(19)【発行国】日本国特許庁(JP)
(12)【公報種別】公表特許公報(A)
(11)【公表番号】
(43)【公表日】2025-01-30
(54)【発明の名称】MuSK標的化オリゴヌクレオチド
(51)【国際特許分類】
C12N 15/11 20060101AFI20250123BHJP
C12N 15/113 20100101ALI20250123BHJP
C12N 15/88 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/28 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/16 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/24 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/18 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/30 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/08 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/14 20060101ALI20250123BHJP
A61P 25/02 20060101ALI20250123BHJP
A61P 21/04 20060101ALI20250123BHJP
A61P 9/10 20060101ALI20250123BHJP
A61P 21/00 20060101ALI20250123BHJP
A61P 21/02 20060101ALI20250123BHJP
A61K 48/00 20060101ALI20250123BHJP
A61K 31/711 20060101ALI20250123BHJP
A61K 31/7125 20060101ALI20250123BHJP
A61K 31/712 20060101ALI20250123BHJP
A61K 9/51 20060101ALI20250123BHJP
A61K 47/54 20170101ALI20250123BHJP
C12N 15/12 20060101ALN20250123BHJP
C12N 15/54 20060101ALN20250123BHJP
【FI】
C12N15/11 Z ZNA
C12N15/113 130Z
C12N15/88 Z
A61P25/28
A61P25/16
A61P25/24
A61P25/18
A61P25/30
A61P25/08
A61P25/14
A61P25/02
A61P21/04
A61P9/10
A61P21/00
A61P21/02
A61K48/00
A61K31/711
A61K31/7125
A61K31/712
A61K9/51
A61K47/54
C12N15/12
C12N15/54
【審査請求】未請求
【予備審査請求】未請求
(21)【出願番号】P 2024543383
(86)(22)【出願日】2023-01-20
(85)【翻訳文提出日】2024-09-18
(86)【国際出願番号】 US2023011286
(87)【国際公開番号】W WO2023141302
(87)【国際公開日】2023-07-27
(32)【優先日】2022-01-20
(33)【優先権主張国・地域又は機関】US
(81)【指定国・地域】
(71)【出願人】
【識別番号】524273731
【氏名又は名称】ボールデン セラピューティクス, インコーポレイテッド
(74)【代理人】
【識別番号】100078282
【氏名又は名称】山本 秀策
(74)【代理人】
【識別番号】100113413
【氏名又は名称】森下 夏樹
(74)【代理人】
【識別番号】100181674
【氏名又は名称】飯田 貴敏
(74)【代理人】
【識別番号】100181641
【氏名又は名称】石川 大輔
(74)【代理人】
【識別番号】230113332
【氏名又は名称】山本 健策
(72)【発明者】
【氏名】ペイジ, ジョン
(72)【発明者】
【氏名】ヴァラ, アンヌ
(72)【発明者】
【氏名】アグラワル, スディール
(72)【発明者】
【氏名】ブラウン, ダンカン
【テーマコード(参考)】
4C076
4C084
4C086
【Fターム(参考)】
4C076AA65
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4C086MA66
4C086NA14
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4C086ZA36
4C086ZA94
(57)【要約】
本開示は、とりわけ、エクソンスキッピングを介してMuSK転写物のスプライシングを変化させるMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物、及び当該組成物を用いて疾患を治療する方法を提供する。
【選択図】
図1
【特許請求の範囲】
【請求項1】
複数のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド組成物であって、
前記オリゴヌクレオチド組成物が、転写スプライシングシステムにおいてMuSK転写物と接触すると、Ig3ドメインコード配列を含む転写物と含まない転写物の相対量が、前記組成物の不在、参照組成物の存在、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるそのような参照条件下で観察される相対量と比較して変化することを特徴とする、組成物。
【請求項2】
前記オリゴヌクレオチドが、MuSK遺伝子の少なくとも1つのエクソンのスキッピングを媒介する、請求項1に記載の組成物。
【請求項3】
前記エクソンスキッピングが、前記エクソンスキッピングの不在下で観察されるレベルと比較して、BMPシグナル伝達に関与するMuSKタンパク質形態をコードするmRNAのレベルを下げる、請求項2に記載の組成物。
【請求項4】
BMPシグナル伝達に関与する前記MuSKタンパク質形態が、MuSK/BMP複合体を形成するMuSKタンパク質形態であるか、又はそれを含む、請求項3に記載の組成物。
【請求項5】
前記エクソンスキッピングが、MuSK/BMP複合体のレベル及び/又は活性を低下させる、請求項4に記載の組成物。
【請求項6】
少なくとも1つのスキップされたエクソンが、エクソン3、4、6、及び7からなる群から選択される、請求項2~5のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項7】
前記相対量が、エクソン6及び7を欠く転写物の量に対する、エクソン6及び7を含む転写物の量である、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項8】
前記相対量が、エクソン6及び7を欠く転写物の量に対する、エクソン3及び4を含む転写物の量である、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項9】
前記変化が、MuSKのエクソン6及び7のうちの1つ以上をスキップすることを含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項10】
前記変化が、MuSKのエクソン3及び4のうちの1つ以上をスキップすることを含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項11】
前記変化が、MuSKのエクソン6及び7のうちの1つ以上をスキップすることを含むが、MuSKのエクソン3及び4のいずれもスキップしないことを含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項12】
MuSKスプライシングが、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であるという点で変化する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項13】
MuSKスプライシングが、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であるという点で変化する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項14】
MuSKスプライシングが、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であるという点で変化する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項15】
MuSKスプライシングが、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であるという点で変化する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項16】
MuSKスプライシングが、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが実質的に変わらず、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するという点で変化する、請求項1~12のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項17】
MuSKスプライシングが、エクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが実質的に変わらず、エクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するという点で変化する、請求項1~12及び16のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項18】
MuSKスプライシングが、MuSK転写物の総レベルが実質的に変わらず、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するという点で変化する、請求項1~12及び16~17のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項19】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方について観察される減少よりも少なくとも2倍高いレベルで減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項20】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方について観察される減少よりも少なくとも3倍高いレベルで減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項21】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方について観察される減少よりも少なくとも4倍高いレベルで減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項22】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方について観察される減少よりも少なくとも5倍高いレベルで減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項23】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方について観察される減少よりも少なくとも10倍高いレベルで減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項24】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、40%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項25】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、70%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、40%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項26】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、80%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、40%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項27】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、90%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、40%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項28】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、30%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項29】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、20%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項30】
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が、10%未満減少する、請求項1~11のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項31】
前記オリゴヌクレオチドの塩基配列が、前記MuSK遺伝子又はその相補体の18~25塩基長部分から5個以下のミスマッチを有する配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項32】
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号77の83776~83800位及び/又は83854~83878位に対応するMuSKゲノム配列上の領域を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項33】
前記オリゴヌクレオチドが、配列ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)内の、又はその少なくとも一部分を含む、MuSKゲノム配列上の領域を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項34】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項35】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項36】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の30個以下の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項37】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項38】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項39】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項40】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項41】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項42】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項43】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項44】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項45】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項46】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項47】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項48】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項49】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項50】
前記オリゴヌクレオチドが、配列GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCCCTTCACATTTG(領域2、配列番号211)内の、又はその少なくとも一部分を含むMUSKゲノム配列上の領域を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項51】
前記オリゴヌクレオチドが、領域2、配列番号211と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項52】
前記オリゴヌクレオチドが、領域2、配列番号211の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項53】
前記オリゴヌクレオチドが、領域2、配列番号211の30個以下の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項54】
前記オリゴヌクレオチドが、領域2、配列番号211の15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項55】
前記オリゴヌクレオチドが、ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)内の配列、又はその少なくとも一部分を含む配列に相補的である核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項56】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列に相補的である核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項57】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項58】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも95%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項59】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)の少なくとも20個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項60】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)の少なくとも21個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項61】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)の少なくとも22個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項62】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1(配列番号126)の少なくとも23個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項63】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の少なくとも24個の連続する塩基を含む、領域1、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項64】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の少なくとも25個の連続する塩基を含む、領域1、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項65】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の少なくとも26個の連続する塩基を含む、領域1、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項66】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項67】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の30個以下の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項68】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項69】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項70】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項71】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項72】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項73】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項74】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項75】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項76】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項77】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項78】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項79】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項80】
前記オリゴヌクレオチドが、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項81】
前記オリゴヌクレオチドが、25塩基の長さを有する、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項82】
前記オリゴヌクレオチドが、24塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項83】
前記オリゴヌクレオチドが、23塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項84】
前記オリゴヌクレオチドが、22塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項85】
前記オリゴヌクレオチドが、21塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項86】
前記オリゴヌクレオチドが、20塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項87】
前記オリゴヌクレオチドが、19塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項88】
前記オリゴヌクレオチドが、18塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項89】
前記オリゴヌクレオチドが、17塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項90】
前記オリゴヌクレオチドが、16塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項91】
前記オリゴヌクレオチドが、15塩基の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項92】
前記オリゴヌクレオチドが、約50塩基未満の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項93】
前記オリゴヌクレオチドが、約40塩基未満の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項94】
前記オリゴヌクレオチドが、約30塩基未満の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項95】
前記オリゴヌクレオチドが、約10塩基超の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項96】
前記オリゴヌクレオチドが、約15塩基超の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項97】
前記オリゴヌクレオチドが、約20塩基超の長さを有する、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項98】
前記オリゴヌクレオチドの前記塩基配列が、5’から3’の方向に、以下を含む、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【表17-1】
【表17-2】
【表17-3】
【請求項99】
前記オリゴヌクレオチドが、配列番号39~76及び212~253のうちのいずれか1つと少なくとも90%同一のヌクレオチド配列に相補的である、請求項1~32のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項100】
前記オリゴヌクレオチドが、塩基修飾、糖修飾、及びヌクレオチド間結合修飾のうちの1つ以上のタイプを含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項101】
前記オリゴヌクレオチドが、非天然糖部分、又は非天然ヌクレオチド間結合、又はその両方を含む、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項102】
前記オリゴヌクレオチドが、ヌクレオチド間結合修飾を含む、請求項100又は101に記載の組成物。
【請求項103】
前記オリゴヌクレオチドの前記ヌクレオチド間結合が、天然のホスフェート結合、ホスホロチオエート結合、又はホスホジチオエート結合を含む、請求項102に記載の組成物。
【請求項104】
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合が、ホスホロチオエート結合である、請求項103に記載の組成物。
【請求項105】
前記オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合が、天然のホスフェート結合である、請求項103に記載の組成物。
【請求項106】
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも1つの天然のホスフェート結合及び少なくとも1つのホスホジチオエート結合を含む、請求項103に記載の組成物。
【請求項107】
前記オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合の少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、94%、又は95%が、ホスホジチオエート結合である、請求項103又は106に記載の組成物。
【請求項108】
前記オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合の少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、94%、又は95%が、天然のホスフェート結合である、請求項103又は106に記載の組成物。
【請求項109】
前記オリゴヌクレオチドが、糖修飾を含む、請求項100~104のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項110】
修飾糖部分が、2’-修飾を有する、請求項105に記載の組成物。
【請求項111】
修飾糖部分が、二環式糖修飾を含む、請求項105に記載の組成物。
【請求項112】
前記修飾糖部分が、2’-修飾を含み、2’-修飾が、2’-OR
1であり、R
1が、任意選択的に置換されたC
1-6アルキルである、請求項110に記載の組成物。
【請求項113】
前記修飾糖部分が、2’-修飾を含み、2’-修飾が、2’-MOEである、請求項112に記載の組成物。
【請求項114】
前記修飾糖部分が、2’-修飾を含み、2’-修飾が、2’-OMeである、請求項112に記載の組成物。
【請求項115】
前記オリゴヌクレオチドが、2’-OH糖(RNA糖)を含む、請求項100~114のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項116】
前記オリゴヌクレオチドが、2’-H糖(DNA糖)を含む、請求項100~115のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項117】
前記オリゴヌクレオチドが、2’-MOE糖を含む、請求項100~116のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項118】
前記オリゴヌクレオチドが、2’-OMe糖を含む、請求項100~117のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項119】
前記オリゴヌクレオチドの各糖が、2’-MOE修飾糖である、請求項112に記載の組成物。
【請求項120】
前記オリゴヌクレオチドの各糖が、2’-OMe修飾糖である、請求項112に記載の組成物。
【請求項121】
前記オリゴヌクレオチドの各糖が、2’-H糖である、請求項112に記載の組成物。
【請求項122】
前記オリゴヌクレオチドの各糖が、2’-OH糖である、請求項112に記載の組成物。
【請求項123】
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の2’-MOE糖及び少なくとも1個の2’-OH糖(RNA糖)を含む、請求項100~116のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項124】
前記オリゴヌクレオチドが、少なくとも1個の2’-MOE糖及び少なくとも1個の2’-H糖(DNA糖)を含む、請求項100~116のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項125】
前記オリゴヌクレオチドが、5’から3’の方向に、以下の構造を有する、先行請求項のいずれか一項に記載の組成物。
【表18-1】
【表18-2】
【表18-3】
表中、*は、ホスホロチオエート結合を表し、前記オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
【請求項126】
請求項1~120のいずれか一項に記載の2つ以上のオリゴヌクレオチドの混合物を含む、オリゴヌクレオチド組成物。
【請求項127】
前記組成物が、配列番号77の83776~83800位及び/又は83854~83878位に対応するMuSKゲノム配列の領域を標的とするオリゴヌクレオチドを含む、請求項126に記載の組成物。
【請求項128】
治療有効量のオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容可能な希釈剤、薬学的に許容可能な賦形剤、及び薬学的に許容可能な担体から選択される少なくとも1つの薬学的に許容可能な不活性成分と、を含む、医薬組成物であって、前記オリゴヌクレオチドが、請求項1~127のいずれか一項に記載のオリゴヌクレオチドである、医薬組成物。
【請求項129】
前記オリゴヌクレオチドが、ナノ担体で製剤化される、請求項1~128のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項130】
前記オリゴヌクレオチドが、脂質ナノ粒子(LNP)中に製剤化される、請求項129のいずれか一項に記載の組成物。
【請求項131】
前記オリゴヌクレオチドが、脂質(例えば、コレステロール)、ペプチド、アプタマー、抗体、及び糖(例えば、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)から選択される追加の部分に共有結合的にコンジュゲートされている、請求項1~128のいずれか一項に記載の組成物の組成物。
【請求項132】
前記オリゴヌクレオチドが、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)に共有結合的にコンジュゲートされている、請求項131に記載の組成物の組成物。
【請求項133】
MuSKスプライシング転写物の相対量を変化させる方法であって、請求項1~132のいずれか一項に記載の組成物を含むか、又は送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項134】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、Ig3ドメインコード配列を含有するMuSK転写物の、Ig3ドメインコード配列を含有しないMuSK転写に対する比が増加することを特徴とする、請求項133に記載の方法。
【請求項135】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、Ig3ドメインコード配列を含有するMuSK転写物の、Ig3ドメインコード配列を含有しないMuSK転写に対する比が減少することを特徴とする、請求項133に記載の方法。
【請求項136】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、Ig3ドメインコード配列を含有するMuSK転写物が減少し、総MuSK転写物のレベルが実質的に同じままであることを特徴とする、請求項133に記載の方法。
【請求項137】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であることを特徴とする、請求項133に記載の方法。
【請求項138】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であることを特徴とする、請求項133に記載の方法。
【請求項139】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であることを特徴とする、請求項133及び136~138のいずれか一項に記載の方法。
【請求項140】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であることを特徴とする、請求項133及び136~138のいずれか一項に記載の方法。
【請求項141】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが実質的に同じままであるか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが実質的に同じままであるか、又はその両方であることを特徴とする、請求項133及び136~138のいずれか一項に記載の方法。
【請求項142】
MuSKスプライシング転写物の前記変化が、
エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが実質的に同じままであるか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが実質的に同じままであるか、又はその両方であり、
エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方である、ことを特徴とする、請求項133及び136~138のいずれか一項に記載の方法。
【請求項143】
神経変性疾患の1つ以上の特徴に罹患している対象を治療する方法であって、請求項1~132のいずれか一項に記載の組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項144】
神経発生を増加させる方法であって、請求項1~132のいずれか一項に記載の組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項145】
神経筋機能障害又は筋ジストロフィーの1つ以上の特徴に罹患している対象を治療する方法であって、請求項1~132のいずれか一項に記載の組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項146】
筋再生及び/又は筋成長を増加させる方法であって、請求項1~132のいずれか一項に記載の組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項147】
筋線維症を治療する方法であって、請求項1~132のいずれか一項に記載の組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む、方法。
【請求項148】
前記対象が、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害、及び筋消耗を特徴とする疾患からなる群から選択される疾患又は障害のリスクがある、又はそれらに罹患している、請求項142及び145のいずれか一項に記載の方法。
【請求項149】
前記神経変性障害が、アルツハイマー病(AD)、パーキンソン病、認知症(例えば、前頭側頭型認知症)、脳卒中、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連障害及び嗜癖障害(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)、側頭葉てんかん、海馬硬化症、ニーマンピック病C型、糖尿病媒介性海馬ニューロン損失、脳損傷(例えば、外傷性及び/又は無酸素性脳損傷)、並びにハンチントン病からなる群から選択される、請求項148に記載の方法。
【請求項150】
前記神経変性疾患が、アルツハイマー病(AD)である、請求項149に記載の方法。
【請求項151】
前記神経筋機能障害が、ベッカー型、先天性、遠位型、デュシェンヌ型、エメリー・ドレヒュス型、顔面肩甲上腕型、肢帯型、筋強直性、及び眼球咽頭型筋ジストロフィーからなる群から選択される、筋ジストロフィーである、請求項148に記載の方法。
【請求項152】
前記心臓障害が、心筋梗塞又は心筋症である、請求項151に記載の方法。
【請求項153】
前記対象が、手術、外傷、及び長期固定化からなる群から選択される状態後の筋再生及び/又は成長の強化を必要としている、請求項142~145のいずれか一項に記載の方法。
【請求項154】
前記長期固定化が、床上安静又はギプス固定により生じる、請求項153に記載の方法。
【請求項155】
前記対象が、サルコペニアのリスクがあるか、又はサルコペニアに罹患している、請求項143~145のいずれか一項に記載の方法。
【請求項156】
前記対象が、外傷、遺伝性疾患、筋障害、及び老化からなる群から選択される疾患又は状態に起因する筋線維症のリスクがあるか、又は罹患している、請求項143~145のいずれか一項に記載の方法。
【請求項157】
前記外傷が、放射線治療、圧挫損傷、裂傷、及び切断からなる群から選択される状態の結果である、請求項156に記載の方法。
【請求項158】
前記遺伝性疾患又は筋障害が、先天性筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、及び加齢に伴うサルコペニアからなる群から選択される、請求項156に記載の方法。
【請求項159】
前記組成物が、CNSに送達される、請求項145~158のいずれか一項に記載の方法。
【請求項160】
前記組成物が、脳脊髄液に送達される、請求項144~158のいずれか一項に記載の方法。
【請求項161】
前記組成物が、筋肉に送達される、請求項144~158のいずれか一項に記載の方法。
【請求項162】
前記組成物が、肝臓に送達される、請求項144~158のいずれか一項に記載の方法。
【請求項163】
前記組成物が、全身投与又は局所投与のために製剤化されることができる、請求項144~158のいずれか一項に記載の方法。
【請求項164】
前記組成物が、静脈内注射、静脈内注入、筋肉内注射、髄腔内投与、経口投与、頬側投与、吸入、経鼻投与、局所投与、眼投与、又は耳投与から選択される経路による送達のために製剤化される、請求項163に記載の方法。
【請求項165】
前記組成物が、筋肉内投与による送達のために製剤化される、請求項164に記載の方法。
【請求項166】
前記組成物が、静脈内投与による送達のために製剤化される、請求項164に記載の方法。
【請求項167】
前記組成物が、経口投与による送達のために製剤化される、請求項164に記載の方法。
【発明の詳細な説明】
【技術分野】
【0001】
関連出願の相互参照
本出願は、2022年1月20日に出願された米国仮特許出願第63/301,416号の利益を主張するものであり、その内容は、参照によりその全体が本明細書に組み込まれる。
【背景技術】
【0002】
神経変性疾患は、主要な公衆衛生上の課題であり、生涯で5人に1人が罹患すると予想される。アルツハイマー病(AD)は、加齢性認知症の最も一般的な原因である。AD及び他の神経変性状態を予防及び治療するための治療剤に対する重要かつ緊急の必要性がある。
【0003】
骨格筋は、損傷後に再生する能力を有する。筋再生は、筋衛星細胞と呼ばれる常在幹細胞に依存する。成熟筋組織では、衛星細胞は、有糸分裂細胞及び生理学的静止細胞の小さな散在集団を構成する。衛星細胞はまた、生涯にわたって正常な筋成長及び維持に関与し、筋消耗状態を治療するために利用され得ることを示す。
【0004】
骨格筋は体重の約35%を占め、代謝、運動、及び呼吸に不可欠であり、これはヒトの健康におけるその重要性を強調する。筋消耗は、大多数のがん患者、高齢患者、及び神経筋機能障害の既往のない他の多くの患者の可動性、代謝、及び生活の質を減少させる。更に、筋ジストロフィーは、小児に影響を及ぼすデュシェンヌ型筋ジストロフィーを含む、重度の筋肉喪失につながる遺伝性疾患のしばしば致命的なグループである。
【0005】
神経発生及び筋再生は、神経幹細胞(NSC)及び筋衛星細胞に依存する。神経変性及び筋消耗の治療の開発の障害は、神経幹細胞及び衛星細胞並びにそれらの再生を調節するシグナル伝達が十分に理解されていないことである。したがって、神経発生及び筋再生を促進するための組成物及び方法に対するニーズがある。
【発明の概要】
【0006】
とりわけ、本開示は、特に機能性Ig3ドメインを欠く、筋特異的チロシンキナーゼ(MuSK)タンパク質の特定の形態の存在及び/又は活性が、例えば、神経発生及び/又は筋再生を含む有益な生物学的事象を達成又は寄与し得るという洞察を提供する。
【0007】
本開示は、特に成人のヒトを含む、神経発生を強化するための特定の技術を提供する。いくつかの実施形態では、本明細書に提供される技術は、神経変性に関連する疾患、障害、若しくは状態、又はそうでなければニューロン活動の低下若しくは低減(例えば、成人海馬及び/若しくは脳室下帯におけるニューロン活動)に関連する疾患、障害、若しくは状態の治療を特に含む、医療において有用であり得る。例えば、いくつかの実施形態では、本明細書に提供される技術は、アルツハイマー病(AD)、パーキンソン病、認知症(例えば、前頭側頭型認知症)、脳卒中、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連障害及び嗜癖障害(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)、側頭葉てんかん、海馬硬化症、ニーマンピック病C型、糖尿病媒介性海馬ニューロン損失、脳損傷(例えば、外傷性及び/又は無酸素性脳損傷)、ハンチントン病のうちの1つ以上の治療に有用であり得る。
【0008】
骨形成タンパク質(BMP)シグナル伝達は、少なくとも2つの重要なNSC決定点、1)増殖幹細胞が細胞周期を出て、新鮮な幹細胞を供給し得る貯蔵プールを補充するために戻る静止、及び2)成熟子孫への分化、を調節する(Mira et al.,2010)。本開示は、NSCにおけるBMP経路を操作することが、成人脳における神経発生を調節するための魅力的な標的であることを企図する。更に、BMPシグナル伝達は、正常状態及び病理学的状態の両方で骨格筋幹細胞活性を調節する。本開示は、神経発生及び/又は筋再生に機能的に関与するMuSK形態のレベル及び/又は活性を増加させるための技術を提供し、いくつかの実施形態では、関与しないMuSK形態を生成するであろう選択的スプライシングを低減することを含む。いくつかの実施形態では、このような増加は、筋肉などの関連組織におけるものである。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、そのような増加は、脳組織(例えば、海馬及び/又は脳室下)及び/又は肺組織などの組織におけるものである。
【0009】
とりわけ、本開示は、特に機能性Ig3ドメインを欠く、筋特異的チロシンキナーゼ(MuSK)タンパク質の特定の形態の存在及び/又は活性が、成人ヒトにおける神経発生を達成若しくは寄与し得るか、又はそうでなければ神経学的利益を提供し得るという洞察を提供する。MuSK転写物は、Ig3ドメインを欠く少なくとも1つの形態(すなわち、ΔIg3-MuSK)を生成することを含む、選択的スプライシングされ得る。本開示では、ΔIg3-MuSK、及び/又はそのIg3ドメインが変化され(例えば、変異、遮断など)又は除去される他の機能的形態の存在及び/又はレベルを増加させることが、本明細書に記載される利益を提供し得ることを認識する。
【0010】
いくつかの実施形態では、本開示は、そのIg3ドメインが、例えば、BMPとの相互作用に効果的に関与しないように変化(例えば、変異、遮断、除去など)されて、1つ以上の形態のMuSKのレベル及び/又は活性を増加させるための技術を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、例えば、Ig3ドメインがBMPとの相互作用に効果的に関与する、1つ以上の形態のMuSKのレベル及び/又は活性を低減することによって、Ig3+MuSKを低減するための技術を提供する。
【0011】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるMuSK Ig3ドメインを標的とし、MuSK/BMP複合体のレベル及び/又は活性を低減させる薬剤(例えば、MuSK標的化オリゴヌクレオチド)は、神経発生及び/又は筋再生及び/又は筋成長の状況で有用である。
【0012】
いくつかの実施形態では、提供される薬剤は、筋成長を強化し得る。いくつかの実施形態では、筋成長は、損傷していない組織で発生する。いくつかの実施形態では、筋成長は、損傷した組織で発生する。いくつかの実施形態では、筋成長の強化及び/又は増加は、衛星細胞数の減少及び/又は筋線維サイズの増加によって決定される。これに関して、筋成長は、衛星細胞数の減少及び/又は筋線維サイズの増加によって特徴付けられ得、これは、衛星細胞が分化して及び既存の筋線維に融合し/それを増強させ、新しい筋線維を形成することを示す。
【0013】
本発明の実施形態は、MuSK Ig3ドメインタンパク質発現、MuSK Ig3ドメイン遺伝子発現、及び/又はBMPシグナル伝達のMuSK Ig3活性化を下方制御する組成物を、例えば、それを必要とする対象において、投与することによって、神経発生及び/又は筋再生及び/又は成長を強化し、それによって筋再生及び/又は成長を強化する筋衛星細胞を上方制御する方法を提供する。いくつかの実施形態では、このような組成物は、MuSK標的化オリゴヌクレオチド(例えば、MuSK Ig3標的化エクソンスキッピングオリゴヌクレオチド)を含む及び/又はそれを送達することができる。
【0014】
いくつかの実施形態では、神経発生の強化は、成人海馬神経発生(AHN)の低下に関連する疾患又は障害を治療する状況で使用される。AHNはヒトにおいて生涯にわたって発生し、ADにおいて劇的に低下する(Moreno-Jimenez et al.,2019、Steiner et al.,2019)ため、本開示は、AHNを促進し、認知機能を強化し、神経変性(例えば、アルツハイマー病)と闘うための組成物及び方法を提供する。
【0015】
いくつかの実施形態では、神経発生の強化は、脳室下帯神経発生の低下に関連する疾患又は障害を治療する状況で使用される。NSCは側脳室の内側を覆う脳室下帯(SVZ)内に存在し、既存の回路を支持する星状細胞及びオリゴデンドロサイト並びに嗅覚弁別に重要な嗅球のニューロンを生成する。本開示は、内因性神経発生の強化を介してSVZ中のニューロンの変性を補償するための組成物及び方法を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、パーキンソン病(これはSVZにおけるAHN及び線条体神経発生の増加の両方から利益を得ることができる、Pitcher et al.2012、Sterling et al.2013)及びハンチントン病(Sassone et al.,2018)などの線条体神経発生に特異的に関連する疾患を治療するための組成物及び方法を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、嗜癖(例えば、慢性コカインの使用及び生涯にわたる喫煙)を含む他の疾患を治療するための組成物及び方法を提供する。
【0016】
いくつかの実施形態では、関心対象となる対象は、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患を含むが、これらに限定されない、疾患若しくは障害のリスクがあるか、又は罹患している可能性がある。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、関心対象となる対象は、例えば、特発性肺線維症(IPF)、急性呼吸窮迫症候群(ARDS)、肺炎、及び/又はCOVID19などのコロナウイルス感染症を含むウイルス感染症を含む特定の感染症を含めた、肺損傷に関連する疾患又は障害のリスクがあるか、又は罹患している可能性がある。
【0017】
本発明の技術によって治療され得る例示的な神経筋機能障害又は障害としては、ベッカー型筋ジストロフィー、先天性筋ジストロフィー、遠位型筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、エメリー・ドレヒュス型筋ジストロフィー、顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー、肢帯型筋ジストロフィー、筋強直性筋ジストロフィー、及び眼球咽頭型筋ジストロフィーが挙げられるが、これらに限定されない。
【0018】
いくつかの実施形態では、筋成長の強化は、筋萎縮又は筋消耗に関連する疾患又は障害を治療する状況で使用される。筋萎縮又は筋消耗は、神経筋障害など、本明細書に記載される様々な疾患及び状態に関連して観察される場合があり、又は長期間の不活動、床上安静、入院、老化、栄養失調、がん性悪液質、慢性炎症性疾患などによって直接的若しくは間接的に引き起こされる場合がある。慢性炎症性疾患の例としては、関節リウマチ、慢性心不全、及び慢性閉塞性肺疾患(COPD)が挙げられる。
【0019】
入院期間、並びに疾患のタイプ及び重症度は、対象における筋消耗の程度に影響を与える可能性があり、筋消耗は、敗血症、臓器不全、高血糖症、並びに慢性及び全身の炎症又は酸化ストレスに関連する疾患に罹患している患者においてよく見られる。更に、完全な固定化/床上安静を必要とする入院は、筋消耗に大きく寄与する。
【0020】
筋萎縮/筋消耗に関連する追加の障害としては、関節リウマチ、変形性関節炎、及び傷害などの可動性の低下に関連する障害が挙げられる。(2016 Powers,Scott K.,et al.Medicine and science in sports and exercise 48(11):2307)。したがって、いくつかの実施形態では、本開示は、本明細書に記載される多くの疾患又は状態に関連するか、又はその結果としての筋消耗又は筋萎縮を予防/治療するための療法を提供する。
【0021】
いくつかの実施形態では、本発明の方法は、外科手術、外傷、及び/又は長期固定化(例えば、床上安静又はギプス固定による)後に、対象が筋再生及び筋成長の強化を必要とする場合にも使用され得る。筋幹細胞活性は、年齢とともに低下することが知られているため、本発明の方法は、他の点では健康な患者におけるサルコペニアを予防又は逆転させるために使用することもでき、生活の質及び自律性における著しい改善につながる可能性がある。
【0022】
本発明の実施形態はまた、例えば、MuSK Ig3ドメインタンパク質発現、MuSK Ig3ドメイン遺伝子発現、及び/又はBMPシグナル伝達のMuSK Ig3活性化を下方制御する組成物を投与することによって、それを必要とする対象において神経変性疾患(例えば、AD)及び/又は筋線維症を予防又は治療する方法を提供する。組成物は、例えば、MuSK標的化オリゴヌクレオチド(例えば、MuSK Ig3標的化エクソンスキッピングオリゴヌクレオチド)を含み得る。対象は、アルツハイマー病(AD)、パーキンソン病、認知症(例えば、前頭側頭型認知症)、脳卒中、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連及び嗜癖障害(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)、側頭葉てんかん、海馬硬化症、ニーマンピック病C型、糖尿病媒介性海馬ニューロン損失、脳損傷(例えば、外傷性及び/又は無酸素性脳損傷)、ハンチントン病又は外傷、遺伝性疾患、筋障害及び老化を含むがこれらに限定されない疾患又は状態に起因する筋線維症などの、様々な神経変性疾患のリスクがあるか、又は罹患している可能性がある。外傷は、例えば、放射線治療、圧挫損傷、裂傷、及び切断から生じる可能性がある。遺伝性疾患又は筋障害としては、以下に限定されないが、先天性筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、及び加齢に伴うサルコペニアが挙げられる。
【0023】
本発明の特徴は、特に、複数のオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド組成物であって、オリゴヌクレオチド組成物が、転写スプライシングシステムにおいてMuSK転写物と接触すると、Ig3ドメインコード配列を含む転写物と含まない転写物の相対量が、組成物の不在、参照組成物の存在、及びそれらの組み合わせからなる群から選択されるそのような参照条件下で観察される相対量と比較して変化することを特徴とする。
【0024】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、MuSK遺伝子の少なくとも1つのエクソンのスキッピングを媒介する。いくつかの実施形態では、エクソンスキッピングは、エクソンスキッピングなしで観察されるレベルと比較して、BMPシグナル伝達に関与するMuSKタンパク質形態をコードするmRNAのレベルを下げる。いくつかの実施形態では、BMPシグナル伝達に関与するMuSKタンパク質形態は、MuSK/BMP複合体を形成するMuSKタンパク質形態であるか、又はそれを含む。
【0025】
いくつかの実施形態では、エクソンスキッピングは、MuSK/BMP複合体のレベル及び/又は活性を低下させる。いくつかの実施形態では、少なくとも1つのスキップされたエクソンは、エクソン3、4、6、及び7からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、相対量は、エクソン6及び7を欠く転写物の量に対する、エクソン6及び7を含む転写物の量である。いくつかの実施形態では、相対量は、エクソン6及び7を欠く転写物の量に対する、エクソン3及び4を含む転写物の量である。
【0026】
いくつかの実施形態では、変化は、MuSKのエクソン6及び7のうちの1つ以上をスキップすることを含む。いくつかの実施形態では、変化は、MuSKのエクソン3及び4のうちの1つ以上をスキップすることを含む。いくつかの実施形態では、変化は、MuSKのエクソン6及び7のうちの1つ以上をスキップすることを含むが、MuSKのエクソン3及び4のいずれもスキップしないことを含む。
【0027】
いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であるという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であるという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であるという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であるという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが実質的に変わらず、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが実質的に変わらず、エクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のlレベルが減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、MuSK転写物の総レベルが実質的に変わらず、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するという点で変化する。
【0028】
いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約10%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約50%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約80%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約100%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約120%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約150%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約180%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約200%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約250%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約300%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約350%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約400%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約450%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約500%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約600%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約700%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約800%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約900%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約1000%増加するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が少なくとも1000%増加するという点で変化する。
【0029】
いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約10%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約50%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約80%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約100%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約120%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約150%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約180%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約200%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約250%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約300%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約350%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約400%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約450%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約500%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約600%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約700%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約800%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約900%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が約1000%減少するという点で変化する。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシングは、エクソン3及び4を含むMuSK転写物の、エクソン6及び7を含むMuSK転写物に対する比が少なくとも1000%減少するという点で変化する。
【0030】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触する前の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:1~1:0.1である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触する前の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:1、1:0.9、1:0.8、1:0.7、1:0.6、1:0.5、1:0.4、1:0.3、1:0.2、又は1:0.1である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触する前の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:0.8である。
【0031】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触した後の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:0.9~1:0.0001である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触した後の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:0.9、1:0.8、1:0.7、1:0.6、1:0.5、1:0.4、1:0.3、1:0.2、又は1:0.1、1:0.05、1:0.01、1:0.001、又は1:0001である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触した後の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:0.9~1:0.8、1:08~1:0.7、1:0.7~1:0.6、1:0.6~1:0.5、1:0.5~1:0.4、1:0.4~1:0.3、1:0.3~1:0.2、1:0.2~1:0.1、1:0.1~1:0.05、1:0.05~1:0.01、1:0.01~1:0.001、又は1:0.001~1:0001である。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される1つ以上のエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドと接触した後の、エクソン3及び4を含むMuSK転写物(すなわち、総MuSK転写物)の、エクソン6及び7を含む細胞又はシステムにおけるMuSK転写物に対する比は、約1:0.9~1:0.5である。
【0032】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方で観察される減少よりも少なくとも2倍高いレベルで減少する。
【0033】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方で観察される減少よりも少なくとも3倍高いレベルで減少する。いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方で観察される減少よりも少なくとも4倍高いレベルで減少する。
【0034】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方で観察される減少よりも少なくとも5倍高いレベルで減少する。いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方で観察される減少よりも少なくとも10倍高いレベルで減少する。
【0035】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、40%未満減少する。
【0036】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、70%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、40%未満減少する。
【0037】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、80%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、40%未満減少する。
【0038】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、90%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、40%未満減少する。
【0039】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、30%未満減少する。
【0040】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、20%未満減少する。いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方は、10%未満減少する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの塩基配列は、MuSK遺伝子又はその相補体(complement)の18~25塩基長部分から5個以下のミスマッチを有する配列を含む。
【0041】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列番号77で表されるMuSK遺伝子配列の83776~83800位及び83854~83878位に対応する。
【0042】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるオリゴヌクレオチドは、配列番号77で表されるMuSK遺伝子配列上のヌクレオチド83841~83905及び83962~84032により規定される領域内のMuSKゲノム配列上の領域を標的とする。
【0043】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)内の、又はその少なくとも一部分を含む、MuSKゲノム配列上の領域を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の30個以下の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも15個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15~30個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の16個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の17個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の18個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。
【0044】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCCCTTCACATTTG(領域2、配列番号211)内の、又はその少なくとも一部分を含む、MuSKゲノム配列上の領域を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の30個以下の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも15個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の15~30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基と同一の配列を含むMUSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の15個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の16個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の17個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の18個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の19個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の20個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の21個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の22個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の23個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の24個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の25個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の26個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の27個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の28個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の29個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2の配列番号211の30個の連続する塩基と同一の配列を含むMuSK転写物の一部分を標的とする。
