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特表2024-532540二機能性融合タンパク質およびその用途
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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-09-05
(54)【発明の名称】二機能性融合タンパク質およびその用途
(51)【国際特許分類】
   C07K 19/00 20060101AFI20240829BHJP
   C12N 15/62 20060101ALI20240829BHJP
   C12N 15/63 20060101ALI20240829BHJP
   C12N 5/10 20060101ALI20240829BHJP
   C12N 1/15 20060101ALI20240829BHJP
   C12N 1/19 20060101ALI20240829BHJP
   C12N 1/21 20060101ALI20240829BHJP
   A61P 11/00 20060101ALI20240829BHJP
   A61P 1/16 20060101ALI20240829BHJP
   A61P 13/12 20060101ALI20240829BHJP
   A61P 29/00 20060101ALI20240829BHJP
   A61P 35/00 20060101ALI20240829BHJP
   A61P 37/06 20060101ALI20240829BHJP
   A61K 39/395 20060101ALI20240829BHJP
   A61K 38/19 20060101ALI20240829BHJP
   C12N 15/13 20060101ALN20240829BHJP
   C12N 15/12 20060101ALN20240829BHJP
【FI】
C07K19/00 ZNA
C12N15/62 Z
C12N15/63 Z
C12N5/10
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
A61P11/00
A61P1/16
A61P13/12
A61P29/00
A61P35/00
A61P37/06
A61K39/395 D
A61K39/395 N
A61K38/19
C12N15/13
C12N15/12
【審査請求】有
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024514514
(86)(22)【出願日】2022-09-02
(85)【翻訳文提出日】2024-04-25
(86)【国際出願番号】 CN2022116919
(87)【国際公開番号】W WO2023030511
(87)【国際公開日】2023-03-09
(31)【優先権主張番号】PCT/CN2021/116558
(32)【優先日】2021-09-03
(33)【優先権主張国・地域又は機関】CN
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】524082753
【氏名又は名称】パルモンジーン(ホンコン)、カンパニー、リミテッド
【氏名又は名称原語表記】PULMONGENE(HONG KONG) CO., LIMITED
(71)【出願人】
【識別番号】524082764
【氏名又は名称】ナン、タン
【氏名又は名称原語表記】NAN TANG
(74)【代理人】
【識別番号】110003421
【氏名又は名称】弁理士法人フィールズ国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】ナン、タン
(72)【発明者】
【氏名】ジェンホワ、スイ
(72)【発明者】
【氏名】シンミン、リウ
(72)【発明者】
【氏名】ナンムン、ソン
(72)【発明者】
【氏名】ルイ、ザオ
【テーマコード(参考)】
4B065
4C084
4C085
4H045
【Fターム(参考)】
4B065AA01X
4B065AA57X
4B065AA72X
4B065AA90X
4B065AB01
4B065AC14
4B065BA02
4B065CA24
4B065CA25
4B065CA44
4C084AA02
4C084AA06
4C084AA07
4C084BA01
4C084BA02
4C084BA41
4C084CA53
4C084DA01
4C084NA14
4C084ZA591
4C084ZA592
4C084ZA751
4C084ZA752
4C084ZA811
4C084ZA812
4C084ZB081
4C084ZB082
4C084ZB111
4C084ZB112
4C084ZB261
4C084ZB262
4C085AA13
4C085AA14
4C085BB11
4C085CC01
4C085DD62
4C085EE01
4H045AA10
4H045AA11
4H045BA10
4H045BA41
4H045CA40
4H045DA50
4H045DA76
4H045EA20
4H045FA74
(57)【要約】
本発明は、TGFβリガンドおよびAREGの両方を標的とし、且つTGFβおよびAREGシグナル伝達を同時にブロッキングする、二機能性融合タンパク質を提供する。本発明は、当該二機能性融合タンパク質をコードする核酸分子、当該二機能性融合タンパク質を産生するための発現ベクター、当該二機能性融合タンパク質を産生するための宿主細胞、ならびに当該二機能性融合タンパク質を調製および/または特徴付けるための方法をさらに提供する。
【選択図】なし

【特許請求の範囲】
【請求項1】
二機能性融合タンパク質であって、
少なくとも二つのドメインを含み、前記二つのドメインは、AREGもしくはその断片、および/またはTGFβリガンドもしくはその断片に結合することができることを特徴とする、前記二機能性融合タンパク質。
【請求項2】
第1のドメインおよび第2のドメインを含み、ここで、前記第1のドメインは、AREGまたはその断片に結合することができ、前記第2のドメインは、TGFβリガンドまたはその断片に結合することができることを特徴とする
請求項1に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項3】
前記第1のドメインは、AREGもしくはその断片に結合する抗体またはその抗原結合断片であり、前記第2のドメインは、TGFβ受容体II(TRII)の細胞外ドメインまたはその変異体の一部を含むことを特徴とする
請求項2に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項4】
前記抗体またはその抗原結合断片は、AREG、好ましくはヒトAREGおよびマウスAREGの両方に結合できる抗AREG抗体またはその断片であるか、あるいは、前記抗AREG抗体またはその断片は、ヒトAREGに結合することができ、マウスAREGに対して弱い交差反応性を有するか、または交差反応性を有さないことを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項5】
前記抗AREG抗体またはその断片は、ヒト抗AREG抗体、ネズミ抗AREG抗体、キメラ抗AREG抗体、またはヒト化抗AREG抗体であり、好ましくは、ヒトモノクローナル抗体(mAb)、ネズミmAb、キメラmAbまたはヒト化mAbであることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項6】
前記抗AREG抗体またはその断片は、可溶性形態のAREGに結合することができ、好ましくは、可溶性形態のAREGの上皮成長因子(EGF)様ドメインに結合することができ、より好ましくは、可溶性形態のAREGのEGF様ドメイン内のC末端に結合することができることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項7】
前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
HCDR1、HCDR2およびHCDR3は、
(1)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYGYDY(SEQ ID NO:3)、
(2)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYSYNN(SEQ ID NO:4)、
(3)HCDR1:SHAMS(SEQ ID NO:5)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:VDTKFDP(SEQ ID NO:6)、
(4)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、
(5)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGRYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:10)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、
(6)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPILRKNYYYGMDV(SEQ ID NO:11)、
(7)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYGMDV(SEQ ID NO:12)、
(8)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDV(SEQ ID NO:14)、
(9)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、
(10)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、
(11)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHCIMDY(SEQ ID NO:19)、
(12)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、および
(13)(1)~(12)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3であるが、ただし、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択され、且つ
LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、
(1)LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDSGLNSVV(SEQ ID NO:23)、
(2)LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDKNNKSVV(SEQ ID NO:24)、
(3)LCDR1:SGSSSNIGSNTVN(SEQ ID NO:25)、LCDR2:SNNQRPS(SEQ ID NO:26)、LCDR3:EVWDDSLNGPV(SEQ ID NO:27)、
(4)LCDR1:RSSQSLVHSDGNTYLH(SEQ ID NO:28)、LCDR2:KVSNRFS(SEQ ID NO:29)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(5)LCDR1:RSSQSLVDGEDGTYLN(SEQ ID NO:31)、LCDR2:KVSERFD(SEQ ID NO:32)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(6)LCDR1:RSSQSLVDGQDGTYLH(SEQ ID NO:33)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(7)LCDR1:RSSQSLVNQEGETYLH(SEQ ID NO:35)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30);
(8)LCDR1:KASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:36)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(9)LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(10)LCDR1:RASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:41)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(11)LCDR1:KSSQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:43)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(12)LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(13)LCDR1:RASQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:45)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(14)LCDR1:KSSQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:47)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(15)LCDR1:KASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:48)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:HQCNEDPYM(SEQ ID NO:49)、
(16)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYM(SEQ ID NO:51)、
(17)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYL(SEQ ID NO:52)、
(18)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYV(SEQ ID NO:53)、
(19)LCDR1:RASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:54)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、
(20)LCDR1:KSSQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:56)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、および
(21)(1)~(20)に示されるようなLCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、ただし、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択されることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項8】
前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、
(1)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYGYDY(SEQ ID NO:3)、LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDSGLNSVV(SEQ ID NO:23)、
(2)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYSYNN(SEQ ID NO:4)、LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDKNNKSVV(SEQ ID NO:24)、
(3)HCDR1:SHAMS(SEQ ID NO:5)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:VDTKFDP(SEQ ID NO:6)、LCDR1:SGSSSNIGSNTVN(SEQ ID NO:25)、LCDR2:SNNQRPS(SEQ ID NO:26)、LCDR3:EVWDDSLNGPV(SEQ ID NO:27)、
(4)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、LCDR1:RSSQSLVHSDGNTYLH(SEQ ID NO:28)、LCDR2:KVSNRFS(SEQ ID NO:29)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(5)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGRYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:10)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、LCDR1:RSSQSLVDGEDGTYLN(SEQ ID NO:31)、LCDR2:KVSERFD(SEQ ID NO:32)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(6)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPILRKNYYYGMDV(SEQ ID NO:11)、LCDR1:RSSQSLVDGQDGTYLH(SEQ ID NO:33)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(7)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYGMDV(SEQ ID NO:12)、LCDR1:RSSQSLVNQEGETYLH(SEQ ID NO:35)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT (SEQ ID NO:30)、
(8)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDV(SEQ ID NO:14)、LCDR1:KASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:36)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(9)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(10)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:RASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:41)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(11)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:KSSQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:43)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(12)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(13)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:RASQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:45)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(14)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:KSSQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:47)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(15)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHCIMDY(SEQ ID NO:19)、LCDR1:KASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:48)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:HQCNEDPYM(SEQ ID NO:49)、
(16)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYM(SEQ ID NO:51)、
(17)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYL(SEQ ID NO:52)、
(18)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYV(SEQ ID NO:53)、
(19)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:54)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、
(20)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:KSSQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:56)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、および
(21)(1)~(20)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、ただし、
そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択されることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項9】
前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、
ここで、前記重鎖可変領域は、SEQ ID NO:57~69から選択されるアミノ酸配列、およびSEQ ID NO:57~69のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有し、
ここで、前記軽鎖可変領域は、SEQ ID NO:70~89から選択されるアミノ酸配列、およびSEQ ID NO:70~89のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項10】
前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、
(1)SEQ ID NO:57およびSEQ ID NO:70、
(2)SEQ ID NO:58およびSEQ ID NO:71、
(3)SEQ ID NO:59およびSEQ ID NO:72、
(4)SEQ ID NO:60およびSEQ ID NO:73、
(5)SEQ ID NO:61およびSEQ ID NO:74、
(6)SEQ ID NO:62およびSEQ ID NO:75、
(7)SEQ ID NO:63およびSEQ ID NO:76、
(8)SEQ ID NO:64およびSEQ ID NO:77、
(9)SEQ ID NO:65およびSEQ ID NO:78、
(10)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:79、
(11)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:80、
(12)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:81、
(13)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:79、
(14)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:82、
(15)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:83、
(16)SEQ ID NO:68およびSEQ ID NO:84、
(17)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:85、
(18)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:86、
(19)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:87、
(20)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:88、
(21)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:89、および
(22)それぞれ(1)~(21)のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持する二つのアミノ酸配列からなる群から選択されることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項11】
前記抗AREG抗体またはその断片は、IgG、IgM、IgA、IgE、IgDのアイソタイプまたはその変異体、好ましくはIgG1、IgG2、IgG3、IgG4のアイソタイプまたはその変異体であることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項12】
前記第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体を含むことを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項13】
前記変異体は、点突然変異および/または欠失を含むことを特徴とする
請求項12に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項14】
前記TRIIの細胞外ドメインは、SEQ ID NO:90に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:90と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項12に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項15】
前記点突然変異は、K7、T16、D17、R34、R66、K67、K103およびK104から選択される位置での一つまたは複数の点突然変異を含み、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
請求項13に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項16】
前記点突然変異は、K7Q、T16S、D17N、R34S、R34H、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される一つまたは複数の部位突然変異を含み、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
請求項13に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項17】
前記点突然変異は、T16SおよびD17N、K7QおよびD17N、K7Q、R34S、R34H、R66SおよびK67S、K103SおよびK104S、K7QおよびR34S、K7Q、R66SおよびK67S、K7Q、K103SおよびK104S、K7Q、R34S、R66SおよびK67S、K7Q、R34S、K103SおよびK104S、K7Q、R66S、K67S、K103SおよびK104S、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104S、K7Q、R34S、R66S、K67S、ならびにK103SおよびK104Sから選択されることを特徴とする
請求項13に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項18】
前記変異体は、4~21個のアミノ酸のN末端欠失、好ましくは4個のアミノ酸、7個のアミノ酸、9個のアミノ酸、13個のアミノ酸、17個のアミノ酸および21個のアミノ酸のN末端欠失を有し、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
請求項13に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項19】
前記変異体は、点突然変異T16SおよびD17N、ならびに7個のアミノ酸のN末端欠失を含むことを特徴とする
請求項13に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項20】
前記第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体を含み、SEQ ID NO:90~107に示されるようなアミノ酸配列のいずれか一つ、またはSEQ ID NO:90~107のいずれか一つと少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項12に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項21】
前記第1のドメインのC末端は、リンカー、好ましくはリンカーペプチドを介して前記第2のドメインのN末端に融合され、その逆も同様であることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項22】
前記抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のC末端は、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に直接またはリンカーを介して融合されるか、あるいは前記抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のN末端は、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に直接またはリンカーを介して連結されることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項23】
前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、それは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体に直接またはリンカーを介して連結されることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項24】
前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのN末端は、直接またはリンカーを介して、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に連結されるか、あるいは、抗AREG抗体の重鎖のC末端は、直接またはリンカーを介して、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に連結されることを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項25】
前記リンカーは、式(GS)、(GS)G、S(GS)G、SG(EAAAK)SG、S(GEGES)nGまたは(EAAAK)で表されるリンカーペプチドを含み、ここで、nは、1~5の整数であり、好ましくは、前記リンカーペプチドは、SEQ ID NO:108~117のいずれか一つに示されるアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項21~24のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項26】
前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのC末端は、リンカーを介して前記TRIIの細胞外ドメインのN末端に連結され、SEQ ID NO:118~139に示されるのいずれか一つのアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:118~139のいずれか一つと少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項27】
抗AREG抗体の軽鎖をさらに含むことを特徴とする
請求項3に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項28】
ヘテロ四量体形態であることを特徴とする
請求項2に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項29】
単離された核酸分子であって、
請求項1-28のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質をコードすることを特徴とする、前記単離された核酸分子。
【請求項30】
発現ベクターであって、
請求項29に記載の単離された核酸分子を含むことを特徴とする、前記発現ベクター。
【請求項31】
宿主細胞であって、
請求項29に記載の単離された核酸分子または請求項30に記載の発現ベクターを含むことを特徴とする、前記宿主細胞。
【請求項32】
請求項1~28のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質を調製する方法であって、
請求項31に記載の宿主細胞を培養する段階を含むことを特徴とする、前記請求項1~28のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質を調製する方法。
【請求項33】
医薬組成物であって、
請求項1~28のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質および薬学的に許容される担体を含むことを特徴とする、前記医薬組成物。
【請求項34】
被験者における線維性疾患、癌および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための、請求項1~28のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質、請求項29に記載の単離された核酸分子または請求項33に記載の医薬組成物の用途であって、
好ましくは、前記線維性疾患は、腎線維症、肝線維症、肺線維症、特に特発性肺線維症(IPF)を含むが、これらに限定されないことを特徴とする、前記用途。
【請求項35】
被験者における線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための方法であって、
被験者に治療有効量の請求項1~28のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質または請求項33に記載の医薬組成物を投与することを含み、好ましくは、前記線維性疾患は、腎線維症、肝線維症、肺線維症を含むが、これらに限定されないことを特徴とする、前記被験者における線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための方法。
【発明の詳細な説明】
【背景技術】
【0001】
トランスフォーミング成長因子β(TGFβ)は、生理学的および病理学的条件下で重要な役割を果たす多面発現性サイトカインである。TGFβ異性体、即ちβ1、β2およびβ3は、約25kDaのホモ二量体ポリペプチドである。これらのリガンドは、細胞表面受容体(トランスフォーミング成長因子β受容体I、IIおよびIII(TRI、TRII、TRIII)を含む)ならびにSMAD2および3等の細胞内SMADエフェクタータンパク質を通じてシグナルを伝達する。シグナルの伝達は、細胞の生存、増殖、分化、細胞の運動性および細胞外マトリックス(ECM)の産生等を含む、細胞プロセスに影響を与える。
【0002】
TGFβは、線維形成の中心的な調節因子であると考えられる。研究によると、TGFβ1は、筋線維芽細胞を活性化し、過剰なECM成分を産生し且つECM分解を阻害することにより、複数の臓器で線維症を誘導することが示される。TGFβシグナル伝達をブロッキングすると、肺、肝臓および腎臓を含む多くの臓器における異常なリモデリングおよび瘢痕の形成を予防および阻害することができる。TGFβは、免疫系において重要な役割を果たすことも示されており、自然免疫応答および適応性免疫応答の両方において最も効果的な免疫阻害因子の一つであると考えられる。さらに、TGFβは、腫瘍細胞および/腫瘍環境に直接作用することにより、特定の癌において腫瘍促進活性を示すことが報告されている。
【0003】
抗TGFβ療法は、線維症、特定の癌および他の疾患に対して開発されている。TGFβ阻害剤は、アンチセンスオリゴヌクレオチド、受容体キナーゼ活性を阻害する小分子、TGFβリガンドまたは受容体に対するモノクローナル抗体、ならびにエンジニアリングによりTGFβトラップを有する二機能タンパク質を含む。具体的には、TGFβトラップは、これらの受容体の細胞外ドメインの人工二量体化によるTGFβ受容体のエンジニアリング修正を含む。
【0004】
アンフィレグリン(AREG)は、上皮成長因子(EGF)ファミリーの低親和性リガンドである。AREGタンパク質は、252個のアミノ酸の膜貫通前駆体から合成され、細胞膜プロテアーゼ、主にTACE(腫瘍壊死因子-α-インベルターゼ)によって細胞外ドメイン内でタンパク質加水分解的切断が行われる。次に、成熟した可溶性AREGは、上皮成長因子受容体(EGFR)に直接結合することで下流のシグナル伝達を活性化する。これにより、MAPK/ERKシグナル伝達を含む主な細胞内シグナル伝達カスケードを引き起こし、細胞の生存、増殖および運動を制御する。
【0005】
肺線維症モデルおよび特発性肺線維症(IPF)患者において、AREGは、II型肺胞細胞(AT2s)で特異的に上方制御される。AREGが肺線維症の発症に必要かつ十分であることを証明する報告もある。具体的には、進行性肺線維症モデルにいて、AREGの発現レベルを低下させると、肺線維症の発症を顕著に軽減される。マウスAT2sにおけるAREGの過剰発現は、肺のリモデリングおよび線維症変化を誘発する。さらに、AREGの発現レベルは、肝臓および腎線維症で上方制御され、AREGは、肝臓、腎臓および皮膚線維症の発症において必要であることが報告されている。従って、AREGは、線維化促進因子として、肺線維症だけでなく、他の臓器の線維症にとっても魅力的なターゲットポイントである。
【0006】
AREG-EGFRシグナル伝達は、免疫系および腫瘍形成にも役割を果たす。AREGは、炎症条件下で様々な免疫細胞で発現される。様々な種類の免疫細胞におけるAREGの存在、およびこれらの免疫細胞の活性化パターンは、免疫由来のAREGが2型免疫媒介性(Th2)抗性および寛容メカニズムに関与していることを示唆する。さらに、AREGは、様々な癌で上方制御される。機能研究によると、AREGは、特定の癌において癌原遺伝子として機能することが証明する。これらの発見は、AREG活性を標的とすることが、慢性炎症関連疾患および癌の治療に対する新しいアプローチとなる可能性があることを示唆する。
【0007】
しかしながら、これまでのところ、それぞれ抗TGFβおよび抗AREG活性を有する二つの別々の薬物の組み合わせ、またはTGFβとAREGとの療法を阻害する能力を同時に有する単一の二機能タンパク質を送達する治療法は、上記疾患(線維症、癌、および慢性炎症に関連する疾患を含む)の病症の治療に関して提案および検証されていない。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0008】
本発明は、TGFβリガンドおよびAREGを同時に標的とし、且つTGFβおよびAREGのシグナル伝達を同時にブロッキングする、二機能性融合タンパク質を提供する。前記二機能性融合タンパク質は、腎線維症、肝線維症および肺線維症、特にIPFを含むがこれに限定されない線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患を治療する理想的な候補物である。本出願は、二機能性融合タンパク質をコードする核酸分子、二機能性融合タンパク質を産生するための発現ベクター、当該二機能性融合タンパク質を産生するための宿主細胞、ならびに当該二機能性融合タンパク質を調製および/または特徴付けるための方法をさらに提供する。本発明は、腎線維症、肝線維症および肺線維症、特にIPFを含むがこれらに限定されない線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患等の疾患を治療、予防および/または診断するための前記二機能性融合タンパク質の用途をさらに提供する。
【課題を解決するための手段】
【0009】
第1の態様において、本発明は、二機能性融合タンパク質を提供し、それは、少なくとも二つのドメインを含み、前記ドメインは、AREGまたはその断片に結合することができ、および/またはTGFβリガンドまたはその断片に結合することができる。
【0010】
いくつかの実施形態において、二機能性融合タンパク質は、第1のドメインおよび第2のドメインを含み、ここで、第1のドメインは、AREGまたはその断片に結合することができ、第2のドメインは、TGFβリガンドまたはその断片にキレートすることができる。
【0011】
いくつかの実施形態において、第1のドメインは、AREGまたはその断片に結合する抗体またはその抗原結合断片であり、第2のドメインは、TGFβ受容体II(TGFβRII、TRII)の細胞外ドメインまたはその変異体の少なくとも一部である。
【0012】
いくつかの実施形態において、抗体またはその抗原結合断片は、ヒトAREG(hAREG)およびマウスAREG(mAREG)の両方に結合できる抗AREG抗体またはその断片である。
【0013】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、ヒト抗AREG抗体、ネズミ抗AREG抗体、キメラ抗AREG抗体またはヒト化抗AREG抗体である。
【0014】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、可溶性形態のAREGに結合することができる。好ましくは、抗AREG抗体は、可溶性形態のAREGのEGF様ドメインに結合することができる。
【0015】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、単鎖抗体、ジスルフィド結合したFv、DART、ダイアボディー、VLまたはVHドメインを含む断片である。前記断片は、IgG、Fab、Fab’、F(ab’)、FvまたはscFvであり得る。前記断片は、特異的抗原と結合して複合体を形成することによって抗体のように機能する、免疫グロブリン可変領域を含む任意の合成タンパク質または遺伝子操作されたタンパク質も含む。構造に関係なく、抗体断片は、完全な抗体によって識別される同一抗原に結合する。
【0016】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
【0017】
