特表 2024-524554 ピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストによる静脈瘤の処置

(19)【発行国】日本国特許庁(JP)

(12)【公報種別】公表特許公報(A)

(11)【公表番号】

(43)【公表日】2024-07-05

(54)【発明の名称】ピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストによる静脈瘤の処置

(51)【国際特許分類】

   A61K 45/00 20060101AFI20240628BHJP

   A61K 45/06 20060101ALI20240628BHJP

   A61P 9/14 20060101ALI20240628BHJP

   A61K 31/497 20060101ALI20240628BHJP

   A61K 31/341 20060101ALI20240628BHJP

   A61K 31/381 20060101ALI20240628BHJP

   A61P 43/00 20060101ALI20240628BHJP

   C12Q 1/6883 20180101ALI20240628BHJP

   C12Q 1/6827 20180101ALI20240628BHJP

   C12Q 1/6874 20180101ALI20240628BHJP

   C12Q 1/686 20180101ALI20240628BHJP

   G01N 33/53 20060101ALI20240628BHJP

【ＦＩ】

A61K45/00

A61K45/06

A61P9/14

A61K31/497

A61K31/341

A61K31/381

A61P43/00 121

C12Q1/6883 Z ZNA

C12Q1/6827 Z

C12Q1/6874 Z

C12Q1/686 Z

G01N33/53 M

【審査請求】未請求

【予備審査請求】未請求

(21)【出願番号】P 2024500281

(86)(22)【出願日】2022-07-05

(85)【翻訳文提出日】2024-03-04

(86)【国際出願番号】 US2022073441

(87)【国際公開番号】W WO2023283560

(87)【国際公開日】2023-01-12

(31)【優先権主張番号】63/219,462

(32)【優先日】2021-07-08

(33)【優先権主張国・地域又は機関】US

(81)【指定国・地域】

(71)【出願人】

【識別番号】597160510

【氏名又は名称】リジェネロン・ファーマシューティカルズ・インコーポレイテッド

【氏名又は名称原語表記】ＲＥＧＥＮＥＲＯＮ ＰＨＡＲＭＡＣＥＵＴＩＣＡＬＳ， ＩＮＣ．

(74)【代理人】

【識別番号】100105957

【弁理士】

【氏名又は名称】恩田 誠

(74)【代理人】

【識別番号】100068755

【弁理士】

【氏名又は名称】恩田 博宣

(74)【代理人】

【識別番号】100142907

【弁理士】

【氏名又は名称】本田 淳

(74)【代理人】

【識別番号】100152489

【弁理士】

【氏名又は名称】中村 美樹

(72)【発明者】

【氏名】フェレイラ、マヌエル アレン レベズ

(72)【発明者】

【氏名】バックマン、ジョシュア

(72)【発明者】

【氏名】リー、アレクサンダー

(72)【発明者】

【氏名】バラス、アリス

(72)【発明者】

【氏名】アベカシス、ゴンサロ

【テーマコード（参考）】

4B063

4C084

4C086

【Ｆターム（参考）】

4B063QA01

4B063QA13

4B063QA18

4B063QA19

4B063QQ03

4B063QQ52

4B063QR08

4B063QR55

4B063QR62

4B063QS25

4B063QS34

4B063QS39

4B063QS40

4B063QX01

4C084AA17

4C084AA20

4C084MA02

4C084NA05

4C084NA14

4C084ZA361

4C084ZA362

4C084ZC751

4C084ZC752

4C086AA01

4C086AA02

4C086BA03

4C086BB02

4C086BC48

4C086GA02

4C086GA04

4C086GA07

4C086GA10

4C086MA01

4C086MA04

4C086NA05

4C086NA14

4C086ZA36

(57)【要約】

本開示は、静脈瘤を有するかまたは静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法、静脈瘤を発症する増加したリスクを有する対象を同定する方法、ならびにピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）バリアント核酸分子及びバリアントポリペプチドを検出する方法を提供する。

【特許請求の範囲】

【請求項1】

静脈瘤を有するかまたは静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法であって、前記対象にピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストを投与することを含む、前記方法。

【請求項2】

伏在静脈瘤を有するかまたは伏在静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法であって、前記対象にピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストを投与することを含む、前記方法。

【請求項3】

網状静脈瘤を有するかまたは網状静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法であって、前記対象にピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストを投与することを含む、前記方法。

【請求項4】

クモ状静脈を有するかまたはクモ状静脈を発症するリスクがある対象を処置する方法であって、前記対象にピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストを投与することを含む、前記方法。

【請求項5】

妊娠関連静脈瘤を有するかまたは妊娠関連静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法であって、前記対象にピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストを投与することを含む、前記方法。

【請求項6】

前記ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、小分子を含む、請求項１～５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項7】

前記小分子アゴニストはＹｏｄａ１である、請求項６に記載の方法。

【請求項8】

前記小分子アゴニストはＪｅｄｉ１である、請求項６に記載の方法。

【請求項9】

前記小分子アゴニストはＪｅｄｉ２である、請求項６に記載の方法。

【請求項10】

前記対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の存在または非存在を検出することをさらに含む、請求項１～９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項11】

標準的な投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を対象に投与することをさらに含み、前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子が前記生物学的サンプルに存在しない、請求項１０に記載の方法。

【請求項12】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である対象に標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与することをさらに含む、請求項１０に記載の方法。

【請求項13】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕをコードする、請求項１０～１２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項14】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、
配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子；
配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子；または
ｍＲＮＡ分子から生成されたｃＤＮＡ分子であって、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する前記ｃＤＮＡ分子である、請求項１３に記載の方法。

【請求項15】

前記検出工程は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで行われる、請求項１０～１４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項16】

前記検出工程は、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子である、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項17】

前記検出工程は、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子である、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項18】

前記検出工程は、前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む場合、前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子である、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項19】

前記検出工程は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項20】

前記検出工程は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項21】

前記検出工程は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項22】

前記検出工程は、前記核酸分子全体をシーケンシングすることを含む、請求項１６～２１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項23】

前記検出工程は、
ａ）前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項24】

前記検出工程は、
ａ）前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項25】

前記検出工程は、
ａ）前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項26】

前記サンプルにおける前記核酸分子は、ｍＲＮＡであり、前記ｍＲＮＡは、前記増幅工程の前にｃＤＮＡに逆転写される、請求項２５に記載の方法。

【請求項27】

前記検出工程は、
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項28】

前記検出工程は、
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項29】

前記検出工程は、
前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項１０～１５のいずれか１項に記載の方法。

【請求項30】

静脈瘤を処置または予防する治療剤で対象を処置する方法であって、前記対象は、静脈瘤を有するか、または静脈瘤を発症するリスクがあり、前記方法は、
前記対象がピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有するかどうかを、
前記対象から生物学的サンプルを得ることまたは得たこと；及び
前記対象が前記ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードする前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために前記生物学的サンプルについて配列分析を実施することまたは実施したこと
によって決定すること；ならびに
ＰＩＥＺＯ１参照である対象に標準的な投薬量で静脈瘤を処置もしくは予防する前記治療剤を投与することもしくは投与を継続すること、及び／または前記対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与すること；ならびに
前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である対象に標準的な投薬量と同じもしくはそれより少ない量で静脈瘤を処置もしくは予防する前記治療剤を投与することもしくは投与を継続すること、及び／または前記対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与すること
を含み、前記ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードする前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在は、前記対象が静脈瘤を発症する低下したリスクを有することを示す、前記方法。

【請求項31】

前記対象は、ＰＩＥＺＯ１参照であり、前記対象は、標準的な投薬量で静脈瘤を処置または予防する前記治療剤を投与されるか、または投与を継続され、かつＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される、請求項３０に記載の方法。

【請求項32】

前記対象は、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合であり、前記対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない量で静脈瘤を処置または予防する前記治療剤を投与されるか、または投与を継続され、かつＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される、請求項３０に記載の方法。

【請求項33】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕをコードする、請求項３０～３２のいずれか１項に記載の方法。

【請求項34】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、
配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子；
配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子；または
ｍＲＮＡ分子から生成されたｃＤＮＡ分子であって、配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する前記ｃＤＮＡ分子である、請求項３３に記載の方法。

【請求項35】

前記配列分析は、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記シーケンシングされる部分が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子である、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項36】

前記配列分析は、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子である、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項37】

前記配列分析は、前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子である、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項38】

前記配列分析は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項39】

前記配列分析は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項40】

前記配列分析は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項41】

前記配列分析は、前記核酸分子全体をシーケンシングすることを含む、請求項３５～４０のいずれか１項に記載の方法。

【請求項42】

前記配列分析は、
ａ）前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項43】

前記配列分析は、
ａ）前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項44】

前記配列分析は、
ａ）前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項45】

前記サンプルにおける前記核酸分子は、ｍＲＮＡであり、前記ｍＲＮＡは、前記増幅工程の前にｃＤＮＡに逆転写される、請求項４４に記載の方法。

【請求項46】

前記配列分析は、
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項47】

前記配列分析は、
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項48】

前記配列分析は、
前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項３０～３４のいずれか１項に記載の方法。

【請求項49】

前記核酸分子は、前記対象から得られた細胞内に存在する、請求項３０～４８のいずれか１項に記載の方法。

【請求項50】

前記ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、小分子を含む、請求項３０～４９のいずれか１項に記載の方法。

【請求項51】

前記小分子アゴニストはＹｏｄａ１である、請求項５０に記載の方法。

【請求項52】

前記小分子アゴニストはＪｅｄｉ１である、請求項５０に記載の方法。

【請求項53】

前記小分子アゴニストはＪｅｄｉ２である、請求項５０に記載の方法。

【請求項54】

静脈瘤を発症する増加したリスクを有する対象を同定する方法であって、前記方法は、
前記対象から得られた生物学的サンプルにおけるピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の存在または非存在を決定することまたは決定したことを含み；
前記対象がＰＩＥＺＯ１参照である場合、前記対象は、静脈瘤を発症する増加したリスクを有し；
前記対象が前記ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合またはホモ接合である場合、前記対象は、静脈瘤を発症する低下したリスクを有する、前記方法。

【請求項55】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕをコードする、請求項５４に記載の方法。

【請求項56】

前記ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、
配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子；
配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子；または
ｍＲＮＡ分子から生成されたｃＤＮＡ分子であって、配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する前記ｃＤＮＡ分子である、請求項５５に記載の方法。

【請求項57】

前記決定工程は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで行われる、請求項５４～５６のいずれか１項に記載の方法。

【請求項58】

前記決定工程は、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子である、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項59】

前記決定工程は、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む場合、前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子である、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項60】

前記決定工程は、前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子の前記ヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、前記シーケンシングされる部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含み；
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子の前記シーケンシングされる部分が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む場合、前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子である、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項61】

前記決定工程は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項62】

前記決定工程は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項63】

前記決定工程は、
ａ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、前記生物学的サンプルを接触させること；
ｂ）前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する前記位置を少なくとも介して、前記プライマーを伸長させること；及び
ｃ）前記プライマーの前記伸長産物が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項64】

前記決定工程は、前記核酸分子全体をシーケンシングすることを含む、請求項５８～６３のいずれか１項に記載の方法。

【請求項65】

前記決定工程は、
ａ）前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項66】

前記決定工程は、
ａ）前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項67】

前記決定工程は、
ａ）前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、前記部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、前記増幅させること；
ｂ）前記増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；
ｃ）前記標識された核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む前記増幅した核酸分子の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
ｄ）前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項68】

前記サンプルにおける前記核酸分子は、ｍＲＮＡであり、前記ｍＲＮＡは、前記増幅工程の前にｃＤＮＡに逆転写される、請求項６７に記載の方法。

【請求項69】

前記決定工程は、
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む前記ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項70】

前記決定工程は、
前記生物学的サンプルにおける前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む前記ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項71】

前記決定工程は、
前記生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成された前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、前記変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む前記ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の前記ヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、前記接触させること；及び
前記検出可能な標識を検出すること
を含む、請求項５４～５７のいずれか１項に記載の方法。

【請求項72】

前記対象は、ＰＩＥＺＯ１参照であり、前記方法は、前記対象に標準的な投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与すること、及び前記対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することをさらに含む、請求項５４～７１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項73】

前記対象は、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合であり、前記方法は、前記対象に標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与すること、及び前記対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することをさらに含む、請求項５４～７１のいずれか１項に記載の方法。

【請求項74】

静脈瘤を処置または予防する治療剤であって、
ピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子もしくはその相補体であって、前記ゲノム核酸分子は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、前記ゲノム核酸分子もしくはその相補体；
ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｍＲＮＡ分子もしくはその相補体であって、前記ｍＲＮＡ分子は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、前記ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体；または
ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｃＤＮＡ分子もしくはその相補体であって、前記ｃＤＮＡ分子は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、前記ｃＤＮＡ分子もしくはその相補体
を有するものとして同定された対象における静脈瘤の処置または予防において使用するための、前記治療剤。

【請求項75】

ピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストであって、
ａ）ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子、もしくはＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子についての参照である対象；または
ｂ）ヘテロ接合である対象であって、
ｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子もしくはその相補体であって、前記ゲノム核酸分子は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、前記ゲノム核酸分子もしくはその相補体；
ｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能喪失ポリペプチドをコードするｍＲＮＡ分子もしくはその相補体であって、前記ｍＲＮＡ分子は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、前記ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体；もしくは
ｉｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｃＤＮＡ分子もしくはその相補体であって、前記ｃＤＮＡ分子は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、前記ｃＤＮＡ分子もしくはその相補体
についてヘテロ接合である前記対象における静脈瘤の処置または予防において使用するための、前記ピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニスト。

