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(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-10-31
(54)【発明の名称】ユニバーサルサルベコウイルスワクチン
(51)【国際特許分類】
C07K 19/00 20060101AFI20241024BHJP
C12N 15/62 20060101ALI20241024BHJP
C12N 15/63 20060101ALI20241024BHJP
C12N 1/15 20060101ALI20241024BHJP
C12N 1/19 20060101ALI20241024BHJP
C12N 1/21 20060101ALI20241024BHJP
C12N 5/10 20060101ALI20241024BHJP
A61P 31/14 20060101ALI20241024BHJP
A61K 39/395 20060101ALI20241024BHJP
A61P 37/04 20060101ALI20241024BHJP
A61K 47/64 20170101ALI20241024BHJP
A61P 43/00 20060101ALI20241024BHJP
C07K 16/28 20060101ALN20241024BHJP
C07K 14/165 20060101ALN20241024BHJP
C12N 15/13 20060101ALN20241024BHJP
C12N 15/50 20060101ALN20241024BHJP
【ＦＩ】
C07K19/00 ZNA
C12N15/62 Z
C12N15/63 Z
C12N1/15
C12N1/19
C12N1/21
C12N5/10
A61P31/14
A61K39/395 N
A61P37/04
A61K47/64
A61P43/00 107
C07K16/28
C07K14/165
C12N15/13
C12N15/50
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024529428
(86)(22)【出願日】2022-11-16
(85)【翻訳文提出日】2024-07-16
(86)【国際出願番号】 EP2022082134
(87)【国際公開番号】W WO2023088968
(87)【国際公開日】2023-05-25
(31)【優先権主張番号】21306597.2
(32)【優先日】2021-11-17
(33)【優先権主張国・地域又は機関】EP
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】507002516
【氏名又は名称】アンスティチュート、ナシオナル、ドゥ、ラ、サンテ、エ、ドゥ、ラ、ルシェルシュ、メディカル
【氏名又は名称原語表記】ＩＮＳＴＩＴＵＴ ＮＡＴＩＯＮＡＬ ＤＥＬＡ ＳＡＮＴＥ ＥＴ ＤＥ ＬＡ ＲＥＣＨＥＲＣＨＥ ＭＥＤＩＣＡＬＥ
(71)【出願人】
【識別番号】591140123
【氏名又は名称】アシスタンス ピュブリク－オピトー ドゥ パリ
【氏名又は名称原語表記】ＡＳＳＩＳＴＡＮＣＥ ＰＵＢＬＩＱＵＥ － ＨＯＰＩＴＡＵＸ ＤＥ ＰＡＲＩＳ
(71)【出願人】
【識別番号】509004712
【氏名又は名称】ベイラー リサーチ インスティテュート
【氏名又は名称原語表記】ＢＡＹＬＯＲ ＲＥＳＥＡＲＣＨ ＩＮＳＴＩＴＵＴＥ
(71)【出願人】
【識別番号】518322621
【氏名又は名称】ユニヴェルシテ・パリ・エ・クレテイユ・ヴァル・ドゥ・マルヌ
(74)【代理人】
【識別番号】110003421
【氏名又は名称】弁理士法人フィールズ国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】イヴ、レヴィ
(72)【発明者】
【氏名】ジェラール、ジュラフスキ
(72)【発明者】
【氏名】サンドラ、ジュラフスキ
(72)【発明者】
【氏名】ミレイユ、セントリヴァー
(72)【発明者】
【氏名】クリスティーヌ、ラカバラツ
(72)【発明者】
【氏名】シルヴァン、カルディノ
(72)【発明者】
【氏名】マチュー、サレノ
【テーマコード（参考）】
4B065
4C076
4C085
4H045
【Ｆターム（参考）】
4B065AA90X
4B065AA90Y
4B065AB01
4B065AC14
4B065BA02
4B065CA24
4B065CA45
4C076AA95
4C076CC07
4C076CC35
4C076CC41
4C076EE59
4C085AA14
4C085AA16
4C085BA71
4C085BB11
4C085CC04
4C085CC31
4C085DD62
4C085EE01
4C085GG04
4H045AA10
4H045AA30
4H045BA10
4H045BA41
4H045CA01
4H045CA40
4H045DA76
4H045DA86
4H045EA31
4H045FA74
(57)【要約】
サルベコウイルス（ベータコロナウイルス属のＢ系統）は、過去２０年間に、２００３年のＳＡＲＳ－ＣｏＶと２０１９年からのＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２との二回の大流行を引き起こした。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ワクチンは、罹患率と死亡率を減少させるために不可欠である。したがって、このクラスのウイルスに対するユニバーサルワクチンは、現在の世界的流行を終わらせるだけでなく、自然界から継続的に見いだされるＳＡＲＳのようなウイルスのさらなる変種の出現や将来の大流行を防止するためにも重要である。そこで、本発明者らは、重鎖がＳＡＲ－ＣｏＶ－２のタンパク質Ｎポリペプチドにコンジュゲート又は融合し、軽鎖がＲＢＤポリペプチドに融合した、抗原提示細胞（すなわち、樹状細胞）の表面抗原（すなわち、ＣＤ４０）に対する抗体を産生した。特に、本発明者らは、前記抗体がサルベコウイルスに対する免疫応答を誘導できることを示している。
【選択図】なし
【選択図】なし
【特許請求の範囲】
【請求項1】
抗原提示細胞の表面抗原に対する抗体であって、－重鎖は、配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート又は融合し、
－軽鎖は、
・配列番号２の３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及び、Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド、又は
・配列番号２の３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及び、Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド
とコンジュゲート又は融合する、
抗体。
【請求項2】
ＩｇＧ抗体、好ましくはＩｇＧ１若しくはＩｇＧ４抗体、又はなお一層好ましくはＩｇＧ４抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項3】
キメラ抗体、特にキメラマウス／ヒト抗体又はヒト化抗体である、請求項１に記載の抗体。
【請求項4】
ＤＣ免疫受容体（ＤＣＩＲ）、ＭＨＣクラスＩ、ＭＨＣクラスＩＩ、ＣＤ１、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１５、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２９、ＣＤ３１、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ４４、ＣＤ４５、ＣＤ５４、ＣＤ５６、ＣＤ５７、ＣＤ５８、ＣＤ８３、ＣＤ８６、ＣＭＲＦ－４４、ＣＭＲＦ－５６、ＤＣＩＲ、ＤＣ－ＡＳＰＧＲ、ＣＬＥＣ－６、ＣＤ４０、ＢＤＣＡ－２、ＭＡＲＣＯ、ＤＥＣ－２０５、マンノース受容体、ランゲリン、ＤＥＣＴＩＮ－１、Ｂ７－１、Ｂ７－２、ＩＦＮ－γ受容体及びＩＬ－２受容体、ＩＣＡＭ－１、Ｆｅｙ受容体、ＬＯＸ－１、並びにＡＳＰＧＲと特異的に結合する抗体から選択される、請求項１に記載の抗体。
【請求項5】
ＣＤ４０に対して特異的である、請求項１に記載の抗体。
【請求項6】
－１２Ｅ１２抗体由来であり、・相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈがアミノ酸配列ＧＦＴＦＳＤＹＹＭＹ（配列番号３）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈがアミノ酸配列ＹＩＮＳＧＧＧＳＴＹＹＰＤＴＶＫＧ（配列番号４）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈがアミノ酸配列ＲＧＬＰＦＨＡＭＤＹ（配列番号５）を有する、重鎖と、
・相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌがアミノ酸配列ＳＡＳＱＧＩＳＮＹＬＮ（配列番号６）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌがアミノ酸配列ＹＴＳＩＬＨＳ（配列番号７）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌがアミノ酸配列ＱＱＦＮＫＬＰＰＴ（配列番号８）を有する、軽鎖と
を含むか、又は
－１１Ｂ６抗体由来であり、
・前記相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈがアミノ酸配列ＧＹＳＦＴＧＹＹＭＨ（配列番号９）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈがアミノ酸配列ＲＩＮＰＹＮＧＡＴＳＹＮＱＮＦＫＤ（配列番号１０）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈがアミノ酸配列ＥＤＹＶＹ（配列番号１１）を有する重鎖と、
・相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌがアミノ酸配列ＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＨ（配列番号１２）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌがアミノ酸配列ＫＶＳＮＲＦＳ（配列番号１３）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌがアミノ酸配列ＳＱＳＴＨＶＰＷＴ（配列番号１４）を有する、軽鎖と
を含むか、又は
－１２Ｂ４抗体由来であり、
・相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈがアミノ酸配列ＧＹＴＦＴＤＹＶＬＨ（配列番号１５）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈがアミノ酸配列ＹＩＮＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号１６）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈがアミノ酸配列ＧＹＰＡＹＳＧＹＡＭＤＹ（配列番号１７）を有する重鎖と、
・相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌがアミノ酸配列ＲＡＳＱＤＩＳＮＹＬＮ（配列番号１８）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌがアミノ酸配列ＹＴＳＲＬＨＳ（配列番号１９）、及び前記ＣＤＲ３Ｌがアミノ酸配列ＨＨＧＮＴＬＰＷＴ（配列番号２０）を有する軽鎖と
を含む、請求項５に記載の抗体。
【請求項7】
前記抗ＣＤ４０抗体が、表Ａに記載する選択されたｍＡｂ１、ｍＡｂ２、ｍＡｂ３、ｍＡｂ４、ｍＡｂ５及びｍＡｂ６からなる群から選択される、請求項６に記載の抗体。
【請求項8】
ランゲリンに対して特異的である、請求項１に記載の抗体。
【請求項9】
－１５Ｂ１０抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖と、前記１５Ｂ１０抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖とを含むか、又は－２Ｇ３抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖と、前記２Ｇ３抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖とを含むか、又は
－４Ｃ７抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖と、前記４Ｃ７抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖とを含む、請求項８に記載の抗体。
【請求項10】
表Ｂに記載する選択されたｍＡｂ７、ｍＡｂ８、及びｍＡｂ９からなる群から選択される、請求項９に記載の抗体。
【請求項11】
前記重鎖及び／又は前記軽鎖が、配列番号３８（ＦｌｅｘＶ１）、配列番号３９（ｆ１）、配列番号４０（ｆ２）、配列番号４１（ｆ３）及び配列番号４２（ｆ４）からなる群から選択されるリンカーを介して前記ＲＢＤポリペプチド又はＮｐｅｐ２ポリペプチドと融合する、請求項１に記載の抗体。
【請求項12】
ｉ）前記ＲＢＤポリペプチドと融合して、配列番号４３に記載する融合タンパク質を形成する軽鎖と、ｉｉ）前記Ｎｐｅｐ２ポリペプチドと融合して、配列番号４５に記載する融合タンパク質を形成する前記重鎖とを含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項13】
ｉ）前記ＲＢＤポリペプチドに融合して配列番号４４に記載する融合タンパク質を形成する軽鎖と、ｉｉ）前記Ｎｐｅｐ２ポリペプチドと融合して、配列番号４５に記載する融合タンパク質を形成する前記重鎖とを含む、請求項１に記載の抗体。
【請求項14】
請求項１に記載の抗体の重鎖及び／又は軽鎖をコード化する核酸。
【請求項15】
請求項１４に記載の核酸を含むベクター。
【請求項16】
請求項１４に記載の核酸及び／又は請求項１５に記載のベクターによってトランスフェクト、感染、又は形質転換された宿主細胞。
【請求項17】
請求項１に記載の抗体を含むワクチン組成物。
【請求項18】
治療上有効量の請求項１に記載の抗体を投与することを含む、サルベコウイルスに対してそれを必要とする対象にワクチン接種する方法。【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本発明は医学、特にウイルス学の分野に関する。
【背景技術】
【0002】
サルベコウイルス（ベータコロナウイルス属のＢ系統）は、過去２０年間に、２００３年のＳＡＲＳ－ＣｏＶと２０１９年からのＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２との二回の大流行を引き起こした。コロナウイルス誘発性疾患２０１９（ＣＯＶＩＤ－１９）は、実際には、人獣共通感染症ウイルスである重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）によって引き起こされ、これは、２０２０年とその翌半年間に急速に広がり、世界中で１億人以上に感染し、２００万人以上が死亡した。世界的流行を永続的に制御するには、集団ワクチン接種が必要であり、そのための最初のワクチン候補は２０２０年末に利用可能になった。これまでに認可されたヒト用のベクター系ワクチンの数は限られているが、組換えＤＮＡベクター及び合成ｍＲＮＡワクチンは、遺伝子工学の可能性が高く、急速に拡張可能であるために、ＣＯＶＩＤ－１９に対する闘いで最先端のものとなっている１、２、３、４。ヒトへの使用に関して、利点がリスクを上回るとして、ｍＲＮＡ由来ワクチン、ベクター系ワクチン、ウイルス不活化ワクチンをはじめとするいくつかのワクチンが、ヒトでの疾患の蔓延と闘うための緊急時使用として認可されている３，５，６，７，８，９，１０，１１。最近では、ＣＤ４０を発現する抗原提示細胞に対するウイルス抗原を標的とする新世代サブユニットワクチンが報告された１２。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイクの受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）は、現在のワクチンの主な免疫原である。しかしながら、コロナウイルスのスパイクは、異なる種や変異体間で相当な遺伝的多様性を示す。さらに、回復期のＣＯＶＩＤ－１９患者はＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対して交差中和活性をほとんど示さず、現在の免疫原は、サルベコウイルスに対して広範な防御を引き起こさない可能性があることが示唆される。したがって、このクラスのウイルスに対するユニバーサルワクチンは、現在の世界的流行を終わらせるだけでなく、自然界から継続的に見いだされるＳＡＲＳのようなウイルスのさらなる変種の出現や将来の大流行を防止するためにも重要である。
【発明の概要】
【0003】
本発明は特許請求の範囲によって規定される。特に、本発明は、抗原提示細胞の表面抗原に対する抗体であって、重鎖がＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート若しくは融合し、軽鎖が
Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド、又は
Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド
とコンジュゲート若しくは融合する抗体に関する。
Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド、又は
Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド
とコンジュゲート若しくは融合する抗体に関する。
【0004】
本発明はまた、ユニバーサルサルベコウイルスワクチンとしての前記抗体の使用にも関する。
【発明の詳細な説明】
【0005】
定義
本明細書において使用される場合、「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という語は本明細書では同義的に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。この語には、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、リン酸化、又は標識化成分とのコンジュゲーションなど、修飾されたアミノ酸ポリマーも含まれる。ポリペプチドは、遺伝子療法に関連して議論する場合、各々のインタクトなポリペプチド、又はそれらの任意のフラグメント若しくは遺伝子操作された誘導体であって、インタクトなタンパク質の所望の生化学的機能を保持するものを指す。
本明細書において使用される場合、「ポリペプチド」、「ペプチド」、及び「タンパク質」という語は本明細書では同義的に使用され、任意の長さのアミノ酸のポリマーを指す。この語には、例えば、ジスルフィド結合形成、グリコシル化、脂質化、リン酸化、又は標識化成分とのコンジュゲーションなど、修飾されたアミノ酸ポリマーも含まれる。ポリペプチドは、遺伝子療法に関連して議論する場合、各々のインタクトなポリペプチド、又はそれらの任意のフラグメント若しくは遺伝子操作された誘導体であって、インタクトなタンパク質の所望の生化学的機能を保持するものを指す。
【0006】
本明細書で使用する場合、「ポリヌクレオチド」という語は、デオキシリボヌクレオチド若しくはリボヌクレオチド、又はそれらの類似体を含む、任意の長さのヌクレオチドのポリマー形態を指す。ポリヌクレオチドは、メチル化ヌクレオチドやヌクレオチド類似体などの修飾ヌクレオチドを含んでもよく、非ヌクレオチド成分によって中断されていてもよい。存在する場合、ヌクレオチド構造への修飾は、ポリマーのアセンブリ前又はアセンブリ後に付与することができる。ポリヌクレオチドという語は、本明細書中で使用する場合、二本鎖及び一本鎖分子を同義的に指す。特に指定されているか又は必要とされる場合を除き、本明細書中で記載する本発明のポリヌクレオチドの任意の実施形態は、二本鎖形態と、二本鎖形態を構成することが知られているか又は予想される二つの相補性一本鎖形態の各々との両方を包含する。
【0007】
本明細書で使用する場合、「コード化する」という語は、例えば、遺伝子、ｃＤＮＡ、又はｍＲＮＡなどのポリヌクレオチドにおける特定のヌクレオチド配列が、所定のヌクレオチド配列（例えば、ｒＲＮＡ、ｔＲＮＡ、ｍＲＮＡ）又は所定のアミノ酸配列のいずれかを有する生物学的プロセスにおける他のポリマー及び巨大分子の合成用テンプレートとして機能する固有の特性及びそれから得られる生物学的特性を指す。したがって、遺伝子、ｃＤＮＡ、又はＲＮＡは、その遺伝子に対応するｍＲＮＡの転写及び翻訳によって細胞又は他の生物学的系においてタンパク質が産生される場合に、タンパク質をコード化する。そのヌクレオチド配列がｍＲＮＡ配列と同一であり、通常、配列表に提示されるコード鎖と、遺伝子又はｃＤＮＡの転写用テンプレートとして使用される非コード鎖はどちらも、その遺伝子又はｃＤＮＡのタンパク質又は他の産物をコード化するということができる。別段の定めがない限り、「アミノ酸配列をコード化するヌクレオチド配列」は、互いの縮重バージョンであり、同じアミノ酸配列をコード化する全てのヌクレオチド配列が含まれる。「タンパク質又はＲＮＡをコード化するヌクレオチド配列」という語句には、タンパク質をコード化するヌクレオチド配列が何らかの形でイントロンを含む可能性がある限り、イントロンも含まれ得る。
【0008】
本明細書で使用する場合、「由来の」という表現は、それによって、第一成分（例えば、第一ポリペプチド）、又は当該第一成分からの情報が、異なる第二成分（例えば、第一ポリペプチドとは異なる第二ポリペプチド）を単離、誘導、又は作製するために使用されるプロセスを指す。
【0009】