HCDR1、HCDR2およびHCDR3は、(1)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:2に示されるHCDR2、SEQ ID NO:3に示されるHCDR3、(2) SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:2に示されるHCDR2、SEQ ID NO:4に示されるHCDR3、(3) SEQ ID NO:5に示されるHCDR1、SEQ ID NO:2に示されるHCDR2、SEQ ID NO:6に示されるHCDR3、(4) SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:8に示されるHCDR2、SEQ ID NO:9に示されるHCDR3、(5) SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:10所示HCDR2、SEQ ID NO:9所示HCDR3、(6) SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:8に示されるHCDR2、SEQ ID NO:11に示されるHCDR3、(7) SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:8に示されるHCDR2、SEQ ID NO:12に示されるHCDR3、(8) SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:13に示されるHCDR2、SEQ ID NO:14に示されるHCDR3、(9) SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:13に示されるHCDR2、SEQ ID NO:140に示されるHCDR3、(10) SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:15に示されるHCDR2、SEQ ID NO:16に示されるHCDR3、(11) SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:19に示されるHCDR3、(12)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:20に示されるHCDR3、および(13)(1)~(12)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3であるが、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択され、ならびに
LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、(1)SEQ ID NO:21に示されるLCDR1、SEQ ID NO:22に示されるLCDR2、SEQ ID NO:23に示されるLCDR3、(2)SEQ ID NO:21に示されるLCDR1、SEQ ID NO:22に示されるLCDR2、SEQ ID NO:24に示されるLCDR3、(3)SEQ ID NO:25に示されるLCDR1、SEQ ID NO:26に示されるLCDR2、SEQ ID NO:27に示されるLCDR3、(4)SEQ ID NO:28に示されるLCDR1、SEQ ID NO:29に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(5)SEQ ID NO:31に示されるLCDR1、SEQ ID NO:32に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(6)SEQ ID NO:33に示されるLCDR1、SEQ ID NO:34に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(7)SEQ ID NO:35に示されるLCDR1、SEQ ID NO:34に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(8)SEQ ID NO:36に示されるLCDR1、SEQ ID NO:37に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(9)SEQ ID NO:39に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(10)SEQ ID NO:41に示されるLCDR1、SEQ ID NO:42に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(11)SEQ ID NO:43に示されるLCDR1、SEQ ID NO:44に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(12)SEQ ID NO:39に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(13)SEQ ID NO:45に示されるLCDR1、SEQ ID NO:42に示されるLCDR2、 SEQ ID NO:46に示されるLCDR3、(14)SEQ ID NO:47に示されるLCDR1、SEQ ID NO:44に示されるLCDR2、SEQ ID NO:46に示されるLCDR3、(15)SEQ ID NO:48に示されるLCDR1、SEQ ID NO:37に示されるLCDR2、SEQ ID NO:49に示されるLCDR3、(16)SEQ ID NO:50に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:51に示されるLCDR3、(17)SEQ ID NO:50に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:52に示されるLCDR3、(18)SEQ ID NO:50に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:53に示されるLCDR3、(19)SEQ ID NO:54に示されるLCDR1、SEQ ID NO:42に示されるLCDR2、SEQ ID NO:55に示されるLCDR3、(20)SEQ ID NO:56に示されるLCDR1、SEQ ID NO:44に示されるLCDR2、SEQ ID NO:55に示されるLCDR3、および(21)(1)~(20)に示されるようなLCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択される。
【0018】
一実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
【0019】
HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、(1)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:2に示されるHCDR2、SEQ ID NO:3に示されるHCDR3、SEQ ID NO:21に示されるLCDR1、SEQ ID NO:22に示されるLCDR2、SEQ ID NO:23に示されるLCDR3、(2)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:2に示されるHCDR2、SEQ ID NO:4に示されるHCDR3、SEQ ID NO:21に示されるLCDR1、SEQ ID NO:22に示されるLCDR2、SEQ ID NO:24に示されるLCDR3、(3)SEQ ID NO:5に示されるHCDR1、SEQ ID NO:2に示されるHCDR2、SEQ ID NO:6に示されるHCDR3、SEQ ID NO:25に示されるLCDR1、SEQ ID NO:26に示されるLCDR2、SEQ ID NO:27に示されるLCDR3、(4)SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:8に示されるHCDR2、SEQ ID NO:9に示されるHCDR3、SEQ ID NO:28に示されるLCDR1、SEQ ID NO:29に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(5)SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:10に示されるHCDR2、SEQ ID NO:9に示されるHCDR3、SEQ ID NO:31に示されるLCDR1、SEQ ID NO:32に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(6)SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:8に示されるHCDR2、SEQ ID NO:11に示されるHCDR3、SEQ ID NO:33に示されるLCDR1、SEQ ID NO:34に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(7)SEQ ID NO:7に示されるHCDR1、SEQ ID NO:8に示されるHCDR2、SEQ ID NO:12に示されるHCDR3、SEQ ID NO:35に示されるLCDR1、SEQ ID NO:34に示されるLCDR2、SEQ ID NO:30に示されるLCDR3、(8)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:13に示されるHCDR2、SEQ ID NO:14に示されるHCDR3、SEQ ID NO:36に示されるLCDR1、SEQ ID NO:37に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(9)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:13に示されるHCDR2、SEQ ID NO:140に示されるHCDR3、SEQ ID NO:39に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(10)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:13に示されるHCDR2、SEQ ID NO:140に示されるHCDR3、SEQ ID NO:41に示されるLCDR1、SEQ ID NO:42に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(11)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:13に示されるHCDR2、SEQ ID NO:140に示されるHCDR3、SEQ ID NO:43に示されるLCDR1、SEQ ID NO:44に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(12)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:15に示されるHCDR2、SEQ ID NO:16に示されるHCDR3、SEQ ID NO:39に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:38に示されるLCDR3、(13)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:15に示されるHCDR2、SEQ ID NO:16に示されるHCDR3、SEQ ID NO:45に示されるLCDR1、SEQ ID NO:42に示されるLCDR2、SEQ ID NO:46に示されるLCDR3、(14)SEQ ID NO:1に示されるHCDR1、SEQ ID NO:15に示されるHCDR2、SEQ ID NO:16に示されるHCDR3、SEQ ID NO:47に示されるLCDR1、SEQ ID NO:44に示されるLCDR2、SEQ ID NO:46に示されるLCDR3、(15)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:19に示されるHCDR3、SEQ ID NO:48に示されるLCDR1、SEQ ID NO:37に示されるLCDR2、SEQ ID NO:49に示されるLCDR3、(16)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:20に示されるHCDR3、SEQ ID NO:50に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:51に示されるLCDR3、(17)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:20に示されるHCDR3、SEQ ID NO:50に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:52に示されるLCDR3、(18)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:20に示されるHCDR3、SEQ ID NO:50に示されるLCDR1、SEQ ID NO:40に示されるLCDR2、SEQ ID NO:53に示されるLCDR3、(19)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:20に示されるHCDR3、SEQ ID NO:54に示されるLCDR1、SEQ ID NO:42に示されるLCDR2、SEQ ID NO:55に示されるLCDR3、(20)SEQ ID NO:17に示されるHCDR1、SEQ ID NO:18に示されるHCDR2、SEQ ID NO:20に示されるHCDR3、SEQ ID NO:56に示されるLCDR1、SEQ ID NO:44に示されるLCDR2、SEQ ID NO:55に示されるLCDR3、および(21)(1)~(20)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択される。
【0020】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、前記重鎖可変領域は、SEQ ID NO:57~69から選択されるアミノ酸配列およびSEQ ID NO:57~69のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有し、ならびに
ここで、前記軽鎖可変領域は、SEQ ID NO:70~89から選択されるアミノ酸配列およびSEQ ID NO:70~89のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有する。
【0021】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域は、(1)SEQ ID NO:57およびSEQ ID NO:70、(2) SEQ ID NO:58およびSEQ ID NO:71、(3) SEQ ID NO:59およびSEQ ID NO:72、(4) SEQ ID NO:60およびSEQ ID NO:73、(5) SEQ ID NO:61およびSEQ ID NO:74、(6) SEQ ID NO:62およびSEQ ID NO:75、(7) SEQ ID NO:63およびSEQ ID NO:76、(8) SEQ ID NO:64およびSEQ ID NO:77、(9) SEQ ID NO:65およびSEQ ID NO:78、(10) SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:79、(11) SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:80、(12) SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:81、(13) SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:79、(14) SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:82、(15) SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:83、(16) SEQ ID NO:68およびSEQ ID NO:84、(17) SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:85、(18) SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:86、(19) SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:87、(20) SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:88、(21)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:89ならびに(22)それぞれ(1)~(21)のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持する二つのアミノ酸配列から選択されるアミノ酸配列を有する。
【0022】
いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、IgG、IgM、IgA、IgE、IgDのアイソタイプまたはその変異体である。いくつかの実施形態において、本発明による抗AREG抗体またはその断片は、IgG1、IgG2、IgG3、IgG4のアイソタイプまたはその変異体である。
【0023】
いくつかの実施形態において、本発明の抗体は、ヒトモノクローナル抗体(mAb)、ネズミmAb、ヒト化mAbまたはキメラmAbである。
【0024】
好ましくは、本発明のヒト化モノクローナル抗体(mAb)は、ヒト定常領域に由来する定常領域からなる。
【0025】
好ましくは、本発明のヒト化モノクローナル抗体(mAb)は、κまたはλ軽鎖定常領域に由来するヒト軽鎖定常領域を有する。
【0026】
好ましくは、本発明のヒト化モノクローナル抗体(mAb)は、ヒトIgG1、IgG2、IgG3またはIgG4重鎖定常領域に由来するヒト重鎖定常領域を有する。
【0027】
いくつかの実施形態において、第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体である。
【0028】
いくつかの実施形態において、TRII細胞外ドメインの変異体は、点突然変異および/または欠失を含む変異体である。
【0029】
いくつかの実施形態において、TRIIの細胞外ドメインは、N末端からC末端までのアミノ酸番号が1~136であるSEQ ID NO:90に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:90と少なくとも85%の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する。
【0030】
いくつかの実施形態において、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までの番号に基づいて、点突然変異は、K7、T16、D17、R34、R66、K67、K103およびK104から選択される一つまたは複数の点突然変異を含む。
【0031】
いくつかの実施形態において、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までの番号に基づいて、点突然変異は、K7Q、T16S、D17N、R34S、R34H、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される一つまたは複数の点突然変異を含む。
【0032】
いくつかの実施形態において、点突然変異は、T16SおよびD17Nを含む。
【0033】
いくつかの実施形態において、点突然変異は、K7QおよびD17Nを含む。
【0034】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Qを含む。
【0035】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、R34Sを含む。
【0036】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、R34Hを含む。
【0037】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、R66SおよびK67Sを含む。
【0038】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K103SおよびK104Sを含む。
【0039】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7QおよびR34Sを含む。
【0040】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Q、R66SおよびK67Sを含む。
【0041】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Q、K103SおよびK104Sを含む。
【0042】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Q、R34S、R66SおよびK67Sを含む。
【0043】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Q、R34S、K103SおよびK104Sを含む。
【0044】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Q、R66S、K67S、K103S、K104Sを含む。
【0045】
いくつかの実施形態において、前記点突然変異は、K7Q、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104Sを含む。
【0046】
いくつかの実施形態において、K7Q、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される一つまたは二つの突然変異を有するTRII細胞外ドメインの変異体は、二機能性融合タンパク質のスプライシングの減少を示す。
【0047】
いくつかの実施形態において、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される突然変異を有するTRII細胞外ドメインの変異体は、スプライシングの減少を示す。
【0048】
いくつかの実施形態において、突然変異K7Qを有するTRII細胞外ドメインの変異体は、スプライシングの顕著な減少を示す。
【0049】
いくつかの実施形態において、TRII細胞外ドメインの変異体は、N末端欠失を有する変異体であり、好ましくは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までのアミノ酸番号に基づいて、4個のアミノ酸、7個のアミノ酸、9個のアミノ酸、13個のアミノ酸、17個のアミノ酸および21個のアミノ酸の欠失がある。
【0050】
いくつかの実施形態において、TRII細胞外ドメインの変異体は、点突然変異T16SおよびD17Nを含み、且つN末端の7個のアミノ酸欠失を有する変異体である。
【0051】
いくつかの実施形態において、第2のドメインは、SEQ ID NO:90~107のいずれか一つに示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:90~107のいずれか一つと少なくとも85%の配列同一性を有するアミノ酸配列を有する、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体である。
