▶ ジ アサン ファウンデーションの特許一覧 ▶ ユニバーシティー オブ ウルサン ファウンデーション フォー インダストリー コーオペレイションの特許一覧
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-08-01
(54)【発明の名称】薬物過敏反応診断用ＳＮＰおよびこれを用いた診断方法
(51)【国際特許分類】
C12Q 1/68 20180101AFI20240725BHJP
C12Q 1/6874 20180101ALI20240725BHJP
C12Q 1/6883 20180101ALI20240725BHJP
C12Q 1/6851 20180101ALI20240725BHJP
【ＦＩ】
C12Q1/68
C12Q1/6874 Z
C12Q1/6883 Z
C12Q1/6851 Z
【審査請求】有
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024507953
(86)(22)【出願日】2022-08-12
(85)【翻訳文提出日】2024-02-07
(86)【国際出願番号】 KR2022012149
(87)【国際公開番号】W WO2023018312
(87)【国際公開日】2023-02-16
(31)【優先権主張番号】10-2021-0107164
(32)【優先日】2021-08-13
(33)【優先権主張国・地域又は機関】KR
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】515267910
【氏名又は名称】ジ アサン ファウンデーション
(71)【出願人】
【識別番号】517301162
【氏名又は名称】ユニバーシティー オブ ウルサン ファウンデーション フォー インダストリー コーオペレイション
【氏名又は名称原語表記】ＵＮＩＶＥＲＳＩＴＹ ＯＦ ＵＬＳＡＮ ＦＯＵＮＤＡＴＩＯＮ ＦＯＲ ＩＮＤＵＳＴＲＹ ＣＯＯＰＥＲＡＴＩＯＮ
(74)【代理人】
【識別番号】110000729
【氏名又は名称】弁理士法人ユニアス国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】キム、テ－ボム
【テーマコード（参考）】
4B063
【Ｆターム（参考）】
4B063QA19
4B063QQ03
4B063QQ42
4B063QR08
4B063QR55
4B063QR62
4B063QS25
4B063QS34
4B063QX02
(57)【要約】
本発明は、薬物過敏反応診断用ＳＮＰおよびこれを用いた診断方法等に関し、本発明者らは、薬物過敏反応患者のゲノムＤＮＡのタンパク質コーディング部位を解析した結果、ｒｓ３５３７２９３２を含む特定ＳＮＰが薬物過敏反応の発病と密接に関連していることを糾明したところ、これを用いて薬物過敏反応の診断または発病予測のための遺伝子診断試薬を開発するのに用いることができる。
【選択図】図４
【選択図】図４
【特許請求の範囲】
【請求項1】
ｄｂＳＮＰデータベースｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項2】
前記薬物過敏反応は、即時型薬物過敏反応または遅延型薬物過敏反応であることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項3】
前記ＳＮＰが、１）ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、およびｒｓ２０６８８７０８４からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から薬物過敏反応の診断または発病予測用であり、前記ＳＮＰが、２）ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、およびｒｓ３９２４１６４からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から即時型薬物過敏反応の診断または発病予測用であり、
前記ＳＮＰが、３）ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、およびｒｓ１４４１３０２１９からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から遅延型薬物過敏反応の診断または発病予測用であり、
前記ＳＮＰが、４）ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、即時型薬物過敏反応と遅延型薬物過敏反応の区別用であることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項4】
前記ＳＮＰは、ｒｓ３５３７２９３２またはｒｓ１３９１４１１０４であることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項5】
前記薬物過敏反応は、韓国人で発病したことを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項6】
前記検出製剤は、請求項１に記載のＳＮＰを検出できるプローブであることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項7】
前記検出製剤は、請求項１に記載のＳＮＰを検出できるプライマーであることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物。
【請求項8】
請求項１に記載の組成物を含む、薬物過敏反応の診断用キット。
【請求項9】
前記キットは、ＲＴ－ＰＣＲキットまたはマイクロアレイチップキットであることを特徴とする請求項８に記載のキット。
【請求項10】
被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法。
【請求項11】
被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測に必要な情報を提供する方法。
【請求項12】
薬物過敏反応患者から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体を遅延型薬物過敏反応であると判定する段階を含む遅延型薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法。
【請求項13】
前記方法は、シーケンシング（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、エクソームシーケンシング（ｅｘｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、マイクロアレイによるハイブリダイゼーション（ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、対立遺伝子特異的なＰＣＲ（ａｌｌｅｌｅ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＰＣＲ）、ダイナミック対立遺伝子ハイブリダイゼーション法（ｄｙｎａｍｉｃ ａｌｌｅｌｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、ＰＣＲ伸長解析およびＴａｑｍａｎ法からなる群から選択される１つ以上の方法で行われることを特徴とする請求項１０から１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項14】
被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断方法。
【請求項15】
被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測方法。
【請求項16】
ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む組成物の薬物過敏反応の診断または発病予測使用。
【請求項17】
薬物過敏反応の診断または発病予測用製剤を製造するためのｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰ検出製剤の使用。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、薬物過敏反応診断用ＳＮＰおよびこれを用いた診断方法等に関する。
【0002】
本出願は、２０２１年０８月１３日に出願された韓国特許出願第１０－２０２１－０１０７１６４号に基づく優先権を主張し、当該出願の明細書および図面に開示されたすべての内容は本出願に援用される。
【背景技術】
【0003】
医学的に薬物アレルギー（ｄｒｕｇ ａｌｌｅｒｇｙ）とは、薬物に感作された患者で免疫学的な機序によって媒介される反応であり、一般人や患者が薬物副作用や薬物アレルギーがあると言うのとは異なる意味である。一般的に言う薬物副作用や薬物アレルギーは、薬物有害反応（ａｄｖｅｒｓｅ ｄｒｕｇ ｒｅａｃｔｉｏｎ）を意味する場合が多いが、薬物有害反応とは、薬物によって発生する有害反応の大部分を含むものであり、ＷＨＯでは、予防、診断および治療のために適切な投与経路で常用量の薬物を投与したとき、治療効果以外に意図しない人体に有害な反応が現れるものであると定義した。薬物有害反応は、大きく、薬の用量に関係して現れる予測可能なＡ型反応と、薬の用量とは関係なく現れる予測不可能なＢ型反応とに分けることができる。予測可能なＡ型薬物有害反応は、全体薬物有害反応の８０％程度であり、主に薬物の固有な薬理作用によって発生するので、用量依存的に薬物中毒、副作用、間接効果、薬物相互作用等である。予測が不可能なＢ型薬物有害反応は、残りの１５～２０％程度を占め、薬物による過敏反応（ｈｙｐｅｒｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ）、特異体質（ｉｄｉｏｓｙｎｃｒａｓｙ）、不耐症（ｉｎｔｏｌｅｒａｎｃｅ）、仮性アレルギー反応（ｐｓｅｕｄｏａｌｌｅｒｇｉｃ ｒｅａｃｔｉｏｎ）等が挙げられる。