本明細書で使用する場合、二つの配列間の「同一性パーセント」は、二つの配列の最適アラインメントのために導入する必要があるギャップの数、及び各ギャップの長さを考慮した、配列によって共有される同一位置の数の関数（すなわち、％同一性＝同一位置の数／位置の総数×１００）である。配列の比較と二つの配列間の同一性パーセントの決定は、以下に記載するように、数学的アルゴリズムを用いて実行できる。二つのアミノ酸配列間の同一性パーセントは、Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ ａｎｄ Ｗｕｎｓｃｈアルゴリズム（Ｎｅｅｄｌｅｍａｎ，Ｓａｕｌ Ｂ．＆Ｗｕｎｓｃｈ，Ｃｈｒｉｓｔｉａｎ Ｄ．（１９７０）．“Ａ ｇｅｎｅｒａｌ ｍｅｔｈｏｄ ａｐｐｌｉｃａｂｌｅ ｔｏ ｔｈｅ ｓｅａｒｃｈ ｆｏｒ ｓｉｍｉｌａｒｉｔｉｅｓ ｉｎ ｔｈｅ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄ ｓｅｑｕｅｎｃｅ ｏｆ ｔｗｏ ｐｒｏｔｅｉｎｓ”．Ｊｏｕｒｎａｌ ｏｆ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ．４８（３）：４４３－５３）を使用して決定できる。二つのヌクレオチド又はアミノ酸配列間の同一性パーセントはまた、例えば、ＥＭＢＯＳＳ Ｎｅｅｄｌｅ（ペアワイズアラインメント；ｗｗｗ．ｅｂｉ．ａｃ．ｕｋで入手可能）などのアルゴリズムを用いて決定することもできる。例えば、ＥＭＢＯＳＳ Ｎｅｅｄｌｅは、ＢＬＯＳＵＭ６２マトリックス、「ギャップオープンペナルティ」１０、「ギャップエクステンドペナルディ」０．５、偽「エンドギャップペナルティ」、「エンドギャップオープンペナルティ」１０及び「エンドギャップエクステンドペナルディ」０．５で使用できる。一般に、「同一性パーセント」は、一致する位置の数を比較する位置の数で割り、１００をかけた関数である。例えば、アラインメント後の二つの比較配列間で１０個の配列位置のうちの６個が同一である場合、同一性は６０％である。％同一性は、典型的には、分析が実施されるクエリー配列の全長にわたって決定される。同じ一次アミノ酸配列又は核酸配列を有する二つの分子は、化学的及び／又は生物学的修飾に関係なく同一である。本発明によると、第一アミノ酸配列が第二アミノ酸配列と少なくとも９０％の同一性を有するということは、第一配列が第二アミノ酸配列と９０；９１；９２；９３；９４；９５；９６；９７；９８；９９又は１００％の同一性を有することを意味する。
【0010】
本明細書で使用する場合、「コロナウイルス」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、コロナウイルス科のメンバーのうちの任意のメンバーを指す。コロナウイルスは、そのゲノムがウイルスの種類に応じて約２７ｋｂ～約３３ｋｂの長さのプラス鎖ＲＮＡであるウイルスである。ビリオンＲＮＡは、５’末端にキャップを有し、３’末端にポリＡテールを有する。ＲＮＡの長さにより、コロナウイルスはＲＮＡウイルスゲノムのうちで最大となる。特に、コロナウイルスＲＮＡは：（１）ＲＮＡ依存性ＲＮＡポリメラーゼ；（２）Ｎ－タンパク質；（３）三つのエンベロープ糖タンパク質；及び（４）三つの非構造タンパク質をコード化する。これらのコロナウイルスは、様々な哺乳類や鳥類に感染する。呼吸器感染症（一般）、腸管感染症（主に、１２カ月を超える乳児）、そして場合によっては神経学的症候群を引き起こす。コロナウイルスは、呼吸器分泌物のエアロゾルによって伝染する。
【0011】
本明細書で使用する場合、「ベータコロナウイルス」という語は、β－ＣｏＶ又はベータＣｏＶとしても知られ、当該技術分野における一般的な意味を有し、コロナウイルスの四つの属（アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ）のうちの一つを指す。ベータコロナウイルス属は、Ａ、Ｂ、Ｃ、Ｄの四つの系統を含む。
【0012】
本明細書で使用する場合、「サルベコウイルス」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、ベータコロナウイルスのＢ系統を指す。ヒトに関して臨床的に最も重要なサルベコウイルスは、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ又はＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１）及び重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２（ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２）である。亜属には、限定されるものではないが、コウモリＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＲａＴＧ１３、コウモリＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＲａｃＣＳ２０３、センザンコウＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＧＸ－Ｐ４Ｌ、センザンコウＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＧＸ－Ｐ５Ｌ、コウモリＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＺＣ４５、コウモリＳＣ２ｒ－ＣｏＶ ＺＸＣ２１、コウモリＳＣ２ｒ－ＣｏＶ Ｒｃ－ｏ３１９、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＷＩＶ１、コウモリＣｏＶ ＷＩＶ１６、コウモリＣｏＶ Ｒｓ３３６７、コウモリＣｏＶ ＬＹＲａ１１、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ Ｃｐ／雲南２０１１、コウモリＣｏＶ Ｒｓ－ＹＮ２０１８Ｂ、コウモリＣｏＶ Ｒｓ７３２７、コウモリＣｏＶ ＲｓＳＨＣ０１４、コウモリＣｏＶ Ｒｓ４２３１、コウモリＣｏＶ Ｒｓ４０８４、コウモリＣｏＶ Ｒｓ４０８１、コウモリＣｏＶ Ｒｓ６７２、コウモリＣｏＶ Ｒｓ４２３７、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＹＮＬＦ＿３１Ｃ、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ Ｒｐ３、ＢｔＲｌ－ベータＣｏＶ／ＳＣ２０１８、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ Ｒｆ１、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＨｅＢ２０１３、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ Ｒｐ／陝西２０１１、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ Ｒｍ１、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＨｕＢ２０１３、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＨＫＵ３－１、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ 龍泉－１４０、コウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＢＭ４８－３１／ＢＧＲ／２００８、及びコウモリＳＣ１ｒ－ＣｏＶ ＢｔＫＹ７２も含まれる。
【0013】
本明細書で使用する場合、「重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２」又は「ＳＡＲＳ－Ｃｏｖ－２」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、軽度上気道疾患（普通感冒のような症状）に似た臨床病理、時として重篤な下気道疾患や肺外症状を示し、多臓器不全や死に至る呼吸器症候群であるコロナウイルス疾患２０１９（ＣＯＶＩＤ－１９）を引き起こすコロナウイルス株を指す。
【0014】
本明細書で使用する場合、「核タンパク質」又は「タンパク質Ｎ」という語は、プラス鎖ウイルスゲノムＲＮＡをらせん状リボヌクレオカプシド（ＲＮＰ）にパッケージングし、ウイルスゲノム及び膜タンパク質Ｍとの相互作用を通してビリオンアセンブリ中に基本的な役割を果たすＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２タンパク質を指す。典型的には、核タンパク質は配列番号１に記載するアミノ酸配列を有する。
【0015】
【表1】
【0016】
本明細書で使用する場合、「Ｎｐｅｐ２ポリペプチド」という語は、ＳＡＲ－ＣｏＶ－２のタンパク質Ｎ由来であり、配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶアミノ酸配列からなるＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ポリペプチドを指す。
【0017】
本明細書で使用する場合、「スパイクタンパク質」又は「タンパク質Ｓ」という語は、その細胞受容体（すなわち、ＡＣＥ２）と結合し、膜融合及びウイルス侵入を仲介するＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２スパイク糖タンパク質を指す。三量体Ｓタンパク質の各モノマーは約１８０ｋＤａであり、それぞれ付着及び膜融合を仲介する二つのサブユニットＳ１及びＳ２を含有する。特に、スパイクタンパク質Ｓ１は、「ＲＢＤ」とも呼ばれる「受容体結合ドメイン」を介して宿主受容体（すなわち、ヒトＡＣＥ２受容体）と相互作用することによって、ビリオンを細胞膜に付着させる。スパイクタンパク質Ｓ２は、クラスＩウイルス融合タンパク質として作用することによって、ビリオンと細胞膜との融合を仲介する。現在のモデルでは、タンパク質には少なくとも三つのコンフォメーション状態、すなわち、融合前のネイティブ状態、ヘアピン前の中間状態、融合後のヘアピン状態がある。ウイルス及び標的細胞膜融合の間、コイルドコイル領域（７反復）は、ヘアピン三量体構造をとり、融合ペプチドを外部ドメインのＣ末端領域にごく接近して配置する。この構造の形成は、ウイルス及び標的細胞膜の接着とその後の融合を促進するようである。スパイクタンパク質Ｓ２’は、ウイルス融合ペプチドとして作用し、ウイルスエンドサイトーシスに際して起こるＳ２切断後にアンマスクされる。典型的には、スパイクタンパク質は、配列番号２に記載するようなアミノ酸配列を有する。
【0018】
【表2】
【0019】
本明細書において使用する場合、「ＲＢＤポリペプチド」という語は、配列番号２における３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及ぶアミノ酸配列からなるポリペプチドを指す。
【0020】
本明細書で使用する場合、「変異」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、置換、欠失又は挿入を指す。特に、「置換」という語は、特定の位置の特定のアミノ酸残基が除去され、同じ位置に別のアミノ酸残基が挿入されることを意味する。本明細書では、変異は標準的な変異命名法に従って言及される。特に、「変異」という語には、「自然発生変異」及び「非自然発生突然変異」が含まれる。
【0021】
本明細書で使用する場合、「自然発生突然変異」という語は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ポリペプチドの自然発生突然変異体において見出すことができる任意の変異を指し、典型的には、Ｂ．１．１．７系統（別名２０Ｉ／５０１Ｙ．Ｖ１懸念される変異株（ＶＯＣ）２０２０１２／０１又はアルファＶＯＣ）、Ｂ．１．３５１系統（別名２０Ｈ／５０１Ｙ．Ｖ２又はベータＶＯＣ）及びＰ．１系統（別名２０Ｊ／５０１Ｙ．Ｖ３又はガンマＶＯＣ）及びＢ．１．６１７．２系統（別名デルタＶＯＣ）が挙げられる。前記変異は当該技術分野では周知であり、参照により組み込まれる以下の文献に記載されているものが含まれる：
（１） Ｊｉｅ Ｈｕ ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ｄ６１４Ｇ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｓｐｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｅｎｈａｎｃｅｓ ｖｉｒａｌ ｉｎｆｅｃｔｉｖｉｔｙ ａｎｄ ｄｅｃｒｅａｓｅｓ ｎｅｕｔｒａｌｉｚａｔｉｏｎ ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ ｔｏ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｃｏｎｖａｌｅｓｃｅｎｔ ｓｅｒａ． ｂｉｏＲｘｖｉｖ （２０２０）．
－（２） Ｋｏｒｂｅｒ Ｂ． ｅｔ ａｌ．Ｓｐｉｋｅ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｐｉｐｅｌｉｎｅ ｒｅｖｅａｌｓ ｔｈｅ ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ ｏｆ ａ ｍｏｒｅ ｔｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅ ｆｏｒｍ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２． ｂｉｏＲｘｖｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．０４．２９．０６９０５４．
－（３） Ｌｉｚｈｏｕ Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ｄ６１４Ｇ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｓｐｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｒｅｄｕｃｅｓ Ｓ１ ｓｈｅｄｄｉｎｇ ａｎｄ ｉｎｃｒｅａｓｅｓ ｉｎｆｅｃｔｉｖｉｔｙ． ｂｉｏＲｘｖｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．０６．１２．１４８７２６．
－（４） Ｊｕｎｘｉａｎ Ｏｕ ｅｔ ａｌ． Ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ ｏｆ ＲＢＤ ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｓｔｒａｉｎｓ ｅｎｈａｎｃｉｎｇ ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｓｔａｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｈｕｍａｎ ＡＣＥ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ａｆｆｉｎｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ｓｐｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ． ｂｉｏＲｘｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ：１０．１１０１／２０２０．０３．１５．９９１８４４ｖ４
－（５） Ｓａｈａ， Ｐ． ｅｔ ａｌ．Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ｓｐｉｋｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｍｏｄｕｌａｔｅ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂｉｎｄｉｎｇ， Ｍｅｍｂｒａｎｅ Ｆｕｓｉｏｎ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ： Ａｎ Ｉｎｓｉｇｈｔ ｉｎｔｏ Ｖｉｒａｌ Ｔｒｏｐｉｓｍ ａｎｄ Ｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓ ｏｆ ＣＯＶＩＤ－１９． ｃｈｅｍＲｘｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ：１０．２６４３４／ｃｈｅｍｒｘｉｖ．１２３２０５６７．ｖ１
－（６） Ｊｉａｎ Ｓｈａｎｇ， Ｙｕｓｈｕｎ Ｗａｎ， Ｃｈｕｍｉｎｇ Ｌｕｏ， Ｇａｎｇ Ｙｅ， Ｑｉｂｉｎ Ｇｅｎｇ， Ａｓｈｌｅｙ Ａｕｅｒｂａｃｈ， Ｆａｎｇ Ｌｉ． Ｃｅｌｌ ｅｎｔｒｙ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２． Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｍａｙ ２０２０， １１７ （２１） １１７２７－１１７３４； ＤＯＩ： １０．１０７３／ｐｎａｓ．２００３１３８１１７
－（７） Ａｌｌｉｓｏｎ Ｊ． Ｇｒｅａｎｅｙ， Ａｎｄｒｅａ Ｎ． Ｌｏｅｓ， Ｋａｔｈａｒｉｎｅ Ｈ．Ｄ． Ｃｒａｗｆｏｒｄ， Ｔｙｌｅｒ Ｎ． Ｓｔａｒｒ， Ｋｅａｒａ Ｄ． Ｍａｌｏｎｅ， Ｈｅｌｅｎ Ｙ． Ｃｈｕ， Ｊｅｓｓｅ Ｄ． Ｂｌｏｏｍ， ｂｉｏＲｘｉｖ ２０２０．１２．３１．４２５０２１； ｄｏｉ： ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．１２．３１．４２５０２１
－（８） Ｎｉｃｈｏｌａｓ Ｇ． Ｄａｖｉｅｓ， Ｒｏｓａｎｎａ Ｃ． Ｂａｒｎａｒｄ， Ｃｈｒｉｓｔｏｐｈｅｒ Ｉ． Ｊａｒｖｉｓ， Ａｄａｍ Ｊ． Ｋｕｃｈａｒｓｋｉ， Ｊａｍｅｓ Ｍｕｎｄａｙ， Ｃａｒｌ Ａ． Ｂ． Ｐｅａｒｓｏｎ， Ｔｉｍｏｔｈｙ Ｗ． Ｒｕｓｓｅｌｌ， Ｄａｍｉｅｎ Ｃ． Ｔｕｌｌｙ， Ｓａｍ Ａｂｂｏｔｔ， Ａｍｙ Ｇｉｍｍａ， Ｗｉｌｌｉａｍ Ｗａｉｔｅｓ， Ｋｅｒｒｙ ＬＭ Ｗｏｎｇ， Ｋｅｖｉｎ ｖａｎ Ｚａｎｄｖｏｏｒｔ， ＣＭＭＩＤ ＣＯＶＩＤ－１９ Ｗｏｒｋｉｎｇ Ｇｒｏｕｐ， Ｒｏｓａｌｉｎｄ Ｍ． Ｅｇｇｏ， Ｓｅｂａｓｔｉａｎ Ｆｕｎｋ， Ｍａｒｋ Ｊｉｔ， Ｋａｔｈｅｒｉｎｅ Ｅ． Ａｔｋｉｎｓ， Ｗ． Ｊｏｈｎ Ｅｄｍｕｎｄｓ． Ｅｓｔｉｍａｔｅｄ ｔｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｓｅｖｅｒｉｔｙ ｏｆ ｎｏｖｅｌ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｖａｒｉａｎｔ ｏｆ Ｃｏｎｃｅｒｎ ２０２０１２／０１ ｉｎ Ｅｎｇｌａｎｄ． ｍｅｄＲｘｉｖ ２０２０．１２．２４．２０２４８８２２； ｄｏｉ： ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．１２．２４．２０２４８８２２
－（９） Ｈｏｕｒｉｉｙａｈ Ｔｅｇａｌｌｙ， Ｅｄｕａｎ Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎ， Ｍａｒｔａ Ｇｉｏｖａｎｅｔｔｉ， ｅｔ ａｌ． Ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ ａｎｄ ｒａｐｉｄ ｓｐｒｅａｄ ｏｆ ａ ｎｅｗ ｓｅｖｅｒｅ ａｃｕｔｅ ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ ｓｙｎｄｒｏｍｅ－ｒｅｌａｔｅｄ ｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ ２ （ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２） ｌｉｎｅａｇｅ ｗｉｔｈ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｐｉｋｅ ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ｓｏｕｔｈ Ａｆｒｉｃａ． ｍｅｄＲｘｉｖ ２０２０．１２．２１．２０２４８６４０； ｄｏｉ： ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．１２．２１．２０２４８６４０
－（１０） Ｋｉｍ ＪＳ， Ｊａｎｇ ＪＨ， Ｋｉｍ ＪＭ， Ｃｈｕｎｇ ＹＳ， Ｙｏｏ ＣＫ， Ｈａｎ ＭＧ． Ｇｅｎｏｍｅ－Ｗｉｄｅ Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｏｉｎｔ Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｇｅｎｏｍｅ． Ｏｓｏｎｇ Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｒｅｓ Ｐｅｒｓｐｅｃｔ． ２０２０；１１（３）：１０１－１１１． ｄｏｉ：１０．２４１７１／ｊ．ｐｈｒｐ．２０２０．１１．３．０５
－（１１） Ｎｉｌｇｉｒｉｗａｌａ Ｋ， Ｍａｎｄａｌ Ａ， Ｐａｔｅｌ Ｇ， Ｍｅｓｔｒｙ Ｔ， Ｖａｓｗａｎｉ Ｓ， Ｓｈａｉｋｈ Ａ， Ｓｒｉｒａｍａｎ Ｋ， Ｐａｒｉｋｈ Ｓ， Ｕｄｕｐａ Ｓ， Ｃｈａｔｔｅｒｊｅｅ Ｎ， Ｓｈａｓｔｒｉ Ｊ， Ｍｉｓｔｒｙ Ｎ． Ｇｅｎｏｍｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｆｉｖｅ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｖａｒｉａｎｔｓ ｆｒｏｍ Ｍｕｍｂａｉ， Ｉｎｄｉａ， Ｏｂｔａｉｎｅｄ ｂｙ Ｎａｎｏｐｏｒｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ． Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｒｅｓｏｕｒ Ａｎｎｏｕｎｃ． ２０２１ Ａｐｒ １５；１０（１５）：ｅ００２３１－２１
（１） Ｊｉｅ Ｈｕ ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ｄ６１４Ｇ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｓｐｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｅｎｈａｎｃｅｓ ｖｉｒａｌ ｉｎｆｅｃｔｉｖｉｔｙ ａｎｄ ｄｅｃｒｅａｓｅｓ ｎｅｕｔｒａｌｉｚａｔｉｏｎ ｓｅｎｓｉｔｉｖｉｔｙ ｔｏ ｉｎｄｉｖｉｄｕａｌ ｃｏｎｖａｌｅｓｃｅｎｔ ｓｅｒａ． ｂｉｏＲｘｖｉｖ （２０２０）．
－（２） Ｋｏｒｂｅｒ Ｂ． ｅｔ ａｌ．Ｓｐｉｋｅ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｐｉｐｅｌｉｎｅ ｒｅｖｅａｌｓ ｔｈｅ ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ ｏｆ ａ ｍｏｒｅ ｔｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｌｅ ｆｏｒｍ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２． ｂｉｏＲｘｖｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．０４．２９．０６９０５４．
