(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2024-12-05
(54)【発明の名称】発現効率を増加させた核酸発現プラットフォーム
(51)【国際特許分類】
C12N 15/12 20060101AFI20241128BHJP
C12N 15/63 20060101ALI20241128BHJP
C12N 15/11 20060101ALI20241128BHJP
C12N 15/53 20060101ALI20241128BHJP
C12N 15/13 20060101ALI20241128BHJP
A61K 31/7088 20060101ALI20241128BHJP
A61K 48/00 20060101ALI20241128BHJP
A61P 43/00 20060101ALI20241128BHJP
A61P 37/04 20060101ALI20241128BHJP
【FI】
C12N15/12 ZNA
C12N15/63 Z
C12N15/11 Z
C12N15/53
C12N15/13
A61K31/7088
A61K48/00
A61P43/00 105
A61P37/04
【審査請求】有
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024557871
(86)(22)【出願日】2022-12-09
(85)【翻訳文提出日】2024-06-12
(86)【国際出願番号】 KR2022020062
(87)【国際公開番号】W WO2023113393
(87)【国際公開日】2023-06-22
(31)【優先権主張番号】10-2021-0177977
(32)【優先日】2021-12-13
(33)【優先権主張国・地域又は機関】KR
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】524223312
【氏名又は名称】エスエムエル バイオファーム カンパニー リミテッド
【氏名又は名称原語表記】SML BIOPHARM CO., LTD.
(74)【代理人】
【識別番号】110000729
【氏名又は名称】弁理士法人ユニアス国際特許事務所
(72)【発明者】
【氏名】ナム、ジェ ファン
(72)【発明者】
【氏名】パク、ヒョン ジュン
(72)【発明者】
【氏名】ノ、ガ ヒョン
【テーマコード(参考)】
4C084
4C086
【Fターム(参考)】
4C084AA13
4C084NA14
4C084ZB09
4C084ZB21
4C086AA02
4C086EA16
4C086NA14
4C086ZB09
4C086ZB21
(57)【要約】
本開示は、コーディング領域の下流に複数の翻訳調節要素が挿入された核酸分子と、前記核酸分子が挿入された組換え発現ベクターのような核酸発現プラットフォームまたは核酸発現システムに関する。本開示の核酸分子を活用してコーディング領域に挿入された目的遺伝子が効率的に発現することができる。発現プラットフォームを活用して、レポーター遺伝子、抗原および/または治療用タンパク質またはペプチドの発現効率を向上させることができる。
【選択図】
図1
【特許請求の範囲】
【請求項1】
翻訳調節要素と、
前記翻訳調節要素と作動可能に連結されるコーディング領域と、を含み、
前記翻訳調節要素は、前記コーディング領域の上流(upstream)に位置する上流翻訳調節要素と、前記コーディング領域の下流(downstream)に位置する下流翻訳調節要素と、を含み、
前記下流翻訳調節要素は、複数の下流翻訳調節要素を含む核酸分子。
【請求項2】
前記下流翻訳調節要素は、前記コーディング領域の下流に位置する第1下流翻訳調節要素および第2下流翻訳調節要素を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項3】
前記複数の下流翻訳調節要素は、それぞれヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つの遺伝子に由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項4】
前記複数の下流翻訳調節要素は、それぞれ独立して、配列識別番号:8、配列識別番号:9、配列識別番号:10、配列識別番号:11、配列識別番号:12、配列識別番号:13および配列識別番号:14から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項5】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、
前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMP、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項6】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、
前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項7】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項8】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトCCL19由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項9】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトAAMP由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項10】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMP、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項11】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMPおよび前記ヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項12】
前記下流翻訳調節要素は、前記第2下流翻訳調節要素の下流に位置する第3下流翻訳調節要素をさらに含む、請求項2に記載の核酸分子。
【請求項13】
前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(TNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(FTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(CCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(AAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(RPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(DEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項12に記載の核酸分子。
【請求項14】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトFTLまたはヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項12に記載の核酸分子。
【請求項15】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項12に記載の核酸分子。
【請求項16】
前記第1下流翻訳調節要素は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトCCL19、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項12に記載の核酸分子。
【請求項17】
前記第1下流翻訳調節要素は、ヒトDEFA5由来の転写翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項12に記載の核酸分子。
【請求項18】
前記上流翻訳調節要素は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項19】
前記上流翻訳調節要素は、配列識別番号:1、配列識別番号:2、配列識別番号:3、配列識別番号:4、配列識別番号:5、配列識別番号:6および配列識別番号:7から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項20】
前記核酸分子は、RNAである、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項21】
前記核酸分子は、前記コーディング領域と作動可能に連結される転写調節要素をさらに含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項22】
前記核酸分子は、前記下流翻訳調節配列の下流に位置するポリアデニル化シグナル配列またはポリアデノシン配列をさらに含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項23】
前記コーディング領域は、レポータータンパク質またはその断片、およびマーカー(marker)または選別タンパク質またはその断片のうち少なくとも1つをコード化する、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項24】
前記コーディング領域は、抗原またはその断片をコード化する、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項25】
前記抗原は、病原性抗原、腫瘍抗原、またはこれらの変異体または誘導体であるペプチドを含む、請求項24に記載の核酸分子。
【請求項26】
前記コーディング領域は、疾患の治療のためのペプチドまたはその断片をコード化する、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項27】
請求項1に記載の核酸分子が挿入された組換え発現ベクター。
【請求項28】
請求項1に記載の核酸分子または請求項1に記載の核酸分子が挿入された組換え発現ベクターを生体内に注入し、前記注入した核酸分子からタンパク質またはペプチドを発現させて前記タンパク質またはペプチドを製造する方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
本特許出願は、韓国政府科学技術情報通信部の「新種・変種感染病対応プラットフォーム核心技術開発事業」の一環として「新しいmRNAワクチン用プラットフォーム開発」課題(主管機関:韓国カトリック大学校産学協力団;課題番号:1711158916)および韓国政府食品医薬品安全処の「感染病対応革新技術支援研究事業」の一環として「mRNAワクチンなどの毒性評価技術開発研究(1)」課題(主管機関:韓国カトリック大学校産学協力団;課題番号:1475013322)の実行結果物に関する。
【0002】
本開示は、核酸発現プラットフォームに関し、より詳細には、発現効率を増加させた核酸分子およびこれを含む組換え発現ベクターのような核酸発現プラットフォームまたは核酸発現システムに関する。
【背景技術】
【0003】
1970年代に遺伝子組換え技術が知られて以来、発現させようとする目的遺伝子(Gene Of Interest,GOI)を発現させることができる発現システムが知られている。このような発現システムの1つとして細胞ベースの発現システムは、微生物や真核細胞(eukaryotes)の発現システムを用い、細胞を含有しない発現システムは、精製されたRNAポリメラーゼ(RNA polymerase)、リボソーム(ribosome)、tRNAおよびリボヌクレオチド(ribonucleotides)を使用することが一般的である。
【0004】
特に、真核細胞から誘導したタンパク質は、発現後にもリン酸化、メチル化、グリコシル化などの翻訳後修飾(post-translational modification)が起こるが、微生物は、このような翻訳後修飾メカニズムを有していない。したがって、真核細胞誘導のタンパク質を発現しようとする場合には、真核細胞発現システムを使用しなければならない。
【0005】
真核細胞誘導の発現システムは、遺伝子治療剤や核酸ワクチンなどに活用することができる。遺伝子治療剤の場合には、様々な疾患を治療できるペプチドまたはタンパク質をコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)からなる目的遺伝子を発現システム内に挿入する。核酸ワクチンの場合には、抗原として発現することができるペプチドまたはタンパク質をコード化するオープンリーディングフレームからなる目的遺伝子を発現システム内に挿入する。しかしながら、目的遺伝子の発現効率を向上させることができる核酸発現システムは、関連技術分野において絶えず要求されている。
【発明の概要】
【発明が解決しようとする課題】
【0006】
本開示の目的は、目的遺伝子の発現効率を向上させることができる核酸発現プラットフォームまたは核酸発現システムを提供することにある。
【課題を解決するための手段】
【0007】
一態様によれば、翻訳調節要素と、前記翻訳調節要素と作動可能に連結されるコーディング領域と、を含み、前記翻訳調節要素は、前記コーディング領域の上流(upstream)に位置する上流翻訳調節要素と、前記コーディング領域の下流(downstream)に位置する下流翻訳調節要素を含み、前記下流翻訳調節要素は、複数の下流翻訳調節要素と、を含む核酸分子を開示する。
【0008】
例示的な実施形態において、前記下流翻訳調節要素は、前記コーディング領域の下流に位置する第1下流翻訳調節要素および第2下流翻訳調節要素を含んでもよい。
【0009】
一例として、前記複数の下流翻訳調節要素(例えば、第1下流翻訳調節要素および第2下流翻訳調節要素)は、それぞれ、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つの遺伝子に由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0010】
前記複数の下流翻訳調節要素(例えば、前記第1下流翻訳調節要素および前記第2下流翻訳調節要素)は、それぞれ独立して、配列識別番号:8、配列識別番号:9、配列識別番号:10、配列識別番号:11、配列識別番号:12、配列識別番号:13および配列識別番号:14から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0011】
例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMP、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0012】
他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0013】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0014】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトCCL19由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0015】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトAAMP由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0016】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMP、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0017】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMPおよび前記ヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0018】
さらに他の例示的な実施形態において、前記下流翻訳調節要素は、前記第2下流翻訳調節要素の下流に位置する第3下流翻訳調節要素をさらに含んでもよい。
【0019】
前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(TNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(FTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(CCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(AAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(RPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(DEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0020】
例えば、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトFTLまたはヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0021】
他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0022】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトCCL19、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0023】
さらに他の例示的な実施形態において、前記第1下流翻訳調節要素は、ヒトDEFA5由来の転写翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0024】
前記上流翻訳調節要素は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0025】
一例として、前記上流翻訳調節要素は、配列識別番号:1、配列識別番号:2、配列識別番号:3、配列識別番号:4、配列識別番号:5、配列識別番号:6および配列識別番号:7から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0026】
前記核酸分子は、RNAでありうる。
【0027】
前記核酸分子は、前記コーディング領域と作動可能に連結される転写調節要素をさらに含んでもよい。
【0028】
選択的な実施形態において、前記核酸分子は、前記下流翻訳調節配列の下流に位置するポリアデニル化シグナル配列またはポリアデノシン配列をさらに含んでもよい。
【0029】
例示的な実施形態において、前記コーディング領域は、レポータータンパク質またはその断片、およびマーカー(marker)または選別タンパク質またはその断片のうち少なくとも1つをコード化することができる。
【0030】
他の例示的な実施形態において、前記コーディング領域は、抗原またはその断片をコード化することができる。
【0031】
例えば、前記抗原は、病原性抗原、腫瘍抗原、またはこれらの変異体または誘導体であるペプチドを含んでもよい。
【0032】
さらに他の例示的な実施形態において、前記コーディング領域は、疾患の治療のためのペプチドまたはその断片をコード化することができる。
【0033】
他の態様において、前述した核酸分子が挿入された組換え発現ベクターを開示する。
【0034】