【0004】
ＷＡＯ（ｔｈｅ Ｗｏｒｌｄ Ａｌｌｅｒｇｙ Ｏｒｇａｎｉｚａｔｉｏｎ）は、薬物アレルギーを薬物露出後に症状が発現するまでかかる時間によって、即時型（ｉｍｍｅｄｉａｔｅ、１時間以内）と遅延型（ｄｅｌａｙｅｄ、１時間以上）に区分するように推奨している。Ｔｈｅ Ｇｅｌｌ ＆ Ｃｏｏｍｂｓ分類によれば、薬物だけでなく、他の環境的要素による過敏反応を４種の類型に分けるが、これらのうち薬物アレルギーと関連したものは、主にＩｇＥが関与するｔｙｐｅ Ｉ、およびＴ－ｃｅｌｌが関与するｔｙｐｅ ＩＶである。
【0005】
Ｔｙｐｅ Ｉは、即時型であり、ＩｇＥ、肥満細胞（ｍａｓｔ ｃｅｌｌ）、好塩球（ｂａｓｏｐｈｉｌｓ）等が媒介された体液性免疫反応であり、アナフィラキシー（ａｎａｐｈｙｌａｘｉｓ）、血管性浮腫（ａｎｇｉｏｅｄｅｍａ）、気管支攣縮（ｂｒｏｎｃｈｏｓｐａｓｍ）、じんましん（ｕｒｔｉｃａｒｉａ、ｈｉｖｅｓ）等が属する。このｔｙｐｅの反応を示す代表的な薬物としては、β系抗生剤（ペニシリン系とセファロスポリン系）、筋肉神経系遮断薬物キノロン系、カルボプラチンとオキサリプラチンｎ等の白金類化合物、セツキシマブ（ｃｅｔｕｘｉｍａｂ）とリツキシマブ（ｒｉｔｕｘｉｍａｂ）等の単クローン抗体がある。
【0006】
Ｔｙｐｅ ＩＩ～ＩＶは、遅延型であり、ｔｙｐｅ ＩＩは、ＩｇＭまたはＩｇＧ抗体と補体によって媒介される体液性の細胞毒性反応（ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ ｒｅａｃｔｉｏｎ）を言い、溶血性貧血（ｈｅｍｏｌｙｔｉｃ ａｎｅｍｉａ）、血小板減少症（ｔｈｒｏｍｂｏｃｙｔｏｐｅｎｉａ）、好中球減少症（ｎｅｕｔｒｏｐｅｎｉａ）等が属する。代表的な薬物としては、β－ｌａｃｔａｍ系抗生剤（ペニシリン系とセファロスポリン系）、ＮＳＡＩＤｓ（Ｎｏｎ－ｓｔｅｒｏｉｄａｌ ＡｎｔｉＩｎｆｌａｍｍｔｏｒｙ Ｄｒｕｇｓ）、キニーネ／キニジン、バンコマイシン、カルバマゼピン、プロピルチオウラシル（ｐｒｏｐｙｌｔｈｉｏｕｒａｃｉｌ）、フレカイニド（ｆｌｅｃａｉｎｉｄｅ）等がある。
【0007】
このように、薬物過敏反応は、アレルギー反応の最も深刻な形態であり、医学的に緊急事態と思われているところ、事前に薬物過敏反応の発生を予測することは非常に重要である。
【0008】
これより、本発明者らは、薬物過敏反応を事前に予測し、診断するために、ＧＷＡＳ解析を行った結果、薬物過敏反応と有意な関連性を有するＳＮＰを確認し、本発明を完成した。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0009】
これより、本発明の目的は、ｄｂＳＮＰデータベースｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物を提供することにある。
【0010】
本発明の他の目的は、前記組成物を含む薬物過敏反応の診断用キットを提供することにある。
【0011】
本発明のさらに他の目的は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法を提供することにある。
【0012】
本発明のさらに他の目的は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測に必要な情報を提供する方法を提供することにある。
【0013】
本発明のさらに他の目的は、薬物過敏反応患者から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体を遅延型薬物過敏反応であると判定する段階を含む遅延型薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法を提供することにある。
【0014】
しかしながら、本発明が解決しようとする技術的課題は、以上で言及した課題に制限されず、言及されていない他の課題は、下記の記載から当該分野における通常の技術者が明確に理解することができる。
【課題を解決するための手段】
【0015】
前記課題を解決するために、本発明は、ｄｂＳＮＰデータベースｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物を提供する。
【0016】
本発明の一実施形態において、前記薬物過敏反応は、即時型薬物過敏反応または遅延型薬物過敏反応であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0017】
本発明の他の実施形態において、前記ＳＮＰが、１）ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、およびｒｓ２０６８８７０８４からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から薬物過敏反応の診断または発病予測用であり、
【0018】
前記ＳＮＰが、２）ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、およびｒｓ３９２４１６４からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から即時型薬物過敏反応の診断または発病予測用であり、
【0019】
前記ＳＮＰが、３）ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、およびｒｓ１４４１３０２１９からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から遅延型薬物過敏反応の診断または発病予測用であり、
【0020】
前記ＳＮＰが、４）ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、即時型薬物過敏反応と遅延型薬物過敏反応の区別用であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0021】
本発明のさらに他の実施形態において、前記ＳＮＰは、ｒｓ３５３７２９３２またはｒｓ１３９１４１１０４であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0022】
本発明のさらに他の実施形態において、前記薬物過敏反応は、韓国人で発病したものであってもよいが、これに限定されるものではない。
【0023】
本発明のさらに他の実施形態において、前記検出製剤は、前記ＳＮＰを検出できるプローブであってもよいが、これに限定されるものではない。
【0024】
本発明のさらに他の実施形態において、前記検出製剤は、前記ＳＮＰを検出できるプライマーであってもよいが、これに限定されるものではない。
【0025】
また、本発明は、前記組成物を含む、薬物過敏反応の診断用キットを提供する。
【0026】
本発明の一実施形態において、前記キットは、ＲＴ－ＰＣＲキットまたはマイクロアレイチップキットであってもよいが、これに限定されるものではない。
【0027】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法を提供する。
【0028】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測に必要な情報を提供する方法を提供する。
【0029】
また、本発明は、薬物過敏反応患者から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体を遅延型薬物過敏反応であると判定する段階を含む遅延型薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法を提供する。
【0030】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断方法を提供する。
【0031】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測方法を提供する。
【0032】
本発明の一実施形態において、前記方法は、シーケンシング（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、エクソームシーケンシング（ｅｘｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、マイクロアレイによるハイブリダイゼーション（ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、対立遺伝子特異的なＰＣＲ（ａｌｌｅｌｅ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＰＣＲ）、ダイナミック対立遺伝子ハイブリダイゼーション法（ｄｙｎａｍｉｃ ａｌｌｅｌｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、ＰＣＲ伸長解析およびＴａｑｍａｎ法からなる群から選択される１つ以上の方法で行われてもよいが、これに限定されるものではない。
【0033】
また、本発明は、ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む組成物の薬物過敏反応の診断用途を提供する。
【0034】
