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▶ イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハーの特許一覧
(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-08-06
(54)【発明の名称】ＣＴ４５に特異的に結合する抗原結合タンパク質
(51)【国際特許分類】
C07K 14/725 20060101AFI20240730BHJP
C07K 14/73 20060101ALI20240730BHJP
C12N 15/12 20060101ALI20240730BHJP
C12N 15/63 20060101ALI20240730BHJP
C12N 1/15 20060101ALI20240730BHJP
C12N 1/19 20060101ALI20240730BHJP
C12N 1/21 20060101ALI20240730BHJP
C12N 5/10 20060101ALI20240730BHJP
C12P 21/02 20060101ALI20240730BHJP
A61K 39/395 20060101ALI20240730BHJP
A61P 35/00 20060101ALI20240730BHJP
A61K 48/00 20060101ALI20240730BHJP
A61K 35/12 20150101ALI20240730BHJP
G01N 33/574 20060101ALI20240730BHJP
【ＦＩ】
C07K14/725 ZNA
C07K14/73
C12N15/12
C12N15/63 Z
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
C12N5/10
C12P21/02 C
A61K39/395 N
A61P35/00
A61K48/00
A61K35/12
G01N33/574 A
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024505122
(86)(22)【出願日】2022-07-27
(85)【翻訳文提出日】2024-03-25
(86)【国際出願番号】 EP2022071104
(87)【国際公開番号】W WO2023006828
(87)【国際公開日】2023-02-02
(31)【優先権主張番号】21188018.2
(32)【優先日】2021-07-27
(33)【優先権主張国・地域又は機関】EP
(31)【優先権主張番号】63/203,582
(32)【優先日】2021-07-27
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(31)【優先権主張番号】63/335,399
(32)【優先日】2022-04-27
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(81)【指定国・地域】
【公序良俗違反の表示】
（特許庁注：以下のものは登録商標）
１．ＴＲＩＴＯＮ
２．ＴＷＥＥＮ
(71)【出願人】
【識別番号】506258073
【氏名又は名称】イマティクス バイオテクノロジーズ ゲーエムベーハー
(74)【代理人】
【識別番号】100145403
【弁理士】
【氏名又は名称】山尾 憲人
(74)【代理人】
【識別番号】100122301
【弁理士】
【氏名又は名称】冨田 憲史
(74)【代理人】
【識別番号】100170520
【弁理士】
【氏名又は名称】笹倉 真奈美
(74)【代理人】
【識別番号】100221545
【弁理士】
【氏名又は名称】白江 雄介
(72)【発明者】
【氏名】ユセフ，ザーラ
(72)【発明者】
【氏名】ブルンク，ファビアン
(72)【発明者】
【氏名】モリッツ，アンドレアス
(72)【発明者】
【氏名】ブンク，ゼバスティアン
(72)【発明者】
【氏名】ヴァーグナー，クラウディア
(72)【発明者】
【氏名】マウラー，ドミニク
(72)【発明者】
【氏名】ウンフェルドルベン，フェリックス
【テーマコード（参考）】
4B064
4B065
4C084
4C085
4C087
4H045
【Ｆターム（参考）】
4B064AG20
4B064CA10
4B064CA19
4B064DA01
4B064DA13
4B065AA93X
4B065AA93Y
4B065AB01
4B065AC14
4B065BA02
4B065CA24
4B065CA44
4B065CA46
4C084AA13
4C084NA14
4C084ZB261
4C085AA14
4C085AA16
4C085CC23
4C085DD62
4C085EE01
4C087AA01
4C087AA03
4C087BB63
4C087CA04
4C087CA12
4C087NA14
4C087ZB26
4H045AA10
4H045AA20
4H045AA30
4H045BA10
4H045CA40
4H045DA50
4H045EA20
4H045EA50
4H045FA74
(57)【要約】
本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含む抗原結合タンパク質を提供する。抗原結合タンパク質をコードする核酸、核酸を含むベクター、抗原結合タンパク質を発現する組換え細胞および抗原結合タンパク質を含む医薬組成物もまた提供される。本発明はさらに、医薬での使用のための抗原結合タンパク質および抗原結合タンパク質を製造する方法を提供する。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、前記ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ前記抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、１）ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
前記抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含み、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３のそれぞれは、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、
抗原結合タンパク質。
【請求項2】
１）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり２）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１２）ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
前記抗原結合タンパク質は、１、２、３または４個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２配列を含み、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２のそれぞれは、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、
請求項１に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項3】
前記抗原結合タンパク質は、ＴＣＲであり、好ましくは、前記ＴＣＲは、α／β ＴＣＲ、γ／δ ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ、膜結合型ＴＣＲ、可溶性ＴＣＲ、一価、二価または多価ＴＣＲ、単一特異性、二重特異性または多重特異性ＴＣＲ、ＴＣＲの機能的断片、およびＴＣＲの機能的断片を含む融合タンパク質またはキメラタンパク質からなる群から選択され、より好ましくは、前記ＴＣＲは、α／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲ、最も好ましくはα／β ＴＣＲである、請求項１または２に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項4】
ＶＡは、配列番号１３、１３２、６２、８９、１、５２、７０、９８、７９、１０６、１２４、１１６、３４、２３、および４２からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１３、１３２、６２、８９、１、５２、７０、９８、７９、１０６、１２４、１１６、３４、２３、および４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ請求項１もしくは２に記載のＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなり；かつＶＢは、配列番号１８、１３５、６５、９４、７、５７、７４、１０３、８４、１１１、１２９、１２１、３７、２８および４７からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１８、１３５、６５、９４、７、５７、７４、１０３、８４、１１１、１２９、１２１、３７、２８および４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ請求項１もしくは２に記載のＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなり、前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異、好ましくはアミノ酸置換を含んでもよい、請求項１～３のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項5】
前記抗原結合タンパク質は、定常ドメインをさらに含み、前記定常ドメインは、配列番号５、７５０、７５１、１５６、１１、３２および１５７からなる群から選択される、好ましくは配列番号５、７５０、７５１、１１および３２からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号５、７５０、７５１、１５６、１１、３２もしくは１５７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなる、請求項１～４のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項6】
前記第１のポリペプチドは、配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６および１５８～１７２からなる群から選択される、好ましくは配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７および４６からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６、もしくは１５８～１７２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつ前記第２のポリペプチドは、配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８ １０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１および１７３～１８７からなる群から選択される、好ましくは配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８ １０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８ １０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１もしくは１７３～１８７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなる、請求項１～５のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項7】
前記抗原結合タンパク質は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群、より好ましくは配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない、請求項１～６のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項8】
前記抗原結合タンパク質は、－ ＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞、および／または
－ ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－Ｔ細胞
を活性化可能であり、
かつ前記抗原結合タンパク質は、好ましくはＴＣＲ、より好ましくはα／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲである、
請求項１～７のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質。
【請求項9】
請求項１～８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質をコードする配列を含む核酸。
【請求項10】
請求項９に記載の核酸を含むベクター。
【請求項11】
請求項１～８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質、または請求項９に記載の核酸、または請求項１０に記載のベクターを含む宿主細胞。
【請求項12】
請求項１～８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質、請求項９に記載の核酸、請求項１０に記載のベクター、または請求項１１に記載の宿主細胞と、適宜、医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物。
【請求項13】
医薬での使用のための、好ましくは増殖性疾患、特にがんの処置および／または診断方法での使用のための、請求項１～８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質、請求項９に記載の核酸、請求項１０に記載のベクター、請求項１１に記載の宿主細胞、または請求項１２に記載の医薬組成物。
【請求項14】
生物学的サンプル中のがん、特にＣＴ４５を発現するがんを検出するインビトロの方法であって、ａ）前記生物学的サンプルを請求項１～８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質と接触させること、および
ｂ）前記生物学的サンプルへの前記抗原結合タンパク質の結合を検出すること
を含む方法。
【請求項15】
請求項１～８のいずれか一項に記載の抗原結合タンパク質を製造する方法であって、ａ）宿主細胞を準備すること、
ｂ）請求項１～８のいずれかに記載の抗原結合タンパク質をコードする核酸を含む遺伝子コンストラクトを準備すること、
ｃ）前記遺伝子コンストラクトを前記宿主細胞に導入すること、および
ｄ）前記宿主細胞により前記遺伝子コンストラクトを発現させること
を含む方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は、ＣＴ４５タンパク質由来抗原に対する抗原結合タンパク質、特に、ＭＨＣとの複合体中の腫瘍発現ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質に関する。抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５発現増殖性疾患の診断、処置および予防での使用のために提供される。抗原結合タンパク質をコードする核酸、核酸を含むベクター、抗原結合タンパク質を発現する組換え細胞および抗原結合タンパク質を含む医薬組成物がさらに提供される。
【背景技術】
【0002】
Ｔ細胞ベース免疫療法は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）の分子により提示される、腫瘍関連または腫瘍特異的タンパク質に由来するペプチドエピトープを標的とする。これらの腫瘍関連抗原（ＴＡＡ）は、がん細胞により特異的に発現される、かつ／またはがん細胞において上方調節される、全てのタンパク質クラス、例えば酵素、受容体、転写因子等に由来するペプチドであり得る。細胞表面タンパク質のみを標的とすることができるＣＡＲ－Ｔ療法および現行の抗体ベースアプローチとは異なり、Ｔ細胞ベース免疫療法は、さもなければアクセス不可能な細胞内タンパク質の標的化を可能にし、そのため標的の数および多様性を大きく増加させる。
【0003】
「がん精巣抗原４５（ＣＴ４５）」は、直接的なタンデムリピート中の９つのほぼ同一の遺伝子（典型的にはＡ１、Ａ２、Ａ３、Ａ５、Ａ６、Ａ７、Ａ８、Ａ９およびＡ１０と命名される）の多遺伝子ファミリーである。９つ全てのＣＴ４５遺伝子は、１８９アミノ酸の推定上のタンパク質をコードする。通常は精巣生殖細胞においてのみ発現されるＣＴ４５Ａ１タンパク質は、肺がん、乳がんおよび卵巣がんにおいても発現されることが示された［Chen, Y. T. et al., Int.J Cancer 124 (2009): 2893-2898］。ＣＴ４５Ａ１はまた、多発性骨髄腫において不良な予後および不良なアウトカムと関連付けられることも示された［Andrade, V. C. et al., Exp.Hematol. 37 (2009): 446-449］。ＣＴ４５Ａ１は、上皮間葉転換（ＥＭＴ）および転移遺伝子を上方調節して、ＥＭＴおよび腫瘍播種を促進する遺伝子として記載された。さらに、ＣＴ４５Ａ１は、がん幹細胞様細胞の開始または維持に関与して、腫瘍形成および悪性進行を促進するとして記載された［Yang, P. et al., Curr.Pharm.Des 21 (2015): 1292-1300］。乳がんモデルにおけるＣＴ４５Ａ１過剰発現は、様々な発がんおよび転移遺伝子の上方調節、ＥＲＫおよびＣＲＥＢシグナル伝達経路の構成的な活性化ならびに腫瘍形成、浸潤および転移の増加をもたらすことが示された。ＣＴ４５Ａ１のサイレンシングは、がん細胞遊走および浸潤を減少させることが示された。ＣＴ４５Ａ２は、デノボの二表現型急性白血病を有する小児患者において新規のスプライシングされたＭＬＬ融合パートナーであることが示されており、そのため白血病誘発に関連する可能性がある［Cerveira, N. et al., BMC.Cancer 10 (2010): 518］。ＣＴ４５は、がん細胞株および肺がん検体の両方において頻繁に発現されることが示された［Chen, L. et al., Cancer Res 65 (2005): 5599-5606］。ＣＴ４５は、正常な成体組織において限られた発現を有するかまたは発現を有しないので、免疫療法介入のための魅力的な標的である。
【0004】
ＭＨＣとの複合体中の細胞内標的を特異的に認識する新たな抗がん剤の開発は、処置困難ながん、特に固形腫瘍を解明するための最も重要な鍵の１つである。そのため、がん細胞に高度に特異的な細胞内タンパク質を特異的に標的とする新たな抗がん剤を開発することが必要とされている。本発明は、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する新規の抗原結合タンパク質、および増殖性疾患、特にがんの処置においてそのような分子を使用する方法を提供することによりその必要性に対処する。本発明の抗原結合タンパク質は、高い安定性、高い親和性、高い機能的なアビディティ、高い有効性および高い特異性によりキャラクタリゼーションされる。ＣＴ４５抗原ペプチドに結合する以前に記載された抗原結合タンパク質と比較して、本発明の抗原結合タンパク質は、増加した安定性、増加した親和性、増加した機能的なアビディティ、増加した有効性および／または増加した特異性の内の少なくとも１つを呈する。本発明の抗原結合タンパク質は、そのため、先行技術の抗原結合タンパク質よりも有効および安全の両方である。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0005】
【課題を解決するための手段】
【0006】
第１の態様では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、
ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む、
抗原結合タンパク質に関する。
ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む、
抗原結合タンパク質に関する。
【0007】
第２の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質をコードする配列を含む核酸に関する。
【0008】
第３の態様では、本発明は、本発明の第２の態様の核酸を含むベクターに関する。
【0009】
第４の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、または本発明の第３の態様のベクターを含む宿主細胞に関する。
【0010】
第５の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクターまたは本発明の第４の態様の宿主細胞と、適宜、医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物に関する。
【0011】
第６の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質を製造する方法であって、（ａ）宿主細胞を準備する工程、（ｂ）本発明の第１の態様のいずれかの抗原結合タンパク質をコードするコード配列を含む遺伝子コンストラクトを準備する工程、（ｃ）遺伝子コンストラクトを宿主細胞に導入する工程、および（ｄ）宿主細胞により遺伝子コンストラクトを発現させる工程を含む方法に関する。
【0012】
第７の態様では、本発明は、医薬での使用のための、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクター、本発明の第４の態様の宿主細胞、または本発明の第４の態様（ｔｈｅ ｆｏｕｒｔｈ ａｓｐｅｃｔ）の医薬組成物に関する。
【0013】
第８の態様では、本発明は、増殖性疾患の処置および／または診断方法での使用のための、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクター、本発明の第４の態様の宿主細胞、または本発明の第４の態様の医薬組成物に関する。
【0014】
第９の態様では、本発明は、生物学的サンプル中のがんを検出するインビトロの方法であって、（ａ）生物学的サンプルを本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質と接触させる工程、および（ｂ）生物学的サンプルへの抗原結合タンパク質の結合を検出する工程を含む方法に関する。
【0015】
定義
「ＣＴ４５抗原ペプチド」は、ＣＴ４５Ａ１（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｑ５ＨＹＮ５下でアクセス可能な配列番号７４９）、ＣＴ４５Ａ２、ＣＴ４５Ａ３、ＣＴ４５Ａ５、ＣＴ４５Ａ６、ＣＴ４５Ａ７、ＣＴ４５Ａ８、ＣＴ４５Ａ９およびＣＴ４５Ａ１０のアミノ酸１４３～１５１に対応するアミノ酸配列ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）を含むか、またはからなる。このＣＴ４５抗原ペプチドはまた、本明細書では、「ＣＴ４５ペプチド」または「ＣＴ４５－ＩＰ」とも称される。ＣＴ４５抗原ペプチドは、腫瘍関連または腫瘍特異的タンパク質に由来するペプチドエピトープであり、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）の分子、好ましくはＭＨＣ Ｉにより細胞表面上に提示される。より具体的には、ＣＴ４５抗原ペプチドは、ＨＬＡタンパク質、好ましくはＨＬＡ－Ａ、より好ましくはＨＬＡ－Ａ＊０２との複合体にて細胞表面上に提示される。最も好ましい実施形態では、ＣＴ４５抗原ペプチドは、アミノ酸配列ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）からなる。ＣＴ４５抗原ペプチドが、アミノ酸配列ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）に加えてさらなるアミノ酸を含む場合には、ＣＴ４５抗原ペプチドの全長は、好ましくは３０または２０個のアミノ酸を超えない、より好ましくは１５個のアミノ酸を超えない、よりいっそう好ましくは１２個のアミノ酸を超えない。ＣＴ４５抗原ペプチドが、配列番号１３８に加えてさらなるアミノ酸を含む場合には、配列番号１３８のアミノ酸は、抗原ペプチドがＭＨＣタンパク質との複合体中に存在する場合にＭＨＣタンパク質のペプチド結合溝内に好ましくは位置する。当業者は、ＭＨＣ Ｉ上に提示される抗原ペプチドは、通常、１２個以下のアミノ酸であることを認識している。しかしながら、ペプチドがＭＨＣタンパク質上に人工的にロードされる場合には、ＭＨＣ Ｉ上に人工的にロードされた抗原ペプチドは１２個のアミノ酸よりも長くてもよいことは妥当である。「抗原」または「標的抗原」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原結合部位の結合を受けることが可能である分子もしくは分子の部分または複合体を指し、前記抗原結合部位は、抗原結合タンパク質、好ましくは本発明の抗原結合タンパク質中に存在する。本発明に関連する抗原は、ＣＴ４５抗原ペプチド、より具体的には、ＭＨＣタンパク質、例えばＨＬＡタンパク質、例えばＨＬＡ－Ａ＊０２との複合体中のＣＴ４５抗原ペプチドである。
「ＣＴ４５抗原ペプチド」は、ＣＴ４５Ａ１（Ｕｎｉｐｒｏｔアクセッション番号Ｑ５ＨＹＮ５下でアクセス可能な配列番号７４９）、ＣＴ４５Ａ２、ＣＴ４５Ａ３、ＣＴ４５Ａ５、ＣＴ４５Ａ６、ＣＴ４５Ａ７、ＣＴ４５Ａ８、ＣＴ４５Ａ９およびＣＴ４５Ａ１０のアミノ酸１４３～１５１に対応するアミノ酸配列ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）を含むか、またはからなる。このＣＴ４５抗原ペプチドはまた、本明細書では、「ＣＴ４５ペプチド」または「ＣＴ４５－ＩＰ」とも称される。ＣＴ４５抗原ペプチドは、腫瘍関連または腫瘍特異的タンパク質に由来するペプチドエピトープであり、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）の分子、好ましくはＭＨＣ Ｉにより細胞表面上に提示される。より具体的には、ＣＴ４５抗原ペプチドは、ＨＬＡタンパク質、好ましくはＨＬＡ－Ａ、より好ましくはＨＬＡ－Ａ＊０２との複合体にて細胞表面上に提示される。最も好ましい実施形態では、ＣＴ４５抗原ペプチドは、アミノ酸配列ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）からなる。ＣＴ４５抗原ペプチドが、アミノ酸配列ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）に加えてさらなるアミノ酸を含む場合には、ＣＴ４５抗原ペプチドの全長は、好ましくは３０または２０個のアミノ酸を超えない、より好ましくは１５個のアミノ酸を超えない、よりいっそう好ましくは１２個のアミノ酸を超えない。ＣＴ４５抗原ペプチドが、配列番号１３８に加えてさらなるアミノ酸を含む場合には、配列番号１３８のアミノ酸は、抗原ペプチドがＭＨＣタンパク質との複合体中に存在する場合にＭＨＣタンパク質のペプチド結合溝内に好ましくは位置する。当業者は、ＭＨＣ Ｉ上に提示される抗原ペプチドは、通常、１２個以下のアミノ酸であることを認識している。しかしながら、ペプチドがＭＨＣタンパク質上に人工的にロードされる場合には、ＭＨＣ Ｉ上に人工的にロードされた抗原ペプチドは１２個のアミノ酸よりも長くてもよいことは妥当である。「抗原」または「標的抗原」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原結合部位の結合を受けることが可能である分子もしくは分子の部分または複合体を指し、前記抗原結合部位は、抗原結合タンパク質、好ましくは本発明の抗原結合タンパク質中に存在する。本発明に関連する抗原は、ＣＴ４５抗原ペプチド、より具体的には、ＭＨＣタンパク質、例えばＨＬＡタンパク質、例えばＨＬＡ－Ａ＊０２との複合体中のＣＴ４５抗原ペプチドである。
【0016】
「ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞」は、本明細書では、ＭＨＣ分子との複合体中のＣＴ４５－ＩＰをその表面上に提示する細胞を指す。好ましい実施形態では、ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞は腫瘍細胞であり、腫瘍は、好ましくは、本明細書の下記の「治療方法および使用」セクションで定義されるがんである。本発明に関連して、ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体は、正常（健常）組織中の細胞（「健常細胞」とも称される）の表面上または異なる抗原提示ペプチドをロードされているかもしくはペプチドをロードされていないコントロール細胞の表面上の前記複合体のレベルと比較して、ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞の細胞表面上に過剰提示される。「過剰提示される」は、ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体が、健常組織またはコントロール細胞において存在するレベルの少なくとも２倍、好ましくは５倍～１０倍のレベルで存在することを意味する。
【0017】
「ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞」の例は、本出願の実施例で使用されたＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞またはＮＣＩＨ１７０３もしくはＡ３７５腫瘍細胞である。
【0018】
「ドメイン」は、タンパク質の任意の領域であり得、一般に、配列相同性に基づいて定義されており、特定の構造的なまたは機能的な実体を指していることが多い。
【0019】
本発明に関連する「免疫グロブリン（Ｉｇ）ドメイン」という用語は、Ｇｒｅｅｋキートポロジー（Ｇｒｅｅｋ ｋｅｙ ｔｏｐｏｌｏｇｙ）を有する２つのβ－シート中に配置された７～９個の逆並行βストランドの２層サンドイッチからなるタンパク質ドメインを指す。Ｉｇドメインは、おそらく、天然に存在するタンパク質中で最も頻繁に使用される「構築ブロック」である。Ｉｇドメインを含むタンパク質は、免疫グロブリンスーパーファミリー（例えば、抗体、Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）、および細胞接着分子を含む）に組み込まれる。Ｉｇドメインの例は、抗体およびＴＣＲの可変ドメインおよび定常ドメインである。
【0020】
本発明に関連する「ＶＡ」は、ＴＣＲ由来ＣＤＲ配列およびＴＣＲ由来フレームワーク配列を含むＴＣＲ可変ドメインを指す。ＣＤＲおよびフレームワーク配列は、ＴＣＲ α鎖（Ｖα）、β鎖（Ｖβ）、γ鎖（Ｖγ）またはδ鎖（Ｖδ）の可変ドメイン、好ましくはＶαに由来してもよい。本発明に関連するＶＡドメインのＣＤＲおよびフレームワーク配列は、必ずしも同じＴＣＲ鎖に由来する必要はない。いくつかの実施形態では、１つのＴＣＲ可変ドメイン（ドナーＴＣＲのＴＣＲ可変ドメイン）に由来するＣＤＲは、別のＴＣＲ可変ドメイン（アクセプターＴＣＲのＴＣＲ可変ドメイン）上にグラフトされる。例えば、ドナーＴＣＲは、ＴＲＡＶ５およびＴＲＡＪ１７によりコードされるＶαを含んでもよく、かつアクセプターＴＣＲは、ＴＲＡＶ１４およびＴＲＡＪ３３によりコードされるＶＡを含んでもよい。ドナーＴＣＲのＣＤＲ１、ＣＤＲ３および適宜ＣＤＲ２がアクセプターＴＣＲ上にグラフトされる場合、ＣＤＲは、異なるフレームワーク領域の状況において存在するが、ＣＤＲにより与えられる抗原ペプチドについての親和性および特異性は変化せず、即ち、グラフト後に、アクセプターＴＣＲの可変ドメインは、ドナーＴＣＲの可変ドメインと実質的に同じ、抗原ペプチドについての親和性および特異性を有する。
【0021】
本発明に関連する「ＶＢ」は、ＴＣＲ由来ＣＤＲ配列およびＴＣＲ由来フレームワーク配列を含む可変ドメインを指す。ＣＤＲおよびフレームワーク配列は、ＴＣＲ α鎖（Ｖα）、β鎖（Ｖβ）、γ鎖（Ｖγ）またはδ鎖（Ｖδ）の可変ドメイン、好ましくはＶβに由来してもよい。本発明に関連するＶＢドメインのＣＤＲおよびフレームワーク配列は、必ずしも同じＴＣＲに由来する必要はない。いくつかの実施形態では、１つのＴＣＲ可変ドメイン（ドナーＴＣＲのＴＣＲ可変ドメイン）に由来するＣＤＲは、別のＴＣＲ可変ドメイン（アクセプターＴＣＲのＴＣＲ可変ドメイン）上にグラフトされる。例えば、ドナーＴＣＲは、ＴＲＢＶ２およびＴＲＢＪ２－１によりコードされるＶｖを含んでもよく、かつアクセプターＴＣＲは、ＴＲＢＶ２７およびＴＲＢＪ１－５によりコードされるＶＡを含んでもよい。ドナーＴＣＲのＣＤＲ１、ＣＤＲ３および適宜ＣＤＲ２がアクセプターＴＣＲ上にグラフトされる場合、ＣＤＲは、異なるフレームワーク領域の状況において存在するが、ＣＤＲにより与えられる抗原ペプチドについての親和性および特異性は変化せず、即ち、グラフト後に、アクセプターＴＣＲの可変ドメインは、ドナーＴＣＲの可変ドメインと実質的に同じ、抗原ペプチドについての親和性および特異性を有する。
【0022】
ＣＤＲは、異なるアルファ可変ドメインまたは異なるベータ可変ドメインの間で交換／グラフトされてもよいだけでなく、ＴＣＲアルファ可変ドメインからＴＣＲベータ、ガンマもしくはデルタ可変ドメインへ、またはＴＣＲベータ可変ドメインからＴＣＲアルファ、ガンマもしくはデルタ可変ドメインにグラフトされてもよい。
【0023】
本発明に関連するＶαは、ＴＣＲ α鎖の可変ドメインを指す。
【0024】
本発明に関連するＶβは、ＴＣＲ β鎖の可変ドメインを指す。
【0025】
本発明に関連するＶγは、ＴＣＲ γ鎖の可変ドメインを指す。
【0026】
本発明に関連するＶδは、ＴＣＲ δ鎖の可変ドメインを指す。
【0027】
本発明に関連するＶＬは、抗体軽鎖の可変ドメインを指す。
【0028】
本発明に関連するＶＨは、抗体重鎖の可変ドメインを指す。
【0029】
本発明に関連するＣＬは、抗体軽鎖の定常ドメインを指す。
【0030】
本発明に関連するＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３は、抗体重鎖（具体的にはＩｇＧ重鎖）の定常ドメインを指す。
【0031】
抗原決定基としても既知である「エピトープ」という用語は、免疫系により認識される抗原の部分のことである。本明細書で使用される場合、エピトープという用語は「構造エピトープ」および「機能エピトープ」という用語を含む。「構造エピトープ」は、抗原に結合した場合に抗原結合タンパク質によりカバーされる抗原（例えば、ペプチド－ＭＨＣ複合体）のアミノ酸である。典型的には、抗原結合タンパク質のアミノ酸の任意の原子から５Å以内に存在する抗原の全てのアミノ酸がカバーされるとみなされる。抗原の構造エピトープは、Ｘ線結晶解析またはＮＭＲ解析を含む当該技術分野で既知の方法により決定され得る。抗体の構造エピトープは、典型的には、２０～３０個のアミノ酸を含む。ＴＣＲの構造エピトープは、典型的には、２０～３０個のアミノ酸を含む。本明細書で定義されている「機能エピトープ」は、構造エピトープを形成するアミノ酸のサブセットであり、非共有結合的相互作用（例えば、Ｈ－結合、塩橋、芳香族スタッキング、もしくは疎水性相互作用）を直接形成することにより、または抗原の結合立体構造を間接的に安定化させることにより、本発明の抗原結合タンパク質またはその機能的断片と界面を形成するのに重要な抗原のアミノ酸を含み、例えば、突然変異スキャニングにより決定される。本発明に関連して、機能エピトープはまた、「結合モチーフ」とも称される。典型的には、抗体が結合した抗原の機能エピトープは、４～６個のアミノ酸を含む。典型的には、ペプチド－ＭＨＣ複合体の機能エピトープは、ペプチドの２～６または７個のアミノ酸と、ＭＨＣ分子の２～７個のアミノ酸とを含む。ＭＨＣ Ｉにより提示されたペプチドは、典型的には８～１０個のアミノ酸を有することから、それぞれの所与のペプチドのアミノ酸のサブセットのみが、ペプチド－ＭＨＣ複合体の機能エピトープの一部である。エピトープ（特に、本発明の抗原結合タンパク質が結合する機能エピトープ）は、結合界面の形成に必要とされる抗原のアミノ酸を含むか、またはからなる。
【0032】
「主要組織適合複合体」（ＭＨＣ）は、脊椎動物において獲得免疫系が外来分子を認識するのに必須の細胞表面タンパク質のセットであり、これにより組織適合性が決定される。ＭＨＣ分子の主な機能は、病原体由来の抗原に結合し、それを細胞表面に提示して適切なＴ細胞に認識させることである。ヒトＭＨＣはまた、ＨＬＡ（ヒト白血球抗原）複合体（または単にＨＬＡ）とも呼ばれる。そのため、好ましい実施形態では、ＭＨＣは、ＨＬＡである。ＭＨＣ遺伝子ファミリーは、クラスＩ、クラスＩＩ、およびクラスＩＩＩの３つのサブグループに分けられる。ペプチドとＭＨＣクラスＩ分子（ＭＨＣ Ｉ）との複合体は、適切なＴ細胞受容体（ＴＣＲ）を持つＣＤ８陽性Ｔ細胞（ＣＤ８＋ Ｔ細胞）により通常は認識され、ペプチドとＭＨＣクラスＩＩ分子（ＭＨＣ ＩＩ）との複合体は、適切なＴＣＲを持つＣＤ４陽性ヘルパーＴ細胞（ＣＤ４＋ Ｔ細胞）により通常は認識される。ＣＤ４およびＣＤ８は、それぞれＭＨＣ ＩおよびＭＨＣ ＩＩへの結合においてＴＣＲの補助受容体として通常は機能する。いくつかの例外的な場合には、ペプチドとＭＨＣ Ｉとの複合体は、ＣＤ８陰性（特にＣＤ８陰性、ＣＤ４陽性）Ｔ細胞により認識される［Soto et al., 2013, Cancer Immunol Immunother. 2013 Feb;62(2): 359-369］。ＣＤ８陽性Ｔ細胞およびＣＤ４陽性Ｔ細胞の応答は、共同して相乗的に抗腫瘍効果に寄与することから、腫瘍関連抗原および対応するＴ細胞受容体の同定およびキャラクタリゼーションは、がん免疫療法、例えばワクチンおよび細胞療法のがん免疫療法の開発において重要である。ＨＬＡ－Ａ遺伝子は、６番染色体の短いアーム上に位置しており、ＨＬＡ－Ａの成分である大きなα鎖をコードしている。ＨＬＡ－Ａ α鎖の変異は、ＨＬＡの機能にとって重要である。この変異により、集団での遺伝子多様性が促進される。それぞれのＨＬＡは、ある特定の構造のペプチドに対する親和性が異なることから、ＨＬＡの種類が多いということは、細胞表面に「提示」される抗原の種類が多いということを意味する。本開示に関連するＭＨＣクラスＩ ＨＬＡタンパク質は、ＨＬＡ－Ａタンパク質、ＨＬＡ－Ｂタンパク質、またはＨＬＡ－Ｃタンパク質であり得、好適にはＨＬＡ－Ａタンパク質であり得、例えばＨＬＡ－Ａ＊０２であり得る。ＭＨＣクラスＩ依存性免疫反応では、ペプチドは、腫瘍細胞により発現されるある特定のＭＨＣクラスＩ分子に結合可能でなければならないだけでなく、その後に特異的Ｔ細胞受容体（ＴＣＲ）を持つＴ細胞により認識されなければならない。
【0033】
「ＭＨＣタンパク質との複合体中の抗原ペプチド」は、本明細書では、ＭＨＣ分子に非共有結合的に結合している抗原ペプチドを指す。具体的には、抗原ペプチドは、ＭＨＣ分子により形成された「ペプチド結合溝」に位置している。ＭＨＣ分子と抗原ペプチドとの複合体は、本明細書では、「ペプチド－ＭＨＣ複合体」または「ｐＭＨＣ複合体」とも称される。ＣＴ４５抗原ペプチドの場合には、この複合体はまた、「ＣＴ４５抗原ペプチド－ＭＨＣ複合体」または「ＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体」とも称される。
【0034】
「ＨＬＡ－Ａ＊０２」は、特定のＨＬＡ対立遺伝子を示しており、文字Ａは、対立遺伝子を示しており、接頭辞「＊０２接頭辞」は、Ａ２血清型を示す。
【0035】
「抗原結合タンパク質」という用語は、本明細書では、抗原、特にＭＨＣとの複合体中の抗原ペプチドに特異的に結合することができる抗原結合部位を含むポリペプチドまたは２個もしくはより多くのポリペプチドの複合体を指す。本明細書に関連して使用される場合、抗原結合タンパク質という用語は、下記に記載されるような複数の異なるフォーマットの抗原結合タンパク質を含み、該フォーマットとして、可溶性抗原結合タンパク質、膜結合型抗原結合タンパク質、一価、二価および多価抗原結合タンパク質、単一特異性、二重特異性および多重特異性抗原結合タンパク質、一本鎖抗原結合タンパク質ならびに２個またはより多くの鎖、融合タンパク質およびキメラタンパク質を含む抗原結合タンパク質が挙げられる。該用語は、ＴＣＲ、抗体またはキメラ抗原受容体（ＣＡＲ）の全体構造を有する抗原結合タンパク質を含む。本発明の抗原結合タンパク質は、ＴＣＲ由来ＣＤＲ、特に、ＴＣＲ由来ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、および適宜ＣＤＲａ２を含む可変ドメインＶＡ、ならびにＴＣＲ由来ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ３、および適宜ＣＤＲｂ２を含む可変ドメインＶＢを含む。特定の実施形態では、ＶＡドメイン全体および／またはＶＢドメイン全体は、ＴＣＲに由来し、そのため、ＴＣＲアルファ、ベータ、ガンマまたはデルタ可変ドメイン（Ｖα、Ｖβ、ＶγまたはＶδ）である。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＴＣＲである。いくつかの実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、本明細書で定義されているＶＡおよびＶＢ、ならびにさらに、ＶＡまたはＶＢに直接的にまたは間接的に融合された追加のドメインを含む。そのような抗原結合タンパク質は、「融合タンパク質」と称され得る。「融合タンパク質」である本発明の抗原結合タンパク質に含まれる追加のドメインの例を、下記に列挙する。抗原結合タンパク質が二重特異性または多重特異性抗原結合タンパク質である場合、それは、本明細書で定義されているＶＡおよびＶＢに加えて、少なくとも１つのさらなる可変ドメイン、好ましくは２つの可変ドメイン、および適宜、定常ドメインを含み、可変および／または定常ドメインは、抗体またはＴＣＲに由来してもよい。抗原結合タンパク質は、そのため、２つの異なる抗原結合部位（１つは、ＶＡおよびＶＢにより形成され、１つは、追加の少なくとも１つ、好ましくは２つの、可変ドメインにより形成される）を含み、例えば二重特異性抗体で既知であるように、同時に２つの異なる抗原に特異的に結合することができる。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＴＣＲ由来ＶＡおよびＶＢならびに追加的に２つの抗体由来可変ドメイン、特にＶＬおよびＶＨを含む。抗体およびＴＣＲの両方の要素を含むそのようなコンストラクトはハイブリッドフォーマットを表し、例えば、「二重特異性ＴＣＲ－抗体融合タンパク質」と称され得る。そのような二重特異性融合タンパク質において、可変ドメインは、様々な方向で並べられてもよい。そのような二重特異性融合タンパク質を製造するための技術は当業者に既知であり、当業者は、そのため、様々なフォーマットにおいて二重特異性抗原結合タンパク質を生成および製造するために、本明細書で定義されている可変ドメインを容易に使用することができる。当業者は、所望される立体構造におけるフォールディングを確実にするために好適なリンカーを選択することが完全に可能である。
【0036】
「少なくとも１」は、本明細書では、１つまたは複数の指定の対象を指しており、例えば、１、２、３、４、５、もしくは６、またはより多くの指定の対象を指す。例えば、少なくとも１個の結合部位は、本明細書では、１、２、３、４、５、もしくは６個、またはより多くの結合部位を指す。
【0037】
本発明に関連する「二重特異性」という用語は、２つの異なる抗原に対して少なくとも２種の価数および結合特異性を有する抗原結合タンパク質を指しており、そのため少なくとも２つの抗原結合部位を含む。「価数」という用語は、抗原結合タンパク質の結合部位の数を指しており、例えば、２価抗原結合タンパク質は、２つの結合部位を有する抗原結合タンパク質に関する。結合部位は、同一のまたは異なる標的に結合し得、即ち、２価抗原結合タンパク質は、単一特異性（即ち、１つの標的に結合する）であってもよいし、二重特異性（即ち、２つの異なる標的に結合する）であってもよい。本発明の抗原結合分子は、ＴＣＲ由来のＣＤＲを含む少なくとも１つの抗原結合部位を含む。好ましい実施形態では、本発明の抗原結合分子は、少なくとも１つのＴＣＲ由来の抗原結合部位を含む。
【0038】
抗原結合タンパク質はＴＣＲであることが好ましい。「ＴＣＲ」という用語は、本明細書で使用される場合、ネイティブなＴＣＲおよび操作されたＴＣＲの両方を含む。
【0039】
「ネイティブＴＣＲ」は、自然界から単離され得る野生型ＴＣＲを指す。ネイティブＴＣＲは、免疫グロブリンスーパーファミリーのヘテロ二量体細胞表面タンパク質であり、このタンパク質は、シグナル伝達の媒介に関与するＣＤ３複合体の不変のタンパク質と会合している。ネイティブヘテロ二量体ＴＣＲは、αβ型およびγδ型で存在しており、これらは、構造的に類似しているが、位置およびおそらく機能も異なる。ネイティブな、全長αβヘテロ二量体ＴＣＲは、α鎖およびβ鎖からなる。α鎖は、ＴＲＡＶ遺伝子によりコードされる可変領域（Ｖ領域）、ＴＲＡＪ遺伝子によりコードされる結合領域（Ｊ領域）、およびＴＲＡＣ遺伝子によりコードされる定常領域（Ｃ領域）を含む。β鎖は、ＴＲＢＶ遺伝子によりコードされる可変領域（Ｖ領域）、ＴＲＢＪ遺伝子によりコードされる結合領域（Ｊ領域）およびＴＲＢＣ遺伝子によりコードされる定常領域（Ｃ領域）を含み、通常は、Ｖ領域とＪ領域との間にＴＲＢＤ遺伝子によりコードされる短い多様性領域（Ｄ領域）を含むが、このＤ領域は、Ｊ領域の一部とみなされることが多い［Lefranc, (2001), Curr Protoc Immunol Appendix 1: Appendix 10］。異なるα鎖およびβ鎖可変、結合および定常領域をコードする遺伝子は、ＩＭＧＴ命名法において固有の番号で言及されている［Folch and Lefranc, (2000), Exp Clin Immunogenet 17(1): 42-54;Scaviner and Lefranc, (2000), Exp Clin Immunogenet 17(2): 83-96;LeFranc and LeFranc, (2001), "T cell Receptor Factsbook", Academic Press］。ＴＣＲ遺伝子に関するさらなる情報を、国際的なＩｍＭｕｎｏＧｅｎｅＴｉｃｓ情報システム（登録商標）、Lefranc M-P et al., (Nucleic Acids Res. 2015 Jan;43(Database issue):D413-22；およびhttp://www.imgt.org/)に見出し得る。
【0040】
タンパク質レベルにおいて、ＴＣＲ α、β、γおよびδ鎖は、２つの免疫グロブリンドメイン、可変ドメインおよび定常ドメインを含む。可変ドメインはＶ（Ｄ）Ｊ領域に対応する。定常ドメインはＣ領域に対応する。定常ドメインは、膜近位ドメインであり、本発明に関連して、膜貫通（ＴＭ）ドメインおよび短い細胞質テイルも含む。定常ドメインおよび可変ドメインのそれぞれは鎖内ジスルフィド結合を含む。可変ドメイン（αβ ＴＣＲ中のＶαおよびＶβならびにγδ ＴＣＲ中のＶγおよびＶδは）、相補性決定領域（ＣＤＲ）を含む高度に多型のループを含有する。
【0041】
それぞれのＴＣＲ可変ドメインは、フレームワーク配列に埋め込まれた３つの「ＴＣＲ相補性決定領域」（ＣＤＲ）を含み、１つは、ＣＤＲ３と命名された超可変領域である。本発明に関連して、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２、およびＣＤＲａ３は、α鎖ＣＤＲを示し、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２、およびＣＤＲｂ３は、β鎖ＣＤＲを示す。ＣＤＲａ１およびＣＤＲａ２をコードする配列はＴＲＡＶに含まれ、ＣＤＲａ３をコードする配列はＴＲＡＶおよびＴＲＡＪに含まれ、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ２をコードする配列はＴＲＢＶに含まれ、ＣＤＲｂ３をコードする配列は、ＴＲＢＶ、ＴＲＢＤおよびＴＲＢＪに含まれる。ＴＣＲでは、ＣＤＲ１およびＣＤＲ３アミノ酸残基は、抗原ペプチドと接触し、ＣＤＲ２アミノ酸残基は、ＨＬＡ分子と主に接触する（Stadinski et al., J Immunol. 2014 June 15; 192(12): 6071-6082; Cole et al., J Biol Chem. 2014 Jan 10;289(2):628-38）。そのため、ＴＣＲの抗原特異性は、ＣＤＲ３およびＣＤＲ１配列により定義される。ＣＤＲ２配列は、抗原特異性の決定には必要ないが、ペプチド：ＭＨＣ複合体に対するＴＣＲの全体的な親和性で役割を果たし得る。
【0042】
「ＴＣＲフレームワーク領域」（ＦＲ）は、ＣＤＲ間に挟まれたアミノ酸配列を指しており、即ち、異なるＴＣＲ間である程度保存されている可変ドメインの部分を指す。α鎖、β鎖、γ鎖、およびδ鎖可変ドメインは、それぞれ、本明細書ではそれぞれＦＲ１－ａ、ＦＲ２－ａ、ＦＲ３－ａ、ＦＲ４－ａ（α鎖またはγ鎖の場合）、およびＦＲ１－ｂ、ＦＲ２－ｂ、ＦＲ３－ｂ、ＦＲ４－ｂ（β鎖またはδ鎖の場合）と呼ばれる４つのＦＲを有する。従って、α鎖またはγ鎖可変ドメインは、（ＦＲ１－ａ）－（ＣＤＲａ１）－（ＦＲ２－ａ）－（ＣＤＲａ２）－（ＦＲ３－ａ）－（ＣＤＲａ３）－（ＦＲ４－ａ）と説明され得、β鎖またはδ鎖可変ドメインは、（ＦＲ１－ｂ）－（ＣＤＲｂ１）－（ＦＲ２－ｂ）－（ＣＤＲｂ２）－（ＦＲ３－ｂ）－（ＣＤＲｂ３）－（ＦＲ４－ｂ）と説明され得る。本発明に関連して、α、β、γ、またはδ鎖可変ドメイン中のＣＤＲ／ＦＲ配列は、ＩＭＧＴ定義に基づいて決定される（Lefranc et al., Dev. Comp. Immunol., 2003, 27(1):55-77; www.imgt.org）。従って、ＴＣＲまたはＴＣＲ由来のドメインに関連する場合のＣＤＲ／ＦＲアミノ酸位置は、前記ＩＭＧＴ定義に従って示される。好ましくは、可変ドメインＶαのＣＤＲ／ＦＲアミノ酸位置のＩＭＧＴ位置は、ＴＲＡＶ２４＊０１のＩＭＧＴナンバリングに類似して付与され、および／または可変ドメインＶβのＣＤＲ／ＦＲアミノ酸位置のＩＭＧＴ位置は、ＴＲＢＶ１２－３＊０１のＩＭＧＴナンバリングに類似して付与される。
【0043】
「操作されたＴＣＲ」は、ネイティブなＴＣＲに密接に似ているが、可変および／もしくは定常ドメイン中に軽微な改変を含むタンパク質、例えば、ヒト化されたＴＣＲ、もしくは改善されたヘテロ二量体化もしくは発現レベルを有するＴＣＲであってもよく、または一本鎖ＴＣＲ、可溶性ＴＣＲ、一価、二価もしくは多価ＴＣＲ、単一特異性、二重特異性もしくは多重特異性ＴＣＲ、ＴＣＲの機能的断片、もしくはＴＣＲの機能的断片を含む融合タンパク質もしくはキメラタンパク質であってもよい。
【0044】
「ＴＣＲの機能的断片」は、標的抗原についての、その由来となる親ＴＣＲの親和性、機能的なアビディティおよび／または特異性を保持するか、または実質的に保持するＴＣＲの断片を指す。これに関連する「親ＴＣＲ」は、機能的断片の由来となる全長ＴＣＲを指す。標的抗原ペプチドへの結合はＣＤＲ１およびＣＤＲ３配列により定義され、標的抗原ペプチドＭＨＣ複合体への結合は、ＣＤＲ１、ＣＤＲ２およびＣＤＲ３により定義されるので、親ＴＣＲのＣＤＲ１およびＣＤＲ３および適宜ＣＤＲ２配列を含む抗原結合タンパク質は、標的抗原についての親ＴＣＲの親和性、機能的なアビディティおよび／または特異性を保持する。ＣＤＲはフレームワーク領域（ＦＲ）を差し挟まれる必要があるが、フレームワーク領域の特定のアミノ酸配列は標的抗原特異性に直接的に関与しないことを当業者は認識している。機能的なＴＣＲ断片の例として、単一の可変ドメイン、例えばＴＣＲアルファ、ベータ、ガンマもしくはデルタ可変ドメイン、またはα、β、δもしくはγ鎖の断片、例えば膜貫通ドメインおよび短い細胞質テイルを有しないα、β、δもしくはγ鎖が挙げられる。「断片」という用語は、本明細書で使用される場合、天然に存在する断片（例えばスプライス変異型またはペプチド断片）および人工的に構築された断片、特に、遺伝子技術的手段により得られる断片を指す。
【0045】
ＴＣＲの機能的断片は、例えば、下記に概説されるように測定された標的抗原に対する結合についてのＫＤが、親ＴＣＲのＫＤと同一であるか、または、１０倍、５倍、３倍、もしくは２倍以下に増加しているか、もしくは１０分の１、５分の１、３分の１、もしくは２分の１以上に減少している、好ましくは減少している（ｉｎｃｒｅａｓｅｄ ｏｒ ｒｅｄｕｃｅｄ， ｐｒｅｆｅｒａｂｌｙ ｒｅｄｕｃｅｄ， ｎｏ ｍｏｒｅ ｔｈａｎ １０ｘ， ５ｘ， ３ｘ， ｏｒ ２ｘ）場合に、標的抗原についての保持されたまたは実質的に保持された親和性を有するとみなされる。
【0046】
ＴＣＲの機能的断片は、例えば、標的抗原についての機能的なアビディティが、親ＴＣＲの機能的なアビディティと同一であるか、または５０％、４０％、３０％、２０％、１５％、１０％、８％、５％、３％、２％もしくは１％以下、増加もしくは減少している、好ましくは減少している場合に、標的抗原についての保持されたまたは実質的に保持された機能的なアビディティを有するとみなされる。特に、ＴＣＲの機能的断片は、例えば、細胞傷害性アッセイ、好ましくは下記に記載されているルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定された親タンパク質の標的に応答したその細胞傷害活性が、親ＴＣＲの細胞傷害活性と同一であるか、または５０％、４０％、３０％、２０％、１５％、１０％、８％、５％、３％、２％もしくは１％、好ましくは１０％、８％、５％、３％、２％もしくは１％以下、増加もしくは減少している、好ましくは減少している場合に、標的抗原についての保持されたまたは実質的に保持された機能的なアビディティを有するとみなされる。
【0047】
ＴＣＲの機能的断片は、親ＴＣＲの標的抗原ペプチド以外のペプチドに有意に結合しない場合に、標的抗原についての保持されたまたは実質的に保持された特異性（即ち、標的抗原に特異的に結合する能力）を有するとみなされる。
【0048】
「α／β ＴＣＲ」または「γ／δ ＴＣＲ」という用語は、上記されているα鎖およびβ鎖、またはγ鎖およびδ鎖をそれぞれ含むＴＣＲを指す。そのようなＴＣＲはまた、「全長ＴＣＲ」または「従来型ＴＣＲ」としても記載され得る。α／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲは、ネイティブなＴＣＲであってもよいか、またはネイティブなＴＣＲの構造を保持する操作されたＴＣＲ、即ち、上記されている可変および／もしくは定常ドメイン中に軽微な改変を含む操作されたＴＣＲ、例えばヒト化されたＴＣＲであってもよい。
【0049】
「一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）」は、本明細書で使用される場合、ＴＣＲの可変ドメインが単一ポリペプチド上に位置しているＴＣＲを示す。典型的には、ｓｃＴＣＲ中の可変ドメインは、リンカーにより分離されており、前記リンカーは、典型的には、１０～３０個のアミノ酸、例えば、２５個のアミノ酸を含む。
【0050】
「キメラタンパク質」は、本明細書では、複数の種からの配列を含むタンパク質を指す。「キメラＴＣＲ」は、本明細書では、複数の種からの配列を含むＴＣＲを指す。好ましくは、本発明に関連するキメラＴＣＲは、ヒトからの少なくとも１つのドメインおよびマウスからの１つのドメインを含むα鎖を含んでもよい。より好ましくは、本発明に関連するキメラＴＣＲは、ヒトα鎖の可変ドメイン、および、例えば、マウスＴＣＲ α鎖の定常ドメインを含むα鎖を含んでもよい。
【0051】
「抗体」という用語は、本明細書で使用される場合は、ネイティブなおよび操作された抗体を含むことが意味される。「操作された抗体」という用語は、機能的抗体断片、一本鎖抗体、単一ドメイン抗体、二重特異性または多重特異性抗体を含む。
【0052】
ネイティブな「抗体」は２つの重鎖および２つの軽鎖を含み、重鎖は、ジスルフィド結合により互いに連結されており、かつそれぞれの重鎖は、ジスルフィド結合により軽鎖に連結されている。軽鎖には、ラムダ（λ）およびカッパ（κ）の２種が存在している。抗体分子の機能的活性を決定する下記の５種の主な重鎖クラス（またはアイソタイプ）が存在している：ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡ、およびＩＧＥ。それぞれの鎖は、異なるドメイン（領域とも称される）を含む。軽鎖は、可変ドメイン（ＶＬ）および定常ドメイン（ＣＬ）という２つのドメインを含む。重鎖は、抗体アイソタイプに応じて、下記の４または５つのドメインを含む：可変ドメイン（ＶＨ）、ならびに３または４つの定常ドメイン（まとめてＣＨと称されるＣＨ１、ＣＨ２、およびＣＨ３、適宜ＣＨ４）。軽（ＶＬ）鎖および重（ＶＨ）鎖の両方の可変ドメインは、抗原に対する結合認識および特異性を決定する。軽（ＣＬ）鎖および重（ＣＨ）鎖の定常ドメインは、抗体鎖の会合、分泌、胎盤通過性、補体結合、およびＦｃ受容体（ＦｃＲ）への結合等の重要な生物学的特性を付与する。
【0053】
抗体の特異性は、抗体結合部位と抗原決定基との間の構造的相補性に存在する。抗体結合部位は、主に「抗体相補性決定領域」（ＣＤＲ）または超可変領域に由来する残基で構成されている。時には、非超可変領域またはフレームワーク領域（ＦＲ）の残基が、ドメイン全体の構造、ひいては結合部位に影響を及ぼす。ＣＤＲは、ネイティブ抗体結合部位の天然Ｆｖ領域の結合親和性および特異性を定義するアミノ酸配列を指す。抗体の軽鎖および重鎖は、それぞれ、それぞれＣＤＲ１－Ｌ、ＣＤＲ２－Ｌ、ＣＤＲ３－Ｌ、およびＣＤＲ１－Ｈ、ＣＤＲ２－Ｈ、ＣＤＲ３－Ｈと呼ばれる３つのＣＤＲを有する。従って、抗体の抗原結合部位は、重鎖Ｖ領域および軽鎖Ｖ領域のそれぞれ由来のＣＤＲセットを含む６つのＣＤＲを含む。「抗体フレームワーク領域」（ＦＲ）は、ＣＤＲ間に介在しているアミノ酸配列を指しており、即ち、抗体軽鎖および重鎖の可変領域の、単一種において異なる抗体間で比較的保存されている部分を指す。抗体の軽鎖および重鎖は、それぞれ、それぞれＦＲ１－Ｌ、ＦＲ２－Ｌ、ＦＲ３－Ｌ、ＦＲ４－Ｌ、およびＦＲ１－Ｈ、ＦＲ２－Ｈ、ＦＲ３－Ｈ、ＦＲ４－Ｈと呼ばれる４つのＦＲを有する。従って、軽鎖可変ドメインは、（ＦＲ１－Ｌ）－（ＣＤＲ１－Ｌ）－（ＦＲ２－Ｌ）－（ＣＤＲ２－Ｌ）－（ＦＲ３－Ｌ）－（ＣＤＲ３－Ｌ）－（ＦＲ４－Ｌ）と説明され得、重鎖可変ドメインは、（ＦＲ１－Ｈ）－（ＣＤＲ１－Ｈ）－（ＦＲ２－Ｈ）－（ＣＤＲ２－Ｈ）－（ＦＲ３－Ｈ）－（ＣＤＲ３－Ｈ）－（ＦＲ４－Ｈ）と説明され得る。本明細書で使用される場合、「ヒトフレームワーク領域」とは、天然に存在するヒト抗体のフレームワーク領域と実質的に同一（約８５％以上、特に、９０％、９５％、９７％、９９％、または１００％）であるフレームワーク領域のことである。本発明に関連して、抗体軽鎖または重鎖の可変ドメインにおけるＣＤＲ／ＦＲ定義は、ＩＭＧＴ定義に基づいて決定される（Lefranc et al., Dev. Comp. Immunol., 2003, 27(1):55-77; www.imgt.org）。従って、所与の可変鎖のＣＤＲ１、ＣＤＲ２、およびＣＤＲ３のアミノ酸配列、ならびにＦＲ１、ＦＲ２、ＦＲ３、およびＦＲ４のアミノ酸配列は、前記ＩＭＧＴ定義に従って示される。
【0054】
本発明の抗体、ＴＣＲ、または抗原結合タンパク質のＣＤＲのアミノ酸配列を知ることにより、当業者は、フレームワーク領域（例えば、ＴＣＲフレームワーク領域または抗体フレームワーク領域）を容易に決定し得る。ＣＤＲが示されていない場合には、当業者は、最初に、ＴＣＲに関するＩＭＧＴ定義または抗体に関するＩＭＧＴ定義に基づいてＣＤＲアミノ酸配列を決定し得、次いで、フレームワーク領域のアミノ酸配列を決定し得る。
【0055】