さらに他の態様において、前述した核酸分子、または前述した核酸分子が挿入された組換え発現ベクターを生体内に注入し、前記注入した核酸分子からタンパク質またはペプチドを発現させて前記タンパク質またはペプチドを製造する方法を開示する。
【発明の効果】
【0035】
本開示の核酸発現プラットフォームは、多数の翻訳調節配列を目的遺伝子のオープンリーディングフレームからなるコーディング領域の下流に配置するように設計される。核酸発現プラットフォームを導入して、発現する転写体を生体内で安定して維持することができる。これによって、本開示の核酸発現プラットフォームを適用して、目的遺伝子が最終的に発現する効率が向上することができる。
【0036】
発現プラットフォームを用いて、レポーター遺伝子、感染性抗原、腫瘍抗原および/または治療目的に活用するペプチドまたはタンパク質のような様々な目的遺伝子の発現効率が向上する。したがって、特定物質の存在の有無を検出または分析するための用途としてはもちろん、遺伝子治療剤、mRNAワクチンおよび/またはタンパク質サブユニットワクチンのようなワクチンを製造するのに本開示の発現プラットフォームを活用することができる。
【図面の簡単な説明】
【0037】
図1は、本開示の例示的な実施形態により目的遺伝子を効率的に発現させることができる核酸分子またはポリヌクレオチドの構成を概略的に示した模式図である。
【0038】
図2は、本開示の他の例示的な実施形態により目的遺伝子を効率的に発現させることができる核酸分子またはポリヌクレオチドの構成を概略的に示した模式図である。
【0039】
図3および
図4は、それぞれ本開示の例示的な実施例によりウミシイタケルシフェラーゼ(renilla luciferase)をコード化するコーディング領域を有する核酸分子をマウス筋肉誘導細胞株であるNor10細胞に形質転換させた後、それぞれ6時間と24時間経過後にウミシイタケルシフェラーゼの発現程度を測定した結果を示したグラフである。
【0040】
図5および
図6は、それぞれ本開示の例示的な実施例によりウミシイタケルシフェラーゼをコード化するコーディング領域を有する核酸分子をヒト誘導細胞株であるHeLa細胞に形質転換させた後、それぞれ6時間と24時間経過後にウミシイタケルシフェラーゼの発現程度を測定した結果を示したグラフである。
【0041】
図7および
図8は、それぞれ本開示の例示的な実施例によりウミシイタケルシフェラーゼをコード化するコーディング領域を有する核酸分子をヒト誘導細胞株である293A細胞に形質転換させた後、それぞれ6時間と24時間経過後にウミシイタケルシフェラーゼの発現程度を測定した結果を示したグラフである。
【0042】
図9および
図10は、それぞれ本開示の例示的な実施例によりウミシイタケルシフェラーゼをコード化するコーディング領域を有する核酸分子をマウスの耳に注射した後、6時間経過後にウミシイタケルシフェラーゼの発現程度を測定した結果を示したグラフである。
【0043】
図11および
図12は、それぞれ、本開示の例示的な実施例によりウミシイタケルシフェラーゼをコード化するコーディング領域を有する核酸分子をヒト誘導細胞株である293A細胞に形質転換させた後、それぞれ6時間と24時間経過後にウミシイタケルシフェラーゼの発現程度を測定した結果を示したグラフである。
【0044】
図3~
図12において、A~Gは、それぞれ下流翻訳調節配列を示すためのものである。一番目の文字は、第1下流翻訳調節要素、二番目の文字は、第2下流翻訳調節要素、三番目の文字は、第3下流翻訳調節要素を示す。Aは、ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素である配列識別番号:8、Bは、ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素である配列識別番号:9、Cは、ヒトFTL由来の翻訳調節要素である配列識別番号:10、Dは、ヒトCCL19由来の翻訳調節要素である配列識別番号:11、Eは、ヒトAAMP由来の翻訳調節要素である配列識別番号:12、Fは、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素である配列識別番号:13、Gは、ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素である配列識別番号:14をそれぞれ下流翻訳調節配列に使用したものを示す。また、比較例として使用したpHJ5核酸分子から発現したペプチドまたはタンパク質の発現程度と比較した。
【発明を実施するための形態】
【0045】
用語の定義
本明細書において、用語「アミノ酸」は、最も広い意味で使用され、自然発生L-アミノ酸または残基を含むものと意図される。アミノ酸は、D-アミノ酸だけでなく、化学的に修飾されたアミノ酸、例えば、アミノ酸類似体、タンパク質に通常的に混入しない自然発生アミノ酸、例えば、ノルロイシン、およびアミノ酸の特徴と当業界に知られている特性を有する化学的に合成された化合物を含む。例えば、天然PheまたはProと同じペプチド化合物の立体形態の制限を許容するフェニルアラニンまたはプロリンの類似体または模倣体がアミノ酸の定義内に含まれる。このような類似体および模倣体は、本明細書においてアミノ酸の「機能的均等物」として称される。
【0046】
例えば、標準固相合成技術によって合成された合成ペプチドは、遺伝子によってコード化される(encoded)アミノ酸に制限されず、これによって、与えられたアミノ酸に対してより広範囲に様々な置換を許容する。遺伝子コードによってコード化されていないアミノ酸は、本明細書において「アミノ酸類似体」として称される。
【0047】
一例として、アミノ酸類似体は、GluおよびAspに対する2-アミノアジピン酸(Aad);GluおよびAspに対する2-アミノピメリン酸(Apm);Met、Leuおよび他の脂肪族アミノ酸に対する2-アミノ酪酸(Abu);Met、Leuおよび他の脂肪族アミノ酸に対する2-アミノヘプタン酸(Ahe);Glyに対する2-アミノ酪酸(Aib);Val、LeuおよびIleに対するシクロヘキシルアラニン(Cha);ArgおよびLysに対するホモアルギニン(Har);Lys、ArgおよびHisに対する2,3-ジアミノプロピオン酸(Dap);Gly、ProおよびAlaに対するN-エチルグリシン(EtGly);Gly、ProおよびAlaに対するN-エチルグリシン(EtGly);AsnおよびGlnに対するN-エチルアスパラギン(EtAsn);Lysに対するヒドロキシリシン(Hyl);Lysに対するアロヒドロキシリシン(AHyl);Pro、SerおよびThrに対する3-(および4-)ヒドロキシプロリン(3Hyp、4Hyp);Ile、LeuおよびValに対するアロイソロイシン(AIle);Argに対する4-アミジノフェニルアラニン;Gly、ProおよびAlaに対するN-メチルグリシン(MeGly、サルコシン);Ileに対するN-メチルイソロイシン(MeIle);Metおよび他の脂肪族アミノ酸に対するノルバリン(Nva);Metおよび他の脂肪族アミノ酸のためのノルロイシン(Nle);Lys、ArgおよびHisに対するオルニチン(Orn);Thr、AsnおよびGlnに対するシトルリン(Cit)およびメチオニンスルホキシド(MSO);およびPheに対するN-メチルフェニルアラニン(MePhe)、トリメチルフェニルアラニン、ハロ-(F-、Cl-、Br-またはI-)フェニルアラニンまたはトリフルオリルフェニルアラニンを含む。
【0048】
本明細書において用語「ペプチド」は、自然に存在するものから分離したり、組換え技術(recombinant technique)によってまたは化学的に合成されたタンパク質、タンパク質断片およびペプチドを全部含む。例えば、本開示のペプチドは、少なくとも5個、一例として、少なくとも10個のアミノ酸で構成されている。
【0049】
特定の実施形態において、化合物の変異体、例えば、1つ以上のアミノ酸置換を有するペプチド変異体を提供する。本明細書において「ペプチド変異体(peptide variants)」とは、1つまたはそれ以上のアミノ酸がペプチドのアミノ酸配列に置換(substitutions)、欠失(deletions)、添加(additions)および/または挿入(insertions)されており、元のアミノ酸で構成されたペプチドとほぼ同じ生物学的機能を発揮するものをいう。ペプチド変異体は、元のペプチドと70%以上、好ましくは、90%以上、より好ましくは、95%以上の同一性(identity)を有していなければならない。
【0050】
このような置換体として「保存性」と知られたアミノ酸置換体が含まれ得る。変異体は、また、非保存性(nonconservative)の変化を含むこともできる。例示的な実施形態において、変異体ポリペプチドの配列は、5個またはそれ以下のアミノ酸が置換、欠失、付加または挿入されることによって、元の配列と異なる。変異体は、また、ペプチドの免疫原性(immunogenicity)、二次構造(secondary structure)および水治療性(hydropathic nature)に最小の影響を与えるアミノ酸の欠失または付加によって変化することができる。
【0051】
「保存性」置換とは、1つのアミノ酸が他のアミノ酸に置換されたときにも、ポリペプチドの二次構造などに大きな変化がないことを意味する。アミノ酸変異は、アミノ酸側鎖置換体の相対的類似性、例えば、極性(polarity)、電荷(charge)、水溶性(solubility)、疎水性(hydrophobicity)、親水性(hydrophilicity)および/または両親媒性(amphipathic nature)などの類似性を基礎にして得られる。
【0052】
例えば、アミノ酸は、共通の側鎖特性によって、1)疎水性(ノルロイシン、メチオニン、アラニン、バリン、ロイシン、イソロイシン)、2)中性親水性(システイン、セリン、スレオニン、アスパラギン、グルタミン)、3)酸性(アスパラギン酸、グルタミン酸)、4)塩基性(ヒスチジン、リシン、アルギニン)、5)鎖方向に影響を及ぼす残基(グリシン、プロリン)、6)芳香族(トリプトファン、チロシン、フェニルアラニン)に分類され得る。保存的置換は、これらそれぞれのクラス中の1つのメンバーを同じクラスの他のメンバーに交換することを伴う。
【0053】
アミノ酸側鎖置換体のサイズ、形態および種類に対する分析によって、アルギニン、リシンとヒスチジンは、全部正電荷を帯びた残基であり;アラニン、グリシンとセリンは、類似のサイズを有し;フェニルアラニン、トリプトファンとチロシンは、類似の形態を有することが分かる。したがって、このような考慮事項に基づいて、アルギニン、リシンとヒスチジン;アラニン、グリシンとセリン;そしてフェニルアラニン、トリプトファンとチロシンは、生物学的に機能的均等物といえる。
【0054】
変異を導入するにあたって、アミノ酸の疎水性インデックス(hydropathic index)を考慮することができる。それぞれのアミノ酸は、疎水性と電荷によって疎水性インデックスが付与されている:イソロイシン(+4.5);バリン(+4.2);ロイシン(+3.8);フェニルアラニン(+2.8);システイン/シスチン(+2.5);メチオニン(+1.9);アラニン(+1.8);グリシン(-0.4);スレオニン(-0.7);セリン(-0.8);トリプトファン(-0.9);チロシン(-1.3);プロリン(-1.6);ヒスチジン(-3.2);グルタミン酸(-3.5);グルタミン(-3.5);アスパラギン酸(-3.5);アスパラギン(-3.5);リシン(-3.9);およびアルギニン(-4.5)。
【0055】
タンパク質の相互的な生物学的機能(interactive biological function)を付与するにあたって、疎水性アミノ酸インデックスは非常に重要である。類似の疎水性インデックスを有するアミノ酸で置換する場合に類似の生物学的活性を保有できることは公知の事実である。疎水性インデックスを参照して変異を導入させる場合、好ましくは、±2以内、より好ましくは、±1以内、さらに好ましくは、±0.5以内の疎水性インデックスの差異を示すアミノ酸の間に置換を行う。
【0056】
なお、類似の親水性値(hydrophilicity value)を有するアミノ酸間の置換が均等な生物学的活性を有するタンパク質をもたらすこともよく知られている。次のような親水性値がそれぞれのアミノ酸残基に付与されている:アルギニン(+3.0);リシン(+3.0);アスパラギン酸(+3.0±1);グルタミン酸(+3.0±1);セリン(+0.3);アスパラギン(+0.2);グルタミン(+0.2);グリシン(0);スレオニン(-0.4);プロリン(-0.5± 1);アラニン(-0.5);ヒスチジン(-0.5);システイン(-1.0);メチオニン(-1.3);バリン(-1.5);リシン(-1.8);イソロイシン(-1.8);チロシン(-2.3);フェニルアラニン(-2.5);トリプトファン(-3.4)。親水性値を参照して変異を導入させる場合、好ましくは、± 2以内、より好ましくは、±1以内、より好ましくは、±0.5以内の親水性値の差異を示すアミノ酸の間に置換を行う。
【0057】
分子の活性を全体的に変更させないタンパク質におけるアミノ酸交換は、当該分野においてよく知られている(H.Neurath,R.L.Hill,The Proteins,Academic Press,New York,1979)。最も通常的に起こる交換は、アミノ酸残基Ala/Ser、Val/Ile、Asp/Glu、Thr/Ser、Ala/Gly、Ala/Thr、Ser/Asn、Ala/Val、Ser/Gly、Thy/Phe、Ala/Pro、Lys/Arg、Asp/Asn、Leu/Ile、Leu/Val、Ala/Glu、Asp/Gly間の交換である。
【0058】
一般的に、本明細書において言及されているペプチド(融合タンパク質を含む)およびポリヌクレオチドは、分離した(isolated)ものである。「分離した(isolated)」ペプチドまたはポリヌクレオチドとは、元の環境から除去されたものである。例えば、自然状態で存在するタンパク質は、その状態で一緒に存在する物質の全部あるいは一部を除去することによって分離されるものである。このようなポリペプチドは、少なくとも90%以上の純度を有しなければならず、好ましくは、95%、より好ましくは、99%以上の純度を有しなければならない。ポリヌクレオチドは、ベクター内でクローニングさせることによって分離される。本明細書上に言及されたヌクレオチド配列によってコード化(encode)される組換えペプチドは、知られている多くの発現ベクターのうちいずれかを用いても公知の方法で容易に製造することができる。発現は、組換えタンパク質をコード化するDNA配列を含む発現ベクターで形質転換された適切な宿主細胞(host cell)内で行うことができる。適切な宿主細胞には、原核細胞(prokaryotes)、酵母(yeast)および真核細胞(eukaryotes)が含まれる。一例として、酵母、昆虫細胞または哺乳動物細胞株(CosまたはCHOなど)のような真核生物誘導の細胞株を宿主細胞に用いることができる。
【0059】
本明細書において「ポリヌクレオチド」または「核酸」は、交換可能に使用され、任意の長さのヌクレオチドの重合体を指し、DNA(例えば、cDNA)およびRNA分子を包括的に含む。核酸分子の構成単位である「ヌクレオチド」は、デオキシリボヌクレオチド、リボヌクレオチド、修飾ヌクレオチドまたは塩基、および/またはその類似体、またはDNAまたはRNAポリメラーゼ(polymerase)によって、または合成反応によって重合体内に混入しうる任意の基質でありうる。ポリヌクレオチドは、修飾ヌクレオチド、糖または塩基が修飾された類似体(analogue)、例えば、メチル化ヌクレオチドおよびその類似体を含んでもよい。
【0060】
ヌクレオチドにおける変異は、タンパク質において変異をもたらさないものもある。このような核酸は、機能的に均等なコドンまたは同じアミノ酸をコード化するコドン(例えば、コドンの縮退性によって、アルギニンまたはセリンに対するコドンは6個である)、または生物学的に均等なアミノ酸をコード化するコドンを含む核酸分子を含む。また、ヌクレオチドにおける変異がタンパク質自体に変化をもたらすこともできる。タンパク質のアミノ酸に変化をもたらす変異である場合にも、本開示のタンパク質とほぼ同じ活性を示すものが得られる。
【0061】
本開示の核酸分子またはポリヌクレオチドが有する特徴、例えば、ワクチンおよび/または免疫増強剤としての効果を有する範囲で、本開示のペプチドおよび核酸分子は、配列リストに記載されたアミノ酸配列または塩基配列に限定されないことは、通常の技術者にとって明確である。例えば、発現調節配列に作動可能に連結されるコーディング領域および/またはこれから発現する組換えタンパク質/ペプチドに含まれ得る生物学的機能的均等物は、前述したコーディング領域および/組換えタンパク質と均等な生物学的活性を発揮する塩基配列の変異を有するポリヌクレオチドおよび/またはアミノ酸配列の変異を有するタンパク質/ペプチドでありうる。
【0062】
前述した生物学的均等活性を有する変異を考慮すると、ペプチドおよび/またはタンパク質をコード化する核酸分子は、配列リストに記載された配列と実質的同一性(substantial identity)を示す配列も含むと解される。前記の実質的同一性は、上記した本開示の配列と任意の他の配列を最大限対応するようにアラインし、当業界において通常用いられるアルゴリズムを用いてアラインした配列を分析した場合に、最小61%の相同性、より好ましくは、70%の相同性、さらに好ましくは、80%の相同性、最も好ましくは、90%の相同性を示す配列を意味する。配列比較のためのアラインメント方法は、当業界においてよく知られている。
本明細書において使用された用語「ベクター」は、宿主細胞に伝達が可能であり、好ましくは、1つ以上の目的遺伝子または配列の発現が可能に作製された構造物を意味する。例えば、ベクターには、ウイルスベクター(viral vectors)、DNAまたはRNA発現ベクター(expression vectors)、プラスミド(plasmid)、コスミド(cosmid)またはファージベクター(phage vectors)、CCA(cationic condensing agents)と連結されたDNAまたはRNA発現ベクター、リポソーム(liposomes)で包まれたDNAまたはRNA発現ベクター、プロデューサー細胞(producer cells)のような特定の真核細胞(eukaryotic cells)などが含まれる。
【0063】
本明細書において「発現調節配列(expression control/regulation sequence)」または「発現調節要素(expression control/regulation element)」は、核酸分子の転写(transcription)および/または転写体(transcript)形態の核酸から翻訳(translation)を調節する核酸配列を意味し得る。なお、「転写調節配列(transcription control/regulation sequence)」または「転写調節要素(transcription control/regulation element)」は、核酸の転写を調節する核酸配列を意味する。転写調節要素は、構成的プロモーター(constituted promoter)または誘導性プロモーター(inducible promoter)のようなプロモーターまたはエンハンサー(enhancer)などがある。
【0064】
また、転写体形態の核酸からタンパク質またはペプチドへの翻訳を調節する核酸配列に対して「翻訳調節配列(translation control/regulation sequence)」または「翻訳調節要素(translation control/regulation element)」という用語を使用することができる。これらの発現調節配列/要素、転写調節配列/要素および/または翻訳調節配列/要素は、発現する配列、例えば、転写または翻訳される核酸配列に作動可能に連結(operatively linked)されている。
【0065】
本明細書において用語「作動可能に連結された(operatively linked)」は、核酸発現調節配列(例:プロモーター、シグナル配列、リボソーム結合部位、転写終止配列など)と他の核酸配列間の機能的結合を意味し、これによって、前記調節配列は、前記他の核酸配列の転写および/または翻訳を調節する。