また、本発明は、ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む組成物の薬物過敏反応の発病予測用途を提供する。
【0035】
また、本発明は、薬物過敏反応の診断または発病予測用製剤を製造するためのｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰ検出製剤の用途を提供する。
【発明の効果】
【0036】
本発明者らは、薬物過敏反応患者のゲノムＤＮＡのタンパク質コーディング部位を解析した結果、一塩基多型（ＳＮＰ）部位であるｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９が、薬物過敏反応の発病と密接に関連していることを糾明し、これを用いて薬物過敏反応の診断または発病予測のための遺伝子診断試薬を開発するのに用いることができる。
【図面の簡単な説明】
【0037】
【図1a-1b】図１ａおよび図１ｂは、本発明の一実施形態による品質管理（ＱＣ）プロセスフローを要約した図であり、図１ａは、発見解析上の品質管理プロセスフロー図であり、図１ｂは、複製解析上の品質管理プロセスフロー図である。
【図2】図２は、１０００Ｇデータセットを発見データの多次元スケーリング（ＭＤＳ）プロットで示す図であり、青色、黄色および灰色は、それぞれ、対照群、ケース（ＤＨＲ、即時型＋遅延型）、および１０００Ｇ母集団を示すものである。
【図5a-5b】図５ａおよび図５ｂは、領域プロットを示す図であり、図５ａは、対照群対ＤＨＲに対するロジスティック回帰解析結果であり、図５ｂは、対照群対遅延型反応に対する一般化した多項ロジットモデルを示す図である。
【発明を実施するための最良の形態】
【0038】
本発明は、ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む薬物過敏反応の診断または発病予測用組成物に関することである。
【0039】
以下、本発明を詳細に説明する。
【0040】
本明細書において、「ポリヌクレオチド（ｐｏｌｙｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）」または「核酸」は、単鎖または二本鎖の形態からなるデオキシリボ核酸（ｄｅｏｘｙｒｉｂｏｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ、ＤＮＡ）またはリボ核酸（ｒｉｂｏｎｕｃｌｅｉｃ ａｃｉｄ、ＲＮＡ）を言う。他の制限がない限り、自然的に生成されるヌクレオチドと同様の方法で核酸にハイブリダイゼーションされる天然ヌクレオチドの既知のアナログも含まれる。一般的に、ＤＮＡは、アデニン（ａｄｅｎｉｎｅ、Ａ）、グアニン（ｇｕａｎｉｎｅ、Ｇ）、シトシン（ｃｙｔｏｓｉｎｅ、Ｃ）、チミン（ｔｈｙｍｉｎｅ、Ｔ）等４種の塩基で構成されており、ＲＮＡは、チミンの代わりに、ウラシル（Ｕｒａｃｉｌ、Ｕ）を持っている。核酸二本鎖においてＡは、ＴまたはＵ、Ｃは、Ｇ塩基と水素結合を成すが、このような塩基の関係を「相補的（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ）」と言う。
【0041】
本明細書において、遺伝子の変異を表記するとき、「ｃ．」は、タンパク質コーディング部位の変異を意味し、「（塩基位置）（塩基１文字）（記号＞）（塩基１文字）」は、当該塩基位置で先行表記された塩基が後行表記された塩基に置換されることを意味する。
【0042】
本明細書において、「多型（ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ）」とは、遺伝的に決定された集団内で２以上の代替配列または対立形質（または対立遺伝子）の発生を意味し、「一塩基多型（ｓｉｎｇｌｅ ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ ｐｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍ、ＳＮＰ）」は、１つの塩基の多型を意味する。具体的には、ゲノムにおいて一塩基（Ａ、Ｔ、ＣまたはＧ）が種のメンバー間または一個体（ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ）のペア染色体間に発生するＤＮＡ配列の多様性を意味する。例えば、互いに異なる個体の３つのＤＮＡ断片（例えば、ＡＡＧＴ［Ａ／Ａ］ＡＧ、ＡＡＧＴ［Ａ／Ｇ］ＡＧ、ＡＡＧＴ［Ｇ／Ｇ］ＡＧ）のように一塩基において差異を含む場合、２つの対立遺伝子（ＡまたはＧ）と呼び、一般的にほぼすべてのＳＮＰは、２つの対立遺伝子を有する。また、ＳＮＰが特定の疾患と遺伝的に密接に関連している場合には、ＳＮＰは、確認された健常者（ｎｏｒｍａｌ）または野生型（ｗｉｌｄ－ｔｙｐｅ、ＷＴ）個体または対立遺伝子と比較して、特定の位置の１つの塩基に変異が発生したことを意味することがある。
【0043】
なお、「ｍＲＮＡ（ｍｅｓｓｅｎｇｅｒ ＲＮＡまたはメッセンジャーＲＮＡ）」は、タンパク質合成過程で特定遺伝子の塩基配列の遺伝情報をリボソーム（ｒｉｂｏｓｏｍｅ）に伝達し、ポリペプチド合成（タンパク質翻訳、ｔｒａｎｓｌａｔｉｏｎ）の青写真の役割をするＲＮＡである。遺伝子を鋳型（ｔｅｍｐｌａｔｅ）にして一本鎖のｍＲＮＡが転写（ｔｒａｎｓｃｒｉｐｔｉｏｎ）過程を通じて合成される。
【0044】
本明細書において「タンパク質」は、「ポリペプチド（ｐｏｌｙｐｅｐｔｉｄｅ）」または「ペプチド（ｐｅｐｔｉｄｅ）」と互換的に使用され、例えば、自然状態のタンパク質で一般的に発見されるようにアミノ酸残基の重合体を言う。
【0045】
本明細書に使用されたアミノ酸の１文字（３文字）は、生化学分野における標準略語規定によって次のアミノ酸を意味する：Ａ（Ａｌａ）：アラニン；Ｃ（Ｃｙｓ）：システイン；Ｄ（Ａｓｐ）：アスパラギン酸；Ｅ（Ｇｌｕ）：グルタミン酸；Ｆ（Ｐｈｅ）：フェニルアラニン；Ｇ（Ｇｌｙ）：グリシン；Ｈ（Ｈｉｓ）：ヒスチジン；Ｉ（ＩＩｅ）：イソロイシン；Ｋ（Ｌｙｓ）：リシン；Ｌ（Ｌｅｕ）：ロイシン；Ｍ（Ｍｅｔ）：メチオニン；Ｎ（Ａｓｎ）：アスパラジン；Ｏ（Ｐｌｙ）：ピロリシン；Ｐ（Ｐｒｏ）：プロリン；Ｑ（Ｇｌｎ）：グルタミン；Ｒ（Ａｒｇ）：アルギニン；Ｓ（Ｓｅｒ）：セリン；Ｔ（Ｔｈｒ）：スレオニン；Ｕ（Ｓｅｃ）：セレノシステイン；Ｖ（Ｖａｌ）：バリン；Ｗ（Ｔｒｐ）：トリプトファン；Ｙ（Ｔｙｒ）：チロシン。
【0046】
本明細書に表記される「（アミノ酸１文字）（アミノ酸位置）（アミノ酸１文字）」は、野生型タンパク質（ｗｉｌｄ－ｔｙｐｅ ｐｒｏｔｅｉｎ）の当該アミノ酸位置で先行表記されたアミノ酸が後行表記されたアミノ酸に置換されることを意味する。
【0047】
本明細書において使用される用語「相補的（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ）」は、所定のハイブリダイゼーションまたはアニーリング条件、具体的には、生理学的条件下（細胞内）で核酸分子内ターゲッティングモイアティがターゲット（例えば、本発明のＳＮＰ）に選択的にハイブリダイゼーションするほど十分に相補的であることを意味し、１つまたはそれ以上のミスマッチ（ｍｉｓｍａｔｃｈ）塩基配列を有していてもよく、実質的に相補的（ｓｕｂｓｔａｎｔｉａｌｌｙ ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ）および完全に相補的（ｐｅｒｆｅｃｔｌｙ ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ）ものを全部包括する意味を有し、より具体的には、完全に相補的であることを意味する。
【0048】
本明細書において前記組成物は、ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰを診断マーカーで検出する。
【0049】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ３５３７２９３２は、染色体６上の３２５９７２０８番目の塩基がＣからＴに置換されたものである。
【0050】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ７９７３６８１８は、染色体５上の１４８３５７５８１番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0051】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ３１２９８７１は、染色体６上の３２４３８５６５番目の塩基がＣからＡに置換されたものである。
【0052】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ９５５７２９１は、染色体１３上の９９７６１２１０番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0053】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１１７２４４２８は、染色体４上の１１２５９８４５１番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0054】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１１１２３５５２は、染色体２上の１２０４５４２４５番目の塩基がＣからＧに置換されたものである。
【0055】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ６２１２４６１３は、染色体２上の２０３８６４６６番目の塩基がＣからＴに置換されたものである。