【請求項76】

小分子アゴニストである、請求項７５に記載のＰＩＥＺＯ１アゴニスト。

【請求項77】

前記小分子アゴニストはＹｏｄａ１である、請求項７６に記載のＰＩＥＺＯ１アゴニスト。

【請求項78】

前記小分子アゴニストはＪｅｄｉ１である、請求項７６に記載のＰＩＥＺＯ１アゴニスト。

【請求項79】

前記小分子アゴニストはＪｅｄｉ２である、請求項７６に記載のＰＩＥＺＯ１アゴニスト。

【発明の詳細な説明】

【技術分野】

【0001】

配列表に対する言及
本出願には、５４２キロバイトのサイズを有する、２０２２年７月２日に作成された１８９２３８０８４０２ＳＥＱという名称のテキストファイルとして電子提出された配列表が含まれる。配列表は、参照により本明細書に組み込まれる。

【0002】

本開示は概して、ピエゾ型機械受容イオンチャネル成分１（ＰＩＥＺＯ１）アゴニストによる、静脈瘤を有するかまたは静脈瘤を発症するリスクがある対象の処置、及び静脈瘤を発症する増加したリスクを有する対象を同定する方法に関する。

【背景技術】

【0003】

静脈瘤は、慢性静脈不全を有する患者にしばしば見られる、遺伝的ドライバーの大部分が未知である高頻度多因子疾患であり、慢性静脈不全と共に慢性静脈疾患に分類される。静脈弁の機能不全は、静脈瘤、静脈性高血圧、及び血栓症に関連している。血流力の変化、内皮活性化、炎症、低酸素、ならびにマトリックスメタロプロテイナーゼ及びその組織アゴニストの調節不全等、いくつかのプロセスが静脈瘤発症に関連している。静脈瘤のリスク因子としては、加齢、女性、妊娠回数、肥満、深部静脈血栓症歴、及び立ち仕事が挙げられる。静脈瘤は、不十分なリンパ排出及び慢性静脈不全にも関係付けられている。さらに、いくつかのゲノムワイド関連研究（ＧＷＡＳ）により、約１８．５％の静脈瘤遺伝率が示された。

【0004】

ＰＩＥＺＯ１は、１６ｑ２４．３に位置する７０ｋｂ遺伝子によってコードされ、可能性のある５つのアイソフォームとして存在する。ＰＩＥＺＯ１タンパク質は、２，５２１アミノ酸長であり、３８の膜貫通ドメインを含有しホモ四量体として機能する２８６ｋＤａの膜貫通タンパク質である。ＰＩＥＺＯ１は、ルテニウムレッド及びガドリニウムに対して感受性がある直線的な電流電圧関係によって特徴付けられる電流を生成する、進化的に保存された内皮の機械受容陽イオンチャネルをコードする。ＰＩＥＺＯ１は普遍的に発現され、おそらくはその活性化状態における小胞体へのＲ－Ｒａｓの動員及びその後のカルパインシグナル伝達の刺激によってインテグリン活性化を維持することにより上皮細胞接着に関与している。脈管構造において、ＰＩＥＺＯ１は内皮細胞の移動及び発芽型血管新生に関与している。具体的には、ＰＩＥＺＯ１は血流関連せん断応力のセンサーとして作用し、血流方向における内皮細胞の編成及び配向を促進することで、適切な血管形成、リモデリング、及び成熟を確実にする。ＰＩＥＺＯ１は、リンパ弁形成に必要であるとも考えられる。報告されている他の機能には、血圧調節、尿浸透圧、赤血球完全性、圧力感知、及び集合管浸透圧調節が含まれる。

【発明の概要】

【課題を解決するための手段】

【0005】

本開示は、静脈瘤を有するかまたは静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。
本開示はまた、伏在静脈瘤を有するかまたは伏在静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0006】

本開示はまた、網状静脈瘤を有するかまたは網状静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0007】

本開示はまた、クモ状静脈を有するかまたはクモ状静脈を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0008】

本開示はまた、妊娠関連静脈瘤を有するかまたは妊娠関連静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0009】

本開示はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤で対象を処置する方法を提供し、該対象は、静脈瘤を有するか、または静脈瘤を発症するリスクがあり、該方法は、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有するかどうかを、対象から生物学的サンプルを得ることまたは得たこと；及び対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生物学的サンプルについて配列分析を実施することまたは実施したことによって決定すること；ならびにＰＩＥＺＯ１参照である対象に標準的な投薬量で静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤を投与することもしくは投与を継続すること、及び／または対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与すること；ならびにＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である対象に標準的な投薬量と同じもしくはそれより少ない量で静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤を投与することもしくは投与を継続すること、及び／または対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含み、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在は、対象が静脈瘤を発症する低下したリスクを有することを示す。

【0010】

本開示はまた、静脈瘤を発症する増加したリスクを有する対象を同定する方法を提供し、該方法は、対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の存在または非存在を決定することまたは決定したことを含み；対象がＰＩＥＺＯ１参照である場合、対象は、静脈瘤を発症する増加したリスクを有し；対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合またはホモ接合である場合、対象は、静脈瘤を発症する低下したリスクを有する。

【0011】

本開示はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤であって、ｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子もしくはその相補体であって、ゲノム核酸分子は、ｉ）配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ゲノム核酸分子もしくはその相補体；ｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｍＲＮＡ分子もしくはその相補体であって、ｍＲＮＡ分子は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体；またはｉｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｃＤＮＡ分子もしくはその相補体であって、ｃＤＮＡ分子は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｃＤＮＡ分子もしくはその相補体を有するものとして同定された対象における静脈瘤の処置または予防において使用するための、治療剤を提供する。

【0012】

本開示はまた、ＰＩＥＺＯ１アゴニストであって、ａ）ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子、もしくはＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子についての参照である対象；またはｂ）ヘテロ接合である対象であって、ｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子もしくはその相補体であって、ゲノム核酸分子は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ゲノム核酸分子もしくはその相補体；ｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｍＲＮＡ分子もしくはその相補体であって、ｍＲＮＡ分子は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；もしくは配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体；もしくはｉｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｃＤＮＡ分子もしくはその相補体であって、ｃＤＮＡ分子は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｃＤＮＡ分子もしくはその相補体についてヘテロ接合である対象における静脈瘤の処置または予防において使用するための、ＰＩＥＺＯ１アゴニストを提供する。

【発明を実施するための形態】

【0013】

本開示の態様に関する様々な用語が本明細書及び特許請求の範囲を通して使用される。そのような用語には、別途示されない限り、当該技術分野におけるそれらの通常の意味が与えられるものとする。他の具体的に定義される用語は、本明細書に提供される定義と一致した様式で解釈されるものとする。

【0014】

別途明示的に記述されない限り、本明細書において示される任意の方法または態様は、その工程が特定の順序で実施されることを要求するものとして解釈されるようには意図されない。したがって、方法の請求項が、工程が特定の順序に限定されるべきことを、特許請求の範囲または明細書において具体的に記述していない場合、いかなる点でも、順序が暗示されることは意図されていない。これは、ステップもしくは動作フローの配置に関する論理の問題、文法構成もしくは句読点に由来する平明な意味、または本明細書中に記載される態様の数もしくは型を含めた解釈のためのあらゆる可能性のある表示されていない基準についても当てはまる。

【0015】

本明細書で使用される場合、単数形「ａ」、「ａｎ」及び「ｔｈｅ」には、文脈が別途明らかに示さない限り複数の指示対象が含まれる。
本明細書で使用される場合、用語「約」は、記述される数値がおおよそであり、小さな変動が、開示される実施形態の実施に有意に影響を及ぼさないであろうことを意味する。数値が使用される場合、文脈によって別途示されない限り、用語「約」は、±１０％変動し、開示される実施形態の範囲内にとどまり得る数値を意味する。

【0016】

本明細書で使用される場合、用語「含む」は、特定の実施形態では、所望により、「からなる」または「から本質的になる」で置き換えられ得る。
本明細書で使用される場合、核酸分子またはポリペプチドに関して、用語「単離された」は、核酸分子またはポリペプチドが、例えば、血液及び／または他の組織とは別として、そのネイティブ環境以外の状態にあることを意味する。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子またはポリペプチドは、他の核酸分子または他のポリペプチド、特に動物起源の他の核酸分子またはポリペプチドを実質的に含まない。いくつかの実施形態では、核酸分子またはポリペプチドは、高度に精製された形態、すなわち、９５％を超えて純粋または９９％を超えて純粋であり得る。この文脈において使用される場合、用語「単離された」は、二量体または代替的にリン酸化もしくは誘導体化された形態等の、代替的な物理的形態の同じ核酸分子またはポリペプチドの存在を排除しない。

【0017】

本明細書で使用される場合、用語「核酸」、「核酸分子」、「核酸配列」、「ポリヌクレオチド」、または「オリゴヌクレオチド」は、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を含み得、ＤＮＡ及び／またはＲＮＡを含み得、一本鎖、二本鎖、または多重鎖であり得る。核酸の一方の鎖はまた、その相補体を指す。

【0018】

本明細書で使用される場合、用語「対象」には、哺乳動物を含む任意の動物が含まれる。哺乳動物には、牧場動物（例えば、ウマ、ウシ、ブタ等）、コンパニオン動物（例えば、イヌ、ネコ等）、実験動物（例えば、マウス、ラット、ウサギ等）、及び非ヒト霊長類（例えば、類人猿及びサル等）が含まれるがこれらに限定されない。いくつかの実施形態では、対象は、ヒトである。いくつかの実施形態では、対象は、医師のケア下の患者である。

【0019】

ヒトにおける静脈瘤を発症する低下したリスクに関連するＰＩＥＺＯ１遺伝子の推定機能獲得（ＧＯＦ）ミスセンスバリアントが、本開示によって同定された。具体的には、ＰＩＥＺＯ１参照ゲノム核酸分子（配列番号１参照）における６９，５７９位のシトシンをチミンに変化させる遺伝子変化は、そのような変化を有する対象が静脈瘤を発症する低下したリスクを有し得ることを示すことが観察された。要するに、本明細書に記載の遺伝子分析は、驚くべきことに、ＰＩＥＺＯ１遺伝子、そして特にＰＩＥＺＯ１遺伝子のｐＧＯＦが、静脈瘤を発症する低下したリスクに関連することを示している。そのため、伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、または妊娠関連静脈瘤等の静脈瘤を発症する増加したリスクを有するＰＩＥＺＯ１参照である対象は、静脈瘤が予防され、その症状が低減され、及び／または症状の進行が抑制されるように処置され得る。したがって、本開示は、リスクがある対象または活動性疾患を有する対象が適宜処置され得るように、対象におけるそのようなバリアントの同定を活用して、伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、もしくは妊娠関連静脈瘤等の静脈瘤を発症するそのような対象におけるリスクを同定もしくは層別化するか、または伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、もしくは妊娠関連静脈瘤等の静脈瘤を発症する増加したリスクを有するものとして対象を診断する方法を提供する。

【0020】

本開示により、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子が（これらのバリエーションが特定の対象においてホモ接合であるかヘテロ接合であるかにかかわらず）、静脈瘤を発症する低下したリスクと関連することがさらに観察された。さらに、本開示による追加のバリアントと遺伝子負荷マスクとの関連の同定は、ＰＩＥＺＯ１自体が（別の遺伝子のバリアントとの連鎖不平衡ではなく）静脈瘤における保護効果の原因であることを示す。

【0021】

本開示の目的ため、任意の特定の対象は、３つのＰＩＥＺＯ１遺伝子型：ｉ）ＰＩＥＺＯ１参照；ｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合；またはｉｉｉ）ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてホモ接合のうちの１つを有するものとして分類され得る。対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のコピーを有しない場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１参照である。対象がＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の単一コピーを有する場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である。本明細書で使用される場合、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、部分的機能獲得、完全機能獲得、予測される部分的機能獲得、または予測される完全機能獲得を有するＰＩＥＺＯ１ポリペプチドをコードする任意のＰＩＥＺＯ１核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）である。部分的機能獲得（または予測される部分的機能獲得）を有するＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有する対象は、ＰＩＥＺＯ１についてハイポモルフィックである。ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕをコードする任意の核酸分子であり得る。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕをコードする。対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を２コピー有する場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてホモ接合である。

【0022】

ＰＩＥＺＯ１参照であるとジェノタイピングまたは決定された対象について、そのような対象は、伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、または妊娠関連静脈瘤等の静脈瘤を発症する増加したリスクを有する。ＰＩＥＺＯ１参照またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合のいずれかであるとジェノタイピングまたは決定された対象について、そのような対象は、ＰＩＥＺＯ１アゴニストで処置され得る。

【0023】

本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、部分的機能獲得、完全機能獲得、予測される部分的機能獲得、または予測される完全機能獲得を有するＰＩＥＺＯ１ポリペプチドをコードする任意のＰＩＥＺＯ１核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子等）であり得る。例えば、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕをコードする任意の核酸分子であり得る。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕをコードする。

【0024】

本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは、部分的機能獲得、完全機能獲得、予測される部分的機能獲得、または予測される完全機能獲得を有する任意のＰＩＥＺＯ１ポリペプチドであり得る。本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは、例えば、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕを含む、本明細書に記載されるＰＩＥＺＯ１ポリペプチドのいずれでもよい。本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕであり得る。

【0025】

本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、静脈瘤は、伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、または妊娠関連静脈瘤である。本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、静脈瘤は、伏在静脈瘤である。本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、静脈瘤は、網状静脈瘤である。本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、静脈瘤は、クモ状静脈である。本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、静脈瘤は、妊娠関連静脈瘤である。

