(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-09-11
(54)【発明の名称】CD28シェディング遮断剤
(51)【国際特許分類】
C07K 16/28 20060101AFI20240904BHJP
C07K 16/46 20060101ALI20240904BHJP
C12P 21/08 20060101ALI20240904BHJP
A61K 39/395 20060101ALI20240904BHJP
A61K 47/65 20170101ALI20240904BHJP
A61K 47/56 20170101ALI20240904BHJP
A61K 47/59 20170101ALI20240904BHJP
A61P 35/00 20060101ALI20240904BHJP
A61P 37/08 20060101ALI20240904BHJP
A61P 29/00 20060101ALI20240904BHJP
A61P 19/02 20060101ALI20240904BHJP
A61P 17/02 20060101ALI20240904BHJP
A61P 25/00 20060101ALI20240904BHJP
A61P 3/10 20060101ALI20240904BHJP
A61P 1/04 20060101ALI20240904BHJP
C12N 15/13 20060101ALN20240904BHJP
C12N 15/63 20060101ALN20240904BHJP
【FI】
C07K16/28
C07K16/46 ZNA
C12P21/08
A61K39/395 N
A61K47/65
A61K47/56
A61K47/59
A61P35/00
A61P37/08
A61P29/00
A61P29/00 101
A61P19/02
A61P17/02
A61P25/00
A61P3/10
A61P1/04
C12N15/13
C12N15/63 Z
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024538512
(86)(22)【出願日】2022-09-06
(85)【翻訳文提出日】2024-04-18
(86)【国際出願番号】 IL2022050972
(87)【国際公開番号】W WO2023031943
(87)【国際公開日】2023-03-09
(32)【優先日】2021-09-06
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(32)【優先日】2021-09-06
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(32)【優先日】2022-06-01
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】522359671
【氏名又は名称】ビオンド バイオロジックス リミテッド
(74)【代理人】
【識別番号】100114775
【氏名又は名称】高岡 亮一
(74)【代理人】
【識別番号】100121511
【氏名又は名称】小田 直
(74)【代理人】
【識別番号】100202751
【氏名又は名称】岩堀 明代
(74)【代理人】
【識別番号】100208580
【氏名又は名称】三好 玲奈
(74)【代理人】
【識別番号】100191086
【氏名又は名称】高橋 香元
(72)【発明者】
【氏名】フリドマン-ドロール,アンナ
(72)【発明者】
【氏名】ガバイ,タル
(72)【発明者】
【氏名】ハキム,モッティ
(72)【発明者】
【氏名】チェン ゼルツバーグ,ライラック
(72)【発明者】
【氏名】ルコウィッツ,アヤラ
(72)【発明者】
【氏名】マンデル,イラナ
(72)【発明者】
【氏名】ベン-モシェ,テヒラ
(72)【発明者】
【氏名】サピール,ヤイール
(72)【発明者】
【氏名】シュルマン,アヴィドール
【テーマコード(参考)】
4B064
4C076
4C085
4H045
【Fターム(参考)】
4B064AG27
4B064CA19
4B064CC24
4B064CE12
4B064DA01
4C076AA95
4C076CC27
4C076EE41
4C076EE59
4C085AA14
4C085AA38
4C085BB11
4C085DD62
4C085EE01
4C085EE06
4H045AA11
4H045AA20
4H045AA30
4H045CA40
4H045DA76
4H045EA20
4H045GA26
(57)【要約】
CD28切断を遮断する単一ドメイン抗体(sdAb)が提供される。sdAbおよび/または二量体剤を使用する方法ならびにsdAbおよび/または二量体剤を含む医薬組成物およびキットと同様に、二量体剤、少なくとも2つの膜CD28結合剤も提供される。
【特許請求の範囲】
【請求項1】
3つのCDRを含む、単一ドメイン抗体(sdAb)であって、
CDR1が配列番号1(INSMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号2(AINEKLLIYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号3(DLYGSDYWD)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号4(INAMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号5(AISGGGDTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号6(DMIEQQWWY)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号4(INAMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号5(AISGGGDTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号7(DTHRGVYWY)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号8(IKTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号9(AINYIKEIYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号11(INSMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号12(AISNAREVYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号13(DVYFQEYWY)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号14(INTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号15(AINSISRTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号8(IKTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号16(AIASDNRKYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含む;
CDR1が配列番号17(IRTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号18(AISSGREVYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号19(DMYWQDYWW)に示されるアミノ酸配列を含む;または
CDR1が配列番号1(INSMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2が配列番号20(AISDRSEKYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3が配列番号21(DHHHSDWWT)に示されるアミノ酸配列を含む;
単一ドメイン抗体(sdAb)。
【請求項2】
ラクダ科動物抗体またはサメ抗体である、請求項1に記載のsdAb。
【請求項3】
VHH抗体である、請求項1または2に記載のsdAb。
【請求項4】
N末端からCDR1までの配列が、X
1VQLVESGGGLVQX
2GX
3SLRLSCX
4ASGSX
5X
6S(配列番号X)からなり、式中、X
1がEまたはQであり、X
2がAまたはPであり、X
3がEまたはGであり、X
4がAまたはKであり、X
5がI、LまたはTであり、X
6がAまたはFであり、CDR1とCDR2との間の配列が、WYRQAPGX
7X
8X
9EX
10VX
11(配列番号X)からなり、式中、X
7がSまたはKであり、X
8がQまたはGであり、X
9がRまたはLであり、X
10がLまたはRであり、X
11がA、SまたはTのうちの1つであり、CDR2とCDR3との間の配列が、RFTX
11SRDNX
12KX
13TX
14YLQMNX
15LX
16X
17X
18DX
19X
20VYYCVV(配列番号X)からなり、式中、X
11がIまたはVであり、X
12がAまたはSであり、X
13がTまたはNであり、X
14がV、MまたはLであり、X
15がSまたはNであり、X
16がR、KまたはEであり、X
17がPまたはAであり、X
18がEまたはRであり、X
19がTまたはAであり、X
20がAまたはGであり、C末端からCDR3までの配列が、WGQGTX
21VTVSS(配列番号X)からなり、式中、X
21がQまたはLである、請求項1~3のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項5】
N末端からCDR1までの配列が、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIAS(配列番号22)からなり、CDR1とCDR2との間の配列が、WYRQAPGSQRELVX(配列番号48)からなり、CDR2とCDR3との間の配列が、RFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVV(配列番号24)からなり、C末端からCDR3までの配列が、WGQGTQVTVSS(配列番号25)からなり、式中、XがAまたはTである、請求項4に記載のsdAb。
【請求項6】
以下からなる群から選択される配列を含む、請求項1~5のいずれか一項に記載のsdAb:
a.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAINEKLLIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号26);
b.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMIEQQWWYWGQGTQVTVSS(配列番号27);
c.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDTHRGVYWYWGQGTQVTVSS(配列番号28);
d.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVAAINYIKEIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号29);
e.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMAWYRQAPGSQRELVAAISNAREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVYFQEYWYWGQGTQVTVSS(配列番号30);
f.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINTMAWYRQAPGSQRELVAAINSISRTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号31);
g.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号32);
h.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGKQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号70);
i.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSIASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号71);
j.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号72);
k.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSTASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号73);
l.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGKGRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号74);
m.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSS(配列番号33);
n.EVQLVESGGGLVQPGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSS(配列番号75);
o.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSIASIRTMAWYRQAPGKGLELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号76);
p.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSTASIRTMAWYRQAPGKGLELVSAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号77);
q.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGKGLELVSAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号78);または
r.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAISDRSEKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDHHHSDWWTWGQGTQVTVSS(配列番号34)。
【請求項7】
CD28アゴニストではない、請求項1~6のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項8】
CD28アンタゴニストではない、請求項1~7のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項9】
CD28アンタゴニストである、請求項1~7のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項10】
前記薬剤が前記mCD28を分解せず、mCD28媒介免疫細胞活性化を阻害しない、請求項1~8のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項11】
前記薬剤がCD28のストーク領域内に結合する、請求項1~10のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項12】
前記ストーク領域が、アミノ酸配列GKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号35)またはKGKHLCPSPLFPGPS(配列番号36)を含む、請求項11に記載のsdAb。
【請求項13】
前記ストーク領域が、アミノ酸配列HVKGKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号37)からなる、請求項11または12に記載のsdAb。
【請求項14】
前記薬剤が、少なくとも1つのプロテアーゼのための切断部位で結合する、請求項1~13のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項15】
前記薬剤が、少なくとも1つのプロテアーゼによるタンパク質分解性切断を阻害する、請求項1~14のいずれか一項に記載のsdAb。
【請求項16】
前記少なくとも1つのプロテアーゼが、少なくとも1つのメタロプロテアーゼである、請求項14または15に記載のsdAb。
【請求項17】
前記少なくとも1つのメタロプロテアーゼが、MMP-2、MMP-13、またはそれらの組み合わせである、請求項16に記載のsdAb。
【請求項18】
少なくとも2つの膜CD28(mCD28)結合単一ドメイン抗体(sdAb)を含む、二量体剤であって、第1のmCD28結合sdAbがリンカーによって第2のmCD28結合sdAbに連結されている、二量体剤。
【請求項19】
前記第1のsdAb、前記第2のsdAb、またはその両方が、以下からなる群から選択される配列を含む、請求項18に記載の二量体剤:
a.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号40);
b.EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSLFSINAMAWYRQAPGKQRELVAAITSSGSTNYANSVKGRFTVSRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCVVDEYGSDYWIWGQGTQVTVSS(配列番号95);および
c.QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIFSINAMGWYRQAPGKQRERVAAITSGGSTNYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNNLEPRDAGVYYCVVDLYGEDYWIWGQGTQVTVSS(配列番号96)。
【請求項20】
請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbを含む、請求項18に記載の二量体剤。
【請求項21】
前記第1のsdAbおよび前記第2のsdAbが同じ配列を含む、請求項18~20のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項22】
前記第1のsdAbおよび前記第2のsdAbが異なる配列を含む、請求項18~20のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項23】
前記mCD28のタンパク質分解性切断を阻害する、請求項18~22のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項24】
二量体剤の一部ではない場合の前記第1のsdAb、前記第2のsdAbまたはその両方がCD28アンタゴニストであり、前記二量体剤がCD28アンタゴニストではない、請求項18~23のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項25】
前記第1のsdAbを含む第1のポリペプチドと、前記第2のsdAbを含む第2のポリペプチドとを含み、前記リンカーが、前記第1のポリペプチドと前記第2のポリペプチドとを連結する、請求項18~24のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項26】
前記第1のポリペプチドが、前記第1のsdAbの外側に第1の遊離システインアミノ酸を含み、前記第2のポリペプチドが、前記第2のsdAbの外側に第2の遊離システインアミノ酸を含み、前記リンカーが、前記第1の遊離システインアミノ酸および前記第2の遊離システインアミノ酸の間の結合を含む、請求項25に記載の二量体剤。
【請求項27】
前記第1の遊離システイン、前記第2の遊離システイン、またはその両方がC末端アミノ酸である、請求項26に記載の二量体剤。
【請求項28】
前記第1のポリペプチドが、前記第1のsdAbおよび第1の二量体化ドメインを含み、前記第2のポリペプチドが、前記第2のsdAbおよび第2の二量体化ドメインを含み、前記リンカーが、前記二量体化ドメイン、前記二量体化ドメイン間の結合、またはその両方を含む、請求項25~27のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項29】
前記第1の二量体化ドメインが、第1の免疫グロブリン(Ig)ヒンジドメインを含み、前記第2の二量体化ドメインが、第2のIgヒンジドメインを含み、前記リンカーが、前記第1のIgヒンジドメインと前記第2のIgヒンジドメインとの間にジスルフィド結合を含む、請求項28に記載の二量体剤。
【請求項30】
前記第1のsdAbがN末端から前記第1の二量体化ドメインまでであるか、前記第2のsdAbがN末端から前記第2の二量体化ドメインまでであるか、またはその両方である、請求項28または29に記載の二量体剤。
【請求項31】
前記Igヒンジドメインが、アミノ酸配列DKTHTCPPCPAPE(配列番号83)またはESKYGPPCPPCPAPEFEGG(配列番号85)を含むヒトIgヒンジドメインである、請求項29または30に記載の二量体剤。
【請求項32】
前記第1のsdAbがアミノ酸リンカーによって前記第1のIgヒンジドメインから分離されるか、前記第2のsdAbがアミノ酸リンカーによって前記第2のIgヒンジドメインから分離されるか、またはその両方である、請求項29~31のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項33】
前記アミノ酸リンカーが可撓性リンカーである、請求項32に記載の二量体剤。
【請求項34】
前記アミノ酸リンカーが、(GGGGS)n、(GS)n、(GGS)n、(GSGGS)n、(EGGGS)n、(EGGS)nおよびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、nが1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である、請求項32または33に記載の二量体剤。
【請求項35】
前記第1の二量体化ドメイン、前記第2の二量体化ドメインまたは両方が、Ig重鎖のCH2ドメインをさらに含む、請求項28~34のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項36】
前記第1の二量体化ドメイン、前記第2の二量体化ドメインまたは両方が、Ig重鎖のCH3ドメインをさらに含む、請求項35に記載の二量体剤。
【請求項37】
前記ヒンジドメインがN末端から前記CH2ドメインまでであり、前記CH2ドメインがN末端から前記CH3ドメインまでである、請求項36に記載の二量体剤。
【請求項38】
前記二量体化ドメインが、抗体依存性細胞傷害(ADCC)もしくは補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導しないか、またはADCCもしくはCDCを減少させる少なくとも1つの変異を含む、請求項27~37のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項39】
前記二量体化ドメインが、DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号39)またはESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号92)を含む、請求項38に記載の二量体剤。
【請求項40】
EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号93)を含む、請求項39に記載の二量体剤。
【請求項41】
EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号94)を含む、請求項39に記載の二量体剤。
【請求項42】
CD28へのリガンドの結合を阻害しないか、または低度に阻害し、低度の阻害が、50%未満の阻害を含む、請求項1~41のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項43】
前記リガンドが、CD86、CD80またはその両方である、請求項42に記載の二量体剤。
【請求項44】
前記リンカーが化学的リンカーである、請求項18~25のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項45】
前記化学的リンカーが生体適合性ポリマーを含む、請求項44に記載の二量体剤。
【請求項46】
前記生体適合性ポリマーがポリエチレングリコール(PEG)を含む、請求項45に記載の二量体剤。
【請求項47】
単一ポリペプチドを含み、前記単一ポリペプチドが、前記第1のsdAbのN末端から前記第2のsdAbまでを含み、13個未満のアミノ酸のアミノ酸リンカーによって分離されている、請求項18~25のいずれか一項に記載の二量体剤であって、場合により、CD28アンタゴニストではないか、CD28へのリガンド結合を50%未満阻害するか、またはその両方である、二量体剤。
【請求項48】
単一ポリペプチドを含み、前記単一ポリペプチドが、前記第1のsdAbのN末端から前記第2のsdAbまでを含み、10個以上のアミノ酸のアミノ酸リンカーによって分離されている、請求項18~25のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項49】
前記アミノ酸リンカーが、正味の中性電荷を含む、請求項48に記載の二量体剤。
【請求項50】
前記アミノ酸リンカーが、(GGGGS)n、(GS)n、(GGS)n、(GSGGS)n、およびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、nが1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である、請求項48または49に記載の二量体剤。
【請求項51】
前記アミノ酸リンカーが、正味の正電荷を含む、請求項48に記載の二量体剤。
【請求項52】
前記アミノ酸リンカーが、(XGGGS)n、(XGGS)n、(GGGXS)n、およびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、Xが、K、RおよびHから選択され、nが、1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である、請求項48~51のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項53】
XがKである、請求項52に記載の二量体剤。
【請求項54】
前記アミノ酸リンカーが、正味の負電荷を含む、請求項48に記載の二量体剤。
【請求項55】
前記アミノ酸リンカーが、(XGGGS)n、(XGGS)n、(GGGXS)n、およびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、Xが、EおよびDから選択され、nが、1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である、請求項48~54のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項56】
XがEである、請求項55に記載の二量体剤。
【請求項57】
前記アミノ酸リンカーが剛性リンカーである、請求項48に記載の二量体剤。
【請求項58】
前記アミノ酸リンカーが、GGGGSAEAAAKEAAAKEAAAKAAAGSGGGGS(配列番号97)を含む、請求項57に記載の二量体剤。
【請求項59】
前記アミノ酸リンカーが、最大で100個のアミノ酸を含む、請求項48~58のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項60】
CD28アンタゴニストである、請求項48~59のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項61】
CD28へのリガンドの結合を阻害し、阻害が少なくとも50%の阻害を含む、請求項48~60のいずれか一項に記載の二量体剤。
【請求項62】
可溶性CD28(sCD28)レベルの低下を必要とする対象においてsCD28レベルを低下させる方法であって、請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項18~61のいずれか一項に記載の二量体剤を前記対象に投与し、それによりsCD28を低下させることを含む、方法。
【請求項63】
癌の治療および/または予防を必要とする対象において癌を治療および/または予防する方法であって、請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項18~61のいずれか一項に記載の二量体剤を前記対象に投与し、それにより癌を治療および/または予防することを含む、方法。
【請求項64】
PD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法の改善を必要とする対象においてPD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法を改善する方法であって、請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項18~61のいずれか一項に記載の二量体剤を前記対象に投与し、それによりPD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法を改善することを含む、方法。
【請求項65】
前記対象が癌に罹患している、請求項62または64に記載の方法。
【請求項66】
前記癌が、黒色腫、頭頸部癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、腎癌、胃癌および結腸直腸癌から選択される、請求項63または65に記載の方法。
【請求項67】
前記癌が、レベルが上昇したsCD28またはレベルが上昇しているsCD28を含む、請求項63、65または66に記載の方法。
【請求項68】
mCD28を分解しない、請求項62~67のいずれか一項に記載の方法。
【請求項69】
mCD28媒介免疫細胞活性化を低下させない、請求項62~68のいずれか一項に記載の方法。
【請求項70】
mCD28へのリガンド結合を阻害する方法であって、前記mCD28を請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項48~61のいずれか一項に記載の二量体剤と接触させ、それによりmCD28へのリガンド結合を阻害することを含む、方法。
【請求項71】
免疫応答の抑制を必要とする対象において免疫応答を抑制するための方法であって、請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項48~61のいずれか一項に記載の二量体剤を前記対象に投与し、それにより免疫応答を抑制することを含む、方法。
【請求項72】
前記二量体剤が、mCD28へのリガンド結合を阻害し、それにより免疫応答を抑制する、請求項71に記載の方法。
【請求項73】
前記リガンドが、CD86、CD80またはその両方である、請求項70または72に記載の方法。
【請求項74】
前記対象が自己免疫疾患に罹患している、請求項62~73のいずれか一項に記載の方法。
【請求項75】
前記自己免疫疾患が、ループス、関節リウマチ、クローン病、炎症性腸疾患、ベーチェット病、大腸炎、潰瘍性大腸炎、糖尿病、グレーブス病および多発性硬化症からなる群から選択される、請求項74に記載の方法。
【請求項76】
請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項18~61のいずれか一項に記載の二量体剤と、薬学的に許容される担体、賦形剤またはアジュバントとを含む、医薬組成物。
【請求項77】
癌の治療および/もしくは予防に使用するため、またはPD-1および/もしくはPD-L1ベースの免疫療法を改善するための、請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項18~47のいずれか一項に記載の二量体剤を含む、請求項76に記載の医薬組成物。
【請求項78】
リガンドのmCD28への結合の阻害に使用するため、または免疫応答を抑制するための、請求項1~17のいずれか一項に記載のsdAbまたは請求項48~61のいずれか一項に記載の二量体剤を含む、請求項76に記載の医薬組成物。
【請求項79】
請求項1~17のいずれか一項に記載の少なくとも1つのsdAbまたは請求項18~61のいずれか一項に記載の二量体剤を含む、キット。
【請求項80】
a.抗PD-1および/またはPD-L1免疫療法;ならびに
b.本発明の前記薬剤がPD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法と共に使用するためのものであることを記載するラベル
のうち少なくとも1つをさらに含む、請求項79に記載のキット。
【請求項81】
細胞の表面上のmCD28のタンパク質分解性切断を阻害する二量体剤を生成する方法であって、
a.i.細胞表面のmCD28に結合し、プロテアーゼによる前記mCD28の切断を遮断する薬剤を得ること;
ii.前記薬剤の第1の部分を前記薬剤の第2の部分にリンカーを介して連結して、二量体剤を生成すること;
iii.プロテアーゼによる細胞表面上のmCD28の切断を遮断する前記二量体剤の能力を試験すること;および
iv.細胞表面上のmCD28の切断を遮断する二量体剤を選択すること;
ならびに
b.二量体剤をコードする1つ以上の核酸配列を含む1つ以上のベクターを含む宿主細胞を培養することであって、前記1つ以上の核酸配列が、
i.細胞表面上のmCD28に結合し、プロテアーゼによる前記mCD28の切断を遮断する薬剤を得ること;
ii.前記薬剤の第1の部分を前記薬剤の第2の部分にリンカーを介して連結して、二量体剤を生成すること;
iii.プロテアーゼによる細胞表面上のmCD28の切断を遮断する前記二量体剤の能力を試験すること;および
iv.細胞表面上のmCD28の切断を遮断する薬剤を選択すること
によって選択される二量体剤のものであること;
のうちの少なくとも1つを含み、
それによって、細胞の表面上のmCD28のタンパク質分解性切断を阻害する薬剤を生成する、
方法。
【請求項82】
前記得られた薬剤がsdAbである、請求項81に記載の方法。
【請求項83】
前記薬剤を得ることが、
a.サメまたはラクダ科動物をCD28の細胞外ドメインまたはそのフラグメントで免疫化し、前記免疫化された生物から抗体を収集すること、またはCD28の細胞外ドメインまたはそのフラグメントに結合するための薬剤のライブラリーをスクリーニングし、結合する薬剤を選択すること;
b.細胞表面上のmCD28に結合する前記抗体または薬剤の結合を試験し、細胞表面上のmCD28に結合する抗体または薬剤を選択すること;ならびに
c.プロテアーゼおよび前記選択された抗体または薬剤、および細胞上の前記mCD28の切断を遮断するさらなる選択された抗体または薬剤の存在下で、細胞上のmCD28の切断を試験すること
を含む、請求項81または82に記載の方法。
【請求項84】
前記細胞外ドメインまたはそのフラグメントが、
a.二量体であるか、
b.CD28ストークドメインを含むか;または
c.その両方である、
請求項83に記載の方法。
【請求項85】
前記プロテアーゼが、MMP-2およびMMP-13から選択される、請求項81~84のいずれか一項に記載の方法。
【請求項86】
前記得られた二量体剤の存在下でmCD28下流シグナル伝達をアッセイすること、およびmCD28シグナル伝達に実質的にアゴナイズせず、実質的に拮抗もしない少なくとも1つの二量体剤を選択することをさらに含む、請求項81~85のいずれか一項に記載の方法。
【請求項87】
前記得られた二量体剤の存在下でmCD28下流シグナル伝達をアッセイすること、およびmCD28シグナル伝達に実質的に拮抗する少なくとも1つの二量体剤を選択することをさらに含む、請求項81~85のいずれか一項に記載の方法。
【請求項88】
請求項81~87のいずれか一項に記載の方法によって製造された二量体剤。
【請求項89】
請求項88に記載の二量体剤と、薬学的に許容される担体、賦形剤またはアジュバントとを含む、医薬組成物。
【請求項90】
癌の治療および/もしくは予防に使用するため、またはPD-1および/もしくはPD-L1ベースの免疫療法を改善するための、請求項86に記載の方法で製造された二量体剤を含む、請求項89に記載の医薬組成物。
【請求項91】
リガンドのmCD28への結合の阻害に使用するため、または免疫応答を抑制するための、請求項87に記載の方法で製造された二量体剤を含む、請求項89に記載の医薬組成物。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願の相互参照
本出願は、2021年9月6日に出願された米国仮特許出願第63/241,010号、2021年9月6日に出願された米国仮特許出願第63/241,011号、および2022年6月1日に出願された米国仮特許出願第63/347,756号の優先権の利益を主張し、これらの内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【0002】
本発明は、免疫調節および免疫療法の分野にある。
【背景技術】
【0003】
適応免疫系は、主に抗原特異的ヘルパーCD4+および細胞傷害性CD8+T細胞の刺激を調整することによって、病原体および癌細胞に対する調節および防御において重要な役割を果たす。抗原提示細胞(APC)によるT細胞の永続的かつ持続的な活性化は、i)T細胞受容体(TCR)と、APC上の主要な組織適合性遺伝子複合体(MHC)によって提示されるペプチドとの係合;ならびにii)APCによっても発現されるB7-1(CD80)およびB7-2(CD86)リガンドに結合するT細胞上の共刺激性CD28受容体、を必要とする。CD28共刺激の生物学的帰結は数多くあり、T細胞周期の制御、拡大、分化、ならびに免疫エフェクター機能を達成するために必要な閾値を低下させることによるTCR刺激の増幅を含む。
【0004】
国際特許出願公開第2019175885号は、可溶性CD28(sCD28)が、CD28のストークドメインのタンパク質分解性切断、および原形質膜からのCD28の細胞外ドメインの能動的シェディング(active shedding)によって産生されることを開示している。このシェディングを阻害し、したがって免疫応答を増強する、CD28に対する抗体の使用も開示される。PD-1/PD-L1ベースの免疫療法の強化のおける、これらの抗体の使用も開示される。重要なことに、これらの抗体はまた、CD28アゴニストまたはアンタゴニスト効果を有さず、したがって免疫活性化を無差別に増強せず、CD86のそのリガンドCD28への結合を遮断することによる活性化を阻害しない。CD28のタンパク質分解性シェディング(proteolytic shedding)を阻害し、免疫療法を増強し、CD28アンタゴニストとして作用しない優れた分子が必要とされている。
【先行技術文献】
【特許文献】
【0005】
【特許文献1】国際特許出願公開第2019175885号
【発明の概要】
【0006】
本発明は、CD28切断を遮断する単一ドメイン抗体(sdAb)を提供する。sdAbを含む二量体剤、sdAbおよび/または二量体剤を使用する方法、ならびにsdAbおよび/または二量体剤を含む医薬組成物およびキットも提供される。
【0007】
第1の態様によれば、3つのCDRを含む単一ドメイン抗体(sdAb)が提供され、ここで
CDR1は配列番号1(INSMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号2(AINEKLLIYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号3(DLYGSDYWD)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号4(INAMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号5(AISGGGDTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号6(DMIEQQWWY)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号4(INAMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号5(AISGGGDTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号7(DTHRGVYWY)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号8(IKTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号9(AINYIKEIYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号11(INSMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号12(AISNAREVYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号13(DVYFQEYWY)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号14(INTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号15(AINSISRTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号8(IKTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号16(AIASDNRKYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含むか、