－（３） Ｌｉｚｈｏｕ Ｚｈａｎｇ ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ｄ６１４Ｇ ｍｕｔａｔｉｏｎ ｉｎ ｔｈｅ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｓｐｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ ｒｅｄｕｃｅｓ Ｓ１ ｓｈｅｄｄｉｎｇ ａｎｄ ｉｎｃｒｅａｓｅｓ ｉｎｆｅｃｔｉｖｉｔｙ． ｂｉｏＲｘｖｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．０６．１２．１４８７２６．
－（４） Ｊｕｎｘｉａｎ Ｏｕ ｅｔ ａｌ． Ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ ｏｆ ＲＢＤ ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｃｉｒｃｕｌａｔｉｎｇ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｓｔｒａｉｎｓ ｅｎｈａｎｃｉｎｇ ｔｈｅ ｓｔｒｕｃｔｕｒａｌ ｓｔａｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｈｕｍａｎ ＡＣＥ２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ａｆｆｉｎｉｔｙ ｏｆ ｔｈｅ ｓｐｉｋｅ ｐｒｏｔｅｉｎ． ｂｉｏＲｘｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ：１０．１１０１／２０２０．０３．１５．９９１８４４ｖ４
－（５） Ｓａｈａ， Ｐ． ｅｔ ａｌ．Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ｓｐｉｋｅ Ｐｒｏｔｅｉｎ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｍｏｄｕｌａｔｅ Ｒｅｃｅｐｔｏｒ Ｂｉｎｄｉｎｇ， Ｍｅｍｂｒａｎｅ Ｆｕｓｉｏｎ ａｎｄ Ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ： Ａｎ Ｉｎｓｉｇｈｔ ｉｎｔｏ Ｖｉｒａｌ Ｔｒｏｐｉｓｍ ａｎｄ Ｐａｔｈｏｇｅｎｅｓｉｓ ｏｆ ＣＯＶＩＤ－１９． ｃｈｅｍＲｘｉｖ （２０２０）． ｄｏｉ：１０．２６４３４／ｃｈｅｍｒｘｉｖ．１２３２０５６７．ｖ１
－（６） Ｊｉａｎ Ｓｈａｎｇ， Ｙｕｓｈｕｎ Ｗａｎ， Ｃｈｕｍｉｎｇ Ｌｕｏ， Ｇａｎｇ Ｙｅ， Ｑｉｂｉｎ Ｇｅｎｇ， Ａｓｈｌｅｙ Ａｕｅｒｂａｃｈ， Ｆａｎｇ Ｌｉ． Ｃｅｌｌ ｅｎｔｒｙ ｍｅｃｈａｎｉｓｍｓ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２． Ｐｒｏｃｅｅｄｉｎｇｓ ｏｆ ｔｈｅ Ｎａｔｉｏｎａｌ Ａｃａｄｅｍｙ ｏｆ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ Ｍａｙ ２０２０， １１７ （２１） １１７２７－１１７３４； ＤＯＩ： １０．１０７３／ｐｎａｓ．２００３１３８１１７
－（７） Ａｌｌｉｓｏｎ Ｊ． Ｇｒｅａｎｅｙ， Ａｎｄｒｅａ Ｎ． Ｌｏｅｓ， Ｋａｔｈａｒｉｎｅ Ｈ．Ｄ． Ｃｒａｗｆｏｒｄ， Ｔｙｌｅｒ Ｎ． Ｓｔａｒｒ， Ｋｅａｒａ Ｄ． Ｍａｌｏｎｅ， Ｈｅｌｅｎ Ｙ． Ｃｈｕ， Ｊｅｓｓｅ Ｄ． Ｂｌｏｏｍ， ｂｉｏＲｘｉｖ ２０２０．１２．３１．４２５０２１； ｄｏｉ： ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．１２．３１．４２５０２１
－（８） Ｎｉｃｈｏｌａｓ Ｇ． Ｄａｖｉｅｓ， Ｒｏｓａｎｎａ Ｃ． Ｂａｒｎａｒｄ， Ｃｈｒｉｓｔｏｐｈｅｒ Ｉ． Ｊａｒｖｉｓ， Ａｄａｍ Ｊ． Ｋｕｃｈａｒｓｋｉ， Ｊａｍｅｓ Ｍｕｎｄａｙ， Ｃａｒｌ Ａ． Ｂ． Ｐｅａｒｓｏｎ， Ｔｉｍｏｔｈｙ Ｗ． Ｒｕｓｓｅｌｌ， Ｄａｍｉｅｎ Ｃ． Ｔｕｌｌｙ， Ｓａｍ Ａｂｂｏｔｔ， Ａｍｙ Ｇｉｍｍａ， Ｗｉｌｌｉａｍ Ｗａｉｔｅｓ， Ｋｅｒｒｙ ＬＭ Ｗｏｎｇ， Ｋｅｖｉｎ ｖａｎ Ｚａｎｄｖｏｏｒｔ， ＣＭＭＩＤ ＣＯＶＩＤ－１９ Ｗｏｒｋｉｎｇ Ｇｒｏｕｐ， Ｒｏｓａｌｉｎｄ Ｍ． Ｅｇｇｏ， Ｓｅｂａｓｔｉａｎ Ｆｕｎｋ， Ｍａｒｋ Ｊｉｔ， Ｋａｔｈｅｒｉｎｅ Ｅ． Ａｔｋｉｎｓ， Ｗ． Ｊｏｈｎ Ｅｄｍｕｎｄｓ． Ｅｓｔｉｍａｔｅｄ ｔｒａｎｓｍｉｓｓｉｂｉｌｉｔｙ ａｎｄ ｓｅｖｅｒｉｔｙ ｏｆ ｎｏｖｅｌ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｖａｒｉａｎｔ ｏｆ Ｃｏｎｃｅｒｎ ２０２０１２／０１ ｉｎ Ｅｎｇｌａｎｄ． ｍｅｄＲｘｉｖ ２０２０．１２．２４．２０２４８８２２； ｄｏｉ： ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．１２．２４．２０２４８８２２
－（９） Ｈｏｕｒｉｉｙａｈ Ｔｅｇａｌｌｙ， Ｅｄｕａｎ Ｗｉｌｋｉｎｓｏｎ， Ｍａｒｔａ Ｇｉｏｖａｎｅｔｔｉ， ｅｔ ａｌ． Ｅｍｅｒｇｅｎｃｅ ａｎｄ ｒａｐｉｄ ｓｐｒｅａｄ ｏｆ ａ ｎｅｗ ｓｅｖｅｒｅ ａｃｕｔｅ ｒｅｓｐｉｒａｔｏｒｙ ｓｙｎｄｒｏｍｅ－ｒｅｌａｔｅｄ ｃｏｒｏｎａｖｉｒｕｓ ２ （ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２） ｌｉｎｅａｇｅ ｗｉｔｈ ｍｕｌｔｉｐｌｅ ｓｐｉｋｅ ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ Ｓｏｕｔｈ Ａｆｒｉｃａ． ｍｅｄＲｘｉｖ ２０２０．１２．２１．２０２４８６４０； ｄｏｉ： ｈｔｔｐｓ：／／ｄｏｉ．ｏｒｇ／１０．１１０１／２０２０．１２．２１．２０２４８６４０
－（１０） Ｋｉｍ ＪＳ， Ｊａｎｇ ＪＨ， Ｋｉｍ ＪＭ， Ｃｈｕｎｇ ＹＳ， Ｙｏｏ ＣＫ， Ｈａｎ ＭＧ． Ｇｅｎｏｍｅ－Ｗｉｄｅ Ｉｄｅｎｔｉｆｉｃａｔｉｏｎ ａｎｄ Ｃｈａｒａｃｔｅｒｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ Ｐｏｉｎｔ Ｍｕｔａｔｉｏｎｓ ｉｎ ｔｈｅ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｇｅｎｏｍｅ． Ｏｓｏｎｇ Ｐｕｂｌｉｃ Ｈｅａｌｔｈ Ｒｅｓ Ｐｅｒｓｐｅｃｔ． ２０２０；１１（３）：１０１－１１１． ｄｏｉ：１０．２４１７１／ｊ．ｐｈｒｐ．２０２０．１１．３．０５
－（１１） Ｎｉｌｇｉｒｉｗａｌａ Ｋ， Ｍａｎｄａｌ Ａ， Ｐａｔｅｌ Ｇ， Ｍｅｓｔｒｙ Ｔ， Ｖａｓｗａｎｉ Ｓ， Ｓｈａｉｋｈ Ａ， Ｓｒｉｒａｍａｎ Ｋ， Ｐａｒｉｋｈ Ｓ， Ｕｄｕｐａ Ｓ， Ｃｈａｔｔｅｒｊｅｅ Ｎ， Ｓｈａｓｔｒｉ Ｊ， Ｍｉｓｔｒｙ Ｎ． Ｇｅｎｏｍｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｆｉｖｅ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ Ｖａｒｉａｎｔｓ ｆｒｏｍ Ｍｕｍｂａｉ， Ｉｎｄｉａ， Ｏｂｔａｉｎｅｄ ｂｙ Ｎａｎｏｐｏｒｅ Ｓｅｑｕｅｎｃｉｎｇ． Ｍｉｃｒｏｂｉｏｌ Ｒｅｓｏｕｒ Ａｎｎｏｕｎｃ． ２０２１ Ａｐｒ １５；１０（１５）：ｅ００２３１－２１
【0022】
例えば、変異Ｎ５０１Ｙは、それぞれ、イングランド南東部、ブラジル／日本、及び南アフリカで最初に特定された三つのＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２系統Ｂ．１．１．７、Ｐ．１（別名２０Ｊ／５０１Ｙ．Ｖ３）及び５０１Ｙ．Ｖ２が共有するＳ－タンパク質の受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）内の非同義変異である。これはＲＢＤ内の重要な接触残基の一つであり、ヒト及びマウスＡＣＥ２に対する結合親和性を増加させることが確認されている。それぞれ南アフリカ及びブラジルからの新しい系統５０１Ｙ．Ｓ２及びＢ．１．１．２８並びにインドからのＢ１．６１７．１（注目すべきカッパ変異株）に存在するＳタンパク質の受容体結合ドメイン（ＲＢＤ）内のＥ４８４Ｋ及びＥ４８４Ｑ変異は、多くの中和抗体の結合について重要であることが示されているＲＢＤ内の残基に影響を及ぼす。したがって、この変異は、抗体認識に影響を及ぼし、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２免疫回避を可能にする。この変異を有するウイルスは、回復期の人の血清中の抗体による認識を回避することが示されており、したがって、ワクチンの有効性を変える可能性がある（例えば、Ａｌｌｉｓｏｎ Ｊ．Ｇｒｅａｎｅｙ，Ａｎｄｒｅａ Ｎ．Ｌｏｅｓ，Ｋａｔｈａｒｉｎｅ Ｈ．Ｄ．Ｃｒａｗｆｏｒｄ，Ｔｙｌｅｒ Ｎ．Ｓｔａｒｒ，Ｋｅａｒａ Ｄ．Ｍａｌｏｎｅ，Ｈｅｌｅｎ Ｙ．Ｃｈｕ，Ｊｅｓｓｅ Ｄ．Ｂｌｏｏｍ，ｂｉｏＲｘｉｖ ２０２０．１２．３１．４２５０２１を参照）。Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、及びＥ４８４Ｋ／Ｅ４８４Ｑ変異をはじめとするいくつかの他の変異が見いだされている。したがって、本発明によると、主な自然発生突然変異としては、配列番号２の４１７位のアミノ酸残基（Ｋ）がアミノ酸残基（Ｎ）で置換されているＫ４１７Ｎ変異、配列番号２の４５２位のアミノ酸残基（Ｌ）がアミノ酸残基（Ｒ）で置換されているＬ４５２Ｒ変異、配列番号２の４７８位のアミノ酸残基（Ｔ）がアミノ酸残基（Ｋ）で置換されているＴ４７８Ｋ変異及び配列番号２の４８４位のアミノ酸残基（Ｅ）がアミノ酸残基（Ｋ）又は（Ｑ）で置換されているＥ４８４Ｋ又はＥ４８４Ｑ変異、及び配列番号２の５０１位のアミノ酸残基（Ｎ）がアミノ酸残基（Ｙ）で置換されているＮ５０１Ｙ変異が挙げられる。
【0023】
本明細書で使用する場合、「非自然発生突然変異」という語は、本発明のポリペプチドに遺伝的に挿入された任意の変異を指す。特に、前記変異はポリペプチドの産生を容易にするために挿入される。例えば、前記変異には、配列番号２の変異Ｃ５３８Ｓが含まれ、配列番号２の５３８位のアミノ酸残基（Ｃ）がアミノ酸残基（Ｓ）で置換されている。前記変異は、本発明のポリペプチド内でのジスルフィド結合の形成を回避するのに特に適している。
【0024】
本明細書で使用する場合、「ベクター」、「クローニングベクター」及び「発現ベクター」という語は、宿主を形質転換し、導入された配列の発現（例えば、転写及び翻訳）を促進するように、ＤＮＡ又はＲＮＡ配列（例えば、外来遺伝子）を宿主細胞に導入できるビヒクルを意味する。
【0025】
本明細書で使用する場合、「プロモーター／制御配列」という語は、ポリヌクレオチド配列の特定の転写を開始し、それによってプロモーター／制御配列と機能的に連結された遺伝子産物の発現を可能にするのに必要な、細胞の合成装置、又は導入された合成装置によって認識される核酸配列（例えば、ＤＮＡ配列）を指す。ある例では、この配列はコアプロモータ配列であってよく、他の例では、この配列は、エンハンサー配列や、遺伝子産物の発現に必要な他の調節エレメントも含んでもよい。プロモーター／制御配列は、例えば、組織特異的に遺伝子産物を発現するものであってよい。
【0026】
本明細書で使用する場合、「機能的に連結された」又は「転写制御」という語は、制御配列と異種核酸配列との間の機能的連結であって、後者の発現をもたらすものを指す。例えば、第一核酸配列が第二核酸配列と機能的関係にされる場合に、当該第一核酸配列は当該第二核酸配列と機能的に連結される。例えば、プロモーターがコード配列の転写又は発現に影響を及ぼす場合、当該プロモーターは当該コード配列に機能的に連結される。機能的に連結されたＤＮＡ配列は、互いに近接させることができ、例えば、二つのタンパク質コード領域を結合させる必要がある場合には、同じリーディングフレーム内にある。
【0027】
本明細書で使用する場合、「形質転換」という語は、「外来」（すなわち、外因性又は細胞外）遺伝子、ＤＮＡ又はＲＮＡ配列を宿主細胞に導入することで、宿主細胞が、導入された遺伝子又は配列を発現し、所望の物質、典型的には、導入された遺伝子又は配列によってコードされるタンパク質又は酵素を産生することを意味する。導入されたＤＮＡ又はＲＮＡを受け取り、発現する宿主細胞は、「形質転換」されている。
【0028】
本明細書で使用する場合、「発現系」という語は、宿主細胞及び適合性ベクターであって、例えば、ベクターによって運ばれ、宿主細胞に導入される外来ＤＮＡによってコードされるタンパク質の発現に適した条件下のものを意味する。
【0029】
本明細書で使用する場合、「コンジュゲート」または同義的に「コンジュゲートされたポリペプチド」という語は、一つ以上のポリペプチドの共有結合によって形成される複合又はキメラ分子を示すことが意図される。「共有結合」又は「コンジュゲーション」という語は、ポリペプチド及び非ペプチド部分が、互いに直接的に共有結合しているか、又はブリッジ、スペーサ、若しくは連結部分などの介在部分を介して互いに間接的に共有結合していることを意味する。特定のコンジュゲートは融合タンパク質である。
【0030】
本明細書で使用する場合、「融合タンパク質」という語は、別のタンパク質に由来する二つ以上のポリペプチドの結合により創出されるタンパク質を指す。特に、融合タンパク質は、組換えＤＮＡ技術で創出することができ、典型的には、生物学的研究または治療法で使用される。融合タンパク質はまた、融合タンパク質のポリペプチド部分間のリンカーの有無にかかわらず、化学的共有コンジュゲーションを介して創出することもできる。融合タンパク質では、二つ以上のポリペプチドが直接的又はリンカーを介して融合している。
【0031】
本明細書で使用する場合、「直接的」という語は、第一ポリペプチドのＮ末端の第一アミノ酸が、第二ポリペプチドのＣ末端の最後のアミノ酸と融合していることを意味する。この直接融合は、（Ｖｉｇｎｅｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２００４，ＰＭＩＤ１５００１７１４）、（Ｗａｒｒｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２００６，ＰＭＩＤ１６９６０００８）、（Ｂｅｒｋｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１５ａ，ＰＭＩＤ２６４０１０００）、（Ｂｅｒｋｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１５ｂ，ＰＭＩＤ２６４０１００３）、（Ｄｅｌｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２０１６，ＰＭＩＤ ２６９１２８５８）（Ｌｉｅｐｅ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２０１６，ＰＭＩＤ２７８４６５７２）、（Ｂａｂｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．２０１６，ＰＭＩＤ２７７９８６１４）で記載されるように、自然に起こり得る。
【0032】
本明細書で使用する場合、「リンカー」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、タンパク質が適切な二次及び三次構造を形成することを確実にするために充分な長さのアミノ酸配列を指す。いくつかの実施形態において、リンカーは、少なくとも一つであるが３０個未満のアミノ酸を含むペプチド性リンカーであり、例えば、２～３０個のアミノ酸、好ましくは１０～３０個のアミノ酸、より好ましくは１５～３０個のアミノ酸、なお一層好ましくは１９～２７個のアミノ酸、最も好ましくは２０～２６個のアミノ酸を含むペプチド性リンカーである。いくつかの実施形態において、リンカーは、２；３；４；５；６；７；８；９；１０；１１；１２；１３；１４；１５；１６；１７；１８；１９；２０；２１；２２；２３；２４；２５；２６；２７；２８；２９；３０個のアミノ酸残基を有する。典型的には、リンカーは、化合物が適切なコンフォメーション（すなわち、ＩＬ－１５Ｒベータ／ガンマシグナル伝達経路を介した適切なシグナル伝達活性を可能にするコンフォメーション）をとることを可能にするものである。最も好適なリンカー配列は、（１）柔軟で拡張されたコンフォメーションをとり、（２）融合タンパク質の機能的ドメインと相互作用できる規則正しい二次構造を生じる傾向を示さず、（３）機能性タンパク質ドメインとの相互作用を促進できる疎水性又は荷電特性が最小限である。
【0033】
本明細書で使用する場合、「抗体」という語は、イムノグロブリン分子及びイムノグロブリン分子の免疫学的に活性な部分、すなわち、抗原と免疫特異的に結合する抗原結合部位を含む分子を指す。げっ歯類や霊長類の自然抗体では、二本の重鎖はジスルフィド結合によって互いに結合し、各重鎖はジスルフィド結合によって軽鎖と結合している。軽鎖には、ラムダ（１）とカッパ（ｋ）の二種類がある。抗体分子の機能活性を決定する五つの主な重鎖クラス（又はアイソタイプ）：ＩｇＭ、ＩｇＤ、ＩｇＧ、ＩｇＡ及びＩｇＥがある。各鎖は異なる配列ドメインを含む。典型的なＩｇＧ抗体では、軽鎖は、可変ドメイン（ＶＬ）と定常ドメイン（ＣＬ）の二つのドメインを含む。重鎖は、可変ドメイン（ＶＨ）と三つの定常ドメイン（ＣＨ１、ＣＨ２及びＣＨ３、総称してＣＨ）の四つのドメインを含む。軽（ＶＬ）鎖及び重（ＶＨ）鎖両方の可変領域は、抗原に対する結合認識及び特異性を決定する。軽（ＣＬ）鎖及び重（ＣＨ）鎖の定常領域ドメインは、抗体鎖結合、分泌、経胎盤性移動度、補体結合、Ｆｃ受容体（ＦｃＲ）に対する結合などの重要な生物学的特性を付与する。Ｆｖフラグメントは、イムノグロブリンのＦａｂフラグメントのＮ末端部分であり、一本の軽鎖と一本の重鎖の可変部分からなる。抗体の特異性は、抗体結合部位と抗原決定基との間の構造相補性にある。抗体結合部位は、主に高頻度可変性又は相補性決定領域（ＣＤＲ）由来の残基で構成される。場合によっては、非高頻度可変性若しくはフレームワーク領域（ＦＲ）由来の残基が抗体結合部位に関与する可能性があったり、又は全体的なドメイン構造、ひいては結合部位に影響を及ぼす可能性があったりする。相補性決定領域又はＣＤＲは、一緒になって、天然のイムノグロブリン結合部位の天然Ｆｖ領域の結合親和性及び特異性を規定するアミノ酸配列を指す。イムノグロブリンの軽鎖及び重鎖は、それぞれ、Ｌ－ＣＤＲ１、Ｌ－ＣＤＲ２、Ｌ－ＣＤＲ３及びＨ－ＣＤＲ１、Ｈ－ＣＤＲ２、Ｈ－ＣＤＲ３と称する、三つのＣＤＲを有する。したがって、抗原結合部位は、典型的には、重及び軽鎖Ｖ領域の各々から設定されたＣＤＲを含む、六つのＣＤＲを含む。フレームワーク領域（ＦＲ）は、ＣＤＲ間に挿入されたアミノ酸配列を指す。したがって、軽鎖及び重鎖の可変領域は、典型的には、以下の配列の四つのフレームワーク領域と三つのＣＤＲとを含む：ＦＲ１－ＣＤＲ１－ＦＲ２－ＣＤＲ２－ＦＲ３－ＣＤＲ３－ＦＲ４。抗体可変ドメイン中の残基は、Ｋａｂａｔらによって考案されたシステムにしたがって慣例的に採番される。このシステムは、Ｋａｂａｔら、１９８７、Ｓｅｑｕｅｎｃｅｓ ｏｆ Ｐｒｏｔｅｉｎｓ ｏｆ Ｉｍｍｕｎｏｌｏｇｉｃａｌ Ｉｎｔｅｒｅｓｔ、ＵＳ Ｄｅｐａｒｔｍｅｎｔ ｏｆ Ｈｅａｌｔｈ ａｎｄ Ｈｕｍａｎ Ｓｅｒｖｉｃｅｓ、ＮＩＨ、ＵＳＡ（Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．、１９９２、以下、「Ｋａｂａｔ ｅｔ ａｌ．」）に記載されている。Ｋａｂａｔ残基の表記は、ＳＥＱ ＩＤ配列内のアミノ酸残基の線形ナンバリング（ｌｉｎｅａｒ ｎｕｍｂｅｒｉｎｇ）と必ずしも直接的に対応するとは限らない。実際の直鎖アミノ酸配列は、基本的可変ドメイン構造のフレームワーク又は相補性決定領域（ＣＤＲ）のいずれであっても、構造成分の短縮又は構造成分への挿入に対応する厳密なＫａｂａｔナンバリングよりも少ないアミノ酸又は追加のアミノ酸を含み得る。残基の正しいＫａｂａｔナンバリングは、「標準的」Ｋａｂａｔ採番配列と抗体の配列における相同性の残基のアラインメントにより所定の抗体について決定できる。重鎖可変ドメインのＣＤＲは、Ｋａｂａｔナンバリングシステムによると、残基３１～３５（Ｈ－ＣＤＲ１）、残基５０～６５（Ｈ－ＣＤＲ２）及び残基９５～１０２（Ｈ－ＣＤＲ３）に位置する。軽鎖可変ドメインのＣＤＲは、Ｋａｂａｔナンバリングシステムによると、残基２４～３４（Ｌ－ＣＤＲ１）、残基５０～５６（Ｌ－ＣＤＲ２）及び残基８９～９７（Ｌ－ＣＤＲ３）に位置する。以下で記載するアゴニスト抗体について、ＣＤＲは、ｗｗｗ．ｂｉｏｉｎｆ．ｏｒｇ．ｕｋからのＣＤＲ検索アルゴリズムを用いて決定される。抗体のページの表題「配列を見てＣＤＲを特定する方法」のセクションを参照。
【0034】
本明細書で使用する場合、「イムノグロブリンドメイン」という語は、抗体鎖（例えば、重鎖抗体鎖若しくは軽鎖）の球状領域、又はそのような球状領域から本質的になるポリペプチドを指す。
【0035】
本明細書で使用する場合、「Ｆｃ領域」という語は、天然配列Ｆｃ領域及び変異Ｆｃ領域を含む、イムノグロブリン重鎖のＣ末端領域を定義するために使用される。ヒトＩｇＧ重鎖Ｆｃ領域は、一般的に、ＩｇＧ抗体のＣ２２６位又はＰ２３０位からカルボキシル末端までのアミノ酸残基を含むと定義される。Ｆｃ領域における残基のナンバリングは、ＫａｂａｔのＥＵ指数のナンバリングである。Ｆｃ領域のＣ末端リジン（残基Ｋ４４７）は、例えば、抗体の産生又は精製中に除去され得る。したがって、本発明の抗体組成物は、全てのＫ４４７残基が除去された抗体集団、Ｋ４４７残基が除去されていない抗体集団、及びＫ４４７残基を有する抗体とＫ４４７残基を有さない抗体との混合物を有する抗体集団を含み得る。
【0036】