操作された抗体フォーマットは、機能的抗体断片、一本鎖抗体、単一ドメイン抗体、およびキメラ抗体、ヒト化抗体、二重特異性抗体、または多重特異性抗体を含む。操作された抗体フォーマットとして、抗体の軽鎖可変ドメインがＴＣＲのα鎖可変ドメインで置き換えられていてもよく、かつ重鎖可変ドメインがＴＣＲのβ鎖可変ドメインで置き換えられていてもよいか、またはその逆であってもよい、コンストラクトがさらに挙げられる。「機能的抗体断片」は、その標的抗原に結合する能力、特にその標的抗原についての親和性および／または特異性を保持する全長抗体の部分を指す。好ましくは、機能的抗体断片は、全長抗体の抗原結合領域または可変領域を含む。機能的抗体断片の例として、Ｆｖ、Ｆａｂ、Ｆ（ａｂ’）２、Ｆａｂ’、ｄｓＦｖ、（ｄｓＦｖ）２、ｓｃＦｖ、ｓｃ（Ｆｖ）２、およびダイアボディが挙げられる。機能的抗体断片はまた、重鎖抗体等の単一ドメイン抗体でもあり得る。「Ｆａｂ」という用語は、ＩｇＧをプロテアーゼ（例えば、パパイン）で処理して得られる断片の内、Ｈ鎖のＮ末端側の約半分とＬ鎖全体とがジスルフィド結合を介して互いに結合している、分子量が約５０，０００ダルトンであり抗原結合活性を有する抗体断片を示す。Ｆｖ断片は、抗体のＦａｂ断片のＮ末端部分であり、１本の軽鎖および１本の重鎖の可変部分からなる。
【0056】
本明細書で使用される場合、抗原結合タンパク質の「フォーマット」は、ドメイン（特に、可変ドメインおよび適宜定常ドメイン）の定義された空間的配置を指定する。そのような抗原結合タンパク質フォーマットの重要な特徴は、下記である：ポリペプチド鎖の数（一本鎖、二本鎖、または多重鎖）、異なるドメインを連結するリンカーのタイプおよび長さ、可変ドメインの数（従って、価数の数）、異なる可変ドメインの数（従って、異なる抗原に対する特異性の数、例えば、二重特異性、多重特異性）、ならびに可変ドメインの順序および方向（例えば、クロスオーバー、パラレル）。
【0057】
「ヒト化抗体」という用語は、完全にまたは部分的に非ヒト起源であり、かつヒトにおける免疫反応を回避するかまたは最小限に抑えるために、ある特定のアミノ酸（特に、重鎖および軽鎖のフレームワーク領域中）を置き換えることにより改変されている抗体を指す。ヒト化抗体の定常ドメインは、主にヒトのＣＨドメインおよびＣＬドメインである。抗体配列のヒト化のための多数の方法が、当該技術分野で既知であり；例えば、Almagro & Fransson (2008) Front Biosci. 13: 1619-1633による概説を参照されたい。
【0058】
本出願の文脈において、「参照配列と少なくとも８５％同一」である配列とは、参照配列の全長との８５％以上、特に、９０％、９１％、９２％、９３％、９４％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％の配列同一性を全長にわたり有する配列のことである。参照配列と「少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一」のアミノ酸配列からなるタンパク質は、参照配列と比較して突然変異（例えば、欠失、挿入、および／または置換）を含み得る。置換の場合には、参照配列と少なくとも８０％、８５％、９０％、９５％、９６％、９７％、９８％、または９９％同一のアミノ酸配列からなるタンパク質は、参照配列とは別の種に由来する相同配列に対応し得る。
【0059】
本出願の文脈において、「同一性の割合」は、グローバルペアワイズアラインメントを使用して算出され得る（即ち、２つの配列が、その全長にわたり比較される）。２つ以上の配列の同一性を比較する方法は、当該技術分野で公知である。例えば、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ－Ｗｕｎｓｃｈグローバルアラインメントアルゴリズム（Needleman and Wunsch, 1970 J. Mol. Biol. 48:443-453）を使用して、２つの配列の全長を考慮した場合の最適なアラインメント（ギャップを含む）を見出す「ニードル」プログラムを使用し得る。ニードルプログラムは、例えば、ebi.ac.uk World Wide Webサイトで入手可能であり、下記の刊行物でさらに説明されている［EMBOSS: The European Molecular Biology Open Software Suite (2000) Rice, P. Longden, I. and Bleasby, A. Trends in Genetics 16, (6) pp. 276-277］。本発明に従う２つのポリペプチド間の同一性の割合は、“Ｇａｐ Ｏｐｅｎ”パラメータ １０．０、“Ｇａｐ Ｅｘｔｅｎｄ”パラメータ ０．５、およびＢｌｏｓｕｍ６２マトリックスでＥＭＢＯＳＳ：ニードル（グローバル）プログラムを使用して算出される。
【0060】
「アミノ酸突然変異」は、欠失、挿入または置換であってもよい。
【0061】
「アミノ酸置換」は、保存的または非保存的であってもよい。一実施形態では、置換は保存的置換であり、保存的置換では、１つのアミノ酸は、類似の構造的および／または化学的特性を有する別のアミノ酸に置換される。
【0062】
一実施形態では、保存的アミノ酸置換として、アミノ酸の同クラスの別のアミノ酸［例えば、（１）非極性：Ａｌａ、Ｖａｌ、Ｌｅｕ、Ｉｌｅ、Ｐｒｏ、Ｍｅｔ、Ｐｈｅ、Ｔｒｐ；（２）非荷電極性：Ｇｌｙ、Ｓｅｒ、Ｔｈｒ、Ｃｙｓ、Ｔｙｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ；（３）酸性：Ａｓｐ、Ｇｌｕ；および（４）塩基性：Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｈｉｓ］による置換も挙げられ得る。他の保存的アミノ酸置換をまた、下記のように行ない得る：（１）芳香族：Ｐｈｅ、Ｔｙｒ、Ｈｉｓ；（２）プロトン供与体：Ａｓｎ、Ｇｌｎ、Ｌｙｓ、Ａｒｇ、Ｈｉｓ、Ｔｒｐ；および（３）プロトン受容体：Ｇｌｕ、Ａｓｐ、Ｔｈｒ、Ｓｅｒ、Ｔｙｒ、Ａｓｎ、Ｇｌｎ（例えば、内容全体が参照により組み込まれる米国特許第１０，１０６，８０５号明細書を参照されたい）。
【0063】
別の実施形態では、保存的置換を、表１に従って行ない得る。タンパク質改変に対する耐性を予測する方法を、例えば、Guo et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 101(25):9205-9210 (2004)（この内容は、その全体が参照により組み込まれる）で見出し得る。
【0064】
【表1】
【0065】
本発明の抗原結合タンパク質は、１つまたは複数の天然に存在するアミノ酸の代わりに、合成アミノ酸を含み得る。そのような合成アミノ酸は、当該技術分野で既知であり、例えば下記が挙げられる：アミノシクロヘキサンカルボン酸、ノルロイシン、α－アミノ ｎ－デカン酸、ホモセリン、Ｓ－アセチルアミノメチル－システイン、トランス－３－およびトランス－４－ヒドロキシプロリン、４－アミノフェニルアラニン、４－ニトロフェニルアラニン、４－クロロフェニルアラニン、４－カルボキシフェニルアラニン、β－フェニルセリン β－ヒドロキシフェニルアラニン、フェニルグリシン、α－ナフチルアラニン、シクロヘキシルアラニン、シクロヘキシルグリシン、インドリン－２－カルボン酸、１，２，３，４－テトラヒドロイソキノリン－３－カルボン酸、アミノマロン酸、アミノマロン酸モノアミド、Ｎ’－ベンジル－Ｎ’－メチル－リシン、Ｎ’，Ｎ’－ジベンジル－リシン、６－ヒドロキシリシン、オルニチン、α－アミノシクロペンタン カルボン酸、α－アミノシクロヘキサン カルボン酸、α－アミノシクロヘプタン カルボン酸、α－（２－アミノ－２－ノルボルナン）－カルボン酸、α，γ－ジアミノ酪酸、α，β－ジアミノプロピオン酸、ホモフェニルアラニン、およびα－ｔｅｒｔ－ブチルグリシン。
【0066】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、グリコシル化され得るか、アミド化され得るか、カルボキシル化され得るか、リン酸化され得るか、エステル化され得るか、Ｎ－アシル化され得るか、例えばジスルフィド架橋を介して環化され得るか、もしくは酸付加塩に変換され得、および／または二量体化され得るかもしくは重合され得るか、またはコンジュゲートされてもよい。
【0067】
「共有結合的連結」は、本明細書では、例えば、ジスルフィド結合、またはポリペプチドリンカー等のリンカーもしくはリンカー配列を介したペプチド連結もしくは共有結合的連結を指す。
【0068】
「リンカー」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原結合部位を形成するために正しく折り畳むのに十分なドメインまたは要素（例えば、二重特異性抗原結合の可変ドメイン）の可動性を提供するためにドメイン間またはドメインと薬剤との間に挿入される１つまたは複数のアミノ酸残基を指す。
【0069】
いくつかの実施形態では、リンカーは、リンカーが存在していないことを意味する０個のアミノ酸からなる。リンカーは、アミノ酸配列レベルで、可変ドメイン間または可変ドメインと定常ドメインとの間（または二量体化ドメイン間）それぞれの転移で挿入される。抗体ドメインおよびＴＣＲドメインのおおよそのサイズがよく理解されていることから、ドメイン間の転移を特定し得る。ドメイン転移の精密な位置は、実験データにより実証されるか、またはモデリングもしくは二次構造予測の技術により推定され得るような二次構造エレメント、例えばベータシートまたはアルファ－ヘリックスを形成しないペプチドストレッチを位置決定することにより決定され得る。
【0070】
リンカーは、それぞれの文脈において別途指定されない限り、少なくとも１～３０個のアミノ酸の長さであり得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、２～２５個、２～２０個、または３～１８個のアミノ酸の長さであり得る。いくつかの実施形態では、リンカーは、１４、１３、１２、１１、１０、９、８、７、６、または５個以下のアミノ酸の長さのペプチドであり得る。他の実施形態では、リンカーは、５～２５個、５～１５個、４～１１個、１０～２０個、または２０～３０個のアミノ酸の長さであり得る。他の実施形態では、のリンカーは、約２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９、または３０個のアミノ酸の長さであり得る。特定の実施形態では、のリンカーは、２４個未満、２０個未満、１６個未満のアミノ酸残基の長さであり得、１２個未満、１０個未満、例えば、５～２４個未満、１０～２４個未満、または５～１０個未満のアミノ酸残基の長さである。いくつかの実施形態では、前記リンカーは、１個以上のアミノ酸残基の長さであり、例えば、１個超、２個超、５個超、１０個超、２０個超のアミノ酸残基の長さであり、２２個超のアミノ酸残基の長さである。好ましい実施形態では、リンカーは、グリシン／セリンリンカー、即ち、グリシンおよびセリン残基からなるか、または本質的にからなるリンカーである。
【0071】
本開示の抗原結合タンパク質は、合成であり得、組換えであり得、単離され得、操作され得、および／または精製され得る。
【0072】
「操作された」抗原結合タンパク質、特に、本発明に関連する操作されたＴＣＲは、生物工学的方法により、特に、ネイティブなタンパク質配列中にアミノ酸突然変異を導入することにより、改変されているタンパク質を指す。そのような生物工学的方法は当業者に周知である。
【0073】
「精製された」は、ポリペプチド（例えば、本発明の抗原結合タンパク質）またはヌクレオチド配列（例えば、本明細書で説明されている抗原結合タンパク質またはその機能的断片をコードするヌクレオチド配列）に言及する場合には、示されている分子が、同一タイプの他の生物学的高分子の実質的非存在下で存在していることを意味する。「精製された」という用語は、特に本明細書で使用される場合、同一タイプの生物学的高分子の少なくとも７５重量％、８５重量％、９５重量％、または９８重量％が存在していることを意味する。「精製された」という用語は、本明細書で使用される場合、抗原結合タンパク質が、その治療的、診断的、予防的、研究または他の使用に干渉するＤＮＡ、ＲＮＡ、タンパク質、ポリペプチドまたは細胞を含まないことをさらに示し得る。
【0074】
特定のポリペプチドをコードする精製された核酸分子は、主題のポリペプチドをコードしない他の核酸分子を実質的に含まない核酸分子を指しており、しかしながら、この分子は、組成の基本特性に悪影響を及ぼさないいくつかのさらなる塩基または部分を含み得る。
【0075】
「単離された」という用語は、天然状態から変化したかまたは取り出されたことを意味する。例えば、生きている動物中に天然に存在する核酸またはペプチドは、「単離され」てはいないが、天然状態の共存物質から部分的または完全に分離された同一の核酸またはペプチドは、「単離され」ている。単離された核酸またはタンパク質は、実質的に精製された形態で存在し得るか、または例えば宿主細胞等の非天然環境中で存在し得る。単離された抗原結合タンパク質は、異なる抗原特異性を有する他の抗原結合タンパク質を実質的に含まない（例えば、ＣＴ４５－ＩＰに特異的に結合する抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰ以外の抗原に特異的に結合する抗原結合タンパク質を実質的に含まない）。さらに、単離された抗原結合タンパク質は、他の細胞物質および／または化学物質を実質的に含まない場合がある。
【0076】
「組換え」分子とは、組換え手段により調製されているか、発現されているか、作製されているか、または単離されている分子のことである。組換え分子は、天然には存在していない。
【0077】
「遺伝子」という用語は、１種または複数種のタンパク質または酵素の全てまたは一部を構成するアミノ酸の特定の配列をコードするかまたはそれに対応するＤＮＡ配列を意味しており、例えばこの遺伝子が発現される条件を決定する制御ＤＮＡ配列（例えば、プロモーター配列）を含んでもよいし、含まなくてもよい。構造遺伝子ではないいくつかの遺伝子は、ＤＮＡからＲＮＡへと転写され得るが、アミノ酸配列へとは翻訳されない。他の遺伝子は、構造遺伝子のレギュレーターとして機能し得るか、またはＤＮＡ転写のレギュレーターとして機能し得る。特に、遺伝子という用語は、タンパク質をコードするゲノム配列（即ち、レギュレーター、プロモーター、イントロン、およびエクソンの配列を含む配列）を対象とし得る。
【0078】
「親和性」は、本発明に関連して、抗原結合タンパク質とその抗原（即ち、ＭＨＣタンパク質との複合体中のＣＴ４５－ＩＰペプチド）との間の平衡結合により定義される。親和性は、平衡解離定数（ＫＤ）として通常は表される。
【0079】
「ＫＤ」は、抗原結合タンパク質とその抗原との間の平衡解離定数（ｋｏｆｆ／ｋｏｎの比）である。ＫＤおよび親和性は、逆相関している。ＫＤ値は、抗原結合タンパク質の濃度に関係しており、ＫＤ値が低いほど、抗原結合タンパク質の親和性が高くなる。ＫＤ値は、表面プラズモン共鳴（ＳＰＲ）または生体層干渉法（ＢＬＩ）による会合速度および解離速度の測定等の様々な既知の方法により実験的に評価し得る。当業者に既知であるように、それらの実験のために使用される実験条件、例えば使用される緩衝液、タンパク質の濃度は、結果に強く影響を及ぼし得る。
【0080】
「機能的なアビディティ」は、ＭＨＣとの複合体中の標的抗原ペプチドへの結合で、エフェクター細胞、好ましくはＴ細胞を活性化させる抗原結合タンパク質、好ましくはＴＣＲの能力を記載するパラメータとして、本発明に関連して定義される。エフェクター細胞、好ましくはＴ細胞の活性化は、機能アッセイ、特に、下記に記載されているサイトカイン産生アッセイまたは細胞傷害性アッセイにおいて測定され得る。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質の機能的なアビディティは、機能アッセイにおいて決定されたＥＣ５０が低い、例えば、下記に記載されている細胞傷害性アッセイにおいて約６０ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、もしくは約１ｎＭ未満である、かつ／または機能アッセイにおいて決定された活性が高い、例えば、それぞれの機能アッセイにおいて定義される最大活性の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、もしくは少なくとも９５％である場合に、高いとみなされる。機能アッセイに依存して、最大活性は、既知の高い機能的なアビディティを有する参照タンパク質の活性または下記に記載されている「最大溶解コントロール」の活性であってもよい。
【0081】
「有効性」は、ＭＨＣとの複合体中の標的抗原ペプチドをその表面上に提示するがん細胞を殺滅するエフェクター細胞、好ましくはＴ細胞を活性化させる抗原結合タンパク質、好ましくはＴＣＲの能力を記載するパラメータとして、本発明に関連して定義される。有効性は、機能アッセイ、特に、下記に記載されている生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイにおいて決定され得る。
【0082】
「機能アッセイ」において、抗原結合タンパク質は、例えば、「エフェクター細胞（Ｅ）」中で発現され、かつエフェクター細胞は、「標的細胞（Ｔ）」と、即ち、ペプチド－ＭＨＣ複合体を提示する抗原提示細胞と共培養される。機能アッセイは、そのためまた、「共培養アッセイ」としても記載され得る。本明細書に記載される全ての細胞培養アッセイのために、細胞培養温度は好ましくは約３７℃である。好ましくは、抗原結合タンパク質はＴＣＲであり、かつエフェクター細胞はＴ細胞である。標的細胞は、抗原ペプチドを人工的にロードされた細胞（例えばＴ２細胞）であってもよいか、または表面上に標的抗原ペプチドを内因性に提示する細胞（例えばＣＴ４５を発現するがん細胞）であってもよい。ペプチド－ＭＨＣ複合体への抗原結合タンパク質の結合は、エフェクター細胞の活性化をもたらす。機能アッセイのタイプに依存して、活性化の程度を測定するための異なるリードアウトがある。サイトカイン産生アッセイにおいて、エフェクター細胞によるサイトカイン（例えばＴＮＦ－α、ＩＦＮ－γ、ＣＤ１０７ａ＋、ＩＬ－２および／またはグランザイムＢ）の産生が決定される。細胞傷害性アッセイにおいて、エフェクター細胞による標的細胞の殺滅が、例えば、標的細胞、特にがん細胞の増殖における低下を測定することにより（例えば生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイにおいて）、または標的細胞からの細胞内タンパク質の放出を測定することにより、決定される。細胞傷害性アッセイにおいて測定される好適な細胞内タンパク質は、内因性タンパク質、例えば、抗原提示細胞により発現されるＬＤＨまたはトランスジェニックタンパク質、例えばルシフェラーゼであり得る。
【0083】
本発明に関連して、「Ｔ２細胞」という用語は、ＴＡＰ機能を欠いているＭＨＣＩ分子（ＨＬＡ－Ａ２）を発現する細胞を指す。Ｔ２細胞は、異なる濃度の外因性抗原ペプチドを容易に人工的にロードされ得る。Ｔ２細胞は、例えば、［Hosken and Bevan, Science 1990 Apr 20;248(4953):367-70］において記載されている。Ｔ２細胞は、例えばＡＴＣＣ（Ａｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ）から、商業的に入手可能である。Ｔ２細胞のローディングは、当業者に既知の標準的な細胞培養条件下で、Ｔ２細胞を約２時間、所望される濃度の抗原ペプチドとインキュベートすることにより達成され得る。本発明に関連して、ある特定の濃度、例えば１μＭ、１００ｎＭ、１０ｎＭ、１ｎＭ、１００ｐＭ、１０ｐＭ、１ｐＭの抗原ペプチドとインキュベートされるＴ２細胞は、前記濃度の抗原ペプチドをロードされたＴ２細胞と称され、例えば、１０μＭの抗原ペプチドとインキュベートされたＴ２細胞は、１０μＭの抗原ペプチドをロードされたＴ２細胞と称される。
【0084】
「Ｅ：Ｔ比」という用語は、エフェクター細胞（即ち、抗原結合タンパク質、特にＴＣＲを発現する、免疫細胞、特にＴ細胞）の標的細胞に対する比を指す。いくつかの実施形態では、Ｅ：Ｔ比は、播種比、即ち、免疫細胞、特にＴ細胞の総数の、標的細胞の総数に対する比に対応する。いくつかの実施形態では、Ｅ：Ｔ比は、播種比よりも低い。これは、例えば低いエレクトロポレーション効率に起因して、全ての免疫細胞が抗原結合タンパク質を発現するわけではない、即ち、全ての免疫細胞がエフェクター細胞であるわけではない場合に適用される。いくつかの実施形態では、播種比は、Ｅ：Ｔ比のおおよその値として使用される。いくつかの実施形態では、Ｅ：Ｔ比は、エレクトロポレーション効率を考慮に入れて播種比を調整することにより決定される。
【0085】
例示的なルシフェラーゼ放出アッセイは、方法セクションにおいて記載されており、実施例１および２において行われている。ルシフェラーゼ放出アッセイの特定の実施形態では、エフェクター細胞は、ＴＣＲを一過的にまたは安定的に発現するＴ細胞、好ましくは予備刺激されたＴ細胞、例えば、ＴＣＲをコードするｍＲＮＡをエレクトロポレートされたＴ細胞、またはＴＣＲをコードする核酸を安定的に形質導入されたＴ細胞、例えば、ＴＣＲをコードする核酸を含むレンチウイルスベクターを形質導入されたＴ細胞である。これらのエフェクター細胞は、ルシフェラーゼを発現する標的細胞と共培養される。好ましくは、標的細胞は、抗原ペプチドをロードされたＴ２細胞である。好ましくは、エフェクター細胞および標的細胞は、２：１～１：２、好ましくは１：１の比において播種される。定義された時間、例えば１２～３８時間、好ましくは１８～３０時間、より好ましくは約２４時間の共培養の後に、上清中のルシフェラーゼの量が測定され、高いルシフェラーゼ濃度は、高い殺滅活性、およびそのため、提示されたペプチドについての、抗原結合タンパク質、好ましくはＴＣＲの高い機能的なアビディティを示す。抗原結合タンパク質の機能的なアビディティは、細胞傷害性アッセイ、好ましくは上記に定義されているルシフェラーゼ放出アッセイにおいて、標的細胞に対するエフェクター細胞の細胞傷害活性が、コントロール毒性試薬の細胞傷害活性の少なくとも５０％、少なくとも６０％、少なくとも７０％、少なくとも７５％、好ましくは少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、または少なくとも９５％である場合に、高いとみなされる。細胞傷害活性は１００％よりも高いものであり得ることを当業者は認識している。これは、１００％の細胞傷害活性は、毒性試薬との標的細胞のインキュベーションを指す「最大溶解コントロール」により定義されるという事実に起因する。いくつかの実施形態では、毒性試薬は、標的細胞の溶解をもたらす界面活性剤、例えばＴｒｉｔｏｎ－Ｘ１００、Ｔｗｅｅｎ－２０、Ｔｗｅｅｎ－８０またはＮＰ－４０である。いくつかの具体例では、最大溶解コントロールは、標的細胞培養物に０．２％ Ｔｒｉｔｏｎ－Ｘ１００溶液を加えることを含む。毒性試薬の細胞傷害活性、即ち、毒性試薬により殺滅された標的細胞の数は、１００％として定義される。標的細胞は共培養の間に依然として増殖することができるので、エフェクター細胞は、最大溶解コントロールの間に殺滅された毒性試薬（ｔｈｅ ｔｏｘｉｃ ｒｅａｇｅｎｔ）よりも多くの数の標的細胞を細胞傷害性アッセイの間に最終的に殺滅し得る。そのような場合には、算出される細胞傷害活性は１００％よりも高い。
【0086】
例示的なサイトカイン産生アッセイは、方法セクションにおいて記載されており、実施例３において行われている。サイトカイン産生アッセイの特定の実施形態では、エフェクター細胞は、ＴＣＲを発現するＴ細胞、好ましくは予備刺激されたＴ細胞、例えば、ＴＣＲをコードする核酸を一過的にトランスフェクトされたかまたは安定的に形質導入されたＴ細胞、好ましくは、ＴＣＲをコードするｍＲＮＡをエレクトロポレートされたＴ細胞である。これらのエフェクター細胞は、好ましくは抗原ペプチドをロードされたＴ２細胞である標的細胞と共培養される。好ましくは、エフェクター細胞および標的細胞は、２：１～１：２、好ましくは１：１の比において播種される。共培養は、好ましくは、分泌遮断剤の存在下で行われる。定義された時間、例えば３～７時間、好ましくは約５時間の共培養の後に、エフェクター細胞は、例えばＣＤ１０７ａ＋、ＩＦＮ－ガンマ、ＴＮＦアルファ、ＩＬ－２およびグランザイムＢから選択される、少なくとも１つの細胞内サイトカインについて染色されて、サイトカインを産生するエフェクター細胞の量が決定される。抗原結合タンパク質の機能的なアビディティは、抗原が、上記に定義されているサイトカイン産生アッセイにおいてエフェクター細胞を活性化可能である場合に、特に、標的細胞との共培養でサイトカインを産生するエフェクター細胞の数が、免疫細胞、例えば生ＣＤ４＋、ＣＤ８＋および／またはＣＤ３＋細胞の集団当たり少なくとも２％、少なくとも２．５％、好ましくは少なくとも３％である場合に、高いとみなされる。好ましくは、標的細胞との共培養でサイトカインを産生するエフェクター細胞の数は、エフェクター細胞の総数当たり少なくとも１０％、少なくとも２５％、少なくとも５０％である。上記に説明されるように、例えば低いエレクトロポレーション効率に起因して、全ての免疫細胞が抗原結合タンパク質を発現するわけではなく、即ち、共培養アッセイにおいて播種された全ての免疫細胞がエフェクター細胞であるわけではない。
【0087】
例示的な生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイは、方法セクションにおいて記載されており、実施例５において行われている。生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイの特定の実施形態では、エフェクター細胞は、ＴＣＲを一過的にまたは安定的に発現するＴ細胞、好ましくは予備刺激されたＴ細胞、例えば、ＴＣＲをコードするｍＲＮＡをエレクトロポレートされたＴ細胞である。これらのエフェクター細胞は、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを内因性に発現しかつ提示し、かつ適宜ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを追加的にロードされた腫瘍細胞と共培養される。いくつかの実施形態では、腫瘍細胞はＡ３７５細胞またはＮＣＩＨ－１７０３細胞である。腫瘍細胞は好ましくは蛍光標識される。生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイのいくつかの実施形態では、全Ｔ細胞［ＴＣＲを発現するＴ細胞（＝エフェクター細胞）およびＴＣＲを発現しないＴ細胞を含む］の播種比は、９：１～０．５：１、例えば９：１、６：１、３：１、２：１または１：１である。いくつかの実施形態では、Ｅ：Ｔ比は６：１～０．２：１である。抗原結合タンパク質の有効性は、上記に定義されている生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイにおいて、腫瘍細胞の殺滅（腫瘍細胞増殖における減少により決定される）が、６：１またはそれ未満、５：１またはそれ未満、４：１またはそれ未満、３：１またはそれ未満、好ましくは２：１またはそれ未満、より好ましくは１：１またはそれ未満、よりいっそう好ましくは０．５：１またはそれ未満のＥ：Ｔ比において観察される場合に、高いとみなされる。
【0088】
「ＥＣ５０」とも呼ばれる「最大半量有効濃度」は、典型的には、特定の暴露時間後にベースラインと最大値との中間の反応を誘発する分子の濃度を指す。ＥＣ５０値が低ければ低いほど、分子の機能的なアビディティはより高い。ＥＣ５０値は、例えば、上記される機能アッセイまたは他のＥＬＩＳＡもしくはフローサイトメトリーベース殺滅アッセイを使用して、様々な既知の方法により実験的に評価され得る。
【0089】
上記されている機能アッセイにおいてＥＣ５０を決定するために、抗原提示細胞、例えばＴ２細胞上にロードされた異なる濃度の抗原ペプチドが「ペプチド滴定実験」において使用される必要がある。ペプチド滴定を伴う例示的なルシフェラーゼ放出アッセイは、方法セクションにおいて記載されており、実施例１において行われている。特定の実施形態では、「ＥＣ５０」は、標的細胞、特に、ＣＴ４５抗原ペプチドをロードされたＴ２細胞が、上記に定義されているルシフェラーゼ放出においてエフェクター細胞と共培養された場合に、ベースラインと最大との間の半分の応答を誘導する、前記標的細胞上にロードされた抗原ペプチドの濃度を指す。抗原結合タンパク質の機能的なアビディティは、細胞傷害性アッセイ、好ましくは上記に定義されているルシフェラーゼ放出アッセイにおいて決定されたＥＣ５０が、約６０ｎＭ未満、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、好ましくは約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、より好ましくは約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である場合に、高いとみなされる。
【0090】
「デキストラマー染色」は、抗原結合タンパク質を発現する細胞を、１０個のＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体を含む蛍光標識された多量体と接触させることを伴う。
【0091】
本発明に関連する「特異性」という用語は、その標的ペプチドを、異なるアミノ酸配列を有するペプチド、例えば、下記に定義されている類似ペプチドから識別する抗原結合タンパク質の能力を表す。抗原結合タンパク質は、標的ペプチドへの結合が、類似ペプチドへの結合よりも有意により高い親和性および／またはより高い機能的なアビディティと共に起こる場合に、標的ペプチドについて特異的であるとみなされる。抗原結合タンパク質の特異性は、アミノ酸配列ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３により決定される。ＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２のアミノ酸配列はＭＨＣ分子に接触し、抗原特異性のために要求されない。
【0092】
本発明に関連して、「類似ペプチド」は、本明細書では、潜在的なオフターゲットペプチドを指しており、即ち、生化学的／生物物理学的特性に基づいて本発明の抗原結合分子が結合する可能性があり得るペプチド（例えば、限定されないが、相同配列または類似モチーフ）を指す。類似ペプチドは、典型的には、８～１２個のアミノ酸の長さである。本発明に関連する類似ペプチドは、典型的には、提示されるＭＨＣ、特にＭＨＣＩである。さらに、本発明に関連する類似ペプチドとして、ＣＴ４５抗原ペプチドのアミノ酸配列に類似するアミノ酸配列を含むかまたはからなるペプチド、より特に、ＣＴ４５抗原ペプチドのエピトープと比較して、一部または全てのアミノ酸が、ＣＴ４５抗原ペプチドのエピトープを構成するアミノ酸と同一および／または類似の生化学的／生物物理学的特性を有するエピトープを含むペプチドが挙げられる。いくつかの実施例では、本発明に関連して調査する類似ペプチドを、ＣＴ４５－ＩＰの結合関連位置内での類似性スコアリング、および正常組織での少なくとも１つの検出の要件を使用して、腫瘍および正常組織により提示されたＨＬＡ－Ａ＊０２結合ペプチドのデータベース（ＸＰＲＥＳＩＤＥＮＴ（登録商標）データベース）から選択した。ＭＨＣタンパク質により提示される類似ペプチドへの抗原結合タンパク質の結合は、有害反応を引き起こす場合がある。そのような有害反応は、Lowdell et al., Cytotherapy, published on December 4, 2018で報告されている特定のＴＣＲと健康組織中の類似ペプチドとの交差反応性等の「オフ腫瘍（ｏｆｆ－ｔｕｍｏｒ）」副作用の場合がある。
【0093】
特に、下記のペプチドは、本発明に関連する類似ペプチドである：配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）。
【0094】
類似ペプチドの中には、検出可能な程度まで本発明の抗原結合タンパク質の結合を受けないいくつかの類似ペプチド、例えば、バックグラウンドレベルを超える機能アッセイにおける結合シグナルまたは応答が検出可能でないペプチドがあることを当業者は認識している。これに関連する「バックグラウンドレベル」は、非相同的な、「非類似」ペプチド、例えばコントロールペプチドＮＹＥＳＯ１－００１について、またはペプチドの非存在下で観察される機能アッセイにおける結合シグナルまたは応答を指す。
【0095】
他の類似ペプチドについて、低いが、有意でない結合が検出可能であってもよい。これらの後者の類似ペプチドもまた、「潜在的に関連する」類似ペプチドとして記載され得る。抗原結合タンパク質は、類似ペプチドおよび標的抗原ペプチドへの結合が、類似の、好ましくは同一の実験条件下で比較された場合に、下記の少なくとも１つが該当する場合に、類似ペプチドに有意に結合しない、およびその標的抗原ペプチドについて特異的であるとみなされる：
－ 上記されている機能アッセイにおいて決定された、類似ペプチドに応答した機能的なアビディティが、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰに応答した機能的なアビディティの２５％またはそれ未満、２０％またはそれ未満、１５％またはそれ未満、１０％またはそれ未満である。
－ 上記されている細胞傷害性アッセイにおいて決定された、類似ペプチドに応答した細胞傷害活性が、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰに応答した細胞傷害活性の２５％またはそれ未満、２０％またはそれ未満、１５％またはそれ未満、１０％またはそれ未満である。
－ 上記されている機能アッセイ、好ましくは細胞傷害性アッセイにおいて決定された、類似ペプチドのＥＣ５０が、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰのＥＣ５０と比較して、少なくとも５０、少なくとも１００、少なくとも２００または少なくとも５００倍増加している。
－ 類似ペプチドについてのＫＤが、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰについてのＫＤと比較して、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、または少なくとも１００倍増加している。
－ 上記されている機能アッセイにおいて決定された、類似ペプチドに応答した機能的なアビディティが、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰに応答した機能的なアビディティの２５％またはそれ未満、２０％またはそれ未満、１５％またはそれ未満、１０％またはそれ未満である。
－ 上記されている細胞傷害性アッセイにおいて決定された、類似ペプチドに応答した細胞傷害活性が、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰに応答した細胞傷害活性の２５％またはそれ未満、２０％またはそれ未満、１５％またはそれ未満、１０％またはそれ未満である。
－ 上記されている機能アッセイ、好ましくは細胞傷害性アッセイにおいて決定された、類似ペプチドのＥＣ５０が、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰのＥＣ５０と比較して、少なくとも５０、少なくとも１００、少なくとも２００または少なくとも５００倍増加している。
－ 類似ペプチドについてのＫＤが、標的抗原ペプチドＣＴ４５－ＩＰについてのＫＤと比較して、少なくとも２５、少なくとも３０、少なくとも４０、少なくとも５０、少なくとも７５、または少なくとも１００倍増加している。
【0096】
本明細書に関連して、特定の値を指す場合の「約」という用語は、値が、±１０％、±９％、±８％、±７％、±６％、±５％、±４％、±３％、±２％または±１％まで逸脱してもよいことを示すことが意味される。
【0097】
抗原結合タンパク質
第１の態様では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、
１）ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４８９、好ましくは配列番号５１９のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０４のアミノ酸配列を含み、
２）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９０、好ましくは配列番号５２０のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０５、好ましくは配列番号５２６のアミノ酸配列を含み、
３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９１のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０６、好ましくは配列番号５２７のアミノ酸配列を含み、
４）ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９２のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０７、好ましくは配列番号５２８のアミノ酸配列を含み、
５）ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９３のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０８、好ましくは配列番号５２９のアミノ酸配列を含み、
６）ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９４、好ましくは配列番号５２１のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０９、好ましくは配列番号５３０のアミノ酸配列を含み、
７）ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９５のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１０、好ましくは配列番号５３１のアミノ酸配列を含み、
８）ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９６、好ましくは配列番号５２２のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１１のアミノ酸配列を含み、
９）ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９７のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１２、好ましくは配列番号５３２のアミノ酸配列を含み、
１０）ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９８、好ましくは配列番号５２３のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１３、好ましくは配列番号５３３のアミノ酸配列を含み、
１１）ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９９のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１４、好ましくは配列番号５３４のアミノ酸配列を含み、
１２）ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５００のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１５、好ましくは配列番号５３５のアミノ酸配列を含み、
１３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５０１、好ましくは配列番号５２４のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１６、好ましくは配列番号５３６のアミノ酸配列を含み、
１４）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５０２、好ましくは配列番号５２５のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１７、好ましくは配列番号５３７のアミノ酸配列を含み、または
１５）ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５０３のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１８、好ましくは配列番号５３８のアミノ酸配列を含み、
抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む、
抗原結合タンパク質に関する。
第１の態様では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、
１）ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４８９、好ましくは配列番号５１９のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０４のアミノ酸配列を含み、
２）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９０、好ましくは配列番号５２０のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０５、好ましくは配列番号５２６のアミノ酸配列を含み、
３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９１のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０６、好ましくは配列番号５２７のアミノ酸配列を含み、
４）ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９２のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０７、好ましくは配列番号５２８のアミノ酸配列を含み、
５）ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９３のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０８、好ましくは配列番号５２９のアミノ酸配列を含み、
６）ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９４、好ましくは配列番号５２１のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０９、好ましくは配列番号５３０のアミノ酸配列を含み、
７）ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９５のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１０、好ましくは配列番号５３１のアミノ酸配列を含み、
８）ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９６、好ましくは配列番号５２２のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１１のアミノ酸配列を含み、
９）ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９７のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１２、好ましくは配列番号５３２のアミノ酸配列を含み、
１０）ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９８、好ましくは配列番号５２３のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１３、好ましくは配列番号５３３のアミノ酸配列を含み、
１１）ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４９９のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１４、好ましくは配列番号５３４のアミノ酸配列を含み、
１２）ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５００のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１５、好ましくは配列番号５３５のアミノ酸配列を含み、
１３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５０１、好ましくは配列番号５２４のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１６、好ましくは配列番号５３６のアミノ酸配列を含み、
１４）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５０２、好ましくは配列番号５２５のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１７、好ましくは配列番号５３７のアミノ酸配列を含み、または
１５）ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５０３のアミノ酸配列を含み、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５１８、好ましくは配列番号５３８のアミノ酸配列を含み、
抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む、
抗原結合タンパク質に関する。
【0098】
ＣＤＲａ３およびＣＤＲｂ３に含まれる上記のアミノ酸配列はＣＤＲａ３およびＣＤＲｂ３の中心アミノ酸（本明細書において「ＣＤＲ３コア」とも称される）である。本発明者らは、ＣＤＲ３配列内で、抗原ペプチドへの特異的結合に最も関連するアミノ酸を含むコア配列が定義可能であり、ＣＤＲ３コアの外側のアミノ酸は抗原ペプチドへの特異的結合にあまり関連しないことを見出した（データ示さず）。ＣＤＲ３コアはＣＤＲ３の中心の８アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ＣＤＲ３コアは、特にＣＤＲ３配列が１２アミノ酸以下である場合に、ＣＤＲ３の中心の８アミノ酸からなる。１２アミノ酸よりも長いＣＤＲ３配列の場合、ＣＤＲ３コアは、さらなるアミノ酸、特に中心の９～１３アミノ酸を含んでもよい。
【0099】
実施形態１（１５個の内）として本明細書に記載される全ての実施形態は、好ましくは、他の実施形態１（１５個の内）と組み合わせられる。同様に、それぞれ実施形態２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４または１５（１５個の内）として本明細書に記載される全ての実施形態は、好ましくは、それぞれ他の実施形態２、３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４または１５（１５個の内）と組み合わせられる。例えば、実施形態１（１５個の内）のＣＤＲ１およびＣＤＲ３配列は、好ましくは、実施形態１（１５個の内）のＣＤＲ２配列と組み合わせられる。
【0100】
好ましい実施形態では、
１）ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む。
１）ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む。
【0101】
１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しないＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含む抗原結合タンパク質は、本明細書では、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３のそれぞれにおいて１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい抗原結合タンパク質を指す。
【0102】
抗原結合タンパク質の好ましい実施形態では、
１）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１２）ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
抗原結合タンパク質は、１、２、３または４個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２配列を含む。
１）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１２）ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
抗原結合タンパク質は、１、２、３または４個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２配列を含む。
【0103】
１、２、３または４個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しないＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２配列を含む抗原結合タンパク質は、本明細書では、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２のそれぞれにおいて１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい抗原結合タンパク質を指す。
【0104】
本発明の抗原結合タンパク質の全ての実施形態では、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３配列内のアミノ酸突然変異が存在する場合、それは、好ましくはアミノ酸置換、より好ましくは保存的アミノ酸置換である（表１を参照）。ＣＤＲ配列は、２個よりも多くの、好ましくは１個よりも多くの、アミノ酸突然変異を含まないことが好ましい。アミノ酸突然変異が存在する場合、それは、それぞれのＣＤＲ配列の最初または最後の位置にあることがさらに好ましい。最も好ましい実施形態では、ＣＤＲ配列はいかなるアミノ酸突然変異も含まない。
【0105】
既知のアミノ酸配列中への突然変異の導入は、当該技術分野において周知の標準的な手順であり、当業者にとってルーチンの作業である。それぞれの方法は、当該分野において既知である（例えば２００７年以来のＳｔｒａｔａｇｅｎｅのＱｕｉｋＣｈａｎｇｅ Ｓｉｔｅ Ｄｉｒｅｃｔｅｄ Ｍｕｔａｇｅｎｅｓｉｓ Ｋｉｔ）。当業者は、そのため、特定の突然変異、例えば置換を、一般にアミノ酸配列中におよび特にＣＤＲ配列中に導入することが非常に十分に可能である。
【0106】
その標的への結合についてのＣＤＲの変異体のスクリーニングもまた、当業者により応用される標準的な手順である。本出願は、ＣＴ４５－ＩＰペプチドへの本発明の抗原結合タンパク質の結合を決定するためのサイトカイン産生およびルシフェラーゼ放出アッセイを含む、機能アッセイに言及する。ＣＴ４５－ＩＰペプチドへの本発明の抗原結合タンパク質の結合はまた、デキストラマー染色により決定され得る。
【0107】
ＣＤＲ中のアミノ酸突然変異のアウトカムは容易に予測可能でないことがあるが、当業者は、過度の負担なしに複数の突然変異体を生成およびスクリーニングすることが十分に可能である。当業者は、そのため、ＣＤＲ内に１、２または３個のアミノ酸突然変異を有する抗原結合タンパク質を生成し、その後に、表３のＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質と同じ結合特性を有する抗原結合タンパク質を同定することができる。
【0108】
好ましい実施形態では、１または２個よりも多くのアミノ酸突然変異、好ましくは１個よりも多くのアミノ酸突然変異、より好ましくは１個よりも多くのアミノ酸置換、最も好ましくは１個よりも多くの保存的アミノ酸置換は、ＣＤＲａ３および／またはＣＤＲｂ３の中心の８アミノ酸内、即ちＣＤＲ３コア内に含まれない。ＣＤＲ３が１２個より多くのアミノ酸を含む場合、１または２個よりも多くのアミノ酸突然変異、好ましくは１個よりも多くのアミノ酸突然変異、より好ましくは１個よりも多くのアミノ酸置換、最も好ましくは１個よりも多くの保存的アミノ酸置換は、ＣＤＲａ３および／またはＣＤＲｂ３の中心の９～１３アミノ酸内、即ちＣＤＲ３コアマックス（ＣＤＲ３ ｃｏｒｅ ｍａｘ）内に含まれないことがよりいっそう好ましい（表３）。
【0109】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、例えば、抗原結合タンパク質を発現する細胞（抗原結合タンパク質が膜結合型である場合）、好ましくはリンパ球、より好ましくはＴ細胞またはＮＫ細胞、より好ましくはＴ細胞において、免疫応答を誘導する。いくつかの実施形態では、免疫応答はまた、本発明の抗原結合タンパク質により動員される細胞において誘導されてもよい（抗原結合タンパク質が、例えばＴ細胞またはＮＫ細胞に結合し、それにより該細胞を動員することが可能な可溶性の、二重特異性抗原結合タンパク質である場合）。好ましくは、免疫応答は、インターフェロン（ＩＦＮ）γおよび／または腫瘍壊死因子（ＴＮＦ）αの産生の増加によりキャラクタリゼーションされる。免疫応答は、好ましくは、ＣＴ４５抗原ペプチドとＭＨＣタンパク質との複合体を表面上に提示する腫瘍細胞に対するものである。
【0110】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５抗原ペプチドとＭＨＣタンパク質との複合体に特異的に結合する。いくつかの実施形態では、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８からなる。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＭＨＣタンパク質との複合体の配列番号１３８のアミノ酸配列に特異的に結合する。
【0111】
本発明の全ての態様では、ＣＴ４５抗原ペプチドは、ＭＨＣクラスＩ ＨＬＡタンパク質、例えばＨＬＡ－Ａ、ＨＬＡ－ＢまたはＨＬＡ－Ｃ、好ましくはＨＬＡ－Ａ、より好ましくはＨＬＡ－Ａ＊０２との複合体中に存在することが好ましい。
【0112】
本発明の抗原結合タンパク質は、高い安定性、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い親和性、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い機能的なアビディティ、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを提示する腫瘍細胞の殺滅における高い有効性および／またはＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い特異性によりキャラクタリゼーションされる。
【0113】
本発明の抗原結合タンパク質は、増加した安定性、増加した結合親和性、増加した機能的なアビディティ、増加した有効性および／または増加した特異性、好ましくは、類似の、好ましくは同一の実験条件下で測定された場合に参照タンパク質と比較して増加した結合親和性、増加した機能的なアビディティ、増加した有効性および／または増加した特異性を有する。
【0114】
「参照タンパク質」は、本明細書では、本発明の抗原結合タンパク質が比較されるタンパク質を指す。本発明の抗原結合タンパク質と参照タンパク質との比較は、好ましくは並行して、同様の（好ましくは同一の）実験条件下で行われる。比較されるパラメータに依存して、そのような参照タンパク質は、例えば、本発明に関連して定義されているＣＤＲ配列を含まないＣＴ４５抗原ペプチドに結合するＴＣＲ、ＣＴ４５に由来する異なる抗原ペプチドに結合するＴＣＲ、または無関連の抗原ペプチド、例えば抗原ペプチドＮＹＥＳＯ１－００１（配列番号１８８）に結合するＴＣＲであってもよい。参照タンパク質は、好ましくは、比較される抗原結合タンパク質と同じフォーマットである。抗原結合タンパク質がＴＣＲである場合には、好適な参照タンパク質はまた、ＴＣＲである。
【0115】
「増加した安定性」は、本明細書では、例えば、同じ実験条件下の参照タンパク質と比較して増加した抗原結合タンパク質の発現レベルを指す。本発明の抗原結合タンパク質は、高い発現レベル、特に、類似の、好ましくは同一の実験条件下で測定された場合に参照タンパク質と比較して増加した発現レベルを有する。本発明者らは、実施例４において、抗原結合タンパク質はＴ細胞において高い発現レベルを呈することを示した。抗原結合タンパク質の発現レベルは、例えば、デキストラマー染色により測定され得る。
【0116】
本発明の抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い親和性、特に、類似の、好ましくは同一の実験条件下で測定された場合に参照タンパク質と比較して増加した親和性を有する。
【0117】
本発明の抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い機能的なアビディティ、特に、類似の、好ましくは同一の実験条件下で測定された場合に参照タンパク質と比較して増加した機能的なアビディティを有する。本発明者らは、実施例１において、抗原結合タンパク質はＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い機能的なアビディティを呈することを示した。機能的なアビディティは、機能アッセイ、特に、上記されている細胞傷害性アッセイにおいて決定され得る。機能的活性の測定は、ペプチド滴定実験においてＥＣ５０を決定することを含むことができる。
【0118】
本発明の抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを提示する腫瘍細胞の殺滅における高い有効性、特に、類似の、好ましくは同一の実験条件下で測定された場合に参照タンパク質と比較して増加した有効性を有する。本発明者らは、実施例５において、抗原結合タンパク質はＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを提示する腫瘍細胞の殺滅における高い有効性を呈することを示した。有効性は、機能アッセイ、特に、上記されている生細胞モニタリング細胞傷害性アッセイにおいて決定され得る。
【0119】
好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰの構造エピトープに特異的に結合する。より好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰの機能エピトープに特異的に結合する。本発明者らは、本発明の抗原結合タンパク質による結合に関連するＣＴ４５－ＩＰの残基を同定するために実験を行った（実施例２、表４）。本発明者らは、配列番号１３８のアミノ酸３、４、５、６および７位が結合に関連することを同定した。そのため、いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１３８の３、４、５、６および７位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むかまたはからなる機能エピトープに特異的に結合する。抗原結合タンパク質による結合に関連する残基はまた、ＣＴ４５－ＩＰの「結合モチーフ」とも称され得る。正確なエピトープまたは機能エピトープの決定は、使用された方法および選択されたカットオフ値に依存してわずかに変動し得ることを当業者は認識している。本発明に関連して、エピトープは、上記されている細胞傷害性アッセイ（ルシフェラーゼ放出）において決定されている。実験条件は実施例２においてさらに定義される。
【0120】
少なくとも１つの位置が置換されている、配列番号１３８に従うアミノ酸配列は、本明細書に関連して「ＣＴ４５－ＩＰ変異型配列」と称される。特に、１つの位置はアラニンに置換される（配列番号１３９～１４５）。ＣＴ４５－ＩＰ変異型配列を有するペプチドは、本明細書では、ＣＴ４５－ＩＰ変異型ペプチドとも称される。１つの実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、減少した機能的なアビディティ、特に、配列番号１３８の３、４、５、６および７位の内の少なくとも１つがアラニンに置換されているＣＴ４５－ＩＰ変異型ペプチドに対する細胞傷害性アッセイ、より具体的には上記されているルシフェラーゼ放出アッセイにおける減少した細胞傷害活性、特に、ＣＴ４５－ＩＰについての機能的なアビディティと比較して７０％より大きく、８０％より大きく、９０％より大きくまたは９５％より大きく減少した機能的なアビディティを示す。