【0056】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ７７３８９５３６は、染色体１０上の１０２４０８３６８番目の塩基がＴからＣに置換されたものである。
【0057】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ２０６８８７０８４は、染色体１２上の９４６２０９８０番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0058】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ９５５７２９１は、染色体１３上の９９７６１２１０番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0059】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ３７２０２５は、染色体４上の１０７０７７２１４番目の塩基がＴからＣに置換されたものである。
【0060】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ８０５８１１４は、染色体１６上の１２６０３７７２番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0061】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１４３３９５８５９は、染色体７上の２７２９３４０４番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0062】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ５７８３３８０１は、染色体２上の１２１７７７４０５番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0063】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１３９８３０８８８は、染色体７上の１４７８７２７４２番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0064】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ９３８４４２３は、染色体６上の１５６０８９０７１番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0065】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ６０９７０６４は、染色体２０上の３７９５２３４８番目の塩基がＡからＣに置換されたものである。
【0066】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ２１７５５６２は、染色体４上の１４０３９８６３９番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0067】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ３９２４１６４は、染色体１８上の７６７３７９２７番目の塩基がＣからＴに置換されたものである。
【0068】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１１２０６４７７は、染色体１上の５４９４１６２１番目の塩基がＣからＡに置換されたものである。
【0069】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ６２２２５０７８は、染色体２２上の４７７４０９７５番目の塩基がＴからＡに置換されたものである。
【0070】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ７３２０２９３３は、染色体１２上の８９８１９３０６番目の塩基がＴからＣに置換されたものである。
【0071】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ７２６２２１８７は、染色体３上の６０７８０５１番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0072】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１３９１４１１０４は、染色体６上の３１０２１２４４番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0073】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ９９９４０９２は、染色体４上の６５５７０３９６番目の塩基がＣからＡに置換されたものである。
【0074】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１７６２８５２８８４は、染色体６上の３０９９４９３６番目の塩基がＡからＣに置換されたものである。
【0075】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ２３３５５４５は、染色体１６上の２９１６１１１番目の塩基がＣからＴに置換されたものである。
【0076】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ９６８８８９５は、染色体６上の３８４６５５２３番目の塩基がＣからＡに置換されたものである。
【0077】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１４４１３０２１９は、染色体１３上の９８７２５７８２番目の塩基がＴからＣに置換されたものである。
【0078】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ７８８３１４８７は、染色体１９上の６５３７１４０番目の塩基がＴからＣに置換されたものである。
【0079】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ４５６４４９は、染色体２１上の３８８５１００３番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0080】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１３２５０５４８は、染色体８上の３５６５０８８２番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0081】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ７７０６８７７３は、染色体２１上の２３２０４１９６番目の塩基がＡからＴに置換されたものである。
【0082】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ３０２５０３５は、染色体６上の４３７８３６２２番目の塩基がＣからＴに置換されたものである。
【0083】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ２０８８１４２は、染色体１５上の３３６９１２８５番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0084】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１２７６１７５は、染色体５上の３０９４５６９１番目の塩基がＧからＡに置換されたものである。
【0085】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ１４４１５７０１７は、染色体６上の５０７４０４６５番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0086】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ５９５９４９５５は、染色体６上の３８４４３３４６番目の塩基がＡからＣに置換されたものである。
【0087】
本明細書においてＳＮＰ ｒｓ２８７１７９９９は、染色体４上の６５５７１２２３番目の塩基がＡからＧに置換されたものである。
【0088】
前記言及されたＳＮＰは、それぞれ、配列番号１～配列番号３８の塩基配列上に位置していてもよい。前記言及された配列番号１～配列番号３８の塩基配列は、本発明によるＳＮＰ位置に該当する塩基をｒで表示し、前記ＳＮＰ位置を基準として、５’方向の配列１０ｎｔ、３’方向の配列１０ｎｔを表示したものである。例えば、配列番号１（ｒｓ＿ｉｄ、ｒｓ３５３７２９３２）の塩基配列は、ＳＮＰ位置をｒで表示し、これを基準としてそれぞれ長さ１０ｎｔの塩基配列を両側に表示したものであり、全長２１ｎｔの配列が表示されたものである。また、ｒで表示した塩基が、例えば、多数対立遺伝子であるＴまたは少数対立遺伝子であるＣと確認された場合、配列目録の識別番号＜２２３＞項目にｒ＝ｔ ｏｒ ｃで表示した。前記配列番号１～配列番号３８の塩基配列は、個体、特にヒトにおいてＳＮＰの位置を特定するための目的で使用されるものであり、したがって、前記配列番号１～配列番号３８の塩基配列が有する長さや表示した範囲によって本発明が制限されるわけではない。
【0089】
