオシドを提供する。特定の実施形態では、ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６及びｑ_７のうちの少なくとも１つは、Ｈ以外である。特定の実施形態では、ｑ_１、ｑ_２、ｑ_３、ｑ_４、ｑ_５、ｑ_６及びｑ_７のうちの少なくとも１つは、メチルである。特定の実施形態では、上記の式中、Ｒ_１及びＲ_２のうちの１つがＦである修飾ＴＨＰヌクレオシドを提供する。特定の実施形態では、Ｒ_１はＦであり、Ｒ_２はＨであり、特定の実施形態では、Ｒ_１はメトキシであり、Ｒ_２はＨであり、特定の実施形態では、Ｒ_１はメトキシエトキシであり、Ｒ_２はＨである。

【0225】

特定の実施形態では、糖代替部分は、６個以上の原子と２つ以上のヘテロ原子を有する環を含む。例えば、モルホリノ糖部分を含むヌクレオシドと、そのヌクレオシドをオリゴヌクレオチドにおいて用いることが報告されている（例えば、Ｂｒａａｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ，２００２，４１，４５０３－４５１０、ならびにＳｕｍｍｅｒｔｏｎらのＵ．Ｓ．５，６９８，６８５、ＳｕｍｍｅｒｔｏｎらのＵ．Ｓ．５，１６６，３１５、ＳｕｍｍｅｒｔｏｎらのＵ．Ｓ．５，１８５，４４４及びＳｕｍｍｅｒｔｏｎらのＵ．Ｓ．５，０３４，５０６を参照されたい）。本明細書で使用する場合、「モルホリノ」という用語は、下記の構造を有する糖代替部分を意味する。

【0226】

【化5】

【0227】

特定の実施形態では、モルホリノは、例えば、上記のモルホリノ構造から、様々な置換基を付加または改変することによって修飾されていてよい。このような糖代替部分は、本明細書では、「修飾モルホリノ」という。

【0228】

特定の実施形態では、糖代替部分は、非環式部分を含む。このような非環式糖代替部分を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドの例としては、ペプチド核酸（「ＰＮＡ」）、非環式ブチル核酸（例えば、Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２０１３，１１，５８５３－５８６５を参照されたい）、ならびにＭａｎｏｈａｒａｎらのＷＯ２０１１／１３３８７６に記載されているヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが挙げられるが、これらに限らない。特定の実施形態では、糖代替部分は、非環式部分を含む。そのような非環式糖代替部分を含むヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドの例としては、限定されないが、ペプチド核酸（「ＰＮＡ」）、非環式ブチル核酸（例えば、Ｋｕｍａｒ ｅｔ ａｌ．，Ｏｒｇ．Ｂｉｏｍｏｌ．Ｃｈｅｍ．，２０１３，１１，５８５３－５８６５を参照のこと）、ならびにＭａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，ＵＳ２０１３／１３０３７８に記載のヌクレオシド及びオリゴヌクレオチドが挙げられる。ＰＮＡ化合物の調製について教示する代表的な米国特許には、限定されないが、米国特許第５，５３９，０８２号、同第５，７１４，３３１号、及び同第５，７１９，２６２号が含まれる。本発明のオリゴヌクレオチドにおける使用に適した追加のＰＮＡ化合物については、例えば、Ｎｉｅｌｓｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９９１，２５４，１４９７－１５００に記載されている。

【0229】

特定の実施形態では、糖代替部分は、ＵＮＡ（非架橋型核酸）ヌクレオシドの「非架橋型」糖構造である。ＵＮＡは非架橋型非環式核酸であり、糖の結合がいずれも除去されて、非架橋型糖代替部分が形成されている。ＵＮＡの調製を教示する代表的な米国公開公報には、限定されないが、米国特許第８，３１４，２２７号、ならびに米国特許公開公報第２０１３／００９６２８９号、同第２０１３／００１１９２２号、及び同第２０１１／０３１３０２０号が含まれ、これらの文献はそれぞれ、その内容全体が参照によって本明細書に組み込まれる。

【0230】

特定の実施形態では、糖代替部分は、以下に示されるＧＮＡ（グリコール核酸）ヌクレオシドに見られるグリセロールである。
（Ｓ）－ＧＮＡ

【0231】

【化6】

【0232】

式中、Ｂｘは、任意の核酸塩基を表す。

【0233】

修飾ヌクレオシドで使用できる多くの他の二環式糖、三環式糖及び糖代替部分は、当該技術分野において知られている。

【0234】

２．特定の修飾核酸塩基
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、非修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含むヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、核酸塩基を含まないヌクレオシド（脱塩基ヌクレオシドという）を１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上のイノシンヌクレオシド（すなわち、ヒポキサンチン核酸塩基を含むヌクレオシド）を含む。

【0235】

特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、５－置換ピリミジン、６－アザピリミジン、アルキル置換ピリミジン、アルキニル置換ピリミジン、アルキル置換プリン、Ｎ－２置換プリン、Ｎ－６置換プリン及びＯ－６置換プリンから選択されている。特定の実施形態では、修飾核酸塩基は、５－メチルシトシン、２－アミノプロピルアデニン、５－ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２－アミノアデニン、６－Ｎ－メチルグアニン、６－Ｎ－メチルアデニン、２－プロピルアデニン、２－チオウラシル、２－チオチミン、２－チオシトシン、５－プロピニル（－Ｃ≡Ｃ－ＣＨ_３）ウラシル、５－プロピニルシトシン、６－アゾウラシル、６－アゾシトシン、６－アゾチミン、５－リボシルウラシル（プソイドウラシル）、４－チオウラシル、８－ハロ、８－アミノ、８－チオール、８－チオアルキル、８－ヒドロキシル、８－アザプリン及びその他の８－置換プリン、５－ハロ、特に、５－ブロモ、５－トリフルオロメチル、５－ハロウラシル及び５－ハロシトシン、７－メチルグアニン、７－メチルアデニン、２－Ｆ－アデニン、２－アミノアデニン、７－デアザグアニン、７－デアザアデニン、３－デアザグアニン、３－デアザアデニン、６－Ｎ－ベンゾイルアデニン、２－Ｎ－イソブチリルグアニン、４－Ｎ－ベンゾイルシトシン、４－Ｎ－ベンゾイルウラシル、５－メチル４－Ｎ－ベンゾイルシトシン、５－メチル４－Ｎ－ベンゾイルウラシル、ユニバーサル塩基、疎水性塩基、プロミスキャス塩基、サイズ拡張型塩基、ならびにフルオロ化塩基から選択されている。さらなる修飾核酸塩基としては、１，３－ジアザフェノキサジン－２－オン、１，３－ジアザフェノチアジン－２－オン及び９－（２－アミノエトキシ）－１，３－ジアザフェノキサジン－２－オン（Ｇクランプ）のような三環式ピリミジンが挙げられる。修飾核酸塩基としては、そのプリン塩基またはピリミジン塩基が、他の複素環、例えば、７－デアザ－アデニン、７－デアザグアノシン、２－アミノピリジン及び２－ピリドンに置き換わっているものも挙げてよい。さらなる核酸塩基としては、ＭｅｒｉｇａｎらのＵ．Ｓ．３，６８７，８０８に開示されているもの、Ｔｈｅ Ｃｏｎｃｉｓｅ Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ Ｏｆ Ｐｏｌｙｍｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ａｎｄ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ，Ｊ．Ｉ．，Ｅｄ．，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，１９９０，８５８－８５９、Ｅｎｇｌｉｓｃｈ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ Ｃｈｅｍｉｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１，３０，６１３、Ｓａｎｇｈｖｉ，Ｙ．Ｓ．，Ｃｈａｐｔｅｒ１５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，Ｃｒｏｏｋｅ，Ｓ．Ｔ．ａｎｄ Ｌｅｂｌｅｕ，Ｂ．，Ｅｄｓ．，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，１９９３，２７３－２８８に開示されているもの、及びＣｈａｐｔｅｒｓ ６ ａｎｄ １５，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｄｒｕｇ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｒｏｏｋｅ Ｓ．Ｔ．，Ｅｄ．，ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，２００８，１６３－１６６ ａｎｄ ４４２－４４３に開示されているものが挙げられる。

【0236】

上記の修飾核酸塩基のうちの特定の塩基の調製、及びその他の修飾核酸塩基を教示している刊行物としては、ＭａｎｏｈａｒａｎらのＵＳ２００３／０１５８４０３、ＭａｎｏｈａｒａｎらのＵＳ２００３／０１７５９０６、ＤｉｎｈらのＵ．Ｓ．４，８４５，２０５、ＳｐｉｅｌｖｏｇｅｌらのＵ．Ｓ．５，１３０，３０２、ＲｏｇｅｒｓらのＵ．Ｓ．５，１３４，０６６、ＢｉｓｃｈｏｆｂｅｒｇｅｒらのＵ．Ｓ．５，１７５，２７３、ＵｒｄｅａらのＵ．Ｓ．５，３６７，０６６、ＢｅｎｎｅｒらのＵ．Ｓ．５，４３２，２７２、ＭａｔｔｅｕｃｃｉらのＵ．Ｓ．５，４３４，２５７、ＧｍｅｉｎｅｒらのＵ．Ｓ．５，４５７，１８７、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，４５９，２５５、ＦｒｏｅｈｌｅｒらのＵ．Ｓ．５，４８４，９０８、ＭａｔｔｅｕｃｃｉらのＵ．Ｓ．５，５０２，１７７、ＨａｗｋｉｎｓらのＵ．Ｓ．５，５２５，７１１、ＨａｒａｌａｍｂｉｄｉｓらのＵ．Ｓ．５，５５２，５４０、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，５８７，４６９、ＦｒｏｅｈｌｅｒらのＵ．Ｓ．５，５９４，１２１、ＳｗｉｔｚｅｒらのＵ．Ｓ．５，５９６，０９１、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，６１４，６１７、ＦｒｏｅｈｌｅｒらのＵ．Ｓ．５，６４５，９８５、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，６８１，９４１、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，８１１，５３４、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，７５０，６９２、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，９４８，９０３、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，５８７，４７０、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，４５７，１９１、ＭａｔｔｅｕｃｃｉらのＵ．Ｓ．５，７６３，５８８、ＦｒｏｅｈｌｅｒらのＵ．Ｓ．５，８３０，６５３、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．５，８０８，０２７、ＣｏｏｋらのＵ．Ｓ．６，１６６，１９９及びＭａｔｔｅｕｃｃｉらのＵ．Ｓ．６，００５，０９６が挙げられるが、これらに限らない。

【0237】

３．特定の修飾インターヌクレオシド結合
ＲＮＡ及びＤＮＡの天然起源のインターヌクレオシド結合は、３’→５’ホスホジエステル結合である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドは、１つ以上の修飾インターヌクレオシド結合を用いて、連結し合っていてよい。インターヌクレオシド連結基の２つの主な種類は、リン原子の有無によって定義される。リンを含む代表的なインターヌクレオシド結合としては、ホスホジエステル結合（「Ｐ＝Ｏ」）（非修飾結合または天然の結合ともいう）、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ホスホロアミデート及びホスホロチオエート（「Ｐ＝Ｓ」）、ならびにホスホロジチオエート（「ＨＳ－Ｐ＝Ｓ」）を含むリン酸エステルが挙げられるが、これらに限らない。リンを含まない代表的なインターヌクレオシド連結基としては、メチレンメチルイミノ（－ＣＨ_２－Ｎ（ＣＨ_３）－Ｏ－ＣＨ_２－）、チオジエステル、チオノカルバメート（－Ｏ－Ｃ（＝Ｏ）（ＮＨ）－Ｓ－）、シロキサン（－Ｏ－ＳｉＨ_２－Ｏ－）及びＮ，Ｎ’－ジメチルヒドラジン（－ＣＨ_２－Ｎ（ＣＨ_３）－Ｎ（ＣＨ_３）－）が挙げられるが、これらに限らない。修飾インターヌクレオシド結合は、天然のリン酸結合と比べて、そのオリゴヌクレオチドのヌクレアーゼ耐性を変化させる目的で、典型的には増大させる目的で用いることができる。特定の実施形態では、キラル原子を有するインターヌクレオシド結合は、ラセミ混合物として、または別々のエナンチオマーとして調製できる。リンを含むかまたはリンを含まないインターヌクレオシド結合の調製方法は、当業者には周知である。

【0238】

特定の実施形態では、修飾インターヌクレオシド結合は、ＷＯ／２０２１／０３０７７８に記載のもののいずれかであり、当該文献は参照によって本明細書に組み込まれる。特定の実施形態では、修飾インターヌクレオシド結合は、式：

