(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-09-05
(54)【発明の名称】抗IL-11Rα抗体
(51)【国際特許分類】
C07K 16/28 20060101AFI20240829BHJP
C07K 16/46 20060101ALI20240829BHJP
C12N 1/15 20060101ALI20240829BHJP
C12N 1/19 20060101ALI20240829BHJP
C12N 1/21 20060101ALI20240829BHJP
C12N 5/10 20060101ALI20240829BHJP
A61P 35/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 29/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 37/06 20060101ALI20240829BHJP
A61P 35/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 35/04 20060101ALI20240829BHJP
A61K 39/395 20060101ALI20240829BHJP
A61K 9/08 20060101ALI20240829BHJP
A61P 43/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 11/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 11/06 20060101ALI20240829BHJP
A61P 11/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 17/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 17/06 20060101ALI20240829BHJP
A61P 1/16 20060101ALI20240829BHJP
A61P 1/04 20060101ALI20240829BHJP
A61P 1/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 17/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 13/12 20060101ALI20240829BHJP
A61P 25/16 20060101ALI20240829BHJP
A61P 25/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 25/28 20060101ALI20240829BHJP
A61P 19/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 31/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 9/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 9/10 20060101ALI20240829BHJP
A61P 3/10 20060101ALI20240829BHJP
A61P 3/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 37/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 27/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 3/02 20060101ALI20240829BHJP
A61P 21/04 20060101ALI20240829BHJP
A61P 17/14 20060101ALI20240829BHJP
A61P 5/14 20060101ALI20240829BHJP
A61P 15/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 7/06 20060101ALI20240829BHJP
A61P 19/08 20060101ALI20240829BHJP
A61P 7/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 21/00 20060101ALI20240829BHJP
A61P 19/10 20060101ALI20240829BHJP
A61K 48/00 20060101ALI20240829BHJP
C12N 15/13 20060101ALN20240829BHJP
C12N 15/63 20060101ALN20240829BHJP
【FI】
C07K16/28 ZNA
C07K16/46
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
C12N5/10
A61P35/00
A61P29/00
A61P37/06
A61P35/02
A61P35/04
A61K39/395 D
A61K39/395 E
A61K39/395 N
A61K39/395 T
A61K39/395 U
A61K39/395 Y
A61K9/08
A61P43/00 111
A61P11/00
A61P11/06
A61P11/02
A61P17/00
A61P17/06
A61P1/16
A61P1/04
A61P1/00
A61P17/02
A61P13/12
A61P25/16
A61P25/00
A61P25/28
A61P19/02
A61P29/00 101
A61P31/00
A61P9/00
A61P9/10
A61P3/10
A61P3/00
A61P37/02
A61P27/02
A61P3/02
A61P21/04
A61P17/14
A61P43/00 105
A61P5/14
A61P15/00
A61P7/06
A61P19/08
A61P7/00
A61P21/00
A61P19/10
A61K48/00
C12N15/13
C12N15/63 Z
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024537308
(86)(22)【出願日】2022-08-30
(85)【翻訳文提出日】2024-04-02
(86)【国際出願番号】 US2022075680
(87)【国際公開番号】W WO2023034809
(87)【国際公開日】2023-03-09
(32)【優先日】2021-08-30
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(32)【優先日】2022-04-26
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】524076349
【氏名又は名称】ラッセン・セラピューティクス1・インコーポレイテッド
【氏名又は名称原語表記】Lassen Therapeutics 1, Inc.
(74)【代理人】
【識別番号】100145403
【氏名又は名称】山尾 憲人
(74)【代理人】
【識別番号】100106518
【氏名又は名称】松谷 道子
(74)【代理人】
【識別番号】100138911
【氏名又は名称】櫻井 陽子
(72)【発明者】
【氏名】ホーリック,ロバート エイ
(72)【発明者】
【氏名】ジュン,ヘレン トニ
(72)【発明者】
【氏名】キング,デイビッド ジェイ
【テーマコード(参考)】
4B065
4C076
4C084
4C085
4H045
【Fターム(参考)】
4B065AA01X
4B065AA57X
4B065AA72X
4B065AA87X
4B065AB01
4B065BA02
4B065CA25
4B065CA44
4C076AA12
4C076BB13
4C076BB15
4C076BB16
4C076BB21
4C076CC01
4C076CC04
4C076CC07
4C076CC10
4C076CC11
4C076CC14
4C076CC15
4C076CC16
4C076CC17
4C076CC18
4C076CC19
4C076CC21
4C076CC26
4C076CC27
4C076CC30
4C076FF12
4C084AA13
4C084MA66
4C084NA14
4C084ZA021
4C084ZA022
4C084ZA151
4C084ZA152
4C084ZA161
4C084ZA162
4C084ZA181
4C084ZA182
4C084ZA331
4C084ZA332
4C084ZA361
4C084ZA362
4C084ZA441
4C084ZA442
4C084ZA451
4C084ZA452
4C084ZA511
4C084ZA512
4C084ZA551
4C084ZA552
4C084ZA591
4C084ZA592
4C084ZA601
4C084ZA602
4C084ZA661
4C084ZA662
4C084ZA681
4C084ZA682
4C084ZA691
4C084ZA692
4C084ZA751
4C084ZA752
4C084ZA811
4C084ZA812
4C084ZA891
4C084ZA892
4C084ZA921
4C084ZA922
4C084ZA941
4C084ZA942
4C084ZA961
4C084ZA962
4C084ZA971
4C084ZA972
4C084ZB051
4C084ZB052
4C084ZB071
4C084ZB072
4C084ZB081
4C084ZB082
4C084ZB111
4C084ZB112
4C084ZB151
4C084ZB152
4C084ZB211
4C084ZB212
4C084ZB261
4C084ZB262
4C084ZB271
4C084ZB272
4C084ZC021
4C084ZC022
4C084ZC061
4C084ZC062
4C084ZC211
4C084ZC212
4C084ZC351
4C084ZC352
4C084ZC411
4C084ZC412
4C085AA13
4C085AA14
4C085BB31
4C085BB33
4C085BB34
4C085BB35
4C085BB36
4C085BB37
4C085CC22
4C085CC23
4C085DD62
4C085EE01
4C085GG02
4C085GG03
4C085GG04
4C085GG06
4H045AA11
4H045AA20
4H045AA30
4H045BA10
(57)【要約】
提供されるのは、ヒトインターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合する抗体及びその抗原結合断片ならびに関連する組成物であって、それらは、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、及び他の処置又は診断を含む、様々な治療方法又は診断方法のいずれかにおいて使用され得る。
【選択図】
図5
【特許請求の範囲】
【請求項1】
インターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合する単離抗体、又はその抗原結合断片であって、前記少なくとも一つの抗体又はその抗原結合断片が、
表A1から選択される相補性決定領域V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列を含む重鎖可変領域(V
H)、ならびにIL-11Rαに特異的に結合するそのバリアント;及び
表A1から選択される相補性決定領域V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列を含む軽鎖可変領域(V
L)、ならびにIL-11Rαに特異的に結合するそのバリアントを含む、単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項2】
請求項1に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片であって、
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号1~3を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号4~6を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号7~9を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号10~12を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号13~15を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号16~18を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号19~21を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号22~24を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号25~27を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号28~30を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号31~33を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号34~36を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号34~39を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号40~42を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号43~45を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号46~48を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号49~51を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号52~54を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号55~57を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号58~60を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号61~63を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号64~66を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号67~69を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号70~72を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号73~75を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号76~78を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号79~81を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号82~84を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号85~87を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号88~90を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号91~93を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号94~96を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号97~99を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号100~102を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号103~105を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号106~108を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号109~111を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号112~114を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号115~117を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号118~120を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号121~123を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号124~126を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号127~129を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号130~132を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号133~135を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号136~138を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号139~141を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
L CDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号142~144を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号145~147を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号148~150を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号151~153を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号154~156を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号157~159を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号160~162を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号163~165を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号166~168を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号169~171を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号172~174を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号175~177を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号178~180を含み;
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号181~183を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号184~186を含み;又は
前記V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列が、それぞれ、配列番号187~189を含み、ならびに前記V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列が、それぞれ、配列番号190~192を含む、単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項3】
前記V
Hが、表A2から選択される配列と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、場合により、前記V
Hが、前記フレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有する、請求項1又は2に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項4】
前記V
Lが、表A2から選択される配列と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、場合により、前記V
Lが、前記フレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有する、請求項1~3のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項5】
請求項1~4のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片であって、
前記V
Hが、配列番号193と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号194と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号195と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号196と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号197と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号198と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号199と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号200と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号201と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号202と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号203と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号204と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号205と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号206と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号207と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号208と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号209と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号210と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号211と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号212と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号213と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号214と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号215と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号216と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号217と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号218と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号219と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号220と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号221と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号222と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号223と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号224と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号225と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号226と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号227と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号228と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号229と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号230と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号231と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号232と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号233と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号234と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号235と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号236と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号237と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号238と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号239と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号240と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号241と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号242と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号243と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号244と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号245と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号246と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号247と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号248と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号249と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号250と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号251と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号252と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
前記V
Hが、配列番号253と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号254と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;あるいは
前記V
Hが、配列番号255と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及び前記V
Lが、配列番号256と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含む、単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項6】
ヒトIL-11Rαに結合する、請求項1~5のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片(表B1を参照のこと)。
【請求項7】
ヒトIL-11RαのフィブロネクチンドメインIII、又は配列番号257のおよそ残基112~219に結合する、請求項6に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項8】
請求項1~7のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片であって、以下の特徴の一つ又は複数を有する:
約500、400、300、200、100、90、80、70、60、50、40、又は30pM未満のヒトIL-11Rαについての結合親和性を有し、場合により、TS7及び8E2抗体のものに比べて、ヒトIL-11Rαについての増加した結合親和性を有する;
IL-11RαとIL-11の間での結合及び/又はシグナル伝達活性に拮抗し、場合により、TS7及び8E2抗体のものに比べて、IL-11シグナル伝達アンタゴニストとして増加した効力を有する;
場合により細胞ベースのアッセイにおいて、IL-11Rα/gp130二量体化又は複合体形成を低下させる;及び/又は
場合によりTS7及び8E2抗体に比べて、V
LCDR3において低下したN連結型グリコシル化を有する、単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項9】
IgA(サブクラスIgA1及びIgA2を含む)、IgD、IgE、IgG(サブクラスIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4を含む)、又はIgM Fcドメイン、場合によりヒトFcドメイン、あるいはそのハイブリッド及び/又はバリアントを含む、請求項1~8のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項10】
ヒトにおいて高いエフェクター機能を伴うIgG Fcドメイン、場合によりIgG1又はIgG3 Fcドメインを含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項11】
ヒトにおいて低いエフェクター機能を伴うIgG Fcドメイン、場合によりIgG2又はIgG4 Fcドメインを含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項12】
場合により表F1から選択されるヒトIgG1又はIgG4 Fcドメインを含む、請求項1~9のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項13】
モノクローナル抗体である、請求項1~12のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項14】
ヒト化抗体であり、
場合により、前記抗体、又はその抗原結合断片が、S228P変異(EUナンバリング)を伴うヒトIgG4 Fcドメインを含むヒト化モノクローナル抗体である、請求項1~13のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項15】
Fv断片、一本鎖Fv(scFv)ポリペプチド、アドネクチン、アンチカリン、アプタマー、アビマー、ラクダ科抗体、設計アンキリンリピートタンパク質(DARPin)、ミニボディ、ナノボディ、及びユニボディから選択される、請求項1~14のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片。
【請求項16】
請求項1~15のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片をコードする単離ポリヌクレオチド、前記単離ポリヌクレオチドを含む発現ベクター、又は前記ベクターを含む単離宿主細胞。
【請求項17】
請求項1~15のいずれか一項に記載の単離抗体、又はその抗原結合断片、及び医薬的に許容可能な担体を含む、医薬組成物。
【請求項18】
前記組成物が、前記少なくとも一つの抗体又は抗原結合断片に関して、タンパク質ベースで少なくとも約80%、85%、90%、95%、98%、又は99%の純度を有し、実質的に凝集体及びエンドトキシンを含まない、請求項17に記載の医薬組成物。
【請求項19】
前記組成物が、場合によりV
LCDR3配列におけるN連結型グリコシル化の(場合により、前記TS7及び8E2抗体に比べて)低下した又は検出不可能な不均質性を有する、請求項17又は18に記載の医薬組成物。
【請求項20】
前記組成物が、場合により、静脈内、筋肉内、皮下、又は腹腔内投与のために適切な滅菌注射溶液である、請求項17~19のいずれか一項に記載の医薬組成物。
【請求項21】
請求項17~20のいずれか一項に記載の医薬組成物を前記対象に投与することを含む、それを必要とする対象において疾患又は状態を処置する方法。
【請求項22】
前記疾患又は状態が、IL-11関連又はIL-11媒介性疾患又は状態である、請求項21に記載の方法。
【請求項23】