【0052】
いくつかの実施形態において、第1のドメインのC末端は、リンカーを介して第2のドメインのN末端に連結されるか、あるいはその逆も同様である。
【0053】
リンカーは、小分子、PEGポリマーまたはリンカーペプチドであり得る。好ましくは、前記リンカーは、リンカーペプチドである。
【0054】
いくつかの実施形態において、第1のドメインおよび第2のドメインは、2~約30個のアミノ酸、好ましくは6~26個のアミノ酸の短いリンカーペプチドに連結される。リンカーは、柔軟性を高めるためにグリシンを豊富に含むか、可溶性を高めるためにセリン、スレオニン、グルタミン酸、アラニンまたはリジンを含むことができ、また抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のC末端をTRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に連結することができるか、あるいはその逆も同様である。リンカーペプチドは、(GS)、(GS)G、S(GS)G、SG(EAAAK)SG、S(GEGES)nG、(EAAAK)から選択されることができ、ここで、nは、1~5の整数である。いくつかの実施形態において、リンカーは、SEQ ID NO:108~117から選択されるアミノ酸配列を含むことができる。いくつかの実施形態において、抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のC末端、好ましくは重鎖のC末端は、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に直接連結されるか、またはリンカーてペプチドを介してに連結され、その逆も同様である。
【0055】
いくつかの実施形態において、抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のN末端、好ましくは重鎖のN末端は、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に直接連結されるか、またはリンカーてペプチドを介してに連結され、その逆も同様である。
【0056】
このような二機能性融合タンパク質は、リンカーの導入にもかかわらず、依然として元の免疫グロブリンの特異性を保持する。
【0057】
いくつかの実施形態において、本発明による二機能性融合タンパク質は、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体に直接連結された、またはリンカーを介して連結された抗AREG抗体の重鎖または軽鎖、好ましくは重鎖を含む。
【0058】
いくつかの実施形態において、本発明による二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖または軽鎖、好ましくは重鎖を含み、そのN末端は、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に直接連結されるか、またはリンカーを介して連結される。
【0059】
いくつかの実施形態において、本発明による二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖または軽鎖、好ましくは重鎖を含み、そのC末端は、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に直接連結されるか、またはリンカーを介して連結される。
【0060】
いくつかの実施形態において、本発明による二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのC末端は、リンカーを介して、TRIIの細胞外ドメインのN末端に連結される。いくつかの実施形態において、本発明による二機能性融合タンパク質は、SEQ ID NO:118~139のいずれか一つに示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:118~139のいずれか一つと少なくとも85%の配列同一性を有するアミノ酸配列を含む。
【0061】
好ましくは、本発明による二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の軽鎖をさらに含む。
【0062】
本発明による二機能性融合タンパク質は、ヘテロ四量体の形態である。
【0063】
いくつかの実施形態において、抗AREG抗体のFc領域は、ヒンジ(Hinge)部分、CH3部分およびCH2部分を含むことができる。
【0064】
いくつかの実施形態において、Fc領域は、ヘテロ二量体化、好ましくは二つの重鎖のヘテロ二量体化を促進するドメインをさらに含むことができる。
【0065】
いくつかの実施形態において、定常領域は、半減期の延長、安定性の向上、ADCCおよび/またはCDCの増加または減少を目的とする、様々な修飾を含む。
【0066】
本発明による二機能性融合タンパク質は、抗TGFβおよび抗AREG活性を同時に有し、TGFβおよびAREGを同時に阻害する能力を有し、TGFβおよびAREGに関連する経路を同時にブロッキングすることができ、また線維症、癌、および慢性炎症に関連する疾患等の疾患を含む病症をより効果的に軽減および治療することができる。特に、本発明による二機能性融合タンパク質は、TGFβリガンドに結合できるTRIIの細胞外ドメインの少なくとも一部と、ならびにAREGに結合して中和する抗体または抗原結合断片とを有する。当該二機能タンパク質は、TGFβおよびAREGシグナル伝達を同時にブロッキングすることができる。従って、本発明の二機能性融合タンパク質は、線維性疾患(腎線維症、肝線維症、肺線維症、特にIPFを含むがこれらに限定されない)、癌、ならびに慢性炎症に関連する疾患の治療に使用されることができる。
【0067】
第2の態様において、本発明は、第1の態様の二機能性融合タンパク質をコードする、単離された核酸を提供する。
【0068】
第3の態様において、本発明は、第2の態様の単離された核酸を含む、発現ベクターを提供する。
【0069】
第4の態様において、本発明は、第2の態様の単離された核酸または第3の態様の発現ベクターを含む、宿主細胞を提供する。
【0070】
宿主細胞は、第3の態様の発現ベクターが、担持された核酸を第1の態様の二機能性融合タンパク質に安定に発現できる限り、当技術分野における従来の宿主細胞である。好ましくは、宿主細胞は、原核細胞および/または真核細胞であり、原核細胞は、好ましくは、TG1、BL21等の大腸菌(E.coli)細胞であり、また真核細胞は、好ましくはは、HEK293細胞、CHO細胞または派生された細胞株である。本発明の宿主細胞は、第3の態様の発現ベクターをトランスフェクションすることによって取得されることができる。トランスフェクション法は、当技術分野における従来のトランスフェクション法であり、好ましくは、化学的トランスフェクション法、ヒートショック法またはエレクトロポレーション法である。
【0071】
第5の態様において、本発明は、第1の態様的二機能性融合タンパク質を調製する方法を提供する。
【0072】
いくつかの実施形態において、当該方法は、第4の態様の宿主細胞を培養する段階を含む。
【0073】
第6の態様において、本発明は、第1の態様の二機能性融合タンパク質および薬学的に許容されるベクターを含む、医薬組成物を提供する。
【0074】
いくつかの実施形態において、医薬組成物は、他の小分子薬物または抗体またはポリペプチド等の他の成分を有効成分として含む。
【0075】
医薬組成物は、非経口、注射または経口によって投与される。医薬組成物は、例えば水溶液、非水溶液または懸濁液、粉末、錠剤、カプセル、顆粒、注射剤または注入剤等の固体、半固体または液体形態等の投与に適した形態である。医薬組成物は、血管内、皮下、腹腔内、筋肉内、吸入、鼻腔内、気道点滴注入または胸腔内点滴注入によって投与される。医薬組成物は、経鼻投与、くも膜下腔内投与、髄内投与または脳室内投与等のエアロゾル剤またはスプレー剤の形態で投与されるか、経皮投与、局所投与、経腸投与、膣内投与、舌下投与または直腸内投与によって投与される。
【0076】
いくつかの実施形態において、二機能性融合タンパク質および一種または複数種の他の有効成分を同時にまたは順次に投与する。
【0077】
第7の態様において、本発明は、被験者における線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患の予防、治療および/または診断における、第1の態様的二機能性融合タンパク質、第2の態様的単離された核酸および第6の態様的医薬組成物の用途を提供する。線維性疾患は、腎線維症、肝線維症および肺線維症、特にIPFをふくむが、これらに限定されない。
【0078】
第9の態様において、本発明は、被験者における線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための方法を提供し、当該方法は、被験者に治療有効量の第1の態様の二機能性融合タンパク質を投与することを含む。線維性疾患は、腎線維症、肝線維症および肺線維症、特にIPFを含むが、これらに限定されない。
【発明の効果】
【0079】
本発明の二機能性融合タンパク質は、次のような技術的効果を有する。
【0080】
1.TGFβおよびAREGのアンタゴニストとして、
【0081】
2.単一の二機能タンパク質として、TGFβおよびAREGを阻害する能力を有し、線維症発症の二つの駆動因子を効果的にブロッキングし、相乗効果を引き起こして、組織線維症、特に肺線維症を治療し、
【0082】
3.単一の二機能タンパク質として、TGFβおよびAREGのシグナル伝達を同時にブロッキングし、
【0083】
4.単一の二機能タンパク質として、TGFβおよびAREG二特異的に結合し、
【0084】
5.AREG誘導性pEGFRを阻害する能力を有し、
【0085】
6.TGFβリガンドに結合する能力を有し、それによってTGFβシグナル伝達経路の下流の活性化を阻害し、
【0086】
7.K7Q、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される一つまたは二つの突然変異を有するTRII細胞外ドメイン変異体を二機能性融合タンパク質は、二機能性融合タンパク質のスプライシングの減少を示し、
【0087】
8.R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される突然変異を有するTRII細胞外ドメイン変異体を含む二機能性融合タンパク質は、スプライシングの減少を示し、
【0088】
9.突然変異K7Qを有するTRII細胞外ドメイン変異体を含む二機能性融合タンパク質は、スプライシングの顕著な減少を示し、
【0089】
10.TRII細胞外ドメイン変異体を含む二機能性融合タンパク質は、ここで、N末端欠失を有する変異体であり、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までのアミノ酸番号に基づいて、4個のアミノ酸、7個のアミノ酸、9個のアミノ酸、13個のアミノ酸、17個のアミノ酸または21個のアミノ酸N末端の欠失を有する、より良好な安定性およびより少ないスプライシングを示す。
【0090】
定義:
【0091】
トランスフォーミング成長因子β(TGFβ)は、生理学的および病理学的条件下で重要な役割を果たす多面発現性サイトカインである。TGFβ異性体、即ちβ1、β2およびβ3は、約25kDaのホモ二量体ポリペプチドである。これらのリガンドは、細胞表面受容体(トランスフォーミング成長因子β受容体I、IIおよびIII(TRI、TRII、TRIII)を含む)、ならびにSMAD2および3等の細胞内SMADエフェクタータンパク質を介してシグナルを伝達する。シグナルの伝達は、細胞の生存、増殖、分化、細胞の運動および細胞外マトリックス(ECM)の産生等、一連の細胞プロセスに影響を与える。
【0092】
アンフィレグリン、AREGは、上皮成長因子(EGF)ファミリーの低親和性リガンドである。AREGタンパク質は、252個のアミノ酸の膜貫通前駆体から合成され、それは、細胞膜プロテアーゼ、主にTACE(腫瘍壊死因子-α-インベルターゼ)によってその細胞外ドメイン内でタンパク質を加水分解的に切断される。次に、成熟した可溶性AREGは、上皮成長因子受容体(EGFR)に直接結合することで下流のシグナル伝達を活性化する。これにより、MAPK/ERKシグナル伝達を含む主な細胞内シグナルカスケードを引き起こして、細胞の生存、増殖および運動を制御する。
【0093】
本明細書で使用されるように、「a」および「an」という冠詞は、本明細書の一つまたは複数の文法的オブジェクト(例えば、少なくとも一つ)を指す。
【0094】
文脈上明確に別段の指示をしない限り、「または」という用語は、本明細書では「および/または」という用語を意味するために使用され、「およびまたは」と交換可能に使用されることができる。
【0095】
「約」および「およそ」とは、一般に、測定された性質または精度を考慮した測定量の許容可能な誤差レベルを指す。例示的な誤差レベルは、所与の値または数値範囲の20%以内、典型的には10%いない、より典型的には、5%いないである。
【0096】
本明細書に開示される製品および方法は、特定の配列またはそれと同一もしくは類似の配列を有するポリペプチドおよびポリヌクレオチドを含み、例えば、特定の配列と少なくとも約85%または95%の配列同一性(同一)を有する配列を有する。アミノ酸配列の文脈において、「85%または95%の配列同一性(同一)」という用語は、十分な数または最小限の数を含むアミノ酸残基が、i)第2のアミノ酸配列中の整列アミノ酸残基と同一であるか、またはii)第1および第2のアミノ酸配列が共通のドメインおよび/または共通の機能活性を有することができるように、第2のアミノ酸配列における整列したアミノ酸残基の保存的置換である、本明細書では第1のアミノ酸配列を指すために使用される。例えば、参照配列(例えば、本明細書で提供される配列)と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有する共通のドメインを含むアミノ酸配列である。
【0097】
核酸の文脈において、「85%または95%の配列同一性(相同性)」という用語は、第1および第2のヌクレオチド配列が共通の機能活性を有するポリペプチドをコードするか、もしくは共通の構造ポリペプチドドメインまたは共通の機能ポリペプチド活性をコードするように、第2の核酸配列における整列したヌクレオチドと同一である十分な数または再上限の数のヌクレオチドを含む、本明細書では第1の核酸配列を指すために使用される。例えば、参照配列(例えば、本明細書で提供される配列)と少なくとも約85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%または99%の同一性を有するヌクレオチド配列である。
【0098】
二つのアミノ酸配列または二つの核酸配列の同一性パーセントを決定するには、配列を最適な比較目的で整列させる(例えば、最適なアラインメントのために、第1および第2のアミノ酸または核酸配列の一方または両方にギャップを導入し、また比較目的で非相同配列を無視することができる)。好ましい実施形態において、比較目的でアラインメントされた参照配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、例えば少なくとも40%、50%、60%、例えば少なくとも70%、80%、90%、100%である。次いで対応するアミノ酸位置またはヌクレオチド位置でのアミノ酸残基またはヌクレオチドを比較する。第1の配列の一つの位置が第2の配列に対応する位置での同じアミノ酸残基またはヌクレオチドによって占められる場合、分子は、当該位置で同一である。
【0099】
「ポリペプチド」、「ペプチド」および「タンパク質」という用語は、本明細書では交換可能に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。
【0100】
「核酸」、「核酸配列」、「ヌクレオチド配列」または「ポリヌクレオチド配列」および「ポリヌクレオチド」という用語は、交換可能に使用される。
【0101】
本明細書で使用されるように、「抗体」という用語は、免疫グロブリン鎖またはその断片等の、少なくとも一つの免疫グロブリン可変ドメイン配列を含むタンパク質を指す。「抗体」という用語は、例えば、モノクローナル抗体(免疫グロブリンFc領域を有する全長抗体を含む)を含むことを指す。一実施形態において、抗体は、全長抗体または全長免疫グロブリン鎖を含む。一実施形態において、抗体は、全長抗体の抗原結合または機能断片、または全長免疫グロブリン鎖を含む。本明細書で使用されるように、抗体が抗原に「結合」するということは、当業者には理解される。一実施形態において、抗体が抗原に結合する解離定数(KD)は、約1×10-5Mまたはそれ以下、1×10-6Mまたはそれ以下、または1×10-7Mまたはそれ以下である。
【0102】
例えば、抗体は、重(H)鎖可変ドメイン配列(本明細書ではVHと略記される)および軽(L)鎖可変ドメイン配列(本明細書ではVLと略記される)を含むことができる。一実施形態において、抗体は、重鎖および軽鎖、または重鎖および軽鎖からなる。別の例において、抗体は、二つの重(H)鎖可変ドメイン配列および二つの軽(L)鎖可変ドメイン配列を含み、それによってFab、Fab’、F(ab’)、Fc、Fd、Fd’、Fv、単鎖抗体(例えば、scFv)、単一可変ドメイン抗体、ダイアボディー(Dab)(二価および二重特異性)およびキメラ(例えば、ヒト化)抗体等の二つの抗原結合部位を形成し、これらは、抗体全体を修飾することによって、または組換えDNA技術を使用した抗体のデノボ合成によって生成されることができる。これらの機能的な抗体断片は、それぞれの抗原または受容体に選択的に結合する能力を保持している。抗体および抗体断片は、IgG、IgA、IgM、IgDおよびIgEを含むがこれらに限定されない任意のクラスの抗体、ならびに任意のサブクラスの抗体(例えば、IgGl、IgG2、IgG3およびIgG4)に由来することができる。抗体の製剤は、モノクローナル抗体またはポリクローナル抗体であり得る。抗体は、ヒト抗体、ヒト化抗体、CDR移植抗体またはインビトロ産生抗体であってもよい。抗体は、例えばIgGl、IgG2、IgG3またはIgG4から選択される重鎖定常領域を有することができる。抗体は、例えばκまたはλから選択される軽鎖を有することができる。本明細書において、「免疫グロブリン」(Ig)という用語は、「抗体」という用語と交換可能に使用される。
【0103】
本明細書で使用される「抗体断片」または「抗原結合断片」という用語は、F(ab’)、F(ab)、Fab’、Fab、Fv、scFv等の抗体の一部である。抗体断片は、完全な抗体によって識別される同じ抗原に結合する。「抗体断片」という用語は、アプタマー、シュピーゲルマー(spiegelmers)およびダイアボディーを含む。「抗体断片」という用語は、特定の抗原に結合して複合体を形成することによって抗体のように機能する合成タンパク質または遺伝子操作されたタンパク質をさらに含む。
【0104】
抗体の抗原結合断片の例としては、(i)VL、VH、CLおよびCH部分から構成される一価断片のFab断片、(ii)ヒンジ領域でジスルフィド結合によって接続された二つのFab断片を含む二価断片のF(ab’)断片、(iii)VH部分およびCH部分からなるFd断片、(iv)抗体のシングルアームのVL部分およびVH部分からなるFv断片、(v)VH部分からなるダイアボディー(dAb)断片、(vi)ラクダ型またはラクダ化された可変部分、(vii)単鎖Fv(scFv)、(viii)単一部分抗体を含む。これらの抗体断片は、当業者に知られている従来の技術を含む、任意の適切な方法を使用して得ることができ、またこれらの断片は、完全な抗体と同じ方法でその用途をスクリーニングすることができる。「抗体断片」という用語は、特定の抗原に結合して複合体を形成することによって抗体のように機能する任意の合成タンパク質または遺伝子操作されたタンパク質をさらに含む。
【0105】
「単鎖可変断片」または「scFv」とは、免疫グロブリンの重鎖(VH)および軽鎖(VL)の可変領域の融合タンパク質を指す。
【0106】
いくつかの態様において、前記領域は、2~約30個のアミノ酸、好ましくは6~26個のアミノ酸の短いリンカーにてペプチドを介して連結される。リンカーは、柔軟性を取得するためにグリシンを豊富に含むことができ、セリン、スレオニン、グルタミン酸、アラニンまたはリジンを含み、またリンカーは、抗AREG抗体またはその断片のVHのN末端をTRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に連結することができ、あるいはその逆も同様である。
【0107】
軽鎖および重鎖は、「定常」領域および「可変」領域に分けられる。軽鎖可変ドメイン(VL)および重鎖可変ドメイン(VH)は、抗原の識別および特異性を部分的に決定する。逆に、軽鎖の定常ドメイン(CL)および重鎖の定常ドメイン(CH1、CH2またはCH3)は、分泌、胎盤経移動性、Fc受容体結合、補体結合等の重要な生物学的特性を与える。N末端部分は、可変領域ドメインであり、またC末端部分は、定常領域であり、CH3部分およびCL部分は、実際にそれぞれ重鎖および軽鎖のカルボキシ基末端を含む。
【0108】
可変領域により、抗体は、抗原上のエピトープを選択的に識別および特異的に結合することができる。抗体のVL部分およびVH部分、または相補性決定領域(CDR)のサブセットは、結合して、三次元の抗原結合部位を限定する可変領域を形成する。このような四次抗体構造は、Yの各アームの末端で抗原結合部位を形成する。より具体的には、抗原結合部位は、VH鎖およびVL鎖(即ちHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3)のそれぞれの三つのCDRによって限定される。
【0109】
本明細書で使用される「相補性決定領域」および「CDR」という用語は、抗体可変領域内の、抗原特異性および結合親和性を与えたアミノ酸配列を指す。いくつかの実施形態において、各重鎖可変領域には、三つのCDR(HCDR1、HCDR2およびHCDR3)が存在し、各軽鎖可変領域には、三つのCDR(LCDR1、LCDR2およびLCDR3)が存在する。
【0110】
所定のCDRアミノ酸配列の正確な境界は、Kabatら(1991)、「Sequences of Proteins of Immunological Interest(免疫学的タンパク質配列)」、第5版、Public Health Service、National Institutes of Health(国立衛生研究所公衆衛生局)、ベセスダ(Bethesda)、MD(「Kabat」番号付けスキーム)によって記載されている周知のプロトコールを使用して決定される。
【0111】