【0239】

【化7】

【0240】

を含み、
式中、修飾オリゴヌクレオチドのインターヌクレオシド連結基ごとに独立して、
Ｘは、ＯまたはＳから選択され、
Ｒ_１は、Ｈ、Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、及び置換Ｃ_１－Ｃ_６アルキルから選択され、
Ｔは、ＳＯ_２Ｒ_２、Ｃ（＝Ｏ）Ｒ_３、及びＰ（＝Ｏ）Ｒ_４Ｒ_５から選択され、
Ｒ_２は、アリール、置換アリール、複素環、置換複素環、芳香族複素環、置換芳香族複素環、ジアゾール、置換ジアゾール、Ｃ_１－Ｃ_６アルコキシ、Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、Ｃ_１－Ｃ_６アルケニル、Ｃ_１－Ｃ_６アルキニル、置換Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、置換Ｃ_１－Ｃ_６アルケニル、置換Ｃ_１－Ｃ_６アルキニル、及びコンジュゲート基から選択され、
Ｒ_３は、アリール、置換アリール、ＣＨ_３、Ｎ（ＣＨ_３）_２、ＯＣＨ_３、及びコンジュゲート基から選択され、
Ｒ_４は、ＯＣＨ_３、ＯＨ、Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、置換Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、及びコンジュゲート基から選択され、
Ｒ_５は、ＯＣＨ_３、ＯＨ、Ｃ_１－Ｃ_６アルキル、及び置換Ｃ_１－Ｃ_６アルキルから選択される。

【0241】

特定の実施形態では、修飾インターヌクレオシド結合は、式：

【0242】

【化8】

【0243】

を有するメシルホスホロアミデート連結基を含む。

【0244】

特定の実施形態では、メシルホスホロアミデートインターヌクレオシド結合は、キラル中心を含み得る。特定の実施形態では、（Ｒｐ）及び／または（Ｓｐ）メシルホスホロアミデートを含む修飾オリゴヌクレオチドは、それぞれ下記の式の１つ以上を含み、式中「Ｂ」は核酸塩基を示す。

【0245】

【化9】

【0246】

キラル中心を有する代表的なインターヌクレオシド結合としては、アルキルホスホネート、メシルホスホロアミデート、及びホスホロチオエートが挙げられるが、これらに限らない。キラル中心を有するインターヌクレオシド結合を含む修飾オリゴヌクレオチドは、ステレオランダムなインターヌクレオシド結合を含む修飾オリゴヌクレオチドの集団として、または特定の立体化学的配置のホスホロチオエートもしくは他のキラル中心含有結合を含む修飾オリゴヌクレオチドの集団として調製できる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、そのホスホロチオエートインターヌクレオシド結合のすべてがステレオランダムであるホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの集団は、メシルホスホロアミデートインターヌクレオシド結合を含み、メシルホスホロアミデートインターヌクレオシド結合はすべて、ステレオランダムである。このような修飾オリゴヌクレオチドは、各ホスホロチオエート結合またはメシルホスホロアミデート結合の立体化学的配置がランダムに選択される合成方法を用いて作製できる。しかしその一方では、個々のオリゴヌクレオチド分子のそれぞれの個々のホスホロチオエートまたはメシルホスホロアミデートはそれぞれ、立体配置が定められている。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド集団においては、独立して選択した特定の立体化学的配置である特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合またはメシルホスホロアミデートインターヌクレオシド結合を１つ以上含む修飾オリゴヌクレオチドが富化されている。特定の実施形態では、その特定の配置の特定のホスホロチオエート結合またはメシルホスホロアミデート結合は、その集団内の分子の少なくとも６５％に存在する。特定の実施形態では、その特定の配置の特定のホスホロチオエート結合またはメシルホスホロアミデート結合は、その集団内の分子の少なくとも７０％に存在する。特定の実施形態では、その特定の配置の特定のホスホロチオエート結合またはメシルホスホロアミデート結合は、その集団内の分子の少なくとも８０％に存在する。特定の実施形態では、その特定の配置の特定のホスホロチオエート結合またはメシルホスホロアミデート結合は、その集団内の分子の少なくとも９０％に存在する。特定の実施形態では、その特定の配置の特定のホスホロチオエート結合またはメシルホスホロアミデート結合は、その集団内の分子の少なくとも９９％に存在する。このようなキラル的に富化された修飾オリゴヌクレオチド集団は、当該技術分野において知られている合成方法、例えば、Ｏｋａ ｅｔ ａｌ．，ＪＡＣＳ １２５，８３０７（２００３）、Ｗａｎ ｅｔ ａｌ．Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ．Ｒｅｓ．４２，１３４５６（２０１４）及びＷＯ２０１７／０１５５５５に記載されている方法を用いて作製できる。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド集団においては、（Ｓｐ）配置である示されているホスホロチオエートまたはメシルホスホロアミデートを少なくとも１つ有する修飾オリゴヌクレオチドが富化されている。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド集団においては、（Ｒｐ）配置であるホスホロチオエートまたはメシルホスホロアミデートを少なくとも１つ有する修飾オリゴヌクレオチドが富化さている。特定の実施形態では、（Ｒｐ）ホスホロチオエート及び／または（Ｓｐ）ホスホロチオエートを含む修飾オリゴヌクレオチドはそれぞれ、以下の式のうちの１つ以上を含み、式中、「Ｂ」は、核酸塩基を示している。

【0247】

【化10】

【0248】

別段に示されていない限り、本明細書に記載されている修飾オリゴヌクレオチドのキラルなインターヌクレオシド結合は、ステレオランダムであることも、特定の立体化学的配置であることもできる。

【0249】

中性インターヌクレオシド結合としては、ホスホトリエステル、メチルホスホネート、ＭＭＩ（３’－ＣＨ_２－Ｎ（ＣＨ_３）－Ｏ－５’）、アミド－３（３’－ＣＨ_２－Ｃ（＝Ｏ）－Ｎ（Ｈ）－５’）、アミド－４（３’－ＣＨ_２－Ｎ（Ｈ）－Ｃ（＝Ｏ）－５’）、ホルムアセタール（３’－Ｏ－ＣＨ_２－Ｏ－５’）、メトキシプロピル（ＭＯＰ）、及びチオホルムアセタール（３’－Ｓ－ＣＨ_２－Ｏ－５’）が挙げられるが、これらに限らない。さらなる中性インターヌクレオシド結合としては、シロキサン（ジアルキルシロキサン）、カルボン酸エステル、カルボキサミド、スルフィド、スルホン酸エステル及びアミドを含む非イオン結合が挙げられる（例えば、Ｃａｒｂｏｈｙｄｒａｔｅ Ｍｏｄｉｆｉｃａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｙ．Ｓ．Ｓａｎｇｈｖｉ ａｎｄ Ｐ．Ｄ．Ｃｏｏｋ，Ｅｄｓ．，ＡＣＳ Ｓｙｍｐｏｓｉｕｍ Ｓｅｒｉｅｓ ５８０；Ｃｈａｐｔｅｒｓ ３ ａｎｄ ４，４０－６５を参照されたい）。さらなる中性インターヌクレオシド結合としては、Ｎ、Ｏ、Ｓ及びＣＨ_２を混合した成分部分を含む非イオン結合が挙げられる。

【0250】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、以下に示される逆位ヌクレオシド

【0251】

【化11】

【0252】

を１つ以上含み、
式中、各Ｂｘは、独立して、任意の核酸塩基を表す。

【0253】

特定の実施形態では、逆位ヌクレオシドは末端（すなわち、オリゴヌクレオチドの一方の末端上の最後のヌクレオシド）に位置し、したがって、上に示されるインターヌクレオシド結合が１つのみ存在することになる。特定のそのような実施形態では、追加の特徴（コンジュゲート基など）は、逆位ヌクレオシドに結合され得る。そのような末端逆位ヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドの一方の末端または両方の末端に結合され得る。

【0254】

特定の実施形態では、そのような基は核酸塩基を含まず、本明細書では逆位糖部分と称される。特定の実施形態では、逆位糖部分は末端に位置し（すなわち、オリゴヌクレオチドの一方の末端上の最後のヌクレオシドに結合される）、したがって、上記のインターヌクレオシド結合が１つのみ存在することになる。特定のそのような実施形態では、追加の特徴（コンジュゲート基など）は逆位糖部分に結合され得る。そのような末端逆位糖部分は、オリゴヌクレオチドの一方の末端または両方の末端に結合され得る。

【0255】

特定の実施形態では、核酸は、標準的な３’→５’結合ではなく、２’→５’結合で連結され得る。そのような結合は以下に示されるものであり、

【0256】

【化12】

【0257】

式中、各Ｂｘは、任意の核酸塩基を表す。

【0258】

Ｂ．特定のモチーフ
特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖部分を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基を含む修飾ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾インターヌクレオシド結合を１つ以上含む。このような実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの修飾型、非修飾型及び異なる修飾を有する糖部分、核酸塩基及び／またはインターヌクレオシド結合によって、パターンまたはモチーフが定められる。特定の実施形態では、糖部分、核酸塩基及びインターヌクレオシド結合のパターンはそれぞれ、互いから独立している。したがって、修飾オリゴヌクレオチドは、その糖モチーフ、核酸塩基モチーフ及び／またはインターヌクレオシド結合モチーフによって説明し得る（本明細書で使用する場合、核酸塩基モチーフは、核酸塩基の配列から独立した、核酸塩基への修飾を説明するものである）。

【0259】

１．特定の糖モチーフ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、そのオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って、定められたパターンまたは糖モチーフで配置された修飾糖部分及び／または非修飾糖部分を１種類以上含む。特定の場合では、このような糖モチーフとしては、本明細書で論じられている修飾糖部分のいずれもが挙げられるが、これらに限らない。

【0260】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾糖部分を含む少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、少なくとも１８個、少なくとも１９個、または少なくとも２０個のヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、修飾糖部分は、２’－置換糖部分、二環式糖部分、または糖代替部分から独立して選択される。特定の実施形態では、２’－置換糖部分は、２’－ＭＯＥ糖部分、２’－ＮＭＡ糖部分、２’－ＯＭｅ糖部分、及び２’－Ｆ糖部分から選択される。特定の実施形態では、二環式糖部分は、ｃＥｔ糖部分及びＬＮＡ糖部分から選択される。特定の実施形態では、糖代替部分は、モルホリノ、修飾モルホリノ、ＴＨＰ、及びＦ－ＨＮＡから選択される。

【0261】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは修飾糖部分を含む（「完全に修飾されたオリゴヌクレオチド」）。特定の実施形態では、完全に修飾されたオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、２’－置換糖部分、二環式糖部分、または糖代替部分を含む。特定の実施形態では、２’－置換糖部分は、２’－ＭＯＥ糖部分、２’－ＮＭＡ糖部分、２’－ＯＭｅ糖部分、及び２’－Ｆ糖部分から選択される。特定の実施形態では、二環式糖部分は、ｃＥｔ糖部分及びＬＮＡ糖部分から選択される。特定の実施形態では、糖代替部分は、モルホリノ、修飾モルホリノ、ＴＨＰ、及びＦ－ＨＮＡから選択される。特定の実施形態では、完全に修飾されたオリゴヌクレオチドの各ヌクレオシドは、同じ修飾糖部分を含む（「均一に修飾された糖モチーフ」）。特定の実施形態では、均一に修飾された糖モチーフのヌクレオシド長は７～２０である。特定の実施形態では、均一に修飾された糖モチーフの各ヌクレオシドは、２’－置換糖部分、二環式糖部分、または糖代替部分を含む。特定の実施形態では、２’－置換糖部分は、２’－ＭＯＥ糖部分、２’－ＮＭＡ糖部分、２’－ＯＭｅ糖部分、及び２’－Ｆ糖部分から選択される。特定の実施形態では、二環式糖部分は、ｃＥｔ糖部分及びＬＮＡ糖部分から選択される。特定の実施形態では、糖代替部分は、モルホリノ、修飾モルホリノ、ＴＨＰ、及びＦ－ＨＮＡから選択される。特定の実施形態では、完全に修飾された糖モチーフを少なくとも１つ有する修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、または少なくとも４つの２’－デオキシリボヌクレオシドも含み得る。

【0262】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、５’→３’：ｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅから選択される糖モチーフを有し、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ糖部分を表す。

【0263】

２．特定の核酸塩基モチーフ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、そのオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って、定められたパターンまたはモチーフで配置された修飾核酸塩基及び／または非修飾核酸塩基を含む。特定の実施形態では、各核酸塩基が修飾されている。特定の実施形態では、修飾されている核酸塩基はない。特定の実施形態では、各プリンまたは各ピリミジンが修飾されている。特定の実施形態では、各アデニンが修飾されている。特定の実施形態では、各グアニンが修飾されている。特定の実施形態では、各チミンが修飾されている。特定の実施形態では、各ウラシルが修飾されている。特定の実施形態では、各シトシンが修飾されている。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドのシトシン核酸塩基のいくつかまたはすべては、５－メチルシトシンである。特定の実施形態では、そのシトシン核酸塩基はすべて、５－メチルシトシンであり、その修飾オリゴヌクレオチドの他の核酸塩基はすべて、非修飾核酸塩基である。