CDR1は配列番号17(IRTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号18(AISSGREVYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号19(DMYWQDYWW)に示されるアミノ酸配列を含むか、または
CDR1は配列番号1(INSMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号20(AISDRSEKYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号21(DHHHSDWWT)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0008】
いくつかの実施形態によれば、sdAbはラクダ科動物抗体またはサメ抗体である。
【0009】
いくつかの実施形態によれば、sdAbはVHH抗体である。
【0010】
いくつかの実施形態によれば、N末端からCDR1までの配列は、X1VQLVESGGGLVQX2GX3SLRLSCX4ASGSX5X6S(配列番号X)からなり、式中、X1はEまたはQであり、X2はAまたはPであり、X3はEまたはGであり、X4はAまたはKであり、X5はI、LまたはTであり、X6はAまたはFであり、CDR1とCDR2との間の配列は、WYRQAPGX7X8X9EX10VX11(配列番号X)からなり、式中、X7はSまたはKであり、X8はQまたはGであり、X9はRまたはLであり、X10はLまたはRであり、X11はA、SまたはTのうちの1つであり、CDR2とCDR3との間の配列は、RFTX11SRDNX12KX13TX14YLQMNX15LX16X17X18DX19X20VYYCVV(配列番号X)からなり、式中、X11はIまたはVであり、X12はAまたはSであり、X13はTまたはNであり、X14はV、MまたはLであり、X15はSまたはNであり、X16はR、KまたはEであり、X17はPまたはAであり、X18はEまたはRであり、X19はTまたはAであり、X20はAまたはGであり、C末端からCDR3までの配列は、WGQGTX21VTVSS(配列番号X)からなり、式中、X21はQまたはLである。
【0011】
いくつかの実施形態によれば、N末端からCDR1までの配列は、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIAS(配列番号22)からなり、CDR1とCDR2との間の配列は、WYRQAPGSQRELVX(配列番号48)からなり、CDR2とCDR3との間の配列は、RFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVV(配列番号24)からなり、C末端CDR3までの配列は、WGQGTQVTVSS(配列番号25)からなり、式中、XはAまたはTである。
【0012】
いくつかの実施形態によれば、sdAbは、以下からなる群から選択される配列を含む:
a.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAINEKLLIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号26);
b.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMIEQQWWYWGQGTQVTVSS(配列番号27);
c.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDTHRGVYWYWGQGTQVTVSS(配列番号28);
d.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVAAINYIKEIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号29);
e.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMAWYRQAPGSQRELVAAISNAREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVYFQEYWYWGQGTQVTVSS(配列番号30);
f.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINTMAWYRQAPGSQRELVAAINSISRTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号31);
g.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号32);
h.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGKQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号70);
i.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSIASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号71);
j.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号72);
k.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSTASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号73);
l.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGKGRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号74);
m.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSS(配列番号33);
n.EVQLVESGGGLVQPGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSS(配列番号75);
o.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSIASIRTMAWYRQAPGKGLELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号76);
p.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSTASIRTMAWYRQAPGKGLELVSAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号77);
q.EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGKGLELVSAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号78);または
r.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAISDRSEKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDHHHSDWWTWGQGTQVTVSS(配列番号34)。
【0013】
いくつかの実施形態によれば、sdAbは、CD28アゴニストではない。
【0014】
いくつかの実施形態によれば、sdAbは、CD28アンタゴニストではない。
【0015】
いくつかの実施形態によれば、sdAbは、CD28アンタゴニストである。
【0016】
いくつかの実施形態によれば、薬剤は、mCD28を分解せず、mCD28媒介性の免疫細胞活性化も阻害しない。
【0017】
いくつかの実施形態によれば、薬剤はCD28のストーク領域内に結合する。
【0018】
いくつかの実施形態によれば、ストーク領域は、アミノ酸配列GKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号35)またはKGKHLCPSPLFPGPS(配列番号36)を含む。
【0019】
いくつかの実施形態によれば、ストーク領域は、アミノ酸配列HVKGKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号37)からなる。
【0020】
いくつかの実施形態によれば、薬剤は、少なくとも1つのプロテアーゼのための切断部位で結合する。
【0021】
いくつかの実施形態によれば、薬剤は、少なくとも1つのプロテアーゼによるタンパク質分解性切断を阻害する。
【0022】
いくつかの実施形態によれば、少なくとも1つのプロテアーゼは、少なくとも1つのメタロプロテアーゼである。
【0023】
いくつかの実施形態によれば、少なくとも1つのメタロプロテアーゼは、MMP-2、MMP-13、またはそれらの組み合わせである。
【0024】
別の態様によれば、少なくとも2つの膜CD28(mCD28)結合単一ドメイン抗体(sdAb)を含み、第1のmCD28結合sdAbがリンカーによって第2のmCD28結合sdAbに連結されている、二量体剤が提供される。
【0025】
いくつかの実施形態によれば、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、以下からなる群から選択される配列を含む:
a.EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号40);
b.EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSLFSINAMAWYRQAPGKQRELVAAITSSGSTNYANSVKGRFTVSRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCVVDEYGSDYWIWGQGTQVTVSS(配列番号95);および
c.QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIFSINAMGWYRQAPGKQRERVAAITSGGSTNYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNNLEPRDAGVYYCVVDLYGEDYWIWGQGTQVTVSS(配列番号96)。
【0026】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、本発明のsdAbを含む。
【0027】
いくつかの実施形態によれば、第1のsdAbおよび第2のsdAbは同じ配列を含む。
【0028】
いくつかの実施形態によれば、第1のsdAbおよび第2のsdAbは異なる配列を含む。
【0029】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、mCD28のタンパク質分解性切断を阻害する。
【0030】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤の一部ではない場合の第1のsdAb、第2のsdAbまたはその両方は、CD28アンタゴニストであり、二量体剤はCD28アンタゴニストではない。
【0031】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、第1のsdAbを含む第1のポリペプチドと、第2のsdAbを含む第2のポリペプチドとを含み、リンカーは、第1のポリペプチドと第2のポリペプチドとを連結する。
【0032】
いくつかの実施形態によれば、第1のポリペプチドは、第1のsdAbの外側に第1の遊離システインアミノ酸を含み、第2のポリペプチドは、第2のsdAbの外側に第2の遊離システインアミノ酸を含み、リンカーは、第1および第2の遊離システインアミノ酸の間の結合を含む。
【0033】
いくつかの実施形態によれば、第1の遊離システイン、第2の遊離システインまたはその両方は、C末端アミノ酸である。
【0034】
いくつかの実施形態によれば、第1のポリペプチドは、第1のsdAbおよび第1の二量体化ドメインを含み、第2のポリペプチドは、第2のsdAbおよび第2の二量体化ドメインを含み、リンカーは、二量体化ドメイン、二量体化ドメイン間の結合、またはその両方を含む。
【0035】
いくつかの実施形態によれば、第1の二量体化ドメインは、第1の免疫グロブリン(Ig)ヒンジドメインを含み、第2の二量体化ドメインは、第2のIgヒンジドメインを含み、リンカーは、第1のIgヒンジドメインと第2のIgヒンジドメインとの間にジスルフィド結合を含む。
【0036】
いくつかの実施形態によれば、第1のsdAbがN末端から第1の二量体化ドメインまでであるか、第2のsdAbがN末端から第2の二量体化ドメインまでであるか、またはその両方である。
【0037】
いくつかの実施形態によれば、Igヒンジドメインは、アミノ酸配列DKTHTCPPCPAPE(配列番号83)またはESKYGPPCPPCPAPEFEGG(配列番号85)を含むヒトIgヒンジドメインである。
【0038】
いくつかの実施形態によれば、第1のsdAbがアミノ酸リンカーによって第1のIgヒンジドメインから分離されるか、第2のsdAbがアミノ酸リンカーによって第2のIgヒンジドメインから分離されるか、またはその両方である。
【0039】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは可撓性リンカーである。
【0040】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは、(GGGGS)n、(GS)n、(GGS)n、(GSGGS)n、(EGGGS)n、(EGGS)nおよびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、ここで、nは、1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である。
【0041】
いくつかの実施形態によれば、第1の二量体化ドメイン、第2の二量体化ドメインまたは両方は、Ig重鎖のCH2ドメインをさらに含む。
【0042】
いくつかの実施形態によれば、第1の二量体化ドメイン、第2の二量体化ドメインまたは両方は、Ig重鎖のCH3ドメインをさらに含む。
【0043】
いくつかの実施形態によれば、ヒンジドメインは、N末端からCH2ドメインまでであり、CH2ドメインは、N末端からCH3ドメインまでである。
【0044】
いくつかの実施形態によれば、二量体化ドメインは、抗体依存性細胞傷害(ADCC)もしくは補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導しないか、またはADCCもしくはCDCを減少させる少なくとも1つの変異を含む。
【0045】
いくつかの実施形態によれば、二量体化ドメインは、DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号39)またはESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号92)を含む。
【0046】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号93)を含む。
【0047】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号94)を含む。
【0048】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、CD28へのリガンドの結合を阻害しないか、または低度に阻害し、低度の阻害は、50%未満の阻害を含む。
【0049】
いくつかの実施形態によれば、リガンドは、CD86、CD80またはその両方である。
【0050】
いくつかの実施形態によれば、リンカーは化学的リンカーである。
【0051】
いくつかの実施形態によれば、化学的リンカーは、生体適合性ポリマーを含む。
【0052】
いくつかの実施形態によれば、生体適合性ポリマーは、ポリエチレングリコール(PEG)を含む。
【0053】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、単一のポリペプチドを含み、単一のポリペプチドは、第1のsdAbのN末端から第2のsdAbまでを含み、13個未満のアミノ酸のアミノ酸リンカーによって分離されており、場合により、二量体剤はCD28アンタゴニストではないか、CD28へのリガンド結合を50%未満阻害するか、またはその両方である。
【0054】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、単一ポリペプチドを含み、単一ポリペプチドは、第1のsdAbのN末端から第2のsdAbまでを含み、10個以上のアミノ酸のアミノ酸リンカーによって分離されている。
【0055】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは正味の中性電荷を含む。
【0056】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは、(GGGGS)n、(GS)n、(GGS)n、(GSGGS)n、およびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、ここで、nは、1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である。
【0057】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは正味の正電荷を含む。
【0058】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは、(XGGGS)n、(XGGS)n、(GGGXS)n、およびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、Xは、K、RおよびHから選択され、nは、1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である。
【0059】
いくつかの実施形態によれば、XはKである。
【0060】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは正味の負電荷を含む。
【0061】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは、(XGGGS)n、(XGGS)n、(GGGXS)n、およびそれらの組み合わせから選択される配列を含み、Xは、EおよびDから選択され、nは、1、2、3、4、5、6、7および8から選択される整数である。
【0062】
いくつかの実施形態によれば、XはEである。
【0063】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは剛性リンカーである。
【0064】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは、GGGGSAEAAAKEAAAKEAAAKAAAGSGGGGS(配列番号97)を含む。
【0065】
いくつかの実施形態によれば、アミノ酸リンカーは、最大で100個のアミノ酸を含む。
【0066】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、CD28アンタゴニストである。
【0067】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、CD28へのリガンドの結合を阻害し、阻害は、少なくとも50%の阻害を含む。
【0068】
別の態様によれば、可溶性CD28(sCD28)レベルの低下を必要とする対象においてsCD28レベルを低下させる方法であって、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤を対象に投与し、それによりsCD28を低下させることを含む方法が提供される。
【0069】
別の態様によれば、癌の治療および/または予防を必要とする対象において癌を治療および/または予防する方法であって、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤を対象に投与し、それにより癌を治療および/または予防することを含む方法が提供される。
【0070】
別の態様によれば、PD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法の改善を必要とする対象においてPD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法を改善する方法であって、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤を対象に投与し、それによりPD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法を改善することを含む方法が提供される。
【0071】
いくつかの実施形態によれば、対象は癌に罹患している。
【0072】
いくつかの実施形態によれば、癌は、黒色腫、頭頸部癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、腎癌、胃癌および結腸直腸癌から選択される。
【0073】
いくつかの実施形態によれば、癌は、レベルが上昇したsCD28またはレベルが上昇しているsCD28を含む。
【0074】
いくつかの実施形態によれば、方法はmCD28を分解しない。
【0075】
いくつかの実施形態によれば、方法は、mCD28媒介免疫細胞活性化を減少させない。
【0076】
別の態様によれば、mCD28へのリガンド結合を阻害する方法であって、mCD28を本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤と接触させ、それによりmCD28へのリガンド結合を阻害することを含む方法が提供される。
【0077】
別の態様によれば、免疫応答の抑制を必要とする対象において免疫応答を抑制するための方法であって、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤を対象に投与し、それにより免疫応答を抑制することを含む方法が提供される。
【0078】
いくつかの実施形態によれば、二量体剤は、mCD28へのリガンド結合を阻害し、それにより免疫応答を抑制する。
【0079】
いくつかの実施形態によれば、リガンドは、CD86、CD80またはその両方である。
【0080】
いくつかの実施形態によれば、対象は、自己免疫疾患に罹患している。
【0081】
いくつかの実施形態によれば、自己免疫疾患は、ループス、関節リウマチ、クローン病、炎症性腸疾患、ベーチェット病(Becht’s disease)、大腸炎、潰瘍性大腸炎、糖尿病、グレーブス病および多発性硬化症からなる群から選択される。
【0082】
別の態様によれば、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤と、薬学的に許容される担体、賦形剤またはアジュバントとを含む、医薬組成物が提供される。
【0083】
いくつかの実施形態によれば、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤を含む本発明の医薬組成物は、癌の治療および/もしくは予防に使用するため、またはPD-1および/もしくはPD-L1ベースの免疫療法を改善するためのものである。
【0084】
いくつかの実施形態によれば、本発明のsdAbまたは本発明の二量体剤を含む本発明の医薬組成物は、mCD28へのリガンド結合の阻害に使用するため、または免疫応答を抑制するためのものである。
【0085】
別の態様によれば、本発明の少なくとも1つのsdAbまたは本発明の二量体剤を含むキットが提供される。
【0086】
いくつかの実施形態によれば、キットは、以下のうちの少なくとも1つをさらに含む:
a.抗PD-1および/またはPD-L1免疫療法;および
b.本発明の薬剤がPD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法と共に使用するためのものであることを記載するラベル。
【0087】
別の態様によれば、細胞の表面上のmCD28のタンパク質分解性切断を阻害する二量体剤を生成する方法が提供され、方法は、
a.i.細胞表面のmCD28に結合し、プロテアーゼによるmCD28の切断を遮断する薬剤を得ること;
ii.薬剤の第1の部分を薬剤の第2の部分にリンカーを介して連結して、二量体剤を生成すること;
iii.プロテアーゼによる細胞表面上のmCD28の切断を遮断する二量体剤の能力を試験すること;および
iv.細胞表面上のmCD28の切断を遮断する二量体剤を選択すること;
ならびに
b.二量体剤をコードする1つ以上の核酸配列を含む1つ以上のベクターを含む宿主細胞を培養することであって、1つ以上の核酸配列が、
i.細胞表面上のmCD28に結合し、プロテアーゼによるmCD28の切断を遮断する薬剤を得ること;
ii.薬剤の第1の部分を薬剤の第2の部分にリンカーを介して連結して、二量体剤を生成すること;
iii.プロテアーゼによる細胞表面上のmCD28の切断を遮断する二量体剤の能力を試験すること;および
iv.細胞表面上のmCD28の切断を遮断する薬剤を選択することによって選択される二量体剤のものであること;
のうちの少なくとも1つを含み、
それによって、細胞の表面上のmCD28のタンパク質分解性切断を阻害する薬剤を生成する。
【0088】
いくつかの実施形態によれば、得られた薬剤はsdAbである。
【0089】
いくつかの実施形態によれば、薬剤を得ることは以下を含む:
a.サメまたはラクダ科動物をCD28の細胞外ドメインまたはそのフラグメントで免疫化し、免疫化された生物から抗体を収集すること、またはCD28の細胞外ドメインまたはそのフラグメントに結合するための薬剤のライブラリーをスクリーニングし、結合する薬剤を選択すること;
b.細胞表面上のmCD28に結合する抗体または薬剤の結合を試験し、細胞表面上のmCD28に結合する抗体または薬剤を選択すること;ならびに
c.プロテアーゼおよび選択された抗体または薬剤、および細胞上のmCD28の切断を遮断するさらなる選択された抗体または薬剤の存在下で、細胞上のmCD28の切断を試験すること。
【0090】
いくつかの実施形態によれば、上記細胞外ドメインまたはそのフラグメントは、
a.二量体であるか、
b.CD28ストークドメインを含むか;または
c.その両方である。
【0091】
いくつかの実施形態によれば、プロテアーゼは、MMP-2およびMMP-13から選択される。
【0092】
いくつかの実施形態によれば、方法は、得られた二量体剤の存在下でmCD28下流シグナル伝達をアッセイすること、およびmCD28シグナル伝達に実質的にアゴナイズもせず、実質的に拮抗もしない少なくとも1つの二量体剤を選択することをさらに含む。
【0093】
いくつかの実施形態によれば、方法は、得られた二量体剤の存在下でmCD28下流シグナル伝達をアッセイすること、およびmCD28シグナル伝達に実質的に拮抗する少なくとも1つの二量体剤を選択することをさらに含む。
【0094】
別の態様によれば、本発明の方法によって製造される二量体剤が提供される。
【0095】
別の態様によれば、本発明の二量体剤と、薬学的に許容される担体、賦形剤またはアジュバントとを含む、医薬組成物が提供される。
【0096】
いくつかの実施形態によれば、本発明の方法によって製造された二量体剤を含む本発明の医薬組成物は、癌の治療および/もしくは予防に使用するため、またはPD-1および/もしくはPD-L1ベースの免疫療法を改善するためのものである。
【0097】
いくつかの実施形態によれば、本発明の方法によって製造された二量体剤を含む本発明の医薬組成物は、mCD28へのリガンド結合の阻害に使用するため、または免疫応答を抑制するためのものである。
【0098】
本発明のさらなる実施形態および適用可能性の全範囲は、以下に与えられる詳細な説明から明らかになるであろう。しかしながら、詳細な説明および特定の例は、本発明の好ましい実施形態を示しているが、本発明の精神および範囲内の様々な変更および修正がこの詳細な説明から当業者に明らかになるので、単なる例示として与えられていることを理解されたい。
【図面の簡単な説明】
【0099】
【
図1】
図1:親クローン(VHH#2A1)および2つの親和性成熟バリアントの存在下での、SEB刺激PBMCからの可溶性CD28の折れ線グラフ定量化。
【0100】
【
図2】
図2:親VHHまたは2つの親和性成熟バリアントの存在下での、混合リンパ球反応(MLR、+mDC)における単離T細胞からのIFNガンマ分泌の棒グラフ。VHH#3C04=陰性対照としての無関係なVHHVHH#12B07=陽性対照としての既知のCD28アンタゴニスト
【0101】
【
図3】
図3:親VHHの2つのコピーまたは2つの親和性成熟バリアントを含むFc二量体剤の存在下での、混合リンパ球反応(MLR、+mDC)における単離T細胞からのIL-2分泌の棒グラフ。ヒトIgG4を陰性対照として使用した。
【0102】
【
図4-1】
図4A-4B:(4A)直接CD28 EIAを使用した、ヒトCD28に対するVHH-hIgG4構築物、2A1-hFc、9B03-hFcおよび12A09-hFcの結合親和性の折れ線グラフ定量化。(4B)ヒトCD3細胞への2A1-hFc、9B03-hFcおよび12A09-hFc結合のヒストグラム(黒色ヒストグラム)。抗ヒトIgG検出抗体のバックグラウンドを灰色のヒストグラムで示す。
【0103】
【
図5】
図5A-5B:異なる濃度の(5A)12A09-25GS-hFc、(5B)9B03-25GS-hFcを用いた、ブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)による刺激に応答した末梢血単核細胞(PBMC)によるsCD28産生を、対応するアイソタイプ対照および親2A1-hFcクローンと比較して示す棒グラフ。
【0104】
【
図6】
図6A-6B:(6A)12A9-25GS-huFcキメラ分子の存在下で抗CD3抗体により刺激されたCD3細胞からのIL-2分泌の棒グラフ、および(6B)9B3-25GS-huFcキメラ分子の存在下で抗CD3抗体により刺激されたCD3細胞からのIL-2分泌の棒グラフ。反発性抗CD28抗体、クローン28.2を陽性対照(PC)として使用し、アイソタイプ対照を陰性対照として使用した。
【0105】
【
図7】
図7:VHH 12A9のCD28シェディング阻害活性(CD28 shedding inhibition activity)に対する可撓性リンカーサイズの効果を示す棒グラフ。2つのVHH濃度、100nM(上)および300nM(下)を試験した。
【0106】
【
図8】
図8A-8B:(8A)MC38細胞接種の6日前から開始する週に2回の12A09-hFcによる処置(予防モデル)に応答した、MC-38シンジェニック腫瘍モデルにおける腫瘍体積を示す線グラフ、(8B)MC38細胞接種の6日後から開始する週に2回の9B03-hFcによる処置(治療モデル)に応答した、MC-38シンジェニック腫瘍モデルにおける腫瘍体積を示す線グラフ。抗PD1(RMP1-14)を、MC38接種の6日後から開始して週2回投与した。ヒトIgG4およびラットIgG2aを陰性対照とした。8A:rG2a、n=10;aPD1、n=10;VHH、n=108B:rG2a、n=10;aPD1、n=10;VHH、n=10 *=0.014のpVal
【0107】
【
図9A】
図9A-9B:直接CD28 EIAを使用した、ヒトCD28に対する(9A)5つのヒト化12A09-hIgG4構築物の結合親和性の折れ線グラフ定量化、および直接CD28 EIAを使用した、ヒトCD28に対する(9B)1つのヒト化9B03-hIgG4構築物の結合親和性の折れ線グラフ定量化。両方のグラフにおいて、結合を親バリアント(黒色線)と比較した。
【0108】
【
図10】
図10A-10B:(10A)12A9-25GS-huFcキメラおよび同じキメラの5つの12A09ヒト化バリアントの存在下での、SEB刺激PBMCからの可溶性CD28の折れ線グラフ定量化、または(10B)9B3-25GS-huFcキメラおよび同じキメラのヒト化9B3バリアントVHH1の存在下での、SEB刺激PBMCからの可溶性CD28の折れ線グラフ定量化。
【0109】
【
図11-1】
図11A-11H:(11A-11B)単鎖タンデム二量体剤の段階希釈による、組換えヒトCD28-Fc融合タンパク質への抗原結合を示す線グラフ。抗原をMaxisorp ELISAプレートに固定した。二量体剤の連続希釈を予め形成し、種々の二量体剤のモル濃度を計算し、正規化して、各アッセイにおける活性部位の量を比較した。結合した抗体の検出を、抗VHH-HRP、およびTMBによる発色を用いて行った。(11C-11H)SEBで刺激したPBMCの培養培地中で測定した可溶性CD28のレベルの棒グラフ。MMP阻害剤(TMI-1、1μM)、無関係なVHHの陰性対照、または様々な濃度(0.024μM~3μM)の(11C)5GS、(11D)10GS、(11E)20GS、(11F)20K、(11G)20E、または(11H)Hel20二量体剤の様々な処置の、可溶性CD28のレベルに対する効果を示す。上清中の可溶性ヒトCD28のレベルを、標準化サンドイッチELISA(R&D system)を用いて定量した。
【0110】
【
図12-1】
図12A-12B:AlexaFlour 647にコンジュゲートした二次抗ヒトFc抗体を使用してCD86-Fc(2μg/mL)結合についてフローサイトメトリによって監視した、ヒトCD28を過剰発現しているHEK293細胞のヒストグラム。監視は、(12A)中性可撓性リンカーまたは(12B)荷電可撓性リンカー、または単鎖二量体剤を含有する剛性リンカーの存在下で行った。薄灰色線-二次抗体対照黒色線-CD86-Fc陽性対照濃灰色線-二量体分子の存在下での結合
【0111】
【
図13-1】
図13A-13I:(13A-13F)無関係な陰性対照VHH、CD80のCD28との相互作用を遮断することが知られている陽性対照(PC)VHH(PC)、および(13A)5GS、(13B)10GS、(13C)20GS、(13D)20K、(13E)20E、(13F)Hel20二量体剤の存在下で、CD28共刺激のためのリガンドとしてのCD80を発現する人工抗原提示細胞として作用するHEK/scOKT3で、24~48時間刺激されたヒト単離CD9細胞からのIL-2分泌の棒グラフ。(3G-3I)(13G)5GS、(13H)10GS、(3I)20GS二量体剤存在下での、同種異系混合リンパ球反応(MLR、+mDC)における単離T細胞からのIFNガンマ分泌の棒グラフ。
【0112】
【
図14-1】
図14A-14J:(14A-14C):(14A)単一システイン二量体分子の段階希釈による組換えヒトCD28-Fc融合タンパク質への抗原結合を示す線グラフ、(14B)PEG結合二量体分子の段階希釈による組換えヒトCD28-Fc融合タンパク質への抗原結合を示す線グラフ、(14C)Fc結合二量体分子の段階希釈による組換えヒトCD28-Fc融合タンパク質への抗原結合を示す線グラフ。 (14D-14I)SEBで刺激したPBMCの培養培地中で測定した可溶性CD28のレベルの棒グラフ。無関係なVHHの陰性対照、単量体2A1(3μM)、または種々の濃度(0.024μM~3μM)の(14D)2A1-1C、(14E)2A1-1C-bmP11、(14F)2A1-Hinge、(14G)2A1-hFC、(14H)2A1-15GS-hFc、または(14I)2A1-25GS-hFc二量体剤の異なる処置の、可溶性CD28のレベルに対する効果を示す。上清中の可溶性ヒトCD28のレベルを、標準化サンドイッチELISA(R&D system)を用いて定量した。 (14J)様々な非拮抗性二量体分子によってもたらされるCD28シェディング阻害(CD28-shedding inhibition)の要約散布図(Summary scatter plot)。
【0113】
【
図15】
図15:11回のPEG反復を有するリンカーを利用する2A1-bmp11-2A1分子の構造。
【0114】
【
図16-1】
図16A-16B:AlexaFlour 647にコンジュゲートした二次抗ヒトFc抗体を使用してCD86-Fc(2μg/mL)結合についてフローサイトメトリによって監視した、ヒトCD28を過剰発現しているHEK293細胞のヒストグラム。監視は、(16A)C末端リンカーまたは(16B)二量体剤を含有するIg系リンカーの存在下で行った。
【0115】
【
図17-1】
図17A-17F:無関係な陰性対照VHH、CD86を遮断することが知られている陽性対照VHH、および(17A)2A1-C、(17B)2A1-1C-bmP11、(17C)2A1-Hinge、(17D)2A1-huFc、(17E)2A1-15GS-huFcおよび(17F)2A1-25GS-huFc二量体剤の存在下で、CD28共刺激のためのリガンドとしてのCD80を発現する人工抗原提示細胞として作用するHEK/scOKT3で、24時間刺激されたヒト単離CD3細胞からのIL-2分泌の棒グラフ。
【0116】
【
図18-1】
図18A-18F:(18A-18E):(18A)2A1-C、(18B)2A1-1C-bmP11、(18C)2A1-huFc、(18D)2A1-15GS-huFcおよび(18E)2A1-25GS-huFc二量体剤の存在下での、混合リンパ球反応(MLR、+mDC)における単離T細胞からのIFNガンマ分泌の棒グラフ。 (18F)T細胞における免疫調節の全変化の散布図。
【発明を実施するための形態】
【0117】
本発明は、いくつかの実施形態では、CD28切断を遮断する単一ドメイン抗体(sdAb)を提供する。少なくとも2つの膜CD28(mCD28)結合単一ドメイン抗体(sdAb)を含む二量体剤も提供される。sdAbおよび/または二量体剤を投与することを含む治療方法、ならびにsdAbおよび/または二量体剤を含む組成物およびキットも提供される。
【0118】
sdAb
【0119】
第1の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号1(INSMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号2(AINEKLLIYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号3(DLYGSDYWD)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0120】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号4(INAMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号5(AISGGGDTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号6(DMIEQQWWY)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0121】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号4(INAMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号5(AISGGGDTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号7(DTHRGVYWY)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0122】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号8(IKTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号9(AINYIKEIYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0123】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号11(INSMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号12(AISNAREVYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号13(DVYFQEYWY)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0124】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号14(INTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号15(AINSISRTYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0125】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号8(IKTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号16(AIASDNRKYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号10(DVTKEDYWY)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0126】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号17(IRTMA)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号18(AISSGREVYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号19(DMYWQDYWW)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0127】
別の態様によって、3つの相補性決定領域(CDR)を含むsdAbが提供され、CDR1は配列番号1(INSMG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR2は配列番号20(AISDRSEKYYADSVKG)に示されるアミノ酸配列を含み、CDR3は配列番号21(DHHHSDWWT)に示されるアミノ酸配列を含む。
