【0281】
特定の実施形態において、変異体GH61酵素の突然変異は、表4に示すアミノ酸置換(実施例3を参照)であり、かつ/又はSELコホート(1、2、3、及び野生型)、コンビナトリアルコホート(1〜11)、又はデコンボリューションコホート(1〜4)のいずれかに存在し、置換部位は、H.ジェコリーナ(H.jecorina)(配列番号3)のGH61Aの成熟形態に対応する。表4に示す置換及び上記のコホートのすべての可能な組み合わせが、本発明の実施形態で想到され、これには下記のものが含まれるが、これらに限定されない:
1.D1、H2、S3、I4、N5、D6、I7、V8、I9、N10、V12、W13、Q15、A16、P19、T20、T21、F22、P23、Y24、E25、S26、N27、P28、P29、V32、G33、T35、A36、A37、D38、L39、N41、F43、V44、D47、A48、Y49、Q50、N51、P52、I54、K58、N59、A60、T61、N62、K64、S68、V69、K70、A71、L76、V80、P83、P89、I90、V91、N96、N98、T103、V104、D105、K106、T107、T108、E110、F112、K113、I114、G116、V117、L119、L120、S121、G122、G123、D124、P125、G126、T127、A129、V132、S135、V141、I144、P145、D146、N147、A149、G151、Y153、V154、E158、I160、A161、H163、S164、G166、C167、A168、A171、N173、P175、I180、A181、S183、S185、S187、L188、Q189、S191、L194、G195、T196、D197、A201、T202、P204、V206、L207、I208、N209、Y211、T212、S213、P214、N216、Y217、I218、I219、P222、T223、V224、S226、T230、S231、V232、A233、G235、T287、L288、T289、L290、Y291、G292、Q293、C294、G295、G296、S297、G298、Y299、G301、P302、T303、R304、C305、A306、P307、P308、A309、T310、C311、S312、T313、N315、P316、Y317、Y318、A319、Q320、C321、L322、及びN323からなる群から選択される位置に少なくとも1つのアミノ酸置換を有する、GH61変異体。
2.D1L置換を有する、項目1に記載のGH61変異体。
3.D1P置換を有する、項目1に記載のGH61変異体。
4.D1S置換を有する、項目1に記載のGH61変異体。
5.H2A置換を有する、項目1〜4のいずれか一項に記載のGH61変異体。
6.H2D置換を有する、項目1〜4のいずれか一項に記載のGH61変異体。
7.H2Q置換を有する、項目1〜4のいずれか一項に記載のGH61変異体。
8.H2R置換を有する、項目1〜4のいずれか一項に記載のGH61変異体。
9.H2S置換を有する、項目1〜4のいずれか一項に記載のGH61変異体。
10.S3F置換を有する、項目1〜9のいずれか一項に記載のGH61変異体。
11.S3L置換を有する、項目1〜9のいずれか一項に記載のGH61変異体。
12.S3N置換を有する、項目1〜9のいずれか一項に記載のGH61変異体。
13.S3Q置換を有する、項目1〜9のいずれか一項に記載のGH61変異体。
14.S3T置換を有する、項目1〜9のいずれか一項に記載のGH61変異体。
15.I4T置換を有する、項目1〜14のいずれか一項に記載のGH61変異体。
16.I4V置換を有する、項目1〜14のいずれか一項に記載のGH61変異体。
17.N5A置換を有する、項目1〜16のいずれか一項に記載のGH61変異体。
18.N5D置換を有する、項目1〜16のいずれか一項に記載のGH61変異体。
19.N5E置換を有する、項目1〜16のいずれか一項に記載のGH61変異体。
20.N5G置換を有する、項目1〜16のいずれか一項に記載のGH61変異体。
21.N5R置換を有する、項目1〜16のいずれか一項に記載のGH61変異体。
22.N5S置換を有する、項目1〜16のいずれか一項に記載のGH61変異体。
23.D6S置換を有する、項目1〜22のいずれか一項に記載のGH61変異体。
24.I7L置換を有する、項目1〜23のいずれか一項に記載のGH61変異体。
25.I7M置換を有する、項目1〜23のいずれか一項に記載のGH61変異体。
26.I7V置換を有する、項目1〜23のいずれか一項に記載のGH61変異体。
27.V8I置換を有する、項目1〜26のいずれか一項に記載のGH61変異体。
28.I9A置換を有する、項目1〜27のいずれか一項に記載のGH61変異体。
29.I9V置換を有する、項目1〜27のいずれか一項に記載のGH61変異体。
30.N10D置換を有する、項目1〜29のいずれか一項に記載のGH61変異体。
31.N10R置換を有する、項目1〜29のいずれか一項に記載のGH61変異体。
32.V12M置換を有する、項目1〜31のいずれか一項に記載のGH61変異体。
33.V12T置換を有する、項目1〜31のいずれか一項に記載のGH61変異体。
34.W13A置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
35.W13E置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
36.W13F置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
37.W13G置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
38.W13I置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
39.W13K置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
40.W13L置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
41.W13M置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
42.W13N置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
43.W13Q置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
44.W13R置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
45.W13T置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
46.W13V置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
47.W13Y置換を有する、項目1〜33のいずれか一項に記載のGH61変異体。
48.Q15D置換を有する、項目1〜47のいずれか一項に記載のGH61変異体。
49.Q15H置換を有する、項目1〜47のいずれか一項に記載のGH61変異体。
50.Q15K置換を有する、項目1〜47のいずれか一項に記載のGH61変異体。
51.A16N置換を有する、項目1〜50のいずれか一項に記載のGH61変異体。
52.P19E置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
53.P19F置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
54.P19H置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
55.P19K置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
56.P19M置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
57.P19Q置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
58.P19T置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
59.P19W置換を有する、項目1〜51のいずれか一項に記載のGH61変異体。
60.T20A置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
61.T20G置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
62.T20K置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
63.T20M置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
64.T20N置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
65.T20P置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
66.T20R置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
67.T20Y置換を有する、項目1〜59のいずれか一項に記載のGH61変異体。
68.T21I置換を有する、項目1〜67のいずれか一項に記載のGH61変異体。
69.T21K置換を有する、項目1〜67のいずれか一項に記載のGH61変異体。
70.T21M置換を有する、項目1〜67のいずれか一項に記載のGH61変異体。
71.T21S置換を有する、項目1〜67のいずれか一項に記載のGH61変異体。
72.F22A置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
73.F22D置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
74.F22G置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
75.F22I置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
76.F22K置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
77.F22L置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
78.F22R置換を有する、項目1〜71のいずれか一項に記載のGH61変異体。
79.P23G置換を有する、項目1〜78のいずれか一項に記載のGH61変異体。
80.Y24A置換を有する、項目1〜79のいずれか一項に記載のGH61変異体。
81.Y24S置換を有する、項目1〜79のいずれか一項に記載のGH61変異体。
82.Y24T置換を有する、項目1〜79のいずれか一項に記載のGH61変異体。
83.E25L置換を有する、項目1〜82のいずれか一項に記載のGH61変異体。
84.E25M置換を有する、項目1〜82のいずれか一項に記載のGH61変異体。
85.E25N置換を有する、項目1〜82のいずれか一項に記載のGH61変異体。
86.E25Q置換を有する、項目1〜82のいずれか一項に記載のGH61変異体。
87.S26M置換を有する、項目1〜86のいずれか一項に記載のGH61変異体。
88.S26P置換を有する、項目1〜86のいずれか一項に記載のGH61変異体。
89.S26T置換を有する、項目1〜86のいずれか一項に記載のGH61変異体。
90.N27E置換を有する、項目1〜89のいずれか一項に記載のGH61変異体。
91.N27E置換を有する、項目1〜89のいずれか一項に記載のGH61変異体。
92.N27H置換を有する、項目1〜89のいずれか一項に記載のGH61変異体。
93.P28A置換を有する、項目1〜92のいずれか一項に記載のGH61変異体。
94.P28K置換を有する、項目1〜92のいずれか一項に記載のGH61変異体。
95.P28M置換を有する、項目1〜92のいずれか一項に記載のGH61変異体。
96.P28S置換を有する、項目1〜92のいずれか一項に記載のGH61変異体。
97.P28V置換を有する、項目1〜92のいずれか一項に記載のGH61変異体。
98.P29C置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
99.P29D置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
100.P29E置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
101.P29F置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
102.P29G置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
103.P29K置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
104.P29M置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
105.P29R置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
106.P29S置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
107.P29T置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
108.P29Y置換を有する、項目1〜97のいずれか一項に記載のGH61変異体。
109.V32A置換を有する、項目1〜108のいずれか一項に記載のGH61変異体。
110.V32P置換を有する、項目1〜108のいずれか一項に記載のGH61変異体。
111.G33A置換を有する、項目1〜110のいずれか一項に記載のGH61変異体。
112.G33Q置換を有する、項目1〜110のいずれか一項に記載のGH61変異体。
113.G33S置換を有する、項目1〜110のいずれか一項に記載のGH61変異体。
114.T35A置換を有する、項目1〜113のいずれか一項に記載のGH61変異体。
115.T35D置換を有する、項目1〜113のいずれか一項に記載のGH61変異体。
116.T35E置換を有する、項目1〜113のいずれか一項に記載のGH61変異体。
117.T35K置換を有する、項目1〜113のいずれか一項に記載のGH61変異体。
118.T35N置換を有する、項目1〜113のいずれか一項に記載のGH61変異体。
119.T35S置換を有する、項目1〜113のいずれか一項に記載のGH61変異体。
120.A36I置換を有する、項目1〜119のいずれか一項に記載のGH61変異体。
121.A36N置換を有する、項目1〜119のいずれか一項に記載のGH61変異体。
122.A36S置換を有する、項目1〜119のいずれか一項に記載のGH61変異体。
123.A36T置換を有する、項目1〜119のいずれか一項に記載のGH61変異体。
124.A36Y置換を有する、項目1〜119のいずれか一項に記載のGH61変異体。
125.A37D置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
126.A37E置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
127.A37F置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
128.A37K置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
129.A37L置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
130.A37Q置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
131.A37S置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
132.A37W置換を有する、項目1〜124のいずれか一項に記載のGH61変異体。
133.D38E置換を有する、項目1〜132のいずれか一項に記載のGH61変異体。
134.D38N置換を有する、項目1〜132のいずれか一項に記載のGH61変異体。
135.L39A置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
136.L39D置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
137.L39E置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
138.L39F置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
139.L39I置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
140.L39M置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
141.L39N置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
142.L39P置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
143.L39Q置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
144.L39S置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
145.L39T置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
146.L39V置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
147.L39Y置換を有する、項目1〜134のいずれか一項に記載のGH61変異体。
148.N41D置換を有する、項目1〜147のいずれか一項に記載のGH61変異体。
149.N41E置換を有する、項目1〜147のいずれか一項に記載のGH61変異体。
150.N41L置換を有する、項目1〜147のいずれか一項に記載のGH61変異体。
151.N41M置換を有する、項目1〜147のいずれか一項に記載のGH61変異体。
152.F43Y置換を有する、項目1〜151のいずれか一項に記載のGH61変異体。
153.V44I置換を有する、項目1〜152のいずれか一項に記載のGH61変異体。
154.D47A置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
155.D47H置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
156.D47K置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
157.D47P置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
158.D47R置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
159.D47T置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
160.D47W置換を有する、項目1〜153のいずれか一項に記載のGH61変異体。
161.A48C置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
162.A48E置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
163.A48G置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
164.A48H置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
165.A48I置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
166.A48K置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
167.A48L置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
168.A48N置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
169.A48Q置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
170.A48S置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
171.A48T置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
172.A48W置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
173.A48Y置換を有する、項目1〜160のいずれか一項に記載のGH61変異体。
174.Y49W置換を有する、項目1〜173のいずれか一項に記載のGH61変異体。
175.Q50A置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
176.Q50D置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
177.Q50E置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
178.Q50G置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
179.Q50K置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
180.Q50T置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
181.Q50Y置換を有する、項目1〜174のいずれか一項に記載のGH61変異体。
182.N51E置換を有する、項目1〜181のいずれか一項に記載のGH61変異体。
183.N51H置換を有する、項目1〜181のいずれか一項に記載のGH61変異体。
184.N51K置換を有する、項目1〜181のいずれか一項に記載のGH61変異体。
185.N51L置換を有する、項目1〜181のいずれか一項に記載のGH61変異体。
186.N51S置換を有する、項目1〜181のいずれか一項に記載のGH61変異体。
187.N51T置換を有する、項目1〜181のいずれか一項に記載のGH61変異体。
188.P52A置換を有する、項目1〜187のいずれか一項に記載のGH61変異体。
189.P52F置換を有する、項目1〜187のいずれか一項に記載のGH61変異体。
190.P52H置換を有する、項目1〜187のいずれか一項に記載のGH61変異体。
191.P52N置換を有する、項目1〜187のいずれか一項に記載のGH61変異体。
192.I54E置換を有する、項目1〜191のいずれか一項に記載のGH61変異体。
193.I54Q置換を有する、項目1〜191のいずれか一項に記載のGH61変異体。
194.K58I置換を有する、項目1〜193のいずれか一項に記載のGH61変異体。
195.K58R置換を有する、項目1〜193のいずれか一項に記載のGH61変異体。
196.K58V置換を有する、項目1〜193のいずれか一項に記載のGH61変異体。
197.N59E置換を有する、項目1〜196のいずれか一項に記載のGH61変異体。
198.N59G置換を有する、項目1〜196のいずれか一項に記載のGH61変異体。
199.N59Q置換を有する、項目1〜196のいずれか一項に記載のGH61変異体。
200.N59S置換を有する、項目1〜196のいずれか一項に記載のGH61変異体。
201.A60G置換を有する、項目1〜200のいずれか一項に記載のGH61変異体。
202.T61A置換を有する、項目1〜201のいずれか一項に記載のGH61変異体。
203.T61D置換を有する、項目1〜201のいずれか一項に記載のGH61変異体。
204.T61Q置換を有する、項目1〜201のいずれか一項に記載のGH61変異体。
205.T61R置換を有する、項目1〜201のいずれか一項に記載のGH61変異体。
206.T61S置換を有する、項目1〜201のいずれか一項に記載のGH61変異体。
207.N62C置換を有する、項目1〜206のいずれか一項に記載のGH61変異体。
208.N62H置換を有する、項目1〜206のいずれか一項に記載のGH61変異体。
209.N62P置換を有する、項目1〜206のいずれか一項に記載のGH61変異体。
210.K64A置換を有する、項目1〜209のいずれか一項に記載のGH61変異体。
211.K64L置換を有する、項目1〜209のいずれか一項に記載のGH61変異体。
212.K64Q置換を有する、項目1〜209のいずれか一項に記載のGH61変異体。
213.S68E置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
214.S68I置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
215.S68L置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
216.S68M置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
217.S68N置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
218.S68T置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
219.S68V置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
220.S68Y置換を有する、項目1〜212のいずれか一項に記載のGH61変異体。
221.V69Y置換を有する、項目1〜220のいずれか一項に記載のGH61変異体。