【0264】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基のブロックを含む。特定のこのような実施形態では、そのブロックは、そのオリゴヌクレオチドの３’末端にある。特定の実施形態では、そのブロックは、そのオリゴヌクレオチドの３’末端から３ヌクレオシド内にある。特定の実施形態では、そのブロックは、そのオリゴヌクレオチドの５’末端にある。特定の実施形態では、そのブロックは、そのオリゴヌクレオチドの５’末端から３ヌクレオシド内にある。

【0265】

３．特定のインターヌクレオシド結合モチーフ
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、そのオリゴヌクレオチドまたはその領域に沿って、定められたパターンまたはモチーフで配置された修飾インターヌクレオシド結合及び／または非修飾インターヌクレオシド結合を含む。特定の実施形態では、各インターヌクレオシド連結基は、ホスホジエステルインターヌクレオシド結合（Ｐ＝Ｏ）である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド連結基は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合（Ｐ＝Ｓ）である。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドの各インターヌクレオシド結合は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合及びホスホジエステルインターヌクレオシド結合から独立して選択されている。特定の実施形態では、各ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合は、ステレオランダムなホスホロチオエート、（Ｓｐ）ホスホロチオエート及び（Ｒｐ）ホスホロチオエートから独立して選択されている。

【0266】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、少なくとも６つ、少なくとも７つ、少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、少なくとも１８個、または少なくとも１９個のホスホジエステルインターヌクレオシド結合を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、少なくとも５つ、少なくとも６つ、少なくとも７つ、少なくとも８つ、少なくとも９つ、少なくとも１０個、少なくとも１１個、少なくとも１２個、少なくとも１３個、少なくとも１４個、少なくとも１５個、少なくとも１６個、少なくとも１７個、少なくとも１８個、または少なくとも１９個のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を含む。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、少なくとも１つ、少なくとも２つ、少なくとも３つ、少なくとも４つ、または少なくとも５つのホスホジエステルインターヌクレオシド結合を含み、残りのインターヌクレオシド結合は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である。

【0267】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、（５’→３’）：ｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓというインターヌクレオシド結合モチーフを有し、各「ｓ」は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を表す。

【0268】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、１つ以上のメシルホスホロアミデート連結基を含むインターヌクレオシド結合モチーフを有する。特定の実施形態では、本明細書に記載のインターヌクレオシド結合モチーフの１つ以上のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合または１つ以上のホスホジエステルインターヌクレオシド結合は、メシルホスホロアミデート連結基で置き換えられている。

【0269】

Ｃ．特定の長さ
活性を消失させずに、オリゴヌクレオチドの長さを増減させることが可能である。例えば、Ｗｏｏｌｆらの文献（Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ ８９：７３０５－７３０９，１９９２）では、卵母細胞注入モデルで、１３～２５核酸塩基長の一連のオリゴヌクレオチドが、標的ＲＮＡの切断を誘導する能力について試験した。オリゴヌクレオチドの末端近くに８個または１１個のミスマッチ塩基を有する２５核酸塩基長のオリゴヌクレオチドは、ミスマッチを含まないオリゴヌクレオチドよりも低い程度であったものの、標的ＲＮＡの所定の切断を誘導できた。同様に、１３個の核酸塩基のオリゴヌクレオチド（１個または３個のミスマッチを有するものを含む）を用いたところ、標的の所定の切断が行われた。

【0270】

特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド（修飾オリゴヌクレオチドを含む）は、様々な範囲の長さのいずれであることもできる。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、Ｘ～Ｙ個の連結ヌクレオシドからなり、式中、Ｘは、その範囲の最小ヌクレオシド数を表し、Ｙは、その範囲の最大ヌクレオシド数を表す。特定のこのような実施形態では、Ｘ及びＹはそれぞれ独立して、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、３０、３１、３２、３３、３４、３５、３６、３７、３８、３９、４０、４１、４２、４３、４４、４５、４６、４７、４８、４９及び５０から選択されており、ただし、Ｘ≦Ｙとする。例えば、特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１２～１３個、１２～１４個、１２～１５個、１２～１６個、１２～１７個、１２～１８個、１２～１９個、１２～２０個、１２～２１個、１２～２２個、１２～２３個、１２～２４個、１２～２５個、１２～２６個、１２～２７個、１２～２８個、１２～２９個、１２～３０個、１３～１４個、１３～１５個、１３～１６個、１３～１７個、１３～１８個、１３～１９個、１３～２０個、１３～２１個、１３～２２個、１３～２３個、１３～２４個、１３～２５個、１３～２６個、１３～２７個、１３～２８個、１３～２９個、１３～３０個、１４～１５個、１４～１６個、１４～１７個、１４～１８個、１４～１９個、１４～２０個、１４～２１個、１４～２２個、１４～２３個、１４～２４個、１４～２５個、１４～２６個、１４～２７個、１４～２８個、１４～２９個、１４～３０個、１５～１６個、１５～１７個、１５～１８個、１５～１９個、１５～２０個、１５～２１個、１５～２２個、１５～２３個、１５～２４個、１５～２５個、１５～２６個、１５～２７個、１５～２８個、１５～２９個、１５～３０個、１６～１７個、１６～１８個、１６～１９個、１６～２０個、１６～２１個、１６～２２個、１６～２３個、１６～２４個、１６～２５個、１６～２６個、１６～２７個、１６～２８個、１６～２９個、１６～３０個、１７～１８個、１７～１９個、１７～２０個、１７～２１個、１７～２２個、１７～２３個、１７～２４個、１７～２５個、１７～２６個、１７～２７個、１７～２８個、１７～２９個、１７～３０個、１８～１９個、１８～２０個、１８～２１個、１８～２２個、１８～２３個、１８～２４個、１８～２５個、１８～２６個、１８～２７個、１８～２８個、１８～２９個、１８～３０個、１９～２０個、１９～２１個、１９～２２個、１９～２３個、１９～２４個、１９～２５個、１９～２６個、１９～２９個、１９～２８個、１９～２９個、１９～３０個、２０～２１個、２０～２２個、２０～２３個、２０～２４個、２０～２５個、２０～２６個、２０～２７個、２０～２８個、２０～２９個、２０～３０個、２１～２２個、２１～２３個、２１～２４個、２１～２５個、２１～２６個、２１～２７個、２１～２８個、２１～２９個、２１～３０個、２２～２３個、２２～２４個、２２～２５個、２２～２６個、２２～２７個、２２～２８個、２２～２９個、２２～３０個、２３～２４個、２３～２５個、２３～２６個、２３～２７個、２３～２８個、２３～２９個、２３～３０個、２４～２５個、２４～２６個、２４～２７個、２４～２８個、２４～２９個、２４～３０個、２５～２６個、２５～２７個、２５～２８個、２５～２９個、２５～３０個、２６～２７個、２６～２８個、２６～２９個、２６～３０個、２７～２８個、２７～２９個、２７～３０個、２８～２９個、２８～３０個または２９～３０個の連結ヌクレオシドからなる。

【0271】

特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１６個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１７個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１８個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１９個の連結ヌクレオシドからなる。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、２０個の連結ヌクレオシドからなる。

【0272】

Ｄ．特定の修飾オリゴヌクレオチド
特定の実施形態では、上記の修飾部（糖、核酸塩基、インターヌクレオシド結合）が修飾オリゴヌクレオチドに導入されている。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチドは、その修飾モチーフと全体の長さによって特徴付けられる。特定の実施形態では、このようなパラメーターはそれぞれ、互いから独立している。別段に示されていない限り、すべての修飾部分は、核酸塩基配列から独立している。

【0273】

Ｅ．特定の修飾オリゴヌクレオチド集団
その修飾オリゴヌクレオチド集団の修飾オリゴヌクレオチドがすべて、同じ分子式である修飾オリゴヌクレオチド集団は、ステレオランダムな集団であることも、キラル的に富化された集団であることもできる。ステレオランダムな集団においては、すべての修飾オリゴヌクレオチドのキラル中心はすべて、ステレオランダムである。キラル的に富化された集団では、少なくとも１つの特定のキラル中心は、その集団の修飾オリゴヌクレオチドにおいては、ステレオランダムではない。特定の実施形態では、キラル的に富化された集団の修飾オリゴヌクレオチドは、β－Ｄリボシル糖部分について富化されており、そのホスホロチオエートインターヌクレオシド結合はすべて、ステレオランダムである。特定の実施形態では、キラル的に富化された集団の修飾オリゴヌクレオチドは、β－Ｄリボシル糖部分と、特定の立体化学的配置である少なくとも１つの特定のホスホロチオエートインターヌクレオシド結合の両方について富化されている。

【0274】

Ｆ．核酸塩基配列
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド（非修飾オリゴヌクレオチドまたは修飾オリゴヌクレオチド）は、その核酸塩基配列によってさらに説明される。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、第２のオリゴヌクレオチドまたは特定した対照核酸（標的核酸など）と相補的である核酸塩基配列を有する。特定のこのような実施形態では、オリゴヌクレオチドの一領域が、第２のオリゴヌクレオチドまたは特定した対照核酸（標的核酸など）と相補的である核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの一領域または全長の核酸塩基配列は、第２のオリゴヌクレオチドまたは核酸（標的核酸など）と少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％または１００％相補的である。

【0275】

ＩＩ．特定のオリゴマー化合物
特定の実施形態では、本発明で提供するのは、オリゴヌクレオチド（修飾オリゴヌクレオチドまたは非修飾オリゴヌクレオチド）と、任意に、１つ以上のコンジュゲート基及び／または末端基からなるオリゴマー化合物である。コンジュゲート基は、１つ以上のコンジュゲート部分と、そのコンジュゲート部分をそのオリゴヌクレオチドに連結するコンジュゲートリンカーからなる。コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドの末端のいずれかもしくは両方、及び／または内部のいずれかの位置に結合していてよい。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドの２’位に結合している。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの末端のいずれかまたは両方に結合しているコンジュゲート基は、末端基である。特定のこのような実施形態では、コンジュゲート基または末端基は、オリゴヌクレオチドの３’末端及び／または５’末端に結合している。特定のこのような実施形態では、コンジュゲート基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの３’末端に結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドの３’末端の近くに結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基（または末端基）は、オリゴヌクレオチドの５’末端に結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドの５’末端の近くに結合している。

【0276】

末端基の例としては、コンジュゲート基、キャッピング基、リン酸部分、保護基、修飾ヌクレオシドまたは非修飾ヌクレオシド、及び独立して修飾されているかまたは修飾されていない２つ以上のヌクレオシドが挙げられるが、これらに限らない。

【0277】

Ａ．特定のコンジュゲート基
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、１つ以上のコンジュゲート基に共有結合している。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、結合しているオリゴヌクレオチドの特性の１つ以上（薬力、薬物動態、安定性、結合性、吸収性、組織分布、細胞分布、細胞取り込み、帯電及びクリアランスが挙げられるが、これらに限らない）を改変する。

【0278】

特定の実施形態では、１つ以上の糖質部分を修飾オリゴヌクレオチドに結合することで、修飾オリゴヌクレオチドの１つ以上の特性が最適化され得る。特定の実施形態では、糖質部分は、修飾オリゴヌクレオチドの修飾サブユニットに結合される。例えば、修飾オリゴヌクレオチドの１つ以上のリボヌクレオチドサブユニットのリボース糖は、別の部分（例えば、糖質リガンドが結合した非糖質（好ましくは、環式）担体）で置き換えられ得る。サブユニットのリボース糖がそのように置き換えられているリボヌクレオチドサブユニットは、本明細書では、リボース置換修飾サブユニット（ＲＲＭＳ）と称され、ＲＲＭＳは、修飾糖部分である。環式担体は、炭素環式環系であり得、すなわち、１つ以上の環原子は、ヘテロ原子（例えば、窒素、酸素、硫黄）であり得る。環式担体は単環式環系であり得るか、または２つ以上の環（例えば、縮合環）を含み得る。環式担体は、完全飽和環系であり得るか、または１つ以上の二重結合を含み得る。