前記疾患又は状態が、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、消耗性疾患、骨疾患、又は線維症である、請求項21又は22に記載の方法。
【請求項24】
前記疾患が、癌、場合によりIL-11Rα及び/又はIL-11を発現又は過剰発現する癌であり、場合により、それにおいて、癌は、IL-11Rα/IL-11依存性成長、接着、遊走、浸潤、及び/又は化学療法抵抗性を呈する、請求項23に記載の方法。
【請求項25】
前記癌が、骨癌、前立腺癌、黒色腫(例、転移性黒色腫)、膵臓癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、中皮腫、白血病(例、リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、急性骨髄性白血病、再発性急性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、急性リンパ芽球性白血病)、リンパ腫(例、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫)、肝細胞癌(肝臓細胞癌)、肉腫、B細胞悪性腫瘍、乳癌、卵巣癌、結腸直腸癌、神経膠腫、多形神経膠芽腫、髄膜腫、下垂体腺腫、前庭神経鞘腫、原発性CNSリンパ腫、原始神経外胚葉腫瘍(髄芽腫)、腎臓癌(例、腎細胞癌)、膀胱癌、子宮癌、食道癌、脳癌、頭頸部癌、子宮頸癌、精巣癌、甲状腺癌、及び胃癌の一つ又は複数から選択される、請求項24に記載の方法。
【請求項26】
前記癌が、転移性癌、場合により、骨に転移した転移性癌である、請求項24又は25に記載の方法。
【請求項27】
前記炎症性疾患が、気道又は肺の炎症(例、炎症性肺疾患)、喘息、鼻炎、慢性閉塞性肺障害(COPD)、皮膚炎、乾癬、肝炎、胃炎、過敏性腸症候群(IBS)、潰瘍性大腸炎、クローン病、大腸炎、憩室炎、紅斑性狼瘡、腎炎、パーキンソン病、多発性硬化症(MS)、アルツハイマー病、関節炎、関節リウマチ、敗血症、感染症誘発性の炎症、心血管疾患、例えばアテローム性動脈硬化症及び血管炎など、糖尿病、ならびに痛風の一つ又は複数から選択される、請求項23に記載の方法。
【請求項28】
前記自己免疫疾患が、関節炎(関節リウマチ、反応性関節炎を含む)、全身性エリテマトーデス(SLE)、乾癬、炎症性腸疾患(IBD)、潰瘍性大腸炎、クローン病、脳脊髄炎、ぶどう膜炎、重症筋無力症、多発性硬化症、インスリン依存性糖尿病、アジソン病、セリアック病、慢性疲労症候群、自己免疫性肝炎、自己免疫性脱毛症、強直性脊椎炎、線維筋痛症、尋常性天疱瘡、シェーグレン症候群、川崎病、甲状腺機能亢進症/バセドウ病、甲状腺機能低下症/橋本病、子宮内膜症、強皮症、悪性貧血、グッドパスチャー症候群、ギラン・バレー症候群、ウェゲナー病、糸球体腎炎、再生不良性貧血(複数回輸血された再生不良性貧血患者を含む)、発作性夜間ヘモグロビン尿症、骨髄異形成症候群、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫性溶血性貧血、エヴァン症候群、第VIII因子阻害症候群、全身性血管炎、皮膚筋炎、多発性筋炎、リウマチ熱、自己免疫性リンパ増殖症候群(ALPS)、自己免疫性水疱性類天疱瘡、パーキンソン病、サルコイドーシス、白斑、原発性胆汁性肝硬変、及び自己免疫性心筋炎の一つ又は複数から選択される、請求項23に記載の方法。
【請求項29】
前記消耗性疾患が、悪液質、場合により、癌又は腎不全に関連付けられる悪液質、及びサルコペニアの一つ又は複数から選択される、請求項23に記載の方法。
【請求項30】
前記骨疾患が、骨粗しょう症(閉経後骨粗しょう症を含む)、骨骨折、骨のパジェット病、ならびに癌又は化学療法、ホルモンアブレーション、及びホルモン阻害を含む癌治療に関連付けられる骨再吸収/損傷から選択される、請求項23に記載の方法。
【請求項31】
前記線維症が、肺、心血管系、肝臓、脳、関節(場合により膝、腰、足首、足関節、肩、肘、手首、手関節、又は脊椎)、腸、皮膚、腎臓、肝臓、甲状腺、骨髄、後腹膜、及び眼の線維症から選択される、請求項23に記載の方法。
【請求項32】
前記肺の線維症が、線維胸、肺線維症(場合により嚢胞性線維症又は間質性肺疾患(ILD))、常染色体劣性遺伝性疾患、場合によりヘルマンスキー・パドラック症候群、及び放射線誘発性肺傷害から選択される、請求項31に記載の方法。
【請求項33】
前記ILDが特発性ILDであり、場合により特発性肺線維症(IPF)、剥離性間質性肺炎(DIP)、急性間質性肺炎(AIP)又はハンマン・リッチ症候群、非特異性間質性肺炎(NSIP)、呼吸細気管支炎を伴う間質性肺疾患(RB-ILD)、特発性器質化肺炎(COP)、及びリンパ球性間質性肺炎(LIP)から選択される、請求項32に記載の方法。
【請求項34】
前記ILDが二次性ILDであり、場合により、結合組織及び自己免疫疾患(場合によりサルコイドーシス、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、全身性硬化症、多発性筋炎、皮膚筋炎、又は抗合成酵素症候群)、吸入物質(場合により珪肺、石綿肺、ベリリウム症、工業用印刷化学薬品、又は慢性過敏性肺炎)、薬物(場合により抗生物質、化学療法剤、又は抗不整脈剤)、感染症(場合によりSARS CoV-2、非定型肺炎、ニューモシスチス肺炎、結核、クラミジア・トラコマティス、又はRSウイルス)、悪性腫瘍(場合により癌性リンパ管症)に関連するILD、ならびに小児ILD(場合により発達障害、成長異常、肺胞形成不全、原因不明の乳児の状態、及び肺胞サーファクタント領域に関連するILD)から選択される、請求項32に記載の方法。
【請求項35】
前記心血管系の前記線維症が、心筋線維症(場合により、間質性線維症又は置換性線維症)である、請求項31に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願への相互参照
本出願は、2021年8月30日に出願された米国仮特許出願第63/238,443号;及び2022年4月26日に出願された米国仮特許出願第63/334,923号に対する優先権を主張するものであり、その各々は、参照によりその全体において組み入れられる。
【0002】
配列表に関する記述
本出願に関連付けられる配列表XMLは、XMLファイル形式において提供され、参照により本明細書中に組み入れられる。配列表XMLを含むXMLファイルの名称は、LASS_005_02WO_ST26.xmlである。XMLファイルは、約328,887バイトであり、2022年8月15日に作成され、USPTO特許センターを介して電子的に提出されている。
【0003】
本開示は、ヒトインターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合する抗体及びその抗原結合断片ならびに関連する組成物に関し、それらは、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、及び他の処置又は診断を含む、様々な治療方法又は診断方法のいずれかにおいて使用され得る。
【背景技術】
【0004】
関連技術の説明
インターロイキン-11(IL-11)はIL-6ファミリーのメンバーであり、慢性炎症、自己免疫、癌、及び他の疾患において顕著な役割を果たす。それはまた、慢性線維性応答の開始及び維持において決定的な役割を果たす。このように、IL-11シグナル伝達阻害剤は、炎症性疾患、自己免疫疾患、慢性線維性疾患、及び癌を含む様々な疾患を処置するための有望な治療アプローチを表す。
【0005】
開発下の例示的なIL-11シグナル伝達阻害剤は、インターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合する抗体を含む(例えば、米国特許第9,796,782号;及び第9,340,618号を参照のこと)。しかし、増加した効力及び最適な開発可能性特徴を伴う抗IL-11Rα抗体についての、当技術分野における必要性がある。
【発明の概要】
【0006】
本開示の実施形態は、単離抗体、又はその抗原結合断片を含み、それは、インターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合し、少なくとも一つの抗体、又はその抗原結合断片は、以下を含む:
表A1から選択される相補性決定領域VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列、ならびにIL-11Rαに特異的に結合するそのバリアントを含む重鎖可変領域(VH);及び
表A1から選択される相補性決定領域VLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列、ならびにIL-11Rαに特異的に結合するそのバリアントを含む軽鎖可変領域(VL)。
【0007】
一部の実施形態では:
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号1~3を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号4~6を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号7~9を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号10~12を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号13~15を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号16~18を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号19~21を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号22~24を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号25~27を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号28~30を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号31~33を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号34~36を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号34~39を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号40~42を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号43~45を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号46~48を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号49~51を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号52~54を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号55~57を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号58~60を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号61~63を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号64~66を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号67~69を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号70~72を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号73~75を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号76~78を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号79~81を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号82~84を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号85~87を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号88~90を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号91~93を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号94~96を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号97~99を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号100~102を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号103~105を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号106~108を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号109~111を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号112~114を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号115~117を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号118~120を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号121~123を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号124~126を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号127~129を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号130~132を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号133~135を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号136~138を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号139~141を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号142~144を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号145~147を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号148~150を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号151~153を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号154~156を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号157~159を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号160~162を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号163~165を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号166~168を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号169~171を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号172~174を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号175~177を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号178~180を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号181~183を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号184~186を含み;又は
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号187~189を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号190~192を含む。
【0008】
一部の実施形態では、VHは、表A2から選択される配列と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、場合により、VHは、フレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有する。一部の実施形態では、VLは、表A2から選択される配列と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、場合により、VLは、フレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有する。
【0009】
特定の実施形態では:
VHは、配列番号193と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号194と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号195と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号196と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号197と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号198と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号199と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号200と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号201と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号202と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号203と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号204と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号205と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号206と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号207と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号208と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号209と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号210と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号211と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号212と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号213と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号214と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号215と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号216と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号217と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号218と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号219と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号220と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号221と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号222と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号223と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号224と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号225と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号226と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号227と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号228と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号229と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号230と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号231と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号232と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号233と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号234と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号235と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号236と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号237と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号238と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号239と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号240と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号241と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号242と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号243と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号244と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号245と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号246と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号247と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号248と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号249と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号250と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号251と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号252と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号253と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号254と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;あるいは
VHは、配列番号255と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号256と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含む。
【0010】
一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、ヒトIL-11Rαに結合する(表B1を参照のこと)。特定の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、ヒトIL-11RαのフィブロネクチンドメインIII、又は配列番号257のおよその残基112~219に結合する。一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、以下の特徴の一つ又は複数を有する:
約500、400、300、200、100、90、80、70、60、50、40、又は30pM未満のヒトIL-11Rαについての結合親和性を有し、場合により、TS7及び8E2抗体のものに比べて、ヒトIL-11Rαについての増加した結合親和性を有する;IL-11RαとIL-11の間での結合及び/又はシグナル伝達活性に拮抗し、及び場合により、TS7及び8E2抗体のものに比べて、IL-11シグナル伝達アンタゴニストとして増加した効力を有する;場合により細胞ベースのアッセイにおいて、IL-11Rα/gp130二量体化又は複合体形成を低下させる;及び/又は場合によりTS7及び8E2抗体に比べて、VLCDR3において低下したN連結型グリコシル化を有する。
【0011】
一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、IgA(サブクラスIgA1及びIgA2を含む)、IgD、IgE、IgG(サブクラスIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4を含む)、又はIgM Fcドメイン、場合によりヒトFcドメイン、あるいはそのハイブリッド及び/又はバリアントを含む。一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、ヒトにおいて高いエフェクター機能を伴うIgG Fcドメイン、場合により、IgG1又はIgG3 Fcドメインを含む。一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、ヒトにおいて低いエフェクター機能を伴うIgG Fcドメイン、場合により、IgG2又はIgG4 Fcドメインを含む。特定の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、場合により、表F1から選択されるヒトIgG1又はIgG4 Fcドメインを含む。
【0012】
一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、モノクローナル抗体である。一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、ヒト化抗体を含み、抗体、又はその抗原結合断片は、S228P変異(EUナンバリング)を伴うヒトIgG4 Fcドメインを含むヒト化モノクローナル抗体である。一部の実施形態では、単離抗体、又はその抗原結合断片は、Fv断片、一本鎖Fv(scFv)ポリペプチド、アドネクチン、アンチカリン、アプタマー、アビマー、ラクダ科抗体、設計アンキリンリピートタンパク質(DARPin)、ミニボディ、ナノボディ、及びユニボディから選択される。
【0013】
また、含まれるのは、本明細書中に記載される、単離抗体、又はその抗原結合断片をコードする単離ポリヌクレオチド、単離ポリヌクレオチドを含む発現ベクター、及びベクター(S)を含む単離宿主細胞である。
【0014】
特定の実施形態は、本明細書中に記載される単離抗体、又はその抗原結合断片、及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物に関する。一部の実施形態では、組成物は、少なくとも一つの抗体又は抗原結合断片に関して、タンパク質ベースで少なくとも約80%、85%、90%、95%、98%、又は99%の純度を有し、実質的に凝集体及びエンドトキシンを含まない。一部の実施形態では、組成物は、場合によりVLCDR3配列におけるN連結型グリコシル化の(場合により、TS7及び8E2抗体に比べて)低下した又は検出不可能な不均質性を有する。一部の実施形態では、組成物は、場合により、静脈内、筋肉内、皮下、又は腹腔内投与のために適切な滅菌、注射溶液である。
【0015】
また、含まれるのは、本明細書中に記載される医薬組成物を対象に投与することを含む、それを必要とする対象において疾患又は状態を処置する方法である。一部の実施形態では、疾患又は状態は、IL-11関連又はIL-11媒介性疾患又は状態である。一部の実施形態では、疾患又は状態は、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、消耗性疾患、骨疾患、又は線維症である。
【0016】
一部の実施形態では、疾患は、癌、場合によりIL-11Rα及び/又はIL-11を発現又は過剰発現する癌であり、場合により、それにおいて、癌は、IL-11Rα/IL-11依存性成長、接着、遊走、浸潤、及び/又は化学療法抵抗性を呈する。一部の実施形態では、癌が、骨癌、前立腺癌、黒色腫(例、転移性黒色腫)、膵臓癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、中皮腫、白血病(例、リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、急性骨髄性白血病、再発性急性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、急性リンパ芽球性白血病)、リンパ腫(例、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫)、肝細胞癌(肝臓細胞癌)、肉腫、B細胞悪性腫瘍、乳癌、卵巣癌、結腸直腸癌、神経膠腫、多形神経膠芽腫、髄膜腫、下垂体腺腫、前庭神経鞘腫、原発性CNSリンパ腫、原始神経外胚葉腫瘍(髄芽腫)、腎臓癌(例、腎細胞癌)、膀胱癌、子宮癌、食道癌、脳癌、頭頸部癌、子宮頸癌、精巣癌、甲状腺癌、及び胃癌の一つ又は複数から選択される。一部の実施形態では、癌は、転移性癌、場合により、骨に転移した転移性癌である。
【0017】
特定の実施形態では、炎症性疾患は、気道又は肺の炎症(例、炎症性肺疾患)、喘息、鼻炎、慢性閉塞性肺障害(COPD)、皮膚炎、乾癬、肝炎、胃炎、過敏性腸症候群(IBS)、潰瘍性大腸炎、クローン病、大腸炎、憩室炎、紅斑性狼瘡、腎炎、パーキンソン病、多発性硬化症(MS)、アルツハイマー病、関節炎、関節リウマチ、敗血症、感染症誘発性の炎症、心血管疾患、例えばアテローム性動脈硬化症及び血管炎など、糖尿病、ならびに痛風の一つ又は複数から選択される。
【0018】
特定の実施形態では、自己免疫疾患が、関節炎(関節リウマチ、反応性関節炎を含む)、全身性エリテマトーデス(SLE)、乾癬、炎症性腸疾患(IBD)、潰瘍性大腸炎、クローン病、脳脊髄炎、ぶどう膜炎、重症筋無力症、多発性硬化症、インスリン依存性糖尿病、アジソン病、セリアック病、慢性疲労症候群、自己免疫性肝炎、自己免疫性脱毛症、強直性脊椎炎、線維筋痛症、尋常性天疱瘡、シェーグレン症候群、川崎病、甲状腺機能亢進症/バセドウ病、甲状腺機能低下症/橋本病、子宮内膜症、強皮症、悪性貧血、グッドパスチャー症候群、ギラン・バレー症候群、ウェゲナー病、糸球体腎炎、再生不良性貧血(複数回輸血された再生不良性貧血患者を含む)、発作性夜間ヘモグロビン尿症、骨髄異形成症候群、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫性溶血性貧血、エヴァン症候群、第VIII因子阻害症候群、全身性血管炎、皮膚筋炎、多発性筋炎、リウマチ熱、自己免疫性リンパ増殖症候群(ALPS)、自己免疫性水疱性類天疱瘡、パーキンソン病、サルコイドーシス、白斑、原発性胆汁性肝硬変、及び自己免疫性心筋炎の一つ又は複数から選択される。
【0019】
一部の実施形態では、消耗性疾患は、悪液質、場合により、癌又は腎不全に関連付けられる悪液質、及びサルコペニアの一つ又は複数から選択される。
【0020】
一部の実施形態では、骨疾患は、骨粗しょう症(閉経後骨粗しょう症を含む)、骨骨折、骨のパジェット病、ならびに癌又は化学療法、ホルモンアブレーション、及びホルモン阻害を含む癌治療に関連付けられる骨再吸収/損傷から選択される。
【0021】
一部の実施形態では、線維症は、肺、心血管系、肝臓、脳、関節(場合により膝、腰、足首、足関節、肩、肘、手首、手関節、又は脊椎)、腸、皮膚、腎臓、肝臓、甲状腺、骨髄、後腹膜、及び眼の線維症から選択される。特定の実施形態では、肺の線維症は、線維胸、肺線維症(場合により嚢胞性線維症又は間質性肺疾患(ILD))、常染色体劣性遺伝性疾患、場合によりヘルマンスキー・パドラック症候群、及び放射線誘発性肺傷害から選択される。特定の実施形態では、ILDは特発性ILDであり、場合により特発性肺線維症(IPF)、剥離性間質性肺炎(DIP)、急性間質性肺炎(AIP)又はハンマン・リッチ症候群、非特異性間質性肺炎(NSIP)、呼吸細気管支炎を伴う間質性肺疾患(RB-ILD)、特発性器質化肺炎(COP)、及びリンパ球性間質性肺炎(LIP)から選択される。特定の実施形態では、ILDは二次性ILDであり、場合により、結合組織及び自己免疫疾患(場合によりサルコイドーシス、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、全身性硬化症、多発性筋炎、皮膚筋炎、又は抗合成酵素症候群)、吸入物質(場合により珪肺、石綿肺、ベリリウム症、工業用印刷化学薬品、又は慢性過敏性肺炎)、薬物(場合により抗生物質、化学療法剤、又は抗不整脈剤)、感染症(場合によりSARS CoV-2、非定型肺炎、ニューモシスチス肺炎、結核、クラミジア・トラコマティス、又はRSウイルス)、悪性腫瘍(場合により癌性リンパ管症)に関連するILD、ならびに小児ILD(場合により発達障害、成長異常、肺胞形成不全、原因不明の乳児の状態、及び肺胞サーファクタント領域に関連するILD)から選択される。