【0128】
本明細書で使用される場合、「単一ドメイン抗体」、「ナノボディ」、「DARPin」および「VHH抗体」という用語は同義語であり、互換的に使用され、単一単量体可変ドメインからなる抗体フラグメントを指す。SdAbは、抗体と同様に特異的抗原に選択的に結合することができる。しかしながら、それらはわずか12~15kDaの分子量を有し、したがって完全抗体、Fabフラグメントまたは単鎖抗体よりもはるかに小さい。その小さいサイズおよび抗原結合が3つのCDRのみに依存することに起因して、単一ドメイン抗体、具体的にはVHHの結合機構は凸状の形状であり、そのエピトープに片側のみから結合し、したがって、膜固定CD28のストーク領域のようなタンパク質裂に見られるような、限定された溶媒露出を特徴とするエピトープに結合するのにより適している。いくつかの実施形態では、sdAbはラクダ科動物抗体である。いくつかの実施形態では、ラクダ科動物は、ラクダ、アルパカまたはラマである。いくつかの実施形態では、ラクダ科動物はラクダである。いくつかの実施形態では、ラクダ科動物はアルパカである。いくつかの実施形態では、ラクダ科動物はラマである。いくつかの実施形態では、sdAbはサメ抗体である。いくつかの実施形態では、sdAbは分子中の第1のsdAbである。いくつかの実施形態では、sdAbは分子中の第2のsdAbである。いくつかの実施形態では、分子は、本発明の二量体分子である。
【0129】
また、本明細書において既に示されているように、ナノボディのアミノ酸残基は、Riechmann and Muyldermans,J.Immunol.Methods 2000 Jun.23;240(1-2):185-195の記事においてラクダ由来のVHHドメインに適用されるように、Kabat et al.(「Sequence of proteins of immunological interest」、US Public Health Services,NIH Bethesda,Md.,Publication No.91)によってもたらされた、VHのための一般的なナンバリングにしたがってナンバリングされるか、または本明細書で称される。このナンバリングによれば、ナノボディのFR1は位置1~30のアミノ酸残基を含み、ナノボディのCDR1は位置31~35のアミノ酸残基を含み、ナノボディのFR2は位置36~49のアミノ酸を含み、ナノボディのCDR2は位置50~65のアミノ酸残基を含み、ナノボディのFR3は位置66~94のアミノ酸残基を含み、ナノボディのCDR3は位置95~102のアミノ酸残基を含み、ナノボディのFR4は位置103~113のアミノ酸残基を含む。これに関して、VHドメインおよびVHHドメインについて当技術分野で周知であるように、CDRのそれぞれにおけるアミノ酸残基の総数は変動する可能性があり、Kabatナンバリングによって示されるアミノ酸残基の総数に対応しない場合があることに留意すべきである(すなわち、Kabatナンバリングに従う1つ以上の位置が実際の配列に占有されていなくてもよく、または実際の配列がKabatナンバリングによって許容される数よりも多くのアミノ酸残基を含んでもよい)。これは、一般に、Kabatによるナンバリングは、実際の配列中のアミノ酸残基の実際のナンバリングに対応しない場合があることを意味する。しかしながら、一般に、Kabatのナンバリングによれば、CDR中のアミノ酸残基の数に関係なく、Kabatナンバリングに従う位置1がFR1の開始に対応し、その逆も同様であり、Kabatナンバリングに従う位置36がFR2の開始に対応し、その逆も同様であり、Kabatナンバリングに従う位置66がFR3の開始に対応し、その逆も同様であり、Kabatナンバリングに従う位置103がFR4の開始に対応し、その逆も同様であると言える。
【0130】
ラクダ科動物のVHHドメインおよびナノボディにも類似の様式で適用することができる、VHドメインのアミノ酸残基をナンバリングするための代替方法は、Chothia et al.(Nature 342,877-883(1989))によって記載される方法、いわゆる「AbM定義」およびいわゆる「接触定義」である。しかしながら、本明細書、態様および図では、特に指示しない限り、Riechmann and MuyldermansによってVHHドメインに適用される通りに、Kabatによるナンバリングに従う。
【0131】
いくつかの実施形態では、sdAbはCD28に結合する。いくつかの実施形態では、薬剤はCD28に結合する。いくつかの実施形態では、CD28は哺乳動物CD28である。いくつかの実施形態では、CD28はヒトCD28である。いくつかの実施形態によれば、ヒトCD28は、アミノ酸配列:MLRLLLALNLFPSIQVTGNKILVKQSPMLVAYDNAVNLSCKYSYNLFSREFRASLHKGLDSAVEVCVVYGNYSQQLQVYSKTGFNCDGKLGNESVTFYLQNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS(配列番号42)を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、成熟CD28はシグナルペプチドを欠き、配列:NKILVKQSPMLVAYDNAVNLSCKYSYNLFSREFRASLHKGLDSAVEVCVVYGNYSQQLQVYSKTGFNCDGKLGNESVTFYLQNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKPFWVLVVVGGVLACYSLLVTVAFIIFWVRSKRSRLLHSDYMNMTPRRPGPTRKHYQPYAPPRDFAAYRS(配列番号43)を含む。いくつかの実施形態では、CD28シグナルペプチドは、MLRLLLALNLFPSIQVTG(配列番号41)を含むかまたはそれからなる。
【0132】
いくつかの実施形態では、完全長ヒトCD28をコードするDNAコード配列は、配列:ATGCTCAGGCTGCTCTTGGCTCTCAACTTATTCCCTTCAATTCAAGTAACAGGAAACAAGATTTTGGTGAAGCAGTCGCCCATGCTTGTAGCGTACGACAATGCGGTCAACCTTAGCTGCAAGTATTCCTACAATCTCTTCTCAAGGGAGTTCCGGGCATCCCTTCACAAAGGACTGGATAGTGCTGTGGAAGTCTGTGTTGTATATGGGAATTACTCCCAGCAGCTTCAGGTTTACTCAAAAACGGGGTTCAACTGTGATGGGAAATTGGGCAATGAATCAGTGACATTCTACCTCCAGAATTTGTATGTTAACCAAACAGATATTTACTTCTGCAAAATTGAAGTTATGTATCCTCCTCCTTACCTAGACAATGAGAAGAGCAATGGAACCATTATCCATGTGAAAGGGAAACACCTTTGTCCAAGTCCCCTATTTCCCGGACCTTCTAAGCCCTTTTGGGTGCTGGTGGTGGTTGGTGGAGTCCTGGCTTGCTATAGCTTGCTAGTAACAGTGGCCTTTATTATTTTCTGGGTGAGGAGTAAGAGGAGCAGGCTCCTGCACAGTGACTACATGAACATGACTCCCCGCCGCCCCGGGCCCACCCGCAAGCATTACCAGCCCTATGCCCCACCACGCGACTTCGCAGCCTATCGCTCCTGA(配列番号44)を含む。
【0133】
いくつかの実施形態では、CD28は膜CD28(membranal CD28)(mCD28)である。いくつかの実施形態では、膜CD28は膜CD28である。いくつかの実施形態では、mCD28は細胞表面上にある。いくつかの実施形態では、mCD28は膜中にある。
【0134】
いくつかの実施形態では、CD28は細胞外CD28である。いくつかの実施形態では、CD28はCD28の細胞外ドメイン(ECD)である。いくつかの実施形態では、CD28のECDは、MLRLLLALNLFPSIQVTGNKILVKQSPMLVAYDNAVNLSCKYSYNLFSREFRASLHKGLDSAVEVCVVYGNYSQQLQVYSKTGFNCDGKLGNESVTFYLQNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号45)を含む。いくつかの実施形態では、CD28のECDは、配列番号45からなる。いくつかの実施形態では、ECDは、NKILVKQSPMLVAYDNAVNLSCKYSYNLFSREFRASLHKGLDSAVEVCVVYGNYSQQLQVYSKTGFNCDGKLGNESVTFYLQNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKGKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号46)を含む。いくつかの実施形態では、ECDは、配列番号46からなる。いくつかの実施形態では、ECDは二量体である。いくつかの実施形態では、ECDは、ストークドメインを含む。
【0135】
いくつかの実施形態において、CD28は、CD28のストークドメインである。いくつかの実施形態では、第1のCD28結合sdAbはストークドメインに結合する。いくつかの実施形態では、第2のCD28結合sdAbはストークドメインに結合する。いくつかの実施形態では、第1および第2のCD28結合sdAbの両方がストークドメインに結合する。いくつかの実施形態では、ストークドメインは、ストーク領域である。いくつかの実施形態では、ストーク領域は、アミノ酸配列GKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号35)を含む。いくつかの実施形態では、ストーク領域は、アミノ酸配列KGKHLCPSPLFPGPS(配列番号36)を含む。いくつかの実施形態では、ストーク領域は、アミノ酸配列HVKGKHLCPSPLFPGPSKP(配列番号37)を含む。いくつかの実施形態では、ストーク領域は、配列番号35からなる。いくつかの実施形態では、ストーク領域は、配列番号36からなる。いくつかの実施形態では、ストーク領域は、配列番号37からなる。
【0136】
いくつかの実施形態では、sdAbはCD28のタンパク質分解性切断を阻害する。本明細書で使用される場合、「タンパク質分解性切断を阻害する」とは、mCD28のタンパク質分解性切断の何らかの減少を指す。いくつかの実施形態では、阻害は、少なくとも5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、97、99または100%の切断の減少である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の阻害により、免疫細胞上のmCD28のレベルが維持される。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の阻害により、免疫細胞上のmCD28のレベルが増加する。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の阻害により、免疫刺激に十分なmCD28のレベルが維持される。
【0137】
いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の減少とは、少なくとも1つのプロテアーゼによる切断の減少である。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の減少とは、少なくとも1つのメタロプロテアーゼによる切断の減少である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、MMP-2、ADAM10、ADAM17、またはそれらの組み合わせである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、MMP-2、ADAM10、ADAM17、MMP-13またはそれらの組み合わせである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはMMP-2である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、MMP-2またはMMP-13である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはMMP-2である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、MMP-2、MMP-13またはそれらの組み合わせである。
【0138】
いくつかの実施形態では、sdAbは、少なくとも1つのプロテアーゼによるタンパク質分解性切断を阻害する。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはメタロプロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはマトリックスメタロプロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはセリンプロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはシステインプロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはトレオニンプロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはセリン、システインまたはトレオニンプロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはアスパラギン酸プロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはグルタミン酸プロテアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼは、アスパラギン酸、グルタミン酸、セリン、システインおよびトレオニンプロテアーゼから選択される。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはアスパラギン酸ペプチドリアーゼである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼはシェダーゼである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはエキソペプチダーゼである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはエンドペプチダーゼである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、エキソペプチダーゼまたはエンドペプチダーゼである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは亜鉛触媒される。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはコバルト触媒される。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはマトリックスメタロプロテイナーゼ-2(MMP-2)である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはマトリックスメタロプロテイナーゼ-13(MMP-13)である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはADAM10である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼはADAM17である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、ADAM10、MMP-2、および/またはADAM17である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、ADAM10、MMP-2、MMP-13および/またはADAM17である。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、MMP-2、ADAM10、ADAM17、またはそれらの組み合わせである。いくつかの実施形態では、メタロプロテアーゼは、MMP-2、MMP-13、ADAM10、ADAM17、またはそれらの組み合わせである。
【0139】
いくつかの実施形態では、sdAbは切断部位に結合する。いくつかの実施形態では、切断部位はストーク領域内にある。いくつかの実施形態では、切断部位は切断モチーフである。いくつかの実施形態では、MMP-2切断モチーフはPXX/Xであり、最後のXは疎水性残基である。いくつかの実施形態では、CD28中のPXX/XモチーフはPSP/Lである。いくつかの実施形態では、プロテアーゼ切断部位は、配列番号42のアミノ酸142~145(PSPL)である。いくつかの実施形態では、プロテアーゼ切断部位は、配列番号43のアミノ酸127~130(PSPL)である。いくつかの実施形態では、プロテアーゼ切断部位は、配列番号37のアミノ酸9~12(PSPL)である。いくつかの実施形態では、薬剤は、切断部位へのプロテアーゼの接近を阻止する。いくつかの実施形態では、薬剤は、mCD28のストークドメイン内のPSPLに結合する。
【0140】
いくつかの実施形態では、切断部位はロイシンの前にある。いくつかの実施形態では、切断部位はバリンの前にある。いくつかの実施形態では、切断部位は芳香族アミノ酸の前にある。いくつかの実施形態では、切断部位は、ロイシン、バリンおよび/または芳香族アミノ酸の前にある。いくつかの実施形態では、芳香族アミノ酸は、フェニルアラニン、トリプトファン、チロシンおよびヒスチジンから選択される。いくつかの実施形態では、切断部位は、配列番号29のヒスチジン134、バリン135、ヒスチジン139、ロイシン140、ロイシン145、およびフェニルアラニン146のいずれか一つの前にある。いくつかの実施形態では、切断部位は、配列番号42のヒスチジン134、バリン135、ヒスチジン139、ロイシン140、ロイシン145、またはフェニルアラニン146の前にある。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、切断部位は、配列番号42のロイシン145の前である。いくつかの実施形態では、切断部位は、配列番号43のロイシン127の前である。
【0141】
いくつかの実施形態では、sdAbはアンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、sdAbは、CD28のアンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。いくつかの実施形態では、アンタゴニストは、直接的なアンタゴニストである。
【0142】
「アンタゴニスト」という用語は、一般に、アゴニストと同じ部位または別の部位で受容体に結合し、受容体を活性化せず、天然リガンドによる受容体の活性化の妨害または阻止、および受容体アゴニストによる受容体の活性化の妨害または阻止のうちの1つ以上を行う分子、化合物または薬剤を指す。いくつかの実施形態では、sdAbはCD28に結合し、受容体の活性化を遮断する。いくつかの実施形態では、薬剤および/またはsdAbは、CD86による活性化を遮断しない。いくつかの実施形態では、sdAbは、CD86による活性化を遮断する。いくつかの実施形態では、sdAbは、CD28へのリガンドの結合を遮断する。いくつかの実施形態では、sdAbは、CD28へのリガンドの結合を阻害しない。いくつかの実施形態では、sdAbは、CD28へのリガンドの結合を阻害する。いくつかの実施形態において、阻害は実質的に阻害である。いくつかの実施形態では、実質的は有意である。いくつかの実施形態では、実質的な拮抗作用は、低阻害よりも大きい。いくつかの実施形態において、実質的なアンタゴニストではない薬剤は、阻害しないかまたは低度に阻害する。いくつかの実施形態では、sdAbは、CD28へのリガンドの結合を低度に阻害する。いくつかの実施形態において、低度の阻害は、50、45、40、35、30、25、20、15、10、7または5%未満の阻害を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態において、低度の阻害は、50%未満の阻害を含む。いくつかの実施形態において、低度の阻害は、35%未満の阻害を含む。いくつかの実施形態において、低度の阻害は、20%未満の阻害を含む。いくつかの実施形態では、CD28リガンドは、CD80、CD86およびICOSLから選択される。いくつかの実施形態では、CD28リガンドはCD86である。いくつかの実施形態では、CD28リガンドはCD80である。いくつかの実施形態では、CD28リガンドはICOSLである。いくつかの実施形態では、CD86はCD86-Fcである。いくつかの実施形態では、CD80はCD80-Fcである。
【0143】
いくつかの実施形態では、sdAbはCD28のアゴニストではない。いくつかの実施形態では、アゴニストは直接的なアゴニストである。「アゴニスト」という用語は、一般に、受容体に結合し、受容体を完全にまたは部分的に活性化する分子、化合物または薬剤を指す。いくつかの実施形態において、アゴニストは、天然リガンドと同じ部位で結合する。いくつかの実施形態において、アゴニストは、天然リガンドの結合部位とは異なるアロステリック部位に結合する。
【0144】
本明細書で使用される場合、「直接的なアゴニスト/アンタゴニスト」は、受容体(mCD28)に結合し、結合によってその分子によるシグナル伝達を増加/減少させる分子を指す。mCD28の場合、アゴニストはmCD28に結合し、結合により細胞内のmCD28シグナル伝達を増加させる。いくつかの実施形態では、アゴニストはT細胞活性化を増加させる。いくつかの実施形態では、アゴニストはT細胞増殖を増加させる。いくつかの実施形態において、アゴニストは、炎症誘発性サイトカイン分泌を増加させる。炎症誘発性サイトカインは当技術分野で周知であり、活性化T細胞によって分泌されることが知られている。炎症誘発性サイトカインの例としては、TNFα、IFNγ、IL-1B、IL-2およびIL-6が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、炎症誘発性サイトカインはIFNγである。いくつかの実施形態では、炎症誘発性サイトカインはIL-2である。mCD28の場合、アンタゴニストはmCD28に結合し、結合により細胞内のmCD28シグナル伝達を減少させる。いくつかの実施形態では、アンタゴニストは、T細胞活性化を減少させ、T細胞増殖を減少させ、かつ/または炎症誘発性サイトカイン分泌を減少させる。受容体のシグナル伝達を、そのリガンドと接触させること、阻害剤と接触させること、共受容体と接触させること、または受容体シグナル伝達を改変するために問題の受容体以外の任意の分子と接触させることによって達成する分子は、直接的なアゴニスト/アンタゴニストとは見なされない。いくつかの実施形態では、本発明のsdAbは、可溶性CD28(sCD28)の産生を(mCD28の切断を阻害することによって)減少させる。いくつかの実施形態では、本発明の薬剤は、可溶性CD28(sCD28)の産生を(mCD28の切断を阻害することによって)減少させる。sCD28は、CD28リガンドに結合することによってデコイとして作用することができ、したがってmCD28に拮抗することができる。それを除去すると、細胞上のmCD28を介したシグナル伝達の増加が可能になる。結果としてmCD28シグナル伝達が増加するが、薬剤は、mCD28へのその結合が受容体シグナル伝達を増加させない場合、mCD28アゴニストまたは直接的なアゴニストではない。
【0145】
いくつかの実施形態では、sdAbは、mCD28のリガンド結合ドメインに結合しない。いくつかの実施形態では、sdAbは、リガンド結合ドメインへの接近を隠さず、または阻害しない。いくつかの実施形態では、sdAbは、sCD28のIgVドメインに結合せず、それへの接近を隠さず、または遮断しない。いくつかの実施形態では、IgVドメインはリガンド結合ドメインである。いくつかの実施形態において、リガンド結合ドメインは、配列番号42のアミノ酸28~137を含む。いくつかの実施形態では、リガンド結合ドメインは、アミノ酸配列MLVAYDNAVNLSCKYSYNLFSREFRASLHKGLDSAVEVCVVYGNYSQQLQVYSKTGFNCDGKLGNESVTFYLQNLYVNQTDIYFCKIEVMYPPPYLDNEKSNGTIIHVKG(配列番号47)を含むか、またはそれからなる。
【0146】
いくつかの実施形態では、sdAbは、N末端からCDR1まで配列X1VQLVESGGGLVQX2GX3SLRLSCX4ASGSX5X6S(配列番号79)を含み、X1はEまたはQであり、X2はAまたはPであり、X3はEまたはGであり、X4はAまたはKであり、X5はI、LまたはTであり、X6はAまたはFである。いくつかの実施形態では、N末端からCDR1までの配列は、配列番号79からなる。いくつかの実施形態では、sdAbは、N末端からCDR1まで配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIAS(配列番号22)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号79は、配列番号22である。いくつかの実施形態では、N末端からCDR1までの配列は、配列番号22からなる。いくつかの実施形態では、sdAbは、CDR1とCDR2との間の配列WYRQAPGX7X8X9EX10VX11(配列番号80)を含み、X7はSまたはKであり、X8はQまたはGであり、X9はRまたはLであり、X10はLまたはRであり、X11はA、S、またはTのいずれか1つある。いくつかの実施形態では、CDR1とCDR2との間の配列は、配列番号79からなる。いくつかの実施形態では、sdAbは、CDR1とCDR2との間の配列WYRQAPGSQRELVX(配列番号48)を含み、XはAまたはTである。いくつかの実施形態では、CDR1とCDR2との間の配列は、配列番号48からなる。いくつかの実施形態では、配列番号80は、配列番号48である。いくつかの実施形態では、配列番号48は、WYRQAPGSQRELVA(配列番号23)である。いくつかの実施形態では、配列番号48は、WYRQAPGSQRELVT(配列番号49)である。いくつかの実施形態では、sdAbは、CDR2とCDR3との間の配列RFTX11SRDNX12KX13TX14YLQMNX15LX16X17X18DX19X20VYYCVV(配列番号81)を含み、X11はIまたはVであり、X12はAまたはSであり、X13はTまたはNであり、X14はV、MまたはLであり、X15はSまたはNであり、X16はR、KまたはEであり、X17はPまたはAであり、X18はEまたはRであり、X19はTまたはAであり、X20はAまたはGである。いくつかの実施形態では、CDR2とCDR3との間の配列は、配列番号81からなる。いくつかの実施形態では、sdAbは、CDR2とCDR3との間の配列RFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVV(配列番号24)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号81は、配列番号24である。いくつかの実施形態では、CDR2とCDR3との間の配列は、配列番号24からなる。いくつかの実施形態では、sdAbは、C末端からCDR3まで配列WGQGTX21VTVSS(配列番号82)を含み、X21はQまたはLである。いくつかの実施形態では、C末端からCDR3までの配列は、配列番号82からなる。いくつかの実施形態では、sdAbは、C末端からCDR3まで配列WGQGTQVTVSS(配列番号25)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号82は、配列番号25である。いくつかの実施形態では、C末端からCDR3までの配列は、配列番号25からなる。
【0147】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAINEKLLIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号26)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号26からなる。いくつかの実施形態では、配列番号26は、VHH 5A3のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号26と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号26のCDRを含む。
【0148】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMIEQQWWYWGQGTQVTVSS(配列番号27)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号27からなる。いくつかの実施形態では、配列番号27は、VHH 6B3のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号27と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号27のCDRを含む。
【0149】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDTHRGVYWYWGQGTQVTVSS(配列番号28)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号28からなる。いくつかの実施形態では、配列番号28は、VHH 6B10のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号28と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号28のCDRを含む。
【0150】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVAAINYIKEIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号29)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号29からなる。いくつかの実施形態では、配列番号29は、VHH 10E1のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号29と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号29のCDRを含む。
【0151】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMAWYRQAPGSQRELVAAISNAREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVYFQEYWYWGQGTQVTVSS(配列番号30)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号30からなる。いくつかの実施形態では、配列番号30は、VHH 11E11のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号30と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号30のCDRを含む。
【0152】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINTMAWYRQAPGSQRELVAAINSISRTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号31)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号31からなる。いくつかの実施形態では、配列番号31は、VHH 11G11のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号31と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号31のCDRを含む。
【0153】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSS(配列番号32)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号32からなる。いくつかの実施形態では、配列番号32は、VHH 12A9のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号32と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号32のCDRを含む。
【0154】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGKQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号70)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号70は、12A09_VHH4のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号70からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号70と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号70のCDRを含む。
【0155】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSIASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号71)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号71は、12A9_VHH12のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号71からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号71と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号71のCDRを含む。
【0156】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSTASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号72)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号72は、12A09_VHH16のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号72からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号72と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号72のCDRを含む。
【0157】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSTASIKTMAWYRQAPGKGLELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号73)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号73は、12A9_VHH17のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号73からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号73と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号73のCDRを含む。
【0158】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGKGRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTLVTVSS(配列番号74)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号74は、12A09_VHH18のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号74からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号74と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号74のCDRを含む。
【0159】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSS(配列番号33)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号33からなる。いくつかの実施形態では、配列番号33は、VHH 9B3のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号33と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号33のCDRを含む。
【0160】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSS(配列番号75)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号75は、9B03_VHH1のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号75からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号75と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号75のCDRを含む。
【0161】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSIASIRTMAWYRQAPGKGLELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号76)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号76は、9B03_VHH12のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号76からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号76と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号76のCDRを含む。
【0162】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCKASGSTASIRTMAWYRQAPGKGLELVSAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号77)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号77は、9B03_VHH19のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号77からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号77と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号77のCDRを含む。
【0163】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGKGLELVSAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNSKTTVYLQMNSLRAEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTLVTVSS(配列番号78)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号78は、9B03_VHH20のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号78からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号78と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号78のCDRを含む。
【0164】
いくつかの実施形態では、sdAbは、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAISDRSEKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDHHHSDWWTWGQGTQVTVSS(配列番号34)を含む。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号34からなる。いくつかの実施形態では、配列番号34は、VHH 9A7のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、sdAbは、配列番号34と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号34のCDRを含む。
【0165】
免疫刺激の目的のために、例えば癌の治療の文脈では、sdAbは非拮抗的であるか、または本発明の薬剤に導入され、拮抗効果が失われるかまたは許容可能な低レベルに低下する限り、拮抗的であってもよいことが当業者によって理解されるであろう。免疫阻害の目的のために、例えば自己免疫疾患の文脈では、sdAbは拮抗的であってもよい。