【0045】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)内の配列、又はその少なくとも一部分を含む配列に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列に相補的である核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも95%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも10個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも11個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも12個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも13個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも14個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも15個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも16個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも17個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも18個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも19個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも20個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも21個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも22個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも23個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも24個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも25個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも26個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも27個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも28個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも29個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1(配列番号126)の少なくとも30個の連続する塩基を含む、領域1(配列番号126)の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。
【0046】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の30個以下の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15~30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。
【0047】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の16個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の17個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の18個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。
【0048】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、30塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、29塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、28塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、27塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、26塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、25塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、24塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、23塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、22塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、21塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、20塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、19塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、18塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、17塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、16塩基の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、15塩基の長さを有する。
【0049】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、約50塩基未満の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、約40塩基未満の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、約30塩基未満の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、約10塩基超の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、約15塩基超の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、約20塩基超の長さを有する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの塩基配列は、5’から3’の方向に、以下を含む。
【表1-1-1】
【表1-1-2】
【表1-1-3】
【0050】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列番号39~76及び及び212~253のうちのいずれか1つと少なくとも90%同一のヌクレオチド配列に相補的である。
【0051】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、塩基修飾、糖修飾、及びヌクレオチド間結合修飾のうちの1つ以上のタイプを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、非天然糖部分、又は非天然ヌクレオチド間結合、又はその両方を含む。
【0052】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ヌクレオチド間結合修飾を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合、ホスホロチオエート結合、又はホスホジチオエート結合を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの天然のホスフェート結合及び少なくとも1つのホスホジチオエート結合を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合の少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、94%、又は95%は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド間結合の少なくとも50%、60%、70%、80%、90%、94%、又は95%は、天然のホスフェート結合である。
【0053】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、糖修飾を含む。いくつかの実施形態では、修飾糖部分は、2’-修飾を有する。いくつかの実施形態では、修飾糖部分は、二環式糖修飾を含む。いくつかの実施形態では、修飾糖部分は、2’-修飾を含み、2’-修飾は、2’-OR1であり、R1は、任意選択的に置換されたC1-6アルキルである。いくつかの実施形態では、修飾糖部分は、2’-修飾を含み、2’-修飾は、2’-MOEである。いくつかの実施形態では、修飾糖部分は、2’-修飾を含み、2’-修飾は、2’-OMeである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’-OH糖(RNA糖)を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’-H糖(DNA糖)を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’-MOE糖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’-OMe糖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、2’-MOE、2’-OMe、2’-OH、2’-H糖、又はそれらの任意の組み合わせを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの2’-MOE糖及び少なくとも1つの2’-OH糖(RNA糖)を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの2’-MOE糖及び少なくとも1つの2’-H糖(DNA糖)を含む。
【0054】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、以下の5’から3’の方向に以下の構造を有する。
【表2-1-1】
【表2-1-2】
【表2-1-3】
表中、*は、ホスホロチオエート結合を表し、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
【0055】
いくつかの実施形態では、実施形態のいずれか1つに記載の2つ以上のオリゴヌクレオチドの混合物を含むオリゴヌクレオチド組成物。
【0056】
いくつかの実施形態では、組成物は、配列番号77の83776~83800位及び83854~83878位に対応するMuSK遺伝子の領域を標的とするオリゴヌクレオチドを含む。
【0057】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、治療有効量のオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容可能な希釈剤、薬学的に許容可能な賦形剤、及び薬学的に許容可能な担体から選択される少なくとも1つの薬学的に許容可能な不活性成分と、を含み、オリゴヌクレオチドは、実施形態のいずれか1つのオリゴヌクレオチドである。
【0058】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ナノ担体で製剤化される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、脂質ナノ粒子(LNP)中に製剤化される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、脂質(例えば、コレステロール)、ペプチド、アプタマー、抗体、及び糖(例えば、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)から選択される追加の部分に共有結合的にコンジュゲートされている。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)に共有結合的にコンジュゲートされている。
【0059】
別の態様では、本開示は、相対量のMuSKスプライシング転写物を変化させる方法を特徴とし、方法は、前述の実施形態のいずれか1つの組成物を含むか、又は送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む。
【0060】
いくつかの実施形態では、本開示は、Ig3ドメインコード配列を含有するMuSK転写物の、Ig3ドメインコード配列を含有しないMuSK転写物に対する比が増加することを特徴とする、MuSKスプライシング転写物の変化を特徴とする。いくつかの実施形態では、Ig3ドメインコード配列を含有するMuSK転写物の、Ig3ドメインコード配列を含有しないMuSK転写物に対する比が減少することを特徴とする、MuSKスプライシング転写物の変化。いくつかの実施形態では、Ig3ドメインコード配列を含有するMuSK転写物は減少し、総MuSK転写物のレベルは実質的に同じままであることを特徴とする、MuSKスプライシング転写物の変化。
【0061】
いくつかの実施形態では、MuSKスプライシング転写物の変化は、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であることを特徴とする。
【0062】
いくつかの実施形態では、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であることを特徴とする、MuSKスプライシング転写物の変化。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシング転写物の変化は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが減少するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少するか、又はその両方であることを特徴とする。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシング転写物の変化は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが増加するか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが増加するか、又はその両方であることを特徴とする。
【0063】
いくつかの実施形態では、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが実質的に同じままであるか、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが実質的に同じままであるか、又はその両方であることを特徴とする、MuSKスプライシング転写物の変化。いくつかの実施形態では、MuSKスプライシング転写物の変化は、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベルが実質的に同じままであること、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが実質的に同じままであること、又は両方であること、及びエクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベルが減少すること、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベルが減少すること、又はその両方であることを特徴とする。
【0064】
別の態様では、本開示は、神経変性疾患の1つ以上の特徴に罹患している対象を治療する方法を特徴とし、方法は、前述の実施形態のいずれか1つの組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む。
【0065】
別の態様では、本開示は、神経発生を増加させる方法を特徴とし、方法は、前述の実施形態のいずれか1つの組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む。
【0066】
別の態様では、本開示は、神経筋機能障害又は筋ジストロフィーの1つ以上の特徴に罹患している対象を治療する方法を特徴とし、方法は、前述の実施形態のいずれか1つの組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む。
【0067】
別の態様では、本開示は、筋再生及び/又は筋成長を増加させる方法を特徴とし、方法は、前述の実施形態のいずれか1つの組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む。
【0068】
別の態様では、本開示は、筋線維症を治療する方法を特徴とし、方法は、前述の実施形態のいずれか1つの組成物を含むか、又はそれを送達する医薬組成物を対象に投与するステップを含む。
【0069】
いくつかの実施形態では、対象は、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害、及び筋消耗を特徴とする疾患からなる群から選択される疾患又は障害のリスクがあるか、又は罹患している。いくつかの実施形態では、神経変性障害は、アルツハイマー病(AD)、パーキンソン病、認知症(例えば、前頭側頭型認知症)、脳卒中、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連障害及び嗜癖障害(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)、側頭葉てんかん、海馬硬化症、ニーマンピック病C型、糖尿病媒介性海馬ニューロン損失、脳損傷(例えば、外傷性及び/又は無酸素性脳損傷)、並びにハンチントン病からなる群から選択される。いくつかの実施形態では、神経変性疾患は、アルツハイマー病(AD)である。
【0070】
いくつかの実施形態では、神経筋機能障害は、以下からなる群から選択される筋ジストロフィーである:ベッカー型、先天性、遠位型、デュシェンヌ型、エメリー・ドレヒュス型、顔面肩甲上腕型、肢帯型、筋強直性、及び眼球咽頭型筋ジストロフィー。別の態様では、本開示の特徴は、
【0071】
いくつかの実施形態では、心臓障害は、心筋梗塞又は心筋症である。いくつかの実施形態では、対象は、手術、外傷、及び長期固定化からなる群から選択される状態後の筋再生及び/又は成長の強化を必要とする。いくつかの実施形態では、長期固定化は、床上安静又はギプス固定から生じる。いくつかの実施形態では、対象は、サルコペニアのリスクがある、又はサルコペニアに罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、外傷、遺伝性疾患、筋障害、及び老化からなる群から選択される疾患又は状態に起因する筋線維症のリスクがあるか、又は罹患している。いくつかの実施形態では、外傷は、放射線治療、圧挫損傷、裂傷、及び切断からなる群から選択される状態の結果である。
【0072】
いくつかの実施形態では、遺伝性疾患又は筋障害は、以下からなる群から選択される:先天性筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、及び加齢に伴うサルコペニア。
【0073】
いくつかの実施形態では、組成物は、CNSに送達される。いくつかの実施形態では、組成物は、脳脊髄液に送達される。いくつかの実施形態では、組成物は、筋肉に送達される。いくつかの実施形態では、組成物は、肝臓に送達される。いくつかの実施形態では、組成物は、全身投与又は局所投与のために製剤化され得る。いくつかの実施形態では、組成物は、静脈内注射、静脈内注入、筋肉内注射、髄腔内投与、経口投与、頬側投与、吸入、経鼻投与、局所投与、眼投与、又は耳投与から選択される経路による送達のために製剤化される。
【0074】
いくつかの実施形態では、組成物は、筋肉内投与による送達のために製剤化される。いくつかの実施形態では、組成物は、静脈内投与による送達のために製剤化される。いくつかの実施形態では、組成物は、経口投与による送達のために製剤化される。
【図面の簡単な説明】
【0075】
例示の目的で、本発明の特定の実施形態を、以下に記載される図面に示す。図面の同様の数字は、全体を通して同様の要素を示す。しかしながら、本発明は、示される正確な配置、寸法、及び器具に限定されないことが理解されるべきである。図面では、
【0076】
【
図1】MuSKのBMPドメインとIg3ドメインとの間の相互作用並びに、BMPシグナル伝達及び神経発生並びに認知におけるその意義の概略図である。
【
図2】全長及びMuSKΔIg3転写物、並びにコードされたタンパク質、並びに総MuSK及び全長MuSK転写物を選択的に検出するための例示的なプライマー設計の概略図である。
【
図3】LHCN-M2細胞においてTaqman又はSYBR green技術を使用してqPCRによって測定された相対的MuSK発現を示す。
【
図4】MuSK転写物のエクソン7の「領域1」及び「領域2」の概略図である。
【
図5】MuSKの遺伝子配列上のASO Bld1~Bld18のアライメントを示す。
【
図6】100nMのASO Bld1~Bld4、Bld6、Bld7、Bld9、Bld11、Bld12、Bld13、Bld14、Bld15、Bld16、Bld17でトランスフェクトされてから24時間後及び未処理対照のLHCN-M2の顕微鏡的取得を示す(スケール100nm)。
【
図7】50及び100nMのASO Bld1~Bld18でトランスフェクトされたLHCN-M2細胞のqPCRによって測定された相対的MuSK発現を示す。パネルAは、総MuSK発現(すなわち、エクソン/エクソン接合部3~4にまたがるプライマーであるMuSK34の)を示し、パネルBは、MuSKエクソン6~7の発現(すなわち、エクソン/エクソン接合部6~7にまたがるプライマーであるMuSK67を使用する)を示す。全ての試料を、ハウスキーピング遺伝子GAPDH及びYWHAZ、並びに対照に対して正規化する。
【
図8】MuSKの遺伝子配列上のASO Bld1~Bld18のアライメント、及びMuSK発現に対するそれらの効果を示す。緑色:MuSK発現に効果なしである又は増加する(MuSK発現は未処理状態の90~300%を含んだ)。橙色:MuSK発現の中等度の減少(MuSK発現は未処理状態の40~70%を含んだ)。赤色:MuSK発現の高い減少(MuSK発現は未処理状態の40%未満)。赤色のエリアは、ASOによって>80%のMuSK67の減少を誘導した、MuSKの発現に重要な領域を示す。
【
図9】MuSKの遺伝子配列上のASO Bld19~Bld38のアライメントを示す。
【
図10】100nMのASO Bld 19~22、Bld29~34でトランスフェクトされてから24時間後及び未処理対照のLHCN-M2の顕微鏡的取得を示す(スケール100nm)。
【
図11】50及び100nMでASO(対照、Bld19~Bld28)でトランスフェクトされたLHCN-M2細胞のqPCRによって測定された相対的MuSK発現を示す。パネルAは、MuSK34の発現を示し、パネルBは、MuSK67の発現を示す。全ての試料を、ハウスキーピング遺伝子GAPDH及びYWHAZ、並びに対照に対して正規化する。
【
図12】遺伝子配列に対するASO Bld19~Bld38のアライメント、及びMuSK発現に対するそれらの効果を示す。緑色:MuSK発現に効果なしである又は増加する(MuSK発現は未処理状態の90~300%を含んだ)。橙色:MuSK発現の中等度の減少(MuSK発現は未処理状態の40~70%を含んだ)。赤色:MuSK発現の高い減少(MuSK発現は未処理状態の40%未満)。赤色のエリアは、ASOによって>80%のMuSK67の減少を誘導した、MuSKの発現に重要な領域を示す。紫色のエリアは、MuSK67の発現を選択的に阻害するために標的とすることができる領域を示す(他のエクソンに対してはより低い効果を有する)。
【
図13】様々な用量のASO(Bld25(パネルA)、Bld26(パネルB)、Bld27(パネルC)、Bld28(パネルD)、Bld35(パネルE)、Bld38(パネルF))に応答した相対的MuSK発現を示す。MuSK34(青色)及びMuSK67(赤色)発現をqPCRによって測定し、ハウスキーピング遺伝子及び対照に対して正規化した。推定ICは、各グラフ上に示される。試験した5つの用量は、2.5、5、25、125、及び400nMであった。
【
図14】様々な用量のASO(Bld25(パネルA)、Bld26(パネルB))に応答した相対的MuSK発現を示す。MuSK34(青色)及びMuSK67(赤色)発現をqPCRによって測定し、ハウスキーピング遺伝子及び対照に対して正規化した。試験した4つの用量は、5、7.5、12.5、及び25nMであった。
【
図15】未処理対照と比較した、12.5nMの最終濃度でのASO Bld25及びBld26の組み合わせに応答した相対的MuSK発現を示す。MuSK34(青色)及びMuSK67(赤色)発現をqPCRによって測定し、ハウスキーピング遺伝子及び対照に対して正規化した。
【
図16】ゲル電気泳動でのエクソン3からエクソン9へのPCR産物の泳動を示す。ASO処理細胞のcDNA(Bld25、すなわち、「hu7-10」又はBld26、すなわち、「hu73」)をPCRによって増幅し、ゲル電気泳動上に置き泳動させた(パネルA)。予測される産物をパネルB及びパネルB’に示す。
【
図17】「領域1」の様々な標的部分の配列のアライメントを示す。ASO Bld25、Bld26、及びBld51~Bld66は、領域1の様々な部分を標的とする。
【
図18】12.5nMの濃度(パネルA)及び100nMの濃度(パネルB)でのASO Bld51~Bld66の総MuSK(MuSK34)及びIg3ドメインを含有するMuSK(MuSK67)の遺伝子発現の相対的変化を示す。
【
図19】ヒトMuSKのエクソン7の「領域1」及び「領域2」の様々な標的部分上のASO Bld25-1、Bld25-2、Bld25、Bld25-3、Bld25-4、BLd25-5、Bld26-1、Bld26-2、Bld26、Bld26-3、Bld26-4、Bld27、Bld28、Bld35、Bld38のアライメントを示す。
【
図20】qPCRで分析したMuSK遺伝子発現を示す。パネルAは、MuSKIg3(MuSK67)の相対的遺伝子発現を示し、パネルBは、総MuSK(MuSK34)の相対的遺伝子発現を示す。
【
図21】対照と比較して、50%未満のMuSK67の相対的発現及び60%超の総MuSK(MuSK34)の相対的発現を示したASOのみからのMuSK遺伝子発現を示す。パネルAは、MuSKIg3(MuSK67)の相対的遺伝子発現を示し、パネルBは、総MuSK(MuSK34)の相対的遺伝子発現を示す。
【
図22】ASOによるトランスフェクション24時間後(パネルA及びB)及び48時間後(パネルC及びD)のBld25-5とBld25との比較を示す。
【
図23】ヒトMuSKのエクソン7の「領域1」の様々な標的部分におけるASO Bld25、Bld25-A、Bld25-B、Bld25-C、Bld25-D、Bld25-E、Bld25-5、Bld25-5-A、Bld25-5-B、Bld25-5-C、Bld25-5-D、Bld25-5-E、Bld26-2、Bld26-2-A、Bld26-2-B、Bld26-2-C、Bld26-2-D、Bld26、Bld26-B、Bld26-C、Bld26-Dのアライメントを示す。
【
図24】ASO Bld25-A、Bld25-B、Bld25-C、Bld25-D、及びBld25-Eの相対的遺伝子発現(MuSK34及びMuSK67)を示す。
【
図25】ASO Bld25-5-A、Bld25-5-B、Bld25-5-C、Bld25-5-D、及びBld25-5-Eの相対的遺伝子発現(MuSK34及びMuSK67)を示す。
【
図26】MuSK RNAの3つのバリアントのグラフ表示を示す。全長及びΔIg3は、それぞれエクソン3からエクソン9までPCRにより増幅された、全長配列及びエクソン6、7の欠失を含む配列の長さを示す。
【
図27】Bld25及びBld25-5で処理された細胞からのpcr産物のゲル泳動、並びにBld25及びBld25-5産物からのバンドの強度を示す。
【
図28】Δ6、7バリアント1(687塩基)が予想される位置にあるバンドの下側のバンドの配列が、実際にこのスプライスバリアントの配列であったことを示す。
【
図29】MuSKに対し10nMのsiRNAで48時間処理され、次いでsiRNA処理後2、3、4、及び5日目にMuSKタンパク質について染色したHCN-M2細胞の画像を示す。
【発明を実施するための形態】
【0077】
定義
便宜上、本明細書、実施例、及び添付の特許請求の範囲で使用されるいくつかの用語及び語句の意味を以下に提供する。別段の記載がない限り、又は文脈から暗黙的に示唆されない限り、以下の用語及び語句は、以下に提供される意味を含む。
【0078】
これらの定義は、特定の実施形態の説明を助けるために提供され、本発明の範囲は特許請求の範囲によってのみ限定されるため、特許請求の範囲の発明を限定することを意図するものではない。
【0079】
別途定義されない限り、本明細書で使用される全ての技術用語及び科学的用語は、本発明が属する分野の当業者によって一般的に理解される意味と同じ意味を有する。当技術分野における用語の使用と本明細書に提供されるその定義との間に明らかな不一致がある場合、本明細書内に提供される定義が優先するものとする。
【0080】
約又はおよそ:値を参照して本明細書で使用される場合、用語「約」又は「およそ」は、参照値に関連して類似する値を指す。概して、当業者は、文脈に精通しており、その文脈において「約」によって包含される関連する分散の程度を理解するであろう。例えば、いくつかの実施形態では、「約」という用語は、言及された値の25%、20%、19%、18%、17%、16%、15%、14%、13%、12%、11%、10%、9%、8%、7%、6%、5%、4%、3%、2%、1%、又はそれ未満以内の値の範囲を包含し得る。
【0081】
投与:本明細書で使用される場合、「投与」という用語は典型的には、対象又はシステムへの組成物の投与を指し、例えば、組成物であるか、又は組成物中に含まれるか、あるいは組成物によって送達される薬剤(例えば、刺激剤(agonizing agent))の送達を実現するためのものを指す。当業者であれば、適切な状況で、例えばヒトなどの対象への投与に利用され得る様々な経路を認識するであろう。例えば、いくつかの実施形態では、投与は、眼、経口、頬側、皮膚(例えば、真皮、皮内、皮間、経皮などへの局所適用のうちの1つ以上であってもよく、又はそれを含んでもよい)、腸内、動脈内、皮内、胃内、髄内、筋肉内、鼻腔内、腹腔内、髄腔内、静脈内、脳室内、特定の臓器内(例えば肝内)、粘膜、経鼻、経口、直腸、皮下、舌下、局所、気管内(例えば気管内注入による)、膣内、硝子体などであってもよい。いくつかの実施形態では、薬剤(例えば、刺激剤)は、中枢神経系(CNS)に送達され、例えば、脳室内投与を介して送達される。いくつかの実施形態では、投与は、単回投与のみを含んでもよい。いくつかの実施形態では、投与は、一定回数の用量の投与を含んでもよい。いくつかの実施形態では、投与は、間欠投与(例えば、時間的に隔てられた複数回の投与)及び/又は周期的投与(例えば、共通の期間で隔てられた個別投与)を含んでもよい。いくつかの実施形態では、投与は、少なくとも選択された期間の連続投与(例えば、灌流)を含んでもよい。
【0082】
薬剤:一般に、本明細書で用いられる場合、用語「薬剤」は、例えば、ポリペプチド、核酸、単糖類、脂質、小分子、金属、又はそれらの組み合わせ若しくは複合体を含む、任意の化学分類の化合物又は物質を指すために使用され得る。適切な状況では、文脈から当業者には明らかであろうように、この用語は、細胞若しくは生物、又はその断片、抽出物、若しくは構成要素であるか、あるいはそれらを含む物質を指すために利用され得る。代替的又は追加的に、文脈から明らかであるように、この用語は、自然界で見出される、及び/又は自然界から得られる天然物を指すために使用され得る。場合によっては、文脈から更に明らかであるように、この用語は、人間の手による行為によって設計、操作、及び/又は生成され、及び/又は自然界では見出されないという点で人工の1つ以上の物質を指すために使用され得る。いくつかの実施形態では、薬剤は、単離形態又は純粋形態で利用されてもよく、いくつかの実施形態では、薬剤は、粗製形態で利用されてもよい。いくつかの実施形態では、コレクション又はライブラリーとして候補の薬剤が提供され得、例えば、それらの中において活性剤を特定するか、又は特性決定するためにスクリーニングを行うことができる。場合によっては、「薬剤」という用語は、ポリマーであるか、又はポリマーを含む化合物又は物質を指してもよく、場合によっては、この用語は、1つ以上のポリマー部分を含む化合物又は物質を指してもよい。いくつかの実施形態では、「薬剤」という用語は、ポリマーではない、及び/又はいずれかのポリマーを実質的に含まない、及び/又は1つ以上の特定のポリマー部分を含まない化合物又は物質を指す場合がある。いくつかの実施形態では、この用語は、いずれかのポリマー部分を欠くか、又は実質的に含まない化合物又は物質を指してもよい。
【0083】
アゴニスト:当業者であれば、「アゴニスト」という用語は、その存在、レベル、程度、タイプ、又は形態が別の薬剤(すなわち、刺激される薬剤又は標的薬剤)のレベル又は活性の増加と相関する薬剤(すなわち、「刺激剤」)、状態、又は事象を指すために使用され得ることを理解するであろう。一般に、アゴニストは、例えば、小分子、ポリペプチド、核酸、炭水化物、脂質、金属、及び/又は関連する活性化活性を示すいずれかの他の物質を含む、いずれかの化学クラスの薬剤であってもよく、又はそれを含んでもよい。いくつかの実施形態では、アゴニストは直接的なものであってもよく(この場合、アゴニストは、その標的に直接その影響を及ぼす)、いくつかの実施形態では、アゴニストは間接的なものであってもよい(この場合、アゴニストは、その標的への結合以外の、例えば、標的の調節因子と相互作用することによって、標的のレベル又は活性が変化するように、その影響を及ぼす)。いくつかの実施形態では、アゴニストは、標的(例えば、タンパク質又は核酸)に結合して、標的のレベル、形成、及び/又は又は活性を変化させる、タンパク質(例えば、抗体)又は核酸(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド)である結合剤である。いくつかの実施形態では、変化したレベル、形態、及び/又は活性は、標的核酸配列から発現される変化したタンパク質のレベルの増加である。当業者であれば、本開示を読めば、いくつかの実施形態では、刺激剤は、結合標的に結合し得(及び潜在的に刺激し得)、その結合は、更に刺激された標的のレベル又は活性の増加を引き起こすことを理解するであろう。具体的な例を挙げると、いくつかの実施形態では、核酸標的に結合する刺激剤が、その標的のレベル及び/又は活性を変化させてもよく、いくつかの特定の実施形態では、その核酸標的の活性を刺激する可能性があり(例えば、その修飾、スプライシング、5’キャップ形成、及び/若しくは3’末端形成、輸送、並びに/又は翻訳を増加させることによって、所望の生成物、例えば、mRNAのレベルが増加する)、及び/又は下流標的、例えば、このような核酸標的によってコードされるポリペプチドを刺激する可能性がある。1つの特定のこのような例を挙げると、いくつかの実施形態では、刺激剤は、一次転写物に結合してそのスプライシングパターンを変化させ、特定のスプライシング形態(例えば、成熟mRNA)のレベル及び/若しくは活性を増加させる、オリゴヌクレオチドであるか、又はそれを含む可能性があり、それにより、次いで、このような特定のスプライシング形態である又はそれによってコードされる産物(例えば、ポリペプチド)の増加したレベルを達成する可能性がある。
【0084】
アンタゴニスト:当業者であれば、本明細書において使用される場合、「アンタゴニスト」という用語は、その存在、レベル、程度、タイプ、又は形態が、別の薬剤(すなわち、阻害剤、又は標的)のレベル又は活性の減少と相関する薬剤(すなわち、「拮抗剤」)、状態、又は事象を指すために使用され得ることを理解するであろう。一般に、アンタゴニストは、例えば、小分子、ポリペプチド、核酸、炭水化物、脂質、金属、及び/又は関連する阻害活性を示すいずれかの他の物質を含む、いずれかの化学クラスの薬剤であってもよく、又はそれを含んでもよい。いくつかの実施形態では、アンタゴニストは直接的なものであってもよく(この場合、アンタゴニストは、その標的に直接その影響を及ぼす)、いくつかの実施形態では、アンタゴニストは間接的なものであってもよい(この場合、アンタゴニストは、その標的への結合以外の、例えば、標的の調節因子と相互作用することによって、標的のレベル又は活性が変化するように、その影響を及ぼす)。いくつかの実施形態では、アンタゴニストは、標的(例えば、タンパク質又は核酸)に結合して、標的のレベル、形成、及び/又は活性を変化させる、タンパク質(例えば、抗体)又は核酸(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド)である結合剤である。いくつかの実施形態では、変化したレベル、形態、及び/又は活性は、標的核酸配列から発現される変化したタンパク質のレベルの減少である。当業者であれば、本開示を読めば、いくつかの実施形態では、拮抗剤は、結合標的に結合し得(及び潜在的に拮抗し得)、その結合は、更に拮抗された標的のレベル又は活性の減少を引き起こすことを理解するであろう。具体的な例を挙げると、いくつかの実施形態では、核酸標的に結合する拮抗剤が、その標的のレベル及び/又は活性を変化させてもよく、いくつかの特定の実施形態では、その核酸標的の活性と拮抗する可能性があり(例えば、その修飾、スプライシング、5’キャップ形成、及び/若しくは3’末端形成、輸送、並びに/又は翻訳を減少させることによって、所望でない生成物、例えば、mRNAのレベルが抑制される)、及び/又は下流標的、例えば、このような核酸標的によってコードされるポリペプチドと拮抗する可能性がある。1つの特定のこのような例を挙げると、いくつかの実施形態では、拮抗剤は、一次転写物に結合してそのスプライシングパターンを変化させ、特定のスプライシング形態(例えば、成熟mRNA)のレベル及び/若しくは活性を抑制する、オリゴヌクレオチドであるか、又はそれを含む可能性があり、それにより、次いで、このような特定のスプライシング形態である又はそれによってコードされる産物(例えば、ポリペプチド)の減少したレベルを達成する可能性がある。
【0085】
抗体剤:本明細書で使用される場合、抗体剤という用語は、特定の抗原に特異的に結合する薬剤を指す(例えば、関心対象となるタンパク質、例えば、MuSKタンパク質、のエピトープであり得るか、又はそれらを含み得る)。いくつかの実施形態では、当該用語は、特異的結合を与えるために十分なイムノグロブリン構造要素を含む任意のポリペプチド又はポリペプチド複合体を包含する。例示的な抗体剤としては、モノクローナル抗体又はポリクローナル抗体が挙げられるが、これに限定されない。いくつかの実施形態では、抗体剤は、マウス抗体、ウサギ抗体、霊長類抗体、又はヒト抗体の特徴である定常領域配列を1つ以上含んでもよい。いくつかの実施形態では、抗体剤は、当技術分野で知られるように、ヒト化、霊長類化、キメラ化された1つ以上の配列要素を含んでもよい。多くの実施形態では、「抗体剤」という用語は、代替的な提示における抗体の構造的特徴及び機能的特徴を利用するための、当技術分野で公知の、若しくは開発された構築物又は形式のうちの1つ以上を指すために使用される。例えば、本開示に従って利用される抗体剤の実施形態は、完全なIgA抗体、IgG抗体、IgE抗体又はIgM抗体、二重特異性抗体又は多重特異性抗体(例えばZybodies(登録商標)など)、例えばFab断片、Fab’断片、F(ab’)2断片、Fd’断片、Fd断片、及び単離CDR、又はそれらのセットなどの抗体断片、一本鎖Fvs、ポリペプチド-Fc融合体、単一ドメイン抗体(例えばIgNARなどのサメ単一ドメイン抗体又はその断片)、ラクダ科抗体(cameloid antibody)、マスク化抗体(例えばProbodies(登録商標))、Small Modular ImmunoPharmaceuticals(「SMIPs(商標)」)、一本鎖又はタンデムダイアボディ(TandAb(登録商標))、VHH、Anticalins(登録商標)、Nanobodies(登録商標)ミニボディ、BiTE(登録商標)、アンキリンリピートタンパク質又はDARPINs(登録商標)、Avimers(登録商標)、DART、TCR様抗体、Adnectins(登録商標)、Affilins(登録商標)、Trans-bodies(登録商標)、Affibodies(登録商標)、TrimerX(登録商標)、微小タンパク質(MicroProtein)、Fynomers(登録商標)、Centyrins(登録商標)、及びKALBITOR(登録商標)から選択される形式のものであるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、抗体は、天然に生成された場合に有するはずである共有結合修飾(例えば、グリカンの付着など)を欠く場合がある。いくつかの実施形態では、抗体は、共有結合修飾(例えば、グリカン、ペイロード[例えば、検出可能な部分、治療部分、触媒部分など]、又は他のペンダント基[例えば、ポリエチレングリコールなど]の付着を含有してもよい。多くの実施形態では、抗体剤は、そのアミノ酸配列が相補性決定領域(CDR)として当業者によって認識される1つ以上の構造要素を含むポリペプチドであるか、又はそれを含み、いくつかの実施形態では、抗体剤は、そのアミノ酸配列が、参照抗体に見られるものと実質的に同一である少なくとも1つのCDR(例えば、少なくとも1つの重鎖CDR及び/又は少なくとも1つの軽鎖CDR)を含むポリペプチドであるか、又はそれを含む。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、参照CDRと比較して、配列が同一であるか、又は1~5個のアミノ酸置換を含有するかのいずれかの点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、参照CDRと、少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%の配列同一性を示す点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、参照CDRと、少なくとも96%、96%、97%、98%、99%、又は100%の配列同一性を示す点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、当該含有されるCDR内の少なくとも1つのアミノ酸が、参照CDRと比較して欠失している、付加されている、又は置換されているが、当該含有されるCDRは、その他では参照CDRのアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を有しているという点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、当該含有されるCDR内の1~5個のアミノ酸が、参照CDRと比較して欠失している、付加されている、又は置換されているが、当該含有されるCDRは、その他では参照CDRのアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を有しているという点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、当該含有されるCDR内の少なくとも1つのアミノ酸が、参照CDRと比較して置換されているが、当該含有されるCDRは、その他では参照CDRのアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を有しているという点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、含有されるCDRは、当該含有されるCDR内の1~5個のアミノ酸が、参照CDRと比較して欠失している、付加されている、又は置換されているが、当該含有されるCDRは、その他では参照CDRのアミノ酸配列と同一であるアミノ酸配列を有しているという点で、参照CDRと実質的に同一である。いくつかの実施形態では、抗体剤は、そのアミノ酸配列がイムノグロブリン可変ドメインとして当分野の当業者に認識されている構造要素を含有しているポリペプチドであるか、又はそのポリペプチドを含有する。いくつかの実施形態では、抗体剤は、イムノグロブリン結合ドメインに対し相同であるか、又は大部分が相同である結合ドメインを有するポリペプチドタンパク質である。
【0086】
抗体:本明細書で使用される場合、「抗体」という用語は、抗原に結合することができるイムノグロブリンドメインを含有するイムノグロブリン又はその誘導体を指す(例えば、それは、関心対象となるタンパク質、例えば、MuSKタンパク質、のエピトープであってもよく、又はそれらを含んでもよい)。抗体は、任意の種、例えば、ヒト、齧歯類、ウサギ、ヤギ、ニワトリなどであり得る。抗体は、任意の免疫グロブリンクラスのメンバーであってもよく、以下のヒトクラスのいずれかを含む:IgG、IgM、IgA、IgD、及びIgE、又はIgG1、IgG2などのそのサブクラス。本発明の様々な実施形態では、抗体は、Fab’、F(ab’)2、scFv(一本鎖可変)若しくは抗原結合部位を保持する他の断片、又は組換えにより産生された断片を含む組換えにより産生されたscFv断片などの断片である。例えば、Allen,T.,Nature Reviews Cancer,Vol.2,750-765,2002、及びその中の参考文献を参照されたい。抗体は、一価、二価、又は多価であり得る。抗体は、例えば、齧歯類起源の可変ドメインがヒト起源の定常ドメインに融合され、したがって齧歯類抗体の特異性を保持するキメラ抗体又はヒト化抗体であってもよい。ヒト起源のドメインは、ヒトにおいて最初に合成されるという意味で、ヒトから直接発生する必要はない。代わりに、「ヒト」ドメインは、そのゲノムがヒト免疫グロブリン遺伝子を組み込む齧歯類において生成され得る。例えば、Vaughan,et al.,(1998),Nature Biotechnology,16:535-539を参照されたい。抗体は、部分的又は完全にヒト化されてもよい。抗体は、ポリクローナル又はモノクローナルであってもよいが、本発明の目的のために、モノクローナル抗体が一般に好ましい。実質的に任意の関心対象となる分子に特異的に結合する抗体を産生する方法は、当該技術分野で公知である。例えば、モノクローナル抗体又はポリクローナル抗体は、抗体を産生する動物の血液又は腹水から精製することができ(例えば、分子又はその抗原性断片への天然の曝露後又は免疫化後)、細胞培養又はトランスジェニック生物における組換え技術を使用して産生することができ、又は化学合成によって少なくとも部分的に作製することができる。いくつかの実施形態では、抗体は、例えば、標的抗原に結合することによってアンタゴニストとして作用し、当該抗原のレベル又は活性の減少をもたらすことができる。いくつかの実施形態では、抗体は、例えば、標的抗原に結合することによってアゴニストとして作用し、当該抗原のレベル又は活性の増加をもたらすことができる。
【0087】
アンチセンス:本明細書では、「アンチセンス」という用語は、ヌクレオチド配列がコード鎖核酸に見られる配列の一部又は全てに相補的である核酸を指すために使用される。典型的には、コード鎖核酸は、その配列が、オープンリーディングフレームの一部若しくは全て、又はポリペプチドの一部若しくは全てをコードする残基の他の連続配列(stretch)を含む核酸である。いくつかの実施形態では、本明細書では「アンチセンス」という用語は、コード鎖に(すなわち、そのようなコード鎖内の標的配列に)特異的に結合するオリゴヌクレオチドに関して特に使用され得る。いくつかの実施形態では、コード鎖は、コード配列及び非コード配列の両方を含んでもよい(例えば、一例を挙げると、イントロン配列及びエクソン配列の両方を含む一次転写物などの転写物であってもよい)。当業者であれば、本開示を読めば、いくつかの実施形態では、その配列の一部又は全てがその標的鎖の非コード部分に相補的であるとき、オリゴヌクレオチドは、「アンチセンス」オリゴヌクレオチドとみなされてもよく、又は称されてもよいことを理解するであろう。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的センス鎖内のコード配列に結合し、いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的コード鎖内の非コード配列に結合する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、標的コード鎖内のコード配列及び非コード配列の両方に結合する。いくつかの実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、コード鎖(例えば、転写物)内のその標的配列に結合されるとき、そのようなコード鎖の転写後プロセシング(例えば、修飾、スプライシング、5’キャップ形成、及び/又は3’末端形成、5’キャップ形成、及び/又は3’末端形成、輸送、及び/又は翻訳のうちの1つ以上)を変化させることを特徴とする。いくつかの特定の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、その標的コード鎖のスプライシングを変化させ、代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、アンチセンスコード鎖複合体は、例えば、RNase Hによって分解されるか、又は分解され得る。
【0088】
およそ:本明細書で使用される場合、数字に関して「およそ」又は「約」という用語は、別段の記載がない限り、又はそうでなければ文脈から明白でない限り(そのような数が可能な値の0%未満又は100%を超えることになる場合を除く)、いずれかの方向(より大きいか、又はそれ未満)に5%、10%、15%、又は20%の範囲内にある数字を含むものと一般的に解釈される。
【0089】
結合剤:一般的に、用語「結合剤」は、本明細書において、本明細書に記載した関心対象となる標的に結合する任意の物質を意味するのに用いられる。多くの実施形態では、関心対象となる結合剤は、特定の相互作用の状況でその標的を他の潜在的な結合パートナーと識別するという点で、その標的と特異的に結合するものである。一般的に、結合剤は、任意の化学分類の物質(例えば、ポリマー、非ポリマー、小分子、ポリペプチド、炭水化物、脂質、核酸など)であり得るか、又は該物質を含み得る。いくつかの実施形態では、結合剤は単一の化学物質である。いくつかの実施形態では、結合剤は、適正な条件下で非共有的な相互作用により相互に会合した2つ以上の別の化学物質の複合体である。例えば、いくつかの実施形態では、結合剤が「ジェネリック」な結合部分(例えば、ビオチン/アビジン/ストレプトアビジンのうちの1つ及び/又はクラス特異的抗体)と、ジェネリックな結合部分のパートナーに連結する「特異的」結合部分(例えば、特定の分子標的を持つ抗体又はアプタマー)とを含み得ることを、当業者は認識するであろう。いくつかの実施形態では、こうしたアプローチにより、種々の特異的結合部分と、同じジェネリックな結合部分のパートナーとの連結を介した多重結合剤のモジュラーアセンブリが可能になり得る。いくつかの実施形態では、結合剤は、ポリペプチド(例えば、抗体又は抗体断片を含む)であるか、又はポリペプチドを含む。いくつかの実施形態では、結合剤は小分子であるか、又は小分子を含む。いくつかの実施形態では、結合剤は核酸(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド)であるか、又は核酸を含む。いくつかの実施形態では、結合剤はアプタマーである。いくつかの実施形態では、結合剤はポリマーであり、いくつかの実施形態では、結合剤はポリマーではない。いくつかの実施形態では、結合剤はポリマー部分を欠くという点で非ポリマーである。いくつかの実施形態では、結合剤は炭水化物であるか、又は炭水化物を含む。いくつかの実施形態では、結合剤はレクチンであるか、又はレクチンを含む。いくつかの実施形態では、結合剤はペプチド模倣薬であるか、又はペプチド模倣薬を含む。いくつかの実施形態では、結合剤はスキャフォールドタンパク質であるか、又はスキャフォールドタンパク質を含む。いくつかの実施形態では、結合剤はミメオトープ(mimeotope)であるか、又はミメオトープを含む。いくつかの実施形態では、結合剤はステープル化ペプチドであるか、又はステープル化ペプチドを含む。いくつかの実施形態では、結合剤はDNA又はRNAなどの核酸(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド)であるか、又は核酸を含む。
【0090】
相補的:本明細書で使用される場合、当該技術分野で許容される意味に従って、「相補的」は、特定の塩基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、又は核酸間の正確な対合能力を指す。例えば、アデニン(A)及びウリジン(U)は相補的であり、アデニン(A)及びチミジン(T)は相補的であり、グアニン(G)及びシトシン(C)は相補的であり、当該技術分野でワトソン・クリック塩基対合と呼ばれる。第1の核酸配列の特定の位置のヌクレオチドが、鎖が逆平行な配向で整列されるとき、第2の核酸配列の反対側に位置するヌクレオチドに相補的である場合、ヌクレオチドは相補的塩基対を形成し、核酸はその位置で相補的である。第1の核酸と第2の核酸との相補性の割合は、それらを、評価ウィンドウにわたって最大相補性について逆平行な配向で整列させること、ウィンドウ内で相補的塩基対を形成する両方の鎖のntの総数を決定すること、ウィンドウ内のntの総数で割ること、及び100を乗じることによって評価され得る。例えば、AAAAAAAA及びTTTGTTATは、合計16ntのうち、12ntが相補的塩基対で存在するため、75%相補的である。特定の%相補性を達成するために必要な相補的ntの数を計算するとき、分数は最も近い整数に丸められる。非相補的ヌクレオチドによって占有される位置は、ミスマッチを構成し、すなわち、位置は、非相補的塩基対によって占有される。特定の実施形態では、評価ウィンドウは、二本鎖部分又は標的部分について本明細書に記載される長さを有する。相補的配列は、第1のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチド塩基対と、第2のヌクレオチド配列を含むポリヌクレオチドとの、両方のヌクレオチド配列の全長にわたる(同じ長さの場合)、又はより短い配列の全長にわたる(異なる長さの場合)塩基対形成を含む。このような配列は、本明細書では互いに対して「完全に相補的」(100%相補性)と称され得る。評価ウィンドウにわたって少なくとも70%相補的である核酸は、そのウィンドウにわたって「実質的に相補的」とみなされる。ある特定の実施形態では、相補的核酸は、評価ウィンドウにわたって少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、少なくとも90%、又は少なくとも95%相補的である。本明細書で、第1の配列が、第2の配列に関して「実質的に相補的」と称される場合、2つの配列は、完全に相補的であってもよく、又はそれらは、意図される用途に最も関連する条件下でハイブリダイズする能力を維持しながら、ハイブリダイゼーション時に1つ以上の合致しない塩基を含んでもよく、例えば、ハイブリダイゼーション時に最大約5%、10%、15%、20%、又は25%の合致しない塩基、例えば、最大30塩基対の二本鎖のハイブリダイゼーション時に1、2、3、4、5、又は6つのミスマッチ塩基対を含んでいてもよい。2つのオリゴヌクレオチドがハイブリダイゼーション時に1つ以上の一本鎖オーバーハングを形成するように設計される場合、このようなオーバーハングは、相補性パーセントの決定に関してミスマッチ又は不対ヌクレオチドとはみなされないことが理解されるべきである。例えば、21ヌクレオチドの長さの1つのオリゴヌクレオチドと23ヌクレオチドの長さの別のオリゴヌクレオチドを含むdsRNAの2本鎖で、より長いオリゴヌクレオチドが、より短いオリゴヌクレオチドと完全に相補的である21ヌクレオチドの配列及び2ヌクレオチドのオーバーハングを含むものは、本明細書では「完全に相補的」と称され得る。本明細書で使用される場合、「相補的」配列は、ハイブリダイズする能力に関する要件が満たされる限りにおいて、1つ以上の非ワトソン・クリック塩基対及び/又は非天然及び他の修飾ヌクレオチドから形成される塩基対を含み得る。そのような非ワトソン・クリック塩基対には、G:Uゆらぎ又はフーグスティン塩基対が含まれるが、これらに限定されない。当業者であれば、グアニン、シトシン、アデニン、及びウラシルが、いわゆる「ゆらぎ」規則に従って、このような塩基を有するヌクレオチドを含むポリヌクレオチドの塩基対形成特性を実質的に変化させることなく、他の塩基によって置き換えられ得ることを認識している(例えば、Murphy,FV IV & V Ramakrishnan,V.,Nature Structural and Molecular Biology 11:1251-1252(2004)を参照されたい)。例えば、その塩基としてイノシンを含むヌクレオチドは、アデニン、シトシン、又はウラシルを含むヌクレオチドと塩基対形成することができる。したがって、ウラシル、グアニン、又はアデニンを含有するヌクレオチドは、本明細書に記載される阻害性RNAのヌクレオチド配列において、例えば、イノシンを含有するヌクレオチドによって置換され得る。「相補的」、「完全に相補的」、及び「実質的に相補的」という用語は、任意の2つの核酸の間の塩基一致、例えば、二本鎖核酸のセンス鎖とアンチセンス鎖との間の塩基一致、又はその一部分に関して使用され得ることが理解されるであろう。本明細書で使用される場合、「ハイブリダイズする」は、当業者であれば理解できるように、相補的な部分を含むか、又はそれからなる2つの核酸配列(いくつかの実施形態では、同じ核酸分子の一部であってもよく、他の実施形態では、異なる核酸分子の一部であるか、又はそれらを含む)間の相互作用を指し、その結果、関心対象となる特定の条件下で安定な二本鎖構造(すなわち、分子内又は分子間二本鎖)が形成される。
【0091】
含む:「含む」という用語は、提示される定義された要素に加えて、他の要素も存在し得ることを意味する。「含む」の使用は、限定ではなく包含を示す。
【0092】
からなる:「からなる」という用語は、実施形態のその説明に列挙されていない任意の要素を含まない、本明細書に記載の組成物、方法、及びそれぞれの構成要素を指す。本明細書で使用される場合、「本質的になる」という用語は、所与の実施形態に必要な要素を指す。この用語は、本発明のその実施形態の基本的及び新規な又は機能的特徴に実質的に影響を与えない追加的な要素の存在を可能にする。
【0093】
併用療法:本明細書で使用される場合、「併用療法」という用語は、対象が2つ以上の治療レジメン(例えば、2つ以上の治療剤)に同時に曝露される状況を指す。いくつかの実施形態では、2つ以上のレジメンは、同時に投与されてもよく、いくつかの実施形態では、そのようなレジメンは、順次投与されてもよく(例えば、第1のレジメンの全ての「用量」は、第2のレジメンの任意の用量の投与の前に投与される)、いくつかの実施形態では、そのような薬剤は、重複する投与レジメンで投与される。いくつかの実施形態では、併用療法の「投与」は、組み合わせで他の薬剤又はモダリティを受けている対象への1つ以上の薬剤又はモダリティの投与を伴い得る。明確にするために、併用療法は、個別の薬剤が単一組成物(又は必ずしも同時に)で一緒に投与される必要はないが、いくつかの実施形態では、2つ以上の薬剤、又はその活性部分は、複合組成物、又は更には複合化合物(例えば、単一化学複合体又は共有結合物質の一部として)で一緒に投与される可能性がある。
【0094】
同等(comparable):本明細書で使用される場合、「同等」という用語は、互いに同一ではない場合があるが、比較を可能とするのに十分な類似性があり、それにより観察された差異又は類似性に基づき当業者が合理的に結論を下し得ると認識する、2つ以上の薬剤、物質、状況、条件のセットなどを指す。いくつかの実施形態では、同等の条件、状況、個体又は集団のセットは、複数の実質的に同一の特徴及び、1つ又は少数の変化した特徴によって特徴付けられる。当分野の当業者であれば、文脈において、2つ以上のそのような薬剤、物質、状況、条件のセットなどが同等とみなされるためには、任意の所与の環境下で、どの程度の同一性が必要とされるかを理解するであろう。例えば当業者であれば、異なるセットの、状況、個体又は集団の下で、又はそれらを用いて取得された結果における差異、又は観察された現象における差異が、変化したそれら特性における変動により引き起こされたという合理的な結論、又はその変動の指標であるという合理的な結論を保証するのに十分な数及びタイプの実質的に同一の特性により特徴付けられる場合に、状況、個体又は集団のセットが、互いに同等であると認識するであろう。
【0095】
ドメイン:本明細書で使用される場合、ドメインという用語は、物質の一区分又は一部分を指す。いくつかの実施形態では、ドメインは、物質の特定の構造的及び/又は機能的特徴と関連付けられるため、ドメインが、その親物質の残りの部分から物理的に分離される場合にも、特定の構造的及び/又は機能的特徴を実質的に又は完全に保持される。代替的又は追加的に、ドメインは、その(親)物質から分離され、異なる(レシピエント)物質と連結された場合、親物質で特徴付けられる1つ以上の構造的及び/又は機能的特徴を、レシピエント物質上に実質的に保持及び/又は付与する物質の一部分であってもよく、又はそれらを含んでもよい。いくつかの実施形態では、ドメインは、分子(例えば、小分子、炭水化物、脂質、核酸、又はポリペプチド)の一区分又は一部分である。いくつかの実施形態では、ドメインは、ポリペプチド(例えば、MuSKタンパク質のIg3ドメイン)の一区分であり、いくつかのこのような実施形態では、ドメインは、特定の構造要素(例えば、特定のアミノ酸配列若しくは配列モチーフ、a-ヘリックス特性、b-シート特性、コイルドコイル特性、ランダムコイル特性など)、及び/又は特定の機能的特徴(例えば、結合活性、酵素活性、フォールディング活性、シグナル伝達活性など)によって特徴付けられる。
【0096】
投与レジメン:当分野の当業者であれば、「投与レジメン」という用語は、対象に個別に、典型的には一定期間を隔てて投与される一連の単位用量(典型的には2つ以上)を指すために使用され得ることを理解するであろう。いくつかの実施形態では、所与の治療剤は、1回以上の投与を含み得る推奨投与レジメンを有する。いくつかの実施形態では、投与レジメンは、複数回の投与を含み、それら各投与は、他の投与から時間的に隔てられている。いくつかの実施形態では、個々の投与は同じ長さの期間で互いに隔てられており、いくつかの実施形態では、投与レジメンは、複数回の投与を含み、かつ個々の投与を隔てる少なくとも2つの異なる期間を含む。いくつかの実施形態では、投与レジメン内の全ての投与が、同一の単位用量である。いくつかの実施形態では、投与レジメン内の異なる投与は、異なる量である。いくつかの実施形態では、投与レジメンは、第1の投与量の第1の投与、次いで第1の投与量とは異なる第2の投与量の1つ以上の追加投与を含む。いくつかの実施形態では、投与レジメンは、第1の投与量の第1の投与、次いで第1の投与量と同じ第2の投与量の1つ以上の追加投与を含む。いくつかの実施形態では、投与レジメンは、関連する集団にわたって投与されたときに、所望の又は有益な結果と相関する(すなわち、治療投与レジメンである)。
【0097】
発現:本明細書で使用される場合、核酸配列の「発現」は、(1)DNA配列からのRNA鋳型の産生(例えば、転写による)、(2)RNA転写物のプロセシング(例えば、スプライシング、編集、5’キャップ形成、及び/又は3’末端形成による)、(3)RNA転写物の輸送(例えば、核から細胞質への輸送、及び/又は(4)ポリペプチド若しくはタンパク質へのRNAの翻訳、並びに/又は(4)ポリペプチド若しくはタンパク質の翻訳後修飾のうちの1つ以上を指す。
【0098】
単離又は部分的に精製:本明細書で使用される場合、「単離された」又は「部分的に精製された」という用語は、核酸又はポリペプチドの場合、その天然源に存在する核酸又はポリペプチドに存在する、及び/又は細胞によって発現されるとき、核酸又はポリペプチドに存在するか、又は分泌ポリペプチドの場合に分泌される、少なくとも1つの他の構成要素(例えば、核酸又はポリペプチド)から分離された核酸又はポリペプチドを指す。化学的に合成された核酸若しくはポリペプチド、又はインビトロ転写/翻訳を使用して合成された核酸若しくはポリペプチドは、「単離された」とみなされる。精製又は実質的に精製されたという用語は、対象の核酸又はポリペプチドが少なくとも95重量%含まれる単離された核酸又はポリペプチドを指し、これは例えば、少なくとも96重量%、少なくとも97重量%、少なくとも98重量%、少なくとも99重量%、又はそれ以上を含む。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体、その抗原結合部分、又はキメラ抗原受容体(CAR)は、単離される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載される抗体、抗体試薬、その抗原結合部分、又はCARは、精製される。
【0099】
遺伝子操作された:本明細書において使用される場合、「遺伝子操作された」とは、人間の手により操作される態様を指す。例えば、抗体、抗体試薬、その抗原結合部分、CAR又は二重特異性抗体は、その抗体、抗体試薬、その抗原結合部分、CAR又は二重特異性抗体の配列が、人間の手によって操作され、自然界に存在する抗体の配列とは異なる場合、「遺伝子操作された」とみなされる。一般的な方法であり、当分野の当業者に理解されているように、遺伝子操作されたポリヌクレオチド又はポリペプチドの子孫及びコピーは、実際の操作が従前の実体に対して行われたのだとしても、典型的にはまだ「遺伝子操作された」と呼称される。
【0100】
断片:本明細書に記載される材料又は物質の「断片」は、全体の個別の部分を含むが、全体的に見られる1つ以上の部分を欠く構造を有する。いくつかの実施形態では、断片は、こうした個別の部分からなる。いくつかの実施形態では、断片は、全体に存在する特徴的な構造要素又は部分からなるか、又はそれを含む。いくつかの実施形態では、ポリマー断片は、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500又はそれ以上のモノマー単位(例えば、残基)を含むか、又はそれからなる。いくつかの実施形態では、ポリマー断片は、ポリマー全体に存在するモノマー単位(例えば、残基)の少なくとも約5%、10%、15%、20%、25%、30%、25%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、96%、97%、98%、99%、又はそれ以上を含むか、又はそれらからなる。材料又は物質全体は、いくつかの実施形態では、断片の「親」と称され得る。
【0101】
遺伝子:本明細書で使用される場合、遺伝子という用語は、産物(例えば、RNA産物及び/又はポリペプチド産物)をコードする染色体中のDNA配列を指す。いくつかの実施形態では、遺伝子はコード配列(すなわち、特定の産物をコードする配列)を含み、いくつかの実施形態では、遺伝子は非コード配列を含む。一部の特定の実施形態では、遺伝子は、コード配列(例えば、エクソン配列)及び非コード配列(例えば、イントロン配列)の両方を含み得る。いくつかの実施形態では、遺伝子は、例えば、遺伝子発現の1つ以上の態様(例えば、細胞型特異的発現、誘導性発現など)を制御又は影響し得る1つ以上の調節要素を含み得る。
【0102】
遺伝子産物又は発現産物:本明細書で使用される場合、「遺伝子産物」又は「発現産物」という用語は、概して、遺伝子から転写されたRNA(プロセシング前及び/又はプロセシング後)、又は遺伝子から転写されたRNAによってコードされたポリペプチド(修飾前及び/又は修飾後)を指す。いくつかの実施形態では、遺伝子産物は、RNA転写物の特定のプロセシングされた形態(例えば、特定の編集された形態、特定のスプライシングされた形態、特定のキャッピングされた形態など)であってもよく、又はそれらを含んでもよい。
【0103】
相同性:本明細書で用いられる場合、用語「相同性」は、ポリマー分子間、例えば、核酸分子(例えば、DNA分子及び/又はRNA分子)間、及び/又はポリペプチド分子間の全体的な関連性を指す。いくつかの実施形態では、ポリマー分子は、その配列が少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%同一である場合、互いに「相同」であるとみなされる。いくつかの実施形態では、ポリマー分子は、その配列が少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%類似である場合、互いに「相同」であるとみなされる。
【0104】
同一性:本明細書で用いられる場合、用語「同一性」は、ポリマー分子間、例えば、核酸分子(例えば、DNA分子及び/又はRNA分子)間、及び/又はポリペプチド分子間の全体的な関連性を指す。いくつかの実施形態では、ポリマー分子は、それらの配列が少なくとも25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%同一である場合、互いに「実質的に同一」であるとみなされる。2つの核酸配列又はポリペプチド配列のパーセント同一性の計算は、例えば、2つの配列を至適比較目的でアライメントすることによって行われ得る(例えば、至適アライメントのためにギャップを第1の配列と第2の配列の一方又は両方に導入することができ、また非同一配列を比較目的のために無視することができる)。特定の実施形態では、比較目的でアライメントされる配列の長さは、参照配列の長さの少なくとも30%、少なくとも40%、少なくとも50%、少なくとも60%、少なくとも70%、少なくとも80%、少なくとも90%、少なくとも95%、又は実質的に100%である。続いて、対応する位置のヌクレオチドを比較する。第1の配列のある位置が、第2の配列における対応する位置と同じ残基(例えば、ヌクレオチド又はアミノ酸)で占有されている場合、分子はその位置で同一である。2つの配列間のパーセント同一性は、配列により共有される同一位置の数の関数であり、2つの配列の至適比較のために導入すべきギャップの数及び各ギャップの長さを考慮に入れている。配列の比較及び2つの配列間のパーセント同一性の測定は、数学的アルゴリズムを用いて遂行され得る。例えば、2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、ALIGNプログラム(バージョン2.0)に組み込まれたMeyers及びMillerのアルゴリズム(CABIOS,1989,4:11-17)を用いて測定され得る。いくつかの例示的な実施形態では、ALIGNプログラムを使用してなされた核酸配列比較は、PAM120重み残基表(PAM120 weight residue table)、ギャップ長ペナルティ12、及びギャップペナルティ4が使用される。あるいは、2つのヌクレオチド配列間のパーセント同一性は、NWSgapdna.CMPマトリックスを使用してGCGソフトウェアパッケージのGAPプログラムを用いて、測定され得る。