222.K70A置換を有する、項目1〜221のいずれか一項に記載のGH61変異体。
223.K70E置換を有する、項目1〜221のいずれか一項に記載のGH61変異体。
224.K70L置換を有する、項目1〜221のいずれか一項に記載のGH61変異体。
225.K70N置換を有する、項目1〜221のいずれか一項に記載のGH61変異体。
226.K70R置換を有する、項目1〜221のいずれか一項に記載のGH61変異体。
227.K70S置換を有する、項目1〜221のいずれか一項に記載のGH61変異体。
228.A71P置換を有する、項目1〜227のいずれか一項に記載のGH61変異体。
229.A71Y置換を有する、項目1〜227のいずれか一項に記載のGH61変異体。
230.L76D置換を有する、項目1〜229のいずれか一項に記載のGH61変異体。
231.L76E置換を有する、項目1〜229のいずれか一項に記載のGH61変異体。
232.V80A置換を有する、項目1〜231のいずれか一項に記載のGH61変異体。
233.V80E置換を有する、項目1〜231のいずれか一項に記載のGH61変異体。
234.V80L置換を有する、項目1〜231のいずれか一項に記載のGH61変異体。
235.V80M置換を有する、項目1〜231のいずれか一項に記載のGH61変異体。
236.V80T置換を有する、項目1〜231のいずれか一項に記載のGH61変異体。
237.P83K置換を有する、項目1〜236のいずれか一項に記載のGH61変異体。
238.P89L置換を有する、項目1〜237のいずれか一項に記載のGH61変異体。
239.P89S置換を有する、項目1〜237のいずれか一項に記載のGH61変異体。
240.P89T置換を有する、項目1〜237のいずれか一項に記載のGH61変異体。
241.P89V置換を有する、項目1〜237のいずれか一項に記載のGH61変異体。
242.I90V置換を有する、項目1〜241のいずれか一項に記載のGH61変異体。
243.V91I置換を有する、項目1〜242のいずれか一項に記載のGH61変異体。
244.V91L置換を有する、項目1〜242のいずれか一項に記載のGH61変異体。
245.N96A置換を有する、項目1〜244のいずれか一項に記載のGH61変異体。
246.N96D置換を有する、項目1〜244のいずれか一項に記載のGH61変異体。
247.N96H置換を有する、項目1〜244のいずれか一項に記載のGH61変異体。
248.N96S置換を有する、項目1〜244のいずれか一項に記載のGH61変異体。
249.N98H置換を有する、項目1〜244のいずれか一項に記載のGH61変異体。
250.T103A置換を有する、項目1〜249のいずれか一項に記載のGH61変異体。
251.T103E置換を有する、項目1〜249のいずれか一項に記載のGH61変異体。
252.V104A置換を有する、項目1〜251のいずれか一項に記載のGH61変異体。
253.V104K置換を有する、項目1〜251のいずれか一項に記載のGH61変異体。
254.D105S置換を有する、項目1〜253のいずれか一項に記載のGH61変異体。
255.K106C置換を有する、項目1〜254のいずれか一項に記載のGH61変異体。
256.K106E置換を有する、項目1〜254のいずれか一項に記載のGH61変異体。
257.K106F置換を有する、項目1〜254のいずれか一項に記載のGH61変異体。
258.K106L置換を有する、項目1〜254のいずれか一項に記載のGH61変異体。
259.K106R置換を有する、項目1〜254のいずれか一項に記載のGH61変異体。
260.T107A置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
261.T107C置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
262.T107D置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
263.T107E置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
264.T107F置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
265.T107G置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
266.T107K置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
267.T107M置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
268.T107N置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
269.T107Q置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
270.T107R置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
271.T107S置換を有する、項目1〜259のいずれか一項に記載のGH61変異体。
272.T108A置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
273.T108C置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
274.T108D置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
275.T108E置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
276.T108K置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
277.T108L置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
278.T108Q置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
279.T108R置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
280.T108S置換を有する、項目1〜271のいずれか一項に記載のGH61変異体。
281.E110K置換を有する、項目1〜280のいずれか一項に記載のGH61変異体。
282.E110L置換を有する、項目1〜280のいずれか一項に記載のGH61変異体。
283.E110M置換を有する、項目1〜280のいずれか一項に記載のGH61変異体。
284.F112W置換を有する、項目1〜283のいずれか一項に記載のGH61変異体。
285.K113P置換を有する、項目1〜284のいずれか一項に記載のGH61変異体。
286.I114F置換を有する、項目1〜285のいずれか一項に記載のGH61変異体。
287.G116H置換を有する、項目1〜286のいずれか一項に記載のGH61変異体。
288.G116Q置換を有する、項目1〜286のいずれか一項に記載のGH61変異体。
289.G116S置換を有する、項目1〜286のいずれか一項に記載のGH61変異体。
290.V117A置換を有する、項目1〜289のいずれか一項に記載のGH61変異体。
291.V117I置換を有する、項目1〜289のいずれか一項に記載のGH61変異体。
292.L119N置換を有する、項目1〜291のいずれか一項に記載のGH61変異体。
293.L119T置換を有する、項目1〜291のいずれか一項に記載のGH61変異体。
294.L120I置換を有する、項目1〜293のいずれか一項に記載のGH61変異体。
295.L120S置換を有する、項目1〜293のいずれか一項に記載のGH61変異体。
296.L120T置換を有する、項目1〜293のいずれか一項に記載のGH61変異体。
297.L120V置換を有する、項目1〜293のいずれか一項に記載のGH61変異体。
298.S121C置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
299.S121D置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
300.S121E置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
301.S121F置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
302.S121G置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
303.S121K置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
304.S121L置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
305.S121M置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
306.S121N置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
307.S121T置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
308.S121V置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
309.S121Y置換を有する、項目1〜297のいずれか一項に記載のGH61変異体。
310.G122A置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
311.G122E置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
312.G122F置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
313.G122L置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
314.G122M置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
315.G122N置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
316.G122S置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
317.G122T置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
318.G122V置換を有する、項目1〜309のいずれか一項に記載のGH61変異体。
319.G123E置換を有する、項目1〜318のいずれか一項に記載のGH61変異体。
320.G123Q置換を有する、項目1〜318のいずれか一項に記載のGH61変異体。
321.G123R置換を有する、項目1〜318のいずれか一項に記載のGH61変異体。
322.D124N置換を有する、項目1〜321のいずれか一項に記載のGH61変異体。
323.D124S置換を有する、項目1〜321のいずれか一項に記載のGH61変異体。
324.P125D置換を有する、項目1〜323のいずれか一項に記載のGH61変異体。
325.G126M置換を有する、項目1〜324のいずれか一項に記載のGH61変異体。
326.G126Q置換を有する、項目1〜324のいずれか一項に記載のGH61変異体。
327.T127A置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
328.T127E置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
329.T127F置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
330.T127I置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
331.T127L置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
332.T127M置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
333.T127V置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
334.T127W置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
335.T127Y置換を有する、項目1〜326のいずれか一項に記載のGH61変異体。
336.A129N置換を有する、項目1〜335のいずれか一項に記載のGH61変異体。
337.V132D置換を有する、項目1〜336のいずれか一項に記載のGH61変異体。
338.V132E置換を有する、項目1〜336のいずれか一項に記載のGH61変異体。
339.V132L置換を有する、項目1〜336のいずれか一項に記載のGH61変異体。
340.V132M置換を有する、項目1〜336のいずれか一項に記載のGH61変異体。
341.V132R置換を有する、項目1〜336のいずれか一項に記載のGH61変異体。
342.S135A置換を有する、項目1〜341のいずれか一項に記載のGH61変異体。
343.S135E置換を有する、項目1〜341のいずれか一項に記載のGH61変異体。
344.S135G置換を有する、項目1〜341のいずれか一項に記載のGH61変異体。
345.S135H置換を有する、項目1〜341のいずれか一項に記載のGH61変異体。
346.S135M置換を有する、項目1〜341のいずれか一項に記載のGH61変異体。
347.S135N置換を有する、項目1〜341のいずれか一項に記載のGH61変異体。
348.V141R置換を有する、項目1〜347のいずれか一項に記載のGH61変異体。
349.V141T置換を有する、項目1〜347のいずれか一項に記載のGH61変異体。
350.V142S置換を有する、項目1〜349のいずれか一項に記載のGH61変異体。
351.I144Y置換を有する、項目1〜350のいずれか一項に記載のGH61変異体。
352.P145D置換を有する、項目1〜351のいずれか一項に記載のGH61変異体。
353.P145F置換を有する、項目1〜351のいずれか一項に記載のGH61変異体。
354.D146E置換を有する、項目1〜353のいずれか一項に記載のGH61変異体。
355.N147E置換を有する、項目1〜354のいずれか一項に記載のGH61変異体。
356.N147M置換を有する、項目1〜354のいずれか一項に記載のGH61変異体。
357.N147S置換を有する、項目1〜354のいずれか一項に記載のGH61変異体。
358.N147T置換を有する、項目1〜354のいずれか一項に記載のGH61変異体。
359.A149E置換を有する、項目1〜358のいずれか一項に記載のGH61変異体。
360.G151D置換を有する、項目1〜359のいずれか一項に記載のGH61変異体。
361.G151P置換を有する、項目1〜359のいずれか一項に記載のGH61変異体。
362.Y153A置換を有する、項目1〜361のいずれか一項に記載のGH61変異体。
363.V154D置換を有する、項目1〜362のいずれか一項に記載のGH61変異体。
364.V154K置換を有する、項目1〜362のいずれか一項に記載のGH61変異体。
365.E158G置換を有する、項目1〜364のいずれか一項に記載のGH61変異体。
366.E158W置換を有する、項目1〜364のいずれか一項に記載のGH61変異体。
367.I160F置換を有する、項目1〜366のいずれか一項に記載のGH61変異体。
368.I160M置換を有する、項目1〜366のいずれか一項に記載のGH61変異体。
369.A161E置換を有する、項目1〜368のいずれか一項に記載のGH61変異体。
370.A161G置換を有する、項目1〜368のいずれか一項に記載のGH61変異体。
371.A161L置換を有する、項目1〜368のいずれか一項に記載のGH61変異体。
372.A161S置換を有する、項目1〜368のいずれか一項に記載のGH61変異体。
373.H163A置換を有する、項目1〜372のいずれか一項に記載のGH61変異体。
374.H163I置換を有する、項目1〜372のいずれか一項に記載のGH61変異体。
375.H163Q置換を有する、項目1〜372のいずれか一項に記載のGH61変異体。
376.H163Y置換を有する、項目1〜372のいずれか一項に記載のGH61変異体。
377.S164A置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
378.S164D置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
379.S164E置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
380.S164G置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
381.S164K置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
382.S164L置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
383.S164M置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
384.S164Q置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
385.S164R置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
386.S164V置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
387.S164Y置換を有する、項目1〜376のいずれか一項に記載のGH61変異体。
388.G166A置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
389.G166D置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
390.G166E置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
391.G166F置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
392.G166H置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
393.G166K置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
394.G166M置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
395.G166N置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
396.G166Q置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
397.G166S置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
398.G166W置換を有する、項目1〜387のいずれか一項に記載のGH61変異体。
399.C167R置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
400.Q167A置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
401.Q167D置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
402.Q167E置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
403.Q167F置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
404.Q167G置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
405.Q167K置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
406.Q167L置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
407.Q167N置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
408.Q167V置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
409.Q167Y置換を有する、項目1〜398のいずれか一項に記載のGH61変異体。
410.A168D置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
411.A168E置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
412.A168F置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
413.A168I置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
414.A168K置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
415.A168L置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
416.A168M置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
417.A168N置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
418.A168P置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
419.A168Q置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
420.A168R置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
421.A168T置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
422.A168Y置換を有する、項目1〜409のいずれか一項に記載のGH61変異体。
423.A171E置換を有する、項目1〜422のいずれか一項に記載のGH61変異体。
424.A171T置換を有する、項目1〜422のいずれか一項に記載のGH61変異体。
425.N173H置換を有する、項目1〜424のいずれか一項に記載のGH61変異体。
426.N173S置換を有する、項目1〜424のいずれか一項に記載のGH61変異体。
427.P175F置換を有する、項目1〜426のいずれか一項に記載のGH61変異体。
428.I180L置換を有する、項目1〜427のいずれか一項に記載のGH61変異体。
429.A181K置換を有する、項目1〜428のいずれか一項に記載のGH61変異体。
430.A181N置換を有する、項目1〜428のいずれか一項に記載のGH61変異体。
431.A181R置換を有する、項目1〜428のいずれか一項に記載のGH61変異体。
432.S183E置換を有する、項目1〜431のいずれか一項に記載のGH61変異体。
433.S183K置換を有する、項目1〜431のいずれか一項に記載のGH61変異体。
434.S183N置換を有する、項目1〜431のいずれか一項に記載のGH61変異体。
435.S183R置換を有する、項目1〜431のいずれか一項に記載のGH61変異体。
436.S183T置換を有する、項目1〜431のいずれか一項に記載のGH61変異体。
437.S185D置換を有する、項目1〜436のいずれか一項に記載のGH61変異体。
438.S185G置換を有する、項目1〜436のいずれか一項に記載のGH61変異体。
439.S185H置換を有する、項目1〜436のいずれか一項に記載のGH61変異体。
440.S185K置換を有する、項目1〜436のいずれか一項に記載のGH61変異体。
441.S185T置換を有する、項目1〜436のいずれか一項に記載のGH61変異体。
442.S187A置換を有する、項目1〜441のいずれか一項に記載のGH61変異体。
443.S187D置換を有する、項目1〜441のいずれか一項に記載のGH61変異体。
444.S187E置換を有する、項目1〜441のいずれか一項に記載のGH61変異体。
445.S187H置換を有する、項目1〜441のいずれか一項に記載のGH61変異体。
446.S187K置換を有する、項目1〜441のいずれか一項に記載のGH61変異体。
447.S187P置換を有する、項目1〜441のいずれか一項に記載のGH61変異体。
448.L188A置換を有する、項目1〜447のいずれか一項に記載のGH61変異体。
449.L188D置換を有する、項目1〜447のいずれか一項に記載のGH61変異体。
450.Q189D置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
451.Q189E置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
452.Q189G置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
453.Q189L置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
454.Q189M置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
455.Q189R置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
456.Q189T置換を有する、項目1〜449のいずれか一項に記載のGH61変異体。