【0166】
薬剤
【0167】
別の態様により、少なくとも2つのCD28結合単一ドメイン抗体(sdAb)を含む薬剤が提供される。
【0168】
いくつかの実施形態では、薬剤は、第1のsdAbおよび第2のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、少なくとも2つのsdAbが本発明のsdAbである。いくつかの実施形態では、第1のsdAbは本発明のsdAbである。いくつかの実施形態では、第2のsdAbは本発明のsdAbである。
【0169】
いくつかの実施形態では、本発明の2つのsdAbがリンカーによって連結されている。いくつかの実施形態では、本発明の第1のsdAbおよび第2のsdAbがリンカーによって連結されている。いくつかの実施形態では、第1のsdAbは、リンカーによって第2のsdAbに連結されている。いくつかの実施形態では、この連結によって本発明の薬剤が製造された。
【0170】
いくつかの実施形態では、薬剤は二量体剤である。本明細書で使用される場合、「二量体」という用語は、2つのより単純な分子、例えば単量体を含む薬剤を指す。いくつかの実施形態では、二量体剤は2つのsdAbを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、モノパラトピック(monoparatopic)である。本明細書中で使用されるとき、用語「モノパラトピック(monoparatopic)」とは、ただ1つのエピトープを標的とする薬剤のことを指す。いくつかの実施形態では、薬剤は2つのsdAbを含む。いくつかの実施形態では、二量体はホモ二量体である。いくつかの実施形態では、二量体はヘテロ二量体である。いくつかの実施形態では、薬剤は、第1のsdAbおよび第2のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は2つの同一のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは同じ配列を含む。いくつかの実施形態では、配列はアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、薬剤は2つの異なるsdAbを含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは異なる配列を含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは同じCDRを含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは異なるCDRを含む。いくつかの実施形態では、sdAbの標的エピトープはCD28ストーク領域である。いくつかの実施形態では、sdAbの標的エピトープはCD28切断部位である。いくつかの実施形態では、標的エピトープはCD28プロテアーゼ媒介シェディングの部位(the site of CD28 protease mediated shedding)である。
【0171】
いくつかの実施形態では、薬剤はCD28のタンパク質分解性切断を阻害する。いくつかの実施形態では、薬剤は、モノマーとしてのsdAbと比較して、タンパク質分解性切断の阻害に優れている。いくつかの実施形態において、優位性は、阻害の増加を含む。いくつかの実施形態では、増加は、少なくとも5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、250、300、400、または500%の増加である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。
【0172】
いくつかの実施形態では、薬剤は、CD28のアンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、各sdAbは、薬剤の一部ではない場合、CD28のアンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、薬剤の一部ではない場合の第1のsdAb、第2のsdAbまたはその両方はアンタゴニストであり、薬剤はCD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、各sdAbは、薬剤の一部ではない場合、アンタゴニストであり、薬剤はCD28のアンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、薬剤および/またはsdAbはCD28に結合するが、受容体を活性化しないか、またはその活性化を遮断する。いくつかの実施形態では、薬剤および/またはsdAbは、CD28へのリガンドの結合を遮断しない。いくつかの実施形態では、薬剤は、CD28へのリガンドの結合を阻害しない。いくつかの実施形態では、薬剤は、CD28へのリガンドの結合を低度に阻害する。
【0173】
いくつかの実施形態では、薬剤は、CD28のアゴニストではない。いくつかの実施形態では、各sdAbは、薬剤の一部ではない場合、CD28のアゴニストではない。いくつかの実施形態では、薬剤は、mCD28のリガンド結合ドメインに結合しない。いくつかの実施形態では、薬剤は、リガンド結合ドメインへの接近を隠さず、または阻害しない。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28のIgVドメインに結合せず、それへの接近を隠さず、または遮断しない。
【0174】
いくつかの実施形態では、薬剤は、第1のsdAbおよび第2のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は2つの同一のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは同じ配列を含む。いくつかの実施形態では、配列はアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、薬剤は2つの異なるsdAbを含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは異なる配列を含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは同じCDRを含む。いくつかの実施形態では、2つのsdAbは異なるCDRを含む。いくつかの実施形態では、sdAbの標的エピトープはCD28ストーク領域である。いくつかの実施形態では、sdAbの標的エピトープはCD28切断部位である。いくつかの実施形態では、標的エピトープはCD28プロテアーゼ媒介シェディングの部位である。
【0175】
いくつかの実施形態では、薬剤は、少なくとも2つのsdAbを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、複数のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、少なくとも2、3、4、5、6または7つのsdAbを含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は2つのsdAbを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、第1のsdAbおよび第2のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは同じsdAbである。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは同じ配列を含む。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは異なるsdAbである。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは異なる配列を含む。
【0176】
いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは、同じmCD28分子を結合する。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは、単一のmCD28分子を結合する。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは、異なるCD28分子を結合する。いくつかの実施形態では、第1のsdAbは第1のCD28分子に結合し、第2のsdAbは第2のCD28分子に結合する。いくつかの実施形態では、第1のCD28分子および第2のCD28分子は同じ分子である。いくつかの実施形態では、第1のCD28分子および第2のCD28分子は異なる分子である。
【0177】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号40)を含む。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号40からなる。いくつかの実施形態では、配列番号40は、VHH 2A1のアミノ酸配列である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号40と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号40のCDRを含む。
【0178】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列EVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSLFSINAMAWYRQAPGKQRELVAAITSSGSTNYANSVKGRFTVSRDNAKNTMYLQMNSLKPEDTAVYYCVVDEYGSDYWIWGQGTQVTVSS(配列番号95)を含む。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号95からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号95と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号95のCDRを含む。
【0179】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、アミノ酸配列QVQLVESGGGLVQAGGSLRLSCAASGSIFSINAMGWYRQAPGKQRERVAAITSGGSTNYADSVKGRFTISRDNAKNTVYLQMNNLEPRDAGVYYCVVDLYGEDYWIWGQGTQVTVSS(配列番号96)を含む。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号96からなる。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAb、またはその両方は、配列番号96と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号96のCDRを含む。
【0180】
いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAbまたは両方は、3つのCDRを含み、CDR1はアミノ酸配列INAMG(配列番号4)を含み、CDR2はアミノ酸配列AISGGGDTYYADSVKG(配列番号5)を含み、CDR3はアミノ酸配列DLYGSDYWD(配列番号3)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号1のCDRは、配列番号3~5である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAbまたは両方は、3つのCDRを含み、CDR1はアミノ酸配列INAMA(配列番号98)を含み、CDR2はアミノ酸配列AITSSGSTNYANSVKG(配列番号99)を含み、CDR3はアミノ酸配列DEYGSDYWI(配列番号100)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号95のCDRは、配列番号98~100である。いくつかの実施形態では、第1のsdAb、第2のsdAbまたは両方は、3つのCDRを含み、CDR1はアミノ酸配列INAMG(配列番号4)を含み、CDR2はアミノ酸配列AITSGGSTNYADSVKG(配列番号101)を含み、CDR3はアミノ酸配列DLYGEDYWI(配列番号102)を含む。いくつかの実施形態では、配列番号96のCDRは、配列番号4、101および102である。
【0181】
細胞上のmCD28に結合し、タンパク質分解性切断およびsCD28シェディングを阻害する任意のsdAbを本発明のsdAbとして使用できることが当業者によって理解されるであろう。免疫刺激の目的のために、例えば癌の文脈では、sdAbは非拮抗的であるか、または本発明の薬剤に導入され、拮抗効果が失われるかまたは許容可能な低レベルに低下する限り、拮抗的であってもよい。免疫阻害の目的のために、例えば自己免疫疾患の文脈では、sdAbは拮抗的であってもよく、または本発明の薬剤の一部になれば拮抗的になることもできる。
【0182】
いくつかの実施形態では、2つのCD28結合sdAbは、リンカーによって連結されている。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは、リンカーによって連結されている。いくつかの実施形態では、第1のsdAbは、リンカーによって第2のsdAbに連結されている。
【0183】
ポリペプチド二量体
【0184】
いくつかの実施形態では、薬剤は、第1のsdAbを含む第1のポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、第2のsdAbを含む第2のポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、第1のポリペプチドと第2のポリペプチドとを連結する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドはポリペプチド鎖である。いくつかの実施形態では、薬剤は、リンカーによって連結された第1のポリペプチドおよび第2のポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、2つのポリペプチドを有する薬剤はCD28アンタゴニストではない。
【0185】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドはシグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドはシグナルペプチドを含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドはシグナルペプチドを欠いている。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドはシグナルペプチドを欠いている。薬剤の活性形態はシグナルペプチドを含まないが、細胞内でポリペプチドを発現させるためには、シグナルペプチドを含むポリペプチドを作製して、細胞からのポリペプチドの分泌を促進することが必要であり得ることが当業者によって理解されるであろう。いくつかの実施形態では、シグナルペプチドは、Igシグナルペプチドである。本発明のポリペプチドの作製を可能にする、任意のシグナルペプチドを使用することができる。
【0186】
本明細書で使用される場合、用語「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」は、アミノ酸残基のポリマーを指すために交換可能に使用される。別の実施形態では、本明細書で使用される「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、天然ペプチド、ペプチド模倣物(典型的には非ペプチド結合または他の合成修飾を含む)ならびにペプチド類似体、ペプトイドおよびセミペプトイドまたはそれらの任意の組み合わせを包含する。別の実施形態では、記載されるペプチドポリペプチドおよびタンパク質は、それらを体内でより安定にするか、またはより多く細胞に浸透できるようにする修飾を有する。一実施形態では、用語「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」は、天然に存在するアミノ酸ポリマーに適用される。別の実施形態では、「ペプチド」、「ポリペプチド」および「タンパク質」という用語は、1つまたは複数のアミノ酸残基が対応する天然アミノ酸の人工化学的類似体である、アミノ酸ポリマーに適用される。
【0187】
いくつかの実施形態において、連結は、C末端からC末端までの連結である。いくつかの実施形態において、C末端は、ポリペプチドの最大C末端アミノ酸における連結である。いくつかの実施形態において、C末端は、ポリペプチドの最大C末端ドメインにおける連結である。いくつかの実施形態において、連結は、C末端ドメインからC末端ドメインまでである。
【0188】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、第1のシステインアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、第2のシステインアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、システインは遊離システインである。いくつかの実施形態では、システインはsdAbの外側にある。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、sdAbの外側にシステインを含む。いくつかの実施形態では、システインはC末端システインである。いくつかの実施形態では、システインはN末端システインである。いくつかの実施形態では、システインはC末端アミノ酸である。いくつかの実施形態では、システインはC末端ドメインにある。いくつかの実施形態では、システインはC末端からsdAbまでのドメインにある。いくつかの実施形態では、sdAbはN末端からシステインまでである。いくつかの実施形態では、連結は、第1のシステインと第2のシステインとの間の結合を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは結合である。いくつかの実施形態では、結合はジスルフィド結合である。いくつかの実施形態では、結合は、各ポリペプチド中の最大のC末端システインの間にある。
【0189】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSC(配列番号113)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号113からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号113を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号113からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号113の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号113の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号113と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号113と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号40のCDRを含む。
【0190】
いくつかの実施形態では、配列番号113またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号113またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0191】
いくつかの実施形態では、連結されたシステインを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、それぞれがC末端遊離システインを有する2つのポリペプチドを含み、遊離システインが連結されている薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0192】
いくつかの実施形態では、リンカーは化学的リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは人工リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸リンカーではない。いくつかの実施形態では、リンカーは結合だけではない。いくつかの実施形態では、リンカーは生体適合性ポリマーを含む。いくつかの実施形態では、生体適合性ポリマーは、少なくとも部分的に生分解性である。いくつかの実施形態では、生体適合性ポリマーは、ポリグリコールエーテル、ポリエステル、ポリアミド、またはそれらの任意の組み合わせであるか、またはそれらを含む。いくつかの実施形態では、ポリグリコールエーテルは、ポリエチレングリコール(PEG)であるか、またはそれを含む。いくつかの実施形態では、本発明のリンカーはPEGを含む。いくつかの実施形態において、本発明のリンカーは、100Da~5000Da(その間の任意の範囲を含む)のMnを特徴とするPEGを含む。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、少なくともPEGの10反復を含む。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、少なくとも1つのPEGの反復を含む。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10または11のPEGの反復を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、少なくともPEGの11反復を含む。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、PEGの11反復を含む。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、
図5に提供されるリンカーである。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、マレイミド-N-(CH2)2-CO-NH-(CH2)2-(O-CH2CH2)n-(CH2)2-NH-CO-(CH2)2-N-マレイミドを含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、PEGリンカーは、N-(CH2)2-CO-NH-(CH2)2-(O-CH2CH2)n-(CH2)2-NH-CO-(CH2)2-Nを含むか、またはそれからなる。
【0193】
いくつかの実施形態では、化学的リンカーによって連結されたシステインを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、それぞれが化学的リンカーによって連結されたシステインを含む2つのポリペプチドからなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。いくつかの実施形態では、化学的リンカーはシステインに連結されている。いくつかの実施形態では、化学的リンカーは、第1および第2のシステインを連結する。いくつかの実施形態では、化学的リンカーは、マレイミド反応性基によってシステインに連結されている。いくつかの実施形態では、反応は、ポリペプチド中のチオールに対するものである。いくつかの実施形態では、反応は、システイン中のチオールに対するものである。化学的リンカーを生成し、それらをポリペプチドに結合させる方法は当技術分野で周知であり、任意のそのような方法を使用して本発明の薬剤を製造することができる。
【0194】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、第1の二量体化ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、第2の二量体化ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、C末端からsdAbまでである。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、N末端からsdAbまでである。いくつかの実施形態では、sdAbは、N末端から二量体化ドメインまでである。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、C末端ドメインである。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、システインを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは二量体化ドメインを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、二量体化ドメイン間の結合を含む。いくつかの実施形態では、結合はジスルフィド結合である。
【0195】
いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、互いに二量体化することができる。いくつかの実施形態では、第1の二量体化ドメインは、第2の二量体化ドメインと二量体化することができる。いくつかの実施形態では、第1および第2の二量体化ドメインは、互いに二量体化することができる。いくつかの実施形態では、二量化する能力が構成されて二量化する。いくつかの実施形態では、二量体化は、生理学的条件下で行われる。いくつかの実施形態では、二量体化は体液内である。いくつかの実施形態では、体液は血液である。いくつかの実施形態では、体液は血漿である。いくつかの実施形態では、体液は血清である。いくつかの実施形態では、二量体化は対象内である。いくつかの実施形態では、二量体化はインビボである。いくつかの実施形態では、二量体化はインビトロである。
【0196】
本明細書で使用される場合、「二量体化ドメイン」という用語は、別のアミノ酸配列(他の二量体化ドメイン)と接触するとそれに結合して二量体を形成するアミノ酸配列を指す。二量体化ドメインは、多くのタンパク質配列が互いに結合することが知られているため、当技術分野で周知である。いくつかの実施形態では、二量体化は、二量体化ドメイン間の共有結合の形成を含む。いくつかの実施形態では、二量体化は静電結合を含む。いくつかの実施形態では、二量体化は静電結合を含まない。いくつかの実施形態では、二量体化は可逆的である。いくつかの実施形態では、二量体化は不可逆的である。いくつかの実施形態では、二量体化は、二量体化ドメイン間を形成する結合を含む。いくつかの実施形態では、結合は化学結合である。いくつかの実施形態では、結合はジスルフィド結合である。いくつかの実施形態では、結合はペプチド結合である。二量体化ドメインの例としては、いくつか例を挙げると、抗体重鎖のヒンジドメイン、抗体重/軽鎖のCH1/CLドメイン、およびTCRアルファ/ベータのECDドメインが挙げられる。
【0197】
いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、免疫グロブリン(Ig)ヒンジドメインを含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、Igヒンジドメインを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。いくつかの実施形態では、第1の二量体化ドメインは、第1のIgヒンジドメインである。いくつかの実施形態では、第2の二量体化ドメインは、第2のIgヒンジドメインである。いくつかの実施形態では、Igヒンジドメインは重鎖ヒンジドメインである。いくつかの実施形態では、IgはヒトIgある。いくつかの実施形態では、免疫グロブリンは、IgA、IgD、IgE、IgGおよびIgMから選択される。いくつかの実施形態では、免疫グロブリンはIgGである。いくつかの実施形態では、IgGはIgG1である。いくつかの実施形態では、IgGはIgG2である。いくつかの実施形態では、IgGはIgG3である。いくつかの実施形態では、IgGはIgG1およびIgG3から選択される。いくつかの実施形態では、IgGはIgG4である。いくつかの実施形態では、IgGはヒトIgGである。いくつかの実施形態では、第1および第2の二量体化ドメインは、両方ともIgヒンジドメインである。いくつかの実施形態では、第1および第2の二量体化ドメインは同一である。いくつかの実施形態では、第1および第2の二量体化ドメインは、少なくとも95%同一である。いくつかの実施形態では、第1および第2の二量体化ドメインは、少なくとも50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、97、99または100%同一である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。
【0198】
いくつかの実施形態では、Igヒンジドメインは、アミノ酸配列DKTHTCPPCPAPEL(配列番号38)を含む。いくつかの実施形態では、Igヒンジドメインは、配列番号38からなる。いくつかの実施形態では、IgG1ヒンジドメインは、配列番号38を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、Igヒンジドメインは、アミノ酸配列DKTHTCPPCPAPE(配列番号83)を含む。いくつかの実施形態では、Igヒンジドメインは、配列番号83からなる。いくつかの実施形態では、IgG1ヒンジドメインは、配列番号83を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列EPKSCDKTHTCPPCPAPELLGG(配列番号50)を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号50のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG1ヒンジは、配列番号50を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列EPKCCVECPPCPAPPAAA(配列番号51)を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号51のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG2ヒンジは、配列番号51を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列EPKCCVECPPCPAPPVAGP(配列番号84)を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号84のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG2ヒンジは、配列番号84を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列ESKYGPPCPPCPAPEFLGG(配列番号52)を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号52のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG4ヒンジは、配列番号52を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列ESKYGPPCPPCPAPEFEGG(配列番号85)を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号85のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG4ヒンジは、配列番号85を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列ESKYGPPCPSCPAPEFLGG(配列番号86)を含む。配列番号85は、当技術分野で周知のS228PおよびL235E変異を含む。配列番号85は、変異を含む配列番号86である。これらの変異は、凝集を減少させ、安定性を高め、エフェクター機能を低下させることが知られている。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号86のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG4ヒンジは、配列番号86を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、アミノ酸配列ELKTPLGDTTHTCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPEPKSCDTPPPCPRCPAPELLGGP(配列番号53)を含む。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、配列番号53のアミノ酸配列からなる。いくつかの実施形態では、IgG3ヒンジは、配列番号53を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、ヒンジドメインは、CPXCP(配列番号54)モチーフを含む。いくつかの実施形態では、配列番号54は、ヒンジドメインコアである。いくつかの実施形態では、配列番号54のXはPおよびRから選択される。いくつかの実施形態では、配列番号54はCPPCP(配列番号55)である。いくつかの実施形態では、IgG1コアは、配列番号55からなる。いくつかの実施形態では、IgG2コアは、配列番号55を含む。いくつかの実施形態では、IgG2コアは、CCVECPPCP(配列番号87)からなる。いくつかの実施形態では、IgG4コアは、配列番号55を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、配列番号54は、CPRCP(配列番号56)である。いくつかの実施形態では、IgG3コアは、配列番号56を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、配列番号54は、CPSCP(配列番号88)である。いくつかの実施形態では、IgG4コアは、配列番号88を含むか、またはそれからなる。したがって、配列番号54に見出されるヒンジドメインのシステインは、ジスルフィド結合および二量体化に必要であることが理解されよう。
【0199】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSDKTHTCPPCPAPEL(配列番号114)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号114からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号114を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号114からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号114の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号114の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号114と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号114と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、配列番号40のCDRを含む。
【0200】
いくつかの実施形態では、配列番号114またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号114またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0201】
いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、IgのCH2ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、Ig重鎖のものである。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、IgのCH3ドメインをさらに含む。いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、Ig重鎖のものである。いくつかの実施形態では、第1の二量体化ドメインは、CH2ドメイン、CH3ドメインまたはその両方を含む。いくつかの実施形態では、第2の二量体化ドメインは、CH2ドメイン、CH3ドメインまたはその両方を含む。いくつかの実施形態では、IgはIgGである。いくつかの実施形態では、IgGはIgG1である。いくつかの実施形態では、IgはIgG2である。いくつかの実施形態では、IgGはIgG4である。いくつかの実施形態では、IgGはIgG3である。いくつかの実施形態では、IgG1は修飾IgG1である。いくつかの実施形態では、IgG3は修飾IgG3である。いくつかの実施形態では、修飾は、エフェクター機能を低下させるように修飾される。いくつかの実施形態では、修飾は、エフェクター機能を無効にするように修飾される。いくつかの実施形態では、修飾はPG-LALA修飾である。
【0202】
いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、Fcドメインを含む。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、Fcドメインからなる。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、ヒンジ、CH2およびCH3ドメインを含む。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、ヒンジ、CH2およびCH3ドメインからなる。いくつかの実施形態では、Fcドメインを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。
【0203】
いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、アミノ酸配列LGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK(配列番号57)を含む。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号57からなる。いくつかの実施形態では、配列番号57は、IgG1 CH2ドメインである。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、アミノ酸配列PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAK(配列番号58)を含む。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号58からなる。いくつかの実施形態では、配列番号58は、IgG1 CH2ドメインである。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号57と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号58と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチド配列の二量体を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、アミノ酸配列PSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAK(配列番号89)を含む。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号89からなる。いくつかの実施形態では、配列番号89は、IgG4 CH2ドメインである。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号89からなる。いくつかの実施形態では、配列番号89は、IgG4 CH2ドメインである。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号89と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、CH2ドメインは、配列番号89と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチド配列の二量体を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。
【0204】
いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、アミノ酸配列GQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号59)を含む。いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、配列番号59からなる。いくつかの実施形態では、配列番号59は、IgG1 CH3ドメインである。いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、配列番号59と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、アミノ酸配列GQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号90)を含む。いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、配列番号90からなる。いくつかの実施形態では、配列番号90は、IgG4 CH3ドメインである。いくつかの実施形態では、CH3ドメインは、配列番号90と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。
【0205】