【0066】
核酸分子
本開示は、発現調節配列と作動可能に連結されたコーディング領域の発現効率を向上させた核酸分子およびこれを含むベクターのような核酸分子ベースの発現プラットフォームまたは発現システムに基づく。
図1は、本開示の例示的な実施形態により、目的遺伝子を効率的に発現させることができる核酸分子またはポリヌクレオチドの構成を概略的に示した模式図である。
【0067】
図1に示されたように、核酸分子は、翻訳開始(translation initiation)活性を有するヌクレオチド配列を含む翻訳調節要素(Translation control element,TLCE)と、翻訳調節要素(TLCE)と作動可能に連結され、目的遺伝子(Gene of Interest,GOI)のオープンリーディングフレーム(open reading frame;ORF)からなるコーディング領域(coding region,CR)と、を含んでもよい。
【0068】
選択的に、核酸分子は、コーディング領域(CR)と作動可能に連結される転写調節要素(TCCE)および/または翻訳調節要素(TLCE)の下流(downstream)に位置するポリアデニル化シグナル配列またはポリアデノシン配列(PA)のうち少なくとも1つのヌクレオチド配列を含んでもよい。
【0069】
翻訳調節要素(TLCE)は、オープンリーディングフレーム(ORF)形態で挿入されるコーディング領域(CR)と作動可能に連結される翻訳開始活性を有するヌクレオチド配列を含んでもよい。例えば、翻訳調節要素(TLCE)は、コーディング領域(CR)の上流(upstream)に位置する上流翻訳調節要素(U-TLCE)および/またはコーディング領域(CR)の下流(downstream)に位置する下流翻訳調節要素(D-TLCE)を含んでもよい。
【0070】
言い換えれば、上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、コーディング領域(CR)の上流に位置することができ、下流翻訳調節要素(D-TLCE)は、コーディング領域(CR)の下流に位置することができる。言い換えれば、コーディング領域(CR)は、上流翻訳調節要素(U-TLCE)と、下流翻訳調節要素(D-TLCE)の間に位置することができ、目的遺伝子のオープンリーディングフレームからなる標的配列(target sequence,TS)を形成する。
【0071】
上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、キャップ依存性(cap dependent)翻訳開始活性を有する5’-非翻訳領域(5’-Untranslated Region、5’-UTR)の全部または一部でありうる。
【0072】
ほとんどの真核細胞のmRNAは、5’末端に7-メチル-グアノシン(cap、m7G)を有するが、タンパク質翻訳開始複合体(translation initiation complex)が5’末端に位置するcapを認識し、開始コドンであるAUGまで進めてタンパク質合成を始める。すなわち、mRNAの5’末端に位置するcap構造は、タンパク質合成を開始するだけでなく、nucleaseの作用からmRNAの破壊を防ぐ。
【0073】
例えば、インビトロ(in vitro)で転写の最初の過程は、pDNA(plasmid DNA)に制限酵素を処理して線型化させた後、適切なRNAポリメラーゼを用いて製造されたmRNAにm7G(5’)-ppp(5’)G(これをレギュラーキャップアナログという)を付けてキャップ化mRNAを作成して使用することができる。選択的に、キャップアナログなしでインビトロ転写を行い、商業的に利用可能なワクシニアウイルス由来のキャップ化酵素を用いてcap反応を行う方法があり、このようなキャップの逆方向反応を防ぐ「アンチリバース」キャップアナログ(ARCA)を使用することができる。ARCAを導入すると、メチル化が起こったグアノシンの3’-O-メチル化だけがメチル化が起こらないグアノシンのヌクレオチドに結合することができる。
【0074】
一例として、修飾5’-Cap構造は、Cap1(m7Gの隣接ヌクレオチド内のリボースのメチル化)、Cap2(m7Gの2番目の下流に位置するヌクレオチドリボースのメチル化)、Cap3(m7Gの3番目の下流に位置するヌクレオチドリボースのメチル化)、Cap4(m7Gの4番目の下流に位置するヌクレオチドリボースのメチル化)、ARCA(アンチリバースキャップアナログ、修飾ARCA(例えば、ホスホロチオエート修飾ARCA)、イノシン、N1-メチル-グアノシン、2’-フルオロ-グアノシン、7-ジアザ-グアノシン、8-オキソ-グアノシン、2-アミノ-グアノシン、LNA-グアノシン、および2-アジド-グアノシンである。
【0075】
例えば、上流翻訳調節要素(U-TLCE)および/または下流翻訳調節要素(D-TLCE)は、それぞれ、動物、例えば、哺乳綱、具体的には、霊長目、より具体的には、ヒトから誘導したキャップ依存性翻訳開始活性を有するヌクレオチド配列またはその転写体(transcript)配列からなることができる。上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、コーディング領域(CR)から発現するペプチドおよび/またはタンパク質の翻訳過程で翻訳開始複合体(translation initiation complex)が結合する領域であり、コーディング領域(CR)の翻訳を誘導するシス作用性ヌクレオチド配列でありうる。
【0076】
上流翻訳調節要素(U-TLCE)がキャップ依存性翻訳開始活性を有するヌクレオチド配列の全部または一部である場合、コーディング領域(CR)の下流に位置する下流翻訳調節要素(D-TLCE)を含んでもよい。上流翻訳調節要素(U-TLCE)および下流翻訳調節要素(D-TLCE)を含む核酸分子は、コーディング領域(CR)を構成するオープンリーディングフレーム(ORF)の発現効率をさらに向上させることができる。言い換えれば、上流翻訳調節要素(U-TLCE)と、下流翻訳調節要素(D-TLCE)は、コーディング領域(CR)を形成する目的遺伝子(GOI)のオープンリーディングフレームまたはその転写体の翻訳効率を向上させ、転写体であるmRNAが細胞内で破壊されずに、安定して維持されるのに重要な役割をする。
【0077】
例示的な実施形態において、上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン(ヒトALB)、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド19(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素を含んでもよいが、これに限定されない。
【0078】
例えば、ヒトTNNT1由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:1の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトALB由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:2の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトFTL由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:3の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
ヒトCCL19由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:4の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトAAMP由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:5の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトRPS27由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:6の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトDEFA5由来の上流翻訳調節要素(U-TLCE)は、配列識別番号:7の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。しかしながら、上流翻訳調節要素(U-TLCE)が特定ヌクレオチド配列またはその転写体配列に限定されない。
【0079】
下流翻訳調節要素(D-TLCE)は、コーディング領域(CR)の下流(downstream)に順次に挿入される第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)からなることができる。第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、互いに同じでも異なっていてもよい。
【0080】
一例として、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、それぞれ独立して、ヒトTNNT1、ヒトALB、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトAAMP、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素を含んでもよい。
【0081】
例えば、ヒトTNNT1由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、それぞれ配列識別番号:7の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトALB由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、配列識別番号:9の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトFTL由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、配列識別番号:10の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトCCL19由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、配列識別番号:11の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトAAMP由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、配列識別番号:12の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトRPS27由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、配列識別番号:13の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。ヒトDEFA5由来の第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)は、配列識別番号:14の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。しかしながら、第1および第2下流翻訳調節要素(D-TLCE1、D-TLCE2)が特定ヌクレオチド配列またはその転写体配列に限定されない。
【0082】
例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトTNNT1由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトALB、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトAAMP、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。例えば、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトTNNT1由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL、ヒトCCL19およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来することができる。
【0083】
選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトTNNT1由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTLまたはヒトCCL19由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトTNNT1由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトCCL19またはヒトRPS27由来の下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0084】
他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトALB由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0085】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトFTL由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトFTL、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。例えば、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトFTL由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0086】
選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトFTL由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトFTLおよびヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトFTL由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0087】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトCCL19由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。例えば、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトCCL19由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素を含んでもよい。
【0088】
選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトCCL19由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTLまたはヒトRPS27に由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトCCL19由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトCCL19に由来する下流翻訳調節配列またはその転写体配列を含んでもよい。さらに他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトCCL19由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトCCL19またはヒトRPS27由来の下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0089】
さらに他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトCCL19由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTLまたはヒトCCL19由来の下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0090】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトAAMP由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトALB、ヒトFTL、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0091】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトRPS27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトALB、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトAAMP、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。例えば、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトRSP27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトFTL1、ヒトCCL19、ヒトAAMP、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0092】
選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトRSP27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトRSP27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0093】
他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトRSP27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトFTL、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。さらに他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトRSP27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトRPS27またはヒトDEFA5由来の下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。さらに他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトRSP27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL由来の下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0094】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトALB、ヒトFTL、ヒトCCL19、ヒトAAMPおよびヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。例えば、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1、ヒトALB、前記ヒトFTL、ヒトAAMPおよびヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つの下部翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0095】