本明細書において、用語「検出」は、目的する物質の存在（発現）の有無を測定および確認すること、または目的する物質の存在レベル（発現レベル）の変化を測定および確認することを全部含む意味である。同じ脈絡で、本発明において前記ＳＮＰの発現レベルを測定することは、発現の有無を測定すること（すなわち、発現有無を測定すること）、または前記ＳＮＰの質的、量的変化レベルを測定することを意味する。前記測定は、定性的な方法（解析）と定量的な方法を全部含んで制限なく行われ得る。ＳＮＰ存在の有無の測定において定性的方法と定量的方法の種類は、当業界においてよく知られており、本明細書において記述した実験法がこれに含まれる。各方法別に具体的ＳＮＰレベル比較方式は、当業界においてよく知られている。
【0090】
本明細書において、「薬物過敏反応」は、薬物アレルギーとも命名され、薬物に感作された患者において免疫学的な機序によって媒介される反応を意味する。薬物アレルギーは、薬物本来の薬理作用と関係なく、免疫機序によって有害反応が発生する場合であり、Ｂ型反応で６～１０％程度を占める。発生機序によって第１型から第４型まで過敏反応（ｔｙｐｅ １－４ ｈｙｐｅｒｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ ｒｅａｃｔｉｏｎｓ）に分けられ、薬剤によって多様に現れ、同じ薬剤が患者によって異なる機序の過敏反応を誘発することができる。一例として、多用される抗生剤であるセファロスポリン（ｃｅｐｈａｌｏｓｐｏｒｉｎ）は、患者によって第１型過敏反応であるじんましんやアナフィラキシーを誘発することができ、第４型過敏反応である紅斑性発疹（ｅｘａｎｔｈｅｍａｔｏｕｓ ｒａｓｈ）も頻繁に現れる。最近使用が増加しているキロノン（ｑｕｉｎｏｌｏｎｅ）系抗生剤による過敏反応も、頻繁に見られ、じんましん等の第１型過敏反応およびＤＲＥＳＳ症候群、ＳＪＳ、ＴＥＮのようなひどい第４型過敏反応も報告されていて、注意を要する。
【0091】
本明細書において、「即時型薬物過敏反応」は、一般的に薬物服用後１時間以内に発生し、じんましん、血管性浮腫、アナフィラキシー等の症状が主に現れる。即時型反応は、主にＩｇＥ抗体媒介型免疫反応または薬剤が直接的に肥満細胞を刺激して発生し、じんましん、血管性浮腫、鼻炎、気道収縮、かゆみ症、嘔吐、下痢、アナフィラキシー等の反応が１つあるいは複合的に現れる。
【0092】
本明細書において、「遅延型薬物過敏反応」とは、薬物投与後、数日から数週後に発生し、補体系の活性、抗原－抗体複合体の形成および免疫細胞の活性による機序で血管炎、血球異常、発疹（固定薬疹、剥脱性皮膚炎、急性全身発疹性膿疱症（ＡＧＥＰ）、ＤＲＥＳＳ症候群、スティーブンス・ジョンソン症候群（ＳＪＳ）、中毒性表皮壊死症（ＴＥＮ）、関節痛、タンパク尿、リンパ節腫脹等が観察される。遅延型過敏反応は、主に投薬後１週から８週間に発生するが、以前に感作されて、軽微な症状があった患者の場合は、投薬後に即時発現することもある。
【0093】
本明細書において、前記薬物過敏反応は、アナフィラキシー、血管性浮腫、じんましん、斑点状丘疹、ＤＲＥＳＳ症候群、スティーブンス・ジョンソン症候群、中毒性表皮壊死症、および固定薬疹からなる群から選択された１つ以上であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0094】
本明細書において、前記薬物は、ＮＳＡＩＤ（含アスピリン）、アセトアミノフェン、セファロスポリン、抗生剤、放射線造影剤、化学療法剤、Ｈ２遮断剤、アロプリノール、および抗けいれん剤からなる群から選択された１つ以上であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0095】
本明細書において、前記ＮＳＡＩＤＳは、アセメタシン、アセチルサリチル酸、ブフェキサマク、ジクロフェナク、ジクロフェナクナトリウム、ジフルニサル、ジピロン（メタミゾール）、メタミゾールナトリウム、エテンザミド、エトフェナメート、フルフェナム酸、フルルビフロフェン、イブプロフェン、インドメタシン、イソシカム、ケブゾン、ケトプロフェン、ケトロラック、ロナゾラック、ロルノキシカム、メクロフェナム酸、メフェナム酸、モフェブタゾン、ナブメトン、ナプロキセン、（＋）－イブプロフェン、（－）－イブプロフェン、（＋）－ナプロキセン、ニフルム酸、オキサプロジン、オキシフェンブタゾン、フェニルブタゾン、ピロキシカム、プロピフェナゾン、サリチルアミド、スリンダク、テノキシカム、チアプロフェン酸、ＳＣ５６０、スルファサラジンおよびトルメチンからなる群から選択された１つ以上であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0096】
本明細書において、前記放射線造影剤は、イオヘキソール（Ｉｏｈｅｘｏ）、イオパミドール（Ｉｏｐａｍｉｄｏｌ）、イオバーソル（Ｉｏｖｅｒｓｏｌ）、イオジキサノール（Ｉｏｄｉｘａｎｏｌ）、イオプロミド（Ｉｏｐｒｏｍｉｄｅ）、イオキサグレート（Ｉｏｘａｇｌａｔｅ）、およびジアトリゾエート（Ｄｉａｔｒｉｚｏａｔｅ）からなる群から選択された１つ以上であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0097】
本明細書において、前記抗生剤は、β－ｌａｃｔａｍ系抗生剤（ペニシリン系またはセファロスポリン系）であってもよいが、これに限定されるものではない。
【0098】
本明細書において、前記薬物過敏反応は、韓国人で発病したものであってもよいが、これに限定されるものではない。
【0099】
本明細書において、用語「診断」は、特定の病気または疾患に対する1つの対象体の感受性（ｓｕｓｃｅｐｔｉｂｉｌｉｔｙ）を判定すること、1つの対象体が特定の病気または疾患を現在持っているかどうかを判定すること、特定の病気または疾患に罹患した1つの対象体の予後（ｐｒｏｇｎｏｓｉｓ）を判定すること、またはテラメトリックス（ｔｈｅｒａｍｅｔｒｉｃｓ）（例えば、治療効能に関する情報を提供するために対象体の状態をモニタリングすること）を全部含む概念である。本明細書において、前記診断は、好ましくは、早期診断または発病予測を意味し得るが、これに限定されるものではない。
【0100】
本明細書において、前記診断は、薬物過敏反応の診断を意味する。本発明において薬物過敏反応は、好ましくは、遺伝的素因（ｇｅｎｅｔｉｃ ｆａｃｔｏｒ）によって誘発される遺伝性（ｈｅｒｅｄｉｔａｒｙ）薬物過敏反応であってもよく、遺伝的素因に環境的な影響が加えられて、症状が重くなったものであってもよい。
【0101】
本明細書において、「プライマー（ｐｒｉｍｅｒ）」は、ＤＮＡ合成の開始点（ｓｔａｒｔｉｎｇ ｐｏｉｎｔ）として作用する短い一本鎖オリゴヌクレオチド（ｓｉｎｇｌｅ ｓｔｒａｎｄ ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ）である。プライマーは、好適な緩衝液（ｂｕｆｆｅｒ）と温度条件で鋳型（ｔｅｍｐｌａｔｅ）のポリヌクレオチドに特異的に結合し、ＤＮＡ重合酵素がプライマーに鋳型ＤＮＡに相補的塩基を有するヌクレオシドトリホスフェートを追加して連結することによってＤＮＡが合成される。プライマーは、一般的に１５～３０個の塩基配列からなり、塩基の構成と長さによって鋳型鎖に結合する温度（ｍｅｌｔｉｎｇ ｔｅｍｐｅｒａｔｕｒｅ、Ｔｍ）が変わる。プライマーの配列は、鋳型の一部の塩基配列と完全に相補的配列を有する必要はなく、鋳型とハイブリダイゼーションされてプライマー固有の作用ができる範囲内での十分な相補性を有すれば十分である。したがって、本発明において、前記ＳＮＰ部位のｃＤＮＡまたはｇｅｎｏｍｉｃ ＤＮＡの塩基配列を参照して、本発明による検出製剤であるプライマーペアを容易にデザインすることができる。ＳＮＰを検出するためのプライマーは、各遺伝子配列に完ぺきに相補的配列を有する必要はなく、ＤＮＡ合成を通じてｍＲＮＡまたはｃＤＮＡの特定区間を増幅してｍＲＮＡの量を測定しようとする目的に合う長さと相補性を有するものであれば十分である。前記増幅反応のためのプライマーは、増幅しようとするｍＲＮＡの特定区間の両端部の鋳型（またはセンス、ｓｅｎｓｅ）と反対側（アンチセンス、ａｎｔｉｓｅｎｓｅ）にそれぞれ相補的に結合するワンセット（ペア）で構成される。
【0102】
本明細書において、「プローブ（ｐｒｏｂｅ）」は、特定遺伝子のｍＲＮＡやｃＤＮＡ（ｃｏｍｐｌｅｍｅｎｔａｒｙ ＤＮＡ）、ＤＮＡ等に特異的に結合できる短くは数個～長くは数百個の塩基（ｂａｓｅ ｐａｉｒ）の長さのＲＮＡまたはＤＮＡ等のポリヌクレオチドの断片を意味し、標識（ｌａｂｅｌｉｎｇ）されていて、結合する対象ｍＲＮＡやｃＤＮＡの存在の有無、発現量等を確認することができる。プローブの選択およびハイブリダイゼーション条件は、当業界において一般的に知られている技術によって適宜選択することができる。前記プローブは、対立形質（または対立遺伝子、ａｌｌｅｌｅ）を検出するための診断方法等に使用することができる。前記診断方法には、サザンブロット等のような核酸のハイブリダイゼーションに基づく検出方法が含まれ、ＤＮＡチップを用いた方法でＤＮＡチップの基板にあらかじめ結合した形態で提供されることもできる。本発明において前記プライマーまたはプローブは、ホスホロアミダイト（ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅ）固体支持体合成法やその他広く知られている方法を用いて化学的に合成することができる。
【0103】
本明細書において、プライマーまたはプローブは、ホスホロアミダイト（ｐｈｏｓｐｈｏｒａｍｉｄｉｔｅ）固体支持体合成法やその他広く知られている方法を用いて化学的に合成することができる。また、プライマーまたはプローブは、検出しようとする標的となるポリヌクレオチドとのハイブリダイゼーションを妨害しない範囲で当該技術分野に一般的に知られている方法により多様に修飾することができる。このような修飾の例としては、メチル化、キャップ化、天然ヌクレオチド１つ以上の同族体への置換およびヌクレオチド間の修飾、例えば、荷電していない連結体（例：メチルホスホネート、ホスホトリエステル、ホスホロジアミデート、カルバマート等）または荷電した連結体（例：ホスホロチオエート、ホスホロジチオアート等）、および蛍光または酵素を用いた標識物質（ｌａｂｅｌｉｎｇ ｍａｔｅｒｉａｌ）の結合等がある。