【0121】
本発明の抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドについての高い特異性、特に、類似の、好ましくは同一の実験条件下で測定された場合に参照タンパク質と比較して増加した特異性を有する。本発明者らは、実施例２において、本発明の抗原結合タンパク質は、標的抗原、即ちＭＨＣタンパク質との複合体中のＣＴ４５抗原ペプチドと高い特異性と共に結合することを実証している。
【0122】
本発明者らは、例えば、ＣＴ４５－ＩＰの配列および／またはモチーフに類似しており、そのため、ＣＴ４５－ＩＰに抗原結合タンパク質が結合するリスクが増加する、潜在的なオフターゲットペプチドを同定した。
【0123】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。
【0124】
好ましい実施形態では、ＶＡおよびＶＢは、ＴＣＲ可変ドメイン、特に、ＴＣＲアルファ、ベータ、ガンマまたはデルタ可変ドメインである。いくつかの実施形態では、ＶＡは、ＴＣＲアルファ、ガンマまたはデルタ可変ドメインであり、かつＶＢは、ＴＣＲベータ、ガンマまたはデルタ可変ドメインである。好ましくは、ＶＡはＴＣＲアルファ可変ドメインであり、かつＶＢはＴＣＲベータ可変ドメインであるか、またはＶＡはＴＣＲガンマ可変ドメインであり、かつＶＢはＴＣＲデルタ可変ドメインであるか、またはＶＡはＴＣＲアルファ可変ドメインであり、かつＶＢはＴＣＲガンマ可変ドメインであるか、またはＶＡはＴＣＲデルタ可変ドメインであり、かつＶＢはＴＣＲベータ可変ドメインである。好ましい実施形態では、ＶＡはＴＣＲアルファ可変ドメインであり、かつＶＢはＴＣＲベータ可変ドメインである。いくつかの実施形態では、ＶＡは、ＴＣＲアルファ可変ドメインに由来するＣＤＲ１およびＣＤＲ３および適宜ＣＤＲ２を含むＴＣＲガンマ可変ドメインであり、かつ／またはＶＢは、ＴＣＲベータ可変ドメインに由来するＣＤＲ１およびＣＤＲ３および適宜ＣＤＲ２を含むＴＣＲデルタ可変ドメインである。
【0125】
好ましくは、ＶＡ内で、
１）ＦＲ１－ａは、配列番号５３９、５５４もしくは５６９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号５９９もしくは６１４を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６２９を含むか、もしくはからなり；または
２）ＦＲ１－ａは、配列番号５４０、５５５もしくは５７０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６００もしくは６１５を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３０を含むか、もしくはからなり；または
３）ＦＲ１－ａは、配列番号５４１、５５６もしくは５７１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０１もしくは６１６を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３１を含むか、もしくはからなり；または
４）ＦＲ１－ａは、配列番号５４２、５５７もしくは５７２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０２もしくは６１７を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３２を含むか、もしくはからなり；または
５）ＦＲ１－ａは、配列番号５４３、５５８もしくは５７３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０３もしくは６１８を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３３を含むか、もしくはからなり；または
６）ＦＲ１－ａは、配列番号５４４、５５９、もしくは５７４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０４もしくは６１９を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３４を含むか、もしくはからなり；または
７）ＦＲ１－ａは、配列番号５４５、５６０もしくは５７５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０５もしくは６２０を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３５を含むか、もしくはからなり；または
８）ＦＲ１－ａは、配列番号５４６、５６１もしくは５７６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０６もしくは６２１を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３６を含むか、もしくはからなり；または
９）ＦＲ１－ａは、配列番号５４７、５６２もしくは５７７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０７もしくは６２２を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３７を含むか、もしくはからなり；または
１０）ＦＲ１－ａは、配列番号５４８、５６３もしくは５７８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０８もしくは６２３を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ１－ａは、配列番号５４９、５６４、もしくは５７９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０９もしくは６２４を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３９を含むか、もしくはからなり；または
１２）ＦＲ１－ａは、配列番号５５０、５６５もしくは５８０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１０もしくは６２５を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４０を含むか、もしくはからなり；または
１３）ＦＲ１－ａは、配列番号５５１、５６６もしくは５８１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１１もしくは６２６を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４１を含むか、もしくはからなり；または
１４）ＦＲ１－ａは、配列番号５５２、５６７もしくは５８２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１２もしくは６２７を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ１－ａは、配列番号５５３、５６８もしくは５８３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１３もしくは６２８を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４３を含むか、もしくはからなり；かつ
ＶＢ内で、
１）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４４もしくは６５９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７４もしくは６８９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０４もしくは７１９を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３４を含むか、もしくはからなり；または
２）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４５もしくは６６０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７５もしくは６９０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０５もしくは７２０を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３５を含むか、もしくはからなり；または
３）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４６もしくは６６１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７６もしくは６９１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０６もしくは７２１を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３６を含むか、もしくはからなり；または
４）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４７もしくは６６２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７７もしくは６９２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０７もしくは７２２を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３７を含むか、もしくはからなり；または
５）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４８もしくは６６３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７８もしくは６９３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０８もしくは７２３を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３８を含むか、もしくはからなり；または
６）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４９もしくは６６４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７９もしくは６９４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０９もしくは７２４を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３９を含むか、もしくはからなり；または
７）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５０もしくは６６５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８０もしくは６９５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１０もしくは７２５を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４０を含むか、もしくはからなり；または
８）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５１もしくは６６６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８１もしくは６９６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１１もしくは７２６を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４１を含むか、もしくはからなり；または
９）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５２もしくは６６７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８２もしくは６９７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１２もしくは７２７を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４２を含むか、もしくはからなり；または
１０）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５３もしくは６６８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８３もしくは６９８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１３もしくは７２８を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４３を含むか、もしくはからなり；または
１１）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５４もしくは６６９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８４もしくは６９９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１４もしくは７２９を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４４を含むか、もしくはからなり；または
１２）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５５もしくは６７０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８５もしくは７００を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１５もしくは７３０を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４５を含むか、もしくはからなり；または
１３）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５６もしくは６７１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８６もしくは７０１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１６もしくは７３１を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４６を含むか、もしくはからなり；または
１４）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５７もしくは６７２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８７もしくは７０２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１７もしくは７３２を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４７を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５８もしくは６７３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８８もしくは７０３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１８もしくは７３３を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４８を含むか、もしくはからなり、
ＦＲ１－ａ、ＦＲ２－ａ、ＦＲ３－ａ、ＦＲ４－ａ、ＦＲ１－ｂ、ＦＲ２－ｂ、ＦＲ３－ｂおよびＦＲ４－ｂのそれぞれは、８、７、６、５、４、３、２または１個のアミノ酸突然変異を適宜含んでもよい。
１）ＦＲ１－ａは、配列番号５３９、５５４もしくは５６９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号５９９もしくは６１４を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６２９を含むか、もしくはからなり；または
２）ＦＲ１－ａは、配列番号５４０、５５５もしくは５７０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６００もしくは６１５を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３０を含むか、もしくはからなり；または
３）ＦＲ１－ａは、配列番号５４１、５５６もしくは５７１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０１もしくは６１６を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３１を含むか、もしくはからなり；または
４）ＦＲ１－ａは、配列番号５４２、５５７もしくは５７２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０２もしくは６１７を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３２を含むか、もしくはからなり；または
５）ＦＲ１－ａは、配列番号５４３、５５８もしくは５７３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０３もしくは６１８を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３３を含むか、もしくはからなり；または
６）ＦＲ１－ａは、配列番号５４４、５５９、もしくは５７４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５８９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０４もしくは６１９を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３４を含むか、もしくはからなり；または
７）ＦＲ１－ａは、配列番号５４５、５６０もしくは５７５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０５もしくは６２０を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３５を含むか、もしくはからなり；または
８）ＦＲ１－ａは、配列番号５４６、５６１もしくは５７６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０６もしくは６２１を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３６を含むか、もしくはからなり；または
９）ＦＲ１－ａは、配列番号５４７、５６２もしくは５７７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０７もしくは６２２を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３７を含むか、もしくはからなり；または
１０）ＦＲ１－ａは、配列番号５４８、５６３もしくは５７８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０８もしくは６２３を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ１－ａは、配列番号５４９、５６４、もしくは５７９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６０９もしくは６２４を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６３９を含むか、もしくはからなり；または
１２）ＦＲ１－ａは、配列番号５５０、５６５もしくは５８０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１０もしくは６２５を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４０を含むか、もしくはからなり；または
１３）ＦＲ１－ａは、配列番号５５１、５６６もしくは５８１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１１もしくは６２６を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４１を含むか、もしくはからなり；または
１４）ＦＲ１－ａは、配列番号５５２、５６７もしくは５８２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１２もしくは６２７を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ１－ａは、配列番号５５３、５６８もしくは５８３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ａは、配列番号５９８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ａは、配列番号６１３もしくは６２８を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ａは、配列番号６４３を含むか、もしくはからなり；かつ
ＶＢ内で、
１）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４４もしくは６５９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７４もしくは６８９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０４もしくは７１９を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３４を含むか、もしくはからなり；または
２）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４５もしくは６６０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７５もしくは６９０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０５もしくは７２０を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３５を含むか、もしくはからなり；または
３）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４６もしくは６６１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７６もしくは６９１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０６もしくは７２１を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３６を含むか、もしくはからなり；または
４）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４７もしくは６６２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７７もしくは６９２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０７もしくは７２２を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３７を含むか、もしくはからなり；または
５）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４８もしくは６６３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７８もしくは６９３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０８もしくは７２３を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３８を含むか、もしくはからなり；または
６）ＦＲ１－ｂは、配列番号６４９もしくは６６４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６７９もしくは６９４を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７０９もしくは７２４を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７３９を含むか、もしくはからなり；または
７）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５０もしくは６６５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８０もしくは６９５を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１０もしくは７２５を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４０を含むか、もしくはからなり；または
８）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５１もしくは６６６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８１もしくは６９６を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１１もしくは７２６を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４１を含むか、もしくはからなり；または
９）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５２もしくは６６７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８２もしくは６９７を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１２もしくは７２７を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４２を含むか、もしくはからなり；または
１０）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５３もしくは６６８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８３もしくは６９８を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１３もしくは７２８を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４３を含むか、もしくはからなり；または
１１）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５４もしくは６６９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８４もしくは６９９を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１４もしくは７２９を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４４を含むか、もしくはからなり；または
１２）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５５もしくは６７０を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８５もしくは７００を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１５もしくは７３０を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４５を含むか、もしくはからなり；または
１３）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５６もしくは６７１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８６もしくは７０１を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１６もしくは７３１を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４６を含むか、もしくはからなり；または
１４）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５７もしくは６７２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８７もしくは７０２を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１７もしくは７３２を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４７を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ１－ｂは、配列番号６５８もしくは６７３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ２－ｂは、配列番号６８８もしくは７０３を含むか、もしくはからなり；
ＦＲ３－ｂは、配列番号７１８もしくは７３３を含むか、もしくはからなり；かつ／もしくは
ＦＲ４－ｂは、配列番号７４８を含むか、もしくはからなり、
ＦＲ１－ａ、ＦＲ２－ａ、ＦＲ３－ａ、ＦＲ４－ａ、ＦＲ１－ｂ、ＦＲ２－ｂ、ＦＲ３－ｂおよびＦＲ４－ｂのそれぞれは、８、７、６、５、４、３、２または１個のアミノ酸突然変異を適宜含んでもよい。
【0126】
いくつかの実施形態では、好ましくは、
１）ＦＲ１－ａは、配列番号５３９を含むか、もしくはからなり；
２）ＦＲ１－ａは、配列番号５４０を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ１－ａは、配列番号５４１を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ１－ａは、配列番号５４２を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ１－ａは、配列番号５４３を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ１－ａは、配列番号５４４を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ１－ａは、配列番号５４５を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ１－ａは、配列番号５４６を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ１－ａは、配列番号５４７を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ１－ａは、配列番号５４８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ１－ａは、配列番号５４９を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ１－ａは、配列番号５５０を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ１－ａは、配列番号５５１を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ１－ａは、配列番号５５２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ１－ａは、配列番号５５３を含むか、もしくはからなり、
ＦＲ１－ａ、ＦＲ２－ａ、ＦＲ３－ａおよびＦＲ４－ａのそれぞれは、８、７、６、５、４、３、２または１個のアミノ酸突然変異を適宜含んでもよい。
１）ＦＲ１－ａは、配列番号５３９を含むか、もしくはからなり；
２）ＦＲ１－ａは、配列番号５４０を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ１－ａは、配列番号５４１を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ１－ａは、配列番号５４２を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ１－ａは、配列番号５４３を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ１－ａは、配列番号５４４を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ１－ａは、配列番号５４５を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ１－ａは、配列番号５４６を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ１－ａは、配列番号５４７を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ１－ａは、配列番号５４８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ１－ａは、配列番号５４９を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ１－ａは、配列番号５５０を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ１－ａは、配列番号５５１を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ１－ａは、配列番号５５２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ１－ａは、配列番号５５３を含むか、もしくはからなり、
ＦＲ１－ａ、ＦＲ２－ａ、ＦＲ３－ａおよびＦＲ４－ａのそれぞれは、８、７、６、５、４、３、２または１個のアミノ酸突然変異を適宜含んでもよい。
【0127】
いくつかの実施形態では、好ましくは、
１）ＦＲ３－ａは、配列番号５９９の１０位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号５９９を含むか、もしくはからなり；
２）ＦＲ３－ａは、配列番号６００の１１位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６００を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ３－ａは、配列番号６０１の５位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０１を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ３－ａは、配列番号６０２の１２位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０２を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ３－ａは、配列番号６０３の２２位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０３を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ３－ａは、配列番号６０４の２５位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０４を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ３－ａは、配列番号６０５の２１位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０５を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ３－ａは、配列番号６０６の１８位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０６を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ３－ａは、配列番号６０７の２４位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０７を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ３－ａは、配列番号６０８の２１位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ３－ａは、配列番号６０９の７位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０９を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ３－ａは、配列番号６１０の３０位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１０を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ３－ａは、配列番号６１１の１８位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１１を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ３－ａは、配列番号６１２の１９位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ３－ａは、配列番号６１３の２３位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１３を含むか、もしくはからなる。
１）ＦＲ３－ａは、配列番号５９９の１０位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号５９９を含むか、もしくはからなり；
２）ＦＲ３－ａは、配列番号６００の１１位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６００を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ３－ａは、配列番号６０１の５位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０１を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ３－ａは、配列番号６０２の１２位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０２を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ３－ａは、配列番号６０３の２２位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０３を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ３－ａは、配列番号６０４の２５位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０４を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ３－ａは、配列番号６０５の２１位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０５を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ３－ａは、配列番号６０６の１８位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０６を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ３－ａは、配列番号６０７の２４位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０７を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ３－ａは、配列番号６０８の２１位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ３－ａは、配列番号６０９の７位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６０９を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ３－ａは、配列番号６１０の３０位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１０を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ３－ａは、配列番号６１１の１８位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１１を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ３－ａは、配列番号６１２の１９位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ３－ａは、配列番号６１３の２３位の外側に８、７、６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６１３を含むか、もしくはからなる。
【0128】
いくつかの実施形態では、好ましくは、
１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７４を含むか、もしくはからなり；
２）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７５を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７６を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７７を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７８を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７９を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８０を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８１を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８２を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８３を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８４を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８５を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８６を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８７を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８８を含むか、もしくはからなり、
ＦＲ１－ｂ、ＦＲ２－ｂ、ＦＲ３－ｂおよびＦＲ４－ｂのそれぞれは、６、５、４、３、２または１個のアミノ酸突然変異を適宜含んでもよい。
１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７４を含むか、もしくはからなり；
２）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７５を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７６を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７７を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７８を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ２－ｂは、配列番号６７９を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８０を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８１を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８２を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８３を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８４を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８５を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８６を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８７を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８８を含むか、もしくはからなり、
ＦＲ１－ｂ、ＦＲ２－ｂ、ＦＲ３－ｂおよびＦＲ４－ｂのそれぞれは、６、５、４、３、２または１個のアミノ酸突然変異を適宜含んでもよい。
【0129】
いくつかの実施形態では、好ましくは、
１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８９の１６位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６８９を含むか、もしくはからなり；または
２）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９０の１７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９０を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９１の５位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９１を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９２の１５位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９２を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９３の７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９３を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９４の１３位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９４を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９５の１１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９５を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９６の１１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９６を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９７の１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９７を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９８の１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９９の１６位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９９を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ２－ｂは、配列番号７００の７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７００を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ２－ｂは、配列番号７０１の１１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７０１を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ２－ｂは、配列番号７０２の１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７０２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ２－ｂは、配列番号７０３の７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７０３を含むか、もしくはからなる。
１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６８９の１６位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６８９を含むか、もしくはからなり；または
２）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９０の１７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９０を含むか、もしくはからなり；
３）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９１の５位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９１を含むか、もしくはからなり；
４）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９２の１５位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９２を含むか、もしくはからなり；
５）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９３の７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９３を含むか、もしくはからなり；
６）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９４の１３位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９４を含むか、もしくはからなり；
７）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９５の１１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９５を含むか、もしくはからなり；
８）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９６の１１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９６を含むか、もしくはからなり；
９）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９７の１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９７を含むか、もしくはからなり；
１０）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９８の１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９８を含むか、もしくはからなり；
１１）ＦＲ２－ｂは、配列番号６９９の１６位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号６９９を含むか、もしくはからなり；
１２）ＦＲ２－ｂは、配列番号７００の７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７００を含むか、もしくはからなり；
１３）ＦＲ２－ｂは、配列番号７０１の１１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７０１を含むか、もしくはからなり；
１４）ＦＲ２－ｂは、配列番号７０２の１位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７０２を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＦＲ２－ｂは、配列番号７０３の７位の外側に６、５、４、３、２もしくは１個のアミノ酸突然変異を適宜含む、配列番号７０３を含むか、もしくはからなる。
【0130】
好ましい実施形態では、
１）ＶＡは、配列番号１８９、もしくは配列番号１８９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１４を含むＣＤＲａ１、配列番号４８９を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３３９、もしくは配列番号３３９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１９を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０４を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号２０を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
２）ＶＡは、配列番号１９０、もしくは配列番号１９０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号４９０を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４０、もしくは配列番号３４０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０５を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号７６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
３）ＶＡは、配列番号１９１、もしくは配列番号１９１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号４９１を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４１、もしくは配列番号３４１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号６６を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０６を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号６７を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
４）ＶＡは、配列番号１９２、もしくは配列番号１９２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号９０を含むＣＤＲａ１、配列番号４９２を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号９１を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４２、もしくは配列番号３４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号６６を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０７を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号９５を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
５）ＶＡは、配列番号１９３、もしくは配列番号１９３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２を含むＣＤＲａ１、配列番号４９３を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号３を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４３、もしくは配列番号３４３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０８を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
６）ＶＡは、配列番号１９４、もしくは配列番号１９４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号５３を含むＣＤＲａ１、配列番号４９４を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号５４を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４４、もしくは配列番号３４４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号５８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０９を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号５９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