【0279】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、結合しているオリゴヌクレオチドに、新たな特性を付与する（例えば、そのオリゴヌクレオチドの検出を可能にするフルオロフォアまたはレポーター基）。特定のコンジュゲート基及びコンジュゲート部分は、以前に説明されており、例えば、コレステロール部分（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，１９８９，８６，６５５３－６５５６）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９４，４，１０５３－１０６０）、チオエーテル、例えば、ヘキシル－Ｓ－トリチルチオール（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，１９９２，６６０，３０６－３０９、Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔｔ．，１９９３，３，２７６５－２７７０）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９２，２０，５３３－５３８）、脂肪族鎖、例えば、ドデカンジオールもしくはウンデシル残基（Ｓａｉｓｏｎ－Ｂｅｈｍｏａｒａｓ ｅｔ ａｌ．，ＥＭＢＯ Ｊ．，１９９１，１０，１１１１－１１１８、Ｋａｂａｎｏｖ ｅｔ ａｌ．，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ．，１９９０，２５９，３２７－３３０、Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ，１９９３，７５，４９－５４）、リン脂質、例えば、ジ－ヘキサデシル－ｒａｃ－グリセロールもしくはトリエチルアンモニウム１，２－ジ－Ｏ－ヘキサデシル－ｒａｃ－グリセロ－３－Ｈ－ホスホネート（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１－３６５４、Ｓｈｅａ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９０，１８，３７７７－３７８３）、ポリアミンもしくはポリエチレングリコール鎖（Ｍａｎｏｈａｒａｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ ＆ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ，１９９５，１４，９６９－９７３）、アダマンタン酢酸、パルミチル部分（Ｍｉｓｈｒａ ｅｔ ａｌ．，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ，１９９５，１２６４，２２９－２３７）、オクタデシルアミンもしくはヘキシルアミノ－カルボニル－オキシコレステロール部分（Ｃｒｏｏｋｅ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．，１９９６，２７７，９２３－９３７）、トコフェロール基（Ｎｉｓｈｉｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ，２０１５，４，ｅ２２０及びＮｉｓｈｉｎａ ｅｔ ａｌ．，Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，２００８，１６，７３４－７４０）、またはＧａｌＮＡｃクラスター（例えばＷＯ２０１４／１７９６２０）である。

【0280】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、Ｃ５アルキル、Ｃ２２アルケニル、Ｃ２０アルケニル、Ｃ１６アルケニル、Ｃ１０アルケニル、Ｃ２１アルケニル、Ｃ１９アルケニル、Ｃ１８アルケニル、Ｃ１５アルケニル、Ｃ１４アルケニル、Ｃ１３アルケニル、Ｃ１２アルケニル、Ｃ１１アルケニル、Ｃ９アルケニル、Ｃ８アルケニル、Ｃ７アルケニル、Ｃ６アルケニル、またはＣ５アルケニルのいずれかから選択されるコンジュゲート部分を含み得る。

【0281】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、Ｃ２２アルキル、Ｃ２０アルキル、Ｃ１６アルキル、Ｃ１０アルキル、Ｃ２１アルキル、Ｃ１９アルキル、Ｃ１８アルキル、Ｃ１５アルキル、Ｃ１４アルキル、Ｃ１３アルキル、Ｃ１２アルキル、Ｃ１１アルキル、Ｃ９アルキル、Ｃ８アルキル、Ｃ７アルキル、Ｃ６アルキル、またはＣ５アルキルのいずれかから選択されるコンジュゲート部分を含み得、アルキル鎖は、１つ以上の不飽和結合を有する。

【0282】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、下記の構造を有する脂質である。

【0283】

【化13】

【0284】

１．コンジュゲート部分
コンジュゲート部分としては、インターカレーター、レポーター分子、ポリアミン、ポリアミド、ペプチド、糖質（例えば、ＧａｌＮＡｃ）、抗体、ビタミン部分、ポリエチレングリコール、チオエーテル、ポリエーテル、コレステロール、チオコレステロール、コール酸部分、葉酸塩、脂質、リン脂質、ビオチン、フェナジン、フェナントリジン、アントラキノン、アダマンタン、アクリジン、フルオレセイン、ローダミン、クマリン、フルオロフォア及び色素が挙げられるが、これらに限らない。

【0285】

特定の実施形態では、コンジュゲート部分は、活性薬剤物質、例えば、アスピリン、ワルファリン、フェニルブタゾン、イブプロフェン、スプロフェン、フェンブフェン、ケトプロフェン、（Ｓ）－（＋）－プラノプロフェン、カルプロフェン、ダンシルサルコシン、２，３，５－トリヨード安息香酸、フィンゴリモド、フルフェナム酸、フォリン酸、ベンゾサイアジアザイド、クロロチアジド、ジアゼピン、インドメタシン、バルビツール酸塩、セファロスポリン、サルファ剤、抗糖尿病剤、抗菌剤または抗生剤を含む。

【0286】

２．コンジュゲートリンカー
コンジュゲート部分は、コンジュゲートリンカーを介して、オリゴヌクレオチドに結合している。特定のオリゴマー化合物では、そのコンジュゲートリンカーは、化学的な単結合である（すなわち、そのコンジュゲート部分は、単結合を介して、オリゴヌクレオチドに直接結合している）。特定の実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、ヒドロカルビル鎖のような鎖構造、またはエチレングリコール、ヌクレオシドもしくはアミノ酸単位のような繰り返し単位のオリゴマーを含む。

【0287】

特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、ピロリジンを含む。

【0288】

特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、アルキル、アミノ、オキソ、アミド、ジスルフィド、ポリエチレングリコール、エーテル、チオエーテル及びヒドロキシルアミノから選択した基を１つ以上含む。特定のこのような実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、アルキル基、アミノ基、オキソ基、アミド基及びエーテル基から選択した基を含む。特定の実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、アルキル基及びアミド基から選択した基を含む。特定の実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、アルキル基及びエーテル基から選択した基を含む。特定の実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、リン部分を少なくとも１つ含む。特定の実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、リン酸基を少なくとも１つ含む。特定の実施形態では、そのコンジュゲートリンカーは、中性連結基を少なくとも１つ含む。

【0289】

特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、上記のコンジュゲートリンカーを含め、二官能性連結部分、例えば、コンジュゲート部分を化合物（本発明で提供するオリゴヌクレオチドなど）に結合するのに有用であることが当該技術分野において知られている二官能性連結部分である。概して、二官能性連結部分は、官能基を少なくとも２つ含む。その官能基のうちの一方は、化合物の特定の部位と反応するように選択されており、もう一方は、コンジュゲート部分と反応するように選択されている。二官能性連結部分で用いられる官能基の例としては、求核基と反応する求電子基、及び求電子基と反応する求核基が挙げられるが、これらに限らない。特定の実施形態では、二官能性連結部分は、アミノ、ヒドロキシル、カルボン酸、チオール、アルキル、アルケニル及びアルキニルから選択した基を１つ以上含む。

【0290】

コンジュゲートリンカーの例としては、ピロリジン、８－アミノ－３，６－ジオキサオクタン酸（ＡＤＯ）、スクシンイミジル４－（Ｎ－マレイミドメチル）シクロヘキサン－１－カルボキシレート（ＳＭＣＣ）及び６－アミノヘキサン酸（ＡＨＥＸまたはＡＨＡ）が挙げられるが、これらに限らない。他のコンジュゲートリンカーとしては、置換もしくは非置換のＣ_１－Ｃ_１０アルキル、置換もしくは非置換のＣ_２－Ｃ_１０アルケニル、または置換もしくは非置換のＣ_２－Ｃ_１０アルキニルが挙げられるが、これらに限らず、その好ましい置換基の非限定的なリストには、ヒドロキシル、アミノ、アルコキシ、カルボキシ、ベンジル、フェニル、ニトロ、チオール、チオアルコキシ、ハロゲン、アルキル、アリール、アルケニル及びアルキニルが含まれる。

【0291】

特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、リンカーヌクレオシドを１～１０個含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、リンカーヌクレオシドを２～５個含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、リンカーヌクレオシドをきっかり３個含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、ＴＣＡモチーフを含む。特定の実施形態では、このようなリンカーヌクレオシドは、修飾ヌクレオシドである。特定の実施形態では、このようなリンカーヌクレオシドは、修飾糖部分を含む。特定の実施形態では、リンカーヌクレオシドは、修飾されていない。特定の実施形態では、リンカーヌクレオシドは、プリン、置換プリン、ピリミジンまたは置換ピリミジンから選択した、任意に保護された複素環型塩基を含む。特定の実施形態では、切断可能な部分は、ウラシル、チミン、シトシン、４－Ｎ－ベンゾイルシトシン、５－メチルシトシン、４－Ｎ－ベンゾイル－５－メチルシトシン、アデニン、６－Ｎ－ベンゾイルアデニン、グアニン及び２－Ｎ－イソブチリルグアニンから選択したヌクレオシドである。典型的には、リンカーヌクレオシドは、標的組織に到達後、オリゴマー化合物から切断されるのが望ましい。したがって、リンカーヌクレオシドは典型的には、互いに連結されているとともに、切断可能な結合を介して、そのオリゴマー化合物の残部に連結されている。特定の実施形態では、このような切断可能な結合は、ホスホジエステル結合である。

【0292】

本明細書では、リンカーヌクレオシドは、オリゴヌクレオチドの一部とはみなさない。したがって、所定の数または範囲の連結ヌクレオシドからなり、及び／または対照核酸との相補率が所定の値であるオリゴヌクレオチドをオリゴマー化合物が含み、そのオリゴマー化合物が、リンカーヌクレオシドを含むコンジュゲートリンカーを含むコンジュゲート基も含む実施形態では、それらのリンカーヌクレオシドは、そのオリゴヌクレオチドの長さには含まれず、対照核酸に対するオリゴヌクレオチドの相補率を求めるのには使用されない。例えば、オリゴマー化合物は、（１）８～３０個のヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドと、（２）その修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシドと連続している１～１０個のリンカーヌクレオシドを含むコンジュゲート基を含んでよい。このようなオリゴマー化合物における、連続した連結ヌクレオシドの総数は、３１個以上である。あるいは、オリゴマー化合物は、８～３０個のヌクレオシドからなる修飾オリゴヌクレオチドを含み、かつコンジュゲート基を含まなくてもよい。このようなオリゴマー化合物における、連続した連結ヌクレオシドの総数は、３０個以下である。別段に示されていない限り、コンジュゲートリンカーは、１０個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、５個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、３個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、２個以下のリンカーヌクレオシドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲートリンカーは、１個以下のリンカーヌクレオシドを含む。

【0293】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、オリゴヌクレオチドから切断されるのが望ましい。例えば、特定の状況では、特定のコンジュゲート部分を含むオリゴマー化合物は、特定の種類の細胞に、より多く取り込まれるが、そのオリゴマー化合物が取り込まれたら、コンジュゲート基が切断されて、コンジュゲートされていないオリゴヌクレオチド、すなわち親オリゴヌクレオチドが放出されるのが望ましい。したがって、特定のコンジュゲートリンカーは、切断可能な部分を１つ以上含んでよい。特定の実施形態では、切断可能な部分は、切断可能な結合である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、切断可能な結合を少なくとも１つ含む原子団である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、切断可能な結合を１つ、２つ、３つ、４つまたは５つ以上有する原子団を含む。特定の実施形態では、切断可能な部分は、細胞、またはリソソームのような細胞内コンパートメントの中で選択的に切断される。特定の実施形態では、切断可能な部分は、ヌクレアーゼのような内因性酵素によって選択的に切断される。

【0294】

特定の実施形態では、切断可能な結合部分は、アミド、エステル、エーテル、ホスホジエステルの一方もしくは両方のエステル、リン酸エステル、カルバミン酸塩、またはジスルフィドの中から選択されている。特定の実施形態では、切断可能な結合部分は、ホスホジエステルのエステルの一方または両方である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、リン酸エステルまたはホスホジエステルを含む。特定の実施形態では、切断可能な部分は、オリゴヌクレオチドと、コンジュゲート部分またはコンジュゲート基との間のリン酸結合である。

【0295】

特定の実施形態では、切断可能な部分は、１つ以上のリンカーヌクレオシドを含むか、または１つ以上のリンカーヌクレオシドからなる。特定のこのような実施形態では、その１つ以上のリンカーヌクレオシドは、互いに連結されており、及び／または切断可能な結合を介して、そのオリゴマー化合物の残部に連結されている。特定の実施形態では、このような切断可能な結合は、修飾されていないホスホジエステル結合である。特定の実施形態では、切断可能な部分は、リン酸インターヌクレオシド結合によって、オリゴヌクレオチドの３’末端ヌクレオシドまたは５’末端ヌクレオシドのいずれかに結合しているとともに、リン酸結合またはホスホロチオエート結合によって、そのコンジュゲートリンカーまたはコンジュゲート部分の残部に共有結合している２’－デオキシヌクレオシドである。特定のこのような実施形態では、その切断可能な部分は、２’－デオキシアデノシンである。

【0296】

３．細胞標的化部分
特定の実施形態では、コンジュゲート基は、細胞標的化部分を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、一般式：