【0104】
また、本発明は、前記組成物を含む薬物過敏反応の診断用キットを提供する。
【0105】
本明細書において、前記キットは、ＲＴ－ＰＣＲキットまたはマイクロアレイチップキットであってもよいが、これに限定されるものではない。
【0106】
前記キットは、薬物過敏反応の診断用マーカーであるＳＮＰマーカーを増幅を通じて確認したり、ＳＮＰマーカーの発現レベルをｍＲＮＡの発現レベルを確認することによって、薬物過敏反応の発病を予測または早期診断することができる。
【0107】
前記ＲＴ－ＰＣＲキットは、前記ＳＮＰ部位を含む核酸を増幅できるそれぞれのプライマーペアを含んでもよいし、その他テストチューブまたは他の適切なコンテナ、反応緩衝液、デオキシヌクレオチド（ｄＮＴＰｓ）、Ｔａｑ－重合酵素および逆転写酵素のような酵素、ＤＮａｓｅ、ＲＮＡｓｅ抑制剤、ＤＥＰＣ水（ＤＥＰＣ－ｗａｔｅｒ）、滅菌水等を含んでもよい。また、定量対照群に使用される遺伝子に特異的なプライマーペアを含んでもよい。
【0108】
前記マイクロアレイチップキットは、前記ＳＮＰ部位を含む核酸が固定化されている基板を有するマイクロアレイを含んでもよい。前記マイクロアレイは、本発明のポリヌクレオチド、プライマーまたはプローブを含むことを除いて、通常のマイクロアレイからなってもよい。マイクロアレイ上での核酸のハイブリダイゼーションおよびハイブリダイゼーション結果の検出は、当業界においてよく知られている。前記検出は、例えば、核酸試料を蛍光物質、例えば、Ｃｙ３およびＣｙ５のような物質を含む検出可能なシグナルを発生させることができる標識物質で標識した後、マイクロアレイ上にハイブリダイゼーションし、前記標識物質から発生するシグナルを検出することによって、ハイブリダイゼーション結果を検出することができる。
【0109】
本発明において用語「個体」または「対象体」は、発病予測または診断をするための被験者を意味する。
【0110】
本発明において「試料」は、発病予測または診断しようとする対象体から採取されたものであれば、制限なく使用することができ、例えば、生検等で得られた細胞や組織、血液、全血、血清、血漿、唾液、脳脊髄液、各種分泌物、尿、便等でありうる。好ましくは、血液、血漿、血清、唾液、鼻液、喀痰、腹水、膣分泌物および尿からなる群から選択することができ、好ましくは、血液、血漿、または血清であってもよい。前記試料は、検出または診断に使用する前に前処理してもよい。例えば、均質化（ｈｏｍｏｇｅｎｉｚａｔｉｏｎ）、ろ過、蒸留、抽出、濃縮、妨害成分の不活性化、試薬の添加等を含んでもよい。
【0111】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法を提供する。
【0112】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測に必要な情報を提供する方法を提供する。
【0113】
また、本発明は、薬物過敏反応患者から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体を遅延型薬物過敏反応であると判定する段階を含む遅延型薬物過敏反応の診断に必要な情報を提供する方法を提供する。
【0114】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の診断方法を提供する。
【0115】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測方法を提供する。
【0116】
本明細書において、前記方法は、シーケンシング（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、エクソームシーケンシング（ｅｘｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、マイクロアレイによるハイブリダイゼーション（ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、対立遺伝子特異的なＰＣＲ（ａｌｌｅｌｅ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＰＣＲ）、ダイナミック対立遺伝子ハイブリダイゼーション法（ｄｙｎａｍｉｃ ａｌｌｅｌｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、ＰＣＲ伸長解析およびＴａｑｍａｎ法からなる群から選択される１つ以上の方法で行われ得るが、これに限定されるものではない。
【0117】
また、本発明は、被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階と、
【0118】
前記被検体が薬物過敏反応を発症したと判定された場合、被検体の薬物過敏反応を治療する段階と、を含む薬物過敏反応の治療方法を提供することができる。
【0119】
本発明において、前記「治療」は、目的する病気とそれによる代謝異常症状が好転したり有益に変更されるすべての行為を意味し、化学療法、外科的手術、または生物学的療法等の方法を使用することができる。
【0120】
本発明において、前記薬物過敏反応の治療のために通常使用される治療方法を使用したり、通常使用される薬物過敏反応の治療薬物を投与することができ、例えば、抗ヒスタミン剤、ステロイド、エピネフリン、または気管支拡張剤等を投与することができるが、これに限らない。
【0121】
また、本発明は、ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む組成物の薬物過敏反応の診断または発病予測用途を提供する。
【0122】
また、本発明は、薬物過敏反応の診断または発病予測用製剤を製造するためのｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰ検出製剤の用途を提供する。
【0123】
本発明は、多様な変換を加えることができ、様々な実施例を有することができるところ、特定の実施例を図面に例示し、詳細な説明に詳細に説明しようとする。しかしながら、これは、本発明を特定の実施形態に対して限定しようとするものではなく、本発明の思想および技術範囲に含まれるすべての変換、均等物や代替物を含むものと理解すべきである。本発明を説明するに際して、関連した公知の技術に関する具体的な説明が本発明の要旨を不明にすることができると判断される場合、その詳細な説明を省略する。
【0124】
以下、本発明の理解を助けるために好適な実施例を提示する。しかしながら、下記の実施例は、ただ本発明をより容易に理解するために提供されるものであり、下記実施例によって本発明の内容が限定されるものではない。
【0125】
［実施例］
実施例１．実験方法
対象
２０１２年から２０１７年までソウルアサン病院に訪問したＤＨＲ（Ｄｒｕｇ Ｈｙｐｅｒｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｒｅａｃｔｉｏｎｓ）患者３７８人を募集した。本研究は、ヘルシンキ宣言によって行われ、プロトコルは、ソウルアサン病院機関審査委員会（２０１１－０９３９）の承認を受けた。登録および血液サンプル採取に対しては、すべての参加者から書面同意を受けた。各被験者から血液サンプルを収集し、Ｋ－ＣＨＩＰを用いて遺伝子型を解析した。Ｋ－ＣＨＩＰは、Ｋ－ＣＨＩＰコンソーシアム（ｈｔｔｐ：／／ｋｏｇｏ．ｏｒ．ｋｒ）を通じて提供され、韓国保健研究院のゲノム科学センターで設計した。対照群データ（Ｎ＝３，７８０）は、韓国セブランス病院の健康診断センターのデータを使用し、Ｋ－ＣＨＩＰを用いて遺伝子型を解析した（図１参照）。Ｂａｔｃｈ効果を最小化するために、Ｋ－ｍｅｄｏｉｄクラスタリングに基づく呼び出し方式を用いてＳＮＰ遺伝子型を解析した。統合データにＥＩＧＥＮＳＴＲＡＴアクセス方式を適用し、対照群と患者グループ間に主成分スコア（ＰＣ（Ｐｒｉｎｃｉｐａｌ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）スコア）を計算した（類似の遺伝情報を有する被験者を一致させるために）、患者当たり合計１０個の対照群が類似のスコアで一致した。ＰＣスコアは、遺伝的背景のない被験者を識別するのに使用された。多次元スケーリングプロットは、図２に示した。
実施例１．実験方法
対象
２０１２年から２０１７年までソウルアサン病院に訪問したＤＨＲ（Ｄｒｕｇ Ｈｙｐｅｒｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ Ｒｅａｃｔｉｏｎｓ）患者３７８人を募集した。本研究は、ヘルシンキ宣言によって行われ、プロトコルは、ソウルアサン病院機関審査委員会（２０１１－０９３９）の承認を受けた。登録および血液サンプル採取に対しては、すべての参加者から書面同意を受けた。各被験者から血液サンプルを収集し、Ｋ－ＣＨＩＰを用いて遺伝子型を解析した。Ｋ－ＣＨＩＰは、Ｋ－ＣＨＩＰコンソーシアム（ｈｔｔｐ：／／ｋｏｇｏ．ｏｒ．ｋｒ）を通じて提供され、韓国保健研究院のゲノム科学センターで設計した。対照群データ（Ｎ＝３，７８０）は、韓国セブランス病院の健康診断センターのデータを使用し、Ｋ－ＣＨＩＰを用いて遺伝子型を解析した（図１参照）。Ｂａｔｃｈ効果を最小化するために、Ｋ－ｍｅｄｏｉｄクラスタリングに基づく呼び出し方式を用いてＳＮＰ遺伝子型を解析した。統合データにＥＩＧＥＮＳＴＲＡＴアクセス方式を適用し、対照群と患者グループ間に主成分スコア（ＰＣ（Ｐｒｉｎｃｉｐａｌ ｃｏｍｐｏｎｅｎｔ）スコア）を計算した（類似の遺伝情報を有する被験者を一致させるために）、患者当たり合計１０個の対照群が類似のスコアで一致した。ＰＣスコアは、遺伝的背景のない被験者を識別するのに使用された。多次元スケーリングプロットは、図２に示した。