７）ＶＡは、配列番号１９５、もしくは配列番号１９５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７１を含むＣＤＲａ１、配列番号４９５を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４５、もしくは配列番号３４５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１０を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号７６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
８）ＶＡは、配列番号１９６、もしくは配列番号１９６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号９９を含むＣＤＲａ１、配列番号４９６を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１００を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４６、もしくは配列番号３４６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１１を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号７６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
９）ＶＡは、配列番号１９７、もしくは配列番号１９７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号８０を含むＣＤＲａ１、配列番号４９７を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号８１を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４７、もしくは配列番号３４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号８５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１２を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号８６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１０）ＶＡは、配列番号１９８、もしくは配列番号１９８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１０７を含むＣＤＲａ１、配列番号４９８を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１０８を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４８、もしくは配列番号３４８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１１２を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１３を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号１１３を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１１）ＶＡは、配列番号１９９、もしくは配列番号１９９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１２５を含むＣＤＲａ１、配列番号４９９を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１２６を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４９、もしくは配列番号３４９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１１２を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１４を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号１１３を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１２）ＶＡは、配列番号２００、もしくは配列番号２００に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１１７を含むＣＤＲａ１、配列番号５００を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１１８を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５０、もしくは配列番号３５０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号５８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１５を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号５９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１３）ＶＡは、配列番号２０１、もしくは配列番号２０１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号５０１を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５１、もしくは配列番号３５１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号３８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１６を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号３９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１４）ＶＡは、配列番号２０２、もしくは配列番号２０２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号５０２を含むＣＤＲａ３および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５２、もしくは配列番号３５２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２９を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１７を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号３０を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１５）ＶＡは、配列番号２０３、もしくは配列番号２０３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号４３を含むＣＤＲａ１、配列番号５０３を含むＣＤＲａ３および適宜、配列番号４４を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５３、もしくは配列番号３５３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号４８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１８を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号４９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含む。
１）ＶＡは、配列番号１８９、もしくは配列番号１８９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１４を含むＣＤＲａ１、配列番号４８９を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３３９、もしくは配列番号３３９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１９を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０４を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号２０を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
２）ＶＡは、配列番号１９０、もしくは配列番号１９０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号４９０を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４０、もしくは配列番号３４０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０５を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号７６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
３）ＶＡは、配列番号１９１、もしくは配列番号１９１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号４９１を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４１、もしくは配列番号３４１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号６６を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０６を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号６７を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
４）ＶＡは、配列番号１９２、もしくは配列番号１９２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号９０を含むＣＤＲａ１、配列番号４９２を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号９１を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４２、もしくは配列番号３４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号６６を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０７を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号９５を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
５）ＶＡは、配列番号１９３、もしくは配列番号１９３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２を含むＣＤＲａ１、配列番号４９３を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号３を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４３、もしくは配列番号３４３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０８を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
６）ＶＡは、配列番号１９４、もしくは配列番号１９４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号５３を含むＣＤＲａ１、配列番号４９４を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号５４を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４４、もしくは配列番号３４４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号５８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５０９を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号５９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
７）ＶＡは、配列番号１９５、もしくは配列番号１９５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７１を含むＣＤＲａ１、配列番号４９５を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４５、もしくは配列番号３４５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１０を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号７６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
８）ＶＡは、配列番号１９６、もしくは配列番号１９６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号９９を含むＣＤＲａ１、配列番号４９６を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１００を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４６、もしくは配列番号３４６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号７５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１１を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号７６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
９）ＶＡは、配列番号１９７、もしくは配列番号１９７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号８０を含むＣＤＲａ１、配列番号４９７を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号８１を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４７、もしくは配列番号３４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号８５を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１２を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号８６を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１０）ＶＡは、配列番号１９８、もしくは配列番号１９８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１０７を含むＣＤＲａ１、配列番号４９８を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１０８を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４８、もしくは配列番号３４８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１１２を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１３を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号１１３を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１１）ＶＡは、配列番号１９９、もしくは配列番号１９９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１２５を含むＣＤＲａ１、配列番号４９９を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１２６を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３４９、もしくは配列番号３４９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１１２を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１４を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号１１３を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１２）ＶＡは、配列番号２００、もしくは配列番号２００に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号１１７を含むＣＤＲａ１、配列番号５００を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号１１８を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５０、もしくは配列番号３５０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号５８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１５を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号５９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１３）ＶＡは、配列番号２０１、もしくは配列番号２０１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号５０１を含むＣＤＲａ３、および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５１、もしくは配列番号３５１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号３８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１６を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号３９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１４）ＶＡは、配列番号２０２、もしくは配列番号２０２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２４を含むＣＤＲａ１、配列番号５０２を含むＣＤＲａ３および適宜、配列番号２５を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５２、もしくは配列番号３５２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号２９を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１７を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号３０を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含み、または
１５）ＶＡは、配列番号２０３、もしくは配列番号２０３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号４３を含むＣＤＲａ１、配列番号５０３を含むＣＤＲａ３および適宜、配列番号４４を含むＣＤＲａ２を含むアミノ酸配列を含み；かつＶＢは、配列番号３５３、もしくは配列番号３５３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ配列番号４８を含むＣＤＲｂ１、配列番号５１８を含むＣＤＲｂ３および適宜、配列番号４９を含むＣＤＲｂ２を含むアミノ酸配列を含む。
【0131】
好ましい実施形態では、
１）ＶＡは、配列番号１８９、２４９、２６４もしくは２７９を含み；かつＶＢは、配列番号３３９、３９９、４１４もしくは４２９を含み、または
２）ＶＡは、配列番号１９０、２５０、２６５もしくは２８０を含み；かつＶＢは、配列番号３４０、４００、４１５もしくは４３０を含み、または
３）ＶＡは、配列番号１９１、２５１、２６６もしくは２８１を含み；かつＶＢは、配列番号３４１、４０１、４１６もしくは４３１を含み、または
４）ＶＡは、配列番号１９２、２５２、２６７もしくは２８２を含み；かつＶＢは、配列番号３４２、４０２、４１７もしくは４３２を含み、または
５）ＶＡは、配列番号１９３、２５３、２６８もしくは２８３を含み；かつＶＢは、配列番号３４３、４０３、４１８もしくは４３３を含み、または
６）ＶＡは、配列番号１９４、２５４、２６９もしくは２８４を含み；かつＶＢは、配列番号３４４、４０４、４１９もしくは４３４を含み、または
７）ＶＡは、配列番号１９５、２５５、２７０もしくは２８５を含み；かつＶＢは、配列番号３４５、４０５、４２０もしくは４３５を含み、または
８）ＶＡは、配列番号１９６、２５６、２７１もしくは２８６を含み；かつＶＢは、配列番号３４６、４０６、４２１もしくは４３６を含み、または
９）ＶＡは、配列番号１９７、２５７、２７２もしくは２８７を含み；かつＶＢは、配列番号３４７、４０７、４２２、もしくは４３７を含み、または
１０）ＶＡは、配列番号１９８、２５８、２７３もしくは２８８を含み；かつＶＢは、配列番号３４８、４０８、４２３もしくは４３８を含み、または
１１）ＶＡは、配列番号１９９、２５９、２７４もしくは２８９を含み；かつＶＢは、配列番号３４９、４０９、４２４もしくは４３９を含み、または
１２）ＶＡは、配列番号２００、２６０、２７５もしくは２９０を含み；かつＶＢは、配列番号３５０、４１０、４２５もしくは４４０を含み、または
１３）ＶＡは、配列番号２０１、２６１、２７６もしくは２９１を含み；かつＶＢは、配列番号３５１、４１１、４２６もしくは４４１を含み、または
１４）ＶＡは、配列番号２０２、２６２、２７７もしくは２９２を含み；かつＶＢは、配列番号３５２、４１２、４２７もしくは４４２を含み、または
１５）ＶＡは、配列番号２０３、２６３、２７８もしくは２９３を含み；かつＶＢは、配列番号３５３、４１３、４２８もしくは４４３を含む。
１）ＶＡは、配列番号１８９、２４９、２６４もしくは２７９を含み；かつＶＢは、配列番号３３９、３９９、４１４もしくは４２９を含み、または
２）ＶＡは、配列番号１９０、２５０、２６５もしくは２８０を含み；かつＶＢは、配列番号３４０、４００、４１５もしくは４３０を含み、または
３）ＶＡは、配列番号１９１、２５１、２６６もしくは２８１を含み；かつＶＢは、配列番号３４１、４０１、４１６もしくは４３１を含み、または
４）ＶＡは、配列番号１９２、２５２、２６７もしくは２８２を含み；かつＶＢは、配列番号３４２、４０２、４１７もしくは４３２を含み、または
５）ＶＡは、配列番号１９３、２５３、２６８もしくは２８３を含み；かつＶＢは、配列番号３４３、４０３、４１８もしくは４３３を含み、または
６）ＶＡは、配列番号１９４、２５４、２６９もしくは２８４を含み；かつＶＢは、配列番号３４４、４０４、４１９もしくは４３４を含み、または
７）ＶＡは、配列番号１９５、２５５、２７０もしくは２８５を含み；かつＶＢは、配列番号３４５、４０５、４２０もしくは４３５を含み、または
８）ＶＡは、配列番号１９６、２５６、２７１もしくは２８６を含み；かつＶＢは、配列番号３４６、４０６、４２１もしくは４３６を含み、または
９）ＶＡは、配列番号１９７、２５７、２７２もしくは２８７を含み；かつＶＢは、配列番号３４７、４０７、４２２、もしくは４３７を含み、または
１０）ＶＡは、配列番号１９８、２５８、２７３もしくは２８８を含み；かつＶＢは、配列番号３４８、４０８、４２３もしくは４３８を含み、または
１１）ＶＡは、配列番号１９９、２５９、２７４もしくは２８９を含み；かつＶＢは、配列番号３４９、４０９、４２４もしくは４３９を含み、または
１２）ＶＡは、配列番号２００、２６０、２７５もしくは２９０を含み；かつＶＢは、配列番号３５０、４１０、４２５もしくは４４０を含み、または
１３）ＶＡは、配列番号２０１、２６１、２７６もしくは２９１を含み；かつＶＢは、配列番号３５１、４１１、４２６もしくは４４１を含み、または
１４）ＶＡは、配列番号２０２、２６２、２７７もしくは２９２を含み；かつＶＢは、配列番号３５２、４１２、４２７もしくは４４２を含み、または
１５）ＶＡは、配列番号２０３、２６３、２７８もしくは２９３を含み；かつＶＢは、配列番号３５３、４１３、４２８もしくは４４３を含む。
【0132】
いくつかの実施形態では、
１）ＶＡは配列番号１８９を含み；かつＶＢは配列番号４１４を含み、または
２）ＶＡは配列番号１９０を含み；かつＶＢは配列番号４１５を含み、または
３）ＶＡは配列番号１９１を含み；かつＶＢは配列番号４１６を含み、または
４）ＶＡは配列番号１９２を含み；かつＶＢは配列番号４１７を含み、または
５）ＶＡは配列番号１９３を含み；かつＶＢは配列番号４１８を含み、または
６）ＶＡは配列番号１９４を含み；かつＶＢは配列番号４１９を含み、または
７）ＶＡは配列番号１９５を含み；かつＶＢは配列番号４２０を含み、または
８）ＶＡは配列番号１９６を含み；かつＶＢは配列番号４２１を含み、または
９）ＶＡは配列番号１９７を含み；かつＶＢは配列番号４２２を含み、または
１０）ＶＡは配列番号１９８を含み；かつＶＢは配列番号４２３を含み、または
１１）ＶＡは配列番号１９９を含み；かつＶＢは配列番号４２４を含み、または
１２）ＶＡは配列番号２００を含み；かつＶＢは配列番号４２５を含み、または
１３）ＶＡは配列番号２０１を含み；かつＶＢは配列番号４２６を含み、または
１４）ＶＡは配列番号２０２を含み；かつＶＢは配列番号４２７を含み、または
１５）ＶＡは配列番号２０３を含み；かつＶＢは配列番号４２８を含む。
１）ＶＡは配列番号１８９を含み；かつＶＢは配列番号４１４を含み、または
２）ＶＡは配列番号１９０を含み；かつＶＢは配列番号４１５を含み、または
３）ＶＡは配列番号１９１を含み；かつＶＢは配列番号４１６を含み、または
４）ＶＡは配列番号１９２を含み；かつＶＢは配列番号４１７を含み、または
５）ＶＡは配列番号１９３を含み；かつＶＢは配列番号４１８を含み、または
６）ＶＡは配列番号１９４を含み；かつＶＢは配列番号４１９を含み、または
７）ＶＡは配列番号１９５を含み；かつＶＢは配列番号４２０を含み、または
８）ＶＡは配列番号１９６を含み；かつＶＢは配列番号４２１を含み、または
９）ＶＡは配列番号１９７を含み；かつＶＢは配列番号４２２を含み、または
１０）ＶＡは配列番号１９８を含み；かつＶＢは配列番号４２３を含み、または
１１）ＶＡは配列番号１９９を含み；かつＶＢは配列番号４２４を含み、または
１２）ＶＡは配列番号２００を含み；かつＶＢは配列番号４２５を含み、または
１３）ＶＡは配列番号２０１を含み；かつＶＢは配列番号４２６を含み、または
１４）ＶＡは配列番号２０２を含み；かつＶＢは配列番号４２７を含み、または
１５）ＶＡは配列番号２０３を含み；かつＶＢは配列番号４２８を含む。
【0133】
ＶＡは、好ましくは、配列番号１３、１３２、６２、８９、１、５２、７０、９８、７９、１０６、１２４、１１６、３４、２３、および４２からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１３、１３２、６２、８９、１、５２、７０、９８、７９、１０６、１２４、１１６、３４、２３、および４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３配列が、１、２もしくは３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなる。ＶＢは、好ましくは、配列番号１８、１３５、６５、９４、７、５７、７４、１０３、８４、１１１、１２９、１２１、３７、２８および４７からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１８、１３５、６５、９４、７、５７、７４、１０３、８４、１１１、１２９、１２１、３７、２８および４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３配列が、１、２もしくは３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなる。
【0134】
本発明の抗原結合タンパク質のアミノ酸配列、および対応するＤＮＡ配列において、それぞれ改変および変更を行ない得、それでも尚、望ましい特性を有する機能的な抗原結合タンパク質またはポリペプチドを得ることができる。
【0135】
好ましい実施形態では、
１）ＶＡは、配列番号１３のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１８のアミノ酸配列、もしくは配列番号１８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
２）ＶＡは、配列番号１３２のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１３５のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
３）ＶＡは、配列番号６２のアミノ酸配列、もしくは配列番号６２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号６５のアミノ酸配列、もしくは配列番号６５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
４）ＶＡは、配列番号８９のアミノ酸配列、もしくは配列番号８９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号９４のアミノ酸配列、もしくは配列番号９４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
５）ＶＡは、配列番号１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７のアミノ酸配列、もしくは配列番号７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
６）ＶＡは、配列番号５２のアミノ酸配列、もしくは配列番号５２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号５７のアミノ酸配列、もしくは配列番号５７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
７）ＶＡは、配列番号７０のアミノ酸配列、もしくは配列番号７０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７４のアミノ酸配列、もしくは配列番号７４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
８）ＶＡは、配列番号９８のアミノ酸配列、もしくは配列番号９８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１０３のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
９）ＶＡは、配列番号７９のアミノ酸配列、もしくは配列番号７９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号８４のアミノ酸配列、もしくは配列番号８４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１０）ＶＡは、配列番号１０６のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１１１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１１）ＶＡは、配列番号１２４のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２９のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１２）ＶＡは、配列番号１１６のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１３）ＶＡは、配列番号３４のアミノ酸配列、もしくは配列番号３４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７のアミノ酸配列、もしくは配列番号３７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１４）ＶＡは、配列番号２３のアミノ酸配列、もしくは配列番号２３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号２８のアミノ酸配列、もしくは配列番号２８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＶＡは、配列番号４２のアミノ酸配列、もしくは配列番号４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号４７のアミノ酸配列、もしくは配列番号４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＶＡおよびＶＢは、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。
１）ＶＡは、配列番号１３のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１８のアミノ酸配列、もしくは配列番号１８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
２）ＶＡは、配列番号１３２のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１３５のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
３）ＶＡは、配列番号６２のアミノ酸配列、もしくは配列番号６２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号６５のアミノ酸配列、もしくは配列番号６５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
４）ＶＡは、配列番号８９のアミノ酸配列、もしくは配列番号８９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号９４のアミノ酸配列、もしくは配列番号９４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
５）ＶＡは、配列番号１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７のアミノ酸配列、もしくは配列番号７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
６）ＶＡは、配列番号５２のアミノ酸配列、もしくは配列番号５２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号５７のアミノ酸配列、もしくは配列番号５７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
７）ＶＡは、配列番号７０のアミノ酸配列、もしくは配列番号７０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７４のアミノ酸配列、もしくは配列番号７４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
８）ＶＡは、配列番号９８のアミノ酸配列、もしくは配列番号９８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１０３のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
９）ＶＡは、配列番号７９のアミノ酸配列、もしくは配列番号７９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号８４のアミノ酸配列、もしくは配列番号８４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１０）ＶＡは、配列番号１０６のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１１１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１１）ＶＡは、配列番号１２４のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２９のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１２）ＶＡは、配列番号１１６のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１３）ＶＡは、配列番号３４のアミノ酸配列、もしくは配列番号３４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７のアミノ酸配列、もしくは配列番号３７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１４）ＶＡは、配列番号２３のアミノ酸配列、もしくは配列番号２３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号２８のアミノ酸配列、もしくは配列番号２８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＶＡは、配列番号４２のアミノ酸配列、もしくは配列番号４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号４７のアミノ酸配列、もしくは配列番号４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
ＶＡおよびＶＢは、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。
【0136】
好ましい実施形態では、
１）ＶＡは、配列番号１３、２０４、２１９もしくは２３４を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１８、３５４、３６９もしくは３８４を含むか、もしくはからなり、または
２）ＶＡは、配列番号１３２、２０５、２２０もしくは２３５を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１３５、３５５、３７０もしくは３８５を含むか、もしくはからなり、または
３）ＶＡは、配列番号６２、２０６、２２１もしくは２３６を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号６５、３５６、３７１もしくは３８６を含むか、もしくはからなり、または
４）ＶＡは、配列番号８９、２０７、２２２もしくは２３７を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号９４、３５７、３７２もしくは３８７を含むか、もしくはからなり、または
５）ＶＡは、配列番号１、２０８、２２３もしくは２３８を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号７、３５８、３７３もしくは３８８を含むか、もしくはからなり、または
６）ＶＡは、配列番号５２、２０９、２２４もしくは２３９を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号５７、３５９、３７４もしくは３８９を含むか、もしくはからなり、または
７）ＶＡは、配列番号７０、２１０、２２５もしくは２４０を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号７４、３６０、３７５もしくは３９０を含むか、もしくはからなり、または
８）ＶＡは、配列番号１９８、２１１、２２６もしくは２４１を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１０３、３６１、３７６もしくは３９１を含むか、もしくはからなり、または
９）ＶＡは、配列番号７９、２１２、２２７もしくは２４２を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号８４、３６２、３７７、もしくは３９２を含むか、もしくはからなり、または
１０）ＶＡは、配列番号１０６、２１３、２２８もしくは２４３を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１１１、３６３、３７８もしくは３９３を含むか、もしくはからなり、または
１１）ＶＡは、配列番号１２４、２１４、２２９もしくは２４４を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１２９、３６４、３７９もしくは３９４を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＶＡは、配列番号１１６、２１５、２３０もしくは２４５を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１２１、３６５、３８０もしくは３９５を含むか、もしくはからなり、または
１３）ＶＡは、配列番号３４、２１６、２３１もしくは２４６を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号３７、３６６、３８１もしくは３９６を含むか、もしくはからなり、または
１４）ＶＡは、配列番号２３、２１７、２３２もしくは２４７を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号２８、３６７、３８２もしくは３９７を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＶＡは、配列番号４２、２１８、２３３もしくは２４８を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号４７、３６８、３８３もしくは３９８を含むか、もしくはからなる。
１）ＶＡは、配列番号１３、２０４、２１９もしくは２３４を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１８、３５４、３６９もしくは３８４を含むか、もしくはからなり、または
２）ＶＡは、配列番号１３２、２０５、２２０もしくは２３５を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１３５、３５５、３７０もしくは３８５を含むか、もしくはからなり、または
３）ＶＡは、配列番号６２、２０６、２２１もしくは２３６を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号６５、３５６、３７１もしくは３８６を含むか、もしくはからなり、または
４）ＶＡは、配列番号８９、２０７、２２２もしくは２３７を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号９４、３５７、３７２もしくは３８７を含むか、もしくはからなり、または
５）ＶＡは、配列番号１、２０８、２２３もしくは２３８を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号７、３５８、３７３もしくは３８８を含むか、もしくはからなり、または
６）ＶＡは、配列番号５２、２０９、２２４もしくは２３９を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号５７、３５９、３７４もしくは３８９を含むか、もしくはからなり、または
７）ＶＡは、配列番号７０、２１０、２２５もしくは２４０を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号７４、３６０、３７５もしくは３９０を含むか、もしくはからなり、または
８）ＶＡは、配列番号１９８、２１１、２２６もしくは２４１を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１０３、３６１、３７６もしくは３９１を含むか、もしくはからなり、または
９）ＶＡは、配列番号７９、２１２、２２７もしくは２４２を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号８４、３６２、３７７、もしくは３９２を含むか、もしくはからなり、または
１０）ＶＡは、配列番号１０６、２１３、２２８もしくは２４３を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１１１、３６３、３７８もしくは３９３を含むか、もしくはからなり、または
１１）ＶＡは、配列番号１２４、２１４、２２９もしくは２４４を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１２９、３６４、３７９もしくは３９４を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＶＡは、配列番号１１６、２１５、２３０もしくは２４５を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号１２１、３６５、３８０もしくは３９５を含むか、もしくはからなり、または
１３）ＶＡは、配列番号３４、２１６、２３１もしくは２４６を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号３７、３６６、３８１もしくは３９６を含むか、もしくはからなり、または
１４）ＶＡは、配列番号２３、２１７、２３２もしくは２４７を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号２８、３６７、３８２もしくは３９７を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＶＡは、配列番号４２、２１８、２３３もしくは２４８を含むか、もしくはからなり；かつＶＢは、配列番号４７、３６８、３８３もしくは３９８を含むか、もしくはからなる。
【0137】
より好ましくは、
１）ＶＡは、配列番号１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
２）ＶＡは、配列番号１３２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
３）ＶＡは、配列番号６２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号６５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
４）ＶＡは、配列番号８９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号９４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
５）ＶＡは、配列番号１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
６）ＶＡは、配列番号５２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号５７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
７）ＶＡは、配列番号７０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
８）ＶＡは、配列番号９８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１０３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
９）ＶＡは、配列番号７９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号８４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１０）ＶＡは、配列番号１０６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１１１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１１）ＶＡは、配列番号１２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１２）ＶＡは、配列番号１１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１３）ＶＡは、配列番号３４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１４）ＶＡは、配列番号２３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号２８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＶＡは、配列番号４２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号４７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなる。
１）ＶＡは、配列番号１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
２）ＶＡは、配列番号１３２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
３）ＶＡは、配列番号６２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号６５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
４）ＶＡは、配列番号８９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号９４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
５）ＶＡは、配列番号１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
６）ＶＡは、配列番号５２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号５７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
７）ＶＡは、配列番号７０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号７４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
８）ＶＡは、配列番号９８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１０３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
９）ＶＡは、配列番号７９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号８４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１０）ＶＡは、配列番号１０６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１１１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１１）ＶＡは、配列番号１２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１２）ＶＡは、配列番号１１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号１２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１３）ＶＡは、配列番号３４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１４）ＶＡは、配列番号２３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号２８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；または
１５）ＶＡは、配列番号４２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号４７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなる。
【0138】
別の実施形態では、
１）ＶＡは、配列番号１３を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３６９を含むか、もしくはからなり、または
２）ＶＡは、配列番号１３２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７０を含むか、もしくはからなり、または
３）ＶＡは、配列番号６２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７１を含むか、もしくはからなり、または
４）ＶＡは、配列番号８９を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７２を含むか、もしくはからなり、または
５）ＶＡは、配列番号１を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７３を含むか、もしくはからなり、または
６）ＶＡは、配列番号５２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７４を含むか、もしくはからなり、または
７）ＶＡは、配列番号７０を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７５を含むか、もしくはからなり、または
８）ＶＡは、配列番号１９８を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７６を含むか、もしくはからなり、または
９）ＶＡは、配列番号７９を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７７を含むか、もしくはからなり、または
１０）ＶＡは、配列番号１０６を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７８を含むか、もしくはからなり、または
１１）ＶＡは、配列番号１２４を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７９を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＶＡは、配列番号１１６を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８０を含むか、もしくはからなり、または
１３）ＶＡは、配列番号３４を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８１を含むか、もしくはからなり、または
１４）ＶＡは、配列番号２３を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８２を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＶＡは、配列番号４２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８３を含むか、もしくはからなる。
１）ＶＡは、配列番号１３を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３６９を含むか、もしくはからなり、または
２）ＶＡは、配列番号１３２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７０を含むか、もしくはからなり、または
３）ＶＡは、配列番号６２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７１を含むか、もしくはからなり、または
４）ＶＡは、配列番号８９を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７２を含むか、もしくはからなり、または
５）ＶＡは、配列番号１を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７３を含むか、もしくはからなり、または
６）ＶＡは、配列番号５２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７４を含むか、もしくはからなり、または
７）ＶＡは、配列番号７０を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７５を含むか、もしくはからなり、または
８）ＶＡは、配列番号１９８を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７６を含むか、もしくはからなり、または
９）ＶＡは、配列番号７９を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７７を含むか、もしくはからなり、または
１０）ＶＡは、配列番号１０６を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７８を含むか、もしくはからなり、または
１１）ＶＡは、配列番号１２４を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３７９を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＶＡは、配列番号１１６を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８０を含むか、もしくはからなり、または
１３）ＶＡは、配列番号３４を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８１を含むか、もしくはからなり、または
１４）ＶＡは、配列番号２３を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８２を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＶＡは、配列番号４２を含むか、もしくはからなり、かつＶＢは、配列番号３８３を含むか、もしくはからなる。
【0139】
抗原結合タンパク質は、一価または多価、例えば四価、三価もしくは二価であってもよい。