【0026】

静脈瘤の症状は、脚のだるさ、罹患下肢におけるクモ状静脈の出現（毛細血管拡張症）、足首の腫脹（特に夜間）、罹患静脈付近の褐色から黄色の光沢のある皮膚の変色、皮膚の一部の赤み、乾燥、及びそう痒（うっ滞性皮膚炎または静脈性湿疹という）、筋痙攣（特に起立等の急な動作を行う際に発生）、罹患部の軽度傷害、出血が正常時より多いもしくは治癒に長時間を要すること、足首より上の皮膚の収縮（脂肪皮膚硬化）、脚不穏症候群、足首に現れる白化した不規則な瘢痕様斑部（白色萎縮）、またはそれらのいずれかの組み合わせを含むが、これらに限定されない。

【0027】

本開示は、静脈瘤を有するかまたは静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。
本開示はまた、伏在静脈瘤を有するかまたは伏在静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0028】

本開示はまた、網状静脈瘤を有するかまたは網状静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0029】

本開示はまた、クモ状静脈を有するかまたはクモ状静脈を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0030】

本開示はまた、妊娠関連静脈瘤を有するかまたは妊娠関連静脈瘤を発症するリスクがある対象を処置する方法を提供し、該方法は、対象にＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与することを含む。

【0031】

いくつかの実施形態では、処置方法は、対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の存在または非存在を検出することをさらに含む。本開示を通して使用される場合、「ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子」は、部分的機能獲得、完全機能獲得、予測される部分的機能獲得、または予測される完全機能獲得を有するＰＩＥＺＯ１ポリペプチドをコードする任意のＰＩＥＺＯ１核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子等）である。

【0032】

本開示はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤で対象を処置する方法も提供する。いくつかの実施形態では、対象は静脈瘤を有する。いくつかの実施形態では、対象は静脈瘤を発症するリスクがある。いくつかの実施形態では、該方法は、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有するかどうかを、対象から生物学的サンプルを得ることまたは得たこと、及び対象がＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を含む遺伝子型を有するかどうかを決定するために生物学的サンプルについて配列分析を実施することまたは実施したことによって決定することを含む。対象がＰＩＥＺＯ１参照である場合、静脈瘤を処置または予防する治療剤が標準的な投薬量で対象に投与されるか、もしくは投与が継続され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストが対象に投与される。対象がＰＩＥＺＯ１バリアントについてヘテロ接合である場合、静脈瘤を処置または予防する治療剤が標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない量で対象に投与されるか、もしくは投与が継続され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストが対象に投与される。ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有する遺伝子型の存在は、対象が静脈瘤を発症する低下したリスクを有することを示す。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１参照である。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である。

【0033】

ＰＩＥＺＯ１参照またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合のいずれかであるとジェノタイピングまたは決定された対象について、そのような対象は、本明細書に記載されるように、ＰＩＥＺＯ１アゴニストで処置され得る。

【0034】

対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の存在または非存在を検出すること、及び／または対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有するかどうかを決定することは、本明細書に記載の方法のいずれかによって行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｓｉｔｕで行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｖｉｖｏで行われ得る。これらの実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、対象から得られた細胞内に存在し得る。

【0035】

いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１参照である場合、対象は、標準的な投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である場合、対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。

【0036】

いくつかの実施形態では、処置方法は、対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドの存在または非存在を検出することをさらに含む。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有しない場合、対象は、標準的な投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有する場合、対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。

【0037】

本開示はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤で対象を処置する方法も提供する。いくつかの実施形態では、対象は静脈瘤を有する。いくつかの実施形態では、対象は静脈瘤を発症するリスクがある。いくつかの実施形態では、該方法は、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するかどうかを、対象から生物学的サンプルを得ることまたは得たこと、及び対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するかどうかを決定するために生物学的サンプルについてアッセイを実施することまたは実施したことによって決定することを含む。対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有しない場合、静脈瘤を処置または予防する治療剤が標準的な投薬量で対象に投与されるか、もしくは投与が継続され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストが対象に投与される。対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有する場合、静脈瘤を処置または予防する治療剤が標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない量で対象に投与されるか、もしくは投与が継続され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストが対象に投与される。ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドの存在は、対象が静脈瘤を発症する低下したリスクを有することを示す。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有する。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有しない。

【0038】

対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドの存在または非存在を検出すること、及び／または対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するかどうかを決定することは、本明細書に記載の方法のいずれかによって行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｓｉｔｕで行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｖｉｖｏで行われ得る。これらの実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは、対象から得られた細胞内に存在し得る。

【0039】

静脈瘤を処置または阻害する治療剤の例は、ジオスミンまたはヘスペリジン等のフラボノイド、ならびにイブプロフェン及びアスピリン等の抗炎症剤を含むが、これらに限定されない。

【0040】

ＰＩＥＺＯ１アゴニストの例は、Ｙｏｄａ１、Ｊｅｄｉ１、及びＪｅｄｉ２を含むが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、小分子を含む。

【0041】

いくつかの実施形態では、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストの用量は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である対象については、ＰＩＥＺＯ１参照である（標準的な投薬量を受けてもよい）対象と比較して約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、約５０％、約６０％、約７０％、約８０％、または約９０％低減され得る（すなわち、標準的な投薬量よりも少ない）。いくつかの実施形態では、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストの用量は、約１０％、約２０％、約３０％、約４０％、または約５０％低減され得る。また、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である対象における静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストの用量は、ＰＩＥＺＯ１参照である対象と比較して低い頻度で投与され得る。

【0042】

静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストの投与は、例えば、１日、２日、３日、５日、１週、２週、３週、１ヶ月、５週、６週、７週、８週、２ヶ月、または３ヶ月後に繰り返され得る。繰り返し投与は、同じ用量または異なる用量であり得る。投与は、１回、２回、３回、４回、５回、６回、７回、８回、９回、１０回、またはそれを超えて繰り返され得る。例えば、所定の投薬レジメンに従って、対象は、例えば、６ヶ月、１年、またはそれ以上のような長期間にわたって療法を受けることができる。また、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストは、順次にまたは同時に投与され得る。また、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストは、別々の組成物で投与してもよく、または同じ組成物で一緒に投与してもよい。

【0043】

静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストの投与は、非経口、静脈内、経口、皮下、動脈内、頭蓋内、髄腔内、腹腔内、局所、鼻腔内、または筋肉内を含むがこれらに限定されない任意の好適な経路によって行われ得る。投与のための薬学的組成物は、望ましくは無菌であり、実質的に等張性であり、ＧＭＰ条件下で製造される。薬学的組成物は、単位投薬形態（すなわち、単一投与のための投薬量）で提供され得る。薬学的組成物は、１つ以上の生理的に及び薬学的に許容可能な担体、希釈剤、賦形剤または補助剤を使用して製剤化され得る。製剤は、選択される投与経路に依存する。用語「薬学的に許容可能な」は、担体、希釈剤、賦形剤、または補助剤が、製剤の他の成分と適合性があり、そのレシピエントに実質的に有害でないことを意味する。

【0044】

用語「処置する」、「処置すること」、及び「処置」ならびに「予防する」、「予防すること」、及び「予防」は、本明細書で使用される場合は、所望の生物学的反応、例えば、治療的及び予防的効果を引き起こすことをそれぞれ指す。いくつかの実施形態では、治療効果は、薬剤または薬剤を含む組成物の投与後の、静脈瘤の低下／低減、静脈瘤の重症度の低下／低減（例えば、静脈瘤の発症の低減または阻害等）、症状及び静脈瘤関連作用の低下／低減、症状及び静脈瘤関連作用の発生を遅延させること、静脈瘤関連作用の症状の重症度を低減すること、急性発病の重症度を低減すること、症状及び静脈瘤関連作用の数を低減すること、症状及び静脈瘤関連作用の潜在性を低減すること、症状及び静脈瘤関連作用の改善、二次症状を低減すること、二次感染症を低減すること、静脈瘤の再燃を予防すること、再燃発病の数または頻度を低下させること、症状を示す発病間の潜在期を増加させること、持続進行までの時間を増加させること、寛解を早めること、寛解を誘導すること、寛解を増強すること、回復を加速させること、または代替的治療剤の有効性を増加させることまたは代替的治療剤に対する耐性を低下させること、及び／または罹患宿主動物の増加した生存時間のうちの１つ以上を含む。予防的効果は、治療的プロトコルの投与後の、静脈瘤発症／進行の完全もしくは部分的回避及び／または阻害もしくは遅延（例えば、完全もしくは部分的回避／阻害もしくは遅延等）、及び罹患した宿主動物の増加した生存時間を含み得る。静脈瘤の処置は、いずれかの臨床的段階または顕現時に何らかの形態の静脈瘤を有するものとして既に診断された対象の処置、静脈瘤の症状もしくは兆候の発生もしくは進展もしくは増悪もしくは悪化の遅延、及び／または静脈瘤の予防及び／またはその重症度の低減を包含する。

【0045】

本開示はまた、静脈瘤を発症する増加したリスクを有する対象を同定する方法も提供する。いくつかの実施形態では、該方法は、対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子（例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子）の存在または非存在を決定することまたは決定したことを含む。対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を欠く（すなわち、対象がＰＩＥＺＯ１参照として遺伝子型的に分類される）場合、対象は、静脈瘤を発症する増加したリスクを有する。対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有する（すなわち、対象がＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合またはホモ接合である）場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１参照である対象と比較して静脈瘤を発症する低下したリスクを有する。

【0046】

ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の単一コピーを有することは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のコピーを有しない場合よりも、対象が静脈瘤を発症することについて保護的である。いずれかの特定の作用理論または作用メカニズムに限定されることを意図するものではないが、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の単一コピー（すなわち、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合）は、対象が静脈瘤を発症することについて保護的であると考えられ、また、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を２コピー有する（すなわち、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてホモ接合である）ことは、単一コピーを有する対象と比べて、対象が静脈瘤を発症することについてより保護的であり得ると考えられる。よって、いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の単一コピーは、完全には保護的でない場合があるが、代わりに、対象が静脈瘤を発症することについて部分的にまたは不完全に保護的であり得る。いずれかの特定の理論に縛られることを望むものではないが、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の単一コピーを有する対象に依然として存在する静脈瘤の発症に関与する追加の要素または分子があることによって、静脈瘤の発症からの完全に満たない保護が生じる可能性がある。

【0047】

対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の存在または非存在を検出すること、及び／または対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有するかどうかを決定することは、本明細書に記載の方法のいずれかによって行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏで行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｓｉｔｕで行われ得る。いくつかの実施形態では、これらの方法は、ｉｎ ｖｉｖｏで行われ得る。これらの実施形態のいずれかでは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、対象から得られた細胞内に存在し得る。

【0048】

ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子の任意の１つ以上（すなわち、任意の組み合わせ）を、本明細書に記載されている方法のいずれかで使用して、対象が静脈瘤を発症する増加したリスクを有するかどうかを決定することができる。特定のバリアントの組み合わせは、ＰＩＥＺＯ１と静脈瘤を発症する低下したリスクとの特定の相関を統計的に分析するために使用されるマスクを形成することができる。

【0049】

いくつかの実施形態では、対象が静脈瘤を発症する増加したリスクを有するものとして同定されると、対象は、本明細書に記載されるように、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストでさらに処置される。例えば、対象がＰＩＥＺＯ１参照であり、それ故に静脈瘤を発症する増加したリスクを有する場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される。いくつかの実施形態では、そのような対象はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である場合、対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１参照である。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である。

【0050】

いくつかの実施形態では、対象が静脈瘤を発症する増加したリスクを有するものとして同定されると、対象は、本明細書に記載されるように、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストをさらに投与される。例えば、対象がＰＩＥＺＯ１参照であり、それ故に静脈瘤発症の増加したリスクを有する場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される。いくつかの実施形態では、そのような対象はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である場合、対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１参照である。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である。

【0051】

いくつかの実施形態では、本明細書に記載される方法のいずれかは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子、及び／または静脈瘤を発症する低下したリスクに関連するＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得バリアントポリペプチドを有する対象の総負荷を決定することをさらに含み得る。総負荷は、ＰＩＥＺＯ１遺伝子のすべてのバリアントの総計であり、これは、静脈瘤との関連分析で行われ得る。いくつかの実施形態では、対象は、静脈瘤を発症する低下したリスクと関連するＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードする１つ以上のＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてホモ接合である。いくつかの実施形態では、対象は、静脈瘤を発症する低下したリスクと関連するＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードする１つ以上のＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である。関連分析の結果は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子が、静脈瘤を発症する低下したリスクに関連することを示唆する。対象がより低い総負荷を有する場合、対象は、静脈瘤を発症するリスクがより高く、対象は、標準的な投薬量における静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与されるか、または投与を継続される。対象がより高い総負荷を有する場合、対象は、静脈瘤を発症するリスクがより低く、対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与されるか、または投与を継続される。総負荷が高いほど、静脈瘤を発症するリスクは低くなる。

【0052】

いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードする任意の１つ以上のＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有することの対象の総負荷は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のいずれかの複数の加重総計を表す。いくつかの実施形態では、総負荷は、ＰＩＥＺＯ１遺伝子内またはその周辺（１０Ｍｂ以内）に存在する、少なくとも約２、少なくとも約３、少なくとも約４、少なくとも約５、少なくとも約１０、少なくとも約２０、少なくとも約３０、少なくとも約４０、少なくとも約５０、少なくとも約６０、少なくとも約７０、少なくとも約８０、少なくとも約１００、少なくとも約１２０、少なくとも約１５０、少なくとも約２００、少なくとも約２５０、少なくとも約３００、少なくとも約４００、少なくとも約５００、少なくとも約１，０００、少なくとも約１０，０００、少なくとも約１００，０００、または少なくとも約１，０００，０００もしくはそれを超える遺伝子バリアントを使用して計算され、ここで、遺伝子負荷は、アレルの数に、各アレルについての静脈瘤または関連するアウトカムとの関連推定値を掛けたもの（例えば、加重多遺伝子負荷スコア）である。これは、ゲノムアノテーションに関係なく、遺伝子関連分析において静脈瘤関連形質とのゼロでない関連を示すＰＩＥＺＯ１遺伝子の近傍（遺伝子の周辺１０Ｍｂ以内）にある、あらゆる遺伝子バリアントを含み得る。いくつかの実施形態では、対象が所望の閾値スコアよりも高い総負荷を有する場合、対象は、静脈瘤を発症する低下したリスクを有する。いくつかの実施形態では、対象が所望の閾値スコアよりも低い総負荷を有する場合、対象は、静脈瘤を発症する増加したリスクを有する。