【0105】
改善する、「増加する」、「阻害する」、又は「低減する」:本明細書で使用される場合、用語「改善する」、「増加する」、「抑制する」、「低減する」、又はその文法上の同義物は、ベースライン又は他の参照測定値に対する値を示す。いくつかの実施形態では、適切な参照測定は、特定の薬剤若しくは治療の存在のない(例えば、その前及び/又はその後に)、又は適切な参照薬剤(例えば、陽性対照薬剤又は陰性対照薬剤)の存在する、その他の同等の条件下での特定のシステム(例えば、単一の個体、単一の細胞、又は細胞集団)における測定であってもよく、又はそのような測定を含んでもよい。いくつかの実施形態では、適切な参照測定は、関連する薬剤又は治療の存在下で、特定の方法で応答することが知られているか、又は予想される同等のシステムでの測定であってもよく、又はそのような測定を含んでいてもよい。当業者であれば、「改善」、「増加、「低減」などは通常、統計的に有意な変化を指すことを理解するであろう。更に、当業者であれば、どのような変化の大きさが関連し得るかを文脈から理解するであろう。例えば、いくつかの実施形態では、変化は、「倍率」変化であってもよく、すなわち、「変化した」値は、関連する参照に対する、1.1、1.2、2、3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、30、40、50倍以上(例えば、500、1000倍)(1以上の全ての整数及び小数点を含む)、例えば、1.5、1.6、1.7、1.8など)の差を表す。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、「変化」は、関連する参照に対して、「変化」値が1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%、9%、10%、11%、12%、13%、14%、15%、16%、17%、18%、19%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は100%の増加又は減少、その間の全ての整数及び小数点を含む)を表すように、変化「パーセント」変化であり得る。
【0106】
連結した:本明細書で使用される場合、「連結した」という用語は、2つ以上の部分に関して使用される場合、部分が物理的に互いに会合又は接続されて、十分に安定な分子構造を形成し、その結果、結合が形成される条件下、好ましくは新しい分子構造が使用される条件下、例えば生理学的条件下で、部分が会合したままであるようにすることを意味する。本発明の特定の好ましい実施形態では、結合は、共有結合である。他の実施形態では、結合は、非共有結合である。部分は、直接的又は間接的のいずれかで連結されてもよい。2つの部分が直接連結される場合、それらは互いに共有結合されるか、又は2つの部分間の分子間力がそれらの会合を維持するように十分に近接している。2つの部分が間接的に連結される場合、それらは各々、2つの部分間の会合を維持する第3の部分に共有結合又は非共有結合のいずれかで連結される。一般に、2つの部分が、「リンカー」又は「連結部分(linking moiety)」又は「連結部分(linking portion)」によって連結されていると言及される場合、2つの連結部分間の結合は間接的であり、典型的には、連結された部分の各々は、リンカーに共有結合している。リンカーは、連結される2つの部分と、その部分の安定性と一致する条件下(条件に応じて、必要に応じて保護され得る)、合理的な期間内に、かつ合理的な収率を生じるのに十分な量で反応する、任意の好適な部分であり得る。
【0107】
ヌクレオチド間結合:本明細書で使用される場合、「ヌクレオチド間結合」という語句は、オリゴヌクレオチドのヌクレオチド単位間のリン含有結合を一般的に指し、上記及び本明細書で使用される場合、「糖間結合」及び「リン原子架橋」と互換性がある。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド間結合は、天然DNA分子及びRNA分子に見られるホスホジエステル結合である。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド間結合は、ホスホジエステル結合の各酸素原子が任意選択的に、かつ独立して、有機部分又は無機部分によって置換された「修飾ヌクレオチド間結合」である。いくつかの実施形態では、このような有機部分又は無機部分は、限定されないが、=S、=Se、=NR’、-SR’、-SeR’、-N(R’)
2、B(R’)
3、-S-、-Se-、及び-N(R’)-から選択され、各R’は独立して、以下に定義され、記載されるとおりである。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド間結合は、ホスホトリエステル結合、ホスホロチオエートジエステル結合
【化1】
又は修飾ホスホロチオエートトリエステル結合である。当業者であれば、ヌクレオチド間結合は、結合中の酸又は塩基部分の存在により、所与のpHでアニオン又はカチオンとして存在し得ることを理解するであろう。いくつかの実施形態では、ヌクレオチド間結合は、キラル結合であってもよい。
【0108】
長期投与:本明細書で使用される場合、長期投与という用語は、治療剤又は薬剤が少なくとも12週間の期間投与されることを意味する。これには、治療剤又は薬剤が、少なくとも12週間の期間にわたって、又は少なくとも12週間の期間、有効であるように投与され、例えば、持続放出性組成物又は長時間作用性治療剤又は薬物が使用される場合など、投与自体が12週間行われることを必ずしも意味しないことが含まれる。したがって、対象は、少なくとも12週間の期間、治療される。多くの場合、長期投与は、少なくとも4、5、6、7、8、9ヶ月以上、又は少なくとも1、2、3、5、7、若しくは10年以上である。
【0109】
部分:当業者であれば、「部分」とは、本明細書に記載される特定の構造及び/又は又は活性を有する定義された化学基又は化学物質であることを理解するであろう。
【0110】
ナノ粒子:本明細書で用いられる場合、用語「ナノ粒子」は、1000ナノメートル(nm)未満の直径を有する粒子を意味する。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は米国科学財団(National Science Foundation)により定義されるように、300nm未満の直径を有する。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は米国国立衛生研究所(National Institutes of Health)により定義されるように、100nm未満の直径を有する。いくつかの実施形態では、ナノ粒子は、ミセル膜によってバルク溶液から分離され、封入された区画を含むという点でミセルであり、典型的には空間又は区画を囲いかつ封入する(例えば、内腔を画定する)両親媒性物質から構成されている。いくつかの実施形態では、ミセル膜は、少なくとも1つのポリマー(例えば、生体適合性及び/又は生分解性のポリマー)から構成される。
【0111】
核酸:本明細書において使用される場合、最も広い意味において、オリゴヌクレオチド鎖に組み込まれる、又は組み込まれることができる任意の化合物及び/又は物質を指す。いくつかの実施形態では、核酸は、ホスホジエステル結合を介してオリゴヌクレオチド鎖に組み込まれるか、又は組み込まれ得る化合物及び/又は物質である。文脈から明らかであるように、いくつかの実施形態では、「核酸」とは、個々の核酸残基(例えば、ヌクレオチド及び/又はヌクレオシド)を指し、いくつかの実施形態では、「核酸」とは、個々の核酸残基を含有するオリゴヌクレオチド鎖を指す。いくつかの実施形態では、「核酸」は、RNAであるか、又はRNAを含み、いくつかの実施形態では、「核酸」は、DNAであるか、又はDNAを含む。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の天然核酸残基であるか、1つ以上の天然核酸残基を含むか、又は1つ以上の天然核酸残基からなる。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の核酸類似体であるか、1つ以上の核酸類似体を含むか、又は1つ以上の核酸類似体からなる。いくつかの実施形態では、核酸類似体は、ホスホジエステル主鎖を使用していないという点で、核酸とは異なっている。例えば、いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の「ペプチド核酸」であるか、それらを含むか、又はそれらからなり、ペプチド核酸は、当分野において公知であり、主鎖中にホスホジエステル結合の代わりにペプチド結合を有しており、本発明の範囲内にあるとみなされる。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、核酸は、ホスホジエステル結合ではなく、1つ以上のホスホロチオエート結合及び/又は5’-N-ホスホラミダイト結合を有している。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上の天然ヌクレオシド(例えば、アデノシン、チミジン、グアノシン、シチジン、ウリジン、デオキシアデノシン、デオキシチミジン、デオキシグアノシン、及びデオキシシチジンなど)であるか、それらを含むか、又はそれらからなる。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上のヌクレオシド類似体(例えば、2-アミノアデノシン、2-チオチミジン、イノシン、ピロロ-ピリミジン、3-メチルアデノシン、5-メチルシチジン、C-5プロピニル-シチジン、C-5プロピニル-ウリジン、2-アミノアデノシン、C5-ブロモウリジン、C5-フルオロウリジン、C5-ヨードウリジン、C5-プロピニル-ウリジン、C5-プロピニル-シチジン、C5-メチルシチジン、2-アミノアデノシン、7-デアザアデノシン、7-デアザグアノシン、8-オキソアデノシン、8-オキソグアノシン、0(6)-メチルグアニン、2-チオシチジン、メチル化塩基、インターカレートした塩基、及びそれらの組み合わせ)であるか、それらを含むか、又はそれらからなる。いくつかの実施形態では、核酸は、天然核酸のものと比較して、1つ以上の修飾糖(例えば、2’-フルオロリボース、リボース、2’-デオキシリボース、アラビノース、及びヘキソース)を含有する。いくつかの実施形態では、核酸は、例えばRNA又はタンパク質などの機能性遺伝子産物をコードするヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、核酸は、1つ以上のイントロンを含む。いくつかの実施形態では、核酸は、天然供給源からの単離、相補性鋳型に基づいた重合による(インビボ又はインビトロの)酵素的合成、組換え細胞又は組換え系での複製、及び化学合成のうちの1つ以上により調製される。いくつかの実施形態では、核酸は、少なくとも3、4、5、6、7、8、9、10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、20、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500、600、700、800、900、1000、1500、2000、2500、3000、3500、4000、4500、5000以上の残基の長さである。いくつかの実施形態では、核酸は部分的に又は完全に一本鎖であり、いくつかの実施形態では、核酸は部分的に又は完全に二本鎖である。いくつかの実施形態では核酸は、ポリペプチドをコードする配列、又はポリペプチドをコードする配列の相補配列である、少なくとも1つの要素を含むヌクレオチド配列を有する。いくつかの実施形態では、核酸は、酵素活性を有する。
【0112】
オリゴヌクレオチド:本明細書で使用される場合、「オリゴヌクレオチド」という用語は、核酸塩基、修飾核酸塩基、糖、修飾糖、リン酸架橋、又は修飾リン原子架橋(本明細書ではヌクレオチド間結合とも呼ばれ、本明細書で更に定義される)の任意の組み合わせを含有するヌクレオチドモノマーのポリマー又はオリゴマーを指す。オリゴヌクレオチドは、一本鎖又は二本鎖であってもよい。一本鎖オリゴヌクレオチドは、二本鎖領域を有することができ、二本鎖オリゴヌクレオチドは、一本鎖領域を有することができる。オリゴヌクレオチドの例には、構造遺伝子、制御領域及び終結領域を含む遺伝子、ウイルスDNA又はプラスミドDNAなどの自己複製システム、一本鎖及び二本鎖siRNA並びに他のRNA干渉試薬(RNAi剤又はiRNA剤)、shRNA、アンチセンスオリゴヌクレオチド、リボザイム、マイクロRNA、マイクロRNA模倣体、スーパーmir(supermir)、アプタマー、アンチmir(antimir)、アンタゴmir(antagomir)、Ulアダプター、三重鎖形成オリゴヌクレオチド、G-四重鎖オリゴヌクレオチド、RNA活性化剤、免疫刺激オリゴヌクレオチド、及びデコイオリゴヌクレオチドが含まれるが、これらに限定されない。RNA干渉の誘導に有効な二本鎖及び一本鎖オリゴヌクレオチドは、本明細書においてsiRNA、RNAi剤、又はiRNA剤とも称される。いくつかの実施形態では、これらのRNA干渉誘導オリゴヌクレオチドは、RNAi誘導サイレンシング複合体(RISC)として知られる細胞質多タンパク質複合体と会合する。多くの実施形態では、一本鎖RNAi剤及び二本鎖RNAi剤は十分に長いため、例えばダイサーなどの内因性分子によって切断され得、RISC機構に入り、例えば標的mRNAなどの標的配列のRISC媒介切断に関与することができる、より小さなオリゴヌクレオチドを産生することができる。
【0113】
作動可能に連結された:本明細書において使用される場合、「作動可能に連結された」という用語は、記載される構成要素が、それらの意図される様式でそれらが機能することが可能となる関係性にある並置を指す。機能要素に「作動可能に連結された」制御要素は、機能要素の発現及び/又は活性が制御要素と互換性のある条件下で達成されるように関連付けられる。いくつかの実施形態では、「作動可能に連結された」制御要素(例えば、プロモーター、エンハンサーなど)は、関心対象となるコード要素と連続している(例えば、共有結合している)。いくつかの実施形態では、制御要素は、関心対象となるコード機能要素とトランス又はシスで作用する。
【0114】
患者:本明細書で使用される場合、「患者」という用語は、例えば、実験目的、診断目的、予防目的、美容目的、及び/又は治療目的のために、提供される組成物(例えばASOなどの刺激剤)が投与される、又は投与される可能性のある任意の生物を指す。典型的な患者としては、動物(例えば、マウス、ラット、ウサギ、非ヒト霊長類、及び/又はヒトなどの哺乳類)が挙げられる。いくつかの実施形態では、患者は、ヒトである。いくつかの実施形態では、患者は、1つ以上の障害又は状態に罹患しているか、又は罹患しやすい。いくつかの実施形態では、患者は、障害又は状態の1つ以上の症状を呈している。いくつかの実施形態では、患者は、1つ以上の障害又は状態と診断されている。いくつかの実施形態では、障害又は状態は、アルツハイマー病又は神経変性により特徴付けられる他の疾患である。いくつかの実施形態では、障害又は状態は、筋ジストロフィー、又は神経筋機能障害により特徴付けられる他の疾患である。いくつかの実施形態では、患者は、疾患、障害又は状態を診断及び/又は治療するために、ある特定の治療を受けているか、又は受けたことがある。
【0115】
医薬組成物:本明細書で用いられる場合、用語「医薬組成物」は、1つ以上の薬学的に許容可能な担体と合わせて製剤化された活性剤(例えば、MuSK標的化オリゴヌクレオチド)を指す。いくつかの実施形態では、活性剤は、関連する集団に投与された際に、所定の治療効果を達成する確率が統計的に有意を示す治療レジメンにおいて、投与に適切な単位投与量で存在する。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、固体形態又は液体形態で投与用に特別に製剤化され得、以下に適応したものを含む:経口投与、例えば、飲薬(水性又は非水性の溶液又は懸濁液)、錠剤、例えば、頬側吸収、舌下吸収、及び全身吸収を対象としたもの、ボーラス、粉末、顆粒、舌への適用用のペースト;非経口投与、例えば、滅菌溶液若しくは懸濁液、又は徐放性製剤としての皮下、筋肉内、静脈、若しくは硬膜外注射剤;局所適用、例えば、クリーム、軟膏、又は皮膚、肺、若しくは口腔に適用される制御放出パッチ若しくはスプレー;腟内又は直腸内投与、例えば、腟坐薬、クリーム、又はフォーム;舌下投与;眼内投与;経皮投与;又は経鼻投与、肺投与、並びに他の粘膜表面への投与。
【0116】
薬学的に許容可能な:本明細書中で使用される場合、用語「薬学的に許容可能な」とは、健全な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー反応、又はその他の問題や合併症を伴わずに、合理的な利益/リスク比に見合った、ヒト及び動物の組織との接触における使用に適した化合物、物質、組成物及び/又は剤形を指す。
【0117】
薬学的に許容可能な担体:本明細書で使用される場合、「薬学的に許容可能な担体」という用語は、物質を封入する液状若しくは固形の充填剤、希釈剤、賦形剤、又は溶媒などの薬学的に許容可能な物質、組成物又はビヒクルを意味し、対象化合物の、身体の1つの臓器又は一部分から、身体の別の臓器又は一部分への運搬又は輸送に関与する。各担体は、製剤の他の成分と適合性があり、患者に有害ではないという意味で「許容可能」でなければならない。薬学的に許容可能な担体として役立ち得る物質のいくつかの例としては、ラクトース、グルコース及びスクロースなどの糖類;コーンスターチ、ジャガイモデンプンなどのデンプン;セルロース、並びにカルボキシメチルセルロースナトリウム、エチルセルロース及び酢酸セルロースなどのセルロース誘導体;粉末トラガカント;モルト;ゼラチン;タルク;ココアバター及び座薬用ワックスなどの賦形剤;ピーナッツ油、綿実油、サフラワー油、ゴマ油、オリーブ油、トウモロコシ油及び大豆油などの油類;プロピレングリコールなどのグリコール類;グリセリン、ソルビトール、マンニトール及びポリエチレングリコールなどのポリオール類;オレイン酸エチル及びラウリン酸エチルなどのエステル類;寒天;水酸化マグネシウム及び水酸化アルミニウムなどの緩衝剤;アルギン酸;発熱物質が含まれていない水;等張生理食塩水;リンゲル溶液;エチルアルコール;pH緩衝溶液;ポリエステル、ポリカーボネート及び/又はポリ無水物;並びに医薬製剤に採用されるその他の非毒性の適合性物質が挙げられる。
【0118】
薬学的に許容可能な塩:本明細書中で使用される場合、用語「薬学的に許容可能な塩」とは、薬学的状況で使用するのに適した化合物の塩、すなわち、健全な医学的判断の範囲内で、過度の毒性、刺激、アレルギー反応などを伴わずに、ヒト及び下等動物の組織との接触における使用に適した塩を指し、合理的な利益/リスク比に見合ったものである。薬学的に許容可能な塩は、当該分野において周知である。例えば、S.M.Berge,et al.は、J.Pharmaceutical Sciences,66:1-19(1977)に薬学的に許容可能な塩を記載している。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩には、例えば塩酸、臭化水素酸、リン酸、硫酸及び過塩素酸などの無機酸、又は酢酸、マレイン酸、酒石酸、クエン酸、コハク酸若しくはマロン酸などの有機酸と形成される、又はイオン交換のような当技術分野で使用される他の方法により形成されるアミノ基の塩である、非毒性の酸付加塩が含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、他の薬学的に許容可能な塩としては、アジピン酸塩、アルギン酸塩、アスコルビン酸塩、アスパラギン酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、安息香酸塩、重硫酸塩、ホウ酸塩、酪酸塩、樟脳酸塩、ショウノウスルホン酸塩、クエン酸塩、シクロペンタンプロピオン酸塩、ジグルコン酸塩、ドデシル硫酸塩、エタンスルホン酸塩、ギ酸塩、フマル酸塩、グルコヘプトン酸塩、グリセロリン酸、グルコン酸塩、ヘミ硫酸塩、ヘプタン酸塩、ヘキサン酸塩、ヨウ化水素酸塩、2-ヒドロキシ-エタンスルホン酸塩、ラクトビオン酸、乳酸塩、ラウリン酸塩、ラウリル硫酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マロン酸塩、メタンスルホン酸塩、2-ナフタレンスルホン酸塩、ニコチン酸塩、硝酸塩、オレイン酸塩、シュウ酸塩、パルミチン酸塩、パモ酸塩、ペクチン酸塩、過硫酸塩、3-フェニルプロピオン酸塩、リン酸塩、ピクリン酸塩、ピバリン酸塩、プロピオン酸塩、ステアリン酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、酒石酸塩、チオシアン酸塩、p-トルエンスルホン酸塩、ウンデカン酸塩、吉草酸塩などが含まれるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、提供される化合物は、1つ以上の酸性基、例えば、オリゴヌクレオチドを含み、薬学的に許容可能な塩は、アルカリ、アルカリ土類金属、又はアンモニウム(例えば、N(R)3のアンモニウム塩であって、各Rは独立して本開示に定義され、記載される)塩である。代表的なアルカリ又はアルカリ土類金属塩には、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどが含まれる。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩は、ナトリウム塩である。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩は、カリウム塩である。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩は、カルシウム塩である。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩としては、適切な場合、ハロゲン化物、水酸化物、カルボン酸塩、硫酸塩、リン酸塩、硝酸塩、1~6個の炭素原子を有するアルキル、スルホン酸塩、アリールスルホン酸塩などの対イオンを使用して形成される非毒性のアンモニウム、四級アンモニウム、及びアミンカチオンが含まれる。いくつかの実施形態では、提供される化合物は、2つ以上の酸基を含有し、例えば、オリゴヌクレオチドは、2つ以上の酸性基を含有してもよい(例えば、天然のホスフェート結合及び/又は修飾ヌクレオチド間結合において)。いくつかの実施形態では、このような化合物の薬学的に許容可能な塩、又は一般的には塩は、同一であっても異なっていてもよい、2つ以上のカチオンを含む。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩(又は一般に塩)では、酸性基中の全てのイオン化水素(例えば、pKaが約11、10、9、8、7、6、5、4、3、又は2以下、いくつかの実施形態では、約7以下、いくつかの実施形態では、約6以下、いくつかの実施形態では、約5以下、いくつかの実施形態では、約4以下、いくつかの実施形態では、約3以下である水溶液中)がカチオンで置換される。いくつかの実施形態では、各ヌクレオチド間結合、例えば、リン酸基は独立して、その塩形態で存在する(例えば、ナトリウム塩の場合、-O-P(O)(ONa)-O-)。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩は、オリゴヌクレオチドのナトリウム塩である。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩は、オリゴヌクレオチドのナトリウム塩であり、各酸性リン酸基及び修飾リン酸基は、存在する場合、塩形態(全てナトリウム塩)として存在する。
【0119】
ポリペプチド:本明細書で使用される場合、「ポリペプチド」という用語は、本明細書では「タンパク質」という用語と互換的に使用され、少なくとも3つのアミノ酸残基のポリマーを指す。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、1つ以上、又は全て天然アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、1つ以上、又は全て非天然アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、1つ以上、又は全てD-アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、1つ以上、又は全てL-アミノ酸を含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ポリペプチドのN末端、ポリペプチドのC末端、若しくはそれらの任意の組み合わせにおいて、1つ以上のペンダント基又は他の修飾、例えば、1つ以上のアミノ酸側鎖に対する修飾、又はそれらに付加されるなどを含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、アセチル化、アミド化、アミノエチル化、ビオチン化、カルバミル化、カルボニル化、シトルリン化、脱アミド化、脱イミノ化、エリミニレーション(eliminylation)、グリコシル化、脂質化、メチル化、ペグ化、リン酸化、SUMO化、又はそれらの組み合わせなどの1つ以上の修飾を含む。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、1つ以上の分子内又は分子間ジスルフィド結合に関与してもよい。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、環状であってもよく、及び/又は環状部分を含有してもよい。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、環状ではなく、及び/又はいずれの環状部分も含有しない。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは直線状である。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、ステープル化ポリペプチドを含み得る。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、1つ以上の他のポリペプチドとの非共有結合又は共有結合による非共有結合複合体形成に関与する(例えば、抗体の場合)。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、自然界に存在するアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、自然界に存在しないアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、ポリペプチドは、人間の手による行為によって設計された、及び/又は生成されたという点で、遺伝子操作されているアミノ酸配列を有する。いくつかの実施形態では、「ポリペプチド」という用語は、参照ポリペプチド、活性、又は構造の名称に加えられてもよい。かかる例において、本明細書では、それは関連活性又は構造を共有するポリペプチドを指すために使用され、したがって同じクラス又はファミリーのポリペプチドのメンバーであるとみなされ得る。そのような各クラスについて、本明細書は、そのアミノ酸配列及び/若しくは機能が公知であるクラス内の例示的なポリペプチドを提供し、かつ/又は当業者はそれを認識している。いくつかの実施形態では、そのような例示的なポリペプチドは、当該ポリペプチドのクラス又はファミリーに対する参照ポリペプチドである。いくつかの実施形態では、ポリペプチドのクラス又はファミリーのメンバーは、当該クラスの参照ポリペプチドと、及びいくつかの実施形態では当該クラス内の全てのポリペプチドと)、高い配列相同性又は同一性を示し、共通の配列モチーフ(例えば、特徴的な配列要素)を共有し、及び/又は(いくつかの実施形態では、同等レベルの、又は指定された範囲内の)共通の活性を共有している。例えば、いくつかの実施形態では、メンバーのポリペプチドは、少なくとも約30%~40%、及び多くの場合には約50%、60%、70%、80%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、若しくは99%以上を超える参照ポリペプチドとの全体的な配列相同性若しくは同一性の程度を示し、並びに/又は、多くの場合には90%を超える、若しくは更には95%、96%、97%、98%、若しくは99%を超える極めて高い配列同一性を示す、少なくとも1つの領域(例えば、いくつかの実施形態では、特徴的な配列要素を含み得る保存領域)を含む。こうした保存領域は通常、少なくとも3個~4個、多くの場合には最大20個まで、又はそれより多いアミノ酸を包含し、いくつかの実施形態では、保存領域は、少なくとも2個、3個、4個、5個、6個、7個、8個、9個、10個、11個、12個、13個、14個、又は15個以上の連続したアミノ酸のうちの少なくとも1つの連続配列を包含する。いくつかの実施形態では、有用なポリペプチドは、親ポリペプチドの断片を含み得る。いくつかの実施形態では、有用なポリペプチドは、複数の断片を含み得るため、それら断片の各々は、関心対象となるポリペプチドに見られる場合とは相互に異なる空間配置で、同じ親ポリペプチドに見られるものであり(例えば、親ポリペプチドでは直接連結されていた断片が、関心対象となるポリペプチドでは空間的に分離されている場合もあり、若しくはその逆の場合もあり、及び/又は断片が、関心対象となるポリペプチドにおいて、親ポリペプチドとは異なる順序で存在している場合もある)、したがって、関心対象となるポリペプチドは、その親ポリペプチドの誘導体となる。いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるポリペプチド(又はそのようなポリペプチドをコードする核酸)は、本明細書に記載されるアミノ酸配列のうちの1つの機能的断片であってもよい。本明細書で使用される場合、「機能的断片」は、本明細書で以下に記載されるアッセイに従って、野生型参照ポリペプチドの活性の少なくとも50%を保持するペプチドの断片又はセグメントである。機能的断片は、本明細書に開示される配列の保存的置換を含み得る。いくつかの実施形態では、本明細書に記載のポリペプチドは、本明細書に記載の配列のバリアントであってもよい。いくつかの実施形態では、バリアントは、保存的に修飾されたバリアントである。保存的置換バリアントは、例えば、天然ヌクレオチド配列の変異によって得ることができる。本明細書で言及される「バリアント」は、天然ポリペプチド又は参照ポリペプチドと実質的に相同であるが、1つ以上の欠失、挿入、又は置換のために天然ポリペプチド又は参照ポリペプチドのアミノ酸配列とは異なるアミノ酸配列を有するポリペプチドである。バリアントポリペプチドをコードするDNA配列は、天然DNA配列又は参照DNA配列と比較してヌクレオチドの1つ以上の付加、欠失、又は置換を含むが、活性を保持するバリアントタンパク質又はその断片をコードする配列を包含する。多種多様なPCRベースの部位特異的変異誘発アプローチが当該技術分野で公知であり、当業者によって適用され得る。本明細書に記載される様々な実施形態では、記載される特定のポリペプチドのいずれかのバリアント(天然型又はその他)、対立遺伝子、相同体、保存的に修飾されたバリアント、及び/又は保存的置換バリアントが包含されることが更に企図される。アミノ酸配列に関して、当業者であれば、コードされた配列中の単一アミノ酸又はアミノ酸のわずかな割合を変化させる、核酸、ペプチド、ポリペプチド、又はタンパク質配列に対する個々の置換、欠失、又は付加は、「保存的に修飾されたバリアント」であり、この変化は、化学的に類似したアミノ酸によるアミノ酸の置換をもたらし、ポリペプチドの所望の活性を保持されることを認識するであろう。このような保存的に修飾されたバリアントは、本開示と一致する多型バリアント、種間相同体、及び対立遺伝子に加えてあり、それらを除外しない。
【0120】
予防する又は予防:本明細書において疾患、障害、及び/又は状態の発生と関連付けて使用される場合、当該疾患、障害、及び/又は状態の発現リスクを低下させること、並びに当該疾患、障害、及び/若しくは状態の特徴又は症状の1つ以上の発症を遅延させること、を指す。予防は、疾患、障害、又は状態の発症が、既定の期間、遅延された場合には、完了したとみなされ得る。
【0121】
組換え体:本明細書で使用される場合、「組換え体」という用語は、組換え手段によって設計、操作、調製、発現、作成、製造及び/又は単離されたポリペプチドを指すことを意図しており、例えば、宿主細胞にトランスフェクトされた組換え発現ベクターを使用して発現されたポリペプチド;組換え、コンビナトリアルヒトポリペプチドライブラリーから単離されたポリペプチド;ポリペプチド又はその1つ以上の成分、部分、要素、若しくはドメインをコード及び/又は発現を指示する遺伝子又は遺伝子成分を発現するようにトランスジェニックにされるか、又はその他の方法で操作された動物(例えば、マウスと、ウサギ、ヒツジ、魚など)から単離されたポリペプチド;並びに/あるいは選択された核酸配列要素を互いにスプライシング若しくはライゲーションすること、選択された配列要素を化学的に合成すること、及び/又はポリペプチド又はその1つ以上の成分、部分、要素、若しくはドメインをコードする及び/又は発現を導く核酸をその他の方法で生成することを含むその他の手段によって調製、発現、作成、又は単離されたポリペプチドを指すことを意図している。いくつかの実施形態は、かかる選択された配列要素のうちの1つ以上が、自然界に存在する。いくつかの実施形態は、かかる選択された配列要素のうちの1つ以上が、インシリコで設計されている。いくつかの実施形態では、1つ以上のかかる選択された配列要素は、公知の配列要素の変異誘発(例えば、インビボ又はインビトロ)の結果であり、例えば、関心対象となる供給源生物(例えば、ヒト、マウスなど)の生殖細胞系列などの天然又は合成の供給源から生じる。
【0122】
小分子:本明細書で使用される場合、小分子という用語は、低分子量の有機化合物及び/又は無機化合物を意味する。一般的に、「小分子」は、約5キロダルトン(kD)未満のサイズの分子である。いくつかの実施形態では、小分子は、約4kD、3kD、約2kD、又は約1kD未満である。いくつかの実施形態では、小分子は、約800ダルトン(D)、約600D、約500D、約400D、約300D、約200D、又は約100D未満である。いくつかの実施形態では、小分子は、約2000g/mol未満、約1500g/mol未満、約1000g/mol未満、約800g/mol未満、又は約500g/mol未満である。いくつかの実施形態では、小分子はポリマーではない。いくつかの実施形態では、小分子はポリマー部分を含まない。いくつかの実施形態では、小分子は、タンパク質でもポリペプチドでもなく、かつ/又はタンパク質もポリペプチドも含まない(例えば、オリゴペプチドでもペプチドでもない)。いくつかの実施形態では、小分子は、ポリヌクレオチドではなく、かつ/又はポリヌクレオチドを含まない(例えば、オリゴヌクレオチドではない)。いくつかの実施形態では、小分子は、多糖類ではなく、かつ/又は多糖類を含まない(例えば、糖タンパク質でも、プロテオグリカンでも、糖脂質などでもない)。いくつかの実施形態では、小分子は脂質ではない。いくつかの実施形態では、低分子は、調節剤である(例えば、阻害剤又は活性化剤である)。いくつかの実施形態では、小分子は生物学的活性がある。いくつかの実施形態では、小分子は検出可能である(例えば、少なくとも1つの検出可能な部分を含む)。いくつかの実施形態では、小分子は治療剤である。当業者であれば、本開示を読めば、本明細書に記載の特定の小分子化合物が、例えば、結晶形態、塩形態、保護された形態、プロドラッグ形態、エステル形態、異性体形態(例えば、光学異性体及び/又は構造異性体)、同位体形態などの様々な形態のいずれかで提供及び/又は利用され得ることを理解するであろう。当業者であれば、特定の小分子化合物が、1つ以上の立体異性体形態で存在し得る構造を有することを理解するであろう。いくつかの実施形態では、このような小分子は、個々のエナンチオマー、ジアステレオマー、又は幾何異性体の形態で本開示に従って利用されてもよく、又は立体異性体の混合物の形態であってもよく、いくつかの実施形態では、このような小分子は、ラセミ混合物形態で本開示に従って利用されてもよい。当業者であれば、特定の小分子化合物が、1つ以上の互変異性体の形態で存在し得る構造を有することを理解するであろう。いくつかの実施形態では、このような小分子は、個々の互変異性体の形態で、又は互変異性体間で相互変換する形態で、本開示に従って利用され得る。当業者であれば、特定の小分子化合物が、同位体置換を可能にする構造を有することを理解するであろう(例えば、Hについては2H又は3H;12Cについては11C、13C又は14C;14Nについては13N又は15N;16Oについては17O又は18O;XXCについては36Cl;XXFについては18F;XXXIについては131Iなど)。いくつかの実施形態では、このような小分子は、本開示に従って、1つ以上の同位体修飾形態、又はそれらの混合物で利用され得る。いくつかの実施形態では、特定の小分子化合物への言及は、その化合物の特定の形態に関連し得る。いくつかの実施形態では、特定の小分子化合物は、塩形態で(例えば、化合物に応じて、酸付加塩形態又は塩基付加塩形態で)提供及び/又は利用され得、いくつかの実施形態では、塩形態は、薬学的に許容可能な塩形態であり得る。いくつかの実施形態では、小分子化合物が自然界に存在するか、又は自然界で見出される化合物である場合、当該化合物は、自然界に存在するか、又は自然界で見出されるものとは異なる形態で本開示に従って提供及び/又は利用されてもよい。当業者であれば、いくつかの実施形態では、特定の小分子化合物の調製物であって、その化合物又はその特定の形態の絶対量又は相対量が、関心対象となる参照調製物中(例えば、生物学的又は環境的供給源などの関心対象となる供給源からの一次試料において)に存在する化合物又は形態の絶対量又は相対量と異なるもの(調製物の別の構成要素、例えば、化合物の別の形態に関して)を含有する調製物は、参照調製物又は供給源中に存在する化合物とは区別されることを理解するであろう。したがって、いくつかの実施形態では、例えば、小分子化合物の単一の立体異性体の調製物は、化合物のラセミ混合物とは異なる形態の化合物であるとみなされ得る;低分子化合物の特定の塩は、化合物の別の塩形態とは異なる形態であるとみなされ得る;二重結合の1つの立体構造異性体((Z)又は(E))を含有する化合物の形態のみを含有する調製物は、二重結合の他方の立体構造異性体((E)又は(Z))を含有するものとは異なる形態の化合物であるとみなされ得る;1つ以上の原子が参照調製物中に存在するものとは異なる同位体である調製物は、異なる形態であるとみなされ得る;などである。
【0123】
特異的結合:本明細書において使用される場合、「特異的結合」という用語は、結合が発生する環境下で、可能性のある結合パートナー間を識別する能力を指す。他の可能性のある標的が存在しているときに、1つの特定の標的と相互作用する結合剤は、相互作用する標的(例えば、関心対象となる標的タンパク質/遺伝子上の標的アミノ酸又は核酸配列)に対し、「特異的に結合する」と言われる。いくつかの実施形態では、特異的結合は、結合剤とそのパートナーの間の会合度を検出又は決定することにより評価され、いくつかの実施形態では、特異的結合は、結合剤-パートナー複合体の解離度を検出又は決定することにより評価され、いくつかの実施形態では、特異的結合は、そのパートナーと他の物質の間の代替的相互作用と競合する結合剤の能力を検出又は決定することにより評価される。いくつかの実施形態では、特異的結合は、様々な範囲の濃度にわたり、このような検出又は決定を行うことにより評価される。
【0124】
特異性:当技術分野で公知のように、「特異性」は、特定のリガンドの、その結合パートナーを他の潜在的な結合パートナーと区別する能力の尺度である。
【0125】
対象:本明細書で使用される場合、「対象」という用語は、生物、典型的には哺乳動物(例えば、ヒト、いくつかの実施形態では、出生前のヒト形態を含む)を指す。いくつかの実施形態では、対象は、関連する疾患、障害、又は状態(例えば、アルツハイマー病(AD)、筋ジストロフィー、又は神経変性若しくは神経筋機能障害によって特徴付けられる他の疾患)に罹患している。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害、又は状態に罹患しやすい。いくつかの実施形態では、対象は、障害又は症状の1つ以上の症状又は特徴を呈している。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害、又は状態のいかなる症状又は特徴も呈していない。いくつかの実施形態では、対象は、疾患、障害、又は状態対する感受性又はそのリスクを特徴付ける1つ以上の特徴を有する人である。いくつかの実施形態では、対象は、患者である。いくつかの実施形態では、対象は、診断及び/又は療法が施されている、及び/又は施された個体である。
【0126】
実質的に:本明細書において使用される場合、「実質的に」という用語は、関心対象となる特徴又は性質の全て、若しくはほぼ全ての範囲又は程度を示す定性的な状態を指す。生物分野の当業者であれば、生物学的及び化学的な現象は、完了にまで進行すること、及び/又は完全性にまで進展すること、又は完全な結果に達すること、若しくは回避することは仮にあったとしても稀であることを理解するであろう。したがって本明細書では、「実質的に」という用語は、多くの生物学的及び化学的な現象に内在する完全性の潜在的な欠如を捉えるために使用される。
【0127】
実質的同一性:本明細書において使用される場合、アミノ酸又は核酸の配列間の比較を指す。当業者により認識されているように、2つの配列が、対応する位置で同一の残基を有する場合、一般に「実質的に同一」であるとみなされる。当分野においてよく知られているように、アミノ酸又は核酸の配列は、例えばヌクレオチド配列に対してはBLASTN、アミノ酸配列に対してはBLASTP、ギャップ化BLAST、及びPSI-BLASTなどの市販のコンピュータープログラムにおいて利用可能なものをはじめとする、任意の様々なアルゴリズムを使用して比較され得る。そのようなプログラムの例は、Altschul et al.,Basic local alignment search tool,J.Mol.Biol.,215(3):403-410,1990、Altschul et al.,Methods in Enzymology、Altschul et al.,Nucleic Acids Res.25:3389-3402,1997、Baxevanis et al.,Bioinformatics:A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins,Wiley,1998、及びMisener,et al,(eds.),Bioinformatics Methods and Protocols(Methods in Molecular Biology,Vol.132),Humana Press,1999に記載されている。同一配列の特定に加えて、上述のプログラムは通常、同一性の程度の指標も提供する。いくつかの実施形態では、2つの配列は、その対応する残基の少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%又はそれ以上が、関連する残基の連続配列にわたり、同一である場合、実質的に同一であるとみなされる。いくつかの実施形態では、関連する連続配列は、完全な配列である。いくつかの実施形態では、関連する連続配列は、少なくとも10、15、20、25、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、125、150、175、200、225、250、275、300、325、350、375、400、425、450、475、500か又はそれ以上の残基数である。
【0128】
罹患している:疾患、障害、及び/又は状態(例えば、神経筋機能障害によって特徴付けられる筋ジストロフィー又は他の疾患)に「罹患している」個体は、疾患、障害、及び/又は状態の1つ以上の症状と診断され、かつ/又はそれらを呈している。
【0129】
罹患しやすい:疾患、障害、及び/又は状態(例えば、アルツハイマー病(AD)、筋ジストロフィー、又は神経変性若しくは神経筋機能障害によって特徴付けられる他の疾患)に「罹患しやすい」個体は、一般市民のメンバーよりも疾患、障害、及び/又は状態を発症するリスクが高い個体である。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/又は状態に罹患しやすい個体は、その疾患、障害、及び/又は状態と診断されていない場合がある。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/又は状態に罹患しやすい個体は、その疾患、障害、及び/又は状態の症状を呈する場合がある。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/又は状態に罹患しやすい個体は、その疾患、障害、及び/又は状態の症状を示さない場合がある。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/又は状態に罹患しやすい個体は、その疾患、障害、及び/又は状態を発症する。いくつかの実施形態では、疾患、障害、及び/又は状態に罹患しやすい個体は、その疾患、障害、及び/又は状態を発症しない。
【0130】
症状が低減される:本発明によれば、特定の疾患、障害、又は状態(例えば、アルツハイマー病(AD)、筋ジストロフィー、又は神経変性若しくは神経筋機能障害によって特徴付けられる他の疾患)の1つ以上の症状が、程度(例えば、強度、重症度など)及び/又は頻度で低減される場合、「症状が低減される」。明確にするために、特定の症状の発症の遅延は、その症状の頻度を低減させるための1つの形態とみなされる。
【0131】
標的遺伝子:本明細書で使用される場合、標的遺伝子は、例えば、スプライス活性の改変を介して(例えば、エクソンスキッピングを誘導することによって)、その発現が調節される遺伝子を指す。本明細書で使用される場合、「標的部分」又は「標的領域」という用語は、標的遺伝子のヌクレオチド配列の連続部分を指す。いくつかの実施形態では、標的部分又は標的領域は、標的遺伝子配列内の1つ以上のエクソンである。標的部分は、長さが約8~36ヌクレオチド、例えば、長さが約10~20又は約15~30ヌクレオチドであってもよい。標的部分の長さは、前述の範囲内の特定の値又は部分範囲を有してもよい。例えば、特定の実施形態では、標的部分は、長さが約15~29、15~28、15~27、15~26、15~25、15~24、15~23、15~22、15~21、15~20、15~19、15~18、15~17、18~30、18~29、18~28、18~27、18~26、18~25、18~24、18~23、18~22、18~21、18~20、19~30、19~29、19~28、19~27、19~26、19~25、19~24、19~23、19~22、19~21、19~20、20~30、20~29、20~28、20~27、20~26、20~25、20~24、20~23、20~22、20~21、21~30、21~29、21~28、21~27、21~26、21~25、21~24、21~23、又は21~22ヌクレオチドであってもよい。
【0132】
治療剤:本明細書中で使用される場合、「治療剤」という語句は、対象に投与された場合に治療効果を有し、かつ/又は所望の生物学的及び/若しくは薬理学的効果を誘発する任意の薬剤を指す。いくつかの実施形態では、治療剤は、疾患、障害、及び/又は状態の1つ以上の症状若しくは特徴(例えば、アルツハイマー病(AD)、筋ジストロフィー、又は神経変性若しくは神経筋機能障害によって特徴付けられる他の疾患の1つ以上の症状若しくは特徴)を軽減する、改善する、緩和する、抑制する、予防する、その開始を遅延する、その重症度を低減する、及び/又はその発症率を低減するために使用することができる物質である。
【0133】
治療有効量:本明細書で使用される場合、治療有効量という用語は、治療投与レジメンの一部として投与された場合に、所望の生物学的応答を誘発する物質(例えば、治療剤、組成物、及び/又は製剤)の量を意味する。いくつかの実施形態では、物質の治療有効量は、疾患、障害、及び/又は状態に罹患しているか、又は罹患しやすい対象に投与された場合、疾患、障害、及び/又は状態を治療、診断、予防、及び/又は発症を遅延させるのに十分な量である。当業者によって理解されるように、物質の有効量は、所望の生物学的エンドポイント、送達される物質、標的細胞又は組織などの要因に応じて変化し得る。所与の用途に対する有効量を決定するための方法が当技術分野で多数知られていることは理解されるであろう。例えば、投与量決定のための薬理学的方法は、治療状況で使用され得る。治療用途又は予防用途の観点から、対象に投与される組成物の量は、疾患の種類及び重症度、並びに全般的な健康、年齢、性別、体重、及び薬物に対する耐性などの個体の特性に依存する。また、疾患の程度、重症度、及び種類にも依存する。当業者であれば、これら及び他の因子に応じて適切な投与量を決定することができるであろう。例えば、疾患、障害、及び/又は状態を治療するための製剤中の化合物の有効量は、疾患、障害、及び/又は状態の1つ以上の症状又は特徴を軽減、改善、緩和、阻害、予防、発症を遅延、重症度を低減、及び/又は発生率を低減する量である。本明細書で使用される場合、「有効量」及び「治療有効量」という用語は、ベッカー型、先天性、遠位型デュシェンヌ型、エメリー・ドレヒュス型、顔面肩甲上腕型、肢帯型、筋強直性、眼球咽頭型筋ジストロフィーなどの筋ジストロフィーに加えて、アルツハイマー病(AD)、パーキンソン病、又はがん患者、高齢患者、神経筋機能障害の既往のない他の多くの患者における神経変性、筋消耗から生じる移動性、代謝、及び生活の質の低下を特徴とする別の疾患などの、疾患の徴候又は病状を予防又は改善するのに十分な量が含まれる。所与の用途に対する有効量を決定するための方法が当技術分野で多数知られていることは理解されるであろう。例えば、投与量決定のための薬理学的方法は、治療状況で使用され得る。治療用途又は予防用途の観点から、対象に投与される組成物の量は、疾患の種類及び重症度、並びに全般的な健康、年齢、性別、体重、及び薬物に対する耐性などの個体の特性に依存する。また、疾患の程度、重症度、及び種類にも依存する。当業者であれば、これら及び他の因子に応じて適切な投与量を決定することができるであろう。組成物はまた、1つ以上の追加の治療化合物と組み合わせて投与することができる。いくつかの実施形態では、治療有効量は、単回用量で投与されるが、いくつかの実施形態では、治療有効量を送達するために複数の単位用量が必要である。
【0134】
治療:本明細書で使用される場合、「治療」という用語は、治療を提供すること、すなわち、対象について任意のタイプの医学的又は外科的管理を提供することを指す。治療は、疾患、障害、若しくは状態を逆転、軽減、その進行を阻害、その可能性を予防若しくは低減するために、又は疾患、障害、若しくは状態の1つ以上の症状若しくは徴候を逆転、軽減、その進行を阻害若しくは防止、その可能性を予防若しくは低減するために提供され得る。有益又は望ましい臨床結果には、治療がない場合に予想されるものと比較して、1つ以上の症状の軽減、欠損の程度の減少、筋ジストロフィーの安定化(すなわち、悪化しない)状態、筋消耗の遅延又は緩徐化、及び寿命の延長が含まれるが、これらに限定されない。治療することは、アルツハイマー病(AD)、筋ジストロフィー、又は神経変性若しくは神経筋機能障害によって特徴付けられる他の疾患を示す1つ以上の症状又は徴候の発症後に、、例えば、状態を逆転、緩和、その重症度を低減する目的で、及び/又は状態の進行を阻害又は防止する目的で、及び/又は状態の1つ以上の症状若しくは徴候を逆転、緩和、その重症度を低減する目的で、及び/又は状態の1つ以上の症状若しくは徴候を阻害又はする目的で、対象に薬剤を投与することが含まれ得る。本開示の組成物は、アルツハイマー病、筋ジストロフィー、又は神経変性、神経筋機能障害によって特徴付けられる他の疾患を発症した対象、又は一般集団のメンバーと比較してそのような障害を発症するリスクが高い対象に投与することができる。本開示の組成物は、予防的に、すなわち、状態の任意の症状又は徴候の発生前に投与することができる。典型的には、この場合、対象は状態を発症するリスクがある。
【0135】
バリアント:分子、例えば、核酸(例えば、ASO)、タンパク質、又は小分子との関連で本明細書で使用される場合、「バリアント」という用語は、参照分子と顕著な構造同一性を示すが、例えば、参照物質と比較して、1つ以上の化学的部分の存在若しくは不在、又はそのレベルにおいて、参照分子とは構造的に異なる分子を指す。いくつかの実施形態では、バリアントは、その参照分子とは機能的にも異なるものである。一般的に、特定の分子が参照分子の「バリアント」であると適切にみなされるかどうかは、参照分子との構造同一性の程度に基づく。当業者によって認識されるように、任意の生物学的又は化学的参照分子は、特定の特徴的な構造要素を有する。定義上、バリアントは、1つ以上のこうした特徴的な構造要素を共有するが、少なくとも1つの態様では参照分子とは異なる、別個の分子である。数例を挙げると、ポリペプチドは、直線状若しくは三次元空間において互いに対して指定された位置を有し、かつ/又は特定の構造モチーフ及び/若しくは生物学的機能に寄与する複数のアミノ酸から構成される特徴的な配列要素を有してもよく、核酸は、直線状若しくは三次元空間において互いに対して指定された位置を有する複数のヌクレオチド残基から構成される特徴的な配列要素を有してもよい。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、アミノ酸又はヌクレオチド配列における1つ以上の差異、及び/又はポリペプチド又は核酸の共有結合構成要素である(例えば、ポリペプチド又は核酸骨格に結合している)化学的部分(例えば、炭水化物、脂質、リン酸基)における1つ以上の差異の結果として、参照ポリペプチド又は核酸とは異なってもよい。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照ポリペプチド又は核酸と少なくとも85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、又は99%の全体的な配列同一性を示す。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照ポリペプチド又は核酸と少なくとも1つの特徴的配列エレメントを共有しない。いくつかの実施形態では、参照ポリペプチド又は核酸は、1つ以上の生物学的活性を有する。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照ポリペプチド又は核酸の生物学的活性のうちの1つ以上を共有する。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照ポリペプチド又は核酸の生物学的活性のうちの1つ以上を欠いている。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照ポリペプチド又は核酸と比較して、1つ以上の生物学的活性レベルが低下している。いくつかの実施形態では、関心対象となるポリペプチド又は核酸は、特定の位置で少数の配列変化を別にすれば、参照アミノ酸又は核酸と同一のアミノ酸又はヌクレオチド配列を有する場合、参照ポリペプチド又は核酸の「バリアント」とみなされる。典型的には、参照と比較して、バリアント中の残基の約20%、約15%、約10%、約9%、約8%、約7%、約6%、約5%、約4%、約3%、又は約2%未満が置換、挿入、又は欠失されている。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照と比較して、約10、約9、約8、約7、約6、約5、約4、約3、約2、又は約1個の置換残基を含む。多くの場合、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照と比較して、非常に少数(例えば、約5、約4、約3、約2、又は約1個未満)の置換、挿入、又は欠失された機能的残基(すなわち、特定の生物学的活性に関与する残基)を含む。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照と比較して、約5、約4、約3、約2、又は約1個以下の付加又は欠失を含み、いくつかの実施形態では、付加又は欠失を含まない。いくつかの実施形態では、バリアントポリペプチド又は核酸は、参照と比較して、約25個、約20個、約19個、約18個、約17個、約16個、約15個、約14個、約13個、約10個、約9個、約8個、約7個、約6個未満の付加又は欠失、通常、約5個、約4個、約3個、又は約2個未満の付加又は欠失を含む。いくつかの実施形態では、参照ポリペプチド又は核酸は、自然界で見出されるものである。いくつかの実施形態では、参照ポリペプチド又は核酸は、ヒトポリペプチド又は核酸である。
【0136】
ベクター:本明細書において使用される場合、「ベクター」という用語は、自身に連結されている他の核酸を輸送することができる核酸分子を指す。ベクターの1つのタイプは、「プラスミド」であり、これは、追加のDNAセグメントがライゲートされ得る環状二本鎖DNAループを指す。別のタイプのベクターはウイルスベクターであり、ここで追加のDNAセグメントは、ウイルスゲノム内にライゲートされ得る。特定のベクターは、自身が導入された宿主細胞内で自律複製することができる(例えば、細菌の複製起点を有する細菌ベクター及びエピソーム哺乳動物ベクター)。他のベクター(例えば、非エピソーム哺乳動物ベクター)は、宿主細胞に導入されると、宿主細胞のゲノム内に組み込まれることができ、それによって、宿主ゲノムとともに複製される。更に、特定のベクターは、自身が作動可能に連結されている遺伝子の発現を導くことができる。このようなベクターは、本明細書において、「発現ベクター」と呼称される。組換えDNA、オリゴヌクレオチド合成、及び組織培養並びに形質転換(例えばエレクトロポレーション法、リポフェクション法)に関し、標準的な技術が使用され得る。酵素反応及び精製技術は、製造業者の仕様に従って、又は当該技術分野で一般的に実施されるように、又は本明細書に記載されるように実行できる。前述の技術及び手順は、当該技術分野で公知の従来的な方法に従って、及び本明細書全体を通して引用及び検討される様々な一般的及びより具体的な参照文献中に記載されているように、一般的に実施することができる。例えば、Sambrook et al.,Molecular Cloning:A Laboratory Manual(2d ed.,Cold Spring Harbor Laboratory Press,Cold Spring Harbor,N.Y.(1989))を参照されたい。本文献は、任意の目的に対し、参照により本明細書に組み込まれる。
(発明を実施するための形態)
【0137】
神経発生
神経発生は、成人哺乳動物脳の別個の領域で発生する。神経幹細胞(NSC)は、新しいニューロンの内因性源であり、ヒトを含む実質的に全ての哺乳動物において生涯にわたって活性である(Eriksson et al.,1998、Ernst et al.,2014、Moreno-Jimenez et al.,2019、Spalding et al.,2013)。齧歯類モデルにおける広範な研究は、神経発生が学習及び記憶、感覚機能、並びに気分調節をサポートすることを示す(Enwere et al.,2004、Gage,2019、Imayoshi et al.,2008、Zhang et al.,2008b)。NSCは、2つの神経原性ニッチ、すなわち海馬の歯状回の顆粒細胞下帯(SGZ)、及び外側脳室の内側を覆う脳室下帯(SVZ)内に存在する。SVZ内のNSCは、既存の回路を支持する星状細胞及びオリゴデンドロサイト、並びに嗅覚弁別に重要な嗅球のニューロンを生成する。歯状回内のNSCは、学習及び記憶に重要な顆粒ニューロンを生じさせる。ヒト脳内のNSCの大部分は海馬内に位置する。ほとんどの海馬NSCは、静止と呼ばれる休止状態に存在する。神経発生が起こるためには、静止NSCは、外因性又は内因性刺激(cue)に応答して活性化される必要がある。新生ニューロンは、海馬内の局所回路に機能的に統合され、認知機能に寄与する。静止NSCの活性化する能力は、健康な及び病的な老化の間に低下し、この低下が認知の低下に先行する(Enwere et al.2004、Giachino et al.2014、Capilla-Gonzalez et al.2014)。
【0138】
最近の研究は、内因性又は外因性NSCが、認知機能低下又は脳損傷に罹患している数百万人の個体にとって新しいニューロンの貴重な供給源となり得ることを示す。運動、再給餌、又は若い血液による内因性NSCの活性化は、マウスにおける加齢に関連する認知障害を改善する(Brandhorst et al.,2015、van Praag et al.,2005、Villeda et al.,2011,2014)。神経原性ニッチを劣化させる負のシグナルの蓄積は、老化及びADにおける新生ニューロンの低減に寄与し得る。しかしながら、阻害シグナルを克服する能力を有する特定の治療標的の欠如により、NSCの神経原性潜在力(neurogenic potential)を利用することは困難であった。本開示は、BMPシグナル伝達が、AD及び神経変性によって特徴付けられる他の疾患との関連で標的化とする有望な経路に対応し得ることを、最近の機構研究が示唆していることを理解している。BMPは、NSCの活性化を負に調節し(Mira et al.,2010)、AD及びAPPトランスジェニックマウスで上方制御される(Crews et al.,2010)。本開示は、神経原性ニッチにおいてBMPシグナル伝達を特異的に調節する技術を提供する。
【0139】
成体海馬神経発生
成体海馬神経発生(AHN)は、正常な学習及び記憶に重要である。AHNは、健康な高齢ヒトには豊富であるが、アルツハイマー病(AD)の初期段階から低減する。AHNは、ヒトでは生涯にわたって発生するが、ADにおいて劇的に低減する(Moreno-Jimenez et al.,2019、Steiner et al.,2019)。動物モデルにおける研究は、AD病理に対して認知の改善におけるAHNの役割を強調している。したがって、AHNの回復は、AD療法の魅力的な標的となる可能性がある。成体海馬神経発生を促進する介入は、認知機能を強化し、神経変性と闘うことができる可能性がある。
【0140】
AHNは、学習及び記憶に重要である。新生歯状回顆粒細胞は、過興奮性であり、堅牢なシナプス可塑性を示す。したがって、静止状態の調節不全及び/又は成熟回路への統合の失敗は、神経発生における加齢に伴う低下及び老化及び認知症における認知能力の低下に寄与すると考えられる。
【0141】
ヒトにおけるAHN。AHNは、齧歯類及び他の種において数十年にわたって確立されてきたが、ヒトにおけるこのプロセスの存在は、ごく最近まで議論の余地があった。BrdU組み込み(Eriksson et al.,1998)、14C年代測定(Ernst et al.,2014、Spalding et al.,2013)、及び未成熟ニューロンのマーカー(Boldrini et al.,2018、Moreno-Jimenez et al.,2019、Tobin et al.,2019)を使用した報告は、ヒトAHNを支持する複数の実験室からの独立したサポートラインを提供している。放射性炭素による出生年代測定データの数学的モデリングにより、ヒトでは海馬ニューロンの35%が成人期に新生ニューロンに置き換わり、その割合は年間1.75%と推定された(Spalding et al.,2013)。一方で、未成熟ニューロンのマーカーを使用した別の最近の報告は、成人ヒトにおいて有意なレベルのAHNを検出できなかった(Sorrells et al.,2018)。これらの報告の詳細な比較では、いくつかの方法論的及びサンプルの違いが明らかになり、Sorrells et al.の論文において成体神経発生を検出できなかった理由を説明できそうである(Kempermann et al.,2018、Lucassen et al.,2019)。
【0142】
AHN及びアルツハイマー病。アルツハイマー病は壊滅的な障害である。これは進行性で致命的であり、社会的及び経済的に多大なコストがかかる。580万人のアメリカ人がADとともに生きている。2050年までに、この数字は1400万人に増加すると予測されている。2019年、AD及びその他の認知症により、米国で2,900億ドルの費用を負担している。2050年までに、これらのコストは1.1億ドルに上昇する可能性がある。効果的な治療法はない。最近、いくつかの注目を集めた治験が行われている。これらのほぼ全ての証跡は、「アミロイド仮説」に基づいている。ADに対する革新的で効果的な治療法に対する非常に多くの満たされていないニーズがある。アルツハイマー病は、記憶をコード化するために必要な脳領域である海馬を破壊する。海馬は、脳内の成体神経発生の2つの部位のうちの1つである。多数の動物研究により、これらの成体新生ニューロンが学習及び記憶に必要であることが示されている。最近の重要な研究は、成人のヒト脳における堅牢な神経発生の説得力のある証拠を提示した。重要なことに、AD脳における成体神経発生のレベルは、同年齢対照群と比較して大幅に減少している。(E.P.Moreno-Jimenez et al.Nature Med.https://doi.org/10.I038/s41591-019-0375-9;2019を参照されたい。関連論説のNature 567:433;28 March 2019も参照されたい)。したがって、成体神経発生の促進は、ADの治療において非常に魅力的な標的として浮上している。
【0143】
海馬は、ADにおいて最も早くかつ最も影響を受ける脳領域の1つであり、その萎縮は、疾患進行の特徴である(Allison et al.,2019)。更に、齧歯類及びヒトの両方における研究は、アルツハイマー病の状況で海馬依存的学習が損なわれることを実証している(Crews et al.,2010)。特に、AD患者におけるAHNレベルは、同年齢の対照で観察されたもののわずか30%である(Moreno-Jimenez et al.,2019)。重要なことに、遺伝的に多様なADマウスモデルを使用した最近のマウス研究では、海馬ニューロン(NeuN+細胞)の総数が認知と相関することが示された(Neuner Neuron 2019)。最後に、最近の研究では、ADマウスにおける病変の運動媒介性救済には、AHNを必要とし、AHN除去のみでは、これらのマウスにおける認知欠陥を悪化させることが分かった(Choi et al.,2018)。したがって、内因性神経発生の強化を通して海馬ニューロンの変性を補償する戦略は、アルツハイマー病を治療するための新たな経路を開く可能性がある。
【0144】
AHN障害に関連する他の疾患としては、例えば、前頭側頭型認知症(Terreros-Roncal et al.,2019)、脳卒中(Lindvall et al.,2015)などの進行性記憶喪失に関連する疾患及び障害が挙げられる。AHN障害はまた、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連及び嗜癖障害(Yun et al.,2016)などの精神障害、並びに側頭葉てんかん(Cook et al.,1992)、海馬硬化症(Tai et al.2018)、ニーマンピック病C型(Hong et al.,2015)、及び糖尿病媒介性海馬ニューロン損失(Ho et al,2013、Gold et al.,2007)などの精神障害と関連している。
【0145】
脳室下帯神経発生
海馬(すなわち、海馬の歯状回の顆粒細胞下帯(SGZ))に加えて、NSCは、側脳室の内側を覆う脳室下帯(SVZ)に存在する。SVZ内のNSCは、既存の回路を支持する星状細胞及びオリゴデンドロサイト、並びに嗅覚弁別に重要な嗅球のニューロンを生成する。最近の証拠は、SVZ NSCが、虚血性脳卒中又は神経変性疾患に応答して線条体に高分化したニューロンを生じる可能性があることを示唆している(Arvidsson et al.2002、Parent et al.2002、Thored et al.2006、Ernst et al.2014)。
【0146】
本開示は、内因性神経発生の強化を通してSVZ内のニューロンの変性を補償するための戦略が、パーキンソン病(これは、SVZにおけるAHN及び線条体神経発生の両方の増加から利益を得る可能性がある。Pitcher et al.2012、Sterling et al.2013)及びハンチントン病(Sassone et al.,2018)などの線条体神経発生に特異的に関連する疾患を治療するための新しい経路を開く可能性を有することを認識している。嗜癖を含む他の疾患(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)も、線条体体積の低下と関連しており(Barros-Loscertales et al.2011、Das et al.,2012)、SVZにおける内因性神経発生の強化を介して治療される可能性がある。
【0147】
MuSK及び神経発生
MuSKは、3つのIgドメイン及び1つのCRD/Fzドメイン、並びに細胞内チロシンドメインで細胞外に構成される受容体チロシンキナーゼである(TK、
図1)。最もよく理解されているMuSKの機能は、神経筋接合部(NMJ)で、Ig1ドメインに結合するアグリン-LRP4がMuSK TK活性及びシナプス分化を誘発するものである(Kim et al.,2008、Zhang et al.,2008a)。
【0148】
MuSK-BMP経路。脳は、生涯にわたってニューロン及びグリア細胞を生成する神経幹細胞(NSC)を保有する(Moreno-Jimenez et al.,2019、Steiner et al.,2019)。BMPは、少なくとも2つの重要なNSC決定点:1)増殖幹細胞が細胞周期から出て、新鮮な幹細胞を供給し得る貯蔵プールを補充するために戻る静止、及び2)成熟子孫への分化、を調節する(Mira et al.,2010)。本開示は、NSCにおけるBMP経路を操作することが、成人脳における神経発生を調節するための魅力的な標的であることを企図する。
【0149】
MuSKはまた、BMP共受容体でもあり、BMP並びにその受容体ALK3及び6に結合するBMPシグナル伝達を上方制御し、筋原細胞における転写応答の構成を形成することが最近発見された(Yilmaz et al.,2016)。このBMPシグナル伝達経路は、MuSK TK活性を調節することも必要とすることもなく、アグリン-LRP4によって活性化することもない。重要なことに、MuSK Ig3ドメインは、高親和性BMP結合に必要であるが、アグリン-LRP4 TK活性化には必要ない。更に、Ig3ドメインは、脳を含め、内因的に選択的スプライシングされる(Garcia-Osta et al.,2006、Hesser et al.,1999)。BMPシグナル伝達はNSC静止を誘導し、新生ニューロンの統合を阻害することができるため、MuSK-BMPシグナル伝達を低減することによってBMP駆動を抑制することが神経発生を増加させる可能性があることを見出した(
図1)。
【0150】
Yilmaz et al.2016は、MuSKの「Ig3」ドメインが、BMPの高親和性結合に必要であることを開示している。内因的に発現されるMuSKの主要種は全長である。このIg3ドメインは、内因的に選択的スプライシングされ、「△g3MuSK」と称されるアイソフォームを生成することができる。このスプライシングは、MuSKプレmRNAからのエクソン6及び7の協調的な除去を伴う。
【0151】
ヒト及びマウスMuSK Ig3ドメイン(すなわち、MuSK Ig3ドメインポリペプチド)の例示的なアミノ酸配列は、以下に記載されるとおりである。
MuSK ヒト_Ig3_ドメイン:
ARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATIS(配列番号116)
MuSK マウス Ig3 ドメイン
ARILRAPESHNVTFGSFVTLRCTAIGIPVPTISWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATVS(配列番号117)
【0152】