【0022】
一部の実施形態では、心血管系の線維症は、心筋線維症(例えば、間質性線維症又は置換性線維症)である。
【図面の簡単な説明】
【0023】
【
図1A】
図1A~1Bは、ドナー1(1A)及びドナー2(1B)からの肺組織の全体的な外観を示す。
【
図2A】
図2A~2Bは、ドナー1(2A、上部胸膜下;底部中央)及びドナー2(2B、上部胸膜下;底部中央)からの線維性肺組織のヘマトキシリン及びエオシン染色を示す。染色を、PCLS組織コアに隣接する組織で行った。代表的な概観写真が示されている。
【
図3A】
図3A~3Bは、ドナー1(3A)及びドナー2(3B)からの未処理(培地)及びLPS処置精密切断肺スライス(PCLS)の組織生存率を示す。LDH放出は、トリトン溶解対照の%として与えられる(100%に設定)。バーは平均値±SDを示し、ドットは技術的複製を表す(各々2つのPCLSを伴う重複ウェル)。ドナー2(3B)については、二重ウェルの上清を測定前にプールした。領域1は胸膜下であり、領域2は中央である。
【
図4A】
図4A~4Bは、ドナー1(4A)及びドナー2(4B)からのLPS処理PCLSにおけるIL-1β上方調節を示す。IL-1βを、ELISAによりPCLS溶解物中で決定し、組織の総タンパク質濃度に対して標準化した。データは、平均値±SDとして示される。各条件について、二重ウェル(各々2つのPCLSを伴う)からの溶解物を測定前にプールした。領域1は胸膜下であり、領域2は中央である。
【
図5】
図5は、全てのドナー及び領域にわたってPRO-C6により評価されたVI型コラーゲン形成を示す。領域1は胸膜下であり、領域2は中央である。データは、処置なし(培地)対照のパーセンテージとして提示され、各ドナーからの各領域からの三つの複製についての個々のデータ点(合計12)として示され、中央値及び四分位範囲の表示を伴う。
【発明を実施するための形態】
【0024】
本開示は、抗体、及びその抗原結合断片に関し、それらは、インターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に特異的に結合し、特にエピトープ特異性及び改善された特徴を有する抗体である。そのような改善された特徴の例は、IL-11Rαについての増加した結合親和性、インターロイキン-11(IL-11)シグナル伝達阻害剤/アンタゴニストとしての増加した効力、ならびに、改善された開発可能性、例えば、潜在的なN連結型グリコシル化部位での減少した不均質性に起因する、増加した製造均質性などを含む。一部の実施形態は、このように、IL-11Rαに結合し、そのリガンドIL-11とのIL-11Rα結合を遮断し、下流細胞シグナル伝達及び生物学的効果を阻害することが可能な特定のヒト化抗体及びその断片を含む。特定の実施形態では、抗IL-11Rα抗体、又はその抗原結合断片は、IL-11Rαアンタゴニスト又は阻害剤である。
【0025】
本明細書中に記載されるIL-11Rαアンタゴニスト抗体は、様々な疾患及び状態、例えば、IL-11シグナル伝達に関連付けられる又はそれにより媒介される疾患及び状態を含む、癌、自己免疫疾患、及び炎症性疾患などの処置及び予防において有用である。一部の実施形態は、このように、IL-11活性又はその異常な発現に関連付けられるものを含む、疾患及び状態の診断、評価、及び処置のための、抗IL-11Rα抗体、又はその抗原結合断片の使用に関する。
【0026】
本開示の実践は、具体的に反対に示されない限り、当技術分野のスキル内のウイルス学、免疫学、微生物学、分子生物学、及び組換えDNA技術の従来の方法を用い、それらの多くが、例証の目的のために以下に記載される。そのような技術は、文献中で完全に説明されている。例えば、Current Protocols in Molecular Biology or Current Protocols in Immunology,John Wiley & Sons,New York,N.Y.(2009);Ausubel et al.,Short Protocols in Molecular Biology,3rd ed.,Wiley & Sons,1995;Sambrook and Russell,Molecular Cloning: A Laboratory Manual (3rd Edition,2001);Maniatis et al.Molecular Cloning: A Laboratory Manual (1982);DNA Cloning: A Practical Approach、vol.I&II(D.Glover,ed.);オリゴヌクレオチド合成(N.Gait,ed.,1984);核酸ハイブリダイゼーション(B.Hames & S.Higgins,eds.,1985);転写及び翻訳(B.Hames & S.Higgins,eds.,1984);動物細胞培養(R.freshney,ed.,1986);Perbal,A Practical Guide to Molecular Cloning(1984)、及び他の同様の参考文献を参照のこと。
【0027】
本明細書及び添付の特許請求の範囲において使用される場合、単数形は、内容が別途明確に指示しない限り、複数の参照を含む。
【0028】
「約」により、参照量、レベル、値、数、頻度、パーセンテージ、寸法、サイズ、量、重量、又は長さに対して20、15、10、9、8、7、6、5、4、3、2、又は1%だけ変動する量、レベル、値、数、頻度、パーセンテージ、寸法、サイズ、量、重量、又は長さを意味する。
【0029】
用語「抗原」は、選択的結合薬剤、例えば抗体などにより結合されることが可能で、加えて、動物において使用されて、その抗原のエピトープに結合することが可能な抗体を産生することが可能な分子又は分子の一部を指す。抗原は、一つ又は複数のエピトープを有してもよい。本明細書中で使用される場合、用語「抗原」は、適した条件下で、物質に対する免疫応答を誘導し、免疫応答の産物と反応することが可能である物質を含む。例えば、抗原は、抗体(液性免疫応答)又は感作Tリンパ球(Tヘルパー又は細胞媒介性免疫応答)、又はその両方により認識され得る。抗原は、可溶性物質、例えば毒素及び外来タンパク質など、又は微粒子、例えば細菌及び組織細胞などであり得るが;しかし、抗原決定基(エピトープ)として公知のタンパク質又は多糖分子の部分のみが、リンパ球上の抗体又は特定の受容体と組み合わされる。より広くは、用語「抗原」は、物質が免疫原性であるか否かにかかわらず、抗体が結合する、又は抗体が望ましい任意の物質を含む。そのような抗原については、抗体は、任意の免疫応答とは独立して、組換え方法により同定することができる。
【0030】
「アンタゴニスト」は、別の薬剤又は分子の生理学的作用に干渉する、又はそうでなければそれを低下させる薬剤(例、抗体)を指す。一部の例では、アンタゴニストは、他の薬剤又は分子に特異的に結合する。含まれるのは、完全及び部分アンタゴニストである。
【0031】
「アゴニスト」は、別の薬剤又は分子の生理学的作用を増加又は増強する薬剤(例、抗体)を指す。一部の例では、アゴニストは、他の薬剤又は分子に特異的に結合する。含まれるのは、完全及び部分アゴニストである。
【0032】
本明細書中で使用される場合、用語「アミノ酸」は、天然及び非天然アミノ酸の両方、ならびにアミノ酸類似体及び模倣体を意味することが意図される。天然アミノ酸は、タンパク質生合成中に利用される20の(L)アミノ酸、ならびに、例えば、他、例えば4-ヒドロキシプロリン、ヒドロキシリジン、デスモシン、イソデスモシン、ホモシステイン、シトルリン、及びオルニチンなどを含む。非天然アミノ酸は、例えば、(D)-アミノ酸、ノルロイシン、ノルバリン、p-フルオロフェニルアラニン、エチオニン及び同様のものを含み、それらは、当業者に公知である。アミノ酸類似体は、天然及び非天然アミノ酸の修飾形態を含む。そのような修飾は、例えば、アミノ酸上での化学基及び部分の置換もしくは交換を含み得る、又はアミノ酸の誘導体化により得る。アミノ酸模倣体は、例えば、機能的に類似した特性、例えば参照アミノ酸の電荷及び電荷間隔特徴などを示す有機構造を含む。例えば、アルギニン(Arg又はR)を模倣する有機構造は、類似の分子空間中に位置付けられ、天然Argアミノ酸の側鎖のe-アミノ基と同じ程度の可動性を有する正電荷部分を有するであろう。模倣体はまた、アミノ酸又はアミノ酸官能基の最適な間隔及び電荷相互作用を維持するように制約された構造を含む。当業者は、どの構造が、機能的に等価なアミノ酸類似体及びアミノ酸模倣体を構成するかを知っている、又は決定することができる。
【0033】
本明細書中で使用される場合、用語「抗体」は、インタクトなポリクローナル又はモノクローナル抗体だけでなく、しかし、また、その断片(例えばdAb、Fab、Fab’、F(ab’)2、Fvなど)、一本鎖(scFv)、その合成バリアント、天然バリアント、要求される特異性の抗原結合断片を伴う抗体部分を含む融合タンパク質、ヒト化抗体、キメラ抗体、及び要求される特異性の抗原結合部位又は断片(エピトープ認識部位)を含む免疫グロブリン分子の任意の他の改変された構成を含む。抗体(及びその抗原結合断片)の特定の特色及び特徴は、本明細書中により詳細に記載されている。
【0034】
抗体又は抗原結合断片は、本質的に任意の種類であり得る。当技術分野において周知であるように、抗体は、免疫グロブリン分子の可変領域中に位置付けられる、少なくとも一つのエピトープ認識部位を通じて、標的、例えば免疫チェックポイント分子などへの特異的な結合が可能な免疫グロブリン分子である。
【0035】
本明細書中で使用される用語「抗原結合断片」は、目的の抗原に結合する免疫グロブリン重鎖及び/又は軽鎖の少なくとも一つのCDRを含むポリペプチド断片を指す。これに関して、本明細書中に記載される抗体の抗原結合断片は、標的分子に結合する抗体からのVH及びVL配列の1、2、3、4、5、又は全て6つのCDRを含み得る。
【0036】
抗体及びその抗原結合断片の結合特性は、当技術分野において周知の方法を使用して定量化することができる(Davies et al.,Annual Rev.Biochem.59:439-473,1990を参照のこと)。一部の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、標的分子、例えば、IL-11Rαポリペプチド又はそのエピトープもしくは複合体に、約≦10-7M~約10-8Mである又はその範囲に及ぶ平衡解離定数を伴って特異的に結合する。一部の実施形態では、平衡解離定数は、約≦10-9M~約≦10-10Mである又はその範囲に及ぶ。特定の例証的な実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、約、少なくとも約、又は約0.01、0.05、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、40、又は50nMを下回る、標的分子(それが特異的に結合する)についての親和性(KD又はEC50)を有する。
【0037】
分子、例えばポリペプチド又は抗体などは、それが、特定の細胞、物質、もしくは特定のエピトープと、それが代替的な細胞もしくは物質、又はエピトープとするよりも、より頻繁に、より迅速に、より大きな持続時間で、及び/又はより大きな親和性で反応又は会合する場合、「特異的結合」又は「優先的結合」を示すと言われる。抗体は、それが、例えば、統計的に有意な量により、他の物質又はエピトープに結合するよりも大きな親和性、結合力で、より容易に、及び/又は長い持続時間で結合する場合、標的分子又はエピトープに「特異的に結合する」又は「優先的に結合する」。典型的には、特異的結合を示す分子の対の一つのメンバーは、その表面上での領域、又は空洞を有し、それは、分子の対の他のメンバーの特定の空間的及び/又は極性構造に特異的に結合し、従って、それに相補的である。このように、対のメンバーは、互いに特異的に結合する特性を有する。例えば、特異的エピトープに特異的又は優先的に結合する抗体は、それが他のエピトープに結合するよりも、より大きな親和性、結合力で、より容易に、及び/又は長い持続時間でその特異的エピトープに結合する抗体である。また、例えば、第一の標的に特異的又は優先的に結合する抗体(又は部分もしくはエピトープ)が、第二の標的に特異的又は優先的に結合し得る又はしないであろうことが、この定義を読むことにより理解される。この用語はまた、例えば、抗体が、多数の抗原により担持される特定のエピトープについて特異的である場合に適用可能であり、その場合では、抗原結合断片又はドメインを担持する特異的結合メンバーは、エピトープを担持する様々な抗原に結合することができ;例えば、それは、共通エピトープを共有する複数の種からの多数の異なる形態の標的抗原に対して交差反応性であり得る。
【0038】
免疫学的結合は、一般的に、免疫グロブリン分子と、免疫グロブリンが特異的である抗原との間で、例えば、例証の目的で、限定しないが、静電、イオン、親水性及び/又は疎水性の引力又は反発、立体力、水素結合、ファンデルワールス力、ならびに他の相互作用の結果として生じる種類の非共有結合的な相互作用を指す。免疫学的結合相互作用の強度、又は親和性は、相互作用の解離定数(KD)の観点から表現することができ、より小さいKDは、より大きな親和性を表す。選択されたポリペプチドの免疫学的結合特性は、当技術分野において周知の方法を使用して定量化することができる。一つのそのような方法は、抗原結合部位/抗原複合体形成及び解離の速度を測定することを伴い、それにおいて、それらの速度は、複合体パートナーの濃度、相互作用の親和性、及び両方向における速度に等しく影響する幾何学的パラメータに依存する。このように、「オン速度定数」(Kon)及び「オフ速度定数」(Koff)の両方が、濃度ならびに会合及び解離の実際の速度の計算により決定され得る。Koff/Konの比率は、親和性に関連しない全てのパラメータの解除を可能にし、このように、解離定数KDと等しい。本明細書中で使用される場合、用語「親和性」は、二つの薬剤の可逆的結合のための平衡定数を含み、KD又はEC50として表現される。リガンドへの結合タンパク質の親和性、例えばエピトープについての抗体の親和性などは、例えば、約100ナノモル(nM)~約0.1nM、約100nM~約1ピコモル(pM)、又は約100nM~約1フェムトモル(fM)であることができる。本明細書中で使用される場合、用語「アビディティ」は、希釈後の解離に対する二つ又はそれ以上の薬剤の複合体の耐性を指す。一部の実施形態では、親和性は、半最大有効濃度(EC50)の観点から表現され、それは、本明細書中で開示されるように、薬剤、例えば抗体、又は抗IL-11Rα抗体などの濃度を指し、それは、特定された曝露時間後のベースラインと最大値の間での中間の応答を誘導する。EC50は、抗体の効力の尺度として一般に使用される。
【0039】
抗体は、当業者に公知の様々な技術のいずれかにより調製することができる。例えば、Harlow and Lane,Antibodies: A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory,1988を参照のこと。目的のポリペプチドについて特異的なモノクローナル抗体は、例えば、Kohler and Milstein,Eur.J.Immunol.6:511-519,1976の技術、及びそれへの改善を使用して調製することができる。また、含まれるのは、トランスジェニック動物、例えばマウスなどを利用してヒト抗体を発現する方法である。例えば、Neuberger et al.,Nature Biotechnology 14:826,1996;Lonberg et al.,Handbook of Experimental Pharmacology 113:49-101,1994;及びLonberg et al.,Internal Review of Immunology 13:65-93,1995を参照のこと。特定の例は、REGENEREX(登録商標)によるVELOCIMMUNE(登録商標)プラットフォームを含む(例、米国特許第6,596,541号を参照のこと)。
【0040】
抗体はまた、ファージディスプレイライブラリ又は酵母ディスプレイライブラリの使用により生成又は同定することができる(例、米国特許第7,244,592号;Chao et al.,Nature Protocols.1:755-768,2006を参照のこと)。利用可能なライブラリの非限定的な例は、クローン化又は合成ライブラリ、例えばヒトコンビナトリアル抗体ライブラリ(HuCAL)などを含み、それにおいて、ヒト抗体レパートリーの構造的多様性は、七つの重鎖及び七つの軽鎖可変領域遺伝子により表される。これらの遺伝子の組み合わせによって、マスターライブラリ中の49のフレームワークが生じる。これらのフレームワーク上に高度に可変な遺伝子カセット(CDR=相補性決定領域)を重ねることにより、広大なヒト抗体レパートリーを再現することができる。また、軽鎖可変領域、重鎖CDR-3、重鎖CDR-1の多様性をコードする合成DNA、および重鎖CDR-2の多様性をコードする合成DNAをコードするヒトドナー供給断片を用いて設計されたヒトライブラリも含まれている。使用のための適切な他のライブラリが、当業者に明らかであろう。
【0041】
特定の実施形態では、本明細書中に記載される抗体及びその抗原結合断片は、CDRに対する支持を提供し、互いに対するCDRの空間的関係を定義する重鎖及び軽鎖のフレームワーク領域(FR)セットの間にそれぞれ挿入された、重鎖及び軽鎖CDRセットを含む。本明細書中で使用される場合、用語「CDRセット」は、重鎖又は軽鎖V領域の三つの超可変領域を指す。重鎖又は軽鎖のN末端から進んで、これらの領域は、それぞれ「CDR1」、「CDR2」、及び「CDR3」として表示される。抗原結合部位は、従って、重鎖及び軽鎖V領域の各々からのCDRセットを含む、六つのCDRを含む。単一のCDR(例、CDR1、CDR2、又はCDR3)を含むポリペプチドは、本明細書中では「分子認識単位」として言及される。多数の抗原-抗体複合体の結晶学的分析によって、CDRのアミノ酸残基が、結合抗原との広範な接触を形成し、それにおいて、最も広範な抗原接触が重鎖CDR3とであることが実証されている。このように、分子認識単位は、主に抗原結合部位の特異性について関与する。
【0042】
本明細書中で使用される場合、用語「FRセット」は、重鎖又は軽鎖V領域のCDRセットのCDRをフレーム化する四つの隣接するアミノ酸配列を指す。一部のFR残基は、結合抗原と接触し得るが;しかし、FRは、主に、V領域を抗原結合部位、特にCDRに直接隣接するFR残基中にフォールディングすることについて関与する。FR内では、特定のアミノ残基及び特定の構造的特色が、非常に高度に保存されている。これに関して、大半のV領域配列は、約90のアミノ酸残基の内部ジスルフィドループを含む。V領域が結合部位中にフォールディングする場合、CDRは、抗原結合表面を形成する突出ループモチーフとして呈される。正確なCDRアミノ酸配列に関係なく、CDRループの折り畳まれた形状に影響するFRの保存された構造領域が、特定の「基準」構造中にあることが一般的に認識される。さらに、特定のFR残基が、抗体重鎖及び軽鎖の相互作用を安定化する非共有結合ドメイン間接触において関与することが公知である。
【0043】
免疫グロブリン可変ドメインの構造及び位置が、Kabat,E.A.et al.,Sequences of Proteins of Immunological Interest.4th Edition.米国保健福祉省、1987年、及びその更新への参照により決定され得る。
【0044】
また、含まれるのは、モノクローナル抗体であって、それは、モノクローナル抗体が、エピトープの選択的結合において含まれるアミノ酸(天然及び非天然)で構成される、均質な抗体集団を指す。モノクローナル抗体は高度に特異的であり、単一のエピトープに対して向けられる。用語「モノクローナル抗体」は、インタクトなモノクローナル抗体及び全長モノクローナル抗体だけでなく、しかし、また、それらの断片(例えばFab、Fab’、F(ab’)2、Fvなど)、一本鎖(scFv)、それらのバリアント、抗原結合部分を含む融合タンパク質、ヒト化モノクローナル抗体、キメラモノクローナル抗体、ならびに要求される特異性及びエピトープに結合する能力の抗原結合断片(エピトープ認識部位)を含む免疫グロブリン分子の任意の他の改変された配置を包含する。それは、抗体の供給源又はそれが作製される様式(例、ハイブリドーマ、ファージ選択、組換え発現、トランスジェニック動物による)に関して限定されることを意図しない。この用語は、免疫グロブリン全体、ならびに「抗体」の定義の下で上に記載される断片などを含む。
【0045】
タンパク質分解酵素パパインは、IgG分子を優先的に切断していくつかの断片をもたらし、それらの二つ(F(ab)断片)は各々、インタクトな抗原結合部位を含む共有結合ヘテロ二量体を含む。酵素ペプシンは、IgG分子を切断して、両方の抗原結合部位を含むF(ab’)2断片を含むいくつかの断片を提供することができる。特定の実施形態による使用のためのFv断片は、IgMの、及び、稀な場合では、IgG又はIgA免疫グロブリン分子の優先的なタンパク質分解切断により産生することができる。Fv断片は、しかし、当技術分野において公知の組換え技術を使用してより一般に由来する。Fv断片は、天然抗体分子の抗原認識能力及び結合能力の大部分を保持する抗原結合部位を含む非共有結合VH::VLヘテロ二量体を含む(Inbar et al.,PNAS USA.69:2659-2662,1972;Hochman et al.,Biochem.15:2706-2710,1976;及びEhrlich et al.,Biochem.19:4091-4096,1980)。一部の実施形態では、Fvは、他の手段、例えば、少なくとも一つのジスルフィド結合の組み入れにより安定化される(Worn & Pluckthun,J.Mol.Biol.305,989-1010,2001)。
【0046】
特定の実施形態では、一本鎖Fv(scFV)抗体が企図される。例えば、カッパボディ(Ill et al.,Prot.Eng.10:949-57,1997);ミニボディ(Martin et al.,EMBO J 13:5305-9,1994);ダイアボディ(Holliger et al.,PNAS 90:6444-8,1993);又はヤヌシン(Traunecker et al.,EMBO J 10:3655-59,1991;及びTraunecker et al.,Int.J.Cancer Suppl.7:51-52,1992)は、所望の特異性を有する抗体を選択することに関する本出願の教示に従って、標準的な分子生物学技術を使用して調製され得る。
【0047】
一本鎖Fv(scFv)ポリペプチドは、共有結合的に連結されたVH::VLヘテロ二量体であり、それは、ペプチドをコードするリンカーにより連結されたVH及びVLコード遺伝子を含む遺伝子融合体から発現される。Huston et al.(PNAS USA.85(16):5879-5883,1988)。抗体V領域から、抗原結合部位の構造と実質的に類似した三次元構造に折り畳まれるscFv分子に、天然に凝集した、しかし、化学的に分離した軽鎖及び重鎖ポリペプチド鎖を変換するための化学構造を識別するための多くの方法が記載されている。例えば、Hustonらの米国特許第5,091,513号及び第5,132,405号;ならびにLadnerらの米国特許第4,946,778号を参照のこと。
【0048】
特定の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、「ダイアボディ」の形態である。ダイアボディはポリペプチドの多量体であり、各々のポリペプチドが、免疫グロブリン軽鎖の結合領域を含む第一のドメイン及び免疫グロブリン重鎖の結合領域を含む第二のドメインを含み、二つのドメインが連結されているが(例、ペプチドリンカーにより)、しかし、互いに会合して抗原結合部位を形成することができない:抗原結合部位は、多量体内の一つのポリペプチドの第一のドメインと、多量体内の別のポリペプチドの第二のドメインとの会合により形成される(WO94/13804)。抗体のdAb断片は、VHドメインからなる(Ward et al.,Nature 341:544-546,1989)。ダイアボディ及び他の多価又は多特異性断片は、例えば、遺伝子融合により構築することができる(WO94/13804;及びHolliger et al.,PNAS USA.90:6444-6448,1993)を参照のこと)。
【0049】
CH3ドメインに連結されたscFvを含むミニボディも含まれる(Hu et al.,Cancer Res.56:3055-3061,1996を参照のこと)。また、Ward et al.,Nature.341:544-546,1989;Bird et al.,Science.242:423-426,1988;Huston et al.,PNAS USA.85:5879-5883,1988);PCT/US92/09965;WO94/13804;及びReiter et al.,Nature Biotech.14:1239-1245,1996を参照のこと。
【0050】
二重特異性抗体が使用される場合、これらは従来の二重特異性抗体であってもよく、それらは様々な方法で製造することができ(Holliger and Winter,Current Opinion Biotechnol.4:446-449,1993)、例えば、化学的に、又はハイブリドーマから調製されてもよく、あるいは上で言及する二重特異性抗体断片のいずれかであってもよい。
【0051】
二重特異性ダイアボディは、二重特異性全抗体とは対照的に、また、特に有用であり得る。なぜなら、それらは、E.coli中で容易に構築及び発現することができるためである。適した結合特異性のダイアボディ(及び多くの他のポリペプチド、例えば抗体断片など)は、ライブラリからのファージディスプレイ(WO94/13804)を使用して容易に選択することができる。ダイアボディの一つのアームが、例えば、抗原Xに対して向けられた特異性を伴って一定に保たれる場合、次に、他のアームが変化し、適した特異性の抗体が選択されるライブラリを作製することができる。二重特異性全抗体は、ノブイントゥーホール操作を含む多くの方法(Brinkman & Kontermann,mAbs 9:182-212,2017)により作製され得る(Ridgeway et al.,Protein Eng.9:616-621,1996)。
【0052】
特定の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、UniBody(登録商標)の形態である。UniBody(登録商標)は、ヒンジ領域が除去されたIgG4抗体である(GenMab Utrecht,The Netherlandsを参照のこと;例えば、また、US20090226421を参照のこと)。この抗体技術によって、現在の小さな抗体フォーマットよりも長い治療ウィンドウが予想される、安定で、より小さな抗体フォーマットが作られる。IgG4抗体は不活性と考えられ、このように、免疫系と相互作用しない。完全ヒトIgG4抗体は、抗体のヒンジ領域を除去して、対応するインタクトなIgG4(GenMab、Utrecht)に比べて、異なる安定性特性を有する半分子断片を得ることにより改変され得る。IgG4分子を半分にすることによって、同族抗原(例、疾患標的)に結合することができるUniBody(登録商標)上に一つの領域のみを残し、従って、UniBody(登録商標)は、標的細胞上の一つの部位にのみ一価で結合する。特定の癌細胞表面抗原については、この一価結合は、同じ抗原特異性を有する二価抗体を使用して見られ得るように、癌細胞を刺激して成長させないであろうが、それ故に、UniBody(登録商標)技術は、従来の抗体を用いた処置に難治性であり得る一部の種類の癌のための処置選択肢を提供し得る。UniBody(登録商標)の小さなサイズは、一部の形態の癌を処置する際に大きな利益となり得るが、より大きな固形腫瘍に対する分子のより良好な分布を可能にし、潜在的に有効性を増加させる。
【0053】
特定の実施形態では、本明細書中に記載される抗体及び抗原結合断片は、ナノボディの形態である。ナノボディは、単一の遺伝子によりコードされ、ほぼ全ての原核及び真核宿主、例えば、大腸菌(米国特許第6,765,087号を参照のこと)、カビ(例えば、アスペルギルス又はトリコデルマ)、及び酵母(例えば、サッカロミセス、クルイベロミセス、ハンセンラ、又はピキア(米国特許第6,838,254号を参照のこと)において効率的に産生される。産生プロセスは拡張可能であり、数キログラム量のナノボディが産生されている。ナノボディは、長い保存期間を有する、直ぐに使用できる溶液として製剤化され得る。ナノクローン方法(WO06/079372を参照のこと)は、B細胞の自動ハイスループット選択に基づいて、所望の標的に対するナノボディを生成するための専有の方法である。
【0054】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、アプタマーの形態である(例、参照により組み入れられる、Ellington et al.,Nature.346,818-22,1990;及びTuerk et al.,Science.249,505-10,1990を参照のこと)。アプタマーの例は、核酸アプタマー(例、DNAアプタマー、RNAアプタマー)及びペプチドアプタマーを含む。核酸アプタマーは、一般的に、インビトロ選択の反復ラウンド、又は同等の方法、例えばSELEX(指数関数的濃縮によるリガンドの系統的進化)などを通じて操作されて、様々な分子標的、例えば小分子、タンパク質、核酸、ならびにさらには細胞、組織、及び生物などに結合する核酸種を指す。例えば、参照により組み入れられる、米国特許第6,376,190号;及び第6,387,620号を参照のこと。
【0055】
ペプチドアプタマーは、典型的には、両端でタンパク質足場に付着された可変ペプチドループを含み、典型的には、ペプチドアプタマーの結合親和性を、抗体のものと同等のレベル(例、ナノモル範囲中)まで増加させる二重構造制約である。特定の実施形態では、可変ループ長は、約10~20のアミノ酸(その間の全ての整数を含む)で構成されてもよく、足場は、良好な溶解度及び緻密特性を有する任意のタンパク質を含み得る。特定の例示的な実施形態は、細菌タンパク質チオレドキシン-Aを足場タンパク質として利用し、可変ループは、還元活性部位(野生型タンパク質中の-Cys-Gly-Pro-Cys-ループ)内に挿入され、二つのシステイン側鎖はジスルフィド架橋を形成することができる。ペプチドアプタマーを同定するための方法が、例えば、参照により組み入れられる、米国特許出願第2003/0108532号において記載されている。ペプチドアプタマー選択は、酵母ツーハイブリッド系を含む、当技術分野において公知の異なる系を使用して実施することができる。
【0056】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、アビマーの形態である。アビマーは、インビトロエクソンシャッフリング及びファージディスプレイを使用して操作された多量体結合タンパク質又はペプチドを指す。複数の結合ドメインが連結され、単一エピトープ免疫グロブリンドメインと比較して、より大きな親和性及び特異性をもたらす。例えば、参照により組み入れられる、Silverman et al.,Nature Biotechnology.23:1556-1561,2005;米国特許第7,166,697号;ならびに米国特許出願第2004/0175756号、第2005/0048512号、第2005/0053973号、第2005/0089932号、及び第2005/0221384号を参照のこと。
【0057】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、アドネクチンの形態である。アドネクチンは、他のタンパク質に天然に結合する豊富な細胞外タンパク質であるヒトフィブロネクチンから由来する、標的化された生物製剤のクラスを指す。例えば、参照により組み入れられる、米国特許出願第2007/0082365号;第2008/0139791号;及び第2008/0220049号を参照のこと。アドネクチンは、典型的には、天然フィブロネクチン骨格、ならびにヒトフィブロネクチンの特定の部分の複数の標的化ドメインからなる。標的化ドメインは、アドネクチンが、IL-11Rαポリペプチド又はそのエピトープを特異的に認識することを可能にするように操作することができる。
【0058】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、アンチカリンの形態である。アンチカリンは、構造的に強固なフレームワークにより支持される超可変ループ領域を伴う結合タンパク質のファミリーであるヒトリポカリンから典型的には合成される抗体模倣体のクラスを指す。例えば、米国特許出願第2006/0058510号を参照のこと。アンチカリンは、典型的には、約20kDaのサイズを有する。アンチカリンは、四つのペプチドループ及び付着α-ヘリックスにより対で接続される八つの逆平行β鎖(安定なβ-バレル足場)により形成されるバレル構造により特徴付けられることができる。特定の態様では、特異的結合を達成するための立体構造の逸脱が、超可変ループ領域中に作製される。例えば、参照により組み入れられる、Skerra,FEBS J.275:2677-83,2008を参照のこと。
【0059】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される抗体又は抗原結合断片は、設計されたアンキリンリピートタンパク質(DARPin)の形態である。DARPinsは、薬物発見及び薬物開発において標的結合について抗体を上回る利点を与え得る、非免疫グロブリンタンパク質のクラスを含む。他の用途の中でもとりわけ、DARPinsは、小サイズ及び高い安定性を含む、好ましい分子特性のため、毒素又は他の治療ペイロードのインビボ画像化又は送達のために理想的に適している。細菌における低コスト産生及び多くの標的特異的DARPinの迅速な生成によって、DARPinアプローチは、薬物発見のために有用になる。加えて、DARPinは、多特異性フォーマットにおいて簡単に生成することができ、エフェクターDARPinを特定の器官に標的化させる、又はいくつかのDARPinで構成される一つの分子で複数の受容体を標的化する潜在能を与える。例えば、参照により組み入れられる、Stumpp et al.,Curr Opin Drug Discov Devel.10:153-159,2007;米国特許出願第2009/0082274号;及びPCT/EP2001/10454号を参照のこと。
【0060】
また、含まれるのは、重鎖二量体、例えばラクダ類及びサメからの抗体などである。ラクダ科抗体及びサメ抗体は、V様ドメイン及びC様ドメインの二つの鎖のホモ二量体対を含む(いずれも軽鎖を有さない)。ラクダ科における重鎖二量体IgGのVHは、軽鎖との疎水性相互作用を作らなくてもよいため、通常は軽鎖と接触する重鎖中の領域は、ラクダ科における親水性アミノ酸残基に変化される。重鎖二量体IgGのVHドメインは、VHHドメインと呼ばれる。サメIg-NARは、一つの可変ドメイン(V-NARドメインと呼ばれる)及び五つのC様定常ドメイン(C-NARドメイン)のホモ二量体を含む。
【0061】