【0053】

いくつかの実施形態では、総負荷は、例えば、上位五分位、中間五分位、及び下位五分位の五分位に分けることができ、総負荷の上位五分位は最低リスク群に対応し、総負荷の下位五分位は最高リスク群に対応する。いくつかの実施形態では、より大きな総負荷を有する対象は、対象集団からの上位１０％、上位２０％、上位３０％、上位４０％、または上位５０％の総負荷を含むがこれらに限定されない、最高加重総負荷を含む。いくつかの実施形態では、遺伝子バリアントは、静脈瘤との関連を、関連のｐ値範囲の上位１０％、上位２０％、上位３０％、上位４０％、または上位５０％に有する遺伝子バリアントを含む。いくつかの実施形態では、同定された遺伝子バリアントの各々は、約１０^－２以下、約１０^－３以下、約１０^－４以下、約１０^－５以下、約１０^－６以下、約１０^－７以下、約１０^－８以下、約１０^－９以下、約１０^－１０以下、約１０^－１１以下、約１０^－１２以下、約１０^－１３以下、約１０^－１４以下、または約１０^－１５以下のｐ値の静脈瘤との関連を有する遺伝子バリアントを含む。いくつかの実施形態では、同定された遺伝子バリアントは、ｐ値５×１０^－８未満の静脈瘤との関連を有する遺伝子バリアントを含む。いくつかの実施形態では、同定された遺伝子バリアントは、オッズ比（ＯＲ）が分布の上位２０％については約１．５以上、約１．７５以上、約２．０以上、もしくは約２．２５以上、または約１．５以上、約１．７５以上、約２．０以上、約２．２５以上、約２．５以上、もしくは約２．７５以上である参照集団の残りと比較して高リスクの対象における静脈瘤との関連を有する遺伝子バリアントを含む。いくつかの実施形態では、オッズ比（ＯＲ）は、約１．０～約１．５、約１．５～約２．０、約２．０～約２．５、約２．５～約３．０、約３．０～約３．５、約３．５～約４．０、約４．０～約４．５、約４．５～約５．０、約５．０～約５．５、約５．５～約６．０、約６．０～約６．５、約６．５～約７．０の範囲か、または７．０を超えていてもよい。いくつかの実施形態では、高リスクの対象は、参照集団における下位十分位、五分位、または三分位の総負荷を有する対象を含む。総負荷の閾値は、意図される実際の用途の性質と、その実際の用途にとって意味があると考えられるリスク差に基づいて決定される。

【0054】

いくつかの実施形態では、対象が静脈瘤を発症する増加したリスクを有するものとして同定されると、対象は、本明細書に記載されるように、静脈瘤を処置もしくは予防する治療剤及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストをさらに投与される。例えば、対象がＰＩＥＺＯ１参照であり、それ故に静脈瘤発症の増加したリスクを有する場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される。いくつかの実施形態では、そのような対象はまた、静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である場合、対象は、標準的な投薬量と同じまたはそれより少ない投薬量で静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与され、及び／またはＰＩＥＺＯ１アゴニストを投与される。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１参照である。いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子についてヘテロ接合である。さらに、対象が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有することについてより低い総負荷を有し、それ故に静脈瘤を発症する増加したリスクを有する場合、対象は、静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有することについてより低い総負荷を有する場合、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を有することについてより大きい総負荷を有する対象に投与される標準的な投薬量と同じまたはそれより多い投薬量で、静脈瘤を処置または予防する治療剤を投与される。

【0055】

本開示はまた、対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、及び／または対象から得られた生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子、及び／または対象から得られた生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成されたＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在または非存在を検出する方法を提供する。集団内の遺伝子配列、及びそのような遺伝子によってコードされるｍＲＮＡ分子は、一塩基多型（ＳＮＰ）のような多型に起因して異なり得ることが理解される。ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子、及びＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子について本明細書で提供される配列は、例示的な配列にすぎない。ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、バリアントｍＲＮＡ分子、及びバリアントｃＤＮＡ分子について他の配列も可能である。

【0056】

生物学的サンプルは、対象からの任意の細胞、組織、または生物学的流体に由来し得る。生物学的サンプルは、任意の臨床的に関連のある組織、例えば、骨髄サンプル、腫瘍生検、微細針吸引物、または血液、歯肉溝滲出液、血漿、血清、リンパ液、腹水、嚢胞液、もしくは尿等の体液のサンプル等を含み得る。いくつかの実施形態では、生物学的サンプルは、口腔内スワブを含む。本明細書に開示される方法において使用される生物学的サンプルは、アッセイフォーマット、検出方法の特質、及びサンプルとして使用される組織、細胞、または抽出物に基づいて様々であり得る。生物学的サンプルは、用いられているアッセイに応じて異なって処理され得る。例えば、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子を検出する際には、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子について生物学的サンプルを単離または濃縮するように設計された予備処理が用いられ得る。多様な技術がこの目的のために使用され得る。ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のレベルを検出する際には、ｍＲＮＡ分子を有する生物学的サンプルを濃縮するために様々な技術が使用され得る。ｍＲＮＡ分子の存在もしくはレベルまたは特定のバリアントゲノムＤＮＡ遺伝子座の存在を検出するための様々な方法が使用され得る。

【0057】

本開示はまた、対象におけるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子またはその相補体を検出する方法を提供する。該方法は、生物学的サンプルにおける核酸分子がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子であるかどうかを決定するために対象から得られた生物学的サンプルをアッセイすることを含む。

【0058】

いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子またはその相補体は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子である。

【0059】

いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子またはその相補体は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子である。

【0060】

いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子またはその相補体は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；もしくは配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成されたｃＤＮＡ分子である。

【0061】

いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン（ゲノム核酸分子の場合）；配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子の場合）；または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン（ｍＲＮＡ分子から得られるｃＤＮＡ分子の場合）を含むヌクレオチド配列を有する。

【0062】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプルは、細胞または細胞ライセートを含む。そのような方法は、例えば、ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはｍＲＮＡ分子を含む対象からの生物学的サンプルを得ること、そしてｍＲＮＡの場合は、任意にｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写することをさらに含み得る。そのようなアッセイは、例えば、特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子のこれらの位置の同一性を決定することを含み得る。いくつかの実施形態では、該方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ方法である。

【0063】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含む。いくつかの実施形態では、アッセイは、シーケンシングされる部分が配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を含む、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすること；シーケンシングされる部分が配列番号２２もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置を含む、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすること；及び／または、シーケンシングされる部分が配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置を含む、生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡから生成されたＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含む。生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子のシーケンシングされる部分が、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン；配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む場合、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子である。

【0064】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、シーケンシングされる部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を含む。生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子のシーケンシングされる部分が、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む場合、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子である。

【0065】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、シーケンシングされる部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含む。生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子のシーケンシングされる部分が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む場合、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子である。

【0066】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成されたＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列の少なくとも一部分をシーケンシングすることを含み、シーケンシングされる部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含む。生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子のシーケンシングされる部分が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む場合、生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成されたＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子である。

【0067】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ゲノム核酸分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置に近い一部分；ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ゲノム核酸分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置；ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン；配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0068】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0069】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0070】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0071】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0072】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0073】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0074】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0075】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0076】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１の、ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置；及び／またはｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0077】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子もしくはその相補体ヌクレオチド配列のうちの、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；ならびにｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0078】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；及びｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むかどうかを決定することを含む。

【0079】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置に近い一部分にハイブリダイズするプライマーと、生物学的サンプルを接触させること；ｂ）ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子もしくはその相補体のヌクレオチド配列のうちの、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を少なくとも介して、プライマーを伸長させること；及びｃ）プライマーの伸長産物が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むかどうかを決定することを含む。

【0080】

いくつかの実施形態では、アッセイは、核酸分子全体をシーケンシングすることを含む。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子のみが分析される。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡのみが分析される。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡから得られたＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡのみが分析される。

【0081】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン；配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン；配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0082】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0083】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0084】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0085】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0086】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0087】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0088】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0089】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0090】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、増幅される部分は、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；ならびにｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0091】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、該部分は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；及びｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0092】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、該部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及びｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0093】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ａ）生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成されたＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体の少なくとも一部分を増幅させることであって、該部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、増幅させること；ｂ）増幅した核酸分子を、検出可能な標識で標識すること；ｃ）標識した核酸分子を、変化特異的プローブを含む支持体と接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む増幅した核酸分子のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及びｄ）検出可能な標識を検出することを含む。

【0094】

いくつかの実施形態では、サンプルにおける核酸分子は、ｍＲＮＡであり、ｍＲＮＡは、増幅工程の前にｃＤＮＡに逆転写される。
いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン；配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0095】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0096】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0097】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0098】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0099】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0100】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0101】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0102】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0103】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル；及び／または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0104】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0105】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0106】

いくつかの実施形態では、アッセイは、生物学的サンプルにおけるｍＲＮＡ分子から生成されたＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体を、検出可能な標識を含む変化特異的プローブと接触させることであって、変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子またはその相補体のヌクレオチド配列にストリンジェントな条件下でハイブリダイズするヌクレオチド配列を含む、接触させること；及び検出可能な標識を検出することを含む。

【0107】

いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１核酸分子は、対象から得られた細胞内に存在する。
変化特異的ポリメラーゼ連鎖反応技術を使用してヌクレオチド配列におけるＳＮＰのような突然変異を検出することができる。変化特異的プライマーが使用され得るのは、鋳型とのミスマッチが存在するとＤＮＡポリメラーゼが伸長しないからである。

【0108】

いくつかの実施形態では、アッセイは、ＲＮＡシーケンシング（ＲＮＡ－Ｓｅｑ）を含む。いくつかの実施形態では、アッセイはまた、例えば、逆転写酵素ポリメラーゼ連鎖反応（ＲＴ－ＰＣＲ）によって、ｍＲＮＡをｃＤＮＡに逆転写することを含む。

【0109】

いくつかの実施形態では、該方法は、標的ヌクレオチド配列に結合し、ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、バリアントｍＲＮＡ分子、またはバリアントｃＤＮＡ分子を含むポリヌクレオチドを特異的に検出及び／または同定するために十分なヌクレオチド長のプローブ及びプライマーを利用する。ハイブリダイゼーション条件または反応条件は、この結果を達成するためにオペレーターによって決定され得る。ヌクレオチド長は、本明細書において記載または例示される任意のアッセイを含む、選択された検出方法における使用のために十分な任意の長さであり得る。そのようなプローブ及びプライマーは、高ストリンジェンシーハイブリダイゼーション条件下で標的ヌクレオチド配列に特異的にハイブリダイズし得る。プローブ及びプライマーは、標的ヌクレオチド配列内の連続ヌクレオチドの完全なヌクレオチド配列同一性を有し得るが、標的ヌクレオチド配列とは異なり、かつ標的ヌクレオチド配列を特異的に検出及び／または同定する能力を保持するプローブは、従来の方法によって設計され得る。プローブ及びプライマーは、標的核酸分子のヌクレオチド配列と約８０％、約８５％、約９０％、約９１％、約９２％、約９３％、約９４％、約９５％、約９６％、約９７％、約９８％、約９９％、または１００％の配列同一性または相補性を有し得る。

【0110】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン（ゲノム核酸分子）、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0111】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0112】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0113】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0114】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、ヌクレオチド配列、配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0115】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0116】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、ヌクレオチド配列、配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0117】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、ヌクレオチド配列、配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0118】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、ヌクレオチド配列、配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0119】

いくつかの実施形態では、生物学的サンプル内のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体が、配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル（ｍＲＮＡ分子）、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミン（ｃＤＮＡ分子）を含むヌクレオチド配列を含むかどうかを決定するために、生物学的サンプルが、配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンに隣接する５’フランキング配列に由来する第１のプライマーと、配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンに隣接する３’フランキング配列に由来する第２のプライマーとを含むプライマー対を使用する増幅方法に供されて、配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンをコードする位置におけるＳＮＰの存在を示すアンプリコンが生成され得る。いくつかの実施形態では、アンプリコンは、プライマー対と１ヌクレオチド塩基対の組み合わせの長さから、ＤＮＡ増幅プロトコルによって生成可能なアンプリコンの任意の長さまでの長さの範囲であり得る。この距離は、１ヌクレオチド塩基対から増幅反応の限界、または約２万ヌクレオチド塩基対までの範囲であり得る。任意に、プライマー対は、配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む位置、及び配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む位置の各側の少なくとも１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０個、またはそれを超えるヌクレオチドを含む領域にフランキングする。