いくつかの実施形態では、Fcドメインは、DKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号60)を含む。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、配列番号60からなる。いくつかの実施形態では、IgG1のFcドメインは、配列番号60を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、配列番号60と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、ESKYGPPCPSCPAPEFLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号91)を含む。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、配列番号91からなる。いくつかの実施形態では、IgG4のFcドメインは、配列番号91を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、配列番号91と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、配列番号91は、S10のPへの変異を含む。いくつかの実施形態では、配列番号91は、L17のEへの変異を含む。
【0206】
いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、抗体依存性細胞傷害(ADCC)を誘導しない。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導しない。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、ADCCまたはCDCを誘導しないように構成される。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、ADCCまたはCDCを低減させるように構成される。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインはエフェクター機能を有しない。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、低下したエフェクター機能を含む。いくつかの実施形態において、二量体化ドメインは、エフェクター機能を低下させるかまたは無効にする少なくとも1つの変異を含む。いくつかの実施形態において、二量体化ドメインは、ADCCまたはCDCを減少させる少なくとも1つの変異を含む。いくつかの実施形態において、二量体化ドメインは、エフェクター機能を低下させる少なくとも1つの変異を含む。いくつかの実施形態では、減少したCDC、ADCCまたはエフェクター機能は、CDC、ADCまたはエフェクター機能を減少させる少なくとも1つの変異を含む。
【0207】
IgG2およびIgG4のエフェクター機能は大幅に低下しており、一般に本質的に細胞傷害性ではないことが当業者には知られているであろう。さらに、IgG4中のS228PおよびL235Eなどの変異は、エフェクター機能をさらに低下させることが知られている。さらに、IgG1およびIgG3の細胞傷害性/エフェクター機能を低下させる変異は、当技術分野で周知である。いくつかの実施形態では、IgGは、少なくとも1つの変異を含む。いくつかの実施形態において、変異は複数の変異である。いくつかの実施形態では、変異は細胞傷害性を低下させる。いくつかの実施形態では、変異は安定性を向上させる。いくつかの実施形態では、変異は凝集を減少させる。いくつかの実施形態では、細胞傷害性を低下させる複数の変異はPG-LALA変異を含む。いくつかの実施形態では、変異は、IgG1ヒト重鎖のプロリン329のグリシンへの変異である(P329G)。いくつかの実施形態において、PからGへの変異は、配列番号60のP109のGへの変異である。いくつかの実施形態において、変異は、IgG1ヒト重鎖のロイシン234のアラニンへの変異である(L234A)。いくつかの実施形態において、LからAへの変異は、配列番号60のL14のAへの変異である。いくつかの実施形態において、変異は、IgG1ヒト重鎖のロイシン235のアラニンへの変異である(L235A)。いくつかの実施形態では、LからAへの変異は、配列番号60のL15のAへの変異である。いくつかの実施形態では、複数の変異は、配列番号60のP109G、L14AおよびL15Aを含む。いくつかの実施形態において、複数の変異は、IgG1ヒト重鎖のP329G、L234AおよびL235Aを含む。IgG3重鎖または非ヒトIgG1の重鎖において並行変異が実行され得ることも、当業者によって理解されるであろう。いくつかの実施態様では、変異は、IgG4ヒト重鎖のロイシン235のグルタミン酸への変異である(L235E)。いくつかの実施態様では、変異は、IgG4ヒト重鎖のセリン228のプロリンへの変異である(S228P)。本明細書に示される数は、可変ドメインを含む全長IgGに関連することが理解されよう。数は、IgGのFc部分内においてのみ、これらのアミノ酸の位置に対応するようにシフトされ得る。
【0208】
いくつかの実施形態では、細胞傷害性および/またはエフェクター機能の低下を含む二量体化ドメインは、DKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号39)を含む。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、配列番号39を含む。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、配列番号39からなる。いくつかの実施形態では、二量体化ドメインは、配列番号39と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、PからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、細胞傷害性および/またはエフェクター機能の低下を含む二量体化ドメインは、ESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号92)を含む。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、配列番号92からなる。いくつかの実施形態では、IgG4のFcドメインは、配列番号92を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、Fcドメインは、配列番号92と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、位置10にPを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、位置17にEを含む。
【0209】
いくつかの実施形態では、sdAbおよび二量体化ドメインは、リンカーによって分離されている。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーはペプチドリンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーはペプチド結合である。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第1の二量体化ドメインは、リンカーによって分離されている。いくつかの実施形態では、第2のsdAbおよび第2の二量体化ドメインは、リンカーによって分離されている。いくつかの実施形態では、両方のポリペプチドがリンカーを含む。いくつかの実施形態では、いずれかがリンカーを含む。
【0210】
いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは可撓性リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは親水性リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列GGGGSを含む。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列GSを含む。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列(GGGGS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列AAA(GGGGS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列(GS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列(GGS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列(GSGGS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列(EGGGS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態では、リンカーはアミノ酸配列(EGGS)nを含み、式中、nは整数である。いくつかの実施形態において、nは、1、2、3、4、5、6、7、8、9および10から選択される整数である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態において、nは1である。いくつかの実施形態において、nは2である。いくつかの実施形態において、nは3である。いくつかの実施形態において、nは4である。いくつかの実施形態において、nは5である。いくつかの実施形態において、nは7である。
【0211】
いくつかの実施形態において、nは8である。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24または25のアミノ酸を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも1つのアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも5つのアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも8つのアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも10のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも13のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも15のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも18のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも25のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも35のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、最大で25、28、30、35、40、45、50、60、70、75、80、90または100のアミノ酸を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、リンカーは、最大で25のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、最大で28のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、最大で35のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、最大で50のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、1~50、1~28、1~25、1~18、1~15、1~13、1~10、5~50、5~28、5~25、5~18、5~15、5~13、5~10、10~50、10~28、10~25、10~18、10~15、10~13、15~50、15~28、15~25、15~18、25~50および28~50のアミノ酸を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、リンカーは、15~25のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、15~35のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、25~35のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、18~28のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、10~25のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、13~28のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、10~20のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、13~23のアミノ酸を含む。リンカー中の反復の数の増加に加えて、N末端およびC末端は、さらなる塩基、例えばさらなるGおよび/またはAsも含み得ることが当業者によって理解されるであろう。
【0212】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号116)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号116からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号116を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号116からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号116の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号116の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号116と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号116と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号1のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号116のG244、A149およびA150を含む。
【0213】
いくつかの実施形態では、配列番号116またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号116またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0214】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号117)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号117からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号117を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号117からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号117の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号117の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号117と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号117と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号1のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号117のG254、A159およびA160を含む。
【0215】
いくつかの実施形態では、配列番号117またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号117またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0216】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号115)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号115からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号115を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号115からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号115の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号115の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号115と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号115と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号1のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号115のG1156、A131およびA132を含む。
【0217】
いくつかの実施形態では、配列番号115またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号115またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0218】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAINEKLLIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号61)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号61からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号61を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号61からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号61の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号61の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号61と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号61と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号26のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号61のG244、A149およびA150を含む。
【0219】
いくつかの実施形態では、配列番号61またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号61またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0220】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMIEQQWWYWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号62)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号62からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号62を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号62からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号62の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号62の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号62と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号62と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号27のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号62のG244、A149およびA150を含む。
【0221】
いくつかの実施形態では、配列番号62またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号62またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0222】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDTHRGVYWYWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号63)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号63からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号63を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号63からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号63の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号63の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号63と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号63と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号28のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号63のG244、A149およびA150を含む。
【0223】
いくつかの実施形態では、配列番号63またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号63またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0224】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVAAINYIKEIYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号64)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号64からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号64を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号64からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号64の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号64の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号64と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号64と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号29のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号64のG244、A149およびA150を含む。
【0225】
いくつかの実施形態では、配列番号64またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号64またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0226】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMAWYRQAPGSQRELVAAISNAREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVYFQEYWYWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号65)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号65からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号65を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号65からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号65の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号65の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号65と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号65と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号30のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号65のG244、A149およびA150を含む。
【0227】
いくつかの実施形態では、配列番号65またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号65またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0228】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINTMAWYRQAPGSQRELVAAINSISRTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号66)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号66からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号66を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号66からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号66の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号66の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号66と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号66と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号31のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号66のG244、A149およびA150を含む。
【0229】
いくつかの実施形態では、配列番号66またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号66またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0230】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号67)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号67からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号67を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号67からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号67の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号67の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号67と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号67と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号32のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号67のG244、A149およびA150を含む。
【0231】
いくつかの実施形態では、配列番号67またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号67またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0232】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号68)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号68からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号68を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号68からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号68の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号68の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号68と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号68と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号33のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号68のG244、A149およびA150を含む。
【0233】
いくつかの実施形態では、配列番号68またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号68またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0234】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINSMGWYRQAPGSQRELVAAISDRSEKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDHHHSDWWTWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSDKTHTCPPCPAPEAAGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALGAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSRDELTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK(配列番号69)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号69からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号69を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号69からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号69の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号69の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号69と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号69と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号34のCDRを含む。いくつかの実施形態では、ホモログを有する配列は、FcドメインのPからGへの変異、LからAへの変異およびLからAへの変異を含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号69のG244、A149およびA150を含む。
【0235】
いくつかの実施形態では、配列番号69またはそのホモログを含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号69またはそのホモログの二量体からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、CD28アンタゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0236】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIKTMAWYRQAPGSQRELVTAIASDNRKYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDVTKEDYWYWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号93)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号93からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号93を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号93からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号93の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号93の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号93と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号93と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号32のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号8、配列番号16および配列番号10のCDRを含む。配列番号Xのアミノ酸1~115は、配列番号70~74のいずれかで置き換えることができることが当業者によって理解されるであろう。
【0237】
いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASIRTMAWYRQAPGSQRELVAAISSGREVYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDMYWQDYWWWGQGTQVTVSSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSESKYGPPCPPCPAPEFEGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSQEDPEVQFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQFNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKGLPSSIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSQEEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSRLTVDKSRWQEGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSLGK(配列番号94)を含む。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチドは、配列番号94からなる。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号94を含む。いくつかの実施形態では、第2のポリペプチドは、配列番号94からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号94の二量体を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号93の二量体からなる。いくつかの実施形態では、第1のポリペプチド、第2のポリペプチドまたはその両方は、配列番号94と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むかまたはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、配列番号94と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有するポリペプチドの二量体を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号33のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号17、配列番号18および配列番号19のCDRを含む。配列番号Xのアミノ酸1~115は、配列番号75~78のいずれかで置き換えることができることが当業者によって理解されるであろう。
【0238】
いくつかの実施形態では、薬剤はCD28の機能および/またはシグナル伝達を調節しない。いくつかの実施形態では、薬剤はmCD28を分解しない。いくつかの実施形態では、薬剤はmCD28分解を引き起こさないか、または促進しない。いくつかの実施形態では、シグナル伝達はmCD28媒介性の免疫細胞活性化である。いくつかの実施形態では、薬剤は免疫細胞活性化を阻害しない。いくつかの実施形態では、薬剤はCD28受容体の内在化または再利用を誘導しない。mCD28を介した共刺激は、T細胞の免疫活性化に不可欠である。タンパク質分解性切断は、膜内に残っているタンパク質の膜貫通部分および細胞質部分からCD28の細胞外領域のリガンド結合ドメインを除去した。したがって、切断されたCD28はシグナル伝達することができず、T細胞活性化に寄与することができない。したがって、切断を遮断し、アンタゴニストでもある薬剤は、mCD28を活性化させない。同様に、切断を遮断するがアゴニストでもある薬剤は、異常なT細胞活性化、および潜在的には自己免疫応答を誘導する可能性がある。いくつかの実施形態では、薬剤は、抗CD28抗体MAB342ではない。いくつかの実施形態では、薬剤は、抗CD28抗体クローン#37407ではない。
【0239】
いくつかの実施形態では、薬剤は免疫細胞上のmCD28の表面レベルを低下させない。いくつかの実施形態では、免疫細胞はT細胞である。いくつかの実施形態では、薬剤は、mCD28の表面レベルを50、40、30、25、20、15、10、7、5、3、2または1%未満低下させる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。
【0240】
いくつかの実施形態では、薬剤の細胞への結合は、細胞を死滅させない。いくつかの実施形態では、薬剤の細胞への結合は、細胞の死滅をもたらさない。いくつかの実施形態では、薬剤は、抗体依存性細胞傷害(ADCC)を誘導しない。いくつかの実施形態では、薬剤は、補体依存性細胞傷害(CDC)を誘導しない。いくつかの実施形態では、薬剤は、ADCCおよび/またはCDCを誘導しない。
【0241】
単鎖剤
【0242】