各VHおよびVLは、通常、アミノ基末端からカルボキシ基末端までFR1、CDR1、FR2、CDR2、FR3、CDR3、FR4の順序で配置される、三つのCDRおよび四つのFRを含む。
【0112】
「被験者」または「個体」または「動物」または「患者」または「哺乳動物」とは、診断、予後または治療を必要とする任意の被験者、特に哺乳動物被験者を指す。哺乳動物は、ヒト、家畜、農場動物、動物園動物、スポーツ動物またはペット動物、例えば、イヌ、猫、モルモット、ウサギ、ラット、マウス、ウマ、ウシ、乳牛等を含む。
【0113】
本明細書で使用されるように、「治療を必要とする患者」または「治療を必要とする被験者」という語句は、本開示の抗体または組成物の投与から恩恵を受ける被験者、例えば、哺乳動物被験者を含み、前記抗体または組成物は、例えば検出、診断手順および/または治療に使用される。
【0114】
本明細書で使用されるように、「エピトープ」という用語は、抗体と特異的に相互作用する抗原(例えば、ヒトAREG)の部分を指す。このような部分は、本明細書ではエピトープ決定基とも呼ばれ、通常、アミノ酸側鎖または糖側鎖等の用を含むか、またはその一部である。エピトープ決定基は、当技術分野で知られている方法、または本明細書に開示されている方法、例えば結晶学または水素-重水素交換によって定義されることができる。エピトープ決定基と特異的に相互作用する抗体上の少なくとも一つまたはいくつかの部分は、通常、CDRに位置する。通常、エピトープは、特定の三次元構造特徴を有する。通常、エピトープは、特定の電荷特性を有する。いくつかのエピトープは、線状エピトープであるが、別のいくつかのエピトープは、コンフォメーション・エピトープである。
【0115】
本明細書で使用される「モノクローナル抗体」または「モノクローナル抗体組成物」という用語は、単一の分子成分を有する抗体の調製物を指す。モノクローナル抗体組成物は、特定のエピトープに対して単一の結合特異性および親和性を示す。モノクローナル抗体は、ハイブリドーマ技術またはハイブリドーマ技術を使用しない方法(例えば、ライブラリー選択、スクリーニングまたは組換え方法)によって調製されることができる。
【0116】
抗体は、ポリクローナル抗体またはモノクローナル抗体であり得る。他の実施形態において、抗体は、酵母ディスプレイ、ファージディスプレイまたはコンビナトリアル法によって、組換え的に産生されることができる。
【0117】
一実施形態において、抗体は、完全なヒト抗体(例えば、酵母ディスプレイによって産生される抗体、ファージディスプレイによって産生される抗体、またはヒト免疫グロブリン配列に対する抗体を産生するように遺伝子操作されたマウスで調製された抗体)、または例えばネズミ(マウスまたはラット)、ヤギ、霊長類動物(例えば、サル)またはラクダ抗体等の非ヒト抗体である。げっ歯類動物抗体を産生する方法は、当技術分野で知られている。
【0118】
ヒト免疫グロブリン遺伝子を保有するトランスジェニックマウス(マウスシステムの代わりに)を使用して、ヒトモノクローナル抗体を産生することができる。目的の抗原またはその断片で免疫されたこれらのトランスジェニックマウスから得られた脾細胞は、エピトープに対して特異的親和性を有するヒトmAbを分泌するハイブリドーマを生成するために使用される。
【0119】
抗体は、可変領域またはその一部(例えば、CDR)が非ヒト生物(例えば、ラットまたはマウス)において産生された抗体であり得る。キメラ抗体、CDR移植抗体およびヒト化抗体は、本発明の範囲内である。ラットまたはマウス等の非ヒト生物で産生され、次いで例えば可変フレームワークまたは定常領域内で修飾されて、ヒトにおける抗原性を低下させる抗体は、すべて本発明の範囲内である。
【0120】
本発明の範囲には、特定のアミノ酸が置換、欠失または付加されたヒト化抗体をさらに含まれる。ドナーからアミノ酸を選択するための標準は、US5585089号、例えばUS5585089号、第12~16欄、例えばUS5585089号の第12~16欄に記載され、その内容は、参照により本明細書に組み込まれる。Padlanらは、1992年12月23日に開示されたEP 519596A1に抗体ヒト化のための他の技術を記載した。
【0121】
他の実施形態において、抗体は、重鎖定常領域を有し、その重鎖定常領域は、例えばIgGl、IgG2、IgG3、IgG4、IgM、IgA1、IgA2、IgDおよびIgEから選択され、特に、その重鎖定常領域は、例えばIgGl、IgG2、IgG3およびIgG4(例えば、ヒト)から選択される。
【0122】
本発明の分子は、それらの機能に実質的な影響を及ぼさない追加の保存的または非必須アミノ酸置換を有することができることを理解されたい。
【0123】
表1に示されるように、「保存的アミノ酸置換」とは、アミノ酸残基が同様の側鎖を有するアミノ酸残基に置換する置換を指す。同様の側鎖を有するアミノ酸残基のファミリーは、当技術分野に置いて定義される。これらのファミリーは、塩基性側鎖を有するアミノ酸(例えば、リジン、アルギニン、ヒスチジン)、酸性側鎖を有するアミノ酸(例えば、アスパラギン酸、グルタミン酸)、非荷電極性側鎖を有するアミノ酸(例えば、グリシン、アスパラギン、グルタミン、セリン、スレオニン、チロシン、システイン),非極性側鎖を有するアミノ酸(例えば、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン、プロリン、フェニルアラニン、メチオニン、トリプトファン)、β分岐鎖側鎖を有するアミノ酸(例えば、スレオニン、バリンおよびイソロイシン)、ならびに芳香族側鎖を有するアミノ酸(例えば、チロシン、フェニルアラニン、トリプトファン、ヒスチジン)を含む。
【0124】
【表1】
【図面の簡単な説明】
【0125】
図1】例示的な抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質の構造を示す。
【0126】
図2】異なるリンカーを有する抗AREG/TRII変異体におけるスプライシング物質の特徴付けを示す。
【0127】
図3】抗AREG/TRIIにおける切断ホットスポット(太字-斜体アルファベット)を示す。
【0128】
図4】抗AREG/TRIIにおけるK7突然変異(014)がスプライシングを減少させることを示す。
【0129】
図5】抗AREG/TRII変異体におけるTRIIのN末端欠失が重鎖スプライシングを減少させることを示す。
【0130】
図6】抗AREG/TRIIにおけるTRIIのN末端欠失(013、017、028、029、030)が重鎖スプライシングを減少させることを示す。
【0131】
図7】抗AREG/TRII変異体013、029および030の純度を示す。
【0132】
図8】pEGFRに対する変異体010の阻害効果を示す。
【0133】
図9】SREレポーター遺伝子に対する変異体010、013および030の阻害を示す。
【0134】
図10】変異体010、013および030がpSMAD2の核局在化をブロッキングすることを示す。
【0135】
図11】変異体013がイムノブロットアッセイにおいてpSMAD2を阻害することを示す。
【0136】
図12】SBEルシフェラーゼレポーター遺伝子測定におけるTGFβシグナル伝達に対する変異体010、013および030の阻害効果を示す。
【0137】
図13】二機能抗AREG/TRII融合タンパク質がAREGおよびTGFβを同時に標的とすることを示す。
【0138】
図14】変異体010、013および030の薬物動態特徴を示す。
【0139】
図15】Cdc42 AT2ヌル線維症モデルにおける抗AREG/TRII融合タンパク質の有効性を示す。
【発明を実施するための形態】
【0140】
特定の実施形態および例の説明は、限定ではなく例示として提供される。当業者であれば、実質的に同様の結果を生み出すために変更または修正されることができる様々な非重要なパラメーターを容易に認識するであろう。
【0141】
以下の表2は、異なる抗AREG/TRII変異体の構造を概略的に示す。
【0142】
【表2】
【実施例
【0143】
実施例1.抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質の産生
【0144】
抗AREG/TRIIは、抗AREG抗体-トランスフォーミング成長因子β受容体II(TGFβRII、TRII)細胞外ドメインの二機能タンパク質である。分子の軽鎖可変領域は、抗AREG抗体の軽鎖可変領域(SEQ ID No.:70~89)と同一である。分子の重鎖は、柔軟性リンカー(SEQ ID No.:108、109、113および116~117)を介して可溶性TRII(SEQ ID No.:90~107)のN末端に融合された抗AREG抗体の重鎖(SEQ ID NO.:57~69)を含む融合タンパク質である。融合接合部では、抗体重鎖のC末端リジン残基は、タンパク質加水分解による切断を減少させるために、アラニンに突然変異する。
【0145】
以下の例示的な手順を使用して、プラスミドを構築する。
【0146】
ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)(TOYOBO、KOD-201)によって断片が増幅される。電気泳動後、1.5%アガロースゲルでPCR産物を分離し、DNA精製キット(Magen、D2111-03)を使用して回収する。制限酵素を使用して断片およびベクターをそれぞれ消化し、T4 DNAリガーゼ(New England Biolabs、M0202L)を使用して連結される。連結された構築物を、陽性クローン選択のために大腸菌Top10株(CWBIO、CW0807)形質転換する。クローン化されたプラスミドは、真核生物の発現系でのタンパク質発現に使用される。
【0147】
以下の例示的な手順を使用して、タンパク質を生成する。
【0148】
1:1の比率で、重鎖および軽鎖を有する2種類の発現ベクターをFreeStyle(商標) 293-F細胞(Invitrogen、R79007)にトランスフェクションする。トランスフェクションの前日に、293-F細胞を継代培養および増幅し、一晩増殖させる。トランスフェクション当日、遠心分離によって細胞を収集し、次いで将新鮮なFreeStyle(商標) 293発現培地(Gibco、12336-018)に最終密度1.2×10細胞/mLになるまで再懸濁する。最終濃度1ug/mLのプラスミドを、示されたモル比でポリエチレンイミン(Polysciences、23966)で一時的に同時トランスフェクションする。トランスフェクションの5~6日後、細胞培養上清液を採取する。
【0149】
実施例2.異なるリンカーを有する抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質の特徴付け
【0150】
例示的な抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質(anti-AREG/TRII)001、005、008および009は、軽鎖(SEQ ID No:70~89)、および異なるリンカー(SEQ ID NO:118~121)を介してTRIIに融合される重鎖を含む。二機能性融合タンパク質の構造は、図1に示されたとおりである。
【0151】
以下の例示的な手順を使用して、融合タンパク質のスプライシングを評価する。トランスフェクション後の融合タンパク質を収集し、次いでワンステッププロテインAクロマトグラフィーによって精製される。すべてのサンプルを0.5mg/mLの濃度に調節し、次いで安定性試験のために37℃でインキュベートされる。サンプルは、還元条件下でドデシル硫酸ナトリウム-ポリアクリルアミドゲル電気泳動(SDS-PAGE)によって分析される。
【0152】
図2は、SDS-PAGE後、すべてのサンプルで約25kDaおよび70kDaの二つのバンドが検出されたことを示す。この二つのバンドは、二機能タンパク質の軽鎖および重鎖を表わす。37℃で2日間インキュベートした後、約50~60kDaの追加のバンドがさらに検出され、これは、追加のインキュベーション後の変異体に様々なスプライシング物質が存在することを示す。
【0153】
実施例3.抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質の切断部位の測定
【0154】
異なるリンカーを有する抗AREG/TRIIは、様々な程度のスプライシングを示し、SDS-PAGE上では異なる分子量の分として表される。従って、スプライシングの部位を決定するために、さらなる研究を実行する。
【0155】
0.5mg/mLの001または009を37℃でインキュベートする。2日間インキュベーション後、サンプルをゲルにロードする。スプライシングされた断片を分離して回収する。断片を質量分析(MS)によって分析する(LTQ Orbitrap、ThermoFisher Scientific)。分析結果は、図3に示されるように、Lys7/Ser8、Arg34/Phe35、Arg66/Lys67およびLys103/Lys104が、TGFβトラップスプライシングのホットスポットであることを示す。
【0156】
https://web.expasy.org/peptide_cutter/で潜在的な切断部位を予測する。これらの分析の結果は、Lys7/Ser8、Arg34/Phe35、Arg66/Lys67およびLys103/Lys104も潜在的な切断部位であることを示す。
【0157】
実施例4.スプライシングを減少させる抗AREG/TRII変異体の研究
【0158】
スプライシングを顕著に減少するTRII含有分子を開発するために、TRII突変異体(SEQ ID NO:90~107)を有する様々なトラップを設計した。
【0159】
例示的な抗AREG/TRIIは、軽鎖(SEQ ID NO:83)、およびTRII変異体に融合する重鎖(SEQ ID NO:122~139)を含む。010は、野生型TRII細胞外ドメインを有する抗AREG/TRII変異体である。014、015、016、017および018は、抗AREG/TRII変異体であり、ここで、TRIIは、上記部位で一つまたは二つの突然変異を有する。精製されたサンプルを37℃で3日間インキュベートする。実施例3に記載の方法によって、スプライシングされた物質を評価する。
【0160】
図4は、K7突然変異(014)が重鎖スプライシングの顕著に減少を示すことを示す。010と比較して、R34(016)、R66/K67(017)およびK103/K104(018)突然変異も、スプライシングの減少を引き起こす。
【0161】
K7がスプライシングを媒介する最も重要な残基であることを考慮して、TRIIのN末端の七つの残基を欠失した新しい変異体026を設計する。K7突然変異とR34、R66/K67およびK103/K104突然変異との組み合わせも設計し(019、020、021、022、024、025および026)、スプライシング評価実施する。図5に示されるように、すべての変異体において、026は、37℃で6日間インキュベーション後に最も少ないスプライシングを示す。
【0162】
点突然変異または点突然変異の組み合わせと比較して、欠失変異体026は、より良好な安定性を示す。従って、四つの残基欠失(027)、九つの残基欠失(028)、13個の残基欠失(029)、17個の残基欠失(030)および21個の残基欠失(013)を含む、追加の欠失変異体を設計する。図6に示されるように、37℃で5日間インキュベーション後、029、030および013は、SDS-PAGEにおいて010より少ないスプライシング物を示す。
【0163】
サイズ排除クロマトグラフィー(SEC)を用いて抗AREG/TRII変異体の純度を評価する。図7は、013、029および030の例示的なマップを示す。精製後の純度は、98%を超える。高分子量(HMW)および低分子量(LMW)のレベルは、2%未満である。
【0164】
実施例5.SPRによる抗AREG/TRII変異体のAREGおよびTGFβへの結合の検出
【0165】
表面プラズモン共鳴(SPR)を使用して、AREGおよびTGFβsに対する抗AREG/TRII変異体の結合動態を特徴付ける。
【0166】
以下の例示的な手順を使用して、平衡解離定数を測定する。
【0167】
Biacore T200機器(GE Life Sciences)を使用して、SPR測定を実施する。サンプルをプロテインA/G CM5バイオセンサーチップの表面に捕捉する。ヒトTGFβ3(R&D、243-B3-010)の様々な変異体への結合を検出する。段階希釈したTGFβタンパク質を抗AREG/TRII変異体に結合する表面に注射し、その後解離段階に入る。1対1のラングミュア(Langmuir)結合モデル(BIA評価ソフトウェア、GE Life Sciences)を使用して、結合速度(ka)および解離速度(kd)を計算する。KDは、kdとkaとの比として計算される。
【0168】
表3に示されるように、010、013および030は、同様の動態でTGFβ1/2/3およびAREGに結合する。
【0169】
【表3】
【0170】
実施例6.リン酸化されたEGFRを検出することによる、EGFRに対する抗AREG/TRII変異体の阻害効果の測定
【0171】
AREGは、上皮成長因子受容体(EGFR)に結合し、且つ受容体の活性化を引き起こし、これは、リン酸化されたEGFR(pEGFR)によって測定されることができる。例示的な抗AREG/TRII変異体010、およびAREGによって誘導されたpEGFRを阻害する能力を検出する。
【0172】
以下の例示的な手順を使用する。A431細胞を2×10細胞/ウェルで6ウェルプレートに接種し、37°Cで一晩培養する。翌日、無血清培地を使用して細胞を2時間飢餓処理し、次いで10nMの組換えヒトAREG(Peprotech、96-100-55B-50)および様々な濃度の抗AREG/TRII変異体で1時間処理する。処理した的細胞を溶解し、サンプルをウェスタン(Western)ブロッティングする。抗pEGFR(Abcam、ab40815)、抗EGFR(Cell Signaling technology、2232)および抗GAPDH(Nakasugi Jinqiao、TA-08)を含む一次抗体を使用して、当該測定に使用する。
【0173】
図8は、変異体010がAREG誘導性pEGFRを5.56nMのIC50で阻害することを示す。当該データは、変異体010がAREG誘導性EGFR活性化を効果的にブロッキングできることを示す。
【0174】
実施例7.MAPK/ERKシグナル伝達を介したルシフェラーゼレポーター遺伝子による抗AREG/TRII変異体の特徴付け
【0175】
血清応答レジメンと(SRE)ルシフェラーゼレポーター遺伝子を使用して、AREG-EGFR下流シグナル伝達に対する抗AREG/TRII変異体の阻害効果を検出する。当該レポーター遺伝子は、通常、EGFR-MAPK/ERKシグナル伝達を評価するために使用される。
【0176】
以下の例示的な手順を使用する。SREルシフェラーゼレポーター遺伝子を構築し、Lipo3000トランスフェクションキット(Invitrogen、L3000-015)を使用して、96ウェルプレートのHEK293T細胞をトランスフェクションする。各ウェルに内部対照としてTK-Renillaプラスミドを共のトランスフェクションする。トランスフェクションの6時間後、細胞を血清飢餓処理し、次いで組換えヒトAREG(Peprotech、96-100-55B-50)および抗AREG/TRII変異体で6時間処理する。Dual-Glo(登録商標)ルシフェラーゼ測定システム(Promega、E2940)を使用して、処理されたルシフェラーゼシグナルを検出する。
【0177】
図9は、010、013および030を含む抗AREG/TRII変異体が、AREG誘導性SREレポーター遺伝子の発現を約25nMのIC99で阻害することを示す。当該データは、抗AREG/TRII変異体がAREG誘導性EGFR-MAPK/ERKシグナル伝達を効果的に阻害できることを示す。
【0178】
実施例8.pSMAD2核局在化によるTGFβシグナル伝達に対する抗AREG/TRII変異体の阻害効果の評価
【0179】
抗AREG/TRII融合タンパク質におけるトランスフォーミング成長因子β受容体IIの細胞外ドメインは、TGFβリガンドにキレートするように設計され、それによってTGFβシグナル伝達経路の下流活性化を阻害する。リン酸化されたSMAD2(pSMAD2)の核局在化は、当該経路の活性化を評価するために頻繁に使用される。pSMAD2免疫蛍光染色を使用して、pSMAD2核局在化、即ち、TGFβシグナル活性化に対する抗AREG/TRII変異体の影響を検出する。
【0180】
以下の例示的な手順を使用して、pSMAD2の核局在化を検出する。A549細胞をウェルあたり5000細胞の密度で96ウェルマイクロウェルプレートに接種し、10%FBSを含むDMEMを使用して37℃で一晩培養する。翌日、まず細胞を血清飢餓処理し、次いでそれぞれ0.078nMのTGFβ1(R&D、240-B-101)、ならびに0.39nMおよび1.95nMの抗AREG/TRII変異体で6時間処理する。細胞をPBSですすぎ、固定し、抗pSMAD2抗体(Cell Signaling technology、18338)を使用して4°Cで一晩染色する。翌日、二次抗体(Jackson Immuno Research、711-064-152)を適用後にElite ABCキット(VECTOR、PK-6100)を使用してサンプルを30分間処理し、次いでチラミドフルオレセインで染色する(Pekin-Elmer、FP1013)。パーキンエルマー(Pekin-Elmer)のOpera LXの20倍空気レンズを使用して蛍光画像を取得する。
【0181】
図10に示されるように、1.95nMの抗AREG/TRII変異体010、013および030は、1ng/mlのTGFβ1によって誘導されるpSMAD2核局在化を効果的にブロッキングし、これは、抗AREG/TRII変異体010、013および030がTGFβ2に結合およびキレートし、下流のTGFβシグナル伝達を阻害することを示す。
【0182】
実施例9.pSMAD2免疫ブロッティング法による、TGFβシグナル伝達に対する抗AREG/TRII変異体の阻害効果の測定および定量化
【0183】
Westernブロッティング(WB)によって示されたpSMAD2タンパク質の発現レベルも、TGFβ1に対する抗AREG/TRII変異体の阻害効果を定量的に測定するために使用される。
【0184】
以下の例示的な手順を使用する。A549細胞を2×10細胞/ウェルで6ウェルプレートに接種し、37°Cで一晩培養する。翌日、無血清培地を使用して細胞を2時間飢餓処理し、組換えヒトTGFβ1(R&D、240-B-101)および異なる濃度の抗AREG/TRIIを使用して2時間処理する。処理した細胞を溶解し、サンプルをWesternブロッティング分析する。一次抗体は、抗pSMAD2(Cell Signaling technology、18338)、抗SMAD2/3(Cell Signaling technology、8685)および抗GAPDH(Nakasugi Jinqiao、TA-08)を含む。
【0185】