選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトALB、ヒトFTL、ヒトAAMPおよびヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトALB、ヒトFTLおよびヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0096】
さらに他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL、ヒトCCL9、ヒトAAMPおよびヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。さらに他の選択的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)がヒトDEFA5由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含む場合、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTLまたはヒトRPS27由来の下流翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0097】
コーディング領域(CR)は、意図した目的遺伝子(GOI)のオープンリーディングフレーム(ORF)を含んでいる場合、特に限定されない。例示的な態様において、コーディング領域(CR)は、レポータータンパク質またはその断片、マーカー(marker)または選別タンパク質またはその断片、抗原またはその断片および疾患の治療のためのタンパク質またはその断片のうち少なくとも1つをコード化するヌクレオチド配列またはその転写体配列であるオープンリーディングフレーム(ORF)からなることができる。
【0098】
一例として、コーディング領域(CR)は、ルシフェラーゼタンパク質(例えば、ウミシイタケルシフェラーゼ(renilla luciferase))、緑色蛍光タンパク質(Green Fluorescent Protein,GFP)、高感度緑色蛍光タンパク質(Enhanced Green Fluorescent Protein,EGFP)、ベータ-グルクロニダーゼのようなグルクロニダーゼ(glucuronidase)および/またはベータ-ガラクトシダーゼのようなガラクトシダーゼ(galactosidase)のようなレポータータンパク質/レポーターペプチドまたはその断片をコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)からなることができる。
【0099】
1つの例示的な態様において、コーディング領域(CR)は、アルファ-グロビンおよび/またはベータ-グロビンのようなグロビンタンパク質、ガラクトキナーゼ(galactokinase)および/またはヒポキサンチングアニンホスホリボシルトランスフェラーゼなどのようなマーカーまたは選別タンパク質/ペプチドまたはその断片をコード化するオープンリーディングフレームからなることができる。その他にも、他のレポータータンパク質/ペプチドおよび/またはマーカーまたは選別タンパク質/ペプチドをコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)をコーディング領域(CR)に挿入することができる。
【0100】
他の例示的な態様において、コーディング領域(CR)に挿入される抗原遺伝子は、病原性抗原またはその断片、腫瘍抗原、これらの変異体または誘導体を含むタンパク質/ペプチドをコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)からなることができる。
【0101】
病原性抗原は、個体、特に哺乳動物個体、より特にヒト内免疫学的反応を起こす病原性有機体、特にバクテリア、ウイルスまたは原生動物(多細胞)病原性有機体から誘導される。より具体的には、病原性抗原は、ウイルスまたはバクテリアまたは原生動物有機体の表面に位置する表面抗原、例えば、タンパク質(またはタンパク質の切片、例えば、表面抗原の外部の一部)でありうる。
【0102】
一例として、病原性抗原は、感染性疾患に関連した病原体から誘導されたペプチドまたはタンパク質抗原でありうる。より具体的には、病原性抗原は、アシネトバクター・バウマニ(Acinetobacter baumannii)、アナプラズマ属(Anaplasma genus)、アナプラズマ・ファゴサイトフイルム(Anaplasma phagocytophilum)、ブラジル鉤虫(Ancylostoma braziliense)、十二指腸鉤虫(Ancylostoma duodenale)、溶血性アルカノバクテリア(Arcanobacterium haemolyticum)、回虫(Ascaris lumbricoides)、アスペルギルス属(Aspergillus genus)、アストロウイルス科(Astroviridae)、バベシア属(Babesia genus)、炭疽菌(Bacillus anthracis)、バチルス・セレウス(Bacillus cereus)、バルトネラ・ヘンセラ菌(Bartonella henselae)、BKウイルス、ブラストシスチス・ホミニス(Blastocystis hominis)、ブラストミセス・デルマティティジス(Blastomyces dermatitidis)、百日咳菌(Bordetella pertussis)、ボレリア・ブルグドルフェリ(Borrelia burgdorferi)、ボレリア属(Borrelia genus)、ボレリア種(Borrelia spp)、ブルセラ属(Brucella genus)、マレー糸状虫(Brugia malayi)、ブニヤウイルス科(Bunyaviridae family)、バークホルデリア・セパシア(Burkholderia cepacia)および他のバークホルデリア種、バークホルデリア・マレイ(Burkholderia mallei)、バークホルデリア・シュードマレイ、カリシウイルス科(Caliciviridae family)、カンピロバクター属(Campylobacter genus)、カンジダ・アルビカンス(Candida albicans)、カンジダ種(Candida spp)、クラミジア・トラコマチス(Chlamydia trachomatis)、クラミドフィラ・ニューモニアエ(Chlamydophila pneumoniae)、クラミドフィラ・シッタシ(Chlamydophila psittaci)、CJDプリオン、肝吸虫(Clonorchis sinensis)、クロストリジウム・ボツリヌス(Clostridium botulinum)、クロストリジウム・ディフィシレ(Clostridium difficile)、クロストリジウム・ディフィシレ(Clostridium perfringens)、クロストリジウム・ディフィシレ、クロストリジウム種(Clostridium spp)、クロストリジウム・テタ二(Clostridium tetani)、コクシジオイデス種(Coccidioides spp)、コロナウイルス(coronaviruses)、ジフテリア菌(Corynebacterium diphtheria)、コクシエラ・バーネティー(Coxiella burnetii)、クリミア・コンゴ出血熱ウイルス(Crimean-Congo hemorrhagic fever virus)、クリプトコッカス・ネオフォルマンス(Cryptococcus neoformans)、クリプトスポリジウム属(Cryptosporidium genus)、サイトメガロウイルス(Cytomegalovirus,CMV)、デングウイルス(Dengue viruses)(DEN-1、DEN-2、DEN-3およびDEN-4)、二核アメーバ(Dientamoeba fragilis)、エボラウイルス(Ebolavirus,EBOV)、エキノコックス種(Echinococcus genus)、エーリキア・シャフェンシス(Ehrlichia chaffeensis)、エールリキア・エウィンギイ(Ehrlichia ewingii)、エールリヒア属(Ehrlichia genus)、赤痢アメーバ(Entamoeba histolytica)、エンテロコッカス属(Enterococcus genus)、エンテロウイルス属(Enterovirus genus)、エンテロウイルス(Enteroviruses)、主にコクサッキーAウイルス(Coxsackie A virus)およびエンテロウイルス71(EV71)、表皮菌種(Epidermophyton spp)、エプスタイン・バールウイルス(Epstein-Barr Virus,EBV)、大腸菌(Escherichia coli)O157:H7、O111およびO104:H4、肝蛭(Fasciola hepatica)および巨大肝蛭(Fasciola gigantica)、FFIプリオン、フィラリア(Filarioidea superfamily)、フ狂犬病ウイルス(Flaviviruses)、野兎病菌(Francisella tularensis)、フソバクテリウム属(Fusobacterium genus)、ゲオトリクム・キャンディダム(Geotrichum candidum)、ランブル鞭毛虫(Giardia intestinalis)、顎口虫属種(Gnathostoma spp)、GSSプリオン、ガナリトウイルス(Guanarito virus)、ヘモフィルス・デュクレイ(Haemophilus ducreyi)、ヘモフィルスインフルエンザ(Haemophilus influenza)、ヘリコバクター・ピロリ(Helicobacter pylori)、ヘニパウイルス(Henipavirus)(Hendra virus Nipah virus)、肝炎Aウイルス、肝炎Bウイルス(HBV)、肝炎Cウイルス(HCV)、肝炎Dウイルス、肝炎Eウイルス、単純ヘルペスウイルス1および2(HSV-1およびHSV-2)、ヒストプラズマ・カプスラツム(Histoplasma capsulatum)、HIV(ヒト免疫不全ウイルス、Human immunodeficiency virus)、ホルタエア・ウェルネキイ(Hortaea werneckii)、ヒトボカウイルス(Human bocavirus)(HBoV)、ヒトヘルペスウイルス6(Human herpesvirus 6,HHV-6)およびヒトヘルペスウイルス7(HHV-7)、ヒトメタニューモウイルス(Human metapneumovirus,hMPV)、ヒト乳頭腫ウイルス(Human papillomavirus,HPV)、ヒトパラインフルエンザウイルス(Human parainfluenza viruses,HPIV)、日本脳炎ウイルス(Japanese encephalitis virus)、JCウイルス、フニン(Junin)ウイルス、キンゲラ・キンゲ(Kingella kingae)、クレブシエラ・グラニュロマティス(Klebsiella granulomatis)、クーループリオン(Kuru prion)、ラッサウイルス(Lassa virus)、レジオネラ・ニューモフィラ(Legionella pneumophila)、リーシュマニア属(Leishmania genus)、レプトスピラ属(Leptospira genus)、リステリア・モノサイトゲネス(Listeria monocytogenes)、リンパ球性脈絡髄膜炎ウイルス(Lymphocytic choriomeningitis virus)(LCMV)、マチュポウイルス(Machupo virus)、マラセジア種(Malassezia spp)、マールブルグ・ウイルス(Marburg virus)、麻疹ウイルス(Measles virus)、メタゴニムス・ヨコカワイ(Metagonimus yokogawai)、ミクロスポリジア門(Microsporidia phylum)、伝染性軟属腫ウイルス(Molluscum contagiosum virus)(MCV)、ムンプスウイルス(Mumps virus)、らい菌(Mycobacterium leprae)およびマイコバクテリウム・レプロマトーシス(Mycobacterium lepromatosis)、マイコバクテリウム・ツベルクローシス(Mycobacterium tuberculosis)、マイコバクテリウム・ウルセランス(Mycobacterium ulcerans)、マイコプラズマ肺炎(Mycoplasma pneumoniae)、フォーラーネグレリア(Naegleria fowleri)、アメリカ鉤虫(Necator americanus)、淋菌(Neisseria gonorrhoeae)、髄膜炎菌(Neisseria meningitides)、ノカルジア・アステロイドス(Nocardia asteroids)、ノカルディア種(Nocardia spp)、オンコセルカ・ボルブルス(Onchocerca volvulus)、オリエンティア・ツツガムシ(Orientia tsutsugamushi)、オルトミクソウイルス科(Orthomyxoviridae family、インフルエンザ)、パラコクシジオイデス・ブラジリエンシス(Paracoccidioides brasiliensis)、肺吸虫種(Paragonimus spp)、ウェステルマン肺吸虫(Paragonimus westermani)、パルボウイルス(Parvovirus)B19、パスツレラ属(Pasteurella genus)、プラスモディウム属(Plasmodium genus)、ニューモシスチス・イロベチイ(Pneumocystis jirovecii)、ポリオウイルス(Poliovirus)、狂犬病ウイルス(Rabies virus)、呼吸器合胞体ウイルス(Respiratory syncytial virus,RSV)、ライノウイルス(Rhinovirus)、ライノウイルス、リケッチア・アカリ(Rickettsia akari)、リケッチア属(Rickettsia genus)、発疹チフスリケッチア(Rickettsia prowazekii)、リケッチア・リケッチイ(Rickettsia rickettsia)、発疹熱リケッチア(Rickettsia typhi)、リフトバレー熱ウイルス((Rift Valley fever virus)、ロタウイルス(Rotavirus)、風疹ウイルス(Rubella virus)、サビアウイルス(Sabia virus)、サルモネラ属(Salmonella genus)、ヒゼンダニ(Sarcoptes scabiei)、SARSコロナウイルス、住血吸虫属(Schistosoma genus)、重症熱性血小板減少症候群ウイルス(Severe fever with thrombocytopenia syndrome virus,SFTSV)、シゲラ属(Shigella genus)、シンノンブルウイルス(Sin Nombre virus)、ハンタウイルス(Hantavirus)、スポロトリックス・シェンキイ(Sporothrix schenckii)、スタヒロコッカス属(Staphylococcus genus)、スタヒロコッカス属、ストレプトコッカス・アガラクティエ(Streptococcus agalactiae)、肺炎レンサ球菌(Streptococcus pneumoniae)、化膿レンサ球菌(Streptococcus pyogenes)、ふん線虫(Strongyloides stercoralis)、テニア属(Taenia genus)、有鉤条虫(Taenia solium)、ダニ媒介性脳炎ウイルス(Tickborne encephalitis virus,TBE
V)、イヌ回虫(Toxocara canis)またはネコ回虫(Toxocara cati)、トキソプラズマ・ゴンディ(Toxoplasma gondii)、梅毒トレポネーマ(Treponema pallidum)、旋毛虫(Trichinella spiralis)、膣トリコモナス(Trichomonas vaginalis)、トリコフィトン種(Trichophyton spp)、鞭虫(Trichuris trichiura)、トリパノソーマ・ブルーセイ(Trypanosoma brucei)、クルーズ・トリパノソーマ(Trypanosoma cruzi)、ウレアプラズマ・ウレアリチカム(Ureaplasma urealyticum)、水痘・帯状疱疹ウイルス(Varicella zoster virus)(VZV)、水痘・帯状疱疹ウイルス(VZV)、天然痘ウイルス(Variola major)または天然痘マイナー(Variola minor)、vCJDプリオン、ベネズエラ馬脳炎ウイルス(Venezuelan equine encephalitis virus)、コレラ菌(Vibrio cholera)、ウエストナイルウイルス(West Nile virus)、西部ウマ脳炎ウイルス(Western equine encephalitis virus)、バンクロフト糸状虫(Wuchereria bancrofti)、黄熱ウイルス(Yellow fever virus)、エルシニア・エンテロコリチカ(Yersinia enterocolitica)、ペスト菌(Yersinia pestis)、およびエルシニア・シュードツベルクローシス(Yersinia pseudotuberculosis)から誘導され得るが、これに限定されない。
【0103】
選択的な観点において、コーディング領域(CR)は、腫瘍抗原またはその断片、これらの変異体または誘導体であるタンパク質またはペプチドをコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)からなることができる。腫瘍抗原は、メラニン細胞特異的抗原、睾丸がん抗原または腫瘍特異的抗原、例えば、CT-X抗原、非CT-X抗原、CT-X抗原に対する結合パートナーまたは非CT-X抗原または腫瘍特異的抗原に対する結合パートナー、または腫瘍特異的抗原、腫瘍抗原の変異体または誘導体でありうる。
【0104】