本明細書で使用する場合、「キメラ抗体」という語は、非ヒト抗体のＶＨドメイン及びＶＬドメインと、ヒト抗体のＣＨドメイン及びＣＬドメインとを含む抗体を指す。一実施形態において、「キメラ抗体」は、（ａ）抗原結合部位（可変領域）が、異なるか若しくは改変されたクラス、エフェクター機能及び／又は種、或いはキメラ抗体に新しい特性を付与する全く異なる分子、例えば、酵素、毒素、アゴニスト分子、例えば、ＣＤ４０リガンド、ホルモン、成長因子、薬物などの定常領域に結合するように、定常領域（すなわち、重鎖及び／又は軽鎖）、又はその一部が変更、置換、又は交換されている；或いは（ｂ）可変領域、又はその一部が、異なるか又は改変された抗原特異性を有する可変領域と変更、置換、又は交換されている、抗体分子である。キメラ抗体には、霊長類化（ｐｒｉｍａｔｉｚｅｄ）、特に、ヒト化抗体も含まれる。さらに、キメラ抗体は、レシピエント抗体又はドナー抗体で見られない残基を含み得る。これらの修飾は、抗体性能をさらに改良するためになされる。さらなる詳細については、Ｊｏｎｅｓ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３２１：５２２－５２５（１９８６）；Ｒｉｅｃｈｍａｎｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔｕｒｅ ３３２：３２３－３２９（１９８８）；及びＰｒｅｓｔａ，Ｃｕｒｒ．Ｏｐ．Ｓｔｒｕｃｔ．Ｂｉｏｌ．２：５９３－５９６（１９９２）を参照のこと。（米国特許第４，８１６，５６７号；及びＭｏｒｒｉｓｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ，８１：６８５１－６８５５（１９８４）を参照）。
【0037】
本明細書で使用する場合、「ヒト化抗体」という語には、マウス抗体の六つのＣＤＲを有するが、ヒト化フレームワーク及び定常領域も有する抗体が含まれる。さらに具体的には、「ヒト化抗体」という語には、本明細書において使用する場合、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖系列由来のＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列にグラフトされた抗体も含まれ得る。
【0038】
本明細書において使用する場合、「ヒトモノクローナル抗体」という語は、ヒトイムノグロブリン配列由来の可変領域及び定常領域を有する抗体を含むことが意図される。本発明のヒト抗体は、ヒトイムノグロブリン配列によってコード化されていないアミノ酸残基（例えば、インビトロでのランダム若しくは部位特異的変異誘発によるか、又はインビボでの体細胞変異によって導入された変異）を含み得る。しかしながら、一実施形態では、「ヒトモノクローナル抗体」という語は、本明細書において使用する場合、マウスなどの別の哺乳動物種の生殖系列由来のＣＤＲ配列がヒトフレームワーク配列にグラフトされた抗体を含むことを意図しない。
【0039】
本明細書で使用する場合、「免疫応答」という語は、宿主の体内での抗原に対する免疫系の反応を指し、抗原特異的抗体及び／又は細胞性細胞傷害応答の生成を含む。初回抗原曝露に対する免疫応答（一次免疫応答）は、典型的には、数日から二週間までの遅延期後に検出可能であり、同じ抗原によるその後の刺激に対する免疫応答（二次免疫応答）は、一次免疫応答の場合よりも急速である。導入遺伝子産物に対する免疫応答は、導入遺伝子によってコード化される免疫原性産物に対して誘発され得る液性免疫応答（例えば、抗体応答）及び細胞性免疫応答（例えば、細胞溶解性Ｔ細胞応答）の両方を含み得る。免疫応答のレベルは、当該技術分野で公知の方法によって（例えば、抗体価を測定することによって）測定することができる。
【0040】
本明細書において使用する場合、「ＡＰＣ」又は「抗原提示細胞」という語は、Ｔ細胞を活性化できる細胞を指し、特定のマクロファージ、Ｂ細胞及び樹状細胞が挙げられるが、これらに限定されるものではない。
【0041】
本明細書で使用する場合、「樹状細胞」又は「ＤＣ」という語は、リンパ様又は非リンパ様組織で見られる形態学的に類似した細胞型の多様な集団の任意のメンバーを指す。これらの細胞は、それらの特徴的な形態、高レベルの表面ＭＨＣ－クラスＩＩ発現によって特徴づけられる（Ｓｔｅｉｎｍａｎ，ｅｔ ａｌ．，Ａｎｎ．Ｒｅｖ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．９：２７１（１９９１）；このような細胞に関する記載は参照により本明細書に組み込まれる）。
【0042】
本明細書で使用する場合、「ＣＤ４０」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、ヒトＣＤ４０ポリペプチド受容体を指す。いくつかの実施形態において、ＣＤ４０は、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ－Ｐ２５９４２によって報告されたヒトカノニカル配列のアイソフォームである（ヒトＴＮＲ５とも称する）。
【0043】
本明細書で使用する場合、「ＣＤ４０アゴニスト抗体」という語は、Ｂ細胞増殖アッセイなどの細胞ベースのアッセイにおいてＣＤ４０Ｌの非存在下で、ＣＤ４０媒介性シグナル伝達活性を増加させる抗体を指すことが意図される。特に、ＣＤ４０アゴニスト抗体は、（ｉ）フローサイトメトリ分析によるか又はＣＦＳＥ標識細胞の複製希釈（ｒｅｐｌｉｃａｔｉｖｅ ｄｉｌｕｔｉｏｎ）の分析によってインビトロで測定されるように、Ｂ細胞の増殖を誘導する；及び／又は（ｉｉ）樹状細胞活性化アッセイで、インビトロで測定されるように、ＩＬ－６、ＩＬ－１２、又はＩＬ－１５などのサイトカインの分泌を誘導する。
【0044】
本明細書で使用する場合、「ランゲリン（Ｌａｎｇｅｒｉｎ）」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、ヒトＣ型レクチンドメインファミリー４メンバーＫポリペプチドを指す。いくつかの実施形態において、ランゲリンは、ＵｎｉＰｒｏｔＫＢ－Ｑ９ＵＪ７１によって報告されたヒトカノニカル配列のアイソフォーム（ヒトＣＤ２０７とも称する）である。
【0045】
本明細書で使用する場合、「対象」又は「それを必要とする対象」という語は、ヒト又はヒト以外の哺乳動物を意図する。典型的には、患者は、サルベコウイルスに冒されているか、又はサルベコウイルスに感染している可能性が高い。
【0046】
本明細書で使用する場合、「Ｃｏｖｉｄ－１９」という語は、重症急性呼吸器症候群コロナウイルス２及びその変異体によって誘導される呼吸器疾患を指す。
【0047】
本明細書で使用する場合、「無症状」という語は、コロナウイルス感染症の検出可能な症状を経験していない対象を指す。本明細書で使用する場合、「症候性」という語は、コロナウイルス感染症の検出可能な症状を経験している対象を指す。コロナウイルス感染症の症状としては、疲労、無嗅覚、頭痛、咳、熱、呼吸困難が挙げられる。
【0048】
本明細書で使用する場合、「治療」又は「治療する」という語は、疾患に罹患するリスクがあるか、又は疾患に罹患した疑いのある患者、並びに病気であるか、又は疾患若しくは身体疾患を患っていると診断された患者の治療を含む、予防的（ｐｒｏｐｈｙｌａｃｔｉｃ又はｐｒｅｖｅｎｔｉｖｅ）治療並びに治癒的又は疾患改変治療の両方を指し、臨床的再発の抑制を含む。治療は、医学的障害を有するか、又は最終的に障害を獲得する可能性のある患者に対して、障害若しくは障害の再発の予防、治癒、発症の遅延、重症度の軽減、若しくは一つ以上の症状の改善のために、又はそのような治療を行わない場合に予想されるよりも患者の生存率を延長するために、施すことができる。「治療レジメン」とは、疾患の治療パターン、例えば、治療中に使用される投薬パターンを意味する。治療レジメンには、誘導レジメン及び維持レジメンが含まれ得る。「誘導レジメン」又は「誘導期間」という語句は、疾患の初期治療に使用される治療レジメン（又は治療レジメンの一部）を指す。誘導レジメンの一般的な目標は、治療レジメンの初期期間中に高レベルの薬物を患者に提供することである。誘導レジメンは、（部分的又は全体的に）「負荷レジメン」（ｌｏａｄｉｎｇ ｒｅｇｉｍｅｎ）を採用することができ、これには、維持レジメン中に医師が採用するよりも多量の薬剤を投与すること、維持レジメン中に医師が薬物を投与するよりも頻繁に薬物を投与すること、またはその両方が含まれる。「維持レジメン」又は「維持期間」という語句は、病気の治療中に患者の維持のために使用される治療レジメン（又は治療レジメンの一部）であって、例えば、患者を長期間（数カ月又は数年）寛解状態に保つために使用されるものを指す。維持レジメンは、持続療法（例えば、毎週、毎月、毎年など、一定間隔で薬物を投与する）又は間欠療法（例えば、断続的治療、間欠式治療、再発時治療、若しくは特定の所定の基準［例えば、痛み、疾患の症候など］を達成した際の治療）を採用することができる。
【0049】
本明細書で使用する場合、「医薬組成物」という語は、本明細書中に記載する組成物、又はその医薬的に許容される塩と、担体及び／又は賦形剤などの他の薬剤を指す。本明細書で提供される医薬組成物は、典型的には、医薬的に許容される担体を含む。
【0050】
本明細書で使用する場合、「医薬的に許容される担体」という語には、所望の特定の剤形に適した、あらゆる溶媒、希釈剤、又は他の液体ビヒクル、分散若しくは懸濁助剤、界面活性剤、等張剤、増粘剤若しくは乳化剤、防腐剤、固体結合剤、潤滑剤などが含まれる。Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ－Ｓｃｉｅｎｃｅｓ， Ｓｉｘｔｅｅｎｔｈ Ｅｄｉｔｉｏｎ，Ｅ．Ｗ．Ｍａｒｔｉｎ（Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏ．，Ｅａｓｔｏｎ，Ｐａ．，１９８０）は、医薬組成物の処方で用いられる様々な担体と、その調製のための公知技術を開示している。
【0051】
本明細書で使用する場合、「ワクチン接種」又は「ワクチン接種する」という語は、特定の抗原に対して対象内で免疫応答を惹起するプロセスを意味するが、これに限定されるものではない。
【0052】
本明細書で使用する場合、「ワクチン組成物」という語は、免疫系応答を誘導するためにヒト又は動物に対して投与できる組成物を意味することが意図され；この免疫系応答は、ある特定の細胞、特に、ＡＰＣ、Ｔリンパ球及びＢリンパ球の活性化をもたらすことができる。
【0053】
本明細書において使用する場合、「抗原」という語は、ＭＨＣ分子によって処理され提示された場合、抗体又はＴ細胞受容体（ＴＣＲ）によって特異的に結合させることができる分子を指す。抗原はさらに、免疫系によって認識することができ、及び／又は液性免疫応答及び／又は細胞性免疫応答を誘導して、Ｂリンパ球及び／又はＴリンパ球の活性化をもたらすことができる。抗原は、一つ以上のエピトープ又は抗原部位（Ｂエピトープ及びＴエピトープ）を有し得る。
【0054】
本明細書で使用する場合、「アジュバント」という語は、対象又は動物に投与された場合に、抗原に対する免疫応答を誘導及び／又は増強できる化合物を指す。また、一般的には、特定の抗原に対する特異的免疫応答を加速、延長、または質を高めるように作用する物質を意味することが意図される。本発明の文脈では、「アジュバント」という語は、自然免疫応答の一過性反応影響を及ぼすことによって自然免疫応答を増強し、かつ抗原提示細胞（ＡＰＣ）、特に、樹状細胞（ＤＣ）の活性化及び成熟化によって適応免疫応答のより長続きする効果を増強する化合物を意味する。
【0055】
本明細書で使用する場合、「治療上有効量」という表現は、医学的処置に適用可能な妥当な損益比で免疫応答を誘導するのに十分な本発明の活性成分の量を意味する。
【0056】
本明細書で使用する場合、「免疫チェックポイント阻害剤」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、免疫阻害性チェックポイントタンパク質の機能を阻害する任意の化合物を指す。本明細書において使用する場合、「免疫チェックポイントタンパク質」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、シグナルの増強（刺激性チェックポイント分子）又はシグナルの低下（阻害性チェックポイント分子）のいずれかの点でＴ細胞によって発現される分子を指す。免疫チェックポイント分子は、当該技術分野では、ＣＴＬＡ－４及びＰＤ－１依存性経路に類似した免疫チェックポイント経路を構成すると認識されている（例えば、Ｐａｒｄｏｌｌ，２０１２．Ｎａｔｕｒｅ Ｒｅｖ Ｃａｎｃｅｒ １２：２５２－２６４；Ｍｅｌｌｍａｎ ｅｔ ａｌ．，２０１１．Ｎａｔｕｒｅ ４８０：４８０－４８９を参照）。阻害性チェックポイント分子の例としては、Ａ２ＡＲ、Ｂ７－Ｈ３、Ｂ７－Ｈ４、ＢＴＬＡ、ＣＴＬＡ－４、ＣＤ２７７、ＩＤＯ、ＫＩＲ、ＰＤ－１、ＬＡＧ－３、ＴＩＭ－３及びＶＩＳＴＡが挙げられる。
【0057】
本発明の抗体：
本発明の第一の目的は、抗原提示細胞の表面抗原に対する抗体に関し、
－重鎖は、Ｎｐｅｐ２ポリペプチドにコンジュゲート若しくは融合し、
－軽鎖は、
・Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド、又は、
・Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド
とコンジュゲート若しくは融合している。
本発明の第一の目的は、抗原提示細胞の表面抗原に対する抗体に関し、
－重鎖は、Ｎｐｅｐ２ポリペプチドにコンジュゲート若しくは融合し、
－軽鎖は、
・Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド、又は、
・Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異を含み、Ｃ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含むＲＢＤポリペプチド
とコンジュゲート若しくは融合している。
【0058】
いくつかの実施形態において、重鎖は、配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶアミノ酸配列からなるＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート又は融合している。
【0059】
いくつかの実施形態において、抗体は：
－配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶのアミノ酸配列からなるＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート又は融合した重鎖と、
－Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異並びにＣ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含む配列番号２の３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及ぶアミノ酸からなるＲＢＤポリペプチドとコンジュゲート又は融合した軽鎖と、
を含む。
－配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶのアミノ酸配列からなるＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート又は融合した重鎖と、
－Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｋ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異並びにＣ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含む配列番号２の３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及ぶアミノ酸からなるＲＢＤポリペプチドとコンジュゲート又は融合した軽鎖と、
を含む。
【0060】
いくつかの実施形態において、抗体は、
－配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶのアミノ酸配列からなるＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート又は融合した重鎖と、
－Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異並びにＣ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含む配列番号２の３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及ぶのアミノ酸からなるＲＢＤポリペプチドとコンジュゲート又は融合した軽鎖と、
を含む。
－配列番号１の２７６位の残基から４１１位の残基まで及ぶのアミノ酸配列からなるＮｐｅｐ２ポリペプチドとコンジュゲート又は融合した重鎖と、
－Ｋ４１７Ｎ、Ｌ４５２Ｒ、Ｔ４７８Ｋ、Ｅ４８４Ｑ、及びＮ５０１Ｙ自然発生突然変異並びにＣ５３８Ｓ非自然発生突然変異を含む配列番号２の３１９位のアミノ酸残基から５４１位のアミノ酸残基まで及ぶのアミノ酸からなるＲＢＤポリペプチドとコンジュゲート又は融合した軽鎖と、
を含む。
【0061】
いくつかの実施形態において、抗体は、ＩｇＧ抗体であり、好ましくはＩｇＧ１若しくはＩｇＧ４抗体であり、又はさらに好ましくはＩｇＧ４抗体である。
【0062】
いくつかの実施形態において、抗体は、キメラ抗体、特にキメラマウス／ヒト抗体である。
【0063】
いくつかの実施形態において、抗体はヒト化抗体である。
【0064】
キメラ又はヒト化抗体は、前記のように調製したマウスモノクローナル抗体の配列に基づいて調製できる。重鎖及び軽鎖イムノグロブリンをコード化するＤＮＡは、関心対象のマウスハイブリドーマから得ることができ、標準的分子生物学技術を使用して非マウス（例えば、ヒト）イムノグロブリン配列を含むように操作できる。例えば、キメラ抗体を作製するために、マウス可変領域は、当該技術分野で公知の方法を用いてヒト定常領域に連結できる（例えば、Ｃａｂｉｌｌｙらの米国特許第４，８１６，５６７号を参照）。ヒト化抗体を作製するために、当該技術分野で公知の方法を用いてマウスＣＤＲ領域をヒトフレームワークに挿入できる。例えば、Ｗｉｎｔｅｒの米国特許第５，２２５，５３９号、並びにＱｕｅｅｎらの米国特許第５，５３０，１０１号；同第５，５８５，０８９号；同第５，６９３，７６２号及び同第６，１８０，３７０号を参照のこと。
【0065】
いくつかの実施形態において、抗体はヒト抗体である。
【0066】
ヒト抗体は、マウス免疫系ではなくヒト免疫系の一部を有する遺伝子導入マウス又は染色体導入マウスを用いて特定できる。これらの遺伝子導入マウス及び染色体導入マウスには、本明細書でそれぞれＨｕＭＡｂマウス及びＫＭマウスと称するマウスが含まれ、本明細書では「ヒトＩｇマウス」と総称する。ＨｕＭＡｂマウス（登録商標）（Ｍｅｄａｒｅｘ，Ｉｎｃ．）は、内因性μ及びκ鎖座位を不活性化する標的化変異とともに、未再配列ヒト重鎖（μ及びγ）並びにκ軽鎖イムノグロブリン配列をコード化するヒトイムノグロブリン遺伝子ミニ座位を含む（例えば、Ｌｏｎｂｅｒｇ，ｅｔ ａｌ．，１９９４ Ｎａｔｕｒｅ ３６８（６４７４）：８５６－８５９を参照）。別の実施形態において、ヒト抗ＰＤ－１抗体は、ヒト重鎖導入遺伝子及びヒト軽鎖導入染色体を有するマウスなど、導入遺伝子及び導入染色体上にヒトイムノグロブリン配列を有するマウスを用いて作製できる。このようなマウスは、本明細書で「ＫＭマウス」と称するが、ＩｓｈｉｄａらのＰＣＴ公開ＷＯ０２／４３４７８に詳細に記載されている。
【0067】
いくつかの実施形態において、抗体はプロフェッショナルＡＰＣの細胞表面マーカーに対して特異的である。抗体は、Ｂ細胞又はマクロファージなどの別のプロフェッショナルＡＰＣの細胞表面マーカーに対して特異的であり得る。
【0068】
いくつかの実施形態において、抗体は、ＤＣ免疫受容体（ＤＣＩＲ）、ＭＨＣクラスＩ、ＭＨＣクラスＩＩ、ＣＤ１、ＣＤ２、ＣＤ３、ＣＤ４、ＣＤ８、ＣＤ１１ｂ、ＣＤ１４、ＣＤ１５、ＣＤ１６、ＣＤ１９、ＣＤ２０、ＣＤ２９、ＣＤ３１、ＣＤ４０、ＣＤ４３、ＣＤ４４、ＣＤ４５、ＣＤ５４、ＣＤ５６、ＣＤ５７、ＣＤ５８、ＣＤ８３、ＣＤ８６、ＣＭＲＦ－４４、ＣＭＲＦ－５６、ＤＣＩＲ、ＤＣ－ＡＳＰＧＲ、ＣＬＥＣ－６、ＣＤ４０、ＢＤＣＡ－２、ＭＡＲＣＯ、ＤＥＣ－２０５、マンノース受容体、ランゲリン、ＤＥＣＴＩＮ－１、Ｂ７－１、Ｂ７－２、ＩＦＮ－γ受容体及びＩＬ－２受容体、ＩＣＡＭ－１、Ｆｅｙ受容体、ＬＯＸ－１、及びＡＳＰＧＲと特異的に結合する抗体から選択される。
【0069】
いくつかの実施形態では、抗体はＣＤ４０に対して特異的である。
【0070】
いくつかの実施形態において、抗ＣＤ４０抗体は１２Ｅ１２抗体由来であり、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈはアミノ酸配列ＧＦＴＦＳＤＹＹＭＹ（配列番号３）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈはアミノ酸配列ＹＩＮＳＧＧＧＳＴＹＹＰＤＴＶＫＧ（配列番号４）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈはアミノ酸配列ＲＧＬＰＦＨＡＭＤＹ（配列番号５）を有する、重鎖と、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌはアミノ酸配列ＳＡＳＱＧＩＳＮＹＬＮ（配列番号６）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌはアミノ酸配列ＹＴＳＩＬＨＳ（配列番号７）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌはアミノ酸配列ＱＱＦＮＫＬＰＰＴ（配列番号８）を有する、軽鎖と
を含む。
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈはアミノ酸配列ＧＦＴＦＳＤＹＹＭＹ（配列番号３）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈはアミノ酸配列ＹＩＮＳＧＧＧＳＴＹＹＰＤＴＶＫＧ（配列番号４）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈはアミノ酸配列ＲＧＬＰＦＨＡＭＤＹ（配列番号５）を有する、重鎖と、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌはアミノ酸配列ＳＡＳＱＧＩＳＮＹＬＮ（配列番号６）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌはアミノ酸配列ＹＴＳＩＬＨＳ（配列番号７）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌはアミノ酸配列ＱＱＦＮＫＬＰＰＴ（配列番号８）を有する、軽鎖と
を含む。
【0071】