457.S191D置換を有する、項目1〜456のいずれか一項に記載のGH61変異体。
458.S191R置換を有する、項目1〜456のいずれか一項に記載のGH61変異体。
459.L194D置換を有する、項目1〜458のいずれか一項に記載のGH61変異体。
460.L194M置換を有する、項目1〜458のいずれか一項に記載のGH61変異体。
461.G195A置換を有する、項目1〜460のいずれか一項に記載のGH61変異体。
462.G195E置換を有する、項目1〜460のいずれか一項に記載のGH61変異体。
463.G195S置換を有する、項目1〜460のいずれか一項に記載のGH61変異体。
464.T196H置換を有する、項目1〜463のいずれか一項に記載のGH61変異体。
465.T196R置換を有する、項目1〜463のいずれか一項に記載のGH61変異体。
466.T196Y置換を有する、項目1〜463のいずれか一項に記載のGH61変異体。
467.D197A置換を有する、項目1〜466のいずれか一項に記載のGH61変異体。
468.D197E置換を有する、項目1〜466のいずれか一項に記載のGH61変異体。
469.D197L置換を有する、項目1〜466のいずれか一項に記載のGH61変異体。
470.D197M置換を有する、項目1〜466のいずれか一項に記載のGH61変異体。
471.D197T置換を有する、項目1〜466のいずれか一項に記載のGH61変異体。
472.D197V置換を有する、項目1〜466のいずれか一項に記載のGH61変異体。
473.A201D置換を有する、項目1〜472のいずれか一項に記載のGH61変異体。
474.A201E置換を有する、項目1〜472のいずれか一項に記載のGH61変異体。
475.A201F置換を有する、項目1〜472のいずれか一項に記載のGH61変異体。
476.A201K置換を有する、項目1〜472のいずれか一項に記載のGH61変異体。
477.A201P置換を有する、項目1〜472のいずれか一項に記載のGH61変異体。
478.A201Q置換を有する、項目1〜472のいずれか一項に記載のGH61変異体。
479.T202A置換を有する、項目1〜478のいずれか一項に記載のGH61変異体。
480.T202E置換を有する、項目1〜478のいずれか一項に記載のGH61変異体。
481.T202Q置換を有する、項目1〜478のいずれか一項に記載のGH61変異体。
482.T202S置換を有する、項目1〜478のいずれか一項に記載のGH61変異体。
483.P204A置換を有する、項目1〜482のいずれか一項に記載のGH61変異体。
484.V206I置換を有する、項目1〜483のいずれか一項に記載のGH61変異体。
485.L207F置換を有する、項目1〜484のいずれか一項に記載のGH61変異体。
486.I208F置換を有する、項目1〜485のいずれか一項に記載のGH61変異体。
487.I208L置換を有する、項目1〜485のいずれか一項に記載のGH61変異体。
488.I208V置換を有する、項目1〜485のいずれか一項に記載のGH61変異体。
489.N209D置換を有する、項目1〜488のいずれか一項に記載のGH61変異体。
490.Y211A置換を有する、項目1〜489のいずれか一項に記載のGH61変異体。
491.T212D置換を有する、項目1〜490のいずれか一項に記載のGH61変異体。
492.T212K置換を有する、項目1〜490のいずれか一項に記載のGH61変異体。
493.T212R置換を有する、項目1〜490のいずれか一項に記載のGH61変異体。
494.S213E置換を有する、項目1〜493のいずれか一項に記載のGH61変異体。
495.S213R置換を有する、項目1〜493のいずれか一項に記載のGH61変異体。
496.S213T置換を有する、項目1〜493のいずれか一項に記載のGH61変異体。
497.P214S置換を有する、項目1〜496のいずれか一項に記載のGH61変異体。
498.N216D置換を有する、項目1〜497のいずれか一項に記載のGH61変異体。
499.N216I置換を有する、項目1〜497のいずれか一項に記載のGH61変異体。
500.N216K置換を有する、項目1〜497のいずれか一項に記載のGH61変異体。
501.N216P置換を有する、項目1〜497のいずれか一項に記載のGH61変異体。
502.N216Q置換を有する、項目1〜497のいずれか一項に記載のGH61変異体。
503.N216T置換を有する、項目1〜497のいずれか一項に記載のGH61変異体。
504.Y217H置換を有する、項目1〜503のいずれか一項に記載のGH61変異体。
505.I218A置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
506.I218D置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
507.I218E置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
508.I218K置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
509.I218M置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
510.I218N置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
511.I218P置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
512.I218R置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
513.I218S置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
514.I218T置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
515.I218V置換を有する、項目1〜504のいずれか一項に記載のGH61変異体。
516.I219A置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
517.I219D置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
518.I219L置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
519.I219M置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
520.I219N置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
521.I219P置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
522.I219Q置換を有する、項目1〜515のいずれか一項に記載のGH61変異体。
523.P222D置換を有する、項目1〜522のいずれか一項に記載のGH61変異体。
524.P222G置換を有する、項目1〜522のいずれか一項に記載のGH61変異体。
525.T223E置換を有する、項目1〜524のいずれか一項に記載のGH61変異体。
526.T223Q置換を有する、項目1〜524のいずれか一項に記載のGH61変異体。
527.T223S置換を有する、項目1〜524のいずれか一項に記載のGH61変異体。
528.V224A置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
529.V224E置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
530.V224I置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
531.V224N置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
532.V224P置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
533.V224Q置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
534.V224S置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
535.V224T置換を有する、項目1〜527のいずれか一項に記載のGH61変異体。
536.S226D置換を有する、項目1〜535のいずれか一項に記載のGH61変異体。
537.S226G置換を有する、項目1〜535のいずれか一項に記載のGH61変異体。
538.S226K置換を有する、項目1〜535のいずれか一項に記載のGH61変異体。
539.S226M置換を有する、項目1〜535のいずれか一項に記載のGH61変異体。
540.S226P置換を有する、項目1〜535のいずれか一項に記載のGH61変異体。
541.S226Q置換を有する、項目1〜535のいずれか一項に記載のGH61変異体。
542.T230S置換を有する、項目1〜541のいずれか一項に記載のGH61変異体。
543.S231C置換を有する、項目1〜542のいずれか一項に記載のGH61変異体。
544.S231I置換を有する、項目1〜542のいずれか一項に記載のGH61変異体。
545.V232F置換を有する、項目1〜544のいずれか一項に記載のGH61変異体。
546.V232Y置換を有する、項目1〜544のいずれか一項に記載のGH61変異体。
547.A233C置換を有する、項目1〜544のいずれか一項に記載のGH61変異体。
548.A233F置換を有する、項目1〜544のいずれか一項に記載のGH61変異体。
549.A233S置換を有する、項目1〜544のいずれか一項に記載のGH61変異体。
550.G235A置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
551.G235D置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
552.G235F置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
553.G235I置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
554.G235K置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
555.G235L置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
556.G235M置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
557.G235N置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
558.G235Q置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
559.G235S置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
560.G235V置換を有する、項目1〜549のいずれか一項に記載のGH61変異体。
561.T287A置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
562.T287D置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
563.T287F置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
564.T287G置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
565.T287H置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
566.T287I置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
567.T287S置換を有する、項目1〜560のいずれか一項に記載のGH61変異体。
568.L288A置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
569.L288C置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
570.L288D置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
571.L288E置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
572.L288F置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
573.L288G置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
574.L288I置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
575.L288K置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
576.L288M置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
577.L288N置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
578.L288R置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
579.L288S置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
580.L288T置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
581.L288V置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
582.L288W置換を有する、項目1〜567のいずれか一項に記載のGH61変異体。
583.T289A置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
584.T289D置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
585.T289K置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
586.T289L置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
587.T289M置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
588.T289R置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
589.T289S置換を有する、項目1〜582のいずれか一項に記載のGH61変異体。
590.L290A置換を有する、項目1〜589のいずれか一項に記載のGH61変異体。
591.L290K置換を有する、項目1〜589のいずれか一項に記載のGH61変異体。
592.L290M置換を有する、項目1〜589のいずれか一項に記載のGH61変異体。
593.L290T置換を有する、項目1〜589のいずれか一項に記載のGH61変異体。
594.Y291A置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
595.Y291D置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
596.Y291E置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
597.Y291F置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
598.Y291G置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
599.Y291I置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
600.Y291K置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
601.Y291L置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
602.Y291M置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
603.Y291N置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
604.Y291R置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
605.Y291S置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
606.Y291V置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
607.Y291W置換を有する、項目1〜593のいずれか一項に記載のGH61変異体。
608.G292D置換を有する、項目1〜607のいずれか一項に記載のGH61変異体。
609.G292K置換を有する、項目1〜607のいずれか一項に記載のGH61変異体。
610.Q293K置換を有する、項目1〜609のいずれか一項に記載のGH61変異体。
611.Q293P置換を有する、項目1〜609のいずれか一項に記載のGH61変異体。
612.C294S置換を有する、項目1〜611のいずれか一項に記載のGH61変異体。
613.G295A置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
614.G295C置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
615.G295D置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
616.G295F置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
617.G295H置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
618.G295Q置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
619.G295R置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
620.G295T置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
621.G295W置換を有する、項目1〜612のいずれか一項に記載のGH61変異体。
622.G296A置換を有する、項目1〜621のいずれか一項に記載のGH61変異体。
623.G296M置換を有する、項目1〜621のいずれか一項に記載のGH61変異体。
624.S297C置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
625.S297D置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
626.S297E置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
627.S297E置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
628.S297K置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
629.S297N置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
630.S297Q置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
631.S297R置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
632.S297T置換を有する、項目1〜623のいずれか一項に記載のGH61変異体。
633.G298A置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
634.G298C置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
635.G298H置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
636.G298I置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
637.G298K置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
638.G298N置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
639.G298Q置換を有する、項目1〜632のいずれか一項に記載のGH61変異体。
640.Y299F置換を有する、項目1〜639のいずれか一項に記載のGH61変異体。
641.Y299N置換を有する、項目1〜639のいずれか一項に記載のGH61変異体。
642.Y299P置換を有する、項目1〜639のいずれか一項に記載のGH61変異体。
643.Y299S置換を有する、項目1〜639のいずれか一項に記載のGH61変異体。
644.G301D置換を有する、項目1〜643のいずれか一項に記載のGH61変異体。
645.G301P置換を有する、項目1〜643のいずれか一項に記載のGH61変異体。
646.G301S置換を有する、項目1〜643のいずれか一項に記載のGH61変異体。
647.G301Y置換を有する、項目1〜643のいずれか一項に記載のGH61変異体。
648.P302F置換を有する、項目1〜647のいずれか一項に記載のGH61変異体。
649.P302G置換を有する、項目1〜647のいずれか一項に記載のGH61変異体。
650.P302L置換を有する、項目1〜647のいずれか一項に記載のGH61変異体。
651.P302T置換を有する、項目1〜647のいずれか一項に記載のGH61変異体。
652.P302V置換を有する、項目1〜647のいずれか一項に記載のGH61変異体。
653.P302Y置換を有する、項目1〜647のいずれか一項に記載のGH61変異体。
654.T303G置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
655.T303K置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
656.T303M置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
657.T303P置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
658.T303R置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
659.T303S置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
660.T303V置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
661.T303Y置換を有する、項目1〜653のいずれか一項に記載のGH61変異体。
662.R304A置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
663.R304C置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
664.R304D置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
665.R304E置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
666.R304N置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
667.R304P置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
668.R304Q置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
669.R304T置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
670.R304V置換を有する、項目1〜661のいずれか一項に記載のGH61変異体。
671.C305E置換を有する、項目1〜670のいずれか一項に記載のGH61変異体。
672.C305G置換を有する、項目1〜670のいずれか一項に記載のGH61変異体。
673.C305K置換を有する、項目1〜670のいずれか一項に記載のGH61変異体。
674.A306E置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
675.A306F置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
676.A306G置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
677.A306I置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
678.A306K置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
679.A306L置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
680.A306M置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