特に本開示は、ADにおいてAHNを増加させるための戦略としてMuSK選択的スプライシングを調節するMuSK標的化オリゴヌクレオチドなどの組成物を提供する。
【0153】
MuSK並びに筋再生及び/又は成長
衛星細胞は、筋核の約5%を占め、成熟した多核筋線維に沿って分布しており、通常は静止状態にある。筋肉が損傷すると、衛星細胞は通常、静止状態に戻るか、又は分化するかのいずれかの前に増殖する。分化すると、衛星細胞は、筋管に融合するコミットした筋芽細胞となり、最終的に筋形成と呼ばれるプロセスで成熟筋線維を形成する。骨形成タンパク質(BMP)シグナル伝達は、転写生産を調節することによって、インビボ及びインビトロの両方で衛星細胞の動態及び筋再生を調節する。BMPシグナル伝達は、静止衛星細胞では検出不能であり、増殖している衛星細胞では上方制御され、分化中には下方制御される。しかしながら、衛星細胞の増殖と分化との間のバランスを調節するメディエーターは不明である。
【0154】
筋特異的キナーゼ(MuSK)は、筋関連受容体チロシンキナーゼとしても知られ、神経筋接合部(NMJ)の形成及び維持においてその重要な役割について最初に認識された膜貫通タンパク質である。MuSKは、3つの細胞外免疫グロブリン(Ig)様ドメインと、システインリッチフリズルド(frizzled)(CRD/Fz)ドメインと、細胞内チロシンキナーゼ(TK)ドメインとを有する。Ig1ドメイン、TKドメイン、及び潜在的にCRD/Fzドメインは、NMJ形成及び維持に必要とされる。Ig1ドメイン及びTKドメインは、シナプス分化を導くアグリン-LRP4シグナル伝達に不可欠である。この理由から、全体的な欠失MuSKマウスは、新生児致死性である。インビボで存在するMuSKの2つのアイソフォームは、全長(FL)MuSK、及びIg3ドメインを欠く天然由来のスプライスバリアント(ΔIg3-MuSK)である。FL MuSK mRNAレベルは、ΔIg3-MuSKのmRNAよりも10X高いが、2つは協調的に発現される。
【0155】
特に、本開示は、筋再生を増加させるための戦略としてMuSK選択的スプライシングを調節するMuSK標的化オリゴヌクレオチドなどの組成物を提供する。
【0156】
MuSKは、アグリンと呼ばれる神経由来プロテオグリカンによって活性化される。アグリンは、胚形成中の神経筋接合部の発達におけるその役割で特徴付けられている。アグリンは、シナプス形成中のアセチルコリン受容体の凝集への関与に基づいて命名されている。ヒトでは、このタンパク質はAGRN遺伝子によってコードされる。アグリンタンパク質は、プロテアーゼ阻害剤と相同性のある9つのドメインを有する。
【0157】
MuSKは筋で発現され、筋再生中に上方制御される。データは、MuSKが筋形成におけるBMPシグナル伝達に関与することを示唆している。MuSKは、BMP2、BMP4、及びBMP7のほか、I型BMP受容体ALK3及びALK6に結合する、BMP共受容体として作用し得る。例えば、Yilmaz et al.,Sci.Signal.9:ra87,doi:10.1126/scisignal.aaf0890,2016を参照されたい。MuSKのIg3ドメインは、BMPへの高親和性結合に必要である。MuSKは、SMAD1/5/8のBMP4依存性リン酸化によって測定されるように、BMPシグナル伝達を上方制御する。重要なことに、MuSK-BMPシグナル伝達は、筋芽細胞及び筋管におけるBMP誘導性トランスクリプトームの大きさ及び構成を形成し、この役割は、任意のMuSKチロシンキナーゼ活性とは無関係である。MuSKは、BMPシグナル伝達を増強し、不死化筋原性細胞において、筋原性因子5(Myf5)などの筋原性因子を調節するBMP共受容体である。
【0158】
活性化された衛星細胞は、MuSKタンパク質を発現し、MuSK-BMPシグナル伝達の阻害は、インビボで再生筋肉における衛星細胞増殖を変化させる。更に、これまでの研究は、衛星細胞及び筋再生におけるMuSK-BMP経路の役割、及びMuSK-BMP経路を標的とすることが筋成長を強化することを示唆している(例えば、参照により本明細書に組み込まれるPCT公開第2021/076883号を参照されたい)。
【0159】
MuSK標的化オリゴヌクレオチド
本明細書に記載されるように、MuSK-BMP経路を調節するための戦略は、MuSK標的化オリゴヌクレオチド(例えば、MuSK Ig3標的化オリゴヌクレオチド)を含む。具体的には、本開示は、とりわけ、MuSKのエクソン6及び/又はエクソン7にまたがる領域を標的にして、エクソン6及び/又はエクソン7のエクソンスキッピングを誘導するオリゴヌクレオチド及びその組成物を提供する。このような選択的スプライシング活性は、ΔIg3-MuSKの発現の増加をもたらす。
【0160】
本開示はまた、エクソン6及び/又はエクソン7のエクソンスキッピングを誘導し、それによってΔIg3-MuSK転写物を生成するオリゴヌクレオチドの標的配列として特に有用である、エクソン6及び/又はエクソン7又はその近傍のMuSK転写物内の領域を記載する。
【0161】
いくつかの実施形態では、本開示はまた、MuSKの選択的スプライシング活性を誘導し、ΔIg3-MuSK転写物を生成する特定のオリゴヌクレオチド及びその組み合わせを提供する。
【0162】
更に本開示は、MuSKエクソン6及び/又は7のエクソンスキッピングを誘導し、対象において神経発生及び/又は筋再生を増加させるために治療有効量で対象に投与することができる、1つ以上のMuSK標的化オリゴヌクレオチドを含む組成物を提供する。
【0163】
本開示は、標的遺伝子(例えば、MuSK)によって産生されるメッセンジャーRNA(mRNA)に結合し、その発現を阻害するオリゴヌクレオチドである、又はこのオリゴヌクレオチドを含む、又はこのオリゴヌクレオチドをコードする、1つ以上のヌクレオチド配列に関連する組成物及び方法を含む。オリゴヌクレオチドは、一本鎖(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド)又は二本鎖核酸であってもよい。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、マイクロRNA(miRNA)又は低分子干渉RNA(siRNA)などの二本鎖RNA二重鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、siRNA若しくはmiRNA、又はsiRNA若しくはmiRNAをコードするヌクレオチド配列を含有するベクターである。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、アンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)、又はASOをコードするヌクレオチド配列を含むベクターである。
【0164】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、全長MuSK配列の発現を阻害することができ、当該MuSK配列は、3つの細胞外免疫グロブリン(Ig)様ドメイン(Ig1、Ig2、及びIg3)、システインリッチフリズルドメイン(CRD/Fz)、並びに細胞内チロシンキナーゼ(TK)ドメインを含む。
【0165】
本明細書に記載されるように、オリゴヌクレオチドは、ヒトMuSK又は1つ以上の非ヒト種、例えば、非ヒト霊長類MuSK、例えば、カニクイザル(Macaca fascicularis)MuSK(遺伝子ID 102127677)、又は例えば、ミドリザル(chlorocebus sabaeus)(遺伝子ID:103219025)、又はマウスMuSK(遺伝子ID:18198)のMuSK配列を標的とし得る。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、ヒト及び/又はマウスのMuSK転写物において同一の標的部分に相補的であるアンチセンス鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、マウス又はヒトMuSK転写物の配列とは、1、2、又は3ヌクレオチドが異なるヒトMuSK転写物の標的部分に相補的である配列を含む。ヒトMuSKのスプライシングを変化させるオリゴヌクレオチドはまた、特にMuSK転写物の保存領域が標的とされる場合、非霊長類MuSK、例えばラット又はマウスMuSKのスプライシングも変化させ得る(すなわち、エクソンスキッピングを誘導する)ことが理解されよう。
【0166】
ヒトMuSKのアミノ酸配列及びヌクレオチド配列は、当該技術分野で公知であり、公的に入手可能なデータベースに見出すことができ、例えば、国立バイオテクノロジー情報センター(NCBI)参照配列(RefSeq)データベース、ゲノムヌクレオチド配列が、RefSeq受託番号NG_016016.2(配列番号77)に記載され及びmRNA/タンパク質配列の形態は、NM_005592.4/NP_005583.1(筋肉、骨格受容体チロシン-タンパク質キナーゼアイソフォーム1)、NM_001166280.2/NP_001159752.1(筋肉、骨格受容体チロシン-タンパク質キナーゼアイソフォーム2)、NM_001166281.2/NP_001159753.1(筋肉、骨格受容体チロシン-タンパク質キナーゼアイソフォーム3)及びNM_001369398.1/NP_001356327.1(筋肉、骨格受容体チロシン-タンパク質キナーゼアイソフォーム4)に記載される。参照により本明細書に組み込まれる、www.ncbi.nlm.nih.gov/gene?Db=gene& Cmd=Details Search&Term=4593を参照されたい。
【0167】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、MuSK転写物、例えば、MuSK mRNAの標的部分に相補的である(例えば、配列番号77の標的部分、例えば、Bld25/hu7-10(配列番号63)、Bld26/hu73(配列番号64)などと、少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一のヌクレオチド配列に相補的である)核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、配列番号77の83776~83800位及び/又は83854~83878位に対応する領域、又はゲノム配列MuSKの異なるバージョンの対応する領域を含む。標的部分は、長さ15~30ヌクレオチド、例えば、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30ヌクレオチドの長さであってもよいが、より短い標的部分及びより長い標的部分も企図される。
【0168】
いくつかの実施形態では、MuSK転写物、例えば、MuSK mRNAの標的部分は、ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC (領域1、配列番号126)の配列、又はその中の領域若しくはその一部分を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも10個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも15個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも18個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも19個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも20個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも21個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも22個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも23個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも24個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも25個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも30個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも35個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の少なくとも15個の連続する塩基及び30個以下の連続する塩基と同一の配列を含む。
【0169】
いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の10個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の11個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の12個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の13個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の14個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の15個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の16個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の17個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の18個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基と同一の配列を含む。
【0170】
いくつかの実施形態では、MuSK転写物、例えば、MuSK mRNAの標的部分は、GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCCCTTCACATTTG(領域2、配列番号211)の配列、又はその中の領域若しくはその一部分を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも10個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも15個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも18個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも19個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも20個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも21個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも22個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも23個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも24個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも25個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも30個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の少なくとも35個の連続する塩基と同一の配列を含む。
【0171】
いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の10個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の11個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の12個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の13個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の14個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の15個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の16個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の17個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の18個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の19個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の20個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の21個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の22個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の23個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の24個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の25個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の26個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の27個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の28個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の29個の連続する塩基と同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、標的部分は、領域2、配列番号211の30個の連続する塩基と同一の配列を含む。
【0172】
いくつかの実施形態では、標的部分は、以下の表1に列挙される配列のいずれか1つと少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一である配列を含む。
【表1-2-1】
【表1-2-2】
【表1-2-3】
【0173】
本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドの投与は、対象又は生体試料(例えば、血液、血清、若しくは血漿試料、又は肝細胞を含む試料)中の全長MuSK転写物又は全長MuSKタンパク質のレベルを、組成物の投与前のレベルと比較して、低減することができる。いくつかの実施形態では、全長MuSK転写物又は全長MuSKタンパク質のレベルは、投与前のレベルと比較して、少なくとも10%、少なくとも15%、少なくとも20%、少なくとも25%、少なくとも30%、少なくとも35%、少なくとも40%、少なくとも45%、少なくとも50%、少なくとも55%、少なくとも60%、少なくとも65%、少なくとも70%、少なくとも75%、少なくとも80%、少なくとも85%、又は少なくとも90%低減する。
【0174】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、MuSK転写物、例えば、MuSK mRNAの標的部分に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、MuSK転写物、例えば、MuSK mRNAの標的部分と少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一のヌクレオチド配列に相補的な核酸鎖を含む。
【0175】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)の一部分であって、領域1、配列番号126の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含むものと少なくとも90%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも95%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも10個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも15個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも18個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも19個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも20個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも21個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも22個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも23個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも24個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも25個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも26個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも27個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも28個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも29個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも30個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。
【0176】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)の一部分であって、領域1、配列番号126の10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含むものと少なくとも90%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも95%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の10個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の18個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基を含む、配列番号126の一部分と少なくとも90%同一の配列を含む。
【0177】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(領域1、配列番号126)の配列に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126と少なくとも10%、15%、20%、25%、30%、35%、40%、45%、又は50%同一である配列に相補的である核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも10個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも15個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも18個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも19個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも20個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも21個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも22個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも23個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも24個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも25個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも26個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも27個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも28個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも29個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の少なくとも35個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。
【0178】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の10個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の11個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の12個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の13個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の14個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の15個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の16個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の17個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の18個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の19個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の20個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の21個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の22個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の23個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の24個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の25個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の26個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の27個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の28個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の29個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域1、配列番号126の30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。
【0179】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、部分配列GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCCCTTCACATTTG(領域2、配列番号211)であって、領域2、配列番号211の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む部分配列と少なくとも90%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、配列番号211の一部分と少なくとも95%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、配列番号211の一部分と少なくとも90%同一である配列を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の10、15、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、又は30個の連続する塩基を含む、配列番号211の一部分と少なくとも95%同一である配列を含む。
【0180】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、配列GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCCCTTCACATTTG(領域2、配列番号211)の一部分に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも10個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも15個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも18個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも19個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも20個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも21個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも22個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも23個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも24個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも25個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の少なくとも35個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。
【0181】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の10個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の11個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の12個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の13個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の14個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の15個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の16個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の17個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の18個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の19個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の20個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の21個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の22個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の23個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の24個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の25個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の26個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の27個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の28個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の29個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、領域2、配列番号211の30個の連続する塩基に相補的な核酸鎖を含む。
【0182】
いくつかの実施形態では、本開示のMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、以下の表2の配列番号1~38、127~142、159~167、177~193のうちのいずれか1つと少なくとも90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%、又は100%同一であるヌクレオチド配列を含むアンチセンスオリゴヌクレオチドである。
【表2-2-1】
【表2-2-2】
【表2-2-3】
【0183】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、例えば、1つ以上の残基、又は残基のタイプを、代替的な残基又は残基タイプ、例えば、類似体又は他の対応する残基タイプ、と置換することによって、表2に明示的に記載される配列とは異なる配列を有する。例えば、いくつかの実施形態では、表2に提示される配列の1つ以上の「T」残基(又は全ての「T」残基)は、「U」残基又はその類似体である。
【0184】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的とのミスマッチを含む。塩基対は、解離又は融解を促進する傾向に基づいてランク付けされ得る(例えば、特定の対の会合又は解離の自由エネルギーに基づいて、最も単純なアプローチは、個々の対ベースで対を調べることであるが、次の隣接又は類似の分析も使用され得る)。解離を促進するという点では:A:UはG:Cよりも好ましく、G:UはG:Cよりも好ましく、I:CはG:Cよりも好ましい(I=イノシン)。
【0185】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、標的配列に対して相補的ではない3’末端及び/又は5’末端に1個以上(例えば、2、3、4又は5個)のヌクレオチドを含むことができる。
【0186】
MuSK標的化オリゴヌクレオチドの化学構造
合成オリゴヌクレオチドは、多種多様な用途において有用な分子ツールを提供する。例えば、オリゴヌクレオチドは、治療、診断、研究、及び新しいナノマテリアル用途に有用である。天然核酸(例えば、非修飾DNA又はRNA)の使用は、例えば、エンドヌクレアーゼ及びエキソヌクレアーゼに対するそれらの感受性によって制限される。そのため、これらの欠点を回避するために、様々な合成対応物が開発されてきた。これらには、化学修飾、例えば、塩基修飾、糖修飾、骨格修飾などを含有する合成オリゴヌクレオチドが含まれ、これらはとりわけ、これらの分子を分解の影響を受けにくくし、オリゴヌクレオチドの他の特性を改善する。
【0187】
とりわけ、本開示は、塩基配列、化学修飾(例えば、糖、塩基、及び/又はヌクレオチド間結合の修飾、並びにそれらのパターン)、及び/又は立体化学(例えば、主鎖キラル中心(キラルヌクレオチド間結合)の立体化学、及び/又はそれらのパターン)などのオリゴヌクレオチドの構造要素が、例えば安定性、スプライシング変更能力などの特性に著しい影響を与え得るという認識を包含する。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド特性は、化学修飾(塩基、糖、及び/又はヌクレオチド間結合の修飾)及び/又は立体化学(主鎖キラル中心のパターン)を最適化することによって調節することができる。
【0188】
いくつかの実施形態では、本開示は、制御された構造要素、例えば、制御された化学修飾を有するオリゴヌクレオチドを含むオリゴヌクレオチド組成物が、本明細書に記載される特性を含むがこれらに限定されない、予想外の特性を提供することを実証する。いくつかの実施形態では、化学修飾(例えば、塩基修飾、糖修飾、ヌクレオチド間結合修飾など)を有するオリゴヌクレオチドを含む提供される組成物は、スプライシング変更能力の改善、又はタンパク質結合プロファイルの改善、及び/又は送達の改善などの改善された特性を有する。特に、いくつかの実施形態では、本開示は、転写物(例えば、MuSK転写物)のスプライシングを変更するための組成物及び方法を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、転写物のスプライシングを改善するための組成物及び方法を提供する。いくつかの実施形態では、提供される組成物及び方法によって変化された転写物スプライシングは、所望される、及び/若しくは改善された生物学的機能を有する産物の産生、並びに/又は例えば、例えば、望ましくない生物学的機能が抑制若しくは除去され得るようにスプライシング産物を改変することによる望ましくない産物のノックダウンを含む。
【0189】
いくつかの実施形態では、スプライシング産物は、mRNAである。いくつかの実施形態では、変化は、1つ以上のエクソンをスキップすることを含む。いくつかの実施形態では、転写物のスプライシングは、エクソンスキッピングが、エクソンスキッピングの不在と比較して、有益な活性が改善されたmRNA及びタンパク質のレベルを増加させるという点で改善される。
【0190】
いくつかの実施形態では、転写物のスプライシングは、エクソンスキッピングが、エクソンスキッピングの不在と比較して、望ましくない活性を有するmRNA及びタンパク質のレベルを下げるという点で改善される。いくつかの実施形態では、標的は、未成熟停止コドン及び/又はフレームシフト変異を引き起こす1つ以上のエクソンをスキップすることによる、エクソンスキッピングを介してノックダウンされる。
【0191】
いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは、1つ以上の天然核酸塩基、及び/又は天然核酸塩基に由来する1つ以上の修飾核酸塩基を含む。例としては、アシル保護基によって保護されるそれぞれのアミノ基を有するウラシル、チミン、アデニン、シトシン、及びグアニン;2-フルオロウラシル、2-フルオロシトシン、5-ブロモウラシル、5-ヨードウラシル、2,6-ジアミノプリン、アザシトシン;シュードイソシトシン及びシュードウラシルなどのピリミジン類似体;並びに8-置換プリン、キサンチン、又はヒポキサンチンなどの他の修飾核酸塩基が挙げられるが、これらに限定されない(最後の2つは、天然分解産物である)。
【0192】
修飾核酸塩基はまた、フェニル環などの1つ以上のアリール環が付加されている、拡張サイズの核酸塩基も含む。
【0193】
いくつかの実施形態では、修飾核酸塩基は、任意に置換された以下の構造のうちのいずれか1つのものである:
【化2】
【0194】
いくつかの実施形態では、修飾核酸塩基は、非置換である。いくつかの実施形態では、修飾核酸塩基は、置換される。いくつかの実施形態では、修飾核酸塩基は、例えば、蛍光部分、ビオチン若しくはアビジン部分、又は他のタンパク質若しくはペプチドに接続されたヘテロ原子、アルキル基、又は連結部分を含有するように置換される。いくつかの実施形態では、修飾核酸塩基は、最も古典的な意味で核酸塩基ではないが、核酸塩基と同様に機能する、「ユニバーサル塩基」である。このようなユニバーサル塩基の代表的な一例は、3-ニトロピロールである。
【0195】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、修飾核酸塩基及び/又は修飾糖に共有結合された核酸塩基を組み込んだヌクレオシドを含む。修飾核酸塩基を組み込んだヌクレオシドの一部の例には、4-アセチルシチジン、5-(カルボキシヒドロキシルメチル)ウリジン、2’-O-メチルシチジン、5-カルボキシメチルアミノメチル-2-チオウリジン、5-カルボキシメチルアミノメチルウリジン、ジヒドロウリジン、2’-O-メチルプソイドウリジン、ベータ、D-ガラクトシルキューオシン(beta,D-galactosylqueosine)、2’-O-メチルグアノシン、N6-イソペンテニルアデノシン、1-メチルアデノシン、1-メチルプソイドウリジン、1-メチルグアノシン、l-メチルイノシン、2,2-ジメチルグアノシン、2-メチルアデノシン、2-メチルグアノシン、N7-メチルグアノシン、3-メチル-シチジン、5-メチルシチジン、5-ヒドロキシメチルシチジン、5-メチルシトシン、5-ホルミルシトシン、5-カルボキシルシトシン、N6-メチルアデノシン、7-メチルグアノシン、5-メチルアミノエチルウリジン、5-メトキシアミノメチル-2-チオウリジン、ベータ、D-マンノシルキューオシン(beta,D-mannosylqueosine)、5-メトキシカルボニルメチルウリジン、5-メトキシウリジン、2-メチルチオ-N6-イソペンテニルアデノシン、N-((9-ベータ、D-リボフラノシル-2-メチルチオプリン-6-イル)カルバモイル)トレオニン、N-((9-ベータ、D-リボフラノシルプリン-6-イル)-N-メチルカルバモイル)トレオニン、ウリジン-5-オキシ酢酸メチルエステル、ウリジン-5-オキシ酢酸(v)、プソイドウリジン、キューオシン(queosine)、2-チオシチジン、5-メチル-2-チオウリジン、2-チオウリジン、4-チオウリジン、5-メチルウリジン、2’-O-メチル-5-メチルウリジン、及び2’-O-メチルウリジンが挙げられる。
【0196】
いくつかの実施形態では、ヌクレオシドは、6’位に(R)又は(S)キラリティのいずれかを有する6’-修飾二環式ヌクレオシド類似体を含み、米国特許第7,399,845号に記載される類似体を含む。他の実施形態では、ヌクレオシドは、5’位に(R)又は(S)キラリティのいずれかを有する5’-修飾二環式ヌクレオシド類似体を含み、米国公開 第2007/0287831号に記載される類似体を含む。いくつかの実施形態では、核酸塩基又は修飾核酸塩基は、5-ブロモウラシル、5-ヨードウラシル、又は2,6-ジアミノプリンである。いくつかの実施形態では、核酸塩基又は修飾核酸塩基は、蛍光部分での置換により修飾される。
【0197】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチドは、ヌクレオチド中のリン酸基又は結合リンは、糖又は修飾糖の様々な位置に連結している、1つ以上の修飾ヌクレオチドを含む。非限定的な例として、リン酸基又は結合リンは、糖又は修飾糖の2’、3’、4’又は5’ヒドロキシル部分に連結され得る。本明細書に記載される修飾核酸塩基を組み込んだヌクレオチドも、これに関連して企図される。
【0198】
他の修飾糖も、オリゴヌクレオチド分子内に組み込まれ得る。いくつかの実施形態では、修飾糖は、2’位に1つ以上の置換基を含有し、置換基は以下のうちの1つを含む:-F;-CF3、-CN、-N3、-NO、-NO2、-OR’、-SR’、若しくは-N(R’)2(式中、各R’は独立して、上記に定義され、本明細書に記載されるとおりである);-O-(C1-C10アルキル)、-S-(C1-C10アルキル)、-NH-(C1-C10アルキル)、若しくは-N(C1-C10アルキル)2;-O-(C2-C10アルケニル)、-S-(C2-C10アルケニル)、-NH-(C2-C10アルケニル)、若しくは-N(C2-C10アルケニル)2;-O-(C2-C10アルキニル)、-S-(C2-C10アルキニル)、-NH-(C2-C10アルキニル)、若しくは-N(C2-C10アルキニル)2;又は-O-(C1-C10アルキレン)-O-(C1-C10アルキル)、-O-(C1-C10アルキレン)-NH-(C1-C10アルキル)、若しくは-O-(C1-C10アルキレン)-NH(C1-C10アルキル)2、-NH-(C1-C10アルキレン)-O-(C1-C10アルキル)、若しくは-N(C1-C10アルキル)-(C1-C10アルキレン)-O-(C1-C10アルキル)、又はこれらの塩であり、当該アルキル、アルキレン、アルケニル及びアルキニルは、置換又は非置換であってもよい。置換基の例としては、-O(CH2)nOCH3、及び-O(CH2)nNH2又はそれらの塩が挙げられ(式中、nは1~約10である)、-OCH2CH2OMe(MOE)又はその塩、-OCH2CH2N(CH3)2(DMAOE)又はその塩、-OCH2CH2OCH2CH2N(CH3)2(DMAEOE)又はその塩が挙げられるが、これらに限定されない。
【0199】
いくつかの実施形態では、リボースの2’-OHは、以下のうちの1つを含む置換基で置換される:-H、-F;-CF3、-CN、-N3、-NO、-NO2、-OR’、-SR’、若しくは-N(R’)2(式中、各R’は独立して、上記に定義され、本明細書に記載されるとおりである);-O-(C1-C10アルキル)、-S-(C1-C10アルキル)、-NH-(C1-C10アルキル)、若しくは-N(C1-C10アルキル)2;-O-(C2-C10アルケニル)、-S-(C2-C10アルケニル)、-NH-(C2-C10アルケニル)、若しくは-N(C2-C10アルケニル)2;-O-(C2-C10アルキニル)、-S-(C2-C10アルキニル)、-NH-(C2-C10アルキニル)、若しくは-N(C2-C10アルキニル)2;又は-O-(C1-C10アルキレン)-O-(C1-C10アルキル)、-O-(C1-C10アルキレン)-NH-(C1-C10アルキル)、若しくは-O-(C1-C10アルキレン)-NH(C1-C10アルキル)2、-NH-(C1-C10アルキレン)-O-(C1-C10アルキル)、若しくは-N(C1-C10アルキル)-(C1-C10アルキレン)-O-(C1-C10アルキル)であり、当該アルキル、アルキレン、アルケニル及びアルキニルは、置換又は非置換であってもよい。いくつかの実施形態では、2’-OHは、-H(デオキシリボース)で置換される。いくつかの実施形態では、2’-OHは、-Fで置換される。いくつかの実施形態では、2’-OHは、-OR’で置換される。いくつかの実施形態では、2’-OHは、-OMeで置換される。いくつかの実施形態では、2’-OHは、-OCH2CH2OMe(MOE)で置換される。
【0200】
修飾糖はまた、ロックド核酸(LNA)を含む。いくつかの実施形態では、ロックド核酸は、以下に示される構造を有する。以下の構造のロックド核酸が示され、式中、Baは、本明細書に記載される核酸塩基又は修飾核酸塩基を表し、R
2sは、-OCH
2C4’-である。
【化3】
【0201】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各糖は、修飾糖部分であるか、又は修飾糖部分を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖であるか、又は2’-MOE修飾糖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-OMe修飾糖であるか、又は2’-OMe修飾糖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-OH修飾糖であるか、又は2’-OH修飾糖を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-H修飾糖であるか、又は2’-H修飾糖を含む。
【0202】
いくつかの実施形態では、本開示は、2’-MOE修飾糖、2’-OMe修飾糖、2’-OH修飾糖、2’-H修飾糖、又はそれらの組み合わせを含むオリゴヌクレオチドを提供する。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの2’-MOE糖及び少なくとも1つの2’-OH糖(RNA糖)を含む。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの2’-MOE糖及び少なくとも1つの2’-H糖(DNA糖)を含む。
【0203】
いくつかの実施形態では、本発明は、式Iの構造を独立して有する1つ以上の修飾ヌクレオチド間結合を含むオリゴヌクレオチドを提供し、
【化4】
式中、
P*は、不斉リン原子であり、Rp又はSp配置のいずれかであり、
Wは、O、S、又はSeであり、
X、Y及びZの各々は独立して、-O-、-S-、-N(-L-R
1)-、又はLであり、
Lは、共有結合、又は任意で置換される直鎖状若しくは分枝状のC
1-C
10アルキレンであり、ここで、Lの1つ以上のメチレン単位は、任意選択的にかつ独立して、任意選択的に置換されたC
1-C
6アルキレン、C
1-C
6アルケニレン、
【化5】
-C(R’)
2-、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)-、-N(R’)C(O)O-、-OC(O)N(R’)-、-S(O)-、-S(O)
2-、-S(O)
2N(R’)-、-N(R’)S(O)
2-、-SC(O)-、-C(O)S-、-OC(O)-、又は-C(O)O-で置換されており、
R
1は、ハロゲン、R、又は任意選択的に置換されたC
1-C
50脂肪族であり、ここで、1つ以上のメチレン単位は、任意選択的にかつ独立して、任意選択的に置換されたC
1-C
6アルキレン、C
1-C
6アルケニレン、
【化6】
-C(R’)
2-、-Cy-、-O-、-S-、-S-S-、-N(R’)-、-C(O)-、-C(S)-、-C(NR’)-、-C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)N(R’)-、-N(R’)C(O)-、-N(R’)C(O)O-、-OC(O)N(R’)-、-S(O)-、-S(O)
2-、-S(O)
2N(R’)-、-N(R’)S(O)
2-、-SC(O)-、-C(O)S-、-OC(O)-、又は-C(O)O-で置換されており、
各R’は独立して、-R、-C(O)R、-CO
2R、若しくは-SO
2Rであるか、又は
同じ窒素上の2つのR’は、それらの介在する原子と一緒になって、任意選択的に置換された複素環若しくはヘテロアリール環を形成するか、又は
同じ炭素上の2つのR’が、それらの介在する原子と一緒になって、任意選択的に置換されたアリール、炭素環、複素環、又はヘテロアリール環を形成し、
-Cy-は、フェニレン、カルボシクリレン、アリーレン、ヘテロアリーレン、又はヘテロシクリレンから選択される任意選択的に置換された二価の環であり、
各Rは独立して、水素、又はC
1-C
6脂肪族、フェニル、カルボシクリル、アリール、ヘテロアリール、若しくはヘテロシクリルから選択される任意選択的に置換された基であり、
各
【化7】
は独立して、ヌクレオシドとの接続を表す。
【0204】
いくつかの実施形態では、式Iの構造を有するヌクレオチド間結合は、
【化8】
である。
【0205】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、本明細書に記載の非天然のヌクレオチド間結合と天然のホスフェート結合の両方を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合は、非天然のヌクレオチド間結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合は、キラルなヌクレオチド間結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合は、ホスホロチオエート結合である
【化9】
。
【0206】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの各ヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの天然のホスフェート結合及び少なくとも1つのホスホジチオエート結合を含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも50%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも60%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも70%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも80%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも90%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも94%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも95%のヌクレオチド間結合は、ホスホジチオエート結合である。
【0207】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも50%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも60%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも70%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも80%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも90%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも94%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドの少なくとも95%のヌクレオチド間結合は、天然のホスフェート結合である。
【0208】
とりわけ、本開示は、様々な設計のオリゴヌクレオチドを提供し、それらは、様々な核酸塩基及びそのパターン、糖及びそのパターン、ヌクレオチド間結合及びそのパターン、並びに/又は本開示に記載される追加の化学的部分及びそのパターンを含み得る。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドは、MuSK Ig3ドメインタンパク質発現、MuSK Ig3ドメイン遺伝子発現、及び/又はBMPシグナル伝達レベルのMuSK Ig3活性化を下方制御でき、それによって成体海馬神経発生(AHN)を増加させ、ADにおける認知を改善することができる。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドは、MuSK Ig3ドメインタンパク質発現、MuSK Ig3ドメイン遺伝子発現、及び/又はBMPシグナル伝達レベルのMuSK Ig3活性化を下方制御でき、それによって筋再生を増加させることができる。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドは、対象又は患者の細胞におけるMuSK Ig3ドメイン及び/又はその産物のうちの1つ以上の発現、レベル及び/又は活性の減少を導くことができる。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドは、対象又は患者の細胞におけるMuSK Ig3ドメイン及び/又はその1つ以上の産物の発現、レベル及び/又は活性の減少を導くことができる一方で、全ての形態のMuSKの発現、レベル及び/又は活性は、実質的に同じままである。いくつかの実施形態では、細胞は通常、MuSK Ig3ドメインによりコードされるタンパク質を発現又は産生する。いくつかの実施形態では、提供されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、MuSK Ig3ドメイン遺伝子又は遺伝子産物の発現、レベル及び/又は活性の減少を指示することができ、本明細書に開示されるオリゴヌクレオチドの塩基配列からなる、オリゴヌクレオチドの塩基配列を含む、又はオリゴヌクレオチドの塩基配列の一部分(例えば、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20個以上の連続する塩基のスパン)を含む塩基配列を有し、ここで各Tは独立してUで置換されてもよく、その逆もまた同様であり、オリゴヌクレオチドは、塩基、糖結合及び/又はヌクレオチド間結合の少なくとも1つの非天然の修飾を含む。
【0209】
本明細書に記載されるように、天然に非常に豊富に存在する全長MuSKは、BMP結合Ig3ドメインを保持し、BMPシグナル伝達を増強し、したがって、神経発生を抑制する。対照的に、ΔIg3-MuSKは、より低いBMPシグナル伝達を有し、AHNを促進し、認知を改善する。いくつかの実施形態では、本開示は、MuSKをAHN制限全長MuSKからAHN許容性ΔIg3-MuSKスプライス形態に切り替えるエクソンスキッピングMuSK標的化オリゴヌクレオチドを提供する。
【0210】
本明細書に記載されるように、天然に非常に豊富に存在する全長MuSKは、BMP結合Ig3ドメインを保持し、BMPシグナル伝達を増強し、したがって、筋再生に影響を与える。対照的に、ΔIg3-MuSKは、より低いBMPシグナル伝達を有し、筋再生を促進し、及び/又は筋線維症を予防する。いくつかの実施形態では、本開示は、MuSKを全長MuSKから筋形成促進ΔIg3-MuSKスプライス形態に切り替えるエクソンスキッピングMuSK標的化オリゴヌクレオチドを提供する。
【0211】
いくつかの実施形態では、1つ以上のスキップされるエクソンは、MuSK遺伝子のエクソン6及び/又は7から選択される。いくつかの実施形態では、MuSKのエクソン6がスキップされる。いくつかの実施形態では、MuSKのエクソン7がスキップされる。いくつかの実施形態では、MuSKのエクソン6及び7の両方がスキップされる。
【0212】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び/又は7のエクソンスキッピングを提供することができるが、エクソン3及び/又は4のエクソンスキッピングは提供しない。
【0213】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン3及び/又は4のエクソンスキッピングを提供するよりも高いレベルで、エクソン6及び/又は7のエクソンスキッピングを提供することができる。
【0214】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が40%未満減少するように、エクソンスキッピングを提供する。
【0215】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が40%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0216】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が70%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が40%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0217】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が80%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が40%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0218】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が90%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が40%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0219】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が30%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0220】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が20%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0221】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び7を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン6及び7によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が60%超減少し、エクソン3及び4を含むMuSK転写物のレベル、又はエクソン3及び4によってコードされる配列を含むMuSKタンパク質形態のレベル、又はその両方が10%未満減少するように、MuSK転写物のスプライシングを変化させる。
【0222】
様々な実施形態では、活性化合物は、MuSK遺伝子中の1つ以上のエクソンのスキッピングを導くオリゴヌクレオチドである。様々な実施形態では、活性化合物は、MuSK遺伝子中の複数のエクソンのスキッピングを導くオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、活性化合物は、MuSK遺伝子中のエクソン6、エクソン7、又はその両方のスキッピングを導くオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、活性化合物は、MuSK遺伝子中のエクソン6のスキッピングを導くオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、活性化合物は、MuSK遺伝子中のエクソン7のスキッピングを導くオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、活性化合物は、MuSK遺伝子中のエクソン6及び7のスキッピングを導くオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、複数のオリゴヌクレオチドが一緒に使用されてもよい。いくつかのこのような実施形態では、2つ以上の異なるエクソンスキッピングオリゴヌクレオチド(例えば、エクソン6のスキッピングを導くものを少なくとも1つと、エクソン7のスキッピングを導くものを1つ)を組み合わせて使用してもよい。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、少なくとも1つのエクソンスキッピングオリゴヌクレオチドは、少なくとも1つの分解オリゴヌクレオチド(例えば、RNase H分解の転写物を標的とするもの)と組み合わせて使用することができ、当該オリゴヌクレオチドは、例えば、機能性Ig3ドメイン又はその一部分を含むMuSK転写物を標的とすることができる。
【0223】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、塩形態で提供及び/又は利用される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、それらの塩形態として存在する負に帯電したヌクレオチド間結合(例えば、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合、天然のホスフェート結合など)を含む塩として提供される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、薬学的に許容可能な塩として提供される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、金属塩として提供される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、ナトリウム塩として提供される。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチドは、金属塩、例えばナトリウム塩として提供され、この場合において各負に帯電したヌクレオチド間結合は独立して、塩形態にある(例えばナトリウム塩の場合、ホスホロチオエートヌクレオチド間結合の場合は-O-P(O)(SNa)-O-、天然のホスフェート結合の場合は-O-P(O)(ONa)-O-など)。
【0224】
いくつかの実施形態では、組成物内では個々のオリゴヌクレオチドは、当該組成物(例えば、液体組成物)内で、特定の時点で特定のそのようなオリゴヌクレオチドが、異なる塩形態であっても(及び溶解されてもよく、オリゴヌクレオチド鎖は、例えば、液体組成物中、アニオン形態として存在してもよい)、同じ構成及び/又は構造であるとみなされ得る。例えば、当業者であれば、所定のpHで、オリゴヌクレオチド鎖に沿った個々のヌクレオチド間結合は、酸(H)形態であってもよく、又は複数の可能性のある塩形態(例えば、ナトリウム塩、又は調製物又は組成物中にどのイオンが存在し得るかに応じて異なるカチオンの塩)のうちの1つであってもよいことを認識し、それらの酸形態(例えば、もしあるならば、全てのカチオンをH+置き換える)が同じ構成及び/又は構造である限り、そのような個々のオリゴヌクレオチドは、同じ構成及び/又は構造であると適切にみなされ得ることを理解するであろう。
【0225】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド組成物は、2つ以上のオリゴヌクレオチドを含む。いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド組成物は、2つ以上のオリゴヌクレオチドを含み、この場合において各複数のオリゴヌクレオチドは独立して、本明細書に記載される複数のオリゴヌクレオチドである。例えばいくつかの実施形態では、各複数のものは独立して、同じ塩基配列及び同じヌクレオチド間結合を共有する。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの複数の又は各複数のものは独立して、同じ転写物の同じエクソン(例えば、MuSKのエクソン6及び/又は7)を標的とする。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの複数の又は各複数のものは独立して、同じ転写物の異なるエクソン(例えば、MuSKのエクソン3、4、6、及び/又は7)を標的とする。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの複数の又は各複数のものは独立して、同じ核酸又は異なる核酸の異なる転写物を標的とする。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの複数の又は各複数のものは独立して、異なる遺伝子の転写物を標的とする。いくつかの実施形態では、少なくとも2つの複数の又は各複数のものは独立して、MuSK転写物上の異なる領域を標的とする。とりわけ、このような組成物は、2つ以上の標的を標的とするために、いくつかの実施形態では、同時に同じシステム内で利用され得る。
【0226】
MuSK標的化オリゴヌクレオチドの特徴付け
本明細書に提供されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、1つ以上のそれらの物理的/化学的特性及び/又は生物学的活性について識別、評価、及び/又は特徴付けることができる。当業者は、こうした識別、評価、及び/又は特徴付けに利用され得る特定のアッセイを含む、様々なアプローチを認識するであろう。
【0227】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、例えば、MuSKを発現する細胞と接触するとき、例えば、別のMuSK形態又は他の適切な参照と比較して、MuSK ΔIg3 mRNA及び/又はタンパク質のレベル又は活性を増加させることを特徴とする。いくつかの実施形態では、こうした増加を達成することは、MuSK ΔIg3を「刺激すること」表すとみなされ得る。
【0228】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、細胞中のMuSKプレmRNAのスプライシング活性を変化させるその能力を特徴とする。例えば、細胞は、MuSK標的化オリゴヌクレオチドでトランスフェクトされてもよく、インキュベーション期間後、MuSK RNA転写物の代替形態(例えば、エクソン6及び7がスキップされた)の発現は、RT-PCRによって測定され得る。例えば、培養細胞におけるMuSKエクソンスキッピングの効率は、10%、20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%、90%、95%、又は95%超である。
【0229】
いくつかの態様では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、MuSK ΔIg3 mRNAを増加させる。いくつかの態様では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、MuSKプレmRNAのスプライシングを変化させる。いくつかの態様では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、エクソン6及び/又はエクソン7のスキッピングを促進する。
【0230】
MuSK ΔIg3の発現の調節は、MuSK MR標的化オリゴヌクレオチドで治療された対象の体液中で測定することができ、これは動物の細胞、組織、又は臓器を含有してもよく、又は含有しなくてもよい。体液(例えば、痰、血清、CSF)、組織(例えば、生検)、又は臓器などの分析用の試料を得る方法、及び分析を可能にするための試料の調製方法は、当業者に周知である。対象に対する治療の効果は、本出願に記載される1つ以上の組成物と接触した動物から採取された、1つ以上の生体液、組織又は臓器における標的遺伝子発現に関連するバイオマーカーを測定することによって評価することができる。
【0231】
いくつかの実施形態では、MuSK ΔIg3 mRNAの増加は、MuSK ΔIg3 mRNAの細胞内レベルが、対照(例えば、MuSK標的化オリゴヌクレオチドを投与されていない対象)におけるMuSK ΔIg3 mRNAのレベルなどの参照レベルよりも高いことを意味する。細胞内MuSK ΔIg3 mRNAの増加は、産生されたMuSK ΔIg3タンパク質及び/又はmRNAのレベルの増加として測定することができる。いくつかの実施形態では、MuSK ΔIg3 mRNAの増加は、例えば、以下の実施例に記載される方法、及び/あるいはRNA溶液ハイブリダイゼーション、ヌクレアーゼ保護、ノーザンハイブリダイゼーション、逆転写、マイクロアレイを用いた遺伝子発現モニタリング、抗体結合、酵素結合免疫吸着測定法(ELISA)、核酸配列決定、ウェスタンブロッティング、ラジオイムノアッセイ(RIA)、その他のイムノアッセイ、蛍光活性化細胞分析(FACS)、又はMuSK ΔIg3 mRNA若しくはタンパク質(例えば、対象又は対象から取得された試料中)の存在を検出できるその他の技術又は技術の組み合わせなどのアッセイ技術によって決定することができる。