【0140】
抗原結合タンパク質は、単一特異性または多重特異性、例えば四重特異性、三重特異性もしくは二重特異性である。
【0141】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、可溶性タンパク質である。
【0142】
本発明の抗原結合タンパク質では、第１および第２のポリペプチドは、単一のポリペプチド鎖に含まれ得る。そのような一本鎖コンストラクトは、例えば、一本鎖ＴＣＲ（ｓｃＴＣＲ）または一本鎖二重特異性抗原結合タンパク質、特に一本鎖二重特異性ＴＣＲ、もしくは一本鎖二重特異性ＴＣＲ－抗体分子であってもよい。
【0143】
第１および第２のポリペプチドは２つのポリペプチド鎖に含まれること、即ち、ＶＡは第１のポリペプチド鎖に含まれ、かつＶＢは第２のポリペプチド鎖に含まれることが好ましい。
【0144】
抗原結合タンパク質はＴＣＲであることが好ましい。ＴＣＲは、α／β ＴＣＲ、γ／δ ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ、膜結合型ＴＣＲ、可溶性ＴＣＲ、一価、二価もしくは多価ＴＣＲ、単一特異性、二重特異性もしくは多重特異性ＴＣＲ、ＴＣＲの機能的断片、ＴＣＲの機能的断片を含む融合タンパク質またはＴＣＲの機能的断片を含むキメラタンパク質からなる群から選択されてもよい。好ましい実施形態では、ＴＣＲは、α／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲ、好ましくはα／β ＴＣＲである。本発明に関連して、抗原結合タンパク質は好ましくはＴＣＲであると記載される場合は常に、これは、最も好ましくは、抗原結合タンパク質は、α／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲ、好ましくはα／β ＴＣＲであることをさらに含意する。１つの実施形態では、ＴＣＲ定常ドメイン配列は、任意の好適な種、例えば任意の哺乳動物、例えば、ヒト、ラット、サル、ウサギ、ロバ、またはマウス、好ましくはヒトまたはマウス、より好ましくはヒトに由来してもよい。１つの実施形態では、ＴＣＲは、αβ ＴＣＲであり、かつ配列番号５、７５０、７５１または１５６、好ましくは配列番号５、７５０または７５１のα鎖定常ドメイン（ＴＲＡＣ）配列、および配列番号１１、３２または１５７、好ましくは配列番号１１または３２のβ鎖定常ドメイン（ＴＲＢＣ１またはＴＲＢＣ２）配列を含む。
【0145】
好ましくは、第１のポリペプチドは、配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６および１５８～１７２からなる群から選択される、好ましくは配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７および４６からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６もしくは１５８～１７２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３配列が、１、２もしくは３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなり；かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８、１０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１および１７３～１８７からなる群から選択される、好ましくは配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８、１０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８、１０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１もしくは１７３～１８７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３配列が、１、２もしくは３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなる。
【0146】
より好ましくは、第１のポリペプチドは、配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６および１５８～１７２からなる群から選択される、好ましくは配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７および４６からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６、もしくは１５８～１７２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつアミノ酸突然変異を有しない本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなり；かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８ １０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１および１７３～１８７からなる群から選択される、好ましくは配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８ １０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３および５１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８ １０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１もしくは１７３～１８７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつアミノ酸突然変異を有しない本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなる。
【0147】
好ましい実施形態では、
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７のアミノ酸配列、もしくは配列番号１７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸配列、もしくは配列番号２２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３７のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４のアミノ酸配列、もしくは配列番号６４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６９のアミノ酸配列、もしくは配列番号６９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３のアミノ酸配列、もしくは配列番号９３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号９７のアミノ酸配列、もしくは配列番号９７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列、もしくは配列番号６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６のアミノ酸配列、もしくは配列番号５６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６１のアミノ酸配列、もしくは配列番号６１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３のアミノ酸配列、もしくは配列番号７３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号７８のアミノ酸配列、もしくは配列番号７８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１０５のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３のアミノ酸配列、もしくは配列番号８３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号８８のアミノ酸配列、もしくは配列番号８８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１１５のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２３のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６のアミノ酸配列、もしくは配列番号３６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４１のアミノ酸配列、もしくは配列番号４１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７のアミノ酸配列、もしくは配列番号２７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号３３のアミノ酸配列、もしくは配列番号３３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６のアミノ酸配列、もしくは配列番号４６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号５１のアミノ酸配列、もしくは配列番号５１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
第１および第２のポリペプチドは、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７のアミノ酸配列、もしくは配列番号１７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２のアミノ酸配列、もしくは配列番号２２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３７のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４のアミノ酸配列、もしくは配列番号６４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６９のアミノ酸配列、もしくは配列番号６９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３のアミノ酸配列、もしくは配列番号９３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号９７のアミノ酸配列、もしくは配列番号９７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６のアミノ酸配列、もしくは配列番号６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６のアミノ酸配列、もしくは配列番号５６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６１のアミノ酸配列、もしくは配列番号６１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３のアミノ酸配列、もしくは配列番号７３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号７８のアミノ酸配列、もしくは配列番号７８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１０５のアミノ酸配列、もしくは配列番号１０５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３のアミノ酸配列、もしくは配列番号８３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号８８のアミノ酸配列、もしくは配列番号８８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１１５のアミノ酸配列、もしくは配列番号１１５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３１のアミノ酸配列、もしくは配列番号１３１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２３のアミノ酸配列、もしくは配列番号１２３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６のアミノ酸配列、もしくは配列番号３６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４１のアミノ酸配列、もしくは配列番号４１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７のアミノ酸配列、もしくは配列番号２７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号３３のアミノ酸配列、もしくは配列番号３３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６のアミノ酸配列、もしくは配列番号４６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号５１のアミノ酸配列、もしくは配列番号５１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり；
第１および第２のポリペプチドは、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。
【0148】
好ましい実施形態では、
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７、２９４、３０９もしくは３２４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２、４４４、４５９もしくは４７４を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４、２９５、３１０もしくは３２５を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３７、４４５、４６０もしくは４７５を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４、２９６、３１１もしくは３２６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６９、４４６、４６１もしくは４７６を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３、２９７、３１２もしくは３２７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号９７、４４７、４６２もしくは４７７を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６、２９８、３１３もしくは３２８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２、４４８、４６３もしくは４７８を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６、２９９、３１４もしくは３２９を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６１、４４９、４６４もしくは４７９を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３、３００、３１５もしくは３３０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号７８、４５０、４６５もしくは４８０を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２、３０１、３１６もしくは３３１を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１０５、４５１、４６６もしくは４８１を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３、３０２、３１７もしくは３３２を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号８８、４５２、４６７もしくは４８２を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０、３０３、３１８もしくは３３３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１１５、４５３、４６８もしくは４８３を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８、３０４、３１９もしくは３３４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３１、４５４、４６９もしくは４８４を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０、３０５、３２０もしくは３３５を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２３、４５５、４７０もしくは４８５を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６、３０６、３２１もしくは３３６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４１、４５６、４７１もしくは４８６を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７、３０７、３２２もしくは３３７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号３３、４５７、４７２もしくは４８７を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６、３０８、３２３もしくは３３８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号５１、４５８、４７３もしくは４８８を含むか、もしくはからなる。
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７、２９４、３０９もしくは３２４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２、４４４、４５９もしくは４７４を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４、２９５、３１０もしくは３２５を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３７、４４５、４６０もしくは４７５を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４、２９６、３１１もしくは３２６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６９、４４６、４６１もしくは４７６を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３、２９７、３１２もしくは３２７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号９７、４４７、４６２もしくは４７７を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６、２９８、３１３もしくは３２８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２、４４８、４６３もしくは４７８を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６、２９９、３１４もしくは３２９を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６１、４４９、４６４もしくは４７９を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３、３００、３１５もしくは３３０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号７８、４５０、４６５もしくは４８０を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２、３０１、３１６もしくは３３１を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１０５、４５１、４６６もしくは４８１を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３、３０２、３１７もしくは３３２を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号８８、４５２、４６７もしくは４８２を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０、３０３、３１８もしくは３３３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１１５、４５３、４６８もしくは４８３を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８、３０４、３１９もしくは３３４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３１、４５４、４６９もしくは４８４を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０、３０５、３２０もしくは３３５を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２３、４５５、４７０もしくは４８５を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６、３０６、３２１もしくは３３６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４１、４５６、４７１もしくは４８６を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７、３０７、３２２もしくは３３７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号３３、４５７、４７２もしくは４８７を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６、３０８、３２３もしくは３３８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号５１、４５８、４７３もしくは４８８を含むか、もしくはからなる。
【0149】
より好ましくは、
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３７を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６９を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号９７を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６１を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号７８を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１０５を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号８８を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１１５を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３１を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２３を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４１を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号３３を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号５１を含むか、もしくはからなる。
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号２２を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３７を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６９を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号９７を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号６１を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号７８を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１０５を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号８８を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１１５を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１３１を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号１２３を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４１を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号３３を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号５１を含むか、もしくはからなる。
【0150】
他の実施形態では、
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４５９を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６０を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６１を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６２を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６３を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６４を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６５を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６６を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６７を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６８を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６９を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７０を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７１を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７２を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７３を含むか、もしくはからなる。
１）第１のポリペプチドは、配列番号１７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４５９を含むか、もしくはからなり；
２）第１のポリペプチドは、配列番号１３４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６０を含むか、もしくはからなり；
３）第１のポリペプチドは、配列番号６４を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６１を含むか、もしくはからなり；
４）第１のポリペプチドは、配列番号９３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６２を含むか、もしくはからなり；
５）第１のポリペプチドは、配列番号６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６３を含むか、もしくはからなり；
６）第１のポリペプチドは、配列番号５６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６４を含むか、もしくはからなり；
７）第１のポリペプチドは、配列番号７３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６５を含むか、もしくはからなり；
８）第１のポリペプチドは、配列番号１０２を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６６を含むか、もしくはからなり；
９）第１のポリペプチドは、配列番号８３を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６７を含むか、もしくはからなり；
１０）第１のポリペプチドは、配列番号１１０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６８を含むか、もしくはからなり；
１１）第１のポリペプチドは、配列番号１２８を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４６９を含むか、もしくはからなり；
１２）第１のポリペプチドは、配列番号１２０を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７０を含むか、もしくはからなり；
１３）第１のポリペプチドは、配列番号３６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７１を含むか、もしくはからなり；
１４）第１のポリペプチドは、配列番号２７を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７２を含むか、もしくはからなり；または
１５）第１のポリペプチドは、配列番号４６を含むか、もしくはからなり、かつ第２のポリペプチドは、配列番号４７３を含むか、もしくはからなる。
【0151】
いくつかの好ましい実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、例えば、発現および安定性を増加させ得る異種配列、好ましくはマウス配列の導入により操作されてもよい。同様に、当該技術分野で既知のさらなる安定化突然変異（例えば、国際公開第２０１８／１０４４０７号パンフレット、ＰＣＴ／ＥＰ２０１８／０６９１５１、国際公開第２０１１／０４４１８６号パンフレット、国際公開第２０１４／０１８８６３号パンフレット）、例えば、可変ドメインにおける望ましくないアミノ酸の置き換え、ならびに／または、例えばＴＣＲの定常ドメインの間の、ジスルフィド結合の導入、および不対システインの除去が導入されてもよい。
【0152】
特に、ＴＣＲ定常ドメイン配列を切断または置換により改変して、ＴＲＡＣのエクソン２のＣｙｓ４と、ＴＲＢＣ１またはＴＲＢＣ２のエクソン２のＣｙｓ２との間のネイティブなジスルフィド結合を欠失させ得る。アルファ鎖および／またはデルタ鎖の定常ドメイン配列をまた、ＴＲＡＣのＴｈｒ４８およびＴＲＢＣ１またはＴＲＢＣ２のＳｅｒ５７のシステイン残基の置換によっても改変し得、前記システインは、ＴＣＲのアルファ定常ドメインとベータ定常ドメインとの間にジスルフィド結合を形成する。ＴＲＢＣ１またはＴＲＢＣ２は、定常ドメインの７５位でのシステインからアラニンへの突然変異、および定常ドメインの８９位でのアスパラギンからアスパラギン酸への突然変異をさらに含み得る。定常ドメインは、さらにまたはあるいは、ネイティブＴＲＡＣおよび／またはＴＲＢＣ１／２配列に対するさらなる突然変異、置換、または欠失を含み得る。ＴＲＡＣおよびＴＲＢＣ１／２という用語は、天然の多型変異体（例えば、ＴＲＡＣの４位でのＮからＫへ）を包含する（Bragado et al Int Immunol. 1994 Feb;6(2):223-30）。
【0153】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、一価または多価、例えば四価、三価もしくは二価である。
【0154】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、二重特異性、特に二重特異性ＴＣＲ、二重特異性抗体または二重特異性ＴＣＲ－抗体分子である。抗原結合タンパク質が二重特異性「抗体」である場合、抗原結合部位の１つは、本発明の抗原結合タンパク質に関連して定義されているＴＣＲ由来ＣＤＲ１、ＣＤＲ３および適宜ＣＤＲ２配列を含み、他の抗原結合部位は全体が抗体由来であってもよいことを当業者は認識している。
【0155】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は可溶性タンパク質である。いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は可溶性ＴＣＲである。本明細書で使用される場合、「可溶性ＴＣＲ」という用語は、例えばジスルフィド結合により連結された、ＴＣＲ α鎖およびβ鎖の細胞外部分を含むが、ネイティブなタンパク質の膜貫通およびサイトゾルドメインを欠いた、ネイティブなＴＣＲのヘテロ二量体切断型変異体を指す。
【0156】
１つの実施形態では、抗原結合タンパク質はヒト起源であり、これは、ヒト遺伝子座から生成され、従ってヒト配列を含むとして理解される。
【0157】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、ヒト化、キメラ化および／またはマウス化されている。
【0158】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、下記：
（ｉ）１箇所または複数箇所のさらなる抗原結合部位；
（ｉｉ）細胞質シグナル伝達領域を含んでもよい膜貫通領域；
（ｉｉｉ）診断薬；
（ｉｖ）治療薬；
の内の１つまたは複数をさらに含む。
（ｉ）１箇所または複数箇所のさらなる抗原結合部位；
（ｉｉ）細胞質シグナル伝達領域を含んでもよい膜貫通領域；
（ｉｉｉ）診断薬；
（ｉｖ）治療薬；
の内の１つまたは複数をさらに含む。
【0159】
上記に列挙された成分（ｉ）～（ｖ）が、本発明の抗原結合タンパク質に融合したポリペプチドである場合には、この抗原結合タンパク質は、「ＴＣＲ融合タンパク質」とも称され得る。
【0160】
さらなる抗原結合部位は、存在する場合、それは、好ましくは、抗体由来である。
【0161】
代替的なドメイン、例えば、内因性の膜貫通領域の代わりに膜アンカードメインを有する、抗原結合タンパク質、特にＴＣＲが本発明により包含される。ＴＣＲの発現もしくは安定性および／または鎖対合を向上させるためにＴＣＲ可変ドメインまたは定常ドメイン中に点突然変異を有する抗原結合タンパク質、特にＴＣＲもまた包含される。
【0162】
本発明に関連する「膜貫通領域」は、例えば、ＴＣＲアルファまたはベータ膜貫通ドメインであり得る。
【0163】
「細胞質シグナル伝達領域」は、例えば、ＴＣＲアルファまたはベータ細胞内ドメインであり得る。
【0164】
「診断薬」は、本明細書では、検出可能な分子または物質（例えば、蛍光分子、放射性分子、またはシグナルを生じる（直接的または間接的）ことが当該技術分野で既知のあらゆる他の標識を指す。
【0165】
当該技術分野で既知の「蛍光分子」として、フルオレセインイソチオシアネート（ＦＩＴＣ）、フィコエリトリン（ＰＥ）、青色レーザーで使用されるフルオロフォア（例えば、ＰｅｒＣＰ、ＰＥ－Ｃｙ７、ＰＥ－Ｃｙ５、ＦＬ３、およびＡＰＣまたはＣｙ５、ＦＬ４）、赤色、紫色、またはＵＶレーザーで使用されるフルオロフォア（例えば、パシフィックブルー、パシフィックオレンジ）が挙げられる。
【0166】
「放射性分子」として、Ｉ１２３、Ｉ１２４、Ｉｎ１１１、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｔｃ９９等のシンチグラフィ研究用の放射性原子が挙げられるが、これらに限定されない。本発明の抗原結合タンパク質はまた、核磁気共鳴（ＮＭＲ）撮像（磁気共鳴撮像、ＭＲＩとしても既知である）用のスピン標識（例えば、ヨウ素－１２３、インジウム－１１１、フッ素－１９、炭素－１３、窒素－１５、酸素－１７、ガドリニウム、マンガン、または鉄）も含み得る。
【0167】
そのような診断薬は、抗原結合タンパク質に直接結合（即ち、物理的に連結）されていてもよいし、間接的に連結されていてもよい。
【0168】
「治療薬」は、本明細書では、治療効果を有する薬剤を指す。治療薬（ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ａｇｅｎｔ）および治療薬（ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｄｒｕｇ）という用語は、本明細書では互換的に使用される。一実施形態では、治療薬は、細胞傷害剤または放射性同位体等の成長阻害剤であり得る。
【0169】
「成長阻害剤」または「抗増殖剤」（これらは無関係に使用される得る）は、インビトロまたはインビボのいずれかで細胞（特に腫瘍細胞）の成長を阻害する化合物または組成物を指す。
【0170】
「細胞傷害剤」という用語は、本明細書で使用される場合、細胞の機能を阻害するかもしくは予防するおよび／または細胞の破壊を引き起こす物質を指す。「細胞傷害剤」という用語は、化学療法剤、酵素、抗生物質、および毒素（例えば、細菌、真菌、植物、または動物起源の低分子毒素または酵素活性毒素）（これらの断片および／または変異体を含む）、ならびに下記で開示する様々な抗腫瘍剤または抗癌剤を含むことが意図されている。いくつかの実施形態では、細胞毒製剤は、タキソイド、ビンカ、タキサン、メイタンシノイドもしくはメイタンシノイド類似体（例えば、ＤＭ１もしくはＤＭ４）、小薬、トマイマイシンもしくはピロロベンゾジアゼピン誘導体、クリプトフィシン誘導体、レプトマイシン誘導体、オーリスタチンもしくはドラスタチン類似体、プロドラッグ、トポイソメラーゼＩＩ阻害剤、ＤＮＡアルキル化剤、抗チューブリン剤、ＣＣ－１０６５、またはＣＣ－１０６５類似体である。
【0171】
「放射性同位体」という用語は、癌の処置に適した放射性同位体を含むことが意図されており、例えば、Ａｔ２１１、Ｂｉ２１２、Ｅｒ１６９、Ｉ１３１、Ｉ１２５、Ｙ９０、Ｉｎ１１１、Ｐ３２、Ｒｅ１８６、Ｒｅ１８８、Ｓｍ１５３、Ｓｒ８９、およびＬｕの放射性同位体を含むことが意図されている。そのような放射性同位体は、一般には、主にベータ線を放射する。一実施形態では、放射性同位体は、アルファ放射体同位体であり、より正確には、アルファ線を放射するトリウム２２７である。
【0172】
いくつかの実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、直接的に、または切断可能なもしくは切断不可能なリンカーを介して、少なくとも１種の成長阻害剤に共有結合している。そのような少なくとも１種の成長阻害剤が結合している抗原結合タンパク質はまた、コンジュゲートとも称され得る。切断可能なリンカーは、細胞内での抗原結合タンパク質からの細胞毒製剤または成長阻害剤の放出を促進する。例えば、酸不安定性リンカー、ペプチダーゼ感受性リンカー、エステラーゼ不安定性リンカー、光不安定性リンカー、またはジスルフィド含有リンカー（例えば、米国特許第５，２０８，０２０号を参照されたい）を使用し得る。このリンカーはまた、場合によっては、より良好な耐性をもたらす可能性がある「切断不可能なリンカー」（例えば、ＳＭＣＣリンカー）でもあり得る。
【0173】
そのようなコンジュゲート（例えば、免疫コンジュゲート）の調製は、国際公開第２００４／０９１６６８号パンフレット、またはHudecz, F., Methods Mol. Biol. 298: 209-223 (2005) and Kirin et al., Inorg Chem. 44(15): 5405-5415 (2005)（これらの内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）で説明されており、当業者は、そのような少なくとも１種の成長阻害剤が結合している本発明の抗原結合タンパク質の調製に転用し得る。
【0174】
あるいは、本発明の抗原結合タンパク質と、細胞傷害性ポリペプチドまたは増殖阻害性ポリペプチドとを含む融合タンパク質を、組換え技術またはペプチド合成により作製し得る。ＤＮＡの長さは、互いに隣接しているコンジュゲートの２つの部分をコードするそれぞれの領域を含んでもよいし、コンジュゲートの所望の特性を破壊しないリンカーペプチドをコードする領域により分離された、コンジュゲートの２つの部分をコードするそれぞれの領域を含んでもよい。
【0175】
本発明の抗原結合タンパク質をまた、プロドラッグ（例えば、ペプチジル化学療法剤、国際公開第８１／０１１４５号パンフレットを参照されたい）を活性抗癌剤（例えば、国際公開第８８／０７３７８号パンフレットおよび米国特許第４，９７５，２７８号明細書を参照されたい）に変換するプロドラッグ活性化酵素にポリペプチドをコンジュゲートさせることにより、依存性酵素媒介プロドラッグ療法でも使用し得る。
【0176】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のアミノ酸１、３および４位を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。いくつかの好ましい実施形態では、これらの抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のアミノ酸１、３、４および５位、または１、３、４および６位または１、３、４、５および６位または１、３、４、５、６および７位を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。
【0177】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のアミノ酸４、６および７位を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。いくつかの好ましい実施形態では、これらの抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のアミノ酸１、４、６および７位、または３、４、６および７位または１、３、４、６および７位を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。
【0178】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のアミノ酸５および７位を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。いくつかの好ましい実施形態では、これらの抗原結合タンパク質は、配列番号１３８のアミノ酸５、６および７位、または３、４、５、６および７位を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。
【0179】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群の類似ペプチドに有意に結合しない。
【0180】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群の類似ペプチドに有意に結合しない。
【0181】
本発明の抗原結合タンパク質のＶＡおよびＶＢに含まれるＶ領域およびＪ領域をコードする遺伝子を表２に列挙する。アノテーションは、参照データベースとしてＩＭＧＴ／ＧＥＮＥ－ＤＢ（バージョン：２８／１１／２０１９）を使用してＧｅｎｅＤａｔａ １１．０．１により行った。
【0182】
いくつかの実施形態では、ＶＡは、ＴＲＡＶ１４、特にＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号２４のＣＤＲａ１および配列番号２５のＣＤＲａ２を含む。
【0183】
いくつかの実施形態では、ＶＢは、ＴＲＢＶ１３によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号７５のＣＤＲｂ１および配列番号７６のＣＤＲｂ２を含む。
【0184】
いくつかの実施形態では、ＶＢは、ＴＲＢＶ４－１によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号５８のＣＤＲｂ１および配列番号５９のＣＤＲｂ２を含む。
【0185】
いくつかの実施形態では、ＶＢは、ＴＲＢＶ６－１によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号１１２のＣＤＲｂ１および配列番号１１３のＣＤＲｂ２を含む。
【0186】
本発明者らは、本発明の抗原結合タンパク質は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞中で発現された場合、抗原提示細胞によりＭＨＣ上に提示されたＣＴ４５－ＩＰへの結合で前記ＣＤ８＋ Ｔ細胞を活性化可能であることを示した。
【0187】
ＣＤ８＋ Ｔ細胞の他に、ヘルパーＴ細胞と称されるＣＤ４＋ Ｔ細胞もまた、全ての種類の異なる免疫細胞にエンゲージする協調的に指揮された免疫応答のために決定的である。そのコグネイトペプチド－ＭＨＣ複合体との遭遇後のＴ細胞の完全な活性化のために、それぞれの補助受容体の追加の結合が通常は必要である。ＣＤ８＋ Ｔ細胞の場合、この助けはＣＤ８補助受容体により提供され、ＣＤ４＋ Ｔ細胞の場合、この助けはＣＤ４補助受容体により提供される。希少な場合にのみ、ＣＤ８＋ Ｔ細胞に由来するＴＣＲは、ＣＤ４＋ Ｔ細胞に移入された場合に、ＣＤ４＋ Ｔ細胞の活性化をもたらすために十分に強い細胞内シグナル伝達を誘発することができる。
【0188】
本発明者らは、本発明の抗原結合タンパク質のいくつかは、ＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞中で発現された場合、抗原提示細胞によりＭＨＣ上に提示されたＣＴ４５－ＩＰへの結合で前記ＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能であることを示した（実施例３、データ示さず）。
【0189】
本発明に関連して、抗原結合タンパク質は、上記に定義されているサイトカイン産生アッセイにおいて、抗原結合タンパク質を発現するＴ細胞（即ち、エフェクター細胞）が、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを提示する標的細胞との共培養で少なくとも１つの細胞内サイトカインを産生する場合に、特に、抗原結合タンパク質を発現し、かつ少なくとも１つの細胞内サイトカインを産生するＴ細胞の数が、分析されたＴ細胞の集団、例えばＣＤ４＋またはＣＤ８＋ Ｔ細胞当たりで少なくとも２％、少なくとも２．５％、好ましくは少なくとも３％である場合に、「Ｔ細胞を活性化可能である」とみなされる。
【0190】
そのため、いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。換言すれば、抗原結合タンパク質、好ましくはＴＣＲは、ＣＤ８から独立してＣＤ４＋Ｔ細胞を活性化可能である。換言すれば、抗原結合タンパク質、好ましくはＴＣＲは、ＣＤ８の非存在下でＣＴ４５抗原ペプチドとＭＨＣ分子との複合体に結合可能である。最も好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞と、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞との両方を活性化可能である。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質はＴＣＲである。
【0191】
本発明に関連して、抗原結合タンパク質は、上記されている機能的サイトカイン産生アッセイにおいて、サイトカイン産生が、前記ＣＤ４＋またはＣＤ４－ ＣＤ８＋ Ｔ細胞集団の少なくとも２％、少なくとも２．５％、好ましくは少なくとも３％において検出される場合に、Ｔ細胞集団を活性化可能であるとみなされる。分泌されるサイトカインは例えばＩＦＮ－ガンマおよび／またはＴＮＦ－アルファであり得る。
【0192】
ＣＤ８＋ Ｔ細胞由来ＴＣＲを介するＣＤ４＋ Ｔ細胞の活性化は、ＣＤ８補助受容体をＴＣＲと共にＣＤ４＋細胞に移入することにより増強され得る。本発明者らは、本明細書に記載されるＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲおよびＣＤ８とのＣＤ４＋ Ｔ細胞の併用トランスフェクションは、ＣＴ４５－ＩＰ提示腫瘍細胞の殺滅を有意に増強することを示した（実施例８、データ示さず）。エンゲージするＣＤ４＋ Ｔ細胞は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞と並んで、細胞免疫療法のために多くの利点をもたらす。ＣＤ４＋ Ｔ細胞は、腫瘍細胞に対する直接的な細胞傷害性を誘発できるだけでなく、他の免疫細胞にエンゲージして、長期持続性の抗腫瘍効果に寄与することができる。このヘルパー機能は、サイトカイン、ケモカインおよび共刺激分子を提供することにより発揮され、細胞傷害性ＣＤ８＋ Ｔ細胞のサポート、エフェクターおよびメモリーＴ細胞の形成、マクロファージ／樹状細胞の活性化および成熟、樹状細胞のライセンシング（これは次いで有効にＣＤ８＋ Ｔ細胞を刺激してＣＤ８＋ Ｔ細胞エフェクターおよびメモリー形成を駆動する）、先天免疫細胞、例えばＮＫ細胞の活性化、メモリーＢ細胞の形成ならびに多くの他の効果を含む。
【0193】
いくつかの実施形態では、抗原結合タンパク質は、特に一過性発現後に、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、または少なくとも４０％の平均発現を有する。ＴＣＲの平均発現は、実施例に記載されているＴＣＲ表面染色により決定され得る。染色は、当該技術分野において既知の技術により行われ得る。例えば、染色は、特定のＶＢ抗体（ヒトＴＣＲの場合）、または抗ｍＴＣＲＢ抗体（キメラＴＣＲの場合）または標識されたＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ多量体（例えば四量体もしくはデキストラマー）を使用して行われ得る。そのような染色は、特定の細胞集団を同定するための染色とさらに組み合わせられてもよい。
【0194】
抗原結合タンパク質１
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１」とも称される。抗原結合タンパク質１の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１は、配列番号１３８の１、３、４、５、６および７位からなる群から選択される４、５または６箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満または約１０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１３のアミノ酸配列、または配列番号１３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１８のアミノ酸配列、または配列番号１８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３８－１によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ７－９によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１」とも称される。抗原結合タンパク質１の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１は、配列番号１３８の１、３、４、５、６および７位からなる群から選択される４、５または６箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満または約１０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１３のアミノ酸配列、または配列番号１３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１８のアミノ酸配列、または配列番号１８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３８－１によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ７－９によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0195】
抗原結合タンパク質２
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質２」とも称される。抗原結合タンパク質２の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質２は、配列番号１３８の３、４、５、６および７位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質２を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満または約５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質２は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質２の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１３２のアミノ酸配列、または配列番号１３２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１３５のアミノ酸配列、または配列番号１３５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質２について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質２のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質２のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１３によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質２は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質２」とも称される。抗原結合タンパク質２の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質２は、配列番号１３８の３、４、５、６および７位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質２を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満または約５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質２は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質２の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１３２のアミノ酸配列、または配列番号１３２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１３５のアミノ酸配列、または配列番号１３５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質２について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質２のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質２のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１３によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質２は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0196】
抗原結合タンパク質３
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質３」とも称される。抗原結合タンパク質３の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質３は、配列番号１３８の３、４、５、６および７位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質３を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満または約１．５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質３は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質３の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号６２のアミノ酸配列、または配列番号６２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号６５のアミノ酸配列、または配列番号６５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質３について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質３のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質３のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ２７によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質３は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質３」とも称される。抗原結合タンパク質３の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質３は、配列番号１３８の３、４、５、６および７位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質３を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満または約１．５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質３は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質３の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号６２のアミノ酸配列、または配列番号６２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号６５のアミノ酸配列、または配列番号６５に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質３について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質３のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質３のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ２７によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質３は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0197】