ラクダ科では、抗体レパートリーの多様性は、VH又はVHH領域中の相補性決定領域(CDR)1、2、及び3により決定される。ラクダ類VHH領域中のCDR3は、平均16のアミノ酸の、その比較的長い長さにより特徴付けられる(Muyldermans et al.,1994,Protein Engineering 7(9): 1129)。これは、多くの他の種の抗体のCDR3領域とは対照的である。例えば、マウスVHのCDR3は、平均9のアミノ酸を有する。ラクダ由来抗体可変領域のライブラリは、ラクダ科の可変領域のインビボ多様性を維持し、例えば、2005年2月17日公開の米国特許出願第20050037421号において開示されている方法により作ることができる。
【0062】
特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、ヒト化される。これらの実施形態は、一般的に組換え技術を使用して調製され、非ヒト種からの免疫グロブリンから由来する抗原結合部位ならびにヒト免疫グロブリンの構造及び/又は配列に基づく分子の残りの免疫グロブリン構造を有するキメラ分子を指す。抗原結合部位は、定常ドメイン上に融合された完全な可変ドメイン、又は可変ドメイン中の適したフレームワーク領域上に移植されたCDR(全体又は一部)のみのいずれかを含み得る。エピトープ結合部位は、野生型であってもよく、あるいは一つ又は複数のアミノ酸置換により改変されてもよい。これによって、ヒト個体における免疫原として定常領域が除去されるが、しかし、外来性可変領域に対する免疫応答の可能性は依然として残っている(LoBuglio et al.,PNAS USA 86:4220-4224,1989;Queen et al.,PNAS USA.86:10029-10033,1988;Riechmann et al.,Nature.332:323-327,1988)。抗体のヒト化のための例証的な方法は、米国特許第7,462,697号において記載される方法を含む。
【0063】
別のアプローチは、ヒト由来定常領域を提供するだけでなく、しかし、可変領域を改変し、それらをヒト形態に可能な限り密接に再形成することにも焦点を合わせる。重鎖及び軽鎖の両方の可変領域は、所与の種において比較的保存され、CDRについての足場を推定的に提供する四つのフレームワーク領域(FR)により隣接される、問題のエピトープに応答して変動し、結合能力を決定する三つの相補性決定領域(CDR)を含むことが公知である。非ヒト抗体が、特定のエピトープに関して調製される場合、可変領域は、改変されるヒト抗体中に存在するFR上に、非ヒト抗体から由来するCDRを移植することにより再形成又はヒト化することができる。様々な抗体へのこのアプローチの適用は、Sato et al.,Cancer Res.53:851-856,1993;Riechmann et al.,Nature 332:323-327,1988;Verhoeyen et al.,Science 239:1534-1536,1988;Kettleborough et al.,Protein Engineering.4:773-3783,1991;Maeda et al.,Human Antibodies Hybridoma 2:124-134,1991;Gorman et al.,PNAS USA.88:4181-4185,1991;Tempest et al.,Bio/Technology 9:266-271,1991;Co et al.,PNAS USA.88:2869-2873,1991;Carter et al.,PNAS USA.89:4285-4289,1992;及びCo et al.,J Immunol.148:1149-1154,1992により報告されている。一部の実施形態では、ヒト化抗体は、全てのCDR配列(例えば、マウス抗体からの全ての六つのCDRを含むヒト化マウス抗体)を保持する。一部の実施形態では、CDR配列の一部のみが、非ヒト抗体から移植される(Bowers et al.,J.Biol.Chem.288:7688-7696,2013)。特定の実施形態では、ヒト化抗体は、本来の抗体に関して変化される一つ又は複数のCDR(一つ、二つ、三つ、四つ、五つ、六つ)を有し、それらはまた、本来の抗体からの一つ又は複数のCDR「から由来する」一つ又は複数のCDRと呼ばれる。
【0064】
特定の実施形態では、抗体はキメラ抗体である。これに関して、キメラ抗体は、異なる抗体の異種Fc部分に動作可能に連結された、又はそうでなければ融合された抗体の抗原結合断片で構成される。特定の実施形態では、Fcドメイン又は異種Fcドメインはヒト起源である。特定の実施形態では、Fcドメイン又は異種Fcドメインはマウス起源である。他の実施形態では、異種Fcドメインは、IgA(サブクラスIgA1及びIgA2を含む)、IgD、IgE、IgG(サブクラスIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4を含む)、及びIgMを含む、親抗体とは異なるIgクラスからであり得る。さらなる実施形態では、異種Fcドメインは、異なるIgクラスの一つ又は複数からのCH2及びCH3ドメインで構成され得る。ヒト化抗体に関して上に記述するように、キメラ抗体の抗原結合断片は、本明細書中に記載される抗体のCDRの一つ又は複数のみを含み得る(例、本明細書中に記載される抗体の1、2、3、4、5、又は6のCDR)、又は可変ドメイン全体を含み得る(VL、VH、又は両方)。
【0065】
用語「結合」は、例えば、相互作用、例えば塩架橋及び水架橋などを含む、共有結合、静電、疎水性、ならびにイオン及び/又は水素結合の相互作用に起因する、二つの分子間の直接的な会合を指す。
【0066】
「コード配列」により、遺伝子のポリペプチド産物についてのコードに寄与する任意の核酸配列を意味する。対照的に、用語「非コード配列」は、遺伝子のポリペプチド産物についてのコードに直接的に寄与しない任意の核酸配列を指す。
【0067】
本明細書全体を通して、文脈が他に要求しない限り、単語「含む(comprise)」、又はバリエーション、例えば「含む(comprises)」もしくは「含んでいる(comprising)」などは、記載されたエレメントもしくは整数、又はエレメントもしくは整数の群の包含を意味し、しかし、任意の他のエレメントもしくは整数又はエレメントもしくは整数の群の除外を意味しないと理解されるであろう。
【0068】
「からなる(consising of)」は、語句「consisting of」に続く全てを含むことを意味し、限定されない。このように、語句「からなる(consisting of)」は、列挙されたエレメントが要求される又は必須であること、及び他のエレメントが存在しないであろうことを示す。「本質的になる(consisting essentially of)」により、語句の後に列挙された任意のエレメントを含むこと、及び列挙されたエレメントについて本開示中で特定される活性又は作用に干渉又は寄与しない他のエレメントに限定されることを意味する。このように、語句「本質的になる(consisting essentially of)」は、列挙されたエレメントが要求される、又は必須であること、しかし、他のエレメントは任意であり、それらが、列挙されたエレメントの活性又は作用に実質的に影響を及ぼすか否かに依存して存在し得る、又は存在しないであろうことを示す。
【0069】
抗体の文脈における用語「エフェクター機能」、又は「ADCCエフェクター機能」は、例えば、古典的補体経路の活性化を含み、又はFc受容体の会合を通じて、免疫系の他のアームと会合するその抗体の能力を指す。補体依存性経路は、C1複合体を伴うC1qと、クラスター化抗体Fcドメインとの相互作用により主に駆動される。抗体依存性細胞傷害(ADCC)は、それ自体が標的細胞に結合されるIgGのFc領域に結合するエフェクター細胞(ナチュラルキラー細胞、マクロファージ、単球、及び好酸球)の表面上でのFc受容体(FcR)の相互作用により主に駆動される。Fc受容体(FcR)は、抗体媒介性(液性)免疫応答を細胞エフェクター機能に接続する重要な免疫調節受容体である。免疫グロブリンの全てのクラスについての受容体が同定されており、FcγR(IgG)、FcεRI(IgE)、FcαRI(IgA)、FcμR(IgM)、及びFcδR(IgD)を含む。白血球上に見出されるヒトIgGについては、少なくとも三つの受容体クラスがある:CD64(FcγRI)、CD32(FcγRIIa、FcγRIIb、及びFcγRIIc)、ならびにCD16(FcγRIIIa及びFcγRIIIb)。FcγRIは、高親和性受容体(ナノモル範囲KD)として分類される一方で、FcγRII及びFcγRIIIは、低~中間親和性(マイクロモル範囲KD)である。Fc結合時に、シグナル伝達経路が誘発され、それは、様々な物質、例えば溶解酵素、パーフォリン、グランザイム、及び腫瘍壊死因子などの分泌をもたらし、それらは、標的細胞の破壊において媒介する。ヒトIgGサブタイプについて様々であるADCCエフェクター機能のレベル。これは、アロタイプ及び特異的FcvRに依存的であるが、単純な用語では、ADCCエフェクター機能は、ヒトIgG1及びIgG3については「高」、ならびにIgG2及びIgG4については「低」である。
【0070】
用語「エンドトキシンを含まない」又は「実質的にエンドトキシンを含まない」は、一般的に、最大微量(例、対象に対して臨床的に有害な生理学的効果を有さない量)のエンドトキシン、及び好ましくは検出不可能な量のエンドトキシンを含む組成物、溶媒、及び/又は容器に関する。エンドトキシンは、特定の微生物、例えば細菌、典型的にはグラム陰性細菌などに関連付けられる毒素であるが、エンドトキシンはグラム陽性細菌、例えばリステリア・モノサイトゲネスなどにおいて見出され得る。最も普遍的なエンドトキシンは、様々なグラム陰性細菌の外膜中に見出されるリポ多糖類(LPS)又はリポオリゴ糖類(LOS)であり、それらは、これらの細菌が疾患を起こす能力における中心的な病原性特色を表す。ヒトにおける少量のエンドトキシンは、他の有害な生理学的効果の中でもとりわけ、発熱、血圧の低下、ならびに炎症及び凝固の活性化を産生し得る。
【0071】
従って、医薬品産生では、薬物産物及び/又は薬物容器から大半又は全ての微量のエンドトキシンを除去することがしばしば望ましい。なぜなら、少量でも、ヒトにおいて有害効果を起こし得るためである。脱水素オーブンがこの目的のために使用され得る。なぜなら、300℃を超える温度が、典型的には、大半のエンドトキシンを分解するために要求されるためである。例えば、一次包装材料、例えばシリンジ又はバイアルなどに基づいて、250℃のガラス温度及び30分の保持時間の組み合わせは、しばしば、エンドトキシンレベルにおける3対数の低下を達成するのに十分である。エンドトキシンを除去する他の方法が企図され、例えば、本明細書中に記載され、当技術分野において公知のクロマトグラフィー及び濾過方法を含む。
【0072】
エンドトキシンは、当技術分野において公知のルーチン的な技術を使用して検出することができる。例えば、リムルスアメボサイト溶解アッセイは、カブトガニからの血液を利用し、エンドトキシンの存在を検出するための非常に高感度のアッセイである。このテストでは、非常に低いレベルのLPSが、この反応を増幅する強力な酵素カスケードに起因して、リムル溶解物の検出可能な凝固を起こし得る。エンドトキシンはまた、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)により定量化することができる。実質的にエンドトキシンを含まないように、エンドトキシンレベルは、約0.001、0.005、0.01、0.02、0.03、0.04、0.05、0.06、0.08、0.09、0.1、0.5、1.0、1.5、2、2.5、3、4、5、6、7、8、9、又は10EU/mg未満の活性化合物であってもよい。典型的には、1ngのリポ多糖類(LPS)は、約1~10EUに相当する。
【0073】
用語「エピトープ」は、免疫グロブリン又はT細胞受容体への特異的な結合が可能な、任意の決定基、好ましくはポリペプチド決定基を含む。エピトープは、抗体により結合される抗原の領域を含む。特定の実施形態では、エピトープ決定基は、分子の化学的に活性な表面分類、例えばアミノ酸、糖側鎖、ホスホリル、又はスルホニルなどを含み、特定の実施形態では、特定の三次元構造特徴、及び/又は特定の電荷特徴を有し得る。エピトープは、抗原、例えば、IL-11Rαポリペプチドの一次構造に関して連続的又は非連続的であり得る。特定の実施形態では、エピトープは、本明細書中に記載される参照配列(例、表B1を参照のこと)又は標的分子の約、少なくとも約、又は約3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、又は20以下の連続アミノ酸(即ち、直鎖状エピトープ)又は非連続アミノ酸(即ち、立体構造エピトープ)を含む、又はそれらからなる、又はそれから本質的になる。
【0074】
「エピトープ」は、結合タンパク質の可変領域結合ポケットと相互作用する、結合相互作用を形成することが可能な抗原又は他の高分子のその部分を含む。そのような結合相互作用は、CDRの一つ又は複数のアミノ酸残基との分子間接触として現れ得る。抗原結合は、CDR3又はCDR3対を含み得る。エピトープは、直鎖状ペプチド配列(即ち、「連続的」)であることができ、又は非連続的アミノ酸配列(即ち、「立体構造的」又は「不連続的」)で構成されることができる。結合タンパク質は、一つ又は複数のアミノ酸配列を認識することができ;従って、エピトープは、1を上回る異なるアミノ酸配列を定義することができる。結合タンパク質により認識されるエピトープは、当業者に周知のペプチドマッピング及び配列分析技術により決定することができる。「潜在性エピトープ」又は「潜在性結合部位」は、曝露されない又は未改変ポリペプチド内での認識から実質的に保護されるが、しかし、変性又はタンパク質分解ポリペプチドの結合タンパク質により認識されることが可能であるタンパク質配列のエピトープ又は結合部位である。未改変ポリペプチド構造中で曝露されない、又は部分的にのみ曝露されるアミノ酸配列は、潜在的な潜在性エピトープである。エピトープが曝露されない、又は部分的にのみ曝露される場合、次に、それは、ポリペプチドの内部内に埋め込まれる可能性が高い。候補潜在性エピトープは、例えば、未改変ポリペプチドの三次元構造を検証することにより同定することができる。
【0075】
用語「最大有効濃度の半分」又は「EC50」は、一部の特定された曝露時間後にベースラインと最大値の間の途中で応答を誘導する、本明細書中に記載される薬剤(例、抗体)の濃度を指し;段階用量応答曲線のEC50は、従って、その最大効果の50%が観察される化合物の濃度を表す。EC50はまた、インビボで最大効果の50%を得るために要求される血漿濃度を表す。同様に、「EC90」は、その最大効果の90%が観察される薬剤又は組成物の濃度を指す。「EC90」は、「EC50」及びヒルスロープから計算することができる、又はそれは、当技術分野におけるルーチン的な知識を使用して、データから直接決定することができる。一部の実施形態では、薬剤(例、抗体)のEC50は、約0.01、0.05、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、50、60、70、80、90、100、200、又は500n未満である。一部の実施形態では、薬剤は、約1nM又はそれ以下のEC50値を有する。
【0076】
「免疫応答」は、細胞及び上腕骨、先天的及び適応免疫系からの応答を含む、免疫系から由来する任意の免疫学的応答を意味する。例示的な細胞免疫細胞は、例えば、リンパ球、マクロファージ、T細胞、B細胞、NK細胞、好中球、好酸球、樹状細胞、マスト細胞、単球、及びそれらの全てのサブセットを含む。細胞応答は、例えば、エフェクター機能、サイトカイン放出、食作用、エフェロサイトーシス、転座、輸送、増殖、分化、活性化、抑制、細胞間相互作用、アポトーシスなどを含む。液性応答は、例えば、IgG、IgM、IgA、IgE、応答及びそれらの対応するエフェクター機能を含む。
【0077】
薬剤、例えば抗体などの「半減期」は、薬剤が、その薬理学的、生理学的、又は他の活性の半分を、生物の血清もしくは組織への投与時でのそのような活性に比べて、又は任意の他の定義された時間点に比べて、失うのにかかる時間を指すことができる。「半減期」はまた、薬剤の量もしくは濃度を、生物の血清もしくは組織への投与時でのそのような量もしくは濃度に比べて、又は任意の他の定義された時間点に比べて、生物の血清もしくは組織に投与される開始量の半分だけ低下させるのにかかる時間を指すことができる。半減期は、血清ならびに/あるいは任意の一つ又は複数の選択された組織中で測定することができる。
【0078】
用語「調節(modulating)」及び「変化(altering)」は、典型的には対照に比べて統計的に有意な又は生理学的に有意な量又は程度における、「増加(increasing)」、「増強(enhancing)」、又は「刺激(stimulating)」、ならびに「減少(decreasing)」、「低下(reducing)」、又は「阻害(inhibiting)」を含む。「増加(increased)」、「刺激(stimulated)」、又は「増強(enhanced)」量は、典型的には、「統計的に有意な(statistically significant)」量であり、 組成物なし(例、薬剤の非存在)又は対照組成物により産生される量の1.1、1.2、1.5、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50、60、70、80、90、100倍又はそれ以上(例、500、1000倍)(全ての整数及びその間の範囲、例、1.5、1.6、1.7.1.8を含む)である増加を含み得る。「減少(decreased)」又は「低下(reduced)」又は「阻害(inhibited)」量は、典型的には「統計的に有意な」量であり、 組成物なし(例、薬剤の非存在)又は対照組成物により産生される量における1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は100%減少(全ての整数及びその間の範囲を含む)を含み得る。比較及び「統計的に有意な」量の例が、本明細書中に記載されている。
【0079】
用語「ポリペプチド」、「タンパク質」、及び「ペプチド」は、互換的に使用され、任意の特定の長さに限定されないアミノ酸のポリマーを意味する。用語「酵素」は、ポリペプチド又はタンパク質触媒を含む。この用語は、修飾、例えばミリストイル化、硫酸化、グリコシル化、リン酸化、及びシグナル配列の付加又は欠失などを含む。用語「ポリペプチド」又は「タンパク質」は、アミノ酸の一つ又は複数の鎖を意味し、それにおいて、各鎖が、ペプチド結合により共有結合的に連結されたアミノ酸を含み、それにおいて、当該ポリペプチド又はタンパク質が、ペプチド結合により一緒に非共有結合的及び/又は共有結合的に連結された複数の鎖を含むことができ、天然タンパク質、すなわち、天然細胞及び特異的非組換え細胞、又は遺伝子操作細胞もしくは組換え細胞により産生されるタンパク質を有し、及び天然タンパク質のアミノ酸配列を有する分子、あるいは天然配列の一つ又は複数のアミノ酸からの欠失、それに対する付加、及び/又はその置換を有する分子を含む。特定の実施形態では、ポリペプチドは、一つ又は複数の組換えDNA分子を含む組換え細胞により産生される「組換え」ポリペプチドであり、それは、典型的には、異種ポリヌクレオチド配列、又はそうでなければ細胞中に見出されないポリヌクレオチド配列の組み合わせで作製される。
【0080】
用語「ポリヌクレオチド」及び「核酸」は、mRNA、RNA、cRNA、cDNA、及びDNAを含む。この用語は、典型的には、リボヌクレオチドもしくはデオキシヌクレオチドのいずれか、又はいずれかの型のヌクレオチドの改変形態の少なくとも10塩基長のヌクレオチドのポリマー形態を指す。この用語は、一本鎖及び二本鎖形態のDNAを含む。用語「単離DNA」及び「単離ポリヌクレオチド」及び「単離核酸」は、特定の種の全ゲノムDNAを含まずに単離された分子を指す。従って、ポリペプチドをコードする単離DNAセグメントは、DNAセグメントが得られる種の全ゲノムDNAとは実質的に別に単離される、又はそれを含まずに精製される、一つ又は複数のコード配列を含むDNAセグメントを指す。また、含まれるのは、非コードポリヌクレオチド(例、プライマー、プローブ、オリゴヌクレオチド)であって、それはポリペプチドをコードしない。また、含まれるのは、例えば、発現ベクター、ウイルスベクター、プラスミド、コスミド、ファージミド、ファージ、ウイルス及び同様のものを含む組換えベクターである。
【0081】
追加のコード配列又は非コード配列は、本明細書中に記載されるポリヌクレオチド内に存在してもよいが、しかし、そうである必要はなく、ポリヌクレオチドは、他の分子及び/又は支持材料に連結されてもよいが、しかし、そうである必要はない。それ故に、ポリヌクレオチド又は発現可能なポリヌクレオチドは、コード配列自体の長さにかかわらず、他の配列、例えば、発現制御配列と組み合わされてもよい。
【0082】
「発現制御配列」は、核酸の調節配列、又は対応するアミノ酸、例えばプロモーター、リーダー、エンハンサー、イントロン、RNAについての認識モチーフ、もしくはDNA結合タンパク質、ポリアデニル化シグナル、ターミネーター、内部リボソーム侵入部位(IRES)、分泌シグナル、細胞内局在化シグナル、及び同様のものを含み、それらは、宿主細胞中のコード配列の転写もしくは翻訳、又は細胞内もしくは細胞位置に影響を及ぼす能力を有する。例示的な発現制御配列が、Goeddel;Gene Expression Technology: Methods in Enzymology 185,Academic Press,San Diego,Calif.(1990)において記載されている。
【0083】
「プロモーター」は、細胞中でRNAポリメラーゼに結合し、下流(3’方向)コード配列の転写を開始することが可能なDNA調節領域である。本明細書中で使用される場合、プロモーター配列は、転写開始部位によりその3’末端で境界付けられ、上流(5’方向)に伸長し、バックグラウンドを上回る検出可能なレベルで転写を開始するために必要な最小数の塩基又はエレメントを含む。転写開始部位(ヌクレアーゼS1とのマッピングにより便利に定義される)は、プロモーター配列、ならびにRNAポリメラーゼの結合について関与するタンパク質結合ドメイン(コンセンサス配列)内に見出すことができる。真核生物プロモーターは、しばしば、「TATA」ボックス及び「CAT」ボックスを含むが、しかし、常にではない。原核生物プロモーターは、-10及び-35コンセンサス配列に加えて、シャイン-ダルガノ配列を含む。
【0084】
様々な異なる供給源からの構成的、誘導性、及び抑制性プロモーターを含む多数のプロモーターが、当技術分野において周知である。代表的な供給源は、例えば、ウイルス、哺乳動物、昆虫、植物、酵母、及び細菌細胞型を含み)、これらの供給源からの適切なプロモーターは、オンラインで、又は、例えば、保管所、例えばATCCなど、ならびに他の商業的又は個々の供給源から公的に入手可能な配列に基づいて、容易に利用可能である、又は合成的に作製することができる。プロモーターは、一方向性(即ち、一つの方向において転写を開始する)又は双方向性(即ち、3’又は5’方向のいずれかにおいて転写を開始する)であり得る。プロモーターの非限定的な例は、例えば、T7細菌発現系、pBAD(araA)細菌発現系、サイトメガロウイルス(CMV)プロモーター、SV40プロモーター、RSVプロモーターを含む。誘導性プロモーターは、Tet系(米国特許第5,464,758号及び第5,814,618号)、エクジソン誘導系(No et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.(1996)93(8):3346-3351;T-RExTM系(Invitrogen、カリフォルニア州カールスバッド)、LacSwitch(登録商標)(Stratagene,(カリフォルニア州サンディエゴ)、及びCre-ERTタモキシフェン誘導性リコンビナーゼ系(Indra et al.Nuc.Acid.Res.(1999) 27 (22): 4324-4327;Nuc.Acid.Res.(2000) 28 (23): e99;米国特許第7,112,715号;及びKramer & Fussenegger,Methods Mol.Biol.(2005) 308: 123-144)、又は所望の細胞における発現のための適切な、当技術分野において公知の任意のプロモーターを含む。
【0085】
「発現可能なポリヌクレオチド」は、少なくとも一つのコード配列、ならびに、場合により、少なくとも一つの発現制御配列、例えば、転写及び/又は翻訳調節エレメントを含み、細胞、例えば、対象における細胞中への導入時にコードポリペプチドを発現することができるcDNA、RNA、mRNA、又は他のポリヌクレオチドを含む。
【0086】
発現可能なポリヌクレオチドを送達するために利用することができる様々なウイルスベクターは、アデノウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、ワクシニアウイルスベクター、アデノ随伴ウイルス(AAV)ベクター、及びレトロウイルスベクターを含む。一部の例では、レトロウイルスベクターは、マウス又は鳥類レトロウイルスの派生体である、又はレンチウイルスベクターである。単一の外来遺伝子を挿入することができるレトロウイルスベクターの例は、以下を含むが、しかし、これらに限定されない:モロニーマウス白血病ウイルス(MoMuLV)、ハーベイマウス肉腫ウイルス(HaMuSV)、マウス乳腺腫瘍ウイルス(MuMTV)、SIV、BIV、HIV、及びラウス肉腫ウイルス(RSV)。多数の追加のレトロウイルスベクターが、複数の遺伝子を組み入れることができる。これらのベクターの全てが、遺伝子を、選択マーカーのために移動又は組み入れることができ、形質導入された細胞を同定及び生成することができるようにする。目的のポリペプチド配列を、特定の標的細胞上の受容体についてのリガンドをコードする別の遺伝子とともにウイルスベクター中に挿入することにより、例えば、ベクターを標的特異的にしてもよい。レトロウイルスベクターは、例えば、タンパク質をコードするポリヌクレオチドを挿入することにより標的特異的にすることができる。例証的な標的化は、抗体を使用してレトロウイルスベクターを標的化することにより達成され得る。当業者は、過度の実験を伴うことなく、レトロウイルスゲノム中に挿入されて、レトロウイルスベクターの標的特異的送達を可能にすることができる特定のポリヌクレオチド配列を知っているであろう、又は容易に確認することができる。
【0087】
特定の実施形態では、発現可能なポリヌクレオチドは、改変RNA又は改変mRNAポリヌクレオチド、例えば、非天然RNA類似体である。特定の実施形態では、改変RNA又はmRNAポリペプチドは、一つ又は複数の改変又は非天然塩基、例えば、アデニン(A)、グアニン(G)、シトシン(C)、チミン(T)、及び/又はウラシル(U)以外のヌクレオチド塩基を含む。一部の実施形態では、改変mRNAは、一つ又は複数の改変又は非天然ヌクレオチド間連結を含む。コードされた治療用ポリペプチドを送達するための発現可能なRNAポリヌクレオチドは、例えば、Kormann et al.,Nat Biotechnol.29:154-7,2011;ならびに米国特許出願第2015/0111248号;第2014/0243399号;第2014/0147454号;及び第2013/0245104号において記載されており、それらは参照によりそれらの全体において組み入れられる。
【0088】
本明細書中で言及される用語「単離」ポリペプチド又はタンパク質は、対象タンパク質(1)が、それが典型的には自然において見出されるであろう少なくとも一部の他のタンパク質を含まない、(2)同じ供給源からの、例えば、同じ種からの他のタンパク質を本質的に含まない、 (3)異なる種からの細胞により発現される、(4)少なくとも約50パーセントのポリヌクレオチド、脂質、炭水化物、又はそれが自然において関連付けられる他の材料から分離されている、(5)「単離」タンパク質が自然において会合しているタンパク質の一部と(共有結合的又は非共有結合的な相互作用により)会合していない、(6)自然において会合していないポリペプチドと(共有結合的又は非共有結合的な相互作用により)動作可能に会合されている、又は(7)自然において生じないことを意味する。そのような単離タンパク質は、ゲノムDNA、cDNA、mRNA、もしくは他のRNAによりコードされてもよく、合成起点であってもよく、又はそれらの任意の組み合わせであってもよい。特定の実施形態では、単離タンパク質は、その使用(治療、診断、予防、研究、又はその他)に干渉するであろう、その天然環境中で見出されるタンパク質もしくはポリペプチド、又は他の汚染物質を実質的に含まない。
【0089】
特定の実施形態では、組成物中の任意の所与の薬剤(例、抗体)の純度が定義され得る。例えば、特定の組成物は、タンパク質に基づき又は重量-重量に基づき、少なくとも80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%純粋である薬剤を含んでもよく、例えば、測定される全ての小数及びその間の範囲を含み、ならびに、いかなる手段によっても、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)、化合物を分離、同定、及び定量化するために生化学及び分析化学において頻繁に使用されるカラムクロマトグラフィーの公知の形態により限定されない。
【0090】
用語「参照配列」は、一般的に、核酸コード配列、又はアミノ酸配列を指し、それに対して別の配列が比較されている。本明細書中に記載される全てのポリペプチド配列及びポリヌクレオチド配列が、参照配列として含まれ、名称により記載されるもの、ならびに表及び配列表中に記載されるものを含む。
【0091】
特定の実施形態は、本明細書中に記載されるポリペプチド(例、抗体)の生物学的に活性な「バリアント」及び「断片」、ならびに同をコードするポリヌクレオチドを含む。「バリアント」は、参照ポリペプチド又はポリヌクレオチドに比べて一つ又は複数の置換、付加、欠失、及び/又は挿入を含む(例、表及び配列表を参照のこと)。バリアントポリペプチド又はポリヌクレオチドは、本明細書中に記載されるように、参照配列と少なくとも約50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上の配列同一性又は類似性又は相同性を伴うアミノ酸又はヌクレオチド配列を含み、その参照配列の活性を実質的に保持する。また、含まれるのは、参照配列からなる、あるいは1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150又はそれ以上のアミノ酸又はヌクレオチドの付加、欠失、挿入、又は置換により参照配列とは異なり、その参照配列の活性を実質的に保持する配列である。特定の実施形態では、付加又は欠失は、C末端及び/又はN末端の付加及び/又は欠失を含む。
【0092】
用語「配列同一性」又は、例えば、「少なくとも50%同一の配列」を含み、本明細書中で使用される場合、配列が、比較のウィンドウにわたってヌクレオチド毎に基づき又はアミノ酸毎に基づき同一である程度を指す。このように、「配列同一性のパーセンテージ」は、比較のウィンドウにわたって二つの最適に整列された配列を比較すること、同一の核酸塩基(例、A、T、C、G、I)又は同一のアミノ酸残基(例、Ala、Pro、Ser、Thr、Gly、Val、Leu、Ile、Phe、Tyr、Trp、Lys、Arg、His、Asp、Glu、Asn、Gln、Cys及びMet)が両方の配列中で生じて、一致した位置の数をもたらす位置の数を決定すること、一致した位置の数を、比較のウィンドウ中の位置の総数(即ち、ウィンドウサイズ)により割ること、及び結果を100により乗算して、配列同一性のパーセンテージをもたらすことにより計算してもよい。比較ウィンドウを整列させるための配列の最適なアラインメントが、アルゴリズム(Wisconsin Genetics Software Package Release 7.0,Genetics Computer Group,575 Science Drive Madison,Wis.,USAにおけるGAP、BESTFIT、FASTA、及びTFASTA)のコンピュータ化された実施により、又は選択された様々な方法のいずれかにより生成される検査及び最良のアラインメント(即ち、比較ウィンドウにわたる最も高いパーセンテージ相同性をもたらす)により行われてもよい。参照がまた、例えば、Altschul et al.,Nucl.Acids Res.25:3389,1997により開示されるように、プログラムのBLASTファミリーに対して作られ得る。
【0093】
用語「溶解度」は、液体溶媒中に溶解して、均質な溶液を形成するための、本明細書中に提供される薬剤(例、抗体)の特性を指す。溶解度は、典型的には、溶媒の単位容積あたりの溶質の質量(溶媒1kgあたりの溶質のg、dLあたりのg(100mL)、mg/mlなど)、モル濃度、モル濃度、モル分画、又は他の濃度の類似の記載のいずれかによる濃度として表現される。溶媒の量あたりで溶解することができる溶質の最大平衡量は、温度、圧力、pH、及び溶媒の性質を含む、特定の条件下でのその溶媒中での溶質の溶解度である。特定の実施形態では、溶解度は、生理学的pH、又は他のpH、例えば、pH5.0、pH6.0、pH7.0、pH7.4、pH7.6、pH7.8、もしくはpH8.0(例、約pH5~8)で測定される。特定の実施形態では、溶解度は、水又は生理学的緩衝液、例えばPBSもしくはNaClなど(NaPO4を伴う又は伴わない)中で測定される。特定の実施形態では、溶解度は、比較的低いpH(例、pH6.0)及び比較的高い塩(例、500mM NaCl及び10mM NaPO4)で測定される。特定の実施形態では、溶解度は、生物学的液体(溶媒)、例えば血液又は血清などの中で測定される。特定の実施形態では、温度は、約室温(例、約20、21、22、23、24、25℃)又は約体温(37℃)であることができる。特定の実施形態では、薬剤は、室温で又は37℃で少なくとも約0.1、0.2、0.3、0.4、0.5、0.6、0.7、0.8、0.9、1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、40、50、60、70、80、90又は100mg/mlの溶解度を有する。
【0094】
「対象」もしくは「それを必要とする対象」又は「患者」もしくは「それを必要とする患者」は、哺乳動物対象、例えばヒト対象などを含む。
【0095】
「実質的に」又は「本質的に」は、ほぼ全く又は完全に、例えば、一部の所与の量の95%、96%、97%、98%、99%、又はそれ以上を意味する。
【0096】
「統計的に有意」により、それは、結果が偶然により生じた可能性が低いことを意味する。統計的有意性は、当技術分野において公知の任意の方法により決定することができる。一般に使用される有意性の尺度は、p値を含み、それは、帰無仮説が真である場合に、観察された事象が生じるであろう頻度又は確率である。得られたp値が有意水準よりも小さい場合、次に帰無仮説は拒絶される。単純な場合では、有意水準は、0.05又はそれ以下のp値で定義される。
【0097】
「治療応答」は、一つ又は複数の治療剤の投与に基づく症状の改善(持続するか否かにかかわらず)を指す。
【0098】
本明細書中で使用される場合、用語「治療有効量」、「治療用量」、「予防的有効量」、又は「診断有効量」は、投与後に所望の生物学的応答を誘発するために必要な薬剤(例、抗IL-11Rα抗体、免疫療法剤)の量である。
【0099】
本明細書中で使用される場合、対象(例、哺乳動物、例えばヒトなど)又は細胞の「処置」は、個体又は細胞の自然な経過を変化させる試みにおいて使用される任意の種類の介入である。処置は、限定されないが、医薬組成物の投与を含み、予防的に、又は病理学的事象の開始もしくは病因的薬剤との接触に続いて、のいずれかに実施され得る。また、含まれるのは、予防的処置であって、それは、処置される疾患もしくは状態の進行の速度を低下させること、その疾患もしくは状態の発症を遅延させること、又はその発症の重症度を低下させることに向けることができる。「処置」又は「予防」は、疾患もしくは状態、又はその関連症状の完全な根絶、治癒、又は防止を必ずしも示さない。