【0232】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド治療を受けている対象から得られた試料中のMuSK ΔIg3 mRNAのレベルを、MuSK標的化オリゴヌクレオチドで治療されていない対象中のMuSK ΔIg3 mRNAのレベルと比較することによって、MuSK標的化オリゴヌクレオチド治療がMuSK ΔIg3 mRNAを増加させた程度を決定することができる。いくつかの実施形態では、MuSK ΔIg3 mRNAの参照レベルは、MuSK標的化オリゴヌクレオチド治療を受ける前に、同じ対象から取得される。いくつかの実施形態では、MuSK ΔIg3 mRNAの参照レベルは、MuSK標的化オリゴヌクレオチド治療を受けていない対象の集団によって決定される範囲である。いくつかの実施形態では、全長MuSK mRNAのレベルは、MuSK ΔIg3 mRNAのレベルと比較される。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド治療を受けている対象における、MuSK ΔIg3 mRNA対全長MuSK mRNA(例えば、エクソン6及び7を含まないMuSK mRNA)との比が、例えば、参照比よりも1倍、1.5~5倍、5~10倍、10~50倍、50~100倍、約1.1倍、1.2倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍超、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、100倍以上大きい。
【0233】
いくつかの実施形態では、増加したレベルのMuSK ΔIg3 mRNAは、例えば、参照値よりも1倍、1.5~5倍、5~10倍、10~50倍、50~100倍、約1.1倍、1.2倍、1.5倍、2倍、3倍、4倍、5倍、6倍、7倍、8倍、9倍、10倍、15倍、20倍、30倍、40倍、50倍、60倍、70倍、80倍、90倍、100倍以上高い。
【0234】
いくつかの実施形態では、対象におけるMuSK ΔIg3 mRNAの増加は、参照レベルと比較したMuSK ΔIg3タンパク質の増加によって示され得る。いくつかの実施形態では、MuSK ΔIg3タンパク質の参照レベルは、例えば、AD又は神経変性を特徴とする疾患を有するか、又は有するリスクがある対象から得られたMuSK ΔIg3タンパク質レベルである。いくつかの実施形態では、MuSK ΔIg3タンパク質の参照レベルは、治療前の、例えば、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患を有するか、又は有するリスクがある対象から得られたMuSK ΔIg3タンパク質レベルである。体液、臓器、又は組織を、有効量の本明細書に記載される1つ以上の組成物と接触させる方法も企図される。体液、臓器、又は組織を、MuSK標的化オリゴヌクレオチドを含む1つ以上の組成物と接触させ、体液、臓器、又は組織の細胞におけるMuSK ΔIg3の発現及びMuSK発現の調節をもたらすことができる。有効量は、対象に投与される、又は細胞と接触するMuSK標的化オリゴヌクレオチドの機能的MuSK ΔIg3タンパク質発現に対する効果を監視することによって決定することができる。
【0235】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、細胞集団(例えば、NSC及び/又は神経前駆細胞(MPC)を含む)に投与された場合、活性化状態(例えば、活発な増殖)にある細胞の数を増加させる。集団内の細胞は、例えば、EdU+サイクル細胞が総細胞数と比較されるEdUアッセイを含む、当該技術分野で既知の方法によって活性化状態にあるかどうかについて評価することができる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、NSCを含む細胞集団に投与された場合、集団における静止NSCの数を減少させ、及び/又は活性化NSCの数を増加させる。
【0236】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、細胞集団(例えば、衛星細胞(SC)、筋芽細胞、筋原性前駆細胞(MPC)を含む)に投与された場合、活性化状態(例えば、活発な増殖)にある細胞の数を増加させる。集団内の細胞は、例えば、EdU+サイクル細胞が総細胞数と比較されるEdUアッセイを含む、当該技術分野で既知の方法によって活性化状態にあるかどうかについて評価することができる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、衛星細胞を含む細胞集団に投与された場合、集団内の静止衛星細胞の数を減少させ、及び/又は活性化衛星細胞の数を増加させる。
【0237】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、NSC及び/又はNPCを含む細胞集団に投与された場合、初期ニューロン(例えば、Dex)に関連する遺伝子を発現する細胞の数を増加させ、及び/又は成熟ニューロン(例えば、Map2)、星状細胞(例えば、GFAP及びS100b)、及び/又はオリゴデンドロサイト(例えば、CNPase及びO4)に関連する遺伝子を発現する細胞の数を減少させる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、NSC及び/又はNPCを含む細胞集団に投与された場合、細胞集団における初期ニューロン(例えば、Dex)に関連する遺伝子の発現レベルを増加させ、及び/又は成熟ニューロン(例えば、Map2)、星状細胞(例えば、GFAP及びS100b)、及び/又はオリゴデンドロサイト(例えば、CNPase及びO4)に関連する遺伝子の発現レベルを減少させる。
【0238】
いくつかの実施形態では、細胞集団は、(例えば、胚性幹細胞又は多能性幹細胞などの幹細胞から)NSCなるように誘導されたNSCを含む。
【0239】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、SC、MPC、及び/又は筋芽細胞を含む細胞集団に投与された場合、遺伝子又は筋原性因子(例えば、Pax7、MyoD、ミオゲニン、及びMERGE)を発現する細胞の数を増加させ、及び/又はMuSK-BMPシグナル伝達経路(例えば、RGS4、Msx2、Myf5、Ptx3、Id1)に関連する遺伝子を発現する細胞の数を減少させる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、衛星細胞及び/又は筋芽細胞を含む細胞集団に投与された場合、細胞集団における筋原性因子(myogenic factor)に関連する遺伝子(例えば、Pax7、MyoD、ミオゲニン、及びMERGE)の発現レベルを増加させ、及び/又はMuSK-BMPシグナル伝達経路に関連する遺伝子(例えば、RGS4、Msx2、Myf5、Ptx3、Id1)の発現レベルを減少させる。
【0240】
いくつかの実施形態では、細胞集団は、(例えば、胚性幹細胞又は多能性幹細胞などの幹細胞から)衛星細胞及び/又は筋芽細胞になるように誘導された衛星細胞及び/又は筋芽細胞を含む。
【0241】
いくつかの実施形態では、細胞集団は、健康な対象から取得される。いくつかの実施形態では、細胞集団は、例えば、AD若しくは神経変性を特徴とする疾患を有するか、若しくは有するリスクがある対象、又は神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、若しくは筋消耗を特徴とする遺伝性疾患などの疾患若しくは障害に罹患している対象から取得される。
【0242】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、対象由来の細胞集団と接触すると、対象における神経発生を増加させる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、例えば、対象への注射によって、インビボで細胞集団と接触される。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、対象から細胞集団を取得することによってエクスビボで細胞集団と接触し、治療された細胞が対象に再導入されるとき、神経発生が増加する。
【0243】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、対象由来の細胞集団と接触すると、対象における筋再生及び/又は成長を増加させる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、例えば、対象への注射によって、インビボで細胞集団と接触される。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、対象から細胞集団を取得することによって細胞集団と接触させ、治療された細胞が対象に再導入されるとき、筋再生が増加する。
【0244】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、対象に投与されたとき、神経発生及び/若しくは成長を増加させ、並びに/又は認知を改善する。これらの生物学的効果を評価する方法の例は、例えば、以下の実施例に詳述される。
【0245】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド又はそれを含む組成物は、対象に投与されたとき、筋再生及び/若しくは成長、並びに/又は神経筋機能、及び/若しくは筋形成を増加させる。これらの生物学的効果を評価する方法の例は、例えば、以下の実施例に詳述される。
【0246】
MuSK標的化オリゴヌクレオチドの産生
本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、当技術分野で公知の標準的な方法によって、例えば、自動合成装置の使用によって合成することができる。化学合成(例えば、ホスホラミダイト法を使用した固相合成)後、オリゴヌクレオチド分子を脱保護し、ds分子にアニーリングし、精製することができる(例えば、ゲル電気泳動又はHPLCによって)。MuSK標的化オリゴヌクレオチド、オリゴヌクレオチド類の調製のためのプロトコルは、当該技術分野で公知である。
【0247】
いくつかの実施形態では、本開示は、キラル制御されたオリゴヌクレオチド及びその組成物を調製するための技術を提供する。いくつかの実施形態では、本開示は、立体的に純粋なオリゴヌクレオチド及びその組成物を調製するための技術を提供する。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド及びその組成物は、高純度である。いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは、キラルなヌクレオチド間結合の結合リンにおいて、少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%の立体化学的に純粋である。いくつかの実施形態では、本開示のオリゴヌクレオチドは、立体選択的に調製され、立体異性体を実質的に含まない。いくつかの実施形態では、提供される組成物は、同じパターンのキラル結合リン立体化学の同じ塩基配列を共有する複数のオリゴヌクレオチドを含む(例えば、Rp及び/又はSpのうちの1つ以上を含み、各キラル結合リンは独立してRp又はSpである)が、組成物中の複数のオリゴヌクレオチドと同じ塩基配列を共有する全てのオリゴヌクレオチドの少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%は、同じパターンのキラル結合リン立体化学を共有するか、又は複数のオリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、提供される組成物は、同じパターンのキラル結合リン立体化学の同じ塩基配列を共有する複数のオリゴヌクレオチドを含むが、組成物中の複数のオリゴヌクレオチドと同じ構成を共有する全てのオリゴヌクレオチドの少なくとも50%、60%、70%、75%、80%、85%、90%、95%、又は99%は、同じパターンのキラル結合リン立体化学を共有するか、又は複数のオリゴヌクレオチドである。
【0248】
MuSK標的化オリゴヌクレオチドはまた、細胞内に導入された発現構築物からのRNAの転写によって細胞内で形成され得る(例えば、Yu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 2002;99:6047-6052)。オリゴヌクレオチド分子のインビボ産生のための発現構築物は、例えば、プロモーターエレメント及び転写終結シグナルを含む、アンチセンスコード配列の適切な転写に必要なエレメントに作動可能に連結された1つ以上のアンチセンスコード配列を含み得る。こうした発現構築物で使用するための好ましいプロモーターには、ポリメラーゼ-III HI-RNAプロモーター(例えば、Brummelkamp et al.,Science 2002;296:550-553を参照)及びU6ポリメラーゼ-IIIプロモーター(例えば、Sui et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 2002、Paul et al.,Nature Biotechnol.2002;20:505-508、及びYu et al.,Proc.Natl.Acad.Sci.USA 2002;99:6047-6052)が挙げられる。MuSK標的化オリゴヌクレオチド発現構築物は、発現構築物のクローニングを容易にする1つ以上のベクター配列を更に含み得る。使用され得る標準ベクターとしては、例えば、pSilencer 2.0-U6ベクター(Ambion Inc.、Austin,Tex.)が挙げられる。
【0249】
医薬組成物
本開示は、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドを含む、及び/又はそれを送達する医薬組成物を提供する。本開示はまた、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチドに曝露された細胞集団であるか、又はそれを含む医薬組成物を提供する。
【0250】
例えば、いくつかの実施形態では、提供される医薬組成物は、投与されたときに、BMPとの相互作用に機能するIg3ドメインを欠くMuSKポリペプチド(例えば、MuSK ΔIg3ポリペプチド、又は破損したIg3を有する別のMuSKバリアントポリペプチド)のレベル及び/又は活性の増加を達成する、MuSK標的化オリゴヌクレオチドを含んでもよく、及び/又は送達してもよい。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、提供される医薬組成物は、MuSK標的化オリゴヌクレオチドに曝露された細胞集団を含んでもよく、及び/又はそれらを送達してもよく、その結果、ニューロン細胞数及び/又は活性が集団において増加する。
【0251】
多くの実施形態では、医薬組成物は、1つ以上の薬学的に許容可能な賦形剤と組み合わせた活性剤(例えば、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチド又はその前駆体)であるか、又はそれを含む。当業者であれば、特定の医薬組成物の成分が、医薬組成物の投与経路によって影響を受け得ることを理解するであろう。
【0252】
本開示の組成物は、全身投与及び局所投与又は局部投与を含む、様々な投与様式用に製剤化することができる。技術及び製剤は、概して、Remington,The Science and Practice of Pharmacy,(20th ed.2000)に記載されている。
【0253】
本発明の組成物は、多種多様な経口、非経口、及び局所剤形で調製及び投与することができる。したがって、本発明の組成物は、注射(例えば、静脈内、筋肉内、皮内、皮下、十二指腸内、又は腹腔内)によって投与することができる。また、本明細書に記載の組成物は、例えば、鼻腔内などの吸入によって投与することができる。更に、本発明の組成物は、経皮的に投与することができる。また、複数の投与経路(例えば、筋肉内、経口、経皮)を使用して、本発明の組成物を投与することができることも想定される。
【0254】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の医薬組成物は、静脈内注射、髄腔内投与、経口投与、頬側投与、吸入、鼻腔投与、局所投与、眼投与、又は耳投与から選択される経路による送達のために製剤化され得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、髄腔内投与による送達のために製剤化され得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、静脈内投与による送達のために製剤化され得る。いくつかの実施形態では、医薬組成物は、経口投与による送達のために製剤化される。
【0255】
特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド及び組成物は、CNSに送達される。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド及び組成物は、脳脊髄液に送達される。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド及び組成物は、脳実質に投与される。特定の実施形態では、オリゴヌクレオチド及び組成物は、髄腔内投与又は脳室内投与によって動物/対象に送達される。中枢神経系内の本明細書に記載されるオリゴヌクレオチド及び組成物の広範な分布は、実質内投与、髄腔内投与、又は脳室内投与によって達成され得る。
【0256】
特定の実施形態では、非経口投与は、注射、例えば、シリンジ、ポンプなどによるものである。特定の実施形態では、注射はボーラス注入である。特定の実施形態では、注射は、線条体、尾状核、皮質、海馬、及び小脳などの組織に直接投与される。
【0257】
特定の実施形態では、ボーラス注入によるなど、医薬を特異的に局在化する方法は、半有効濃度(EC50)を20倍、25倍、30倍、35倍、40倍、45倍、又は50倍減少させる。ある特定の実施形態では、本明細書に更に記載されるように、アンチセンス化合物の医薬。特定の実施形態では、標的組織は脳組織である。特定の実施形態では、標的組織は海馬組織である。特定の実施形態では、EC50の減少は、それを必要とする患者において薬理学的結果を達成するために必要な用量を低下させるため、望ましい。
【0258】
ある特定の実施形態では、アンチセンスオリゴヌクレオチドは、月1回、2ヶ月に1回、90日に1回、3ヶ月に1回、6ヶ月に1回、年2回、又は年1回、注射又は注入によって送達される。
【0259】
活性成分に加えて、これらの医薬組成物は、賦形剤及び補助剤を含む好適な薬学的に許容可能な担体を含有してもよく、これは、薬学的に使用することができる調製物への活性化合物の加工を容易にする。経口投与用に製剤化された調製物は、錠剤、糖衣剤、カプセル、又は溶液の形態であってもよい。
【0260】
経口使用のための医薬調製物は、活性化合物を固体賦形剤と組み合わせ、任意選択的に得られた混合物を粉砕し、所望であれば、適切な補助剤を添加した後に顆粒の混合物を加工して、錠剤又は糖衣剤コアを得ることによって得ることができる。適切な賦形剤は、特に、充填剤であり、例えばラクトース、スクロース、マンニトール、又はソルビトールを含む糖類;例えばトウモロコシデンプン、小麦デンプン、米デンプン、ジャガイモデンプン、ゼラチン、トラガカントガム、メチルセルロース、ヒドロキシプロピルメチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム(CMC)、及び/又はポリビニルピロリドン(PVP:ポビドン)などのセルロース調製物である。必要に応じて、架橋ポリビニルピロリドン、寒天、若しくはアルギン酸、又はアルギン酸ナトリウムなどのその塩などの崩壊剤を添加してもよい。
【0261】
糖衣剤コアには適切なコーティングが提供される。この目的のために、濃縮糖溶液が使用されてもよく、これは任意選択的に、アラビアゴム、タルク、ポリビニルピロリドン、カルボポールゲル、ポリエチレングリコール(PEG)、及び/又は二酸化チタン、ラッカー溶液、並びに適切な有機溶媒又は溶媒混合物を含有してもよい。識別のため又は活性化合物用量の異なる組み合わせを特徴付けるため、色素又は顔料を錠剤又は糖衣剤コーティングに添加してもよい。
【0262】
経口的に使用され得る医薬調製物は、ゼラチンで作製された押込み式(push-fit)カプセル、並びにゼラチン、及びグリセロール又はソルビトールなどの可塑剤で作製された軟質の密封カプセルを含む。押込み式カプセルには、ラクトースなどの充填剤、デンプンなどの結合剤、及び/又はタルク若しくはステアリン酸マグネシウムなどの滑沢剤、及び任意選択的に安定剤と混合した活性成分を含めることができる。軟カプセルでは、活性化合物は、脂肪油、流動パラフィン、又は液体ポリエチレングリコール(PEG)などの適切な液体中に溶解又は懸濁されてもよい。加えて、安定剤を添加してもよい。
【0263】
いくつかの実施形態では、医薬組成物は、錠剤、丸剤、カプセル剤、液体、吸入剤、鼻腔スプレー溶液、座薬、懸濁液、ゲル、コロイド、分散液、懸濁液、溶液、エマルション、軟膏、ローション、点眼薬、又は点耳薬である。
【0264】
治療される特定の状態に応じて、本開示の医薬組成物は、液体又は固体剤形に製剤化され、全身的に又は局所的に投与され得る。医薬組成物は、例えば、当業者に公知の時限的又は持続的低放出形態で送達されてもよい。製剤化及び投与の技術は、Remington,The Science and Practice of Pharmacy(20th ed.2000)に見出すことができる。適切な経路としては、経口、頬側、吸入スプレー、舌下、直腸、経皮、膣内、経粘膜、経鼻、又は腸管内投与;筋肉内、皮下、髄内注射、並びに髄腔内、直接脳室内、静脈内、関節内(intra-articullar)、胸骨内、滑膜内、肝臓内、病変内、頭蓋内、腹腔内、鼻腔内、若しくは眼内注射、又は他の送達様式を含む非経口送達を挙げることができる。
【0265】
注射のために、本開示の医薬組成物は、ハンク溶液、リンゲル溶液、又は生理食塩水緩衝液などの生理学的に適合した緩衝液中などの水溶液中で製剤化及び希釈されてもよい。そのような経粘膜投与については、浸透されるバリアに適切な浸透剤が製剤に使用される。このような浸透剤は、当該技術分野で一般的に公知である。
【0266】
本開示の実施のために、本明細書に開示される組成物を全身投与に好適な投与量に製剤化するための薬学的に許容可能な不活性担体の使用は、本開示の範囲内である。担体の適切な選択及び適切な製造実践により、本開示の組成物、特に溶液として製剤化された組成物は、静脈内注射などによって非経口的に投与され得る。
【0267】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の組成物は、当該技術分野で利用可能な薬学的に許容可能な担体を使用して、経口投与に好適な投与量に製剤化することができる。このような担体は、本開示の化合物を、治療される対象(例えば、患者)による経口摂取のために、錠剤、丸剤、カプセル剤、液体、ゲル、シロップ、スラリー、懸濁液などとして製剤化することができる。
【0268】
鼻腔送達又は吸入送達のために、生理食塩水、ベンジルアルコールなどの防腐剤、吸収促進剤、及びフルオロカーボンなどの1つ以上の可溶化物質、希釈物質、又は分散物質が採用されてもよい。
【0269】
いくつかの実施形態では、提供される組成物は、活性剤の前駆体を含んでもよく、及び/又はそれを送達してもよく、前駆体は、投与されると活性治療剤になるか、又は活性治療剤を放出する。いくつかの実施形態では、例えば、前駆体は、小分子刺激剤のプロドラッグ、又はタンパク質刺激剤をコードする核酸などであってもよく、又はそれを含んでもよい。
【0270】
いくつかの特定の実施形態では、提供される医薬組成物は、治療有効量(例えば、確立されたプロトコルに従って投与された場合に有効である量)の提供されるオリゴヌクレオチド(本明細書に記載されるように、薬学的に許容可能な塩形態、例えば、ナトリウム塩アンモニウム塩などとして、提供され得る)を含むか又は送達する。いくつかの実施形態では、そのような提供される医薬組成物は、関連するオリゴヌクレオチドと、薬学的に許容可能な希釈剤、薬学的に許容可能な賦形剤、及び薬学的に許容可能な担体から選択される少なくとも1つの薬学的に許容可能な不活性成分とを含む。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチドの塩形態は、例えば、いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド中の負に荷電した酸性基(例えば、ホスフェート、ホスホロチオエートなど)の数まで、2つ以上のカチオンを含む。
【0271】
薬学的に許容可能な塩は、一般的に当業者に周知であり、限定するものではないが、例として、酢酸塩、ベンゼンスルホン酸塩、ベシル酸塩、安息香酸塩、重炭酸塩、重酒石酸塩、臭化物、エデト酸カルシウム、カルンシル酸塩(carnsylate)、炭酸塩、クエン酸塩、エデト酸塩、エジシル酸塩、エストレート(estolate)、エシレート(esylate)、フマル酸塩、グルセプト酸塩、グルコン酸塩、グルタミン酸塩、グリコリルアルサニレート(glycollylarsanilate)、ヘキシルレゾルシネート、ヒドラバミン、臭化水素酸塩、塩酸塩、ヒドロキシナフトエート、ヨウ化物、イセチオン酸塩、乳酸塩、ラクトビオン酸塩、リンゴ酸塩、マレイン酸塩、マンデル酸塩、メシル酸塩、ムチン酸塩(mucate)、ナプシル酸塩、硝酸塩、パモ酸塩(エンボネート(embonate))、パントテン酸塩、リン酸塩/二リン酸塩、ポリガラクツロン酸塩、サリチル酸塩、ステアリン酸塩、塩基性酢酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、タンニン酸塩、酒石酸塩、又はテオクル酸を挙げることができる。その他の薬学的に許容可能な塩は、例えば、Remington,The Science and Practice of Pharmacy(20th ed.2000)に記載されている。好ましい薬学的に許容可能な塩としては、例えば、酢酸塩、安息香酸塩、臭化物、炭酸塩、クエン酸塩、グルコン酸塩、臭化水素酸塩、塩酸塩、マレイン酸塩、メシル酸塩、ナプシル酸塩、パモ酸塩(エンボネート)、リン酸塩、サリチル酸塩、コハク酸塩、硫酸塩、又は酒石酸塩が挙げられる。
【0272】
当業者によって理解されるように、オリゴヌクレオチドは、例えば、医薬用途のためのいくつかの塩として製剤化されてもよい。いくつかの実施形態では、塩は、金属カチオン塩及び/又はアンモニウム塩である。いくつかの実施形態では、塩は、オリゴヌクレオチドの金属カチオン塩である。いくつかの実施形態では、塩は、オリゴヌクレオチドのアンモニウム塩である。代表的なアルカリ又はアルカリ土類金属塩には、ナトリウム、リチウム、カリウム、カルシウム、マグネシウムなどが含まれる。いくつかの実施形態では、塩は、オリゴヌクレオチドのナトリウム塩である。いくつかの実施形態では、薬学的に許容可能な塩には、適切な場合、提供されるオリゴヌクレオチド内にあり得る、水酸化物、カルボン酸塩、硫酸塩、リン酸塩、硝酸塩、スルホン酸塩、ホスホロチオエートなどの対イオンで形成される非毒性アンモニウムカチオン、四級アンモニウムカチオン、及びアミンカチオンが含まれる。当業者によって理解されるように、オリゴヌクレオチドの塩は、オリゴヌクレオチド内に2つ以上のアニオンが存在し得るように、2つ以上のカチオン、例えばナトリウムイオンを含有し得る。
【0273】
いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド、及びその組成物は、広い投与量範囲にわたって有効である可能性がある。例えば、成人の治療において、1日当たり約0.01~約1000mg、約0.5~約100mg、約1~約50mg、及び1日当たり約5~約100mgの投与量が、使用され得る投与量の例である。正確な投与量は、投与経路、化合物が投与される形態、治療される対象、治療される対象の体重、及び担当医の選好及び経験に依存する。
【0274】
いくつかの実施形態では、本開示は、例えば、他の治療剤及び/又は医療処置との併用療法のための技術(例えば、組成物、方法など)を提供する。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド及び/又は組成物は、1つ以上の他の治療剤とともに使用されてもよい。いくつかの実施形態では、提供される組成物は、提供されるオリゴヌクレオチドと、1つ以上の他の治療剤を含む。いくつかの実施形態では、1つ以上の他の治療剤は、組成物中の提供されるオリゴヌクレオチドと比較した場合、1つ以上の異なる標的、及び/又は標的に対する1つ以上の異なる機構を有し得る。いくつかの実施形態では、治療剤は、オリゴヌクレオチドである。いくつかの実施形態では、治療剤は、小分子薬物である。いくつかの実施形態では、治療剤は、タンパク質である。いくつかの実施形態では、治療剤は、抗体である。本開示に従って、多数の治療剤を利用することができる。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド又はその組成物は、1つ以上の他の治療剤及び/又は医療処置の前に、それと同時に、又はその後に投与される。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド又はその組成物は、1つ以上の他の治療剤及び/又は医療処置と同時に投与される。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド又はその組成物は、1つ以上の他の治療剤及び/又は医療処置の前に投与される。いくつかの実施形態では、提供されるオリゴヌクレオチド又はその組成物は、1つ以上の他の治療剤及び/又は医療処置の後に投与される。いくつかの実施形態では、提供される組成物は、1つ以上の他の治療剤を含む。
【0275】
医薬組成物の製造
本発明の組成物から医薬組成物を調製するために、薬学的に許容可能な担体は、固体又は液体のいずれかであってもよい。固体形態調製物としては、粉末剤、錠剤、丸剤、カプセル剤、カシェ剤、座薬、及び分散性顆粒剤が挙げられる。固体担体は、希釈剤、香味剤、結合剤、防腐剤、錠剤崩壊剤、又は封入材料としても機能し得る1つ以上の物質であり得る。
【0276】
粉末剤では、担体は、微細に分割された活性成分との混合物中の微細に分割された固体である。錠剤では、活性成分は、必要な結合特性を有する担体と適切な割合で混合され、所望の形状及びサイズに圧縮される。
【0277】
粉末剤及び錠剤は、5%~70%の治療剤を含有することが好ましい。適切な担体は、炭酸マグネシウム、ステアリン酸マグネシウム、タルク、糖、ラクトース、ペクチン、デキストリン、デンプン、ゼラチン、トラガカント、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、低融点ワックス、ココアバターなどである。「調製物」という用語は、他の担体を含むか又は含まない活性成分が担体で包囲されて、担体が活性成分と会合しているカプセルを提供する担体としてのカプセル化材料と活性治療剤との製剤を含むことが意図されている。同様に、カシェ剤及びトローチ剤が含まれる。錠剤、粉末剤、カプセル剤、丸剤、カシェ剤、及びトローチ剤は、経口投与に適した固形剤形として使用することができる。
【0278】
坐剤を調製するために、脂肪酸グリセリド又はココアバターの混合物などの低融点ワックスを最初に溶融し、活性成分を撹拌などによってその中に均一に分散させる。次に、溶融された均質な混合物を、都合のよいサイズの型に注ぎ、冷却して固化させる。
【0279】
液体形態調製物としては、溶液、懸濁液、及びエマルション、例えば、水又は水/プロピレングリコール溶液が挙げられる。非経口注射については、液体調製物は、ポリエチレングリコール水溶液の溶液中で製剤化することができる。
【0280】
非経口適用が必要な場合又は所望される場合、本発明の組成物に特に好適な混合物は、注射可能な滅菌溶液、好ましくは油性又は水性溶液、並びに懸濁液、エマルション、又は坐剤を含むインプラントである。特に、非経口投与用の担体には、デキストロースの水溶液、生理食塩水、純水、エタノール、グリセロール、プロピレングリコール、ピーナッツ油、ゴマ油、ポリオキシエチレンブロックポリマーなどが含まれる。アンプルは、便利な単位用量である。本発明の組成物はまた、リポソームに組み込まれてもよく、又は経皮ポンプ(transdermal pump)若しくはパッチを介して投与されてもよい。本発明での使用に適した医薬混合物としては、例えば、Pharmaceutical Sciences(17th Ed.,Mack Pub.Co.,Easton,PA)及びWO96/05309に記載したものが挙げられ、これらは参照により本明細書に組み込まれる。
【0281】
経口使用に適した水溶液は、活性成分を水に溶解し、所望に応じて適切な着色剤、風味剤、安定剤、及び増粘剤を加えることによって調製することができる。経口用途に適した水性懸濁液は、天然ゴム又は合成ゴム、樹脂、メチルセルロース、カルボキシメチルセルロースナトリウム、及び他の周知の懸濁剤などの粘性物質とともに、微粉化活性成分を水中に分散させることによって作製することができる。
【0282】
また、使用直前に経口投与用の液体形態調製物に変換されることが意図される固体形態調製物も含まれる。このような液体形態には、溶液、懸濁液、及びエマルションが含まれる。これらの調製物は、活性成分に加えて、着色剤、香味剤、安定剤、緩衝剤、人工及び天然甘味料、分散剤、増粘剤、可溶化剤などを含有してもよい。
【0283】
医薬調製物は、単位剤形であることが好ましい。このような形態では、調製物は、適切な量の活性成分を含有する単位用量に分割される。単位剤形は、包装された調製物であってもよく、パッケージには、分包錠剤、カプセル、及びバイアル又はアンプル中の粉末剤などの個別の調製量を含有する。また、単位剤形は、カプセル剤、錠剤、カシェ剤、又はトローチ剤自体であってもよく、又はこれらの任意の適切な数を包装された形態にすることができる。
【0284】
単位用量調製物における活性成分の量は、特定の用途及び活性成分の効力に従って変更又は調整され得る。組成物はまた、必要に応じて、他の適合性のある治療剤を含有してもよい。
【0285】
患者集団
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、神経変性(例えば、AD)に関連する疾患、障害、又は状態に罹患している、及び/又はそれらに罹患しやすい患者又は集団、又はそうでなければ神経発生の増加から利益を得るであろう患者又は集団である。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、神経筋機能障害、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患などの疾患、障害に罹患している、及び/又は罹患しやすい患者又は集団か、又はそうでなければ筋再生の増加から利益を得るであろう患者又は集団である)。
【0286】
いくつかの実施形態では、神経変性疾患、障害、又は状態は、アルツハイマー病(AD)、パーキンソン病、認知症(例えば、前頭側頭型認知症)、脳卒中、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連障害及び嗜癖障害(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)、側頭葉てんかん、海馬硬化症、ニーマンピック病C型、糖尿病媒介性海馬ニューロン損失、脳損傷(例えば、外傷性及び/又は無酸素性脳損傷)、ハンチントン病のうちの1つ以上である。
【0287】
いくつかの実施形態では、集団は、追加的又は代替的に、肺の疾患又は障害に罹患している、及び/又は罹患しやすい可能性がある。いくつかの実施形態では、そのような疾患又は障害は、特発性肺線維症(IPF)、急性呼吸窮迫症候群(ARDS)、肺炎、及びウイルス感染による肺合併症のうちの1つ以上である。
【0288】
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、モデル生物である。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、ヒトである。いくつかの実施形態では、ヒトは、約0ヶ月~約6ヶ月齢、約6~約12ヶ月齢、約6~約18ヶ月齢、約18~約36ヶ月齢、約1~約5歳、約5~約10歳、約10~約15歳、約15~約20歳、約20~約25歳、約25~約30歳、約30~約35歳、約35~約40歳、約40~約45歳、約45~約50歳、約50~約55歳、約55~約60歳、約60~約65歳、約65~約70歳、約70~約75歳、約75~約80歳、約80~約85歳、約85~約90歳、約90~約95歳又は約95~約100歳の範囲の年齢を有する。
【0289】
いくつかの実施形態では、ヒトは、ヒト乳児である。いくつかの実施形態では、ヒトは、ヒト幼児である。いくつかの実施形態では、ヒトは、ヒト小児である。いくつかの実施形態では、ヒトは、ヒト成人である。更に他の実施形態では、ヒトは、高齢のヒトである。
【0290】
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、年齢層、性別、遺伝的背景、既存の臨床状態、療法への以前の曝露などの1つ以上の基準によって特徴付けられ得る。
【0291】
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、例えば、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患に罹患している患者又は集団である。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、手術を受けたか、又は傷害、外傷、及び/又は長期固定化(例えば、床上安静又はギプス固定による)を経験した、罹患している患者又は集団である。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、サルコペニアに罹患している患者である。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、外傷、遺伝性疾患、筋障害、及び老化を含むがこれらに限定されない疾患又は状態に起因する筋線維症に罹患しているか、又はそのリスクがあるものである。外傷は、例えば、放射線処理、圧挫損傷、裂傷、及び切断から生じる可能性がある。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、先天性筋ジストロフィー、デュシェンヌ型筋ジストロフィー、ベッカー型筋ジストロフィー、筋萎縮性側索硬化症(ALS)、加齢に伴うサルコペニア、遠位型筋ジストロフィー、エメリー・ドレヒュス型筋ジストロフィー、顔面肩甲上腕型筋ジストロフィー、肢帯型筋ジストロフィー、筋強直性筋ジストロフィー、及び眼球咽頭型筋ジストロフィーなどの筋線維症に関連する遺伝性疾患に罹患しているか、又はそのリスクがある患者又は集団である。
【0292】
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、アルツハイマー病に関連する疾患又は障害のためのスクリーニングツールに従って定義され得る。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、神経変性によって特徴付けられる他の疾患、例えば、パーキンソン病、認知症(例えば、前頭側頭型認知症)、脳卒中、大うつ病性障害(MDD)、双極性障害、統合失調症、外傷後ストレス障害(PTSD)、物質関連障害及び嗜癖障害(例えば、慢性コカイン使用及び生涯喫煙)、側頭葉てんかん、海馬硬化症、ニーマンピック病C型、糖尿病媒介性海馬ニューロン損失、脳損傷(例えば、外傷性及び/又は無酸素性脳損傷)、及びハンチントン病、のためのスクリーニングツールに従って定義されてもよい。
【0293】
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、筋線維症及び/又は筋消耗に関連する疾患又は障害のためのスクリーニングツールに従って定義され得る。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、筋線維症及び/又は筋消耗に関連する疾患を診断するためのスクリーニングツール及び方法に従って定義され得る。
【0294】
いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、構造的イメージング(例えば、磁気共鳴画像法(MRI)、コンピューター断層撮影法(CT)、超音波診断など)で得られた結果に従って定義されてもよい。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、認知検査の結果に応じて定義されてもよい。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、神経学的検査の結果応じて定義されてもよい。いくつかの実施形態では、認知検査には、運動スクリーニングタスク(MOT)、反応時間(RTI)、対連合学習(PAL)、空間作業記憶(SWM)、パターン認識記憶(PRM)、遅延見本合わせ(DMS)、急速視覚情報処理(RVP)のうちの1つ以上の試験が伴う。急速視覚情報処理(RVP)、遅延見本合わせ(DMS)、見本合わせ視覚探索(MTS)。いくつかの実施形態では、適切な患者又は集団は、筋酵素の測定、EMG、筋生検、遺伝子検査、心臓検査(例えば、ECG)、力及び呼吸機能の評価などの評価結果に応じて定義され得る。
【0295】
投与
当業者であれば、いくつかの実施形態では、対象、特にヒトに投与される投与量は、例えば、用いられる特定の治療剤及び/又は製剤、投与方法、投与レジメン、治療される特定の対象の1つ以上の特性などに応じて変化し得ることを理解するであろう。いくつかの実施形態では、当該分野の熟練の臨床医は、特定の病状を治療又は予防するために、ヒト又は他の対象に投与される治療剤の治療有効量を決定する。治療効果を得るために必要な治療剤の正確な量は、当業者にとって多くの対象特有の考慮事項に加えて、例えば、治療剤の特異的活性、及び投与経路などの多数の要因に依存する。
【0296】
いくつかの実施形態では、投与は、眼、経口、頬側、皮膚(例えば、真皮、皮内、皮間、経皮などへの局所適用のうちの1つ以上であってもよく、又はそれを含んでもよい)、腸内、動脈内、皮内、胃内、髄内、筋肉内、鼻腔内、腹腔内、髄腔内、静脈内、脳室内、特定の臓器内(例えば肝内)、粘膜、経鼻、経口、直腸、皮下、舌下、局所、気管内(例えば気管内注入による)、膣内、硝子体などであってもよい。
【0297】
本開示を読んだ当業者であれば、いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物の筋肉への送達を達成することが望ましい場合があることを理解するであろう。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物の、CNS(例えば、海馬及び/又は脳室下領域などの脳)及び/又は肺への送達を達成することが望ましい場合がある。
【0298】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物は、全身送達及び/又は筋肉への局所送達を介して(例えば、筋肉内注射を介して)送達される。
【0299】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物は、ウイルスベクターを使用して投与され、核酸ペイロードの形態でMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物を効果的に送達する。いくつかの実施形態では、ウイルスベクターは、特定の細胞タイプ(例えば、筋芽細胞、筋細胞、筋管、衛星細胞、及び筋線維)を標的とする。AAV1、AAV6、及びAAV9ベクターは、異なる筋細胞タイプを標的とするために使用されている(例えば、Arnett et al.,Mol Ther Methods Clin Dev.1.pii:14038,2014及びRiaz et al.,Skeletal Muscle 5(37)2015を参照されたい)。
【0300】
本開示を読んだ当業者であれば、いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物のCNSへの送達を、及びいくつかの実施形態では脳への送達を達成することが望ましい場合があることを理解するであろう。
【0301】
いくつかの実施形態では、全身投与は、CNS(例えば、脳、例えば、海馬及び/又は脳室下帯)への送達を達成する。いくつかの実施形態では、薬剤(例えば、刺激剤又はMuSK標的化オリゴヌクレオチド)は、脳室内投与を介して中枢神経系(CNS)に送達される。
【0302】
更に、特定のウイルスベクターは、ニューロンを選択的に標的とし、遺伝子ペイロードを効果的に脳に送達することが知られている。例えば、AAV2/1ベクターは、核酸ペイロード(例えば、遺伝子療法、コードRNAなど)を海馬の神経細胞に効果的に送達するために確立されている。例えば、Hammond et al PLoS One 12:e0188830,2017、Guggenhuber et al PLoS One 5:e15707,2010、Lawlor et al Mol.Neurodeg.2:11,2007を参照されたい)。同様に、ある特定のAAVベクター(例えば、AAV2/1及び/又はAAV4ベクター)は、脳室下帯細胞中のある特定の細胞を標的とし、核酸ペイロードを効果的に送達するように確立されている。例えば、Liu et al Gene Thep 12:1503,2005、Bockstael et al Hum Gene Therap 23:doi.org/10.1089/hum.2011.216,2012を参照されたい)。
【0303】
神経変性に関連する疾患、障害、又は状態に罹患しているか、又は罹患しやすい対象の場合、CNSへの、例えば脳への(例えば、海馬及び/又は脳室下領域への)送達を達成する投与が望ましい場合がある。
【0304】
いくつかの実施形態では、効果的な送達は、本明細書に記載される組成物の全身投与によって達成され得る。代替的又は追加的に、いくつかの実施形態では、効果的な送達は、CNS及び/又は脳への局所投与によって、例えば、髄腔内及び/又は腔内(例えば、脳室内)送達によって達成され得る。
【0305】
CNS及び/又は脳への局所投与のための技術が開発され、例えば、様々なタンパク質治療剤に対して(例えば、Calias et al.,Pharmacol.& Therap.144:122,2014を参照されたい)、小分子に対して(例えば、Dodou Pharm.J.289:501,2012を参照されたい)、細胞組成物に対して(例えば、Eftekharzadeh et al.,Iran J Basic Med Sci 18:520,2015を参照されたい)、及び核酸治療剤(例えば、Otsuka et al,J.Neurotrauma 28:1063,2011を参照されたい;また、オナセムノゲン アベパルボベク-xioi[Zolgensma(商標)という商品名で販売された]、及びヌシネルセン[Spinraza(商標)という商品名で販売された]の処方情報も参照されたい)有効であることが実証されている。
【0306】
当業者であれば、髄腔内送達は、細胞、タンパク質、及び核酸治療剤を含む海馬への送達を達成するために特に効果的であり得ることを認識するであろう。
【0307】
全身投与技術(例えば、経口、非経口、粘膜などを含む)は、多種多様な薬剤に対して十分に確立されている。いくつかの実施形態では、CNS及び/又は脳送達を達成する全身投与は、血液脳関門(BBB)を通過する能力に依存し得る。
【0308】
特定の活性薬剤及び/又は送達システムは、BBBを通過することが知られている。最近の技術は、歴史的に、その点で特に困難であると考えられていた、オリゴヌクレオチドなどの薬剤でさえもCNS及び/又は脳への送達を達成することが示されている。一例を挙げると、参照により本明細書に組み込まれる、Min et al.Angew Chem Int Ed Engl doi:10.1002/anie.201914751,2020は、BBBを横切ってオリゴヌクレオチドを輸送するグルコースコーティングされた高分子ナノ担体を記載する。
【0309】
また、オリゴヌクレオチド治療剤への特定の化学物質の組み込みは、BBBを横切るそれらの移動を容易にし得ることも報告されている。例えば、Khorkova et al(Nature Biotech 35:249,2017、参照により本明細書に組み込まれる)は、
「2’修飾ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド...は、単回注射後最大6ヶ月間脳における効果が持続する、それらの長い半減期を考慮すると、CNS障害に特に適合できる可能性があることを記載している。別のタイプの糖部分の修飾である、ロックド核酸(LNA)では、2’酸素と4’炭素を接続するブリッジが導入される。この修飾は、LNA-DNA及びLNA-RNAハイブリッドの融解温度を大幅に上昇させ、したがって、バイオアベイラビリティの増加及び製造コストの低減を伴う、より短いODNベースの化合物の生成を可能にする。立体構造的に拘束されたオリゴヌクレオチド類似体である最近提案されたトリシクロ-DNAは、糖のC(5’)とC(3’)との間に3個の追加のC原子を有する(
図2)。この修飾は、安定性、疎水性、及びRNA親和性を増加させ、組織への取り込み及びBBB透過性を改善する。
(引用省略)。
【0310】
特発性肺線維症(IPF)、急性呼吸窮迫症候群(ARDS)、肺炎、及びウイルス感染による肺合併症などの疾患又は障害に罹患しているか、又は罹患しやすい対象の場合、肺への送達を達成する投与が望ましい場合がある。
【0311】
いくつかの実施形態では、オリゴヌクレオチド(例えば、アンチセンスオリゴヌクレオチド)は、標的部位へのそれらの送達を強化するために開発される。当技術分野に記載されるように、オリゴヌクレオチドは、送達を強化するために、追加の化学的部分(例えば、担体又はリガンド)に共有結合又は非共有結合される。Thomas C.Roberts et al.Nature Reviews Drug Discovery volume 19,pages 673-694(2020)を参照されたい。その全体が参照により本明細書に組み込まれる)。
【0312】
当業者によって理解されるように、標的部位への送達オリゴヌクレオチドを強化するために、様々なバイオコンジュゲーションの技術を利用することができる。例えば、オリゴヌクレオチドは、脂質(例えば、循環中のリポタンパク質粒子との相互作用を促進するコレステロール)、ペプチド(細胞標的化及び/又は細胞浸透用)、アプタマー、抗体、及び糖(例えば、標的部位へのより安全な送達を強化するためのN-アセチルガラクトサミン(Verma,Ann Indian Acad Neurol.2018 21(1):3-8.doi:10.4103/aian.AIAN_298_17を参照されたい)、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc))に共有結合的にコンジュゲートされ得る。
【0313】
当業者によって理解されるように、脂質コンジュゲートとしては、例えば、コレステロール、α-トコフェロール(ビタミンE)、長鎖(>C18)脂肪酸、リポタンパク質粒子(例えば、HDL及びLDL)などに結合したオリゴヌクレオチドが挙げられる。
【0314】
当業者によって理解されるように、N-アセチルガラクトサミン(GalNAc)のコンジュゲートは、オリゴヌクレオチドの標的部位(例えば、肝細胞)への取り込みを強化することができる。
【0315】
当業者によって理解されるように、抗体及びアプタマーコンジュゲートを使用して、オリゴヌクレオチド送達を強化することができる。オリゴヌクレオチド送達に対し、例えばHIV gp160タンパク質、HER2,CD7(T細胞マーカー)、CD71(心筋及び骨格筋で高度に発現されるトランスフェリン受容体)、及びTMEFF2を含む、様々な受容体を標的とすることが成功している。同様に、オリゴヌクレオチドはまた、CD44(神経幹細胞マーカー)、EPHA2、及びEGFR193に対する抗体とコンジュゲートされている。更に、アプタマーをオリゴヌクレオチドにコンジュゲートして、その送達を強化することができる。
【0316】
当業者によって理解されるように、様々なナノ担体を使用して、オリゴヌクレオチド送達を強化することができる。例えば、オリゴヌクレオチドは、カチオン性ポリマー(例えば、ポリエチレンイミン)、デンドリマー、CPP(例えば、MPG-8、PepFect6、RVG-9R228、及びXentry-KALA229)及び無機方法(例えば、リン酸カルシウムナノ粒子)と非共有結合複合体を形成することができる。
【0317】
当業者によって理解されるように、様々なリポプレックス及びリポソーム(例えば、脂質ナノ粒子(LNP))を使用して、オリゴヌクレオチド送達を強化することができる。
【0318】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、標的部位へのその送達を強化するために、(例えば、糖、ペプチド、抗体、アプタマー、脂質などとコンジュゲートされた)バイオコンジュゲートを形成するように改変される。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、標的部位へのその送達を強化するために、リポプレックス及びリポソーム(例えば、脂質ナノ粒子(LNP))として製剤化される。
【0319】
標的部位、例えば筋肉へのASOの細胞送達の効率を改善するために、特定の技術が開発されてきた。例えば、アミノグリコシド(AG)は、インビトロ及びインビボの両方でアンチセンスホスホロジアミデートモルホリノオリゴマー(PMO)の送達を改善することが示されている(Wang,et al.,Mol Ther Nucleic Acids,2019;16:663-674,doi:10.1016/j.omtn.2019.04.023を参照されたい)。共有結合を介してオリゴヌクレオチドに直接結合され得るか又は非共有結合ナノ粒子複合体の形成を介して、短い細胞膜透過性ペプチド(CPP)は、細胞取り込みを促進することができる(McClorey et al.;Biomedicines 2018,6(2),51)。ASO脂肪酸コンジュゲートもまた、筋肉におけるアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)の機能的取り込みを強化すると報告されている(Prakash et al.;Nucleic Acids Research,47,2019,6029-6044を参照されたい)。
【0320】
当業者とって、デュシェンヌ型筋ジストロフィー(DMD)に対する承認された治療剤であるエテプリルセン(ExonDys 51)はよく知られており、これは第3世代のホスホロジアミデートモルホリノASOである。
【0321】
Exondys 51(商標)という商品名で販売されているエテプリルセン(Sarepta Therapeutics’)は、プレmRNAのエクソン51を切り出し、適応可能なフレームシフト変異を有する患者の13%でリーディングフレームを回復させる(Crudele et al.Human Molecular Genetics,Volume 28,Issue R1,pp.R102-R107,2019)。
【0322】
エテプリルセンは、静脈内注入を介して35~60分間かけて投与される。具体的には、その推奨投与量は、毎週体重1kg当たり30mgである。単回投与バイアルでは、医薬組成物は、100mg/2mL又は500mg/mL(50mg/mL)溶液として製剤化される。
【0323】
当業者は、オリゴヌクレオチド治療剤で使用される他の送達システムについても更に精通しているであろう。例えば、TTR(遺伝性トランスサイレチン型アミロイドーシス、多発ニューロパチー)の治療のためにAlnylam Pharmaによって開発された、最初の承認されたRNAiオリゴヌクレオチド治療剤であるパチシラン(Onpattro)は、ナノ粒子送達システム(すなわち、脂質ナノ粒子、LNP製剤)を利用し、ステロイド及び抗ヒスタミン剤との併用治療も含まれる。
【0324】
パチシランは、静脈内注入を介して投与される。特に、体重が100kg未満の患者については、その推奨投与量は0.3mg/kgを3週間に1回である。体重が100kg以上の患者については、推奨投与量は30mgを3週間に1回である。
【0325】
他の承認されたオリゴヌクレオチド治療剤は、典型的には、例えば目、肝臓、骨格筋、脊髄などの様々な臓器への静脈内注入を介して投与される。
【0326】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド治療剤は、静脈内投与されてもよい。いくつかのこのような実施形態では、そのようなオリゴヌクレオチド治療剤は、エテプリルセン[Exondys 51(商標)という商品名で販売されている]に使用されるレジメンに合理的に匹敵するレジメンに従って投与されてもよい。いくつかのこのような実施形態では、そのようなオリゴヌクレオチド治療剤は、パチシラン[Onpattroという商品名で販売されている]に使用されるレジメンに合理的に匹敵するレジメンに従って投与されてもよい。
【0327】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のMuSK標的化オリゴヌクレオチドの低用量は、12mgである。いくつかの実施形態では、1回投与当たり合計5mg~60mgのMuSK標的化オリゴヌクレオチドが対象に投与される。いくつかの実施形態では、1回投与当たり合計12mg~48mgのMuSK標的化オリゴヌクレオチドが対象に投与される。いくつかの態様では、1回投与当たり合計12mg~36mgのMuSK標的化オリゴヌクレオチドが対象に投与される。いくつかの態様では、1回投与当たり合計12mgのMuSK標的化オリゴヌクレオチドが対象に投与される。
【0328】
当業者にとって、ヌシネルセン[Spinraza(商標)という商品名で販売]、が、生存運動ニューロン-2(SMN2)指向遺伝子転写を標的とし、小児及び成人患者における脊髄性筋萎縮症(SMA)の治療に適応する、アンチセンスオリゴヌクレオチド治療剤であることはよく知られているであろう。Spinrazaは、髄腔内に投与される。特に、その推奨用量は、4回の負荷用量を含むレジメンに従って、1回の投与当たり単回用量バイアルで12mg/5mL(2.4mg/mL)であり、最初の3回は14日間隔で投与され、4回目は3回目の用量の30日後に投与され、その後維持用量が4ヶ月ごとに1回投与される。ベースライン時及び各投与前に、血小板数、凝固検査、及び定量的スポット尿タンパク質検査を行うことが推奨される。
【0329】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド治療剤は、髄腔内に投与することができる。いくつかのこのような実施形態では、そのようなオリゴヌクレオチド治療剤は、ヌシネルセン[Spinraza(商標)]という商品名で販売されているに使用されるレジメンに合理的に匹敵するレジメンに従って投与されてもよい。
【0330】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のオリゴヌクレオチド治療剤は、髄腔内に投与することができる。いくつかのこのような実施形態では、そのようなオリゴヌクレオチド治療剤は、ヌシネルセン[Spinraza(商標)]という商品名で販売されているに使用されるレジメンに合理的に匹敵するレジメンに従って投与されてもよい。
【0331】
本明細書に記載のオリゴヌクレオチド治療剤は、本明細書に記載の投与レジメンのいずれかに従って投与されてもよい。
【0332】
細胞療法
本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物が(例えば、神経前駆細胞であるか、又は神経前駆細胞を含む細胞集団において)神経発生を促進する能力を考慮すると、本開示を読む当業者は、とりわけ、本開示は、細胞集団中に存在する神経細胞のレベルを強化するための技術を提供することを理解するであろう。すなわち、元の細胞集団を、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物と接触させることは、元の集団におけるものと比較して、神経細胞のレベル及び/又は割合が増加した結果として生じる集団を生成することができ、本明細書に記載されるそのようなMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物の投与により、このような増加を達成することができる。
【0333】
更に、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物は、筋再生を促進し(例えば、SC、MPC、及び/又は筋芽細胞であるか、又はそれらを含む細胞集団において)、本開示を読む当業者は、とりわけ、本開示は、細胞集団中に存在するSC、MPC、及び/又は筋芽細胞のレベルを強化するための技術を提供することを理解するであろう。すなわち、元の細胞集団を、本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物と接触させることは、元の集団におけるものと比較して、SC、MPC、及び/又は筋芽細胞のレベル及び/又は割合が増加した結果として生じる集団を生成することができ、本明細書に記載されるそのようなMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物の投与により、このような増加を達成することができる。
【0334】
いくつかの実施形態では、元の細胞集団は、NSC及び/又はNPCであってもよく、又はNSC及び/又はNPCを含んでもよい。いくつかの実施形態では、元の細胞集団は、SC、MPC、及び/又は筋芽細胞であってもよく、又はそれらを含んでもよい。いくつかの実施形態では、元の細胞集団は、胚性幹細胞及び/又は多能性幹細胞であるか、又はそれらを含む。いくつかの実施形態では、胚性幹細胞及び/又は多能性幹細胞は、例えば、当技術分野で公知の技術を使用して、神経又は神経前駆細胞に分化しているか、又は分化されている(例えば、米国特許第9,631,175号を参照されたい)。いくつかの実施形態では、胚性幹細胞及び/又は多能性幹細胞は、例えば、当技術分野で公知の技術を使用して、筋原性前駆細胞に分化しているか、又は分化されている(例えば、Miyagoe-Suzuki et al.,Stem Cells Int.7824614 2017)。
【0335】
いくつかの実施形態では、上で論じたように、細胞集団への投与は、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物を送達し、それが、関連する元の細胞集団にインビボで(例えば、ヒトにおいて、特に成人ヒトにおいて、例えば、脳内、例えば、そのようなヒトの脳-例えば海馬及び/又は脳室下領域内で)曝露される(すなわち、接触される)ようにする。
【0336】
いくつかの実施形態では、上で論じたように、投与は、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物を送達し、それが、関連する元の細胞集団にインビボで(例えば、ヒトにおいて、特に成人ヒトにおいて、例えば、そのようなヒトの、筋肉組織内で)曝露される(すなわち、接触する)ようにする。
【0337】
いくつかの実施形態では、本開示による投与は、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物を、神経前駆細胞、SC、MPC、及び/又は筋芽細胞であるか、又はそれを含み得る、細胞集団(例えば、細胞の元の集団)と、例えば、エクスビボで、接触させる。例えば、いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物は、対象由来の細胞集団にエクスビボ(例えば、インビトロ)で投与される。いくつかの実施形態では、対象から得られた細胞集団。
【0338】
機能性Ig3を欠く形態を優先するために、MuSK転写物のエクソンスキッピングを導く、かつ/又は機能性Ig3を含む形態の直接的な分解(及び/又は翻訳をブロック)を導く、オリゴヌクレオチドを利用することができる。
【0339】
いくつかの実施形態では、細胞集団を、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物と接触させ、同時に又は続いて刺激及び/又は増殖させる。代替的又は追加的に、細胞集団は、活性化NSCの特徴(例えば、Dexの発現)又は衛星細胞の特徴を示す細胞について、又は筋原性因子(例えば、Pax7、MyoD、ミオゲニン、及びMERGE)の発現について、又はMuSK-BMPシグナル伝達経路に関連する遺伝子(例えば、RGS4、Msx2、Myf5、Ptx3、Id1)の発現の減少/欠如について濃縮及び/又は選択される。
【0340】
いくつかの実施形態では、元の細胞集団をMuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物とエクスビボで接触させることによって達成された結果、得られる細胞集団を、次に対象に投与する。いくつかの実施形態では、結果として生じる細胞集団は、神経筋機能障害、神経変性障害(例えば、AD)、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患などの疾患若しくは障害に罹患しているか、又は罹患しやすい対象に投与される。いくつかの実施形態では、結果として得られる細胞集団は、元の細胞集団が取得された対象に投与される。いくつかの実施形態では、得られた細胞集団は、元の細胞集団が取得された対象とは異なる対象に投与され、いくつかのこのような実施形態では、元の集団は、健康な対象から取得され、得られた集団は、神経変性障害(例えば、AD)、神経筋機能障害、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患に罹患しているか、又は罹患しやすい対象に投与される。
【0341】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド組成物と接触させた細胞集団を投与することは、対象における神経筋機能障害、神経変性障害(例えば、AD)、心臓障害(例えば、心筋梗塞、心筋症)、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患などの疾患又は障害を効果的に治療する。
【0342】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載される刺激及び/又は拡張されたNSC、SC、MPC、及び/又は筋芽細胞の集団は、細胞治療剤に製剤化され得る。いくつかの実施形態では、細胞治療剤には、薬学的に許容可能な担体、希釈剤、及び/又は賦形剤が含まれる。本明細書に記載される薬学的に許容可能な担体、例えばビヒクル、アジュバント、賦形剤、及び希釈剤は、当業者に周知であり、容易に入手可能である。好ましくは、薬学的に許容可能な担体は、例えば、細胞治療剤などの活性剤に対して化学的に不活性であり、使用条件下で有害な副作用又は毒性を引き起こさない。
【0343】
いくつかの実施形態では、細胞治療剤は、例えば、静脈内、腫瘍内、動脈内、筋肉内、腹腔内、髄腔内、硬膜外、及び/又は皮下投与経路などの任意の適切な経路による投与のために製剤化され得る。好ましくは、細胞治療剤は、非経口投与経路用に製剤化される。いくつかの実施形態では、細胞治療剤は、注入を介して対象に投与される。
【0344】
いくつかの実施形態では、非経口投与に適した細胞治療剤は、水性又は非水性の等張性滅菌注射溶液であってもよく、これは、例えば、抗酸化剤、緩衝剤、静菌剤、及び組成物を意図されるレシピエントの血液と等張性にする溶質を含有し得る。水性又は非水性の滅菌懸濁液は、1つ以上の懸濁剤、可溶化剤、増粘剤、安定剤、及び防腐剤を含有し得る。
【0345】
いくつかの実施形態では、本明細書に記載の単一の治療用細胞は、増殖させ、治療的利益を提供することができる。いくつかの実施形態では、102個以上、例えば、103個以上、104個以上、105個以上、又は108個以上の治療用細胞が、細胞治療剤として投与される。代替的に、又は追加的に、本明細書に記載される1012個以下、例えば、1011個以下、109個以下、107個以下、又は105個以下の治療用細胞が、細胞治療剤として対象に投与される。いくつかの実施形態では、本明細書に記載に記載される102~105、104~107、103~109、又は105~1010個の治療用細胞が、細胞治療剤として投与される。
【0346】
本明細書に記載される細胞治療剤の用量は、必要に応じて、一度に、又は好適な期間にわたって、例えば、毎日、週2回、毎週、隔週ごと、半月ごと、隔月ごと、半年ごと、若しくは年1回ベースなどで、一連の部分用量(subdose)で対象に投与することができる。有効量の細胞治療剤を含む投与単位は、1日1回用量で投与されてもよく、又は1日総投与量は、必要に応じて、1日2回、3回、4回、又はそれ以上の分割用量で投与されてもよい。いくつかの実施形態では、細胞治療剤は、別の療法と組み合わせて投与される。
【0347】
併用療法
いくつかの実施形態では、本明細書に記載のMuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、別の療法と組み合わせて施与され、例えば、対象が両方の療法に同時又は順次曝露される。
【0348】
本明細書に記載されるMuSK標的化オリゴヌクレオチド療法の投与量、及び併用で投与される別の療法の投与量、並びに投与スケジュールは、治療される疾患(例えば、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患)、対象の全般的な健康、及び投与医師の判断を含むが、これらに限定されない、様々なパラメータに依存し得る。
【0349】
MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、他の療法の施与前(例えば、5分、15分、30分、45分、1時間、2時間、4時間、6時間、12時間、24時間、48時間、72時間、96時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、8週間、又は12週間前)、他の療法同時に、又は他の療法の施与後(例えば、5分、15分、30分、45分、1時間、2時間、4時間、6時間、12時間、24時間、48時間、72時間、96時間、1週間、2週間、3週間、4週間、5週間、6週間、8週間、又は12週間後)に、それを必要とする対象に施与できる。様々な実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法と他の療法とは、1分間隔、10分間隔、30分間隔、1時間未満間隔、1時間間隔、1時間~2時間間隔、2時間~3時間間隔、3時間~4時間間隔、4時間~5時間間隔、5時間~6時間間隔、6時間~7時間間隔、7時間~8時間間隔、8時間~9時間間隔、9時間~10時間間隔、10時間~11時間間隔、11時間~12時間間隔、24時間以内間隔、又は48時間以内間隔で施与される。一実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法及び他の療法は、3時間以内に施与される。別の実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法及び他の療法は、1分~24時間間隔で施与される。
【0350】
MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法と他の療法との相乗的組み合わせは、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患に罹患している対象への、これらの薬剤のうちの一方若しくは両方のより低い投与量の使用、及び/又は療法のより少ない頻度の投与を可能にし得る。相乗効果は、これらの薬剤の有効性の改善、及び/又はいずれかの薬剤単独での使用に関連する任意の有害又は望ましくない副作用の低減をもたらし得る。
【0351】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、関連する疾患、障害、又は状態(例えば、神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患)に対する標準治療と組み合わせて投与される。
【0352】