いくつかの実施形態において、抗ＣＤ４０抗体は１１Ｂ６抗体由来であり、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈはアミノ酸配列ＧＹＳＦＴＧＹＹＭＨ（配列番号９）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈはアミノ酸配列ＲＩＮＰＹＮＧＡＴＳＹＮＱＮＦＫＤ（配列番号１０）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈはアミノ酸配列ＥＤＹＶＹ（配列番号１１）を有する、重鎖と、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌはアミノ酸配列ＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＨ（配列番号１２）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌはアミノ酸配列ＫＶＳＮＲＦＳ（配列番号１３）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌはアミノ酸配列ＳＱＳＴＨＶＰＷＴ（配列番号１４）を有する、軽鎖と
を含む。
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈはアミノ酸配列ＧＹＳＦＴＧＹＹＭＨ（配列番号９）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈはアミノ酸配列ＲＩＮＰＹＮＧＡＴＳＹＮＱＮＦＫＤ（配列番号１０）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈはアミノ酸配列ＥＤＹＶＹ（配列番号１１）を有する、重鎖と、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌはアミノ酸配列ＲＳＳＱＳＬＶＨＳＮＧＮＴＹＬＨ（配列番号１２）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌはアミノ酸配列ＫＶＳＮＲＦＳ（配列番号１３）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌはアミノ酸配列ＳＱＳＴＨＶＰＷＴ（配列番号１４）を有する、軽鎖と
を含む。
【0072】
いくつかの実施形態において、抗ＣＤ４０抗体は１２Ｂ４抗体由来であり、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈはアミノ酸配列ＧＹＴＦＴＤＹＶＬＨ（配列番号１５）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈはアミノ酸配列ＹＩＮＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号１６）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈはアミノ酸配列ＧＹＰＡＹＳＧＹＡＭＤＹ（配列番号１７）を有する、重鎖と、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌはアミノ酸配列ＲＡＳＱＤＩＳＮＹＬＮ（配列番号１８）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌはアミノ酸配列ＹＴＳＲＬＨＳ（配列番号１９）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌはアミノ酸配列ＨＨＧＮＴＬＰＷＴ（配列番号２０）を有する、軽鎖と、
を含む。
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｈはアミノ酸配列ＧＹＴＦＴＤＹＶＬＨ（配列番号１５）を有し、前記ＣＤＲ２Ｈはアミノ酸配列ＹＩＮＰＹＮＤＧＴＫＹＮＥＫＦＫＧ（配列番号１６）を有し、前記ＣＤＲ３Ｈはアミノ酸配列ＧＹＰＡＹＳＧＹＡＭＤＹ（配列番号１７）を有する、重鎖と、
－相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖であって、前記ＣＤＲ１Ｌはアミノ酸配列ＲＡＳＱＤＩＳＮＹＬＮ（配列番号１８）を有し、前記ＣＤＲ２Ｌはアミノ酸配列ＹＴＳＲＬＨＳ（配列番号１９）を有し、前記ＣＤＲ３Ｌはアミノ酸配列ＨＨＧＮＴＬＰＷＴ（配列番号２０）を有する、軽鎖と、
を含む。
【0073】
いくつかの実施形態において、抗ＣＤ４０抗体は、表Ａに記載するｍＡｂ１、ｍＡｂ２、ｍＡｂ３、ｍＡｂ４、ｍＡｂ５及びｍＡｂ６からなる群から選択される。
【0074】
【表3】
【0075】
【表4】
【0076】
いくつかの実施形態において、抗ＣＤ４０抗体は、
－可変ドメインが配列番号２１に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２２に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２３に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２２に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２４に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２５に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２６に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２７に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２８に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２９に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、及び
－可変ドメインが配列番号３０に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号３１に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体
からなる群から選択される。
－可変ドメインが配列番号２１に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２２に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２３に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２２に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２４に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２５に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２６に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２７に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号２８に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号２９に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、及び
－可変ドメインが配列番号３０に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号３１に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体
からなる群から選択される。
【0077】
いくつかの実施形態において、抗ＣＤ４０抗体はＣＤ４０アゴニスト抗体である。ＣＤ４０アゴニスト抗体は、ＷＯ２０１０／００９３４６、ＷＯ２０１０／１０４７４７及びＷＯ２０１０／１０４７４９に記載されている。開発中の他の抗ＣＤ４０アゴニスト抗体には、Ｐｆｉｚｅｒにより開発された完全ヒトＩｇＧ２ＣＤ４０アゴニスト抗体であるＣＰ－８７０，８９３が含まれる。これは、３．４８×１０－１０ＭのＫＤでＣＤ４０と結合するが、ＣＤ４０Ｌ（例えば、米国特許第７，３３８，６６０号参照）及び免疫原としてヒト膀胱がん細胞株を使用して生成された、マウス抗体クローンＳ２Ｃ６からＳｅａｔｔｌｅ Ｇｅｎｅｔｉｃｓによって開発されたヒト化ＩｇＧ１抗体であるＳＧＮ－４０の結合をブロックしない。これは、１．０×１０－９ＭのＫＤでＣＤ４０と結合し、ＣＤ４０とＣＤ４０Ｌとの間の相互作用を増強することによって作用して、部分アゴニスト効果を示す（Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ Ｊ Ａ，ｅｔ ａｌ．，Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ，６０：３２２５－３１，２０００）。さらに詳細には、ＣＤ４０アゴニスト抗体は、表Ａに記載するような選択されたｍＡｂ１、ｍＡｂ２、ｍＡｂ３、ｍＡｂ４、ｍＡｂ５及びｍＡｂ６からなる群から選択される。
【0078】
いくつかの実施形態では、抗体はランゲリンに対して特異的である。いくつかの実施形態では、抗体は、ＡＴＣＣ受入番号ＰＴＡ－９８５２の抗体１５Ｂ１０に由来する。いくつかの実施形態では、抗体は、ＡＴＣＣ受入番号ＰＴＡ－９８５３の抗体２Ｇ３に由来する。いくつかの実施形態では、抗体は、ＷＯ２０１１０３２１６１に記載されているような抗体９１Ｅ７、３７Ｃ１、又は４Ｃ７に由来する。
【0079】
いくつかの実施形態において、抗ランゲリン抗体は、１５Ｂ１０抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖と、１５Ｂ１０抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖とを含む。
【0080】
いくつかの実施形態において、抗ランゲリン抗体は、２Ｇ３抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖と、２Ｇ３抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖とを含む。
【0081】
いくつかの実施形態において、抗ランゲリン抗体は、４Ｃ７抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｈ、ＣＤＲ２Ｈ、及びＣＤＲ３Ｈを含む重鎖と、４Ｃ７抗体の相補性決定領域ＣＤＲ１Ｌ、ＣＤＲ２Ｌ、及びＣＤＲ３Ｌを含む軽鎖とを含む。
【0082】
いくつかの実施形態において、抗ランゲリン抗体は、表Ｂに記載するような選択されたｍＡｂ７、ｍＡｂ８、ｍＡｂ９からなる群から選択される。
【0083】
【表5】
【0084】
【表6】
【0085】
いくつかの実施形態において、抗ランゲリン抗体は、
－可変ドメインが配列番号３２に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号３３に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号３４に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号３５に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、及び
－配列番号３６に記載する配列を有する重鎖と、配列番号３７に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体
からなる群から選択される。
－可変ドメインが配列番号３２に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号３３に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、
－可変ドメインが配列番号３４に記載する配列を有する重鎖と、可変ドメインが配列番号３５に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体、及び
－配列番号３６に記載する配列を有する重鎖と、配列番号３７に記載する配列を有する軽鎖とを含む抗体
からなる群から選択される。
【0086】
本発明の抗体は、限定されるものではないが、任意の化学的、生物学的、遺伝子的、又は酵素的技術など、当該技術分野でそれ自体公知の任意の技術の、単独又は組み合わせのいずれかによって、産生することができる。所望の配列のアミノ酸配列を知ることで、当業者は、ポリペプチドを産生するための標準的技術によって、前記ポリペプチドを容易に産生できる。例えば、本発明の抗体は、当該技術分野で現在周知のように、組換えＤＮＡ技術によって合成できる。例えば、これらのフラグメントは、所望の（ポリ）ペプチドをコード化するＤＮＡ配列を発現ベクターに組込み、かかるベクターを所望のポリペプチドを発現する好適な真核又は原核宿主に導入した後に、ＤＮＡ発現産物として得ることができ、そこから後に周知の技術を用いて単離できる。
【0087】
いくつかの実施形態では、軽鎖は、そのＣ末端を介してＲＢＤポリペプチドにコンジュゲート又は融合される。いくつかの実施形態では、抗体の軽鎖は、ＲＢＤポリペプチドのＮ末端に融合される。
【0088】
いくつかの実施形態では、重鎖は、そのＣ末端を介してＮｐｅｐ２ポリペプチドにコンジュゲート又は融合される。いくつかの実施形態では、抗体の重鎖は、Ｎｐｅｐ２ポリペプチドのＮ末端に融合される。
【0089】
いくつかの実施形態において、抗体の重鎖及び／又は軽鎖は、化学的カップリングを使用することにより、ＲＢＤポリペプチドにコンジュゲートされる。抗体をそのコンジュゲート部分に付着又はコンジュゲートさせるための方法が当該技術分野ではいくつか知られている。部分を抗体にコンジュゲートさせるために使用されてきたリンカーの種類の例としては、限定されるものではないが、ヒドラゾン、チオエーテル、エステル、ジスルフィド及びペプチド含有リンカー、例えば、バリン－シトルリンリンカーが挙げられる。例えば、リソソーム区画内の低ｐＨによる切断を受けやすいリンカー、又はカテプシン（例えば、カテプシンＢ、Ｃ、Ｄ）などの腫瘍組織で優先的に発現されるプロテアーゼなどのプロテアーゼによる切断を受けやすいリンカーを選択できる。ポリペプチドをコンジュゲートするための技術は特に当該技術分野では周知である（例えば、Ａｒｎｏｎ ｅｔ ａｌ．，“Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｉｍｍｕｎｏｔａｒｇｅｔｉｎｇ Ｏｆ Ｄｒｕｇｓ Ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，”ｉｎ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ａｎｄ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ（Ｒｅｉｓｆｅｌｄ ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，Ａｌａｎ Ｒ．Ｌｉｓｓ，Ｉｎｃ．，１９８５）；Ｈｅｌｌｓｔｒｏｍ ｅｔ ａｌ．，“Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ，”ｉｎ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ （Ｒｏｂｉｎｓｏｎ ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｉｋｅｒ，Ｉｎｃ．， ２ｎｄ ｅｄ．１９８７）；Ｔｈｏｒｐｅ，“Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｃａｒｒｉｅｒｓ Ｏｆ Ｃｙｔｏｔｏｘｉｃ Ａｇｅｎｔｓ Ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ：Ａ Ｒｅｖｉｅｗ，”ｉｎ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ’８４：Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ Ａｎｄ Ｃｌｉｎｉｃａｌ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ（Ｐｉｎｃｈｅｒａ ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，１９８５）；“Ａｎａｌｙｓｉｓ，Ｒｅｓｕｌｔｓ，ａｎｄ Ｆｕｔｕｒｅ Ｐｒｏｓｐｅｃｔｉｖｅ ｏｆ ｔｈｅ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｕｓｅ ｏｆ Ｒａｄｉｏｌａｂｅｌｅｄ Ａｎｔｉｂｏｄｙ Ｉｎ Ｃａｎｃｅｒ Ｔｈｅｒａｐｙ，”ｉｎ Ｍｏｎｏｃｌｏｎａｌ Ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ Ｆｏｒ Ｃａｎｃｅｒ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ Ａｎｄ Ｔｈｅｒａｐｙ（Ｂａｌｄｗｉｎ ｅｔ ａｌ．ｅｄｓ．，Ａｃａｄｅｍｉｃ Ｐｒｅｓｓ，１９８５）；及びＴｈｏｒｐｅ ｅｔ ａｌ．，１９８２，Ｉｍｍｕｎｏｌ．Ｒｅｖ．６２：１１９－５８を参照；また、例えば、ＰＣＴ公開ＷＯ８９／１２６２４も参照）。典型的には、ペプチドは、それぞれ、Ｎ－ヒドロキシスクシンイミドエステル又はマレイミド官能基を介して、抗体上のリジン又はシステイン残基に共有結合している。改変システインを使用したコンジュゲーション又は非天然アミノ酸の組込みの方法は、コンジュゲートの均一性を改善することが報告されている（Ａｘｕｐ，Ｊ．Ｙ．，Ｂａｊｊｕｒｉ，Ｋ．Ｍ．，Ｒｉｔｌａｎｄ，Ｍ．，Ｈｕｔｃｈｉｎｓ，Ｂ．Ｍ．，Ｋｉｍ，Ｃ．Ｈ．，Ｋａｚａｎｅ，Ｓ．Ａ．，Ｈａｌｄｅｒ，Ｒ．，Ｆｏｒｓｙｔｈ，Ｊ．Ｓ．，Ｓａｎｔｉｄｒｉａｎ，Ａ．Ｆ．，Ｓｔａｆｉｎ，Ｋ．，ｅｔ ａｌ．（２０１２）．Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ ｏｆ ｓｉｔｅ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ａｎｔｉｂｏｄｙ－ｄｒｕｇ ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ ｕｓｉｎｇ ｕｎｎａｔｕｒａｌ ａｍｉｎｏ ａｃｉｄｓ．Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ １０９，１６１０１－１６１０６．；Ｊｕｎｕｔｕｌａ，Ｊ．Ｒ．，Ｆｌａｇｅｌｌａ， Ｋ．Ｍ．，Ｇｒａｈａｍ，Ｒ．Ａ．，Ｐａｒｓｏｎｓ，Ｋ．Ｌ．，Ｈａ，Ｅ．，Ｒａａｂ，Ｈ．，Ｂｈａｋｔａ，Ｓ．，Ｎｇｕｙｅｎ，Ｔ．，Ｄｕｇｇｅｒ，Ｄ．Ｌ．，Ｌｉ，Ｇ．，ｅｔ ａｌ．（２０１０）．Ｅｎｇｉｎｅｅｒｅｄ ｔｈｉｏ－ｔｒａｓｔｕｚｕｍａｂ－ＤＭ１ ｃｏｎｊｕｇａｔｅ ｗｉｔｈ ａｎ ｉｍｐｒｏｖｅｄ ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ ｉｎｄｅｘ ｔｏ ｔａｒｇｅｔ ｈｕｍａｎ ｅｐｉｄｅｒｍａｌ ｇｒｏｗｔｈ ｆａｃｔｏｒ ｒｅｃｅｐｔｏｒ ２－ｐｏｓｉｔｉｖｅ ｂｒｅａｓｔ ｃａｎｃｅｒ．Ｃｌｉｎ．Ｃａｎｃｅｒ Ｒｅｓ．１６，４７６９－４７７８）。Ｊｕｎｕｔｕｌａら（Ｎａｔ Ｂｉｏｔｅｃｈｎｏｌ．２００８；２６：９２５－３２）は、従来のコンジュゲーション法と比較して治療指数の改善を示すとされる「ＴＨＩＯＭＡＢ」（ＴＤＣ）と呼ばれるシステインベースの部位特異的コンジュゲーションを開発した。抗体に組み込まれた非天然アミノ酸に対するコンジュゲーションもＡＤＣのために調査されているが、このアプローチの普遍性はまだ確立されていない（Ａｘｕｐ ｅｔ ａｌ．，２０１２）。特に当業者は、アシルドナーグルタミン含有タグ（例えば、Ｇｉｎ含有ペプチドタグ若しくはＱタグ）又はポリペプチド改変（例えば、ポリペプチド上のアミノ酸欠失、挿入、置換、又は変異を介する）によって反応性にされた内因性グルタミンで改変されたＦｃ含有ポリペプチドも想定できる。次いで、トランスグルタミナーゼは、アシルドナーグルタミン含有タグ又はアクセス可能／露出／反応性内因性グルタミンを介してＦｃ含有ポリペプチドに対して部位特異的にコンジュゲートされたアミンドナー剤（例えば、反応性アミンを含むか、又は反応性アミンに結合した小分子）と共有的に架橋して、改変Ｆｃ含有ポリペプチドコンジュゲートの安定かつ均一な集団を形成できる（ＷＯ２０１２０５９８８２）。
【0090】
いくつかの実施形態において、コンジュゲーションは、ＵＳ２０１６００３１９８８Ａ１及びＵＳ２０１２００３９９１６Ａ１で記載されているようなコヒーシン融合タンパク質に対する非共有カップリングを可能にするドッカリンドメイン又は複数のドメインによって行われる。
【0091】
いくつかの実施形態において、融合は、直接又はリンカーを介して行われる。本明細書で使用する場合、「直接的」という語は、第一ポリペプチドのＮ末端の第一アミノ酸が、第二ポリペプチドのＣ末端の最後のアミノ酸と融合していることを意味する。この直接融合は、（Ｖｉｇｎｅｒｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２００４，ＰＭＩＤ １５００１７１４）、（Ｗａｒｒｅｎ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２００６，ＰＭＩＤ １６９６０００８）、（Ｂｅｒｋｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１５ａ，ＰＭＩＤ ２６４０１０００）、（Ｂｅｒｋｅｒｓ ｅｔ ａｌ．，Ｊ．Ｉｍｍｕｎｏｌ．２０１５ｂ，ＰＭＩＤ ２６４０１００３）、（Ｄｅｌｏｎｇ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２０１６，ＰＭＩＤ ２６９１２８５８）（Ｌｉｅｐｅ ｅｔ ａｌ．，Ｓｃｉｅｎｃｅ ２０１６，ＰＭＩＤ ２７８４６５７２）、（Ｂａｂｏｎ ｅｔ ａｌ．，Ｎａｔ．Ｍｅｄ．２０１６，ＰＭＩＤ ２７７９８６１４）で記載されているように自然に起こり得る。
【0092】
いくつかの実施形態において、リンカーは、以下に記載するようにＦｌｅｘＶ１、ｆ１、ｆ２、ｆ３、又はｆ４からなる群から選択される。
【0093】
言い換えると、いくつかの実施形態において、リンカーは、配列番号３８、配列番号３９、配列番号４０、配列番号４１、及び配列番号４２からなる群から選択される。
ＱＴＰＴＮＴＩＳＶＴＰＴＮＮＳＴＰＴＮＮＳＮＰＫＰＮＰ（ｆｌｅｘＶ１、配列番号３８）
ＳＳＶＳＰＴＴＳＶＨＰＴＰＴＳＶＰＰＴＰＴＫＳＳＰ（ｆ１、配列番号３９）
ＰＴＳＴＰＡＤＳＳＴＩＴＰＴＡＴＰＴＡＴＰＴＩＫＧ（ｆ２、配列番号４０）
ＴＶＴＰＴＡＴＡＴＰＳＡＩＶＴＴＩＴＰＴＡＴＴＫＰ（ｆ３、配列番号４１）