681.A306Q置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
682.A306T置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
683.A306Y置換を有する、項目1〜673のいずれか一項に記載のGH61変異体。
684.P307A置換を有する、項目1〜683のいずれか一項に記載のGH61変異体。
685.P307F置換を有する、項目1〜683のいずれか一項に記載のGH61変異体。
686.P307H置換を有する、項目1〜683のいずれか一項に記載のGH61変異体。
687.P307L置換を有する、項目1〜683のいずれか一項に記載のGH61変異体。
688.P307V置換を有する、項目1〜683のいずれか一項に記載のGH61変異体。
689.P308A置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
690.P308G置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
691.P308H置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
692.P308I置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
693.P308K置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
694.P308L置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
695.P308Q置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
696.P308R置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
697.P308S置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
698.P308T置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
699.P308V置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
700.P308W置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
701.P308Y置換を有する、項目1〜688のいずれか一項に記載のGH61変異体。
702.A309I置換を有する、項目1〜701のいずれか一項に記載のGH61変異体。
703.A309K置換を有する、項目1〜701のいずれか一項に記載のGH61変異体。
704.A309R置換を有する、項目1〜701のいずれか一項に記載のGH61変異体。
705.A309T置換を有する、項目1〜701のいずれか一項に記載のGH61変異体。
706.A309V置換を有する、項目1〜701のいずれか一項に記載のGH61変異体。
707.A309Y置換を有する、項目1〜701のいずれか一項に記載のGH61変異体。
708.T310L置換を有する、項目1〜707のいずれか一項に記載のGH61変異体。
709.T310M置換を有する、項目1〜707のいずれか一項に記載のGH61変異体。
710.T310Q置換を有する、項目1〜707のいずれか一項に記載のGH61変異体。
711.T310S置換を有する、項目1〜707のいずれか一項に記載のGH61変異体。
712.T310W置換を有する、項目1〜707のいずれか一項に記載のGH61変異体。
713.C311S置換を有する、項目1〜712のいずれか一項に記載のGH61変異体。
714.S312D置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
715.S312F置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
716.S312G置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
717.S312I置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
718.S312K置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
719.S312L置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
720.S312M置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
721.S312N置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
722.S312Q置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
723.S312R置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
724.S312T置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
725.S312V置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
726.S312Y置換を有する、項目1〜713のいずれか一項に記載のGH61変異体。
727.T313D置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
728.T313E置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
729.T313F置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
730.T313G置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
731.T313I置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
732.T313K置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
733.T313L置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
734.T313M置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
735.T313P置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
736.T313S置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
737.T313V置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
738.T313Y置換を有する、項目1〜726のいずれか一項に記載のGH61変異体。
739.N315E置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
740.N315H置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
741.N315K置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
742.N315L置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
743.N315M置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
744.N315Q置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
745.N315R置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
746.N315S置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
747.N315V置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
748.N315W置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
749.N315Y置換を有する、項目1〜738のいずれか一項に記載のGH61変異体。
750.P316A置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
751.P316C置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
752.P316D置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
753.P316F置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
754.P316N置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
755.P316R置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
756.P316T置換を有する、項目1〜749のいずれか一項に記載のGH61変異体。
757.Y317E置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
758.Y317G置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
759.Y317L置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
760.Y317M置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
761.Y317P置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
762.Y317Q置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
763.Y317R置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
764.Y317S置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
765.Y317T置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
766.Y317V置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
767.Y317W置換を有する、項目1〜756のいずれか一項に記載のGH61変異体。
768.Y318T置換を有する、項目1〜767のいずれか一項に記載のGH61変異体。
769.Y318W置換を有する、項目1〜767のいずれか一項に記載のGH61変異体。
770.A319D置換を有する、項目1〜769のいずれか一項に記載のGH61変異体。
771.A319F置換を有する、項目1〜769のいずれか一項に記載のGH61変異体。
772.A319Q置換を有する、項目1〜769のいずれか一項に記載のGH61変異体。
773.A319S置換を有する、項目1〜769のいずれか一項に記載のGH61変異体。
774.A319W置換を有する、項目1〜769のいずれか一項に記載のGH61変異体。
775.Q320A置換を有する、項目1〜774のいずれか一項に記載のGH61変異体。
776.Q320P置換を有する、項目1〜774のいずれか一項に記載のGH61変異体。
777.Q320R置換を有する、項目1〜774のいずれか一項に記載のGH61変異体。
778.Q320S置換を有する、項目1〜774のいずれか一項に記載のGH61変異体。
779.C321E置換を有する、項目1〜778のいずれか一項に記載のGH61変異体。
780.C321G置換を有する、項目1〜778のいずれか一項に記載のGH61変異体。
781.C321R置換を有する、項目1〜778のいずれか一項に記載のGH61変異体。
782.L322A置換を有する、項目1〜781のいずれか一項に記載のGH61変異体。
783.L322E置換を有する、項目1〜781のいずれか一項に記載のGH61変異体。
784.L322S置換を有する、項目1〜781のいずれか一項に記載のGH61変異体。
785.L322T置換を有する、項目1〜781のいずれか一項に記載のGH61変異体。
786.L322V置換を有する、項目1〜781のいずれか一項に記載のGH61変異体。
787.N323V置換を有する、項目1〜786のいずれか一項に記載のGH61変異体。
【実施例】
【0333】
本発明は、下記の実施例に更に詳しく記述されるが、これはいかなる意味でも、請求される本発明の範囲を制限することを意図したものではない。添付の図は、本開示の仕様及び説明の不可分の部分と見なされることが意図されている。本明細書に引用されているすべての参照文献は、その中のすべての記述が参照により本明細書に援用される。
【0334】
下記の実験的開示において、下記の略語が適用される:M(モル濃度)、mM(ミリモル濃度)、μM(マイクロモル濃度)、nM(ナノモル濃度)、mol(モル)、mmol(ミリモル)、μmol(マイクロモル)、nmol(ナノモル)、g及びgm(グラム)、mg(ミリグラム)、μg(マイクログラム)、pg(ピコグラム)、L(リットル)、ml及びmL(ミリリットル)、μl及びμL(マイクロリットル)、cm(センチメートル)、mm(ミリメートル)、μm(マイクロメートル)、nm(ナノメートル)、U(単位)、V(ボルト)、MW(分子量)、sec(秒)、min(分)、h及びhr(時間)、℃(摂氏温度)、QS(十分な量)、ND(実施せず)、NA(該当せず)、rpm(毎分回転数)、H
2O(水)、dH
2O(脱イオン水)、HCl(塩酸)、aa(アミノ酸)、bp(塩基対)、kb(キロ塩基対)、kD(キロダルトン)、cDNA(コピー又は相補的DNA)、DNA(デオキシリボ核酸)、ssDNA(単鎖DNA)、dsDNA(二本鎖DNA)、dNTP(デオキシリボヌクレオチド三リン酸)、RNA(リボ核酸)、MgCl
2(塩化マグネシウム)、NaCl(塩化ナトリウム)、w/v(重量/体積)、v/v(体積比)、g(重力)、OD(光学密度)、ABTS(2,2’−アジノ−ビス(3−エチルベンゾ−チアゾリン−6−スルホン酸)二アンモニウム塩、HPLC(高圧液体クロマトグラフィー)、PAGE(ポリアクリルアミドゲル電気泳動)、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)、whPCS(全加水分解物希釈酸前処理トウモロコシ茎葉)、daCS(希釈アンモニア前処理トウモロコシ茎葉)、Pi又はPI(性能指数)、RT−PCR(逆転写PCR)、TFA(トリフルオロ酢酸)、FAB(特定のハイブリッドβ−グルコシダーゼ、PCT国際特許公開第2012/125951号に記述)、SEC(サイズ排除クロマトグラフィー)、RPC(逆相クロマトグラフィー)、並びにSEL(部位評価ライブラリ)。
【0335】
(実施例1)
アッセイ
下記のアッセイが、後述の実施例に使用された。下記のプロトコルからの逸脱がある場合は、実施例に記述される。これらの実験において、反応完了後に形成された生成物の吸光度を測定するのに、分光光度計が使用された。
【0336】
I.グルコースの測定
A.残留グルコース測定のためのヘキソキナーゼアッセイ
whPCSから産生されたグルコースが、ヘキソキナーゼアッセイを用いて測定された。10μLの10倍に希釈した上清を、96ウェルマイクロタイタープレート(Costar Flat Bottom PS)内の190μLのグルコースヘキソキナーゼアッセイ混合物(Instrumentation Laboratory、Breda、Netherlands)に加えた。このプレートを室温で15分間インキュベーションした。インキュベーション後、上清の吸光度を340nmで測定した。残留グルコースを含む培養物の上清を、更なる研究用のプールから除外した。
【0337】
B.グルコース測定のためのABTSアッセイ
GH61Aアビセル(Avicel)活性アッセイで産生されたモノマーグルコースが、ABTSアッセイを用いて検出された。アッセイ緩衝液は、5.48g/Lの2,2’−アジノ−ビス(3−エチルベンゾ−チアゾリン−6−スルホン酸)二アンモニウム塩(ABTS、Sigma、カタログ番号A1888)、0.2U/mLのホースラディッシュペルオキシダーゼ、タイプVI−A(Sigma、カタログ番号P8375)、及び2U/mLの食品グレードのグルコースオキシダーゼ(GENENCOR(登録商標)5989U/mL)を、50mM、pH 5.0の酢酸ナトリウム緩衝液中に含んでいた。50μLのGH61A活性アッセイ混合物(下記VIIIに記述されているアビセル(Avicel)アッセイで取得)を、50μLのABTSアッセイ溶液に加えた。活性アッセイ混合物を添加した後、周辺温度22℃で、反応を5分間、OD
420で動的に追跡した。各アッセイ条件について、グルコースの適切な校正曲線が常に含められた。
【0338】
C.グルコース濃度決定のためのHPLCアッセイ
グルコース濃度は、REZEX RFQ−Fast Fruit H+(8%)100×7.8mm(Phenomenex)を備えたAgilent 1200(Agilent Technologies)HPLCを用いて決定された。カラムは、80℃、流量0.9mL/分、溶出液として0.01N H
2SO
4で動作した。30μLのサンプルを、90μLのmilliQと混合し、減圧下で0.22μm Millipore Multiscreen HTS 96ウェル濾過システムを用いて濾過した。10μLの4倍希釈サンプルを注入した。適切なグルコース校正セットを使用して、正確なグルコース濃度を決定した。
【0339】
II.タンパク質精製及び透析
野生型又は変異体GH61Aを発現しているH.ジェコリーナ(H.jecorina)からの上清(Δeg1、Δeg2、Δeg3、Δeg5、Δeg6、Δgh61a、Δcbh1、Δcbh2、Δman1)を、1M HEPES(pH 8.0)で4倍に希釈し、最終体積を500μLとした。この混合物を30分間インキュベーションし、200μLのBiokal Workbead 40 IDA Highで合間に混合し(5回)、100mM CuSO
4を入れた。通過画分中にある精製したタンパク質サンプルを、2分間1,000rpmで遠心分離にかけることにより取得した。「Harvard apparatus 96 well dispo dialyzer」10kD MWCO(#74−0903)プレートを使用して、精製サンプルを一晩、4℃で50mM酢酸ナトリウム(pH 5.0)を用いて透析した(40倍)。
【0340】
III.Bradford、標準化、及びendoH処理によるタンパク質決定
タンパク質濃度は、BSAを標準に用いたBioRad Bradfordアッセイを使用して決定された。選択されたサンプルについて、Bradfordにより取得したタンパク質濃度を、精製GH61Aを参照に用い、SEC HPLC及び/又はRP HPLCにより取得したタンパク質データと比較した。GH61Aサンプルを、50mM NaAC(pH 5.0)で適切に希釈することにより100ppmに標準化した。これは、(必要に応じて)BradfordとHPLC測定との間の補正因子を考慮し、HPLC値を指標とした。タンパク質サンプルは、S.プリカタス(S.plicatus)(例えば、NEB P0702L)由来の10ppmのendoHグリコシダーゼで処理し、37℃で4〜20時間インキュベーションし、800rpmにかけた。
【0341】
IV.標準化後のタンパク質成分決定のためのHPLCアッセイ
A.タンパク質決定のためのサイズ排除クロマトグラフィー(SEC)
endoH処理され標準化されたGH61A変異体の濃度は、Waters Acquity BEH125 SEC 1.7μm(4.6×150mm)カラムを備えたAgilent 1200(Agilent Technologies)HPLCで決定された。25μLのサンプルを、75μLのmilliQと混合した。10μLのサンプルを、カラムに注入した。化合物は、NaH
2PO
4(pH 6.75)を用いて、4.5分間、流量0.35mL/分で無勾配溶離を行った。タンパク質は波長220nmで検出した。GH61A変異体のタンパク質濃度は、精製野生型GH61A(3.125、6.25、12.5、25、50、100、200、400μg/mL)を用いて生成された校正曲線から決定された。性能指数(PI)を計算するため、GH61A変異体の濃度を、同じプレートの野生型GH61A平均(例えば参照酵素)の濃度で割った。
【0342】
B.タンパク質決定のための逆相クロマトグラフィー(RPC)
精製培養上清から得たGH61A変異体タンパク質の濃度は、Phenomenex Aeris Widepore 3.6 u XB−C8(50×2.1mm)カラムを備えたAgilent 1200(Agilent Technologies)HPLCで決定された。90μLのサンプルを、10μLの50%アセトニトリルと混合した。10μLのサンプルを、カラムに注入した。化合物は、次の勾配を用いて溶出させた:溶出液A(0分、90%);(1.5分、70%);(3.5分、55%);(3.6分、5%);(4.1分、5%);(4.2分、90%);(4.5分、90%)。溶出液AはMilliQ+0.1% TFAであり、溶出液Bはアセトニトリル+0.07% TFAであった。タンパク質は波長220nmで検出した。GH61A変異体のタンパク質濃度は、精製野生型GH61A(15.625、31.25、62.5、125、250、500μg/mL)を用いて生成された校正曲線から決定された。性能指数(PI)を計算するため、GH61A変異体の濃度を、同じプレートの野生型GH61A平均(例えば参照酵素)の濃度で割った。
【0343】
V.熱安定性アッセイ
A.熱安定性測定のためのアビセル(Avicel)アッセイ(「アビセル アフター(Avicel After)」とも呼ばれる)
加熱インキュベーション後のGH61Aポリペプチド(野生型及び変異体を含む)の残留活性を、アビセル(Avicel)アッセイを用いて決定した。25μLのアリコートの4重複製を、PCR装置内の96ウェルPCRプレートで、66℃で1時間インキュベーションした。インキュベーション後、GH61Aポリペプチドの残留固有活性を、後述のように決定した(セクションVIII参照)。野生型酵素の相対的残留活性に対する変異体の相対的残留活性は、インキュベーション後の平均固有活性と、インキュベーション前の平均固有活性とを比較することによって決定された。
【0344】
B.SYPRO(登録商標)オレンジ及びRT−PCR装置を用いたタンパク質温度シフトアッセイ(「Tm」とも呼ばれる)
GH61Aポリペプチド(野生型及び変異体を含む)のアンフォールディングを下記のように測定した。25μLのGH61A野生型及び変異体タンパク質サンプル(EndoH処理なし)及び8μL(50mMのNaAC(pH 5.0)で1000倍に希釈)のSYPRO(登録商標)オレンジを、96ウェルHard Shell Plate(HSP9645 BioRad)内で混合した。このサンプルを、BioRad CFXを接続したRT−PCR装置でインキュベーションした。サンプルを30℃で1分間インキュベーションした後、5秒ごとに0.2℃刻みで、30℃から90℃までの勾配にした。5秒ごとに蛍光データを収集し、BioRad CFXマネージャーソフトウェアを使ってデータを解析した。各GH61A変異体について明らかな融点Tmを測定し、上述の方法に従って、野生型GH61Aの平均(中央値)Tmと比較した。Tmに見られる改善の度合が記録された。
【0345】
VI.全加水分解物希釈酸前処理トウモロコシ茎葉(whPCS)加水分解アッセイ
トウモロコシ茎葉は、記述に従い2% w/wのH
2SO
4で前処理し(Schell et al.、J.Appl.Biochem.Biotechnol.、105:69〜86、2003を参照)、3M水酸化アンモニウムでpHを5.0に調節し、保存のために最終濃度0.01%のアジ化ナトリウムを加えた。次に、酢酸ナトリウム緩衝液(pH 5.0)を加えて、固形物の最終濃度を10%とした。反応混合物のセルロース濃度は約3%であった。このセルロース懸濁液70μLを、96ウェルマイクロタイタープレート(Corning平底非結合PS)の各ウェルに加えた。2つの異なる方法を用いて、whPCSに対する性能を測定した:A)47μLの2g/L酵素バックグラウンド混合物をwhPCSに加えた。この酵素混合物は、CBH:BG:EG酵素をそれぞれ約8:1:1の比で提供した。次に、野生型GH61A又はGH61A変異体のいずれかを発現するH.ジェコリーナ(H.jecorina)細胞由来の22、11、5及び3μLの100μg/mL精製上清を、whPCS/バックグラウンド酵素混合物に加えた。体積を補う分の酢酸ナトリウム緩衝液を加えて、合計体積の差をなくした。B)25μLの0.225g/L酵素バックグラウンド混合物をwhPCSに加えた。この酵素バックグラウンド混合物は、CBH:BG:EG酵素をそれぞれ約4:1.5:1の比で提供し、またアクセサリーキシラナーゼ及びヘミセルラーゼ酵素を提供した(この混合物中、約5%及び20%の酵素に相当)。次に、野生型GH61A又はGH61A変異体のいずれかを発現するH.ジェコリーナ(H.jecorina)細胞由来の25μLの50μg/mL精製上清を、whPCS/バックグラウンド酵素混合物に加えた。体積を補う分の酢酸ナトリウム緩衝液を加えて、合計体積の差をなくした。
【0346】
密封後、プレートを50℃のサーモスタット付きインキュベーターに入れ、900rpmで連続振盪した。72時間後、プレートを氷上に5分間置き、100μLの100mMグリシン緩衝液(pH 10)を各ウェルに添加することによって加水分解反応を止めた。プレートを密封し、室温で3,000rpmの遠心分離に2分間かけた。上清中のグルコース遊離加水分解反応生成物は、ヘキソキナーゼ及び/又はHPLCグルコース濃度決定方法により解析した。野生型GH61A酵素について用量反応曲線を生成した。性能指数(PI)を計算するため、変異体GH61Aにより生成された(平均)合計の糖を、同じ用量での野生型GH61A(例えば参照酵素)により生成された(平均)合計の糖で割った。
【0347】
VII.希釈アンモニア前処理トウモロコシ茎葉(daCS)加水分解アッセイ