いくつかの実施形態では、薬剤は、単一ポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、薬剤は、単鎖剤である。いくつかの実施形態では、薬剤は、単一ポリペプチドからなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、第1のsdAbおよび第2のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、第1のsdAbは、第2のsdAbまでのN末端である。いくつかの実施形態では、第2のsdAbは、第1のsdAbまでのN末端である。いくつかの実施形態では、第1のsdAbは、第2のsdAbまでのC末端である。いくつかの実施形態では、第2のsdAbは、第1のsdAbまでのC末端である。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドのN末端はsdAbである。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドのC末端はsdAbである。いくつかの実施形態では、N末端ドメイン、C末端ドメインまたは両方がsdAbである。
【0243】
いくつかの実施形態では、2つのsdAbは、アミノ酸リンカーによって分離されている。いくつかの実施形態では、第1のsdAbおよび第2のsdAbは、リンカーによって分離されている。
【0244】
いくつかの実施形態では、リンカーは短リンカーである。いくつかの実施形態では、短リンカーは、10未満のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、13未満のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、10以下のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、13以下のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、最大で5、6、7、8、9、10、11、12または13のアミノ酸を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、短リンカーは、5以下のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、8以下のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、最大で5のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、最大で8のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、最大で9のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは、最大で12のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、短リンカーは可撓性リンカーである。いくつかの実施形態では、短リンカーはGGGGSリンカーである。いくつかの実施形態では、短リンカーは1つのGGGGSを含む。いくつかの実施形態において、短リンカーは、nが整数である(GGGGS)nを含む。いくつかの実施形態では、短リンカーはAAAGGGGSを含む。いくつかの実施形態において、nは1または2である。いくつかの実施形態において、nは1である。いくつかの実施形態では、短リンカーはAAAGGGGSからなる。
【0245】
いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号103)を含む。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列番号103からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号103を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号103からなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドまたは薬剤は、配列番号103と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号40のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、本発明の他のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、本発明の他のsdAbは、2A1の位置にある。
【0246】
いくつかの実施形態では、短リンカーを有する単鎖剤はCD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号103を含む薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、配列番号103からなる薬剤は、CD28アンタゴニストではない。いくつかの実施形態では、アゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0247】
いくつかの実施形態では、リンカーは長リンカーである。いくつかの実施形態では、長リンカーは、10以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、13以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、少なくとも10のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、リンカーは、少なくとも10のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27または28のアミノ酸を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、長リンカーは、15以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、18以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、少なくとも15のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、少なくとも18のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、少なくとも20のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、少なくとも23のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、20以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは、23以上のアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、長リンカーは可撓性リンカーである。いくつかの実施形態において、長リンカーは、nが整数である(GGGGS)nを含む。いくつかの実施形態において、長リンカーは、nが整数であるAAA(GGGGS)nを含む。いくつかの実施形態において、nは2、3、4、5、6、7、8、9または10である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態において、nは2である。いくつかの実施形態において、nは3である。いくつかの実施形態において、nは4である。いくつかの実施形態では、長リンカーは、AAAGGGGSGGGGS(配列番号46)を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、長リンカーは、AAAGGGGSGGGGSGGGGSGGGGS(配列番号109)を含むか、またはそれからなる。
【0248】
いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号104)を含む。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列番号104からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号104を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号104からなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドまたは薬剤は、配列番号104と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号40のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、本発明のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、本発明のsdAbは、2A1の位置にある。
【0249】
いくつかの実施形態では、長リンカーを有する単鎖剤はCD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号104を含む薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号104からなる薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、アゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0250】
いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSGGGGSGGGGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号105)を含む。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列番号105からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号105を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号105からなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドまたは薬剤は、配列番号105と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号40のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、本発明のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、本発明のsdAbは、2A1の位置にある。
【0251】
いくつかの実施形態では、配列番号105を含む薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号105からなる薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、アゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0252】
いくつかの実施形態では、リンカーは正味の中性電荷を含む。いくつかの実施形態では、リンカーはアラニン(A)、グリシン(G)およびセリン(S)残基からなる。いくつかの実施形態では、リンカーはアラニン、グリシンおよびセリン残基のみを含む。いくつかの実施形態では、リンカーは荷電アミノ酸を欠く。
【0253】
いくつかの実施形態では、リンカーは荷電リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは正味電荷を含む。いくつかの実施形態では、荷電リンカーは正味の正電荷を含む。いくつかの実施形態では、荷電リンカーは正味の正電荷を含む。いくつかの実施形態では、正に帯電したリンカーは、少なくとも1つの正に帯電したアミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、正に荷電したアミノ酸は、リジン(K)、アルギニン(R)またはヒスチジン(H)である。いくつかの実施形態では、荷電リンカーは正味の負電荷を含む。いくつかの実施形態では、負に帯電したリンカーは、少なくとも1つの負に帯電したアミノ酸を含む。いくつかの実施形態において、負に荷電したアミノ酸は、グルタミン酸(E)またはアスパラギン酸(D)である。いくつかの実施形態では、帯電リンカーは、少なくとも1つの帯電アミノ酸を含む。いくつかの実施形態において、荷電アミノ酸は、K、R、H、EまたはDである。いくつかの実施形態において、荷電リンカーは、nが整数である(GGGXS)nを含む。いくつかの実施形態において、荷電リンカーは、nが整数であるAAA(GGGXS)nを含む。いくつかの実施形態において、Xは荷電アミノ酸である。いくつかの実施形態において、Xは正に荷電したアミノ酸である。いくつかの実施形態において、Xは負に荷電したアミノ酸である。いくつかの実施形態では、XはKである。いくつかの実施形態では、XはEである。いくつかの実施形態では、nは2、3、4、5、6、7、8、9または10である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態において、nは2である。いくつかの実施形態において、nは3である。いくつかの実施形態において、nは4である。いくつかの実施形態では、荷電リンカーは、AAAGGGKSGGGKSGGGKSGGGKS(配列番号110)を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、長リンカーは、AAAGGGESGGGESGGGESGGGES(配列番号111)を含むか、またはそれからなる。
【0254】
いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGKSGGGKSGGGKSGGGKSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号106)を含む。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列番号106からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号106を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号106からなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドまたは薬剤は、配列番号106と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号40のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、本発明のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、本発明のsdAbは、2A1の位置にある。
【0255】
いくつかの実施形態では、荷電リンカーを有する単鎖薬剤はCD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、正に荷電したリンカーを有する単鎖薬剤はCD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号106を含む薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号106からなる薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、アゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0256】
いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGESGGGESGGGESGGGESEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号107)を含む。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列番号107からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号107を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号107からなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドまたは薬剤は、配列番号107と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号40のCDRを含む。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、本発明のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、本発明のsdAbは、2A1の位置にある。
【0257】
いくつかの実施形態では、負に荷電したリンカーを有する単鎖薬剤はCD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号107を含む薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号107からなる薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、アゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0258】
いくつかの実施形態では、リンカーは剛性リンカーである。いくつかの実施形態では、リンカーは螺旋形リンカーである。いくつかの実施形態では、剛性リンカーは螺旋形リンカーである。いくつかの実施形態では、剛性リンカーは長い連結である。いくつかの実施形態において、剛性リンカーは、nが整数である(EAAAK)nを含む。いくつかの実施形態では、剛性リンカーは、GGGGSAEAAAKEAAAKEAAAKAAAGSGGGGS(配列番号97)を含むか、またはそれからなる。いくつかの実施形態では、剛性リンカーは、AAAGGGGSAEAAAKEAAAKEAAAKAAAGSGGGGS(配列番号112)を含むか、またはそれからなる。
【0259】
いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSSAAAGGGGSAEAAAKEAAAKEAAAKAAAGSGGGGSEVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号108)を含む。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドは、配列番号108からなる。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号108を含む。いくつかの実施形態では、薬剤は配列番号108からなる。いくつかの実施形態では、単一ポリペプチドまたは薬剤は、配列番号108と少なくとも70、75、80、85、90、93、95、97、または99%の相同性を有する配列を含むか、またはそれからなる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、相同性を有する配列は、配列番号40のCDRを含む。
【0260】
いくつかの実施形態では、剛性リンカーを有する単鎖剤はCD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号108を含む薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、配列番号108からなる薬剤は、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、アゴニストは、実質的なアンタゴニストである。
【0261】
核酸分子
【0262】
別の態様により、本発明のsdAbをコードする核酸分子が提供される。
【0263】
別の態様により、本発明の薬剤をコードする核酸分子が提供される。
【0264】
いくつかの実施形態では、核酸分子は複数の核酸分子である。いくつかの実施形態では、第1の核酸分子は、第1のポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、第2の核酸分子は、第2のポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、単一の核酸分子は、第1および第2の両方のポリペプチドをコードする。
【0265】
いくつかの実施形態では、核酸分子は、本発明のsdAbをコードするコード領域を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子は、本発明の薬剤をコードするコード領域を含む。いくつかの実施形態では、薬剤をコードすることは、第1のポリペプチドをコードすることを含む。いくつかの実施形態では、薬剤をコードすることは、第2のポリペプチドをコードすることを含む。いくつかの実施形態では、核酸分子は、第1および第2のポリペプチドをコードする。いくつかの実施形態では、第1および第2のポリペプチドは同一であり、核酸分子は、ポリペプチドをコードする単一のコード領域を含む。いくつかの実施形態では、核酸分子は複数の核酸分子である。いくつかの実施形態では、複数は、第1のポリペプチドをコードする第1分子および第2のポリペプチドをコードする第2分子を含む。
【0266】
いくつかの実施形態では、核酸分子はベクターである。いくつかの実施形態において、ベクターは発現ベクターである。いくつかの実施形態では、ベクターはプラスミドである。いくつかの実施形態では、ベクターは哺乳動物発現ベクターである。いくつかの実施形態では、哺乳動物はヒトである。いくつかの実施形態では、ベクターはヒト細胞における発現のためのものである。いくつかの実施形態では、ベクターは培養での発現のためのものである。いくつかの実施形態では、ベクターはインビトロ発現のためのものである。いくつかの実施形態では、ベクターはインビボ発現のためのものである。細胞内の薬剤をコードする核酸分子の発現は、当業者に周知である。それは、多くの方法の中でも、トランスフェクション、ウイルス感染、または細胞のゲノムの直接改変によって行うことができる。
【0267】
ベクター核酸配列は、一般に、細胞内での増殖のための少なくとも1つの複製起点と、場合によりさらなるエレメント、例えば異種ポリヌクレオチド配列、発現制御エレメント(例えば、プロモーター、エンハンサー)、選択マーカー(例えば、抗生物質耐性)、ポリアデニン配列とを含有する。
【0268】
ベクターは、非ウイルス法またはウイルス法を介して送達されるDNAプラスミドであり得る。ウイルスベクターは、レトロウイルスベクター、ヘルペスウイルスベクター、アデノウイルスベクター、アデノ随伴ウイルスベクターまたはポックスウイルスベクターであり得る。プロモーターは、哺乳動物細胞において活性であり得る。プロモーターは、ウイルスプロモーターであり得る。
【0269】
いくつかの実施形態では、薬剤をコードする核酸配列は、プロモーターに作動可能に連結されている。用語「作動可能に連結された」は、目的のヌクレオチド配列が、(例えば、ベクターが宿主細胞に導入されると、インビトロ転写/翻訳系において、または宿主細胞において)ヌクレオチド配列の発現を可能にする様式で、1つまたは複数の調節エレメントに連結されていることを意味することを意図している。いくつかの実施形態では、プロモーターは哺乳動物プロモーターである。いくつかの実施形態では、プロモーターは標的細胞における発現のために構成されている。いくつかの実施形態では、標的細胞は哺乳動物細胞である。いくつかの実施形態では、哺乳動物はヒトである。
【0270】
いくつかの実施形態では、ベクターは、エレクトロポレーション(例えば、From et al.、Proc.Natl.Acad.Sci.USA 82,5824(1985)に記載の通り)、ヒートショック、ウイルスベクターによる感染、小ビーズもしくは粒子のマトリックス内、または表面上のいずれかに核酸を含む小粒子による高速衝撃浸透(Klein et al.,Nature 327.70-73(1987))等を含む、標準的な方法によって細胞に導入される。
【0271】
本明細書で使用される「プロモーター」という用語は、RNAポリメラーゼ、すなわちRNAポリメラーゼIIの開始部位の周りに集中している転写制御モジュールの群を指す。プロモーターは、それぞれがおよそ7~20bpのDNAからなる、個別の機能モジュールから構成され、転写活性化因子またはリプレッサータンパク質のための1つ以上の認識部位を含む。
【0272】
いくつかの実施形態では、核酸配列は、RNAポリメラーゼII(RNAP IIおよびPol II)によって転写される。RNAP IIは、真核細胞に見られる酵素である。それは、DNAの転写を触媒して、mRNAならびにほとんどのsnRNAおよびマイクロRNAの前駆体を合成する。
【0273】
いくつかの実施形態では、哺乳動物発現ベクターとしては、限定されないが、Invitrogenから入手可能なpcDNA3、pcDNA3.1(±)、pGL3、pZeoSV2(±)、pSecTag2、pDisplay、pEF/myc/cyto、pCMV/myc/cyto、pCR3.1、pSinRep5、DH26S、DHBB、pNMT1、pNMT41、pNMT81、Promegaから入手可能なpCI、Strategeneから入手可能なpMbac、pPbac、pBK-RSVおよびpBK-CMV、Clontechから入手可能なpTRES、およびそれらの誘導体が挙げられる。
【0274】
いくつかの実施形態では、レトロウイルスなどの真核生物ウイルス由来の調節エレメントを含有する発現ベクターが、本発明によって使用される。SV40ベクターには、pSVT7およびpMT2が含まれる。いくつかの実施形態において、ウシパピローマウイルスに由来するベクターとしては、pBV-1MTHAが挙げられ、エプスタインバーウイルスに由来するベクターとしては、pHEBOおよびp2O5が挙げられる。他の例示的なベクターには、pMSG、pAV009/A+、pMTO10/A+、pMAMneo-5、バキュロウイルスpDSVE、およびSV-40初期プロモーター、SV-40後期プロモーター、メタロチオネインプロモーター、マウス乳腺腫瘍ウイルスプロモーター、ラウス肉腫ウイルスプロモーター、ポリヘドリンプロモーター、または真核細胞での発現に有効であることが示されている他のプロモーターの指示下で、タンパク質の発現を可能にする任意の他のベクターが含まれる。
【0275】
いくつかの実施形態では、組換えウイルスベクターがインビボ発現に使用され、それらは、ラテラル感染および標的特異性などの利点を提供する。一実施形態では、ラテラル感染は、例えばレトロウイルスのライフサイクルに固有であり、単一の感染細胞が、発芽して隣接細胞に感染する多くの後代ビリオンを発生させるプロセスである。一実施形態では、その結果、広い領域が急速に感染し、その大部分は、最初は元のウイルス粒子に感染していなかった。一実施形態では、横に拡散することができないウイルスベクターが作製される。一実施形態では、この特徴は、所望の目的が、特定の遺伝子を局所的な数の標的細胞にのみ導入することである場合に有用であり得る。
【0276】
様々な方法を使用して、本発明の発現ベクターを細胞に導入することができる。そのような方法は、一般に、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual,Cold Springs Harbor Laboratory,New York(1989,1992)、Ausubel et al.,Current Protocols in Molecular Biology,John Wiley and Sons,Baltimore,Md.(1989)、Chang et al.,Somatic Gene Therapy,CRC Press,Ann Arbor,Mich.(1995)、Vega et al.,Gene Targeting,CRC Press,Ann Arbor Mich.(1995)、Vectors:A Survey of Molecular Cloning Vectors and Their Uses,Butterworths,Boston Mass.(1988)、およびGilboa et at.[Biotechniques 4(6):504-512,1986]に記載され、例えば、安定または一過性のトランスフェクション、リポフェクション、エレクトロポレーションおよび組換えウイルスベクターによる感染が挙げられる。さらに、ポジティブ-ネガティブセレクション法については、米国特許第5,464,764号および5,487,992号を参照されたい。
【0277】
挿入された(ポリペプチドをコードする)コード配列の転写および翻訳に必要なエレメントを含有すること以外に、本発明の発現構築物は、発現されるポリペプチドの安定性、産生、精製、収率または活性を最適化するように操作された配列も含み得ることが理解されるであろう。
【0278】
組成物
【0279】
別の態様により、本発明のsdAbを含む組成物が提供される。
【0280】
別の態様により、本発明の薬剤を含む組成物が提供される。
【0281】
別の態様により、本発明の核酸分子を含む組成物が提供される。
【0282】
いくつかの実施形態では、組成物は医薬組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は治療用組成物である。いくつかの実施形態では、組成物は、治療的に許容される担体、賦形剤またはアジュバントを含む。
【0283】
本明細書で使用される場合、「担体」、「賦形剤」または「アジュバント」という用語は、活性薬剤ではない医薬組成物の任意の成分を指す。本明細書で使用される場合、「薬学的に許容される担体」という用語は、非毒性の不活性固体、半固体液体充填剤、希釈剤、封入材料、任意の種類の製剤補助剤、または単に滅菌水性媒体、例えば生理食塩水を指す。薬学的に許容される担体として機能し得る材料のいくつかの例は、糖、例えばラクトース、グルコースおよびスクロース、デンプン、例えばコーンスターチおよびジャガイモデンプン、セルロースおよびその誘導体、例えばカルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロースおよび酢酸セルロース;粉末トラガカント;麦芽、ゼラチン、タルク;賦形剤、例えばカカオバターおよび坐剤ワックス;油、例えば落花生油、綿実油、ベニバナ油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油および大豆油;グリコール、例えばプロピレングリコール、ポリオール、例えばグリセリン、ソルビトール、マンニトールおよびポリエチレングリコール;エステル、例えばオレイン酸エチル、ラウリン酸エチル、寒天;緩衝剤、例えば水酸化マグネシウム、水酸化アルミニウム;アルギン酸;パイロジェンフリー水;等張食塩水、リンゲル液;エチルアルコールおよびリン酸緩衝液、ならびに医薬製剤に使用される他の非毒性の適合性物質である。本明細書で担体として機能することができる物質のいくつかの非限定的な例としては、糖、デンプン、セルロースおよびその誘導体、粉末トラガカント、麦芽、ゼラチン、タルク、ステアリン酸、ステアリン酸マグネシウム、硫酸カルシウム、植物油、ポリオール、アルギン酸、パイロジェンフリー水、等張食塩水、リン酸緩衝液、ココアバター(坐剤基剤)、乳化剤、ならびに他の医薬製剤に使用される他の非毒性の薬学的に適合性の物質が挙げられる。ラウリル硫酸ナトリウムなどの湿潤剤および潤滑剤、ならびに着色剤、香味剤、賦形剤、安定剤、酸化防止剤、および保存剤も存在し得る。本明細書で企図される組成物を製剤化するために、任意の非毒性、不活性かつ有効な担体を使用することができる。これに関して適切な薬学的に許容される担体、賦形剤、および希釈剤は、当業者に周知であり、例えば、The Merck Index,Thirteenth Edition,Budavari et al.,Eds.,Merck&Co.,Inc.,Rahway,N.J.(2001);the CTFA(Cosmetic,Toiletry,and Fragrance Association)International Cosmetic Ingredient Dictionary and Handbook,Tenth Edition(2004);および「Inactive Ingredient Guide」、U.S.Food and Drug Administration(FDA)Center for Drug Evaluation and Research(CDER)Office of Management(これらの全ての内容は参照によりその全体が本明細書に組み込まれる)に記載されるものである。本発明の組成物に有用な薬学的に許容される賦形剤、担体および希釈剤の例としては、蒸留水、生理食塩水、リンゲル液、デキストロース溶液、ハンクス溶液およびDMSOが挙げられる。これらの追加の不活性成分、ならびに有効な製剤および投与手順は当技術分野で周知であり、標準的な教科書、例えばGoodman and Gillman’s:The Pharmacological Bases of Therapeutics,8 th Ed.,Gilman et al.Eds.Pergamon Press(1990);Remington’s Pharmaceutical Sciences,18th Ed.,Mack Publishing Co.,Easton,Pa.(1990);およびRemington:The Science and Practice of Pharmacy,21st Ed.,Lippincott Williams&Wilkins,Philadelphia,Pa.,(2005)に記載されており、これらの各々は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。本明細書に記載の組成物はまた、リポソーム、ISCOMS、徐放性粒子、および血清中のペプチドまたはポリペプチドの半減期を延長する他のビヒクルなど、人工的に作製された構造に包含されてもよい。リポソームには、エマルジョン、フォーム、ミセル、不溶性単層、液晶、リン脂質分散液、ラメラ層などが含まれる。本明細書に記載のペプチドと共に使用するためのリポソームは、一般に中性で負に帯電したリン脂質およびステロール、例えばコレステロールを含む標準的なベシクル形成脂質から形成される。脂質の選択は、一般に、リポソームサイズおよび血液中の安定性などを考慮して決定される。例えば、Coligan,J.E.et al,Current Protocols in Protein Science,1999,John Wiley&Sons,Inc.,New Yorkに概説されているように、リポソームを調製するための様々な方法が利用可能であり、また、米国特許第4,235,871号、4,501,728号、4,837,028号、および5,019,369号も参照されたい。
【0284】
担体は、合計で、本明細書に提示される医薬組成物の約0.1重量%~約99.99999重量%を構成し得る。
【0285】
いくつかの実施形態では、組成物は、治療有効量のsdAbを含む。いくつかの実施形態では、組成物は、治療有効量の薬剤を含む。いくつかの実施形態では、組成物は、治療有効量の核酸分子を含む。本明細書で使用される場合、「治療有効量」という用語は、哺乳動物の疾患または障害を治療するのに有効な薬剤の量を指す。「治療有効量」という用語は、所望の治療的または予防的結果を達成するために、必要な投与量および期間で効果のある量を指す。正確な投与形態およびレジメンは、患者の状態に応じて医師によって決定される。
【0286】
いくつかの実施形態では、組成物は、対象への投与のために製剤化される。いくつかの実施形態では、組成物は、全身投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、組成物は、局所投与用に製剤化される。いくつかの実施形態では、局所投与は炎症部位への投与である。いくつかの実施形態では、局所投与は腫瘍内投与である。いくつかの実施形態では、局所投与は免疫応答部位への投与である。いくつかの実施形態では、免疫応答は自己免疫応答である。
【0287】
本明細書で使用される場合、「投与する」、「投与」などの用語は、健全な医療行為において、治療効果をもたらすような方法で活性剤を含有する組成物を対象に送達する任意の方法を指す。本主題の一態様は、治療有効量の本発明の薬剤の静脈内投与を、それを必要とする患者へ提供する。他の適切な投与経路としては、非経口、皮下、経口、筋肉内または腹腔内が挙げられ得る。
【0288】
治療方法
【0289】
別の態様によって、sCD28レベルの低下を必要とする対象においてsCD28レベルを低下させる方法であって、本発明のsdAb、本発明の薬剤または本発明の医薬組成物を対象に投与し、それによりsCD28レベルを低下させることを含む方法が提供される。
【0290】
別の態様によって、細胞の表面上のCD28切断を減少させる方法であって、細胞を本発明のsdAb、本発明の薬剤または本発明の医薬組成物に接触させ、それによりsCD28レベルを低下させることを含む方法が提供される。
【0291】
別の態様によって、疾患の治療および/または予防を必要とする対象において疾患を治療および/または予防する方法であって、本発明のsdAb、本発明の薬剤または本発明の医薬組成物を対象に投与し、それにより疾患を治療および/または予防することを含む方法が提供される。
【0292】
別の態様によって、免疫療法の改善を必要とする対象において免疫療法を改善する方法であって、本発明のsdAb、本発明の薬剤または本発明の医薬組成物を対象に投与し、それにより免疫療法を改善することを含む方法が提供される。
【0293】
sCD28を減少させる、特にCD28切断を遮断する能力は、癌の有効な治療、免疫刺激を増加させる方法、および免疫療法の有効な後押しであることが実証されている。これは、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際特許出願公開第2019/175885号および第2020111441号に実証されている。
【0294】
いくつかの実施形態では、免疫療法は、PD-1および/またはPD-L1ベースの癌免疫療法である。いくつかの実施形態では、PD-1/PD-L1ベースの免疫療法は、抗PD1または抗PD-L1抗体を投与することを含む。いくつかの実施形態では、治療はPD-1チェックポイントの遮断を含む。いくつかの実施形態では、免疫療法は、同種異系、シンジェニックまたは自家免疫細胞を対象に投与することを含む。いくつかの実施形態では、免疫細胞はT細胞である。いくつかの実施形態では、免疫療法を必要とする対象は、癌に罹患している。
【0295】
本明細書で使用される場合、疾患、障害、または状態の「治療」または「治療すること」という用語は、その少なくとも1つの症状の緩和、その重症度の低下、またはその進行の阻害を包含する。治療は、疾患、障害または状態が完全に治癒することを意味する必要はない。有効な治療であるために、本明細書の有用な組成物は、疾患、障害、または状態の重症度を低下させるか、それに関連する症状の重症度を低下させるか、または患者または対象の生活の質を改善するだけでよい。
【0296】
いくつかの実施形態では、対象は哺乳動物である。いくつかの実施形態では、対象はヒトである。いくつかの実施形態では、対象は疾患に罹患している。いくつかの実施形態では、対象はそれを必要としている。いくつかの実施形態では、対象は免疫療法を必要としている。いくつかの実施形態では、対象は免疫療法で治療されている。
【0297】
いくつかの実施形態では、対象の血液は、上昇したレベルのsCD28を含む。いくつかの実施形態では、対象の血液は、上昇したレベルのsCD28を含み、その後低下する。いくつかの実施形態では、レベルは、健康な対象のものよりも高い。いくつかの実施形態では、対象のsCD28レベルは、健康な対象のレベルよりも少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、250%、300%、350%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、または1000%上昇している。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、レベルは、血液1mlあたり5、6、7、8、9、10、12、14、15、16、18、20、25、30、35、40、45または50ngを超えて上昇している。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、レベルは5ng/ml超に上昇している。いくつかの実施形態では、レベルは10ng/ml超に上昇している。いくつかの実施形態では、レベルは20ng/ml超に上昇している。いくつかの実施形態では、対象の血液は、血液1ml当たり少なくとも5、6、7、8、9、10、12、14、15、16、18、20、25、30、35、40、45または50ngのsCD28を含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、対象の血液は、血液1ml当たり少なくとも5、6、7、8、9、10、12、14、15、16、18、20、25、30、35、40、45または50ngのsCD28を、減少される前に含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、対象の血液は、1ml当たり少なくとも5ngのsCD28を含む。いくつかの実施形態では、対象の血液は、1ml当たり少なくとも10ngのsCD28を含む。いくつかの実施形態では、対象の血液は、1ml当たり少なくとも20ngのsCD28を含む。いくつかの実施形態では、対象の血液は、1ml当たり少なくとも5ngのsCD28を、減少される前に含む。いくつかの実施形態では、対象の血液は、1ml当たり少なくとも10ngのsCD28を、減少される前に含む。いくつかの実施形態では、対象の血液は、1ml当たり少なくとも20ngのsCD28を、減少される前に含む。
【0298】
いくつかの実施形態では、対象は、sCD28の増加しているレベルを含む。いくつかの実施形態では、増加しているレベルは、血液中の増加しているレベルである。いくつかの実施形態では、増加は、第1の時点から第2の時点までである。いくつかの実施形態では、増加は、免疫療法による治療前から治療後までである。いくつかの実施形態では、増加は、疾患が進行するにつれて増大する。国際特許出願公開第2021/111442号(その内容全体が参照により本明細書に組み込まれる)には、sCD28レベルが癌進行中および免疫療法中に増加し得ること、ならびに切断遮断剤を使用してそのような癌を治療することができることが示されている。