このような腫瘍抗原をコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)は、5T4、707-AP、9D7、AFP、AlbZIP HPG1、アルファ-5-ベータ-1-インテグリン、アルファ-5-ベータ-6-インテグリン、アルファ-アクチニン-4/m、アルファ-メチルアシル-コエンザイムAラセマーゼ、ART-4、ARTC1/m、B7H4、BAGE-1、BCL-2、bcr/abl、ベータ-カテニン/m、BING-4、BRCA1/m、BRCA2/m、CA 15-3/CA 27-29、CA19-9、CA72-4、CA125、カルレティキュリン(calreticulin)、CAMEL、CASP-8/m、カテプシンB(cathepsin B)、カテプシンL、CD19、CD20、CD22、CD25、CDE30、CD33、CD4、CD52、CD55、CD56、CD80、CDC27/m、CDK4/m、CDKN2A/m、CEA、CLCA2、CML28、CML66、COA-1/m、コアクトシン様タンパク質、コラージュ(collage) XXIII、COX-2、CT-9/BRD6、Cten、サイクリンB1、サイクリンD1、cyp-B、CYPB1、DAM-10、DAM-6、DEKCAN、EFTUD2/m、EGFR、ELF2/m、EMMPRIN、EpCam、EphA2、EphA3、ErbB3、ETV6-AML1、EZH2、FGF-5、FN、Frau-1、G250、GAGE-1、GAGE-2、GAGE-3、GAGE-4、GAGE-5、GAGE-6、GAGE7b、GAGE-8、GDEP、GnT-V、gp100、GPC3、GPNMB/m、HAGE、HAST-2、ヘプシン、Her2/neu、HERV-K-MEL、HLA-A*0201-R17I、HLA-A11/m、HLA-A2/m、HNE、ホメオボックスNKX3.1、HOM-TES-14/SCP-1、HOM-TES-85、HPV-E6、HPV-E7、HSP70-2M、HST-2、hTERT、iCE、IGF-1R、IL-13Ra2、IL-2R、IL-5、未成熟ラミニン受容体、カリクレイン(kallikrein)-2、クレイン-4、Ki67、KIAA0205、KIAA0205/m、KK-LC-1、K-Ras/m、LAGE-A1、LDLR-FUT、MAGE-A1、MAGE-A2、MAGE-A3、MAGE-A4、MAGE-A6、MAGE-A9、MAGE-A10、MAGE-A12、MAGE-B1、MAGE-B2、MAGE-B3、MAGE-B4、MAGE-B5、MAGE-B6、MAGE-B10、MAGE-B16、MAGE-B17、MAGE-C1、MAGE-C2、MAGE-C3、MAGE-D1、MAGE-D2、MAGE-D4、MAGE-E1、MAGE-E2、MAGE-F1、MAGE-H1、MAGEL2、マンマグロビン(mammaglobin)A、MART-1/メラン-A、MART-2、MART-2/m、基質タンパク質(matrix protein)22、MC1R、M-CSF、ME1/m、メソテリン(mesothelin)、MG50/PXDN、MMP11、MN/CA IX-抗原、MRP-3、MUC-1、MUC-2、MUM-1/m、MUM-2/m、MUM-3/m、ミオシンクラスI/m、NA88-A、N-アセチルグルコサミニルトランスフェラーゼ-V、ネオ-PAP、ネオ-PAP/m、NFYC/m、NGEP、NMP22、NPM/ALK、N-Ras/m、NSE、NY-ESO-1、NY-ESO-B、OA1、OFA-iLRP、OGT、OGT/m、OS-9、OS-9/m、オステオカルシン、オステオポンチン、p15、p190マイナーbcr-abl、p53、p53/m、PAGE-4、PAI-1、PAI-2、PAP、PART-1、PATE、PDEF、Pim-1-キナーゼ、Pin-1、Pml/PARアルファ、POTE、PRAME、PRDX5/m、プロステイン、プロテイナーゼ-3、PSA、PSCA、PSGR、PSM、PSMA、PTPRK/m、RAGE-1、RBAF600/m、RHAMM/CD168、RU1、RU2、S-100、SAGE、SART-1、SART-2、SART-3、SCC、SIRT2/m、Sp17、SSX-1、SSX-2/HOM-MEL-40、SSX-4、STAMP-1、STEAP-1、サバイビン、サバイビン-2B、SYT-SSX-1、SYT-SSX-2、TA-90、TAG-72、TARP、TEL-AML1、TGFベータ、TGFベータRII、TGM-4、TPI/m、TRAG-3、TRG、TRP-1、TRP-2/6b、TRP/INT2、TRP-p8、チロシナーゼ、UPA、VEGFR1、VEGFR-2/FLK-1、WT1およびリンパ球血球の免疫グロブリンの遺伝子型またはリンパ球血球のT細胞受容体の遺伝子型、またはこれらの断片、変異体または誘導体をコード化するヌクレオチド配列またはこれらの転写体配列からなることができるが、これに限定されない。
【0105】
さらに他の例示的な態様において、コーディング領域(CR)は、治療的タンパク質/ペプチドまたはその断片、変異体または誘導体であるタンパク質/ペプチドをコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)からなることができる。
【0106】
治療用タンパク質は、遺伝的欠陥の修飾および治療、がん細胞または病原体感染細胞の破壊、免疫系疾患の治療、代謝性または内分泌疾患の治療ができる、治療剤の生成において重要な役割を行うことができる。一例として、治療用タンパク質は、遺伝的または後天的なものと独立して、例えば、感染性疾患、腫瘍(neoplasm)(例えば、がんまたは腫瘍疾患)、血液および血液形成器官の疾患、内分泌、栄養および代謝性疾患、神経系疾患、循環系疾患、呼吸系疾患、消化器系疾患、皮膚および皮下組織疾患、筋骨格系疾患および結合組織、および泌尿生殖器系疾患のような様々な疾患の治療を含む様々な目的に使用することができる。
【0107】
例えば、代謝性または内分泌疾患の治療に使用することができるタンパク質(タンパク質治療に使用する特定の疾患)は、酸性スフィンゴミエリナーゼ(Acid sphingomyelinase)(ニーマンピック病、Niemann-Pick disease)、アディポタイド(Adipotide)(肥満)、アガルシダーゼベータ(Agalsidase-beta)(ヒトガラクトシダーゼA)(ファブリー病(Fabry disease);腎臓および心血管合併症を誘導する脂質の蓄積を防止)、アルグルコシダーゼ(Alglucosidase)(ポンペ病(Pompe disease;グリコーゲン蓄積症タイプII)、アルファ-ガラクトシダーゼA(アルファ-GAL A、アガルシダーゼアルファ)(ファブリー病)、アルファ-グルコシダーゼ(グリコーゲン蓄積症(GSD)、ポンペ病(Morbus Pompe))、アルファ-L-イズロニダーゼ(alpha-L-iduronidase)(ムコ多糖症(MPS)、ハーラー症候群(Hurler syndrome)、シャイエ症候群(Scheie syndrome))、アルファ-N-アセチルグルコサミニダーゼ(alpha-N-acetylglucosaminidase)(サンフィリポ症候群、Sanfilippo syndrome)、アンフィレグリン(Amphiregulin)(がん、代謝性疾患)、アンジオポイエチン(Angiopoietin)((Ang1、Ang2、Ang3、Ang4、ANGPTL2、ANGPTL3、ANGPTL4、ANGPTL5、ANGPTL6、ANGPTL7)(血管形成、血管安定)、ベータセルリン(Betacellulin)(代謝性疾患)、ベータ-グルクロニダーゼ(Beta-glucuronidase)(スライ症候群(Sly syndrome))、骨形成タンパク質(Bone morphogenetic protein)BMPs(BMP1、BMP2、BMP3、BMP4、BMP5、BMP6、BMP7、BMP8a、BMP8b、BMP10、BMP15)(再生的影響、骨関連症状、慢性腎疾患(CKD))、CLN6タンパク質(CLN6疾患-非定型後期小児性(Atypical Late Infantile)、遅発性バリアント(Late Onset variant)、早期若年(Early Juvenile)、神経セロイドリポフスチン症(Neuronal Ceroid Lipofuscinosis,NCL))、表皮成長因子(EGF)(創傷治癒、細胞成長、増殖および分化の調節)、エピゲン(Epigen)(代謝性疾患)、エピレグリン(Epiregulin)(代謝性疾患)、線維芽細胞成長因子(Fibroblast Growth Factor)(FGF、FGF-1、FGF-2、FGF-3、FGF-4、FGF-5、FGF-6、FGF-7、FGF-8、FGF-9、FGF-10、FGF-11、FGF-12、FGF-13、FGF-14、FGF-16、FGF-17、FGF-17、FGF-18、FGF-19、FGF-20、FGF-21、FGF-22、FGF-23)(創傷治癒、血管新生、内分泌疾患、組織再生)、ガルスルファーゼ(Galsulphase)(ムコ多糖症(Mucopolysaccharidosis)VI型)、グレリン(Ghrelin)(過敏性大腸症候群(irritable bowel syndrome,IBS)、肥満、プラダー・ウィリ症候群(Prader-Willi syndrome)、2型真性糖尿病(diabetes mellitus)、グルコセレブロシダーゼ(Glucocerebrosidase)(ゴーシェ病(Gaucher’s disease))、GM-CSF(再生効果、白血球生産、がん)、ヘパリン結合性EGF様成長因子(HB-EGF)(創傷治癒、心臓肥大および心臓発達および機能)、肝細胞成長因子(Hepatocyte growth factor,HGF)(再生効果、創傷治癒)、ヘプシジン(Hepcidin)(鉄代謝障害、ベータ地中海貧血(Beta-thalassemia))、ヒトアルブミン(アルブミンの減少した生産(低タンパク血症)、増加したアルブミンの減少(腎症候群)、ヒポボレミア(hypovolaemia)、高ビリルビン血症(hyperbilirubinemia))、イデュルスルファーゼ(Idursulfase)(イズロン酸-2-スルファターゼ、Iduronate-2-sulfatase)(ムコ多糖症(Mucopolysaccharidosis)II型(ハンター症候群、Hunter syndrome))、インテグリンαVβ3、αVβ5およびα5β1(結合基質高分子およびタンパク質分解酵素(Bind matrix macromolecules and proteinases)、血管新生)、イズロン酸スルファターゼ(Iduronate sulfatase)(ハンター症候群(Hunter syndrome))、ラロニダーゼ(Laronidase)(ムコ多糖症I型のハーラーおよびハーラー-シャイエ形態)、N-アセチルガラクトサミン-4-スルファターゼ(rhASB;ガルスルファーゼ(galsulfase)、アリールスルファターゼA(Arylsulfatase A)(ARSA)、アリールスルファターゼB(ARSB))(アリルスルファターゼB欠損、マロトー・ラミー症候群(Maroteaux-Lamy syndrome)、ムコ多糖症VI型)、N-アセチルグルコサミン-6-スルファターゼ(N-acetylglucosamine-6-sulfatase)(サンフィリポ症候群(Sanfilippo syndrome))、神経成長因子(Nerve growth factor)(NGF、脳由来神経栄養因子(Brain-Derived Neurotrophic Factor,BDNF)、ニューロトロフィン-3(Neurotrophin-3,NT-3)、およびニューロトロフィン4/5(NT-4/5)(再生効果、心血管疾患、冠動脈形成術アテローム性動脈硬化症(coronary atherosclerosis)、肥満、2型真性糖尿病、代謝性症候群、急性冠動脈症候群、認知症、うつ病、統合失調症(schizophrenia)、自閉症、レット症候群(Rett syndrome)、神経性無食欲症(anorexia nervosa)、神経性過食症(bulimia nervosa)、創傷治癒、皮膚潰瘍、角膜潰瘍、アルツハイマー病)、ニューレグリン(Neuregulin)(NRG1、NRG2、NRG3、NRG4)(代謝性疾患、統合失調症)、ニューロピリン(Neuropilin)(NRP-1、NRP-2)(血管新生、軸索誘導(axon guidance)、細胞生存、移動)、オベスタチン(Obestatin)(過敏性大腸症候群(irritable bowel syndrome,IBS)、肥満、プラダー・ウィリ症候群(Prader-Willi syndrome)、2型真性糖尿病)、血小板由来増殖因子(Platelet Derived Growth factor)(PDGF(PDFF-A、PDGF-B、PDGF-C、PDGF-D)(再生効果、創傷治癒、血管新生疾患、動脈硬化症、線維症、がん)、TGFベータ受容体(エンドグリン(endoglin)、TGF-ベータ1受容体、TGF-ベータ2受容体、TGF-ベータ3受容体)(腎線維症(renal fibrosis)、腎臓疾患、糖尿病、末期腎不全腎臓疾患(ESRD)、血管新生)、トロンボポエチン(THPO)(巨核球(Megakaryocyte)成長および発達因子(MGDF))(血小板障害、寄贈(donation)に対する血小板、骨髄抑制抗がん化学療法(myelosuppressive chemotherapy)後の血小板数の回復、形質転換成長因子(Transforming Growth factor)(TGF(TGF-アルファ、TGF-ベータ(TGFベータ1、TGFベータ2、およびTGFベータ3)))(再生効果、創傷治癒、免疫力、がん、心臓疾患、糖尿病、マルファン症候群(Marfan syndrome)、ロイス・ディーツ症候群(Loeys-Dietz syndrome))、VEGF(VEGF-A、VEGF-B、VEGF-C、VEGF-D、VEGF-E、VEGF-FおよびPIGF)(再生効果、血管新生、創傷治癒、がん、浸透性)、ネシリチド(Nesiritide)(急性非代償性鬱血性心不全(Acute decompensated congestive heart failure)、トリプシン(褥瘡(Decubitus ulcer)、静脈瘤性潰瘍(varicose ulcer)、痂皮(eschar)の創傷清拭(debridement)、裂開性創傷(dehiscent wound)、火傷(sunburn)、胎便性イレウス(meconium ileus))、副腎皮質刺激ホルモン(adrenocorticotrophic hormone,ACTH)(アジソン病、小細胞がん、副腎白質ジストロフィー(Adrenoleukodystrophy)、先天性副腎過形成症(Congenital adrenal hyperplasia)、クッシング症候群(Cushing’s syndrome)、ネルソン症候群(Nelson’s syndrome)、点頭てんかん(Infantile spasms))、心房性ナトリウム利尿ペプチド(Atrial-natriuretic peptide,ANP)(内分泌疾患)、コレシストキニン(Cholecystokinin)(様々な)、ガストリン(Gastrin)(低ガストリン血症、hypogastrinemia)、レプチン(Leptin)(糖尿病(Diabetes)、高トリグリセリド血症(hypertriglyceridemia)、糖尿病)、オキシトシン(Oxytocin)(授乳(breastfeeding)刺激、分娩の非進行)、ソマトスタチン(Somatostatin)(カルチノイド症候群(carcinoid syndrome)の対症療法、急性静脈瘤出血(acute variceal bleeding)、および先端巨大症(acromegaly)、肝および腎臓の多嚢性疾患、神経内分泌腫瘍による先端巨大症および症状)、バソプレシン(抗利尿ホルモン)(尿崩症(diabetes insipidus))、カルシトニン(閉経後骨粗しょう症(Postmenopausal osteoporosis)、高カルシウム血症(Hypercalcaemia)、パジェット病(Paget’s disease)、骨転移、幻肢痛(Phantom limb pain)、脊髄狭窄症(Spinal Stenosis))、エキセナチド(Exenatide)(メトホルミン(metformin)およびスルホニルウレア(sulphonylurea)による治療に耐性のある2型糖尿病)、成長ホルモン(GH)、ソマトトロピン(GH欠損または慢性腎不全(chronic renal insufficiency)による成長不全)、プラダー・ウィリ症候群(Prader-Willi syndrome)、ターナー症候群、エイズ消耗(AIDS wasting)または抗ウイルス治療とともに悪液質(cachexia))、インスリン(真性糖尿病、糖尿病性ケトアシドーシス(diabetic ketoacidosis)、高カリウム血症(hyperkalaemia))、インスリン様成長因子1、IGF-1(GH遺伝子欠損または重症先天性IGF1欠損(severe primary IGF1 deficiency)による子供成長不全、神経変性疾患(neurodegenerative disease)、心血管疾患、心不全)、メカセルミンリンファバート(Mecasermin rinfabate)、IGF-1アナログ(analog)(GH遺伝子欠損または
重症先天性IGF1欠損による子供成長不全、神経変性疾患、心血管疾患、心不全)、メカセルミン(Mecasermin)、IGF-1アナログ(GH遺伝子欠損または重症先天性IGF1欠損による子供成長不全、神経変性疾患、心血管疾患、心不全)、ペグビソマント(Pegvisomant)(先端巨大症(Acromegaly))、プラムリンタイド(Pramlintide)(真性糖尿病、インスリンと組み合わせ)、テリパラチド(Teriparatide)(ヒトパラチロイドホルモン残基1-34)(重度の骨粗しょう症、Severe osteoporosis)、ベカプレルミン(Becaplermin)(糖尿病性潰瘍に対する創傷清拭付加(Debridement adjunct))、ジボテルミン-アルファ(Dibotermin-alpha)(骨形成タンパク質2(Bone morphogenetic protein 2))(脊椎固定術(Spinal fusion surgery)、骨創傷回復)、酢酸ヒストレリン(Histrelin acetate)(ゴナドトロピン放出ホルモン(gonadotropin releasing hormone);GnRH)(性的早熟(Precocious puberty))、オクトレオチド(Octreotide)(先端巨大症、VIP分泌アデノーマおよび転移性カルチノイド腫瘍(metastatic carcinoid tumours)の症状緩和)およびパリフェルミン(Palifermin)(ケラチノサイト成長因子(keratinocyte growth factor;KGF))(化学療法を受けている患者内の深刻な口腔粘膜炎、創傷回復)を含んでもよいが、これに限定されない。
【0108】