トウモロコシ茎葉を磨砕して0.9mmのスクリーンに通してから、PCT国際特許公開第06110901号、又は米国特許出願公開第20070031918号、同第20070031919号、同第2007−0031953号、又は同第20070037259号の記述に従って希釈アンモニアで前処理し、1M H
2SO
4でpHを5.0に調節し、保存のために最終濃度0.01%のアジ化ナトリウムを加えた。次に、酢酸ナトリウム緩衝液(pH 5.0)を加えて、固形物の最終濃度を10%とした。反応混合物のセルロース濃度は約3%であった。このセルロース懸濁液70μLを、96ウェルマイクロタイタープレート(Corning平底非結合)の各ウェルに加えた。25μLの0.225g/L酵素バックグラウンド混合物をdaCSに加えた。この酵素バックグラウンド混合物は、CBH:BG:EG酵素を(それぞれ約4:1.5:1の比で)提供し、またアクセサリーキシラナーゼ及びヘミセルラーゼ酵素を提供した(この混合物中、約5%及び20%の酵素に相当)。次に、野生型GH61A又はGH61A変異体のいずれかを発現するH.ジェコリーナ(H.jecorina)細胞由来の25μLの25μg/mL精製上清を、daCS/バックグラウンド酵素混合物に加えた。体積を補う分の酢酸ナトリウム緩衝液を加えて、合計体積の差をなくした。密封後、プレートを50℃のサーモスタット付きインキュベーターに入れ、900rpmで連続振盪した。72時間後、プレートを氷上に5分間置き、100μLの100mMグリシン緩衝液(pH 10)を各ウェルに添加することによって加水分解反応を止めた。プレートを密封し、室温で3,000rpmの遠心分離に2分間かけた。上清中のグルコース遊離加水分解反応生成物は、HPLCグルコース濃度決定方法により解析した。野生型GH61A酵素について用量反応曲線を生成した。性能指数(PI)を計算するため、変異体GH61Aにより生成された(平均)合計の糖を、同じ用量での野生型GH61A(例えば参照酵素)により生成された(平均)合計の糖で割った。
【0348】
VIII.アビセル(Avicel)活性アッセイ
アビセル(Avicel)を50mM酢酸ナトリウム(pH 5.0)で希釈し、3.33%w/v混合液を得た。この懸濁液75μLを、96ウェルマイクロタイタープレート(Corning平底非結合PS)に入れた。次に、15μLの10mMアスコルビン酸、15μLの1mM CuCl
2、及び、FABを発現する(Δeg1、Δeg2、Δeg3、Δeg5、Δeg6、Δgh61a、Δcbh1、Δcbh2、ΔMan1)株に由来する35 μLの714μg/mL培養上清(PCT国際特許公開第2012/125951号を参照)を、アビセル(Avicel)溶液に加えた。次に、10μLの100μg/mL精製GH61A野生型又はGH61A変異体を、アビセル(Avicel)/FAB混合物に加えた。各野生型及び変異体を、4重複製でアッセイを行った。マイクロタイタープレートを密封し、50℃のサーモスタット付きインキュベーターで、900rpmで連続振盪しながらインキュベーションした。20時間後、100μLの100mMグリシン緩衝液(pH 10)を各ウェルに添加することによって加水分解反応を止めた。プレートを密封し、室温で3,000rpmの遠心分離に2分間かけた。上清中の加水分解反応生成物(上記I.BのGH61A活性アッセイ混合物とも呼ばれる)を、ABTSアッセイ(上記I.B参照)で解析した。野生型GH61Aについて用量反応曲線を生成した。性能指数(PI)を計算するため、変異体GH61Aにより生成された(平均)合計の糖を、同じ用量での野生型GH61A(例えば参照酵素)により生成された(平均)合計の糖で割った。
【0349】
(実施例2)
I.ヒポクレア ジェコリーナ(Hypocrea jecorina)GH61A部位評価ライブラリ(「SEL」)の生成
H.ジェコリーナ(H.jecorina)GH61A酵素をエンコーディングする配列(配列番号1)が、pTTTpyr2ベクターにクローニングされ、pTTTpyr2−GH61Aプラスミドを生成した(pTTTpyr2ベクターは、PCT国際特許公開第2011/063308号(参照により本明細書に援用される)に記述されているpTTTpyrGベクターに類似であるが、ただしpyrG遺伝子がpyr2遺伝子に置換されている)。完全長GH61A酵素のアミノ酸配列を配列番号2に示す。pTTTpyr2−GH61Aプラスミド又はPTTTpyrGを使って、部位評価ライブラリ(SEL)をGH61A成熟酵素(配列番号3)の部位すべて(配列番号3のアミノ酸位置236〜286及びアミノ酸残基314を除く)について生成した。野生型GH61A酵素は、同一アミノ酸が、ある部位(例えばH1H、G2Gなど)でエンコードされた場所で産生された。
【0350】
下記の配列番号1は、参照H.ジェコリーナ(H.jecorina)GH61AをコーディングするDNA配列を示す:
ATGATCCAGAAGCTTTCCAACCTCCTTGTCACCGCACTGGCGGTGGCTACTGGCGTTGTCGGACATGGACATATTAATGACATTGTCATCAACGGGGTGTGGTATCAGGCCTATGATCCTACAACGTTTCCATACGAGTCAAACCCCCCCATAGTAGTGGGCTGGACGGCTGCCGACCTTGACAACGGCTTCGTTTCACCCGACGCATACCAAAACCCTGACATCATCTGCCACAAGAATGCTACGAATGCCAAGGGGCACGCGTCTGTCAAGGCCGGAGACACTATTCTCTTCCAGTGGGTGCCAGTTCCATGGCCGCACCCTGGTCCCATTGTCGACTACCTGGCCAACTGCAATGGTGACTGCGAGACCGTTGACAAGACGACGCTTGAGTTCTTCAAGATCGATGGCGTTGGTCTCCTCAGCGGCGGGGATCCGGGCACCTGGGCCTCAGACGTGCTGATCTCCAACAACAACACCTGGGTCGTCAAGATCCCCGACAATCTTGCGCCAGGCAATTACGTGCTCCGCCACGAGATCATCGCGTTACACAGCGCCGGGCAGGCAAACGGCGCTCAGAACTACCCCCAGTGCTTCAACATTGCCGTCTCAGGCTCGGGTTCTCTGCAGCCCAGCGGCGTTCTAGGGACCGACCTCTATCACGCGACGGACCCTGGTGTTCTCATCAACATCTACACCAGCCCGCTCAACTACATCATCCCTGGACCTACCGTGGTATCAGGCCTGCCAACGAGTGTTGCCCAGGGGAGCTCCGCCGCGACGGCCACCGCCAGCGCCACTGTTCCTGGAGGCGGTAGCGGCCCGACCAGCAGAACCACGACAACGGCGAGGACGACGCAGGCCTCAAGCAGGCCCAGCTCTACGCCTCCCGCAACCACGTCGGCACCTGCTGGCGGCCCAACCCAGACTCTGTACGGCCAGTGTGGTGGCAGCGGTTACAGCGGGCCTACTCGATGCGCGCCGCCAGCCACTTGCTCTACCTTGAACCCCTACTACGCCCAGTGCCTTAAC
【0351】
下記の配列番号2は、H.ジェコリーナ(H.jecorina)GH61A完全長酵素の配列を示す:
MIQKLSNLLVTALAVATGVVGHGHINDIVINGVWYQAYDPTTFPYESNPPIVVGWTAADLDNGFVSPDAYQNPDIICHKNATNAKGHASVKAGDTILFQWVPVPWPHPGPIVDYLANCNGDCETVDKTTLEFFKIDGVGLLSGGDPGTWASDVLISNNNTWVVKIPDNLAPGNYVLRHEIIALHSAGQANGAQNYPQCFNIAVSGSGSLQPSGVLGTDLYHATDPGVLINIYTSPLNYIIPGPTVVSGLPTSVAQGSSAATATASATVPGGGSGPTSRTTTTARTTQASSRPSSTPPATTSAPAGGPTQTLYGQCGGSGYSGPTRCAPPATCSTLNPYYAQCLN
【0352】
下記の配列番号3は、H.ジェコリーナ(H.jecorina)GH61A成熟酵素の配列を示す:
HGHINDIVINGVWYQAYDPTTFPYESNPPIVVGWTAADLDNGFVSPDAYQNPDIICHKNATNAKGHASVKAGDTILFQWVPVPWPHPGPIVDYLANCNGDCETVDKTTLEFFKIDGVGLLSGGDPGTWASDVLISNNNTWVVKIPDNLAPGNYVLRHEIIALHSAGQANGAQNYPQCFNIAVSGSGSLQPSGVLGTDLYHATDPGVLINIYTSPLNYIIPGPTVVSGLPTSVAQGSSAATATASATVPGGGSGPTSRTTTTARTTQASSRPSSTPPATTSAPAGGPTQTLYGQCGGSGYSGPTRCAPPATCSTLNPYYAQCLN
【0353】
選択された178部位のそれぞれについて、典型的に14〜16の置換変異体が得られた。SEL変異体は、それぞれ示された位置で置換されたGH61A変異体配列をエンコードする、個々に精製されたプラスミドとして受容された。
【0354】
II.GH61A変異体の産生
H.ジェコリーナ(H.jecorina)菌株(Δeg1、Δeg2、Δeg3、Δeg5、Δeg6、Δgh61a、Δcbh1、Δcbh2、Δman1)のプロトプラストが、個別のpTTTpyr2−GH61A又はpTTTpyrG−GH61A SEL構造体で形質転換され(形質転換あたり単一のGH61A変異体)、前述したように、例えばPCT国際特許出願公開第2009/048488号(参照により本明細書に援用される)に従って、アセトアミドを含む選択的寒天培地を用い28℃で7日間成長させた。H.ジェコリーナ(H.jecorina)のプロトプラストを生成させ、採取し、アセトアミド寒天で再び培養し、28℃で7日間インキュベーションした。胞子を15%グリセロール中に採取し、−20℃で保存した。GH61A変異体産生のため、体積10μLの胞子懸濁液を、PVDFフィルタープレート内で、2%グルコース/ソホロース混合物を添加した200μLのグリシン最少培地に加えた。各GH61A変異体を4重複製で成長させた。プレートを酸素透過性膜で密封後、プレートを28℃で6日間、220rpmで振盪しながらインキュベーションした。低圧で培地をマイクロタイタープレートに移すことにより、上清を採取した。残留グルコースは、実施例1、セクションI.Aに記述されているヘキソキナーゼアッセイを用いて測定された。
【0355】
(実施例3)
GH61A変異体の発現、活性及び性能
H.ジェコリーナ(H.jecorina)GH61A SEL変異体酵素が、所望のさまざまな特性に関して試験された。特に、GH61A変異体は、実施例1、セクションIV.A又はBに示すタンパク質発現、実施例1、セクションV.B(Tm)に示す熱安定性、実施例1、セクションVI.Aに示すwhPCSの加水分解が、残留グルコース測定のためのヘキソキナーゼアッセイ(whPCS HK)を用いて、及び、実施例1、セクションVI.Bに示すwhPCSの加水分解が、グルコース濃度決定のためのHPLCアッセイ(whPCS HPLC)を用いて、試験された。
【0356】
試験されたGH61A変異体それぞれについての性能指数(PI)が、上記の両方のwhPCSアッセイについて決定され、上記で、特定レベルのタンパク質産生が決定された。PIは、試験したGH61A変異体の性能の、参照GH61Aとの比である(すなわち、その部位に野生型アミノ酸を有するGH61A)。0.05以下のPIは、一般に0.05に固定された。ただし、HPLCタンパク質発現値が0.0であった場合は、0.04に固定された。野生型残基を備えたGH61A酵素のPI値は、1.00に設定された。Tmの改善は、変異体のTm測定値を、野生型の親GH61Aの平均Tm測定値と比較することにより示した。
【0357】
下記は、少なくとも1つのアッセイで、野生型GH61Aに比べて改善された特性を有するGH61A置換変異体のリストである(例えば、WhPCS HPLC又はWhPCS HKについてPI>1.0、又はTmが上昇)。GH61A変異体は、下記のSELコホートに分類される。
【0358】
SELコホート1−whPCS(HPLC)において、改善されたPIを有するGH61A変異体:G2C、G2F、G2I、G2N、G2R、G2S、G2T、G2Y、H3F、H3P、H3Q、I4K、N5H、N5I、D6C、D6F、D6H、D6I、D6P、D6R、D6S、D6V、V8M、N10H、A16D、A16E、A16I、A16N、A16V、A16Y、Y17M、Y17S、Y17V、D18L、F22A、F22C、F22E、F22N、P23C、P23E、P23Q、P23S、P23T、P23V、P23W、P23Y、Y24C、Y24N、E25C、E25D、E25V、P28C、P28D、P28E、P28F、P28Q、V32F、V32W、A36C、A36P、A37H、A37N、A37Y、D38H、D38Q、N41K、D47F、D47I、D47V、A48D、A48R、Y49S、Q50G、Q50N、D53A、D53C、D53L、D53Q、D53R、D53S、D53T、D53V、D53W、D53Y、H57F、H57I、H57K、H57N、H57P、H57Q、H57S、H57T、H57V、H57W、H57Y、A60C、A60E、A60F、A60L、A60Q、A60W、T61A、T61D、T61E、T61G、T61M、T61N、T61W、T61Y、N62A、N62C、N62D、N62F、N62S、N62T、A63D、A63G、A63H、A63R、K64C、K64D、K64G、K64M、K64P、K64S、K64T、G65D、G65F、G65H、G65K、G65L、G65T、G65W、H66C、H66I、H66N、H66Q、H66S、H66V、H66W、A67F、A67G、S68A、K70D、T74V、V80F、P83N、W84F、W84I、W84K、W84Q、W84R、W84S、W84T、W84V、P85A、P85D、P85L、P85M、P85Q、P85S、P85V、P85W、G88P、D92Q、N96I、C97D、C97E、N98Q、G99H、V104A、V104C、V104D、V104E、V104F、V104G、V104H、V104I、V104K、V104L、V104M、V104N、V104P、V104Q、D105Y、K106A、K106C、K106D、K106E、K106F、K106G、K106H、K106L、K106M、K106N、K106Q、K106R、K106Y、T107A、T107C、T107D、T107E、T107F、T107G、T107H、T107I、T107K、T107L、T107M、T107N、T107P、T107Q、T107R、T108A、T108C、T108D、T108E、T108F、T108G、T108H、T108I、T108K、T108L、E110D、G116K、G116M、L119C、L119D、L119E、L119F、L119G、L119N、L119Q、L119W、L120A、L120C、L120D、L120E、L120F、L120G、L120I、S121C、S121D、S121E、S121F、S121G、S121L、S121P、S121Q、G122A、G122C、G122E、G122F、G122L、G122P、G122Y、L133H、V141I、V141P、V142D、V142W、V142Y、K143A、K143D、K143H、P145G、D146K、D146Q、D146Y、N147F、Y153K、V154A、V154C、V154D、V154E、V154G、V154H、V154M、V154P、V154Q、V154T、R156A、R156C、R156D、R156E、R156F、R156H、R156I、R156K、R156L、R156M、R156P、R156Q、E158A、E158C、E158D、E158F、E158H、E158I、E158M、E158N、E158P、E158Q、E158T、H163A、H163C、H163C、H163D、H163D、H163E、H163F、H163F、H163G、H163I、H163K、H163M、H163P、H163T、H163W、S164F、S164H、G166P、A168C、Q172G、Q172I、Q172M、Y174E、Y174H、Y174I、Y174K、Y174L、
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【0359】
コホート2−whPCS(HK)において改善されたPIを有するGH61A変異体:H1D、H1K、G2C、G2D、G2F、G2I、G2L、G2M、G2N、G2Q、G2R、G2S、G2T、G2Y、H3F、H3I、H3K、H3L、H3P、H3Q、H3V、I4D、I4F、I4K、I4M、I4N、I4Q、N5C、N5D、N5F、N5H、N5I、N5K、N5M、N5P、N5R、N5S、N5T、N5V、D6C、D6F、D6G、D6H、D6I、D6K、D6L、D6M、D6P、D6Q、D6S、D6T、D6V、D6Y、V8I、V8L、N10H、N10M、G11D、G11W、V12I、W13A、W13D、W13E、W13H、W13K、W13L、W13P、Y14F、Y14M、Y14Q、Q15H、Q15R、Q15Y、A16C、A16D、A16I、A16M、A16N、A16Q、A16S、A16T、Y17G、Y17H、Y17I、Y17L、Y17M、Y17N、Y17P、Y17R、Y17S、Y17V、D18A、D18C、D18F、D18I、D18K、D18L、D18M、D18N、D18R、D18Y、P19E、P19H、P19W、T20F、T20G、T20L、T21C、T21F、T21H、T21I、T21K、T21L、T21N、T21Q、T21Y、F22A、F22C、F22D、F22E、F22I、P23C、P23D、E25C、E25D、P28A、P28C、P28D、P28F、P28G、P28K、P28W、I30K、V32A、V32C、V32D、V32L、V32W、G33D、W34A、W34D、W34H、W34K、W34N、T35D、T35G、T35K、A37I、A37R、D38A、D40I、N41H、G42C、G42K、F43A、F43D、F43Y、D47C、D47F、D47V、A48D、A48R、A48T、Y49D、Y49G、Y49P、Q50S、I55G、I55M、I55Y、K58A、K58D、K58E、K58F、K58R、K58V、K58W、N59F、N59K、N59P、N59V、A60C、A60D、A60L、A60Q、T61D、T61E、T61G、T61M、N62A、N62C、N62D、N62F、N62L、A63C、A63D、A63E、A63F、A63G、A63H、A63I、A63L、A63M、A63R、K64A、K64G、K64I、K64M、G65D、G65H、G65K、G65M、G65Y、H66M、H66N、H66S、A67H、S68A、S68D、S68H、S68N、S68V、V69D、V69E、V69G、V69W、K70A、K70C、K70D、K70E、K70I、K70L、K70M、K70N、K70Q、K70T、K70W、A71E、G72A、G72D、G72E、G72F、G72H、G72I、G72L、G72M、G72N、G72P、G72Q、G72T、G72W、D73A、D73C、D73H、D73L、D73Q、D73T、D73Y、I75K、L76A、L76C、L76C、L76D、L76E、L76E、L76F、L76F、L76G、L76H、L76I、L76N、F77A、F77E、F77H、Q78D、Q78F、Q78H、W79E、P83N、H86D、H86N、G88C、G88N、G88R、P89D、D92A、D92C、D92F、D92T、N96C、N96I、N96K、C97A、C97D、C97E、C97G、C97H、C97I、C97K、C97L、C97M、N98A、N98C、N98D、N98E、N98G、N98I、N98K、N98L、N98P、N98Q、N98S、G99A、G99C、G99D、G99E、G99H、G99I、G99K、G99L、G99N、D100A、D100F、D100G、D100N、D100P、D100Q、D100S、D100W、C101A、C101F、C101W、E102A、E102H、E102K、E102L、E102N、E102P、E102S、V104A、V104C、V104E、V104G、V104H、V104I、V104K、V104L、V104N、D105A、D105C、D105E、D105G、D105H、D105I、D105K、D105L、D105M、D105N、D105Q、D105S、D105W、D105Y、K106C、K106D、K106E、K106F、K106G、K106R、K106Y、T107A、T107C、T107F、T107H、T107I、T107L、T107N、T108A、T108C、T108E、T108K、E110F、E110H、E110I、E110L、E110P、F112R、F112W、K113H、K113P、K113Q、I114Q、G116E、G116I、G116K、G116L、G116M、L119C、L119D、L119H、L119K、L119M、L119P、L119Q、L119Q、L119W、L120C、L120E、L120F、L120H、L120I、L120K、L120P、L120Q、L120R、L120T、L120W、S121A、S121D、S121E、S121F、S121Q、S121Q、S121R、G122C、G123H、W128S、A129H、A129N、A129R、A129V、A129W、S130C、S130E、S130F、S130M、S130R、V132D、L133Y、S135F、S135H、N136A、N136E、N136Q、N136R、N137C、T139A、T139G、T139V、W140A、W140H、V141G、V141N、V142F、V142H、V142L、K143A、K143F、K143Q、K143V、I144K、I144M、I144R、I144S、P145G、P145H、P145I、P145K、P145R、P145S、P145V、D146A、D146C、D146E、D146F、D146K、D146M、D146T、N147F、N147M、L148K、L148V、A149C、A149D、A149F、A149G、A149I、A149N、A149V、P150A、P150C、P150D、P150E、P150F、P150G、P150H、P150I、
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【0360】
コホート3−改善されたTmを有するGH61A変異体:H1G、H1P、H1T、G2A、G2E、G2I、G2P、G2Q、G2V、G2W、H3C、H3D、H3E、H3K、H3N、H3R、H3S、H3T、I4A、I4C、I4G、I4P、I4T、I4T、I4V、I4V、I4Y、N5C、N5D、D6G、D6V、D6W、D6Y、I7L、I9C、I9I、I9V、N10L、N10N、N10Q、N10S、N10V、V12F、V12I、V12M、V12T、W13C、W13I、W13K、W13V、Y14R、A16N、P19I、T20I、T20L、T20M、T21D、T21I、T21K、F22L、F22R、P23G、P23R、Y24K、E25D、E25K、E25N、S26A、S26D、S26E、S26I、S26K、S26L、S26M、S26N、S26P、S26Q、S26R、S26T、N27E、N27L、P28L、P29A、P29C、P29D、P29E、P29F、P29G、P29I、P29K、P29L、P29M、P29N、P29Q、P29R、P29S、P29T、P29V、P29W、P29Y、V32P、T35M、A36D、A36E、A36F、A36G、A36N、A36Y、A37D、A37L、A37W、D38N、D38P、L39F、L39I、L39V、L39Y、D40G、D40I、N41D、N41E、N41F、N41Q、N41T、N41V、F43Y、V44K、V44N、V44Q、V44Y、S45H、S45R、S45Y、P46H、P46I、P46M、P46Q、D47N、D47P、D47R、A48H、A48R、Y49Y、Q50T、N51C、N51E、N51F、N51G、N51H、N51K、N51L、N51M、N51Q、N51R、N51S、N51T、N51Y、P52N、D53H、D53V、I54E、I54Q、I55I、I55M、I55V、C56G、C56R、K58M、K58V、N59E、N59Q、N59S、A60H、A60L、A60N、A60R、T61A、T61Q、T61S、N62C、N62I、N62K、N62P、N62S、A63C、A63K、K64L、K64Q、H66W、S68F、S68G、S68L、S68Q、S68T、S68Y、K70H、K70I、K70N、K70Q、K70R、K70S、K70T、K70V、K70Y、A71Y、G72A、G72K、D73A、D73E、D73N、D73Q、D73S、F77P、Q78H、Q78L、Q78M、W79A、W79D、V80I、V80K、V82I、V82L、V82Y、P83Y、W84D、P85K、P85R、P85T、H86Y、P87E、G88D、G88N、P89A、P89C、I90V、V91G、V91L、V91P、V91R、V91T、D92G、D92H、D92M、D92P、D92V、Y93D、Y93H、Y93N、Y93P、Y93S、L94T、A95W、N96A、N98H、N98P、N98W、G99E、G99Y、