【0126】
複製解析
２０１２年から２０１５年までソウルアサン病院で募集された追加ＤＨＲ患者１８５人を対象に遺伝子型の解析を繰り返した。この患者は、Ａｘｉｏｍ Ａｓｉａｎ ｃｈｉｐ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）を用いて遺伝子型を指定した。対照群は、セブランス病院の健康診断センター（Ｎ＝２,３１２）に登録し、Ｋ－ＣＨＩＰを用いて遺伝子型を解析した。すべてのデータをプールし、対象代入を行った（図１参照）。
２０１２年から２０１５年までソウルアサン病院で募集された追加ＤＨＲ患者１８５人を対象に遺伝子型の解析を繰り返した。この患者は、Ａｘｉｏｍ Ａｓｉａｎ ｃｈｉｐ（Ａｆｆｙｍｅｔｒｉｘ）を用いて遺伝子型を指定した。対照群は、セブランス病院の健康診断センター（Ｎ＝２,３１２）に登録し、Ｋ－ＣＨＩＰを用いて遺伝子型を解析した。すべてのデータをプールし、対象代入を行った（図１参照）。
【0127】
データ解析グループ
ＤＨＲ患者を即時反応と遅延反応の２つのグループに分けた。比較解析は、総ＤＨＲを対照群と比較し、各ＤＨＲ群を対照群と比較し、最後に即時型反応群と遅延型反応群を比較した。
ＤＨＲ患者を即時反応と遅延反応の２つのグループに分けた。比較解析は、総ＤＨＲを対照群と比較し、各ＤＨＲ群を対照群と比較し、最後に即時型反応群と遅延型反応群を比較した。
【0128】
品質管理
ＳＮＰと被験者のクォリティー、すなわち品質を評価した。品質管理のすべての段階は、ＰＬＩＮＫとＯＮＥＴＯＯＬを用いて行われた。Ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡（ＨＷＥ）テストに対するＰ値が１×１０－５未満、ＭＡＦ（マイナー対立遺伝子頻度）が０．０５未満または遺伝子型解析率が０．９５未満のＳＮＰを除いた。また、欠測率（ｍｉｓｓｉｎｇ ｒａｔｅ）が０．０５より大きかったり、他の個体と共にＩＢＳ（Ｉｄｅｎｔｉｔｙ－Ｂｙ－Ｓｔａｔｅ）が０．９より大きい個体を除いた。このようなフィルタリング手続きは、各ケースと対照群に別に適用され、ケースと対照群を統合した。また、２つのグループ両方に存在するＳＮＰを考慮し、プールされたデータに同じ品質管理手続きを適用した。また、Ｆｉｓｈｅｒの正確確率検定を用いて各ケースと対照群間の平均欠測率の同等性をテストし、１×１０－５有意性レベルで有意味なＳＮＰをＧＷＡＳから除去した。このようなプロセスは、要約して図１ａに示した。
ＳＮＰと被験者のクォリティー、すなわち品質を評価した。品質管理のすべての段階は、ＰＬＩＮＫとＯＮＥＴＯＯＬを用いて行われた。Ｈａｒｄｙ－Ｗｅｉｎｂｅｒｇ平衡（ＨＷＥ）テストに対するＰ値が１×１０－５未満、ＭＡＦ（マイナー対立遺伝子頻度）が０．０５未満または遺伝子型解析率が０．９５未満のＳＮＰを除いた。また、欠測率（ｍｉｓｓｉｎｇ ｒａｔｅ）が０．０５より大きかったり、他の個体と共にＩＢＳ（Ｉｄｅｎｔｉｔｙ－Ｂｙ－Ｓｔａｔｅ）が０．９より大きい個体を除いた。このようなフィルタリング手続きは、各ケースと対照群に別に適用され、ケースと対照群を統合した。また、２つのグループ両方に存在するＳＮＰを考慮し、プールされたデータに同じ品質管理手続きを適用した。また、Ｆｉｓｈｅｒの正確確率検定を用いて各ケースと対照群間の平均欠測率の同等性をテストし、１×１０－５有意性レベルで有意味なＳＮＰをＧＷＡＳから除去した。このようなプロセスは、要約して図１ａに示した。
【0129】
遺伝子型代入および推論された遺伝子型を用いた統計的解析
発見データがあるＧＷＡＳは、一般化ロジスティック回帰（ＧＬＲ）を用いて行われた。年齢と性別を共変量に含ませた。また、ロジスティック回帰（ＬＲ）モデルを用いて２進反応（対照群対ＤＨＲ）を予測した。ＧＬＲとＬＲは、いずれも、Ｒ統計ソフトウェア（Ｒ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｆｏｒ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ、Ｖｉｅｎｎａ、Ａｕｓｔｒｉａ；ｗｗｗ．ｒ－ｐｒｏｊｅｃｔ．ｏｒｇ）を用いて適用された。５×１０－８有意レベルでゲノム全般にわたる有意味なＳＮＰが選択された。微細マッピングのために全長ゲノムで有意なＳＮＰの±５,０００塩基対内に位置するＳＮＰを推論（ｉｍｐｕｔａｔｉｏｎ）した。推論は、Ｓａｎｇｅｒ推論サービス（ｈｔｔｐｓ：／／ｉｍｐｕｔａｔｉｏｎ．ｓａｎｇｅｒ．ａｃ．ｕｋ）を用いて行われた。Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ ｒｅｌｅａｓｅ ｖ１．１を使用し、６４,９４０ハプロタイプで構成されたヨーロッパ系アジア人（ＣＨＢ／ＪＰＴ）１６を主な参照パネルとして考慮した。ＳＨＡＰＥＩＴ１７およびＰＢＷＴ１８を用いてＰｒｅ－ｐｈａｓｉｎｇおよび推論を行い、ＩＮＦＯメトリックを用いて推論正確度を評価した。
発見データがあるＧＷＡＳは、一般化ロジスティック回帰（ＧＬＲ）を用いて行われた。年齢と性別を共変量に含ませた。また、ロジスティック回帰（ＬＲ）モデルを用いて２進反応（対照群対ＤＨＲ）を予測した。ＧＬＲとＬＲは、いずれも、Ｒ統計ソフトウェア（Ｒ Ｐｒｏｊｅｃｔ ｆｏｒ Ｓｔａｔｉｓｔｉｃａｌ Ｃｏｍｐｕｔｉｎｇ、Ｖｉｅｎｎａ、Ａｕｓｔｒｉａ；ｗｗｗ．ｒ－ｐｒｏｊｅｃｔ．ｏｒｇ）を用いて適用された。５×１０－８有意レベルでゲノム全般にわたる有意味なＳＮＰが選択された。微細マッピングのために全長ゲノムで有意なＳＮＰの±５,０００塩基対内に位置するＳＮＰを推論（ｉｍｐｕｔａｔｉｏｎ）した。推論は、Ｓａｎｇｅｒ推論サービス（ｈｔｔｐｓ：／／ｉｍｐｕｔａｔｉｏｎ．ｓａｎｇｅｒ．ａｃ．ｕｋ）を用いて行われた。Ｈａｐｌｏｔｙｐｅ Ｒｅｆｅｒｅｎｃｅ Ｃｏｎｓｏｒｔｉｕｍ ｒｅｌｅａｓｅ ｖ１．１を使用し、６４,９４０ハプロタイプで構成されたヨーロッパ系アジア人（ＣＨＢ／ＪＰＴ）１６を主な参照パネルとして考慮した。ＳＨＡＰＥＩＴ１７およびＰＢＷＴ１８を用いてＰｒｅ－ｐｈａｓｉｎｇおよび推論を行い、ＩＮＦＯメトリックを用いて推論正確度を評価した。
【0130】
実施例１．被験者の特性の確認
研究参加者の人口統計学的特性は、表１に要約した。
研究参加者の人口統計学的特性は、表１に要約した。
【0131】
研究に登録されたＤＨＲ患者（Ｎ＝３７８）の平均年齢は、４２．０３±１４．８２歳であり、２４７人の患者（６５．３４％）が女性であった。これらのうち２９５ケース（７８．０４％）は、即時型過敏反応を示し、８３ケース（２１．９６％）は、遅延型／非即時型反応を示した。即時型過敏反応を誘発する最も一般的な原因薬物は、ＮＳＡＩＤｓ、抗生剤の順であった。原因薬物の詳しい目録は、下記表２に示した。
【0132】
遅延型反応群では、原因薬物として抗生剤が最も多く、抗けいれん剤がその後に続いた。対照群（Ｎ＝３，７７９）の平均年齢は、４３．０７±９．８５歳であり、合計１２３６人の患者（３２．７％）が女性であった。複製解析で登録された１８５人のＤＨＲ患者の平均年齢は、５０．３８±１６．５８歳であり、１０５人の女性（５６．７６％）が含まれた。１８５人の患者のうち８０人の患者は、即時型過敏反応を示したのに対し、１０５人の患者は、遅延型過敏反応を示した。対照群は、合計９２１人の女性（３９．８４％）を含んで２，３１２人の被験者で構成され、被験者の平均年齢は、４６．９６±１０．７２歳であった。複製グループでは、ＮＳＡＩＤが最も一般的な原因薬物であり、抗生剤がその後に続いた（表２）。
【0133】
【表1】
【0134】
【表2】
【0135】
実施例２．ＧＷＡＳ解析結果の確認
合計２６５，８７８個のＳＮＰが品質管理を通過した（遺伝子型解析率（ｃａｌｌ ｒａｔｅ）＞９８％、ＭＡＦ＞０．０５）。まず、２つのグループのＤＨＲ（即時型および遅延型反応）間の関連性を解析した。ＬＲに対するＱ－Ｑプロットは、図３に示し、解析結果は、統計的に有意であった。
合計２６５，８７８個のＳＮＰが品質管理を通過した（遺伝子型解析率（ｃａｌｌ ｒａｔｅ）＞９８％、ＭＡＦ＞０．０５）。まず、２つのグループのＤＨＲ（即時型および遅延型反応）間の関連性を解析した。ＬＲに対するＱ－Ｑプロットは、図３に示し、解析結果は、統計的に有意であった。
【0136】
なお、図４に示されたように、ただ１つのＳＮＰのみがゲノム全体有意レベル（ｒｓ３５３７２９３２、ｐ＝７．９９Ｅ－０８）に近いことが分かった。前記ゲノム次元のＳＮＰは、ｒｓ３５３７２９３２であり、これは、染色体６にあるＨＬＡ－ＤＲＢ１遺伝子のアップストリーム領域に存在することが確認された（表３参照）。
【0137】
【表3】
【0138】
また、図５ａに示されたように、遺伝子型および代替ＳＮＰを用いた領域プロットで紫色で充填された点は、ｒｓ３５３７２９３２を示し、他の点の色相は、ｒｓ３５３７２９３２との相関関係を示す。すなわち、最も有意なＳＮＰは、ｒｓ３５３７２９３２であった。
【0139】
【0140】
なお、遅延型過敏反応と対照群の間で全長ゲノム上の５個の有意味なＳＮＰ（ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７およびｒｓ１３９１４１１０４）を比較した（表３および表４参照）。
【0141】
前記表３に示されたように、最も有意なＳＮＰ ｒｓ１３９１４１１０４は、６番染色体のＭＵＣ２２遺伝子のイントロン領域に存在する。
【0142】