【0120】

同様のアンプリコンは、ｍＲＮＡ及び／またはｃＤＮＡ配列から生成され得る。ＰＣＲプライマー対は、例えば、Ｖｅｃｔｏｒ ＮＴＩバージョン１０（Ｉｎｆｏｒｍａｘ Ｉｎｃ．，Ｂｅｔｈｅｓｄａ Ｍｄ．）；ＰｒｉｍｅｒＳｅｌｅｃｔ（ＤＮＡＳＴＡＲ Ｉｎｃ．，Ｍａｄｉｓｏｎ，Ｗｉｓ．）；及びＰｒｉｍｅｒ３（Ｖｅｒｓｉｏｎ ０．４．０．ＣＯＰＹＲＧＴ．，１９９１，Ｗｈｉｔｅｈｅａｄ Ｉｎｓｔｉｔｕｔｅ ｆｏｒ Ｂｉｏｍｅｄｉｃａｌ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，Ｃａｍｂｒｉｄｇｅ，Ｍａｓｓ．）におけるＰＣＲプライマー解析ツール等のその目的のために意図されたコンピュータープログラムを使用することによって、既知の配列から生成され得る。また、配列は、既知のガイドラインを使用して視覚的に精査され、プライマーが手動で特定され得る。

【0121】

核酸シーケンシング技術の例示的な例には、チェーンターミネーター（サンガー）シーケンシング及びダイターミネーターシーケンシングが含まれるがこれらに限定されない。他の方法は、精製ＤＮＡ、増幅ＤＮＡ及び固定細胞調製物に仕向けられた標識プライマーまたは標識プローブを使用することを含む、シーケンシング以外の核酸ハイブリダイズ法（蛍光ｉｎ ｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ））を伴う。いくつかの方法では、標的核酸分子は、検出の前にまたは検出と同時に増幅させられ得る。核酸増幅技術の例示的な例には、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）、リガーゼ連鎖反応（ＬＣＲ）、鎖置換増幅（ＳＤＡ）、及び核酸配列ベース増幅（ＮＡＳＢＡ）が含まれるがこれらに限定されない。他の方法には、リガーゼ連鎖反応、鎖置換増幅、及び好熱性ＳＤＡ（ｔＳＤＡ）が含まれるがこれらに限定されない。

【0122】

ハイブリダイゼーション技術では、プローブまたはプライマーがその標的に特異的にハイブリダイズするようにストリンジェントな条件が用いられ得る。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下のポリヌクレオチドプライマーまたはプローブは、他の非標的配列よりも検出可能に高い程度で、例えば、バックグラウンドの少なくとも２倍、少なくとも３倍、少なくとも４倍、またはそれを超えて（バックグラウンドの１０倍超を含む）、その標的配列とハイブリダイズすることになる。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下のポリヌクレオチドプライマーまたはプローブは、他のヌクレオチド配列よりも検出可能に高い程度でその標的配列と少なくとも２倍ハイブリダイズすることになる。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下のポリヌクレオチドプライマーまたはプローブは、他のヌクレオチド配列よりも検出可能に高い程度でその標的配列と少なくとも３倍ハイブリダイズすることになる。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下のポリヌクレオチドプライマーまたはプローブは、他のヌクレオチド配列よりも検出可能に高い程度でその標的配列と少なくとも４倍ハイブリダイズすることになる。いくつかの実施形態では、ストリンジェントな条件下のポリヌクレオチドプライマーまたはプローブは、他のヌクレオチド配列よりも検出可能に高い程度でその標的ヌクレオチド配列とバックグラウンドの１０倍を超えてハイブリダイズすることになる。ストリンジェントな条件は、配列依存的であり、異なる状況で異なることになる。

【0123】

ＤＮＡハイブリダイゼーションを促進する適切なストリンジェンシー条件、例えば、約４５℃での６×塩化ナトリウム／クエン酸ナトリウム（ＳＳＣ）、続いて５０℃での２×ＳＳＣの洗浄が知られており、またはＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，Ｎ．Ｙ．（１９８９），６．３．１－６．３．６で見ることができる。典型的には、ハイブリダイゼーション及び検出のためのストリンジェントな条件は、塩濃度が、ｐＨ７．０～８．３で約１．５Ｍ未満のＮａ^＋イオン、典型的には約０．０１～１．０ＭのＮａ^＋イオン濃度（または他の塩）であり、温度が、短いプローブ（例えば、１０～５０ヌクレオチド等）について少なくとも約３０℃及びより長いプローブ（例えば、５０ヌクレオチド超等）について少なくとも約６０℃であるものとなる。ストリンジェントな条件はまた、不安定化剤、例えば、ホルムアミドの添加によって達成され得る。任意に、洗浄緩衝液は、約０．１％～約１％のＳＤＳを含み得る。ハイブリダイゼーションの継続時間は、概して約２４時間未満、通常は約４～約１２時間である。洗浄時間の継続時間は、少なくとも平衡に達するのに十分な時間の長さとなる。

【0124】

本開示はまた、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドの存在を検出する方法であって、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ポリペプチドが、ポリペプチドに機能獲得（部分的または完全）または予測される機能獲得（部分的または完全）を持たせる１つ以上のバリエーションを含有するかどうかを決定するために、対象から得られた生物学的サンプルについてアッセイを実施することを含む、方法を提供する。ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは、本明細書に記載されるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドのいずれでもよい。いくつかの実施形態では、該方法は、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ、Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ、またはＰｒｏ９２Ｌｅｕの存在を検出する。いくつかの実施形態では、該方法は、ＰＩＥＺＯ１ Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕの存在を検出する。

【0125】

いくつかの実施形態では、該方法は、生物学的サンプルにおけるＰＩＥＺＯ１ポリペプチドが、配列番号４７による２，５１０位に対応する位置におけるロイシン；配列番号４８による２，０２４位に対応する位置におけるロイシン；配列番号４９による２，０７９位に対応する位置におけるロイシン；または配列番号５０による９４位に対応する位置におけるロイシンを含むかどうかを決定するために、対象から得られた生物学的サンプルについてアッセイを実施することを含む。

【0126】

いくつかの実施形態では、アッセイは、配列番号４７による２，５１０位、配列番号４８による２，０２４位、配列番号４９による２，０７９位、または配列番号５０による９４位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１ポリペプチドの少なくとも一部分をシーケンシングすることを含む。

【0127】

いくつかの実施形態では、アッセイは、配列番号４７による２，５１０位、配列番号４８による２，０２４位、配列番号４９による２，０７９位、または配列番号５０による９４位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１ポリペプチドの存在を検出するためのイムノアッセイである。

【0128】

いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有しない場合、対象は、静脈瘤または伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、もしくは妊娠関連静脈瘤のいずれかを発症する増加したリスクを有する。いくつかの実施形態では、対象がＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有する場合、対象は、静脈瘤または伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、もしくは妊娠関連静脈瘤のいずれかを発症する低下したリスクを有する。

【0129】

本開示はまた、ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子、及び／またはＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子（例えば、本明細書において開示されるゲノムバリアント核酸分子、ｍＲＮＡバリアント分子、及びｃＤＮＡバリアント分子のいずれか）にハイブリダイズする単離された核酸分子を提供する。いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、ストリンジェントな条件下でＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子にハイブリダイズする。そのような核酸分子は、例えば、本明細書において記載または例示されるプローブ、プライマー、変化特異的プローブ、または変化特異的プライマーとして使用され得る。

【0130】

いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号２による６９，５７９位、配列番号１３による７，７８５位、または配列番号３３による７，７８５位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１４による１，０９５位、または配列番号３４による１，０９５位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１５による６，０７３位、または配列番号３５による６，０７３位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１６による１，３３６位、または配列番号３６による１，３３６位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１７による６，０７３位、または配列番号３７による６，０７３位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１８による６，２３６位、または配列番号３８による６，２３６位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号１９による７，５２６位、または配列番号３９による７，５２６位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号２０による１，３３６位、または配列番号２０による１，３３６位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号２１による３６１位、または配列番号２１による３６１位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、配列番号２２による７，７７６位、または配列番号４２による７，７７６位に対応する位置を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子の一部分にハイブリダイズする。

【0131】

いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１１、少なくとも約１２、少なくとも約１３、少なくとも約１４、少なくとも約１５、少なくとも約１６、少なくとも約１７、少なくとも約１８、少なくとも約１９、少なくとも約２０、少なくとも約２１、少なくとも約２２、少なくとも約２３、少なくとも約２４、少なくとも約２５、少なくとも約３０、少なくとも約３５、少なくとも約４０、少なくとも約４５、少なくとも約５０、少なくとも約５５、少なくとも約６０、少なくとも約６５、少なくとも約７０、少なくとも約７５、少なくとも約８０、少なくとも約８５、少なくとも約９０、少なくとも約９５、少なくとも約１００、少なくとも約２００、少なくとも約３００、少なくとも約４００、少なくとも約５００、少なくとも約６００、少なくとも約７００、少なくとも約８００、少なくとも約９００、少なくとも約１０００、少なくとも約２０００、少なくとも約３０００、少なくとも約４０００、または少なくとも約５０００ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、そのような単離された核酸分子は、少なくとも約５、少なくとも約８、少なくとも約１０、少なくとも約１１、少なくとも約１２、少なくとも約１３、少なくとも約１４、少なくとも約１５、少なくとも約１６、少なくとも約１７、少なくとも約１８、少なくとも約１９、少なくとも約２０、少なくとも約２１、少なくとも約２２、少なくとも約２３、少なくとも約２４、または少なくとも約２５ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約１８ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約１５ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１０～約３５、約１０～約３０、約１０～約２５、約１２～約３０、約１２～約２８、約１２～約２４、約１５～約３０、約１５～約２５、約１８～約３０、約１８～約２５、約１８～約２４、または約１８～約２２ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１８～約３０ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、少なくとも約１５ヌクレオチド～少なくとも約３５ヌクレオチドを含む、またはそれからなる。

【0132】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１核酸分子、またはその相補体の一部分のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位、または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位、または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位、または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位、または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位、または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位、または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位、または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位、または配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位、または配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位、または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含む。

【0133】

いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子、及び／またはＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子と少なくとも約７０％、少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９６％、少なくとも約９７％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％、または１００％同一である核酸分子の少なくとも約１５連続ヌクレオチドにハイブリダイズする。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチド、または約１５～約３５ヌクレオチドからなる、またはそれを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約１００ヌクレオチドからなる、またはそれを含む。いくつかの実施形態では、単離された核酸分子は、約１５～約３５ヌクレオチドからなる、またはそれを含む。

【0134】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位、または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７８～６９，５８０位、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８４～７，７８６位、及び／または配列番号３３もしくはその相補体による７，７８４～７，７８６位に対応する位置を含む。

【0135】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位、または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９４～１，０９６位、及び／または配列番号３４もしくはその相補体による１，０９４～１，０９６位に対応する位置を含む。

【0136】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位、または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位、及び／または配列番号３５もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位に対応する位置を含む。

【0137】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位、または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位、及び／または配列番号３６もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位に対応する位置を含む。

【0138】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位、または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位、及び／または配列番号３７もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位に対応する位置を含む。

【0139】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位、または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３５～６，２３７位、及び／または配列番号３８もしくはその相補体による６，２３５～６，２３７位に対応する位置を含む。

【0140】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位、または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２５～７，５２７位、及び／または配列番号３９もしくはその相補体による７，５２５～７，５２７位に対応する位置を含む。

【0141】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位、または配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位、及び／または配列番号４０もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位に対応する位置を含む。

【0142】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号２１もしくはその相補体による１，３３６位、または配列番号４１もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２１もしくはその相補体による３６０～３６２位、及び／または配列番号４１もしくはその相補体による３６０～３６２位に対応する位置を含む。

【0143】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアント核酸分子のヌクレオチド配列の一部分に相補的であるヌクレオチド配列を含み、該部分は、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位、または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７５～７，７７７位、及び／または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７５～７，７７７位に対応する位置を含む。

【0144】

いくつかの実施形態では、単離された変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、少なくとも約１５ヌクレオチドを含み、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１核酸分子、またはその相補体の一部分のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含む。いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置を含む。

【0145】

いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７８～６９，５８０位に対応する位置を含む。
いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含む。

【0146】

いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８４～７，７８６位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９４～１，０９６位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３５～６，２３７位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２５～７，５２７位；または配列番号２０もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位；配列番号２１もしくはその相補体による３６０～３６２位；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７５～７，７７７位に対応する位置を含む。

【0147】

いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置を含む。

【0148】

いくつかの実施形態では、該部分は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８４～７，７８６位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９４～１，０９６位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７２～６，０７４位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３５～６，２３７位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２５～７，５２７位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３５～１，３３７位；配列番号４１もしくはその相補体による３６０～３６２位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７５～７，７７７位に対応する位置を含む。

【0149】

いくつかの実施形態では、変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーは、ＤＮＡを含む。いくつかの実施形態では、変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーは、ＲＮＡを含む。

【0150】

いくつかの実施形態では、本明細書に記載のプローブ及びプライマー（変化特異的プローブ及び変化特異的プライマーを含む）は、本明細書に開示される核酸分子のいずれか、またはその相補体に特異的にハイブリダイズするヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、プローブ及びプライマーは、ストリンジェントな条件下で本明細書に開示される核酸分子のいずれかに特異的にハイブリダイズする。

【0151】

いくつかの実施形態では、変化特異的プライマーを含むプライマーは、第２世代シーケンシングまたはハイスループットシーケンシングにおいて使用され得る。いくつかの例では、変化特異的プライマーを含むプライマーは、修飾され得る。特に、プライマーは、例えば、大規模並行シグネチャーシーケンシング（ＭＰＳＳ）、ポロニーシーケンシング、及び４５４パイロシーケンシングの異なる工程で使用される様々な修飾を含み得る。修飾されたプライマーは、クローニング工程におけるビオチン化プライマー、ならびにビーズ負荷工程及び検出工程にて使用される蛍光標識プライマーを含めて、プロセスのうちのいくつかの工程で使用され得る。ポロニーシーケンシングは通常、ＤＮＡ鋳型の各分子が約１３５ｂｐの長さであるペアエンドタグライブラリーを使用して実施される。ビオチン化プライマーは、ビーズ負荷工程及びエマルションＰＣＲで使用される。蛍光標識された縮重ノナマーオリゴヌクレオチドが検出工程で使用される。アダプターは、ストレプトアビジン被覆ビーズへのＤＮＡライブラリの固定化のための５’－ビオチンタグを含有し得る。