D100F、D100I、D100L、D100N、D100P、D100Q、D100Y、C101M、E102E、T103A、T103C、T103D、T103F、T103M、T103N、T103Q、T103S、T103V、T103Y、D105H、D105I、D105V、K106I、K106R、K106V、L109Q、L109T、L109V、E110E、E110K、E110M、E110Q、E110R、E110Y、F111A、F112F、K113L、K113T、D115C、D115E、D115I、D115L、V117R、L119N、L120P、L120R、L120V、S121Y、G123A、G123P、G123Q、G123S、G123T、D124N、D124Q、D124S、D124W、G126M、G126Q、G126Y、T127F、T127I、T127K、T127L、T127M、T127N、T127R、T127V、T127W、T127Y、W128H、W128L、W128Q、A129C、A129E、A129F、A129N、A129S、A129V、S130C、S130E、S130H、S130I、S130L、S130N、S130P、S130Q、S130T、D131K、D131R、I134K、I134M、I134V、S135A、S135E、S135H、S135M、N137I、N137P、N138S、T139M、T139N、T139Q、T139V、W140C、W140F、V142I、V142T、V142Y、K143C、K143M、K143W、I144G、I144V、D146F、L148P、A149P、G151Q、G151V、N152F、N152F、N152G、N152Q、N152S、N152Y、V154V、L155L、L155M、R156S、H157H、H157W、E158W、E158Y、I159Q、I160D、I160F、A161E、A161L、A161Y、L162A、L162F、H163L、H163Q、H163R、H163Y、S164A、S164H、S164K、S164L、S164M、S164N、S164Q、S164R、S164V、S164W、S164Y、A165M、A165N、A165P、A165Y、G166A、G166F、G166H、G166K、G166L、G166M、G166N、G166Q、G166R、G166S、G166T、G166V、G166W、Q167A、Q167F、Q167I、Q167K、Q167L、Q167M、Q167N、Q167R、Q167S、Q167V、Q167W、Q167Y、A168E、A168F、A168H、A168I、A168K、A168L、A168M、A168N、A168P、A168Q、A168R、A168S、A168T、A168V、A168Y、N169N、G170P、A171H、Q172H、N173N、P175F、P175H、Q176C、Q176Q、C177S、C177V、N179C、N179M、I180L、I180M、I180T、A181E、A181H、A181K、A181L、A181N、A181R、A181S、V182G、V182N、V182R、V182T、V182Y、S183A、S183D、S183E、S183H、S183I、S183K、S183N、S183P、S183R、S183T、S183V、S183Y、G184H、G184N、G184R、S185D、S185F、S185G、S185H、S185I、S185K、S185L、S185N、S185P、S185Q、S185T、S185V、G186L、G186P、S187A、S187D、S187E、S187H、S187K、S187L、S187M、S187N、S187Q、S187R、S187T、S187V、S187W、L188M、Q189D、Q189E、Q189R、P190R、S191M、S191P、S191Q、G192S、G192Y、V193F、L194D、L194M、L194Q、G195I、G195K、G195L、G195N、G195R、G195S、G195V、T196L、T196N、T196Q、T196V、D197I、D197L、D197M、D197P、D197Q、D197T、D197V、L198M、L198Y、H200C、H200I、H200R、A201G、A201Q、T202A、T202E、T202H、T202Q、T202S、D203K、D203M、G205H、V206I、V206T、L207F、L207M、L207W、L207Y、I208V、N209D、Y211G、T212L、S213K、S213R、S213T、S213W、S213Y、N216D、N216I、N216K、N216M、N216Q、N216T、Y217D、Y217G、
Y217H、Y217M、Y217Q、Y217T、I218Q、I218T、I218V、I219M、I219T、T223Q、T223S、S226D、S226L、S226M、S226N、S226P、S226Q、T230W、S231W、S231Y、A233F、A233Q、A233R、A233S、G235L、T287A、T287C、T287F、T287G、T287H、T287I、T287S、Q288A、Q288C、Q288D、Q288E、Q288F、Q288G、Q288I、Q288K、Q288L、Q288M、Q288N、Q288R、Q288S、Q288T、Q288V、Q288W、Q288Y、T289A、T289C、T289D、T289F、T289I、T289K、T289L、T289M、T289N、T289R、T289S、T289V、T289Y、L290A、L290I、L290K、L290M、L290S、L290T、Y291A、Y291C、Y291H、Y291I、Y291M、Y291N、Y291P、Y291S、Y291T、Y291V、Y291W、G292L、G292M、G292P、G292S、G292T、G292W、Q293T、Q293W、Q293Y、G295E、G296A、G296C、G296F、G296I、G296L、G296M、G296P、G296R、G296S、G296T、G296V、G296Y、S297W、G298I、G298P、Y299C、Y299E、Y299F、Y299G、Y299H、Y299I、Y299K、Y299L、Y299N、Y299P、Y299S、S300C、S300E、S300F、S300L、S300Q、S300Q、S300T、G301A、G301D、G301K、G301M、G301P、G301T、G301V、G301Y、P302M、P302R、P302T、P302Y、T303A、T303G、T303H、T303I、T303K、T303M、T303N、T303P、T303Q、T303R、T303S、T303V、T303Y、R304A、R304C、R304D、R304E、R304G、R304H、R304I、R304L、R304M、R304N、R304Q、R304S、R304T、R304V、R304Y、C305E、C305L、C305M、C305N、C305P、C305Q、C305R、C305S、C305T、C305V、C305W、C305Y、A306D、A306E、A306F、A306G、A306H、A306I、A306K、A306L、A306M、A306N、A306P、A306Q、A306R、A306S、A306T、A306V、A306W、A306Y、P307A、P307C、P307F、P307G、P307H、P307L、P307M、P307N、P307Q、P307R、P307S、P307T、P307V、P307Y、P308C、P308D、P308G、P308H、P308K、P308L、P308M、P308Q、P308R、P308S、P308T、P308V、P308W、P308Y、A309L、A309P、A309S、A309V、T310F、T310I、T310L、T310M、T310P、T310R、T310S、T310V、T310W、T310Y、S312C、S312F、S312I、S312L、S312M、S312N、S312P、S312Q、S312R、S312T、S312V、S312W、S312Y、T313F、T313M、T313P、T313T、T313V、T313W、T313Y、N315M、N315S、P316A、P316C、P316D、P316F、P316H、P316I、P316L、P316N、P316Q、P316R、P316S、P316T、P316V、P316W、Y317A、Y317E、Y317P、Y317Q、Y317S、Y317T、Y318Q、Y318T、A319D、A319E、A319F、A319I、A319L、A319M、A319Q、A319R、A319S、A319T、A319V、A319W、Q320A、Q320C、Q320H、Q320I、Q320L、Q320M、Q320P、Q320R、Q320S、Q320T、Q320Y、C321E、C321L、C321M、C321P、C321Q、C321V、C321Y、L322S、L322T、L322V、L322W、N323M、N323P、N323S、N323T、及びN323V。
【0361】
コホート1、2又は3のGH61A変異体のいずれか1つが、本発明に利用される。特定のGH61A変異体は、例えば、SELコホート1及び2、SELコホート1及び3、SELコホート2及び3、又はSELコホート1、2及び3に存在するGH61A変異体などのように、複数のSELコホートに存在し、本発明の態様によるGH61A変異体として特に有用である。更に、SELコホート1、2、及び/又は3のGH61A変異体の任意の置換組み合わせを使用して、コンビナトリアルGH61A変異体を生成することができる(すなわち、複数の置換を有するGH61A変異体)。コンビナトリアルGH61A変異体は、下記で詳しく記述される。
【0362】
上記SELコホート1、2及び3のGH61A変異体に加えて、GH61A置換変異体は、野生型GH61Aに比べて改善された特性を有していなくとも、whPCS(HPLC)アッセイ、whPCS(HK)アッセイのいずれか又は両方において、野生型レベルの活性を示すものとして識別される。これらのGH61A変異体を下記に示す。これは本明細書で野生型SELコホートと呼ばれるものを形成する:H1A、H1C、H1E、H1F、H1I、H1L、H1M、H1N、H1Q、H1R、H1S、H1V、H1W、H1Y、G2H、G2K、H3A、H3G、H3M、H3W、H3Y、I4A、I4C、I4D、I4E、I4F、I4G、I4H、I4I、I4K、I4L、I4M、I4N、I4P、I4Q、I4R、I4S、I4W、N5A、N5E、N5G、N5L、N5Q、N5W、N5Y、D6A、D6E、D6N、I7A、I7C、I7D、I7F、I7G、I7H、I7K、I7M、I7N、I7P、I7Q、I7R、I7S、I7T、I7V、I7W、I7Y、V8A、V8C、V8D、V8E、V8F、V8G、V8H、V8K、V8N、V8P、V8Q、V8R、V8S、V8T、V8W、V8Y、I9A、I9D、I9E、I9F、I9G、I9H、I9K、I9L、I9M、I9N、I9P、I9Q、I9R、I9S、I9T、I9W、I9Y、N10A、N10C、N10D、N10E、N10F、N10G、N10I、N10K、N10P、N10R、N10T、N10W、N10Y、G11A、G11C、G11E、G11F、G11H、G11I、G11K、G11L、G11M、G11N、G11P、G11Q、G11R、G11S、G11T、G11V、G11Y、V12A、V12C、V12D、V12E、V12G、V12H、V12K、V12L、V12N、V12P、V12Q、V12R、V12S、V12W、V12Y、W13F、W13G、W13M、W13N、W13Q、W13R、W13S、W13T、W13Y、Y14C、Y14E、Y14G、Y14H、Y14I、Y14K、Y14L、Y14N、Y14P、Y14S、Y14T、Y14V、Y14W、Q15A、Q15C、Q15D、Q15E、Q15F、Q15G、Q15I、Q15K、Q15L、Q15M、Q15N、Q15P、Q15S、Q15T、Q15V、Q15W、A16F、A16G、A16H、A16K、A16L、A16P、A16R、A16W、Y17A、Y17C、Y17D、Y17E、Y17F、Y17K、Y17Q、Y17T、Y17W、D18E、D18G、D18H、D18P、D18Q、D18S、D18T、D18V、D18W、P19A、P19C、P19D、P19F、P19G、P19K、P19L、P19M、P19N、P19Q、P19R、P19S、P19T、P19V、P19Y、T20A、T20C、T20D、T20E、T20H、T20K、T20N、T20P、T20R、T20S、T20V、T20W、T20Y、T21A、T21E、T21G、T21M、T21P、T21R、T21S、T21V、T21W、F22G、F22H、F22K、F22M、F22P、F22Q、F22S、F22T、F22V、F22W、F22Y、P23A、P23F、P23H、P23I、P23K、P23L、P23M、P23N、P23T、Y24D、Y24E、Y24F、Y24G、Y24H、Y24I、Y24L、Y24M、Y24P、Y24Q、Y24R、Y24S、Y24T、Y24V、Y24W、E25A、E25F、E25G、E25H、E25I、E25L、E25M、E25P、E25Q、E25R、E25S、E25T、E25W、E25Y、S26C、S26F、S26G、S26H、S26V、S26W、S26Y、N27A、N27C、N27D、N27F、N27G、N27H、N27I、N27K、N27M、N27P、N27Q、N27R、N27S、N27T、N27V、N27W、N27Y、P28H、P28I、P28M、P28N、P28R、P28S、P28T、P28V、P28Y、P29H、I30A、I30C、I30D、I30E、I30F、I30G、I30H、I30L、I30M、I30N、I30P、I30Q、I30R、I30S、I30T、I30V、I30W、I30Y、V31A、V31C、V31D、V31E、V31F、V31G、V31H、V31I、V31K、V31L、V31M、V31N、V31P、V31Q、V31R、V31S、V31T、V31W、V31Y、V32E、V32G、
V32H、V32I、V32K、V32M、V32N、V32Q、V32R、V32S、V32T、V32V、V32Y、G33A、G33C、G33E、G33F、G33H、G33I、G33K、G33L、G33M、G33N、G33P、G33Q、G33R、G33S、G33T、G33V、G33W、G33Y、W34C、W34E、W34F、W34G、W34I、W34L、W34M、W34P、W34Q、W34R、W34S、W34T、W34V、W34Y、T35A、T35C、T35E、T35F、T35H、T35I、T35L、T35N、T35P、T35Q、T35R、T35S、T35V、T35W、T35Y、A36H、A36I、A36K、A36L、A36M、A36Q、A36R、A36S、A36T、A36V、A37A、A37C、A37E、A37F、A37G、A37K、A37M、A37P、A37Q、A37S、A37T、A37V、D38C、D38E、D38F、D38G、D38I、D38K、D38L、D38M、D38R、D38S、D38T、D38V、D38W、D38Y、L39A、L39C、L39D、L39E、L39G、L39H、L39K、L39M、L39N、L39P、L39Q、L39R、L39S、L39T、L39W、D40A、D40C、D40E、D40F、D40H、D40K、D40L、D40M、D40N、D40P、D40Q、D40R、D40S、D40T、D40V、D40W、D40Y、N41A、N41C、N41G、N41I、N41L、N41M、N41P、N41R、N41S、N41W、N41Y、G42A、G42D、G42E、G42F、G42H、G42I、G42L、G42M、G42N、G42P、G42Q、G42R、G42S、G42T、G42V、G42W、G42Y、F43C、F43E、F43G、F43H、F43I、F43K、F43L、F43M、F43N、F43P、F43Q、F43R、F43S、F43T、F43V、F43W、V44A、V44C、V44D、V44E、V44F、V44G、V44H、V44I、V44L、V44M、V44P、V44R、V44S、V44T、V44W、S45A、S45C、S45D、S45E、S45F、S45G、S45I、S45K、S45L、S45M、S45N、S45P、S45Q、S45T、S45V、S45W、P46A、P46C、P46D、P46E、P46F、P46G、P46K、P46L、P46N、P46R、P46S、P46T、P46V、P46W、P46Y、D47A、D47E、D47G、D47H、D47K、D47L、D47M、D47Q、D47S、D47T、D47W、D47Y、A48C、A48E、A48F、A48G、A48I、A48K、A48L、A48M、A48N、A48P、A48Q、A48S、A48V、A48W、A48Y、Y49A、Y49C、Y49E、Y49F、Y49H、Y49I、Y49K、Y49L、Y49M、Y49N、Y49Q、Y49R、Y49T、Y49V、Y49W、Q50A、Q50C、Q50D、Q50E、Q50F、Q50H、Q50I、Q50K、Q50L、Q50M、Q50P、Q50R、Q50V、Q50W、Q50Y、N51A、N51D、N51I、N51P、N51V、N51W、P52A、P52C、P52D、P52E、P52F、P52G、P52H、P52I、P52K、P52L、P52M、P52Q、P52R、P52S、P52T、P52V、P52W、P52Y、D53I、D53P、I54A、I54C、I54D、I54F、I54G、I54H、I54K、I54L、I54M、I54N、I54P、I54R、I54S、I54T、I54V、I54W、I54Y、I55A、I55C、I55D、I55E、I55F、I55H、I55K、I55L、I55N、I55P、I55Q、I55R、I55S、I55T、I55W、C56A、C56D、C56E、C56F、C56H、C56I、C56K、C56L、C56M、C56N、C56P、C56Q、C56S、C56T、C56V、C56W、C56Y、H57A、H57C、H57D、H57G、H57L、H57M、H57R、K58C、K58G、K58H、K58I、K58L、K58N、K58P、K58Q、K58S、K58T、K58Y、N59A、N59C、N59D、N59G、N59H、N59I、N59L、N59M、N59R、N59T、N59W、N59Y、A60G、A60I、A60K、A60M、A60P、A60S、A60T、A60V、A60Y、T61C、T61F、T61H、T61I、T61K、T61L、T61P、T61R、T61V、N62E、N62G、N62H、N62M、
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L228M、L228P、L228Q、L228R、L228S、L228V、L228W、L228Y、P229A、P229D、P229E、P229F、P229G、P229H、P229K、P229L、P229M、P229N、P229Q、P229R、P229S、P229V、P229W、P229Y、T230C、T230E、T230F、T230G、T230H、T230I、T230K、T230L、T230M、T230N、T230P、T230Q、T230R、T230S、T230Y、S231E、S231F、S231I、S231P、S231Q、S231T、S231V、V232A、V232D、V232E、V232F、V232G、V232K、V232M、V232N、V232P、V232R、V232S、V232T、V232Y、A233H、A233I、A233K、A233L、A233M、A233N、A233N、A233P、A233T、A233V、A233Y、Q234A、Q234C、Q234D、Q234E、Q234F、Q234G、Q234H、Q234I、Q234K、Q234L、Q234M、Q234N、Q234P、Q234R、Q234S、Q234T、Q234V、Q234W、Q234Y、G235C、G235I、G235M、G235Q、G235R、G235V、G235W、T287D、T287N、T287W、T287Y、Q288H、Q288P、T289E、T289G、T289H、T289P、T289Q、T289W、L290E、L290G、L290Q、L290R、L290W、L290Y、Y291D、Y291E、Y291F、Y291G、Y291K、Y291L、Y291Q、Y291R、G292A、G292C、G292D、G292E、G292F、G292H、G292K、G292N、G292Q、G292R、G292V、G292Y、Q293A、Q293D、Q293E、Q293F、Q293H、Q293I、Q293K、Q293L、Q293N、Q293P、Q293R、Q293S、Q293V、C294D、C294E、C294F、C294G、C294H、C294I、C294K、C294M、C294N、C294P、C294Q、C294S、C294T、C294V、C294W、C294Y、G295F、G295L、G295P、G295Q、G295R、G296D、G296E、G296H、G296N、G296Q、G296W、S297A、S297V、G298K、G298M、G298N、G298Q、G298R、G298T、G298V、Y299D、Y299M、Y299Q、Y299R、Y299T、Y299V、Y299W、S300A、S300D、S300G、S300I、S300M、S300N、S300P、S300R、S300W、S300Y、G301A、G301C、G301E、G301F、G301H、G301I、G301L、G301N、G301Q、G301R、G301S、G301W、P302A、P302C、P302D、P302E、P302F、P302G、P302H、P302I、P302K、P302L、P302N、P302Q、P302S、P302V、T303C、T303D、T303E、T303F、T303L、T303W、R304F、R304K、R304P、R304R、R304W、C305D、C305F、C305H、C305I、A306C、P307D、P307E、P307K、P307W、P308A、P308E、P308F、P308I、P308N、A309A、A309C、A309D、A309E、A309F、A309G、A309H、A309I、A309K、A309M、A309N、A309Q、A309R、A309T、A309W、A309Y、T310A、T310C、T310D、T310E、T310G、T310H、T310K、T310N、T310Q、C311A、C311D、C311F、C311G、C311H、C311I、C311K、C311L、C311M、C311N、C311P、C311Q、C311R、C311S、C311T、C311V、C311W、C311Y、S312A、S312D、S312E、S312G、S312H、S312K、T313A、T313C、T313D、T313E、T313G、T313H、T313I、T313K、T313L、T313S、N315A、N315D、N315E、N315F、N315H、N315K、N315Q、N315R、N315W、N315Y、P316K、P316M、P316Y、Y317C、Y317F、Y317K、Y317L、Y317M、Y317N、Y317R、Y317V、Y317W、Y318A、
Y318C、Y318D、Y318E、Y318F、Y318G、Y318H、Y318I、Y318K、Y318L、Y318M、Y318N、Y318P、Y318R、Y318S、Y318V、Y318W、A319C、A319K、A319P、A319Y、Q320D、Q320E、Q320F、Q320G、Q320K、Q320W、C321A、C321D、C321F、C321K、C321N、C321S、C321T、C321W、L322A、L322C、L322D、L322E、L322G、L322H、L322I、L322K、L322M、L322N、L322P、L322Q、L322Y、N323A、N323C、N323D、N323E、N323F、N323G、N323H、N323I、N323K、N323Q、N323R、N323W、及びN323Y。
【0363】
本発明の特定の実施形態において、この野生型SELコホートの置換のうちの1つ又は組み合わせは、上記のSELコホート1、2及び/又は3に識別されている1つ又は2つ以上の置換を備えたコンビナトリアルGH61A変異体を生成するのに利用される。
【0364】
上述のSELデータを用いて、GH61Aの生産的位置が識別された。生産的位置とは、本明細書において、改善された特性を呈するコンビナトリアル変異体を形成するのに最も有用な、分子内の位置として定義され、この位置自体によって、少なくとも1つの組み合わせ可能な突然変異を可能にする。高度に組み合わせ可能な突然変異とは、本明細書において、コンビナトリアル変異体を形成するのに使用することができる任意のアミノ酸位置での突然変異として定義される。高度に組み合わせ可能な突然変異は、発現、活性又は安定性を顕著に低下させずに、分子の少なくとも1つの望ましい特性を改善する。高度に組み合わせ可能な突然変異は、下記のグループに分けることができる:
グループA:変異体を産生する突然変異であって、(1)(a)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイにおいて、最小性能指数(PI)が、定義された親ポリペプチドに比べて、0.9以上であり、かつ(b)Tm値が、実施例1のセクションV.Bによって測定されたとき、野生型ポリペプチドのTm中央値から2℃以上下回らず、かつ、(2)(a)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイにおいて、最小性能指数PIが、定義された親ポリペプチドに比べて、1.0以上であるか、又は(b)Tm値が、実施例1のセクションV.Bによって測定されたとき、定義されている親ポリペプチドのTm値よりも高い。
【0365】
グループB:変異体を産生する突然変異であって、(1)(a)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイにおいて、最小性能指数(PI)が、定義された親ポリペプチドに比べて、0.8以上であり、かつ(b)Tm値が、実施例1のセクションV.Bによって測定されたとき、野生型ポリペプチドのTm中央値から3℃以上下回らず、かつ、(2)(a)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイにおいて、最小性能指数PIが、定義された親ポリペプチドに比べて、1.2以上でありか、又は(b)Tm値が、実施例1のセクションV.Bによって測定されたとき、定義されている親ポリペプチドのTm値より少なくとも1℃以上高い。
【0366】
グループC:変異体を産生する突然変異であって、(1)(a)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイにおいて、最小性能指数(PI)が、定義された親ポリペプチドに比べて、0.5以上であり、かつ(b)Tm値が、実施例1のセクションV.Bによって測定されたとき、野生型ポリペプチドのTm中央値から4℃以上下回らず、かつ、(2)(a)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイにおいて、最小性能指数PIが、定義された親ポリペプチドに比べて、1.5以上であるか、又は(b)Tm値が、実施例1のセクションV.Bによって測定されたとき、定義されている親ポリペプチドのTm値より少なくとも3℃以上高い。
【0367】
好ましい組み合わせ可能な突然変異は、後述されるように、「生産的位置」にある。本GH61の場合、「活性」はGH61媒介セルラーゼ強化活性を指し、これは本明細書の記述に従って測定することができる。
【0368】
生産的位置は、異なるアミノ酸残基での置換を許容するアミノ酸位置であって、結果として得られる変異体が、前述のように、組み合わせの一連の性能基準に合致するものである。生産的位置は、次のように生産性スコアを割り当てることができる:
・所与の位置での置換の15%未満がグループA、B、又はCに入る位置は、生産性スコア「1」が与えられる。
・所与の位置での置換の40%未満であるが15%以上がグループA、B、又はCに入る位置は、生産性スコア「2」が与えられる。
・所与の位置での置換の75%未満であるが40%以上がグループA、B、又はCに入る位置は、生産性スコア「3」が与えられる。
・所与の位置での置換の75%以上がグループA、B、又はCに入る位置は、生産性スコア「4」が与えられる。
【0369】
好ましい生産的位置は、高度に組み合わせ可能な突然変異である。
【0370】
適合性スコアは、突然変異それぞれが属する組み合わせ可能性の性能基準(すなわち、上に示すA、B、及びC)に基づいて、コンビナトリアル変異体を形成するのに使用される、1つ又は2つ以上の高度に組み合わせ可能な突然変異の能力を指す。適合性スコアが高いほど、コンビナトリアル変異体の形成に使用するのにより好適な突然変異であることを示す。適合性スコアを下記の表2に示す。
【0371】
【表3】
【0372】