図６に示されたように、合計５個のＳＮＰ（ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７およびｒｓ１３９１４１１０４）が全長遺伝子で有意であることを確認した。これは、表４に示されたのと同じ結果である。
【0143】
なお、遺伝子型および代替ＳＮＰを用いて準備した図５ｂの領域プロットで紫色で充填された点は、ｒｓ１３９１４１１０４を示し、他の点の色相は、これとの相関関係を示す。
【0144】
最後に、本発明者らは、薬物過敏反応の表現型を比較した。
【0145】
表４に示されたように、即時型過敏反応と遅延型過敏反応を比較したときには、有意味なＳＮＰが確認されなかった。
【0146】
【表4】
【0147】
実施例３．複製解析
代替を用いて複製解析を行った。合計７５，０７７個のＳＮＰが品質管理を通過した（遺伝子型解析率＞９８％、ＭＡＦ＞０．０３）（図１）。
代替を用いて複製解析を行った。合計７５，０７７個のＳＮＰが品質管理を通過した（遺伝子型解析率＞９８％、ＭＡＦ＞０．０３）（図１）。
【0148】
表５に示されたように、ディスカバリーデータ解析で有意味なものと確認されたＳＮＰのうち６番染色体のＨＬＡ－ＤＲＢ１上流領域であるｒｓ３５３７２９３２（ｐ＝０．００８）のみが統計的に有意であることが分かった。これは、ｒｓ３５３７２９３２が特定薬物過敏反応の表現型または原因薬物に限定されない一般的なマーカーとして使用可能であることを裏付ける結果である。
【0149】
【表5】
【0150】
実施例４．ＧＣＴＡ（Ｇｅｎｏｍｅ－ｗｉｄｅ Ｃｏｍｐｌｅｘ Ｔｒａｉｔ Ａｎａｌｙｓｉｓ）解析
ＧＣＴＡは、遺伝可能性を推定する方法の１つであり、ＳＮＰの遺伝力を推定できる方法の１つである。
ＧＣＴＡは、遺伝可能性を推定する方法の１つであり、ＳＮＰの遺伝力を推定できる方法の１つである。
【0151】
本発明者らは、遺伝子型ＳＮＰのｈＳＮＰ２（ａｄｄｉｔｉｖｅ ＳＮＰ ｈｅｒｉｔａｂｉｌｉｔｙ）を用いて表現型変異の割合を計算した。結果は、有病率によるｈＳＮＰ２の推定値を示した。
【0152】
図７に示されたように、薬物過敏反応有病率を２×１０－２に設定した結果、責任尺度でｈＳＮＰ２が３９．１２％であった。これは、従来の研究に照らしてみて、薬物過敏反応が相対的に高い遺伝性を有することを裏付ける結果である。
【0153】
前記実施例によって薬物過敏反応とその細部類型である即時型薬物過敏反応および遅延型薬物過敏反応において臨床的有意性があると判断されるＳＮＰが選別されたところ、本発明のＳＮＰは、薬物過敏反応の早期診断および発病予測に有用に用いることができることが期待される。
【0154】
上述した本発明の説明は、例示のためのものであって、本発明の属する技術分野における通常の知識を有する者は、本発明の技術的思想や必須的な特徴を変更することなく、他の具体的な形態に容易に修飾が可能であることが理解することができる。したがって、以上で記述した実施例は、全ての面において例示的なものであり、限定的でないものと理解すべきである。
【産業上の利用可能性】
【0155】
本発明において薬物過敏反応の発病と密接に関連しているものと確認した特定ＳＮＰは、薬物過敏反応の診断または発病予測のための遺伝子診断試薬を開発するのに有用に用いることができることが期待されるところ、産業上の利用可能性がある。
【図1a】
【図1b】
【図2】
【図3a】
【図3b】
【図3c】
【図4】
【図5a】
【図5b】
【図6】
【図7】
【配列表】
【手続補正書】
【提出日】2024-02-07
【手続補正1】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項1】
ｄｂＳＮＰデータベースｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項2】
前記薬物過敏反応は、即時型薬物過敏反応または遅延型薬物過敏反応であることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項3】
前記ＳＮＰが、１）ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、およびｒｓ２０６８８７０８４からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から薬物過敏反応の判定または発病予測用であり、前記ＳＮＰが、２）ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、およびｒｓ３９２４１６４からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から即時型薬物過敏反応の判定または発病予測用であり、
前記ＳＮＰが、３）ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、およびｒｓ１４４１３０２１９からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、健常者から遅延型薬物過敏反応の判定または発病予測用であり、
前記ＳＮＰが、４）ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の場合、前記組成物は、即時型薬物過敏反応と遅延型薬物過敏反応の区別用であることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項4】
前記ＳＮＰは、ｒｓ３５３７２９３２またはｒｓ１３９１４１１０４であることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項5】
前記薬物過敏反応は、韓国人で発病したことを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項6】
前記検出製剤は、請求項１に記載のＳＮＰを検出できるプローブであることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項7】
前記検出製剤は、請求項１に記載のＳＮＰを検出できるプライマーであることを特徴とする請求項１に記載の薬物過敏反応の判定または発病予測用組成物。
【請求項8】
請求項１に記載の組成物を含む、薬物過敏反応の判定用キット。
【請求項9】
前記キットは、ＲＴ－ＰＣＲキットまたはマイクロアレイチップキットであることを特徴とする請求項８に記載のキット。
【請求項10】
被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症したものと判定する段階を含む薬物過敏反応の判定に必要な情報を提供する方法。
【請求項11】
被検体から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体が薬物過敏反応を発症するリスクが高いものと判定する段階を含む薬物過敏反応の発病予測に必要な情報を提供する方法。
【請求項12】
薬物過敏反応患者から収得した試料中のＳＮＰ部位の塩基配列にｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上の一塩基多型が存在する場合、被検体を遅延型薬物過敏反応であると判定する段階を含む遅延型薬物過敏反応の判定に必要な情報を提供する方法。
【請求項13】
前記方法は、シーケンシング（ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、エクソームシーケンシング（ｅｘｏｍｅ ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ）、マイクロアレイによるハイブリダイゼーション（ｍｉｃｒｏａｒｒａｙ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、対立遺伝子特異的なＰＣＲ（ａｌｌｅｌｅ ｓｐｅｃｉｆｉｃ ＰＣＲ）、ダイナミック対立遺伝子ハイブリダイゼーション法（ｄｙｎａｍｉｃ ａｌｌｅｌｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ｈｙｂｒｉｄｉｚａｔｉｏｎ）、ＰＣＲ伸長解析およびＴａｑｍａｎ法からなる群から選択される１つ以上の方法で行われることを特徴とする請求項１０から１３のいずれか一項に記載の方法。
【請求項14】
ｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰの検出製剤を含む組成物の薬物過敏反応の判定または発病予測使用。
【請求項15】
薬物過敏反応の判定または発病予測用製剤を製造するためのｄｂＳＮＰ ｄａｔａｂａｓｅ ｒｓ３５３７２９３２、ｒｓ７９７３６８１８、ｒｓ３１２９８７１、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ１１７２４４２８、ｒｓ１１１２３５５２、ｒｓ６２１２４６１３、ｒｓ７７３８９５３６、ｒｓ２０６８８７０８４、ｒｓ９５５７２９１、ｒｓ３７２０２５、ｒｓ８０５８１１４、ｒｓ１４３３９５８５９、ｒｓ５７８３３８０１、ｒｓ１３９８３０８８８、ｒｓ９３８４４２３、ｒｓ６０９７０６４、ｒｓ２１７５５６２、ｒｓ３９２４１６４、ｒｓ１１２０６４７７、ｒｓ６２２２５０７８、ｒｓ７３２０２９３３、ｒｓ７２６２２１８７、ｒｓ１３９１４１１０４、ｒｓ９９９４０９２、ｒｓ１７６２８５２８８４、ｒｓ２３３５５４５、ｒｓ９６８８８９５、ｒｓ１４４１３０２１９、ｒｓ７８８３１４８７、ｒｓ４５６４４９、ｒｓ１３２５０５４８、ｒｓ７７０６８７７３、ｒｓ３０２５０３５、ｒｓ２０８８１４２、ｒｓ１２７６１７５、ｒｓ１４４１５７０１７、ｒｓ５９５９４９５５、およびｒｓ２８７１７９９９からなる群から選択された１つ以上のＳＮＰ検出製剤の使用。
【国際調査報告】