DMDの療法には、デフラザコート(Emflaza、PTC Therapeutics)エテプリルセン(Exondys 51、Sarepta Therapeutics)、アタルレン(Translarna、PTC Therapeutics)、及びプレドニゾンなどのグルココルチコイドが含まれる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、DMDに対する1つ以上の療法と組み合わせて投与される。
【0353】
ALSに対する承認された治療法には、Radicava、Rilutek、Tiglutik、及びNuedextaが含まれる。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、ALSに対する1つ以上の療法と組み合わせて施与される。
【0354】
心筋症に対する承認された療法としては、アンジオテンシンII変換酵素(ACE)阻害剤、アンジオテンシンII受容体拮抗薬(ARB)、及びスピロノラクトンが挙げられるが、これらに限定されない。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、心筋症に対する1つ以上の療法と組み合わせて施与される。
【0355】
いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、関連する疾患、障害、若しくは状態、又はそれに対する治療の症状又は特徴を軽減する1つ以上の療法と組み合わせて施される。いくつかの実施形態では、MuSK標的化オリゴヌクレオチド療法は、症状又は特徴を軽減する1つ以上の他の療法と組み合わせて施与され、その結果、当該他の療法に関連する副作用が軽減される。いくつかの実施形態では、療法に伴う副作用は、吐き気、嘔吐、食欲不振、筋痙攣及びれん縮、排便頻度の増加、頭痛、錯乱及びめまい、便秘、疲労、過剰な唾液及び痰、疼痛、うつ病、睡眠障害、並びに制御不能な笑いや泣きの爆発のうちの1つ以上を特徴とする。
【0356】
神経筋機能障害、神経変性障害、心臓障害、又は筋消耗を特徴とする遺伝性疾患の治療又は予防に有用であることが知られているか、又は使用されてきた、使用されるであろう、若しくは現在使用されている任意の療法は、本明細書に記載される本発明によるMuSK標的化オリゴヌクレオチド療法と組み合わせて使用することができる。
【実施例】
【0357】
実施例1:MuSK標的化オリゴヌクレオチドの設計及びスクリーニング
本実施例では、ヒトMuSK標的化オリゴヌクレオチドを設計し、MuSKエクソン6及び/又はエクソン7のエクソンスキッピングを誘導する能力について試験した。
【0358】
方法
A.細胞型
細胞型の選択は、MuSKの発現及び研究に対する細胞型の関連性に基づいていた。2つの細胞型を保持し、試験した:
【0359】
1.HEK293(ATCC、CRL-1573)は、神経原性系統に分化する能力のため、神経科学研究で一般的に使用される細胞株である(Shaw et al.,2002)。
【0360】
2.LHCN-M2(Evercyte社、CkHT-040-231-2)は、MuSKを高度に発現することが示された細胞株である(ProteinAtlas社による19.8NX)。HEK293では、MuSK発現は変動し、時にはqPCRで検出するのに十分に高くなかった。LHCN-M2では、MuSK発現がより一貫しており、検出可能であった。したがって、LHCN-M2を選択した。
【0361】
B.細胞培養
LHCN-M2をEvercyte(CkHT-040-231-2)から入手し、製造元のプロトコルに従って培養した。
【0362】
細胞容器を、80μl/cm2の水中0.1%ブタゼラチン(Sigma-Aldrich、カタログ番号G1890)で、37℃で少なくとも4時間、最大1週間プレコーティングした。細胞を播種する前に、過剰なゼラチンを除去した。
【0363】
剥離のために、細胞をPBS(Thermofisher、14190144)で2回すすぎ、トリプシン-EDTA溶液(Sigma、T3924-100ML)(室温、20μl/cm2)で2分間インキュベートした。
【0364】
細胞が剥離したら、約160μl/cm2の増殖培地をトリプシンに添加した。細胞をピペッティングにより剥がし、適切な密度(1/2~1/6)で希釈した。増殖培地の最終体積は240μl/cm2であった。
【0365】
LHCN-M2細胞を、5%CO2を含む加湿雰囲気中、37℃でMyoUp培地で増殖させた。細胞は、約30~40%のコンフルエンスに達した時点で、週に2回継代した。
【0366】
MyoUp培地:
DMEM(Thermofisherカタログ番号10566016)/M199(Gibco、カタログ番号31150022)(4+1)
15%ウシ胎仔血清(FBS)(Hyclone、SH30071.03)
20mM Hepes(Sigma Aldrich、カタログ番号H0887)
3μg/ml硫酸亜鉛(Sigma、カタログ番号Z0251)
1.4μg/mlビタミンB12(Sigma、カタログ番号V2876)
0.055μg/ml デキサメタゾン(Sigma Aldrich、カタログ番号D4902)
2.5ng/ml HGF(Merck Millipore、カタログ番号GF116)
10ng/ml bFGF(Peprotech、カタログ番号100-18C)
【0367】
C.ASOトランスフェクション
ASOを細胞培養グレードの水で希釈して、100μMの濃度に到達させ、-20℃で保存した。
【0368】
LHCN-M2細胞を、ゼラチンコーティングされた6ウェルプレートに、35,000細胞/ウェル、2.25mLで播種した。2日後、細胞は60%のコンフルエンシーに達し、製造元のプロトコルに従って、ASO及びリポフェクタミンRNAiMAX(Invitrogen、13778150)でトランスフェクトする準備が整った。
【表16】
【0369】
トランスフェクションの24時間後、細胞をPBSですすぎ、RNAを抽出した。
【0370】
D.RNA抽出
最良のRNA抽出率を得るために、2つのキットを試験した。Zymo Research Quick-RNA(商標)Miniprep Kit(カタログ番号50444597)及びQiagen RNeasy Plus Mini Kit(カタログ番号74136)。
【0371】
細胞を、45,000細胞/ウェルの密度で6ウェルプレートに播種した。播種の2日後にRNAを抽出した。RNA濃度を、ナノドロップ(Thermofisher、NanoDrop(商標)8000分光光度計)を使用して測定し、結果を表3に示す。
【表3-1】
【表3-2】
表3:ZYMO又はQIAGEN抽出キットを用いたLHCN-M2細胞からのRNA抽出の収量。
【0372】
Zymoキットでは、3.82μg/ウェルのRNA抽出の収量が得られ、一方Qiagenキットでは2.9μg/ウェルが得られた。したがって、Zymoキットを研究に選択した。
【0373】
Zymo Research Quick-RNA(商標)Miniprep KitをRNA抽出用に使用する(カタログ番号50444597)。
Zymoキットプロトコル:
特に指定されない限り、全てのステップは室温で行い、13,000×gで30秒間遠心分離する。
1.細胞を、細胞スクレーパーを使用して400μLのRNA溶解緩衝液に溶解させる。
2.溶解物を20秒間ボルテックスして均質化し、13,000×gで30秒間遠心分離して、細胞残屑を除去する。
3.上清を、コレクションチューブ内のSpin-Away(商標)フィルター(黄色)に移し、遠心分離して、ゲノムDNAの大部分を除去する。
4.0.5体積のエタノール(95~100%)をフロースルーに添加し、よく混合する。試料を、コレクションチューブ内のZymo-Spin(商標)IIICGカラム(緑色)に移し、遠心分離する。
5.カラムに付着したRNAは、DNase処理される。(D1)カラムを400μlのRNA洗浄緩衝液で洗浄し、遠心分離する。フロースルーを廃棄する。
(D2)ヌクレアーゼを含まないチューブ内で、5μlのDNase I(1U/μl)を75μlのDNA消化緩衝液に添加して混合する。混合物をカラムマトリックスに直接添加する。(D3)カラムを、室温(20~30℃)で15分間インキュベートする。
6.400μlのRNA調製緩衝液をカラムに加え、遠心分離する。フロースルーは廃棄される。
7.700μlのRNA洗浄緩衝液をカラムに加え、遠心分離する。フロースルーは廃棄される。
8.400μlのRNA洗浄緩衝液をカラムに加え、1分間遠心分離して、洗浄緩衝液の完全な除去を確実にする。次に、カラムを1.5mLのヌクレアーゼを含まないチューブに移す。
9.100μlのDNase/RNaseを含まない水をカラムマトリックスに直接添加し、遠心分離する。
10.抽出されたRNAは通常、cDNAに直ちに転写されるか、又は必要に応じて-80℃で保存される。
cDNA転写:
Thermofisherの逆転写酵素SuperScript(商標)IV VILO(商標)Master Mix(11756050)を使用する。4uLの酵素を16uLのRNA(約550~650ngに相当)に添加する。
製造元のプロトコルによると、逆転写は、以下のステップによって得られる。
-プライマーをアニールするために、25℃で10分間
-逆転写を実行するために、50℃で10分間
-酵素を不活化するために、85℃で5分間
次いで、cDNAをDNase RNaseを含まない水で2倍に希釈し、qPCRが完了するまで-20℃で保存する。
MuSK分析については、cDNAをこの濃度で使用した。
ハウスキーピング遺伝子解析については、cDNAを更に5倍に希釈した。
【0374】
E.qPCR
2つのqPCR技術、TaqMan及びSYBR Greenを試験した。
【0375】
LHCN-M2細胞でTaqman又はSYBR green技術を使用してqPCRによって相対的MuSK発現を測定した。両方とも、siRNA(Thermofisher、4392420)によるMuSK阻害に関して同様の結果を得た(
図3)。しかしながら、検出レベルに関連するCqは、SYBR greenでTaqmanの場合よりも低く、対照ではそれぞれ約22及び27であり、SYBR green技術でより良好な検出を示した。検出レベルは、条件間のMuSK阻害レベルを区別するために重要であるため、研究にはSYBR Green技術を選択した。
【0376】
SYBR Green qPCRプロトコル:
【0377】
遺伝子発現を分析するために、SYBR Green技術を使用した。結果を2つのハウスキーピング遺伝子(GAPDH及びYWHAZ)に対して正規化した。qPCRを384ウェルプレートで実行した。cDNAを、MuSK発現を分析するのには1/2で、HKG発現を分析するのには1/10で使用した。測定は、二連又は三連で実行された。
【0378】
【0379】
各ウェルに、9μLのプレミックス[3.5μLのRNAse/DNAseを含まない水、5μLのSYBR Green(Biorad、1725120)、0.5μLの10μMプライマー]を入れ、1μLの適切な希釈度のcDNAを添加した。密封した後、プレートを遠心分離し、軽くボルテックスし、2回目の遠心分離を行った。Thermocycler QuantStudio 6又は7 Pro(Thermofisher)を使用してqPCRを実行した。ステップは次のとおりである。
-95℃で30秒
-PCR(X40 サイクル):
-95℃で3秒
-60℃で30秒
-融解曲線(ステップアンドホールド、4秒):
-65℃で20秒
-95℃で15秒
【0380】
ヒトASOの設計及びスクリーニング
最初のバッチの、38個のヒトアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を設計し、その後、Microsynth(Switzerland)によって製造された。ASO配列を以下の表5に示す。
【表5-1】
【表5-2】
【0381】
全てのASO Bld1~Bld38は、各糖に2’-MOE修飾を含み、各ヌクレオチド間にホスホロチオエートヌクレオチド間結合が存在するように設計された。配列は、RNase Hの活性化を回避するように設計された。全てのASOは、長さが25ヌクレオチドであった。ASO Bld1~Bld38の、エクソン6及び7を含む領域に沿ったMuSKゲノム配列に対するアライメントを
図4に示す。
【0382】
エクソン6を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
i.遺伝子配列へのアライメント
ASOは、
図5に提示するMuSKエクソン6遺伝子配列の領域に相補的となるように設計された。
【0383】
ii.細胞観察
細胞を、ゼラチンで予めコーティングされた6ウェルプレートに30,000細胞/ウェルで播種し、播種の48時間後に50nM及び100nMのASOでトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、細胞を観察し(
図4)、RNAを抽出して分析した。
図6は、100nMのASOでトランスフェクトされてから24時間後のLHCN-M2細胞の顕微鏡的取得を示す(スケール=100nm)。Bld5、Bld8、Bld10、及びBld18のデータは示されていない。
【0384】
一部のASOは、24時間後に細胞に目に見える効果をもたらした:Bld8(データは示さず)、Bld5(データは示さず)、Bld10(データは示さず)、Bld126、及びBld14は、細胞の健康に悪影響を及ぼしているようであった。その他のASOは、わずかな違いをもたらした。例えば、ASO Bld11、Bld13、及びBld15でトランスフェクトされた細胞はより短くなった。それ以外の点では、他の治療群の細胞は健康であり、Bld18を含む対照と同様であった。そのデータは
図6及びBld9には示されていない。
【0385】
iii.MuSK発現解析
トランスフェクションの24時間後、RNAを抽出し、MuSK発現をqPCRによって測定した。プライマーは、3~4エクソン/エクソン接合部(MuSK34と称される)又は6~7エクソン/エクソン接合部(MuSK67と称される)のいずれかにまたがるように設計された。そのため、MuSK34プライマーは、MuSK転写物の全ての形態(すなわち、長い形態(すなわち、Ig3ドメインを含む形態と短い形態(すなわち、MuSKΔIg3)の両方)を検出するが、MuSK67プライマーは、長い形態のMuSKのみを検出し、MuSKΔIg3は検出しない。プライマー設計の原理を
図2に示す。結果を、2つのハウスキーピング遺伝子、YWHAZ及びGAPDHに対して正規化し、その安定性をソフトウェアBestKeeperを使用して評価し、
図7に示した。
【0386】
qPCR結果は、ASO Bld7、Bld8、Bld9、Bld11、Bld13、Bld16、Bld15、及びBld18が、MuSK34(>75%)及びMuSK67(>90%)の発現の減少を引き起こしたことを示す。ASO Bld13、Bld4、Bld5、Bld6、Bld12、及びBld14、及びBld17は、MuSK34の減少(50~75%)及びMuSK67のより大きな減少(70~85%)を引き起こした。ASO Bld3及びBld17は、MuSK34及びMuSK67の発現に対しわずかな影響を及ぼした(20~50%)。最後に、2つのASO Bld1及びBld18は、MuSK34及び67の発現の増加を誘導した。
【0387】
ASOのスクリーニングの目的は、MuSK34に影響を与えずに、MuSK67の中程度/重大な減少を誘発する(例えば、MuSKΔIg3の増加を誘発する)ASOを特定することであった。
図7に示す結果は、エクソン6を標的とする試験されたASOが、エクソン6及び7の良好なスキッピングを得るために適切な領域を標的としていない可能性があることを示す。
【0388】
結果は、MuSK発現に重要な配列上の主要領域を特定するために、ASOアライメントと相関付けられた(
図8)。
図8では、緑色は、MuSK発現のわずかな減少又は増加を示す(対照の90~300%)。橙色は、MuSK発現の中等度の減少を示す(MuSK34は対照の40~70%、MuSK67は対照の<45%)。赤色は、MuSK発現の大幅な減少を示す(MuSK34、対照の<40%;MuSK67、対照の<20%)。赤色の領域は、ASOによってMuSK34が>60%及びMuSK67が>80%の減少がもたらされた、MuSKの発現の主要領域を示す。
【0389】
50nMでのASO Bld1~Bld18の各々に対するMuSK67の相対的発現を以下の表6に示す。
【表6-1】
【表6-2】
a)*は、ホスホロチオエート結合を表し、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
b)1.0の値は、未処理細胞に対するMuSK67の発現のレベルを表す。
【0390】
エクソン7を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチド
i.遺伝子配列へのアライメント
MuSKのエクソン7の遺伝子配列に対するASO Bld19~Bld38のアライメントを
図9に提示する。
【0391】
ii.細胞観察
細胞を、ゼラチンで予めコーティングされた6ウェルプレートに30,000細胞/ウェルで播種し、播種の48時間後に50nM及び100nMのASOでトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、細胞を観察し(
図10)、RNAを抽出して分析した。
図10は、100nMのASOでトランスフェクトされてから24時間後のLHCN-M2細胞の顕微鏡的取得を示す(スケール=100nm)。
【0392】
トランスフェクションの24時間後、細胞は全ての状態で健康に見えた。ASO Bld19及びBld30でトランスフェクトされた細胞は対照よりも短くなり、ASO Bld32及びBld34でトランスフェクトされた細胞はより長くなってた。ASO Bld23、Bld24、Bld25、Bld26、Bld27、Bld28、Bld35、Bld36、Bld37、Bld38でトランスフェクトされた細胞は、対照と比較して有意差を示さなかった(データは示さず)。
【0393】
iii.MuSK発現解析
トランスフェクションの24時間後、RNAを抽出し、MuSK遺伝子発現をqPCRで解析した(
図11)。ASOのエクソン6に対するスクリーニングについて記載した方法を使用した。
【0394】
50nMの各ASOの相対的発現を以下の表7に示す。
【表7-1】
【表7-2】
a)*は、ホスホロチオエート結合を表し、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
b)1.0の値は、未処理細胞に対するMuSK67の発現のレベルを表す。
【0395】
ASO Bld29及びBld31は、MuSK34(>75%)及びMuSK67(>90%)の発現の減少を引き起こした。ASO Bld30、Bld32及びBld34は、MuSK34の減少(40~60%)及びMuSK67のより大きな減少(55~85%)を引き起こした。ASO Bld19は、MuSK34及びMuSK67の発現に対しわずかな影響を及ぼした(<20%)。ASO Bld19、Bld20、Bld24、Bld23、及びBld33は、MuSK34及び67の発現の増加を誘導した。
【0396】
ASO Bld25、Bld26、Bld27、Bld28、Bld35、及びBld38は、50nMでMuSK67は>60%の減少、及び両方の濃度でMuSK34は<40%の減少を引き起こした。したがって、これらのASOは、追加用量で試験するのに良好な候補とみなされた。
【0397】
これらの結果を遺伝子配列とアライメントさせると、ある領域が、他のエクソンの転写に影響を与えずに、エクソン6及び7のスプライシングを調節する主要領域であることが示唆された(
図12において紫色で示されている)。
【0398】
これらの結果をMuSKエクソン7遺伝子配列とアライメントさせると、一部の領域が、他のエクソンの転写に影響を与えずに、エクソン6及び7のスプライシングを調節する主要領域である可能性があることが示唆された(
図12において紫色で示されている)。
図12では、緑色は、MuSK発現のわずかな減少又は増加を示す(対照の90~300%)。橙色は、MuSK発現の中等度の減少を示す(MuSK34は対照の40~70%、MuSK67は対照の<45%)。赤色は、MuSK発現の大幅な減少を示す。MuSK34が対照の<40%、MuSK67が対照の<20%である紫色及び灰色の領域は、
図11に示される結果に基づいて、他のエクソンへの影響を抑えながらエクソン6/7を効率的なスキッピングを得るために標的とされ得る領域を示す(すなわち、ASO hu7-10、hu73、hu717、hu730、hu711及びhu7158によって標的とされる領域)。これらの領域「領域1」及び「領域2」を
図4に示す。
【0399】
例示的なASO候補の用量応答
50nM及び100nMでの最初のASOスクリーニングでは、Bld25、Bld26、Bld27、Bld28、Bld35、及びBld38が、エクソン6/7の効率的なスキッピングを誘導してMuSKΔIg3転写物発現を生成し得る可能性のある候補であることを示した。これらのASOを、用量応答を調べるために、2.5、5、25、125、及び400nMの異なる濃度で試験した。結果を
図13に示す(パネルA~F)。
【0400】
具体的には、
図13は、6つの候補ASO(Bld25(A)、Bld26(B)、Bld27(C)、Bld28(D)、Bld35(E)、Bld38(F))の様々な用量に応答した相対的MuSK発現を示す。MuSK34(青色)及びMuSK67(赤色)の発現をqPCRによって測定し、各々をハウスキーピング遺伝子及び未処理細胞について得られた値に対して正規化した。推定ICは、各グラフ上に示される。試験した5つの用量は、2.5、5、25、125、400nMであった。
【0401】
用量応答試験の結果は、ASO Bld35が、それぞれ20~40% 及び50~70%でMuSK34及びMuSK67の両方の減少を誘導したことを示した。したがって、MuSK34の発現とMuSK67の発現との間の差が低すぎるため、他のエクソンの転写に影響を与えずに高い割合のΔIg3 MuSKを得ることができない。
【0402】
Bld25、Bld26、Bld27、Bld28、及びBld38のASOの場合は、MuSK34の発現は対照レベルの75~85%であり、一方でMuSK67では対照レベルの50%であったため、潜在的な候補となった。
【0403】
ASO Bld38の場合は、MuSK67の阻害は、高濃度(400nM)であっても、対照レベルの60%に制限された。
【0404】
ASO Bld27及びBld28の場合は、125nMを超える濃度では、MuSK34の発現に>75%の減少をもたらした。
【0405】
ASO Bld25及びBld26の場合、ASO濃度が25~400nMのときに、MuSK34の発現は対照レベルの60%のプラトーに達したが、MuSK67の発現は対照の10%に減少した。これらの結果は、ASO Bld25及びBld26が、MuSK67の発現を標的として減少させ、MuSK34の発現に対する影響がより少ないことを示し、これら2つがこの試験の最良の候補となっている。推定IC50値は、Bld25及びBld26で、それぞれ11.5nM及び11.4nMであった。
【0406】
これらの結果を精査するために、この領域でより標的を絞った用量反応を実行した(
図14)。これらの追加のデータは、IC50が、Bld25及びBld26の両方に対して実際に5~7.5nMであることを示した。ASO Bld26では、MuSK67と同じASO濃度(7.5nM)でMuSK34の発現が低下した。ASO Bld25では、7.5nMの濃度で、MuSK67の発現は70%減少したが、MuSK34の発現は対照の94%であった。したがって、Bld25は、エクソン6及び7の選択的なスキッピングを得るために、Bld26よりも良好な候補である可能性がある。
【0407】
Bld25とBld26の両方を12.5nMの最終濃度で組み合わせて、追加の試験を行った。結果を
図15に示す。具体的には、
図19は、qPCRによって測定され、ハウスキーピング遺伝子及び対照に対して正規化された、緑色でMuSK34の発現及び赤色でMuSK67の発現を示す。
【0408】
Bld25/Bld26混合物は、対照レベルの72%のレベルにおいてMuSK34の発現をもたらしたが、MuSK67の発現は対照レベルの6%のレベルであった。注目すべきことに、10nMのMuSKに対し、siRNA(Thermofisher、カタログ番号4392420、アッセイID s224071)によって阻害された場合、MuSK67の発現は8%であった(データは示さず)。これらの結果は、いくつかのオリゴ(例えば、Bld25及びBld26)を組み合わせることが、エクソン6及び7の選択的なスキッピングを得るための良好な戦略である可能性のあることを示唆している。
【0409】
ゲル泳動によるエクソンスキッピングの確認
ASOによって誘導されたRNAのスプライシングを検証するために、本発明者らは、エクソン3からエクソン9までの遺伝子配列をPCRにより増幅し、PCR産物のサイズを、ゲル電気泳動でそれを泳動させることによって測定した。
【0410】
MuSK RNAのいくつかの形態は、ヒトにおいて天然に存在する。文献では3つのバリアントが特定されている(
図26):
バリアント1、NM_005592.4(全長:972bp及びΔIg3:687bp)
バリアント2、NM_001166280.2(全長:783bp及びΔIg3:453bp)
バリアント3、NM_001166281.2(全長:708bp及びΔIg3:423bp)
【0411】
全長及びΔIg3は、エクソン3からエクソン9までのPCRによって増幅された全長配列及びΔIg3(6、7)配列の長さを示す。バリアント1と比較すると、バリアント2及びバリアント3において、エクソン8が欠落している。更に、30塩基の小さなエクソンは、バリアント2にのみ存在する。したがって、エクソン6及び7をスキップすると、3つの追加のMuSK RNA形態が生成される。
【0412】
図10に提示される用量応答からのcDNAのエクソン3~9の配列を、5及び25nMのhu7-10(Bld25)及びhu73(Bld26)を有しない、又は有する条件下でPCRにより増幅した。ゲル電気泳動の結果を
図16に示す。
図16では、「長い」(エクソン6~7を有する)及び「短い」(エクソン6~7を有しない、すなわち、ΔIg3)設計した合成配列は、バリアント1に基づいていた。
【0413】
図16に示すように、いくつかのバンドが検出された。対照条件では、主要なバンドは、およそ1kb、970b(赤色矢印)に、二重バンドは700~750b(緑色矢印)に見られた(
図16、パネルBを参照)。エクソン6/7のスプライシングが発生した(qPCRによって事前に確認された)条件下では、主要なバンドは、およそ690b(黄色の矢印)及び450b(青色の矢印)で観察され(
図16、パネルB’)、970bではより薄いバンドが観察された。600bで追加の二重バンドを検出した(橙色の矢印)。
【0414】
図16に提示されるシーケンスに基づいて、以下のことが分かる:
【0415】
赤色の矢印は、バリアント1の全長(972塩基)のcDNAを示し、緑色の矢印で強調表示された二重バンドは、バリアント2及び3の全長(それぞれ738塩基及び708塩基)に対応する。これは、25nMの条件でBld25の赤色のバンドの小さな部分が観察された理由(
図16B’を参照)及び緑色のバンドの部分が、薄すぎて検出できなかった理由を説明している。
【0416】
25nMのASO hu7-10(Bld25)の場合、黄色のバンドはΔ6、7バリアント1(687塩基)に対応し、青色のバンドはΔ5+、6、7バリアント2及びΔ6、7バリアント3(453塩基)に対応する。
【0417】
次に、これらのバンドが示されたバリアントに対応することを確認するためにバンドを配列決定した。
【0418】
結論
この研究は、他のエクソンに影響を与えることなく、MuSKタンパク質中のエクソン6及び7のスキッピングを誘導するASOを見出すことが目的であった。試験のために38個のASOが設計され、製造された。LHCN-M2細胞株が、そのqPCR検出可能なMuSK発現のために選択された。
【0419】
最初のスクリーニングでは、50及び100nMの濃度で38個のASOの各々を試験した。このスクリーニングから、エクソン7付近/エクソン7上の主要領域にある6つの最良の候補が選択され、又は更なる試験が行われた。これらの6つの候補を、2.5、5、25、125、及び400nMの異なる用量で更に試験した。結果は、25nM未満の用量が、他のエクソンの転写に影響を与えることなく所望のスプライシングを得るのに十分であること、及び2つのASO、Bld25及びBld26が、より高い用量で他のエクソンの発現の安定性を維持しながら、所望のスプライシングを得るのにより良好であることを示した。これら2つの候補を、5、7.5、12.5、及び25nMの追加用量で試験した。これらの結果は、両方のASOについてIC50が5~7.5nMであることを示す。更に、Bld25は、他のエクソンにほとんど影響を与えずにエクソン6/7の効率的なスキッピング(70%)が得られる用量(7.5nM)があるため(発現は対照レベルの94%であった)、最良の候補とみなされた。
【0420】
更に、これら2つの候補(Bld25及びBld26)の12.5nMでの組み合わせはまた、全長MuSK転写物の発現レベルを94%低下させるのに効果的であることが示され(
図15のMuSK67によって示される)、一方MuSKの総発現(
図15のMuSK34によって示される)は28%しか低下しなかった。ゲル電気泳動の泳動及び更なる配列決定により、これがエクソンスキッピングによるものであることが確認された。
【0421】
実施例2:MuSK標的化オリゴヌクレオチドによって誘導されるエクソンスキッピングのインビボ評価
本明細書に提供されるオリゴヌクレオチドの活性の予備的確認は、確立されたマウスモデルにおける対応するマウスオリゴヌクレオチド配列を試験することによって確認されている。例えば、その全体が参照により本明細書に組み込まれる、Renault et al.,2009を参照されたい。
【0422】
この実験では、対応するマウスオリゴヌクレオチドは、AHNが低下した年齢の野生型マウスにおいてインビボで更に評価される。薬力学及び安全性研究などの更なる評価を実施して、老化野生型マウスにおけるASO媒介性MuSKエクソンスキッピングの最適な条件を確立する。
【0423】
実験番号1:忍容性、エクソンスキッピング、PK
ASOは、脳室内(ICV)定位的注入によって、5~100μg、n=6/群の範囲の4回の用量で送達される。スクランブルされたASO(同じ数の塩基を有する)は、対照として機能する。
【0424】
マウスは、潜在的な即時安全性シグナル(例えば、発作、後肢の衰弱、長期の嗜眠)についてモニタリングされ、これらの問題が投与後最初の数時間以内に解決しない動物は安楽死させられる。
【0425】
忍容性シグナルを示さない用量を受けているマウスを毎日監視する。
【0426】
固定されていない脳を4週間で採取する。脳の半分を切片化し、組織学的に炎症の兆候又は他の毒性について、委員会認定の獣医病理学者によって分析される。
【0427】
残り半分の海馬及び皮質を解剖し、RNA単離及びPK分析のために更に分割する。MuSK選択的スプライシング(すなわち、エクソン6~7のスキッピング)のレベルは、実施例1~2に記載されるTaqManアッセイ及びゲルベースのPCRによって評価される。後者については、ゲルバンドを切除し、配列決定して、正しいスキッピングを確認する。皮質の残りの部分は、ASO(PK)のHPLC定量に使用される。
【0428】
実験番号2.神経発生(固定された脳)
神経発生群サイズ:神経発生の増加を評価するために必要な動物の数を決定するために、G*Powerバージョン3.1を使用した検出力分析を実施した(Faul et al.,2007)。実験中の動物の損失の可能性を見越して、6匹/群の動物が割り当てられる。分析は、GraphPad Prism又はRのいずれかを使用して実行される。
【0429】
この実験では、ASOは、少なくとも3つの非毒性用量(実験1で決定される)で第2の動物セットに送達される。
【0430】
これらの動物については、EdUは注射の3~4週間後に送達される。動物を灌流し、固定し、EdU及びDCXに対して免疫組織化学を行い、新しいニューロンの数(EdU+/DCX+細胞)を評価する。
【0431】
新生細胞の成熟は、EdU投与後に30日間の追跡を行い、Edu+/NeuN+細胞を測定することによって評価される。
【0432】
実験番号3.認知
認知群サイズ:G*Power 3.1.9.4.を使用した分析 (Faul et al.,2007)を行って、認知実験の群サイズを決定した。以前の研究に基づいて、1群当たり18匹の動物は、1(a=0.05、検出力=0.80)の効果サイズ(d)を観察するのに十分である。
【0433】
高齢の野生型マウスは、11ヶ月齢でICVにより投与され、12ヶ月齢で認知について評価される。実験番号2で決定されたように、AHNを促進するために、単回投与を実施する(1群当たり18匹の動物)。
【0434】
マウスは、新規物体位置探索タスク、海馬依存性空間学習タスク、並びに条件付け恐怖及び空間作業記憶を測定するためのY字迷路を含む試験を使用して評価され(Gotz and Ittner,2008)、2つのタスクは認知を試験するために一般的に使用される。
【0435】
ペアワイズ比較は、スチューデントt検定を使用して分析される。3つ以上の群による実験を、多重比較のためのボンフェローニ補正を使用して分析する。
【0436】
メスのマウス。メスマウスにおける上記で決定された最適用量を使用した神経発生の促進に対するASO治療の有効性も評価される。
【0437】
考察。実験1~3は、送達される用量が、安全性、PK、MuSKスプライシングのレベル、AHN促進の程度、及び認知改善に関連するように設計されている。
【0438】
NSCが新生して成熟する時間経過である期間であるという理由で、4週間の曝露期間を利用した(Babcock et al.,2021)。しかしながら、反復投与を伴う、及び伴わない、より長い曝露を有する追加試験も実行される。
【0439】
脳内のASOのHPLC測定に加えて、ハイブリダイゼーションベースの方法も利用される。
【0440】
実施例3:FADモデルにおけるMuSK標的化オリゴヌクレオチドによって誘導されるエクソンスキッピングのインビボ評価
この実験では、実施例2からの対応するマウスオリゴヌクレオチドを、プラーク負荷が十分に確立され、もつれ(tangle)が存在する家族性アルツハイマー病(FAD)マウスモデルで評価する。この実験は、対応するマウスオリゴヌクレオチド及びエクソンスキッピングアプローチが、AD脳を特徴付ける高いプラーク負荷及び神経原線維性のもつれとともに、敵対的な炎症性環境において有効であるかどうか、及び対応するオリゴヌクレオチドがFADマウスモデルにおいてAHNを促進するかどうかを決定することを目的とする。
【0441】
FADマウスモデルこの実験では、Tau、PSEN1、及びAPP FAD対立遺伝子の導入遺伝子を保有する3xTgが使用される(Oakley et al.,2006、Kimura and Ohno、2009、Belfiore et al.,2019)。このモデルは、特徴付けられており、6ヶ月でアミロイド斑を、12ヶ月までに神経原線維性のもつれを発症する。AHNは3ヶ月齢という早さで減少し、12ヶ月までに本質的に検出不能である。本発明者らは、これらのマウスにおいて、6ヶ月でAHNの低下を確認した。AHNのこの減少は、アミロイド量の増加と強く相関している(Rodriguez et al.,2008)。動物にASOを11ヶ月で投与し、AHN及び認知表現型が明らかになる12ヶ月齢で分析する。メスの3xTgマウスは、より早期の、より一貫した病理学的プロファイルを示すため使用される(Belfiore et al.,2019)。
【0442】
実験的アプローチ。投与戦略(レベル、期間)は、実施例3の結果に基づく。3つの群に投与される:スクランブルASO、及び2つの用量のMuSKエクソンスキッピングASO。群サイズは、AHN及び認知の両方を評価するためにn=18である。また各群から6匹の動物を、神経発生分析のために1日1回7日間、EdUで処置する。取り扱いの潜在的な影響を制御するために、残りの動物には生理食塩水を注射する。神経発生及び認知分析は、実施例3に記載されるように実行される。AD病理組織学に対するASO治療の影響も評価される。
【0443】
実施例4:MuSK標的化オリゴヌクレオチドの製剤化及び投与
A.製剤化
本実施例では、本明細書に記載されるヒトMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、標的部位への送達を強化するために好適な形態に製剤化され、様々な手段を介してヒト対象に投与される。
【0444】
いくつかの実施形態では、ヒトMuSK標的化オリゴヌクレオチドは、単回投与バイアル中の均質な溶液として、脂質複合体中に配合される。いくつかの実施形態では、単回投与バイアルは、10mg/5mL(2mg/mL)である。
【0445】
B.投与
1.適応
MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、成人におけるADの治療に適応される。
【0446】
2.用法及び用量
2.1 投与情報
MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、医療従事者によって投与される。
【0447】
MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、静脈内(IV)注入を介して投与される。投与は、実際の体重に基づく。体重が100kg未満の患者については、推奨投与量は0.3mg/kgを3週間に1回である。体重が100kg以上の患者については、推奨投与量は30mgを3週間に1回である。
【0448】
服用忘れ:投与を忘れた場合、できるだけ早くMuSK標的化オリゴヌクレオチドを投与する。MuSK標的化オリゴヌクレオチドが、投与忘れから3日以内に投与される場合、患者の元のスケジュールに従って投与を継続する。MuSK標的化オリゴヌクレオチドが、投与忘れの3日超後に投与される場合、その後3週間ごとに投与を継続する。
【0449】
2.2 調製
MuSK標的化オリゴヌクレオチドを、静脈内注入の前に濾過し、希釈する。希釈した注入液は、以下のように無菌技術を使用して医療従事者によって調製される。
1.MuSK標的化オリゴヌクレオチドバイアルを冷蔵庫から取り出し、室温まで温める。振とう又はボルテックスしない。
2.目視で粒子状物質や変色がないか調べる。変色や異物が存在する場合は使用しない。
3.推奨される体重ベースの投与量に基づいて、必要な用量のMuSK標的化オリゴヌクレオチドを計算する〔投与量及び投与(2.1)を参照〕。
4.1つ以上のバイアルの全内容物を単一の滅菌シリンジに採取する。
5.MuSK標的化オリゴヌクレオチドを、滅菌0.45ミクロンポリエーテルスルホン(PES)シリンジフィルターを通して滅菌容器に濾過する。
6.滅菌シリンジを使用して、滅菌容器から必要な量の濾過されたMuSK標的化オリゴヌクレオチドを採取する。
7.必要な量の濾過されたMuSK標的化オリゴヌクレオチドを、0.9%塩化ナトリウム注射液、USPを含有する注入バッグに入れて、総体積を200mLになるように希釈する。フタル酸ジ(2-エチルヘキシル)を含まない(DEHPを含まない)注入バッグを使用する。
8.バッグをゆっくりと反転させて溶液を混合する。振とうしない。他の薬剤と混合又は希釈しない。
9.MuSK標的化オリゴヌクレオチドの未使用部分は全て廃棄する。
10.希釈した溶液は、調製直後に投与する必要がある。直ちに使用されない場合、室温(最大30℃[86°F])で最大16時間(注入時間を含む)、注入バッグで保管する。凍結しない。
【0450】
2.3 注入
MuSK標的化オリゴヌクレオチドは、以下のように注入される:
1.1.2ミクロンのポリエーテルスルホン(PES)インライン注入フィルターを含む注入セット付きの専用ラインを使用する。DEHPを含まない注入セットとラインを使用する。・
2.MuSK標的化オリゴヌクレオチドの希釈溶液を、携帯型の注入ポンプを使用して約80分にわたって静脈内注入し、最初の15分間は約1mL/分の初期注入速度で、その後残りの注入では約3mL/分まで増加させる。
3.自由流動性の静脈アクセスラインを通してのみ投与する。薬剤投与中の浸潤の可能性について注入部位を監視する。血管外漏出が疑われる場合は、非壊死起因性薬(non-vesicant)に対する現地の標準的慣行に従って管理する必要がある。・
4.注入中は患者を観察する。
5.注入完了後、静脈内投与セットを0.9%塩化ナトリウム注射液USPで洗い流し、全てのONPATTROが投与されたことを確認する。
参照文献
Shaw,G.,Morse,S.,Ararat,M.,& Graham,F.L.(2002).Preferential transformation of human neuronal cells by human adenoviruses and the origin of HEK 293 cells.The FASEB Journal:Official Publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology,16(8),869-871
【0451】
実施例5:20merのMuSK標的化オリゴヌクレオチドの設計及びスクリーニング
本実施例では、実施例1からのリード候補に基づいて、MuSKのエクソン7を標的とする追加のヒトMuSK標的化オリゴヌクレオチドを設計した。実施例1のスクリーニングは、MuSKエクソン7内の2つの領域を標的とした6つのリードASOを特定した。更なる用量応答実験及び得られたMuSK転写物の分析により、これらの領域のうちの1つを、Ig3ドメインのスプライシングを調節するための主要領域として特定した。この領域、すなわち「領域1」は、コア配列、配列番号126(ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC)に対応し、これはMuSK転写物(配列番号77)(又は他のMuSKバリアント配列内の対応する領域)の83841~83905位に位置している。本実施例では、追加のASOは、エクソン7の配列番号126(領域1)に対応する領域を標的とし、具体的にはASO Bld25及びBld26の配列の異なる部分を含むように設計される。これらのASOは、25ヌクレオチドではなく、20ヌクレオチドのより短いASO(実施例1で試験される)のより短いASOが活性を増加させるかどうかを試験するように設計された。
【0452】
追加のオリゴヌクレオチドを、MuSKエクソン6及び/又はエクソン7のエクソンスキッピングを誘導する能力について試験した。
【0453】
ヒトASOの設計
ヒトアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)は、上述のように、及び
図17に示されるように設計し、Microsynth(Switzerland)によって製造された。ASO配列を以下の表8に示す。
【表8-1】
【表8-2】
【0454】
表8中の全てのASOは、各糖に2’-MOE修飾を含み、各ヌクレオチド間にホスホロチオエートヌクレオチド間結合が存在するように設計される。表8中の全てのASOは、長さが20ヌクレオチドであった。
【0455】
エクソン7領域1を標的とするより短いアンチセンスオリゴヌクレオチドのスクリーニング
ASOトランスフェクション及び細胞培養、RNA抽出、cDNA転写、qPCRを、別段の示唆がない限り、実施例1に記載の方法に従って行った。
【0456】
i.遺伝子配列へのアライメント
MuSKのエクソン7の遺伝子配列に対する表8のASOのアライメントを
図17に示す。
【0457】
ii.細胞観察
LHCN-M2細胞を、ゼラチンで予めコーティングされた6ウェルプレートに30,000細胞/ウェルで播種し、播種の48時間後に12.5nM及び100nMのASOでトランスフェクトした。トランスフェクションの24時間後、細胞を観察し(データは示さず)、RNAを抽出して分析した。
【0458】
トランスフェクションの24時間後、細胞は、100nM用量でASO Bld54、Bld55、及びBld56で処理された細胞を除いて、全ての条件で健康に見えた(データは示さず)。
【0459】
iii.MuSK発現解析
トランスフェクションの24時間後、RNAを抽出し、MuSK遺伝子発現をqPCRで解析した。総MuSK(MuSK34)及びMuSKIg3ドメイン(MuSK67)の相対的遺伝子発現を、
図18に示す。実施例1で記載したASOのスクリーニング方法を使用した。
【0460】
本実施例で使用される修飾を有するASOを以下の表9に示す。
【表9-1】
【表9-2】
a)*は、ホスホロチオエート結合を表し、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
b)1.0の値は、未処理細胞に対するMuSK67の発現のレベルを表す。
【0461】
スクリーニングの結果、エクソン7の領域1を標的とするこれらのより短いASO(20mer)は、ASO Bld25及びBld26(25mer)よりも低い活性をもたらし、MuSKdelIg3レベルにほとんど/全く影響を及ぼさず、又は総MuSKレベルを阻害することが示された。
【0462】
実施例6:エクソン7の領域1を標的とする追加のMuSK標的化オリゴヌクレオチドの設計及びスクリーニング
本実施例では、実施例1からのリード候補に基づいて、配列番号126のMuSKのエクソン7の領域1を標的とする追加のヒトMuSK標的化オリゴヌクレオチドを設計した。配列番号126(CTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC)は、MuSK転写物(配列番号77)(又は他のMuSKバリアント配列内の対応する領域)の83841~83905位に位置している。
【0463】
配列は、ASO Bld25及びBld26の配列の異なる部分を含むように特別に設計された。この領域を標的とするASOの長さを短くすると、活性が低下すること示されたため、本実施例で設計されたASOは、長さが25ヌクレオチドになるように生成された。
【0464】
追加のオリゴヌクレオチドを、MuSKエクソン6及び/又はエクソン7のエクソンスキッピングを誘導する能力について試験した。
【0465】
ヒトASOの設計
ヒトアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を、上述のように設計し、
図19に示す。これらのASOは、Microsynth(Switzerland)によって製造された。ASO配列を以下の表10に示す。
【表10-1】
【表10-2】
【0466】
表10中の全てのASOは、各糖に2’-MOE修飾を含み、各ヌクレオチド間にホスホロチオエートヌクレオチド間結合が存在するように設計される。表10中の全てのASOは、長さが25ヌクレオチドであった。
【0467】
エクソン7領域1を標的とするアンチセンスオリゴヌクレオチドのスクリーニング
ASOトランスフェクション及び細胞培養、RNA抽出、cDNA転写、qPCRを、別段の示唆がない限り、実施例1に記載の方法に従って行った。
【0468】
i.遺伝子配列へのアライメント
MuSKのエクソン7の遺伝子配列に対する表10のASOのアライメントを
図19に示す。
【0469】
ii.細胞観察
LHCN-M2細胞を、ゼラチンで予めコーティングされた6ウェルプレートに35,000細胞/ウェルで播種し、播種の48時間後に5nM、12.5nM、25nM、50nM、及び125nMのASOでトランスフェクトした。表10のASOの各々を、Bld25、Bld26、Bld27、Bld28、Bld35、及びBld38(実施例1で特定されたリード)で試験した。トランスフェクションの24時間後に細胞を観察し(データは示さず)、RNAを抽出及び分析した。
【0470】
トランスフェクションの24時間後、細胞は、140nM用量でASO Bld25-3及びBld25-4で処理された細胞を除いて、全ての条件で健康に見えた(データは示さず)。
【0471】
iii.MuSK発現解析
トランスフェクションの24時間後、RNAを抽出し、MuSK遺伝子発現をqPCRで解析した(
図20)。パネルAは、MuSK67の相対的遺伝子発現を示し、パネルBは、総MuSK(MuSK34)の相対的遺伝子発現を示す。新しい配列を、実施例1のBld25及びBld26と比較した。
図21は、未処理対照と比較して、50%未満のMuSK67の相対的発現及び60%超の総MuSK(MuSK34)の相対的発現を示したASOのみからの同じデータを示す。
【0472】
図22は、ASOによるトランスフェクション24時間後(パネルA及びB)及び48時間後(パネルC及びD)のBld25-5とBld25との比較を示す。実施例1のASOのスクリーニングについて記載した方法を使用した。
【0473】
本実施例で使用される修飾を有するASOを以下の表11に示す。
【表11】
【表12】
【表13】
【0474】
表12は、総MuSK67発現において50%(IC50)又は75%(IC75)阻害のいずれかがある濃度を示す。表13は、各ASOのMuSK34(nM)のIC10及びIC25値を示し、総MuSK発現(MuSK34)において10%(IC10)又は25%(IC25)阻害のいずれかがある濃度を表す。エクソン6及び/又は7のエクソンスキッピングを行うASOは、より低いMuSK67のIC50/IC75値、及びより高いMuSK34のIC10/25値を示すと予想される。
【0475】
このスクリーニングの結果は、ASO Bld25、Bld25-5、Bld26-2、及びBld26が最良の効力及び選択性を示したことを示した(表12及び13を参照)。
【0476】
ゲル泳動によるエクソンスキッピングの確認
ASOによって誘導されたRNAのスプライシングを検証するために、エクソン3からエクソン9までの遺伝子配列をPCRによって増幅し、PCR産物のサイズをゲル電気泳動でそれを泳動させることによって測定した。
【0477】
MuSK RNAのいくつかの形態は、ヒトにおいて天然に存在する。文献では3つのバリアントが特定されている(
図26):
バリアント1、NM_005592.4(全長:972bp及びΔIg3:687bp)
バリアント2、NM_001166280.2(全長:783bp及びΔIg3:453bp)
バリアント3、NM_001166281.2(全長:708bp及びΔIg3:423bp)
【0478】
全長及びΔIg3は、エクソン3からエクソン9までのPCRによって増幅された全長配列及びΔIg3(6、7)配列の長さを示す。バリアント1と比較すると、バリアント2及びバリアント3において、エクソン8が欠落している。更に、30塩基の小さなエクソンは、バリアント2にのみ存在する。したがって、エクソン6及び7をスキップすると、3つの追加のMuSK RNA形態が生成される。
【0479】
本実施例に提示される用量反応からのcDNAのエクソン3~9の配列を、50nMのBld25及びBld25-5を有しない、又は有する条件下でPCRによって増幅した。ゲル電気泳動の結果を
図27に示す。
図27では、「4/5/6/7/EWS/8/9」は全長バリアント1を示し、「4/5/5+/6/7/EWS/9」は全長バリアント2を示し、「4/5/6/7/EWS/9」は全長バリアント3を示す。同様に、「4/5/EWS/8/9」は、バリアント1のΔIg3(6、7)を示し、「4/5/9」は、バリアント2のΔ5+/Ig3(6、7)を示し、バリアント3のΔIg3(6、7)を示す。
【0480】
図27に示すように、いくつかのバンドが検出された。対照条件では、全長バリアントが予想される場所で主要なバンドが見られた。エクソン6/7のスプライシングが発生した(qPCRによって以前に確認された)条件下では、バリアントのスプライシングされたバージョンについて、主要なバンドが観察された。
【0481】
バンドの強度も調べられた。Bld25及びBld25-5産物からのバンドの強度も、
図27のゲル画像の上に示される。これらの結果は、ASOを含むMuSK PCR産物の量が、未処理条件(対照)におけるMuSK PCR産物の量の約80~90%であることを示す。したがって、総MuSKはわずかに減少するのみである。
【0482】
次に、ASO 25-5で処理された細胞からのpcr産物のバンドを配列決定して、これらのバンドが示されたバリアントに対応することを確認した。
図28は、Δ6、7バリアント1(687塩基)に位置するバンドの下側のバンドの配列が実際にこのスプライスバリアントの配列であったことを示す。
【0483】
実施例7:エクソン7の領域1を標的とする短縮型MuSK標的化オリゴヌクレオチドの設計及びスクリーニング
本実施例では、追加のヒトMuSK標的化オリゴヌクレオチドを、実施例1及び実施例6で特定されたリードASO(Bld25、Bld25-5、Bld26及びBld26-2)のサイズを縮小することによって設計した。これらのASOは、配列番号126(ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC)のMuSKのエクソン7の領域1を標的とし、この領域はMuSK転写物(配列番号77)(又は他のMuSKバリアント配列内の対応する領域)の83841~83905位に位置している。
【0484】
配列は、ASO Bld25、Bld25-5、Bld26、Bld26-2の配列を異なる量で短縮することによって設計された。本実施例で設計されたASOは、長さが21ヌクレオチド及び23ヌクレオチドになるように生成された。
【0485】
次いで、これらのASOを、MuSKエクソン6及び/又はエクソン7のエクソンスキッピングを誘導する能力について試験した。
【0486】
ヒトASOの設計
ヒトアンチセンスオリゴヌクレオチド(ASO)を、上述のように設計し、
図23に示す。ASOは、Microsynth(Switzerland)によって製造された。ASO配列を以下の表14に示す。
【表14】
【0487】
表14中の全てのASOは、各糖に2’-MOE修飾を含み、各ヌクレオチド間にホスホロチオエートヌクレオチド間結合が存在するように設計される。表14中の全てのASOは、長さが21又は23ヌクレオチドであった。
【0488】
エクソン7領域1を標的とする21mer及び23merのアンチセンスオリゴヌクレオチドのスクリーニング
ASOトランスフェクション及び細胞培養、RNA抽出、cDNA転写、qPCRを、別段の示唆がない限り、実施例1に記載の方法に従って行った。
【0489】
i.遺伝子配列へのアライメント
MuSKのエクソン7の遺伝子配列に対する表14のASOのアライメントを
図23に示す。
【0490】
ii.細胞観察
LHCN-M2細胞を、ゼラチンで予めコーティングされた6ウェルプレートに35,000細胞/ウェルで播種し、播種の48時間後に5nM、12.5nM、25nM、50nM、及び125nMのASOでトランスフェクトした。表14のASOの各々を、Bld25、Bld25-5、Bld26、及びBld26-2(実施例1及び6で特定されたリード)に加えて試験した。トランスフェクションの24時間後に細胞を観察し(データは示さず)、RNAを抽出及び分析した。
【0491】
トランスフェクションの24時間後、細胞は全ての条件で健康に見えた(データは示さず)。
【0492】
iii.MuSK発現解析
トランスフェクションの24時間後、RNAを抽出し、MuSK遺伝子発現をqPCRで解析した(
図24~25)。
【0493】
本実施例で使用される修飾を有するASOを以下の表15に示す。
【表15-1】
【表15-2】
a)*は、ホスホロチオエート結合を表し、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
【0494】
このスクリーニングの結果は、ASO Bld25-E及びBld25-5-Aが最良の活性を示したことを示した(
図24及び
図25を参照)。Bld25-Eは、MuSK67の最大補正80%を示し、総MuSK(MuSK34)への影響は少なく、MuSK67のIC50は約21nMであった。Bld25-5-Aは、MuSK67の最大補正80%を示したが、総MuSK(MuSK34)への影響は少なく、MuSK67のIC50は約35nM未満であった。これらの結果は、ASO Bld25-E及びBld25-5-Aが、MuSKにおいてエクソン6-7スキッピングを実施するための追加の候補であり、実施例1及び6で特定されたリードASOよりも短い長さ(21mer及び23mer)を有することを示す。
【0495】
実施例8:MuSKタンパク質の分析
本実施例は、本明細書に記載されるASOを用いた処理後に得られたMuSKタンパク質を調べることを目的とする。
【0496】
MuSKタンパク質に対する効果のタイミング
ASO処理した細胞から産生された結果のMuSKタンパク質を調べるために、MuSKをRNAで標的化することの効果の相対的なタイミングを理解することが重要である。
【0497】
RNA処理からの時間の長さを調べて、処理後、MuSKタンパク質(すなわち、MuSKΔIg3の産生)に効果がある期間を決定した。
【0498】
この実験では、LHCN-M2細胞を、MuSKに対する10nMのsiRNA(Thermofisher、4392420、アッセイID s224071)で48時間処理し、次いで、siRNA処理後、2、3、4、及び5日目にMuSKタンパク質について(MuSK抗体の天然産生を伴う疾患を有する患者から単離されたMuSK抗体、続いてヤギ抗ヒト(A-2133)で)染色した。処理細胞及び未処理細胞における各時点の結果を、
図29に示す。結果は、未処理ウェルでは、MuSKタンパク質量が増加すると同時に、細胞はコンフルエントになり始めることを示す。siRNAで処理されたウェルでは、MuSKタンパク質の量は、特にトランスフェクションの5日後に減少する。全体的に、これらの結果は、MuSKタンパク質量を調節することができ、効果を観察するための最良のタイミングがRNAを調節する5日後であることを示す。
【0499】
図29は、MuSK(赤色)(MuSK抗体の天然産生を伴う疾患を有する患者から単離されたMuSK抗体と、続いてヤギ抗ヒト(A-2133))及びアクチンファロイジン(緑色)(ab ab176743、1:1000)について拡大及び染色した5日目の細胞を示す。これらの結果は、(i)MuSKタンパク質の染色に使用されるMuSK抗体が免疫蛍光で機能すること、(ii)おそらく細胞分化とともに、MuSKタンパク質レベルが経時的に増加すること、及び(iii)MuSK siRNA(Si-MuSK)が、特に5日間の曝露後に、MuSKタンパク質の低減を誘発することを確認する。
【0500】
MuSKのIg3ドメインの除去を測定
本明細書に記載されるASOは、Ig3ドメインを標的化し、エクソンスキッピング(6、7)を誘導してMuSKΔIg3を産生するため、MuSKΔIg3タンパク質を検出する方法が必要である。MuSKタンパク質に対するASO/RNAの効果のタイミングが確立されている。評価(ウェスタンブロット分析など)が実行される。このような評価には、本明細書に記載されるASOで処理された細胞から産生されたMuSKΔIg3タンパク質の評価が含まれる。MuSK細胞質ドメインを標的とするMuSK抗体は、MuSKΔIg3タンパク質の同定に利用される。組換えMuSK細胞質ドメインを使用して抗体を産生し、試験する。
【0501】
ヒト及びマウスのMuSKタンパク質配列は様々であるため、評価にはヒトMuSK対照を使用しなくてはならない(例えば、ウェスタンブロットによって)。存在するMuSKの形態を確認するために、陽性対照(すなわち、MuSKΔIg3タンパク質及びヒトFL MuSKタンパク質)を使用する。MuSKタンパク質の異なるWT及びD3(Ig3)アイソフォームをコードするプラスミドを得る。細胞をプラスミドでトランスフェクトし、陽性対照アイソフォームを発現させ、得る。
【0502】
MuSKの細胞質ドメインを標的とするヒトMuSK抗体及びヒトMuSK陽性対照(すなわち、MuSKΔIg3タンパク質及びヒトFL MuSKタンパク質)が得られ、そのような試薬は、本明細書に記載されるASOで処理された細胞から産生されたMuSKタンパク質を特徴付ける評価(例えば、ウェスタンブロット)で使用される。
配列表
オリゴヌクレオチド(配列番号1)
GCTAGGGTGGTCTTTTAGAAATGCA
オリゴヌクレオチド(配列番号2)
GGTCAAGCTAGGGTGGTCTTTTAGA
オリゴヌクレオチド(配列番号3)
CTGCAGGAAATGGTCAAGCTAGGGT
オリゴヌクレオチド(配列番号4)
GAAGTGGTGAGTGACGCTCCTGCAG
オリゴヌクレオチド(配列番号5)
GTTAGGAAGACAGAAGTGGTGAGTG
オリゴヌクレオチド(配列番号6)
ATCCTGGCAAAAACTGTTAGGAAGA
オリゴヌクレオチド(配列番号7)
GTGGGATTCAGGAGCCCGCAGGATC
オリゴヌクレオチド(配列番号8)
GGTGACATTGTGGGATTCAGGAGCC
オリゴヌクレオチド(配列番号9)
GGAGCCAAAGGTGACATTGTGGGAT
オリゴヌクレオチド(配列番号10)
GGTCACAAAGGAGCCAAAGGTGACA
オリゴヌクレオチド(配列番号11)
ACAGTGCAGGGTCACAAAGGAGCCA
オリゴヌクレオチド(配列番号12)
CTGTTGCTGTACAGTGCAGGGTCAC
オリゴヌクレオチド(配列番号13)
GGGACAGGAATGCCTGTTGCTGTAC
オリゴヌクレオチド(配列番号14)
CAGGTGATGGTGGGGACAGGAATGC
オリゴヌクレオチド(配列番号15)
CCGTTTTCAATCCAGGTGATGGTGG
オリゴヌクレオチド(配列番号16)
TGACACTCACAGCATTTCCGTTTTC
オリゴヌクレオチド(配列番号17)
AAGTCCCCACACACATGACACTCAC
オリゴヌクレオチド(配列番号18)
GGTCTTCCCCAGACAAGTCCCCACA
オリゴヌクレオチド(配列番号19)
ACTATGTCAGTAGATTTGAAGGGAA
オリゴヌクレオチド(配列番号20)
TCCCACTATACTATGTCAGTAGATT
オリゴヌクレオチド(配列番号21)
TCAGTCAAGGATTTCCCACTATACT
オリゴヌクレオチド(配列番号22)
AAAAGAACTCAGTCAAGGATTTCCC
オリゴヌクレオチド(配列番号23)
GTAAAGGAAAATAAAAGAACTCAGT
オリゴヌクレオチド(配列番号24)
AACCTGACAGAGTAAAGGAAAATAA
オリゴヌクレオチド(配列番号25)
GGACCCAGAAGAAACCTGACAGAGT
オリゴヌクレオチド(配列番号26)
CACTCTCTTGAATGGACCCAGAAGA
オリゴヌクレオチド(配列番号27)
CACTCGGTCTTTCACACTCTCTTGA
オリゴヌクレオチド(配列番号28)
GTCTTGAGTCAATCACTCGGTCTTT
オリゴヌクレオチド(配列番号29)
GATAAACAGCTGCAGTCTTGAGTCA
オリゴヌクレオチド(配列番号30)
AGTCCTGGCTTGGTGATAAACAGCT
オリゴヌクレオチド(配列番号31)
ATGTGTAGAGTCCTGGCTTGGTGAT
オリゴヌクレオチド(配列番号32)
GTAGCTATGCATGTGTAGAGTCCTG
オリゴヌクレオチド(配列番号33)
TGCTTATTGGTAGCTATGCATGTGT
オリゴヌクレオチド(配列番号34)
ACTTCTCCCCATGCTTATTGGTAGC
オリゴヌクレオチド(配列番号35)
CCTTGGCAGTACTGAACTTCTCCCC
オリゴヌクレオチド(配列番号36)
CCTGCTATGCTGATGGTGGCTGCAG
オリゴヌクレオチド(配列番号37)
GGGCATCCTACCTGCTATGCTGATG
オリゴヌクレオチド(配列番号38)
GCAAATGTGAAGGGGCATCCTACCT
hu6-75、配列番号39
TGCATTTCTAAAAGACCACCCTAGC
hu6-69、配列番号40
TCTAAAAGACCACCCTAGCTTGACC
hu6-58、配列番号41
ACCCTAGCTTGACCATTTCCTGCAG
hu6-39、配列番号42
CTGCAGGAGCGTCACTCACCACTTC
hu6-27、配列番号43
CACTCACCACTTCTGTCTTCCTAAC
hu6-12、配列番号44
TCTTCCTAACAGTTTTTGCCAGGAT
hu610、配列番号45
GATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCAC
hu619、配列番号46
GGCTCCTGAATCCCACAATGTCACC
hu628、配列番号47
ATCCCACAATGTCACCTTTGGCTCC
hu637、配列番号48
TGTCACCTTTGGCTCCTTTGTGACC
hu646、配列番号49
TGGCTCCTTTGTGACCCTGCACTGT
hu656、配列番号50
GTGACCCTGCACTGTACAGCAACAG
hu669、配列番号51
GTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCC
hu681、配列番号52
GCATTCCTGTCCCCACCATCACCTG
hu693、配列番号53
CCACCATCACCTGGATTGAAAACGG
hu6110、配列番号54
GAAAACGGAAATGCTGTGAGTGTCA
hu6125、配列番号55
GTGAGTGTCATGTGTGTGGGGACTT
hu6139、配列番号56
TGTGGGGACTTGTCTGGGGAAGACC
hu7-75、配列番号57
TTCCCTTCAAATCTACTGACATAGT
hu7-66、配列番号58
AATCTACTGACATAGTATAGTGGGA
hu7-53、配列番号59
AGTATAGTGGGAAATCCTTGACTGA
hu7-45、配列番号60
GGGAAATCCTTGACTGAGTTCTTTT
hu7-33、配列番号61
ACTGAGTTCTTTTATTTTCCTTTAC
hu7-22、配列番号62
TTATTTTCCTTTACTCTGTCAGGTT
hu7-10、配列番号63
ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCC
hu73、配列番号64
TCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTG
hu717、配列番号65
TCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTG
hu730、配列番号66
AAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC
hu744、配列番号67
TGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATC
hu758、配列番号68
AGCTGTTTATCACCAAGCCAGGACT
hu766、配列番号69
ATCACCAAGCCAGGACTCTACACAT
hu776、配列番号70
CAGGACTCTACACATGCATAGCTAC
hu785、配列番号71
ACACATGCATAGCTACCAATAAGCA
hu796、配列番号72
GCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGT
hu7111、配列番号73
GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGG
hu7136、配列番号74
CTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGG
hu7146、配列番号75
CATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCC
hu7158、配列番号76
AGGTAGGATGCCCCTTCACATTTGC
MuSKゲノム配列(配列番号77)
1 tatacagtca tttatcactt aacatcaggg atatgttctg agaaatgcat ccatagttca
61 ttttgttatt gtgtgaacat catagagtat acttacagaa accttgatgg tatagcccac
121 tgcacaccta ggctgtatgg atagcctatt gcccgtaggc tacaaacctg tcagcatgtt
181 actacactga atactgtagg caattgtagc acaatggtac gtatttgtgt atctaaacat
241 agaaaacata cagtaaaaat acagtataaa agataaaaat ggtacacctg cattgggcac
301 ttaccatgaa cgaagatttc agcactgaag tttgctctgg gtaagtcagt gagtgagtga
361 tgtgtgaatg tgaaggccta ggacattact gtacactgct gtaaacttta taaatactgt
421 acacttagac tacgctaaat ttatttttaa aatatttttc tttctttaat aataaattaa
481 ccttagctta ccacaactat tttattttat aaacttttaa aatttgtaat ctttttgact
541 cttttgtaat aatactctgt ttgaaacaca aatatattgt acagttatac aaaaatagtt
601 tttcttcata tccttaagct cttttctatc ttaaaatttt atttttattt tttactttct
661 aaactttttt tgttaaacac taagacaaaa acacacaata gccttggcct acacagggtc
721 aggatcaaaa catcactgcc tttcaacagc ttgtcctact ggaaggtcct caggggcaat
781 aacacacatg gagctgccat ctcctatggt aacaatgtat tcttctagaa tacctgcctg
841 aggctgtttt acaatcaatt ttttatttat ttttattttt tatgttttta aataagtaca
901 gggtatacac agtaaaataa taataaaaat atagtacatt aaaaaaacca gcaacatggt
961 catttattat cattatcaac tattatgtac tctacataat tgtatgtgct tttttattca
1021 aaaagaaaat cattaagaac acagcaatat taatatttat tctttttttt agaagaacct
1081 gatttattta tttaattttt ttattatact ttaagttctg ggatacatgt gcaaaacgtg
1141 taggtttgtt acacaggtat acatgtgcca tggtggtttg ctgtatccat caacccatca
1201 tctacattag gcatttctcc taatgctatc cctcccctag ccccccaccc cttgacaggc
1261 cccagtatgt gattctcccc tccctgtgtc catgtgttct cattgttagc tcccacttat
1321 gagtgagaac atgtggtgtt tggttttctg ttcctgtatt agtttgctga gaatgatggt
1381 ttccagcttc atccatgtcc ctgcaaagga tataaactca ttgtttttta tggctgcata
1441 gtattccgta gtgtatatgt gccacatttt ctttatctag tctatcattg attggcattt
1501 gggttggttc caagtctttg ccattgtgaa tagtgctgaa ataaacatat atgtgcatgt
1561 gtctttatag tagaatgatt tatagtcctt tgggtatata cccagtaatg agattgctgg
1621 gtcaaatggt atttctggtt ctaatccttg aagaattgcc acactgtctc ccacaatggt
1681 tgaactaatt tacactccca caaacagtgt aaaagcattc ctatttttcc acattctctc
1741 cagcatcggt tgcttcctga ctttttaatg attgccactc taacaggcat gagatggtat
1801 ctcattgtgg ttttgatttg catttctcta atgaccaata atgatgagct ttatttcata
1861 tgtttgttgg ctgcataaat gtcttatttt gagaagtgtc tgttcatatc cttcgcccac
1921 tttttgatgg ggttgtttgt ttttttcttg taaatttgtt taagttcttt gtagattctg