表3は、GH61Aポリペプチドの各位置について計算した生産性スコア(4、3、2、1)を示す。各GH61A位置について、それぞれに与えられた適合性スコア(+、++、+++、++++、又は+++++)に基づいて変異体がリストされている。位置番号は、配列番号3に記載されている成熟GH61Aポリペプチドに基づく。下記の表3における、任意の個々のGH61A置換又は任意の組み合わせは、本発明の態様によるGH61A変異体として利用される。
【0373】
【表4-1】
【0374】
【表4-2】
【0375】
【表4-3】
【0376】
【表4-4】
【0377】
(実施例4)
GH61Aコンビナトリアルライブラリ変異体と、高度に組み合わせ可能で生産的な置換の識別
下記の表4は、GH61Aコンビナトリアル変異体ライブラリの構築に含めるための、上記実施例3のSELから選択されたGH61Aの置換リストである。これらの変異体は上記表3に示されているものもあるが、示されていないものもある。表4の置換に基づいて生成されたGH61Aコンビナトリアル変異体ライブラリの各個々のメンバーは、少なくとも2つの異なるアミノ酸置換を有する。表4のアミノ酸残基番号は、野生型GH61Aの成熟アミノ酸配列(すなわち配列番号3)を参照して割り当てられた。コンビナトリアルGH61A変異体ライブラリが構築された。この実施例においてコンビナトリアルライブラリ構築に選択されていない、上記SEL(例えば、コホート1、2、3及び/又は野生型コホートのSEL)におけるGH61A置換は、依然として、本発明の態様による改善された特性を有するコンビナトリアルGH61A変異体において利用される。表4の置換は、所望の改善された特性を有する置換を単に代表するものとして選択されたものである。
【0378】
【表5-1】
【0379】
【表5-2】
【0380】
【表5-3】
【0381】
【表5-4】
【0382】
GH61Aコンビナトリアル変異体をエンコードするポリヌクレオチドは、pTTTpyr2−GH61Aベクターをテンプレートとして使用し、大腸菌に形質転換し、2×TY寒天プレート(16g/LのBactoトリプトン(Difco、USA)、10g/LのBacto酵母抽出物(Difco、USA)、5g/L NaCl、16g/LのBacto寒天(Difco、USA))に、100μg/mLのアンピシリンを添加)で培養した。37℃で一晩培養した後、アンピシリン抵抗性大腸菌コロニーを、100μg/mLアンピシリンを含む2×TY寒天プレートから選び、100μg/mLのアンピシリンと50μg/mLのカナマイシンを加えた1mLの2×TY培地の入ったマイクロタイタープレートで、37℃で24時間成長させた。これらの細菌培養物を、プラスミドDNAの精製に使用した。
【0383】
GH61Aコンビナトリアル変異体をエンコードする精製pTTTpyr2−GH61A誘導プラスミドが、150〜300ng/μLの濃度で使用された。例えば、米国特許出願公開第2006/0094080 A1号に記述されるように、真菌形質転換のために5μLのプラスミドDNAを使用した。H.ジェコリーナ(H.jecorina)菌株(Δeg1、Δeg2、Δeg3、Δeg5、Δeg6、Δgh61a、Δcbh1、Δcbh2、Δman1)のプロトプラストを、個別のpTTTpyr2−GH61A構造体で形質転換し(すなわち、形質転換あたりの単一GH61A変異体を含む)、24ウェルマイクロタイタープレートの、アセトアミドを含む選択的培地で、28℃で7日間成長させた。
【0384】
個々の変異体のH.ジェコリーナ(H.jecorina)形質変換体の初期群から得た胞子を採取し、アセトアミド寒天プレート上で再選択して、プラスミドを含む胞子の数を増やした。胞子は、生理食塩水を用いて採取し、96ウェルマイクロタイタープレートに配列し直し、多くの生産培地の接種に使用して、GH61A変異体サンプルを産生した。この目的のために、96ウェルフィルタープレート(Corning、Art.No.3505)の各ウェルには、250μLのグリシン生産培地を入れ、これは4.7g/Lの(NH
4)
2SO
4、33g/Lの1,4−ピペラジンビス(プロパンスルホン酸)(pH 5.5)、6.0g/Lのグリシン、5.0g/LのKH
2PO
4、1.0g/LのCaCl
2×2H
2O、1.0g/LのMgSO
4×7H
2O、2.5mL/Lの400X T.レーシ(T.reesei)微量元素(5g/LのFeSO
4×7H
2O、1.4g/LのZnSO
4×7H
2O、1.6g/LのMnSO
4×H
2O、3.7g/LのCoCl
2×6H
2Oを含む)、20g/Lのグルコース、及び6.5g/Lのソホロースを含み、これにH.ジェコリーナ(H.jecorina)形質変換体の胞子懸濁液を用いて4重複製で接種した。プレートを、28℃かつ湿度80%で6〜8日間インキュベーションした。培養上清を減圧濾過で採取した。
【0385】
GH61Aコンビナトリアル変異体を培養上清から単離し、さまざまな活性の試験を行った。各GH61Aコンビナトリアル変異体について、実施例1のセクションIV.Aに記述されるSECと、実施例1のセクションIV.Bに記述されるRPCの、2つの定量方法が使用された。野生型GH61Aに比べて培養上清中に存在する酵素の量が増加したGH61A変異体は、改善された産生(又は収量)を有すると言われる。変異体における改善された熱安定性は、例えば、実施例1のセクションV.B(Tm)に記述されている熱安定性アッセイを用いて決定された。性能指数(PI)値は、次のアッセイのうちの1つ以上を用いて、精製GH61Aコンビナトリアル変異体(SECとRPCの両方)について決定した:(i)実施例1のセクションVIに記述されているwhPCS加水分解アッセイ(whPCS)、(ii)実施例1のセクションVIIに記述されているdaCS加水分解アッセイ(daCS)、及び(iii)上記実施例1のセクションVIIIに記述されているアビセル(Avicel)活性(アビセル(Avicel))。
【0386】
下記に示すのは、上記のアッセイのうちの少なくとも1つにおいて、改善された特性(例えば、野生型GH61Aに比べて、改善された産生、改善された熱安定性)/改善されたPI(すなわちPI>1.0)を有するコンビナトリアルGH61A変異体のリストである。GH61A変異体は、下記のコンビナトリアルコホートに分類される。
【0387】
コンビナトリアルコホート1:SEC及び/又はRPCでの評価により、野生型に比べて、改善された産生(収量)を有するコンビナトリアルGH61A変異体:A165G−S185D、A168K−L290D−S297D−R304A、A168K−L290K、A168K−L290K−R304D、A168K−R304A、A168K−R304A−T313K、A168K−R304A−T313K、A168K−S187D−L290D−S297D−R304D、A168K−S187D−L290K−T313K、A168K−S187D−R304D、A168K−S297D−R304D−T313K、A16N−A48R、A16N−A48R−G99E、A16N−A48R−G99E−L290A、A16N−A48R−N59K、A16N−A48R−S164M−L290M、A16N−G99E−S164M、A16N−L290A、A16N−L290A、A16N−L290S、A16N−N59K、A16N−N59K−L290S、A16N−N59K−S164M、A48R−A168K−L290D−S297R、A48R−A168K−R304D−T313K、A48R−A168K−S187D−L290D−S297D−R304D、A48R−A168K−S297R、A48R−A168K−S297R−R304A、A48R−K70E−A168K−L290D−S297D−R304D、A48R−K70E−A168K−L290D−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−S297R−R304A−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−S297R−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−L290D−S297D、A48R−K70E−A168K−S187D−L290D−S297R−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D−R304D−T313K、A48R−K70E−A168K−S187D−S297R−R304D−T313K、A48R−K70E−L290D−S297R−R304A、A48R−K70E−L290D−S297R−R304A、A48R−K70E−R304D、A48R−K70E−R304D−T313K、A48R−K70L−A168K−L290D−S297D−R304A、A48R−K70L−A168K−L290D−S297D−R304D、A48R−K70L−A168K−L290D−S297D−R304D、A48R−K70L−A168K−L290K−S297R−R304D、A48R−K70L−A168K−L290K−T313K、A48R−K70L−A168K−S297D−R304D、A48R−K70L−A168K−S297R−R304A、A48R−K70L−L290K、A48R−K70L−L290K−R304A、A48R−K70L−S187D−L290D−R304A、A48R−K70L−S187D−L290K−R304A、A48R−K70L−S187D−L290K−R304D−T313K、A48R−K70L−S187D−R304D、A48R−K70L−S297D−R304D−T313K、A48R−L290D−S297R−R304A、
A48R−L290D−S297R−R304D−T313K、A48R−L290K−S297R−R304D−T313K、A48R−N59K、A48R−R304A−T313K、A48R−R304D、A48R−S187D−L290D−S297D−R304A、A48R−S187D−L290D−S297D−R304D−T313K、A48R−S187D−L290D−T313K、A48R−S187D−L290K−S297D−R304D、A48R−S187D−L290K−S297D−T313K、A48R−S187D−L290K−S297R−R304D、A48R−S187D−S297D−R304D−T313K、D100Q−D124N、D100Q−D124N−S185H、D100Q−S185H、D100Q−S185H、D100Q−S185H、D100Q−S185H、D124N−Q167K−S185H、D124N−S185H、D197E−S297C、D197L−G235F、D197L−P316F、D197M−G235F−P316F、D197M−P316F、D197M−S297K、D73A−D100Q、D73A−D100Q−D124N、D73A−D124N、D73A−E110Q−D124N、D73A−E110Q−D124N−Q167K、D73A−E110Q−D124N−S185H、D73A−E110Q−Q167K−S185H、D73A−Q167K、D73A−S185H、D73A−S185H、D73E−G99E−T107F−Q167I、D73E−Q167A−S300K、D73E−Q167I、D73E−T107E−Q167A−A233C、D73E−T107E−Q167A−S300K、D73E−T107E−Q167I、D73E−T107E−Q167I、D73E−T107F−S300K、E102S−V193T、E110Q−D124N、E110Q−D124N−S185H、E110Q−S185H、G192A−G235F−S297K、G192A−T212K−G235A−S297K、G235A−S297C、G235F−P316F、G235F−S297C、G235F−S297K、G235F−S297K、G235K−S297C、G235S−S297C、G295C−G298C、G295C−G298C、G295C−N315W、G295T−G298C、G2W−A165G、G2W−A165G、G2W−A165G、G301A−P302G−T303G、G301A−P302G−T303G−N315W、G301A−P302G−T303P、G301A−R304P、G301P−T303P−R304P−Q320A、G301S−P302G−T303P−N315W−Q320P、G301S−T303G−Q320A、G301S−T303P−N315W−Y317W−Y318W、G99E、G99E−T107E−Q167A、I30E−E102S−V132N、I30E−E102S−V193T、I30E−E102S−V193T、I30E−N96P、I30E−N96P−E102S、I30E−N96P−E102S−V132N、I30E−N96P−V193T、I30E−P87H−N96P、I30E−P87H−N96P−E102S、I30E−P87H−N96P−E102S、I30E−P87H−N96P−E102S−V193T、I30E−P87H−N96P−V193T、I30E−V132N、I30E−V132N−V193T、I30E−V193T、I30E−V193T、I30E−V80T、I30E−V80T−E102S、I30E−V80T−E102S−V193T、I30E−V80T−N96P、I30E−V80T−N96P、I30E−V80T−N96P−E102S、I30E−V80T−N96P−E102S−V193T、
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【0388】
コンビナトリアルコホート2:野生型に比べて、改善されたTmを有するコンビナトリアルGH61A変異体:A168K−L290K、A168K−L290K−R304D、A168K−R304A、A168K−R304A−T313K、A168K−S187D−L290D−S297D−R304D、A168K−S187D−L290K−T313K、A168K−S187D−R304D、A168K−S297D−R304D−T313K、A16N−A48R、A16N−A48R−G99E、A16N−A48R−G99E−L290A、A16N−A48R−N59K、A16N−A48R−S164M−L290M、A16N−G99E−S164M、A16N−G99E−S164M−L290A、A16N−L290A、A16N−L290A、A16N−L290S、A16N−N59K、A16N−N59K−G99E−L290A、A16N−N59K−L290S、A16N−N59K−S164M、A48R−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−A168K−R304D−T313K、A48R−A168K−S187D−L290D−S297D−R304D、A48R−A168K−S297R、A48R−K70E−A168K−L290D−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−S297R−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−L290D−S297D、A48R−K70E−A168K−S187D−L290D−S297R−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D−R304D−T313K、A48R−K70E−L290D−S297R−R304A、A48R−K70E−R304A、A48R−K70E−R304D−T313K、A48R−K70L−A168K−L290D−S297D−R304A、A48R−K70L−A168K−L290D−S297D−R304D、A48R−K70L−A168K−L290K−S297R−R304D、A48R−K70L−A168K−S297R−R304A、A48R−K70L−L290K、A48R−K70L−S187D−L290D−R304A、
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【0389】
コンビナトリアルコホート3:野生型に比べて、whPCSアッセイ(SEC及び/又はRPC精製酵素を用いる)において改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:A16N−S164M、A48R−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−K70E−R304D−T313K、A48R−L290K−S297R−R304D−T313K、A48R−N59K−S164M−L290A、A48R−R304A−T313K、A48R−S187D−L290D−S297D−R304D−T313K、D197L−P316F、D197M−G235A−P316C、D197M−T212D、D197M−T212K−G235A−S297K、G235A−S297C、G235F−S297C、G235K−S297C、G235S−S297C、G295C−N315W、G301S−P302G−T303P−N315W−Q320P、G99E、G99E−S164M、I30E−N96P、K106C−G235F、K106F−D197M−S297E、K106H−D197M−G235F−P316C、K106H−P316F、K58V−A168E、K58V−K64L−K70N−A168E、K58V−K64L−K70N−A168E、K64L−K70N−A168E、K70L−R304D、K70R−T108E−P316A、K70S−N96P−H200A、K70S−N96P−V104A−H200A、K70S−N96P−V104A−T108E、K70S−T108E−P316A、K70S−V104I−H200A、N10D−N51T−V82W−T108Q−D197A、N10D−N51T−V82W−T108Q−T127I−D197A、N10D−N51T−V82W−T108Q−T127I−D197A−A201D、N10D−T108Q−T127I−D197A、N10D−T127I−D197A、N10D−T127I−D197A−A201D、N10D−V82W−T127I−D197A−A201D、N51E−K58V−K64L−K70N、N51E−K58V−K64L−K70N、N51E−K58V−K64L−K70N−S135E、N51E−K64L−K70N−A168E、N51H−D73A−D100Q−E110Q−S185H、N51H−D73A−D100Q−S185H、N51H−D73A−D124N−S185H、N51H−D73A−S185H、N51T−D197A、N51T−V82W−T127I−D197A−A201D、N62S−K70A−T108K−T196C−T287H、N62S−K70A−T287H、N96D−G235F−S297C、N96D−T107D−S297C、N96D−T107K−D197E−G235A−S297C、N96D−T107K−D197E−G235S−S297C、N96D−T107M−G235F−S297C、N96D−T107Q−D197E−S297C、N96D−T107Q−D197E−S297C、P28K−V104A−T108D、P52F−D197L、P52F−G235A−P316F、P52F−G235F−P316F、P52F−K106H−G235A−P316F、P52F−K106R−G235F−P316F、P52F−P316F、P52I−D197L−G235F−P316F、P52I−D197L−P316F、P52I−D197M−G235F−P316F、P52I−G235F−P316F、P52I−G235F−P316F、P52I−K106C−G235F、P52I−K106C−P316F、Q50G−D197M−T212K、Q50G−D197M−T212K−G235A−S297E、Q50G−K106F−D197M−S297K、Q50G−T108D−T212K−S297E、
Q50G−V117I−D197M−T212K−G235F−S297K、Q50G−V117I−T212D−S297K、S300T−G301A−Y317W−Y318W、T107A−D197E−G235A−S297C、T107D−G235A−S297C、T107E−D197E−G235A−S297C、T107E−G235A−S297C、T107E−S297C、T107E−S297C、T107H−D197E−G235L−S297C、T107K−G235A−S297C、T107M−G235K−S297C、T107N−D197E−G235S−S297C、T107N−S297C、T107Q−G235A−S297C、T107R−D197E−G235K−S297C、T108A−G295T−G298C、T108A−T287A、T108H−N315W、T108Q−D197A、T61D−G99E−A233C−S300K、T61R−D73E−T107A−Q167A−A233C、T61R−D73E−T107E、T61R−T107E−A233C−S300K、V104A−T107H−S231A、V104A−T107I、V104A−T108E−G298C−N315W、V104I−V117I−T212D−S297K、V80T−V132N、V82W−D197A、V82W−T108Q−T127I、V82W−T127I、V82W−T127I−A201D、Y291F−S300T−G301S−P302G−N315W−Y317W、Y291F−S300T−Q320A、及びY291F−S300T−Y317W−Y318W−Q320S。
【0390】
コンビナトリアルコホート4:野生型に比べて、daCSアッセイ(SEC及び/又はRPC精製酵素を用いる)において改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:A165G−S185D、A168K−L290D−S297D−R304A、A16N−S164M、A48R−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−K70L−S187D−L290K−R304D−T313K、A48R−L290K−S297R−R304D−T313K、A48R−N59K−S164M−L290A、A48R−R304A−T313K、A48R−S187D−L290D−S297D−R304D−T313K、D197M−G235A−P316C、D197M−P316F、D197M−T212D、D197M−T212K−G235A−S297K、D73A−D100Q、G235A−S297C、G235K−S297C、G235S−S297C、G295C−G298C、G295C−N315W、G295T−G298C、G301A−P302G−T303G−N315W−Y317W−Y318W−Q320P、G301A−P302G−T303G−R304P−N315W、G301A−R304P、G301A−R304P−N315W−Y317W−Q320A、G301P−T303P−R304P−Q320A、G301S−P302G−T303G−R304P−Y317W−Q320S、G301S−P302G−T303P−N315W−Q320P、G301S−T303G−Q320A、G301S−T303G−Y317W−Y318W−Q320P、G301S−T303P−N315W−Y317W−Y318W、G99E、G99E−L290A、G99E−S164M、I30E−N96P、K106C−G235A−P316C、K106C−G235F、K106C−P316F、K106C−P316F、K106F−D197M−S297E、K106F−T108D−D197M−S297K、K106H−D197M、K106H−P316F、K58V−A168E、K58V−K64L−K70N−A168E、K58V−K64L−K70N−A168E、K58V−K64L−S135E、K64L−K70N−A168E、K70A−H200A、K70A−N96P−V104I−T108E−P316A、K70A−T108E−T287A、K70A−T108E−T287H、K70A−V104A−T108E−H200A、K70A−V104I、K70A−V104I−T108E、K70A−V104I−T108E−H200A−P316A、K70E−S187D−L290D−S297R、K70L−A168K−L290D−S297D−R304A−T313K、K70L−R304D、K70N−S135E、K70R−H200A−P316A、K70R−N96P−T108E−H200A−P316A、K70R−N96P−V104A−T108E−H200A、K70R−N96P−V104A−T108E−H200A−P316A、K70R−N96P−V104A−T108E−P316A、K70R−T108E−P316A、K70S、
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【0391】
コンビナトリアルコホート5:野生型に比べて、アビセル(Avicel)アッセイ(SEC及び/又はRPC精製酵素を用いる)において改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:
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【0392】
コンビナトリアルコホート6:野生型に比べて、アビセル アフター(Avicel After)アッセイ(SEC及び/又はRPC精製酵素を用いる)において改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:A168K−R304A−T313K、A16N−A48R−G99E−L290A、A16N−G99E−S164M、A16N−G99E−S164M−L290A、A16N−L290S、A16N−N59K、A16N−N59K−S164M、A16N−S164M、A48R−K70E−A168K−L290K−S297R−R304A、A48R−K70E−R304A、A48R−K70L−A168K−L290D−S297D−R304D、A48R−N59K−S164M−L290A、A48R−S187D−L290K−S297D−T313K、D100Q−E110Q−D124N−S185H、D124N−Q167K−S185H、D197L−P316F、D197M−P316F、D197M−S297K、D197M−T212K−G235A−S297K、D73A−D100Q、D73A−D100Q−D124N−Q167K−S185H、D73A−D100Q−E110Q、D73A−D124N、D73A−D124N−S185H、D73A−E110Q−D124N、D73A−E110Q−D124N−Q167K、D73A−Q167K、D73A−S185H、D73E−G99E−T107A−S300K、D73E−G99E−T107F−Q167I、E110Q−D124N、E110Q−D124N−S185H、G192A−D197M−G235F−S297K、G235F−S297C、G235K−S297C、G2V−A165G、G301S−P302G−T303G−R304P−Y317W−Q320S、G301S−T303G−Y317W−Y318W−Q320P、G99E、G99E−L290A、G99E−S164M、G99E−T107F−Q167A−A233C、I30E−E102S−V132N−V193T、I30E−N96P−E102S−V132N−V193T、I30E−V80T−P87H−E102S−V193T、I30E−V80T−P87H−N96P−E102S−V193T、I30E−V80T−P87H−N96P−V132N、I30E−V80T−P87H−V132N、I30E−V80T−P87H−V132N、I30E−V80T−P87H−V132N−V193T、K106C−G235F、K106E−T108D−G235A−S297K、K106E−T108D−V117I−S297E、K106F−G235A−S297K、K106F−T108D−D197M−S297K、K106F−T108D−V117I−G235F−S297K、K106F−T212K−G235A、K58V−A168E、K58V−K64L−H163Y−A168E、K58V−K64L−K70N−A168E、K58V−K64L−K70N−A168E、K58V−K64L−K70N−S135E−H163Y、K58V−K64L−S135E−H163Y、K58V−S135E−H163Y−A168E、K64L−K70N、K64L−K70N−A168E、K70A−T108E−T287H、K70A−T108I−T196C、K70A−T108I−T196C、K70A−T108K−T287H、K70A−T108L、K70E−A168K−S297R−R304D−T313K、K70L−A168K−S187D−L290K−S297D−R304A−T313K、K70L−A168K−S187D−L290K−S297R−R304D−T313K、K70L−L290D−S297D、K70R−N96P−V104A−T108E−P316A、K70R−T108E−P316A、