なお、血液疾患、循環系疾患、呼吸系疾患、がんまたは腫瘍疾患、感染性疾患または免疫不全症と関連したタンパク質(タンパク質治療に使用される特定の疾患)は、アルテプラーゼ(Alteplase)(組織プラスミノゲン活性化因子(tissue plasminogen activator);tPA)(肺塞栓(Pulmonary embolism)、心筋梗塞(myocardial infarction)、急性虚血性脳卒中(acute ischaemic stroke)、中心静脈アクセスデバイスの閉塞(occlusion of central venous access devices))、アニストレプラーゼ(Anistreplase)(血栓溶解)、アンチトロンビンIII(AT-III)(遺伝的AT-III欠損、血栓塞栓症)、ビバリルジン(Bivalirudin)(冠動脈形成術およびヘパリン起因性血小板減少症における血液凝固危険の減少)、ダーベポエチン-アルファ(Darbepoetin-alpha)(慢性腎機能障害(renal insufficiency)および慢性腎不全(renal failure)(+/-透析)を有する患者における貧血の治療)、ドロトレコギン-アルファ(Drotrecogin-alpha)(活性化タンパク質C)(死亡率の高い重症敗血症(severe sepsis))、エリスロポエチン(Erythropoietin)、エポエチン-アルファ(Epoetin-alpha)、エリスロポエチン(erythropoietin)(慢性疾患の貧血、骨髄異形成(myelodysplasia)、腎不全または化学療法による貧血、手術前の準備)、因子IX(血友病(Haemophilia)B)、因子VIIa(血友病AまたはBおよび因子VIIIまたは因子IXに阻害者を有する患者の出血)、因子VIII(血友病A)、レピルジン(Lepirudin)(ヘパリン起因性低血小板症)、タンパク質C濃縮(concentrate)(静脈血栓症(Venous thrombosis)、電撃性紫斑病(Purpura fulminans))、レテプラーゼ(Reteplase)(tPAの削除突然変異)(急性心筋梗塞の調節、左心室機能の増進)、ストレプトキナーゼ(Streptokinase)(急性進行性貫壁性心筋梗塞(Acute evolving transmural myocardial infarction)、肺塞栓(pulmonary embolism)、深部静脈血栓症(deep vein thrombosis)、動脈血栓症または塞栓症、動静脈カニューレの閉塞)、テネクテプラーゼ(Tenecteplase)(急性心筋梗塞)、ウロキナーゼ(Urokinase)(肺塞栓)、アンギオスタチン(Angiostatin)(がん)、抗-CD22免疫毒素(再発性(relapsed)CD33+急性骨髄性白血病)、デニロイキン ジフチトクス(Denileukin diftitox)(皮膚T細胞性リンパ腫(Cutaneous T-cell lymphoma,CTCL))、イムノシアニン(Immunocyanin)(膀胱および前立腺がん)、MPS(メタロパンチスチムリン、Metallopanstimulin)(がん)、アフリベルセプト(Aflibercept)(非小細胞肺がん(NSCLC)、転移性大腸がん(mCRC)、ホルモン抵抗性転移性前立腺がん、湿性黄斑変性)、エンドスタチン(Endostatin)(がん、関節リウマチだけでなく、クローン病、糖尿病性網膜症、乾癬、および子宮内膜症のような炎症性疾患)、コラゲナーゼ(慢性皮膚潰瘍の創傷清拭および重症火傷部位、デュピュイトラン拘縮(Dupuytren’s contracture)、ペイロニー病(Peyronie’s disease))、ヒトデオキシリボヌクレアーゼI、ドルナーゼ(dornase)(嚢胞性線維症(Cystic fibrosis);予想された40%より大きいFVCを有する選択された患者における呼吸器感染の減少)、ヒアルロニダーゼ(Hyaluronidase)(注射された薬物、特に眼科手術および特定の造影剤の吸収および分散を向上させるアジュバントとして使用される)、パパイン(Papain)(褥瘡、静脈瘤(varicose)および糖尿性潰瘍、火傷、術後の創部、毛巣嚢胞の創傷 、皮下組織の炎症(carbuncles)、および他の創傷のような急性および慢性病変における壊死組織の創傷清拭または苦痛(slough)の液化(liquefication))、L-アスパラギナーゼ(L-Asparaginase)(増殖のための外因性アスパラギンを必要とする、急性リンパ性白血病)、ペグアスパラガーゼ(Peg-asparaginase)(増殖のための外因性アスパラギンを必要とする急性リンパ性白血病)、ラスブリカーゼ(Rasburicase)(抗がん治療中の白血病、リンパ腫、および固形腫瘍を有する小児患者は腫瘍溶解症候群を起こすことができる)、ヒト慢性ゴナドトロピン(Human chorionic gonadotropin,HCG)(生殖補助(Assisted reproduction))、ヒト卵胞刺激ホルモン(Human follicle-stimulating hormone,FSH)(生殖補助)、ルトロピン-アルファ(Lutropin-alpha)(黄体形成ホルモン欠損と共に不妊)、プロラクチン(Prolactin)(低プロラクチン血症(Hypoprolactinemia)、血清プロラクチン欠損、女性の卵巣機能障害、不安、男性の動脈性勃起不全(arteriogenic erectile dysfunction)、早漏(premature ejaculation)、精子減少症(oligozoospermia)、精子無力症(asthenospermia)、精嚢(seminal vesicles)の機能不全、男性ホルモン減少症(hypoandrogenism))、アルファ-1-プロティナーゼ阻害剤(先天性トリプシン欠損症(Congenital antitrypsin deficiency))、ラクターゼ(Lactase)(ラクトース消化不能によるガス、膨張感(bloating)、けいれんおよび下痢)、膵酵素(Pancreatic enzymes)(リパーゼ(lipase)、アミラーゼ(amylase)、プロテアーゼ(protease))(嚢胞性線維症(Cystic fibrosis)、慢性膵炎(chronic pancreatitis)、膵機能不全(pancreatic insufficiency)、ポスト-ビルロートII胃バイパス手術(post-Billroth II gastric bypass surgery)、膵管閉塞(pancreatic duct obstruction)、脂肪便(steatorrhoea)、消化不良(poor digestion)、ガス、膨張感)、アデノシン・デアミナーゼ(Adenosine deaminase)(ペガデマーゼボビン(pegademase bovine)、PEG-ADA)(アデノシン・デアミナーゼ欠損による重症複合免疫不全疾患)、アバタセプト(Abatacept)(関節リウマチ(特にTNFアルファ阻害に対して耐性(refractory)のとき))、アレファセプト(Alefacept)(尋常性乾癬(Plaque Psoriasis))、アナキンラ(Anakinra)(関節リウマチ)、エタネルセプト(Etanercept)(関節リウマチ、多関節型若年性関節リウマチ(polyarticular-course juvenile rheumatoid arthritis)、乾癬性関節炎、強直性脊髄炎(ankylosing spondylitis)、尋常性乾癬、強直性脊髄炎)、インターロイキン-1(IL-1)受容体拮抗剤、アナキンラ(Anakinra)(関節リウマチに関連した炎症および軟骨退行)、チムリン(Thymulin)(神経変性疾患、リウマチ、神経性無食欲症)、TNF-アルファ拮抗薬(関節リウマチ、強直性脊髄炎、クローン病、乾癬、化膿性汗腺炎、難治性喘息のような自己免疫疾患)、エンフュービルタイド(Enfuvirtide)(HIV-1感染)、およびサイモシン(Thymosin)α1(肝炎BおよびC)を含んでもよいが、これに限定されない。
【0109】
コーディング領域(CR)を構成するオープンリーディングフレーム(ORF)の長さは、制限がなく、オープンリーディングフレーム(ORF)の長さによる発現効率は、本開示による核酸分子、これを用いた組換え発現ベクターおよび治療または予防のための核酸ワクチンなどの開発において大きな考慮対象でない。コドン使用頻度(Codon usage)は、通常、様々な種においてタンパク質/ペプチド発現に影響を及ぼすことができるが、ヒトのコドン使用頻度の偏り(Codon usage bias)は、通常、タンパク質/ペプチド発現に大きな影響を及ぼさないと知られているので、ヒトを対象とする核酸ワクチンや遺伝子治療剤を開発するときに考慮対象でない。ただし、開始コドン(initial codon)は、Kozak配列(例えば、GCCACC)を持っておくべきであり、終止コドン近くのヌクレオチド配列も最適化する必要がある。必要な場合、コーディング領域(CR)で発現しようとする遺伝子またはその転写体であるmRNAのコドン配列のうち三番目の部分をGCに変えてアミノ酸の変化なしで標的遺伝子のGC%を増加させてmRNAの安定性を高めることができる。
【0110】
選択的な実施形態において、核酸分子は、オープンリーディングフレーム(ORF)形態で連結されるコーディング領域(CR)の発現効率を増加させることができるヌクレオチド配列をさらに挿入することができる。一例として、核酸分子は、翻訳調節要素、例えば、上流翻訳調節要素(U-TLCE)に隣接して核酸分子の転写を促進する転写調節要素(Transcription control element,TCCE)を有することができる。例えば、転写調節要素(TCCE)は、上流翻訳調節要素(U-TLCE)の上流に位置することができる。このような転写調節要素(TCCE)は、特に制限されるものではなく、説明の重複を避けるために、後述する組換え発現ベクターの部分において詳細に説明する。
【0111】
その他にも、核酸分子は、前述した翻訳調節要素(TLCE)、コーディング領域(CR)および転写調節要素(TCCE)以外にもコーディング領域(CR)を構成する遺伝子またはその転写体配列からなるオープンリーディングフレーム(ORF)の発現を誘導できるヌクレオチド配列を挿入することができる。1つの例示的な実施形態において、上流翻訳調節要素(U-TLCE)とコーディング領域(CR)の開始コドンの間にKozak配列を挿入することができる。
【0112】
また、コーディング領域(CR)の下流、より具体的には、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)の下流に戦死した核酸分子を安定化させながら、コーディング領域(CR)に存在する遺伝子またはその転写体配列からなるオープンリーディングフレーム(ORF)の翻訳効率をさらに向上させることができるポリアデニル化シグナル配列および/またはポリアデノシン配列(PA)をさらに挿入することができる。
【0113】
例えば、本開示の核酸分子がRNA形態の転写体配列からなる場合、ポリアデノシン配列(PA)は、略25個~略400個、例えば、30個~400個、50~250個、または60~250個のアデノシンからなるヌクレオチド配列でありうる。
【0114】
他の例示的な実施形態において、本開示の核酸分子がDNA形態のヌクレオチド配列からなる場合、ポリアデニル化シグナル配列(PA)が第2下流翻訳調節配列(D-TLCE2)の下流に位置することができる。一例として、ポリアデニル化シグナル配列(PA)は、SV40、ヒト成長ホルモン(human growth factor,hGH)、ウシ成長ホルモン(Bovine Growth hormone,BGH)またはウサギのベータ-グロビン(rabbit beta-globin,rbGlob)などから誘導したものを使用することができるが、本開示がこれに限定されない。
【0115】
選択的に、ポリアデニル化シグナル配列またはポリアデノシン配列(PA)は、多数のアデノシン、例えば、25個~略400個、30個~400個、50個~250個、または60個~250個のアデノシンまたはその転写配列からなる2個のヌクレオチドの間に5’-GATCATCAGT-3’のようなシグナル配列が挿入された配列からなることもできる。
【0116】
核酸分子にコーディング領域(CR)を挿入するために、核酸分子は、1つ以上のクローニングサイト、好ましくは、マルチプルクローニングサイト(Multiple Cloning Site;MCS)を含んでもよい。1つ以上のクローニングサイトは、1つ以上の制限酵素(restriction endonuclease)認識配列(recognition site)および/または制限酵素によって切断される配列を含んでもよい。制限酵素は、バクテリアや古細菌などで発見される自然な制限酵素はもちろん、人工的に製造された制限酵素(例えば、ジンクフィンガーヌクレアーゼやTALエフェクターのDNA結合部位に基づく制限酵素またはDNAベースのDNAznymesなど)を含んでもよい。
【0117】
例えば、自然に発生する制限酵素は、1)TypeI制限酵素(認識部位から離れた部位を切断し、ATP、S-アデノシル-L-メチオニンおよびマグネシウムイオンを必要とする)、2)TypeII制限酵素(認識部位の内部または認識部位から若干離れた特定の部位を切断し、ほとんどがマグネシウムイオンを必要とする)、3)TypeIII制限酵素(認識部位から若干離れた部位を切断し、ATPは、必要であるが、ATPの加水分解は、必要をとしない)、4)TypeIV制限酵素(メチル化、ヒドロキシメチル化またはグルコシル-ヒドロキシメチル化など修飾部位を標的とする)、5)TypeV制限酵素(CRISPRsのcas9-gRNA complex)などに区分され得る。
【0118】
例えば、次のような制限酵素認識部位および/または制限酵素切断部位(制限酵素)を使用することができる。5’-ATCGAT-3’(AngI)、5’-AGGCCT-3’(AatI)、5’-TGATCA-3’(AbaI)、5’-GGATCC-3’(BamHI)、5’-GCAGC(N)8-3’(BbvI)、5’-(N)10CGA(N)6TGC(N)12-3’(BcgI)、5’-(N)8GAG(N)5CTC(N)13-3’(BplI)、5’-GTCTC(N)-3’(BsmAI;Alw26I)、5’-ACTGGN-3’(BsrI)、5’-ATCGAT-3’(ClaI)、5’-CTCTTCN-3’(EarI)、5’-CTGAAG(N)16-3’(Eco57I)、5’-GAATTC-3’(EcoRI)、5’-CCWGG-3’(EcoRII;WはAまたはT)、5’-GATATC-3’(EcoRV)、5’-GGATG(N)9-3’(FokI)、5’-GGCC-3’(HaeIII)、5’-AAGCTT-3’(HindIII)、5’-CCGG-3’(HpaIII)、5’-GGTGA(N)8-3’(HphI)、5’-GGTACC-3’(KpnI)、5’-GATC-3’(MboI)、5’-ACGCGT-3’(MluI)、5’-GCCGGC-3’(NaeI)、5’-GATATG-3’(NdeII)、5’-GCCGGC-3’(NgoMIV)、5’-CATG-3’(NlaIII)、5’-GCGGCCGC-3’(NotI)、5’-TTAATTAA-3’(PacI)、5’-CTGCAG-3’(PstI)、5’-GAGCTC-3’(SacI)、5’-CCGCGG-3’(SacII)、5’-GTCGAC-3’(SalI)、5’-GCATC(N)5-3’(SfaNI)、5’-CCCGGG-3’(SmaI)、5’-TCGA-3’(TaqI)、5’-TCTAGA-3’(XbaI)、5’-CTCGAG-3’(XhoI)、5’-CGATCG-3’(PvuI)およびこれらの組み合わせ。
【0119】
他の例示的な実施形態において、クローニングサイトは、配列識別番号:19からなることもできる。
【0120】
核酸分子は、DNAまたはRNAでありうる。例示的な実施形態によれば、本開示による核酸分子は、RNA形態を有することができる。コーディング領域(CR)が前述したタンパク質またはペプチドをコード化するオープンリーディングフレーム(ORF)の転写体配列からなるなど核酸分子がRNA形態からなる場合、DNA形態の核酸分子に比べて有利である。
【0121】
第一に、RNA形態の核酸分子は、その特性上、DNA形態の核酸分子とは異なって、mRNAへの転写のために、宿主細胞の核内に進入する必要がない。したがって、突然変異誘発の潜在的な危険が少なく、生体内で速く分解されるので安全である。RNA形態の核酸分子は、核内で宿主の染色体内に入り込む可能性がなく、宿主細胞で選別生産するために使用する選別マーカーである抗生剤抵抗遺伝子がRNA核酸分子の製作に不要であり、RNAは、DNAに比べて半減期が短いので、持続性遺伝子組換え(persistence genetic transformation)を誘導しない。すなわち、一般的な形態の核酸分子は、細胞内に伝達され、短期間だけ活性化して、標的ペプチド/タンパク質を発現し、数日内に酵素学的反応で破壊されるが、最初発現した標的ペプチド/タンパク質に対する特異的な免疫反応は残っている。
【0122】
第二に、RNA形態の核酸分子は、相対的にDNA形態の核酸分子に比べて少ない量を使用しても、所望の生体内免疫反応を誘導することができる。前述したように、RNA形態の核酸分子は、DNA形態の核酸分子とは異なって、核に入る必要がなく、細胞膜だけを通過すれば良い。したがって、RNA形態の核酸分子を使用すると、DNA形態の核酸分子より少ない量を使用しても、同じ程度の標的ペプチドを発現することができる。
【0123】
第三に、すべての製作工程を人工的に制御できるので、生物学的汚染に対する危険なしで小規模GMP(good manufacturing practice)生産施設で安全にワクチンを生産することができる。RNA形態の核酸分子は、小規模GMP実験室レベルの施設だけが必要であり、直接感染源(ウイルスあるいは病原性微生物)を扱わなくても良いので、迅速に様々なワクチンを製造、生産することができる。
【0124】
第四に、RNA形態の核酸分子は、裸のDNA核酸分子に比べてさらに強い免疫反応を誘導することができる。これは、RNA核酸分子のステム-ループ(stem-loop)構造およびRNA自らの特性により誘導された先天性免疫反応と、免疫した宿主細胞で発現した標的ペプチド/タンパク質によって誘導された後天性免疫反応が相互協力して示すと考えられる。また、RNA核酸分子自体が細胞内で複雑な抗原複合体(complex antigen)を生産し、これが抗原提示細胞のMHC(major Histocompatibility complex;主要組織適合性複合体)classIIに接近して理想的なワクチンとして作用することができる。
【0125】
第五に、RNA核酸分子は、既存のDNA核酸分子に比べて生産が容易である。前述したように、RNA核酸分子を生産するとき、感染源を直接扱う必要がなく、その代わりに、発現しようとする感染源の中和抗体誘導関連部分(中和エピトープ)の核酸配列だけを人工的に合成し、インビトロ転写(in vitro transcription,IVT)だけで大量のRNA核酸分子を生産することができる。最近では、IVT反応に関連した試薬、特にDNA依存性RNAポリメラーゼが改善され、少量のDNA鋳型(template)を用いて大量のRNAを1~2週内に迅速に生産することができる。また、免疫反応を誘導しようとする多数の抗原を同時に製作して混合した後、免疫することができ、発現しようとする抗原の遺伝子長さに特別な制約がないので、NA核酸分子製作の応用性および簡便性が増加することができる。
【0126】
他の例示的な態様において、核酸分子は、3個以上の下流翻訳調節要素を含んでもよい。
図2は、本開示の他の例示的な実施形態により目的遺伝子を効率的に発現させることができる核酸分子またはポリヌクレオチドの構成を概略的に示した模式図である。
【0127】
図2に示されたように、核酸分子は、翻訳開始(translation initiation)活性を有するヌクレオチド配列を含む翻訳調節要素(TLCE)と、翻訳調節要素(TLCE)と作動可能に連結され、目的遺伝子(GOI)のオープンリーディングフレーム(ORF)からなるコーディング領域(coding region,CR)と、を含み、選択的に翻訳調節要素(TLCE)の上流に位置する転写調節要素(TCCE)および/またはポリアデニル化シグナル配列(PA)を含んでもよい。翻訳調節要素(TLCE)は、コーディング領域(CR)の上流に位置する上流翻訳調節要素(U-TLCE)と、コーディング領域(CR)の下流に位置する下流翻訳調節要素(D-TLCE)と、を含む。本実施形態において、下流翻訳調節要素(D-TLCE)は、コーディング領域(CR)と、ポリアデニル化シグナル配列(PA)の間に順次に位置する第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)および第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)を含む。下流翻訳調節要素(D-TLCE)が第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)を含む点を除いて、
図1を参照して説明した第1実施形態の核酸分子と同一であってもよい。
【0128】
一例として、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)および第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)は、それぞれ独立して、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(TNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(FTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(CCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(AAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(RPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(DEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0129】
例えば、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)および第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)は、それぞれ独立して、配列識別番号:8、配列識別番号:9、配列識別番号:10、配列識別番号:11、配列識別番号:12、配列識別番号:13および配列識別番号:14から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0130】