1981 gatattagcc ctttgtcaga tggatagatt gcaaaaattt tctcccactc tgtaggttgc
2041 ctgctcactc taatgatagt tccttttgct gagcagatgg tctttagttt aattaggtcc
2101 catttgtcaa ttttgacttt tgttgccatt gcttttgggg ttttagtcat gaagtctttg
2161 cccatgccta tgtcctgaat ggtattgcct aggttttctt ctagggtttt tatggtttta
2221 ggttttacat ttaagtattt aatccatctt gagttaattt ttgtatgaga tataaggaag
2281 gggtccagtt ccagttttcc gcatatggct agccagtttt cccaacacca tttattaaat
2341 agggaatcct ttccctactg cttgtttttg tcaggtttgt caaagatcag atggttgtag
2401 atgtgtggca ttatttctta ggcctctgtt ctgttccatt ggtctatata tctgttttgg
2461 taccagtacc atgctgtttt ggcaaaccag gaagaagctg aatccctgaa tataccaata
2521 agaagttctg aaattgaggc agtaattaat agcctaccga gcaaaaaaaa aaaaaaaaaa
2581 aaaaaaatcc aggaccagac ggattcacag ccgaattcta ccagaggtac aaagaggagc
2641 tggtaccatt ccttctgaaa ctattccaat caatagaaaa agagggaatc ctctctaact
2701 aattttatga gtccagcatc atcctgatac caaaacctgg cagaggcaca accaaaaaca
2761 gaaaatttca ggccaatatc cctgatgaat attgatgtga aaattctcaa taaaatactg
2821 gcaaactgaa tccaacagca catcaaaaag cttacccacc acgatcaagt tggcttcatc
2881 cctgggatgc aaggctggtt aaacatatgc aaatcaataa atgtaatcca tcacataaac
2941 agaaccagtg acaaaaacca catgattatc tcaatagatg cagaaaaggc tttcaataaa
3001 atttaacacc cctttatgct aaaaactctc aataaactag gtattgatgg aacccatcga
3061 aaaaaaatga gctatttatg acaaacccac agccaatgtc acactgaatg agaaaaagct
3121 ggaagtattc cctttgaaaa ctggcacgag acaaggatgc cctctctcac cactcgtatt
3181 caacctacta ttggaagttc tggccagggc aatcaggcaa gagaaagaaa taaagcgtat
3241 tcaaatagga agagagaaag tcaaattgtc tctgtttgca gatgacatga ttgtatattt
3301 agaaaacccc atcatctcag ccccaaatct ccttaagctg ataagcaact tcagcaaagt
3361 cccaggatac aaaatcaatg tgcaaagatc acaagattcc tatataccaa taacagacaa
3421 acagagagcc aaatcatgag tgaactccca ttcacaattg ctacaaagag aataaaatac
3481 ctaggaatcc aacttacaag ggatatgaag gacctcttca aggagaacta caaaccactg
3541 ctcaagggaa taaaagagga cacaaataaa tggaaaaaca ttccatgctc atgataggaa
3601 gaatcaatat tgtgaaaatg gctgtactgc ccaaggtaat ttatagattc aatgctatcc
3661 ccatcaagct accattgact ttcttcacag aattagaaaa aactacttta aatttcatat
3721 ggaaccaaaa aagagcccat atagccaagg caatcctaag caaaaagaac aaagctggcg
3781 gcatcacact acctgactct aaagttctat aaatgaactc acgaggccaa agaatgaaga
3841 agacaccaac acaaagggga aaaaatcaaa acaatatggt cattgcaatg gtagagatat
3901 gcacagtata ttatggaaac ccagagaaga caaacgtaac acagctttgg gaagatatgg
3961 aatttttctc ccaggaggag aggatgatca agctgagaga tgtgtgaact gagtggaaag
4021 gaggggagta gtattccaag agaagcaaac agtatgagca attcatggag gtaggaaagc
4081 tgtatacagg gaaccatcag caggttgttg aataaaggaa gctgaatgag gctgggcaca
4141 gtagctcacg cctgcattcc cagcactttg agaggccgag gtggaatcat catttgaggc
4201 cagcagtttg agaccagcct gggtaacata gcctgaccac atctctccaa aaaataaaaa
4261 taaattagcc tgctgtagtg gcagtgcctg tagtcctagc tactctgaaa ggatcacttg
4321 agtccaggag gctgaggttg cagtgagcta tgattacccc attgcactcc agcctgggca
4381 acagagcaag accctgactc tgaaaaaaaa aaaaaacaaa aaacaaaaac aggatcgtaa
4441 aagacaatac taacatacaa caaagcatgc agattccagt aaagcctgtc atattaggca
4501 gattaggcag gtttaaatat atttttatgt gatgatgagc ccctaaaggc ttttgagcag
4561 gagggactat ctgaaaaaag atatagaatg gttaagaccc aagacagaga gaaggtacaa
4621 ggactatttg gttgataaaa tctgtaggaa ttggaatggg ctgaatgtgg gagtgggggt
4681 ggggtgagag atggggagga ctgaagactg aatagaccca gatttctggt ttgagtccgg
4741 gagaggtggg gtgctgaatt cgaaggtcag gacacctata cctctgggaa tacagcgatg
4801 gttgcaaaag gcatctggta ttgtccttct gccactgtct taaaagggat tctaaaggga
4861 ttttcttgcc cttgttcctc cagccctaca cttgcattac tggcctacgt ggatgctcac
4921 cagctggctg tgtccatcat tgcagccaag tctgagaatt cctgattata cttagagcct
4981 gtggagctgc tgacacaaac agtcattagc agacaaccct tttgcaacaa agtatgcttt
5041 aaaatgtaaa ctgtggagcc attttccttg cgttgtccag aaggaacttc gtcctgcgtg
5101 agcctggatt aatcatgaga gagctcgtca acattccact ggtacatatt cttactctgg
5161 ttgccttcag cggaactgag aaacttccaa aaggttggtt tgagcaatcg tgtcttcttg
5221 ttgtcttgtc atggttgtaa agtgtgtgta tatgagatat gaccaagact gatttatagt
5281 atggtgggct tgggttttac ttgaagaagt aagggtgaaa tgtatgatga gggaggaaat
5341 tatatacata agcaattggt tgatggtctc tctaccaata ttttactccg aagttctgca
5401 ataaaaggct tagccacata gtgcatgcag agctctgact tctagggcaa aacataagca
5461 tgtacactgc aagttatcaa ggtctatttt gtttatgcga atgtcaaatt tcagggtggt
5521 ctaagtggat gatgacaacc ttttcgcatc aggtttgcca ggaatagaat caaccccatt
5581 ctcagacatc cagagcattt gcttctgaat aaaaatcact tttattttca gttttagctt
5641 tgccaaactc ttaataaata ttttagttgc taaaaattgg aaatacagaa agacgtacac
5701 aatttgcctg tgtaacaaac ccggaagaca atggatttta aataactttg aggctggagt
5761 catgatttgg cttggcaaga gactgcaaaa gtttttttca gagcctttgg aatgtaccgg
5821 aaataacacc acctcagggg aaaggaaagc aacttaagaa actgacaaac acctgttgca
5881 gtagcaagaa tgtccagtga tatagtttct ggccagtgta ttatgaaact gggactagcg
5941 tatttgaaat cagaaagact ggaaagtctg tgatttgcaa agtgactaag ggtatcactg
6001 aaatcttttt ttaaaaagac atgagaaagc agatcgagtg gtatcaatac aagagttttc
6061 aaatttaatg ttataccata gagtaaaaag agatttttgc ttcaggacat gttcaaatta
6121 atcattttcc ctttatatta atcaaagcac tgaaacagtt tgtattgtgt agataaatga
6181 aggtggtatc tgtatataga tgcaaaatgt atctttagat tttctggttc actaaaaatt
6241 ctggagccat aaggtcaaag ttcacatgca aataagatgc gggtttcttc acaaacaatc
6301 tgatttcaca gatttttttg tttcattttg ttgcttctct ttttccattt tacttgagta
6361 taatggtatc ttcaaatgta tttaaacatt taatttctaa tgaatacttt aaggcatcta
6421 cagataaaag agactctaga tcttttcaaa cagctaataa tagtcagaaa gacttaacat
6481 tggcttcaga ttattttaat acttcctgat caaacaacgg atgtccggta aggccccacc
6541 tggatgtttg aacgtatggg ttgtcttaag tattatttgt atatttctaa accacgcagt
6601 tacataaaaa tgatagggtt aaatactaaa atacagtctt ataaagagca ggacaattga
6661 ttttgatgat tcaaataagg atttgttgta cacacacaca aaacccccaa aatctctcta
6721 tctgaataag tcttaattta tattctagaa agaattgatt ttcatttcca aactttacaa
6781 ataaagccct taattcaaat gcacactatc tctattttga aaatattgaa atatagtggc
6841 atagagataa caaagccaaa caccctgact tttaaataaa ctaaccagat cattcaccca
6901 atttcatttc ttataattta tttactacta gaattaggtt ttaaaatcaa aaaatttaag
6961 caattttttc tcagtctatt gtactgtaaa atctaaatta gtatgagttt aacatcactc
7021 ttagccaaaa taccatgtct aggagaacaa acatttattt actacataca gcagttctga
7081 gaataactaa tatcatgaaa gcataatcct taaaatttta aatgttgaag ggtgaggaat
7141 acattggtag aaaagaacca caataaaatt ttattatttt cattattatt attattattt
7201 gagacagagt ctcgttctgt tgccaggctg cagtgcagtg gtgtgatctc agctcactgc
7261 aacctcctcc tcccaggttc aagctatact cctgcctcag actcgcaaat acctgggact
7321 acaggtgcaa gccaccacac tcggctaatt tttatatttt tagtagagac agggtttcac
7381 catgttggcc aagatggtct ccatctcttg acctcgtgat ctgcctgcct cggcctccca
7441 aagtgctggg attacaggca tgagccactg cgccagccat tatactactg aaactaataa
7501 aaatggccca cccaaactat ttctactatt tctagaaaac tactgttttc cctattcttg
7561 gcagacggta ataacaaaaa gagtttttta gataatatac ttcttcctaa gtcctttatc
7621 atgaatgcat aaaggaaatt gtacaatatg tattagctaa taaattgaca tatttaaaat
7681 aacacaaaag tattcagtgg attattttct gactttctgc acatcatttt ttgataaaaa
7741 ttaatatcca actttgtaga attaattgtt catagttttc attttagttt aattaaggct
7801 actaatgccc aatgataagg ggaagaatca ttgtctttct gaatcatttc aactagtgat
7861 attttcaatg atgaattcag tgccataacc caagtagtag aatttcacaa actgtcattt
7921 atgaaagtag ccaatgttcc actggataat tggcttaact acatacatca ataacattta
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8041 gttcatgtaa gcagctctgg atttgcttaa tatgcacaaa gaactatcaa aagtctcact
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8161 tagatagatt tgaataacct cctcttttaa attgtatgta tataaggata ggattcacag
8221 atttgacata tgactaagtc atgactgaca cagctgtcat tgaaatccag gacacacagt
8281 cctggatgaa tattttatat tgacatgcat tgaaagagtt actcattgca tgtttgagta
8341 aacagagttg cttcaaatat tattgacctt aaagaaaaga aggaaggagc agaaatttca
8401 agatctcttt aaactctacc ttatttccaa aggtaaatga agtaggcagc ttctcagtga
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8701 cactttccag ggtcagtaca gctaaagaac tagagagtaa aggagttgga gttatatggc
8761 agcgtaccat gagatacaga ttggatcagg aagaaagtaa aacaaggata tttaatgctt
8821 ggaagagaag gttaaaaagt ttaaaccaac cccaaagtgt tttgttgtac taaaaaaaaa
8881 atactgcatt cataatgtta gagaaacatg aatattttcc aagtcagagc cctaatttta
8941 ctaaaataga aaggagcaaa tacaccttgt ttctttatgt acccaatcat tgggtcatgt
9001 caatccaaaa ataatcaatc aaaagttggt aagtcaatag tcatatgcga gagcccataa
9061 aatacaaagg aaaggtaatg tcatgtcctt ctcatcaagc agttgatatc caagtcaagc
9121 ttttcttcgg gtccagaaaa ggattgtgtt cattttcatg tatttgttat tcatgtagtc
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9241 ggatagtaga atgaaagtaa acaagagaca gtgtgctgag tcaacaaata tcattaaata
9301 caactgatcc atgtgattgt gtcagtgaaa accggaaagc agatttggat aactggaaat
9361 atggacaatg tggacttggc attctgtgtg tagaaactga tattgatgta catcttctct
9421 tatccatctg tgcataatca gtatgatctt gaagatgcag tatgtcttag agaaaggaag
9481 tataaaccaa ctttaaccct gaagttcagc tagttcagct ctatcacttc ctatttttgt
9541 gatatgtaga caagttgtgc aaccattttt agtccccatt tctggtctgc aagtggaaat
9601 attaatagta tctacctttt ttgtgttaaa taaaaagata atgaataaaa agtataatgc
9661 atggcacata ccagattctt aatcactttt agatgctaat attagtaaaa acagtcaaac
9721 ttcacacaag actgttatgt cactgaatct tatgggaagg tgttaactta ataaagttct
9781 tagtaacacc ttccatattt ctccatgtct attttccaag acattctaag actcacttct
9841 ttgatcttaa ctgatctcaa cagttcatgt gacatctcca gtgtgtcacc tcattggaaa
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10021 tttgaaaatg caaaatacat aaagtttaag acagaagaag tcatccatac ttccaggact
10081 attaacacat tggcatattt tcttccattt ttttctacat atttttaaag tccttattaa
10141 cattgtgctg cctgctattt ttacttagca ctaaagcatg agcatattct atattattag
10201 taatcttcca aacgtcatgt gtggtgacta aataatattc tgtttagata acagtgtgct
10261 agtatatgtt taatattcac ctcactgaga aaaaaaaaga cgtggatttg ttgctcttgt
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10441 atattatttc taccacacag acacattaca gataacctca agaacttata taataataaa
10501 atgtagttaa atcattggga atttcaagta ttaatacttt gtttttaata tatttgatta
10561 taaatgtata caacttagtt tttaataatg attgtatata acaatcacct ctcaaaattc
10621 ctaaaaaatt accaagtggc tcttgcaaac ctgcggaaga caaaacttgt gtgcctcaat
10681 cttctcccac ttgactacga ttaatagaat ttagtacaat tgatctgttt tctgcagtaa
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11101 atgagccacc aaccacaccc agcctgagat aaaatattaa cggtataata catttgaatg
11161 taataaagac aaggaaaaca atcaaacagc ctgggtttct ttttctaaat tatagaatca
11221 agtaacattt gcacagtgct ccatgtggac caaggacaat tttaaatggt ttccatttat
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11521 tccctggttc acgccattct cctgcctcag cctcccgagt tgctgggact acaggcaccc
11581 gccaccacgc ccggctaatt ttttgtattt ttagtagaga tggggtttca ccctgttagc
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11701 gattacaggc gtgagccacc gtgcctggcc gctacattgc ctcttaatgt gtagttgctc
11761 aatagtcttc cctttttttt tttttttttt tttttttggg actgagtctc actctgttgc
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11881 gtgattctcc tgcctcagcc tcccgagtag ctgggattac aggcctgcac caccacaccc
11941 agctaatttt tgtattttta gtagagatgg gatttcacca tgttggccag gaatctcttg
12001 aactcgtggt cctccccgcc tcggcctccc aaagtgctcg gattacaggc gtgagccacc
12061 gcacctggcc tagtctttct ttttaaacag taaaagcatt caacatcatc aattaacctt
12121 tgggctcatt gttaaccaca ctccacaagc ttaataaaat attgtttttg ttctttatct
12181 ctcaatatct agatgattat actattaatt gcttatttca ttcattcgtt gtttagaaaa
12241 taacttttta ttgagattga ctttctcaaa ctttatgaat tataagtttg cctccattgc
12301 attttgaaaa ttaacacttc tttggcattc tatctgctac aatttttttc tattatgaaa
12361 gcaatatgta ttcatttttt taaaaaatcc tgtaagatac agaaaaacaa aaatataaaa
12421 ttacacataa tgctcatagc aagggataag tgctcttagc attttgctat tcattctttc
12481 agtctctttc tctcatatat gtgtgtgtgt atatgtaagt gtatatatgt tgtatatata
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12601 ttttattttg taaattttaa gttccggggt acaagtgcag gatgtgcagt tttgttacat
12661 aggtaaacgt gtgccatggt ggtttgctgc acctgtcacc catcacctaa ataactgggc
12721 tcagcatgta ttagctattt ttcataatgc tctccctccc ccaatcccac ctgctgacag
12781 gccccagtgt gtgttgttcc cttccctgtg tccatgtgtt ctcattgttc agttcccact
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12901 cttccagctc tatccatgtc cctgcaaagg acataatctc attccttttt atggctgcat
12961 agtattccat ggtgtatatg tatcacattt tctttatcca gtctatcatt gatggtcact
13021 tgggttgctt ccatgtcttt gctattgtga atagtgctgc agtgaacata ggtgtgcatg
13081 tatctttaca aatttcagag gctgttattt cattgaggaa agagaagcat ttaaataaga
13141 agctctctct tcagctgcct accagcaaag gggaaaaacc tacctctctg catccatctt
13201 gtcctccttc tccctcactg tgctttaaga ggactttctc ttcctatccg tggttaaccc
13261 gtctttcttc ctctgagccc cacataaatc tgctttctca gggacctatt tccctcaatt
13321 atctcctgtc tttctccaat gtcctacatt tttgcttcta ctaggtgctt ccagtcagca
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13561 caacatgacc tcctcatcag gaaactcagt gggcactttt aggtccttat ttaacttaac
13621 gtctcggcag catttgattc tccctctttt gtgaaacgtg tgctactctt gggctctgcc
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13741 ctcttcattc tcccacccat cttttataaa tgtttgtgtt ttcttctaat tggcttaggg
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14161 tctgcctaaa tgcatagtaa taattttgaa atttatgatt taatttaatt tgctttttaa
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14821 tgaacaattt tgtttttaaa attcttaatt ctttagattt tcatctttaa atattcatta
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15001 tgatgtgcat atctgtttaa ttaattttac taattctgct attctgtttt actacatata
15061 taattatatt tttgtctttt gatctataaa caggattggg attttttgtt tttttgctat
15121 ctttttattg tctatttctt acagatttta ttatggttag aaaatataga ctatataaaa
15181 tcaattcttt gagctgggtt aaaatctcct atgtagcttg gtatattttc tttatgtttg
15241 aatgtttcat ctatgcatca tttacaaaat gtattctgta attgtttcat tgttttataa
15301 atgtacatta tatctagtgt taattttgat gtttatatct tctatatctt tactgtagtt
15361 ctgtttgata tattagtgtc tgaaggagat ctcttaaagg gttacactat gttaaaacat
15421 ttctccatgt actcttgtga taattttact tttgggtttg agtccatatt tttaaataat
15481 taagtttcat gattgtcata tctttttagg gcttgttcct tttatcatta agcaatgttt
15541 ctttttttct tataaatgca tatgccccta tattacattt ttcttatatt actattgcta
15601 tgtcactttc tttgggatat cgtttgcttt atacatattt tccctcccct ttatttttaa
15661 catttctgtt ttattttatt taagtgtgtc ttttgtgttt gatagcatct gtcatttcat
15721 aggtcagctt ataccattgg cacttactgt gatttctggt atatttggac ttgtttcttc
15781 catattattt tatgtcttct gttaaccatg ctttttcttg gcttatttat tcctcctctt
15841 cttcctgttt gtttttgctt ttgtttttga ttgataaagc ctttctggta cctctttttt
15901 tctctgttgt tttggaattt ttgaatttta tttatttttt agtagtaacc attaataagg
15961 ttttaacata atcatttaac catagatgct tctttctgtt tgaagttatt caatatttct
16021 gtcctcttgt ttatggcaaa gagcttagca ttttttaatt acttagcatt ttaaacttct
16081 ttcctgaact ttgatcttat agttgtttgt ctagaattta attccactct ttttaaacac
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16981 tatcagccat ttatctcttt atatattgct tctaggctgc tcccctcttt tatttttctc
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17161 tatgatatat atatcatata tatgatatat ataatgatcc ttataatata ttatattata
17221 tataatatat attatatatt atatattata taatatatat tatatattat atatataata
17281 ttatatatat tatataatat atattatata atatatatta tatataatat atattatata
17341 tattataagg atcgttataa tatatattat aaaaattatt ataatatata ttataacaat
17401 ccttataata tatattataa tgattattct gttgaaaagc tgggaagaaa gtggccctga
17461 tgactgtgta taagatgtca ttttacataa aaattctgct ttcttatttc aactactatg
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19081 ttatgaagta gatgagatgt tttgatacag gcatgcaatg taaaataagt acctcatgga
19141 gaatggggta tccatcccct caagcattaa tcatttgaat tacaaacaat ccaattacac
19201 actttaagtt attttaaaat gtacaactaa gttattgttg actatagtca ctctgttgtc
19261 ttatcaaata gtaggacttt ttcattcttt ctattttttt tgcacccact aaacatcccc
19321 tactcccccc gatccctgta ctaccctttc cagcctctgg taaccatcct tttacgctcc
19381 atgtccatga gttcaattgt tttgatgttt agatcccaca aataagtgag aacatgcaat
19441 gtttgtcttt ctgtgcctgg ctaatttcat ttaacataat gatctccagt tccatccatg
19501 tctttgcaaa tgactggatc tcattctttt tatggctgaa tagtactcca ttgtgtatat
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19801 ccacatcaac agtgtacaag gattccctta tctacacatc cttgcgagca tttgttattg
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19981 tgcatgtctt ctttcgagaa attgttcaaa cttttttgcc tatttttgat tggattaata
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20161 gtatcctttg ctgtgcagaa ggccttttaa cttgatgtga tcccatttgt ccatttttgt
20221 tttggttgcc tatgcctgtg ggtatctctc aagaaatttt tccccagacc aatgtcctgg
20281 agagtttccc caatgttttc ttggagtagt ttcatagatt gaagtcttag atttaaatct
20341 ttaatccatt ttgatttgat ttttgtatat ggagagagat aggggtctag ttttattctt
20401 ctgtacatgg atatccagtt ttccacacat catttactga agagactgtc tttttcccag
20461 tgtatgttct tggtacctct gtcaaaaatg aaatgagttc actgcaggtg catgaattta
20521 tttctgggtt ctctgttttt tcccattggt ctatgtgtct cttttgatga aagtactgtg
20581 ctgttttggt tactctagct ctgtagtatg atttgaagta aggcaatgtg attcctccag
20641 tttttttctt ttttcttttg gctattctgg gcctttcgtg gtttcacata aattttagga
20701 tttttttttt ctatttctgt gaagaatgtc atcggtattt tgataggaat tgcatggaat
20761 ctatagactg cttttggtag tatgaacatt ttaataatat tgattcttcc aatccattaa
20821 tatggaatat ttttccattt ttttggtgtc ctcatgaatt tctttcattg atgtcttaca
20881 gttttcatta tagagatctt tcacttcttt gattaattcc tagctattta attttatgtg
20941 tggctattgt aaataggatt atttttaaat ttatttttca tattgttcat tgttggtata
21001 tacaaatgtt actgattttt gtacattgat tttgtatcct gcaacttcat tgaatttatc
21061 agttctaata gttttctgtg gagtatttaa gtttttccaa atataagagc atatcatttg
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21301 tagctgtggg tctgtcatat atggctttta ttattttgag gcattttcca tctatttttt
21361 gagggttttt atcacaaagg gatgctgaat ttttatcaaa tgctttttca gcatatattg
21421 aaataatcgt atgtttctta cccttcatct gttgatatga tgtatcacat tgattgattt
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21901 acatatttct acgaatagtc tgttcatgat aatttaggta ttctttaaga tgatgtagat
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22141 gcagcagcac cacacttcca ggtaccaaaa cctgtattta tttattatcc ttgctgtaac
22201 aaattaccac aaacttagtg gcctaaaaca acataaacgt actatgttac agttctggag
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24181 tcttctgagt gattttctgc ttcagtggaa gctgttctat tttctccact tcatgtctac
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25201 tatacttaaa tatataaaaa catatttaaa tataaatacg tataactata tatttaaata
25261 tataaatata tagctatagt tatatatagt tatatattta catttaaata tatagtttta
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25441 atatataaat atataaacta tatatttata tattgtatag ttatatttat atataaatat
25501 atagctatat atttatattt aaatatatat taaatatata tttaaatata aatatataaa
25561 tatatataaa tacatattta tatatatgta aaaaatataa aaatatgtga aaaatacata
25621 tttatatata atatatgtaa aaaatattaa aatatgtaaa aaatacatat ttatatatat
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25741 ataaatatat agttatatat atttatatat tatatatatt tatatatttt ttactacata
25801 atatataaca tattatatat tttagtatat atattatata ttagtatata ttagtaatat
25861 accatataat atacatagta tattatatat aactatatat agttatatat aaatatataa
25921 ctatatatgt tatatatagt ttatatataa tattatatat tatatataaa ctatatatat
25981 cacatatagt ttatatattt tttaatatat aatatataac tatatattta aatatataaa
26041 tatgtaacta tatatttata tataactata tatttaaata taaatatata tttaaatata
26101 aattatataa atatacataa aaatacatat ttaaatataa tatataaata tatatttaaa
26161 tataaatata tatttatata ttatattata aatattataa ttatatatta tatattataa
26221 atatataata tatattatat attaatataa gtataaatat ataaatatat attatgtaag
26281 tataaatata taaatatata ttatataagt ataaatatag aaatatatat tatataagta
26341 taaatataga aatatatatt taagtataaa tatataaata tataaatata tatttaagta
26401 tatataaata tatataaata tatatttaag tataaatata tatttaagta tatataaata
26461 tatataaata tatatttaag tacaaatata taaatatata taaatatata tttaagtata
26521 aatatagaaa tatatattta aatataagta tatatatatt taaatataag tatatacata
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26761 taaatataag tatatatata aatatatata tttaaatata agtatatata taaatatata
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30421 aatacaaaaa aaaaaaaaaa aaaaaattag ccgggtgtgg tggtgggcgc ctgtagtccc
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34801 cagctttaat gatctcgttt cccacgtttg cctccaattg aggtaacatc tttattatgt
34861 cattgtacca attgctcata aaattttcat taattcctca tggaaaataa tgaggttggt
34921 gggaatagtg gctgtcagaa tataaaaata cattttcatc aagttgctgt aatttaatat
34981 cttctaaata atcagtgcta tttgaagctc cgtattcaac aaccagttga tatgatttat
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49021 cttaaggata cagacgaaag agagatgtgg ttcatttctt gaaaagtgtt caaattcagt
49081 gaggaagatg gatatgcaaa caagtaaaat gcaatatatt tacaatgata gaagtttgtg
49141 tagggttata tacacaggac agaggagata gggaaaggtc agggaaatct tcagagaggt
49201 gaaggccaac agggctttga ttgatgaaga gtgaggagct cttggtgagg atcatatcac
49261 attgagggag gaaaaagaaa atagaggaaa aaattcagat ttaccatgca agcacagcct
49321 gacactgact cataaccagg gagtaaaaga aggattagag agtttgggac agtatctatt
49381 agtggtgcta taaaaacaga ataaaccatg atttgactca caggctaaca tggagatcat
49441 cttcttggta tcttctcttg gacctttttt tctttttttt tttttttgag acagagtctc
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49681 tctgctctca agctcctggc ctcaagtgat ccacctgcct cagtcttcca aagtgctagg
49741 attacaggtg tgagccacca tgcctagccc tctcttagac ataattttaa acgggtagat
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49861 ccagaattcc atctaaaagg ttacagaaat gttcccaacc caagccactt taggcaactg
49921 ggatactgtg gtatgattta agattaagtt tatggcttct atttattttt ccaactaaaa
49981 tttccggttg gctaaaacaa aaatcttatt cttaatagac ctcagctcgt ttaacgcatg
50041 tcagagtgca ggcatcttcc agagcttaga tcaaaaaagt tatttaaaag taaactaaga
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50161 tacatggaaa ccttctatac tatctttgca actcttatgt aaatctaaaa ttatttcaaa
50221 ataaaaatgt tttaaaaagg taaactaaga aatacttctt tgtcctggta attaagcagt
50281 ttagcatctc ctcccatcaa aaacagaaaa tgaactttct ttaagaagaa aaaagtgaat
50341 caggaatgaa gtcacatatt ttattggctg atgattaaac ttctaatata ttttcagaac
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50461 ctttgtgtag ctcttgtctg atttacatgg taaacatttc ttgctcgtac ccactattca
50521 ccatccatat ttacaagtga gaaaaacgtt accatctcaa aggccacaga aatgttccca
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51061 ttcttaaaat atgatgctag atgagacaaa tagtctattt aagagcagat tcaaataatc
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52741 ttcaataaat taatattgta ccagaatacc aaactgcatt tggaatcata ggcaactgtt
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63241 aaaaaagatt tcttcatttg aaggtacatt tgacagacga cctctaaatc tccttttaac
63301 gataaatata ttcaattcag aagttttaaa tagtttttga acttgatgct tataaacaaa
63361 aaccaagaat gtaccactga gttgatggag gtagggaaag ttcagacagt agaatctaaa
63421 tgaggaatca caaattcact taaatgtaag gggattgggt gttaagtgta aatatgagac
63481 cttctcattg ggaagactca atgtctgaaa agggggttga atttctggct ctgcacctgc
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63781 taaccttgtc aaccttggct aagttcatct ggatggatgc atggtccttg gcacccatga
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64081 aactctaaga aaggttcaaa tttacatgaa caaataaaac ttcaggaaag aaaactagag
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77341 gtgttctcaa aacacacaca caaaggtaac catgtgagat gatacttcac tagcttgatt
77401 gcagtaatca tttcataata tacatatata tctcaaaaca tcaccttgtt caccttaaat
77461 atatacaatt tctatttgtg agttatacca ccaataagct aaaaaaaatt aaaagtctaa
77521 atttttttaa aggagtttca aaaactaatg ctttgctcta tacttgtacc tggccccacc
77581 cttgtctctc taaagcaggg tgccctagga agactgattg gctgtagccc caaaaggtga
77641 gaactaggac ataagataag aaagggaaga agggaaaggg agagaaggaa gtggggaaca
77701 aagtgcgtca atgtgtgaaa ttttagttgg atgttgtaaa acaggaaaaa aaatgccaaa
77761 ttctatggct accccaataa caaagaatgt cttatggcaa tggcaccctc caagtcatat
77821 aattcattta ttattgtcac tttcactatt gttttcgctg aagtcttttt tctgttactt
77881 gaacaaaatc atttttttcg taatttgtta ataaaattgt ttcattttat ctgtctatcc
77941 tacatccctt caaatacagt acacaaacaa atgaacgtgc ttttccagct tgtaacttga
78001 ggcatggtag aatgagaatt agatggggag ttggaagact gaggttgtaa atgcccctct
78061 ttagttaatg tgattttggg gtccgtttac aactcagaca ctgattttct catatctatc
78121 tacactaaca cagacgtcag gtggctgtca aagatgatct ctaatggtat aattagagac
78181 atcagggcta atgttctcta attttgtcca gttatgataa agtaacttgg agtgcctgtt
78241 ctttacctct ctaagaacgt ttcaagtgtc atttaaaatt tgattcttat ttgtcaatgt
78301 gttttttggc tcctctgtgg aaactgttat agtcttaagc ctgtcaaggg agtataaaga
78361 catcctaaga aaatttggag actgggccgg gtgcggtgac tcactcctgt aatcccagca
78421 cttttggagg ccaaggtggg aggattatga ggtcaggatg gagaccatcc tggctaacac
78481 ggtgaaaacc tcgtatctac taaaaataca aaaaatttag tcaggcgtgg tggcacatgt
78541 ctgtagtccc agctacttgg gaggctgagg cagaagaatc acttgaatcc aggaggtgga
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78721 tatgtaaaaa tagtaataaa gaaaatggaa aggtatatac tttttaaatt tctagtattt
78781 tcaaaagatt catatgaggt tataaatgga agataaatga ttattctctg tcgaagttta
78841 ggaataacaa gagtaggata gtttaagata gttgaggcct tattgagacc ccaacttatt
78901 cattcaacat gtgactcaca aaaagtgaaa ggcaaaatag atttatcacc tcagattcta
78961 aaacaggaat aaaacaaaca aagtgacttt catccaggaa gaaagcaaaa gtacatccgc
79021 agttcttacg gtcagagagt gtgtgctgct cttagagcca agtttagttc ttggtaattc
79081 tacccaagtc tgaaaggaaa tcaagatgac tgtccacatt gacgcaaatc acaggacatg
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79201 acacagagaa tcctatagtc ctgatatcat ttttggtgga atgaacaaag acgaacgcag
79261 agctgggaga tatttggcac agaatgaaac agagtttgaa ctgtggctct tcactcacta
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79441 agccaaagag caggagaaag tccagcaacg tgtcccaaag tgattagaaa ctatcttgct
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79741 atgtccctct tgctttgtcc aataaatata atttctaaaa tattgtagaa gttgaataat
79801 tttaacttgt tagaagaatt ttataaaata aacagccaaa tcacctaggt tgaaggttgt
79861 cttttagaat tttcttaaag ggaggcatat ctatatttag acatattttt aagaggcagt
79921 agttttgctt taaaatatat gacctgtgaa gtccttttat cttactagct gtgtaaacca
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80041 aattaatatt tgtggctaca ttaatcagaa aaactatgga aatgtctctt ggtttattat
80101 ccctttttct atgattcata aacagacatt attacaactg cataaacatg aaccctactg
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80581 taaggtcaaa tcataaaatt atcggattat ccatagctgg gggtggattc tctcaagacc
80641 gcattagtaa tgtattaatg atacattaag aagtactcca caggtctata actgctcaat
80701 caccttcaaa gagtttttac acacattatg tcaggcatga attattatgc ctatttaata
80761 gagcttccta tcctactgcc tctttttaga aaaaaaagtt ttattgtgat ctttattgta
80821 tacatttaag gtacaaaaca tgatgtttag ataaacatat acagtgaaat gattactata
80881 gtcaagcaaa ttaacaagtc catctcctca catagttaca gctaacttag aaagacagaa
80941 catcacaccc agagcaggga gctgtgtctc cagctccctc aggtccatat acctgagtga
81001 cttggagaaa atcatgcatt tcctgtaact accagacgta gtcacctcaa ttaagtaatc
81061 tgttttgctt aggcatacct tggtaaaagc tcacagtact aatctggacc cacccctttg
81121 atctttgaaa cctgaggtgc gaaaaaatat caaaatggag ggcagaggga tttgttttta
81181 ttttcagatc atcaaaaata ctaaactgtt gatcagaacc atccatgaag aaagaaaaac
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81301 gcctctggaa gcagggggaa aagcattcag gagtcacttt gtactcaagc atgaacctcc
81361 taaagtgttg gtctctttgc tgaactattt caacacctgg atgaagtcca ggagaagaga
81421 cgtcaggcag tttaaaaatt gcttctcttt cctactaagg atgttttcag tgaccttgag
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82201 gtcaaactgt gaaaatcctt tctcatgcaa cacaataaaa taattggctc caaaatgtct
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82501 tgaaaaaaga accaccattt aaaaaaaatg ccaccacctt aacaatgaca tttgtcagat
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82621 actgctcatt tgttctctct tctaggacta gggaaggcac tgtaacataa tgattaaaag
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82921 ttcaacacct ggatgaagtc caggagaaga gaggtcaggc agtttaaaaa ctgcttctgt
82981 ttcctactaa ggatgttttc ggtgaccttg aggtattatg tatgtattat gtatgtcatg
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83101 tgcatttatg gggaactgaa caggagttat gaaaataagt ccttaagtct gcaacctctc
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83521 ggctcttgct tgtttatagg cagtcccagg ttccataaac aagaaagcaa gccacaatgt
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83701 atggacacag ggagggaaaa tcttttggct atgtttgcag tgtaccacat gcacttgatt
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85261 taatagtata atcatataat ataaatagta ataagaatta ctatttacat agcactttgc
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86161 tggtctcact gtctttgtat tatttgacat ttgatcaaga cctactgtta aataaacata
86221 tatttataaa aatctatcaa tatatattta tataacatat atgtatgtat gtgtgtttat
86281 atacacacac atggagagag agagagaatc acatttaaat atgaatactc catccaagaa
86341 aataaactga tctactttaa tttaacctgc actttcactg gcagaagaaa aatactaatg
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87121 ataaaatatc caaattttta atctccctac cttcctcctt ttcacagcat atgaagctgg
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87241 atcataagta caaaggtggt tgtgaaggca gtgctataac cactgagggg aacctaataa
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105421 tgataaaacc agaaactatt taaatattgc aataatttga ggacactctc tatttagcat
105481 tcaataacaa cagtatggtc attaaattag agttttgtat tcctcaattt actgcaaagt
105541 ttgagggttt ggagacacta taagagtaat ataatttgtt tattcatcta agaagattgt
105601 attgtgatca ggcatgttat ctaaaaatct ctagggactt cagcattgac agaataagaa
105661 ggggaaagag aaggagagaa aaagtaaaat tactgcaaaa aaaaatggga agagtgggtg
105721 aggggcagta aaatttgttt taatagaact taagaaatac tgatgctatt tcaactgtcc
105781 ttgcagttat ttgaaaaaat agtgtctctg ttaattatca cttctttagt ttagatttct
105841 ctttcttggg cttctttata ggattctcca aaattgttta tttgacgtac tgctcaacag
105901 tgaaaatcct tttgctagaa agtagcacgt gtataataaa cagaatgtaa ccagcaaaat
105961 aaagtgacag tagattctat cagcttttcc tttagtacta ctaacataat ttgtggtggc
106021 cacgggatag ttatcatact tacacagtga cactcaggca aatcagctca acaccatgga
106081 tagatgcttg agagaaataa taattagatt agaaaaattc tctgtgtgtg tgacagccat
106141 tgtggttttc tgattacaaa acccacaaga ctccattgta taaaaaaaga acacagtact
106201 ttcattgcta aaacccagaa agttggtcac tactgaggtg tgtgtttact tatatttact
106261 tatatctata tttctgtact ctgaattcta tttcatggat ggtttctcta tttttgcatt
106321 agagactttg ggtttaatta ctgtctttat aattaatttc aatttgtgct acgaatttcg
106381 caggttttca tcttttaaaa aattattgtt tactcattat ataattattt ttattacatg
106441 ttgacattgg caaaatgttt ctaaatttca tatttaaaaa taattatata agttatataa
106501 tacaattata tattaactta acaataatta tcaataataa ttaataatta ttatattaat
106561 aataaataat acttaatatg atataactaa ttataagcta tataattata tattatagta
106621 tataacttat ataattgata taatttacaa ttatatatta attatataac atataattaa
106681 tatataatta taattatagt ttataataat ataattatat attatatagc tcactatata
106741 attattttta aatataaaat ttagaaacat tttgccaatg tccacatgta aataccattt
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106861 acattactga gtattctcat ttaggagtat ggtatgccat tctttttatg tagatcttgt
106921 attatgcctg ctagtaaaat ttgatgattt ctttcttact tttttttaat taaatttatg
106981 actaggtgtg ttttatagtc attgctgttg ttgcaagagt attaattata atatagttat
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107161 tttttggatc atattaatca gatttctaaa aatgtattct tttttttgag gtagttagtt
107221 gatagaagta taatttatat acaagaaact gtgccccttt taaccatata gttcagagtt
107281 tgacaaacgt atacaacaat gtaaccacta ccccaatcaa gacatagaat gttttcacca
107341 cccataaatt tctcttatgc tcatttcctt cttttttttt tttttttttt tttgtccctg
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107461 caggtatttt tgtattttta gtagagatgg ggtttcacct tgttggtcag gctggtctcg
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107581 tgagccaccg cgcccagccc tcttatgctc atttctaatc aacttcccat tatctctaaa
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107761 attcatccac attgctacat gtaacagtgg tttgttcctt ttcattgcag cttttatttg
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107881 tgcctaagaa ttataaagca attaatttga acaactgcag tatcaaaagg aaagttagta
107941 tagaaatgtt aggccactca agatgacaga ctcatcagcc acaacaaaaa agtcagatac
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108061 attttgtttg gtattatacc tcctaattat tgagaggaat caagtctcat caatcataaa
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108661 gaaaatgtta ttttttaaaa tcctcatcat caaatatttt gttcccattg aagtaagaaa
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108781 taataaaaat tggcatttat aaagacttag tctcttccat taacatacaa aattcatata
108841 tttatgttca atcctttctg ctcttaaatg agtattagct atttggtcca atagtttaat
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110161 tttcatgtaa tataaataat ataaaaataa tgggtaatat gccctaaaca ttgtgccctt
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110281 ctggttctct tgctaagaaa cactattatt tgattttgaa cttcttactt gctccacctt
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110581 ttttttcttg tgaaaaactc tgctatagag ggcatgcttt agtgcatggc aatgaaaaca
110641 aagcaaacca aaagccattc attaatgtgt tcttctgttt agaataaaaa aatttcccag
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110761 ttacacttta actatgctgt ctgcgtgcaa aaaaatgtgc ttatacaacc caggggtgga
110821 accaagctaa gcaactctcc tcaggtcctt tacctgctca gaagtcttga aagccccatt
110881 atactccctt ctcccttacg cacaccaaga attataaatc ccattgtttt cttcatataa
110941 gaatatattt gcatctcatc acattcatat gcacagcctt ttattctatg catactcaat
111001 tagcacatat tggcaagtta ggaaagtagg agtgtgggaa taagtatgaa aaaagacacc
111061 attgtggcat atatatacac acacacacac acacacacac actcttacaa tttcctcctc
111121 tctgaatcct tcagatactg aataaaggac atctgctatt attatgttta atttatttaa
111181 ttatctttaa tttcctctta ttattaaccc caaatacctt aatttgaaat taaccaggtt