ＴＮＧＳＩＴＶＡＡＴＡＰＴＶＴＰＴＶＮＡＴＰＳＡＡ（ｆ４、配列番号４２）
ＱＴＰＴＮＴＩＳＶＴＰＴＮＮＳＴＰＴＮＮＳＮＰＫＰＮＰ（ｆｌｅｘＶ１、配列番号３８）
ＳＳＶＳＰＴＴＳＶＨＰＴＰＴＳＶＰＰＴＰＴＫＳＳＰ（ｆ１、配列番号３９）
ＰＴＳＴＰＡＤＳＳＴＩＴＰＴＡＴＰＴＡＴＰＴＩＫＧ（ｆ２、配列番号４０）
ＴＶＴＰＴＡＴＡＴＰＳＡＩＶＴＴＩＴＰＴＡＴＴＫＰ（ｆ３、配列番号４１）
ＴＮＧＳＩＴＶＡＡＴＡＰＴＶＴＰＴＶＮＡＴＰＳＡＡ（ｆ４、配列番号４２）
【0094】
いくつかの実施形態において、本発明の融合タンパク質は、前記融合タンパク質をコードするポリヌクレオチド中に存在する制限クローニング部位に由来する一つ以上の配列をさらに含む。典型的には、前記配列は、二つのアミノ酸残基からなるものであってよく、典型的には、ＡＰ、ＡＳ、ＡＲ、ＰＲ、ＳＡ、ＴＲ、及びＴＳ配列を含む。
【0095】
いくつかの実施形態において、融合タンパク質はシグナルペプチドの配列を含む。本明細書で使用する場合、「シグナルペプチド」という語は、当該技術分野における一般的な意味を有し、タンパク質の前駆体形態上のＮ末端ペプチドとして存在するプレペプチドを指す。シグナルペプチドの機能は、それが結合している発現されたポリペプチドの小胞体への移行を促進することである。シグナルペプチドは、通常、このプロセスの過程で切断される。シグナルペプチドは、ポリペプチドを産生するために使用される生物に対して異種性又は相同性であってよい。
【0096】
いくつかの実施形態において、抗体は、ｉ）ＲＢＤポリペプチドに融合して、配列番号４３に記載する融合タンパク質を形成する軽鎖と、ｉｉ）Ｎｐｅｐ２ポリペプチドと融合して、配列番号４５に記載する融合タンパク質を形成する重鎖とを含む。
【0097】
いくつかの実施形態において、抗体は、ｉ）ＲＢＤポリペプチドに融合して、配列番号４４に記載する融合タンパク質を形成する軽鎖と、Ｎｐｅｐ２ポリペプチドと融合して、配列番号４５に記載する融合タンパク質を形成する重鎖とを含む。
【0098】
【表7】
【0099】
本発明の核酸、ベクター、及び宿主細胞：
本発明のさらなる目的は、本発明の抗体の重鎖及び／又は軽鎖をコードする核酸に関する。
本発明のさらなる目的は、本発明の抗体の重鎖及び／又は軽鎖をコードする核酸に関する。
【0100】
典型的には、前記核酸は、ＤＮＡ又はＲＮＡ分子であって、プラスミド、コスミド、エピソーム、人工染色体、ファージ又はウイルスベクターなどの任意の好適なベクターに含めることができるものである。
【0101】
したがって、本発明のさらなる目的は、本発明の核酸を含むベクターに関する。
【0102】
かかるベクターは、プロモーター、エンハンサー、ターミネーターなどの調節エレメントを含んでもよく、対象への投与に際して前記抗体の発現を引き起こすか又は指示する。動物細胞用の発現ベクターで使用されるプロモーター及びエンハンサーの例としては、ＳＶ４０の初期プロモーター及びエンハンサー、モロニ―マウス白血病ウイルスのＬＴＲプロモーター及びエンハンサー、イムノグロブリンＨ鎖のプロモーター及びエンハンサーなどが挙げられる。ヒト抗体Ｃ領域をコード化する遺伝子を挿入でき、発現させることができる限り、動物細胞用のいかなる発現ベクターも使用できる。好適なベクターの例としては、ｐＡＧＥ１０７、ｐＡＧＥ１０３、ｐＨＳＧ２７４、ｐＫＣＲ、ｐＳＧ１βｄ２－４などが挙げられる。プラスミドの他の例としては、複製開始点を含む複製プラスミド、又は組み込みプラスミド、例えば、ｐＵＣ、ｐｃＤＮＡ、ｐＢＲなどが挙げられる。ウイルスベクターの他の例としては、アデノウイルス、レトロウイルス、ヘルペスウイルス、及びＡＡＶベクターが挙げられる。そのような組換えウイルスは、パッケージング細胞のトランスフェクション又はヘルパープラスミド若しくはウイルスでの一過性トランスフェクションによるなど、当該技術分野で公知の技術によって産生することができる。ウイルスパッケージング細胞の典型的な例としては、ＰＡ３１７細胞、ＰｓｉＣＲＩＰ細胞、ＧＰｅｎｖ＋細胞、２９３細胞などが挙げられる。そのような複製欠損組換えウイルスを産生するための詳細なプロトコルは、例えば、ＷＯ９５／１４７８５、ＷＯ９６／２２３７８、ＵＳ５，８８２，８７７、ＵＳ６，０１３，５１６、ＵＳ４，８６１，７１９、ＵＳ５，２７８，０５６、及びＷＯ９４／１９４７８で見出すことができる。
【0103】
本発明のさらなる目的は、本発明にかかる核酸及び／又はベクターによってトランスフェクト、感染、又は形質転換された宿主細胞に関する。
【0104】
本発明の核酸は、好適な発現系において本発明の抗体を産生するために使用できる。一般的な発現系としては、大腸菌宿主細胞及びプラスミドベクター、昆虫宿主細胞及びバキュロウイルスベクター、並びに哺乳動物宿主細胞及びベクターが挙げられる。宿主細胞の他の例としては、限定されることなく、原核細胞（例えば、細菌）及び真核細胞（例えば、酵母細胞、哺乳動物細胞、昆虫細胞、植物細胞など）が挙げられる。具体例としては、大腸菌、クルイベロマイセス、又はサッカロマイセス酵母が挙げられる。哺乳動物宿主細胞には、ＤＨＦＲ選択可能マーカーとともに使用されるｄｈｆｒ－ＣＨＯ細胞（Ｕｒｌａｕｂ ａｎｄ Ｃｈａｓｉｎ，１９８０に記載）を含むチャイニーズハムスター卵巣（ＣＨＯ細胞）、ＣＨＯＫ１ ｄｈｆｒ＋細胞株、ＮＳＯ骨髄腫細胞、ＣＯＳ細胞、及びＳＰ２細胞、例えば、ＧＳ Ｘｃｅｅｄ（商標）遺伝子発現系（Ｌｏｎｚａ）とあわせたＧＳ ＣＨＯ細胞株、又はＨＥＫ細胞が含まれる。
【0105】
本発明はまた、本発明にかかるポリペプチドを発現する組換え宿主細胞を産生する方法に関し、前記方法は：（ｉ）前記組換え核酸又はベクターをインビトロ又はインビボでコンピテント宿主細胞に導入するステップ、（ｉｉ）得られた組換え宿主細胞をインビトロ又はエクスビボで培養するステップ、及び（ｉｉｉ），任意選択的に、前記抗体を発現及び／又は分泌する細胞を選択するステップを含む。そのような組換え宿主細胞は、本発明の抗体の産生のために使用できる。
【0106】
したがって、本明細書中で開示する宿主細胞は、本発明の抗体を産生するために特に適している。実際、組換え発現を哺乳動物宿主細胞に導入すると、宿主細胞において抗体を発現させ、必要に応じて、宿主細胞を成長させる培養培地へ抗体を分泌させるのに充分な期間、宿主細胞を培養することによって、ポリペプチドが産生される。抗体は、例えば、それらの分泌後の培養培地から、標準的タンパク質精製方法を使用して、回収・精製することができる。
【0107】
医薬組成物及びワクチン組成物：
本明細書で記載する抗体は、一つ以上の医薬組成物の一部として投与することができる。任意の従来の担体媒体が、望ましくない生物学的効果を生じさせるか、さもなければ医薬組成物の他の成分（複数可）と有害な方法で相互作用するなど、本発明の抗体と不適合である場合を除いて、その使用は、本発明の範囲内であることが企図される。薬剤的に許容される担体として機能し得る材料のいくつかの例としては、限定されるものではないが、ラクトース、グルコース、及びスクロースなどの糖類；コーンスターチ及びジャガイモデンプンなどのデンプン；セルロース、並びにカルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース、及び酢酸セルロースなどのセルロースの誘導体；粉末トラガカント；麦芽；ゼラチン；タルク；ココアバター及び坐剤ワックスなどの賦形剤；ピーナッツ油、綿実油；ベニバナ油、ゴマ油；オリーブ油；コーン油及びダイズ油などの油；プロピレングリコールなどのグリコール；オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル；寒天；水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤；アルギン酸；パイロゲンフリー水；等張食塩水；リンゲル液；エチルアルコール、及びリン酸緩衝溶液、並びにラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムなどの他の非毒性適合性潤滑剤が挙げられ、また着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味料、香味料、及び香料、防腐剤及び酸化防止剤も、調剤者の判断にしたがって組成物中に存在させることができる。
本明細書で記載する抗体は、一つ以上の医薬組成物の一部として投与することができる。任意の従来の担体媒体が、望ましくない生物学的効果を生じさせるか、さもなければ医薬組成物の他の成分（複数可）と有害な方法で相互作用するなど、本発明の抗体と不適合である場合を除いて、その使用は、本発明の範囲内であることが企図される。薬剤的に許容される担体として機能し得る材料のいくつかの例としては、限定されるものではないが、ラクトース、グルコース、及びスクロースなどの糖類；コーンスターチ及びジャガイモデンプンなどのデンプン；セルロース、並びにカルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース、及び酢酸セルロースなどのセルロースの誘導体；粉末トラガカント；麦芽；ゼラチン；タルク；ココアバター及び坐剤ワックスなどの賦形剤；ピーナッツ油、綿実油；ベニバナ油、ゴマ油；オリーブ油；コーン油及びダイズ油などの油；プロピレングリコールなどのグリコール；オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル；寒天；水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤；アルギン酸；パイロゲンフリー水；等張食塩水；リンゲル液；エチルアルコール、及びリン酸緩衝溶液、並びにラウリル硫酸ナトリウム及びステアリン酸マグネシウムなどの他の非毒性適合性潤滑剤が挙げられ、また着色剤、放出剤、コーティング剤、甘味料、香味料、及び香料、防腐剤及び酸化防止剤も、調剤者の判断にしたがって組成物中に存在させることができる。
【0108】
本明細書で記載する抗体は、ワクチン組成物を調製するのに特に適している。したがって、本発明のさらなる目的は、本発明の抗体を含むワクチン組成物に関する。
【0109】
いくつかの実施形態において、本発明のワクチン組成物はアジュバントを含む。いくつかの実施形態において、アジュバントはミョウバンである。
いくつかの実施形態において、アジュバントは、不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）又は他の油性アジュバントであり、重量比（ｗ／ｗ）で３０～７０％、好ましくは４０～６０％、さらに好ましくは４５～５５％の割合で存在する。いくつかの実施形態において、本発明のワクチン組成物は、ＴＬＲ１、ＴＬＲ２、ＴＬＲ３、ＴＬＲ４、ＴＬＲ５、ＴＬＲ６、ＴＬＲ７、及びＴＬＲ８アゴニストからなる群から選択される少なくとも一つのＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニストを含む。
いくつかの実施形態において、アジュバントは、不完全フロイントアジュバント（ＩＦＡ）又は他の油性アジュバントであり、重量比（ｗ／ｗ）で３０～７０％、好ましくは４０～６０％、さらに好ましくは４５～５５％の割合で存在する。いくつかの実施形態において、本発明のワクチン組成物は、ＴＬＲ１、ＴＬＲ２、ＴＬＲ３、ＴＬＲ４、ＴＬＲ５、ＴＬＲ６、ＴＬＲ７、及びＴＬＲ８アゴニストからなる群から選択される少なくとも一つのＴｏｌｌ様受容体（ＴＬＲ）アゴニストを含む。
【0110】
治療方法：
本明細書で記載する抗体並びに医薬組成物又はワクチン組成物は、サルベコウイルスに対する免疫応答、特にＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する免疫応答を誘導するのに特に適し、したがって、ワクチン目的に使用できる。本発明の抗体は、ユニバーサルサルベコウイルスワクチンとして使用できる。
本明細書で記載する抗体並びに医薬組成物又はワクチン組成物は、サルベコウイルスに対する免疫応答、特にＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対する免疫応答を誘導するのに特に適し、したがって、ワクチン目的に使用できる。本発明の抗体は、ユニバーサルサルベコウイルスワクチンとして使用できる。
【0111】
したがって、本発明のさらなる目的は、必要とする対象にサルベコウイルスに対するワクチン接種をする方法であって、治療上有効量の本発明の抗体を投与することを含む方法に関する。
【0112】
本発明のさらなる目的は、必要とする対象にＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に対するワクチン接種をする方法であって、治療上有効量の本発明の抗体を投与することを含む方法に関する。
【0113】
いくつかの実施形態において、本明細書で記載するような抗体並びに医薬組成物又はワクチン組成物は、Ｃｏｖｉｄ－１９の治療に特に適している。
【0114】
いくつかの実施形態において、対象は、コロナウイルス感染症にかかりやすいヒト又は任意の他の動物（例えば、鳥類及び哺乳類）（例えば、ネコ、イヌなどの飼育動物；ウマ、ウシ、ブタ、ニワトリなどの家畜（家畜及び農場動物））であり得る。典型的には、前記対象は、非霊長類（例えば、ラクダ、ロバ、シマウマ、ウシ、ブタ、ウマ、ヤギ、ヒツジ、ネコ、イヌ、ラット、マウス）と霊長類（例えば、サル、チンパンジー、ヒト）を含む哺乳動物である。いくつかの実施形態において、対象は非ヒト動物である。いくつかの実施形態において、対象は家畜又はペットである。いくつかの実施形態において、対象はヒトである。いくつかの実施形態において、対象はヒト乳児である。いくつかの実施形態において、対象はヒト小児である。いくつかの実施形態において、対象は成人である。いくつかの実施形態において、対象は高齢者である。いくつかの実施形態において、対象はヒト未熟児である。
【0115】
いくつかの実施形態において、対象は症候性又は無症状であり得る。
【0116】
典型的には、本発明の活性成分（すなわち、本明細書で記載するような抗体及び医薬組成物又はワクチン組成物）は治療上有効量で対象に投与される。本発明の化合物及び組成物の一日の総使用量は、健全な医学的判断の範囲内で主治医によって決定されると理解される。任意の特定の対象についての特定の治療上有効な用量レベルは、治療する障害および当該障害の重症度；採用した特定の化合物の活性；採用した特定の組成物、対象の年齢、体重、全体的な健康、性別及び食事；採用した特定の化合物の投与時間、投与経路、及び排泄速度；治療期間；採用した特定のポリペプチドと組み合わせて又は同時に使用する薬物；並びに医療分野で周知の同様の要因をはじめとする様々な要因に依存するであろう。例えば、所望の治療効果を達成するために必要なレベルよりも低いレベルで化合物の投与を開始し、所望の効果が達成されるまで徐々に投与量を増加させることは、当業者の技術範囲内である。しかしながら、製品の一日の投与量は、成人一日当たり０．０１～１，０００ｍｇと広範囲にわたって変動し得る。特に、組成物は、治療される対象に対する投与量の症状調節のために、０．０１、０．０５、０．１、０．５、１．０、２．５、５．０、１０．０、１５．０、２５．０、５０．０、１００、２５０、及び５００ｍｇの活性成分を含む。薬物は、典型的には、約０．０１ｍｇ～約５００ｍｇの活性成分を含み、特に、１ｍｇ～約１００ｍｇの活性成分を含む。薬物の有効量は、通常、一日につき体重１ｋｇあたり０．０００２ｍｇ～約２０ｍｇ、特に、一日につき体重１ｋｇあたり約０．００１ｍｇ～７ｍｇの投与レベルで供給される。
【0117】
本明細書で記載するような抗体及び医薬組成物又はワクチン組成物は、任意の投与経路、特に、経口、経鼻、直腸、局所、頬側（例えば、舌下）、非経口（例えば、皮下、筋肉内、皮内、又は静脈内）及び経皮投与によって対象に投与することができるが、任意の所与の場合で最も好適な経路は、治療される状態の性質及び重症度並びに使用される特定の活性剤の性質に依存するであろう。
【0118】
いくつかの実施形態において、本明細書で記載するような抗体並びに医薬組成物又はワクチン組成物は、例えば、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２コロナウイルスに対するワクチン接種のための任意の公知治療剤又は方法と組み合わせて対象に投与できる。そのような公知治療薬の非限定例としては、レムデシビル、ロピナビル、リトナビル、ヒドロキシクロロキン、クロロキノンなどの抗ウイルス剤が挙げられるが、これらに限定されるものではない。いくつかの実施形態において、本明細書で記載する抗体並びに医薬組成物又はワクチン組成物は、免疫チェックポイント阻害剤と組み合わせて投与される。免疫チェックポイント阻害剤の例としては、ＰＤ－１アンタゴニスト、ＰＤ－Ｌ１アンタゴニスト、ＰＤ－Ｌ２アンタゴニストＣＴＬＡ－４アンタゴニスト、ＶＩＳＴＡアンタゴニスト、ＴＩＭ－３アンタゴニスト、ＬＡＧ－３アンタゴニスト、ＩＤＯアンタゴニスト、ＫＩＲ２Ｄアンタゴニスト、Ａ２ＡＲアンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ３アンタゴニスト、Ｂ７－Ｈ４アンタゴニスト、及びＢＴＬＡアンタゴニストが挙げられる。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ－１）軸アンタゴニストには、ＰＤ－１アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－１抗体）、ＰＤ－Ｌ１（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ Ｌｉｇａｎｄ－１）アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ１抗体）及びＰＤ－Ｌ２（Ｐｒｏｇｒａｍｍｅｄ Ｄｅａｔｈ Ｌｉｇａｎｄ－２）アンタゴニスト（例えば、抗ＰＤ－Ｌ２抗体）が含まれる。いくつかの実施形態において、抗ＰＤ－１抗体は、ＭＤＸ－１１０６（ニボルマブ、ＭＤＸ－１１０６－０４、ＯＮＯ－４５３８、ＢＭＳ－９３６５５８、及びＯｐｄｉｖｏ（登録商標）としても知られる）、Ｍｅｒｃｋ３４７５（ペムブロリズマブ、ＭＫ－３４７５、Ｌａｍｂｒｏｌｉｚｕｍａｂ、Ｋｅｙｔｒｕｄａ（登録商標）、及びＳＣＨ－９００４７５としても知られる）、及びＣＴ－０１１（ピディリズマブ、ｈＢＡＴ、及びｈＢＡＴ－１としても知られる）からなる群から選択される。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１結合アンタゴニストはＡＭＰ－２２４（Ｂ７－ＤＣＩｇとしても知られる）である。いくつかの実施形態において、抗ＰＤ－Ｌ１抗体は、ＹＷ２４３．５５．Ｓ７０、ＭＰＤＬ３２８０Ａ、ＭＤＸ－１１０５、及びＭＥＤＩ４７３６からなる群から選択される。ＢＭＳ－９３６５５９としても知られるＭＤＸ－１１０５は、ＷＯ２００７／００５８７４に記載されている抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。抗体ＹＷ２４３．５５．Ｓ７０は、ＷＯ２０１０／０７７６３４Ａ１に記載されている抗ＰＤ－Ｌ１である。ＭＥＤＩ４７３６は、ＷＯ２０１１／０６６３８９及びＵＳ２０１３／０３４５５９に記載されている抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。ＭＤＸ－１１０６は、ＭＤＸ－１１０６－０４、ＯＮＯ－４５３８又はＢＭＳ－９３６５５８としても知られ、米国特許第８，００８，４４９号及びＷＯ２００６／１２１１６８に記載されている抗ＰＤ－１抗体である。Ｍｅｒｃｋ３７４５は、ＭＫ－３４７５又はＳＣＨ－９００４７５としても知られ、米国特許第８，３４５，５０９号及びＷＯ２００９／１１４３３５に記載されている抗ＰＤ－１抗体である。ＣＴ－０１１（Ｐｉｄｉｚｉｌｕｍａｂ）は、ｈＢＡＴ又はｈＢＡＴ－１としても知られ、ＷＯ２００９／１０１６１１に記載されている抗ＰＤ－１抗体である。ＡＭＰ－２２４は、Ｂ７－ＤＣＩｇとしても知られ、ＷＯ２０１０／０２７８２７及びＷＯ２０１１／０６６３４２で記載されているＰＤ－Ｌ２－Ｆｃ融合可溶性受容体である。アテゾリズマブ（Ａｔｅｚｏｌｉｍｕｍａｂ）は、米国特許第８，２１７，１４９号で記載されている抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。アベルマブは、ＵＳ２０１４０３４１９１７で記載されている抗ＰＤ－Ｌ１抗体である。ＣＡ－１７０は、ＷＯ２０１５０３３３０１及びＷＯ２０１５０３３２９９で記載されているＰＤ－１アンタゴニストである。他の抗ＰＤ－１抗体は、米国特許第８，６０９，０８９号、ＵＳ２０１００２８３３０、及び／又はＵＳ２０１２０１１４６４９に開示されている。いくつかの実施形態において、ＰＤ－１阻害剤は、ニボルマブ、ペムブロリズマブ又はピディリズマブから選択される抗ＰＤ－１抗体である。いくつかの実施形態において、ＰＤ－Ｌ１アンタゴニストは、アベルマブ、ＢＭＳ－９３６５５９、ＣＡ－１７０、デュルバルマブ、ＭＣＬＡ－１４５、ＳＰ１４２、ＳＴＩ－Ａ１０１１、ＳＴＩＡ１０１２、ＳＴＩ－Ａ１０１０、ＳＴＩ－Ａ１０１４、Ａ１１０、ＫＹ１００３及びアテゾリズマブ（Ａｔｅｚｏｌｉｍｕｍａｂ）からなる群から選択され、好ましいのは、アベルマブ、デュルバルマブ、又はアテゾリズマブ（Ａｔｅｚｏｌｉｍｕｍａｂ）である。
【0119】
本発明を、以下の図面及び実施例によってさらに説明する。ただし、これらの実施例及び図面は、本発明の範囲を制限するものと解釈されるべきではない。
【図面の簡単な説明】
【0120】
【図2A】図２：ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した回復期のドナーＰＢＭＣ培養物におけるサルベコウイルスＴ細胞のインビトロ増殖を介して試験した汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン。図２Ａ）ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２＋回復期ドナー患者のＰＢＭＣ（ｎ＝６）をＤ０でＣＤ４０．Ｎ２．ＲＢＤｖＳＡＤワクチン（１ｎＭ）にて刺激し、ＩＬ－２と共に９日間培養し、最後の２４ｈに以下の配列にわたる異なる重複ペプチド（ＯＬＰ）プール（１μｇ／ｍｌ）で刺激した：ｉ）ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（武漢）、ＶＯＣベータ／ガンマ、ＶＯＣデルタ、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１のワクチンＲＢＤ（ｖＲＢＤ）、ｉｉ）ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１領域のＮｐｅｐ２（ｖＮ）をワクチン接種し、次いで細胞内サイトカイン染色（ＩＣＳ）によりＤ９で分析した。