例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)は、ヒトFTLまたはヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0131】
他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0132】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)は、ヒトCCL19、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0133】
さらに他の例示的な実施形態において、第1下流翻訳調節要素(D-TLCE1)は、ヒトDEFA5由来の転写翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第2下流翻訳調節要素(D-TLCE2)は、ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含み、第3下流翻訳調節要素(D-TLCE3)は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素またはその転写体配列を含んでもよい。
【0134】
組換え発現ベクター、発現コンストラクト
図1および
図2にそれぞれ示された核酸分子は、組換え発現ベクター内に挿入することができる。組換え発現ベクターは、翻訳開始活性を有する翻訳調節要素(TLCE;例えばU-TLCEおよびD-TLCE)と、コーディング領域(CR)を含み、転写調節要素(TCCE)およびまたはポリアデニル化シグナル配列(PA)を含んでもよい。すなわち、組換え発現ベクターは、
図1および
図2を参照して説明した核酸分子を含んでもよいが、この核酸分子は、他の核酸と結合して融合タンパク質または融合ペプチドをコード化することもできる。
【0135】
例えば、ベクターには、ウイルスベクター(viral vectors)、DNAまたはRNA発現ベクター(expression vectors)、プラスミド(plasmid)、コスミド(cosmid)またはファージベクター(phage vectors)、CCA(cationic condensing agents)と連結されたDNAまたはRNA発現ベクター、リポソーム(liposomes)で包まれたDNAまたはRNA発現ベクター、プロデューサー細胞(producer cells)のような特定の真核細胞(eukaryotic cells)などが含まれる。
【0136】
例示的に、本開示の核酸分子は、哺乳動物細胞内に入って発現するように構成されてもよい。このような構成は、感染性疾患の治療および/または予防目的に使用するのに特に有用である。核酸分子を宿主細胞内で発現させるのに多くの方法があり、適切ないずれの方法も使用可能である。例えば、本開示による核酸分子は、アデノウイルス(adenovirus)、アデノ随伴ウイルス(adeno-associated virus)、レトロウイルス(retrovirus)、ワクシニア(vaccinia)または他のポックスウイルス(e.q.,avian pox virus)などのウイルス ベクターに挿入が可能である。1つの例示的な実施形態によれば、前述した核酸分子を適切なベクターに挿入した後にインビトロ転写(in vitro transcription,IVT)を通じてRNA形態の核酸分子に修飾することができる。
【0137】
核酸分子、例えば、DNAをこのようなベクターに挿入させる技術に関しては、すでに良く知られている。レトロウイルスベクターには、形質導入された細胞の確認または選択を容易にする選択マーカー(selectable marker)に対する遺伝子および/または特定の標的細胞に対する受容体の役割をするリガンド(ligand)をコード化する遺伝子のような標的部位(targeting moiety)を付加的に挿入させることができる。標的(targeting)は、また、抗体を用いた公知の方法によっても行われ得る。
【0138】
入手可能であり、本開示の属する技術分野において一般に知られた多数のベクターを本開示の目的に使用することができる。適切なベクターの選択は、主にベクターに挿入される核酸分子の大きさおよびベクターで形質転換される特定の宿主細胞によって変わる。それぞれのベクターは、その機能(異種ポリヌクレオチドの増幅または発現、または二つとも)およびベクターが存在する特定の宿主細胞との相溶性によって様々な成分を含有する。ベクター成分は、一般的に複製起点(特にベクターが原核細胞に挿入される場合)、選別マーカー遺伝子、プロモーター、リボソーム結合部位(RBS)、シグナル配列、異種核酸挿入物および/または転写終止配列を含むが、これに制限されない。
【0139】
例えば、本開示による発現ベクターは、コーディング領域(CR)内にコード化されたタンパク質および/またはペプチド(一例として、レポータータンパク質/ペプチド、抗原、治療用タンパク質/ペプチド)の発現に影響を及ぼすことができる発現調節要素、例えば、開始コドン、終止コドン、ポリアデニル化シグナル配列、エンハンサー、膜標的化または分泌のためのシグナル配列などを含んでもよい。ポリアデニル化シグナル配列(PA)は、転写体の安定性を増加させたり細胞質輸送を容易にする。エンハンサー配列は、プロモーターにおいて様々な部位に位置し、エンハンサー配列がないときのプロモーターによる転写活性と比較して、転写活性を増加させる核酸塩基配列である。
【0140】
宿主がエスケリキア(Escherichia)属菌である場合には、シグナル配列は、PhoAシグナル配列、OmpAシグナル配列などが、宿主がバシラス(Bacillus)属菌である場合には、α-アミラーゼシグナル配列、サブチリシンシグナル配列などを用いることができる。宿主が酵母である場合には、シグナル配列は、MF-αシグナル配列、SUC2シグナル配列などが、宿主が動物細胞である場合には、インスリンシグナル配列、a-インターフェロンシグナル配列、抗体分子シグナル配列などを用いることができるが、本開示がこれに制限されない。
【0141】
ベクターの一つの類型は、さらなるDNA切片がその内部にライゲーション(ligation)され得る環状二本鎖DNAループを指す「プラスミド」である。他の類型のベクターは、ファージベクターである。さらに他の類型のベクターは、さらなるDNA切片がウイルスゲノム内にライゲーションされ得るウイルスベクターである。或るベクター(例えば、バクテリア複製起点を有するバクテリアベクターおよびエピゾーム哺乳動物ベクター)は、それが導入された宿主細胞内で自律複製が可能である。他のベクター(例えば、非エピゾーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞内に導入時に宿主細胞のゲノム内に統合されてもよく、これによって、宿主のゲノムと共に複製される。また、或るベクターは、ベクターが作動可能に連結されたオープンリーディングフレーム形態の遺伝子の発現を指示することができる。このようなベクターが本明細書において「組換え発現ベクター」(または、簡単に「組換えベクター」)として称される。一般的に、組換えDNA技術に有用な発現ベクターは、たびたびプラスミドの形態で存在する。
【0142】
本開示の具体的な実施形態において、核酸分子は、ウイルス発現システム(ワクシニアまたは他のポックスウイルス、レトロウイルスまたはアデノウイルス)を用いて宿主細胞に挿入することができる。例示的に、ウイルスベクターには、HIV、SIV、マウスレトロウイルス(murine retroviruses)、テナガザル白血病ウイルス(gibbon ape leukemia virus)、AAVs(adeno-associated viruses)およびアデノウイルス(adenoviruses)などから誘導されたレトロウイルスベクターを含んでもよいが、これに限定されない(Miller et al.,1990,Mol.Cell Biol.10:4239;J.Kolberg 1992,NIH Res.4:43;Cornetta et al.,1991,Hum.Gene Ther.2:215)。マウス白血病ウイルス(murine leukemia virus,MuLV)、テナガザル白血病ウイルス(gibbon ape leukemia virus,GaLV)、エコトロピック・レトロウイルス(ecotropic retroviruses)、SIV(simian immunodeficiency virus)、HIV(human immunodeficiency virus)などから誘導されたレトロウイルスベクターが広く使用されている(Buchscher et al.,1992,J.Virol,66(5):2731-2739;Johann et al.,1992,J.Virol.66(5):1635-1640;Sommerfelt et al.,1990,Virol.176:58-59;Wilson et al.,1989,J.Virol.63:2374-2378;Miller et al.,1991,J.Virol.65:2220-2224;Rosenberg and Fauci 1993 in Fundermental Immunology,Third Edition,W.E.Paul(ed.)Raven Press,Ltd.,New York and the references therein;Miller et al.,1990,Mol.Cell.Biol.10:4239;R.Kolberg 1992,J.NIH Res.4:43;Cornetta et al.,1991,Hum.Gene Ther.2:215)。
【0143】
本開示によるベクターシステムは、本開示の属する技術分野において一般的に知られた様々な方法を通じて構築することができ、これに対する具体的な方法は、Sambrook et al.,Molecular Cloning,A Laboratory Manual,Cold Spring Harbor Laboratory Press(2001)に開示されており、この文献は、本明細書に参照として併合される。
【0144】
例えば、本開示のベクターは、典型的にクローニング(cloning)のためのベクターまたは発現のためのベクターとして構築することができる。また、本開示のベクターは、原核細胞または真核細胞を宿主として構築することができる。例えば、本開示に用いられ得るベクターは、本開示の属する技術分野においてたびたび使用されるプラスミド(例:pSC101、ColE1、pBR322、pUC8/9、pHC79、pUC19、pETなど)、ファージ(例:λgt4λB、λ-Charon、λΔz1、λGEM.TM.-11およびM13など)またはウイルス(例:SV40など)を操作して製作することができる。
【0145】
構成的または誘導性プロモーター(例えば、転写調節要素)は、通常の技術者によって確認できる特定の状況の必要に応じて本開示に使用することができる。様々な可能な宿主細胞によって認識される多数のプロモーターが広く公知されている。選択されたプロモーターは、制限酵素の消化を通じて供給源核酸分子からプロモーターを除去し、単離したプロモーター配列を選択ベクター内に挿入することによって、ペプチドおよび/またはタンパク質をコード化する遺伝子または転写体のオープンリーディングフレーム(ORF)からなるコーディング領域(CR)を有する核酸分子に作動可能に連結することができる。天然プロモーター配列および多数の異種プロモーターを二つとも使用してコーディング領域(CR)を構成する遺伝子または転写体の増幅および/または発現を指示することができる。しかしながら、異種プロモーターは、一般的に天然プロモーターと比較して発現した目的遺伝子のより大きい転写およびより高い収率を得ることができるので好ましい。
【0146】
例えば、本開示のベクターが発現ベクターであり、原核細胞を宿主とする場合には、転写を進行させることができる強力なプロモーター(例えば、tacプロモーター、lacプロモーター、lacUV5プロモーター、lppプロモーター、pLλプロモーター、pRλプロモーター、rac5プロモーター、ampプロモーター、recAプロモーター、SP6プロモーター、trpプロモーターおよびT7プロモーターなど)のような転写調節要素(TCCE)、翻訳を開始するための翻訳調節配列(TLCE)、および転写/翻訳終止配列を含むことが一般的である。宿主細胞としてE.coliが用いられる場合、E.coliトリプトファン生合成経路のプロモーターおよびオペレーター部位(Yanofsky,C.,J.Bacteriol.,158:1018-1024(1984))、そしてファージλの左向プロモーター(pLλプロモーター,Herskowitz,I.and Hagen,D.,Ann.Rev.Genet.,14:399-445(1980))を調節部位として用いることができる。
【0147】
なお、本開示のベクターが発現ベクターであり、真核細胞を宿主とする場合には、哺乳動物細胞のゲノムから誘導されたプロモーター(例:メタロチオニンプロモーター)または哺乳動物ウイルスから誘導されたプロモーター(例:アデノウイルス後期プロモーター、ワクシニアウイルス7.5Kプロモーター、SV40プロモーター、サイトメガロウイルスプロモーターおよびHSVのtkプロモーター)またはバクテリオファージから誘導したプロモーター(例:T7プロモーター、T3プロモーター、SM6プロモーター)を用いることができ、転写終止配列としてポリアデニル化シグナル配列(PA)を一般的に有する。
【0148】
また、本開示の組換えベクターが複製可能な発現ベクターである場合、複製が開始される特定の核酸配列である複製起点(replication origin)を含んでもよい。また、組換えベクターは、選別マーカー(selection marker)を含んでもよい。選別マーカーは、ベクターで形質転換された細胞を選別するためのものであり、薬物耐性、栄養要求性、細胞毒性剤に対する耐性または表面タンパク質の発現のような選択可能な表現型を付与するマーカーを使用することができる。本開示のベクターは、選別標識として、当該技術分野において通常用いられる抗生剤耐性遺伝子を含み、例えば、アンピシリン、ゲンタマイシン、カルベニシリン、クロラムフェニコール、ストレプトマイシン、カナマイシン、ゲネチシン、ネオマイシンおよびテトラサイクリンに対する耐性遺伝子がある。選別剤(selective agent)で処理された環境で選別マーカーを発現する細胞だけが生存するので、形質転換された細胞を選別することができる。選別マーカーの代表的な例として、栄養要求性マーカー(auxotrophic marker)としてのura4、leu1、his3などが挙げられるが、前記例によって本開示において使用できる選別マーカーの種類が制限されるものではない。
【0149】
発現ベクターにサブクローンされた配列を増幅させる様々なインビトロ増幅技法(in vitro amplification techniques)が知られている。このような技法には、PCR(polymerase chain reaction)、LCR(ligase chain reaction)、Qβ-レプリカーゼ増幅(replicase amplification)および他のRNAポリメラーゼを用いた技法がある(Sambrook et al.,1989,Molecular Cloning-A Laboratory Manual(2nd Ed)1-3;U.S.Patent No.4,683,202;PCR protocols A Guide to Methods and Applications,Innis et al.,eds.Academic Press Inc.San Diego,CA 1990.Improved methods of cloning in vitro amplified nucleic acids are described in U.S.Patent No.5,426,039)。
【0150】
本開示のベクターは、それから発現する組換えタンパク質またはペプチドの精製を容易にするために、他の配列と融合することもできる。融合する配列は、例えば、グルタチオンS-トランスフェラーゼ(Pharmacia,USA)、マルトース結合タンパク質(NEB,USA)、FLAG(IBI,USA)および6x His(hexahistidine;Quiagen,USA)などがあり、最も好ましくは、6x Hisである。前記精製のためのさらなる配列のため、宿主で発現したタンパク質は、親和性クロマトグラフィーを通じて迅速かつ容易に精製される。必要に応じて、これらの組換えタンパク質の細胞外分泌を促進することができるように、Fc切片をコード化する配列が融合することもできる。
【0151】
本開示の例示的な実施形態によれば、前記融合配列が含まれているベクターによって発現した融合タンパク質は、親和性クロマトグラフィーによって精製される。例えば、グルタチオン-S-トランスフェラーゼが融合した場合には、この酵素の基質であるグルタチオンを用いることができ、6x Hisが用いられた場合には、Ni-NTA His-結合レジンカラム(Novagen,USA)を用いて所望の組換えタンパク質を迅速かつ容易に得ることができる。
【0152】
前述したベクターを安定的かつ連続的にクローニングおよび発現させることができる宿主細胞は、本開示の属する技術分野においてよく知られているいずれの宿主細胞も用いることができ、例えば、E.coli JM109、E.coli BL21(DE3)、E.coli RR1、E.coli LE392、E.coli B、E.coli X 1776、E.coli W3110、バチルス・サブティリス、バチルス・チューリンゲンシスのようなバシラス属菌株、そしてサルモネラ・チフィムリウム、セラチア・マルセッセンスおよび様々なシュードモナス種のような腸内菌と菌株などがある。また、本開示のベクターを真核細胞に形質転換させる場合には、宿主細胞として、イースト(Saccharomyce cerevisiae)、昆虫細胞(例えば、SF9細胞)およびヒト細胞(例えば、CHO細胞株(Chinese hamster ovary)、W138、BHK、COS-7、293、HepG2、3T3、RINおよびMDCK細胞株)などが用られ得る。
【0153】
本開示のベクターは、細胞を細胞内外(in vivo、ex vivo)またはインビトロ(in vitro)で遺伝的に修飾させるのに用られ得る。細胞を遺伝的に修飾させる方法としては、細胞をウイルスベクターで感染または形質導入させる方法、リン酸カルシウム沈殿(calcium phosphate precipitation)、受容細胞(recipient cells)をDNAを含む細菌プロトプラスト(bacterial protoplasts)と融合させる方法、受容体細胞にDNAを含んでいるリポソーム(liposome)または微小球(microspheres)を処理する方法、エンドサイトーシス(DEAE dextran、receptor-mediated endocytosis)、エレクトロポレーション(electroporation)、マイクロインジェクション(micro-injection)などを含む様々な方法が知られている。
【0154】
例えば、宿主細胞が原核細胞である場合、CaCl2方法(Cohen,S.N.et al.,Proc.Natl.Acac.Sci.USA,9:2110-2114,1973)、ハナハン方法(Hanahan,D.,J.Mol.Biol.,166:557-580,1983)および/または電気穿孔方法(Dower,W.J.et al.,Nucleic.Acids Res.,16:6127-6145,1988)などによって実施することができる。また、宿主細胞が真核細胞である場合には、微細注入法(Capecchi,M.R.,Cell,22:479,1980))、リン酸カルシウム沈殿法(Graham,F.L.et al.,Virology,52:456,11973)、電気穿孔法(Neumann,E.et al.,EMBO J.,1:841,1982)、リポソーム媒介形質転換法(Wong,T.K.et al.,Gene,10:87,1980)、DEAE-デキストラン処理法(Gopal,Mol.Cell Biol.,5:1188-1190,1985)、および/または遺伝子ボンバードメント(Yang et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.、87:9568-9572,1990)などによってベクターを宿主細胞内に注入することができる。宿主細胞内に注入されたベクターは、宿主細胞内で発現することができ、このような場合には、多量の組換えタンパク質または組換えペプチドを得ることになる。例えば、前記発現ベクターがlacプロモーターを含む場合には、宿主細胞にIPTGを処理して遺伝子発現を誘導することができる。