【0299】
いくつかの実施形態では、対象は癌に罹患している。いくつかの実施形態では、癌は免疫療法によって治療され得る。いくつかの実施形態では、癌は、PD-1/PD-L1療法で治療され得る癌である。いくつかの実施形態では、対象はPD-1/PD-L1療法を受けたことがある。いくつかの実施形態では、対象はPD-1/PD-L1療法に非応答である。いくつかの実施形態では、対象はPD-1/PD-L1療法に対してナイーブである。いくつかの実施形態において、本発明の方法は、PD-1/PD-L1療法と共に行われる。いくつかの実施形態において、本発明の方法は、PD-1/PD-L1療法の前に行われる。
【0300】
いくつかの実施形態では、方法は、別の免疫療法を対象に投与することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、PD-1および/またはPD-L1ベースの免疫療法を投与することをさらに含む。いくつかの実施形態では、別の免疫療法はチェックポイント阻害剤である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤はPD-1および/またはPD-L1阻害剤である。いくつかの実施形態では、チェックポイント阻害剤はCTLA-4阻害剤である。いくつかの実施形態では、別の免疫療法はキメラ抗原受容体(CAR)ベースの免疫療法である。いくつかの実施形態では、CARはCAR-Tである。いくつかの実施形態では、CARはCAR-NKである。いくつかの実施形態では、別の免疫療法は癌ワクチンである。
【0301】
本明細書で使用される場合、「CAR-T細胞」および「CAR-NK細胞」という用語は操作された受容体を指し、それは、少なくとも1つの目的のタンパク質(例えば、エピジェネティック修飾剤での治療後に発現が増加した免疫原性タンパク質)に対する特異性を有し、免疫エフェクター細胞(T細胞またはNK細胞)上にグラフトされる。いくつかの実施形態では、CAR-T細胞は、T細胞上にグラフトされたモノクローナル抗体の特異性を有する。いくつかの実施形態では、CAR-NK細胞は、NK細胞上にグラフトされたモノクローナル抗体の特異性を有する。いくつかの実施形態では、T細胞は、細胞傷害性Tリンパ球および制御性T細胞から選択される。
【0302】
CAR-TおよびCAR-NK細胞ならびにそれらのベクターは当技術分野において周知である。そのような細胞は、受容体が結合するタンパク質を標的とし、それに対して細胞傷害性である。いくつかの実施形態では、CAR-TまたはCAR-NK細胞は、少なくとも1つのウイルスタンパク質を標的とする。いくつかの実施形態では、CAR-TまたはCAR-NK細胞は、複数のウイルスタンパク質を標的とする。いくつかの実施形態では、CAR-TまたはCAR-NK細胞は、エピジェネティック修飾剤との接触により発現が増加したウイルスタンパク質を標的とする。
【0303】
CAR-T細胞の構築は当技術分野において周知である。1つの非限定的な例では、ウイルスタンパク質に対するモノクローナル抗体を作製し、次いで、抗体をコードするベクターを構築することができる。ベクターはまた、共刺激性シグナル領域を含むであろう。いくつかの実施形態では、共刺激性シグナル領域は、既知のT細胞またはNK細胞刺激性分子の細胞内ドメインを含む。いくつかの実施形態では、細胞内ドメインは、CD3Z、CD27、CD28、4-1BB、OX40、CD30、CD40、PD-1、ICOS、リンパ球機能関連抗原-1(LFA-1)、CD2、CD7、LIGHT、NKG2C、B7-H3、およびCD83と特異的に結合するリガンドのうちの少なくとも1つから選択される。いくつかの実施形態では、ベクターはCD3Zシグナル伝達ドメインも含む。次いで、このベクターを、例えばレンチウイルス感染によってT細胞にトランスフェクトする。
【0304】
いくつかの実施形態では、癌は、上昇したsCD28レベルを伴う癌である。いくつかの実施形態では、癌は、上昇したsCD28レベルを有する対象に存在する。いくつかの実施形態では、癌は、高いsCD28レベルを含む。いくつかの実施形態では、癌は、高いsCD28レベルを有する対象に存在する。いくつかの実施形態では、上昇したsCD28レベルおよび/または高いsCD28レベルは、5、6、7、8、9、10、12、14、15、17、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90または100ng/mlであり、かつ/またはそれを超えるレベルである。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、癌は、高いsCD28レベルを含む。いくつかの実施形態では、上昇したsCD28レベルおよび/または高いsCD28レベルは、健康な対象のレベルの5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、300、400、500、600、700、800、900または1000%であり、かつ/またはそれを超えるレベルである。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、癌は乳癌ではない。いくつかの実施形態では、癌は、黒色腫、頭頸部癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、腎癌、胃癌および結腸直腸癌から選択される。いくつかの実施形態では、癌は、黒色腫、頭頸部癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、および結腸直腸癌から選択される。いくつかの実施形態では、癌は、黒色腫、頭頸部癌、非小細胞肺癌、卵巣癌、腎癌、胃癌または結腸直腸癌である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。癌の例には、脳癌、口腔癌、頭頸部癌、食道癌、肺癌、皮膚癌、肝臓癌、膵臓癌、膀胱癌、腎臓癌、血液癌、膀胱癌、骨癌、乳癌、甲状腺癌、子宮頸癌、卵巣癌、精巣癌、網膜芽細胞腫、胃癌、結腸直腸癌および子宮癌が含まれるが、これらに限定されない。
【0305】
いくつかの実施形態では、疾患は増殖性疾患である。いくつかの実施形態では、疾患は癌である。いくつかの実施形態では、疾患は免疫刺激によって治療可能である。いくつかの実施形態では、疾患は、上昇したsCD28レベルを含む。いくつかの実施形態では、疾患は、sCD28のレベルを増加させることを含む。いくつかの実施形態では、増加は経時的に増大する。いくつかの実施形態では、増加は、疾患の進行中に増大する。いくつかの実施形態では、疾患は感染性疾患である。いくつかの実施形態では、疾患は免疫療法によって治療可能な疾患である。
【0306】
いくつかの実施形態では、方法はインビボで行われる。いくつかの実施形態では、方法はインビトロで行われる。いくつかの実施形態では、減少はインビボで行われる。いくつかの実施形態では、減少はインビトロで行われる。いくつかの実施形態では、減少は、対象から血液を取り出し、取り出された血液中のsCD28レベルを低下させ、血液を対象に戻し、それによって対象のsCD28を減少させることを含む。透析および血液浄化の方法は周知である。本発明は、sCD28をインビトロで一掃し、次いで血液を対象に戻すことによって実施することができる。
【0307】
いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを少なくとも5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、97または99%低下させる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを健康な個体のレベルまで低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを最大で1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45または50ng/mlに低下させる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28血中レベルを最大5ng/mlまで低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28血中レベルを最大10ng/mlまで低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28血中レベルを最大20ng/mlまで低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを健康な個体のレベルまで低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを1、2、3、4、5、10、15、20、25、30、35、40、45または50ng/ml未満に低下させる。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを5ng/ml未満に低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを10ng/ml未満に低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤は、sCD28レベルを20ng/ml未満に低下させる。いくつかの実施形態では、低下または減少は、対象の血液、末梢血またはTMEで起こる。いくつかの実施形態では、低下または減少は血液中で起こる。
【0308】
いくつかの実施形態では、sCD28レベルはELISAによって測定される通りである。いくつかの実施形態では、ELISAはサンドイッチELISAである。いくつかの実施形態では、ELISAは標準化サンドイッチELISAである。いくつかの実施形態では、ELISAはBender MedSystems ELISAである。いくつかの実施形態では、ELISAはBender MedSystems ELISAキットBMS290である。いくつかの実施形態では、ELISAは、本発明の薬剤を用いて行われる。
【0309】
いくつかの実施形態では、CD28シェディング(CD28 shedding)を遮断することは、タンパク質分解性切断を遮断することを含む。いくつかの実施形態では、遮断は阻害することである。いくつかの実施形態では、遮断は減少させることである。
【0310】
本明細書で使用される場合、「タンパク質分解性切断を阻害する」とは、mCD28のタンパク質分解性切断の何らかの減少を指す。いくつかの実施形態では、阻害は、少なくとも5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、97、99または100%の切断の減少である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の阻害により、免疫細胞上のmCD28のレベルが維持される。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の阻害により、免疫細胞上のmCD28のレベルが増加する。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の阻害により、免疫刺激に十分なmCD28のレベルが維持される。いくつかの実施形態では、タンパク質分解性切断の減少とは、少なくとも1つのプロテアーゼによる切断の減少である。
【0311】
いくつかの実施形態では、本発明の方法は、mCD28を分解しないか、または分解に至らない。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、免疫細胞上のmCD28レベルを低下させない。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、mCD28媒介免疫細胞活性化を減少させない。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、対象の免疫細胞上のmCD28レベルを維持する。いくつかの実施形態では、本発明の方法は、対象の免疫細胞上のmCD28レベルを増加させる。
【0312】
いくつかの実施形態では、減少は、sCD28の少なくとも10、20、30、40、50、60、70、80、90、95、または99%の減少である。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、減少は血清sCD28中である。いくつかの実施形態では、減少はsCD28の血中レベルにある。いくつかの実施形態では、減少は、腫瘍微小環境(TME)におけるsCD28のレベルにある。
【0313】
いくつかの実施形態では、免疫活性化の増加、疾患の治療、および/または免疫療法の改善の方法は、アンタゴニストではない薬剤を投与することを含む。いくつかの実施形態では、免疫活性化の増加、疾患の治療、および/または免疫療法の改善の方法は、実質的に拮抗しない薬剤を投与することを含む。いくつかの実施形態では、疾患は免疫活性化の増加によって治療可能な疾患である。
【0314】
別の態様によって、CD28へのリガンド結合を阻害する方法であって、CD28を本発明のsdAbまたは本発明の組成物と接触させ、それによりリガンド結合を阻害することを含む方法が提供される。
【0315】
別の態様によって、免疫応答の抑制を必要とする対象において免疫応答を抑制する方法であって、本発明のsdAbまたは本発明の組成物を対象に投与し、それにより免疫応答を抑制することを含む方法が提供される。
【0316】
CD28の阻害が免疫刺激を遮断し、自己免疫疾患を治療するために使用できることは当技術分野で周知である。さらに、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる国際特許出願公開第2020/183471号は、sCD28レベルの増加およびCD28阻害が治療上有効な様式であることを実証している。いくつかの実施形態において、リガンド結合を阻害することは、免疫応答を抑制することを含む。
【0317】
いくつかの実施形態では、薬剤はT細胞活性化を減少させる。いくつかの実施形態では、薬剤はT細胞増殖を減少させる。いくつかの実施形態では、薬剤はT細胞のクラスター形成を減少させる。いくつかの実施形態において、薬剤は、抗炎症性サイトカイン分泌を増加させる。抗炎症性サイトカインは当技術分野で周知である。抗炎症性サイトカインの非限定例としては、IL-10およびTGFβが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態において、薬剤は、炎症誘発性サイトカイン分泌を減少させる。いくつかの実施形態では、炎症誘発性サイトカインはIFNγである。
【0318】
いくつかの実施形態では、薬剤はCD28の機能および/またはシグナル伝達を調節する。いくつかの実施形態では、薬剤はCD28の機能および/またはシグナル伝達を低下させる。いくつかの実施形態では、薬剤はCD28活性化を減少させる。いくつかの実施形態では、シグナル伝達はCD28媒介性の免疫応答である。いくつかの実施形態では、薬剤は免疫抑制を増加または促進する。
【0319】
本明細書で使用される場合、「免疫応答」という用語は、身体が病原体または異常から自身を防御するために行う任意の応答を指す。一実施形態では、免疫応答は、免疫細胞を媒介または必要とする応答を含む。
【0320】
一実施形態では、免疫応答は、免疫系または免疫系のメディエーターを活性化または阻害する任意の応答を含む。別の実施形態では、免疫応答の活性化は、免疫細胞の活性化を含む。別の実施形態では、免疫細胞の活性化は、免疫細胞のサブセットの増殖をもたらす。別の実施形態では、免疫細胞の活性化は、活性化された細胞による免疫学的メディエーターの分泌増加をもたらす。別の実施形態では、免疫細胞の活性化は、病原体、外来細胞、疾患細胞、それらから誘導もしくは分泌される分子、またはそれらの任意の組み合わせの貪食および/または破壊をもたらす。別の実施形態では、免疫細胞の活性化は、隣接細胞、例えば限定されないが、ウイルスに感染した細胞の貪食および/または破壊をもたらす。別の実施形態では、免疫細胞の活性化は、宿主細胞、それらから誘導もしくは分泌される分子、またはそれらの任意の組み合わせの貪食および/または破壊をもたらす。別の実施形態では、免疫細胞の活性化は、特定の分子、エピトープ、病原体、またはそれらの任意の組み合わせに対する抗体の分泌の活性化をもたらす。
【0321】
いくつかの実施形態では、免疫応答は細胞傷害性応答である。本明細書で使用される場合、細胞傷害性応答は、細胞溶解および/または他の損傷をもたらす、補体系の活性化を含む応答を指す。いくつかの実施形態では、免疫応答は体液性応答であり、すなわち抗体の産生および分泌を伴う。いくつかの実施形態では、免疫応答は自然免疫応答であり、すなわち自然免疫系に関わる。いくつかの実施形態では、免疫応答は獲得免疫応答であり、すなわち獲得免疫応答を含む。
【0322】
いくつかの実施形態では、対象は、グラフトレシピエントまたは生着の候補である。いくつかの実施形態では、グラフトは、単独細胞、細胞懸濁液、器官、またはそれらの任意の組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、グラフトは自家グラフトである。いくつかの実施形態では、グラフトはシンジェニックグラフトである。いくつかの実施形態では、グラフトは同種異系グラフトである。いくつかの実施形態では、グラフトは異種移植片である。いくつかの実施形態では、グラフトは造血グラフトである。いくつかの実施形態では、グラフトは造血幹細胞を含む。いくつかの実施形態では、グラフトは非造血グラフトである。
【0323】
いくつかの実施形態では、対象は、アレルギーまたはアレルギー反応に悩まされている。いくつかの実施形態では、アレルギー反応は、感染性疾患または障害に起因する。いくつかの実施形態では、アレルギー反応は、感染性疾患または障害の症状である。いくつかの実施形態では、アレルギー反応は、感染性疾患または障害とは無関係である。いくつかの実施形態では、アレルギー反応は、感染性疾患または障害に並行して刺激される。
【0324】
いくつかの実施形態では、対象は、サイトカイン放出症候群(CRS)に罹患している。本明細書中で使用されるとき、「サイトカイン放出症候群」とは、他の疾患または感染の合併症に起因する全身性炎症反応症候群のことを指す。一実施形態では、CRSは、モノクローナル抗体薬物などの(例えば、有害作用)免疫療法によって誘導されるか、またはそれから生じる。一実施形態では、CRSは、養子T細胞療法によって誘導されるか、またはそれから生じる。本明細書で使用される場合、「CRS」および「サイトカインストーム」という用語は交換可能である。
【0325】
いくつかの実施形態では、対象は、感染性疾患に罹患している。感染性疾患の非限定的な例としては、尿路感染症、胃腸感染症、腸炎、サルモネラ症、下痢、非結核性抗酸菌感染症、レジオネラ病、院内肺炎、皮膚感染症、コレラ、敗血症性ショック、歯周炎、感染症、副鼻腔炎、菌血症、新生児感染症、肺炎、心内膜炎、骨髄炎、毒性ショック症候群、熱傷様皮膚症候群、および食中毒が挙げられるが、これらに限定されない。
【0326】
いくつかの実施形態では、対象は、自己免疫疾患に罹患している。本明細書で使用される場合、「自己免疫疾患」という用語は、対象自身の組織または組織構成要素(例えば、細胞およびそれによって産生または分泌される分子)に対する免疫応答、または対象に本質的に有害ではない抗原に対する免疫応答に起因する任意の疾患または障害を指す。いくつかの実施形態では、対象は、T細胞媒介性自己免疫疾患に罹患している。自己免疫疾患の例としては、アカラシア、アジソン病、成人スチル病、無ガンマグロブリン血症、円形脱毛症、アミロイドーシス、強直性脊椎炎、抗GBM/抗TBM腎炎、抗リン脂質症候群、自己免疫性血管浮腫、自己免疫性自律神経障害、自己免疫性脳脊髄炎、自己免疫性肝炎、自己免疫性内耳疾患(AIED)、自己免疫性心筋炎、自己免疫性卵巣炎、自己免疫性眼炎、自己免疫性膵炎、自己免疫性網膜症、自己免疫性蕁麻疹、軸索性神経障害(AMAN)、バロー病、ベーチェット病、良性粘膜類天疱瘡、水疱性類天疱瘡、キャッスルマン病(CD)、セリアック病、シャーガス病、慢性炎症性脱髄性多発ニューロパチー(CIDP)、慢性再発性多巣性骨髄炎(CRMO)、チャーグ・ストラウス症候群(CSS)または好酸球性肉芽腫症(EGPA)、瘢痕性類天疱瘡、コーガン症候群、寒冷凝集素症、先天性心ブロック、コクサッキー心筋炎、CREST症候群、クローン病、疱疹状皮膚炎、皮膚筋炎、デビック病(視神経脊髄炎)、円板状狼瘡、ドレスラー症候群、子宮内膜症、好酸球性食道炎(EoE)、好酸球性筋炎、結節性紅斑、本態性混合型クリオグロブリン血症、エバンス症候群、線維筋痛症、線維性肺胞炎、巨細胞炎(側頭動脈炎)、巨細胞性心筋炎、糸球体腎炎、グッドパスチャー症候群、多発血管炎性肉芽腫症、グレーブス病、ギラン・バレー症候群、橋本甲状腺炎、溶血性貧血、ヘノッホ-シェンライン紫斑病(HSP)、妊娠性ヘルペスまたは妊娠性類天疱瘡(PG)、化膿性汗腺炎(HS)(アクネ病)、低ガンマグロブリン血症、IgA腎症、IgG4関連硬化性疾患、免疫性血小板減少性紫斑病(ITP)、封入体筋炎(IBM)、間質性膀胱炎(IC)、若年性関節炎、若年性筋炎(JM)、川崎病、ランバート-イートン症候群、白血球破砕性血管炎、扁平苔癬、硬化性苔癬、木質性結膜炎、線状IgA病(LAD)、狼瘡、慢性ライム病、メニエル病、顕微鏡的多発血管炎(MPA)、混合性結合組織病(MCTD)、モーレン潰瘍、ムチャ・ハーバーマン病、多巣性運動神経障害(MMN)またはMMNCB、多発性硬化症、重症筋無力症、筋炎、ナルコレプシー、新生児狼瘡、視神経脊髄炎、好中球減少症、眼性瘢痕性類天疱瘡、視神経炎、回帰性リウマチ(PR)、PANDAS、傍腫瘍性小脳変性症(PCD)、発作性夜間ヘモグロビン尿症(PNH)、パリー・ロンベルグ症候群、扁平部炎(末梢ブドウ膜炎)、乾癬性ターナー症候群、天疱瘡、末梢神経障害、静脈周囲脊髄炎、悪性貧血(PA)、POEMS症候群、結節性多発動脈炎、多腺性症候群I型、II型、III型、リウマチ性多発筋痛症、多発性筋炎、心筋梗塞後症候群、心膜切開後症候群、原発性胆汁性肝硬変、原発性硬化性胆管炎、プロゲステロン皮膚炎、乾癬、乾癬性関節炎、赤芽球ろう(PRCA)、壊疽性膿皮症、レイノー現象、反応性関節炎、反射性交感神経性ジストロフィー、再発性多発性軟骨炎、下肢静止不能症候群(RLS)、後腹膜線維症、リウマチ熱、関節リウマチ、サルコイドーシス、シュミット症候群、強膜炎、強皮症、シェーグレン症候群、精子および精巣自己免疫、スティッフパーソン症候群(SPS)、亜急性細菌性心内膜炎(SBE)、スザック症候群、交感性眼炎(SO)、高安動脈炎、側頭動脈炎/巨細胞性動脈炎、血小板減少性紫斑病(TTP)、トロサ・ハンツ症候群(THS)、横断性脊髄炎、1型糖尿病、潰瘍性大腸炎(UC)、未分化結合組織病(UCTD)、ブドウ膜炎、血管炎、白斑およびフォークト・小柳・原田病が挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患は、ループス、関節リウマチ、クローン病、炎症性腸疾患、ベーチェット病、大腸炎、潰瘍性大腸炎、糖尿病、グレーブス病および多発性硬化症から選択される。
【0327】
いくつかの実施形態では、方法は、少なくとも1つの他の免疫抑制療法を投与することをさらに含む。いくつかの実施形態では、免疫抑制療法は免疫抑制薬である。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬は免疫抑制剤である。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬は、リガンドに結合するsCD28またはその誘導体である。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、国際特許出願WO2020/183471号に提供されているsCD28安定化剤である。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬はステロイドである。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬はカルシニューリン阻害剤である。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬は抗増殖剤である。いくつかの実施形態では、免疫抑制薬はmTOR阻害剤である。免疫抑制薬は当技術分野で周知であり、任意のそのような治療を使用することができる。免疫抑制薬の例としては、プレドニゾン、シロリムス、タクロリムス、シクロスポリン、ミコフェノール酸、ミコフェノール酸ナトリウム、アザチオプリン、レナリドミド、ポマリドミド、メトトレキサート、アザチオプリンおよびサリドマイドが挙げられるが、これらに限定されない。
【0328】
いくつかの実施形態において、自己免疫疾患は、上昇したsCD28レベルを伴う自己免疫疾患である。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患は、高いsCD28レベルを含む。いくつかの実施形態では、上昇したsCD28レベルおよび/または高いsCD28レベルは、5、6、7、8、9、10、12、14、15、17、20、25、30、35、40、50、60、70、80、90または100ng/mlであり、かつ/またはそれを超えるレベルである。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患は、高いsCD28レベルを含む。いくつかの実施形態では、上昇したsCD28レベルおよび/または高いsCD28レベルは、健康な対象のレベルの5、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、150、200、300、400、500、600、700、800、900または1000%であり、かつ/またはそれを超えるレベルである。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患は、sCD28の上昇したレベルを含まない。いくつかの実施形態では、自己免疫疾患は、sCD28の高いレベルを含まない。いくつかの実施形態では、高レベルおよび/または上昇したレベルは、健康な対象と比較した場合である。
【0329】
いくつかの実施形態では、対象は、健康な対象と比較して上昇したsCD28レベルを有する。いくつかの実施形態では、対象は、健康な対象と比較して上昇していないsCD28レベルを有する。いくつかの実施形態では、対象および健康な対象は、同等のsCD28レベルを有する。いくつかの実施形態では、上昇していないsCD28レベルまたは健康な対象と同等のsCD28レベルを有する対象は、健康な対象よりも0~5%未満多いsCD28を有する。いくつかの実施形態では、上昇していないsCD28レベルまたは健康な対象と同等のsCD28レベルを有する対象は、5ng/ml未満のsCD28を含む。
【0330】
いくつかの実施形態では、上昇したsCD28レベルを有する対象は、健康な対象のレベルを少なくとも5%、10%、15%、20%、25%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、100%、150%、200%、250%、300%、350%、400%、500%、600%、700%、800%、900%、または1,000%を越えて、またはそれらの間の任意の値および範囲で上昇した血中sCD28レベルを含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、血中sCD28レベルは、健康な対象のレベルよりも5~25%、10~50%、25~75%、50~125%、100~250%、200~550%、500~750%、または700~1,000%上昇している。いくつかの実施形態では、上昇したsCD28レベルを有する対象は、血液1ml当たり、5、6、7、8、9、10、12、14、15、16、18、20、25、30、35、40、45または50ngを超えて上昇したレベルを含む。それぞれの可能性は、本発明の別個の実施形態を代表する。いくつかの実施形態では、レベルは5ng/ml超に上昇している。いくつかの実施形態では、レベルは10ng/ml超に上昇している。
【0331】
別の態様により、本発明の治療方法による治療に適した対象を選択する方法が提供され、方法は、対象および/または癌のsCD28レベルを測定することを含み、所定の閾値を超えるsCD28レベルは、対象が本発明の方法による治療に適していることを示す。
【0332】
いくつかの実施形態では、本方法は、sCD28レベルの上昇を確認することをさらに含む。いくつかの実施形態では、本方法は、sCD28レベルを測定することをさらに含む。いくつかの実施形態では、sCD28レベルは対象におけるレベルである。いくつかの実施形態では、sCD28レベルは癌におけるレベルである。いくつかの実施形態では、sCD28レベルは対象からの試料におけるレベルである。いくつかの実施形態では、試料は体液である。いくつかの実施形態では、所定の閾値は、健康な対象におけるレベルである。いくつかの実施形態では、所定の閾値は、それを超えると高いレベルおよび/または上昇したレベルとなる閾値である。いくつかの実施形態では、所定の閾値は5ng/mlである。
【0333】
別の態様により、癌の治療および/または予防に使用するための本発明のsdAb、本発明の薬剤または本発明の医薬組成物が提供される。
【0334】
別の態様により、免疫療法の改善に使用するための本発明のsdAb、本発明の薬剤または本発明の医薬組成物が提供される。
【0335】
別の態様により、免疫応答の抑制に使用するための本発明のsdAb、または本発明の医薬組成物が提供される。
【0336】
キット
【0337】
別の態様により、本発明の少なくとも1つのsdAbまたは本発明の少なくとも1つの薬剤を含むキットが提供される。
【0338】
いくつかの実施形態では、キットは、少なくとも1つの本発明の組成物を含む。いくつかの実施形態では、キットは少なくとも1つの免疫療法をさらに含む。いくつかの実施形態では、キットは、本発明の薬剤が免疫療法と共に使用するためのものであることを記載するラベルを含む。いくつかの実施形態では、キットは、免疫療法が本発明の薬剤と共に使用するためのものであることを記載するラベルを含む。
【0339】
製造方法
【0340】
別の態様により、本発明の薬剤を生成する方法であって、
i.CD28に結合し、切断を遮断するsdAbを得ること;および
ii.リンカーを介してsdAbの第1の部分をsdAbの第2の部分に連結して、二量体剤を作製することを含み;
それによって薬剤を製造する方法を提供する。
【0341】
別の態様により、本発明の薬剤を生成するための方法であって、二量体剤をコードする1つ以上の核酸配列を含む1つ以上のベクターを含む宿主細胞を培養することを含み、1つ以上の核酸配列が、
i.CD28に結合し、切断を遮断するsdAbを得ること;および
ii.リンカーを介してsdAbの第1の部分をsdAbの第2の部分に連結して、二量体剤を作製すること;
によって選択された二量体剤のものであり、それによって薬剤を製造する方法を提供する。
【0342】
いくつかの実施形態では、薬剤はsdAbである。いくつかの実施形態では、sdAbはmCD28を結合する。いくつかの実施形態では、sdAbは細胞上のmCD28を結合する。いくつかの実施形態では、sdAbは細胞表面上のmCD28を結合する。いくつかの実施形態では、切断はプロテアーゼによるものである。いくつかの実施形態では、方法は、切断を遮断する二量体剤の能力を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、選択する方法は、切断を遮断する二量体剤の能力を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、CD28の切断を遮断する二量体剤を選択することをさらに含む。いくつかの実施形態では、選択する方法は、CD28の切断を遮断する二量体剤を選択することをさらに含む。
【0343】
いくつかの実施形態では、切断を遮断するsdAbの能力を試験することは、以下に記載される方法による。いくつかの実施形態では、切断を遮断するsdAbの能力を試験することは、sdAb、プロテアーゼ、およびCD28の細胞外ドメインまたは切断部位を含むそのフラグメントを混合することを含む。いくつかの実施形態では、試験は、CD28またはそのフラグメントの細胞外ドメインを配列決定して、トランケーションおよび/または切断について調べることをさらに含む。いくつかの実施形態では、試験は、CD28の細胞外ドメインまたはそのフラグメントを、切断によるサイズ変化を測定するために十分に感受性であるゲルに流すことをさらに含む。いくつかの実施形態では、試験は、薬剤およびプロテアーゼの存在下で、mCD28を発現する細胞からのsCD28の産生を測定することをさらに含む。
【0344】
いくつかの実施形態では、得られるsdAbは、CD28アンタゴニストである。いくつかの実施形態では、得られるsdAbは、CD28へのリガンドの結合を遮断または阻害する。いくつかの実施形態では、得られるsdAbは、CD28媒介免疫活性化を遮断または阻害する。いくつかの実施形態では、方法は、sdAbによって引き起こされる拮抗作用、遮断および/または阻害を確認することをさらに含む。
【0345】
いくつかの実施形態では、方法は、宿主細胞から薬剤を単離および/または抽出することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、宿主細胞の培養培地から薬剤を単離および/または抽出することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、宿主細胞または宿主細胞の培養培地から薬剤を精製することをさらに含む。
【0346】
いくつかの実施形態では、薬剤を得ることは、サメまたはラクダ科動物を前記CD28細胞外ドメインまたはそのフラグメントで免疫化すること、および前記免疫化された生物から抗体を収集することを含む。いくつかの実施形態では、薬剤を得ることは、CD28細胞外ドメインまたはそのフラグメントへの結合について薬剤のライブラリーをスクリーニングし、結合する薬剤を選択することを含む。
【0347】
いくつかの実施形態では、抗体を回収することは、免疫化されたサメまたはラクダ科動物の脾臓からB細胞を抽出することを含む。いくつかの実施形態では、B細胞は、メラノーマ細胞と融合されてハイブリドーマを生成する。いくつかの実施形態では、抗体はハイブリドーマの培養培地から回収される。いくつかの実施形態では、薬剤を得ることは、生物をCD28細胞外ドメインまたはそのフラグメントで免疫化すること、および免疫化された生物から抗体を収集することを含む。いくつかの実施形態では、生物はマウスである。いくつかの実施形態では、生物は、ウサギ、マウス、ラット、サメ、ラクダ科動物、ニワトリ、ヤギおよびファージから選択される。いくつかの実施形態では、ラクダ科動物は、ラクダおよびラマから選択される。いくつかの実施形態では、回収することは、血液を採取することを含む。いくつかの実施形態では、回収することは、
a.免疫された生物の脾臓からB細胞を抽出すること;
b.抽出されたB細胞をミエローマ細胞と融合させてハイブリドーマを作製すること;および
c.ハイブリドーマから抗体を回収すること、を含む。
【0348】
いくつかの実施形態では、sdAbを得ることは、CD28細胞外ドメインまたはそのフラグメントへの結合についてsdAbのライブラリーをスクリーニングし、そのように結合するsdAbを選択することを含む。いくつかの実施形態では、薬剤を得ることは、CD28細胞外ドメインまたはそのフラグメントへの結合について薬剤のライブラリーをスクリーニングし、そのように結合する薬剤を選択することを含む。いくつかの実施形態では、sdAbを得ることは、CD28細胞外ドメインまたはそのフラグメントへの結合についてsdAbのライブラリーをスクリーニングし、そのように結合するsdAbを選択することを含む。いくつかの実施形態では、ライブラリーはファージディスプレイライブラリーである。いくつかの実施形態では、ライブラリーは脾臓B細胞に由来する免疫化ライブラリーである。いくつかの実施形態では、ライブラリーはVHH抗体のライブラリーである。いくつかの実施形態では、ライブラリーは単一ドメインまたはナノボディのライブラリーである。いくつかの実施形態では、sdAbを得ることは、sdAbを配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、sdAbを得ることは、sdAbの組換え形態を作製することを含む。いくつかの実施形態では、組換え形態は、sdAbの配列から作製される。いくつかの実施形態では、方法は、sdAbをヒト化することをさらに含む。いくつかの実施形態では、sdAbを得ることは、sdAbを配列決定することを含む。いくつかの実施形態では、sdAbを得ることは、sdAbの組換え形態を作製することを含む。いくつかの実施形態では、組換え形態は、sdAbの配列から作製される。いくつかの実施形態では、方法は、sdAbをヒト化することをさらに含む。
【0349】
いくつかの実施形態では、本方法は、mCD28への薬剤またはsdAbの結合を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、mCD28は細胞表面上にある。いくつかの実施形態では、方法は、mCD28に結合するsdAbまたは薬剤を選択することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、プロテアーゼの存在下で細胞表面上のmCD28の切断を試験することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、プロテアーゼによるmCD28の切断を遮断または阻害する薬剤またはsdAbを選択することをさらに含む。
【0350】
いくつかの実施形態では、ある部分はsdAbのコピーである。いくつかの実施形態では、その部分は、単一コピーである。いくつかの実施形態では、その部分は、VHHである。いくつかの実施形態では、その部分は、本発明のsdAbである。
【0351】
いくつかの実施形態では、方法は、得られた二量体剤の存在下でmCD28下流シグナル伝達をアッセイすることをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、mCD28シグナル伝達を実質的にアゴナイズしない少なくとも1つの二量体剤を選択することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、mCD28シグナル伝達に実質的に拮抗しない少なくとも1つの二量体剤を選択することをさらに含む。いくつかの実施形態では、方法は、mCD28シグナル伝達に拮抗する少なくとも1つの二量体剤を選択することを含む。癌治療の場合、CD28シグナル伝達をアゴナイズすることは有害ではないかもしれないが、シグナル伝達に拮抗することは非効果的であることが当業者によって理解されるであろう。自己免疫疾患または他の状態を治療するためには、免疫抑制拮抗作用から利益を得ることは有利であり、CD28シグナル伝達をアゴナイズすることは逆効果であることがさらに理解されよう。アゴニズムおよび拮抗作用を測定する方法は当技術分野で周知であり、さらに以下に提供される。
【0352】
別の態様によって、本発明の方法によって製造される二量体剤が提供される。
【0353】
本明細書で使用される場合、「約」という用語は、値と組み合わせた場合、基準値の±10%を指す。例えば、約1000ナノメートル(nm)の長さは、1000nm±100nmの長さを指す。
【0354】
本明細書および添付の特許請求の範囲で使用される場合、単数形「a」、「an」、および「the」は、文脈上他に明確に指示されない限り、複数の指示対象を含むことに留意されたい。したがって、例えば、「ポリヌクレオチド」への言及は、複数のそのようなポリヌクレオチドを含み、「ポリペプチド」への言及は、当業者に公知の1つまたは複数のポリペプチドおよびその等価物などへの言及を含む。特許請求は、任意の要素を除外するように起草され得ることにさらに留意されたい。したがって、この記述は、特許請求の要素の列挙に関連して「専ら」、「のみ」などのような排他的な用語を使用するための、または「否定的」限定を使用するための先行詞としての役割を果たすことを意図している。
【0355】
「A、B、およびCなどのうちの少なくとも1つ」に類似した慣例が使用される場合、一般に、そのような構成は、当業者が慣例を理解するであろうという意味で意図される(例えば、「A、B、およびCのうちの少なくとも1つを有するシステム」は、これらに限定されないが、Aのみ、Bのみ、Cのみ、AとBとを一緒に、AとCとを一緒に、BとCとを一緒に、および/またはAとBとCとを一緒に有するシステムなどを含む)。2つ以上の代替的な用語を提示する実質的に任意の選言的な単語および/または句は、明細書、特許請求の範囲、または図面のいずれかにかかわらず、用語の1つ、用語のいずれか、または両方の用語を含む可能性を考慮すると理解されるべきであることが当業者によってさらに理解されるであろう。例えば、「AまたはB」という語句は、「A」または「B」または「AおよびB」の可能性を含むと理解される。
【0356】
明確にするために別個の実施形態の文脈で説明されている本発明の特定の特徴は、単一の実施形態において組み合わせて提供されてもよいことが理解される。逆に、簡潔にするために単一の実施形態の文脈で説明されている本発明の様々な特徴は、別個にまたは任意の適切な部分的組み合わせで提供されてもよい。本発明に関連する実施形態のすべての組み合わせは、本発明によって具体的に包含され、あたかもそれぞれおよびすべての組み合わせが個別に明示的に開示されているかのように本明細書に開示される。さらに、様々な実施形態およびその要素のすべての部分的組み合わせもまた、本発明によって具体的に包含され、あたかもそのような部分的組み合わせのそれぞれおよびすべてが個別に明示的に本明細書に開示されているかのように本明細書に開示される。
【0357】
本発明のさらなる目的、利点、および新規な特徴は、限定することを意図するものではない以下の実施例を検討することによって当業者に明らかになるであろう。さらに、本明細書で上に描写され、以下の特許請求の範囲の項で請求される本発明の様々な実施形態および態様のそれぞれは、以下の実施例において実験的裏付けを見出す。
【0358】
本明細書で上に描写され、以下の特許請求の範囲の項で請求される本発明の様々な実施形態および態様は、以下の実施例において実験的裏付けを見出す。
【実施例】
【0359】