【0152】

本明細書に記載のプローブ及びプライマーは、本明細書において開示されるＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子、及び／またはＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のいずれかにおけるヌクレオチドバリエーションを検出するために使用され得る。本明細書に記載のプライマーは、ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子、もしくはＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子、またはその断片を増幅するために使用され得る。

【0153】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号１による６９，５７９位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ゲノム核酸分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号３による７，７８５位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２３による７，７８５位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0154】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号４による１，０９５位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１４による１，０９５位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２４による１，０９５位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３４による１，０９５位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0155】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号５による６，０７３位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１５による６，０７３位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２５による６，０７３位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３５による６，０７３位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0156】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号６による１，３３６位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１６による１，３３６位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２６による１，３３６位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３６による１，３３６位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0157】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号７による６，０７３位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１７による６，０７３位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２７による６，０７３位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３７による６，０７３位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0158】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号８による６，２３６位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１８による６，２３６位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２８による６，２３６位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３８による６，２３６位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0159】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号９による７，５２６位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号１９による７，５２６位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号２９による７，５２６位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号３９による７，５２６位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0160】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号１０による１，３３６位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号２０による１，３３６位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号３０による１，３３６位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号４０による１，３３６位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0161】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号１１による３６１位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号２１による３６１位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号３１による３６１位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号４１による３６１位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0162】

本開示はまた、上述したプライマーのいずれかを含むプライマーの対を提供する。例えば、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号１２による７，７７６位に対応する位置におけるシトシン（ウラシルではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子における配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシル（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号２２による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。また、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子における配列番号３２による７，７７６位に対応する位置におけるシトシン（チミンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。逆に、プライマーの一方の３’末端が特定のＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子における配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミン（シトシンではない）にハイブリダイズする場合、増幅した断片の存在は、ＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子の存在を示すことになる。いくつかの実施形態では、配列番号４２による７，７７６位に対応する位置におけるチミンに相補的なプライマーのヌクレオチドは、プライマーの３’末端にあり得る。

【0163】

本開示の文脈において、「特異的にハイブリダイズする」は、プローブまたはプライマー（例えば、変化特異的プローブまたは変化特異的プライマー等）が、ＰＩＥＺＯ１参照ゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子、及び／またはＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子をコードするヌクレオチド配列にハイブリダイズしないことを意味する。

【0164】

本開示を通して記載される実施形態のいずれかでは、プローブ（例えば、変化特異的プローブ等）は、標識を含み得る。いくつかの実施形態では、標識は、蛍光標識、放射性標識、またはビオチンである。

【0165】

本開示はまた、本明細書に開示されるプローブの任意の１つ以上が結合した基質を含む支持体を提供する。固体支持体は、本明細書に開示されるプローブのいずれか等の分子が会合し得る固体状態基質または支持体である。固体支持体の一形態は、アレイである。固体支持体の別の形態は、アレイ検出器である。アレイ検出器は、複数の異なるプローブがアレイ、グリッド、または他の編成されたパターンでカップリングされた固体支持体である。固体状態基質のための形態は、マイクロタイターディッシュ、例えば、標準的な９６ウェルタイプである。いくつかの実施形態では、通常１ウェル当たり１つのアレイを含有するマルチウェルスライドグラスが用いられ得る。いくつかの実施形態では、支持体は、マイクロアレイである。

【0166】

本開示はまた、本明細書に記載のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）のいずれか、またはその相補体、及び本明細書に記載の変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブのいずれかを含む、またはそれからなる分子複合体を提供する。いくつかの実施形態では、分子複合体におけるＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）、またはその相補体は、一本鎖である。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１核酸分子は、本明細書に記載のゲノム核酸分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１核酸分子は、本明細書に記載のｍＲＮＡ分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、ＰＩＥＺＯ１核酸分子は、本明細書に記載のｃＤＮＡ分子のいずれかである。いくつかの実施形態では、分子複合体は、本明細書に記載のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）のいずれか、またはその相補体、及び本明細書に記載の変化特異的プライマーのいずれかを含む、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、分子複合体は、本明細書に記載のＰＩＥＺＯ１核酸分子（ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、またはｃＤＮＡ分子）のいずれか、またはその相補体、及び本明細書に記載の変化特異的プローブのいずれかを含む、またはそれからなる。

【0167】

いくつかの実施形態では、分子複合体は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子にハイブリダイズされた変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含み、変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置でＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子にハイブリダイズされている。

【0168】

いくつかの実施形態では、分子複合体における変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号２による６９，５７８～６９，５８０位に対応する位置のＣＴＧコドンにハイブリダイズされている。

【0169】

いくつかの実施形態では、分子複合体におけるゲノム核酸分子は、配列番号２を含む。
いくつかの実施形態では、分子複合体は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズされた変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含み、変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置でＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子にハイブリダイズされている。

【0170】

いくつかの実施形態では、分子複合体における変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号１３による７，７８４～７，７８６位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号１４による１，０９４～１，０９６位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号１５による６，０７２～６，０７４位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号１６による１，３３５～１，３３７位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号１７による６，０７２～６，０７４位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号１８による６，２３５～６，２３７位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号１９による７，５２５～７，５２７位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号２０による１，３３５～１，３３７位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、配列番号２１による３６０～３６２位に対応する位置におけるＣＵＧコドン、または配列番号２２による７，７７５～７，７７７位に対応する位置におけるＣＵＧコドンにハイブリダイズされている。

【0171】

いくつかの実施形態では、分子複合体におけるｍＲＮＡ分子は、配列番号１３、配列番号１４、配列番号１５、配列番号１６、配列番号１７、配列番号１８、配列番号１９、配列番号２０、配列番号２１、または配列番号２２を含む。

【0172】

いくつかの実施形態では、分子複合体は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズされた変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブを含み、変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置でＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子にハイブリダイズされている。

【0173】

いくつかの実施形態では、分子複合体における変化特異的プライマーまたは変化特異的プローブは、配列番号３３による７，７８４～７，７８６位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号３４による１，０９４～１，０９６位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号３５による６，０７２～６，０７４位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号３６による１，３３５～１，３３７位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号３７による６，０７２～６，０７４位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号３８による６，２３５～６，２３７位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号３９による７，５２５～７，５２７位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号４０による１，３３５～１，３３７位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、配列番号４１による３６０～３６２位に対応する位置におけるＣＴＧコドン、または配列番号４２による７，７７５～７，７７７位に対応する位置におけるＣＴＧコドンにハイブリダイズされている。

【0174】

いくつかの実施形態では、分子複合体におけるｃＤＮＡ分子は、配列番号３３、配列番号３４、配列番号３５、配列番号３６、配列番号３７、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、または配列番号４２を含む。

【0175】

いくつかの実施形態では、分子複合体は、標識を含む変化特異的プローブまたは変化特異的プライマーを含む。いくつかの実施形態では、標識は、蛍光標識、放射性標識、またはビオチンである。いくつかの実施形態では、分子複合体は、非ヒトポリメラーゼをさらに含む。

【0176】

ＰＩＥＺＯ１参照ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号１に示されている（ＧＲＣｈ３８／ｈｇ３８ヒトゲノムアセンブリ中のｃｈｒ１６：８８，７１５，３３８－８８，７８５，２２０を包含するＥＮＳＧ０００００１０３３３５．２２）。配列番号１を参照すると、６９，５７９位はシトシンである。

【0177】

６９，５７９位におけるシトシンがチミンで置き換えられたＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子のヌクレオチド配列は、配列番号２に示されている。

【0178】

ＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３に示されている。配列番号３を参照すると、７，７８５位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号４に示されている。配列番号４を参照すると、１，０９５位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号５に示されている。配列番号５を参照すると、６，０７３位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号６に示されている。配列番号６を参照すると、１，３３６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号７に示されている。配列番号７を参照すると、６，０７３位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号８に示されている。配列番号８を参照すると、６，２３６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号９に示されている。配列番号９を参照すると、７，５２６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号１０に示されている。配列番号１０を参照すると、１，３３６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号１１に示されている。配列番号１０を参照すると、３６１位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号１２に示されている。配列番号１２を参照すると、７，７７６位はシトシンである。

【0179】

７，７８５位におけるシトシンがウラシルで置き換えられたＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１３に示されている。

【0180】

１，０９５位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１４に示されている。

【0181】

６，０７３位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１５に示されている。

【0182】

１，３３６位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１６に示されている。

【0183】

６，０７３位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１７に示されている。

【0184】

６，２３６位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１８に示されている。

【0185】

７，５２６位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号１９に示されている。

【0186】

１，３３６位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号２０に示されている。

【0187】

３６１位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号２１に示されている。

【0188】

７，７７６位におけるシトシンがウラシルで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｍＲＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号２２に示されている。

【0189】

ＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号２３に示されている。配列番号２３を参照すると、７，７８５位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号２４に示されている。配列番号２４を参照すると、１，０９５位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号２５に示されている。配列番号２５を参照すると、６，０７３位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号２６に示されている。配列番号２６を参照すると、１，３３６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号２７に示されている。配列番号２７を参照すると、６，０７３位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号２８に示されている。配列番号２８を参照すると、６，２３６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号２９に示されている。配列番号２９を参照すると、７，５２６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号３０に示されている。配列番号３０を参照すると、１，３３６位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号３１に示されている。配列番号３１を参照すると、３７１位はシトシンである。別のＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列が、配列番号３２に示されている。配列番号３２を参照すると、７，７７６位はシトシンである。

【0190】

７，７８５位におけるシトシンがチミンで置き換えられたＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３３に示されている。

【0191】

１，０９５位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３４に示されている。

【0192】

６，０７３位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３５に示されている。

【0193】

１，３３６位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３６に示されている。

【0194】

６，０７３位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３７に示されている。

【0195】

６，２３６位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３８に示されている。

【0196】

７，５２６位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号３９に示されている。

【0197】

１，３３６位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号４０に示されている。

【0198】

３６１位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号４１に示されている。

【0199】

７，７７６位におけるシトシンがチミンで置き換えられた別のＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子が存在する。このＰＩＥＺＯ１バリアントｃＤＮＡ分子のヌクレオチド配列は、配列番号４２に示されている。

【0200】

ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及びｃＤＮＡ分子は、任意の生物からのものであり得る。例えば、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及びｃＤＮＡ分子は、ヒトまたは別の生物、例えば、非ヒト哺乳動物、げっ歯類、マウス、またはラットからのオルソログであり得る。集団内の遺伝子配列は、一塩基多型のような多型に起因して異なり得ることが理解される。本明細書で提供される例は、例示的な配列にすぎない。他の配列もまた可能である。

【0201】

また本明細書で提供されるのは、開示されている核酸分子と相互作用することができる機能性ポリヌクレオチドである。機能性ポリヌクレオチドの例は、アンチセンス分子、アプタマー、リボザイム、三重鎖形成分子、及び外部ガイド配列を含むが、これらに限定されない。機能性ポリヌクレオチドは標的分子が持つ特定の活性のエフェクター、アゴニスト、モジュレーター、及び刺激剤として作用することができ、または機能性ポリヌクレオチドはいかなる他の分子とも無関係なデノボ活性を持つことができる。

【0202】

本明細書で開示されている単離された核酸分子は、ＲＮＡ、ＤＮＡ、またはＲＮＡとＤＮＡの両方を含み得る。単離された核酸分子はまた、ベクター等において、異種核酸配列に、または異種標識に連結または融合され得る。例えば、本明細書に開示される単離された核酸分子は、単離された核酸分子及び異種核酸配列を含むベクター内に、またはそれらを含む外来性ドナー配列として存在し得る。単離された核酸分子はまた、異種標識に連結または融合され得る。標識は、直接的に検出可能であり（例えば、フルオロフォア等）、または間接的に検出可能であり得る（例えば、ハプテン、酵素、またはフルオロフォアクエンチャー等）。そのような標識は、分光的、光化学的、生化学的、免疫化学的、または化学的手段によって検出可能であり得る。そのような標識には、例えば、放射性標識、顔料、色素、クロモゲン、スピン標識、及び蛍光標識が含まれる。標識はまた、例えば、化学発光物質；金属含有物質；または酵素であり得、その場合、シグナルの酵素依存性の二次生成が生じる。用語「標識」はまた、コンジュゲートされた分子が、後に基質と共に添加された場合、検出可能なシグナルを生成するために使用されるようにコンジュゲートされた分子に選択的に結合し得る「タグ」またはハプテンを指し得る。例えば、ビオチンは、タグに結合するためのホースラディッシュペルオキシダーゼ（ＨＲＰ）のアビジンコンジュゲートまたはストレプトアビジンコンジュゲートと共にタグとして使用され、比色測定基質（例えば、テトラメチルベンジジン（ＴＭＢ）等）または蛍光発生基質を使用して検査されて、ＨＲＰの存在が検出され得る。精製を容易化するためにタグとして使用され得る例示的な標識には、ｍｙｃ、ＨＡ、ＦＬＡＧもしくは３ＸＦＬＡＧ、６ＸＨｉｓもしくはポリヒスチジン、グルタチオン－Ｓ－トランスフェラーゼ（ＧＳＴ）、マルトース結合タンパク質、エピトープタグ、または免疫グロブリンのＦｃ部分が含まれるがこれらに限定されない。多数の標識には、例えば、粒子、フルオロフォア、ハプテン、酵素ならびにそれらの熱量測定、蛍光及び化学発光基質及び他の標識が含まれる。