抗原結合タンパク質４
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質４」とも称される。抗原結合タンパク質４の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質４は、配列番号１３８の３、４、６、７および８位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質４を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満または約１．５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質４の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号８９のアミノ酸配列、または配列番号８９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号９４のアミノ酸配列、または配列番号９４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質４について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質４のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質４のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ６－２によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質４は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質４」とも称される。抗原結合タンパク質４の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質４は、配列番号１３８の３、４、６、７および８位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質４を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満または約１．５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質４の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号８９のアミノ酸配列、または配列番号８９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号９４のアミノ酸配列、または配列番号９４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質４について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質４のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質４のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ６－２によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質４は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0198】
抗原結合タンパク質５
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質５」とも称される。抗原結合タンパク質５の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質５は、配列番号１３８の３、６、７および８位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質５を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約２５ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質５は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質５の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１のアミノ酸配列、または配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号７のアミノ酸配列、または配列番号７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質５について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質５のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３５によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質５のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ９によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質５は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質５」とも称される。抗原結合タンパク質５の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質５は、配列番号１３８の３、６、７および８位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質５を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約２５ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質５は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質５の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１のアミノ酸配列、または配列番号１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号７のアミノ酸配列、または配列番号７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質５について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質５のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３５によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質５のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ９によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質５は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0199】
抗原結合タンパク質６
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質６」とも称される。抗原結合タンパク質６の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質６は、配列番号１３８の１、３、４および６位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質６を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満または約５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質６は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、より好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質６の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号５２のアミノ酸配列、または配列番号５２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号５７のアミノ酸配列、または配列番号５７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質６について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質６のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１２－３によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質６のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ４－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質６は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質６」とも称される。抗原結合タンパク質６の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質６は、配列番号１３８の１、３、４および６位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質６を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満または約５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質６は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、より好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質６の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号５２のアミノ酸配列、または配列番号５２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号５７のアミノ酸配列、または配列番号５７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質６について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質６のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１２－３によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質６のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ４－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質６は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0200】
抗原結合タンパク質７
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質７」とも称される。抗原結合タンパク質７の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質７は、配列番号１３８の１、４、６および７位からなる群から選択される３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質７を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質７は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質７の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号７０のアミノ酸配列、または配列番号７０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号７４のアミノ酸配列、または配列番号７４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質７について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質７のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３８－２／ＤＶ８によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質７のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１３によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質７は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質７」とも称される。抗原結合タンパク質７の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質７は、配列番号１３８の１、４、６および７位からなる群から選択される３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質７を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質７は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質７の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号７０のアミノ酸配列、または配列番号７０に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号７４のアミノ酸配列、または配列番号７４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質７について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質７のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ３８－２／ＤＶ８によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質７のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１３によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質７は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0201】
抗原結合タンパク質８
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質８」とも称される。抗原結合タンパク質８の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質８は、配列番号１３８の５および７位からなる群から選択される１または２箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質８を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、または約１０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質８は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質８の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号９８のアミノ酸配列、または配列番号９８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１０３のアミノ酸配列、または配列番号１０３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質８について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質８のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１９によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質８のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１３によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質８は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質８」とも称される。抗原結合タンパク質８の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質８は、配列番号１３８の５および７位からなる群から選択される１または２箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質８を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、または約１０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質８は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質８の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号９８のアミノ酸配列、または配列番号９８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１０３のアミノ酸配列、または配列番号１０３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質８について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質８のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１９によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質８のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１３によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質８は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0202】
抗原結合タンパク質９
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質９」とも称される。抗原結合タンパク質９の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質９は、配列番号１３８の１、３、４、５、６、７および８位からなる群から選択される５、６または７箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質９を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質９は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質９の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号７９のアミノ酸配列、または配列番号７９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号８４のアミノ酸配列、または配列番号８４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質９について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質９のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ５によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質９のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ２によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質９は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質９」とも称される。抗原結合タンパク質９の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質９は、配列番号１３８の１、３、４、５、６、７および８位からなる群から選択される５、６または７箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質９を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質９は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質９の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号７９のアミノ酸配列、または配列番号７９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号８４のアミノ酸配列、または配列番号８４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質９について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質９のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ５によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質９のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ２によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質９は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0203】
抗原結合タンパク質１０
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１０」とも称される。抗原結合タンパク質１０の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１０は、配列番号１３８の５、６および７位からなる群から選択される２または３箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１０を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満または約１０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１０は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１０の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１０６のアミノ酸配列、または配列番号１０６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１１１のアミノ酸配列、または配列番号１１１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１０について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１０のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１－２によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１０のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ６－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１０は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１０」とも称される。抗原結合タンパク質１０の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１０は、配列番号１３８の５、６および７位からなる群から選択される２または３箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１０を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満または約１０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１０は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１０の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１０６のアミノ酸配列、または配列番号１０６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１１１のアミノ酸配列、または配列番号１１１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１０について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１０のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１－２によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１０のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ６－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１０は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0204】
抗原結合タンパク質１１
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１１」とも称される。抗原結合タンパク質１１の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１１は、配列番号１３８の１、３、４、５、６および８位からなる群から選択される４、５または６箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１１を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約６０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１１は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１１の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１２４のアミノ酸配列、または配列番号１２４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１２９のアミノ酸配列、または配列番号１２９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１１について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１１のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ２２によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１１のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ６－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１１は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１１」とも称される。抗原結合タンパク質１１の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１１は、配列番号１３８の１、３、４、５、６および８位からなる群から選択される４、５または６箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１１を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約６０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１１は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１１の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１２４のアミノ酸配列、または配列番号１２４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１２９のアミノ酸配列、または配列番号１２９に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１１について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１１のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ２２によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１１のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ６－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１１は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0205】
抗原結合タンパク質１２
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１２」とも称される。抗原結合タンパク質１２の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１２は、配列番号１３８の３、４、６および７位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１２を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約６０ｎＭ未満、または約５０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１２は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１２の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１１６のアミノ酸配列、または配列番号１１６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１２１のアミノ酸配列、または配列番号１２１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１２について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１２のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ２７によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１２のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ４－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１２は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１２」とも称される。抗原結合タンパク質１２の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１２は、配列番号１３８の３、４、６および７位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１２を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約６０ｎＭ未満、または約５０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１２は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１２の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号１１６のアミノ酸配列、または配列番号１１６に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号１２１のアミノ酸配列、または配列番号１２１に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１２について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１２のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ２７によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１２のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ４－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１２は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0206】
抗原結合タンパク質１３
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１３」とも称される。抗原結合タンパク質１３の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１３は、配列番号１３８の１、３、４、６および７位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１３を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満または約１５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１３は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１３の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号３４のアミノ酸配列、または配列番号３４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号３７のアミノ酸配列、または配列番号３７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１３について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１３のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１３のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１９によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１３は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１３」とも称される。抗原結合タンパク質１３の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１３は、配列番号１３８の１、３、４、６および７位からなる群から選択される３、４または５箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１３を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満または約１５ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１３は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１３の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号３４のアミノ酸配列、または配列番号３４に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号３７のアミノ酸配列、または配列番号３７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１３について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１３のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１３のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１９によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１３は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0207】
抗原結合タンパク質１４
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１４」とも称される。抗原結合タンパク質１４の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１４は、配列番号１３８の１、３、４および５位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１４を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満または約２０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１４は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１４の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号２３のアミノ酸配列、または配列番号２３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号２８のアミノ酸配列、または配列番号２８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１４について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１４のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１４のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１１－２によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１４は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１４」とも称される。抗原結合タンパク質１４の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１４は、配列番号１３８の１、３、４および５位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１４を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満または約２０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１４は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１４の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号２３のアミノ酸配列、または配列番号２３に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号２８のアミノ酸配列、または配列番号２８に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１４について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１４のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１４のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ１１－２によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１４は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0208】
抗原結合タンパク質１５
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１５」とも称される。抗原結合タンパク質１５の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１５は、配列番号１３８の１、３、４、５、６および７位からなる群から選択される４、５または６箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１５を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満または約２０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１５は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１５の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号４２のアミノ酸配列、または配列番号４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号２７のアミノ酸配列、または配列番号２７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１５について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１５のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ２１によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１５のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ５－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１５は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
いくつかの実施形態では、本発明は、主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、抗原結合タンパク質に関する。前記ＣＤＲ配列を含む抗原結合タンパク質は以下において「抗原結合タンパク質１５」とも称される。抗原結合タンパク質１５の好ましい実施形態では、ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、またはからなり、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２配列は、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい。抗原結合タンパク質１５は、配列番号１３８の１、３、４、５、６および７位からなる群から選択される４、５または６箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する。例えばルシフェラーゼ放出アッセイにおいて測定される、抗原結合タンパク質１５を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞、例えばＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞の殺滅の誘導についてのＥＣ５０は、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満または約２０ｎＭ未満である。抗原結合タンパク質１５は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない。抗原結合タンパク質１５の好ましい実施形態では、ＶＡは、配列番号４２のアミノ酸配列、または配列番号４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつＶＢは、配列番号２７のアミノ酸配列、または配列番号２７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり；ＶＡおよびＶＢは、抗原結合タンパク質１５について上記されているＣＤＲ配列を含み、ＣＤＲ配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよく、好ましくはアミノ酸突然変異を含まない。好ましくは、抗原結合タンパク質１５のアルファ鎖可変領域はＴＲＡＶ２１によりコードされ、かつ／または抗原結合タンパク質１５のベータ鎖可変領域はＴＲＢＶ５－１によりコードされる。好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質１５は、ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－ Ｔ細胞、および／またはＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞を活性化可能である。
【0209】
本発明はまた、抗原結合タンパク質（特に、ＴＣＲ）を提示する粒子、および粒子のライブラリ内の前記粒子の包含も含む。そのような粒子として、ファージ、酵母、リボソーム、または哺乳動物細胞が挙げられるが、これらに限定されない。そのような粒子およびライブラリを製造する方法は、当該技術分野で既知である（例えば、国際公開第２００４／０４４００４号パンフレット；同第０１／４８１４５号パンフレット，Chervin et al. (2008) J. Immuno. Methods 339.2: 175-184を参照されたい）。
【0210】
核酸、ベクター、および組換え宿主細胞
本発明の抗原結合タンパク質のポリペプチドは、核酸によりコードされ、インビボ（ｉｎ ｖｉｖｏ）、エクスビボ（ｅｘ ｖｉｖｏ）またはインビトロ（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）で発現され得る。そのため、第２の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質をコードする１つまたは複数の配列を含むか、またはからなる１つまたは複数の核酸に関する。
本発明の抗原結合タンパク質のポリペプチドは、核酸によりコードされ、インビボ（ｉｎ ｖｉｖｏ）、エクスビボ（ｅｘ ｖｉｖｏ）またはインビトロ（ｉｎ ｖｉｔｒｏ）で発現され得る。そのため、第２の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質をコードする１つまたは複数の配列を含むか、またはからなる１つまたは複数の核酸に関する。
【0211】
核酸は、１つの核酸分子に含まれてもよく、または２つもしくはより多くの核酸分子に分離されてもよく、それぞれの核酸分子は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質をコードする１つまたは複数の配列の内の少なくとも１つを含む。いくつかの実施形態では、１つの核酸分子は、本発明の抗原結合タンパク質の１つの部分または単量体（例えば本発明のＴＣＲの２つの鎖の内の１つ）をコードし、かつ別の核酸分子は、本発明の抗原結合タンパク質の別の部分または単量体（例えばＴＣＲの２つの鎖の内の他方）をコードする。いくつかの実施形態では、核酸は、２つまたはより多くの抗原結合タンパク質ポリペプチド鎖、例えば、少なくとも２つのＴＣＲ鎖をコードする。複数の抗原結合タンパク質ポリペプチド鎖をコードする核酸は、少なくとも２つの鎖配列の間の核酸切断部位を含むことができ、転写もしくは翻訳開始部位、例えば２つもしくはより多くの鎖配列の間の内部リボソーム進入部位（ＩＲＥＳ）をコードすることができ、かつ／または２つもしくはより多くの抗原結合タンパク質鎖の間のタンパク質分解標的部位をコードすることができる。２つまたはより多くの抗原結合タンパク質ポリペプチド鎖が１つの核酸分子上にコードされる場合、２つまたはより多くの抗原結合タンパク質ポリペプチド鎖は、同じプロモーターの制御下または別々のプロモーターの制御下にあることができる。
【0212】
「核酸」という用語は、本発明に関連して、デオキシリボヌクレオチド、またはリボヌクレオチド塩基、または両方の一本鎖または二本鎖のオリゴマーまたはポリマーを指す。ヌクレオチド単量体は、核酸塩基、五炭糖（例えば、限定されないが、リボースまたは２’－デオキシリボース）、および１～３個のリン酸基で構成されている。典型的には、核酸は、個々のヌクレオチド単量体間のホスホジエステル結合により形成されている。本発明に関連して、核酸という用語は、リボ核酸（ＲＮＡ）分子およびデオキシリボ核酸（ＤＮＡ）分子を含むがこれらに限定されず、他の結合を含む核酸の合成形態も含む［例えば、Nielsen et al. (Science 254:1497-1500, 1991)で説明されているペプチド核酸］。典型的には、核酸は、一本鎖分子または二本鎖分子であり、天然に存在するヌクレオチドで構成されている。核酸の一本鎖の描写は、相補鎖の配列も（少なくとも部分的に）定義する。核酸は、一本鎖であってもよいし二本鎖であってもよいか、または二本鎖配列および一本鎖配列の両方の一部を含んでもよい。例示されている二本鎖核酸分子は、３’または５’オーバーハングを有し得、そのため、その全長にわたり完全な二本鎖である必要はないが、そうであると思われる。核酸という用語は、染色体または染色体セグメント、ベクター（例えば、発現ベクター）、発現カセット、裸のＤＮＡまたはＲＮＡポリマー、プライマー、プローブ、ｃＤＮＡ、ゲノムＤＮＡ、組換えＤＮＡ、ｃＲＮＡ、ｍＲＮＡ、ｔＲＮＡ、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、または低分子干渉ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）を含む。核酸は、例えば、一本鎖、二本鎖、または三本鎖であり得、任意の特定の長さに限定されない。別途示されない限り、特定の核酸配列は、明示的に示されている任意の配列に加えて、相補配列を含むか、またはコードする。
【0213】
好ましい実施形態では、核酸は、単離された核酸である。好ましい実施形態では、核酸は組換え核酸である。
【0214】
核酸は、細胞全体中に存在し得、細胞溶解物中に存在し得、または部分的に精製されているかもしくは実質的に純粋な形態の核酸であり得る。核酸は、標準的な技術により、他の細胞成分または他の夾雑物（例えば、他の細胞核酸またはタンパク質）から精製されている場合に、「単離されている」か、または「実質的に純粋になっている」。
【0215】
本開示の核酸分子を、増幅およびＲＮＡの逆転写の方法が挙げられるがこれらに限定されない標準的な分子生物学的技術を使用し得ることができる。例えば可変鎖をコードするＤＡＮ断片が得られると、このＤＮＡ断片を、標準的な組換えＤＮＡ技術によりさらに操作して、例えば可変領域遺伝子を完全長鎖遺伝子へと変換させ得る。この操作では、変異体をコードするＤＮＡ断片は、別のＤＮＡ分子、または別のタンパク質（例えば、定常領域またはフレキシブルリンカー）をコードする断片に、作動可能に連結されている。「作動可能に連結されている」という用語は、この文脈で使用される場合、例えば、２つのＤＮＡ断片によりコードされるアミノ酸配列がインフレームのままであるように、またはタンパク質が所望のプロモーターの制御下で発現されるように、これら２つのＤＮＡ断片が機能的に連結されていることを意味することが意図されている。可変コードＤＮＡを、定常領域をコードする別のＤＮＡ分子に作動可能に連結することにより、可変領域（例えば、可変アルファ領域および／または可変ベータ領域）をコードする単離ＤＮＡを完全長鎖遺伝子へと変換させ得る。例えばＴＣＲまたは抗体に関するヒト定常領域遺伝子の配列は、当該技術分野で既知であり、この領域を包含するＤＮＡ断片を、標準的なＰＣＲ増幅により得ることができる。
【0216】
典型的には、前記核酸は、１つまたは複数のＤＮＡまたはＲＮＡ分子を含み、該分子は、１つまたは複数の好適なベクターに含まれてもよい。
【0217】
第３の態様では、本発明は、本発明の第２の態様の核酸を含むベクターまたはベクターの集合物に関する。好ましくは、抗原結合タンパク質をコードする配列は、プロモーター配列に作動可能に連結されている。「ベクターの集合物」は、本明細書では、２つまたはより多くのベクターを指す。２つまたはより多くの抗原結合タンパク質ポリペプチド鎖が１つのベクター上にコードされる場合、２つまたはより多くの抗原結合タンパク質ポリペプチド鎖は、同じプロモーターの制御下または別々のプロモーターの制御下にあることができる。
【0218】
「ベクター」、「クローニングベクター」、および「発現ベクター」という用語は、ＤＮＡまたはＲＮＡ配列（例えば外来遺伝子）を宿主細胞に導入して、この宿主を形質転換して、導入された配列の発現（例えば、転写および翻訳）を促進し得る媒体を指す。
【0219】
様々な発現ベクターを採用して、抗原結合タンパク質またはその機能的断片をコードするポリヌクレオチドを発現させ得る。ウイルスベースの発現ベクターおよび非ウイルスベースの発現ベクターの両方を使用して、哺乳動物宿主細胞中において、本明細書で説明されている抗原結合タンパク質またはその機能的断片を産生させ得る。非ウイルス性のベクターおよびシステムとして、複数のプラスミド、プラスミド、コスミド、エピソーム、人工染色体、ファージ、またはウイルスベクターが挙げられる。
【0220】
そのようなベクターは、対象への投与時に前記ポリペプチドの発現を引き起こすかまたは誘導するために、調節エレメント（例えば、プロモーター、エンハンサー、ターミネーター、および同類のもの）を含み得る。動物細胞用の発現ベクターで使用されるプロモーターおよびエンハンサーの例として、ＳＶ４０の初期プロモーターおよびエンハンサー（Mizukami T. et al. 1987）、Ｍｏｌｏｎｅｙマウス白血病ウイルスのＬＴＲプロモーターおよびエンハンサー（Kuwana Y et al. 1987）、抗体重鎖のプロモーター（Mason JO et al. 1985）およびエンハンサー（Gillies SD et al. 1983）、ならびに同類のものが挙げられる。
【0221】
例えば、哺乳動物（例えば、ヒトまたは非ヒト）細胞中における、本明細書で説明されているポリヌクレオチドおよびポリペプチドの発現に有用な非ウイルスベクターとして、タンパク質の発現用に当該技術分野で既知の全ての好適なベクターが挙げられる。プラスミドの他の例として、複製起点を含む複製プラスミド、または組込みプラスミド（例えばｐＵＣ、ｐｃＤＮＡ、ｐＢＲ、および同類のもの）が挙げられる。
【0222】
「ウイルスベクター」という用語は、ウイルス起源の少なくとも１つの要素を含み、ウイルスベクター粒子へとパッケージされる能力を有しており、かつ少なくとも外来性核酸をコードする核酸ベクターコンストラクトを指す。ベクターおよび／または粒子を、インビトロまたはインビボのいずれかで細胞に目的の核酸を導入する目的に利用し得る。多数の形態のウイルスベクターが、当該技術分野で既知である。有用なウイルスベクターとして、レトロウイルス、レンチウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ヘルペスウイルスに基づくベクター、ＳＶ４０、パピローマウイルス、エプスタイン・バーウイルス、ワクシニアウイルスベクター、およびＳｅｍｌｉｋｉ Ｆｏｒｅｓｔ ｖｉｒｕｓ（ＳＦＶ）に基づくベクターが挙げられる。組換えウイルスを、当該技術分野で既知の技術により製造し得、例えば、パッケージング細胞をトランスフェクトすることにより製造し得るか、またはヘルパープラスミドもしくはウイルスによる一過性トランスフェクションにより製造し得る。ウイルスパッケージング細胞の典型例として、ＰＡ３１７細胞、ＰｓｉＣＲＩＰ細胞、ＧＰｅｎｖ＋細胞、２９３細胞等が挙げられる。そのような複製欠損組換えウイルスを製造するための詳細なプロトコルを、例えば、国際公開第９５／１４７８５号パンフレット、同第９６／２２３７８号パンフレット、米国特許第５，８８２，８７７号明細書、同第６，０１３，５１６号明細書、同第４，８６１，７１９号明細書、同第５，２７８，０５６号明細書、および国際公開第９４／１９４７８号パンフレットで見出し得る。