【0297】

【化14】

【0298】

を有し、
式中、ｎは１～約３であり、ｎが１の場合、ｍは０であり、ｎが２以上の場合、ｍは１であり、ｊは１または０であり、ｋは１または０である。

【0299】

特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは１である。

【0300】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、少なくとも１つのテザーリガンドを有する細胞標的化部分を含む。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、分岐基に共有結合で結合した２つのテザーリガンドを含む。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、ニューロンを標的とする。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、神経伝達物質受容体を標的とする。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、神経伝達物質トランスポーターを標的とする。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、ＧＡＢＡトランスポーターを標的とする。例えば、ＷＯ２０１１／１３１６９３、ＷＯ２０１４／０６４２５７を参照のこと。

【0301】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、トランスフェリン受容体（ＴｆＲ）（本明細書では、ＴｆＲ１及びＣＤ７１とも称される）に親和性を有する細胞標的化部分を含む。特定の実施形態では、本明細書に記載のコンジュゲート基は、抗ＴｆＲ１抗体またはその断片を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なタンパク質またはペプチドを含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なアプタマーを含む。特定の実施形態では、抗ＴｆＲ１抗体またはその断片は、当該技術分野で知られる任意のものであり得、こうしたものには、限定されないが、ＷＯ１９９１／００４７５３、ＷＯ２０１３／１０３８００、ＷＯ２０１４／１４４０６０、ＷＯ２０１６／０８１６４３、ＷＯ２０１６／１７９２５７、ＷＯ２０１６／２０７２４０、ＷＯ２０１７／２２１８８３、ＷＯ２０１８／１２９３８４、ＷＯ２０１８／１２４１２１、ＷＯ２０１９／１５１５３９、ＷＯ２０２０／１３２５８４、ＷＯ２０２０／０２８８６４、ＵＳ７，２０８，１７４、ＵＳ９，０３４，３２９、及びＵＳ１０，５５０，１８８に記載のものが含まれる。特定の実施形態では、抗ＴｆＲ１抗体の断片は、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ、Ｆａｂ’、Ｆｖ、またはｓｃＦｖである。

【0302】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なタンパク質またはペプチドを含む。特定の実施形態では、ＴｆＲ１に結合することが可能なタンパク質またはペプチドは、当該技術分野で知られる任意のものであり得、こうしたものには、限定されないが、ＷＯ２０１９／１４００５０、ＷＯ２０２０／０３７１５０、ＷＯ２０２０／１２４０３２、及びＵＳ１０，１３８，４８３に記載のものが含まれる。

【0303】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、ＴｆＲ１に結合することが可能なアプタマーを含む。特定の実施形態では、ＴｆＲ１に結合することが可能なアプタマーは、当該技術分野で知られる任意のものであり得、こうしたものには、限定されないが、ＷＯ２０１３／１６３３０３、ＷＯ２０１９／０３３０５１、及びＷＯ２０２０／２４５１９８に記載のものが含まれる。

【0304】

特定の実施形態では、細胞標的化部分の各リガンドは、標的細胞上の少なくとも１つの型の受容体に親和性を有する。特定の実施形態では、各リガンドは、哺乳動物の肝細胞の表面上の少なくとも１つの型の受容体に親和性を有する。特定の実施形態では、各リガンドは、肝臓のアシアロ糖タンパク質受容体（ＡＳＧＰ－Ｒ）に親和性を有する。特定の実施形態では、各リガンドは、糖質である。

【0305】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、細胞標的化コンジュゲート部分を含む。特定の実施形態では、コンジュゲート基は、一般式：

【0306】

【化15】

【0307】

を有し、
式中、ｎは１～約３であり、ｎが１の場合、ｍは０であり、ｎが２以上の場合、ｍは１であり、ｊは１または０であり、ｋは１または０である。

【0308】

特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは１であり、ｊは１であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは２であり、ｊは１であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは０である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは０であり、ｋは１である。特定の実施形態では、ｎは３であり、ｊは１であり、ｋは１である。

【0309】

特定の実施形態では、コンジュゲート基は、少なくとも１つのテザーリガンドを有する細胞標的化部分を含む。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、分岐基に共有結合で結合した２つのテザーリガンドを含む。特定の実施形態では、細胞標的化部分は、分岐基に共有結合で結合した３つのテザーリガンドを含む。

【0310】

Ｂ．特定の末端基
特定の実施形態では、オリゴマー化合物は、末端基を１つ以上含む。特定のこのような実施形態では、オリゴマー化合物は、安定化５’－リン酸を含む。安定化５’－リン酸としては、５’－ホスホネートが挙げられるが、これに限らず、その５’－ホスホネートとしては、５’－ビニルホスホネートが挙げられるが、これに限らない。特定の実施形態では、末端基は、脱塩基糖部分及び／または逆位ヌクレオシドを１つ以上含む。特定の実施形態では、末端基は、２’－連結ヌクレオシドまたは糖部分を１つ以上含む。特定のこのような実施形態では、その２’－連結基は、脱塩基糖部分である。

【0311】

ＩＩＩ．アンチセンス活性
特定の実施形態では、オリゴマー化合物及び二本鎖オリゴマーは、標的核酸とハイブリダイズすることにより、少なくとも１つのアンチセンス活性をもたらすことができ、このようなオリゴマー化合物及び二本鎖オリゴマーは、アンチセンス化合物である。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、標準的な細胞アッセイにおいて、標的核酸の量または活性を１０％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、またはそれを超える％調節または増大させる場合に、アンチセンス活性を有する。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、それによって隠れエキソン含有標的核酸の量が標準的な細胞アッセイにおいて１０％、２０％、２５％、３０％、４０％、５０％、６０％、７０％、８０％、９０％、またはそれを超える％調節または低減される場合に、アンチセンス活性を有する。特定の実施形態では、アンチセンス化合物は、１つ以上の標的核酸に選択的に作用を及ぼす。このようなアンチセンス化合物は、１つ以上の標的核酸とハイブリダイズすることにより、１つ以上の所望のアンチセンス活性をもたらすとともに、１つ以上の非標的核酸とハイブリダイズしないか、または顕著な望ましくないアンチセンス活性をもたらすような形では、１つ以上の非標的核酸とハイブリダイズしない核酸塩基配列を含む。

【0312】

特定のアンチセンス活性では、アンチセンス化合物が標的核酸とハイブリダイズすると、その標的核酸を切断するタンパク質がリクルートされる。例えば、特定のアンチセンス化合物は、ＲＮａｓｅ Ｈの媒介により、標的核酸を切断させる。ＲＮａｓｅ Ｈは、ＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖のＲＮＡ鎖を切断する細胞内エンドヌクレアーゼである。このようなＲＮＡ：ＤＮＡ二本鎖のＤＮＡは、非修飾ＤＮＡである必要はない。特定の実施形態では、ＲＮａｓｅ Ｈ活性を誘導するのに充分に「ＤＮＡ様」であるアンチセンス化合物が本明細書に記載される。特定の実施形態では、１つ以上の非ＤＮＡ様ヌクレオシドが許容される。

【0313】

特定のアンチセンス活性では、アンチセンス化合物またはアンチセンス化合物の一部は、ＲＮＡ誘導サイレンシング複合体（ＲＩＳＣ）に取り込まれることにより、最終的に、標的核酸を切断させる。例えば、特定のアンチセンス化合物は、アルゴノートによって標的核酸を切断させる。ＲＩＳＣに取り込まれるアンチセンス化合物は、ＲＮＡｉ化合物である。ＲＮＡｉ化合物は、二本鎖（ｓｉＲＮＡもしくはｄｓＲＮＡｉ）であっても、一本鎖（ｓｓＲＮＡ）であってもよい。

【0314】

特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸とハイブリダイズしても、標的核酸を切断するタンパク質はリクルートされない。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸とハイブリダイズすると、標的核酸のスプライシングが改変される。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸とハイブリダイズすると、標的核酸と、タンパク質またはその他の核酸との結合相互作用が阻害される。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸とハイブリダイズすると、標的核酸の翻訳が改変される。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、隠れエキソンを含むＲＮＡの量が減少する。特定のそのような実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズする結果、隠れエキソンが排除される。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、隠れエキソンが排除されたＲＮＡの量が増加する。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、標的核酸の量または活性が増加する。特定の実施形態では、アンチセンス化合物が標的核酸にハイブリダイズすると、全標的ＲＮＡの量が増加する。特定の実施形態では、標的核酸と相補的なアンチセンス化合物のハイブリダイゼーションが生じる結果、スプライシングが変化してｍＲＮＡ中のエキソンが排除される。

【0315】

アンチセンス活性は、直接または間接的に観察してよい。特定の実施形態では、アンチセンス活性の観察または検出には、標的核酸もしくはそのような標的核酸によってコードされるタンパク質の量の変化、核酸もしくはタンパク質のスプライスバリアントの比率の変化、及び／または細胞もしくは動物における表現型の変化の観察または検出が伴う。

【0316】

ＩＶ．特定の標的核酸
特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、標的核酸と相補的である領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、またはそのオリゴヌクレオチドからなる。特定の実施形態では、その標的核酸は、内因性ＲＮＡ分子である。特定の実施形態では、その標的核酸は、タンパク質をコードする。特定のこのような実施形態では、その標的核酸は、イントロン領域、エキソン領域及び非翻訳領域を含む成熟ｍＲＮＡ及びｐｒｅ－ｍＲＮＡから選択されている。特定の実施形態では、その標的ＲＮＡは、成熟ｍＲＮＡである。特定の実施形態では、その標的核酸は、ｐｒｅ－ｍＲＮＡである。特定の実施形態では、その標的領域は、全体がイントロン内にある。特定の実施形態では、その標的領域は、イントロン／エキソン接合部に及ぶ。特定の実施形態では、その標的領域は、少なくとも５０％がイントロン内にある。特定の実施形態では、その標的核酸は、レトロ遺伝子のＲＮＡ転写産物である。特定の実施形態では、その標的核酸は、非コードＲＮＡである。特定の実施形態では、標的である非コードＲＮＡは、長い非コードＲＮＡ、短い非コードＲＮＡ、及びイントロンＲＮＡ分子から選択されている。

【0317】

Ａ．標的核酸との相補性／ミスマッチ、及び二本鎖相補性
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、そのオリゴヌクレオチドの全長にわたって、標的核酸と相補的である。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的核酸と９９％、９５％、９０％、８５％または８０％相補的である。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、そのオリゴヌクレオチドの全長にわたって、標的核酸と少なくとも８０％相補的であり、標的核酸と１００％、すなわち完全に相補的な領域を含む。特定の実施形態では、完全に相補的な領域は、６～２０核酸塩基長、１０～１８核酸塩基長または１８～２０核酸塩基長である。

【0318】

活性を消失させずに、ミスマッチ塩基を導入するのが可能である。例えば、Ｇａｕｔｓｃｈｉら（Ｊ．Ｎａｔｌ．Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｓｔ．９３：４６３－４７１，Ｍａｒｃｈ ２００１）は、ｂｃｌ－２ ｍＲＮＡとの相補性が１００％であるとともに、ｂｃｌ－ｘＬ ｍＲＮＡとのミスマッチを３つ有するオリゴヌクレオチドが、ｉｎ ｖｉｔｒｏ及びｉｎ ｖｉｖｏにおいて、ｂｃｌ－２及びｂｃｌ－ｘＬの両方の発現を減少できることを示した。さらに、このオリゴヌクレオチドは、ｉｎ ｖｉｖｏにおいて強力な抗腫瘍活性を示した。Ｍａｈｅｒ及びＤｏｌｎｉｃｋ（Ｎｕｃ．Ａｃｉｄ．Ｒｅｓ．１６：３３４１－３３５８，１９８８）は、ウサギ網赤血球アッセイにおいて、２つまたは３つのタンデムオリゴヌクレオチドの配列でそれぞれ構成された一連のタンデムな１４核酸塩基のオリゴヌクレオチド、２８核酸塩基のオリゴヌクレオチド及び４２核酸塩基のオリゴヌクレオチドが、ヒトＤＨＦＲの翻訳を阻止する能力について試験した。その３つの１４核酸塩基のオリゴヌクレオチドのそれぞれのみが、翻訳を阻害できた。ただし、２８核酸塩基または４２核酸塩基のオリゴヌクレオチドよりも控えめなレベルであった。

【0319】

特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的核酸に対してミスマッチである核酸塩基を１つ以上含む。特定の実施形態では、標的に対するアンチセンス活性は、このようなミスマッチによって低下するが、非標的に対する活性は、より多い量低下する。したがって、特定の実施形態では、オリゴヌクレオチドの選択性が向上されている。