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【0393】
コンビナトリアルコホート7:野生型に比べて、改善された安定性(SEC及び/又はRPC精製酵素を用いる)を有するコンビナトリアルGH61A変異体:A165Y−S185D、A168K−L290D−S297D−R304A、A168K−L290K、A168K−L290K−R304D、A168K−R304A−T313K、A168K−R304A−T313K、A168K−S187D−L290D−S297D−R304D、A168K−S187D−L290K−T313K、A168K−S297D−R304D−T313K、A16N−A48R−G99E−L290A、A16N−A48R−N59K−G99E、A16N−A48R−S164M−L290M、A16N−G99E−S164M、A16N−G99E−S164M−L290A、A16N−L290A、A16N−L290A、A16N−N59K、A16N−N59K−G99E−L290A、A16N−N59K−G99E−S164M、A16N−N59K−L290S、A16N−N59K−S164M、A16N−S164M、A48R−A168K−L290D−S297R、A48R−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−A168K−R304D−T313K、A48R−A168K−S187D−L290D−S297D−R304D、A48R−A168K−S297R、A48R−G99E−L290A、A48R−K70E−A168K−L290D−S297D−R304D、A48R−K70E−A168K−L290D−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−R304A−T313K、A48R−K70E−A168K−L290K−S297R−R304A、A48R−K70E−A168K−L290K−S297R−R304A−T313K、A48R−K70E−A168K−S187D−L290D−S297D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D−R304D、A48R−K70E−A168K−S187D−S297D−R304D−T313K、
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V104I−T108A−G295C−N315W、V104I−T108A−G295C−N315W、V104I−T108A−G295T−N315W、V104I−T108A−G298C、V104I−T108A−N315W、V104I−T108D、V104I−T108D−G295C−N315W、V104I−T108D−G295T、V104I−T108D−G295T、V104I−T108D−G295T−G298C−N315W、V104I−T108D−N315W、V104I−T108D−N315W、V104I−T108E−G295C−G298C、V104I−T108E−G295T−G298C−N315W、V104I−T108H−G295T−G298C、V104I−T108H−G295T−G298C−N315W、V104I−T108H−G295T−N315W、V104I−T108H−G295T−N315W、V104I−T108H−G298C−N315W、V104I−T108H−N315W、V104I−T108I、V104I−T108I−G295C−G298C、V104I−T108I−G295C−N315W、V104I−T108I−G295T−N315W、V104I−T108I−G295T−N315W、V104I−T108M、V104I−T108M、V104I−T108M−G298C−N315W、V104K−T107H−S231C、V104K−T107M、V104K−T107Q、V104K−T107Q、V104K−T107Q、V104R−T107G−S231C、V104R−T107H、V80T−E102S−V132N−V193T、V80T−N96P−E102S−V132N、V80T−P87H、V80T−P87H、V80T−P87H−E102S、V80T−P87H−E102S、V80T−P87H−E102S−V193T、V80T−P87H−N96P、V80T−P87H−N96P−E102S、V80T−P87H−N96P−E102S−V193T、V80T−P87H−N96P−V132N−V193T、V80T−P87H−N96P−V193T、V80T−P87H−V132N、V82W−T127I、Y291F−G301A−P302G−T303P−Q320A、Y291F−G301S−T303G−R304P−N315W−Y317W−Q320A、Y291F−G301S−T303P−R304P−N315W−Y317W−Q320S、Y291F−P302G−R304P−Y317W−Y318W−Q320P、Y291F−P302G−T303P−N315W−Y317W−Q320P、Y291F−R304P、Y291F−S300T−G301A−T303G−R304P−Y317W−Y318W−Q320P、Y291F−S300T−G301P−N315W−Q320A、Y291F−S300T−G301S−P302G−N315W−Y317W、Y291F−S300T−G301S−P302G−T303G−N315W−Y318W−Q320P、Y291F−S300T−G301S−P302G−T303G−N315W−Y318W−Q320P、Y291F−S300T−G301S−R304P−N315W−Q320P、Y291F−S300T−G301S−R304P−Q320S、Y291F−S300T−G301S−R304P−Y317W−Y318W−Q320P、Y291F−S300T−N315W−Y317W−Q320A、Y291F−S300T−P302G−T303G−R304P、Y291F−S300T−P302G−T303G−Y317W、Y291F−S300T−P302G−T303P−R304P−N315W−Y317W−Q320A、Y291F−S300T−P302G−Y318W−Q320S、Y291F−S300T−Q320A、Y291F−S300T−R304P−N315W−Q320A、Y291F−S300T−R304P−N315W−Y317W−Q320P、Y291F−S300T−T303G−N315W−Y317W、Y291F−S300T−T303G−R304P−N315W−Y318W−Q320P、Y291F−S300T−T303G−Y317W−Y318W、Y291F−S300T−T303P−R304P−N315W−Q320A、Y291F−S300T−Y317W−Y318W−Q320S、Y291F−T303G−N315W−Y317W−Y318W、Y291F−Y317W−Y318W−Q320A、Y291W−G301A−P302G−T303P−R304P−N315W−Y318W−Q320A、Y291W−G301P−P302G−T303G−R304P−Y317W−Q320A、Y291W−G301S−P302G−T303G−Q320A、Y291W−G301S−P302G−T303G−Y317W−Q320A、Y291W−G301S−T303G−N315W−Y317W−Q320S、Y291W−N315W−Y317W−Q320S、Y291W−N315W−Y317W−Y318W、Y291W−P302G−R304P−N315W−Y317W−Y318W、Y291W−S300T−G301A−P302G−T303P−N315W、Y291W−S300T−G301A−Q320A、Y291W−S300T−G301A−Y317W−Y318W−Q320P、Y291W−S300T−G301S−T303G−Y317W−Y318W−Q320S、Y291W−S300T−P302G−T303P−R304P−N315W−Y317W−Y318W、及びY291W−T303P−Q320S。
【0394】
コンビナトリアルコホート1〜7におけるコンビナトリアルGH61A変異体の任意のものが、本発明の態様において利用される。前のセクションで記述された単一のSEL変異体と共に、数多くのコンビナトリアルGH61A変異体が、上記の複数のコンビナトリアルコホートに属する。よって、上記のコンビナトリアルコホートのうちの2つ以上、3つ以上、4つ以上、5つ以上、6つ以上、又は7つ全部に属する(例えば、コンビナトリアルGH61A変異体K64L−K70N−A168Eは、上記のコンビナトリアルコホート7つ全部にある)コンビナトリアルGH61A変異体が、本発明の態様において利用される。同様に、同様のコンビナトリアルの改善された特性/PIを有するGH61Aコンビナトリアル変異体(すなわち、同じコンビナトリアルコホートに属するもの)は、固有の機能性グループを形成する。
【0395】
上記で生成されたコンビナトリアルGH61A変異体それぞれから得られたデータは、線形モデルデコンボリューション法を用いて解析され、各特性に対する置換の個々の影響が、すべての置換の追加を仮定した単純線型モデル回帰を用いて(相互作用項は使用せず)、デコンボリューションされた。Ihaka et al.、「A Language for Data Analysis and Graphics」J.Comput.Graphical Statistics 1996、5(3):299〜314を参照。具体的には、線形モデリングは、野生型アミノ酸を第1因子とし、すべての置換部位を因子変数に変換した後に、Rのベースパッケージ(下記参照)内の/m関数を用いて実施された。Tm、タンパク質産生(収量)、daCSアッセイでの性能、及びwhPCSアッセイでの性能におけるGH61Aの個々の置換それぞれの影響が、このようにしてデコンボリューションされた。Tm、タンパク質産生(収量)、daCSアッセイでの性能、及びwhPCSアッセイでの性能のうちの1つ又は2つ以上の改善に対応するGH61A置換が、下記のデコンボリューションコホートにリストされている。
【0396】
デコンボリューションコホート1:daCSアッセイでの改善された活性に対応するGH61Aの置換:N10D、N51E、K58V、K64L、K70S、K70E、V104A、K106C、T108K、T108A、T127I、A129N、Q167K、D197A、D197M、A201D、T287A、Y291F、Y291W、G295T、G295C、S297E、S300T、T303G、T303P、R304D、R304P、T313K、N315W、P316F、Y317W、Q320A、Q320P、及びQ320S。
【0397】
デコンボリューションコホート2:whPCSアッセイでの改善された活性に対応するGH61Aの置換:N10D、A16N、N51E、P52F、K58V、K64L、K70N、T107G、T107Q、T107E、T107N、T108K、T127I、S185D、D197L、H200A、T287A、Y291F、S297E、T313K、P316A、及びP316F。
【0398】
デコンボリューションコホート3:改善されたTmに対応するGH61Aの置換:A16N、N51H、N51T、K70N、K70L、T107N、T107M、D124N、T127I、S164M、Q167K、A168K、S187D、D197E、G235K、T287A、L290A、S297C、G298C、G301S、G301P、T313K、P316A、Y318W、及びQ320A。
【0399】
デコンボリューションコホート4:改善された産生(収量)に対応するGH61Aの置換:A16N、N51H、N51T、K70N、V80T、T107E、T108K、S135E、S187D、D197E、G235K、G235L、G235S、T287A、L290M、及びP316A。
【0400】
デコンボリューションコホート1、2、3及び/又は4にあるGH61A置換の任意の1つ又は任意の組み合わせが、本発明の態様に利用される。前のセクションで記述された単一のSEL変異体と共に、数多くのGH61A置換が、上記の複数のデコンボリューションコホートに属する。よって、上記のデコンボリューションコホートのうちの2つ以上、3つ以上、又は4つ全部に属する(例えば、GH61A置換T287Aは、上記のデコンボリューションコホート4つ全部にある)GH61A置換が、本発明の態様において利用される。同様に、同様の組み合わせの改善された特性を有するGH61Aコンビナトリアル変異体(すなわち、同じデコンボリューションコホートに属するもの)は、固有の機能性グループを形成する。ただし一例として、下記のGH61A置換は、上記のデコンボリューションコホート1及び2の両方に属する(けれども必ずしも排他的ではなく、例えば、T287Aはデコンボリューションコホート3及び4にも属する):N10D、N51E、K58V、K64L、T108K、T127I、T287A、Y291F、S297E、T313K、及びP316F。
【0401】
追加的コンビナトリアルGH61A変異体ライブラリが構築され、次の試験が行われた:(i)実施例1のセクションV.Bに記述されている熱安定性アッセイ(Tm)、(ii)実施例1のセクションVI.Aに記述されているwhPCS加水分解アッセイ(whPCS−A)、(iii)実施例1のセクションVI.Bに記述されているwhPCS加水分解アッセイ(whPCS−B)、(iv)実施例1のセクションVIIに記述されているdaCS加水分解アッセイ(daCS)。
【0402】
下記に示すのは、上記のアッセイのうちの少なくとも1つにおいて、改善された特性(例えば、改善されたTm)/野生型GH61Aに比べて改善されたPI(すなわちPI>1.0)を有する、この追加的コンビナトリアルGH61A変異体ライブラリからの、コンビナトリアルGH61A変異体のリストである。GH61A変異体は、下記のコンビナトリアルコホートに分類される。下記のいくつかのコンビナトリアルコホートは、前述のコンビナトリアルGH61Aライブラリについて記述したコンビナトリアルコホートと同じであり、よって、前のコンビナトリアルコホートに対する「補足」となることに注意されたい。
【0403】
コンビナトリアルコホート8(上記コンビナトリアルコホート2の補足):野生型に比べて、改善されたTmを有するコンビナトリアルGH61A変異体:C294S−C311S、D038N−S135H−Q167R−S213R、D038N−S164L−G166F−Q167R−A168L−V206I、D100L−S185K、D124S−S164R、G166F−A168Y、I004V−D038N−G166W−N216I、I004V−D038N−G166W−Q167R−A168L−V206I−N216I、I004V−D038N−H163Q−S164R−G166W−Q167R−A168L−V206I−N216I、I004V−D038N−S164K−G166W−Q167R−A168L−V206I−N216I、I004V−G166W、I004V−S164K−G166W、K070N−T107E−N147E−S187E、N005E−K064Q−S135E−S187E、N005R−P028A−T061D−V104A−H200A−G235A−S297E、N147E−S187E、P052H−V141R、P083K−Q167R、S164K−G166W、S164K−G166W−Q167R−A168L−V206I、S297E−R304D、T287D−S297E、及びY024S−V132L−T202A−A233C−L290M−P316C。
【0404】
コンビナトリアルコホート9(上記コンビナトリアルコホート3の補足):野生型に比べて、whPCS−Aアッセイにおいて改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:D038N−T212R、D100L−S185K、E025M−Q050G−G192A−G235A、E025M−Q050G−V104A−T108A、E025M−T107C−G192A−G235F、E025M−T107F−G235F、E110M−S187H、F022D−Q050G−T107C、F112W−K113P−I114F、I004V−K106E−V117I−Y153A、I004V−V104A−T107A−A171E、I004V−V104A−T108E−N173S−T287A、I114F−G151D−E158G、I114F−H163Y、I114F−V154K、K058I−K070N−T107E−S164E−Q189D−S213E、K064Q−L076E、K070N−T107E−N147E−S187E、K106C−T107A−T108E、K113P−E158G、N005A−T061A−V104K−T107F−T108C、N005E−K058I−S135E−Q167E、N005E−N027E−K058I−L076E−T103E−Q167E−S185D−Q189D、N005R−P028A−T061D−N062C−V104A−T107D−T108E−H200A−G235A−G295W−S297E−G298A、N027H−D197T、N027H−P052H−V141R−I218R、N096D−T107A−G235A−T287A、P052H−V141R、P083K−Q167R、Q050G−V104A−C167R、Q050G−V104A−K106C、S135E−S213E、S135H−S213R、S183R−S191R、T061R−I218R、T103E−Q189D、T103E−S185D−Q189D−T223E、T107A−T108E−G166F−A171E、T107A−V117I−S187K−T212D、T107E−T223E、T108D−H163I−G166W−T212D、T287D−S297E、T287H−S297R、V104A−K106C−T107A、V104A−K106C−T108E、V104A−T107A−G235F、V104A−T107A−T108E、V104A−T107A−T108E−A171E−T287A、及びV104A−T108E−A171E−N173S。
【0405】
コンビナトリアルコホート10:野生型に比べて、whPCS−Bアッセイにおいて改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:D038N−T212R、D100L−S185K、E025L−V104A−T108L、E025M−Q050G−G192A−G235A、E025M−Q050G−V104A−T108A、E025M−T107F−G235F、F022A−K106F−V117I−T212K−S297C、F022D−Q050G−T107C、I004V−V104A−T108E−N173S−T287A、K058I−S164E、K064Q−L076E、K113P−E158G、N005A−T061A−V104K−T107F−T108C、N005E−L039D−T103E−S135E−S185D−T223E、N010D−N027E、N027H−D197T、N096D−T107A−G235A−T287A、Q050G−T107A−T108E、Q050G−V104A−C167R、Q050G−V104A−G235F、S135E−S213E、S135H−S213R、S183R−S191R、S297E−R304D、T061R−I218R、T103E−Q189D、T107E−T223E、T287D−S297E、T287H−S297R、及びV104A−T107A−G235F。
【0406】
コンビナトリアルコホート11(上記コンビナトリアルコホート4の補足):野生型に比べて、daCSアッセイにおいて改善された性能を有するコンビナトリアルGH61A変異体:C294S−C311S、C305E−C321E、C305G−C321G、C305K−C321R、D006S−E025L−D105S−T108K−H200D−G298H、D038N−S135H−Q167R−S213R、D038N−S164L−G166F−Q167R−A168L−V206I、D038N−T212R、D038N−V142S−V154D−S185H、D100L−S183R−S187H−S191R、D100L−S185K、E025L−V104A−T108L、E025M−Q050G−G192A−G235A、E025M−Q050G−V104A−T108A、E025M−T107C−G192A−G235F、E025M−T107F−G235F、E110M−S187H、F022A−K106F−V117I−T212K−S297C、F022D−Q050G−T107C、F022D−V104A−T107A−T287H、F022G−A060G−N096A−V142S−N173S−A201F、F112W−H163Y、F112W−I144Y−V154K、F112W−K113P−I114F、I004V−D038N−G166W−N216I、I004V−D038N−G166W−Q167R−A168L−V206I−N216I、I004V−G166W、I004V−K106E−V117I−Y153A、I004V−V104A−T107A−A171E、I004V−V104A−T108E−N173S−T287A、I004V−V154K−S187P−T212D、I004V−Y024A−G151P−N315W、I114F−G151D−E158G、I114F−H163Y、I114F−V154K、I144Y−P145D−G151D−V154K−E158G−H163Y、K058I−K070N−T107E−S164E−Q189D−S213E、K064Q−L076E、K070A−N096D−K106L−E110L−A201E−G235D−G295D、K070N−T107E−N147E−S187E、K106C−T107A−T108E、K113P−E158G、K113P−P145D−H163Y、L039D−Q167E、L039D−T103E−Q167E−T223E、N005A−T061A−V104K−T107F−T108C、N005E−K058I−S135E−Q167E、N005E−K064Q−S135E−S187E、N005E−L039D−T103E−S135E−S185D−T223E、N005E−N027E−K058I−L076E−T103E−Q167E−S185D−Q189D、N005R−P028A−T061D−N062C−V104A−T107D−T108E−H200A−G235A−G295W−S297E−G298A、N005R−P028A−T061D−V104A−H200A−G235A−S297E、N010D−L076D−N147E−H163Y−Q167E−S187E、N010D−N027E、N010R−E110M−S185K−Q189R、N010R−Q189R、N027E−L076E−T107E−S213E、N027H−D197T、N027H−P052H−V141R−I218R、N062H−K070A−N096H−E110L−A201E−S297K、N096D−T107A−G235A−T287A、P028K−N062C−T107D−T108E−G295W−G298A、P052H−V141R、Q050G−K106C−A171E−T287A、Q050G−T107A−T108E、Q050G−V104A−C167R、Q050G−V104A−G235F、Q050G−V104A−K106C、S135E−S213E、S135H−S213R、S183R−S191R、T061R−I218R、T103E−Q189D、T103E−S185D−Q189D−T223E、T107A−T108E−G166F−A171E、T107A−V117I−S187K−T212D、T107E−T223E、T108D−H163I−G166W−T212D、T287D−S297E、T287H−S297R、V008I−D038N−P145F−S187P、V008I−K106E−V142S−G235F、V104A−K106C−T107A、V104A−K106C−T108E、V104A−K106R−T107A−T108A、V104A−T107A−G166F−N173S、V104A−T107A−G235F、V104A−T107A−T108E、V104A−T107A−T108E−A171E−T287A、V104A−T108E−A171E−N173S、V104A−T108E−G166F−T287A、Y024A−D038N−V104A−E158W、Y024S−T108D−V142S−G235A、及びY024S−V132L−T202A−A233C−L290M−P316C。
【0407】
コンビナトリアルコホート8〜11におけるコンビナトリアルGH61A変異体の任意のものが、本発明の態様において利用される。前のセクションで記述された単一のSEL変異体と共に、数多くのコンビナトリアルGH61A変異体が、複数のコンビナトリアルコホート8〜11に属する。よって、上記コンビナトリアルコホート8〜11のうちの2つ以上、3つ以上、又は4つ全部に属する(例えば、コンビナトリアルGH61A変異体T287D−S297Eは、上記コンビナトリアルコホート8〜11のうちの4つ全部にある)コンビナトリアルGH61A変異体が、本発明の態様において利用される。同様に、同様のコンビナトリアルの改善された特性/PIを有するGH61Aコンビナトリアル変異体(すなわち、同じコンビナトリアルコホートに属するもの)は、固有の機能性グループを形成する。
【0408】
本明細書に記述される実施例及び実施形態は単に説明目的であり、これを考慮してさまざまな改変又は変更が当業者に提示され、本出願の趣旨と範囲及び添付の請求項の範囲の中に含まれるものであることが理解されよう。本明細書に引用されるすべての出版物、特許、及び特許出願は、すべての目的に関してその全体が参照により本明細書に援用される。
【0409】
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