一般に、本明細書で使用される命名法および本発明で利用される実験室手順には、分子、生化学、微生物学および組換えDNA技術が含まれる。そのような技術は文献で十分に説明されている。例えば、「Molecular Cloning:A laboratory Manual」Sambrook et al.,(1989);「Current Protocols in Molecular Biology」Volumes I-III Ausubel,R.M.,ed.(1994);Ausubel et al.,「Current Protocols in Molecular Biology」,John Wiley and Sons,Baltimore,Maryland(1989);Perbal,「A Practical Guide to Molecular Cloning」,John Wiley&Sons,New York(1988);Watson et al.,「Recombinant DNA」,Scientific American Books,New York;Birren et al.(eds)「Genome Analysis:A Laboratory Manual Series」 Vols.1-4,Cold Spring Harbor Laboratory Press,New York(1998);米国特許第4,666,828号、4,683,202号、4,801,531号、5,192,659号および5,272,057号に示される方法論;「Cell Biology:A Laboratory Handbook」,Volumes I-III Cellis,J.E.,ed.(1994);Freshneyによる「Culture of Animal Cells-A Manual of Basic Technique」,Wiley-Liss,N.Y.(1994),Third Edition;「Current Protocols in Immunology」Volumes I-III Coligan J.E.,ed.(1994);Stites et al.(eds),「Basic and Clinical Immunology」(8th Edition),Appleton&Lange,Norwalk,CT(1994);Mishell and Shiigi(eds),「Strategies for Protein Purification and Characterization-A Laboratory Course Manual」CSHL Press(1996)を参照されたい(これらの全ては参照により組み込まれる)。他の一般的な参考文献がこの文書全体にわたって提供される。
【0360】
材料および方法
組換え2A1構築物の作製-合成コドン最適化遺伝子を、関連するpcDNA3.1発現ベクターにサブクローニングした。一過性トランスフェクトExpiCHO細胞から2A1構築物を作製し、タンデム構築物については固定化金属アフィニティークロマトグラフィー(IMAC)、FcキメラについてはMabSelect Sure Protein A、またはdi-VHH2 2A1構築物についてはAmsphere A3によって精製した。1×PBS pH7.4中のタンパク質調製物を、非還元条件下での正確な鎖の存在についてSDS-PAGEによって分析し、調製物内の単量体形態の定量について分析サイズ排除クロマトグラフィー(aSEC)によって分析した。
【0361】
組換えナノボディの作製-合成コドン最適化遺伝子を、関連するpcDNA3.1発現ベクターにサブクローニングした。一過性トランスフェクトExpiCHO細胞からナノボディ構築物を作製し、タンデム構築物については固定化金属アフィニティークロマトグラフィー(IMAC)、FcキメラについてはMabSelect Sure Protein Aによって精製した。1×PBS pH7.4中のタンパク質調製物を、非還元条件下での正確な鎖の存在についてSDS-PAGEによって分析し、調製物内の単量体形態の定量について分析サイズ排除クロマトグラフィー(aSEC)によって分析した。
【0362】
親2A1分子の化学修飾-C末端システインを有する2A1構築物(2A1-1C)を、Bis-Mal-PEG11化学部分(Broadpharm、カタログ番号BP-22151)とインキュベートした。トリス(2-カルボキシエチル)ホスフィン塩酸塩(TCEP)(Sigma Aldrich、カタログ番号第75259号)を反応前に添加して、二量体内容物を分解した。反応の完了後、混合物をSPカチオン交換カラムに充填して、過剰の試薬および未反応物質を除去した。Viva-スピン濃縮器を使用して調製物をPBS脱塩し、コンジュゲーション検証のために質量分析によって分析した。
【0363】
サイトカインELISA-市販のELISAキットを、ヒトインターフェロンガンマ(Biolegend、カタログ番号430103)、ヒトインターロイキン2(Biolegend、カタログ番号431802)およびヒトCD28(R&D system、カタログ番号DY342)の量の定量に使用した。細胞増殖および生存率(MTTアッセイ)を、結果の妥当性を保証するために実施し、製造者の説明書(Roche、カタログ番号11465007001)に従って実施した。
【0364】
直接CD28 EIA-特に明記しない限り、Corning高結合プレートまたは同等物をスクリーニングに使用した。各ウェルを300ngのヒトCD28-Fcキメラ(R&D、カタログ番号342-CD)でコーティングした。プレートを、PBS中の1%カゼインを使用して、室温(RT)で1時間ブロッキング処理した。プレートをPBSTを使用して4回洗浄し、Fcキメラについてロバ抗ヒトIgG FC HRP(Jackson immuno research、カタログ番号709-035-098)で、タンデム二量体VHHヒンジ構築物についてHRPコンジュゲートウサギ抗ラクダVHHカクテル(GenScript、カタログ番号A02016)で、またはマウス抗ヒトIgG4 pFc’ HRP(abcam、カタログ番号ab99817)により検出した後に、調査したナノボディ/薬剤とインキュベートした。
【0365】
細胞株およびヒト免疫細胞の単離-PBMCを、標準的なリンパ球分離培地(MBP、カタログ番号850494)を使用して健康なドナーの新鮮な血液試料から単離した。健康なドナーの新鮮血液試料から、RossetteSEP(商標)ヒトT細胞濃縮キット(STEMCELL、カタログ番号15061)を用いてネガティブセレクション法によりCD3細胞を単離した。健康なドナーの新鮮血液試料から、EasySep(商標)ヒト単球濃縮キット(STEMCELL、カタログ番号17952)を用いてネガティブセレクション法により単球を単離した。すべての細胞を、10% HI-FCSおよびpen/strep混合物を補充した完全RPMI-1640培地で増殖させた。
【0366】
トランスフェクション-CD28-FL(完全長CD28転写物をコードする)、CD80-FL(完全長CD80転写物をコードする)およびscOKT3-CD14(CD14細胞外ドメインに融合したマウス抗CD3 OKT3クローンの単鎖FV部分をコードする)プラスミドを、DNA配列をPCDNA3.1ベクターにクローニングすることによって作製した。JetPeiトランスフェクション試薬(PolyPlus Transfections)を使用してトランスフェクションを行った。G418および/またはヒグロマイシン含有培地中で安定なトランスフェクタントを選択した。
【0367】
樹状細胞分化-単球を、3日目および6日目に更新された増殖因子を含むRPMI培地中、1×10^6/mLの密度で培養した。未成熟樹状細胞(iDC)を、50ng/mLのGM-CSF(R&D systems、カタログ番号215-GM)および20ng/mLのIL-4(R&D systems、カタログ番号204-IL)によって6日間誘導した。必要に応じて、100ng/mLのLPS(Sigma、カタログ番号L4391)および20ng/mLのインターフェロン-ガンマ(R&D systems、カタログ番号285-IF)を48時間添加することによって、iDCを成熟樹状細胞にさらに分化させた。生成された細胞集団を、関連マーカーのFACS分析および特徴的なサイトカインの分泌の分析によって、示された表現型について試験した。
【0368】
可溶性CD28を生成するためのPBMCのSEB活性化-0.1×10^6のPBMCを、96ウェルプレート中、示された濃度の様々な処理およびプロテアーゼ阻害剤あり/なしで、10~50ng/mLのSEB(Sigma、カタログ番号S4881)で7日間、37°Cで刺激した。アッセイは、FCSおよびpen/strep混合物を補充した完全RPMI-1640培地で行った。使用されるプロテアーゼ阻害剤は、TMI-1(Sigma、カタログ番号PZ0336)である。CD28シェディングの阻害が示されている場合、以下の式:100-(sCD283μM/sCD28basal*100)を使用して計算されている。
【0369】
同種異系混合リンパ球反応-示された濃度での処理の有無にかかわらず、0.1×10^6のT細胞を、異なるドナー由来の0.2×10^4の成熟樹状細胞と37°Cで24~96時間混合した。アッセイは、10% FCSおよびpen/strep混合物を補充した完全RPMI-1640培地で行った。記載されている場合、VHH#3C04(ヒトHER2に対して増殖させた)を「無関係な対照」として使用し、VHH#12B09を、CD28アンタゴニスト効果を有するナノボディについての「陽性対照」として使用した。
【0370】
HEK/CD80/scOKT3人工抗原提示細胞(aAPC-CD80)でのT細胞刺激-1×10^5の単離CD3 T細胞(健康なドナー由来)を、0.5×10^4のマイトマイシン処理aAPC-CD80(CD80およびscOKT3-CD14キメラプラスミドで安定にトランスフェクトしたHEK293細胞)で37°Cにて24~72時間刺激した。CD28を標的とするVHHまたは対照の処理を、可溶性形態で示される濃度で加えた。記載されている場合、VHH#3C04(ヒトHER2に対して増殖させた)を「無関係な対照」として使用し、VHH#12B09を、CD28アンタゴニスト効果を有するナノボディについての「陽性対照」として使用した。アッセイは、10% FCSおよびpen/strep混合物を補充した完全RPMI-1640培地で行った。
【0371】
CD86を遮断するFACS-ヒトCD28で安定にトランスフェクトした0.25×10^6のHEK293細胞を、2μg/mlビオチン化CD86-Fc(R&D systems、カタログ番号141-B2)と共に、抗CD28シェディングクローン#2A1を用いずに、または様々なフォーマットで3μMの固定濃度で用いて室温で30分間インキュベートした。細胞を、フルオロフォアにコンジュゲートしたストレプトアビジン(Jackson immuno research、カタログ番号016-130-084)を1:500希釈で氷上で20分間用いて、二次結合のために洗浄および採取した。インキュベーションは、96ウェルU底プレート中100μLの体積で行った。細胞を200μLのFACS緩衝液で2回洗浄し、分析のために150μLのFACS緩衝液のFACSチューブに移した。細胞を、Gallios Flow Cytometry Acquisition Software用のKaluzaを使用して、Gallios Flow Cytometer(Beckman Coulter)で分析した。
【0372】
CD3細胞上のフローサイトメトリー-健康なドナー由来の2.5×105のCD3細胞を、記載された濃度の示される構築物あり/なしで37°Cで30分間インキュベートした。インキュベーションは、96ウェルU底プレート中100μLの体積で行った。細胞を200μLのFACS緩衝液(0.05% BSAを含むPBS)で2回洗浄した。試験した構築物の細胞への結合を、Nano-Secondaryアルパカ抗ヒトIgG組換えVHH Alexa Flour 647抗体(Chromotek、カタログ番号srbAF647-1)とのインキュベーション(氷上で30分)によって評価した。インキュベーションは、製造業者が推奨する濃度を適用して100μLの体積で暗所で行った。インキュベーション後、細胞を200μLのFACS緩衝液で3回洗浄し、CytExpert Acquisition and Analysis Softwareを使用して、CytoFLEX Flow Cytometer(Beckman Coulter)で分析した。
【0373】
MC-38シンジェニック腫瘍モデル-MC38腫瘍細胞をDMEM中で培養し、ヒト化CD28トランスジェニックC57/Bl6マウス(genOway)(n=10の5つの群)に皮下移植した(0.5×10^6細胞)。接種の6日後、各群のマウスを抗PD1(RMP1-14)で、シェディング遮断剤有り/無しで週に2回(200μg/マウス)、合計6回の注射で処置した。予防モデルを設定するために、MC-38接種前にマウスの1つの群にシェディング遮断薬も注射した(200μg/マウス、2回)。アイソタイプ対照として、InVivoMAbヒトIgG4(BE0349-BioXcell)またはラットIgG2a(2A3)を使用した。腫瘍体積を、較正されたキャリパーによって週に3回測定した。
【0374】
VHH親和性成熟-親モノクローナル抗CD28 VHH#2A01ラマ抗体を親和性成熟させるために、相補性決定領域(CDR)残基を、三量体/プライマーミックスを使用する合理的突然変異誘発によってランダム化した。ライブラリー設計は、代表するアミノ酸のヒトおよびラマの自然多様性に基づいた(Kim et al.,「Generation,diversity determination,and application to antibody selection of a human naive Fab library」、Mol.Cells,2017,40(9):655-666;Zemlin et al.,「Expressed murine and human CDR-H3 intervals of equal length exhibit distinct repertoires that differ in their amino acid composition and predicted range of structures」、J.Mol.Biol.,2003,334:733-749;およびTiller et al.,「A fully synthetic human Fab antibody library based on fixed VH/VL framework pairings with favorable biophysical properties」、mAbs 20135:445-470、これらはその全体が参照により本明細書に組み込まれる)。多数の重複オリゴヌクレオチドを使用してPCR遺伝子アセンブリプロトコルを実施して、CDR多様性を導入した。PCR産物をpDCL1ファージミドにクローニングして、それぞれ8.0E+7~1.0E+09の最終サイズを有するCDR1、CDR2、CDR1+CDR2およびCDR3に関する変異を含む、4つの異なるファージライブラリーを作製した。ライブラリーを配列決定によってQCeした。親和性成熟バリアントについてスクリーニングして、溶液選択を、Dynabeads(商標)MyOne(商標)ストレプトアビジンT1磁気ビーズ上に捕捉されたビオチン化組換えヒトCD28-FcまたはヒトCD28ストーク領域二量体ペプチドに対して行った。選択の4サイクルを、抗原濃度を減少させ、かつ溶液中の遊離抗原を増加させて実施して、オフレートキネティクスが改善されたバリアントを達成した。バックグラウンドを減少させるために、ヒトIgGによる対抗選択を行った。濃縮されたCDR1-3バリアントを、配列決定、biacore、ELISAにおける抗原結合、およびCD28シェディング遮断活性における効率によって検証した。CDR1~3の特定の位置における有益な残基変異を採取し、互いにランダム化して、コンビナトリアルライブラリーのリードパネルを作成した。コンビナトリアルライブラリーを、厳密性を高めながらヒト抗原に対する4サイクルの溶液中選択に供した。20個のバリアントを単離し、CD28免疫調節およびCD28シェディング遮断活性について詳細に特徴付けた。6つの最上位性能クローンを親和性決定のためにさらに特徴付け、Fcキメラとして作製した。
【0375】
VHHヒト化-VHHクローンのタンパク質モデルを分析して、抗体の立体配座および結合に重要な残基を同定する。MHCクラスII結合を評価するためのインシリコツール、およびエクスビボT細胞免疫原性アッセイを使用して以前にスクリーニングされた抗体セグメントを含むデータベースと共にこの情報を使用して、T細胞エピトープが回避されることを目的として、一連のヒト化重鎖VHH領域配列をヒトV領域配列のセグメントから設計する。
【0376】
Biacore-VHH#2A01親和性成熟ライブラリーに由来する親和性クローンを、CM5 Series Sセンサーチップに固定化したCD28-Fcを使用して決定した。200nMから12.5nMまでの分析物(VHHクローン)の5段階希釈を使用して、多サイクルキネティクス測定を行った。動態学的パラメータおよび親和性値は、二重(ブランクチャネルおよびブランク試料)減算を導入することによって、Biacore T 200 E評価ソフトウェア3.1の1:1結合モデルを使用して計算した。
【0377】
実施例1:単一ドメイン抗体の親和性成熟
3つの単一ドメインVHH抗体は、CD28細胞外ドメインのストークドメインに対して以前に生成され、細胞の表面からの膜CD28の切断を阻止するのに有効であることが見出された(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、PCT/IL2020/050297を参照されたい)。3つすべてのVHHは、CD28シグナル伝達に実質的にアゴナイズせず、実質的に拮抗もしないことが見出された。VHH 2A1は、最も高度に研究され、最も効果的な分子であるので、相補性決定領域(CDR)の親和性成熟のために選択された。
【0378】
2A1の完全な配列は、EVQLVESGGGLVQAGESLRLSCAASGSIASINAMGWYRQAPGSQRELVAAISGGGDTYYADSVKGRFTISRDNAKTTVYLQMNSLRPEDTAVYYCVVDLYGSDYWDWGQGTQVTVSS(配列番号40)である。これには、INAMG(配列番号4)のCDR1、AISGGGDTYYADSVKG(配列番号5)のCDR2およびDLYGSDYWD(配列番号3)のCDR3が含まれる。
【0379】
親VHH#2A1ラマ抗体を親和性成熟させるために、CDR残基を、三量体/プライマーミックスを使用する合理的突然変異誘発によってランダム化した。ライブラリー設計は、代表されるアミノ酸のヒトおよびラマの自然多様性に基づいていた。多数の重複オリゴヌクレオチドを使用してPCR遺伝子アセンブリプロトコルを実施して、CDR多様性を導入した。PCR産物をpDCL1ファージミドにクローニングして、それぞれ8.0E+7~1.0E+09の最終サイズを有するCDR1、CDR2、CDR1+CDR2およびCDR3における変異を含む、4つの異なるファージライブラリーを作製した。ライブラリーを配列決定によって品質管理した。親和性成熟バリアントの溶液中選択のためのスクリーニングを、Dynabeads(商標)MyOne(商標)ストレプトアビジンT1磁気ビーズ上に捕捉されたビオチン化組換えヒトCD28-FcまたはヒトCD28ストーク領域二量体ペプチドに対して行った。選択の4サイクルを、ビーズ上の抗原濃度を減少させ、かつ溶液中の遊離抗原を増加させて実施して、オフレートキネティクスが改善されたバリアントを達成した。バックグラウンドを減少させるために、ヒトIgGによる対抗選択を行った。濃縮されたCDR1-3バリアントを、配列決定、Biacore、ELISAにおける抗原結合、およびCD28シェディング遮断活性における効率によって検証した。CDR1~3の特定の位置における有益な残基変異を採取し、互いにランダム化して、コンビナトリアルライブラリーのリードパネルを作成した。コンビナトリアルライブラリーを、厳密性を高めながらヒト抗原に対する4サイクルの溶液中選択に供した。作製したバリアントの配列を表1に示し、各バリアントのCDRを表2に示し、9つのVHHクローンのうち7つの親和定数を表3に要約する。
【0380】
【0381】
【0382】
【0383】
3つの親和性成熟バリアントを1回目の突然変異誘発から選択し、1つはそれぞれCDR1+CDR2変異を有し(5A3)、2つはCDR3変異を有する(6B3および6B10)。コンビナトリアルライブラリーから20個のバリアントを単離し、CD28免疫調節およびCD28シェディング遮断活性について詳細に特徴付けた。CD28結合およびCD28シェディングの遮断に基づく6つの最良の候補を選択した。6つすべてが、遮断に関して親VHHよりも優れていることが分かった(
図1、2つの代表的なバリアント、5A3および6B10を示す)。しかしながら、下流のシグナル伝達を混合リンパ球反応(MLR)で試験した場合、親和性成熟VHHは、特に高濃度で強い拮抗効果をもたらし、炎症促進性サイトカイン分泌を減少させた(
図2、2つの代表的なバリアント、5A3および6B10を示す)。
【0384】
切断の遮断は、免疫阻害性の可溶性CD28(sCD28)のレベルを低下させ、したがって免疫細胞活性化を増加させる。しかしながら、切断遮断剤が活性化リガンド(例えば、CD86、CD80)へのCD28の結合も阻害する場合、この拮抗効果は逆の結果をもたらし、免疫細胞活性化を阻害する。したがって、拮抗効果をもたらしたこれらの分子は、免疫刺激には有用でないかもしれないが、自己免疫疾患などの免疫過剰活性化の状態では使用され得る。
【0385】
実施例2:二量体結合剤はCD28拮抗効果を低下させる
驚くべきことに、二量体結合剤内に単量体sdAbを含めると、それらの結合効率を高めるだけでなく、拮抗効果も低下させることができることが発見された。したがって、親和性成熟バリアントをFcキメラ分子に含め、CD28シグナル伝達に対する効果についてアッセイした。
【0386】
ヒトIgG1のFc鎖(配列番号39、エフェクター機能が低下したFc)の上流にsdAbをクローニングすることによって、Fcキメラ分子を生成した。可撓性アミノ酸リンカー(15アミノ酸GGGGSリンカー;簡潔さのために、GGGGS反復リンカーは、以下、GSリンカーと呼ばれる)を、FcのsdAbのC末端とN末端との間に挿入した。これらの二量体剤をMLR実験で試験した。驚くべきことに、Fcドメインを含めると、単量体sdAbで見られた拮抗効果が消滅した(
図3、2つの代表的なバリアント、5A3および6B10を示す)。したがって、これらの二量体剤は、sCD28産生を減少させ、膜CD28(mCD28)活性化を妨害しないので、非常に有効な免疫刺激剤である。
【0387】
実施例3:親和性成熟クローン12A09-Fcおよび9B03-FcはmCD28切断を阻害する
次に、Fcに融合した親和性成熟クローンのCD28に結合する能力を試験した。12A9および9B3クローンをヒトIgG4のFc鎖の上流にクローニングした。IgG4は、一般に非細胞傷害性Fcであるので選択された。細胞傷害性をさらに低下させ、安定性を増強/凝集を減少させるために、IgG4鎖に2点変異(S228PおよびL235E)を生成した。25アミノ酸リンカー(GGGGSx5)をVHHとFcとの間に挿入した。これらの2つの分子のCD28への結合を、親VHH構築物の結合と比較した。予想されるように、2つの親和性成熟VHHを含む構築物は、溶液中(
図4A)および細胞表面上(
図4B)において著しくより良好にCD28に結合した。
【0388】
細胞表面のmCD28に実際に結合し、切断を遮断する二量体融合タンパク質の能力を試験した。ブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)は末梢血単核細胞(PBMC)を活性化し、CD28切断およびsCD28シェディングを誘導する。親VHH(2A1、濃度100nm)を含む二量体分子の添加は、sCD28産生を減少させ、真の表面結合および切断の遮断を示す(
図5A~
図5B)。12A9-25GS-hIgG4(
図5A)および9B3-25GS-hIgG4(
図5B)の両方が親分子に勝り、用量依存的にCD28切断の強力な阻害をもたらした。
【0389】
実施例4:二量体結合剤は反発的ではない
二量体結合剤が単量体VHHよりも高い親和性でCD28に結合し、改善されたCD28切断遮断をもたらし、CD28に対して拮抗作用をもたらさないことを確認して、これらの薬剤が反発的に作用する可能性を試験した。単離されたヒトCD3細胞を、scOKT3(抗CD3)を過剰発現するA375細胞株の細胞で2日間刺激した。この刺激は、抗CD28アゴニスト抗体、陽性対照としての役割を果たすクローン28.2、陰性対照としての役割を果たす無関係のヒトIgG5、またはFcキメラ親和性成熟クローンVHH(25アミノ酸リンカー)の存在下で行った。上清中に分泌されたヒトIL-2の濃度を、標準化サンドイッチELISA(Biolegend)を用いて定量した。予想通り、クローン28.2は強力なIL-2分泌をもたらしたが、Fcキメラは有意な反発的効果を示さなかった(
図6A~6B、クローン12A9および9B3を示す)。
【0390】
実施例5:リンカー長の検査
15アミノ酸GGGGSリンカーおよび25アミノ酸GGGGSリンカー(本明細書全体を通してGSリンカーと呼ぶ)の両方が有効な切断遮断をもたらしたので、リンカーの最適サイズを調査した。VHH12A9のFcキメラバリアントを、FcモジュールとVHHモジュールとの間で異なる長さの可撓性リンカーを用いて作製した。10アミノ酸~35のリンカーを調査した。SEB活性化PBMCを再度使用して、細胞表面からのCD28切断を測定した。キメラ分子を2つの異なる濃度(100nMおよび300nM)でPBMCに導入し、sCD28レベルを測定した。両方の濃度で、リンカーの長さが増すほどシェディング阻害のレベルが向上し、25アミノ酸以上のリンカーが90%を超えるシェディング阻害をもたらすことが明らかに観察された(
図7)。35アミノ酸リンカーで最大のシェディング阻害が達成されたので、さらに長いリンカーを使用する理由はない。
【0391】
実施例6:インビボ検査
これらの二量体VHH構築物の治療可能性を、MC38腫瘍細胞をヒト化CD28トランスジェニックマウスに皮下移植した、MC-38シンジェニックモデルにおいてインビボでさらに調べた。移植6日後に開始した抗PD1(RMP1-14)処置は、対応するアイソタイプ対照(rG2aはPD-1抗体のラットアイソタイプ対照である)と比較して腫瘍成長の速度を遅らせた(
図8A~
図8B)。驚くべきことに、抗PD1処置と組み合わせた、癌細胞の移植の5日前の12A9-25GS-hIgG4による予防的処置は、癌成長の完全な予防につながった(
図8A)。全ての癌細胞をマウスの免疫系によって死滅させ、さらに30日目まで癌が検出されなかった。移植後の併用処置(両方とも6日目)は腫瘍成長を有意に遅らせ、抗PD1のみによる処置よりも優れていた(
図8B)。これらのインビボ結果は、二量体剤がCD28に対して拮抗効果を有さないことをさらに裏付ける。そのような効果は腫瘍成長をもたらし、収縮/予防をもたらさないからである。したがって、これらの薬剤が細胞表面からのCD28切断を遮断し、それを、強固な癌治療につながるCD28機能に拮抗することなく行うことは、完全に明らかである。
【0392】
実施例7:VHHヒト化
VHHクローンのうちの2つ、12A9および9B3を、VHHのラクダ科動物バックボーンが除去されるようにさらにヒト化した。この目的のために、重鎖VHH領域のタンパク質モデルを分析して、抗体の立体配座および結合に重要な残基を同定した。この情報をインシリコ技術(ツール1:MHCクラスII結合の評価、ツール2:エクスビボT細胞免疫原性アッセイを使用して以前にスクリーニングされた抗体セグメントを含むデータベース)と共に使用して、T細胞エピトープが回避されることを目的として、一連のヒト化重鎖VHH領域配列をヒトV領域配列のセグメントから設計した。5つのクローンを12A9に、4つのクローンを9B3に与えた。これらのクローンの配列を表4に示す。
【0393】
【0394】
二量体結合剤も、ヒト化VHHバリアントを用いて製造した。5つの12A9ヒト化バリアントおよび1つの9B3ヒト化バリアントを、25アミノ酸GS可撓性リンカーを介してヒトIgG4 Fcに連結した。ヒト化バリアントキメラのヒトCD28への結合を、以前と同様に直接CD28 EIAを使用して確認した。試験した5つ12A9ヒト化バリアントおよび試験した1つの9B3ヒト化バリアントはすべて、少なくともそれらの親(ラクダ科動物)バリアントキメラと同様にCD28に結合した(
図9A~
図9B)。実際、12A9-VHH18-25GS-huFcおよび12A9-VHH4-25GS-huFcは両方とも、親12A9 VHHキメラよりも測定可能に優れていた。ヒト化バリアントを含む6つの二量体剤および親VHHを含む薬剤の親和定数を表5に要約する。
【0395】
【0396】
細胞表面上のCD28への結合も以前と同様に評価した。CD3細胞を、アイソタイプ対照、ヒト化VHHキメラまたは親VHHキメラ(300nM)の存在下でFACSによって分析した。これらの様々な薬剤について測定された平均蛍光強度を表6および7に要約する。ヒト化VHHキメラのすべてが、親VHHキメラと少なくとも同程度に良好な結合剤であり、実際に、12A09-VHH12-25GS-huFc、12A09-VHH16-25GS-huFc(ヒト化)、および12A09-VHH17-25GS-huFcは、親構築物の3倍の蛍光を生成した。
【0397】
【0398】
【0399】
CD28シェディングを遮断するヒト化バリアントキメラの能力も調べた。PMBCを、ヒト化バリアントの存在下で先のようにSEBで刺激した。Fcキメラの試験した5つの12A9ヒト化バリアントおよび試験した1つの9B3ヒト化バリアントはすべて、少なくとも親バリアントキメラと同様に、細胞表面からのCD28シェディングを遮断した(
図10A~
図10B)。実際、ヒト化バリアントは、特に中間濃度でシェディング遮断をわずかに改善し、12A9-VHH12、12A9-VHH16および12A9-VHH17は、親VHHを上回る改善を示した(
図10A)。
【0400】
実施例8:二量体単鎖sdAb分子の生成
3つの単一ドメインVHH抗体は、CD28細胞外ドメインのストークドメインに対して以前に生成され、細胞の表面からの膜CD28の切断を阻止するのに有効であることが見出された(参照によりその全体が本明細書に組み込まれる、PCT/IL2020/050297を参照されたい)。3つすべてのVHHは、CD28シグナル伝達に実質的にアゴナイズせず、実質的に拮抗もしないことが見出された。これらの単一ドメイン抗体(sdAb)の配列を表8に提供し、これらのsdAbのCDRを表9に提供する。
【0401】
【0402】
【0403】
切断を遮断するVHHの特異性および有効性を改善するために、VHHの2コピーを含む二量体剤を生成することにした。VHH 2A1が最も効果的な切断遮断剤であることが判明したので、それを二量体分子に含めるために選択した。
【0404】
第1の2A1のC末端がペプチドリンカーを介して第2の2A1のN末端に接続されている、単鎖タンデム二量体構築物を最初に生成した。最初に、可撓性(G
4S)リンカーを試験した。二量体単鎖分子を、1回、2回または4回のリンカー反復で作製した。様々な単鎖分子の配列を表10に要約する。これらの二量体構築物を、Fcバックボーンに融合した組換えCD28への結合について試験し、対照としての単量体2A1と比較した。非常に短い5アミノ酸リンカーは、CD28に対する親和性を増加させず、単量体2A1と同等であった(
図11A)。対照的に、10または20アミノ酸リンカーは、モノマーと比較して結合の増加をもたらした(
図11A)。EC50の違いを表11に要約する。
【0405】
【0406】
【0407】
切断に対する効果を細胞において直接測定した。末梢血単核細胞(PBMC)を健康なドナーから収集し、ブドウ球菌エンテロトキシンB(SEB)で刺激して免疫細胞を活性化し、強力なレベルのsCD28を産生した。汎メタロプロテアーゼ阻害剤TMIまたは単量体2A1(3μM)の添加は両方ともsCD28レベルを大幅に低下させたが、無関係のVHHは効果が無かった(
図11C-11E)。20GS構築物は、試験した最低濃度でもTMI阻害剤および単量体2A1と同程度に強力であり、より高い濃度ではsCD28産生をほぼ消失させ、それが単量体よりも強力な切断阻害剤であることを示している(
図11E)。10GS構築物は、最低濃度ではそれほど効果的ではなかったが、濃度を上げると、やはりCD28切断を本質的に消失させ、依然として単量体よりもかなり優れていた(
図11D)。結合データに基づいて予想されるように、5GS構築物は最も効果が低かったが、高濃度では、TMI阻害剤および単量体よりわずかに優れていた(
図11C)。これらの結果は、単鎖二量体分子が、VHHの単量体形態以上に、sCD28産生の遮断に有効であることを示している。
【0408】
次に、これらの単鎖二量体剤を試験して、それらがCD28に対して拮抗作用を生じるかどうかを調べた。切断の遮断は、免疫阻害性の可溶性CD28(sCD28)のレベルを低下させ、したがって免疫細胞活性化を増加させるであろう。しかしながら、切断遮断剤が活性化リガンド(例えば、CD86)へのCD28の結合も阻害する場合、この拮抗効果は逆の結果をもたらし、免疫細胞活性化を阻害する。VHH 2A1は、拮抗効果を生じないことが知られており、ヒトCD28を過剰発現するHEK細胞への組換えCD86の結合を遮断しなかった(
図12A)。予想外にも、10または20アミノ酸リンカーを有する単鎖二量体分子は、CD86結合を強力に阻害し、結合は75%超を阻害した(
図12A)。短リンカーは、CD86結合を実質的に阻害せず、単量体2A1とほぼ同様に見えた(
図12A)。
【0409】
拮抗効果は、リンカーとCD28のリガンド結合領域との間の相互作用によって引き起こされると仮定された。この相互作用を回避するために、2つの追加の単鎖二量体剤を作製した。これらの分子では、4つのG4S反復を有する20アミノ酸長のリンカーは、4つおきのGが荷電アミノ酸で置換されている。1つの構築物においてリンカーは、リジンアミノ酸で置換されるグリシンアミノ酸で正にされ(20K)、他においてリンカーは、グルタミン酸アミノ酸で置換されるグリシンアミノ酸で負にされた(20E)。荷電アミノ酸は、CD28細胞外ドメインからの静電反発をもたらし、したがって、拮抗効果を無効にすると仮定された。3つ目の新しい単鎖二量体剤も作製したが、可撓性リンカーの代わりに剛性螺旋形リンカーを使用した(Hel20)。これらの二量体剤の配列を表10に示す。
【0410】
これらの分子で同じ結合アッセイを繰り返し、20GS剤および単量体2A1分子を対照として使用した(
図11B)。使用されるリンカーの電荷または剛性にかかわらず、全ての長リンカー構築物は同様に挙動し、単量体2A1と比較して優れた標的結合をもたらした。実際、2つの荷電リンカーおよび剛性リンカー構築物は、実際には20GS分子よりわずかに優れていた(
図11B)。これらの構築物のEC50値を表12に要約する。新しい薬剤もすべて、予想通りにsCD28産生を阻害した(
図11F-11H)。
【0411】
【0412】
すべての新しいリンカー分子が依然として切断遮断の増強を実証したので、CD28-CD86結合に対する拮抗効果について先と同様に試験した。予想されたものとは対照的に、3つの新しいリンカー分子はすべて、堅固なCD86遮断をもたらし、阻害レベルは可撓性20アミノ酸リンカーに匹敵した(
図12B)。これらの結果は、リンカーの構造にかかわらず、C末端をN末端に連結したタンデムVHHを有する単鎖VHH二量体に使用されるより長いリンカーは、CD86結合の遮断を常にもたらすことを示している。
【0413】
実施例9:単鎖二量体タンデム剤の機能分析
観察されたCD86遮断の機能的効果をさらに調査した。単離されたT細胞を人工抗原提示細胞(aAPC、CD80およびscOKT3を発現するHEK細胞)で刺激し、IL-2分泌を測定した。これは、無関係のVHH、CD86結合を遮断することが知られているVHH、および様々な濃度の単鎖二量体剤の存在下で行った(
図13A~13F)。予想通り、遮断結果に基づいて、5GS剤はIL-2分泌に影響を及ぼさなかった(
図13A)。しかしながら20GS構築物は、低濃度(
図13C)であってもCD86によって引き起こされるIL-2分泌の誘導をほぼ完全に消失させ、10GS構築物は、低濃度でIL-2分泌を約50%減少させる中間効果をもたらし、高濃度では減少は約80%まで増加した(
図13B)。他の3つの20アミノ酸リンカー構築物もまた、IL-2分泌の堅固な阻害をもたらしたが(
図13D~13F)、剛性リンカー構築物は、最大阻害が生じるためにより高い濃度を必要とした(
図13F)。インターフェロンガンマ(IFNg)分泌を混合リンパ球反応において測定した場合、同様の結果が観察された(
図13G-13I)。拮抗効果をもたらすこれらの分子は、免疫刺激には有用でないかもしれないが、自己免疫疾患などの免疫過剰活性化の状態では使用され得る。
【0414】
実施例10:C末端結合のみを有する二量体剤の生成
5アミノ酸リンカーを除いて、sdAbがC末端をN末端に連結した単鎖剤のすべてが拮抗効果をもたらしたので、新しい二量体剤を設計した。この次の薬剤セットでは、両方のsdAbまでのC末端領域間に常に連結が生成された。最初に、C末端システイン残基を、2つの遊離システインの間にジスルフィド結合を形成することによって二量体化することができる2A1の配列(2A1-C、配列番号113)に付加した。所望されるように、二量体2A1-Cは、単量体2A1よりも低い濃度で組換えCD28-Fcに結合した(
図14A)。EC50値を表13に要約する。より長いリンカーを用いて同様の分子も生成された。システインの遊離チオール(マレイミド)に対する反応性を有し、短い離散性PEG鎖(PEG
11)に基づく化学的リンカーを使用して、2つのシステインを連結した(
図15、2A1-1C-bmp11)。この分子はまた、CD28への優れた結合を示した(
図14B)。EC50値を表14に要約する。
【0415】
【0416】
【0417】
C末端システインへの代替アプローチは、C末端二量体化ドメインを使用することである。免疫グロブリン(Ig)重鎖のヒンジ領域は、主に重鎖二量体化を担ういくつかのシステイン残基を有する。そのため、単一のシステインを付加する代わりに、ヒトIgG1ヒンジ領域(DKTHTCPPCPAPEL、配列番号38)をVHH 2A1(2A1-ヒンジ、配列番号114)の下流に挿入した。同様に、重鎖のより多くのC末端領域(CH2およびCH3ドメイン、配列番号39)もヒンジの下流に付加した(2A1-huFC、配列番号115)。PG-LALA変異を重鎖に組み込み、エフェクター機能を低下させた。FcがVHH結合を妨害しないことを確実にするために、VHHとヒンジとの間に可撓性リンカーを用いて他の2つの薬剤を作製した(2A1-15GS-huFC、配列番号116;2A1-25GS-huFC、配列番号117)。これらの分子はすべて、CD28への結合を改善することが見出され、より長いリンカーが最良の結果をもたらした(
図14C)。EC50値を表15に要約する。
【0418】
【0419】
以前と同様に、sCD28の産生を阻害する二量体剤の能力も試験した。2A1-C構築物は、その最低濃度では切断を阻害しなかったが、同じ濃度で、単量体2A1よりも優れていることが見出された(
図14D)。同様に、PEG系リンカーを有する2A1も、同じ濃度で適用した場合の単量体2A1よりも優れていた(
図14E)。2A1-ヒンジ剤は、2A1モノマーと同等のレベルのみであるが、sCD28産生を阻害した(
図14F)。対照的に、完全Fcを有する二量体分子は、TMI阻害剤と同等であり、単量体2A1よりも優れたsCD28阻害をもたらした(
図14G)。可撓性リンカーを含む薬剤は両方とも、リンカーを含まないFc分子と同等に機能した(
図14H-
図14I)。これらの分子によってもたらされるシェディング遮断の改善は、3μMの二量体剤で処置した3つの異なるPBMCドナーからの結果を示す
図14Jに要約されている。
【0420】
実施例11:C末端結合のみを有する二量体剤は拮抗作用が少ない
二量体分子の最初のバッチは予想外にCD28アンタゴニストであったので、二量体分子の新しいバッチも試験した。C末端分子は、ジスルフィド結合によって接続されているか、またはPEGベース系リンカーと接続されているかにかかわらず、両方とも最小のCD86遮断を示したが、以前に試験されたN-C結合二量体分子よりもはるかに優れたレベルであった(
図16A)。二量体化のためにヒンジ領域を利用する分子は、さらに良好な結果をもたらした(
図16B)。これらの分子はすべて、CD86結合を有意に阻害せず、単量体モノマーと同等であり、したがってCD28アンタゴニストであるようには全く見えなかった。それらをCD28に対する反発的効果についてさらに試験したが、何ら認められなかった(データは示さず)。これらすべてが一緒になって、それらを理想的なCD28シェディング遮断剤、したがって免疫刺激分子にする。
【0421】
拮抗効果の欠如は、より生理学的に関連する状況でさらに確認された。以前と同様に、T細胞からの炎症促進性サイトカインの分泌を、直接的なaAPC刺激(
図17A~17F)を用いて調べ、MLRの状況において調べた(
図18A~18E)。2A1-C二量体剤は、IL-2レベルの穏やかな用量依存的減少をもたらした(
図17A)。MLRでも同様の結果が観察された(
図18A)。PEG系リンカーの使用は同様の結果を示し、高濃度でのみ軽度の阻害が観察された(
図17Bおよび
図18B)。ここでも、Fc系の薬剤は拮抗効果を示さなかった。2A1-ヒンジ二量体剤は、IL-2分泌への影響を示さなかった(
図17C)。リンカーを有しないヒトFc分子もまた、IL-2分泌に対する影響を何ら示さず(
図17D)、IFNg分泌の阻害もしなかった(
図18C)。リンカーを有するFc二量体剤は、全く拮抗効果がなく、まさに良好であった(
図17E~17F、
図18D~18E)。T細胞活性に対する全効果を
図18Fに要約しており、これは4人の異なるドナー由来の細胞を用いたMLRアッセイの結果を示す。C末端リンカーを使用した分子、特にヒンジまたはFcなどの二量体化ドメインを有する分子はすべて、切断も遮断しながら実質的な拮抗効果をもたらさないことに成功し、それらは過剰なsCD28産生の状況における免疫刺激に理想的であった。
【0422】
本発明をその特定の実施形態と併せて説明してきたが、多くの代替形態、修正形態および変形形態が当業者には明らかであることは明らかである。したがって、添付の特許請求の範囲の精神および広い範囲に含まれるすべてのそのような代替形態、修正形態および変形形態を包含することが意図されている。
【配列表】
【手続補正書】
【提出日】2024-05-08
【手続補正1】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】配列表
【補正方法】追加
【補正の内容】
【配列表】
【国際調査報告】