【0320】

Ｂ．ＵＮＣ１３Ａ
特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、標的核酸と相補的な領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、または当該オリゴヌクレオチドからなり、標的核酸は、ＵＮＣ１３Ａ核酸である。特定の実施形態では、ＵＮＣ１３Ａ核酸は、配列番号１（ＧＥＮＢＡＮＫアクセッション番号ＮＣ＿００００１９．１０のヌクレオシド１７５９８００１から１７６９１０００までの切断鎖の相補鎖）または配列番号２（ＧＥＮＢＡＮＫアクセッション番号ＮＭ＿００１０８０４２１．２）に示される配列を有する。特定の実施形態では、配列番号１または配列番号２と相補的なオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と細胞とを接触させると、ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量が増加し、特定の実施形態では、ＵＮＣ１３Ａタンパク質の量が増加する。特定の実施形態では、配列番号１または配列番号２と相補的なオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と細胞とを接触させると、ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡのスプライシングが調節される。特定の実施形態では、配列番号１または配列番号２と相補的なオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と細胞とを接触させると、隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量が減少する。特定の実施形態では、配列番号１または配列番号２と相補的なオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と細胞とを接触させると、隠れエキソンが排除されたＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量が増加する。特定の実施形態では、隠れエキソンは、ＵＮＣ１３Ａイントロン２０（すなわち、ＵＮＣ１３Ａのエキソン２０とエキソン２１との間のイントロン）中に位置する。特定の実施形態では、隠れエキソンは、ＣＥ２０ｘ（「ＣＥ」または「ＣＥ－１」または「隠れエキソン１」と呼ばれる）である。特定の実施形態では、隠れエキソンは、配列番号１の４８，４６０位に開始部位を有し、配列番号１の４８，５８７位に終結部位を有する。特定の実施形態では、ＣＥ２０ｘの核酸塩基長は１２８であり、ＣＥ２０ｘは、染色体座標ＧＲＣｈ３８：１９：１７６４２４１３：１７６４２５４１：－１に対応する（Ｍａ，Ｘ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８２１３）。特定の実施形態では、ＣＥ２０ｘは、ＣＴＧＣＣＴＧＧＧＴＴＴＣＣＴＧＧＡＡＡＧＡＡＣＴＣＴＴＡＴＣＣＣＣＡＧＧＡＡＣＴＡＧＴＴＴＧＴＴＧＡＡＴＡＡＡＴＧＣＴＧＧＴＧＡＡＴＧＡＡＴＧＡＡＴＧＡＴＴＧＡＡＣＡＧＡＴＧＡＡＴＧＡＧＴＧＡＴＧＡＧＴＡＧＡＴＡＡＡＡＧＧＡＴＧＧＡＴＧＧＡＧＡＧＡＴＧＧという核酸塩基配列（配列番号３；Ｍａ，Ｘ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８２１３、Ｂｒｏｗｎ，Ａ－Ｌ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８１７０）を有する。特定の実施形態では、隠れエキソンは、配列番号１の４８，４１０位に開始部位を有し、配列番号１の４８，５８７位に終結部位を有する。特定の実施形態では、隠れエキソンは、ＵＮＣ１３Ａイントロン２０中に位置し、１７８核酸塩基長を有し、染色体座標ＧＲＣｈ３８：１９：１７６４２４１３：１７６４２５９１：－１に対応する（Ｍａ，Ｘ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８２１３）（「ＣＥ－２」または「隠れエキソン２」と呼ばれる）。特定の実施形態では、ＣＥ－２は、ＣＣＣＴＡＡＣＣＡＣＴＣＡＧＧＡＴＴＧＧＧＣＣＧＴＴＴＧＴＧＴＣＴＧＧＧＴＡＴＧＴＣＴＣＴＴＣＣＡＧＣＴＧＣＣＴＧＧＧＴＴＴＣＣＴＧＧＡＡＡＧＡＡＣＴＣＴＴＡＴＣＣＣＣＡＧＧＡＡＣＴＡＧＴＴＴＧＴＴＧＡＡＴＡＡＡＴＧＣＴＧＧＴＧＡＡＴＧＡＡＴＧＡＡＴＧＡＴＴＧＡＡＣＡＧＡＴＧＡＡＴＧＡＧＴＧＡＴＧＡＧＴＡＧＡＴＡＡＡＡＧＧＡＴＧＧＡＴＧＧＡＧＡＧＡＴＧＧという核酸塩基配列（配列番号４）を有する。特定の実施形態では、隠れエキソンは、配列番号１の４８，１５７位に開始部位を有し、配列番号１の４８，５８７位に終結部位を有する。特定の実施形態では、隠れエキソンは、ＵＮＣ１３Ａイントロン２０中に位置し、４３１核酸塩基長を有し、染色体座標ＧＲＣｈ３８：１９：１７６４２４１３：１７６４２８４４：－１に対応する（Ｍａ，Ｘ．Ｒ．，ｅｔ ａｌ．，２０２１，ｂｉｏＲｘｉｖ，ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２１．０４．０２．４３８２１３）（「ＣＥ－３」または「隠れエキソン３」と呼ばれる）。特定の実施形態では、ＣＥ－３は、ＧＴＧＡＧＧＧＴＣＡＴＴＧＣＴＣＧＧＣＣＣＣＴＣＣＣＡＴＧＣＣＡＣＴＴＣＣＡＣＴＣＡＣＣＡＴＴＣＣＴＧＣＣＴＧＣＣＣＡＧＣＴＣＴＴＣＣＴＣＴＴＴＣＴＧＧＣＣＡＣＡＣＣＡＴＣＣＡＣＡＣＴＣＴＣＣＴＧＧＣＣＣＴＣＴＧＡＧＡＣＴＧＣＣＣＧＣＣＡＴＧＣＣＡＴＴＣＣＣＴＴＴＡＣＣＴＧＧＡＡＡＡＣＴＣＣＴＣＣＣＴＡＴＣＣＡＴＣＡＡＡＧＴＣＣＡＧＡＴＴＣＡＧＧＧＴＣＡＣＣＴＣＣＴＣＴＧＧＧＡＡＧＣＣＣＡＣＣＴＴＧＧＣＣＴＣＣＡＧＧＴＴＧＡＣＴＣＴＣＡＣＴＡＣＴＣＡＴＣＡＴＣＡＧＧＴＴＣＴＴＣＣＴＴＣＴＡＴＴＣＣＡＧＣＣＣＴＡＡＣＣＡＣＴＣＡＧＧＡＴＴＧＧＧＣＣＧＴＴＴＧＴＧＴＣＴＧＧＧＴＡＴＧＴＣＴＣＴＴＣＣＡＧＣＴＧＣＣＴＧＧＧＴＴＴＣＣＴＧＧＡＡＡＧＡＡＣＴＣＴＴＡＴＣＣＣＣＡＧＧＡＡＣＴＡＧＴＴＴＧＴＴＧＡＡＴＡＡＡＴＧＣＴＧＧＴＧＡＡＴＧＡＡＴＧＡＡＴＧＡＴＴＧＡＡＣＡＧＡＴＧＡＡＴＧＡＧＴＧＡＴＧＡＧＴＡＧＡＴＡＡＡＡＧＧＡＴＧＧＡＴＧＧＡＧＡＧＡＴＧＧという核酸塩基配列（配列番号５）を有する。

【0321】

特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、またはアンチセンス剤は、修飾オリゴヌクレオチドからなる。特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、またはアンチセンス剤は、修飾オリゴヌクレオチド及びコンジュゲート基からなる。

【0322】

Ｃ．特定の組織における特定の標的核酸
特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、またはアンチセンス剤は、標的核酸と相補的である領域を含むオリゴヌクレオチドを含むか、またはそのオリゴヌクレオチドからなり、その標的核酸は、薬理学的に関連する組織で発現する。特定の実施形態では、その薬理学的に関連する組織は、中枢神経系（ＣＮＳ）を構成する細胞及び組織であり、こうした組織には、限定されないが、脊髄、皮質（限定されないが、運動皮質、前頭皮質、及び側頭皮質）、海馬、髄質、ならびに脳橋が含まれる。

【0323】

Ｖ．特定のホットスポット領域
１．配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１
特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１は、ホットスポット領域を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１の一部と相補的である。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の核酸塩基長は１８である。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の各ヌクレオシドは、２’－ＭＯＥ糖部分を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤のインターヌクレオシド結合はすべて、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である。

【0324】

配列番号２９０、２９１、２９３、及び２９４の核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１と相補的である。化合物番号１６１６３１０、１６１６３１１、１６１６３１３、及び１６１６３１４のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤の核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１と相補的である。

【0325】

特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１の一部と相補的なオリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６２（隠れエキソン１を特異的に認識するように設計されていることから、隠れエキソン１を含むＲＮＡが測定される）を用いて測定すると、ＣＥ－１を含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡを標準的な細胞アッセイにおいて少なくとも６９％低減する。特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，１２８～４８，１５１の一部と相補的なオリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６２を用いて測定すると、ＣＥ－１を含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡを標準的な細胞アッセイにおいて平均で７８．８％低減する。

【0326】

２．配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５
特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５は、ホットスポット領域を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５の一部と相補的である。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の核酸塩基長は１８である。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の各ヌクレオシドは、２’－ＭＯＥ糖部分を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤のインターヌクレオシド結合はすべて、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である。

【0327】

配列番号８５～１０１の核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５と相補的である。化合物番号１６１６１０５～１６１６１２１のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤の核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５と相補的である。

【0328】

特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５の一部と相補的なオリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６３（３つすべての隠れエキソンを認識するように設計されていることから、ＵＮＣ１３Ａのエキソン２０とエキソン２１との間の３つの隠れエキソンのいずれを含むＲＮＡも測定される（隠れエキソンの完全網羅））を用いて測定すると、ＣＥ－１、ＣＥ－２、及び／またはＣＥ－３を含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡを標準的な細胞アッセイにおいて少なくとも５２％低減する。特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，４３２～４８，４６５の一部と相補的なオリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６３を用いて測定すると、ＣＥ－１、ＣＥ－２、及び／またはＣＥ－３を含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡを標準的な細胞アッセイにおいて平均で６５．４％低減する。

【0329】

３．配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１
特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１は、ホットスポット領域を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１の一部と相補的である。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の核酸塩基長は１８である。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンス剤の各ヌクレオシドは、２’－ＭＯＥ糖部分を含む。特定の実施形態では、オリゴマー化合物またはアンチセンスオリゴヌクレオチドのインターヌクレオシド結合はすべて、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合である。

【0330】

配列番号２１～３０、３２～４１、４３～５２、５４～６０、６２～６６、及び３２６～３３２の核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１と相補的である。化合物番号１６１６０４１～１６１６０５０、１６１６０５２～１６１６０６１、１６１６０６３～１６１６０７２、１６１６０７４～１６１６０８０、１６１６０８２～１６１６０８６、及び１６１６３４６～１６１６３５２のオリゴマー化合物またはアンチセンス剤の核酸塩基配列は、配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１と相補的である。

【0331】

特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１の一部と相補的なオリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６３を用いて測定すると、ＣＥ－１、ＣＥ－２、及び／またはＣＥ－３を含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡを標準的な細胞アッセイにおいて少なくとも４６％低減する。特定の実施形態では、配列番号１の核酸塩基４８，４６６～４８，５６１の一部と相補的なオリゴマー化合物またはアンチセンス剤は、ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６３を用いて測定すると、ＣＥ－１、ＣＥ－２、及び／またはＣＥ－３を含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡを標準的な細胞アッセイにおいて平均で７５．９％低減する。

【0332】

ＶＩ．特定の方法及び使用
本明細書で提供される特定の実施形態は、ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量もしくは活性を増加させる方法、または隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を低減する方法に関し、この方法は、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患の治療に有用であり得る。オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、及びアンチセンス剤を用いて治療可能な疾患の例としては、神経変性疾患が挙げられる。特定の実施形態では、神経変性疾患は、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である。

【0333】

特定の実施形態では、方法は、オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤を対象に投与することを含み、これらはいずれも、ＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、対象は、神経変性疾患を有する。特定の実施形態では、対象は、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）を有する。

【0334】

特定の実施形態では、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患の治療方法は、オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤を対象に投与することを含み、これらはいずれも、ＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、対象は、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患またはその発症リスクを有する。特定の実施形態では、対象は、神経変性疾患を有する。特定の実施形態では、対象は、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）を有する。特定の実施形態では、神経変性疾患の少なくとも１つの症状が改善される。特定の実施形態では、症状は、運動機能障害、筋力低下、筋肉消耗、シナプス機能障害、疲労、発話困難、嚥下困難、息切れ、認識機能障害、寿命の短期化、またはそれらの組み合わせである。

【0335】

特定の実施形態では、細胞におけるＵＮＣ１３Ａ核酸（例えば、ＲＮＡ）の発現の増加方法は、細胞をオリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と接触させることを含み、これらはいずれも、ＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、細胞は、ニューロンまたはグリア細胞である。特定の実施形態では、細胞は、アストロサイトまたはミクログリア細胞である。特定の実施形態では、細胞は、ヒト細胞である。