【図2B】図２：ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した回復期のドナーＰＢＭＣ培養物におけるサルベコウイルスＴ細胞のインビトロ増殖を介して試験した汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン。図２Ｂ）グラフは、必要に応じて、細胞内インターフェロンγ（ＩＦＮγ＋）、細胞内腫瘍壊死因子α（ＴＮＦα＋）、又はインターロイキン２（ＩＬ－２＋）について染色したＣＤ４＋Ｔ及びＣＤ８＋Ｔ細胞％についてのスタック値を示す。
【図3】図３：ベータコロナウイルス間のワクチンＲＤＢ及びＮｐｅｐ２（Ｎ２）領域の相同性の分析により、サルベコウイルス内でこれらのワクチン領域の相同性のパーセンテージが高いことが明らかになった。コバルト（ｈｔｔｐｓ：／／ｗｗｗ－ｎｃｂｉ－ｎｌｍ－ｎｉｈ－ｇｏｖ．ｐｒｏｘｙ．ｉｎｓｅｒｍｂｉｂｌｉｏ．ｉｎｉｓｔ．ｆｒ／ｔｏｏｌｓ／ｃｏｂａｌｔ／ｒｅ＿ｃｏｂａｌｔ．ｃｇｉ）を使用して、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、四つのＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ＶＯＣ（α、β、γ、δ）、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１、及びコウモリ起源の３０ウイルスとセンザンコウ起源の２ウイルス（全てサルベコウイルス亜属由来）の３２の最近記載されたＳＡＲＳ－ＣｏＶ関連コロナウイルスからの配列のアラインメントを実施した。
【図4A】図４：汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ）は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した回復期ドナーのＰＢＭＣからのＢ細胞のインビトロでの活性化及び形質細胞分化を誘導した。図４Ａ）ＣＯＶＩＤ－１９回復期個体からのＰＢＭＣをＣＤ４０．ＣｏＶ２、ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ（すなわち、ＣＤ４０．Ｎ２．ＲＢＤｖＳＡＤ－Ｑ）、ＩｇＧ４．ＣｏＶ２、ＣＤ４０．ＮｉｖＧ（ニパ制御ワクチン）又は非融合ＣＤ４０ｍＡｂ（１ｎＭ）にてインビトロで刺激した。１０％ヒト血清ＡＢ（ＳＡＢ）を追加した３００μＬのＲＰＭＩ中でＰＢＭＣ（５Ｅ０５）をインキュベートした。４８時間後、上清を捨て、１０％ヒト血清ＡＢ（ＳＡＢ）を追加した新鮮なＲＰＭＩ１ｍＬで置換する。培地を２日おきに半分ずつ補充する。７日後、ＰＢＭＣをＲＰＭＩ １０％ＦＣＳ中で洗浄し、５００μｌのＲＰＭＩ １０％ＦＣＳ中で培養する。
【図4B】図４：汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ）は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した回復期ドナーのＰＢＭＣからのＢ細胞のインビトロでの活性化及び形質細胞分化を誘導した。図４Ｂ）９日後、細胞を、ＣＤ１９Ａｌｅｘａ７００（ＢＤ製；ｒｅｆ：５６１０３１）、ＣＤ２１ ＰＥＣＦ５９４（ＢＤ製；ｒｅｆ：５６３４７４）、ＣＤ２７ ＡＰＣ（ＢＤ製；ｒｅｆ３３７１６９）、ＣＤ３８ ＰｅｒｃＰＣｙ５．５（Ｂｉｏｌｅｇｅｎｄ製；ｒｅｆ３０３５２２）、ＣＤ １３８ＰＥ（ＢＤ製；ｒｅｆ：５５２０２６）、及びＩｇＤ ＦＩＴＣ（Ｉｎｖｉｔｒｏｇｅｎ製；ｒｅｆ：Ｈ１５５０１）に加えて生存性マーカーで染色して、Ｂ細胞系統を決定し、ＬＳＲ ＩＩ－３レーザーフローサイトメータ（４０５、４８８、及び６４０ｎｍ）（Ｂｅｃｔｏｎ Ｄｉｃｋｉｎｓｏｎ）を用いて分析した。
【図4C】図４：汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ）は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した回復期ドナーのＰＢＭＣからのＢ細胞のインビトロでの活性化及び形質細胞分化を誘導した。図４Ｃ）ＬＵＭＩＮＥＸテクノロジーを使用して、細胞培養上清中のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ＲＢＤに対するＩｇＧ抗体の測定を実施した。
【図5】図５：汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ）は、Ｋ１８ｈＡＣＥ２ｔｇ×ｈＣＤ４０ｔｇマウスをＳＡＲＳ－ＣｏＶ２感染から保護した。Ｋ１８ｈＡＣＥ２ｔｇ×ｈＣＤ４０ｔｇマウスを０日目及び２１日目の二回、ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶワクチン（１０μｇ／マウス）＋アジュバントとしてｐｏｌｙ－ＩＣＬＣ（Ｈｉｌｔｏｎｏｌ（登録商標））（５０μｇ／マウス）（ｎ＝６）で腹腔内免疫化した。モックマウスにＤ０及びＤ２１にＰＢＳ又はｐｏｌｙ－ＩＣＬＣ（ｎ＝９／群）を投与した。次に、マウスをプライミング後Ｄ２８に鼻腔内注入によりＳＡＲＳ－ＣｏＶ２ウイルス（武漢株１０＾４ＰＦＵ）で感染させた。図５Ａ）マウスを１２日間生存についてモニタリングした。図５Ｂ）一群あたり三匹のマウスをランダムに選択し、感染後５日目に処分し、肺のウイルス量とウイルス感染力を評価した。
【図6】図６：デルタＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２株に曝露した回復期ＮＨＰにおける汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ）の抗ウイルス効果。アジュバントを含まないワクチン２００μｇを五匹の回復期カニクイザルに皮下注射した。回復期のカニクイザルはすべて以前にＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２（１ｘ１０＾６ＰＦＵ；株：ベータＣｏＶ／フランス／ＩＤＦ／０３７２／２０２０；２０２０年３月～４月及び２０２０年１０月）に曝露され、ＲＴ－ｑＰＣＲ及び血清学により感染が確認された。免疫化の四週間後、五匹のＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ免疫化回復期ＮＨＰ及び六匹のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ナイーブ動物（対照群）を、前投薬としてのアトロピン（０．０４ｍｇ／ｋｇ）と、麻酔としてのケタミン（５ｍｇ／ｋｇ）とメデトミジン（０．０５ｍｇ／ｋｇ）とを使用して、合計用量１０ｅ５ＴＣＩＤ５０のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｂ．１．６１７．２変異ウイルス（デルタ株；ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２、ｈＣｏＶ－１９／ＵＳＡ／ＰＨＣ６５８／２０２１；ＢＥＩ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ Ｒｅｐｏｓｉｔｏｒｙ（米国国立保健研究所）を鼻腔内経路及び気管内経路の組み合わせ２５（各鼻孔内に０．２５ｍＬ、気管内に４．５ｍＬ、すなわち、合計５ｍＬ；０日目）に曝露した。血液、鼻咽頭及び気管スワブ、並びに気管支肺胞洗浄液を定期的に採取した。Ａ）ナイーブ及びＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶワクチン接種を受けた回復期のカニクイザルの気管、鼻咽頭スワブ及びＢＡＬにおけるゲノムウイルスＲＮＡ（ｇＲＮＡ）定量化。水平の点線は検出限界を表す。Ｂ）ナイーブ及びＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶワクチン接種を受けた回復期のカニクイザルの気管、鼻咽頭スワブ及びＢＡＬにおけるサブゲノムウイルスＲＮＡ（ｇＲＮＡ）定量化。水平の点線は検出限界を表す。
【図7E】図７：回復期ＮＨＰにおける汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ）の免疫原性。図７Ｅ）抗ＲＢＤベータＩｇＧを、すでに記載されているように、Ｍｅｓｏｓｃａｌｅ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ（メリーランド州ロックビルのＭＳＤ）によって開発された市販のマルチプレックスイムノアッセイを使用して滴定した（Ａｎｄｅｒｓｏｎ，Ｅ．Ｊ．ｅｔ ａｌ．Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｍＲＮＡ－１２７３ ｖａｃｃｉｎｅ ｉｎ ｏｌｄｅｒ ａｄｕｌｔｓ．Ｎ．Ｅｎｇｌ．Ｊ．Ｍｅｄ．３８３，２４２７－２４３８（２０２０））。スパイクタンパク質のＡＣＥ２受容体に対する結合を中和するＡ）抗スパイク及びＣ）抗ＲＢＤデルタ、Ｄ）抗ＲＢＤ武漢、及びＥ）抗ＲＢＤベータ抗体をＭＳＤ疑似中和アッセイで滴定した。
【実施例】
【0121】
発現ベクター及びタンパク質精製産生の方法並びにＣＤ４０結合特異性を含む品質保証の方法は記載するとおりであった［１；２；３，４，５］。タンパク質発現は、ＴｒａｎｓＩＴ（登録商標）－ＣＨＯトランスフェクションキット（Ｍｉｒｕｓ）を使用した一過性ＣＨＯ－Ｓ（チャイニーズハムスター卵巣細胞）トランスフェクションによるものであった。クローニングでは、ＣＨＯ最適化コドンを使用して）、典型的には、様々な組み合わせのベクターへのライゲーションに便利な制限部位によって区切られた、様々なＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２抗原領域をコード化する合成ＤＮＡカセットを使用した。
［１］ Ｆｌａｍａｒ ＡＬ．， Ｓ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ， Ｆ． Ｓｃｈｏｌｚ， Ｉ． Ｇａｙｅｔ， Ｌ． Ｎｉ， ＸＨ． Ｌｉ， Ｅ． Ｋｌｅｃｈｅｖｓｋｙ， Ｊ． Ｑｕｉｎｎ， Ｓ． Ｏｈ， Ｄ． Ｈ． Ｋａｐｌａｎ， Ｊ． Ｂａｎｃｈｅｒｅａｕ ａｎｄ Ｇ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ． ２０１２． Ｎｏｎｃｏｖａｌｅｎｔ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｏｆ ａｎｔｉ－Ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ Ｃｅｌｌ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ ａｎｔｉｇｅｎｓ ｆｏｒ ｅｖｏｋｉｎｇ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ａｎｄ ｉｎ ｖｉｖｏ． Ｊ． Ｉｍｍｕｎｌ． １８９： ２６４５－５５．
［２］ Ｆｌａｍａｒ ＡＬ．， Ｙ． Ｘｕｅ， Ｓ． Ｍ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ， Ｍ． Ｍｏｎｔｅｓ， Ｂ． Ｋｉｎｇ， Ｌ． Ｓｌｏａｎ， Ｓ． Ｏｈ， Ｊ． Ｂａｎｃｈｅｒｅａｕ， Ｙ． Ｌｅｖｙ ａｎｄ Ｇ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ． ２０１３． Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｃｏｎｃａｔｅｎａｔｅｄ ＨＩＶ ａｎｔｉｇｅｎｓ ｔｏ ｈｕｍａｎ ＣＤ４０ ｅｘｐａｎｄｓ ａ ｂｒｏａｄ ｒｅｐｅｒｔｏｉｒｅ ｏｆ ｍｕｌｔｉｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ＣＤ４＋ ａｎｄ ＣＤ８＋ Ｔ Ｃｅｌｌｓ． ＡＩＤＳ． ２７： ２０４１－５１．
［３］ Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｇ．， Ｘ． Ｓｈｅｎ， Ｓ． Ｚｕｒａｗａｓｋｉ， Ｇ． Ｄ． Ｔｏｍａｒａｓ， Ｄ． Ｃ． Ｍｏｎｔａｆｉｏｒｉ， Ｍ． Ｒｏｅｄｅｒｅｒ， Ｇ． Ｆｅｒｒａｒｉ， Ｃ． Ｌａｃａｂａｒａｔｚ， Ｐ． Ｋｌｕｃａｒ， Ｚ． Ｗａｎｇ， Ｋ． Ｅ． Ｆｏｕｌｄｓ， ＳＦ． Ｋａｏ， Ｘ． Ｙｕ， Ａ． Ｓａｔｏ， Ｎ． Ｌ． Ｙａｔｅｓ， Ｃ． ＬａＢｒａｎｃｈｅ， Ｓ． Ｓｔａｎｆｉｅｌｄ－Ｏａｋｌｅｙ， Ｋ． Ｋｉｂｌｅｒ， Ｂ． Ｊａｃｏｂｓ， Ａ． Ｓａｌａｚａｒ， Ｓ． Ｓｅｌｆ， Ｅ． Ｆｕｌｐ， Ｒ． Ｇｏｔｔａｒｄｏ， Ｌ． Ｇａｌｍｉｎ， Ｄ． Ｗｅｉｓｓ， Ａ． Ｃｒｉｓｔｉｌｌｏ， Ｇ． Ｐａｎｔａｌｅｏ ａｎｄ Ｙ． Ｌｅｖｙ． ２０１７． Ｓｕｐｅｒｉｏｒｉｔｙ ｉｎ ｒｈｅｓｕｓ ｍａｃａｑｕｅｓ ｏｆ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＨＩＶ－１ Ｅｎｖ ｇｐ１４０ ｔｏ ＣＤ４０ ｖｅｒｓｕｓ ＬＯＸ－１ ｉｎ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ－ｃｏｍｐｅｔｅｎｔ ＮＹＶＡＣ－ＫＣ ｆｏｒ ｉｎｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｅｎｖ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ａｎｔｉｂｏｄｙ ａｎｄ Ｔ Ｃｅｌｌ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ． Ｊ． Ｖｉｒｏｌ． ９１： １－２０．
［４］ Ｍａｒｌｉｎ Ｒ．， Ｇｏｄｏｔ Ｖ．， Ｃａｒｄｉｎａｕｄ Ｓ．， Ｇａｌｈａｕｔ Ｍ．， Ｃｏｌｅｏｎ Ｓ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｓ．， Ｄｅｒｅｕｄｄｒｅ－Ｂｏｓｑｕｅｔ Ｎ．， Ｃａｖａｒｅｌｌｉ Ｍ．， Ｇａｌｌｏｕｅｔ Ａ．Ｓ．， Ｍａｉｓｏｎｎａｓｓｅ Ｐ．， Ｄｕｐａｔｙ Ｌ．， Ｆｅｎｗｉｃｋ Ｃ．， Ｎａｎｉｎｃｋ Ｔ．， Ｌｅｍａｉｔｒｅ Ｊ．， Ｇｏｍｅｚ－ Ｐａｃｈｅｃｏ Ｍ．， Ｋａｈｌａｏｕｉ Ｎ．， Ｃｏｎｔｒｅｒａｓ Ｖ．， Ｒｅｌｏｕｚａｔ Ｆ．， Ｆａｎｇ Ｒ．Ｈ．Ｔ．， Ｗａｎｇ Ｚ．， Ｅｌｌｉｓ Ｊ． ３ｒｄ， Ｃｈａｐｏｎ Ｃ．， Ｃｅｎｔｌｉｖｒｅ Ｍ．， Ｗｉｅｄｅｍａｎｎ Ａ．， Ｌａｃａｂａｒａｔｚ Ｃ．， Ｓｕｒｅｎａｕｄ Ｍ．， Ｓｚｕｒｇｏｔ Ｉ．， Ｌｉｌｊｅｓｔｒｏｍ Ｐ．， Ｐｌａｎａｓ Ｄ．， Ｂｒｕｅｌ Ｔ．， Ｓｃｈｗａｒｔｚ Ｏ．， Ｗｅｒｆ Ｓ．Ｖ．， Ｐａｎｔａｌｅｏ Ｇ．， Ｐｒａｇｕｅ Ｍ．， Ｔｈｉｅｂａｕｔ Ｒ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｇ．， Ｌｅｖｙ Ｙ．， Ｌｅ Ｇｒａｎｄ Ｒ． Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｄｏｍａｉｎ ｔｏ ｃｅｌｌｓ ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ ＣＤ４０ ｉｍｐｒｏｖｅｓ ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ｔｏ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｃｏｎｖａｌｅｓｃｅｎｔ ｍａｃａｑｕｅｓ． Ｎａｔｕｒｅ ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎｓ． ２０２１；１２（１）：５２１５．
［５］ Ｃｏｌｅｏｎ Ｓ．， Ｗｉｅｄｅｍａｎｎ Ａ．， Ｓｕｒｅｎａｕｄ Ｍ．， Ｌａｃａｂａｒａｔｚ Ｃ．， Ｈｕｅ Ｓ．， Ｐｒａｇｕｅ Ｍ．， Ｃｅｒｖａｎｔｅｓ－Ｇｏｎｚａｌｅｚ Ｍ．， Ｗａｎｇ Ｚ．， Ｅｌｌｉｓ Ｊ．， Ｓａｎｓｏｎｉ Ａ．， Ｐｉｅｒｉｎｉ Ｃ．， Ｂａｒｄｉｎ Ｑ．， Ｆａｂｒｅｇｕｅ Ｍ．， Ｓｈａｒｋａｏｕｉ Ｓ．， Ｈｏｅｓｔ Ｐ．， Ｄｕｐａｔｙ Ｌ．， Ｐｉｃａｒｄ Ｆ．， Ｃｅｎｔｌｉｖｒｅ Ｍ．， Ｇｈｏｓｎ Ｊ．， Ｆｒｅｎｃｈ ＣＯＶＩＤ Ｃｏｈｏｒｔ Ｓｔｕｄｙ Ｇｒｏｕｐ， Ｔｈｉｅｂａｕｔ Ｒ．， Ｃａｒｄｉｎａｕｄ Ｓ．， Ｍａｌｉｓｓｅｎ Ｂ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｇ．， Ｚａｒｕｂｉｃａ Ａ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｓ．Ｍ．， Ｇｏｄｏｔ Ｖ．， Ｌｅｖｙ Ｙ． Ｄｅｓｉｇｎ， ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ， ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ａ ｐａｎ－ｓａｒｂｅｃｏｖｉｒｕｓ ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ－ｃｅｌｌ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｖａｃｃｉｎｅ． ＥＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅ． ２０２２；８０：１０４０６２．
［１］ Ｆｌａｍａｒ ＡＬ．， Ｓ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ， Ｆ． Ｓｃｈｏｌｚ， Ｉ． Ｇａｙｅｔ， Ｌ． Ｎｉ， ＸＨ． Ｌｉ， Ｅ． Ｋｌｅｃｈｅｖｓｋｙ， Ｊ． Ｑｕｉｎｎ， Ｓ． Ｏｈ， Ｄ． Ｈ． Ｋａｐｌａｎ， Ｊ． Ｂａｎｃｈｅｒｅａｕ ａｎｄ Ｇ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ． ２０１２． Ｎｏｎｃｏｖａｌｅｎｔ ａｓｓｅｍｂｌｙ ｏｆ ａｎｔｉ－Ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ Ｃｅｌｌ ａｎｔｉｂｏｄｉｅｓ ａｎｄ ａｎｔｉｇｅｎｓ ｆｏｒ ｅｖｏｋｉｎｇ ｉｍｍｕｎｅ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ ｉｎ ｖｉｔｒｏ ａｎｄ ｉｎ ｖｉｖｏ． Ｊ． Ｉｍｍｕｎｌ． １８９： ２６４５－５５．
［２］ Ｆｌａｍａｒ ＡＬ．， Ｙ． Ｘｕｅ， Ｓ． Ｍ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ， Ｍ． Ｍｏｎｔｅｓ， Ｂ． Ｋｉｎｇ， Ｌ． Ｓｌｏａｎ， Ｓ． Ｏｈ， Ｊ． Ｂａｎｃｈｅｒｅａｕ， Ｙ． Ｌｅｖｙ ａｎｄ Ｇ． Ｚｕｒａｗｓｋｉ． ２０１３． Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｃｏｎｃａｔｅｎａｔｅｄ ＨＩＶ ａｎｔｉｇｅｎｓ ｔｏ ｈｕｍａｎ ＣＤ４０ ｅｘｐａｎｄｓ ａ ｂｒｏａｄ ｒｅｐｅｒｔｏｉｒｅ ｏｆ ｍｕｌｔｉｆｕｎｃｔｉｏｎａｌ ＣＤ４＋ ａｎｄ ＣＤ８＋ Ｔ Ｃｅｌｌｓ． ＡＩＤＳ． ２７： ２０４１－５１．
［３］ Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｇ．， Ｘ． Ｓｈｅｎ， Ｓ． Ｚｕｒａｗａｓｋｉ， Ｇ． Ｄ． Ｔｏｍａｒａｓ， Ｄ． Ｃ． Ｍｏｎｔａｆｉｏｒｉ， Ｍ． Ｒｏｅｄｅｒｅｒ， Ｇ． Ｆｅｒｒａｒｉ， Ｃ． Ｌａｃａｂａｒａｔｚ， Ｐ． Ｋｌｕｃａｒ， Ｚ． Ｗａｎｇ， Ｋ． Ｅ． Ｆｏｕｌｄｓ， ＳＦ． Ｋａｏ， Ｘ． Ｙｕ， Ａ． Ｓａｔｏ， Ｎ． Ｌ． Ｙａｔｅｓ， Ｃ． ＬａＢｒａｎｃｈｅ， Ｓ． Ｓｔａｎｆｉｅｌｄ－Ｏａｋｌｅｙ， Ｋ． Ｋｉｂｌｅｒ， Ｂ． Ｊａｃｏｂｓ， Ａ． Ｓａｌａｚａｒ， Ｓ． Ｓｅｌｆ， Ｅ． Ｆｕｌｐ， Ｒ． Ｇｏｔｔａｒｄｏ， Ｌ． Ｇａｌｍｉｎ， Ｄ． Ｗｅｉｓｓ， Ａ． Ｃｒｉｓｔｉｌｌｏ， Ｇ． Ｐａｎｔａｌｅｏ ａｎｄ Ｙ． Ｌｅｖｙ． ２０１７． Ｓｕｐｅｒｉｏｒｉｔｙ ｉｎ ｒｈｅｓｕｓ ｍａｃａｑｕｅｓ ｏｆ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＨＩＶ－１ Ｅｎｖ ｇｐ１４０ ｔｏ ＣＤ４０ ｖｅｒｓｕｓ ＬＯＸ－１ ｉｎ ｃｏｍｂｉｎａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｒｅｐｌｉｃａｔｉｏｎ－ｃｏｍｐｅｔｅｎｔ ＮＹＶＡＣ－ＫＣ ｆｏｒ ｉｎｄｕｃｔｉｏｎ ｏｆ Ｅｎｖ－ｓｐｅｃｉｆｉｃ ａｎｔｉｂｏｄｙ ａｎｄ Ｔ Ｃｅｌｌ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ． Ｊ． Ｖｉｒｏｌ． ９１： １－２０．
［４］ Ｍａｒｌｉｎ Ｒ．， Ｇｏｄｏｔ Ｖ．， Ｃａｒｄｉｎａｕｄ Ｓ．， Ｇａｌｈａｕｔ Ｍ．， Ｃｏｌｅｏｎ Ｓ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｓ．， Ｄｅｒｅｕｄｄｒｅ－Ｂｏｓｑｕｅｔ Ｎ．， Ｃａｖａｒｅｌｌｉ Ｍ．， Ｇａｌｌｏｕｅｔ Ａ．Ｓ．， Ｍａｉｓｏｎｎａｓｓｅ Ｐ．， Ｄｕｐａｔｙ Ｌ．， Ｆｅｎｗｉｃｋ Ｃ．， Ｎａｎｉｎｃｋ Ｔ．， Ｌｅｍａｉｔｒｅ Ｊ．， Ｇｏｍｅｚ－ Ｐａｃｈｅｃｏ Ｍ．， Ｋａｈｌａｏｕｉ Ｎ．， Ｃｏｎｔｒｅｒａｓ Ｖ．， Ｒｅｌｏｕｚａｔ Ｆ．， Ｆａｎｇ Ｒ．Ｈ．Ｔ．， Ｗａｎｇ Ｚ．， Ｅｌｌｉｓ Ｊ． ３ｒｄ， Ｃｈａｐｏｎ Ｃ．， Ｃｅｎｔｌｉｖｒｅ Ｍ．， Ｗｉｅｄｅｍａｎｎ Ａ．， Ｌａｃａｂａｒａｔｚ Ｃ．， Ｓｕｒｅｎａｕｄ Ｍ．， Ｓｚｕｒｇｏｔ Ｉ．， Ｌｉｌｊｅｓｔｒｏｍ Ｐ．， Ｐｌａｎａｓ Ｄ．， Ｂｒｕｅｌ Ｔ．， Ｓｃｈｗａｒｔｚ Ｏ．， Ｗｅｒｆ Ｓ．Ｖ．， Ｐａｎｔａｌｅｏ Ｇ．， Ｐｒａｇｕｅ Ｍ．， Ｔｈｉｅｂａｕｔ Ｒ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｇ．， Ｌｅｖｙ Ｙ．， Ｌｅ Ｇｒａｎｄ Ｒ． Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｄｏｍａｉｎ ｔｏ ｃｅｌｌｓ ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ ＣＤ４０ ｉｍｐｒｏｖｅｓ ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ｔｏ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｃｏｎｖａｌｅｓｃｅｎｔ ｍａｃａｑｕｅｓ． Ｎａｔｕｒｅ ｃｏｍｍｕｎｉｃａｔｉｏｎｓ． ２０２１；１２（１）：５２１５．