【0100】
用語「野生型」は、集団において最も頻繁に観察され、このように、遺伝子の「正常」又は「野生型」形態で任意に設計される遺伝子又は遺伝子産物(例、ポリペプチド)を指す。
【0101】
本明細書中の各実施形態は、他に明示的に記述されない限り、すべての他の実施形態に準用されるべきである。
【0102】
抗IL-11Rα抗体
特定の実施形態は、抗体、及びそれらの抗原結合断片を含み、それらは、インターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合する。一部の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、IL-11Rαの、そのリガンドであるインターロイキン11(IL-11)への結合を調節する(例、それに干渉する、拮抗する、阻害する)。特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、相補性決定領域V
HCDR1、V
HCDR2、及びV
HCDR3配列を含む重鎖可変領域(V
H)、ならびに相補性決定領域V
LCDR1、V
LCDR2、及びV
LCDR3配列を含む軽鎖可変領域(V
L)により特徴付けられる、又はそれらを含む。例示的なV
H配列、V
HCDR1配列、V
HCDR2配列、V
HCDR3配列、V
L配列、V
LCDR1配列、V
LCDR2配列、及びV
LCDR3配列を、以下の表A1及び表A2中に提供する。
【表1-1】
【表1-2】
【表1-3】
【表1-4】
【表1-5】
【0103】
このように、特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、
表A1から選択される相補性決定領域VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列を含むVH配列、ならびにIL-11Rαに結合するそのバリアント;及び表A1から選択される相補性決定領域VLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列を含むVL配列、ならびにIL-11Rαに結合するそのバリアント。
【0104】
特定の実施形態では、CDR配列は、以下の通りである:
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号1~3を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号4~6を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号7~9を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号10~12を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号13~15を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号16~18を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号19~21を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号22~24を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号25~27を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号28~30を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号31~33を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号34~36を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号37~39を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号40~42を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号43~45を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号46~48を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号49~51を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号52~54を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号55~57を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号58~60を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号61~63を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号64~66を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号67~69を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号70~72を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号73~75を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号76~78を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号79~81を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号82~84を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号85~87を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号88~90を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号91~93を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号94~96を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号97~99を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号100~102を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号103~105を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号106~108を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号109~111を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号112~114を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号115~117を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号118~120を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号121~123を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号124~126を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号127~129を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号130~132を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号133~135を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号136~138を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号139~141を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号142~144を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号145~147を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号148~150を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号151~153を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号154~156を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号157~159を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号160~162を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号163~165を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号166~168を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号169~171を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号172~174を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号175~177を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号178~180を含み;
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号181~183を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号184~186を含み;又は
VHCDR1、VHCDR2、及びVHCDR3配列は、それぞれ、配列番号187~189を含み、ならびにVLCDR1、VLCDR2、及びVLCDR3配列は、それぞれ、配列番号190~192を含む。
【0105】
また、含まれるのは、前述のCDRのマイナーバリアントである。例示的なバリアントは、IL-11Rαに結合し、個々のCDRの任意の一つ又は複数、例えば、本明細書中に記載されるVHCDR1、VHCDR2、VHCDR3、VLCDR1、VLCDR2、及び/又はVLCDR3配列の任意の一つ又は複数における1、2、又は3つの総変化を有する。例示的な「変化」は、アミノ酸置換、付加、及び欠失を含む。
【0106】
例示的なV
H及びV
L配列を以下の表A2中に提供する。
【表2-1】
【表2-2】
【表2-3】
【表2-4】
【表2-5】
【表2-6】
【表2-7】
【表2-8】
【0107】
このように、特定の実施形態では、抗体、又はその抗原結合断片は、IL-11Rαに結合し、表A2から選択されるVH配列及び対応するVL配列を含む。特定の実施形態では、VHは、表A2から選択される配列と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、例えば、それにおいて、VHは、一つ又は複数のフレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有する。一部の実施形態では、VLは、表A2から選択される配列と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、例えば、それにおいて、VLは、一つ又は複数のフレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有する。
【0108】
一部の実施形態では、抗体又は抗原結合断片のVH及びVLは、以下の通りである:
VHは、配列番号193と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号194と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号195と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号196と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号197と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号198と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号199と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号200と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号201と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号202と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号203と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号204と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号205と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号206と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号207と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号208と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号209と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号210と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号211と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号212と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号213と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号214と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号215と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号216と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号217と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号218と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号219と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号220と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号221と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号222と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号223と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号224と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号225と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号226と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号227と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号228と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号229と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号230と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号231と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号232と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号233と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号234と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号235と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号236と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号237と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号238と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号239と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号240と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号241と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号242と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号243と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号244と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号245と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号246と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号247と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号248と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号249と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号250と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号251と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号252と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;
VHは、配列番号253と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号254と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み;あるいは
VHは、配列番号255と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含み、及びVLは、配列番号256と少なくとも80、85、90、95、97、98、99、又は100%同一の配列を含む。
【0109】
また、含まれるのは、IL-Rαに結合するそのバリアント、例えば、前述のVH及び/又はVL配列の任意の一つ又は複数の一つ又は複数のフレームワーク領域中に1、2、3、4、5、6、7、8、9、又は10の変化を有するバリアントである。例示的な「変化」は、アミノ酸置換、付加、及び欠失を含む。
【0110】
上述のように、本明細書中に記載される抗体又はその抗原結合断片は、IL-11Rα、例えば、膜結合IL-11Rαに結合する。特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、ヒトIL-11Rα、又はその領域もしくは断片に結合する。ヒトIL-11Rαのアミノ酸配列を以下の表B1中に提供する。
【表3】
【0111】
このように、特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、表B1中のIL-11Rα配列、例えば、ヒトIL-11Rα配列に結合する。特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、例えば、配列番号257のおよそ残基112~219で構成されるヒトIL-11Rα中のフィブロネクチンIII型ドメインに結合する。
【0112】
一部の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片が、約1pM~約10pM~約500pM、又は約、少なくとも約、又は約1未満、5、10、20、30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、300、400、又は500pMの結合親和性を伴って、あるいは、場合により、約1pM~約500pM、約1pM~約400pM、約1pM~約300pM、約1pM~約200pM、約1pM~約100pM、約1pM~約50pM、約1pM~約40pM、約1pM~約30pM、約1pM~約20pM、約1pM~約10pM、約1pM~約5pM、約5pM~約500pM、約5pM~約400pM、約5pM~約300pM、約5pM~約200pM、約5pM~約100pM、約5pM~約50pM、約5pM~約40pM、約5pM~約30pM、約5pM~約20pM、約5pM~約10pM、約10pM~約500pM、約10pM~約400pM、約10pM~約300pM、約10pM~約200pM、約10pM~約100pM、約10pM~約50pM、約10pM~約40pM、約10pM~約30pM、約10pM~約20pM、又は約20pM~約500pM、約20pM~約400pM、約20pM~約300pM、約20pM~約200pM、約20pM~約100pM、約20pM~約50pM、約20pM~約40pM、約20pM~約30pM、又は約30pM~約500pM、約30pM~約400pM、約30pM~約300pM、約30pM~約200pM、約30pM~約100pM、約30pM~約50pM、又は約30pM~約40pMの範囲の親和性を伴って、ヒトIL-11Rαに結合する。特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、TS7抗体及び8E2抗体のものに比べて、ヒトIL-11Rαについての増加した結合親和性を有する(例えば、米国特許第9,796,782号;第9,340,618号を参照のこと)。
【0113】
一部の実施形態では、抗体、又はその抗原結合断片は、IL-11Rαアンタゴニストである。一部の例では、抗体、又はその抗原結合断片は、IL-11RαとそのリガンドIL-11の間での結合及び/又はシグナル伝達活性に拮抗する。一部の実施形態では、抗体、又はその抗原結合断片は、例えば、細胞ベースのアッセイにおいて、IL-11RαとIL-11の間での結合及び/又はシグナル伝達活性に拮抗する又はそれを約、または少なくとも約10~1000%(例、約20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、90、100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000%以上)低下させる。一部の実施形態では、抗IL-11Rα抗体又はその抗原結合断片は、IL-11媒介性STAT3リン酸化を低下させる。例示的なアッセイでは、IL-11Rα及びgp130を発現する細胞は、IL-11Rα結合タンパク質の存在又は非存在において、IL-11の存在において培養される。STAT3リン酸化のレベルを次に、リン酸化STAT3について特異的な抗体を使用して、ウェスタンブロッティング又はFACSにより評価する。FACSを使用する例示的なアッセイが、Dams-Kozlowska et al.,BMC Biotechnol,12:8,2012において記載されている。特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、TS7抗体及び8E2抗体のものに比べて、IL-11シグナル伝達アンタゴニストとして増加した効力を有する(例えば、米国特許第9,796,782号;第9,340,618号を参照のこと)。特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、IL-11シグナル伝達に関して検出可能なアゴニスト活性を有さない。
【0114】
一部の実施形態では、抗体、又はその抗原結合断片は、例えば、gp130を伴うIL-11Rα二量体化又は複合体形成を阻害する、又はそうでなければ低下させる。特定の実施形態では、抗体、又はその抗原結合断片は、例えば、細胞ベースのアッセイにおいて、IL-11Rα二量体化又は複合体形成を、約又は少なくとも約10~1000%(例、約20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、90、100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000%以上)だけ阻害する、又はそうでなければ低下させる。
【0115】
一部の実施形態では、抗IL-11Rα抗体又はその抗原結合断片は、IL-11の存在において培養される、IL-11Rα及びgp130を発現する細胞(例、BaF3細胞、B9細胞、T10細胞)(例、両方のタンパク質を自然に発現する又は発現するように改変された細胞)の増殖を低下させる。細胞増殖を評価するための方法は、当技術分野において公知であり、例えば、MTT低下及び/又はチミジン組み入れを含む。B9細胞又はT10細胞を用いたアッセイが記載されている(Dams-Kozlowska et al.,BMC Biotechnol,12: 8,2012;及びYokote et al.,J AOAC,83:1053-1057,2000を参照のこと)。T10細胞については、増殖を、テトラゾリウム化合物、4-[3-(4-ヨードフェニル)-2-(4-ニトロフェニル)-2H-5-テトラゾリオ]-1,3-ベンゼンジスルホネート(WST-1)の低下を比色的に検出することにより測定することができる。IL-11Rα結合タンパク質の非存在において観察されるレベルと比較して、増殖のレベルを低下させるIL-11Rα結合タンパク質は、IL-11Rシグナル伝達を低下させる、又は他の方法で低下させると考えられる。
【0116】
一部の実施形態では、抗IL-11Rα抗体又はその抗原結合断片は、癌細胞(例えば、胃癌細胞、急性骨髄性白血病(AML)細胞)のIL-11媒介性増殖を低下させる。例示的なアッセイでは、癌細胞(例、AGN、MKN45胃癌細胞)は、IL-11Rα結合タンパク質の存在又は非存在において、IL-11の存在において培養される。AML細胞については、細胞はまた、G-CSFの存在において培養され得る。細胞の増殖は次に、例えば、本明細書中で考察されるように、標準的な技術を使用して、及び/又はAML細胞の場合においてL-CFUの形成を評価することにより測定される。本開示に適応可能な例示的アッセイは、Zhang et al.,Int J Biol Sci.,8: 383-393,2012及びKimura et al.,Leukemia,13: 1018-1027,1999に含まれる。
【0117】
単に例証の目的のために、本明細書中に記載される、IL-11Rαと抗体、又はその抗原結合断片の間での結合相互作用、又はIL-11RαとIL-11の間での結合/シグナル伝達を、様々なルーチン的な方法を使用して検出及び定量化することができ、Biacore(登録商標)アッセイ(例えば、適切にタグ付けされた可溶性試薬を用いて、センサーチップに結合される)、細胞表面上にIL-11Rαを発現する細胞(天然、又は組換え体のいずれか)を用いたFACS分析、免疫アッセイ、蛍光染色アッセイ、ELISAアッセイ、及びマイクロ熱量測定アプローチ、例えばITC(等温滴定熱量測定)などを含む。同様に、抗IL-11Rα抗体の機能特性は、当業者に公知の様々な方法、親和性/結合アッセイ(例えば、表面プラズモン共鳴、競合阻害アッセイ);細胞傷害性アッセイ、細胞生存アッセイ、細胞増殖もしくは分化アッセイ、インビトロもしくはインビボモデルを使用した癌細胞及び/又は腫瘍成長阻害を使用して評価され得る。他のアッセイは、正常なIL-11Rα媒介性応答を遮断する、本明細書中に記載される抗体の能力をテストし得る。本明細書中に記載される抗体はまた、インビトロ及びインビボ有効性についてテストされてもよい。そのようなアッセイは、当業者に公知の十分に確立されたプロトコル(例、Current Protocols in Molecular Biology (Greene Publ.Assoc.Inc.& John Wiley & Sons,Inc.,NY,NY);Current Protocols in Immunology (Edited by: John E.Coligan,Ada M.Kruisbeek,David H.Margulies,Ethan M.Shevach,Warren Strober 2001 John Wiley & Sons,NY,NYを参照のこと);又は市販のキットを使用して実施され得る。
【0118】
特定の実施形態では、抗体、又はその抗原結合断片のFc領域は、IgA(サブクラスIgA1及びIgA2を含む)、IgD、IgE、IgG(サブクラスIgG1、IgG2、IgG3、及びIgG4を含む)、あるいはIgM Fcドメイン、場合によりヒトFcドメイン、あるいはそのハイブリッド及び/又はバリアントを含む、それからなる、又はそれから本質的になる。特定の実施形態では、Fc領域は、ヒトIgG1又はIgG4からのFc(例、Allberse and Schuurman,Immunology.105:9-19,2002を参照のこと)、又はその断片もしくはバリアントを含む、それからなる、又はそれから実質的になる。以下の表F1は、ヒトIgG4からの例示的な配列(CH1、ヒンジ(下線)、CH2、及びCH3領域)を提供する。用いることができるバリアントIgG4配列の例は、S228P/S241Pバリアントを含む。
【表4】
【0119】
特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、野生型Fc領域に比べて、変化した特性又は生物学的活性を有するものを含む、バリアント又はそうでなければ改変Fc領域を含む。改変Fc領域の例は、例えば、野生型配列に対する一つ又は複数のアミノ酸の置換、挿入、欠失、又は切断による変異配列を有する領域、異なる免疫グロブリンクラス/サブクラスからのドメインで構成されるハイブリッドFcポリペプチド、変化させたグリコシル化/シアリル化パターンを有するFcポリペプチド、及び、例えば、ビオチニル化(例えば、米国特許出願第2010/0209424号を参照のこと)、リン酸化、硫酸化など、又は前述の任意の組み合わせにより改変又は誘導体化されるFcポリペプチドを含む。そのような改変は、一つ又は複数の特定のFcR(例、FcγRI、FcγRIIa、FcγRIIb、FcγRIIc、FcγRIIIa、FcγRIIIb、FcRn)に対するFc領域の結合特性、その薬物動態特性(例、安定性又は半減期、バイオアベイラビリティ、組織分布、分布の容積、濃度、除去速度定数、除去速度、曲線下面積(AUC)、クリアランス、Cmax、tmax、Cmin、変動)、その免疫原性、その補体固定又は活性化、ならびに/あるいはFc領域のCDC/ADCC/ADCP関連活性を、本明細書中に記載される他の特性の中でもとりわけ、抗体又はその抗原結合断片の対応する野生型Fc配列に対して変化(例、増加、減少)させるために用いることができる。含まれるのは、ヒト及び/又はマウス起源の改変Fc領域である。
【0120】
特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、ハイブリッドFc領域、例えば、異なる種(例、ヒト、マウス)、異なるIgクラス、及び/又は異なるIgサブクラスの免疫グロブリンからのFcドメイン(例、ヒンジ、CH2、CH3、CH4)の組み合わせを含むFc領域を含む。また、含まれるのは、誘導体化又はそうでなければ改変Fc領域を含む抗体又はその抗原結合断片である。特定の態様では、Fc領域は、例えば、野生型又は天然Fc領域に比べて、リン酸化、硫酸化、アクリル化、グリコシル化、メチル化、ファルネシル化、アセチル化、アミド化、及び同様のものにより改変される。特定の実施形態では、Fc領域は、野生型もしくは天然グリコシル化パターンを含む、又は代替的に、それは、天然形態に比べて増加したグリコシル化、天然形態に比べて減少したグリコシル化を含む、又は、それは完全に脱グリコシル化される。改変Fcグリコフォームの一例として、Fc領域の減少したグリコシル化は、第一の補体成分C1のC1q領域への結合、ADCC関連活性における減少、及び/又はCDC関連活性における減少を低下させる。特定の実施形態は、このように、脱グリコシル化又は非グリコシル化Fc領域を用いる。例示的な非グリコシル化Fc領域の産生については、例えば、WO2005/047337を参照のこと。Fc領域グリコフォームの別の例は、Kabat et al.ナンバリングシステムに従って、Q295位置をシステイン残基で置換することにより生成される(例えば、米国特許出願第2010/0080794号を参照のこと)。特定の実施形態は、Fc領域を含み、ここで、Fc領域中の糖タンパク質の約80~100%が、フコースを欠く成熟コア炭水化物構造を含む(例えば、米国特許出願第2010/0255013号を参照のこと)。一部の実施形態は、フコシル化のレベルを低下させるために、例えば、FcγRI、FcγRIa、又はFcγRIIIaについての親和性を増加させるために、ならびに/あるいはFcγRIIa発現細胞による貪食を改善させるために、置換又は欠失により最適化されるFc領域を含む(米国特許出願第2010/0249382号及び第2007/0148170号を参照のこと)。
【0121】