【0223】
本明細書に記載される第１のポリペプチドおよび第２のポリペプチドは、同じベクターまたは別々のベクター、即ちベクターの集合物中に存在することができる。
【0224】
第４の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸または本発明の第３の態様のベクターを含む宿主細胞に関する。宿主細胞は、特に本発明に従う核酸および／またはベクターを用いて、トランスフェクト、感染または形質導入または形質転換されてもよい。
【0225】
宿主細胞は、真核細胞、例えば、植物、動物、真菌、もしくは藻類、または原核細胞、例えば、細菌もしくは原生動物であり得る。宿主細胞は、培養された細胞または初代細胞、即ち、生物、例えば、ヒトから直接的に単離された細胞であり得る。宿主細胞は、接着細胞または懸濁された細胞、即ち、懸濁状態で増殖する細胞であり得る。組換え抗原結合タンパク質、例えばＴＣＲ、ポリペプチド、またはタンパク質を製造する目的のために、宿主細胞は好ましくは哺乳動物細胞である。最も好ましくは、宿主細胞はヒト細胞である。宿主細胞は任意の細胞タイプであり得、任意のタイプの組織を起源とすることができ、かつ任意の発生ステージであり得るが、宿主細胞は、好ましくは、末梢血白血球（ＰＢＬ）または末梢血単核細胞（ＰＢＭＣ）である。より好ましくは、宿主細胞は、リンパ球、例えばＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞である。ＮＫ細胞は、ウイルスに感染した細胞および腫瘍細胞を迅速に殺滅することができる天然に存在するリンパ球非Ｔ細胞である。ＮＫ細胞は、がん療法における細胞療法製造物としての使用のための腫瘍特異的ＴＣＲを発現するように操作され得る（Shimasaki et al., Nat Rev Drug Discov. 2020 Mar;19(3):200-218）。好ましい実施形態では、宿主細胞は、Ｔ細胞、例えばＣＤ４もしくはＣＤ８陽性Ｔ細胞またはγδ Ｔ細胞である。Ｔ細胞は、任意のＴ細胞、例えば、培養されたＴ細胞、例えば、初代Ｔ細胞、または培養されたＴ細胞株、例えば、Ｊｕｒｋａｔ、ＳｕｐＴ１等からのＴ細胞、または哺乳動物から得られたＴ細胞、好ましくはヒト患者からのＴ細胞もしくはＴ細胞前駆体であり得る。哺乳動物から得られる場合、Ｔ細胞は、血液、骨髄、リンパ節、胸腺、または他の組織もしくは流体が挙げられるがこれらに限定されない、多数の供給源から得られ得る。Ｔ細胞はまた、濃縮または精製され得る。好ましくは、Ｔ細胞はヒトＴ細胞である。より好ましくは、Ｔ細胞は、ヒトから単離されたＴ細胞である。Ｔ細胞は、任意のタイプのＴ細胞であり得、かつ任意の発生ステージであり得、ＣＤ４陽性ヘルパーＴ細胞、例えば、Ｔｈ１およびＴｈ２細胞、ＣＤ８陽性Ｔ細胞（例えば、細胞傷害性Ｔ細胞）、腫瘍浸潤細胞（ＴＩＬ）、メモリーＴ細胞、ナイーブＴ細胞、ならびにγδ Ｔ細胞等が挙げられるがこれらに限定されない。
【0226】
他の好ましい実施形態では、宿主細胞は、組換え発現用の細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞または酵母細胞である（ｉｓ ｏｒ）。
【0227】
「形質転換」という用語は、宿主細胞が、導入された遺伝子または配列を発現して、所望の物質（典型的には、本明細書で説明されている抗原結合タンパク質またはその機能的断片）を産生するような、宿主細胞への「外来」（即ち外因性）遺伝子、ＤＮＡ、またはＲＮＡ配列の導入を意味する。導入されたＤＡＮまたはＲＮＡを受け取って発現する宿主細胞は、「形質転換されている」。
【0228】
本発明の核酸を使用して、好適な発現系で本発明の組換え抗原結合タンパク質を産生し得る。「発現系」という用語は、例えば、ベクターにより運ばれて宿主細胞に導入された外来ＤＮＡによりコードされるタンパク質の発現のための、好適な条件下での宿主細胞および適合するベクターを意味する。
【0229】
一般的な発現系として、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）宿主細胞およびプラスミドベクター、昆虫宿主細胞およびバキュロウイルス（Ｂａｃｕｌｏｖｉｒｕｓ）ベクター、ならびに哺乳動物宿主細胞およびベクターが挙げられる。宿主細胞の他の例として、原核細胞（例えば細菌）、および真核細胞（例えば、酵母細胞、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞等）が挙げられるが、これらに限定されない。具体例として、大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）、クリベロミセス属（Ｋｌｕｙｖｅｒｏｍｙｃｅｓ）またはサッカロマイセス属（Ｓａｃｃｈａｒｏｍｙｃｅｓ）の酵母、哺乳動物細胞株（例えば、Ｖｅｒｏ細胞、ＣＨＯ細胞、３Ｔ３細胞、ＣＯＳ細胞、ＨＥＫ細胞等）、ならびに初代または確立された哺乳動物細胞培養物（例えば、リンパ芽球、線維芽細胞、胚細胞、上皮細胞、神経細胞、脂肪細胞等から産生されたもの）が挙げられる。例としてまた、マウスＳＰ２／０－Ａｇ１４細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ１５８１）、マウスＰ３Ｘ６３－Ａｇ８．６５３細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ１５８０）、ジヒドロ葉酸レダクターゼ遺伝子が欠損しているＣＨＯ細胞（Ｕｒｌａｕｂ Ｇ ｅｔ ａｌ；１９８０）、ラットＹＢ２／３ＨＬ．Ｐ２．Ｇ１１．１６Ａｇ．２０細胞（ＡＴＣＣ ＣＲＬ１６６２）、および同類のものも挙げられる。いくつかの実施形態では、ＹＢ２／０細胞が好ましい場合があり、なぜならば、この細胞中で発現された場合には、キメラ抗体またはヒト化抗体のＡＤＣＣ活性が増強されるからである。好ましい実施形態では、上記される宿主細胞は、発現システムとして使用される。
【0230】
特に、本発明の抗原結合タンパク質のいくつか、特に、連結されていない２つのポリペプチドを含む抗原結合タンパク質の発現のために、発現ベクターは、第１のポリペプチド、例えばＴＣＲアルファ鎖をコードする遺伝子および第２のポリペプチド、例えばＴＣＲベータ鎖等をコードする遺伝子が別々のベクター上に存在するタイプ、または両方の遺伝子が同じベクター上に存在するタイプ（タンデムタイプ）のいずれかであってもよい。抗原結合タンパク質発現ベクターの構築の容易性、動物細胞中への導入の容易性、ならびに動物細胞中での２つのポリペプチド、例えばＴＣＲアルファおよびベータ鎖の発現レベルの間の均衡の点において、ヒト化抗体に関連して記載されているタンデムタイプの発現ベクターは好ましい（Shitara K et al. J Immunol Methods. 1994 Jan. 3; 167(1-2):271-8）。ヒト化抗体に関連して記載されているタンデムタイプ発現ベクターの例として、ｐＫＡＮＴＥＸ９３（国際公開第９７／１０３５４号パンフレット）、およびｐＥＥ１８等が挙げられる。
【0231】
一実施形態では、そのような組換え宿主細胞を、本発明の少なくとも１種の抗原結合タンパク質の製造に使用し得る。
【0232】
医薬組成物
第５の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクターまたは本発明の第４の態様の宿主細胞と、適宜、医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物に関する。
第５の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクターまたは本発明の第４の態様の宿主細胞と、適宜、医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物に関する。
【0233】
本発明の抗原結合タンパク質は、ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドを提示する細胞に対して細胞傷害性をもたらすことが可能であることが示されている。このペプチドは特に腫瘍細胞により提示されるので、本発明の抗原結合タンパク質は、患者において腫瘍細胞を破壊するために有用である。患者における免疫反応を、理想的には、免疫原性を増強する薬剤（即ち、アジュバント）と組み合わされた、説明されている抗原結合タンパク質の患者への直接投与により誘発し得る。そのような治療用ワクチン接種により生じる免疫反応は、腫瘍細胞に対して非常に特異的であることが予想され得、なぜならば、ペプチドＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）は、正常組織上では、同程度のコピー数で提示されないかまたは過剰に提示されないからであり、患者の正常組織細胞に対する望ましくない自己免疫反応のリスクが予防される。
【0234】
本発明はまた、医薬品としての使用のための、本発明に係る抗原結合タンパク質にも関する。本発明はまた、医薬品としての使用のための、本発明の医薬組成物にも関する。
【0235】
「医薬組成物」または「治療用組成物」という用語は、本明細書で使用される場合、対象に適切に投与された場合に所望の治療効果を誘発可能な化合物または組成物を指す。
【0236】
いくつかの実施形態では、対象はまた、患者とも称され得る。
【0237】
そのような治療用組成物または医薬組成物は、投与様式に適合するように選択された薬学的にまたは生理学的に許容される製剤との混合物で、本発明の抗原結合タンパク質、または治療薬をさらに含む抗原結合タンパク質の治療上有効な量を含み得る。
【0238】
いくつかの実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、薬学的に許容される担体を通常は含む滅菌医薬組成物の一部として供給される。
【0239】
「薬学的に」または「薬学的に許容される」は、必要に応じて、哺乳動物（特に、ヒト）に投与された場合に、有害反応、アレルギー反応、または他の有害な反応を生じない分子実態および組成物を指す。薬学的に許容される担体は、任意のタイプの非毒性の固体、半固体、または液体の充填剤、希釈剤、カプセル化材料、または製剤化補助剤を指す。
【0240】
「薬学的に許容される担体」は、生理学的に適合する溶媒、増量剤、安定化剤、分散媒体、コーティング剤、抗菌剤および抗真菌剤、等張化剤および吸収遅延剤、および同類のものを含み得る。一実施形態では、担体は、水性担体である。いくつかの実施形態では、水性担体は、本明細書で説明されている抗原結合タンパク質と組み合わされた場合に、改善された特性（例えば、改善された溶解性、有効性、および／または改善された免疫療法）を付与することが可能である。
【0241】
本発明において有用な医薬的に許容される担体または希釈剤のさらなる例として、安定化剤、例えばＳＰＧＡ、炭水化物（例えばソルビトール、マンニトール、デンプン、スクロース、グルコース、デキストラン）、タンパク質、例えばアルブミンまたはカゼイン、タンパク質含有剤、例えばウシ血清または脱脂粉乳および緩衝剤（例えばリン酸緩衝剤）が挙げられる。
【0242】
医薬組成物の形態、投与経路、投与量、およびレジメンは、当然のことながら、処置する状態、疾病の重症度、患者の年齢、体重、および性別等に依存する。この医薬組成物は、（患者に投与する所望の方法に応じて）任意の好適な形態であり得る。この医薬組成物は、単位剤形で提供され得、一般に、密封容器で提供され得、かつキットの一部として提供され得る。そのようなキットは、通常は（必ずしもではないが）使用説明書を含むだろう。そのようなキットはまた、複数の前記単位剤形を含み得る。
【0243】
好ましくは、医薬組成物は、注射により、例えば、静脈内に投与される。医薬組成物が、本発明の抗原結合タンパク質、好ましくはＴＣＲを発現する宿主細胞を含む場合、注射用の細胞のための医薬的に許容される担体は、任意の等張担体、例えば、生理食塩水（水中の約０．９０％ ｗ／ｖのＮａＣｌ、水中の約３００ｍＯｓｍ／ＬのＮａＣｌ、もしくは水１リットル当たり約９．０ｇのＮａＣｌ）、ＮＯＲＭＯＳＯＬ Ｒ電解質溶液（Ａｂｂｏｔｔ、Ｃｈｉｃａｇｏ、ＩＬ）、ＰＬＡＳＭＡＬＹＴＥ Ａ（Ｂａｘｔｅｒ、Ｄｅｅｒｆｉｅｌｄ、ＩＬ）、水中の約５％のデキストロース、または乳酸リンゲル液等を含んでもよい。一実施形態では、医薬的に許容される担体は、ヒト血清卵白（ｈｕｍａｎ ｓｅｒｕｍ ａｌｂｕｍｅｎ）を補充される。
【0244】
生物学的半減期等の経験による考察は、一般に、投与量の決定に寄与する。投与頻度は、決定されて治療期間中に調整され得、かつがん細胞の数の減少、がん細胞の減少の維持、がん細胞の増殖の減少、またはがん細胞の殺滅に基づいている。あるいは、抗原結合タンパク質の持続的連続放出製剤が適切であり得る。持続放出を達成するための様々な製剤およびデバイスが、当該技術分野で既知である。
【0245】
一実施形態では、抗原結合分子の投与量を、１回または複数回の投与を受けている個体において、経験的に決定し得る。個体に、抗原結合タンパク質の漸増投与量を投与する。抗原結合タンパク質の有効性を評価するために、がん細胞の状態のマーカーを追跡し得る。これには、ＦＡＣＳ、他の撮像技術によるがん細胞の増殖および細胞死の直接測定、そのような測定により評価される場合の健康状態の改善、または受け入れられている検査により測定した場合の生活の質の向上、もしくは生存期間の延長が含まれる。投与量が、個体、疾患の段階、ならびに使用されている過去および同時の処置に応じて異なることは、当業者に明らかであるだろう。
【0246】
投与に使用される用量を、様々なパラメータの関数として適合させ得、特に、使用される投与様式の関数として適合させ得るか、関連する病理の関数として適合させ得るか、あるいは所望の処置期間の関数として適合させ得る。
【0247】
本発明の医薬組成物、ベクター、核酸、および細胞は、実質的に純粋な形態で提供され得、例えば、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９１％、少なくとも９２％、少なくとも９３％、少なくとも９４％、少なくとも９５％、少なくとも９６％、少なくとも９７％、少なくとも９８％、少なくとも９９％、または１００％純粋な形態で提供され得る。
【0248】
抗原結合タンパク質を製造する方法
第６の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質を製造する方法であって、（ａ）宿主細胞を準備する工程、（ｂ）本発明の第１の態様のいずれかの抗原結合タンパク質をコードするコード配列を含む遺伝子コンストラクトを準備する工程、（ｃ）遺伝子コンストラクトを宿主細胞に導入する工程、および（ｄ）宿主細胞により遺伝子コンストラクトを発現させる工程を含む方法に関する。
第６の態様では、本発明は、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質を製造する方法であって、（ａ）宿主細胞を準備する工程、（ｂ）本発明の第１の態様のいずれかの抗原結合タンパク質をコードするコード配列を含む遺伝子コンストラクトを準備する工程、（ｃ）遺伝子コンストラクトを宿主細胞に導入する工程、および（ｄ）宿主細胞により遺伝子コンストラクトを発現させる工程を含む方法に関する。
【0249】
１つの実施形態では、方法は、宿主細胞からの抗原結合タンパク質の単離および精製、ならびに、適宜、宿主細胞、好ましくはリンパ球、より好ましくはＴ細胞またはＮＫ細胞、最も好ましくはＴ細胞中での抗原結合タンパク質の再構成をさらに含む。当業者は、抗原結合タンパク質を発現させるための好適な宿主細胞を選択することが完全に可能である。
【0250】
本発明の抗原結合タンパク質を、当該技術分野で既知の任意の技術（例えば、限定されないが、任意の化学的技術、生物学的技術、遺伝学的技術、または酵素的技術の単独または組合せ）により製造し得る。
【0251】
本発明の抗原結合タンパク質は、抗体精製手順（例えば、例えば、プロテインＡ－セファロース、ヒドロキシルアパタイトクロマトグラフィー、ゲル電気泳動、透析、または親和性クロマトグラフィー）により、培養培地から好適に分離される。
【0252】
一実施形態では、発現された抗原結合タンパク質またはポリペプチドを回収することは、本明細書では、プロテインＡクロマトグラフィー、カッパセレクトクロマトグラフィー、および／またはサイズ排除クロマトグラフィー、好ましくはプロテインＡクロマトグラフィーおよび／またはサイズ排除クロマトグラフィー、より好ましくはプロテインＡクロマトグラフィーおよびサイズ排除クロマトグラフィーを実施することを指す。
【0253】
所望の配列のアミノ酸配列を知ることにより、当業者は、ポリペプチドの製造のための標準的な技術により、本発明の抗原結合タンパク質を製造し得る。例えば、このタンパク質を、公知の固相法を使用して、特に、市販のペプチド合成装置（例えば、Ａｐｐｌｉｅｄ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ，Ｆｏｓｔｅｒ Ｃｉｔｙ，Ｃａｌｉｆｏｒｎｉａ製のもの）を使用して、かつ製造業者の指示に従って、合成し得る。あるいは、本発明の抗体および抗原結合タンパク質を、当該技術分野で公知の組換えＤＮＡおよび遺伝性トランスフェクション技術により製造し得る［Morrison SL. et al. (1984) and patent documents US5,202,238; and US5,204, 244を参照されたい］。例えば、断片を、所望の（ポリ）ペプチドをコードするＤＮＡ配列を発現ベクターに組み込み、そのようなベクターを、所望のポリペプチドを発現する好適な真核生物または原核生物の宿主に導入した後に、ＤＮＡ発現産物として得ることができ、その後、この断片を、公知の技術を使用して単離し得る。
【0254】
従来の組換えＤＮＡおよび遺伝子のトランスフェクション技術に基づいてヒト化抗体を製造する方法は、当該技術分野で公知であり（例えば、Riechmann L. et al. 1988; Neuberger MS. et al. 1985を参照されたい）、本発明の抗原結合タンパク質の製造に容易に適用し得る。
【0255】
一例では、本発明の組換え抗原結合タンパク質の発現用のベクターを、例えば、ＨＣＭＶ由来のプロモーターエレメント、ｐＵＣ１９誘導体により制御されるモノシストロニックとして設計した。プラスミドＤＮＡを、標準的な培養方法に従って例えば大腸菌（Ｅ．ｃｏｌｉ）中で増幅させ、その後に市販のキット（Ｍａｃｈｅｒｅｙ ＆ Ｎａｇｅｌ）を使用して精製した。精製されたプラスミドＤＮＡを、例えば、製造業者の指示に従って、ＣＨＯ－Ｓ細胞の一過性トランスフェクションに使用した（ＥｘｐｉＣＨＯ（商標）システム；Ｔｈｅｒｍｏ Ｆｉｓｈｅｒ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）。トランスフェクトされたＣＨＯ細胞を、例えば３２℃～３７℃で６～１４日にわたり培養し、ＥｘｐｉＣＨＯ（商標）Ｆｅｅｄ溶液の１～２回の餌を与えた。
【0256】
条件付け細胞上清を、例えば、Ｓａｒｔｏｃｌｅａｒ Ｄｙｎａｍｉｃｓ（登録商標）Ｌａｂ Ｆｉｌｔｅｒ Ａｉｄ（Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ）を利用するろ過（０．２２μｍ）により清澄化した。二重特異性抗原結合タンパク質を、例えば、親和性クロマトグラフィーおよびサイズ排除クロマトグラフィーをインラインで実施するように装備されたＡｅｋｔａ Ｐｕｒｅ ２５ Ｌ ＦＰＬＣシステム（ＧＥ Ｌｉｆｅｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用して精製した。親和性クロマトグラフィーを、例えば、標準的な親和性クロマトグラフィープロトコルに従ってプロテインＡまたはＬカラム（ＧＥ Ｌｉｆｅｓｃｉｅｎｃｅｓ）で実施した。例えば、サイズ排除クロマトグラフィーを、例えば、標準プロトコルに従ってＳｕｐｅｒｄｅｘ ２００ ｐｇ １６／６００カラム（ＧＥ Ｌｉｆｅｓｃｉｅｎｃｅｓ）を使用して、親和性カラムからの溶出（ｐＨ２．８）直後に実施して、高純度の単量体タンパク質を得た。タンパク質濃度を、例えば、予測されるタンパク質配列に従って算出された減衰係数を使用して、ＮａｎｏＤｒｏｐシステム（Ｔｈｅｒｍｏ Ｓｃｉｅｎｔｉｆｉｃ）で決定した。濃度を、必要に応じて、Ｖｉｖａｓｐｉｎデバイス（Ｓａｒｔｏｒｉｕｓ）を使用して調整した。最後に、精製された分子を、例えば、２～８℃の温度で約１ｍｇ／ｍＬの濃度にて、リン酸緩衝生理食塩水中で保存した。
【0257】
精製された二重特異性抗原結合タンパク質の品質を、例えば、Ｖａｎｑｕｉｓｈ ＵＨＰＬＣ－Ｓｙｓｔｅｍ内で、３００ ｍＭ ＮａＣｌを含む５０ｍＭ リン酸ナトリウム（ｐＨ６．８）で動作するＭａｂＰａｃ ＳＥＣ－１カラム（５μｍ、７．８×３００ｍｍ）によるＨＰＬＣ－ＳＥＣにより決定した。
【0258】
治療方法および治療用途
第７の態様では、本発明は、医薬での使用のための、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクター、本発明の第４の態様の宿主細胞、または本発明の第４の態様の医薬組成物に関する。
第７の態様では、本発明は、医薬での使用のための、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクター、本発明の第４の態様の宿主細胞、または本発明の第４の態様の医薬組成物に関する。
【0259】
第８の態様では、本発明は、増殖性疾患の処置および／または診断方法での使用のための、本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクター、本発明の第４の態様の宿主細胞、または本発明の第４の態様の医薬組成物に関する。
【0260】
本発明の抗原結合タンパク質は、特に、増殖性疾患の予防および／または処置のための免疫療法、好ましくは養子細胞療法、より好ましくは養子Ｔ細胞療法での使用のためのものである。本発明の化合物の投与は、例えば、前記患者への本発明のリンパ球、好ましくはＮＫ細胞またはＴ細胞、より好ましくはＴ細胞の注入を伴うことができる。好ましくは、そのようなリンパ球は、患者の自家リンパ球であり、本発明の核酸または抗原結合タンパク質をインビトロで形質導入される。
【0261】
好ましい実施形態では、増殖性疾患は、がん、特にＣＴ４５発現がんである。
【0262】
本発明に関連して、がんは、関連するペプチド、例えばＣＴ４５－ＩＰペプチド等が、ＮＣＩによるガイドラインに従って全てのがんの９８％超において提示される場合に、「ＣＴ４５発現がん」（ＣＴ４５「陽性」がんとも称される）であるとみなされる。ここで挙げられた全ての他の適応症では、生検を、これらの癌の処置で標準的であることから実施し得、ペプチドを、ＸＰｒｅｓｉｄｅｎｔ（登録商標）および関連する方法に従って［国際公開第０３／１００４３２号パンフレット；同第２００５／０７６００９号パンフレット；同第２０１１／１２８４４８号パンフレット；同第２０１６／１０７７４０号パンフレット、米国特許第７，８１１，８２８号明細書、同第９，７９１，４４４号明細書、および米国特許出願公開第２０１６／０１８７３５１号明細書（それぞれの内容は、その全体が参照により本明細書に組み込まれる）に従って］同定し得る。一実施形態では、例えば、本発明の抗原結合タンパク質を使用することにより、がんを容易にアッセイする（即ち、診断する）。抗原結合タンパク質を使用して、抗原を発現するがんを同定する方法は、当業者に既知である。癌腫は、身体の臓器を補強するかまたは覆う皮膚または組織で出現する特定のタイプのがんであることから、「がん」および「癌腫」という用語は、本明細書では互換的に使用されないことを理解しなければならない。
【0263】
１つの実施形態では、ＣＴ４５発現がんは、肺がん、ＮＳＣＬＣ、胆嚢がん、胆管がん、リンパ節がん、卵巣がん、食道がん、肝臓がん、子宮がんおよび黒色腫からなる群から選択される。
【0264】
１つの実施形態では、がんは、ＣＴ４５抗原が、過剰発現される、突然変異している、かつ／またはＣＴ４５抗原ペプチドが提示されるがんである。そのようながんは、例えば本発明の抗原結合タンパク質を使用することにより、容易にアッセイ（即ち診断）される。抗原結合タンパク質を使用して、抗原を発現するがんを同定する方法は、当業者に既知である。
【0265】
別の態様では、本発明は、増殖性疾患の処置方法であって、それを必要とする対象に治療有効量の、本明細書において上記で定義されている本発明の抗原結合タンパク質、核酸もしくはベクター、宿主細胞または医薬組成物を投与することを含む方法に関する。
【0266】
特定の実施形態では、本発明は、増殖性疾患を有する対象の処置方法であって、前記対象に、細胞表面上に本発明の抗原結合タンパク質を発現するリンパ球、好ましくはＮＫ細胞またはＴ細胞、より好ましくはＴ細胞を投与することを含む方法に関する。
【0267】
「対象」または「個体」という用語は、互換的に使用され、例えば、ヒトまたは非ヒト哺乳動物であり得、好ましくはヒトであり得る。
【0268】
本発明に関連して、「処置する」または「処置」という用語は、治療的処置（即ち、所与の疾患を有する対象におけるもの）および／または予防的もしくは防止的処置（即ち、所与の疾患を発症しやすい対象におけるもの）の両方を含む。治療的処置は、障害または状態の１つまたは複数の症状の好転、軽減および／またはその進行の阻害を意味する（ａｎｄ ｍｅａｎｓ）。防止的処置は、障害または状態の１つまたは複数の症状の発生の予防を意味する。従って、処置は、疾患の完全な治癒をもたらす処置を指すだけでなく、疾患の進行を減速させ、疾患の発生を予防しもしくは遅延させ、かつ／または対象の生存を長期化させる処置も指す。
【0269】
一実施形態では、「疾患」または「障害」とは、本発明の抗原結合タンパク質による処置から利益を得るであろうあらゆる状態のことである。一実施形態では、これには、対象を問題の障害にかかりやすくさせる病理学的状態を含む慢性および急性の障害または疾患が含まれている。「処置が必要な」という用語は、障害を既に有する対象、および障害を予防すべきである対象を指す。
【0270】
がん等の「増殖性疾患」は、細胞の無秩序なおよび／または不適当な増殖を伴う。
【0271】
１つの実施形態では、処置方法は、免疫療法、特に養子自家または異種細胞療法、好ましくはＴ細胞療法を含む。
【0272】
好ましい実施形態では、抗原結合タンパク質は、ＴＣＲまたはその機能的断片であるか、またはそれを含む。
【0273】
抗原結合タンパク質は宿主細胞の表面上に発現されることが好ましい。
【0274】
１つの実施形態では、処置方法は、抗原結合タンパク質を発現する宿主細胞の投与を含み、宿主細胞は、Ｔ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、好ましくはＴ細胞である。
【0275】
１つの実施形態では、宿主細胞、好ましくはＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、より好ましくはＴ細胞は、自家である。
【0276】
１つの実施形態では、宿主細胞、好ましくはＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、より好ましくはＴ細胞は、同種である。
【0277】
１つの実施形態では、抗原結合タンパク質は、治療活性剤、好ましくは、放射性核種、化学療法剤および毒素からなる群から選択される治療活性剤にコンジュゲートされる。
【0278】
１つの実施形態では、処置方法は、処置を必要とする対象に少なくとも１つの化学療法剤を投与することをさらに含む。
【0279】
１つの実施形態では、処置方法は、処置を必要とする対象に放射線療法を投与することをさらに含む。
【0280】
関連する態様では、本発明は、増殖性疾患、特に、ＭＨＣタンパク質との複合体中のＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）のアミノ酸配列を含むか、またはからなるペプチドを提示するがんを有する患者において免疫応答を誘発する方法であって、患者に本開示の抗原結合タンパク質を投与することを含み、前記がんは、肺がん、ＮＳＣＬＣ、胆嚢がん、胆管がん、リンパ節がん、卵巣がん、食道がん、肝臓がん、子宮がんおよび黒色腫からなるがんの群から選択される方法に関する。１つの実施形態では、前記方法において言及される免疫応答は細胞傷害性Ｔ細胞応答である。
【0281】
さらに別の態様では、本発明は、対象における増殖性疾患の処置用の医薬の製造のための、本発明の抗原結合タンパク質、核酸もしくはベクター、宿主細胞または医薬組成物の使用に関する。
【0282】
さらに別の態様では、本発明は、対象において疾患を処置するための、本発明の抗原結合タンパク質、核酸もしくはベクター、宿主細胞または医薬組成物の使用に関する。
【0283】
がん治療のガイドラインを示すテキストは、Cancer, Principles and Practice of Oncology, 4th Edition, DeVita et al, Eds. J. B. Lippincott Co., Philadelphia, Pa. (1993)である。関連分野で認識されているように、特定のタイプのがん、および他の因子（例えば、患者の全身状態）に従って、適切な治療アプローチが選択される。本発明の抗原結合タンパク質を、それ自体で使用し得るか、またはがん患者の処置で他の抗新生物剤を使用する治療レジメンに加え得る。
【0284】
従って、いくつかの実施形態では、例えば、抗原結合タンパク質を、化学療法剤、非化学療法剤、抗新生物剤、および／または放射線等のがん処置で広く採用されている様々な薬物および処置と同時に、その前に、またはその後に投与し得る。
【0285】
「診断」は、本明細書では、医学的診断を指し、いずれの疾患または状態が、ある人の症状および徴候を説明するのかを決定することを指す。
【0286】
抗原結合タンパク質またはその医薬組成物の「治療上有効な量」は、任意の医学的処置に適用可能な妥当なベネフィット／リスク比で前記増殖性疾患を処置するのに十分な量の抗原結合タンパク質を意味する。しかしながら、本発明の抗原結合タンパク質、核酸またはベクター、宿主細胞または医薬組成物の１日当たりの総使用量は、健全な医学的判断の範囲内で主治医により決定されることが理解されるだろう。任意の特定の患者に関する具体的な治療上有効な用量は、様々な因子に依存しており、この因子として下記が挙げられる：処置される障害および障害の重症度；採用される具体的な抗原結合タンパク質の活性；採用される具体的な組成物；患者の年齢、体重、全体的な健康状態、性別、および食事；採用される具体的なポリペプチドの投与時間、投与経路、および排出速度；処置の継続期間；採用される具体的なポリペプチドと併用されるかまたは同時に使用される薬物；ならびに医学技術分野で公知の同類の因子。例えば、所望の治療効果を得るのに必要なレベルと比べて低いレベルで化合物の用量を開始し、所望の効果が得られるまで投与量を徐々に増加させることが当業者に公知である。
【0287】
一実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質による処置の有効性を、例えば、がんのマウスモデルにおいて、例えば、処置群とコントロール群との間の腫瘍体積の変化を測定することにより、インビボでアッセイする。
【0288】
本発明の抗原結合タンパク質、本発明の核酸または本発明のベクター、本発明の宿主細胞または本発明の医薬組成物を、任意の実現可能な方法により投与し得る。
【0289】
本明細書で開示されているように、いくつかの実施形態では、本明細書の上記で定義されている宿主細胞を、本明細書で説明されている医療用途または処置方法で使用する。そのような実施形態では、宿主細胞は、好ましくはリンパ球、例えばＮＫ細胞、Ｔ細胞またはＴ細胞前駆細胞、好ましくはＣＤ４および／もしくはＣＤ８陽性Ｔ細胞またはγδ Ｔ細胞、最も好ましくはＣＤ４および／またはＣＤ８陽性Ｔ細胞、最も好ましくはＣＤ４および／またはＣＤ８陽性Ｔ細胞である。
【0290】
従って、本発明の宿主細胞（好ましくは、Ｔ細胞）を、治療用組成物の有効成分として使用し得る。そのため、本発明はまた、ペプチドＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）を含むポリペプチドを標的細胞が異常発現する患者において標的細胞を殺滅する方法であって、患者に、宿主細胞（好ましくはＴ細胞）の有効数を投与することを含む方法も提供する。この方法に関連して、宿主細胞は、対象に投与されると、好ましくは免疫反応を誘発する。
【0291】
ある態様では、ＴＣＲにより誘発された反応、またはＴ細胞反応は、インビトロ、エクスビボまたはインビボにおける、ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）等のペプチドにより誘発されるエフェクター機能の増大および活性化を指し得る。ＭＨＣクラスＩにより制限された細胞傷害性Ｔ細胞の場合には、例えば、エフェクター機能は、ペプチドパルスされた、ペプチド前駆体パルスされた、もしくは天然にペプチドを提示する標的細胞の溶解、ペプチドにより誘発されるサイトカイン（好ましくは、インターフェロン－ガンマ、ＴＮＦ－アルファ、もしくはＩＬ－２）の分泌、ペプチドにより誘発されるエフェクター分子（例えば、グランザイムもしくはパーフォリン）の分泌、または脱顆粒であり得る。
【0292】
本発明に関連して、Ｔ細胞を医薬品として使用する場合には、通常、Ｔ細胞を、アフェレーシスにより細胞から採取する。次いで、Ｔ細胞を、その細胞表面上で本発明の抗原結合タンパク質を発現するように遺伝子操作し、次いで、遺伝子操作されたＴ細胞を増殖させて、次いで対象に再注入する。この例では、抗原結合タンパク質は、好ましくは膜結合型抗原結合タンパク質、より好ましくはＴＣＲである。
【0293】
従って、宿主細胞は、本明細書の上記「核酸、ベクター、および組換え宿主細胞」セクションで説明されているように、本発明に係る核酸および／またはベクターでトランスフェクトされているか、感染されているか、または形質転換されている。
【0294】
本発明の抗原結合タンパク質を発現させるために宿主細胞をトランスフェクトした場合には、好ましくは、細胞は、抗原結合タンパク質を発現可能な発現ベクターを含む。次いで、宿主細胞は、活性化宿主細胞と称され得る。
【0295】
このいわゆるＴ細胞の養子移入のプロトコルは、当該技術分野で公知である。概説を、Gattioni et al.およびMorgan et al.［Gattinoni, L. et al., Nat.Rev.Immunol. 6 (2006): 383-393；Morgan, R. A. et al., Science 314 (2006): 126-129］で見出し得る。
【0296】
本発明の目的のために、投与される本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質、本発明の第２の態様の核酸、本発明の第３の態様のベクター、本発明の第４の態様の宿主細胞、または本発明の第５の態様の医薬組成物の量または用量は、合理的な時間枠にかけて対象または動物において、例えば、治療的なまたは予防的な応答をもたらすために十分なものであってもよい。例えば、本発明の抗原結合タンパク質、核酸、ベクター、宿主細胞、または医薬組成物の用量は、投与の時点から、約２時間またはより長い期間、例えば、１２～２４時間またはより長い時間において、がん抗原に結合するため、またはがんを検出、処置もしくは予防するために十分であるべきである。ある特定の実施形態では、期間はよりいっそう長いものであり得る。用量は、本発明の抗原結合タンパク質、核酸、ベクター、宿主細胞、または医薬組成物の有効性および動物（例えば、ヒト）の状態の他に、処置される動物（例えば、ヒト）の体重により決定される。
【0297】
多くの他の方法を使用して、インビトロでＴ細胞を生成し得る。例えば、自己腫瘍浸潤リンパ球を、ＣＴＬの生成で使用し得る。Plebanski et al. (Plebanski, M. et al., Eur.J Immunol 25 (1995): 1783-1787)は、Ｔ細胞の調製において自己末梢血リンパ球（ＰＬＢ）を使用した。同様に、Ｂ細胞を、自己Ｔ細胞の製造で使用し得る。
【0298】
Ｔ細胞の調製では同種細胞も使用し得、方法が、参照により本明細書に組み込まれる米国特許第６８０５８６１号明細書で詳細に説明されている。
【0299】
ペプチドＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）に対して本発明の抗原結合タンパク質を発現する宿主細胞は、治療に有用である。そのため、本発明のさらなる態様は、本発明の上述の方法により得られる活性化宿主細胞を提供する。
【0300】
上記方法により製造される活性化宿主細胞は、ペプチドＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）を含むポリペプチドを異常発現する細胞を特異的に認識し得る。
【0301】
「異常発現される」により、本発明者らはまた、ポリペプチドが、正常な（健康な）組織の発現レベルと比較して過剰発現されていること、または腫瘍が由来する組織では遺伝子がサイレントであるが腫瘍内では遺伝子が発現されることも意味する。「過剰発現される」により、本発明者らは、ポリペプチドが、正常組織中に存在するレベルの少なくとも１．２倍のレベルで存在することを意味しており、好ましくは、正常組織中に存在するレベルの少なくとも２倍、より好ましくは少なくとも５倍または１０倍のレベルで存在することを意味している。
【0302】
ある態様では、宿主細胞（特に、Ｔ細胞）は、その抗原結合タンパク質（特に、そのＴＣＲ）を介してＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体と相互作用する（例えば結合する）ことにより、細胞を認識する。宿主細胞は、ペプチドＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）を含むポリペプチドを標的細胞が異常発現する患者の標的細胞を殺滅する方法で有用であり、この患者に、活性化宿主細胞の有効数を投与する。患者に投与されるＴ細胞は、患者に由来し得、上述したように活性化され得る（即ち，自己Ｔ細胞である）。あるいは、Ｔ細胞は、患者由来ではないが、別の個体由来である（即ち、それらは異種Ｔ細胞である）。そのような場合には、これは、個体が健康な個体である場合に好ましい。「健康な個体」により、本発明者らは、個体が、一般に良好な健康状態であり、好ましくは、適格性の免疫系を有しており、より好ましくは、容易に検査されて検出され得る任意の疾患に罹患していないことを意味する。
【0303】
インビボでは、本発明に係るＣＤ８陽性Ｔ細胞の標的細胞は、腫瘍の細胞（ＭＨＣクラスＩＩを発現することがある）および／または腫瘍（腫瘍細胞）を取り囲む間質細胞（ＭＨＣクラスＩＩも発現することがある）であり得る［Dengjel, J. et al., Clin Cancer Res 12 (2006): 4163-4170］。
【0304】
診断用途
ＣＴ４５は、本明細書の上記で定義されたがんの表面上で発現される。ＣＴ４５抗原ペプチドは、がんマーカーを構成し、従って、抗がん治療の有効性を示すために使用される可能性を有するか、または疾患の再発の検出のために使用される可能性を有する。
ＣＴ４５は、本明細書の上記で定義されたがんの表面上で発現される。ＣＴ４５抗原ペプチドは、がんマーカーを構成し、従って、抗がん治療の有効性を示すために使用される可能性を有するか、または疾患の再発の検出のために使用される可能性を有する。
【0305】
そのため、別の態様では、本発明は、診断薬としての使用のための、特に、インビボ診断薬としての使用のための、第１の態様の抗原結合タンパク質、第２の態様の核酸、第３の態様のベクター、第４の態様の宿主細胞、または第５の態様の医薬組成物を提供する。好ましい実施形態では、この診断薬は、増殖性疾患の診断用である。より好ましい実施形態では、診断剤は、ＭＨＣタンパク質との複合体中のＫＩＦＥＭＬＥＧＶ（配列番号１３８）のアミノ酸配列を含むか、またはからなるペプチドを提示するがんの診断用であり、好ましくは、前記がんは、肺がん、ＮＳＣＬＣ、胆嚢がん、胆管がん、リンパ節がん、卵巣がん、食道がん、肝臓がん、子宮がんおよび黒色腫からなるがんの群から選択される。
【0306】
ある実施形態では、本発明の抗原結合タンパク質は、治療薬に対する患者の感受性を決定するために、抗がん治療の有効性をモニタリングするために、または処置後の疾患の再発を検出するために、ＣＴ４５を発現する腫瘍を標的とする治療に関連するアッセイの構成要素として使用される。
【0307】
そのため、本発明のさらなる目的は、対象中でのＣＴ４５発現をインビボで検出するための使用のための、または対象の生物学的サンプル中でのＣＴ４５発現をエクスビボもしくはインビトロで検出するための使用のための、本発明に係る抗原結合タンパク質に関する。前記検出は、特に、
ａ）対象におけるがんの存在の診断、または
ｂ）ＣＴ４５を標的とする治療剤に対する、がんを有する患者の感受性の決定、または
ｃ）腫瘍細胞上のＣＴ４５抗原ペプチドの提示を検出することによる；抗ＣＴ４５がん療法の有効性のモニタリング、もしくは、特に本発明の抗原結合タンパク質を用いた療法のための、抗ＣＴ４５がん療法後のがんの再発の検出
のために意図されてもよい。
ａ）対象におけるがんの存在の診断、または
ｂ）ＣＴ４５を標的とする治療剤に対する、がんを有する患者の感受性の決定、または
ｃ）腫瘍細胞上のＣＴ４５抗原ペプチドの提示を検出することによる；抗ＣＴ４５がん療法の有効性のモニタリング、もしくは、特に本発明の抗原結合タンパク質を用いた療法のための、抗ＣＴ４５がん療法後のがんの再発の検出
のために意図されてもよい。
【0308】
一実施形態では、抗原結合タンパク質は、インビトロまたはエクスビボでの使用のために意図される。
【0309】
さらに別の態様では、本発明は、生物学的サンプル中のがんを検出するインビトロの方法であって、（ａ）生物学的サンプルを本発明の第１の態様の抗原結合タンパク質と接触させる工程、および（ｂ）生物学的サンプルへの抗原結合タンパク質の結合を検出する工程を含む方法に関する。
【0310】
キット
最後に、本発明はまた、本発明の少なくとも１種の抗原結合タンパク質を含むキットも提供する。
最後に、本発明はまた、本発明の少なくとも１種の抗原結合タンパク質を含むキットも提供する。
【0311】
１つの実施形態では、キットは、
ａ）本明細書において上記の「抗原結合タンパク質」セクション中で定義されている本発明の少なくとも１つの抗原結合タンパク質、前記抗原結合タンパク質をコードする核酸、前記核酸を含むベクター、または前記抗原結合タンパク質、核酸および／もしくはベクターを含む宿主細胞、
ｂ）適宜、パッケージング材料、ならびに
ｃ）適宜、前記抗原結合タンパク質が、がんを処置するために有効であることまたはがんの処置のための使用のためのものであることを示す前記パッケージング材料内に含有される標識またはパッケージング挿入物
を含む。
ａ）本明細書において上記の「抗原結合タンパク質」セクション中で定義されている本発明の少なくとも１つの抗原結合タンパク質、前記抗原結合タンパク質をコードする核酸、前記核酸を含むベクター、または前記抗原結合タンパク質、核酸および／もしくはベクターを含む宿主細胞、
ｂ）適宜、パッケージング材料、ならびに
ｃ）適宜、前記抗原結合タンパク質が、がんを処置するために有効であることまたはがんの処置のための使用のためのものであることを示す前記パッケージング材料内に含有される標識またはパッケージング挿入物
を含む。
【0312】
好ましい実施形態では、キットは、本発明の抗原結合タンパク質をコードする核酸、またはこの核酸を含むベクターを含む。キットは、細胞、好ましくはＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、より好ましくはＴ細胞の表面上での抗原結合タンパク質の調節可能な発現のための使用説明書をさらに含んでもよい。
【0313】
本開示のキットは、細胞、好ましくはＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、より好ましくはＴ細胞の表面上の抗原結合タンパク質の調節可能な発現のために有用な任意の他の試薬、例えば核酸または発現ベクターを細胞に導入するために有用なトランスフェクション／形質導入試薬をさらに含んでもよい。
【0314】
キットが、本発明の抗原結合タンパク質をコードする核酸、またはこの核酸を含むベクターを含む宿主細胞、即ち、本発明の抗原結合タンパク質を発現可能な宿主細胞を含むこともまた好ましいことがある。
【0315】
キットの構成要素は別々の容器中に存在してもよく、または複数の構成要素は単一の容器中に存在してもよい。好適な容器として、単一のチューブ、またはプレート（例えば、９６ウェルプレート、３８４ウェルプレート等）の１つもしくは複数のウェル等が挙げられる。
【0316】
関連する実施形態では、本発明の少なくとも１種の抗原結合タンパク質は、単室および／または多室のプレ充填シリンジ［例えば、液体シリンジおよび凍結乾燥シリンジ（ｌｙｏｓｙｒｉｎｇｅ）］に入っている。
【0317】
一実施形態では、本発明は、単回容量投与単位を製造するためのキットを包含する。
【0318】
従って、一実施形態では、本発明のキットのａ）で言及されている本発明の少なくとも１種の抗原結合タンパク質は、第１の容器に入っている本発明の乾燥抗原結合タンパク質である。次いで、このキットは、水性製剤が入っている第２の容器をさらに含む。
【0319】
従って、一実施形態では、キットは、
ａ）本明細書の上記「抗原結合タンパク質」セクションで定義されている本発明の少なくとも１種の乾燥抗原結合タンパク質が入っている第１の容器、
ｂ）水性製剤が入っている第２の容器、
ｃ）適宜パッケージング材料、および
ｄ）適宜前記抗原結合タンパク質ががんの処置に有効であるかまたはがんの処置のための使用に有効であることを示す、前記パッケージング材料に含まれるラベルまたはパッケージング挿入物
を含む。
ａ）本明細書の上記「抗原結合タンパク質」セクションで定義されている本発明の少なくとも１種の乾燥抗原結合タンパク質が入っている第１の容器、
ｂ）水性製剤が入っている第２の容器、
ｃ）適宜パッケージング材料、および
ｄ）適宜前記抗原結合タンパク質ががんの処置に有効であるかまたはがんの処置のための使用に有効であることを示す、前記パッケージング材料に含まれるラベルまたはパッケージング挿入物
を含む。
【0320】
水性製剤は、典型的には、本明細書の上記「医薬組成物」セクションで定義されている薬学的に許容される担体を含む水溶液である。
【0321】
関連する実施形態では、「第１の容器」および「第２の」容器は、多室のプレ充填シリンジ（例えば、凍結乾燥シリンジ）のチャンバーを指す。
【0322】
本願全体を通して、「および／または」という用語は、これが接続する場合の内の１つまたは複数が起こり得ることを包含すると解釈されるべき文法上の接続詞である。例えば、「そのような天然配列タンパク質を、標準的な組換え方法および／または合成方法を使用して調製し得る」という文言は、天然配列タンパク質を、標準的な組換え方法および合成方法を使用して調製し得ること、または天然配列タンパク質を、標準的な組換え方法を使用して調製し得ること、または天然配列タンパク質を、合成方法を使用して調製し得ることを示す。
【0323】
さらに、本願全体を通して、「含む」という用語は、具体的に言及された全ての特徴だけでなく、任意の、追加の、不特定のものも包含すると解釈されるべきである。本明細書で使用される場合、「含む」という用語の使用はまた、具体的に言及された特徴以外の特徴が存在していない（即ち、「からなる」）実施形態も開示する。
【0324】
さらに、不定冠詞「ａ」または「ａｎ」は、複数を除外しない。ある特定の手段が相互に異なる従属請求項で列挙されているという単なる事実は、これらの手段の組合せが有利に使用され得ないことを示すものではない。
【0325】
これより、本発明を、下記の図面および実施例を参照してより詳細に説明する。本明細書で引用されている全ての文献および特許文献は、参照により本明細書に組み込まれる。本発明を、下記の説明において詳細に示して説明しているが、実施例は例示的なものであり限定的ではないと考えられるべきである。
【図面の簡単な説明】
【0326】
【図1-1】ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰペプチドロードＴ２細胞の殺滅効率により測定された機能的なアビディティ（ＥＣ５０）。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、滴定された量のＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードし、次に特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（塗りつぶした丸および菱形記号により示される）。試験されたＴＣＲの半数最大殺滅効率を算出することにより機能的なアビディティを評価した。
【図1-2】ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰペプチドロードＴ２細胞の殺滅効率により測定された機能的なアビディティ（ＥＣ５０）。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、滴定された量のＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードし、次に特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（塗りつぶした丸および菱形記号により示される）。試験されたＴＣＲの半数最大殺滅効率を算出することにより機能的なアビディティを評価した。
【図1-3】ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰペプチドロードＴ２細胞の殺滅効率により測定された機能的なアビディティ（ＥＣ５０）。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、滴定された量のＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードし、次に特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（塗りつぶした丸および菱形記号により示される）。試験されたＴＣＲの半数最大殺滅効率を算出することにより機能的なアビディティを評価した。
【図1-4】ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰペプチドロードＴ２細胞の殺滅効率により測定された機能的なアビディティ（ＥＣ５０）。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、滴定された量のＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードし、次に特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（塗りつぶした丸および菱形記号により示される）。試験されたＴＣＲの半数最大殺滅効率を算出することにより機能的なアビディティを評価した。
【図1-5】ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰペプチドロードＴ２細胞の殺滅効率により測定された機能的なアビディティ（ＥＣ５０）。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、滴定された量のＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードし、次に特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（塗りつぶした丸および菱形記号により示される）。試験されたＴＣＲの半数最大殺滅効率を算出することにより機能的なアビディティを評価した。
【図2-1】配列類似ペプチドについての交差反応性の確認。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、ペプチド当たり１０μＭの濃度のＣＴ４５－ＩＰペプチド、１０の異なる配列類似ペプチド、無関連ペプチドコントロールＮＹＥＳＯ１－００１をそれぞれロードしたか、またはロードしなかった。それらのＴ２細胞を次に、特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（黒バー＝アッセイ１、ドナー１；赤バー＝アッセイ２、ドナー２）。
【図2-2】配列類似ペプチドについての交差反応性の確認。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、ペプチド当たり１０μＭの濃度のＣＴ４５－ＩＰペプチド、１０の異なる配列類似ペプチド、無関連ペプチドコントロールＮＹＥＳＯ１－００１をそれぞれロードしたか、またはロードしなかった。それらのＴ２細胞を次に、特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（黒バー＝アッセイ１、ドナー１；赤バー＝アッセイ２、ドナー２）。
【図2-3】配列類似ペプチドについての交差反応性の確認。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、ペプチド当たり１０μＭの濃度のＣＴ４５－ＩＰペプチド、１０の異なる配列類似ペプチド、無関連ペプチドコントロールＮＹＥＳＯ１－００１をそれぞれロードしたか、またはロードしなかった。それらのＴ２細胞を次に、特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（黒バー＝アッセイ１、ドナー１；赤バー＝アッセイ２、ドナー２）。
【図2-4】配列類似ペプチドについての交差反応性の確認。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、ペプチド当たり１０μＭの濃度のＣＴ４５－ＩＰペプチド、１０の異なる配列類似ペプチド、無関連ペプチドコントロールＮＹＥＳＯ１－００１をそれぞれロードしたか、またはロードしなかった。それらのＴ２細胞を次に、特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（黒バー＝アッセイ１、ドナー１；赤バー＝アッセイ２、ドナー２）。
【図2-5】配列類似ペプチドについての交差反応性の確認。構成的にルシフェラーゼを発現するＴ２細胞に、ペプチド当たり１０μＭの濃度のＣＴ４５－ＩＰペプチド、１０の異なる配列類似ペプチド、無関連ペプチドコントロールＮＹＥＳＯ１－００１をそれぞれロードしたか、またはロードしなかった。それらのＴ２細胞を次に、特定のＴＣＲをトランスフェクトされたＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した。死にゆくＴ２細胞により放出される上清中のルシフェラーゼ活性を測定することにより殺滅を分析した。２人の異なるドナーの細胞を用いてアッセイを２回繰り返した（黒バー＝アッセイ１、ドナー１；赤バー＝アッセイ２、ドナー２）。
【図3-1】ＴＣＲ表面染色。ｐＨＬＡ－Ｄｅｘｔｒａｍｅｒ結合により測定されたＴＣＲ発現のフローサイトメトリー評価。ヒストグラムは、ＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ２＊０２デキストラマーを用いた染色後のＴＣＲ－ｍＲＮＡをエレクトロポレートされたＴ細胞（黒線）およびＭｏｃｋ－ＴＣＲコントロール（ライトグレーの点線）を示す。陽性事象パーセントをプロットで示す。Ｍｏｃｋ－ＴＣＲコントロールは、デキストラマー陰性区画用の参照として使用している。
【図3-2】ＴＣＲ表面染色。ｐＨＬＡ－Ｄｅｘｔｒａｍｅｒ結合により測定されたＴＣＲ発現のフローサイトメトリー評価。ヒストグラムは、ＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ２＊０２デキストラマーを用いた染色後のＴＣＲ－ｍＲＮＡをエレクトロポレートされたＴ細胞（黒線）およびＭｏｃｋ－ＴＣＲコントロール（ライトグレーの点線）を示す。陽性事象パーセントをプロットで示す。Ｍｏｃｋ－ＴＣＲコントロールは、デキストラマー陰性区画用の参照として使用している。
【図4】腫瘍細胞株への有効性。我々の関心対象のＴＣＲを発現するＴ細胞のありまたはなしで共培養されたＲＦＰを発現する腫瘍細胞株の生細胞モニタリング。腫瘍細胞を表す赤色カウントを４８ｈの期間にかけて定量化し、時点０ｈに対して正規化した。左側のプロットは腫瘍細胞株ＮＣＩＨ１７０３を示し、右側のプロットは細胞株Ａ３７５の増殖を示す。Ｍｏｃｋ－ＴＣＲ（陰性コントロール、上）、ＴＣＲ－９（中央）およびＴＣＲ－７（下）をエレクトロポレートされたＣＤ８＋ Ｔ細胞を示す。陽性コントロールとして１０μＭのＣＴ４５－ＩＰペプチドを追加的にロードされた標的細胞（中央に点を伴う丸）の他に、エフェクター細胞なしの標的細胞（アステリスク）および関心対象のＴＣＲを発現する異なるＥ：Ｔ比のエフェクター細胞（灰色の異なる濃淡の丸）を使用した。
【発明を実施するための形態】
【実施例】
【0327】
材料および方法
ＴＣＲの同定
アルファおよびベータＴＣＲ鎖配列を健常ドナーのＴ細胞から単離した。ペプチド特異的Ｔ細胞の濃縮を確実にするために、細胞をWalter et al., 2003 J Immunol., Nov 15;171(10):4974-8に記載されるようにＣＴ４５－ＩＰ－ＭＨＣおよびＣＤ２８（Ｐｒｉｍｉｎｇ）で被覆した人工的な抗原提示細胞を用いて繰り返し刺激し、その後に、ＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ＊０２四量体を使用して単一細胞を選別したか、または代替的にＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞を用いて刺激した。十分な拡大増殖後に、ＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ＊０２四量体を使用して細胞を選別した。
ＴＣＲの同定
アルファおよびベータＴＣＲ鎖配列を健常ドナーのＴ細胞から単離した。ペプチド特異的Ｔ細胞の濃縮を確実にするために、細胞をWalter et al., 2003 J Immunol., Nov 15;171(10):4974-8に記載されるようにＣＴ４５－ＩＰ－ＭＨＣおよびＣＤ２８（Ｐｒｉｍｉｎｇ）で被覆した人工的な抗原提示細胞を用いて繰り返し刺激し、その後に、ＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ＊０２四量体を使用して単一細胞を選別したか、または代替的にＣＴ４５－ＩＰロードＴ２細胞を用いて刺激した。十分な拡大増殖後に、ＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ＊０２四量体を使用して細胞を選別した。
【0328】
例えばMolecular Cloning, Laboratory Manual, Fourth Edition by Green and Sambrookに記載されるように標準的な方法、例えば５’ ＲＡＣＥおよびサンガーシークエンシングを介してＴＣＲヌクレオチド配列を得た。ＴＣＲのＶ領域およびＪ領域をコードする遺伝子を表２に列挙する。アノテーションは、参照データベースとしてＩＭＧＴ／ＧＥＮＥ－ＤＢ（バージョン：２８／１１／２０１９）を使用してＧｅｎｅＤａｔａ １１．０．１により行った。ＴＣＲアミノ酸配列を表３に列挙する。
【0329】
【表2】
【0330】
【表3-1】
【表3-2】
【表3-3】
【表3-4】
【表3-5】
【表3-6】
【表3-7】
【表3-8】
【表3-9】
【表3-10】
【表3-11】
【表3-12】
【0331】
ＴＣＲの再発現
ヒト定常鎖ドメインを、疎水性を増強するための膜貫通ドメイン中の追加の突然変異を有するそれらのマウス対応物により交換した。両方の改変は、Jin et al., JCI Insight. 2018;3(8):e99488において記載されている。
ヒト定常鎖ドメインを、疎水性を増強するための膜貫通ドメイン中の追加の突然変異を有するそれらのマウス対応物により交換した。両方の改変は、Jin et al., JCI Insight. 2018;3(8):e99488において記載されている。
【0332】