［５］ Ｃｏｌｅｏｎ Ｓ．， Ｗｉｅｄｅｍａｎｎ Ａ．， Ｓｕｒｅｎａｕｄ Ｍ．， Ｌａｃａｂａｒａｔｚ Ｃ．， Ｈｕｅ Ｓ．， Ｐｒａｇｕｅ Ｍ．， Ｃｅｒｖａｎｔｅｓ－Ｇｏｎｚａｌｅｚ Ｍ．， Ｗａｎｇ Ｚ．， Ｅｌｌｉｓ Ｊ．， Ｓａｎｓｏｎｉ Ａ．， Ｐｉｅｒｉｎｉ Ｃ．， Ｂａｒｄｉｎ Ｑ．， Ｆａｂｒｅｇｕｅ Ｍ．， Ｓｈａｒｋａｏｕｉ Ｓ．， Ｈｏｅｓｔ Ｐ．， Ｄｕｐａｔｙ Ｌ．， Ｐｉｃａｒｄ Ｆ．， Ｃｅｎｔｌｉｖｒｅ Ｍ．， Ｇｈｏｓｎ Ｊ．， Ｆｒｅｎｃｈ ＣＯＶＩＤ Ｃｏｈｏｒｔ Ｓｔｕｄｙ Ｇｒｏｕｐ， Ｔｈｉｅｂａｕｔ Ｒ．， Ｃａｒｄｉｎａｕｄ Ｓ．， Ｍａｌｉｓｓｅｎ Ｂ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｇ．， Ｚａｒｕｂｉｃａ Ａ．， Ｚｕｒａｗｓｋｉ Ｓ．Ｍ．， Ｇｏｄｏｔ Ｖ．， Ｌｅｖｙ Ｙ． Ｄｅｓｉｇｎ， ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ， ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ａ ｐａｎ－ｓａｒｂｅｃｏｖｉｒｕｓ ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ－ｃｅｌｌ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｖａｃｃｉｎｅ． ＥＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅ． ２０２２；８０：１０４０６２．
【0122】
特に、図１に示すような二つのコンストラクトを作製した。当該コンストラクトはヒトＣＤ４０に結合することを確認した（データ示さず）。次に、異なるサルベコウイルスのＲＢＤ領域及びＮｐｅｐ２領域に特異的な異なる重複ペプチド（ＯＬＰ）プールを用いて、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２で感染した回復期ドナーのＰＢＭＣ培養物におけるＴ細胞のインビトロ増殖により、コンストラクトを試験した（図２）。ＲＢＤ領域とＮｐｅｐ２領域との相同性は非常に高いので（図３）、本明細書で開示するコンストラクトはユニバーサルサルベコウイルスワクチンとして使用できる。特に、Ｎｐｅｐ２についてこれら３８のサルベコウイルス間の相同性の平均［最小－最大］％は９３．５［８９．７～１００］％であった（図３）。サルベコウイルス間の配列相同性を超えて、ワクチンＴ細胞エピトープがＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＳＡＲＳ－ＣｏＶ－１と３２のサルベコウイルス間で高度に保存され、７５～１００％相同性に達することが観察された。さらに綿密な分析により、全てのＣＤ８＋Ｔ細胞エピトープのうち、６２％（ｎ＝５７）は、ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２及びＣｏＶ－１間で少なくとも一つの変異が異なるが、これらの変異はＮｅｔＭＨＣ４により予想されるように、それらの大部分（８１％）のＨＬＡ－クラスＩ結合に影響を及ぼさないことが示された。さらに、Ｎｐｅｐ２に含まれる二つのＣＤ４＋Ｔ細胞エピトープ（Ｎ３０１－３１５、及びＮ３０６－３２０）及びＮｐｅｐ２からの六つのＣＤ８＋Ｔ細胞エピトープ（Ｎ３０５－３１４；Ｎ３０６－３１５；Ｎ３０７－３１５；３０８－３１７；３１０－３１９；３１１－３１９）は全てのサルベコウイルス間で１００％相同性であった。さらに、長期にわたる免疫にとって非常に重要なＮｐｅｐ２に対する非常に強力なＣＤ８＋Ｔ細胞応答を観察した（Ｃｏｌｅｏｎ，Ｓｅｖｅｒｉｎ，ｅｔ ａｌ．“Ｄｅｓｉｇｎ，ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ，ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ａ ｐａｎ－ｓａｒｂｅｃｐｖｏｒｉｓ ｄｅｎｄｒｉｔｉｃ－ｃｅｌｌ ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ｖａｃｃｉｎｅ．”ＥＢｉｏＭｅｄｉｃｉｎｅ ８０（２０２２）：１０４０６２の図６ｃを参照）。世界的に、これらの結果から、Ｎｐｅｐ２配列が広範な交差反応性Ｔ細胞応答を誘発することを目的とする汎サルベコウイルスワクチンの設計に適していることが確認されている。ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２に感染した回復期ドナーのＰＢＭＣ培養物の汎サルベコウイルスＤＣ標的化ワクチン（ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶ、すなわち、ＣＤ４０．Ｎ２．ＲＢＤｖＳＡＤ－Ｑワクチン）刺激後（図４Ａ）、インビトロでＢ細胞活性化及び形質細胞分化を誘導し（図４Ｂ）、抗ＲＢＤ ＩｇＧを産生することができた図４Ｃ）。ｐｏｌｙ－ＩＣＬＣをアジュバントとしたＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶワクチンで二回免疫化したＫ１８ｈＡＣＥ２ｔｇ×ｈＣＤ４０ｔｇマウスは、対照動物（ＰＢＳ又はｐｏｌｙ－ＩＣＬＣ）と比較して、致死性ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２武漢曝露から保護されることを実証した（図５Ａ）。したがって、ワクチン接種を受けたマウスの肺中のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ウイルス複製（ゲノム当量／μｇＲＮＡ）及び脳中のウイルス感染粒子（ＰＦＵ／ｍｇ組織）は、対照よりも低い乃至検出不可能であった（図５Ｂ）。次に、アジュバントを含まないＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶワクチン２００μｇを五匹の回復期カニクイザルに皮下注射した。免疫化の四週間後、五匹のＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶで免疫化された回復期ＮＨＰ及び六匹のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ナイーブ動物（対照群）を、総用量１０ｅ５ＴＣＩＤ５０のＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２Ｂ．１．６１７．２変異ウイルス（デルタ株）に曝露した。気管及び鼻咽頭スワブ及び気管支肺胞洗浄（ＢＡＬ）でウイルスゲノムＲＮＡ（ｇＲＮＡ、図６Ａ）及びサブゲノムＲＮＡ（ｓｇＲＮＡ、図６Ｂ）が検出されたことから示されるように全てのナイーブ動物が感染した。デルタ株への曝露後にＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶで免疫化された回復期カニクイザルはすべて、対象動物よりも有意に低いウイルスゲノムＲＮＡレベル（図６Ａ）及びウイルスサブゲノムＲＮＡレベル（図６Ｂ）を示すことを実証した。ＣＤ４０．Ｐａｎ．ＣｏＶでの免疫化により、スパイクに対する結合及び中和Ａｂ応答（図７Ａ）、及びヌクレオカプシドに対する結合Ａｂ応答（図７Ｂ）、並びに武漢、デルタ、及びベータＲＢＤに対する交差反応性結合及び中和Ａｂ応答（図７Ｃ～Ｅ）を誘導できることも実証した。
【0123】
参考文献：
本願全体を通して、様々な文献で本発明が関係する分野の技術状態について記載されている。これらの文献の開示は、参照により本開示に組み込まれる。
１． Ｖｏｙｓｅｙ， Ｍ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ｔｈｅ ＣｈＡｄＯｘ１ ｎＣｏＶ－１９ ｖａｃｃｉｎｅ （ＡＺＤ１２２２） ａｇａｉｎｓｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２： ａｎ ｉｎｔｅｒｉｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｆｏｕｒ ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｔｒｉａｌｓ ｉｎ Ｂｒａｚｉｌ， Ｓｏｕｔｈ Ａｆｒｉｃａ， ａｎｄ ｔｈｅ ＵＫ． Ｌａｎｃｅｔ （Ｌｏｎｄｏｎ， Ｅｎｇｌａｎｄ） ３９７， ９９－１１１， （２０２０）．
２． Ｃｏｒｂｅｔｔ， Ｋ． Ｓ． ｅｔ ａｌ． Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｍＲＮＡ－１２７３ ｖａｃｃｉｎｅ ａｇａｉｎｓｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｉｎ ｎｏｎｈｕｍａｎ ｐｒｉｍａｔｅｓ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ ３８３， １５４４－１５５５ （２０２０）．
３． Ｐｏｌａｃｋ， Ｆ． Ｐ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ｔｈｅ ＢＮＴ１６２ｂ２ ｍＲＮＡ Ｃｏｖｉｄ－１９ ｖａｃｃｉｎｅ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ． ３８３， ２６０３－２６１５ （２０２０）．
４． Ｍｅｒｃａｄｏ， Ｎ． Ｂ． ｅｔ ａｌ． Ｓｉｎｇｌｅ－ｓｈｏｔ Ａｄ２６ ｖａｃｃｉｎｅ ｐｒｏｔｅｃｔｓ ａｇａｉｎｓｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｉｎ ｒｈｅｓｕｓ ｍａｃａｑｕｅｓ． Ｎａｔｕｒｅ ５８６， ５８３－５８８ （２０２０）．
５． Ｏｌｉｖｅｒ， Ｓ． Ｅ． ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ａｄｖｉｓｏｒｙ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｏｎ Ｉｍｍｕｎｉｚａｔｉｏｎ Ｐｒａｃｔｉｃｅｓ’ Ｉｎｔｅｒｉｍ Ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｕｓｅ ｏｆ Ｐｆｉｚｅｒ－ＢｉｏＮＴｅｃｈ ＣＯＶＩＤ－１９ Ｖａｃｃｉｎｅ － Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ， Ｄｅｃｅｍｂｅｒ ２０２０． ＭＭＷＲ Ｍｏｒｂ． Ｍｏｒｔａｌ． Ｗｋｌｙ Ｒｅｐ． ６９， １９２２－１９２４ （２０２０）．
６． Ｗｉｄｇｅ， Ａ． Ｔ． ｅｔ ａｌ． Ｄｕｒａｂｉｌｉｔｙ ｏｆ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ ａｆｔｅｒ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｍＲＮＡ－１２７３ Ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ． ３８４， ８０－８２ （２０２０）．
７． Ａｎｄｅｒｓｏｎ， Ｅ． Ｊ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｍＲＮＡ－１２７３ ｖａｃｃｉｎｅ ｉｎ ｏｌｄｅｒ ａｄｕｌｔｓ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ． ３８３， ２４２７－２４３８ （２０２０）．
８． Ｅｌｌａ， Ｒ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ａｎ ｉｎａｃｔｉｖａｔｅｄ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｖａｃｃｉｎｅ， ＢＢＶ１５２： ｉｎｔｅｒｉｍ ｒｅｓｕｌｔｓ ｆｒｏｍ ａ ｄｏｕｂｌｅ－ｂｌｉｎｄ， ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ， ｍｕｌｔｉｃｅｎｔｒｅ， ｐｈａｓｅ ２ ｔｒｉａｌ， ａｎｄ ３－ｍｏｎｔｈ ｆｏｌｌｏｗ－ｕｐ ｏｆ ａ ｄｏｕｂｌｅ－ｂｌｉｎｄ， ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ ｐｈａｓｅ １ ｔｒｉａｌ． Ｌａｎｃｅｔ Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ． ７， ９５０－９６１ （２０２１）．
９． Ｌｅｖｉｎｅ－Ｔｉｅｆｅｎｂｒｕｎ， Ｍ． ｅｔ ａｌ． Ｉｎｉｔｉａｌ ｒｅｐｏｒｔ ｏｆ ｄｅｃｒｅａｓｅｄ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｖｉｒａｌ ｌｏａｄ ａｆｔｅｒ ｉｎｏｃｕｌａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ＢＮＴ１６２ｂ２ ｖａｃｃｉｎｅ． Ｎａｔ． Ｍｅｄ． ２７， ７９０－７８２ （２０２１）．
１０． Ｌｏｇｕｎｏｖ， Ｄ． Ｙ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ａｎ ｒＡｄ２６ ａｎｄ ｒＡｄ５ ｖｅｃｔｏｒ－ｂａｓｅｄ ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ ｐｒｉｍｅ－ｂｏｏｓｔ ＣＯＶＩＤ－１９ ｖａｃｃｉｎｅ： ａｎ ｉｎｔｅｒｉｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ａ ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｐｈａｓｅ ３ ｔｒｉａｌ ｉｎ Ｒｕｓｓｉａ． Ｌａｎｃｅｔ （Ｌｏｎｄ．， Ｅｎｇｌ．） ３９７， ６７１－６８１ （２０２１）．
１１． Ｗｕ， Ｚ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ， ｔｏｌｅｒａｂｉｌｉｔｙ， ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ａｎ ｉｎａｃｔｉｖａｔｅｄ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｖａｃｃｉｎｅ （ＣｏｒｏｎａＶａｃ） ｉｎ ｈｅａｌｔｈｙ ａｄｕｌｔｓ ａｇｅｄ ６０ ｙｅａｒｓ ａｎｄ ｏｌｄｅｒ： ａ ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ， ｄｏｕｂｌｅ－ｂｌｉｎｄ， ｐｌａｃｅｂｏ－ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ， ｐｈａｓｅ １／２ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｔｒｉａｌ． Ｌａｎｃｅｔ Ｉｎｆｅｃｔ． Ｄｉｓ． ２１， ８０３－８１２ （２０２１）．
１２． Ｍａｒｌｉｎ Ｒ，． ｅｔ ａｌ． Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｄｏｍａｉｎ ｔｏ ｃｅｌｌｓ ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ ＣＤ４０ ｉｍｐｒｏｖｅｓ ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ｔｏ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｃｏｎｖａｌｅｓｃｅｎｔ ｍａｃａｑｕｅｓ． Ｎａｔ Ｃｏｍｍｕｎ． ２０２１ Ｓｅｐ １；１２（１）：５２１５． ｄｏｉ： １０．１０３８／ｓ４１４６７－０２１－２５３８２－０． ＰＭＩＤ： ３４４７１１２２．
本願全体を通して、様々な文献で本発明が関係する分野の技術状態について記載されている。これらの文献の開示は、参照により本開示に組み込まれる。
１． Ｖｏｙｓｅｙ， Ｍ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ｔｈｅ ＣｈＡｄＯｘ１ ｎＣｏＶ－１９ ｖａｃｃｉｎｅ （ＡＺＤ１２２２） ａｇａｉｎｓｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２： ａｎ ｉｎｔｅｒｉｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ｆｏｕｒ ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｔｒｉａｌｓ ｉｎ Ｂｒａｚｉｌ， Ｓｏｕｔｈ Ａｆｒｉｃａ， ａｎｄ ｔｈｅ ＵＫ． Ｌａｎｃｅｔ （Ｌｏｎｄｏｎ， Ｅｎｇｌａｎｄ） ３９７， ９９－１１１， （２０２０）．
２． Ｃｏｒｂｅｔｔ， Ｋ． Ｓ． ｅｔ ａｌ． Ｅｖａｌｕａｔｉｏｎ ｏｆ ｔｈｅ ｍＲＮＡ－１２７３ ｖａｃｃｉｎｅ ａｇａｉｎｓｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｉｎ ｎｏｎｈｕｍａｎ ｐｒｉｍａｔｅｓ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ ３８３， １５４４－１５５５ （２０２０）．
３． Ｐｏｌａｃｋ， Ｆ． Ｐ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ｔｈｅ ＢＮＴ１６２ｂ２ ｍＲＮＡ Ｃｏｖｉｄ－１９ ｖａｃｃｉｎｅ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ． ３８３， ２６０３－２６１５ （２０２０）．
４． Ｍｅｒｃａｄｏ， Ｎ． Ｂ． ｅｔ ａｌ． Ｓｉｎｇｌｅ－ｓｈｏｔ Ａｄ２６ ｖａｃｃｉｎｅ ｐｒｏｔｅｃｔｓ ａｇａｉｎｓｔ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｉｎ ｒｈｅｓｕｓ ｍａｃａｑｕｅｓ． Ｎａｔｕｒｅ ５８６， ５８３－５８８ （２０２０）．
５． Ｏｌｉｖｅｒ， Ｓ． Ｅ． ｅｔ ａｌ． Ｔｈｅ Ａｄｖｉｓｏｒｙ Ｃｏｍｍｉｔｔｅｅ ｏｎ Ｉｍｍｕｎｉｚａｔｉｏｎ Ｐｒａｃｔｉｃｅｓ’ Ｉｎｔｅｒｉｍ Ｒｅｃｏｍｍｅｎｄａｔｉｏｎ ｆｏｒ Ｕｓｅ ｏｆ Ｐｆｉｚｅｒ－ＢｉｏＮＴｅｃｈ ＣＯＶＩＤ－１９ Ｖａｃｃｉｎｅ － Ｕｎｉｔｅｄ Ｓｔａｔｅｓ， Ｄｅｃｅｍｂｅｒ ２０２０． ＭＭＷＲ Ｍｏｒｂ． Ｍｏｒｔａｌ． Ｗｋｌｙ Ｒｅｐ． ６９， １９２２－１９２４ （２０２０）．
６． Ｗｉｄｇｅ， Ａ． Ｔ． ｅｔ ａｌ． Ｄｕｒａｂｉｌｉｔｙ ｏｆ ｒｅｓｐｏｎｓｅｓ ａｆｔｅｒ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｍＲＮＡ－１２７３ Ｖａｃｃｉｎａｔｉｏｎ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ． ３８４， ８０－８２ （２０２０）．
７． Ａｎｄｅｒｓｏｎ， Ｅ． Ｊ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｍＲＮＡ－１２７３ ｖａｃｃｉｎｅ ｉｎ ｏｌｄｅｒ ａｄｕｌｔｓ． Ｎ． Ｅｎｇｌ． Ｊ． Ｍｅｄ． ３８３， ２４２７－２４３８ （２０２０）．
８． Ｅｌｌａ， Ｒ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ａｎ ｉｎａｃｔｉｖａｔｅｄ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｖａｃｃｉｎｅ， ＢＢＶ１５２： ｉｎｔｅｒｉｍ ｒｅｓｕｌｔｓ ｆｒｏｍ ａ ｄｏｕｂｌｅ－ｂｌｉｎｄ， ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ， ｍｕｌｔｉｃｅｎｔｒｅ， ｐｈａｓｅ ２ ｔｒｉａｌ， ａｎｄ ３－ｍｏｎｔｈ ｆｏｌｌｏｗ－ｕｐ ｏｆ ａ ｄｏｕｂｌｅ－ｂｌｉｎｄ， ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ ｐｈａｓｅ １ ｔｒｉａｌ． Ｌａｎｃｅｔ Ｉｎｆｅｃｔ Ｄｉｓ． ７， ９５０－９６１ （２０２１）．
９． Ｌｅｖｉｎｅ－Ｔｉｅｆｅｎｂｒｕｎ， Ｍ． ｅｔ ａｌ． Ｉｎｉｔｉａｌ ｒｅｐｏｒｔ ｏｆ ｄｅｃｒｅａｓｅｄ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｖｉｒａｌ ｌｏａｄ ａｆｔｅｒ ｉｎｏｃｕｌａｔｉｏｎ ｗｉｔｈ ｔｈｅ ＢＮＴ１６２ｂ２ ｖａｃｃｉｎｅ． Ｎａｔ． Ｍｅｄ． ２７， ７９０－７８２ （２０２１）．
１０． Ｌｏｇｕｎｏｖ， Ｄ． Ｙ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ ａｎｄ ｅｆｆｉｃａｃｙ ｏｆ ａｎ ｒＡｄ２６ ａｎｄ ｒＡｄ５ ｖｅｃｔｏｒ－ｂａｓｅｄ ｈｅｔｅｒｏｌｏｇｏｕｓ ｐｒｉｍｅ－ｂｏｏｓｔ ＣＯＶＩＤ－１９ ｖａｃｃｉｎｅ： ａｎ ｉｎｔｅｒｉｍ ａｎａｌｙｓｉｓ ｏｆ ａ ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ ｐｈａｓｅ ３ ｔｒｉａｌ ｉｎ Ｒｕｓｓｉａ． Ｌａｎｃｅｔ （Ｌｏｎｄ．， Ｅｎｇｌ．） ３９７， ６７１－６８１ （２０２１）．
１１． Ｗｕ， Ｚ． ｅｔ ａｌ． Ｓａｆｅｔｙ， ｔｏｌｅｒａｂｉｌｉｔｙ， ａｎｄ ｉｍｍｕｎｏｇｅｎｉｃｉｔｙ ｏｆ ａｎ ｉｎａｃｔｉｖａｔｅｄ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｖａｃｃｉｎｅ （ＣｏｒｏｎａＶａｃ） ｉｎ ｈｅａｌｔｈｙ ａｄｕｌｔｓ ａｇｅｄ ６０ ｙｅａｒｓ ａｎｄ ｏｌｄｅｒ： ａ ｒａｎｄｏｍｉｓｅｄ， ｄｏｕｂｌｅ－ｂｌｉｎｄ， ｐｌａｃｅｂｏ－ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ， ｐｈａｓｅ １／２ ｃｌｉｎｉｃａｌ ｔｒｉａｌ． Ｌａｎｃｅｔ Ｉｎｆｅｃｔ． Ｄｉｓ． ２１， ８０３－８１２ （２０２１）．
１２． Ｍａｒｌｉｎ Ｒ，． ｅｔ ａｌ． Ｔａｒｇｅｔｉｎｇ ＳＡＲＳ－ＣｏＶ－２ ｒｅｃｅｐｔｏｒ－ｂｉｎｄｉｎｇ ｄｏｍａｉｎ ｔｏ ｃｅｌｌｓ ｅｘｐｒｅｓｓｉｎｇ ＣＤ４０ ｉｍｐｒｏｖｅｓ ｐｒｏｔｅｃｔｉｏｎ ｔｏ ｉｎｆｅｃｔｉｏｎ ｉｎ ｃｏｎｖａｌｅｓｃｅｎｔ ｍａｃａｑｕｅｓ． Ｎａｔ Ｃｏｍｍｕｎ． ２０２１ Ｓｅｐ １；１２（１）：５２１５． ｄｏｉ： １０．１０３８／ｓ４１４６７－０２１－２５３８２－０． ＰＭＩＤ： ３４４７１１２２．
【図1】
【図2A】
【図2B】
【図3】
【図4A】
【図4B】
【図4C】
【図5】
【図6】
【図7A】
【図7B】
【図7C】
【図7D】
【図7E】
【配列表】
【国際調査報告】