【0336】

特定の実施形態では、細胞における隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａの量の低減方法は、細胞をオリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と接触させることを含み、これらはいずれも、ＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、細胞は、ニューロンまたはグリア細胞である。特定の実施形態では、細胞は、アストロサイトまたはミクログリア細胞である。特定の実施形態では、細胞は、ヒト細胞である。

【0337】

特定の実施形態は、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患の治療における使用、またはＵＮＣ１３Ａと関連する疾患を治療するための医薬の製造における使用のためのオリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤に関し、これらはいずれも、ＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な核酸塩基配列を有する。特定の実施形態では、ＵＮＣ１３Ａと関連する疾患は、神経変性疾患である。特定の実施形態では、神経変性疾患は、筋萎縮性側索硬化症（ＡＬＳ）または前頭側頭型認知症（ＦＴＤ）である。

【0338】

本明細書に記載の方法または使用のいずれかでは、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、修飾オリゴヌクレオチド、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、本明細書に記載のいずれかであり得る。

【0339】

ＶＩＩ．特定の医薬組成物
特定の実施形態では、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤を含む医薬組成物が本明細書に記載される。特定の実施形態では、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤はそれぞれ、修飾オリゴヌクレオチドを含む。特定の実施形態では、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、またはアンチセンス剤はそれぞれ、修飾オリゴヌクレオチドからなる。特定の実施形態では、医薬組成物は、薬学的に許容される希釈剤または担体を含む。特定の実施形態では、医薬組成物は、滅菌生理食塩水と、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と、を含む、から本質的になる、またはからなる。特定の実施形態では、滅菌生理食塩水は、医薬品グレードの生理食塩水である。特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と、滅菌水と、を含む、から本質的になる、またはからなる。特定の実施形態では、滅菌水は、医薬品グレードの水である。特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と、リン酸緩衝生理食塩水（ＰＢＳ）と、を含む、から本質的になる、またはからなる。特定の実施形態では、滅菌ＰＢＳは、医薬品グレードのＰＢＳである。特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と、人工脳脊髄液（「人工ＣＳＦ」または「ａＣＳＦ」）と、を含む、から本質的になる、またはからなる。特定の実施形態では、人工脳脊髄液は、医薬品グレードの人工脳脊髄液である。

【0340】

特定の実施形態では、医薬組成物は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、アンチセンス剤、または修飾オリゴヌクレオチドと、ＰＢＳと、を含む。特定の実施形態では、医薬組成物は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、アンチセンス剤、または修飾オリゴヌクレオチドと、ＰＢＳと、からなる。特定の実施形態では、医薬組成物は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、アンチセンス剤、または修飾オリゴヌクレオチドと、ＰＢＳと、から本質的になる。特定の実施形態では、ＰＢＳは、医薬品グレードのものである。

【0341】

特定の実施形態では、医薬組成物は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、アンチセンス剤、または修飾オリゴヌクレオチドと、人工脳脊髄液（ａＣＳＦ）と、を含む。特定の実施形態では、医薬組成物は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、アンチセンス剤、または修飾オリゴヌクレオチドと、人工脳脊髄液と、からなる。特定の実施形態では、医薬組成物は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、アンチセンス剤、または修飾オリゴヌクレオチドと、人工脳脊髄液と、から本質的になる。特定の実施形態では、人工脳脊髄液は、医薬品グレードのものである。

【0342】

特定の実施形態では、ａＣＳＦは、塩化ナトリウム、塩化カリウム、リン酸二水素ナトリウム二水和物、無水二塩基性リン酸ナトリウム、塩化カルシウム二水和物、及び塩化マグネシウム六水和物を含む。特定の実施形態では、ａＣＳＦ溶液のｐＨは、適切なｐＨ調整剤（例えば、酸（塩酸など）及びアルカリ（水酸化ナトリウムなど））で約７．１～７．３の範囲または約７．２に調節される。

【0343】

特定の実施形態では、医薬組成物は、１つ以上のオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤と、１つ以上の賦形剤と、を含む。特定の実施形態では、賦形剤は、水、塩溶液、アルコール、ポリエチレングリコール、ゼラチン、ラクトース、アミラーゼ、ステアリン酸マグネシウム、タルク、ケイ酸、粘性パラフィン、ヒドロキシメチルセルロース及びポリビニルピロリドンから選択されている。

【0344】

特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、医薬組成物または医薬製剤を調製するために、薬学的に許容される活性及び／または不活性な物質に添加混合し得る。医薬組成物を調合するための組成物及び方法は、多くの基準（投与経路、疾患の程度または投与用量が挙げられるが、これらに限らない）によって決まる。

【0345】

特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤を含む医薬組成物は、そうしたオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、もしくはアンチセンス剤の任意の薬学的に許容される塩、そうしたオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、もしくはアンチセンス剤のエステル、またはそのようなエステルの塩を含む。特定の実施形態では、１つ以上の修飾オリゴヌクレオチドを含むオリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤を含む医薬組成物は、動物（ヒトを含む）に投与すると、生物学的に活性な代謝物またはその残留物を（直接的または間接的に）与えることが可能である。したがって、例えば、本開示は、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤の薬学的に許容される塩、プロドラッグ、そのようなプロドラッグの薬学的に許容される塩、及び他の生物学的同等物にも関する。特定の実施形態では、薬学的に許容される塩は、無機塩（一価または二価の無機塩など）を含む。適切な薬学的に許容される塩には、限定されないが、ナトリウム塩、カリウム塩、カルシウム塩、及びマグネシウム塩が含まれる。特定の実施形態では、プロドラッグは、修飾オリゴヌクレオチドに結合した１つ以上のコンジュゲート基を含み、コンジュゲート基は、体内の内在性ヌクレアーゼによって切断される。

【0346】

特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は凍結乾燥され、ナトリウム塩として単離される。特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤のナトリウム塩は、薬学的に許容される希釈剤と混合される。特定の実施形態では、薬学的に許容される希釈剤は、滅菌生理食塩水、滅菌水、ＰＢＳ、またはａＣＳＦを含む。特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤のナトリウム塩は、ＰＢＳと混合される。特定の実施形態では、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤のナトリウム塩は、ａＣＳＦと混合される。

【0347】

様々な方法における核酸療法で、脂質部分が用いられている。特定のこのような方法では、カチオン性脂質と中性脂質の混合物で作られた予め形成済みのリポソームまたはリポプレックスに核酸（オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤など）を導入する。特定の方法では、中性脂質の非存在下で、モノカチオン性脂質またはポリカチオン性脂質とのＤＮＡ複合体を形成する。特定の実施形態では、脂質部分は、医薬剤の特定の細胞または組織への分布を増大させるように選択する。特定の実施形態では、脂質部分は、医薬剤の脂肪組織への分布を増大させるように選択する。特定の実施形態では、脂質部分は、医薬剤の筋肉組織への分布を増大させるように選択する。特定の実施形態では、医薬組成物は、送達システムを含む。送達システムの例としては、リポソーム及びエマルジョンが挙げられるが、これらに限らない。特定の送達システムは、特定の医薬組成物（疎水性化合物を含む医薬組成物を含む）を調製するのに有用である。特定の実施形態では、ジメチルスルホキシドのような特定の有機溶媒が用いられている。

【0348】

特定の実施形態では、医薬組成物は、本発明の１つ以上の医薬剤を所定の種類の組織または細胞に送達するように設計された組織特異的な送達分子を１つ以上含む。例えば、特定の実施形態では、医薬組成物は、組織特異的な抗体で被覆されたリポソームを含む。

【0349】

特定の実施形態では、医薬組成物は、共溶媒システムを含む。特定のこのような共溶媒システムは、例えば、ベンジルアルコール、非極性界面活性剤、水混和性有機ポリマー及び水相を含む。特定の実施形態では、このような共溶媒システムは、疎水性化合物に用いられている。このような共溶媒システムの非限定的な例は、ＶＰＤ共溶媒システムであり、このシステムは、ベンジルアルコールを３％（ｗ／ｖ）、非極性界面活性剤Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ８０（商標）を８％（ｗ／ｖ）、及びポリエチレングリコール３００を６５％（ｗ／ｖ）含む無水エタノールの溶液である。このような共溶媒システムの比率は、その溶解性及び毒性の特徴をあまり大きく変化させなければ、かなり変化させてよい。さらに、共溶媒成分の内訳が変更されていてもよく、例えば、Ｐｏｌｙｓｏｒｂａｔｅ８０（商標）の代わりに、他の界面活性剤が用いられていてもよく、ポリエチレングリコールの割合の大きさが変更されていてもよく、ポリエチレングリコールが、その他の生体適合性ポリマー、例えばポリビニルピロリドンに置き換えられていてもよく、デキストロースが、その他の糖または多糖に置き換わっていてもよい。

【0350】

特定の実施形態では、医薬組成物は、経口投与用に調製されている。特定の実施形態では、医薬組成物は、口腔内投与用に調製されている。特定の実施形態では、医薬組成物は、注射（例えば、静脈内注射、皮下注射、筋肉内注射、髄腔内（ＩＴ）注射、脳室内（ＩＣＶ）注射など）による投与用に調製されている。特定のこのような実施形態では、医薬組成物は、担体を含み、水のような水性溶液、またはハンクス液、リンゲル液もしくは生理食塩水のような生理学的に適合する緩衝剤中に調合されている。特定の実施形態では、その他の成分（例えば、溶解性を補助するか、または成分保存剤として機能する成分）が含まれている。特定の実施形態では、適切な液体担体、懸濁化剤などを用いて、懸濁注射剤が調製されている。注射用の特定の医薬組成物は、単位剤形で、例えば、アンプルまたは複数回用量用容器で供給する。注射用の特定の医薬組成物は、油性または水性のビヒクル中の懸濁剤、液剤または乳剤であり、懸濁化剤、安定剤及び／または分散剤のような製剤化剤を含んでよい。注射用の医薬組成物で用いるのに適する特定の溶媒としては、親油性溶媒、ならびに脂肪油（ゴマ油など）、合成脂肪酸エステル（オレイン酸エチルまたはトリグリセリドなど）及びリポソームが挙げられるが、これらに限らない。

【0351】

特定の条件下では、本明細書で開示する特定の化合物は、酸として機能する。このような化合物は、プロトン化（遊離酸）形態、またはイオン化され、カチオンを伴う（塩）形態で描画または記載されている場合があるが、このような化合物の水溶液は、上記のような形態の間で平衡状態にある。例えば、水溶液中のオリゴヌクレオチドのリン酸結合は、遊離酸形態、アニオン形態及び塩形態の間で平衡状態にある。別段に示されていない限り、本明細書に記載されている化合物には、上記のような形態がすべて含まれるように意図されている。さらに、特定のオリゴヌクレオチドは、このような結合をいくつか有し、その各結合は、平衡状態にある。したがって、溶液中のオリゴヌクレオチドは、複数の位置における形態がすべて平衡状態にある集合体で存在する。「オリゴヌクレオチド」という用語には、このような形態がすべて含まれるように意図されている。描かれている構造には、やむを得ず、１つの形態が示されている。しかしその一方で、別段に示されていない限り、このような図面には、上記と同様に、対応する形態が含まれるように意図されている。本明細書では、化合物の遊離酸を示す構造の後に「またはその塩」あるいは「またはその薬学的に許容される塩」という用語が続く場合、完全または部分的にプロトン化し得る／脱プロトン化し得る／カチオンと結び付き得るそのような形態のすべてが明確に含まれる。特定の実施形態では、１つ以上の所定のカチオンが特定されている。カチオンには、限定されないが、ナトリウム、カリウム、カルシウム、またはマグネシウムが含まれ得る。

【0352】

特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、ナトリウム水溶液中に存在する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、カリウム水溶液中に存在する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、カルシウム水溶液中に存在する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、マグネシウム水溶液中に存在する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、ＰＢＳ中に存在する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、ａＣＳＦ中に存在する。特定の実施形態では、修飾オリゴヌクレオチド、オリゴマー剤、オリゴマー化合物、二本鎖オリゴマー、またはアンチセンス剤は、水中に存在する。特定のこのような実施形態では、その溶液のｐＨは、所望のｐＨとなるように、ＮａＯＨ及び／またはＨＣｌで調整されている。

【0353】

非限定的な開示及び参照による援用
本明細書に列挙されている文献及び特許出願はそれぞれ、参照により、その全体が援用される。

【0354】

本明細書に記載されている特定の化合物及び組成物について、特定の実施形態に従って具体的に説明されている一方で、下記の実施例は、本明細書に記載されている化合物を例示する役割を果たすに過ぎず、その化合物を限定するようには意図されていない。本願に示されている参考資料、ＧｅｎＢａｎｋアクセッション番号、ＥＮＳＥＭＢＬ識別子などはそれぞれ、参照により、その全体が本明細書に援用される。