【0203】

単離された核酸分子、またはその相補体はまた、宿主細胞内に存在し得る。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、本明細書に記載の核酸分子のいずれか、またはその相補体を含むベクターを含み得る。いくつかの実施形態では、核酸分子は、宿主細胞において活性なプロモーターに機能可能に連結される。いくつかの実施形態では、プロモーターは、外因性プロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは、誘導性プロモーターである。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、細菌細胞、酵母細胞、昆虫細胞、または哺乳動物細胞である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、細菌細胞である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、酵母細胞である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、昆虫細胞である。いくつかの実施形態では、宿主細胞は、哺乳動物細胞である。

【0204】

開示される核酸分子は、例えば、ヌクレオチドまたは非天然もしくは修飾ヌクレオチド、例えば、ヌクレオチドアナログまたはヌクレオチド置換体を含み得る。そのようなヌクレオチドには、修飾された塩基、糖、またはリン酸基を含有する、またはその構造における非天然部位を組み込んでいるヌクレオチドが含まれる。非天然ヌクレオチドの例には、ジデオキシヌクレオチド、ビオチン化、アミノ化、脱アミノ化、アルキル化、ベンジル化、及びフルオロフォア標識ヌクレオチドが含まれるがこれらに限定されない。

【0205】

本明細書に開示される核酸分子はまた、１つ以上のヌクレオチドアナログまたは置換体を含み得る。ヌクレオチドアナログは、塩基、糖、またはリン酸部位のいずれかに対する修飾を含有するヌクレオチドである。塩基部位に対する修飾には、Ａ、Ｃ、Ｇ、及びＴ／Ｕの天然及び合成修飾、ならびに異なるプリンまたはピリミジン塩基、例えば、シュードウリジン、ウラシル－５－イル、ヒポキサンチン－９－イル（Ｉ）、及び２－アミノアデニン－９－イル等が含まれるがこれらに限定されない。修飾された塩基には、５－メチルシトシン（５－ｍｅ－Ｃ）、５－ヒドロキシメチルシトシン、キサンチン、ヒポキサンチン、２－アミノアデニン、アデニン及びグアニンの６－メチル及び他のアルキル誘導体、アデニン及びグアニンの２－プロピル及び他のアルキル誘導体、２－チオウラシル、２－チオチミン及び２－チオシトシン、５－ハロウラシル及びシトシン、５－プロピニルウラシル及びシトシン、６－アゾウラシル、シトシン及びチミン、５－ウラシル（シュードウラシル）、４－チオウラシル、８－ハロ、８－アミノ、８－チオール、８－チオアルキル、８－ヒドロキシル及び他の８－置換アデニン及びグアニン、５－ハロ（例えば、５－ブロモ等）、５－トリフルオロメチル及び他の５－置換ウラシル及びシトシン、７－メチルグアニン、７－メチルアデニン、８－アザグアニン、８－アザアデニン、７－デアザグアニン、７－デアザアデニン、３－デアザグアニン、及び３－デアザアデニンが含まれるがこれらに限定されない。

【0206】

ヌクレオチドアナログにはまた、糖部位の修飾が含まれ得る。糖部位に対する修飾には、リボース及びデオキシリボースの天然修飾ならびに合成修飾が含まれるがこれらに限定されない。糖修飾には、２’位における以下の修飾：ＯＨ；Ｆ；Ｏ－、Ｓ－、またはＮ－アルキル；Ｏ－、Ｓ－、またはＮ－アルケニル；Ｏ－、Ｓ－またはＮ－アルキニル；またはＯ－アルキル－Ｏ－アルキルが含まれるがこれらに限定されず、アルキル、アルケニル、及びアルキニルは、置換または非置換Ｃ_１－１０アルキルまたはＣ_２－１０アルケニル、及びＣ_２－１０アルキニルであり得る。例示的な２’糖修飾にはまた、－Ｏ［（ＣＨ_２）_ｎＯ］_ｍＣＨ_３、－Ｏ（ＣＨ_２）_ｎＯＣＨ_３、－Ｏ（ＣＨ_２）_ｎＮＨ_２、－Ｏ（ＣＨ_２）_ｎＣＨ_３、－Ｏ（ＣＨ_２）_ｎ－ＯＮＨ_２、及び－Ｏ（ＣＨ_２）_ｎＯＮ［（ＣＨ_２）_ｎＣＨ_３）］_２（ｎ及びｍは、独立して、１～約１０である）が含まれるがこれらに限定されない。２’位における他の修飾には、Ｃ_１－１０アルキル、置換低級アルキル、アルカリール、アラルキル、Ｏ－アルカリールまたはＯ－アラルキル、ＳＨ、ＳＣＨ_３、ＯＣＮ、Ｃｌ、Ｂｒ、ＣＮ、ＣＦ_３、ＯＣＦ_３、ＳＯＣＨ_３、ＳＯ_２ＣＨ_３、ＯＮＯ_２、ＮＯ_２、Ｎ_３、ＮＨ_２、ヘテロシクロアルキル、ヘテロシクロアルカリール、アミノアルキルアミノ、ポリアルキルアミノ、置換シリル、ＲＮＡ切断基、レポーター基、インターカレーター、オリゴヌクレオチドの薬物動態特性を改善するための基、またはオリゴヌクレオチドの薬力学的特性を改善するための基、及び同様の特性を有する他の置換基が含まれるがこれらに限定されない。同様の修飾はまた、糖上の他の位置、特に３’末端ヌクレオチド上または２’－５’結合オリゴヌクレオチドにおける糖の３’位、及び５’末端ヌクレオチドの５’位で行われ得る。修飾された糖にはまた、ＣＨ_２及びＳ等の架橋環酸素での修飾を含有するものが含まれ得る。ヌクレオチド糖アナログはまた、ペントフラノシル糖の代わりにシクロブチル部位等の糖模倣体を有し得る。

【0207】

ヌクレオチドアナログはまた、リン酸部位で修飾され得る。修飾されたリン酸部位には、２つのヌクレオチド間の結合が、ホスホロチオエート、キラルホスホロチオエート、ホスホロジチオエート、ホスホトリエステル、アミノアルキルホスホトリエステル、メチルホスホネート及び他のアルキルホスホネート（３’－アルキレンホスホネート及びキラルホスホネートを含む）、ホスフィネート、ホスホロアミデート（３’－アミノホスホロアミデート及びアミノアルキルホスホロアミデートを含む）、チオノホスホロアミデート、チオノアルキルホスホネート、チオノアルキルホスホトリエステル、ならびにボラノホスフェートを含有するように修飾され得るものが含まれるがこれらに限定されない。２つのヌクレオチド間のこれらのリン酸または修飾リン酸結合は、３’－５’結合または２’－５’結合を介するものであり得、結合は、３’－５’から５’－３’または２’－５’から５’－２’のような逆極性を含有し得る。様々な塩、混合された塩、及び遊離酸形態も含まれる。ヌクレオチド置換体にはまた、ペプチド核酸（ＰＮＡ）が含まれる。

【0208】

本開示はまた、本明細書に開示される核酸分子の任意の１つ以上を含むベクターを提供する。いくつかの実施形態では、ベクターは、本明細書に開示される核酸分子の任意の１つ以上及び異種核酸を含む。ベクターは、核酸分子を輸送することが可能なウイルスまたは非ウイルスベクターであり得る。いくつかの実施形態では、ベクターは、プラスミドまたはコスミド（例えば、追加のＤＮＡセグメントがライゲーションされ得る環状二本鎖ＤＮＡ等）である。いくつかの実施形態では、ベクターは、追加のＤＮＡセグメントがウイルスゲノム内にライゲーションされ得るウイルスベクターである。発現ベクターには、プラスミド、コスミド、レトロウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス（ＡＡＶ）、植物ウイルス、例えば、カリフラワーモザイクウイルス及びタバコモザイクウイルス、酵母人工染色体（ＹＡＣ）、エプスタイン・バー（ＥＢＶ）由来エピソーム、及び当該技術分野で知られている他の発現ベクターが含まれるがこれらに限定されない。

【0209】

哺乳動物宿主細胞発現のための所望の制御性配列には、例えば、哺乳動物細胞における高レベルのポリペプチド発現を誘導するウイルス要素、例えば、レトロウイルスＬＴＲ、サイトメガロウイルス（ＣＭＶ）（例えば、ＣＭＶプロモーター／エンハンサー等）、シミアンウイルス４０（ＳＶ４０）（例えば、ＳＶ４０プロモーター／エンハンサー等）、アデノウイルス（例えば、アデノウイルス主要後期プロモーター（ＡｄＭＬＰ）等）、ポリオーマに由来するプロモーター及び／またはエンハンサーならびに強力な哺乳動物プロモーター、例えば、ネイティブ免疫グロブリンプロモーター及びアクチンプロモーターが含まれ得る。細菌細胞または真菌細胞（例えば、酵母細胞等）においてポリペプチドを発現させる方法もよく知られている。プロモーターは、例えば、構成的活性プロモーター、コンディショナルプロモーター、誘導性プロモーター、時間的に制限されるプロモーター（例えば、発生的に制御されるプロモーター等）、または空間的に制限されるプロモーター（例えば、細胞特異的または組織特異的プロモーター等）であり得る。

【0210】

核酸分子内のヌクレオチド配列またはポリペプチド内のアミノ酸配列の特定伸長部間の同一率（または相補率）は、ＢＬＡＳＴプログラム（基礎的ローカルアライメント検索ツール）及びＰｏｗｅｒＢＬＡＳＴプログラム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，１９９０，２１５，４０３－４１０；Ｚｈａｎｇ ａｎｄ Ｍａｄｄｅｎ，Ｇｅｎｏｍｅ Ｒｅｓ．，１９９７，７，６４９－６５６）を使用して、またはＳｍｉｔｈ及びＷａｔｅｒｍａｎのアルゴリズム（Ａｄｖ．Ａｐｐｌ．Ｍａｔｈ．，１９８１，２，４８２－４８９）を使用するデフォルト設定を使用するＧａｐプログラム（Ｗｉｓｃｏｎｓｉｎ Ｓｅｑｕｅｎｃｅ Ａｎａｌｙｓｉｓ Ｐａｃｋａｇｅ，Ｖｅｒｓｉｏｎ ８ ｆｏｒ Ｕｎｉｘ（登録商標），Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｃｏｍｐｕｔｅｒ Ｇｒｏｕｐ，Ｕｎｉｖｅｒｓｉｔｙ Ｒｅｓｅａｒｃｈ Ｐａｒｋ，Ｍａｄｉｓｏｎ Ｗｉｓ．）を使用することによって慣例的に決定され得る。本明細書において、配列同一率について言及する場合、配列同一性のパーセンテージは低いよりも高い方が好ましい。

【0211】

本開示はまた、本明細書で開示されている単離された核酸分子、ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、及び／またはｃＤＮＡ分子のうちの１以上を含む組成物、またはそれを含むベクターも提供する。いくつかの実施形態では、組成物は、薬学的組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、担体及び／または賦形剤を含む。担体の例には、ポリ（乳酸）（ＰＬＡ）マイクロスフィア、ポリ（Ｄ，Ｌ－乳酸－グリコール酸共重合体）（ＰＬＧＡ）マイクロスフィア、リポソーム、ミセル、逆ミセル、脂質コクリエート、及び脂質微小管が含まれるがこれらに限定されない。担体は、ＰＢＳ、ＨＢＳＳ等のような緩衝塩溶液を含んでもよい。

【0212】

本明細書で使用される場合、「に対応する」という語句またはその文法的変形は、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチドの配列もしくは位置の付番の文脈で使用される場合、その特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列が参照配列（例えば、配列番号１、配列番号３または配列番号４０等）と比較された場合の指定された参照配列の付番を指す。言い換えれば、特定のポリマーの残基（例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸）の番号または残基（例えば、ヌクレオチドまたはアミノ酸）の位置は、その特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列の範囲内でのその残基の実際の位置番号によってではなく、参照配列を基準として指定される。例えば、特定のヌクレオチド配列は、２つの配列間の残基の一致を最適化するためにギャップを導入することによって参照配列に対してアライメントされ得る。これらの場合では、ギャップは存在するが、特定のヌクレオチドまたはヌクレオチド配列における残基の付番は、それがアライメントされた参照配列に対して行われる。

【0213】

例えば、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＰＩＥＺＯ１核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、ＰＩＥＺＯ１核酸分子は、ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子のヌクレオチド配列が配列番号２の配列にアライメントされた場合、ＰＩＥＺＯ１配列が配列番号２の６９，５７９位に対応する位置にチミン残基を有することを意味する。同じことは、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３による７，７８５位に対応する位置におけるウラシルを含む、ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子、及びＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３３による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む、ＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子にも適用される。これらの語句は、ゲノム核酸分子が配列番号２の６９，５７９位におけるチミン残基と相同であるチミン残基を含むヌクレオチド配列を有する（またはｍＲＮＡ分子が配列番号１３の７，７８５位におけるウラシル残基と相同であるウラシル残基を含むヌクレオチド配列を有する、またはｃＤＮＡ分子が配列番号３３の７，７８５位におけるチミン残基と相同であるチミン残基を含むヌクレオチド配列を有する）、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１核酸分子を指す。本明細書において、そのような配列は、「Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ変化を有するＰＩＥＺＯ１配列」または「Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕバリエーションを有するＰＩＥＺＯ１配列」とも呼ばれる。