図11は、培養物に1ng/mLのTGFβ1を添加する場合、変異体030が0.034nMのIC50でpSMAD2を阻害することを示す。当該データは、抗AREG/TRII的TRII-ECD部分がTGFβ1等のリガンドを効果的に捕捉し、下流のシグナル伝達の活性化を阻害できることを示す。
【0186】
実施例10.SBEレポーター遺伝子による、TGFβシグナル伝達に対する抗AREG/TRII変異体の阻害効果の定量化および測定
【0187】
SMAD結合レジメント(SBE)ルシフェラーゼレポーター遺伝子を使用して、TGFβ下流シグナル伝達に対する例示的な抗AREG/TRII変異体010、013および030の阻害効果をさらに定量化および測定する。当該レポーター遺伝子は、TGFβシグナル伝達の活性を評価するために頻繁に使用される。
【0188】
以下の例示的な手順を使用する。SBEルシフェラーゼレポーター遺伝子を構築し、Lipo 3000トランスフェクションキット(Invitrogen、L3000-015)を使用して96ウェルプレートのHEK293T細胞にトランスフェクションする。各ウェルに内部対照としてTK Renillaプラスミドを共のトランスフェクションする。トランスフェクションの6時間後、細胞を血清飢餓処理し、次いでヒトTGFβ1(R&D,240-B-101)および抗AREG/TRIIを使用して6時間処理する。次いでDual-Glo(登録商標)ルシフェラーゼ測定システム(Promega,E2940)を使用して、処理されたルシフェラーゼシグナルを検出する。
【0189】
図12に示されるように、抗AREG/TRII変異体010、013および030は、すべてTGFβ1(0.015nM)のSBEレポーター遺伝子の誘導をブロッキングし、IC50は、それぞれ0.045nM、0.085nMおよび0.06nMである。
【0190】
実施例11.AREGおよびTGFβを同時に標的とする抗AREG/TRII変異体
【0191】
抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質とは、一つの分子を通じてAREGおよびTGFβリガンドを同時に標的とするすることを指す。これを試験するために、主に細胞膜に結合するAREG-EGF様ドメインを過剰発現する、CHO-hAREG細胞株を構築する。抗AREG/TRIIをCHO-hAREG細胞に添加する場合、二機能性融合タンパク質は、抗AREG部分を介して膜AREG-EGF様ドメインに結合する。膜結合二機能分子は、遊離のTGFβリガンドを捕捉することによって、TGFβシグナル伝達の活性化をブロッキングすることもできる。
【0192】
以下の例示的な手順を使用する。CHOおよびCHO-hAREG細胞を収集し、ウェルあたり8000細胞の密度で96ウェルマイクロウェルプレートにおける10%FBSが添加されたDMEMに接種する。ウェルプレートを37℃のCOインキュベーターで一晩インキュベートする。翌日、細胞を無血清DMEMで4時間飢餓処理し、次いで10nM変異体を含むDMEMで2時間処理する。遊離変異体を洗い流した後、0.078nMのTGFβ1を加え、COインキュベーターで細胞とともに1時間インキュベートする。処理後、PBSで細胞を2回洗浄し、4%PFAで固定し、次いで抗pSMAD2抗体(Cell Signaling technology、18338)で染色する。染色後、Pekin-Elmerのハイコンテント細胞分析システムの20倍空気レンズを使用して、蛍光画像を取得する。
【0193】
図13は、変異体010、013および030がTGFβ1誘導性シグナル伝達を効果的にブロッキングし、同時にAREGに結合し、これは、二機能融合分子がAREGおよびTGFβシグナル伝達を同時にブロッキングできることが実証される。
【0194】
実施例12.マウスにおける抗AREG/TRII変異体の薬物動態
【0195】
C57/Bl6マウスに、単一用量の抗AREG/TRII変異体010、013および030を投与し、容量は、15mg/kgである。投与前、投与後3時間、8時間、24時間、48時間、72時間、120時間、168時間、336時間および504時間に血液サンプルを採取する。標準的なプロトコルを使用して、血清サンプルを分離し、次いで分析まで-60℃以下で保存した。
【0196】
分析プログラムは、以下のとおりである。
【0197】
1)コーティング:各ウェルに100μLの3μg/mLストレプトアビジン(Sigma、S4762)を加え、次いでウェルプレートを密閉し、2~8°Cで一晩インキュベートする。
【0198】
2)ブロッキング:ウェルの内容物を廃棄し、各ウェルを300μLの洗浄緩衝液で3回洗浄し、ウェルプレートを乾燥させる。各ウェルに、100μLのビオチン化AREG-hFc(希釈緩衝液において、濃度は1μg/mLである)を加える。ウェルプレートを密閉し、30°Cで約1時間インキュベートする。
【0199】
3)サンプルの添加:ウェルの内容物を捨て、各ウェルを300μLの洗浄緩衝液で3回洗浄し、ウェルプレートを乾燥させる。血清サンプルおよび検量線サンプルを希釈緩衝液で希釈する。次に、100μLの各処理サンプルをウェルプレートの各ウェルに添加する。ウェルプレートを密閉し、30°Cで約1時間インキュベートする。
【0200】
4)抗TRII抗体作業溶液の添加:ウェルの内容物を廃棄する。各ウェルを300μLの洗浄緩衝液で6回洗浄し、ウェルプレートを乾燥させる。100μLの5μg/mL抗TRII抗体作業溶液をウェルプレートの各ウェルに添加し、30°Cで約1時間インキュベートする。
【0201】
5)抗体検出作業溶液の添加:ウェルの内容物を廃棄する。各ウェルを300μLの洗浄緩衝液で6回洗浄し、ウェルプレートを乾燥させる。100μLの抗体検出作業溶液をウェルプレートの各ウェルに加え、30°Cで約0.5時間インキュベートする。
【0202】
6)発色:ウェルの内容物を廃棄する。各ウェルを300μLの洗浄緩衝液で6回洗浄し、ウェルプレートを乾燥させる。各ウェルに100μLの基質溶液を加える。ウェルプレートを室温の暗所で10分間インキュベートする。
【0203】
7)プレートの読み取り:各ウェルに50μLの停止溶液を加え、30分間内にプレートリーダーを使用して450 nmの波長でウェルプレートを読み取り、参照波長は、630nmに設定される。
【0204】
8)結果出力:キャリブレーション濃度をX軸、対応する吸光度(OD)値(OD450nm~OD630nm、空白を控除なし)をY軸として、キャリブレーション標準曲線を描き、サンプル濃度を計算する。
【0205】
図14に示されるように、15mg/kgの単一用量で010、013および030を腹腔内注射した後、これらの変異体は、同様のCmax(200~250μg/ml)、および約4~10日の半減期を示す。
【0206】
実施例13.抗AREG/TRII融合タンパク質のインビボ有効性
【0207】
代替分子を使用して、進行性肺線維症の動物モデルで抗AREG/TRII融合タンパク質のインビボ有効性を実証する。当該動物モデルにおいて、II型肺胞細胞(AT2s)におけるCdc42(細胞分裂制御タンパク質42のホモログであるCDC42をコードする)の欠失は、肺切除術(PNX)誘発性肺損傷後のマウスで肺胞再生障害および進行性肺線維症を引き起こす。当該モデル(以下でCdc42 AT2ヌルモデルと略記する)における線維症は、周縁部から中心部への進行性の瘢痕形成を特徴とし、IPF患者に見られる疾患の進行を再現する。Cdc42 AT2欠失マウスは、線維症の進行に悩まされ、これらの動物の体重は、顕著に減少され、生存率も顕著に低くなる。抗AREG/TRII融合タンパク質は、軽鎖(SEQ ID NO:141)、およびリンカーを介してTRIIに融合する重鎖(SEQ ID NO:142)を含み、ここで、抗AREGは、動物モデルにおけるAREGに特異的に結合する。
【0208】
マウス線維症モデルの詳細な生成は、以前に記載されている(WO2020237587A1)。簡単に説明すると、Cdc42_flox/floxマウスをSpc-CreER-rtTAと交配する。AT2のCdc42を特異的に削除するためにタモキシフェンを注射する。次に、これらのトランスジェニックマウスは、部分肺切除術(PNX)を受けて左肺葉を切除し、それによって機械的張力を増加させて線維症を誘導する。PNX後14日目から開始し、Cdc42 AT2ヌルマウスに、PNX後60日目まで、5日ごとに15mg/kgの用量で抗AREG/TRII代替分子を投与する。5日ごとに体重を測定する。代替分子による治療は、一貫して有効性を示し、これは、生存率の顕著な改善(P=0.0083、図15A)、体重減少の顕著な減少(P<0.0001、図15B)、線維症スコアによって示される線維性病巣および面積の顕著な減少(P<0.0001、図15C)として現わされる。従って、抗AREG/TRIIメカニズムは、線維症の進行を減少するのに十分である。
【0209】
議論
本発明者らは、構築された二機能抗AREG/TRII融合タンパク質が、1)pEGFRイムノブロットアッセイおよびSREレポーター遺伝子測定において、AREG-EGFRシグナル伝達を効果的にブロッキングし、ならびに2)免疫染色によって検出されるpSMAD2核局在化の防止、免疫ブロッティングによって検出されたSMAD2リン酸化の現象、およびTGFβ1誘導性SBEレポーター遺伝子の誘導の阻害等のTGFβシグナル伝達を効果的に阻害することを実証する。さらに、本発明者らは、抗AREG/TRII変異体がAREGおよびTGFβシグナル伝達を同時に標的とすることができることが発見された。これらの結果は、抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質がAREGおよびTGFβシグナル伝達をブロッキングでき、線維症、慢性炎症および癌の治療分子として使用できることを総合的に示す。
図1
図2
図3
図4
図5
図6
図7
図8
図9
図10
図11
図12
図13
図14
図15
【配列表】
2024532540000001.xml
【手続補正書】
【提出日】2024-05-29
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】0209
【補正方法】変更
【補正の内容】
【0209】
議論
本発明者らは、構築された二機能抗AREG/TRII融合タンパク質が、1)pEGFRイムノブロットアッセイおよびSREレポーター遺伝子測定において、AREG-EGFRシグナル伝達を効果的にブロッキングし、ならびに2)免疫染色によって検出されるpSMAD2核局在化の防止、免疫ブロッティングによって検出されたSMAD2リン酸化の現象、およびTGFβ1誘導性SBEレポーター遺伝子の誘導の阻害等のTGFβシグナル伝達を効果的に阻害することを実証する。さらに、本発明者らは、抗AREG/TRII変異体がAREGおよびTGFβシグナル伝達を同時に標的とすることができることが発見された。これらの結果は、抗AREG/TRII二機能性融合タンパク質がAREGおよびTGFβシグナル伝達をブロッキングでき、線維症、慢性炎症および癌の治療分子として使用できることを総合的に示す。
本発明は以下の通りである。
[1]二機能性融合タンパク質であって、
少なくとも二つのドメインを含み、前記二つのドメインは、AREGもしくはその断片、および/またはTGFβリガンドもしくはその断片に結合することができることを特徴とする、前記二機能性融合タンパク質。
[2]第1のドメインおよび第2のドメインを含み、ここで、前記第1のドメインは、AREGまたはその断片に結合することができ、前記第2のドメインは、TGFβリガンドまたはその断片に結合することができることを特徴とする
上記[1]に記載の二機能性融合タンパク質。
[3]前記第1のドメインは、AREGもしくはその断片に結合する抗体またはその抗原結合断片であり、前記第2のドメインは、TGFβ受容体II(TRII)の細胞外ドメインまたはその変異体の一部を含むことを特徴とする
上記[2]に記載の二機能性融合タンパク質。
[4]前記抗体またはその抗原結合断片は、AREG、好ましくはヒトAREGおよびマウスAREGの両方に結合できる抗AREG抗体またはその断片であるか、あるいは、前記抗AREG抗体またはその断片は、ヒトAREGに結合することができ、マウスAREGに対して弱い交差反応性を有するか、または交差反応性を有さないことを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[5]前記抗AREG抗体またはその断片は、ヒト抗AREG抗体、ネズミ抗AREG抗体、キメラ抗AREG抗体、またはヒト化抗AREG抗体であり、好ましくは、ヒトモノクローナル抗体(mAb)、ネズミmAb、キメラmAbまたはヒト化mAbであることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[6]前記抗AREG抗体またはその断片は、可溶性形態のAREGに結合することができ、好ましくは、可溶性形態のAREGの上皮成長因子(EGF)様ドメインに結合することができ、より好ましくは、可溶性形態のAREGのEGF様ドメイン内のC末端に結合することができることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[7]前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
HCDR1、HCDR2およびHCDR3は、
(1)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYGYDY(SEQ ID NO:3)、
(2)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYSYNN(SEQ ID NO:4)、
(3)HCDR1:SHAMS(SEQ ID NO:5)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:VDTKFDP(SEQ ID NO:6)、
(4)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、
(5)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGRYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:10)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、
(6)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPILRKNYYYGMDV(SEQ ID NO:11)、
(7)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYGMDV(SEQ ID NO:12)、
(8)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDV(SEQ ID NO:14)、
(9)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、
(10)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、
(11)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHCIMDY(SEQ ID NO:19)、
(12)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、および
(13)(1)~(12)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3であるが、ただし、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択され、且つ
LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、
(1)LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDSGLNSVV(SEQ ID NO:23)、
(2)LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDKNNKSVV(SEQ ID NO:24)、
(3)LCDR1:SGSSSNIGSNTVN(SEQ ID NO:25)、LCDR2:SNNQRPS(SEQ ID NO:26)、LCDR3:EVWDDSLNGPV(SEQ ID NO:27)、
(4)LCDR1:RSSQSLVHSDGNTYLH(SEQ ID NO:28)、LCDR2:KVSNRFS(SEQ ID NO:29)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(5)LCDR1:RSSQSLVDGEDGTYLN(SEQ ID NO:31)、LCDR2:KVSERFD(SEQ ID NO:32)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(6)LCDR1:RSSQSLVDGQDGTYLH(SEQ ID NO:33)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(7)LCDR1:RSSQSLVNQEGETYLH(SEQ ID NO:35)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30);
(8)LCDR1:KASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:36)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(9)LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(10)LCDR1:RASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:41)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(11)LCDR1:KSSQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:43)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(12)LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(13)LCDR1:RASQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:45)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(14)LCDR1:KSSQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:47)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(15)LCDR1:KASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:48)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:HQCNEDPYM(SEQ ID NO:49)、
(16)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYM(SEQ ID NO:51)、
(17)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYL(SEQ ID NO:52)、
(18)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYV(SEQ ID NO:53)、
(19)LCDR1:RASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:54)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、
(20)LCDR1:KSSQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:56)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、および
(21)(1)~(20)に示されるようなLCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、ただし、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択されることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[8]前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、
(1)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYGYDY(SEQ ID NO:3)、LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDSGLNSVV(SEQ ID NO:23)、
(2)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYSYNN(SEQ ID NO:4)、LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDKNNKSVV(SEQ ID NO:24)、
(3)HCDR1:SHAMS(SEQ ID NO:5)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:VDTKFDP(SEQ ID NO:6)、LCDR1:SGSSSNIGSNTVN(SEQ ID NO:25)、LCDR2:SNNQRPS(SEQ ID NO:26)、LCDR3:EVWDDSLNGPV(SEQ ID NO:27)、