修飾Fcグリコフォームの別の例として、抗体又はその抗原結合断片のFc領域は、オリゴマンノース型N-グリカンを含んでもよく、場合により、以下の一つ又は複数を有する:複合体型N-グリカンを含む対応するFc領域に比べて、増加したADCCエフェクター活性、FcγRIIIA(及び特定の他のFcR)についての増加した結合親和性、IL-11Rαポリペプチドの標的についての類似の又は増加した結合特異性、IL-11Rαポリペプチドの標的についての類似の又はより高い結合親和性、ならびに/あるいはマンノース受容体についての類似の又はより低い結合親和性(例えば、米国特許出願第2007/0092521号及び米国特許第7,700,321号を参照のこと)。別の例として、FcγRについてのFc領域の増強した親和性は、操作された又はバリアント細胞株における抗体の発現により生成された操作グリコフォームを使用して達成されている(例えば、Umana et al.,Nat Biotechnol.17:176-180,1999;Davies et al.,Biotechnol Bioeng.74:288-294,2001;Shields et al.,J Biol Chem.277:26733-26740,2002;Shinkawa et al.,2003,J Biol Chem.278:3466-3473,2003;及び米国特許出願第2007/0111281号を参照のこと)。特定のFc領域グリコフォームは、増加した割合のN-グリコシド結合型複合体糖鎖を含み、それは、糖鎖の還元末端でN-アセチルグルコサミンの6位に結合したフコースの1位を有さない(例えば、米国特許出願第2010/0092997号を参照のこと)。特定の実施形態は、α-2,6連結によりそれぞれの末端シアル酸部分に連結された少なくとも一つのガラクトース部分でグリコシル化されるIgG Fc領域を含んでもよく、場合により、ここで、Fc領域は、対応する、野生型Fc領域に比べてより高い抗炎症活性を有する(米国特許出願第2008/0206246号を参照のこと)。これらの及び関連する、変化したグリコシル化アプローチのいくつかは、本明細書中に記載されるように、FcR、例えばFcγRIIIなどに選択的に結合し、ADCCを媒介し、及びFc領域の他の特性を改変させるFc領域の能力の実質的な増強を生成している。
【0122】
抗体又はその抗原結合断片の特定のバリアント、断片、ハイブリッド、又はそうでなければ改変Fc領域は、対応する、野生型Fc配列(例、同じ種、同じIgクラス、同じIgサブクラス)に比べて、一つ又は複数のFcRへの変化した結合、及び/又はエフェクター機能への対応する変化を有し得る。例えば、そのようなFc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcε受容体、及び/又は新生児Fc受容体の一つ又は複数への増加した結合を有し得る。他の実施形態では、バリアント、断片、ハイブリッド、又は修飾Fc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcε受容体、及び/又は新生児Fc受容体の一つ又は複数への減少した結合を有し得る。特定のFcRは、本明細書中の他の箇所に記載されている。
【0123】
一部の実施形態では、抗体は、対応する、野生型Fc配列に比べて、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcε受容体、及び/又は新生児Fc受容体の一つ又は複数への結合を増加させるための一つ又は複数の変異を含む、Fcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、対応する、野生型Fc配列に比べて、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcε受容体、及び/又は新生児Fc受容体の一つ又は複数への結合を増加させるための一つ又は複数の変異を含む、IgG1又はIgG3 Fcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、エフェクター機能を増加させるための一つ又は複数の変異を含むFcドメインを含む。一部の実施形態では、少なくとも一つの抗体は、エフェクター機能を増加させるための一つ又は複数の変異を含む、ヒトIgG1及びIgG3から選択されるFcドメインを含む。
【0124】
一部の実施形態では、抗体は、高いエフェクター活性を伴うFcドメインを含む遮断抗体である。一部の実施形態では、遮断抗体は、エフェクター機能を増加させるための一つ又は複数の変異を含む、ヒトIgG1及びIgG3から選択されるFcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、高いエフェクター活性を伴うFcドメインを含む部分遮断抗体である。一部の実施形態では、部分遮断抗体は、エフェクター機能を増加させるための一つ又は複数の変異を含む、ヒトIgG1及びIgG3から選択されるFcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、高いエフェクター活性を伴うFcドメインを含む非遮断抗体である。一部の実施形態では、非遮断抗体は、エフェクター機能を増加させるための一つ又は複数の変異を含む、ヒトIgG1又はIgG3から選択されるFcドメインを含む。
【0125】
一部の実施形態では、抗体は、対応する、野生型Fc配列に比べて、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcε受容体、及び/又は新生児Fc受容体の一つ又は複数への結合を減少させるための一つ又は複数の変異を含むFcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、対応する、野生型Fc配列に比べて、Fcγ受容体、Fcα受容体、Fcε受容体、及び/又は新生児Fc受容体の一つ又は複数への結合を減少させるための一つ又は複数の変異を含むIgG1又はIgG3 Fcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、エフェクター機能を減少させるための一つ又は複数の変異を含むFcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、エフェクター機能を減少させるための一つ又は複数の変異を含むヒトIgG2及びIgG4から選択されるFcドメインを含む。
【0126】
一部の実施形態では、抗体は、低いエフェクター活性を伴うFcドメインを含む遮断抗体である。一部の実施形態では、遮断抗体は、エフェクター機能を減少させるための一つ又は複数の変異を含むヒトIgG2及びIgG4から選択されるFcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、低いエフェクター活性を伴うFcドメインを含む部分遮断抗体である。一部の実施形態では、部分遮断抗体は、エフェクター機能を減少させるための一つ又は複数の変異を含むヒトIgG2及びIgG4から選択されるFcドメインを含む。一部の実施形態では、抗体は、低いエフェクター活性を伴うFcドメインを含む非遮断抗体である。一部の実施形態では、非遮断抗体は、エフェクター機能を減少させるための一つ又は複数の変異を含むヒトIgG2及びIgG4から選択されるFcドメインを含む。
【0127】
変化した(例、増加した、減少した)エフェクター機能/FcR結合を有するFcバリアントの具体的な例が、例えば、米国特許第5,624,821号及び第7,425,619号;米国特許出願第2009/0017023号、第2009/0010921号、及び第2010/0203046号;ならびにWO2000/42072号及びWO2004/016750号において記載されている。特定の例は、298位、333位、及び/又は334位に一つ又は複数の置換、例えば、S298A、E333A、及び/又はK334A(KabatらのEUインデックスのナンバリングに基づく)を有するヒトFc領域を含み、それらは、活性化受容体FcγRIIIaへの結合を増加させ、阻害受容体FcγRIIbへの結合を低下させることが示されている。これらの変異を組み合わせて、FcRへの結合におけるさらなる改善を有する二重及び三重変異バリアントを得ることができる。特定の実施形態は、S298A/E333A/K334A三重変異体を含み、それは、FcγRIIIaへの結合を増加させ、FcγRIIbへの結合を減少させ、及びADCCを増加させた(例、Shields et al.,J Biol Chem.276:6591-6604,2001;及びPresta et al.,Biochem Soc Trans.30:487-490,2002を参照のこと)。また、Umana et al.(上記);及び米国特許第7,662,925号において開示されているように、FcRへの結合を増加させた操作Fcグリコフォームを参照のこと。一部の実施形態は、KabatらのEUインデックスに基づいて、434S、252Y/428L、252Y/434S、及び428L/434Sから選択される一つ又は複数の置換を含むFc領域を含む(米国特許出願第2009/0163699号及び第20060173170号を参照のこと)。
【0128】
特定のバリアント、断片、ハイブリッド、又は改変Fc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、変化したエフェクター機能を有し得る。例えば、そのようなFc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、増加した補体固定又は活性化、増加したClq結合親和性、増加したCDC関連活性、増加したADCC関連活性、ならびに/あるいは増加したADCP関連活性を有し得る。他の実施形態では、そのようなFc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、減少した補体固定又は活性化、減少したClq結合親和性、減少したCDC関連活性、減少したADCC関連活性、ならびに/あるいは減少したADCP関連活性を有し得る。単に一つの例証的な例として、Fc領域は、補体結合部位、例えばC1q結合部位などにおける欠失もしくは置換、及び/又はADCC部位における欠失もしくは置換を含み得る。そのような欠失/置換の例は、例えば、米国特許第7,030,226号において記載されている。多くのFcエフェクター機能、例えばADCCなどは、当技術分野におけるルーチン的な技術に従ってアッセイすることができる(例、Zuckerman et al.,CRC Crit Rev Microbiol.7:1-26,1978を参照のこと)。そのようなアッセイのための有用なエフェクター細胞は、限定されないが、ナチュラルキラー(NK)細胞、マクロファージ、及び他の末梢血単核細胞(PBMC)を含む。代替的に、又は追加的に、特定のFcエフェクター機能は、例えば、Clynes et al.PNAS.95:652-656,1998において記載されている動物モデルを用いることにより、インビボで評価され得る。
【0129】
特定のバリアントハイブリッド、又は改変Fc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、変化した安定性又は半減期を有し得る。特定の実施形態では、そのようなFc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、増加した半減期を有し得る。他の実施形態では、バリアントハイブリッド、又は改変Fc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、減少した半減期を有し得る。半減期は、当技術分野におけるルーチン的な技術、例えば放射性標識、ELISA、又は他の方法などに従って、インビトロ(例、生理学的条件下で)又はインビボで測定することができる。安定性又は半減期のインビボ測定は、血液、血清、血漿、尿、もしくは脳脊髄液を含む一つ又は複数の体液、又は所与の組織、例えば肝臓、腎臓、筋肉、中枢神経系組織、骨などにおいて測定することができる。一例として、FcRnに結合するその能力を変化させる、Fc領域への改変は、インビボでのその半減期を変化させることができる。インビボ薬物動態特性(例、インビボ平均除去半減期)を測定するためのアッセイ、及びFcRnへのその結合を変化させるFc改変の非限定的な例が、例えば、米国特許第7,217,797号及び第7,732,570号;ならびに米国特許出願第US2010/0143254号及び第2010/0143254号において記載されている。
【0130】
安定性又は半減期を変化させる改変の追加の非限定的な例は、Kabatらのナンバリングシステムに従った、CH2ドメイン中の251~256、285~290、及び308~314、ならびにCH3ドメイン中の385~389及び428~436から選択されるアミノ酸残基の一つ又は複数での置換/欠失を含む。米国特許出願第2003/0190311号を参照のこと。具体的な例は、251位でのロイシンでの置換、252位でのチロシン、トリプトファン又はフェニルアラニンでの置換、254位でのスレオニン又はセリンでの置換、255位でのアルギニンでの置換、256位でのグルタミン、アルギニン、セリン、スレオニン、又はグルタミン酸での置換、308位でのスレオニンでの置換、309位でのプロリンでの置換、311位でのセリンでの置換、312位でのアスパラギン酸での置換、314位でのロイシンでの置換、385位でのアルギニン、アスパラギン酸又はセリンでの置換、386位でのスレオニン又はプロリンでの置換、387位でのアルギニン又はプロリンでの置換、389位でのプロリン、アスパラギン又はセリンでの置換、428位でのメチオニン又はスレオニンでの置換、434位でのチロシン又はフェニルアラニンでの置換、433位でのヒスチジン、アルギニン、リジン又はセリンでの置換、ならびに/あるいは436位でのヒスチジン、チロシン、アルギニン又はスレオニンでの置換を含み、それらの任意の組み合わせを含む。そのような改変は、場合により、FcRnについてのFc領域の親和性を増加させ、それにより、対応する、野生型Fc領域に比べて、半減期を増加させる。
【0131】
特定のバリアントハイブリッド、又は改変Fc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、変化した溶解度を有し得る。特定の実施形態では、そのようなFc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、増加した溶解度を有し得る。他の実施形態では、バリアントハイブリッド、又は改変Fc領域は、対応する、野生型Fc配列に比べて、減少した溶解度を有し得る。溶解度は、例えば、当技術分野におけるルーチン的な技術に従って、インビトロ(例、生理学的条件下で)で測定することができる。例示的な溶解度の測定値が、本明細書中の他の箇所に記載されている。
【0132】
バリアントFc領域はまた、例えば、米国特許出願第2003/0118592号において記載されるように、一つ又は複数の変異ヒンジ領域を有することができる。例えば、ヒンジ領域中の一つ又は複数のシステインは、欠失される、又は異なるアミノ酸で置換することができる。変異ヒンジ領域は、システイン残基を含まないことができる、又はそれは、対応する、野生型ヒンジ領域よりも1、2、もしくは3つ少ないシステイン残基を含むことができる。一部の実施形態では、この種類の変異ヒンジ領域を有するFc領域は、野生型Igヒンジ領域に比べて、低下した二量体化能力を示す。
【0133】
特定の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、約pH7.4で、約生理学的pHで、約25℃もしくは室温で、及び/又は約37℃もしくはヒトの体温で(例、インビボ、血清中、所与の組織中、所与の種、例えばラット、マウス、サル、又はヒトなどにおいて)、約又は少なくとも約30分、約1時間、約2時間、約3時間、約4時間、約5時間、約6時間、約12時間、約18時間、約20時間、約24時間、約30時間、約36時間、約40時間、約48時間、約50時間、約60時間、約70時間、約72時間、約80時間、約84時間、約90時間、約96時間、約120時間、又は約144時間もしくはそれ以上、又は約1週間、又は約2週間、又は約3週間、又は約4週間、又は約5週間、又は約6週間もしくはそれ以上の生物学的半減期、あるいは任意の介在する半減期を有し、その間の全ての範囲を含む。
【0134】
一部の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、約又は少なくとも約60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、又は75℃のTmを有する。一部の実施形態では、抗体又はその抗原結合断片は、例えば、PBS(リン酸緩衝生理食塩水)中で約65℃又はそれ以上のTmを有する。
【0135】
一部の実施形態では、一つ又は複数の細胞傷害性又は化学療法薬剤に複合体化された抗体又はその抗原結合断片。細胞傷害性又は化学療法薬剤の一般的な例は、限定を伴わないが、アルキル化剤、抗代謝剤、アントラサイクリン、抗腫瘍抗生物質、白金、I型トポイソメラーゼ阻害剤、II型トポイソメラーゼ阻害剤、ビンカアルカロイド、及びタキサンを含む。細胞傷害性又は化学療法薬剤の具体的な例は、限定を伴わないが、シクロホスファミド、シレンギチド、ロムスチン(CCNU)、メルファラン、プロカルバジン、カルムスチン(BCNU)、エンザスタウリン、ブスルファン、ダウノルビシン、ドキソルビシン、ゲフィチニブ、エルロチニブ イダルビシン、テモゾロミド、エピルビシン、ミトキサントロン、ブレオマイシン、シスプラチン、カルボプラチン、オキサリプラチン、カンプトテシン、イリノテカン、トポテカン、アムサクリン、エトポシド、リン酸エトポシド、テニポシド、テムシロリムス、エベロリムス、ビンクリスチン、ビンブラスチン、ビノレルビン、ビンデシン、CT52923、パクリタキセル、イマチニブ、ダサチニブ、ソラフェニブ、パゾパニブ、スニトニブ、バタラニブ、ゲフチニブ、エルロチニブ、AEE-788、ジクロロ酢酸、タモキシフェン、ファスジル、SB-681323、セマキサニブ、ドネピジル(donepizil)、ガランタミン、メマンチン、リバスチグミン、タクリン、ラシギリン、ナルトレキソン、ルビプロストン、サフィナミド、イストラデフィリン、ピマバンセリン、ピトリサント、イスラジピン、プリドピジン(ACR16)、テトラベナジン、ベキサロテン、酢酸グラチリマー(glatirimer acetate)、フィンゴリモド、及びミトキサントロンを含み、それらの医薬的に許容可能な塩及び酸を含む。細胞傷害性又は化学療法薬剤のさらなる例は、アルキル化剤、例えばチオテパ、シクロホスファミド(CYTOXAN(商標))など;アルキルスルホネート、例えばブスルファン、インプロスルファン及びピポスルファンなど;アジリジン、例えばベンゾドーパ、カルボクオン、メツレドーパ、ウレドーパなど;アルトレタミン、トリエチレンメラミン、トリエチレンホスホルアミド、トリエチレンチオホスホルアミド、及びトリメチロールメラミンを含む、エチレンイミン及びメチルアメラミン;ナイトロジェンマスタード、例えばクロランブシル、クロルナファジン、クロロホスファミド、エストラムスチン、イホスファミド、メクロレタミン、メクロレタミンオキシド塩酸塩、メルファラン、ノベンビチン、フェネステリン、プレドニムスチン、トロホスファミド、ウラシルマスタードなど;ニトロスレア、例えばカルムスチン、クロロゾトシン、フォテムスチン、ロムスチン、ニムスチン、ラニムスチンなど;抗生物質、例えばアクラシノマイシン、アクチノマイシン、オートラマイシン、アザセリン、ブレオマイシン、カクチノマイシン、カリケアマイシン、カラビシン、カルミノマイシン、カルジノフィリン、クロモマイシン、ダクチノマイシン、ダウノルビシン、デトルビシン、6-ジアゾ-5-オキソ-L-ノルロイシン、ドキソルビシン、エピルビシン、エソルビシン、イダルビシン、マルチロマイシン、マイトマイシン、ミコフェノール酸、ノガラマイシン、オリボマイシン、ペプロマイシン、ポトフィロマイシン、ピューロマイシン、クエラマイシン、ロドルビシン、ストレプトニグリン、ストレプトゾシン、ツベルシジン、ウベニメックス、ジノスタチン、ゾルビシンなど;代謝拮抗物質、例えばメトトレキサート及び5-フルオロウラシル(5-FU)など;葉酸類似体、例えばデノプテリン、メトトレキサート、プテロプテリン、トリメトレキサートなど;プリン類似体、例えばフルダラビン、6-メルカプトプリン、チアミプリン、チオグアニンなど;ピリミジン類似体、例えばアンシタビン、アザシチジン、6-アザウリジン、カルモフール、シタラビン、ジデオキシウリジン、ドキシフルリジン、エノシタビン、フロクスウリジン、5-FUなど;アンドロゲン、例えばカルステロン、プロピオン酸ドロモスタノロン、エピチオスタノール、メピチオスタン、テストラクトンなど;抗副腎剤、例えばアミノグルテチミド、ミトタン、トリロスタンなど;葉酸補給剤、例えばフロリン酸など;アセグラトン;アルドホスファミドグリコシド;アミノレブリン酸;アムサクリン;ベストラブシル;ビサントレン;エダトラキサート;デフォアミン;デメコルシン;ジアジクオン;エルホルミチン;酢酸エリプチニウム;エトグルシド;硝酸ガリウム;ヒドロキシ尿素;レンチナン;ロニダミン;ミトグアゾン;ミトキサントロン;モピダモール;ニトラクリン;ペントスタチン;フェナメット;ピラルビシン;ポドフィリン酸;2-エチルヒドラジド;プロカルバジン;PSK;ラゾキサン;シゾフィラン;スピロゲルマニウム;テヌアゾン酸;トリアジコン;2,2’,2”-トリクロロトリエチルアミン;ウレタン;ビンデシン;ダカルバジン;マンノムスチン;ミトブロニトール;ミトラクトール;ピポブロマン;ガシトシン;アラビノシド(「Ara-C」);シクロホスファミド;チオテパ;タキソイド、例えば、パクリタキセル(TAXOL(登録商標)、Bristol-Myers Squibb Oncology、ニュージャージー州プリンストン)及びドキセタキセル(TAXOTERE(登録商標)、ローヌ-プーランローラー、フランス、アントニー);クロラムブシル;ゲムシタビン;6-チオグアニン;メルカプトプリン;メトトレキサート;プラチナ類似体、例えばシスプラチン及びカルボプラチンなど;ビンブラスチン;白金;エトポシド(VP-16);イホスファミド;マイトマイシンC;ミトキサントロン;ビンクリスチン;ビノレルビン;ナベルビン;ノバントロン;テニポシド;ダウノマイシン;アミノプテリン;ゼロダ;イバンドロネート;CPT-11;トポイソメラーゼ阻害剤RFS 2000;ジフルオロメチルオルチン(DMFO);レチノイン酸誘導体、例えばTargretin(商標)(ベキサロテン);Panretin(商標)(アリトレチノイン)など;ONTAK(商標)(デニロイキンディフティトックス);エスペラマイシン;カペシタビン;ならびに上のいずれかの医薬的に許容可能な塩、酸又は誘導体を含む。
【0136】
一部の実施形態では、本明細書中に開示される抗体は、放射性同位体に複合体化される又は動作可能に連結され、放射性金属イオンを複合体化するために有用な放射性コンジュゲート及び/又は大環状キレート剤を形成する。様々な放射性同位体が、放射性コンジュゲート抗体の産生のために利用可能である。例は、限定されないが、90Y、123I、125I、131I、186Re、188Re、211At、及び212Biを含む。特定の実施形態では、大環状キレート剤は、リンカー分子を介して抗体に付着させることができる1,4,7,10-テトラアザシクロドデカン-N,N’,N’’,N’’’-テトラ酢酸(DOTA)である。そのようなリンカー分子は、当技術分野において一般に公知であり、Denardo et al.,1998,Clin Cancer Res.4:2483-90;Peterson et al.,1999,Bioconjug.Chem.10:553;及びZimmerman et al.,1999,Nucl.Med.Biol.26:943-50において記載されている。
【0137】
本開示の抗体(及びポリペプチド)の他の改変がまた、本明細書中で企図される。例えば、一部の実施形態では、抗体は、様々な非タンパク質性ポリマー、例えば、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、ポリオキシアルキレン、又はポリエチレングリコール及びポリプロピレングリコールのコポリマーの一つに連結される。一部の実施形態では、抗体は、例えば、コアセルベーション技術により、又は界面重合(例えば、それぞれ、ヒドロキシメチルセルロースもしくはゼラチン-マイクロカプセル及びポリ-(メチルメタシル酸塩)マイクロカプセル)により調製されたマイクロカプセル中に、コロイド薬剤送達系(例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルション、ナノ粒子及びナノカプセル)中に、又はマクロエマルション中に封入される。そのような技術は、Remington’s Pharmaceutical Sciences,16th edition,Oslo,A.,Ed.,(1980)において開示されている。
【0138】
抗体又はその抗原結合断片は、本明細書中に記載される組成物、方法、及び/又はキットのいずれかにおいて使用し、本明細書中に記載される追加の薬剤の一つ又は複数と組み合わせることができる。
【0139】
使用の方法及び医薬組成物
特定の実施形態は、それを必要とする対象において疾患もしくは状態を処置する、寛解させる、及び/又はその進行を低下させる方法に関し、本明細書中に記載されるインターロイキン-11受容体サブユニットα(IL-11Rα)に結合する抗体もしくはその抗原結合断片、又は同を含む医薬組成物を対象に投与することを含む。一部の例では、抗体又はその抗原結合断片は、IL-11RαとそのリガンドIL-11の間での結合/シグナル伝達活性に拮抗する。一部の実施形態では、疾患又は状態は、IL-11関連又はIL-11媒介性疾患又は状態である。一部の実施形態では、疾患又は状態は、癌、炎症性疾患、自己免疫疾患、消耗性疾患、骨疾患、又は線維性疾患である。
【0140】
一部の実施形態では、上に述べるように、疾患又は状態は癌又は腫瘍である。例えば、一部の例では、癌は、IL-11Rα及び/又はIL-11を発現又は過剰発現し、一部の例では、癌は、IL-11Rα/IL-11依存的な成長、接着、遊走、浸潤、及び/又は化学療法抵抗性を呈する。一部の例では、癌は原発性癌である。一部の例では、癌は転移性癌である。
【0141】
例示的な癌は、限定を伴わないが、骨癌、前立腺癌、黒色腫(例、転移性黒色腫)、膵臓癌、小細胞肺癌、非小細胞肺癌(NSCLC)、中皮腫、白血病(例、リンパ性白血病、慢性骨髄性白血病、急性骨髄性白血病、再発性急性骨髄性白血病、有毛細胞白血病、急性リンパ芽球性白血病)、リンパ腫(例、非ホジキンリンパ腫、ホジキンリンパ腫)、肝細胞癌(肝臓細胞癌)、肉腫、B細胞悪性腫瘍、乳癌、卵巣癌、結腸直腸癌、神経膠腫、多形神経膠芽腫、髄膜腫、下垂体腺腫、前庭神経鞘腫、原発性CNSリンパ腫、原始神経外胚葉腫瘍(髄芽腫)、腎臓癌(例、腎細胞癌)、膀胱癌、子宮癌、食道癌、脳癌、頭頸部癌、子宮頸癌、精巣癌、甲状腺癌、及び胃癌を含む。特定の実施形態では、癌は、例えば、骨に転移した転移性癌である。
【0142】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、対象の生存期間の中央値を4週間、5週間、6週間、7週間、8週間、9週間、10週間、15週間、20週間、25週間、30週間、40週間、又はそれ以上だけ増加させる。特定の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、対象の生存期間の中央値を1年、2年、3年、又はそれ以上だけ増加させる。一部の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、無増悪生存期間を2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、7週間、8週間、9週間、10週間、又はそれ以上だけ増加させる。特定の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、無増悪生存期間を1年、2年、3年、又はそれ以上だけ増加させる。
【0143】
特定の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、生存腫瘍の量における統計的に有意な減少、例えば、腫瘍質量における少なくとも10%、20%、30%、40%、50%もしくはそれより大きな減少、又は変化した(例、統計的有意性を伴って減少した)スキャン寸法により示されるように、腫瘍退縮をもたらすのに十分である。一部の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、未処置対照に比べて、癌の成長速度(例、インビボ又はインビトロ、生検又は他のサンプルから単離され、インビトロで成長させた癌細胞を含む)を約又は少なくとも約5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000%又はそれ以上だけ低下させる。一部の例では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、癌細胞の開始、移動、接着、侵襲性、及び/又は転移を、未処置対照に比べて、約又は少なくとも約5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000%又はそれ以上だけ低下させる。一部の例では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、腫瘍環境における血管新生を、未処置対照に比べて、約又は少なくとも約5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、60、70、80、90、100、200、300、400、500、600、700、800、900、1000、2000%又はそれ以上だけ低下させる。
【0144】
特定の実施形態では、疾患又は状態は炎症性疾患である。炎症性疾患及び状態の非限定的な例は、気道又は肺の炎症(例、炎症性肺疾患)、喘息、鼻炎、慢性閉塞性肺障害(COPD)、皮膚炎、乾癬、肝炎、胃炎、過敏性腸症候群(IBS)、潰瘍性大腸炎、クローン病、大腸炎、憩室炎、紅斑性狼瘡、腎炎、パーキンソン病、多発性硬化症(MS)、アルツハイマー病、関節炎、関節リウマチ、敗血症、感染症誘発性の炎症、心血管疾患、例えばアテローム性動脈硬化症及び血管炎など、糖尿病、ならびに痛風を含む。
【0145】
特定の実施形態では、疾患又は状態は自己免疫疾患である。自己免疫疾患及び状態の非限定的な例は、関節炎(関節リウマチ、反応性関節炎を含む)、全身性エリテマトーデス(SLE)、乾癬、炎症性腸疾患(IBD)、潰瘍性大腸炎、クローン病、脳脊髄炎、ぶどう膜炎、重症筋無力症、多発性硬化症、インスリン依存性糖尿病、アジソン病、セリアック病、慢性疲労症候群、自己免疫性肝炎、自己免疫性脱毛症、強直性脊椎炎、線維筋痛症、尋常性天疱瘡、シェーグレン症候群、川崎病、甲状腺機能亢進症/バセドウ病、甲状腺機能低下症/橋本病、子宮内膜症、強皮症、悪性貧血、グッドパスチャー症候群、ギラン・バレー症候群、ウェゲナー病、糸球体腎炎、再生不良性貧血(複数回輸血された再生不良性貧血患者を含む)、発作性夜間ヘモグロビン尿症、骨髄異形成症候群、特発性血小板減少性紫斑病、自己免疫性溶血性貧血、エヴァン症候群、第VIII因子阻害症候群、全身性血管炎、皮膚筋炎、多発性筋炎、リウマチ熱、自己免疫性リンパ増殖症候群(ALPS)、自己免疫性水疱性類天疱瘡、パーキンソン病、サルコイドーシス、白斑、原発性胆汁性肝硬変、及び自己免疫性心筋炎を含む。
【0146】
特定の実施形態では、疾患又は状態は消耗性疾患である。消耗性疾患及び状態の非限定的な例は、癌又は腎不全に関連付けられる悪液質を含む悪液質、及びサルコペニアを含む。特定の実施形態では、疾患又は状態は骨疾患である。骨疾患及び状態の非限定的な例は、骨粗しょう症(閉経後骨粗しょう症を含む)、骨骨折、骨のパジェット病、ならびに化学療法、ホルモンアブレーション、及びホルモン阻害を含む、癌又は癌治療に関連付けられる骨再吸収/損傷を含む。
【0147】
一部の実施形態では、疾患又は状態は、線維症、又は線維性疾患である。例は、肺、心血管系、肝臓、脳、関節(例、膝、腰、足首、足関節、肩、肘、手首、手関節、脊椎)、腸、皮膚、腎臓、肝臓、甲状腺、骨髄、後腹腔、眼の線維症を含む(例えば、Schafer et al.,Nature.552: 110-115,2017;及びNg et al.,Sci Transl Med.2019 Sep 25;11(511)を参照のこと)。
【0148】
一部の実施形態では、肺の線維症は、線維胸、肺線維症(例えば、嚢胞性線維症、間質性肺疾患(ILD)、常染色体劣性遺伝性疾患、例えばヘルマンスキー・パドラック症候群1型、2型、3型、4型、5型、6型、7型、又は8型など)、及び放射線誘発性肺損傷から選択される。一部の実施形態では、肺線維症は、ILD、例えば、特発性又は二次性ILDに関連する。特発性ILDの例は、特発性肺線維症(IPF)、剥離性間質性肺炎(DIP)、ハンマン・リッチ症候群としても公知の急性間質性肺炎(AIP)、非特異的間質性肺炎(NSIP)、呼吸器細気管支炎を伴う間質性肺疾患(RB-ILD)、特発性器質化肺炎(COP)、及びリンパ球性間質性肺炎(LIP)を含む。二次性ILDの一般的な例は、結合織疾患及び自己免疫疾患(例えば、サルコイドーシス、関節リウマチ、全身性エリテマトーデス、全身性硬化症、多発性筋炎、皮膚筋炎、抗合成酵素症候群)、吸入物質(例えば、珪肺、石綿肺、ベリリウム症、工業用印刷化学薬品、慢性過敏性肺炎)、薬物(薬物誘発性ILD、例えば、抗生物質、化学療法剤、抗不整脈剤)、感染症(例えば、SARS CoV-2、非定型肺炎、ニューモシスチス肺炎、結核、クラミジア・トラコマティス、RSウイルス)、悪性腫瘍(癌性リンパ管症)に関連するILD、ならびに小児ILD、例えばびまん性発達障害、成長異常、肺胞形成不全、原因不明の乳児疾患など、及び肺胞サーファクタント領域に関連するILDなどを含む。
【0149】
特定の実施形態では、心血管系の線維症は、心筋線維症(例えば、間質性線維症、置換性線維症)である。
【0150】
一部の実施形態では、本明細書中に記載される抗体は、マウス及びヒトの両方のIL-11Rαについて選択的であり、STAT3経路及びERK経路の両方を通したIL-11シグナル伝達を遮断し、ならびにシス及びトランスIL-11シグナル伝達の両方を抑止する。TGFβ刺激後、本明細書中に記載される特定の抗huIL-11Rα抗体は、原発性IPF患者の線維芽細胞におけるコラーゲン発現を低下させ、健康なドナーからのPCLSによるプロコラーゲンI及びTIMPの発現を減少させることが示されている。プロコラーゲン放出における同様の低下が、IPF患者からの予備的PCLS試験において、抗huIL-11Rαに応答して観察された。マウスブレオマイシン肺線維症試験では、IL-11Rαシグナル伝達の遮断は、肺線維症を低下させ、肺線維症の発症後に予防的又は治療的に投与された場合、BAL炎症細胞を減少させる。
【0151】
特定の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、安定な疾患をもたらすのに十分である。特定の実施形態では、本明細書中に記載される方法及び組成物は、熟練した臨床医に公知の特定の疾患適応症の症状における臨床的に関連する低下をもたらすのに十分である。
【0152】
インビボ使用のために、特定の実施形態は、本明細書中に記載される抗体又はその抗原結合断片、及び医薬的に許容可能な担体を含む医薬組成物を含む。治療用又は医薬組成物を調製するために、有効な又は所望の量の一つ又は複数の薬剤を、特定の薬剤及び/又は投与の様式のために適切であることが当業者に公知の任意の医薬担体又は賦形剤と混合する。医薬担体は、液体、半液体、又は固体であり得る。非経口、皮内、眼内、皮下、膀胱中への直接点滴、又は局所適用のために使用される溶液又は懸濁液は、例えば、滅菌希釈剤(例えば水など)、生理食塩水(例、リン酸緩衝生理食塩水;PBS)、固定油、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール又は他の合成溶媒;抗菌剤(例えばベンジルアルコール及びメチルパラベンなど);酸化防止剤(例えばアスコルビン酸及び亜硫酸水素ナトリウムなど)及びキレート剤(例えばエチレンジアミン四酢酸(EDTA)など);緩衝剤(例えば酢酸塩、クエン酸塩、及びリン酸塩など)を含み得る。静脈内に(例、IV注入により)投与される場合、適切な担体は、生理食塩水又はリン酸緩衝生理食塩水(PBS)、ならびに増粘剤及び可溶化剤、例えばグルコース、ポリエチレングリコール、ポリプロピレングリコール、及びそれらの混合物などを含む溶液を含む。