【0214】

本明細書に記載されるように、例えば、配列番号２による６９，５７９位に対応するＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子内の位置は、特定のＰＩＥＺＯ１核酸分子のヌクレオチド配列と配列番号２のヌクレオチド配列との間の配列アライメントを実施することによって同定され得る。例えば、配列番号２における６９，５７９位に対応するヌクレオチド位置を同定するために配列アライメントを実施するために使用され得る多様なコンピュータアルゴリズムが存在する。例えば、ＮＣＢＩ ＢＬＡＳＴアルゴリズム（Ａｌｔｓｃｈｕｌ ｅｔ ａｌ．，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９７，２５，３３８９－３４０２）またはＣＬＵＳＴＡＬＷソフトウェア（Ｓｉｅｖｅｒｓ ａｎｄ Ｈｉｇｇｉｎｓ，Ｍｅｔｈｏｄｓ Ｍｏｌ．Ｂｉｏｌ．，２０１４，１０７９，１０５－１１６）を使用することによって、配列アライメントが実施され得る。しかしながら、配列はまた、手動でアライメントされ得る。

【0215】

ＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドのアミノ酸配列は、配列番号４３に示されている。配列番号４３を参照すると、ＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドは、２，５２１アミノ酸長である。配列番号４３を参照すると、２，５１０位はプロリンである。

【0216】

別のＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドのアミノ酸配列が、配列番号４４に示されている。配列番号４４を参照すると、ＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドは、２，０３５アミノ酸長である。配列番号４４を参照すると、２，０２４位はプロリンである。

【0217】

別のＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドのアミノ酸配列が、配列番号４５に示されている。配列番号４５を参照すると、ＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドは、２，０９０アミノ酸長である。配列番号４５を参照すると、２，０７９位はプロリンである。

【0218】

別のＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドのアミノ酸配列が、配列番号４６に示されている。配列番号４６を参照すると、ＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドは、１０５アミノ酸長である。配列番号４６を参照すると、９４位はプロリンである。

【0219】

あるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドが存在し（Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ）、そのアミノ酸配列は配列番号４７に示されている。配列番号４７を参照すると、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは２，５２１アミノ酸長である。配列番号８６を参照すると、２，５１０位はロイシンである。

【0220】

別のＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドが存在し（Ｐｒｏ２，０２４Ｌｅｕ）、そのアミノ酸配列は配列番号４８に示されている。配列番号４８を参照すると、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは２，０３５アミノ酸長である。配列番号４８を参照すると、２，０２４位はロイシンである。

【0221】

別のＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドが存在し（Ｐｒｏ２，０７９Ｌｅｕ）、そのアミノ酸配列は配列番号４９に示されている。配列番号４９を参照すると、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは２，０９０アミノ酸長である。配列番号４９を参照すると、２，０７９位はロイシンである。

【0222】

別のＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドが存在し（Ｐｒｏ９４Ｌｅｕ）、そのアミノ酸配列は配列番号５０に示されている。配列番号５０を参照すると、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドは１０５アミノ酸長である。配列番号５０を参照すると、９４位はロイシンである。

【0223】

添付の配列表に列挙されるヌクレオチド及びアミノ酸配列は、ヌクレオチド塩基の場合は標準的な文字略称、及びアミノ酸の場合３文字のコードを使用して示される。ヌクレオチド配列は、配列の５’末端で開始し、３’末端へ前向きに進行する（すなわち各行における左から右へ）標準的な慣例に従う。各ヌクレオチド配列の１つの鎖のみが示されるが、提示された鎖に対する任意の参照によって相補鎖が包含されることが理解される。アミノ酸配列は、配列のアミノ末端で開始し、カルボキシ末端へ前向きに進行する（すなわち、各配列において左から右に）標準的な慣例に従う。

【0224】

本開示はまた、対象における静脈瘤の処置または予防に使用するための（または静脈瘤を処置もしくは予防するための医薬品の調製において使用するための）静脈瘤を処置または予防する治療剤であって、対象が、本明細書に記載されるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、バリアントｍＲＮＡ分子、及び／またはバリアントｃＤＮＡ分子のいずれかを有する、治療剤を提供する。静脈瘤を処置または予防する治療剤は、本明細書に記載されている静脈瘤を処置または予防する治療剤のいずれでもよい。静脈瘤は、伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、及び妊娠関連静脈瘤のいずれでもよい。

【0225】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子またはその相補体であって、ゲノム核酸分子は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ゲノム核酸分子またはその相補体を有するものとして同定される。

【0226】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｍＲＮＡ分子またはその相補体であって、ｍＲＮＡ分子は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子またはその相補体を有するものとして同定される。

【0227】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｃＤＮＡ分子またはその相補体であって、ｃＤＮＡ分子は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｃＤＮＡ分子またはその相補体を有するものとして同定される。

【0228】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号４７による２，５１０位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するものとして同定される。

【0229】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号４８による２，０２４位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するものとして同定される。

【0230】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号４９による２，０７９位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するものとして同定される。

【0231】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号５０による９４位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドを有するものとして同定される。

【0232】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子を有するものとして同定される。

【0233】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子を有するものとして同定される。

【0234】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子を有するものとして同定される。

【0235】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子を有するものとして同定される。

【0236】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子を有するものとして同定される。

【0237】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子を有するものとして同定される。

【0238】

本開示はまた、対象における静脈瘤の処置または予防において使用するための（または静脈瘤を処置もしくは予防するための医薬品の調製において使用するための）ＰＩＥＺＯ１アゴニストであって、対象が、本明細書に記載されるＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするＰＩＥＺＯ１バリアントゲノム核酸分子、バリアントｍＲＮＡ分子、及び／またはバリアントｃＤＮＡ分子のいずれかについてヘテロ接合である、または対象が、ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子、ｍＲＮＡ分子、もしくはｃＤＮＡ分子についての参照である、ＰＩＥＺＯ１アゴニストを提供する。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。静脈瘤は、伏在静脈瘤、網状静脈瘤、クモ状静脈、及び妊娠関連静脈瘤のいずれでもよい。

【0239】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１ゲノム核酸分子、ＰＩＥＺＯ１ ｍＲＮＡ分子、またはＰＩＥＺＯ１ ｃＤＮＡ分子についての参照である。
いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするゲノム核酸分子またはその相補体であって、ゲノム核酸分子は、配列番号２またはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ゲノム核酸分子またはその相補体についてヘテロ接合である。

【0240】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｍＲＮＡ分子またはその相補体であって、ｍＲＮＡ分子は、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシル；配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシル；または配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含むヌクレオチド配列を有する、ｍＲＮＡ分子またはその相補体についてヘテロ接合である。

【0241】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするｃＤＮＡ分子またはその相補体であって、ｃＤＮＡ分子は、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミン；配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミン；配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミン；配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミン；または配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含むヌクレオチド配列を有する、ｃＤＮＡ分子またはその相補体についてヘテロ接合である。

【0242】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２もしくはその相補体による６９，５７９位に対応する位置におけるチミンを含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３３もしくはその相補体による７，７８５位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号４７による２，５１０位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドについてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0243】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３４もしくはその相補体による１，０９５位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号４８による２，０２４位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドについてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0244】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３５もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号４９による２，０７９位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドについてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0245】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３６もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子；または配列番号５０による９４位に対応する位置におけるロイシンを含むＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドについてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0246】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３７もしくはその相補体による６，０７３位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子についてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0247】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３８もしくはその相補体による６，２３６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子についてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0248】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号１９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号３９もしくはその相補体による７，５２６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子についてヘテロ接合であるものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0249】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号４０もしくはその相補体による１，３３６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子についてヘテロ接合であるものとして同定される。

【0250】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号４１もしくはその相補体による３６１位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子についてヘテロ接合であるものとして同定される。

【0251】

いくつかの実施形態では、対象は、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するゲノム核酸分子であって、ヌクレオチド配列が、ＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｍＲＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号２２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるウラシルを含む、ｍＲＮＡ分子を含む、ゲノム核酸分子；またはＰＩＥＺＯ１の予測される機能獲得ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を有するｃＤＮＡ分子であって、ヌクレオチド配列が、配列番号４２もしくはその相補体による７，７７６位に対応する位置におけるチミンを含む、ｃＤＮＡ分子についてヘテロ接合であるものとして同定される。

【0252】

いくつかの実施形態では、対象は、配列番号１を含むＰＩＥＺＯ１参照ゲノム核酸分子、１つ以上の配列番号３～１２を含むＰＩＥＺＯ１参照ｍＲＮＡ分子、１つ以上の配列番号２３～３２を含むＰＩＥＺＯ１参照ｃＤＮＡ分子、または１つ以上の配列番号４３～４６を含むＰＩＥＺＯ１参照ポリペプチドを有するものとして同定される。ＰＩＥＺＯ１アゴニストは、本明細書に記載されているＰＩＥＺＯ１アゴニストのいずれでもよい。

【0253】

上または下で引用されるすべての特許文献、ウェブサイト、他の刊行物、アクセッション番号等は、各々の個別の項目が、参照によりそのように組み込まれることが具体的かつ個別に示されているかのように、同じ程度までそれらの全体がすべての目的のために参照により組み込まれる。異なるバージョンの配列が、異なる時点でのアクセッション番号と関連している場合、本出願の有効出願日でのアクセッション番号と関連したバージョンを意味する。有効出願日は、該当する場合、そのアクセッション番号を言及する実際の出願日または優先権主張出願の出願日のうちの早い方を意味する。同様に、刊行物、ウェブサイト等の異なるバージョンが異なる時点で公開される場合、別途示されない限り、本出願の有効出願日での最新の公開バージョンを意味する。本開示の任意の特徴、工程、要素、実施形態、または態様は、別途具体的に示されない限り、任意の他の特徴、工程、要素、実施形態、または態様と組み合わせて使用され得る。本開示は、明確性及び理解の目的のために、説明及び実施例によってある程度詳細に記載されているが、所定の変化及び修飾が添付の特許請求の範囲内で実践され得ることが明らかとなる。

【0254】

以下の実施例は、実施形態をより詳細に説明するために提供される。それらは、請求された実施形態を限定するものではなく、説明することが意図されている。以下の実施例は、本明細書に記載の化合物、組成物、物品、デバイス及び／または方法がどのように作製及び評価されるかの開示及び説明を当業者に提供し、純粋に例示的であることが意図されており、任意の請求項の範囲を限定することは意図されていない。数値（例えば量、温度等）に関して正確性を確保するための試みがなされているが、ある程度の誤差及び偏差が考慮され得る。別途示されない限り、部は、重量部であり、温度は、℃または周囲温度であり、圧力は、大気圧または大気圧近傍である。

【実施例】

【0255】

実施例１：静脈瘤のＰＩＥＺＯ１ ＧＯＦバリアントとの関連
既報の通り（Ｓｚｕｓｔａｋｏｗｓｋｉ，Ａｄｖａｎｃｉｎｇ Ｈｕｍａｎ Ｇｅｎｅｔｉｃｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ｄｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ ｔｈｒｏｕｇｈ Ｅｘｏｍｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ ｏｆ ｔｈｅ ＵＫ Ｂｉｏｂａｎｋ．ｂｉｏＲｘｉｖ，２０２１；及びＶａｎ Ｈｏｕｔ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ，２０２０）、４５４，７８７人のＵＫＢ試験参加者のエクソームがシーケンシングされ、標的塩基の９５．８％が２０倍以上の深度でカバーされた。１８，６５９遺伝子のコード領域にわたって３９００万の塩基対において１２００万個のバリアントが同定された（データは示されていない）。同定されたバリアントの中には、３，３７５，２５２（被験者あたりの中央値は１０，２６０）の同義バリアント、７，６８９，４９５（被験者あたり９，２８４）のミスセンスバリアント、及び８８９，９５７（被験者あたり２１２）の推定機能獲得（ｐＬＯＦ）バリアント（データは示されていない）があり、これらのうち約半分は、このデータセットで１回しか観察されなかった（シングルトンバリアント；データは示されていない）。

【0256】

ＰＩＥＺＯ１におけるミスセンスバリアント（ｒｓ６１７４５０８６：Ａ、Ｐｒｏ２，５１０Ｌｅｕ、ＭＡＦ＝０．９８％）は、静脈瘤の低下したリスクに関連していることが発見された（７，４５５人の保因者；ＯＲ＝０．６９、９５％ＣＩ ０．６１～０．７０、Ｐ＝２．６１×１０^－８）。ＰＩＥＺＯ１は、静脈及びリンパ弁の形成において重要な役割を果たす機械受容陽イオンチャネルをコードする。ＵＫＢからの最初の５０Ｋのエクソームにおいて、この遺伝子における希少なｐＬＯＦが下肢の無症候性静脈瘤のリスクを４．９倍増加させることが以前に示されたが（１６２人の保因者；９５％ＣＩ ２．８～８．６、Ｐ＝３．２×１０^－８）、この関連は現在、約８倍多くのデータを用いて２．０４倍と推定されている（１，３０２人の保因者；ＯＲ＝２．０４、９５％ＣＩ １．６３～２．５６、Ｐ＝５．３×１０^－１０）。ＧＨＳコホートにおいて再現されたｒｓ６１７４５０８６：Ａとの新たな保護的関連（２，２４３人の保因者；ＯＲ＝０．６６、９５％ＣＩ ０．４７～０．９３、Ｐ＝０．０１７）は、このミスセンスバリアントが機能獲得効果を有する可能性が高いことを示唆している。ＰＩＥＺＯ１の活性化は、利用可能な薬理学的介入がない高頻度病態のための治療経路を提供し得るため、このことは重要である。

【0257】

本明細書に記載されるものに加えて、記載される主題の様々な修飾が、前述の記載から当業者に明らかとなる。そのような修飾もまた、添付の特許請求の範囲の範囲に入ることが意図される。本出願で引用される各参考文献（学術誌記事、米国及び米国以外の特許、特許出願公開、国際特許出願公開、遺伝子バンクアクセッション番号等を含むが、これらに限定されない）は、その全体がすべての目的のために参照により本明細書に組み込まれる。

【配列表】

2024524554000001.xml

【国際調査報告】