機能的な特性を評価するために、同定されたＴＣＲを、ＴＣＲ ｍＲＮＡエレクトロポレーション技術を使用して健常ドナーの初代Ｔ細胞中で再発現させた。簡潔に述べれば、Ｔ７転写をＴＣＲアルファおよびベータ鎖ヌクレオチド配列のＤＮＡ鋳型上で行った。得られたＴＣＲ ｍＲＮＡを、共培養実験において検証された外因性ＴＣＲの一過性発現のための予備活性化されたＴ細胞のエレクトロポレーションのために使用した。
【0333】
共培養アッセイ（機能的なアビディティ、特異性、およびＴＣＲモチーフの評価）
ＴＣＲの機能的な特性を、Ｔ２細胞を用いた共培養実験において評価した。ＣＤ８＋ Ｔ細胞を予備刺激し、ＴＣＲ ｍＲＮＡをエレクトロポレートした。共培養の日に、ルシフェラーゼを形質導入されたＴ２細胞に、異なる濃度のペプチドＣＴ４５－ＩＰ（配列番号１３８）（機能的なアビディティの評価、ＥＣ５０）、１０μＭの濃度の配列類似ペプチド（配列番号１４６～１５５）、またはそれぞれのＴＣＲの平均ＥＣ５０を１０～３０倍上回る濃度範囲のＣＴ４５－ＩＰペプチドのアラニン置換変異体（配列番号１３９～１４５）（ＴＣＲモチーフ決定）のいずれかをロードした。コントロールとして、１０μＭの濃度の無関連ペプチドＮＹＥＳＯ１－００１（配列番号１８８）およびロードされていないＴ２細胞を使用した。簡潔に述べれば、Ｔ２細胞をそれぞれの量のペプチドと２時間インキュベートし、その後に洗浄および採取した。
ＴＣＲの機能的な特性を、Ｔ２細胞を用いた共培養実験において評価した。ＣＤ８＋ Ｔ細胞を予備刺激し、ＴＣＲ ｍＲＮＡをエレクトロポレートした。共培養の日に、ルシフェラーゼを形質導入されたＴ２細胞に、異なる濃度のペプチドＣＴ４５－ＩＰ（配列番号１３８）（機能的なアビディティの評価、ＥＣ５０）、１０μＭの濃度の配列類似ペプチド（配列番号１４６～１５５）、またはそれぞれのＴＣＲの平均ＥＣ５０を１０～３０倍上回る濃度範囲のＣＴ４５－ＩＰペプチドのアラニン置換変異体（配列番号１３９～１４５）（ＴＣＲモチーフ決定）のいずれかをロードした。コントロールとして、１０μＭの濃度の無関連ペプチドＮＹＥＳＯ１－００１（配列番号１８８）およびロードされていないＴ２細胞を使用した。簡潔に述べれば、Ｔ２細胞をそれぞれの量のペプチドと２時間インキュベートし、その後に洗浄および採取した。
【0334】
モデルＴＣＲ １Ｇ４－ａ９５Ｌｙをエレクトロポレートされた細胞の他に、外因性ＴＣＲを有しないｍｏｃｋエレクトロポレートＴ細胞をコントロールとした。Ｔ細胞およびペプチドロードＴ２細胞を１：１の比で播種し、上清採取まで２４ｈインキュベートした。上清を、ペプチド特異的Ｔ細胞により殺滅されたアポトーシス／ネクローシスＴ２細胞により放出されるルシフェラーゼの存在についての分析に供した。特異的な基質を加えることにより、上清中に存在するルシフェラーゼの量を、マイクロプレートリーダーにおいて化学発光シグナルを測定することにより決定した。
【0335】
ＣＤ４＋ Ｔ細胞における機能性についての試験
ＣＤ３＋ Ｔ細胞を刺激し、ＴＣＲ ｍＲＮＡをエレクトロポレートした。終夜のインキュベーション後に、ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞を、１０μＭのＣＴ４５－ＩＰ（配列番号１３８）または１０μＭの無関連ＮＹＥＳＯ１－００１（配列番号１８８）ペプチドのいずれかをロードされたＴ２細胞と１：１の比で共培養した。共培養の開始の直後に、サイトカイン分泌遮断試薬を加え、３７℃で５ｈインキュベートした。その後に、Ｔ細胞を、異なる表面マーカー、例えばＣＤ４およびＣＤ８のための蛍光標識された抗体で染色した。固定および透過処理の後に、細胞を細胞内サイトカイン（ＴＮＦ－αおよびＩＦＮ－γ）について染色し、フローサイトメーター上で分析した（データ示さず）。
ＣＤ３＋ Ｔ細胞を刺激し、ＴＣＲ ｍＲＮＡをエレクトロポレートした。終夜のインキュベーション後に、ＴＣＲをトランスフェクトされたＴ細胞を、１０μＭのＣＴ４５－ＩＰ（配列番号１３８）または１０μＭの無関連ＮＹＥＳＯ１－００１（配列番号１８８）ペプチドのいずれかをロードされたＴ２細胞と１：１の比で共培養した。共培養の開始の直後に、サイトカイン分泌遮断試薬を加え、３７℃で５ｈインキュベートした。その後に、Ｔ細胞を、異なる表面マーカー、例えばＣＤ４およびＣＤ８のための蛍光標識された抗体で染色した。固定および透過処理の後に、細胞を細胞内サイトカイン（ＴＮＦ－αおよびＩＦＮ－γ）について染色し、フローサイトメーター上で分析した（データ示さず）。
【0336】
共刺激分子ＣＤ８のレンチウイルス併用形質導入
ＭＨＣクラスＩ制限ＴＣＲの形質導入後にＣＤ４ Ｔ細胞を免疫応答に関与させるために、共刺激分子ＣＤ８を用いる併用形質導入を実行した。その目的のために、ＴＣＲ鎖の他にＣＤ８分子をコードするレンチウイルスベクターを、予備刺激されたＣＤ３＋ Ｔ細胞の形質導入のために使用した。ＩＬ－２の追加と共にプレートに被覆されたＣＤ３および抗ＣＤ２８を使用してＴ細胞を２４ｈ活性化させた。予備滴定された濃縮されたレンチウイルス上清を、レンチウイルス粒子の形質導入増強用のアジュバント、例えば、Ｌｅｎｔｉｂｏｏｓｔ（登録商標）試薬（Ｓｉｒｉｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈ）と共に細胞に加えた。Ｔ細胞をより大きい細胞培養フラスコに連続的に移しながら、増加容量の培地および減少濃度のＩＬ－２を使用して１０日にかけてＴ細胞を拡大増殖させた。Ｔ細胞の形質導入効率および静止状態を細胞の凍結に先立ってフローサイトメトリーを介して確認した。その後に、ＣＴ４５－ＩＰ提示腫瘍細胞に対する殺滅効率におけるＣＤ８併用トランスフェクションの効果を生細胞モニタリング殺滅アッセイにおいて分析した（データ示さず）。
ＭＨＣクラスＩ制限ＴＣＲの形質導入後にＣＤ４ Ｔ細胞を免疫応答に関与させるために、共刺激分子ＣＤ８を用いる併用形質導入を実行した。その目的のために、ＴＣＲ鎖の他にＣＤ８分子をコードするレンチウイルスベクターを、予備刺激されたＣＤ３＋ Ｔ細胞の形質導入のために使用した。ＩＬ－２の追加と共にプレートに被覆されたＣＤ３および抗ＣＤ２８を使用してＴ細胞を２４ｈ活性化させた。予備滴定された濃縮されたレンチウイルス上清を、レンチウイルス粒子の形質導入増強用のアジュバント、例えば、Ｌｅｎｔｉｂｏｏｓｔ（登録商標）試薬（Ｓｉｒｉｏｎ Ｂｉｏｔｅｃｈ）と共に細胞に加えた。Ｔ細胞をより大きい細胞培養フラスコに連続的に移しながら、増加容量の培地および減少濃度のＩＬ－２を使用して１０日にかけてＴ細胞を拡大増殖させた。Ｔ細胞の形質導入効率および静止状態を細胞の凍結に先立ってフローサイトメトリーを介して確認した。その後に、ＣＴ４５－ＩＰ提示腫瘍細胞に対する殺滅効率におけるＣＤ８併用トランスフェクションの効果を生細胞モニタリング殺滅アッセイにおいて分析した（データ示さず）。
【0337】
ＴＣＲ表面染色
エレクトロポレートおよび予備活性化されたＣＤ８＋ Ｔ細胞を用いて表面マーカー染色を行った。この目的のために、抗ＣＤ８、ＣＤ３および／またはｍＴＣＲＢ抗体を使用した他に、蛍光標識されたＤｅｘｔｒａｍｅｒ（コンジュゲートされたＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ＊０２または無関連ＮＹＥＳＯ１－００１－ＨＬＡ－Ａ＊０２を有するデキストラマー骨格）を用いてＴＣＲ染色を行った。３０分後に、細胞を洗浄し、固定し、その後にフローサイトメトリーにより分析した。デキストラマー陽性細胞を定義するために、ゲートを、無関連ペプチド－ＭＨＣデキストラマーを用いて染色された細胞のシグナルに従って設定した。
エレクトロポレートおよび予備活性化されたＣＤ８＋ Ｔ細胞を用いて表面マーカー染色を行った。この目的のために、抗ＣＤ８、ＣＤ３および／またはｍＴＣＲＢ抗体を使用した他に、蛍光標識されたＤｅｘｔｒａｍｅｒ（コンジュゲートされたＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ＊０２または無関連ＮＹＥＳＯ１－００１－ＨＬＡ－Ａ＊０２を有するデキストラマー骨格）を用いてＴＣＲ染色を行った。３０分後に、細胞を洗浄し、固定し、その後にフローサイトメトリーにより分析した。デキストラマー陽性細胞を定義するために、ゲートを、無関連ペプチド－ＭＨＣデキストラマーを用いて染色された細胞のシグナルに従って設定した。
【0338】
生細胞モニタリング殺滅アッセイ
赤色蛍光タンパク質（ＲＦＰ）を発現する腫瘍細胞株の増殖を、生細胞イメージングシステムを使用して、赤色物体カウントを経時的に定量化することによりモニターした。細胞株ＮＣＩＨ１７０３およびＡ３７５を、本発明のＴＣＲを発現するＴ細胞と９：１、３：１もしくは１：１のＥ：Ｔ比で共培養したか、またはＴ細胞なしで培養し、４８ｈの期間にかけてモニターした。陽性コントロールとして、標的細胞に１０μＭのペプチドＣＴ４５－ＩＰをロードした。経時的な腫瘍細胞株増殖の低下は腫瘍細胞殺滅についての指標である。
［実施例１］
赤色蛍光タンパク質（ＲＦＰ）を発現する腫瘍細胞株の増殖を、生細胞イメージングシステムを使用して、赤色物体カウントを経時的に定量化することによりモニターした。細胞株ＮＣＩＨ１７０３およびＡ３７５を、本発明のＴＣＲを発現するＴ細胞と９：１、３：１もしくは１：１のＥ：Ｔ比で共培養したか、またはＴ細胞なしで培養し、４８ｈの期間にかけてモニターした。陽性コントロールとして、標的細胞に１０μＭのペプチドＣＴ４５－ＩＰをロードした。経時的な腫瘍細胞株増殖の低下は腫瘍細胞殺滅についての指標である。
［実施例１］
【0339】
機能的なアビディティ
１５個全ての同定されたＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲは、図１に示される半数最大殺滅能力ＥＣ５０として表されるペプチド滴定実験により測定された場合の高い機能的なアビディティを示す。測定されたＥＣ５０値は０．１５ｎＭ～５９．５ｎＭの範囲に及ぶ。特に、ＥＣ５０値は、７．７８ｎＭ（ＴＣＲ－１）；４．６９ｎＭ（ＴＣＲ－２）；１．０２ｎＭ（ＴＣＲ－３）；１．３１ｎＭ（ＴＣＲ－４）；１．３２ｎＭ（ＴＣＲ－５）；３．２５ｎＭ（ＴＣＲ－６）；０．４８ｎＭ（ＴＣＲ－７）；６．５２ｎＭ（ＴＣＲ－８）；０．１５ｎＭ（ＴＣＲ－９）；８．７５ｎＭ（ＴＣＲ－１０）；５９．５０ｎＭ（ＴＣＲ－１１）；４７．４７ｎＭ（ＴＣＲ－１２）；１１．３８ｎＭ（ＴＣＲ－１３）；１７．６９ｎＭ（ＴＣＲ－１４）；１８．６０ｎＭ（ＴＣＲ－１５）である。
［実施例２］
１５個全ての同定されたＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲは、図１に示される半数最大殺滅能力ＥＣ５０として表されるペプチド滴定実験により測定された場合の高い機能的なアビディティを示す。測定されたＥＣ５０値は０．１５ｎＭ～５９．５ｎＭの範囲に及ぶ。特に、ＥＣ５０値は、７．７８ｎＭ（ＴＣＲ－１）；４．６９ｎＭ（ＴＣＲ－２）；１．０２ｎＭ（ＴＣＲ－３）；１．３１ｎＭ（ＴＣＲ－４）；１．３２ｎＭ（ＴＣＲ－５）；３．２５ｎＭ（ＴＣＲ－６）；０．４８ｎＭ（ＴＣＲ－７）；６．５２ｎＭ（ＴＣＲ－８）；０．１５ｎＭ（ＴＣＲ－９）；８．７５ｎＭ（ＴＣＲ－１０）；５９．５０ｎＭ（ＴＣＲ－１１）；４７．４７ｎＭ（ＴＣＲ－１２）；１１．３８ｎＭ（ＴＣＲ－１３）；１７．６９ｎＭ（ＴＣＲ－１４）；１８．６０ｎＭ（ＴＣＲ－１５）である。
［実施例２］
【0340】
特異性およびＴＣＲモチーフ
本明細書に記載されるＴＣＲを、１０個のＣＴ４５－ＩＰ配列類似ペプチド（配列番号１４６～１５５）を認識する能力を試験することによりそれらの特異性プロファイルについて試験した。ＣＴ４５－ＩＰおよびＣＴ４５－ＩＰ配列類似ペプチドを用いたローディングは、低いシグナルを検出するために、１０μＭの非常に高い濃度で行った。ＴＣＲは、ＣＴ４５－ＩＰ以外の別のペプチドへの結合を示さなかった。図２において描写されるように、ペプチドＳＰ－０５－０００４（配列番号１４９）に対する軽微な結合シグナルがＴＣＲ－９およびＴＣＲ－６について検出された。ＴＣＲのキャラクタリゼーションはまた、表４に列挙されているＣＴ４５－ＩＰペプチドに対するＴＣＲ結合モチーフの決定を伴った。この目的のために、ＣＴ４５－ＩＰアラニン交換ペプチド変異体（配列番号１３９～１４５）を、１５個全てのＴＣＲを用いた共培養実験において試験した。アラニン交換ペプチドは、それぞれのＴＣＲの平均ＥＣ５０を１０～３０倍上回る濃度範囲において試験した。関連する位置は数（ペプチド中のアミノ酸の位置を指す）により示され、関連しない位置はハイフンにより表され、試験されなかった位置はｘにより標識される。
本明細書に記載されるＴＣＲを、１０個のＣＴ４５－ＩＰ配列類似ペプチド（配列番号１４６～１５５）を認識する能力を試験することによりそれらの特異性プロファイルについて試験した。ＣＴ４５－ＩＰおよびＣＴ４５－ＩＰ配列類似ペプチドを用いたローディングは、低いシグナルを検出するために、１０μＭの非常に高い濃度で行った。ＴＣＲは、ＣＴ４５－ＩＰ以外の別のペプチドへの結合を示さなかった。図２において描写されるように、ペプチドＳＰ－０５－０００４（配列番号１４９）に対する軽微な結合シグナルがＴＣＲ－９およびＴＣＲ－６について検出された。ＴＣＲのキャラクタリゼーションはまた、表４に列挙されているＣＴ４５－ＩＰペプチドに対するＴＣＲ結合モチーフの決定を伴った。この目的のために、ＣＴ４５－ＩＰアラニン交換ペプチド変異体（配列番号１３９～１４５）を、１５個全てのＴＣＲを用いた共培養実験において試験した。アラニン交換ペプチドは、それぞれのＴＣＲの平均ＥＣ５０を１０～３０倍上回る濃度範囲において試験した。関連する位置は数（ペプチド中のアミノ酸の位置を指す）により示され、関連しない位置はハイフンにより表され、試験されなかった位置はｘにより標識される。
【0341】
【表4】
【0342】
ＣＤ４機能性
ＣＤ４＋ Ｔ細胞における機能性についての試験を上記のように行った。１５個の試験されたＴＣＲの中で、本発明者らは、ＣＤ８＋ Ｔ細胞の他にＣＤ４＋ Ｔ細胞において機能性を示すＴＣＲを同定した（データ示さず）。
［実施例４］
ＣＤ４＋ Ｔ細胞における機能性についての試験を上記のように行った。１５個の試験されたＴＣＲの中で、本発明者らは、ＣＤ８＋ Ｔ細胞の他にＣＤ４＋ Ｔ細胞において機能性を示すＴＣＲを同定した（データ示さず）。
［実施例４］
【0343】
表面発現
本明細書に記載されるＴＣＲの表面発現をＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ２＊０２デキストラマー染色により測定し、図３に示した。表面発現は、ＴＣＲ ｍＲＮＡエレクトロポレーション後のＣＤ３＋ Ｔ細胞におけるゲーティング後に０．５３％（ＴＣＲ－１１）～５５．５％（ＴＣＲ－５）の陽性事象で変動した。特に、表面発現は、８．９％（ＴＣＲ－１）；３９．１％（ＴＣＲ－２）；２７．２％（ＴＣＲ－３）；３９．１％（ＴＣＲ－４）；６１．１％（ＴＣＲ－５）；２．９％（ＴＣＲ－６）；５３．３％（ＴＣＲ－７）；６０．７％（ＴＣＲ－８）；４４．０％（ＴＣＲ－９）；５２．８％（ＴＣＲ－１０）；６．６％（ＴＣＲ－１１）；２０．１％（ＴＣＲ－１２）；５３．１％（ＴＣＲ－１３）；１１．６％（ＴＣＲ－１４）；２２．６％（ＴＣＲ－１５）であった。
［実施例５］
本明細書に記載されるＴＣＲの表面発現をＣＴ４５－ＩＰ－ＨＬＡ－Ａ２＊０２デキストラマー染色により測定し、図３に示した。表面発現は、ＴＣＲ ｍＲＮＡエレクトロポレーション後のＣＤ３＋ Ｔ細胞におけるゲーティング後に０．５３％（ＴＣＲ－１１）～５５．５％（ＴＣＲ－５）の陽性事象で変動した。特に、表面発現は、８．９％（ＴＣＲ－１）；３９．１％（ＴＣＲ－２）；２７．２％（ＴＣＲ－３）；３９．１％（ＴＣＲ－４）；６１．１％（ＴＣＲ－５）；２．９％（ＴＣＲ－６）；５３．３％（ＴＣＲ－７）；６０．７％（ＴＣＲ－８）；４４．０％（ＴＣＲ－９）；５２．８％（ＴＣＲ－１０）；６．６％（ＴＣＲ－１１）；２０．１％（ＴＣＲ－１２）；５３．１％（ＴＣＲ－１３）；１１．６％（ＴＣＲ－１４）；２２．６％（ＴＣＲ－１５）であった。
［実施例５］
【0344】
腫瘍細胞株に対する有効性
２つの腫瘍細胞株、細胞当たり約３０コピーのＣＴ４５－ＩＰを有するＡ３７５および細胞当たり約１５０コピーのＣＴ４５－ＩＰを有するＮＣＩＨ１７０３を、ＴＣＲ－９、ＴＣＲ－７またはＭｏｃｋ－ＴＣＲを発現するＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した（図４）。２つの細胞株を殺滅するためのそれらのＴＣＲの有効性を生細胞モニタリング実験において評価した。＜２の正規化された赤色物体カウントにより測定された場合に、Ｍｏｃｋ－ＴＣＲは腫瘍細胞増殖の有意な減少をもたらさないが、ＴＣＲ－９およびＴＣＲ－７は、６：１（ＴＣＲ－９）または１．８：１（ＴＣＲ－７）のＥ：Ｔ比においてＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードされた腫瘍細胞株（ＮＣＩＨ１７０３＆Ａ３７５）、６：１（ＴＣＲ－９）または１．８：１（ＴＣＲ－７）のＥ：Ｔ比において追加のペプチドローディングなしの腫瘍細胞株（ＮＣＩＨ１７０３＆Ａ３７５）、ならびに２：１（ＴＣＲ－９）または０．６：１（ＴＣＲ－７）および０．６：１（ＴＣＲ－９）または０．２：１（ＴＣＲ－７）のＥ：Ｔ比において腫瘍細胞株（ＮＩＣＩＨ１７０３）を効率的に殺滅する。
［実施例６］
２つの腫瘍細胞株、細胞当たり約３０コピーのＣＴ４５－ＩＰを有するＡ３７５および細胞当たり約１５０コピーのＣＴ４５－ＩＰを有するＮＣＩＨ１７０３を、ＴＣＲ－９、ＴＣＲ－７またはＭｏｃｋ－ＴＣＲを発現するＣＤ８＋ Ｔ細胞と共培養した（図４）。２つの細胞株を殺滅するためのそれらのＴＣＲの有効性を生細胞モニタリング実験において評価した。＜２の正規化された赤色物体カウントにより測定された場合に、Ｍｏｃｋ－ＴＣＲは腫瘍細胞増殖の有意な減少をもたらさないが、ＴＣＲ－９およびＴＣＲ－７は、６：１（ＴＣＲ－９）または１．８：１（ＴＣＲ－７）のＥ：Ｔ比においてＣＴ４５－ＩＰペプチドをロードされた腫瘍細胞株（ＮＣＩＨ１７０３＆Ａ３７５）、６：１（ＴＣＲ－９）または１．８：１（ＴＣＲ－７）のＥ：Ｔ比において追加のペプチドローディングなしの腫瘍細胞株（ＮＣＩＨ１７０３＆Ａ３７５）、ならびに２：１（ＴＣＲ－９）または０．６：１（ＴＣＲ－７）および０．６：１（ＴＣＲ－９）または０．２：１（ＴＣＲ－７）のＥ：Ｔ比において腫瘍細胞株（ＮＩＣＩＨ１７０３）を効率的に殺滅する。
［実施例６］
【0345】
安全性ウィンドウ
それぞれペプチドＣＴ４５－ＩＰおよびＳＰ－０５－０００４の滴定系列をロードされたＴ２細胞を使用して共培養アッセイを行った。ＥＣ５０ ＳＰ－０５－０００４をＥＣ５０ ＣＴ４５－ＩＰで割ることで安全性ウィンドウを決定した（データ示さず）。
［実施例７］
それぞれペプチドＣＴ４５－ＩＰおよびＳＰ－０５－０００４の滴定系列をロードされたＴ２細胞を使用して共培養アッセイを行った。ＥＣ５０ ＳＰ－０５－０００４をＥＣ５０ ＣＴ４５－ＩＰで割ることで安全性ウィンドウを決定した（データ示さず）。
［実施例７］
【0346】
ＣＴ４５－ＩＰ提示
ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドの検出頻度を初代および培養された腫瘍サンプルにおいて分析した。結果の要約を表５に示す。表において、＞０％の発現を＋として示し、≧１０％の発現を＋＋として示し、≧３０％の発現を＋＋＋として示す。提示が検出された腫瘍実体は、胆管がん（ＣＣＣ）、肝臓がん（ＨＣＣ）、皮膚がん（細胞株同定に起因して、ＭＥＬ）、リンパ節がん（ＮＨＬ）、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、卵巣がん（ＯＣ）、食道がん（ＯＳＣＡＲ）および子宮がん（ＵＥＣ）である。
ＣＴ４５－ＩＰ抗原ペプチドの検出頻度を初代および培養された腫瘍サンプルにおいて分析した。結果の要約を表５に示す。表において、＞０％の発現を＋として示し、≧１０％の発現を＋＋として示し、≧３０％の発現を＋＋＋として示す。提示が検出された腫瘍実体は、胆管がん（ＣＣＣ）、肝臓がん（ＨＣＣ）、皮膚がん（細胞株同定に起因して、ＭＥＬ）、リンパ節がん（ＮＨＬ）、非小細胞肺がん（ＮＳＣＬＣ）、卵巣がん（ＯＣ）、食道がん（ＯＳＣＡＲ）および子宮がん（ＵＥＣ）である。
【0347】
【表5】
【0348】
腫瘍細胞に対するＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲおよびＣＤ８を併用形質導入されたＣＤ４＋ Ｔ細胞の有効性
ＣＴ４５－ＩＰを提示する腫瘍細胞を、本明細書に記載されるＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲおよびＣＤ８を併用形質導入されたＣＤ４＋ Ｔ細胞またはＣＤ３＋ Ｔ細胞と共培養した。Ｔ細胞の殺滅有効性を生細胞モニタリング実験において評価した。ＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲおよびＣＤ８の併用形質導入で、＜２の正規化された赤色物体カウントにより測定された場合の腫瘍細胞株の効率的な殺滅が観察された（データ示さず）。
ＣＴ４５－ＩＰを提示する腫瘍細胞を、本明細書に記載されるＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲおよびＣＤ８を併用形質導入されたＣＤ４＋ Ｔ細胞またはＣＤ３＋ Ｔ細胞と共培養した。Ｔ細胞の殺滅有効性を生細胞モニタリング実験において評価した。ＣＴ４５－ＩＰ特異的ＴＣＲおよびＣＤ８の併用形質導入で、＜２の正規化された赤色物体カウントにより測定された場合の腫瘍細胞株の効率的な殺滅が観察された（データ示さず）。
【0349】
項目
１．主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、前記ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ前記抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、
１）ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
前記抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含み、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３のそれぞれは、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、
抗原結合タンパク質。
１．主要組織適合複合体（ＭＨＣ）タンパク質との複合体で存在しているＣＴ４５抗原ペプチドに特異的に結合する抗原結合タンパク質であって、前記ＣＴ４５抗原ペプチドは、配列番号１３８のアミノ酸配列（ＫＩＦＥＭＬＥＧＶ）を含むか、またはからなり、かつ前記抗原結合タンパク質は、相補性決定領域（ＣＤＲ）ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含む可変ドメインＶＡを含む第１のポリペプチドと、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含む可変ドメインＶＢを含む第２のポリペプチドとを含み、
１）ＣＤＲａ１は、配列番号１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号２１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１３３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号６３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ１は、配列番号９０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号９２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号６６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号９６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ１は、配列番号２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ１は、配列番号５３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号５５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号６０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ１は、配列番号７１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号７２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号７７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ１は、配列番号９９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号７５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１０４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ１は、配列番号８０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号８２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号８５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号８７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ１は、配列番号１０７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１０９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１１４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ１は、配列番号１２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１２７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号１１２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ１は、配列番号１１７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号１１９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号５８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号１２２のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号３５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号３８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号４０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ１は、配列番号２４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号２９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号３１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ１は、配列番号４３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲａ３は、配列番号４５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、ＣＤＲｂ１は、配列番号４８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ３は、配列番号５０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
前記抗原結合タンパク質は、１、２または３個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１およびＣＤＲｂ３配列を含み、ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１および／またはＣＤＲｂ３のそれぞれは、１、２または３個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、
抗原結合タンパク質。
【0350】
２．
１）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
前記抗原結合タンパク質は、１、２、３または４個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２配列を含み、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２のそれぞれは、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、
項目１に記載の抗原結合タンパク質。
１）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号２０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
２）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号６７のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
４）ＣＤＲａ２は、配列番号９１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
５）ＣＤＲａ２は、配列番号３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
６）ＣＤＲａ２は、配列番号５４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
７）ＣＤＲａ２は、配列番号１５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
８）ＣＤＲａ２は、配列番号１００のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号７６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
９）ＣＤＲａ２は、配列番号８１のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号８６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１０）ＣＤＲａ２は、配列番号１０８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１１）ＣＤＲａ２は、配列番号１２６のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号１１３のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１２）ＣＤＲａ２は、配列番号１１８のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号５９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１３）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
１４）ＣＤＲａ２は、配列番号２５のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号３０のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、または
１５）ＣＤＲａ２は、配列番号４４のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、かつＣＤＲｂ２は、配列番号４９のアミノ酸配列を含むか、もしくはからなり、
前記抗原結合タンパク質は、１、２、３または４個よりも多くのアミノ酸突然変異を有しない前記ＣＤＲａ２およびＣＤＲｂ２配列を含み、ＣＤＲａ２および／またはＣＤＲｂ２のそれぞれは、１、２、３または４個のアミノ酸突然変異を含んでもよい、
項目１に記載の抗原結合タンパク質。
【0351】
３．前記抗原結合タンパク質は、前記ＣＴ４５抗原ペプチドとＭＨＣタンパク質との複合体に特異的に結合する、項目１または２に記載の抗原結合タンパク質。
【0352】
４．前記ＭＨＣタンパク質は、ＨＬＡタンパク質、より具体的にはＨＬＡ－Ａ、よりいっそう具体的にはＨＬＡ－Ａ＊０２である、項目１～３のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0353】
５．前記抗原結合タンパク質を発現するＴ細胞によるＣＴ４５－ＩＰ：ＭＨＣ複合体提示細胞の殺滅の誘導についてのＣＴ４５－ＩＰのＥＣ５０は、約６０ｎＭ未満、約５０ｎＭ未満、約３０ｎＭ未満、約２５ｎＭ未満、約２０ｎＭ未満、約１５ｎＭ未満、約１０ｎＭ未満、約５ｎＭ未満、約２．５ｎＭ未満、約１．５ｎＭ未満または約１ｎＭ未満である、項目１～４のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0354】
６．前記抗原結合タンパク質は、配列番号１３８の３、４、５、６および７位からなる群から選択される２、３または４箇所のアミノ酸位置を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する、項目１～５のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0355】
７．前記抗原結合タンパク質は、配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群、好ましくは配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群、より好ましくは配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）からなる群から選択される少なくとも１、少なくとも２、少なくとも３、少なくとも４、少なくとも５個、または全ての類似ペプチドに有意に結合しない、項目１～６のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0356】
８．前記第１のポリペプチドおよび前記第２のポリペプチドは２つのポリペプチド鎖上に含まれており、好ましくは、ＶＡは、第１のポリペプチド鎖に含まれており、かつＶＢは、第２のポリペプチド鎖に含まれている、項目１～７のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0357】
９．前記抗原結合タンパク質は、一本鎖抗原結合タンパク質、好ましくは一本鎖ＴＣＲ、または一本鎖二重特異性抗原結合タンパク質、好ましくは一本鎖二重特異性ＴＣＲである、項目１～７のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0358】
１０．前記抗原結合タンパク質は、一価または多価、例えば四価、三価もしくは二価である、項目１～９のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0359】
１１．前記抗原結合タンパク質は、単一特異性または多重特異性、例えば四重特異性、三重特異性もしくは二重特異性である、項目１～１０のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0360】
１２．前記抗原結合タンパク質は、可溶性タンパク質である、項目１～１１のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0361】
１３．前記抗原結合タンパク質は、ＴＣＲである、項目１～１２のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0362】
１４．前記ＴＣＲは、α／β ＴＣＲ、γ／δ ＴＣＲ、一本鎖ＴＣＲ、膜結合型ＴＣＲ、可溶性ＴＣＲ、一価、二価または多価ＴＣＲ、単一特異性、二重特異性または多重特異性ＴＣＲ、ＴＣＲの機能的断片、およびＴＣＲの機能的断片を含む融合タンパク質またはキメラタンパク質からなる群から選択される、項目１３に記載の抗原結合タンパク質。
【0363】
１５．前記ＴＣＲは、α／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲ、好ましくはα／β ＴＣＲである、項目１３に記載の抗原結合タンパク質。
【0364】
１６．下記：
（ｉ）１つまたは複数のさらなる抗原結合部位；
（ｉｉ）細胞質シグナル伝達領域を適宜含む、膜貫通ドメイン；
（ｉｉｉ）診断剤；
（ｉｖ）治療剤
の内の１つまたは複数をさらに含む、項目１～１５のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
（ｉ）１つまたは複数のさらなる抗原結合部位；
（ｉｉ）細胞質シグナル伝達領域を適宜含む、膜貫通ドメイン；
（ｉｉｉ）診断剤；
（ｉｖ）治療剤
の内の１つまたは複数をさらに含む、項目１～１５のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0365】
１７．前記１つまたは複数のさらなる抗原結合部位は、ＶＬおよびＶＨを好ましくは含むか、またはからなる、抗体由来抗原結合部位を含む、項目１６に記載の抗原結合タンパク質。
【0366】
１８．ＶＡは、配列番号１３、１３２、６２、８９、１、５２、７０、９８、７９、１０６、１２４、１１６、３４、２３、および４２からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１３、１３２、６２、８９、１、５２、７０、９８、７９、１０６、１２４、１１６、３４、２３、もしくは４２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ項目１もしくは２に記載のＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２およびＣＤＲａ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなり；かつＶＢは、配列番号１８、１３５、６５、９４、７、５７、７４、１０３、８４、１１１、１２９、１２１、３７、２８および４７からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１８、１３５、６５、９４、７、５７、７４、１０３、８４、１１１、１２９、１２１、３７、２８もしくは４７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有し、かつ項目１もしくは２に記載のＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２およびＣＤＲｂ３を含むアミノ酸配列を含むか、またはからなり、前記ＣＤＲａ１、ＣＤＲａ２、ＣＤＲａ３、ＣＤＲｂ１、ＣＤＲｂ２および／またはＣＤＲｂ３配列は、１、２または３個のアミノ酸突然変異、好ましくはアミノ酸置換を含んでもよい、項目１～１７のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0367】
１９．ＶＡおよびＶＢは、ＴＣＲ可変ドメイン、好ましくはＴＣＲアルファ、ベータ、ガンマまたはデルタ可変ドメインであり、より好ましくは、ＶＡは、ＴＣＲアルファまたはガンマ、好ましくはアルファ、可変ドメインであり、かつＶＢは、ＴＣＲベータまたはデルタ、好ましくはベータ、可変ドメインである、項目１～１８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0368】
２０．前記抗原結合タンパク質は、定常ドメインをさらに含み、前記定常ドメインは、配列番号５、７５０、７５１、１５６、１１、３２、および１５７からなる群から選択される、好ましくは配列番号５、７５０、７５１、１１および３２からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号５、７５０、７５１、１５６、１１、３２もしくは１５７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなる、項目１～１９のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0369】
２１．前記第１のポリペプチドはＴＣＲアルファ鎖であり、かつ前記第２のポリペプチドはＴＣＲベータ鎖であるか、または前記第１のポリペプチドはＴＣＲガンマ鎖であり、かつ前記第２のポリペプチドはＴＣＲデルタ鎖であり、好ましくは、前記第１のポリペプチドはＴＣＲアルファ鎖であり、かつ前記第２のポリペプチドはＴＣＲベータ鎖である、項目１～２０のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0370】
２２．前記第１のポリペプチドは、配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６および１５８～１７２からなる群から選択される、好ましくは配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号１７、１３４、６４、９３、６、５６、７３、１０２、８３、１１０、１２８、１２０、３６、２７、４６もしくは１５８～１７２に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなり、かつ前記第２のポリペプチドは、配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８、１０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１および１７３～１８７からなる群から選択される、好ましくは配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８、１０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１からなる群から選択されるアミノ酸配列、または配列番号２２、１３７、６９、９７、１２、６１、７８、１０５、８８、１１５、１３１、１２３、４１、３３、５１もしくは１７３～１８７に対して少なくとも７０％、７５％、８０％、８５％、９０％、９５％、９８％もしくは９９％の同一性を有するアミノ酸配列を含むか、またはからなる、項目１～２１のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0371】
２３．前記抗原結合タンパク質は、
ｉ．配列番号１３８のアミノ酸１、３および４位、好ましくは、配列番号１３８のアミノ酸１、３、４および５位、もしくは１、３、４および６位もしくは１、３、４、５および６位もしくは１、３、４、５、６および７位；
ｉｉ．配列番号１３８のアミノ酸４、６および７位、好ましくは、配列番号１３８のアミノ酸１、４、６および７位、もしくは３、４、６および７位もしくは１、３、４、６および７位；または
ｉｉｉ．配列番号１３８のアミノ酸５および７位、好ましくは、配列番号１３８のアミノ酸５、６および７位、もしくは３、４、５、６および７位
を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する、項目１～２２のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
ｉ．配列番号１３８のアミノ酸１、３および４位、好ましくは、配列番号１３８のアミノ酸１、３、４および５位、もしくは１、３、４および６位もしくは１、３、４、５および６位もしくは１、３、４、５、６および７位；
ｉｉ．配列番号１３８のアミノ酸４、６および７位、好ましくは、配列番号１３８のアミノ酸１、４、６および７位、もしくは３、４、６および７位もしくは１、３、４、６および７位；または
ｉｉｉ．配列番号１３８のアミノ酸５および７位、好ましくは、配列番号１３８のアミノ酸５、６および７位、もしくは３、４、５、６および７位
を含むか、またはからなる機能エピトープに特異的に結合する、項目１～２２のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0372】
２４．前記抗原結合タンパク質は、
ｉ．配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）；または
ｉｉ．配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）
からなる群の類似ペプチドに有意に結合しない、項目１～２３のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
ｉ．配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１４９（ＳＰ－０５－０００４）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）；または
ｉｉ．配列番号１４６（ＳＰ－０５－０００１）、配列番号１４７（ＳＰ－０５－０００２）、配列番号１４８（ＳＰ－０５－０００３）、配列番号１５０（ＳＰ－０５－０００５）、配列番号１５１（ＳＰ－０５－０００６）、配列番号１５２（ＳＰ－０５－０００７）、配列番号１５３（ＳＰ－０５－０００８）、配列番号１５４（ＳＰ－０５－０００９）および配列番号１５５（ＳＰ－０５－００１０）
からなる群の類似ペプチドに有意に結合しない、項目１～２３のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0373】
２５．前記抗原結合タンパク質は、少なくとも５％、少なくとも１０％、少なくとも２０％、少なくとも３０％、または少なくとも４０％の平均発現を有する、項目１～２４のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0374】
２６．ＶＡは、ＴＲＡＶ１４、特にＴＲＡＶ１４／ＤＶ４によりコードされるＶセグメント、ならびに配列番号２４のＣＤＲａ１および配列番号２５のＣＤＲａ２を含む、項目１～２５のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0375】
２７．ＶＢは、
ｉ． ＴＲＢＶ１３によりコードされるＶセグメント、ならびに配列番号７５のＣＤＲｂ１および配列番号７６のＣＤＲｂ２；
ｉｉ． ＴＲＢＶ４－１によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号５８のＣＤＲｂ１および配列番号５９のＣＤＲｂ２、または
ｉｉｉ． ＴＲＢＶ６－１によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号１１２のＣＤＲｂ１および配列番号１１３のＣＤＲｂ２
を含む、項目１～２６のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
ｉ． ＴＲＢＶ１３によりコードされるＶセグメント、ならびに配列番号７５のＣＤＲｂ１および配列番号７６のＣＤＲｂ２；
ｉｉ． ＴＲＢＶ４－１によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号５８のＣＤＲｂ１および配列番号５９のＣＤＲｂ２、または
ｉｉｉ． ＴＲＢＶ６－１によりコードされるＶ領域、ならびに配列番号１１２のＣＤＲｂ１および配列番号１１３のＣＤＲｂ２
を含む、項目１～２６のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0376】
２８．前記抗原結合タンパク質は、
－ ＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞、および／または
－ ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－Ｔ細胞
を活性化可能であり、
かつ前記抗原結合タンパク質は、好ましくはＴＣＲ、より好ましくはα／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲである、
項目１～２７のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
－ ＣＤ４＋ Ｔ細胞、特にＣＤ４＋ ＣＤ８－ Ｔ細胞、および／または
－ ＣＤ８＋ Ｔ細胞、特にＣＤ８＋ ＣＤ４－Ｔ細胞
を活性化可能であり、
かつ前記抗原結合タンパク質は、好ましくはＴＣＲ、より好ましくはα／β ＴＣＲまたはγ／δ ＴＣＲである、
項目１～２７のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質。
【0377】
２９．項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質をコードする１つまたは複数の配列を含む１つまたは複数の核酸。
【0378】
３０．項目２９に記載の核酸を含むベクターまたはベクターの集合物。
【0379】
３１．項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質、または項目２９に記載の核酸、または項目３０に記載のベクターもしくはベクターの集合物を含む宿主細胞。
【0380】
３２．前記宿主細胞は、
－ リンパ球、好ましくはＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞もしくはＮＫ細胞、より好ましくはＣＤ４もしくはＣＤ８陽性Ｔ細胞；または
－ 組換え発現用の細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞もしくは酵母細胞
である、項目３１に記載の宿主細胞。
－ リンパ球、好ましくはＴ細胞、Ｔ細胞前駆細胞もしくはＮＫ細胞、より好ましくはＣＤ４もしくはＣＤ８陽性Ｔ細胞；または
－ 組換え発現用の細胞、例えばチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ）細胞もしくは酵母細胞
である、項目３１に記載の宿主細胞。
【0381】
３３．項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質、項目２９に記載の核酸、項目３０に記載のベクターもしくはベクターの集合物、または項目３１もしくは３２に記載の宿主細胞と、適宜、医薬的に許容される担体とを含む医薬組成物。
【0382】
３４．医薬での使用のための、項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質、項目２９に記載の核酸、項目３０に記載のベクターもしくはベクターの集合物、項目３１もしくは３２に記載の宿主細胞、または項目３３に記載の医薬組成物。
【0383】
３５．増殖性疾患、特にがんの処置および／または診断方法での使用のための、項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質、項目２９に記載の核酸、項目３０に記載のベクターもしくはベクターの集合物、項目３１もしくは３２に記載の宿主細胞、または項目３３に記載の医薬組成物。
【0384】
３６．増殖性疾患、特にがんの処置方法であって、それを必要とする対象に、治療有効量の、項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質、項目２９に記載の核酸、項目３０に記載のベクターもしくはベクターの集合物、項目３１もしくは３２に記載の宿主細胞、または項目３３に記載の医薬組成物を投与することを含む方法。
【0385】
３７．前記がんは、ＣＴ４５発現がん、より具体的には、肺がん、ＮＳＣＬＣ、胆嚢がん、胆管がん、リンパ節がん、卵巣がん、食道がん、肝臓がん、子宮がんおよび黒色腫からなるがんの群から選択される、項目３５に記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６に記載の処置方法。
【0386】
３８．前記処置方法は、免疫療法、特に養子自家または異種Ｔ細胞療法を含む、項目３５もしくは３７に記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６もしくは３７に記載の処置方法。
【0387】
３９．前記抗原結合タンパク質は、ＴＣＲである、項目３５、３７もしくは３８のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６～３８のいずれか１つに記載の処置方法。
【0388】
４０．前記抗原結合タンパク質は、宿主細胞の表面上に発現される、項目３５もしくは３７～３９のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６～３９のいずれか１つに記載の処置方法。
【0389】
４１．前記処置方法は、前記抗原結合タンパク質を発現する宿主細胞の投与を含み、前記宿主細胞は、Ｔ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、好ましくはＴ細胞である、項目３５もしくは３７～４０のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６～４０のいずれか１つに記載の処置方法。
【0390】
４２．前記宿主細胞、好ましくは前記Ｔ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、より好ましくは前記Ｔ細胞は、自家である、項目４０に記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目４０に記載の処置方法。
【0391】
４３．前記宿主細胞、好ましくは前記Ｔ細胞、Ｔ細胞前駆細胞またはＮＫ細胞、より好ましくは前記Ｔ細胞は、同種である、項目４０に記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目４０に記載の処置方法。
【0392】
４４．前記抗原結合タンパク質は、治療活性剤にコンジュゲートされている、項目３５もしくは３７～４３のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６～４３のいずれか１つに記載の処置方法。
【0393】
４５．前記治療活性剤は、放射性核種、化学療法剤および毒素からなる群から選択される、項目４４のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目４４のいずれか１つに記載の処置方法。
【0394】
４６．前記処置方法は、処置を必要とする前記対象に少なくとも１つの化学療法剤を投与することをさらに含む、項目３５もしくは３７～４５のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６～４５のいずれか１つに記載の処置方法。
【0395】
４７．前記処置方法は、処置を必要とする前記対象に放射線療法を投与することをさらに含む、項目３５もしくは３７～４６のいずれか１つに記載の使用のための抗原結合タンパク質、核酸、ベクターもしくはベクターの集合物、宿主細胞もしくは医薬組成物または項目３６～４６のいずれか１つに記載の処置方法。
【0396】
４８．それを必要とする対象においてがんを処置する方法であって、
ａ）前記対象から細胞を単離すること；
ｂ）項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質をコードするベクターまたはベクターの集合物を用いて前記細胞を形質転換して、形質転換された細胞を製造すること；
ｃ）前記形質転換された細胞を拡大増殖させて、複数の形質転換された細胞を製造すること；および
ｄ）前記複数の形質転換された細胞を前記対象に投与すること
を含む方法。
ａ）前記対象から細胞を単離すること；
ｂ）項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質をコードするベクターまたはベクターの集合物を用いて前記細胞を形質転換して、形質転換された細胞を製造すること；
ｃ）前記形質転換された細胞を拡大増殖させて、複数の形質転換された細胞を製造すること；および
ｄ）前記複数の形質転換された細胞を前記対象に投与すること
を含む方法。
【0397】
４９．それを必要とする対象においてがんを処置する方法であって、
ａ）健常ドナーから細胞を単離すること；
ｂ）項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質をコードするベクターまたはベクターの集合物を用いて前記細胞を形質転換して、形質転換された細胞を製造すること；
ｃ）前記形質転換された細胞を拡大増殖させて、複数の形質転換された細胞を製造すること；および
ｄ）前記複数の形質転換された細胞を前記対象に投与すること
を含む方法。
ａ）健常ドナーから細胞を単離すること；
ｂ）項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質をコードするベクターまたはベクターの集合物を用いて前記細胞を形質転換して、形質転換された細胞を製造すること；
ｃ）前記形質転換された細胞を拡大増殖させて、複数の形質転換された細胞を製造すること；および
ｄ）前記複数の形質転換された細胞を前記対象に投与すること
を含む方法。
【0398】
５０．前記形質転換された細胞は、リンパ球、好ましくはＮＫ細胞またはＴ細胞またはＴ細胞前駆細胞、より好ましくはＴ細胞である、項目４８または４９に記載の方法。
【0399】
５１．増殖性疾患の処置用の医薬の生産のための、項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質の使用。
【0400】
５２．生物学的サンプル中のがん、特にＣＴ４５を発現するがんを検出するインビトロの方法であって、
ａ）前記生物学的サンプルを項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質と接触させること、および
ｂ）前記生物学的サンプルへの前記抗原結合タンパク質の結合を検出すること
を含む方法。
ａ）前記生物学的サンプルを項目１～２８のいずれか１つに記載の抗原結合タンパク質と接触させること、および
ｂ）前記生物学的サンプルへの前記抗原結合タンパク質の結合を検出すること
を含む方法。
【0401】
５３．項目１～２８のいずれか１つに係る抗原結合タンパク質を製造する方法であって、
ａ）宿主細胞を準備すること、
ｂ）項目１～２８のいずれかに記載の抗原結合タンパク質をコードする１つまたは複数の核酸を含む遺伝子コンストラクトを準備すること、
ｃ）遺伝子コンストラクトを宿主細胞に導入すること、および
ｄ）宿主細胞により遺伝子コンストラクトを発現させること
を含む方法。
ａ）宿主細胞を準備すること、
ｂ）項目１～２８のいずれかに記載の抗原結合タンパク質をコードする１つまたは複数の核酸を含む遺伝子コンストラクトを準備すること、
ｃ）遺伝子コンストラクトを宿主細胞に導入すること、および
ｄ）宿主細胞により遺伝子コンストラクトを発現させること
を含む方法。
【0402】
５４．前記宿主細胞からの前記抗原結合タンパク質の単離および精製、ならびに適宜、Ｔ細胞中での前記抗原結合タンパク質の再構築をさらに含む項目５３に記載の方法。
【0403】
５５．前記抗原結合タンパク質の細胞表面提示をさらに含む、項目５３または５４に記載の方法。
【0404】
５６．前記遺伝子コンストラクトは、前記抗原結合タンパク質をコードする前記核酸に作動可能に連結されているプロモーター配列を含む発現コンストラクトである、項目５３～５５のいずれか１つに記載の方法。
【0405】
５７．前記遺伝子コンストラクトは、レトロウイルストランスフェクションにより前記宿主細胞に導入される、項目５３～５６のいずれか１つに記載の方法。
【図1-1】
【図1-2】
【図1-3】
【図1-4】
【図1-5】
【図2-1】
【図2-2】
【図2-3】
【図2-4】
【図2-5】
【図3-1】
【図3-2】
【図4】
【配列表】
【国際調査報告】