(4)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、LCDR1:RSSQSLVHSDGNTYLH(SEQ ID NO:28)、LCDR2:KVSNRFS(SEQ ID NO:29)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(5)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGRYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:10)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、LCDR1:RSSQSLVDGEDGTYLN(SEQ ID NO:31)、LCDR2:KVSERFD(SEQ ID NO:32)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(6)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPILRKNYYYGMDV(SEQ ID NO:11)、LCDR1:RSSQSLVDGQDGTYLH(SEQ ID NO:33)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(7)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYGMDV(SEQ ID NO:12)、LCDR1:RSSQSLVNQEGETYLH(SEQ ID NO:35)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT (SEQ ID NO:30)、
(8)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDV(SEQ ID NO:14)、LCDR1:KASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:36)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(9)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(10)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:RASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:41)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(11)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:KSSQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:43)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(12)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(13)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:RASQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:45)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(14)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:KSSQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:47)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(15)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHCIMDY(SEQ ID NO:19)、LCDR1:KASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:48)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:HQCNEDPYM(SEQ ID NO:49)、
(16)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYM(SEQ ID NO:51)、
(17)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYL(SEQ ID NO:52)、
(18)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYV(SEQ ID NO:53)、
(19)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:54)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、
(20)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:KSSQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:56)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、および
(21)(1)~(20)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、ただし、
そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択されることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[9]前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、
ここで、前記重鎖可変領域は、SEQ ID NO:57~69から選択されるアミノ酸配列、およびSEQ ID NO:57~69のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有し、
ここで、前記軽鎖可変領域は、SEQ ID NO:70~89から選択されるアミノ酸配列、およびSEQ ID NO:70~89のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有することを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[10]前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、
(1)SEQ ID NO:57およびSEQ ID NO:70、
(2)SEQ ID NO:58およびSEQ ID NO:71、
(3)SEQ ID NO:59およびSEQ ID NO:72、
(4)SEQ ID NO:60およびSEQ ID NO:73、
(5)SEQ ID NO:61およびSEQ ID NO:74、
(6)SEQ ID NO:62およびSEQ ID NO:75、
(7)SEQ ID NO:63およびSEQ ID NO:76、
(8)SEQ ID NO:64およびSEQ ID NO:77、
(9)SEQ ID NO:65およびSEQ ID NO:78、
(10)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:79、
(11)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:80、
(12)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:81、
(13)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:79、
(14)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:82、
(15)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:83、
(16)SEQ ID NO:68およびSEQ ID NO:84、
(17)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:85、
(18)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:86、
(19)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:87、
(20)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:88、
(21)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:89、および
(22)それぞれ(1)~(21)のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持する二つのアミノ酸配列からなる群から選択されることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[11]前記抗AREG抗体またはその断片は、IgG、IgM、IgA、IgE、IgDのアイソタイプまたはその変異体、好ましくはIgG1、IgG2、IgG3、IgG4のアイソタイプまたはその変異体であることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[12]前記第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体を含むことを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[13]前記変異体は、点突然変異および/または欠失を含むことを特徴とする
上記[12]に記載の二機能性融合タンパク質。
[14]前記TRIIの細胞外ドメインは、SEQ ID NO:90に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:90と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
上記[12]に記載の二機能性融合タンパク質。
[15]前記点突然変異は、K7、T16、D17、R34、R66、K67、K103およびK104から選択される位置での一つまたは複数の点突然変異を含み、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
上記[13]に記載の二機能性融合タンパク質。
[16]前記点突然変異は、K7Q、T16S、D17N、R34S、R34H、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される一つまたは複数の部位突然変異を含み、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
上記[13]に記載の二機能性融合タンパク質。
[17]前記点突然変異は、T16SおよびD17N、K7QおよびD17N、K7Q、R34S、R34H、R66SおよびK67S、K103SおよびK104S、K7QおよびR34S、K7Q、R66SおよびK67S、K7Q、K103SおよびK104S、K7Q、R34S、R66SおよびK67S、K7Q、R34S、K103SおよびK104S、K7Q、R66S、K67S、K103SおよびK104S、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104S、K7Q、R34S、R66S、K67S、ならびにK103SおよびK104Sから選択されることを特徴とする
上記[13]に記載の二機能性融合タンパク質。
[18]前記変異体は、4~21個のアミノ酸のN末端欠失、好ましくは4個のアミノ酸、7個のアミノ酸、9個のアミノ酸、13個のアミノ酸、17個のアミノ酸および21個のアミノ酸のN末端欠失を有し、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
上記[13]に記載の二機能性融合タンパク質。
[19]前記変異体は、点突然変異T16SおよびD17N、ならびに7個のアミノ酸のN末端欠失を含むことを特徴とする
上記[13]に記載の二機能性融合タンパク質。
[20]前記第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体を含み、SEQ ID NO:90~107に示されるようなアミノ酸配列のいずれか一つ、またはSEQ ID NO:90~107のいずれか一つと少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
上記[12]に記載の二機能性融合タンパク質。
[21]前記第1のドメインのC末端は、リンカー、好ましくはリンカーペプチドを介して前記第2のドメインのN末端に融合され、その逆も同様であることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[22]前記抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のC末端は、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に直接またはリンカーを介して融合されるか、あるいは前記抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のN末端は、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に直接またはリンカーを介して連結されることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[23]前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、それは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体に直接またはリンカーを介して連結されることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[24]前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのN末端は、直接またはリンカーを介して、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に連結されるか、あるいは、抗AREG抗体の重鎖のC末端は、直接またはリンカーを介して、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に連結されることを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[25]前記リンカーは、式(G S) 、(G S) G、S(G S) G、SG(EAAAK) SG、S(GEGES)nGまたは(EAAAK) で表されるリンカーペプチドを含み、ここで、nは、1~5の整数であり、好ましくは、前記リンカーペプチドは、SEQ ID NO:108~117のいずれか一つに示されるアミノ酸配列を有することを特徴とする
上記[21]~[24]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質。
[26]前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのC末端は、リンカーを介して前記TRIIの細胞外ドメインのN末端に連結され、SEQ ID NO:118~139に示されるのいずれか一つのアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:118~139のいずれか一つと少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[27]抗AREG抗体の軽鎖をさらに含むことを特徴とする
上記[3]に記載の二機能性融合タンパク質。
[28]ヘテロ四量体形態であることを特徴とする
上記[2]に記載の二機能性融合タンパク質。
[29]単離された核酸分子であって、
上記[1]-[28]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質をコードすることを特徴とする、前記単離された核酸分子。
[30]発現ベクターであって、
上記[29]に記載の単離された核酸分子を含むことを特徴とする、前記発現ベクター。
[31]宿主細胞であって、
上記[29]に記載の単離された核酸分子または上記[30]に記載の発現ベクターを含むことを特徴とする、前記宿主細胞。
[32]上記[1]~[28]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質を調製する方法であって、
上記[31]に記載の宿主細胞を培養する段階を含むことを特徴とする、前記上記[1]~[28]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質を調製する方法。
[33]医薬組成物であって、上記[1]~[28]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質および薬学的に許容される担体を含むことを特徴とする、前記医薬組成物。
[34]被験者における線維性疾患、癌および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための、上記[1]~[28]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質、上記[29]に記載の単離された核酸分子または上記[33]に記載の医薬組成物の用途であって、
好ましくは、前記線維性疾患は、腎線維症、肝線維症、肺線維症、特に特発性肺線維症(IPF)を含むが、これらに限定されないことを特徴とする、前記用途。
[35]被験者における線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための方法であって、
被験者に治療有効量の上記[1]~[28]のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質または上記[33]に記載の医薬組成物を投与することを含み、好ましくは、前記線維性疾患は、腎線維症、肝線維症、肺線維症を含むが、これらに限定されないことを特徴とする、前記被験者における線維性疾患、癌、および慢性炎症に関連する疾患を予防、治療および/または診断するための方法。
【手続補正2】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項1】
第1のドメインおよび第2のドメインを含む二機能性融合タンパク質であって、
前記第1のドメインは、AREGもしくはその断片に結合することができ、好ましくはAREGもしくはその断片に結合する抗体またはその抗原結合断片であり、
前記第2のドメインは、TGFβリガンドまたはその断片に結合することができ、好ましくはTGFβ受容体II(TRII)の細胞外ドメインまたはその変異体の一部を含むことを特徴とする、前記二機能性融合タンパク質。
【請求項2】
前記抗体またはその抗原結合断片は、ヒトAREGおよびマウスAREGの両方に結合できるか、あるいは、前記抗AREG抗体またはその断片は、ヒトAREGに結合することができ、マウスAREGに対して弱い交差反応性を有するか、または交差反応性を有さないことを特徴とし、および/または
前記抗AREG抗体またはその断片は、ヒト抗AREG抗体、ネズミ抗AREG抗体、
キメラ抗AREG抗体、またはヒト化抗AREG抗体であり、好ましくは、ヒトモノクローナル抗体(mAb)、ネズミmAb、キメラmAbまたはヒト化mAbであることを特徴とし、および/または
前記抗AREG抗体またはその断片は、可溶性形態のAREGに結合することができ、
好ましくは、可溶性形態のAREGの上皮成長因子(EGF)様ドメインに結合すること
ができることを特徴とし、および/または
前記抗AREG抗体またはその断片は、IgG、IgM、IgA、IgE、IgDのア
イソタイプまたはその変異体、好ましくはIgG1、IgG2、IgG3、IgG4のア
イソタイプまたはその変異体であることを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項3】
前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
HCDR1、HCDR2およびHCDR3は、
(1)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYGYDY(SEQ ID NO:3)、
(2)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYSYNN(SEQ ID NO:4)、
(3)HCDR1:SHAMS(SEQ ID NO:5)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:VDTKFDP(SEQ ID NO:6)、
(4)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、
(5)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGRYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:10)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、
(6)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPILRKNYYYGMDV(SEQ ID NO:11)、
(7)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYGMDV(SEQ ID NO:12)、
(8)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDV(SEQ ID NO:14)、
(9)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、
(10)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、
(11)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHCIMDY(SEQ ID NO:19)、
(12)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、および
(13)(1)~(12)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3であるが、ただし、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択され、且つ
LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、