【0153】
本明細書中に記載される薬剤の、純粋な形態での又は適した治療組成物もしくは医薬組成物中での投与は、類似の有用性を果たすための薬剤の許容される投与の様式のいずれかを介して行うことができる。治療用又は医薬組成物は、薬剤含有組成物を、適した生理学的に許容可能な担体、希釈剤、又は賦形剤と組み合わせることにより調製することができ、固体、半固体、液体、又は気体の形態、例えば錠剤、カプセル、粉末、顆粒、軟膏、溶液、座剤、注射剤、吸入剤、ゲル、マイクロスフェア、及びエアロゾルなどにおける調製物中に製剤化され得る。また、他の医薬的に活性な成分(本明細書中の他の箇所に記載される他の小分子を含む)及び/又は適切な賦形剤、例えば塩、緩衝剤、及び安定剤などは、組成物内に存在してもよいが、しかし、そうである必要はない。
【0154】
投与は、経口、非経口、経鼻、静脈内、眼内、皮内、筋肉内、皮下、膀胱中への設置、又は局所を含む、様々な異なる経路により達成され得る。好ましい投与の様式は、処置又は予防される状態の性質に依存する。特定の実施形態は、IV注入による投与を含む。
【0155】
担体は、例えば、用いられる投与量及び濃度でそれに曝露される細胞又は哺乳動物に対して非毒性である、医薬的又は生理学的に許容可能な担体、賦形剤、又は安定剤を含むことができる。しばしば、生理学的に許容可能な担体は、水性pH緩衝溶液である。生理学的に許容可能な担体の例は、緩衝剤、例えばリン酸塩、クエン酸塩、他の有機酸など;アスコルビン酸を含む抗酸化物質;低分子量(約10残基未満)ポリペプチド;タンパク質、例えば血清アルブミン、ゼラチン、又は免疫グロブリンなど;親水性ポリマー、例えばポリビニルピロリドンなど;アミノ酸、例えばグリシン、グルタミン、アスパラギン、アルギニン、ヒスチジン、及び/又はリジンなど;グルコース、マンノース、またはデキストリンを含む、単糖類、二糖類、及び他の炭水化物;キレート剤、例えばEDTAなど;糖アルコール、例えばマンニトール又はソルビトールなど;塩形成対イオン、例えばナトリウムなど;ならびに/あるいは非イオン性界面活性剤、例えばポリソルベート20(TWEEN(商標))ポリエチレングリコール(PEG)、ポロクサマー(PLURONICS(商標))など、及び同様のものを含む。
【0156】
一部の実施形態では、一つ又は複数の薬剤は、例えば、コアセルベーション技術により、又は界面重合(例えば、それぞれ、ヒドロキシメチルセルロースもしくはゼラチン-マイクロカプセル及びポリ-(メチルメタシル酸塩)マイクロカプセル)により調製されたマイクロカプセル中に、コロイド薬剤送達系(例えば、リポソーム、アルブミンマイクロスフェア、マイクロエマルション、ナノ粒子及びナノカプセル)中に、又はマクロエマルション中に封入することができる。そのような技術は、Remington’s Pharmaceutical Sciences,16th edition,Oslo,A.,Ed.,(1980)において開示されている。粒子又はリポソームは、他の治療用又は診断用薬剤をさらに含み得る。
【0157】
処置の正確な投与量及び持続時間は、処置されるている疾患の関数であり、公知のテストプロトコルを使用して経験的に、又は当技術分野において公知のモデル系において組成物をテストし、そこから外挿することにより決定され得る。対照臨床治験も実施され得る。投与量はまた、軽減される状態の重症度によって変動し得る。医薬組成物は、一般的に、望ましくない副作用を最小化しながら、治療的に有用な効果を発揮するように製剤化及び投与される。組成物は、一回投与されてもよく、又は一定間隔で投与される多数のより小さな用量中に分割されてもよい。任意の特定の対象について、特定の投与レジメンは、個々の必要性に従って経時的に調整され得る。
【0158】
これら及び関連する治療用又は医薬組成物を投与する典型的な経路は、このように、限定を伴わないが、経口、局所、経皮、吸入、非経口、舌下、口腔、眼、直腸、膣、及び鼻腔内を含む。本明細書中で使用される用語「非経口」は、皮下注射、静脈内、膀胱中への注入、筋肉内、胸骨内注射、又は注入技術を含む。本開示の特定の実施形態に従った治療用又は医薬組成物は、その中に含まれる活性成分が、対象又は患者への組成物の投与時に生物学的に利用可能になるように製剤化される。対象又は患者に投与される組成物は、一つ又は複数の投与単位の形態を取り得るが、ここで、例えば、錠剤は、単一投与単位であってもよく、エアロゾル形態中の本明細書中に記載される薬剤の容器は、複数の投与単位を保持し得る。そのような投薬形態を調製する実際の方法は、当業者に公知である、又は明らかであろう;例えば、Remington: The Science and Practice of Pharmacy,20th Edition (Philadelphia College of Pharmacy and Science,2000)を参照のこと。投与される組成物は、典型的には、目的の疾患又は状態の処置のための、本明細書中に記載される薬剤の治療有効量を含む。
【0159】
治療用又は医薬組成物は、固体又は液体の形態であることができる。一部の実施形態では、担体は粒子状であり、組成物は、例えば、錠剤又は粉末形態である。担体は液体であることができ、組成物は、例えば、経口油、注射可能な液体、又はエアロゾルであり、それは、例えば、吸入投与において有用である。経口投与について意図される場合、医薬組成物は、好ましくは、固体又は液体形態のいずれかであり、ここで、半固体、半液体、懸濁液、及びゲル形態が、固体又は液体のいずれかとして本明細書中で考慮される形態内に含まれる。特定の実施形態は、滅菌注射溶液を含む。
【0160】
経口投与用の固形組成物として、医薬組成物は、粉末、顆粒、ゲル、圧縮錠剤、丸剤、カプセル剤、チューインガム、ウエハー又は同様のものに製剤化され得る。そのような固体組成物は、典型的には、一つ又は複数の不活性希釈剤又は食用担体を含む。また、以下の一つ又は複数が存在し得る:結合剤、例えばカルボキシメチルセルロース、エチルセルロース、微結晶セルロース、トラガカントゴム又はゼラチンなど;賦形剤、例えばデンプン、乳糖又はデキストリンなど、崩壊剤、例えばアルギン酸、アルギン酸ナトリウム、プリモゲル、コーンスターチ及び同様のもの;潤滑剤、例えばステアリン酸マグネシウム又はステレオテックスなど;滑剤、例えばコロイド状二酸化ケイ素など;甘味剤、例えばスクロース又はサッカリンなど;香味剤、例えばペパーミント、サリチル酸メチル又はオレンジ香料など;ならびに着色剤。医薬組成物が、カプセル、例えば、ゼラチンカプセルの形態である場合、それは、上の種類の材料に加えて、液体担体、例えばポリエチレングリコール又は油などを含み得る。
【0161】
治療用又は医薬組成物は、液体、例えば、エリキシル、シロップ、溶液、ゲル、エマルション、又は懸濁液の形態であり得る。液体は、二つの例として、経口投与用又は注射による送達用であり得る。経口投与のために意図される場合、好ましい組成物は、本化合物に加えて、甘味剤、保存剤、染料/着色剤、及び香味増強剤の一つ又は複数を含む。注射により投与されることが意図される組成物中で、界面活性剤、保存剤、湿潤剤、分散剤、懸濁剤、緩衝剤、安定剤、及び等張剤の一つ又は複数が含まれ得る。
【0162】
液体治療用又は医薬組成物は、それらが、溶液、懸濁液、又は他の同様の形態であるかを問わず、以下のアジュバントの一つ又は複数を含み得る:無菌希釈剤、例えば注射用水、食塩水、好ましくは生理食塩水、リンゲル液、等張塩化ナトリウム、固定油、例えば溶媒又は懸濁培地としての役割を果たす合成モノ又はジグリセリド、ポリエチレングリコール、グリセリン、プロピレングリコール又は他の溶媒など;抗菌剤、例えばベンジルアルコール又はメチルパラベンなど;抗酸化物質、例えばアスコルビン酸又は亜硫酸水素ナトリウムなど;キレート剤、例えばエチレンジアミン四酢酸など;緩衝剤、例えば酢酸塩、クエン酸塩、リン酸塩など、及び張性の調整用薬剤、例えば塩化ナトリウム又はブドウ糖など。非経口調製物は、アンプル、使い捨てシリンジ、又はガラスもしくはプラスチックで作製された複数用量バイアル中に封入することができる。生理学的生理食塩水は、好ましいアジュバントである。注射用医薬組成物は、好ましくは、滅菌される。
【0163】
非経口投与、眼内投与、又は経口投与のいずれかについて意図される液体治療用又は医薬組成物は、適切な投与量が得られるように、薬剤の量を含むべきである。典型的には、この量は、組成物中の目的の薬剤の少なくとも0.01%である。経口投与のために意図される場合、この量は、組成物の重量の0.1~約70%の間であるように変動し得る。特定の経口治療用又は医薬組成物は、約4%~約75%の間の目的の薬剤を含む。特定の実施形態では、治療用又は医薬組成物及び調製物は、非経口投薬単位が、希釈前に0.01~10重量%の間の目的の薬剤を含むように調製される。
【0164】
治療用又は医薬組成物は、局所投与のために意図されてもよく、その場合では、担体は、溶液、エマルション、軟膏、又はゲル基剤を適切に含んでもよい。基剤は、例えば、以下の一つ又は複数を含んでもよい:ワセリン、ラノリン、ポリエチレングリコール、ミツロウ、鉱油、希釈剤、例えば水及びアルコールなど、ならびに乳化剤及び安定剤。増粘剤は、局所投与のための治療用又は医薬組成物中に存在してもよい。経皮投与のために意図される場合、組成物は経皮パッチ又はイオン泳動デバイスを含み得る。
【0165】
治療用又は医薬組成物は、例えば、直腸中で溶解し、薬物を放出する座剤の形態での直腸投与のために意図され得る。直腸投与のための組成物は、適切な非刺激性賦形剤として油性基剤を含み得る。そのような基剤は、限定を伴わずに、ラノリン、ココアバター、及びポリエチレングリコールを含む。
【0166】
治療用又は医薬組成物は、様々な材料を含み得るが、それらは、固体又は液体投薬単位の物理的形態を改変する。例えば、組成物は、活性成分の周りにコーティングシェルを形成する材料を含み得る。コーティングシェルを形成する材料は、典型的には不活性であり、例えば、糖、シェラック、及び他の腸溶コーティング剤から選択され得る。あるいは、活性成分はゼラチンカプセル中に封入されてもよい。固体又は液体形態の治療用又は医薬組成物は、薬剤に結合し、それにより、化合物の送達において支援する成分を含み得る。この能力において作用し得る適切な成分は、モノクローナル抗体もしくはポリクローナル抗体、一つ又は複数のタンパク質又はリポソームを含む。
【0167】
治療用又は医薬組成物は、エアロゾルとして投与することができる投薬単位から本質的になり得る。用語「エアロゾル」は、コロイド性質のものから、加圧パッケージからなる系に及ぶ様々な系を表示するために使用される。送達は、液化ガスもしくは圧縮ガスによって、又は活性成分を分注する適切なポンプ系によってもよい。エアロゾルは、活性成分を送達するために、単一相、二相、又は三相系において送達されてもよい。エアロゾルの送達は、必要な容器、活性化剤、弁、サブコンテナ、及び同様のものを含み、それらは一緒にキットを形成し得る。当業者は、過度の実験を伴うことなく、好ましいエアロゾルを決定し得る。
【0168】
本明細書中に記載される組成物は、身体からの迅速な除去に対して薬剤を保護する担体、例えば徐放性製剤又はコーティングなどを用いて調製され得る。そのような担体は、制御放出製剤、例えば、限定されないが、インプラント及びマイクロカプセル化送達系、ならびに生分解性、生体適合性ポリマー、例えばエチレン酢酸ビニル、ポリ無水物、ポリグリコール酸、ポリオルトエステル、ポリ乳酸及び当業者に公知の他を含む。
【0169】
医薬組成物は、医薬技術分野において周知の方法論により調製され得る。例えば、注射により投与されることが意図される治療用又は医薬組成物は、溶液を形成するために滅菌蒸留水を伴い、塩、緩衝液及び/又は安定剤の一つ又は複数を含み得る。界面活性剤を加えて、均質な溶液又は懸濁液の形成を促進してもよい。界面活性剤は、水性送達系における薬剤の溶解又は均質な懸濁を促進するために、薬剤と非共有結合的に相互作用する化合物である。
【0170】
治療用又は医薬組成物は、治療有効量で投与されてもよく、それは、様々な要因、用いられる特定の化合物の活性;化合物の代謝安定性及び作用の時間;対象の年齢、体重、一般的な健康状態、性別、及び食事;投与の様式及び時間;排泄率;薬物の組み合わせ;特定の障害又は状態の重症度;ならびに治療を受けている対象を含む、に依存して変動するであろう。一部の例では、治療的に有効な一日用量は、(体重70kgの哺乳動物について)約0.001mg/kg(即ち、~0.07mg)から約100mg/kg(即ち、~7.0g)であり;好ましくは、治療有効用量は、(体重70kgの哺乳動物について)約0.01mg/kg(即ち、~0.7mg)から約50mg/kg(即ち、~3.5g)であり;より好ましくは、治療有効量は、(体重70kgの哺乳動物について)約1mg/kg(即ち、~70mg)から約25mg/kg(即ち、~1.75g)である。一部の実施形態では、治療有効用量は、毎週、隔週、又は毎月投与される。特定の実施形態では、治療有効用量は、毎週、隔週、又は毎月、例えば、約1~10もしくは1~5mg/kg、又は約1、2、3、4、5、6、7、8、9、もしくは10mg/kgの用量で投与される。
【0171】
また、含まれるのは、患者ケアキットであって、(a)本明細書中に記載される、IL-11Rαに結合する抗体又はその抗原結合断片;及び、場合により、(b)少なくとも一つの追加の治療剤を含む。特定のキットでは、(a)及び(b)は、別々の治療用組成物中にある。一部のキットでは、(a)及び(b)は、同じ治療用組成物中にある。
【0172】
本明細書中のキットはまた、処置されている適応症について、又は所望の診断適用について適切な、又は望ましい一つ又は複数の追加の治療剤又は他の成分を含み得る。本明細書中のキットはまた、意図される送達の様式(例、ステント、移植可能なデポなど)を促進するために必要な又は望ましい一つ又は複数のシリンジ又は他のコンポーネントを含むことができる。
【0173】
一部の実施形態では、患者ケアキットは、組成物及び情報材料のための別々の容器、仕切り、又は区画を含む。例えば、組成物は、ボトル、バイアル、又はシリンジ中に含まれてもよく、情報材料は、容器との関連において含まれることができる。一部の実施形態では、キットの別々の要素は、単一の、分割されていない容器内に含まれる。例えば、組成物は、付着された、ラベルの形態における情報材料を有するボトル、バイアル、又はシリンジ中に含まれる。一部の実施形態では、キットは、複数の(例、パック)個々の容器を含み、各々が、抗体の一つ又は複数の単位投薬形態(例、本明細書中に記載される投薬形態)及び、場合により、少なくとも一つの追加の治療剤を含む。例えば、キットは、複数のシリンジ、アンプル、ホイルパケット、又はブリスターパックを含み、各々が、単一の単位用量の抗体及び、場合により、少なくとも一つの追加の治療剤を含む。キットの容器は、気密性、防水性(例、水分又は蒸発における変化に対して不透過性)、及び/又は遮光性であることができる。
【0174】
患者ケアキットは、場合により、組成物の投与のために適切なデバイス、例えば、シリンジ、吸入器、ドロッパ(例、点眼器)、スワブ(例、綿スワブ又は木製スワブ)、又は任意のそのような送達デバイスを含む。一部の実施形態では、デバイスは、薬剤の定用量を分注する移植可能なデバイスである。また、含まれるのは、例えば、本明細書中に記載される構成要素を組み合わせることにより、キットを提供する方法である。
【0175】
発現及び精製系
特定の実施形態は、本明細書中に記載される抗IL-11Rα抗体又はその抗原結合断片を発現及び精製するための方法及び関連する組成物を含む。そのような組換え抗IL-11Rα抗体は、例えば、Sambrook,et al.,(1989,上記)、特にセクション16及び17;Ausubel et al.,(1994,上記)、特にチャプター10及び16;ならびにColigan et al.,Current Protocols in Protein Science (John Wiley & Sons,Inc.1995-1997)、特にチャプター1、5、及び6において記載される標準プロトコルを使用して便利に調製することができる。一つの一般的な例として、抗IL-11Rα抗体は、以下の工程の一つ又は複数を含む手順により調製され得る:(a)抗IL-11Rα抗体重鎖及び/又は軽鎖をコードし、調節エレメントに動作可能に連結されたポリヌクレオチド配列を含む構築物を調製すること;(b)構築物を宿主細胞中に導入すること;(c)抗IL-11Rα抗体を発現するように宿主細胞を培養すること;及び(d)抗IL-11Rαを宿主細胞から単離すること。
【0176】
特定の実施形態は、このように、本明細書中に記載される抗IL-11Rα抗体又はその抗原結合断片をコードするポリヌクレオチドを含み、当該ポリヌクレオチドを含むベクター、ならびにポリヌクレオチド及び/又はベクターを含む宿主細胞を含む。所望のポリペプチドを発現させるために、抗IL-11Rαをコードするヌクレオチド配列、又は機能的等価物を、適した発現ベクター、即ち、挿入されたコード配列の転写及び翻訳のために必要なエレメントを含むベクター中に挿入してもよい。当業者に周知である方法を使用して、目的のポリペプチドをコードする配列、ならびに適した転写及び翻訳制御エレメントを含む発現ベクターを構築してもよい。これらの方法は、インビトロ組換えDNA技術、合成技術、及びインビボ遺伝子組換えを含む。そのような技術は、Sambrook et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual(1989)、及びAusubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology(1989)において記載されている。
【0177】
様々な発現ベクター/宿主系が公知であり、ポリヌクレオチド配列を含み、発現するために利用され得る。これらは、限定されないが、組換えバクテリオファージ、プラスミド、又はコスミドDNA発現ベクターで形質転換された微生物、例えば細菌など;酵母発現ベクターで形質転換された酵母;ウイルス発現ベクター(例、バキュロウイルス)で感染された昆虫細胞系;ウイルス発現ベクター(例、カリフラワーモザイクウイルス、CaMV;タバコモザイクウイルス、TMV)で又は細菌発現ベクター(例、Ti又はpBR322プラスミド)で形質転換された植物細胞系;あるいは動物細胞系、哺乳動物細胞、より具体的にはヒト細胞系を含む、を含む。
【0178】
発現ベクター中に存在する「制御エレメント」又は「調節配列」は、宿主細胞タンパク質と相互作用して転写及び翻訳を行う、ベクター-エンハンサー、プロモーター、5’及び3’非翻訳領域のそれらの非翻訳領域である。そのようなエレメントは、それらの強度及び特異性において変動し得る。利用されるベクター系及び宿主に依存して、構成的及び誘導性プロモーターを含む、任意の数の適切な転写及び翻訳エレメントが使用され得る。例えば、細菌系においてクローニングする場合、誘導性プロモーター、例えばPBLUESCRIPTファージミド(Stratagene、カリフォルニア州ラ・ホーヤ)又はPSPORT1プラスミド(Gibco BRL、メリーランド州ゲイザースバーグ)のハイブリッドlacZプロモーターなどが使用され得る。哺乳動物細胞系では、哺乳動物遺伝子からの又は哺乳動物ウイルスからのプロモーターが、一般的に好ましい。ポリペプチドをコードする配列の複数のコピーを含む細胞株を生成することが必要である場合、SV40又はEBVに基づくベクターが、適した選択マーカーと有利に使用され得る。
【0179】
細菌系では、多数の発現ベクターが、発現ポリペプチドについて意図される使用に依存して選択され得る。例えば、大量が必要とされる場合、容易に精製される融合タンパク質の高レベル発現に向けるベクターが使用され得る。そのようなベクターは、限定されないが、多機能大腸菌クローニング及び発現ベクター、例えばBLUESCRIPT (Stratagene) など、それにおいて、目的のポリペプチドをコードする配列は、アミノ末端Met及びそれに続くβ-ガラクトシダーゼの7残基についての配列とインフレームでベクター中に連結され得る;ハイブリッドタンパク質が産生されるようにする;pINベクター(Van Heeke & Schuster,J.Biol.Chem.264:5503 5509(1989));及び同様のもの。pGEXベクター(Promega、ウィスコンシン州マディソン)がまた、外来ポリペプチドを、グルタチオンS-トランスフェラーゼ(GST)との融合タンパク質として発現させるために使用され得る。一般的に、そのような融合タンパク質は可溶性であり、グルタチオン-アガロースビーズへの吸着、それに続く遊離グルタチオンの存在における溶出により、溶解した細胞から簡単に精製することができる。そのような系において作製されたタンパク質は、ヘパリン、トロンビン、又は第XA因子プロテアーゼ切断部位を含むように設計されてもよく、目的のクローン化されたポリペプチドを、任意でGST部分から放出できるようにする。
【0180】
特定の実施形態は、大腸菌ベースの発現系を用いてもよい(例えば、Structural Genomics Consortium et al.,Nature Methods.5:135-146,2008を参照のこと)。これらの及び関連する実施形態は、適切な発現ベクターを産生するために、ライゲーション非依存的クローニング(LIC)に部分的又は完全に頼り得る。特定の実施形態では、タンパク質発現は、T7 RNAポリメラーゼ(例、pETベクター系列)により制御され得る。これらの及び関連する実施形態は、T7媒介性発現を支持し、改善された標的タンパク質安定性のためにlon及びompTプロテアーゼにおいて欠損しているBL21のλDE3溶原菌である、発現宿主株BL21(DE3)を利用し得る。また、含まれるのは、大腸菌、例えばROSETTA(商標)(DE3)株及びRosetta 2(DE3)株などにおいて稀にしか使用されない、tRNAをコードするプラスミドを担持する発現宿主株である。細胞溶解及びサンプルの取り扱いはまた、商標BENZONASE(登録商標)ヌクレアーゼ及びBUGBUSTER(登録商標)タンパク質抽出試薬の下で販売されている試薬を使用して改善され得る。細胞培養については、自動誘導培地は、ハイスループット発現系を含む、多くの発現系の効率を改善することができる。この種類の培地(例、OVERNIGHT EXPRESS(商標)自動誘導系)は、人工誘導剤、例えばIPTGなどの添加を伴わずに、代謝シフトを通してタンパク質発現を徐々に惹起させる。特定の実施形態は、ヘキサヒスチジンタグ(例えば商標HIS・TAG(登録商標)融合体の下で販売されたものなど)、それに続いて固定化金属親和性クロマトグラフィー(IMAC)精製、又は関連技術を用いる。特定の態様では、しかし、臨床グレードのタンパク質は、親和性タグの使用を伴わずに又は伴わずに、大腸菌含有体から単離することができる(例、Shimp et al.,Protein Expr Purif.50:58-67,2006を参照のこと)。さらなる例として、特定の実施形態は、コールドショック誘導性大腸菌高収率産生系を用いてもよい。なぜなら、低温での大腸菌中のタンパク質の過剰発現によって、それらの溶解度及び安定性が改善されるためである(例、Qing et al.,Nature Biotechnology.22:877-882,2004を参照のこと)。
【0181】
また、含まれるのは、高密度細菌発酵系である。例えば、ラルストニア・ユートロファの高細胞密度培養は、150g/Lを超える細胞密度でのタンパク質産生、及び10g/Lを超える力価での組換え型タンパク質の発現を可能にする。
【0182】
酵母サッカロミセス・セレビシエでは、構成的又は誘導性プロモーター、例えばアルファ因子、アルコールオキシダーゼ、及びPHHなどを含む多数のベクターが使用され得る。総説については、Ausubel et al.(上記)及びGrant et al.,Methods Enzymol.153:516-544 (1987)を参照のこと。また、含まれるのは、ピキア・パンドリス(Pichia pandoris)発現系である(例、Li et al.,Nature Biotechnology.24,210-215,2006;及びHamilton et al.,Science,301:1244,2003を参照のこと)。特定の実施形態は、とりわけ、ヒト化N-グリコシル化経路を有する酵母を含む、タンパク質を選択的にグリコシル化するように操作された酵母系を含む(例、Hamilton et al.,Science.313:1441-1443,2006;Wildt et al.,Nature Reviews Microbiol.3:119-28,2005;及びGerngross et al.,Nature-Biotechnology.22:1409 -1414,2004;米国特許第7,629,163号;第7,326,681号;及び第7,029,872号を参照のこと)。単に一例として、組換え酵母培養物を、とりわけ、フェルンバッハフラスコ又は15L、50L、100L、及び200Lの発酵体中で成長させることができる。
【0183】
植物発現ベクターが使用される場合では、ポリペプチドをコードする配列の発現は、多数のプロモーターのいずれかにより駆動され得る。例えば、ウイルスプロモーター、例えばCaMVの35S及び19Sプロモーターなどは、単独で、又はTMVからのオメガリーダー配列との組み合わせにおいて使用され得る(Takamatsu,EMBO J.6:307-311 (1987))。あるいは、植物プロモーター、例えばRUBISCO又は熱ショックプロモーターの小さなサブユニットなどが使用され得る(Coruzzi et al.,EMBO J.3:1671-1680 (1984);Broglie et al.,Science 224:838-843 (1984);及びWinter et al.,Results Probl.Cell Differ.17:85-105 (1991))。これらの構築物は、直接的なDNA形質転換又は病原体媒介性トランスフェクションにより植物細胞中に導入することができる。そのような技術は、多くの一般的に入手可能な総説において記載されている(例、Hobbs in McGraw Hill,Yearbook of Science and Technology,pp.191-196 (1992)を参照のこと)。
【0184】
昆虫系がまた、目的のポリペプチドを発現するために使用され得る。例えば、一つのそのような系では、オートグラファ・カリフォルニカ核多角体病ウイルス(AcNPV)が、スポドプテラ・フルギペルダ細胞において又はトリコプルシア細胞において外来遺伝子を発現するためのベクターとして使用される。ポリペプチドをコードする配列は、ウイルスの非必須領域、例えばポリヘドリン遺伝子などの中にクローニングされ、ポリヘドリンプロモーターの制御下に置かれてもよい。ポリペプチドコード配列の成功裏の挿入によって、ポリヘドリン遺伝子が不活性になり、コートタンパク質を欠く組換えウイルスが産生される。組換えウイルスを次に使用して、例えば、目的のポリペプチドが発現され得るS.フルギペルダ細胞又はトリコプルシア細胞に感染させてもよい(Engelhard et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.91:3224-3227 (1994))。また、含まれるのは、SF9、SF21、及びT.ni細胞を利用するものを含む、バキュロウイルス発現系である(例、Murphy and Piwnica‐Worms,Curr Protoc Protein Sci.Chapter 5:Unit5.4,2001を参照のこと)。昆虫系は、哺乳動物系に類似した翻訳後修飾を提供することができる。
【0185】
哺乳動物宿主細胞では、多くのウイルスベースの発現系が一般的に利用可能である。例えば、アデノウイルスが発現ベクターとして使用される場合、目的のポリペプチドをコードする配列は、後期プロモーター及び三者間リーダー配列からなるアデノウイルス転写/翻訳複合体中に連結され得る。ウイルスゲノムの非必須E1又はE3領域中での挿入を使用して、感染宿主細胞においてポリペプチドを発現することが可能である生育可能なウイルスを得てもよい(Logan & Shenk,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.81:3655-3659 (1984))。また、転写エンハンサー、例えばラウス肉腫ウイルス(RSV)エンハンサーなどを使用して、哺乳動物宿主細胞における発現を増加させてもよい。
【0186】
有用な哺乳動物宿主細胞株の例は、SV40で形質転換されたサル腎臓CV1株(COS-7、ATCC CRL 1651);ヒト胎児腎臓株(懸濁培養中での成長のためにサブクローン化された293又は293細胞、Graham et al.,J.Gen Virol.36:59 (1977));ベビーハムスター腎臓細胞(BHK、ATCC CCL 10);マウスセルトリ細胞(TM4、Mather,Biol.Reprod.23:243-251 (1980));サル腎臓細胞(CV1 ATCC CCL 70);アフリカミドリザル腎臓細胞(VERO-76、ATCC CRL-1587);ヒト子宮頸癌細胞(HELA、ATCC CCL 2);イヌ腎臓細胞(MDCK、ATCC CCL 34);バッファローラット肝細胞(BRL 3A、ATCC CRL 1442);ヒト肺細胞(W138、ATCC CCL 75);ヒト肝臓細胞(Hep G2、HB 8065);マウス乳腺腫瘍(MMT 060562、ATCC CCL51);TR1細胞(Mather et al.,Annals N.Y.Acad.Sci.383:44-68(1982));MRC 5細胞;FS4細胞;及びヒト肝癌株(Hep G2)を含む。他の有用な哺乳動物宿主細胞株は、DHFR-CHO細胞を含むチャイニーズハムスター卵巣(CHO)細胞(Urlaub et al.,PNAS USA 77:4216 (1980));ならびに骨髄腫細胞株、例えばNSO及びSp2/0などを含む。抗体産生のための適切な特定の哺乳動物宿主細胞株の総説については、例えば、Yazaki and Wu,Methods in Molecular Biology,Vol.248 (B.K.C Lo,ed.,Humana Press,Totowa,N.J.,2003),pp.255-268を参照のこと。特定の好ましい哺乳動物細胞発現系は、CHO及びHEK293-cellベースの発現系を含む。哺乳動物発現系は、付着細胞株を、例えば、Tフラスコ、ローラーボトル、又は細胞工場、又は懸濁培養物、例えば、当技術分野において公知の他のでもとりわけ、1L及び5Lのスピナー、5L、14L、40L、100L及び200Lの撹拌タンクバイオリアクター、又は20/50L及び100/200LのWAVEバイオリアクター中で利用することができる。
【0187】
また、含まれるのは、タンパク質の無細胞発現である。これら及び関連する実施形態は、典型的には、精製されたRNAポリメラーゼ、リボソーム、tRNA、及びリボヌクレオチドを利用し;これらの試薬は、細胞からの又は細胞ベースの発現系からの抽出により産生され得る。
【0188】
特定の開始シグナルがまた、目的のポリペプチドをコードする配列のより効率的な翻訳を達成するために使用され得る。そのようなシグナルは、ATG開始コドン及び隣接配列を含む。ポリペプチドをコードする配列、その開始コドン、及び上流配列が、適した発現ベクター中に挿入される場合では、追加の転写又は翻訳制御シグナルは必要とされないことがある。しかし、コード配列、又はその一部のみが挿入される場合では、ATG開始コドンを含む外因性翻訳制御シグナルが提供されるべきである。さらに、開始コドンは、インサート全体の翻訳を確実にするために、正しいリーディングフレーム中にあるべきである。外因性翻訳エレメント及び開始コドンは、天然及び合成の両方の様々な起源であり得る。発現の効率は、使用される特定の細胞系のために適しているエンハンサー、例えば文献中に記載されるものなどの包含により増強され得る(Scharf.et al.,Results Probl.Cell Differ.20:125-162 (1994))。
【0189】
また、宿主細胞株は、挿入された配列の発現を調節する、又は発現されたタンパク質を所望の様式において処理するその能力について選ばれてもよい。ポリペプチドのそのような修飾は、限定されないが、翻訳後修飾、例えばアセチル化、カルボキシル化、グリコシル化、リン酸化、脂質化、及びアシル化などを含む。タンパク質の「prepro」形態を切断する翻訳後プロセシングを使用して、正確な挿入、折り畳み、及び/又は機能を促進し得る。異なる宿主細胞、例えば酵母、CHO、HeLa、MDCK、HEK293、及びW138などが、そのような翻訳後活性のための特定の細胞機構及び特徴的な機構を有する、又は欠く細菌細胞に加えて、外来タンパク質の正確な修飾及びプロセシングを確実にするように選ばれ得る。
【0190】
組換えタンパク質の長期の高収率産生については、安定な発現が一般的に好ましい。例えば、目的のポリヌクレオチドを安定的に発現する細胞株は、ウイルス複製の起点及び/又は内因性発現エレメント、ならびに同じ又は別々のベクター上の選択マーカー遺伝子を含み得る発現ベクターを使用して形質転換され得る。ベクターの導入後、細胞を、それらを選択培地に切り替える前に、濃縮培地中で約1~2日間にわたり成長させてもよい。選択マーカーの目的は、選択に対する耐性を付与することであり、その存在によって、導入された配列を成功裏に発現する細胞の成長及び回復が可能になる。安定的に形質転換された細胞の耐性クローンは、細胞型に適した組織培養技術を使用して増殖されてもよい。例えば一過性トランスフェクション又は感染などによる一過性産生も用いることができる。一過性産生のために適切である、例示的な哺乳動物発現系は、HEK293系及びCHOベース系を含む。
【0191】
任意の数の選択系を使用して、形質転換又は形質導入された細胞株を回収してもよい。これらは、限定されないが、単純ヘルペスウイルスチミジンキナーゼ(Wigler et al.,Cell 11:223-232(1977))及びアデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ(Lowy et al.,Cell 22:817-823(1990))遺伝子を含み、それらは、それぞれtk-細胞又はaprt-細胞において用いることができる。また、抗代謝剤、抗生物質、又は除草剤耐性が、選択のための基礎として使用することができ;例えば、メトトレキサートに対する耐性を付与するdhfr(Wigler et al.,PNAS USA.77:3567-70(1980));npt、アミノグリコシド、ネオマイシン、及びG-418に対する耐性を付与する(Colbere-Garapin et al.,J.Mol.Biol.150:1-14 (1981));ならびにals又はpat、それぞれクロルスルフロン及びホスフィノトリシンアセチルトランスフェラーゼに対する耐性を付与する(Murry、上記)。追加の選択可能な遺伝子が記載されており、例えば、細胞がトリプトファンの代わりにインドールを利用することを可能にするtrpB、又は細胞がヒスチジンの代わりにヒスチノールを利用することを可能にするhisD(Hartman & Mulligan,Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.85:8047-51 (1988))。可視マーカーの使用は、緑色蛍光タンパク質(GFP)及び他の蛍光タンパク質(例、RFP、YFP)、アントシアニン、β-グルクロニダーゼ及びその基質GAS、ならびにルシフェラーゼ及びその基質ルシフェリンなどのマーカーで人気を得ており、形質転換体を同定するためだけでなく、しかし、また、特定のベクター系に起因する一過性又は安定なタンパク質発現の量を定量化するために広く使用されている(例、Rhodes et al.,Methods Mol.Biol.55:121-131 (1995)を参照のこと)。