【0355】

本出願に添付されている配列表には、必要に応じて「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」のいずれかとして各配列が示されているが、実際には、これらの配列は、化学修飾をいずれかに組み合わせたものによって修飾してもよい。修飾オリゴヌクレオチドを説明するために、上記のように「ＲＮＡ」または「ＤＮＡ」と称しているのは、特定の場合では、任意であることを当業者は容易に認識するであろう。例えば、２’－ＯＨ糖部分とチミン塩基を含むヌクレオシドを含むオリゴヌクレオチドは、修飾糖を有するＤＮＡ（ＤＮＡの２’－Ｈの１つが２’－ＯＨに置き換わっている）または修飾塩基を有するＲＮＡ（ＲＮＡのウラシルがチミン（メチル化ウラシル）に置き換わっている）として記載できる。したがって、本明細書で提供する核酸配列（配列表内の核酸配列が挙げられるが、これらに限らない）には、天然または修飾型のＲＮＡ及び／またはＤＮＡをいずれかに組み合わせたものを含む核酸が含まれるように意図されており、その核酸としては、修飾核酸塩基を有する核酸が挙げられるが、これらに限らない。さらなる例として、かつ以下に限定されるものではないが、「ＡＴＣＧＡＴＣＧ」という核酸塩基配列を有するオリゴマー化合物には、修飾されているか、修飾されていないかにかかわらず、このような核酸塩基配列を有するいずれのオリゴマー化合物も含まれ、その化合物としては、ＲＮＡ塩基を含む化合物（「ＡＵＣＧＡＵＣＧ」という配列を有する化合物など）、「ＡＵＣＧＡＴＣＧ」のように、いくつかのＤＮＡ塩基と、いくつかのＲＮＡ塩基を有する化合物、及び「ＡＴ^ｍＣＧＡＵＣＧ」（式中、^ｍＣは、５位にメチル基を含むシトシン塩基を示す）のように、他の修飾核酸塩基を有するオリゴマー化合物が挙げられるが、これらに限らない。

【0356】

本明細書に記載されている特定の化合物（例えば修飾オリゴヌクレオチド）は、不斉中心を１つ以上有するので、エナンチオマー、ジアステレオマー、及び絶対立体化学の観点で（Ｒ）もしくは（Ｓ）として、糖アノマーにおけるようにαもしくはβとして、またはアミノ酸におけるように（Ｄ）もしくは（Ｌ）などとして定義し得る他の立体異性配置が生じる。本明細書で提供する化合物のうち、特定の立体異性配置を有するものとして描写または記載されている化合物には、その示されている化合物のみが含まれる。本明細書で提供する化合物のうち、立体化学が定義されていないものとして描写または説明されている化合物には、他に断りがない限り、そのステレオランダムな形態及び光学的に純粋な形態を含め、考え得るあらゆる異性体が含まれる。同様に、別段に示されていない限り、その化合物の互変異性体も含まれる。別段に示されていない限り、本明細書に記載されている化合物には、対応する塩形態が含まれるように意図されている。

【0357】

本明細書に記載されている化合物には、１つ以上の原子が、その示されている元素の非放射性同位体または放射性同位体に置き換わっている変形形態が含まれる。例えば、水素原子を含む本明細書の化合物には、^１Ｈ水素原子のそれぞれが重水素に置換されたあらゆる考え得るケースが含まれる。本明細書の化合物に含まれる同位体置換としては、^１Ｈの^２Ｈまたは^３Ｈへの置換、^１２Ｃの^１３Ｃまたは^１４Ｃへの置換、^１４Ｎの^１５Ｎへの置換、^１６Ｏの^１７Ｏまたは^１８Ｏへの置換、及び^３２Ｓの^３３Ｓ、^３４Ｓ、^３５Ｓまたは^３６Ｓへの置換が挙げられるが、これらに限らない。特定の実施形態では、非放射性同位体置換により、治療ツールまたは研究ツールとして用いる際に有益である新たな特性をオリゴマー化合物に付与し得る。特定の実施形態では、放射性同位体置換により、その化合物が、研究目的または画像診断などの診断目的においてに適する化合物となり得る。

【実施例】

【0358】

下記の実施例は、本開示の特定の実施形態を例示するものであり、限定するものではない。さらに、具体的な実施形態が示されている場合、本発明者は、それらの具体的な実施形態の一般的適用を企図している。例えば、特定のモチーフを有するオリゴヌクレオチドの開示によって、同じモチーフまたは類似のモチーフを有する追加のオリゴヌクレオチドが合理的に網羅される。また、例えば、特定の高親和性の修飾が特定の位置に見られる場合、別段に示されていない限り、同じ位置にある他の高親和性の修飾は、好適なものとみなす。

【0359】

実施例１：ヒトＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を均一に有するＭＯＥ均一修飾オリゴヌクレオチドの設計
ヒトＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な修飾オリゴヌクレオチドを設計した。以下の表中の修飾オリゴヌクレオチドは、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を均一に有するＭＯＥ均一修飾オリゴヌクレオチドである。これらの修飾オリゴヌクレオチドのヌクレオシド長は１８である。これらの修飾オリゴヌクレオチドの糖モチーフは、（５’→３’）：ｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅｅであり、各「ｅ」は、２’－ＭＯＥ糖部分を表す。これらの修飾オリゴヌクレオチドのインターヌクレオシド結合モチーフは、（５’→３’）：ｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓｓであり、各「ｓ」は、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を表す。各シトシン残基は、５－メチルシトシンである。以下の表中の「開始部位」は、標的核酸配列中で修飾オリゴヌクレオチドが相補的な５’最末端ヌクレオシドを示す。以下の表中の「終結部位」は、標的核酸配列中で修飾オリゴヌクレオチドが相補的な３’最末端ヌクレオシドを示す。以下の表中に記載の各修飾オリゴヌクレオチドは、配列番号１（ＧＥＮＢＡＮＫアクセッション番号ＮＣ＿００００１９．１０のヌクレオシド１７５９８００１から１７６９１０００までの切断鎖の相補鎖）、配列番号２（ＧＥＮＢＡＮＫアクセッション番号ＮＭ＿００１０８０４２１．２）、またはこれらの両方と１００％相補的である。「Ｎ／Ａ」は、その特定の標的核酸配列と修飾オリゴヌクレオチドが１００％相補的ではないことを示す。

【0360】

【表1-1】

【0361】

【表1-2】

【0362】

【表1-3】

【0363】

【表1-4】

【0364】

【表1-5】

【0365】

【表1-6】

【0366】

【表1-7】

【0367】

【表1-8】

【0368】

【表1-9】

【0369】

実施例２：ヒトＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡに対する、ホスホロチオエートインターヌクレオシド結合を均一に有するＭＯＥ均一修飾オリゴヌクレオチドの単回用量でのインビトロ作用
ヒトＵＮＣ１３Ａ核酸と相補的な修飾オリゴヌクレオチド（上記のもの）を、ＵＮＣ１３Ａを発現する培養細胞中のＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡに対するインビトロでのその単回用量の作用について試験する。

【0370】

修飾オリゴヌクレオチドで培養細胞を処理し、ＲＮＡを抽出して、ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの定量的リアルタイムＲＴＰＣＲ解析用とする。プライマープローブセットＡを使用して、ＣＥ２０ｘ隠れエキソンを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を決定する。プライマープローブＢを使用して、ＣＥ２０ｘ隠れエキソンが排除されているＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を決定する。プライマープローブセットＣを使用して、全ＵＮＣ１３Ａの量を決定する。

【0371】

修飾オリゴヌクレオチドは、ＣＥ２０ｘを含むＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を低減することが明らかになっている。修飾オリゴヌクレオチドは、ＣＥ２０ｘが排除されているＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を増加させることが明らかになっている。修飾オリゴヌクレオチドは、全ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量を増加させることが明らかになっている。

【0372】

実施例３：ヒトＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡと相補的な修飾オリゴヌクレオチドの活性
ヒトＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡと相補的な修飾オリゴヌクレオチドを、ＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡに対するインビトロでのその単回用量の作用について試験した。下記の培養条件を有する一連の実験において修飾オリゴヌクレオチドを試験した。

【0373】

修飾オリゴヌクレオチドでの処理に先立って、１００μＭのシクロヘキシミドで培養ＳＨ－ＳＹ５Ｙ細胞を２４時間処理した。その後、電気穿孔によって、７，０００ｎＭの濃度の修飾オリゴヌクレオチドで１００，０００個細胞／ウェルの密度のＳＨ－ＳＹ５Ｙ細胞を処理し、シクロヘキシミド含有培地に播種し戻した。約２４時間の処理時間後に、細胞から全ＲＮＡを単離し、定量的リアルタイムＲＴＰＣＲによってＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡレベルを測定した。

【0374】

ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６２（隠れエキソン１を特異的に認識するように設計されていることから、隠れエキソン１を含むＲＮＡが測定される）（フォワード配列ＧＴＡＣＡＡＣＣＴＧＧＡＣＡＡＧＣＧＡＡＣＴ（本明細書では配列番号６として示される）、リバース配列ＧＧＡＡＡＣＣＣＡＧＧＣＡＧＣＴＣＡＴ（本明細書では配列番号７として示される）、プローブ配列ＡＴＣＡＡＡＧＧＣＧＡＧＧＡＧＡＡＧＧＴＧＧＣ（本明細書では配列番号８として示される））によってＵＮＣＡ１３Ａ ＲＮＡレベルを測定した（以下の表に示される）。

【0375】

ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６３（３つすべての隠れエキソンを認識するように設計されていることから、ＵＮＣ１３Ａのエキソン２０とエキソン２１との間の３つの隠れエキソンのいずれを含むＲＮＡも測定される（隠れエキソンの完全網羅））（フォワード配列ＴＧＧＡＴＧＧＡＧＡＧＡＴＧＧＡＡＣＣＴ（本明細書では配列番号９として示される）、リバース配列ＧＧＧＣＴＧＴＣＴＣＡＴＣＧＴＡＧＴＡＡＡＣ（本明細書では配列番号１０として示される）、プローブ配列ＴＴＧＧＣＡＴＣＴＧＧＧＡＴＣＴＴＣＡＣＧＡＣＣ（本明細書では配列番号１１として示される））によってもＵＮＣＡ１３Ａ ＲＮＡレベルを測定した（以下の表に示される）。

【0376】

ヒトプライマープローブセットＲＴＳ５４３６５（隠れエキソンの完全排除（「排除転写産物」）を特異的に検出するように設計されていることから、ＵＮＣ１３Ａのエキソン２０とエキソン２１との間に隠れエキソン１、隠れエキソン２、及び隠れエキソン３を含まないＲＮＡが測定される）（フォワード配列ＣＡＣＣＴＧＴＣＴＧＣＡＴＧＡＧＡＡＣＣＴ（本明細書では配列番号１２として示される）、リバース配列ＣＡＴＧＧＣＡＡＡＣＴＣＧＴＣＣＡＣＡＡＴＣ（本明細書では配列番号１３として示される）、プローブ配列ＴＡＡＡＣＣＴＴＣＣＡＧＧＣＡＴＣＧＴＣＡＣＣＣ（本明細書では配列番号１４として示される））によってもＵＮＣＡ１３Ａ ＲＮＡレベルを測定した（以下の表に示される）。３つすべての隠れエキソンが排除されている転写産物（「排除転写産物」）の固有発現のＲＴＳ５４３６５による認識量は、ＲＴＳ５４３６２またはＲＴＳ５４３６３による転写産物（「含有転写産物」）の認識量よりも顕著に多いことから、含有転写産物のレベルの低下時でも、排除転写産物のレベルは不変のままであるか、またはわずかに増加するものと予想される。

【0377】

ＲＩＢＯＧＲＥＥＮ（登録商標）によって測定した全ＲＮＡ含量でＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡレベルを正規化した。以下の表には、非処理対照細胞中のＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの量に対するＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡのパーセント（％ＵＴＣ）としてＵＮＣ１３Ａ ＲＮＡの減少が示される。「†」で印付けされた値は、修飾オリゴヌクレオチドがプライマープローブセットのアンプリコン領域と相補的であることを示す。アンプリコン領域と相補的な修飾オリゴヌクレオチドの効力及び有効性の測定には、追加のアッセイを使用することができる。

【0378】

【表2-1】

【0379】

【表2-2】

【0380】

【表2-3】

【0381】

【表3-1】

【0382】

【表3-2】

【0383】

【表3-3】

【0384】

【表4-1】

【0385】

【表4-2】

【0386】

【表4-3】

【0387】

【表5-1】

【0388】

【表5-2】

【0389】

【表5-3】

【配列表】

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【国際調査報告】