(1)LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDSGLNSVV(SEQ ID NO:23)、
(2)LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDKNNKSVV(SEQ ID NO:24)、
(3)LCDR1:SGSSSNIGSNTVN(SEQ ID NO:25)、LCDR2:SNNQRPS(SEQ ID NO:26)、LCDR3:EVWDDSLNGPV(SEQ ID NO:27)、
(4)LCDR1:RSSQSLVHSDGNTYLH(SEQ ID NO:28)、LCDR2:KVSNRFS(SEQ ID NO:29)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(5)LCDR1:RSSQSLVDGEDGTYLN(SEQ ID NO:31)、LCDR2:KVSERFD(SEQ ID NO:32)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(6)LCDR1:RSSQSLVDGQDGTYLH(SEQ ID NO:33)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(7)LCDR1:RSSQSLVNQEGETYLH(SEQ ID NO:35)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30);
(8)LCDR1:KASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:36)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(9)LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(10)LCDR1:RASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:41)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(11)LCDR1:KSSQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:43)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(12)LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(13)LCDR1:RASQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:45)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(14)LCDR1:KSSQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:47)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(15)LCDR1:KASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:48)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:HQCNEDPYM(SEQ ID NO:49)、
(16)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYM(SEQ ID NO:51)、
(17)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYL(SEQ ID NO:52)、
(18)LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYV(SEQ ID NO:53)、
(19)LCDR1:RASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:54)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、
(20)LCDR1:KSSQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:56)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、および
(21)(1)~(20)に示されるようなLCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、ただし、そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択されることを特徴とし、
好ましくは、前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、前記重鎖可変領域は、重鎖相補性決定領域HCDR1、HCDR2およびHCDR3を含み、前記軽鎖可変領域は、軽鎖相補性決定領域LCDR1、LCDR2およびLCDR3を含み、ここで、
HCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2およびLCDR3は、
(1)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYGYDY(SEQ ID NO:3)、LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDSGLNSVV(SEQ ID NO:23)、
(2)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:PTSRYSYSYNN(SEQ ID NO:4)、LCDR1:TGNSNNVGDQGAV(SEQ ID NO:21)、LCDR2:RNNNRPS(SEQ ID NO:22)、LCDR3:STWDKNNKSVV(SEQ ID NO:24)、
(3)HCDR1:SHAMS(SEQ ID NO:5)、HCDR2:AISGSGGSTYYADSVKG(SEQ ID NO:2)、HCDR3:VDTKFDP(SEQ ID NO:6)、LCDR1:SGSSSNIGSNTVN(SEQ ID NO:25)、LCDR2:SNNQRPS(SEQ ID NO:26)、LCDR3:EVWDDSLNGPV(SEQ ID NO:27)、
(4)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、LCDR1:RSSQSLVHSDGNTYLH(SEQ ID NO:28)、LCDR2:KVSNRFS(SEQ ID NO:29)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(5)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGRYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:10)、HCDR3:QGPIYYGNYYYAMDY(SEQ ID NO:9)、LCDR1:RSSQSLVDGEDGTYLN(SEQ ID NO:31)、LCDR2:KVSERFD(SEQ ID NO:32)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(6)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPILRKNYYYGMDV(SEQ ID NO:11)、LCDR1:RSSQSLVDGQDGTYLH(SEQ ID NO:33)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(7)HCDR1:SYPMS(SEQ ID NO:7)、HCDR2:TISTGGTYTYYPDSVKG(SEQ ID NO:8)、HCDR3:QGPIYYGNYYYGMDV(SEQ ID NO:12)、LCDR1:RSSQSLVNQEGETYLH(SEQ ID NO:35)、LCDR2:KVSNRFD(SEQ ID NO:34)、LCDR3:SQSTHVPYT(SEQ ID NO:30)、
(8)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDV(SEQ ID NO:14)、LCDR1:KASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:36)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(9)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(10)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:RASQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:41)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(11)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:13)、HCDR3:HGYLLYDGYYEWYFDY(SEQ ID NO:140)、LCDR1:KSSQSVDYDGHSFLN(SEQ ID NO:43)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(12)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:RASESVDYDGHSFIN(SEQ ID NO:39)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:QQSTEDPPYT(SEQ ID NO:38)、
(13)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:RASQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:45)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(14)HCDR1:SYAMS(SEQ ID NO:1)、HCDR2:TISTGGSHTYYPESVKG(SEQ ID NO:15)、HCDR3:HGYLLYEGYYEWYFDY(SEQ ID NO:16)、LCDR1:KSSQSVDYEGHSFLN(SEQ ID NO:47)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSTENPPYT(SEQ ID NO:46)、
(15)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHCIMDY(SEQ ID NO:19)、LCDR1:KASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:48)、LCDR2:AASNLES(SEQ ID NO:37)、LCDR3:HQCNEDPYM(SEQ ID NO:49)、
(16)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYM(SEQ ID NO:51)、
(17)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYL(SEQ ID NO:52)、
(18)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASESVDYDGDSFIN(SEQ ID NO:50)、LCDR2:AASNKDT(SEQ ID NO:40)、LCDR3:HQSNEDPYV(SEQ ID NO:53)、
(19)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:RASQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:54)、LCDR2:AASNLQS(SEQ ID NO:42)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、
(20)HCDR1:GYPMS(SEQ ID NO:17)、HCDR2:TISTGARHTYYPDSVKG(SEQ ID NO:18)、HCDR3:HEGLRRGKYHSIMDY(SEQ ID NO:20)、LCDR1:KSSQSIDYDGDSFLN(SEQ ID NO:56)、LCDR2:AASNRES(SEQ ID NO:44)、LCDR3:QQSNEDPYV(SEQ ID NO:55)、および
(21)(1)~(20)に示されるようなHCDR1、HCDR2、HCDR3、LCDR1、LCDR2、LCDR3であるが、ただし、
そのうちの少なくとも一つは、一つ、二つ、三つ、四つまたは五つのアミノ酸の付加、欠失、保存的アミノ酸置換またはその組み合わせを含むものからなる群から選択されることを特徴とする、請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項4】
前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、
ここで、前記重鎖可変領域は、SEQ ID NO:57~69から選択されるアミノ酸配列、およびSEQ ID NO:57~69のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有し、
ここで、前記軽鎖可変領域は、SEQ ID NO:70~89から選択されるアミノ酸配列、およびSEQ ID NO:70~89のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持するアミノ酸配列を有することを特徴とし、
好ましくは、前記抗AREG抗体またはその断片は、重鎖可変領域および軽鎖可変領域を含み、ここで、前記重鎖可変領域および前記軽鎖可変領域のアミノ酸配列は、
(1)SEQ ID NO:57およびSEQ ID NO:70、
(2)SEQ ID NO:58およびSEQ ID NO:71、
(3)SEQ ID NO:59およびSEQ ID NO:72、
(4)SEQ ID NO:60およびSEQ ID NO:73、
(5)SEQ ID NO:61およびSEQ ID NO:74、
(6)SEQ ID NO:62およびSEQ ID NO:75、
(7)SEQ ID NO:63およびSEQ ID NO:76、
(8)SEQ ID NO:64およびSEQ ID NO:77、
(9)SEQ ID NO:65およびSEQ ID NO:78、
(10)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:79、
(11)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:80、
(12)SEQ ID NO:66およびSEQ ID NO:81、
(13)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:79、
(14)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:82、
(15)SEQ ID NO:67およびSEQ ID NO:83、
(16)SEQ ID NO:68およびSEQ ID NO:84、
(17)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:85、
(18)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:86、
(19)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:87、
(20)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:88、
(21)SEQ ID NO:69およびSEQ ID NO:89、および
(22)それぞれ(1)~(21)のいずれか一つと少なくとも95%の配列同一性を有し且つエピトープ結合活性を保持する二つのアミノ酸配列からなる群から選択されることを特徴とする、請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項5】
前記第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体を含むことを特徴とし、好ましくは、前記変異体は点突然変異および/または欠失を含み、
好ましくは、前記TRIIの細胞外ドメインは、SEQ ID NO:90に示されるアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:90と少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とし、
好ましくは、前記点突然変異は、K7、T16、D17、R34、R66、K67、K103およびK104から選択される位置での一つまたは複数の点突然変異を含み、その位置番号付け
は、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とし、
好ましくは、前記点突然変異は、K7Q、T16S、D17N、R34S、R34H、R66S、K67S、K103SおよびK104Sから選択される一つまたは複数の部位突然変異を含み、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とし、
より好ましくは、前記点突然変異は、T16SおよびD17N、K7QおよびD17N、K7Q、R34S、R34H、R66SおよびK67S、K103SおよびK104S、K7QおよびR34S、K7Q、R66SおよびK67S、K7Q、K103SおよびK104S、K7Q、R34S、R66SおよびK67S、K7Q、R34S、K103SおよびK104S、K7Q、R66S、K67S、K103SおよびK104S、R34S、R66S、K67S、K103SおよびK104S、K7Q、R34S、R66S、K67S、ならびにK103SおよびK104Sから選択されることを特徴とし、および/または、
好ましくは、前記変異体は、4~21個のアミノ酸のN末端欠失、より好ましくは4個のアミノ酸、7個のアミノ酸、9個のアミノ酸、13個のアミノ酸、17個のアミノ酸および21個のアミノ酸のN末端欠失を有し、その位置番号付けは、SEQ ID NO:90のN末端からC末端までに基づくことを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項6】
前記変異体は、点突然変異T16SおよびD17N、ならびに7個のアミノ酸のN末端欠失を含むことを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項7】
前記第2のドメインは、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体を含み、SEQ ID NO:90~107に示されるようなアミノ酸配列のいずれか一つ、またはSEQ ID NO:90~107のいずれか一つと少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項8】
前記抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のC末端は、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に直接またはリンカーを介して融合されるか、あるいは前記抗AREG抗体の重鎖または軽鎖のN末端は、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に直接またはリンカーを介して連結されることを特徴とし、
好ましくは、前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのN末端は、直接またはリンカーを介して、前記TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のC末端に連結されるか、あるいは、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのC末端は、直接またはリンカーを介して、TRIIの細胞外ドメインまたはその変異体のN末端に連結されることを特徴とし、
好ましくは、前記二機能性融合タンパク質がさらに抗AREG抗体の軽鎖を含む、および/またはへテロ四量体形態であることを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項9】
前記リンカーは、式(GS)、(GS)G、S(GS)G、SG(EAAAK)SG、S(GEGES)nGまたは(EAAAK)で表されるリンカーペプチドを含み、ここで、nは、1~5の整数であり、好ましくは、前記リンカーペプチドは、SEQ ID NO:108~117のいずれか一つに示されるアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項10】
前記二機能性融合タンパク質は、抗AREG抗体の重鎖を含み、そのC末端は、リンカーを介して前記TRIIの細胞外ドメインのN末端に連結され、SEQ ID NO:118~139及び142に示されるいずれか一つのアミノ酸配列、またはSEQ ID NO:118~139及び142のいずれか一つと少なくとも85%の同一性を有するアミノ酸配列を有することを特徴とする
請求項に記載の二機能性融合タンパク質。
【請求項11】
単離された核酸分子であって、
請求項1-10のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質をコードすることを特徴とする、前記単離された核酸分子。
【請求項12】
発現ベクターであって、
請求項11に記載の単離された核酸分子を含むことを特徴とする、前記発現ベクター。
【請求項13】
宿主細胞であって、
請求項11に記載の単離された核酸分子または請求項12に記載の発現ベクターを含むことを特徴とする、前記宿主細胞。
【請求項14】
医薬組成物であって、
請求項1~10のいずれか一つに記載の二機能性融合タンパク質および薬学的に許容される担体を含むことを特徴とする、前記医薬組成物。
【請求項15】
被験者における線維性疾患、癌および慢性炎症に関連する疾患予防、治療および/または診断に使用するための請求項14に記載の医薬組成物であって、
好ましくは、前記線維性疾患は、腎線維症、肝線維症、肺線維症、特に特発性肺線維症(IPF)を含むことを特徴とする、前記医薬組成物
【国際調査報告】