【0192】
また、含まれるのは、ハイスループットタンパク質産生系、又はマイクロ産生系である。特定の態様は、例えば、金属キレート改変スライド表面又はMagneHis Ni-粒子上でのタンパク質発現及び精製のためにヘキサヒスチジン融合タグを利用し得る(例、Kwon et al.,BMC Biotechnol.9:72,2009;及びLin et al.,Methods Mol Biol.498:129-41,2009)を参照のこと)。また、含まれるのは、ハイスループット無細胞タンパク質発現系である(例、SSitaraman et al.,Methods Mol Biol.498:229-44,2009を参照のこと)。これら及び関連する実施形態を使用して、例えば、¥抗体のマイクロアレイを生成することができ、それを次に、ライブラリをスクリーニングするために使用して、目的のIL-11Rαポリペプチドと相互作用する抗体及び抗原結合ドメインを同定することができる。
【0193】
結合剤又は抗体、例えば産物について特異的なポリクローナル抗体もしくはモノクローナル抗体などを使用して、ポリヌクレオチドコード産物の発現を検出及び測定するための様々なプロトコルが、当技術分野において公知である。例は、酵素結合免疫吸着アッセイ(ELISA)、ウェスタン免疫ブロット、放射免疫アッセイ(RIA)、及び蛍光活性化細胞ソーティング(FACS)を含む。これら及び他のアッセイは、とりわけ、Hampton et al.,Serological Methods,a Laboratory Manual (1990)及びMaddox et al.,J.Exp.Med.158:1211-1216 (1983)において記載されている。
【0194】
多種多様な標識及びコンジュゲーション技術が、当業者に公知であり、様々な核酸及びアミノ酸アッセイにおいて使用され得る。ポリヌクレオチドに関連する配列を検出するための標識されたハイブリダイゼーション又はPCRプローブを産生するための手段は、標識されたヌクレオチドを使用したオリゴ標識、ニック翻訳、末端標識、又はPCR増幅を含む。あるいは、配列、又はその任意の部分は、mRNAプローブの産生のためにベクター中にクローニングされてもよい。そのようなベクターは、当技術分野において公知であり、市販されており、適したRNAポリメラーゼ、例えばTT7、T3、又はSP6など及び標識ヌクレオチドの添加によりインビトロでRNAプローブを合成するために使用され得る。これらの手順は、様々な市販のキットを使用して行ってもよい。使用され得る適切なレポーター分子又は標識は、放射性核種、酵素、蛍光剤、化学発光剤、又は発色剤ならびに基質、補因子、阻害剤、磁性粒子、及び同様のものを含む。
【0195】
目的のポリヌクレオチド配列で形質転換された宿主細胞は、細胞培養からのタンパク質の発現及び回収のために適切な条件下で培養されてもよい。ある特定の実施形態は、無血清細胞発現系を利用する。例は、無血清培地上で成長させることができるHEK293細胞及びCHO細胞を含む(例、Rosser et al.,Protein Expr.Purif.40:237-43,2005;及び米国特許第6,210,922号を参照のこと)。
【0196】
組換え細胞により産生される抗体、又はその抗原結合断片は、使用される配列及び/又はベクターに依存して細胞内に分泌されてもよい又は含まれてもよい。当業者により理解されるように、ポリヌクレオチドを含む発現ベクターは、原核又は真核細胞膜を通して、コードされたポリペプチドの分泌に向けるシグナル配列を含有するように設計されてもよい。他の組換え構築物を使用して、可溶性タンパク質の精製及び/又は検出を促進するポリペプチドドメインをコードするヌクレオチド配列に、目的のポリペプチドをコードする配列を連結させてもよい。そのようなドメインの例は、切断可能及び切断不可能な親和性精製タグならびにエピトープタグ、例えばアビジン、FLAGタグ、ポリヒスチジンタグ(例、6xHis)、cMycタグ、V5タグ、グルタチオンS-トランスフェラーゼ(GST)タグ、及び他を含む。
【0197】
組換え細胞により産生されるタンパク質は、当技術分野において公知の様々な技術に従って精製及び特徴付けすることができる。タンパク質精製を実施する及びタンパク質純度を分析するための例示的な系は、高速タンパク質液体クロマトグラフィー(FPLC)(例、AKTA及びBio-Rad FPLC系)、高圧液体クロマトグラフィー(HPLC)(例、Beckman及びWaters HPLC)を含む。精製のための例示的な化学物質は、とりわけ、当技術分野において公知の、イオン交換クロマトグラフィー(例、Q、S)、サイズ排除クロマトグラフィー、塩勾配、親和性精製(例、Ni、Co、FLAG、マルトース、グルタチオン、プロテインA/G)、ゲル濾過、逆相、セラミックHYPERD(登録商標)イオン交換クロマトグラフィー、及び疎水性相互作用カラム(HIC)を含む。また、含まれるのは、分析方法、例えばSDS-PAGE(例、クーマシー、銀染色)、免疫ブロット、ブラッドフォード、及びELISAなどであって、それらは、典型的にはタンパク質組成物の純度を測定するために、産生又は精製プロセスの任意の工程の間に利用され得る。
【0198】
また、含まれるのは、抗IL-11Rα抗体及びその抗原結合断片を濃縮する方法、ならびに濃縮可溶性タンパク質を含む組成物である。特定の態様では、抗IL-11Rα抗体の濃縮溶液は、約5mg/mL;又は約8mg/mL;又は約10mg/mL;約15mg/mL;又は約20mg/mL又はそれ以上の濃度のタンパク質を含む。
【0199】
一部の態様では、組成物は、実質的に単分散であり、例えば、ここで、抗IL-11Rα抗体が、例えば、サイズ排除クロマトグラフィー、動的光散乱、及び/又は分析的超遠心分離により評価された場合、一つの見かけの分子量形態において主に(即ち、少なくとも約90%以上)存在する。
【0200】
一部の態様では、組成物は、少なくとも約90%、又は一部の態様では少なくとも約95%純度、又は一部の実施形態では、少なくとも約98%純度(タンパク質ベース)を有する。純度は、当技術分野において公知の任意のルーチン的な分析方法を介して決定することができる。
【0201】
一部の態様では、組成物は、約10%未満、約5%未満、約3%未満、約1%未満の高分子量凝集体含量を有する。高分子量凝集体含量は、例えば、サイズ排除クロマトグラフィー、動的光散乱、及び/又は分析的超遠心分離を含む様々な分析技術により決定することができる。
【0202】
本明細書中で企図される濃縮アプローチの例は、凍結乾燥を含み、それは、典型的には、溶液が目的のタンパク質以外の可溶性成分をほとんど含まない場合に用いられる。凍結乾燥は、しばしば、HPLC実行後に実施され、混合物から大半の又は全ての揮発性成分を除去することができる。また、含まれるのは、限外濾過技術であって、それは、典型的には、タンパク質溶液を濃縮するために一つ又は複数の選択的透過性膜を用いる。膜は、水及び小分子が、タンパク質を通過して保持することを可能にし;溶液は、他の技術の中でもとりわけ、機械的ポンプ、ガス圧力、又は遠心分離により膜に対して強いることができる。
【0203】
特定の実施形態では、抗IL-11Rα抗体、試薬、又は関連薬剤は、当技術分野におけるルーチン的な技術に従って測定された場合、少なくとも約90%の純度を有する。特定の実施形態では、抗IL-11Rα組成物は、少なくとも約95%の純度を有する。特定の実施形態、例えば治療用又は医薬組成物などでは、抗IL-11Rα抗体組成物は、少なくとも約97%又は98%又は99%の純度を有する。一部の実施形態、参照試薬又は研究試薬として使用される場合などでは、抗IL-11Rα抗体は、より低純度であることができ、少なくとも約50%、60%、70%、又は80%の純度を有してもよい。純度は、全体的に、又は選択された成分、例えば他のタンパク質などに関連して測定することができ、例えば、タンパク質ベースでの純度である。
【0204】
精製された抗体はまた、それらの生物学的特徴に従って特徴付けることができる。結合親和性及び結合動態は、当技術分野において公知の様々な技術、例えばBiacore(登録商標)及び表面プラズモン共鳴(SPR)を利用する関連技術などに従って測定することができ、リアルタイムでの未標識の相互作用物質の検出を可能にする光学現象である。SPRベースのバイオセンサーは、親和性及び動態の両方の観点から、活性濃度、スクリーニング、及び特徴付けの決定において使用することができる。一つ又は複数の基準又は非基準生物学的活性の存在又はレベルは、本明細書中に記載されるように、読み出し又はインジケータ、例えば生物学的活性の蛍光又は発光インジケータなどに機能的に共役される、選択された抗IL-11Rα抗体の細胞結合パートナーを利用するアッセイを含む、細胞ベースのアッセイに従って測定することができる。
【0205】
特定の実施形態では、上に述べるように、組成物は、実質的にエンドトキシンを含まない、例えば、約もしくは少なくとも約95%エンドトキシンを含まない、約もしくは少なくとも約99%エンドトキシンを含まない、又は約もしくは少なくとも約99.99%エンドトキシンを含まない、を含む。エンドトキシンの存在は、本明細書中に記載されるように、当技術分野におけるルーチン的な技術に従って検出することができる。特定の実施形態では、組成物は、実質的に無血清の培地中で真核細胞、例えば哺乳動物又はヒト細胞などから作製される。特定の実施形態では、本明細書中に述べるように、組成物は、約10EU/mg未満の抗体、又は約5EU/mg未満の抗体、約3EU/mg未満の抗体、又は約1EU/mg未満の抗体のエンドトキシン含量を有する。
【0206】
特定の実施形態では、組成物は、約10重量/重量%未満の高分子量凝集体、又は約5重量/重量%未満の高分子量凝集体、又は約2重量/重量%未満の高分子量凝集体、又は約1重量/重量%未満未満の高分子量凝集体を含む。
【0207】
また、含まれるのは、タンパク質ベースの分析アッセイ及び方法であって、それらは、他の特徴の中でもとりわけ、例えば、タンパク質純度、サイズ、溶解度、及び凝集の程度を評価するために使用することができる。タンパク質純度は、多数の方法で評価することができる。例えば、純度は、一次構造、高次構造、サイズ、電荷、疎水性、及びグリコシル化に基づいて評価することができる。一次構造を評価するための方法の例は、N及びC末端の配列決定ならびにペプチドマッピングを含む(例、Allen et al.,Biologicals.24:255-275,1996を参照のこと)。高次構造を評価するための方法の例は、円二色性(例、Kelly et al.,Biochim Biophys Acta.1751:119-139,2005を参照のこと)、蛍光分光法(例、Meagher et al.,J.Biol.Chem.273:23283-89,1998を参照のこと)、FT-IR、アミド水素-重水素交換動態、示差走査熱量測定、NMR分光法、立体構造感受性抗体との免疫反応性を含む。高次構造はまた、様々なパラメータ、例えばpH、温度、又は添加塩などの関数として評価することができる。タンパク質の特徴、例えばサイズなどを評価するための方法の例は、分析的超遠心分離及びサイズ排除HPLC(SEC-HPLC)を含み、電荷を測定するための例示的な方法は、イオン交換クロマトグラフィー及び等電点電気泳動を含む。疎水性は、例えば、逆相HPLC及び疎水性相互作用クロマトグラフィーHPLCにより評価することができる。グリコシル化は、薬物動態(例、クリアランス)、立体構造又は安定性、受容体結合、及びタンパク質機能に影響を及ぼし得るが、例えば、質量分析及び核磁気共鳴(NMR)分光法により評価することができる。
【0208】
上に述べるように、特定の実施形態は、他の使用の中でとりわけ、タンパク質の特徴、例えば純度、サイズ(例、サイズ均質性)、もしくは凝集の程度などのを評価するための、及び/又はタンパク質を精製するためのSEC-HPLCの使用を含む。SECは、また、ゲル濾過クロマトグラフィー(GFC)及びゲル透過クロマトグラフィー(GPC)を含み、溶液中の分子が、それらのサイズ、又はより具体的には、それらの流体力学的容積、拡散係数、及び/又は表面特性に基づいて多孔性材料中で分離されるクロマトグラフィー方法を指す。このプロセスは一般的に、生物学的分子を分離し、ポリマーの分子量及び分子量分布を決定するために使用される。典型的には、生物学的又はタンパク質サンプル(例えば、本明細書中に提供され、当技術分野において公知のタンパク質発現方法に従って産生されるタンパク質抽出物など)は、定義された固定相(多孔性材料)、好ましくはサンプル中のタンパク質と相互作用しない相を伴う、選択されたサイズ排除カラム中に装填される。特定の態様では、固定相は、ガラス又は鋼カラム内の高密度三次元マトリクス中に充填された不活性粒子で構成される。移動相は、純水、水性緩衝液、有機溶媒、又はそれらの混合物であることができる。固定相粒子は、典型的には、特定のサイズ以下の分子のみが入ることを可能にする小さな細孔及び/又はチャネルを有する。大きな粒子は、従って、これらの細孔及びチャネルから除外され、固定相とのそれらの限定的な相互作用は、それらを、実験の開始時に「完全に除外された」ピークとして溶出することに導く。より小さな分子は、細孔に適合することができ、流動する移動相から除去され、それらが固定相の細孔中に固定化されるのに費やす時間は、部分的に、それらが浸透する細孔中にどの程度遠いかに依存する。移動相の流動からのそれらの除去は、それらをカラムからより長い時間溶出させ、それらのサイズにおける差に基づいて粒子間の分離をもたらす。所与のサイズ排除カラムは、分離することができる分子量の範囲を有する。全体的に、上限よりも大きい分子は、固定相により捕捉されず、下限よりも小さい分子は、固相に完全に入り、単一のバンドとして溶出し、範囲内の分子は、それらの特性、例えば流体力学的容積などにより定義される異なる速度で溶出する。医薬タンパク質を用いた実践におけるこれらの方法の例については、Bruner et al.,Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis.15: 1929-1935,1997を参照のこと。
【0209】
臨床適用のためのタンパク質純度は、例えば、Anicetti et al.(Trends in Biotechnology.7:342-349,1989)により考察されている。タンパク質純度を分析するためのより最近の技術は、限定を伴わないが、タンパク質及び核酸の迅速な分析のための自動プラットフォームであるLabChip GXIIを含み、それによって、タンパク質の力価、サイズ、及び純度分析のハイスループット分析が提供される。特定の非限定的な実施形態では、臨床グレードのタンパク質、例えばタンパク質断片及び抗体などは、他の方法の中でとりわけ、少なくとも二つの直交工程においてクロマトグラフィー材料の組み合わせを利用することにより得ることができる(例、Therapeutic Proteins: Methods and Protocols.Vol.308,Eds.,Smales and James,Humana Press Inc.,2005を参照のこと)。典型的には、タンパク質薬剤(例、抗体及び抗原結合断片)は、当技術分野において公知の技術に従って測定され、本明細書中に記載されるように、実質的にエンドトキシンを含まない。
【0210】
タンパク質溶解アッセイがまた、含まれる。そのようなアッセイは、例えば、組換え産生のための最適な成長及び精製条件を決定し、緩衝液の選択を最適化し、ならびに抗体又はその抗原結合断片の選択を最適化するために利用することができる。溶解度又は凝集は、温度、pH、塩、及び他の添加剤の存在又は非存在を含む、様々なパラメータに従って評価することができる。溶解度スクリーニングアッセイの例は、限定を伴わないが、とりわけ、エンドポイントとして濁度又は他の尺度を使用してタンパク質の溶解度を測定するマイクロプレートベースの方法、精製組換えタンパク質の溶解度の分析のためのハイスループットアッセイ(例、Stenvall et al.,Biochim Biophys Acta.1752:6-10,2005を参照のこと)、遺伝子マーカータンパク質の構造的相補性を使用して、インビボでのタンパク質の折り畳み及び溶解度をモニター及び測定するアッセイ(例、Wigley et al.,Nature Biotechnology.19:131-136,2001を参照のこと)、及び走査型電気化学顕微鏡法(SECM)を使用した大腸菌における組換えタンパク質の溶解度の電気化学的スクリーニング(例、Nagamine et al.,Biotechnology and Bioengineering.96:1008-1013,2006を参照のこと)を含む。増加した溶解度(又は低下した凝集)を伴う抗体は、タンパク質溶解度についての単純なインビボアッセイを含む、当技術分野におけるルーチン的な技術に従って同定又は選択することができる(例、Maxwell et al.,Protein Sci.8:1908-11,1999を参照のこと)。
【0211】
タンパク質溶解度及び凝集はまた、動的光散乱技術により測定することができる。凝集は、可溶性/不溶性、共有結合的/非共有結合的、可逆的/不可逆的、ならびに天然/変性相互作用及び特徴を含む、いくつかの種類の相互作用又は特徴を包含する一般用語である。タンパク質治療薬については、凝集体の存在は、典型的には、凝集体が免疫原性反応(例、小さな凝集体)を起こし得る、又は投与時に有害事象(例、微粒子)を起こし得るという懸念のため、望ましくないと考えられる。動的光散乱は、懸濁液中の小粒子又は溶液中のポリマー、例えばタンパク質などのサイズ分布プロファイルを決定するために使用することができる技術を指す。この技術は、また、光子相関分光法(PCS)又は準弾性光散乱法(QELS)として言及され、散乱光を使用してタンパク質粒子の拡散の速度を測定する。散乱強度の変動は、溶液中の分子及び粒子のブラウン運動に起因して観察することができる。この運動データは、従来的に処理されて、サンプルについてのサイズ分布を導き出すことができ、それにおいて、サイズは、タンパク質粒子のストークス半径又は流体力学的半径により与えられる。流体力学的サイズは、質量及び形状(組成)の両方に依存する。動的散乱によって、広範囲の質量を含むサンプル中でも、非常に少量の凝集タンパク質(<0.01重量%)の存在を検出することができる。また、例えば、上昇温度での変化のリアルタイムモニタリングに頼る適用を含む、異なる製剤の安定性を比較するために使用することができる。したがって、特定の実施形態は、本開示の抗体を含むサンプル中の凝集体の溶解度及び/又は存在を分析するための動的光散乱の使用を含む。
【0212】
前述の実施形態は、理解の明瞭化の目的のために、例証及び実施例によりいくらか詳細に記載されてきたが、特定の変化及び改変が、添付の特許請求の範囲の精神又は範囲から逸脱することなく作られ得ることが、本開示の教示を考慮して、当業者には容易に明らかであろう。以下の実施例は、例証のみとして、限定としてではなく提供されている。当業者は、本質的に類似した結果をもたらすように変化又は改変され得る様々な非重要パラメータを容易に認識するであろう。
【実施例】
【0213】
実施例1
抗IL-11Rα抗体
試験を、例えば、8E2及びTS7として指定される抗体を含む、米国特許第9,796,782号;及び第9,340,618号において記載される抗体に比べて、改善された抗IL-11Rα抗体を生成するために実施した。例えば、TS7抗体のVL CDR3中の潜在的なN連結型グリコシル化を除去して、不均質性を低下させ、開発可能性を改善させ、他の配列変化を、結合親和性及び効力を改善するために作製した。抗体のCDR配列を表A1(上記)中に提供する。抗体をHEK293細胞中で発現させ、標準的な方法論を使用してプロテインAベースのクロマトグラフィーを使用して精製した。全ての抗体を、カッパ軽鎖を伴うヒトIgG4(EUナンバリングによるS228P;KabatナンバリングによるS241P)フォーマット中で発現させた。
【0214】
抗体の相対結合活性を、ビオチン化mAb8E2又はTS7を使用して競合ELISAによりテストした。抗体8E2及びTS7を、製造業者の指示に従って、スルホ-NHSビオチン(Thermo Fisher)を使用してビオチン化した。IL-11Rを、PBS中の2μg/mLでELISAプレート(Nunc、MaxiSorp)上にコーティングし、プレートをPBS中の2%BSAでブロッキングした。プレートを水で洗浄した後、テストされる抗体を、90μLの最終容積中でプレートにわたって滴定し、その後に、表E1中に示されるように、各々のウェルへの10μLのビオチン化8E2又はビオチン化TS7の添加が続いた(0.1μg/mLの最終濃度)。プレートをプレート振盪器上で2時間にわたりインキュベートし、その後に洗浄及び100μL/ウェルのストレプトアビジン-HRP(Jackson ImmunoResearch、1/1000希釈)の添加が続いた。さらに1時間のインキュベーション後、プレートを洗浄し、Ultra-TMB HRP基質(Thermo Fisher)を用いて発色させ、50μL/ウェルの2M硫酸の添加により停止させた。プレートを、iD5プレートリーダー(Molecular Devices)上で450nmで読み取った。
【0215】
以下の表E1中に示すように、テストされた抗体の多くは、8E2抗体及びTS7抗体の結合に比べて、ヒトIL-11Rαへの増加した結合を有することが示された。
【表5】
【0216】
mAbの動態結合分析をテストして、Octet RED96e機器上でバイオレイヤー干渉法を使用して抗原結合親和性を決定した。mAbを、PBS、0.1%BSA、0.02%Tween 20からなる10×動態緩衝液中のプロテインGバイオセンサー(ForteBio)上に120秒間にわたり装填し、0.8~1.2nmのスペクトルシフト値を得た。会合は、hIL-11Rαの2倍希釈系列の存在において行われ、120秒間にわたり進行させ;解離を300~1200秒間にわたり測定した。希釈系列は、より弱いバリアントについては100nM又は最も強力なmAbについては10nMで開始した。
【0217】
以下の表E2中に示すように、mAb5、mAb6、mAb7、mAb8、mAb9、mAb12、mAb13、mAb14、及びmAb15は、正確なオフレート(kd)を決定する機器の能力を超える、非常に高い結合親和性を有した。
【表6】
【0218】
リードmAbのさらなるテストを、細胞ベースのレポーターアッセイを使用して行った。IL-11は、STAT3及びERK経路を通じてシグナル伝達することが報告されている。従って、ホタルルシフェラーゼ遺伝子発現が、最小TATAプロモーターの上流に位置するSTAT3応答エレメントにより駆動されるSTAT3レポーター細胞株を選択して、mAb機能活性を分析した。これらの細胞において、IL-11は、内因性STAT3を活性化することができ、それが内因性STAT3応答エレメントに結合し、ルシフェラーゼレポーター遺伝子の転写を誘導し、容易に検出可能なルシフェラーゼ発現をもたらすことができる。IL-11シグナル伝達を遮断するIL-11Rに対する抗体は、これらの細胞におけるIL-11駆動ルシフェラーゼの発現を阻害するはずである。
【0219】
STAT3レポーター(ルシフェラーゼ)-HEK293細胞株(BPS Bioscience、カタログ番号79800-P)を、製造業者のプロトコルに従って成長させ、継代し、アッセイした。細胞を、96ウェルマイクロタイターディッシュ中でウェルあたり25,000個細胞で加えて、5%CO2加湿空気中で37℃で30~45分間にわたりインキュベートした。抗IL-11R mAbを、二連のカラム又は列において3倍希釈系列として加えて、プレートを37℃で追加の1時間にわたりインキュベーターに戻し、その後に、40ng/mLのIL-11を各ウェルに加えて、シグナル伝達カスケード及びルシフェラーゼ産生を開始した。プレートを37℃で18~24時間にわたりインキュベートし、ルシフェラーゼを、製造業者の指示に従って、ワンステップルシフェラーゼアッセイ系(BPS Bioscience、カタログ番号60690-1)を使用して検出した。
【0220】
表E3中に示されるように、TS7は、8E2よりも有意に強力であり、ならびにmAb5、mAb9、及びmAb13は、TS7又は8E2のいずれかよりもIL-11シグナル伝達の阻害でより強力である。ELISAデータと一致して、mAb7、mAb8、mAb10、及びmAb11は、TS7よりも強力ではなく、ならびにmAb12、mAb14、及びmAb15は、TS7と効力において同等であった。mAb6についての結果は、このアッセイにおいて可変であったが、しかし、上のELISAデータ及びOctetデータは、mAb6がまた、強力なmAbであることを示唆する。
【表7】
【0221】
さらなる一連の抗体を設計し、それにおいて、重鎖のKabat31位での残基を変動させた(mAb16-32)。この場合では、代替的なバイオレイヤー干渉法アッセイを使用して、配列中でmAb16~32に最も近いmAb5と比較して抗体を最初にランク付けした。MAbを、PBS、0.1%BSA、0.02%Tween 20からなる10x動態緩衝液中の抗ヒト定常ドメイン(AHC)バイオセンサー(ForteBio)上に120秒間にわたり装填し、0.8~1.2nmのスペクトルシフト値を達成した。会合を、hIL-11Rの2倍希釈系列の存在において行い、120秒間にわたり進行させた。希釈系列は、10nMで開始した。1200秒間にわたる10×動態緩衝液中の解離。結合動態測定値を、Octet RED96e機器で取った。
【0222】
表E4中に示されるように、初期定性的評価によって、mAb5と類似している、又はそれよりも良好な高い効力を伴う追加の抗体が同定された。より詳細な動態測定値を、mAb21、mAb23、mAb29、及びmAb31について得て、mAb5と比較し、それによって、これらのmAbについてのさらに改善された効力が確認された。ELISAによるこれらのmAbのさらなるテストによって、選択されたmAbの改善された効力が確認された。
【表8】
【0223】
本明細書中に引用される全ての刊行物、特許出願、及び発行された特許は、各々の個々の刊行物、特許出願、又は発行された特許が、参照により組み入れられるように具体的かつ個別に示されているかのように、参照により本明細書中に組み入れられる。
【0224】
実施例2.
線維性ヒト精密切断肺スライスモデルにおける抗IL-11Rα抗体の活性
試験を、線維性ヒト精密切断肺スライス(PCLS)モデルにおけるECMリモデリングを反映するバイオマーカーに対するmAb5抗体の効果を評価するために実施した。抗線維性効果を、肺線維症患者から調製されたヒトエクスビボ肺組織スライスにおいて三つの異なる濃度で調べた。
【0225】
材料及び方法
組織スライスを、肺線維症(IPF及び二次線維症)を伴う、二人のヒト末期ドナーからの線維性肺の胸膜下及び中央領域から調製した(例えば、Hess et al.,Toxicol In Vitro.32:347-61,2016を参照のこと)。両方のドナーについて、二つの異なる領域(皮下及び中央)からの肺組織サンプルを使用して、PCLSのために使用される組織コアを生成した。隣接コアを使用して、同じコアからの培地処理PCLSと比較して、一つの処理の分析のための連続PCLSを達成した。これによって、線維性病巣を伴う、密に充填された線維性領域と、あまり影響を受けていない領域との比較が可能となる。線維性状態を確実にするために、各患者についての臨床/人口統計学的情報が提供される。
【0226】
含まれる実験的処置を表E5中に列挙している。各処置を、各肺領域について及び各ドナーについて三つの複製でテストした。
【表9】
【0227】
精密切断肺スライスの調製及びインキュベーション。肺葉をカニューレ状にし、37℃の温かい2%低溶解アガロース/培地溶液で充填した。充填した葉を氷上で冷却して、アガロースを重合させた。直径8mmを伴う組織コアを調製し、Earle’s Balanced Salts Solution(EBSS)中のミクロトーム(Krumdieck tissue slicer、Alabama Research and Development、アメリカ合衆国アラバマ州マンフォード、又はVibratome OTS-5000、Science Services GmbH、ミュンヘン)を使用して、約300μmの厚さのスライスに切断した。組織スライスを、L-グルタミン及び15mM HEPESを伴い、フェノールレッドを伴わないダルベッコ改変イーグル培地/栄養素混合物F-12 Ham(DMEM)中でインキュベートした。組織スライスをペトリディッシュ中に移し、DMEMで2時間にわたり洗浄した。培地を、細胞破片を除去するために、30分毎に四回変えた。
【0228】
ウェルあたり二つのPCLSを、最終洗浄工程のために、24ウェルプレート中の500μLのDMEM中に一晩放置した。翌日、PCLSを、通常の細胞培養条件(37℃、5% CO2)下で48時間にわたり、250μlのDMEM/F-12培地中で実験的処理又は対照(表E5を参照のこと)で処理した。培地は、100単位/mLのペニシリン及び100μg/mLのストレプトマイシンを含んだが、ウシ胎児血清で補充されなかった。
【0229】
48時間にわたるインキュベーション後、上清を収集し、プロテイナーゼ阻害剤カクテル(0.2%)を加えて、サンプルを-80℃まで凍結させた。加えて、各ウェルからの二つのPCLSを2mLのセーフロックチューブに移し、液体窒素中で直ちに瞬間凍結し、-80℃で保存した。各条件についての三つの複製物からのサンプルはプールされなかった。
【0230】
免疫刺激剤に対する組織の生存率及び応答性を、PCLSをマイトジェン100ng/mLのリポ多糖類(LPS)とインキュベートした品質管理サンプルにおいて確認した。48時間のインキュベーション後、乳酸デヒドロゲナーゼ(LDH)活性による生存率及びIL-1βによる炎症促進性応答の評価を実施した。
【0231】
組織生存率 肺組織の生存率を評価して、PCLSの十分な品質を確保した。品質管理サンプルについては、LDH活性を、インキュベーション後の上清中での商業的酵素アッセイで決定した。PCLS中での死細胞又は細胞膜損傷細胞の量の増加は、培養上清中でのLDH酵素活性の増加をもたらす。トリトンX-100(PBS中1%)処理したPCLSを、参照対照として調べた。50μLのサンプルを、50μLのLDH試薬と室温で20分間にわたりインキュベートした。吸光度を、マイクロプレートリーダーを使用して、参照波長として490nm及び630nmで測定した。全てのテストは、ウェルあたりの単一の測定として実施された。線維性PCLSの高密度組織材料に起因して、トリトンX-100対照について測定された吸光度値は最大であった。従って、これらの対照の1:10希釈を並行してテストし、サンプルの相対LDH放出の算出のために、検出スペクトルの範囲内の適した値を達成した。
【0232】
組織応答性 処置に対する肺組織の一般的な応答性を、PCLSの最適な状態を確保するために評価した。品質管理サンプルについては、PCLSをトリトンX-100(PBS中1%)で1時間にわたり溶解し、その後に、固有IL-1βレベルを、製造業者の指示に従って、R&DからのELISAを使用して評価した。光度測定を、マイクロプレートリーダーを使用して、450nm及び参照波長570nmで実施した。IL-1β濃度を、BCAアッセイにより決定されたPCLSの総タンパク質濃度に対して標準化した。
【0233】
組織外観 PCLSを生成するために使用される組織の巨視的外観ならびにコアの位置を、写真により記録した。PCLS調製のために使用したものに隣接した組織コアを、10%ホルマリン中に固定し、その後にパラフィン中に包埋した。パラフィン包埋組織切片を、ヘマトキシリン及びエオシン(H&E)での染色のためにスライスにさらに処理して、線維性リモデリングを評価した。
【0234】
細胞外マトリックスリモデリング評価 ECMリモデリングを反映するバイオマーカーを、以下の競合ELISAを使用して、Nordic Bioscienceにより上清中で評価した:PRO-C6(VI型コラーゲンとして放出されるVI型コラーゲンC5ドメインのC末端をマトリックス中に組み入れて;メソスケールプラットフォーム[hsPRO-C6]で測定する): VI型コラーゲン形成を反映する。VI型コラーゲンは、主に間質基質と基底膜との間の界面において見出されるビーズ状フィラメントコラーゲンである。
【0235】
統計 バイオマーカーデータは、中央値及び四分位範囲(IQR)の表示を伴う散布図として提示される。データは、各領域及びドナーについての生バイオマーカー値として提示される。プールされたデータは、個々の領域及びドナーについて計算された、「処置なし」対照のパーセンテージとして提示される。統計的有意差を、「処置なし」対照と比較して、ダンの多重比較検定を用いて、クラスカル-ワリスによりプールデータで評価した。調整されたp値は、*p<0.05、**p<0.01、***p<0.001、****p<0.0001として示される。
【0236】
結果
線維性状態 ヒトPCLSは、肺線維症を伴う二人のドナーからの肺組織から生成された。試験の完了後に提供される病理学的報告では、線維性組織が明確なUIPパターンを表し、IPFと適合性があることが述べられた(表E6を参照のこと)。
【表10】
【0237】
組織外観 PCLSを線維性肺の異なる領域から調製した。
図1A-1Bは、各ドナーの肺及び使用された領域の画像を示し、ここで、描かれた円は、PCLSを生成するために使用された組織の領域を標識する。PCLSのために使用されるものと同じ肺領域からの隣接組織コアを、その後、H&E染色のために調製し、組織の線維性リモデリングを評価した(
図2A-2Bを参照のこと)。ドナー2は、ドナー1よりも広範な組織変化を有するように見え、それは、ドナー2組織が、ずっと進行した段階中のIPFと適合性があるという病理学的報告における記述に従っている。
【0238】
組織生存率 品質管理サンプル(LPS)の組織生存率を、48時間のインキュベーション後のLDH放出により測定した。トリトンX溶解対照のLDH放出<20%が、全てのサンプルについて観察されたが、組織が、48時間の実験期間にわたって生存可能であったことを示す(
図3A-3Bを参照のこと)。
【0239】
組織応答性 品質管理サンプル(LPS)の組織応答性を、IL-1β発現により分析した。分析は、両方のドナーからのヒト線維性肺組織が、炎症促進性刺激LPSに応答し、48時間後の上方調節されたIL-1βの発現により同定されたことを示した(
図4A-4Bを参照のこと)。
【0240】
細胞外マトリックスリモデリング VI型コラーゲン形成をPRO-C6により評価した。PRO-C6の培地バックグラウンドレベルは低く、アッセイについての検出下限のレベルであった。ドナー1は、ドナー2と比較してより低いレベルのPRO-C6を示し、レベルは中程度のバックグラウンドにかなり近い。
【0241】
図5中に示されるように、全てのドナー及び領域についてのプールされたPRO-C6データは、ニンテダニブについてのPRO-C6のレベルの中央値及びmAb5(抗IL11R)の全ての濃度が、無処置(培地)対照と比較して減少したことを示した。mAb5は、用量依存的な様式においてPRO-C6を低下させた。アイソタイプ対照は、無処置(培地)対照と比較して、PRO-C6レベルの中央値における変化を示さず、わずかに増加する傾向さえあった。
【0242】
ニンテダニブの効果に基づき、肺スライスは抗線維性処置に応答性であった。なぜなら、ECMリモデリングが低下され得るためである。全体的に、ECMリモデリングに対する効果についての傾向が、mAb5抗IL-11Rα抗体で観察された。特に興味深いのは、mAb5抗体によるVI型コラーゲン形成(PRO-C6)の用量関連低下であった。いくつかの場合では、mAb5抗体は、承認された治療ニンテダニブに比べて、ECMリモデリングに対するより良好な効果を示し、この抗体が抗線維効果を有するという結論を強化した。
【配列表】
【国際調査報告】