111241 tttcctatgc agtttgtcct attttctatc aggcttaaac aaatactaat ctgcaaaatt
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111421 gcaatgggac aggattccgt gcctcaaagt aagggctgag taaggaccca gatgccctcc
111481 tataagctgc cagggaggtg gtggtgttct gtttcagagg acaaagcaca cagaggccca
111541 gactgtgttc ctcgagccct acccattagc cccaagatca tagaaaaatc ttccaagctg
111601 gaaactggtt gacaatgatc ctgactttca gtaggtgtgt tttttaaact ctgtatacct
111661 ttttcctcta cctgtgttgt tatttgaata tgaagttggg agaagacata tcagagattc
111721 ccaatctaat acgttttaaa tttgacgttt ttttccctta gactagcatt aattgtgttt
111781 cacaacaaaa cgagatagca tttcatctca cgggacagta cactagattt catgaggtct
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111901 atgatgatgt cttgaaaaca cagaatttag gctctgccac aaatttgctt taacatgtaa
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112081 gatccgagat gcatttgctg tccgtgccag aatgcagcaa gcttcccagc atgcattggg
112141 accccacggc ctgtgccaga ctgccacatc taggtaacac agagttctcc caagactttg
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113221 acccaacatt tatttcttca ttgagccaat tcatgatctt catttgtgac aatagatccc
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113401 tgcttgaaaa gggatgtcgt acaaaataac ttgtatcaga tagtgcttta acctgtcaga
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113641 cttaaaagta ttaaaagcaa gaatgctact ggtcctagtt gaattactca gaggtattaa
113701 acaagaagag ttatggaaac cttaaaaatc tattattctg gtagcctgtc aaattgttat
113761 tcccaaatcg aaggaataaa aaaaaatttc aattctttgt tatatgagca gccaaagttt
113821 actttgattg gactttgaat tgattactgt gctctttgtt atccatcgat tgctcactca
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113941 tagacaggaa caatacacaa aaaagcatcc acatttctgc ctttcacact aattataaag
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114061 ttatgaaatc ttcgatacat gtaagaaaat gagctcctaa tgtcatgaac taaccattta
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114481 cctttgtgct atttacatta tttgtaagca aggattacac tattcctctc ttccgtgaga
114541 cttcacatac tttattacag aaacactcag cagtgaatct gtcttctatt tcagagcttc
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119101 tcttccagtt ccaggtgcct gcctgagtca cagtggtgac caggcctggc atccgcaggc
119161 ttcagaatca cttgcttagc cattggtact cagggcataa tcactgggtc cacttcatgt
119221 atgactaaga agtcatacat gagcgtctct tgtagcctcc aattttgcaa gtgccctatt
119281 tcaaatgctt taggcatcta ctgccataaa ggttttattt tgactttgta atatgttata
119341 ttaatatgtc cccttctatt aaatcattat tctctgacta tgatgtagtc agttgctaat
119401 atttcgttta ggatcttcta aacttaggtt gtataatcta tgtatgctct tttcttctgt
119461 gctaacattg ccaggttgtg atattggtat tataataatt tctaaaataa tttgaaagaa
119521 ttttctctta ctggaacata ttataaatat ggaaatttta tctctttcaa gactaaaaga
119581 atgtctttta taatgtgatg acttaaaaat ctagtttcct gcctatggta atatttatat
119641 tttctaatgc ttcaaatttg gggattaata tgttcctatc attttcctta aggtgtgaaa
119701 tataataatt acacattatt ttaattaact ttgaatctgt tataactttt ttatcatttc
119761 taattttctg tttgtacctt ttctctttaa ttaaaattcc attgattaga ctactatatg
119821 aatatttata aaaccaacta ttgatctttt aattctatca tttgtgttac gtgtattcta
119881 acttattaac ttctgcttgt gtatggctgt tactttatta cctattatct tttgttttct
119941 gtagttattg tttcttaccc aaagtcttgg gttaaatgtt cagttcattt actttcattc
120001 ttttttatct agtggaagga gataacacta tgactttatc tttgagcaca actttggcta
120061 aataaaatac acactattaa gaggcttgtg tctaatctat aactatagtt actctctagt
120121 ttttgatcaa aaagtcattg atttttttct ttttaaaaat gtcccattgg attttattta
120181 atctattatt aattgcactt tggccattaa gtagatatgc ataatttctg cctttaaaat
120241 ttattgagat taatccacaa atatttgaaa ggaaggttta ttctctattt ttgggtacaa
120301 aggtcattct tagctattaa aacattgttg ctgattattt taaaatactc tgtatccctg
120361 tttttgtctt tactcaatct gttaagagga tttaaatgtg attaataagg ttcttttaat
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120541 acaggagttc agtttttaga tgaattaact tctcatttgt ctcctaatat tttcattttt
120601 catcttcttt catgattttt cttctgtttg taaactgaca gtaaatgtat ataaaagctc
120661 agctctagac aatcctgatg tcaagtgtaa ttatgtgaaa atattttatt tgataatttc
120721 catgatttat gtcaggtcat agataatatg attcagtata aatggcacca gcccaagatc
120781 tacatttatc tcagaaaaaa aaaacctatt tcctctctct gagtctcatc tttaaaattc
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120901 accagggaga acctgataca taaatatatt attatcatga aatttatttt actgattgct
120961 taaatacaaa aaattgcttc ttaaaggttt gagaatgaat gaaataatta ttctttactt
121021 acagcattcc caccaatgac gtcctcaaag ccaagtgtgg acattccaaa tctgccttcc
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121141 atgtccagct ttgcaatatt tgtgcttctt accataacta ctctctattg ctgccgaaga
121201 agaaaacaat ggaaaaataa gaaaaggtga gattctagtt tcagctaacc atgtgtagta
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121441 caaaaggtaa aatctaaaca ataatttgga ggaaaatggc tattcctgct ccttgtcttc
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121561 tttgactcta gaccaaacaa aatattttat tgctctcaaa acgaaggatc tttggctgcc
121621 ttagtataac ttgttttcat tactcttaaa tgccatattt cttagaatct aagtctaagt
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121921 caagcaaggt aaagttacct atggaaaaaa aaactccatt gaaatatgtt atgtctgaaa
121981 agctaccaaa ctattagctt ggtatatata taatattagc tttatatata tatacacaca
122041 catatatata tatatatcaa gctaatgata tagtacatat atatgtacac tgtgtgtgta
122101 tatatatata cacacacaca tatacatata tacacacagt gtaatataca gtattatata
122161 gtattaatac aatattatat atgtattata tggtaataat atactatata aaatagtttt
122221 tatcaagtta gttaattctg gccaggtgcg gtggctcgtg cctgtaatcc cagcactttg
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122521 aaaaaaaaaa aaaaaaagaa aagaaaaact agttaattct ttacatcatt aaccttattt
122581 gtattgcata atacacttca aatcttaatt tcccctcttt gctggaaaac agtagcctat
122641 atggagataa tatattttac tgcacttaaa ataggtaatt tattggagat gtaaatgtgt
122701 cttcacttct acgattttta aattataaga aattagtaat atagttcaat aatatttcct
122761 tttcaggaaa gaatttacca tatattttta atcataattt cttacattgt tttaaataac
122821 tccttacatt ataatataat gtatagatat taagtagatg ttcatgaaat gacaaacaga
122881 aaaggaataa aaaggcaaaa atttataaaa aatgagctca agaaaggagt atgtattagg
122941 gccaatatta gcctatgtat cacctttgtg cgaattggaa taaaataccc tttctgctgc
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123121 gccctggcgt agaggttaca tgaatagtga aaatctcaca caaacatgtc ttggaaacca
123181 aaatttgcaa ggcaccactt taggctcaat ggagggtaca aagatgagta agccatagtt
123241 cctacgtcat ggaatttaga ttctggacaa agattaaaag gttaggatgt ggctgggcgc
123301 gatggctcac acctgtaatc cccgcagttt gggaggccga ggtggtcata tcacgaggtc
123361 aggagattga gaccatcctg gctaacacag tgaaaccctg tctctactaa aaatacaaaa
123421 aattagccag gtgtggtggc gggtgcctgt agacccagct actcaggagg ctgaggcagg
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123601 tggcaatgat aatcctattg ggggtgtata cttcagaatt cctataattt gtaaataatg
123661 catctttcaa acttcattgt ttgaaattgt tgaaaataac accagtgatt tttattagtt
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124261 gtctctgtct ttgctgcctc ctatttataa aaatgtttaa aatgtcccca ttgtaaaaaa
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124381 ttttgtttct cctctttctt ccctaactag aatgtcatga gcagcgattt gtatcttttc
124441 tgttcattgt tgagttccag tttattccca gattcataaa ttcaacacaa attttacaaa
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124921 aaacaaaaat atgggatgct ggatattaag ttctacagac tttttaaagt gttaaagcag
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125161 agcaaggaga tgaatgtggc tggagcagag tgaaagatgg ggagagttat caaagatgag
125221 atcagagagg taatggggga ggtaggcagg tcctgtcagg ccttattaaa aacattggct
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125341 acattttttc agatcttctc tggctgcttt cttgagcatt gcatgaaggg aagcaatgaa
125401 atcaggaaga cagtaaacag gtattgcaat gatgcagcaa gagaagatga tggcatgggc
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125581 tagtatcgaa gtatttggct gtgcagatga gtgaatggag gtgccattgg ctgagttgag
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132961 tgtggcacat atacaccatg gaatactatg cagccataaa aaatgatgag ttcatgtcct
133021 ttgtagggac atggatgaaa ttggaaacca tcattctcag taaactatcg caagaacaaa
133081 aaaccaaaca ccgcatattc tcactcatag gtgggaattg aacaatgaga tcacatggac
133141 acaggaaggg gaatatcaca ctctggggac tgtggtgggg tcaggggagg ggggagggat
133201 agcattggga gatataccta atgctagatg acacgttagt gggtgcagcg caccagcatg
133261 gcacatgtat acatatgtaa ctaacctgca caatgtgcac atgtacccta aaacttagag
133321 tataacaaaa aaataaaaaa ataaaaaata aaaaataaat gcatgaatac ccaaaaaaaa
133381 aaaaaaaaaa aaaaaaaaga aggcatttca gcatgcaaac aagtaatact tttaggaatt
133441 acactgactt cattgtaatg cataggaaaa ataaataatt cacaaataaa aaacaaacaa
133501 acaaaaaaaa agtttcagtg gggtcaaagg atttttagag ttagggcagt cgaggcagtg
133561 aactagggtg aaaaagggag gaagtgatga acaacaggta gagtaactga aaatgagatt
133621 atgggaggta tacaaatgta tggaatgaca aagtcagggg tatgacaatg tgagtgatta
133681 gctgaagttg ggcagaggtc taaggaaagg aagtaaagta atttagtggt caggatattg
133741 gaaggaatct agataaatat taaaagcaag aatttctata gtagtatctc gaatagtttc
133801 tggcacattg taggcactct ataaatattt gttcaataaa tgaataaacg atattaagta
133861 cataacaatt catcttgaaa acacttcttc catttcctca actcctaaac attcatttat
133921 tcattcttca tcacacaaaa atctgaatct ggcttctgcc ccctaccctc cttatttact
133981 ttctcaaata gtatacattt agtcattaaa caaacataca tacatgcata ttttcaagat
134041 tatcaagcaa ttcctgtttc aacttttctt aaaatgttga ctctgtattc gtatacagtt
134101 tataacatcc tgaattcctg aaattgattc aaacagaaac tatgtacagt tttccaattt
134161 aaccacagta gcatgcttat acatcactac ttggagtttt ctctcatttt tattgtccaa
134221 caagaactga aacttatgtt gccgtttgtt aaatgctata tctaaattcc atttggatat
134281 ccaatgaaca caggttctat tttttatcaa gtatacataa gcagtaatca ttcatgcaag
134341 tgattccact actctcatag tttcttgtaa gttaatccca gtgaaataag atgacaatag
134401 tggaagaaag gggaattggg aaaatccata aaattcactt ctatcaataa aagaaatcta
134461 ctttgtttta tatatttgat acatcagcca cttattgaac atgttcgtat cttaaaaatt
134521 gtttcccttt tattgaaatc ctagtggata atggttttgt agtcataaat tgggaaaaat
134581 ggtataacta aagaaatatg cagaatttta gaatgggagt aggcattgaa tattatagac
134641 tcttacggaa tattctggca gtggagcaaa cagtagaaca atcaggtgag attattcatt
134701 gaagatgtca tgctaaagtt taaagacatg gcttgggcta ggcatgaggt tttcttatgc
134761 ccatccatct atgcatccat ccttaaatct atccatgcat ccacctatgc attaattcat
134821 ccatccaccc atcaacatat attgaaaacc catagtgagc catgtgtagt attagacctg
134881 aggttacaag gatgaataaa atacagtctt cctctcaata attattatat tttgaagtcc
134941 cacctaagag ttgggttgga gtaattacaa tatagaaaac attttgaggt cttaaataaa
135001 tgtatataca tatataattg taaattatat ctatacacat gtatatataa ttgttcataa
135061 taatcacaaa gtagaaatct tttgtatagt attttcttta tcagagtgga aaatttcatt
135121 aaatcaattt agttcaaaac tttatttctc agagaaatat tttgtcattt ttttccagta
135181 taagaaatta tttttaaatc aactcaacca gcataacaat ggtaaagcca gttgatgaga
135241 taggtaagtc cctgttaact aaagattatc caaaaaggat cccacagaag aaacttctaa
135301 gtattatcca gttggtattt ctttattttt tccctttagt ttacagaaat gtgctaattg
135361 aggtccttgg aattaaaaat taatgccaaa ataaataagc caagatagca gtattcctca
135421 tttctcctct ttttcaaaca gatactttta acttttgcct gaaaaaaccc aatagatcta
135481 ataatctatt tttaagatga tgtgaaatta tgcccatctt atctaatatt ccaagttctc
135541 cagtttccct ctcaaatata tcaagacttt aagatttgaa aatgatcttc tggctttaaa
135601 tctaagactt tatttatatt aacttttttg gtagcatgaa cattgtaaaa cctaaatttc
135661 aaaatgtttt actgcagcaa cttaaatact tcatctaaga cacttgaatt gtatttgtta
135721 ttgtttccaa acttgataca tctttcttat taacatcctt catagaagta aacagaaaca
135781 gacagcaatt acattacata ctcagagcaa gcatccattc ataaattaac tcaccaaaca
135841 ttatgaggca tctgctctgc cagacacgtg gtaggtgtgg ggaattttta aagaagaata
135901 aggttcaatc tctcctttca aagtgctaaa acgttgggga gaaacctcaa atagtcaaat
135961 gattataaaa taggatggta ggttctctgt gaaaggatga cagtaggaaa atctaacagt
136021 tactggaagg atcaggagct gaggcaccct agggagagtg ataaactgaa tcttaaaggc
136081 aaagaggaga tgtttaggca gagaaatagg gtcagggttc aaccatggtg ttgtcaacaa
136141 aaaaccaggg cctccagatt tcagagagaa gagccactcc agagaactga tacaccatgt
136201 acttatatgc accatgaact tgatgcacca tgtacgatgt acttatgaca agtgcccagg
136261 acaacagcgc tctgctggaa gtcctcaaaa actttagcca agggacagaa accccactac
136321 ccagagtgca tttcctagct gagactcctt ttgtgttgtg attaaaagga tacaaatatt
136381 aaaaaacaaa catacgacaa caacaacaaa aaacagggct tcatatgttc tgacatggtc
136441 gtttgctttt ggagtgctct ttccattgtt tcattgtaga aactgagact aacagggatg
136501 gtcttttggt tccaggagtg tgtgctgtcg ggaagccaat gtgcctgctc tttgaataca
136561 tggcctatgg tgacctcaat gagttcctcc gcagcatgtc ccctcacacc gtgtgcagcc
136621 tcagtcacag tgacttgtct atgagggctc aggtctccag ccctgggccc ccacccctct
136681 cctgtgctga gcagctttgc attgccaggc aggtggcagc tggcatggct tacctctcag
136741 aacgtaagtt tgttcaccga gatttagcca ccaggaactg cctggtgggc gagaacatgg
136801 tggtgaaaat tgccgacttt ggcctctcca ggaacatcta ctcagcagac tactacaaag
136861 ctaatgaaaa cgacgctatc cctatccgtt ggatgccacc agagtccatt ttttataacc
136921 gctacactac agagtctgat gtgtgggcct atggcgtggt cctctgggag atcttctcct
136981 atggcctgca gccctactat gggatggccc atgaggaggt catttactac gtgcgagatg
137041 gcaacatcct ctcctgccct gagaactgcc ccgtggagct gtacaatctc atgcgtctat
137101 gttggagcaa gctgcctgca gacagaccca gtttcaccag tattcaccga attctggaac
137161 gcatgtgtga gagggcagag ggaactgtga gtgtctaagg ttgaagacgt tcaaataaaa
137221 tgctgcagtt tcctctcaga ctctgtgagc caggggaatc ctacaccaga ggcccaacaa
137281 gacccacata ggaaagagta agagtaaaca tgagtagtgt gttgtttgct tcccagggag
137341 agcaaagaca gtgcaaaacc catgtggtag acggacccat tgaaagccag tgattggaaa
137401 cacaggctag gaaatgtgtc agataatgga gacaactatt cttcttcatg aaggtttgta
137461 atacacactg cacagggaag aatgtcatcc tgttcagttt ccaaagtagc tggtcacaga
137521 gtaaagctct gctgtattaa attttaatat gaaatgggat tcagagcttc attttttaat
137581 tgagttaatt cctgtccatt gtgaaagtag cttaatcgtc atgtaagaca cttaggtgaa
137641 gtacagaaaa ctaaaaagaa ggaaaagcca ctcattctgt ctccccccaa agacgagtct
137701 tagtgtttta ttaaatcttt cttgcattta atgcataatt ttatatttgt ttgtattctg
137761 cagagttgtg gttacatttt attgatagag ggtttctaag gaatgaaaca gcaaatcagc
137821 aagcctgtaa ctctgagttc ccttttctgt cctgtgcccc tccttttttc ctttctgtgc
137881 atttgtcatg aattaagtct gcttatttta ttcctccagt tttcttgaaa caagtttttg
137941 tatcttactg atttaccttt tcctttaaaa attgtattgg tatcttttcc attgctttaa
138001 tctttatttc ttcttctttc caggacttct gtcctttttt agttattaag ctattttttt
138061 cttttatttc attcatgtaa taaacactct ggcagaaata ataacatttt aaataccatt
138121 gtagattgat atgtatatgc cttttgcaaa gtattactat ttttcctgca tttgcctttg
138181 aagccacaca tttcaacatt ctcacctatt aatattatta ctagagtcta tttaaatctc
138241 ttaaaccata atttataata tgagatttca caagatacac ttgtggctct gagttatttc
138301 aaaactgata tttctgtgca ttctgacatt ttattccttt tagaaacaaa ttcagttggc
138361 tgtagaatta atatcgttct gcttaacaac tttgtgcatg acatattaac tgattttgtt
138421 gtatttcatg atttaaaaaa aaaagcagca gctctggaac tcagattcct gggggttcag
138481 attttttctc agtggatcct cacacaatac atctttatct aagtccatac atgatctgag
138541 tttatttctg atatagcagg aacccaaatt ctcctgaaaa cgaacaggga agagaaaata
138601 acagtctact ctataccagc ttatcttaat tcagactaat tggtagttag ggcattggag
138661 gaatggtgtg aattcttgaa agtagatttt cgctgtctgc tggaaaactc tgcctgaaat
138721 ccccaaatct gcctcatgta acagcttgac atctttggtg ggaaacctgc catttcttat
138781 tcatagtgtc tccaggcaac caagacaaaa atgtagaaat tttcctagac tttgccctct
138841 ctttcatcat cagttttcta ttagttttac ttcctaaaat cctcctgctg acatcctctt
138901 cccttcaacc caagagccaa tgactcaacc tctaccgttg cccaccctgt ctattagctg
138961 gccttcctct catttcagac ctgaacagat tctgtaggat acaacgacag taaggcggtc
139021 cttagtcaca gttctggttc ataaatagcg aggtcagcat ttaggactga gacctaaaga
139081 agtgcttcag ataaaaatca tgagtctaag tccaaaattg atactgtaat ccaaatgact
139141 gaataaagaa taaagttgca gcgtgtgtct aaagcagaaa gtcaagatgc caacaaagca
139201 gaaaagttgg agagggccac cagcaagtct agaacttgag catagatatc catggcttat
139261 tttagatggt tcatgtatgc tctgcaaaat tcaaagacag cttcgggctt tctccgctga
139321 taaagttttg ttgtaaaaga cagacataga agtcaggctg acagaaaata gagtaacagt
139381 aatcataaaa attataatat cagctagcat ttattgaaat cttaccatgt gtattctgag
139441 gcctttaaat atatgaactt aaacctcaca acatccctgt aatgttggta ctatcattat
139501 atacatttta gttttgcttt gttttgtttt gtttttgaga cggagtctcg ctctgtcgcc
139561 caggctggag tgcagtggca cgatcttggc tcactgcaag ctcagcctcc aacagtcaca
139621 gagagattgt gcaactggcc cgagtgcaca cagcaacaga gcctactttt tgaccaaaag
139681 aggccgaatt ctcaaccact atactgtaga gcctctgtac atgatagaag caataactga
139741 acctcagtaa ctctgtggaa gtgatttgta atttgcatgt cgtttcaagc acactctata
139801 tctatatttt attctattaa cttcctaagt ctttttaatg aatagcaaaa aaagtatatt
139861 tcagcattat caatttaagt taatcataac atctaatagg tgacatgttt attttttcat
139921 gagttctaat tacattttca agttaagatc actgacttat tccctaagtg ctcgatctaa
139981 tgttctgaat cacaggagta tagatgcatt attcaccaat attgtttact tttttaaata
140041 agattttttt tcatggtaga atcatcatat acattcaaaa aggtagacaa aagagagaca
140101 ctcacagtgt cactgttacc aagtgccagg acagatatca gtaaggcacc agcagtcatt
140161 tttagtgatc aaataccaaa catggtaaga taccagagta tttttcacat gacacccaaa
140221 aacatattct ctgctatcgt ggtagagcag aaaaagaaca ctttcttttc attttacagt
140281 atattacgaa cctgttccac gtcattaaat attcttctaa aaacccaatt ttggaataat
140341 attctatttt attcatatac tgtaatttag ctaatcaatc ttgtattttt gaacatttag
140401 gttttttcca atttttatca ttataaaaaa tgctgtaatt aacatcctta tttgttcatg
140461 tccacatttc tttttatgaa aattcagaga aaggaaatgt ctggaccaaa tggcatgtac
140521 aatattaaca cttctgttat gtggtttcat attctgcaga aatattactg ccacttctac
140581 attgtacaag agatctcata gccctaaaca tttgctttca tagataattt tctgtttttt
140641 agaaatcttt tgtctctttg gttatagaaa aagagaacct ctttttaatt ttatttttta
140701 aattactagt caggttgaat gtttcttgtt cctaggtcat taacagtttt tattttggca
140761 attgtctaca gcccattttt ctgctgtgtt cattttctaa tcgaattatg ggatttatct
140821 tgtaaaaagc ctattaagcc tttttcatac tttacacaag agatcacatc tacttacttt
140881 accttaaaat aacatttact tattttctta taaaagtaat atattatgtt tgaaaagaaa
140941 aataatatgc aataatatac aataatatgt ataatcataa tagacaataa taaaaatgaa
141001 aaaacaccaa ccagaggtaa ttaacattaa catcataata ttcttccagg ctttttcaga
141061 tagacaggta ggtaagtagg ttggtaggta aatagataga tagatgatac atagagagag
141121 atagatagat aatttaaaca aaaataagat catactgcta cattacttca agccttgctt
141181 ttatcactta atatatctta aacatcttct acatgaacaa gtattcatgt gcaacattaa
141241 ttttgatggt tgaatagtat tatacagatt tatcgtaatt gacataacta ttctactgtt
141301 agacatttgg tttatttcta tttttccatt ataaaatgta atgtttggat catcctgttg
141361 ctaaattttg taagcattta tcttaagtga tttctttagc tataactcct agaagtgaaa
141421 tttctagatt aaaggataaa tgcactttta atacttttta aatatattaa aaaattacct
141481 tcctgaatta ttttattaac atgtacctct cctagtcaga taagacagcc catttatttc
141541 agtctcacca atactgagta tagcatttta atcattgcca atataatagc taatagctta
141601 aagttatttc atagcttata tttacacttc tttaaatact aataaaattg aacattgttt
141661 aatgttttga ggatacttga ttggtgattt gcctcctact attatttttc tactgggtat
141721 atctttttct tgttgctttg taagagcact ttatatatta aggagttaaa ttttgtgata
141781 tatgtttcaa ctacttttat catgttaaaa atatagactt ctatttgtct tttattgtag
141841 gttttatcaa tcagaaaaga atgttgactt ttccgtccat tcagatgatt gtggcttttt
141901 tccctaatgg atttgttaat atgttcaatt gtatgaattt atttcctaat gtagcgatat
141961 ccttgtcttc taggaataaa ctttttgggc gaatcatatc aatcttctac ttaactacca
142021 aattaattta catatatttg catcaatatt aagttcataa aattaaaagt ttatcatttt
142081 catctctgtt agagttttgt attggcatta gcatttgtat tagcattgta ttaggaaaaa
142141 ctcaggagtt tttctctata atcttggtta gtttattttt aaataattgt tatttatgaa
142201 agtaatacat aaaaatgttg tttaaaaaaa ctcacaagag ggtaaaaatt aaaaaaataa
142261 taaaagttcc cttcttcctt ttcatctcta gtcccagcct aagtgctaac cacttcaccc
142321 atttatagtg ttagttcttc tggtgattac cagtgcaatt ctaacaaata ggtttgcatt
142381 tctctttctg aattgatcaa ttttttaaaa atatgcagca ctctgactca aactcccttt
142441 ctttttcctg agatatgtta acttctaatg ttatattgtt tatcacaact ttcacaaata
142501 tttctaaata aaggttacct actgattctg gattgtgcta cataaaatta gagcttccaa
142561 atttccctcc atcacttctc cctgctctct actctcacaa tcagtcaact atacacctat
142621 ttctacgctg tcaactatat gttcatttct atgaatctgt aatatttgca ttttgttctg
142681 gaacaaatta agatttaggt gctttgacta gattgattct aaacatcaaa aaacaaaaat
142741 aaaatatctg caattatgtg atcatgtatt tatgcattgc caaataatgg tattccatta
142801 ttttaatttg ataagataaa tttaatatac attaattctt atttcctcta ttttatggaa
142861 gaaatatttt taaaaatcac aaaactttta cattcgcttc tcttcctgat atttattttt
142921 cctttttctt ctgcctctct tctttcgtgc ccttttttcc gaaaattatt ttgatgattt
142981 tttttattca ccatacataa ttacaaatga agagttgctc tggttcgtat tggtagtaga
143041 agtggggtcc ctttgctgtt ttgttggtat attcacccag tgtgacctct tttccgtggg
143101 atggctacct ctgggctctg attatgtggc tcatagggaa gtataggcag cctgagtcag
143161 aatccccaca gttccaaagt gatggaagac tgtactctga gatacaatat tttgacgtat
143221 ttcactccca gggagagcta cttgctattc tttcactgct tccattaccc aaaagagtat
143281 gatattctcc ccattttctg tattgcctca cacctaggac ccttcaaacc cacaccaacg
143341 acctctcagg caaattgatc tattcagata gcagtttaca gggatagaca tgaggcctct
143401 tggcccacct gctctataca caatcttcta gtcgaccatc ctgattgaca acccacagcc
143461 cacccctgtc tctgtatttg ctgactcaga gcatggagac tttatacatg tgaaatcaca
143521 tctcccctcc cctcacgctt ggcttgtgtg tattgcaaaa gctgcaattt agtttttcct
143581 gtgccttgtc ttacccatgg ataagaacac taagatactt tccgcttttt gaatatttgt
143641 caaagtgatg gcacttggat tggtttcagc atgtacatag attgattctt attcatatac
143701 atttactgtc atattgggga aatcttgagg ggaaaagaaa agcctcttac taccatgttc
143761 atcaagagtc ctctctggaa tagttgaaat agtttaggag ttatcggttc actccttcgt
143821 cttgtttgcc tccagatttc ttttttcctt cttttcctgt ttcttaatgt tggaacagcc
143881 cacacctcaa tccttggatg acatctccct tttatctgta ttcatcccta gtgatctctt
143941 ctggttgcaa ggctataaat gccatctgta tgctgagatt tttttatttt tagttcaaac
144001 ctctctcccc aactttacac tcacatttct aactgtgtgt tatagatgat agctttagat
144061 tctcctcctc aggactaggc tttctgcttg atctaggagc aaagctgaaa actgctatgg
144121 agcttggtgt tgccttgata ccgaggagga gtctcagagc ctctccagtg caaatacaca
144181 cttgcagtgt cctagtgctg ctgacttacg tactcattct aaagagggta gattgtatcc
144241 attttaatag ctctcaatac ccttgcccat tcccattaca gctggcagaa attccccagc
144301 tgcaaatggg ttgcatttat ctgttaccca ttcctgattt gcagcacgat tgactgtttc
144361 cttttctgcg tggtctatgt gtcactccat gagaatctgg gagaggagaa ctcgatatgg
144421 tgctcattcc atcattttaa ccatagtgtt ctttattgtg aagaggtatc ccggttagag
144481 tggagtcaaa gctttatagc aagtgtattt caggtaacta ttcttttact tgtttcagat
144541 ctatttcagt agcacagcca ccaagataga acacttataa gcccttattt tggtatagat
144601 caccagagaa accactcacc actcgcactt ggccttcagt actgagtcat tacatattgg
144661 aaggtcagaa actacatcaa caggaaagac ccataggtgt gggggtctga tatatttgcc
144721 agtacatttc ttatcattac aaacaaagat ttatgtgtgt ctagatgt
hu6-75、配列番号78
G*C*T *A*G*G *G*T*G *G*T*C *T*T*T *T*A*G *A*A*A *T*G*C *A
*は、ホスホロチオエート結合を表し、オリゴヌクレオチドの各糖は、2’-MOE修飾糖である。
hu6-69、配列番号79
G*G*T *C*A*A *G*C*T *A*G*G *G*T*G *G*T*C *T*T*T *T*A*G *A
hu6-58、配列番号80
C*T*G *C*A*G *G*A*A *A*T*G *G*T*C *A*A*G *C*T*A *G*G*G *T
hu6-39、配列番号81
G*A*A *G*T*G *G*T*G *A*G*T *G*A*C *G*C*T *C*C*T *G*C*A *G
hu6-27、配列番号82
G*T*T *A*G*G *A*A*G *A*C*A *G*A*A *G*T*G *G*T*G *A*G*T *G
hu6-12、配列番号83
A*T*C *C*T*G *G*C*A *A*A*A *A*C*T *G*T*T *A*G*G *A*A*G *A
hu610、配列番号84
G*T*G *G*G*A *T*T*C *A*G*G *A*G*C *C*C*G *C*A*G *G*A*T *C
hu619、配列番号85
G*G*T *G*A*C *A*T*T *G*T*G *G*G*A *T*T*C *A*G*G *A*G*C *C
hu628、配列番号86
G*G*A *G*C*C *A*A*A *G*G*T *G*A*C *A*T*T *G*T*G *G*G*A *T
hu637、配列番号87
G*G*T *C*A*C *A*A*A *G*G*A *G*C*C *A*A*A *G*G*T *G*A*C *A
hu646、配列番号88
A*C*A *G*T*G *C*A*G *G*G*T *C*A*C *A*A*A *G*G*A *G*C*C *A
hu656、配列番号89
C*T*G *T*T*G *C*T*G *T*A*C *A*G*T *G*C*A *G*G*G *T*C*A *C
hu669、配列番号90
G*G*G *A*C*A *G*G*A *A*T*G *C*C*T *G*T*T *G*C*T *G*T*A *C
hu681、配列番号91
C*A*G *G*T*G *A*T*G *G*T*G *G*G*G *A*C*A *G*G*A *A*T*G *C
hu693、配列番号92
C*C*G *T*T*T *T*C*A *A*T*C *C*A*G *G*T*G *A*T*G *G*T*G *G
hu6110、配列番号93
T*G*A *C*A*C *T*C*A *C*A*G *C*A*T *T*T*C *C*G*T *T*T*T *C
hu6125、配列番号94
A*A*G *T*C*C *C*C*A *C*A*C *A*C*A *T*G*A *C*A*C *T*C*A *C
hu6139、配列番号95
G*G*T *C*T*T *C*C*C *C*A*G *A*C*A *A*G*T *C*C*C *C*A*C *A
hu7-75、配列番号96
A*C*T *A*T*G *T*C*A *G*T*A *G*A*T *T*T*G *A*A*G *G*G*A *A
hu7-66、配列番号97
T*C*C *C*A*C *T*A*T *A*C*T *A*T*G *T*C*A *G*T*A *G*A*T *T
hu7-53、配列番号98
T*C*A *G*T*C *A*A*G *G*A*T *T*T*C *C*C*A *C*T*A *T*A*C *T
hu7-45、配列番号99
A*A*A *A*G*A *A*C*T *C*A*G *T*C*A *A*G*G *A*T*T *T*C*C *C
hu7-33、配列番号100
G*T*A *A*A*G *G*A*A *A*A*T *A*A*A *A*G*A *A*C*T *C*A*G *T
hu7-22、配列番号101
A*A*C *C*T*G *A*C*A *G*A*G *T*A*A *A*G*G *A*A*A *A*T*A *A
hu7-10、配列番号102
G*G*A *C*C*C *A*G*A *A*G*A *A*A*C *C*T*G *A*C*A *G*A*G *T
hu73、配列番号103
C*A*C *T*C*T *C*T*T *G*A*A *T*G*G *A*C*C *C*A*G *A*A*G *A
hu717、配列番号104
C*A*C *T*C*G *G*T*C *T*T*T *C*A*C *A*C*T *C*T*C *T*T*G *A
hu730、配列番号105
G*T*C *T*T*G *A*G*T *C*A*A *T*C*A *C*T*C *G*G*T *C*T*T *T
hu744、配列番号106
G*A*T *A*A*A *C*A*G *C*T*G *C*A*G *T*C*T *T*G*A *G*T*C *A
hu758、配列番号107
A*G*T *C*C*T *G*G*C *T*T*G *G*T*G *A*T*A *A*A*C *A*G*C *T
hu766、配列番号108
A*T*G *T*G*T *A*G*A *G*T*C *C*T*G *G*C*T *T*G*G *T*G*A *T
hu776、配列番号109
G*T*A *G*C*T *A*T*G *C*A*T *G*T*G *T*A*G *A*G*T *C*C*T *G
hu785、配列番号110
T*G*C *T*T*A *T*T*G *G*T*A *G*C*T *A*T*G *C*A*T *G*T*G *T
hu796、配列番号111
A*C*T *T*C*T *C*C*C *C*A*T *G*C*T *T*A*T *T*G*G *T*A*G *C
hu7111、配列番号112
C*C*T *T*G*G *C*A*G *T*A*C *T*G*A *A*C*T *T*C*T *C*C*C *C
hu7136、配列番号113
C*C*T *G*C*T *A*T*G *C*T*G *A*T*G *G*T*G *G*C*T *G*C*A *G
hu7146、配列番号114
G*G*G *C*A*T *C*C*T *A*C*C *T*G*C *T*A*T *G*C*T *G*A*T *G
hu7158、配列番号115
G*C*A *A*A*T *G*T*G *A*A*G *G*G*G *C*A*T *C*C*T *A*C*C *T
MuSK HUMAN_Ig3_ドメイン(配列番号116)
ARILRAPESHNVTFGSFVTLHCTATGIPVPTITWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATIS
MuSK MOUSE Ig3ドメイン(配列番号117)
ARILRAPESHNVTFGSFVTLRCTAIGIPVPTISWIENGNAVSSGSIQESVKDRVIDSRLQLFITKPGLYTCIATNKHGEKFSTAKAAATVS
MuSK34(エクソン/エクソン接合部3~4にまたがる)フォワード
CCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAA(配列番号118)
MuSK34(エクソン/エクソン接合部3~4にまたがる)リバース
ATGAATCCTCAAGCTCCCAGA(配列番号119)
MuSK67(エクソン/エクソン接合部6~7にまたがる)フォワード
GGCTCCTGAATCCCACAATG(配列番号120)
MuSK67(エクソン/エクソン接合部6~7にまたがる)リバース
GAATGGACCCAGAAGAAACAGCA(配列番号121)
GAPDH(HKG)フォワード
CCTCAACGACCACTTTGTCA(配列番号122)
GAPDH(HKG)リバース
TTACTCCTTGGAGGCCATGT(配列番号123)
YWHAZ(HKG)フォワード
CGAAGCTGAAGCAGGAGAAG(配列番号124)
YWHAZ(HKG)リバース
TTTGTGGGACAGCATGGATG(配列番号125)
領域1-MuSKエクソン7
ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGAC(配列番号126)
オリゴヌクレオチドBld51(配列番号127)
TTGAATGGACCCAGAAGAAA
オリゴヌクレオチドBld52(配列番号128)
CTTGAATGGACCCAGAAGAA
オリゴヌクレオチドBld53(配列番号129)
TCTTGAATGGACCCAGAAGA
オリゴヌクレオチドBld54(配列番号130)
CTCTTGAATGGACCCAGAAG
オリゴヌクレオチドBld55(配列番号131)
TCTCTTGAATGGACCCAGAA
オリゴヌクレオチドBld56(配列番号132)
CTCTCTTGAATGGACCCAGA
オリゴヌクレオチドBld57(配列番号133)
ACTCTCTTGAATGGACCCAG
オリゴヌクレオチドBld58(配列番号134)
CACTCTCTTGAATGGACCCA
オリゴヌクレオチドBld59(配列番号135)
ACACTCTCTTGAATGGACCC
オリゴヌクレオチドBld60(配列番号136)
CACACTCTCTTGAATGGACC
オリゴヌクレオチドBld61(配列番号137)
TCACACTCTCTTGAATGGAC
オリゴヌクレオチドBld62(配列番号138)
TTCACACTCTCTTGAATGGA
オリゴヌクレオチドBld63(配列番号139)
TTTCACACTCTCTTGAATGG
オリゴヌクレオチドBld64(配列番号140)
CTTTCACACTCTCTTGAATG
オリゴヌクレオチドBld65(配列番号141)
TCTTTCACACTCTCTTGAAT
オリゴヌクレオチドBld66(配列番号142)
GTCTTTCACACTCTCTTGAA
Bld51、配列番号143
T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A
Bld52、配列番号144
C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A
Bld53、配列番号145
T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A
Bld54、配列番号146
C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G
Bld55、配列番号147
T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A
Bld56、配列番号148
C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A
Bld57、配列番号149
A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G
Bld58、配列番号150
C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A
Bld59、配列番号151
A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C
Bld60、配列番号152
C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C
Bld61、配列番号153
T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C
Bld62、配列番号154
T*T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A
Bld63、配列番号155
T*T*T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G
Bld64、配列番号156
C*T*T*T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G
Bld65、配列番号157
T*C*T*T*T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T
Bld66、配列番号158
G*T*C*T*T*T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A
オリゴヌクレオチドBld25-1(配列番号159)
CCAGAAGAAACCTGACAGAGTAAAG
オリゴヌクレオチドBld25-2(配列番号160)
ACCCAGAAGAAACCTGACAGAGTAA
オリゴヌクレオチドBld25-3(配列番号161)
ATGGACCCAGAAGAAACCTGACAGA
オリゴヌクレオチドBld25-4(配列番号162)
GAATGGACCCAGAAGAAACCTGACA
オリゴヌクレオチドBld25-5(配列番号163)
CTTGAATGGACCCAGAAGAAACCTG
オリゴヌクレオチドBld26-1(配列番号164)
CTCTTGAATGGACCCAGAAGAAACC
オリゴヌクレオチドBld26-2(配列番号165)
CTCTCTTGAATGGACCCAGAAGAAA
オリゴヌクレオチドBld26-3(配列番号166)
CACACTCTCTTGAATGGACCCAGAA
オリゴヌクレオチドBld26-4(配列番号167)
TTCACACTCTCTTGAATGGACCCAG
Bld25-1、配列番号168
C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A*G*T*A*A*A*G*
Bld25-2、配列番号169
A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A*G*T*A*A*
Bld25-3、配列番号170
A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A*
Bld25-4、配列番号171
G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*
Bld25-5、配列番号172
C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*
Bld26-1、配列番号173
C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*
Bld26-2、配列番号174
C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*
Bld26-3、配列番号175
C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*
Bld26-4、配列番号176
T*T*C*A*C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*
オリゴヌクレオチドBld25-A(配列番号177)
ACCCAGAAGAAACCTGACAGAGT
オリゴヌクレオチドBld25-B(配列番号178)
CCAGAAGAAACCTGACAGAGT
オリゴヌクレオチドBld25-C(配列番号179)
GGACCCAGAAGAAACCTGACAGA
オリゴヌクレオチドBld25-D(配列番号180)
ACCCAGAAGAAACCTGACAGA
オリゴヌクレオチドBld25-E(配列番号181)
GGACCCAGAAGAAACCTGACA
オリゴヌクレオチドBld25-5-A(配列番号182)
GAATGGACCCAGAAGAAACCTGA
オリゴヌクレオチドBld25-5-B(配列番号183)
ATGGACCCAGAAGAAACCTGA
オリゴヌクレオチドBld25-5-C(配列番号184)
TTGAATGGACCCAGAAGAAACCT
オリゴヌクレオチドBld25-5-D(配列番号185)
GAATGGACCCAGAAGAAACCT
オリゴヌクレオチドBld25-5-E(配列番号186)
TTGAATGGACCCAGAAGAAAC
オリゴヌクレオチドBld26-2-A(配列番号187)
CTCTTGAATGGACCCAGAAGAAA
オリゴヌクレオチドBld26-2-B(配列番号188)
CTTGAATGGACCCAGAAGAAA
オリゴヌクレオチドBld26-2-C(配列番号189)
CTCTCTTGAATGGACCCAGAAGA
オリゴヌクレオチドBld26-2-D(配列番号190)
CTCTCTTGAATGGACCCAGAA
オリゴヌクレオチドBld26-B(配列番号191)
CTCTTGAATGGACCCAGAAGA
オリゴヌクレオチドBld26-C(配列番号192)
CACTCTCTTGAATGGACCCAGAA
オリゴヌクレオチドBld26-D(配列番号193)
CACTCTCTTGAATGGACCCAG
Bld25-A、配列番号194
A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A*G*T
Bld25-B、配列番号195
C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A*G*T
Bld25-C、配列番号196
G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A
Bld25-D、配列番号197
A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A*G*A
Bld25-E、配列番号198
G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A*C*A
Bld25-5-A、配列番号199
G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A
Bld25-5-B、配列番号200
A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T*G*A
Bld25-5-C、配列番号201
T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T
Bld25-5-D、配列番号202
G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C*C*T
Bld25-5-E、配列番号203
T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A*C
Bld26-2-A、配列番号204
C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A
Bld26-2-B、配列番号205
C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A*A*A
Bld26-2-C、配列番号206
C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A
Bld26-2-D、配列番号207
C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A
Bld26-B、配列番号208
C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A*G*A
Bld26-C、配列番号209
C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G*A*A
Bld26-D、配列番号210
C*A*C*T*C*T*C*T*T*G*A*A*T*G*G*A*C*C*C*A*G
領域2-MuSKエクソン7
GGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCATCAGCATAGCAGGTAGGATGCCCCTTCACATTTG(配列番号211)
配列番号212
TTTCTTCTGGGTCCATTCAA
配列番号213
TTCTTCTGGGTCCATTCAAG
配列番号214
TCTTCTGGGTCCATTCAAGA
配列番号215
CTTCTGGGTCCATTCAAGAG
配列番号216
TTCTGGGTCCATTCAAGAGA
配列番号217
TCTGGGTCCATTCAAGAGAG
配列番号218
CTGGGTCCATTCAAGAGAGT
配列番号219
TGGGTCCATTCAAGAGAGTG
配列番号220
GGGTCCATTCAAGAGAGTGT
配列番号221
GGTCCATTCAAGAGAGTGTG
配列番号222
GTCCATTCAAGAGAGTGTGA
配列番号223
TCCATTCAAGAGAGTGTGAA
配列番号224
CCATTCAAGAGAGTGTGAAA
配列番号225
CATTCAAGAGAGTGTGAAAG
配列番号226
ATTCAAGAGAGTGTGAAAGA
配列番号227
TTCAAGAGAGTGTGAAAGAC
配列番号228
CTTTACTCTGTCAGGTTTCTTCTGG
配列番号229
TTACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGT
配列番号230
TCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCAT
配列番号231
TGTCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTC
配列番号232
CAGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAG
配列番号233
GGTTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAG
配列番号234
TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAG
配列番号235
TTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTG
配列番号236
CTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAA
配列番号237
ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGGGT
配列番号238
ACTCTGTCAGGTTTCTTCTGG
配列番号239
TCTGTCAGGTTTCTTCTGGGTCC
配列番号240
TCTGTCAGGTTTCTTCTGGGT
配列番号241
TGTCAGGTTTCTTCTGGGTCC
配列番号242
TCAGGTTTCTTCTGGGTCCATTC
配列番号243
TCAGGTTTCTTCTGGGTCCAT
配列番号244
AGGTTTCTTCTGGGTCCATTCAA
配列番号245
AGGTTTCTTCTGGGTCCATTC
配列番号246
GTTTCTTCTGGGTCCATTCAA
配列番号247
TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAG
配列番号248
TTTCTTCTGGGTCCATTCAAG
配列番号249
TCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAG
配列番号250
TTCTGGGTCCATTCAAGAGAG
配列番号251
TCTTCTGGGTCCATTCAAGAG
配列番号252
TTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTG
配列番号253
CTGGGTCCATTCAAGAGAGTG
【0503】
均等物
当業者は、本明細書に記載された本発明の特定の実施形態に対する多くの均等物を認識するか、又は日常的な実験のみを用いて確認することができるであろう。本発明の範囲は上記の説明に限定されることを意図するものではなく、添付の特許請求の範囲に記載されているとおりである。
【国際調査報告】