【0155】
前述した核酸分子および/または遺伝子伝達体として前述した核酸分子が挿入された発現システムである発現コンストラクト(construct)は、或る物質の存在の有無を検出するための検出システム、免疫反応を誘導するためのワクチンおよび/または疾患の治療のための治療剤として活用することができる。
【0156】
一例として、核酸分子または核酸分子を含む発現コンストラクトの薬学的有効量を含むワクチンまたは治療剤のような薬学組成物は、薬学的に許容される担体(carrier)、希釈剤および/または賦形剤を含んでもよい。本明細書において「薬学的有効量」とは、本開示による核酸分子の効能または活性を達成するのに十分な量を意味する。
【0157】
また、このような薬学組成物は、前述した核酸分子または発現コンストラクトを安定化させることができるカチオン性ポリマー、カチオン性ペプチドまたはカチオン性ポリペプチドのような安定化剤;免疫反応を強化させることができる少なくとも1つの免疫増強剤;持続放出製剤;および/または有効成分である核酸分子を保護し、生体注入活性を向上させることができる脂質ナノ粒子(lipid nano particle,LNP)を含んでもよい。
【0158】
本開示の核酸分子または発現コンストラクトは、任意の適切な手段、例えば、経口、局所(頬側および舌下を含む)、直腸、膣、経皮、非経口、皮下、腹腔内、肺内、皮内、硬膜内および硬膜外および鼻腔内、および所望の場合に、局部治療、病変内投与のための手段によって投与することができる。非経口注入は、筋肉内、静脈内、動脈内、腹腔内または皮下投与を含む。
【0159】
本開示の核酸分子または発現コンストラクトは、任意の便利な投与形態、例えば、錠剤、粉末、カプセル、溶液、分散液、懸濁液、シロップ、噴霧剤、坐剤、ゲル、エマルジョン、パッチなどで投与することができる。このような組成物は、製薬製剤に通常の成分、例えば、希釈剤、担体、pH調整剤、甘味剤、バルク剤およびさらなる活性剤を含有することができる。
【0160】
以下、例示的な実施例に基づいて本開示を説明するが、本開示が下記実施例に記載された技術思想に限定されない。
【0161】
比較例1:ウミシイタケルシフェラーゼ(R/L)コード化配列が挿入された核酸分子の製作
インフルエンザウイルスのヘマグルチニン(HA)コード化配列が挿入された核酸分子を製作した。鋳型DNA配列は、次のように設計した。
【0162】
5’-KpnI認識配列(GGTACC)-T7プロモーター(配列識別番号:16)-ヒトトロポニンT1(TNNT1)由来の上流翻訳調節要素(配列識別番号:1)-PacI認識配列(TTAATTAA)-Kozak配列(GCCACC)-ウミシイタケルシフェラーゼコード化配列(R/L、配列識別番号:15)-ClaI認識配列(ATCGAT)-ヒトトロポニンT1(ヒトTNNT1)由来の下流翻訳調節要素(配列識別番号:8)-EcoRI認識配列(GAATCC)-ポリアデニル化シグナル(配列識別番号:17)-制限酵素認識配列(配列識別番号:19)。
【0163】
鋳型DNAをpGHベクター(配列識別番号:18)の下流に挿入、クローニング(cloning)し、制限酵素で線型化させ、インビトロ転写(in vitro transcription,IVT)を通じてRNAプラットフォーム形態の核酸分子(以下、「pHJ5L」という)を製作した。
【0164】
実施例1:ウミシイタケルシフェラーゼ(R/L)コード化配列が挿入された核酸分子の製作
ウミシイタケルシフェラーゼをコード化するコーディング領域の下流に単一TNNT1由来の翻訳調節要素の代わりに、2個の下流翻訳調節要素を挿入したことを除いて、比較例の手続きを繰り返した。2個の下流翻訳調節要素は、それぞれ独立して、配列識別番号:8(ヒトTNNT1由来)、配列識別番号:9(ヒトアルブミン由来)、配列識別番号:10(ヒトFTL由来)、配列識別番号:11(ヒトCCL19由来)、配列識別番号:12(ヒトAAMP由来)、配列識別番号:13(ヒトRPS27由来)および配列識別番号:14(ヒトDEFA5由来)から成る群から選択された。以下、配列識別番号:8の下流翻訳調節要素を「A」、配列識別番号:9の下流翻訳調節要素を「B」、配列識別番号:10の下流翻訳調節要素を「C」、配列識別番号:11の下流翻訳調節要素を「D」、配列識別番号:12の下流翻訳調節要素を「E」、配列識別番号:13の下流翻訳調節要素を「F」、配列識別番号:14の下流翻訳調節要素を「G」とそれぞれ略称して表示する。
【0165】
実験例1:生体外発現
マウス筋肉細胞株であるNor10、ヒト由来増殖細胞株HeLaおよびヒト胚芽腎臓細胞株である293A細胞株をそれぞれ48ウェルプレートに8x104 cells/wellの濃度で接種させた。その後、プレートを37℃インキュベーターに入れ、24時間細胞が付着し、成長できるようにした。比較例および実施例で製造された各mRNAは、500ng/wellの濃度で形質転換させた。リポフェクションTM2000は、それぞれのmRNA 1μg当たり1μlを使用してOPTI-MEM培地で十分に混合され得るように30分以上処理した。mRNAとリポフェクションTM2000が混合されると、細胞が付着した48ウェルプレートを取り出して上清を除去し、PBSで洗浄した後、さらに除去した。その上に培地を100μl入れ、mRNAとリポフェクションTM2000の混合物を100μl入れた。
【0166】
この際、陰性対照群は、200μlの培地のみを入れた。プレートをさらに37℃インキュベーターに入れ、6時間と24時間となる時間に取り出して、発現を確認した。6時間と24時間が経過したとき、プレートを取り出して上清を全部除去し、PBSで1回洗浄し、その上にウミシイタケルシフェラーゼアッセイシステムキット(Promega)にあるウミシイタケル溶解バッファー(renilla lysis buffer)を80μlずつ入れて細胞を十分に破壊した後、キットの説明のとおり、ウミシイタケルシフェラーゼ(renilla luciferase)の発現程度を分光光度計で発光を測定した。比較例で製作されたpHJ5L核酸分子を適用したNor10細胞株で6時間経過後のウミシイタケルシフェラーゼの発現量は、2X107、24時間経過後のウミシイタケルシフェラーゼの発現量は、2X106であった。
【0167】
比較例で製作されたpHJ5L核酸分子を適用したHeLa細胞株で6時間経過後のウミシイタケルシフェラーゼの発現量は、7X107、24時間経過後のウミシイタケルシフェラーゼの発現量は、5.5X106であった。比較例で製作されたpHJ5L核酸分子を適用した293A細胞株で6時間経過後のウミシイタケルシフェラーゼの発現量は、4.3X107、24時間経過後のウミシイタケルシフェラーゼの発現量は、2.2X106であった。
【0168】
基本鋳型となる核酸発現プラットフォームは、比較例で製造されたpHJ5Lであり、このプラットフォームでウミシイタケルシフェラーゼの発現量を1に設定し、実施例1でそれぞれ製作されたRNA発現プラットフォームでウミシイタケルシフェラーゼの発現量をpHJ5Lでの発現量と比較した。測定結果を
図3~
図8に示す。
図3~
図8に示されたように、2個の下流翻訳調節要素がコーディング領域と3’末端の間に挿入された実施例で製造された核酸分子は、Nor10細胞株、HeLa細胞株、293A細胞株において全部コーディング領域に挿入されたウミシイタケルシフェラーゼの発現を効率的に向上させた。
【0169】
実験例2:生体内発現
比較例および実施例1でそれぞれ製作されたmRNAをLNP(モデルナのワクチンで使用されたのと同一)と剤形化(formulation)して、生体注入用組成物を製造した。マウスは、呼吸麻酔を通じて麻酔した後、耳を固定させた。それぞれのマウスの耳に比較例および実施例で製造されたmRNAが剤形化された組成物を5μg/20μlの濃度で注射した。注射後6時間と24時間にそれぞれマウスを犠牲にして耳を切って300μlのウミシイタケル溶解バッファーに入れ、はさみで細かく切断した。切断したマウスの耳は、ホモジナイザーを用いてさらに細かく破砕して上清を白色96ウェルプレートに20μlずつ入れた。その後、ウミシイタケルシフェラーゼアッセイキットにあるウミシイタケル基質を用いて分光光度計で発光を測定した。基本鋳型となる核酸発現プラットフォームは、比較例で製造されたpHJ5Lであり、このプラットフォームでウミシイタケルシフェラーゼの発現量を1に設定し、実施例でそれぞれ製作されたRNA発現プラットフォームでウミシイタケルシフェラーゼの発現量をpHJ5Lでの発現量と比較した。測定結果を
図9と
図10に示す。
図9および
図10に示されたように、コーディング領域と3’末端の間に2個の下流翻訳調節要素が挿入された核酸分子からウミシイタケルシフェラーゼの発現量が増加した。
【0170】
実施例2:ウミシイタケルシフェラーゼ(R/L)コード化配列が挿入された核酸分子の製作
ウミシイタケルシフェラーゼをコード化するコーディング領域の下流に2個の下流翻訳調節要素を挿入したことに代わりに、3個の下流翻訳調節要素を挿入したことを除いて、実施例1の手続きを繰り返した。3個の下流翻訳調節要素は、それぞれ独立して、実施例1で使用したのと同じ下流翻訳調節要素を使用した。
【0171】
実験例3:生体外発現
実施例2で製作した核酸分子を実験例1と同じ方法でヒト胚腎臓細胞株である293A細胞株に形質転換させ、ウミシイタケルシフェラーゼの発現程度を分光光度計で発光を測定した。基本鋳型となる核酸発現プラットフォームは、比較例で製造されたpHJ5Lであり、このプラットフォームでウミシイタケルシフェラーゼの発現量を1に設定し、実施例2でそれぞれ製作されたRNA発現プラットフォームでウミシイタケルシフェラーゼの発現量をpHJ5Lでの発現量と比較した。測定結果を
図11および
図12に示す。
図11および
図12に示されたように、3個の下流翻訳調節要素がコーディング領域と3’末端の間に挿入された実施例で製造された核酸分子は、293A細胞株において全部コーディング領域に挿入されたウミシイタケルシフェラーゼの発現を効率的に向上させた。
【0172】
前記では、本開示の例示的な実施形態および実施例に基づいて本開示を説明したが、本開示が前記実施形態および実施例に記載された技術思想に限定されるものではない。かえって本開示の属する技術分野における通常の知識を有する者なら、前述した実施形態および実施例に基づいて様々な修飾と変更を容易に考慮することができる。しかしながら、このような修飾と変更は、全て、本開示の権利範囲に属するという点は、添付の請求範囲において明らかである。
【配列表】
【手続補正書】
【提出日】2024-06-12
【手続補正1】
【補正対象書類名】特許請求の範囲
【補正対象項目名】全文
【補正方法】変更
【補正の内容】
【特許請求の範囲】
【請求項1】
コーディング領域と、
前記
コーディング領域と作動可能に連結される
翻訳調節要素と、を含み、
前記翻訳調節要素は、前記コーディング領域の上流(upstream)に位置する上流翻訳調節要素と、前記コーディング領域の下流(downstream)に位置する下流翻訳調節要素と、を含み、
前記下流翻訳調節要素は、複数の下流翻訳調節要素を含む核酸分子。
【請求項2】
前記下流翻訳調節要素は、前記コーディング領域の下流に位置する第1下流翻訳調節要素および第2下流翻訳調節要素を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項3】
前記複数の下流翻訳調節要素は、それぞれヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つの遺伝子に由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項4】
前記複数の下流翻訳調節要素は、それぞれ独立して、配列識別番号:8、配列識別番号:9、配列識別番号:10、配列識別番号:11、配列識別番号:12、配列識別番号:13および配列識別番号:14から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項5】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素
若しくはその転写体配列を含み、
前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMP、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素
若しくはその転写体配列を含
み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトCCL19由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトAAMP由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトRPS27由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMP、前記ヒトRPS27および前記ヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1、前記ヒトアルブミン、前記ヒトFTL、前記ヒトCCL19、前記ヒトAAMPおよび前記ヒトRPS27から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含む、請求項
3に記載の核酸分子。
【請求項6】
前記下流翻訳調節要素は、前記第2下流翻訳調節要素の下流に位置する第3下流翻訳調節要素をさらに含む、請求項
3に記載の核酸分子。
【請求項7】
前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(TNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(FTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(CCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(AAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(RPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(DEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項
6に記載の核酸分子。
【請求項8】
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素
若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素
若しくはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトFTLまたはヒトRPS27由来の翻訳調節要素
若しくはその転写体配列を含
み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、前記ヒトアルブミン由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトDEFA5由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、ヒトRPS27由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、ヒトFTL由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、ヒトCCL19、ヒトRPS27およびヒトDEFA5から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、または、
前記第1下流翻訳調節要素は、ヒトDEFA5由来の転写翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第2下流翻訳調節要素は、前記ヒトTNNT1由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含み、前記第3下流翻訳調節要素は、前記ヒトFTL由来の翻訳調節要素若しくはその転写体配列を含む、請求項
7に記載の核酸分子。
【請求項9】
前記上流翻訳調節要素は、ヒトトロポニンT1、スロー骨格型(ヒトTNNT1)、ヒトアルブミン、ヒトフェリチン軽鎖(ヒトFTL)、ヒトC-Cモチーフケモカインリガンド(ヒトCCL19)、ヒト血管関連の移動性細胞タンパク質(ヒトAAMP)、ヒトリボソームタンパク質S27(ヒトRPS27)およびヒトディフェンシンアルファ5(ヒトDEFA5)から成る群から選択されるいずれか1つに由来する翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項10】
前記上流翻訳調節要素は、配列識別番号:1、配列識別番号:2、配列識別番号:3、配列識別番号:4、配列識別番号:5、配列識別番号:6および配列識別番号:7から成る群から選択される翻訳調節要素またはその転写体配列を含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項11】
前記核酸分子は、RNAである、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項12】
前記核酸分子は、前記コーディング領域と作動可能に連結される転写調節要素
、および
前記下流翻訳調節配列の下流に位置するポリアデニル化シグナル配列またはポリアデノシン配列のうち、少なくとも1つをさらに含む、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項13】
前記コーディング領域は、レポータータンパク質
、若しくはその断片
、若しくはマーカー(marker)
、または選別タンパク質
、若しくはその断片、
または抗原、若しくはその断片、または疾患の治療のためのペプチド、若しくはその断片のうち、少なくとも1つをコード化する、請求項1に記載の核酸分子。
【請求項14】
請求項1に記載の核酸分子が挿入された組換え発現ベクター。
【請求項15】
請求項1に記載の核酸分子または請求項1に記載の核酸分子が挿入された組換え発現ベクターを生体内に注入し、前記注入した核酸分子からタンパク質またはペプチドを発現させて前記タンパク質またはペプチドを製造する方法。
【手続補正2】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】0007
【補正方法】変更
【補正の内容】
【0007】
一態様によれば、コーディング領域と、前記コーディング領域と作動可能に連結される翻訳調節要素と、を含み、前記翻訳調節要素は、前記コーディング領域の上流(upstream)に位置する上流翻訳調節要素と、前記コーディング領域の下流(downstream)に位置する下流翻訳調節要素を含み、前記下流翻訳調節要素は、複数の下流翻訳調節要素と、を含む核酸分子を開示する。
【手続補正3】
【補正対象書類名】明細書
【補正対象項目名】0161
【補正方法】変更
【補正の内容】
【0161】
比較例1:ウミシイタケルシフェラーゼ(R/L)コード化配列が挿入された核酸分子の製作
ウミシイタケルシフェラーゼコード化配列が挿入された核酸分子を製作した。鋳型DNA配列は、次のように設計した。
【国際調査報告】